NONHSAT060105 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0
ENST00000328113 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:101926805:101927707:-1 gene:ENSG00000183909 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000492842 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:62948:63887:1 gene:ENSG00000240361 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000588632 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:19:104535:105471:1 gene:ENSG00000267310 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONHSAT000016 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONHSAT051704 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONHSAT060106 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
ENST00000387377 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:GRCh38:MT:4402:4469:1 gene:ENSG00000210112 gene_biotype:Mt_tRNA transcript_biotype:Mt_tRNA // chr1 // 78 // 96 // 21 // 27 // 0 /// AK074482 // GenBank // Homo sapiens cDNA fis, A-BNGH41000020, highly similar to Homo sapiens isolate EIJbIII-4-94 NADH dehydrogenase subunit 1 gene; mitochondrial gene for mitochondrial product. // chr1 // 79 // 100 // 22 // 28 // 0 /// NC_001807 // GenBank // gi|17981852|ref|NC_001807.4|:4403-4470; gene=TRNM; product=tRNA-Met // chr1 // 78 // 96 // 21 // 27 // 0 /// NONHSAT135808 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 79 // 100 // 22 // 28 // 0
ENST00000387382 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:GRCh38:MT:5512:5579:1 gene:ENSG00000210117 gene_biotype:Mt_tRNA transcript_biotype:Mt_tRNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NC_001807 // GenBank // gi|17981852|ref|NC_001807.4|:5513-5580; gene=TRNW; product=tRNA-Trp // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT135810 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000387419 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:GRCh38:MT:7518:7585:1 gene:ENSG00000210154 gene_biotype:Mt_tRNA transcript_biotype:Mt_tRNA // chr1 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// NC_001807 // GenBank // gi|17981852|ref|NC_001807.4|:7519-7586; gene=TRND; product=tRNA-Asp // chr1 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// NONHSAT135817 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 79 // 100 // 22 // 28 // 0
ENST00000387421 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:GRCh38:MT:8295:8364:1 gene:ENSG00000210156 gene_biotype:Mt_tRNA transcript_biotype:Mt_tRNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// M37726 // GenBank // Human mitochondrial Lys-tRNA-aaa. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NC_001807 // GenBank // gi|17981852|ref|NC_001807.4|:8296-8365; gene=TRNK; product=tRNA-Lys // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT139825 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// NONHSAT139826 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// NONHSAT147698 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0
ENST00000540997 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:224008727:224010612:1 gene:ENSG00000185495 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000591702 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:785800:787672:1 gene:ENSG00000237491 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AK026836 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ23183 fis, clone LNG11477. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AK290103 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78588 complete cds. // chr1 // 87 // 100 // 20 // 23 // 0 /// NONHSAT000137 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT009765 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT139832 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NR_103536 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 87, member B (FAM87B), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NR_103537 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 87, member A (FAM87A), long non-coding RNA. // chr1 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// ENST00000326734 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:817371:819837:1 gene:ENSG00000177757 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000330148 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:8:375931:383174:-1 gene:ENSG00000182366 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// BC037297 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4821387. // chr1 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// ENST00000602608 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:8:376243:377759:-1 gene:ENSG00000182366 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// BC118644 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:40030978. // chr1 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// ENST00000613235 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:8:377779:378637:-1 gene:ENSG00000182366 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 90 // 38 // 9 // 10 // 0 /// NONHSAT000148 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT124585 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// TCONS_00000129-XLOC_000007 // Rinn lincRNA // linc-SAMD11-5 chr1:+:752750-755214 // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT124586 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_005101 // RefSeq // Homo sapiens ISG15 ubiquitin-like modifier (ISG15), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000379389 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:1013423:1014540:1 gene:ENSG00000187608 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY168648 // GenBank // Homo sapiens ubiquitin-like protein ISG15 mRNA, complete cds. // chr1 // 82 // 41 // 9 // 11 // 0 /// BC009507 // GenBank // Homo sapiens ISG15 ubiquitin-like modifier, mRNA (cDNA clone MGC:3945 IMAGE:3545944), complete cds. // chr1 // 85 // 74 // 17 // 20 // 0 /// BT007297 // GenBank // Homo sapiens interferon, alpha-inducible protein (clone IFI-15K) mRNA, complete cds. // chr1 // 82 // 41 // 9 // 11 // 0 /// M13755 // GenBank // Human interferon-induced 17-kDa/15-kDa protein mRNA, complete cds. // chr1 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// GENSCAN00000014873 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:1006335:1014478:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0
NM_198576 // RefSeq // Homo sapiens agrin (AGRN), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 49 // 49 // 0 /// XM_006710635 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens agrin (AGRN), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 80 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000379370 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:1020123:1056116:1 gene:ENSG00000188157 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 49 // 49 // 0 /// AB191264 // GenBank // Homo sapiens AGRN mRNA for agrin, complete cds. // chr1 // 98 // 100 // 48 // 49 // 0 /// ENST00000461111 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:1051986:1056112:1 gene:ENSG00000188157 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 20 // 20 // 10 // 49 // 1 /// AK128761 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ45064 fis, clone BRAWH3024242. // chr1 // 20 // 20 // 10 // 49 // 1 /// ENST00000620552 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:1020123:1056118:1 gene:ENSG00000188157 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 49 // 49 // 0 /// GENSCAN00000014913 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:1034556:1054981:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 40 // 40 // 0
NR_029639 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 200b (MIR200B), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000384997 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:1167092:1167202:1 gene:ENSG00000207730 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-200b // miRBase Micro RNA Database // MI0000342 Homo sapiens miR-200b stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT000250 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT000251 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029834 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 200a (MIR200A), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000384875 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:1167846:1167956:1 gene:ENSG00000207607 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-200a // miRBase Micro RNA Database // MI0000737 Homo sapiens miR-200a stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT000250 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT000253 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029957 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 429 (MIR429), microRNA. // chr1 // 94 // 94 // 16 // 17 // 0 /// ENST00000362106 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:1169005:1169087:1 gene:ENSG00000198976 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 94 // 94 // 16 // 17 // 0 /// hsa-mir-429 // miRBase Micro RNA Database // MI0001641 Homo sapiens miR-429 stem-loop // chr1 // 94 // 94 // 16 // 17 // 0 /// NONHSAT000250 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT000255 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 94 // 94 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000014910 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:1126225:1185529:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 71 // 94 // 12 // 17 // 0
NM_080605 // RefSeq // Homo sapiens UDP-Gal:betaGal beta 1,3-galactosyltransferase polypeptide 6 (B3GALT6), mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000379198 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:1232265:1235041:1 gene:ENSG00000176022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000014884 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:1232279:1233268:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// AY050570 // GenBank // Homo sapiens beta-1,3-galactosyltransferase-6 (B3GALT6) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
NM_153339 // RefSeq // Homo sapiens pseudouridylate synthase-like 1 (PUSL1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000379031 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:1308567:1311677:1 gene:ENSG00000169972 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000467712 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:1308821:1311069:1 gene:ENSG00000169972 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000470520 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:1308611:1311028:1 gene:ENSG00000169972 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 94 // 62 // 15 // 16 // 0 /// AK298218 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57412 complete cds, highly similar to tRNA pseudouridine synthase-like 1 (EC 5.4.99.-). // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC034304 // GenBank // Homo sapiens pseudouridylate synthase-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:30098 IMAGE:4778177), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000493657 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:1309235:1311676:1 gene:ENSG00000169972 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// AK027721 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ14815 fis, clone OVARC1000017. // chr1 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// ENST00000463758 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:1308788:1309840:1 gene:ENSG00000169972 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000014917 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:1307814:1311379:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// NONHSAT000277 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr1 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_001029885 // RefSeq // Homo sapiens ceramide-1-phosphate transfer protein (CPTP), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENST00000343938 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:1324767:1328897:1 gene:ENSG00000224051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENST00000464957 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:1324756:1327994:1 gene:ENSG00000224051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 57 // 26 // 26 // 0 /// BC072454 // GenBank // Homo sapiens hypothetical protein MGC10334, mRNA (cDNA clone IMAGE:6185216), partial cds. // chr1 // 100 // 50 // 23 // 23 // 0 /// BC098429 // GenBank // Homo sapiens glycolipid transfer protein domain containing 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5927583), partial cds. // chr1 // 100 // 50 // 23 // 23 // 0 /// JN542538 // GenBank // Homo sapiens ceramide-1-phosphate transfer protein (GLTPD1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 39 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000488011 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:1325241:1327471:1 gene:ENSG00000224051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 37 // 37 // 17 // 46 // 1 /// GENSCAN00000014870 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:1326911:1327763:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 39 // 18 // 18 // 0
NM_152228 // RefSeq // Homo sapiens taste receptor, type 1, member 3 (TAS1R3), mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// XM_006710939 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens taste receptor, type 1, member 3 (TAS1R3), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 96 // 60 // 23 // 24 // 0 /// ENST00000339381 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:1331314:1335306:1 gene:ENSG00000169962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// AK122959 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ16679 fis, clone TLIVE2003381, moderately similar to Mus musculus taste receptor, type 1, member 3 (Tas1r3). // chr1 // 89 // 45 // 16 // 18 // 0 /// GENSCAN00000014893 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:1331346:1334464:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0
NM_022834 // RefSeq // Homo sapiens von Willebrand factor A domain containing 1 (VWA1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000476993 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:1435671:1442882:1 gene:ENSG00000179403 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0 /// AK291557 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75292 complete cds, highly similar to Homo sapiens von Willebrand factor A domain containing 1 (VWA1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 81 // 78 // 26 // 32 // 0 /// BC059409 // GenBank // Homo sapiens von Willebrand factor A domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:71828 IMAGE:30349211), complete cds. // chr1 // 100 // 85 // 35 // 35 // 0 /// NM_199121 // RefSeq // Homo sapiens von Willebrand factor A domain containing 1 (VWA1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 90 // 90 // 37 // 41 // 1 /// ENST00000338660 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:1435523:1440765:1 gene:ENSG00000179403 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 83 // 83 // 34 // 41 // 1 /// ENST00000495558 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:1434861:1437459:1 gene:ENSG00000179403 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 20 // 20 // 8 // 41 // 1 /// GENSCAN00000014877 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:1426194:1468530:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 61 // 61 // 25 // 41 // 1
AB593172 // GenBank // Homo sapiens HP08716 mRNA, partial sequence, clone: HP08716-RBd88H07. // chr1 // 91 // 100 // 20 // 22 // 0 /// ENST00000366221 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:1574975:1577075:1 gene:ENSG00000215014 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AF161351 // GenBank // Homo sapiens HSPC088 mRNA, partial cds. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT000333 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_138705 // RefSeq // Homo sapiens calmodulin-like 6 (CALML6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// XM_005244729 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens calmodulin-like 6 (CALML6), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 67 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000307786 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:1914827:1917294:1 gene:ENSG00000169885 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000378604 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:1915108:1917294:1 gene:ENSG00000169885 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0 /// AF490905 // GenBank // Homo sapiens calglandulin-like protein (CALGP) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// AY566229 // GenBank // Homo sapiens calglandulin-like protein (CAGLP) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000482402 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:1915266:1917296:1 gene:ENSG00000169885 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 78 // 78 // 14 // 18 // 1 /// BC053567 // GenBank HTC // Homo sapiens calmodulin-like 6, mRNA (cDNA clone IMAGE:6203086), with apparent retained intron. // chr1 // 78 // 78 // 14 // 18 // 1 /// GENSCAN00000014892 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:1887090:1917193:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 56 // 56 // 10 // 18 // 1
NM_000815 // RefSeq // Homo sapiens gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, delta (GABRD), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000378585 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:2019341:2030753:1 gene:ENSG00000187730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF016917 // GenBank // Homo sapiens GABA-A receptor delta subunit (GABRD) mRNA, complete cds. // chr1 // 94 // 64 // 17 // 18 // 0 /// AK290861 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75677 complete cds, highly similar to Homo sapiens gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, delta (GABRD), mRNA. // chr1 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// BC033801 // GenBank // Homo sapiens gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, delta, mRNA (cDNA clone MGC:45284 IMAGE:5171119), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000045683 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:2019424:2030282:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0
AK093927 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ36608 fis, clone TRACH2015824. // chr1 // 100 // 55 // 17 // 17 // 0 /// BC018779 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4870477, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr1 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0
NM_003036 // RefSeq // Homo sapiens v-ski avian sarcoma viral oncogene homolog (SKI), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// XM_005244776 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens v-ski avian sarcoma viral oncogene homolog (SKI), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 64 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000378536 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:2228695:2310119:1 gene:ENSG00000157933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000045688 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:2280608:2319130:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 36 // 36 // 16 // 44 // 1 /// GENSCAN00000045692 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:2224815:2238246:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 36 // 36 // 16 // 44 // 1
AK055432 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ30870 fis, clone FEBRA2004237. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT000425 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_080431 // RefSeq // Homo sapiens actin-related protein T2 (ACTRT2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000378404 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:3021483:3022903:1 gene:ENSG00000169717 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB057364 // GenBank // Homo sapiens mRNA for actin-related protein hArpM2, complete cds. // chr1 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// AF440740 // GenBank // Homo sapiens actin-related protein T2 (ACTRT2) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// BC029499 // GenBank // Homo sapiens actin-related protein T2, mRNA (cDNA clone MGC:33234 IMAGE:5270604), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000017687 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:3015773:3031219:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 86 // 54 // 12 // 14 // 0
NM_182752 // RefSeq // Homo sapiens tumor protein p63 regulated 1-like (TPRG1L), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000344579 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:3625050:3630127:1 gene:ENSG00000158109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000378344 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:3625002:3630127:1 gene:ENSG00000158109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK289919 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77019 complete cds. // chr1 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// AK298343 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55125 complete cds. // chr1 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// BC019034 // GenBank // Homo sapiens tumor protein p63 regulated 1-like, mRNA (cDNA clone MGC:20946 IMAGE:4576259), complete cds. // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000017696 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:3615419:3628603:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
NM_152492 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 27 (CCDC27), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000294600 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:3752398:3771644:1 gene:ENSG00000162592 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000462521 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:3752445:3771645:1 gene:ENSG00000162592 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// AK057387 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ32825 fis, clone TESTI2003074, weakly similar to TRICHOHYALIN. // chr1 // 97 // 100 // 37 // 38 // 0 /// BC112108 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 27, mRNA (cDNA clone MGC:138313 IMAGE:8327576), complete cds. // chr1 // 97 // 95 // 35 // 36 // 0 /// BC112112 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 27, mRNA (cDNA clone MGC:138317 IMAGE:8327580), complete cds. // chr1 // 97 // 95 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000017703 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:3752668:3775921:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0
NM_001042478 // RefSeq // Homo sapiens adherens junctions associated protein 1 (AJAP1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000378190 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:4654732:4777794:1 gene:ENSG00000196581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// AF175409 // GenBank // Homo sapiens MOT8 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// AY282806 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein SHREW1 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NM_018836 // RefSeq // Homo sapiens adherens junctions associated protein 1 (AJAP1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 93 // 93 // 28 // 30 // 1 /// ENST00000378191 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:4655045:4792534:1 gene:ENSG00000196581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 93 // 28 // 30 // 1 /// GENSCAN00000013385 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:4665503:4716885:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
ENST00000466994 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:6205475:6208307:1 gene:ENSG00000158286 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000484435 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:6206129:6207564:1 gene:ENSG00000158286 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 92 // 48 // 12 // 13 // 0 /// AK128246 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ46380 fis, clone THYMU2008207. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC119780 // GenBank // Homo sapiens ring finger protein 207, mRNA (cDNA clone IMAGE:40109293), complete cds. // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NM_207396 // RefSeq // Homo sapiens ring finger protein 207 (RNF207), mRNA. // chr1 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// ENST00000377939 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:1:6206176:6221299:1 gene:ENSG00000158286 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// NONHSAT000629 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONHSAT000630 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 92 // 48 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000026031 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:6205959:6219407:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
ENST00000485539 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:6208618:6210900:1 gene:ENSG00000158286 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000492476 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:6211035:6212836:1 gene:ENSG00000158286 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// AK056658 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ32096 fis, clone OCBBF2001075. // chr1 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// AK294223 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54599 complete cds. // chr1 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// BC034459 // GenBank HTC // Homo sapiens ring finger protein 207, mRNA (cDNA clone IMAGE:5185460). // chr1 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// NM_207396 // RefSeq // Homo sapiens ring finger protein 207 (RNF207), mRNA. // chr1 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// ENST00000377939 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:1:6206176:6221299:1 gene:ENSG00000158286 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// ENST00000496676 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:6208860:6220805:1 gene:ENSG00000158286 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 1 /// XM_006710639 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ring finger protein 207 (RNF207), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// NONHSAT000631 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 1 /// GENSCAN00000026031 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:6205959:6219407:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1
NR_103534 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 337 (LINC00337), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000429480 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:6237771:6239444:1 gene:ENSG00000225077 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC030279 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 211, mRNA (cDNA clone MGC:40168 IMAGE:5141008), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000441724 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:6236240:6238940:1 gene:ENSG00000225077 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// NONHSAT000635 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT000636 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT000637 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// TCONS_l2_00000080-XLOC_l2_000048 // Broad TUCP // linc-ICMT-BP chr1:+:6297876-6298880 // chr1 // 93 // 58 // 14 // 15 // 0 /// TCONS_l2_00001970-XLOC_l2_000048 // Broad TUCP // linc-ICMT-BP chr1:+:6296299-6299000 // chr1 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1
NM_001024598 // RefSeq // Homo sapiens hes family bHLH transcription factor 3 (HES3), mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000377898 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:6244192:6245578:1 gene:ENSG00000173673 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000026052 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:6244191:6245507:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0
AY358179 // GenBank // Homo sapiens clone DNA147310 GSQS6193 (UNQ6193) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_031475 // RefSeq // Homo sapiens espin (ESPN), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000377828 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:6424788:6460944:1 gene:ENSG00000187017 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000416731 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:6448043:6460398:1 gene:ENSG00000187017 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000461727 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:6448043:6460929:1 gene:ENSG00000187017 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 6 // 6 // 0
ENST00000517213 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:6540854:6540964:1 gene:ENSG00000253022 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT000649 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_153812 // RefSeq // Homo sapiens PHD finger protein 13 (PHF13), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000377648 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:6613685:6624033:1 gene:ENSG00000116273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AY069975 // GenBank // Homo sapiens PHD finger protein SPOC1 (SPOC1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// BC038516 // GenBank // Homo sapiens PHD finger protein 13, mRNA (cDNA clone MGC:43399 IMAGE:5266750), complete cds. // chr1 // 97 // 94 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000026030 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:6604255:6621637:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0
NM_001195752 // RefSeq // Homo sapiens THAP domain containing, apoptosis associated protein 3 (THAP3), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 62 // 13 // 13 // 0 /// NM_001195753 // RefSeq // Homo sapiens THAP domain containing, apoptosis associated protein 3 (THAP3), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000054650 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:6624866:6633565:1 gene:ENSG00000041988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000307896 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:6625181:6633368:1 gene:ENSG00000041988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 91 // 52 // 10 // 11 // 0 /// BC092427 // GenBank // Homo sapiens THAP domain containing, apoptosis associated protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:102992 IMAGE:30376814), complete cds. // chr1 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// NM_138350 // RefSeq // Homo sapiens THAP domain containing, apoptosis associated protein 3 (THAP3), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 76 // 76 // 16 // 21 // 1 /// ENST00000377627 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:6625192:6635586:1 gene:ENSG00000041988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 62 // 62 // 13 // 21 // 1 /// GENSCAN00000026046 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:6625084:6633077:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 48 // 10 // 10 // 0
NM_015215 // RefSeq // Homo sapiens calmodulin binding transcription activator 1 (CAMTA1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006710483 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens calmodulin binding transcription activator 1 (CAMTA1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000303635 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:6785324:7769706:1 gene:ENSG00000171735 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000495233 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:7736408:7767856:1 gene:ENSG00000171735 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 42 // 13 // 13 // 0 /// AK302088 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58640 complete cds, highly similar to Calmodulin-binding transcription activator 1. // chr1 // 100 // 42 // 13 // 13 // 0 /// AK309727 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99768. // chr1 // 100 // 42 // 13 // 13 // 0 /// BC151835 // GenBank // Homo sapiens calmodulin binding transcription activator 1, mRNA (cDNA clone MGC:166913 IMAGE:8860115), complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000008712 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:7646453:7739471:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 35 // 11 // 11 // 0
ENST00000384328 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:7219360:7219524:1 gene:ENSG00000207056 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT000698 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001080397 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 45, member 1 (SLC45A1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000289877 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:8324330:8344167:1 gene:ENSG00000162426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000471889 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:8317826:8344165:1 gene:ENSG00000162426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000481265 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:8330428:8336109:1 gene:ENSG00000162426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 39 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000497660 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:8330138:8344157:1 gene:ENSG00000162426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF118274 // GenBank // Homo sapiens DNb-5 mRNA, partial cds. // chr1 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// GENSCAN00000046062 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:8215469:8344013:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
ENST00000516445 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:8328067:8328179:1 gene:ENSG00000252254 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT000746 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000425872 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:8893409:8894151:1 gene:ENSG00000238249 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000046050 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:8893509:8893781:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT000773 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT139835 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000516595 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:9082696:9082879:1 gene:ENSG00000252404 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT000779 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001282587 // RefSeq // Homo sapiens hexose-6-phosphate dehydrogenase (glucose 1-dehydrogenase) (H6PD), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NM_004285 // RefSeq // Homo sapiens hexose-6-phosphate dehydrogenase (glucose 1-dehydrogenase) (H6PD), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000377403 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:9234775:9271337:1 gene:ENSG00000049239 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000602477 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:1:9239844:9267898:1 gene:ENSG00000049239 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// BC081559 // GenBank // Homo sapiens hexose-6-phosphate dehydrogenase (glucose 1-dehydrogenase), mRNA (cDNA clone MGC:87643 IMAGE:5266232), complete cds. // chr1 // 94 // 65 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000049210 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:9244935:9264869:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
NM_025106 // RefSeq // Homo sapiens splA/ryanodine receptor domain and SOCS box containing 1 (SPSB1), mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000328089 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:9292880:9369532:1 gene:ENSG00000171621 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000357898 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:9351431:9367863:1 gene:ENSG00000171621 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000377399 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:9355707:9367575:1 gene:ENSG00000171621 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// AF403026 // GenBank // Homo sapiens SPRY domain-containing SOCS box protein SSB-1 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// BC015711 // GenBank // Homo sapiens splA/ryanodine receptor domain and SOCS box containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:16798 IMAGE:3916157), complete cds. // chr1 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000049215 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:9323171:9367575:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
NM_032315 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 25 (pyrimidine nucleotide carrier), member 33 (SLC25A33), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// XM_005263503 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens solute carrier family 25 (pyrimidine nucleotide carrier), member 33 (SLC25A33), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 74 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000302692 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:9539482:9585179:1 gene:ENSG00000171612 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// AF495714 // GenBank // Homo sapiens mitochondrial carrier protein mRNA, complete cds; nuclear gene for mitochondrial product. // chr1 // 98 // 95 // 39 // 40 // 0 /// BC004991 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 25, member 33, mRNA (cDNA clone MGC:4399 IMAGE:2905957), complete cds. // chr1 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// BC073135 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 25, member 33, mRNA (cDNA clone MGC:87888 IMAGE:6172562), complete cds. // chr1 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000526165 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:11:49433480:49434438:-1 gene:ENSG00000226268 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 97 // 71 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000035118 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:11:49433473:49434438:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000049213 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:9506465:9582501:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 37 // 37 // 0
NM_001010866 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 201 (TMEM201), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 53 // 20 // 20 // 0 /// NM_001130924 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 201 (TMEM201), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000340305 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:9588922:9604954:1 gene:ENSG00000188807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 53 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000340381 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:9588922:9614849:1 gene:ENSG00000188807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000416541 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:9596897:9614873:1 gene:ENSG00000188807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 66 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000508400 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:9607728:9613247:1 gene:ENSG00000188807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0 /// BC121187 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 201, mRNA (cDNA clone MGC:117148 IMAGE:3870153), complete cds. // chr1 // 100 // 53 // 20 // 20 // 0 /// BC137291 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 201, mRNA (cDNA clone MGC:168911 IMAGE:9021288), complete cds. // chr1 // 100 // 47 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000049208 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:9588931:9613083:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 53 // 20 // 20 // 0
NM_022787 // RefSeq // Homo sapiens nicotinamide nucleotide adenylyltransferase 1 (NMNAT1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_005263489 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens nicotinamide nucleotide adenylyltransferase 1 (NMNAT1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000377205 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:9943428:9985498:1 gene:ENSG00000173614 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000403197 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:9943428:9981766:1 gene:ENSG00000173614 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000462686 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:9943429:9983669:1 gene:ENSG00000173614 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF312734 // GenBank // Homo sapiens NMN adenylyltransferase mRNA, complete cds. // chr1 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// AF314163 // GenBank // Homo sapiens nicotinamide mononucleotide adenylyl transferase mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// AF459819 // GenBank // Homo sapiens nicotinamide mononucleotide adenylyl transferase mRNA, complete cds. // chr1 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// BC014943 // GenBank // Homo sapiens nicotinamide nucleotide adenylyltransferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:22925 IMAGE:4874147), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000049207 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:9972074:9982701:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0
ENST00000365545 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:9947318:9947636:1 gene:ENSG00000202415 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 91 // 100 // 21 // 23 // 0 /// NONHSAT000831 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr1 // 91 // 100 // 21 // 23 // 0
NM_052960 // RefSeq // Homo sapiens retinol binding protein 7, cellular (RBP7), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000294435 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:9997216:10016020:1 gene:ENSG00000162444 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000315901 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:9997206:10016020:1 gene:ENSG00000162444 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AF399927 // GenBank // Homo sapiens retinoid binding protein 7 (RBP7) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AY145438 // GenBank // Homo sapiens putative cellular retinol-binding protein CRBP IV (RBP7) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC033883 // GenBank // Homo sapiens retinol binding protein 7, cellular, mRNA (cDNA clone IMAGE:5555132), partial cds. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC063013 // GenBank // Homo sapiens retinol binding protein 7, cellular, mRNA (cDNA clone MGC:70641 IMAGE:5224517), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENST00000364876 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:10163268:10163374:1 gene:ENSG00000201746 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT000839 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000461850 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:10616836:10617115:1 gene:ENSG00000243267 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT000865 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_021146 // RefSeq // Homo sapiens angiopoietin-like 7 (ANGPTL7), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000376819 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:11189341:11195981:1 gene:ENSG00000171819 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000476934 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:11193627:11195178:1 gene:ENSG00000171819 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// AB593026 // GenBank // Homo sapiens ANGPTL7 mRNA for angiopoietin-related protein 7, complete cds, clone: HP04607-ARi15F09. // chr1 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// AB593027 // GenBank // Homo sapiens ANGPTL7 mRNA for angiopoietin-related protein 7, complete cds, clone: HP04607-ARiS049I20. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AY358301 // GenBank // Homo sapiens clone DNA47470 NL4 (UNQ313) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// BC001881 // GenBank // Homo sapiens angiopoietin-like 7, mRNA (cDNA clone MGC:1422 IMAGE:3544149), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BT009802 // GenBank // Homo sapiens angiopoietin-like factor mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000014867 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:11189580:11195023:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
ENST00000384720 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:11226254:11226360:1 gene:ENSG00000207451 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT000888 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_013319 // RefSeq // Homo sapiens UbiA prenyltransferase domain containing 1 (UBIAD1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000376810 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:11273206:11288434:1 gene:ENSG00000120942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AF117064 // GenBank // Homo sapiens transitional epithelia response protein (TERE1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// BC004468 // GenBank // Homo sapiens UbiA prenyltransferase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:10310 IMAGE:3936638), complete cds. // chr1 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// BT006832 // GenBank // Homo sapiens transitional epithelia response protein mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// XM_006710590 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens UbiA prenyltransferase domain containing 1 (UBIAD1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 67 // 67 // 16 // 24 // 1 /// ENST00000486588 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:11273889:11295183:1 gene:ENSG00000120942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1 /// GENSCAN00000014838 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:11272773:11286131:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0
NM_020780 // RefSeq // Homo sapiens patched domain containing 2 (PTCHD2), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000294484 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:11479238:11537584:1 gene:ENSG00000204624 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000304391 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:1:11533676:11537225:1 gene:ENSG00000204624 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// AB593117 // GenBank // Homo sapiens PTCHD2 mRNA for patched domain-containing protein 2, complete cds, clone: HP07344-RBd24E07. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AL117235 // GenBank // Novel human gene mapping to chomosome 1. // chr1 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000014849 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:11487336:11601114:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_018438 // RefSeq // Homo sapiens F-box protein 6 (FBXO6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_005263448 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens F-box protein 6 (FBXO6), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// XM_005263449 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens F-box protein 6 (FBXO6), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// XM_005263451 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens F-box protein 6 (FBXO6), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// XM_006710571 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens F-box protein 6 (FBXO6), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000376753 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:11664124:11674354:1 gene:ENSG00000116663 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000449067 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:11668696:11674030:1 gene:ENSG00000116663 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// AF233223 // GenBank // Homo sapiens F-box protein FBG2 (FBG2) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// BC020880 // GenBank // Homo sapiens F-box protein 6, mRNA (cDNA clone MGC:24107 IMAGE:4614957), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000474239 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:11664486:11672064:1 gene:ENSG00000116663 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// GENSCAN00000014845 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:11655836:11673851:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1
NM_198545 // RefSeq // Homo sapiens dorsal inhibitory axon guidance protein (DRAXIN), mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000294485 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:11691729:11725857:1 gene:ENSG00000162490 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AB301919 // GenBank // Homo sapiens mRNA for neucrin, complete cds. // chr1 // 86 // 67 // 12 // 14 // 0 /// AY358750 // GenBank // Homo sapiens clone DNA145583 AGPA3119 (UNQ3119) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// BC111064 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 187, mRNA (cDNA clone MGC:117222 IMAGE:5769984), complete cds. // chr1 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// AK075558 // GenBank // Homo sapiens cDNA PSEC0258 fis, clone NT2RP3003731. // chr1 // 81 // 81 // 17 // 21 // 1 /// GENSCAN00000014866 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:11706289:11719696:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 57 // 12 // 12 // 0
ENST00000362477 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:11908152:11908271:1 gene:ENSG00000199347 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// NR_002754 // RefSeq // Homo sapiens RNA, U5E small nuclear 1 (RNU5E-1), small nuclear RNA. // chr1 // 67 // 100 // 16 // 24 // 0 /// M77839 // GenBank // Human U5E snRNA sequence. // chr1 // 67 // 100 // 16 // 24 // 0 /// NONHSAT000924 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 67 // 100 // 16 // 24 // 0
NM_001127660 // RefSeq // Homo sapiens mitofusin 2 (MFN2), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NM_014874 // RefSeq // Homo sapiens mitofusin 2 (MFN2), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_005263547 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens mitofusin 2 (MFN2), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000235329 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:11980312:12013508:1 gene:ENSG00000116688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000444836 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:11980181:12013514:1 gene:ENSG00000116688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AF036536 // GenBank // Homo sapiens CPRP1 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK289828 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78432 complete cds, highly similar to Homo sapiens mitofusin 2 (MFN2), mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// AK295890 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57997 complete cds, highly similar to Transmembrane GTPase MFN2 (EC 3.6.5.-). // chr1 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// AY028429 // GenBank // Homo sapiens mitochondrial assembly regulatory factor mRNA, complete cds; nuclear gene for mitochondrial product. // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC017061 // GenBank // Homo sapiens mitofusin 2, mRNA (cDNA clone MGC:9514 IMAGE:3901235), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049164 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:11998700:12011999:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0
NM_001066 // RefSeq // Homo sapiens tumor necrosis factor receptor superfamily, member 1B (TNFRSF1B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000376259 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:12167003:12209228:1 gene:ENSG00000028137 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000492361 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:12167003:12209228:1 gene:ENSG00000028137 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000536782 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:12167003:12192358:1 gene:ENSG00000028137 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// AY148473 // GenBank // Homo sapiens soluble tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr1 // 95 // 67 // 19 // 20 // 0 /// BC052977 // GenBank // Homo sapiens tumor necrosis factor receptor superfamily, member 1B, mRNA (cDNA clone MGC:60023 IMAGE:6198614), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BT019927 // GenBank // Homo sapiens tumor necrosis factor receptor superfamily, member 1B mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// EU826615 // GenBank // Homo sapiens soluble TNFR1B variant 1 (TNFR1B) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// M32315 // GenBank // Human tumor necrosis factor receptor mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// M55994 // GenBank // Human tumor necrosis factor receptor II (TNFrII) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000049173 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:12167092:12207020:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
NR_003022 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 59B (SNORA59B), small nucleolar RNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NR_003025 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 59A (SNORA59A), small nucleolar RNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000458926 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:19557560:19557711:1 gene:ENSG00000276660 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA gene:ENSG00000266079 // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000459326 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:12507246:12507397:1 gene:ENSG00000239149 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000578183 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:19557211:19557911:1 gene:ENSG00000266079 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// DQ786227 // GenBank // Homo sapiens clone HLS_IMAGE_1687053 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT139837 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT146495 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT146496 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001013630 // RefSeq // Homo sapiens arylacetamide deacetylase-like 4 (AADACL4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// XM_006710608 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens arylacetamide deacetylase-like 4 (AADACL4), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000376221 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:12644547:12667086:1 gene:ENSG00000204518 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000049169 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:12644547:12666735:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0
NM_001103170 // RefSeq // Homo sapiens arylacetamide deacetylase-like 3 (AADACL3), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 93 // 100 // 13 // 14 // 0 /// NR_111984 // RefSeq // Homo sapiens arylacetamide deacetylase-like 3 (AADACL3), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr1 // 100 // 71 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000332530 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:12716115:12728759:1 gene:ENSG00000188984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000359318 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:12716143:12728400:1 gene:ENSG00000188984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 100 // 13 // 14 // 0 /// ENST00000620146 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:12716115:12728759:1 gene:ENSG00000188984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 71 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000049170 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:12683439:12725996:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 90 // 71 // 9 // 10 // 0
NONHSAT000962 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0
NM_152290 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 158 (C1orf158), mRNA. // chr1 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000376210 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:12746425:12761169:1 gene:ENSG00000157330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// AK026705 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ23052 fis, clone LNG02660. // chr1 // 93 // 91 // 28 // 30 // 0 /// BC029894 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 158, mRNA (cDNA clone MGC:35194 IMAGE:5171302), complete cds. // chr1 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// BX647383 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686C0236 (from clone DKFZp686C0236). // chr1 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// AK298760 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56581 complete cds. // chr1 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1 /// ENST00000614859 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:12746215:12763699:1 gene:ENSG00000157330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONHSAT000964 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 93 // 91 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000049175 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:12758614:12777599:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
NM_001080830 // RefSeq // Homo sapiens PRAME family member 12 (PRAMEF12), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENST00000357726 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:12774841:12777906:1 gene:ENSG00000116726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000049175 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:12758614:12777599:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0
NM_023014 // RefSeq // Homo sapiens PRAME family member 2 (PRAMEF2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000240189 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:12857086:12861909:1 gene:ENSG00000120952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC075008 // GenBank // Homo sapiens PRAME family member 2, mRNA (cDNA clone MGC:104155 IMAGE:30915615), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC075009 // GenBank // Homo sapiens PRAME family member 2, mRNA (cDNA clone MGC:103994 IMAGE:30915402), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
ENST00000384703 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:12922554:12922660:1 gene:ENSG00000207434 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000384780 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:13279125:13279231:-1 gene:ENSG00000207511 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000516430 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR1_2_CTG3:13297705:13297811:-1 gene:ENSG00000252239 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONHSAT000968 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONHSAT000971 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001099852 // RefSeq // Homo sapiens PRAME family member 20 (PRAMEF20), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000316412 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:13410450:13421328:1 gene:ENSG00000204478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000602960 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:13416351:13421328:1 gene:ENSG00000204478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000021092 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:13389658:13464872:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_001099852 // RefSeq // Homo sapiens PRAME family member 20 (PRAMEF20), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000316412 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:13410450:13421328:1 gene:ENSG00000204478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000602960 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:13416351:13421328:1 gene:ENSG00000204478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// NM_001098376 // RefSeq // Homo sapiens PRAME family member 15 (PRAMEF15), mRNA. // chr1 // 38 // 100 // 8 // 21 // 0 /// ENST00000376152 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:13315581:13322598:1 gene:ENSG00000204501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 38 // 100 // 8 // 21 // 0 /// AK124292 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ42298 fis, clone TLIVE2009163, moderately similar to MELANOMA ANTIGEN PREFERENTIALLY EXPRESSED IN TUMORS. // chr1 // 38 // 100 // 8 // 21 // 0 /// GENSCAN00000021092 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:13389658:13464872:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000436041 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:1:13049476:13056491:-1 gene:ENSG00000274764 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSG00000239810 // chr1 // 38 // 100 // 8 // 21 // 0 /// ENST00000612758 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR1_2_CTG3:13191011:13198026:1 gene:ENSG00000276420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 38 // 100 // 8 // 21 // 0 /// ENST00000613225 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:12938605:13056491:-1 gene:ENSG00000232423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 38 // 100 // 8 // 21 // 0
NM_201628 // RefSeq // Homo sapiens kazrin, periplakin interacting protein (KAZN), transcript variant E, mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000376030 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:14598704:15118043:1 gene:ENSG00000189337 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// AK125794 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ43806 fis, clone TESTI4001100. // chr1 // 94 // 89 // 31 // 33 // 0 /// BC101637 // GenBank // Homo sapiens kazrin, mRNA (cDNA clone IMAGE:8069143), complete cds. // chr1 // 100 // 27 // 10 // 10 // 0 /// BC113621 // GenBank // Homo sapiens kazrin, mRNA (cDNA clone IMAGE:8322673), complete cds. // chr1 // 91 // 30 // 10 // 11 // 0 /// BC143641 // GenBank // Homo sapiens kazrin, mRNA (cDNA clone IMAGE:9052155), complete cds. // chr1 // 90 // 27 // 9 // 10 // 0 /// BX648256 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686D08115 (from clone DKFZp686D08115). // chr1 // 92 // 100 // 34 // 37 // 0 /// AK293806 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58452 complete cds, weakly similar to Liprin-alpha. // chr1 // 43 // 43 // 16 // 37 // 1 /// GENSCAN00000045957 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:15090465:15140143:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 38 // 38 // 14 // 37 // 1
NM_024329 // RefSeq // Homo sapiens EF-hand domain family, member D2 (EFHD2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000375980 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:15409895:15430343:1 gene:ENSG00000142634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000445566 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:15410265:15429081:1 gene:ENSG00000142634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// BC007233 // GenBank // Homo sapiens EF-hand domain family, member D2, mRNA (cDNA clone MGC:15408 IMAGE:2961350), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC014923 // GenBank // Homo sapiens EF-hand domain family, member D2, mRNA (cDNA clone MGC:17894 IMAGE:3909362), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC023611 // GenBank // Homo sapiens EF-hand domain family, member D2, mRNA (cDNA clone MGC:23298 IMAGE:4638660), complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC068473 // GenBank // Homo sapiens EF-hand domain family, member D2, mRNA (cDNA clone MGC:87102 IMAGE:5267148), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000045944 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:15259702:15428724:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
NM_007272 // RefSeq // Homo sapiens chymotrypsin C (caldecrin) (CTRC), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000375949 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:15438439:15446654:1 gene:ENSG00000162438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000476813 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:15438453:15443540:1 gene:ENSG00000162438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 38 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000483406 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:15440350:15446654:1 gene:ENSG00000162438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// AK289447 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75241 complete cds, highly similar to Homo sapiens chymotrypsin C (caldecrin), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC015118 // GenBank // Homo sapiens chymotrypsin C (caldecrin), mRNA (cDNA clone MGC:23991 IMAGE:3950170), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// S82198 // GenBank // Homo sapiens caldecrin precursor, mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000375943 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:15438442:15449242:1 gene:ENSG00000162438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1 /// CR749296 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp779K0837 (from clone DKFZp779K0837). // chr1 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1 /// GENSCAN00000045945 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:15438465:15472007:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT001027 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 38 // 9 // 9 // 0
NM_033440 // RefSeq // Homo sapiens chymotrypsin-like elastase family, member 2A (CELA2A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000359621 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:15456729:15472091:1 gene:ENSG00000142615 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000459653 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:15456728:15463011:1 gene:ENSG00000142615 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 61 // 11 // 11 // 0 /// AK056678 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ32116 fis, clone PANCR1000081, highly similar to Elastase-2A precursor (EC 3.4.21.71). // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC007031 // GenBank // Homo sapiens elastase 2A, mRNA (cDNA clone MGC:12394 IMAGE:3950124), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC069331 // GenBank // Homo sapiens elastase 2A, mRNA (cDNA clone MGC:97041 IMAGE:7262251), complete cds. // chr1 // 94 // 94 // 16 // 17 // 0 /// BC069432 // GenBank // Homo sapiens elastase 2A, mRNA (cDNA clone MGC:97063 IMAGE:7262275), complete cds. // chr1 // 82 // 94 // 14 // 17 // 0 /// CR450291 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834B081D for gene ELA2A, elastase 2A; complete cds; without stopcodon. // chr1 // 82 // 94 // 14 // 17 // 0 /// D00236 // GenBank // Homo sapiens mRNA for pancreatic elastase 2 precursor, complete cds. // chr1 // 94 // 100 // 17 // 18 // 0 /// M16631 // GenBank // Human elastase 2 mRNA, complete cds. // chr1 // 94 // 100 // 17 // 18 // 0 /// M16652 // GenBank // Human pancreatic elastase IIA mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000045945 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:15438465:15472007:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0
NM_015849 // RefSeq // Homo sapiens chymotrypsin-like elastase family, member 2B (CELA2B), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// ENST00000375910 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:15476101:15491400:1 gene:ENSG00000215704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000422901 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:15476465:15482357:1 gene:ENSG00000215704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 43 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000488764 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:15485861:15491395:1 gene:ENSG00000215704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 39 // 9 // 9 // 0 /// BC069412 // GenBank // Homo sapiens elastase 2B, mRNA (cDNA clone MGC:97052 IMAGE:7262263), complete cds. // chr1 // 95 // 87 // 19 // 20 // 0 /// BC069455 // GenBank // Homo sapiens elastase 2B, mRNA (cDNA clone MGC:96983 IMAGE:7262192), complete cds. // chr1 // 95 // 87 // 19 // 20 // 0 /// BC113540 // GenBank // Homo sapiens elastase 2B, mRNA (cDNA clone MGC:142100 IMAGE:8322592), complete cds. // chr1 // 85 // 87 // 17 // 20 // 0 /// BC113542 // GenBank // Homo sapiens elastase 2B, mRNA (cDNA clone MGC:142102 IMAGE:8322594), complete cds. // chr1 // 85 // 87 // 17 // 20 // 0 /// M16653 // GenBank // Human pancreatic elastase IIB mRNA, complete cds. // chr1 // 87 // 100 // 20 // 23 // 0 /// ENST00000494280 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:15465909:15483368:1 gene:ENSG00000215704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 52 // 52 // 12 // 23 // 1 /// BC171735 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:9052412. // chr1 // 70 // 70 // 16 // 23 // 1 /// GENSCAN00000045952 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:15476126:15491312:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0
ENST00000454346 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:15604597:15605043:1 gene:ENSG00000235084 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000045941 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:15604621:15605043:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT001041 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT139838 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT139839 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0
NM_015164 // RefSeq // Homo sapiens pleckstrin homology domain containing, family M (with RUN domain) member 2 (PLEKHM2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_005245791 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens pleckstrin homology domain containing, family M (with RUN domain) member 2 (PLEKHM2), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000375793 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:15684390:15734769:1 gene:ENSG00000116786 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENST00000375799 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:15684332:15734769:1 gene:ENSG00000116786 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000477849 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:15729845:15734115:1 gene:ENSG00000116786 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// BC040441 // GenBank // Homo sapiens pleckstrin homology domain containing, family M (with RUN domain) member 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:5590182), partial cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000045940 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:15671660:15739406:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0
NM_207348 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 25, member 34 (SLC25A34), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000294454 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:15736405:15741396:1 gene:ENSG00000162461 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC027998 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 25, member 34, mRNA (cDNA clone MGC:40185 IMAGE:5189944), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_005245856 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens solute carrier family 25, member 34 (SLC25A34), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// GENSCAN00000045940 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:15671660:15739406:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_001013641 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 82 (TMEM82), mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000375782 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:15742422:15747982:1 gene:ENSG00000162460 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000465575 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:15742547:15744580:1 gene:ENSG00000162460 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 55 // 12 // 12 // 0 /// BC127706 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 82, mRNA (cDNA clone MGC:157801 IMAGE:40127826), complete cds. // chr1 // 95 // 91 // 19 // 20 // 0 /// BC127707 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 82, mRNA (cDNA clone MGC:157802 IMAGE:40127833), complete cds. // chr1 // 90 // 91 // 18 // 20 // 0 /// BC137239 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 82, mRNA (cDNA clone MGC:168859 IMAGE:9021236), complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// BC137240 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 82, mRNA (cDNA clone MGC:168860 IMAGE:9021237), complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000045956 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:15741480:15793133:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 59 // 59 // 13 // 22 // 1
ENST00000321418 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:15828232:15828669:1 gene:ENSG00000178715 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000045935 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:15828232:15828672:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0
NM_015001 // RefSeq // Homo sapiens spen family transcriptional repressor (SPEN), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000375759 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:15847864:15940460:1 gene:ENSG00000065526 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// AF356524 // GenBank // Homo sapiens nuclear receptor transcription cofactor (SHARP) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000045946 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:15847812:15939427:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 29 // 29 // 0
NONHSAT001066 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_178840 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 64 (C1orf64), mRNA. // chr1 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// ENST00000329454 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:16004236:16008807:1 gene:ENSG00000183888 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK127425 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ45517 fis, clone BRTHA2023402. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC017946 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 64, mRNA (cDNA clone MGC:24047 IMAGE:4295881), complete cds. // chr1 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000017013 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:16004304:16013140:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_001165945 // RefSeq // Homo sapiens chloride channel, voltage-sensitive Kb (CLCNKB), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000375667 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:16048789:16057308:1 gene:ENSG00000184908 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// BC020873 // GenBank // Homo sapiens chloride channel Kb, mRNA (cDNA clone MGC:24087 IMAGE:4608625), complete cds. // chr1 // 80 // 56 // 12 // 15 // 0 /// NM_000085 // RefSeq // Homo sapiens chloride channel, voltage-sensitive Kb (CLCNKB), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 1 /// ENST00000375679 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:16043777:16057308:1 gene:ENSG00000184908 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 1 /// AK292335 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77596 complete cds, highly similar to Homo sapiens chloride channel Kb (CLCNKB), mRNA. // chr1 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// ENST00000619181 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:16043736:16057285:1 gene:ENSG00000184908 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000017027 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:16042459:16056916:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0
XM_006711085 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens putative uncharacterized protein FLJ35883-like (LOC102724970), mRNA. // chr1 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// AK093202 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ35883 fis, clone TESTI2008929. // chr1 // 96 // 72 // 22 // 23 // 0 /// NONHSAT001139 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC044863 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4822225. // chr1 // 31 // 100 // 10 // 32 // 0
NM_001282321 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 231, member A (FAM231A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// XM_001721533 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens family with sequence similarity 231, member B (FAM231B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// ENST00000434336 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:16673003:16673512:1 gene:ENSG00000237847 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// ENST00000600179 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:16733952:16734461:-1 gene:ENSG00000268991 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// ENST00000601199 // ENSEMBL // ensembl:known scaffold:GRCh38:KI270713.1:35407:35916:1 gene:ENSG00000268674 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0
NM_014675 // RefSeq // Homo sapiens ciliary rootlet coiled-coil, rootletin (CROCC), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000375541 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:16921950:16972979:1 gene:ENSG00000058453 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000445545 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:16922755:16961078:1 gene:ENSG00000058453 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000467938 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:16922767:16954362:1 gene:ENSG00000058453 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 34 // 10 // 10 // 0 /// BC126911 // GenBank // Homo sapiens ciliary rootlet coiled-coil, rootletin, mRNA (cDNA clone IMAGE:40073934), partial cds. // chr1 // 95 // 66 // 18 // 19 // 0 /// DQ139275 // GenBank // Homo sapiens Tax1-binding protein 2 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 94 // 62 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000017014 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:16922019:16972446:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// AL834169 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp762M2112 (from clone DKFZp762M2112). // chr1 // 90 // 34 // 9 // 10 // 0
NM_016233 // RefSeq // Homo sapiens peptidyl arginine deiminase, type III (PADI3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000375460 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:17249098:17284233:1 gene:ENSG00000142619 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AB026831 // GenBank // Homo sapiens mRNA for peptidylarginine deiminase type III, complete cds. // chr1 // 95 // 100 // 36 // 38 // 0 /// BC041592 // GenBank // Homo sapiens peptidyl arginine deiminase, type III, mRNA (cDNA clone MGC:52193 IMAGE:5431445), complete cds. // chr1 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// BC109091 // GenBank // Homo sapiens peptidyl arginine deiminase, type III, mRNA (cDNA clone MGC:126307 IMAGE:40034659), complete cds. // chr1 // 92 // 95 // 33 // 36 // 0 /// BC109092 // GenBank // Homo sapiens peptidyl arginine deiminase, type III, mRNA (cDNA clone MGC:126308 IMAGE:40034660), complete cds. // chr1 // 97 // 95 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000003966 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:17249138:17283079:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0
ENST00000375453 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:17308195:17334796:1 gene:ENSG00000159339 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0 /// AF229067 // GenBank HTC // Homo sapiens PADI-H protein mRNA, complete cds. // chr1 // 80 // 26 // 8 // 10 // 0 /// NM_012387 // RefSeq // Homo sapiens peptidyl arginine deiminase, type IV (PADI4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 1 /// ENST00000375448 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:17308197:17364004:1 gene:ENSG00000159339 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 1 /// AB017919 // GenBank // Homo sapiens mRNA for peptidylarginine deiminase type V, complete cds. // chr1 // 95 // 95 // 36 // 38 // 1 /// AK290507 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78525 complete cds, highly similar to Homo sapiens peptidyl arginine deiminase, type IV (PADI4), mRNA. // chr1 // 92 // 92 // 35 // 38 // 1 /// BC025718 // GenBank // Homo sapiens peptidyl arginine deiminase, type IV, mRNA (cDNA clone MGC:34387 IMAGE:5228777), complete cds. // chr1 // 89 // 89 // 34 // 38 // 1 /// AK309637 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99678. // chr1 // 58 // 58 // 22 // 38 // 1 /// GENSCAN00000003953 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:17308223:17401980:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 79 // 79 // 30 // 38 // 1
NM_207421 // RefSeq // Homo sapiens peptidyl arginine deiminase, type VI (PADI6), mRNA. // chr1 // 95 // 100 // 38 // 40 // 0 /// AY422079 // GenBank // Homo sapiens peptidylarginine deiminase type 6 (PADI6) mRNA, complete cds. // chr1 // 88 // 100 // 35 // 40 // 0 /// AY443100 // GenBank // Homo sapiens peptidyl arginine deiminase-like protein mRNA, complete cds. // chr1 // 95 // 100 // 38 // 40 // 0 /// ENST00000619609 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:17372196:17401699:1 gene:ENSG00000276747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 100 // 38 // 40 // 0 /// GENSCAN00000003953 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:17308223:17401980:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 95 // 36 // 38 // 0
NM_030812 // RefSeq // Homo sapiens actin-like 8 (ACTL8), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000375406 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:17755313:17827063:1 gene:ENSG00000117148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC028909 // GenBank // Homo sapiens actin-like 8, mRNA (cDNA clone MGC:24924 IMAGE:4933032), complete cds. // chr1 // 89 // 97 // 25 // 28 // 0 /// ENST00000617065 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:17822982:17827061:1 gene:ENSG00000117148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000003973 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:17823009:17896353:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1
NM_032880 // RefSeq // Homo sapiens immunoglobin superfamily, member 21 (IGSF21), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000251296 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:18107746:18378482:1 gene:ENSG00000117154 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000412684 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:18278845:18376367:1 gene:ENSG00000117154 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 91 // 42 // 10 // 11 // 0 /// BC007618 // GenBank // Homo sapiens immunoglobin superfamily, member 21, mRNA (cDNA clone MGC:15730 IMAGE:3355289), complete cds. // chr1 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// AK294121 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55949 complete cds, highly similar to Immunoglobulin superfamily member 21 precursor. // chr1 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// ENST00000497331 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:18361367:18378483:1 gene:ENSG00000117154 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// AK123172 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ41177 fis, clone BRACE2042628, highly similar to Immunoglobulin superfamily member 21 precursor. // chr1 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// AK092618 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ35299 fis, clone PROST2009347. // chr1 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// GENSCAN00000018831 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:18274213:18397848:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_152375 // RefSeq // Homo sapiens kelch domain containing 7A (KLHDC7A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000400664 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:18480982:18486126:1 gene:ENSG00000179023 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000018823 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:18447359:18513387:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0
ENST00000596113 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:18513118:18513383:1 gene:ENSG00000235282 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000018823 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:18447359:18513387:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT001267 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT001268 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001135254 // RefSeq // Homo sapiens paired box 7 (PAX7), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NM_002584 // RefSeq // Homo sapiens paired box 7 (PAX7), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NM_013945 // RefSeq // Homo sapiens paired box 7 (PAX7), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000375375 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:18631006:18736138:1 gene:ENSG00000009709 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000400661 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:18631524:18736102:1 gene:ENSG00000009709 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// BC121165 // GenBank // Homo sapiens paired box 7, mRNA (cDNA clone MGC:150507 IMAGE:40121582), complete cds. // chr1 // 91 // 85 // 21 // 23 // 0 /// BC121166 // GenBank // Homo sapiens paired box 7, mRNA (cDNA clone MGC:150508 IMAGE:40121584), complete cds. // chr1 // 91 // 85 // 21 // 23 // 0 /// DQ322591 // GenBank // Homo sapiens PAX7 transcriptional factor isoform B (PAX7B) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// X96743 // GenBank // H.sapiens mRNA for paired box containing transcription factor, PAX7. // chr1 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000420770 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:18631521:18748866:1 gene:ENSG00000009709 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// GENSCAN00000018825 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:18631604:18802370:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1
NM_016183 // RefSeq // Homo sapiens mRNA turnover 4 homolog (S. cerevisiae) (MRTO4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// XM_006710675 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens mRNA turnover 4 homolog (S. cerevisiae) (MRTO4), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000330263 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:19251539:19260128:1 gene:ENSG00000053372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// AF173378 // GenBank // Homo sapiens 60S acidic ribosomal protein PO mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0 /// AK295328 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57985 complete cds, moderately similar to mRNA turnover protein 4 homolog. // chr1 // 94 // 84 // 15 // 16 // 0 /// AY303790 // GenBank // Homo sapiens acidic ribosomal protein PO-like mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0 /// BC003013 // GenBank // Homo sapiens mRNA turnover 4 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:4041 IMAGE:2821148), complete cds. // chr1 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0 /// BC006504 // GenBank // Homo sapiens mRNA turnover 4 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:2400 IMAGE:2821148), complete cds. // chr1 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000033793 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:19255795:19258830:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 53 // 10 // 10 // 0
ENST00000481521 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:19424384:19424671:1 gene:ENSG00000240490 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONHSAT001305 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
ENST00000364739 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:19510593:19510733:1 gene:ENSG00000201609 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT001307 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NR_077246 // RefSeq // Homo sapiens ribosomal protein S14 pseudogene 3 (RPS14P3), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000457263 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:19608114:19608568:1 gene:ENSG00000226396 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 62 // 13 // 13 // 0 /// BC072682 // GenBank // Homo sapiens ribosomal protein S14 pseudogene 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:6201343). // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_000871 // RefSeq // Homo sapiens 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 6, G protein-coupled (HTR6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000289753 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:19665287:19679562:1 gene:ENSG00000158748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY429105 // GenBank // Homo sapiens 5-hydroxytryptamine/serotonin receptor 6 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// BC074995 // GenBank // Homo sapiens 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 6, mRNA (cDNA clone MGC:103988 IMAGE:30915396), complete cds. // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC074996 // GenBank // Homo sapiens 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 6, mRNA (cDNA clone MGC:104148 IMAGE:30915608), complete cds. // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// L41147 // GenBank // Homo sapiens 5-HT6 serotonin receptor mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB209129 // GenBank // Homo sapiens mRNA for 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 6 variant protein. // chr1 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// GENSCAN00000033783 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:19665754:19679368:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0
NM_015207 // RefSeq // Homo sapiens OTU deubiquitinase 3 (OTUD3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_005245792 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens OTU domain containing 3 (OTUD3), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000375120 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:19882513:19912945:1 gene:ENSG00000169914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC119636 // GenBank // Homo sapiens OTU domain containing 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:40115666), complete cds. // chr1 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC134416 // GenBank // Homo sapiens OTU domain containing 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:40115667), complete cds. // chr1 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// XM_006710481 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens OTU domain containing 3 (OTUD3), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// GENSCAN00000033781 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:19882514:19907746:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
ENST00000488028 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:19970969:19971269:1 gene:ENSG00000242688 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT001329 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_022819 // RefSeq // Homo sapiens phospholipase A2, group IIF (PLA2G2F), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000375102 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:20139326:20150386:1 gene:ENSG00000158786 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF306566 // GenBank // Homo sapiens group IIF secreted phospholipase A2 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000465062 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:20139330:20144080:1 gene:ENSG00000158786 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// BX647458 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp313B092 (from clone DKFZp313B092). // chr1 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// GENSCAN00000009694 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:20139428:20148401:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT001342 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_152376 // RefSeq // Homo sapiens UBX domain protein 10 (UBXN10), mRNA. // chr1 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000375099 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:20186085:20196048:1 gene:ENSG00000162543 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK058158 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ25429 fis, clone TST05630. // chr1 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0 /// BC047428 // GenBank // Homo sapiens UBX domain protein 10, mRNA (cDNA clone MGC:51306 IMAGE:5295853), complete cds. // chr1 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// BX648631 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686A1528 (from clone DKFZp686A1528). // chr1 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000009705 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:20190562:20299316:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1
NM_001039500 // RefSeq // Homo sapiens von Willebrand factor A domain containing 5B1 (VWA5B1), mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// XM_006710360 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens von Willebrand factor A domain containing 5B1 (VWA5B1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000289815 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:20290919:20354894:1 gene:ENSG00000158816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000375079 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:20290919:20354263:1 gene:ENSG00000158816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000467486 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:20332915:20354251:1 gene:ENSG00000158816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 93 // 44 // 14 // 15 // 0 /// ENST00000473325 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:20290937:20339222:1 gene:ENSG00000158816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000485375 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:20290919:20354251:1 gene:ENSG00000158816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 96 // 82 // 27 // 28 // 0 /// AK057346 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ32784 fis, clone TESTI2002245. // chr1 // 93 // 44 // 14 // 15 // 0 /// AK125833 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ43845 fis, clone TESTI4006326. // chr1 // 95 // 65 // 21 // 22 // 0 /// ENST00000525343 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:20332918:20354222:1 gene:ENSG00000158816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 32 // 32 // 11 // 34 // 1 /// GENSCAN00000009693 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:20310602:20354263:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0
NM_207334 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 43, member B (FAM43B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000332947 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:20552439:20555010:1 gene:ENSG00000183114 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC142610 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 43, member B, mRNA (cDNA clone MGC:164761 IMAGE:40147211), complete cds. // chr1 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// BC142686 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 43, member B, mRNA (cDNA clone MGC:164996 IMAGE:40148591), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000009691 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:20549478:20553963:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
NM_001785 // RefSeq // Homo sapiens cytidine deaminase (CDA), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000375071 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:20588948:20618908:1 gene:ENSG00000158825 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000461985 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:20589086:20618903:1 gene:ENSG00000158825 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 95 // 72 // 20 // 21 // 0 /// AY634312 // GenBank // Homo sapiens small cytidine deaminase mRNA, complete cds. // chr1 // 77 // 45 // 10 // 13 // 0 /// BC048284 // GenBank // Homo sapiens cytidine deaminase, mRNA (cDNA clone IMAGE:5213873). // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC054036 // GenBank // Homo sapiens cytidine deaminase, mRNA (cDNA clone MGC:64975 IMAGE:5403243), complete cds. // chr1 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// L27943 // GenBank // Homo sapiens cytidine deaminase (CDA) mRNA, complete cds. // chr1 // 92 // 90 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000009698 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:20589130:20618568:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0
NM_032409 // RefSeq // Homo sapiens PTEN induced putative kinase 1 (PINK1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000321556 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:20633455:20651511:1 gene:ENSG00000158828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000400490 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:20645508:20651510:1 gene:ENSG00000158828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// AB053323 // GenBank // Homo sapiens PINK1 mRNA for PTEN induced putative kinase 1, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF316873 // GenBank // Homo sapiens protein kinase BRPK mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// AK075225 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ90744 fis, clone PLACE1011364, weakly similar to MYOTONIN-PROTEIN KINASE (EC 2.7.1.-). // chr1 // 89 // 60 // 16 // 18 // 0 /// BC028215 // GenBank // Homo sapiens PTEN induced putative kinase 1, mRNA (cDNA clone MGC:39860 IMAGE:5214483), complete cds. // chr1 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// ENST00000492302 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:20638129:20651316:1 gene:ENSG00000158828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1 /// AK130746 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ27236 fis, clone SYN07450, highly similar to Homo sapiens PTEN induced putative kinase 1 (PINK1). // chr1 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// GENSCAN00000009697 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:20633549:20650691:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// AK093117 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ35798 fis, clone TESTI2005908, highly similar to Homo sapiens hyaluronidase (LUCA-3) mRNA. // chr1 // 96 // 77 // 22 // 23 // 0
ENST00000486095 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:21397987:21398362:1 gene:ENSG00000236216 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000033131 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:21325793:21398524:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 14 // 14 // 0
NM_001013693 // RefSeq // Homo sapiens low density lipoprotein receptor class A domain containing 2 (LDLRAD2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_005245873 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens low density lipoprotein receptor class A domain containing 2 (LDLRAD2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 96 // 77 // 22 // 23 // 0 /// ENST00000344642 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:21812265:21825221:1 gene:ENSG00000187942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000543870 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:21812363:21823963:1 gene:ENSG00000187942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 70 // 20 // 21 // 0 /// BC146860 // GenBank // Homo sapiens low density lipoprotein receptor class A domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:181963 IMAGE:9056788), complete cds. // chr1 // 86 // 70 // 18 // 21 // 0 /// GENSCAN00000033134 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:21812452:21821737:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0
NM_007352 // RefSeq // Homo sapiens chymotrypsin-like elastase family, member 3B (CELA3B), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000337107 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:21977021:21989344:1 gene:ENSG00000219073 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000374666 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:21977893:21983777:1 gene:ENSG00000219073 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// BC005216 // GenBank // Homo sapiens elastase 3B, pancreatic, mRNA (cDNA clone MGC:12233 IMAGE:3949903), complete cds. // chr1 // 75 // 89 // 18 // 24 // 0 /// M18692 // GenBank // Human elastase III B mRNA, complete cds, clone pCL1E3. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000400277 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:21981102:21998642:1 gene:ENSG00000219073 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// AK092382 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ35063 fis, clone PANCR1000086, highly similar to ELASTASE IIIB PRECURSOR (EC 3.4.21.70). // chr1 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// GENSCAN00000033112 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:21977043:21986683:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
ENST00000485776 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:21987481:21987777:1 gene:ENSG00000273610 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA gene:ENSG00000263991 // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONHSAT001450 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
ENST00000364403 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:22010985:22011088:1 gene:ENSG00000201273 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 88 // 100 // 15 // 17 // 0 /// ENST00000365049 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:21987816:21987919:1 gene:ENSG00000201919 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT001451 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT001454 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 88 // 100 // 15 // 17 // 0
NM_005747 // RefSeq // Homo sapiens chymotrypsin-like elastase family, member 3A (CELA3A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000290122 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:22001656:22012522:1 gene:ENSG00000142789 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000374663 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:22001660:22006068:1 gene:ENSG00000142789 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 9 // 9 // 0 /// BC005918 // GenBank // Homo sapiens elastase 3A, pancreatic, mRNA (cDNA clone MGC:14514 IMAGE:4295129), complete cds. // chr1 // 89 // 100 // 16 // 18 // 0 /// BC007028 // GenBank // Homo sapiens elastase 3A, pancreatic, mRNA (cDNA clone MGC:12383 IMAGE:3950453), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC008383 // GenBank // Homo sapiens elastase 3A, pancreatic, mRNA (cDNA clone MGC:12505 IMAGE:3949901), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC015103 // GenBank // Homo sapiens elastase 3A, pancreatic, mRNA (cDNA clone MGC:22851 IMAGE:3950076), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// D00306 // GenBank // Homo sapiens mRNA for pancreatic protease E precursor, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// AK308510 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ98551. // chr1 // 83 // 83 // 15 // 18 // 1 /// GENSCAN00000046156 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:22001529:22030555:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
ENST00000466485 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:22010650:22010946:1 gene:ENSG00000278124 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA gene:ENSG00000263929 // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONHSAT001453 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
ENST00000364403 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:22010985:22011088:1 gene:ENSG00000201273 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000365049 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:21987816:21987919:1 gene:ENSG00000201919 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 71 // 100 // 15 // 21 // 0 /// NONHSAT001454 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT001451 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 71 // 100 // 15 // 21 // 0
NM_044472 // RefSeq // Homo sapiens cell division cycle 42 (CDC42), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000315554 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:22052689:22090804:1 gene:ENSG00000070831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 65 // 11 // 11 // 0 /// BC018266 // GenBank // Homo sapiens cell division cycle 42 (GTP binding protein, 25kDa), mRNA (cDNA clone MGC:17253 IMAGE:3449526), complete cds. // chr1 // 90 // 59 // 9 // 10 // 0 /// NM_001039802 // RefSeq // Homo sapiens cell division cycle 42 (CDC42), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 65 // 65 // 11 // 17 // 1 /// NM_001791 // RefSeq // Homo sapiens cell division cycle 42 (CDC42), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 65 // 65 // 11 // 17 // 1 /// ENST00000344548 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:22052668:22092946:1 gene:ENSG00000070831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 53 // 53 // 9 // 17 // 1 /// ENST00000400259 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:22052627:22092923:1 gene:ENSG00000070831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 53 // 53 // 9 // 17 // 1
NM_001083621 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger and BTB domain containing 40 (ZBTB40), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NM_014870 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger and BTB domain containing 40 (ZBTB40), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000374651 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:22451851:22531157:1 gene:ENSG00000184677 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000375647 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:22451867:22531154:1 gene:ENSG00000184677 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000400239 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:22451867:22506241:1 gene:ENSG00000184677 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 36 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000404138 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:22451851:22531157:1 gene:ENSG00000184677 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AK095273 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ37954 fis, clone CTONG2009270, weakly similar to Mus musculus transcriptional repressor RP58 (rp58) mRNA. // chr1 // 94 // 47 // 16 // 17 // 0 /// BC114607 // GenBank // Homo sapiens zinc finger and BTB domain containing 40, mRNA (cDNA clone MGC:133098 IMAGE:40027579), complete cds. // chr1 // 97 // 86 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000046159 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:22489949:22548396:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0
NM_001006943 // RefSeq // Homo sapiens EPH receptor A8 (EPHA8), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 38 // 16 // 16 // 0 /// NM_020526 // RefSeq // Homo sapiens EPH receptor A8 (EPHA8), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000166244 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:22563564:22603594:1 gene:ENSG00000070886 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000374644 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:22563564:22589621:1 gene:ENSG00000070886 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 33 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000538803 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:22563577:22589610:1 gene:ENSG00000070886 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 33 // 14 // 14 // 0 /// BC038796 // GenBank // Homo sapiens EPH receptor A8, mRNA (cDNA clone IMAGE:5767875), complete cds. // chr1 // 100 // 33 // 14 // 14 // 0 /// BC072417 // GenBank // Homo sapiens EPH receptor A8, mRNA (cDNA clone IMAGE:6170274), complete cds. // chr1 // 100 // 38 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000046170 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:22563636:22601741:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0
NM_015991 // RefSeq // Homo sapiens complement component 1, q subcomponent, A chain (C1QA), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000374642 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:22636506:22639608:1 gene:ENSG00000173372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000402322 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:22637580:22639608:1 gene:ENSG00000173372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000438241 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:22636762:22639331:1 gene:ENSG00000173372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// AF135157 // GenBank // Homo sapiens complement C1q A chain precursor, mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// AF260332 // GenBank // Homo sapiens DC33 mRNA, complete cds. // chr1 // 83 // 62 // 15 // 18 // 0 /// BC030153 // GenBank // Homo sapiens complement component 1, q subcomponent, A chain, mRNA (cDNA clone MGC:29490 IMAGE:4850418), complete cds. // chr1 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// BC071986 // GenBank // Homo sapiens complement component 1, q subcomponent, A chain, mRNA (cDNA clone MGC:88683 IMAGE:6300836), complete cds. // chr1 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000046158 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:22618613:22639407:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1
NM_001114101 // RefSeq // Homo sapiens complement component 1, q subcomponent, C chain (C1QC), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_172369 // RefSeq // Homo sapiens complement component 1, q subcomponent, C chain (C1QC), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000374637 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:22643653:22647887:1 gene:ENSG00000159189 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000374639 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:22643633:22648110:1 gene:ENSG00000159189 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000374640 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:22643630:22648110:1 gene:ENSG00000159189 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF087892 // GenBank // Homo sapiens C1q-C mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// AK226152 // GenBank // Homo sapiens mRNA for complement component 1, q subcomponent, gamma polypeptide variant, clone: sj00468. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC009016 // GenBank // Homo sapiens complement component 1, q subcomponent, C chain, mRNA (cDNA clone MGC:17279 IMAGE:4212772), complete cds. // chr1 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000046155 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:22644024:22647783:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
NM_000491 // RefSeq // Homo sapiens complement component 1, q subcomponent, B chain (C1QB), mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000314933 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:22653189:22661536:1 gene:ENSG00000173369 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000432749 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:22653189:22661316:1 gene:ENSG00000173369 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 83 // 67 // 15 // 18 // 0 /// ENST00000509305 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:22652981:22661538:1 gene:ENSG00000173369 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000510260 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:22652762:22661090:1 gene:ENSG00000173369 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// BC008983 // GenBank // Homo sapiens complement component 1, q subcomponent, B chain, mRNA (cDNA clone MGC:17227 IMAGE:4212848), complete cds. // chr1 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// X03084 // GenBank // Human mRNA for C1q B-chain of complement system. // chr1 // 90 // 78 // 19 // 21 // 0 /// GENSCAN00000046157 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:22659460:22661386:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
ENST00000384208 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:23162704:23162810:1 gene:ENSG00000206935 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT001506 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
ENST00000516769 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:23163953:23164053:1 gene:ENSG00000252578 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT001507 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_033690 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 213 (C1orf213), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NR_033691 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 213 (C1orf213), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 29 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000335648 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:23369236:23371782:1 gene:ENSG00000249087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000437367 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:23369250:23371783:1 gene:ENSG00000249087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 29 // 9 // 9 // 0 /// BC028411 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 213, mRNA (cDNA clone MGC:33553 IMAGE:4822173), complete cds. // chr1 // 96 // 81 // 24 // 25 // 0 /// BC054115 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 213, mRNA (cDNA clone MGC:51339 IMAGE:5270027), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC068594 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 213, mRNA (cDNA clone MGC:87626 IMAGE:4828713), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000454117 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:23369218:23371839:1 gene:ENSG00000249087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
NR_027042 // RefSeq // Homo sapiens myelodysplastic syndrome 2 translocation associated (MDS2), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000374555 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:23627334:23640568:1 gene:ENSG00000197880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000477916 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:23581495:23640568:1 gene:ENSG00000197880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 48 // 48 // 10 // 21 // 1 /// BC041472 // GenBank // Homo sapiens myelodysplastic syndrome 2 translocation associated, mRNA (cDNA clone IMAGE:5229269). // chr1 // 48 // 48 // 10 // 21 // 1 /// ENST00000612756 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:23639109:23640549:1 gene:ENSG00000197880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 16 // 16 // 0 /// NONHSAT001534 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 48 // 48 // 10 // 21 // 1
NM_000975 // RefSeq // Homo sapiens ribosomal protein L11 (RPL11), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 79 // 11 // 11 // 0 /// NM_001199802 // RefSeq // Homo sapiens ribosomal protein L11 (RPL11), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 79 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000374550 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:23691779:23696425:1 gene:ENSG00000142676 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000458455 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:23692609:23696128:1 gene:ENSG00000142676 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 7 // 7 // 0 /// ENST00000482370 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:23692306:23696418:1 gene:ENSG00000142676 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 71 // 10 // 10 // 0 /// AY871274 // GenBank // Homo sapiens cell growth-inhibiting protein 34 mRNA, complete cds. // chr1 // 80 // 71 // 8 // 10 // 0 /// BC018970 // GenBank // Homo sapiens ribosomal protein L11, mRNA (cDNA clone MGC:19586 IMAGE:4337066), complete cds. // chr1 // 100 // 71 // 10 // 10 // 0 /// L05092 // GenBank // Homo sapiens ribosomal protein L11 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 71 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000019038 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:23670778:23711231:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 11 // 11 // 0 /// AK225425 // GenBank // Homo sapiens mRNA for Growth/differentiation factor 15 precursor variant, clone: HRC10120. // chr1 // 100 // 71 // 10 // 10 // 0
NM_003198 // RefSeq // Homo sapiens transcription elongation factor B (SIII), polypeptide 3 (110kDa, elongin A) (TCEB3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000418390 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:23743155:23762059:1 gene:ENSG00000011007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000609199 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:23743472:23759893:1 gene:ENSG00000011007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC002883 // GenBank // Homo sapiens transcription elongation factor B (SIII), polypeptide 3 (110kDa, elongin A), mRNA (cDNA clone MGC:10488 IMAGE:3941728), complete cds. // chr1 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// L47345 // GenBank // Homo sapiens elongin A mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// ENST00000613537 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:23743366:23762040:1 gene:ENSG00000011007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000019045 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:23743504:23759573:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
NM_020362 // RefSeq // Homo sapiens PITH (C-terminal proteasome-interacting domain of thioredoxin-like) domain containing 1 (PITHD1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000246151 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:23778405:23788232:1 gene:ENSG00000057757 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000374524 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:23785192:23788232:1 gene:ENSG00000057757 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// AF221595 // GenBank // Homo sapiens HT014 (HT014) mRNA, complete cds. // chr1 // 92 // 96 // 24 // 26 // 0 /// AF271784 // GenBank // Homo sapiens AD039 mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// AK296662 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60641 complete cds. // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// AK310330 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17372. // chr1 // 95 // 74 // 19 // 20 // 0 /// BC017208 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 128, mRNA (cDNA clone MGC:10673 IMAGE:3943360), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000415372 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:23779357:23786378:1 gene:ENSG00000057757 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// GENSCAN00000019044 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:23778516:23795363:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
NM_007260 // RefSeq // Homo sapiens lysophospholipase II (LYPLA2), mRNA. // chr1 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000374514 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:23790970:23795539:1 gene:ENSG00000011009 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000421070 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:23791992:23793907:1 gene:ENSG00000011009 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 53 // 8 // 8 // 0 /// AF098668 // GenBank // Homo sapiens acyl-protein thioesterase mRNA, complete cds. // chr1 // 89 // 60 // 8 // 9 // 0 /// BC017034 // GenBank // Homo sapiens lysophospholipase II, mRNA (cDNA clone MGC:9106 IMAGE:3845764), complete cds. // chr1 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0 /// BC017193 // GenBank // Homo sapiens lysophospholipase II, mRNA (cDNA clone MGC:1904 IMAGE:3138786), complete cds. // chr1 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000019044 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:23778516:23795363:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 67 // 67 // 10 // 15 // 1
NM_017761 // RefSeq // Homo sapiens proline-rich nuclear receptor coactivator 2 (PNRC2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000334351 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:23959812:23963462:1 gene:ENSG00000189266 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000374468 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:23959828:23961880:1 gene:ENSG00000189266 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000579103 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:23960968:23961443:1 gene:ENSG00000189266 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// AF374386 // GenBank // Homo sapiens proline-rich nuclear receptor coactivator 2 (PNRC2) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC001959 // GenBank // Homo sapiens proline-rich nuclear receptor coactivator 2, mRNA (cDNA clone MGC:885 IMAGE:3536977), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC078177 // GenBank // Homo sapiens proline-rich nuclear receptor coactivator 2, mRNA (cDNA clone MGC:87829 IMAGE:6526331), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// BC085018 // GenBank // Homo sapiens proline-rich nuclear receptor coactivator 2, mRNA (cDNA clone MGC:99541 IMAGE:6650445), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK300522 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57595 complete cds, moderately similar to Proline-rich nuclear receptor coactivator 2. // chr1 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// ENST00000471915 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:23959109:23961465:1 gene:ENSG00000189266 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_020448 // RefSeq // Homo sapiens NIPA-like domain containing 3 (NIPAL3), mRNA. // chr1 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// XM_005245948 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens NIPA-like domain containing 3 (NIPAL3), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 74 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000003912 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:24415803:24472976:1 gene:ENSG00000001461 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000339255 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:24415814:24466310:1 gene:ENSG00000001461 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 74 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000358028 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:24415813:24454824:1 gene:ENSG00000001461 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 48 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000374399 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:24415794:24469307:1 gene:ENSG00000001461 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 74 // 17 // 17 // 0 /// BC001265 // GenBank // Homo sapiens NIPA-like domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:5034 IMAGE:3452234), complete cds. // chr1 // 100 // 48 // 11 // 11 // 0 /// BC063583 // GenBank // Homo sapiens NIPA-like domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:74951 IMAGE:4386115), complete cds. // chr1 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000030496 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:24415307:24469185:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 57 // 13 // 13 // 0
NM_001010980 // RefSeq // Homo sapiens noncompact myelin associated protein (NCMAP), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000374392 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:24556111:24609325:1 gene:ENSG00000184454 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000486262 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:24589464:24609328:1 gene:ENSG00000184454 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC050474 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 130, mRNA (cDNA clone IMAGE:6196152). // chr1 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// BC127785 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 130, mRNA (cDNA clone MGC:157901 IMAGE:40134460), complete cds. // chr1 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// BC147014 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 130, mRNA (cDNA clone MGC:182117 IMAGE:9056942), complete cds. // chr1 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// BC147015 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 130, mRNA (cDNA clone MGC:182118 IMAGE:9056943), complete cds. // chr1 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// NONHSAT001654 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000030500 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:24557719:24650525:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_018202 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 57 (TMEM57), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// XM_005245931 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens transmembrane protein 57 (TMEM57), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000374343 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:25430920:25500209:1 gene:ENSG00000204178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// AK311472 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ18514. // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// AY845015 // GenBank // Homo sapiens macoilin mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC007687 // GenBank HTC // Homo sapiens transmembrane protein 57, mRNA (cDNA clone IMAGE:3944074), with apparent retained intron. // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC020801 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4250293, containing frame-shift errors. // chr1 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// BC032427 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 57, mRNA (cDNA clone MGC:40289 IMAGE:5246967), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// NM_001282564 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 57 (TMEM57), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 1 /// ENST00000399766 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:25430858:25500205:1 gene:ENSG00000204178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 1 /// AY845035 // GenBank // Homo sapiens macoilin isoform 1 mRNA, complete cds. // chr1 // 88 // 88 // 14 // 16 // 1 /// GENSCAN00000023748 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:25430440:25498466:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0 /// NONHSAT001726 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_020451 // RefSeq // Homo sapiens selenoprotein N, 1 (SEPN1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// NM_206926 // RefSeq // Homo sapiens selenoprotein N, 1 (SEPN1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000354177 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:25800176:25818219:1 gene:ENSG00000162430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000361547 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:25800176:25818224:1 gene:ENSG00000162430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000374315 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:25800193:25818221:1 gene:ENSG00000162430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000494537 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:25812728:25815990:1 gene:ENSG00000162430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 31 // 13 // 13 // 0 /// BC015638 // GenBank // Homo sapiens selenoprotein N, 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4637019), complete cds. // chr1 // 91 // 52 // 20 // 22 // 0 /// BC042154 // GenBank // Homo sapiens selenoprotein N, 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4551053), complete cds. // chr1 // 91 // 52 // 20 // 22 // 0 /// BC107036 // GenBank HTC // Homo sapiens selenoprotein N, 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:40000676), with apparent retained intron. // chr1 // 100 // 19 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000023741 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:25800231:25815718:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 27 // 27 // 0
ENST00000384572 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:25877496:25877605:1 gene:ENSG00000207302 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT001759 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000384508 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:25964197:25964300:1 gene:ENSG00000207237 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT001768 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000516882 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:26006216:26006299:1 gene:ENSG00000252691 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT001775 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_004455 // RefSeq // Homo sapiens exostosin-like glycosyltransferase 1 (EXTL1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// XM_006710448 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens exostosin-like glycosyltransferase 1 (EXTL1), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 96 // 66 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000374280 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:26021780:26036464:1 gene:ENSG00000158008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000481377 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:26019884:26031547:1 gene:ENSG00000158008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000484339 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:26023189:26031555:1 gene:ENSG00000158008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 29 // 11 // 11 // 0 /// BC065528 // GenBank // Homo sapiens exostoses (multiple)-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:70794 IMAGE:6150218), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// U67191 // GenBank // Human multiple exostosis-like protein (EXTL) mRNA, complete cds. // chr1 // 84 // 100 // 32 // 38 // 0 /// ENST00000470037 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:26032130:26035004:1 gene:ENSG00000158008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 26 // 26 // 10 // 38 // 1 /// GENSCAN00000041745 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:26006098:26035347:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// NONHSAT001776 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 26 // 26 // 10 // 38 // 1
NM_001243532 // RefSeq // Homo sapiens PDLIM1 interacting kinase 1 like (PDIK1L), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// NM_001243533 // RefSeq // Homo sapiens PDLIM1 interacting kinase 1 like (PDIK1L), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_152835 // RefSeq // Homo sapiens PDLIM1 interacting kinase 1 like (PDIK1L), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000374269 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:26111849:26124033:1 gene:ENSG00000175087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000374271 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:26111837:26125543:1 gene:ENSG00000175087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000444713 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:26111173:26122124:1 gene:ENSG00000175087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// BC028713 // GenBank // Homo sapiens PDLIM1 interacting kinase 1 like, mRNA (cDNA clone MGC:27093 IMAGE:4828997), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENST00000619836 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:26111165:26125530:1 gene:ENSG00000175087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000041749 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:26114309:26122577:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 91 // 39 // 10 // 11 // 0
NM_024869 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 110, member D (FAM110D), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000374268 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:26159020:26162628:1 gene:ENSG00000197245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AK290715 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76134 complete cds, highly similar to Homo sapiens glycine/arginine rich protein 1, mRNA. // chr1 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// BC025658 // GenBank // Homo sapiens glycine/arginine rich protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:34152 IMAGE:5198480), complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000041752 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:26161292:26162107:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0
NM_015871 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 593 (ZNF593), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000270812 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:26169942:26172060:1 gene:ENSG00000142684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000374266 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:26169871:26172060:1 gene:ENSG00000142684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC002580 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 593, mRNA (cDNA clone MGC:717 IMAGE:3143091), complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC019267 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 593, mRNA (cDNA clone MGC:3359 IMAGE:2823658), complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// D45213 // GenBank // Homo sapiens mRNA for zinc finger protein, complete cds. // chr1 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000041748 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:26169984:26170716:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
NM_198137 // RefSeq // Homo sapiens cation channel, sperm associated 4 (CATSPER4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000338855 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:26190561:26201603:1 gene:ENSG00000188782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000456354 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:26190561:26202968:1 gene:ENSG00000188782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000518899 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:26190628:26202968:1 gene:ENSG00000188782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC128138 // GenBank // Homo sapiens cation channel, sperm associated 4, mRNA (cDNA clone MGC:149223 IMAGE:40112485), complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC128139 // GenBank // Homo sapiens cation channel, sperm associated 4, mRNA (cDNA clone MGC:149224 IMAGE:40112493), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC144663 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:9053194. // chr1 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000611853 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:26190628:26202542:1 gene:ENSG00000188782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000041734 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:26174143:26281123:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0
NM_031286 // RefSeq // Homo sapiens SH3 domain binding glutamate-rich protein like 3 (SH3BGRL3), mRNA. // chr1 // 100 // 67 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000270792 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:26279176:26281522:1 gene:ENSG00000142669 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000319041 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:26280122:26281450:1 gene:ENSG00000142669 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 43 // 9 // 9 // 0 /// AF247790 // GenBank // Homo sapiens putative SH3 domain-binding protein SH3BP-1 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 43 // 9 // 9 // 0 /// AF304163 // GenBank // Homo sapiens P1725 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 43 // 9 // 9 // 0 /// BC030135 // GenBank // Homo sapiens SH3 domain binding glutamic acid-rich protein like 3, mRNA (cDNA clone MGC:19619 IMAGE:4040656), complete cds. // chr1 // 100 // 48 // 10 // 10 // 0 /// FJ224343 // GenBank // Homo sapiens epididymis secretory protein Li 297 (HEL-S-297) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000614679 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:26279176:26281516:1 gene:ENSG00000142669 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0
NM_001803 // RefSeq // Homo sapiens CD52 molecule (CD52), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000374213 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:26317957:26320523:1 gene:ENSG00000169442 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000470468 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:26317958:26320324:1 gene:ENSG00000169442 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 94 // 64 // 17 // 18 // 0 /// BC000644 // GenBank // Homo sapiens CD52 molecule, mRNA (cDNA clone MGC:1783 IMAGE:3345325), complete cds. // chr1 // 92 // 89 // 23 // 25 // 0 /// BT007116 // GenBank // Homo sapiens CDW52 antigen (CAMPATH-1 antigen) mRNA, complete cds. // chr1 // 83 // 43 // 10 // 12 // 0 /// CR456874 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834G116D for gene CDW52, CDW52 antigen (CAMPATH-1 antigen); complete cds, incl. stopcodon. // chr1 // 83 // 43 // 10 // 12 // 0 /// FJ460513 // GenBank // Homo sapiens epididymis secretory sperm binding protein Li 171mP (HEL-S-171mP) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000492808 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:26317958:26318994:1 gene:ENSG00000169442 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// AK311554 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ18596. // chr1 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// NONHSAT001802 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr1 // 94 // 64 // 17 // 18 // 0
NM_024674 // RefSeq // Homo sapiens lin-28 homolog A (C. elegans) (LIN28A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000254231 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:26410817:26429719:1 gene:ENSG00000131914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000326279 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:26410778:26429722:1 gene:ENSG00000131914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AF521099 // GenBank // Homo sapiens RNA-binding protein LIN-28 (LIN-28) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// BC028566 // GenBank // Homo sapiens lin-28 homolog (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:15037 IMAGE:3841184), complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000041750 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:26410892:26426458:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0
NM_005517 // RefSeq // Homo sapiens high mobility group nucleosomal binding domain 2 (HMGN2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000468388 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:26472450:26474128:1 gene:ENSG00000198830 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0 /// BC075837 // GenBank // Homo sapiens high-mobility group nucleosomal binding domain 2, mRNA (cDNA clone MGC:88719 IMAGE:6272425), complete cds. // chr1 // 86 // 78 // 6 // 7 // 0 /// NONHSAT001823 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0
ENST00000477476 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:26814822:26815112:1 gene:ENSG00000241188 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT001850 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_032283 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, DHHC-type containing 18 (ZDHHC18), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000374141 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:26832004:26853963:1 gene:ENSG00000204160 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000374142 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:26826710:26857601:1 gene:ENSG00000204160 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000534643 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:26832020:26851174:1 gene:ENSG00000204160 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 80 // 33 // 8 // 10 // 0 /// AK298683 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59953 complete cds, highly similar to Palmitoyltransferase ZDHHC18 (EC 2.3.1.-). // chr1 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// BC066776 // GenBank // Homo sapiens zinc finger, DHHC-type containing 18, mRNA (cDNA clone MGC:71808 IMAGE:30342061), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000488397 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:26850362:26857602:1 gene:ENSG00000204160 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1 /// AK091260 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ33941 fis, clone CTONG2018135. // chr1 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// GENSCAN00000041746 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:26826805:26863959:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
NM_006142 // RefSeq // Homo sapiens stratifin (SFN), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000339276 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:26863138:26864457:1 gene:ENSG00000175793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF029082 // GenBank // Homo sapiens 14-3-3 sigma protein mRNA, complete cds. // chr1 // 89 // 97 // 25 // 28 // 0 /// BC000329 // GenBank // Homo sapiens stratifin, mRNA (cDNA clone MGC:8516 IMAGE:2822397), complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC000995 // GenBank // Homo sapiens stratifin, mRNA (cDNA clone MGC:5018 IMAGE:3445915), complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC001550 // GenBank // Homo sapiens stratifin, mRNA (cDNA clone MGC:5019 IMAGE:3457665), complete cds. // chr1 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// BC002995 // GenBank // Homo sapiens stratifin, mRNA (cDNA clone MGC:3828 IMAGE:2822397), complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC023552 // GenBank // Homo sapiens stratifin, mRNA (cDNA clone MGC:19713 IMAGE:3534328), complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// CR541905 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834E0233D for gene SFN, stratifin; complete cds, incl. stopcodon. // chr1 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// CR541926 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834H1133D for gene SFN, stratifin; complete cds, without stopcodon. // chr1 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// M93010 // GenBank // Human epithelial cell marker protein 1 (HMe1) mRNA, complete cds. // chr1 // 79 // 83 // 19 // 24 // 0 /// X57348 // GenBank // H.sapiens mRNA (clone 9112). // chr1 // 83 // 83 // 20 // 24 // 0 /// GENSCAN00000041746 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:26826805:26863959:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1
NM_001013642 // RefSeq // Homo sapiens TMF1-regulated nuclear protein 1 (TRNP1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000522111 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:26993707:27000898:1 gene:ENSG00000253368 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000531285 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:26994319:27000109:1 gene:ENSG00000253368 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 44 // 11 // 12 // 0 /// BC069216 // GenBank // Homo sapiens TMF1-regulated nuclear protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:78739 IMAGE:6376829), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000041737 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:26993787:26994470:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0
ENST00000457038 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:27176751:27177277:1 gene:ENSG00000229985 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042493 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:27177083:27177277:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT001868 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001276252 // RefSeq // Homo sapiens WD and tetratricopeptide repeats 1 (WDTC1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_015023 // RefSeq // Homo sapiens WD and tetratricopeptide repeats 1 (WDTC1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000319394 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:27234516:27308633:1 gene:ENSG00000142784 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000361771 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:27234668:27308244:1 gene:ENSG00000142784 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000447062 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:27261048:27308241:1 gene:ENSG00000142784 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000491239 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:27287709:27308619:1 gene:ENSG00000142784 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// AB028960 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1037 protein, partial cds. // chr1 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// BC032523 // GenBank // Homo sapiens WD and tetratricopeptide repeats 1, mRNA (cDNA clone MGC:44910 IMAGE:5500384), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000042478 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:27261055:27353852:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
NM_005281 // RefSeq // Homo sapiens G protein-coupled receptor 3 (GPR3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000374024 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:27392644:27395814:1 gene:ENSG00000181773 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK291185 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78018 complete cds, highly similar to Homo sapiens G protein-coupled receptor 3, mRNA. // chr1 // 93 // 56 // 13 // 14 // 0 /// BC032702 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 3, mRNA (cDNA clone MGC:45242 IMAGE:5247608), complete cds. // chr1 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0
ENST00000384367 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:27693731:27693835:1 gene:ENSG00000207095 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT001914 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_177424 // RefSeq // Homo sapiens syntaxin 12 (STX12), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000373943 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:27773183:27824452:1 gene:ENSG00000117758 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000440806 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:27773235:27812268:1 gene:ENSG00000117758 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// AF123769 // GenBank // Homo sapiens syntaxin mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// AK297585 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50021 complete cds, highly similar to Syntaxin-12. // chr1 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// AK299982 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54877 complete cds, highly similar to Syntaxin-12. // chr1 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// AK315880 // GenBank // Homo sapiens cDNA, FLJ79529 complete cds, highly similar to Syntaxin-12. // chr1 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// BC046999 // GenBank // Homo sapiens syntaxin 12, mRNA (cDNA clone MGC:51957 IMAGE:3851266), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// CR407620 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834C0111D for gene STX12, syntaxin 12 complete cds, without stopcodon. // chr1 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000468761 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:27773255:27802039:1 gene:ENSG00000117758 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// GENSCAN00000042499 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:27726081:27850446:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
ENST00000411130 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:27824538:27824643:1 gene:ENSG00000223062 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONHSAT001918 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NR_002997 // RefSeq // Homo sapiens small Cajal body-specific RNA 1 (SCARNA1), guide RNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000517138 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:27834401:27834566:1 gene:ENSG00000252947 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT001919 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_018053 // RefSeq // Homo sapiens XK, Kell blood group complex subunit-related family, member 8 (XKR8), mRNA. // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000373884 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:27959462:27968096:1 gene:ENSG00000158156 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK091615 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ34296 fis, clone FEBRA2005734. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY534246 // GenBank // Homo sapiens XK-related protein 8 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC003606 // GenBank // Homo sapiens XK, Kell blood group complex subunit-related family, member 8, mRNA (cDNA clone IMAGE:3544705), complete cds. // chr1 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// BC013379 // GenBank // Homo sapiens XK, Kell blood group complex subunit-related family, member 8, mRNA (cDNA clone MGC:16520 IMAGE:4025274), complete cds. // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC028564 // GenBank // Homo sapiens XK, Kell blood group complex subunit-related family, member 8, mRNA (cDNA clone MGC:14905 IMAGE:3832072), complete cds. // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// AK054909 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ30347 fis, clone BRACE2007538. // chr1 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// GENSCAN00000042491 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:27960070:27967200:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0
AF116696 // GenBank HTC // Homo sapiens PRO2239 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_031459 // RefSeq // Homo sapiens sestrin 2 (SESN2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000253063 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:28259527:28282491:1 gene:ENSG00000130766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AY123223 // GenBank // Homo sapiens sestrin 2 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC013304 // GenBank // Homo sapiens sestrin 2, mRNA (cDNA clone MGC:4448 IMAGE:2959845), complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// BC033719 // GenBank // Homo sapiens sestrin 2, mRNA (cDNA clone MGC:44920 IMAGE:4931535), complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000016581 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:28247169:28280802:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 77 // 77 // 24 // 31 // 1
NM_001048183 // RefSeq // Homo sapiens phosphatase and actin regulator 4 (PHACTR4), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_023923 // RefSeq // Homo sapiens phosphatase and actin regulator 4 (PHACTR4), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006710845 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens phosphatase and actin regulator 4 (PHACTR4), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000373836 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:28438171:28500308:1 gene:ENSG00000204138 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000373839 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:28369603:28500369:1 gene:ENSG00000204138 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000493669 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:28369744:28497156:1 gene:ENSG00000204138 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AK025436 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ21783 fis, clone HEP00284. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC021247 // GenBank // Homo sapiens phosphatase and actin regulator 4, mRNA (cDNA clone MGC:20618 IMAGE:4577873), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC029266 // GenBank // Homo sapiens phosphatase and actin regulator 4, mRNA (cDNA clone MGC:34186 IMAGE:4422413), complete cds. // chr1 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// BC068508 // GenBank // Homo sapiens phosphatase and actin regulator 4, mRNA (cDNA clone MGC:87269 IMAGE:4825777), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000016583 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:28438385:28577636:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1
NR_002907 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 73A (SNORA73A), small nucleolar RNA. // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000364938 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:28507366:28507571:1 gene:ENSG00000274266 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA gene:ENSG00000242125 // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000437681 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:28506351:28509633:1 gene:ENSG00000242125 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// AK092726 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ35407 fis, clone SKNSH2007739. // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT001955 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT001956 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NONHSAT001961 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_152304 // RefSeq // Homo sapiens RAB42, member RAS oncogene family (RAB42), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000373826 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:28592200:28595443:1 gene:ENSG00000188060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC033175 // GenBank // Homo sapiens RAB42, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:45806 IMAGE:4561064), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NR_004407 // RefSeq // Homo sapiens RNA, U11 small nuclear (RNU11), small nuclear RNA. // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000387069 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:28648600:28648733:1 gene:ENSG00000274978 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA gene:ENSG00000270103 // chr1 // 95 // 100 // 19 // 20 // 0 /// ENST00000602813 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:28648600:28648730:1 gene:ENSG00000270103 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 80 // 100 // 16 // 20 // 0 /// NONHSAT001987 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 70 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT001989 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 95 // 100 // 19 // 20 // 0 /// AK292656 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77957 complete cds, highly similar to Homo sapiens HBS1-like (S. cerevisiae) (HBS1L), mRNA. // chr1 // 70 // 100 // 14 // 20 // 0 /// NONHSAT001988 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 64 // 70 // 9 // 14 // 0
NM_006582 // RefSeq // Homo sapiens glucocorticoid modulatory element binding protein 1 (GMEB1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_024482 // RefSeq // Homo sapiens glucocorticoid modulatory element binding protein 1 (GMEB1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000294409 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:28668780:28714873:1 gene:ENSG00000162419 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000361872 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:28668778:28714886:1 gene:ENSG00000162419 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000373816 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:28668732:28719353:1 gene:ENSG00000162419 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000480454 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:28683564:28715065:1 gene:ENSG00000162419 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AF099013 // GenBank // Homo sapiens glucocorticoid modulatory element binding protein-1 (GMEB1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// AF173868 // GenBank // Homo sapiens DNA binding protein p96PIF mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// AF203694 // GenBank // Homo sapiens glucocorticoid modulatory element binding protein 1 (GMEB1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC001473 // GenBank // Homo sapiens glucocorticoid modulatory element binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:1001 IMAGE:3138481), complete cds. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000016580 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:28683613:28714773:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
ENST00000516968 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:28689665:28689794:1 gene:ENSG00000252777 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT001992 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_000911 // RefSeq // Homo sapiens opioid receptor, delta 1 (OPRD1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000234961 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:28812142:28863696:1 gene:ENSG00000116329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// EF057065 // GenBank // Homo sapiens delta opioid receptor 1 variant mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// EU883570 // GenBank // Homo sapiens opioid receptor delta 1 (OPRD1) mRNA, complete cds. // chr1 // 94 // 71 // 16 // 17 // 0 /// U07882 // GenBank // Human delta opioid receptor mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 96 // 22 // 23 // 0 /// U10504 // GenBank // Human delta opiate receptor mRNA, complete cds. // chr1 // 94 // 71 // 16 // 17 // 0 /// ENST00000621425 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:28812142:28863283:1 gene:ENSG00000116329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000016571 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:28796793:28863283:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 71 // 71 // 17 // 24 // 1
ENST00000383977 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:28985710:28985810:1 gene:ENSG00000206704 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT002004 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
ENST00000414532 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:30718504:30726744:1 gene:ENSG00000186056 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000443076 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:30725720:30726364:1 gene:ENSG00000186056 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// AK128076 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ46197 fis, clone TESTI4007565. // chr1 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// NR_034182 // RefSeq // Homo sapiens MATN1 antisense RNA 1 (MATN1-AS1), long non-coding RNA. // chr1 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1 /// ENST00000454613 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:30718772:30726827:1 gene:ENSG00000186056 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1 /// NONHSAT002056 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONHSAT002059 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// NONHSAT002061 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// NONHSAT139856 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONHSAT002057 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1
ENST00000410852 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:30843823:30844110:1 gene:ENSG00000222784 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0 /// NONHSAT002068 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0
AF111851 // GenBank HTC // Homo sapiens PRO0611 mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_012316 // RefSeq // Homo sapiens karyopherin alpha 6 (importin alpha 7) (KPNA6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000373625 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:32108038:32176568:1 gene:ENSG00000025800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000446515 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:32156862:32167296:1 gene:ENSG00000025800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 53 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000469790 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:32142923:32162394:1 gene:ENSG00000025800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 94 // 47 // 15 // 16 // 0 /// ENST00000471599 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:32108058:32173173:1 gene:ENSG00000025800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AF060543 // GenBank // Homo sapiens importin alpha 7 subunit mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// AK295615 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53998 complete cds, highly similar to Importin alpha-7 subunit. // chr1 // 93 // 85 // 27 // 29 // 0 /// AK301714 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53229 complete cds, highly similar to Importin alpha-7 subunit. // chr1 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// BC020520 // GenBank // Homo sapiens karyopherin alpha 6 (importin alpha 7), mRNA (cDNA clone MGC:17918 IMAGE:3913864), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BT009843 // GenBank // Homo sapiens karyopherin alpha 6 (importin alpha 7) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000015902 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:32142931:32170894:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0
NM_175852 // RefSeq // Homo sapiens taxilin alpha (TXLNA), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000373609 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:32180065:32198285:1 gene:ENSG00000084652 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000373610 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:32179686:32198285:1 gene:ENSG00000084652 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// AF516206 // GenBank // Homo sapiens taxilin mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 71 // 29 // 29 // 0 /// AL832636 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp451I0918 (from clone DKFZp451I0918); complete cds. // chr1 // 95 // 95 // 37 // 39 // 0 /// AL832637 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp451J0118 (from clone DKFZp451J0118). // chr1 // 97 // 95 // 38 // 39 // 0 /// BC046565 // GenBank // Homo sapiens taxilin alpha, mRNA (cDNA clone IMAGE:5534975), complete cds. // chr1 // 100 // 39 // 16 // 16 // 0 /// BC080578 // GenBank // Homo sapiens taxilin alpha, mRNA (cDNA clone MGC:99831 IMAGE:6598234), complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// BC103823 // GenBank // Homo sapiens taxilin alpha, mRNA (cDNA clone MGC:118870 IMAGE:40001224), complete cds. // chr1 // 100 // 71 // 29 // 29 // 0 /// BC103824 // GenBank // Homo sapiens taxilin alpha, mRNA (cDNA clone MGC:118871 IMAGE:40001225), complete cds. // chr1 // 100 // 71 // 29 // 29 // 0 /// AK096939 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39620 fis, clone SMINT2001114. // chr1 // 29 // 29 // 12 // 41 // 1 /// GENSCAN00000015905 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:32179893:32231196:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 71 // 71 // 29 // 41 // 1
NM_024296 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 28B (CCDC28B), mRNA. // chr1 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000373602 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:32200386:32205387:1 gene:ENSG00000160050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000421922 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:32200633:32205387:1 gene:ENSG00000160050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000461819 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:32200644:32205383:1 gene:ENSG00000160050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// AK225113 // GenBank // Homo sapiens mRNA for MGC1203 protein variant, clone: CAS11258. // chr1 // 94 // 60 // 17 // 18 // 0 /// AK291904 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77161 complete cds, highly similar to Homo sapiens coiled-coil domain containing 28B, mRNA. // chr1 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// BC022848 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 28B, mRNA (cDNA clone MGC:16441 IMAGE:3946778), complete cds. // chr1 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000015905 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:32179893:32231196:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_001160042 // RefSeq // Homo sapiens IQ motif containing C (IQCC), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_018134 // RefSeq // Homo sapiens IQ motif containing C (IQCC), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000291358 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:32205661:32208687:1 gene:ENSG00000160051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000537469 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:32205671:32208682:1 gene:ENSG00000160051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AK299235 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60335 complete cds, highly similar to Homo sapiens IQ motif containing C (IQCC), mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC098250 // GenBank // Homo sapiens IQ motif containing C, mRNA (cDNA clone IMAGE:40024455), complete cds. // chr1 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// BC098260 // GenBank // Homo sapiens IQ motif containing C, mRNA (cDNA clone MGC:120342 IMAGE:40024457), complete cds. // chr1 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// BC098317 // GenBank // Homo sapiens IQ motif containing C, mRNA (cDNA clone MGC:120343 IMAGE:40024460), complete cds. // chr1 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// BC098366 // GenBank // Homo sapiens IQ motif containing C, mRNA (cDNA clone MGC:120344 IMAGE:40024462), complete cds. // chr1 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000617816 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:32205671:32208548:1 gene:ENSG00000160051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000015905 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:32179893:32231196:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1
NM_032648 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 167, member B (FAM167B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000373582 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:32247233:32248856:1 gene:ENSG00000183615 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC004269 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 167, member B, mRNA (cDNA clone MGC:10820 IMAGE:3613742), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000015901 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:32247422:32248601:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0
NM_052841 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific serine kinase 3 (TSSK3), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000373534 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:32362197:32364312:1 gene:ENSG00000162526 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF296450 // GenBank // Homo sapiens testis-specific serine/threonine kinase 3 (TSSK-3) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// AY048701 // GenBank // Homo sapiens TSSK3 precursor RNA, complete cds. // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC035354 // GenBank // Homo sapiens testis-specific serine kinase 3, mRNA (cDNA clone MGC:34807 IMAGE:5171736), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000015887 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:32362702:32364256:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0
ENST00000579362 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:32457835:32458135:1 gene:ENSG00000263529 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT002209 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
ENST00000363721 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:32639951:32640052:1 gene:ENSG00000200591 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT002219 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001198972 // RefSeq // Homo sapiens KIAA1522 (KIAA1522), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// NM_001198973 // RefSeq // Homo sapiens KIAA1522 (KIAA1522), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 100 // 56 // 23 // 23 // 0 /// NM_020888 // RefSeq // Homo sapiens KIAA1522 (KIAA1522), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000373480 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:32765667:32774970:1 gene:ENSG00000162522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000373481 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:32754021:32774970:1 gene:ENSG00000162522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000401073 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:32741885:32774970:1 gene:ENSG00000162522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000294521 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:1:32765634:32773197:1 gene:ENSG00000162522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 32 // 32 // 13 // 41 // 1 /// AK298965 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60810 complete cds. // chr1 // 32 // 32 // 13 // 41 // 1 /// GENSCAN00000015891 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:32765770:32773998:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 30 // 30 // 0
NM_001256121 // RefSeq // Homo sapiens S100P binding protein (S100PBP), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NM_022753 // RefSeq // Homo sapiens S100P binding protein (S100PBP), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006710819 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens S100P binding protein (S100PBP), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// XM_006710820 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens S100P binding protein (S100PBP), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000356689 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:32817592:32837178:1 gene:ENSG00000116497 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000373475 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:32817555:32858879:1 gene:ENSG00000116497 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000373476 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:32817442:32857854:1 gene:ENSG00000116497 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000531123 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:32817575:32843187:1 gene:ENSG00000116497 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// BC015175 // GenBank // Homo sapiens S100P binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:10147 IMAGE:3904501), complete cds. // chr1 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// BX647667 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp313K2325 (from clone DKFZp313K2325). // chr1 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000015881 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:32826100:32859365:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0
NM_002143 // RefSeq // Homo sapiens hippocalcin (HPCA), mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000373467 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:32886435:32894646:1 gene:ENSG00000121905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000470166 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:32885994:32894063:1 gene:ENSG00000121905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000480118 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:32886082:32893629:1 gene:ENSG00000121905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// BC001777 // GenBank // Homo sapiens hippocalcin, mRNA (cDNA clone MGC:1822 IMAGE:3355354), complete cds. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BT019750 // GenBank // Homo sapiens hippocalcin mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// BT019789 // GenBank // Homo sapiens hippocalcin mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// D16593 // GenBank // Homo sapiens BDR-2 mRNA for hippocalcin, complete cds. // chr1 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000459874 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:32886462:32894143:1 gene:ENSG00000121905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// GENSCAN00000015900 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:32888899:32893862:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
ENST00000401937 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:32979947:32980472:1 gene:ENSG00000217644 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000015895 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:32979945:32980472:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0
NM_152493 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 362 (ZNF362), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_005270507 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens zinc finger protein 362 (ZNF362), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000373428 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:33270575:33300719:1 gene:ENSG00000160094 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000483388 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:33256545:33280414:1 gene:ENSG00000160094 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000539719 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:33256573:33300719:1 gene:ENSG00000160094 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC104779 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 362, mRNA (cDNA clone MGC:132439 IMAGE:8143782), complete cds. // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC112113 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 362, mRNA (cDNA clone MGC:138318 IMAGE:8327581), complete cds. // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000039570 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:33220035:33299046:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
AK021842 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ11780 fis, clone HEMBA1005931, weakly similar to ZINC FINGER PROTEIN 83. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// DQ414819 // GenBank // Homo sapiens HBV DNAPTP1-binding protein 1 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// DQ499598 // GenBank // Homo sapiens HBeAg-binding protein 2 binding protein B (HBEBP2BPB) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0
NM_145238 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger and SCAN domain containing 20 (ZSCAN20), mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000361328 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:33472645:33496507:1 gene:ENSG00000121903 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000373413 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:33472651:33492636:1 gene:ENSG00000121903 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 47 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000480917 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:33472660:33489245:1 gene:ENSG00000121903 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 39 // 14 // 14 // 0 /// AK290195 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78043 complete cds. // chr1 // 97 // 89 // 31 // 32 // 0 /// BC008827 // GenBank // Homo sapiens zinc finger and SCAN domain containing 20, mRNA (cDNA clone MGC:13310 IMAGE:4110431), complete cds. // chr1 // 97 // 89 // 31 // 32 // 0 /// BC011404 // GenBank // Homo sapiens zinc finger and SCAN domain containing 20, mRNA (cDNA clone IMAGE:3872276), complete cds. // chr1 // 100 // 42 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000039569 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:33479289:33495476:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0
NM_145205 // RefSeq // Homo sapiens high mobility group box 4 (HMGB4), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NR_033264 // RefSeq // Homo sapiens high mobility group box 4 (HMGB4), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr1 // 100 // 55 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000425537 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:33864077:33864791:1 gene:ENSG00000176256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 55 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000519684 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:33860475:33864791:1 gene:ENSG00000176256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000522796 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:33860500:33864791:1 gene:ENSG00000176256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// BC021180 // GenBank // Homo sapiens high-mobility group box 4, mRNA (cDNA clone MGC:33358 IMAGE:5266418), complete cds. // chr1 // 96 // 62 // 25 // 26 // 0 /// BC070148 // GenBank // Homo sapiens high-mobility group box 4, mRNA (cDNA clone MGC:88128 IMAGE:6617009), complete cds. // chr1 // 96 // 55 // 22 // 23 // 0 /// DQ207367 // GenBank // Homo sapiens HMBG4 mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 62 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000039563 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:33864192:33864752:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 48 // 20 // 20 // 0
NM_145205 // RefSeq // Homo sapiens high mobility group box 4 (HMGB4), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_033264 // RefSeq // Homo sapiens high mobility group box 4 (HMGB4), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000425537 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:33864077:33864791:1 gene:ENSG00000176256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000519684 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:33860475:33864791:1 gene:ENSG00000176256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000522796 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:33860500:33864791:1 gene:ENSG00000176256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC021180 // GenBank // Homo sapiens high-mobility group box 4, mRNA (cDNA clone MGC:33358 IMAGE:5266418), complete cds. // chr1 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// BC070148 // GenBank // Homo sapiens high-mobility group box 4, mRNA (cDNA clone MGC:88128 IMAGE:6617009), complete cds. // chr1 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// DQ207367 // GenBank // Homo sapiens HMBG4 mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000039563 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:33864192:33864752:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
ENST00000364278 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:34112949:34113063:1 gene:ENSG00000201148 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT002302 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_001134734 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 94 (C1orf94), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000488417 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:34177670:34219131:1 gene:ENSG00000142698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC007637 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 94, mRNA (cDNA clone MGC:15882 IMAGE:3529463), complete cds. // chr1 // 95 // 67 // 19 // 20 // 0 /// BC064845 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 94, mRNA (cDNA clone MGC:75454 IMAGE:30390219), complete cds. // chr1 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// NM_032884 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 94 (C1orf94), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1 /// ENST00000373374 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:34166883:34219131:1 gene:ENSG00000142698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1 /// GENSCAN00000012099 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:34177859:34345796:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 63 // 18 // 19 // 0
NM_005268 // RefSeq // Homo sapiens gap junction protein, beta 5, 31.1kDa (GJB5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000338513 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:34755047:34758512:1 gene:ENSG00000189280 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AF052693 // GenBank // Homo sapiens connexin 31.1 (GJB5) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// BC004379 // GenBank // Homo sapiens gap junction protein, beta 5, 31.1kDa, mRNA (cDNA clone MGC:10657 IMAGE:3639452), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000012101 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:34757331:34785575:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1
NM_153212 // RefSeq // Homo sapiens gap junction protein, beta 4, 30.3kDa (GJB4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000339480 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:34759741:34763724:1 gene:ENSG00000189433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC034709 // GenBank // Homo sapiens gap junction protein, beta 4, 30.3kDa, mRNA (cDNA clone MGC:21116 IMAGE:4755173), complete cds. // chr1 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000012101 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:34757331:34785575:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
AF052692 // GenBank // Homo sapiens connexin 31 (GJB3) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// BC110640 // GenBank // Homo sapiens gap junction protein, beta 3, 31kDa, mRNA (cDNA clone MGC:102938 IMAGE:4780218), complete cds. // chr1 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// NM_001005752 // RefSeq // Homo sapiens gap junction protein, beta 3, 31kDa (GJB3), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// NM_024009 // RefSeq // Homo sapiens gap junction protein, beta 3, 31kDa (GJB3), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// ENST00000373362 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:34782278:34786369:1 gene:ENSG00000188910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// ENST00000373366 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:34781189:34786364:1 gene:ENSG00000188910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// AK026139 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ22486 fis, clone HRC10924, highly similar to AF052692 Homo sapiens connexin 31 (GJB3) mRNA. // chr1 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// BC012918 // GenBank // Homo sapiens gap junction protein, beta 3, 31kDa, mRNA (cDNA clone MGC:21115 IMAGE:4500186), complete cds. // chr1 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1
NM_002060 // RefSeq // Homo sapiens gap junction protein, alpha 4, 37kDa (GJA4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000342280 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:34792998:34795747:1 gene:ENSG00000187513 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000450137 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:34792999:34795090:1 gene:ENSG00000187513 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// AK291563 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76661 complete cds, highly similar to Homo sapiens gap junction protein, alpha 4, 37kDa (connexin 37) (GJA4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK313477 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ94024. // chr1 // 78 // 69 // 14 // 18 // 0 /// BC027889 // GenBank // Homo sapiens gap junction protein, alpha 4, 37kDa, mRNA (cDNA clone MGC:34596 IMAGE:5222521), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC072389 // GenBank // Homo sapiens gap junction protein, alpha 4, 37kDa, mRNA (cDNA clone MGC:88029 IMAGE:5722834), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// M96789 // GenBank // Homo sapiens connexin 37 (GJA4) mRNA, complete cds. // chr1 // 83 // 88 // 19 // 23 // 0 /// AF180815 // GenBank // Homo sapiens truncated connexin 37 polymorph mRNA, complete cds. // chr1 // 69 // 50 // 9 // 13 // 0 /// AF181620 // GenBank // Homo sapiens connexin 37 mRNA, complete cds. // chr1 // 69 // 50 // 9 // 13 // 0 /// GENSCAN00000012100 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:34787996:34795215:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
ENST00000364998 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:35195969:35196062:1 gene:ENSG00000201868 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 75 // 3 // 3 // 0 /// NONHSAT002349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 75 // 3 // 3 // 0
NM_005095 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, MYM-type 4 (ZMYM4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000314607 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:35268967:35421944:1 gene:ENSG00000146463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000457946 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:35361705:35422058:1 gene:ENSG00000146463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// AK309705 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99746. // chr1 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// BC127113 // GenBank // Homo sapiens zinc finger, MYM-type 4, mRNA (cDNA clone MGC:150705 IMAGE:40125110), complete cds. // chr1 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// BC127114 // GenBank // Homo sapiens zinc finger, MYM-type 4, mRNA (cDNA clone MGC:150706 IMAGE:40125115), complete cds. // chr1 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000013555 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:35350934:35419677:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 58 // 22 // 22 // 0
ENST00000364672 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:35310274:35310425:1 gene:ENSG00000201542 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT002354 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_014284 // RefSeq // Homo sapiens neurochondrin (NCDN), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000373243 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:35557808:35566773:1 gene:ENSG00000020129 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000459931 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:35557831:35560843:1 gene:ENSG00000020129 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0 /// BC024592 // GenBank // Homo sapiens neurochondrin, mRNA (cDNA clone MGC:9465 IMAGE:3914058), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NM_001014839 // RefSeq // Homo sapiens neurochondrin (NCDN), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 79 // 79 // 23 // 29 // 1 /// ENST00000356090 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:35557792:35566779:1 gene:ENSG00000020129 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 79 // 79 // 23 // 29 // 1 /// NM_001014841 // RefSeq // Homo sapiens neurochondrin (NCDN), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// ENST00000373253 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:35557473:35566772:1 gene:ENSG00000020129 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// AB018739 // GenBank // Homo sapiens mRNA for neurochondrin-1, complete cds. // chr1 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// AB018740 // GenBank // Homo sapiens mRNA for neurochondrin-2, complete cds. // chr1 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1 /// GENSCAN00000013542 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:35557166:35565663:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0
NM_178548 // RefSeq // Homo sapiens transcription factor AP-2 epsilon (activating enhancer binding protein 2 epsilon) (TFAP2E), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006710602 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens transcription factor AP-2 epsilon (activating enhancer binding protein 2 epsilon) (TFAP2E), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000373235 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:35573370:35595328:1 gene:ENSG00000116819 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AY326454 // GenBank // Homo sapiens transcription factor AP-2 epsilon mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC041175 // GenBank // Homo sapiens transcription factor AP-2 epsilon (activating enhancer binding protein 2 epsilon), mRNA (cDNA clone MGC:49007 IMAGE:5786430), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000013551 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:35583825:35594676:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 33 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000013553 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:35573602:35577384:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
NM_017629 // RefSeq // Homo sapiens argonaute RISC catalytic component 4 (AGO4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000373210 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:35808172:35857890:1 gene:ENSG00000134698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC152450 // GenBank // Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 2C, 4, mRNA (cDNA clone MGC:176703 IMAGE:8862582), complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000013548 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:35807609:35921758:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1
NM_012199 // RefSeq // Homo sapiens argonaute RISC catalytic component 1 (AGO1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000373204 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:35883209:35929610:1 gene:ENSG00000092847 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF093097 // GenBank // Homo sapiens putative RNA-binding protein Q99 mRNA, complete cds. // chr1 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// BC063275 // GenBank // Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 2C, 1, mRNA (cDNA clone MGC:71487 IMAGE:30344513), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000373206 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:35869808:35920958:1 gene:ENSG00000092847 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// GENSCAN00000013548 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:35807609:35921758:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_014466 // RefSeq // Homo sapiens tektin 2 (testicular) (TEKT2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000207457 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:36084075:36088275:1 gene:ENSG00000092850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000469024 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:36084338:36088275:1 gene:ENSG00000092850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000473120 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:36087251:36088275:1 gene:ENSG00000092850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// AB033823 // GenBank // Homo sapiens mRNA for h-TEKTIN-t, complete cds. // chr1 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// AF054910 // GenBank // Homo sapiens testicular tektin B1-like protein mRNA, complete cds. // chr1 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// BC022005 // GenBank HTC // Homo sapiens tektin 2 (testicular), mRNA (cDNA clone IMAGE:4824814), with apparent retained intron. // chr1 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// BC035620 // GenBank // Homo sapiens tektin 2 (testicular), mRNA (cDNA clone MGC:44852 IMAGE:5172213), complete cds. // chr1 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000040006 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:36084922:36088186:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_017825 // RefSeq // Homo sapiens ADP-ribosylhydrolase like 2 (ADPRHL2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000373178 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:36088875:36093932:1 gene:ENSG00000116863 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF212236 // GenBank // Homo sapiens HPHase mRNA, complete cds. // chr1 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// AK295283 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51852 complete cds, highly similar to Homo sapiens ADP-ribosylhydrolase like 2 (ADPRHL2), mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// AK316349 // GenBank // Homo sapiens cDNA, FLJ79248 complete cds, highly similar to Homo sapiens ADP-ribosylhydrolase like 2 (ADPRHL2), mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC014169 // GenBank // Homo sapiens ADP-ribosylhydrolase like 2, mRNA (cDNA clone MGC:20733 IMAGE:4552006), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// CR457237 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834C0419D for gene ADPRHL2, ADP-ribosylhydrolase like 2; complete cds, incl. stopcodon. // chr1 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000040012 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:36088905:36093386:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0
NM_005119 // RefSeq // Homo sapiens thyroid hormone receptor associated protein 3 (THRAP3), mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_005271371 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens thyroid hormone receptor associated protein 3 (THRAP3), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// XR_246308 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens thyroid hormone receptor associated protein 3 (THRAP3), transcript variant X4, misc_RNA. // chr1 // 91 // 85 // 20 // 22 // 0 /// ENST00000354618 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:36224416:36305357:1 gene:ENSG00000054118 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000469141 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:36224432:36304148:1 gene:ENSG00000054118 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AF117756 // GenBank // Homo sapiens thyroid hormone receptor-associated protein complex component TRAP150 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// BC054046 // GenBank // Homo sapiens thyroid hormone receptor associated protein 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:6147798), partial cds. // chr1 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// BC112330 // GenBank // Homo sapiens thyroid hormone receptor associated protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:133082 IMAGE:40012311), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// BC112350 // GenBank // Homo sapiens thyroid hormone receptor associated protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:133083 IMAGE:40012315), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040011 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:36212976:36321127:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// BC080652 // GenBank HTC // Homo sapiens eukaryotic translation elongation factor 1 alpha 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3677669). // chr1 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
ENST00000384598 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:37203610:37203716:1 gene:ENSG00000207328 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT002431 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_025079 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger CCCH-type containing 12A (ZC3H12A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_005271227 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens zinc finger CCCH-type containing 12A (ZC3H12A), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 57 // 20 // 20 // 0 /// XM_006710925 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens zinc finger CCCH-type containing 12A (ZC3H12A), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 40 // 14 // 14 // 0 /// XM_006710926 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens zinc finger CCCH-type containing 12A (ZC3H12A), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 60 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000373087 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:37474552:37484379:1 gene:ENSG00000163874 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AK093343 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ36024 fis, clone TESTI2016667, highly similar to Homo sapiens zinc finger CCCH-type containing 12A (ZC3H12A), mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// AY920403 // GenBank // Homo sapiens MCP-1 treatment-induced protein mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0 /// BC005001 // GenBank // Homo sapiens zinc finger CCCH-type containing 12A, mRNA (cDNA clone MGC:4427 IMAGE:2958199), complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000471012 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:37481690:37482602:1 gene:ENSG00000163874 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 23 // 23 // 8 // 35 // 1 /// GENSCAN00000046518 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:37475545:37483611:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 21 // 21 // 0
NONHSAT002464 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001142726 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 122 (C1orf122), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 67 // 12 // 12 // 0 /// NM_198446 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 122 (C1orf122), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000373042 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:37808146:37809454:1 gene:ENSG00000197982 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000373043 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:37806979:37809452:1 gene:ENSG00000197982 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000468084 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:37807747:37809449:1 gene:ENSG00000197982 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 12 // 12 // 0 /// AY517499 // GenBank // Homo sapiens hypothetical protein ALAESM mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC057819 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 122, mRNA (cDNA clone MGC:71776 IMAGE:4792982), complete cds. // chr1 // 94 // 100 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000046525 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:37808405:37809073:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 9 // 9 // 0
ENST00000410350 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:37885023:37885117:1 gene:ENSG00000222282 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 94 // 100 // 16 // 17 // 0 /// NONHSAT002487 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 94 // 100 // 16 // 17 // 0
ENST00000363926 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:38396659:38396765:1 gene:ENSG00000200796 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT002515 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
ENST00000363093 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:38926870:38926977:1 gene:ENSG00000199963 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT002535 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001136275 // RefSeq // Homo sapiens akirin 1 (AKIRIN1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NM_024595 // RefSeq // Homo sapiens akirin 1 (AKIRIN1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000372984 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:38991288:39004854:1 gene:ENSG00000174574 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000432648 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:38991223:39006059:1 gene:ENSG00000174574 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000446189 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:38991288:39004761:1 gene:ENSG00000174574 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000531822 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:38991496:39004381:1 gene:ENSG00000174574 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// AK298890 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54126 complete cds. // chr1 // 91 // 81 // 20 // 22 // 0 /// AK303098 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54208 complete cds. // chr1 // 91 // 81 // 20 // 22 // 0 /// AY326465 // GenBank // Homo sapiens putative protein STRF2 (STRF2) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// BC119745 // GenBank // Homo sapiens akirin 1, mRNA (cDNA clone MGC:149866 IMAGE:40119229), complete cds. // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// BC119746 // GenBank // Homo sapiens akirin 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:40119230), partial cds. // chr1 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0
NM_001184979 // RefSeq // Homo sapiens NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 5, 15kDa (NADH-coenzyme Q reductase) (NDUFS5), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 95 // 100 // 18 // 19 // 0 /// NM_004552 // RefSeq // Homo sapiens NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 5, 15kDa (NADH-coenzyme Q reductase) (NDUFS5), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000372967 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:39026318:39034636:1 gene:ENSG00000168653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 100 // 18 // 19 // 0 /// ENST00000372969 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:39026318:39034636:1 gene:ENSG00000168653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// AF020352 // GenBank // Homo sapiens NADH:ubiquinone oxidoreductase 15 kDa IP subunit mRNA, nuclear gene encoding mitochondrial protein, complete cds. // chr1 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// AF086268 // GenBank // Homo sapiens full length insert cDNA clone ZD43H11. // chr1 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// AK223309 // GenBank // Homo sapiens mRNA for ribosomal protein L10 variant, clone: TMS00528. // chr1 // 89 // 100 // 17 // 19 // 0 /// BC001884 // GenBank // Homo sapiens NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 5, 15kDa (NADH-coenzyme Q reductase), mRNA (cDNA clone MGC:1496 IMAGE:3544747), complete cds. // chr1 // 92 // 68 // 12 // 13 // 0 /// BC093057 // GenBank // Homo sapiens NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 5, 15kDa (NADH-coenzyme Q reductase), mRNA (cDNA clone MGC:111140 IMAGE:30382835), complete cds. // chr1 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT002539 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 92 // 63 // 11 // 12 // 0
AY527403 // GenBank // Homo sapiens 10kDa eEF1A interacting protein mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_181809 // RefSeq // Homo sapiens bone morphogenetic protein 8a (BMP8A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_022120 // RefSeq // Homo sapiens 3-oxoacid CoA transferase 2 (OXCT2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000327582 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:39769523:39771348:-1 gene:ENSG00000198754 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000447263 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:39514956:39516490:1 gene:ENSG00000237624 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr1 // 100 // 74 // 29 // 29 // 0 /// AB050193 // GenBank // Homo sapiens h-scot-t mRNA for succinyl CoA: 3-oxo acid CoA transferase, complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// BC072388 // GenBank // Homo sapiens 3-oxoacid CoA transferase 2, mRNA (cDNA clone MGC:87924 IMAGE:5588771), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// AK024440 // GenBank // Homo sapiens mRNA for FLJ00030 protein, partial cds. // chr1 // 33 // 33 // 13 // 39 // 1 /// GENSCAN00000008248 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:39760419:39771255:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 74 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000008253 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:39514956:39525798:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 26 // 26 // 0
NM_012421 // RefSeq // Homo sapiens rearranged L-myc fusion (RLF), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000372771 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:40161373:40240921:1 gene:ENSG00000117000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AB209099 // GenBank // Homo sapiens mRNA for rearranged L-myc fusion sequence variant protein. // chr1 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// BC113666 // GenBank // Homo sapiens rearranged L-myc fusion, mRNA (cDNA clone MGC:142226 IMAGE:8322718), complete cds. // chr1 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// U22377 // GenBank // Human Zn-15 related zinc finger protein (rlf) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000011577 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:40161400:40240447:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0
ENST00000384777 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:40177843:40177949:1 gene:ENSG00000207508 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT002624 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001008740 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane and coiled-coil domains 2 (TMCO2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000372766 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:40247901:40251691:1 gene:ENSG00000188800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000468258 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:40245947:40251683:1 gene:ENSG00000188800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// BC108666 // GenBank // Homo sapiens transmembrane and coiled-coil domains 2, mRNA (cDNA clone MGC:131705 IMAGE:5743890), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT002626 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
NM_005857 // RefSeq // Homo sapiens zinc metallopeptidase STE24 (ZMPSTE24), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000372759 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:40258107:40294184:1 gene:ENSG00000084073 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB016068 // GenBank // Homo sapiens mRNA for Ste24p, complete cds. // chr1 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// AF064867 // GenBank // Homo sapiens CAAX prenyl protease (STE24) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC037283 // GenBank // Homo sapiens zinc metallopeptidase (STE24 homolog, S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:33086 IMAGE:5269064), complete cds. // chr1 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000011579 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:40258272:40292669:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
NM_023070 // RefSeq // Homo sapiens ZFP69 zinc finger protein B (ZFP69B), mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000361584 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:40450665:40463716:1 gene:ENSG00000187801 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000411995 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:40450107:40463718:1 gene:ENSG00000187801 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000469416 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:40450102:40463714:1 gene:ENSG00000187801 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000484445 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:40450107:40463680:1 gene:ENSG00000187801 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// AK091612 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ34293 fis, clone FEBRA2004651, highly similar to Zinc finger protein 643. // chr1 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// BC017498 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 643, mRNA (cDNA clone MGC:20042 IMAGE:4576469), complete cds. // chr1 // 100 // 57 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000011572 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:40449856:40463589:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 52 // 12 // 12 // 0
XM_005270808 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ZFP69 zinc finger protein (ZFP69), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000372706 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:40477215:40496343:1 gene:ENSG00000187815 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC041873 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 642, mRNA (cDNA clone MGC:43732 IMAGE:5271835), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NM_198494 // RefSeq // Homo sapiens ZFP69 zinc finger protein (ZFP69), mRNA. // chr1 // 81 // 81 // 25 // 31 // 1 /// ENST00000372705 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:40477630:40496288:1 gene:ENSG00000187815 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 81 // 81 // 25 // 31 // 1 /// GENSCAN00000011578 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:40479362:40496059:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 45 // 14 // 14 // 0
ENST00000493756 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:40531722:40547785:1 gene:ENSG00000117010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// NM_152373 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 684 (ZNF684), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 1 /// ENST00000372699 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:40531561:40548169:1 gene:ENSG00000117010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 1 /// BC091518 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 684, mRNA (cDNA clone MGC:111500 IMAGE:30367496), complete cds. // chr1 // 89 // 89 // 24 // 27 // 1 /// ENST00000465152 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:40531653:40546765:1 gene:ENSG00000117010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// ENST00000472043 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:40541314:40546708:1 gene:ENSG00000117010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// NONHSAT002649 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000011562 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:40514545:40547460:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// NONHSAT002650 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NR_029846 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 30e (MIR30E), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000362104 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:40754351:40754463:1 gene:ENSG00000198974 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-30e // miRBase Micro RNA Database // MI0000749 Homo sapiens miR-30e stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT002660 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT002661 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029833 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 30c-1 (MIR30C1), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000385227 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:40757284:40757372:1 gene:ENSG00000207962 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-30c-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0000736 Homo sapiens miR-30c-1 stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT002663 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_004700 // RefSeq // Homo sapiens potassium voltage-gated channel, KQT-like subfamily, member 4 (KCNQ4), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_172163 // RefSeq // Homo sapiens potassium voltage-gated channel, KQT-like subfamily, member 4 (KCNQ4), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000347132 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:40784012:40840452:1 gene:ENSG00000117013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000443478 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:40817265:40839289:1 gene:ENSG00000117013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000506017 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:40818964:40840451:1 gene:ENSG00000117013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000509682 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:1:40784094:40838523:1 gene:ENSG00000117013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// AF105202 // GenBank // Homo sapiens voltage-gated potassium channel KCNQ4 (KCNQ4) mRNA, complete cds. // chr1 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000011569 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:40784094:40840413:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
ENST00000477493 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:40804846:40805141:1 gene:ENSG00000264582 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT002668 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_007102 // RefSeq // Homo sapiens guanylate cyclase activator 2B (uroguanylin) (GUCA2B), mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000372581 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:42153421:42155824:1 gene:ENSG00000044012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC069301 // GenBank // Homo sapiens guanylate cyclase activator 2B (uroguanylin), mRNA (cDNA clone MGC:97480 IMAGE:7262756), complete cds. // chr1 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// BC093779 // GenBank // Homo sapiens guanylate cyclase activator 2B (uroguanylin), mRNA (cDNA clone MGC:120814 IMAGE:7939624), complete cds. // chr1 // 78 // 67 // 14 // 18 // 0 /// BC093781 // GenBank // Homo sapiens guanylate cyclase activator 2B (uroguanylin), mRNA (cDNA clone MGC:120816 IMAGE:7939626), complete cds. // chr1 // 83 // 67 // 15 // 18 // 0 /// U34279 // GenBank // Human uroguanylin mRNA, complete cds. // chr1 // 91 // 85 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000022103 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:42153451:42155764:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 80 // 56 // 12 // 15 // 0
NM_173642 // RefSeq // Homo sapiens ribosomal modification protein rimK-like family member A (RIMKLA), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000410070 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:42380795:42410165:1 gene:ENSG00000177181 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000431473 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:42380806:42422578:1 gene:ENSG00000177181 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC039737 // GenBank // Homo sapiens ribosomal modification protein rimK-like family member A, mRNA (cDNA clone MGC:47816 IMAGE:6021672), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000022090 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:42334996:42414974:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
NM_024097 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 50 (C1orf50), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NR_040733 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 50 (C1orf50), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr1 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000372525 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:42767269:42775747:1 gene:ENSG00000164008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000468913 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:42769678:42775428:1 gene:ENSG00000164008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000603943 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:42767306:42789937:1 gene:ENSG00000164008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 94 // 75 // 17 // 18 // 0 /// BC001508 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 50, mRNA (cDNA clone MGC:2448 IMAGE:2959109), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// BC001711 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 50, mRNA (cDNA clone MGC:955 IMAGE:3543543), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// ENST00000464081 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:42767292:42794493:1 gene:ENSG00000164008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1 /// AK299874 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52234 complete cds. // chr1 // 94 // 75 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000022101 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:42767312:42798005:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 54 // 54 // 13 // 24 // 1
NM_001242750 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC100129924 (LOC100129924), mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000421630 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:42792833:42798153:1 gene:ENSG00000274386 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA gene:ENSG00000164008 // chr1 // 88 // 64 // 14 // 16 // 0 /// ENST00000536543 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:42787990:42798230:1 gene:ENSG00000274386 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA gene:ENSG00000164008 // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000464081 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:42767292:42794493:1 gene:ENSG00000164008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000022101 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:42767312:42798005:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
ENST00000384526 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:42991438:42991544:1 gene:ENSG00000207256 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT002773 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001167965 // RefSeq // Homo sapiens WD repeat domain 65 (WDR65), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_152498 // RefSeq // Homo sapiens WD repeat domain 65 (WDR65), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000528956 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:43172330:43210878:1 gene:ENSG00000243710 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000533339 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:43172422:43210118:1 gene:ENSG00000243710 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC117280 // GenBank // Homo sapiens WD repeat domain 65, mRNA (cDNA clone MGC:150889 IMAGE:40125831), complete cds. // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC117306 // GenBank // Homo sapiens WD repeat domain 65, mRNA (cDNA clone MGC:150915 IMAGE:40125857), complete cds. // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC143804 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:9052318, with apparent retained intron. // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NM_001195831 // RefSeq // Homo sapiens WD repeat domain 65 (WDR65), transcript variant 5, mRNA. // chr1 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// ENST00000372492 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:43172149:43254358:1 gene:ENSG00000243710 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// ENST00000610710 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:43172330:43254355:1 gene:ENSG00000243710 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// GENSCAN00000038346 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:43172754:43267821:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1
ENST00000362370 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:43196417:43196536:1 gene:ENSG00000199240 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT002788 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0
NM_144626 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 125 (TMEM125), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_005270467 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens transmembrane protein 125 (TMEM125), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000432792 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:43270025:43274002:1 gene:ENSG00000179178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000439858 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:43269994:43274002:1 gene:ENSG00000179178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC016858 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 125, mRNA (cDNA clone MGC:17299 IMAGE:3845811), complete cds. // chr1 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// BC072393 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 125, mRNA (cDNA clone IMAGE:5751449). // chr1 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// ENST00000456751 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:43270946:43272769:1 gene:ENSG00000179178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// GENSCAN00000038347 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:43272723:43273382:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0
NM_005373 // RefSeq // Homo sapiens MPL proto-oncogene, thrombopoietin receptor (MPL), mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000372470 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:43337807:43352772:1 gene:ENSG00000117400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000413998 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:43337849:43349537:1 gene:ENSG00000117400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 32 // 32 // 0 /// DQ234353 // GenBank // Homo sapiens myeloproliferative leukemia virus oncogene mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 92 // 82 // 33 // 36 // 0 /// M90102 // GenBank // Human (clones 15, 39, 41) c-myeloproliferative leukemia virus type P (c-mpl-P) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 82 // 36 // 36 // 0 /// M90103 // GenBank // Human (clones 18, 23, 27, 24) c-myeloproliferative leukemia virus type K (c-mpl-K) mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 73 // 31 // 32 // 0 /// ENST00000612993 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:43337849:43349537:1 gene:ENSG00000117400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 73 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000038345 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:43337849:43363129:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 64 // 64 // 28 // 44 // 1
NM_014663 // RefSeq // Homo sapiens lysine (K)-specific demethylase 4A (KDM4A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000372396 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:43650158:43705515:1 gene:ENSG00000066135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000463151 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:43650536:43667021:1 gene:ENSG00000066135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// AB014577 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA0677 protein, partial cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK294596 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60248 complete cds, highly similar to JmjC domain-containing histone demethylation protein 3A (EC 1.14.11.-). // chr1 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// AK300039 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60146 complete cds, highly similar to JmjC domain-containing histone demethylation protein 3A (EC 1.14.11.-). // chr1 // 92 // 43 // 12 // 13 // 0 /// BC002558 // GenBank // Homo sapiens jumonji domain containing 2A, mRNA (cDNA clone MGC:1972 IMAGE:3138875), complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000038340 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:43653176:43704370:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
ENST00000516392 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:43716467:43716556:1 gene:ENSG00000252201 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT002825 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_014652 // RefSeq // Homo sapiens importin 13 (IPO13), mRNA. // chr1 // 100 // 71 // 34 // 34 // 0 /// XM_003846624 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens importin 13 (IPO13), mRNA. // chr1 // 100 // 71 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000372339 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:43965939:43967752:1 gene:ENSG00000117408 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 25 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000372343 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:43946939:43968022:1 gene:ENSG00000117408 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000492152 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:43953217:43957549:1 gene:ENSG00000117408 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 21 // 10 // 10 // 0 /// AF267987 // GenBank // Homo sapiens Ran binding protein 13 (RANBP13) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 67 // 32 // 32 // 0 /// AK091565 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ34246 fis, clone FCBBF4000061, highly similar to Importin-13. // chr1 // 100 // 25 // 12 // 12 // 0 /// AK290173 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77274 complete cds, highly similar to Homo sapiens importin 13 (IPO13), mRNA. // chr1 // 100 // 69 // 33 // 33 // 0 /// BC002608 // GenBank // Homo sapiens importin 13, mRNA (cDNA clone IMAGE:3161848), partial cds. // chr1 // 100 // 25 // 12 // 12 // 0 /// BC008194 // GenBank // Homo sapiens importin 13, mRNA (cDNA clone MGC:5113 IMAGE:2985721), complete cds. // chr1 // 100 // 71 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000489773 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:43947570:43956844:1 gene:ENSG00000117408 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 17 // 17 // 8 // 48 // 1 /// GENSCAN00000038336 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:43947601:43967682:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 32 // 32 // 0
NM_173484 // RefSeq // Homo sapiens Kruppel-like factor 17 (KLF17), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000372299 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:44118850:44135140:1 gene:ENSG00000171872 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC035408 // GenBank // Homo sapiens Kruppel-like factor 17, mRNA (cDNA clone IMAGE:5164557). // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC049844 // GenBank // Homo sapiens Kruppel-like factor 17, mRNA (cDNA clone MGC:52016 IMAGE:5166200), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_005270464 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens Kruppel-like factor 17 (KLF17), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// ENST00000476802 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:44118870:44130716:1 gene:ENSG00000171872 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// AK308458 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ98406. // chr1 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// NONHSAT002862 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// GENSCAN00000017131 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:44118932:44130756:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
ENST00000362515 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:44390722:44390823:1 gene:ENSG00000199385 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT002874 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NR_000015 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 55 (SNORD55), small nucleolar RNA. // chr1 // 88 // 96 // 21 // 24 // 0 /// ENST00000485390 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:44775636:44778779:1 gene:ENSG00000142937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000581525 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:44775864:44775943:1 gene:ENSG00000264294 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT002897 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_000024 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 46 (SNORD46), small nucleolar RNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000364043 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:44776490:44776593:1 gene:ENSG00000200913 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT002898 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NR_001456 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 38A (SNORD38A), small nucleolar RNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000365161 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:44777843:44777912:1 gene:ENSG00000202031 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT002900 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_001457 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 38B (SNORD38B), small nucleolar RNA. // chr1 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000384690 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:44778390:44778456:1 gene:ENSG00000207421 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000484599 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:44777550:44778663:1 gene:ENSG00000142937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT002899 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT002902 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0
ENST00000517230 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:44932323:44932431:1 gene:ENSG00000253039 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT002913 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_032756 // RefSeq // Homo sapiens 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase-like (HPDL), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000334815 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:45326905:45328533:1 gene:ENSG00000186603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// AK313714 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ94307. // chr1 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// BC007293 // GenBank // Homo sapiens 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase-like, mRNA (cDNA clone MGC:15668 IMAGE:3349473), complete cds. // chr1 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_015506 // RefSeq // Homo sapiens methylmalonic aciduria (cobalamin deficiency) cblC type, with homocystinuria (MMACHC), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000401061 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:45500053:45513382:1 gene:ENSG00000132763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC006122 // GenBank // Homo sapiens methylmalonic aciduria (cobalamin deficiency) cblC type, with homocystinuria, mRNA (cDNA clone MGC:13015 IMAGE:3535453), complete cds. // chr1 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// AK098537 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ25671 fis, clone TST03755. // chr1 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// ENST00000616135 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:45500341:45511065:1 gene:ENSG00000132763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// GENSCAN00000004166 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:45490602:45509215:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_016486 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 69 (TMEM69), mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000372025 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:45687214:45694443:1 gene:ENSG00000159596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000496366 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:45688196:45693845:1 gene:ENSG00000159596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 43 // 9 // 9 // 0 /// BC013608 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 69, mRNA (cDNA clone MGC:8776 IMAGE:3864518), complete cds. // chr1 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// BC034147 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 69, mRNA (cDNA clone MGC:32767 IMAGE:4655713), complete cds. // chr1 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// BC039718 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 69, mRNA (cDNA clone MGC:47649 IMAGE:5784175), complete cds. // chr1 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// BC046130 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 69, mRNA (cDNA clone MGC:57610 IMAGE:5787422), complete cds. // chr1 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// BC064539 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 69, mRNA (cDNA clone MGC:74477 IMAGE:5725426), complete cds. // chr1 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// BC073836 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 69, mRNA (cDNA clone MGC:90165 IMAGE:5548608), complete cds. // chr1 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// BC121117 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 69, mRNA (cDNA clone MGC:150421 IMAGE:40120483), complete cds. // chr1 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// BC133692 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 69, mRNA (cDNA clone MGC:150420 IMAGE:40120480), complete cds. // chr1 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT002965 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 43 // 9 // 9 // 0
NM_001013615 // RefSeq // Homo sapiens leucine rich adaptor protein 1 (LURAP1), mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000371980 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:46203334:46221261:1 gene:ENSG00000171357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AK057892 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ25163 fis, clone CBR08185. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC034422 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 190, mRNA (cDNA clone MGC:34658 IMAGE:5163612), complete cds. // chr1 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000006524 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:46203427:46220220:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
NM_006004 // RefSeq // Homo sapiens ubiquinol-cytochrome c reductase hinge protein (UQCRH), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 55 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000311672 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:46303631:46316776:1 gene:ENSG00000173660 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 55 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000496387 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:46303709:46316776:1 gene:ENSG00000173660 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0 /// BC093060 // GenBank // Homo sapiens ubiquinol-cytochrome c reductase hinge protein, mRNA (cDNA clone MGC:111145 IMAGE:30409772), complete cds. // chr1 // 100 // 73 // 8 // 8 // 0 /// NM_001297565 // RefSeq // Homo sapiens ubiquinol-cytochrome c reductase hinge protein (UQCRH), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NM_001297566 // RefSeq // Homo sapiens ubiquinol-cytochrome c reductase hinge protein (UQCRH), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 100 // 55 // 6 // 6 // 0 /// BC000206 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3350658. // chr1 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0 /// NONHSAT003005 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0
NM_001441 // RefSeq // Homo sapiens fatty acid amide hydrolase (FAAH), mRNA. // chr1 // 98 // 98 // 40 // 41 // 0 /// ENST00000243167 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:46394265:46413845:1 gene:ENSG00000117480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000468718 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:46394329:46405789:1 gene:ENSG00000117480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 29 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000484697 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:46405723:46413848:1 gene:ENSG00000117480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 91 // 52 // 20 // 22 // 0 /// ENST00000489366 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:46406038:46409288:1 gene:ENSG00000117480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 24 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000493735 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:46394371:46409198:1 gene:ENSG00000117480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 57 // 24 // 24 // 0 /// BC093632 // GenBank // Homo sapiens fatty acid amide hydrolase, mRNA (cDNA clone MGC:120667 IMAGE:7939477), complete cds. // chr1 // 98 // 95 // 39 // 40 // 0 /// BC110404 // GenBank // Homo sapiens fatty acid amide hydrolase, mRNA (cDNA clone MGC:102823 IMAGE:5728192), complete cds. // chr1 // 98 // 98 // 40 // 41 // 0 /// BC111941 // GenBank // Homo sapiens fatty acid amide hydrolase, mRNA (cDNA clone MGC:138146 IMAGE:8327409), complete cds. // chr1 // 98 // 95 // 39 // 40 // 0 /// U82535 // GenBank // Human fatty acid amide hydrolase mRNA, complete cds. // chr1 // 95 // 98 // 39 // 41 // 0 /// GENSCAN00000006529 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:46394349:46413575:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0
NM_147192 // RefSeq // Homo sapiens diencephalon/mesencephalon homeobox 1 (DMBX1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_172225 // RefSeq // Homo sapiens diencephalon/mesencephalon homeobox 1 (DMBX1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000360032 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:46506997:46514226:1 gene:ENSG00000197587 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000371956 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:46506996:46514212:1 gene:ENSG00000197587 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF398527 // GenBank // Homo sapiens homeoprotein MBX-S mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// AF398528 // GenBank // Homo sapiens homeoprotein MBX-L mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000006531 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:46498763:46512494:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0
NM_001145474 // RefSeq // Homo sapiens testis expressed 38 (TEX38), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000334122 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:46671828:46673594:1 gene:ENSG00000186118 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000415500 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:46671859:46673476:1 gene:ENSG00000186118 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000564373 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:46671878:46673494:1 gene:ENSG00000186118 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// BC144026 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 223, mRNA (cDNA clone MGC:177563 IMAGE:9052546), complete cds. // chr1 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// BC144027 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 223, mRNA (cDNA clone MGC:177564 IMAGE:9052547), complete cds. // chr1 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// FJ211596 // GenBank // Homo sapiens testis highly expressed protein 4 (THEG4) mRNA, complete cds. // chr1 // 94 // 62 // 15 // 16 // 0 /// ENST00000564071 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:46668855:46673251:1 gene:ENSG00000186118 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000006525 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:46672998:46673456:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 91 // 42 // 10 // 11 // 0
NM_178033 // RefSeq // Homo sapiens cytochrome P450, family 4, subfamily X, polypeptide 1 (CYP4X1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000371901 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:47023568:47050751:1 gene:ENSG00000186377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK091806 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ34487 fis, clone HLUNG2004273, weakly similar to CYTOCHROME P450 4A4 (EC 1.14.14.1). // chr1 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// AK131355 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ16384 fis, clone TLIVE2007607, weakly similar to CYTOCHROME P450 4A4 (EC 1.14.14.1). // chr1 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// AY358537 // GenBank // Homo sapiens clone DNA84142 EFSW1929 (UNQ1929) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC028102 // GenBank // Homo sapiens cytochrome P450, family 4, subfamily X, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:40051 IMAGE:5243005), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000009716 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:47023818:47050174:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
NM_178134 // RefSeq // Homo sapiens cytochrome P450, family 4, subfamily Z, polypeptide 1 (CYP4Z1), mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000334194 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:47067488:47118319:1 gene:ENSG00000186160 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// AK292175 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75783 complete cds, highly similar to Homo sapiens cytochrome P450, family 4, subfamily Z, polypeptide 1 (CYP4Z1), mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// AY262056 // GenBank // Homo sapiens cytochrome P450 (CYP4Z1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// AY358631 // GenBank // Homo sapiens clone DNA125150 EPSW3060 (UNQ3060) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_012186 // RefSeq // Homo sapiens forkhead box E3 (FOXE3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000335071 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:47416072:47418052:1 gene:ENSG00000186790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF275722 // GenBank // Homo sapiens forkhead transcription factor (FOXE3) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000009724 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:47416334:47417275:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0
NM_004474 // RefSeq // Homo sapiens forkhead box D2 (FOXD2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000334793 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:47436017:47440691:1 gene:ENSG00000186564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF042832 // GenBank // Homo sapiens forkhead-related transcription factor FREAC-9 (FKHL17) mRNA, complete cds. // chr1 // 92 // 93 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009734 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:47434539:47439623:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0
AF111848 // GenBank HTC // Homo sapiens PRO0529 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
ENST00000383973 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:48344209:48344315:1 gene:ENSG00000206700 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT003129 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000411243 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:48447936:48448042:1 gene:ENSG00000223175 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 61 // 92 // 14 // 23 // 0 /// NONHSAT003136 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 61 // 92 // 14 // 23 // 0
AF119862 // GenBank HTC // Homo sapiens PRO2130 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
ENST00000423464 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:50326131:50327007:1 gene:ENSG00000234080 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000029432 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:50326348:50327025:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0
ENST00000384465 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:50582404:50582511:1 gene:ENSG00000207194 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT003170 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONHSAT003171 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 75 // 3 // 3 // 0
ENST00000363392 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:51107222:51107331:1 gene:ENSG00000200262 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT003183 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_014372 // RefSeq // Homo sapiens ring finger protein 11 (RNF11), mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000242719 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:51236271:51273455:1 gene:ENSG00000123091 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// ENST00000486691 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:51269918:51271536:1 gene:ENSG00000123091 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000494873 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:51236339:51271562:1 gene:ENSG00000123091 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// AB024703 // GenBank // Homo sapiens mRNA for Sid1669p, complete cds. // chr1 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// AF151881 // GenBank // Homo sapiens CGI-123 protein mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// AK293047 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77817 complete cds, highly similar to Homo sapiens ring finger protein 11 (RNF11), mRNA. // chr1 // 86 // 48 // 12 // 14 // 0 /// BC020964 // GenBank // Homo sapiens ring finger protein 11, mRNA (cDNA clone MGC:8915 IMAGE:3917224), complete cds. // chr1 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// BC047654 // GenBank // Homo sapiens ring finger protein 11, mRNA (cDNA clone MGC:51169 IMAGE:5261966), complete cds. // chr1 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT003189 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0
ENST00000383868 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:51382308:51382414:1 gene:ENSG00000206595 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT003196 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000578661 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:51995740:51996039:1 gene:ENSG00000264613 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONHSAT003224 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
ENST00000460504 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:52150104:52150419:1 gene:ENSG00000241745 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT003234 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
BC057844 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone MGC:71846 IMAGE:5313492, complete cds. // chr1 // 94 // 100 // 15 // 16 // 0 /// NONHSAT003245 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 56 // 9 // 9 // 0
NM_032864 // RefSeq // Homo sapiens pre-mRNA processing factor 38A (PRPF38A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000257181 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:52404564:52420839:1 gene:ENSG00000134748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC105004 // GenBank // Homo sapiens PRP38 pre-mRNA processing factor 38 (yeast) domain containing A, mRNA (cDNA clone MGC:132664 IMAGE:8144007), complete cds. // chr1 // 100 // 76 // 16 // 16 // 0 /// BC105006 // GenBank // Homo sapiens PRP38 pre-mRNA processing factor 38 (yeast) domain containing A, transcript variant 2, mRNA (cDNA clone MGC:132666 IMAGE:8144009), complete cds. // chr1 // 100 // 76 // 16 // 16 // 0 /// BC063655 // GenBank // Homo sapiens PRP38 pre-mRNA processing factor 38 (yeast) domain containing A, mRNA (cDNA clone IMAGE:5138659), complete cds. // chr1 // 76 // 76 // 16 // 21 // 1 /// ENST00000474048 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:52404628:52417022:1 gene:ENSG00000134748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 67 // 67 // 14 // 21 // 1 /// BC000777 // GenBank // Homo sapiens PRP38 pre-mRNA processing factor 38 (yeast) domain containing A, mRNA (cDNA clone IMAGE:3510134), complete cds. // chr1 // 67 // 67 // 14 // 21 // 1 /// GENSCAN00000006515 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:52404750:52416760:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 14 // 14 // 0
NM_015696 // RefSeq // Homo sapiens glutathione peroxidase 7 (GPX7), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006710586 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens glutathione peroxidase 7 (GPX7), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000361314 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:52602372:52609051:1 gene:ENSG00000116157 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF320068 // GenBank // Homo sapiens glutathione peroxidase 7 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY358402 // GenBank // Homo sapiens clone DNA57037 CL683 (UNQ469) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC032788 // GenBank // Homo sapiens glutathione peroxidase 7, mRNA (cDNA clone MGC:44859 IMAGE:5212085), complete cds. // chr1 // 87 // 82 // 20 // 23 // 0 /// XM_006710587 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens glutathione peroxidase 7 (GPX7), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// ENST00000459779 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:52602400:52607408:1 gene:ENSG00000116157 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// GENSCAN00000006511 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:52602410:52608425:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0
NM_001042693 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 159, member A (FAM159A), mRNA. // chr1 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000440303 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:52633344:52669121:1 gene:ENSG00000182183 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000517870 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:52633344:52657065:1 gene:ENSG00000182183 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// AK128236 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ46370 fis, clone TESTI4051858. // chr1 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// AY358621 // GenBank // Homo sapiens clone DNA108670 WWLS2783 (UNQ2783) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// BC041608 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 159, member A, mRNA (cDNA clone IMAGE:5484285). // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000401050 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:52633394:52669683:1 gene:ENSG00000182183 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// GENSCAN00000006510 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:52633494:52657040:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONHSAT003252 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1
ENST00000498506 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:52714399:52714695:1 gene:ENSG00000239640 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT003256 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_024646 // RefSeq // Homo sapiens zyg-11 family member B, cell cycle regulator (ZYG11B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000294353 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:52726509:52827342:1 gene:ENSG00000162378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000545132 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:52726467:52816638:1 gene:ENSG00000162378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// AK023518 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ13456 fis, clone PLACE1003258, weakly similar to EARLY EMBRYOGENESIS ZYG-11 PROTEIN. // chr1 // 100 // 41 // 15 // 15 // 0 /// AK296460 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61304 complete cds, highly similar to Homo sapiens zyg-11 homolog B-like (ZYG11BL), mRNA. // chr1 // 97 // 84 // 30 // 31 // 0 /// DQ646393 // GenBank // Homo sapiens ZYG11B (ZYG11B) mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 89 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000006516 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:52756611:52892957:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 54 // 54 // 20 // 37 // 1
NM_001004339 // RefSeq // Homo sapiens zyg-11 family member A, cell cycle regulator (ZYG11A), mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000371528 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:52842736:52894998:1 gene:ENSG00000203995 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000371532 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:52842511:52894998:1 gene:ENSG00000203995 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AY271826 // GenBank // Homo sapiens ZYG-11A early embryogenesis protein mRNA, complete cds. // chr1 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// ENST00000612017 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:52842511:52894991:1 gene:ENSG00000203995 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000006516 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:52756611:52892957:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 39 // 39 // 14 // 36 // 1
NM_000098 // RefSeq // Homo sapiens carnitine palmitoyltransferase 2 (CPT2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000371486 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:53196429:53214197:1 gene:ENSG00000157184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC002445 // GenBank // Homo sapiens carnitine palmitoyltransferase 2, mRNA (cDNA clone MGC:1771 IMAGE:3346025), complete cds. // chr1 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// BC005172 // GenBank // Homo sapiens carnitine palmitoyltransferase 2, mRNA (cDNA clone MGC:4851 IMAGE:3605012), complete cds. // chr1 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// M58581 // GenBank // Human carnitine palmitoyltransferase (CPT1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// U09648 // GenBank // Human carnitine palmitoyltransferase II precursor (CPT1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000468572 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:53196859:53202736:1 gene:ENSG00000157184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1 /// GENSCAN00000039239 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:53171494:53213595:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0
NM_033067 // RefSeq // Homo sapiens DMRT-like family B with proline-rich C-terminal, 1 (DMRTB1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000371445 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:53459399:53467488:1 gene:ENSG00000143006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AK302085 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54197 complete cds, highly similar to Homo sapiens DMRT-like family B with proline-rich C-terminal, 1 (DMRTB1), mRNA. // chr1 // 100 // 57 // 20 // 20 // 0 /// BC029566 // GenBank // Homo sapiens DMRT-like family B with proline-rich C-terminal, 1, mRNA (cDNA clone MGC:39572 IMAGE:4836894), complete cds. // chr1 // 100 // 60 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000039238 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:53459289:53466662:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0
NM_001256409 // RefSeq // Homo sapiens leucine rich repeat containing 42 (LRRC42), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NM_052940 // RefSeq // Homo sapiens leucine rich repeat containing 42 (LRRC42), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// XM_006710328 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens leucine rich repeat containing 42 (LRRC42), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 96 // 84 // 25 // 26 // 0 /// ENST00000319223 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:53946353:53968168:1 gene:ENSG00000116212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000371368 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:53946085:53958252:1 gene:ENSG00000116212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 39 // 11 // 12 // 0 /// ENST00000371370 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:53946077:53968168:1 gene:ENSG00000116212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000444987 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:53946358:53960468:1 gene:ENSG00000116212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 42 // 12 // 13 // 0 /// AK090881 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ33562 fis, clone BRAMY2009934. // chr1 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// BC013101 // GenBank // Homo sapiens leucine rich repeat containing 42, mRNA (cDNA clone MGC:8974 IMAGE:3918785), complete cds. // chr1 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000039226 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:53894211:53967939:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1
ENST00000371331 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:54054134:54096493:1 gene:ENSG00000116205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// NM_153035 // RefSeq // Homo sapiens transcription elongation factor A (SII) N-terminal and central domain containing 2 (TCEANC2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 1 /// ENST00000234827 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:54053601:54099743:1 gene:ENSG00000116205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 1 /// ENST00000498272 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:54053587:54112519:1 gene:ENSG00000116205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 83 // 83 // 24 // 29 // 1 /// AK096488 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39169 fis, clone OCBBF2002980. // chr1 // 79 // 79 // 23 // 29 // 1 /// BC035374 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 83, mRNA (cDNA clone MGC:35300 IMAGE:5176979), complete cds. // chr1 // 90 // 90 // 26 // 29 // 1 /// GENSCAN00000018640 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:54054333:54096473:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0
NR_103541 // RefSeq // Homo sapiens SSBP3 antisense RNA 1 (SSBP3-AS1), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000361350 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:54236440:54239063:1 gene:ENSG00000198711 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF176918 // GenBank HTC // Homo sapiens MSTP128 (MST128) mRNA, complete cds. // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONHSAT003368 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001110533 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 177 (C1orf177), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NM_152607 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 177 (C1orf177), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000358193 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:54806063:54842252:1 gene:ENSG00000162398 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000371273 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:54806102:54842252:1 gene:ENSG00000162398 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC039109 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 177, mRNA (cDNA clone MGC:42925 IMAGE:4837126), complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC064142 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 177, mRNA (cDNA clone MGC:75422 IMAGE:30390069), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000018634 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:54805832:54849948:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0
NM_182532 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 61 (TMEM61), mRNA. // chr1 // 79 // 100 // 23 // 29 // 0 /// XM_005270586 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens transmembrane protein 61 (TMEM61), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000371268 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:54980792:54992293:1 gene:ENSG00000143001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC029775 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 61, mRNA (cDNA clone MGC:35394 IMAGE:5186268), complete cds. // chr1 // 79 // 100 // 23 // 29 // 0 /// GENSCAN00000018633 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:54966832:54990190:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NM_057176 // RefSeq // Homo sapiens barttin CLCNK-type chloride channel accessory beta subunit (BSND), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006710883 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens Bartter syndrome, infantile, with sensorineural deafness (Barttin) (BSND), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000371265 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:54998933:55010883:1 gene:ENSG00000162399 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK129999 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ26489 fis, clone KDN05855. // chr1 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// AY034632 // GenBank // Homo sapiens barttin (BSND) mRNA, complete cds. // chr1 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// BC103898 // GenBank // Homo sapiens Bartter syndrome, infantile, with sensorineural deafness (Barttin), mRNA (cDNA clone MGC:119283 IMAGE:40005137), complete cds. // chr1 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// BC103899 // GenBank // Homo sapiens Bartter syndrome, infantile, with sensorineural deafness (Barttin), mRNA (cDNA clone MGC:119284 IMAGE:40005138), complete cds. // chr1 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// BC103900 // GenBank // Homo sapiens Bartter syndrome, infantile, with sensorineural deafness (Barttin), mRNA (cDNA clone MGC:119285 IMAGE:40005139), complete cds. // chr1 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000035746 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:54990539:55008628:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1
NM_174936 // RefSeq // Homo sapiens proprotein convertase subtilisin/kexin type 9 (PCSK9), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NR_110451 // RefSeq // Homo sapiens proprotein convertase subtilisin/kexin type 9 (PCSK9), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr1 // 96 // 63 // 23 // 24 // 0 /// ENST00000302118 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:55039548:55064852:1 gene:ENSG00000169174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000490692 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:55050934:55064850:1 gene:ENSG00000169174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 53 // 20 // 20 // 0 /// AK293870 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60453 complete cds, highly similar to Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9 precursor (EC 3.4.21.-). // chr1 // 94 // 45 // 16 // 17 // 0 /// AK297473 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57533 complete cds, highly similar to Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9 precursor (EC 3.4.21.-). // chr1 // 80 // 53 // 16 // 20 // 0 /// EF692496 // GenBank // Homo sapiens convertase subtilisin/kexin type 9 preproprotein (PCSK9) mRNA, complete cds. // chr1 // 91 // 89 // 31 // 34 // 0 /// AK124635 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ42644 fis, clone BRACE3025630. // chr1 // 47 // 47 // 18 // 38 // 1 /// GENSCAN00000035745 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:55015476:55066162:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 89 // 89 // 34 // 38 // 1
ENST00000516353 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:55398514:55398620:1 gene:ENSG00000252162 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT003414 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000422374 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:55581037:55735002:1 gene:ENSG00000234810 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AK127270 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ45337 fis, clone BRHIP3007960. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT003417 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_006252 // RefSeq // Homo sapiens protein kinase, AMP-activated, alpha 2 catalytic subunit (PRKAA2), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000371244 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:56645322:56715335:1 gene:ENSG00000162409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC069680 // GenBank // Homo sapiens protein kinase, AMP-activated, alpha 2 catalytic subunit, mRNA (cDNA clone MGC:97288 IMAGE:7262537), complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC069740 // GenBank // Homo sapiens protein kinase, AMP-activated, alpha 2 catalytic subunit, mRNA (cDNA clone MGC:97300 IMAGE:7262549), complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC069823 // GenBank // Homo sapiens protein kinase, AMP-activated, alpha 2 catalytic subunit, mRNA (cDNA clone MGC:97312 IMAGE:7262561), complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// EF056019 // GenBank // Homo sapiens AMP-activated alpha 2 subunit (PRKAA2) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// FJ200485 // GenBank // Homo sapiens AMP-activated protein kinase alpha-2 subunit variant 2 (PRKAA2) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// FJ200486 // GenBank // Homo sapiens AMP-activated protein kinase alpha-2 subunit variant 3 (PRKAA2) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// U06454 // GenBank // Human AMP-activated protein kinase (hAMPK) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000610361 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:56645388:56715334:1 gene:ENSG00000162409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000026209 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:56643515:56707713:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_000562 // RefSeq // Homo sapiens complement component 8, alpha polypeptide (C8A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000361249 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:56854806:56918221:1 gene:ENSG00000157131 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// AK309596 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99637. // chr1 // 90 // 53 // 19 // 21 // 0 /// BC132911 // GenBank // Homo sapiens complement component 8, alpha polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:164542 IMAGE:40146933), complete cds. // chr1 // 97 // 78 // 30 // 31 // 0 /// BC132913 // GenBank // Homo sapiens complement component 8, alpha polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:164544 IMAGE:40146935), complete cds. // chr1 // 97 // 78 // 30 // 31 // 0 /// M16974 // GenBank // Human complement protein C8 alpha subunit mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000026218 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:56852501:56917798:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0
NONHSAT003519 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_015888 // RefSeq // Homo sapiens hook microtubule-tethering protein 1 (HOOK1), mRNA. // chr1 // 98 // 100 // 47 // 48 // 0 /// ENST00000371208 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:59814861:59876378:1 gene:ENSG00000134709 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENST00000455990 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:59814786:59835350:1 gene:ENSG00000134709 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 25 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000465876 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:59815172:59873007:1 gene:ENSG00000134709 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 97 // 81 // 38 // 39 // 0 /// AF044923 // GenBank // Homo sapiens hook1 protein (HOOK1) mRNA, complete cds. // chr1 // 98 // 100 // 47 // 48 // 0 /// AK097735 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ40416 fis, clone TESTI2038275, highly similar to Homo sapiens hook1 protein (HOOK1) mRNA. // chr1 // 92 // 81 // 36 // 39 // 0 /// AK292314 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76934 complete cds, highly similar to Homo sapiens hook homolog 1 (Drosophila) (HOOK1), mRNA. // chr1 // 98 // 96 // 45 // 46 // 0 /// AK301768 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53232 complete cds, highly similar to Hook homolog 1. // chr1 // 100 // 88 // 42 // 42 // 0 /// BC011621 // GenBank // Homo sapiens hook homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:10642 IMAGE:3959931), complete cds. // chr1 // 98 // 100 // 47 // 48 // 0 /// ENST00000466803 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:59864639:59872978:1 gene:ENSG00000134709 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 23 // 23 // 11 // 48 // 1 /// GENSCAN00000041026 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:59776801:59872965:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0
NR_073400 // RefSeq // Homo sapiens sepiapterin reductase (7,8-dihydrobiopterin:NADP+ oxidoreductase) pseudogene (MGC34796), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000416440 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:61654194:61654908:1 gene:ENSG00000223920 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC034822 // GenBank // Homo sapiens SPR pseudogene, mRNA (cDNA clone IMAGE:5166892). // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
ENST00000363705 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:61816419:61816522:1 gene:ENSG00000200575 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONHSAT003619 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
ENST00000391058 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:61852499:61852602:1 gene:ENSG00000212360 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT003620 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000444290 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:62038842:62039111:1 gene:ENSG00000236646 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AY669118 // GenBank // Homo sapiens hepatitis B x-interacting protein (HBXIP) mRNA, complete cds. // chr1 // 81 // 100 // 17 // 21 // 0 /// NONHSAT003621 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000044630 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:61989720:62128987:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 62 // 62 // 13 // 21 // 1
ENST00000466769 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:62072448:62072741:1 gene:ENSG00000242860 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT003622 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001164835 // RefSeq // Homo sapiens LINE-1 type transposase domain containing 1 (L1TD1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 58 // 58 // 0 /// NM_019079 // RefSeq // Homo sapiens LINE-1 type transposase domain containing 1 (L1TD1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 58 // 58 // 0 /// ENST00000498273 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:62194831:62212328:1 gene:ENSG00000240563 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 58 // 58 // 0 /// AB211065 // GenBank // Homo sapiens ECAT11 mRNA for ES cell associated transcript 11, complete cds. // chr1 // 87 // 53 // 27 // 31 // 0 /// BC111559 // GenBank // Homo sapiens LINE-1 type transposase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:133253 IMAGE:40035707), complete cds. // chr1 // 87 // 53 // 27 // 31 // 0 /// ENST00000363304 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:62211557:62211666:1 gene:ENSG00000200174 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 43 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT003630 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 43 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000044636 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:62155272:62229983:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 14 // 14 // 8 // 58 // 1
NM_014495 // RefSeq // Homo sapiens angiopoietin-like 3 (ANGPTL3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000371129 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:62597487:62606159:1 gene:ENSG00000132855 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000482591 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:62601034:62602380:1 gene:ENSG00000132855 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// AF152562 // GenBank // Homo sapiens angiopoietin-related protein 3 (ANGPTL3) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// AK289426 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77880 complete cds, highly similar to Homo sapiens angiopoietin-like 3, mRNA. // chr1 // 88 // 80 // 21 // 24 // 0 /// AY358273 // GenBank // Homo sapiens clone DNA16451 NL6 (UNQ153) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// BC058287 // GenBank // Homo sapiens angiopoietin-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:61934 IMAGE:4767228), complete cds. // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000044638 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:62597567:62604817:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 63 // 18 // 19 // 0 /// NONHSAT003634 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr1 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0
NM_032852 // RefSeq // Homo sapiens autophagy related 4C, cysteine peptidase (ATG4C), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NM_178221 // RefSeq // Homo sapiens autophagy related 4C, cysteine peptidase (ATG4C), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// XM_005271288 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens autophagy related 4C, cysteine peptidase (ATG4C), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000317868 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:62784135:62865513:1 gene:ENSG00000125703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000371118 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:62785233:62819179:1 gene:ENSG00000125703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 34 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000371120 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:62784135:62865513:1 gene:ENSG00000125703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000443289 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:62784135:62819065:1 gene:ENSG00000125703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 37 // 12 // 13 // 0 /// BC033024 // GenBank // Homo sapiens ATG4 autophagy related 4 homolog C (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:32915 IMAGE:4838543), complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000044631 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:62803787:62864159:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 51 // 18 // 18 // 0 /// BC020951 // GenBank HTC // Homo sapiens Ctr9, Paf1/RNA polymerase II complex component, homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone IMAGE:3915089), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr1 // 23 // 23 // 8 // 35 // 1
NM_012183 // RefSeq // Homo sapiens forkhead box D3 (FOXD3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000371116 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:63323041:63325126:1 gene:ENSG00000187140 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010743 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:63261709:63324495:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_032437 // RefSeq // Homo sapiens EF-hand calcium binding domain 7 (EFCAB7), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006710978 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens EF-hand calcium binding domain 7 (EFCAB7), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 47 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000371088 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:63523390:63572693:1 gene:ENSG00000203965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AB058702 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1799 protein, partial cds. // chr1 // 94 // 86 // 29 // 31 // 0 /// AK292220 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75001 complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AK315850 // GenBank // Homo sapiens cDNA, FLJ79499 complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC015814 // GenBank // Homo sapiens EF-hand calcium binding domain 7, mRNA (cDNA clone MGC:9635 IMAGE:3915942), complete cds. // chr1 // 94 // 97 // 33 // 35 // 0 /// ENST00000460678 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:63548009:63571128:1 gene:ENSG00000203965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// ENST00000461039 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:63555075:63572693:1 gene:ENSG00000203965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 47 // 47 // 17 // 36 // 1 /// AL833720 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp666D225 (from clone DKFZp666D225). // chr1 // 47 // 47 // 17 // 36 // 1 /// GENSCAN00000010742 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:63525573:63731289:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 58 // 58 // 21 // 36 // 1
NR_002771 // RefSeq // Homo sapiens deleted in lymphocytic leukemia 2-like (DLEU2L), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000371086 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:63547082:63550636:1 gene:ENSG00000116652 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONHSAT003692 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
ENST00000489463 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:63655743:63656047:1 gene:ENSG00000244256 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT003695 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001083592 // RefSeq // Homo sapiens receptor tyrosine kinase-like orphan receptor 1 (ROR1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// NM_005012 // RefSeq // Homo sapiens receptor tyrosine kinase-like orphan receptor 1 (ROR1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000371079 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:63774043:64181498:1 gene:ENSG00000185483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000371080 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:63774022:64143385:1 gene:ENSG00000185483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000482426 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:63775290:64140364:1 gene:ENSG00000185483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000545203 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:64009303:64181492:1 gene:ENSG00000185483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// AK309189 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99230. // chr1 // 83 // 53 // 15 // 18 // 0 /// BC080541 // GenBank // Homo sapiens receptor tyrosine kinase-like orphan receptor 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5477978), complete cds. // chr1 // 91 // 65 // 20 // 22 // 0 /// M97675 // GenBank // Human transmembrane receptor (ror1) mRNA, complete cds. // chr1 // 88 // 94 // 28 // 32 // 0 /// GENSCAN00000026766 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:64005894:64178855:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 65 // 65 // 22 // 34 // 1
NM_152489 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin-conjugating enzyme E2U (putative) (UBE2U), mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_005270498 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ubiquitin-conjugating enzyme E2U (putative) (UBE2U), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// XM_005270499 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ubiquitin-conjugating enzyme E2U (putative) (UBE2U), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000371076 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:64203807:64244344:1 gene:ENSG00000177414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000371077 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:64203627:64260694:1 gene:ENSG00000177414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000464349 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:64215453:64244340:1 gene:ENSG00000177414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 34 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000608020 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:64214815:64267368:1 gene:ENSG00000177414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 34 // 11 // 11 // 0 /// BC029895 // GenBank // Homo sapiens ubiquitin-conjugating enzyme E2U (putative), mRNA (cDNA clone MGC:35130 IMAGE:5168406), complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000611228 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:1:64203627:64267368:1 gene:ENSG00000177414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NONHSAT003707 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 34 // 11 // 11 // 0
NM_001293274 // RefSeq // Homo sapiens cache domain containing 1 (CACHD1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NM_020925 // RefSeq // Homo sapiens cache domain containing 1 (CACHD1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000290039 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:64470792:64693058:1 gene:ENSG00000158966 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000470527 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:64563677:64693058:1 gene:ENSG00000158966 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000495994 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:64505915:64693053:1 gene:ENSG00000158966 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// AK299361 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54934 complete cds, highly similar to Homo sapiens cache domain containing 1 (CACHD1), mRNA. // chr1 // 100 // 42 // 13 // 13 // 0 /// BC039301 // GenBank // Homo sapiens cache domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:39570 IMAGE:4836806), complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// BX537603 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686L04115 (from clone DKFZp686L04115). // chr1 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000026768 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:64628574:64691561:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0
NM_018211 // RefSeq // Homo sapiens ribonucleoprotein, PTB-binding 2 (RAVER2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000294428 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:64745095:64833229:1 gene:ENSG00000162437 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000371072 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:64745095:64833232:1 gene:ENSG00000162437 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC065303 // GenBank // Homo sapiens ribonucleoprotein, PTB-binding 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:6156321), partial cds. // chr1 // 100 // 76 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000418058 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:64778066:64816509:1 gene:ENSG00000162437 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 37 // 37 // 14 // 38 // 1 /// AK001632 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ10770 fis, clone NT2RP4000159. // chr1 // 32 // 32 // 12 // 38 // 1 /// AK299228 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57423 complete cds, highly similar to Ribonucleoprotein PTB-binding 2. // chr1 // 37 // 37 // 14 // 38 // 1 /// GENSCAN00000026769 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:64745173:64830985:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0
NM_001005353 // RefSeq // Homo sapiens adenylate kinase 4 (AK4), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0 /// NM_013410 // RefSeq // Homo sapiens adenylate kinase 4 (AK4), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0 /// NM_203464 // RefSeq // Homo sapiens adenylate kinase 4 (AK4), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000327299 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:65148203:65232136:1 gene:ENSG00000162433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000395334 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:65147830:65232145:1 gene:ENSG00000162433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000470888 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:65147669:65224837:1 gene:ENSG00000162433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000545314 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:65147549:65232145:1 gene:ENSG00000162433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0 /// BC066944 // GenBank // Homo sapiens adenylate kinase 3-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:87322 IMAGE:4819382), complete cds. // chr1 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0
AB088847 // GenBank // Homo sapiens BPA-1 mRNA for brain peptide A1, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NONHSAT003741 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_152665 // RefSeq // Homo sapiens Tctex1 domain containing 1 (TCTEX1D1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000282670 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:66752460:66778787:1 gene:ENSG00000152760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000489510 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:66776155:66777820:1 gene:ENSG00000152760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000528352 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:66752495:66777701:1 gene:ENSG00000152760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// AK307100 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ97048. // chr1 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// BC106885 // GenBank // Homo sapiens Tctex1 domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:125768 IMAGE:40029630), complete cds. // chr1 // 96 // 77 // 22 // 23 // 0 /// ENST00000525663 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:66752459:66770896:1 gene:ENSG00000152760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// ENST00000491611 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:66752532:66770507:1 gene:ENSG00000152760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// GENSCAN00000044418 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:66639787:66777454:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// NONHSAT003765 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
ENST00000517265 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:67196140:67196243:1 gene:ENSG00000253074 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT003780 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000411331 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:67417214:67417318:1 gene:ENSG00000223263 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT003788 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000384773 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:67541127:67541233:1 gene:ENSG00000207504 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT003800 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_020794 // RefSeq // Homo sapiens leucine rich repeat containing 7 (LRRC7), mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000035383 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:69760175:70122243:1 gene:ENSG00000033122 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000310961 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:69568398:70123488:1 gene:ENSG00000033122 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000370958 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:69568450:69875004:1 gene:ENSG00000033122 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 27 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000415775 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:69760187:70121994:1 gene:ENSG00000033122 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 65 // 24 // 24 // 0 /// AB037786 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1365 protein, partial cds. // chr1 // 100 // 32 // 12 // 12 // 0 /// AF434715 // GenBank // Homo sapiens densin-180 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// AF498274 // GenBank // Homo sapiens densin-180 like protein mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 27 // 10 // 10 // 0 /// AK294206 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54846 complete cds, highly similar to Leucine-rich repeat-containing protein 7. // chr1 // 100 // 27 // 10 // 10 // 0 /// BC128989 // GenBank // Homo sapiens leucine rich repeat containing 7, mRNA (cDNA clone MGC:144918 IMAGE:8381584), complete cds. // chr1 // 96 // 65 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000026906 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:69994561:70127178:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 54 // 20 // 20 // 0
ENST00000494227 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:69879592:69879895:1 gene:ENSG00000240692 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT003838 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_023916 // RefSeq // Homo sapiens peptidylprolyl cis/trans isomerase, NIMA-interacting 1 pseudogene 1 (PIN1P1), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000412108 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:69919322:69920317:1 gene:ENSG00000229359 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000439639 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:69919357:69919657:1 gene:ENSG00000229359 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr1 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// U82382 // GenBank // Homo sapiens PIN1 peptidyl-prolyl cis/trans isomerase-like (PIN1L) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000045394 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:69919357:69980457:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT003839 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
ENST00000456361 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:70530526:70531492:1 gene:ENSG00000233020 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000026902 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:70530526:70530960:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONHSAT003861 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001001933 // RefSeq // Homo sapiens LIM homeobox 8 (LHX8), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NM_001256114 // RefSeq // Homo sapiens LIM homeobox 8 (LHX8), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000294638 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:75128434:75161533:1 gene:ENSG00000162624 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000356261 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:75134882:75161533:1 gene:ENSG00000162624 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// BC040321 // GenBank // Homo sapiens LIM homeobox 8, mRNA (cDNA clone MGC:43046 IMAGE:4839343), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000043474 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:75134620:75199410:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1
ENST00000384272 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:75183045:75183147:1 gene:ENSG00000206999 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT003980 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NR_003042 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 45C (SNORD45C), small nucleolar RNA. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000383893 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:75787072:75787150:1 gene:ENSG00000206620 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000471759 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:75786701:75794803:1 gene:ENSG00000137955 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT003998 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT003999 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NR_002749 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 45A (SNORD45A), small nucleolar RNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000384512 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:75787889:75787972:1 gene:ENSG00000207241 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000496055 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:75786197:75794833:1 gene:ENSG00000137955 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000497648 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:75786243:75788783:1 gene:ENSG00000137955 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK128861 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ46674 fis, clone TRACH3009148, highly similar to Geranylgeranyl transferase type II beta subunit (EC 2.5.1.-). // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT003995 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT004001 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000364617 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:75789477:75789548:1 gene:ENSG00000201487 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000461653 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:75787496:75792250:1 gene:ENSG00000137955 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000496055 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:75786197:75794833:1 gene:ENSG00000137955 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NR_002748 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 45B (SNORD45B), small nucleolar RNA. // chr1 // 47 // 100 // 8 // 17 // 0 /// NONHSAT003995 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT004002 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_002440 // RefSeq // Homo sapiens mutS homolog 4 (MSH4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000263187 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:75796882:75913238:1 gene:ENSG00000057468 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF104243 // GenBank // Homo sapiens meiosis-specific MutS homolog (MSH4) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC033030 // GenBank // Homo sapiens mutS homolog 4 (E. coli), mRNA (cDNA clone MGC:33143 IMAGE:5266997), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// U89293 // GenBank // Homo sapiens MSH4 (HMSH4) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000043479 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:75749428:75912887:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
ENST00000420977 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:76699789:76700538:1 gene:ENSG00000226415 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 91 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000046643 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:76699789:76700538:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 10 // 10 // 0
ENST00000363051 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:76753135:76753240:1 gene:ENSG00000199921 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT004015 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_012093 // RefSeq // Homo sapiens adenylate kinase 5 (AK5), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NM_174858 // RefSeq // Homo sapiens adenylate kinase 5 (AK5), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000344720 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:77282602:77559962:1 gene:ENSG00000154027 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000354567 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:77282051:77559969:1 gene:ENSG00000154027 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// AF062595 // GenBank // Homo sapiens adenylate kinase 5 (AK5) mRNA, complete cds. // chr1 // 83 // 48 // 10 // 12 // 0 /// AY171600 // GenBank // Homo sapiens adenylate kinase 6 mRNA, complete cds. // chr1 // 91 // 88 // 20 // 22 // 0 /// BC033896 // GenBank // Homo sapiens adenylate kinase 5, mRNA (cDNA clone MGC:33394 IMAGE:4818069), complete cds. // chr1 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// BC036666 // GenBank // Homo sapiens adenylate kinase 5, mRNA (cDNA clone MGC:33326 IMAGE:4816351), complete cds. // chr1 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0
ENST00000515976 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:77614869:77614952:1 gene:ENSG00000251785 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT004034 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000470869 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:77645324:77645618:1 gene:ENSG00000243437 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT004037 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0
XM_005270848 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens family with sequence similarity 73, member A (FAM73A), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000410917 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:77779904:77779999:1 gene:ENSG00000222849 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000477627 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:77779908:77801431:1 gene:ENSG00000180488 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT004047 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0
NM_017655 // RefSeq // Homo sapiens GIPC PDZ domain containing family, member 2 (GIPC2), mRNA. // chr1 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// ENST00000370759 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:78045902:78138449:1 gene:ENSG00000137960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AB073737 // GenBank // Homo sapiens mRNA for PDZ domain protein GIPC2, complete cds. // chr1 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// AK000082 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ20075 fis, clone COL02542. // chr1 // 100 // 58 // 21 // 21 // 0 /// BC036075 // GenBank // Homo sapiens GIPC PDZ domain containing family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:33726 IMAGE:5296057), complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000007240 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:78091499:78135743:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1
ENST00000411094 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:81251789:81252096:1 gene:ENSG00000223026 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT004126 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AY047582 // GenBank // Homo sapiens neural precursor cell expressed developmentally down-regulated protein 8 (NEDD8) mRNA, complete cds. // chr1 // 87 // 83 // 13 // 15 // 0 /// ENST00000441775 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:84244334:84244577:1 gene:ENSG00000226970 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 50 // 9 // 9 // 0 /// NONHSAT004193 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 50 // 9 // 9 // 0
ENST00000363089 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:84277321:84277457:1 gene:ENSG00000199959 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT004194 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0
NM_021233 // RefSeq // Homo sapiens deoxyribonuclease II beta (DNASE2B), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NM_058248 // RefSeq // Homo sapiens deoxyribonuclease II beta (DNASE2B), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000370662 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:84408230:84415008:1 gene:ENSG00000137976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000370665 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:84398532:84415018:1 gene:ENSG00000137976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// AF274571 // GenBank // Homo sapiens deoxyribonuclease II beta mRNA, complete cds. // chr1 // 89 // 85 // 25 // 28 // 0 /// AF333389 // GenBank // Homo sapiens lung-specific DLAD mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// BC126136 // GenBank // Homo sapiens deoxyribonuclease II beta, mRNA (cDNA clone MGC:161414 IMAGE:8991852), complete cds. // chr1 // 93 // 88 // 27 // 29 // 0 /// BC126138 // GenBank // Homo sapiens deoxyribonuclease II beta, mRNA (cDNA clone MGC:161416 IMAGE:8991854), complete cds. // chr1 // 93 // 88 // 27 // 29 // 0 /// GENSCAN00000004350 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:84398580:84414868:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0
NM_025065 // RefSeq // Homo sapiens ribosome production factor 1 homolog (S. cerevisiae) (RPF1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 1 /// ENST00000370654 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:84479267:84497790:1 gene:ENSG00000117133 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 1 /// AF322053 // GenBank // Homo sapiens RNA processing factor 1 (RPF1) mRNA, complete cds. // chr1 // 76 // 76 // 25 // 33 // 1 /// BC016051 // GenBank // Homo sapiens brix domain containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:22954 IMAGE:4853072), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 1 /// CR627468 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp761M0215 (from clone DKFZp761M0215). // chr1 // 88 // 88 // 29 // 33 // 1 /// GENSCAN00000004363 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:84479282:84526126:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 67 // 67 // 22 // 33 // 1
ENST00000411322 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:85264296:85264402:1 gene:ENSG00000223254 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT004240 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000363064 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:85592280:85592356:1 gene:ENSG00000199934 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT004255 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_006536 // RefSeq // Homo sapiens chloride channel accessory 2 (CLCA2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000370565 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:86424086:86456558:1 gene:ENSG00000137975 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB026833 // GenBank // Homo sapiens mRNA for chloride channel protein, complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AF043977 // GenBank // Homo sapiens calcium-activated chloride channel-2 (hCLCA2) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// AF127980 // GenBank // Homo sapiens calcium-activated chloride channel protein 3 (CaCC3) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// AK290348 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75628 complete cds, highly similar to Homo sapiens chloride channel, calcium activated, family member 2 (CLCA2), mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC041096 // GenBank // Homo sapiens chloride channel accessory 2, mRNA (cDNA clone MGC:46036 IMAGE:5752653), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000004805 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:86426940:86455527:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0
NM_001285 // RefSeq // Homo sapiens chloride channel accessory 1 (CLCA1), mRNA. // chr1 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// ENST00000234701 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:86468368:86500259:1 gene:ENSG00000016490 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000394711 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:86468843:86500289:1 gene:ENSG00000016490 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AF039400 // GenBank // Homo sapiens calcium-dependent chloride channel-1 (hCLCA1) mRNA, complete cds. // chr1 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// AF127036 // GenBank // Homo sapiens calcium-activated chloride channel protein 1 (CaCC1) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// AK291999 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78073 complete cds, highly similar to Homo sapiens calcium-dependent chloride channel-1 (hCLCA1) mRNA. // chr1 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// AK300858 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56608 complete cds, highly similar to Homo sapiens chloride channel, calcium activated, family member 1 (CLCA1), mRNA. // chr1 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000004808 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:86468972:86500045:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
NM_012128 // RefSeq // Homo sapiens chloride channel accessory 4 (CLCA4), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NR_024602 // RefSeq // Homo sapiens chloride channel accessory 4 (CLCA4), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr1 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// XM_006710453 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chloride channel accessory 4 (CLCA4), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 63 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000370563 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:86547078:86580754:1 gene:ENSG00000016602 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AF127035 // GenBank // Homo sapiens calcium-activated chloride channel protein 2 (CaCC2) mRNA, complete cds. // chr1 // 95 // 97 // 35 // 37 // 0 /// AK293766 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54980 complete cds, highly similar to Homo sapiens chloride channel, calcium activated, family member 4 (CLCA4), mRNA. // chr1 // 94 // 42 // 15 // 16 // 0 /// AY358470 // GenBank // Homo sapiens clone DNA60629 CLCA4 (UNQ562) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// BC113687 // GenBank // Homo sapiens chloride channel accessory 4, mRNA (cDNA clone MGC:142247 IMAGE:8322739), complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// BC113689 // GenBank // Homo sapiens chloride channel accessory 4, mRNA (cDNA clone MGC:142249 IMAGE:8322741), complete cds. // chr1 // 97 // 97 // 36 // 37 // 0 /// GENSCAN00000004810 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:86502811:86588675:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 74 // 74 // 28 // 38 // 1
NR_024604 // RefSeq // Homo sapiens chloride channel accessory 3, pseudogene (CLCA3P), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000284054 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:86634273:86651666:1 gene:ENSG00000153923 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000466454 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:86634276:86655376:1 gene:ENSG00000153923 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000490028 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:86634276:86654745:1 gene:ENSG00000153923 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// AF043976 // GenBank // Homo sapiens CLCA homolog (hCLCA3) mRNA, complete cds. // chr1 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// TCONS_l2_00002093-XLOC_l2_000288 // Broad TUCP // linc-SH3GLB1 chr1:+:87099955-87117349 // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// TCONS_l2_00002094-XLOC_l2_000288 // Broad TUCP // linc-SH3GLB1 chr1:+:87099958-87121058 // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000004804 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:86634294:86743235:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1
ENST00000447415 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:86784913:86785467:1 gene:ENSG00000230721 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000004807 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:86784913:86785467:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001134492 // RefSeq // Homo sapiens heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1 (HS2ST1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 60 // 21 // 21 // 0 /// NM_012262 // RefSeq // Homo sapiens heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1 (HS2ST1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000370550 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:86914674:87109998:1 gene:ENSG00000153936 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000370551 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:86914648:87098445:1 gene:ENSG00000153936 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 21 // 21 // 0 /// AB024568 // GenBank // Homo sapiens mRNA for heparan sulfate 2-sulfotransferase, complete cds. // chr1 // 96 // 74 // 25 // 26 // 0 /// BC025384 // GenBank // Homo sapiens heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:26221 IMAGE:4826825), complete cds. // chr1 // 100 // 60 // 21 // 21 // 0 /// BC025990 // GenBank // Homo sapiens heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:26219 IMAGE:4821110), complete cds. // chr1 // 100 // 60 // 21 // 21 // 0 /// BC108735 // GenBank // Homo sapiens heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:131986 IMAGE:5722244), complete cds. // chr1 // 100 // 60 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000042667 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:87059790:87104696:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 51 // 51 // 18 // 35 // 1 /// ENST00000370548 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:86993009:87169204:1 gene:ENSG00000267561 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 43 // 43 // 15 // 35 // 1 /// AK002179 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ11317 fis, clone PLACE1010261, moderately similar to SEGREGATION DISTORTER PROTEIN. // chr1 // 43 // 43 // 15 // 35 // 1
NR_026989 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 1140 (LINC01140), transcript variant 5, long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000490006 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:87129774:87169198:1 gene:ENSG00000267272 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000370548 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:86993009:87169204:1 gene:ENSG00000267561 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK002179 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ11317 fis, clone PLACE1010261, moderately similar to SEGREGATION DISTORTER PROTEIN. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONHSAT004284 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_006769 // RefSeq // Homo sapiens LIM domain only 4 (LMO4), mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000370542 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:87331668:87345408:1 gene:ENSG00000143013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000370544 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:87328468:87348923:1 gene:ENSG00000143013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000489303 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:87331781:87345015:1 gene:ENSG00000143013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 33 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000495705 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:87329099:87339632:1 gene:ENSG00000143013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// AK292578 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77516 complete cds, highly similar to Homo sapiens LIM domain only 4 (LMO4), mRNA. // chr1 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// BC003600 // GenBank // Homo sapiens LIM domain only 4, mRNA (cDNA clone MGC:872 IMAGE:3355972), complete cds. // chr1 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// BC017673 // GenBank // Homo sapiens LIM domain only 4, mRNA (cDNA clone MGC:17816 IMAGE:3893112), complete cds. // chr1 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// BC065818 // GenBank // Homo sapiens LIM domain only 4, mRNA (cDNA clone MGC:75040 IMAGE:6196307), complete cds. // chr1 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// U24576 // GenBank // Homo sapiens breast tumor autoantigen (LMO4) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000042676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:87328022:87350546:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
ENST00000384505 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:88816779:88816885:1 gene:ENSG00000207234 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AK023600 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ13538 fis, clone PLACE1006617. // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT004331 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_198460 // RefSeq // Homo sapiens guanylate binding protein family, member 6 (GBP6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000370456 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:89364058:89386461:1 gene:ENSG00000183347 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AK290303 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77935 complete cds, highly similar to Homo sapiens guanylate binding protein family, member 6 (GBP6), mRNA. // chr1 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// AK299408 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54753 complete cds, highly similar to Homo sapiens guanylate binding protein family, member 6 (GBP6), mRNA. // chr1 // 96 // 82 // 26 // 27 // 0 /// AK299466 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59401 complete cds, highly similar to Homo sapiens guanylate binding protein family, member 6 (GBP6), mRNA. // chr1 // 96 // 79 // 25 // 26 // 0 /// AK303987 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53421 complete cds, highly similar to Homo sapiens guanylate binding protein family, member 6 (GBP6), mRNA. // chr1 // 97 // 88 // 28 // 29 // 0 /// AK315834 // GenBank // Homo sapiens cDNA, FLJ79483 complete cds, highly similar to Homo sapiens guanylate binding protein family, member 6 (GBP6), mRNA. // chr1 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// BC131713 // GenBank // Homo sapiens guanylate binding protein family, member 6, mRNA (cDNA clone MGC:150574 IMAGE:40122722), complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// BX537949 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686G0786 (from clone DKFZp686G0786); complete cds. // chr1 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// GENSCAN00000010064 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:89368552:89498902:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 88 // 88 // 29 // 33 // 1
NM_001134476 // RefSeq // Homo sapiens leucine rich repeat containing 8 family, member B (LRRC8B), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// NM_015350 // RefSeq // Homo sapiens leucine rich repeat containing 8 family, member B (LRRC8B), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 70 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000330947 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:89524903:89597864:1 gene:ENSG00000197147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000439853 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:89568241:89597859:1 gene:ENSG00000197147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000449440 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:89524836:89582961:1 gene:ENSG00000197147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 57 // 13 // 13 // 0 /// AF385436 // GenBank // Homo sapiens T-cell activation leucine repeat-rich protein mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 70 // 16 // 16 // 0 /// AY358112 // GenBank // Homo sapiens clone DNA161005 ITLT6413 (UNQ6413) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 52 // 12 // 12 // 0 /// BC030607 // GenBank // Homo sapiens leucine rich repeat containing 8 family, member B, mRNA (cDNA clone MGC:26970 IMAGE:4824652), complete cds. // chr1 // 94 // 78 // 17 // 18 // 0 /// BC060782 // GenBank // Homo sapiens leucine rich repeat containing 8 family, member B, mRNA (cDNA clone MGC:71558 IMAGE:5298560), complete cds. // chr1 // 94 // 74 // 16 // 17 // 0 /// D86984 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA0231 protein, partial cds. // chr1 // 100 // 70 // 16 // 16 // 0
NM_032270 // RefSeq // Homo sapiens leucine rich repeat containing 8 family, member C (LRRC8C), mRNA. // chr1 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000370454 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:89633072:89719533:1 gene:ENSG00000171488 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000479252 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:89633072:89764518:1 gene:ENSG00000171488 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 68 // 23 // 23 // 0 /// AB081509 // GenBank // Homo sapiens mRNA for AD158, complete cds. // chr1 // 88 // 50 // 15 // 17 // 0 /// BC036122 // GenBank // Homo sapiens leucine rich repeat containing 8 family, member C, mRNA (cDNA clone IMAGE:5311838), complete cds. // chr1 // 87 // 68 // 20 // 23 // 0 /// BC113973 // GenBank // Homo sapiens leucine rich repeat containing 8 family, member C, mRNA (cDNA clone MGC:138551 IMAGE:40007964), complete cds. // chr1 // 94 // 47 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000010072 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:89686474:89714982:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 35 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT004371 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 68 // 23 // 23 // 0
ENST00000362796 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:90657750:90657964:1 gene:ENSG00000199666 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT004401 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000384090 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:91261625:91261724:1 gene:ENSG00000206817 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT004430 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000415545 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:91642516:91644082:1 gene:ENSG00000203914 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 74 // 17 // 17 // 0 /// AY956769 // GenBank // Homo sapiens heat shock protein 94c (GRP94c) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000039162 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:91635011:91643778:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_173567 // RefSeq // Homo sapiens epoxide hydrolase 4 (EPHX4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000370383 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:92029982:92063536:1 gene:ENSG00000172031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC041475 // GenBank // Homo sapiens abhydrolase domain containing 7, mRNA (cDNA clone MGC:50295 IMAGE:5244314), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000032687 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:92030080:92067544:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_183242 // RefSeq // Homo sapiens BTB (POZ) domain containing 8 (BTBD8), mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000342818 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:92080336:92147836:1 gene:ENSG00000189195 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000370382 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:92080305:92139946:1 gene:ENSG00000189195 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// AK296516 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60117 complete cds, highly similar to BTB/POZ domain-containing protein 8. // chr1 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// AY346333 // GenBank // Homo sapiens double BTB/POZ domain containing protein mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC013922 // GenBank // Homo sapiens BTB (POZ) domain containing 8, mRNA (cDNA clone MGC:24000 IMAGE:4048340), complete cds. // chr1 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000032698 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:92080572:92108005:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0
NM_015237 // RefSeq // Homo sapiens KIAA1107 (KIAA1107), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000370378 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:92167052:92184723:1 gene:ENSG00000069712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AK302496 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54894 complete cds, weakly similar to Dentin sialophosphoprotein precursor. // chr1 // 97 // 92 // 32 // 33 // 0 /// BC047628 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4797071. // chr1 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1 /// GENSCAN00000032693 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:92129724:92184330:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0
NM_001012425 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 146 (C1orf146), mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000370373 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:92218032:92245715:1 gene:ENSG00000203910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000370375 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:92217940:92245813:1 gene:ENSG00000203910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC130499 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 146, mRNA (cDNA clone MGC:163371 IMAGE:40146530), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC171742 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:9052972. // chr1 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_024813 // RefSeq // Homo sapiens RNA polymerase II associated protein 2 (RPAP2), mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// XM_006710905 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens RNA polymerase II associated protein 2 (RPAP2), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 65 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000477322 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:92333242:92387233:1 gene:ENSG00000122484 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 30 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000484158 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:92299085:92324084:1 gene:ENSG00000122484 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 35 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000610020 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:92298965:92402056:1 gene:ENSG00000122484 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// BC031070 // GenBank // Homo sapiens RNA polymerase II associated protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:33693 IMAGE:5313284), complete cds. // chr1 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// BC039014 // GenBank // Homo sapiens RNA polymerase II associated protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:47579 IMAGE:5744281), complete cds. // chr1 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000032697 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:92259132:92412295:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 54 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT004454 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 30 // 11 // 11 // 0
NM_000969 // RefSeq // Homo sapiens ribosomal protein L5 (RPL5), mRNA. // chr1 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000370321 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:92832025:92841924:1 gene:ENSG00000122406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// AK222604 // GenBank // Homo sapiens mRNA for ribosomal protein L5 variant, clone: CAS05133. // chr1 // 85 // 48 // 11 // 13 // 0 /// BC001882 // GenBank // Homo sapiens ribosomal protein L5, mRNA (cDNA clone IMAGE:3544216), complete cds. // chr1 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// BC109370 // GenBank // Homo sapiens ribosomal protein L5, mRNA (cDNA clone MGC:117339 IMAGE:5736022), complete cds. // chr1 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// BC132970 // GenBank // Homo sapiens ribosomal protein L5, mRNA (cDNA clone MGC:164601 IMAGE:40146992), complete cds. // chr1 // 85 // 48 // 11 // 13 // 0 /// BC132972 // GenBank // Homo sapiens ribosomal protein L5, mRNA (cDNA clone MGC:164603 IMAGE:40146994), complete cds. // chr1 // 85 // 48 // 11 // 13 // 0 /// U14966 // GenBank // Human ribosomal protein L5 mRNA, complete cds. // chr1 // 85 // 48 // 11 // 13 // 0 /// AK095815 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ38496 fis, clone FELIV1000137, highly similar to 60S RIBOSOMAL PROTEIN L5. // chr1 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// GENSCAN00000032692 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:92832480:92841865:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0
NR_000006 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 21 (SNORD21), small nucleolar RNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000383953 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:92837289:92837383:1 gene:ENSG00000206680 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000497519 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:92836610:92841862:1 gene:ENSG00000122406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT004469 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000384295 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:92846059:92846182:1 gene:ENSG00000207022 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT004472 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000516943 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:93010257:93010351:1 gene:ENSG00000252752 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT004478 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000410732 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:93026252:93026542:1 gene:ENSG00000222664 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT004479 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_206886 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 18 (CCDC18), mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// XM_006710612 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens coiled-coil domain containing 18 (CCDC18), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 50 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000343253 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:93179919:93278477:1 gene:ENSG00000122483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000370276 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:93180724:93278730:1 gene:ENSG00000122483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000401026 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:93180363:93278607:1 gene:ENSG00000122483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000455267 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:93205555:93246892:1 gene:ENSG00000122483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000481180 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:93180769:93216679:1 gene:ENSG00000122483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 35 // 12 // 12 // 0 /// BC056667 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 18, mRNA (cDNA clone IMAGE:4686590), partial cds. // chr1 // 89 // 26 // 8 // 9 // 0 /// GENSCAN00000008729 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:93183362:93318154:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// NONHSAT004488 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 47 // 16 // 16 // 0
NM_001938 // RefSeq // Homo sapiens down-regulator of transcription 1, TBP-binding (negative cofactor 2) (DR1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000370267 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:93345935:93361168:1 gene:ENSG00000117505 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000370272 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:93345888:93369498:1 gene:ENSG00000117505 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AK311288 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ18330. // chr1 // 100 // 38 // 11 // 11 // 0 /// BC002809 // GenBank // Homo sapiens down-regulator of transcription 1, TBP-binding (negative cofactor 2), mRNA (cDNA clone MGC:4292 IMAGE:3634908), complete cds. // chr1 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// BC035507 // GenBank // Homo sapiens down-regulator of transcription 1, TBP-binding (negative cofactor 2), mRNA (cDNA clone MGC:29766 IMAGE:4555131), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC068553 // GenBank // Homo sapiens down-regulator of transcription 1, TBP-binding (negative cofactor 2), mRNA (cDNA clone MGC:87462 IMAGE:4822070), complete cds. // chr1 // 92 // 83 // 22 // 24 // 0 /// BT006972 // GenBank // Homo sapiens down-regulator of transcription 1, TBP-binding (negative cofactor 2) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0 /// M97388 // GenBank // Human TATA binding protein-associated phosphoprotein (DR1) mRNA, complete cds. // chr1 // 58 // 66 // 11 // 19 // 0 /// GENSCAN00000008739 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:93346646:93360639:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0
ENST00000384649 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:93385711:93385817:1 gene:ENSG00000207379 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT004534 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NONHSAT004575 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000429913 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:94302038:94303022:1 gene:ENSG00000178596 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000424043 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:92114803:92115796:-1 gene:ENSG00000224678 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 50 // 100 // 6 // 12 // 0 /// GENSCAN00000001392 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:94302038:94302990:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0
NM_001199679 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 56 (TMEM56), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// NM_152487 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 56 (TMEM56), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// ENST00000370203 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:1:95117338:95197607:1 gene:ENSG00000152078 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000455656 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:95117923:95173845:1 gene:ENSG00000152078 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 87 // 63 // 13 // 15 // 0 /// BC137457 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 56, mRNA (cDNA clone MGC:169080 IMAGE:9021457), complete cds. // chr1 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// BC137458 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 56, mRNA (cDNA clone MGC:169081 IMAGE:9021458), complete cds. // chr1 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// BC139737 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 56, mRNA (cDNA clone MGC:141823 IMAGE:40053604), complete cds. // chr1 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000456991 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:95117439:95173878:1 gene:ENSG00000152078 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 75 // 75 // 18 // 24 // 1 /// NM_001199691 // RefSeq // Homo sapiens TMEM56-RWDD3 readthrough (TMEM56-RWDD3), mRNA. // chr1 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1 /// ENST00000604534 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:1:95117923:95244955:1 gene:ENSG00000271092 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1
ENST00000363930 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:96225901:96226060:1 gene:ENSG00000200800 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONHSAT004699 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
ENST00000415278 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:96446930:96448318:1 gene:ENSG00000228502 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000031023 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:96390727:96448318:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 71 // 71 // 10 // 14 // 1
ENST00000460344 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:96583209:96583527:1 gene:ENSG00000241992 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT004707 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENST00000390946 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:99978939:99979045:1 gene:ENSG00000212248 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT004771 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_033055 // RefSeq // Homo sapiens hippocampus abundant transcript 1 (HIAT1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000370152 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:100038097:100083377:1 gene:ENSG00000156875 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF427492 // GenBank // Homo sapiens putative tetracycline transporter-like protein mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC033696 // GenBank HTC // Homo sapiens hippocampus abundant transcript 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3446672), with apparent retained intron. // chr1 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000019713 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:100053792:100082209:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// BC073837 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4480603, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr1 // 83 // 43 // 10 // 12 // 0
NM_022049 // RefSeq // Homo sapiens G protein-coupled receptor 88 (GPR88), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000315033 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:100538137:100542018:1 gene:ENSG00000181656 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB042410 // GenBank // Homo sapiens strg mRNA for striatum-specific G protein-coupled receptor, complete cds. // chr1 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000019708 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:100538967:100540121:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0
NM_001144884 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 30 (zinc transporter), member 7 (SLC30A7), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// NM_133496 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 30 (zinc transporter), member 7 (SLC30A7), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// XM_005270503 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens solute carrier family 30 (zinc transporter), member 7 (SLC30A7), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000357650 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:1:100896254:100974998:1 gene:ENSG00000162695 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 68 // 26 // 27 // 0 /// ENST00000370112 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:1:100896076:100981753:1 gene:ENSG00000162695 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// AF233345 // GenBank // Homo sapiens zinc transporter-like 2 protein mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 68 // 26 // 27 // 0 /// AY094606 // GenBank // Homo sapiens zinc transporter ZnT-7 (ZNT7) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 60 // 24 // 24 // 0 /// BC064692 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 30 (zinc transporter), member 7, mRNA (cDNA clone MGC:71576 IMAGE:30330665), complete cds. // chr1 // 97 // 85 // 33 // 34 // 0 /// BX537375 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686D18111 (from clone DKFZp686D18111); complete cds. // chr1 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0 /// XR_246237 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens solute carrier family 30 (zinc transporter), member 7 (SLC30A7), transcript variant X3, misc_RNA. // chr1 // 75 // 75 // 30 // 40 // 1 /// GENSCAN00000019699 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:100895766:100926119:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 30 // 12 // 12 // 0
ENST00000516956 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:101133153:101133339:1 gene:ENSG00000252765 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT004840 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001400 // RefSeq // Homo sapiens sphingosine-1-phosphate receptor 1 (S1PR1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000305352 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:101236888:101241518:1 gene:ENSG00000170989 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK297005 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58121 complete cds, highly similar to Sphingosine 1-phosphate receptor Edg-1. // chr1 // 83 // 38 // 10 // 12 // 0 /// BC018650 // GenBank // Homo sapiens sphingosine-1-phosphate receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:22155 IMAGE:4071217), complete cds. // chr1 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// M31210 // GenBank // Human endothelial differentiation protein (edg-1) gene mRNA, complete cds. // chr1 // 86 // 69 // 19 // 22 // 0 /// GENSCAN00000018504 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:101190278:101240133:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0
ENST00000516908 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:101859851:101859957:1 gene:ENSG00000252717 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT004866 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NR_033424 // RefSeq // Homo sapiens DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily A, member 1 pseudogene 5 (DNAJA1P5), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000440278 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:101893105:101894047:1 gene:ENSG00000162699 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 93 // 58 // 14 // 15 // 0 /// AF395440 // GenBank // Homo sapiens HEJ1 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT004867 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT004869 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 93 // 58 // 14 // 15 // 0
NM_017619 // RefSeq // Homo sapiens RNA-binding region (RNP1, RRM) containing 3 (RNPC3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// ENST00000423855 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:103525971:103555239:1 gene:ENSG00000185946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// ENST00000524631 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:103525691:103553343:1 gene:ENSG00000185946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// ENST00000531883 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:103525697:103535441:1 gene:ENSG00000185946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// ENST00000533099 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:103525699:103555112:1 gene:ENSG00000185946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// AK057799 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ25070 fis, clone CBL05164. // chr1 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// AK289844 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77710 complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// AY099329 // GenBank // Homo sapiens RNA recognition protein (RNP) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// BC010697 // GenBank // Homo sapiens RNA-binding region (RNP1, RRM) containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:9935 IMAGE:3873751), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// GENSCAN00000043456 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:103502353:103551109:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// AB058742 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1839 protein, partial cds. // chr1 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0
NM_020978 // RefSeq // Homo sapiens amylase, alpha 2B (pancreatic) (AMY2B), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000361355 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:103554700:103579529:1 gene:ENSG00000240038 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000477657 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:103553815:103579530:1 gene:ENSG00000240038 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// BC011179 // GenBank // Homo sapiens amylase, alpha 2B (pancreatic), mRNA (cDNA clone MGC:17195 IMAGE:4150646), complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// NM_017619 // RefSeq // Homo sapiens RNA-binding region (RNP1, RRM) containing 3 (RNPC3), mRNA. // chr1 // 58 // 58 // 14 // 24 // 1 /// ENST00000423855 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:103525971:103555239:1 gene:ENSG00000185946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 58 // 58 // 14 // 24 // 1 /// ENST00000533099 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:103525699:103555112:1 gene:ENSG00000185946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 71 // 71 // 17 // 24 // 1 /// AK057799 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ25070 fis, clone CBL05164. // chr1 // 67 // 67 // 16 // 24 // 1 /// AY099329 // GenBank // Homo sapiens RNA recognition protein (RNP) mRNA, complete cds. // chr1 // 58 // 58 // 14 // 24 // 1 /// BC010697 // GenBank // Homo sapiens RNA-binding region (RNP1, RRM) containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:9935 IMAGE:3873751), complete cds. // chr1 // 58 // 58 // 14 // 24 // 1 /// AB058742 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1839 protein, partial cds. // chr1 // 92 // 92 // 22 // 24 // 1
NM_018137 // RefSeq // Homo sapiens protein arginine methyltransferase 6 (PRMT6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000370078 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:107056679:107059294:1 gene:ENSG00000198890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY043278 // GenBank // Homo sapiens arginine methyltransferase 6 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC002729 // GenBank // Homo sapiens protein arginine methyltransferase 6, mRNA (cDNA clone MGC:3421 IMAGE:3629812), complete cds. // chr1 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// BC063446 // GenBank // Homo sapiens protein arginine methyltransferase 6, mRNA (cDNA clone MGC:74997 IMAGE:5501091), complete cds. // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC073866 // GenBank // Homo sapiens protein arginine methyltransferase 6, mRNA (cDNA clone MGC:90294 IMAGE:5212478), complete cds. // chr1 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// AK297898 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51478 complete cds. // chr1 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000014159 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:107056716:107057843:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 56 // 13 // 14 // 0
ENST00000416095 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:107505203:107505448:1 gene:ENSG00000224550 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 42 // 8 // 8 // 0 /// NONHSAT004964 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 42 // 8 // 8 // 0
NM_001010883 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 102, member B (FAM102B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000370035 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:108560089:108639327:1 gene:ENSG00000162636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000483371 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:108624665:108639322:1 gene:ENSG00000162636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// BC127898 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 102, member B, mRNA (cDNA clone MGC:158036 IMAGE:40132918), complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC140863 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 102, member B, mRNA (cDNA clone MGC:176540 IMAGE:9021731), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC140865 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 102, member B, mRNA (cDNA clone MGC:176542 IMAGE:9021733), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC150530 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 102, member B, mRNA (cDNA clone MGC:179678 IMAGE:40132919), complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000405454 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:108560089:108644900:1 gene:ENSG00000162636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// GENSCAN00000011775 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:108447753:108628812:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NM_001144937 // RefSeq // Homo sapiens fibronectin type III domain containing 7 (FNDC7), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000370017 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:108712657:108742740:1 gene:ENSG00000143107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000445274 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:108722411:108742056:1 gene:ENSG00000143107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 76 // 25 // 26 // 0 /// BC130421 // GenBank // Homo sapiens fibronectin type III domain containing 7, mRNA (cDNA clone MGC:163293 IMAGE:40146452), complete cds. // chr1 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000011773 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:108712934:108741804:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 82 // 27 // 28 // 0
NR_034168 // RefSeq // Homo sapiens spermatogenesis associated 42 (non-protein coding) (SPATA42), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_049777 // RefSeq // Homo sapiens spermatogenesis associated 42 (non-protein coding) (SPATA42), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000369989 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:108857217:108858524:1 gene:ENSG00000203897 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000417241 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:108857244:108858340:1 gene:ENSG00000203897 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// AY312144 // GenBank // Homo sapiens spermatogenesis-related protein 7 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT005003 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT005004 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_006513 // RefSeq // Homo sapiens seryl-tRNA synthetase (SARS), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000234677 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:109213918:109238120:1 gene:ENSG00000031698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000369923 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:109213982:109238148:1 gene:ENSG00000031698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC000716 // GenBank // Homo sapiens seryl-tRNA synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:1285 IMAGE:3505218), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC009390 // GenBank // Homo sapiens seryl-tRNA synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:16732 IMAGE:4129592), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC111398 // GenBank // Homo sapiens seryl-tRNA synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:104285 IMAGE:4133889), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// D49914 // GenBank // Homo sapiens mRNA for Seryl tRNA Synthetase, complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000468588 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:109236231:109238169:1 gene:ENSG00000031698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// ENST00000477544 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:109213968:109235431:1 gene:ENSG00000031698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// AK093718 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ36399 fis, clone THYMU2009658. // chr1 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// GENSCAN00000000311 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:109213993:109237888:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
NM_001408 // RefSeq // Homo sapiens cadherin, EGF LAG seven-pass G-type receptor 2 (CELSR2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENST00000271332 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:109250019:109275750:1 gene:ENSG00000143126 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENST00000498157 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:109270824:109275607:1 gene:ENSG00000143126 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 29 // 14 // 14 // 0 /// AK127086 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ45143 fis, clone BRAWH3040900, moderately similar to Homo sapiens cadherin, EGF LAG seven-pass G-type receptor 2 (flamingo homolog, Drosophila) (CELSR2) mRNA. // chr1 // 100 // 29 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000489018 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:109269727:109274309:1 gene:ENSG00000143126 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 40 // 40 // 19 // 48 // 1 /// AK127745 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ45845 fis, clone OCBBF2004478, highly similar to Homo sapiens cadherin, EGF LAG seven-pass G-type receptor 2 (CELSR2) mRNA. // chr1 // 33 // 33 // 16 // 48 // 1 /// GENSCAN00000000318 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:109250080:109273674:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// AK091437 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ34118 fis, clone FCBBF3009428, highly similar to Homo sapiens FLAMINGO 1 mRNA. // chr1 // 88 // 33 // 14 // 16 // 0
NM_001040709 // RefSeq // Homo sapiens synaptophysin-like 2 (SYPL2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 54 // 54 // 0 /// XM_005270773 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens synaptophysin-like 2 (SYPL2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 50 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000369872 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:109466628:109482137:1 gene:ENSG00000143028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 54 // 54 // 0 /// AB158472 // GenBank // Homo sapiens Mg29 mRNA for mitsugumin 29, complete cds. // chr1 // 100 // 37 // 20 // 20 // 0 /// AK131459 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ16618 fis, clone TESTI4013894, highly similar to Mus musculus mitsugumin 29 (Mg29). // chr1 // 94 // 100 // 51 // 54 // 0 /// AK289513 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78701 complete cds. // chr1 // 96 // 44 // 23 // 24 // 0 /// AK293082 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75842 complete cds, highly similar to Synaptophysin-like protein 2. // chr1 // 97 // 54 // 28 // 29 // 0 /// AK301509 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58954 complete cds, highly similar to Synaptophysin-like protein 2. // chr1 // 100 // 19 // 10 // 10 // 0 /// AK302566 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57854 complete cds, highly similar to Synaptophysin-like protein 2. // chr1 // 96 // 48 // 25 // 26 // 0 /// AY358862 // GenBank // Homo sapiens clone DNA142979 RLSC6348 (UNQ6348) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 41 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000000300 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:109425973:109479548:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 54 // 29 // 29 // 0
XM_005270445 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ataxin 7-like 2 (ATXN7L2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000369869 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:109489551:109492804:1 gene:ENSG00000162650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000497545 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:109485546:109492727:1 gene:ENSG00000162650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AK090460 // GenBank // Homo sapiens mRNA for FLJ00381 protein. // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC036849 // GenBank // Homo sapiens ataxin 7-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:46565 IMAGE:5248803), complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// BC037582 // GenBank HTC // Homo sapiens ataxin 7-like 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:5242570), with apparent retained intron. // chr1 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// NM_153340 // RefSeq // Homo sapiens ataxin 7-like 2 (ATXN7L2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 1 /// ENST00000369870 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:109483939:109492734:1 gene:ENSG00000162650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 1 /// ENST00000463678 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:109483479:109492704:1 gene:ENSG00000162650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 1 /// ENST00000615509 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:109483939:109492796:1 gene:ENSG00000162650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000000314 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:109483954:109505545:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1
NM_006496 // RefSeq // Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein), alpha inhibiting activity polypeptide 3 (GNAI3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000369851 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:109548611:109618321:1 gene:ENSG00000065135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF493907 // GenBank // Homo sapiens guanine nucleotide binding protein alpha i3 (GNAI3) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// BC025285 // GenBank // Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein), alpha inhibiting activity polypeptide 3, mRNA (cDNA clone MGC:39207 IMAGE:5433334), complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// BT019973 // GenBank // Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein), alpha inhibiting activity polypeptide 3 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// BT019974 // GenBank // Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein), alpha inhibiting activity polypeptide 3 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// J03005 // GenBank // Human alternative guanine nucleotide-binding regulatory protein (G) alpha-inhibitory-subunit mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 75 // 23 // 24 // 0 /// J03198 // GenBank // Human stimulatory G protein (of receptor-regulated K+ channels) alpha subunit mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// J03238 // GenBank // Human GTP-binding protein mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 75 // 23 // 24 // 0 /// M27543 // GenBank // Human guanine nucleotide-binding protein (Gi) alpha subunit mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000000315 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:109548721:109592233:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0
NR_029583 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 197 (MIR197), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000369851 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:109548611:109618321:1 gene:ENSG00000065135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000384976 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:109598893:109598967:1 gene:ENSG00000207709 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-197 // miRBase Micro RNA Database // MI0000239 Homo sapiens miR-197 stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT005049 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_203412 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin-like 4B (UBL4B), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000334179 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:110112468:110113945:1 gene:ENSG00000186150 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// BC058929 // GenBank // Homo sapiens ubiquitin-like 4B, mRNA (cDNA clone MGC:65142 IMAGE:5741847), complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000044607 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:110100454:110113059:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 52 // 52 // 12 // 23 // 1
NM_001010898 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 6 (neutral amino acid transporter), member 17 (SLC6A17), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_006710643 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens solute carrier family 6 (neutral amino acid transporter), member 17 (SLC6A17), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000331565 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:110150486:110202202:1 gene:ENSG00000197106 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AK289982 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76758 complete cds, highly similar to Homo sapiens solute carrier family 6, member 17 (SLC6A17), mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// BC140908 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 6, member 17, mRNA (cDNA clone MGC:176585 IMAGE:9056720), complete cds. // chr1 // 100 // 76 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000044588 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:110166930:110198444:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0
ENST00000363666 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:110272484:110272607:1 gene:ENSG00000200536 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT005105 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_032414 // RefSeq // Homo sapiens prokineticin 1 (PROK1), mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000271331 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:110451200:110457354:1 gene:ENSG00000143125 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AF333024 // GenBank // Homo sapiens prokineticin 1 precursor (PROK1) mRNA, complete cds. // chr1 // 93 // 97 // 27 // 29 // 0 /// AY029225 // GenBank // Homo sapiens black mamba toxin-related protein mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AY358683 // GenBank // Homo sapiens clone DNA60621 EG-VEGF (UNQ600) mRNA, complete cds. // chr1 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// BC025399 // GenBank // Homo sapiens prokineticin 1, mRNA (cDNA clone MGC:27084 IMAGE:4826496), complete cds. // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000044604 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:110451217:110456351:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0
ENST00000486033 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:110853938:110854891:1 gene:ENSG00000232791 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:unitary_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000516951 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:111041834:111041925:1 gene:ENSG00000252760 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT005154 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_003928 // RefSeq // Homo sapiens chitinase, acidic pseudogene 2 (CHIAP2), non-coding RNA. // chr1 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// ENST00000369743 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:111280059:111286108:1 gene:ENSG00000203878 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000532686 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:111280060:111286043:1 gene:ENSG00000203878 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr1 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000449687 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:111283349:111286116:1 gene:ENSG00000203878 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// ENST00000456752 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:111280060:111284238:1 gene:ENSG00000203878 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// GENSCAN00000021042 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:111280060:111286042:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// TCONS_l2_00002132-XLOC_l2_000357 // Broad TUCP // linc-CHIA-1 chr1:+:111823145-111828729 // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0
ENST00000363020 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:111446798:111446908:1 gene:ENSG00000199890 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT005184 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_001688 // RefSeq // Homo sapiens ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial Fo complex, subunit B1 (ATP5F1), mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 13 // 13 // 0 /// XM_005270929 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial Fo complex, subunit B1 (ATP5F1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000369722 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:111448936:111462773:1 gene:ENSG00000116459 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// AK291077 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78635 complete cds, highly similar to Homo sapiens ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial F0 complex, subunit b, isoform 1 (ATP5F1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 90 // 67 // 9 // 10 // 0 /// BC005366 // GenBank // Homo sapiens ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial F0 complex, subunit B1, mRNA (cDNA clone MGC:12481 IMAGE:3839745), complete cds. // chr1 // 100 // 53 // 8 // 8 // 0 /// BC016350 // GenBank // Homo sapiens ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial F0 complex, subunit B1, mRNA (cDNA clone MGC:24431 IMAGE:4074170), complete cds. // chr1 // 100 // 53 // 8 // 8 // 0
NM_174896 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 162 (C1orf162), mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// XM_005270475 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 162 (C1orf162), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// XM_005270476 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 162 (C1orf162), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000343534 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:111473792:111478512:1 gene:ENSG00000143110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000369718 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:111473869:111478472:1 gene:ENSG00000143110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// BC017973 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 162, mRNA (cDNA clone MGC:24133 IMAGE:4693393), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000464591 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:111474568:111478511:1 gene:ENSG00000143110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1 /// AK123160 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ41165 fis, clone BRACE2040640. // chr1 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1 /// NONHSAT005190 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1
NM_001010935 // RefSeq // Homo sapiens RAP1A, member of RAS oncogene family (RAP1A), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// NM_001291896 // RefSeq // Homo sapiens RAP1A, member of RAS oncogene family (RAP1A), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 100 // 70 // 14 // 14 // 0 /// NM_002884 // RefSeq // Homo sapiens RAP1A, member of RAS oncogene family (RAP1A), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// XR_246288 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens RAP1A, member of RAS oncogene family (RAP1A), transcript variant X2, misc_RNA. // chr1 // 100 // 65 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000356415 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:111542218:111713113:1 gene:ENSG00000116473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 65 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000369709 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:111619783:111716691:1 gene:ENSG00000116473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000433097 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:111619777:111704405:1 gene:ENSG00000116473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 55 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000494982 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:111627469:111712696:1 gene:ENSG00000116473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 60 // 12 // 12 // 0 /// AK293044 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75985 complete cds, highly similar to Homo sapiens RAP1A, member of RAS oncogene family (RAP1A), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 45 // 9 // 9 // 0 /// BC014086 // GenBank // Homo sapiens RAP1A, member of RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:20027 IMAGE:4422971), complete cds. // chr1 // 100 // 55 // 11 // 11 // 0 /// M22995 // GenBank // Human ras-related protein (Krev-1) mRNA, complete cds. // chr1 // 62 // 65 // 8 // 13 // 0
NONHSAT005225 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000459350 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:112371004:112371107:1 gene:ENSG00000238761 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT005229 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_018704 // RefSeq // Homo sapiens CTTNBP2 N-terminal like (CTTNBP2NL), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006710770 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens CTTNBP2 N-terminal like (CTTNBP2NL), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000271277 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:112396181:112461164:1 gene:ENSG00000143079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000441739 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:112396519:112456306:1 gene:ENSG00000143079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// AK023340 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ13278 fis, clone OVARC1001051, weakly similar to EPIDERMAL GROWTH FACTOR RECEPTOR SUBSTRATE SUBSTRATE 15. // chr1 // 89 // 56 // 16 // 18 // 0 /// BC016029 // GenBank // Homo sapiens CTTNBP2 N-terminal like, mRNA (cDNA clone MGC:16974 IMAGE:3921313), complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000032272 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:112396091:112457412:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// AB037854 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1433 protein, partial cds. // chr1 // 91 // 91 // 29 // 32 // 1
NM_001291880 // RefSeq // Homo sapiens wingless-type MMTV integration site family, member 2B (WNT2B), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 88 // 73 // 21 // 24 // 0 /// NM_024494 // RefSeq // Homo sapiens wingless-type MMTV integration site family, member 2B (WNT2B), transcript variant WNT-2B2, mRNA. // chr1 // 88 // 73 // 21 // 24 // 0 /// ENST00000256640 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:112466541:112521283:1 gene:ENSG00000134245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 88 // 73 // 21 // 24 // 0 /// ENST00000369684 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:112508778:112522666:1 gene:ENSG00000134245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// AB045117 // GenBank // Homo sapiens mRNA for WNT-2B Isoform 2, complete cds. // chr1 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// AK307185 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ97133. // chr1 // 100 // 30 // 10 // 10 // 0 /// BC141825 // GenBank // Homo sapiens wingless-type MMTV integration site family, member 2B, mRNA (cDNA clone MGC:164954 IMAGE:40148248), complete cds. // chr1 // 88 // 73 // 21 // 24 // 0 /// NM_004185 // RefSeq // Homo sapiens wingless-type MMTV integration site family, member 2B (WNT2B), transcript variant WNT-2B1, mRNA. // chr1 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// ENST00000369686 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:112467434:112530165:1 gene:ENSG00000134245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// AB045116 // GenBank // Homo sapiens mRNA for WNT-2B Isoform 1, complete cds. // chr1 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// GENSCAN00000032267 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:112509263:112520509:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// Z71621 // GenBank // H.sapiens Wnt-13 mRNA. // chr1 // 71 // 73 // 17 // 24 // 0
NONHSAT005269 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001004440 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 19 (chemokine (C-C motif)-like), member A3 (FAM19A3), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NM_182759 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 19 (chemokine (C-C motif)-like), member A3 (FAM19A3), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000361886 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:112720577:112727235:1 gene:ENSG00000184599 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000369630 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:112720419:112727235:1 gene:ENSG00000184599 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY325116 // GenBank // Homo sapiens TAFA3 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// AY325119 // GenBank // Homo sapiens TAFA3.2 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC112268 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 19 (chemokine (C-C motif)-like), member A3, transcript variant 2, mRNA (cDNA clone MGC:138473 IMAGE:8327736), complete cds. // chr1 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// BC117479 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 19 (chemokine (C-C motif)-like), member A3, mRNA (cDNA clone MGC:151088 IMAGE:40126030), complete cds. // chr1 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// BC144043 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 19 (chemokine (C-C motif)-like), member A3, mRNA (cDNA clone MGC:177580 IMAGE:9052563), complete cds. // chr1 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000032265 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:112722104:112912336:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NR_002796 // RefSeq // Homo sapiens aldo-keto reductase family 7, member A2 pseudogene 1 (AKR7A2P1), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000460134 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:112923423:112924337:1 gene:ENSG00000229020 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000032270 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:112921921:112924344:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 70 // 16 // 16 // 0
NM_014813 // RefSeq // Homo sapiens leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains 2 (LRIG2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000361127 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:113073209:113132260:1 gene:ENSG00000198799 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000466161 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:113103201:113124997:1 gene:ENSG00000198799 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// AK123606 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ41612 fis, clone CTONG3002370, highly similar to Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2 precursor. // chr1 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// AK291031 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76499 complete cds, highly similar to Homo sapiens leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains 2 (LRIG2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC117368 // GenBank // Homo sapiens leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains 2, mRNA (cDNA clone MGC:150977 IMAGE:40125919), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC117370 // GenBank // Homo sapiens leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains 2, mRNA (cDNA clone MGC:150979 IMAGE:40125921), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000492207 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:113100397:113127200:1 gene:ENSG00000198799 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// GENSCAN00000049539 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:113073407:113124360:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_022836 // RefSeq // Homo sapiens DNA cross-link repair 1B (DCLRE1B), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000369563 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:113905141:113914086:1 gene:ENSG00000118655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC029687 // GenBank // Homo sapiens DNA cross-link repair 1B (PSO2 homolog, S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:29835 IMAGE:5001181), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000466480 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:113905409:113914086:1 gene:ENSG00000118655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1 /// GENSCAN00000049543 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:113907074:113912191:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0
ENST00000364244 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:114490724:114490832:1 gene:ENSG00000201114 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT005363 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000365030 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:114727720:114727824:1 gene:ENSG00000201900 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT005369 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_000549 // RefSeq // Homo sapiens thyroid stimulating hormone, beta (TSHB), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NM_001277991 // RefSeq // Homo sapiens thyroid stimulating hormone, beta (TSHB), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000256592 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:115029824:115034309:1 gene:ENSG00000134200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000369517 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:115033363:115034284:1 gene:ENSG00000134200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// BC069298 // GenBank // Homo sapiens thyroid stimulating hormone, beta, mRNA (cDNA clone MGC:97444 IMAGE:7262720), complete cds. // chr1 // 80 // 71 // 16 // 20 // 0
ENST00000463843 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:115606471:115606768:1 gene:ENSG00000239984 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT005394 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_018420 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 22, member 15 (SLC22A15), mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// XR_426622 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens solute carrier family 22, member 15 (SLC22A15), transcript variant X9, misc_RNA. // chr1 // 94 // 47 // 16 // 17 // 0 /// ENST00000369502 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:115976614:116031890:1 gene:ENSG00000163393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 42 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000369503 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:115976498:116070054:1 gene:ENSG00000163393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// AY358258 // GenBank // Homo sapiens clone DNA175711 trans-like protein (UNQ9429) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 42 // 15 // 15 // 0 /// BC026358 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 22, member 15, mRNA (cDNA clone MGC:26945 IMAGE:4814675), complete cds. // chr1 // 88 // 89 // 28 // 32 // 0 /// AY145501 // GenBank // Homo sapiens putative transmembrane transporter FLIPT 1 mRNA, complete cds. // chr1 // 81 // 81 // 29 // 36 // 1 /// XM_005271004 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens solute carrier family 22, member 15 (SLC22A15), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 47 // 47 // 17 // 36 // 1 /// XR_426621 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens solute carrier family 22, member 15 (SLC22A15), transcript variant X8, misc_RNA. // chr1 // 44 // 44 // 16 // 36 // 1 /// GENSCAN00000004565 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:115992031:116067108:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 72 // 72 // 26 // 36 // 1
NM_152367 // RefSeq // Homo sapiens mab-21-like 3 (C. elegans) (MAB21L3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000369500 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:116111755:116135240:1 gene:ENSG00000173212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC128148 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 161, mRNA (cDNA clone MGC:149233 IMAGE:40112561), complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC128149 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 161, mRNA (cDNA clone MGC:149234 IMAGE:40112562), complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000004563 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:116104142:116133365:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0
ENST00000408113 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:116278606:116278821:1 gene:ENSG00000221040 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT005416 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001013643 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 137 (C1orf137), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000369482 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:116694112:116706603:1 gene:ENSG00000203864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001767 // RefSeq // Homo sapiens CD2 molecule (CD2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000369478 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:116754385:116769228:1 gene:ENSG00000116824 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AK223393 // GenBank // Homo sapiens mRNA for CD2 antigen (p50), sheep red blood cell receptor variant, clone: FCC107D05. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC033583 // GenBank // Homo sapiens CD2 molecule, mRNA (cDNA clone MGC:34621 IMAGE:5227138), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// M14362 // GenBank // Human T-cell surface antigen CD2 (T11) mRNA, complete cds. // chr1 // 91 // 100 // 31 // 34 // 0 /// M16336 // GenBank // Human T-cell surface antigen CD2 (T11) mRNA, complete cds, clone PB1. // chr1 // 91 // 100 // 31 // 34 // 0 /// M16445 // GenBank // Human surface antigen CD2 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AK301154 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59767 complete cds, highly similar to T-cell surface antigen CD2 precursor. // chr1 // 38 // 38 // 13 // 34 // 1 /// AK303367 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51428 complete cds, highly similar to T-cell surface antigen CD2 precursor. // chr1 // 32 // 32 // 11 // 34 // 1 /// AK310676 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17718. // chr1 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1 /// GENSCAN00000004573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:116754493:116764683:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 38 // 13 // 13 // 0
NM_020440 // RefSeq // Homo sapiens prostaglandin F2 receptor inhibitor (PTGFRN), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000393203 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:116910057:116990358:1 gene:ENSG00000134247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC152454 // GenBank // Homo sapiens prostaglandin F2 receptor negative regulator, mRNA (cDNA clone MGC:176708 IMAGE:8862587), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000004564 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:116910204:116974323:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 54 // 19 // 19 // 0
NM_001256106 // RefSeq // Homo sapiens CD101 molecule (CD101), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001256109 // RefSeq // Homo sapiens CD101 molecule (CD101), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001256111 // RefSeq // Homo sapiens CD101 molecule (CD101), transcript variant 4, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_004258 // RefSeq // Homo sapiens CD101 molecule (CD101), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000256652 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:117001750:117034250:1 gene:ENSG00000134256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000369470 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:117001812:117036417:1 gene:ENSG00000134256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK298237 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53583 complete cds, highly similar to Homo sapiens immunoglobulin superfamily, member 2 (IGSF2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC130327 // GenBank // Homo sapiens immunoglobulin superfamily, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:163199 IMAGE:40146358), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC136484 // GenBank // Homo sapiens immunoglobulin superfamily, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:168096 IMAGE:9020473), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC171768 // GenBank // Homo sapiens immunoglobulin superfamily, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:198483 IMAGE:9054422), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000047207 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:116984685:117034101:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
NM_003594 // RefSeq // Homo sapiens transcription termination factor, RNA polymerase II (TTF2), mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000369466 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:117060303:117107453:1 gene:ENSG00000116830 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// AF073771 // GenBank // Homo sapiens RNA polymerase II termination factor mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// AF080255 // GenBank // Homo sapiens lodestar protein mRNA, complete cds. // chr1 // 84 // 94 // 26 // 31 // 0 /// AK291017 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75070 complete cds, highly similar to Homo sapiens transcription termination factor, RNA polymerase II(TTF2), mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// BC030058 // GenBank // Homo sapiens transcription termination factor, RNA polymerase II, mRNA (cDNA clone MGC:39244 IMAGE:5457833), complete cds. // chr1 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// AB209845 // GenBank // Homo sapiens mRNA for transcription termination factor, RNA polymerase II variant protein. // chr1 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1 /// GENSCAN00000047205 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:117048714:117101524:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0
NM_006699 // RefSeq // Homo sapiens mannosidase, alpha, class 1A, member 2 (MAN1A2), mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000356554 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:117367449:117528872:1 gene:ENSG00000198162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000449370 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:117420597:117515939:1 gene:ENSG00000198162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0 /// AF027156 // GenBank // Homo sapiens alpha 1,2-mannosidase IB mRNA, complete cds. // chr1 // 94 // 59 // 16 // 17 // 0 /// AK001970 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ11108 fis, clone PLACE1005804, highly similar to Mannosyl-oligosaccharide1,2-alpha-mannosidase IB (EC 3.2.1.113). // chr1 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0 /// BC052954 // GenBank // Homo sapiens mannosidase, alpha, class 1A, member 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:5264139), partial cds. // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC063300 // GenBank // Homo sapiens mannosidase, alpha, class 1A, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:71683 IMAGE:5263292), complete cds. // chr1 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000047200 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:117345709:117541364:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1 /// AK023308 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ13246 fis, clone OVARC1000682, highly similar to PROCESSING ALPHA-1,2-MANNOSIDASE (EC 3.2.1.-). // chr1 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1
NM_017709 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 46, member C (FAM46C), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000369448 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:117605934:117628372:1 gene:ENSG00000183508 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC036516 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 46, member C, mRNA (cDNA clone MGC:33007 IMAGE:5267660), complete cds. // chr1 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// BC131726 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 46, member C, mRNA (cDNA clone MGC:150652 IMAGE:40123993), complete cds. // chr1 // 95 // 78 // 20 // 21 // 0
NM_006784 // RefSeq // Homo sapiens WD repeat domain 3 (WDR3), mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000349139 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:117929768:117966542:1 gene:ENSG00000065183 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000369441 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:117929720:117941788:1 gene:ENSG00000065183 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 32 // 12 // 12 // 0 /// AF083217 // GenBank // Homo sapiens WD repeat protein WDR3 (WDR3) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// AK292438 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77605 complete cds, highly similar to Homo sapiens WD repeat domain 3 (WDR3), mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// BC058836 // GenBank // Homo sapiens WD repeat domain 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:6745281), complete cds. // chr1 // 100 // 32 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000047204 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:117933320:117959447:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 27 // 27 // 0
NONHSAT005543 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
CR627415 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686G19280 (from clone DKFZp686G19280). // chr1 // 71 // 78 // 5 // 7 // 0
ENST00000286193 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:119467221:119473803:1 gene:ENSG00000187481 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000032640 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:119462332:119514645:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 63 // 100 // 19 // 30 // 0
NR_033781 // RefSeq // Homo sapiens hydroxy-delta-5-steroid dehydrogenase, 3 beta, pseudogene 4 (HSD3BP4), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000511509 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:119564066:119572067:1 gene:ENSG00000203855 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000032623 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:119559604:119572067:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
ENST00000475753 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:119853316:119853748:1 gene:ENSG00000227205 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000032625 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:119849934:119853698:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
ENST00000364919 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:146288596:146288696:1 gene:ENSG00000201789 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000384420 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:120126974:120127074:1 gene:ENSG00000207149 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000516706 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:148739379:148739479:1 gene:ENSG00000252515 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT005588 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT005876 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AF172850 // GenBank // Homo sapiens melanoma antigen mRNA, complete cds. // chr1 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// ENST00000436585 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:13:18809830:18810048:1 gene:ENSG00000225016 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 56 // 100 // 14 // 25 // 0 /// ENST00000618686 // ENSEMBL // ensembl:known scaffold:GRCh38:GL000009.2:56140:58376:-1 gene:ENSG00000278704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 52 // 100 // 13 // 25 // 0 /// NONHSAT032213 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 56 // 100 // 14 // 25 // 0
NR_104081 // RefSeq // Homo sapiens RNA, variant U1 small nuclear 3 (RNVU1-3), small nuclear RNA. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000364313 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:148402715:148402875:1 gene:ENSG00000201183 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT005746 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT006110 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
ENST00000364829 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:149162783:149162944:-1 gene:ENSG00000201699 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 64 // 100 // 16 // 25 // 0 /// ENST00000614085 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:120354987:120355148:1 gene:ENSG00000273727 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// NONHSAT005812 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT005813 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000618578 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:144523860:144524021:-1 gene:ENSG00000275291 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// ENST00000620022 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:146409903:146410062:1 gene:ENSG00000274428 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 60 // 100 // 15 // 25 // 0 /// ENST00000621107 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR1_4_CTG31:144523860:144524021:-1 gene:ENSG00000273990 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// NONHSAT068478 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 60 // 100 // 15 // 25 // 0
ENST00000618978 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:120571120:120571264:1 gene:ENSG00000273694 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 70 // 100 // 7 // 10 // 0
NR_104085 // RefSeq // Homo sapiens RNA, variant U1 small nuclear 6 (RNVU1-6), small nuclear RNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000364688 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:146052081:146052244:-1 gene:ENSG00000201558 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT005895 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001039888 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat domain 34A (ANKRD34A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000606888 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:145959442:145964582:-1 gene:ENSG00000272031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000619813 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:145961404:145962596:-1 gene:ENSG00000272031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000619519 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:145961449:145962955:-1 gene:ENSG00000272031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// GENSCAN00000015863 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:145960269:145964824:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1
NM_153713 // RefSeq // Homo sapiens Lix1 homolog (mouse)-like (LIX1L), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000604000 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:145933423:145958001:-1 gene:ENSG00000271601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC035727 // GenBank // Homo sapiens Lix1 homolog (mouse)-like, mRNA (cDNA clone MGC:46719 IMAGE:5723677), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// CR627381 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp762F237 (from clone DKFZp762F237). // chr1 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000015856 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:145936310:145957927:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_005105 // RefSeq // Homo sapiens RNA binding motif protein 8A (RBM8A), mRNA. // chr1 // 100 // 55 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000583313 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:145921556:145927495:-1 gene:ENSG00000265241 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 55 // 6 // 6 // 0
NM_144698 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat domain 35 (ANKRD35), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000355594 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:145866560:145885845:-1 gene:ENSG00000198483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK296861 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57392 complete cds, highly similar to Ankyrin repeat domain-containing protein 35. // chr1 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// BC101618 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat domain 35, mRNA (cDNA clone MGC:126667 IMAGE:8069124), complete cds. // chr1 // 93 // 90 // 25 // 27 // 0 /// BC101620 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat domain 35, mRNA (cDNA clone MGC:126669 IMAGE:8069126), complete cds. // chr1 // 93 // 90 // 25 // 27 // 0 /// NM_001280799 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat domain 35 (ANKRD35), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 83 // 83 // 25 // 30 // 1 /// ENST00000544626 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:145866560:145885866:-1 gene:ENSG00000198483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 83 // 83 // 25 // 30 // 1 /// AK294308 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58791 complete cds, highly similar to Ankyrin repeat domain-containing protein 35. // chr1 // 83 // 83 // 25 // 30 // 1 /// GENSCAN00000015854 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:145849446:145910096:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0
NM_014455 // RefSeq // Homo sapiens ring finger protein 115 (RNF115), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_005272952 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ring finger protein 115 (RNF115), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000582693 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:145738868:145824077:-1 gene:ENSG00000265491 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AF542552 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 364 (ZNF364) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// AK290749 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75672 complete cds, highly similar to Homo sapiens zinc finger protein 364 (ZNF364), mRNA. // chr1 // 95 // 92 // 21 // 22 // 0 /// AL079314 // GenBank // Homo sapiens mRNA full length insert cDNA clone EUROIMAGE 469780. // chr1 // 94 // 67 // 15 // 16 // 0 /// BC054049 // GenBank // Homo sapiens ring finger protein 115, mRNA (cDNA clone MGC:65162 IMAGE:6157275), complete cds. // chr1 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// BC064903 // GenBank // Homo sapiens ring finger protein 115, mRNA (cDNA clone MGC:70861 IMAGE:6020168), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000539368 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:145746389:145773843:-1 gene:ENSG00000265491 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron gene:ENSG00000121848 // chr1 // 67 // 67 // 16 // 24 // 1 /// GENSCAN00000015879 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:145746866:145796207:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0
ENST00000459463 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:148193716:148193838:1 gene:ENSG00000238765 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONHSAT005975 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONHSAT006074 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000622298 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:146539541:146539663:-1 gene:ENSG00000274408 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 56 // 100 // 15 // 27 // 0 /// NONHSAT068477 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 59 // 100 // 16 // 27 // 0
ENST00000364272 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:147079746:147079870:1 gene:ENSG00000201142 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONHSAT005994 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_004326 // RefSeq // Homo sapiens B-cell CLL/lymphoma 9 (BCL9), mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// XM_005272971 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens B-cell CLL/lymphoma 9 (BCL9), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000234739 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:147541412:147626216:1 gene:ENSG00000116128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000473292 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:147611613:147615902:1 gene:ENSG00000116128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 35 // 13 // 13 // 0 /// BC116451 // GenBank // Homo sapiens B-cell CLL/lymphoma 9, mRNA (cDNA clone MGC:131591 IMAGE:7961941), complete cds. // chr1 // 100 // 68 // 25 // 25 // 0 /// Y13620 // GenBank // Homo sapiens mRNA for B-cell CLL/lymphoma 9 (BCL9 gene). // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000622552 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:147541412:147626211:1 gene:ENSG00000116128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000036940 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:147598936:147624959:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 25 // 25 // 0 /// AK298105 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60744 complete cds, moderately similar to B-cell lymphoma 9 protein. // chr1 // 57 // 57 // 21 // 37 // 1
ENST00000613441 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:147689256:147689537:1 gene:ENSG00000277762 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT006039 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENST00000458399 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:147840962:147842359:1 gene:ENSG00000223728 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000036938 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:147840962:147842431:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 59 // 13 // 13 // 0
NM_005267 // RefSeq // Homo sapiens gap junction protein, alpha 8, 50kDa (GJA8), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000369235 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:147907956:147909257:1 gene:ENSG00000121634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000036933 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:147907956:147909257:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0
ENST00000363009 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:148263476:148263632:1 gene:ENSG00000199879 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// NONHSAT006082 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AB042555 // GenBank // Homo sapiens mRNA, similar to rat myomegalin, complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
JQ988807 // GenBank // Homo sapiens U1 snRNA variant 13, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NR_104086 // RefSeq // Homo sapiens RNA, variant U1 small nuclear 19 (RNVU1-19), small nuclear RNA. // chr1 // 52 // 100 // 12 // 23 // 0 /// NONHSAT006122 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000613023 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:120850819:120850985:-1 gene:ENSG00000275538 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 52 // 100 // 12 // 23 // 0
NR_104073 // RefSeq // Homo sapiens RNA, variant U1 small nuclear 4 (RNVU1-4), small nuclear RNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000612985 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:120942600:120942763:1 gene:ENSG00000277610 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT005786 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT005805 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT006232 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001282321 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 231, member A (FAM231A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000434336 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:16673003:16673512:1 gene:ENSG00000237847 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000600179 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:16733952:16734461:-1 gene:ENSG00000268991 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000601199 // ENSEMBL // ensembl:known scaffold:GRCh38:KI270713.1:35407:35916:1 gene:ENSG00000268674 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 80 // 100 // 8 // 10 // 0 /// ENST00000607157 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:149702328:149705721:1 gene:ENSG00000272058 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// AK123662 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ41668 fis, clone FEBRA2028477. // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000424684 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:143790010:143797108:1 gene:ENSG00000263590 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA gene:ENSG00000226067 // chr1 // 70 // 100 // 7 // 10 // 0 /// ENST00000621033 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:145164100:145167488:-1 gene:ENSG00000272419 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000017019 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:16657032:16673512:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 70 // 7 // 7 // 0 /// NONHSAT006185 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 80 // 100 // 8 // 10 // 0 /// GENSCAN00000033597 // ENSEMBL // cdna:genscan scaffold:GRCh38:KI270713.1:13826:35916:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 71 // 70 // 5 // 7 // 0
BC068044 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6380649, containing frame-shift errors. // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_003517 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 2, H2ac (HIST2H2AC), mRNA. // chr1 // 100 // 72 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000331380 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:149886975:149887364:1 gene:ENSG00000184260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 44 // 8 // 8 // 0 /// BC060324 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 2, H2ac, mRNA (cDNA clone MGC:74460 IMAGE:3892650), complete cds. // chr1 // 80 // 83 // 12 // 15 // 0 /// GENSCAN00000015433 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:149886975:149887364:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 44 // 8 // 8 // 0
NM_016074 // RefSeq // Homo sapiens bolA family member 1 (BOLA1), mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000369150 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:149899626:149900548:1 gene:ENSG00000178096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 65 // 16 // 17 // 0 /// ENST00000369152 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:149899597:149900792:1 gene:ENSG00000178096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000369153 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:149887890:149900491:1 gene:ENSG00000178096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// AF151901 // GenBank // Homo sapiens CGI-143 protein mRNA, complete cds. // chr1 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// AK313014 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ93480, Homo sapiens CGI-143 protein (CGI-143), mRNA. // chr1 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// BC063405 // GenBank // Homo sapiens bolA homolog 1 (E. coli), mRNA (cDNA clone MGC:75015 IMAGE:5190565), complete cds. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000476344 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:149899606:149900798:1 gene:ENSG00000178096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// GENSCAN00000015434 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:149900060:149900473:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0
ENST00000581481 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:150211632:150211925:1 gene:ENSG00000266187 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT006277 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 90 // 100 // 19 // 21 // 0
ENST00000410290 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:150236967:150237156:1 gene:ENSG00000222222 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT006280 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONHSAT006281 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_024579 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 54 (C1orf54), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006711538 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 54 (C1orf54), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006711539 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 54 (C1orf54), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000369098 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:150272780:150280914:1 gene:ENSG00000118292 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000369099 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:150272699:150280916:1 gene:ENSG00000118292 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000369102 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:150268200:150280916:1 gene:ENSG00000118292 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// BC017761 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 54, mRNA (cDNA clone MGC:22166 IMAGE:4617936), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000002866 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:150272818:150286954:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1
NM_018997 // RefSeq // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein S21 (MRPS21), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NM_031901 // RefSeq // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein S21 (MRPS21), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// AF182417 // GenBank // Homo sapiens MDS016 (MDS016) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 57 // 12 // 12 // 0 /// BC006554 // GenBank // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein S21, mRNA (cDNA clone MGC:2680 IMAGE:2819715), complete cds. // chr1 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// AK289467 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76504 complete cds, highly similar to Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein S21 (MRPS21), nuclear gene encoding mitochondrial protein, transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 76 // 76 // 16 // 21 // 1 /// AB049955 // GenBank // Homo sapiens MRPS21 mRNA for mitochondrial ribosomal protein S21, complete cds. // chr1 // 57 // 57 // 12 // 21 // 1 /// BC004566 // GenBank // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein S21, mRNA (cDNA clone MGC:14148 IMAGE:3633098), complete cds. // chr1 // 57 // 57 // 12 // 21 // 1 /// ENST00000581066 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:150293920:150308979:1 gene:ENSG00000266472 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 86 // 17 // 18 // 0 /// ENST00000614145 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:150293720:150308979:1 gene:ENSG00000266472 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 81 // 16 // 17 // 0
NM_015203 // RefSeq // Homo sapiens regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 2 (RPRD2), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_005245031 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 2 (RPRD2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000369068 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:150364711:150473556:1 gene:ENSG00000163125 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000401000 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:150364650:150476566:1 gene:ENSG00000163125 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000492220 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:150363091:150473556:1 gene:ENSG00000163125 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// AK125864 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ43876 fis, clone TESTI4008816. // chr1 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// AK291703 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78236 complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// AK304380 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54323 complete cds. // chr1 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC045623 // GenBank // Homo sapiens regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:39541 IMAGE:5269891), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BX641025 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686H22247 (from clone DKFZp686H22247). // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002874 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:150324943:150478645:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
ENST00000384204 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:150701866:150701972:1 gene:ENSG00000206931 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT006325 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
ENST00000443545 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:150903896:150904213:1 gene:ENSG00000229357 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000002876 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:150903896:150904213:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT006337 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_003568 // RefSeq // Homo sapiens annexin A9 (ANXA9), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_005245539 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens annexin A9 (ANXA9), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000368947 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:150982017:150995634:1 gene:ENSG00000143412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000474997 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:150982249:150984371:1 gene:ENSG00000143412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 90 // 33 // 9 // 10 // 0 /// AF230929 // GenBank // Homo sapiens keratinocyte annexin-like protein pemphaxin mRNA, complete cds. // chr1 // 93 // 93 // 26 // 28 // 0 /// AK314926 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ95835. // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC005830 // GenBank // Homo sapiens annexin A9, mRNA (cDNA clone MGC:1925 IMAGE:2959488), complete cds. // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// CR536481 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834D0220D for gene ANXA9, annexin A9; complete cds, incl. stopcodon. // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000011007 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:150982301:150995878:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT006345 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 90 // 33 // 9 // 10 // 0
NM_017860 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 56 (C1orf56), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000368926 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:151047740:151051420:1 gene:ENSG00000143443 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK301712 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56800 complete cds. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// AK315680 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ96774. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// AY358436 // GenBank // Homo sapiens clone DNA59616 VPAA547 (UNQ547) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC002469 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 56, mRNA (cDNA clone MGC:1029 IMAGE:3347975), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006711401 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 56 (C1orf56), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 96 // 96 // 25 // 26 // 1 /// GENSCAN00000011053 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:151047848:151067497:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_024575 // RefSeq // Homo sapiens tumor necrosis factor, alpha-induced protein 8-like 2 (TNFAIP8L2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000368910 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:151156629:151159749:1 gene:ENSG00000163154 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF271774 // GenBank // Homo sapiens TNFIP-iso mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC063014 // GenBank // Homo sapiens tumor necrosis factor, alpha-induced protein 8-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:74911 IMAGE:5224593), complete cds. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000011003 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:151158566:151159252:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 56 // 13 // 14 // 0
NM_002810 // RefSeq // Homo sapiens proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 4 (PSMD4), mRNA. // chr1 // 100 // 56 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000368881 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:151254709:151267459:1 gene:ENSG00000159352 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000368884 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:151254703:151267479:1 gene:ENSG00000159352 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000476855 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:151254769:151267232:1 gene:ENSG00000159352 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// AB033605 // GenBank // Homo sapiens mRNA for pUb-R5, complete cds. // chr1 // 93 // 88 // 13 // 14 // 0 /// BC002365 // GenBank // Homo sapiens proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 4, mRNA (cDNA clone MGC:8410 IMAGE:2820813), complete cds. // chr1 // 100 // 50 // 8 // 8 // 0 /// BC072008 // GenBank // Homo sapiens proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 4, mRNA (cDNA clone MGC:88714 IMAGE:6285035), complete cds. // chr1 // 100 // 50 // 8 // 8 // 0 /// U24704 // GenBank // Human antisecretory factor-1 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 56 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000011050 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:151199783:151291209:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 8 // 8 // 0
NM_020770 // RefSeq // Homo sapiens cingulin (CGN), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENST00000271636 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:151511397:151538692:1 gene:ENSG00000143375 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// AF263462 // GenBank // Homo sapiens cingulin mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// AK290007 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77968 complete cds, highly similar to Homo sapiens cingulin (CGN), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// BC146657 // GenBank // Homo sapiens cingulin, mRNA (cDNA clone MGC:164854 IMAGE:40147940), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// BC150604 // GenBank // Homo sapiens cingulin, mRNA (cDNA clone MGC:183514 IMAGE:9056974), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// BC152445 // GenBank // Homo sapiens cingulin, mRNA (cDNA clone MGC:176694 IMAGE:8862573), complete cds. // chr1 // 100 // 98 // 45 // 45 // 0 /// ENST00000473377 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:151534140:151538692:1 gene:ENSG00000143375 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 30 // 30 // 14 // 46 // 1 /// BX647343 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp779N1112 (from clone DKFZp779N1112). // chr1 // 30 // 30 // 14 // 46 // 1 /// AK096600 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39281 fis, clone OCBBF2011067, highly similar to Homo sapiens cingulin mRNA. // chr1 // 100 // 57 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000011008 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:151494678:151581707:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 87 // 87 // 40 // 46 // 1
ENST00000383908 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:151629324:151629430:1 gene:ENSG00000206635 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT006403 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001144956 // RefSeq // Homo sapiens regulatory subunit of type II PKA R-subunit (RIIa) domain containing 1 (RIIAD1), mRNA. // chr1 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000326413 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:151710433:151729606:1 gene:ENSG00000178796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000451484 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:151721836:151729606:1 gene:ENSG00000178796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000479191 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:151721537:151729600:1 gene:ENSG00000178796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// AK093351 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ36032 fis, clone TESTI2017069. // chr1 // 97 // 97 // 30 // 31 // 0 /// NONHSAT006411 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0
ENST00000453847 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:152399577:152399769:1 gene:ENSG00000183586 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 89 // 100 // 8 // 9 // 0 /// GENSCAN00000020288 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:152399468:152399809:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONHSAT006487 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 89 // 100 // 8 // 9 // 0
NM_178438 // RefSeq // Homo sapiens late cornified envelope 5A (LCE5A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000334269 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:152510844:152512177:1 gene:ENSG00000186207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_019060 // RefSeq // Homo sapiens cysteine-rich C-terminal 1 (CRCT1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000368790 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:152514502:152516010:1 gene:ENSG00000169509 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC119710 // GenBank // Homo sapiens cysteine-rich C-terminal 1, mRNA (cDNA clone MGC:149658 IMAGE:40117182), complete cds. // chr1 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0 /// CR457218 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834G0516D for gene NICE-1, NICE-1 protein; complete cds, incl. stopcodon. // chr1 // 89 // 36 // 8 // 9 // 0
NM_178434 // RefSeq // Homo sapiens late cornified envelope 3C (LCE3C), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000333881 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:152600662:152601086:1 gene:ENSG00000244057 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC130365 // GenBank // Homo sapiens late cornified envelope 3C, mRNA (cDNA clone MGC:163237 IMAGE:40146396), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC130367 // GenBank // Homo sapiens late cornified envelope 3C, mRNA (cDNA clone MGC:163239 IMAGE:40146398), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000617545 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:152511535:152601016:1 gene:ENSG00000244057 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0
NM_178433 // RefSeq // Homo sapiens late cornified envelope 3B (LCE3B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000335633 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:1:152613811:152614098:1 gene:ENSG00000187238 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000020295 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:152579679:152687063:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 41 // 41 // 9 // 22 // 1
ENST00000444515 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:152655477:152656804:1 gene:ENSG00000176075 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// AF005082 // GenBank // Homo sapiens skin-specific protein (xp33) mRNA, partial cds. // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONHSAT006492 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// NONHSAT006493 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONHSAT006494 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// TCONS_00000313-XLOC_000411 // Rinn lincRNA // linc-LCE2D chr1:+:152627952-152629280 // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_178430 // RefSeq // Homo sapiens late cornified envelope 2D (LCE2D), mRNA. // chr1 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000368784 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:152663396:152664659:1 gene:ENSG00000187223 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC130603 // GenBank // Homo sapiens late cornified envelope 2D, mRNA (cDNA clone MGC:163475 IMAGE:40146634), complete cds. // chr1 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0 /// BC130605 // GenBank // Homo sapiens late cornified envelope 2D, mRNA (cDNA clone MGC:163477 IMAGE:40146636), complete cds. // chr1 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0
NM_178429 // RefSeq // Homo sapiens late cornified envelope 2C (LCE2C), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000368783 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:152675295:152676574:1 gene:ENSG00000187180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_014357 // RefSeq // Homo sapiens late cornified envelope 2B (LCE2B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000368780 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:152686123:152687401:1 gene:ENSG00000159455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// AF005080 // GenBank // Homo sapiens skin-specific protein (xp5) mRNA, complete cds. // chr1 // 85 // 100 // 11 // 13 // 0 /// AF086289 // GenBank // Homo sapiens full length insert cDNA clone ZD48C09. // chr1 // 92 // 100 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000020295 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:152579679:152687063:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 62 // 62 // 8 // 13 // 1
NM_178428 // RefSeq // Homo sapiens late cornified envelope 2A (LCE2A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000368779 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:152698364:152699442:1 gene:ENSG00000187173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC119707 // GenBank // Homo sapiens late cornified envelope 2A, mRNA (cDNA clone MGC:149654 IMAGE:40117159), complete cds. // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_178356 // RefSeq // Homo sapiens late cornified envelope 4A (LCE4A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000335535 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:152709047:152709434:1 gene:ENSG00000187170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000368777 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:152708160:152709491:1 gene:ENSG00000187170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC113446 // GenBank // Homo sapiens late cornified envelope 4A, mRNA (cDNA clone MGC:142006 IMAGE:8322498), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC113448 // GenBank // Homo sapiens late cornified envelope 4A, mRNA (cDNA clone MGC:142008 IMAGE:8322500), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001024679 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 68 (C1orf68), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000368775 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:152719522:152720470:1 gene:ENSG00000198854 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT006495 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 67 // 84 // 14 // 21 // 0
NM_001025231 // RefSeq // Homo sapiens keratinocyte proline-rich protein (KPRP), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000606109 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:152759561:152762052:1 gene:ENSG00000203786 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY960854 // GenBank // Homo sapiens keratinocyte proline-rich protein (KPRP) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_178354 // RefSeq // Homo sapiens late cornified envelope 1F (LCE1F), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000334371 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:152776372:152776728:1 gene:ENSG00000240386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_178353 // RefSeq // Homo sapiens late cornified envelope 1E (LCE1E), mRNA. // chr1 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000368770 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:152786277:152788426:1 gene:ENSG00000186226 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000368771 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:152786214:152787702:1 gene:ENSG00000186226 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 13 // 13 // 0
NM_178352 // RefSeq // Homo sapiens late cornified envelope 1D (LCE1D), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000326233 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:152796751:152798181:1 gene:ENSG00000172155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000618532 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:152797795:152798139:1 gene:ENSG00000172155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 70 // 14 // 14 // 0
NM_178349 // RefSeq // Homo sapiens late cornified envelope 1B (LCE1B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000360090 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:152811971:152813109:1 gene:ENSG00000196734 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_178348 // RefSeq // Homo sapiens late cornified envelope 1A (LCE1A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000335123 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:152827473:152827894:1 gene:ENSG00000186844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_030663 // RefSeq // Homo sapiens sperm mitochondria-associated cysteine-rich protein (SMCP), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000368765 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:152878317:152885047:1 gene:ENSG00000163206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC014593 // GenBank // Homo sapiens sperm mitochondria-associated cysteine-rich protein, mRNA (cDNA clone MGC:26305 IMAGE:4824172), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC016744 // GenBank // Homo sapiens sperm mitochondria-associated cysteine-rich protein, mRNA (cDNA clone MGC:26519 IMAGE:4829283), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AK058132 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ25403 fis, clone TST02879. // chr1 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0
NM_005547 // RefSeq // Homo sapiens involucrin (IVL), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000368764 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:152908545:152911886:1 gene:ENSG00000163207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AK300492 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61407 complete cds, highly similar to Involucrin. // chr1 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// AK301649 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51358 complete cds, highly similar to Involucrin. // chr1 // 75 // 91 // 15 // 20 // 0 /// BC046391 // GenBank // Homo sapiens involucrin, mRNA (cDNA clone MGC:25201 IMAGE:4749952), complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000020287 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:152879821:152972130:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 59 // 13 // 13 // 0
NM_173080 // RefSeq // Homo sapiens small proline-rich protein 4 (SPRR4), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// ENST00000328051 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:152970666:152972574:1 gene:ENSG00000184148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 83 // 19 // 20 // 0 /// BC069445 // GenBank // Homo sapiens small proline-rich protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:97451 IMAGE:7262727), complete cds. // chr1 // 92 // 50 // 11 // 12 // 0 /// BC069549 // GenBank // Homo sapiens small proline-rich protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:97463 IMAGE:7262739), complete cds. // chr1 // 92 // 50 // 11 // 12 // 0 /// BC112170 // GenBank // Homo sapiens small proline-rich protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:138375 IMAGE:8327638), complete cds. // chr1 // 88 // 71 // 15 // 17 // 0 /// BC112172 // GenBank // Homo sapiens small proline-rich protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:138377 IMAGE:8327640), complete cds. // chr1 // 88 // 67 // 14 // 16 // 0 /// GENSCAN00000020287 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:152879821:152972130:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1
NM_001199828 // RefSeq // Homo sapiens small proline-rich protein 1A (SPRR1A), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NM_005987 // RefSeq // Homo sapiens small proline-rich protein 1A (SPRR1A), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC105081 // GenBank // Homo sapiens small proline-rich protein 1A, mRNA (cDNA clone MGC:132741 IMAGE:8144084), complete cds. // chr1 // 93 // 75 // 14 // 15 // 0 /// BC105083 // GenBank // Homo sapiens small proline-rich protein 1A, mRNA (cDNA clone MGC:132743 IMAGE:8144086), complete cds. // chr1 // 93 // 75 // 14 // 15 // 0 /// BC143782 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone MGC:177313 IMAGE:9052296, complete cds. // chr1 // 93 // 75 // 14 // 15 // 0
NM_005416 // RefSeq // Homo sapiens small proline-rich protein 3 (SPRR3), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000331860 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:153001747:153003855:1 gene:ENSG00000163209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AY118269 // GenBank // Homo sapiens esophagin mRNA, complete cds. // chr1 // 86 // 61 // 12 // 14 // 0 /// BC017802 // GenBank // Homo sapiens small proline-rich protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:22360 IMAGE:4288753), complete cds. // chr1 // 72 // 78 // 13 // 18 // 0 /// NM_001097589 // RefSeq // Homo sapiens small proline-rich protein 3 (SPRR3), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 78 // 78 // 18 // 23 // 1 /// ENST00000443178 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:153001751:153003496:1 gene:ENSG00000163209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 83 // 83 // 19 // 23 // 1 /// ENST00000295367 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:153001771:153003856:1 gene:ENSG00000163209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 61 // 61 // 14 // 23 // 1 /// EF553525 // GenBank HTC // Homo sapiens clone DKFZp781B0847 SPRR3 (SPRR3) mRNA, complete cds. // chr1 // 57 // 57 // 13 // 23 // 1 /// GENSCAN00000003823 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:153003021:153003530:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 43 // 10 // 10 // 0
NM_003125 // RefSeq // Homo sapiens small proline-rich protein 1B (SPRR1B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000307098 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:153031202:153032900:1 gene:ENSG00000169469 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC056240 // GenBank // Homo sapiens small proline-rich protein 1B (cornifin), mRNA (cDNA clone IMAGE:6494770), complete cds. // chr1 // 80 // 100 // 16 // 20 // 0
NM_001010857 // RefSeq // Homo sapiens late cornified envelope-like proline-rich 1 (LELP1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000368747 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:153203443:153205120:1 gene:ENSG00000203784 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC087854 // GenBank // Homo sapiens late cornified envelope-like proline-rich 1, mRNA (cDNA clone MGC:102979 IMAGE:30387074), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC130507 // GenBank // Homo sapiens late cornified envelope-like proline-rich 1, mRNA (cDNA clone MGC:163379 IMAGE:40146538), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC130511 // GenBank // Homo sapiens late cornified envelope-like proline-rich 1, mRNA (cDNA clone MGC:163383 IMAGE:40146542), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
BC034690 // GenBank // Homo sapiens loricrin, mRNA (cDNA clone MGC:21357 IMAGE:4752776), complete cds. // chr1 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// BC108290 // GenBank // Homo sapiens loricrin, mRNA (cDNA clone MGC:111513 IMAGE:4754528), complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// CR536555 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834H1020D for gene LOR, loricrin; complete cds, incl. stopcodon. // chr1 // 100 // 39 // 11 // 11 // 0 /// M61120 // GenBank // Human loricrin mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NM_000427 // RefSeq // Homo sapiens loricrin (LOR), mRNA. // chr1 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1 /// ENST00000368742 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:153259700:153262122:1 gene:ENSG00000203782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1 /// GENSCAN00000003893 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:153244887:153261888:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 39 // 11 // 11 // 0 /// AB013076 // GenBank // Homo sapiens gene for loricrin, complete cds. // chr1 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// M63394 // GenBank // Human 3 nucleotide sequence mRNA. // chr1 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1
ENST00000384591 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:153331622:153331728:1 gene:ENSG00000207321 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT006514 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0
NM_002965 // RefSeq // Homo sapiens S100 calcium binding protein A9 (S100A9), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000368738 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:153357854:153361027:1 gene:ENSG00000163220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF086362 // GenBank // Homo sapiens full length insert cDNA clone ZD66A09. // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC047681 // GenBank // Homo sapiens S100 calcium binding protein A9, mRNA (cDNA clone MGC:51841 IMAGE:6060124), complete cds. // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// CR542207 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834C0125D for gene S100A9, S100 calcium binding protein A9 (calgranulin B); complete cds, incl. stopcodon. // chr1 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// CR542224 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834A1125D for gene S100A9, S100 calcium binding protein A9 (calgranulin B); complete cds, without stopcodon. // chr1 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// M26311 // GenBank // Human cystic fibrosis antigen mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000003872 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:153358284:153361791:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_176823 // RefSeq // Homo sapiens S100 calcium binding protein A7A (S100A7A), mRNA. // chr1 // 100 // 74 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000329256 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:153417944:153419355:1 gene:ENSG00000184330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 53 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000368729 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:153416524:153423225:1 gene:ENSG00000184330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 74 // 14 // 14 // 0 /// AY189118 // GenBank // Homo sapiens EF-hand type calcium-binding protein S100A15 mRNA, complete cds, splice variant 1. // chr1 // 100 // 74 // 14 // 14 // 0 /// AY189119 // GenBank // Homo sapiens EF-hand type calcium-binding protein S100A15 mRNA, complete cds, splice variant 2. // chr1 // 100 // 53 // 10 // 10 // 0
NM_006271 // RefSeq // Homo sapiens S100 calcium binding protein A1 (S100A1), mRNA. // chr1 // 100 // 59 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000292169 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:153628397:153632037:1 gene:ENSG00000160678 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 59 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000368698 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:153627926:153632034:1 gene:ENSG00000160678 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 59 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000469893 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:153628384:153632039:1 gene:ENSG00000160678 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// AK126904 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44956 fis, clone BRAWH2011796, moderately similar to S-100 protein, alpha chain. // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC014392 // GenBank // Homo sapiens S100 calcium binding protein A1, mRNA (cDNA clone MGC:1324 IMAGE:3543900), complete cds. // chr1 // 100 // 53 // 9 // 9 // 0 /// BC094843 // GenBank // Homo sapiens S100 calcium binding protein A1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4544435). // chr1 // 47 // 47 // 8 // 17 // 1
NM_000906 // RefSeq // Homo sapiens natriuretic peptide receptor 1 (NPR1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000368677 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:153688724:153693968:1 gene:ENSG00000169418 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000368680 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:153678637:153693992:1 gene:ENSG00000169418 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK298090 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51762 complete cds, highly similar to Atrial natriuretic peptide receptor A precursor. // chr1 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// AK300446 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59428 complete cds, highly similar to Atrial natriuretic peptide receptor A precursor. // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC063304 // GenBank // Homo sapiens natriuretic peptide receptor A/guanylate cyclase A (atrionatriuretic peptide receptor A), mRNA (cDNA clone MGC:71716 IMAGE:30331757), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000003841 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:153679109:153693414:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
ENST00000461982 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:153704088:153704385:1 gene:ENSG00000242565 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000578047 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR1_1_CTG31:153721328:153721625:1 gene:ENSG00000276295 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA gene:ENSG00000266380 // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000583838 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR1_1_CTG31:153700659:153700956:1 gene:ENSG00000275531 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA gene:ENSG00000264632 // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONHSAT006540 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000475373 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:154259736:154263322:1 gene:ENSG00000143569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000364259 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:154259727:154259862:1 gene:ENSG00000201129 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT006599 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000390990 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:154295503:154295601:1 gene:ENSG00000212292 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT006606 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENST00000410525 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:154297650:154297748:1 gene:ENSG00000222457 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT006607 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENST00000355197 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:154321090:154324042:1 gene:ENSG00000143595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 50 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000484864 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:154321120:154325325:1 gene:ENSG00000143595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AB066105 // GenBank // Homo sapiens AQP10 mRNA for aquaporin 10, complete cds. // chr1 // 88 // 80 // 14 // 16 // 0 /// AF159174 // GenBank // Homo sapiens small intestine aquaporin mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC069607 // GenBank // Homo sapiens aquaporin 10, mRNA (cDNA clone MGC:97000 IMAGE:7262209), complete cds. // chr1 // 100 // 40 // 8 // 8 // 0 /// BC074896 // GenBank // Homo sapiens aquaporin 10, mRNA (cDNA clone MGC:103867 IMAGE:30915249), complete cds. // chr1 // 100 // 40 // 8 // 8 // 0 /// BC074897 // GenBank // Homo sapiens aquaporin 10, mRNA (cDNA clone MGC:104034 IMAGE:30915478), complete cds. // chr1 // 100 // 40 // 8 // 8 // 0 /// NM_080429 // RefSeq // Homo sapiens aquaporin 10 (AQP10), mRNA. // chr1 // 80 // 80 // 16 // 20 // 1 /// ENST00000324978 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:154321116:154325325:1 gene:ENSG00000143595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 80 // 80 // 16 // 20 // 1 /// AK314993 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ95919, highly similar to Homo sapiens aquaporin 10 (AQP10), mRNA. // chr1 // 40 // 40 // 8 // 20 // 1
NM_001005855 // RefSeq // Homo sapiens ATPase, aminophospholipid transporter, class I, type 8B, member 2 (ATP8B2), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 37 // 14 // 14 // 0 /// NM_020452 // RefSeq // Homo sapiens ATPase, aminophospholipid transporter, class I, type 8B, member 2 (ATP8B2), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000368487 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:154325553:154337846:1 gene:ENSG00000143515 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 37 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000368489 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:154327800:154351307:1 gene:ENSG00000143515 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000426445 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:154328799:154341788:1 gene:ENSG00000143515 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 37 // 14 // 14 // 0 /// AK054886 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ30324 fis, clone BRACE2007138, weakly similar to PROBABLE CALCIUM-TRANSPORTING ATPASE 3 (EC 3.6.1.38). // chr1 // 100 // 37 // 14 // 14 // 0 /// AK304806 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57058 complete cds, highly similar to Probable phospholipid-transporting ATPase ID(EC 3.6.3.1). // chr1 // 92 // 32 // 11 // 12 // 0 /// AY302537 // GenBank // Homo sapiens possible aminophospholipid translocase ATP8B2 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 76 // 29 // 29 // 0 /// BC069264 // GenBank // Homo sapiens ATPase, class I, type 8B, member 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:6463955), complete cds. // chr1 // 100 // 37 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000035705 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:154312492:154349118:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 27 // 27 // 0
NM_001098475 // RefSeq // Homo sapiens tudor domain containing 10 (TDRD10), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// NM_182499 // RefSeq // Homo sapiens tudor domain containing 10 (TDRD10), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// XM_006711154 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens tudor domain containing 10 (TDRD10), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000368480 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:154502972:154548147:1 gene:ENSG00000163239 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000368482 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:154502219:154548147:1 gene:ENSG00000163239 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000468714 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:154534541:154547479:1 gene:ENSG00000163239 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000479937 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:154521366:154548147:1 gene:ENSG00000163239 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// AK302144 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50035 complete cds. // chr1 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// AY358195 // GenBank // Homo sapiens clone DNA171706 RGSF9380 (UNQ9380) mRNA, complete cds. // chr1 // 94 // 56 // 17 // 18 // 0 /// BC044864 // GenBank // Homo sapiens tudor domain containing 10, mRNA (cDNA clone MGC:42905 IMAGE:4836747), complete cds. // chr1 // 93 // 88 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000035707 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:154507218:154547557:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0
NM_000748 // RefSeq // Homo sapiens cholinergic receptor, nicotinic, beta 2 (neuronal) (CHRNB2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006711143 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens cholinergic receptor, nicotinic, beta 2 (neuronal) (CHRNB2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000368476 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:154567781:154580026:1 gene:ENSG00000160716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC075040 // GenBank // Homo sapiens cholinergic receptor, nicotinic, beta 2 (neuronal), mRNA (cDNA clone MGC:103958 IMAGE:30915357), complete cds. // chr1 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// BC075041 // GenBank // Homo sapiens cholinergic receptor, nicotinic, beta 2 (neuronal), mRNA (cDNA clone MGC:104119 IMAGE:30915573), complete cds. // chr1 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// U62437 // GenBank // Human nicotinic acetylcholine receptor beta2 subunit precursor, mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000035690 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:154568045:154577129:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
NM_001826 // RefSeq // Homo sapiens CDC28 protein kinase regulatory subunit 1B (CKS1B), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0 /// NR_024163 // RefSeq // Homo sapiens CDC28 protein kinase regulatory subunit 1B (CKS1B), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000368439 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:154974653:154979248:1 gene:ENSG00000173207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// AF274943 // GenBank // Homo sapiens PNAS-18 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0 /// AK307066 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ97014. // chr1 // 89 // 89 // 8 // 9 // 1 /// NONHSAT006654 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 1
NM_018655 // RefSeq // Homo sapiens lens epithelial protein (LENEP), mRNA. // chr1 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000392487 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:154993588:154994142:1 gene:ENSG00000163352 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 16 // 16 // 0 /// BC069140 // GenBank // Homo sapiens lens epithelial protein, mRNA (cDNA clone MGC:95424 IMAGE:7216999), complete cds. // chr1 // 100 // 48 // 10 // 10 // 0 /// BC096714 // GenBank // Homo sapiens lens epithelial protein, mRNA (cDNA clone MGC:118969 IMAGE:40002566), complete cds. // chr1 // 100 // 76 // 16 // 16 // 0 /// BC098148 // GenBank // Homo sapiens lens epithelial protein, mRNA (cDNA clone MGC:118968 IMAGE:40002565), complete cds. // chr1 // 100 // 76 // 16 // 16 // 0 /// BC098246 // GenBank // Homo sapiens lens epithelial protein, mRNA (cDNA clone MGC:118966 IMAGE:40002556), complete cds. // chr1 // 100 // 76 // 16 // 16 // 0 /// BC098253 // GenBank // Homo sapiens lens epithelial protein, mRNA (cDNA clone MGC:118967 IMAGE:40002559), complete cds. // chr1 // 100 // 76 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000368427 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:154993586:154994315:1 gene:ENSG00000163352 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 71 // 71 // 15 // 21 // 1 /// AF268478 // GenBank // Homo sapiens lens epithelial cell protein (LEP503) mRNA, complete cds. // chr1 // 71 // 71 // 15 // 21 // 1
NM_005227 // RefSeq // Homo sapiens ephrin-A4 (EFNA4), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_182689 // RefSeq // Homo sapiens ephrin-A4 (EFNA4), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NM_182690 // RefSeq // Homo sapiens ephrin-A4 (EFNA4), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000359751 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:155063737:155069538:1 gene:ENSG00000243364 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000368409 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:155063731:155069553:1 gene:ENSG00000243364 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000427683 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:155063761:155069538:1 gene:ENSG00000243364 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// BC107483 // GenBank // Homo sapiens ephrin-A4, mRNA (cDNA clone MGC:125826 IMAGE:40030599), complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// CR533569 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834H0122D for gene EFNA4, ephrin-A4; complete cds, incl. stopcodon. // chr1 // 89 // 68 // 17 // 19 // 0 /// U14188 // GenBank // Homo sapiens LERK-4 (EPLG4) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000505139 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:155063748:155086807:1 gene:ENSG00000251246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// GENSCAN00000016426 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:155051387:155072537:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// AK301966 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57652 complete cds, highly similar to Ephrin-A3 precursor. // chr1 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
ENST00000365157 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:155120490:155120598:1 gene:ENSG00000202027 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT006682 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000450680 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:155148544:155148813:1 gene:ENSG00000223452 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 87 // 100 // 20 // 23 // 0 /// GENSCAN00000016425 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:155148544:155167188:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT006687 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 87 // 100 // 20 // 23 // 0 /// NONHSAT006688 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 87 // 100 // 20 // 23 // 0
NM_002455 // RefSeq // Homo sapiens metaxin 1 (MTX1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NM_198883 // RefSeq // Homo sapiens metaxin 1 (MTX1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000316721 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:155208797:155213823:1 gene:ENSG00000173171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000368376 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:155208699:155213823:1 gene:ENSG00000173171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000424959 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:155209238:155213656:1 gene:ENSG00000173171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000609421 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:155209247:155213824:1 gene:ENSG00000173171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0 /// BC001906 // GenBank // Homo sapiens metaxin 1, mRNA (cDNA clone MGC:2518 IMAGE:3546178), complete cds. // chr1 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000481771 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:155209251:155213823:1 gene:ENSG00000173171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 63 // 63 // 10 // 16 // 1 /// ENST00000622808 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:155208699:155213823:1 gene:ENSG00000173171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000016416 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:155208805:155213698:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0
ENST00000384415 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:155419397:155419500:1 gene:ENSG00000207144 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT006738 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_152280 // RefSeq // Homo sapiens synaptotagmin XI (SYT11), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000368324 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:155859509:155885199:1 gene:ENSG00000132718 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AK296378 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50786 complete cds, highly similar to Synaptotagmin-11. // chr1 // 100 // 44 // 16 // 16 // 0 /// BC004291 // GenBank // Homo sapiens synaptotagmin XI, mRNA (cDNA clone MGC:10881 IMAGE:3621175), complete cds. // chr1 // 96 // 69 // 24 // 25 // 0 /// BC013690 // GenBank // Homo sapiens synaptotagmin XI, mRNA (cDNA clone MGC:17226 IMAGE:4179089), complete cds. // chr1 // 96 // 64 // 22 // 23 // 0 /// BC039205 // GenBank // Homo sapiens synaptotagmin XI, mRNA (cDNA clone MGC:26698 IMAGE:4819614), complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// D38522 // GenBank // Homo sapiens KIAA0080 mRNA, partial cds. // chr1 // 97 // 86 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000016427 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:155853485:155881508:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0
NM_181885 // RefSeq // Homo sapiens relaxin/insulin-like family peptide receptor 4 (RXFP4), mRNA. // chr1 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000368318 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:155941710:155942949:1 gene:ENSG00000173080 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY170824 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor (GPR100) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// AY288415 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 100 (GPR100) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// AY394502 // GenBank // Homo sapiens relaxin-3 receptor-2 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// BC101507 // GenBank // Homo sapiens relaxin/insulin-like family peptide receptor 4, mRNA (cDNA clone MGC:126556 IMAGE:8069013), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC101509 // GenBank // Homo sapiens relaxin/insulin-like family peptide receptor 4, mRNA (cDNA clone MGC:126558 IMAGE:8069015), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// EU432129 // GenBank // Homo sapiens relaxin/insulin-like family peptide receptor 4 (RXFP4) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000016423 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:155941710:155946535:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0
NONHSAT006887 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001105669 // RefSeq // Homo sapiens tetratricopeptide repeat domain 24 (TTC24), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000368236 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:156579727:156586770:1 gene:ENSG00000187862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000368237 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:156581365:156586770:1 gene:ENSG00000187862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000413282 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:156582067:156585244:1 gene:ENSG00000187862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000495690 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:156582293:156585227:1 gene:ENSG00000187862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 73 // 46 // 8 // 11 // 0 /// ENST00000478081 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:156582427:156585841:1 gene:ENSG00000187862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 46 // 46 // 11 // 24 // 1 /// GENSCAN00000029106 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:156581365:156586690:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 79 // 18 // 19 // 0 /// NONHSAT006889 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 46 // 46 // 11 // 24 // 1
NM_005973 // RefSeq // Homo sapiens papillary renal cell carcinoma (translocation-associated) (PRCC), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000271526 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:156767500:156800817:1 gene:ENSG00000143294 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000454659 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:156786891:156800771:1 gene:ENSG00000143294 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000491853 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:156750610:156791792:1 gene:ENSG00000143294 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 26 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000526188 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:156786875:156800497:1 gene:ENSG00000143294 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 26 // 8 // 8 // 0 /// AK289872 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78011 complete cds, highly similar to Homo sapiens papillary renal cell carcinoma (translocation-associated) (PRCC), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0 /// BC004913 // GenBank // Homo sapiens papillary renal cell carcinoma (translocation-associated), mRNA (cDNA clone MGC:4723 IMAGE:3535413), complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// BC010450 // GenBank // Homo sapiens papillary renal cell carcinoma (translocation-associated), mRNA (cDNA clone MGC:17178 IMAGE:4179105), complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000029103 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:156767772:156800460:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0
NM_001080471 // RefSeq // Homo sapiens platelet endothelial aggregation receptor 1 (PEAR1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006711301 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens platelet endothelial aggregation receptor 1 (PEAR1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000292357 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:156893731:156916434:1 gene:ENSG00000187800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000338302 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:156893720:156916429:1 gene:ENSG00000187800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000469390 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:156906317:156916426:1 gene:ENSG00000187800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AK098809 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ25943 fis, clone JTH10559. // chr1 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// GENSCAN00000029110 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:156903927:156914798:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
NM_144702 // RefSeq // Homo sapiens leucine rich repeat containing 71 (LRRC71), mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// XM_006711189 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens leucine rich repeat containing 71 (LRRC71), transcript variant X11, mRNA. // chr1 // 100 // 76 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000337428 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:156920650:156933094:1 gene:ENSG00000160838 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000490146 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:156920912:156933088:1 gene:ENSG00000160838 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 85 // 35 // 35 // 0 /// AK057446 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ32884 fis, clone TESTI2004229. // chr1 // 100 // 85 // 35 // 35 // 0 /// AK292342 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77598 complete cds. // chr1 // 95 // 90 // 35 // 37 // 0 /// BC033790 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 92, mRNA (cDNA clone MGC:45468 IMAGE:5163973), complete cds. // chr1 // 97 // 90 // 36 // 37 // 0 /// ENST00000476550 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:156927362:156933085:1 gene:ENSG00000160838 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 32 // 32 // 13 // 41 // 1 /// GENSCAN00000029097 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:156920804:156932969:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 34 // 34 // 0
ENST00000435919 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:157709086:157709643:1 gene:ENSG00000231700 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 95 // 95 // 20 // 21 // 0
ENST00000424704 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:157861197:157861460:1 gene:ENSG00000227425 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000017991 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:157861197:157861460:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001766 // RefSeq // Homo sapiens CD1d molecule (CD1D), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000368171 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:158179947:158184896:1 gene:ENSG00000158473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AK310541 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17583. // chr1 // 90 // 32 // 9 // 10 // 0 /// BC027926 // GenBank // Homo sapiens CD1d molecule, mRNA (cDNA clone MGC:34622 IMAGE:5229534), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// J04142 // GenBank // Homo sapiens (lambda-gt11ht-5) MHC class I antigen-like glycoprotein (CD1D) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// AK310749 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17791. // chr1 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1 /// GENSCAN00000044450 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:158181102:158184254:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0
NM_001763 // RefSeq // Homo sapiens CD1a molecule (CD1A), mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000289429 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:158254137:158258269:1 gene:ENSG00000158477 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// M28825 // GenBank // Human thymocyte antigen CD1a mRNA, complete cds. // chr1 // 90 // 88 // 19 // 21 // 0 /// BC031645 // GenBank // Homo sapiens CD1a molecule, mRNA (cDNA clone MGC:35168 IMAGE:5170038), complete cds. // chr1 // 71 // 71 // 17 // 24 // 1 /// GENSCAN00000044452 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:158248387:158293476:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1
NM_001765 // RefSeq // Homo sapiens CD1c molecule (CD1C), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000368170 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:158289786:158293630:1 gene:ENSG00000158481 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000443761 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:158291270:158293617:1 gene:ENSG00000158481 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0 /// BC126465 // GenBank // Homo sapiens CD1c molecule, mRNA (cDNA clone MGC:161743 IMAGE:8992181), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC126467 // GenBank // Homo sapiens CD1c molecule, mRNA (cDNA clone MGC:161745 IMAGE:8992183), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// CR457080 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834E0711D for gene CD1C, CD1C antigen, c polypeptide; complete cds, incl. stopcodon. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// M28827 // GenBank // Human thymocyte antigen CD1c mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK298234 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61149 complete cds, highly similar to T-cell surface glycoprotein CD1c precursor. // chr1 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// AK310710 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17752. // chr1 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// AK310577 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17619. // chr1 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// GENSCAN00000044452 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:158248387:158293476:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
NM_001004473 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 10, subfamily K, member 1 (OR10K1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000289451 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:158465562:158466503:1 gene:ENSG00000173285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC137323 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 10, subfamily K, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:168943 IMAGE:9021320), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC137324 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 10, subfamily K, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:168944 IMAGE:9021321), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000044439 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:158465562:158466503:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001004472 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 10, subfamily R, member 2 (OR10R2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000368152 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:158479878:158480885:1 gene:ENSG00000198965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000044441 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:158479959:158488099:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0
ENST00000361688 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:158491219:158492160:1 gene:ENSG00000198703 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK122667 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ16108 fis, clone THYMU2009425, moderately similar to OLFACTORY RECEPTOR-LIKE PROTEIN HGMP07J. // chr1 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// GENSCAN00000044464 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:158491453:158491974:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
NM_001004478 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 10, subfamily Z, member 1 (OR10Z1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000361284 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:158606439:158607380:1 gene:ENSG00000198967 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000044444 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:158606439:158607380:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001005184 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 6, subfamily K, member 6 (OR6K6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000368144 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:158754720:158755891:1 gene:ENSG00000180433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC140743 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 6, subfamily K, member 6, mRNA (cDNA clone MGC:176420 IMAGE:9021611), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000044446 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:158754888:158755847:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0
NM_002432 // RefSeq // Homo sapiens myeloid cell nuclear differentiation antigen (MNDA), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000368141 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:158831317:158849504:1 gene:ENSG00000163563 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000438394 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:158845901:158849506:1 gene:ENSG00000163563 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 86 // 47 // 12 // 14 // 0 /// AK290392 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78191 complete cds, highly similar to Homo sapiens myeloid cell nuclear differentiation antigen, mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// BC020715 // GenBank // Homo sapiens myeloid cell nuclear differentiation antigen, mRNA (cDNA clone IMAGE:4717988), partial cds. // chr1 // 93 // 50 // 14 // 15 // 0 /// BC032319 // GenBank // Homo sapiens myeloid cell nuclear differentiation antigen, mRNA (cDNA clone MGC:40350 IMAGE:5223430), complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// M81750 // GenBank // H.sapiens myeloid cell nuclear differentiation antigen mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000044451 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:158830725:158971640:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
NM_001127173 // RefSeq // Homo sapiens cell adhesion molecule 3 (CADM3), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NM_021189 // RefSeq // Homo sapiens cell adhesion molecule 3 (CADM3), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000368124 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:159171609:159202012:1 gene:ENSG00000162706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000368125 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:159171609:159203313:1 gene:ENSG00000162706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000497636 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:159196842:159201328:1 gene:ENSG00000162706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// AF062733 // GenBank // Homo sapiens nectin-like protein 1 (NECL1) mRNA, complete cds. // chr1 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// AF363367 // GenBank // Homo sapiens TSLC1-like 1 (TSLL1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// AK289541 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75954 complete cds, highly similar to Homo sapiens immunoglobulin superfamily, member 4B (IGSF4B), mRNA. // chr1 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// AY046418 // GenBank // Homo sapiens brain immunoglobulin receptor precursor, mRNA, complete cds. // chr1 // 92 // 48 // 11 // 12 // 0 /// AY358332 // GenBank // Homo sapiens clone DNA35918 GAPA225 (UNQ225) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC033819 // GenBank // Homo sapiens cell adhesion molecule 3, mRNA (cDNA clone MGC:45003 IMAGE:5199627), complete cds. // chr1 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000039823 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:159185222:159277111:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
ENST00000410620 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:159178473:159178559:1 gene:ENSG00000222552 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT006997 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_002001 // RefSeq // Homo sapiens Fc fragment of IgE, high affinity I, receptor for; alpha polypeptide (FCER1A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000368114 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:159302336:159307993:1 gene:ENSG00000179639 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 53 // 16 // 17 // 0 /// ENST00000368115 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:159289714:159308224:1 gene:ENSG00000179639 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC005912 // GenBank // Homo sapiens Fc fragment of IgE, high affinity I, receptor for; alpha polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:14507 IMAGE:4294467), complete cds. // chr1 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// BC015195 // GenBank // Homo sapiens Fc fragment of IgE, high affinity I, receptor for; alpha polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:14717 IMAGE:4251469), complete cds. // chr1 // 96 // 75 // 23 // 24 // 0 /// BC015185 // GenBank HTC // Homo sapiens Fc fragment of IgE, high affinity I, receptor for; alpha polypeptide, mRNA (cDNA clone IMAGE:4273144), with apparent retained intron. // chr1 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// GENSCAN00000039817 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:159302356:159307932:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0
NM_012351 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 10, subfamily J, member 1 (OR10J1), mRNA. // chr1 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000423932 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:159439722:159440811:1 gene:ENSG00000196184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0 /// BC069150 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 10, subfamily J, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:95435 IMAGE:7217010), complete cds. // chr1 // 87 // 43 // 13 // 15 // 0 /// BC112290 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 10, subfamily J, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:138495 IMAGE:8327758), complete cds. // chr1 // 67 // 69 // 16 // 24 // 0 /// ENST00000504970 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:159432204:159433138:1 gene:ENSG00000249730 gene_biotype:polymorphic_pseudogene transcript_biotype:polymorphic_pseudogene // chr1 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1 /// GENSCAN00000039819 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:159406222:159440721:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 54 // 19 // 19 // 0
NM_001639 // RefSeq // Homo sapiens amyloid P component, serum (APCS), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000255040 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:159587825:159588865:1 gene:ENSG00000132703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC007039 // GenBank // Homo sapiens amyloid P component, serum, mRNA (cDNA clone MGC:12419 IMAGE:3935086), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC007058 // GenBank // Homo sapiens amyloid P component, serum, mRNA (cDNA clone MGC:12497 IMAGE:3934872), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BT006750 // GenBank // Homo sapiens amyloid P component, serum mRNA, complete cds. // chr1 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// CR450313 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834F071D for gene APCS, amyloid P component, serum; complete cds; without stopcodon. // chr1 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// FJ460512 // GenBank // Homo sapiens epididymis secretory sperm binding protein Li 92n (HEL-S-92n) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// M10944 // GenBank // Human serum amyloid P component (SAP) mRNA, complete cds. // chr1 // 86 // 85 // 19 // 22 // 0 /// BC070178 // GenBank // Homo sapiens amyloid P component, serum, mRNA (cDNA clone IMAGE:4723576), complete cds. // chr1 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// GENSCAN00000039815 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:159587922:159588708:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
ENST00000289731 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:159598298:159599227:1 gene:ENSG00000158731 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039809 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:159598298:159599128:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000426330 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:159759170:159759589:1 gene:ENSG00000235226 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000039805 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:159759170:159782338:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0
NM_017823 // RefSeq // Homo sapiens dual specificity phosphatase 23 (DUSP23), mRNA. // chr1 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// XM_005245289 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens dual specificity phosphatase 23 (DUSP23), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000368107 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:159781003:159782543:1 gene:ENSG00000158716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000368108 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:159780960:159782543:1 gene:ENSG00000158716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000368109 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:159780932:159782543:1 gene:ENSG00000158716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// AB164404 // GenBank // Homo sapiens LDP-3 mRNA for low-molecular-mass dual-specificity phosphatase 3, complete cds. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// AF086553 // GenBank // Homo sapiens full length insert cDNA clone ZE12H05. // chr1 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// BC001140 // GenBank // Homo sapiens dual specificity phosphatase 23, mRNA (cDNA clone MGC:1042 IMAGE:3535406), complete cds. // chr1 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// AK000449 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ20442 fis, clone KAT04828. // chr1 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// GENSCAN00000039805 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:159759170:159782338:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_001004310 // RefSeq // Homo sapiens Fc receptor-like 6 (FCRL6), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001284217 // RefSeq // Homo sapiens Fc receptor-like 6 (FCRL6), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000321935 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:1:159800512:159816251:1 gene:ENSG00000181036 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000339348 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:159802417:159815802:1 gene:ENSG00000181036 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000368106 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:159802424:159815661:1 gene:ENSG00000181036 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000392235 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:159802424:159815592:1 gene:ENSG00000181036 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// AY212514 // GenBank // Homo sapiens tissue-type tonsil IFGP6 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// AY513661 // GenBank // Homo sapiens Fc receptor-like protein 6 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// AY654627 // GenBank // Homo sapiens IFGP6 isoform 3 mRNA, complete cds. // chr1 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// AY654628 // GenBank // Homo sapiens IFGP6 isoform 2 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000039824 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:159803773:159837157:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
NM_020125 // RefSeq // Homo sapiens SLAM family member 8 (SLAMF8), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000289707 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:159826750:159837249:1 gene:ENSG00000158714 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000471286 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:159830008:159837249:1 gene:ENSG00000158714 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000497141 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:159833005:159837249:1 gene:ENSG00000158714 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 35 // 12 // 12 // 0 /// AF146761 // GenBank // Homo sapiens BCM-like membrane protein precursor, mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// BC109194 // GenBank // Homo sapiens SLAM family member 8, mRNA (cDNA clone MGC:129578 IMAGE:40004601), complete cds. // chr1 // 100 // 50 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000368104 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:159826811:159835679:1 gene:ENSG00000158714 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 44 // 44 // 15 // 34 // 1 /// GENSCAN00000039824 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:159803773:159837157:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 47 // 47 // 16 // 34 // 1
NM_004983 // RefSeq // Homo sapiens potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 9 (KCNJ9), mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006711305 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 9 (KCNJ9), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000368088 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:160081570:160090563:1 gene:ENSG00000162728 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// U52152 // GenBank // Human inwardly rectifying potassium channel Kir3.3 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005601 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:160044053:160087817:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0
NM_000702 // RefSeq // Homo sapiens ATPase, Na+/K+ transporting, alpha 2 polypeptide (ATP1A2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000361216 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:160115773:160143591:1 gene:ENSG00000018625 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000392233 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:160115777:160141545:1 gene:ENSG00000018625 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000447527 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:160127672:160143591:1 gene:ENSG00000018625 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000472488 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:160115759:160137202:1 gene:ENSG00000018625 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// AK091617 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ34298 fis, clone FEBRA2006357, highly similar to Sodium/potassium-transporting ATPase alpha-2 chain precursor (EC 3.6.3.9). // chr1 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// AK295729 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56089 complete cds, highly similar to Sodium/potassium-transporting ATPase alpha-2 chain precursor (EC 3.6.3.9). // chr1 // 95 // 58 // 18 // 19 // 0 /// AK299460 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60028 complete cds, highly similar to Sodium/potassium-transporting ATPase alpha-2 chain precursor (EC 3.6.3.9). // chr1 // 91 // 33 // 10 // 11 // 0 /// BC052271 // GenBank // Homo sapiens ATPase, Na+/K+ transporting, alpha 2 (+) polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:59864 IMAGE:6672133), complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000005573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:160115862:160188426:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1
NM_001231 // RefSeq // Homo sapiens calsequestrin 1 (fast-twitch, skeletal muscle) (CASQ1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000368078 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:160190556:160201886:1 gene:ENSG00000143318 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000467691 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:160198210:160201493:1 gene:ENSG00000143318 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 43 // 11 // 12 // 0 /// ENST00000481081 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:160192638:160199053:1 gene:ENSG00000143318 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// AK300713 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51316 complete cds, highly similar to Calsequestrin-1 precursor. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC022289 // GenBank // Homo sapiens calsequestrin 1 (fast-twitch, skeletal muscle), mRNA (cDNA clone MGC:22462 IMAGE:4338020), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// S73775 // GenBank // Homo sapiens calmitine mRNA, nuclear gene encoding mitochondrial product, complete cds. // chr1 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// GENSCAN00000005596 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:160190770:160201376:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NR_002190 // RefSeq // Homo sapiens SUMO1 pseudogene 3 (functional) (SUMO1P3), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000439961 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:160317403:160317706:1 gene:ENSG00000235082 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_005598 // RefSeq // Homo sapiens nescient helix loop helix 1 (NHLH1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000302101 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:160367067:160372848:1 gene:ENSG00000171786 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC013789 // GenBank // Homo sapiens nescient helix loop helix 1, mRNA (cDNA clone MGC:17696 IMAGE:3866861), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// BT006859 // GenBank // Homo sapiens nescient helix loop helix 1 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// M96739 // GenBank // Human NSCL-1 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000005584 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:160370732:160425378:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NM_020335 // RefSeq // Homo sapiens VANGL planar cell polarity protein 2 (VANGL2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000368061 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:160400586:160428678:1 gene:ENSG00000162738 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK290981 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77107 complete cds, highly similar to Homo sapiens vang-like 2 (VANGL2), mRNA. // chr1 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000005584 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:160370732:160425378:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NM_004106 // RefSeq // Homo sapiens Fc fragment of IgE, high affinity I, receptor for; gamma polypeptide (FCER1G), mRNA. // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000289902 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:161215297:161219248:1 gene:ENSG00000158869 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000367992 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:161215279:161220699:1 gene:ENSG00000158869 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000490414 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:161215234:161219248:1 gene:ENSG00000158869 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// AK307102 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ97050. // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC033872 // GenBank // Homo sapiens Fc fragment of IgE, high affinity I, receptor for; gamma polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:45270 IMAGE:5219148), complete cds. // chr1 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// M33195 // GenBank // Human Fc-epsilon-receptor gamma-chain mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT007139 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000013857 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:161202386:161218943:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_001102566 // RefSeq // Homo sapiens Purkinje cell protein 4 like 1 (PCP4L1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000504449 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:161258727:161285450:1 gene:ENSG00000248485 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC028905 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4480427. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC147003 // GenBank // Homo sapiens Purkinje cell protein 4 like 1, mRNA (cDNA clone MGC:182106 IMAGE:9056931), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC147004 // GenBank // Homo sapiens Purkinje cell protein 4 like 1, mRNA (cDNA clone MGC:182107 IMAGE:9056932), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000013860 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:161273149:161284481:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_001035511 // RefSeq // Homo sapiens succinate dehydrogenase complex, subunit C, integral membrane protein, 15kDa (SDHC), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 78 // 7 // 7 // 0 /// NM_003001 // RefSeq // Homo sapiens succinate dehydrogenase complex, subunit C, integral membrane protein, 15kDa (SDHC), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 78 // 7 // 7 // 0 /// NR_103459 // RefSeq // Homo sapiens succinate dehydrogenase complex, subunit C, integral membrane protein, 15kDa (SDHC), transcript variant 6, non-coding RNA. // chr1 // 100 // 78 // 7 // 7 // 0 /// ENST00000367975 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:161314257:161375340:1 gene:ENSG00000143252 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
ENST00000384194 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:161401289:161401395:1 gene:ENSG00000206921 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT007161 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_002155 // RefSeq // Homo sapiens heat shock 70kDa protein 6 (HSP70B) (HSPA6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000309758 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:161524540:161526910:1 gene:ENSG00000173110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// AK295212 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51847 complete cds, highly similar to Heat shock 70 kDa protein 6. // chr1 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0 /// BC035665 // GenBank // Homo sapiens heat shock 70kDa protein 6 (HSP70B), mRNA (cDNA clone MGC:46216 IMAGE:5723718), complete cds. // chr1 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000013853 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:161440218:161526590:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 80 // 80 // 8 // 10 // 1
NM_002155 // RefSeq // Homo sapiens heat shock 70kDa protein 6 (HSP70B) (HSPA6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// NR_024151 // RefSeq // Homo sapiens heat shock 70kDa protein 7 (HSP70B) (HSPA7), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// ENST00000309758 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:161524540:161526910:1 gene:ENSG00000173110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// ENST00000445535 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:161606291:161608217:1 gene:ENSG00000225217 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// BC035665 // GenBank // Homo sapiens heat shock 70kDa protein 6 (HSP70B), mRNA (cDNA clone MGC:46216 IMAGE:5723718), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// AK295212 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51847 complete cds, highly similar to Heat shock 70 kDa protein 6. // chr1 // 60 // 100 // 3 // 5 // 0 /// GENSCAN00000013853 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:161440218:161526590:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// GENSCAN00000013869 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:161565820:161608217:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0
ENST00000362725 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:161699506:161699607:1 gene:ENSG00000199595 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT007199 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000497546 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:161735808:161736102:1 gene:ENSG00000241347 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// NONHSAT007201 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0
NM_007240 // RefSeq // Homo sapiens dual specificity phosphatase 12 (DUSP12), mRNA. // chr1 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// ENST00000367943 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:161749770:161757162:1 gene:ENSG00000081721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000464004 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:161749780:161753105:1 gene:ENSG00000081721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 95 // 67 // 19 // 20 // 0 /// ENST00000484291 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:161749758:161757238:1 gene:ENSG00000081721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AF119226 // GenBank // Homo sapiens dual-specificity tyrosine phosphatase YVH1 mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// BC006286 // GenBank // Homo sapiens dual specificity phosphatase 12, mRNA (cDNA clone MGC:10337 IMAGE:3958403), complete cds. // chr1 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// BT006633 // GenBank // Homo sapiens dual specificity phosphatase 12 mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000490591 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:161749805:161751781:1 gene:ENSG00000081721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1 /// GENSCAN00000013849 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:161749763:161873568:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1
NM_007348 // RefSeq // Homo sapiens activating transcription factor 6 (ATF6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000367942 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:161766294:161964070:1 gene:ENSG00000118217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// AB015856 // GenBank // Homo sapiens mRNA for ATF6, complete cds. // chr1 // 85 // 100 // 33 // 39 // 0 /// AK290498 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75428 complete cds, highly similar to Homo sapiens activating transcription factor 6 (ATF6), mRNA. // chr1 // 77 // 100 // 30 // 39 // 0 /// BC014969 // GenBank // Homo sapiens activating transcription factor 6, mRNA (cDNA clone IMAGE:4908463), complete cds. // chr1 // 100 // 31 // 12 // 12 // 0 /// BC071997 // GenBank // Homo sapiens activating transcription factor 6, mRNA (cDNA clone IMAGE:6379669), complete cds. // chr1 // 100 // 31 // 12 // 12 // 0 /// AF005887 // GenBank // Homo sapiens ATF family member ATF6 (ATF6) mRNA, complete cds. // chr1 // 67 // 100 // 26 // 39 // 0 /// AB208929 // GenBank // Homo sapiens mRNA for activating transcription factor 6 variant protein. // chr1 // 79 // 79 // 31 // 39 // 1 /// ENST00000476437 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:161840075:161860244:1 gene:ENSG00000118217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 26 // 26 // 10 // 39 // 1 /// GENSCAN00000013849 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:161749763:161873568:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 64 // 64 // 25 // 39 // 1 /// NONHSAT007205 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 26 // 26 // 10 // 39 // 1
NM_003115 // RefSeq // Homo sapiens UDP-N-acteylglucosamine pyrophosphorylase 1 (UAP1), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000271469 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:162561506:162599842:1 gene:ENSG00000117143 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000367924 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:162566037:162599831:1 gene:ENSG00000117143 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000367925 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:162566037:162599831:1 gene:ENSG00000117143 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000367926 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:162561533:162599837:1 gene:ENSG00000117143 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AB011004 // GenBank // Homo sapiens HuUAP1 mRNA for UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase, complete cds. // chr1 // 94 // 57 // 15 // 16 // 0 /// BC009377 // GenBank // Homo sapiens UDP-N-acteylglucosamine pyrophosphorylase 1, mRNA (cDNA clone MGC:15342 IMAGE:4121439), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// S73498 // GenBank // Homo sapiens AgX-1 antigen mRNA, complete cds. // chr1 // 79 // 86 // 19 // 24 // 0 /// GENSCAN00000029464 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:162566069:162599363:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0
NM_001014796 // RefSeq // Homo sapiens discoidin domain receptor tyrosine kinase 2 (DDR2), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 98 // 100 // 43 // 44 // 0 /// NM_006182 // RefSeq // Homo sapiens discoidin domain receptor tyrosine kinase 2 (DDR2), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 98 // 93 // 40 // 41 // 0 /// XM_006711345 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens discoidin domain receptor tyrosine kinase 2 (DDR2), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 50 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000367921 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:162632470:162780421:1 gene:ENSG00000162733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000367922 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:162632465:162787400:1 gene:ENSG00000162733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000415555 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:162632011:162755182:1 gene:ENSG00000162733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 20 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000446985 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:162631373:162754828:1 gene:ENSG00000162733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 18 // 8 // 8 // 0 /// BC052998 // GenBank // Homo sapiens discoidin domain receptor tyrosine kinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:60389 IMAGE:6162716), complete cds. // chr1 // 98 // 98 // 42 // 43 // 0 /// GENSCAN00000029463 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:162719064:162780246:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 30 // 30 // 0
ENST00000473793 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:162777730:162778014:1 gene:ENSG00000243173 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT007234 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000367922 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:162632465:162787400:1 gene:ENSG00000162733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// AY423733 // GenBank // Homo sapiens migration-inducing gene 16 protein mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 7 // 7 // 0 /// BX537651 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686C0390 (from clone DKFZp686C0390). // chr1 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0 /// NONHSAT007235 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
ENST00000391225 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:163509484:163509595:1 gene:ENSG00000212527 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 100 // 75 // 3 // 3 // 0 /// NONHSAT007271 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 75 // 3 // 3 // 0
ENST00000391236 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:163923670:163923873:1 gene:ENSG00000212538 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT007274 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
ENST00000362979 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:164351273:164351388:1 gene:ENSG00000199849 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT007276 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000384354 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:164639565:164639671:1 gene:ENSG00000207082 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001005214 // RefSeq // Homo sapiens leucine rich repeat containing 52 (LRRC52), mRNA. // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000294818 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:165544007:165563961:1 gene:ENSG00000162763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK098677 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ25811 fis, clone TST07369. // chr1 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// BC132981 // GenBank // Homo sapiens leucine rich repeat containing 52, mRNA (cDNA clone MGC:164612 IMAGE:40147003), complete cds. // chr1 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// BC132983 // GenBank // Homo sapiens leucine rich repeat containing 52, mRNA (cDNA clone MGC:164614 IMAGE:40147005), complete cds. // chr1 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000000333 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:165544348:165563824:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0
NR_036683 // RefSeq // Homo sapiens carbonic anhydrase XIV (CA14) pseudogene (LOC440700), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000400982 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:165698750:165709968:1 gene:ENSG00000215838 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC012108 // GenBank // Homo sapiens carbonic anhydrase XIV (CA14) pseudogene, mRNA (cDNA clone IMAGE:4643256). // chr1 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// ENST00000453762 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:165708283:165709510:1 gene:ENSG00000215838 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr1 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// NONHSAT007332 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONHSAT007333 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
ENST00000415894 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:165819353:165819787:1 gene:ENSG00000230659 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000000340 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:165819353:165819760:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
ENST00000384611 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:166042244:166042350:1 gene:ENSG00000207341 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT007348 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000434461 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:166566178:166580705:1 gene:ENSG00000238087 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT007363 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NR_002925 // RefSeq // Homo sapiens flavin containing monooxygenase 9 pseudogene (FMO9P), non-coding RNA. // chr1 // 88 // 62 // 14 // 16 // 0 /// ENST00000477875 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:166603675:166625238:1 gene:ENSG00000215834 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000488458 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:166612470:166631400:1 gene:ENSG00000215834 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:unitary_pseudogene // chr1 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC014341 // GenBank // Homo sapiens flavin containing monooxygenase 9 pseudogene, mRNA (cDNA clone IMAGE:3997249). // chr1 // 88 // 62 // 14 // 16 // 0 /// GENSCAN00000017211 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:166566178:166675464:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_017542 // RefSeq // Homo sapiens pogo transposable element with KRAB domain (POGK), mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000367875 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:166840089:166854473:1 gene:ENSG00000143157 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000367876 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:166839457:166856344:1 gene:ENSG00000143157 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000449930 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:166839447:166849208:1 gene:ENSG00000143157 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 26 // 9 // 9 // 0 /// AB040946 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1513 protein, partial cds. // chr1 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// AK093951 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ36632 fis, clone TRACH2018446. // chr1 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// AK293946 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58794 complete cds, highly similar to Pogo transposable element with KRAB domain. // chr1 // 100 // 54 // 19 // 19 // 0 /// AK299537 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58256 complete cds, highly similar to Pogo transposable element with KRAB domain. // chr1 // 100 // 60 // 21 // 21 // 0 /// BC131624 // GenBank // Homo sapiens pogo transposable element with KRAB domain, mRNA (cDNA clone MGC:149714 IMAGE:40117695), complete cds. // chr1 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000017210 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:166681991:166852815:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 40 // 40 // 14 // 35 // 1
ENST00000363166 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:167005959:167006077:1 gene:ENSG00000200036 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT007376 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONHSAT007378 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001080426 // RefSeq // Homo sapiens dual specificity phosphatase 27 (putative) (DUSP27), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 52 // 52 // 0 /// ENST00000271385 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:167094340:167128608:1 gene:ENSG00000198842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000361200 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:167094045:167129129:1 gene:ENSG00000198842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 52 // 52 // 0 /// ENST00000443333 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:167094850:167129165:1 gene:ENSG00000198842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 52 // 52 // 0 /// ENST00000485151 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:167125919:167129125:1 gene:ENSG00000198842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 19 // 19 // 10 // 52 // 1 /// GENSCAN00000032363 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:167088565:167128608:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 41 // 41 // 0
NM_052862 // RefSeq // Homo sapiens RCSD domain containing 1 (RCSD1), mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000361496 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:167630193:167697287:1 gene:ENSG00000198771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000367854 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:167630093:167706249:1 gene:ENSG00000198771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000537350 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:167630093:167706248:1 gene:ENSG00000198771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// AK025425 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ21772 fis, clone COLF7808. // chr1 // 93 // 47 // 14 // 15 // 0 /// AY530954 // GenBank // Homo sapiens protein kinase substrate CapZIP mRNA, complete cds. // chr1 // 94 // 56 // 17 // 18 // 0 /// BC013186 // GenBank // Homo sapiens RCSD domain containing 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4339483), complete cds. // chr1 // 100 // 34 // 11 // 11 // 0 /// BC101536 // GenBank // Homo sapiens RCSD domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:126585 IMAGE:8069042), complete cds. // chr1 // 91 // 69 // 20 // 22 // 0 /// BC101562 // GenBank // Homo sapiens RCSD domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:126611 IMAGE:8069068), complete cds. // chr1 // 91 // 69 // 20 // 22 // 0 /// BC143428 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone MGC:176953 IMAGE:9051936, complete cds. // chr1 // 89 // 59 // 17 // 19 // 0 /// AK124221 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ42227 fis, clone THYMU2041007. // chr1 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// GENSCAN00000032355 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:167591757:167787921:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1
AY194294 // GenBank // Homo sapiens INM04 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001031800 // RefSeq // Homo sapiens TOR signaling pathway regulator (TIPRL), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// NM_152902 // RefSeq // Homo sapiens TOR signaling pathway regulator (TIPRL), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000367830 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:168179055:168192395:1 gene:ENSG00000143155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000367833 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:168178933:168202114:1 gene:ENSG00000143155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AB097034 // GenBank // Homo sapiens mRNA for putative MAPK activating protein, complete cds, clone: PM10. // chr1 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// BC009506 // GenBank // Homo sapiens TIP41, TOR signaling pathway regulator-like (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:3794 IMAGE:3532344), complete cds. // chr1 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// BX648646 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686C19117 (from clone DKFZp686C19117). // chr1 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1 /// GENSCAN00000000034 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:168179078:168200046:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0
NM_199344 // RefSeq // Homo sapiens SFT2 domain containing 2 (SFT2D2), mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000271375 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:168226008:168253025:1 gene:ENSG00000213064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000367829 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:168225950:168239160:1 gene:ENSG00000213064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000471981 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:168225938:168236770:1 gene:ENSG00000213064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// AK290325 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76535 complete cds, highly similar to Homo sapiens SFT2 domain containing 2 (SFT2D2), mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// AL035297 // GenBank // H.sapiens gene from PAC 747L4. // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AY358675 // GenBank // Homo sapiens clone DNA59605 GPVK512 (UNQ512) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// BC068098 // GenBank // Homo sapiens SFT2 domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:78728 IMAGE:6304345), complete cds. // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT007425 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC034482 // GenBank HTC // Homo sapiens SCY1-like 1 binding protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4837122), with apparent retained intron. // chr1 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// GENSCAN00000000026 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:168225923:168242605:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
NM_005149 // RefSeq // Homo sapiens T-box 19 (TBX19), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000367821 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:168281040:168314426:1 gene:ENSG00000143178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000431969 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:168291160:168314424:1 gene:ENSG00000143178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// ENST00000441464 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:168297624:168313915:1 gene:ENSG00000143178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000465440 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:168308017:168314424:1 gene:ENSG00000143178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// AK091862 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ34543 fis, clone HLUNG2008875. // chr1 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// AK129813 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ26302 fis, clone DMC07804, highly similar to T-box transcription factor TBX19. // chr1 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// BC093664 // GenBank // Homo sapiens T-box 19, mRNA (cDNA clone MGC:120699 IMAGE:7939509), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC093666 // GenBank // Homo sapiens T-box 19, mRNA (cDNA clone MGC:120701 IMAGE:7939511), complete cds. // chr1 // 91 // 88 // 20 // 22 // 0 /// AK091404 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ34085 fis, clone FCBBF3004842, highly similar to TBX19 PROTEIN. // chr1 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// NONHSAT007433 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000000036 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:168281097:168343048:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1
NM_002995 // RefSeq // Homo sapiens chemokine (C motif) ligand 1 (XCL1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000367818 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:168576473:168582077:1 gene:ENSG00000143184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// D43768 // GenBank // Homo sapiens SCM-1 mRNA for cytokine, complete cds. // chr1 // 100 // 70 // 7 // 7 // 0
NM_003666 // RefSeq // Homo sapiens basic leucine zipper nuclear factor 1 (BLZF1), mRNA. // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000329281 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:169367970:169396540:1 gene:ENSG00000117475 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000367807 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:169367970:169377383:1 gene:ENSG00000117475 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// AF288161 // GenBank // Homo sapiens JEM-1short protein (BLZF1) mRNA, complete cds. // chr1 // 92 // 46 // 11 // 12 // 0 /// BC020716 // GenBank // Homo sapiens basic leucine zipper nuclear factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:22497 IMAGE:4723421), complete cds. // chr1 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// U79751 // GenBank // Human basic-leucine zipper nuclear factor (JEM-1) mRNA, complete cds. // chr1 // 90 // 77 // 18 // 20 // 0 /// ENST00000367808 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:169367970:169388305:1 gene:ENSG00000117475 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// AK291725 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75726 complete cds, highly similar to Homo sapiens basic leucine zipper nuclear factor 1 (JEM-1) (BLZF1), mRNA. // chr1 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// ENST00000426663 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:169368237:169380562:1 gene:ENSG00000117475 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// GENSCAN00000022789 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:169360036:169387182:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
ENST00000476398 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:169859756:169860052:1 gene:ENSG00000239494 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONHSAT007481 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_006902 // RefSeq // Homo sapiens paired related homeobox 1 (PRRX1), transcript variant pmx-1a, mRNA. // chr1 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// NM_022716 // RefSeq // Homo sapiens paired related homeobox 1 (PRRX1), transcript variant pmx-1b, mRNA. // chr1 // 95 // 70 // 20 // 21 // 0 /// XM_006711388 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens paired related homeobox 1 (PRRX1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 95 // 63 // 18 // 19 // 0 /// ENST00000239461 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:170663906:170739419:1 gene:ENSG00000116132 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// ENST00000367760 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:170663134:170736508:1 gene:ENSG00000116132 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 73 // 21 // 22 // 0 /// ENST00000495280 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:170722645:170736233:1 gene:ENSG00000116132 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// AK225968 // GenBank // Homo sapiens mRNA for paired mesoderm homeobox 1 isoform pmx-1b variant, clone: FCC113D08. // chr1 // 95 // 70 // 20 // 21 // 0 /// BC074993 // GenBank // Homo sapiens paired related homeobox 1, mRNA (cDNA clone MGC:103918 IMAGE:30915308), complete cds. // chr1 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000497230 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:170663937:170729021:1 gene:ENSG00000116132 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1 /// GENSCAN00000010716 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:170718856:170766045:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// M95929 // GenBank // Human homeobox protein (PHOX1) mRNA, 3 end. // chr1 // 93 // 50 // 14 // 15 // 0
NM_001163629 // RefSeq // Homo sapiens maestro heat-like repeat family member 9 (MROH9), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// NM_025063 // RefSeq // Homo sapiens maestro heat-like repeat family member 9 (MROH9), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000367758 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:170935526:170998806:1 gene:ENSG00000117501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000367759 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:170935471:171064765:1 gene:ENSG00000117501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000040157 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:170971748:171084154:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 55 // 11 // 11 // 0
NM_001002294 // RefSeq // Homo sapiens flavin containing monooxygenase 3 (FMO3), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NM_006894 // RefSeq // Homo sapiens flavin containing monooxygenase 3 (FMO3), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000367755 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:171090877:171117819:1 gene:ENSG00000007933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000472784 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:171090917:171107737:1 gene:ENSG00000007933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 32 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000479749 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:171090919:171110878:1 gene:ENSG00000007933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 42 // 12 // 13 // 0 /// AK223166 // GenBank // Homo sapiens mRNA for flavin containing monooxygenase 3 isoform 2 variant, clone: LNG05587. // chr1 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// AK296105 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60275 complete cds, highly similar to Dimethylaniline monooxygenase (N-oxide-forming) 3 (EC 1.14.13.8). // chr1 // 96 // 81 // 24 // 25 // 0 /// AK298406 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51030 complete cds, highly similar to Dimethylaniline monooxygenase (N-oxide-forming) 3 (EC 1.14.13.8). // chr1 // 90 // 94 // 26 // 29 // 0 /// BC032016 // GenBank // Homo sapiens flavin containing monooxygenase 3, mRNA (cDNA clone MGC:34400 IMAGE:5175615), complete cds. // chr1 // 97 // 94 // 28 // 29 // 0 /// M83772 // GenBank // Human flavin-containing monooxygenase form II (FMO2) mRNA, complete cds. // chr1 // 90 // 100 // 28 // 31 // 0 /// GENSCAN00000040153 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:171092659:171209145:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 74 // 74 // 23 // 31 // 1
NR_002601 // RefSeq // Homo sapiens flavin containing monooxygenase 6 pseudogene (FMO6P), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000236166 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:171138102:171161396:1 gene:ENSG00000117507 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000367754 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:171137740:171161568:1 gene:ENSG00000117507 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000040153 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:171092659:171209145:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 76 // 76 // 22 // 29 // 1
NM_001460 // RefSeq // Homo sapiens flavin containing monooxygenase 2 (non-functional) (FMO2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000209929 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:171185208:171211230:1 gene:ENSG00000094963 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// ENST00000529935 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:171185300:171209196:1 gene:ENSG00000094963 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 94 // 53 // 16 // 17 // 0 /// AK304385 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50367 complete cds, highly similar to Dimethylaniline monooxygenase (N-oxide-forming) 2 (EC 1.14.13.8). // chr1 // 100 // 53 // 17 // 17 // 0 /// BC005894 // GenBank // Homo sapiens flavin containing monooxygenase 2 (non-functional), mRNA (cDNA clone MGC:14468 IMAGE:4293031), complete cds. // chr1 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// BT006979 // GenBank // Homo sapiens flavin containing monooxygenase 2 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000040153 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:171092659:171209145:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 53 // 53 // 17 // 32 // 1
NM_002022 // RefSeq // Homo sapiens flavin containing monooxygenase 4 (FMO4), mRNA. // chr1 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENST00000367749 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:171314234:171342084:1 gene:ENSG00000076258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000480136 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:171334526:171342084:1 gene:ENSG00000076258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// BC002780 // GenBank // Homo sapiens flavin containing monooxygenase 4, mRNA (cDNA clone MGC:3785 IMAGE:3618884), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BT007444 // GenBank // Homo sapiens flavin containing monooxygenase 4 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// XM_006711243 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens flavin containing monooxygenase 4 (FMO4), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// ENST00000475780 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:171314234:171337423:1 gene:ENSG00000076258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// GENSCAN00000040171 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:171340690:171341839:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000040179 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:171319826:171339963:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1
NONHSAT007531 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000461095 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:171492411:171492704:1 gene:ENSG00000239373 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT007532 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000468716 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:171762074:171762524:1 gene:ENSG00000236741 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000040161 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:171762074:171762532:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NONHSAT007587 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000383957 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:172366540:172366646:1 gene:ENSG00000206684 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT007608 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_005245609 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 105 (C1orf105), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000367725 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:172452893:172468831:1 gene:ENSG00000180999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// NM_139240 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 105 (C1orf105), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 1 /// XM_005245608 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 105 (C1orf105), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// ENST00000367727 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:172420688:172468829:1 gene:ENSG00000180999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 1 /// BC038410 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 105, mRNA (cDNA clone MGC:35143 IMAGE:5169137), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 1 /// ENST00000367726 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:172451041:172468827:1 gene:ENSG00000180999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// ENST00000488100 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:172445139:172465681:1 gene:ENSG00000180999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
NM_000639 // RefSeq // Homo sapiens Fas ligand (TNF superfamily, member 6) (FASLG), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000340030 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:172659144:172666075:1 gene:ENSG00000117560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000367721 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:172659018:172666874:1 gene:ENSG00000117560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF288573 // GenBank // Homo sapiens FasL isoform mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// AY225406 // GenBank // Homo sapiens FAS ligand (TNFSF6) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// AY858799 // GenBank // Homo sapiens CD95 ligand (FASLG) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 75 // 23 // 24 // 0 /// BC017502 // GenBank // Homo sapiens Fas ligand (TNF superfamily, member 6), mRNA (cDNA clone MGC:23109 IMAGE:4849770), complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// D38122 // GenBank // Homo sapiens mRNA for Fas ligand, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// U08137 // GenBank // Human Fas ligand mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// U11821 // GenBank // Human Fas ligand (FasL) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000031300 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:172659202:172666016:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0
NM_004905 // RefSeq // Homo sapiens peroxiredoxin 6 (PRDX6), mRNA. // chr1 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000340385 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:173477266:173488807:1 gene:ENSG00000117592 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000470017 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:173481199:173488015:1 gene:ENSG00000117592 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 70 // 14 // 14 // 0 /// AK289352 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76595 complete cds, highly similar to Homo sapiens peroxiredoxin 6 (PRDX6), mRNA. // chr1 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0 /// AK300680 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51310 complete cds, moderately similar to Peroxiredoxin-6 (EC 1.11.1.15). // chr1 // 88 // 80 // 14 // 16 // 0 /// BC035857 // GenBank // Homo sapiens peroxiredoxin 6, mRNA (cDNA clone MGC:46173 IMAGE:5767682), complete cds. // chr1 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// BC053550 // GenBank // Homo sapiens peroxiredoxin 6, mRNA (cDNA clone MGC:61484 IMAGE:6013037), complete cds. // chr1 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// D14662 // GenBank // Homo sapiens KIAA0106 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// EU794652 // GenBank // Homo sapiens epididymis secretory sperm binding protein Li 128m (HEL-S-128m) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000016951 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:173477398:173487863:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 55 // 11 // 11 // 0 /// BC017252 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:2905229, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr1 // 70 // 70 // 14 // 20 // 1 /// AK095940 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ38621 fis, clone HEART2008111. // chr1 // 45 // 45 // 9 // 20 // 1
ENST00000479505 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:173714941:173733828:1 gene:ENSG00000076321 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000493170 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:173715567:173734513:1 gene:ENSG00000076321 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 33 // 12 // 12 // 0 /// AB026190 // GenBank // Homo sapiens mRNA for Kelch motif containing protein, complete cds. // chr1 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// BC005253 // GenBank // Homo sapiens kelch-like 20 (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:3951189), complete cds. // chr1 // 100 // 33 // 12 // 12 // 0 /// BC063418 // GenBank // Homo sapiens kelch-like 20 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:74874 IMAGE:5221643), complete cds. // chr1 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// NM_014458 // RefSeq // Homo sapiens kelch-like family member 20 (KLHL20), mRNA. // chr1 // 81 // 81 // 29 // 36 // 1 /// ENST00000209884 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:173714984:173786702:1 gene:ENSG00000076321 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 75 // 75 // 27 // 36 // 1 /// AJ844466 // GenBank // Homo sapiens partial mRNA for KLEIP (kelch-like ECT2 interacting protein), (KLHLX gene). // chr1 // 61 // 61 // 22 // 36 // 1 /// AK300755 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57439 complete cds, highly similar to Kelch-like protein 20. // chr1 // 61 // 61 // 22 // 36 // 1 /// NONHSAT007648 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000016944 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:173715172:173785247:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 64 // 64 // 23 // 36 // 1
ENST00000363804 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:173791548:173791887:1 gene:ENSG00000200674 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT007651 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000516548 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:173808489:173808622:1 gene:ENSG00000252357 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT007656 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_018122 // RefSeq // Homo sapiens aspartyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (DARS2), mRNA. // chr1 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000361951 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:173824503:173858546:1 gene:ENSG00000117593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000471476 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:173840913:173857838:1 gene:ENSG00000117593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 93 // 36 // 14 // 15 // 0 /// AK290873 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76156 complete cds, highly similar to Homo sapiens aspartyl-tRNA synthetase 2 (DARS2), mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// BC045173 // GenBank // Homo sapiens aspartyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:43833 IMAGE:5273243), complete cds. // chr1 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000016946 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:173826421:173857705:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 35 // 35 // 0 /// AK022713 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ12651 fis, clone NT2RM4002062, moderately similar to ASPARTYL-TRNA SYNTHETASE (EC 6.1.1.12). // chr1 // 33 // 33 // 14 // 42 // 1
NM_005684 // RefSeq // Homo sapiens G protein-coupled receptor 52 (GPR52), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000367685 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:174448111:174449198:1 gene:ENSG00000203737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// BC067456 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 52, mRNA (cDNA clone MGC:79289 IMAGE:6971753), complete cds. // chr1 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// BC067457 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 52, mRNA (cDNA clone MGC:79290 IMAGE:6971754), complete cds. // chr1 // 94 // 63 // 16 // 17 // 0 /// BC067458 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 52, mRNA (cDNA clone MGC:79291 IMAGE:6971755), complete cds. // chr1 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// BC067459 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 52, mRNA (cDNA clone MGC:79292 IMAGE:6971756), complete cds. // chr1 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// BC067460 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 52, mRNA (cDNA clone MGC:79293 IMAGE:6971757), complete cds. // chr1 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// BC069460 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 52, mRNA (cDNA clone MGC:97070 IMAGE:7262282), complete cds. // chr1 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// HQ995526 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 52 (GPR52) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// BC095532 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 52, mRNA (cDNA clone MGC:111751 IMAGE:7002024), complete cds. // chr1 // 74 // 100 // 20 // 27 // 0 /// GENSCAN00000005435 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:174448112:174449197:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0
ENST00000516743 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:174996524:174996629:1 gene:ENSG00000252552 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT007743 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001007214 // RefSeq // Homo sapiens calcyclin binding protein (CACYBP), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NM_014412 // RefSeq // Homo sapiens calcyclin binding protein (CACYBP), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000367679 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:174999733:175011710:1 gene:ENSG00000116161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000473925 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:174999955:175008754:1 gene:ENSG00000116161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// AF314752 // GenBank // Homo sapiens calcyclin binding protein (CACYBP) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// BC005975 // GenBank // Homo sapiens calcyclin binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:14660 IMAGE:4102572), complete cds. // chr1 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0 /// BC022352 // GenBank // Homo sapiens calcyclin binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:23835 IMAGE:4281339), complete cds. // chr1 // 89 // 36 // 8 // 9 // 0 /// BC078151 // GenBank // Homo sapiens calcyclin binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:87971 IMAGE:6065872), complete cds. // chr1 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000426793 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:174999435:175004750:1 gene:ENSG00000116161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// ENST00000483307 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:174999945:175005050:1 gene:ENSG00000116161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// ENST00000613570 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:1:174999163:175011715:1 gene:ENSG00000116161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_022093 // RefSeq // Homo sapiens tenascin N (TNN), mRNA. // chr1 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000239462 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:175067858:175148066:1 gene:ENSG00000120332 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// BC136619 // GenBank // Homo sapiens tenascin N, mRNA (cDNA clone MGC:168232 IMAGE:9020609), complete cds. // chr1 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// BC144305 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone MGC:177842 IMAGE:9052825, complete cds. // chr1 // 97 // 90 // 36 // 37 // 0 /// ENST00000621086 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:175077419:175147936:1 gene:ENSG00000120332 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000622870 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:175077389:175147391:1 gene:ENSG00000120332 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 90 // 36 // 37 // 0 /// GENSCAN00000001380 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:175077434:175147071:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0
NM_021936 // RefSeq // Homo sapiens pappalysin 2 (PAPPA2), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 32 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000367661 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:176463171:176691204:1 gene:ENSG00000116183 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 32 // 12 // 12 // 0 /// AF342990 // GenBank // Homo sapiens pregnancy-associated plasma protein E2 (PAPPE) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 32 // 12 // 12 // 0 /// BC117193 // GenBank // Homo sapiens pappalysin 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:40125744), complete cds. // chr1 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0 /// BC117195 // GenBank // Homo sapiens pappalysin 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:40125746), complete cds. // chr1 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0 /// BC152552 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:40147673. // chr1 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// NM_020318 // RefSeq // Homo sapiens pappalysin 2 (PAPPA2), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 95 // 95 // 36 // 38 // 1 /// ENST00000367662 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:176463171:176845605:1 gene:ENSG00000116183 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 97 // 37 // 38 // 1 /// AF311940 // GenBank // Homo sapiens pregnancy-associated plasma preproprotein-A2 mRNA, complete cds. // chr1 // 82 // 82 // 31 // 38 // 1 /// AF342989 // GenBank // Homo sapiens pregnancy-associated plasma protein E1 (PAPPE) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 95 // 95 // 36 // 38 // 1 /// GENSCAN00000041075 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:176625003:176842454:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0
NM_021165 // RefSeq // Homo sapiens bone morphogenetic protein/retinoic acid inducible neural-specific 2 (BRINP2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000361539 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:177171497:177282422:1 gene:ENSG00000198797 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000478325 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:177256860:177281814:1 gene:ENSG00000198797 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// AB161694 // GenBank // Homo sapiens DBCCR1L2 mRNA for DBCCR1-like2, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK123336 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ41342 fis, clone BRAWH2001940. // chr1 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// AK296524 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60628 complete cds, highly similar to Protein FAM5B precursor. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC028036 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 5, member B, mRNA (cDNA clone MGC:40127 IMAGE:5242899), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026136 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:177229877:177281528:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_004841 // RefSeq // Homo sapiens RAS protein activator like 2 (RASAL2), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 83 // 38 // 38 // 0 /// NM_170692 // RefSeq // Homo sapiens RAS protein activator like 2 (RASAL2), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000367649 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:178094141:178473422:1 gene:ENSG00000075391 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 98 // 89 // 40 // 41 // 0 /// ENST00000433130 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:178452437:178473522:1 gene:ENSG00000075391 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 37 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000462775 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:178341471:178478850:1 gene:ENSG00000075391 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 38 // 38 // 0 /// AF047711 // GenBank // Homo sapiens nGAP mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 78 // 36 // 36 // 0 /// AK311017 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ18059. // chr1 // 92 // 28 // 12 // 13 // 0 /// BC041045 // GenBank // Homo sapiens, Similar to RAS protein activator like 2, clone IMAGE:4902898, mRNA, partial cds. // chr1 // 100 // 33 // 15 // 15 // 0 /// BC110611 // GenBank // Homo sapiens RAS protein activator like 2, mRNA (cDNA clone MGC:129919 IMAGE:40028914), complete cds. // chr1 // 97 // 85 // 38 // 39 // 0 /// GENSCAN00000000718 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:178233292:178473239:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 36 // 36 // 0
NR_033186 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 220 (C1orf220), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000367638 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:178542752:178545500:1 gene:ENSG00000213057 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000521244 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:178542796:178548889:1 gene:ENSG00000213057 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC136727 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 220, mRNA (cDNA clone MGC:168340 IMAGE:9020717), complete cds. // chr1 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0
ENST00000364477 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:178560913:178561029:1 gene:ENSG00000201347 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 100 // 75 // 3 // 3 // 0 /// NONHSAT007823 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 75 // 3 // 3 // 0
NM_001286247 // RefSeq // Homo sapiens Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 2 (RALGPS2), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// NM_152663 // RefSeq // Homo sapiens Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 2 (RALGPS2), transcript variant 10, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000324778 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:178725396:178883533:1 gene:ENSG00000116191 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 38 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000367634 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:178725147:178921841:1 gene:ENSG00000116191 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000367635 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:178725165:178920103:1 gene:ENSG00000116191 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000495034 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:178725165:178879788:1 gene:ENSG00000116191 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0 /// AK001106 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ10244 fis, clone HEMBB1000632, weakly similar to GUANINE NUCLEOTIDE RELEASING PROTEIN. // chr1 // 92 // 54 // 12 // 13 // 0 /// AK301753 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61610 complete cds, highly similar to Homo sapiens Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 2 (RALGPS2), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// BC047391 // GenBank // Homo sapiens Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 2, mRNA (cDNA clone MGC:48311 IMAGE:5298449), complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT007834 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr1 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0
NM_014864 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 20, member B (FAM20B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000263733 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:179025896:179076562:1 gene:ENSG00000116199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AB007944 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA0475 protein, partial cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AB480690 // GenBank // Homo sapiens gxk1 mRNA for glycosaminoglycan xylosylkinase, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK289989 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75598 complete cds. // chr1 // 92 // 87 // 24 // 26 // 0 /// BC046441 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 20, member B, mRNA (cDNA clone MGC:34351 IMAGE:5197154), complete cds. // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC051794 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 20, member B, mRNA (cDNA clone MGC:57628 IMAGE:5492043), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000039962 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:179043848:179072144:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0
ENST00000364749 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:179201487:179201627:1 gene:ENSG00000201619 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT007854 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000516066 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:179576268:179576349:1 gene:ENSG00000251875 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 84 // 79 // 16 // 19 // 0 /// NONHSAT007866 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 84 // 79 // 16 // 19 // 0
NM_173509 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 163, member A (FAM163A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_005244913 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens family with sequence similarity 163, member A (FAM163A), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006711177 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens family with sequence similarity 163, member A (FAM163A), transcript variant X6, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000341785 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:179743163:179816198:1 gene:ENSG00000143340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AK292432 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78583 complete cds. // chr1 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0 /// AK310711 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17753. // chr1 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// AK313887 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ94522. // chr1 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0 /// AY902195 // GenBank // Homo sapiens neuroblastoma derived secretory protein mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC009382 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 163, member A, mRNA (cDNA clone MGC:16664 IMAGE:4124490), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC001205 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA similar to KIAA0700 protein (cDNA clone IMAGE:3501686). // chr1 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000039952 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:179782359:179833671:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
ENST00000580835 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:179900262:179900564:1 gene:ENSG00000264916 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT008229 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_014810 // RefSeq // Homo sapiens centrosomal protein 350kDa (CEP350), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 58 // 58 // 0 /// ENST00000367607 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:179954738:180114880:1 gene:ENSG00000135837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 58 // 58 // 0 /// ENST00000429851 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:180073819:180113380:1 gene:ENSG00000135837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 29 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000490141 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:180085604:180111192:1 gene:ENSG00000135837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 17 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000491495 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:179954773:179996963:1 gene:ENSG00000135837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 14 // 8 // 8 // 0 /// AF287356 // GenBank // Homo sapiens centrosome-associated protein 350 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 56 // 56 // 0 /// AK126046 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44058 fis, clone TESTI4035063. // chr1 // 100 // 17 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000035100 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:179968886:180111161:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 50 // 50 // 0
AY358491 // GenBank // Homo sapiens clone DNA125192 GLLV3061 (UNQ3061) mRNA, complete cds. // chr1 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
NM_033343 // RefSeq // Homo sapiens LIM homeobox 4 (LHX4), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000263726 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:180230286:180278982:1 gene:ENSG00000121454 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000561113 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:180248285:180271894:1 gene:ENSG00000121454 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// AB055703 // GenBank // Homo sapiens LHx4 mRNA for LIM homeobox 4, complete cds. // chr1 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// AB055704 // GenBank // Homo sapiens LHx4 mRNA for LIM homeobox 4 transcript variant, complete cds. // chr1 // 86 // 47 // 12 // 14 // 0 /// AF179849 // GenBank // Homo sapiens LIM homeobox protein 4 (LHX4) mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// AF282899 // GenBank // Homo sapiens LIM homeobox protein (LHX4) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// AY053457 // GenBank // Homo sapiens LIM homeodomain protein (LHX4) mRNA, complete cds. // chr1 // 95 // 67 // 19 // 20 // 0 /// BC011759 // GenBank // Homo sapiens LIM homeobox 4, mRNA (cDNA clone MGC:19602 IMAGE:3529089), complete cds. // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000558139 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:180230298:180248697:1 gene:ENSG00000121454 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// GENSCAN00000035107 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:180266231:180274579:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT008252 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
ENST00000450197 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:180434800:180435936:1 gene:ENSG00000235060 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 86 // 100 // 19 // 22 // 0
NM_001135669 // RefSeq // Homo sapiens xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1 (XPR1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// NM_004736 // RefSeq // Homo sapiens xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1 (XPR1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000367589 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:180632032:180886126:1 gene:ENSG00000143324 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000367590 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:180632004:180890251:1 gene:ENSG00000143324 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// AF089744 // GenBank // Homo sapiens xenotropic and polytropic murine leukemia virus receptor (X3) mRNA, complete cds. // chr1 // 93 // 100 // 39 // 42 // 0 /// AF099082 // GenBank // Homo sapiens xenotropic and polytropic murine retrovirus receptor (XPR1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// AF115389 // GenBank // Homo sapiens SYG1 protein (SYG1) mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 86 // 35 // 36 // 0 /// BC041142 // GenBank // Homo sapiens xenotropic and polytropic retrovirus receptor, mRNA (cDNA clone MGC:47521 IMAGE:5582839), complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000035109 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:180635171:180965763:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 62 // 62 // 26 // 42 // 1
NM_020950 // RefSeq // Homo sapiens KIAA1614 (KIAA1614), mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000367587 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:180928147:180946102:1 gene:ENSG00000135835 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000367588 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:180913189:180951614:1 gene:ENSG00000135835 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK090668 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ33349 fis, clone BRACE2003905. // chr1 // 94 // 50 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000035109 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:180635171:180965763:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 78 // 78 // 25 // 32 // 1
NM_016545 // RefSeq // Homo sapiens immediate early response 5 (IER5), mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000367577 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:181088712:181090838:1 gene:ENSG00000162783 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AF258581 // GenBank // Homo sapiens PP4583 mRNA, complete cds. // chr1 // 81 // 84 // 17 // 21 // 0 /// AJ251089 // GenBank // Homo sapiens mRNA for hypothetical protein, clone AV1-56. // chr1 // 89 // 76 // 17 // 19 // 0 /// BC000128 // GenBank // Homo sapiens immediate early response 5, mRNA (cDNA clone MGC:5355 IMAGE:3048356), complete cds. // chr1 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0 /// BC108253 // GenBank // Homo sapiens immediate early response 5, mRNA (cDNA clone MGC:102760 IMAGE:6025403), complete cds. // chr1 // 86 // 84 // 18 // 21 // 0 /// AK300732 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56760 complete cds, highly similar to Immediate early response gene 5 protein. // chr1 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000031151 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:181034008:181089886:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1
ENST00000517168 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:181771566:181771644:1 gene:ENSG00000252977 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 56 // 100 // 14 // 25 // 0 /// NONHSAT008294 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 56 // 100 // 14 // 25 // 0
ENST00000384037 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:182327068:182327174:1 gene:ENSG00000206764 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT008313 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000423841 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:182336001:182336334:1 gene:ENSG00000231684 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000047246 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:182318408:182336340:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NR_034131 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 272 (LINC00272), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000367563 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:182407621:182414815:1 gene:ENSG00000203729 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC140780 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 120, mRNA (cDNA clone MGC:176457 IMAGE:9021648), complete cds. // chr1 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// ENST00000612603 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:182407771:182409332:1 gene:ENSG00000203729 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// NONHSAT008315 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// TCONS_00000009-XLOC_000485 // Rinn lincRNA // linc-RGSL1-1 chr1:+:182376755-182383948 // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001357 // RefSeq // Homo sapiens DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box helicase 9 (DHX9), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NR_033302 // RefSeq // Homo sapiens DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box helicase 9 (DHX9), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000367549 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:182839369:182887751:1 gene:ENSG00000135829 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000473076 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:182881285:182887747:1 gene:ENSG00000135829 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 43 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000485081 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:182877418:182887747:1 gene:ENSG00000135829 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 48 // 11 // 11 // 0 /// AK096582 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39263 fis, clone OCBBF2009571, highly similar to ATP-dependent RNA helicase A (EC 3.6.1.-). // chr1 // 100 // 48 // 11 // 11 // 0 /// BC137136 // GenBank // Homo sapiens DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 9, mRNA (cDNA clone MGC:168756 IMAGE:9021133), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// U03643 // GenBank // Human leukophysin (LKP) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 43 // 10 // 10 // 0 /// L13848 // GenBank // Human RNA helicase A mRNA, complete cds. // chr1 // 65 // 100 // 15 // 23 // 0 /// GENSCAN00000047235 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:182770111:182887434:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0
NM_002293 // RefSeq // Homo sapiens laminin, gamma 1 (formerly LAMB2) (LAMC1), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000258341 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:183023460:183145592:1 gene:ENSG00000135862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// BC015586 // GenBank // Homo sapiens laminin, gamma 1 (formerly LAMB2), mRNA (cDNA clone IMAGE:4642245), complete cds. // chr1 // 100 // 36 // 13 // 13 // 0 /// J03202 // GenBank // Human laminin B2 chain mRNA, complete cds. // chr1 // 94 // 94 // 32 // 34 // 0 /// GENSCAN00000009033 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:183023717:183142790:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0
NM_005562 // RefSeq // Homo sapiens laminin, gamma 2 (LAMC2), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// NM_018891 // RefSeq // Homo sapiens laminin, gamma 2 (LAMC2), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// XM_006711316 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens laminin, gamma 2 (LAMC2), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000264144 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:183186288:183244900:1 gene:ENSG00000058085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000493293 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:183186238:183241261:1 gene:ENSG00000058085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// BC112286 // GenBank // Homo sapiens laminin, gamma 2, mRNA (cDNA clone MGC:138491 IMAGE:8327754), complete cds. // chr1 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// BC113378 // GenBank // Homo sapiens laminin, gamma 2, mRNA (cDNA clone MGC:141938 IMAGE:8322430), complete cds. // chr1 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// AK296944 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57342 complete cds, highly similar to Laminin gamma-2 chain precursor. // chr1 // 85 // 85 // 28 // 33 // 1 /// GENSCAN00000009030 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:183186353:183243400:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0
ENST00000384352 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:184315658:184315765:1 gene:ENSG00000207080 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT008381 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000479178 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:184335658:184335949:1 gene:ENSG00000244568 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT008383 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_030806 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 21 (C1orf21), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000235307 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:184387058:184629020:1 gene:ENSG00000116667 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF312864 // GenBank // Homo sapiens C1orf21 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY258286 // GenBank // Homo sapiens proliferation-inducing protein 13 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// BC028567 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 21, mRNA (cDNA clone MGC:16172 IMAGE:3635521), complete cds. // chr1 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0
NM_007212 // RefSeq // Homo sapiens ring finger protein 2 (RNF2), mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000367509 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:185045526:185101057:1 gene:ENSG00000121481 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000367510 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:185045364:185102608:1 gene:ENSG00000121481 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000453650 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:185046096:185098344:1 gene:ENSG00000121481 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 39 // 9 // 9 // 0 /// AF141327 // GenBank // Homo sapiens ring finger protein BAP-1 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// BC012583 // GenBank // Homo sapiens ring finger protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:13490 IMAGE:4285715), complete cds. // chr1 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000033868 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:185087554:185100301:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 52 // 12 // 12 // 0
NM_001105518 // RefSeq // Homo sapiens SWT1 RNA endoribonuclease homolog (S. cerevisiae) (SWT1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NM_017673 // RefSeq // Homo sapiens SWT1 RNA endoribonuclease homolog (S. cerevisiae) (SWT1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_005245271 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens SWT1 RNA endoribonuclease homolog (S. cerevisiae) (SWT1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006711391 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens SWT1 RNA endoribonuclease homolog (S. cerevisiae) (SWT1), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000367500 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:185157159:185291765:1 gene:ENSG00000116668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AF288392 // GenBank // Homo sapiens C1orf26 mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// AK291443 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77988 complete cds. // chr1 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// BC030781 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 26, mRNA (cDNA clone MGC:26704 IMAGE:4821611), complete cds. // chr1 // 88 // 96 // 22 // 25 // 0 /// ENST00000367501 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:185157080:185291007:1 gene:ENSG00000116668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1
NM_031935 // RefSeq // Homo sapiens hemicentin 1 (HMCN1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 125 // 125 // 0 /// ENST00000271588 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:185734551:186190949:1 gene:ENSG00000143341 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 125 // 125 // 0 /// ENST00000485744 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:185957069:185993437:1 gene:ENSG00000143341 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 12 // 15 // 15 // 0 /// AF156100 // GenBank // Homo sapiens hemicentin mRNA, complete cds. // chr1 // 98 // 100 // 123 // 125 // 0 /// AK056336 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ31774 fis, clone NT2RI2008050, weakly similar to BASEMENT MEMBRANE-SPECIFIC HEPARAN SULFATE PROTEOGLYCAN CORE PROTEIN PRECURSOR. // chr1 // 100 // 12 // 15 // 15 // 0 /// AL833232 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp762L185 (from clone DKFZp762L185). // chr1 // 100 // 22 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000033857 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:185864491:185965915:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 12 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000046087 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:185970335:186189878:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 95 // 95 // 0
NM_001127708 // RefSeq // Homo sapiens proteoglycan 4 (PRG4), transcript variant B, mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// NM_001127709 // RefSeq // Homo sapiens proteoglycan 4 (PRG4), transcript variant C, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// NM_001127710 // RefSeq // Homo sapiens proteoglycan 4 (PRG4), transcript variant D, mRNA. // chr1 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// NM_005807 // RefSeq // Homo sapiens proteoglycan 4 (PRG4), transcript variant A, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000367482 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:186296279:186308682:1 gene:ENSG00000116690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 35 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000367483 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:186296279:186314562:1 gene:ENSG00000116690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000367485 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:186296279:186314562:1 gene:ENSG00000116690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000445192 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:186296279:186314562:1 gene:ENSG00000116690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AK301343 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61694 complete cds, highly similar to Proteoglycan-4 precursor. // chr1 // 100 // 53 // 18 // 18 // 0 /// U70136 // GenBank // Human megakaryocyte stimulating factor mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// GENSCAN00000046089 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:186238280:186313778:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// NONHSAT008445 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr1 // 100 // 32 // 11 // 11 // 0
NM_022375 // RefSeq // Homo sapiens oculomedin (OCLM), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000574641 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:186400572:186401455:1 gene:ENSG00000262180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF142063 // GenBank // Homo sapiens oculomedin mRNA, complete cds. // chr1 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// BC069096 // GenBank // Homo sapiens oculomedin, mRNA (cDNA clone MGC:95371 IMAGE:7216910), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC093987 // GenBank // Homo sapiens oculomedin, mRNA (cDNA clone MGC:121022 IMAGE:7939832), complete cds. // chr1 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// BC093989 // GenBank // Homo sapiens oculomedin, mRNA (cDNA clone MGC:121024 IMAGE:7939834), complete cds. // chr1 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0
NM_024420 // RefSeq // Homo sapiens phospholipase A2, group IVA (cytosolic, calcium-dependent) (PLA2G4A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000367466 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:186828953:186988981:1 gene:ENSG00000116711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000466600 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:186854286:186939230:1 gene:ENSG00000116711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 40 // 16 // 16 // 0 /// AK290336 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75258 complete cds, highly similar to Homo sapiens phospholipase A2, group IVA (cytosolic, calcium-dependent) (PLA2G4A), mRNA. // chr1 // 97 // 98 // 38 // 39 // 0 /// AK302938 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51413 complete cds, highly similar to Cytosolic phospholipase A2. // chr1 // 97 // 80 // 31 // 32 // 0 /// BC114340 // GenBank // Homo sapiens phospholipase A2, group IVA (cytosolic, calcium-dependent), mRNA (cDNA clone MGC:126350 IMAGE:40034995), complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// M68874 // GenBank // Homo sapiens phosphatidylcholine 2-acylhydrolase (cPLA2) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// M72393 // GenBank // Human calcium-dependent phospholipid-binding protein (PLA2) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000046090 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:186840844:186965593:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 65 // 26 // 26 // 0
ENST00000429725 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:187641226:187643860:1 gene:ENSG00000230426 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC040856 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 99, mRNA (cDNA clone MGC:50356 IMAGE:5526465), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000614505 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:187641616:187643849:1 gene:ENSG00000230426 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 38 // 9 // 9 // 0 /// BC101452 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:40022131. // chr1 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT008466 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_130782 // RefSeq // Homo sapiens regulator of G-protein signaling 18 (RGS18), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000367460 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:192158457:192185815:1 gene:ENSG00000150681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000492967 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:192158514:192181454:1 gene:ENSG00000150681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// AF076642 // GenBank // Homo sapiens regulator of G-protein signaling 13 mRNA, complete cds. // chr1 // 92 // 92 // 22 // 24 // 0 /// AF268036 // GenBank // Homo sapiens regulator of G-protein signaling 18 mRNA, complete cds. // chr1 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// AK292015 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78111 complete cds, highly similar to Homo sapiens regulator of G-protein signalling 18 (RGS18), mRNA. // chr1 // 87 // 88 // 20 // 23 // 0 /// BC020632 // GenBank // Homo sapiens regulator of G-protein signaling 18, mRNA (cDNA clone MGC:22266 IMAGE:4714909), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000481707 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:192158485:192163656:1 gene:ENSG00000150681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// ENST00000491030 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:192158676:192160683:1 gene:ENSG00000150681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// NONHSAT008528 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT008527 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONHSAT008529 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001039152 // RefSeq // Homo sapiens regulator of G-protein signaling 21 (RGS21), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000417209 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:192316992:192367285:1 gene:ENSG00000253148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AY643711 // GenBank // Homo sapiens RGS mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000020200 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:192306417:192507568:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1
ENST00000367427 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:196774813:196793488:1 gene:ENSG00000116785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 61 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000471440 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:1:196774813:196790022:1 gene:ENSG00000116785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 61 // 11 // 11 // 0 /// BC070259 // GenBank // Homo sapiens complement factor H-related 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:4716670), complete cds. // chr1 // 100 // 61 // 11 // 11 // 0 /// NM_001166624 // RefSeq // Homo sapiens complement factor H-related 3 (CFHR3), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 56 // 56 // 10 // 18 // 1 /// NM_021023 // RefSeq // Homo sapiens complement factor H-related 3 (CFHR3), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 56 // 56 // 10 // 18 // 1 /// ENST00000367425 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:196774795:196794073:1 gene:ENSG00000116785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 56 // 56 // 10 // 18 // 1 /// ENST00000391985 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:1:196774816:196793675:1 gene:ENSG00000116785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 56 // 56 // 10 // 18 // 1 /// AK298459 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60136 complete cds, moderately similar to Complement factor H-related protein 3 precursor. // chr1 // 56 // 56 // 10 // 18 // 1 /// BC020687 // GenBank // Homo sapiens complement factor H-related 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:4734101), complete cds. // chr1 // 50 // 50 // 9 // 18 // 1 /// BC058009 // GenBank // Homo sapiens complement factor H-related 3, mRNA (cDNA clone MGC:61905 IMAGE:4716505), complete cds. // chr1 // 56 // 56 // 10 // 18 // 1
NM_002113 // RefSeq // Homo sapiens complement factor H-related 1 (CFHR1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000320493 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:196819757:196832189:1 gene:ENSG00000244414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000367424 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:196819781:196832189:1 gene:ENSG00000244414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0 /// BC016755 // GenBank // Homo sapiens complement factor H-related 1, mRNA (cDNA clone MGC:13525 IMAGE:3934474), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC107771 // GenBank // Homo sapiens complement factor H-related 1, mRNA (cDNA clone MGC:104329 IMAGE:4712577), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// M65292 // GenBank // Human factor H homologue mRNA, complete cds. // chr1 // 70 // 100 // 7 // 10 // 0 /// M65293 // GenBank // Human factor H homologue mRNA, complete cds. // chr1 // 70 // 100 // 7 // 10 // 0 /// GENSCAN00000005264 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:196774887:196831999:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONHSAT008600 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 86 // 70 // 6 // 7 // 0
NM_001201550 // RefSeq // Homo sapiens complement factor H-related 4 (CFHR4), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NM_001201551 // RefSeq // Homo sapiens complement factor H-related 4 (CFHR4), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// XM_006711128 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens complement factor H-related 4 (CFHR4), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// XM_006711130 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens complement factor H-related 4 (CFHR4), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000367416 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:196888014:196918713:1 gene:ENSG00000134365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// AJ640130 // GenBank // Homo sapiens mRNA for complement factor H-related protein 4A precursor (FHR4 gene). // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// AK292752 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77201 complete cds, highly similar to Homo sapiens mRNA for complement factor H-related protein 4A precursor (FHR4 gene). // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NM_006684 // RefSeq // Homo sapiens complement factor H-related 4 (CFHR4), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 1 /// ENST00000251424 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:196888082:196918633:1 gene:ENSG00000134365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 1 /// ENST00000367418 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:1:196888103:196918428:1 gene:ENSG00000134365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 89 // 89 // 8 // 9 // 1 /// BC074957 // GenBank // Homo sapiens complement factor H-related 4, mRNA (cDNA clone MGC:103897 IMAGE:30915282), complete cds. // chr1 // 89 // 89 // 8 // 9 // 1
NM_005666 // RefSeq // Homo sapiens complement factor H-related 2 (CFHR2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// XM_006711285 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens complement factor H-related 2 (CFHR2), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000367415 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:196943781:196959226:1 gene:ENSG00000080910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000367421 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:196819745:196959210:1 gene:ENSG00000276911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSG00000080910 // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000473386 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:196943858:196959215:1 gene:ENSG00000080910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000476712 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:196943772:196959226:1 gene:ENSG00000080910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000496448 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:196943827:196959219:1 gene:ENSG00000080910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC022283 // GenBank // Homo sapiens complement factor H-related 2, mRNA (cDNA clone MGC:22434 IMAGE:4734331), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONHSAT008605 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 86 // 70 // 6 // 7 // 0 /// NONHSAT008608 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONHSAT008609 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_030787 // RefSeq // Homo sapiens complement factor H-related 5 (CFHR5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000256785 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:196977556:197009674:1 gene:ENSG00000134389 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AF295327 // GenBank // Homo sapiens complement factor H-related protein 5 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC111773 // GenBank // Homo sapiens complement factor H-related 5, mRNA (cDNA clone MGC:133240 IMAGE:40034462), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000042092 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:196982885:197008683:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 33 // 8 // 8 // 0
NM_001024594 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 53 (C1orf53), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000367393 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:197902647:197907367:1 gene:ENSG00000203724 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000436652 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:197902778:197907367:1 gene:ENSG00000203724 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000542800 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:197905517:197907364:1 gene:ENSG00000203724 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// BC130608 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 53, mRNA (cDNA clone MGC:163480 IMAGE:40146639), complete cds. // chr1 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// BC130634 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 53, mRNA (cDNA clone MGC:163506 IMAGE:40146665), complete cds. // chr1 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// NONHSAT008636 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000042097 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:197902650:197908982:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_133494 // RefSeq // Homo sapiens NIMA-related kinase 7 (NEK7), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000367383 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:198157121:198256531:1 gene:ENSG00000151414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000367385 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:198156963:198322420:1 gene:ENSG00000151414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000493790 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:198277704:198319749:1 gene:ENSG00000151414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000538004 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:198156998:198319522:1 gene:ENSG00000151414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AB062450 // GenBank // Homo sapiens nek7 mRNA for NEK7, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000391974 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:198220799:198262623:1 gene:ENSG00000151414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// ENST00000544035 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:198206874:198253168:1 gene:ENSG00000151414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1 /// GENSCAN00000037304 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:198232581:198319522:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1
ENST00000436136 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:198949016:198949805:1 gene:ENSG00000227747 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000037296 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:198919978:198949827:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0
ENST00000363269 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:199888159:199888261:1 gene:ENSG00000200139 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT008678 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000517051 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:200054061:200054165:1 gene:ENSG00000252860 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT008685 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000439056 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:200213678:200214322:1 gene:ENSG00000233827 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000014836 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:200213573:200283076:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 70 // 14 // 14 // 0
NM_203459 // RefSeq // Homo sapiens calmodulin regulated spectrin-associated protein family, member 2 (CAMSAP2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENST00000236925 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:200739779:200860701:1 gene:ENSG00000118200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000358823 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:200739558:200860704:1 gene:ENSG00000118200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENST00000413307 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:200739779:200858119:1 gene:ENSG00000118200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 38 // 38 // 0 /// BC056910 // GenBank // Homo sapiens calmodulin regulated spectrin-associated protein 1-like 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:6172242), partial cds. // chr1 // 89 // 20 // 8 // 9 // 0 /// BC125229 // GenBank // Homo sapiens calmodulin regulated spectrin-associated protein 1-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:150680 IMAGE:40124603), complete cds. // chr1 // 100 // 87 // 40 // 40 // 0 /// BC125230 // GenBank // Homo sapiens calmodulin regulated spectrin-associated protein 1-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:150681 IMAGE:40124604), complete cds. // chr1 // 95 // 83 // 36 // 38 // 0 /// ENST00000447701 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:200832716:200853415:1 gene:ENSG00000118200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 30 // 30 // 14 // 46 // 1 /// GENSCAN00000014833 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:200739828:200862877:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 70 // 32 // 32 // 0
ENST00000432390 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:200863808:200864152:1 gene:ENSG00000231333 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0 /// NONHSAT008711 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0
NM_005298 // RefSeq // Homo sapiens G protein-coupled receptor 25 (GPR25), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000304244 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:200873038:200874123:1 gene:ENSG00000170128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC126386 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 25, mRNA (cDNA clone MGC:161664 IMAGE:8992102), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC126388 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 25, mRNA (cDNA clone MGC:161666 IMAGE:8992104), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014827 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:200873038:200960433:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001142569 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 106 (C1orf106), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// NM_018265 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 106 (C1orf106), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000367342 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:200891341:200915735:1 gene:ENSG00000163362 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000413687 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:200894821:200913728:1 gene:ENSG00000163362 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// AK303885 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58417 complete cds, weakly similar to FERM domain-containing protein 4A. // chr1 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// AK316510 // GenBank // Homo sapiens cDNA, FLJ79409 complete cds, weakly similar to FERM domain-containing protein 4A. // chr1 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// BC106877 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 106, mRNA (cDNA clone MGC:125608 IMAGE:40026425), complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000014827 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:200873038:200960433:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 75 // 75 // 18 // 24 // 1
NM_000299 // RefSeq // Homo sapiens plakophilin 1 (PKP1), transcript variant 1b, mRNA. // chr1 // 93 // 100 // 37 // 40 // 0 /// NM_001005337 // RefSeq // Homo sapiens plakophilin 1 (PKP1), transcript variant 1a, mRNA. // chr1 // 92 // 95 // 35 // 38 // 0 /// ENST00000263946 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:201283452:201332993:1 gene:ENSG00000081277 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 98 // 100 // 39 // 40 // 0 /// ENST00000352845 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:201283703:201328836:1 gene:ENSG00000081277 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 78 // 30 // 31 // 0 /// ENST00000367324 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:201283452:201332993:1 gene:ENSG00000081277 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 95 // 37 // 38 // 0 /// AK299473 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56941 complete cds, highly similar to Plakophilin-1. // chr1 // 86 // 35 // 12 // 14 // 0 /// AK316131 // GenBank // Homo sapiens cDNA, FLJ79030 complete cds, highly similar to Plakophilin-1. // chr1 // 86 // 35 // 12 // 14 // 0 /// BC114571 // GenBank // Homo sapiens plakophilin 1 (ectodermal dysplasia/skin fragility syndrome), mRNA (cDNA clone MGC:138829 IMAGE:40082609), complete cds. // chr1 // 92 // 90 // 33 // 36 // 0 /// BC115702 // GenBank // Homo sapiens plakophilin 1 (ectodermal dysplasia/skin fragility syndrome), mRNA (cDNA clone IMAGE:40082608), complete cds. // chr1 // 89 // 90 // 32 // 36 // 0 /// ENST00000622031 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:201283512:201330288:1 gene:ENSG00000081277 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 90 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000027790 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:201212199:201326045:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 70 // 70 // 28 // 40 // 1
NR_026667 // RefSeq // Homo sapiens ribosomal protein S10 pseudogene 7 (RPS10P7), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000441932 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:201518703:201530474:1 gene:ENSG00000223396 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// AK055590 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ31028 fis, clone HLUNG2000570, weakly similar to 40S RIBOSOMAL PROTEIN S10. // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000482594 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:201520056:201520549:1 gene:ENSG00000242150 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr1 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0 /// NONHSAT008756 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONHSAT008757 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONHSAT008758 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONHSAT008759 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0
AF289601 // GenBank HTC // Homo sapiens clone pp8142 unknown mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000364072 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:201733406:201733505:1 gene:ENSG00000200942 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AF289601 // GenBank HTC // Homo sapiens clone pp8142 unknown mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT008773 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_018085 // RefSeq // Homo sapiens importin 9 (IPO9), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000361565 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:201829141:201884294:1 gene:ENSG00000198700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF410465 // GenBank // Homo sapiens importin 9 mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000027787 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:201829210:201876054:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AK094603 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ37284 fis, clone BRAMY2013590. // chr1 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
ENST00000383910 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:201978461:201978595:1 gene:ENSG00000206637 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONHSAT008786 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
ENST00000412093 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:201978642:201978949:1 gene:ENSG00000238003 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000043761 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:201978644:201978851:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_004767 // RefSeq // Homo sapiens G protein-coupled receptor 37 like 1 (GPR37L1), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000367282 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:202122858:202133592:1 gene:ENSG00000170075 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC050334 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 37 like 1, mRNA (cDNA clone MGC:49917 IMAGE:5174449), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AK295576 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53885 complete cds, highly similar to Endothelin B receptor-like protein 2 precursor. // chr1 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// GENSCAN00000043769 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:202122964:202128556:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NONHSAT008806 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AF314543 // GenBank // Homo sapiens ovarian cancer-related protein 1 (OCR1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NR_038135 // RefSeq // Homo sapiens alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase-like protein pseudogene (LOC641515), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000330493 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:202820266:202827225:1 gene:ENSG00000184774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000549576 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:202823257:202827225:1 gene:ENSG00000184774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// TCONS_l2_00000774-XLOC_l2_000581 // Broad TUCP // linc-TMEM183B-2 chr1:+:202792781-202794425 // chr1 // 89 // 35 // 8 // 9 // 0 /// TCONS_l2_00002280-XLOC_l2_000581 // Broad TUCP // linc-TMEM183B-2 chr1:+:202789393-202796339 // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000043771 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:202796030:202848894:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_006763 // RefSeq // Homo sapiens BTG family, member 2 (BTG2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000290551 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:203305536:203309602:1 gene:ENSG00000159388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC105948 // GenBank // Homo sapiens BTG family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:126064 IMAGE:40032676), complete cds. // chr1 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// BC105949 // GenBank // Homo sapiens BTG family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:126063 IMAGE:40032675), complete cds. // chr1 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// U72649 // GenBank // Human BTG2 (BTG2) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000475157 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:203305491:203309569:1 gene:ENSG00000159388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1
NM_002725 // RefSeq // Homo sapiens proline/arginine-rich end leucine-rich repeat protein (PRELP), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_201348 // RefSeq // Homo sapiens proline/arginine-rich end leucine-rich repeat protein (PRELP), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000343110 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:203475828:203491352:1 gene:ENSG00000188783 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC032498 // GenBank // Homo sapiens proline/arginine-rich end leucine-rich repeat protein, mRNA (cDNA clone MGC:45323 IMAGE:5222817), complete cds. // chr1 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// CR541787 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834G0830D for gene PRELP, proline arginine-rich end leucine-rich repeat protein; complete cds, without stopcodon. // chr1 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// CR542270 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834E0526D for gene PRELP, proline arginine-rich end leucine-rich repeat protein; complete cds, incl. stopcodon. // chr1 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// U29089 // GenBank // Human proline- arginine-rich end leucine-rich repeat protein PRELP mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000044157 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:203462208:203486881:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// AF190164 // GenBank HTC // Homo sapiens MSTP161 (MST161) mRNA, complete cds. // chr1 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_014359 // RefSeq // Homo sapiens opticin (OPTC), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000367222 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:203494143:203508864:1 gene:ENSG00000188770 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000448911 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:203495970:203499709:1 gene:ENSG00000188770 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// AF161702 // GenBank // Homo sapiens oculoglycan mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AY077681 // GenBank // Homo sapiens opticin (OPTC) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC074942 // GenBank // Homo sapiens opticin, mRNA (cDNA clone MGC:104049 IMAGE:30915495), complete cds. // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC074943 // GenBank // Homo sapiens opticin, mRNA (cDNA clone MGC:103888 IMAGE:30915272), complete cds. // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000044153 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:203496006:203517684:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0
NR_046213 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 260 (LINC00260), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC000988 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 217, mRNA (cDNA clone MGC:5457 IMAGE:3450898), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT008901 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_003094 // RefSeq // Homo sapiens small nuclear ribonucleoprotein polypeptide E (SNRPE), mRNA. // chr1 // 93 // 100 // 13 // 14 // 0 /// ENST00000414487 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:203861615:203870550:1 gene:ENSG00000182004 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 11 // 11 // 0 /// BC072433 // GenBank // Homo sapiens small nuclear ribonucleoprotein polypeptide E, mRNA (cDNA clone IMAGE:5727660). // chr1 // 93 // 100 // 13 // 14 // 0 /// BC090951 // GenBank // Homo sapiens small nuclear ribonucleoprotein polypeptide E, mRNA (cDNA clone MGC:105067 IMAGE:5204266), complete cds. // chr1 // 93 // 100 // 13 // 14 // 0
NM_005076 // RefSeq // Homo sapiens contactin 2 (axonal) (CNTN2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000331830 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:205043197:205078499:1 gene:ENSG00000184144 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000481872 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:205058605:205074956:1 gene:ENSG00000184144 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// AK124736 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ42746 fis, clone BRAWH3000166, highly similar to Contactin-2 precursor. // chr1 // 92 // 76 // 23 // 25 // 0 /// AK289985 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75250 complete cds, highly similar to Homo sapiens contactin 2 (axonal) (CNTN2), mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// BC129986 // GenBank // Homo sapiens contactin 2 (axonal), mRNA (cDNA clone MGC:157722 IMAGE:40128240), complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// CR749495 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp781D102 (from clone DKFZp781D102). // chr1 // 96 // 82 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000009371 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:205053186:205073765:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0
ENST00000432323 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:205351247:205351471:1 gene:ENSG00000235363 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 54 // 7 // 7 // 0 /// NONHSAT008991 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 54 // 7 // 7 // 0
ENST00000517288 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:205566716:205566799:1 gene:ENSG00000253097 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 93 // 58 // 13 // 14 // 0 /// ENST00000411041 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:9:2162763:2162953:-1 gene:ENSG00000222973 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1 /// NONHSAT009012 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 93 // 58 // 13 // 14 // 0 /// NONHSAT129987 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1
ENST00000384035 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:205595041:205595147:1 gene:ENSG00000206762 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT009014 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK055340 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ30778 fis, clone FEBRA2000809. // chr1 // 40 // 100 // 10 // 25 // 0
AF130080 // GenBank HTC // Homo sapiens clone FLC0675 PRO2870 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// EU137727 // GenBank // Homo sapiens Heg mRNA, complete sequence. // chr1 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0
NM_000707 // RefSeq // Homo sapiens arginine vasopressin receptor 1B (AVPR1B), mRNA. // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000367126 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:206109692:206117355:-1 gene:ENSG00000198049 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF030512 // GenBank // Homo sapiens small cell vasopressin subtype 1b receptor mRNA, complete cds. // chr1 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0 /// AF101726 // GenBank // Homo sapiens vasopressin receptor subtype 1b mRNA, complete cds. // chr1 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0 /// D31833 // GenBank // Homo sapiens mRNA for vasopressin V1b receptor, complete cds. // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// L37112 // GenBank // Homo sapiens vasopressin V3 receptor mRNA, complete cds. // chr1 // 81 // 64 // 13 // 16 // 0
NM_001910 // RefSeq // Homo sapiens cathepsin E (CTSE), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NM_148964 // RefSeq // Homo sapiens cathepsin E (CTSE), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000358184 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:206009264:206023909:-1 gene:ENSG00000196188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000360218 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:206009265:206023895:-1 gene:ENSG00000196188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// AK292057 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75771 complete cds, highly similar to Homo sapiens cathepsin E (CTSE), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// AK298069 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60742 complete cds, highly similar to Homo sapiens cathepsin E (CTSE), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0 /// BC042537 // GenBank // Homo sapiens cathepsin E, mRNA (cDNA clone MGC:34609 IMAGE:5174814), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// J05036 // GenBank // Human cathepsin E mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000468617 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:206013774:206021374:-1 gene:ENSG00000196188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// GENSCAN00000006049 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:206010183:206023791:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0
NM_004759 // RefSeq // Homo sapiens mitogen-activated protein kinase-activated protein kinase 2 (MAPKAPK2), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000294981 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:206684944:206732863:1 gene:ENSG00000162889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// AK307499 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ97447. // chr1 // 94 // 53 // 17 // 18 // 0 /// BC036060 // GenBank // Homo sapiens mitogen-activated protein kinase-activated protein kinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:33670 IMAGE:5296259), complete cds. // chr1 // 92 // 74 // 23 // 25 // 0 /// BC052584 // GenBank // Homo sapiens mitogen-activated protein kinase-activated protein kinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:59706 IMAGE:6267183), complete cds. // chr1 // 97 // 91 // 30 // 31 // 0 /// NM_032960 // RefSeq // Homo sapiens mitogen-activated protein kinase-activated protein kinase 2 (MAPKAPK2), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 88 // 88 // 30 // 34 // 1 /// ENST00000367103 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:206685037:206734283:1 gene:ENSG00000162889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 88 // 88 // 30 // 34 // 1 /// U12779 // GenBank // Human MAP kinase activated protein kinase 2 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000006054 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:206685230:206732718:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 74 // 74 // 25 // 34 // 1
NM_013371 // RefSeq // Homo sapiens interleukin 19 (IL19), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000270218 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:206828877:206842622:1 gene:ENSG00000142224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// AF192498 // GenBank // Homo sapiens melanoma differentiation associated protein-like protein (ZMDA1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// AF453946 // GenBank // Homo sapiens interleukin 19 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// NM_153758 // RefSeq // Homo sapiens interleukin 19 (IL19), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 76 // 76 // 22 // 29 // 1 /// ENST00000340758 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:206798870:206842981:1 gene:ENSG00000142224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 76 // 76 // 22 // 29 // 1 /// AY040367 // GenBank // Homo sapiens interleukin 19 (IL19) mRNA, complete cds. // chr1 // 76 // 76 // 22 // 29 // 1 /// ENST00000476097 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:206836663:206840614:1 gene:ENSG00000142224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1 /// FJ380053 // GenBank // Homo sapiens interleukin 19 isoform 3 precursor (IL19) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1 /// ENST00000620365 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:206833708:206842979:1 gene:ENSG00000142224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000006053 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:206777664:206903059:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1
AF116608 // GenBank HTC // Homo sapiens PRO0907 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_000715 // RefSeq // Homo sapiens complement component 4 binding protein, alpha (C4BPA), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000367070 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:207104262:207144972:1 gene:ENSG00000123838 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000421786 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:207104306:207123949:1 gene:ENSG00000123838 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 88 // 48 // 14 // 16 // 0 /// ENST00000424088 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:207104378:207115465:1 gene:ENSG00000123838 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 39 // 13 // 13 // 0 /// AK303793 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51597 complete cds, highly similar to C4b-binding protein alpha chain precursor. // chr1 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// AK303798 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51598 complete cds, highly similar to C4b-binding protein alpha chain precursor. // chr1 // 89 // 85 // 25 // 28 // 0 /// BC022312 // GenBank // Homo sapiens complement component 4 binding protein, alpha, mRNA (cDNA clone MGC:22604 IMAGE:4688428), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// M31452 // GenBank // Human proline-rich protein (PRP) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000029350 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:207088853:207144717:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// NONHSAT009107 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0
NM_001006658 // RefSeq // Homo sapiens complement component (3d/Epstein Barr virus) receptor 2 (CR2), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// NM_001877 // RefSeq // Homo sapiens complement component (3d/Epstein Barr virus) receptor 2 (CR2), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000367057 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:207454230:207489895:1 gene:ENSG00000117322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENST00000367058 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:207454230:207489895:1 gene:ENSG00000117322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000367059 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:207454230:207489895:1 gene:ENSG00000117322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 38 // 38 // 0 /// AK301496 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57050 complete cds, highly similar to Homo sapiens complement component receptor 2 (CR2), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 40 // 40 // 0 /// BC090937 // GenBank // Homo sapiens complement component (3d/Epstein Barr virus) receptor 2, mRNA (cDNA clone MGC:104994 IMAGE:3066233), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 38 // 38 // 0 /// BC136394 // GenBank // Homo sapiens complement component (3d/Epstein Barr virus) receptor 2, mRNA (cDNA clone MGC:168004 IMAGE:9020381), complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// M26004 // GenBank // Human CR2/CD21/C3d/Epstein-Barr virus receptor mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 88 // 37 // 38 // 0 /// GENSCAN00000029333 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:207466320:207669569:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 34 // 34 // 0
NM_175710 // RefSeq // Homo sapiens complement component (3b/4b) receptor 1-like (CR1L), mRNA. // chr1 // 93 // 83 // 14 // 15 // 0 /// ENST00000294997 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:207677460:207738416:1 gene:ENSG00000197721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000508064 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:207645174:207723703:1 gene:ENSG00000197721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 83 // 14 // 15 // 0 /// AY114160 // GenBank // Homo sapiens complement C4b binding protein CR-1 like mRNA, partial cds. // chr1 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0 /// BC109190 // GenBank // Homo sapiens complement component (3b/4b) receptor 1-like, mRNA (cDNA clone IMAGE:40000722), complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000029358 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:207673436:207795718:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 50 // 9 // 18 // 1
NR_026817 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC148696 (LOC148696), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT009152 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NR_029622 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 205 (MIR205), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000384891 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:209432133:209432242:1 gene:ENSG00000276335 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA gene:ENSG00000230937 // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK002208 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ11346 fis, clone PLACE1010900. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC063704 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4804382, partial cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1 /// hsa-mir-205 // miRBase Micro RNA Database // MI0000285 Homo sapiens miR-205 stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT009217 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_020439 // RefSeq // Homo sapiens calcium/calmodulin-dependent protein kinase IG (CAMK1G), mRNA. // chr1 // 96 // 85 // 27 // 28 // 0 /// ENST00000009105 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:209583717:209613938:1 gene:ENSG00000008118 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 97 // 31 // 32 // 0 /// ENST00000361322 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:209583729:209613938:1 gene:ENSG00000008118 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 85 // 27 // 28 // 0 /// ENST00000423146 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:209583729:209609913:1 gene:ENSG00000008118 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000494990 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:209607794:209611944:1 gene:ENSG00000008118 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 90 // 30 // 9 // 10 // 0 /// AF428261 // GenBank // Homo sapiens calcium/calmodulin-dependent protein kinase I gamma (CAMK1G) mRNA, complete cds. // chr1 // 89 // 85 // 25 // 28 // 0 /// AK095713 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ38394 fis, clone FEBRA2007534, highly similar to Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1G (EC 2.7.11.17). // chr1 // 97 // 97 // 31 // 32 // 0 /// AK289675 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75465 complete cds, highly similar to Homo sapiens CLICK III mRNA. // chr1 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0 /// AY212935 // GenBank // Homo sapiens CLICK III mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// BC032787 // GenBank // Homo sapiens calcium/calmodulin-dependent protein kinase IG, mRNA (cDNA clone MGC:44894 IMAGE:5179957), complete cds. // chr1 // 96 // 85 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000008455 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:209538437:209613231:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1
NM_015714 // RefSeq // Homo sapiens G0/G1 switch 2 (G0S2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000367029 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:209675420:209676388:1 gene:ENSG00000123689 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC009694 // GenBank // Homo sapiens G0/G1switch 2, mRNA (cDNA clone MGC:9181 IMAGE:3891372), complete cds. // chr1 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000008439 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:209675192:209675996:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001206741 // RefSeq // Homo sapiens hydroxysteroid (11-beta) dehydrogenase 1 (HSD11B1), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NM_005525 // RefSeq // Homo sapiens hydroxysteroid (11-beta) dehydrogenase 1 (HSD11B1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_181755 // RefSeq // Homo sapiens hydroxysteroid (11-beta) dehydrogenase 1 (HSD11B1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000261465 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:209686269:209734478:1 gene:ENSG00000117594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000367027 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:209704846:209734950:1 gene:ENSG00000117594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000367028 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:209686180:209734949:1 gene:ENSG00000117594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC012593 // GenBank // Homo sapiens hydroxysteroid (11-beta) dehydrogenase 1, mRNA (cDNA clone MGC:13539 IMAGE:4286028), complete cds. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000615289 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:209686178:209732465:1 gene:ENSG00000117594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 50 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000008440 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:209683072:209734521:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_014388 // RefSeq // Homo sapiens digestive organ expansion factor homolog (zebrafish) (DIEXF), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000491415 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:209828007:209857565:1 gene:ENSG00000117597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK289613 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78223 complete cds. // chr1 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// BC022964 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 107, mRNA (cDNA clone MGC:29875 IMAGE:5110673), complete cds. // chr1 // 94 // 61 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000008444 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:209801972:209872561:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1
NM_019605 // RefSeq // Homo sapiens SERTA domain containing 4 (SERTAD4), mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000367012 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:210232799:210246255:1 gene:ENSG00000082497 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000490620 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:210237282:210242165:1 gene:ENSG00000082497 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// AK315386 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ96433, Homo sapiens SERTA domain containing 4 (SERTAD4), mRNA. // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC012083 // GenBank // Homo sapiens SERTA domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:19998 IMAGE:4564813), complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000003806 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:210016004:210242337:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1
ENST00000427600 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:211173488:211173849:1 gene:ENSG00000234004 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039744 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:211133521:211173851:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT009273 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT009274 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000431591 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:211207239:211207897:1 gene:ENSG00000226986 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000039755 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:211207239:211207898:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001199756 // RefSeq // Homo sapiens protein phosphatase 2, regulatory subunit B, alpha (PPP2R5A), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// NM_006243 // RefSeq // Homo sapiens protein phosphatase 2, regulatory subunit B, alpha (PPP2R5A), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000261461 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:212285537:212361863:1 gene:ENSG00000066027 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000537030 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:212301806:212360922:1 gene:ENSG00000066027 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 79 // 26 // 27 // 0 /// AK302202 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51383 complete cds, highly similar to Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit alpha isoform. // chr1 // 96 // 79 // 26 // 27 // 0 /// BC022474 // GenBank // Homo sapiens protein phosphatase 2, regulatory subunit B, alpha isoform, mRNA (cDNA clone MGC:26270 IMAGE:4815091), complete cds. // chr1 // 97 // 97 // 32 // 33 // 0 /// BC110883 // GenBank // Homo sapiens protein phosphatase 2, regulatory subunit B, alpha isoform, mRNA (cDNA clone MGC:131915 IMAGE:6045358), complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// L42373 // GenBank // Homo sapiens phosphatase 2A B56-alpha (PP2A) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000010582 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:212319382:212360770:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0
NR_004389 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 16B (SNORA16B), small nucleolar RNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000364674 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:212352816:212352950:1 gene:ENSG00000201544 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT009364 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_013349 // RefSeq // Homo sapiens neudesin neurotrophic factor (NENF), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NR_026598 // RefSeq // Homo sapiens neudesin neurotrophic factor (NENF), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000366988 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:212432887:212446379:1 gene:ENSG00000117691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000473900 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:212432973:212446372:1 gene:ENSG00000117691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000479589 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:212432923:212446372:1 gene:ENSG00000117691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AB126219 // GenBank // Homo sapiens mRNA for neudesin protein, complete cds. // chr1 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// AF173937 // GenBank // Homo sapiens secreted protein of unknown function (SPUF), mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AY762102 // GenBank // Homo sapiens cell growth-inhibiting protein 47 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC008823 // GenBank // Homo sapiens neuron derived neurotrophic factor, mRNA (cDNA clone MGC:12619 IMAGE:4303614), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000010567 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:212432944:212446006:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// NONHSAT009370 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
NM_153606 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 71, member A (FAM71A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000294829 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:212624474:212626778:1 gene:ENSG00000162771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC035007 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 71, member A, mRNA (cDNA clone MGC:33363 IMAGE:5267155), complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// AK301981 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51372 complete cds. // chr1 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1 /// GENSCAN00000010563 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:212624878:212626662:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0
ENST00000384760 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:212692264:212692367:1 gene:ENSG00000207491 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT009398 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001270616 // RefSeq // Homo sapiens prospero homeobox 1 (PROX1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NM_002763 // RefSeq // Homo sapiens prospero homeobox 1 (PROX1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_005273195 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens prospero homeobox 1 (PROX1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000261454 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:213988501:214041502:1 gene:ENSG00000117707 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000366958 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:213987943:214041252:1 gene:ENSG00000117707 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000435016 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:213988517:214036423:1 gene:ENSG00000117707 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000498508 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:213987935:214041502:1 gene:ENSG00000117707 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// AK298182 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51261 complete cds, highly similar to Homeobox prospero-like protein PROX1. // chr1 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// BC024201 // GenBank // Homo sapiens prospero homeobox 1, mRNA (cDNA clone MGC:3668 IMAGE:3532312), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// U44060 // GenBank // Human homeodomain protein (Prox 1) mRNA, complete cds. // chr1 // 83 // 88 // 19 // 23 // 0 /// AK290176 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75014 complete cds, highly similar to Homo sapiens prospero-related homeobox 1 (PROX1), mRNA. // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_016343 // RefSeq // Homo sapiens centromere protein F, 350/400kDa (CENPF), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000366955 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:214603195:214664588:1 gene:ENSG00000117724 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// U19769 // GenBank // Human CENP-F kinetochore protein mRNA, complete cds. // chr1 // 94 // 97 // 31 // 33 // 0 /// U30872 // GenBank // Human mitosin mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000000641 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:214605596:214748472:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0
NM_138796 // RefSeq // Homo sapiens spermatogenesis associated 17 (SPATA17), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000366933 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:217631324:217871696:1 gene:ENSG00000162814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000470448 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:217631324:217774424:1 gene:ENSG00000162814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000471021 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:217801718:217867588:1 gene:ENSG00000162814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 33 // 8 // 8 // 0 /// AK310291 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17333. // chr1 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// AY963797 // GenBank // Homo sapiens spermatogenesis-related protein 11 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC014608 // GenBank // Homo sapiens spermatogenesis associated 17, mRNA (cDNA clone MGC:26968 IMAGE:4824429), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000040739 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:217651130:217841571:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT009505 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 33 // 8 // 8 // 0
ENST00000364623 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:218129795:218129952:1 gene:ENSG00000201493 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONHSAT009512 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_016052 // RefSeq // Homo sapiens ribosomal RNA processing 15 homolog (S. cerevisiae) (RRP15), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000366932 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:218285287:218337983:1 gene:ENSG00000067533 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000491428 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:218285342:218302671:1 gene:ENSG00000067533 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// AF151873 // GenBank // Homo sapiens CGI-115 protein mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// AK290066 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75605 complete cds, highly similar to Homo sapiens CGI-115 protein (CGI-115), mRNA. // chr1 // 88 // 81 // 23 // 26 // 0 /// BC003668 // GenBank // Homo sapiens ribosomal RNA processing 15 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone IMAGE:3950114), partial cds. // chr1 // 100 // 34 // 11 // 11 // 0 /// BC020641 // GenBank // Homo sapiens ribosomal RNA processing 15 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:22291 IMAGE:4772128), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000010675 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:218285317:218331091:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0
ENST00000516277 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:219761789:219761875:1 gene:ENSG00000252086 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT009566 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000408746 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:219962652:219962865:1 gene:ENSG00000221673 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT009570 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_018060 // RefSeq // Homo sapiens isoleucyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (IARS2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000366922 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:220094102:220148041:1 gene:ENSG00000067704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AK291432 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75180 complete cds, highly similar to Homo sapiens mitochondrial isoleucine tRNA synthetase, mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// AY267462 // GenBank // Homo sapiens isoleucine tRNA synthetase mRNA, complete cds; nuclear gene for mitochondrial product. // chr1 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// BC040376 // GenBank // Homo sapiens isoleucyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial, mRNA (cDNA clone IMAGE:4778897), partial cds. // chr1 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// BC137438 // GenBank // Homo sapiens isoleucyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:169059 IMAGE:9021436), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000046787 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:220094217:220150867:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0
NONHSAT009583 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_024709 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 115 (C1orf115), mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000294889 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:220689845:220699157:1 gene:ENSG00000162817 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK125403 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ43414 fis, clone OCBBF2024781. // chr1 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// BC036067 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 115, mRNA (cDNA clone MGC:33695 IMAGE:5274863), complete cds. // chr1 // 93 // 90 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000046784 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:220690403:220698327:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0
NM_022746 // RefSeq // Homo sapiens mitochondrial amidoxime reducing component 1 (MARC1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000366910 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:220786759:220819657:1 gene:ENSG00000186205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000407981 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:220791491:220814388:1 gene:ENSG00000186205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// AK290812 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76149 complete cds, highly similar to Homo sapiens MOCO sulphurase C-terminal domain containing 1 (MOSC1), mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC010619 // GenBank // Homo sapiens MOCO sulphurase C-terminal domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:16799 IMAGE:3872779), complete cds. // chr1 // 92 // 92 // 22 // 24 // 0 /// ENST00000496110 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:220793189:220814393:1 gene:ENSG00000186205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// AK092439 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ35120 fis, clone PLACE6007687, moderately similar to Rattus norvegicus MG87 mRNA. // chr1 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// GENSCAN00000046781 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:220791522:220823202:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
ENST00000408644 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:220825776:220825893:1 gene:ENSG00000276642 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA gene:ENSG00000221571 // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000609276 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:220825620:220826063:1 gene:ENSG00000221571 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT009621 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_021958 // RefSeq // Homo sapiens H2.0-like homeobox (HLX), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000366903 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:220879400:220885059:1 gene:ENSG00000136630 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000427693 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:220881069:220884493:1 gene:ENSG00000136630 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000549319 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:220879431:220885056:1 gene:ENSG00000136630 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// AB208812 // GenBank // Homo sapiens mRNA for H2.0-like homeo box 1 variant protein. // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// BC007294 // GenBank // Homo sapiens H2.0-like homeobox, mRNA (cDNA clone MGC:15670 IMAGE:3349581), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// BC033808 // GenBank // Homo sapiens H2.0-like homeobox, mRNA (cDNA clone MGC:44994 IMAGE:5184776), complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// M60721 // GenBank // Human homeobox gene, complete cds. // chr1 // 95 // 100 // 35 // 37 // 0 /// GENSCAN00000046788 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:220873301:220884704:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 25 // 25 // 0
NM_207468 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 177, member B (FAM177B), mRNA. // chr1 // 100 // 72 // 33 // 33 // 0 /// XM_006711318 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens family with sequence similarity 177, member B (FAM177B), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 46 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000360827 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:222737307:222750196:1 gene:ENSG00000197520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 65 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000391880 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:222737216:222750805:1 gene:ENSG00000197520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENST00000434700 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:222737207:222749524:1 gene:ENSG00000197520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 57 // 24 // 26 // 0 /// ENST00000445590 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:222746529:222750660:1 gene:ENSG00000197520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 59 // 27 // 27 // 0 /// AK125494 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ43505 fis, clone PEBLM2007140. // chr1 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENST00000456298 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:222739684:222749521:1 gene:ENSG00000197520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 46 // 46 // 21 // 46 // 1 /// ENST00000460763 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:222739684:222747447:1 gene:ENSG00000197520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 22 // 22 // 10 // 46 // 1 /// GENSCAN00000016340 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:222718989:222750058:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 26 // 26 // 12 // 46 // 1 /// NONHSAT009704 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 22 // 22 // 10 // 46 // 1
NM_032890 // RefSeq // Homo sapiens dispatched homolog 1 (Drosophila) (DISP1), mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// XM_006711593 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens dispatched homolog 1 (Drosophila) (DISP1), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000284476 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:222928424:223005995:1 gene:ENSG00000154309 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000360254 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:222872271:222979862:1 gene:ENSG00000154309 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 21 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000482856 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:222928441:222943550:1 gene:ENSG00000154309 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000495684 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:222815064:222994906:1 gene:ENSG00000278610 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA gene:ENSG00000154309 // chr1 // 89 // 24 // 8 // 9 // 0 /// BC007734 // GenBank // Homo sapiens dispatched homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:4123247), complete cds. // chr1 // 100 // 58 // 22 // 22 // 0 /// BC107762 // GenBank // Homo sapiens dispatched homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:4610177), complete cds. // chr1 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000019662 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:222983080:223103265:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 53 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT009711 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 89 // 24 // 8 // 9 // 0 /// NONHSAT009721 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0
NM_152610 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 185 (CCDC185), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000366875 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:223393417:223395470:1 gene:ENSG00000178395 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC030026 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 65, mRNA (cDNA clone MGC:33402 IMAGE:4822648), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC031066 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 65, mRNA (cDNA clone MGC:33445 IMAGE:5272765), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019666 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:223393476:223395347:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
ENST00000540997 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:224008727:224010612:1 gene:ENSG00000185495 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000591702 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:785800:787672:1 gene:ENSG00000237491 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// AK026836 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ23183 fis, clone LNG11477. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK290103 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78588 complete cds. // chr1 // 83 // 100 // 20 // 24 // 0 /// NONHSAT000137 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// NONHSAT009765 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT139832 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0
NM_001136115 // RefSeq // Homo sapiens F-box protein 28 (FBXO28), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NM_015176 // RefSeq // Homo sapiens F-box protein 28 (FBXO28), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NR_049764 // RefSeq // Homo sapiens F-box protein 28 (FBXO28), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr1 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000366862 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:224114087:224162047:1 gene:ENSG00000143756 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000424254 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:224114111:224158150:1 gene:ENSG00000143756 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000483773 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:224114171:224134365:1 gene:ENSG00000143756 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000523990 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:224114119:224158182:1 gene:ENSG00000143756 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// AK303381 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50331 complete cds, highly similar to F-box only protein 28. // chr1 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// BC031576 // GenBank // Homo sapiens F-box protein 28, mRNA (cDNA clone MGC:34350 IMAGE:5188219), complete cds. // chr1 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000023588 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:224114130:224157746:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0
ENST00000365028 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:224179641:224179767:1 gene:ENSG00000201898 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT009777 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_003676 // RefSeq // Homo sapiens delta(4)-desaturase, sphingolipid 1 (DEGS1), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000323699 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:224183171:224193441:1 gene:ENSG00000143753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000391877 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:224183266:224193157:1 gene:ENSG00000143753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// AF002668 // GenBank // Homo sapiens putative fatty acid desaturase MLD mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// AF466375 // GenBank // Homo sapiens sphingolipid delta 4 desaturase protein DES1 mRNA, complete cds. // chr1 // 95 // 69 // 19 // 20 // 0 /// AY423730 // GenBank // Homo sapiens migration-inducing gene 15 protein mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC000961 // GenBank // Homo sapiens degenerative spermatocyte homolog 1, lipid desaturase (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:5079 IMAGE:3450936), complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000023593 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:224183337:224211655:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
ENST00000384160 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:224305380:224305483:1 gene:ENSG00000206887 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT009791 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0
NONHSAT009794 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_152495 // RefSeq // Homo sapiens cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 3 (CNIH3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_005273075 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 3 (CNIH3), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000272133 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:224616293:224740549:1 gene:ENSG00000143786 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000498382 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:224529191:224739621:1 gene:ENSG00000143786 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// BC022780 // GenBank // Homo sapiens cornichon homolog 3 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:9297 IMAGE:3894832), complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000478120 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:224529196:224739337:1 gene:ENSG00000143786 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// ENST00000481095 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:224529218:224734706:1 gene:ENSG00000143786 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// NONHSAT009814 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_001373 // RefSeq // Homo sapiens dynein, axonemal, heavy chain 14 (DNAH14), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0 /// ENST00000430092 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:224929654:225399269:1 gene:ENSG00000185842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0 /// ENST00000439375 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:224952703:225399269:1 gene:ENSG00000185842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0 /// ENST00000445597 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:1:224896262:225399269:1 gene:ENSG00000185842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 5 // 5 // 0 /// GENSCAN00000042809 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:224964479:225331583:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 5 // 5 // 0
ENST00000327794 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:225240794:225398064:1 gene:ENSG00000185842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 98 // 51 // 51 // 0 /// ENST00000450490 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:225250663:225270796:1 gene:ENSG00000185842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 89 // 17 // 8 // 9 // 0 /// CR936804 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp781B1548 (from clone DKFZp781B1548). // chr1 // 94 // 98 // 48 // 51 // 0 /// NM_001373 // RefSeq // Homo sapiens dynein, axonemal, heavy chain 14 (DNAH14), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 94 // 94 // 49 // 52 // 1 /// ENST00000430092 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:224929654:225399269:1 gene:ENSG00000185842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 94 // 49 // 52 // 1 /// ENST00000439375 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:224952703:225399269:1 gene:ENSG00000185842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 94 // 49 // 52 // 1 /// ENST00000445597 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:1:224896262:225399269:1 gene:ENSG00000185842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 67 // 67 // 35 // 52 // 1 /// GENSCAN00000042808 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:225340521:225399269:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 33 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000042809 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:224964479:225331583:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 38 // 38 // 20 // 52 // 1
AF090941 // GenBank // Homo sapiens clone HQ0650 PRO0650 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001282402 // RefSeq // Homo sapiens Mix paired-like homeobox (MIXL1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NM_031944 // RefSeq // Homo sapiens Mix paired-like homeobox (MIXL1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000366810 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:226223618:226227054:1 gene:ENSG00000185155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000542034 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:1:226223618:226225864:1 gene:ENSG00000185155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// ENST00000557734 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:226225503:226226389:1 gene:ENSG00000185155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// AF211891 // GenBank // Homo sapiens Mix.1 homeobox-like protein (MIXL) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC111974 // GenBank // Homo sapiens Mix1 homeobox-like 1 (Xenopus laevis), mRNA (cDNA clone MGC:138179 IMAGE:8327442), complete cds. // chr1 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// BC113441 // GenBank // Homo sapiens Mix1 homeobox-like 1 (Xenopus laevis), mRNA (cDNA clone MGC:142001 IMAGE:8322493), complete cds. // chr1 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// BC143784 // GenBank // Homo sapiens Mix1 homeobox-like 1 (Xenopus laevis), mRNA (cDNA clone MGC:177315 IMAGE:9052298), complete cds. // chr1 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000049498 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:226223682:226226363:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT009886 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0
NONHSAT009887 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000411350 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:226445937:226446292:1 gene:ENSG00000223282 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT009894 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001003665 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 95 (C1orf95), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000366788 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:226548800:226609214:1 gene:ENSG00000203685 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000366789 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:226548800:226605602:1 gene:ENSG00000203685 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
BC062736 // GenBank // Homo sapiens basic transcription factor 3, pseudogene 9, mRNA (cDNA clone IMAGE:30320007). // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
ENST00000365394 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:227561181:227561300:1 gene:ENSG00000202264 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT009926 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_178549 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 678 (ZNF678), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0 /// NR_033184 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 678 (ZNF678), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000343776 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:227563543:227662461:1 gene:ENSG00000181450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000397097 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:227650992:227662462:1 gene:ENSG00000181450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000465266 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:227563551:227654353:1 gene:ENSG00000181450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 55 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000608949 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:227563543:227677443:1 gene:ENSG00000181450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 55 // 11 // 11 // 0 /// BC042500 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 678, mRNA (cDNA clone MGC:42493 IMAGE:4823179), complete cds. // chr1 // 95 // 100 // 19 // 20 // 0 /// NR_102302 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 678 (ZNF678), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr1 // 55 // 55 // 11 // 20 // 1 /// GENSCAN00000004066 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:227608771:227655828:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 45 // 9 // 9 // 0 /// NONHSAT139934 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 55 // 11 // 11 // 0 /// NONHSAT009927 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 55 // 55 // 11 // 20 // 1
NM_178549 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 678 (ZNF678), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_033184 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 678 (ZNF678), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000343776 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:227563543:227662461:1 gene:ENSG00000181450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000397097 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:227650992:227662462:1 gene:ENSG00000181450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_183062 // RefSeq // Homo sapiens protease, serine, 38 (PRSS38), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000366757 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:227815693:227846470:1 gene:ENSG00000185888 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC130400 // GenBank // Homo sapiens marapsin 2, mRNA (cDNA clone MGC:163272 IMAGE:40146431), complete cds. // chr1 // 90 // 97 // 28 // 31 // 0 /// GENSCAN00000004060 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:227815738:227846208:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0
NM_033131 // RefSeq // Homo sapiens wingless-type MMTV integration site family, member 3A (WNT3A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000284523 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:228007051:228061260:1 gene:ENSG00000154342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AB060284 // GenBank // Homo sapiens mRNA for WNT3A, complete cds. // chr1 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// BC103921 // GenBank // Homo sapiens wingless-type MMTV integration site family, member 3A, mRNA (cDNA clone MGC:119418 IMAGE:40007188), complete cds. // chr1 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// BC103922 // GenBank // Homo sapiens wingless-type MMTV integration site family, member 3A, mRNA (cDNA clone MGC:119419 IMAGE:40007189), complete cds. // chr1 // 100 // 68 // 23 // 23 // 0 /// BC103923 // GenBank // Homo sapiens wingless-type MMTV integration site family, member 3A, mRNA (cDNA clone MGC:119420 IMAGE:40007191), complete cds. // chr1 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000018398 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:228013335:228059465:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 44 // 15 // 15 // 0
NM_020435 // RefSeq // Homo sapiens gap junction protein, gamma 2, 47kDa (GJC2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000366714 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:228149852:228159826:1 gene:ENSG00000198835 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY285161 // GenBank // Homo sapiens connexin47 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC089439 // GenBank // Homo sapiens gap junction protein, gamma 2, 47kDa, mRNA (cDNA clone MGC:105119 IMAGE:30558819), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000018362 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:228157768:228159078:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NM_001010867 // RefSeq // Homo sapiens IBA57, iron-sulfur cluster assembly homolog (S. cerevisiae) (IBA57), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000366711 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:228165815:228182257:1 gene:ENSG00000181873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000484749 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:228171178:228182257:1 gene:ENSG00000181873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// XM_006711753 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens IBA57, iron-sulfur cluster assembly homolog (S. cerevisiae) (IBA57), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// AK022796 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ12734 fis, clone NT2RP2000198. // chr1 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000018369 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:228165817:228360755:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_175055 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 3, H2bb (HIST3H2BB), mRNA. // chr1 // 100 // 35 // 8 // 8 // 0 /// AK091220 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ33901 fis, clone CTONG2008321, highly similar to HISTONE H2B F. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000620438 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:228458107:228460470:1 gene:ENSG00000196890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001010858 // RefSeq // Homo sapiens ring finger protein 187 (RNF187), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000305943 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:228487061:228495766:1 gene:ENSG00000168159 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000482739 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:228488222:228495766:1 gene:ENSG00000168159 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// BC080645 // GenBank // Homo sapiens ring finger protein 187, mRNA (cDNA clone IMAGE:5093646). // chr1 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000018359 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:228486832:228493370:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT010028 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// AB019524 // GenBank // Homo sapiens mRNA for nuclear receptor co-repressor, partial cds. // chr1 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
ENST00000365186 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:228555793:228555901:1 gene:ENSG00000202056 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 75 // 100 // 3 // 4 // 0 /// NONHSAT010033 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 75 // 100 // 3 // 4 // 0
NR_002834 // RefSeq // Homo sapiens dual specificity phosphatase 5 pseudogene 1 (DUSP5P1), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000441325 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:228650241:228651379:1 gene:ENSG00000183929 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000018381 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:228650281:228650875:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 12 // 12 // 0
ENST00000384151 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:228652436:228652560:1 gene:ENSG00000206878 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT010051 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000466086 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:228687415:228687826:1 gene:ENSG00000234975 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_021205 // RefSeq // Homo sapiens ras homolog family member U (RHOU), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NR_037962 // RefSeq // Homo sapiens ras homolog family member U (RHOU), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr1 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000366691 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:228735077:228746669:1 gene:ENSG00000116574 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB051826 // GenBank // Homo sapiens hG28K mRNA for GTP-binding protein like 1, complete cds. // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// AB074878 // GenBank // Homo sapiens ARHU mRNA for Rho GTPase-like protein, complete cds. // chr1 // 95 // 70 // 18 // 19 // 0 /// AF211836 // GenBank // Homo sapiens CDC42-like GTPase (CDC42L1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF251701 // GenBank // Homo sapiens GTP-binding protein SB128 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// AF282258 // GenBank // Homo sapiens Ryu GTPase mRNA, complete cds. // chr1 // 86 // 81 // 19 // 22 // 0 /// AF378087 // GenBank // Homo sapiens Wrch-1 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// AK289971 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76757 complete cds, highly similar to Homo sapiens ras homolog gene family, member U (RHOU), mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// BC040076 // GenBank // Homo sapiens ras homolog gene family, member U, mRNA (cDNA clone MGC:47524 IMAGE:5768957), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018355 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:228735743:228743740:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
ENST00000323223 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:229249636:229251810:1 gene:ENSG00000177800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AK097487 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ40168 fis, clone TESTI2016410. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
ENST00000364622 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:229549905:229550022:1 gene:ENSG00000201492 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT010093 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_014777 // RefSeq // Homo sapiens URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae) (URB2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000258243 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:229626234:229660199:1 gene:ENSG00000135763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AK291013 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75337 complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC114559 // GenBank // Homo sapiens URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:138837 IMAGE:40082897), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC114963 // GenBank // Homo sapiens URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:138838 IMAGE:40082900), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000043301 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:229625306:229659297:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0
ENST00000365193 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:230820250:230820358:1 gene:ENSG00000202063 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT010142 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000463010 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:230894141:230894427:1 gene:ENSG00000240502 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT010151 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001004342 // RefSeq // Homo sapiens tripartite motif containing 67 (TRIM67), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000444294 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:231162112:231221556:1 gene:ENSG00000119283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000449018 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:231162970:231215440:1 gene:ENSG00000119283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// AY253917 // GenBank // Homo sapiens TRIM9-like protein TNL (TNL) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000366653 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:1:231162970:231217024:1 gene:ENSG00000119283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 94 // 31 // 33 // 1 /// GENSCAN00000037046 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:231182562:231214180:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// GENSCAN00000037054 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:231108074:231164097:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1
ENST00000411054 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:231670635:231670750:1 gene:ENSG00000222986 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT010188 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000464573 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:232222866:232223145:1 gene:ENSG00000242794 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT010205 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000459179 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:232700204:232700308:1 gene:ENSG00000238382 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT010216 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT010217 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_019090 // RefSeq // Homo sapiens microtubule-associated protein 10 (MAP10), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000418460 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:232804892:232808407:1 gene:ENSG00000212916 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK290216 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75125 complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// BC036663 // GenBank // Homo sapiens KIAA1383 protein, mRNA (cDNA clone MGC:33261 IMAGE:5266476), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC109122 // GenBank // Homo sapiens KIAA1383, mRNA (cDNA clone MGC:126466 IMAGE:40036000), complete cds. // chr1 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000048924 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:232805450:232808167:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_032435 // RefSeq // Homo sapiens mixed lineage kinase 4 (KIAA1804), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000366622 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:233375783:233385147:1 gene:ENSG00000143674 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000366623 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:233327768:233374134:1 gene:ENSG00000143674 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000366624 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:233327768:233385148:1 gene:ENSG00000143674 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB058707 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1804 protein, partial cds. // chr1 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// AJ311797 // GenBank // Homo sapiens mRNA for mixed lineage kinase 4alpha (MLK4ALPHA gene). // chr1 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC136648 // GenBank // Homo sapiens mixed lineage kinase 4, mRNA (cDNA clone MGC:168261 IMAGE:9020638), complete cds. // chr1 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// BC136649 // GenBank // Homo sapiens mixed lineage kinase 4, mRNA (cDNA clone MGC:168262 IMAGE:9020639), complete cds. // chr1 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000024749 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:233346540:233443840:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000024736 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:233328029:233330077:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
ENST00000366620 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:233629607:233672238:1 gene:ENSG00000135750 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// AK090902 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ33583 fis, clone BRAMY2011872, highly similar to Human two P-domain K+ channel TWIK-1 mRNA. // chr1 // 87 // 56 // 13 // 15 // 0 /// U76996 // GenBank // Homo sapiens two P domain potassium channel subunit (HOHO1) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// NM_002245 // RefSeq // Homo sapiens potassium channel, subfamily K, member 1 (KCNK1), mRNA. // chr1 // 96 // 96 // 26 // 27 // 1 /// ENST00000366621 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:233614004:233672512:1 gene:ENSG00000135750 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 96 // 26 // 27 // 1 /// BC018051 // GenBank // Homo sapiens potassium channel, subfamily K, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:26384 IMAGE:4817185), complete cds. // chr1 // 93 // 93 // 25 // 27 // 1 /// U33632 // GenBank // Human two P-domain K+ channel TWIK-1 mRNA, complete cds. // chr1 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// U90065 // GenBank // Human potassium channel KCNO1 mRNA, complete cds. // chr1 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// ENST00000472190 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:233629558:233671699:1 gene:ENSG00000135750 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// GENSCAN00000024745 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:233629289:233671530:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
ENST00000366617 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:234214271:234324511:1 gene:ENSG00000183780 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// BC037878 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 35, member F3, mRNA (cDNA clone MGC:43868 IMAGE:5273868), complete cds. // chr1 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// NM_173508 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 35, member F3 (SLC35F3), mRNA. // chr1 // 88 // 88 // 30 // 34 // 1 /// ENST00000366618 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:233904933:234324516:1 gene:ENSG00000183780 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 88 // 88 // 30 // 34 // 1 /// AK095031 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ37712 fis, clone BRHIP2018369. // chr1 // 88 // 88 // 30 // 34 // 1 /// GENSCAN00000011908 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:234279661:234323243:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 53 // 18 // 18 // 0
ENST00000366612 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:234373701:234384046:1 gene:ENSG00000168275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC064905 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6024528, partial cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_001012985 // RefSeq // Homo sapiens cytochrome c oxidase assembly factor 6 homolog (S. cerevisiae) (COA6), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 1 /// ENST00000366613 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:1:234373683:234384045:1 gene:ENSG00000168275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 1 /// BC116455 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 31, mRNA (cDNA clone MGC:131683 IMAGE:4540930), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 1 /// NM_001206641 // RefSeq // Homo sapiens cytochrome c oxidase assembly factor 6 homolog (S. cerevisiae) (COA6), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// ENST00000366615 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:234373456:234384049:1 gene:ENSG00000168275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// BC052810 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6150603, partial cds. // chr1 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// AK297239 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60021 complete cds, moderately similar to Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1. // chr1 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// GENSCAN00000011910 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:234365831:234383818:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 50 // 13 // 14 // 0 /// ENST00000619305 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:234373468:234384048:1 gene:ENSG00000168275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
ENST00000390842 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:234593275:234593402:1 gene:ENSG00000212144 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT010290 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000364768 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:234837976:234838069:1 gene:ENSG00000201638 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 75 // 100 // 3 // 4 // 0
ENST00000493933 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:234904186:234904488:1 gene:ENSG00000239690 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT010317 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000384076 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:235915415:235915521:1 gene:ENSG00000206803 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT010386 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000517013 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:236060677:236060772:1 gene:ENSG00000252822 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT010393 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000410718 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:236267780:236267958:1 gene:ENSG00000222650 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT010400 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000450819 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:236981339:236981708:1 gene:ENSG00000237991 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000020221 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:236981337:236981708:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT010436 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT010437 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001035 // RefSeq // Homo sapiens ryanodine receptor 2 (cardiac) (RYR2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 117 // 117 // 0 /// ENST00000360064 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:237270497:237832644:1 gene:ENSG00000198626 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 113 // 113 // 0 /// ENST00000366574 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:237042205:237833988:1 gene:ENSG00000198626 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 117 // 117 // 0 /// ENST00000608590 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:237791846:237832758:1 gene:ENSG00000198626 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 10 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000609119 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:237674764:237786036:1 gene:ENSG00000198626 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 27 // 32 // 32 // 0 /// AK297823 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61140 complete cds, highly similar to Ryanodine receptor 2. // chr1 // 92 // 10 // 11 // 12 // 0 /// GENSCAN00000020222 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:237368400:237872639:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 103 // 103 // 0
ENST00000516587 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:237120807:237121109:1 gene:ENSG00000252396 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT010441 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_027247 // RefSeq // Homo sapiens POTE ankyrin domain family, member F pseudogene (LOC100130331), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// ENST00000450451 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:237862175:237928321:1 gene:ENSG00000237250 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// ENST00000450208 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:237926831:237927605:1 gene:ENSG00000243781 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// GENSCAN00000020224 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:237926750:237927555:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// TCONS_l2_00000914-XLOC_l2_000690 // Broad TUCP // linc-CHRM3-4 chr1:+:238084605-238090956 // chr1 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0
ENST00000424695 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:238491358:238492644:1 gene:ENSG00000215149 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000030787 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:238425065:238492127:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0
NM_000740 // RefSeq // Homo sapiens cholinergic receptor, muscarinic 3 (CHRM3), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000255380 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:239629073:239915452:1 gene:ENSG00000133019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000448020 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:239719543:239907780:1 gene:ENSG00000133019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// AF498917 // GenBank // Homo sapiens muscarinic acetylcholine receptor M3 (CHRM3) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// AK074575 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ90094 fis, clone HEMBA1005545, highly similar to MUSCARINIC ACETYLCHOLINE RECEPTOR M3. // chr1 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// BC121026 // GenBank // Homo sapiens cholinergic receptor, muscarinic 3, mRNA (cDNA clone MGC:149689 IMAGE:40117429), complete cds. // chr1 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000468573 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:239386565:239886596:1 gene:ENSG00000133019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// AK056349 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ31787 fis, clone NT2RI2008566. // chr1 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// ENST00000615928 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:239632206:239909415:1 gene:ENSG00000133019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000029485 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:239907452:239909224:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// NONHSAT010470 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1
NM_020066 // RefSeq // Homo sapiens formin 2 (FMN2), mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000319653 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:240091880:240475189:1 gene:ENSG00000155816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000545751 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:240329144:240475183:1 gene:ENSG00000155816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 33 // 13 // 13 // 0 /// AF225426 // GenBank // Homo sapiens HT016 mRNA, complete cds. // chr1 // 85 // 33 // 11 // 13 // 0 /// AK297716 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55858 complete cds, highly similar to Homo sapiens formin 2 (FMN2), mRNA. // chr1 // 93 // 38 // 14 // 15 // 0 /// AK297755 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58678 complete cds, highly similar to Formin-2. // chr1 // 85 // 33 // 11 // 13 // 0 /// AK298141 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60748 complete cds, highly similar to Homo sapiens formin 2 (FMN2), mRNA. // chr1 // 100 // 33 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000023366 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:240178011:240257079:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 23 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000023367 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:240091681:240093939:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 28 // 11 // 11 // 0
ENST00000516508 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:240341385:240341477:1 gene:ENSG00000252317 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT010495 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000515941 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:240653367:240653477:1 gene:ENSG00000251750 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT010502 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
ENST00000362371 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:240698320:240698429:1 gene:ENSG00000199241 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT010505 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_144625 // RefSeq // Homo sapiens WD repeat domain 64 (WDR64), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000366552 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:241652278:241802133:1 gene:ENSG00000162843 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000414635 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:241683580:241801463:1 gene:ENSG00000162843 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000425826 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:241749547:241801655:1 gene:ENSG00000162843 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000437684 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:241683580:241801467:1 gene:ENSG00000162843 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000472717 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:241741548:241796298:1 gene:ENSG00000162843 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 95 // 65 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000021617 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:241652515:241832486:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0
NM_001278196 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger and BTB domain containing 18 (ZBTB18), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// NM_006352 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger and BTB domain containing 18 (ZBTB18), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// AK293892 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58172 complete cds, highly similar to Zinc finger protein 238. // chr1 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// BC036677 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 238, mRNA (cDNA clone MGC:33778 IMAGE:5259205), complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// BC078175 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 238, mRNA (cDNA clone IMAGE:6181071). // chr1 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// U38896 // GenBank // Human zinc finger protein C2H2-171 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0 /// NM_205768 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger and BTB domain containing 18 (ZBTB18), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 91 // 91 // 31 // 34 // 1 /// ENST00000358704 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:244051283:244057476:1 gene:ENSG00000179456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 91 // 91 // 31 // 34 // 1 /// AK291408 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77297 complete cds, highly similar to Homo sapiens zinc finger protein 238 (ZNF238), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 82 // 82 // 28 // 34 // 1 /// ENST00000622512 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:244048939:244057472:1 gene:ENSG00000179456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006273 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:244047831:244055370:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0
ENST00000467120 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:244103932:244104210:1 gene:ENSG00000244066 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT010632 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001012970 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 100 (C1orf100), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NM_001276348 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 100 (C1orf100), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// NM_001276349 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 100 (C1orf100), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 94 // 65 // 16 // 17 // 0 /// ENST00000308105 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:244352635:244389091:1 gene:ENSG00000173728 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000366537 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:244352635:244389091:1 gene:ENSG00000173728 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// ENST00000486803 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:244352649:244389091:1 gene:ENSG00000173728 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 94 // 65 // 16 // 17 // 0 /// BC054479 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 100, mRNA (cDNA clone IMAGE:6622863). // chr1 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// ENST00000470211 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:244378512:244389663:1 gene:ENSG00000173728 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// GENSCAN00000006264 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:244319733:244395653:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT010638 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_016076 // RefSeq // Homo sapiens desumoylating isopeptidase 2 (DESI2), mRNA. // chr1 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000302550 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:1:244652935:244709033:1 gene:ENSG00000121644 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0 /// BC004485 // GenBank // Homo sapiens PPPDE peptidase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:10665 IMAGE:3831754), complete cds. // chr1 // 100 // 55 // 6 // 6 // 0
NM_198076 // RefSeq // Homo sapiens COX20 cytochrome C oxidase assembly factor (COX20), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000411948 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:244835322:244845057:1 gene:ENSG00000203667 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
ENST00000364888 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:244943910:244944216:1 gene:ENSG00000201758 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT010662 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000516264 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:244954858:244954963:1 gene:ENSG00000252073 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT010664 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000516473 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:245023015:245023118:1 gene:ENSG00000252282 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 86 // 6 // 6 // 0 /// NONHSAT010672 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 86 // 6 // 6 // 0
ENST00000515945 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:245043928:245044032:1 gene:ENSG00000251754 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT010673 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000366522 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:244969982:245127164:1 gene:ENSG00000203666 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NM_001143943 // RefSeq // Homo sapiens EF-hand calcium binding domain 2 (EFCAB2), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1 /// NR_026587 // RefSeq // Homo sapiens EF-hand calcium binding domain 2 (EFCAB2), transcript variant 4, non-coding RNA. // chr1 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1 /// AB209286 // GenBank // Homo sapiens mRNA for hypothetical protein MGC12458 variant protein. // chr1 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1 /// AK027158 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ23505 fis, clone LNG03017. // chr1 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// NONHSAT010669 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1
NM_018012 // RefSeq // Homo sapiens kinesin family member 26B (KIF26B), mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000366518 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:245511002:245709431:1 gene:ENSG00000162849 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000407071 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:245154985:245703126:1 gene:ENSG00000162849 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// AK293964 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58496 complete cds. // chr1 // 100 // 32 // 11 // 11 // 0 /// AY923834 // GenBank // Homo sapiens kinesin family member 26B (KIF26B) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// BC035896 // GenBank // Homo sapiens kinesin family member 26B, mRNA (cDNA clone IMAGE:5239561), partial cds. // chr1 // 100 // 32 // 11 // 11 // 0 /// AK125187 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ43197 fis, clone FEBRA2006396. // chr1 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1 /// GENSCAN00000020453 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:245684249:245702606:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000033385 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR1_1_CTG32_1:245687970:245706327:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 17 // 17 // 0
NM_152609 // RefSeq // Homo sapiens consortin, connexin sorting protein (CNST), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 83 // 38 // 38 // 0 /// XM_005273081 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens consortin, connexin sorting protein (CNST), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 74 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000366511 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:246566514:246633957:1 gene:ENSG00000162852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 89 // 20 // 8 // 9 // 0 /// ENST00000366513 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:1:246566446:246668584:1 gene:ENSG00000162852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000483271 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:246566444:246648235:1 gene:ENSG00000162852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 65 // 30 // 30 // 0 /// BC036200 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 71, mRNA (cDNA clone IMAGE:4828136), complete cds. // chr1 // 100 // 65 // 30 // 30 // 0 /// NM_001139459 // RefSeq // Homo sapiens consortin, connexin sorting protein (CNST), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 61 // 61 // 28 // 46 // 1 /// ENST00000366512 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:246566461:246648243:1 gene:ENSG00000162852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 61 // 61 // 28 // 46 // 1 /// BC010228 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 71, mRNA (cDNA clone MGC:18089 IMAGE:4151228), complete cds. // chr1 // 59 // 59 // 27 // 46 // 1 /// GENSCAN00000006558 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:246619866:246665905:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 35 // 35 // 16 // 46 // 1
NM_016002 // RefSeq // Homo sapiens saccharopine dehydrogenase (putative) (SCCPDH), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000366510 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:246724047:246768137:1 gene:ENSG00000143653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// AF151807 // GenBank // Homo sapiens CGI-49 protein mRNA, complete cds. // chr1 // 95 // 90 // 36 // 38 // 0 /// BC026185 // GenBank // Homo sapiens saccharopine dehydrogenase (putative), mRNA (cDNA clone MGC:33173 IMAGE:4798194), complete cds. // chr1 // 94 // 81 // 32 // 34 // 0 /// GENSCAN00000006553 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:246699265:246771983:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 62 // 62 // 26 // 42 // 1
NM_173858 // RefSeq // Homo sapiens vomeronasal 1 receptor 5 (gene/pseudogene) (VN1R5), mRNA. // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENST00000472952 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:247256072:247257143:1 gene:ENSG00000197617 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC126341 // GenBank // Homo sapiens vomeronasal 1 receptor 5, mRNA (cDNA clone MGC:161619 IMAGE:8992057), complete cds. // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC126367 // GenBank // Homo sapiens vomeronasal 1 receptor 5, mRNA (cDNA clone MGC:161645 IMAGE:8992083), complete cds. // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
ENST00000365209 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:247294835:247294941:1 gene:ENSG00000202079 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT010768 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001004698 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily W, member 5 (OR2W5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000366492 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:247491128:247492090:1 gene:ENSG00000203664 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr1 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 /// ENST00000522351 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:247491068:247492147:1 gene:ENSG00000203664 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC137203 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily W, member 5, mRNA (cDNA clone MGC:168823 IMAGE:9021200), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC137204 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily W, member 5, mRNA (cDNA clone MGC:168824 IMAGE:9021201), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000047847 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:247484761:247492090:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0
NM_001001915 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily G, member 2 (OR2G2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000320065 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:247588360:247589313:1 gene:ENSG00000177489 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000047848 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:247555959:247589313:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001001914 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily G, member 3 (OR2G3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000320002 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:247605586:247606515:1 gene:ENSG00000177476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC136712 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily G, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:168325 IMAGE:9020702), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC136713 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily G, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:168326 IMAGE:9020703), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000047842 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:247605586:247606515:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENST00000419087 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:247619643:247620570:1 gene:ENSG00000198452 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000047836 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:247617600:247620562:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
ENST00000283225 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:247738615:247739559:1 gene:ENSG00000153230 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047831 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:247738615:247746277:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0
ENST00000446393 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:247774910:247775836:1 gene:ENSG00000228336 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:unitary_pseudogene // chr1 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// AY358215 // GenBank // Homo sapiens clone DNA175742 VNFT9373 (UNQ9373) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0
NM_001001957 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily W, member 3 (OR2W3), mRNA. // chr1 // 100 // 45 // 25 // 25 // 0 /// NM_015431 // RefSeq // Homo sapiens tripartite motif containing 58 (TRIM58), mRNA. // chr1 // 100 // 50 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000360358 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:247895587:247896531:1 gene:ENSG00000238243 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 45 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000366481 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:247857199:247878205:1 gene:ENSG00000162722 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 28 // 28 // 0 /// AF327057 // GenBank // Homo sapiens BIA2 protein mRNA, complete cds. // chr1 // 88 // 46 // 23 // 26 // 0 /// BC146848 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily W, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:181951 IMAGE:9056776), complete cds. // chr1 // 85 // 48 // 23 // 27 // 0 /// BX537432 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686N09198 (from clone DKFZp686N09198); complete cds. // chr1 // 88 // 57 // 28 // 32 // 0 /// GENSCAN00000047833 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:247895587:247896531:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 45 // 25 // 25 // 0 /// AL080170 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp434C091 (from clone DKFZp434C091). // chr1 // 82 // 30 // 14 // 17 // 0 /// GENSCAN00000047843 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:247857247:247865904:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 21 // 21 // 12 // 56 // 1 /// AB208969 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA0182 protein variant protein. // chr1 // 20 // 20 // 11 // 56 // 1
NM_001001957 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily W, member 3 (OR2W3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000360358 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:247895587:247896531:1 gene:ENSG00000238243 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC146848 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily W, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:181951 IMAGE:9056776), complete cds. // chr1 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// BX537432 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686N09198 (from clone DKFZp686N09198); complete cds. // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047833 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:247895587:247896531:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001005522 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily T, member 8 (OR2T8), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000319968 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:247921018:247921956:1 gene:ENSG00000177462 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000047827 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:247921018:247921956:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
ENST00000318244 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:247933769:247934755:1 gene:ENSG00000177275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000047834 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:247933769:247934755:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0
NM_175911 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily L, member 13 (OR2L13), mRNA. // chr1 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// ENST00000358120 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:248098649:248100922:1 gene:ENSG00000196071 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000366478 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:247937191:248100921:1 gene:ENSG00000196071 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC028158 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily L, member 13, mRNA (cDNA clone MGC:40047 IMAGE:5240594), complete cds. // chr1 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0
NM_001001963 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily L, member 8 (OR2L8), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000357191 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:247948858:247949796:1 gene:ENSG00000196936 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC140751 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily L, member 8, mRNA (cDNA clone MGC:176428 IMAGE:9021619), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000047844 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:247948858:247949796:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_001004491 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily AK, member 2 (OR2AK2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000366480 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:247965233:247966339:1 gene:ENSG00000187080 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC136816 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily AK, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:168430 IMAGE:9020807), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000028751 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:247965377:247966339:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
NM_001258284 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily L, member 5 (OR2L5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000355281 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:248021948:248022886:1 gene:ENSG00000197454 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000028778 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:248015335:248022886:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001004686 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily L, member 2 (OR2L2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000366479 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:248038268:248039206:1 gene:ENSG00000203663 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// BC104792 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily L, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:132452 IMAGE:8143795), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC104794 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily L, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:132454 IMAGE:8143797), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000028784 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:248038616:248039206:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0
NM_001004687 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily L, member 3 (OR2L3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000359959 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:248060682:248061620:1 gene:ENSG00000198128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC137039 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily L, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:168658 IMAGE:9021035), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC137040 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily L, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:168659 IMAGE:9021036), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000028769 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:248048466:248061620:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001004690 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily M, member 5 (OR2M5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000366476 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:248145148:248146086:1 gene:ENSG00000162727 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000028772 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:248145148:248165490:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001004688 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily M, member 2 (OR2M2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000359682 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:248179986:248181029:1 gene:ENSG00000198601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000028761 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:248180160:248204006:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 55 // 11 // 12 // 0
NM_001004689 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily M, member 3 (OR2M3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000456743 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:248203068:248204006:1 gene:ENSG00000228198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC136970 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily M, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:168585 IMAGE:9020962), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC136971 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily M, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:168586 IMAGE:9020963), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000028761 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:248180160:248204006:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 61 // 11 // 11 // 0
NM_017504 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily M, member 4 (OR2M4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000306687 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:248238929:248239864:1 gene:ENSG00000171180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028764 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:248238929:248239864:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001918 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 14, subfamily C, member 36 (OR14C36), mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000317861 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:248348775:248349713:1 gene:ENSG00000177174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000028774 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:248348775:248349713:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0
NM_001004696 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily T, member 4 (OR2T4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000366475 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:248361581:248362627:1 gene:ENSG00000196944 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000621754 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR1_2_CTG32_1:248361581:248362627:1 gene:ENSG00000274870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000622637 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR1_ALT2_1_CTG32_1:248361581:248362627:1 gene:ENSG00000275617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000028754 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:248361581:248362627:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000032132 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR1_2_CTG32_1:248361581:248362627:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000041176 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR1_ALT2_1_CTG32_1:248361581:248362627:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_001005471 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily T, member 6 (OR2T6), mRNA. // chr1 // 88 // 89 // 14 // 16 // 0 /// ENST00000355728 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:248387609:248388535:1 gene:ENSG00000198104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 88 // 89 // 14 // 16 // 0 /// ENST00000612137 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR1_ALT2_1_CTG32_1:248387949:248388875:1 gene:ENSG00000278659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 88 // 89 // 14 // 16 // 0 /// ENST00000621336 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR1_2_CTG32_1:248387950:248388876:1 gene:ENSG00000278689 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 88 // 89 // 14 // 16 // 0 /// GENSCAN00000028750 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:248387609:248388535:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 88 // 89 // 14 // 16 // 0 /// GENSCAN00000032131 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR1_2_CTG32_1:248387950:248388876:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 88 // 89 // 14 // 16 // 0 /// GENSCAN00000041175 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR1_ALT2_1_CTG32_1:248387949:248388875:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 88 // 89 // 14 // 16 // 0
NM_030904 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily T, member 1 (OR2T1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000366474 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:248405995:248407104:1 gene:ENSG00000175143 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000611851 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR1_ALT2_1_CTG32_1:248408227:248409336:1 gene:ENSG00000273508 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000613540 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR1_2_CTG32_1:248412061:248413170:1 gene:ENSG00000275244 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000028752 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:248406148:248474307:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000032133 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR1_2_CTG32_1:248412214:248480373:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000041177 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR1_ALT2_1_CTG32_1:248408380:248476751:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0
NM_001013355 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily G, member 6 (OR2G6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000343414 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:248521647:248522597:1 gene:ENSG00000188558 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC137245 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily G, member 6, mRNA (cDNA clone MGC:168865 IMAGE:9021242), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC137266 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily G, member 6, mRNA (cDNA clone MGC:168886 IMAGE:9021263), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028759 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:248521647:248522597:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
BC008872 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 672, mRNA (cDNA clone IMAGE:4136336), complete cds. // chr1 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// BC035140 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 672, mRNA (cDNA clone MGC:43244 IMAGE:5264126), complete cds. // chr1 // 92 // 80 // 22 // 24 // 0 /// BC050348 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 672, mRNA (cDNA clone MGC:51164 IMAGE:5260682), complete cds. // chr1 // 92 // 80 // 22 // 24 // 0 /// NM_024836 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 672 (ZNF672), mRNA. // chr1 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// XM_005270336 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens zinc finger protein 672 (ZNF672), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// ENST00000306562 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:248838280:248849517:1 gene:ENSG00000171161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// BC068506 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 672, mRNA (cDNA clone MGC:87260 IMAGE:4824147), complete cds. // chr1 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// BC029310 // GenBank HTC // Homo sapiens zinc finger protein 672, mRNA (cDNA clone IMAGE:5175166). // chr1 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// AK298016 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57544 complete cds, highly similar to Zinc finger protein 672. // chr1 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1 /// GENSCAN00000028763 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:248847275:248848633:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0
NM_170725 // RefSeq // Homo sapiens piggyBac transposable element derived 2 (PGBD2), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000329291 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:248906243:248918573:1 gene:ENSG00000185220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// AK298248 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59727 complete cds, moderately similar to Homo sapiens piggyBac transposable element derived 1 (PGBD1), mRNA. // chr1 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// BC063785 // GenBank // Homo sapiens piggyBac transposable element derived 2, mRNA (cDNA clone MGC:70396 IMAGE:6173868), complete cds. // chr1 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// BX647065 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686F06130 (from clone DKFZp686F06130). // chr1 // 95 // 71 // 19 // 20 // 0 /// NM_001017434 // RefSeq // Homo sapiens piggyBac transposable element derived 2 (PGBD2), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// ENST00000355360 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:248906196:248919946:1 gene:ENSG00000185220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// ENST00000462488 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:248906372:248917401:1 gene:ENSG00000185220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// GENSCAN00000028781 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:248906196:248918363:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT010843 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
ENST00000387372 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:GRCh38:MT:4329:4400:-1 gene:ENSG00000210107 gene_biotype:Mt_tRNA transcript_biotype:Mt_tRNA // chr1 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// NC_001807 // GenBank // gi|17981852|ref|NC_001807.4|:c4401-4330; gene=TRNQ; product=tRNA-Gln // chr1 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// NONHSAT135807 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// S71596 // GenBank // tRNA(Gln) [human, tRNA Mitochondrial Mutant CAA Gln, 73 nt]. // chr1 // 64 // 100 // 18 // 28 // 0 /// S77916 // GenBank // tRNA-Gln [human, Parkinsons disease patient PD4, tRNA Mitochondrial Partial Mutant CAA Gln, 72 nt]. // chr1 // 64 // 100 // 18 // 28 // 0
ENST00000387392 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:GRCh38:MT:5587:5655:-1 gene:ENSG00000210127 gene_biotype:Mt_tRNA transcript_biotype:Mt_tRNA // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NC_001807 // GenBank // gi|17981852|ref|NC_001807.4|:c5656-5588; gene=TRNA; product=tRNA-Ala // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONHSAT135811 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000387400 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:GRCh38:MT:5657:5729:-1 gene:ENSG00000210135 gene_biotype:Mt_tRNA transcript_biotype:Mt_tRNA // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NC_001807 // GenBank // gi|17981852|ref|NC_001807.4|:c5730-5658; gene=TRNN; product=tRNA-Asn // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT135812 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
ENST00000387409 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:GRCh38:MT:5826:5891:-1 gene:ENSG00000210144 gene_biotype:Mt_tRNA transcript_biotype:Mt_tRNA // chr1 // 54 // 100 // 7 // 13 // 0 /// NC_001807 // GenBank // gi|17981852|ref|NC_001807.4|:c5892-5827; gene=TRNY; product=tRNA-Tyr // chr1 // 54 // 100 // 7 // 13 // 0 /// NONHSAT135814 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 54 // 100 // 7 // 13 // 0
ENST00000387416 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:GRCh38:MT:7446:7514:-1 gene:ENSG00000210151 gene_biotype:Mt_tRNA transcript_biotype:Mt_tRNA // chr1 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// AF284749 // GenBank // Homo sapiens XHRIP110 (XHRIP110) mRNA, complete cds. // chr1 // 83 // 100 // 20 // 24 // 0 /// AF284753 // GenBank // Homo sapiens X2HRIP110 (X2HRIP110) mRNA, complete cds. // chr1 // 83 // 100 // 20 // 24 // 0 /// NC_001807 // GenBank // gi|17981852|ref|NC_001807.4|:c7517-7446; gene=TRNS1; product=tRNA-Ser // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT135816 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0
ENST00000411249 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:758233:758336:-1 gene:ENSG00000223181 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT000114 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NR_024321 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 115 (LINC00115), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000473798 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:826206:827522:-1 gene:ENSG00000225880 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000521238 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:8:232586:242900:1 gene:ENSG00000172748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 92 // 50 // 11 // 12 // 0 /// BC017762 // GenBank // Homo sapiens non-protein coding RNA 115, mRNA (cDNA clone IMAGE:4700838). // chr1 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// NONHSAT000157 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT124579 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 92 // 50 // 11 // 12 // 0 /// GENSCAN00000017663 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:826700:857109:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1
NM_015658 // RefSeq // Homo sapiens nucleolar complex associated 2 homolog (S. cerevisiae) (NOC2L), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000327044 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:944204:959290:-1 gene:ENSG00000188976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000477976 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:944205:958458:-1 gene:ENSG00000188976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0 /// BC003555 // GenBank // Homo sapiens nucleolar complex associated 2 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:1451 IMAGE:3546209), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000017664 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:944694:959240:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0
NM_001291366 // RefSeq // Homo sapiens PPARGC1 and ESRR induced regulator, muscle 1 (PERM1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NM_001291367 // RefSeq // Homo sapiens PPARGC1 and ESRR induced regulator, muscle 1 (PERM1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000341290 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:975204:982093:-1 gene:ENSG00000187642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000433179 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:975205:981029:-1 gene:ENSG00000187642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000479361 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:975205:976641:-1 gene:ENSG00000187642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0 /// BC006300 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 170, mRNA (cDNA clone IMAGE:4080218), complete cds. // chr1 // 94 // 52 // 15 // 16 // 0 /// KF150175 // GenBank // Homo sapiens PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle 1 (PERM1) mRNA, complete cds. // chr1 // 88 // 77 // 21 // 24 // 0 /// NONHSAT000218 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000017674 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:976015:999772:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1
NM_001142467 // RefSeq // Homo sapiens hes family bHLH transcription factor 4 (HES4), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_021170 // RefSeq // Homo sapiens hes family bHLH transcription factor 4 (HES4), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_005244771 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens hes family bHLH transcription factor 4 (HES4), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000304952 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:998964:1000111:-1 gene:ENSG00000188290 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000428771 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:998962:1000172:-1 gene:ENSG00000188290 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000481869 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:998966:1000096:-1 gene:ENSG00000188290 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000484667 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:998970:999981:-1 gene:ENSG00000188290 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// AB048791 // GenBank // Homo sapiens mRNA for bHLH factor Hes4, complete cds. // chr1 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// BC012351 // GenBank // Homo sapiens hairy and enhancer of split 4 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:20232 IMAGE:4562569), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000017674 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:976015:999772:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_003327 // RefSeq // Homo sapiens tumor necrosis factor receptor superfamily, member 4 (TNFRSF4), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000379236 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:1211326:1214132:-1 gene:ENSG00000186827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000453580 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:1212019:1213498:-1 gene:ENSG00000186827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000497869 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:1211340:1214138:-1 gene:ENSG00000186827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC105070 // GenBank // Homo sapiens tumor necrosis factor receptor superfamily, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:132730 IMAGE:8144073), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC105072 // GenBank // Homo sapiens tumor necrosis factor receptor superfamily, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:132732 IMAGE:8144075), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014906 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:1211555:1214127:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT000260 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT000261 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// X75962 // GenBank // H.sapiens mRNA for OX40 homologue. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NM_001014980 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 132, member A (FAM132A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000330388 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:1242453:1246722:-1 gene:ENSG00000184163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC089443 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 132, member A, mRNA (cDNA clone MGC:105127 IMAGE:30554756), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000462849 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:1242446:1243463:-1 gene:ENSG00000184163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// ENST00000468365 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:1243266:1244418:-1 gene:ENSG00000184163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// ENST00000478606 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:1242449:1243158:-1 gene:ENSG00000184163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// ENST00000486627 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:1243981:1244724:-1 gene:ENSG00000184163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1 /// GENSCAN00000014908 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:1235428:1246690:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONHSAT000264 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
ENST00000482352 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:1405109:1407290:-1 gene:ENSG00000242485 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000582431 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:1405460:1405752:-1 gene:ENSG00000264293 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AK301440 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57630 complete cds, moderately similar to Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein L20 (MRPL20), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT000312 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_014188 // RefSeq // Homo sapiens SSU72 RNA polymerase II CTD phosphatase homolog (S. cerevisiae) (SSU72), mRNA. // chr1 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000291386 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:1541673:1574869:-1 gene:ENSG00000160075 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000359060 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:1562345:1574584:-1 gene:ENSG00000160075 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000378726 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:1541674:1546487:-1 gene:ENSG00000160075 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// AF277178 // GenBank // Homo sapiens PNAS-120 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// AK023110 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ13048 fis, clone NT2RP3001399, weakly similar to SSU72 PROTEIN. // chr1 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// AK127149 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ45206 fis, clone BRCAN2010581. // chr1 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// AK291324 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77664 complete cds. // chr1 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// BC008070 // GenBank // Homo sapiens SSU72 RNA polymerase II CTD phosphatase homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:2805 IMAGE:2961422), complete cds. // chr1 // 93 // 54 // 13 // 14 // 0 /// AK297505 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60055 complete cds, highly similar to Rattus norvegicus Ssu72 RNA polymerase II CTD phosphatase homolog, mRNA. // chr1 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001110781 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 35, member E2B (SLC35E2B), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 92 // 57 // 12 // 13 // 0 /// NM_001290264 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 35, member E2B (SLC35E2B), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 92 // 57 // 12 // 13 // 0 /// XM_006710870 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens solute carrier family 35, member E2B (SLC35E2B), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 52 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000480991 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:1663782:1670139:-1 gene:ENSG00000189339 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 43 // 10 // 10 // 0 /// AK092311 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ34992 fis, clone OCBBF2011228, weakly similar to Mesembryanthemum crystallinum phosphoenolpyruvate/phosphate translocator precursor (PPT) mRNA. // chr1 // 90 // 43 // 9 // 10 // 0 /// BC110653 // GenBank // Homo sapiens similar to solute carrier family 35, member E2, mRNA (cDNA clone MGC:117254 IMAGE:4392812), complete cds. // chr1 // 92 // 57 // 12 // 13 // 0 /// ENST00000611123 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:1661479:1692728:-1 gene:ENSG00000189339 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 57 // 12 // 13 // 0 /// ENST00000617444 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:1661478:1692644:-1 gene:ENSG00000189339 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 52 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000014901 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:1665782:1679001:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 43 // 10 // 10 // 0 /// NONHSAT000349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 43 // 10 // 10 // 0
ENST00000378602 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:1917590:1918797:-1 gene:ENSG00000178821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000602604 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:1918099:1919269:-1 gene:ENSG00000178821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// AY358544 // GenBank // Homo sapiens clone DNA125151 ERHC3048 (UNQ3048) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 67 // 14 // 14 // 0 /// NM_178545 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 52 (TMEM52), mRNA. // chr1 // 81 // 81 // 17 // 21 // 1 /// ENST00000310991 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:1917591:1919273:-1 gene:ENSG00000178821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 81 // 81 // 17 // 21 // 1 /// AJ278736 // GenBank // Homo sapiens mRNA for hypothetical protein (ORF1), 971BP. // chr1 // 81 // 81 // 17 // 21 // 1 /// ENST00000470931 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:1917937:1919270:-1 gene:ENSG00000178821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 67 // 67 // 14 // 21 // 1 /// ENST00000378598 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:1917845:1919258:-1 gene:ENSG00000178821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 48 // 48 // 10 // 21 // 1 /// ENST00000416272 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:1918386:1919269:-1 gene:ENSG00000178821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1 /// GENSCAN00000014886 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:1917882:1919265:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT000375 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0
ENST00000412120 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:1922083:1927403:-1 gene:ENSG00000142609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000464311 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:1921957:1927929:-1 gene:ENSG00000142609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC114926 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 222, mRNA (cDNA clone MGC:133181 IMAGE:40026076), complete cds. // chr1 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// XM_005244811 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens KIAA1751 (KIAA1751), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 89 // 89 // 17 // 19 // 1 /// ENST00000493964 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:1921951:2003837:-1 gene:ENSG00000142609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 79 // 79 // 15 // 19 // 1 /// GENSCAN00000014900 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:1922287:1974191:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 79 // 79 // 15 // 19 // 1
ENST00000378592 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:1983671:2003837:-1 gene:ENSG00000142609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 20 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000461752 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:1955711:1960108:-1 gene:ENSG00000142609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 30 // 12 // 12 // 0 /// NM_001080484 // RefSeq // Homo sapiens KIAA1751 (KIAA1751), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 1 /// XM_005244811 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens KIAA1751 (KIAA1751), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 1 /// ENST00000270720 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:1953313:2003837:-1 gene:ENSG00000142609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 1 /// ENST00000468610 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:1955148:2003714:-1 gene:ENSG00000142609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 1 /// ENST00000493964 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:1921951:2003837:-1 gene:ENSG00000142609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 1 /// AB051538 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1751 protein, partial cds. // chr1 // 90 // 90 // 36 // 40 // 1 /// GENSCAN00000014900 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:1922287:1974191:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 75 // 75 // 30 // 40 // 1 /// GENSCAN00000014912 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:1982975:1990956:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1
ENST00000606533 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:2141084:2145279:-1 gene:ENSG00000271806 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC028413 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4823388. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_006711074 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens uncharacterized LOC100506504 (LOC100506504), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000333854 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:2181794:2183875:-1 gene:ENSG00000182873 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AK024190 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ14128 fis, clone MAMMA1002590. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC002643 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3613158. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT000393 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT000394 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NR_024489 // RefSeq // Homo sapiens small nuclear ribonucleoprotein polypeptide N pseudogene (LOC100129534), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000602865 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:2350414:2352820:-1 gene:ENSG00000269896 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000045686 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:2351353:2351979:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 52 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT000416 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001010926 // RefSeq // Homo sapiens hes family bHLH transcription factor 5 (HES5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000378453 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:2528745:2530245:-1 gene:ENSG00000197921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC087840 // GenBank // Homo sapiens hairy and enhancer of split 5 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:102848 IMAGE:6204648), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// DQ272660 // GenBank // Homo sapiens HES5 (HES5) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000612705 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR1_1_CTG3:2528747:2530245:-1 gene:ENSG00000273529 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000004823 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR1_1_CTG3:2529469:2551862:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1 /// GENSCAN00000045694 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:2529469:2551862:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1
NR_015440 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 982 (LINC00982), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000321399 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:3059615:3063786:-1 gene:ENSG00000177133 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000445317 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:3059617:3068437:-1 gene:ENSG00000177133 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000453118 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:3059617:3062032:-1 gene:ENSG00000177133 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 1 /// ENST00000606861 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:3059615:3062531:-1 gene:ENSG00000177133 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 1 /// AL713743 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp761G0122 (from clone DKFZp761G0122). // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 1 /// NONHSAT000493 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// NONHSAT000495 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// NONHSAT000496 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// NONHSAT000494 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 1 /// TCONS_00000460-XLOC_000682 // Rinn lincRNA // linc-MMEL1-3 chr1:-:2976180-2978596 // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 1
NR_015440 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 982 (LINC00982), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr1 // 94 // 75 // 17 // 18 // 0 /// NR_024371 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 982 (LINC00982), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000321336 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:3064072:3067769:-1 gene:ENSG00000177133 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000445317 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:3059617:3068437:-1 gene:ENSG00000177133 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 95 // 83 // 19 // 20 // 0 /// NONHSAT000495 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 94 // 75 // 17 // 18 // 0 /// NONHSAT000496 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 95 // 83 // 19 // 20 // 0 /// NONHSAT000502 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT000503 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 58 // 58 // 14 // 24 // 1 /// GENSCAN00000017712 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:3033778:3073173:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 46 // 46 // 11 // 24 // 1
NM_001409 // RefSeq // Homo sapiens multiple EGF-like-domains 6 (MEGF6), mRNA. // chr1 // 100 // 63 // 29 // 29 // 0 /// XM_006710410 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens multiple EGF-like-domains 6 (MEGF6), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 46 // 21 // 21 // 0 /// XR_426590 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens multiple EGF-like-domains 6 (MEGF6), transcript variant X6, misc_RNA. // chr1 // 100 // 59 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000294599 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:3489920:3531448:-1 gene:ENSG00000162591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000485002 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:3490562:3611277:-1 gene:ENSG00000162591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 97 // 80 // 36 // 37 // 0 /// AB011539 // GenBank // Homo sapiens mRNA for MEGF6 protein (KIAA0815), partial cds. // chr1 // 100 // 76 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000356575 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:3489926:3611495:-1 gene:ENSG00000162591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 91 // 91 // 42 // 46 // 1 /// GENSCAN00000017700 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:3482561:3531245:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 35 // 35 // 0
NM_020710 // RefSeq // Homo sapiens leucine rich repeat containing 47 (LRRC47), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000378251 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:3778558:3796504:-1 gene:ENSG00000130764 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000462356 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:3781135:3784175:-1 gene:ENSG00000130764 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 89 // 36 // 8 // 9 // 0 /// BC031301 // GenBank // Homo sapiens leucine rich repeat containing 47, mRNA (cDNA clone MGC:39317 IMAGE:4330114), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017713 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:3781088:3796476:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_014704 // RefSeq // Homo sapiens centrosomal protein 104kDa (CEP104), mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000378223 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:3843109:3857214:-1 gene:ENSG00000116198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 25 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000378230 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:3812081:3857199:-1 gene:ENSG00000116198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000494653 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:3833671:3857198:-1 gene:ENSG00000116198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// AK302190 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51382 complete cds. // chr1 // 86 // 39 // 12 // 14 // 0 /// BC047450 // GenBank // Homo sapiens KIAA0562, mRNA (cDNA clone MGC:48315 IMAGE:5297035), complete cds. // chr1 // 94 // 50 // 17 // 18 // 0 /// BC050721 // GenBank // Homo sapiens KIAA0562, mRNA (cDNA clone IMAGE:6151735), complete cds. // chr1 // 89 // 25 // 8 // 9 // 0 /// GENSCAN00000017719 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:3834770:3852407:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 44 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000017722 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:3815402:3832569:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
NM_207356 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 174 (C1orf174), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000361605 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:3889125:3900285:-1 gene:ENSG00000198912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000474140 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:3889125:3900293:-1 gene:ENSG00000198912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000486765 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:3889125:3900247:-1 gene:ENSG00000198912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AK125092 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ43102 fis, clone CTONG2008689. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AK289493 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75900 complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC047611 // GenBank HTC // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 174, mRNA (cDNA clone IMAGE:5758800), with apparent retained intron. // chr1 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// BC067302 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 174, mRNA (cDNA clone MGC:75526 IMAGE:30409047), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017697 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:3889960:3904012:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_015557 // RefSeq // Homo sapiens chromodomain helicase DNA binding protein 5 (CHD5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 53 // 53 // 0 /// ENST00000262450 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:6101793:6180123:-1 gene:ENSG00000116254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 53 // 53 // 0 /// ENST00000377999 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:6105083:6131739:-1 gene:ENSG00000116254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 47 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000462991 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:6105081:6144104:-1 gene:ENSG00000116254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 62 // 33 // 33 // 0 /// AF425231 // GenBank // Homo sapiens chromodomain helicase DNA binding protein 5 (CHD5) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 53 // 53 // 0 /// AL110281 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp434K213 (from clone DKFZp434K213). // chr1 // 100 // 62 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000496404 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:6105091:6180023:-1 gene:ENSG00000116254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 75 // 75 // 40 // 53 // 1 /// GENSCAN00000026058 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:6104071:6180023:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 48 // 48 // 0
NM_000983 // RefSeq // Homo sapiens ribosomal protein L22 (RPL22), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000234875 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:6185020:6199612:-1 gene:ENSG00000116251 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_012405 // RefSeq // Homo sapiens isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase (ICMT), mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000343813 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:6221193:6235940:-1 gene:ENSG00000116237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000489498 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:6223491:6235972:-1 gene:ENSG00000116237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// AF064084 // GenBank // Homo sapiens prenylcysteine carboxyl methyltransferase (PCCMT) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// BC017037 // GenBank // Homo sapiens isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase, mRNA (cDNA clone IMAGE:3904144). // chr1 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// BC028168 // GenBank // Homo sapiens isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:39955 IMAGE:5245125), complete cds. // chr1 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// CR541671 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834H1127D for gene ICMT, isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase; complete cds, incl. stopcodon. // chr1 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0 /// CR541711 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834E1228D for gene ICMT, isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase; complete cds, without stopcodon. // chr1 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000474756 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:6224599:6235972:-1 gene:ENSG00000116237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1 /// GENSCAN00000026055 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:6225080:6235911:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0
NM_207370 // RefSeq // Homo sapiens G protein-coupled receptor 153 (GPR153), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000377893 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:6247346:6260975:-1 gene:ENSG00000158292 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC068275 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 153, mRNA (cDNA clone MGC:35103 IMAGE:5167285), complete cds. // chr1 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000026044 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:6249338:6254905:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0
NM_024654 // RefSeq // Homo sapiens nucleolar protein 9 (NOL9), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_005263493 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens nucleolar protein 9 (NOL9), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 61 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000377705 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:6521347:6554535:-1 gene:ENSG00000162408 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000464383 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:6531995:6545017:-1 gene:ENSG00000162408 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 92 // 36 // 11 // 12 // 0 /// AK289653 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75381 complete cds, highly similar to Homo sapiens nucleolar protein 9 (NOL9), mRNA. // chr1 // 93 // 91 // 28 // 30 // 0 /// BC105095 // GenBank // Homo sapiens nucleolar protein 9, mRNA (cDNA clone MGC:132755 IMAGE:8144098), complete cds. // chr1 // 93 // 91 // 28 // 30 // 0 /// BC110849 // GenBank // Homo sapiens nucleolar protein 9, mRNA (cDNA clone MGC:131821 IMAGE:6167575), complete cds. // chr1 // 93 // 88 // 27 // 29 // 0 /// BC112278 // GenBank // Homo sapiens nucleolar protein 9, mRNA (cDNA clone MGC:138483 IMAGE:8327746), complete cds. // chr1 // 93 // 91 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000026034 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:6525854:6554502:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0
NM_014851 // RefSeq // Homo sapiens kelch-like family member 21 (KLHL21), mRNA. // chr1 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000377658 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:6590724:6602869:-1 gene:ENSG00000162413 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000377663 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:6590724:6603001:-1 gene:ENSG00000162413 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// AB007938 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA0469 protein, partial cds. // chr1 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// BC034039 // GenBank // Homo sapiens kelch-like 21 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:26467 IMAGE:4811534), complete cds. // chr1 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0 /// BC091648 // GenBank // Homo sapiens kelch-like 21 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:99635 IMAGE:6373903), complete cds. // chr1 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000467612 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:6593193:6614560:-1 gene:ENSG00000162413 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 26 // 26 // 9 // 35 // 1 /// ENST00000496707 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:1:6593381:6599816:-1 gene:ENSG00000162413 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 26 // 26 // 9 // 35 // 1 /// AK307564 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ97512. // chr1 // 26 // 26 // 9 // 35 // 1 /// GENSCAN00000026042 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:6593365:6602817:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 26 // 9 // 9 // 0
NM_006786 // RefSeq // Homo sapiens urotensin 2 (UTS2), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// NM_021995 // RefSeq // Homo sapiens urotensin 2 (UTS2), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000054668 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:7847766:7853431:-1 gene:ENSG00000049247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000361696 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:7847614:7853035:-1 gene:ENSG00000049247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000377516 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:7843083:7853512:-1 gene:ENSG00000049247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// AF104118 // GenBank // Homo sapiens urotensin II precursor, mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// AF140630 // GenBank // Homo sapiens urotensin-II mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0 /// AY358375 // GenBank // Homo sapiens clone DNA59214 UTS2 (UNQ525) mRNA, complete cds. // chr1 // 90 // 65 // 18 // 20 // 0 /// BC025776 // GenBank // Homo sapiens urotensin 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:5223016), partial cds. // chr1 // 96 // 74 // 22 // 23 // 0 /// BC126443 // GenBank // Homo sapiens urotensin 2, mRNA (cDNA clone MGC:161721 IMAGE:8992159), complete cds. // chr1 // 96 // 77 // 23 // 24 // 0
NM_001561 // RefSeq // Homo sapiens tumor necrosis factor receptor superfamily, member 9 (TNFRSF9), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006710618 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens tumor necrosis factor receptor superfamily, member 9 (TNFRSF9), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000377507 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:7919847:7940866:-1 gene:ENSG00000049249 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000492571 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:7933127:7938304:-1 gene:ENSG00000049249 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 44 // 15 // 15 // 0 /// BC006196 // GenBank // Homo sapiens tumor necrosis factor receptor superfamily, member 9, mRNA (cDNA clone MGC:2172 IMAGE:2924109), complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// L12964 // GenBank // Human activation dependent T cell mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// U03397 // GenBank // Human receptor protein 4-1BB mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000615230 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:7915894:7943165:-1 gene:ENSG00000049249 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NM_018948 // RefSeq // Homo sapiens ERBB receptor feedback inhibitor 1 (ERRFI1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000377482 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:8011719:8026308:-1 gene:ENSG00000116285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000469499 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:8013739:8026296:-1 gene:ENSG00000116285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000487559 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:8014040:8026296:-1 gene:ENSG00000116285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// BC025337 // GenBank // Homo sapiens ERBB receptor feedback inhibitor 1, mRNA (cDNA clone MGC:39368 IMAGE:4810371), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000467067 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:8013427:8015633:-1 gene:ENSG00000116285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// ENST00000474874 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:8004404:8026283:-1 gene:ENSG00000116285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// BC012839 // GenBank HTC // Homo sapiens ERBB receptor feedback inhibitor 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4178738), with apparent retained intron. // chr1 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// GENSCAN00000046046 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:8013210:8092927:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
ENST00000364105 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:8206434:8206597:-1 gene:ENSG00000200975 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT000739 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000516168 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:8292157:8292263:-1 gene:ENSG00000251977 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT000744 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
BC029383 // GenBank HTC // Homo sapiens hypothetical LOC54744, mRNA (cDNA clone IMAGE:4607730), with apparent retained intron. // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
ENST00000410579 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:8796571:8796673:-1 gene:ENSG00000222511 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT000763 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000364855 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:8883427:8883533:-1 gene:ENSG00000201725 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT000772 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000583026 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:8979576:8979874:-1 gene:ENSG00000265141 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONHSAT000776 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_207420 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 2 (facilitated glucose transporter), member 7 (SLC2A7), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000400906 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:9003300:9026345:-1 gene:ENSG00000197241 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// AY571960 // GenBank // Homo sapiens intestinal facilitative glucose transporter 7 (SLC2A7) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000049200 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:9003300:9026345:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
AK304154 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52296 complete cds, moderately similar to Probable G-protein coupled receptor 157. // chr1 // 90 // 67 // 18 // 20 // 0 /// NM_024980 // RefSeq // Homo sapiens G protein-coupled receptor 157 (GPR157), mRNA. // chr1 // 77 // 77 // 23 // 30 // 1 /// ENST00000377411 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:9100305:9129170:-1 gene:ENSG00000180758 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 77 // 77 // 23 // 30 // 1 /// AK292888 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77244 complete cds, highly similar to Homo sapiens G protein-coupled receptor 157 (GPR157), mRNA. // chr1 // 77 // 77 // 23 // 30 // 1 /// AY768808 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 157 (GPR157) mRNA, complete cds. // chr1 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// BC094733 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:30337465, partial cds. // chr1 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1 /// GENSCAN00000049211 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:9071629:9129027:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 43 // 12 // 13 // 0 /// BC018691 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 157, mRNA (cDNA clone IMAGE:4720622). // chr1 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0
NR_029610 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 34a (MIR34A), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000385130 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:9151668:9151777:-1 gene:ENSG00000207865 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// EF592573 // GenBank // Homo sapiens microRNA-34a primary transcript, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// EF570048 // GenBank // Homo sapiens microRNA 34a (MIRN34A) precursor RNA, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-34a // miRBase Micro RNA Database // MI0000268 Homo sapiens miR-34a stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT000787 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049216 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:9150489:9196981:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
EF592573 // GenBank // Homo sapiens microRNA-34a primary transcript, complete sequence. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000437157 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:9182007:9202619:-1 gene:ENSG00000228526 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000049216 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:9150489:9196981:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK123145 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ41150 fis, clone BRACE2038114. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT000786 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT000790 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// EF570048 // GenBank // Homo sapiens microRNA 34a (MIRN34A) precursor RNA, complete sequence. // chr1 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
ENST00000517147 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:9437669:9437778:-1 gene:ENSG00000252956 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT000807 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_027045 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 200 (C1orf200), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000377320 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:9652610:9654586:-1 gene:ENSG00000179840 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC144613 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 200, mRNA (cDNA clone IMAGE:9053144). // chr1 // 91 // 71 // 20 // 22 // 0 /// GENSCAN00000049202 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:9652126:9690635:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1
NM_020248 // RefSeq // Homo sapiens catenin, beta interacting protein 1 (CTNNBIP1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000377256 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:9850659:9878176:-1 gene:ENSG00000178585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000377258 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:9850450:9893237:-1 gene:ENSG00000178585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000377263 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:9848276:9910263:-1 gene:ENSG00000178585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// AB021262 // GenBank // Homo sapiens mRNA for beta-catenin-interacting protein ICAT, complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC146892 // GenBank // Homo sapiens catenin, beta interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:181995 IMAGE:9056820), complete cds. // chr1 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// BC146896 // GenBank // Homo sapiens catenin, beta interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:181999 IMAGE:9056824), complete cds. // chr1 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NM_001012329 // RefSeq // Homo sapiens catenin, beta interacting protein 1 (CTNNBIP1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// ENST00000400904 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:9850109:9910336:-1 gene:ENSG00000178585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// BC014300 // GenBank // Homo sapiens catenin, beta interacting protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3938651), complete cds. // chr1 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// GENSCAN00000049204 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:9850718:9912801:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001079843 // RefSeq // Homo sapiens castor zinc finger 1 (CASZ1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 68 // 68 // 0 /// NM_017766 // RefSeq // Homo sapiens castor zinc finger 1 (CASZ1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 56 // 39 // 39 // 0 /// XM_005263479 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens castor zinc finger 1 (CASZ1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 51 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000344008 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:10647213:10796650:-1 gene:ENSG00000130940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000377022 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:10636604:10796648:-1 gene:ENSG00000130940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 68 // 68 // 0 /// ENST00000496432 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:10652984:10694479:-1 gene:ENSG00000130940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 26 // 18 // 18 // 0 /// AK293839 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56058 complete cds, highly similar to Castor homolog 1 zinc finger protein. // chr1 // 94 // 26 // 17 // 18 // 0 /// BC051883 // GenBank // Homo sapiens castor zinc finger 1, mRNA (cDNA clone MGC:60281 IMAGE:5534858), complete cds. // chr1 // 100 // 44 // 31 // 31 // 0 /// DQ217660 // GenBank // Homo sapiens castor long variant (CAS11) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 97 // 65 // 68 // 0 /// DQ372703 // GenBank // Homo sapiens survival-related (SRG) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 30 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000002782 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:10638942:10669682:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 49 // 34 // 34 // 0
NM_001079843 // RefSeq // Homo sapiens castor zinc finger 1 (CASZ1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000377022 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:10636604:10796648:-1 gene:ENSG00000130940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// DQ217660 // GenBank // Homo sapiens castor long variant (CAS11) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// DQ372703 // GenBank // Homo sapiens survival-related (SRG) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001079843 // RefSeq // Homo sapiens castor zinc finger 1 (CASZ1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000377022 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:10636604:10796648:-1 gene:ENSG00000130940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// DQ217660 // GenBank // Homo sapiens castor long variant (CAS11) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// DQ372703 // GenBank // Homo sapiens survival-related (SRG) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001170754 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 127 (C1orf127), mRNA. // chr1 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000377004 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:10946473:10982037:-1 gene:ENSG00000175262 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000418570 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:10946473:10964201:-1 gene:ENSG00000175262 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000520253 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:10946730:10976215:-1 gene:ENSG00000175262 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// BC126349 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 127, mRNA (cDNA clone MGC:161627 IMAGE:8992065), complete cds. // chr1 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// BC143794 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 127, mRNA (cDNA clone MGC:177325 IMAGE:9052308), complete cds. // chr1 // 90 // 81 // 19 // 21 // 0 /// BC143795 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 127, mRNA (cDNA clone MGC:177326 IMAGE:9052309), complete cds. // chr1 // 90 // 81 // 19 // 21 // 0 /// BC143797 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 127, mRNA (cDNA clone MGC:177328 IMAGE:9052311), complete cds. // chr1 // 90 // 77 // 18 // 20 // 0 /// ENST00000476357 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:10946471:10949751:-1 gene:ENSG00000175262 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// AK095152 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ37833 fis, clone BRSSN2009702. // chr1 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// GENSCAN00000002780 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:10947663:10982037:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_006610 // RefSeq // Homo sapiens mannan-binding lectin serine peptidase 2 (MASP2), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// NM_139208 // RefSeq // Homo sapiens mannan-binding lectin serine peptidase 2 (MASP2), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 45 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000400897 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:11026523:11047223:-1 gene:ENSG00000009724 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000400898 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:11044798:11047233:-1 gene:ENSG00000009724 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 45 // 17 // 17 // 0 /// AB008047 // GenBank // Homo sapiens sMAP mRNA for small MBL-associated protein, complete cds. // chr1 // 100 // 45 // 17 // 17 // 0 /// AK290823 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77090 complete cds, highly similar to Homo sapiens mannan-binding lectin serine peptidase 2 (MASP2), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 94 // 87 // 31 // 33 // 0 /// ENST00000480221 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:11044798:11047227:-1 gene:ENSG00000009724 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 42 // 42 // 16 // 38 // 1 /// BC080556 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6269223. // chr1 // 42 // 42 // 16 // 38 // 1 /// GENSCAN00000014840 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:11026746:11059943:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 58 // 58 // 22 // 38 // 1
NM_003132 // RefSeq // Homo sapiens spermidine synthase (SRM), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000376957 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:11054589:11060024:-1 gene:ENSG00000116649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000459997 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:11056011:11060020:-1 gene:ENSG00000116649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000465788 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:11056011:11058873:-1 gene:ENSG00000116649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0 /// BC000309 // GenBank // Homo sapiens spermidine synthase, mRNA (cDNA clone MGC:8422 IMAGE:2820975), complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC033106 // GenBank // Homo sapiens spermidine synthase, mRNA (cDNA clone MGC:45687 IMAGE:5420683), complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// M34338 // GenBank // Human spermidine synthase mRNA, complete cds. // chr1 // 94 // 97 // 30 // 32 // 0 /// GENSCAN00000014840 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:11026746:11059943:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1
NM_001001998 // RefSeq // Homo sapiens exosome component 10 (EXOSC10), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NM_002685 // RefSeq // Homo sapiens exosome component 10 (EXOSC10), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000304457 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:11066618:11099869:-1 gene:ENSG00000171824 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000376936 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:11066618:11099881:-1 gene:ENSG00000171824 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000474216 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:11066621:11081217:-1 gene:ENSG00000171824 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 58 // 19 // 19 // 0 /// AB209236 // GenBank // Homo sapiens mRNA for exosome component 10 isoform 2 variant protein. // chr1 // 97 // 97 // 31 // 32 // 0 /// AK294058 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59618 complete cds, highly similar to Exosome component 10. // chr1 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// AK296559 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60634 complete cds, highly similar to Exosome component 10. // chr1 // 97 // 97 // 31 // 32 // 0 /// BC039901 // GenBank // Homo sapiens exosome component 10, mRNA (cDNA clone MGC:47752 IMAGE:5505500), complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// BC073788 // GenBank // Homo sapiens exosome component 10, mRNA (cDNA clone MGC:88806 IMAGE:5420763), complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// L01457 // GenBank // Homo sapiens (clone JH4B1) PM-scl autoantigen mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000014860 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:11067968:11099831:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0
NM_012168 // RefSeq // Homo sapiens F-box protein 2 (FBXO2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000354287 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:11648367:11654682:-1 gene:ENSG00000116661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC025233 // GenBank // Homo sapiens F-box protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:39079 IMAGE:5090925), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC096747 // GenBank // Homo sapiens F-box protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:104581 IMAGE:5259298), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// CR542110 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834F0737D for gene FBXO2, F-box only protein 2; complete cds, incl. stopcodon. // chr1 // 79 // 80 // 19 // 24 // 0 /// AK308531 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ98572. // chr1 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// ENST00000466919 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:11649874:11654197:-1 gene:ENSG00000116661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// ENST00000471501 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:11649528:11650713:-1 gene:ENSG00000116661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// GENSCAN00000014863 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:11608221:11655177:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1
NM_005957 // RefSeq // Homo sapiens methylenetetrahydrofolate reductase (NAD(P)H) (MTHFR), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_005263458 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens methylenetetrahydrofolate reductase (NAD(P)H) (MTHFR), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000376583 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:11785730:11803514:-1 gene:ENSG00000177000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000376585 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:11788294:11805413:-1 gene:ENSG00000177000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000376590 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:11786603:11806058:-1 gene:ENSG00000177000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000376592 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:11785723:11803245:-1 gene:ENSG00000177000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB209113 // GenBank // Homo sapiens mRNA for 5,10-methylenetetrahydrofolate reductase (NADPH) variant protein. // chr1 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// AJ237672 // GenBank // Homo sapiens mRNA for methylenetetrahydrofolate reductase. // chr1 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// BC053509 // GenBank // Homo sapiens 5,10-methylenetetrahydrofolate reductase (NADPH), mRNA (cDNA clone MGC:59799 IMAGE:6374885), complete cds. // chr1 // 92 // 93 // 24 // 26 // 0 /// JQ429447 // GenBank // Homo sapiens 5,10-methylenetetrahydrofolate reductase isoform 2 (MTHFR) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 94 // 64 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000014855 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:11790680:11803116:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_138346 // RefSeq // Homo sapiens KIAA2013 (KIAA2013), mRNA. // chr1 // 100 // 50 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000376576 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:11922175:11926428:-1 gene:ENSG00000116685 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// AB095933 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA2013 protein. // chr1 // 83 // 100 // 10 // 12 // 0
NM_006172 // RefSeq // Homo sapiens natriuretic peptide A (NPPA), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000376476 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:11845879:11848345:-1 gene:ENSG00000175206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 80 // 38 // 8 // 10 // 0 /// ENST00000376480 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:11845709:11847783:-1 gene:ENSG00000175206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC005893 // GenBank // Homo sapiens natriuretic peptide precursor A, mRNA (cDNA clone MGC:14467 IMAGE:4273949), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// M30262 // GenBank // Human cardiodilatin-atrial natriuretic factor (CDD-ANF) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000610706 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:11845712:11847783:-1 gene:ENSG00000175206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000014851 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:11843730:11847684:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
NM_002521 // RefSeq // Homo sapiens natriuretic peptide B (NPPB), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000376468 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:11857464:11858931:-1 gene:ENSG00000120937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC025785 // GenBank // Homo sapiens natriuretic peptide precursor B, mRNA (cDNA clone MGC:34579 IMAGE:5229356), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// CR541976 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834B0135D for gene NPPB, natriuretic peptide precursor B; complete cds, incl. stopcodon. // chr1 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// CR542003 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834E0135D for gene NPPB, natriuretic peptide precursor B; complete cds, without stopcodon. // chr1 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// M25296 // GenBank // Human natriuretic peptide precursor mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000014846 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:11853856:11858833:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0
ENST00000364931 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:11909808:11909927:-1 gene:ENSG00000201801 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONHSAT000925 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
ENST00000365591 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:12024012:12024124:-1 gene:ENSG00000202461 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT000935 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000496974 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:12036740:12037014:-1 gene:ENSG00000243539 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT000938 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0
ENST00000364265 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:12077881:12077984:-1 gene:ENSG00000201135 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT000939 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001013631 // RefSeq // Homo sapiens heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 1 (HNRNPCL1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000317869 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:12847408:12848725:-1 gene:ENSG00000179172 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 83 // 100 // 15 // 18 // 0 /// BC137258 // GenBank // Homo sapiens heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:168878 IMAGE:9021255), complete cds. // chr1 // 83 // 100 // 15 // 18 // 0
NM_001136561 // RefSeq // Homo sapiens heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 2 (HNRNPCL2), mRNA. // chr1 // 86 // 100 // 18 // 21 // 0 /// ENST00000323770 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:13115521:13116400:-1 gene:ENSG00000179412 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 86 // 100 // 18 // 21 // 0 /// BC144551 // GenBank // Homo sapiens heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like, mRNA (cDNA clone MGC:178095 IMAGE:9053078), complete cds. // chr1 // 86 // 100 // 18 // 21 // 0 /// BC157858 // GenBank // Homo sapiens heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like, mRNA (cDNA clone MGC:189753 IMAGE:9057077), complete cds. // chr1 // 86 // 100 // 18 // 21 // 0 /// BC171863 // GenBank // Homo sapiens heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like, mRNA (cDNA clone MGC:198578 IMAGE:9054517), complete cds. // chr1 // 86 // 100 // 18 // 21 // 0 /// ENST00000619361 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR1_2_CTG3:13136143:13137509:-1 gene:ENSG00000274109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000020394 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR1_2_CTG3:13136174:13137055:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000021080 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:13115519:13116400:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 86 // 100 // 18 // 21 // 0
ENST00000376101 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:13369067:13371693:-1 gene:ENSG00000204480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// NM_001099850 // RefSeq // Homo sapiens PRAME family member-like (LOC391003), mRNA. // chr1 // 67 // 100 // 16 // 24 // 0 /// ENST00000540591 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR1_2_CTG3:13241275:13244713:-1 gene:ENSG00000277853 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSG00000204480 // chr1 // 63 // 100 // 15 // 24 // 0 /// XM_006724955 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens PRAME family member 25 (PRAMEF25), mRNA. // chr1 // 42 // 42 // 10 // 24 // 1 /// ENST00000415919 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:13149237:13226106:-1 gene:ENSG00000204505 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr1 // 46 // 46 // 11 // 24 // 1 /// GENSCAN00000021069 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:13342528:13371900:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 75 // 75 // 18 // 24 // 1 /// GENSCAN00000020391 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR1_2_CTG3:13215394:13244686:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 58 // 58 // 14 // 24 // 1 /// GENSCAN00000021076 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:13196823:13226106:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 58 // 58 // 14 // 24 // 1 /// ENST00000616664 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR1_2_CTG3:13093629:13098253:1 gene:ENSG00000276816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 42 // 42 // 10 // 24 // 1 /// GENSCAN00000020383 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR1_2_CTG3:13093639:13098183:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 42 // 42 // 10 // 24 // 1
NM_001010847 // RefSeq // Homo sapiens leucine rich repeat containing 38 (LRRC38), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006710336 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens leucine rich repeat containing 38 (LRRC38), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000376085 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:13474977:13514048:-1 gene:ENSG00000162494 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021073 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:13475846:13513593:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
ENST00000517276 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:13696070:13696199:-1 gene:ENSG00000253085 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONHSAT000986 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
ENST00000516342 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:14124233:14124335:-1 gene:ENSG00000252151 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT000990 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_027136 // RefSeq // Homo sapiens TMEM51 antisense RNA 1 (TMEM51-AS1), long non-coding RNA. // chr1 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// BC036877 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5242289, partial cds. // chr1 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// NONHSAT001017 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NR_027136 // RefSeq // Homo sapiens TMEM51 antisense RNA 1 (TMEM51-AS1), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000310916 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:15115953:15152464:-1 gene:ENSG00000175147 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000404665 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:15115952:15152402:-1 gene:ENSG00000175147 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// AK074283 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ23703 fis, clone HEP10820. // chr1 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// NONHSAT001017 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT001018 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_024758 // RefSeq // Homo sapiens agmatine ureohydrolase (agmatinase) (AGMAT), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000375826 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:15572353:15585110:-1 gene:ENSG00000116771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY057097 // GenBank // Homo sapiens agmatinase mRNA, complete cds. // chr1 // 88 // 86 // 21 // 24 // 0 /// BC005090 // GenBank // Homo sapiens agmatine ureohydrolase (agmatinase), mRNA (cDNA clone MGC:13078 IMAGE:3837251), complete cds. // chr1 // 88 // 89 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045953 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:15573568:15584967:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// AK027037 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ23384 fis, clone HEP16468. // chr1 // 83 // 86 // 20 // 24 // 0
NR_024279 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC729614 (FLJ37453), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000317122 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:15834479:15848147:-1 gene:ENSG00000179743 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AK094772 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ37453 fis, clone BRAWH2010754. // chr1 // 89 // 39 // 8 // 9 // 0 /// NONHSAT001062 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 39 // 9 // 9 // 0 /// NONHSAT001063 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_182623 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 131, member C (FAM131C), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000375662 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:16057769:16073626:-1 gene:ENSG00000185519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC016848 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 131, member C, mRNA (cDNA clone MGC:10240 IMAGE:3913592), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC037394 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 131, member C, mRNA (cDNA clone MGC:35515 IMAGE:5198517), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000017022 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:16058080:16073762:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 63 // 5 // 5 // 0
NM_004431 // RefSeq // Homo sapiens EPH receptor A2 (EPHA2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// XM_005245751 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens EPH receptor A2 (EPHA2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000358432 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:16124337:16156087:-1 gene:ENSG00000142627 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000461614 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:16148378:16156052:-1 gene:ENSG00000142627 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 20 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000480202 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:16134560:16146450:-1 gene:ENSG00000142627 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 20 // 8 // 8 // 0 /// AK296788 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51229 complete cds, highly similar to Ephrin type-A receptor 2 precursor (EC 2.7.10.1). // chr1 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0 /// BC037166 // GenBank // Homo sapiens EPH receptor A2, mRNA (cDNA clone MGC:29717 IMAGE:5090654), complete cds. // chr1 // 98 // 100 // 39 // 40 // 0 /// EU826606 // GenBank // Homo sapiens soluble EPHA2 variant 1 (EPHA2) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 92 // 33 // 12 // 13 // 0 /// M59371 // GenBank // Human protein tyrosine kinase mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 95 // 37 // 38 // 0 /// ENST00000611929 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:16124338:16156087:-1 gene:ENSG00000142627 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000017004 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:16125215:16188066:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0
NM_153213 // RefSeq // Homo sapiens Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 19 (ARHGEF19), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000270747 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:16198104:16212609:-1 gene:ENSG00000142632 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000478117 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:16197854:16207011:-1 gene:ENSG00000142632 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// AL137736 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp586P2321 (from clone DKFZp586P2321). // chr1 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// BC040640 // GenBank // Homo sapiens Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 19, mRNA (cDNA clone MGC:9689 IMAGE:3847806), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// AK297707 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60716 complete cds, highly similar to Homo sapiens Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 19 (ARHGEF19), mRNA. // chr1 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// GENSCAN00000017006 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:16198587:16236742:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0
NM_030907 // RefSeq // Homo sapiens REM2 and RAB-like small GTPase 1 (RSG1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000375599 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:16231700:16237162:-1 gene:ENSG00000132881 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC002946 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 89, mRNA (cDNA clone MGC:10731 IMAGE:3955163), complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC008702 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 89, mRNA (cDNA clone MGC:15466 IMAGE:2966866), complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000017006 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:16198587:16236742:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_018994 // RefSeq // Homo sapiens F-box protein 42 (FBXO42), mRNA. // chr1 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// ENST00000375592 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:16246839:16352454:-1 gene:ENSG00000037637 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB037753 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1332 protein, partial cds. // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC043410 // GenBank // Homo sapiens F-box protein 42, mRNA (cDNA clone MGC:50954 IMAGE:6155685), complete cds. // chr1 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// BC047296 // GenBank HTC // Homo sapiens F-box protein 42, mRNA (cDNA clone IMAGE:4428383), with apparent retained intron. // chr1 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// BC063864 // GenBank // Homo sapiens F-box protein 42, mRNA (cDNA clone MGC:75362 IMAGE:6182628), complete cds. // chr1 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// AK310671 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17713. // chr1 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// GENSCAN00000017008 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:16250670:16321212:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0
ENST00000445689 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:16369150:16369530:-1 gene:ENSG00000226457 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000017020 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:16369150:16369530:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NR_023386 // RefSeq // Homo sapiens ciliary rootlet coiled-coil, rootletin pseudogene 3 (CROCCP3), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000263511 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:16467436:16492701:-1 gene:ENSG00000080947 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000420820 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:16475916:16491307:-1 gene:ENSG00000080947 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr1 // 92 // 78 // 23 // 25 // 0 /// ENST00000590118 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:16490634:16499257:-1 gene:ENSG00000080947 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000591348 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:16468922:16491082:-1 gene:ENSG00000080947 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// AB067509 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1922 protein, partial cds. // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC033082 // GenBank // Homo sapiens ciliary rootlet coiled-coil, rootletin-like 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:2960715). // chr1 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000017012 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:16475912:16499025:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 78 // 23 // 25 // 0 /// NONHSAT001125 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0
XR_241218 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens uncharacterized LOC101927806 (LOC101927806), misc_RNA. // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000438002 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:16870945:16874079:1 gene:ENSG00000228549 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000415386 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:16533886:16535649:-1 gene:ENSG00000233421 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 1 /// ENST00000453554 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:16872284:16874044:1 gene:ENSG00000228549 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 1 /// BC036435 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4816083, partial cds. // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 1 /// ENST00000614408 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:16535342:16536172:-1 gene:ENSG00000233421 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000619677 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:16871761:16872591:1 gene:ENSG00000228549 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT001137 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT001209 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT001136 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 1 /// NONHSAT001211 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 1
NR_026567 // RefSeq // Homo sapiens espin pseudogene (ESPNP), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000270691 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:16691218:16720157:-1 gene:ENSG00000268869 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000492551 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:16691218:16720157:-1 gene:ENSG00000268869 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000017018 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:16685621:16750436:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001136204 // RefSeq // Homo sapiens regulator of chromosome condensation 2 (RCC2), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NM_018715 // RefSeq // Homo sapiens regulator of chromosome condensation 2 (RCC2), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000375433 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:17408676:17438561:-1 gene:ENSG00000179051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000375436 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:17406760:17439724:-1 gene:ENSG00000179051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// AK126021 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44033 fis, clone TESTI4028062. // chr1 // 100 // 34 // 10 // 10 // 0 /// BC042141 // GenBank // Homo sapiens regulator of chromosome condensation 2, mRNA (cDNA clone MGC:52285 IMAGE:5932549), complete cds. // chr1 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// BC053908 // GenBank // Homo sapiens regulator of chromosome condensation 2, mRNA (cDNA clone MGC:61610 IMAGE:6502476), complete cds. // chr1 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000003974 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:17409090:17438514:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0
NM_152232 // RefSeq // Homo sapiens taste receptor, type 1, member 2 (TAS1R2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000375371 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:1:18839599:18859682:-1 gene:ENSG00000179002 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000018820 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:18839599:18857600:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000494072 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:18849273:18921121:-1 gene:ENSG00000255275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_001136265 // RefSeq // Homo sapiens intermediate filament family orphan 2 (IFFO2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000455833 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:18904281:18956686:-1 gene:ENSG00000169991 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NR_040288 // RefSeq // Homo sapiens aldo-keto reductase family 7-like (AKR7L), transcript variant 1, non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NR_040289 // RefSeq // Homo sapiens aldo-keto reductase family 7-like (AKR7L), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr1 // 100 // 88 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000420396 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:19267130:19274151:-1 gene:ENSG00000211454 gene_biotype:polymorphic_pseudogene transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 86 // 82 // 12 // 14 // 0 /// ENST00000429712 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:19267103:19274194:-1 gene:ENSG00000211454 gene_biotype:polymorphic_pseudogene transcript_biotype:polymorphic_pseudogene // chr1 // 100 // 82 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000457194 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:19265982:19273941:-1 gene:ENSG00000211454 gene_biotype:polymorphic_pseudogene transcript_biotype:polymorphic_pseudogene // chr1 // 100 // 88 // 15 // 15 // 0 /// BC035351 // GenBank // Homo sapiens aldo-keto reductase family 7-like, mRNA (cDNA clone IMAGE:5190563), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 15 // 15 // 0
NM_012067 // RefSeq // Homo sapiens aldo-keto reductase family 7, member A3 (aflatoxin aldehyde reductase) (AKR7A3), mRNA. // chr1 // 100 // 79 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000361640 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:19282558:19289250:-1 gene:ENSG00000162482 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC025709 // GenBank // Homo sapiens aldo-keto reductase family 7, member A3 (aflatoxin aldehyde reductase), mRNA (cDNA clone MGC:34394 IMAGE:5224626), complete cds. // chr1 // 91 // 79 // 10 // 11 // 0 /// BC031562 // GenBank // Homo sapiens aldo-keto reductase family 7, member A3 (aflatoxin aldehyde reductase), mRNA (cDNA clone MGC:34393 IMAGE:5184829), complete cds. // chr1 // 100 // 79 // 11 // 11 // 0 /// BC042420 // GenBank // Homo sapiens aldo-keto reductase family 7, member A3 (aflatoxin aldehyde reductase), mRNA (cDNA clone MGC:34818 IMAGE:5186889), complete cds. // chr1 // 91 // 79 // 10 // 11 // 0 /// AF040639 // GenBank // Homo sapiens aflatoxin B1-aldehyde reductase mRNA, complete cds. // chr1 // 73 // 79 // 8 // 11 // 0 /// GENSCAN00000033777 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:19282731:19288709:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 11 // 11 // 0
NR_037847 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC100506730 (LOC100506730), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// AK094604 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ37285 fis, clone BRAMY2013621. // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT001292 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NONHSAT001309 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_019062 // RefSeq // Homo sapiens ring finger protein 186 (RNF186), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000375121 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:19814029:19815278:-1 gene:ENSG00000178828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC030960 // GenBank // Homo sapiens ring finger protein 186, mRNA (cDNA clone MGC:32566 IMAGE:4592873), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC051880 // GenBank // Homo sapiens ring finger protein 186, mRNA (cDNA clone MGC:60270 IMAGE:5224608), complete cds. // chr1 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000033782 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:19814418:19815101:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0
NM_014589 // RefSeq // Homo sapiens phospholipase A2, group IIE (PLA2G2E), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000375116 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:19920009:19923617:-1 gene:ENSG00000188784 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF189279 // GenBank // Homo sapiens group IIE secretory phospholipase A2 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000033794 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:19920307:19978773:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1
NM_001271814 // RefSeq // Homo sapiens phospholipase A2, group IID (PLA2G2D), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NM_012400 // RefSeq // Homo sapiens phospholipase A2, group IID (PLA2G2D), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000375105 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:20111939:20119557:-1 gene:ENSG00000117215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF112982 // GenBank // Homo sapiens group IID secretory phospholipase A2 (PLA2) mRNA, complete cds. // chr1 // 91 // 79 // 20 // 22 // 0 /// AF188625 // GenBank // Homo sapiens phospholipase A2 (SPLASH) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AK290406 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78104 complete cds, highly similar to Homo sapiens phospholipase A2, group IID (PLA2G2D), mRNA. // chr1 // 91 // 79 // 20 // 22 // 0 /// AK301396 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54861 complete cds, highly similar to Group IID secretory phospholipase A2 precursor (EC 3.1.1.4). // chr1 // 92 // 89 // 23 // 25 // 0 /// BC025706 // GenBank // Homo sapiens phospholipase A2, group IID, mRNA (cDNA clone MGC:34386 IMAGE:5223912), complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000617227 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:20112657:20119566:-1 gene:ENSG00000117215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000009687 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:20114114:20119498:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// AY358606 // GenBank // Homo sapiens clone DNA76538 PLA2G2D (UNQ768) mRNA, complete cds. // chr1 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_001105572 // RefSeq // Homo sapiens phospholipase A2, group IIC (PLA2G2C), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000247992 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:20163991:20175194:-1 gene:ENSG00000187980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000429261 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:20161253:20177424:-1 gene:ENSG00000187980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000495760 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:20163092:20175169:-1 gene:ENSG00000187980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 96 // 96 // 24 // 25 // 1 /// GENSCAN00000009701 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:20152097:20175194:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT001346 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 96 // 96 // 24 // 25 // 1
NM_018584 // RefSeq // Homo sapiens calcium/calmodulin-dependent protein kinase II inhibitor 1 (CAMK2N1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000375078 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:20482391:20486220:-1 gene:ENSG00000162545 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY204901 // GenBank // Homo sapiens calcium/calmodulin-dependent protein kinase II inhibitor alpha (CaMKIINalpha) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000489020 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:20483187:20484645:-1 gene:ENSG00000162545 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// GENSCAN00000009702 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:20483649:20495170:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// AF116637 // GenBank HTC // Homo sapiens PRO1489 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT001373 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NM_024544 // RefSeq // Homo sapiens mitochondrial E3 ubiquitin protein ligase 1 (MUL1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000264198 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:20499448:20508161:-1 gene:ENSG00000090432 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AB097015 // GenBank // Homo sapiens mRNA for putative NFkB activating protein, complete cds, clone: 266. // chr1 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// AK293430 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52155 complete cds, moderately similar to Rattus norvegicus ring finger protein 34 (Rnf34), mRNA. // chr1 // 95 // 63 // 18 // 19 // 0 /// AK303820 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55316 complete cds. // chr1 // 96 // 77 // 22 // 23 // 0 /// BC010101 // GenBank // Homo sapiens mitochondrial E3 ubiquitin ligase 1, mRNA (cDNA clone MGC:19697 IMAGE:3508192), complete cds. // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC014010 // GenBank // Homo sapiens mitochondrial E3 ubiquitin ligase 1, mRNA (cDNA clone MGC:19881 IMAGE:4026435), complete cds. // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// EU935008 // GenBank // Homo sapiens E3 ubiquitin ligase (GIDE) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000009685 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:20500690:20508024:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0
NR_046507 // RefSeq // Homo sapiens PINK1 antisense RNA (PINK1-AS), antisense RNA. // chr1 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000451424 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:20642657:20652193:-1 gene:ENSG00000117242 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// AK172749 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ23910 fis, clone ADSU02249. // chr1 // 91 // 100 // 21 // 23 // 0 /// AY358957 // GenBank // Homo sapiens clone DNA71277 PINK1 (UNQ740) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT001380 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr1 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0
NR_046507 // RefSeq // Homo sapiens PINK1 antisense RNA (PINK1-AS), antisense RNA. // chr1 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENST00000451424 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:20642657:20652193:-1 gene:ENSG00000117242 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// AK172749 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ23910 fis, clone ADSU02249. // chr1 // 95 // 96 // 42 // 44 // 0 /// AY358957 // GenBank // Homo sapiens clone DNA71277 PINK1 (UNQ740) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 41 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT001380 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr1 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// NONHSAT001381 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr1 // 96 // 50 // 22 // 23 // 0
NM_001291860 // RefSeq // Homo sapiens heparan sulfate proteoglycan 2 (HSPG2), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 117 // 117 // 0 /// NM_005529 // RefSeq // Homo sapiens heparan sulfate proteoglycan 2 (HSPG2), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 117 // 117 // 0 /// ENST00000374695 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:21822245:21937297:-1 gene:ENSG00000142798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 117 // 117 // 0 /// ENST00000412328 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:21887233:21896310:-1 gene:ENSG00000142798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 7 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000486901 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:21822245:21830713:-1 gene:ENSG00000142798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 18 // 21 // 21 // 0 /// AF479675 // GenBank // Homo sapiens perlecan variant miniperl mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr1 // 100 // 7 // 8 // 8 // 0 /// AK126516 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44552 fis, clone UTERU3007104, highly similar to Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein precursor. // chr1 // 90 // 18 // 19 // 21 // 0 /// M85289 // GenBank // Human heparan sulfate proteoglycan (HSPG2) mRNA, complete cds. // chr1 // 95 // 100 // 111 // 117 // 0 /// GENSCAN00000033127 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:21823316:21903939:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 102 // 102 // 0
NM_030761 // RefSeq // Homo sapiens wingless-type MMTV integration site family, member 4 (WNT4), mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000290167 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:22117305:22142966:-1 gene:ENSG00000162552 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AB061675 // GenBank // Homo sapiens mRNA for WNT4, complete cds. // chr1 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// AF316543 // GenBank // Homo sapiens signaling protein WNT-4 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// AK296058 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57881 complete cds. // chr1 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// AY009398 // GenBank // Homo sapiens WNT4 precursor (WNT4) mRNA, complete cds. // chr1 // 90 // 71 // 18 // 20 // 0 /// AY358947 // GenBank // Homo sapiens clone DNA48328 Wnt4 (UNQ426) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC057781 // GenBank // Homo sapiens wingless-type MMTV integration site family, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:71587 IMAGE:30330746), complete cds. // chr1 // 88 // 89 // 22 // 25 // 0 /// BT020125 // GenBank // Homo sapiens wingless-type MMTV integration site family, member 4 mRNA, complete cds. // chr1 // 95 // 71 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000046172 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:22120050:22142922:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
XM_005246048 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A-like (LOC101060363), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000487348 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:22322840:22323331:-1 gene:ENSG00000234397 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000046161 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:22322840:22335699:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_001142546 // RefSeq // Homo sapiens leucine zipper protein 1 (LUZP1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// NM_033631 // RefSeq // Homo sapiens leucine zipper protein 1 (LUZP1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000302291 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:23084030:23177808:-1 gene:ENSG00000169641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000314174 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:23090427:23168817:-1 gene:ENSG00000169641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 37 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000418342 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:23084023:23168858:-1 gene:ENSG00000169641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000471849 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:23093443:23168845:-1 gene:ENSG00000169641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 21 // 8 // 8 // 0 /// AK074153 // GenBank // Homo sapiens mRNA for FLJ00226 protein. // chr1 // 100 // 32 // 12 // 12 // 0 /// BC002428 // GenBank // Homo sapiens, Similar to KIAA1275 protein, clone IMAGE:3346688, mRNA. // chr1 // 100 // 21 // 8 // 8 // 0 /// BC033219 // GenBank // Homo sapiens leucine zipper protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5017908), complete cds. // chr1 // 100 // 47 // 18 // 18 // 0 /// BC051733 // GenBank // Homo sapiens leucine zipper protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:51018 IMAGE:4838475), complete cds. // chr1 // 100 // 37 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000019034 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:23088895:23094261:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 32 // 12 // 12 // 0
NM_000864 // RefSeq // Homo sapiens 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 1D, G protein-coupled (HTR1D), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000374619 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:23191895:23194729:-1 gene:ENSG00000179546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC007720 // GenBank // Homo sapiens 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 1D, mRNA (cDNA clone MGC:12645 IMAGE:4299633), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// M81589 // GenBank // Homo sapiens serotonin 1D receptor (5-HT1D`) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 52 // 12 // 12 // 0
NM_030634 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 436 (ZNF436), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000374608 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:23359975:23368386:-1 gene:ENSG00000125945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC056400 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 436, mRNA (cDNA clone MGC:50766 IMAGE:5244536), complete cds. // chr1 // 96 // 77 // 22 // 23 // 0 /// NM_001077195 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 436 (ZNF436), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// ENST00000314011 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:23359448:23369442:-1 gene:ENSG00000125945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// GENSCAN00000019046 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:23361969:23506659:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
NM_003196 // RefSeq // Homo sapiens transcription elongation factor A (SII), 3 (TCEA3), mRNA. // chr1 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// XM_005245980 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens transcription elongation factor A (SII), 3 (TCEA3), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 96 // 81 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000374601 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:1:23403481:23424707:-1 gene:ENSG00000204219 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 42 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000450454 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:23381061:23424740:-1 gene:ENSG00000204219 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// AK290272 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78474 complete cds, highly similar to Homo sapiens transcription elongation factor A (SII), 3 (TCEA3), mRNA. // chr1 // 96 // 84 // 25 // 26 // 0 /// AK300707 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53745 complete cds, highly similar to Transcription elongation factor A protein 3. // chr1 // 95 // 65 // 19 // 20 // 0 /// AK310039 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17081. // chr1 // 96 // 81 // 24 // 25 // 0 /// AY540752 // GenBank // Homo sapiens rhabdomyosarcoma antigen MU-RMS-40.22 (TCEA3) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 42 // 13 // 13 // 0 /// BC041613 // GenBank // Homo sapiens transcription elongation factor A (SII), 3, mRNA (cDNA clone MGC:52303 IMAGE:5797769), complete cds. // chr1 // 96 // 77 // 23 // 24 // 0 /// ENST00000461794 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:23404069:23419386:-1 gene:ENSG00000204219 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1 /// GENSCAN00000019046 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:23361969:23506659:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 68 // 68 // 21 // 31 // 1
BC024651 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4509288. // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT001523 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_004091 // RefSeq // Homo sapiens E2F transcription factor 2 (E2F2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000361729 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:23506430:23531220:-1 gene:ENSG00000007968 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC007609 // GenBank // Homo sapiens E2F transcription factor 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:3351479), complete cds. // chr1 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// BC053676 // GenBank // Homo sapiens E2F transcription factor 2, mRNA (cDNA clone MGC:61488 IMAGE:6170186), complete cds. // chr1 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// BT019523 // GenBank // Homo sapiens E2F transcription factor 2 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// L22846 // GenBank // Homo sapiens transcription factor E2F-2 mRNA, complete cds (clone 9). // chr1 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000019042 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:23509880:23530793:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0
NM_002167 // RefSeq // Homo sapiens inhibitor of DNA binding 3, dominant negative helix-loop-helix protein (ID3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000374561 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:23557918:23559794:-1 gene:ENSG00000117318 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000463312 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:23557934:23559075:-1 gene:ENSG00000117318 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// AK225965 // GenBank // Homo sapiens mRNA for inhibitor of DNA binding 3 variant, clone: FCC114B01. // chr1 // 84 // 86 // 21 // 25 // 0 /// BC003107 // GenBank // Homo sapiens inhibitor of DNA binding 3, dominant negative helix-loop-helix protein, mRNA (cDNA clone MGC:1988 IMAGE:3543936), complete cds. // chr1 // 84 // 86 // 21 // 25 // 0 /// AK290003 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76527 complete cds, highly similar to Homo sapiens inhibitor of DNA binding 3, dominant negative helix-loop-helix protein (ID3), mRNA. // chr1 // 74 // 66 // 14 // 19 // 0 /// X66924 // GenBank // H.sapiens heir-1 mRNA for helix-loop-helix protein. // chr1 // 70 // 79 // 16 // 23 // 0 /// ENST00000486541 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:23558445:23559443:-1 gene:ENSG00000117318 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1 /// GENSCAN00000019048 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:23558960:23559426:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 41 // 11 // 12 // 0 /// NONHSAT001530 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0
ENST00000366398 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:23705801:23706934:-1 gene:ENSG00000203589 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 53 // 10 // 10 // 0 /// AF010144 // GenBank // Homo sapiens neuronal thread protein AD7c-NTP mRNA, complete cds. // chr1 // 84 // 100 // 16 // 19 // 0 /// NONHSAT001540 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 53 // 10 // 10 // 0
NONHSAT001542 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_000147 // RefSeq // Homo sapiens fucosidase, alpha-L- 1, tissue (FUCA1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000374479 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:23845077:23868294:-1 gene:ENSG00000179163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK295535 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56770 complete cds, highly similar to Tissue alpha-L-fucosidase precursor (EC 3.2.1.51). // chr1 // 94 // 56 // 17 // 18 // 0 /// AK301302 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52780 complete cds, highly similar to Tissue alpha-L-fucosidase precursor (EC 3.2.1.51). // chr1 // 93 // 91 // 27 // 29 // 0 /// AK310143 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17185. // chr1 // 95 // 63 // 19 // 20 // 0 /// BC017338 // GenBank // Homo sapiens fucosidase, alpha-L- 1, tissue, mRNA (cDNA clone MGC:29579 IMAGE:4871788), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// M29877 // GenBank // Human alpha-L-fucosidase, complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000019035 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:23845715:23868286:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0
NM_001841 // RefSeq // Homo sapiens cannabinoid receptor 2 (macrophage) (CNR2), mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000374472 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:23870526:23913362:-1 gene:ENSG00000188822 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC069722 // GenBank // Homo sapiens cannabinoid receptor 2 (macrophage), mRNA (cDNA clone MGC:97279 IMAGE:7262528), complete cds. // chr1 // 94 // 59 // 15 // 16 // 0 /// BC074767 // GenBank // Homo sapiens cannabinoid receptor 2 (macrophage), mRNA (cDNA clone MGC:103805 IMAGE:30915186), complete cds. // chr1 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// EU517121 // GenBank // Homo sapiens testis-dominant CNR2 isoform CB2 (CNR2) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// X74328 // GenBank // H.sapiens mRNA for CB2 (peripheral) cannabinoid receptor. // chr1 // 87 // 85 // 20 // 23 // 0 /// GENSCAN00000019037 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:23874535:23875617:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 90 // 37 // 9 // 10 // 0
NM_152372 // RefSeq // Homo sapiens myomesin 3 (MYOM3), mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 45 // 45 // 0 /// ENST00000338909 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:24056035:24066579:-1 gene:ENSG00000142661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 32 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000374434 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:1:24056037:24112175:-1 gene:ENSG00000142661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 45 // 45 // 0 /// AK093280 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ35961 fis, clone TESTI2012528, weakly similar to M-PROTEIN, STRIATED MUSCLE. // chr1 // 100 // 32 // 16 // 16 // 0 /// BC067101 // GenBank // Homo sapiens myomesin family, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:71483 IMAGE:5928128), complete cds. // chr1 // 97 // 70 // 34 // 35 // 0 /// ENST00000475306 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:24081549:24108439:-1 gene:ENSG00000142661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 36 // 36 // 18 // 50 // 1 /// AK125972 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ43984 fis, clone TESTI4018886, weakly similar to M-protein, striated muscle. // chr1 // 34 // 34 // 17 // 50 // 1 /// GENSCAN00000030497 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:24057364:24108636:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 98 // 82 // 40 // 41 // 0
NM_021258 // RefSeq // Homo sapiens interleukin 22 receptor, alpha 1 (IL22RA1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000270800 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:1:24119771:24143121:-1 gene:ENSG00000142677 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF286095 // GenBank // Homo sapiens IL-22 receptor (IL22R) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// AK292204 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78147 complete cds, highly similar to Homo sapiens IL-22 receptor (IL22R) mRNA. // chr1 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// AK304454 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51773 complete cds, highly similar to Homo sapiens interleukin 22 receptor, alpha 1 (IL22RA1), mRNA. // chr1 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// AK308522 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ98563. // chr1 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// BC029273 // GenBank // Homo sapiens interleukin 22 receptor, alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:34232 IMAGE:4347189), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000030504 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:24120805:24203103:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// NONHSAT001584 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
ENST00000459380 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:24625411:24625513:-1 gene:ENSG00000239106 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT001655 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONHSAT001663 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000459588 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:24777873:24777979:-1 gene:ENSG00000238482 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT001668 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_004350 // RefSeq // Homo sapiens runt-related transcription factor 3 (RUNX3), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000308873 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:24899518:24929877:-1 gene:ENSG00000020633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000496967 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:24902572:24928798:-1 gene:ENSG00000020633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// AK300056 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52905 complete cds, highly similar to Runt-related transcription factor 3. // chr1 // 93 // 45 // 14 // 15 // 0 /// AK301044 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56502 complete cds, highly similar to Runt-related transcription factor 3. // chr1 // 100 // 52 // 17 // 17 // 0 /// BC013362 // GenBank // Homo sapiens runt-related transcription factor 3, mRNA (cDNA clone MGC:16070 IMAGE:3615873), complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// NM_001031680 // RefSeq // Homo sapiens runt-related transcription factor 3 (RUNX3), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 1 /// ENST00000338888 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:24901029:24964984:-1 gene:ENSG00000020633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 94 // 31 // 33 // 1 /// ENST00000399916 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:24899511:24965010:-1 gene:ENSG00000020633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 1 /// AK310945 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17987. // chr1 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1 /// GENSCAN00000030499 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:24902122:24932702:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0
NM_015484 // RefSeq // Homo sapiens SYF2 pre-mRNA-splicing factor (SYF2), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NM_207170 // RefSeq // Homo sapiens SYF2 pre-mRNA-splicing factor (SYF2), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000236273 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:25222679:25232493:-1 gene:ENSG00000117614 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000354361 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:25222965:25232486:-1 gene:ENSG00000117614 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// AF273089 // GenBank // Homo sapiens P29 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// BC010862 // GenBank // Homo sapiens SYF2 homolog, RNA splicing factor (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:9401 IMAGE:3877165), complete cds. // chr1 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// AK303582 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58970 complete cds, highly similar to Homo sapiens SYF2 homolog, RNA splicing factor (SYF2), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// GENSCAN00000023746 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:25223266:25246963:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1
NR_024498 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC646471 (LOC646471), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK054768 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ30206 fis, clone BRACE2001508, weakly similar to PROTEIN-LYSINE 6-OXIDASE PRECURSOR (EC 1.4.3.13). // chr1 // 88 // 100 // 21 // 24 // 0 /// ENST00000536896 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:25818491:25820797:-1 gene:ENSG00000228172 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense gene:ENSG00000223474 // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT001750 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001287490 // RefSeq // Homo sapiens aurora kinase A and ninein interacting protein (AUNIP), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// NM_024037 // RefSeq // Homo sapiens aurora kinase A and ninein interacting protein (AUNIP), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000374298 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:25834006:25859412:-1 gene:ENSG00000127423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000538789 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:25831913:25859458:-1 gene:ENSG00000127423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// BC000209 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 135, mRNA (cDNA clone MGC:2603 IMAGE:3350471), complete cds. // chr1 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// GQ844687 // GenBank // Homo sapiens aurora A-binding protein (C1orf135) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0
NM_178422 // RefSeq // Homo sapiens progestin and adipoQ receptor family member VII (PAQR7), mRNA. // chr1 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// XM_005245745 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens progestin and adipoQ receptor family member VII (PAQR7), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000374296 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:25861210:25871253:-1 gene:ENSG00000182749 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// AY424285 // GenBank // Homo sapiens progestin and adipoQ receptor family member VII (PAQR7) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 33 // 8 // 8 // 0 /// BC034015 // GenBank // Homo sapiens progestin and adipoQ receptor family member VII, mRNA (cDNA clone MGC:22013 IMAGE:4400504), complete cds. // chr1 // 90 // 83 // 18 // 20 // 0
NM_001145454 // RefSeq // Homo sapiens stathmin 1 (STMN1), transcript variant 4, mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000513116 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:25884181:25892607:-1 gene:ENSG00000117632 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK056768 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ32206 fis, clone PLACE6003109. // chr1 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// BC114443 // GenBank // Homo sapiens stathmin 1/oncoprotein 18, mRNA (cDNA clone MGC:138869 IMAGE:40083863), complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC114502 // GenBank // Homo sapiens stathmin 1/oncoprotein 18, mRNA (cDNA clone MGC:138870 IMAGE:40083868), complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_001004434 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 30 (zinc transporter), member 2 (SLC30A2), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// NM_032513 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 30 (zinc transporter), member 2 (SLC30A2), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// ENST00000374276 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:26038022:26046133:-1 gene:ENSG00000158014 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000374278 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:26037252:26046113:-1 gene:ENSG00000158014 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AK023491 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ13429 fis, clone PLACE1002500, weakly similar to Rattus norvegicus zinc transporter (ZnT-2) mRNA. // chr1 // 83 // 46 // 10 // 12 // 0 /// BC006251 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 30 (zinc transporter), member 2, mRNA (cDNA clone MGC:11303 IMAGE:3948165), complete cds. // chr1 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000041743 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:26039160:26111884:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1
NM_032588 // RefSeq // Homo sapiens tripartite motif containing 63, E3 ubiquitin protein ligase (TRIM63), mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000374272 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:26051304:26067633:-1 gene:ENSG00000158022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000483052 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:26061244:26068436:-1 gene:ENSG00000158022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// AF353673 // GenBank // Homo sapiens iris ring finger protein mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// AK297820 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50813 complete cds, highly similar to Ubiquitin ligase TRIM63 (EC 6.3.2.-). // chr1 // 91 // 67 // 20 // 22 // 0 /// BC080529 // GenBank // Homo sapiens tripartite motif-containing 63, mRNA (cDNA clone MGC:99548 IMAGE:4862321), complete cds. // chr1 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// BT007373 // GenBank // Homo sapiens ring finger protein 28 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// AF361946 // GenBank // Homo sapiens striated muscle RING zinc finger protein SMRZ mRNA, complete cds. // chr1 // 62 // 64 // 13 // 21 // 0 /// AJ291713 // GenBank // Homo sapiens mRNA for RNF28 gene for ring finger protein 28. // chr1 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000041743 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:26039160:26111884:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1
ENST00000497096 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:26593243:26593546:-1 gene:ENSG00000243905 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT001836 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENST00000459201 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:26642286:26642389:-1 gene:ENSG00000238316 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT001839 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_018066 // RefSeq // Homo sapiens GPN-loop GTPase 2 (GPN2), mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000374133 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:26879376:26886525:-1 gene:ENSG00000142751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000374135 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:26876133:26890297:-1 gene:ENSG00000142751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000431781 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:26884233:26890260:-1 gene:ENSG00000142751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 48 // 11 // 12 // 0 /// ENST00000477418 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:26879501:26886341:-1 gene:ENSG00000142751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// AY358864 // GenBank // Homo sapiens clone DNA145690 AGAA5828 (UNQ5828) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// BC007815 // GenBank // Homo sapiens GPN-loop GTPase 2, mRNA (cDNA clone MGC:14380 IMAGE:4299794), complete cds. // chr1 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// BC008634 // GenBank // Homo sapiens GPN-loop GTPase 2, mRNA (cDNA clone MGC:9656 IMAGE:3463813), complete cds. // chr1 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0 /// GENSCAN00000041741 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:26879426:26900442:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_022078 // RefSeq // Homo sapiens G patch domain containing 3 (GPATCH3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000361720 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:26890489:26900466:-1 gene:ENSG00000198746 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000450844 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:26891057:26892892:-1 gene:ENSG00000198746 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// AK303183 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53947 complete cds, highly similar to G patch domain-containing protein 3. // chr1 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// AL833886 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp547G125 (from clone DKFZp547G125); complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC007767 // GenBank // Homo sapiens G patch domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:13149 IMAGE:4298740), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000041741 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:26879426:26900442:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_021969 // RefSeq // Homo sapiens nuclear receptor subfamily 0, group B, member 2 (NR0B2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000254227 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:26911489:26913966:-1 gene:ENSG00000131910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// BC030207 // GenBank // Homo sapiens nuclear receptor subfamily 0, group B, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:34176 IMAGE:5222402), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// HQ692833 // GenBank // Homo sapiens nuclear receptor SHP (NR0B2) mRNA, complete cds. // chr1 // 94 // 65 // 16 // 17 // 0 /// AK310048 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17090. // chr1 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// GENSCAN00000041736 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:26911149:26913940:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 65 // 16 // 17 // 0
NM_152365 // RefSeq // Homo sapiens keratinocyte differentiation factor 1 (KDF1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_005245735 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 172 (C1orf172), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000320567 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:26949562:26960406:-1 gene:ENSG00000175707 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC033143 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 172, mRNA (cDNA clone MGC:45763 IMAGE:3960220), complete cds. // chr1 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000616918 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:26949565:26960385:-1 gene:ENSG00000175707 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000041735 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:26950069:26952380:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0
NM_052943 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 46, member B (FAM46B), mRNA. // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000289166 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:27005020:27012836:-1 gene:ENSG00000158246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// AK122816 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ16413 fis, clone BRACE2031553. // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC012790 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 46, member B, mRNA (cDNA clone MGC:16491 IMAGE:3957388), complete cds. // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC014160 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 46, member B, mRNA (cDNA clone MGC:20845 IMAGE:4542896), complete cds. // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000042481 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:27005944:27012667:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0
ENST00000516289 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:27255464:27255567:-1 gene:ENSG00000252098 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT001874 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_207397 // RefSeq // Homo sapiens CD164 sialomucin-like 2 (CD164L2), mRNA. // chr1 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// ENST00000374025 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:27381776:27383306:-1 gene:ENSG00000174950 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 94 // 56 // 17 // 18 // 0 /// ENST00000374027 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:27379176:27383303:-1 gene:ENSG00000174950 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// ENST00000374030 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:27379176:27383380:-1 gene:ENSG00000174950 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// AY358761 // GenBank // Homo sapiens clone DNA139623 EAPG6122 (UNQ6122) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC137466 // GenBank // Homo sapiens CD164 sialomucin-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:169089 IMAGE:9021466), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000042494 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:27380047:27383239:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1
NM_001201404 // RefSeq // Homo sapiens WAS protein family, member 2 (WASF2), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 11 // 11 // 0 /// NM_006990 // RefSeq // Homo sapiens WAS protein family, member 2 (WASF2), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// AB026542 // GenBank // Homo sapiens WAVE2 mRNA for WASP-family protein, complete cds. // chr1 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0 /// AK304750 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55445 complete cds, highly similar to Wiskott-Aldrich syndrome protein family member 2. // chr1 // 100 // 62 // 8 // 8 // 0 /// BC012329 // GenBank // Homo sapiens WAS protein family, member 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:4555042). // chr1 // 100 // 54 // 7 // 7 // 0 /// BC040943 // GenBank // Homo sapiens WAS protein family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:48747 IMAGE:4385298), complete cds. // chr1 // 100 // 85 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000618852 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:27404226:27490158:-1 gene:ENSG00000158195 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000042488 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:27408189:27428890:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0
NM_001029882 // RefSeq // Homo sapiens AT hook, DNA binding motif, containing 1 (AHDC1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// XM_005245853 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens AT hook, DNA binding motif, containing 1 (AHDC1), transcript variant X6, mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000247087 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:27534035:27603591:-1 gene:ENSG00000126705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000374011 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:27534303:27603632:-1 gene:ENSG00000126705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// BC064935 // GenBank // Homo sapiens AT hook, DNA binding motif, containing 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:6152308). // chr1 // 94 // 44 // 17 // 18 // 0 /// U79259 // GenBank // Human clone 23945 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 27 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000042490 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:27547304:27553199:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 28 // 28 // 0 /// BC042058 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5588836, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr1 // 100 // 46 // 19 // 19 // 0
NM_002038 // RefSeq // Homo sapiens interferon, alpha-inducible protein 6 (IFI6), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NM_022872 // RefSeq // Homo sapiens interferon, alpha-inducible protein 6 (IFI6), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NM_022873 // RefSeq // Homo sapiens interferon, alpha-inducible protein 6 (IFI6), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000339145 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:27666064:27672178:-1 gene:ENSG00000126709 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000361157 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:27666061:27672218:-1 gene:ENSG00000126709 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000362020 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:27666066:27672198:-1 gene:ENSG00000126709 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC011601 // GenBank // Homo sapiens interferon, alpha-inducible protein 6, mRNA (cDNA clone MGC:1748 IMAGE:3140035), complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC015603 // GenBank // Homo sapiens interferon, alpha-inducible protein 6, mRNA (cDNA clone MGC:23426 IMAGE:4654295), complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BT006850 // GenBank // Homo sapiens interferon, alpha-inducible protein (clone IFI-6-16) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000042482 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:27666381:27687440:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
AF118091 // GenBank HTC // Homo sapiens PRO2047 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENST00000476501 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:28031884:28032180:-1 gene:ENSG00000240750 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT001930 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
ENST00000517196 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:28142737:28142841:-1 gene:ENSG00000253005 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT001936 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_014280 // RefSeq // Homo sapiens DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 8 (DNAJC8), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000263697 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:28200278:28233025:-1 gene:ENSG00000126698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000489277 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:28200559:28233025:-1 gene:ENSG00000126698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// AF083190 // GenBank // Homo sapiens SPF31 (SPF31) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// AK300797 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61418 complete cds, highly similar to DnaJ homolog subfamily C member 8. // chr1 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0 /// BC033159 // GenBank // Homo sapiens DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 8, mRNA (cDNA clone MGC:45787 IMAGE:4330676), complete cds. // chr1 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0 /// BX538122 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686P08160 (from clone DKFZp686P08160). // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// CR456900 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834B047D for gene DNAJC8, DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 8; complete cds, incl. stopcodon. // chr1 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0
NR_002987 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 61 (SNORA61), small nucleolar RNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000384581 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:28579764:28579893:-1 gene:ENSG00000278274 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA gene:ENSG00000197989 // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000461448 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:28578538:28581842:-1 gene:ENSG00000197989 gene_biotype:antisense transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000470977 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:28578538:28581872:-1 gene:ENSG00000197989 gene_biotype:antisense transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000474814 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:28578539:28581871:-1 gene:ENSG00000197989 gene_biotype:antisense transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK092096 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ34777 fis, clone NT2NE2003485. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC064589 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 79, mRNA (cDNA clone IMAGE:5749955). // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT001968 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT001971 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT001972 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT001978 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NR_003035 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 16A (SNORA16A), small nucleolar RNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000384342 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:28580920:28581056:-1 gene:ENSG00000274582 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA gene:ENSG00000197989 // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000474814 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:28578539:28581871:-1 gene:ENSG00000197989 gene_biotype:antisense transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000481368 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:28578540:28581663:-1 gene:ENSG00000197989 gene_biotype:antisense transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK092096 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ34777 fis, clone NT2NE2003485. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC034611 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4828533. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000464612 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:28578538:28581010:-1 gene:ENSG00000197989 gene_biotype:antisense transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// NONHSAT001972 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT001973 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT001983 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT001969 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
ENST00000362886 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:28881726:28881835:-1 gene:ENSG00000199756 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT002001 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001003682 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 200B (TMEM200B), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NM_001171868 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 200B (TMEM200B), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000420504 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:29119434:29122501:-1 gene:ENSG00000253304 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000521452 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:29119428:29123935:-1 gene:ENSG00000253304 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC064375 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 200B, mRNA (cDNA clone MGC:70973 IMAGE:5722634), complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// BC082989 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 200B, mRNA (cDNA clone MGC:90489 IMAGE:5763085), complete cds. // chr1 // 88 // 100 // 29 // 33 // 0 /// BC110336 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 200B, mRNA (cDNA clone MGC:102864 IMAGE:5753003), complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000037928 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:29120905:29230906:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1
NM_002379 // RefSeq // Homo sapiens matrilin 1, cartilage matrix protein (MATN1), mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000373765 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:30711277:30723587:-1 gene:ENSG00000162510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000477320 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:30716026:30719251:-1 gene:ENSG00000162510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000041778 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:30700319:30723551:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_006762 // RefSeq // Homo sapiens lysosomal protein transmembrane 5 (LAPTM5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000294507 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:30732469:30757820:-1 gene:ENSG00000162511 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK292009 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75768 complete cds, highly similar to Homo sapiens lysosomal associated multispanning membrane protein 5 (LAPTM5), mRNA. // chr1 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// AK297014 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57504 complete cds, highly similar to Lysosomal-associated multitransmembrane protein. // chr1 // 89 // 69 // 16 // 18 // 0 /// BC106896 // GenBank // Homo sapiens lysosomal multispanning membrane protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:125860 IMAGE:40030918), complete cds. // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC106897 // GenBank // Homo sapiens lysosomal multispanning membrane protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:125861 IMAGE:40030919), complete cds. // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// U30498 // GenBank // Human retinoic acid-inducible E3 protein mRNA, complete cds. // chr1 // 91 // 85 // 20 // 22 // 0 /// U51240 // GenBank // Human lysosomal-associated multitransmembrane protein (LAPTm5) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENST00000464569 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:30733889:30746229:-1 gene:ENSG00000162511 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// GENSCAN00000041779 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:30733828:30850479:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// AK303314 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61683 complete cds, moderately similar to Lysosomal-associated multitransmembrane protein. // chr1 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_014654 // RefSeq // Homo sapiens syndecan 3 (SDC3), mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000336798 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:30869467:30878740:-1 gene:ENSG00000162512 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000339394 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:30873135:30908761:-1 gene:ENSG00000162512 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 48 // 19 // 20 // 0 /// ENST00000471567 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:30876767:30881429:-1 gene:ENSG00000162512 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 24 // 10 // 10 // 0 /// AB007937 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA0468 protein, partial cds. // chr1 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// AF248634 // GenBank // Homo sapiens syndecan 3 (SDC3) mRNA, complete cds. // chr1 // 89 // 43 // 16 // 18 // 0 /// AK295698 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60567 complete cds, highly similar to Syndecan-3. // chr1 // 100 // 45 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000041780 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:30873211:30908586:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 38 // 16 // 16 // 0
NR_004054 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 103A (SNORD103A), small nucleolar RNA. // chr1 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 /// NR_033295 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 103B (SNORD103B), small nucleolar RNA. // chr1 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 /// NONHSAT139857 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 /// NONHSAT139858 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0
AF090988 // GenBank // Homo sapiens U5 snRNP-specific 40 kDa protein mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0 /// AK298823 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56825 complete cds, highly similar to WD repeat protein 57. // chr1 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0 /// BC001494 // GenBank // Homo sapiens small nuclear ribonucleoprotein 40kDa (U5), mRNA (cDNA clone MGC:1910 IMAGE:3504573), complete cds. // chr1 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0 /// EF011621 // GenBank // Homo sapiens CDW11/WDR57 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0 /// NM_004814 // RefSeq // Homo sapiens small nuclear ribonucleoprotein 40kDa (U5) (SNRNP40), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 1 /// ENST00000263694 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:31259568:31296770:-1 gene:ENSG00000060688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 1
NM_004102 // RefSeq // Homo sapiens fatty acid binding protein 3, muscle and heart (mammary-derived growth inhibitor) (FABP3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000373713 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:31365625:31373076:-1 gene:ENSG00000121769 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000497275 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:31365713:31369590:-1 gene:ENSG00000121769 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000498148 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:31365721:31373073:-1 gene:ENSG00000121769 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// BC007021 // GenBank // Homo sapiens fatty acid binding protein 3, muscle and heart (mammary-derived growth inhibitor), mRNA (cDNA clone MGC:12366 IMAGE:3934295), complete cds. // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BT006727 // GenBank // Homo sapiens fatty acid binding protein 3, muscle and heart (mammary-derived growth inhibitor) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// CR456867 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834E0715D for gene FABP3, fatty acid binding protein 3, muscle and heart (mammary-derived growth inhibitor); complete cds, incl. stopcodon. // chr1 // 94 // 53 // 15 // 16 // 0 /// ENST00000482018 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:31365891:31376850:-1 gene:ENSG00000121769 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// GENSCAN00000011485 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:31365886:31373973:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1
AF116607 // GenBank HTC // Homo sapiens PRO0899 mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_001195100 // RefSeq // Homo sapiens protein tyrosine phosphatase type IVA, member 2 (PTP4A2), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 100 // 67 // 10 // 10 // 0 /// NM_001195101 // RefSeq // Homo sapiens protein tyrosine phosphatase type IVA, member 2 (PTP4A2), transcript variant 4, mRNA. // chr1 // 100 // 53 // 8 // 8 // 0 /// NM_080391 // RefSeq // Homo sapiens protein tyrosine phosphatase type IVA, member 2 (PTP4A2), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// XM_005271229 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens protein tyrosine phosphatase type IVA, member 2 (PTP4A2), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0 /// XM_006710927 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens protein tyrosine phosphatase type IVA, member 2 (PTP4A2), transcript variant X6, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000344035 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:31906421:31938387:-1 gene:ENSG00000184007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000602725 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:31906421:31919483:-1 gene:ENSG00000184007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 10 // 10 // 0 /// BC070182 // GenBank // Homo sapiens protein tyrosine phosphatase type IVA, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:88163 IMAGE:4686913), complete cds. // chr1 // 89 // 60 // 8 // 9 // 0
NM_023009 // RefSeq // Homo sapiens MARCKS-like 1 (MARCKSL1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NR_052852 // RefSeq // Homo sapiens MARCKS-like 1 (MARCKSL1), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr1 // 86 // 54 // 12 // 14 // 0 /// ENST00000329421 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:32333832:32336379:-1 gene:ENSG00000175130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC007904 // GenBank // Homo sapiens MARCKS-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:14113 IMAGE:4138092), complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC066915 // GenBank // Homo sapiens MARCKS-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:87111 IMAGE:5259353), complete cds. // chr1 // 92 // 92 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000015903 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:32334597:32362220:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001161708 // RefSeq // Homo sapiens syncoilin, intermediate filament protein (SYNC), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 95 // 83 // 19 // 20 // 0 /// NM_030786 // RefSeq // Homo sapiens syncoilin, intermediate filament protein (SYNC), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000409190 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:32680360:32703119:-1 gene:ENSG00000162520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC119700 // GenBank // Homo sapiens syncoilin, intermediate filament protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:40116868), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// BC119701 // GenBank // Homo sapiens syncoilin, intermediate filament protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:40116869), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// AK302275 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53567 complete cds, moderately similar to Mus musculus syncoilin (Sync), mRNA. // chr1 // 79 // 79 // 19 // 24 // 1 /// ENST00000373484 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:32681491:32702756:-1 gene:ENSG00000162520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 71 // 71 // 17 // 24 // 1 /// AK297958 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54475 complete cds, moderately similar to Mus musculus syncoilin (Sync), mRNA. // chr1 // 67 // 67 // 16 // 24 // 1 /// GENSCAN00000015893 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:32694826:32702660:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1
NM_001171941 // RefSeq // Homo sapiens fibronectin type III domain containing 5 (FNDC5), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NM_153756 // RefSeq // Homo sapiens fibronectin type III domain containing 5 (FNDC5), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000373471 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:32862268:32870813:-1 gene:ENSG00000160097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000496770 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:1:32864449:32872480:-1 gene:ENSG00000160097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// BC062297 // GenBank // Homo sapiens fibronectin type III domain containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:71121 IMAGE:6338770), complete cds. // chr1 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// NM_001171940 // RefSeq // Homo sapiens fibronectin type III domain containing 5 (FNDC5), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1 /// GENSCAN00000015898 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:32863810:32870890:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0
NM_001127361 // RefSeq // Homo sapiens ring finger protein 19B (RNF19B), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_153341 // RefSeq // Homo sapiens ring finger protein 19B (RNF19B), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006710356 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ring finger protein 19B (RNF19B), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// XM_006710358 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ring finger protein 19B (RNF19B), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000235150 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:32936668:32964685:-1 gene:ENSG00000116514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000356990 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:32936454:32964685:-1 gene:ENSG00000116514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000373456 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:32936445:32964685:-1 gene:ENSG00000116514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC062374 // GenBank // Homo sapiens ring finger protein 19B, mRNA (cDNA clone IMAGE:5458402), partial cds. // chr1 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// BC113560 // GenBank // Homo sapiens ring finger protein 19B, mRNA (cDNA clone MGC:142120 IMAGE:8322612), complete cds. // chr1 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// BC143687 // GenBank // Homo sapiens ring finger protein 19B, mRNA (cDNA clone MGC:177218 IMAGE:9052201), complete cds. // chr1 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015897 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:32894805:32964685:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0
ENST00000610352 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:33029232:33029576:-1 gene:ENSG00000276645 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_018207 // RefSeq // Homo sapiens tripartite motif containing 62 (TRIM62), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006710737 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens tripartite motif containing 62 (TRIM62), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 47 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000291416 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:33145402:33181666:-1 gene:ENSG00000116525 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000543586 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:33146702:33176550:-1 gene:ENSG00000116525 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 38 // 13 // 13 // 0 /// AK300177 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51302 complete cds, highly similar to Mus musculus tripartite motif-containing 62 (Trim62), mRNA. // chr1 // 100 // 38 // 13 // 13 // 0 /// BC001222 // GenBank // Homo sapiens tripartite motif-containing 62, mRNA (cDNA clone MGC:938 IMAGE:3355572), complete cds. // chr1 // 96 // 71 // 23 // 24 // 0 /// BC007999 // GenBank // Homo sapiens tripartite motif-containing 62, mRNA (cDNA clone MGC:15757 IMAGE:3357436), complete cds. // chr1 // 96 // 71 // 23 // 24 // 0 /// BC011689 // GenBank // Homo sapiens tripartite motif-containing 62, mRNA (cDNA clone MGC:19672 IMAGE:3353034), complete cds. // chr1 // 96 // 71 // 23 // 24 // 0 /// BC012152 // GenBank // Homo sapiens tripartite motif-containing 62, mRNA (cDNA clone MGC:20370 IMAGE:4558639), complete cds. // chr1 // 96 // 71 // 23 // 24 // 0 /// ENST00000485148 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:33159692:33182053:-1 gene:ENSG00000116525 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// GENSCAN00000039566 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:33147177:33182182:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 56 // 56 // 19 // 34 // 1
NM_001080438 // RefSeq // Homo sapiens alpha 1,3-galactosyltransferase 2 (A3GALT2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000442999 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:1:33306766:33321098:-1 gene:ENSG00000184389 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000039571 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:33306766:33319384:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENST00000410180 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:33336566:33336864:-1 gene:ENSG00000222112 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 83 // 100 // 20 // 24 // 0 /// NONHSAT002276 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr1 // 83 // 100 // 20 // 24 // 0
DQ309022 // GenBank // Homo sapiens clone 3B12-s049 cystic fibrosis transmembrane regulator/ATP-binding cassette subfamily C member 7-like mRNA, 5 UTR, complete cds and 3 UTR. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000446026 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:34855050:34859069:-1 gene:ENSG00000163866 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000456842 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:34855169:34859755:-1 gene:ENSG00000163866 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 90 // 38 // 9 // 10 // 0 /// BC034598 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 212, mRNA (cDNA clone IMAGE:4828218), complete cds. // chr1 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// NM_001164824 // RefSeq // Homo sapiens small integral membrane protein 12 (SMIM12), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// NM_001164825 // RefSeq // Homo sapiens small integral membrane protein 12 (SMIM12), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// NM_138428 // RefSeq // Homo sapiens small integral membrane protein 12 (SMIM12), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// ENST00000521580 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:34852669:34859816:-1 gene:ENSG00000163866 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// BC011880 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 212, mRNA (cDNA clone MGC:20548 IMAGE:3607345), complete cds. // chr1 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// BC073851 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 212, mRNA (cDNA clone MGC:90223 IMAGE:5499672), complete cds. // chr1 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// BC107421 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 212, mRNA (cDNA clone MGC:104258 IMAGE:4688408), complete cds. // chr1 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001080418 // RefSeq // Homo sapiens discs, large (Drosophila) homolog-associated protein 3 (DLGAP3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000235180 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:34865436:34905383:-1 gene:ENSG00000116544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000373347 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:34865436:34929585:-1 gene:ENSG00000116544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK294907 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59589 complete cds, highly similar to Disks large-associated protein 3. // chr1 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000012097 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:34866083:34985305:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
NM_005066 // RefSeq // Homo sapiens splicing factor proline/glutamine-rich (SFPQ), mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000357214 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:35182932:35193148:-1 gene:ENSG00000116560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000470472 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:35176378:35190574:-1 gene:ENSG00000116560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 42 // 14 // 14 // 0 /// BC000546 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3162440, containing frame-shift errors. // chr1 // 88 // 52 // 15 // 17 // 0 /// BC027717 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3831469, containing frame-shift errors. // chr1 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// BC051192 // GenBank // Homo sapiens splicing factor proline/glutamine-rich (polypyrimidine tract binding protein associated), mRNA (cDNA clone MGC:57191 IMAGE:5262885), complete cds. // chr1 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000013550 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:35186947:35193049:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0
ENST00000475222 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:35292196:35292498:-1 gene:ENSG00000240374 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT002353 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 87 // 100 // 20 // 23 // 0
NM_152374 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 216 (C1orf216), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000270815 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:35713875:35719472:-1 gene:ENSG00000142686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK294352 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53732 complete cds. // chr1 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// BC026909 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 216, mRNA (cDNA clone MGC:24981 IMAGE:4932944), complete cds. // chr1 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000013552 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:35715632:35769685:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_001190481 // RefSeq // Homo sapiens claspin (CLSPN), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NM_022111 // RefSeq // Homo sapiens claspin (CLSPN), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AY605064 // GenBank // Homo sapiens arsenic transactivated protein 1 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001294347 // RefSeq // Homo sapiens collagen, type VIII, alpha 2 (COL8A2), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NM_005202 // RefSeq // Homo sapiens collagen, type VIII, alpha 2 (COL8A2), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000303143 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:36095236:36100249:-1 gene:ENSG00000171812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000397799 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:36095236:36125220:-1 gene:ENSG00000171812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000481785 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:36097507:36100249:-1 gene:ENSG00000171812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// BC096295 // GenBank // Homo sapiens collagen, type VIII, alpha 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:40007332), complete cds. // chr1 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// BC096296 // GenBank // Homo sapiens collagen, type VIII, alpha 2, mRNA (cDNA clone MGC:116972 IMAGE:40007335), complete cds. // chr1 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// GENSCAN00000040015 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:36097569:36149378:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000615990 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:36097507:36100249:-1 gene:ENSG00000171812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_018166 // RefSeq // Homo sapiens eva-1 homolog B (C. elegans) (EVA1B), mRNA. // chr1 // 81 // 88 // 17 // 21 // 0 /// ENST00000270824 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:36322031:36324154:-1 gene:ENSG00000142694 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000490466 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:36322281:36323615:-1 gene:ENSG00000142694 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 95 // 79 // 18 // 19 // 0 /// BC006241 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 176, member B, mRNA (cDNA clone MGC:11318 IMAGE:3951625), complete cds. // chr1 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// BC071697 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 176, member B, mRNA (cDNA clone MGC:87957 IMAGE:4371667), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000039999 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:36322295:36323037:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0
NM_032881 // RefSeq // Homo sapiens LSM10, U7 small nuclear RNA associated (LSM10), mRNA. // chr1 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// ENST00000315732 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:36393430:36397892:-1 gene:ENSG00000181817 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AF394685 // GenBank // Homo sapiens U7 snRNA-associated Sm-like protein LSM10 mRNA, complete cds. // chr1 // 94 // 86 // 17 // 18 // 0 /// BC007623 // GenBank // Homo sapiens LSM10, U7 small nuclear RNA associated, mRNA (cDNA clone MGC:15749 IMAGE:3357043), complete cds. // chr1 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// ENST00000476041 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:36391238:36397887:-1 gene:ENSG00000181817 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 52 // 52 // 11 // 21 // 1
ENST00000410889 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:36402721:36402859:-1 gene:ENSG00000222821 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT002413 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000364578 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:36418450:36418578:-1 gene:ENSG00000201448 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT002415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_031280 // RefSeq // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein S15 (MRPS15), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000373116 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:36455718:36464437:-1 gene:ENSG00000116898 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB049946 // GenBank // Homo sapiens MRPS15 mRNA for mitochondrial ribosomal protein S15, complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AB209905 // GenBank // Homo sapiens mRNA for mitochondrial ribosomal protein S15 variant protein. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AF265439 // GenBank // Homo sapiens DC37 mRNA, complete cds. // chr1 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// BC031336 // GenBank // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein S15, mRNA (cDNA clone MGC:45738 IMAGE:3543896), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AK302633 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56752 complete cds, highly similar to 28S ribosomal protein S15, mitochondrial precursor (S15mt). // chr1 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// ENST00000462067 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:36455774:36464345:-1 gene:ENSG00000116898 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// ENST00000488606 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:36455772:36459703:-1 gene:ENSG00000116898 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// GENSCAN00000040003 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:36455788:36464275:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
NM_000831 // RefSeq // Homo sapiens glutamate receptor, ionotropic, kainate 3 (GRIK3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000373091 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:36795527:37034125:-1 gene:ENSG00000163873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000373093 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:36804618:37034129:-1 gene:ENSG00000163873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// AJ249210 // GenBank // Homo sapiens mRNA for glutamate/kainate receptor subtype GluR7 (GRIK3 gene). // chr1 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// U16127 // GenBank // Human glutamate/kainate receptor subunit (EAA5) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000040001 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:36801851:36912188:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0
ENST00000516559 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:37264677:37264786:-1 gene:ENSG00000252368 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT002433 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AF172817 // GenBank HTC // Homo sapiens MSTP088 (MST088) mRNA, complete cds. // chr1 // 89 // 100 // 16 // 18 // 0
NM_024700 // RefSeq // Homo sapiens Smad nuclear interacting protein 1 (SNIP1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000296215 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:37534449:37554302:-1 gene:ENSG00000163877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000468040 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:37540500:37554248:-1 gene:ENSG00000163877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 34 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000493916 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:37552487:37554290:-1 gene:ENSG00000163877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 49 // 17 // 17 // 0 /// AK293229 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51792 complete cds, highly similar to Smad nuclear-interacting protein 1. // chr1 // 96 // 77 // 26 // 27 // 0 /// AY081909 // GenBank // Homo sapiens Smad nuclear-interacting protein 1 (SNIP1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// BC027040 // GenBank // Homo sapiens Smad nuclear interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:30036 IMAGE:4540112), complete cds. // chr1 // 94 // 100 // 33 // 35 // 0 /// AK297176 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57163 complete cds, moderately similar to Smad nuclear-interacting protein 1. // chr1 // 51 // 51 // 18 // 35 // 1 /// AK300796 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57162 complete cds, highly similar to Smad nuclear-interacting protein 1. // chr1 // 69 // 69 // 24 // 35 // 1 /// GENSCAN00000046523 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:37537748:37554229:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT002446 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 34 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT002448 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 49 // 17 // 17 // 0
NM_013285 // RefSeq // Homo sapiens guanine nucleotide binding protein-like 2 (nucleolar) (GNL2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000373062 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:37566816:37595921:-1 gene:ENSG00000134697 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000538069 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:37575595:37582923:-1 gene:ENSG00000134697 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 24 // 9 // 9 // 0 /// AK298358 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54985 complete cds, highly similar to Nucleolar GTP-binding protein 2. // chr1 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// BC000107 // GenBank // Homo sapiens guanine nucleotide binding protein-like 2 (nucleolar), mRNA (cDNA clone MGC:1085 IMAGE:3506131), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC009250 // GenBank // Homo sapiens guanine nucleotide binding protein-like 2 (nucleolar), mRNA (cDNA clone MGC:4453 IMAGE:2960125), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// L05425 // GenBank // Homo sapiens nucleolar GTPase mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000462812 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:37566817:37570893:-1 gene:ENSG00000134697 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 26 // 26 // 10 // 38 // 1 /// AK130697 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ27187 fis, clone SYN02458. // chr1 // 26 // 26 // 10 // 38 // 1 /// AK307352 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ97300. // chr1 // 32 // 32 // 12 // 38 // 1 /// GENSCAN00000046515 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:37566855:37595822:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0
ENST00000363551 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:37737955:37738054:-1 gene:ENSG00000200421 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT002463 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_173641 // RefSeq // Homo sapiens EPH receptor A10 (EPHA10), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000319637 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:37760272:37765133:-1 gene:ENSG00000183317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// BC067734 // GenBank // Homo sapiens EPH receptor A10, mRNA (cDNA clone MGC:86967 IMAGE:4375803), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001099439 // RefSeq // Homo sapiens EPH receptor A10 (EPHA10), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// ENST00000373048 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:37715974:37765066:-1 gene:ENSG00000183317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// ENST00000427468 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:37715854:37765066:-1 gene:ENSG00000183317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// GENSCAN00000046513 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:37718372:37764581:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_024640 // RefSeq // Homo sapiens yrdC N(6)-threonylcarbamoyltransferase domain containing (YRDC), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000373044 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:37802944:37808185:-1 gene:ENSG00000196449 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// AY172561 // GenBank // Homo sapiens YRDC protein mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// AY286019 // GenBank // Homo sapiens ischemia/reperfusion inducible protein transcript variant 1 mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr1 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// AY286020 // GenBank // Homo sapiens ischemia/reperfusion inducible protein transcript variant 2 mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr1 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// BC008984 // GenBank // Homo sapiens yrdC domain containing (E. coli), mRNA (cDNA clone IMAGE:4338853), partial cds. // chr1 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// BC080186 // GenBank // Homo sapiens yrdC domain containing (E. coli), mRNA (cDNA clone MGC:87915 IMAGE:6147134), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// AK129676 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ26165 fis, clone ADG02840. // chr1 // 42 // 42 // 8 // 19 // 1 /// GENSCAN00000046511 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:37803925:37808180:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 74 // 14 // 14 // 0
NM_005955 // RefSeq // Homo sapiens metal-regulatory transcription factor 1 (MTF1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000373036 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:37809567:37859620:-1 gene:ENSG00000188786 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AK309584 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99625. // chr1 // 93 // 86 // 28 // 30 // 0 /// BC014454 // GenBank // Homo sapiens metal-regulatory transcription factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:23036 IMAGE:4901099), complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000046514 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:37815136:37857658:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 21 // 21 // 0
NM_002699 // RefSeq // Homo sapiens POU class 3 homeobox 1 (POU3F1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000373012 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:38043827:38046794:-1 gene:ENSG00000185668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// L26494 // GenBank // Homo sapiens (oct-6) mRNA, complete cds. // chr1 // 88 // 96 // 21 // 24 // 0 /// GENSCAN00000030309 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:38045388:38046743:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// Z18284 // GenBank // Homo sapiens Oct-6 transcription factor. // chr1 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0
NM_030772 // RefSeq // Homo sapiens gap junction protein, alpha 9, 59kDa (GJA9), mRNA. // chr1 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// NR_037633 // RefSeq // Homo sapiens GJA9-MYCBP readthrough (GJA9-MYCBP), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000357771 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:38874551:38881587:-1 gene:ENSG00000131233 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 66 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000360786 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:38874451:38876351:-1 gene:ENSG00000131233 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000489803 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:38864501:38881597:-1 gene:ENSG00000274944 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron gene:ENSG00000214114 // chr1 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// AF271261 // GenBank // Homo sapiens connexin 58 (CX58) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// NR_037634 // RefSeq // Homo sapiens GJA9-MYCBP readthrough (GJA9-MYCBP), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr1 // 66 // 66 // 23 // 35 // 1 /// ENST00000454994 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:38864503:38881617:-1 gene:ENSG00000274944 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay gene:ENSG00000131233 // chr1 // 66 // 66 // 23 // 35 // 1 /// GENSCAN00000030311 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:38839553:38876098:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 43 // 43 // 15 // 35 // 1
ENST00000384735 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:38950825:38950925:-1 gene:ENSG00000207466 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT002536 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000383927 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:39120940:39121043:-1 gene:ENSG00000206654 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT002544 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000410446 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:39154164:39154296:-1 gene:ENSG00000222378 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT002545 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000331856 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:39522280:39525685:-1 gene:ENSG00000182109 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// AK093659 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ36340 fis, clone THYMU2006468. // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT002563 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT002558 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 53 // 53 // 9 // 17 // 1
NR_002983 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 55 (SNORA55), small nucleolar RNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000364587 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:39567374:39567508:-1 gene:ENSG00000201457 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT002589 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_014571 // RefSeq // Homo sapiens hes-related family bHLH transcription factor with YRPW motif-like (HEYL), mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000372852 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:39624153:39639945:-1 gene:ENSG00000163909 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AF311885 // GenBank // Homo sapiens hairy-related transcription factor 3 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0 /// AK300463 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52278 complete cds, highly similar to Homo sapiens hairy/enhancer-of-split related with YRPW motif-like (HEYL), mRNA. // chr1 // 83 // 53 // 15 // 18 // 0 /// BC006087 // GenBank // Homo sapiens hairy/enhancer-of-split related with YRPW motif-like, mRNA (cDNA clone MGC:12623 IMAGE:2964729), complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000008259 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:39626507:39639625:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0
NM_032526 // RefSeq // Homo sapiens 5-nucleotidase, cytosolic IA (NT5C1A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000235628 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:39659121:39672038:-1 gene:ENSG00000116981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF331801 // GenBank // Homo sapiens cytosolic nucleotidase I mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY028778 // GenBank // Homo sapiens 5-nucleotidase I mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC103879 // GenBank // Homo sapiens 5-nucleotidase, cytosolic IA, mRNA (cDNA clone MGC:119199 IMAGE:40004489), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC103880 // GenBank // Homo sapiens 5-nucleotidase, cytosolic IA, mRNA (cDNA clone MGC:119201 IMAGE:40004491), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000008255 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:39659121:39698849:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001282396 // RefSeq // Homo sapiens hippocalcin like 4 (HPCAL4), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NM_001282397 // RefSeq // Homo sapiens hippocalcin like 4 (HPCAL4), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NM_016257 // RefSeq // Homo sapiens hippocalcin like 4 (HPCAL4), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000372844 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:39678648:39691689:-1 gene:ENSG00000116983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB001105 // GenBank // Homo sapiens mRNA for hippocalcin-like protein 4, complete cds. // chr1 // 88 // 57 // 14 // 16 // 0 /// AK294412 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61110 complete cds, highly similar to Hippocalcin-like protein 4. // chr1 // 92 // 46 // 12 // 13 // 0 /// AK294813 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50758 complete cds, moderately similar to Hippocalcin-like protein 4. // chr1 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// BC030827 // GenBank // Homo sapiens hippocalcin like 4, mRNA (cDNA clone MGC:26229 IMAGE:4811834), complete cds. // chr1 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000612703 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:39678648:39691485:-1 gene:ENSG00000116983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000617690 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:39678648:39691485:-1 gene:ENSG00000116983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000008255 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:39659121:39698849:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001720 // RefSeq // Homo sapiens bone morphogenetic protein 8b (BMP8B), mRNA. // chr1 // 100 // 70 // 7 // 7 // 0 /// ENST00000372827 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:39757182:39788861:-1 gene:ENSG00000116985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 9 // 9 // 0 /// AY303955 // GenBank // Homo sapiens bone morphogenetic protein 8B (BMP8B) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 70 // 7 // 7 // 0 /// M97016 // GenBank // Homo sapiens osteogenic protein-2 (OP-2) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0
NM_022120 // RefSeq // Homo sapiens 3-oxoacid CoA transferase 2 (OXCT2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000327582 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:39769523:39771348:-1 gene:ENSG00000198754 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// AB050193 // GenBank // Homo sapiens h-scot-t mRNA for succinyl CoA: 3-oxo acid CoA transferase, complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// BC072388 // GenBank // Homo sapiens 3-oxoacid CoA transferase 2, mRNA (cDNA clone MGC:87924 IMAGE:5588771), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000447263 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:39514956:39516490:1 gene:ENSG00000237624 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr1 // 74 // 74 // 29 // 39 // 1 /// AK024440 // GenBank // Homo sapiens mRNA for FLJ00030 protein, partial cds. // chr1 // 33 // 33 // 13 // 39 // 1 /// GENSCAN00000008248 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:39760419:39771255:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 74 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000008253 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:39514956:39525798:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 26 // 26 // 0
ENST00000365352 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:39881566:39881678:-1 gene:ENSG00000202222 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT002610 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001033081 // RefSeq // Homo sapiens v-myc avian myelocytomatosis viral oncogene lung carcinoma derived homolog (MYCL), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0 /// NM_001033082 // RefSeq // Homo sapiens v-myc avian myelocytomatosis viral oncogene lung carcinoma derived homolog (MYCL), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000372816 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:39897227:39901882:-1 gene:ENSG00000116990 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 89 // 39 // 8 // 9 // 0 /// ENST00000397332 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:1:39895426:39902013:-1 gene:ENSG00000116990 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0 /// AK296078 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60597 complete cds, highly similar to L-myc-1 proto-oncogene protein. // chr1 // 100 // 39 // 9 // 9 // 0 /// NM_005376 // RefSeq // Homo sapiens v-myc avian myelocytomatosis viral oncogene lung carcinoma derived homolog (MYCL), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 70 // 70 // 16 // 23 // 1 /// ENST00000372815 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:39899612:39901919:-1 gene:ENSG00000116990 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 57 // 57 // 13 // 23 // 1 /// BC011864 // GenBank // Homo sapiens v-myc myelocytomatosis viral oncogene homolog 1, lung carcinoma derived (avian), mRNA (cDNA clone MGC:20172 IMAGE:4541675), complete cds. // chr1 // 43 // 43 // 10 // 23 // 1
ENST00000384626 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:39944890:39944998:-1 gene:ENSG00000207356 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT002614 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000600955 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:40333078:40333557:-1 gene:ENSG00000227311 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000011563 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:40333076:40333474:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0
NM_014747 // RefSeq // Homo sapiens regulating synaptic membrane exocytosis 3 (RIMS3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000372683 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:40626214:40665445:-1 gene:ENSG00000117016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000372684 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:40620679:40665657:-1 gene:ENSG00000117016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY326956 // GenBank // Homo sapiens RIM3 gamma mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// BC003103 // GenBank // Homo sapiens regulating synaptic membrane exocytosis 3, mRNA (cDNA clone MGC:1884 IMAGE:3503630), complete cds. // chr1 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// D87074 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA0237 gene, partial cds. // chr1 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// KJ535026 // GenBank HTC // Homo sapiens clone RIMS3_iso-A_fetal-F13 regulating synaptic membrane exocytosis 3 isoform A (RIMS3) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000011568 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:40594309:40641925:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0
NR_024567 // RefSeq // Homo sapiens NFYC antisense RNA 1 (NFYC-AS1), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000606277 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:40690380:40692066:-1 gene:ENSG00000272145 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT002658 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_133467 // RefSeq // Homo sapiens Cbp/p300-interacting transactivator, with Glu/Asp-rich carboxy-terminal domain, 4 (CITED4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000372638 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:40861051:40862366:-1 gene:ENSG00000179862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC035496 // GenBank // Homo sapiens Cbp/p300-interacting transactivator, with Glu/Asp-rich carboxy-terminal domain, 4, mRNA (cDNA clone MGC:19748 IMAGE:3622207), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC052559 // GenBank // Homo sapiens Cbp/p300-interacting transactivator, with Glu/Asp-rich carboxy-terminal domain, 4, mRNA (cDNA clone MGC:59904 IMAGE:6250908), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011565 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:40848808:40926072:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001127714 // RefSeq // Homo sapiens human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 3 (HIVEP3), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// NM_024503 // RefSeq // Homo sapiens human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 3 (HIVEP3), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENST00000247584 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:41506368:41701001:-1 gene:ENSG00000127124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000372583 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:41506365:41918498:-1 gene:ENSG00000127124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 98 // 45 // 45 // 0 /// ENST00000372584 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:41506365:41918707:-1 gene:ENSG00000127124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000460604 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:41510230:41579900:-1 gene:ENSG00000127124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 41 // 19 // 19 // 0 /// AF278765 // GenBank // Homo sapiens kappa B and V(D)J recombination signal sequences binding protein (KRC) mRNA, complete cds. // chr1 // 93 // 93 // 40 // 43 // 0 /// BC152563 // GenBank // Homo sapiens human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:167844 IMAGE:8860523), complete cds. // chr1 // 95 // 93 // 41 // 43 // 0 /// GENSCAN00000006737 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:41561879:41628812:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 33 // 14 // 15 // 0 /// GENSCAN00000006747 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:41510451:41526530:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 35 // 16 // 16 // 0
NM_033553 // RefSeq // Homo sapiens guanylate cyclase activator 2A (guanylin) (GUCA2A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000357001 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:42162691:42164718:-1 gene:ENSG00000197273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// M95174 // GenBank // Human guanylin mRNA, complete cds. // chr1 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// M97496 // GenBank // Homo sapiens guanylin mRNA, complete cds. // chr1 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000022106 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:42162614:42164712:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0
NM_001146192 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, MYND-type containing 12 (ZMYND12), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NM_032257 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, MYND-type containing 12 (ZMYND12), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000372565 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:42430329:42456267:-1 gene:ENSG00000066185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000433602 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:42430335:42456267:-1 gene:ENSG00000066185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AK301839 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58334 complete cds, highly similar to Zinc finger MYND domain-containing protein 12. // chr1 // 81 // 90 // 22 // 27 // 0 /// BC024186 // GenBank // Homo sapiens zinc finger, MYND-type containing 12, mRNA (cDNA clone MGC:26592 IMAGE:4826255), complete cds. // chr1 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// ENST00000461083 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:42436421:42456011:-1 gene:ENSG00000066185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// ENST00000611861 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:42430415:42456253:-1 gene:ENSG00000066185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000022105 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:42433107:42449980:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 43 // 13 // 13 // 0
NM_001123395 // RefSeq // Homo sapiens claudin 19 (CLDN19), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NM_001185117 // RefSeq // Homo sapiens claudin 19 (CLDN19), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NM_148960 // RefSeq // Homo sapiens claudin 19 (CLDN19), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000296387 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:42733093:42740254:-1 gene:ENSG00000164007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000372539 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:42734995:42740140:-1 gene:ENSG00000164007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000539749 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:42733093:42740254:-1 gene:ENSG00000164007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// AF497644 // GenBank // Homo sapiens claudin-19 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0 /// AK291197 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75363 complete cds, highly similar to Homo sapiens claudin 19, mRNA. // chr1 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// AK298992 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56757 complete cds, moderately similar to Claudin-19. // chr1 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// BC030524 // GenBank // Homo sapiens claudin 19, mRNA (cDNA clone MGC:40523 IMAGE:5207628), complete cds. // chr1 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000022094 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:42735868:42740063:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0
ENST00000481465 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:42749901:42754936:-1 gene:ENSG00000117385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_199342 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 23 (CCDC23), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000372521 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:42807056:42817252:-1 gene:ENSG00000177868 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000372522 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:42807052:42816804:-1 gene:ENSG00000177868 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// AK291356 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76410 complete cds, highly similar to Homo sapiens coiled-coil domain containing 23 (CCDC23), mRNA. // chr1 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// BC029427 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 23, mRNA (cDNA clone MGC:32681 IMAGE:4809776), complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000497437 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:42813410:42817252:-1 gene:ENSG00000177868 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// NONHSAT002756 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr1 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// GENSCAN00000022100 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:42807414:42816544:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001164829 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 210 (C1orf210), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// NM_182517 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 210 (C1orf210), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_005270523 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 210 (C1orf210), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 94 // 70 // 15 // 16 // 0 /// ENST00000423420 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:43282661:43285617:-1 gene:ENSG00000253313 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 70 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000523677 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:43281883:43285579:-1 gene:ENSG00000253313 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC041633 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 210, mRNA (cDNA clone MGC:52423 IMAGE:4868093), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000038342 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:43275920:43287297:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 57 // 57 // 13 // 23 // 1
NM_001001653 // RefSeq // Homo sapiens mediator complex subunit 8 (MED8), transcript variant 4, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NM_201542 // RefSeq // Homo sapiens mediator complex subunit 8 (MED8), transcript variant 5, mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000372455 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:43384726:43389784:-1 gene:ENSG00000159479 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// AF521562 // GenBank // Homo sapiens mediator of RNA polymerase II transcription subunit MED8 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// BC010019 // GenBank // Homo sapiens mediator complex subunit 8, mRNA (cDNA clone MGC:19641 IMAGE:2905623), complete cds. // chr1 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000372457 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:43383969:43389808:-1 gene:ENSG00000159479 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 89 // 89 // 24 // 27 // 1 /// NM_052877 // RefSeq // Homo sapiens mediator complex subunit 8 (MED8), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// ENST00000290663 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:43383917:43389808:-1 gene:ENSG00000159479 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// ENST00000473560 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:43385978:43387647:-1 gene:ENSG00000159479 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// GENSCAN00000038344 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:43363916:43396964:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
ENST00000472003 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:44117098:44117397:-1 gene:ENSG00000239560 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT002861 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
ENST00000402743 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:44122153:44122512:-1 gene:ENSG00000233514 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 92 // 11 // 11 // 0 /// NONHSAT002863 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 92 // 11 // 11 // 0
ENST00000363301 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:44153385:44153480:-1 gene:ENSG00000200171 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT002865 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NR_002753 // RefSeq // Homo sapiens RNA, U5F small nuclear 1 (RNU5F-1), small nuclear RNA. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000362507 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:44721786:44721902:-1 gene:ENSG00000199377 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// M77840 // GenBank // Human U5F snRNA sequence. // chr1 // 52 // 100 // 13 // 25 // 0 /// NONHSAT002884 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 52 // 100 // 13 // 25 // 0
NR_002755 // RefSeq // Homo sapiens RNA, U5D small nuclear 1 (RNU5D-1), small nuclear RNA. // chr1 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// ENST00000363299 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:44731055:44731170:-1 gene:ENSG00000200169 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000594193 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:44780331:44780715:-1 gene:ENSG00000234093 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 50 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000017120 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:44780326:44780715:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 8 // 8 // 0
NM_153274 // RefSeq // Homo sapiens bestrophin 4 (BEST4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_005270748 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens bestrophin 4 (BEST4), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000372207 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:44783585:44787705:-1 gene:ENSG00000142959 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF440757 // GenBank // Homo sapiens vitelliform macular dystrophy 2-like protein 2 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AY515707 // GenBank // Homo sapiens bestrophin 4 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC101823 // GenBank // Homo sapiens bestrophin 4, mRNA (cDNA clone MGC:126872 IMAGE:8069329), complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000017111 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:44784210:44787705:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0
NM_001013632 // RefSeq // Homo sapiens Tctex1 domain containing 4 (TCTEX1D4), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000339355 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:44805913:44806675:-1 gene:ENSG00000188396 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC092499 // GenBank // Homo sapiens Tctex1 domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:104730 IMAGE:30531412), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// DQ132441 // GenBank // Homo sapiens Tctex2 beta mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006710614 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens Tctex1 domain containing 4 (TCTEX1D4), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// GENSCAN00000017113 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:44806003:44806668:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
NM_001166292 // RefSeq // Homo sapiens patched 2 (PTCH2), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000365574 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:44819883:44819997:-1 gene:ENSG00000202444 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// ENST00000438067 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:44819844:44823260:-1 gene:ENSG00000117425 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000447098 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:44819844:44842944:-1 gene:ENSG00000117425 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT002909 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0
NM_001166292 // RefSeq // Homo sapiens patched 2 (PTCH2), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// NM_003738 // RefSeq // Homo sapiens patched 2 (PTCH2), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000372192 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:44821933:44843063:-1 gene:ENSG00000117425 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000447098 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:44819844:44842944:-1 gene:ENSG00000117425 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// AF087651 // GenBank // Homo sapiens patched 2 (PTCH2) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AF091501 // GenBank // Homo sapiens receptor protein patched 2 (PTCH2) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AF119569 // GenBank // Homo sapiens patched 2 (PTCH2) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// AY358555 // GenBank // Homo sapiens clone DNA35621 Patched 2 (UNQ560) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AY359016 // GenBank // Homo sapiens clone DNA67654 Patched 2 (UNQ560) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000017124 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:44822415:44842932:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0
ENST00000411837 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:44988234:44988725:-1 gene:ENSG00000232369 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000017123 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:44988234:44988725:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_020883 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, SWIM-type containing 5 (ZSWIM5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000359600 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:45016399:45206556:-1 gene:ENSG00000162415 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000004165 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:45018454:45096386:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000004171 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:45116295:45263760:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
NM_007170 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific kinase 2 (TESK2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000372084 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:45343883:45457799:-1 gene:ENSG00000070759 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000372086 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:45343883:45491166:-1 gene:ENSG00000070759 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000486676 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:45343884:45491161:-1 gene:ENSG00000070759 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// AB057597 // GenBank // Homo sapiens mRNA for testicular protein kinase 2, complete cds. // chr1 // 94 // 100 // 32 // 34 // 0 /// AK294172 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58133 complete cds, highly similar to Dual specificity testis-specific protein kinase 2 (EC 2.7.12.1). // chr1 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// AK302494 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58888 complete cds, highly similar to Dual specificity testis-specific protein kinase 2 (EC 2.7.12.1). // chr1 // 100 // 47 // 16 // 16 // 0 /// BC033085 // GenBank // Homo sapiens testis-specific kinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:45651 IMAGE:5425494), complete cds. // chr1 // 96 // 71 // 23 // 24 // 0 /// AK299269 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60830 complete cds, highly similar to Dual specificity testis-specific protein kinase 2 (EC 2.7.12.1). // chr1 // 47 // 47 // 16 // 34 // 1 /// GENSCAN00000004170 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:45344840:45457785:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0
NONHSAT002938 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001145349 // RefSeq // Homo sapiens intracisternal A particle-promoted polypeptide (IPP), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NM_005897 // RefSeq // Homo sapiens intracisternal A particle-promoted polypeptide (IPP), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006710622 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens intracisternal A particle-promoted polypeptide (IPP), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000359942 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:45694324:45750650:-1 gene:ENSG00000197429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000396478 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:45698711:45750649:-1 gene:ENSG00000197429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// AF156857 // GenBank // Homo sapiens actin-binding protein (IPP) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC032544 // GenBank // Homo sapiens intracisternal A particle-promoted polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:45221 IMAGE:5535760), complete cds. // chr1 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000495072 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:45697059:45714252:-1 gene:ENSG00000197429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000004163 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:45699966:45746411:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONHSAT002969 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001097611 // RefSeq // Homo sapiens kinocilin (KNCN), mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000294445 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:46545644:46550012:-1 gene:ENSG00000162456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000396314 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:46547428:46551215:-1 gene:ENSG00000162456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 67 // 15 // 16 // 0 /// ENST00000524908 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:46547349:46549733:-1 gene:ENSG00000162456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 94 // 75 // 17 // 18 // 0 /// AK056573 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ32011 fis, clone NT2RP7009507. // chr1 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// ENST00000481882 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:46547380:46551527:-1 gene:ENSG00000162456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 83 // 83 // 20 // 24 // 1 /// NONHSAT003020 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT003021 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 94 // 75 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000006526 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:46532994:46615320:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1
NM_145279 // RefSeq // Homo sapiens MOB kinase activator 3C (MOB3C), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// NM_201403 // RefSeq // Homo sapiens MOB kinase activator 3C (MOB3C), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000271139 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:46607719:46615133:-1 gene:ENSG00000142961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000319928 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:46607715:46616891:-1 gene:ENSG00000142961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000371940 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:46607725:46616465:-1 gene:ENSG00000142961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000477318 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:46610002:46616884:-1 gene:ENSG00000142961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// AK090453 // GenBank // Homo sapiens mRNA for FLJ00374 protein. // chr1 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC121169 // GenBank // Homo sapiens MOB1, Mps One Binder kinase activator-like 2C (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:150540 IMAGE:40122151), complete cds. // chr1 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000006526 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:46532994:46615320:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
NM_014774 // RefSeq // Homo sapiens EF-hand calcium binding domain 14 (EFCAB14), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000371933 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:46675159:46719064:-1 gene:ENSG00000159658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000479745 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:46678263:46689691:-1 gene:ENSG00000159658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 32 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000481623 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:46678407:46686929:-1 gene:ENSG00000159658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000487741 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:46678290:46689636:-1 gene:ENSG00000159658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 27 // 10 // 10 // 0 /// AK295722 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57374 complete cds. // chr1 // 100 // 49 // 18 // 18 // 0 /// BC002525 // GenBank // Homo sapiens KIAA0494, mRNA (cDNA clone MGC:1949 IMAGE:3139273), complete cds. // chr1 // 100 // 68 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000484461 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:46684172:46696596:-1 gene:ENSG00000159658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 30 // 30 // 11 // 37 // 1 /// GENSCAN00000006532 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:46678461:46757921:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 25 // 25 // 0 /// AK296777 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60653 complete cds. // chr1 // 96 // 73 // 26 // 27 // 0
NR_002788 // RefSeq // Homo sapiens cytochrome P450, family 4, subfamily Z, polypeptide 2, pseudogene (CYP4Z2P), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000423332 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:46843178:46900434:-1 gene:ENSG00000154198 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr1 // 100 // 78 // 7 // 7 // 0 /// ENST00000505841 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:46843095:46900437:-1 gene:ENSG00000154198 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// AK097373 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ40054 fis, clone TBAES2000315, weakly similar to CYTOCHROME P450 4A1 (EC 1.14.15.3). // chr1 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0 /// AY696295 // GenBank // Homo sapiens cytochrome P450 (CYP4Z2P) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0 /// GENSCAN00000006523 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:46867991:46900407:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0 /// TCONS_l2_00002489-XLOC_l2_000894 // Broad TUCP // linc-KIAA0494 chr1:-:47308766-47366109 // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// TCONS_l2_00002490-XLOC_l2_000894 // Broad TUCP // linc-KIAA0494 chr1:-:47323905-47366147 // chr1 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0 /// TCONS_l2_00002491-XLOC_l2_000894 // Broad TUCP // linc-KIAA0494 chr1:-:47333618-47366147 // chr1 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0
XR_246241 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens cytochrome P450, family 4, subfamily A, polypeptide 11 (CYP4A11), transcript variant X4, misc_RNA. // chr1 // 100 // 55 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000371904 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:46929180:46941456:-1 gene:ENSG00000187048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0 /// ENST00000371905 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:46932431:46941464:-1 gene:ENSG00000187048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 55 // 6 // 6 // 0 /// AK298267 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60759 complete cds, highly similar to Cytochrome P450 4A11 precursor (EC 1.14.15.3). // chr1 // 100 // 55 // 6 // 6 // 0 /// BC041158 // GenBank // Homo sapiens cytochrome P450, family 4, subfamily A, polypeptide 11, mRNA (cDNA clone MGC:48730 IMAGE:5183289), complete cds. // chr1 // 100 // 55 // 6 // 6 // 0 /// D13705 // GenBank // Homo sapiens mRNA for fatty acids omega-hydroxylase (cytochrome P-450HKV), complete cds. // chr1 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0 /// D26481 // GenBank // Homo sapiens mRNA for fatty acids omega-hydroxylase, complete cds. // chr1 // 89 // 82 // 8 // 9 // 0 /// L04751 // GenBank // Human cytochrome p-450 4A (CYP4A) mRNA, complete cds. // chr1 // 89 // 82 // 8 // 9 // 0 /// NM_000778 // RefSeq // Homo sapiens cytochrome P450, family 4, subfamily A, polypeptide 11 (CYP4A11), mRNA. // chr1 // 82 // 82 // 9 // 11 // 1 /// ENST00000310638 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:46929177:46941465:-1 gene:ENSG00000187048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 82 // 82 // 9 // 11 // 1
NM_005764 // RefSeq // Homo sapiens PDZK1 interacting protein 1 (PDZK1IP1), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000294338 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:47183593:47190055:-1 gene:ENSG00000162366 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000371885 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:47183971:47191044:-1 gene:ENSG00000162366 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000489919 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:47183593:47190007:-1 gene:ENSG00000162366 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC012303 // GenBank // Homo sapiens PDZK1 interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:21224 IMAGE:4469903), complete cds. // chr1 // 79 // 92 // 19 // 24 // 0 /// CR450304 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834D101D for gene MAP17, membrane-associated protein 17; complete cds; without stopcodon. // chr1 // 94 // 62 // 15 // 16 // 0 /// ENST00000491793 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:47183600:47185344:-1 gene:ENSG00000162366 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// GENSCAN00000009735 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:47183971:47189932:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NONHSAT003060 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// U21049 // GenBank // Homo sapiens DD96 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT003061 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001194986 // RefSeq // Homo sapiens TraB domain containing 2B (TRABD2B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000606738 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:47760528:47996895:-1 gene:ENSG00000269113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
AF251047 // GenBank // Homo sapiens connexin mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENST00000334103 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:48534173:48663244:-1 gene:ENSG00000186094 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000371838 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:48634208:50023913:-1 gene:ENSG00000186094 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000416121 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:48583870:49045714:-1 gene:ENSG00000186094 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// AK027348 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ14442 fis, clone HEMBB1001126. // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// AK294394 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53507 complete cds, weakly similar to Homo sapiens ATP/GTP binding protein-like 2 (AGBL2), mRNA. // chr1 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// AK294633 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60499 complete cds. // chr1 // 95 // 69 // 19 // 20 // 0 /// AK296221 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56815 complete cds, weakly similar to Mus musculus ATP/GTP binding protein-like 3 (Agbl3), mRNA. // chr1 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// BC126383 // GenBank // Homo sapiens ATP/GTP binding protein-like 4, mRNA (cDNA clone MGC:161661 IMAGE:8992099), complete cds. // chr1 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// NM_032785 // RefSeq // Homo sapiens ATP/GTP binding protein-like 4 (AGBL4), mRNA. // chr1 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1 /// ENST00000371839 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:48532855:50023913:-1 gene:ENSG00000186094 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1 /// GENSCAN00000016738 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:48600864:48679951:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NM_032110 // RefSeq // Homo sapiens DMRT-like family A2 (DMRTA2), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000404795 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:50417550:50423500:-1 gene:ENSG00000142700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000418121 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:50417550:50421632:-1 gene:ENSG00000142700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC136282 // GenBank // Homo sapiens DMRT-like family A2, mRNA (cDNA clone MGC:167892 IMAGE:9020269), complete cds. // chr1 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// BC143800 // GenBank // Homo sapiens DMRT-like family A2, mRNA (cDNA clone MGC:177331 IMAGE:9052314), complete cds. // chr1 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000029430 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:50418665:50788404:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1
NONHSAT003169 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
AF242772 // GenBank // Homo sapiens mesenchymal stem cell protein DSCD28 mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 96 // 22 // 23 // 0
NONHSAT003188 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000480705 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:51250603:51251472:-1 gene:ENSG00000233406 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 95 // 100 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000031546 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:51250598:51251425:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 95 // 18 // 19 // 0
ENST00000516223 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:51538625:51538729:-1 gene:ENSG00000252032 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT003203 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_002867 // RefSeq // Homo sapiens RAB3B, member RAS oncogene family (RAB3B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000371655 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:51907956:51990764:-1 gene:ENSG00000169213 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF498932 // GenBank // Homo sapiens small GTP binding protein RAB3B (RAB3B) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// AK291653 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77324 complete cds, highly similar to Homo sapiens RAB3B, member RAS oncogene family (RAB3B), mRNA. // chr1 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// BC005035 // GenBank // Homo sapiens RAB3B, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:12720 IMAGE:4040566), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// M28214 // GenBank // Homo sapiens GTP-binding protein (RAB3B) mRNA, complete cds. // chr1 // 95 // 75 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000031547 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:51919927:51990611:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NM_138417 // RefSeq // Homo sapiens KTI12 homolog, chromatin associated (S. cerevisiae) (KTI12), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// NR_046405 // RefSeq // Homo sapiens thioredoxin domain containing 12 (endoplasmic reticulum) (TXNDC12), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NR_046406 // RefSeq // Homo sapiens thioredoxin domain containing 12 (endoplasmic reticulum) (TXNDC12), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000371614 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:52032103:52033816:-1 gene:ENSG00000198841 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC012173 // GenBank // Homo sapiens KTI12 homolog, chromatin associated (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:20419 IMAGE:4643409), complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000006502 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:52020933:52055096:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 61 // 61 // 14 // 23 // 1
NM_032449 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil and C2 domain containing 1B (CC2D1B), mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000284376 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:52352532:52366179:-1 gene:ENSG00000154222 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000371586 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:52350593:52366193:-1 gene:ENSG00000154222 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000438021 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:1:52352538:52360196:-1 gene:ENSG00000154222 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 57 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000450942 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:52353519:52360548:-1 gene:ENSG00000154222 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000460261 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:52353089:52361100:-1 gene:ENSG00000154222 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000491136 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:52352532:52366156:-1 gene:ENSG00000154222 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// BC016880 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil and C2 domain containing 1B, mRNA (cDNA clone MGC:17913 IMAGE:3913149), complete cds. // chr1 // 100 // 57 // 20 // 20 // 0 /// BC039308 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil and C2 domain containing 1B, mRNA (cDNA clone IMAGE:5268327), complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000006513 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:52349113:52368960:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0
NM_001190818 // RefSeq // Homo sapiens origin recognition complex, subunit 1 (ORC1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001190819 // RefSeq // Homo sapiens origin recognition complex, subunit 1 (ORC1), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_004153 // RefSeq // Homo sapiens origin recognition complex, subunit 1 (ORC1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000371566 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:52372831:52404387:-1 gene:ENSG00000085840 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000371568 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:52372829:52404459:-1 gene:ENSG00000085840 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK291909 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76308 complete cds, highly similar to Homo sapiens origin recognition complex, subunit 1-like (yeast) (ORC1L), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK303420 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61742 complete cds, highly similar to Origin recognition complex subunit 1. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC011539 // GenBank // Homo sapiens origin recognition complex, subunit 1-like (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:9175 IMAGE:3870637), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// U40152 // GenBank // Human origin recognition complex 1 (HsORC1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U43416 // GenBank // Human replication control protein 1 (PARC1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006508 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:52373181:52402259:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_023077 // RefSeq // Homo sapiens cytochrome c oxidase assembly factor 7 (putative) (COA7), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000371538 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:52684451:52698366:-1 gene:ENSG00000162377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000486918 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:52687562:52698068:-1 gene:ENSG00000162377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 91 // 41 // 10 // 11 // 0 /// BC015313 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 163, mRNA (cDNA clone MGC:21050 IMAGE:4430419), complete cds. // chr1 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// AK023237 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ13175 fis, clone NT2RP3003842. // chr1 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// GENSCAN00000006505 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:52687720:52698326:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0
ENST00000437890 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:52772194:52772648:-1 gene:ENSG00000228929 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0
ENST00000383900 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:52805108:52805212:-1 gene:ENSG00000206627 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT003258 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000294360 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:53214099:53220617:-1 gene:ENSG00000162384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000470385 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:53214375:53220592:-1 gene:ENSG00000162384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000483739 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:53214137:53219920:-1 gene:ENSG00000162384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// AK092734 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ35415 fis, clone SMINT2000629. // chr1 // 96 // 78 // 24 // 25 // 0 /// BC010908 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 123, mRNA (cDNA clone MGC:13430 IMAGE:4093763), complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000478839 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:53214474:53218360:-1 gene:ENSG00000162384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1 /// ENST00000489755 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:53216786:53219027:-1 gene:ENSG00000162384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// AK094371 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ37052 fis, clone BRACE2013806. // chr1 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1 /// GENSCAN00000039230 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:53214659:53238448:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// NONHSAT003296 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1 /// NONHSAT003297 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_002370 // RefSeq // Homo sapiens mago-nashi homolog, proliferation-associated (Drosophila) (MAGOH), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000371466 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:53226926:53238499:-1 gene:ENSG00000162385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000371470 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:53226892:53238610:-1 gene:ENSG00000162385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF035940 // GenBank // Homo sapiens MAGOH mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// AF086246 // GenBank // Homo sapiens full length insert cDNA clone ZD38E05. // chr1 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// AK297895 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55283 complete cds, moderately similar to Protein mago nashi homolog. // chr1 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// BC018211 // GenBank // Homo sapiens mago-nashi homolog, proliferation-associated (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:17367 IMAGE:3861094), complete cds. // chr1 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000462941 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:53233122:53238508:-1 gene:ENSG00000162385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// ENST00000495868 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:53226931:53233939:-1 gene:ENSG00000162385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// GENSCAN00000039230 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:53214659:53238448:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_147193 // RefSeq // Homo sapiens GLIS family zinc finger 1 (GLIS1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_005270505 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens GLIS family zinc finger 1 (GLIS1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000312233 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:53506237:53734204:-1 gene:ENSG00000174332 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC101799 // GenBank // Homo sapiens GLIS family zinc finger 1, mRNA (cDNA clone MGC:126848 IMAGE:8069305), complete cds. // chr1 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// BC104911 // GenBank // Homo sapiens GLIS family zinc finger 1, mRNA (cDNA clone MGC:132571 IMAGE:8143914), complete cds. // chr1 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000039225 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:53506619:53739323:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_001168551 // RefSeq // Homo sapiens NDC1 transmembrane nucleoporin (NDC1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NM_018087 // RefSeq // Homo sapiens NDC1 transmembrane nucleoporin (NDC1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_033142 // RefSeq // Homo sapiens NDC1 transmembrane nucleoporin (NDC1), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006710762 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens NDC1 transmembrane nucleoporin (NDC1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000371429 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:53765460:53838860:-1 gene:ENSG00000058804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK295000 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53988 complete cds, highly similar to Nucleoporin NDC1. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AK298909 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53159 complete cds, highly similar to Nucleoporin NDC1. // chr1 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// AK302910 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53254 complete cds, highly similar to Nucleoporin NDC1. // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC003082 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 48, mRNA (cDNA clone MGC:970 IMAGE:3509727), complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// DQ141696 // GenBank // Homo sapiens NDC1 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
ENST00000364133 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:53771018:53771153:-1 gene:ENSG00000201003 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT003336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_201546 // RefSeq // Homo sapiens CUB domain containing protein 2 (CDCP2), mRNA. // chr1 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000371330 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:54138995:54153770:-1 gene:ENSG00000157211 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000311841 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:54143392:54200073:-1 gene:ENSG00000256407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// AK122760 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ16295 fis, clone OCBBF2033869. // chr1 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// GENSCAN00000018671 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:54132968:54152922:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_176782 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 151, member A (FAM151A), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006710599 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens family with sequence similarity 151, member A (FAM151A), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000302250 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:54609182:54623556:-1 gene:ENSG00000162391 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000371304 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:54609182:54623556:-1 gene:ENSG00000162391 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// AY358629 // GenBank // Homo sapiens clone DNA119514 VCRE3034 (UNQ3034) mRNA, complete cds. // chr1 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// BC015993 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 151, member A, mRNA (cDNA clone MGC:27169 IMAGE:4614435), complete cds. // chr1 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// BC020874 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 151, member A, mRNA (cDNA clone MGC:24088 IMAGE:4608844), complete cds. // chr1 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000018637 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:54609268:54623395:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_152268 // RefSeq // Homo sapiens prolyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (putative) (PARS2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000371279 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:54756898:54764514:-1 gene:ENSG00000162396 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK289679 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75964 complete cds, highly similar to Homo sapiens prolyl-tRNA synthetase (mitochondrial)(putative) (PARS2), mRNA. // chr1 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// BC007956 // GenBank // Homo sapiens prolyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (putative), mRNA (cDNA clone MGC:14416 IMAGE:4301987), complete cds. // chr1 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// BC011758 // GenBank // Homo sapiens prolyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (putative), mRNA (cDNA clone MGC:19467 IMAGE:3530065), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000018648 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:54757734:54759161:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
NM_017904 // RefSeq // Homo sapiens tetratricopeptide repeat domain 22 (TTC22), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENST00000371274 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:54784551:54801198:-1 gene:ENSG00000006555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001114108 // RefSeq // Homo sapiens tetratricopeptide repeat domain 22 (TTC22), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// ENST00000371276 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:54779712:54801267:-1 gene:ENSG00000006555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// ENST00000448308 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:54784554:54787792:-1 gene:ENSG00000006555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// ENST00000474654 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:54786643:54787905:-1 gene:ENSG00000006555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// ENST00000488771 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:54781596:54787995:-1 gene:ENSG00000006555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// AL049431 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp586J211 (from clone DKFZp586J211). // chr1 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// GENSCAN00000018638 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:54781243:54801163:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_015306 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 24 (USP24), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 65 // 65 // 0 /// ENST00000294383 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:1:55066359:55215113:-1 gene:ENSG00000162402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 63 // 63 // 0 /// BC029660 // GenBank // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 24, mRNA (cDNA clone IMAGE:4995223), complete cds. // chr1 // 95 // 32 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000035751 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:55069045:55215113:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 50 // 50 // 0
ENST00000362961 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:55376526:55376852:-1 gene:ENSG00000199831 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT003413 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000606692 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:55484871:55484972:-1 gene:ENSG00000272051 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_001004303 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 168 (C1orf168), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000343433 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:56718804:56819371:-1 gene:ENSG00000187889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000484327 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:56726544:56819696:-1 gene:ENSG00000187889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000493000 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:56718871:56762013:-1 gene:ENSG00000187889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// AK093468 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ36149 fis, clone TESTI2025174, weakly similar to FYN-BINDING PROTEIN. // chr1 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// AK125198 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ43208 fis, clone FEBRA2014213. // chr1 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000026210 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:56719627:56794395:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
ENST00000488067 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:58056133:58056480:-1 gene:ENSG00000223416 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000010548 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:58048309:58062595:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
ENST00000485760 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:56997899:58546734:-1 gene:ENSG00000173406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF263547 // GenBank // Homo sapiens disabled-1 (DAB1) mRNA, complete cds. // chr1 // 60 // 100 // 15 // 25 // 0
ENST00000485760 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:56997899:58546734:-1 gene:ENSG00000173406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF263547 // GenBank // Homo sapiens disabled-1 (DAB1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000582127 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:58565631:58565932:-1 gene:ENSG00000264128 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT003507 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_002353 // RefSeq // Homo sapiens tumor-associated calcium signal transducer 2 (TACSTD2), mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000371225 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:58575423:58577773:-1 gene:ENSG00000184292 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// BC009409 // GenBank // Homo sapiens tumor-associated calcium signal transducer 2, mRNA (cDNA clone MGC:10655 IMAGE:3611756), complete cds. // chr1 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// BT007255 // GenBank // Homo sapiens tumor-associated calcium signal transducer 2 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0 /// CR542260 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834A1126D for gene TACSTD2, tumor-associated calcium signal transducer 2; complete cds, incl. stopcodon. // chr1 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0 /// X77753 // GenBank // H.sapiens TROP-2 gene. // chr1 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// X77754 // GenBank // H.sapiens TROP-2 mRNA. // chr1 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000010545 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:58480965:58577156:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1
NM_001085487 // RefSeq // Homo sapiens Myb-like, SWIRM and MPN domains 1 (MYSM1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000401044 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:58659153:58690394:-1 gene:ENSG00000162601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 78 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000472487 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:58654739:58700092:-1 gene:ENSG00000162601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000493821 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:58654740:58689662:-1 gene:ENSG00000162601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// AB067502 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1915 protein, partial cds. // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// AK292919 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75030 complete cds. // chr1 // 100 // 38 // 15 // 15 // 0 /// BX537912 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp313C082 (from clone DKFZp313C082); complete cds. // chr1 // 100 // 50 // 20 // 20 // 0 /// CR749450 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp779J1721 (from clone DKFZp779J1721). // chr1 // 100 // 35 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000622766 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:58654751:58668483:-1 gene:ENSG00000162601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000010552 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:58631050:58700052:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 24 // 24 // 0
NM_002228 // RefSeq // Homo sapiens jun proto-oncogene (JUN), mRNA. // chr1 // 94 // 94 // 30 // 32 // 0 /// ENST00000371222 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:58780788:58784327:-1 gene:ENSG00000177606 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC006175 // GenBank // Homo sapiens jun oncogene, mRNA (cDNA clone MGC:13254 IMAGE:4053956), complete cds. // chr1 // 94 // 47 // 15 // 16 // 0 /// BC068522 // GenBank // Homo sapiens jun oncogene, mRNA (cDNA clone MGC:87323 IMAGE:5267423), complete cds. // chr1 // 92 // 76 // 24 // 26 // 0 /// BT019759 // GenBank // Homo sapiens v-jun sarcoma virus 17 oncogene homolog (avian) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// CR541724 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834D0929D for gene JUN, v-jun sarcoma virus 17 oncogene homolog (avian); complete cds, incl. stopcodon. // chr1 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// CR541752 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834E1029D for gene JUN, v-jun sarcoma virus 17 oncogene homolog (avian); complete cds, without stopcodon. // chr1 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000010547 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:58769863:58835575:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 41 // 41 // 14 // 34 // 1
ENST00000583379 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:59974757:59975054:-1 gene:ENSG00000265535 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT003580 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_152377 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 87 (C1orf87), mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000371201 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:59990394:60073770:-1 gene:ENSG00000162598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000450089 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:59990394:60073736:-1 gene:ENSG00000162598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 59 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000488027 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:59990397:60008845:-1 gene:ENSG00000162598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 33 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000491817 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:59990800:60010954:-1 gene:ENSG00000162598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 90 // 26 // 9 // 10 // 0 /// BC027878 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 87, mRNA (cDNA clone MGC:34837 IMAGE:5207590), complete cds. // chr1 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// BC042203 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 87, mRNA (cDNA clone IMAGE:5172151), complete cds. // chr1 // 85 // 33 // 11 // 13 // 0 /// ENST00000486478 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:59987269:60008852:-1 gene:ENSG00000162598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 33 // 33 // 13 // 39 // 1 /// AK126061 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44073 fis, clone TESTI4038223. // chr1 // 23 // 23 // 9 // 39 // 1 /// GENSCAN00000041005 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:59990673:60145368:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 74 // 29 // 29 // 0