ENST00000410903 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:91674857:91674966:1 gene:ENSG00000222835 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr2 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000410922 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:144701050:144701159:-1 gene:ENSG00000222854 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr2 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000517021 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:143439605:143439714:1 gene:ENSG00000252830 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr2 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000516193 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:9792751:9792861:-1 gene:ENSG00000252002 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr2 // 31 // 96 // 8 // 26 // 0 /// ENST00000612131 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:89600571:89600680:1 gene:ENSG00000276861 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr2 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000621941 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:144265217:144265326:1 gene:ENSG00000276442 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr2 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT006153 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT072372 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0
NM_001286559 // RefSeq // Homo sapiens tektin 4 (TEKT4), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NM_144705 // RefSeq // Homo sapiens tektin 4 (TEKT4), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000295201 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:94871443:94876829:1 gene:ENSG00000163060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000468063 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:94871433:94876823:1 gene:ENSG00000163060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC021716 // GenBank // Homo sapiens tektin 4, mRNA (cDNA clone MGC:27019 IMAGE:4831157), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000012150 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:94871580:94876769:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0
NM_016044 // RefSeq // Homo sapiens fumarylacetoacetate hydrolase domain containing 2A (FAHD2A), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000233379 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:95402726:95416616:1 gene:ENSG00000115042 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 7 // 7 // 0 /// ENST00000445649 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:95402721:95405802:1 gene:ENSG00000115042 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 63 // 5 // 5 // 0 /// ENST00000447036 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:95402723:95413096:1 gene:ENSG00000115042 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 7 // 7 // 0 /// AF151863 // GenBank // Homo sapiens CGI-105 protein mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC009403 // GenBank // Homo sapiens fumarylacetoacetate hydrolase domain containing 2A, mRNA (cDNA clone MGC:15165 IMAGE:4309334), complete cds. // chr2 // 100 // 88 // 7 // 7 // 0 /// BC110911 // GenBank // Homo sapiens fumarylacetoacetate hydrolase domain containing 2A, mRNA (cDNA clone MGC:131995 IMAGE:6064857), complete cds. // chr2 // 100 // 88 // 7 // 7 // 0 /// GENSCAN00000012139 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:95274586:95421585:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 63 // 5 // 5 // 0
ENST00000448855 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:95546531:95547545:1 gene:ENSG00000168992 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr2 // 76 // 100 // 13 // 17 // 0 /// GENSCAN00000012127 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:95525579:95601077:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_001164464 // RefSeq // Homo sapiens tripartite motif containing 43B (TRIM43B), mRNA. // chr2 // 100 // 98 // 42 // 42 // 0 /// NM_138800 // RefSeq // Homo sapiens tripartite motif containing 43 (TRIM43), mRNA. // chr2 // 100 // 98 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000272395 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:95592018:95599778:1 gene:ENSG00000144015 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 98 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000422468 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:97025981:97031636:-1 gene:ENSG00000144188 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr2 // 90 // 67 // 26 // 29 // 0 /// ENST00000432468 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:95477164:95482714:-1 gene:ENSG00000144010 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr2 // 100 // 81 // 35 // 35 // 0 /// BC015353 // GenBank // Homo sapiens tripartite motif-containing 43, mRNA (cDNA clone MGC:21446 IMAGE:3445177), complete cds. // chr2 // 100 // 98 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000012131 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:95475659:95506683:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 53 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT072599 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 90 // 67 // 26 // 29 // 0 /// GENSCAN00000012127 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:95525579:95601077:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 67 // 67 // 29 // 43 // 1 /// GENSCAN00000041307 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:97024479:97059243:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 51 // 51 // 22 // 43 // 1
NR_046322 // RefSeq // Homo sapiens STARD7 antisense RNA 1 (STARD7-AS1), long non-coding RNA. // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000432267 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:96239713:96242621:1 gene:ENSG00000204685 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000446816 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:96208416:96242594:1 gene:ENSG00000204685 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:antisense // chr2 // 61 // 61 // 11 // 18 // 1 /// ENST00000614453 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:96240239:96240752:1 gene:ENSG00000204685 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT072550 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT147106 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT072549 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr2 // 61 // 61 // 11 // 18 // 1
ENST00000454558 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:96537345:96552634:1 gene:ENSG00000196843 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY358167 // GenBank // Homo sapiens clone DNA128322 RFVG5814 (UNQ5814) mRNA, complete cds. // chr2 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// BC047390 // GenBank // Homo sapiens AT rich interactive domain 5A (MRF1-like), mRNA (cDNA clone IMAGE:5295251). // chr2 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
ENST00000505256 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:96642737:96654898:1 gene:ENSG00000249715 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK126032 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44044 fis, clone TESTI4030069. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_001293083 // RefSeq // Homo sapiens fer-1-like family member 5 (FER1L5), mRNA. // chr2 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// ENST00000436930 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:96642837:96704692:1 gene:ENSG00000249715 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:unitary_pseudogene // chr2 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// AY461813 // GenBank // Homo sapiens FER-1-like protein 5 (FER1L5) mRNA, complete cds. // chr2 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// GENSCAN00000029145 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:96642837:96673254:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NM_001293083 // RefSeq // Homo sapiens fer-1-like family member 5 (FER1L5), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000436930 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:96642837:96704692:1 gene:ENSG00000249715 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:unitary_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000457909 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:96670218:96704885:1 gene:ENSG00000249715 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// AL133022 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp434I0121 (from clone DKFZp434I0121). // chr2 // 95 // 100 // 18 // 19 // 0 /// AY461813 // GenBank // Homo sapiens FER-1-like protein 5 (FER1L5) mRNA, complete cds. // chr2 // 95 // 100 // 18 // 19 // 0 /// BC117324 // GenBank // Homo sapiens fer-1-like 5 (C. elegans), mRNA (cDNA clone IMAGE:40125875), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC126368 // GenBank // Homo sapiens fer-1-like 5 (C. elegans), mRNA (cDNA clone IMAGE:8992084), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC143825 // GenBank // Homo sapiens fer-1-like 5 (C. elegans), mRNA (cDNA clone IMAGE:9052340), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000041300 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:96684327:96704692:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_020184 // RefSeq // Homo sapiens cyclin M4 (CNNM4), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000377075 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:96760902:96811891:1 gene:ENSG00000158158 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000496186 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:96788590:96808686:1 gene:ENSG00000158158 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// AF202777 // GenBank // Homo sapiens ancient conserved domain protein 4 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AK095065 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ37746 fis, clone BRHIP2022708. // chr2 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// AK293915 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58754 complete cds, highly similar to Homo sapiens cyclin M4 (CNNM4), mRNA. // chr2 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// BC063295 // GenBank // Homo sapiens cyclin M4, mRNA (cDNA clone MGC:71640 IMAGE:30340626), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000041306 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:96761000:96809517:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0
NM_017623 // RefSeq // Homo sapiens cyclin M3 (CNNM3), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_199078 // RefSeq // Homo sapiens cyclin M3 (CNNM3), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000305510 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:96816250:96833911:1 gene:ENSG00000168763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000377060 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:96816245:96833911:1 gene:ENSG00000168763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AF216965 // GenBank // Homo sapiens ancient conserved domain protein 3 (ACDP3) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// AK128698 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ46865 fis, clone UTERU3011795. // chr2 // 100 // 28 // 9 // 9 // 0 /// BC007199 // GenBank // Homo sapiens cyclin M3, mRNA (cDNA clone MGC:12617 IMAGE:2964706), complete cds. // chr2 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// BC037272 // GenBank // Homo sapiens cyclin M3, mRNA (cDNA clone MGC:27075 IMAGE:4823510), complete cds. // chr2 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000465224 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:96825175:96833577:1 gene:ENSG00000168763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// CR749702 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp434I1016 (from clone DKFZp434I1016). // chr2 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// GENSCAN00000041309 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:96816278:96832616:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT072589 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
BC104424 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 26 (sulfate transporter), member 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:40010605), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONHSAT072606 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000041293 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:97081082:97083259:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 11 // 11 // 1 /// ENST00000445404 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:97081098:97083249:1 gene:ENSG00000188383 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr2 // 73 // 73 // 8 // 11 // 1 /// NONHSAT072605 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 73 // 73 // 8 // 11 // 1
ENST00000497618 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:97100587:97100874:1 gene:ENSG00000275655 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA gene:ENSG00000242421 // chr2 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT072609 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_001164315 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat domain 36 (ANKRD36), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000420699 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:97113496:97264521:1 gene:ENSG00000135976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000461153 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:97113496:97250199:1 gene:ENSG00000135976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BX647769 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686H1459 (from clone DKFZp686H1459). // chr2 // 89 // 100 // 8 // 9 // 0
ENST00000446623 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:97827248:97827545:1 gene:ENSG00000235734 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000033353 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:97827248:97827550:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONHSAT072687 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr2 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONHSAT072688 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr2 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
AF119842 // GenBank HTC // Homo sapiens PRO1048 mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0
ENST00000364200 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:98782410:98782548:1 gene:ENSG00000201070 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 93 // 100 // 13 // 14 // 0 /// NONHSAT072726 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 93 // 100 // 13 // 14 // 0
ENST00000302513 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:99141485:99151487:1 gene:ENSG00000273045 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000409684 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:99141750:99151047:1 gene:ENSG00000273045 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK314133 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ94831. // chr2 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// BC021264 // GenBank // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 15, mRNA (cDNA clone MGC:29762 IMAGE:4542657), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000424491 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:99141485:99322733:1 gene:ENSG00000241962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 71 // 71 // 17 // 24 // 1 /// ENST00000496794 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:99141950:99147490:1 gene:ENSG00000273045 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1 /// GENSCAN00000021262 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:99139429:99150834:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// AK126402 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44438 fis, clone UTERU2019940, moderately similar to Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein L30 (MRPL30). // chr2 // 71 // 71 // 17 // 24 // 1 /// NONHSAT072734 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr2 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1
NM_145212 // RefSeq // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein L30 (MRPL30), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000338148 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:99181079:99197626:1 gene:ENSG00000185414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000409841 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:99186176:99197423:1 gene:ENSG00000185414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 70 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000465432 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:99181211:99197399:1 gene:ENSG00000185414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 85 // 57 // 11 // 13 // 0 /// BC000217 // GenBank // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein L30, mRNA (cDNA clone MGC:3314 IMAGE:3509919), complete cds. // chr2 // 100 // 43 // 10 // 10 // 0 /// BC022391 // GenBank // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein L30, mRNA (cDNA clone MGC:24095 IMAGE:4611185), complete cds. // chr2 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// NR_028356 // RefSeq // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein L30 (MRPL30), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr2 // 74 // 74 // 17 // 23 // 1 /// NONHSAT072745 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 85 // 57 // 11 // 13 // 0 /// NONHSAT072743 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 74 // 74 // 17 // 23 // 1
NM_015904 // RefSeq // Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 5B (EIF5B), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000289371 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:99337353:99401326:1 gene:ENSG00000158417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF078035 // GenBank // Homo sapiens translation initiation factor IF2 mRNA, complete cds. // chr2 // 94 // 94 // 29 // 31 // 0 /// BC006970 // GenBank // Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 5B, mRNA (cDNA clone IMAGE:4041983), partial cds. // chr2 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// BC032639 // GenBank // Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 5B, mRNA (cDNA clone MGC:44860 IMAGE:5496504), complete cds. // chr2 // 94 // 97 // 30 // 32 // 0 /// ENST00000617677 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:99337371:99400265:1 gene:ENSG00000158417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000021258 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:99336017:99399414:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0
NM_001011717 // RefSeq // Homo sapiens neuromedin S (NMS), mRNA. // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000376865 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:100470482:100483280:1 gene:ENSG00000204640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AB164464 // GenBank // Homo sapiens NMS mRNA for neuromedin S precursor, complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016690 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:100470426:100480665:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
ENST00000376856 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:100509277:100509612:1 gene:ENSG00000204637 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 92 // 93 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000016698 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:100509277:100509615:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 13 // 13 // 0
NM_024065 // RefSeq // Homo sapiens phosducin-like 3 (PDCL3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000264254 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:100562690:100576735:1 gene:ENSG00000115539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// AF110511 // GenBank // Homo sapiens IAP-associated factor VIAF1 (VIAF1) mRNA, complete cds. // chr2 // 92 // 81 // 12 // 13 // 0 /// AF267853 // GenBank // Homo sapiens HTPHLP mRNA, complete cds. // chr2 // 92 // 81 // 12 // 13 // 0 /// AK300827 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51322 complete cds, highly similar to Phosducin-like protein 3. // chr2 // 92 // 81 // 12 // 13 // 0 /// AK313985 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ94636. // chr2 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// BC001021 // GenBank // Homo sapiens phosducin-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:3062 IMAGE:3344703), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000016689 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:100514799:100576496:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 63 // 63 // 10 // 16 // 1
NM_001099693 // RefSeq // Homo sapiens ribosomal protein L31 (RPL31), transcript variant 4, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000409320 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:101002293:101006418:1 gene:ENSG00000071082 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000409711 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:101002691:101006367:1 gene:ENSG00000071082 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000419276 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:101002311:101006423:1 gene:ENSG00000071082 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC001663 // GenBank // Homo sapiens ribosomal protein L31, mRNA (cDNA clone IMAGE:2823904), partial cds. // chr2 // 86 // 100 // 12 // 14 // 0 /// BC070210 // GenBank // Homo sapiens ribosomal protein L31, mRNA (cDNA clone MGC:88191 IMAGE:4714258), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_017546 // RefSeq // Homo sapiens CCR4-NOT transcription complex, subunit 11 (CNOT11), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000289382 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:101252802:101270316:1 gene:ENSG00000158435 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC064421 // GenBank // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 29, mRNA (cDNA clone MGC:74475 IMAGE:5752134), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000043711 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:101252965:101268578:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0
AY358263 // GenBank // Homo sapiens clone DNA180542 AHPA9419 (UNQ9419) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031366 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:102111608:102121397:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
NM_001011552 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 9, subfamily A (NHE4, cation proton antiporter 4), member 4 (SLC9A4), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000295269 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:102473303:102533972:1 gene:ENSG00000180251 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000031345 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:102473760:102614375:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 75 // 75 // 27 // 36 // 1
NM_003048 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 9, subfamily A (NHE2, cation proton antiporter 2), member 2 (SLC9A2), mRNA. // chr2 // 97 // 100 // 37 // 38 // 0 /// ENST00000233969 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:102619707:102711318:1 gene:ENSG00000115616 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// AF073299 // GenBank // Homo sapiens Na+/H+ exchanger isoform 2 (NHE2) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// BC136377 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 9 (sodium/hydrogen exchanger), member 2, mRNA (cDNA clone MGC:167987 IMAGE:9020364), complete cds. // chr2 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// BC136378 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 9 (sodium/hydrogen exchanger), member 2, mRNA (cDNA clone MGC:167988 IMAGE:9020365), complete cds. // chr2 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000025463 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:102660159:102708489:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 58 // 22 // 22 // 0
ENST00000362857 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:104532773:104532985:1 gene:ENSG00000199727 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT072929 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000002436 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:104513395:104551274:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 71 // 71 // 12 // 17 // 0
ENST00000384520 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:104733234:104733362:1 gene:ENSG00000207249 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT072938 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_006236 // RefSeq // Homo sapiens POU class 3 homeobox 3 (POU3F3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000361360 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:104855511:104860471:1 gene:ENSG00000198914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000026343 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:104855511:104857289:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 95 // 91 // 20 // 21 // 0
NM_182640 // RefSeq // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein S9 (MRPS9), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000258455 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:105037983:105099960:1 gene:ENSG00000135972 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000413583 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:105089018:105097288:1 gene:ENSG00000135972 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// BC057240 // GenBank // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein S9, mRNA (cDNA clone MGC:62135 IMAGE:6495350), complete cds. // chr2 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000472220 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:105092098:105099900:1 gene:ENSG00000135972 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1 /// GENSCAN00000026340 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:105070828:105099761:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000026338 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:105017251:105049380:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_007227 // RefSeq // Homo sapiens G protein-coupled receptor 45 (GPR45), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000258456 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:105241743:105243049:1 gene:ENSG00000135973 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// BC066879 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 45, mRNA (cDNA clone MGC:79286 IMAGE:6971748), complete cds. // chr2 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// BC066880 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 45, mRNA (cDNA clone MGC:79288 IMAGE:6971750), complete cds. // chr2 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// BC067455 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 45, mRNA (cDNA clone MGC:79287 IMAGE:6971749), complete cds. // chr2 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// EU883573 // GenBank // Homo sapiens orphan GPCR 45 (GPR45) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// U92642 // GenBank // Human high-affinity lysophosphatidic acid receptor homolog mRNA, complete cds. // chr2 // 88 // 100 // 21 // 24 // 0 /// GENSCAN00000026329 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:105241859:105242977:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0
NM_001286537 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 49 (C2orf49), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// NM_024093 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 49 (C2orf49), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000258457 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:105337359:105349211:1 gene:ENSG00000135974 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000410049 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:2:105337532:105345596:1 gene:ENSG00000135974 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// AK304268 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55159 complete cds. // chr2 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// BC001310 // GenBank // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 49, mRNA (cDNA clone MGC:5509 IMAGE:3453623), complete cds. // chr2 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// XM_005264019 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 49 (C2orf49), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 75 // 75 // 18 // 24 // 1 /// GENSCAN00000026323 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:105334901:105345371:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 75 // 75 // 18 // 24 // 1
NM_032411 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 40 (C2orf40), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006712799 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 40 (C2orf40), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000238044 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:106065656:106078159:1 gene:ENSG00000119147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000409944 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:106063294:106078155:1 gene:ENSG00000119147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000479337 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:106073818:106078155:1 gene:ENSG00000119147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// AF325503 // GenBank // Homo sapiens esophageal cancer related gene 4 protein (ECRG4) mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// AY358601 // GenBank // Homo sapiens clone DNA73742 ECRG4 (UNQ761) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC021742 // GenBank // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 40, mRNA (cDNA clone MGC:33676 IMAGE:5260075), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000437659 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:106065800:106077900:1 gene:ENSG00000119147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// ENST00000489174 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:106063257:106074239:1 gene:ENSG00000119147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// GENSCAN00000022274 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:106065765:106077926:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
ENST00000448535 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:107914948:107915286:1 gene:ENSG00000237745 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 50 // 6 // 6 // 0
NM_021815 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 5 (sodium/choline cotransporter), member 7 (SLC5A7), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000264047 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:107986539:108013994:1 gene:ENSG00000115665 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000409059 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:107986523:108010861:1 gene:ENSG00000115665 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// AB043997 // GenBank // Homo sapiens mRNA for high-affinity choline transporter CHT1, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF276871 // GenBank // Homo sapiens high affinity choline transporter (SLC5A7) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// AK300801 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51317 complete cds, highly similar to High-affinity choline transporter 1. // chr2 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// BC111524 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 5 (choline transporter), member 7, mRNA (cDNA clone MGC:126299 IMAGE:40034612), complete cds. // chr2 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC111525 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 5 (choline transporter), member 7, mRNA (cDNA clone MGC:126300 IMAGE:40034618), complete cds. // chr2 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000017397 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:107988156:108010861:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0
NM_001008743 // RefSeq // Homo sapiens sulfotransferase family, cytosolic, 1C, member 3 (SULT1C3), mRNA. // chr2 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000329106 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:108247195:108265351:1 gene:ENSG00000196228 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000017404 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:108247195:108265351:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
NM_006588 // RefSeq // Homo sapiens sulfotransferase family, cytosolic, 1C, member 4 (SULT1C4), mRNA. // chr2 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000272452 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:108378012:108388057:1 gene:ENSG00000198075 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000494122 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:108377911:108382922:1 gene:ENSG00000198075 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// AK298755 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60793 complete cds, highly similar to Sulfotransferase 1C2 (EC 2.8.2.-). // chr2 // 92 // 50 // 11 // 12 // 0 /// BC058861 // GenBank // Homo sapiens sulfotransferase family, cytosolic, 1C, member 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:5191408), complete cds. // chr2 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// XM_005263919 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens sulfotransferase family, cytosolic, 1C, member 4 (SULT1C4), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 67 // 67 // 16 // 24 // 1 /// ENST00000409309 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:108378185:108387640:1 gene:ENSG00000198075 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 54 // 54 // 13 // 24 // 1 /// AK297851 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53816 complete cds, highly similar to Sulfotransferase 1C2 (EC 2.8.2.-). // chr2 // 58 // 58 // 14 // 24 // 1 /// BC125043 // GenBank // Homo sapiens sulfotransferase family, cytosolic, 1C, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:149521 IMAGE:40115974), complete cds. // chr2 // 54 // 54 // 13 // 24 // 1 /// GENSCAN00000017411 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:108378353:108387432:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0 /// AF055584 // GenBank // Homo sapiens SULT1C sulfotransferase (SULT1C) mRNA, complete cds. // chr2 // 95 // 83 // 19 // 20 // 0
AK296992 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55516 complete cds, highly similar to Particularly interesting new Cys-His protein. // chr2 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0 /// BC005341 // GenBank // Homo sapiens LIM and senescent cell antigen-like domains 1, mRNA (cDNA clone MGC:12432 IMAGE:3838632), complete cds. // chr2 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0 /// NM_001193483 // RefSeq // Homo sapiens LIM and senescent cell antigen-like domains 1 (LIMS1), transcript variant 5, mRNA. // chr2 // 80 // 80 // 8 // 10 // 1 /// ENST00000544547 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:108534355:108687238:1 gene:ENSG00000169756 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 80 // 80 // 8 // 10 // 1
NM_006267 // RefSeq // Homo sapiens RAN binding protein 2 (RANBP2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000283195 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:108719481:108785811:1 gene:ENSG00000153201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AY170822 // GenBank // Homo sapiens transformation-related protein 1 mRNA, complete cds. // chr2 // 92 // 52 // 11 // 12 // 0 /// D42063 // GenBank // Homo sapiens mRNA for RanBP2 (Ran-binding protein 2), complete cds. // chr2 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000007180 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:108655075:108783901:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 95 // 83 // 18 // 19 // 0 /// AY170823 // GenBank // Homo sapiens transformation-related protein 2 mRNA, complete cds. // chr2 // 90 // 43 // 9 // 10 // 0
NM_144978 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 138 (CCDC138), mRNA. // chr2 // 94 // 90 // 34 // 36 // 0 /// ENST00000295124 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:108786763:108876578:1 gene:ENSG00000163006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000409529 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:108786761:108876576:1 gene:ENSG00000163006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000412964 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:108786757:108876578:1 gene:ENSG00000163006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000447782 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:108786788:108794712:1 gene:ENSG00000163006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 20 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000456512 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:2:108791716:108846780:1 gene:ENSG00000163006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 40 // 16 // 16 // 0 /// AK125199 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ43209 fis, clone FEBRA2015588. // chr2 // 95 // 95 // 36 // 38 // 0 /// BC015847 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 138, mRNA (cDNA clone IMAGE:4657146), partial cds. // chr2 // 83 // 45 // 15 // 18 // 0 /// BC050579 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 138, mRNA (cDNA clone MGC:57804 IMAGE:5764613), complete cds. // chr2 // 95 // 95 // 36 // 38 // 0 /// GENSCAN00000007173 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:108786823:108874808:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 35 // 14 // 14 // 0
NM_001099289 // RefSeq // Homo sapiens SH3 domain containing ring finger 3 (SH3RF3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// XM_006712493 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens SH3 domain containing ring finger 3 (SH3RF3), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// XM_006712494 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens SH3 domain containing ring finger 3 (SH3RF3), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000309415 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:109129541:109501671:1 gene:ENSG00000172985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000418513 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:109129348:109449489:1 gene:ENSG00000172985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000007192 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:109371553:109482848:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_023016 // RefSeq // Homo sapiens sosondowah ankyrin repeat domain family member C (SOWAHC), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000356454 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:109614334:109618990:1 gene:ENSG00000198142 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC036652 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat domain 57, mRNA (cDNA clone MGC:32964 IMAGE:5267818), complete cds. // chr2 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0
ENST00000434894 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:109737139:109737523:-1 gene:ENSG00000233707 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// ENST00000401483 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:110633947:110634333:1 gene:ENSG00000216867 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 65 // 100 // 17 // 26 // 0
ENST00000483161 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:111930175:111930467:1 gene:ENSG00000240183 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT073677 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_032824 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 87B (TMEM87B), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000283206 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:112055223:112119318:1 gene:ENSG00000153214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000452029 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:112055720:112081411:1 gene:ENSG00000153214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 27 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000452614 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:2:112055720:112081411:1 gene:ENSG00000153214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 32 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000463427 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:112086024:112105910:1 gene:ENSG00000153214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 30 // 13 // 13 // 0 /// AK290294 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78085 complete cds. // chr2 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// BC115373 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 87B, mRNA (cDNA clone MGC:134796 IMAGE:40026807), complete cds. // chr2 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// ENST00000471632 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:112089632:112116339:1 gene:ENSG00000153214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 23 // 23 // 10 // 44 // 1 /// NONHSAT073681 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 100 // 30 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000026154 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:112055592:112136477:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 34 // 34 // 15 // 44 // 1 /// NONHSAT073682 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 23 // 23 // 10 // 44 // 1
NM_198581 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger CCCH-type containing 6 (ZC3H6), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000343936 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:112275601:112340063:1 gene:ENSG00000188177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000409871 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:112275594:112340059:1 gene:ENSG00000188177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000026167 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:112153209:112332488:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1
NM_153712 // RefSeq // Homo sapiens tubulin tyrosine ligase (TTL), mRNA. // chr2 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENST00000233336 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:112482154:112541739:1 gene:ENSG00000114999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000460450 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:112522151:112532411:1 gene:ENSG00000114999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// AB071393 // GenBank // Homo sapiens TTL mRNA for tubulin tyrosine ligase, complete cds. // chr2 // 95 // 78 // 20 // 21 // 0 /// AK126378 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44414 fis, clone UTERU1000339. // chr2 // 89 // 33 // 8 // 9 // 0 /// BC036819 // GenBank // Homo sapiens tubulin tyrosine ligase, mRNA (cDNA clone MGC:46235 IMAGE:5767758), complete cds. // chr2 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// BX649144 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686C2044 (from clone DKFZp686C2044). // chr2 // 89 // 33 // 8 // 9 // 0 /// ENST00000476615 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:112501286:112520680:1 gene:ENSG00000114999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// GENSCAN00000026156 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:112482345:112528795:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// NONHSAT073697 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0
NM_032309 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 5 (CHCHD5), mRNA. // chr2 // 90 // 37 // 9 // 10 // 0 /// XM_005263824 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 5 (CHCHD5), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000324913 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:112584441:112589040:1 gene:ENSG00000125611 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000409719 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:2:112584595:112589275:1 gene:ENSG00000125611 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// AK096990 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39671 fis, clone SMINT2008917. // chr2 // 91 // 81 // 20 // 22 // 0 /// BC004498 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:11104 IMAGE:3831856), complete cds. // chr2 // 90 // 37 // 9 // 10 // 0 /// ENST00000454841 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:112584469:112589040:1 gene:ENSG00000125611 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// ENST00000469030 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:112584872:112589040:1 gene:ENSG00000125611 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// GENSCAN00000026151 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:112542229:112588972:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// NONHSAT073701 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
ENST00000327581 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:2:112721486:112742879:1 gene:ENSG00000144130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC041437 // GenBank // Homo sapiens 5-nucleotidase domain containing 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:5163442), partial cds. // chr2 // 94 // 100 // 32 // 34 // 0 /// ENST00000497526 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:112722964:112731673:1 gene:ENSG00000144130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 59 // 59 // 20 // 34 // 1 /// AK092780 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ35461 fis, clone SMINT2004992, moderately similar to CYTOSOLIC PURINE 5-NUCLEOTIDASE (EC 3.1.3.5). // chr2 // 53 // 53 // 18 // 34 // 1 /// ENST00000470675 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:112722964:112724316:1 gene:ENSG00000144130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1 /// GENSCAN00000020347 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:112721080:112728011:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0
ENST00000312918 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:112853328:112854122:1 gene:ENSG00000180152 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_014440 // RefSeq // Homo sapiens interleukin 36, alpha (IL36A), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000259211 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:113005461:113008044:1 gene:ENSG00000136694 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF201831 // GenBank // Homo sapiens FIL1 epsilon mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC107042 // GenBank // Homo sapiens interleukin 1 family, member 6 (epsilon), mRNA (cDNA clone MGC:129552 IMAGE:40002575), complete cds. // chr2 // 82 // 100 // 23 // 28 // 0 /// BC107043 // GenBank // Homo sapiens interleukin 1 family, member 6 (epsilon), mRNA (cDNA clone MGC:129553 IMAGE:40002576), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000020332 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:113005872:113008044:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
ENST00000364935 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:113086805:113086911:1 gene:ENSG00000201805 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT073740 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
ENST00000453673 // ENSEMBL // ensembl_havana_ig_gene:known chromosome:GRCh38:2:113406396:113406872:1 gene:ENSG00000231292 gene_biotype:IG_V_gene transcript_biotype:IG_V_gene // chr2 // 88 // 100 // 21 // 24 // 0 /// GENSCAN00000020327 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:113406396:113495743:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0
ENST00000272567 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:113657908:113658675:1 gene:ENSG00000144158 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000024805 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:113628607:113658675:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
ENST00000365557 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:113681111:113681217:1 gene:ENSG00000202427 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT073827 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
ENST00000410991 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:114420125:114420302:1 gene:ENSG00000222923 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 93 // 100 // 13 // 14 // 0 /// NONHSAT073865 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 93 // 100 // 13 // 14 // 0
NM_006773 // RefSeq // Homo sapiens DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 18 (DDX18), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000263239 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:117814650:117832379:1 gene:ENSG00000088205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000474694 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:117815058:117824599:1 gene:ENSG00000088205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 47 // 8 // 8 // 0 /// BC001238 // GenBank // Homo sapiens DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 18, mRNA (cDNA clone MGC:4933 IMAGE:3452935), complete cds. // chr2 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0 /// BC003360 // GenBank // Homo sapiens DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 18, mRNA (cDNA clone MGC:5316 IMAGE:2900252), complete cds. // chr2 // 100 // 82 // 14 // 14 // 0 /// BC024739 // GenBank // Homo sapiens DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 18, mRNA (cDNA clone MGC:29902 IMAGE:4995871), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// CR457060 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834G0414D for gene DDX18, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 18; complete cds, incl. stopcodon. // chr2 // 100 // 65 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000476149 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:117824337:117832370:1 gene:ENSG00000088205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 47 // 47 // 8 // 17 // 1 /// AB209392 // GenBank // Homo sapiens mRNA for Hypothetical protein FLJ33908 variant protein. // chr2 // 47 // 47 // 8 // 17 // 1 /// GENSCAN00000031463 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:117769788:117829498:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 71 // 12 // 12 // 0
ENST00000430851 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:117859427:117903338:1 gene:ENSG00000125631 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000031457 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:117859427:117903338:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 67 // 12 // 12 // 0
ENST00000468841 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:118016385:118016669:1 gene:ENSG00000243510 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT073925 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_006770 // RefSeq // Homo sapiens macrophage receptor with collagenous structure (MARCO), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000327097 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:118942166:118994660:1 gene:ENSG00000019169 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// AF035819 // GenBank // Homo sapiens macrophage receptor MARCO mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// AK297030 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56989 complete cds, highly similar to Macrophage receptor MARCO. // chr2 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// AK301407 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51344 complete cds, highly similar to Macrophage receptor MARCO. // chr2 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// BC016004 // GenBank // Homo sapiens macrophage receptor with collagenous structure, mRNA (cDNA clone MGC:27263 IMAGE:4618447), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000041823 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:118942301:118994520:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 97 // 88 // 34 // 35 // 0
ENST00000582256 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:119169822:119170115:1 gene:ENSG00000264833 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_183240 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 37 (TMEM37), mRNA. // chr2 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// XM_005263598 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens transmembrane protein 37 (TMEM37), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// XM_006712300 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens transmembrane protein 37 (TMEM37), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000306406 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:119431869:119438520:1 gene:ENSG00000171227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000409826 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:119429901:119437599:1 gene:ENSG00000171227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000465296 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:119432090:119437547:1 gene:ENSG00000171227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// AF361356 // GenBank // Homo sapiens voltage-dependent calcium channel gamma subunit-like protein mRNA, complete cds. // chr2 // 86 // 58 // 12 // 14 // 0 /// BC046362 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 37, mRNA (cDNA clone MGC:50757 IMAGE:5221396), complete cds. // chr2 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000041829 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:119427064:119437440:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 67 // 67 // 16 // 24 // 1
NM_002830 // RefSeq // Homo sapiens protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4 (megakaryocyte) (PTPN4), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000263708 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:119759631:119983818:1 gene:ENSG00000088179 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000433888 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:119877323:119934960:1 gene:ENSG00000088179 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 28 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000488279 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:119760224:119882146:1 gene:ENSG00000088179 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 25 // 9 // 9 // 0 /// AK301218 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53929 complete cds, highly similar to Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type4 (EC 3.1.3.48). // chr2 // 100 // 42 // 15 // 15 // 0 /// BC010674 // GenBank // Homo sapiens protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4 (megakaryocyte), mRNA (cDNA clone MGC:9204 IMAGE:3853914), complete cds. // chr2 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// M68941 // GenBank // Human protein-tyrosine phosphatase mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000430976 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:119882503:119977461:1 gene:ENSG00000088179 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 58 // 58 // 21 // 36 // 1 /// BX648614 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686P05224 (from clone DKFZp686P05224). // chr2 // 58 // 58 // 21 // 36 // 1 /// GENSCAN00000043204 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:119769597:120104240:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1
NONHSAT073976 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000365176 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:120192245:120192357:1 gene:ENSG00000202046 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT073985 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_002193 // RefSeq // Homo sapiens inhibin, beta B (INHBB), mRNA. // chr2 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000295228 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:120346143:120351808:1 gene:ENSG00000163083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// BC030029 // GenBank // Homo sapiens inhibin, beta B, mRNA (cDNA clone MGC:33716 IMAGE:5258851), complete cds. // chr2 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000043194 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:120346189:120349874:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0
ENST00000364136 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:120651273:120651374:1 gene:ENSG00000201006 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT074008 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_023343 // RefSeq // Homo sapiens RNA, U4atac small nuclear (U12-dependent splicing) (RNU4ATAC), small nuclear RNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000580972 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:121530881:121531007:1 gene:ENSG00000264229 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U62822 // GenBank // Human small nuclear RNA U4atac, partial sequence. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_130773 // RefSeq // Homo sapiens contactin associated protein-like 5 (CNTNAP5), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000431078 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:124025287:124915287:1 gene:ENSG00000155052 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// AB077881 // GenBank // Homo sapiens mRNA for caspr5, complete cds. // chr2 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0
ENST00000383999 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:124989219:124989325:1 gene:ENSG00000206726 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT074114 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONHSAT074115 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000365559 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:127472234:127472415:1 gene:ENSG00000202429 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT074168 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_032740 // RefSeq // Homo sapiens SFT2 domain containing 3 (SFT2D3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000310981 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:127701508:127705242:1 gene:ENSG00000173349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// BC110324 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5549215. // chr2 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000029635 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:127700735:127702176:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0
ENST00000365662 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:127845236:127845341:1 gene:ENSG00000202532 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 79 // 73 // 15 // 19 // 0 /// NONHSAT074203 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 79 // 73 // 15 // 19 // 0
ENST00000363562 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:128067800:128067901:1 gene:ENSG00000200432 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT074213 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NONHSAT074240 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_005263792 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens mitotic spindle organizing protein 2B (MZT2B), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 71 // 12 // 12 // 0 /// AK024408 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ14346 fis, clone THYRO1001320. // chr2 // 94 // 100 // 16 // 17 // 0
ENST00000409982 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:130570886:130577341:1 gene:ENSG00000183292 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000440359 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:130574331:130582406:1 gene:ENSG00000183292 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 83 // 5 // 5 // 0 /// AY713301 // GenBank // Homo sapiens TISP43 mRNA, partial sequence. // chr2 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// AY726562 // GenBank // Homo sapiens clone TESTIS-608 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000409259 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:130539095:130549883:-1 gene:ENSG00000184761 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// GENSCAN00000032489 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:130539821:130563817:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// GENSCAN00000040272 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:130574220:130580910:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// NONHSAT074358 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 83 // 5 // 5 // 0
NM_207364 // RefSeq // Homo sapiens G protein-coupled receptor 148 (GPR148), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000309926 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:130729070:130730336:1 gene:ENSG00000173302 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY280965 // GenBank // Homo sapiens BTR mRNA, complete cds. // chr2 // 91 // 41 // 10 // 11 // 0 /// AY569570 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 148 (GPR148) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC105013 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 148, mRNA (cDNA clone MGC:132673 IMAGE:8144016), complete cds. // chr2 // 92 // 89 // 22 // 24 // 0 /// BC105041 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 148, mRNA (cDNA clone MGC:132701 IMAGE:8144044), complete cds. // chr2 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000040285 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:130690236:130730195:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0
NM_001105193 // RefSeq // Homo sapiens APC membrane recruitment protein 3 (AMER3), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0 /// NM_001105194 // RefSeq // Homo sapiens APC membrane recruitment protein 3 (AMER3), transcript variant 3, mRNA. // chr2 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0 /// NM_001105195 // RefSeq // Homo sapiens APC membrane recruitment protein 3 (AMER3), transcript variant 4, mRNA. // chr2 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0 /// NM_152698 // RefSeq // Homo sapiens APC membrane recruitment protein 3 (AMER3), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000321420 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:130755435:130765086:1 gene:ENSG00000178171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000423981 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:130756291:130768134:1 gene:ENSG00000178171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0 /// AK289525 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78168 complete cds. // chr2 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// AK291424 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78143 complete cds. // chr2 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// BC113445 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 123C, mRNA (cDNA clone MGC:142005 IMAGE:8322497), complete cds. // chr2 // 100 // 74 // 17 // 17 // 0 /// BC113447 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 123C, mRNA (cDNA clone MGC:142007 IMAGE:8322499), complete cds. // chr2 // 100 // 74 // 17 // 17 // 0 /// BC143806 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 123C, mRNA (cDNA clone MGC:177338 IMAGE:9052321), complete cds. // chr2 // 100 // 74 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000040280 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:130743574:130808111:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 57 // 13 // 13 // 0
ENST00000390897 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:131229607:131229713:1 gene:ENSG00000212199 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONHSAT074423 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
ENST00000515948 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:130622838:130622944:1 gene:ENSG00000251757 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000516147 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:131602790:131602896:1 gene:ENSG00000251956 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000516164 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:130497743:130497849:-1 gene:ENSG00000251973 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000390914 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:22:15701459:15701565:1 gene:ENSG00000212216 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 59 // 100 // 19 // 32 // 0 /// ENST00000391214 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:14:19422815:19422921:-1 gene:ENSG00000212516 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 59 // 100 // 19 // 32 // 0 /// ENST00000391310 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:14:18978847:18978953:1 gene:ENSG00000212612 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 59 // 100 // 19 // 32 // 0 /// ENST00000516414 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:130109204:130109310:-1 gene:ENSG00000252223 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 53 // 100 // 17 // 32 // 0 /// ENST00000390897 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:131229607:131229713:1 gene:ENSG00000212199 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 44 // 100 // 14 // 32 // 0 /// NONHSAT035457 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 59 // 100 // 19 // 32 // 0 /// NONHSAT035531 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 59 // 100 // 19 // 32 // 0 /// NONHSAT083103 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 59 // 100 // 19 // 32 // 0 /// NONHSAT074423 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 44 // 100 // 14 // 32 // 0
XR_158980 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens family with sequence similarity 201, member B (FAM201B), misc_RNA. // chr2 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000458407 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:132352722:132353318:1 gene:ENSG00000230992 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 93 // 13 // 13 // 0 /// BC045732 // GenBank // Homo sapiens hypothetical protein LOC339742, mRNA (cDNA clone IMAGE:4820816), partial cds. // chr2 // 93 // 100 // 13 // 14 // 0 /// NONHSAT074534 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT147114 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 93 // 13 // 13 // 0
NM_001508 // RefSeq // Homo sapiens G protein-coupled receptor 39 (GPR39), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000329321 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:132416574:132646559:1 gene:ENSG00000183840 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// AF034633 // GenBank // Homo sapiens orphan G protein-coupled receptor (GPR39) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC125046 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 39, mRNA (cDNA clone MGC:149541 IMAGE:40116106), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// FJ348258 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 39 (GPR39) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000470071 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:132604441:132646554:1 gene:ENSG00000183840 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 53 // 53 // 8 // 15 // 1 /// AK123759 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ41765 fis, clone IMR322006012, highly similar to Probable G-protein coupled receptor 39. // chr2 // 53 // 53 // 8 // 15 // 1
ENST00000363848 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:132523617:132523936:1 gene:ENSG00000200718 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// NONHSAT074537 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr2 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0
AF251048 // GenBank // Homo sapiens connexin mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000516879 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:133333829:133333930:1 gene:ENSG00000252688 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT074546 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000363838 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:133596091:133596399:1 gene:ENSG00000200708 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 88 // 92 // 21 // 24 // 0 /// NONHSAT074550 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 88 // 92 // 21 // 24 // 0
ENST00000410989 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:134231195:134231312:1 gene:ENSG00000222921 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT074557 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AF113921 // GenBank // Homo sapiens alpha-1,3(6)-mannosylglycoprotein beta-1,6-N-acetyl-glucosaminyltransferase (MGAT5) mRNA, complete cds. // chr2 // 91 // 81 // 32 // 35 // 0 /// D17716 // GenBank // Homo sapiens mRNA for N-acetylglucosaminyltransferase V, complete cds. // chr2 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// NM_002410 // RefSeq // Homo sapiens mannosyl (alpha-1,6-)-glycoprotein beta-1,6-N-acetyl-glucosaminyltransferase (MGAT5), mRNA. // chr2 // 91 // 91 // 39 // 43 // 1 /// XM_005263669 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens mannosyl (alpha-1,6-)-glycoprotein beta-1,6-N-acetyl-glucosaminyltransferase (MGAT5), transcript variant X6, mRNA. // chr2 // 91 // 91 // 39 // 43 // 1 /// ENST00000281923 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:134254259:134454620:1 gene:ENSG00000152127 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 91 // 91 // 39 // 43 // 1 /// ENST00000409645 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:134120182:134454621:1 gene:ENSG00000152127 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 91 // 91 // 39 // 43 // 1 /// GENSCAN00000006161 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:134310801:134403788:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 40 // 40 // 17 // 43 // 1 /// GENSCAN00000006152 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:134411854:134454282:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 23 // 23 // 10 // 43 // 1
NM_138326 // RefSeq // Homo sapiens aminocarboxymuconate semialdehyde decarboxylase (ACMSD), mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_005263589 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens aminocarboxymuconate semialdehyde decarboxylase (ACMSD), transcript variant X4, mRNA. // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_005263590 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens aminocarboxymuconate semialdehyde decarboxylase (ACMSD), transcript variant X5, mRNA. // chr2 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000356140 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:134838547:134902034:1 gene:ENSG00000153086 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000392928 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:134838618:134902034:1 gene:ENSG00000153086 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AB071418 // GenBank // Homo sapiens ACMSD mRNA for 2-amino-3-carboxylmuconate-6-semialdehy de decarboxylase, complete cds. // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC016018 // GenBank // Homo sapiens aminocarboxymuconate semialdehyde decarboxylase, mRNA (cDNA clone MGC:27478 IMAGE:4714682), complete cds. // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC107420 // GenBank // Homo sapiens aminocarboxymuconate semialdehyde decarboxylase, mRNA (cDNA clone MGC:111184 IMAGE:4594027), complete cds. // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000485893 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:134838616:134873661:1 gene:ENSG00000153086 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// AK125008 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ43018 fis, clone BRTHA2017353. // chr2 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// GENSCAN00000031757 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:134824516:134954648:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NM_001172435 // RefSeq // Homo sapiens RAB3 GTPase activating protein subunit 1 (catalytic) (RAB3GAP1), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_012233 // RefSeq // Homo sapiens RAB3 GTPase activating protein subunit 1 (catalytic) (RAB3GAP1), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000264158 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:135052265:135170706:1 gene:ENSG00000115839 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000442034 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:2:135052298:135169989:1 gene:ENSG00000115839 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000487003 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:135089654:135176394:1 gene:ENSG00000115839 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000539493 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:135089855:135175590:1 gene:ENSG00000115839 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// AB449877 // GenBank // Homo sapiens RAB3GAP1 mRNA for RAB3 GTPase activating protein subunit 1, complete cds. // chr2 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// BC146809 // GenBank // Homo sapiens RAB3 GTPase activating protein subunit 1 (catalytic), mRNA (cDNA clone MGC:167035 IMAGE:8860368), complete cds. // chr2 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031755 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:135124140:135186289:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NR_029672 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 128-1 (MIR128-1), microRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000384921 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:135665376:135665484:1 gene:ENSG00000207654 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-128-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0000447 Homo sapiens miR-128-1 stem-loop // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT074598 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_014607 // RefSeq // Homo sapiens UBX domain protein 4 (UBXN4), mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000272638 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:135741619:135785055:1 gene:ENSG00000144224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000416538 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:135741868:135761911:1 gene:ENSG00000144224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000490163 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:135754152:135785055:1 gene:ENSG00000144224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// AK292829 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77280 complete cds, highly similar to Homo sapiens UBX domain containing 2 (UBXD2), mRNA. // chr2 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// AK304096 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58827 complete cds, highly similar to UBX domain-containing protein 2. // chr2 // 83 // 75 // 15 // 18 // 0 /// BC020806 // GenBank // Homo sapiens UBX domain protein 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:4280469), complete cds. // chr2 // 91 // 46 // 10 // 11 // 0 /// BC035594 // GenBank // Homo sapiens UBX domain protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:45412 IMAGE:5580880), complete cds. // chr2 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// BX647216 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686N1093 (from clone DKFZp686N1093). // chr2 // 96 // 96 // 22 // 23 // 0 /// EF199840 // GenBank // Homo sapiens erasin (UBXD2) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000016992 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:135748290:135782887:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0
NM_001080427 // RefSeq // Homo sapiens thrombospondin, type I, domain containing 7B (THSD7B), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000272643 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:136882179:137677717:1 gene:ENSG00000144229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000409968 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:2:136765545:137677717:1 gene:ENSG00000144229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000413152 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:136990892:137677717:1 gene:ENSG00000144229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC019344 // GenBank // Homo sapiens thrombospondin, type I, domain containing 7B, mRNA (cDNA clone IMAGE:3530946), partial cds. // chr2 // 100 // 47 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000024487 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:137616193:137683586:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000003995 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:137206934:137416331:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
ENST00000410462 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:137715332:137715440:1 gene:ENSG00000222394 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT074651 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001664 // RefSeq // Homo sapiens speckle-type POZ protein-like (SPOPL), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000280098 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:138501801:138573547:1 gene:ENSG00000144228 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000420679 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:138550157:138569130:1 gene:ENSG00000144228 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 93 // 78 // 26 // 28 // 0 /// ENST00000430968 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:138501932:138552582:1 gene:ENSG00000144228 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 92 // 33 // 11 // 12 // 0 /// AK293850 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53775 complete cds, moderately similar to Speckle-type POZ protein. // chr2 // 100 // 25 // 9 // 9 // 0 /// BC071613 // GenBank // Homo sapiens speckle-type POZ protein-like, mRNA (cDNA clone MGC:87667 IMAGE:5275316), complete cds. // chr2 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000048817 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:138550546:138569080:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 56 // 20 // 20 // 0 /// AK021919 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ11857 fis, clone HEMBA1006807. // chr2 // 69 // 69 // 25 // 36 // 1
ENST00000384174 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:139511424:139511555:1 gene:ENSG00000206901 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT074690 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000489055 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:139982684:139982986:1 gene:ENSG00000240977 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT074697 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000365022 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:140992543:140992659:1 gene:ENSG00000201892 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT074703 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000363417 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:143897263:143897361:1 gene:ENSG00000200287 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT074749 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0
NR_026904 // RefSeq // Homo sapiens poly(A) binding protein, cytoplasmic 1 pseudogene 2 (PABPC1P2), non-coding RNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000471997 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:146587506:146589310:1 gene:ENSG00000198526 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AK292357 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76362 complete cds, highly similar to Homo sapiens poly(A) binding protein, cytoplasmic, pseudogene 2, mRNA. // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000007950 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:146538319:146589241:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1
NONHSAT074853 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000384496 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:147408342:147408448:1 gene:ENSG00000207225 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT074854 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
ENST00000391087 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:147877422:147877528:1 gene:ENSG00000212389 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT074863 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_018328 // RefSeq // Homo sapiens methyl-CpG binding domain protein 5 (MBD5), mRNA. // chr2 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000404807 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:2:148458630:148513451:1 gene:ENSG00000204406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000407073 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:148021011:148513451:1 gene:ENSG00000204406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000496893 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:148485116:148513477:1 gene:ENSG00000204406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 54 // 19 // 19 // 0 /// AK055079 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ30517 fis, clone BRAWH2000752. // chr2 // 95 // 54 // 18 // 19 // 0 /// AK304424 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61558 complete cds, highly similar to Methyl-CpG-binding domain protein 5. // chr2 // 90 // 57 // 18 // 20 // 0 /// BC150264 // GenBank // Homo sapiens methyl-CpG binding domain protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:166842 IMAGE:9007212), complete cds. // chr2 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// EF542797 // GenBank // Homo sapiens methyl-CpG binding domain protein 5 (MBD5) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000416015 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:2:148468725:148518236:1 gene:ENSG00000204406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 60 // 60 // 21 // 35 // 1 /// GENSCAN00000033754 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:148458759:148490627:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 60 // 21 // 21 // 0
NM_015630 // RefSeq // Homo sapiens enhancer of polycomb homolog 2 (Drosophila) (EPC2), mRNA. // chr2 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000258484 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:148644984:148787568:1 gene:ENSG00000135999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// AF286904 // GenBank // Homo sapiens enhancer of polycomb 2 (EPC2) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// AK001433 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ10571 fis, clone NT2RP2003121, weakly similar to Mus musculus enhancer of polycomb mRNA. // chr2 // 100 // 69 // 27 // 27 // 0 /// AK125789 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ43801 fis, clone TESTI4000394, highly similar to Enhancer of polycomb homolog 2. // chr2 // 97 // 100 // 38 // 39 // 0 /// BC093818 // GenBank // Homo sapiens enhancer of polycomb homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:120853 IMAGE:7939663), complete cds. // chr2 // 97 // 79 // 30 // 31 // 0 /// BC093820 // GenBank // Homo sapiens enhancer of polycomb homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:120855 IMAGE:7939665), complete cds. // chr2 // 97 // 79 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000026360 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:148645018:148786377:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 79 // 31 // 31 // 0
NM_007115 // RefSeq // Homo sapiens tumor necrosis factor, alpha-induced protein 6 (TNFAIP6), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000243347 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:151357592:151380048:1 gene:ENSG00000123610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF086484 // GenBank // Homo sapiens full length insert cDNA clone ZD93D04. // chr2 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// BC030205 // GenBank // Homo sapiens tumor necrosis factor, alpha-induced protein 6, mRNA (cDNA clone MGC:34404 IMAGE:5208773), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000460812 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:151366142:151373744:1 gene:ENSG00000123610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1 /// GENSCAN00000049584 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:151347554:151379533:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0
ENST00000498656 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:151372003:151372287:1 gene:ENSG00000242113 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT074953 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_052905 // RefSeq // Homo sapiens formin-like 2 (FMNL2), mRNA. // chr2 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0 /// XM_006712229 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens formin-like 2 (FMNL2), transcript variant X7, mRNA. // chr2 // 100 // 54 // 21 // 21 // 0 /// XR_241279 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens formin-like 2 (FMNL2), transcript variant X5, misc_RNA. // chr2 // 100 // 56 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000288670 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:152335237:152649834:1 gene:ENSG00000157827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000475377 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:2:152619578:152649823:1 gene:ENSG00000157827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 44 // 17 // 17 // 0 /// BC036492 // GenBank HTC // Homo sapiens formin-like 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:5262578), with apparent retained intron. // chr2 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0 /// BC113878 // GenBank // Homo sapiens formin-like 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:40081737), complete cds. // chr2 // 93 // 38 // 14 // 15 // 0 /// BC114438 // GenBank // Homo sapiens formin-like 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:40081739), complete cds. // chr2 // 93 // 36 // 13 // 14 // 0 /// BC167159 // GenBank // Homo sapiens formin-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:176702 IMAGE:8862581), complete cds. // chr2 // 97 // 87 // 33 // 34 // 0 /// GENSCAN00000005960 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:152578900:152647905:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 54 // 21 // 21 // 0
ENST00000411358 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:154590407:154590528:1 gene:ENSG00000223290 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT075018 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000383991 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:155330421:155330527:1 gene:ENSG00000206718 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT075032 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONHSAT075051 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_014568 // RefSeq // Homo sapiens polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 5 (GALNT5), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000259056 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:157257598:157314211:1 gene:ENSG00000136542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AK292154 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75131 complete cds, highly similar to Homo sapiens UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 5 (GalNAc-T5) (GALNT5), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AY277591 // GenBank // Homo sapiens GalNAc-T5 (GALNT5) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC142676 // GenBank // Homo sapiens UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 5 (GalNAc-T5), mRNA (cDNA clone MGC:164948 IMAGE:40148207), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000012979 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:157258083:157311348:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0
ENST00000363537 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:41448742:41448844:-1 gene:ENSG00000200407 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 83 // 100 // 5 // 6 // 0 /// ENST00000384576 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:48196680:48196786:-1 gene:ENSG00000207306 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 83 // 100 // 5 // 6 // 0 /// ENST00000516171 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:157912772:157912885:1 gene:ENSG00000251980 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000516485 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:102678707:102678813:-1 gene:ENSG00000252294 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 83 // 100 // 5 // 6 // 0 /// NONHSAT041945 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 83 // 100 // 5 // 6 // 0 /// NONHSAT054391 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 83 // 100 // 5 // 6 // 0 /// NONHSAT075075 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// NONHSAT137983 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 83 // 100 // 5 // 6 // 0
NM_001135098 // RefSeq // Homo sapiens uridine phosphorylase 2 (UPP2), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_173355 // RefSeq // Homo sapiens uridine phosphorylase 2 (UPP2), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_005246359 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens uridine phosphorylase 2 (UPP2), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 95 // 75 // 20 // 21 // 0 /// ENST00000005756 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:158101870:158135966:1 gene:ENSG00000007001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000605860 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:157876702:158136154:1 gene:ENSG00000007001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY225131 // GenBank // Homo sapiens uridine phosphorylase 2 (UPASE2) mRNA, complete cds. // chr2 // 80 // 89 // 20 // 25 // 0 /// BC033529 // GenBank // Homo sapiens uridine phosphorylase 2, mRNA (cDNA clone MGC:42328 IMAGE:4818300), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000460456 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:158101868:158135227:1 gene:ENSG00000007001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1 /// GENSCAN00000048228 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:158029065:158134890:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1 /// NONHSAT075080 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
NR_038850 // RefSeq // Homo sapiens CCDC148 antisense RNA 1 (CCDC148-AS1), long non-coding RNA. // chr2 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000412781 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:158166650:158236169:1 gene:ENSG00000227480 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr2 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT075083 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr2 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000486202 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:160877547:160877850:1 gene:ENSG00000244372 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT075148 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_005805 // RefSeq // Homo sapiens proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 14 (PSMD14), mRNA. // chr2 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000409682 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:161308038:161411717:1 gene:ENSG00000115233 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AK055128 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ30566 fis, clone BRAWH2005068, highly similar to 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 14. // chr2 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// BC009524 // GenBank // Homo sapiens proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 14, mRNA (cDNA clone IMAGE:3889839), complete cds. // chr2 // 100 // 26 // 8 // 8 // 0 /// BC066336 // GenBank // Homo sapiens proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 14, mRNA (cDNA clone MGC:87397 IMAGE:5296432), complete cds. // chr2 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// U86782 // GenBank // Human 26S proteasome-associated pad1 homolog (POH1) mRNA, complete cds. // chr2 // 95 // 71 // 21 // 22 // 0 /// ENST00000477232 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:161381360:161411715:1 gene:ENSG00000115233 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1 /// AB209220 // GenBank // Homo sapiens mRNA for 26S proteasome-associated pad1 homolog variant protein. // chr2 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1 /// GENSCAN00000049684 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:161366512:161411400:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 55 // 17 // 17 // 0
ENST00000458927 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:161558544:161558646:1 gene:ENSG00000238570 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT075184 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000391010 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:162496936:162497051:1 gene:ENSG00000212312 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT075206 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000364032 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:163288995:163289096:1 gene:ENSG00000200902 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT075211 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000362986 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:18:7995570:7995785:1 gene:ENSG00000199856 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr2 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0 /// ENST00000384034 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:14:101145480:101145695:-1 gene:ENSG00000277754 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA gene:ENSG00000206761 // chr2 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0 /// NONHSAT006578 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0 /// NONHSAT040012 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0 /// NONHSAT057163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr2 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0 /// NONHSAT076932 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 63 // 100 // 5 // 8 // 0
ENST00000362638 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:164858432:164858546:1 gene:ENSG00000199508 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr2 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT075233 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_024969 // RefSeq // Homo sapiens cysteine-serine-rich nuclear protein 3 (CSRNP3), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000342316 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:165572339:165689407:1 gene:ENSG00000178662 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000409420 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:165574109:165680194:1 gene:ENSG00000178662 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// AB063300 // GenBank // Homo sapiens TAIP-2 mRNA for TGF-beta induced apotosis protein 2, complete cds. // chr2 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// NM_001172173 // RefSeq // Homo sapiens cysteine-serine-rich nuclear protein 3 (CSRNP3), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 93 // 93 // 28 // 30 // 1 /// ENST00000314499 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:165469647:165689407:1 gene:ENSG00000178662 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 93 // 93 // 28 // 30 // 1 /// ENST00000421875 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:165469647:165679307:1 gene:ENSG00000178662 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1 /// GENSCAN00000004528 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:165476251:165679753:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0
NONHSAT075292 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_020981 // RefSeq // Homo sapiens UDP-Gal:betaGlcNAc beta 1,3-galactosyltransferase, polypeptide 1 (B3GALT1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_005246931 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens UDP-Gal:betaGlcNAc beta 1,3-galactosyltransferase, polypeptide 1 (B3GALT1), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// XM_006712819 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens UDP-Gal:betaGlcNAc beta 1,3-galactosyltransferase, polypeptide 1 (B3GALT1), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000392690 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:167868948:167874041:1 gene:ENSG00000172318 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// AF117222 // GenBank // Homo sapiens beta 1,3-galactosyltransferase polypeptide 1 (B3GALT1) mRNA, complete cds. // chr2 // 93 // 58 // 13 // 14 // 0 /// BC101545 // GenBank // Homo sapiens UDP-Gal:betaGlcNAc beta 1,3-galactosyltransferase, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:126594 IMAGE:8069051), complete cds. // chr2 // 100 // 38 // 9 // 9 // 0 /// BC104813 // GenBank // Homo sapiens UDP-Gal:betaGlcNAc beta 1,3-galactosyltransferase, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:132473 IMAGE:8143816), complete cds. // chr2 // 100 // 38 // 9 // 9 // 0
ENST00000489529 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:168451324:168451606:1 gene:ENSG00000241074 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT075328 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001256126 // RefSeq // Homo sapiens ceramide synthase 6 (CERS6), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NM_203463 // RefSeq // Homo sapiens ceramide synthase 6 (CERS6), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000305747 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:168455862:168775137:1 gene:ENSG00000172292 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000392687 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:168456249:168775134:1 gene:ENSG00000172292 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC030800 // GenBank // Homo sapiens LAG1 homolog, ceramide synthase 6, mRNA (cDNA clone IMAGE:4396549), complete cds. // chr2 // 100 // 42 // 14 // 14 // 0 /// BC109284 // GenBank // Homo sapiens LAG1 homolog, ceramide synthase 6, mRNA (cDNA clone MGC:129949 IMAGE:40031838), complete cds. // chr2 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// BC109285 // GenBank // Homo sapiens LAG1 homolog, ceramide synthase 6, mRNA (cDNA clone MGC:129950 IMAGE:40031840), complete cds. // chr2 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000045627 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:168681163:168788540:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
NM_006063 // RefSeq // Homo sapiens kelch-like family member 41 (KLHL41), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000284669 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:169509702:169526262:1 gene:ENSG00000239474 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000463400 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:169514262:169521007:1 gene:ENSG00000239474 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// AF056929 // GenBank // Homo sapiens sarcosin mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// AF333387 // GenBank // Homo sapiens Kel-like protein 23 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC006534 // GenBank // Homo sapiens kelch repeat and BTB (POZ) domain containing 10, mRNA (cDNA clone MGC:1367 IMAGE:2959774), complete cds. // chr2 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000016017 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:169479459:169525696:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000513963 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:169479480:169525922:1 gene:ENSG00000251569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// AK302851 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60989 complete cds, highly similar to Bardet-Biedl syndrome 5 protein. // chr2 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
ENST00000384234 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:169727872:169728003:1 gene:ENSG00000206961 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT075367 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001294145 // RefSeq // Homo sapiens Sjogren syndrome antigen B (autoantigen La) (SSB), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 92 // 11 // 11 // 0 /// NM_003142 // RefSeq // Homo sapiens Sjogren syndrome antigen B (autoantigen La) (SSB), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000260956 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:169798812:169812064:1 gene:ENSG00000138385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000409333 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:169799279:169812064:1 gene:ENSG00000138385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 11 // 11 // 0 /// AB451228 // GenBank // Homo sapiens SSB mRNA for autoantigen La, complete cds, clone: FLJ08015AAAN. // chr2 // 100 // 92 // 11 // 11 // 0 /// BC001289 // GenBank // Homo sapiens Sjogren syndrome antigen B (autoantigen La), mRNA (cDNA clone MGC:5194 IMAGE:3454454), complete cds. // chr2 // 100 // 92 // 11 // 11 // 0 /// BC020818 // GenBank // Homo sapiens Sjogren syndrome antigen B (autoantigen La), mRNA (cDNA clone MGC:23872 IMAGE:4338551), complete cds. // chr2 // 100 // 92 // 11 // 11 // 0 /// BT009862 // GenBank // Homo sapiens Sjogren syndrome antigen B (autoantigen La) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 92 // 11 // 11 // 0 /// J04205 // GenBank // Human La protein mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 92 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000016022 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:169800961:169811756:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 11 // 11 // 0
NM_001003845 // RefSeq // Homo sapiens Sp5 transcription factor (SP5), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_005246542 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens Sp5 transcription factor (SP5), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000375281 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:170715351:170718078:1 gene:ENSG00000204335 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB096175 // GenBank // Homo sapiens Sp5 mRNA for trans-acting transcription factor 5, complete cds. // chr2 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC069026 // GenBank HTC // Homo sapiens Sp5 transcription factor, mRNA (cDNA clone IMAGE:6267944), with apparent retained intron. // chr2 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000015226 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:170711752:170717404:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
ENST00000461070 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:170751805:170752788:1 gene:ENSG00000128692 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000015220 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:170744386:170752788:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
ENST00000410577 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:170783167:170783271:1 gene:ENSG00000222509 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT075429 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000458863 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:172691299:172691402:1 gene:ENSG00000239041 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT075520 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000461543 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:174043008:174043880:1 gene:ENSG00000235414 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000013359 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:174043107:174071155:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0
ENST00000313760 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:174501952:174502312:1 gene:ENSG00000179997 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000021724 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:174501952:174523625:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0
NONHSAT075589 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000390865 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:175022214:175022319:1 gene:ENSG00000212167 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT075591 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000362957 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:175029769:175029877:1 gene:ENSG00000199827 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT075592 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_000523 // RefSeq // Homo sapiens homeobox D13 (HOXD13), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000392539 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:2:176092891:176095938:1 gene:ENSG00000128714 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000040950 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:176092915:176094730:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0
NM_021193 // RefSeq // Homo sapiens homeobox D12 (HOXD12), mRNA. // chr2 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// ENST00000404162 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:2:176099802:176100760:1 gene:ENSG00000170178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000406506 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:176099730:176101193:1 gene:ENSG00000170178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// BC121103 // GenBank // Homo sapiens homeobox D12, mRNA (cDNA clone MGC:150397 IMAGE:40120251), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC121104 // GenBank // Homo sapiens homeobox D12, mRNA (cDNA clone MGC:150398 IMAGE:40120253), complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000040944 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:176099386:176100760:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_021192 // RefSeq // Homo sapiens homeobox D11 (HOXD11), mRNA. // chr2 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// ENST00000249504 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:176107286:176109588:1 gene:ENSG00000128713 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// AK309681 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99722. // chr2 // 88 // 53 // 15 // 17 // 0 /// BC109394 // GenBank // Homo sapiens homeobox D11, mRNA (cDNA clone IMAGE:40068657), complete cds. // chr2 // 94 // 50 // 15 // 16 // 0 /// ENST00000498438 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:176104216:176109754:1 gene:ENSG00000128713 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 53 // 53 // 17 // 32 // 1 /// ENST00000490088 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:176108790:176119394:1 gene:ENSG00000128710 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1 /// ENST00000549469 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:176108877:176119243:1 gene:ENSG00000128710 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1 /// ENST00000619244 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:176107356:176109243:1 gene:ENSG00000128713 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 94 // 50 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000040947 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:176107356:176109142:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT075623 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 53 // 53 // 17 // 32 // 1 /// NONHSAT075625 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1 /// NONHSAT075626 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1
NM_002148 // RefSeq // Homo sapiens homeobox D10 (HOXD10), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000249501 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:176116579:176119942:1 gene:ENSG00000128710 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC069619 // GenBank // Homo sapiens homeobox D10, mRNA (cDNA clone MGC:97208 IMAGE:7262455), complete cds. // chr2 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// BC074760 // GenBank // Homo sapiens homeobox D10, mRNA (cDNA clone MGC:103837 IMAGE:30915219), complete cds. // chr2 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000490088 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:176108790:176119394:1 gene:ENSG00000128710 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1 /// ENST00000549469 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:176108877:176119243:1 gene:ENSG00000128710 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1 /// AK309451 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99492. // chr2 // 46 // 46 // 11 // 24 // 1 /// GENSCAN00000040937 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:176116960:176119231:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT075625 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1 /// NONHSAT075626 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1
NM_014213 // RefSeq // Homo sapiens homeobox D9 (HOXD9), mRNA. // chr2 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000249499 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:176122720:176124937:1 gene:ENSG00000128709 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// BC044855 // GenBank // Homo sapiens homeobox D9, mRNA (cDNA clone MGC:34365 IMAGE:5191006), complete cds. // chr2 // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// ENST00000613849 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:176122763:176124244:1 gene:ENSG00000128709 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000040945 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:176122799:176126738:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 65 // 65 // 22 // 34 // 1
NM_001199746 // RefSeq // Homo sapiens homeobox D8 (HOXD8), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NM_019558 // RefSeq // Homo sapiens homeobox D8 (HOXD8), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000313173 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:176129740:176132029:1 gene:ENSG00000175879 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000450510 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:176130357:176132000:1 gene:ENSG00000175879 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 70 // 14 // 14 // 0 /// BC038709 // GenBank // Homo sapiens homeobox D8, mRNA (cDNA clone MGC:24105 IMAGE:4614350), complete cds. // chr2 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// BC090853 // GenBank // Homo sapiens homeobox D8, mRNA (cDNA clone MGC:102704 IMAGE:6180525), complete cds. // chr2 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// NM_001199747 // RefSeq // Homo sapiens homeobox D8 (HOXD8), transcript variant 3, mRNA. // chr2 // 50 // 50 // 10 // 20 // 1 /// ENST00000429017 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:176129694:176132695:1 gene:ENSG00000175879 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 50 // 50 // 10 // 20 // 1 /// ENST00000544999 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:2:176130022:176132100:1 gene:ENSG00000175879 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 50 // 50 // 10 // 20 // 1
NR_029609 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 10b (MIR10B), microRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000385011 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:176150303:176150412:1 gene:ENSG00000207744 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-10b // miRBase Micro RNA Database // MI0000267 Homo sapiens miR-10b stem-loop // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT075632 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_014621 // RefSeq // Homo sapiens homeobox D4 (HOXD4), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000306324 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:176151222:176153226:1 gene:ENSG00000170166 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000468418 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:176151085:176173097:1 gene:ENSG00000278500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay gene:ENSG00000128652 // chr2 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC016763 // GenBank // Homo sapiens homeobox D4, mRNA (cDNA clone MGC:22628 IMAGE:4068219), complete cds. // chr2 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// BC074797 // GenBank // Homo sapiens homeobox D4, mRNA (cDNA clone MGC:103906 IMAGE:30915295), complete cds. // chr2 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// X04706 // GenBank // Human homeobox gene (clone HHO.c13). // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AK311735 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ18777. // chr2 // 58 // 58 // 18 // 31 // 1 /// XM_005246514 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens homeobox D4 (HOXD4), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1 /// GENSCAN00000040952 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:176151652:176153082:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 81 // 24 // 25 // 0
NM_006898 // RefSeq // Homo sapiens homeobox D3 (HOXD3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_005246511 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens homeobox D3 (HOXD3), transcript variant X4, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000249440 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:176164077:176173102:1 gene:ENSG00000128652 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000410016 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:176160891:176173085:1 gene:ENSG00000128652 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000468418 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:176151085:176173097:1 gene:ENSG00000278500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay gene:ENSG00000128652 // chr2 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC005124 // GenBank // Homo sapiens homeobox D3, mRNA (cDNA clone MGC:10470 IMAGE:3936607), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC008789 // GenBank // Homo sapiens homeobox D3, mRNA (cDNA clone MGC:3852 IMAGE:3628279), complete cds. // chr2 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000432796 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:176136957:176169415:1 gene:ENSG00000128652 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 73 // 35 // 8 // 11 // 0 /// GENSCAN00000040951 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:176169163:176172274:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0
NM_024501 // RefSeq // Homo sapiens homeobox D1 (HOXD1), mRNA. // chr2 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// XM_005246507 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens homeobox D1 (HOXD1), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 96 // 79 // 25 // 26 // 0 /// ENST00000331462 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:176188579:176190907:1 gene:ENSG00000128645 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// AF241528 // GenBank // Homo sapiens homeobox-containing transcripton factor HOXD1 (HOXD1) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// BC014477 // GenBank // Homo sapiens homeobox D1, mRNA (cDNA clone MGC:23144 IMAGE:4869019), complete cds. // chr2 // 97 // 88 // 28 // 29 // 0 /// BC028190 // GenBank // Homo sapiens homeobox D1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5171360), partial cds. // chr2 // 100 // 61 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000040949 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:176178147:176190142:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0
ENST00000515937 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:177138699:177138797:1 gene:ENSG00000251746 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr2 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// NONHSAT075692 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0
ENST00000364232 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:177194983:177195095:1 gene:ENSG00000201102 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT075695 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_003659 // RefSeq // Homo sapiens alkylglycerone phosphate synthase (AGPS), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENST00000264167 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:177392644:177543836:1 gene:ENSG00000018510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// AK296239 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51873 complete cds, highly similar to Alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, peroxisomal precursor (EC 2.5.1.26). // chr2 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// AK309714 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99755. // chr2 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// AK316240 // GenBank // Homo sapiens cDNA, FLJ79139 complete cds, highly similar to Alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, peroxisomal precursor (EC 2.5.1.26). // chr2 // 88 // 60 // 23 // 26 // 0 /// AY544121 // GenBank // Homo sapiens aging-associated protein 5 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// BC141820 // GenBank // Homo sapiens alkylglycerone phosphate synthase, mRNA (cDNA clone MGC:164922 IMAGE:40148148), complete cds. // chr2 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000409888 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:177392768:177538418:1 gene:ENSG00000018510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 23 // 23 // 10 // 43 // 1 /// GENSCAN00000014776 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:177413963:177541509:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 72 // 31 // 31 // 0 /// AK225439 // GenBank // Homo sapiens mRNA for alkylglycerone phosphate synthase precursor variant, clone: HRT02684. // chr2 // 100 // 65 // 28 // 28 // 0
ENST00000384061 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:178038902:178039004:1 gene:ENSG00000206788 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT075733 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_152945 // RefSeq // Homo sapiens RNA binding motif protein 45 (RBM45), mRNA. // chr2 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000286070 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:178112455:178129656:1 gene:ENSG00000155636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000424000 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:178112424:178129656:1 gene:ENSG00000155636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000493048 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:178121004:178124290:1 gene:ENSG00000155636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// AB036991 // GenBank // Homo sapiens drb1 mRNA for developmentally regulated RNA-binding protein 1, complete cds. // chr2 // 96 // 72 // 22 // 23 // 0 /// AF526533 // GenBank // Homo sapiens putative RNA binding protein RB-1 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC037837 // GenBank HTC // Homo sapiens RNA binding motif protein 45, mRNA (cDNA clone IMAGE:4813419), with apparent retained intron. // chr2 // 100 // 28 // 9 // 9 // 0 /// BC066549 // GenBank // Homo sapiens RNA binding motif protein 45, mRNA (cDNA clone MGC:70459 IMAGE:5748065), complete cds. // chr2 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000616198 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:178112455:178129653:1 gene:ENSG00000155636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014782 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:178084633:178126176:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT075736 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0
ENST00000411164 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:178142548:178142651:1 gene:ENSG00000223096 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT075738 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_019091 // RefSeq // Homo sapiens pleckstrin homology domain containing, family A (phosphoinositide binding specific) member 3 (PLEKHA3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000234453 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:178480468:178516462:1 gene:ENSG00000116095 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000421187 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:178495619:178503961:1 gene:ENSG00000116095 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0 /// AF286162 // GenBank // Homo sapiens Phosphoinositol 4-phosphate Adaptor Protein-1 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC044567 // GenBank // Homo sapiens pleckstrin homology domain containing, family A (phosphoinositide binding specific) member 3, mRNA (cDNA clone MGC:57118 IMAGE:5262097), complete cds. // chr2 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// DQ786259 // GenBank // Homo sapiens clone HLS_IMAGE_287618 mRNA sequence. // chr2 // 57 // 88 // 4 // 7 // 0
ENST00000410486 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:182048822:182048905:1 gene:ENSG00000222418 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr2 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONHSAT075898 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
ENST00000485107 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:182314284:182314544:1 gene:ENSG00000242121 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT075907 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENST00000391102 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:182828124:182828221:1 gene:ENSG00000212404 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT075922 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENST00000384449 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:182873841:182873947:1 gene:ENSG00000207178 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 94 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT075923 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 94 // 15 // 15 // 0
NM_194250 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 804A (ZNF804A), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000302277 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:184598366:184939492:1 gene:ENSG00000170396 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AK295280 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56984 complete cds. // chr2 // 100 // 48 // 16 // 16 // 0 /// BC136602 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 804A, mRNA (cDNA clone MGC:168215 IMAGE:9020592), complete cds. // chr2 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// BC150198 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 804A, mRNA (cDNA clone MGC:165030 IMAGE:40148778), complete cds. // chr2 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000613975 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:184866365:184939489:1 gene:ENSG00000170396 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046311 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:184597302:184946902:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 91 // 70 // 21 // 23 // 0
ENST00000391279 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:185661774:185661906:1 gene:ENSG00000212581 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr2 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// NONHSAT075964 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0
ENST00000429412 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:185745540:185766549:1 gene:ENSG00000188738 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 58 // 26 // 26 // 0 /// AK092099 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ34780 fis, clone NT2NE2003705, weakly similar to U2 SMALL NUCLEAR RIBONUCLEOPROTEIN AUXILIARY FACTOR 35 KDA SUBUNIT RELATED-PROTEIN 2. // chr2 // 96 // 58 // 25 // 26 // 0 /// NM_173651 // RefSeq // Homo sapiens fibrous sheath interacting protein 2 (FSIP2), mRNA. // chr2 // 93 // 93 // 42 // 45 // 1 /// ENST00000343098 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:185738628:185833289:1 gene:ENSG00000188738 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 93 // 93 // 42 // 45 // 1 /// ENST00000424728 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:185738895:185833290:1 gene:ENSG00000188738 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 93 // 93 // 42 // 45 // 1 /// GENSCAN00000041478 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:185672914:185896781:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 60 // 60 // 27 // 45 // 1
NM_173651 // RefSeq // Homo sapiens fibrous sheath interacting protein 2 (FSIP2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000343098 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:185738628:185833289:1 gene:ENSG00000188738 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000415915 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:185794618:185833289:1 gene:ENSG00000188738 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000424728 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:185738895:185833290:1 gene:ENSG00000188738 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000041478 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:185672914:185896781:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_173651 // RefSeq // Homo sapiens fibrous sheath interacting protein 2 (FSIP2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000343098 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:185738628:185833289:1 gene:ENSG00000188738 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000424728 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:185738895:185833290:1 gene:ENSG00000188738 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000415915 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:185794618:185833289:1 gene:ENSG00000188738 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 41 // 41 // 14 // 34 // 1 /// ENST00000611759 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:185806082:185833289:1 gene:ENSG00000188738 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000041478 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:185672914:185896781:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0
NM_177454 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 171, member B (FAM171B), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000304698 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:186693971:186765965:1 gene:ENSG00000144369 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB075826 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1946 protein. // chr2 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// AK289737 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77486 complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC060872 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 171, member B, mRNA (cDNA clone MGC:71825 IMAGE:30347998), complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENST00000612606 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:186694080:186751257:1 gene:ENSG00000144369 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000033363 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:186694174:186762823:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
NM_000090 // RefSeq // Homo sapiens collagen, type III, alpha 1 (COL3A1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 63 // 63 // 0 /// ENST00000304636 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:188974320:189012746:1 gene:ENSG00000168542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 63 // 63 // 0 /// ENST00000317840 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:188974386:189012051:1 gene:ENSG00000168542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 76 // 48 // 48 // 0 /// BC028178 // GenBank // Homo sapiens collagen, type III, alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:39848 IMAGE:5405119), complete cds. // chr2 // 100 // 76 // 48 // 48 // 0 /// ENST00000487010 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:189008302:189012048:1 gene:ENSG00000168542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 16 // 16 // 10 // 63 // 1 /// AK091853 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ34534 fis, clone HLUNG2008333, highly similar to Alpha1 (III) collagen. // chr2 // 16 // 16 // 10 // 63 // 1 /// GENSCAN00000028108 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:188899960:189011774:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 98 // 76 // 47 // 48 // 0
NM_144708 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin and armadillo repeat containing (ANKAR), mRNA. // chr2 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000313581 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:189676427:189746649:1 gene:ENSG00000151687 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000433782 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:189675985:189746644:1 gene:ENSG00000151687 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000441800 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:189674290:189761193:1 gene:ENSG00000151687 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 61 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000520309 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:189675985:189746644:1 gene:ENSG00000151687 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0 /// BC037215 // GenBank // Homo sapiens hypothetical protein FLJ25415, mRNA (cDNA clone IMAGE:4827498). // chr2 // 100 // 61 // 20 // 20 // 0 /// BC044907 // GenBank // Homo sapiens ankyrin and armadillo repeat containing, mRNA (cDNA clone MGC:42906 IMAGE:4836761), complete cds. // chr2 // 100 // 61 // 20 // 20 // 0 /// BC047413 // GenBank // Homo sapiens ankyrin and armadillo repeat containing, mRNA (cDNA clone IMAGE:5273473), complete cds. // chr2 // 96 // 82 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000015309 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:189676491:189743213:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0
ENST00000411317 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:189753464:189753559:1 gene:ENSG00000223249 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001042519 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 88 (C2orf88), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NM_001042520 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 88 (C2orf88), transcript variant 3, mRNA. // chr2 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// NM_001042521 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 88 (C2orf88), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// NM_032321 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 88 (C2orf88), transcript variant 4, mRNA. // chr2 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000340623 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:190180863:190203484:1 gene:ENSG00000187699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000409870 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:190180482:190200209:1 gene:ENSG00000187699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// AK075168 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ90687 fis, clone PLACE1006093. // chr2 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000396974 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:190137760:190200479:1 gene:ENSG00000187699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// ENST00000443551 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:190180955:190200214:1 gene:ENSG00000187699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_017694 // RefSeq // Homo sapiens major facilitator superfamily domain containing 6 (MFSD6), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000281416 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:190435895:190502315:1 gene:ENSG00000151690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000392328 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:190408355:190502315:1 gene:ENSG00000151690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000434582 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:2:190437424:190502113:1 gene:ENSG00000151690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// AB472299 // GenBank // Homo sapiens hMMR2 mRNA for macrophage MHC receptor 2, complete cds. // chr2 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// AK302647 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52807 complete cds. // chr2 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// AK302753 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52808 complete cds. // chr2 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// BC050537 // GenBank // Homo sapiens major facilitator superfamily domain containing 6, mRNA (cDNA clone MGC:57598 IMAGE:6204874), complete cds. // chr2 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000003988 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:190436030:190500218:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
ENST00000384671 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:191121950:191122056:1 gene:ENSG00000207402 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT076113 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
ENST00000516321 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:191370938:191371044:1 gene:ENSG00000252130 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT076118 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000365336 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:195514036:195514142:1 gene:ENSG00000202206 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 90 // 100 // 19 // 21 // 0 /// NONHSAT076175 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 90 // 100 // 19 // 21 // 0
ENST00000616437 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:196289409:196289707:1 gene:ENSG00000276200 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT076187 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENST00000365564 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:197404718:197404854:1 gene:ENSG00000202434 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT076220 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000384109 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:197447745:197447851:1 gene:ENSG00000206836 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 93 // 13 // 13 // 0 /// NONHSAT076224 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 93 // 13 // 13 // 0
NM_025147 // RefSeq // Homo sapiens coenzyme Q10 homolog B (S. cerevisiae) (COQ10B), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006712776 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens coenzyme Q10 homolog B (S. cerevisiae) (COQ10B), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000263960 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:197453423:197475308:1 gene:ENSG00000115520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000409010 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:2:197453794:197474410:1 gene:ENSG00000115520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000409398 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:2:197453493:197474168:1 gene:ENSG00000115520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 94 // 75 // 17 // 18 // 0 /// AK308977 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99018. // chr2 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0 /// BC022453 // GenBank // Homo sapiens coenzyme Q10 homolog B (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:26023 IMAGE:4796819), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK294093 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52258 complete cds, highly similar to Protein COQ10 B, mitochondrial precursor. // chr2 // 54 // 54 // 13 // 24 // 1
NM_002157 // RefSeq // Homo sapiens heat shock 10kDa protein 1 (HSPE1), mRNA. // chr2 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000233893 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:197499994:197503457:1 gene:ENSG00000115541 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// BC023518 // GenBank // Homo sapiens heat shock 10kDa protein 1 (chaperonin 10), mRNA (cDNA clone MGC:12734 IMAGE:4304224), complete cds. // chr2 // 100 // 77 // 10 // 10 // 0 /// U07550 // GenBank // Human chaperonin 10 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 54 // 7 // 7 // 0
NM_138395 // RefSeq // Homo sapiens methionyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (MARS2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000282276 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:197705369:197708387:1 gene:ENSG00000247626 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// AB107013 // GenBank // Homo sapiens MetRS mRNA for mitochondrial methionyl-tRNA synthetase, complete cds. // chr2 // 86 // 94 // 25 // 29 // 0 /// AK301252 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51339 complete cds, highly similar to Methionyl-tRNA synthetase, mitochondrial precursor (EC 6.1.1.10). // chr2 // 85 // 65 // 17 // 20 // 0 /// BC040934 // GenBank // Homo sapiens methionyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial, mRNA (cDNA clone IMAGE:4999520), complete cds. // chr2 // 92 // 77 // 22 // 24 // 0 /// BC126294 // GenBank // Homo sapiens methionyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:161572 IMAGE:8992010), complete cds. // chr2 // 95 // 61 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000046669 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:197705406:197707187:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0
NM_006226 // RefSeq // Homo sapiens phospholipase C-like 1 (PLCL1), mRNA. // chr2 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000428675 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:197804702:198148401:1 gene:ENSG00000115896 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000435320 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:197804702:198149884:1 gene:ENSG00000115896 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000437704 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:198083749:198149884:1 gene:ENSG00000115896 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000487695 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:197810258:198146934:1 gene:ENSG00000115896 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// AK302673 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59788 complete cds, highly similar to Homo sapiens phospholipase C-like 1 (PLCL1), mRNA. // chr2 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// BC101531 // GenBank // Homo sapiens phospholipase C-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:126580 IMAGE:8069037), complete cds. // chr2 // 95 // 69 // 19 // 20 // 0 /// BC111985 // GenBank // Homo sapiens phospholipase C-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:138190 IMAGE:8327453), complete cds. // chr2 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// D42108 // GenBank // Homo sapiens mRNA for phospholipase C, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000046667 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:198050022:198273451:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0
NR_026830 // RefSeq // Homo sapiens SATB2 antisense RNA 1 (SATB2-AS1), long non-coding RNA. // chr2 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000416200 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:199469896:199476935:1 gene:ENSG00000225953 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000450728 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:199468098:199472756:1 gene:ENSG00000225953 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr2 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// AK056625 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ32063 fis, clone OCBBF1000067. // chr2 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// AK290476 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77938 complete cds. // chr2 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// AK291368 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77853 complete cds. // chr2 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONHSAT076256 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr2 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT076258 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_153689 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 69 (C2orf69), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000319974 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:199911256:199928273:1 gene:ENSG00000178074 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC036456 // GenBank // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 69, mRNA (cDNA clone MGC:33409 IMAGE:4825616), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000491721 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:199911306:199955935:1 gene:ENSG00000178074 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// AK303210 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58443 complete cds. // chr2 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// GENSCAN00000008964 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:199911439:199925886:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NONHSAT076297 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr2 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
ENST00000364779 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:200373175:200373269:1 gene:ENSG00000201649 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT076307 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001160033 // RefSeq // Homo sapiens shugoshin-like 2 (S. pombe) (SGOL2), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// NM_001160046 // RefSeq // Homo sapiens shugoshin-like 2 (S. pombe) (SGOL2), transcript variant 3, mRNA. // chr2 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NM_152524 // RefSeq // Homo sapiens shugoshin-like 2 (S. pombe) (SGOL2), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000357799 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:200526157:200583782:1 gene:ENSG00000163535 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000409203 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:200526167:200570142:1 gene:ENSG00000163535 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// AK302457 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61724 complete cds, highly similar to Shugoshin-like 2. // chr2 // 92 // 81 // 23 // 25 // 0 /// AY094614 // GenBank // Homo sapiens tripin (TRIPIN) mRNA, complete cds. // chr2 // 95 // 71 // 21 // 22 // 0 /// BC035764 // GenBank // Homo sapiens shugoshin-like 2 (S. pombe), mRNA (cDNA clone IMAGE:5551931), partial cds. // chr2 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0 /// BC048349 // GenBank // Homo sapiens shugoshin-like 2 (S. pombe), mRNA (cDNA clone IMAGE:5555637), complete cds. // chr2 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// BC092412 // GenBank // Homo sapiens shugoshin-like 2 (S. pombe), mRNA (cDNA clone MGC:102910 IMAGE:30383194), complete cds. // chr2 // 96 // 84 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000036290 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:200525823:200788819:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 90 // 68 // 19 // 21 // 0
NM_001159 // RefSeq // Homo sapiens aldehyde oxidase 1 (AOX1), mRNA. // chr2 // 97 // 100 // 38 // 39 // 0 /// ENST00000374700 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:200585868:200671495:1 gene:ENSG00000138356 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000465297 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:200609220:200670872:1 gene:ENSG00000138356 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 62 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000485106 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:200609243:200671136:1 gene:ENSG00000138356 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 62 // 24 // 24 // 0 /// AB046692 // GenBank // Homo sapiens hAO mRNA for aldeyde oxidase, complete cds. // chr2 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// AK297930 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51005 complete cds, highly similar to Aldehyde oxidase (EC 1.2.3.1). // chr2 // 100 // 62 // 24 // 24 // 0 /// AK301052 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51111 partial cds, highly similar to Aldehyde oxidase (EC 1.2.3.1). // chr2 // 100 // 62 // 24 // 24 // 0 /// BC117179 // GenBank // Homo sapiens aldehyde oxidase 1, mRNA (cDNA clone MGC:150788 IMAGE:40125730), complete cds. // chr2 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// BC117181 // GenBank // Homo sapiens aldehyde oxidase 1, mRNA (cDNA clone MGC:150790 IMAGE:40125732), complete cds. // chr2 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// L11005 // GenBank // Human aldehyde oxidase (hAOX) mRNA, complete cds. // chr2 // 90 // 100 // 35 // 39 // 0 /// GENSCAN00000036290 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:200525823:200788819:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 82 // 32 // 32 // 0
ENST00000364867 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:200775584:200775750:1 gene:ENSG00000201737 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT076320 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000517107 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:200899020:200899121:1 gene:ENSG00000252916 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK125652 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ43664 fis, clone SYNOV4006256. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT076349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001257102 // RefSeq // Homo sapiens NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 beta subcomplex, 3, 12kDa (NDUFB3), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NM_002491 // RefSeq // Homo sapiens NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 beta subcomplex, 3, 12kDa (NDUFB3), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000237889 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:201071739:201085750:1 gene:ENSG00000119013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000433898 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:201072008:201085744:1 gene:ENSG00000119013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 59 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000454214 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:201072030:201085750:1 gene:ENSG00000119013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 59 // 10 // 10 // 0 /// AF035839 // GenBank // Homo sapiens NADH:ubiquinone oxidoreductase B12 subunit mRNA, nuclear gene encoding mitochondrial protein, complete cds. // chr2 // 92 // 71 // 11 // 12 // 0 /// AF047183 // GenBank // Homo sapiens NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit CI-B12 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC018183 // GenBank // Homo sapiens NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 beta subcomplex, 3, 12kDa, mRNA (cDNA clone MGC:9039 IMAGE:3881592), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// XM_006712544 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 beta subcomplex, 3, 12kDa (NDUFB3), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 59 // 59 // 10 // 17 // 1
ENST00000516339 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:201079842:201079944:1 gene:ENSG00000252148 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT076361 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000621081 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:201097744:201098091:1 gene:ENSG00000273975 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_001127183 // RefSeq // Homo sapiens CASP8 and FADD-like apoptosis regulator (CFLAR), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NM_001202515 // RefSeq // Homo sapiens CASP8 and FADD-like apoptosis regulator (CFLAR), transcript variant 4, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NM_001202516 // RefSeq // Homo sapiens CASP8 and FADD-like apoptosis regulator (CFLAR), transcript variant 5, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NM_001202517 // RefSeq // Homo sapiens CASP8 and FADD-like apoptosis regulator (CFLAR), transcript variant 6, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NM_001202518 // RefSeq // Homo sapiens CASP8 and FADD-like apoptosis regulator (CFLAR), transcript variant 7, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NM_001202519 // RefSeq // Homo sapiens CASP8 and FADD-like apoptosis regulator (CFLAR), transcript variant 8, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NM_003879 // RefSeq // Homo sapiens CASP8 and FADD-like apoptosis regulator (CFLAR), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000309955 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:201116104:201176687:1 gene:ENSG00000003402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
ENST00000365138 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:201423513:201423604:1 gene:ENSG00000202008 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT076397 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000411040 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:201646716:201646820:1 gene:ENSG00000222972 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONHSAT076418 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
ENST00000390882 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:201927439:201927543:1 gene:ENSG00000212184 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT076430 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_003507 // RefSeq // Homo sapiens frizzled class receptor 7 (FZD7), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000286201 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:202034587:202038445:1 gene:ENSG00000155760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AB017365 // GenBank // Homo sapiens mRNA for frizzled-7, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC015915 // GenBank // Homo sapiens frizzled homolog 7 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:20119 IMAGE:4549389), complete cds. // chr2 // 96 // 75 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000046035 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:201971813:202197050:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
NM_001277372 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized protein KIAA2012 (LOC100652824), mRNA. // chr2 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// XM_006712171 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens uncharacterized protein KIAA2012 (LOC100652824), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000409515 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:202073289:202154756:1 gene:ENSG00000182329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000459709 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:202073289:202109664:1 gene:ENSG00000182329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000541917 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:202073255:202197163:1 gene:ENSG00000182329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// AK096380 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39061 fis, clone NT2RP7013764. // chr2 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// AK295603 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52575 complete cds. // chr2 // 93 // 83 // 28 // 30 // 0 /// AK297413 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52086 complete cds. // chr2 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000046035 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:201971813:202197050:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0
NONHSAT076434 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000469462 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:202135716:202197862:1 gene:ENSG00000182329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB095932 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA2012 protein. // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC118982 // GenBank // Homo sapiens KIAA2012 protein, mRNA (cDNA clone MGC:141748 IMAGE:40026312), complete cds. // chr2 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NM_001277372 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized protein KIAA2012 (LOC100652824), mRNA. // chr2 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// ENST00000541917 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:202073255:202197163:1 gene:ENSG00000182329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// XM_006712171 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens uncharacterized protein KIAA2012 (LOC100652824), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// ENST00000498697 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:2:202100435:202194351:1 gene:ENSG00000182329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// GENSCAN00000046035 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:201971813:202197050:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
ENST00000581238 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:202333439:202333728:1 gene:ENSG00000264275 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT076451 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001204 // RefSeq // Homo sapiens bone morphogenetic protein receptor, type II (serine/threonine kinase) (BMPR2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000374574 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:2:202377434:202567751:1 gene:ENSG00000204217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000374580 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:202376936:202567751:1 gene:ENSG00000204217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK292430 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76945 complete cds, highly similar to Homo sapiens bone morphogenetic protein receptor, type II(serine/threonine kinase) (BMPR2), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 95 // 79 // 18 // 19 // 0 /// BC052985 // GenBank // Homo sapiens bone morphogenetic protein receptor, type II (serine/threonine kinase), mRNA (cDNA clone MGC:60135 IMAGE:6149698), complete cds. // chr2 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// D50516 // GenBank // Homo sapiens mRNA for type II receptor for bone morphogenetic protein-4, complete cds. // chr2 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// U20165 // GenBank // Human type II serine/threonine kinase receptor mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// Z48923 // GenBank // H.sapiens mRNA for BMPR-II. // chr2 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000049484 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:202436846:202559946:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// U25110 // GenBank // Human bone morphogenic protein type II receptor mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0
NM_173511 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 117, member B (FAM117B), mRNA. // chr2 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000392238 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:202635188:202769757:1 gene:ENSG00000138439 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000481658 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:202635489:202725232:1 gene:ENSG00000138439 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// AB053315 // GenBank // Homo sapiens ALS2CR13 mRNA, partial cds. // chr2 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// BC106906 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 117, member B, mRNA (cDNA clone MGC:125968 IMAGE:40031780), complete cds. // chr2 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0 /// BC106907 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 117, member B, mRNA (cDNA clone MGC:125969 IMAGE:40031781), complete cds. // chr2 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000049489 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:202641189:202765764:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT076468 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0
NM_001114132 // RefSeq // Homo sapiens neurobeachin-like 1 (NBEAL1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000449802 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:203014879:203219874:1 gene:ENSG00000144426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000478884 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:203014925:203062488:1 gene:ENSG00000144426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 60 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000497505 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:203014879:203086212:1 gene:ENSG00000144426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AB053318 // GenBank // Homo sapiens ALS2CR16 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 50 // 10 // 10 // 0 /// BC132950 // GenBank // Homo sapiens neurobeachin-like 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:40146972), complete cds. // chr2 // 100 // 60 // 12 // 12 // 0 /// BC137214 // GenBank // Homo sapiens neurobeachin-like 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:9021211), complete cds. // chr2 // 100 // 60 // 12 // 12 // 0 /// AK130065 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ26555 fis, clone LNF01917. // chr2 // 60 // 60 // 12 // 20 // 1 /// NONHSAT076477 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 100 // 50 // 10 // 10 // 0 /// AK096293 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ38974 fis, clone NT2RI2003667. // chr2 // 60 // 60 // 12 // 20 // 1
NM_001114132 // RefSeq // Homo sapiens neurobeachin-like 1 (NBEAL1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_005246788 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens neurobeachin-like 1 (NBEAL1), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000414576 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:203167310:203217464:1 gene:ENSG00000144426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 53 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000449802 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:203014879:203219874:1 gene:ENSG00000144426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AY172970 // GenBank // Homo sapiens beach protein mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 84 // 26 // 27 // 0 /// BX647133 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686L12166 (from clone DKFZp686L12166). // chr2 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1 /// GENSCAN00000049482 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:203083252:203191277:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 59 // 59 // 19 // 32 // 1 /// GENSCAN00000049479 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:203199350:203292408:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
ENST00000384243 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:203782037:203782143:1 gene:ENSG00000206970 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT076499 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_012092 // RefSeq // Homo sapiens inducible T-cell co-stimulator (ICOS), mRNA. // chr2 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000316386 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:203936748:203961577:1 gene:ENSG00000163600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000435193 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:203936780:203961577:1 gene:ENSG00000163600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// AB023135 // GenBank // Homo sapiens mRNA for activation-inducible lymphocyte immunomediatory molecule AILIM, complete cds. // chr2 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// BC028006 // GenBank // Homo sapiens inducible T-cell co-stimulator, mRNA (cDNA clone MGC:39850 IMAGE:5212706), complete cds. // chr2 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// BC028210 // GenBank // Homo sapiens inducible T-cell co-stimulator, mRNA (cDNA clone MGC:40066 IMAGE:5215237), complete cds. // chr2 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
ENST00000272849 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:205683291:205779714:1 gene:ENSG00000118257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF119893 // GenBank HTC // Homo sapiens PRO2714 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// AK024680 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ21027 fis, clone CAE07110. // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONHSAT076526 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000365005 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:205900630:205900958:1 gene:ENSG00000201875 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT076529 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000384656 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:206025593:206025697:1 gene:ENSG00000207386 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT076534 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000434035 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:206040432:206040845:1 gene:ENSG00000237041 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000049240 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:206040432:206040845:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NR_002589 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 51 (SNORD51), small nucleolar RNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000384320 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:206161878:206161957:1 gene:ENSG00000207047 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT076548 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_002590 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 41 (SNORA41), small nucleolar RNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000384675 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:206162228:206162359:1 gene:ENSG00000207406 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000482103 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:206162228:206162928:1 gene:ENSG00000114942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT076551 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000410564 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:206221315:206221634:1 gene:ENSG00000222496 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT076552 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001285549 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, DBF-type containing 2 (ZDBF2), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NM_020923 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, DBF-type containing 2 (ZDBF2), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000374423 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:206274663:206314428:1 gene:ENSG00000204186 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// AB775780 // GenBank // Homo sapiens ZDBF2 mRNA for zinc finger DBF-type containing 2 vesion 2, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// AB775781 // GenBank // Homo sapiens ZDBF2 mRNA for zinc finger DBF-type containing 2 vesion 1, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000611847 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:206292063:206314424:1 gene:ENSG00000204186 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 50 // 6 // 6 // 0
NM_003812 // RefSeq // Homo sapiens ADAM metallopeptidase domain 23 (ADAM23), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000264377 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:206443539:206621130:1 gene:ENSG00000114948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000374415 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:206443867:206617842:1 gene:ENSG00000114948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// AB009672 // GenBank // Homo sapiens mRNA for MDC3, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AK296844 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53382 complete cds, highly similar to ADAM 23 precursor (A disintegrin and metalloproteinase domain 23). // chr2 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// BC132763 // GenBank // Homo sapiens ADAM metallopeptidase domain 23, mRNA (cDNA clone MGC:164394 IMAGE:40146785), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC132765 // GenBank // Homo sapiens ADAM metallopeptidase domain 23, mRNA (cDNA clone MGC:164396 IMAGE:40146787), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000014031 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:206443867:206596263:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0
NM_173077 // RefSeq // Homo sapiens carboxypeptidase O (CPO), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000272852 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:206939554:206969474:1 gene:ENSG00000144410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC112076 // GenBank // Homo sapiens carboxypeptidase O, mRNA (cDNA clone MGC:138281 IMAGE:8327544), complete cds. // chr2 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// BC112078 // GenBank // Homo sapiens carboxypeptidase O, mRNA (cDNA clone MGC:138283 IMAGE:8327546), complete cds. // chr2 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// GENSCAN00000014032 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:206939600:206969436:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
ENST00000363894 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:207687960:207688059:1 gene:ENSG00000200764 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT076620 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001142300 // RefSeq // Homo sapiens cyclin Y-like 1 (CCNYL1), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_152523 // RefSeq // Homo sapiens cyclin Y-like 1 (CCNYL1), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000295414 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:207711686:207756174:1 gene:ENSG00000163249 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000339882 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:207711751:207755244:1 gene:ENSG00000163249 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000392209 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:207711540:207754465:1 gene:ENSG00000163249 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000452312 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:207712100:207751114:1 gene:ENSG00000163249 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// AK095479 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ38160 fis, clone DFNES2002509. // chr2 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// BC067253 // GenBank // Homo sapiens cyclin Y-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:74564 IMAGE:6500304), complete cds. // chr2 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000029969 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:207711897:207753698:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
NM_005048 // RefSeq // Homo sapiens parathyroid hormone 2 receptor (PTH2R), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NR_073601 // RefSeq // Homo sapiens parathyroid hormone 2 receptor (PTH2R), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr2 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000272847 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:208406831:208494506:1 gene:ENSG00000144407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AK294181 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60238 complete cds, highly similar to Parathyroid hormone receptor precursor. // chr2 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0 /// AY497546 // GenBank // Homo sapiens parathyroid hormone receptor 2 precursor (PTHR2) mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0 /// BC036811 // GenBank // Homo sapiens parathyroid hormone 2 receptor, mRNA (cDNA clone MGC:46164 IMAGE:5734330), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// U25128 // GenBank // Human PTH2 parathyroid hormone receptor mRNA, complete cds. // chr2 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// ENST00000617735 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:208359714:208494029:1 gene:ENSG00000144407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000003474 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:208407044:208493659:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0
ENST00000478701 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:209771993:209796547:1 gene:ENSG00000144406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AK090815 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ33496 fis, clone BRAMY2003929. // chr2 // 90 // 100 // 28 // 31 // 0 /// BC136690 // GenBank // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 21, mRNA (cDNA clone IMAGE:9020680), complete cds. // chr2 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// BC136693 // GenBank // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 21, mRNA (cDNA clone IMAGE:9020683), complete cds. // chr2 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// NM_032504 // RefSeq // Homo sapiens unc-80 homolog (C. elegans) (UNC80), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 87 // 87 // 27 // 31 // 1 /// NM_182587 // RefSeq // Homo sapiens unc-80 homolog (C. elegans) (UNC80), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 87 // 87 // 27 // 31 // 1 /// ENST00000272845 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:209772039:209999296:1 gene:ENSG00000144406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 84 // 84 // 26 // 31 // 1 /// ENST00000439458 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:209771993:209999300:1 gene:ENSG00000144406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 87 // 87 // 27 // 31 // 1 /// GENSCAN00000010941 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:209772073:209995595:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 77 // 77 // 24 // 31 // 1
ENST00000428587 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:209808804:209809580:1 gene:ENSG00000237194 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010941 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:209772073:209995595:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
ENST00000333907 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:209959523:209982933:1 gene:ENSG00000144406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 22 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000489023 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:209829229:209970314:1 gene:ENSG00000144406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 84 // 49 // 49 // 0 /// AB058746 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1843 protein, partial cds. // chr2 // 100 // 84 // 49 // 49 // 0 /// AK027583 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ14677 fis, clone NT2RP2004095. // chr2 // 100 // 24 // 14 // 14 // 0 /// AK299022 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53903 complete cds. // chr2 // 100 // 21 // 12 // 12 // 0 /// NM_032504 // RefSeq // Homo sapiens unc-80 homolog (C. elegans) (UNC80), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 90 // 90 // 52 // 58 // 1 /// NM_182587 // RefSeq // Homo sapiens unc-80 homolog (C. elegans) (UNC80), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 90 // 90 // 52 // 58 // 1 /// ENST00000272845 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:209772039:209999296:1 gene:ENSG00000144406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 90 // 90 // 52 // 58 // 1 /// ENST00000439458 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:209771993:209999300:1 gene:ENSG00000144406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 90 // 90 // 52 // 58 // 1 /// ENST00000477924 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:209960931:209995813:1 gene:ENSG00000144406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 21 // 21 // 12 // 58 // 1 /// AK302830 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59793 complete cds. // chr2 // 21 // 21 // 12 // 58 // 1 /// GENSCAN00000010941 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:209772073:209995595:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 84 // 84 // 49 // 58 // 1
AF143882 // GenBank // Homo sapiens clone IMAGE:121214 mRNA sequence. // chr2 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// NONHSAT076676 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000362333 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:210265963:210266074:1 gene:ENSG00000199203 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT076677 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_002763 // RefSeq // Homo sapiens CPS1 intronic transcript 1 (non-protein coding) (CPS1-IT1), long non-coding RNA. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AF090897 // GenBank // Homo sapiens clone HQ0132 PRO0132 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT076682 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr2 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0
ENST00000362715 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:211535653:211535769:1 gene:ENSG00000199585 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr2 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT076686 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
ENST00000312710 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:214697727:214698059:1 gene:ENSG00000177261 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000007067 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:214629427:214698064:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT076726 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT076727 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000384544 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:214846947:214847081:1 gene:ENSG00000207274 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr2 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT076733 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0
NONHSAT076740 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK094277 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ36958 fis, clone BRACE2005881. // chr2 // 95 // 100 // 19 // 20 // 0 /// AY450391 // GenBank // Homo sapiens DNA polymerase-transactivated protein 3 (DNAPTP3) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NR_037701 // RefSeq // Homo sapiens DKFZp434H1419 (PKI55), long non-coding RNA. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000562038 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:216217045:216220192:1 gene:ENSG00000260804 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT076795 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT076791 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1 /// TCONS_00004015-XLOC_001854 // Rinn lincRNA // linc-SMARCAL1-2 chr2:+:217074539-217084905 // chr2 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1
ENST00000384573 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:216351403:216351504:1 gene:ENSG00000207303 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT076799 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_198483 // RefSeq // Homo sapiens RUN and FYVE domain containing 4 (RUFY4), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// NR_034176 // RefSeq // Homo sapiens RUN and FYVE domain containing 4 (RUFY4), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000344321 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:218070496:218090580:1 gene:ENSG00000188282 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000374155 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:218069255:218090580:1 gene:ENSG00000188282 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000457754 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:218034988:218090581:1 gene:ENSG00000188282 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000463872 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:218072871:218075720:1 gene:ENSG00000188282 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// AK131246 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ16168 fis, clone BRHIP2002722. // chr2 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// BC113712 // GenBank // Homo sapiens FLJ46536 protein, mRNA (cDNA clone MGC:142272 IMAGE:8322764), complete cds. // chr2 // 100 // 47 // 16 // 16 // 0 /// NONHSAT076883 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000049403 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:218070606:218135884:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 71 // 71 // 24 // 34 // 1
NM_198559 // RefSeq // Homo sapiens ciliogenesis associated TTC17 interacting protein (CATIP), mRNA. // chr2 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// ENST00000289388 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:218356856:218368094:1 gene:ENSG00000158428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC052750 // GenBank // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 62, mRNA (cDNA clone MGC:50811 IMAGE:5742766), complete cds. // chr2 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// ENST00000481940 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:218357703:218368099:1 gene:ENSG00000158428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// ENST00000494447 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:218365508:218368093:1 gene:ENSG00000158428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// AK098178 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ40859 fis, clone TRACH2016980. // chr2 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// GENSCAN00000044276 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:218286424:218449336:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0
NR_029500 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 26b (MIR26B), microRNA. // chr2 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// ENST00000362251 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:218402637:218402746:1 gene:ENSG00000199121 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-26b // miRBase Micro RNA Database // MI0000084 Homo sapiens miR-26b stem-loop // chr2 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// NONHSAT076921 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0
NM_007127 // RefSeq // Homo sapiens villin 1 (VIL1), mRNA. // chr2 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000248444 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:218419092:218453295:1 gene:ENSG00000127831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000392114 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:218419123:218449524:1 gene:ENSG00000127831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 63 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000440053 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:218423765:218431216:1 gene:ENSG00000127831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 51 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000454069 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:2:218419121:218428255:1 gene:ENSG00000127831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 19 // 8 // 8 // 0 /// AK300965 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57609 complete cds, highly similar to Villin-1. // chr2 // 96 // 63 // 26 // 27 // 0 /// BC017303 // GenBank // Homo sapiens villin 1, mRNA (cDNA clone MGC:29534 IMAGE:5087169), complete cds. // chr2 // 100 // 51 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000044276 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:218286424:218449336:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0
NONHSAT076932 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000362986 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:18:7995570:7995785:1 gene:ENSG00000199856 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr2 // 63 // 100 // 5 // 8 // 0 /// ENST00000384034 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:14:101145480:101145695:-1 gene:ENSG00000277754 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA gene:ENSG00000206761 // chr2 // 63 // 100 // 5 // 8 // 0 /// NONHSAT006578 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 71 // 88 // 5 // 7 // 0 /// NONHSAT040012 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 63 // 100 // 5 // 8 // 0 /// NONHSAT057163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr2 // 63 // 100 // 5 // 8 // 0
NM_001243313 // RefSeq // Homo sapiens serine/threonine kinase 36 (STK36), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// NM_015690 // RefSeq // Homo sapiens serine/threonine kinase 36 (STK36), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006712421 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens serine/threonine kinase 36 (STK36), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000295709 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:218672026:218702715:1 gene:ENSG00000163482 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000392105 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:218672069:218702709:1 gene:ENSG00000163482 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000440309 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:218672296:218702623:1 gene:ENSG00000163482 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// AF200815 // GenBank // Homo sapiens FUSED serine/threonine kinase mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// BC026158 // GenBank // Homo sapiens serine/threonine kinase 36, fused homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:26231 IMAGE:4839214), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000044297 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:218669842:218699399:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0
NM_006522 // RefSeq // Homo sapiens wingless-type MMTV integration site family, member 6 (WNT6), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000233948 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:218859821:218874233:1 gene:ENSG00000115596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000486233 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:218859965:218871739:1 gene:ENSG00000115596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 82 // 42 // 9 // 11 // 0 /// AB059570 // GenBank // Homo sapiens mRNA for WNT6, complete cds. // chr2 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// AY009401 // GenBank // Homo sapiens WNT6 precursor (WNT6) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC004329 // GenBank // Homo sapiens wingless-type MMTV integration site family, member 6, mRNA (cDNA clone MGC:10938 IMAGE:3630498), complete cds. // chr2 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// BT007456 // GenBank // Homo sapiens wingless-type MMTV integration site family, member 6 mRNA, complete cds. // chr2 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000044295 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:218857014:218873845:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_025216 // RefSeq // Homo sapiens wingless-type MMTV integration site family, member 10A (WNT10A), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000258411 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:218880363:218893931:1 gene:ENSG00000135925 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AB059569 // GenBank // Homo sapiens mRNA for WNT10A, complete cds. // chr2 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// AY009400 // GenBank // Homo sapiens WNT10a precursor (WNT10a) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC052234 // GenBank // Homo sapiens wingless-type MMTV integration site family, member 10A, mRNA (cDNA clone MGC:59695 IMAGE:5442628), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000458582 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:2:218882161:218893146:1 gene:ENSG00000135925 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// GENSCAN00000044290 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:218880996:218893271:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0
NM_003936 // RefSeq // Homo sapiens cyclin-dependent kinase 5, regulatory subunit 2 (p39) (CDK5R2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000302625 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:218959655:218962162:1 gene:ENSG00000171450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC009910 // GenBank HTC // Homo sapiens cyclin-dependent kinase 5, regulatory subunit 2 (p39), mRNA (cDNA clone IMAGE:2820025), with apparent retained intron. // chr2 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0 /// BC041771 // GenBank // Homo sapiens cyclin-dependent kinase 5, regulatory subunit 2 (p39), mRNA (cDNA clone MGC:26409 IMAGE:4818320), complete cds. // chr2 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// BT007437 // GenBank // Homo sapiens cyclin-dependent kinase 5, regulatory subunit 2 (p39) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// U34051 // GenBank // Human cyclin-dependent kinase 5 activator isoform p39i mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000044296 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:218959821:218960924:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0
ENST00000487337 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:219102434:219102719:1 gene:ENSG00000240317 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT076978 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NR_003063 // RefSeq // Homo sapiens tubulin, alpha 4b (pseudogene) (TUBA4B), non-coding RNA. // chr2 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// ENST00000486997 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:219269628:219272146:1 gene:ENSG00000243910 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr2 // 95 // 72 // 20 // 21 // 0 /// ENST00000490341 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:219253243:219272188:1 gene:ENSG00000243910 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000473885 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:219253243:219272011:1 gene:ENSG00000243910 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 79 // 79 // 23 // 29 // 1 /// ENST00000485041 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:219253243:219272011:1 gene:ENSG00000243910 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 79 // 79 // 23 // 29 // 1 /// BC121127 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:40120714, containing frame-shift errors. // chr2 // 76 // 76 // 22 // 29 // 1 /// GENSCAN00000043075 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:219270202:219271923:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 75 // 41 // 9 // 12 // 0
NM_001005209 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 198 (TMEM198), mRNA. // chr2 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000344458 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:219543663:219550579:1 gene:ENSG00000188760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000373883 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:219544023:219550595:1 gene:ENSG00000188760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000421791 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:219544006:219548020:1 gene:ENSG00000188760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000451952 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:2:219544050:219547549:1 gene:ENSG00000188760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// AK302369 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55861 complete cds. // chr2 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// BC068567 // GenBank // Homo sapiens similar to RIKEN cDNA A230078I05 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:5275321). // chr2 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// BC080573 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 198, mRNA (cDNA clone MGC:99813 IMAGE:6569597), complete cds. // chr2 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000043068 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:219544009:219549854:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
NM_002191 // RefSeq // Homo sapiens inhibin, alpha (INHA), mRNA. // chr2 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000243786 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:219572195:219575713:1 gene:ENSG00000123999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC006391 // GenBank // Homo sapiens inhibin, alpha, mRNA (cDNA clone MGC:12547 IMAGE:4126990), complete cds. // chr2 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BT006954 // GenBank // Homo sapiens inhibin, alpha mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// M13981 // GenBank // Human inhibin A-subunit mRNA, complete cds. // chr2 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0 /// GENSCAN00000043070 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:219572375:219616193:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 92 // 48 // 11 // 12 // 0 /// AK292340 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75124 complete cds, highly similar to Homo sapiens inhibin, alpha (INHA), mRNA. // chr2 // 89 // 72 // 16 // 18 // 0
ENST00000414016 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:221592441:221592861:1 gene:ENSG00000230406 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000024038 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:221592486:221592827:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0
NM_153038 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 140 (CCDC140), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000295226 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:222298147:222305217:1 gene:ENSG00000163081 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC109388 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 140, mRNA (cDNA clone MGC:133159 IMAGE:40023803), complete cds. // chr2 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
ENST00000363952 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:222404985:222405095:1 gene:ENSG00000200822 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT077124 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_152386 // RefSeq // Homo sapiens sphingosine-1-phosphate phosphatase 2 (SGPP2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000321276 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:222424517:222560948:1 gene:ENSG00000163082 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF542512 // GenBank // Homo sapiens sphingosine 1-phosphate phosphohydrolase 2 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK096323 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39004 fis, clone NT2RI2024460, weakly similar to Homo sapiens mRNA for sphingosine-1-phosphatase (ORF1). // chr2 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// AK314322 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ95081, Homo sapiens sphingosine-1-phosphate phosphotase 2 (SGPP2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC134342 // GenBank // Homo sapiens sphingosine-1-phosphate phosphotase 2, mRNA (cDNA clone MGC:125951 IMAGE:40031702), complete cds. // chr2 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000005292 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:222480469:222558898:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1
ENST00000365146 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:222498291:222498398:1 gene:ENSG00000202016 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT077125 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_058165 // RefSeq // Homo sapiens monoacylglycerol O-acyltransferase 1 (MOGAT1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000446656 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:222671786:222709930:1 gene:ENSG00000124003 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AF384163 // GenBank // Homo sapiens diacylglycerol acyltransferase 2-like protein mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000611505 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:222671738:222709897:1 gene:ENSG00000124003 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000005283 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:222689331:222709890:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0
NM_004457 // RefSeq // Homo sapiens acyl-CoA synthetase long-chain family member 3 (ACSL3), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NM_203372 // RefSeq // Homo sapiens acyl-CoA synthetase long-chain family member 3 (ACSL3), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000357430 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:222860934:222944639:1 gene:ENSG00000123983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000392066 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:222860942:222942222:1 gene:ENSG00000123983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0 /// AB061712 // GenBank // Homo sapiens FACL3 mRNA for Acyl-CoA synthetase 3, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC041692 // GenBank // Homo sapiens acyl-CoA synthetase long-chain family member 3, mRNA (cDNA clone MGC:48741 IMAGE:5226905), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// D89053 // GenBank // Homo sapiens mRNA for Acyl-CoA synthetase 3, complete cds. // chr2 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000005280 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:222860863:222966174:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 62 // 62 // 13 // 21 // 1
NM_080671 // RefSeq // Homo sapiens potassium voltage-gated channel, Isk-related family, member 4 (KCNE4), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000281830 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:223051814:223055637:1 gene:ENSG00000152049 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AK294423 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56338 complete cds, highly similar to Potassium voltage-gated channel subfamily E member 4. // chr2 // 100 // 76 // 16 // 16 // 0 /// AY065987 // GenBank // Homo sapiens potassium voltage-gated channel-like protein (KCNE4) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// BC014429 // GenBank // Homo sapiens potassium voltage-gated channel, Isk-related family, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:20353 IMAGE:4548085), complete cds. // chr2 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000488477 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:223052200:223198399:1 gene:ENSG00000152049 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1 /// GENSCAN00000005295 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:223052145:223053343:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 67 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT077143 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1
NM_022915 // RefSeq // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein L44 (MRPL44), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000258383 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:223957404:223967714:1 gene:ENSG00000135900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC012058 // GenBank // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein L44, mRNA (cDNA clone MGC:19885 IMAGE:4554033), complete cds. // chr2 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// CR457293 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834B0913D for gene MRPL44, mitochondrial ribosomal protein L44; complete cds, incl. stopcodon. // chr2 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000024160 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:223957473:223967034:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0
NM_020864 // RefSeq // Homo sapiens neuronal tyrosine-phosphorylated phosphoinositide-3-kinase adaptor 2 (NYAP2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000272907 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:225400648:225654018:1 gene:ENSG00000144460 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC131727 // GenBank // Homo sapiens KIAA1486 protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:40124248), complete cds. // chr2 // 89 // 51 // 16 // 18 // 0 /// AK055226 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ30664 fis, clone FCBBF1000604, weakly similar to Myosin heavy chain Myr 8b. // chr2 // 26 // 26 // 9 // 35 // 1 /// GENSCAN00000004770 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:225315599:225620514:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 60 // 60 // 21 // 35 // 1
NM_000091 // RefSeq // Homo sapiens collagen, type IV, alpha 3 (Goodpasture antigen) (COL4A3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 71 // 71 // 0 /// ENST00000396578 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:227164565:227314792:1 gene:ENSG00000169031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 71 // 71 // 0 /// ENST00000471862 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:227297691:227304328:1 gene:ENSG00000169031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 89 // 13 // 8 // 9 // 0 /// GENSCAN00000013018 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:227244951:227311944:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 62 // 44 // 44 // 0 /// NONHSAT077211 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 89 // 13 // 8 // 9 // 0
NM_178821 // RefSeq // Homo sapiens dynein assembly factor with WDR repeat domains 1 (DAW1), mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000309931 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:227871607:227924341:1 gene:ENSG00000123977 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000373666 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:2:227871054:227924344:1 gene:ENSG00000123977 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000454999 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:227871642:227903086:1 gene:ENSG00000123977 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 94 // 47 // 15 // 16 // 0 /// AK127882 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ45988 fis, clone PUAEN2006639, weakly similar to Vegetatible incompatibility protein HET-E-1. // chr2 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// AK301861 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54195 complete cds, highly similar to WD repeat protein 69. // chr2 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// BC036377 // GenBank // Homo sapiens WD repeat domain 69, mRNA (cDNA clone MGC:26723 IMAGE:4824989), complete cds. // chr2 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000472604 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:227889513:227895591:1 gene:ENSG00000123977 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1 /// GENSCAN00000013019 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:227871434:227944046:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 62 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT077228 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
ENST00000363411 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:228169743:228169849:1 gene:ENSG00000200281 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT077231 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0
ENST00000410412 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:229894346:229894453:1 gene:ENSG00000222344 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT077250 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK289655 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76331 complete cds, highly similar to Homo sapiens F-box protein 36 (FBXO36), mRNA. // chr2 // 89 // 47 // 8 // 9 // 0 /// BC022538 // GenBank // Homo sapiens F-box protein 36, mRNA (cDNA clone MGC:26691 IMAGE:4817261), complete cds. // chr2 // 79 // 74 // 11 // 14 // 0 /// AK123085 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ41090 fis, clone ASTRO2003960, highly similar to F-box only protein 36. // chr2 // 71 // 74 // 10 // 14 // 0 /// NM_174899 // RefSeq // Homo sapiens F-box protein 36 (FBXO36), mRNA. // chr2 // 53 // 53 // 10 // 19 // 1 /// ENST00000283946 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:229922496:230013109:1 gene:ENSG00000153832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 53 // 53 // 10 // 19 // 1 /// ENST00000373652 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:2:229922302:230013109:1 gene:ENSG00000153832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 68 // 68 // 13 // 19 // 1 /// ENST00000409992 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:2:229922506:230012280:1 gene:ENSG00000153832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 53 // 53 // 10 // 19 // 1 /// ENST00000465090 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:229922491:229977174:1 gene:ENSG00000153832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 58 // 58 // 11 // 19 // 1 /// BC017869 // GenBank HTC // Homo sapiens F-box protein 36, mRNA (cDNA clone IMAGE:4273668), with apparent retained intron. // chr2 // 58 // 58 // 11 // 19 // 1 /// BC033935 // GenBank // Homo sapiens F-box protein 36, mRNA (cDNA clone MGC:41928 IMAGE:5296808), complete cds. // chr2 // 42 // 42 // 8 // 19 // 1 /// NONHSAT077251 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 58 // 58 // 11 // 19 // 1
ENST00000383998 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:229973315:229973421:1 gene:ENSG00000206725 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT077254 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000461450 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:230507101:230507386:1 gene:ENSG00000243650 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT077292 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENST00000362921 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:230587121:230587227:1 gene:ENSG00000199791 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT077298 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000364174 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:230752141:230752247:1 gene:ENSG00000201044 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT077302 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
ENST00000364704 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:231133462:231133630:1 gene:ENSG00000201574 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT077337 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_145236 // RefSeq // Homo sapiens UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 7 (B3GNT7), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000287590 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:231395543:231401164:1 gene:ENSG00000156966 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// AF502430 // GenBank // Homo sapiens beta 1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 7 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000011180 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:231395962:231398925:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 74 // 14 // 14 // 0
NM_152614 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 57 (C2orf57), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000313965 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:231592901:231594283:1 gene:ENSG00000177673 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC034405 // GenBank // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 57, mRNA (cDNA clone MGC:35154 IMAGE:5169625), complete cds. // chr2 // 91 // 85 // 20 // 22 // 0 /// BC063389 // GenBank // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 57, mRNA (cDNA clone MGC:70484 IMAGE:5170341), complete cds. // chr2 // 91 // 85 // 20 // 22 // 0 /// GENSCAN00000011185 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:231592952:231594139:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// BC024251 // GenBank // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 57, mRNA (cDNA clone MGC:33563 IMAGE:4822990), complete cds. // chr2 // 87 // 88 // 20 // 23 // 0
ENST00000410064 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:231709781:231712856:1 gene:ENSG00000187514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 70 // 14 // 14 // 0 /// AF452640 // GenBank // Homo sapiens tissue-type testis hypothetical protein mRNA, complete cds. // chr2 // 86 // 70 // 12 // 14 // 0 /// GENSCAN00000011182 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:231709527:231712851:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 40 // 8 // 8 // 0
NM_001632 // RefSeq // Homo sapiens alkaline phosphatase, placental (ALPP), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// XM_005246439 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens alkaline phosphatase, placental (ALPP), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 63 // 5 // 5 // 0 /// ENST00000392027 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:232378534:232382889:1 gene:ENSG00000163283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// AK312931 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ93382, highly similar to Homo sapiens alkaline phosphatase, placental (Regan isozyme) (ALPP), mRNA. // chr2 // 100 // 63 // 5 // 5 // 0 /// BC009647 // GenBank // Homo sapiens alkaline phosphatase, placental (Regan isozyme), mRNA (cDNA clone MGC:5096 IMAGE:3460735), complete cds. // chr2 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// BC068501 // GenBank // Homo sapiens alkaline phosphatase, placental (Regan isozyme), mRNA (cDNA clone MGC:87242 IMAGE:30349481), complete cds. // chr2 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// BC094743 // GenBank // Homo sapiens alkaline phosphatase, placental (Regan isozyme), mRNA (cDNA clone MGC:104591 IMAGE:30330997), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// M12551 // GenBank // Human placental alkaline phosphatase (PLAP) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0
NM_031313 // RefSeq // Homo sapiens alkaline phosphatase, placental-like 2 (ALPPL2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000295453 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:232406843:232410714:1 gene:ENSG00000163286 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// AK293017 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75984 complete cds, highly similar to Homo sapiens alkaline phosphatase, placental-like 2 (ALPPL2), mRNA. // chr2 // 80 // 77 // 8 // 10 // 0 /// J04948 // GenBank // Human alkaline phosphatase (ALP-1) mRNA, complete cds. // chr2 // 77 // 100 // 10 // 13 // 0 /// BC014139 // GenBank // Homo sapiens alkaline phosphatase, placental-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:20678 IMAGE:4652865), complete cds. // chr2 // 73 // 85 // 8 // 11 // 0 /// ENST00000611550 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:232406895:232409872:1 gene:ENSG00000163286 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000014996 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:232406895:232409872:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0
NM_001631 // RefSeq // Homo sapiens alkaline phosphatase, intestinal (ALPI), mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000295463 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:232456123:232460032:1 gene:ENSG00000163295 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000457560 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:232456125:232459284:1 gene:ENSG00000163295 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC132678 // GenBank // Homo sapiens alkaline phosphatase, intestinal, mRNA (cDNA clone MGC:164309 IMAGE:40146700), complete cds. // chr2 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// M15694 // GenBank // Human adult intestinal phosphatase type, complete cds. // chr2 // 91 // 79 // 20 // 22 // 0 /// M31008 // GenBank // Human intestinal alkaline phosphatase mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014977 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:232442105:232459146:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1
NM_005199 // RefSeq // Homo sapiens cholinergic receptor, nicotinic, gamma (muscle) (CHRNG), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000389492 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:2:232539748:232545716:1 gene:ENSG00000196811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000389494 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:232539727:232546403:1 gene:ENSG00000196811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK125362 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ43372 fis, clone NTONG2006324, highly similar to Acetylcholine receptor protein subunit gamma precursor. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC111802 // GenBank // Homo sapiens cholinergic receptor, nicotinic, gamma, mRNA (cDNA clone MGC:133376 IMAGE:40069605), complete cds. // chr2 // 93 // 88 // 26 // 28 // 0 /// ENST00000485094 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:232539727:232541882:1 gene:ENSG00000196811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// AK309340 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99381. // chr2 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// GENSCAN00000014981 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:232539748:232603623:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1
ENST00000473502 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:232649849:232650136:1 gene:ENSG00000244384 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT077427 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NONHSAT077428 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000516643 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:232782665:232782766:1 gene:ENSG00000252452 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 79 // 88 // 11 // 14 // 0 /// NONHSAT077448 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 79 // 88 // 11 // 14 // 0
ENST00000362911 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:232828653:232828751:1 gene:ENSG00000199781 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT077450 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_005383 // RefSeq // Homo sapiens sialidase 2 (cytosolic sialidase) (NEU2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000233840 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:233032672:233035057:1 gene:ENSG00000115488 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC069151 // GenBank // Homo sapiens sialidase 2 (cytosolic sialidase), mRNA (cDNA clone MGC:95436 IMAGE:7217011), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC107053 // GenBank // Homo sapiens sialidase 2 (cytosolic sialidase), mRNA (cDNA clone MGC:129579 IMAGE:40004620), complete cds. // chr2 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014978 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:233001600:233035057:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NR_003008 // RefSeq // Homo sapiens small Cajal body-specific RNA 5 (SCARNA5), guide RNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000516201 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:233275727:233276002:1 gene:ENSG00000252010 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT077462 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr2 // 64 // 100 // 16 // 25 // 0
NR_003006 // RefSeq // Homo sapiens small Cajal body-specific RNA 6 (SCARNA6), guide RNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000515982 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:233288676:233288940:1 gene:ENSG00000251791 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT077466 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001287395 // RefSeq // Homo sapiens maestro heat-like repeat family member 2A (MROH2A), mRNA. // chr2 // 100 // 95 // 53 // 53 // 0 /// ENST00000389758 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:2:233778330:233833423:1 gene:ENSG00000185038 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 95 // 53 // 53 // 0 /// ENST00000487979 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:233828555:233833418:1 gene:ENSG00000185038 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 52 // 29 // 29 // 0 /// BC042133 // GenBank // Homo sapiens HEAT repeat containing 7B1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5478533), partial cds. // chr2 // 100 // 52 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000610772 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:233775679:233833423:1 gene:ENSG00000185038 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 95 // 53 // 53 // 0 /// GENSCAN00000011140 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:233779359:233834540:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 79 // 44 // 44 // 0 /// TCONS_l2_00014299-XLOC_l2_007808 // Broad TUCP // linc-TRPM8-2 chr2:+:234702856-234707497 // chr2 // 100 // 16 // 9 // 9 // 0 /// TCONS_l2_00014300-XLOC_l2_007808 // Broad TUCP // linc-TRPM8-2 chr2:+:234702858-234730909 // chr2 // 100 // 38 // 21 // 21 // 0
NM_006944 // RefSeq // Homo sapiens secreted phosphoprotein 2, 24kDa (SPP2), mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000168148 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:234050699:234077134:1 gene:ENSG00000072080 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000373368 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:234050679:234077130:1 gene:ENSG00000072080 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000425558 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:234050787:234070010:1 gene:ENSG00000072080 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 95 // 63 // 18 // 19 // 0 /// BC069401 // GenBank // Homo sapiens secreted phosphoprotein 2, 24kDa, mRNA (cDNA clone MGC:96949 IMAGE:7262158), complete cds. // chr2 // 95 // 70 // 20 // 21 // 0 /// U20530 // GenBank // Human bone phosphoprotein spp-24 precursor mRNA, complete cds. // chr2 // 95 // 70 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000011138 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:233914296:234076933:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
NM_020311 // RefSeq // Homo sapiens atypical chemokine receptor 3 (ACKR3), mRNA. // chr2 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// XM_005246097 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens atypical chemokine receptor 3 (ACKR3), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000272928 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:236569641:236582358:1 gene:ENSG00000144476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// AF030297 // GenBank // Homo sapiens G protein coupled receptor (RDC1) mRNA, complete cds. // chr2 // 92 // 41 // 12 // 13 // 0 /// AK291659 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75051 complete cds, highly similar to Homo sapiens chemokine orphan receptor 1 (CMKOR1), mRNA. // chr2 // 100 // 34 // 11 // 11 // 0 /// BC036661 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) receptor 7, mRNA (cDNA clone MGC:33224 IMAGE:5267661), complete cds. // chr2 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// DQ822477 // GenBank // Homo sapiens chemokine orphan receptor 1 (CMKOR1) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000022180 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:236571488:236581554:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0
NM_006710 // RefSeq // Homo sapiens COP9 signalosome subunit 8 (COPS8), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 94 // 90 // 17 // 18 // 0 /// NM_198189 // RefSeq // Homo sapiens COP9 signalosome subunit 8 (COPS8), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000354371 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:237085312:237100466:1 gene:ENSG00000198612 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 95 // 95 // 18 // 19 // 0 /// ENST00000392008 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:237085882:237098618:1 gene:ENSG00000198612 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 65 // 13 // 13 // 0 /// AK289891 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75974 complete cds, highly similar to Homo sapiens COP9 constitutive photomorphogenic homolog subunit 8 (Arabidopsis) (COPS8), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 65 // 13 // 13 // 0 /// BC003090 // GenBank // Homo sapiens COP9 constitutive photomorphogenic homolog subunit 8 (Arabidopsis), mRNA (cDNA clone MGC:1297 IMAGE:3503287), complete cds. // chr2 // 92 // 60 // 11 // 12 // 0 /// BC036499 // GenBank // Homo sapiens COP9 constitutive photomorphogenic homolog subunit 8 (Arabidopsis), mRNA (cDNA clone MGC:43256 IMAGE:5264527), complete cds. // chr2 // 94 // 85 // 16 // 17 // 0
NM_015893 // RefSeq // Homo sapiens prolactin releasing hormone (PRLH), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000165524 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:237566574:237567175:1 gene:ENSG00000071677 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB015419 // GenBank // Homo sapiens mRNA for preproprolactin-releasing peptide, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC069081 // GenBank // Homo sapiens prolactin releasing hormone, mRNA (cDNA clone MGC:95356 IMAGE:7216895), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC069284 // GenBank // Homo sapiens prolactin releasing hormone, mRNA (cDNA clone MGC:97403 IMAGE:7262679), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000006764 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:237566574:237567175:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001137550 // RefSeq // Homo sapiens leucine rich repeat (in FLII) interacting protein 1 (LRRFIP1), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// XM_005246128 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens leucine rich repeat (in FLII) interacting protein 1 (LRRFIP1), transcript variant X17, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// XM_005246138 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens leucine rich repeat (in FLII) interacting protein 1 (LRRFIP1), transcript variant X27, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000308482 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:2:237627576:237780315:1 gene:ENSG00000124831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000473815 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:237692494:237735676:1 gene:ENSG00000124831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// GENSCAN00000006757 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:237627651:237720900:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_001137550 // RefSeq // Homo sapiens leucine rich repeat (in FLII) interacting protein 1 (LRRFIP1), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// XM_005246138 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens leucine rich repeat (in FLII) interacting protein 1 (LRRFIP1), transcript variant X27, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000308482 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:2:237627576:237780315:1 gene:ENSG00000124831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_001137550 // RefSeq // Homo sapiens leucine rich repeat (in FLII) interacting protein 1 (LRRFIP1), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_005246128 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens leucine rich repeat (in FLII) interacting protein 1 (LRRFIP1), transcript variant X17, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_005246138 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens leucine rich repeat (in FLII) interacting protein 1 (LRRFIP1), transcript variant X27, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000308482 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:2:237627576:237780315:1 gene:ENSG00000124831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000420665 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:237692333:237749300:1 gene:ENSG00000124831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001137550 // RefSeq // Homo sapiens leucine rich repeat (in FLII) interacting protein 1 (LRRFIP1), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// XM_005246138 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens leucine rich repeat (in FLII) interacting protein 1 (LRRFIP1), transcript variant X27, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000308482 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:2:237627576:237780315:1 gene:ENSG00000124831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000473815 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:237692494:237735676:1 gene:ENSG00000124831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_001137550 // RefSeq // Homo sapiens leucine rich repeat (in FLII) interacting protein 1 (LRRFIP1), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_005246138 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens leucine rich repeat (in FLII) interacting protein 1 (LRRFIP1), transcript variant X27, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000308482 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:2:237627576:237780315:1 gene:ENSG00000124831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000473815 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:237692494:237735676:1 gene:ENSG00000124831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001137550 // RefSeq // Homo sapiens leucine rich repeat (in FLII) interacting protein 1 (LRRFIP1), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_005246128 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens leucine rich repeat (in FLII) interacting protein 1 (LRRFIP1), transcript variant X17, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_005246138 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens leucine rich repeat (in FLII) interacting protein 1 (LRRFIP1), transcript variant X27, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000308482 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:2:237627576:237780315:1 gene:ENSG00000124831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001137550 // RefSeq // Homo sapiens leucine rich repeat (in FLII) interacting protein 1 (LRRFIP1), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_005246128 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens leucine rich repeat (in FLII) interacting protein 1 (LRRFIP1), transcript variant X17, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_005246138 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens leucine rich repeat (in FLII) interacting protein 1 (LRRFIP1), transcript variant X27, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000308482 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:2:237627576:237780315:1 gene:ENSG00000124831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006751 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:237738099:237764140:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000480583 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:237798389:237842808:1 gene:ENSG00000177483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AK097730 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ40411 fis, clone TESTI2037845. // chr2 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// BX648107 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686C1232 (from clone DKFZp686C1232). // chr2 // 91 // 100 // 32 // 35 // 0 /// NM_001080504 // RefSeq // Homo sapiens RNA binding motif protein 44 (RBM44), mRNA. // chr2 // 94 // 94 // 33 // 35 // 1 /// ENST00000316997 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:237798745:237842807:1 gene:ENSG00000177483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 94 // 94 // 33 // 35 // 1 /// ENST00000409864 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:237799178:237834437:1 gene:ENSG00000177483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 89 // 89 // 31 // 35 // 1 /// BC126111 // GenBank // Homo sapiens RNA binding motif protein 44, mRNA (cDNA clone IMAGE:8991827), complete cds. // chr2 // 60 // 60 // 21 // 35 // 1 /// ENST00000611254 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:237813664:237841869:1 gene:ENSG00000177483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 60 // 60 // 21 // 35 // 1
NM_194312 // RefSeq // Homo sapiens espin-like (ESPNL), mRNA. // chr2 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000343063 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:238100157:238133287:1 gene:ENSG00000144488 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000409169 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:238100420:238133287:1 gene:ENSG00000144488 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000409506 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:238127390:238133287:1 gene:ENSG00000144488 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000477241 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:238128948:238133281:1 gene:ENSG00000144488 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// AK128187 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ46313 fis, clone TESTI4040598. // chr2 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// BC080639 // GenBank // Homo sapiens espin-like, mRNA (cDNA clone MGC:99829 IMAGE:6597009), complete cds. // chr2 // 94 // 56 // 17 // 18 // 0 /// ENST00000612395 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:238107886:238133286:1 gene:ENSG00000144488 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000006762 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:238100420:238131732:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0
NM_198582 // RefSeq // Homo sapiens kelch-like family member 30 (KLHL30), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000409223 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:238138722:238152947:1 gene:ENSG00000168427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000006761 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:238140755:238151065:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0
NM_001139490 // RefSeq // Homo sapiens TNF receptor-associated factor 3 interacting protein 1 (TRAF3IP1), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NM_015650 // RefSeq // Homo sapiens TNF receptor-associated factor 3 interacting protein 1 (TRAF3IP1), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000373327 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:238320441:238400900:1 gene:ENSG00000204104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000391993 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:238320441:238400822:1 gene:ENSG00000204104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000409739 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:238320536:238329342:1 gene:ENSG00000204104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 28 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000462122 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:238347183:238397680:1 gene:ENSG00000204104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 33 // 12 // 12 // 0 /// AF230877 // GenBank // Homo sapiens MIP-T3 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// AF242456 // GenBank // Homo sapiens interleukin 13 receptor alpha 1-binding protein-1 mRNA, complete cds. // chr2 // 94 // 97 // 33 // 35 // 0 /// BC059174 // GenBank // Homo sapiens TNF receptor-associated factor 3 interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:54069 IMAGE:6191726), complete cds. // chr2 // 97 // 83 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000048961 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:238320663:238340279:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 33 // 12 // 12 // 0
ENST00000365229 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:238412642:238412745:1 gene:ENSG00000202099 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT077716 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001040445 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat and SOCS box containing 1 (ASB1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_005246080 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ankyrin repeat and SOCS box containing 1 (ASB1), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// XR_241235 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ankyrin repeat and SOCS box containing 1 (ASB1), transcript variant X2, misc_RNA. // chr2 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// XR_241236 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ankyrin repeat and SOCS box containing 1 (ASB1), transcript variant X3, misc_RNA. // chr2 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000264607 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:238426824:238452250:1 gene:ENSG00000065802 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000438264 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:238427029:238446651:1 gene:ENSG00000065802 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000463352 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:238426742:238444375:1 gene:ENSG00000065802 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000491653 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:238433314:238444474:1 gene:ENSG00000065802 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// AF156777 // GenBank // Homo sapiens ASB-1 protein mRNA, complete cds. // chr2 // 92 // 44 // 11 // 12 // 0 /// BC014528 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat and SOCS box-containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:11165 IMAGE:3842384), complete cds. // chr2 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000048966 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:238379346:238487343:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
ENST00000358775 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:239578301:239586094:1 gene:ENSG00000196758 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK127861 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ45964 fis, clone PLACE7014396. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NR_029702 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 149 (MIR149), microRNA. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000384879 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:240456001:240456089:1 gene:ENSG00000207611 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// hsa-mir-149 // miRBase Micro RNA Database // MI0000478 Homo sapiens miR-149 stem-loop // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT077821 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001033575 // RefSeq // Homo sapiens dual specificity phosphatase 28 (DUSP28), mRNA. // chr2 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000343217 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:240560054:240564014:1 gene:ENSG00000188542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000405954 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:240560302:240564014:1 gene:ENSG00000188542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC036198 // GenBank // Homo sapiens dual specificity phosphatase 28, mRNA (cDNA clone MGC:39555 IMAGE:5298326), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000438823 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:240560792:240564014:1 gene:ENSG00000188542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 58 // 58 // 19 // 33 // 1 /// ENST00000497221 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:240562983:240564013:1 gene:ENSG00000188542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// GENSCAN00000048375 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:240560685:240561467:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 83 // 36 // 10 // 12 // 0 /// NONHSAT077833 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
NM_001001666 // RefSeq // Homo sapiens anoctamin 7 (ANO7), transcript variant NGEP-S, mRNA. // chr2 // 100 // 44 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000402530 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:241188509:241196168:1 gene:ENSG00000146205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 44 // 20 // 20 // 0 /// AY617080 // GenBank // Homo sapiens NGEP short variant mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr2 // 100 // 44 // 20 // 20 // 0 /// NM_001001891 // RefSeq // Homo sapiens anoctamin 7 (ANO7), transcript variant NGEP-L, mRNA. // chr2 // 82 // 82 // 37 // 45 // 1 /// ENST00000274979 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:241188509:241225376:1 gene:ENSG00000146205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 82 // 82 // 37 // 45 // 1 /// AY617079 // GenBank // Homo sapiens NGEP long variant mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr2 // 80 // 80 // 36 // 45 // 1 /// ENST00000402430 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:241188612:241223357:1 gene:ENSG00000146205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 73 // 73 // 33 // 45 // 1 /// GENSCAN00000007458 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:241198884:241224544:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 49 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000048363 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:241148815:241195845:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 27 // 27 // 12 // 45 // 1
AF116718 // GenBank HTC // Homo sapiens PRO2900 mRNA, complete cds. // chr2 // 89 // 78 // 16 // 18 // 0
NM_001282983 // RefSeq // Homo sapiens FERM, RhoGEF and pleckstrin domain protein 2 (FARP2), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// NM_001282984 // RefSeq // Homo sapiens FERM, RhoGEF and pleckstrin domain protein 2 (FARP2), transcript variant 3, mRNA. // chr2 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0 /// XM_005247050 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens FERM, RhoGEF and pleckstrin domain protein 2 (FARP2), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 95 // 69 // 21 // 22 // 0 /// ENST00000373287 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:241356297:241466030:1 gene:ENSG00000006607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// AK300435 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61617 complete cds, highly similar to FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 2. // chr2 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// BC021301 // GenBank // Homo sapiens FERM, RhoGEF and pleckstrin domain protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:29593 IMAGE:5013180), complete cds. // chr2 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// NM_014808 // RefSeq // Homo sapiens FERM, RhoGEF and pleckstrin domain protein 2 (FARP2), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 91 // 91 // 29 // 32 // 1 /// ENST00000264042 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:241356243:241494841:1 gene:ENSG00000006607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 91 // 91 // 29 // 32 // 1 /// GENSCAN00000007468 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:241454130:241494125:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1 /// GENSCAN00000007487 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:241373222:241442533:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
NM_032515 // RefSeq // Homo sapiens BCL2-related ovarian killer (BOK), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XM_005247039 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens BCL2-related ovarian killer (BOK), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 64 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000318407 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:241558721:241574138:1 gene:ENSG00000176720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AF174487 // GenBank // Homo sapiens BCL-2-related ovarian killer protein (BOK) mRNA, complete cds. // chr2 // 90 // 91 // 18 // 20 // 0 /// BT007272 // GenBank // Homo sapiens BCL2-related ovarian killer mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 55 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000007481 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:241552660:241572422:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 64 // 64 // 14 // 22 // 1
NM_022134 // RefSeq // Homo sapiens galactose-3-O-sulfotransferase 2 (GAL3ST2), mRNA. // chr2 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000192314 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:241776825:241804208:1 gene:ENSG00000154252 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 97 // 83 // 32 // 33 // 0 /// AB040610 // GenBank // Homo sapiens GP3ST mRNA for glycoprotein beta-Gal 3-sulfotransferase, complete cds. // chr2 // 85 // 100 // 34 // 40 // 0 /// BC117293 // GenBank // Homo sapiens galactose-3-O-sulfotransferase 2, mRNA (cDNA clone MGC:150902 IMAGE:40125844), complete cds. // chr2 // 84 // 78 // 26 // 31 // 0 /// BC117295 // GenBank // Homo sapiens galactose-3-O-sulfotransferase 2, mRNA (cDNA clone MGC:150904 IMAGE:40125846), complete cds. // chr2 // 84 // 78 // 26 // 31 // 0 /// ENST00000610560 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR2_3_CTG15:241799063:241804166:1 gene:ENSG00000276126 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 60 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000007461 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:241799045:241817048:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 60 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000037199 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR2_3_CTG15:241799045:241804166:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 60 // 24 // 24 // 0
NM_173821 // RefSeq // Homo sapiens receptor (chemosensory) transporter protein 5 (putative) (RTP5), mRNA. // chr2 // 95 // 61 // 18 // 19 // 0 /// ENST00000343216 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:241869729:241873823:1 gene:ENSG00000188011 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000419912 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:241869600:241873819:1 gene:ENSG00000188011 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AK090909 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ33590 fis, clone BRAMY2012555, weakly similar to Homo sapiens mRNA for 28kD interferon responsive protein. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC113517 // GenBank // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 85, mRNA (cDNA clone MGC:142077 IMAGE:8322569), complete cds. // chr2 // 95 // 61 // 18 // 19 // 0 /// BC113519 // GenBank // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 85, mRNA (cDNA clone MGC:142079 IMAGE:8322571), complete cds. // chr2 // 95 // 61 // 18 // 19 // 0 /// ENST00000617264 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR2_3_CTG15:241869734:241873330:1 gene:ENSG00000277949 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 95 // 61 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000007457 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:241869757:241873274:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000037197 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR2_3_CTG15:241869757:241873274:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0
AK123321 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ41327 fis, clone BRAMY2047169. // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000007466 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:242003505:242031153:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 44 // 44 // 8 // 18 // 1 /// GENSCAN00000028247 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR2_1_CTG15:242003505:242036528:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 44 // 44 // 8 // 18 // 1
NM_001077710 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 110, member C (FAM110C), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006711892 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens family with sequence similarity 110, member C (FAM110C), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_426958 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens family with sequence similarity 110, member C (FAM110C), transcript variant X2, misc_RNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000327669 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:38814:46385:-1 gene:ENSG00000184731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK302544 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59640 complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// DQ431183 // GenBank // Homo sapiens FAM110C (FAM110C) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000046282 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:33580:46385:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_012293 // RefSeq // Homo sapiens peroxidasin homolog (Drosophila) (PXDN), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000252804 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:1631887:1744506:-1 gene:ENSG00000130508 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000433670 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:1653076:1744442:-1 gene:ENSG00000130508 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 53 // 18 // 18 // 0 /// AF200348 // GenBank // Homo sapiens melanoma-associated antigen MG50 mRNA, partial cds. // chr2 // 91 // 100 // 31 // 34 // 0 /// BC098579 // GenBank // Homo sapiens peroxidasin homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:30921082), partial cds. // chr2 // 94 // 53 // 17 // 18 // 0 /// EF090903 // GenBank // Homo sapiens VPO mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 79 // 26 // 27 // 0 /// ENST00000478155 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:1633892:1676507:-1 gene:ENSG00000130508 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 53 // 53 // 18 // 34 // 1 /// BC030834 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4792124. // chr2 // 38 // 38 // 13 // 34 // 1 /// BC070119 // GenBank // Homo sapiens peroxidasin homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:5296296). // chr2 // 44 // 44 // 15 // 34 // 1 /// GENSCAN00000011813 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:1634204:1744455:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 68 // 68 // 23 // 34 // 1
NM_015025 // RefSeq // Homo sapiens myelin transcription factor 1-like (MYT1L), mRNA. // chr2 // 97 // 91 // 31 // 32 // 0 /// ENST00000399161 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:1789113:2331194:-1 gene:ENSG00000186487 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000407844 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:1789136:1842886:-1 gene:ENSG00000186487 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 26 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000428368 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:1791242:2331116:-1 gene:ENSG00000186487 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000602387 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:1883877:1922730:-1 gene:ENSG00000186487 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 31 // 11 // 11 // 0 /// AF036943 // GenBank // Homo sapiens myelin transcription factor 1-like (MYT1-l) mRNA, complete cds. // chr2 // 90 // 86 // 27 // 30 // 0 /// AL133024 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp434E0922 (from clone DKFZp434E0922). // chr2 // 100 // 31 // 11 // 11 // 0 /// BC137272 // GenBank // Homo sapiens myelin transcription factor 1-like, mRNA (cDNA clone MGC:168892 IMAGE:9021269), complete cds. // chr2 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// BC137273 // GenBank // Homo sapiens myelin transcription factor 1-like, mRNA (cDNA clone MGC:168893 IMAGE:9021270), complete cds. // chr2 // 97 // 89 // 30 // 31 // 0 /// BC150281 // GenBank // Homo sapiens myelin transcription factor 1-like, mRNA (cDNA clone MGC:166897 IMAGE:9007267), complete cds. // chr2 // 94 // 89 // 29 // 31 // 0 /// GENSCAN00000011814 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:1791867:1923228:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 54 // 54 // 19 // 35 // 1
NM_018269 // RefSeq // Homo sapiens acireductone dioxygenase 1 (ADI1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000327435 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:3497361:3519736:-1 gene:ENSG00000182551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000382093 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:3498453:3517747:-1 gene:ENSG00000182551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// AF087863 // GenBank // Homo sapiens submergence induced protein 2 mRNA, complete cds. // chr2 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// AF403478 // GenBank // Homo sapiens SIPL mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// AK127473 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ45565 fis, clone BRTHA3007662. // chr2 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC001467 // GenBank // Homo sapiens acireductone dioxygenase 1, mRNA (cDNA clone MGC:918 IMAGE:3138914), complete cds. // chr2 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// AB158319 // GenBank // Homo sapiens MTCBP-1 mRNA for membrane-type 1 matrix metalloproteinase cytoplasmic tail binding protein-1, complete cds. // chr2 // 69 // 100 // 18 // 26 // 0 /// GENSCAN00000037789 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:3498963:3519487:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000007091 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR2_1_CTG1:3500330:3502360:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
ENST00000335179 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:3617548:3617757:-1 gene:ENSG00000188765 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr2 // 100 // 42 // 8 // 8 // 0 /// BC104196 // GenBank // Homo sapiens thymosin-like 2 (pseudogene), mRNA (cDNA clone IMAGE:40031302). // chr2 // 85 // 68 // 11 // 13 // 0 /// NONHSAT068750 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr2 // 92 // 68 // 12 // 13 // 0 /// NONHSAT068751 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr2 // 100 // 42 // 8 // 8 // 0
ENST00000516429 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:4827001:4827084:-1 gene:ENSG00000252238 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr2 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONHSAT068795 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NR_038369 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 487 (LINC00487), long non-coding RNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000382045 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:6729168:6770311:-1 gene:ENSG00000205837 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000424179 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:6729168:6731226:-1 gene:ENSG00000205837 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr2 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// NONHSAT068912 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// NONHSAT068913 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// TCONS_l2_00015686-XLOC_l2_007873 // Broad TUCP // linc-RNASEH1-13 chr2:-:6869299-6871358 // chr2 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// TCONS_l2_00015687-XLOC_l2_007873 // Broad TUCP // linc-RNASEH1-13 chr2:-:6869300-6910442 // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000048418 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:6713318:6738672:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
ENST00000411213 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:7141227:7141544:-1 gene:ENSG00000223145 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 77 // 100 // 20 // 26 // 0 /// NONHSAT068942 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 77 // 100 // 20 // 26 // 0
AK125905 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ43917 fis, clone TESTI4011505. // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000034330 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:7813696:7857327:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 41 // 41 // 9 // 22 // 1
ENST00000442956 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:8207143:8328419:-1 gene:ENSG00000236790 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK127578 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ45673 fis, clone D9OST2003989. // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NR_034135 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 299 (LINC00299), long non-coding RNA. // chr2 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// ENST00000430192 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:8007771:8324630:-1 gene:ENSG00000236790 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr2 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// BC043563 // GenBank // Homo sapiens hypothetical protein LOC339789, mRNA (cDNA clone IMAGE:5211629), partial cds. // chr2 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONHSAT068983 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// TCONS_00002744-XLOC_001974 // Rinn lincRNA // linc-CMPK2-2 chr2:-:8347272-8468549 // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT068976 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// TCONS_00002661-XLOC_001974 // Rinn lincRNA // linc-CMPK2-2 chr2:-:8147901-8468549 // chr2 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// TCONS_00002743-XLOC_001974 // Rinn lincRNA // linc-CMPK2-2 chr2:-:8147901-8464814 // chr2 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NONHSAT147072 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NONHSAT069052 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000363164 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:9740643:9740783:-1 gene:ENSG00000200034 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONHSAT069065 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
ENST00000340444 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:10003158:10006030:-1 gene:ENSG00000188525 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr2 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// AY358123 // GenBank // Homo sapiens clone DNA149986 AILT5830 (UNQ5830) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// AY358741 // GenBank // Homo sapiens clone DNA149995 AILT5830 (UNQ5830) mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// NONHSAT069074 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0
NM_001037160 // RefSeq // Homo sapiens cystin 1 (CYS1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000381813 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:10056780:10080411:-1 gene:ENSG00000205795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF544983 // GenBank // Homo sapiens cilia-associated protein (CYS1) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000477304 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:10058614:10080944:-1 gene:ENSG00000205795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// GENSCAN00000031962 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:10058853:10080223:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0 /// NONHSAT069087 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
ENST00000383920 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:10155072:10155206:-1 gene:ENSG00000206647 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT069090 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000384171 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:10296047:10296180:-1 gene:ENSG00000206898 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT069096 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_028374 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 80B (SNORA80B), small nucleolar RNA. // chr2 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// ENST00000383906 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:10446714:10446849:-1 gene:ENSG00000206633 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr2 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// NONHSAT069102 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0
NR_040080 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC285150 (FLJ33534), long non-coding RNA. // chr2 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000536743 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:11105317:11132176:-1 gene:ENSG00000145063 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr2 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000544306 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:11105317:11132221:-1 gene:ENSG00000145063 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr2 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// AK090853 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ33534 fis, clone BRAMY2007411. // chr2 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENST00000447433 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:11124219:11132770:-1 gene:ENSG00000145063 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr2 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// AK311163 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ18205. // chr2 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// NONHSAT069136 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT069137 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT069140 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT069144 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// NONHSAT069145 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// NONHSAT069139 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// NONHSAT069142 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// NONHSAT069143 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_004850 // RefSeq // Homo sapiens Rho-associated, coiled-coil containing protein kinase 2 (ROCK2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000261535 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:11215360:11344141:-1 gene:ENSG00000134318 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 39 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000315872 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:11179761:11344585:-1 gene:ENSG00000134318 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000401753 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:11183331:11234670:-1 gene:ENSG00000134318 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// AB014519 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA0619 protein, partial cds. // chr2 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// AK299296 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51533 complete cds, highly similar to Rho-associated protein kinase 2 (EC 2.7.11.1). // chr2 // 95 // 53 // 18 // 19 // 0 /// AK310358 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17400. // chr2 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// BC111801 // GenBank // Homo sapiens Rho-associated, coiled-coil containing protein kinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:133382 IMAGE:40069866), complete cds. // chr2 // 95 // 58 // 20 // 21 // 0 /// D87931 // GenBank // Homo sapiens mRNA for Rho kinase, complete cds. // chr2 // 97 // 92 // 32 // 33 // 0 /// ENST00000616279 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:11181652:11344585:-1 gene:ENSG00000134318 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000024410 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:11192144:11344136:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0
ENST00000365378 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:11561661:11561779:-1 gene:ENSG00000202248 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr2 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT069178 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_012344 // RefSeq // Homo sapiens neurotensin receptor 2 (NTSR2), mRNA. // chr2 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// ENST00000306928 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:11658178:11670164:-1 gene:ENSG00000169006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AY429107 // GenBank // Homo sapiens neurotensin receptor 2 mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// BC022501 // GenBank // Homo sapiens neurotensin receptor 2, mRNA (cDNA clone MGC:26447 IMAGE:4792730), complete cds. // chr2 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// BC037776 // GenBank // Homo sapiens neurotensin receptor 2, mRNA (cDNA clone MGC:41842 IMAGE:4817029), complete cds. // chr2 // 89 // 90 // 24 // 27 // 0 /// GENSCAN00000024409 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:11658479:11670129:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0
ENST00000384454 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:12411398:12411501:-1 gene:ENSG00000207183 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 94 // 100 // 15 // 16 // 0 /// NONHSAT069228 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 94 // 100 // 15 // 16 // 0
ENST00000516050 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:14274622:14274725:-1 gene:ENSG00000251859 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT069263 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_026766 // RefSeq // Homo sapiens MYCN opposite strand (MYCNOS), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr2 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000419083 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:15939898:15941723:-1 gene:ENSG00000233718 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr2 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// S49953 // GenBank // N-cym=DNA-binding transcriptional activator homolog {oncogene} [human, Kelly neuroblastoma cell line, mRNA, 778 nt]. // chr2 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONHSAT069305 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr2 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
ENST00000498686 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:15950689:15950981:-1 gene:ENSG00000243541 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT069308 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0
NM_030797 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 49, member A (FAM49A), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_005262630 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens family with sequence similarity 49, member A (FAM49A), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000381323 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:16549459:16665834:-1 gene:ENSG00000197872 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000406434 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:16552936:16665828:-1 gene:ENSG00000197872 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000445605 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:16564005:16666086:-1 gene:ENSG00000197872 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// AK315065 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ96018. // chr2 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// AL136704 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp566A1524 (from clone DKFZp566A1524); complete cds. // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC038971 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 49, member A, mRNA (cDNA clone MGC:47569 IMAGE:5200807), complete cds. // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000021808 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:16552936:16665079:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
ENST00000410910 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:17122841:17123140:-1 gene:ENSG00000222842 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT069348 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000391153 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:18040606:18040733:-1 gene:ENSG00000212455 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT069363 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_020905 // RefSeq // Homo sapiens retinol dehydrogenase 14 (all-trans/9-cis/11-cis) (RDH14), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000381249 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:18554723:18560680:-1 gene:ENSG00000240857 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF237952 // GenBank // Homo sapiens PAN2 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY358511 // GenBank // Homo sapiens clone DNA58747 PAN2 (UNQ529) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC009830 // GenBank // Homo sapiens retinol dehydrogenase 14 (all-trans/9-cis/11-cis), mRNA (cDNA clone MGC:15072 IMAGE:4053893), complete cds. // chr2 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NM_001199103 // RefSeq // Homo sapiens NT5C1B-RDH14 readthrough (NT5C1B-RDH14), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// NM_001199104 // RefSeq // Homo sapiens NT5C1B-RDH14 readthrough (NT5C1B-RDH14), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// AK023625 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ13563 fis, clone PLACE1008111, weakly similar to PROBABLE OXIDOREDUCTASE (EC 1.-.-.-). // chr2 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// GENSCAN00000035658 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:18555191:18560572:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 91 // 44 // 10 // 11 // 0
ENST00000384441 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:18583367:18583468:-1 gene:ENSG00000207170 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT069370 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_145260 // RefSeq // Homo sapiens odd-skipped related transciption factor 1 (OSR1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006711942 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens odd-skipped related transciption factor 1 (OSR1), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000272223 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:19351485:19358653:-1 gene:ENSG00000143867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AB082568 // GenBank // Homo sapiens odd-skipped related 1(OSR1) mRNA for zinc finger transcription factor, complete cds. // chr2 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// BC025712 // GenBank // Homo sapiens odd-skipped related 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:34783 IMAGE:5227308), complete cds. // chr2 // 93 // 97 // 28 // 30 // 0 /// ENST00000487581 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:19352012:19356912:-1 gene:ENSG00000143867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 68 // 68 // 21 // 31 // 1 /// AK122756 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ16288 fis, clone OCBBF2008724, highly similar to Protein odd-skipped-related 1. // chr2 // 68 // 68 // 21 // 31 // 1 /// GENSCAN00000027760 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:19352275:19353805:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0
NM_001008237 // RefSeq // Homo sapiens tetratricopeptide repeat domain 32 (TTC32), mRNA. // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000333610 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:19896753:19901986:-1 gene:ENSG00000183891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000402414 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:19896643:19901956:-1 gene:ENSG00000183891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC057850 // GenBank // Homo sapiens tetratricopeptide repeat domain 32, mRNA (cDNA clone MGC:71866 IMAGE:4795916), complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC050088 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5268509, with apparent retained intron. // chr2 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// ENST00000495698 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:19897026:19898477:-1 gene:ENSG00000183891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// GENSCAN00000027767 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:19896987:19901854:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_001006657 // RefSeq // Homo sapiens WD repeat domain 35 (WDR35), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NM_020779 // RefSeq // Homo sapiens WD repeat domain 35 (WDR35), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000281405 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:19910260:19990122:-1 gene:ENSG00000118965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000345530 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:19910260:19990131:-1 gene:ENSG00000118965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000414212 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:19913558:19990048:-1 gene:ENSG00000118965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 97 // 85 // 28 // 29 // 0 /// ENST00000445063 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:19913242:19975636:-1 gene:ENSG00000118965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 56 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000453014 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:19935032:19953871:-1 gene:ENSG00000118965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// AL832903 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp762F1313 (from clone DKFZp762F1313). // chr2 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// BC036659 // GenBank // Homo sapiens WD repeat domain 35, mRNA (cDNA clone MGC:33196 IMAGE:5266940), complete cds. // chr2 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000019605 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:19935471:19978862:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 41 // 41 // 14 // 34 // 1
NM_002381 // RefSeq // Homo sapiens matrilin 3 (MATN3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000407540 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:19992111:20012694:-1 gene:ENSG00000132031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000421259 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:19993037:20012665:-1 gene:ENSG00000132031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// AK290856 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76037 complete cds, highly similar to Homo sapiens matrilin 3 (MATN3), mRNA. // chr2 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC139907 // GenBank // Homo sapiens matrilin 3, mRNA (cDNA clone MGC:164801 IMAGE:40147495), complete cds. // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// EU541440 // GenBank // Homo sapiens cell-line HCS-2/8 matrilin-3 alternative transcript (MATN3) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr2 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000019612 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:19989755:20012631:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_014713 // RefSeq // Homo sapiens lysosomal protein transmembrane 4 alpha (LAPTM4A), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000175091 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:20032650:20052028:-1 gene:ENSG00000068697 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AY359028 // GenBank // Homo sapiens clone DNA19360 MTP (UNQ1846) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC000421 // GenBank // Homo sapiens lysosomal protein transmembrane 4 alpha, mRNA (cDNA clone MGC:8667 IMAGE:2964450), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC003158 // GenBank // Homo sapiens lysosomal protein transmembrane 4 alpha, mRNA (cDNA clone MGC:4121 IMAGE:2958870), complete cds. // chr2 // 90 // 100 // 26 // 29 // 0 /// BC093075 // GenBank // Homo sapiens lysosomal protein transmembrane 4 alpha, mRNA (cDNA clone MGC:111219 IMAGE:30402963), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// CR456758 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834C054D for gene LAPTM4A, lysosomal-associated protein transmembrane 4 alpha; complete cds, incl. stopcodon. // chr2 // 83 // 79 // 19 // 23 // 0 /// ENST00000483117 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:20033169:20035243:-1 gene:ENSG00000068697 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1 /// AK304433 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51463 complete cds, highly similar to Lysosomal-associated transmembrane protein 4A. // chr2 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// GENSCAN00000019617 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:20033205:20051520:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0
NM_022460 // RefSeq // Homo sapiens HCLS1 binding protein 3 (HS1BP3), mRNA. // chr2 // 97 // 94 // 28 // 29 // 0 /// ENST00000304031 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:20617822:20651089:-1 gene:ENSG00000118960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000402541 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:20634716:20651078:-1 gene:ENSG00000118960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000446825 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:20560448:20651082:-1 gene:ENSG00000118960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// BC050636 // GenBank // Homo sapiens HCLS1 binding protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:60121 IMAGE:5193161), complete cds. // chr2 // 96 // 84 // 25 // 26 // 0 /// BC057389 // GenBank HTC // Homo sapiens HCLS1 binding protein 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:5574764), with apparent retained intron. // chr2 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000019610 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:20618987:20651063:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0
NM_000384 // RefSeq // Homo sapiens apolipoprotein B (APOB), mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// ENST00000233242 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:21001429:21044073:-1 gene:ENSG00000084674 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// ENST00000399256 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:2:21024170:21043962:-1 gene:ENSG00000084674 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 42 // 19 // 19 // 0 /// BC051278 // GenBank // Homo sapiens apolipoprotein B (including Ag(x) antigen), mRNA (cDNA clone IMAGE:6270815), complete cds. // chr2 // 100 // 42 // 19 // 19 // 0 /// HM487065 // GenBank // Homo sapiens mutant Apo B 100 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 93 // 42 // 42 // 0 /// J02610 // GenBank // Human apolipoprotein B-100 mRNA, complete cds. // chr2 // 98 // 93 // 41 // 42 // 0 /// M14162 // GenBank // Human apolipoprotein B-100 mRNA, complete cds. // chr2 // 98 // 93 // 41 // 42 // 0 /// M15421 // GenBank // Human apolipoprotein B-100 mRNA, complete cds. // chr2 // 93 // 33 // 14 // 15 // 0 /// ENST00000616098 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:21001429:21043945:-1 gene:ENSG00000084674 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000047228 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:21001730:21043945:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 40 // 40 // 0
AF113010 // GenBank HTC // Homo sapiens PRO0397 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENST00000384155 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:22338886:22339003:-1 gene:ENSG00000206882 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT069514 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000463845 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:23996795:23997085:-1 gene:ENSG00000243847 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT069552 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_001142319 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 44 (C2orf44), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NM_025203 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 44 (C2orf44), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000295148 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:24029340:24047353:-1 gene:ENSG00000163026 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000406895 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:2:24029347:24047361:-1 gene:ENSG00000163026 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC035698 // GenBank // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 44, mRNA (cDNA clone MGC:46017 IMAGE:5547301), complete cds. // chr2 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000025396 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:24030933:24039494:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NM_016047 // RefSeq // Homo sapiens splicing factor 3b, subunit 6, 14kDa (SF3B6), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000233468 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:24067584:24076443:-1 gene:ENSG00000115128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// AF151868 // GenBank // Homo sapiens CGI-110 protein mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// AF184213 // GenBank // Homo sapiens ht006 protein mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// AF401310 // GenBank // Homo sapiens pre-mRNA branch site protein p14 mRNA, complete cds. // chr2 // 82 // 71 // 14 // 17 // 0 /// BC015463 // GenBank // Homo sapiens splicing factor 3B, 14 kDa subunit, mRNA (cDNA clone MGC:8723 IMAGE:3914184), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000478050 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:24073649:24076373:-1 gene:ENSG00000115128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 54 // 54 // 13 // 24 // 1 /// GENSCAN00000025403 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:24067762:24124137:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 54 // 54 // 13 // 24 // 1 /// NONHSAT069556 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 54 // 54 // 13 // 24 // 1
NM_199346 // RefSeq // Homo sapiens profilin family, member 4 (PFN4), mRNA. // chr2 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// XM_005264292 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens profilin family, member 4 (PFN4), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000313213 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:24115371:24123477:-1 gene:ENSG00000176732 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000465360 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:24115397:24123319:-1 gene:ENSG00000176732 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// AK292601 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75814 complete cds, highly similar to Homo sapiens profilin family, member 4 (PFN4), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC029523 // GenBank // Homo sapiens profilin family, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:33886 IMAGE:5297707), complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// BC043236 // GenBank // Homo sapiens profilin family, member 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:5295726). // chr2 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1 /// NONHSAT069575 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000025403 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:24067762:24124137:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1
ENST00000365560 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:24564630:24564738:-1 gene:ENSG00000202430 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT069594 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001013663 // RefSeq // Homo sapiens peptidyl-tRNA hydrolase domain containing 1 (PTRHD1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000328379 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:24789734:24793382:-1 gene:ENSG00000184924 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000467797 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:24790263:24791606:-1 gene:ENSG00000184924 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// BC073803 // GenBank // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 79, mRNA (cDNA clone MGC:88825 IMAGE:4896064), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000474668 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:24790266:24793074:-1 gene:ENSG00000184924 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// ENST00000480190 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:24790205:24793053:-1 gene:ENSG00000184924 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// ENST00000487316 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:24790275:24793090:-1 gene:ENSG00000184924 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONHSAT069599 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT069598 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONHSAT069600 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONHSAT069601 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_004036 // RefSeq // Homo sapiens adenylate cyclase 3 (ADCY3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000260600 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:24819169:24919839:-1 gene:ENSG00000138031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000405392 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:24819172:24919186:-1 gene:ENSG00000138031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000435135 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:24836982:24919839:-1 gene:ENSG00000138031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 90 // 38 // 9 // 10 // 0 /// ENST00000606682 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:2:24819172:24841636:-1 gene:ENSG00000138031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// AF033861 // GenBank // Homo sapiens type III adenylyl cyclase (AC-III) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC126235 // GenBank // Homo sapiens adenylate cyclase 3, mRNA (cDNA clone MGC:161513 IMAGE:8991951), complete cds. // chr2 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC144119 // GenBank // Homo sapiens adenylate cyclase 3, mRNA (cDNA clone MGC:177656 IMAGE:9052639), complete cds. // chr2 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000025391 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:24818674:24842497:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
ENST00000365609 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:24969388:24969477:-1 gene:ENSG00000202479 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT069624 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000384341 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:25008845:25008946:-1 gene:ENSG00000207069 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT069634 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000313031 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:25369136:25370687:-1 gene:ENSG00000235072 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA gene:ENSG00000179061 // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AF052121 // GenBank // Homo sapiens clone 23636 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AK098562 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ25696 fis, clone TST04563. // chr2 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// NONHSAT069654 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
AY358728 // GenBank // Homo sapiens clone DNA108758 GNNC2999 (UNQ2999) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000364290 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:25697076:25697188:-1 gene:ENSG00000201160 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT069668 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_018263 // RefSeq // Homo sapiens additional sex combs like transcriptional regulator 2 (ASXL2), mRNA. // chr2 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000336112 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:25737692:25878466:-1 gene:ENSG00000143970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000404843 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:25741925:25780309:-1 gene:ENSG00000143970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000435504 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:25733753:25878516:-1 gene:ENSG00000143970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AB084279 // GenBank // Homo sapiens ASXH2 mRNA for polycomb group protein, complete cds. // chr2 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// AK001760 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ10898 fis, clone NT2RP5003492. // chr2 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// BC042999 // GenBank // Homo sapiens additional sex combs like 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:44431 IMAGE:5297392), complete cds. // chr2 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0 /// BX648218 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686L2369 (from clone DKFZp686L2369). // chr2 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// FJ230888 // GenBank // Homo sapiens EPC1/ASXL2b fusion protein mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000032442 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:25558327:25810656:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0 /// AB084281 // GenBank // Homo sapiens mRNA for chimeric MOZ-ASXH2 fusion protein, complete cds. // chr2 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0
ENST00000599234 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:26028208:26028612:-1 gene:ENSG00000268412 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 75 // 67 // 9 // 12 // 0 /// GENSCAN00000047806 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:26028205:26028612:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_000182 // RefSeq // Homo sapiens hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/3-ketoacyl-CoA thiolase/enoyl-CoA hydratase (trifunctional protein), alpha subunit (HADHA), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000380649 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:26190635:26244726:-1 gene:ENSG00000084754 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// AK299258 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54509 complete cds, highly similar to Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial precursor. // chr2 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0 /// BC009235 // GenBank // Homo sapiens hydroxyacyl-Coenzyme A dehydrogenase/3-ketoacyl-Coenzyme A thiolase/enoyl-Coenzyme A hydratase (trifunctional protein), alpha subunit, mRNA (cDNA clone MGC:1728 IMAGE:2966432), complete cds. // chr2 // 93 // 94 // 14 // 15 // 0 /// D16480 // GenBank // Homo sapiens mRNA for mitochondrial enoyl-CoA hydratase/3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenese alpha-subunit of trifunctional protein, complete cds. // chr2 // 93 // 88 // 13 // 14 // 0 /// GU727642 // GenBank // Homo sapiens epididymis tissue sperm binding protein Li 14m mRNA, complete cds. // chr2 // 93 // 94 // 14 // 15 // 0 /// U04627 // GenBank // Human 78 kDa gastrin-binding protein mRNA, complete cds. // chr2 // 92 // 75 // 11 // 12 // 0 /// AK293398 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53969 complete cds, highly similar to Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial precursor. // chr2 // 56 // 56 // 9 // 16 // 1 /// GENSCAN00000047802 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:26191250:26244596:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 69 // 11 // 11 // 0
NM_001029881 // RefSeq // Homo sapiens calcium and integrin binding family member 4 (CIB4), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000288861 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:26581202:26641368:-1 gene:ENSG00000157884 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000403670 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:26581207:26605563:-1 gene:ENSG00000157884 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// BC127684 // GenBank // Homo sapiens calcium and integrin binding family member 4, mRNA (cDNA clone MGC:157771 IMAGE:40127392), complete cds. // chr2 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// BC127685 // GenBank // Homo sapiens calcium and integrin binding family member 4, mRNA (cDNA clone MGC:157772 IMAGE:40127393), complete cds. // chr2 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// BC140923 // GenBank // Homo sapiens calcium and integrin binding family member 4, mRNA (cDNA clone MGC:176600 IMAGE:9056735), complete cds. // chr2 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// ENST00000405346 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:26581340:26623627:-1 gene:ENSG00000157884 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// GENSCAN00000047804 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:26582821:26640609:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NM_178553 // RefSeq // Homo sapiens proline rich 30 (PRR30), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000335524 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:27136848:27139410:-1 gene:ENSG00000186143 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// BC045671 // GenBank // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 53, mRNA (cDNA clone MGC:44505 IMAGE:5298697), complete cds. // chr2 // 86 // 97 // 30 // 35 // 0 /// ENST00000432962 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:27137523:27139403:-1 gene:ENSG00000186143 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 47 // 47 // 17 // 36 // 1
NONHSAT072183 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 4 // 4 // 1
NM_003353 // RefSeq // Homo sapiens urocortin (UCN), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000296099 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:27307400:27308445:-1 gene:ENSG00000163794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC104470 // GenBank // Homo sapiens urocortin, mRNA (cDNA clone MGC:129974 IMAGE:40033510), complete cds. // chr2 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// BC104471 // GenBank // Homo sapiens urocortin, mRNA (cDNA clone MGC:129975 IMAGE:40033515), complete cds. // chr2 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// CR542244 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834B0226D for gene UCN, urocortin; complete cds, incl. stopcodon. // chr2 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000035543 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:27307521:27307895:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0
NM_001201459 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 513 (ZNF513), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NM_144631 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 513 (ZNF513), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_005264142 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens zinc finger protein 513 (ZNF513), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000323703 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:27377231:27380725:-1 gene:ENSG00000163795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000407879 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:2:27377235:27380444:-1 gene:ENSG00000163795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000436006 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:2:27378731:27380790:-1 gene:ENSG00000163795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// AB075875 // GenBank // Homo sapiens mRNA for putative protein product of HMFT0656, complete cds. // chr2 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AK290690 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76130 complete cds, highly similar to Homo sapiens zinc finger protein 513 (ZNF513), mRNA. // chr2 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AL833946 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp434E231 (from clone DKFZp434E231). // chr2 // 100 // 37 // 11 // 11 // 0 /// BC052282 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 513, mRNA (cDNA clone MGC:59968 IMAGE:5467936), complete cds. // chr2 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000035533 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:27377545:27380526:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 95 // 73 // 21 // 22 // 0
NR_002201 // RefSeq // Homo sapiens ferritin, heavy polypeptide 1 pseudogene 3 (FTH1P3), non-coding RNA. // chr2 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000394290 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:27392784:27393367:-1 gene:ENSG00000213453 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 53 // 9 // 9 // 0 /// BC073777 // GenBank // Homo sapiens ferritin, heavy polypeptide-like 3 pseudogene, mRNA (cDNA clone IMAGE:4559428). // chr2 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000035532 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:27393146:27393457:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 53 // 9 // 9 // 0 /// NONHSAT069771 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr2 // 100 // 53 // 9 // 9 // 0
ENST00000363133 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:27475494:27475595:-1 gene:ENSG00000200003 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT069780 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0
NM_022823 // RefSeq // Homo sapiens fibronectin type III domain containing 4 (FNDC4), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000264703 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:27491883:27495245:-1 gene:ENSG00000115226 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000476197 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:27492713:27494812:-1 gene:ENSG00000115226 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 95 // 58 // 20 // 21 // 0 /// ENST00000491414 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:27491901:27495162:-1 gene:ENSG00000115226 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// AY358136 // GenBank // Homo sapiens clone DNA167975 PSGC6389 (UNQ6389) mRNA, complete cds. // chr2 // 94 // 89 // 30 // 32 // 0 /// BC032725 // GenBank // Homo sapiens fibronectin type III domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:44971 IMAGE:5533159), complete cds. // chr2 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONHSAT069781 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000035538 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:27444432:27495283:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1
NM_001142683 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 121 (CCDC121), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 50 // 6 // 6 // 0 /// XM_005264560 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens coiled-coil domain containing 121 (CCDC121), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 50 // 6 // 6 // 0 /// AK124337 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ42346 fis, clone UTERU2002841. // chr2 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// NM_024584 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 121 (CCDC121), transcript variant 3, mRNA. // chr2 // 75 // 75 // 9 // 12 // 1 /// ENST00000324364 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:27625639:27629012:-1 gene:ENSG00000176714 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 75 // 75 // 9 // 12 // 1
ENST00000384004 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:27642043:27642169:-1 gene:ENSG00000206731 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT069789 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_022128 // RefSeq // Homo sapiens ribokinase (RBKS), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000302188 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:27781364:27891098:-1 gene:ENSG00000171174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000453412 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:27858501:27890681:-1 gene:ENSG00000171174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0 /// AY643715 // GenBank // Homo sapiens RBSK mRNA, complete cds. // chr2 // 93 // 88 // 27 // 29 // 0 /// BC017425 // GenBank // Homo sapiens ribokinase, mRNA (cDNA clone MGC:27415 IMAGE:4694872), complete cds. // chr2 // 96 // 85 // 27 // 28 // 0 /// NM_001287580 // RefSeq // Homo sapiens ribokinase (RBKS), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 91 // 91 // 30 // 33 // 1 /// ENST00000449378 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:27781573:27890366:-1 gene:ENSG00000171174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1 /// AK300989 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60169 complete cds, highly similar to Ribokinase (EC 2.7.1.15). // chr2 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1 /// ENST00000458185 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:27809687:27843161:-1 gene:ENSG00000171174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// GENSCAN00000035535 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:27781615:27890345:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0
NM_017910 // RefSeq // Homo sapiens tRNA methyltransferase 61 homolog B (S. cerevisiae) (TRMT61B), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000306108 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:28849821:28870301:-1 gene:ENSG00000171103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000419999 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:2:28849821:28851283:-1 gene:ENSG00000171103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 39 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000439947 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:28849840:28870295:-1 gene:ENSG00000171103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 74 // 17 // 17 // 0 /// BC000952 // GenBank // Homo sapiens tRNA methyltransferase 61 homolog B (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:4955 IMAGE:3450078), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC010365 // GenBank // Homo sapiens tRNA methyltransferase 61 homolog B (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:13425 IMAGE:4284118), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000490390 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:28851191:28861490:-1 gene:ENSG00000171103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1 /// GENSCAN00000022775 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:28842361:28875455:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 52 // 12 // 12 // 0 /// AK000635 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ20628 fis, clone KAT03903. // chr2 // 91 // 96 // 20 // 22 // 0 /// NONHSAT069852 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1
ENST00000410292 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:28927243:28927340:-1 gene:ENSG00000222224 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT069856 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000363413 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:28972414:28972521:-1 gene:ENSG00000200283 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT069859 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001029883 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 71 (C2orf71), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000331664 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:29061692:29074261:-1 gene:ENSG00000179270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000013328 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:29064869:29074261:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0
ENST00000496127 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:29681027:29681323:-1 gene:ENSG00000242699 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT069876 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_144575 // RefSeq // Homo sapiens calpain 13 (CAPN13), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000295055 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:30722771:30807446:-1 gene:ENSG00000162949 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000458085 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:30741374:30807426:-1 gene:ENSG00000162949 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000465960 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:30758046:30820542:-1 gene:ENSG00000162949 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// AK074418 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ23838 fis, clone KAT02256. // chr2 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// AK290298 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76080 complete cds, highly similar to Homo sapiens calpain 13 (CAPN13), mRNA. // chr2 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// BC117345 // GenBank // Homo sapiens calpain 13, mRNA (cDNA clone MGC:150954 IMAGE:40125896), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC117347 // GenBank // Homo sapiens calpain 13, mRNA (cDNA clone MGC:150956 IMAGE:40125898), complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENST00000450650 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:30722771:30743518:-1 gene:ENSG00000162949 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// BX647678 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp779O203 (from clone DKFZp779O203). // chr2 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// GENSCAN00000014245 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:30705090:30809466:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
AY358806 // GenBank // Homo sapiens clone DNA119530 VLCS3029 (UNQ3029) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_000379 // RefSeq // Homo sapiens xanthine dehydrogenase (XDH), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000379416 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:31334321:31414715:-1 gene:ENSG00000158125 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// D11456 // GenBank // Homo sapiens Xdha mRNA for xanthine dehydrogenase, complete cds. // chr2 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// U06117 // GenBank // Human xanthine dehydrogenase (XDH) mRNA, complete cds. // chr2 // 97 // 95 // 38 // 39 // 0 /// U39487 // GenBank // Human xanthine dehydrogenase/oxidase mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000000502 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:31303129:31429552:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 78 // 78 // 32 // 41 // 1
NM_000348 // RefSeq // Homo sapiens steroid-5-alpha-reductase, alpha polypeptide 2 (3-oxo-5 alpha-steroid delta 4-dehydrogenase alpha 2) (SRD5A2), mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// AK307235 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ97183. // chr2 // 93 // 48 // 13 // 14 // 0 /// BC112252 // GenBank // Homo sapiens steroid-5-alpha-reductase, alpha polypeptide 2 (3-oxo-5 alpha-steroid delta 4-dehydrogenase alpha 2), mRNA (cDNA clone MGC:138457 IMAGE:8327720), complete cds. // chr2 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC113641 // GenBank // Homo sapiens steroid-5-alpha-reductase, alpha polypeptide 2 (3-oxo-5 alpha-steroid delta 4-dehydrogenase alpha 2), mRNA (cDNA clone MGC:142201 IMAGE:8322693), complete cds. // chr2 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// EF560740 // GenBank // Homo sapiens clone DKFZp781N23150 SRD5A2 protein (SRD5A2) mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 83 // 23 // 24 // 0 /// M74047 // GenBank // Human steroid 5-alpha-reductase 2 (SRD5A2) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000622030 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:31522480:31581067:-1 gene:ENSG00000277893 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000000509 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:31526196:31580900:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1
ENST00000404956 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:31822591:31823436:-1 gene:ENSG00000237007 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000000501 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:31822622:31823817:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
ENST00000364243 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:32214456:32214562:-1 gene:ENSG00000201113 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT069970 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
ENST00000384224 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:32945339:32945451:-1 gene:ENSG00000206951 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT070005 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000390902 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:33285769:33285887:-1 gene:ENSG00000212204 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT070008 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_003143 // RefSeq // Homo sapiens myeloid-associated differentiation marker-like (pseudogene) (MYADML), non-coding RNA. // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000474610 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:33726061:33728207:-1 gene:ENSG00000239649 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000491596 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:33727038:33727988:-1 gene:ENSG00000239649 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr2 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// BC031088 // GenBank // Homo sapiens myeloid-associated differentiation marker-like, mRNA (cDNA clone IMAGE:5297847). // chr2 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0
NM_003162 // RefSeq // Homo sapiens striatin, calmodulin binding protein (STRN), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000263918 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:36843640:36966472:-1 gene:ENSG00000115808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000379213 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:36849406:36966471:-1 gene:ENSG00000115808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000495595 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:36869703:36902928:-1 gene:ENSG00000115808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 92 // 35 // 12 // 13 // 0 /// AK307836 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ97784. // chr2 // 92 // 35 // 12 // 13 // 0 /// BC106879 // GenBank // Homo sapiens striatin, calmodulin binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:125642 IMAGE:40027865), complete cds. // chr2 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000023703 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:36849456:36869729:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 38 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000031806 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:36877891:37083414:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 54 // 54 // 20 // 37 // 1
ENST00000516947 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:36867398:36867495:-1 gene:ENSG00000252756 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT070092 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_019024 // RefSeq // Homo sapiens HEAT repeat containing 5B (HEATR5B), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENST00000233099 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:36980897:37084342:-1 gene:ENSG00000008869 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// BC150605 // GenBank // Homo sapiens HEAT repeat containing 5B, mRNA (cDNA clone MGC:183515 IMAGE:9056975), complete cds. // chr2 // 95 // 100 // 41 // 43 // 0 /// BX648805 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686P15184 (from clone DKFZp686P15184). // chr2 // 100 // 65 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000031806 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:36877891:37083414:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 40 // 40 // 0
NM_001032377 // RefSeq // Homo sapiens sulfotransferase family, cytosolic, 6B, member 1 (SULT6B1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000407963 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:37167935:37196598:-1 gene:ENSG00000138068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000535679 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:37167820:37188640:-1 gene:ENSG00000138068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC140797 // GenBank // Homo sapiens sulfotransferase family, cytosolic, 6B, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:176474 IMAGE:9021665), complete cds. // chr2 // 91 // 100 // 20 // 22 // 0 /// BC144573 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:9053102. // chr2 // 95 // 86 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000031811 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:37107273:37188640:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 50 // 50 // 11 // 22 // 1
NM_005760 // RefSeq // Homo sapiens CCAAT/enhancer binding protein (C/EBP), zeta (CEBPZ), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENST00000234170 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:37201612:37231713:-1 gene:ENSG00000115816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENST00000489306 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:37201784:37212108:-1 gene:ENSG00000115816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 35 // 15 // 15 // 0 /// BC034475 // GenBank // Homo sapiens CCAAT/enhancer binding protein (C/EBP), zeta, mRNA (cDNA clone MGC:26288 IMAGE:4822708), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// M37197 // GenBank // Human CCAAT-box-binding factor (CBF) mRNA, complete cds. // chr2 // 97 // 91 // 38 // 39 // 0 /// ENST00000619061 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:37201723:37231579:-1 gene:ENSG00000115816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 97 // 91 // 38 // 39 // 0 /// GENSCAN00000031810 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:37201764:37231567:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 72 // 31 // 31 // 0
ENST00000494667 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:37267565:37317023:-1 gene:ENSG00000115825 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 94 // 34 // 17 // 18 // 0 /// AB015982 // GenBank // Homo sapiens EPK2 mRNA for serine/threonine kinase, complete cds. // chr2 // 95 // 42 // 21 // 22 // 0 /// BC030706 // GenBank // Homo sapiens protein kinase D3, mRNA (cDNA clone MGC:33062 IMAGE:5266769), complete cds. // chr2 // 94 // 34 // 17 // 18 // 0 /// ENST00000379066 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:37250502:37317894:-1 gene:ENSG00000115825 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 91 // 91 // 48 // 53 // 1 /// NM_005813 // RefSeq // Homo sapiens protein kinase D3 (PRKD3), mRNA. // chr2 // 42 // 42 // 22 // 53 // 1 /// ENST00000234179 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:37250505:37317079:-1 gene:ENSG00000115825 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 42 // 42 // 22 // 53 // 1 /// ENST00000469275 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:37256662:37279390:-1 gene:ENSG00000115825 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 19 // 19 // 10 // 53 // 1 /// AK122883 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ16531 fis, clone OCBBF2026144, highly similar to Protein kinase C, nu type (EC 2.7.1.-). // chr2 // 19 // 19 // 10 // 53 // 1 /// GENSCAN00000031816 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:37253177:37345178:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 34 // 18 // 18 // 0
ENST00000384634 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:37331770:37331876:-1 gene:ENSG00000207364 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT070120 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000517269 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:37435510:37435608:-1 gene:ENSG00000253078 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT070123 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001270436 // RefSeq // Homo sapiens CDC42 effector protein (Rho GTPase binding) 3 (CDC42EP3), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NM_006449 // RefSeq // Homo sapiens CDC42 effector protein (Rho GTPase binding) 3 (CDC42EP3), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000295324 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:37641889:37672191:-1 gene:ENSG00000163171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC019270 // GenBank // Homo sapiens CDC42 effector protein (Rho GTPase binding) 3, mRNA (cDNA clone MGC:3481 IMAGE:2823261), complete cds. // chr2 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NM_001270437 // RefSeq // Homo sapiens CDC42 effector protein (Rho GTPase binding) 3 (CDC42EP3), transcript variant 3, mRNA. // chr2 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// NM_001270438 // RefSeq // Homo sapiens CDC42 effector protein (Rho GTPase binding) 3 (CDC42EP3), transcript variant 4, mRNA. // chr2 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// ENST00000457889 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:37645941:37672199:-1 gene:ENSG00000163171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// ENST00000611976 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:37641882:37672535:-1 gene:ENSG00000163171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NM_000104 // RefSeq // Homo sapiens cytochrome P450, family 1, subfamily B, polypeptide 1 (CYP1B1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000494864 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:38070066:38109902:-1 gene:ENSG00000138061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 39 // 14 // 14 // 0 /// AK297039 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51600 complete cds, highly similar to Cytochrome P450 1B1 (EC 1.14.14.1). // chr2 // 100 // 64 // 23 // 23 // 0 /// BC012049 // GenBank // Homo sapiens cytochrome P450, family 1, subfamily B, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:19842 IMAGE:4662252), complete cds. // chr2 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// BT019979 // GenBank // Homo sapiens cytochrome P450, family 1, subfamily B, polypeptide 1 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// BT020001 // GenBank // Homo sapiens cytochrome P450, family 1, subfamily B, polypeptide 1 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// U03688 // GenBank // Human dioxin-inducible cytochrome P450 (CYP1B1) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// AK303862 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51599 complete cds, highly similar to Cytochrome P450 1B1 (EC 1.14.14.1). // chr2 // 36 // 36 // 13 // 36 // 1 /// ENST00000610745 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:38067507:38076181:-1 gene:ENSG00000138061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000614273 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:38070482:38076076:-1 gene:ENSG00000138061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000024342 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:38070722:38092768:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 56 // 20 // 20 // 0
NM_198963 // RefSeq // Homo sapiens DEAH (Asp-Glu-Ala-Asp/His) box polypeptide 57 (DHX57), mRNA. // chr2 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000452978 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:2:38797736:38848402:-1 gene:ENSG00000163214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 48 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000457308 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:38797729:38875908:-1 gene:ENSG00000163214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000474104 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:38853045:38875879:-1 gene:ENSG00000163214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 48 // 16 // 16 // 0 /// AF283512 // GenBank // Homo sapiens putative DEAH-box RNA/DNA helicase mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0 /// BC039270 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5296135. // chr2 // 96 // 76 // 24 // 25 // 0 /// BC060778 // GenBank // Homo sapiens DEAH (Asp-Glu-Ala-Asp/His) box polypeptide 57, mRNA (cDNA clone IMAGE:30338933), complete cds. // chr2 // 94 // 48 // 15 // 16 // 0 /// BC131534 // GenBank // Homo sapiens DEAH (Asp-Glu-Ala-Asp/His) box polypeptide 57, mRNA (cDNA clone MGC:141843 IMAGE:40082400), complete cds. // chr2 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000620517 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:38798280:38867238:-1 gene:ENSG00000163214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000622155 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:38797968:38875925:-1 gene:ENSG00000163214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000024343 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:38798299:38868411:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0
ENST00000384565 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:38884560:38884666:-1 gene:ENSG00000207295 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT070206 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NR_028386 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC375196 (LOC375196), long non-coding RNA. // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000601251 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:38959287:38960342:-1 gene:ENSG00000269210 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT070211 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_005633 // RefSeq // Homo sapiens son of sevenless homolog 1 (Drosophila) (SOS1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000395038 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:2:38985686:39120450:-1 gene:ENSG00000115904 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000402219 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:38981553:39120463:-1 gene:ENSG00000115904 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000426016 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:38981396:39121051:-1 gene:ENSG00000115904 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK290228 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76778 complete cds, highly similar to Homo sapiens son of sevenless homolog 1 (Drosophila) (SOS1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK301960 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53939 complete cds, highly similar to Son of sevenless homolog 1. // chr2 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// L13857 // GenBank // Human guanine nucleotide exchange factor mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000045026 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:38985824:39525801:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
NM_001009565 // RefSeq // Homo sapiens cyclin-dependent kinase-like 4 (CDKL4), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_006712003 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens cyclin-dependent kinase-like 4 (CDKL4), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000378803 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:39178547:39229532:-1 gene:ENSG00000205111 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000395035 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:2:39178547:39229532:-1 gene:ENSG00000205111 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000419111 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:39204527:39229588:-1 gene:ENSG00000205111 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 34 // 12 // 12 // 0 /// AY845084 // GenBank // Homo sapiens cyclin-dependent kinase-like 4 (CDKL4) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AY847283 // GenBank // Homo sapiens cyclin-dependent kinase-like 4 (CDKL4) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// BC144460 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:9052986. // chr2 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// XM_006712004 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens cyclin-dependent kinase-like 4 (CDKL4), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 43 // 43 // 15 // 35 // 1 /// ENST00000451199 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:2:39175646:39187707:-1 gene:ENSG00000205111 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 26 // 26 // 9 // 35 // 1 /// GENSCAN00000045026 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:38985824:39525801:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 66 // 66 // 23 // 35 // 1
ENST00000414823 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:41850203:41850601:-1 gene:ENSG00000236533 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000007879 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:41850203:41850601:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
ENST00000384489 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:41857271:41857372:-1 gene:ENSG00000207218 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT070292 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_133329 // RefSeq // Homo sapiens potassium voltage-gated channel, subfamily G, member 3 (KCNG3), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_172344 // RefSeq // Homo sapiens potassium voltage-gated channel, subfamily G, member 3 (KCNG3), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000306078 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:42442017:42494097:-1 gene:ENSG00000171126 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000394973 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:42442032:42493977:-1 gene:ENSG00000171126 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AB070604 // GenBank // Homo sapiens KV6.3 mRNA for voltage-gated K+ channel 6.3, complete cds. // chr2 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// AF348982 // GenBank // Homo sapiens voltage-gated potassium channel Kv10.1 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// AF454547 // GenBank // Homo sapiens voltage-gated potassium channel subunit Kv10.1a mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AF454548 // GenBank // Homo sapiens voltage-gated potassium channel subunit Kv10.1b mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC071558 // GenBank // Homo sapiens potassium voltage-gated channel, subfamily G, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:86973 IMAGE:4375480), complete cds. // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
NM_148962 // RefSeq // Homo sapiens oxoeicosanoid (OXE) receptor 1 (OXER1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000378661 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:42762481:42764261:-1 gene:ENSG00000162881 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB083055 // GenBank // Homo sapiens tg1019 mRNA for G-protein coupled receptor, complete cds. // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AY158687 // GenBank // Homo sapiens putative 5-oxo-ETE G-protein coupled receptor mRNA, complete cds. // chr2 // 94 // 67 // 17 // 18 // 0 /// BC063549 // GenBank // Homo sapiens oxoeicosanoid (OXE) receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:75428 IMAGE:4777971), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000049904 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:42762908:42789011:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
ENST00000384359 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:43091388:43091494:-1 gene:ENSG00000207087 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT070376 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_006887 // RefSeq // Homo sapiens ZFP36 ring finger protein-like 2 (ZFP36L2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000282388 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:43222402:43226609:-1 gene:ENSG00000152518 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC005010 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 36, C3H type-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:10502 IMAGE:3640393), complete cds. // chr2 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000620081 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:43224235:43226379:-1 gene:ENSG00000152518 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014358 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:43224319:43572930:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 91 // 91 // 30 // 33 // 1
ENST00000384680 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:43620878:43620984:-1 gene:ENSG00000207411 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT070396 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001101330 // RefSeq // Homo sapiens hCG1645220 (LOC728819), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000475092 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:43675380:43676322:-1 gene:ENSG00000223658 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014343 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:43675375:43681630:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
ENST00000516790 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:44154789:44154895:-1 gene:ENSG00000252599 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONHSAT070406 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NONHSAT070412 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_016932 // RefSeq // Homo sapiens SIX homeobox 2 (SIX2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000303077 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:45005161:45009430:-1 gene:ENSG00000170577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF136940 // GenBank // Homo sapiens sine oculis homeobox homolog 2 (SIX2) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// AF332197 // GenBank // Homo sapiens adult SIX2 (SIX2) mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC024033 // GenBank // Homo sapiens SIX homeobox 2, mRNA (cDNA clone MGC:4249 IMAGE:3027992), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BT020100 // GenBank // Homo sapiens sine oculis homeobox homolog 2 (Drosophila) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000024339 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:45006170:45009110:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
NM_018079 // RefSeq // Homo sapiens S1 RNA binding domain 1 (SRBD1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_005264398 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens S1 RNA binding domain 1 (SRBD1), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000263736 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:45388680:45611281:-1 gene:ENSG00000068784 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK301122 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57207 complete cds. // chr2 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// AK316222 // GenBank // Homo sapiens cDNA, FLJ79121 complete cds, highly similar to Homo sapiens S1 RNA binding domain 1 (SRBD1). // chr2 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// BC032538 // GenBank // Homo sapiens S1 RNA binding domain 1, mRNA (cDNA clone MGC:45074 IMAGE:5528417), complete cds. // chr2 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000024338 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:45389310:45643898:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0
ENST00000469545 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:45569199:45569492:-1 gene:ENSG00000239396 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT070462 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr2 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0
ENST00000480777 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:46448224:46448511:-1 gene:ENSG00000241791 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT070500 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_080653 // RefSeq // Homo sapiens ATPase, H+ transporting, lysosomal 31kDa, V1 subunit E2 (ATP6V1E2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000306448 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:46511847:46519957:-1 gene:ENSG00000250565 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB074759 // GenBank // Homo sapiens mRNA for V-ATPase E1 subunit, complete cds. // chr2 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC008981 // GenBank // Homo sapiens ATPase, H+ transporting, lysosomal 31kDa, V1 subunit E2, mRNA (cDNA clone MGC:9341 IMAGE:3456620), complete cds. // chr2 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC034808 // GenBank // Homo sapiens ATPase, H+ transporting, lysosomal 31kDa, V1 subunit E2, mRNA (cDNA clone MGC:35093 IMAGE:5167103), complete cds. // chr2 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// XM_005264633 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ATPase, H+ transporting, lysosomal 31kDa, V1 subunit E2 (ATP6V1E2), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// ENST00000522587 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:46511867:46542557:-1 gene:ENSG00000250565 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_002643 // RefSeq // Homo sapiens phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class F (PIGF), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 54 // 7 // 7 // 0 /// NM_173074 // RefSeq // Homo sapiens phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class F (PIGF), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000281382 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:46580937:46617119:-1 gene:ENSG00000151665 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 54 // 7 // 7 // 0 /// ENST00000306465 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:46581285:46617051:-1 gene:ENSG00000151665 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000412717 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:46581416:46617055:-1 gene:ENSG00000151665 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 54 // 7 // 7 // 0 /// AK291108 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77121 complete cds, highly similar to Homo sapiens phosphatidylinositol glycan, class F (PIGF), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 54 // 7 // 7 // 0 /// BC021725 // GenBank // Homo sapiens phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class F, mRNA (cDNA clone MGC:33136 IMAGE:5269689), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// BC029408 // GenBank // Homo sapiens phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class F, mRNA (cDNA clone MGC:32646 IMAGE:4664848), complete cds. // chr2 // 100 // 54 // 7 // 7 // 0
NM_173649 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 61 (C2orf61), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000294947 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:47128875:47155287:-1 gene:ENSG00000239605 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_001163561 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 61 (C2orf61), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// ENST00000445927 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:47086991:47155378:-1 gene:ENSG00000239605 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// ENST00000449846 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:47086991:47151295:-1 gene:ENSG00000239605 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1 /// GENSCAN00000018759 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:47086563:47155251:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000422269 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:47065941:47176511:-1 gene:ENSG00000273269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// AK309369 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99410. // chr2 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// NONHSAT070543 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr2 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
ENST00000410753 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:47359505:47359777:-1 gene:ENSG00000222685 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 76 // 77 // 13 // 17 // 0 /// NONHSAT070573 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 76 // 77 // 13 // 17 // 0
NM_022055 // RefSeq // Homo sapiens potassium channel, subfamily K, member 12 (KCNK12), mRNA. // chr2 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000327876 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:47516581:47570939:-1 gene:ENSG00000184261 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF287302 // GenBank // Homo sapiens tandem pore domain potassium channel THIK-2 (KCNK12) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC047749 // GenBank // Homo sapiens potassium channel, subfamily K, member 12, mRNA (cDNA clone MGC:54139 IMAGE:6186991), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000493527 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:47543344:47570315:-1 gene:ENSG00000184261 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// GENSCAN00000018755 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:47520907:47630033:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
ENST00000456046 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:47690716:47691246:-1 gene:ENSG00000230979 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000018746 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:47690716:47783529:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
ENST00000516080 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:48340687:48340826:-1 gene:ENSG00000251889 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT070620 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000365357 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:48501922:48502024:-1 gene:ENSG00000202227 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT070623 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000384188 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:49233794:49233899:-1 gene:ENSG00000206915 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT070639 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
ENST00000391278 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:49888868:49888986:-1 gene:ENSG00000212580 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT070642 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000516133 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:53470447:53470629:-1 gene:ENSG00000251942 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT070686 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000384725 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:53570374:53570480:-1 gene:ENSG00000207456 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONHSAT070688 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NONHSAT070702 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_006794 // RefSeq // Homo sapiens G protein-coupled receptor 75 (GPR75), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000394705 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:53852913:53859989:-1 gene:ENSG00000119737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AF072693 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 75 (GPR75) mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// BC067475 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 75, mRNA (cDNA clone MGC:79309 IMAGE:6971705), complete cds. // chr2 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// BC067476 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 75, mRNA (cDNA clone MGC:79310 IMAGE:6971810), complete cds. // chr2 // 93 // 58 // 13 // 14 // 0 /// GENSCAN00000039302 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:53853134:53971497:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0
NM_001003937 // RefSeq // Homo sapiens TSPY-like 6 (TSPYL6), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000317802 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:54253184:54256272:-1 gene:ENSG00000178021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC068576 // GenBank // Homo sapiens TSPY-like 6, mRNA (cDNA clone MGC:87554 IMAGE:4374337), complete cds. // chr2 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000039295 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:54254919:54256151:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0
ENST00000363216 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:55014418:55014521:-1 gene:ENSG00000200086 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT070757 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000459318 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:55451004:55451099:-1 gene:ENSG00000238619 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONHSAT070789 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
ENST00000459541 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:55456106:55456204:-1 gene:ENSG00000238493 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT070790 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_033109 // RefSeq // Homo sapiens polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1 (PNPT1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000260604 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:55635094:55693842:-1 gene:ENSG00000138035 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000415374 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:55634569:55693823:-1 gene:ENSG00000138035 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000415489 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:55647401:55671368:-1 gene:ENSG00000138035 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000447944 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:55634265:55693910:-1 gene:ENSG00000138035 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK307589 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ97537. // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AY027528 // GenBank // Homo sapiens 3-5 RNA exonuclease (OLD35) mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC053660 // GenBank // Homo sapiens polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:61565 IMAGE:6062060), complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000619878 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:55634063:55693910:-1 gene:ENSG00000138035 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024820 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:55636237:55693823:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// AK027437 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ14531 fis, clone NT2RM2000371. // chr2 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0
ENST00000365474 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:55951654:55952014:-1 gene:ENSG00000202344 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT070810 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NR_029630 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 217 (MIR217), microRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000384817 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:55982952:55983063:-1 gene:ENSG00000207548 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// hsa-mir-217 // miRBase Micro RNA Database // MI0000293 Homo sapiens miR-217 stem-loop // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT070814 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029629 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 216a (MIR216A), microRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000385063 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:55988950:55989059:-1 gene:ENSG00000207798 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-216a // miRBase Micro RNA Database // MI0000292 Homo sapiens miR-216a stem-loop // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT070816 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000447423 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:56175551:56184913:-1 gene:ENSG00000233251 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000596663 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:56173534:56184908:-1 gene:ENSG00000233251 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK096196 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ38877 fis, clone MESAN2015277. // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AK295617 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55309 complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XR_431428 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens uncharacterized LOC100129434 (AC007743.1), transcript variant X2, misc_RNA. // chr2 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// ENST00000432793 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:56174740:56185770:-1 gene:ENSG00000233251 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr2 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// AK311113 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ18155. // chr2 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// NONHSAT070822 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT070823 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT070821 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr2 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// NONHSAT070824 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr2 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
ENST00000362525 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:56235217:56235330:-1 gene:ENSG00000199395 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT070826 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000605365 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:60734895:60735715:-1 gene:ENSG00000271707 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000029889 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:60734890:60735718:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NONHSAT070906 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0
ENST00000489734 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:60831664:60831929:-1 gene:ENSG00000241524 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT070909 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_144709 // RefSeq // Homo sapiens pseudouridylate synthase 10 (PUS10), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// XM_006711952 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens pseudouridylate synthase 10 (PUS10), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000316752 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:60941969:61018254:-1 gene:ENSG00000162927 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000407787 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:60942225:61017193:-1 gene:ENSG00000162927 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000602599 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:60940222:61018259:-1 gene:ENSG00000162927 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// AK291729 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77651 complete cds. // chr2 // 97 // 95 // 38 // 39 // 0 /// BC101680 // GenBank // Homo sapiens pseudouridylate synthase 10, mRNA (cDNA clone MGC:126729 IMAGE:8069186), complete cds. // chr2 // 98 // 100 // 40 // 41 // 0 /// BC101706 // GenBank // Homo sapiens pseudouridylate synthase 10, mRNA (cDNA clone MGC:126755 IMAGE:8069212), complete cds. // chr2 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000025458 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:60942395:61018340:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 68 // 28 // 28 // 0
NR_036496 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC339803 (LOC339803), long non-coding RNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000420918 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:61141592:61144950:-1 gene:ENSG00000212978 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:lincRNA // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC008254 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone MGC:9921 IMAGE:3872056, complete cds. // chr2 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000417691 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:61143555:61144952:-1 gene:ENSG00000212978 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// NONHSAT070922 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONHSAT070923 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONHSAT070924 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// NONHSAT070926 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 94 // 57 // 15 // 16 // 0 /// TCONS_00002665-XLOC_002111 // Rinn lincRNA // linc-PUS10 chr2:-:61368726-61372110 // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// TCONS_00004269-XLOC_002111 // Rinn lincRNA // linc-PUS10 chr2:-:61367899-61372076 // chr2 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONHSAT070930 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NR_003707 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 70B (SNORA70B), small nucleolar RNA. // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000384210 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:61417244:61417378:-1 gene:ENSG00000206937 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT070960 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT070961 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
ENST00000618813 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:61928634:61928704:-1 gene:ENSG00000278523 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000468230 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:62262387:62262671:-1 gene:ENSG00000239958 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT071003 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_198276 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 17 (TMEM17), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006711965 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens transmembrane protein 17 (TMEM17), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000335390 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:62500221:62506341:-1 gene:ENSG00000186889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000479763 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:62500627:62511894:-1 gene:ENSG00000186889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000494919 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:62500635:62506469:-1 gene:ENSG00000186889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK091902 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ34583 fis, clone KIDNE2008666. // chr2 // 88 // 100 // 28 // 32 // 0 /// AK124081 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ42087 fis, clone TESOP2000739. // chr2 // 96 // 75 // 23 // 24 // 0 /// BC047439 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 17, mRNA (cDNA clone MGC:51350 IMAGE:5289095), complete cds. // chr2 // 90 // 91 // 26 // 29 // 0 /// GENSCAN00000033011 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:62467497:62506129:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
ENST00000516627 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:62726636:62726740:-1 gene:ENSG00000252436 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT071036 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_036635 // RefSeq // Homo sapiens diazepam binding inhibitor-like 5 pseudogene 2 (DBIL5P2), non-coding RNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000443827 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:63119011:63119263:-1 gene:ENSG00000242412 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr2 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000491724 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:63117851:63119542:-1 gene:ENSG00000242412 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF229803 // GenBank // Homo sapiens endozepine-like protein type 1 mutant mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT071052 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT071053 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0
ENST00000436998 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:63622178:63622831:-1 gene:ENSG00000228305 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000013532 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:63622175:63643787:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
ENST00000466177 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:64100398:64144362:-1 gene:ENSG00000197329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 38 // 13 // 13 // 0 /// AF300987 // GenBank // Homo sapiens pellino related intracellular signalling molecule (PRISM) mRNA, complete cds. // chr2 // 92 // 74 // 23 // 25 // 0 /// AF302505 // GenBank // Homo sapiens pellino 1 (PELI1) mRNA, complete cds. // chr2 // 91 // 97 // 30 // 33 // 0 /// AY364257 // GenBank // Homo sapiens clone peg2514 pellino (PELI1) mRNA, complete cds. // chr2 // 88 // 76 // 23 // 26 // 0 /// NM_020651 // RefSeq // Homo sapiens pellino E3 ubiquitin protein ligase 1 (PELI1), mRNA. // chr2 // 91 // 91 // 31 // 34 // 1 /// ENST00000358912 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:64092652:64144454:-1 gene:ENSG00000197329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 91 // 91 // 31 // 34 // 1 /// BC050019 // GenBank // Homo sapiens pellino homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:50990 IMAGE:5296990), complete cds. // chr2 // 91 // 91 // 31 // 34 // 1 /// BC063611 // GenBank // Homo sapiens pellino homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:70885 IMAGE:4992160), complete cds. // chr2 // 85 // 85 // 29 // 34 // 1 /// BX649152 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686C18116 (from clone DKFZp686C18116). // chr2 // 53 // 53 // 18 // 34 // 1 /// AK022261 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ12199 fis, clone MAMMA1000880. // chr2 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// GENSCAN00000025609 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:64094702:64122725:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 44 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT071088 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 100 // 38 // 13 // 13 // 0
ENST00000479658 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:64347193:64347741:-1 gene:ENSG00000236148 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000025588 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:64347266:64347739:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_014755 // RefSeq // Homo sapiens SERTA domain containing 2 (SERTAD2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_005264669 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens SERTA domain containing 2 (SERTAD2), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000313349 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:64631621:64653913:-1 gene:ENSG00000179833 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000363094 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:64834056:64834157:-1 gene:ENSG00000199964 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT071134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000485246 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:64906863:64907138:-1 gene:ENSG00000244534 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT071140 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NONHSAT071141 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000492123 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:65545401:65545696:-1 gene:ENSG00000243029 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT071189 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000406334 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:68131238:68261230:-1 gene:ENSG00000273398 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000614162 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:68130149:68261230:-1 gene:ENSG00000273398 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003782 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:68122479:68321046:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY183476 // GenBank // Homo sapiens HZGJ (HZGJ) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000406334 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:68131238:68261230:-1 gene:ENSG00000273398 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000614162 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:68130149:68261230:-1 gene:ENSG00000273398 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// AY183476 // GenBank // Homo sapiens HZGJ (HZGJ) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_001111101 // RefSeq // Homo sapiens cannabinoid receptor interacting protein 1 (CNRIP1), transcript variant CRIP1b, mRNA. // chr2 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// NM_015463 // RefSeq // Homo sapiens cannabinoid receptor interacting protein 1 (CNRIP1), transcript variant CRIP1a, mRNA. // chr2 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000263655 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:68293010:68320006:-1 gene:ENSG00000119865 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000409559 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:68284171:68319400:-1 gene:ENSG00000119865 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000481714 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:68293066:68320051:-1 gene:ENSG00000119865 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// AY144596 // GenBank // Homo sapiens cannabinoid receptor CB1-interacting protein 1 mRNA, complete cds. // chr2 // 83 // 44 // 10 // 12 // 0 /// BC011535 // GenBank // Homo sapiens cannabinoid receptor interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:17718 IMAGE:3870150), complete cds. // chr2 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// BC035125 // GenBank // Homo sapiens cannabinoid receptor interacting protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5263512). // chr2 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000409862 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:68315921:68319887:-1 gene:ENSG00000119865 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// AK308979 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99020. // chr2 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// GENSCAN00000003782 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:68122479:68321046:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_001024680 // RefSeq // Homo sapiens F-box protein 48 (FBXO48), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_005264407 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens F-box protein 48 (FBXO48), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_005264408 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens F-box protein 48 (FBXO48), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000377957 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:68459419:68467258:-1 gene:ENSG00000204923 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC089423 // GenBank // Homo sapiens F-box protein 48, mRNA (cDNA clone MGC:105016 IMAGE:3103174), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// DQ904332 // GenBank // Homo sapiens F-box only protein 48 (FBXO48) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_014482 // RefSeq // Homo sapiens bone morphogenetic protein 10 (BMP10), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000295379 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:68865481:68871517:-1 gene:ENSG00000163217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF101441 // GenBank // Homo sapiens bone morphogenetic protein 10 (BMP10) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC069080 // GenBank // Homo sapiens bone morphogenetic protein 10, mRNA (cDNA clone MGC:95355 IMAGE:7216894), complete cds. // chr2 // 95 // 75 // 20 // 21 // 0 /// BC101734 // GenBank // Homo sapiens bone morphogenetic protein 10, mRNA (cDNA clone MGC:126783 IMAGE:8069240), complete cds. // chr2 // 94 // 61 // 16 // 17 // 0 /// BC105063 // GenBank // Homo sapiens bone morphogenetic protein 10, mRNA (cDNA clone MGC:132723 IMAGE:8144066), complete cds. // chr2 // 94 // 61 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000046348 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:68865631:68871358:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0
NM_182536 // RefSeq // Homo sapiens gastrokine 2 (GKN2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000328895 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:68945232:68952970:-1 gene:ENSG00000183607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000481498 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:68945297:68952880:-1 gene:ENSG00000183607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// AF494509 // GenBank // Homo sapiens GDDR (GDDR) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY358664 // GenBank // Homo sapiens clone DNA57834 VLTI465 (UNQ465) mRNA, complete cds. // chr2 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// AY943908 // GenBank // Homo sapiens blottin precursor, mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC110809 // GenBank HTC // Homo sapiens gastrokine 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:5186851), with apparent retained intron. // chr2 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000046354 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:68935833:68975200:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_001244710 // RefSeq // Homo sapiens glutamine--fructose-6-phosphate transaminase 1 (GFPT1), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000357308 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:69319769:69387254:-1 gene:ENSG00000198380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000361060 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:69319780:69387248:-1 gene:ENSG00000198380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000493759 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:69350098:69363592:-1 gene:ENSG00000198380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 27 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000494201 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:69363611:69387250:-1 gene:ENSG00000198380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 90 // 23 // 9 // 10 // 0 /// NM_002056 // RefSeq // Homo sapiens glutamine--fructose-6-phosphate transaminase 1 (GFPT1), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 95 // 95 // 42 // 44 // 1 /// BC045641 // GenBank // Homo sapiens glutamine-fructose-6-phosphate transaminase 1, mRNA (cDNA clone MGC:41887 IMAGE:5298728), complete cds. // chr2 // 95 // 95 // 42 // 44 // 1 /// M90516 // GenBank // Human glutamine:fructose-6-phosphate amidotransferase (GFAT) mRNA, complete cds. // chr2 // 91 // 91 // 40 // 44 // 1 /// GENSCAN00000046345 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:69326189:69387307:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// NONHSAT071336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 90 // 23 // 9 // 10 // 0
NM_014911 // RefSeq // Homo sapiens AP2 associated kinase 1 (AAK1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000339092 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:69457995:69643845:-1 gene:ENSG00000115977 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSG00000188971 // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000606389 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:69457997:69466503:-1 gene:ENSG00000188971 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr2 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000046346 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:69465425:69690855:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 55 // 55 // 12 // 22 // 1
ENST00000406297 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:69481056:69643717:-1 gene:ENSG00000115977 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AB028971 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1048 protein, partial cds. // chr2 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC002695 // GenBank // Homo sapiens AP2 associated kinase 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3607681), complete cds. // chr2 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// BC104842 // GenBank // Homo sapiens AP2 associated kinase 1, mRNA (cDNA clone MGC:132502 IMAGE:8143845), complete cds. // chr2 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC111965 // GenBank // Homo sapiens AP2 associated kinase 1, mRNA (cDNA clone MGC:138170 IMAGE:8327433), complete cds. // chr2 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC143710 // GenBank // Homo sapiens AP2 associated kinase 1, mRNA (cDNA clone MGC:177241 IMAGE:9052224), complete cds. // chr2 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NM_014911 // RefSeq // Homo sapiens AP2 associated kinase 1 (AAK1), mRNA. // chr2 // 89 // 89 // 24 // 27 // 1 /// ENST00000409085 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:69467787:69643717:-1 gene:ENSG00000115977 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// ENST00000409068 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:69461400:69643654:-1 gene:ENSG00000115977 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// ENST00000339092 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:69457995:69643845:-1 gene:ENSG00000115977 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSG00000188971 // chr2 // 89 // 89 // 24 // 27 // 1 /// GENSCAN00000046346 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:69465425:69690855:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1
NR_003705 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 36C (SNORA36C), small nucleolar RNA. // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000384289 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:69520043:69520174:-1 gene:ENSG00000207016 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONHSAT071345 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_152792 // RefSeq // Homo sapiens aspartic peptidase, retroviral-like 1 (ASPRV1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000320256 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:69960089:69962265:-1 gene:ENSG00000244617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC094000 // GenBank // Homo sapiens aspartic peptidase, retroviral-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:121035 IMAGE:7939845), complete cds. // chr2 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0 /// BC094002 // GenBank // Homo sapiens aspartic peptidase, retroviral-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:121037 IMAGE:7939847), complete cds. // chr2 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000026385 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:69960657:70053761:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_017880 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 42 (C2orf42), mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// XM_005264390 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 42 (C2orf42), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// XM_005264391 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 42 (C2orf42), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000264434 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:70149880:70191071:-1 gene:ENSG00000115998 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000420306 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:70149898:70181995:-1 gene:ENSG00000115998 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC002825 // GenBank // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 42, mRNA (cDNA clone MGC:3447 IMAGE:3635986), complete cds. // chr2 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// BC005079 // GenBank // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 42, mRNA (cDNA clone MGC:13036 IMAGE:3615724), complete cds. // chr2 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000026387 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:70150356:70181985:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0
ENST00000482975 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:2:70281504:70293438:-1 gene:ENSG00000143977 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 64 // 9 // 9 // 0 /// BC035103 // GenBank // Homo sapiens small nuclear ribonucleoprotein polypeptide G, mRNA (cDNA clone MGC:43169 IMAGE:5262406), complete cds. // chr2 // 100 // 64 // 9 // 9 // 0
NM_032822 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 136, member A (FAM136A), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000037869 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:70295975:70302090:-1 gene:ENSG00000035141 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000450256 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:2:70297011:70302056:-1 gene:ENSG00000035141 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000460307 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:70295976:70302056:-1 gene:ENSG00000035141 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// AK027574 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ14668 fis, clone NT2RP2003194. // chr2 // 83 // 100 // 20 // 24 // 0 /// AK315877 // GenBank // Homo sapiens cDNA, FLJ79526 complete cds. // chr2 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// BC014975 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 136, member A, mRNA (cDNA clone MGC:23146 IMAGE:4903550), complete cds. // chr2 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000430566 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:2:70297176:70302045:-1 gene:ENSG00000035141 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 67 // 67 // 16 // 24 // 1 /// ENST00000438759 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:2:70297426:70301994:-1 gene:ENSG00000035141 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 46 // 46 // 11 // 24 // 1 /// ENST00000498665 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:70300508:70302012:-1 gene:ENSG00000035141 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1 /// GENSCAN00000026384 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:70297289:70302011:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0
NM_001004311 // RefSeq // Homo sapiens folliculogenesis specific basic helix-loop-helix (FIGLA), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000332372 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:70777310:70790643:-1 gene:ENSG00000183733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AY541030 // GenBank // Homo sapiens factor in the germline alpha (FIGLA) mRNA, complete cds. // chr2 // 91 // 100 // 20 // 22 // 0 /// BC039536 // GenBank HTC // Homo sapiens folliculogenesis specific basic helix-loop-helix, mRNA (cDNA clone IMAGE:5744748), with apparent retained intron. // chr2 // 89 // 86 // 17 // 19 // 0 /// GENSCAN00000000488 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:70767326:70790638:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 45 // 45 // 10 // 22 // 1
NM_001258027 // RefSeq // Homo sapiens C-type lectin domain family 4, member F (CLEC4F), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NM_173535 // RefSeq // Homo sapiens C-type lectin domain family 4, member F (CLEC4F), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000272367 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:70808643:70820600:-1 gene:ENSG00000152672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000426626 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:70808813:70820547:-1 gene:ENSG00000152672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// AK301242 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61608 complete cds, highly similar to C-type lectin domain family 4 member F. // chr2 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// BC139723 // GenBank // Homo sapiens C-type lectin domain family 4, member F, mRNA (cDNA clone MGC:129639 IMAGE:40007404), complete cds. // chr2 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// BC144652 // GenBank // Homo sapiens C-type lectin domain family 4, member F, mRNA (cDNA clone MGC:178200 IMAGE:9053183), complete cds. // chr2 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000000492 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:70808929:70820523:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0
NM_015717 // RefSeq // Homo sapiens CD207 molecule, langerin (CD207), mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000410009 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:70830214:70835822:-1 gene:ENSG00000116031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AJ242859 // GenBank // Homo sapiens mRNA for langerin protein. // chr2 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// BC022278 // GenBank // Homo sapiens CD207 molecule, langerin, mRNA (cDNA clone MGC:22374 IMAGE:4692155), complete cds. // chr2 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000498 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:70828215:70836007:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 93 // 52 // 13 // 14 // 0
NM_032601 // RefSeq // Homo sapiens methylmalonyl CoA epimerase (MCEE), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000244217 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:71109684:71130237:-1 gene:ENSG00000124370 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000413592 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:2:71109684:71124451:-1 gene:ENSG00000124370 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000486135 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:71124206:71130239:-1 gene:ENSG00000124370 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// AF364547 // GenBank // Homo sapiens methylmalonyl-CoA epimerase mRNA, complete cds; nuclear gene for mitochondrial product. // chr2 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// BC020825 // GenBank // Homo sapiens methylmalonyl CoA epimerase, mRNA (cDNA clone MGC:23899 IMAGE:4734422), complete cds. // chr2 // 93 // 97 // 26 // 28 // 0 /// XM_006712120 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens methylmalonyl CoA epimerase (MCEE), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1 /// ENST00000462609 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:71109814:71118384:-1 gene:ENSG00000124370 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// ENST00000494660 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:71124206:71130214:-1 gene:ENSG00000124370 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1 /// AB209469 // GenBank // Homo sapiens mRNA for methylmalonyl-CoA epimerase variant protein. // chr2 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1 /// NONHSAT071548 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NM_020459 // RefSeq // Homo sapiens poly(A) binding protein interacting protein 2B (PAIP2B), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000244221 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:71182739:71227083:-1 gene:ENSG00000124374 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK094335 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ37016 fis, clone BRACE2010632. // chr2 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// BC052312 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA similar to hypothetical protein MGC27648 (cDNA clone IMAGE:6671490). // chr2 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// GENSCAN00000000494 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:71166815:71257794:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
ENST00000363909 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:71379755:71379858:-1 gene:ENSG00000200779 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT071559 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_015189 // RefSeq // Homo sapiens exocyst complex component 6B (EXOC6B), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000272427 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:72175984:72826041:-1 gene:ENSG00000144036 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000410104 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:2:72461476:72826041:-1 gene:ENSG00000144036 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000410112 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:72496454:72826005:-1 gene:ENSG00000144036 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// AB023136 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA0919 protein, partial cds. // chr2 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// XM_005264224 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens exocyst complex component 6B (EXOC6B), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1 /// AK023791 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ13729 fis, clone PLACE3000121, weakly similar to VESICULAR TRAFFIC CONTROL PROTEIN SEC15. // chr2 // 46 // 46 // 11 // 24 // 1 /// GENSCAN00000031335 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:72179335:72591357:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0
NM_015470 // RefSeq // Homo sapiens RAB11 family interacting protein 5 (class I) (RAB11FIP5), mRNA. // chr2 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000258098 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:73073382:73113018:-1 gene:ENSG00000135631 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000482554 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:73073384:73084396:-1 gene:ENSG00000135631 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000486777 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:73073382:73080211:-1 gene:ENSG00000135631 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000493523 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:73073384:73089655:-1 gene:ENSG00000135631 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// AF334812 // GenBank // Homo sapiens Rab11 interacting protein Rip11a mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// AK023823 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ13761 fis, clone PLACE3000477, highly similar to Homo sapiens phosphoprotein pp75 mRNA. // chr2 // 89 // 60 // 16 // 18 // 0 /// BC035013 // GenBank // Homo sapiens RAB11 family interacting protein 5 (class I), mRNA (cDNA clone MGC:33435 IMAGE:5269818), complete cds. // chr2 // 92 // 80 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000018200 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:73075521:73112777:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0
NM_032319 // RefSeq // Homo sapiens protease-associated domain containing 1 (PRADC1), mRNA. // chr2 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000258083 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:73228006:73233228:-1 gene:ENSG00000135617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000480093 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:73228331:73233238:-1 gene:ENSG00000135617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 78 // 7 // 7 // 0 /// AY358605 // GenBank // Homo sapiens clone DNA76532 C2orf7 (UNQ833) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// BC005069 // GenBank // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 7, mRNA (cDNA clone MGC:13004 IMAGE:3530601), complete cds. // chr2 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000018204 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:73228454:73233160:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0
NM_001080410 // RefSeq // Homo sapiens F-box protein 41 (FBXO41), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// ENST00000295133 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:73254682:73269630:-1 gene:ENSG00000163013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// ENST00000520530 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:73258606:73284310:-1 gene:ENSG00000163013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 83 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000521871 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:73254690:73284431:-1 gene:ENSG00000163013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// GENSCAN00000018187 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:73254972:73269630:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 66 // 31 // 31 // 0
NM_001965 // RefSeq // Homo sapiens early growth response 4 (EGR4), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000436467 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:73290929:73293705:-1 gene:ENSG00000135625 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000545030 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:73290930:73293701:-1 gene:ENSG00000135625 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC034462 // GenBank HTC // Homo sapiens, clone IMAGE:5179180, mRNA. // chr2 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC136252 // GenBank // Homo sapiens early growth response 4, mRNA (cDNA clone MGC:167862 IMAGE:9020239), complete cds. // chr2 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC143379 // GenBank // Homo sapiens early growth response 4, mRNA (cDNA clone MGC:176902 IMAGE:9051885), complete cds. // chr2 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000018188 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:73291457:73307200:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_003960 // RefSeq // Homo sapiens N-acetyltransferase 8 (GCN5-related, putative) (NAT8), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000272425 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:73640832:73642393:-1 gene:ENSG00000144035 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// AB013094 // GenBank // Homo sapiens TSC501 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// AB019551 // GenBank // Homo sapiens GLA mRNA, complete cds. // chr2 // 81 // 89 // 13 // 16 // 0 /// AF187813 // GenBank // Homo sapiens putative N-acetyltransferase CML1 (CML1) mRNA, complete cds. // chr2 // 89 // 100 // 16 // 18 // 0 /// BC012626 // GenBank // Homo sapiens N-acetyltransferase 8 (GCN5-related, putative), mRNA (cDNA clone MGC:13677 IMAGE:4045439), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// CR407610 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834A092D for gene NAT8, N-acetyltransferase 8 (camello like) complete cds, without stopcodon. // chr2 // 100 // 50 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000018190 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:73620606:73641628:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 50 // 9 // 9 // 0
NM_016347 // RefSeq // Homo sapiens N-acetyltransferase 8B (GCN5-related, putative, gene/pseudogene) (NAT8B), mRNA. // chr2 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// AF185571 // GenBank // Homo sapiens putative N-acetyltransferase Camello 2 (CML2) mRNA, complete cds. // chr2 // 81 // 100 // 22 // 27 // 0 /// ENST00000377712 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:73700627:73701305:-1 gene:ENSG00000204872 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr2 // 86 // 78 // 18 // 21 // 0 /// GENSCAN00000018193 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:73700622:73706670:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0
ENST00000365006 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:73968123:73968206:-1 gene:ENSG00000201876 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr2 // 90 // 100 // 9 // 10 // 0 /// NONHSAT071646 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 90 // 100 // 9 // 10 // 0
NM_001035505 // RefSeq // Homo sapiens bolA family member 3 (BOLA3), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0 /// NM_212552 // RefSeq // Homo sapiens bolA family member 3 (BOLA3), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000327428 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:74135398:74147994:-1 gene:ENSG00000163170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000469676 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:74135415:74147912:-1 gene:ENSG00000163170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000477685 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:74135401:74145508:-1 gene:ENSG00000163170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 50 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000484655 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:74135401:74147912:-1 gene:ENSG00000163170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0 /// BC017744 // GenBank // Homo sapiens bolA-like 3 (E. coli), mRNA (cDNA clone IMAGE:4392561). // chr2 // 100 // 50 // 8 // 8 // 0 /// DQ225187 // GenBank // Homo sapiens bolA-like 3 (BOLA3) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000002970 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:74135593:74147874:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT071662 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0 /// NONHSAT071663 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0
NM_018221 // RefSeq // Homo sapiens MOB kinase activator 1A (MOB1A), mRNA. // chr2 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000396049 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:74152528:74178868:-1 gene:ENSG00000114978 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000495286 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:74159109:74178314:-1 gene:ENSG00000114978 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000497054 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:74159069:74178866:-1 gene:ENSG00000114978 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// AB016839 // GenBank // Homo sapiens mob1 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// AK001650 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ10788 fis, clone NT2RP4000498, moderately similar to MOB1 PROTEIN. // chr2 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC003398 // GenBank // Homo sapiens MOB1, Mps One Binder kinase activator-like 1B (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:4929 IMAGE:3448503), complete cds. // chr2 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000463975 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:74164022:74178868:-1 gene:ENSG00000114978 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// AK021657 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ11595 fis, clone HEMBA1003836, moderately similar to MOB1 PROTEIN. // chr2 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// GENSCAN00000002965 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:74156568:74178674:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT071671 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT071672 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
NM_001145054 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 81 (C2orf81), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000290390 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:74414178:74417717:-1 gene:ENSG00000159239 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000517883 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:74414177:74416583:-1 gene:ENSG00000159239 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000612891 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:74414176:74421560:-1 gene:ENSG00000159239 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000002968 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:74407797:74418442:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_053050 // RefSeq // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein L53 (MRPL53), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000258105 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:74471958:74473322:-1 gene:ENSG00000204822 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000409710 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:2:74471986:74472687:-1 gene:ENSG00000204822 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000454193 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:74471986:74482542:-1 gene:ENSG00000135637 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000467349 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:74471992:74472547:-1 gene:ENSG00000204822 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000468875 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:74471993:74472664:-1 gene:ENSG00000204822 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// BC012163 // GenBank // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein L53, mRNA (cDNA clone MGC:20402 IMAGE:4622995), complete cds. // chr2 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// AK075209 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ90728 fis, clone PLACE1009735. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000002974 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:74472119:74482837:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1
NM_001282430 // RefSeq // Homo sapiens ladybird homeobox 2 (LBX2), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000377566 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:74497517:74499716:-1 gene:ENSG00000179528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000550249 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:74497582:74503216:-1 gene:ENSG00000179528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// BC144442 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:9052967. // chr2 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// BC150517 // GenBank // Homo sapiens ladybird homeobox 2, mRNA (cDNA clone MGC:179663 IMAGE:40132747), complete cds. // chr2 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0 /// NM_001009812 // RefSeq // Homo sapiens ladybird homeobox 2 (LBX2), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// ENST00000460508 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:74497517:74503316:-1 gene:ENSG00000179528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// AY305861 // GenBank // Homo sapiens ladybird-like homeodomain protein 2 (LBX2) mRNA, complete cds. // chr2 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// ENST00000341396 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:74497582:74502984:-1 gene:ENSG00000179528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// GENSCAN00000002934 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:74497927:74499537:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0 /// NONHSAT071721 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0
NM_133637 // RefSeq // Homo sapiens DEAQ box RNA-dependent ATPase 1 (DQX1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000393951 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:74518131:74526191:-1 gene:ENSG00000144045 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000404568 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:74518131:74526336:-1 gene:ENSG00000144045 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000418139 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:74518131:74523925:-1 gene:ENSG00000144045 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000473508 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:74519586:74526281:-1 gene:ENSG00000144045 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000483555 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:74519586:74523302:-1 gene:ENSG00000144045 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// AK092420 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ35101 fis, clone PLACE6006418. // chr2 // 92 // 75 // 22 // 24 // 0 /// BC075018 // GenBank // Homo sapiens DEAQ box RNA-dependent ATPase 1, mRNA (cDNA clone MGC:104000 IMAGE:30915408), complete cds. // chr2 // 93 // 84 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000002972 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:74519036:74529721:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0
AF119878 // GenBank HTC // Homo sapiens PRO2353 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
NONHSAT071795 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000363618 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:76445079:76445410:-1 gene:ENSG00000200488 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONHSAT071817 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
ENST00000516138 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:76595413:76595678:-1 gene:ENSG00000251947 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT071821 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
BC024248 // GenBank // Homo sapiens cytochrome c, somatic pseudogene 6, mRNA (cDNA clone IMAGE:4815768). // chr2 // 83 // 100 // 19 // 23 // 0 /// NONHSAT071835 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT071846 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// TCONS_l2_00015845-XLOC_l2_008095 // Broad TUCP // linc-LRRTM4-4 chr2:-:78639672-78769187 // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_006507 // RefSeq // Homo sapiens regenerating islet-derived 1 beta (REG1B), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000305089 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:79085031:79087993:-1 gene:ENSG00000172023 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000454188 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:79085030:79086847:-1 gene:ENSG00000172023 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// BC027895 // GenBank // Homo sapiens regenerating islet-derived 1 beta, mRNA (cDNA clone MGC:34236 IMAGE:5227370), complete cds. // chr2 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// CR450322 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834G041D for gene REG1B, regenerating islet-derived 1 beta (pancreatic stone protein, pancreatic thread protein); complete cds; without stopcodon. // chr2 // 100 // 57 // 12 // 12 // 0 /// D16816 // GenBank // Homo sapiens mRNA for regenerating protein I beta, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000479258 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:79085540:79088019:-1 gene:ENSG00000172023 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 52 // 52 // 11 // 21 // 1 /// AK308507 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ98548. // chr2 // 52 // 52 // 11 // 21 // 1 /// ENST00000476554 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:79085875:79088017:-1 gene:ENSG00000172023 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1 /// AK308515 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ98556. // chr2 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1 /// NONHSAT071862 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1
NR_002714 // RefSeq // Homo sapiens regenerating islet-derived 1 pseudogene (REG1P), non-coding RNA. // chr2 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 /// ENST00000377435 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:79135503:79138427:-1 gene:ENSG00000204787 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000444841 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:79135503:79138427:-1 gene:ENSG00000204787 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000447469 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:79135701:79138030:-1 gene:ENSG00000204787 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr2 // 83 // 50 // 10 // 12 // 0 /// D56494 // GenBank // Homo sapiens mRNA for Reg-related sequence derived peptide-1, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// D56495 // GenBank // Homo sapiens mRNA for Reg-related sequence derived peptide-2, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT071867 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT071868 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// TCONS_l2_00015848-XLOC_l2_008100 // Broad TUCP // linc-REG1B chr2:-:79362628-79365528 // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000027813 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:79135427:79159405:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1
NM_002580 // RefSeq // Homo sapiens regenerating islet-derived 3 alpha (REG3A), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// NM_138937 // RefSeq // Homo sapiens regenerating islet-derived 3 alpha (REG3A), transcript variant 3, mRNA. // chr2 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// NM_138938 // RefSeq // Homo sapiens regenerating islet-derived 3 alpha (REG3A), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000305165 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:79157092:79159749:-1 gene:ENSG00000172016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000393878 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:79157007:79159753:-1 gene:ENSG00000172016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// AY544128 // GenBank // Homo sapiens proliferation-inducing protein 34 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// AY544130 // GenBank // Homo sapiens proliferation-inducing protein 42 mRNA, complete cds. // chr2 // 92 // 75 // 11 // 12 // 0 /// BC036776 // GenBank // Homo sapiens regenerating islet-derived 3 alpha, mRNA (cDNA clone MGC:46207 IMAGE:5749980), complete cds. // chr2 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// D13510 // GenBank // Homo sapiens mRNA for PAP homologous protein, complete cds. // chr2 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// M84337 // GenBank // Human pancreatitis associated protein mRNA, complete cds. // chr2 // 93 // 88 // 13 // 14 // 0 /// ENST00000409839 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:79157003:79159753:-1 gene:ENSG00000172016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 88 // 88 // 14 // 16 // 1 /// AK291973 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76569 complete cds, highly similar to Homo sapiens regenerating islet-derived 3 alpha (REG3A), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 69 // 69 // 11 // 16 // 1
ENST00000516222 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:79636862:79636963:-1 gene:ENSG00000252031 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT071882 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000364441 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:82307067:82307168:-1 gene:ENSG00000201311 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT071919 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000436601 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:85102389:85102694:-1 gene:ENSG00000225787 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT071972 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
ENST00000458902 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:85332895:85332996:-1 gene:ENSG00000239143 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT071987 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000363066 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:85460144:85460252:-1 gene:ENSG00000199936 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT072008 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000607168 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:9:32820261:32820350:1 gene:ENSG00000272113 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 50 // 100 // 2 // 4 // 0
ENST00000616400 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:85567662:85567960:-1 gene:ENSG00000276281 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT072020 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000362817 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:85728194:85728337:-1 gene:ENSG00000199687 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 79 // 73 // 15 // 19 // 0 /// NONHSAT072047 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 79 // 73 // 15 // 19 // 0
ENST00000516512 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:85820435:85820612:-1 gene:ENSG00000252321 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT072053 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000363371 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:86159956:86160066:-1 gene:ENSG00000200241 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT072093 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000365667 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:86347062:86347195:-1 gene:ENSG00000202537 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr2 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONHSAT072100 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
ENST00000363693 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:86515204:86515308:-1 gene:ENSG00000200563 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT072109 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001178100 // RefSeq // Homo sapiens CD8b molecule (CD8B), transcript variant 6, mRNA. // chr2 // 83 // 83 // 10 // 12 // 1 /// NM_172101 // RefSeq // Homo sapiens CD8b molecule (CD8B), transcript variant 3, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 1 /// NM_172102 // RefSeq // Homo sapiens CD8b molecule (CD8B), transcript variant 4, mRNA. // chr2 // 83 // 83 // 10 // 12 // 1 /// NM_172213 // RefSeq // Homo sapiens CD8b molecule (CD8B), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 83 // 83 // 10 // 12 // 1 /// ENST00000393759 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:86815347:86861915:-1 gene:ENSG00000172116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 1 /// ENST00000393761 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:86815339:86861924:-1 gene:ENSG00000172116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 83 // 83 // 10 // 12 // 1 /// ENST00000349455 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:86815450:86861915:-1 gene:ENSG00000172116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 67 // 67 // 8 // 12 // 1 /// BX647150 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686B15223 (from clone DKFZp686B15223). // chr2 // 67 // 67 // 8 // 12 // 1
ENST00000410792 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:88016354:88016547:-1 gene:ENSG00000222724 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT072171 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_016618 // RefSeq // Homo sapiens lysine-rich coiled-coil 1 (KRCC1), mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000347055 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:88027205:88055729:-1 gene:ENSG00000172086 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// BC015927 // GenBank // Homo sapiens lysine-rich coiled-coil 1, mRNA (cDNA clone MGC:8762 IMAGE:3908532), complete cds. // chr2 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC107580 // GenBank // Homo sapiens lysine-rich coiled-coil 1, mRNA (cDNA clone MGC:111153 IMAGE:4668988), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK025986 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ22333 fis, clone HRC05801, highly similar to AF217520 Homo sapiens uncharacterized bone marrow protein BM044 mRNA. // chr2 // 53 // 53 // 17 // 32 // 1 /// GENSCAN00000042842 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:87753976:88047212:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NONHSAT072183 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
ENST00000390831 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:88383494:88383597:-1 gene:ENSG00000212133 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT072194 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000516586 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:88414898:88415004:-1 gene:ENSG00000252395 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_004836 // RefSeq // Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 2-alpha kinase 3 (EIF2AK3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENST00000303236 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:88556743:88627576:-1 gene:ENSG00000172071 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENST00000415570 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:88557854:88595857:-1 gene:ENSG00000172071 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 62 // 27 // 28 // 0 /// ENST00000419748 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:2:88556741:88624929:-1 gene:ENSG00000172071 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 73 // 33 // 33 // 0 /// AF110146 // GenBank // Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 2 alpha kinase PEK mRNA, complete cds. // chr2 // 98 // 91 // 40 // 41 // 0 /// AF193339 // GenBank // Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 2 alpha kinase PEK mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// AK308312 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ98260. // chr2 // 93 // 62 // 26 // 28 // 0 /// BC126354 // GenBank // Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 2-alpha kinase 3, mRNA (cDNA clone MGC:161632 IMAGE:8992070), complete cds. // chr2 // 98 // 89 // 39 // 40 // 0 /// BC126356 // GenBank // Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 2-alpha kinase 3, mRNA (cDNA clone MGC:161634 IMAGE:8992072), complete cds. // chr2 // 98 // 89 // 39 // 40 // 0 /// CR749382 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp781H1925 (from clone DKFZp781H1925). // chr2 // 97 // 73 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000042845 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:88557736:88627274:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 78 // 35 // 35 // 0
BC005332 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone MGC:12418 IMAGE:3934658, complete cds. // chr2 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1
ENST00000357453 // ENSEMBL // havana_ig_gene:known chromosome:GRCh38:2:88915081:88915378:-1 gene:ENSG00000197794 gene_biotype:IG_V_pseudogene transcript_biotype:IG_V_pseudogene // chr2 // 85 // 57 // 11 // 13 // 0 /// GENSCAN00000025097 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:88915065:88922741:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 57 // 13 // 13 // 0 /// NONHSAT072273 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 85 // 57 // 11 // 13 // 0
ENST00000519785 // ENSEMBL // havana_ig_gene:known chromosome:GRCh38:2:90052581:90053372:1 gene:ENSG00000254220 gene_biotype:IG_V_pseudogene transcript_biotype:IG_V_pseudogene // chr2 // 92 // 100 // 11 // 12 // 0 /// ENST00000522607 // ENSEMBL // havana_ig_gene:known chromosome:GRCh38:2:89128724:89129483:-1 gene:ENSG00000254157 gene_biotype:IG_V_pseudogene transcript_biotype:IG_V_pseudogene // chr2 // 83 // 100 // 10 // 12 // 0 /// GENSCAN00000025116 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:89128685:89143108:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 75 // 9 // 9 // 0 /// NONHSAT072285 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 83 // 100 // 10 // 12 // 0 /// NONHSAT072330 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 92 // 100 // 11 // 12 // 0
ENST00000429992 // ENSEMBL // havana_ig_gene:known chromosome:GRCh38:2:89851791:89852493:1 gene:ENSG00000251039 gene_biotype:IG_V_gene transcript_biotype:IG_V_gene // chr2 // 93 // 100 // 13 // 14 // 0 /// ENST00000560045 // ENSEMBL // ensembl_ig_gene:known chromosome:GRCh38:2:89852186:89852497:1 gene:ENSG00000251039 gene_biotype:IG_V_gene transcript_biotype:IG_V_gene // chr2 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000620613 // ENSEMBL // havana_ig_gene:known chromosome:GRCh38:2:89330116:89330429:-1 gene:ENSG00000273962 gene_biotype:IG_V_gene transcript_biotype:IG_V_gene // chr2 // 86 // 100 // 12 // 14 // 0 /// ENST00000621595 // ENSEMBL // ensembl_ig_gene:known chromosome:GRCh38:2:89330110:89330421:-1 gene:ENSG00000273962 gene_biotype:IG_V_gene transcript_biotype:IG_V_gene // chr2 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000017896 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:89839624:89857170:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT072310 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NR_037597 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC442028 (LOC442028), long non-coding RNA. // chr2 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000568768 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:94867486:94947341:-1 gene:ENSG00000259848 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000582835 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:94868685:94947341:-1 gene:ENSG00000259848 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// BC042429 // GenBank // Homo sapiens hypothetical LOC442028, mRNA (cDNA clone MGC:42476 IMAGE:4822931), complete cds. // chr2 // 95 // 100 // 18 // 19 // 0 /// NONHSAT072427 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr2 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT072428 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr2 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT072429 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr2 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0
ENST00000620774 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:95003545:95003843:-1 gene:ENSG00000277591 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT072456 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_031902 // RefSeq // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein S5 (MRPS5), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000272418 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:95087207:95122000:-1 gene:ENSG00000144029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000345084 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:95087208:95121799:-1 gene:ENSG00000144029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000461916 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:95087324:95101953:-1 gene:ENSG00000144029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000482568 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:95087407:95106653:-1 gene:ENSG00000144029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// AB049940 // GenBank // Homo sapiens MRPS5 mRNA for mitochondrial ribosomal protein S5, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC014172 // GenBank // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein S5, mRNA (cDNA clone MGC:20735 IMAGE:4561399), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000475895 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:95103753:95121813:-1 gene:ENSG00000144029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// AK295812 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61282 complete cds, highly similar to Mitochondrial 28S ribosomal protein S5. // chr2 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// GENSCAN00000012149 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:95087357:95121791:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0
XM_005264033 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens zinc finger protein 514 (ZNF514), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006712806 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens zinc finger protein 514 (ZNF514), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000295208 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:95147937:95159607:-1 gene:ENSG00000144026 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000411425 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:95148303:95159337:-1 gene:ENSG00000144026 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000496060 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:95147330:95155691:-1 gene:ENSG00000144026 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// BC074900 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 514, mRNA (cDNA clone MGC:104036 IMAGE:30915480), complete cds. // chr2 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// BC074901 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 514, mRNA (cDNA clone MGC:103869 IMAGE:30915251), complete cds. // chr2 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// BC110524 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 514, mRNA (cDNA clone MGC:126229 IMAGE:40034154), complete cds. // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NM_032788 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 514 (ZNF514), mRNA. // chr2 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// BC110525 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 514, mRNA (cDNA clone MGC:126230 IMAGE:40034155), complete cds. // chr2 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// GENSCAN00000012136 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:95149282:95153253:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0
NM_001164464 // RefSeq // Homo sapiens tripartite motif containing 43B (TRIM43B), mRNA. // chr2 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// NM_138800 // RefSeq // Homo sapiens tripartite motif containing 43 (TRIM43), mRNA. // chr2 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000272395 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:95592018:95599778:1 gene:ENSG00000144015 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000422468 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:97025981:97031636:-1 gene:ENSG00000144188 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr2 // 90 // 63 // 26 // 29 // 0 /// ENST00000432468 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:95477164:95482714:-1 gene:ENSG00000144010 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr2 // 100 // 76 // 35 // 35 // 0 /// BC015353 // GenBank // Homo sapiens tripartite motif-containing 43, mRNA (cDNA clone MGC:21446 IMAGE:3445177), complete cds. // chr2 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000012131 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:95475659:95506683:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 50 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT072599 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 90 // 63 // 26 // 29 // 0 /// GENSCAN00000012127 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:95525579:95601077:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 63 // 63 // 29 // 46 // 1 /// GENSCAN00000041307 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:97024479:97059243:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 48 // 48 // 22 // 46 // 1
XM_003960295 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ankyrin repeat domain 36C (ANKRD36C), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 10 // 10 // 1 /// ENST00000456556 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:95851166:95991793:-1 gene:ENSG00000174501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 10 // 10 // 1 /// ENST00000612359 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:95836919:95855377:-1 gene:ENSG00000174501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
ENST00000484688 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:96004563:96004850:-1 gene:ENSG00000275961 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA gene:ENSG00000243039 // chr2 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT072529 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_000682 // RefSeq // Homo sapiens adrenoceptor alpha 2B (ADRA2B), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC133021 // GenBank // Homo sapiens adrenergic, alpha-2B-, receptor, mRNA (cDNA clone MGC:164652 IMAGE:40147043), complete cds. // chr2 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// BC136537 // GenBank // Homo sapiens adrenergic, alpha-2B-, receptor, mRNA (cDNA clone MGC:168150 IMAGE:9020527), complete cds. // chr2 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// ENST00000620793 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:96112875:96116245:-1 gene:ENSG00000274286 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000029171 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:96022159:96138436:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
NM_001002036 // RefSeq // Homo sapiens astacin-like metallo-endopeptidase (M12 family) (ASTL), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000342380 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:96123850:96138436:-1 gene:ENSG00000188886 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC107127 // GenBank // Homo sapiens astacin-like metallo-endopeptidase (M12 family), mRNA (cDNA clone MGC:129843 IMAGE:40023980), complete cds. // chr2 // 88 // 100 // 29 // 33 // 0 /// ENST00000470582 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:96133684:96137777:-1 gene:ENSG00000188886 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 39 // 39 // 13 // 33 // 1 /// GENSCAN00000029171 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:96022159:96138436:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 91 // 91 // 30 // 33 // 1
NM_004418 // RefSeq // Homo sapiens dual specificity phosphatase 2 (DUSP2), mRNA. // chr2 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000288943 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:96143166:96145440:-1 gene:ENSG00000158050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000488952 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:96143729:96144617:-1 gene:ENSG00000158050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// AF331843 // GenBank // Homo sapiens phosphatase mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// BC007771 // GenBank // Homo sapiens dual specificity phosphatase 2, mRNA (cDNA clone MGC:12703 IMAGE:4297852), complete cds. // chr2 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// L11329 // GenBank // Homo sapiens protein tyrosine phosphatase (PAC-1) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000029156 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:96143485:96165201:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_001193304 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 127 (TMEM127), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_017849 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 127 (TMEM127), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000258439 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:96248516:96265994:-1 gene:ENSG00000135956 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000432959 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:96251660:96265994:-1 gene:ENSG00000135956 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// AK293276 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52989 complete cds. // chr2 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// BC028575 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 127, mRNA (cDNA clone MGC:26185 IMAGE:4837629), complete cds. // chr2 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// BC039892 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 127, mRNA (cDNA clone MGC:47628 IMAGE:5725347), complete cds. // chr2 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000029169 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:96253808:96265381:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0
ENST00000480615 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:96284815:96289855:-1 gene:ENSG00000144028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 25 // 9 // 9 // 0 /// NM_014014 // RefSeq // Homo sapiens small nuclear ribonucleoprotein 200kDa (U5) (SNRNP200), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 1 /// ENST00000323853 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:96274336:96305515:-1 gene:ENSG00000144028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 1 /// AY572488 // GenBank // Homo sapiens 200 kDa U5 snRNP-specific spliceosomal protein (BRR2) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 1 /// GENSCAN00000029151 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:96275012:96305437:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 97 // 97 // 35 // 36 // 1
NM_016466 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat domain 39 (ANKRD39), mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000393537 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:96847985:96858095:-1 gene:ENSG00000213337 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000443120 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:96836611:96858014:-1 gene:ENSG00000213337 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// AF151034 // GenBank HTC // Homo sapiens HSPC200 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC031303 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat domain 39, mRNA (cDNA clone MGC:41816 IMAGE:5284947), complete cds. // chr2 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000041305 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:96848301:96857987:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
ENST00000517036 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:96956708:96956815:-1 gene:ENSG00000252845 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT072596 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONHSAT072597 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001164464 // RefSeq // Homo sapiens tripartite motif containing 43B (TRIM43B), mRNA. // chr2 // 90 // 100 // 18 // 20 // 0 /// NM_138800 // RefSeq // Homo sapiens tripartite motif containing 43 (TRIM43), mRNA. // chr2 // 90 // 100 // 18 // 20 // 0 /// ENST00000272395 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:95592018:95599778:1 gene:ENSG00000144015 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 90 // 100 // 18 // 20 // 0 /// ENST00000422468 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:97025981:97031636:-1 gene:ENSG00000144188 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000432468 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:95477164:95482714:-1 gene:ENSG00000144010 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr2 // 90 // 100 // 18 // 20 // 0 /// BC015353 // GenBank // Homo sapiens tripartite motif-containing 43, mRNA (cDNA clone MGC:21446 IMAGE:3445177), complete cds. // chr2 // 90 // 100 // 18 // 20 // 0 /// NONHSAT072599 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000012127 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:95525579:95601077:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 45 // 45 // 9 // 20 // 1 /// GENSCAN00000012131 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:95475659:95506683:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 45 // 45 // 9 // 20 // 1 /// GENSCAN00000041307 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:97024479:97059243:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 45 // 45 // 9 // 20 // 1
NM_025190 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat domain 36B (ANKRD36B), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// XM_006712662 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ankyrin repeat domain 36B (ANKRD36B), transcript variant X10, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000258459 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:97504798:97589965:-1 gene:ENSG00000196912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000359901 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:97492663:97589721:-1 gene:ENSG00000196912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 83 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000419390 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:97551312:97589815:-1 gene:ENSG00000196912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000438709 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:97504798:97589965:-1 gene:ENSG00000196912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000443455 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:97547565:97589864:-1 gene:ENSG00000196912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000041288 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:97402035:97637703:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 67 // 67 // 8 // 12 // 1
NM_005735 // RefSeq // Homo sapiens ARP1 actin-related protein 1 homolog B, centractin beta (yeast) (ACTR1B), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000289228 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:97655963:97664107:-1 gene:ENSG00000115073 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000451664 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:97657978:97663916:-1 gene:ENSG00000115073 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 94 // 59 // 15 // 16 // 0 /// BC004374 // GenBank // Homo sapiens ARP1 actin-related protein 1 homolog B, centractin beta (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:10568 IMAGE:3638252), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC006372 // GenBank // Homo sapiens ARP1 actin-related protein 1 homolog B, centractin beta (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:12805 IMAGE:4138683), complete cds. // chr2 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// BC010090 // GenBank // Homo sapiens ARP1 actin-related protein 1 homolog B, centractin beta (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:19650 IMAGE:2989545), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000041304 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:97656858:97669802:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0
ENST00000364936 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:97664591:97664731:-1 gene:ENSG00000201806 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT072665 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_015348 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 131 (TMEM131), mRNA. // chr2 // 100 // 81 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000186436 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:97756340:97995891:-1 gene:ENSG00000075568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 81 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000418629 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:97814349:97995544:-1 gene:ENSG00000075568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 90 // 21 // 9 // 10 // 0 /// AK297450 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55106 complete cds, highly similar to Transmembrane protein 131. // chr2 // 90 // 21 // 9 // 10 // 0 /// BC036841 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 131, mRNA (cDNA clone IMAGE:5213717), complete cds. // chr2 // 100 // 19 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000485245 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:97756333:97765317:-1 gene:ENSG00000075568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 25 // 25 // 12 // 48 // 1 /// BX647728 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686G2424 (from clone DKFZp686G2424). // chr2 // 25 // 25 // 12 // 48 // 1 /// GENSCAN00000033348 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:97757099:97817272:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 90 // 42 // 18 // 20 // 0 /// NONHSAT072683 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 25 // 25 // 12 // 48 // 1
NM_001008215 // RefSeq // Homo sapiens cytochrome c oxidase assembly factor 5 (COA5), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000328709 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:98599310:98608492:-1 gene:ENSG00000183513 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000466848 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:98600473:98605837:-1 gene:ENSG00000183513 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000483527 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:98600353:98608507:-1 gene:ENSG00000183513 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// BC047722 // GenBank // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 64, mRNA (cDNA clone MGC:52110 IMAGE:5748383), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000409997 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:2:98602382:98608515:-1 gene:ENSG00000183513 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 58 // 58 // 14 // 24 // 1 /// ENST00000480666 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:98600519:98604790:-1 gene:ENSG00000183513 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 46 // 46 // 11 // 24 // 1 /// NONHSAT072710 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT072711 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT072712 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000033351 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:98593068:98608405:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1
NM_207362 // RefSeq // Homo sapiens KIAA1211-like (KIAA1211L), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_005263923 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens KIAA1211-like (KIAA1211L), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_005263925 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens KIAA1211-like (KIAA1211L), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000397899 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:98793846:98936259:-1 gene:ENSG00000196872 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000423771 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:2:98826988:98869362:-1 gene:ENSG00000196872 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000428096 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:2:98832348:98936203:-1 gene:ENSG00000196872 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000462314 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:98826975:98936174:-1 gene:ENSG00000196872 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// BC068277 // GenBank // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 55, mRNA (cDNA clone MGC:42367 IMAGE:4820685), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000612523 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:98793846:98936215:-1 gene:ENSG00000196872 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000021271 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:98794554:98846800:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// NONHSAT072728 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0
NM_174898 // RefSeq // Homo sapiens lysozyme G-like 1 (LYG1), mRNA. // chr2 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// XM_005263871 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens lysozyme G-like 1 (LYG1), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000308528 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:99284238:99301176:-1 gene:ENSG00000144214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000409448 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:99284257:99304742:-1 gene:ENSG00000144214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AY358988 // GenBank // Homo sapiens clone DNA96867 SALW1939 (UNQ1939) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC029126 // GenBank // Homo sapiens lysozyme G-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:35380 IMAGE:5184582), complete cds. // chr2 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000021263 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:99171331:99333210:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 50 // 50 // 11 // 22 // 1
NM_005783 // RefSeq // Homo sapiens thioredoxin domain containing 9 (TXNDC9), mRNA. // chr2 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000264255 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:99318982:99336462:-1 gene:ENSG00000115514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000409434 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:99321534:99336333:-1 gene:ENSG00000115514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 42 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000422767 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:99319508:99333242:-1 gene:ENSG00000115514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 42 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000463385 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:99321561:99336310:-1 gene:ENSG00000115514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 42 // 10 // 10 // 0 /// AB006679 // GenBank // Homo sapiens mRNA for ATP binding protein, complete cds. // chr2 // 89 // 79 // 17 // 19 // 0 /// BC005968 // GenBank // Homo sapiens thioredoxin domain containing 9, mRNA (cDNA clone MGC:14620 IMAGE:4073821), complete cds. // chr2 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// BC022864 // GenBank // Homo sapiens thioredoxin domain containing 9, mRNA (cDNA clone MGC:23721 IMAGE:4096526), complete cds. // chr2 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0 /// BC024223 // GenBank // Homo sapiens thioredoxin domain containing 9, mRNA (cDNA clone MGC:23755 IMAGE:4107372), complete cds. // chr2 // 100 // 42 // 10 // 10 // 0 /// BC070183 // GenBank // Homo sapiens thioredoxin domain containing 9, mRNA (cDNA clone MGC:88164 IMAGE:4551680), complete cds. // chr2 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0
NM_198461 // RefSeq // Homo sapiens LON peptidase N-terminal domain and ring finger 2 (LONRF2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000393437 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:100273291:100322733:-1 gene:ENSG00000170500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000409647 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:100283542:100309505:-1 gene:ENSG00000170500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC101662 // GenBank // Homo sapiens LON peptidase N-terminal domain and ring finger 2, mRNA (cDNA clone MGC:126711 IMAGE:8069168), complete cds. // chr2 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// BC101664 // GenBank // Homo sapiens LON peptidase N-terminal domain and ring finger 2, mRNA (cDNA clone MGC:126713 IMAGE:8069170), complete cds. // chr2 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// DQ020495 // GenBank // Homo sapiens neuroblastoma apoptosis-related protease mRNA, complete cds. // chr2 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000016694 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:100262888:100339475:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
ENST00000595083 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:100370255:100370545:-1 gene:ENSG00000269383 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000016701 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:100370243:100377623:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001102426 // RefSeq // Homo sapiens TBC1 domain family, member 8 (with GRAM domain) (TBC1D8), mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// XM_005263862 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens TBC1 domain family, member 8 (with GRAM domain) (TBC1D8), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// ENST00000376840 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:101007617:101151253:-1 gene:ENSG00000204634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 94 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000409318 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:101007617:101151384:-1 gene:ENSG00000204634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 94 // 44 // 44 // 0 /// AB449889 // GenBank // Homo sapiens TBC1D8A mRNA for TBC1 domain family, member 8A, complete cds. // chr2 // 100 // 91 // 43 // 43 // 0 /// AK292826 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76128 complete cds, highly similar to Homo sapiens TBC1 domain family, member 8 (with GRAM domain) (TBC1D8), mRNA. // chr2 // 98 // 94 // 43 // 44 // 0 /// AK300533 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58691 complete cds, highly similar to Mus musculus TBC1 domain family, member 8 (Tbc1d8), mRNA. // chr2 // 34 // 34 // 16 // 47 // 1 /// AK000748 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ20741 fis, clone HEP06932, highly similar to AB024057 Homo sapiens mRNA for vascular Rab-GAP/TBC-containing. // chr2 // 17 // 17 // 8 // 47 // 1 /// GENSCAN00000043716 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:101007821:101151253:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 83 // 39 // 39 // 0 /// AB024057 // GenBank // Homo sapiens mRNA for vascular Rab-GAP/TBC-containing protein, complete cds. // chr2 // 94 // 100 // 44 // 47 // 0
NM_173647 // RefSeq // Homo sapiens ring finger protein 149 (RNF149), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_005263920 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ring finger protein 149 (RNF149), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// XM_005263921 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ring finger protein 149 (RNF149), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000295317 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:101276091:101308696:-1 gene:ENSG00000163162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AY450390 // GenBank // Homo sapiens DNA polymerase-transactivated protein 2 (DNAPTP2) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// BC019355 // GenBank // Homo sapiens ring finger protein 149, mRNA (cDNA clone MGC:13104 IMAGE:3956746), complete cds. // chr2 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// BC032328 // GenBank // Homo sapiens ring finger protein 149, mRNA (cDNA clone MGC:40400 IMAGE:5106286), complete cds. // chr2 // 97 // 94 // 28 // 29 // 0 /// BC045743 // GenBank // Homo sapiens ring finger protein 149, mRNA (cDNA clone MGC:48430 IMAGE:5260812), complete cds. // chr2 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000424632 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:101271222:101308701:-1 gene:ENSG00000163162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 84 // 84 // 26 // 31 // 1 /// AK129799 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ26288 fis, clone DMC06933. // chr2 // 84 // 84 // 26 // 31 // 1 /// GENSCAN00000043714 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:101274101:101308588:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
NM_153836 // RefSeq // Homo sapiens cellular repressor of E1A-stimulated genes 2 (CREG2), mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000324768 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:101345551:101387595:-1 gene:ENSG00000175874 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000486966 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:101382926:101387466:-1 gene:ENSG00000175874 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// AB046109 // GenBank // Homo sapiens hCREG2 mRNA for CREG2, complete cds. // chr2 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// BC032949 // GenBank // Homo sapiens cellular repressor of E1A-stimulated genes 2, mRNA (cDNA clone MGC:33323 IMAGE:4814957), complete cds. // chr2 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC047514 // GenBank // Homo sapiens cellular repressor of E1A-stimulated genes 2, mRNA (cDNA clone MGC:48471 IMAGE:5276849), complete cds. // chr2 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000043713 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:101343136:101387682:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1
NM_001145664 // RefSeq // Homo sapiens RFX family member 8, lacking RFX DNA binding domain (RFX8), mRNA. // chr2 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000428343 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:101397404:101474703:-1 gene:ENSG00000196460 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 95 // 73 // 21 // 22 // 0 /// ENST00000481179 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:101397361:101474703:-1 gene:ENSG00000196460 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// AK124976 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ42986 fis, clone BRTHA2008535. // chr2 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// AK131289 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ16242 fis, clone HCASM2009424. // chr2 // 95 // 73 // 21 // 22 // 0 /// AK298610 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52890 complete cds. // chr2 // 95 // 73 // 21 // 22 // 0
AF083117 // GenBank // Homo sapiens CATX-1 mRNA, partial cds. // chr2 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
ENST00000481111 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:106288803:106289053:-1 gene:ENSG00000230353 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022278 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:106275979:106289104:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 89 // 76 // 17 // 19 // 0 /// NONHSAT073012 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT073013 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XR_251142 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens uncharacterized LOC644903 (FLJ38668), misc_RNA. // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// AK095987 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ38668 fis, clone HLUNG2008439. // chr2 // 92 // 100 // 11 // 12 // 0 /// BC004487 // GenBank // Homo sapiens hypothetical LOC644903, mRNA (cDNA clone MGC:10701 IMAGE:3832541), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000322353 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:108507515:108534196:-1 gene:ENSG00000214184 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT073104 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_022336 // RefSeq // Homo sapiens ectodysplasin A receptor (EDAR), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000258443 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:108894471:108989372:-1 gene:ENSG00000135960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000376651 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:108894478:108989372:-1 gene:ENSG00000135960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000409271 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:108894471:108989269:-1 gene:ENSG00000135960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AF130988 // GenBank // Homo sapiens ectodysplasin-A receptor protein (EDAR) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AK296936 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57029 complete cds, highly similar to Tumor necrosis factor receptor superfamily member EDAR precursor. // chr2 // 84 // 94 // 27 // 32 // 0 /// BC093870 // GenBank // Homo sapiens ectodysplasin A receptor, mRNA (cDNA clone MGC:120905 IMAGE:7939715), complete cds. // chr2 // 89 // 82 // 25 // 28 // 0 /// BC093872 // GenBank // Homo sapiens ectodysplasin A receptor, mRNA (cDNA clone MGC:120907 IMAGE:7939717), complete cds. // chr2 // 82 // 82 // 23 // 28 // 0 /// GENSCAN00000007195 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:108896907:108931014:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0
ENST00000434894 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:109737139:109737523:-1 gene:ENSG00000233707 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000401483 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:110633947:110634333:1 gene:ENSG00000216867 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 54 // 100 // 14 // 26 // 0
NM_005434 // RefSeq // Homo sapiens mal, T-cell differentiation protein-like (MALL), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000272462 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:110083870:110116566:-1 gene:ENSG00000144063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000424988 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:110085712:110115821:-1 gene:ENSG00000144063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000568189 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:110245591:110285856:1 gene:ENSG00000261760 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr2 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// BC003179 // GenBank // Homo sapiens mal, T-cell differentiation protein-like, mRNA (cDNA clone MGC:4419 IMAGE:2958058), complete cds. // chr2 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000427178 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:2:110085023:110116022:-1 gene:ENSG00000144063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// GENSCAN00000016824 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:110085695:110115792:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// TCONS_l2_00013891-XLOC_l2_007489 // Broad TUCP // linc-ACOXL-3 chr2:+:111003113-111045267 // chr2 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0
NR_122074 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC400997 (LOC400997), long non-coding RNA. // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000376593 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:111098345:111114185:-1 gene:ENSG00000204581 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr2 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT073611 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr2 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0
NM_152515 // RefSeq // Homo sapiens cytoskeleton associated protein 2-like (CKAP2L), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000302450 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:112736607:112764677:-1 gene:ENSG00000169607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000481732 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:112756775:112764618:-1 gene:ENSG00000169607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// AK292530 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76452 complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK302875 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55314 complete cds, weakly similar to Cytoskeleton-associated protein 2. // chr2 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// AL832036 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp313A1610 (from clone DKFZp313A1610). // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC036217 // GenBank // Homo sapiens cytoskeleton associated protein 2-like, mRNA (cDNA clone MGC:39683 IMAGE:5270339), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000435431 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:112737867:112764617:-1 gene:ENSG00000169607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 92 // 92 // 24 // 26 // 1 /// ENST00000474331 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:112742431:112756074:-1 gene:ENSG00000169607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000020350 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:112738823:112783770:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT073724 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0
NM_000575 // RefSeq // Homo sapiens interleukin 1, alpha (IL1A), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000263339 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:112773915:112784590:-1 gene:ENSG00000115008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// BC013142 // GenBank // Homo sapiens interleukin 1, alpha, mRNA (cDNA clone MGC:9225 IMAGE:3875617), complete cds. // chr2 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// BT007014 // GenBank // Homo sapiens interleukin 1, alpha mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// CR457414 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834B0914D for gene IL1A, interleukin 1, alpha; complete cds, incl. stopcodon. // chr2 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// M15329 // GenBank // Human interleukin 1-alpha (IL1A) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// M28983 // GenBank // Homo sapiens interleukin 1 alpha (IL 1) mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 82 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000020350 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:112738823:112783770:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 47 // 47 // 16 // 34 // 1
NM_173178 // RefSeq // Homo sapiens interleukin 36, beta (IL36B), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000327407 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:113027433:113052867:-1 gene:ENSG00000136696 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// AF200494 // GenBank // Homo sapiens interleukin-1 homolog 2 mRNA, complete cds. // chr2 // 90 // 70 // 19 // 21 // 0 /// AF201833 // GenBank // Homo sapiens FIL1 eta mRNA, complete cds. // chr2 // 94 // 60 // 17 // 18 // 0 /// BC101831 // GenBank // Homo sapiens interleukin 1 family, member 8 (eta), mRNA (cDNA clone MGC:126880 IMAGE:8069337), complete cds. // chr2 // 80 // 50 // 12 // 15 // 0 /// BC101833 // GenBank // Homo sapiens interleukin 1 family, member 8 (eta), mRNA (cDNA clone MGC:126882 IMAGE:8069339), complete cds. // chr2 // 80 // 50 // 12 // 15 // 0 /// NM_014438 // RefSeq // Homo sapiens interleukin 36, beta (IL36B), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// ENST00000259213 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:113022091:113052867:-1 gene:ENSG00000136696 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// GENSCAN00000020334 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:113027903:113031709:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0
NM_001097 // RefSeq // Homo sapiens acrosin (ACR), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000216139 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:50738196:50745334:1 gene:ENSG00000100312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000527761 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:50744144:50744910:1 gene:ENSG00000100312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 55 // 12 // 12 // 0 /// CR456366 // GenBank // Homo sapiens ACR full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.ACR.V3). // chr2 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// Y00970 // GenBank // Human mRNA for acrosin (EC 3.4.21.10). // chr2 // 82 // 100 // 18 // 22 // 0 /// ENST00000419351 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:113667478:113668621:-1 gene:ENSG00000175509 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000016254 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:50738236:50745207:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000024797 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:113667479:113756409:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT087538 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 100 // 55 // 12 // 12 // 0 /// TCONS_l2_00014840-XLOC_l2_008217 // Broad TUCP // linc-PAX8-4 chr2:-:114425312-114426158 // chr2 // 87 // 68 // 13 // 15 // 0
NONHSAT073846 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000390880 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:114005440:114005655:-1 gene:ENSG00000212182 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT073861 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NONHSAT073864 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_019044 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 93 (CCDC93), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000319432 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:2:117915478:118014133:-1 gene:ENSG00000125633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000376300 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:117915478:118014133:-1 gene:ENSG00000125633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000437999 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:117920305:117948179:-1 gene:ENSG00000125633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000460781 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:117951489:117996289:-1 gene:ENSG00000125633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// AK290722 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76711 complete cds, highly similar to Homo sapiens coiled-coil domain containing 93, mRNA. // chr2 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// AK309040 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99081. // chr2 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// BC028609 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 93, mRNA (cDNA clone MGC:33252 IMAGE:4826022), complete cds. // chr2 // 89 // 90 // 24 // 27 // 0 /// BC093018 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 93, mRNA (cDNA clone MGC:110897 IMAGE:30337330), complete cds. // chr2 // 93 // 90 // 25 // 27 // 0 /// XM_006712599 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens coiled-coil domain containing 93 (CCDC93), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// GENSCAN00000031462 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:117920116:118014595:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1
NM_001426 // RefSeq // Homo sapiens engrailed homeobox 1 (EN1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000295206 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:118842171:118847678:-1 gene:ENSG00000163064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000041840 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:118842938:118847167:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0
NM_182528 // RefSeq // Homo sapiens complement component 1, q subcomponent-like 2 (C1QL2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000272520 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:119156243:119158889:-1 gene:ENSG00000144119 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF525315 // GenBank // Homo sapiens C1q-domain containing protein mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000041830 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:119156802:119230482:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_002980 // RefSeq // Homo sapiens secretin receptor (SCTR), mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// XM_006712683 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens secretin receptor (SCTR), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000019103 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:119439843:119524494:-1 gene:ENSG00000080293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000485440 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:119439845:119479889:-1 gene:ENSG00000080293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// AK055551 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ30989 fis, clone HLUNG1000034, highly similar to SECRETIN RECEPTOR PRECURSOR. // chr2 // 95 // 73 // 21 // 22 // 0 /// AY462218 // GenBank // Homo sapiens secretin receptor (SCTR) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC035757 // GenBank // Homo sapiens secretin receptor, mRNA (cDNA clone MGC:46199 IMAGE:5763906), complete cds. // chr2 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// U13989 // GenBank // Human secretin receptor mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// U20178 // GenBank // Human secretin receptor precursor mRNA, complete cds. // chr2 // 86 // 93 // 24 // 28 // 0 /// U28281 // GenBank // Human secretin receptor mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000041837 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:119440117:119524226:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0
NM_024121 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 185B (TMEM185B), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000426077 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:120221278:120223408:-1 gene:ENSG00000226479 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK289880 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77405 complete cds. // chr2 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000043193 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:120221924:120222976:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NR_027181 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 1101 (LINC01101), long non-coding RNA. // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENST00000364714 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:121040610:121040710:-1 gene:ENSG00000201584 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT074020 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_014553 // RefSeq // Homo sapiens transcription factor CP2-like 1 (TFCP2L1), mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// XM_006712459 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens transcription factor CP2-like 1 (TFCP2L1), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 38 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000263707 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:121216587:121285207:-1 gene:ENSG00000115112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000464621 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:121224164:121234274:-1 gene:ENSG00000115112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 21 // 8 // 8 // 0 /// AF198488 // GenBank // Homo sapiens transcription factor LBP-9 (LBP-9) mRNA, complete cds. // chr2 // 95 // 97 // 36 // 38 // 0 /// BC064698 // GenBank // Homo sapiens transcription factor CP2-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:71670 IMAGE:30347863), complete cds. // chr2 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// XM_005263652 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens transcription factor CP2-like 1 (TFCP2L1), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 38 // 38 // 15 // 39 // 1 /// GENSCAN00000014670 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:121132232:121285226:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 74 // 29 // 29 // 0
ENST00000411186 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:123869256:123869570:-1 gene:ENSG00000223118 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// NONHSAT074106 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0
ENST00000384236 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:126702839:126702942:-1 gene:ENSG00000206963 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT074135 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001001665 // RefSeq // Homo sapiens cytochrome P450, family 27, subfamily C, polypeptide 1 (CYP27C1), mRNA. // chr2 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006712483 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens cytochrome P450, family 27, subfamily C, polypeptide 1 (CYP27C1), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000335247 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:127184120:127205767:-1 gene:ENSG00000186684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000409327 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:127186410:127220078:-1 gene:ENSG00000186684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// AK131190 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ16008 fis, clone NT2NE2000390, weakly similar to 25-HYDROXYVITAMIN D-1 ALPHA HYDROXYLASE, MITOCHONDRIAL PRECURSOR (EC 1.14.-.-). // chr2 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// BC039307 // GenBank // Homo sapiens cytochrome P450, family 27, subfamily C, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:39642 IMAGE:5266370), complete cds. // chr2 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000043746 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:127187271:127220270:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
AK127469 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ45561 fis, clone BRTHA3003736, highly similar to TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit (EC 3.6.1.-). // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_006609 // RefSeq // Homo sapiens mitogen-activated protein kinase kinase kinase 2 (MAP3K2), mRNA. // chr2 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000344908 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:127307404:127343229:-1 gene:ENSG00000169967 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 83 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000409947 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:127298730:127388465:-1 gene:ENSG00000169967 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// AF111105 // GenBank // Homo sapiens mitogen-activated protein kinase kinase kinase MEKK2 mRNA, complete cds. // chr2 // 89 // 86 // 32 // 36 // 0 /// AF239798 // GenBank // Homo sapiens protein kinase MEKK2b mRNA, complete cds. // chr2 // 94 // 83 // 33 // 35 // 0 /// AK315007 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ95937. // chr2 // 97 // 83 // 34 // 35 // 0 /// BC136293 // GenBank // Homo sapiens mitogen-activated protein kinase kinase kinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:167903 IMAGE:9020280), complete cds. // chr2 // 100 // 93 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000043737 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:127307579:127388904:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 55 // 23 // 23 // 0
AF234262 // GenBank // Homo sapiens IL-1beta-regulated neutrophil survival protein mRNA, complete cds. // chr2 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
NM_017969 // RefSeq // Homo sapiens IWS1 homolog (S. cerevisiae) (IWS1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENST00000295321 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:127480806:127526468:-1 gene:ENSG00000163166 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 98 // 42 // 42 // 0 /// AK001717 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ10855 fis, clone NT2RP4001524. // chr2 // 100 // 58 // 25 // 25 // 0 /// AK295970 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59547 complete cds, highly similar to IWS1 homolog. // chr2 // 96 // 60 // 25 // 26 // 0 /// BC017012 // GenBank // Homo sapiens IWS1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone IMAGE:3914688), complete cds. // chr2 // 100 // 72 // 31 // 31 // 0 /// BC110536 // GenBank // Homo sapiens IWS1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:126375 IMAGE:40035173), complete cds. // chr2 // 100 // 88 // 38 // 38 // 0 /// BC110537 // GenBank // Homo sapiens IWS1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:126376 IMAGE:40035174), complete cds. // chr2 // 100 // 88 // 38 // 38 // 0 /// AK294669 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53983 complete cds, highly similar to IWS1 homolog. // chr2 // 91 // 91 // 39 // 43 // 1 /// AK296848 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54017 complete cds, highly similar to IWS1 homolog. // chr2 // 88 // 88 // 38 // 43 // 1 /// GENSCAN00000043742 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:127485905:127509767:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 60 // 26 // 26 // 0
ENST00000364600 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:127798903:127798998:-1 gene:ENSG00000201470 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 83 // 5 // 5 // 0 /// NONHSAT074189 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 83 // 5 // 5 // 0
ENST00000363520 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:127829747:127829852:-1 gene:ENSG00000200390 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT074191 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001199140 // RefSeq // Homo sapiens AMMECR1-like (AMMECR1L), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NM_031445 // RefSeq // Homo sapiens AMMECR1-like (AMMECR1L), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000272647 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:127861630:127885922:-1 gene:ENSG00000144233 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000393001 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:127861637:127884860:-1 gene:ENSG00000144233 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK304145 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52670 complete cds, moderately similar to AMME syndrome candidate gene 1 protein. // chr2 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// BC016181 // GenBank // Homo sapiens AMME chromosomal region gene 1-like, mRNA (cDNA clone MGC:20482 IMAGE:4644159), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC078174 // GenBank // Homo sapiens AMME chromosomal region gene 1-like, mRNA (cDNA clone MGC:88063 IMAGE:6012672), complete cds. // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000029628 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:127865094:127874234:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0
NM_001145928 // RefSeq // Homo sapiens Sin3A-associated protein, 130kDa (SAP130), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NM_024545 // RefSeq // Homo sapiens Sin3A-associated protein, 130kDa (SAP130), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000259234 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:127941224:128028120:-1 gene:ENSG00000136715 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// ENST00000259235 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:127941218:128027293:-1 gene:ENSG00000136715 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000357702 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:127941217:128027295:-1 gene:ENSG00000136715 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000424298 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:128010351:128027313:-1 gene:ENSG00000136715 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 28 // 9 // 9 // 0 /// AK055979 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ31417 fis, clone NT2NE2000327, weakly similar to GLUCOAMYLASE S1/S2 PRECURSOR (EC 3.2.1.3). // chr2 // 95 // 69 // 21 // 22 // 0 /// AY220791 // GenBank // Homo sapiens SIN3A-associated protein 130 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// BC117255 // GenBank // Homo sapiens Sin3A-associated protein, 130kDa, mRNA (cDNA clone MGC:150864 IMAGE:40125806), complete cds. // chr2 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// BC143898 // GenBank // Homo sapiens Sin3A-associated protein, 130kDa, mRNA (cDNA clone MGC:177433 IMAGE:9052416), complete cds. // chr2 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000029634 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:127942006:128027163:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0
ENST00000516933 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:128350829:128350927:-1 gene:ENSG00000252742 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT074225 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000459503 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:128445081:128445198:-1 gene:ENSG00000238379 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT074226 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_122040 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC151121 (LOC151121), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NR_122041 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC151121 (LOC151121), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NR_122042 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC151121 (LOC151121), transcript variant 3, long non-coding RNA. // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000375987 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:129242173:129273848:-1 gene:ENSG00000204460 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT074236 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// TCONS_l2_00015957-XLOC_l2_008252 // Broad TUCP // linc-HS6ST1-3 chr2:-:129999745-130031421 // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
ENST00000516414 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:130109204:130109310:-1 gene:ENSG00000252223 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_207312 // RefSeq // Homo sapiens tubulin, alpha 3e (TUBA3E), mRNA. // chr2 // 75 // 80 // 6 // 8 // 0 /// ENST00000312988 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:130191743:130198461:-1 gene:ENSG00000152086 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0 /// BC057811 // GenBank // Homo sapiens tubulin, alpha 3e, mRNA (cDNA clone MGC:71743 IMAGE:5298532), complete cds. // chr2 // 75 // 80 // 6 // 8 // 0 /// GENSCAN00000032464 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:130191831:130200994:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0
ENST00000517020 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:130929762:130929883:-1 gene:ENSG00000252829 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT074387 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001009993 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 168, member B (FAM168B), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000389915 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:131052367:131093460:-1 gene:ENSG00000152102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 94 // 75 // 17 // 18 // 0 /// ENST00000409185 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:131047876:131093428:-1 gene:ENSG00000152102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// AY253283 // GenBank // Homo sapiens p20 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// BC110642 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 168, member B, mRNA (cDNA clone MGC:110972 IMAGE:6144610), complete cds. // chr2 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// BC066347 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 168, member B, mRNA (cDNA clone MGC:87527 IMAGE:5312158), complete cds. // chr2 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1 /// GENSCAN00000040267 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:131052903:131082646:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0
NR_002826 // RefSeq // Homo sapiens nucleolar complex associated 2 homolog (S. cerevisiae) pseudogene (LOC401010), non-coding RNA. // chr2 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000407594 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:131442644:131444587:-1 gene:ENSG00000217950 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0 /// AK302229 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61647 complete cds, highly similar to Nucleolar complex protein 2 homolog. // chr2 // 87 // 88 // 13 // 15 // 0 /// GENSCAN00000040277 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:131442641:131444865:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 71 // 12 // 12 // 0
NM_001085365 // RefSeq // Homo sapiens mitotic spindle organizing protein 2A (MZT2A), mRNA. // chr2 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0 /// XM_005263741 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens mitotic spindle organizing protein 2A (MZT2A), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// XM_005263742 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens mitotic spindle organizing protein 2A (MZT2A), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000309451 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:131483960:131492422:-1 gene:ENSG00000173272 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0 /// BC018206 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 128, member A, mRNA (cDNA clone MGC:8772 IMAGE:3862861), complete cds. // chr2 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000427024 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:131464900:131492335:-1 gene:ENSG00000173272 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 50 // 50 // 8 // 16 // 1 /// ENST00000445782 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:131469809:131492387:-1 gene:ENSG00000173272 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 50 // 50 // 8 // 16 // 1 /// ENST00000491265 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:131489369:131492376:-1 gene:ENSG00000173272 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 50 // 50 // 8 // 16 // 1 /// GENSCAN00000040259 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:131484061:131492376:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0
ENST00000303798 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:131794961:131801661:-1 gene:ENSG00000186825 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC043584 // GenBank // Homo sapiens MGC50273 protein, mRNA (cDNA clone MGC:50273 IMAGE:5229449), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000617372 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR2_3_CTG7_2:131795990:131802689:-1 gene:ENSG00000274362 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NR_027020 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat domain 30B-like (ANKRD30BL), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr2 // 100 // 55 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000470729 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:132147591:132257969:-1 gene:ENSG00000163046 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 55 // 6 // 6 // 0 /// BC045801 // GenBank // Homo sapiens non-protein coding RNA 164, mRNA (cDNA clone IMAGE:4814810). // chr2 // 100 // 55 // 6 // 6 // 0 /// NONHSAT074513 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 55 // 6 // 6 // 0
ENST00000459214 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:132152243:132152349:-1 gene:ENSG00000239108 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000465868 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:132147591:132152738:-1 gene:ENSG00000163046 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC029821 // GenBank HTC // Homo sapiens non-protein coding RNA 164, mRNA (cDNA clone IMAGE:5169389), with apparent retained intron. // chr2 // 50 // 100 // 9 // 18 // 0 /// NONHSAT074512 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT074514 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
ENST00000365304 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:132253154:132253305:-1 gene:ENSG00000202174 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT074515 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000516896 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:132406752:132406858:-1 gene:ENSG00000252705 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT074535 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_144586 // RefSeq // Homo sapiens LY6/PLAUR domain containing 1 (LYPD1), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000397463 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:132644853:132670205:-1 gene:ENSG00000150551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000449209 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:132663026:132670200:-1 gene:ENSG00000150551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// AY358628 // GenBank // Homo sapiens clone DNA119474 PSCA Hlog (UNQ3079) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC011449 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4026092, partial cds. // chr2 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// BC017318 // GenBank // Homo sapiens LY6/PLAUR domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:29643 IMAGE:3641660), complete cds. // chr2 // 94 // 65 // 16 // 17 // 0 /// BC040046 // GenBank // Homo sapiens LY6/PLAUR domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:50792 IMAGE:5727798), complete cds. // chr2 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// NM_001077427 // RefSeq // Homo sapiens LY6/PLAUR domain containing 1 (LYPD1), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// ENST00000345008 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:132645787:132671579:-1 gene:ENSG00000150551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// AK309668 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99709. // chr2 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// GENSCAN00000006143 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:132645037:132671621:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_207363 // RefSeq // Homo sapiens NCK-associated protein 5 (NCKAP5), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000317721 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:132671800:133568460:-1 gene:ENSG00000176771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000409261 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:132671799:133568460:-1 gene:ENSG00000176771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// AY946008 // GenBank // Homo sapiens peripheral clock protein 2 (ERIH2) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// NM_207481 // RefSeq // Homo sapiens NCK-associated protein 5 (NCKAP5), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 61 // 61 // 20 // 33 // 1 /// ENST00000405974 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:132671800:133568460:-1 gene:ENSG00000176771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 61 // 61 // 20 // 33 // 1 /// ENST00000409213 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:132673049:133568463:-1 gene:ENSG00000176771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 58 // 58 // 19 // 33 // 1 /// AY946007 // GenBank // Homo sapiens peripheral clock protein 1 (ERIH1) mRNA, complete cds. // chr2 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// GENSCAN00000006146 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:132673024:132793887:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 58 // 19 // 19 // 0
ENST00000410136 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:133391109:133391398:-1 gene:ENSG00000222068 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT074547 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_030923 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 163 (TMEM163), mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000281924 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:134455759:134719000:-1 gene:ENSG00000152128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// AL122044 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp566N034 (from clone DKFZp566N034). // chr2 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// BC026170 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 163, mRNA (cDNA clone MGC:26919 IMAGE:4837567), complete cds. // chr2 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000467316 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:134455760:134459274:-1 gene:ENSG00000152128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// ENST00000476823 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:134455764:134470036:-1 gene:ENSG00000152128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1 /// AK054738 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ30176 fis, clone BRACE2001017. // chr2 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// NONHSAT074563 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// NONHSAT074564 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1
NM_002299 // RefSeq // Homo sapiens lactase (LCT), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000264162 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:135787840:135837180:-1 gene:ENSG00000115850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000452974 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:135794337:135812959:-1 gene:ENSG00000115850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 39 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000016995 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:135788324:135990380:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AY191611 // GenBank // Homo sapiens lactase-phlorizin hydrolase-1 (LCT) mRNA, partial cds. // chr2 // 100 // 39 // 11 // 11 // 0
ENST00000363794 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:135810169:135810279:-1 gene:ENSG00000200664 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT074604 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_005915 // RefSeq // Homo sapiens minichromosome maintenance complex component 6 (MCM6), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000264156 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:135839626:135876426:-1 gene:ENSG00000076003 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000492091 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:135844608:135865051:-1 gene:ENSG00000076003 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 24 // 10 // 10 // 0 /// BC032374 // GenBank // Homo sapiens minichromosome maintenance complex component 6, mRNA (cDNA clone MGC:40308 IMAGE:5122786), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// D84557 // GenBank // Homo sapiens mRNA for HsMcm6, complete cds. // chr2 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// U46838 // GenBank // Human p105MCM mRNA, complete cds. // chr2 // 89 // 90 // 34 // 38 // 0 /// AK303455 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51590 complete cds, moderately similar to DNA replication licensing factor MCM6. // chr2 // 21 // 21 // 9 // 42 // 1 /// GENSCAN00000016995 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:135788324:135990380:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 76 // 76 // 32 // 42 // 1
ENST00000391123 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:137512098:137512210:-1 gene:ENSG00000212425 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT074647 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_007226 // RefSeq // Homo sapiens neurexophilin 2 (NXPH2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000272641 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:138670772:138780348:-1 gene:ENSG00000144227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB162675 // GenBank // Homo sapiens NXPH2 mRNA for neurexophilin2, complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC101461 // GenBank // Homo sapiens neurexophilin 2, mRNA (cDNA clone MGC:125477 IMAGE:40022686), complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC101462 // GenBank // Homo sapiens neurexophilin 2, mRNA (cDNA clone MGC:125478 IMAGE:40022687), complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC101463 // GenBank // Homo sapiens neurexophilin 2, mRNA (cDNA clone MGC:125479 IMAGE:40022688), complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC104741 // GenBank // Homo sapiens neurexophilin 2, mRNA (cDNA clone MGC:125480 IMAGE:40022689), complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000048816 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:138583468:138689535:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000048822 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:138740028:138780241:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
ENST00000410894 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:138863597:138863895:-1 gene:ENSG00000222826 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// NONHSAT074677 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0
AK074482 // GenBank // Homo sapiens cDNA fis, A-BNGH41000020, highly similar to Homo sapiens isolate EIJbIII-4-94 NADH dehydrogenase subunit 1 gene; mitochondrial gene for mitochondrial product. // chr2 // 47 // 100 // 8 // 17 // 0
NM_018557 // RefSeq // Homo sapiens low density lipoprotein receptor-related protein 1B (LRP1B), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 114 // 114 // 0 /// ENST00000389484 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:140231423:142131701:-1 gene:ENSG00000168702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 114 // 114 // 0 /// ENST00000434794 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:2:140850131:142131005:-1 gene:ENSG00000168702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 18 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000437977 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:2:140231772:140358068:-1 gene:ENSG00000168702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 18 // 20 // 20 // 0 /// AF176832 // GenBank // Homo sapiens low density lipoprotein receptor related protein-deleted in tumor (LRPDIT) mRNA, complete cds. // chr2 // 99 // 100 // 113 // 114 // 0 /// ENST00000618808 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:140238151:141254642:-1 gene:ENSG00000168702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 90 // 103 // 103 // 0 /// GENSCAN00000025359 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:140715969:141265104:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 31 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000033776 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:140174800:140525993:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 38 // 43 // 43 // 0
AK098835 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ25969 fis, clone CBR02250. // chr2 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT074762 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
ENST00000384432 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:147472133:147472243:-1 gene:ENSG00000207161 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT074855 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000365204 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:147495438:147495540:-1 gene:ENSG00000202074 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT074856 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
ENST00000390879 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:148260574:148260708:-1 gene:ENSG00000212181 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT074879 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENST00000410194 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:148825691:148825835:-1 gene:ENSG00000222126 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT074882 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
ENST00000438503 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:148870024:148870381:-1 gene:ENSG00000228848 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000026365 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:148870024:148914025:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT074885 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT074886 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
ENST00000384540 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:149610668:149610774:-1 gene:ENSG00000207270 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT074906 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_198557 // RefSeq // Homo sapiens RNA binding motif protein 43 (RBM43), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000331426 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:151247940:151261879:-1 gene:ENSG00000184898 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC136410 // GenBank // Homo sapiens RNA binding motif protein 43, mRNA (cDNA clone MGC:168021 IMAGE:9020398), complete cds. // chr2 // 89 // 72 // 16 // 18 // 0 /// BC136411 // GenBank // Homo sapiens RNA binding motif protein 43, mRNA (cDNA clone MGC:168022 IMAGE:9020399), complete cds. // chr2 // 89 // 72 // 16 // 18 // 0 /// GENSCAN00000049585 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:151250906:151256953:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_004688 // RefSeq // Homo sapiens N-myc (and STAT) interactor (NMI), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_005246941 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens N-myc (and STAT) interactor (NMI), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000243346 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:151270465:151290057:-1 gene:ENSG00000123609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AB451305 // GenBank // Homo sapiens NMI mRNA for N-myc and STAT interactor, complete cds, clone: FLJ08162AAAN. // chr2 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// AK291548 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75708 complete cds, highly similar to Homo sapiens N-myc (and STAT) interactor (NMI), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AK298754 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58389 complete cds, highly similar to N-myc-interactor. // chr2 // 100 // 55 // 17 // 17 // 0 /// BC001268 // GenBank // Homo sapiens N-myc (and STAT) interactor, mRNA (cDNA clone MGC:5050 IMAGE:3452659), complete cds. // chr2 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// BC021987 // GenBank // Homo sapiens N-myc (and STAT) interactor, mRNA (cDNA clone MGC:23722 IMAGE:4096531), complete cds. // chr2 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// U32849 // GenBank // Homo sapiens Nmi mRNA, complete cds. // chr2 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// ENST00000491771 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:151277255:151289863:-1 gene:ENSG00000123609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1 /// GENSCAN00000049591 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:151270693:151282948:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0
ENST00000363014 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:152284350:152284460:-1 gene:ENSG00000199884 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT074979 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AF130063 // GenBank HTC // Homo sapiens clone FLB7723 PRO2055 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT074982 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_017892 // RefSeq // Homo sapiens PRP40 pre-mRNA processing factor 40 homolog A (S. cerevisiae) (PRPF40A), mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000354363 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:152672548:152717461:-1 gene:ENSG00000196504 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 37 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000410080 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:152651593:152717981:-1 gene:ENSG00000196504 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000493468 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:2:152676399:152717373:-1 gene:ENSG00000196504 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000545856 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:152672565:152717407:-1 gene:ENSG00000196504 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// AF049528 // GenBank // Homo sapiens huntingtin-interacting protein HYPA/FBP11 (HYPA) mRNA, partial cds. // chr2 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// AK024810 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ21157 fis, clone CAS09937. // chr2 // 100 // 37 // 11 // 11 // 0 /// AK021621 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ11559 fis, clone HEMBA1003098, highly similar to Homo sapiens NY-REN-6 antigen mRNA. // chr2 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1 /// GENSCAN00000005963 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:152656306:152730107:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0
NM_019845 // RefSeq // Homo sapiens reprimo, TP53 dependent G2 arrest mediator candidate (RPRM), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000325926 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:153477338:153478808:-1 gene:ENSG00000177519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB043585 // GenBank // Homo sapiens mRNA for Reprimo, complete cds. // chr2 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// BC002908 // GenBank // Homo sapiens reprimo, TP53 dependent G2 arrest mediator candidate, mRNA (cDNA clone MGC:11260 IMAGE:3942270), complete cds. // chr2 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005954 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:153447383:153478565:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0
ENST00000430257 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:154940541:154941067:-1 gene:ENSG00000228837 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011130 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:154940568:155167885:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
ENST00000411265 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:155089439:155089538:-1 gene:ENSG00000223197 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT075024 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NONHSAT075050 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000410472 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:157298807:157299158:-1 gene:ENSG00000222404 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 62 // 100 // 16 // 26 // 0 /// NONHSAT075063 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr2 // 62 // 100 // 16 // 26 // 0
ENST00000391108 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:157985789:157985894:-1 gene:ENSG00000212410 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT075078 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000463588 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:158447166:158447461:-1 gene:ENSG00000243723 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT075086 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000410368 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:158935798:158935985:-1 gene:ENSG00000222300 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT075102 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000365159 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:159027036:159027142:-1 gene:ENSG00000202029 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT075103 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
ENST00000384389 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:159536244:159536346:-1 gene:ENSG00000207117 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT075113 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001007267 // RefSeq // Homo sapiens phospholipase A2 receptor 1, 180kDa (PLA2R1), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 86 // 37 // 37 // 0 /// NM_001195641 // RefSeq // Homo sapiens phospholipase A2 receptor 1, 180kDa (PLA2R1), transcript variant 3, mRNA. // chr2 // 100 // 98 // 42 // 42 // 0 /// NM_007366 // RefSeq // Homo sapiens phospholipase A2 receptor 1, 180kDa (PLA2R1), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 84 // 36 // 36 // 0 /// XM_005246392 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens phospholipase A2 receptor 1, 180kDa (PLA2R1), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 84 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000392771 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:159945815:160062610:-1 gene:ENSG00000153246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 86 // 37 // 37 // 0 /// BC140823 // GenBank // Homo sapiens phospholipase A2 receptor 1, 180kDa, mRNA (cDNA clone MGC:176500 IMAGE:9021691), complete cds. // chr2 // 100 // 84 // 36 // 36 // 0 /// BC144631 // GenBank // Homo sapiens phospholipase A2 receptor 1, 180kDa, mRNA (cDNA clone MGC:178179 IMAGE:9053162), complete cds. // chr2 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// U17033 // GenBank // Human 180 kDa transmembrane PLA2 receptor mRNA, complete cds. // chr2 // 98 // 98 // 41 // 42 // 0 /// U17034 // GenBank // Human soluble PLA2 receptor mRNA, complete cds. // chr2 // 97 // 84 // 35 // 36 // 0 /// ENST00000283243 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:159937851:160062610:-1 gene:ENSG00000153246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 98 // 98 // 42 // 43 // 1 /// GENSCAN00000028723 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:159941778:160062403:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 65 // 28 // 28 // 0
NM_002897 // RefSeq // Homo sapiens RNA binding motif, single stranded interacting protein 1 (RBMS1), transcript variant 3, mRNA. // chr2 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0 /// NM_016836 // RefSeq // Homo sapiens RNA binding motif, single stranded interacting protein 1 (RBMS1), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000348849 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:160272151:160493794:-1 gene:ENSG00000153250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000474820 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:160272151:160493379:-1 gene:ENSG00000153250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0 /// AK297812 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61322 complete cds, highly similar to RNA-binding motif,single-stranded-interacting protein 1. // chr2 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0 /// BC012992 // GenBank // Homo sapiens RNA binding motif, single stranded interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:3331 IMAGE:3530897), complete cds. // chr2 // 100 // 50 // 5 // 5 // 0 /// BC012993 // GenBank // Homo sapiens RNA binding motif, single stranded interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:3332 IMAGE:3530898), complete cds. // chr2 // 100 // 50 // 5 // 5 // 0 /// BC018951 // GenBank // Homo sapiens RNA binding motif, single stranded interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:15146 IMAGE:4137722), complete cds. // chr2 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0 /// X77494 // GenBank // H.sapiens MSSP-2 mRNA. // chr2 // 100 // 50 // 5 // 5 // 0
AK093576 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ36257 fis, clone THYMU2002376. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT075144 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000049687 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:161340814:161341326:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 88 // 67 // 7 // 8 // 0
NM_015446 // RefSeq // Homo sapiens AT hook containing transcription factor 1 (AHCTF1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NR_077058 // RefSeq // Homo sapiens AT hook containing transcription factor 1 pseudogene 1 (AHCTF1P1), non-coding RNA. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000326225 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:246839098:246931424:-1 gene:ENSG00000153207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000366508 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:246839098:246931363:-1 gene:ENSG00000153207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000420969 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:161500885:161507705:-1 gene:ENSG00000226121 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AB059277 // GenBank // Homo sapiens mRNA for transcription factor ELYS, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AY157619 // GenBank // Homo sapiens ELYS transcription factor-like protein TMBS62 (TMBS62) mRNA, complete cds. // chr2 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// GENSCAN00000020993 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:161501279:161569834:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NONHSAT147122 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// TCONS_l2_00014965-XLOC_l2_008329 // Broad TUCP // linc-RBMS1-3 chr2:-:162359312-162364091 // chr2 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000006551 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:246788921:246918370:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 55 // 55 // 17 // 31 // 1
NM_001935 // RefSeq // Homo sapiens dipeptidyl-peptidase 4 (DPP4), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000360534 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:161992241:162074542:-1 gene:ENSG00000197635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000434918 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:161993283:162074122:-1 gene:ENSG00000197635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000490286 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:161995178:162073486:-1 gene:ENSG00000197635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000491591 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:161994961:162017551:-1 gene:ENSG00000197635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// AB451339 // GenBank // Homo sapiens DPP4 mRNA for dipeptidylpeptidase IV, complete cds, clone: FLJ85507SAAN. // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AK314798 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ95671. // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC065265 // GenBank // Homo sapiens dipeptidyl-peptidase 4, mRNA (cDNA clone MGC:74748 IMAGE:6156880), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// M74777 // GenBank // Human dipeptidyl peptidase IV (CD26) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// M80536 // GenBank // H.sapiens dipeptidyl peptidase IV (DPP4) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000020996 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:161994955:162073981:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0
NM_002054 // RefSeq // Homo sapiens glucagon (GCG), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000375497 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:162143905:162152404:-1 gene:ENSG00000115263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000418842 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:162142873:162152403:-1 gene:ENSG00000115263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000492913 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:162145359:162152237:-1 gene:ENSG00000115263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// BC005278 // GenBank // Homo sapiens glucagon, mRNA (cDNA clone MGC:12325 IMAGE:3950435), complete cds. // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BT006813 // GenBank // Homo sapiens glucagon mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// J04040 // GenBank // Human glucagon mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// ENST00000483769 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:162143178:162144415:-1 gene:ENSG00000115263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// ENST00000497568 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:162144695:162147393:-1 gene:ENSG00000115263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// GENSCAN00000020991 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:162115621:162446443:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// NONHSAT075194 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_022168 // RefSeq // Homo sapiens interferon induced with helicase C domain 1 (IFIH1), mRNA. // chr2 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000263642 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:162267079:162318703:-1 gene:ENSG00000115267 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AF095844 // GenBank // Homo sapiens melanoma differentiation associated protein-5 (MDA5) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AK292941 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78660 complete cds, highly similar to Homo sapiens interferon induced with helicase C domain 1 (IFIH1), mRNA. // chr2 // 91 // 88 // 21 // 23 // 0 /// AY017378 // GenBank // Homo sapiens RNA helicase-DEAD box protein RH116 mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// BC111750 // GenBank // Homo sapiens interferon induced with helicase C domain 1, mRNA (cDNA clone MGC:133047 IMAGE:40008600), complete cds. // chr2 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000020991 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:162115621:162446443:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
NM_033272 // RefSeq // Homo sapiens potassium voltage-gated channel, subfamily H (eag-related), member 7 (KCNH7), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// NM_173162 // RefSeq // Homo sapiens potassium voltage-gated channel, subfamily H (eag-related), member 7 (KCNH7), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 52 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000328032 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:162423247:162838730:-1 gene:ENSG00000184611 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 52 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000332142 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:162371407:162838618:-1 gene:ENSG00000184611 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// AF032897 // GenBank // Homo sapiens potassium channel subunit (HERG-3) mRNA, complete cds. // chr2 // 98 // 91 // 41 // 42 // 0 /// BC035815 // GenBank // Homo sapiens potassium voltage-gated channel, subfamily H (eag-related), member 7, mRNA (cDNA clone MGC:45986 IMAGE:5769938), complete cds. // chr2 // 100 // 52 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000618399 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:162371407:162538076:-1 gene:ENSG00000184611 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 78 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000621889 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:162423270:162537081:-1 gene:ENSG00000184611 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 35 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000020991 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:162115621:162446443:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 57 // 57 // 26 // 46 // 1
NM_018086 // RefSeq // Homo sapiens fidgetin (FIGN), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000333129 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:163602611:163736007:-1 gene:ENSG00000182263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK025747 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ22094 fis, clone HEP16856. // chr2 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// XM_005246662 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens fidgetin (FIGN), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// ENST00000409634 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:163593396:163736012:-1 gene:ENSG00000182263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000032888 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:163609552:163611798:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
NR_033309 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 70F (SNORA70F), small nucleolar RNA. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000384142 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:164687643:164687777:-1 gene:ENSG00000206869 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT075225 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_024753 // RefSeq // Homo sapiens tetratricopeptide repeat domain 21B (TTC21B), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000243344 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:165873362:165953843:-1 gene:ENSG00000123607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000464374 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:165928717:165953745:-1 gene:ENSG00000123607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 30 // 12 // 12 // 0 /// AB073395 // GenBank // Homo sapiens primary neuroblastoma cDNA, clone:Nbla10696, full insert sequence. // chr2 // 92 // 30 // 11 // 12 // 0 /// AK292942 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78669 complete cds, highly similar to Homo sapiens tetratricopeptide repeat domain 21B (TTC21B), mRNA. // chr2 // 94 // 85 // 32 // 34 // 0 /// BC055424 // GenBank // Homo sapiens tetratricopeptide repeat domain 21B, mRNA (cDNA clone MGC:48421 IMAGE:4837489), complete cds. // chr2 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// XM_006712761 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens tetratricopeptide repeat domain 21B (TTC21B), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 63 // 63 // 25 // 40 // 1 /// ENST00000392695 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:165857478:165890641:-1 gene:ENSG00000123607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 23 // 23 // 9 // 40 // 1 /// GENSCAN00000004534 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:165874755:165955650:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 83 // 33 // 33 // 0 /// AB082523 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1992 protein. // chr2 // 65 // 65 // 26 // 40 // 1 /// AK021519 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ11457 fis, clone HEMBA1001522. // chr2 // 23 // 23 // 9 // 40 // 1
ENST00000410444 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:166180652:166180966:-1 gene:ENSG00000222376 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT075288 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_002977 // RefSeq // Homo sapiens sodium channel, voltage-gated, type IX, alpha subunit (SCN9A), mRNA. // chr2 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENST00000303354 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:166195194:166375987:-1 gene:ENSG00000169432 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000409435 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:166198672:166311756:-1 gene:ENSG00000169432 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000409672 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:166195185:166375993:-1 gene:ENSG00000169432 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000452182 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:166281760:166306571:-1 gene:ENSG00000169432 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 89 // 30 // 8 // 9 // 0 /// ENST00000454569 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:2:166281760:166306571:-1 gene:ENSG00000169432 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 89 // 30 // 8 // 9 // 0 /// DQ857292 // GenBank // Homo sapiens voltage-gated sodium channel Nav1.7 (SCN9A) mRNA, complete cds. // chr2 // 93 // 93 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000004526 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:166198672:166335127:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0
NM_002976 // RefSeq // Homo sapiens sodium channel, voltage-gated, type VII, alpha subunit (SCN7A), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NR_045628 // RefSeq // Homo sapiens sodium channel, voltage-gated, type VII, alpha subunit (SCN7A), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr2 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000409855 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:166403573:166486968:-1 gene:ENSG00000136546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000419992 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:166432321:166494247:-1 gene:ENSG00000136546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 66 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000424326 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:166405513:166486968:-1 gene:ENSG00000136546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000441411 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:166456953:166494205:-1 gene:ENSG00000136546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 92 // 37 // 12 // 13 // 0 /// M91556 // GenBank // Human voltage-gated sodium channel mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000619410 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:166403573:166486971:-1 gene:ENSG00000136546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000621965 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:166403573:166486971:-1 gene:ENSG00000136546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000004532 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:166405580:166441617:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 31 // 11 // 11 // 0
NM_013233 // RefSeq // Homo sapiens serine threonine kinase 39 (STK39), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000355999 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:167954020:168248141:-1 gene:ENSG00000198648 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000487143 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:167954020:168113106:-1 gene:ENSG00000198648 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 42 // 10 // 10 // 0 /// AF017635 // GenBank // Homo sapiens DCHT mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// AF030403 // GenBank // Homo sapiens Ste20-like protein kinase mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// AF099989 // GenBank // Homo sapiens Ste-20 related kinase SPAK mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// BX647113 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686K05124 (from clone DKFZp686K05124). // chr2 // 100 // 42 // 10 // 10 // 0 /// AY629298 // GenBank // Homo sapiens small intestine SPAK-like kinase mRNA, complete cds. // chr2 // 95 // 83 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000045057 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:168105499:168193340:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1
NONHSAT075327 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENST00000362478 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:168606390:168606496:-1 gene:ENSG00000199348 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT075330 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_003742 // RefSeq // Homo sapiens ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP), member 11 (ABCB11), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000263817 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:168922938:169031322:-1 gene:ENSG00000073734 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000439188 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:168923383:168972032:-1 gene:ENSG00000073734 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 53 // 17 // 17 // 0 /// AF091582 // GenBank // Homo sapiens bile salt export pump (BSEP) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF136523 // GenBank // Homo sapiens bile salt export pump (BSEP) mRNA, complete cds. // chr2 // 94 // 97 // 29 // 31 // 0 /// AK302540 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56177 complete cds, highly similar to Bile salt export pump. // chr2 // 89 // 56 // 16 // 18 // 0 /// AK303050 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51418 complete cds, highly similar to Bile salt export pump. // chr2 // 94 // 53 // 16 // 17 // 0 /// ENST00000611248 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR2_1_CTG7_2:168940372:168953422:-1 gene:ENSG00000276582 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000618180 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR2_1_CTG7_2:168939927:168953422:-1 gene:ENSG00000276582 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 28 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000000295 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR2_1_CTG7_2:168940611:168953365:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000045625 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:168923622:169036111:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0
NM_004525 // RefSeq // Homo sapiens low density lipoprotein receptor-related protein 2 (LRP2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 94 // 94 // 0 /// ENST00000263816 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:169127109:169362685:-1 gene:ENSG00000081479 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 94 // 94 // 0 /// ENST00000443831 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:169240750:169362534:-1 gene:ENSG00000081479 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 31 // 29 // 29 // 0 /// AK295005 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61253 complete cds, highly similar to Low-density lipoprotein receptor-related protein 2 precursor. // chr2 // 97 // 31 // 28 // 29 // 0 /// AK302843 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53943 complete cds, highly similar to Low-density lipoprotein receptor-related protein 2 precursor. // chr2 // 100 // 21 // 20 // 20 // 0 /// AY265357 // GenBank // Homo sapiens glycoprotein receptor gp330/megalin precursor, mRNA, complete cds. // chr2 // 98 // 98 // 90 // 92 // 0 /// AY265358 // GenBank // Homo sapiens glycoprotein receptor gp330/megalin precursor, mRNA, complete cds. // chr2 // 99 // 98 // 91 // 92 // 0 /// U33837 // GenBank // Human glycoprotein receptor gp330 precursor, mRNA, complete cds. // chr2 // 99 // 99 // 92 // 93 // 0 /// GENSCAN00000045626 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:169128663:169329792:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 83 // 83 // 0
NM_001085447 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 173 (CCDC173), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000447353 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:169645425:169694433:-1 gene:ENSG00000154479 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK301851 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59063 complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC015980 // GenBank // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 77, mRNA (cDNA clone IMAGE:3935159), partial cds. // chr2 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC117445 // GenBank // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 77, mRNA (cDNA clone MGC:151054 IMAGE:40125996), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000016037 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:169640192:169697648:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0
ENST00000516998 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:170119996:170120098:-1 gene:ENSG00000252807 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT075394 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
ENST00000455362 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:170601662:170602228:-1 gene:ENSG00000214821 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000015230 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:170601653:170602228:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT147125 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0
NR_027433 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 1124 (LINC01124), long non-coding RNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000409786 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:2:170712451:170714567:-1 gene:ENSG00000222033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT075415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
ENST00000433675 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:171517270:171517716:-1 gene:ENSG00000233762 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 85 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000018177 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:171517270:171517716:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 85 // 11 // 11 // 0 /// NONHSAT075470 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 85 // 100 // 11 // 13 // 0 /// NONHSAT075471 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 85 // 100 // 11 // 13 // 0
NM_004405 // RefSeq // Homo sapiens distal-less homeobox 2 (DLX2), mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000234198 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:172099439:172102900:-1 gene:ENSG00000115844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB208823 // GenBank // Homo sapiens mRNA for distal-less homeo box 2 variant protein. // chr2 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// AK291367 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75693 complete cds, highly similar to Homo sapiens distal-less homeo box 2 (DLX2), mRNA. // chr2 // 86 // 75 // 18 // 21 // 0 /// BC032558 // GenBank // Homo sapiens distal-less homeobox 2, mRNA (cDNA clone MGC:45154 IMAGE:5562689), complete cds. // chr2 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// ENST00000466293 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:172100557:172102900:-1 gene:ENSG00000115844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// AK297503 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56718 complete cds, highly similar to Homeobox protein DLX-2. // chr2 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// AK316129 // GenBank // Homo sapiens cDNA, FLJ79028 complete cds, highly similar to Homeobox protein DLX-2. // chr2 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1 /// GENSCAN00000018186 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:172094962:172165514:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NONHSAT075492 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000362996 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:172558151:172558252:-1 gene:ENSG00000199866 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT075515 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000440938 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:173485865:173486362:-1 gene:ENSG00000226131 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000013376 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:173485865:173486362:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000485221 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:174240143:174240457:-1 gene:ENSG00000243770 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT075552 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr2 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
ENST00000364218 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:174264878:174264981:-1 gene:ENSG00000201088 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT075553 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_004882 // RefSeq // Homo sapiens corepressor interacting with RBPJ, 1 (CIR1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000342016 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:174348022:174395715:-1 gene:ENSG00000138433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AF098297 // GenBank // Homo sapiens CBF1 interacting corepressor CIR mRNA, complete cds. // chr2 // 82 // 81 // 14 // 17 // 0 /// AK292389 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75065 complete cds, highly similar to Homo sapiens CBF1 interacting corepressor, mRNA. // chr2 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// BC046098 // GenBank // Homo sapiens CBF1 interacting corepressor, mRNA (cDNA clone MGC:57509 IMAGE:5495320), complete cds. // chr2 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0 /// U03644 // GenBank // Human recepin mRNA, complete cds. // chr2 // 79 // 90 // 15 // 19 // 0 /// GENSCAN00000013361 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:174340082:174395622:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 62 // 62 // 13 // 21 // 1
NM_001080458 // RefSeq // Homo sapiens even-skipped homeobox 2 (EVX2), mRNA. // chr2 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// ENST00000308618 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:176077472:176083913:-1 gene:ENSG00000174279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000040943 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:176080107:176085386:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 94 // 78 // 17 // 18 // 0
XR_251221 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens uncharacterized LOC100129455 (LOC100129455), misc_RNA. // chr2 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// AK092134 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ34815 fis, clone NT2NE2007786. // chr2 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONHSAT075629 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0
ENST00000405359 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:176200908:176201252:-1 gene:ENSG00000218175 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000040936 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:176200908:176206424:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONHSAT075650 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
ENST00000432828 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:176809426:176809859:-1 gene:ENSG00000223777 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000003501 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:176807034:176809748:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT075678 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0
ENST00000384139 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:176929985:176930090:-1 gene:ENSG00000206866 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT075689 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NR_026966 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC100130691 (LOC100130691), long non-coding RNA. // chr2 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000397057 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:177283508:177392687:-1 gene:ENSG00000213963 gene_biotype:sense_overlapping transcript_biotype:sense_overlapping // chr2 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000456746 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:177283512:177392691:-1 gene:ENSG00000213963 gene_biotype:sense_overlapping transcript_biotype:sense_overlapping // chr2 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// AK126517 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44553 fis, clone UTERU3007134. // chr2 // 96 // 87 // 26 // 27 // 0 /// AL833088 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp451M2119 (from clone DKFZp451M2119); complete cds. // chr2 // 93 // 87 // 25 // 27 // 0 /// ENST00000447413 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:177321607:177392681:-1 gene:ENSG00000213963 gene_biotype:sense_overlapping transcript_biotype:sense_overlapping // chr2 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1 /// ENST00000464747 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:177230308:177392697:-1 gene:ENSG00000116044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1 /// BC093095 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:30372456. // chr2 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1 /// NONHSAT075710 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NONHSAT075711 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NONHSAT075714 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// BX647407 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686G13152 (from clone DKFZp686G13152). // chr2 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1 /// NONHSAT075717 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1
ENST00000459157 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:177345858:177345961:-1 gene:ENSG00000238295 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT075719 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_152517 // RefSeq // Homo sapiens tetratricopeptide repeat domain 30B (TTC30B), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000408939 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:177548998:177553014:-1 gene:ENSG00000196659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// AK296828 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55706 complete cds. // chr2 // 90 // 77 // 9 // 10 // 0 /// BC033795 // GenBank // Homo sapiens tetratricopeptide repeat domain 30B, mRNA (cDNA clone MGC:45475 IMAGE:5175299), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000014775 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:177550766:177553552:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0
NM_152275 // RefSeq // Homo sapiens tetratricopeptide repeat domain 30A (TTC30A), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000355689 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:177612992:177618966:-1 gene:ENSG00000197557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK292395 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77601 complete cds. // chr2 // 88 // 71 // 15 // 17 // 0 /// BC042848 // GenBank // Homo sapiens tetratricopeptide repeat domain 30A, mRNA (cDNA clone MGC:42903 IMAGE:4831326), complete cds. // chr2 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// BC048006 // GenBank // Homo sapiens tetratricopeptide repeat domain 30A, mRNA (cDNA clone MGC:51026 IMAGE:5299020), complete cds. // chr2 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0
NM_173648 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 141 (CCDC141), mRNA. // chr2 // 98 // 94 // 43 // 44 // 0 /// ENST00000343876 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:178835756:178884951:-1 gene:ENSG00000163492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 85 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000420890 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:178829757:179050059:-1 gene:ENSG00000163492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 98 // 94 // 43 // 44 // 0 /// ENST00000480419 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:178833081:178845742:-1 gene:ENSG00000163492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 94 // 38 // 17 // 18 // 0 /// AK129847 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ26337 fis, clone HRT02844. // chr2 // 100 // 85 // 40 // 40 // 0 /// BC115378 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 141, mRNA (cDNA clone MGC:134803 IMAGE:40028485), complete cds. // chr2 // 100 // 83 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000443758 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:2:178856257:179050063:-1 gene:ENSG00000163492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 43 // 43 // 20 // 47 // 1 /// ENST00000446116 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:2:178872133:179050086:-1 gene:ENSG00000163492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 17 // 17 // 8 // 47 // 1 /// GENSCAN00000016080 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:178527012:179049941:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 81 // 81 // 38 // 47 // 1
NONHSAT075825 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000365346 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:179934402:179934527:-1 gene:ENSG00000202216 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr2 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT075837 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_020943 // RefSeq // Homo sapiens CWC22 spliceosome-associated protein (CWC22), mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000404136 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:179945621:180007113:-1 gene:ENSG00000163510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000410053 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:179944876:180007053:-1 gene:ENSG00000163510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// AB046824 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1604 protein, partial cds. // chr2 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// AK123647 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ41653 fis, clone FEBRA2024987, weakly similar to Caenorhabditis elegans Nucampholin (let-858). // chr2 // 91 // 39 // 10 // 11 // 0 /// BC093952 // GenBank // Homo sapiens CWC22 spliceosome-associated protein homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:120987 IMAGE:7939797), complete cds. // chr2 // 92 // 89 // 23 // 25 // 0 /// BC093954 // GenBank // Homo sapiens CWC22 spliceosome-associated protein homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:120989 IMAGE:7939799), complete cds. // chr2 // 92 // 89 // 23 // 25 // 0 /// BC143433 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:9051941. // chr2 // 91 // 79 // 20 // 22 // 0 /// GENSCAN00000018686 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:179945129:179978302:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0
NM_001463 // RefSeq // Homo sapiens frizzled-related protein (FRZB), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000295113 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:182833275:182867162:-1 gene:ENSG00000162998 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC027855 // GenBank // Homo sapiens frizzled-related protein, mRNA (cDNA clone MGC:34598 IMAGE:5221358), complete cds. // chr2 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BT019883 // GenBank // Homo sapiens frizzled-related protein mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// U24163 // GenBank // Human Frizzled related protein Frzb precursor (fzrb) mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// U68057 // GenBank // Human frezzled (fre) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// U91903 // GenBank // Human Fritz mRNA, complete cds. // chr2 // 92 // 96 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000019427 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:182834849:182866528:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0
NM_013436 // RefSeq // Homo sapiens NCK-associated protein 1 (NCKAP1), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NM_205842 // RefSeq // Homo sapiens NCK-associated protein 1 (NCKAP1), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000360982 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:182924877:183038858:-1 gene:ENSG00000061676 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000361354 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:182909115:183038472:-1 gene:ENSG00000061676 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// AB014509 // GenBank // Homo sapiens mRNA for Nck-associated protein 1 (Nap1), complete cds. // chr2 // 97 // 86 // 31 // 32 // 0 /// AK292914 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78656 complete cds, highly similar to Homo sapiens NCK-associated protein 1 (NCKAP1), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 97 // 84 // 30 // 31 // 0 /// BC015025 // GenBank // Homo sapiens NCK-associated protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:8981 IMAGE:3907646), complete cds. // chr2 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// BT007033 // GenBank // Homo sapiens NCK-associated protein 1 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000019422 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:182928099:183041327:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 46 // 17 // 17 // 0
NONHSAT075948 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AF119910 // GenBank HTC // Homo sapiens PRO2964 mRNA, complete cds. // chr2 // 90 // 100 // 19 // 21 // 0
AF119892 // GenBank HTC // Homo sapiens PRO2710 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_182521 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, SWIM-type containing 2 (ZSWIM2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000295131 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:186827835:186849170:-1 gene:ENSG00000163012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC031094 // GenBank // Homo sapiens zinc finger, SWIM-type containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:33890 IMAGE:5298288), complete cds. // chr2 // 83 // 83 // 25 // 30 // 0 /// ENST00000419862 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:186844753:186849208:-1 gene:ENSG00000163012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1
ENST00000410913 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:187122562:187122861:-1 gene:ENSG00000222845 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT076009 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000362756 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:187270698:187270804:-1 gene:ENSG00000199626 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT076013 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000363780 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:188276732:188276844:-1 gene:ENSG00000200650 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr2 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT076029 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_052952 // RefSeq // Homo sapiens disrupted in renal carcinoma 1 (DIRC1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000308100 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:188734155:188790104:-1 gene:ENSG00000174325 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// AY039011 // GenBank // Homo sapiens disrupted in renal cancer protein (DIRC1) mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// BC125137 // GenBank // Homo sapiens disrupted in renal carcinoma 1, mRNA (cDNA clone MGC:150330 IMAGE:40119557), complete cds. // chr2 // 90 // 43 // 9 // 10 // 0
NM_000393 // RefSeq // Homo sapiens collagen, type V, alpha 2 (COL5A2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 65 // 65 // 0 /// ENST00000374866 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:189031896:189179879:-1 gene:ENSG00000204262 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 65 // 65 // 0 /// AK297936 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60734 complete cds, highly similar to Collagen alpha-2(V) chain precursor. // chr2 // 96 // 43 // 27 // 28 // 0 /// AK300146 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53096 complete cds, highly similar to Collagen alpha-2(V) chain precursor. // chr2 // 100 // 15 // 10 // 10 // 0 /// BC043613 // GenBank // Homo sapiens collagen, type V, alpha 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:6047742), complete cds. // chr2 // 94 // 28 // 17 // 18 // 0 /// BC086874 // GenBank // Homo sapiens collagen, type V, alpha 2, mRNA (cDNA clone MGC:105115 IMAGE:30708812), complete cds. // chr2 // 93 // 69 // 42 // 45 // 0 /// ENST00000618828 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:189031915:189179879:-1 gene:ENSG00000204262 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 98 // 88 // 56 // 57 // 0 /// GENSCAN00000028097 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:189034070:189116456:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 93 // 68 // 41 // 44 // 0
NM_005259 // RefSeq // Homo sapiens myostatin (MSTN), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000260950 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:190055697:190062729:-1 gene:ENSG00000138379 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF019627 // GenBank // Homo sapiens myostatin (MSTN) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// AF104922 // GenBank // Homo sapiens myostatin (GDF8) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK291524 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75269 complete cds, highly similar to Homo sapiens myostatin (GDF8) mRNA. // chr2 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// BC074757 // GenBank // Homo sapiens myostatin, mRNA (cDNA clone MGC:103834 IMAGE:30915216), complete cds. // chr2 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000015308 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:190038860:190062596:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0
NM_001142645 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 194B (TMEM194B), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000409150 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:190504342:190534722:-1 gene:ENSG00000189362 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AK296987 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52654 complete cds. // chr2 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// ENST00000414176 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:190510498:190534349:-1 gene:ENSG00000189362 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 36 // 36 // 8 // 22 // 1 /// AK302425 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60961 complete cds. // chr2 // 36 // 36 // 8 // 22 // 1 /// GENSCAN00000003991 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:190506853:190534655:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0
NM_001142645 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 194B (TMEM194B), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000343105 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:190516264:190534678:-1 gene:ENSG00000189362 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000409150 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:190504342:190534722:-1 gene:ENSG00000189362 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000414176 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:190510498:190534349:-1 gene:ENSG00000189362 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AK296987 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52654 complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK302425 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60961 complete cds. // chr2 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000444545 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:190514452:190525325:-1 gene:ENSG00000189362 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// ENST00000492292 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:190518736:190534328:-1 gene:ENSG00000189362 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// GENSCAN00000003991 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:190506853:190534655:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// NONHSAT076086 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_004657 // RefSeq // Homo sapiens serum deprivation response (SDPR), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000304141 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:191834302:191847255:-1 gene:ENSG00000168497 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF085481 // GenBank // Homo sapiens serum deprivation response (SDPR) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// AK290378 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78516 complete cds. // chr2 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// BC016475 // GenBank // Homo sapiens serum deprivation response (phosphatidylserine binding protein), mRNA (cDNA clone MGC:8984 IMAGE:3882155), complete cds. // chr2 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// AK311055 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ18097. // chr2 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// GENSCAN00000027708 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:191835923:191882286:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1
ENST00000621610 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:194658376:194658675:-1 gene:ENSG00000276123 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000364943 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:195670372:195670474:-1 gene:ENSG00000201813 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONHSAT076178 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_018897 // RefSeq // Homo sapiens dynein, axonemal, heavy chain 7 (DNAH7), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 75 // 75 // 0 /// ENST00000312428 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:195737703:196068812:-1 gene:ENSG00000118997 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 75 // 75 // 0 /// ENST00000409063 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:195737703:195795879:-1 gene:ENSG00000118997 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 13 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000410072 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:195998760:196068812:-1 gene:ENSG00000118997 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 17 // 13 // 13 // 0 /// AB023161 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA0944 protein, partial cds. // chr2 // 99 // 100 // 74 // 75 // 0 /// AF327442 // GenBank // Homo sapiens ciliary dynein heavy chain 7 (DNAH7) mRNA, complete cds. // chr2 // 99 // 100 // 74 // 75 // 0 /// AK094515 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ37196 fis, clone BRALZ2005888. // chr2 // 92 // 17 // 12 // 13 // 0 /// BC029567 // GenBank // Homo sapiens dynein, axonemal, heavy chain 7, mRNA (cDNA clone IMAGE:4838108), complete cds. // chr2 // 80 // 13 // 8 // 10 // 0 /// GENSCAN00000046851 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:195737921:196048928:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 98 // 81 // 60 // 61 // 0
NM_004226 // RefSeq // Homo sapiens serine/threonine kinase 17b (STK17B), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000263955 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:196133566:196171575:-1 gene:ENSG00000081320 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000409228 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:196137447:196176503:-1 gene:ENSG00000081320 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// AB011421 // GenBank // Homo sapiens mRNA for DRAK2, complete cds. // chr2 // 97 // 97 // 30 // 31 // 0 /// AK312865 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ93309, Homo sapiens serine/threonine kinase 17b (apoptosis-inducing) (STK17B), mRNA. // chr2 // 88 // 75 // 21 // 24 // 0 /// BC016040 // GenBank // Homo sapiens serine/threonine kinase 17b, mRNA (cDNA clone MGC:20123 IMAGE:4575012), complete cds. // chr2 // 94 // 97 // 29 // 31 // 0 /// CR542210 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834B0225D for gene STK17B, serine/threonine kinase 17b (apoptosis-inducing); complete cds, incl. stopcodon. // chr2 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// CR542225 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834D1125D for gene STK17B, serine/threonine kinase 17b (apoptosis-inducing); complete cds, without stopcodon. // chr2 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000046857 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:196079866:196163383:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 59 // 59 // 19 // 32 // 1 /// GENSCAN00000046852 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:196170738:196337987:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_020760 // RefSeq // Homo sapiens HECT, C2 and WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2 (HECW2), mRNA. // chr2 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// XM_006712648 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens HECT, C2 and WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2 (HECW2), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000260983 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:196194370:196592611:-1 gene:ENSG00000138411 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000409111 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:2:196199251:196362222:-1 gene:ENSG00000138411 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// BC117194 // GenBank // Homo sapiens HECT, C2 and WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2, mRNA (cDNA clone MGC:150803 IMAGE:40125745), complete cds. // chr2 // 97 // 92 // 32 // 33 // 0 /// BC117198 // GenBank // Homo sapiens HECT, C2 and WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2, mRNA (cDNA clone MGC:150807 IMAGE:40125749), complete cds. // chr2 // 97 // 92 // 32 // 33 // 0 /// CR749424 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686M17164 (from clone DKFZp686M17164). // chr2 // 97 // 89 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000046852 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:196170738:196337987:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 83 // 83 // 30 // 36 // 1
NONHSAT076183 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000517114 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:196686148:196686330:-1 gene:ENSG00000252923 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT076192 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001206774 // RefSeq // Homo sapiens general transcription factor IIIC, polypeptide 3, 102kDa (GTF3C3), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NM_012086 // RefSeq // Homo sapiens general transcription factor IIIC, polypeptide 3, 102kDa (GTF3C3), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000263956 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:196763032:196799701:-1 gene:ENSG00000119041 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000409364 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:196780089:196799659:-1 gene:ENSG00000119041 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000470386 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:196785444:196791897:-1 gene:ENSG00000119041 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// AF133123 // GenBank // Homo sapiens transcription factor IIIC102 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AF465407 // GenBank // Homo sapiens transcription factor IIIC102 short isoform mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// BC043347 // GenBank // Homo sapiens general transcription factor IIIC, polypeptide 3, 102kDa, mRNA (cDNA clone MGC:49899 IMAGE:5498609), complete cds. // chr2 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000002138 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:196764563:196809336:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_213608 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 66 (C2orf66), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000342506 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:196805002:196810276:-1 gene:ENSG00000187944 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AY358249 // GenBank // Homo sapiens clone DNA167689 IIDS6411 (UNQ6411) mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// BC137150 // GenBank // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 66, mRNA (cDNA clone MGC:168770 IMAGE:9021147), complete cds. // chr2 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// BC137151 // GenBank // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 66, mRNA (cDNA clone MGC:168771 IMAGE:9021148), complete cds. // chr2 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0
NM_144629 // RefSeq // Homo sapiens raftlin family member 2 (RFTN2), mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000295049 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:197568224:197675995:-1 gene:ENSG00000162944 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000454447 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:197572006:197617895:-1 gene:ENSG00000162944 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000494346 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:197571735:197618021:-1 gene:ENSG00000162944 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 39 // 13 // 13 // 0 /// BC093966 // GenBank // Homo sapiens raftlin family member 2, mRNA (cDNA clone MGC:121001 IMAGE:7939811), complete cds. // chr2 // 93 // 82 // 25 // 27 // 0 /// BC111069 // GenBank // Homo sapiens raftlin family member 2, mRNA (cDNA clone MGC:117313 IMAGE:5764096), complete cds. // chr2 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// BC113361 // GenBank // Homo sapiens raftlin family member 2, mRNA (cDNA clone MGC:141921 IMAGE:8322413), complete cds. // chr2 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000429081 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:197644247:197676045:-1 gene:ENSG00000162944 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1 /// GENSCAN00000046674 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:197572008:197669342:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0
ENST00000478343 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:199901081:199901377:-1 gene:ENSG00000240302 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT076294 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENST00000516950 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:200863152:200863247:-1 gene:ENSG00000252759 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT076341 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000364629 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:200881715:200881821:-1 gene:ENSG00000201499 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT076345 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_173822 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 126, member B (FAM126B), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000286181 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:200978493:201071665:-1 gene:ENSG00000155744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000418596 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:200973718:201071669:-1 gene:ENSG00000155744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000452799 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:200997445:201071645:-1 gene:ENSG00000155744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// AL832346 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp451A156 (from clone DKFZp451A156). // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC039295 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 126, member B, mRNA (cDNA clone MGC:39518 IMAGE:5267063), complete cds. // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000498780 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:200996050:201071669:-1 gene:ENSG00000155744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// AK124184 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ42190 fis, clone THYMU2032825, moderately similar to Down-regulated by CTNNB1 protein A. // chr2 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// GENSCAN00000036280 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:200911042:201024009:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
ENST00000559747 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:40133768:40135214:-1 gene:ENSG00000259239 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 79 // 100 // 19 // 24 // 0 /// NONHSAT041812 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 79 // 100 // 19 // 24 // 0
NM_015049 // RefSeq // Homo sapiens trafficking protein, kinesin binding 2 (TRAK2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000332624 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:201377207:201451579:-1 gene:ENSG00000115993 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000430254 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:2:201395128:201451500:-1 gene:ENSG00000115993 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// AB038951 // GenBank // Homo sapiens ALS2CR3 mRNA for amyotrophic lateral sclerosis 2, candidate 3, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK054763 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ30201 fis, clone BRACE2001477, weakly similar to HUNTINGTIN ASSOCIATED PROTEIN 1. // chr2 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// BC040668 // GenBank // Homo sapiens trafficking protein, kinesin binding 2, mRNA (cDNA clone MGC:42256 IMAGE:4814594), complete cds. // chr2 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// BC041330 // GenBank // Homo sapiens trafficking protein, kinesin binding 2, mRNA (cDNA clone MGC:41785 IMAGE:5284937), complete cds. // chr2 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// BC048093 // GenBank // Homo sapiens trafficking protein, kinesin binding 2, mRNA (cDNA clone MGC:57139 IMAGE:5284127), complete cds. // chr2 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// ENST00000620184 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:201379852:201451611:-1 gene:ENSG00000115993 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000046032 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:201380543:201411874:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
ENST00000475212 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:202201384:202201886:-1 gene:ENSG00000223825 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000046036 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:202201380:202232261:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_018256 // RefSeq // Homo sapiens WD repeat domain 12 (WDR12), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000261015 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:202874782:202912226:-1 gene:ENSG00000138442 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF242546 // GenBank // Homo sapiens YTM1 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC008082 // GenBank // Homo sapiens WD repeat domain 12, mRNA (cDNA clone MGC:835 IMAGE:3050219), complete cds. // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// EF011617 // GenBank // Homo sapiens CDW7/WDR12 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AK299489 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51286 complete cds, highly similar to WD repeat protein 12. // chr2 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// GENSCAN00000049487 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:202880860:202912618:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0
ENST00000365189 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:203052285:203052418:-1 gene:ENSG00000202059 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT076478 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000430003 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:203634577:203636016:-1 gene:ENSG00000233459 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000038422 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:203603501:203682345:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_017759 // RefSeq // Homo sapiens INO80 complex subunit D (INO80D), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000403263 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:205993721:206086182:-1 gene:ENSG00000114933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000424117 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:2:206009705:206063244:-1 gene:ENSG00000114933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 94 // 53 // 16 // 17 // 0 /// BC136278 // GenBank // Homo sapiens INO80 complex subunit D, mRNA (cDNA clone MGC:167888 IMAGE:9020265), complete cds. // chr2 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000414320 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:206062906:206086303:-1 gene:ENSG00000114933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1 /// GENSCAN00000049237 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:206046500:206063016:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000049244 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:206004368:206029503:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0
ENST00000516907 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:206260066:206260214:-1 gene:ENSG00000252716 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT076557 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
ENST00000420063 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:206410087:206410909:-1 gene:ENSG00000180105 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
ENST00000384589 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:206701065:206701185:-1 gene:ENSG00000207319 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT076567 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000362381 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:207680533:207680639:-1 gene:ENSG00000199251 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONHSAT076619 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_003468 // RefSeq // Homo sapiens frizzled class receptor 5 (FZD5), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 54 // 54 // 0 /// ENST00000295417 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:207762586:207769563:-1 gene:ENSG00000163251 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 54 // 54 // 0 /// AB043702 // GenBank // Homo sapiens FZD5 mRNA for seven-transmembrane receptor Frizzled-5, complete cds. // chr2 // 96 // 43 // 22 // 23 // 0 /// AK290386 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77885 complete cds, highly similar to Homo sapiens FZD5 mRNA for seven-transmembrane receptor Frizzled-5. // chr2 // 100 // 20 // 11 // 11 // 0 /// U43318 // GenBank // Human putative transmembrane receptor (frizzled 5) mRNA, complete cds. // chr2 // 71 // 31 // 12 // 17 // 0 /// GENSCAN00000029962 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:207766982:207768739:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 15 // 8 // 8 // 0
NM_001080475 // RefSeq // Homo sapiens pleckstrin homology domain containing, family M, member 3 (PLEKHM3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000343987 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:207821290:207822769:-1 gene:ENSG00000244567 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC065842 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:30408657, partial cds. // chr2 // 42 // 42 // 10 // 24 // 1 /// NONHSAT076624 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001080475 // RefSeq // Homo sapiens pleckstrin homology domain containing, family M, member 3 (PLEKHM3), mRNA. // chr2 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// XM_006712521 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens pleckstrin homology domain containing, family M, member 3 (PLEKHM3), transcript variant X4, mRNA. // chr2 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// ENST00000427836 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:207828303:208025560:-1 gene:ENSG00000178385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// ENST00000447645 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:207851238:207977450:-1 gene:ENSG00000178385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 95 // 95 // 20 // 21 // 0 /// ENST00000457206 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:207900041:208025498:-1 gene:ENSG00000178385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// AK123204 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ41210 fis, clone BRALZ2014484. // chr2 // 95 // 95 // 20 // 21 // 0 /// BC151137 // GenBank // Homo sapiens pleckstrin homology domain containing, family M, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:184049 IMAGE:9057037), complete cds. // chr2 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// BX648983 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686H2498 (from clone DKFZp686H2498). // chr2 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// BC020812 // GenBank // Homo sapiens pleckstrin homology domain containing, family M, member 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:4295234), partial cds. // chr2 // 91 // 91 // 20 // 22 // 1 /// GENSCAN00000029965 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:207902046:207978790:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0
ENST00000390944 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:208019638:208019741:-1 gene:ENSG00000212246 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT076626 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000516132 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:208054161:208054258:-1 gene:ENSG00000251941 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT076628 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONHSAT076629 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_006891 // RefSeq // Homo sapiens crystallin, gamma D (CRYGD), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000264376 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:208121607:208124501:-1 gene:ENSG00000118231 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0 /// U66583 // GenBank // Human gammaD-crystallin (CRYGD) mRNA, complete cds. // chr2 // 76 // 94 // 13 // 17 // 0 /// BC117338 // GenBank // Homo sapiens crystallin, gamma D, mRNA (cDNA clone MGC:150947 IMAGE:40125889), complete cds. // chr2 // 72 // 100 // 13 // 18 // 0 /// BC117340 // GenBank // Homo sapiens crystallin, gamma D, mRNA (cDNA clone MGC:150949 IMAGE:40125891), complete cds. // chr2 // 72 // 100 // 13 // 18 // 0
NM_020989 // RefSeq // Homo sapiens crystallin, gamma C (CRYGC), mRNA. // chr2 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000282141 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:208128137:208129830:-1 gene:ENSG00000163254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// BC074954 // GenBank // Homo sapiens crystallin, gamma C, mRNA (cDNA clone MGC:103895 IMAGE:30915279), complete cds. // chr2 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// BC074955 // GenBank // Homo sapiens crystallin, gamma C, mRNA (cDNA clone MGC:104054 IMAGE:30915501), complete cds. // chr2 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// U66582 // GenBank // Human gammaC-crystallin (CRYGC) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000029960 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:208128203:208137697:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0
NM_005210 // RefSeq // Homo sapiens crystallin, gamma B (CRYGB), mRNA. // chr2 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000260988 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:208142573:208146168:-1 gene:ENSG00000182187 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC074944 // GenBank // Homo sapiens crystallin, gamma B, mRNA (cDNA clone MGC:103889 IMAGE:30915273), complete cds. // chr2 // 82 // 68 // 14 // 17 // 0 /// BC074945 // GenBank // Homo sapiens crystallin, gamma B, mRNA (cDNA clone MGC:104050 IMAGE:30915496), complete cds. // chr2 // 82 // 68 // 14 // 17 // 0 /// BC117384 // GenBank // Homo sapiens crystallin, gamma B, mRNA (cDNA clone MGC:150993 IMAGE:40125935), complete cds. // chr2 // 87 // 92 // 20 // 23 // 0 /// BC117388 // GenBank // Homo sapiens crystallin, gamma B, mRNA (cDNA clone MGC:150997 IMAGE:40125939), complete cds. // chr2 // 87 // 92 // 20 // 23 // 0 /// GENSCAN00000029950 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:208142638:208163556:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_014617 // RefSeq // Homo sapiens crystallin, gamma A (CRYGA), mRNA. // chr2 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000304502 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:208160740:208163576:-1 gene:ENSG00000168582 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// BC114456 // GenBank // Homo sapiens crystallin, gamma A, mRNA (cDNA clone MGC:138558 IMAGE:40014816), complete cds. // chr2 // 86 // 75 // 18 // 21 // 0 /// EF426311 // GenBank // Homo sapiens gammaA-crystallin (CRYGA) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000029950 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:208142638:208163556:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001099334 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 80 (C2orf80), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000341287 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:208165347:208190073:-1 gene:ENSG00000188674 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000423952 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:208171006:208187016:-1 gene:ENSG00000188674 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 53 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000428015 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:208165376:208183024:-1 gene:ENSG00000188674 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 88 // 50 // 14 // 16 // 0 /// ENST00000449053 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:208182972:208189985:-1 gene:ENSG00000188674 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000451342 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:2:208165343:208181286:-1 gene:ENSG00000188674 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 34 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000451346 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:2:208165355:208190024:-1 gene:ENSG00000188674 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000453017 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:2:208165478:208187004:-1 gene:ENSG00000188674 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// BC035737 // GenBank // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 80, mRNA (cDNA clone MGC:46742 IMAGE:5730487), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000029964 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:208172166:208196010:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
ENST00000365294 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:208920547:208920664:-1 gene:ENSG00000202164 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT076652 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000410385 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:209721913:209722021:-1 gene:ENSG00000222317 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT076659 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001608 // RefSeq // Homo sapiens acyl-CoA dehydrogenase, long chain (ACADL), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_005246517 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens acyl-CoA dehydrogenase, long chain (ACADL), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000233710 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:210187939:210225491:-1 gene:ENSG00000115361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC039063 // GenBank // Homo sapiens acyl-Coenzyme A dehydrogenase, long chain, mRNA (cDNA clone MGC:34642 IMAGE:5189329), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC064549 // GenBank // Homo sapiens acyl-Coenzyme A dehydrogenase, long chain, mRNA (cDNA clone MGC:70826 IMAGE:5745188), complete cds. // chr2 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// M74096 // GenBank // Human long chain acyl-CoA dehydrogenase (ACADL) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000010949 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:210164593:210225263:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1
NM_015657 // RefSeq // Homo sapiens ATP-binding cassette, sub-family A (ABC1), member 12 (ABCA12), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 86 // 56 // 56 // 0 /// NM_173076 // RefSeq // Homo sapiens ATP-binding cassette, sub-family A (ABC1), member 12 (ABCA12), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 63 // 63 // 0 /// NR_103740 // RefSeq // Homo sapiens ATP-binding cassette, sub-family A (ABC1), member 12 (ABCA12), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr2 // 100 // 97 // 63 // 63 // 0 /// ENST00000272895 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:214931542:215138428:-1 gene:ENSG00000144452 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 63 // 63 // 0 /// ENST00000389661 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:214932622:215032086:-1 gene:ENSG00000144452 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 85 // 55 // 55 // 0 /// AF418105 // GenBank // Homo sapiens ATP-binding cassette transporter family A member 12 mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 88 // 55 // 57 // 0 /// AY033486 // GenBank // Homo sapiens ATP-binding cassette transporter family A member 12 (ABCA12) mRNA, complete cds. // chr2 // 98 // 85 // 54 // 55 // 0 /// AY219711 // GenBank // Homo sapiens ABCA12 transporter subfamily A mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 97 // 63 // 63 // 0 /// GENSCAN00000007072 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:214932634:215101447:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 80 // 52 // 52 // 0
NM_018000 // RefSeq // Homo sapiens melanoregulin (MREG), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000263268 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:215944490:216013623:-1 gene:ENSG00000118242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// BC082990 // GenBank // Homo sapiens melanoregulin, mRNA (cDNA clone MGC:90296 IMAGE:6159624), complete cds. // chr2 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// BC032747 // GenBank // Homo sapiens melanoregulin, mRNA (cDNA clone MGC:45077 IMAGE:5573149), complete cds. // chr2 // 81 // 81 // 25 // 31 // 1 /// ENST00000620139 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:215942805:216013613:-1 gene:ENSG00000118242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_020814 // RefSeq // Homo sapiens membrane-associated ring finger (C3HC4) 4, E3 ubiquitin protein ligase (MARCH4), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000273067 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:216257865:216372027:-1 gene:ENSG00000144583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC098448 // GenBank // Homo sapiens membrane-associated ring finger (C3HC4) 4, mRNA (cDNA clone MGC:104908 IMAGE:6209260), complete cds. // chr2 // 95 // 67 // 19 // 20 // 0
ENST00000457237 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:216610342:216610959:-1 gene:ENSG00000235444 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000009639 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:216610342:216610926:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_000599 // RefSeq // Homo sapiens insulin-like growth factor binding protein 5 (IGFBP5), mRNA. // chr2 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// ENST00000233813 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:216672105:216695525:-1 gene:ENSG00000115461 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF055033 // GenBank // Homo sapiens clone 24645 insulin-like growth factor binding protein 5 (IGFBP5) mRNA, complete cds. // chr2 // 93 // 42 // 14 // 15 // 0 /// BC011453 // GenBank // Homo sapiens insulin-like growth factor binding protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:17161 IMAGE:4186607), complete cds. // chr2 // 92 // 36 // 12 // 13 // 0 /// BT019706 // GenBank // Homo sapiens insulin-like growth factor binding protein 5 mRNA, complete cds. // chr2 // 92 // 33 // 11 // 12 // 0 /// BT019707 // GenBank // Homo sapiens insulin-like growth factor binding protein 5 mRNA, complete cds. // chr2 // 92 // 33 // 11 // 12 // 0 /// CR456809 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834A0619D for gene IGFBP5, insulin-like growth factor binding protein 5; complete cds, incl. stopcodon. // chr2 // 92 // 33 // 11 // 12 // 0 /// M62782 // GenBank // Homo sapiens insulin-like growth factor binding protein 5 (IGFBP-5) mRNA, complete cds. // chr2 // 92 // 33 // 11 // 12 // 0 /// M65062 // GenBank // Human insulin-like growth factor binding protein 5 (IGFBP-5) mRNA, complete cds. // chr2 // 93 // 42 // 14 // 15 // 0 /// GENSCAN00000009646 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:216676751:216694775:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 33 // 12 // 12 // 0
NM_003284 // RefSeq // Homo sapiens transition protein 1 (during histone to protamine replacement) (TNP1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000236979 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:216859458:216860064:-1 gene:ENSG00000118245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC029516 // GenBank // Homo sapiens transition protein 1 (during histone to protamine replacement), mRNA (cDNA clone MGC:33798 IMAGE:5272281), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// X07948 // GenBank // Human mRNA for transition protein 1 (TP1). // chr2 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000009638 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:216810290:216994487:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 42 // 42 // 10 // 24 // 1
NM_000634 // RefSeq // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) receptor 1 (CXCR1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000295683 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:218162845:218166995:-1 gene:ENSG00000163464 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK298647 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51527 complete cds, moderately similar to High affinity interleukin-8 receptor A. // chr2 // 96 // 84 // 26 // 27 // 0 /// BC028221 // GenBank // Homo sapiens interleukin 8 receptor, alpha, mRNA (cDNA clone MGC:40015 IMAGE:5217529), complete cds. // chr2 // 88 // 78 // 22 // 25 // 0 /// BC072397 // GenBank // Homo sapiens interleukin 8 receptor, alpha, mRNA (cDNA clone MGC:87714 IMAGE:5755928), complete cds. // chr2 // 88 // 78 // 22 // 25 // 0 /// CR541994 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834D0835D for gene IL8RA, interleukin 8 receptor, alpha; complete cds, incl. stopcodon. // chr2 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// CR542029 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834E0935D for gene IL8RA, interleukin 8 receptor, alpha; complete cds, without stopcodon. // chr2 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// L19591 // GenBank // Homo sapiens interleukin 8 receptor alpha (IL8RA) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// M68932 // GenBank // Human IL-8 receptor mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000049398 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:218164159:218187545:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0
NONHSAT076893 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000410782 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:218500729:218501037:-1 gene:ENSG00000222714 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// NONHSAT076926 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr2 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0
ENST00000384663 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:218589214:218589320:-1 gene:ENSG00000207393 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT076930 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_022453 // RefSeq // Homo sapiens ring finger protein 25 (RNF25), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000295704 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:218663864:218672411:-1 gene:ENSG00000163481 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000423170 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:218665154:218671967:-1 gene:ENSG00000163481 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000463188 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:218664827:218671984:-1 gene:ENSG00000163481 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000473034 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:218663892:218671977:-1 gene:ENSG00000163481 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000497832 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:218665932:218668168:-1 gene:ENSG00000163481 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 90 // 36 // 9 // 10 // 0 /// AK289501 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75387 complete cds, highly similar to Homo sapiens ring finger protein 25, mRNA. // chr2 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// BC015612 // GenBank // Homo sapiens ring finger protein 25, mRNA (cDNA clone MGC:22940 IMAGE:4811222), complete cds. // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000044274 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:218663957:218668710:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0
ENST00000363159 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:218916184:218916287:-1 gene:ENSG00000200029 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT076958 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_017521 // RefSeq // Homo sapiens FEV (ETS oncogene family) (FEV), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000295727 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:218981087:218985657:-1 gene:ENSG00000163497 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC023511 // GenBank // Homo sapiens FEV (ETS oncogene family), mRNA (cDNA clone MGC:12793 IMAGE:4130242), complete cds. // chr2 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000044280 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:218981667:218985500:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0
NR_029867 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 375 (MIR375), microRNA. // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000362103 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:219001628:219001739:-1 gene:ENSG00000198973 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000044277 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:218990252:219038836:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// hsa-mir-375 // miRBase Micro RNA Database // MI0000783 Homo sapiens miR-375 stem-loop // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT076974 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_002181 // RefSeq // Homo sapiens indian hedgehog (IHH), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000295731 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:219054420:219060467:-1 gene:ENSG00000163501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC136587 // GenBank // Homo sapiens Indian hedgehog homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:168200 IMAGE:9020577), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC136588 // GenBank // Homo sapiens Indian hedgehog homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:168201 IMAGE:9020578), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000044279 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:219055207:219060467:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_015680 // RefSeq // Homo sapiens cyclin Pas1/PHO80 domain containing 1 (CNPPD1), mRNA. // chr2 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000360507 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:219171897:219176966:-1 gene:ENSG00000115649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000409789 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:219172174:219178106:-1 gene:ENSG00000115649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000451647 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:2:219173051:219176898:-1 gene:ENSG00000115649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 75 // 23 // 24 // 0 /// ENST00000453038 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:219172894:219177313:-1 gene:ENSG00000115649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// AF151815 // GenBank // Homo sapiens CGI-57 protein mRNA, complete cds. // chr2 // 93 // 91 // 27 // 29 // 0 /// BC001393 // GenBank // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 24, mRNA (cDNA clone MGC:782 IMAGE:3051397), complete cds. // chr2 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// BC012821 // GenBank // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 24, mRNA (cDNA clone MGC:4432 IMAGE:2958621), complete cds. // chr2 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// AK311656 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ18698. // chr2 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1 /// GENSCAN00000044273 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:219160447:219176828:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1
NR_029688 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 153-1 (MIR153-1), microRNA. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000384914 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:219294111:219294200:-1 gene:ENSG00000207647 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// hsa-mir-153-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0000463 Homo sapiens miR-153-1 stem-loop // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT077020 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001007089 // RefSeq // Homo sapiens regulated endocrine-specific protein 18 (RESP18), mRNA. // chr2 // 91 // 85 // 21 // 23 // 0 /// ENST00000333527 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:2:219327409:219333177:-1 gene:ENSG00000182698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 91 // 85 // 21 // 23 // 0 /// ENST00000392083 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:2:219327409:219332629:-1 gene:ENSG00000182698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000470719 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:219327409:219331178:-1 gene:ENSG00000182698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 90 // 74 // 18 // 20 // 0 /// AF437883 // GenBank // Homo sapiens regulated endocrine-specific Resp18B isoform (RESP18) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr2 // 87 // 85 // 20 // 23 // 0 /// AF439399 // GenBank // Homo sapiens regulated endocrine-specific protein 18 isoform A (RESP18) mRNA, complete cds. // chr2 // 95 // 74 // 19 // 20 // 0 /// DQ227570 // GenBank // Homo sapiens regulated endocrine-specific protein 18 isoform C mRNA, complete cds. // chr2 // 90 // 74 // 18 // 20 // 0 /// GENSCAN00000043082 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:219327513:219358983:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_001195731 // RefSeq // Homo sapiens chondroitin polymerizing factor (CHPF), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// NM_024536 // RefSeq // Homo sapiens chondroitin polymerizing factor (CHPF), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000243776 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:219538947:219543787:-1 gene:ENSG00000123989 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000535926 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:219538948:219543097:-1 gene:ENSG00000123989 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// AB086063 // GenBank // Homo sapiens CSS3 mRNA for chondroitin sulfate synthase, complete cds. // chr2 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// AB095813 // GenBank // Homo sapiens ChPF mRNA for chondroitin polymerizing factor, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AK302124 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53626 complete cds, highly similar to Chondroitin sulfate synthase 2 (EC 2.4.1.175). // chr2 // 82 // 50 // 9 // 11 // 0 /// AY358403 // GenBank // Homo sapiens clone DNA59820 RASL651 (UNQ651) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC008878 // GenBank // Homo sapiens chondroitin polymerizing factor, mRNA (cDNA clone IMAGE:4298587), partial cds. // chr2 // 100 // 59 // 13 // 13 // 0 /// BC021223 // GenBank // Homo sapiens chondroitin polymerizing factor, mRNA (cDNA clone MGC:13135 IMAGE:4128192), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC023531 // GenBank // Homo sapiens chondroitin polymerizing factor, mRNA (cDNA clone MGC:14188 IMAGE:4123041), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000043080 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:219539383:219543538:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 55 // 12 // 12 // 0
ENST00000410746 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:219590687:219590984:-1 gene:ENSG00000222678 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 83 // 100 // 15 // 18 // 0 /// NONHSAT077056 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 83 // 100 // 15 // 18 // 0
NM_004438 // RefSeq // Homo sapiens EPH receptor A4 (EPHA4), mRNA. // chr2 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// ENST00000281821 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:221418029:221572290:-1 gene:ENSG00000116106 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000409854 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:221425599:221572283:-1 gene:ENSG00000116106 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000409938 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:221425901:221574202:-1 gene:ENSG00000116106 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// AK290306 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78431 complete cds, highly similar to Homo sapiens EPH receptor A4 (EPHA4), mRNA. // chr2 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// AK300772 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53205 complete cds, highly similar to Ephrin type-A receptor 4 precursor (EC 2.7.10.1). // chr2 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC026327 // GenBank // Homo sapiens EPH receptor A4, mRNA (cDNA clone MGC:26318 IMAGE:4814429), complete cds. // chr2 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// BC105000 // GenBank // Homo sapiens EPH receptor A4, mRNA (cDNA clone MGC:132660 IMAGE:8144003), complete cds. // chr2 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC105002 // GenBank // Homo sapiens EPH receptor A4, mRNA (cDNA clone MGC:132662 IMAGE:8144005), complete cds. // chr2 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// L36645 // GenBank // Homo sapiens receptor protein-tyrosine kinase (HEK8) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000024048 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:221419675:221564376:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NONHSAT077131 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000470923 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:223248498:223248794:-1 gene:ENSG00000243125 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT077146 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_003469 // RefSeq // Homo sapiens secretogranin II (SCG2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000305409 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:223596940:223602503:-1 gene:ENSG00000171951 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC022509 // GenBank // Homo sapiens secretogranin II (chromogranin C), mRNA (cDNA clone MGC:26541 IMAGE:4820104), complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// M25756 // GenBank // Human secretogranin II gene, complete cds. // chr2 // 94 // 59 // 15 // 16 // 0 /// AK298828 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51276 complete cds, highly similar to Secretogranin-2 precursor. // chr2 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// GENSCAN00000024168 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:223597429:223599282:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0
NM_001122779 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 124B (FAM124B), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000243806 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:224399525:224402085:-1 gene:ENSG00000124019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000409685 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:224378698:224402034:-1 gene:ENSG00000124019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NM_024785 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 124B (FAM124B), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1 /// ENST00000389874 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:224378698:224401994:-1 gene:ENSG00000124019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1 /// BC025754 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 124B, mRNA (cDNA clone MGC:34161 IMAGE:5202295), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1 /// GENSCAN00000044184 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:224379573:224407354:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_005544 // RefSeq // Homo sapiens insulin receptor substrate 1 (IRS1), mRNA. // chr2 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// XM_005246534 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens insulin receptor substrate 1 (IRS1), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000305123 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:226731317:226799759:-1 gene:ENSG00000169047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC053895 // GenBank // Homo sapiens insulin receptor substrate 1, mRNA (cDNA clone MGC:61462 IMAGE:6144252), complete cds. // chr2 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// S62539 // GenBank // insulin receptor substrate-1 [human, skeletal muscle, mRNA, 5828 nt]. // chr2 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000029800 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:226744013:226840353:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0
XM_006712249 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens collagen, type IV, alpha 4 (COL4A4), transcript variant X6, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000391089 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:226968989:226969122:-1 gene:ENSG00000212391 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT077198 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_000092 // RefSeq // Homo sapiens collagen, type IV, alpha 4 (COL4A4), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 62 // 62 // 0 /// XM_006712247 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens collagen, type IV, alpha 4 (COL4A4), transcript variant X4, mRNA. // chr2 // 100 // 95 // 59 // 59 // 0 /// XM_006712248 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens collagen, type IV, alpha 4 (COL4A4), transcript variant X5, mRNA. // chr2 // 100 // 95 // 59 // 59 // 0 /// XM_006712249 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens collagen, type IV, alpha 4 (COL4A4), transcript variant X6, mRNA. // chr2 // 100 // 95 // 59 // 59 // 0 /// XM_006712251 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens collagen, type IV, alpha 4 (COL4A4), transcript variant X8, mRNA. // chr2 // 100 // 89 // 55 // 55 // 0 /// XR_427067 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens collagen, type IV, alpha 4 (COL4A4), transcript variant X12, misc_RNA. // chr2 // 100 // 95 // 59 // 59 // 0 /// ENST00000396625 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:227002711:227164113:-1 gene:ENSG00000081052 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 98 // 61 // 61 // 0 /// GENSCAN00000029794 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:226998882:227204996:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 73 // 45 // 45 // 0
NM_024795 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane 4 L six family member 20 (TM4SF20), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000304568 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:227362156:227379306:-1 gene:ENSG00000168955 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY358671 // GenBank // Homo sapiens clone DNA58855 TCCE518 (UNQ518) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// BC035754 // GenBank // Homo sapiens transmembrane 4 L six family member 20, mRNA (cDNA clone MGC:46020 IMAGE:5760060), complete cds. // chr2 // 90 // 77 // 18 // 20 // 0 /// BC137256 // GenBank // Homo sapiens transmembrane 4 L six family member 20, mRNA (cDNA clone MGC:168876 IMAGE:9021253), complete cds. // chr2 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// BC137257 // GenBank // Homo sapiens transmembrane 4 L six family member 20, mRNA (cDNA clone MGC:168877 IMAGE:9021254), complete cds. // chr2 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000013022 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:227363724:227379268:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0
NM_001162483 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 83 (C2orf83), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_020161 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 83 (C2orf83), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000264387 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:227610090:227633172:-1 gene:ENSG00000042304 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000409066 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:227610091:227633320:-1 gene:ENSG00000042304 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK055355 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ30793 fis, clone FEBRA2001020. // chr2 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC131618 // GenBank // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 83, mRNA (cDNA clone MGC:149617 IMAGE:40116809), complete cds. // chr2 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000509872 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:227632969:227648606:-1 gene:ENSG00000250599 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr2 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_025243 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 19 (thiamine transporter), member 3 (SLC19A3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006712779 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens solute carrier family 19 (thiamine transporter), member 3 (SLC19A3), transcript variant X6, mRNA. // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000258403 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:227685855:227718012:-1 gene:ENSG00000135917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000425817 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:227685210:227718010:-1 gene:ENSG00000135917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// AF271633 // GenBank // Homo sapiens solute carrier 19A3 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// AF283317 // GenBank // Homo sapiens orphan transporter SLC19A3 (SLC19A3) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// AK301490 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51347 complete cds, highly similar to Thiamine transporter 2. // chr2 // 94 // 64 // 17 // 18 // 0 /// BC032014 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 19, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:34143 IMAGE:5177540), complete cds. // chr2 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000013012 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:227666887:227701050:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0
ENST00000516537 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:227763052:227763152:-1 gene:ENSG00000252346 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT077222 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001142644 // RefSeq // Homo sapiens SPHK1 interactor, AKAP domain containing (SPHKAP), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NM_030623 // RefSeq // Homo sapiens SPHK1 interactor, AKAP domain containing (SPHKAP), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000344657 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:227979957:228181626:-1 gene:ENSG00000153820 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000392056 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:227979950:228181645:-1 gene:ENSG00000153820 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC104954 // GenBank // Homo sapiens SPHK1 interactor, AKAP domain containing, mRNA (cDNA clone MGC:132614 IMAGE:8143957), complete cds. // chr2 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// BC104956 // GenBank // Homo sapiens SPHK1 interactor, AKAP domain containing, mRNA (cDNA clone MGC:132616 IMAGE:8143959), complete cds. // chr2 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000013015 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:227981717:228115076:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0
NM_017933 // RefSeq // Homo sapiens phosphotyrosine interaction domain containing 1 (PID1), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000354069 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:229025577:229232085:-1 gene:ENSG00000153823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000392054 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:229023974:229271265:-1 gene:ENSG00000153823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// AK000708 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ20701 fis, clone KAIA2204. // chr2 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// AY317148 // GenBank // Homo sapiens NYGGF4 mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr2 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// NM_001100818 // RefSeq // Homo sapiens phosphotyrosine interaction domain containing 1 (PID1), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// ENST00000392055 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:229023995:229271285:-1 gene:ENSG00000153823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// ENST00000409462 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:229023989:229271280:-1 gene:ENSG00000153823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// BC040164 // GenBank // Homo sapiens phosphotyrosine interaction domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:48969 IMAGE:5589172), complete cds. // chr2 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
ENST00000517197 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:229236340:229236609:-1 gene:ENSG00000253006 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT077243 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_139072 // RefSeq // Homo sapiens delta/notch-like EGF repeat containing (DNER), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000341772 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:229357629:229714558:-1 gene:ENSG00000187957 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF442487 // GenBank // Homo sapiens delta-notch-like EGF repeat-containing transmembrane protein (DNER) mRNA, complete cds. // chr2 // 94 // 97 // 33 // 35 // 0 /// AK289553 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76207 complete cds, highly similar to Homo sapiens delta-notch-like EGF repeat-containing transmembrane (DNER), mRNA. // chr2 // 97 // 97 // 34 // 35 // 0 /// AK304596 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53900 complete cds, highly similar to Homo sapiens delta-notch-like EGF repeat-containing transmembrane (DNER), mRNA. // chr2 // 100 // 61 // 22 // 22 // 0 /// AK304631 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55313 complete cds, highly similar to Homo sapiens delta-notch-like EGF repeat-containing transmembrane (DNER), mRNA. // chr2 // 96 // 64 // 22 // 23 // 0 /// AY358891 // GenBank // Homo sapiens clone DNA39976 QPRR262 (UNQ262) mRNA, complete cds. // chr2 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// BC035009 // GenBank // Homo sapiens delta/notch-like EGF repeat containing, mRNA (cDNA clone MGC:33398 IMAGE:4820343), complete cds. // chr2 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// GENSCAN00000036183 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:229582264:229623356:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1 /// GENSCAN00000036194 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:229358540:229472399:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
NM_152527 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 16, member 14 (SLC16A14), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000295190 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:230034974:230068999:-1 gene:ENSG00000163053 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000412034 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:230045670:230068548:-1 gene:ENSG00000163053 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 91 // 46 // 10 // 11 // 0 /// ENST00000457406 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:230045657:230068907:-1 gene:ENSG00000163053 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 92 // 54 // 12 // 13 // 0 /// AK123207 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ41213 fis, clone BRALZ2016085, weakly similar to MONOCARBOXYLATE TRANSPORTER 3. // chr2 // 91 // 46 // 10 // 11 // 0 /// AK292873 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77286 complete cds, highly similar to Homo sapiens solute carrier family 16 (monocarboxylic acid transporters), member 14 (SLC16A14), mRNA. // chr2 // 92 // 54 // 12 // 13 // 0 /// BC034382 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 16, member 14 (monocarboxylic acid transporter 14), mRNA (cDNA clone IMAGE:5193124), partial cds. // chr2 // 92 // 54 // 12 // 13 // 0 /// BC065524 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 16, member 14 (monocarboxylic acid transporter 14), mRNA (cDNA clone MGC:70493 IMAGE:6058847), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000036189 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:230021330:230059352:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 91 // 46 // 10 // 11 // 0
ENST00000362530 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:230058229:230058324:-1 gene:ENSG00000199400 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0 /// ENST00000516225 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:18:46077004:46077099:-1 gene:ENSG00000252034 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 83 // 86 // 5 // 6 // 0 /// NONHSAT059123 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 83 // 86 // 5 // 6 // 0 /// NONHSAT077257 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0
ENST00000412556 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:230725143:230725403:-1 gene:ENSG00000237758 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000030243 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:230725143:230725403:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_000867 // RefSeq // Homo sapiens 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 2B, G protein-coupled (HTR2B), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000258400 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:231108230:231125118:-1 gene:ENSG00000135914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AY136751 // GenBank // Homo sapiens 5-hydroxytryptamine receptor 2B (HTR2B) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// BC063123 // GenBank // Homo sapiens 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 2B, mRNA (cDNA clone MGC:71977 IMAGE:30321290), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006712482 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 2B, G protein-coupled (HTR2B), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1
ENST00000423890 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:231433923:231434426:-1 gene:ENSG00000172799 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000011187 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:231434055:231434426:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_005381 // RefSeq // Homo sapiens nucleolin (NCL), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000322723 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:231453531:231464594:-1 gene:ENSG00000115053 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000356936 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:2:231455442:231458357:-1 gene:ENSG00000115053 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 89 // 38 // 8 // 9 // 0 /// ENST00000461347 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:231454908:231483641:-1 gene:ENSG00000115053 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// AK000250 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ20243 fis, clone COLF6418, highly similar to NUCL_HUMAN NUCLEOLIN. // chr2 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// AK127608 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ45706 fis, clone FEBRA2028457, highly similar to Nucleolin. // chr2 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// AK128584 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ46743 fis, clone TRACH3021778, moderately similar to Nucleolin. // chr2 // 95 // 92 // 21 // 22 // 0 /// BC002343 // GenBank // Homo sapiens nucleolin, mRNA (cDNA clone MGC:8580 IMAGE:2960982), complete cds. // chr2 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1 /// BC006494 // GenBank // Homo sapiens nucleolin, mRNA (cDNA clone MGC:1440 IMAGE:2960982), complete cds. // chr2 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1 /// BC006516 // GenBank // Homo sapiens nucleolin, mRNA (cDNA clone MGC:3588 IMAGE:2960982), complete cds. // chr2 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1 /// GENSCAN00000011195 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:231455191:231521837:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0
NR_002921 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 75 (SNORA75), small nucleolar RNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000384158 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:231455800:231455936:-1 gene:ENSG00000206885 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT077360 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_002908 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 20 (SNORD20), small nucleolar RNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000384550 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:231456444:231456523:-1 gene:ENSG00000207280 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT077361 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000365530 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:231460371:231460440:-1 gene:ENSG00000202400 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_004398 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 82 (SNORD82), small nucleolar RNA. // chr2 // 48 // 100 // 12 // 25 // 0 /// NONHSAT077363 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000411266 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:231501990:231502201:-1 gene:ENSG00000223198 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT077372 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
ENST00000313064 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:231508426:231514339:-1 gene:ENSG00000181798 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC033054 // GenBank // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 52, mRNA (cDNA clone IMAGE:5260929). // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONHSAT077373 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000011195 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:231455191:231521837:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_006056 // RefSeq // Homo sapiens neuromedin U receptor 1 (NMUR1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006712195 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens neuromedin U receptor 1 (NMUR1), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 34 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000305141 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:231523160:231530495:-1 gene:ENSG00000171596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF272362 // GenBank // Homo sapiens neuromedin U receptor 1 (NMUR1) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// AK300222 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60151 complete cds, highly similar to Neuromedin U receptor 1. // chr2 // 95 // 66 // 20 // 21 // 0 /// AK301102 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56741 complete cds, highly similar to Neuromedin U receptor 1. // chr2 // 100 // 34 // 11 // 11 // 0 /// BC036543 // GenBank // Homo sapiens neuromedin U receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:41854 IMAGE:5265972), complete cds. // chr2 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// BC051914 // GenBank // Homo sapiens neuromedin U receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:60397 IMAGE:6194542), complete cds. // chr2 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000011179 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:231525043:231530867:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0
ENST00000481141 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:231645998:231646273:-1 gene:ENSG00000239202 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT077383 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_024409 // RefSeq // Homo sapiens natriuretic peptide C (NPPC), mRNA. // chr2 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// ENST00000295440 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:231925385:231926328:-1 gene:ENSG00000163273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000409852 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:231921820:231926403:-1 gene:ENSG00000163273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// BC069120 // GenBank // Homo sapiens natriuretic peptide precursor C, mRNA (cDNA clone MGC:95399 IMAGE:7216974), complete cds. // chr2 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// BC105065 // GenBank // Homo sapiens natriuretic peptide precursor C, mRNA (cDNA clone MGC:132725 IMAGE:8144068), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC105067 // GenBank // Homo sapiens natriuretic peptide precursor C, mRNA (cDNA clone MGC:132727 IMAGE:8144070), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000011174 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:231925425:231926249:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
NR_028501 // RefSeq // Homo sapiens endothelin converting enzyme-like 1, pseudogene 2 (ECEL1P2), non-coding RNA. // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000461596 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:232385750:232387044:-1 gene:ENSG00000244280 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000465689 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:232386701:232387457:-1 gene:ENSG00000244280 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr2 // 80 // 80 // 16 // 20 // 1 /// NONHSAT077404 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_001290787 // RefSeq // Homo sapiens endothelin converting enzyme-like 1 (ECEL1), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NM_004826 // RefSeq // Homo sapiens endothelin converting enzyme-like 1 (ECEL1), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000304546 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:232479827:232487828:-1 gene:ENSG00000171551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000409941 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:232480153:232486653:-1 gene:ENSG00000171551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000482346 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:232479827:232487821:-1 gene:ENSG00000171551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AB030579 // GenBank // Homo sapiens mRNA for endotheline-converting enzyme ECEL1, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY358923 // GenBank // Homo sapiens clone DNA84932 ECEL1 (UNQ2431) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC050453 // GenBank // Homo sapiens endothelin converting enzyme-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:54244 IMAGE:6194919), complete cds. // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// DQ114476 // GenBank // Homo sapiens endothelin converting enzyme-like 1 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr2 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000014994 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:232476036:232498733:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
NM_145702 // RefSeq // Homo sapiens tigger transposable element derived 1 (TIGD1), mRNA. // chr2 // 100 // 59 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000408957 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:232547968:232550592:-1 gene:ENSG00000221944 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC035143 // GenBank // Homo sapiens tigger transposable element derived 1, mRNA (cDNA clone MGC:43254 IMAGE:5264460), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC063500 // GenBank // Homo sapiens tigger transposable element derived 1, mRNA (cDNA clone MGC:74576 IMAGE:5248661), complete cds. // chr2 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0
ENST00000364143 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:233379843:233379955:-1 gene:ENSG00000201013 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT077482 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_018218 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 40 (USP40), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000251722 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:233475526:233566782:-1 gene:ENSG00000085982 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000427112 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:233477392:233565590:-1 gene:ENSG00000085982 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 76 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000450966 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:233475520:233565590:-1 gene:ENSG00000085982 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000483519 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:233475526:233489640:-1 gene:ENSG00000085982 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 38 // 16 // 16 // 0 /// AL833371 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp667G1714 (from clone DKFZp667G1714). // chr2 // 100 // 38 // 16 // 16 // 0 /// BC067300 // GenBank // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 40, mRNA (cDNA clone IMAGE:30389677), partial cds. // chr2 // 93 // 33 // 13 // 14 // 0 /// ENST00000430158 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:233487681:233511758:-1 gene:ENSG00000085982 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1 /// GENSCAN00000011145 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:233474231:233557016:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 50 // 21 // 21 // 0 /// AK295569 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53044 complete cds, highly similar to Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 40 (EC 3.1.2.15). // chr2 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1
NM_001001394 // RefSeq // Homo sapiens DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 3 (DNAJB3), mRNA. // chr2 // 100 // 94 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000446806 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:233743188:233743916:-1 gene:ENSG00000227802 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr2 // 100 // 50 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000449667 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:233742750:233744015:-1 gene:ENSG00000227802 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 94 // 15 // 15 // 0 /// AY083665 // GenBank // Homo sapiens HCG3 protein mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 94 // 15 // 15 // 0 /// BC017590 // GenBank // Homo sapiens DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:26890 IMAGE:4828023), complete cds. // chr2 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// BC024013 // GenBank // Homo sapiens DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:26879 IMAGE:4826480), complete cds. // chr2 // 100 // 69 // 11 // 11 // 0
NR_024322 // RefSeq // Homo sapiens male-specific lethal 3 homolog (Drosophila) pseudogene 1 (MSL3P1), non-coding RNA. // chr2 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000438684 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:233865437:233868444:-1 gene:ENSG00000224287 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000440028 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:233866129:233868230:-1 gene:ENSG00000224287 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// AK301707 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52683 complete cds, highly similar to Male-specific lethal 3-like 1. // chr2 // 75 // 100 // 3 // 4 // 0 /// AK316372 // GenBank // Homo sapiens cDNA, FLJ79271 complete cds, highly similar to Male-specific lethal 3-like 1. // chr2 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// GENSCAN00000011136 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:233866125:233868444:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// BC070305 // GenBank HTC // Homo sapiens signal recognition particle 9kDa, mRNA (cDNA clone IMAGE:3829096), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr2 // 75 // 100 // 3 // 4 // 0
NM_001282431 // RefSeq // Homo sapiens ADP-ribosylation factor-like 4C (ARL4C), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NM_005737 // RefSeq // Homo sapiens ADP-ribosylation factor-like 4C (ARL4C), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000339728 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:234493041:234497053:-1 gene:ENSG00000188042 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000390645 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:234493041:234497053:-1 gene:ENSG00000188042 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AB016811 // GenBank // Homo sapiens mRNA for ADP ribosylation factor-like protein, complete cds. // chr2 // 89 // 62 // 16 // 18 // 0 /// BC089043 // GenBank // Homo sapiens ADP-ribosylation factor-like 4C, mRNA (cDNA clone MGC:99646 IMAGE:6578402), complete cds. // chr2 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0
ENST00000384322 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:236153071:236153172:-1 gene:ENSG00000207049 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT077597 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001485 // RefSeq // Homo sapiens gastrulation brain homeobox 2 (GBX2), mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000306318 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:236165236:236168369:-1 gene:ENSG00000168505 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000551105 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:2:236165729:236168009:-1 gene:ENSG00000168505 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// AF118452 // GenBank // Homo sapiens homeobox protein GBX2 mRNA, complete cds. // chr2 // 95 // 91 // 20 // 21 // 0 /// BC137448 // GenBank // Homo sapiens gastrulation brain homeobox 2, mRNA (cDNA clone MGC:169071 IMAGE:9021448), complete cds. // chr2 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// BC137449 // GenBank // Homo sapiens gastrulation brain homeobox 2, mRNA (cDNA clone MGC:169072 IMAGE:9021449), complete cds. // chr2 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000028731 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:236165914:236167971:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0
AK123854 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ41860 fis, clone NTONG2006354. // chr2 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// NM_212556 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat and SOCS box containing 18 (ASB18), mRNA. // chr2 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// ENST00000409749 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:236194872:236264345:-1 gene:ENSG00000182177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// GENSCAN00000022167 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:236214362:236264345:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
ENST00000363875 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:236210373:236210548:-1 gene:ENSG00000200745 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT077599 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000365471 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:237015204:237015305:-1 gene:ENSG00000202341 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT077617 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
BC031945 // GenBank // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 19, mRNA (cDNA clone IMAGE:4830090). // chr2 // 91 // 100 // 20 // 22 // 0 /// NONHSAT077674 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr2 // 91 // 100 // 20 // 22 // 0
NM_022817 // RefSeq // Homo sapiens period circadian clock 2 (PER2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 56 // 56 // 0 /// XM_005246111 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens period circadian clock 2 (PER2), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 52 // 52 // 0 /// ENST00000254657 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:238244038:238288609:-1 gene:ENSG00000132326 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 56 // 56 // 0 /// ENST00000355768 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:238261810:238277936:-1 gene:ENSG00000132326 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 61 // 34 // 34 // 0 /// AB012614 // GenBank // Homo sapiens mRNA for Per2S, complete cds. // chr2 // 100 // 61 // 34 // 34 // 0 /// AK294876 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60515 complete cds, highly similar to Period circadian protein 2. // chr2 // 96 // 96 // 52 // 54 // 0 /// AK304108 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59252 complete cds, highly similar to Period circadian protein 2. // chr2 // 94 // 64 // 34 // 36 // 0 /// ENST00000431832 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:238275863:238290102:-1 gene:ENSG00000132326 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 16 // 16 // 9 // 56 // 1 /// GENSCAN00000048962 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:238238827:238277936:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 91 // 51 // 51 // 0
NR_034162 // RefSeq // Homo sapiens FLJ43879 protein (FLJ43879), long non-coding RNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000455228 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:238919302:238926269:-1 gene:ENSG00000227744 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONHSAT077769 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONHSAT077770 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// TCONS_00002681-XLOC_002539 // Rinn lincRNA // linc-PER2-3 chr2:-:239840997-239847965 // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NR_026664 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC85009 (MGC16025), long non-coding RNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONHSAT077791 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001005853 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 6, subfamily B, member 2 (OR6B2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000402971 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:240028965:240030456:-1 gene:ENSG00000182083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC137561 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 6, subfamily B, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:169184 IMAGE:9021561), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC137562 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 6, subfamily B, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:169185 IMAGE:9021562), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000045486 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:240029491:240042978:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_001080835 // RefSeq // Homo sapiens proline rich 21 (PRR21), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000408934 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:240041813:240042982:-1 gene:ENSG00000221961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045486 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:240029491:240042978:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 80 // 60 // 12 // 15 // 0
NM_173351 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 6, subfamily B, member 3 (OR6B3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000319423 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:240045077:240046072:-1 gene:ENSG00000178586 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000045479 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:240045077:240046072:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001163424 // RefSeq // Homo sapiens myeloma overexpressed 2 (MYEOV2), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NM_138336 // RefSeq // Homo sapiens myeloma overexpressed 2 (MYEOV2), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000307266 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:240126563:240136347:-1 gene:ENSG00000172428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000607357 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:2:240130826:240136303:-1 gene:ENSG00000172428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// AF487338 // GenBank // Homo sapiens multiple myeloma overexpression gene 2 (MYEOV2) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000489698 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:240130828:240136176:-1 gene:ENSG00000172428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// ENST00000491765 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:240130828:240134290:-1 gene:ENSG00000172428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// AK126809 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44859 fis, clone BRALZ2003330. // chr2 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000045488 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:240113769:240136347:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT077811 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONHSAT077812 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_148961 // RefSeq // Homo sapiens otospiralin (OTOS), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000319460 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:2:240139029:240140656:-1 gene:ENSG00000178602 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000391989 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:240139026:240144562:-1 gene:ENSG00000178602 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC105085 // GenBank // Homo sapiens otospiralin, mRNA (cDNA clone MGC:132745 IMAGE:8144088), complete cds. // chr2 // 95 // 70 // 18 // 19 // 0 /// BC105087 // GenBank // Homo sapiens otospiralin, mRNA (cDNA clone MGC:132747 IMAGE:8144090), complete cds. // chr2 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000045498 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:240139170:240161250:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1
ENST00000404891 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:240449419:240456700:-1 gene:ENSG00000218416 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000471662 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:240449315:240451543:-1 gene:ENSG00000218416 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AF318342 // GenBank HTC // Homo sapiens pp14571 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AK092442 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ35123 fis, clone PLACE6008036. // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000404327 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:240449418:240456714:-1 gene:ENSG00000218416 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 48 // 48 // 10 // 21 // 1 /// ENST00000538012 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:240450763:240452431:-1 gene:ENSG00000218416 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron gene:ENSG00000255735 // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT077819 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT077820 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001085437 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 54 (C2orf54), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// NM_001282921 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 54 (C2orf54), transcript variant 3, mRNA. // chr2 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// NM_024861 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 54 (C2orf54), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000307486 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:240886049:240892038:-1 gene:ENSG00000172478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000388934 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:2:240886662:240896156:-1 gene:ENSG00000172478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000402775 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:240886048:240892035:-1 gene:ENSG00000172478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// BC125154 // GenBank // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 54, mRNA (cDNA clone MGC:150431 IMAGE:40120634), complete cds. // chr2 // 86 // 61 // 12 // 14 // 0 /// BC125155 // GenBank // Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 54, mRNA (cDNA clone MGC:150432 IMAGE:40120635), complete cds. // chr2 // 86 // 61 // 12 // 14 // 0 /// AK055735 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ31173 fis, clone KIDNE2000070. // chr2 // 39 // 39 // 9 // 23 // 1 /// GENSCAN00000048369 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:240887070:240898732:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 94 // 78 // 17 // 18 // 0
NM_153325 // RefSeq // Homo sapiens defensin, beta 125 (DEFB125), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000382410 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:87710:96533:1 gene:ENSG00000178591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 90 // 83 // 18 // 20 // 0 /// ENST00000608838 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:87250:97094:1 gene:ENSG00000178591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr20 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// AF525927 // GenBank // Homo sapiens beta-defensin 25 precursor (DEFB25) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// AK311802 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ92063, Homo sapiens defensin, beta 125 (DEFB125), mRNA. // chr20 // 93 // 58 // 13 // 14 // 0 /// AY122477 // GenBank // Homo sapiens defensin beta 125 (DEFB125) mRNA, complete cds. // chr20 // 90 // 83 // 18 // 20 // 0 /// BC128195 // GenBank // Homo sapiens defensin, beta 125, mRNA (cDNA clone MGC:149307 IMAGE:40113902), complete cds. // chr20 // 91 // 96 // 21 // 23 // 0 /// BC128196 // GenBank // Homo sapiens defensin, beta 125, mRNA (cDNA clone MGC:149308 IMAGE:40113904), complete cds. // chr20 // 96 // 96 // 22 // 23 // 0 /// BC048429 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5275617, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr20 // 94 // 71 // 16 // 17 // 0
NM_030931 // RefSeq // Homo sapiens defensin, beta 126 (DEFB126), mRNA. // chr20 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000382398 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:142369:145751:1 gene:ENSG00000125788 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000542572 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:20:142634:145749:1 gene:ENSG00000125788 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr20 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// AF525928 // GenBank // Homo sapiens beta-defensin 26 precursor (DEFB26) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// AK225987 // GenBank // Homo sapiens mRNA for beta defensin 126 preproprotein variant, clone: FCC111E11. // chr20 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT078047 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr20 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// BC069294 // GenBank // Homo sapiens defensin, beta 126, mRNA (cDNA clone IMAGE:7262754). // chr20 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// GENSCAN00000007251 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:87710:189743:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_139074 // RefSeq // Homo sapiens defensin, beta 127 (DEFB127), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000382388 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:157470:159163:1 gene:ENSG00000088782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF525929 // GenBank // Homo sapiens beta-defensin 27 precursor (DEFB27) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// AY358796 // GenBank // Homo sapiens clone DNA82403 DEFB127 (UNQ1956) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// BC069486 // GenBank // Homo sapiens defensin, beta 127, mRNA (cDNA clone MGC:97392 IMAGE:7262668), complete cds. // chr20 // 88 // 62 // 14 // 16 // 0 /// BC109395 // GenBank // Homo sapiens defensin, beta 127, mRNA (cDNA clone MGC:133358 IMAGE:40069027), complete cds. // chr20 // 88 // 62 // 14 // 16 // 0 /// BC110085 // GenBank // Homo sapiens defensin, beta 127, mRNA (cDNA clone MGC:133357 IMAGE:40069026), complete cds. // chr20 // 81 // 62 // 13 // 16 // 0
NM_080831 // RefSeq // Homo sapiens defensin, beta 129 (DEFB129), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000246105 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:227258:229886:1 gene:ENSG00000125903 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// AF525931 // GenBank // Homo sapiens beta-defensin 29 precursor (DEFB29) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 74 // 14 // 14 // 0 /// AF529413 // GenBank // Homo sapiens beta-defensin (DEFB129) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 74 // 14 // 14 // 0 /// AY358186 // GenBank // Homo sapiens clone DNA82394 DEFB129 (UNQ5794) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0 /// BC070359 // GenBank // Homo sapiens defensin, beta 129, mRNA (cDNA clone MGC:88365 IMAGE:6592149), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000007249 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:227289:229771:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 74 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT078051 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr20 // 100 // 63 // 12 // 12 // 0
NM_207469 // RefSeq // Homo sapiens defensin, beta 132 (DEFB132), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000382376 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:257736:261096:1 gene:ENSG00000186458 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF525932 // GenBank // Homo sapiens beta-defensin 32 precursor (DEFB32) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// AY358708 // GenBank // Homo sapiens clone DNA76385 KFLL827 (UNQ827) mRNA, complete cds. // chr20 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AY621329 // GenBank // Homo sapiens beta-defensin 133 (DEFB133) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// BC137292 // GenBank // Homo sapiens defensin, beta 132, mRNA (cDNA clone MGC:168912 IMAGE:9021289), complete cds. // chr20 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC137293 // GenBank // Homo sapiens defensin, beta 132, mRNA (cDNA clone MGC:168913 IMAGE:9021290), complete cds. // chr20 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// EF426755 // GenBank // Homo sapiens epididymis secretory sperm binding protein Li 154w (HEL-S-154w) mRNA, complete cds. // chr20 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_033089 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, CCHC domain containing 3 (ZCCHC3), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC069238 // GenBank // Homo sapiens zinc finger, CCHC domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:78475 IMAGE:6287290), complete cds. // chr20 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC107584 // GenBank // Homo sapiens zinc finger, CCHC domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:104290 IMAGE:6457775), complete cds. // chr20 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// ENST00000500893 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:296968:300321:1 gene:ENSG00000247315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000007266 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:297587:298798:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
NM_006943 // RefSeq // Homo sapiens SRY (sex determining region Y)-box 12 (SOX12), mRNA. // chr20 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000342665 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:325401:330224:1 gene:ENSG00000177732 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC067361 // GenBank // Homo sapiens SRY (sex determining region Y)-box 12, mRNA (cDNA clone MGC:71161 IMAGE:6480102), complete cds. // chr20 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// U35612 // GenBank // Homo sapiens SOX22 protein (SOX22) mRNA, complete cds. // chr20 // 92 // 86 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007255 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:325925:326872:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0
ENST00000384070 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:20:450663:450762:1 gene:ENSG00000206797 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT078072 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001136566 // RefSeq // Homo sapiens RAD21-like 1 (S. pombe) (RAD21L1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000402452 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:1226056:1296421:1 gene:ENSG00000244588 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000409241 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:1226120:1254501:1 gene:ENSG00000244588 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC157891 // GenBank // Homo sapiens RAD21-like 1 (S. pombe), mRNA (cDNA clone MGC:189715 IMAGE:8862712), complete cds. // chr20 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC171911 // GenBank // Homo sapiens RAD21-like 1 (S. pombe), mRNA (cDNA clone MGC:198626 IMAGE:9054565), complete cds. // chr20 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// HQ603827 // GenBank // Homo sapiens RAD21L (RAD21L) mRNA, complete cds. // chr20 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENST00000246108 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:1226135:1229931:1 gene:ENSG00000244588 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
ENST00000488553 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:1666360:1666640:1 gene:ENSG00000242348 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT078126 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_080836 // RefSeq // Homo sapiens serine/threonine kinase 35 (STK35), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000381482 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:2101611:2148555:1 gene:ENSG00000125834 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000493263 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:2102891:2177038:1 gene:ENSG00000125834 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr20 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// AF195026 // GenBank // Homo sapiens serine/threonine kinase CLIK1 (CLIK1) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// AK302629 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50299 complete cds, highly similar to Serine/threonine-protein kinase 35 (EC 2.7.11.1). // chr20 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// BC017340 // GenBank // Homo sapiens serine/threonine kinase 35, mRNA (cDNA clone IMAGE:4869353), partial cds. // chr20 // 86 // 54 // 12 // 14 // 0 /// BC140883 // GenBank // Homo sapiens serine/threonine kinase 35, mRNA (cDNA clone MGC:176560 IMAGE:9021751), complete cds. // chr20 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC140884 // GenBank // Homo sapiens serine/threonine kinase 35, mRNA (cDNA clone MGC:176561 IMAGE:9021752), complete cds. // chr20 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// GQ281297 // GenBank // Homo sapiens serine threonine kinase 35 long form (STK35L1) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000009334 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:2102873:2117378:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0
NM_001254734 // RefSeq // Homo sapiens transglutaminase 6 (TGM6), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// NM_198994 // RefSeq // Homo sapiens transglutaminase 6 (TGM6), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000202625 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:2380908:2432753:1 gene:ENSG00000166948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000381423 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:2380908:2432753:1 gene:ENSG00000166948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// AF540969 // GenBank // Homo sapiens transglutaminase y (TGM6) mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr20 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// AF540970 // GenBank // Homo sapiens transglutaminase y short form (TGM6) mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr20 // 97 // 94 // 28 // 29 // 0 /// ENST00000477505 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:2394452:2400444:1 gene:ENSG00000166948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr20 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// GENSCAN00000009340 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:2350381:2432643:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NONHSAT078175 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr20 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1
NM_080751 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane channel-like 2 (TMC2), mRNA. // chr20 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// XM_005260660 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens transmembrane channel-like 2 (TMC2), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000358864 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:2536607:2641784:1 gene:ENSG00000149488 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000496948 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:2602166:2618379:1 gene:ENSG00000149488 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr20 // 100 // 32 // 10 // 10 // 0 /// AF417580 // GenBank // Homo sapiens transmembrane channel-like protein 2 (TMC2) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// AK094789 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ37470 fis, clone BRAWH2012258. // chr20 // 89 // 29 // 8 // 9 // 0 /// AK294013 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57849 complete cds, highly similar to Transmembrane cochlear-expressed protein 2. // chr20 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// AK316261 // GenBank // Homo sapiens cDNA, FLJ79160 complete cds, highly similar to Transmembrane cochlear-expressed protein 2. // chr20 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1 /// GENSCAN00000009336 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:2520742:2658294:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 68 // 68 // 21 // 31 // 1
NR_002981 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 51 (SNORA51), small nucleolar RNA. // chr20 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000484998 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:2655097:2656549:1 gene:ENSG00000101361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr20 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000606420 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:2655067:2655198:1 gene:ENSG00000271798 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr20 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT078191 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NR_002738 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 57 (SNORD57), small nucleolar RNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000448188 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:2656939:2657010:1 gene:ENSG00000226572 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000467857 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:2656949:2658393:1 gene:ENSG00000101361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr20 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000471023 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:2656410:2657225:1 gene:ENSG00000101361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK097186 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39867 fis, clone SPLEN2015310, highly similar to NUCLEOLAR PROTEIN NOP56. // chr20 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// ENST00000612233 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:2655413:2658392:1 gene:ENSG00000101361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT078195 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001110514 // RefSeq // Homo sapiens early B-cell factor 4 (EBF4), mRNA. // chr20 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000342725 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:20:2692879:2760101:1 gene:ENSG00000088881 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// ENST00000380648 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:20:2692878:2760107:1 gene:ENSG00000088881 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000449079 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:2692878:2760101:1 gene:ENSG00000088881 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr20 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000477287 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:2755088:2760101:1 gene:ENSG00000088881 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr20 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000609451 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:20:2693574:2759393:1 gene:ENSG00000088881 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000609967 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:2693574:2760071:1 gene:ENSG00000088881 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr20 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC037555 // GenBank // Homo sapiens, Similar to early B-cell factor (olfactory neuronal transcription factor 1), clone IMAGE:4944280, mRNA. // chr20 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// BC054347 // GenBank // Homo sapiens early B-cell factor 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:5502800), complete cds. // chr20 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000009337 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:2692834:2780772:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT078205 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr20 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0
NONHSAT078201 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr20 // 84 // 79 // 16 // 19 // 0 /// AF161343 // GenBank // Homo sapiens HSPC080 mRNA, partial cds. // chr20 // 61 // 96 // 14 // 23 // 0
NM_001256538 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 141 (C20orf141), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 96 // 82 // 22 // 23 // 0 /// NM_080739 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 141 (C20orf141), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000380589 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:2815011:2815833:1 gene:ENSG00000258713 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000603872 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:2814987:2815793:1 gene:ENSG00000258713 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// BC014591 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 141, mRNA (cDNA clone MGC:26144 IMAGE:4821474), complete cds. // chr20 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000380593 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:20:2814968:2818066:1 gene:ENSG00000241690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// GENSCAN00000009328 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:2814972:2817013:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// AK129653 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ26142 fis, clone TST04526. // chr20 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001167670 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 239 (TMEM239), mRNA. // chr20 // 86 // 54 // 12 // 14 // 0 /// ENST00000361033 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:20:2816302:2820284:1 gene:ENSG00000198326 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000380585 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:2816333:2817031:1 gene:ENSG00000198326 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 86 // 54 // 12 // 14 // 0 /// AK126033 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44045 fis, clone TESTI4030159. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC021178 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 141, mRNA (cDNA clone MGC:33216 IMAGE:5265299), complete cds. // chr20 // 86 // 54 // 12 // 14 // 0 /// GENSCAN00000009328 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:2814972:2817013:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
NM_178331 // RefSeq // Homo sapiens gonadotropin-releasing hormone 2 (GNRH2), transcript variant 3, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_178332 // RefSeq // Homo sapiens gonadotropin-releasing hormone 2 (GNRH2), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000359100 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:3043622:3045747:1 gene:ENSG00000125787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000380346 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:3044412:3045747:1 gene:ENSG00000125787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000380347 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:3044010:3045747:1 gene:ENSG00000125787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// BC115399 // GenBank // Homo sapiens gonadotropin-releasing hormone 2, mRNA (cDNA clone MGC:134861 IMAGE:40069240), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001501 // RefSeq // Homo sapiens gonadotropin-releasing hormone 2 (GNRH2), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 1 /// ENST00000245983 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:3043622:3045747:1 gene:ENSG00000125787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 1 /// BC069362 // GenBank // Homo sapiens gonadotropin-releasing hormone 2, transcript variant 1, mRNA (cDNA clone MGC:97397 IMAGE:7262673), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 1 /// BC115400 // GenBank // Homo sapiens gonadotropin-releasing hormone 2, mRNA (cDNA clone MGC:134862 IMAGE:40069241), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 1 /// NONHSAT078210 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 73 // 42 // 8 // 11 // 0
NM_030811 // RefSeq // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein S26 (MRPS26), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000380325 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:3045945:3048254:1 gene:ENSG00000125901 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC013018 // GenBank // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein S26, mRNA (cDNA clone MGC:4583 IMAGE:3051126), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000027456 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:3044415:3051909:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
NM_000915 // RefSeq // Homo sapiens oxytocin/neurophysin I prepropeptide (OXT), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000217386 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:3071620:3072517:1 gene:ENSG00000101405 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC069144 // GenBank // Homo sapiens oxytocin, prepropeptide, mRNA (cDNA clone MGC:95429 IMAGE:7217004), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC101841 // GenBank // Homo sapiens oxytocin, prepropeptide, mRNA (cDNA clone MGC:126890 IMAGE:8069347), complete cds. // chr20 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC101843 // GenBank // Homo sapiens oxytocin, prepropeptide, mRNA (cDNA clone MGC:126892 IMAGE:8069349), complete cds. // chr20 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// M25650 // GenBank // Human oxytocin mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000027468 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:3071656:3072418:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 94 // 65 // 16 // 17 // 0 /// NONHSAT078213 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 91 // 42 // 10 // 11 // 0
ENST00000584742 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:3094171:3094509:1 gene:ENSG00000263905 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT078215 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr20 // 91 // 92 // 20 // 22 // 0
ENST00000364476 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:20:3384229:3384440:1 gene:ENSG00000201346 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT078234 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001207047 // RefSeq // Homo sapiens attractin (ATRN), transcript variant 4, mRNA. // chr20 // 100 // 67 // 26 // 26 // 0 /// NM_139321 // RefSeq // Homo sapiens attractin (ATRN), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// NM_139322 // RefSeq // Homo sapiens attractin (ATRN), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 74 // 29 // 29 // 0 /// XM_005260860 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens attractin (ATRN), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 77 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000262919 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:3471040:3651122:1 gene:ENSG00000088812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000446916 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:3471108:3615947:1 gene:ENSG00000088812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 72 // 28 // 28 // 0 /// AF106861 // GenBank // Homo sapiens attractin-2 (ATRN) mRNA, complete cds. // chr20 // 93 // 72 // 26 // 28 // 0 /// AK293010 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78769 complete cds, highly similar to Homo sapiens attractin (ATRN), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 97 // 74 // 28 // 29 // 0 /// AK302730 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58441 complete cds, highly similar to Attractin precursor. // chr20 // 96 // 67 // 25 // 26 // 0 /// BC101705 // GenBank // Homo sapiens attractin, mRNA (cDNA clone MGC:126754 IMAGE:8069211), complete cds. // chr20 // 100 // 74 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000027466 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:3541888:3646847:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 96 // 67 // 25 // 26 // 0
NM_001204446 // RefSeq // Homo sapiens adaptor-related protein complex 5, sigma 1 subunit (AP5S1), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NM_001204447 // RefSeq // Homo sapiens adaptor-related protein complex 5, sigma 1 subunit (AP5S1), transcript variant 3, mRNA. // chr20 // 95 // 83 // 19 // 20 // 0 /// NM_018347 // RefSeq // Homo sapiens adaptor-related protein complex 5, sigma 1 subunit (AP5S1), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000246041 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:20:3820524:3825307:1 gene:ENSG00000125843 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000379567 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:3820536:3825302:1 gene:ENSG00000125843 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 95 // 83 // 19 // 20 // 0 /// ENST00000379573 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:3820531:3825302:1 gene:ENSG00000125843 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000455742 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:3820547:3823954:1 gene:ENSG00000125843 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 94 // 71 // 16 // 17 // 0 /// BC043344 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 29, mRNA (cDNA clone MGC:49882 IMAGE:5505030), complete cds. // chr20 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000615891 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:3820556:3828837:1 gene:ENSG00000125843 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000027474 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:3796532:3824297:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1
NR_029519 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 103a-2 (MIR103A2), microRNA. // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000362154 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:3917494:3917571:1 gene:ENSG00000199024 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// hsa-mir-103a-2 // miRBase Micro RNA Database // MI0000108 Homo sapiens miR-103a-2 stem-loop // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT078258 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0
BC008667 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone MGC:17708 IMAGE:3868595, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONHSAT078260 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr20 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_012409 // RefSeq // Homo sapiens prion protein 2 (dublet) (PRND), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000305817 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:4721910:4728460:1 gene:ENSG00000171864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AF187844 // GenBank // Homo sapiens prion-like protein (PRND) mRNA, complete cds. // chr20 // 79 // 58 // 11 // 14 // 0 /// AK313404 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ93940, Homo sapiens prion gene complex, downstream (PRND), mRNA. // chr20 // 92 // 50 // 11 // 12 // 0 /// AY358985 // GenBank // Homo sapiens clone DNA87991 PRND (UNQ1830) mRNA, complete cds. // chr20 // 86 // 58 // 12 // 14 // 0 /// BC043644 // GenBank // Homo sapiens prion protein 2 (dublet), mRNA (cDNA clone MGC:41841 IMAGE:5272576), complete cds. // chr20 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000009665 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:4724552:4725082:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 33 // 8 // 8 // 0
NR_029405 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC643406 (LOC643406), long non-coding RNA. // chr20 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000430097 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:5471207:5475182:1 gene:ENSG00000230563 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr20 // 100 // 58 // 11 // 11 // 0 /// BC031676 // GenBank // Homo sapiens hypothetical protein LOC643406, mRNA (cDNA clone IMAGE:5164807), complete cds. // chr20 // 100 // 58 // 11 // 11 // 0 /// NONHSAT078335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr20 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
ENST00000303142 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:5750397:5863912:1 gene:ENSG00000171984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000378979 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:5750393:5773447:1 gene:ENSG00000171984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000442185 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:5750453:5863304:1 gene:ENSG00000171984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 80 // 33 // 8 // 10 // 0 /// ENST00000445603 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:5750437:5863208:1 gene:ENSG00000171984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// AK292708 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75967 complete cds. // chr20 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// BC035800 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 196, mRNA (cDNA clone MGC:46244 IMAGE:5734487), complete cds. // chr20 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000026784 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:5688930:5831200:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1 /// GENSCAN00000026792 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:5856519:5888353:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
ENST00000365510 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:5890055:5890212:1 gene:ENSG00000202380 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr20 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONHSAT078511 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_001819 // RefSeq // Homo sapiens chromogranin B (secretogranin 1) (CHGB), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000378961 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:5911430:5925361:1 gene:ENSG00000089199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000455042 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:5911530:5923073:1 gene:ENSG00000089199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 48 // 16 // 16 // 0 /// AK289386 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78130 complete cds, highly similar to Homo sapiens chromogranin B (secretogranin 1) (CHGB), mRNA. // chr20 // 88 // 100 // 29 // 33 // 0 /// BC000375 // GenBank // Homo sapiens chromogranin B (secretogranin 1), mRNA (cDNA clone MGC:8377 IMAGE:2820258), complete cds. // chr20 // 97 // 97 // 31 // 32 // 0 /// CR456726 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834E0114D for gene CHGB, chromogranin B (secretogranin 1); complete cds, incl. stopcodon. // chr20 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// AK293536 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58131 complete cds, highly similar to Secretogranin-1 precursor. // chr20 // 97 // 97 // 32 // 33 // 1 /// GENSCAN00000026783 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:5911634:5925049:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// BC042679 // GenBank HTC // Homo sapiens MON2 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone IMAGE:5196631), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr20 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
ENST00000384650 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:20:5964538:5964650:1 gene:ENSG00000207380 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT078514 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000583650 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:6001733:6002030:1 gene:ENSG00000263755 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT078517 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001200 // RefSeq // Homo sapiens bone morphogenetic protein 2 (BMP2), mRNA. // chr20 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000378827 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:6767664:6780280:1 gene:ENSG00000125845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// KC294426 // GenBank // Homo sapiens bone morphogenetic protein 2 (BMP2) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000030419 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:6770127:6779089:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0
NR_004386 // RefSeq // Homo sapiens RNA, U105B small nucleolar (RNU105B), small nucleolar RNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000364478 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:8831186:8831393:1 gene:ENSG00000201348 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT078560 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr20 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_001199897 // RefSeq // Homo sapiens lysosomal-associated membrane protein family, member 5 (LAMP5), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// NM_012261 // RefSeq // Homo sapiens lysosomal-associated membrane protein family, member 5 (LAMP5), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000246070 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:9514361:9530524:1 gene:ENSG00000125869 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000427562 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:9514358:9529923:1 gene:ENSG00000125869 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 94 // 71 // 16 // 17 // 0 /// AK295336 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60063 complete cds. // chr20 // 94 // 67 // 15 // 16 // 0 /// AK316114 // GenBank // Homo sapiens cDNA, FLJ79013 complete cds. // chr20 // 94 // 71 // 16 // 17 // 0 /// BC050727 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 103, mRNA (cDNA clone MGC:60360 IMAGE:6044324), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000023160 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:9353710:9529820:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 67 // 67 // 16 // 24 // 1
ENST00000614195 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:20:10025917:10026168:1 gene:ENSG00000276525 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr20 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_022096 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat and EF-hand domain containing 1 (ANKEF1), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NM_198798 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat and EF-hand domain containing 1 (ANKEF1), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000378380 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:10035049:10058303:1 gene:ENSG00000132623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000378392 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:10035041:10055822:1 gene:ENSG00000132623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000488991 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:10035117:10055827:1 gene:ENSG00000132623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr20 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// BC022878 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat domain 5, mRNA (cDNA clone MGC:26575 IMAGE:4821619), complete cds. // chr20 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000005887 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:10038302:10055660:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0
NM_001009608 // RefSeq // Homo sapiens SLX4 interacting protein (SLX4IP), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000334534 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:10435303:10628034:1 gene:ENSG00000149346 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000005892 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:10549317:10609238:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
ENST00000378252 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:11027760:11029366:1 gene:ENSG00000125899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_080826 // RefSeq // Homo sapiens isthmin 1, angiogenesis inhibitor (ISM1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000262487 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:13221771:13300651:1 gene:ENSG00000101230 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK074473 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ23893 fis, clone LNG14589. // chr20 // 94 // 57 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000003640 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:13232801:13299459:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
ENST00000493457 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:14223041:14223325:1 gene:ENSG00000239923 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr20 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT078711 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr20 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
ENST00000362700 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:14352320:14352425:1 gene:ENSG00000199570 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr20 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT078713 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NR_104193 // RefSeq // Homo sapiens MACROD2 intronic transcript 1 (non-protein coding) (MACROD2-IT1), long non-coding RNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000448536 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:14554384:14628908:1 gene:ENSG00000227927 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000605675 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:14626913:14636524:1 gene:ENSG00000227927 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chr20 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONHSAT078718 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000364310 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:15022852:15022958:1 gene:ENSG00000201180 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr20 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT078726 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_003092 // RefSeq // Homo sapiens small nuclear ribonucleoprotein polypeptide B (SNRPB2), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NM_198220 // RefSeq // Homo sapiens small nuclear ribonucleoprotein polypeptide B (SNRPB2), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 71 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000246071 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:16729984:16742563:1 gene:ENSG00000125870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000377943 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:16729961:16741776:1 gene:ENSG00000125870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 71 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000478522 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:16730029:16732468:1 gene:ENSG00000125870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr20 // 100 // 57 // 8 // 8 // 0 /// BC018022 // GenBank // Homo sapiens small nuclear ribonucleoprotein polypeptide B, mRNA (cDNA clone MGC:24807 IMAGE:4286926), complete cds. // chr20 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0 /// BC036737 // GenBank // Homo sapiens small nuclear ribonucleoprotein polypeptide B, mRNA (cDNA clone MGC:45309 IMAGE:5533477), complete cds. // chr20 // 100 // 57 // 8 // 8 // 0 /// M15841 // GenBank // Human U2 small nuclear RNA-associated B antigen mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 71 // 10 // 10 // 0
NM_020157 // RefSeq // Homo sapiens otoraplin (OTOR), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000246081 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:16748358:16752164:1 gene:ENSG00000125879 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000486129 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:16749360:16751782:1 gene:ENSG00000125879 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr20 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// AF233261 // GenBank // Homo sapiens otoraplin (OTOR) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// AF243505 // GenBank // Homo sapiens fibrocyte-derived protein (FDP) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// AY359082 // GenBank // Homo sapiens clone DNA143076 OTOR (UNQ3054) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// BC101688 // GenBank // Homo sapiens otoraplin, mRNA (cDNA clone MGC:126737 IMAGE:8069194), complete cds. // chr20 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC101690 // GenBank // Homo sapiens otoraplin, mRNA (cDNA clone MGC:126739 IMAGE:8069196), complete cds. // chr20 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT078743 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr20 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000031131 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:16748402:16764406:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
ENST00000458943 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:17209060:17209220:1 gene:ENSG00000238833 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT078752 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001011546 // RefSeq // Homo sapiens destrin (actin depolymerizing factor) (DSTN), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NM_006870 // RefSeq // Homo sapiens destrin (actin depolymerizing factor) (DSTN), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000246069 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:17569863:17609919:1 gene:ENSG00000125868 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000449141 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:17570090:17607222:1 gene:ENSG00000125868 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr20 // 100 // 48 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000474024 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:17570082:17608242:1 gene:ENSG00000125868 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0 /// AK302338 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52030 complete cds, highly similar to Destrin. // chr20 // 100 // 57 // 12 // 12 // 0 /// AK308562 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ98603. // chr20 // 100 // 43 // 9 // 9 // 0 /// AK315994 // GenBank // Homo sapiens cDNA, FLJ78893 complete cds, highly similar to Destrin. // chr20 // 100 // 62 // 13 // 13 // 0 /// BC009477 // GenBank // Homo sapiens destrin (actin depolymerizing factor), mRNA (cDNA clone MGC:15087 IMAGE:3938287), complete cds. // chr20 // 100 // 48 // 10 // 10 // 0 /// EU794606 // GenBank // Homo sapiens epididymis luminal protein 32 (HEL32) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT078759 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr20 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0
ENST00000391253 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:17903762:17903861:1 gene:ENSG00000212555 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr20 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT078775 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NR_034167 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 851 (LINC00851), long non-coding RNA. // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000423033 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:18379049:18381484:1 gene:ENSG00000237282 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000594642 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:20:18380772:18381481:1 gene:ENSG00000237282 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT078820 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT078821 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT078822 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT078823 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT078824 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// TCONS_00027832-XLOC_013472 // Rinn lincRNA // linc-POLR3F chr20:+:18359692-18362125 // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// TCONS_00028116-XLOC_013472 // Rinn lincRNA // linc-POLR3F chr20:+:18358898-18362332 // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// TCONS_00028506-XLOC_013472 // Rinn lincRNA // linc-POLR3F chr20:+:18359744-18362127 // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000516613 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:18433842:18433944:1 gene:ENSG00000252422 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT078825 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000494527 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:18592330:18592619:1 gene:ENSG00000243702 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT078837 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_178483 // RefSeq // Homo sapiens SCP2 sterol-binding domain containing 1 (SCP2D1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000377428 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:18813726:18814392:1 gene:ENSG00000132631 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF418568 // GenBank // Homo sapiens unknown mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC105121 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 79, mRNA (cDNA clone MGC:132781 IMAGE:8144124), complete cds. // chr20 // 91 // 85 // 20 // 22 // 0 /// BC112024 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 79, mRNA (cDNA clone MGC:138229 IMAGE:8327492), complete cds. // chr20 // 91 // 85 // 20 // 22 // 0 /// GENSCAN00000037364 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:18813816:18824964:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0
NM_020689 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 24 (sodium/potassium/calcium exchanger), member 3 (SLC24A3), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000328041 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:19212646:19722937:1 gene:ENSG00000185052 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000613834 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:20:19212843:19722899:1 gene:ENSG00000185052 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000027016 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:19681913:19721140:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 39 // 11 // 11 // 0
NM_002196 // RefSeq // Homo sapiens insulinoma-associated 1 (INSM1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000310227 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:20368121:20370949:1 gene:ENSG00000173404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// M93119 // GenBank // Human zinc-finger DNA-binding motifs (IA-1) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000012731 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:20368268:20392575:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1
NM_012255 // RefSeq // Homo sapiens 5-3 exoribonuclease 2 (XRN2), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000377191 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:21303304:21389827:1 gene:ENSG00000088930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF064257 // GenBank // Homo sapiens Dhm1-like protein mRNA, complete cds. // chr20 // 91 // 97 // 32 // 35 // 0 /// AF152169 // GenBank // Homo sapiens DHP protein mRNA, complete cds. // chr20 // 91 // 97 // 32 // 35 // 0 /// AK302846 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55645 complete cds, highly similar to 5-3 exoribonuclease 2 (EC 3.1.11.-). // chr20 // 97 // 94 // 33 // 34 // 0 /// AK303312 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54526 complete cds, highly similar to 5-3 exoribonuclease 2 (EC 3.1.11.-). // chr20 // 97 // 92 // 32 // 33 // 0 /// AY382900 // GenBank // Homo sapiens 5-3 exoribonuclease 2 isoform 3 mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr20 // 97 // 94 // 33 // 34 // 0 /// GENSCAN00000040323 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:21291067:21393534:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 96 // 75 // 26 // 27 // 0
NM_001257096 // RefSeq // Homo sapiens paired box 1 (PAX1), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_006192 // RefSeq // Homo sapiens paired box 1 (PAX1), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000398485 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:21705659:21715982:1 gene:ENSG00000125813 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000444366 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:20:21706223:21715109:1 gene:ENSG00000125813 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000460221 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:21705687:21709424:1 gene:ENSG00000125813 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr20 // 92 // 43 // 11 // 12 // 0 /// AK303335 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60204 complete cds, highly similar to Paired box protein Pax-1. // chr20 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC069134 // GenBank // Homo sapiens paired box 1, mRNA (cDNA clone MGC:95415 IMAGE:7216990), complete cds. // chr20 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000613128 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:20:21705659:21718486:1 gene:ENSG00000125813 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000040313 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:21690908:21724223:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
NM_001052 // RefSeq // Homo sapiens somatostatin receptor 4 (SSTR4), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000255008 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:23035386:23036812:1 gene:ENSG00000132671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC069063 // GenBank // Homo sapiens somatostatin receptor 4, mRNA (cDNA clone MGC:95337 IMAGE:7216876), complete cds. // chr20 // 88 // 100 // 21 // 24 // 0 /// BC117270 // GenBank // Homo sapiens somatostatin receptor 4, mRNA (cDNA clone MGC:150879 IMAGE:40125821), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC117272 // GenBank // Homo sapiens somatostatin receptor 4, mRNA (cDNA clone MGC:150881 IMAGE:40125823), complete cds. // chr20 // 88 // 100 // 21 // 24 // 0 /// GENSCAN00000018074 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:23035484:23036650:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_013248 // RefSeq // Homo sapiens nuclear transport factor 2-like export factor 1 (NXT1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000254998 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:23350736:23354777:1 gene:ENSG00000132661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF156957 // GenBank // Homo sapiens NTF2-related export protein NXT1 (NXT1) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC000759 // GenBank // Homo sapiens NTF2-like export factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:2701 IMAGE:2820775), complete cds. // chr20 // 81 // 81 // 17 // 21 // 0 /// BC002687 // GenBank // Homo sapiens NTF2-like export factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:3469 IMAGE:3608037), complete cds. // chr20 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// BC003029 // GenBank // Homo sapiens NTF2-like export factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:4329 IMAGE:2820775), complete cds. // chr20 // 81 // 81 // 17 // 21 // 0 /// BC003410 // GenBank // Homo sapiens NTF2-like export factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:4978 IMAGE:3450767), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000018064 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:23350762:23354464:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
NM_022482 // RefSeq // Homo sapiens GDNF-inducible zinc finger protein 1 (GZF1), mRNA. // chr20 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000338121 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:23362182:23373063:1 gene:ENSG00000125812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000377051 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:20:23364384:23373045:1 gene:ENSG00000125812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AB100265 // GenBank // Homo sapiens hGZF1 mRNA for GDNF-inducible zinc finger protein 1, complete cds. // chr20 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// AK289814 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77873 complete cds, highly similar to Homo sapiens hGZF1 mRNA for GDNF-inducible zinc finger protein 1. // chr20 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// BC016049 // GenBank HTC // Homo sapiens GDNF-inducible zinc finger protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4853006), with apparent retained intron. // chr20 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// AK293942 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59859 complete cds, highly similar to Zinc finger protein 336. // chr20 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// AK295362 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59892 complete cds, highly similar to Zinc finger protein 336. // chr20 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// GENSCAN00000018071 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:23355683:23370441:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NM_138283 // RefSeq // Homo sapiens cystatin-like 1 (CSTL1), mRNA. // chr20 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000246020 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:23440248:23444930:1 gene:ENSG00000125823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 57 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000347397 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:20:23439685:23444930:1 gene:ENSG00000125823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000472140 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:23439685:23440818:1 gene:ENSG00000125823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr20 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0 /// AY707749 // GenBank // Homo sapiens RCET11 mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// BC117396 // GenBank // Homo sapiens cystatin-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:151005 IMAGE:40125947), complete cds. // chr20 // 93 // 61 // 13 // 14 // 0 /// FJ895879 // GenBank // Homo sapiens cystatin-like 1 testis transcript 1 (CSTL1) pseudogene mRNA, partial sequence. // chr20 // 100 // 48 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000619238 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:20:23439685:23440637:1 gene:ENSG00000125823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000018060 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:23440268:23444878:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 57 // 13 // 13 // 0 /// NONHSAT079060 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr20 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT079062 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr20 // 100 // 43 // 10 // 10 // 0
NM_001281730 // RefSeq // Homo sapiens cystatin 8 (cystatin-related epididymal specific) (CST8), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NM_005492 // RefSeq // Homo sapiens cystatin 8 (cystatin-related epididymal specific) (CST8), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000246012 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:23491129:23496018:1 gene:ENSG00000125815 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000449810 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:23491101:23495889:1 gene:ENSG00000125815 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// AF059244 // GenBank // Homo sapiens cystatin-related epididymal spermatogenic protein (CRES) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC069496 // GenBank // Homo sapiens cystatin 8 (cystatin-related epididymal specific), mRNA (cDNA clone MGC:96991 IMAGE:7262200), complete cds. // chr20 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC105113 // GenBank // Homo sapiens cystatin 8 (cystatin-related epididymal specific), mRNA (cDNA clone MGC:132773 IMAGE:8144116), complete cds. // chr20 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// BC105119 // GenBank // Homo sapiens cystatin 8 (cystatin-related epididymal specific), mRNA (cDNA clone MGC:132779 IMAGE:8144122), complete cds. // chr20 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000018053 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:23491668:23508624:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
ENST00000419331 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:23989292:23990454:1 gene:ENSG00000167390 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr20 // 83 // 100 // 10 // 12 // 0 /// NONHSAT079091 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr20 // 83 // 100 // 10 // 12 // 0 /// TCONS_l2_00016200-XLOC_l2_008587 // Broad TUCP // linc-TMEM90B-4 chr20:+:23969935-23976596 // chr20 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000030464 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:23989292:23990856:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 12 // 12 // 1
ENST00000363361 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:24237255:24237398:1 gene:ENSG00000200231 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr20 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONHSAT079105 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_024893 // RefSeq // Homo sapiens synapse differentiation inducing 1 (SYNDIG1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006723626 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens synapse differentiation inducing 1 (SYNDIG1), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// XM_006723627 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens synapse differentiation inducing 1 (SYNDIG1), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// XM_006723628 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens synapse differentiation inducing 1 (SYNDIG1), transcript variant X3, mRNA. // chr20 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000376862 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:24469199:24666616:1 gene:ENSG00000101463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC030637 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 39, mRNA (cDNA clone MGC:26011 IMAGE:4821088), complete cds. // chr20 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// CR457325 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834G109D for gene C20orf39, chromosome 20 open reading frame 39; complete cds, incl. stopcodon. // chr20 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000030466 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:24581395:24704676:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_003650 // RefSeq // Homo sapiens cystatin F (leukocystatin) (CST7), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000480798 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:24949230:24959928:1 gene:ENSG00000077984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AB015225 // GenBank // Homo sapiens mRNA for human CMAP, complete cds. // chr20 // 90 // 91 // 26 // 29 // 0 /// AF031824 // GenBank // Homo sapiens leukocystatin mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC015507 // GenBank // Homo sapiens cystatin F (leukocystatin), mRNA (cDNA clone MGC:9133 IMAGE:3893020), complete cds. // chr20 // 90 // 94 // 27 // 30 // 0 /// BT009825 // GenBank // Homo sapiens cystatin F (leukocystatin) mRNA, complete cds. // chr20 // 85 // 63 // 17 // 20 // 0 /// CR541860 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834G0732D for gene CST7, cystatin F (leukocystatin); complete cds, incl. stopcodon. // chr20 // 88 // 50 // 14 // 16 // 0 /// CR541878 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834A0433D for gene CST7, cystatin F (leukocystatin); complete cds, without stopcodon. // chr20 // 81 // 50 // 13 // 16 // 0 /// AF036342 // GenBank // Homo sapiens cystatin F mRNA, complete cds. // chr20 // 74 // 72 // 17 // 23 // 0 /// GENSCAN00000030922 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:24949506:24960571:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
ENST00000384625 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:24974171:24974280:1 gene:ENSG00000207355 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT079121 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000365544 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:20:25214698:25214798:1 gene:ENSG00000202414 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT079138 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_002862 // RefSeq // Homo sapiens phosphorylase, glycogen; brain (PYGB), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000216962 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:25248069:25298014:1 gene:ENSG00000100994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK299697 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53850 complete cds, highly similar to Glycogen phosphorylase, brain form (EC 2.4.1.1). // chr20 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AK309036 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99077. // chr20 // 89 // 64 // 16 // 18 // 0 /// BC017045 // GenBank // Homo sapiens phosphorylase, glycogen; brain, mRNA (cDNA clone MGC:9213 IMAGE:3877951), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC030795 // GenBank // Homo sapiens phosphorylase, glycogen; brain, mRNA (cDNA clone MGC:16933 IMAGE:3916938), complete cds. // chr20 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// J03544 // GenBank // Human brain glycogen phosphorylase mRNA, complete cds. // chr20 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// U47025 // GenBank // Human fetal brain glycogen phosphorylase B mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000030914 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:25195465:25296522:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1
NM_021067 // RefSeq // Homo sapiens GINS complex subunit 1 (Psf1 homolog) (GINS1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XR_244227 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens GINS complex subunit 1 (Psf1 homolog) (GINS1), transcript variant X3, misc_RNA. // chr20 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000262460 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:25407727:25448555:1 gene:ENSG00000101003 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000484893 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:25407731:25418195:1 gene:ENSG00000101003 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr20 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// AK294593 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60107 complete cds, highly similar to DNA replication complex GINS protein PSF1. // chr20 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// BC012542 // GenBank // Homo sapiens GINS complex subunit 1 (Psf1 homolog), mRNA (cDNA clone MGC:13345 IMAGE:4333095), complete cds. // chr20 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0
ENST00000516074 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:25611153:25611223:1 gene:ENSG00000251883 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr20 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT079167 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
ENST00000278882 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:30377181:30399334:1 gene:ENSG00000149531 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 58 // 7 // 7 // 0 /// BC062743 // GenBank // Homo sapiens FSHD region gene 1 family, member B, mRNA (cDNA clone IMAGE:4717235). // chr20 // 80 // 83 // 8 // 10 // 0 /// NONHSAT079276 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr20 // 100 // 83 // 10 // 10 // 0
NM_001037730 // RefSeq // Homo sapiens defensin, beta 115 (DEFB115), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000400552 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:31257664:31259632:1 gene:ENSG00000215547 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// DQ012019 // GenBank // Homo sapiens beta-defensin 115 (DEFB115) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENST00000516840 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:31356870:31356978:1 gene:ENSG00000252649 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT079286 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_054112 // RefSeq // Homo sapiens defensin, beta 118 (DEFB118), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000253381 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:31368618:31373923:1 gene:ENSG00000131068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF347073 // GenBank // Homo sapiens ESC42 mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// AF529415 // GenBank // Homo sapiens beta-defensin (DEFB118) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// AY122471 // GenBank // Homo sapiens defensin beta 118 (DEFB118) mRNA, partial cds. // chr20 // 100 // 38 // 11 // 11 // 0 /// BC117378 // GenBank // Homo sapiens defensin, beta 118, mRNA (cDNA clone MGC:150987 IMAGE:40125929), complete cds. // chr20 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0
ENST00000390832 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:20:31376319:31376446:1 gene:ENSG00000212134 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr20 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONHSAT079288 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_153324 // RefSeq // Homo sapiens defensin, beta 123 (DEFB123), mRNA. // chr20 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000376309 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:31440519:31450257:1 gene:ENSG00000180424 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// AF479701 // GenBank // Homo sapiens ESC42-RELD mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0 /// AY122475 // GenBank // Homo sapiens defensin beta 123 (DEFB123) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// AY358859 // GenBank // Homo sapiens clone DNA101924 DEFB123 (UNQ1963) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// AY501002 // GenBank // Homo sapiens beta-defensin 123 isoform b (DEFB123) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr20 // 81 // 78 // 17 // 21 // 0 /// BC126365 // GenBank // Homo sapiens defensin, beta 123, mRNA (cDNA clone MGC:161643 IMAGE:8992081), complete cds. // chr20 // 92 // 48 // 12 // 13 // 0 /// BC126391 // GenBank // Homo sapiens defensin, beta 123, mRNA (cDNA clone MGC:161669 IMAGE:8992107), complete cds. // chr20 // 92 // 48 // 12 // 13 // 0
NM_014012 // RefSeq // Homo sapiens RAS (RAD and GEM)-like GTP-binding 1 (REM1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000201979 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:31475293:31484905:1 gene:ENSG00000088320 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AF084465 // GenBank // Homo sapiens Ras-like GTP-binding protein REM mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// AF152863 // GenBank // Homo sapiens GTPase GES (GES) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC039813 // GenBank // Homo sapiens RAS (RAD and GEM)-like GTP-binding 1, mRNA (cDNA clone MGC:48669 IMAGE:5220518), complete cds. // chr20 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BT020078 // GenBank // Homo sapiens RAS (RAD and GEM)-like GTP-binding mRNA, complete cds. // chr20 // 93 // 58 // 14 // 15 // 0 /// BT020079 // GenBank // Homo sapiens RAS (RAD and GEM)-like GTP-binding mRNA, complete cds. // chr20 // 87 // 58 // 13 // 15 // 0 /// GENSCAN00000000059 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:31440699:31484430:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0
ENST00000364900 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:31581089:31581192:1 gene:ENSG00000201770 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000611296 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:31580890:31581214:1 gene:ENSG00000278276 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT079314 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_032609 // RefSeq // Homo sapiens cytochrome c oxidase subunit IV isoform 2 (lung) (COX4I2), mRNA. // chr20 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// XM_005260579 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens cytochrome c oxidase subunit IV isoform 2 (lung) (COX4I2), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// XM_005260581 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens cytochrome c oxidase subunit IV isoform 2 (lung) (COX4I2), transcript variant X3, mRNA. // chr20 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000376075 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:31637888:31645006:1 gene:ENSG00000131055 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000490030 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:31637933:31644828:1 gene:ENSG00000131055 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr20 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// AF257180 // GenBank // Homo sapiens cytochrome c oxidase subunit IV isoform 2 precursor, mRNA, complete cds. // chr20 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// BC057779 // GenBank // Homo sapiens cytochrome c oxidase subunit IV isoform 2 (lung), mRNA (cDNA clone MGC:71584 IMAGE:30337282), complete cds. // chr20 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000049 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:31610681:31644904:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1
NM_033118 // RefSeq // Homo sapiens myosin light chain kinase 2 (MYLK2), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000375985 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:31819373:31834689:1 gene:ENSG00000101306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000375994 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:31819308:31834689:1 gene:ENSG00000101306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000468730 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:31826777:31834689:1 gene:ENSG00000101306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr20 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// AF325549 // GenBank // Homo sapiens skeletal myosin light chain kinase mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// BC069627 // GenBank // Homo sapiens myosin light chain kinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:97200 IMAGE:7262446), complete cds. // chr20 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// BC092413 // GenBank // Homo sapiens myosin light chain kinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:102926 IMAGE:30530456), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC127622 // GenBank // Homo sapiens myosin light chain kinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:157650 IMAGE:40085085), complete cds. // chr20 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// BX647635 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp451D066 (from clone DKFZp451D066). // chr20 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000024315 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:31808422:31833797:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0
ENST00000362627 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:31901254:31901426:1 gene:ENSG00000199497 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr20 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT079323 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001011718 // RefSeq // Homo sapiens XK, Kell blood group complex subunit-related family, member 7 (XKR7), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000562532 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:31968002:32003387:1 gene:ENSG00000260903 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AY534245 // GenBank // Homo sapiens XK-related protein 7 mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000024327 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:31968176:31997457:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1
NM_080625 // RefSeq // Homo sapiens cerebral cavernous malformation 2-like (CCM2L), mRNA. // chr20 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006723706 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens cerebral cavernous malformation 2-like (CCM2L), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000262659 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:32010450:32032180:1 gene:ENSG00000101331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000452892 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:32019218:32032180:1 gene:ENSG00000101331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// AK125588 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ43600 fis, clone SPLEN2002147, weakly similar to Halocynthia roretzi mRNA for HrPET-3. // chr20 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0 /// BC030254 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 160, mRNA (cDNA clone MGC:40114 IMAGE:5182496), complete cds. // chr20 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC032455 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 160, mRNA (cDNA clone IMAGE:5174270), complete cds. // chr20 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000024323 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:32010455:32031314:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0
ENST00000391269 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:32050588:32050705:1 gene:ENSG00000212571 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT079333 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_004798 // RefSeq // Homo sapiens kinesin family member 3B (KIF3B), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000375712 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:32277664:32335011:1 gene:ENSG00000101350 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AK299877 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55620 complete cds, highly similar to Kinesin-like protein KIF3B. // chr20 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// BC136310 // GenBank // Homo sapiens kinesin family member 3B, mRNA (cDNA clone MGC:167920 IMAGE:9020297), complete cds. // chr20 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC136311 // GenBank // Homo sapiens kinesin family member 3B, mRNA (cDNA clone MGC:167921 IMAGE:9020298), complete cds. // chr20 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000024320 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:32309778:32440615:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 71 // 71 // 22 // 31 // 1
NR_034152 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC149950 (LOC149950), long non-coding RNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000375670 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:32587479:32608893:1 gene:ENSG00000204393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000375671 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:20:32564992:32608890:1 gene:ENSG00000204393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 90 // 77 // 18 // 20 // 0
NM_012325 // RefSeq // Homo sapiens microtubule-associated protein, RP/EB family, member 1 (MAPRE1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000375571 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:32819893:32850405:1 gene:ENSG00000101367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// AK297273 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52068 complete cds, highly similar to Microtubule-associated protein RP/EB family member 1. // chr20 // 100 // 74 // 14 // 14 // 0 /// BC106068 // GenBank // Homo sapiens microtubule-associated protein, RP/EB family, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:117374 IMAGE:6527006), complete cds. // chr20 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0 /// BC109281 // GenBank // Homo sapiens microtubule-associated protein, RP/EB family, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:129946 IMAGE:40031641), complete cds. // chr20 // 100 // 74 // 14 // 14 // 0 /// U24166 // GenBank // Homo sapiens EB1 mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000032309 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:32825474:32848728:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 68 // 13 // 13 // 0
NM_025227 // RefSeq // Homo sapiens BPI fold containing family B, member 2 (BPIFB2), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000170150 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:33007600:33023709:1 gene:ENSG00000078898 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AF465765 // GenBank // Homo sapiens bactericidal/permeability-increasing protein-like 1 (BPIL1) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// AK304064 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53463 complete cds, highly similar to Bactericidal/permeability-increasingprotein-like 1 precursor. // chr20 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// AY358723 // GenBank // Homo sapiens clone DNA96872 DJ726C3.2 (UNQ2489) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// BC034415 // GenBank // Homo sapiens bactericidal/permeability-increasing protein-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:34059 IMAGE:5173032), complete cds. // chr20 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000032308 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:33008575:33023383:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0
NM_174897 // RefSeq // Homo sapiens BPI fold containing family B, member 6 (BPIFB6), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000349552 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:33031648:33044047:1 gene:ENSG00000167104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000542375 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:33031648:33044041:1 gene:ENSG00000167104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr20 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// AF465767 // GenBank // Homo sapiens bactericidal/permeability-increasing protein-like 3 (BPIL3) mRNA, complete cds. // chr20 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000032298 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:33031648:33044047:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_182658 // RefSeq // Homo sapiens BPI fold containing family B, member 3 (BPIFB3), mRNA. // chr20 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENST00000375494 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:33055424:33073628:1 gene:ENSG00000186190 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF549189 // GenBank // Homo sapiens RYA3 (RYA3) mRNA, complete cds. // chr20 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// BC113398 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 185, mRNA (cDNA clone MGC:141958 IMAGE:8322450), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC113400 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 185, mRNA (cDNA clone MGC:141960 IMAGE:8322452), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000032310 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:33055436:33139029:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0
NM_182519 // RefSeq // Homo sapiens BPI fold containing family B, member 4 (BPIFB4), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000375483 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:33081527:33111751:1 gene:ENSG00000186191 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// AF549190 // GenBank // Homo sapiens RY2G5 (RY2G5) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000032310 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:33055436:33139029:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0
NM_080574 // RefSeq // Homo sapiens BPI fold containing family A, member 2 (BPIFA2), mRNA. // chr20 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000253362 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:33161768:33181412:1 gene:ENSG00000131050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000354932 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:33168154:33181412:1 gene:ENSG00000131050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// AF432917 // GenBank // Homo sapiens parotid secretory protein mRNA, complete cds. // chr20 // 95 // 64 // 20 // 21 // 0 /// AK291854 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77339 complete cds. // chr20 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// AY359055 // GenBank // Homo sapiens clone DNA59622 C20orf70 (UNQ510) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC065726 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 70, mRNA (cDNA clone MGC:72029 IMAGE:30326122), complete cds. // chr20 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// AK130487 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ26977 fis, clone SLV02302, highly similar to Homo sapiens prolactin-induced protein (PIP). // chr20 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000032305 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:33140558:33354074:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1
NR_026760 // RefSeq // Homo sapiens BPI fold containing family A, member 4, pseudogene (BPIFA4P), non-coding RNA. // chr20 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000375465 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:33193605:33210462:1 gene:ENSG00000183566 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr20 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000420169 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:33198209:33205169:1 gene:ENSG00000183566 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr20 // 95 // 65 // 21 // 22 // 0 /// ENST00000603168 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:33193605:33210462:1 gene:ENSG00000183566 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:unitary_pseudogene // chr20 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AY180924 // GenBank // Homo sapiens BASE mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AY389991 // GenBank // Homo sapiens BASE variant mRNA, partial sequence; alternatively spliced. // chr20 // 95 // 65 // 21 // 22 // 0 /// TCONS_00027834-XLOC_013508 // Rinn lincRNA // linc-C20orf71 chr20:+:31781410-31798268 // chr20 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000032305 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:33140558:33354074:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 65 // 65 // 22 // 34 // 1
NM_001042439 // RefSeq // Homo sapiens BPI fold containing family A, member 3 (BPIFA3), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NM_178466 // RefSeq // Homo sapiens BPI fold containing family A, member 3 (BPIFA3), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000375452 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:33217352:33227758:1 gene:ENSG00000131059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000375454 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:33217327:33227758:1 gene:ENSG00000131059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000490499 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:33217310:33227758:1 gene:ENSG00000131059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr20 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC066354 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 71, mRNA (cDNA clone MGC:87618 IMAGE:4826101), complete cds. // chr20 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000471233 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:33217327:33227758:1 gene:ENSG00000131059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr20 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// GENSCAN00000032305 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:33140558:33354074:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_033197 // RefSeq // Homo sapiens BPI fold containing family B, member 1 (BPIFB1), mRNA. // chr20 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000253354 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:33283135:33309878:1 gene:ENSG00000125999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000423645 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:33273480:33291033:1 gene:ENSG00000125999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 25 // 9 // 9 // 0 /// AF364078 // GenBank // Homo sapiens von Ebner minor protein mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// AK290243 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78502 complete cds. // chr20 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// AK310964 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ18006. // chr20 // 100 // 39 // 14 // 14 // 0 /// AY358595 // GenBank // Homo sapiens clone DNA64881 C20orf114 (UNQ706) mRNA, complete cds. // chr20 // 97 // 97 // 34 // 35 // 0 /// BC008429 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 114, mRNA (cDNA clone MGC:14597 IMAGE:4291561), complete cds. // chr20 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000464032 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:33298713:33307966:1 gene:ENSG00000125999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr20 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1 /// AK127971 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ46086 fis, clone TESTI2008636. // chr20 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1 /// GENSCAN00000032305 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:33140558:33354074:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 97 // 92 // 32 // 33 // 0
ENST00000246222 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:33347720:33354444:1 gene:ENSG00000125997 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000032305 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:33140558:33354074:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
ENST00000246222 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:33347720:33354444:1 gene:ENSG00000125997 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr20 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENST00000420264 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:33350863:33354060:1 gene:ENSG00000125997 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr20 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// GENSCAN00000032305 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:33140558:33354074:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT079388 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr20 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// TCONS_l2_00016762-XLOC_l2_008609 // Broad TUCP // linc-CBFA2T2 chr20:+:31938668-31941866 // chr20 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_080825 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 144 (C20orf144), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000375222 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:33662284:33663914:1 gene:ENSG00000149609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC032818 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 144, mRNA (cDNA clone MGC:45473 IMAGE:5172528), complete cds. // chr20 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// DQ080434 // GenBank // Homo sapiens Bcl-2-like protein mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000607738 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:33663366:33665619:1 gene:ENSG00000149609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr20 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// AK126548 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44584 fis, clone ASTRO2005413. // chr20 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// GENSCAN00000032312 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:33662346:33668235:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 94 // 65 // 16 // 17 // 0
NM_001024675 // RefSeq // Homo sapiens actin-like 10 (ACTL10), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000330271 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:20:33666498:33668525:1 gene:ENSG00000182584 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC137111 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 134, mRNA (cDNA clone MGC:168731 IMAGE:9021108), complete cds. // chr20 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// BC137114 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 134, mRNA (cDNA clone MGC:168734 IMAGE:9021111), complete cds. // chr20 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000032312 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:33662346:33668235:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0
NM_176812 // RefSeq // Homo sapiens charged multivesicular body protein 4B (CHMP4B), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000217402 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:33811304:33854366:1 gene:ENSG00000101421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AB100261 // GenBank // Homo sapiens Shax1 mRNA for Snf7 homologue associated with Alix 1, complete cds. // chr20 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// AY329085 // GenBank // Homo sapiens SNF7-2 mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// BC033859 // GenBank // Homo sapiens chromatin modifying protein 4B, mRNA (cDNA clone MGC:45387 IMAGE:5173394), complete cds. // chr20 // 95 // 92 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000043980 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:33811469:33853560:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0
NM_001672 // RefSeq // Homo sapiens agouti signaling protein (ASIP), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000374954 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:34260365:34269344:1 gene:ENSG00000101440 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000568305 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:34194569:34269176:1 gene:ENSG00000101440 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC104238 // GenBank // Homo sapiens agouti signaling protein, nonagouti homolog (mouse), mRNA (cDNA clone MGC:126092 IMAGE:40033052), complete cds. // chr20 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// BC104239 // GenBank // Homo sapiens agouti signaling protein, nonagouti homolog (mouse), mRNA (cDNA clone MGC:126093 IMAGE:40033056), complete cds. // chr20 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000043970 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:34242856:34269167:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 95 // 78 // 20 // 21 // 0
NM_032514 // RefSeq // Homo sapiens microtubule-associated protein 1 light chain 3 alpha (MAP1LC3A), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000360668 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:34558108:34560345:1 gene:ENSG00000101460 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000397709 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:34558718:34560345:1 gene:ENSG00000101460 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000476428 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:34558775:34560345:1 gene:ENSG00000101460 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr20 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// AF276658 // GenBank // Homo sapiens MAP1 light chain 3-like protein 1 mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// BC015810 // GenBank // Homo sapiens microtubule-associated protein 1 light chain 3 alpha, mRNA (cDNA clone MGC:9521 IMAGE:3909192), complete cds. // chr20 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// BT007452 // GenBank // Homo sapiens microtubule-associated protein 1 light chain 3 alpha mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000374837 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:20:34546854:34560345:1 gene:ENSG00000101460 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// NM_181509 // RefSeq // Homo sapiens microtubule-associated protein 1 light chain 3 alpha (MAP1LC3A), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1 /// GENSCAN00000043968 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:34479670:34559898:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1
NM_021202 // RefSeq // Homo sapiens tumor protein p53 inducible nuclear protein 2 (TP53INP2), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000374809 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:34704339:34713439:1 gene:ENSG00000078804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000374810 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:34704290:34713439:1 gene:ENSG00000078804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000414082 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:34704735:34709343:1 gene:ENSG00000078804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000451665 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:34704350:34709496:1 gene:ENSG00000078804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 33 // 11 // 11 // 0 /// AK292443 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75799 complete cds, highly similar to Homo sapiens tumor protein p53 inducible nuclear protein 2 (TP53INP2), mRNA. // chr20 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// AL122050 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp434O0827 (from clone DKFZp434O0827). // chr20 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// AY422170 // GenBank // Homo sapiens p53-inducible protein (PINH) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC035639 // GenBank // Homo sapiens tumor protein p53 inducible nuclear protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:46653 IMAGE:5547220), complete cds. // chr20 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000046568 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:34704339:34710307:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT079453 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr20 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1
NM_020884 // RefSeq // Homo sapiens myosin, heavy chain 7B, cardiac muscle, beta (MYH7B), mRNA. // chr20 // 100 // 98 // 45 // 45 // 0 /// ENST00000262873 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:20:34975403:35002437:1 gene:ENSG00000078814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 98 // 45 // 45 // 0 /// ENST00000470929 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:34977667:34982025:1 gene:ENSG00000078814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr20 // 100 // 17 // 8 // 8 // 0 /// AK000947 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ10085 fis, clone HEMBA1002161, moderately similar to MYOSIN HEAVY CHAIN, CARDIAC MUSCLE BETA ISOFORM. // chr20 // 100 // 17 // 8 // 8 // 0 /// BC151242 // GenBank // Homo sapiens myosin, heavy chain 7B, cardiac muscle, beta, mRNA (cDNA clone MGC:167836 IMAGE:8860515), complete cds. // chr20 // 98 // 98 // 44 // 45 // 0 /// ENST00000618182 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:20:34977630:35002436:1 gene:ENSG00000078814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000046585 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:34977750:35002188:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 87 // 40 // 40 // 0
NM_006404 // RefSeq // Homo sapiens protein C receptor, endothelial (PROCR), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_005260251 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens protein C receptor, endothelial (PROCR), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// XM_006723682 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens protein C receptor, endothelial (PROCR), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000216968 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:35172073:35177362:1 gene:ENSG00000101000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC014451 // GenBank // Homo sapiens protein C receptor, endothelial (EPCR), mRNA (cDNA clone MGC:23024 IMAGE:4907433), complete cds. // chr20 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// CR456948 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834A0516D for gene PROCR, protein C receptor, endothelial (EPCR); complete cds, incl. stopcodon. // chr20 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// L35545 // GenBank // Homo sapiens endothelial cell protein C/APC receptor (EPCR) mRNA, complete cds. // chr20 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000046576 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:35167824:35176813:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0
ENST00000363431 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:35195306:35195423:1 gene:ENSG00000200301 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT079472 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000421424 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:35218009:35218185:1 gene:ENSG00000229230 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr20 // 91 // 44 // 10 // 11 // 0 /// BC133653 // GenBank // Homo sapiens metallothionein 1 pseudogene 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:40002174). // chr20 // 68 // 76 // 13 // 19 // 0 /// NONHSAT079477 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 91 // 44 // 10 // 11 // 0
NM_006690 // RefSeq // Homo sapiens matrix metallopeptidase 24 (membrane-inserted) (MMP24), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000246186 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:35226654:35277000:1 gene:ENSG00000125966 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AB021227 // GenBank // Homo sapiens mt5-mmp mRNA for membrane-type-5 matrix metalloproteinase, complete cds. // chr20 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// AF131284 // GenBank // Homo sapiens membrane type 5 matrix metalloproteinase (MMP24) mRNA, complete cds. // chr20 // 97 // 97 // 34 // 35 // 0 /// GENSCAN00000046583 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:35226739:35274609:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0
ENST00000374375 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:35433029:35435450:1 gene:ENSG00000204183 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC085019 // GenBank // Homo sapiens growth differentiation factor 5 opposite strand, mRNA (cDNA clone MGC:99835 IMAGE:6650156), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000410528 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:35643143:35643462:1 gene:ENSG00000222460 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr20 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// NONHSAT079517 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr20 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0
NM_080748 // RefSeq // Homo sapiens reactive oxygen species modulator 1 (ROMO1), mRNA. // chr20 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000336695 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:35699451:35700980:1 gene:ENSG00000125995 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000374072 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:20:35699442:35700978:1 gene:ENSG00000125995 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000374077 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:35699353:35700984:1 gene:ENSG00000125995 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000374078 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:35699272:35700984:1 gene:ENSG00000125995 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000397416 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:35699451:35700910:1 gene:ENSG00000125995 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 85 // 46 // 11 // 13 // 0 /// BC008488 // GenBank // Homo sapiens reactive oxygen species modulator 1, mRNA (cDNA clone MGC:14813 IMAGE:4133274), complete cds. // chr20 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// BC105281 // GenBank // Homo sapiens reactive oxygen species modulator 1, mRNA (cDNA clone MGC:111180 IMAGE:6739248), complete cds. // chr20 // 90 // 75 // 19 // 21 // 0 /// GU727625 // GenBank // Homo sapiens epididymis tissue protein Li 175 mRNA, complete cds. // chr20 // 90 // 75 // 19 // 21 // 0 /// GENSCAN00000041500 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:35698028:35700906:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 94 // 64 // 17 // 18 // 0 /// NONHSAT079521 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr20 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1
ENST00000364351 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:35887659:35887801:1 gene:ENSG00000201221 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT079542 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001207076 // RefSeq // Homo sapiens cyclic nucleotide binding domain containing 2 (CNBD2), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NM_080834 // RefSeq // Homo sapiens cyclic nucleotide binding domain containing 2 (CNBD2), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000349339 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:35968607:36030700:1 gene:ENSG00000149646 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000373973 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:35968590:36030700:1 gene:ENSG00000149646 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000463258 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:35968623:36030669:1 gene:ENSG00000149646 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr20 // 91 // 67 // 20 // 22 // 0 /// ENST00000489667 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:20:35968611:35974956:1 gene:ENSG00000149646 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 30 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000538900 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:35968623:36030669:1 gene:ENSG00000149646 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 93 // 82 // 25 // 27 // 0 /// BC030782 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 152, mRNA (cDNA clone IMAGE:4824231), complete cds. // chr20 // 91 // 33 // 10 // 11 // 0 /// BC114945 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 152, mRNA (cDNA clone MGC:138880 IMAGE:40084218), complete cds. // chr20 // 93 // 82 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000041508 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:35968763:36030648:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0
NONHSAT079557 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_015511 // RefSeq // Homo sapiens AAR2 splicing factor homolog (S. cerevisiae) (AAR2), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000373932 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:36236485:36256933:1 gene:ENSG00000131043 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// AF132957 // GenBank // Homo sapiens CGI-23 protein mRNA, complete cds. // chr20 // 88 // 55 // 14 // 16 // 0 /// BC001751 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 4, mRNA (cDNA clone MGC:1227 IMAGE:3536406), complete cds. // chr20 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// BC019311 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 4, mRNA (cDNA clone MGC:4208 IMAGE:2905315), complete cds. // chr20 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NM_001271874 // RefSeq // Homo sapiens AAR2 splicing factor homolog (S. cerevisiae) (AAR2), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// ENST00000320849 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:36236465:36256933:1 gene:ENSG00000131043 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// ENST00000397286 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:20:36236459:36270918:1 gene:ENSG00000131043 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1 /// GENSCAN00000041505 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:36173778:36255745:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1
ENST00000480334 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:36870099:36870402:1 gene:ENSG00000242509 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr20 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT079597 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr20 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0
NM_080628 // RefSeq // Homo sapiens TBC/LysM-associated domain containing 2 (TLDC2), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000217320 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:36876131:36894235:1 gene:ENSG00000101342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC127688 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 118, mRNA (cDNA clone MGC:157775 IMAGE:40127440), complete cds. // chr20 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// BC130646 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 118, mRNA (cDNA clone MGC:163518 IMAGE:40146677), complete cds. // chr20 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC130648 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 118, mRNA (cDNA clone MGC:163520 IMAGE:40146679), complete cds. // chr20 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000602922 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:36876121:36889863:1 gene:ENSG00000101342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 88 // 88 // 23 // 26 // 1 /// GENSCAN00000020269 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:36871726:36889386:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
ENST00000598590 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:37095785:37097178:1 gene:ENSG00000269846 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC017557 // GenBank // Homo sapiens retinoblastoma-like 1 (p107), mRNA (cDNA clone IMAGE:3908672), partial cds. // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_005386 // RefSeq // Homo sapiens neuronatin (NNAT), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_181689 // RefSeq // Homo sapiens neuronatin (NNAT), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000062104 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:37521215:37523693:1 gene:ENSG00000053438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000346199 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:37521219:37523690:1 gene:ENSG00000053438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// AB002392 // GenBank // Homo sapiens mRNA for neuronatin alpha, complete cds. // chr20 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC001768 // GenBank // Homo sapiens neuronatin, mRNA (cDNA clone MGC:1439 IMAGE:3353944), complete cds. // chr20 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BT019426 // GenBank // Homo sapiens neuronatin mRNA, complete cds. // chr20 // 87 // 56 // 13 // 15 // 0 /// U25033 // GenBank // Human neuronatin alpha mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// U25034 // GenBank // Human neuronatin beta mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000020262 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:37519675:37522759:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
NM_080607 // RefSeq // Homo sapiens V-set and transmembrane domain containing 2 like (VSTM2L), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000373459 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:20:37903111:37944450:1 gene:ENSG00000132821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 33 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000373461 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:37903104:37945350:1 gene:ENSG00000132821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000448944 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:37903142:37944136:1 gene:ENSG00000132821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 82 // 52 // 14 // 17 // 0 /// BC033818 // GenBank // Homo sapiens V-set and transmembrane domain containing 2 like, mRNA (cDNA clone MGC:45439 IMAGE:5201150), complete cds. // chr20 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000003017 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:37903351:37944253:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1
NM_021215 // RefSeq // Homo sapiens regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B (RPRD1B), mRNA. // chr20 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_005260480 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B (RPRD1B), transcript variant X4, mRNA. // chr20 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000373433 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:38033546:38092366:1 gene:ENSG00000101413 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000449186 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:20:38049753:38089839:1 gene:ENSG00000101413 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000462548 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:38033725:38091237:1 gene:ENSG00000101413 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr20 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000495457 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:38033832:38059425:1 gene:ENSG00000101413 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr20 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// BC033629 // GenBank // Homo sapiens regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, mRNA (cDNA clone MGC:45008 IMAGE:5223673), complete cds. // chr20 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// DQ372938 // GenBank // Homo sapiens cell-cycle related and expression-elevated protein in tumor (CREPT) mRNA, complete cds. // chr20 // 91 // 81 // 20 // 22 // 0 /// XM_005260477 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B (RPRD1B), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// GENSCAN00000003029 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:38033948:38089875:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0
NM_004139 // RefSeq // Homo sapiens lipopolysaccharide binding protein (LBP), mRNA. // chr20 // 94 // 94 // 30 // 32 // 0 /// ENST00000217407 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:38346356:38377023:1 gene:ENSG00000129988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 94 // 94 // 30 // 32 // 0 /// AF105067 // GenBank // Homo sapiens lipopolysaccharide-binding protein (LBP) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// BC022256 // GenBank // Homo sapiens lipopolysaccharide binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:22233 IMAGE:4767724), complete cds. // chr20 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// M35533 // GenBank // Human lipopolysaccharide binding protein (LBP) mRNA, complete cds. // chr20 // 90 // 85 // 26 // 29 // 0 /// GENSCAN00000003024 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:38346517:38377214:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 89 // 82 // 25 // 28 // 0
ENST00000364941 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:20:38442036:38442169:1 gene:ENSG00000201811 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT079671 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_002986 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 60 (SNORA60), small nucleolar RNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000362396 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:38449370:38449503:1 gene:ENSG00000199266 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK091209 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ33890 fis, clone CTONG2007474. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT079686 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT079689 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000373348 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:20:38581206:38585695:1 gene:ENSG00000182035 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000416116 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:20:38581306:38588463:1 gene:ENSG00000182035 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// BC119705 // GenBank // Homo sapiens adipogenin, mRNA (cDNA clone MGC:149650 IMAGE:40117137), complete cds. // chr20 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NM_001018082 // RefSeq // Homo sapiens adipogenin (ADIG), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 1 /// ENST00000470147 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:38581195:38588463:1 gene:ENSG00000182035 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 1 /// ENST00000537425 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:20:38581195:38588461:1 gene:ENSG00000182035 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 1 /// BC029594 // GenBank // Homo sapiens adipogenin, mRNA (cDNA clone MGC:39724 IMAGE:5273249), complete cds. // chr20 // 88 // 88 // 23 // 26 // 1 /// BC119704 // GenBank // Homo sapiens adipogenin, mRNA (cDNA clone MGC:149649 IMAGE:40117136), complete cds. // chr20 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// GENSCAN00000003025 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:38581173:38585878:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_080552 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 32 (GABA vesicular transporter), member 1 (SLC32A1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000217420 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:38724462:38729372:1 gene:ENSG00000101438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY044836 // GenBank // Homo sapiens vesicular inhibitory amino acid transporter mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// BC053582 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 32 (GABA vesicular transporter), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:61677 IMAGE:5180816), complete cds. // chr20 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000004553 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:38724725:38728639:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0
NM_024855 // RefSeq // Homo sapiens ARP5 actin-related protein 5 homolog (yeast) (ACTR5), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_005260555 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ARP5 actin-related protein 5 homolog (yeast) (ACTR5), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000243903 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:38748442:38772520:1 gene:ENSG00000101442 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC038402 // GenBank // Homo sapiens ARP5 actin-related protein 5 homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:34153 IMAGE:5198236), complete cds. // chr20 // 91 // 100 // 31 // 34 // 0 /// GENSCAN00000004550 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:38748479:38807236:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0
ENST00000362821 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:38761528:38761842:1 gene:ENSG00000199691 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr20 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// NONHSAT079700 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr20 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0
NM_001172735 // RefSeq // Homo sapiens protein phosphatase 1, regulatory subunit 16B (PPP1R16B), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NM_015568 // RefSeq // Homo sapiens protein phosphatase 1, regulatory subunit 16B (PPP1R16B), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000299824 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:38805705:38923024:1 gene:ENSG00000101445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000373331 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:38805724:38923024:1 gene:ENSG00000101445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AF362910 // GenBank // Homo sapiens CAAX box protein TIMAP mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC131801 // GenBank // Homo sapiens protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 16B, mRNA (cDNA clone MGC:156925 IMAGE:40081818), complete cds. // chr20 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// BC152467 // GenBank // Homo sapiens protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 16B, mRNA (cDNA clone MGC:176724 IMAGE:8862603), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000004556 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:38835926:38918666:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
ENST00000470786 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:38872770:38873074:1 gene:ENSG00000240474 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT079706 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_030919 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 83, member D (FAM83D), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000217429 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:20:38926312:38953056:1 gene:ENSG00000101447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK303860 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54227 complete cds. // chr20 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// AK095660 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ38341 fis, clone FCBBF3028143. // chr20 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// ENST00000619304 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:38926312:38953106:1 gene:ENSG00000101447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000619850 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:20:38926426:38953106:1 gene:ENSG00000101447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000004560 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:38926443:38952520:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NONHSAT079717 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000410680 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:41024205:41024394:1 gene:ENSG00000222612 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK023614 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ13552 fis, clone PLACE1007218. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT079748 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT079753 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_003286 // RefSeq // Homo sapiens topoisomerase (DNA) I (TOP1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000361337 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:41028818:41124487:1 gene:ENSG00000198900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AK292943 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77890 complete cds, highly similar to Homo sapiens type I DNA topoisomerase gene. // chr20 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// BC039009 // GenBank // Homo sapiens, clone IMAGE:5578397, mRNA. // chr20 // 100 // 35 // 8 // 8 // 0 /// BC136297 // GenBank // Homo sapiens topoisomerase (DNA) I, mRNA (cDNA clone MGC:167907 IMAGE:9020284), complete cds. // chr20 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// J03250 // GenBank // Human topoisomerase I mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000001969 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:40946850:41123297:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0
NM_002660 // RefSeq // Homo sapiens phospholipase C, gamma 1 (PLCG1), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NM_182811 // RefSeq // Homo sapiens phospholipase C, gamma 1 (PLCG1), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000244007 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:41136960:41175721:1 gene:ENSG00000124181 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000373271 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:41137237:41175721:1 gene:ENSG00000124181 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AB210028 // GenBank // Homo sapiens mRNA for PLCG1 variant protein, partial cds, clone: hh03521. // chr20 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AK297370 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60301 complete cds, highly similar to 1-phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate phosphodiesterase gamma 1 (EC 3.1.4.11). // chr20 // 100 // 55 // 21 // 21 // 0 /// AK309606 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99647. // chr20 // 100 // 21 // 8 // 8 // 0 /// BC136466 // GenBank // Homo sapiens phospholipase C, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:168078 IMAGE:9020455), complete cds. // chr20 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// BC144136 // GenBank // Homo sapiens phospholipase C, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:177673 IMAGE:9052656), complete cds. // chr20 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// M34667 // GenBank // Human phospholipase C-gamma mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000001949 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:41125703:41174509:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0
ENST00000445975 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:41352681:41358470:1 gene:ENSG00000132793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// BC140806 // GenBank // Homo sapiens lipin 3, mRNA (cDNA clone MGC:176483 IMAGE:9021674), complete cds. // chr20 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// BX647082 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686H07111 (from clone DKFZp686H07111). // chr20 // 97 // 97 // 31 // 32 // 0 /// BX648609 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686P07216 (from clone DKFZp686P07216). // chr20 // 100 // 30 // 10 // 10 // 0 /// NM_022896 // RefSeq // Homo sapiens lipin 3 (LPIN3), mRNA. // chr20 // 94 // 94 // 31 // 33 // 1 /// XM_006723859 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens lipin 3 (LPIN3), transcript variant X3, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 1 /// ENST00000373257 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:41340920:41360582:1 gene:ENSG00000132793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 94 // 94 // 31 // 33 // 1 /// GENSCAN00000001966 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:41338178:41358866:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1
ENST00000439970 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:41547422:41547922:1 gene:ENSG00000232493 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr20 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000001959 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:41543674:41547925:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
ENST00000411258 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:43063326:43063609:1 gene:ENSG00000223190 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr20 // 86 // 85 // 19 // 22 // 0 /// NONHSAT079809 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr20 // 86 // 85 // 19 // 22 // 0
ENST00000460953 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:43222206:43222509:1 gene:ENSG00000240639 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr20 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT079812 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr20 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENST00000464473 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:43230760:43231260:1 gene:ENSG00000226038 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000043386 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:43230760:43231257:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0
ENST00000516384 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:20:43304555:43304679:1 gene:ENSG00000252193 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT079814 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000364151 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:43405473:43405578:1 gene:ENSG00000201021 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr20 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT079818 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0
NM_006275 // RefSeq // Homo sapiens serine/arginine-rich splicing factor 6 (SRSF6), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// NR_034009 // RefSeq // Homo sapiens serine/arginine-rich splicing factor 6 (SRSF6), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr20 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000244020 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:43457928:43464247:1 gene:ENSG00000124193 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000483871 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:43457928:43461334:1 gene:ENSG00000124193 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr20 // 100 // 69 // 11 // 11 // 0 /// AK300411 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50863 complete cds, moderately similar to Splicing factor, arginine/serine-rich 6. // chr20 // 100 // 69 // 11 // 11 // 0 /// BC006832 // GenBank // Homo sapiens splicing factor, arginine/serine-rich 6, mRNA (cDNA clone MGC:5045 IMAGE:3449841), complete cds. // chr20 // 100 // 50 // 8 // 8 // 0 /// U30828 // GenBank // Human splicing factor SRp55-2 (SRp55) mRNA, complete cds. // chr20 // 91 // 69 // 10 // 11 // 0
NM_001278610 // RefSeq // Homo sapiens v-myb avian myeloblastosis viral oncogene homolog-like 2 (MYBL2), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// NM_002466 // RefSeq // Homo sapiens v-myb avian myeloblastosis viral oncogene homolog-like 2 (MYBL2), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000217026 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:43667157:43716496:1 gene:ENSG00000101057 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000396863 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:20:43667019:43716495:1 gene:ENSG00000101057 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// AK303249 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57697 complete cds, highly similar to Myb-related protein B. // chr20 // 97 // 92 // 34 // 35 // 0 /// BC007585 // GenBank // Homo sapiens v-myb myeloblastosis viral oncogene homolog (avian)-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:15600 IMAGE:3162656), complete cds. // chr20 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// BC053555 // GenBank // Homo sapiens v-myb myeloblastosis viral oncogene homolog (avian)-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:61523 IMAGE:6140320), complete cds. // chr20 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// BX647151 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686B24223 (from clone DKFZp686B24223). // chr20 // 39 // 39 // 15 // 38 // 1 /// GENSCAN00000045034 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:43652523:43716087:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0
ENST00000464331 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:44007248:44007537:1 gene:ENSG00000241229 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr20 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// JN655167 // GenBank // Homo sapiens TOX2 variant 6 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr20 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT079845 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr20 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_178491 // RefSeq // Homo sapiens R3H domain containing-like (R3HDML), mRNA. // chr20 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000217043 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:44336986:44351235:1 gene:ENSG00000101074 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC107048 // GenBank // Homo sapiens R3H domain containing-like, mRNA (cDNA clone MGC:129564 IMAGE:40003509), complete cds. // chr20 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000045041 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:44337158:44350792:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
ENST00000364493 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:20:44344839:44344933:1 gene:ENSG00000201363 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr20 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT079860 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_022358 // RefSeq // Homo sapiens potassium channel, subfamily K, member 15 (KCNK15), mRNA. // chr20 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000372861 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:44745780:44752313:1 gene:ENSG00000124249 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF257081 // GenBank // Homo sapiens two pore potassium channel KT3.3 mRNA, complete cds. // chr20 // 93 // 93 // 25 // 27 // 0 /// AF294350 // GenBank // Homo sapiens clone 1 tandem acid-sensitive potassium channel TASK5 (KCNK15) mRNA, complete cds. // chr20 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// AF294351 // GenBank // Homo sapiens clone 2 tandem acid-sensitive potassium channel TASK5 (KCNK15) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AF336342 // GenBank // Homo sapiens tandem pore domain potassium channel TASK-5 mRNA, complete cds. // chr20 // 96 // 83 // 23 // 24 // 0 /// BC093874 // GenBank // Homo sapiens potassium channel, subfamily K, member 15, mRNA (cDNA clone MGC:120909 IMAGE:7939719), complete cds. // chr20 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC143282 // GenBank // Homo sapiens potassium channel, subfamily K, member 15, mRNA (cDNA clone MGC:176802 IMAGE:9051785), complete cds. // chr20 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000034172 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:44745911:44750838:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0
NM_002638 // RefSeq // Homo sapiens peptidase inhibitor 3, skin-derived (PI3), mRNA. // chr20 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000243924 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:45174876:45176544:1 gene:ENSG00000124102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// BC010952 // GenBank // Homo sapiens peptidase inhibitor 3, skin-derived, mRNA (cDNA clone MGC:13613 IMAGE:4083155), complete cds. // chr20 // 89 // 75 // 16 // 18 // 0 /// CR542234 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834F0625D for gene PI3, protease inhibitor 3, skin-derived (SKALP); complete cds, without stopcodon. // chr20 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000034167 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:45174923:45176135:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0
NM_003007 // RefSeq // Homo sapiens semenogelin I (SEMG1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000372781 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:45206997:45209772:1 gene:ENSG00000124233 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BT007177 // GenBank // Homo sapiens semenogelin I mRNA, complete cds. // chr20 // 82 // 38 // 9 // 11 // 0 /// J04440 // GenBank // Homo sapiens semenogelin protein (SEMG) mRNA, complete cds. // chr20 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// BC007096 // GenBank // Homo sapiens semenogelin I, mRNA (cDNA clone MGC:14719 IMAGE:4251523), complete cds. // chr20 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1 /// BC055416 // GenBank // Homo sapiens semenogelin I, mRNA (cDNA clone MGC:61979 IMAGE:6668871), complete cds. // chr20 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1 /// BC011442 // GenBank HTC // Homo sapiens semenogelin I, mRNA (cDNA clone IMAGE:4296701), with apparent retained intron. // chr20 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// GENSCAN00000034174 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:45206982:45208686:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT079940 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr20 // 100 // 38 // 11 // 11 // 0
NM_003008 // RefSeq // Homo sapiens semenogelin II (SEMG2), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000372769 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:45221300:45224458:1 gene:ENSG00000124157 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC005262 // GenBank // Homo sapiens semenogelin II, mRNA (cDNA clone IMAGE:3951184), partial cds. // chr20 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// BC070306 // GenBank // Homo sapiens semenogelin II, mRNA (cDNA clone MGC:88306 IMAGE:4356587), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// M81652 // GenBank // Homo sapiens semenogelin II mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK291811 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78262 complete cds, highly similar to Homo sapiens semenogelin II (SEMG2), mRNA. // chr20 // 87 // 100 // 26 // 30 // 0 /// GENSCAN00000034169 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:45221390:45223381:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
NM_080753 // RefSeq // Homo sapiens WAP four-disulfide core domain 10A (WFDC10A), mRNA. // chr20 // 90 // 100 // 18 // 20 // 0 /// ENST00000372643 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:45629526:45631196:1 gene:ENSG00000180305 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AY038182 // GenBank // Homo sapiens probable protease inhibitor WAP10 precursor, mRNA, complete cds. // chr20 // 90 // 100 // 18 // 20 // 0 /// BC131579 // GenBank // Homo sapiens WAP four-disulfide core domain 10A, mRNA (cDNA clone MGC:149187 IMAGE:40112102), complete cds. // chr20 // 85 // 65 // 11 // 13 // 0
NM_172005 // RefSeq // Homo sapiens WAP four-disulfide core domain 13 (WFDC13), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000305479 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:45702016:45708817:1 gene:ENSG00000168634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF454505 // GenBank // Homo sapiens probable protease inhibitor WAP13 precursor, mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000021777 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:45702124:45704929:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0
NM_178455 // RefSeq // Homo sapiens serine peptidase inhibitor, Kunitz type 4 (SPINT4), mRNA. // chr20 // 94 // 78 // 17 // 18 // 0 /// ENST00000279058 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:45722351:45725830:1 gene:ENSG00000149651 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AY372173 // GenBank // Homo sapiens serine protease inhibitor Kunitz type 4 (SPINT4) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr20 // 94 // 78 // 17 // 18 // 0 /// AY372174 // GenBank // Homo sapiens serine protease inhibitor Kunitz type 4 (SPINT4) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr20 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0
ENST00000448174 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:45749920:45750074:1 gene:ENSG00000168630 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT079976 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000408119 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:45778698:45778823:1 gene:ENSG00000221046 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT079983 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_052951 // RefSeq // Homo sapiens deoxynucleotidyltransferase, terminal, interacting protein 1 (DNTTIP1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000372622 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:45791937:45811427:1 gene:ENSG00000101457 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000415790 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:20:45792536:45802055:1 gene:ENSG00000101457 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 41 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000435014 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:20:45793965:45811427:1 gene:ENSG00000101457 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000449078 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:20:45792020:45796573:1 gene:ENSG00000101457 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000456939 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:20:45792055:45811427:1 gene:ENSG00000101457 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// AB035676 // GenBank // Homo sapiens mRNA for TdT binding protein, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC024290 // GenBank // Homo sapiens deoxynucleotidyltransferase, terminal, interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:39276 IMAGE:4099255), complete cds. // chr20 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000021776 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:45792005:45816767:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 71 // 71 // 24 // 34 // 1
NM_080752 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, SWIM-type containing 3 (ZSWIM3), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NR_037628 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, SWIM-type containing 3 (ZSWIM3), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000255152 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:45857617:45879122:1 gene:ENSG00000132801 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK302767 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50306 complete cds, highly similar to Zinc finger SWIM domain-containing protein 3. // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK316214 // GenBank // Homo sapiens cDNA, FLJ79113 complete cds, highly similar to Zinc finger SWIM domain-containing protein 3. // chr20 // 97 // 97 // 30 // 31 // 0 /// BC027611 // GenBank // Homo sapiens zinc finger, SWIM-type containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:27014 IMAGE:4829980), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000021769 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:45857826:45878649:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0
NM_080603 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, SWIM-type containing 1 (ZSWIM1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_005260610 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens zinc finger, SWIM-type containing 1 (ZSWIM1), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_005260611 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens zinc finger, SWIM-type containing 1 (ZSWIM1), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000372520 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:20:45881241:45885265:1 gene:ENSG00000168612 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000372523 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:45881227:45885266:1 gene:ENSG00000168612 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK291304 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77289 complete cds, highly similar to Homo sapiens zinc finger, SWIM domain containing 1 (ZSWIM1), mRNA. // chr20 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// BC001672 // GenBank // Homo sapiens zinc finger, SWIM-type containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:2467 IMAGE:2988536), complete cds. // chr20 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC080525 // GenBank // Homo sapiens zinc finger, SWIM-type containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:99454 IMAGE:4547006), complete cds. // chr20 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000021771 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:45882680:45884050:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// AK026450 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ22797 fis, clone KAIA2589, highly similar to AF059202 Homo sapiens ACAT related gene product 1 mRNA. // chr20 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
NM_022104 // RefSeq // Homo sapiens PDX1 C-terminal inhibiting factor 1 (PCIF1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000372409 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:45934628:45948023:1 gene:ENSG00000100982 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000479348 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:20:45945007:45948023:1 gene:ENSG00000100982 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 45 // 18 // 18 // 0 /// AB050014 // GenBank // Homo sapiens mRNA for posphorylated CTD interacting factor PCIF1, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// AK056553 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ31991 fis, clone NT2RP7009097. // chr20 // 100 // 83 // 33 // 33 // 0 /// AK299435 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61655 complete cds, highly similar to Phosphorylated CTD-interacting factor 1. // chr20 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// AL137473 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp434E1723 (from clone DKFZp434E1723). // chr20 // 100 // 45 // 18 // 18 // 0 /// BC010005 // GenBank // Homo sapiens PDX1 C-terminal inhibiting factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:15106 IMAGE:4131938), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// BC013365 // GenBank // Homo sapiens PDX1 C-terminal inhibiting factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:16205 IMAGE:3640928), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000021780 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:45934628:45947755:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0
NM_004994 // RefSeq // Homo sapiens matrix metallopeptidase 9 (gelatinase B, 92kDa gelatinase, 92kDa type IV collagenase) (MMP9), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000372330 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:46008908:46016561:1 gene:ENSG00000100985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AK298246 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51036 complete cds, highly similar to Matrix metalloproteinase-9 precursor (EC3.4.24.35). // chr20 // 93 // 90 // 26 // 28 // 0 /// AK316145 // GenBank // Homo sapiens cDNA, FLJ79044 complete cds, highly similar to Matrix metalloproteinase-9 precursor (EC 3.4.24.35). // chr20 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// BC006093 // GenBank // Homo sapiens matrix metallopeptidase 9 (gelatinase B, 92kDa gelatinase, 92kDa type IV collagenase), mRNA (cDNA clone MGC:12688 IMAGE:4054882), complete cds. // chr20 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// J05070 // GenBank // Human type IV collagenase mRNA, complete cds. // chr20 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// AK301446 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51120 complete cds, highly similar to Matrix metalloproteinase-9 precursor (EC 3.4.24.35). // chr20 // 84 // 84 // 26 // 31 // 1 /// AK303080 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51166 complete cds, highly similar to Matrix metalloproteinase-9 precursor (EC 3.4.24.35). // chr20 // 87 // 87 // 27 // 31 // 1 /// AK302530 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52524 complete cds, moderately similar to Matrix metalloproteinase-9 precursor (EC3.4.24.35). // chr20 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1 /// AK311648 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ18690. // chr20 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1 /// GENSCAN00000021758 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:46008927:46057605:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0
ENST00000504759 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:46484461:46492640:1 gene:ENSG00000184617 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr20 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONHSAT080024 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr20 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
ENST00000504759 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:46484461:46492640:1 gene:ENSG00000184617 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr20 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0 /// GENSCAN00000021775 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:46480356:46492640:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 57 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT080024 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr20 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0 /// NONHSAT080025 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr20 // 86 // 100 // 6 // 7 // 0
NM_030777 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 2 (facilitated glucose transporter), member 10 (SLC2A10), mRNA. // chr20 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000359271 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:20:46709487:46736347:1 gene:ENSG00000197496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AF248053 // GenBank // Homo sapiens glucose transporter (GLUT10) mRNA, complete cds. // chr20 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// AF321240 // GenBank // Homo sapiens facilitative glucose transporter GLUT10 (SLC2A10) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// AK290961 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78183 complete cds, highly similar to Homo sapiens glucose transporter (GLUT10) mRNA. // chr20 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// BC101657 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 2 (facilitated glucose transporter), member 10, mRNA (cDNA clone MGC:126706 IMAGE:8069163), complete cds. // chr20 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// BC113423 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 2 (facilitated glucose transporter), member 10, mRNA (cDNA clone MGC:141983 IMAGE:8322475), complete cds. // chr20 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000033394 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:46708167:46733834:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0
ENST00000410942 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:46859333:46859672:1 gene:ENSG00000222874 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT080034 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NR_024594 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC100131496 (LOC100131496), long non-coding RNA. // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000599904 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:47318502:47320754:1 gene:ENSG00000267882 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
BC012881 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3463076. // chr20 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONHSAT080182 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr20 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_006420 // RefSeq // Homo sapiens ADP-ribosylation factor guanine nucleotide-exchange factor 2 (brefeldin A-inhibited) (ARFGEF2), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// ENST00000371917 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:48921890:49036693:1 gene:ENSG00000124198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// AF084521 // GenBank // Homo sapiens brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2 mRNA, complete cds. // chr20 // 96 // 96 // 43 // 45 // 0 /// AK302526 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55398 complete cds, highly similar to Brefeldin A-inhibited guaninenucleotide-exchange protein 2. // chr20 // 96 // 60 // 27 // 28 // 0 /// BC144626 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:9053157. // chr20 // 98 // 96 // 44 // 45 // 0 /// GENSCAN00000041765 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:48921890:49096438:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 81 // 81 // 38 // 47 // 1
ENST00000437218 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:49134480:49135012:1 gene:ENSG00000226284 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr20 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NR_002433 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 12C (SNORD12C), small nucleolar RNA. // chr20 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000386307 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:49278940:49279028:1 gene:ENSG00000209042 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041763 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:49278883:49289162:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT080213 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
ENST00000466981 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:20:49721949:49722247:1 gene:ENSG00000276031 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA gene:ENSG00000264946 // chr20 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT080233 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr20 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENST00000516731 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:49794811:49794914:1 gene:ENSG00000252540 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT080235 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_018683 // RefSeq // Homo sapiens ring finger protein 114 (RNF114), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000244061 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:49936411:49953892:1 gene:ENSG00000124226 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AF265215 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 313 short isoform mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// AK297188 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58907 complete cds, moderately similar to Zinc finger protein 313. // chr20 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// AK301731 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54192 complete cds, highly similar to Zinc finger protein 313. // chr20 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// BC013695 // GenBank // Homo sapiens ring finger protein 114, mRNA (cDNA clone MGC:9801 IMAGE:3858611), complete cds. // chr20 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC066919 // GenBank // Homo sapiens ring finger protein 114, mRNA (cDNA clone MGC:87140 IMAGE:5264729), complete cds. // chr20 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// BT006795 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 313 mRNA, complete cds. // chr20 // 94 // 57 // 15 // 16 // 0 /// BX640603 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686G1376 (from clone DKFZp686G1376); complete cds. // chr20 // 92 // 93 // 24 // 26 // 0 /// AK097265 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39946 fis, clone SPLEN2024070, highly similar to Mus musculus Zfp228 (Znf228) mRNA. // chr20 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// GENSCAN00000017786 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:49936413:49958032:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
ENST00000383983 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:49972106:49972212:1 gene:ENSG00000206710 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr20 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT080246 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_005985 // RefSeq // Homo sapiens snail family zinc finger 1 (SNAI1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000244050 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:49982999:49988886:1 gene:ENSG00000124216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF125377 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein (SNAH) mRNA, complete cds. // chr20 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// BC012910 // GenBank // Homo sapiens snail homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:21748 IMAGE:4537122), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000017795 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:49970753:49988056:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0
NM_001285878 // RefSeq // Homo sapiens CCAAT/enhancer binding protein (C/EBP), beta (CEBPB), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NM_001285879 // RefSeq // Homo sapiens CCAAT/enhancer binding protein (C/EBP), beta (CEBPB), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NM_005194 // RefSeq // Homo sapiens CCAAT/enhancer binding protein (C/EBP), beta (CEBPB), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000303004 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:50190734:50192689:1 gene:ENSG00000172216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// AK291536 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75704 complete cds, highly similar to Homo sapiens CCAAT/enhancer binding protein (C/EBP), beta (CEBPB), mRNA. // chr20 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// BC007538 // GenBank // Homo sapiens CCAAT/enhancer binding protein (C/EBP), beta, mRNA (cDNA clone MGC:15409 IMAGE:3028673), complete cds. // chr20 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC021931 // GenBank // Homo sapiens CCAAT/enhancer binding protein (C/EBP), beta, mRNA (cDNA clone MGC:32080 IMAGE:4870789), complete cds. // chr20 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000017788 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:50191034:50192071:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0
NR_034124 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 1270 (LINC01270), long non-coding RNA. // chr20 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000371639 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:50292720:50314922:1 gene:ENSG00000203999 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr20 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT080290 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr20 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT080291 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr20 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT080293 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr20 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT080294 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr20 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0 /// TCONS_00027836-XLOC_013560 // Rinn lincRNA // linc-PTPN1-2 chr20:+:48909256-48931456 // chr20 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// TCONS_00028215-XLOC_013560 // Rinn lincRNA // linc-PTPN1-2 chr20:+:48910098-48931457 // chr20 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0
ENST00000364631 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:20:50563009:50563110:1 gene:ENSG00000201501 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr20 // 100 // 75 // 3 // 3 // 0 /// NONHSAT080306 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 75 // 3 // 3 // 0
NM_032521 // RefSeq // Homo sapiens par-6 family cell polarity regulator beta (PARD6B), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000371610 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:50731544:50753741:1 gene:ENSG00000124171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000396039 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:20:50731665:50756795:1 gene:ENSG00000124171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 57 // 12 // 12 // 0 /// AB044555 // GenBank // Homo sapiens mRNA for PAR-6 beta, complete cds. // chr20 // 100 // 57 // 12 // 12 // 0 /// AB178534 // GenBank // Homo sapiens PARD6B mRNA for Par6 beta short form, complete cds. // chr20 // 100 // 38 // 8 // 8 // 0 /// BC060847 // GenBank // Homo sapiens par-6 partitioning defective 6 homolog beta (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:71759 IMAGE:30345080), complete cds. // chr20 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000024127 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:50731155:50750488:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 76 // 16 // 16 // 0
NM_014484 // RefSeq // Homo sapiens molybdenum cofactor synthesis 3 (MOCS3), mRNA. // chr20 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000244051 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:50958826:50963931:1 gene:ENSG00000124217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// BC015939 // GenBank // Homo sapiens molybdenum cofactor synthesis 3, mRNA (cDNA clone MGC:9252 IMAGE:3908290), complete cds. // chr20 // 100 // 64 // 14 // 14 // 0
ENST00000516658 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:51902291:51902395:1 gene:ENSG00000252467 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT080350 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001193421 // RefSeq // Homo sapiens teashirt zinc finger homeobox 2 (TSHZ2), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 89 // 51 // 51 // 0 /// NM_173485 // RefSeq // Homo sapiens teashirt zinc finger homeobox 2 (TSHZ2), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 98 // 56 // 56 // 0 /// ENST00000329613 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:20:53185646:53256560:1 gene:ENSG00000182463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 53 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000371497 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:52972407:53495330:1 gene:ENSG00000182463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 98 // 56 // 56 // 0 /// ENST00000603338 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:53185283:53487479:1 gene:ENSG00000182463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 53 // 30 // 30 // 0 /// AF230201 // GenBank // Homo sapiens OVC10-2 mRNA, complete cds. // chr20 // 76 // 37 // 16 // 21 // 0 /// AK302570 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51401 complete cds, highly similar to Teashirt homolog 2. // chr20 // 97 // 53 // 29 // 30 // 0 /// AY926481 // GenBank // Homo sapiens cell growth-inhibiting protein 7 mRNA, complete cds. // chr20 // 95 // 37 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000037478 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:53234032:53261298:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 47 // 27 // 27 // 0
ENST00000362348 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:53097652:53097984:1 gene:ENSG00000199218 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT080389 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001193421 // RefSeq // Homo sapiens teashirt zinc finger homeobox 2 (TSHZ2), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NM_173485 // RefSeq // Homo sapiens teashirt zinc finger homeobox 2 (TSHZ2), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000371497 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:52972407:53495330:1 gene:ENSG00000182463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AF230201 // GenBank // Homo sapiens OVC10-2 mRNA, complete cds. // chr20 // 76 // 100 // 16 // 21 // 0 /// AY926481 // GenBank // Homo sapiens cell growth-inhibiting protein 7 mRNA, complete cds. // chr20 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0
ENST00000384232 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:20:53544615:53544725:1 gene:ENSG00000206959 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr20 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT080395 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NR_110051 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC101927770 (LOC101927770), long non-coding RNA. // chr20 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000424252 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:53552770:53575308:1 gene:ENSG00000197670 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr20 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONHSAT080396 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr20 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000005511 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:53539377:53570495:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 50 // 50 // 8 // 16 // 1
ENST00000487129 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:54208312:54219203:1 gene:ENSG00000101132 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr20 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000493356 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:54208300:54219285:1 gene:ENSG00000101132 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr20 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// U41816 // GenBank // Human C-1 mRNA, complete cds. // chr20 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// NM_002623 // RefSeq // Homo sapiens prefoldin subunit 4 (PFDN4), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 1 /// ENST00000371419 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:54207847:54219953:1 gene:ENSG00000101132 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 1 /// ENST00000441080 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:54208095:54228052:1 gene:ENSG00000101132 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr20 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// BC010953 // GenBank // Homo sapiens prefoldin subunit 4, mRNA (cDNA clone MGC:13614 IMAGE:4273238), complete cds. // chr20 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// GENSCAN00000005512 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:54213111:54219150:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0
NM_018431 // RefSeq // Homo sapiens docking protein 5 (DOK5), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_177959 // RefSeq // Homo sapiens docking protein 5 (DOK5), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000262593 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:54475597:54651171:1 gene:ENSG00000101134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000395939 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:20:54475718:54650890:1 gene:ENSG00000101134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// AF466368 // GenBank // Homo sapiens downstream of tyrosine kinase 5 (DOK5) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// BC008992 // GenBank // Homo sapiens docking protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:16926 IMAGE:4183000), complete cds. // chr20 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041081 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:54554933:54649041:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1
NM_019888 // RefSeq // Homo sapiens melanocortin 3 receptor (MC3R), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000243911 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:56248732:56249815:1 gene:ENSG00000124089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AY227893 // GenBank // Homo sapiens melanocortin 3 receptor (MC3R) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC069105 // GenBank // Homo sapiens melanocortin 3 receptor, mRNA (cDNA clone MGC:95382 IMAGE:7216921), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC069599 // GenBank // Homo sapiens melanocortin 3 receptor, mRNA (cDNA clone MGC:97059 IMAGE:7262270), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC096702 // GenBank // Homo sapiens melanocortin 3 receptor, mRNA (cDNA clone MGC:119971 IMAGE:40016185), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC096737 // GenBank // Homo sapiens melanocortin 3 receptor, mRNA (cDNA clone MGC:119973 IMAGE:40016189), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC098169 // GenBank // Homo sapiens melanocortin 3 receptor, mRNA (cDNA clone MGC:119972 IMAGE:40016186), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC098351 // GenBank // Homo sapiens melanocortin 3 receptor, mRNA (cDNA clone MGC:119970 IMAGE:40016184), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000039385 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:56248733:56249815:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_080821 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 210, member B (FAM210B), mRNA. // chr20 // 90 // 90 // 26 // 29 // 1 /// ENST00000371384 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:56358915:56368663:1 gene:ENSG00000124098 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 90 // 90 // 26 // 29 // 1 /// BC017725 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 108, mRNA (cDNA clone MGC:21371 IMAGE:3887324), complete cds. // chr20 // 76 // 76 // 22 // 29 // 1 /// GENSCAN00000039386 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:56359006:56366287:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1
NM_001164114 // RefSeq // Homo sapiens Cas scaffolding protein family member 4 (CASS4), transcript variant 3, mRNA. // chr20 // 97 // 76 // 28 // 29 // 0 /// NM_001164115 // RefSeq // Homo sapiens Cas scaffolding protein family member 4 (CASS4), transcript variant 4, mRNA. // chr20 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// NM_001164116 // RefSeq // Homo sapiens Cas scaffolding protein family member 4 (CASS4), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 82 // 31 // 31 // 0 /// NM_020356 // RefSeq // Homo sapiens Cas scaffolding protein family member 4 (CASS4), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000360314 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:56412112:56458780:1 gene:ENSG00000087589 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 76 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000497244 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:56412308:56453896:1 gene:ENSG00000087589 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr20 // 100 // 76 // 29 // 29 // 0 /// AK295613 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53493 complete cds, highly similar to HEF-like protein. // chr20 // 96 // 66 // 24 // 25 // 0 /// AK308057 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ98005. // chr20 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// BC027951 // GenBank // Homo sapiens Cas scaffolding protein family member 4, mRNA (cDNA clone MGC:34259 IMAGE:5205865), complete cds. // chr20 // 94 // 82 // 29 // 31 // 0 /// ENST00000434344 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:56412261:56460387:1 gene:ENSG00000087589 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 68 // 68 // 26 // 38 // 1 /// GENSCAN00000039387 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:56412459:56458747:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0
NONHSAT080454 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
AK097528 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ40209 fis, clone TESTI2020999. // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT080458 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001012971 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 209, member A (FAM209A), mRNA. // chr20 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000371328 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:56524486:56526142:1 gene:ENSG00000124103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC107704 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 106, mRNA (cDNA clone MGC:104272 IMAGE:6614835), complete cds. // chr20 // 100 // 53 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000481560 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:56517187:56526075:1 gene:ENSG00000124103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr20 // 53 // 53 // 8 // 15 // 1 /// GENSCAN00000018655 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:56524809:56526070:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 53 // 8 // 8 // 0 /// NONHSAT080457 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr20 // 53 // 53 // 8 // 15 // 1
NM_001013646 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 209, member B (FAM209B), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// XM_006723795 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens family with sequence similarity 209, member B (FAM209B), transcript variant X4, mRNA. // chr20 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000371325 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:56533246:56536520:1 gene:ENSG00000213714 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000018668 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:56533342:56638013:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 89 // 89 // 8 // 9 // 1
NONHSAT080465 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_003222 // RefSeq // Homo sapiens transcription factor AP-2 gamma (activating enhancer binding protein 2 gamma) (TFAP2C), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000201031 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:56629302:56639283:1 gene:ENSG00000087510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AK301572 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50899 complete cds, highly similar to Transcription factor AP-2 gamma. // chr20 // 95 // 67 // 21 // 22 // 0 /// BC035664 // GenBank // Homo sapiens transcription factor AP-2 gamma (activating enhancer binding protein 2 gamma), mRNA (cDNA clone MGC:46194 IMAGE:5723548), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC051829 // GenBank // Homo sapiens transcription factor AP-2 gamma (activating enhancer binding protein 2 gamma), mRNA (cDNA clone MGC:60114 IMAGE:6148554), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// U85658 // GenBank // Human transcription factor ERF-1 mRNA, complete cds. // chr20 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000018668 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:56533342:56638013:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 91 // 91 // 30 // 33 // 1
ENST00000516282 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:56667430:56667531:1 gene:ENSG00000252091 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT080466 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000487098 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:56688401:56688695:1 gene:ENSG00000241821 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr20 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT080468 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr20 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
ENST00000516255 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:20:57311854:57311958:1 gene:ENSG00000252064 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT080498 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001291780 // RefSeq // Homo sapiens RNA binding motif protein 38 (RBM38), transcript variant 3, mRNA. // chr20 // 92 // 96 // 23 // 25 // 0 /// NM_017495 // RefSeq // Homo sapiens RNA binding motif protein 38 (RBM38), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 92 // 96 // 23 // 25 // 0 /// NM_183425 // RefSeq // Homo sapiens RNA binding motif protein 38 (RBM38), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 92 // 92 // 22 // 24 // 0 /// ENST00000342690 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:57391453:57407776:1 gene:ENSG00000132819 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr20 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000344785 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:57391637:57409333:1 gene:ENSG00000132819 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr20 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000356208 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:57391407:57409333:1 gene:ENSG00000132819 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000440234 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:57391428:57407713:1 gene:ENSG00000132819 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// AF432218 // GenBank // Homo sapiens CLL-associated antigen KW-5 mRNA, complete cds. // chr20 // 88 // 96 // 22 // 25 // 0 /// BC018711 // GenBank // Homo sapiens RNA binding motif protein 38, mRNA (cDNA clone MGC:31775 IMAGE:4852523), complete cds. // chr20 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// X75315 // GenBank // H.sapiens seb4B mRNA. // chr20 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000018659 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:57329868:57412089:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_178456 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 85 (C20orf85), mRNA. // chr20 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000371168 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:58150904:58161150:1 gene:ENSG00000124237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC035405 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 85, mRNA (cDNA clone MGC:34794 IMAGE:5166377), complete cds. // chr20 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000020811 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:58114257:58205470:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_020673 // RefSeq // Homo sapiens RAB22A, member RAS oncogene family (RAB22A), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000244040 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:58309696:58367507:1 gene:ENSG00000124209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF091034 // GenBank // Homo sapiens GTP-binding protein RAB22A (RAB22A) mRNA, complete cds. // chr20 // 85 // 71 // 17 // 20 // 0 /// BC015710 // GenBank // Homo sapiens RAB22A, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:16770 IMAGE:3907891), complete cds. // chr20 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// BC063457 // GenBank // Homo sapiens RAB22A, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:74949 IMAGE:5182786), complete cds. // chr20 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// BT007046 // GenBank // Homo sapiens RAB22A, member RAS oncogene family mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000488949 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:58309758:58346048:1 gene:ENSG00000124209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr20 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// AF125104 // GenBank // Homo sapiens RAB22 mRNA, complete cds. // chr20 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// GENSCAN00000020801 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:58309977:58444235:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// NONHSAT080540 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr20 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
ENST00000598340 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:58634772:58635738:1 gene:ENSG00000268941 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC002831 // GenBank // Homo sapiens hypothetical protein MGC4294, mRNA (cDNA clone MGC:4294 IMAGE:3636069), complete cds. // chr20 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_030773 // RefSeq // Homo sapiens tubulin, beta 1 class VI (TUBB1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000217133 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:59019254:59026654:1 gene:ENSG00000101162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC033679 // GenBank // Homo sapiens tubulin, beta 1, mRNA (cDNA clone MGC:44928 IMAGE:5180793), complete cds. // chr20 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000028215 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:59019523:59024783:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0
NM_178457 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 831 (ZNF831), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000371030 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:20:59191020:59259113:1 gene:ENSG00000124203 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000028213 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:59183327:59254743:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
NM_001190826 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 217, member B (FAM217B), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NM_001190827 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 217, member B (FAM217B), transcript variant 3, mRNA. // chr20 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// NM_022106 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 217, member B (FAM217B), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000358293 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:59933764:59948680:1 gene:ENSG00000196227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000360816 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:59940439:59948680:1 gene:ENSG00000196227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000421092 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:59942124:59944086:1 gene:ENSG00000196227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// BC020771 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 177, mRNA (cDNA clone IMAGE:4771037), partial cds. // chr20 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// BC054002 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 177, mRNA (cDNA clone MGC:61749 IMAGE:6066745), complete cds. // chr20 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AK304220 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57295 complete cds. // chr20 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// ENST00000469084 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:59940459:59945000:1 gene:ENSG00000196227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr20 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// GENSCAN00000002200 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:59943944:59945095:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0
ENST00000313426 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:60055925:60072953:1 gene:ENSG00000176659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// AK091179 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ33860 fis, clone CTONG2006273. // chr20 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// AY358539 // GenBank // Homo sapiens clone DNA108728 SAMK3000 (UNQ3000) mRNA, complete cds. // chr20 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// BC101349 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 197, mRNA (cDNA clone MGC:120494 IMAGE:40025393), complete cds. // chr20 // 100 // 37 // 11 // 11 // 0 /// BC101351 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 197, mRNA (cDNA clone MGC:120496 IMAGE:40025395), complete cds. // chr20 // 100 // 37 // 11 // 11 // 0
AK128288 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ46426 fis, clone THYMU3013897. // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NR_046099 // RefSeq // Homo sapiens MIR646 host gene (non-protein coding) (MIR646HG), long non-coding RNA. // chr20 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// ENST00000432910 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:60138492:60322256:1 gene:ENSG00000228340 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr20 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// NONHSAT080648 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr20 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
NM_144703 // RefSeq // Homo sapiens LSM14B, SCD6 homolog B (S. cerevisiae) (LSM14B), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000279068 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:62122507:62135378:1 gene:ENSG00000149657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AF165185 // GenBank // Homo sapiens FT005 (FT005) mRNA, complete cds. // chr20 // 87 // 63 // 13 // 15 // 0
AK126744 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44790 fis, clone BRACE3039288. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000615516 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:62231922:62236299:1 gene:ENSG00000130703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT080718 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// TCONS_00027874-XLOC_013597 // Rinn lincRNA // linc-OSBPL2 chr20:+:60807015-60811355 // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000618509 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:62234978:62260011:1 gene:ENSG00000130703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_001281437 // RefSeq // Homo sapiens adhesion regulating molecule 1 (ADRM1), transcript variant 3, mRNA. // chr20 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// NM_001281438 // RefSeq // Homo sapiens adhesion regulating molecule 1 (ADRM1), transcript variant 4, mRNA. // chr20 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// NM_007002 // RefSeq // Homo sapiens adhesion regulating molecule 1 (ADRM1), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_175573 // RefSeq // Homo sapiens adhesion regulating molecule 1 (ADRM1), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000253003 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:20:62302896:62308860:1 gene:ENSG00000130706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000491935 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:62302093:62308862:1 gene:ENSG00000130706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC010733 // GenBank // Homo sapiens, clone IMAGE:3897044, mRNA, partial cds. // chr20 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC017245 // GenBank // Homo sapiens adhesion regulating molecule 1, mRNA (cDNA clone MGC:29536 IMAGE:4890786), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// D64154 // GenBank // Homo sapiens mRNA for Mr 110,000 antigen, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK054985 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ30423 fis, clone BRACE2008867, highly similar to 110 KD CELL MEMBRANE GLYCOPROTEIN. // chr20 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// ENST00000620230 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:20:62302896:62308860:1 gene:ENSG00000130706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000036650 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:62295522:62308761:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NM_178463 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 166 (C20orf166), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000370523 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:20:62553561:62570764:1 gene:ENSG00000174407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000370527 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:62550453:62570764:1 gene:ENSG00000174407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC110595 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 166, mRNA (cDNA clone MGC:129808 IMAGE:40022808), complete cds. // chr20 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
NR_029780 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 1-1 (MIR1-1), microRNA. // chr20 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000362147 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:62554303:62554379:1 gene:ENSG00000199017 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-1-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0000651 Homo sapiens miR-1-1 stem-loop // chr20 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT080759 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_002531 // RefSeq // Homo sapiens neurotensin receptor 1 (high affinity) (NTSR1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000370501 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:62708837:62762771:1 gene:ENSG00000101188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000482259 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:62756631:62762771:1 gene:ENSG00000101188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr20 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// AY429106 // GenBank // Homo sapiens neurotensin receptor 1 mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000050078 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:62743229:62813649:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_018270 // RefSeq // Homo sapiens MRG/MORF4L binding protein (MRGBP), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_244123 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens MRG/MORF4L binding protein (MRGBP), transcript variant X1, misc_RNA. // chr20 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000370487 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:62796453:62801738:1 gene:ENSG00000101189 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB085682 // GenBank // Homo sapiens URCC4 mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC009889 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 20, mRNA (cDNA clone MGC:16534 IMAGE:4026378), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC014235 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 20, mRNA (cDNA clone MGC:20903 IMAGE:4555060), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC018841 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 20, mRNA (cDNA clone MGC:917 IMAGE:3050866), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050078 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:62743229:62813649:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1
NM_080750 // RefSeq // Homo sapiens diphthamide biosynthesis 3 pseudogene 1 (DPH3P1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000486648 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:62845664:62845912:1 gene:ENSG00000233838 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr20 // 100 // 56 // 10 // 10 // 0 /// NONHSAT080808 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr20 // 100 // 56 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000050085 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:62841937:62845900:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 56 // 56 // 10 // 18 // 1
NM_017896 // RefSeq // Homo sapiens GID complex subunit 8 (GID8), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000266069 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:62938119:62948475:1 gene:ENSG00000101193 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC032120 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 11, mRNA (cDNA clone MGC:29516 IMAGE:4137113), complete cds. // chr20 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// AK299509 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52229 complete cds. // chr20 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// GENSCAN00000050113 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:62941503:62944912:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0
NR_029670 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 124-3 (MIR124-3), microRNA. // chr20 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000384866 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:63178500:63178586:1 gene:ENSG00000207598 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr20 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// hsa-mir-124-3 // miRBase Micro RNA Database // MI0000445 Homo sapiens miR-124-3 stem-loop // chr20 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT080837 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_022161 // RefSeq // Homo sapiens baculoviral IAP repeat containing 7 (BIRC7), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NM_139317 // RefSeq // Homo sapiens baculoviral IAP repeat containing 7 (BIRC7), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000217169 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:63235883:63240507:1 gene:ENSG00000101197 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000342412 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:63235883:63240495:1 gene:ENSG00000101197 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// AF301009 // GenBank // Homo sapiens inhibitor of apoptosis protein KIAP mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// AF311388 // GenBank // Homo sapiens livin inhibitor-of-apotosis (LIVIN) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// AY358835 // GenBank // Homo sapiens clone DNA142232 LIVIN (UNQ5800) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// AY358836 // GenBank // Homo sapiens clone DNA172970 LIVIN (UNQ5800) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AY517497 // GenBank // Homo sapiens baculoviral IAP repeat-containing 7 (BIRC7) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr20 // 88 // 80 // 21 // 24 // 0 /// BC014475 // GenBank // Homo sapiens baculoviral IAP repeat-containing 7, mRNA (cDNA clone MGC:23131 IMAGE:4859588), complete cds. // chr20 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000395306 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:20:63238202:63239610:1 gene:ENSG00000101197 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// GENSCAN00000050096 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:63220224:63239605:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
ENST00000410507 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:63337339:63337449:1 gene:ENSG00000222439 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr20 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT080857 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_024299 // RefSeq // Homo sapiens pancreatic progenitor cell differentiation and proliferation factor (PPDPF), mRNA. // chr20 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000370177 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:63520775:63521938:1 gene:ENSG00000125534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000370179 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:63520724:63522206:1 gene:ENSG00000125534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000473620 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:63520777:63521949:1 gene:ENSG00000125534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr20 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// BC002531 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 149, mRNA (cDNA clone MGC:2479 IMAGE:3140372), complete cds. // chr20 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC056416 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 149, mRNA (cDNA clone MGC:64958 IMAGE:6138381), complete cds. // chr20 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// AK311318 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ18360. // chr20 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000028863 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:63521309:63523252:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// NONHSAT080896 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr20 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
XM_005260231 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 195 (C20orf195), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_005260232 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 195 (C20orf195), transcript variant X3, mRNA. // chr20 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000370097 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:63554143:63556708:1 gene:ENSG00000125531 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000370098 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:63553020:63556683:1 gene:ENSG00000125531 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK125168 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ43178 fis, clone FCBBF3012288. // chr20 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC000912 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 195, mRNA (cDNA clone MGC:5356 IMAGE:3048411), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000615526 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:63553715:63556668:1 gene:ENSG00000125531 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000028856 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:63555595:63556620:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
AK000832 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ20825 fis, clone ADSE00160. // chr20 // 76 // 94 // 13 // 17 // 0 /// NONHSAT080946 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr20 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0
NM_080622 // RefSeq // Homo sapiens abhydrolase domain containing 16B (ABHD16B), mRNA. // chr20 // 88 // 80 // 14 // 16 // 0 /// ENST00000369916 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:63861213:63863306:1 gene:ENSG00000183260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000028822 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:63840642:63862950:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 50 // 50 // 10 // 20 // 1
NM_025219 // RefSeq // Homo sapiens DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 5 (DNAJC5), mRNA. // chr20 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000360864 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:63895182:63936031:1 gene:ENSG00000101152 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000470551 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:63895182:63936031:1 gene:ENSG00000101152 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr20 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AK128776 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ45412 fis, clone BRHIP3032413, highly similar to DnaJ homolog subfamily C member 5. // chr20 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AK289585 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75958 complete cds, highly similar to Homo sapiens DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 5 (DNAJC5), mRNA. // chr20 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// BC053642 // GenBank // Homo sapiens DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 5, mRNA (cDNA clone MGC:61683 IMAGE:5215195), complete cds. // chr20 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000028832 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:63928346:63931568:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0
ENST00000362935 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:63908955:63909119:1 gene:ENSG00000199805 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr20 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT080956 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_012469 // RefSeq // Homo sapiens pre-mRNA processing factor 6 (PRPF6), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000266079 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:63981135:64033100:1 gene:ENSG00000101161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB019219 // GenBank // Homo sapiens mRNA, complete cds, similar to yeast pre-mRNA splicing factors, Prp1/Zer1 and Prp6. // chr20 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AF026031 // GenBank // Homo sapiens putative mitochondrial outer membrane protein import receptor (hTOM) mRNA, nuclear gene encoding mitochondrial protein, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF221842 // GenBank // Homo sapiens U5 snRNP-associated 102 kDa protein mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC001666 // GenBank // Homo sapiens PRP6 pre-mRNA processing factor 6 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:1852 IMAGE:2988165), complete cds. // chr20 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028833 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:63981246:64032993:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
NM_001037732 // RefSeq // Homo sapiens defensin, beta 128 (DEFB128), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000334391 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:187853:189681:-1 gene:ENSG00000185982 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AF525930 // GenBank // Homo sapiens beta-defensin 28 precursor (DEFB28) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC140936 // GenBank // Homo sapiens defensin, beta 128, mRNA (cDNA clone MGC:176613 IMAGE:9056748), complete cds. // chr20 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0
NM_004609 // RefSeq // Homo sapiens transcription factor 15 (basic helix-loop-helix) (TCF15), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000246080 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:603797:610398:-1 gene:ENSG00000125878 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC067836 // GenBank // Homo sapiens transcription factor 15 (basic helix-loop-helix), mRNA (cDNA clone IMAGE:30347726), partial cds. // chr20 // 91 // 100 // 30 // 33 // 0 /// U08336 // GenBank // Human basic helix-loop-helix transcription factor mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000621005 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:20:604259:610266:-1 gene:ENSG00000125878 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000007246 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:568766:610237:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 48 // 16 // 16 // 0
NM_080725 // RefSeq // Homo sapiens sulfiredoxin 1 (SRXN1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000381962 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:646615:653370:-1 gene:ENSG00000271303 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF075053 // GenBank // Homo sapiens full length insert cDNA YO23H03. // chr20 // 100 // 26 // 8 // 8 // 0 /// BC032604 // GenBank // Homo sapiens sulfiredoxin 1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:45429 IMAGE:5535883), complete cds. // chr20 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// BC047707 // GenBank // Homo sapiens sulfiredoxin 1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:51983 IMAGE:5735551), complete cds. // chr20 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// AY427953 // GenBank // Homo sapiens HBV preS1-transactivated protein 5 (PS1TP5) mRNA, complete cds. // chr20 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1 /// ENST00000488788 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:20:646626:675800:-1 gene:ENSG00000270299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007258 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:648714:653185:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 29 // 9 // 9 // 0 /// AK125343 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ43353 fis, clone NT2RP7009867. // chr20 // 96 // 81 // 24 // 25 // 0
ENST00000488788 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:20:646626:675800:-1 gene:ENSG00000270299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AK125343 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ43353 fis, clone NT2RP7009867. // chr20 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_033129 // RefSeq // Homo sapiens scratch family zinc finger 2 (SCRT2), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000246104 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:661596:676179:-1 gene:ENSG00000215397 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY129025 // GenBank // Homo sapiens clone FP7030 unknown mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000007253 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:663671:675601:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0
ENST00000381944 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:760080:768487:-1 gene:ENSG00000101276 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000473664 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:761024:765825:-1 gene:ENSG00000101276 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr20 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// AK074650 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ90169 fis, clone MAMMA1000226. // chr20 // 91 // 100 // 29 // 32 // 0 /// AK291706 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78620 complete cds. // chr20 // 96 // 75 // 23 // 24 // 0 /// JX478249 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 52 member 3 (SLC52A3) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// NM_033409 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 52 (riboflavin transporter), member 3 (SLC52A3), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 1 /// ENST00000217254 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:760080:768487:-1 gene:ENSG00000101276 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 1 /// BC009750 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 54, mRNA (cDNA clone MGC:10698 IMAGE:3689286), complete cds. // chr20 // 91 // 91 // 29 // 32 // 1 /// GENSCAN00000007254 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:761026:765774:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0
ENST00000492704 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:839447:839977:-1 gene:ENSG00000101278 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000007250 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:820205:839977:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0
NM_015985 // RefSeq // Homo sapiens angiopoietin 4 (ANGPT4), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006723567 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens angiopoietin 4 (ANGPT4), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000381922 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:869899:916317:-1 gene:ENSG00000101280 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF074332 // GenBank // Homo sapiens angiopoietin-3 (ANG-3) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AK304756 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59224 complete cds, highly similar to Angiopoietin-4 precursor. // chr20 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// BC111976 // GenBank // Homo sapiens angiopoietin 4, mRNA (cDNA clone MGC:138181 IMAGE:8327444), complete cds. // chr20 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// BC111978 // GenBank // Homo sapiens angiopoietin 4, mRNA (cDNA clone MGC:138183 IMAGE:8327446), complete cds. // chr20 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000007261 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:872960:916196:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0
NM_001029871 // RefSeq // Homo sapiens R-spondin 4 (RSPO4), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// NM_001040007 // RefSeq // Homo sapiens R-spondin 4 (RSPO4), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// XM_006723563 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens R-spondin 4 (RSPO4), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 45 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000217260 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:958452:1002261:-1 gene:ENSG00000101282 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000400634 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:960254:1002264:-1 gene:ENSG00000101282 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 42 // 13 // 13 // 0 /// DQ355152 // GenBank // Homo sapiens R-spondin family member 4 variant (RSPO4) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr20 // 100 // 42 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000007247 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:934747:968800:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1
NM_018354 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 74B (TMEM74B), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XM_006723586 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens transmembrane protein 74B (TMEM74B), transcript variant X3, mRNA. // chr20 // 100 // 59 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000381894 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:1180561:1184473:-1 gene:ENSG00000125895 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XM_005260747 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens transmembrane protein 74B (TMEM74B), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 82 // 82 // 18 // 22 // 1 /// ENST00000429036 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:1181157:1184675:-1 gene:ENSG00000125895 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 68 // 68 // 15 // 22 // 1
NM_000801 // RefSeq // Homo sapiens FK506 binding protein 1A, 12kDa (FKBP1A), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 75 // 9 // 9 // 0 /// NM_001199786 // RefSeq // Homo sapiens FK506 binding protein 1A, 12kDa (FKBP1A), transcript variant 3, mRNA. // chr20 // 100 // 75 // 9 // 9 // 0 /// NM_054014 // RefSeq // Homo sapiens FK506 binding protein 1A, 12kDa (FKBP1A), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 58 // 7 // 7 // 0 /// ENST00000400137 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:1368978:1393162:-1 gene:ENSG00000088832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 75 // 9 // 9 // 0 /// BC001925 // GenBank // Homo sapiens FK506 binding protein 1A, 12kDa, mRNA (cDNA clone MGC:3950 IMAGE:2823635), complete cds. // chr20 // 100 // 50 // 6 // 6 // 0 /// M34539 // GenBank // Human FK506-binding protein (FKBP) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 50 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000618612 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:20:1368979:1393172:-1 gene:ENSG00000088832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 75 // 9 // 9 // 0
ENST00000516294 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:1529056:1529159:-1 gene:ENSG00000252103 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT078120 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_178460 // RefSeq // Homo sapiens signal-regulatory protein delta (SIRPD), mRNA. // chr20 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006723542 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens signal-regulatory protein delta (SIRPD), transcript variant X3, mRNA. // chr20 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000381621 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:20:1534251:1557705:-1 gene:ENSG00000125900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000381623 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:1534251:1558843:-1 gene:ENSG00000125900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000429387 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:20:1534251:1551939:-1 gene:ENSG00000125900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// AK093083 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ35764 fis, clone TESTI2004906, highly similar to Signal-regulatory protein delta precursor. // chr20 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC033502 // GenBank // Homo sapiens signal-regulatory protein delta, mRNA (cDNA clone MGC:35245 IMAGE:5172531), complete cds. // chr20 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// ENST00000453770 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:1516759:1557653:-1 gene:ENSG00000242324 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr20 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001135844 // RefSeq // Homo sapiens signal-regulatory protein beta 1 (SIRPB1), transcript variant 3, mRNA. // chr20 // 100 // 47 // 8 // 8 // 0 /// NM_006065 // RefSeq // Homo sapiens signal-regulatory protein beta 1 (SIRPB1), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 47 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000279477 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:1597340:1620009:-1 gene:ENSG00000101307 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 47 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000381605 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:1563521:1620009:-1 gene:ENSG00000101307 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 89 // 53 // 8 // 9 // 0 /// BX537992 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686A05192 (from clone DKFZp686A05192); complete cds. // chr20 // 100 // 47 // 8 // 8 // 0 /// Y10376 // GenBank // H.sapiens mRNA for SIRP-beta1. // chr20 // 89 // 53 // 8 // 9 // 0
ENST00000384575 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:20:2453010:2453117:-1 gene:ENSG00000207305 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT078177 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001184699 // RefSeq // Homo sapiens carboxypeptidase X (M14 family), member 1 (CPXM1), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NM_019609 // RefSeq // Homo sapiens carboxypeptidase X (M14 family), member 1 (CPXM1), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000380605 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:2794069:2800637:-1 gene:ENSG00000088882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// AK303142 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56273 complete cds, highly similar to Probable carboxypeptidase X precursor (EC 3.4.17.-). // chr20 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// AY358956 // GenBank // Homo sapiens clone DNA71162 CPXM (UNQ3015) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC063430 // GenBank // Homo sapiens carboxypeptidase X (M14 family), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:74418 IMAGE:5239864), complete cds. // chr20 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000009332 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:2794190:2800572:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_000490 // RefSeq // Homo sapiens arginine vasopressin (AVP), mRNA. // chr20 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// ENST00000380293 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:3082556:3084724:-1 gene:ENSG00000101200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// AF031475 // GenBank // Homo sapiens vasopressin-neurophysin precursor, mRNA, partial cds. // chr20 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// AF031476 // GenBank // Homo sapiens vasopressin precursor, mRNA, complete cds. // chr20 // 86 // 78 // 18 // 21 // 0 /// BC126196 // GenBank // Homo sapiens arginine vasopressin, mRNA (cDNA clone MGC:161474 IMAGE:8991912), complete cds. // chr20 // 95 // 78 // 20 // 21 // 0 /// BC126224 // GenBank // Homo sapiens arginine vasopressin, mRNA (cDNA clone MGC:161502 IMAGE:8991940), complete cds. // chr20 // 90 // 78 // 19 // 21 // 0 /// KJ534778 // GenBank HTC // Homo sapiens clone AVP_iso-A_adult-A16 arginine vasopressin isoform A (AVP) mRNA, partial cds, alternatively spliced. // chr20 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// M25647 // GenBank // Human vasopressin mRNA, complete cds. // chr20 // 90 // 78 // 19 // 21 // 0 /// GENSCAN00000027473 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:3082630:3084674:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// NONHSAT078214 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr20 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0
NM_001282533 // RefSeq // Homo sapiens leucine zipper, putative tumor suppressor family member 3 (LZTS3), mRNA. // chr20 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000329152 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:3162617:3168561:-1 gene:ENSG00000088899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000337576 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:20:3162618:3173592:-1 gene:ENSG00000088899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000360342 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:3162617:3173546:-1 gene:ENSG00000088899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// AB011124 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA0552 protein, partial cds. // chr20 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC038860 // GenBank // Homo sapiens ProSAPiP1 protein, mRNA (cDNA clone MGC:33747 IMAGE:5260571), complete cds. // chr20 // 92 // 73 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000027467 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:3164454:3167163:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0
NM_001009984 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 194 (C20orf194), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// XM_005260687 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 194 (C20orf194), transcript variant X4, mRNA. // chr20 // 100 // 48 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000252032 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:3249305:3407625:-1 gene:ENSG00000088854 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// AK303375 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50097 complete cds. // chr20 // 97 // 73 // 28 // 29 // 0 /// AK310540 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17582. // chr20 // 93 // 35 // 13 // 14 // 0 /// BC122529 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 194, mRNA (cDNA clone MGC:141683 IMAGE:40012183), complete cds. // chr20 // 97 // 75 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000027463 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:3252572:3407557:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 70 // 28 // 28 // 0
NM_022139 // RefSeq // Homo sapiens GDNF family receptor alpha 4 (GFRA4), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NM_145762 // RefSeq // Homo sapiens GDNF family receptor alpha 4 (GFRA4), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000290417 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:3659292:3663399:-1 gene:ENSG00000125861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000319242 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:3659909:3663399:-1 gene:ENSG00000125861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000477160 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:3660625:3663399:-1 gene:ENSG00000125861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr20 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// AF253318 // GenBank // Homo sapiens GFR receptor alpha 4 protein (GFRA4) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000027461 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:3655026:3663399:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0
NM_023068 // RefSeq // Homo sapiens sialic acid binding Ig-like lectin 1, sialoadhesin (SIGLEC1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000344754 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:3686970:3707128:-1 gene:ENSG00000088827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000419548 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:3686970:3693079:-1 gene:ENSG00000088827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 37 // 11 // 11 // 0 /// AF230073 // GenBank // Homo sapiens sialoadhesin mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AK122586 // GenBank // Homo sapiens mRNA for FLJ00411 protein. // chr20 // 95 // 63 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000027460 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:3687353:3707128:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0
NM_015417 // RefSeq // Homo sapiens sperm flagellar 1 (SPEF1), mRNA. // chr20 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000379756 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:3777504:3781448:-1 gene:ENSG00000101222 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000463490 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:3777504:3781448:-1 gene:ENSG00000101222 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000471499 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:3777504:3781448:-1 gene:ENSG00000101222 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr20 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AK313766 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ94367. // chr20 // 92 // 40 // 11 // 12 // 0 /// BC022476 // GenBank // Homo sapiens sperm flagellar 1, mRNA (cDNA clone MGC:26275 IMAGE:4816764), complete cds. // chr20 // 86 // 97 // 25 // 29 // 0 /// EF560745 // GenBank // Homo sapiens clone IMAGp998L0111406 C20orf28 protein (C20orf28) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000027459 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:3754058:3786965:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
NM_001810 // RefSeq // Homo sapiens centromere protein B, 80kDa (CENPB), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000379751 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:3783851:3786690:-1 gene:ENSG00000125817 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC053847 // GenBank // Homo sapiens centromere protein B, 80kDa, mRNA (cDNA clone MGC:61764 IMAGE:6470289), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000027459 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:3754058:3786965:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1
NM_000678 // RefSeq // Homo sapiens adrenoceptor alpha 1D (ADRA1D), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000379453 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:4220631:4249074:-1 gene:ENSG00000171873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// L31772 // GenBank // Human alpha-1a/d adrenergic receptor mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// S70782 // GenBank // Homo sapiens alpha adrenergic receptor subtype alpha 1a mRNA, complete cds. // chr20 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// U03864 // GenBank // Human adrenergic alpha-1a receptor protein mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009654 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:4232300:4248957:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000009667 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:4221523:4225741:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// M76446 // GenBank // Human alpha-A1-adrenergic receptor mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
ENST00000326539 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:4731282:4740668:-1 gene:ENSG00000180259 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AJ427540 // GenBank // Homo sapiens mRNA for putative M8 protein, isoform 3. // chr20 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENST00000423718 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:4731282:4740668:-1 gene:ENSG00000180259 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// ENST00000418528 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:4731282:4740668:-1 gene:ENSG00000180259 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
ENST00000391234 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:5098387:5098476:-1 gene:ENSG00000212536 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT078299 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000516558 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:20:5113993:5114083:-1 gene:ENSG00000252367 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT078301 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000436669 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:5292388:5292831:-1 gene:ENSG00000225022 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr20 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT078315 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr20 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000026778 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:5204930:5292831:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 12 // 12 // 1
NM_144773 // RefSeq // Homo sapiens prokineticin receptor 2 (PROKR2), mRNA. // chr20 // 100 // 70 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000217270 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:5302040:5314369:-1 gene:ENSG00000101292 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 70 // 16 // 16 // 0 /// AB084081 // GenBank // Homo sapiens mRNA for GPRg2, complete cds. // chr20 // 100 // 70 // 16 // 16 // 0 /// AF506288 // GenBank // Homo sapiens prokineticin receptor 2 (PKR2) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 70 // 16 // 16 // 0 /// AK289995 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76003 complete cds, highly similar to Homo sapiens G protein-coupled receptor 73-like 1 (GPR73L1), mRNA. // chr20 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// BC104959 // GenBank // Homo sapiens prokineticin receptor 2, mRNA (cDNA clone MGC:132619 IMAGE:8143962), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC104961 // GenBank // Homo sapiens prokineticin receptor 2, mRNA (cDNA clone MGC:132621 IMAGE:8143964), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// EF577398 // GenBank // Homo sapiens prokineticin receptor 2 mRNA, complete cds. // chr20 // 94 // 70 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000026793 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:5302040:5317993:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 70 // 16 // 16 // 0
ENST00000363443 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:5346006:5346160:-1 gene:ENSG00000200313 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr20 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONHSAT078316 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_019593 // RefSeq // Homo sapiens glycerophosphocholine phosphodiesterase GDE1 homolog (S. cerevisiae) (GPCPD1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// XM_006723596 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens glycerophosphocholine phosphodiesterase GDE1 homolog (S. cerevisiae) (GPCPD1), transcript variant X6, mRNA. // chr20 // 100 // 87 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000379019 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:5544439:5611026:-1 gene:ENSG00000125772 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000481038 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:5544439:5586037:-1 gene:ENSG00000125772 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr20 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0 /// AL833069 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp451O1715 (from clone DKFZp451O1715). // chr20 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000026791 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:5547661:5617711:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 53 // 8 // 8 // 0
NM_152611 // RefSeq // Homo sapiens leucine rich repeat neuronal 4 (LRRN4), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000378858 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:6040778:6054049:-1 gene:ENSG00000125872 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AK290123 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75257 complete cds. // chr20 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC019612 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 75, mRNA (cDNA clone IMAGE:4470395). // chr20 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// BC027720 // GenBank // Homo sapiens leucine rich repeat neuronal 4, mRNA (cDNA clone MGC:20770 IMAGE:4588586), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AK172833 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ23994 fis, clone HRC11286. // chr20 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// GENSCAN00000030421 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:6041022:6133382:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0
ENST00000619370 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:6065966:6067897:-1 gene:ENSG00000278192 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr20 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC019703 // GenBank // Homo sapiens mRNA similar to hypothetical protein FLJ21463 (cDNA clone IMAGE:4941290). // chr20 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_017671 // RefSeq // Homo sapiens fermitin family member 1 (FERMT1), mRNA. // chr20 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000217289 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:6074845:6123544:-1 gene:ENSG00000101311 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000478194 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:6074845:6094172:-1 gene:ENSG00000101311 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr20 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000536936 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:20:6076022:6123030:-1 gene:ENSG00000101311 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// AB105105 // GenBank // Homo sapiens mRNA for DTGCU2, complete cds. // chr20 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// AF443278 // GenBank // Homo sapiens URP1 (URP1) mRNA, complete cds. // chr20 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// AK225216 // GenBank // Homo sapiens mRNA for Unc-112 related protein 1 variant, clone: COL05655. // chr20 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// AY137240 // GenBank // Homo sapiens Kindler syndrome protein (KIND1) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// BC035882 // GenBank // Homo sapiens fermitin family homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:46404 IMAGE:4941567), complete cds. // chr20 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// BC040545 // GenBank // Homo sapiens fermitin family homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:39737 IMAGE:5277060), complete cds. // chr20 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000030421 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:6041022:6133382:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1
ENST00000490793 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:7633562:7633851:-1 gene:ENSG00000240584 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr20 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT078546 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr20 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_017545 // RefSeq // Homo sapiens hydroxyacid oxidase (glycolate oxidase) 1 (HAO1), mRNA. // chr20 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000378789 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:7882981:7940474:-1 gene:ENSG00000101323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB024079 // GenBank // Homo sapiens mRNA for liver specific gene product, complete cds. // chr20 // 91 // 85 // 20 // 22 // 0 /// AF231916 // GenBank // Homo sapiens short chain 2-hydroxy acid oxidase HAOX1 (HAOX1) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AF244134 // GenBank // Homo sapiens glycolate oxidase mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// AK289423 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78493 complete cds, highly similar to Homo sapiens hydroxyacid oxidase (glycolate oxidase) 1 (HAO1), mRNA. // chr20 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AK308963 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99004. // chr20 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// AL121739 // GenBank // Novel gene on chromosome 20, similar to AF104312; mus musculus glycolate oxidase. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC113665 // GenBank // Homo sapiens hydroxyacid oxidase (glycolate oxidase) 1, mRNA (cDNA clone MGC:142225 IMAGE:8322717), complete cds. // chr20 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC113667 // GenBank // Homo sapiens hydroxyacid oxidase (glycolate oxidase) 1, mRNA (cDNA clone MGC:142227 IMAGE:8322719), complete cds. // chr20 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000026314 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:7832038:7899072:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_021156 // RefSeq // Homo sapiens thioredoxin-related transmembrane protein 4 (TMX4), mRNA. // chr20 // 88 // 90 // 23 // 26 // 0 /// ENST00000246024 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:7977348:8019829:-1 gene:ENSG00000125827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000462384 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:7987310:8019646:-1 gene:ENSG00000125827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr20 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000527925 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:20:7983794:8019805:-1 gene:ENSG00000125827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000530935 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:7987324:8013930:-1 gene:ENSG00000125827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr20 // 92 // 41 // 11 // 12 // 0 /// AB032988 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1162 protein, partial cds. // chr20 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0 /// AY359004 // GenBank // Homo sapiens clone DNA56433 DJ971N18.2 (UNQ475) mRNA, complete cds. // chr20 // 88 // 90 // 23 // 26 // 0 /// BC033787 // GenBank // Homo sapiens thioredoxin-related transmembrane protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:45002 IMAGE:5165952), complete cds. // chr20 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000046187 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:7982251:8019613:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0
NM_020341 // RefSeq // Homo sapiens p21 protein (Cdc42/Rac)-activated kinase 7 (PAK7), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000378423 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:9537389:9838831:-1 gene:ENSG00000101349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000378429 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:9537389:9839041:-1 gene:ENSG00000101349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// AB040812 // GenBank // Homo sapiens mRNA for protein kinase PAK5, complete cds. // chr20 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// NM_177990 // RefSeq // Homo sapiens p21 protein (Cdc42/Rac)-activated kinase 7 (PAK7), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1 /// AK315820 // GenBank // Homo sapiens cDNA, FLJ79469 complete cds, highly similar to Serine/threonine-protein kinase PAK 7 (EC2.7.11.1). // chr20 // 76 // 76 // 25 // 33 // 1 /// ENST00000353224 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:9537389:9838867:-1 gene:ENSG00000101349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 70 // 70 // 23 // 33 // 1 /// AK291401 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75338 complete cds, highly similar to Homo sapiens p21(CDKN1A)-activated kinase 7, transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1 /// BC024179 // GenBank // Homo sapiens p21 protein (Cdc42/Rac)-activated kinase 7, mRNA (cDNA clone MGC:26232 IMAGE:4821164), complete cds. // chr20 // 58 // 58 // 19 // 33 // 1 /// GENSCAN00000023153 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:9539462:9603402:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 48 // 16 // 16 // 0
NM_000214 // RefSeq // Homo sapiens jagged 1 (JAG1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000254958 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:10637684:10674107:-1 gene:ENSG00000101384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000423891 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:10637759:10662506:-1 gene:ENSG00000101384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr20 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// AF003837 // GenBank // Homo sapiens Jagged1 (JAG1) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF028593 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein Jagged 1 (HJ1) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// AK302554 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51576 complete cds, highly similar to Jagged-1 precursor. // chr20 // 96 // 75 // 26 // 27 // 0 /// BC098393 // GenBank // Homo sapiens jagged 1 (Alagille syndrome), mRNA (cDNA clone MGC:104644 IMAGE:30528888), complete cds. // chr20 // 97 // 97 // 34 // 35 // 0 /// BC126207 // GenBank // Homo sapiens jagged 1 (Alagille syndrome), mRNA (cDNA clone MGC:161485 IMAGE:8991923), complete cds. // chr20 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// U61276 // GenBank // Human transmembrane protein Jagged 1 (HJ1) mRNA, complete cds. // chr20 // 97 // 94 // 33 // 34 // 0 /// U73936 // GenBank // Homo sapiens Jagged 1 (HJ1) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// BC126205 // GenBank // Homo sapiens jagged 1 (Alagille syndrome), mRNA (cDNA clone MGC:161483 IMAGE:8991921), complete cds. // chr20 // 86 // 86 // 31 // 36 // 1 /// GENSCAN00000005890 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:10639498:10805370:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0
NM_024674 // RefSeq // Homo sapiens lin-28 homolog A (C. elegans) (LIN28A), mRNA. // chr20 // 60 // 100 // 9 // 15 // 0 /// ENST00000254231 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:26410817:26429719:1 gene:ENSG00000131914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 60 // 100 // 9 // 15 // 0 /// ENST00000326279 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:26410778:26429722:1 gene:ENSG00000131914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 60 // 100 // 9 // 15 // 0 /// AF521099 // GenBank // Homo sapiens RNA-binding protein LIN-28 (LIN-28) mRNA, complete cds. // chr20 // 60 // 100 // 9 // 15 // 0 /// BC028566 // GenBank // Homo sapiens lin-28 homolog (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:15037 IMAGE:3841184), complete cds. // chr20 // 60 // 100 // 9 // 15 // 0 /// ENST00000603272 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:11608436:11609048:-1 gene:ENSG00000271397 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr20 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000044578 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:11536083:11646459:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
ENST00000427835 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:11809987:11849611:-1 gene:ENSG00000228422 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NR_110635 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 687 (LINC00687), long non-coding RNA. // chr20 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// ENST00000557899 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:11810021:11870715:-1 gene:ENSG00000228422 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr20 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// ENST00000558175 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:11800463:11810426:-1 gene:ENSG00000228422 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr20 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// NONHSAT078636 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT078638 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr20 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONHSAT078637 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr20 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// GENSCAN00000044583 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:11686400:11820782:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
ENST00000410349 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:11818821:11819091:-1 gene:ENSG00000222281 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr20 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT078639 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr20 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0
NM_001276380 // RefSeq // Homo sapiens ESF1, nucleolar pre-rRNA processing protein, homolog (S. cerevisiae) (ESF1), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NM_016649 // RefSeq // Homo sapiens ESF1, nucleolar pre-rRNA processing protein, homolog (S. cerevisiae) (ESF1), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000202816 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:13714322:13784886:-1 gene:ENSG00000089048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF068285 // GenBank // Homo sapiens HDCMC28P mRNA, complete cds. // chr20 // 86 // 56 // 12 // 14 // 0 /// BC039706 // GenBank // Homo sapiens ESF1, nucleolar pre-rRNA processing protein, homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone IMAGE:4525941), partial cds. // chr20 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000617257 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:20:13728399:13782597:-1 gene:ENSG00000089048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 93 // 56 // 13 // 14 // 0 /// GENSCAN00000003650 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:13714874:13783119:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
ENST00000390945 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:13973316:13973424:-1 gene:ENSG00000212247 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT078703 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_013281 // RefSeq // Homo sapiens fibronectin leucine rich transmembrane protein 3 (FLRT3), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NM_198391 // RefSeq // Homo sapiens fibronectin leucine rich transmembrane protein 3 (FLRT3), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000341420 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:14323995:14337616:-1 gene:ENSG00000125848 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000378053 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:14322988:14337608:-1 gene:ENSG00000125848 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// AB040902 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1469 protein, partial cds. // chr20 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// AF169677 // GenBank // Homo sapiens leucine-rich repeat transmembrane protein FLRT3 (FLRT3) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 41 // 13 // 13 // 0 /// AY358319 // GenBank // Homo sapiens clone DNA81757 FLRT3 (UNQ856) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// BC020870 // GenBank // Homo sapiens fibronectin leucine rich transmembrane protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:24073 IMAGE:4606852), complete cds. // chr20 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000462077 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:14328922:14337614:-1 gene:ENSG00000125848 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr20 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1 /// NONHSAT078712 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr20 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1
ENST00000362933 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:15021553:15021659:-1 gene:ENSG00000199803 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr20 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT078725 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
ENST00000410568 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:15280764:15280873:-1 gene:ENSG00000222500 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT078727 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001199866 // RefSeq // Homo sapiens kinesin family member 16B (KIF16B), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 87 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000408042 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:16366843:16573433:-1 gene:ENSG00000089177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 87 // 34 // 34 // 0 /// BC150261 // GenBank // Homo sapiens kinesin family member 16B, mRNA (cDNA clone MGC:166834 IMAGE:9007204), complete cds. // chr20 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// NM_001199865 // RefSeq // Homo sapiens kinesin family member 16B (KIF16B), transcript variant 3, mRNA. // chr20 // 87 // 87 // 34 // 39 // 1 /// NM_024704 // RefSeq // Homo sapiens kinesin family member 16B (KIF16B), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 90 // 90 // 35 // 39 // 1 /// ENST00000354981 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:16272104:16573433:-1 gene:ENSG00000089177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 90 // 90 // 35 // 39 // 1 /// AY166853 // GenBank // Homo sapiens kinesin motor protein mRNA, complete cds. // chr20 // 90 // 90 // 35 // 39 // 1 /// GENSCAN00000031135 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:16345807:16433071:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 51 // 51 // 20 // 39 // 1 /// GENSCAN00000031128 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:16475997:16512929:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 21 // 21 // 8 // 39 // 1
AF258585 // GenBank // Homo sapiens PP5241 mRNA, complete cds. // chr20 // 89 // 100 // 17 // 19 // 0
ENST00000390863 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:20:16982831:16983033:-1 gene:ENSG00000212165 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT078747 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000365390 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:17576206:17576510:-1 gene:ENSG00000202260 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr20 // 80 // 96 // 20 // 25 // 0 /// NONHSAT078760 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr20 // 80 // 96 // 20 // 25 // 0
NM_021220 // RefSeq // Homo sapiens ovo-like zinc finger 2 (OVOL2), mRNA. // chr20 // 96 // 85 // 27 // 28 // 0 /// XM_005260783 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ovo-like zinc finger 2 (OVOL2), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000278780 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:18024152:18057877:-1 gene:ENSG00000125850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 96 // 85 // 27 // 28 // 0 /// ENST00000483661 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:18024262:18059050:-1 gene:ENSG00000125850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr20 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000494030 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:18024262:18059188:-1 gene:ENSG00000125850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr20 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// AK022284 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ12222 fis, clone MAMMA1001105, moderately similar to OVO PROTEIN. // chr20 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// AL079276 // GenBank // Homo sapiens mRNA full length insert cDNA clone EUROIMAGE 566589. // chr20 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// BC006148 // GenBank // Homo sapiens ovo-like 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:13109 IMAGE:3959436), complete cds. // chr20 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// BT007295 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 339 mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000037370 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:18024636:18057634:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0
ENST00000384552 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:20:18113467:18113579:-1 gene:ENSG00000207282 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr20 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT078800 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000579715 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:18258554:18258851:-1 gene:ENSG00000266720 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr20 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT078806 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr20 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
ENST00000516826 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:18265690:18265879:-1 gene:ENSG00000252635 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT078807 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000362849 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:18295143:18295451:-1 gene:ENSG00000199719 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT078814 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_006606 // RefSeq // Homo sapiens retinoblastoma binding protein 9 (RBBP9), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000337227 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:18486540:18497243:-1 gene:ENSG00000089050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000491835 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:18489459:18497174:-1 gene:ENSG00000089050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr20 // 100 // 42 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000493184 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:18489288:18497180:-1 gene:ENSG00000089050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr20 // 100 // 33 // 8 // 8 // 0 /// AL832411 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp667H1113 (from clone DKFZp667H1113). // chr20 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// BC015938 // GenBank // Homo sapiens retinoblastoma binding protein 9, mRNA (cDNA clone MGC:9236 IMAGE:3922423), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC020627 // GenBank HTC // Homo sapiens retinoblastoma binding protein 9, mRNA (cDNA clone IMAGE:4688718), with apparent retained intron. // chr20 // 100 // 33 // 8 // 8 // 0 /// AF237576 // GenBank // Homo sapiens retinoblastoma-binding protein (RBBP10) mRNA, complete cds. // chr20 // 79 // 79 // 19 // 24 // 1 /// ENST00000622282 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:20:18489802:18497167:-1 gene:ENSG00000089050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 42 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000037368 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:18489764:18497167:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT078829 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr20 // 100 // 33 // 8 // 8 // 0
ENST00000408879 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:18611047:18611167:-1 gene:ENSG00000221806 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT078838 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001242671 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 78 (C20orf78), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000278779 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:18809728:18830153:-1 gene:ENSG00000149443 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000463425 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:20:18809728:18811716:-1 gene:ENSG00000149443 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr20 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONHSAT078851 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr20 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
NR_024564 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC100130264 (LOC100130264), long non-coding RNA. // chr20 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000319682 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:19242302:19284596:-1 gene:ENSG00000179447 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr20 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT078859 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr20 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
XR_248910 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens uncharacterized LOC100287166 (LOC100287166), misc_RNA. // chr20 // 90 // 100 // 19 // 21 // 0 /// ENST00000598007 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:19756390:19758037:-1 gene:ENSG00000268628 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr20 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC004382 // GenBank // Homo sapiens, clone IMAGE:3640982, mRNA, partial cds. // chr20 // 90 // 100 // 19 // 21 // 0
ENST00000424633 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:19823443:19823943:-1 gene:ENSG00000236992 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr20 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000027009 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:19823446:19823943:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_020343 // RefSeq // Homo sapiens Ral GTPase activating protein, alpha subunit 2 (catalytic) (RALGAPA2), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000202677 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:20392767:20712488:-1 gene:ENSG00000188559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// ENST00000430436 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:20:20389552:20639900:-1 gene:ENSG00000188559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 84 // 37 // 37 // 0 /// BC013749 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 74, mRNA (cDNA clone IMAGE:4517329), complete cds. // chr20 // 100 // 18 // 8 // 8 // 0 /// DQ310704 // GenBank // Homo sapiens akt substrate AS250 mRNA, complete cds. // chr20 // 98 // 98 // 42 // 43 // 0 /// AK127228 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ45295 fis, clone BRHIP3003306, weakly similar to Rattus norvegicus tuberin-like protein 1 (Tulip1). // chr20 // 25 // 25 // 11 // 44 // 1 /// ENST00000620717 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:20:20392768:20512658:-1 gene:ENSG00000188559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 18 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000012727 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:20490902:20592455:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 43 // 19 // 19 // 0 /// AB033098 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1272 protein, partial cds. // chr20 // 100 // 45 // 20 // 20 // 0 /// AK309650 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99691. // chr20 // 100 // 32 // 14 // 14 // 0
ENST00000461220 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:20:20738433:20738731:-1 gene:ENSG00000278525 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA gene:ENSG00000264361 // chr20 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT078907 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr20 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENST00000362639 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:21138956:21139074:-1 gene:ENSG00000199509 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT078917 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000457423 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:21166206:21166596:-1 gene:ENSG00000214535 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr20 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000040315 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:21166408:21166596:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 78 // 69 // 7 // 9 // 0 /// NONHSAT078924 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr20 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_033176 // RefSeq // Homo sapiens NK2 homeobox 4 (NKX2-4), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000351817 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:21395367:21398028:-1 gene:ENSG00000125816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000040317 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:21395911:21397309:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0
ENST00000411196 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:21424758:21425041:-1 gene:ENSG00000223128 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT078939 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_002509 // RefSeq // Homo sapiens NK2 homeobox 2 (NKX2-2), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006723566 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens NK2 homeobox 2 (NKX2-2), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000377142 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:21511010:21514026:-1 gene:ENSG00000125820 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC075092 // GenBank // Homo sapiens NK2 homeobox 2, mRNA (cDNA clone MGC:104145 IMAGE:30915603), complete cds. // chr20 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// BC075093 // GenBank // Homo sapiens NK2 homeobox 2, mRNA (cDNA clone MGC:103984 IMAGE:30915391), complete cds. // chr20 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000040320 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:21504441:21513669:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_021784 // RefSeq // Homo sapiens forkhead box A2 (FOXA2), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NM_153675 // RefSeq // Homo sapiens forkhead box A2 (FOXA2), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000377115 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:22581005:22585455:-1 gene:ENSG00000125798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000419308 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:22581005:22584463:-1 gene:ENSG00000125798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AB028021 // GenBank // Homo sapiens HNF-3beta mRNA for hepatocyte nuclear factor-3 beta, complete cds. // chr20 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// BC011780 // GenBank // Homo sapiens forkhead box A2, mRNA (cDNA clone MGC:19807 IMAGE:3940139), complete cds. // chr20 // 95 // 74 // 19 // 20 // 0 /// AK301611 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51352 complete cds, highly similar to Hepatocyte nuclear factor 3-beta. // chr20 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// GENSCAN00000036819 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:22581850:22589208:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0
NM_000361 // RefSeq // Homo sapiens thrombomodulin (THBD), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000377103 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:23045633:23049741:-1 gene:ENSG00000178726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC035602 // GenBank // Homo sapiens thrombomodulin, mRNA (cDNA clone MGC:45302 IMAGE:5176531), complete cds. // chr20 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC053357 // GenBank // Homo sapiens thrombomodulin, mRNA (cDNA clone MGC:61509 IMAGE:6007870), complete cds. // chr20 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// M16552 // GenBank // Human endothelial cell thrombomodulin mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000018076 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:23047777:23049504:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0
NM_012072 // RefSeq // Homo sapiens CD93 molecule (CD93), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000246006 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:23079349:23086340:-1 gene:ENSG00000125810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC028075 // GenBank // Homo sapiens CD93 molecule, mRNA (cDNA clone MGC:39899 IMAGE:5216061), complete cds. // chr20 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// U94333 // GenBank // Human Clq/MBL/SPA receptor C1qR(p) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// AK299957 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60144 complete cds, highly similar to Complement component C1q receptor precursor. // chr20 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1 /// GENSCAN00000018068 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:23061548:23086192:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0
ENST00000364657 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:23160857:23160971:-1 gene:ENSG00000201527 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT079038 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000364858 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:23380896:23381012:-1 gene:ENSG00000201728 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT079059 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_080830 // RefSeq // Homo sapiens cystatin 11 (CST11), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// NM_130794 // RefSeq // Homo sapiens cystatin 11 (CST11), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000377007 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:23450403:23452857:-1 gene:ENSG00000125831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000377009 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:23450403:23452845:-1 gene:ENSG00000125831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AF335480 // GenBank // Homo sapiens CST11 mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AF335481 // GenBank // Homo sapiens CST11delta mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// BC121079 // GenBank // Homo sapiens cystatin 11, mRNA (cDNA clone MGC:150350 IMAGE:40119721), complete cds. // chr20 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// BC121080 // GenBank // Homo sapiens cystatin 11, mRNA (cDNA clone MGC:150351 IMAGE:40119722), complete cds. // chr20 // 91 // 100 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000018072 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:23450506:23452808:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0
ENST00000363338 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:20:23457584:23457685:-1 gene:ENSG00000200208 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT079063 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_080610 // RefSeq // Homo sapiens cystatin 9-like (CST9L), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000376979 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:23564732:23568749:-1 gene:ENSG00000101435 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AY358615 // GenBank // Homo sapiens clone DNA86571 testatin (UNQ1835) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC029656 // GenBank // Homo sapiens cystatin 9-like, mRNA (cDNA clone MGC:34724 IMAGE:5163974), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000018061 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:23564948:23568450:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 62 // 13 // 13 // 0
NM_001008693 // RefSeq // Homo sapiens cystatin 9 (testatin) (CST9), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000376971 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:23602410:23605876:-1 gene:ENSG00000173335 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AF494536 // GenBank // Homo sapiens cystatin 9 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr20 // 91 // 100 // 20 // 22 // 0 /// BC137302 // GenBank // Homo sapiens cystatin 9 (testatin), mRNA (cDNA clone MGC:168922 IMAGE:9021299), complete cds. // chr20 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// BC137303 // GenBank // Homo sapiens cystatin 9 (testatin), mRNA (cDNA clone MGC:168923 IMAGE:9021300), complete cds. // chr20 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000018049 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:23603510:23605837:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 64 // 14 // 14 // 0
NM_000099 // RefSeq // Homo sapiens cystatin C (CST3), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// ENST00000376925 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:23633648:23638026:-1 gene:ENSG00000101439 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000398409 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:23633657:23638473:-1 gene:ENSG00000101439 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC013083 // GenBank // Homo sapiens cystatin C, mRNA (cDNA clone MGC:18114 IMAGE:4153023), complete cds. // chr20 // 92 // 90 // 24 // 26 // 0 /// BC110305 // GenBank // Homo sapiens cystatin C, mRNA (cDNA clone MGC:117328 IMAGE:5248305), complete cds. // chr20 // 92 // 90 // 24 // 26 // 0 /// BT006839 // GenBank // Homo sapiens cystatin C (amyloid angiopathy and cerebral hemorrhage) mRNA, complete cds. // chr20 // 89 // 62 // 16 // 18 // 0 /// CR541988 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834A0635D for gene CST3, cystatin C (amyloid angiopathy and cerebral hemorrhage); complete cds, incl. stopcodon. // chr20 // 89 // 62 // 16 // 18 // 0 /// CR542018 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834G0535D for gene CST3, cystatin C (amyloid angiopathy and cerebral hemorrhage); complete cds, without stopcodon. // chr20 // 89 // 62 // 16 // 18 // 0 /// NM_001288614 // RefSeq // Homo sapiens cystatin C (CST3), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1 /// ENST00000398411 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:23626706:23637945:-1 gene:ENSG00000101439 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1 /// GENSCAN00000018065 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:23625918:23637862:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0
NM_001899 // RefSeq // Homo sapiens cystatin S (CST4), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000217423 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:23685640:23689040:-1 gene:ENSG00000101441 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC065714 // GenBank // Homo sapiens cystatin S, mRNA (cDNA clone MGC:71923 IMAGE:30327736), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC074952 // GenBank // Homo sapiens cystatin S, mRNA (cDNA clone MGC:103894 IMAGE:30915278), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC074953 // GenBank // Homo sapiens cystatin S, mRNA (cDNA clone MGC:104053 IMAGE:30915500), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000018062 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:23683863:23688969:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 1
NM_001898 // RefSeq // Homo sapiens cystatin SN (CST1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000304749 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:23747553:23750937:-1 gene:ENSG00000170373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000398402 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:23747731:23751268:-1 gene:ENSG00000170373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// BC021225 // GenBank // Homo sapiens cystatin SN, mRNA (cDNA clone MGC:12741 IMAGE:4298603), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// J03870 // GenBank // Human cystatin SA-I mRNA, complete cds. // chr20 // 83 // 75 // 5 // 6 // 0
NM_001322 // RefSeq // Homo sapiens cystatin SA (CST2), mRNA. // chr20 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000304725 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:23823769:23826731:-1 gene:ENSG00000170369 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC062679 // GenBank // Homo sapiens cystatin SA, mRNA (cDNA clone MGC:71924 IMAGE:30350087), complete cds. // chr20 // 95 // 100 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000030472 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:23824020:23826660:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 50 // 10 // 10 // 0
NM_001900 // RefSeq // Homo sapiens cystatin D (CST5), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000304710 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:23875935:23879750:-1 gene:ENSG00000170367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC062678 // GenBank // Homo sapiens cystatin D, mRNA (cDNA clone MGC:71922 IMAGE:30349574), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC069514 // GenBank // Homo sapiens cystatin D, mRNA (cDNA clone MGC:97457 IMAGE:7262733), complete cds. // chr20 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000030478 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:23855309:23879676:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1
NM_178311 // RefSeq // Homo sapiens gamma-glutamyltransferase light chain 1 (GGTLC1), transcript variant A, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NM_178312 // RefSeq // Homo sapiens gamma-glutamyltransferase light chain 1 (GGTLC1), transcript variant B, mRNA. // chr20 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// XM_006723661 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens gamma-glutamyltransferase light chain 1 (GGTLC1), transcript variant X4, mRNA. // chr20 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000278765 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:23985053:23986875:-1 gene:ENSG00000149435 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000286890 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:23985050:23986795:-1 gene:ENSG00000149435 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000335694 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:23985053:23988779:-1 gene:ENSG00000149435 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC040904 // GenBank // Homo sapiens gamma-glutamyltransferase light chain 1, mRNA (cDNA clone MGC:50550 IMAGE:5744021), complete cds. // chr20 // 95 // 100 // 19 // 20 // 0 /// L20491 // GenBank // Human gamma-glutamyl transpeptidase mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// L20492 // GenBank // Human gamma-glutamyl transpeptidase mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000030477 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:23976237:23986611:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 70 // 70 // 14 // 20 // 1
NM_020531 // RefSeq // Homo sapiens adipocyte plasma membrane associated protein (APMAP), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000217456 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:24962925:24992979:-1 gene:ENSG00000101474 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000451442 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:24962925:24992642:-1 gene:ENSG00000101474 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// AK291129 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76183 complete cds. // chr20 // 88 // 84 // 23 // 26 // 0 /// AK301959 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58338 complete cds, highly similar to Adipocyte plasma membrane-associated protein. // chr20 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// AY359076 // GenBank // Homo sapiens clone DNA84141 C20orf3 (UNQ1869) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC003501 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 3, mRNA (cDNA clone MGC:10335 IMAGE:3530962), complete cds. // chr20 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000030923 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:24963813:24992688:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0
NM_025176 // RefSeq // Homo sapiens ninein-like (NINL), mRNA. // chr20 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000278886 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:25452705:25585517:-1 gene:ENSG00000101004 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000422516 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:20:25452826:25585517:-1 gene:ENSG00000101004 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// AK293991 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56426 complete cds, weakly similar to Ninein. // chr20 // 91 // 32 // 10 // 11 // 0 /// AK309298 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99339. // chr20 // 94 // 50 // 16 // 17 // 0 /// BC036380 // GenBank // Homo sapiens ninein-like, mRNA (cDNA clone MGC:33226 IMAGE:5268454), complete cds. // chr20 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// EU718622 // GenBank // Homo sapiens ninein-like protein isoform B mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// XM_005260680 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ninein-like (NINL), transcript variant X3, mRNA. // chr20 // 74 // 74 // 25 // 34 // 1 /// AK093569 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ36250 fis, clone THYMU2002037. // chr20 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1 /// GENSCAN00000030920 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:25368275:25696955:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 91 // 91 // 31 // 34 // 1
NM_152667 // RefSeq // Homo sapiens N-acetylneuraminic acid phosphatase (NANP), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000304788 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:25612935:25624175:-1 gene:ENSG00000170191 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AL833116 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp313O1829 (from clone DKFZp313O1829). // chr20 // 92 // 93 // 23 // 25 // 0 /// BC022552 // GenBank // Homo sapiens N-acetylneuraminic acid phosphatase, mRNA (cDNA clone MGC:26833 IMAGE:4819016), complete cds. // chr20 // 87 // 56 // 13 // 15 // 0 /// AK074335 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ23755 fis, clone HEP17336. // chr20 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// GENSCAN00000030920 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:25368275:25696955:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
ENST00000470590 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:25654595:25654881:-1 gene:ENSG00000242236 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr20 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT079174 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr20 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001290261 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 337 (ZNF337), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NM_015655 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 337 (ZNF337), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000252979 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:25674215:25696841:-1 gene:ENSG00000130684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000376436 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:25674215:25686957:-1 gene:ENSG00000130684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000481610 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:25676949:25696815:-1 gene:ENSG00000130684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr20 // 100 // 37 // 11 // 11 // 0 /// AK291235 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78383 complete cds, highly similar to Homo sapiens zinc finger protein 337 (ZNF337), mRNA. // chr20 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// AK299811 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53476 complete cds, highly similar to Zinc finger protein 337. // chr20 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// BC021298 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 337, mRNA (cDNA clone MGC:29686 IMAGE:4551314), complete cds. // chr20 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT079178 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr20 // 100 // 37 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000030920 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:25368275:25696955:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1
NR_003678 // RefSeq // Homo sapiens nuclear receptor corepressor 1 pseudogene 1 (NCOR1P1), non-coding RNA. // chr20 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000478176 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:26103416:26114028:-1 gene:ENSG00000240108 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr20 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// NONHSAT079222 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr20 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0
ENST00000380888 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:30278906:30286537:-1 gene:ENSG00000205611 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr20 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// AK127732 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ45832 fis, clone NT2RP8007503. // chr20 // 93 // 100 // 13 // 14 // 0 /// NONHSAT079263 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr20 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
ENST00000363455 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:20:30309015:30309126:-1 gene:ENSG00000200325 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr20 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT079268 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_001037731 // RefSeq // Homo sapiens defensin, beta 116 (DEFB116), mRNA. // chr20 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// ENST00000400549 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:31303212:31308585:-1 gene:ENSG00000215545 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// DQ012020 // GenBank // Homo sapiens beta-defensin 116 (DEFB116) mRNA, complete cds. // chr20 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0
NM_001011878 // RefSeq // Homo sapiens defensin, beta 121 (DEFB121), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000376314 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:31404869:31406266:-1 gene:ENSG00000204548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF479700 // GenBank // Homo sapiens ESC42-RELC mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// AY501000 // GenBank // Homo sapiens beta-defensin 121 (DEFB121) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC130607 // GenBank // Homo sapiens defensin, beta 121, mRNA (cDNA clone MGC:163479 IMAGE:40146638), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC130609 // GenBank // Homo sapiens defensin, beta 121, mRNA (cDNA clone MGC:163481 IMAGE:40146640), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001171832 // RefSeq // Homo sapiens defensin, beta 121 (DEFB121), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// ENST00000376312 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:31404845:31412838:-1 gene:ENSG00000204548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr20 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// GENSCAN00000000058 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:31377246:31406152:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_001037500 // RefSeq // Homo sapiens defensin, beta 124 (DEFB124), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000317676 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:31465506:31473013:-1 gene:ENSG00000180383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// DQ119827 // GenBank // Homo sapiens beta-defensin 124 (DEFB124) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000481595 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:31472599:31476757:-1 gene:ENSG00000180383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr20 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONHSAT079294 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONHSAT079295 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 92 // 50 // 12 // 13 // 0 /// NONHSAT079296 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr20 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_004118 // RefSeq // Homo sapiens forkhead box S1 (FOXS1), mRNA. // chr20 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000375978 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:31844301:31845619:-1 gene:ENSG00000179772 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC013408 // GenBank // Homo sapiens forkhead box S1, mRNA (cDNA clone MGC:4544 IMAGE:3028182), complete cds. // chr20 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BT009768 // GenBank // Homo sapiens forkhead-like 18 (Drosophila) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000024322 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:31844550:31845542:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
NM_030815 // RefSeq // Homo sapiens p53 and DNA-damage regulated 1 (PDRG1), mRNA. // chr20 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000202017 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:31944342:31952092:-1 gene:ENSG00000088356 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY286301 // GenBank // Homo sapiens p53 and DNA damage-regulated protein (PDRG) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC009334 // GenBank // Homo sapiens p53 and DNA damage regulated 1, mRNA (cDNA clone MGC:16693 IMAGE:4126826), complete cds. // chr20 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000024314 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:31945807:31953857:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT079327 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr20 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0
NR_002781 // RefSeq // Homo sapiens testis specific protein, Y-linked 26, pseudogene (TSPY26P), non-coding RNA. // chr20 // 91 // 100 // 21 // 23 // 0 /// ENST00000476365 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:32189202:32190527:-1 gene:ENSG00000235217 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr20 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000565928 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:32186477:32190360:-1 gene:ENSG00000235217 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr20 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000024319 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:32189202:32190269:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0
NM_002657 // RefSeq // Homo sapiens pleiomorphic adenoma gene-like 2 (PLAGL2), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000246229 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:32192503:32207791:-1 gene:ENSG00000126003 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AF006005 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein PLAGL2 (PLAGL2) mRNA, complete cds. // chr20 // 94 // 80 // 15 // 16 // 0 /// BC000197 // GenBank HTC // Homo sapiens pleiomorphic adenoma gene-like 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:3351694), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr20 // 50 // 50 // 10 // 20 // 1
NM_182584 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 203 (C20orf203), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000360785 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:20:32650390:32651759:-1 gene:ENSG00000198547 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000608990 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:32631652:32673941:-1 gene:ENSG00000198547 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GU931819 // GenBank // Homo sapiens alugen isoform 2 mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GU931820 // GenBank // Homo sapiens alugen isoform 1 mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONHSAT079366 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONHSAT147163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001099339 // RefSeq // Homo sapiens COMM domain containing 7 (COMMD7), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// NM_053041 // RefSeq // Homo sapiens COMM domain containing 7 (COMMD7), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000278980 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:32702691:32743997:-1 gene:ENSG00000149600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000446419 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:32702703:32743455:-1 gene:ENSG00000149600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000474815 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:20:32704474:32743406:-1 gene:ENSG00000149600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 95 // 63 // 18 // 19 // 0 /// ENST00000610160 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:32702703:32743445:-1 gene:ENSG00000149600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr20 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// AK097059 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39740 fis, clone SMINT2016477. // chr20 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// AY542162 // GenBank // Homo sapiens COMMD7 mRNA, complete cds. // chr20 // 81 // 70 // 17 // 21 // 0 /// BC000628 // GenBank // Homo sapiens COMM domain containing 7, mRNA (cDNA clone MGC:3046 IMAGE:3343149), complete cds. // chr20 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// BC047440 // GenBank // Homo sapiens COMM domain containing 7, mRNA (cDNA clone MGC:48469 IMAGE:5275167), complete cds. // chr20 // 83 // 80 // 20 // 24 // 0 /// NONHSAT079370 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000032301 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:32727893:32768955:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_080675 // RefSeq // Homo sapiens Sad1 and UNC84 domain containing 5 (SUN5), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006723708 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens Sad1 and UNC84 domain containing 5 (SUN5), transcript variant X3, mRNA. // chr20 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000356173 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:32983773:33004433:-1 gene:ENSG00000167098 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000375519 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:32999853:33004359:-1 gene:ENSG00000167098 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000375523 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:32983773:33004407:-1 gene:ENSG00000167098 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AF401350 // GenBank // Homo sapiens testis and spermatogenesis related gene 4 mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC026118 // GenBank // Homo sapiens sperm associated antigen 4-like, mRNA (cDNA clone MGC:33594 IMAGE:4824412), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC029528 // GenBank // Homo sapiens sperm associated antigen 4-like, mRNA (cDNA clone MGC:33913 IMAGE:5271065), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000032315 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:32983794:33006047:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0
NM_003098 // RefSeq // Homo sapiens syntrophin, alpha 1 (SNTA1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000217381 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:33407955:33443892:-1 gene:ENSG00000101400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AK095942 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ38623 fis, clone HEART2008509, highly similar to Alpha-1-syntrophin. // chr20 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// AK291994 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75889 complete cds, highly similar to Homo sapiens syntrophin, alpha 1 (dystrophin-associated protein A1, 59kDa, acidic component) (SNTA1), mRNA. // chr20 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// AK301800 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56556 complete cds, highly similar to Alpha-1-syntrophin. // chr20 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// BC026215 // GenBank // Homo sapiens syntrophin, alpha 1 (dystrophin-associated protein A1, 59kDa, acidic component), mRNA (cDNA clone MGC:21330 IMAGE:4413197), complete cds. // chr20 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// U40571 // GenBank // Human alpha1-syntrophin (SNT A1) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000032306 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:33358819:33443620:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 74 // 74 // 23 // 31 // 1
NM_005225 // RefSeq // Homo sapiens E2F transcription factor 1 (E2F1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000343380 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:33675683:33686404:-1 gene:ENSG00000101412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC050369 // GenBank // Homo sapiens E2F transcription factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:51826 IMAGE:6025053), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC058902 // GenBank // Homo sapiens E2F transcription factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:64963 IMAGE:6055344), complete cds. // chr20 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// M96577 // GenBank // Homo sapiens (E2F-1) pRB-binding protein mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000622594 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:20:33675487:33686404:-1 gene:ENSG00000101412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000032300 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:33676732:33686264:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0
NM_007238 // RefSeq // Homo sapiens peroxisomal membrane protein 4, 24kDa (PXMP4), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_183397 // RefSeq // Homo sapiens peroxisomal membrane protein 4, 24kDa (PXMP4), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000217398 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:20:33707489:33720310:-1 gene:ENSG00000101417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000344022 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:33707269:33720319:-1 gene:ENSG00000101417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 94 // 67 // 17 // 18 // 0 /// ENST00000409299 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:33702754:33720300:-1 gene:ENSG00000101417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF072864 // GenBank // Homo sapiens peroxisomal membrane protein PMP 24 mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// AK297018 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51989 complete cds, highly similar to Peroxisomal membrane protein 4. // chr20 // 83 // 67 // 15 // 18 // 0 /// AK301532 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53748 complete cds, moderately similar to Peroxisomal membrane protein 4. // chr20 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// BC001147 // GenBank // Homo sapiens peroxisomal membrane protein 4, 24kDa, mRNA (cDNA clone MGC:1213 IMAGE:3533572), complete cds. // chr20 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// CR533471 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834A0617D for gene PXMP4, peroxisomal membrane protein 4, 24kDa; complete cds, incl. stopcodon. // chr20 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000043967 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:33710555:33720207:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0
NM_003908 // RefSeq // Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 2, subunit 2 beta, 38kDa (EIF2S2), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000374980 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:34088298:34112332:-1 gene:ENSG00000125977 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC000461 // GenBank // Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 2, subunit 2 beta, 38kDa, mRNA (cDNA clone MGC:8508 IMAGE:2822324), complete cds. // chr20 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0 /// BC000934 // GenBank // Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 2, subunit 2 beta, 38kDa, mRNA (cDNA clone MGC:5085 IMAGE:3447202), complete cds. // chr20 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0
ENST00000449115 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:34475924:34476474:-1 gene:ENSG00000181741 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr20 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000043966 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:34476010:34476474:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NR_002165 // RefSeq // Homo sapiens high mobility group box 3 pseudogene 1 (HMGB3P1), non-coding RNA. // chr20 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000393368 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:34833575:34834462:-1 gene:ENSG00000225336 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr20 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000046586 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:34833575:34833931:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0
NM_000178 // RefSeq // Homo sapiens glutathione synthetase (GSS), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000216951 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:34928430:34955817:-1 gene:ENSG00000100983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000451957 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:20:34928828:34951852:-1 gene:ENSG00000100983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// AB459500 // GenBank // Homo sapiens GSS mRNA for glutathione synthetase, complete cds. // chr20 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// AK293144 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51785 complete cds, highly similar to Glutathione synthetase (EC 6.3.2.3). // chr20 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// AK298292 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50601 complete cds, highly similar to Glutathione synthetase (EC 6.3.2.3). // chr20 // 96 // 83 // 23 // 24 // 0 /// BC007927 // GenBank // Homo sapiens glutathione synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:14098 IMAGE:3946317), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// EU794618 // GenBank // Homo sapiens epididymis secretory sperm binding protein Li 64p (HEL-S-64p) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// U34683 // GenBank // Human glutathione synthetase mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// AK311421 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ18463. // chr20 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1 /// AK311567 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ18609. // chr20 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// GENSCAN00000046564 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:34928828:34968956:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// L42531 // GenBank // Homo sapiens (clone pGSH1) glutathione synthetase (gsh-s) mRNA, complete cds. // chr20 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0
NM_015638 // RefSeq // Homo sapiens transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 4 associated protein (TRPC4AP), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NM_199368 // RefSeq // Homo sapiens transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 4 associated protein (TRPC4AP), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000252015 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:35002404:35092871:-1 gene:ENSG00000100991 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000451813 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:35002404:35092807:-1 gene:ENSG00000100991 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AK074106 // GenBank // Homo sapiens mRNA for FLJ00177 protein. // chr20 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// AK298958 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51744 complete cds, highly similar to Trpc4-associated protein. // chr20 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// AK301368 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50256 complete cds, highly similar to Trpc4-associated protein. // chr20 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// AK303476 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50335 complete cds, highly similar to Trpc4-associated protein. // chr20 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC013144 // GenBank // Homo sapiens transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 4 associated protein, mRNA (cDNA clone MGC:21388 IMAGE:4475866), complete cds. // chr20 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AL096738 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp586C1223 (from clone DKFZp586C1223). // chr20 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// GENSCAN00000046582 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:35003146:35092781:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
ENST00000365280 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:35030317:35030420:-1 gene:ENSG00000202150 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr20 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// NONHSAT079469 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0
NM_178468 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 83, member C (FAM83C), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000374408 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:35285731:35292401:-1 gene:ENSG00000125998 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC113483 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 83, member C, mRNA (cDNA clone MGC:142043 IMAGE:8322535), complete cds. // chr20 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000046572 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:35286535:35292304:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0
NM_000557 // RefSeq // Homo sapiens growth differentiation factor 5 (GDF5), mRNA. // chr20 // 95 // 75 // 20 // 21 // 0 /// ENST00000374369 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:35433347:35438243:-1 gene:ENSG00000125965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// ENST00000374372 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:35433347:35454746:-1 gene:ENSG00000125965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// AB593125 // GenBank // Homo sapiens GDF5 mRNA for growth/differentiation factor 5, complete cds, clone: HP08116-ARiS122L17. // chr20 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// BC032495 // GenBank // Homo sapiens growth differentiation factor 5, mRNA (cDNA clone MGC:40325 IMAGE:5243109), complete cds. // chr20 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// U13660 // GenBank // Human cartilage-derived morphogenetic protein 1 (CDMP-1) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000046570 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:35345795:35437928:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NM_001145350 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 173 (C20orf173), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// ENST00000246199 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:35526971:35529619:-1 gene:ENSG00000125975 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000374345 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:35523186:35529652:-1 gene:ENSG00000125975 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 94 // 61 // 16 // 17 // 0 /// ENST00000424444 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:20:35528745:35529623:-1 gene:ENSG00000125975 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 89 // 32 // 8 // 9 // 0 /// ENST00000444723 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:20:35526971:35529652:-1 gene:ENSG00000125975 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// AK058089 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ25360 fis, clone TST01708. // chr20 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC112060 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 173, mRNA (cDNA clone MGC:138265 IMAGE:8327528), complete cds. // chr20 // 87 // 54 // 13 // 15 // 0 /// BC112062 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 173, mRNA (cDNA clone MGC:138267 IMAGE:8327530), complete cds. // chr20 // 87 // 54 // 13 // 15 // 0 /// NR_026933 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 173 (C20orf173), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr20 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// GENSCAN00000046587 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:35520988:35529373:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NR_119376 // RefSeq // Homo sapiens fer-1-like family member 4, pseudogene (functional) (FER1L4), non-coding RNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000325076 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:35600699:35605326:-1 gene:ENSG00000088340 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:retained_intron // chr20 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000426117 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:35603921:35607529:-1 gene:ENSG00000088340 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr20 // 91 // 39 // 10 // 11 // 0 /// ENST00000430275 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:35582119:35607562:-1 gene:ENSG00000088340 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000434843 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:35603104:35606540:-1 gene:ENSG00000088340 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:retained_intron // chr20 // 91 // 39 // 10 // 11 // 0 /// AK026266 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ22613 fis, clone HSI04987. // chr20 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// AY461812 // GenBank // Homo sapiens FER-1-like protein 4 (FER1L4) mRNA, complete cds. // chr20 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENST00000615531 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:35558866:35607494:-1 gene:ENSG00000088340 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:unitary_pseudogene // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000046563 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:35558325:35607494:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
ENST00000516740 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:35647328:35647430:-1 gene:ENSG00000252549 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr20 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT079518 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
ENST00000410220 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:35769785:35769867:-1 gene:ENSG00000222152 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT079536 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000362806 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:20:35853252:35853364:-1 gene:ENSG00000199676 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr20 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT079539 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000384325 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:35928570:35928675:-1 gene:ENSG00000207053 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT079543 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_016558 // RefSeq // Homo sapiens SCAN domain containing 1 (SCAND1), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 96 // 79 // 25 // 26 // 0 /// NM_033630 // RefSeq // Homo sapiens SCAN domain containing 1 (SCAND1), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 58 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000305978 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:35953617:35954626:-1 gene:ENSG00000171222 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 58 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000373991 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:35953629:35959472:-1 gene:ENSG00000171222 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// AF204271 // GenBank // Homo sapiens SDP1 mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// BC000785 // GenBank // Homo sapiens SCAN domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:838 IMAGE:3508136), complete cds. // chr20 // 94 // 55 // 17 // 18 // 0 /// BC036709 // GenBank // Homo sapiens SCAN domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:20960 IMAGE:4620185), complete cds. // chr20 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// BC041022 // GenBank // Homo sapiens SCAN domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:52365 IMAGE:3830122), complete cds. // chr20 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// CR457188 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834B128D for gene SCAND1, SCAN domain containing 1; complete cds, incl. stopcodon. // chr20 // 92 // 36 // 11 // 12 // 0 /// ENST00000615116 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:20:35953617:35955359:-1 gene:ENSG00000171222 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 96 // 79 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000041507 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:35953745:35962112:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0
NM_032214 // RefSeq // Homo sapiens Src-like-adaptor 2 (SLA2), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// NM_175077 // RefSeq // Homo sapiens Src-like-adaptor 2 (SLA2), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000262866 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:36612318:36646216:-1 gene:ENSG00000101082 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000360672 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:36612519:36645881:-1 gene:ENSG00000101082 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// AF290985 // GenBank // Homo sapiens Src-like adaptor protein-2 mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// AF290986 // GenBank // Homo sapiens Src-like adaptor protein-2 splice isoform mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr20 // 86 // 58 // 18 // 21 // 0 /// AF326353 // GenBank // Homo sapiens Src-like adapter protein-2 mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// AK025645 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ21992 fis, clone HEP06554. // chr20 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// AK291513 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78411 complete cds, highly similar to Homo sapiens Src-like-adaptor 2 (SLA2), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// BC042041 // GenBank // Homo sapiens Src-like-adaptor 2, mRNA (cDNA clone MGC:49845 IMAGE:4429896), complete cds. // chr20 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// XM_005260572 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens Src-like-adaptor 2 (SLA2), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 58 // 58 // 21 // 36 // 1 /// GENSCAN00000041498 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:36613866:36682578:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 58 // 58 // 21 // 36 // 1
ENST00000365385 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:20:36668559:36668670:-1 gene:ENSG00000202255 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT079591 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_199181 // RefSeq // Homo sapiens suppressor of glucose, autophagy associated 1 (SOGA1), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 42 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000237536 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:36777442:36863686:-1 gene:ENSG00000149639 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 58 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000279034 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:36777449:36859873:-1 gene:ENSG00000149639 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 42 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000465671 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:36783782:36816281:-1 gene:ENSG00000149639 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr20 // 100 // 42 // 21 // 21 // 0 /// BC113405 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 117, mRNA (cDNA clone IMAGE:8322457), complete cds. // chr20 // 100 // 48 // 24 // 24 // 0 /// BC113433 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 117, mRNA (cDNA clone IMAGE:8322485), complete cds. // chr20 // 100 // 48 // 24 // 24 // 0 /// NM_080627 // RefSeq // Homo sapiens suppressor of glucose, autophagy associated 1 (SOGA1), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 54 // 54 // 27 // 50 // 1 /// AB020696 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA0889 protein, partial cds. // chr20 // 48 // 48 // 24 // 50 // 1 /// AK022023 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ11961 fis, clone HEMBB1001020, highly similar to Homo sapiens mRNA for KIAA0889 protein. // chr20 // 46 // 46 // 23 // 50 // 1 /// GENSCAN00000020268 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:36783304:36863344:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 44 // 22 // 22 // 0
NM_015474 // RefSeq // Homo sapiens SAM domain and HD domain 1 (SAMHD1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// XM_005260384 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens SAM domain and HD domain 1 (SAMHD1), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000262878 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:36890229:36951843:-1 gene:ENSG00000101347 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// AB013847 // GenBank // Homo sapiens mRNA for MOP-5, complete cds. // chr20 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// AK304187 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54403 complete cds, highly similar to SAM domain and HD domain-containing protein 1. // chr20 // 100 // 93 // 39 // 39 // 0 /// AK304795 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51783 complete cds, highly similar to SAM domain and HD domain-containing protein 1. // chr20 // 100 // 52 // 22 // 22 // 0 /// AK311150 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ18192. // chr20 // 100 // 24 // 10 // 10 // 0 /// BC036450 // GenBank // Homo sapiens SAM domain and HD domain 1, mRNA (cDNA clone MGC:33043 IMAGE:4816438), complete cds. // chr20 // 93 // 95 // 37 // 40 // 0 /// GENSCAN00000020257 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:36892932:36951643:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0
NM_002895 // RefSeq // Homo sapiens retinoblastoma-like 1 (RBL1), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// NM_183404 // RefSeq // Homo sapiens retinoblastoma-like 1 (RBL1), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000344359 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:37003574:37095989:-1 gene:ENSG00000080839 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000373664 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:36996349:37095995:-1 gene:ENSG00000080839 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// AK290380 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76705 complete cds, highly similar to Homo sapiens retinoblastoma-like 1 (p107) (RBL1), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// AK310870 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17912. // chr20 // 100 // 42 // 13 // 13 // 0 /// BC032247 // GenBank // Homo sapiens retinoblastoma-like 1 (p107), mRNA (cDNA clone MGC:40006 IMAGE:4521266), complete cds. // chr20 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// L14812 // GenBank // Human retinoblastoma related protein (p107) mRNA, complete cds. // chr20 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000020242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:36998759:37179239:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 55 // 55 // 17 // 31 // 1
NM_001184731 // RefSeq // Homo sapiens growth hormone releasing hormone (GHRH), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_021081 // RefSeq // Homo sapiens growth hormone releasing hormone (GHRH), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000237527 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:20:37251086:37256896:-1 gene:ENSG00000118702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000373611 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:37251160:37256889:-1 gene:ENSG00000118702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// ENST00000373614 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:37251082:37261835:-1 gene:ENSG00000118702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC098109 // GenBank // Homo sapiens growth hormone releasing hormone, mRNA (cDNA clone MGC:119778 IMAGE:40014055), complete cds. // chr20 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// BC098161 // GenBank // Homo sapiens growth hormone releasing hormone, mRNA (cDNA clone MGC:119780 IMAGE:40014060), complete cds. // chr20 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// BC099727 // GenBank // Homo sapiens growth hormone releasing hormone, mRNA (cDNA clone MGC:119781 IMAGE:40014061), complete cds. // chr20 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// X00094 // GenBank // Human mRNA for growth hormone-releasing factor (hpGRF). // chr20 // 88 // 93 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000020261 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:37242980:37269535:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0
ENST00000362813 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:37975156:37975481:-1 gene:ENSG00000199683 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr20 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONHSAT079636 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr20 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_014657 // RefSeq // Homo sapiens TELO2 interacting protein 1 (TTI1), mRNA. // chr20 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000373447 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:37983007:38033468:-1 gene:ENSG00000101407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000373448 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:37983007:38033461:-1 gene:ENSG00000101407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000449821 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:20:37983022:38013903:-1 gene:ENSG00000101407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000473288 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:37996375:38000515:-1 gene:ENSG00000101407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr20 // 100 // 21 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000487362 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:20:38011808:38013857:-1 gene:ENSG00000101407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr20 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0 /// BC013121 // GenBank // Homo sapiens KIAA0406, mRNA (cDNA clone MGC:5207 IMAGE:2901089), complete cds. // chr20 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// BC013755 // GenBank // Homo sapiens KIAA0406, mRNA (cDNA clone MGC:21430 IMAGE:4510329), complete cds. // chr20 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000003023 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:37983456:38013816:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// NONHSAT079637 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr20 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0
NONHSAT079638 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000580912 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:38098414:38098700:-1 gene:ENSG00000264767 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT079641 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001029864 // RefSeq // Homo sapiens KIAA1755 (KIAA1755), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000279024 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:38210488:38260772:-1 gene:ENSG00000149633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000484362 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:38212472:38223144:-1 gene:ENSG00000149633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr20 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000487506 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:38212476:38218105:-1 gene:ENSG00000149633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr20 // 100 // 39 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000496900 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:20:38225549:38260772:-1 gene:ENSG00000149633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 39 // 11 // 11 // 0 /// AK096202 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ38883 fis, clone MESAN2016409. // chr20 // 100 // 39 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000460881 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:38212472:38218183:-1 gene:ENSG00000149633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr20 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1 /// BC033704 // GenBank HTC // Homo sapiens, clone IMAGE:4154500, mRNA. // chr20 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1 /// GENSCAN00000003031 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:38130219:38255922:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1 /// NONHSAT079643 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr20 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
ENST00000362582 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:20:38421647:38421774:-1 gene:ENSG00000277034 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA gene:ENSG00000196756 // chr20 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000414142 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:38420593:38435273:-1 gene:ENSG00000196756 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC012894 // GenBank HTC // Homo sapiens hypothetical LOC388796, mRNA (cDNA clone IMAGE:4155833), with apparent retained intron. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT079661 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT079663 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NR_002910 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 71B (SNORA71B), small nucleolar RNA. // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000364546 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:38425198:38425331:-1 gene:ENSG00000273718 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA gene:ENSG00000235408 // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000439232 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:38425195:38425330:-1 gene:ENSG00000235408 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BX640887 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686B0328 (from clone DKFZp686B0328). // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT079665 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NR_002911 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 71A (SNORA71A), small nucleolar RNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000364729 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:38427309:38427442:-1 gene:ENSG00000225091 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr20 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT079666 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_003017 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 71C (SNORA71C), small nucleolar RNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000364642 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:38429670:38429803:-1 gene:ENSG00000201512 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT079667 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_003018 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 71D (SNORA71D), small nucleolar RNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000363484 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:38433865:38433998:-1 gene:ENSG00000200354 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr20 // 52 // 100 // 13 // 25 // 0 /// NONHSAT079669 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000620379 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:20:39349094:39349392:-1 gene:ENSG00000275337 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr20 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT079716 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr20 // 90 // 100 // 19 // 21 // 0
NM_005461 // RefSeq // Homo sapiens v-maf avian musculoaponeurotic fibrosarcoma oncogene homolog B (MAFB), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000373313 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:40685848:40689240:-1 gene:ENSG00000204103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF134157 // GenBank // Homo sapiens MAFB/Kreisler basic region/leucine zipper transcription factor (MAFB) mRNA, complete cds. // chr20 // 93 // 87 // 25 // 27 // 0 /// BC028098 // GenBank // Homo sapiens v-maf musculoaponeurotic fibrosarcoma oncogene homolog B (avian), mRNA (cDNA clone MGC:39981 IMAGE:5242606), complete cds. // chr20 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0 /// BC036689 // GenBank // Homo sapiens v-maf musculoaponeurotic fibrosarcoma oncogene homolog B (avian), mRNA (cDNA clone MGC:43127 IMAGE:5261053), complete cds. // chr20 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000001956 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:40687879:40699394:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
ENST00000458857 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:40854119:40854229:-1 gene:ENSG00000238908 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT079745 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AF090938 // GenBank // Homo sapiens clone HQ0628 PRO0628 mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENST00000584065 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:41290280:41290577:-1 gene:ENSG00000263989 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr20 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT079792 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr20 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_052846 // RefSeq // Homo sapiens elastin microfibril interfacer 3 (EMILIN3), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000332312 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:41359966:41366827:-1 gene:ENSG00000183798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// BC101043 // GenBank // Homo sapiens elastin microfibril interfacer 3, mRNA (cDNA clone MGC:119498 IMAGE:40007928), complete cds. // chr20 // 96 // 73 // 23 // 24 // 0 /// BC101045 // GenBank // Homo sapiens elastin microfibril interfacer 3, mRNA (cDNA clone MGC:119500 IMAGE:40007932), complete cds. // chr20 // 96 // 73 // 23 // 24 // 0 /// BC101046 // GenBank // Homo sapiens elastin microfibril interfacer 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:40007933), complete cds. // chr20 // 58 // 58 // 19 // 33 // 1 /// GENSCAN00000001951 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:41360902:41366634:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0
NM_032221 // RefSeq // Homo sapiens chromodomain helicase DNA binding protein 6 (CHD6), mRNA. // chr20 // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// XM_005260575 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chromodomain helicase DNA binding protein 6 (CHD6), transcript variant X3, mRNA. // chr20 // 100 // 87 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000309279 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:20:41437262:41499317:-1 gene:ENSG00000124177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 30 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000373222 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:41496809:41618375:-1 gene:ENSG00000124177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 19 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000373233 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:41402101:41618494:-1 gene:ENSG00000124177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// ENST00000440697 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:41426142:41499317:-1 gene:ENSG00000124177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 30 // 14 // 14 // 0 /// AF525085 // GenBank // Homo sapiens RIGB (RIGB) mRNA, complete cds. // chr20 // 93 // 30 // 13 // 14 // 0 /// AK026022 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ22369 fis, clone HRC06676. // chr20 // 100 // 34 // 16 // 16 // 0 /// AY034072 // GenBank // Homo sapiens chromodomain helicase DNA binding protein 5 (CHD5) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// BC040016 // GenBank HTC // Homo sapiens chromodomain helicase DNA binding protein 6, mRNA (cDNA clone IMAGE:5495304), with apparent retained intron. // chr20 // 100 // 19 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000001968 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:41404593:41533537:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 91 // 43 // 43 // 0
ENST00000516577 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:41684986:41685091:-1 gene:ENSG00000252386 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT079798 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONHSAT079799 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000384271 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:20:43451159:43451260:-1 gene:ENSG00000206998 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr20 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT079820 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_001008901 // RefSeq // Homo sapiens gametocyte specific factor 1-like (GTSF1L), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// NM_176791 // RefSeq // Homo sapiens gametocyte specific factor 1-like (GTSF1L), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000373003 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:43726164:43726998:-1 gene:ENSG00000124196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000373005 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:43726164:43726697:-1 gene:ENSG00000124196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// BC040049 // GenBank // Homo sapiens gametocyte specific factor 1-like, mRNA (cDNA clone MGC:50820 IMAGE:5744556), complete cds. // chr20 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000045044 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:43726248:43777601:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 63 // 63 // 19 // 30 // 1
ENST00000384074 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:43796437:43796543:-1 gene:ENSG00000206801 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr20 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT079839 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_020433 // RefSeq // Homo sapiens junctophilin 2 (JPH2), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// NM_175913 // RefSeq // Homo sapiens junctophilin 2 (JPH2), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 44 // 16 // 16 // 0 /// XM_006723833 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens junctophilin 2 (JPH2), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 33 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000342272 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:44176817:44187093:-1 gene:ENSG00000149596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 36 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000372980 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:44111695:44187578:-1 gene:ENSG00000149596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// AK304863 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51473 complete cds, highly similar to Junctophilin-2. // chr20 // 100 // 44 // 16 // 16 // 0 /// XM_006723832 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens junctophilin 2 (JPH2), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 78 // 78 // 28 // 36 // 1 /// GENSCAN00000045033 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:44114796:44186705:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 53 // 19 // 19 // 0
NM_016470 // RefSeq // Homo sapiens oxidative stress responsive serine-rich 1 (OSER1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006723803 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens oxidative stress responsive serine-rich 1 (OSER1), transcript variant X3, mRNA. // chr20 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000255174 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:44196496:44210791:-1 gene:ENSG00000132823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000372970 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:44196496:44210076:-1 gene:ENSG00000132823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AK000476 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ20469 fis, clone KAT06801. // chr20 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC064973 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 111, mRNA (cDNA clone MGC:74539 IMAGE:6151501), complete cds. // chr20 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000045048 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:44197052:44206957:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// BC018328 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3859994, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr20 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// BC013692 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3882225, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr20 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_001080472 // RefSeq // Homo sapiens fat storage-inducing transmembrane protein 2 (FITM2), mRNA. // chr20 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000396825 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:44302838:44311169:-1 gene:ENSG00000197296 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC130446 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 142, mRNA (cDNA clone MGC:163318 IMAGE:40146477), complete cds. // chr20 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// BC136640 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 142, mRNA (cDNA clone MGC:168253 IMAGE:9020630), complete cds. // chr20 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000045040 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:44306625:44311148:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_001287807 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 62 (C20orf62), mRNA. // chr20 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000306731 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:20:44451984:44465328:-1 gene:ENSG00000168746 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000372910 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:20:44461763:44465344:-1 gene:ENSG00000168746 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC030259 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 62, mRNA (cDNA clone IMAGE:5163284). // chr20 // 86 // 78 // 18 // 21 // 0
NR_034104 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 1260 (LINC01260), long non-coding RNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000255183 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:44656451:44663498:-1 gene:ENSG00000132832 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr20 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000415889 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:44656451:44696096:-1 gene:ENSG00000132832 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK090842 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ33523 fis, clone BRAMY2006411. // chr20 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONHSAT079894 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr20 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONHSAT079896 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT079897 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT079898 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr20 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT079899 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT147167 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr20 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT079903 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr20 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONHSAT079904 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr20 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001205317 // RefSeq // Homo sapiens regulating synaptic membrane exocytosis 4 (RIMS4), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_182970 // RefSeq // Homo sapiens regulating synaptic membrane exocytosis 4 (RIMS4), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000372851 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:44751808:44810338:-1 gene:ENSG00000101098 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000541604 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:44755911:44810271:-1 gene:ENSG00000101098 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 96 // 77 // 22 // 23 // 0 /// AY326954 // GenBank // Homo sapiens RIM4 gamma mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000034177 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:44756134:44842491:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1
NONHSAT079919 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr20 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_145652 // RefSeq // Homo sapiens WAP four-disulfide core domain 5 (WFDC5), mRNA. // chr20 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000307971 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:45109452:45115162:-1 gene:ENSG00000175121 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000372789 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:45109452:45115172:-1 gene:ENSG00000175121 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// AY038181 // GenBank // Homo sapiens probable protease inhibitor WAP1 precursor, mRNA, complete cds. // chr20 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// AY358822 // GenBank // Homo sapiens clone DNA119525 WFDC5 (UNQ3036) mRNA, complete cds. // chr20 // 92 // 96 // 23 // 25 // 0 /// BC039173 // GenBank // Homo sapiens WAP four-disulfide core domain 5, mRNA (cDNA clone MGC:21441 IMAGE:4755260), complete cds. // chr20 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0
NM_080869 // RefSeq // Homo sapiens WAP four-disulfide core domain 12 (WFDC12), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000372785 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:45123425:45124465:-1 gene:ENSG00000168703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY037803 // GenBank // Homo sapiens putative protease inhibitor WAP2 precursor (WAP2) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY358678 // GenBank // Homo sapiens clone DNA59838 WFDC12 (UNQ544) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034166 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:45094870:45124447:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_003064 // RefSeq // Homo sapiens secretory leukocyte peptidase inhibitor (SLPI), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000338380 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:45252239:45254564:-1 gene:ENSG00000124107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF114471 // GenBank // Homo sapiens secretory leukocyte proteinase inhibitor precursor, mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// BC020708 // GenBank // Homo sapiens secretory leukocyte peptidase inhibitor, mRNA (cDNA clone MGC:22479 IMAGE:4733996), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000034164 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:45230747:45254543:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0
NM_002999 // RefSeq // Homo sapiens syndecan 4 (SDC4), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000372733 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:45325288:45348424:-1 gene:ENSG00000124145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK303964 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50358 complete cds, highly similar to Syndecan-4 precursor. // chr20 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// BC030805 // GenBank // Homo sapiens syndecan 4, mRNA (cDNA clone MGC:22217 IMAGE:4690309), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// CR542045 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834B0436D for gene SDC4, syndecan 4 (amphiglycan, ryudocan); complete cds, without stopcodon. // chr20 // 95 // 74 // 19 // 20 // 0 /// CR542074 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834F0836D for gene SDC4, syndecan 4 (amphiglycan, ryudocan); complete cds, incl. stopcodon. // chr20 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// D13292 // GenBank // Homo sapiens mRNA for ryudocan core protein, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB795241 // GenBank // Homo sapiens SDC4-ROS1_S4;R32 mRNA for SDC4-ROS1_S4;R32 fusion protein, complete cds. // chr20 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// AB795242 // GenBank // Homo sapiens SDC4-ROS1_S4;R34 mRNA for SDC4-ROS1_S4;R34 fusion protein, complete cds. // chr20 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// AB795240 // GenBank // Homo sapiens SDC4-ROS1_S2;R32 mRNA for SDC4-ROS1_S2;R32 fusion protein, complete cds. // chr20 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// GENSCAN00000034160 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:45327264:45348384:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0
AF305815 // GenBank HTC // Homo sapiens PRO0433 mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_006652 // RefSeq // Homo sapiens serine peptidase inhibitor, Kunitz type, 3 (SPINT3), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000217428 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:45512461:45515624:-1 gene:ENSG00000101446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY372172 // GenBank // Homo sapiens serine protease inhibitor Kunitz type 3 (SPINT3) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000034170 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:45512651:45588966:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_080827 // RefSeq // Homo sapiens WAP four-disulfide core domain 6 (WFDC6), mRNA. // chr20 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000372665 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:20:45535158:45539407:-1 gene:ENSG00000243543 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000372670 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:45534196:45539495:-1 gene:ENSG00000243543 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// AF411861 // GenBank // Homo sapiens probable protease inhibitor WAP6 precursor, mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// BC101600 // GenBank // Homo sapiens WAP four-disulfide core domain 6, mRNA (cDNA clone MGC:126649 IMAGE:8069106), complete cds. // chr20 // 96 // 77 // 22 // 23 // 0 /// BC101604 // GenBank // Homo sapiens WAP four-disulfide core domain 6, mRNA (cDNA clone MGC:126653 IMAGE:8069110), complete cds. // chr20 // 96 // 77 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000034170 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:45512651:45588966:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
NM_130896 // RefSeq // Homo sapiens WAP four-disulfide core domain 8 (WFDC8), transcript variant a, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000289953 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:45551762:45579326:-1 gene:ENSG00000158901 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF492015 // GenBank // Homo sapiens probable protease inhibitor splice variant WAP8a precursor, mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_181510 // RefSeq // Homo sapiens WAP four-disulfide core domain 8 (WFDC8), transcript variant b, mRNA. // chr20 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// ENST00000357199 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:45551153:45579326:-1 gene:ENSG00000158901 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// AF492016 // GenBank // Homo sapiens probable protease inhibitor splice variant WAP8b precursor, mRNA, complete cds. // chr20 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// GENSCAN00000034170 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:45512651:45588966:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
ENST00000365053 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:45559758:45559876:-1 gene:ENSG00000201923 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT079970 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_147198 // RefSeq // Homo sapiens WAP four-disulfide core domain 9 (WFDC9), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000326000 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:45607939:45631268:-1 gene:ENSG00000180205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY047610 // GenBank // Homo sapiens putative protease inhibitor WAP9 precursor, mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC069295 // GenBank // Homo sapiens WAP four-disulfide core domain 9, mRNA (cDNA clone MGC:97395 IMAGE:7262671), complete cds. // chr20 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// BC101652 // GenBank // Homo sapiens WAP four-disulfide core domain 9, mRNA (cDNA clone MGC:126701 IMAGE:8069158), complete cds. // chr20 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// BC101656 // GenBank // Homo sapiens WAP four-disulfide core domain 9, mRNA (cDNA clone MGC:126705 IMAGE:8069162), complete cds. // chr20 // 93 // 52 // 13 // 14 // 0
ENST00000447334 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:45640486:45641370:-1 gene:ENSG00000235508 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr20 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000021757 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:45640489:45641316:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0
NM_147197 // RefSeq // Homo sapiens WAP four-disulfide core domain 11 (WFDC11), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000324384 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:45648564:45670239:-1 gene:ENSG00000180083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000356562 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:45648563:45670270:-1 gene:ENSG00000180083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AY047609 // GenBank // Homo sapiens putative protease inhibitor WAP11 precursor, mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC062670 // GenBank // Homo sapiens WAP four-disulfide core domain 11, mRNA (cDNA clone MGC:71905 IMAGE:6101449), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000618797 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:20:45648563:45667177:-1 gene:ENSG00000180083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_172006 // RefSeq // Homo sapiens WAP four-disulfide core domain 10B (WFDC10B), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NM_172131 // RefSeq // Homo sapiens WAP four-disulfide core domain 10B (WFDC10B), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000330523 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:45684653:45705019:-1 gene:ENSG00000182931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000335769 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:45684653:45705019:-1 gene:ENSG00000182931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// AF454506 // GenBank // Homo sapiens probable protease inhibitor WAP12a precursor, mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AF454507 // GenBank // Homo sapiens probable protease inhibitor WAP12b precursor, mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// BC121071 // GenBank // Homo sapiens WAP four-disulfide core domain 10B, mRNA (cDNA clone MGC:150335 IMAGE:40119593), complete cds. // chr20 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// BC121072 // GenBank // Homo sapiens WAP four-disulfide core domain 10B, mRNA (cDNA clone MGC:150336 IMAGE:40119597), complete cds. // chr20 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0
NM_003279 // RefSeq // Homo sapiens troponin C type 2 (fast) (TNNC2), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000372555 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:45823214:45827341:-1 gene:ENSG00000101470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000372557 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:45823214:45833745:-1 gene:ENSG00000101470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AK291323 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76408 complete cds, highly similar to Homo sapiens troponin C type 2 (fast) (TNNC2), mRNA. // chr20 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// BC005323 // GenBank // Homo sapiens troponin C type 2 (fast), mRNA (cDNA clone MGC:12407 IMAGE:3934188), complete cds. // chr20 // 88 // 100 // 28 // 32 // 0 /// CR541864 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834H0832D for gene TNNC2, troponin C2, fast; complete cds, incl. stopcodon. // chr20 // 95 // 63 // 19 // 20 // 0 /// CR541884 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834D0533D for gene TNNC2, troponin C2, fast; complete cds, without stopcodon. // chr20 // 85 // 63 // 17 // 20 // 0 /// M22307 // GenBank // Human (clone PWTNC4) skeletal muscle troponin C mRNA, complete cds. // chr20 // 81 // 100 // 26 // 32 // 0 /// AK300665 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55420 complete cds, highly similar to Troponin C, skeletal muscle. // chr20 // 53 // 53 // 17 // 32 // 1 /// GENSCAN00000021755 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:45823348:45827248:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// BX649077 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp779C2156 (from clone DKFZp779C2156). // chr20 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1