NM_030581 // RefSeq // Homo sapiens WD repeat domain 59 (WDR59), mRNA. // chr16 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000262144 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:74871367:74985148:-1 gene:ENSG00000103091 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000536050 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:74912005:74984826:-1 gene:ENSG00000103091 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 42 // 14 // 14 // 0 /// AF370390 // GenBank HTC // Homo sapiens FP977 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// AK022332 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ12270 fis, clone MAMMA1001649. // chr16 // 100 // 42 // 14 // 14 // 0 /// AK302557 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54513 complete cds, highly similar to Homo sapiens WD repeat domain 59 (WDR59), mRNA. // chr16 // 100 // 42 // 14 // 14 // 0 /// BC004519 // GenBank // Homo sapiens WD repeat domain 59, mRNA (cDNA clone MGC:11230 IMAGE:3938206), complete cds. // chr16 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000616369 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:74908733:74985083:-1 gene:ENSG00000103091 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000026644 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:74863792:74985017:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0
NM_153486 // RefSeq // Homo sapiens lactate dehydrogenase D (LDHD), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_194436 // RefSeq // Homo sapiens lactate dehydrogenase D (LDHD), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000300051 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:75111860:75116767:-1 gene:ENSG00000166816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000450168 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:75111896:75116771:-1 gene:ENSG00000166816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000569876 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:75114526:75116755:-1 gene:ENSG00000166816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// AY092767 // GenBank // Homo sapiens D-lactate dehydrogenase mRNA, complete cds. // chr16 // 89 // 93 // 25 // 28 // 0 /// BC040279 // GenBank // Homo sapiens lactate dehydrogenase D, mRNA (cDNA clone MGC:34649 IMAGE:5162826), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC047902 // GenBank // Homo sapiens lactate dehydrogenase D, mRNA (cDNA clone MGC:57726 IMAGE:5762691), complete cds. // chr16 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000568164 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:75114504:75115592:-1 gene:ENSG00000166816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1 /// GENSCAN00000026654 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:75112356:75161410:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
NM_021615 // RefSeq // Homo sapiens carbohydrate (N-acetylglucosamine 6-O) sulfotransferase 6 (CHST6), mRNA. // chr16 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000332272 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:75472052:75495028:-1 gene:ENSG00000183196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000390664 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:75478428:75495384:-1 gene:ENSG00000183196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// AF280086 // GenBank // Homo sapiens N-acetylglucosamine 6-O-sulfotransferase GST-4beta mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// BC074834 // GenBank // Homo sapiens carbohydrate (N-acetylglucosamine 6-O) sulfotransferase 6, mRNA (cDNA clone MGC:104095 IMAGE:30915547), complete cds. // chr16 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// BC074883 // GenBank // Homo sapiens carbohydrate (N-acetylglucosamine 6-O) sulfotransferase 6, mRNA (cDNA clone MGC:103859 IMAGE:30915241), complete cds. // chr16 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000007544 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:75478641:75479828:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// AF219990 // GenBank // Homo sapiens corneal N-acetylglucosamine-6-O-sulfotransferase (CHST6) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
NM_024533 // RefSeq // Homo sapiens carbohydrate (N-acetylglucosamine 6-O) sulfotransferase 5 (CHST5), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000336257 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:75528535:75535170:-1 gene:ENSG00000135702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// AF246718 // GenBank // Homo sapiens intestinal GlcNAc-6-sulfotransferase (CHST5) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr16 // 86 // 100 // 12 // 14 // 0 /// AF176838 // GenBank // Homo sapiens intestine N-acetylglucosamine 6-O-sulfotransferase (I-GlcNAc-6-ST) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 64 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000460606 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:75528532:75545428:-1 gene:ENSG00000260092 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 64 // 64 // 9 // 14 // 1
ENST00000474110 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:75698531:75698816:-1 gene:ENSG00000240199 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT143761 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_199355 // RefSeq // Homo sapiens ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 18 (ADAMTS18), mRNA. // chr16 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000282849 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:77282128:77435114:-1 gene:ENSG00000140873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000449265 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:77355951:77435034:-1 gene:ENSG00000140873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 92 // 40 // 11 // 12 // 0 /// AJ311903 // GenBank // Homo sapiens mRNA for ADAMTS18 protein (ADAMTS18 gene). // chr16 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// AK293831 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60448 complete cds, highly similar to ADAMTS-18 precursor (EC 3.4.24.-) (Adisintegrin and metalloproteinase with thrombospondin motifs 18). // chr16 // 92 // 40 // 11 // 12 // 0 /// BC063283 // GenBank // Homo sapiens ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 18, mRNA (cDNA clone MGC:71557 IMAGE:30343625), complete cds. // chr16 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000029304 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:77279960:77367698:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0
GENSCAN00000030907 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:78511260:78597449:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 87 // 92 // 20 // 23 // 0 /// AF116601 // GenBank HTC // Homo sapiens PRO0128 mRNA, complete cds. // chr16 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
NM_001031804 // RefSeq // Homo sapiens v-maf avian musculoaponeurotic fibrosarcoma oncogene homolog (MAF), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_005360 // RefSeq // Homo sapiens v-maf avian musculoaponeurotic fibrosarcoma oncogene homolog (MAF), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000326043 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:79593838:79600714:-1 gene:ENSG00000178573 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000393350 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:79594331:79600714:-1 gene:ENSG00000178573 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000569649 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:16:79585843:79599902:-1 gene:ENSG00000178573 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// AF055376 // GenBank // Homo sapiens short form transcription factor C-MAF (c-maf) mRNA, complete cds. // chr16 // 95 // 63 // 19 // 20 // 0 /// AF055377 // GenBank // Homo sapiens long form transcription factor C-MAF (c-maf) mRNA, complete cds. // chr16 // 95 // 69 // 21 // 22 // 0 /// BC081542 // GenBank // Homo sapiens v-maf musculoaponeurotic fibrosarcoma oncogene homolog (avian), mRNA (cDNA clone MGC:71685 IMAGE:30347784), complete cds. // chr16 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000045286 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:79590288:79613839:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0
NM_001100873 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 16 open reading frame 46 (C16orf46), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NM_152337 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 16 open reading frame 46 (C16orf46), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000299578 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:81060980:81077244:-1 gene:ENSG00000166455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000378611 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:81053497:81077213:-1 gene:ENSG00000166455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// BC064143 // GenBank // Homo sapiens chromosome 16 open reading frame 46, mRNA (cDNA clone MGC:75427 IMAGE:30389327), complete cds. // chr16 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// AK295411 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50770 complete cds. // chr16 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// ENST00000444657 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:81061710:81077267:-1 gene:ENSG00000166455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// GENSCAN00000006692 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:81046105:81063955:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 92 // 50 // 12 // 13 // 0 /// NONHSAT143934 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
AF220234 // GenBank // Homo sapiens FGF-2 activity-associated protein 2 (GAFA2) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_145168 // RefSeq // Homo sapiens short chain dehydrogenase/reductase family 42E, member 1 (SDR42E1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000328945 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:81988855:82011488:-1 gene:ENSG00000184860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000532128 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:81999699:82011481:-1 gene:ENSG00000184860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 91 // 39 // 10 // 11 // 0 /// ENST00000534209 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:81999755:82011465:-1 gene:ENSG00000184860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// BC019670 // GenBank // Homo sapiens short chain dehydrogenase/reductase family 42E, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:25141 IMAGE:4517213), complete cds. // chr16 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000041035 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:81999111:82019752:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 39 // 11 // 11 // 0
NM_001080442 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 38, member 8 (SLC38A8), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000299709 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:84009784:84042157:-1 gene:ENSG00000166558 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000568178 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:84022794:84042636:-1 gene:ENSG00000166558 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 73 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000044207 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:84009784:84101783:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENST00000362480 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:84039918:84040033:-1 gene:ENSG00000199350 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr16 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT144033 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0
NM_003791 // RefSeq // Homo sapiens membrane-bound transcription factor peptidase, site 1 (MBTPS1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000343411 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:84053766:84116906:-1 gene:ENSG00000140943 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000570064 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:84053766:84075433:-1 gene:ENSG00000140943 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// AK091212 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ33893 fis, clone CTONG2007681, highly similar to Membrane-bound transcription factor site 1 protease precursor (EC 3.4.21.-). // chr16 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// AK291773 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78678 complete cds, highly similar to Homo sapiens membrane-bound transcription factor peptidase, site 1 (MBTPS1), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// AK299067 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58156 complete cds, highly similar to Membrane-bound transcription factor site 1 protease precursor (EC 3.4.21.-). // chr16 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC114555 // GenBank // Homo sapiens membrane-bound transcription factor peptidase, site 1, transcript variant 1, mRNA (cDNA clone MGC:138712 IMAGE:40054075), complete cds. // chr16 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC114961 // GenBank // Homo sapiens membrane-bound transcription factor peptidase, site 1, mRNA (cDNA clone MGC:138711 IMAGE:40054074), complete cds. // chr16 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000044207 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:84009784:84101783:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
ENST00000536986 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:84192558:84197053:-1 gene:ENSG00000250685 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr16 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000561900 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:84194177:84194714:-1 gene:ENSG00000250685 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr16 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000565643 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:84192558:84197053:-1 gene:ENSG00000250685 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr16 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// AK095331 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ38012 fis, clone CTONG2012554. // chr16 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// AK123582 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ41588 fis, clone CTONG2020806. // chr16 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// DQ323994 // GenBank // Homo sapiens SFPQ mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr16 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// NONHSAT144052 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr16 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONHSAT144053 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr16 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONHSAT144054 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr16 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0
ENST00000568181 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:84235408:84239750:-1 gene:ENSG00000168418 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// BC008969 // GenBank // Homo sapiens potassium voltage-gated channel, subfamily G, member 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:3028985), complete cds. // chr16 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// NM_172347 // RefSeq // Homo sapiens potassium voltage-gated channel, subfamily G, member 4 (KCNG4), mRNA. // chr16 // 79 // 79 // 23 // 29 // 1 /// ENST00000308251 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:84218667:84239698:-1 gene:ENSG00000168418 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1 /// AF348984 // GenBank // Homo sapiens voltage-gated potassium channel Kv6.3 mRNA, complete cds. // chr16 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1 /// AF450108 // GenBank // Homo sapiens voltage-gated potassium channel subunit Kv6.3 mRNA, complete cds. // chr16 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1 /// BC109203 // GenBank // Homo sapiens potassium voltage-gated channel, subfamily G, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:129609 IMAGE:40005993), complete cds. // chr16 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1 /// GENSCAN00000044202 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:84222217:84252136:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0
ENST00000364491 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:84262815:84262928:-1 gene:ENSG00000201361 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT144059 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_198491 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 92, member B (FAM92B), mRNA. // chr16 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// ENST00000539556 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:85098358:85112508:-1 gene:ENSG00000153789 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC093665 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 92, member B, mRNA (cDNA clone MGC:120700 IMAGE:7939510), complete cds. // chr16 // 89 // 64 // 16 // 18 // 0 /// BC111944 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 92, member B, mRNA (cDNA clone MGC:138149 IMAGE:8327412), complete cds. // chr16 // 78 // 64 // 14 // 18 // 0 /// GENSCAN00000027139 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:85098535:85151711:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// ENST00000618669 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:85098370:85108071:-1 gene:ENSG00000153789 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_016095 // RefSeq // Homo sapiens GINS complex subunit 2 (Psf2 homolog) (GINS2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000253462 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:85676198:85688999:-1 gene:ENSG00000131153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// AF151880 // GenBank // Homo sapiens CGI-122 protein mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// AF201939 // GenBank // Homo sapiens DC5 (DC5) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// AK091519 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ34200 fis, clone FCBBF3019663. // chr16 // 100 // 68 // 13 // 13 // 0 /// BC003186 // GenBank // Homo sapiens GINS complex subunit 2 (Psf2 homolog), mRNA (cDNA clone MGC:673 IMAGE:3503268), complete cds. // chr16 // 84 // 100 // 16 // 19 // 0 /// BC010164 // GenBank // Homo sapiens GINS complex subunit 2 (Psf2 homolog), mRNA (cDNA clone MGC:19836 IMAGE:4098007), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC062444 // GenBank // Homo sapiens GINS complex subunit 2 (Psf2 homolog), mRNA (cDNA clone MGC:72118 IMAGE:6710847), complete cds. // chr16 // 84 // 100 // 16 // 19 // 0 /// CR457186 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834H038D for gene Pfs2, DNA replication complex GINS protein PSF2; complete cds, incl. stopcodon. // chr16 // 75 // 63 // 9 // 12 // 0 /// GENSCAN00000018233 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:85678212:85767505:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 63 // 63 // 12 // 19 // 1
ENST00000602583 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:16:85707517:85710850:-1 gene:ENSG00000154102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000602766 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:16:85707654:85751112:-1 gene:ENSG00000154102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// BC009078 // GenBank HTC // Homo sapiens chromosome 16 open reading frame 74, mRNA (cDNA clone IMAGE:3855543), with apparent retained intron. // chr16 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NM_206967 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 16 open reading frame 74 (C16orf74), mRNA. // chr16 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// XM_006721191 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chromosome 16 open reading frame 74 (C16orf74), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// ENST00000284245 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:85707517:85751091:-1 gene:ENSG00000154102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// ENST00000602675 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:16:85707517:85750951:-1 gene:ENSG00000154102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// ENST00000602914 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:16:85707532:85751105:-1 gene:ENSG00000154102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// ENST00000602719 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:16:85690170:85751129:-1 gene:ENSG00000154102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// GENSCAN00000018233 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:85678212:85767505:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
ENST00000516502 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:85781775:85781899:-1 gene:ENSG00000252311 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 94 // 70 // 15 // 16 // 0 /// NONHSAT144144 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 94 // 70 // 15 // 16 // 0
ENST00000363079 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:16:86275429:86275523:-1 gene:ENSG00000199949 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT144186 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000600892 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:86331844:86337556:-1 gene:ENSG00000168367 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr16 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// AL137562 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp434O0320 (from clone DKFZp434O0320). // chr16 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// NONHSAT144192 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// NONHSAT144196 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 80 // 100 // 4 // 5 // 0 /// TCONS_00024277-XLOC_012045 // Rinn lincRNA // linc-COX4NB-6 chr16:-:86365455-86371167 // chr16 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0
NM_001195124 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 16 open reading frame 95 (C16orf95), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NM_001195125 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 16 open reading frame 95 (C16orf95), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NM_001256917 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 16 open reading frame 95 (C16orf95), transcript variant 3, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000253461 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:87302814:87317416:-1 gene:ENSG00000260456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000565212 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:87302814:87306125:-1 gene:ENSG00000260456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 50 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000567970 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:87302884:87317380:-1 gene:ENSG00000260456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000568879 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:87302876:87334273:-1 gene:ENSG00000131152 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000618367 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:16:87302801:87317420:-1 gene:ENSG00000260456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT144271 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 100 // 50 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000038315 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:87242671:87317193:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 78 // 78 // 14 // 18 // 1
NM_015144 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, CCHC domain containing 14 (ZCCHC14), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000268616 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:87406246:87492045:-1 gene:ENSG00000140948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000561928 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:87411412:87433134:-1 gene:ENSG00000140948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 52 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000568020 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:87406257:87491859:-1 gene:ENSG00000140948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// AB030243 // GenBank // Homo sapiens mRNA for BDG-29, complete cds. // chr16 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// AK289682 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75992 complete cds, highly similar to Homo sapiens zinc finger, CCHC domain containing 14 (ZCCHC14), mRNA. // chr16 // 100 // 70 // 16 // 16 // 0 /// AL117532 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp434E192 (from clone DKFZp434E192); partial cds. // chr16 // 100 // 52 // 12 // 12 // 0 /// BC101478 // GenBank // Homo sapiens zinc finger, CCHC domain containing 14, mRNA (cDNA clone MGC:126527 IMAGE:8068984), complete cds. // chr16 // 100 // 70 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000041121 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:87410280:87426611:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 48 // 11 // 11 // 0
NM_001739 // RefSeq // Homo sapiens carbonic anhydrase VA, mitochondrial (CA5A), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000309893 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:87881546:87936516:-1 gene:ENSG00000174990 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC137405 // GenBank // Homo sapiens carbonic anhydrase VA, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:169026 IMAGE:9021403), complete cds. // chr16 // 100 // 78 // 7 // 7 // 0 /// BC137411 // GenBank // Homo sapiens carbonic anhydrase VA, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:169032 IMAGE:9021409), complete cds. // chr16 // 100 // 78 // 7 // 7 // 0 /// L19297 // GenBank // Human nuclear-encoded mitochondrial carbonic anhydrase (CA5) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_178310 // RefSeq // Homo sapiens snail family zinc finger 3 (SNAI3), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000332281 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:88677682:88686493:-1 gene:ENSG00000185669 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC041461 // GenBank // Homo sapiens, Similar to snail homolog 3 (Drosophila), clone IMAGE:5209145, mRNA, partial cds. // chr16 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// BC107058 // GenBank // Homo sapiens snail homolog 3 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:129606 IMAGE:40005947), complete cds. // chr16 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_005256310 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens snail family zinc finger 3 (SNAI3), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// GENSCAN00000011667 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:88678448:88706325:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_152339 // RefSeq // Homo sapiens spermatogenesis associated 2-like (SPATA2L), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000289805 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:89696343:89701695:-1 gene:ENSG00000158792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000569918 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:89698068:89701640:-1 gene:ENSG00000158792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// BC039608 // GenBank // Homo sapiens spermatogenesis associated 2-like, mRNA (cDNA clone MGC:48943 IMAGE:5248678), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC053588 // GenBank // Homo sapiens spermatogenesis associated 2-like, mRNA (cDNA clone MGC:61628 IMAGE:5245683), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000335360 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:89696357:89701705:-1 gene:ENSG00000158792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// BC027606 // GenBank // Homo sapiens spermatogenesis associated 2-like, mRNA (cDNA clone IMAGE:4827501), complete cds. // chr16 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// GENSCAN00000033824 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:89697334:89720861:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_004913 // RefSeq // Homo sapiens VPS9 domain containing 1 (VPS9D1), mRNA. // chr16 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000389386 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:89707134:89720986:-1 gene:ENSG00000075399 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000561976 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:89707134:89719369:-1 gene:ENSG00000075399 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000563798 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:89711393:89720885:-1 gene:ENSG00000075399 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000565023 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:16:89707784:89710642:-1 gene:ENSG00000075399 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 92 // 35 // 11 // 12 // 0 /// AB018551 // GenBank // Homo sapiens ATPBL mRNA for coiled-coil protein, complete cds. // chr16 // 91 // 97 // 30 // 33 // 0 /// ENST00000568691 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:89710933:89713080:-1 gene:ENSG00000075399 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 32 // 32 // 11 // 34 // 1 /// ENST00000567379 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:89711359:89713040:-1 gene:ENSG00000075399 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1 /// ENST00000614968 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:16:89707134:89719369:-1 gene:ENSG00000075399 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000033824 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:89697334:89720861:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 79 // 79 // 27 // 34 // 1
NM_145039 // RefSeq // Homo sapiens CENPB DNA-binding domains containing 1 (CENPBD1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000314994 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:89969791:89972534:-1 gene:ENSG00000177946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC040698 // GenBank // Homo sapiens hypothetical protein MGC16385, mRNA (cDNA clone IMAGE:6155608). // chr16 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0
NR_122031 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 16 open reading frame 3 (C16orf3), long non-coding RNA. // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000408886 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:90028908:90029342:-1 gene:ENSG00000221819 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// AF050080 // GenBank // Homo sapiens C16orf3 small protein mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// AF050081 // GenBank // Homo sapiens C16orf3 large protein mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC093751 // GenBank // Homo sapiens chromosome 16 open reading frame 3, mRNA (cDNA clone MGC:120786 IMAGE:7939596), complete cds. // chr16 // 93 // 58 // 13 // 14 // 0 /// BC104849 // GenBank // Homo sapiens chromosome 16 open reading frame 3, mRNA (cDNA clone MGC:132509 IMAGE:8143852), complete cds. // chr16 // 93 // 58 // 13 // 14 // 0
NM_001098173 // RefSeq // Homo sapiens PR domain containing 7 (PRDM7), mRNA. // chr16 // 100 // 87 // 13 // 13 // 0 /// XM_005256275 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens PR domain containing 7 (PRDM7), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 85 // 87 // 11 // 13 // 0 /// ENST00000325921 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:90056566:90062325:-1 gene:ENSG00000126856 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 87 // 13 // 13 // 0 /// AF274348 // GenBank // Homo sapiens PR-domain zinc finger protein 7 isoform B (PRDM7) mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr16 // 92 // 87 // 12 // 13 // 0 /// AF274347 // GenBank // Homo sapiens PR-domain zinc finger protein 7 isoform A (PRDM7) mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr16 // 73 // 100 // 11 // 15 // 0 /// ENST00000449207 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:90057780:90075930:-1 gene:ENSG00000126856 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 67 // 67 // 10 // 15 // 1
NM_152338 // RefSeq // Homo sapiens zymogen granule protein 16 (ZG16), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000400752 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:29778240:29782973:1 gene:ENSG00000174992 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AB092813 // GenBank // Homo sapiens mRNA for ZG16p, complete cds. // chr16 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// AK125559 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ43571 fis, clone RECTM2000433, highly similar to Zymogen granule membrane protein 16 precursor. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC029149 // GenBank // Homo sapiens zymogen granule protein 16 homolog (rat), mRNA (cDNA clone MGC:34820 IMAGE:5187790), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC150656 // GenBank // Homo sapiens zymogen granule protein 16 homolog (rat), mRNA (cDNA clone MGC:183567 IMAGE:9057027), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000049729 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:29779267:29780419:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0
GENSCAN00000001345 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_1_CTG1:191957:241406:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 88 // 100 // 7 // 8 // 0 /// GENSCAN00000016888 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:206498:230349:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 63 // 5 // 5 // 0
NM_001013672 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 97 (C17orf97), mRNA. // chr17 // 88 // 100 // 21 // 24 // 0 /// ENST00000360127 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:410327:414666:1 gene:ENSG00000187624 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 88 // 100 // 21 // 24 // 0 /// AK128660 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ46819 fis, clone TSTOM2000235. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC057385 // GenBank // Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 97, mRNA (cDNA clone IMAGE:4826627), partial cds. // chr17 // 85 // 83 // 17 // 20 // 0 /// BC141806 // GenBank // Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 97, mRNA (cDNA clone MGC:164782 IMAGE:40147362), complete cds. // chr17 // 88 // 100 // 21 // 24 // 0 /// ENST00000491373 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:410361:414305:1 gene:ENSG00000187624 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1 /// GENSCAN00000016882 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:410343:414115:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 83 // 75 // 15 // 18 // 0
NR_024120 // RefSeq // Homo sapiens diazepam binding inhibitor-like 5, pseudogene (DBIL5P), non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000449830 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:752667:754888:1 gene:ENSG00000231784 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 65 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000536214 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:752660:755336:1 gene:ENSG00000231784 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// AF229804 // GenBank // Homo sapiens endozepine-like protein type 2 mutant mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT144755 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT144756 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 65 // 11 // 11 // 0 /// TCONS_l2_00011512-XLOC_l2_005613 // Broad TUCP // linc-GEMIN4-BP chr17:+:655906-658128 // chr17 // 100 // 65 // 11 // 11 // 0
NM_018146 // RefSeq // Homo sapiens RNA methyltransferase like 1 (RNMTL1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000304478 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:782273:792509:1 gene:ENSG00000171861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000571157 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:782600:788198:1 gene:ENSG00000171861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000574916 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:782358:783517:1 gene:ENSG00000171861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// BC011550 // GenBank // Homo sapiens RNA methyltransferase like 1, mRNA (cDNA clone MGC:19968 IMAGE:4620063), complete cds. // chr17 // 87 // 85 // 20 // 23 // 0 /// BC050614 // GenBank // Homo sapiens RNA methyltransferase like 1, mRNA (cDNA clone MGC:60073 IMAGE:5248052), complete cds. // chr17 // 87 // 85 // 20 // 23 // 0 /// ENST00000574509 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:782367:791766:1 gene:ENSG00000171861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// GENSCAN00000016894 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:782379:792069:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0
NM_013337 // RefSeq // Homo sapiens translocase of inner mitochondrial membrane 22 homolog (yeast) (TIMM22), mRNA. // chr17 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000327158 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:997117:1003671:1 gene:ENSG00000177370 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// AF155330 // GenBank // Homo sapiens putative membrane protein (TIM22) mRNA, complete cds. // chr17 // 86 // 95 // 18 // 21 // 0 /// BC002324 // GenBank // Homo sapiens translocase of inner mitochondrial membrane 22 homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:2678 IMAGE:2819655), complete cds. // chr17 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000613269 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_3_CTG2:997117:1002148:1 gene:ENSG00000278501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000617832 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_2_CTG2:997117:1002148:1 gene:ENSG00000277649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000033125 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:996675:1001088:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 77 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000039164 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_3_CTG2:996675:1001088:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 77 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000043669 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_2_CTG2:996675:1001088:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 77 // 17 // 17 // 0
NM_001164405 // RefSeq // Homo sapiens basic helix-loop-helix family, member a9 (BHLHA9), mRNA. // chr17 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000391429 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:1270559:1271460:1 gene:ENSG00000205899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// GENSCAN00000033144 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:1270564:1271512:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0
NM_172367 // RefSeq // Homo sapiens tumor suppressor candidate 5 (TUSC5), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000333813 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:1279663:1300987:1 gene:ENSG00000184811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB090231 // GenBank // Homo sapiens mRNA for LOST1, complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// BC142615 // GenBank // Homo sapiens tumor suppressor candidate 5, mRNA (cDNA clone MGC:164777 IMAGE:40147346), complete cds. // chr17 // 89 // 96 // 24 // 27 // 0
NM_001098202 // RefSeq // Homo sapiens hypermethylated in cancer 1 (HIC1), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NM_006497 // RefSeq // Homo sapiens hypermethylated in cancer 1 (HIC1), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000322941 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:2056310:2059686:1 gene:ENSG00000177374 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000399849 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:2055099:2059686:1 gene:ENSG00000177374 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000619757 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:2055099:2063241:1 gene:ENSG00000177374 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000032426 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:2051853:2058835:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0
NM_021947 // RefSeq // Homo sapiens serine racemase (SRR), mRNA. // chr17 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000344595 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:2303704:2325260:1 gene:ENSG00000167720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000574987 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:2303954:2323222:1 gene:ENSG00000167720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 33 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000576620 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:2303950:2323249:1 gene:ENSG00000167720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 28 // 10 // 10 // 0 /// AF169974 // GenBank // Homo sapiens serine racemase mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// AY034081 // GenBank // Homo sapiens serine racemase mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// BC057234 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6496415, containing frame-shift errors. // chr17 // 89 // 75 // 24 // 27 // 0 /// BC074728 // GenBank // Homo sapiens serine racemase, mRNA (cDNA clone MGC:103800 IMAGE:30915181), complete cds. // chr17 // 96 // 78 // 27 // 28 // 0 /// CR457300 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834B1113D for gene SRR, serine racemase; complete cds, incl. stopcodon. // chr17 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// XM_006721566 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens serine racemase (SRR), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 83 // 83 // 30 // 36 // 1 /// ENST00000576848 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:2303950:2323964:1 gene:ENSG00000167720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1 /// GENSCAN00000032424 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:2306748:2323372:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1
NONHSAT144976 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000492377 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:2680958:2681236:1 gene:ENSG00000239884 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000574213 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:2680844:2681857:1 gene:ENSG00000007168 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 96 // 96 // 24 // 25 // 1 /// NONHSAT144979 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT144978 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 96 // 96 // 24 // 25 // 1
ENST00000575608 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:3116423:3117366:1 gene:ENSG00000142163 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_012352 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 1, subfamily A, member 2 (OR1A2), mRNA. // chr17 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENST00000381951 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:3197519:3198448:1 gene:ENSG00000172150 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC069092 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 1, subfamily A, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:95367 IMAGE:7216906), complete cds. // chr17 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// BC106733 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 1, subfamily A, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:119930 IMAGE:40015715), complete cds. // chr17 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC106734 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 1, subfamily A, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:119931 IMAGE:40015716), complete cds. // chr17 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046268 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:3197519:3198448:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_014565 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 1, subfamily A, member 1 (OR1A1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000304094 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:3215621:3216550:1 gene:ENSG00000172146 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC069169 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 1, subfamily A, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:95377 IMAGE:7216916), complete cds. // chr17 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// BC141934 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 1, subfamily A, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:165257 IMAGE:40114773), complete cds. // chr17 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC141935 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 1, subfamily A, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:165258 IMAGE:40114774), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046253 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:3215621:3216550:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_024128 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 3, subfamily A, member 4 pseudogene (OR3A4P), non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000323164 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:3310312:3311189:1 gene:ENSG00000180068 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr17 // 83 // 74 // 19 // 23 // 0 /// ENST00000574571 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:3311193:3311892:1 gene:ENSG00000272546 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr17 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// GENSCAN00000046271 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:3310311:3311742:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0
ENST00000572493 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:3385930:3386833:1 gene:ENSG00000180042 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000046266 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:3385930:3386874:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_012373 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 3, subfamily A, member 3 (OR3A3), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000291231 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:3420568:3421533:1 gene:ENSG00000159961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC069415 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 3, subfamily A, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:97045 IMAGE:7262255), complete cds. // chr17 // 80 // 100 // 8 // 10 // 0 /// BC108921 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 3, subfamily A, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:120202 IMAGE:40023068), complete cds. // chr17 // 80 // 100 // 8 // 10 // 0 /// GENSCAN00000046272 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:3420568:3421533:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_000049 // RefSeq // Homo sapiens aspartoacylase (ASPA), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 96 // 97 // 27 // 28 // 0 /// NM_001128085 // RefSeq // Homo sapiens aspartoacylase (ASPA), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// XM_005256649 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens aspartoacylase (ASPA), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000263080 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:3476002:3503419:1 gene:ENSG00000108381 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000456349 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:3474053:3499088:1 gene:ENSG00000108381 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000571278 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:3476024:3489251:1 gene:ENSG00000108381 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// AK312901 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ93347, Homo sapiens aspartoacylase (aminoacylase 2, Canavan disease)(ASPA), mRNA. // chr17 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// BC029128 // GenBank // Homo sapiens aspartoacylase (Canavan disease), mRNA (cDNA clone MGC:34517 IMAGE:5180104), complete cds. // chr17 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// CR541908 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834E0433D for gene ASPA, aspartoacylase (aminoacylase 2, Canavan disease); complete cds, without stopcodon. // chr17 // 95 // 72 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000046255 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:3481371:3499088:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0
NM_001014764 // RefSeq // Homo sapiens ER membrane protein complex subunit 6 (EMC6), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_031298 // RefSeq // Homo sapiens ER membrane protein complex subunit 6 (EMC6), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000248378 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:3668815:3669665:1 gene:ENSG00000127774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000397133 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:3668822:3669668:1 gene:ENSG00000127774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC001409 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 93, mRNA (cDNA clone MGC:2963 IMAGE:3139577), complete cds. // chr17 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_031965 // RefSeq // Homo sapiens germ cell associated 2 (haspin) (GSG2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000325418 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:3723903:3726699:1 gene:ENSG00000177602 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AB039834 // GenBank // Homo sapiens mRNA for H-Haspin, complete cds. // chr17 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// AF289865 // GenBank // Homo sapiens haploid germ cell-specific nuclear protein kinase (GSG2) mRNA, complete cds. // chr17 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// AK292715 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78032 complete cds, highly similar to Homo sapiens haploid germ cell-specific nuclear protein kinase (GSG2) mRNA. // chr17 // 96 // 97 // 27 // 28 // 0 /// AK310546 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17588. // chr17 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// BC047457 // GenBank // Homo sapiens germ cell associated 2 (haspin), mRNA (cDNA clone MGC:50981 IMAGE:5298590), complete cds. // chr17 // 89 // 97 // 25 // 28 // 0 /// AK056691 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ32129 fis, clone PEBLM2000213, weakly similar to Mus musculus genes for integrin aM290, hapsin. // chr17 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1 /// GENSCAN00000046262 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:3723936:3726332:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0
NONHSAT145044 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000516003 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:4186326:4186424:1 gene:ENSG00000251812 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT145071 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NONHSAT145074 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_182538 // RefSeq // Homo sapiens spinster homolog 3 (Drosophila) (SPNS3), mRNA. // chr17 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// XM_006721472 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens spinster homolog 3 (Drosophila) (SPNS3), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000355530 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:4433688:4488208:1 gene:ENSG00000182557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000575194 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:4433963:4488208:1 gene:ENSG00000182557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000576069 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:4433957:4453205:1 gene:ENSG00000182557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// BC023646 // GenBank // Homo sapiens spinster homolog 3 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:29671 IMAGE:5087991), complete cds. // chr17 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000038230 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:4365442:4487894:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0
NM_001124758 // RefSeq // Homo sapiens spinster homolog 2 (Drosophila) (SPNS2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006721449 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens spinster homolog 2 (Drosophila) (SPNS2), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000329078 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:4498838:4539035:1 gene:ENSG00000183018 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000571386 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:4533032:4537798:1 gene:ENSG00000183018 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 35 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000571668 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:4533726:4537718:1 gene:ENSG00000183018 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 29 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000576635 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:4533243:4537699:1 gene:ENSG00000183018 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 35 // 11 // 11 // 0 /// AB441165 // GenBank // Homo sapiens spinster2 mRNA for spinster2, complete cds. // chr17 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// BC041772 // GenBank // Homo sapiens spinster homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:27061 IMAGE:4814561), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000038229 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:4499048:4536942:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0
ENST00000575018 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:4572206:4572515:1 gene:ENSG00000262519 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr17 // 92 // 60 // 11 // 12 // 0 /// NONHSAT145093 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 92 // 60 // 11 // 12 // 0
NM_001114974 // RefSeq // Homo sapiens smoothelin-like 2 (SMTNL2), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000389313 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:4584539:4608314:1 gene:ENSG00000188176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// BC105050 // GenBank // Homo sapiens smoothelin-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:132710 IMAGE:8144053), complete cds. // chr17 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// BC110859 // GenBank // Homo sapiens smoothelin-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:131847 IMAGE:5190568), complete cds. // chr17 // 93 // 91 // 27 // 29 // 0 /// BC112177 // GenBank // Homo sapiens smoothelin-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:138382 IMAGE:8327645), complete cds. // chr17 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// NM_198501 // RefSeq // Homo sapiens smoothelin-like 2 (SMTNL2), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1 /// ENST00000338859 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:4583999:4608319:1 gene:ENSG00000188176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1 /// ENST00000572951 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:4592355:4595260:1 gene:ENSG00000188176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1 /// GENSCAN00000038214 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:4579587:4607487:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0
NM_001001683 // RefSeq // Homo sapiens mediator complex subunit 11 (MED11), mRNA. // chr17 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENST00000293777 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:4731434:4733610:1 gene:ENSG00000161920 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000575284 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:4731428:4733312:1 gene:ENSG00000161920 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC070377 // GenBank // Homo sapiens mediator complex subunit 11, mRNA (cDNA clone MGC:88387 IMAGE:6450545), complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// HG518163 // GenBank // Homo sapiens mRNA for mediator complex subunit 11 (MED11 gene). // chr17 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// ENST00000573708 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:4731431:4732433:1 gene:ENSG00000161920 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// GENSCAN00000038215 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:4710722:4733187:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1
NM_003963 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane 4 L six family member 5 (TM4SF5), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000270560 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:4771892:4783211:1 gene:ENSG00000142484 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000576530 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:4771884:4783213:1 gene:ENSG00000142484 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC069519 // GenBank // Homo sapiens transmembrane 4 L six family member 5, mRNA (cDNA clone MGC:97017 IMAGE:7262226), complete cds. // chr17 // 83 // 94 // 24 // 29 // 0 /// BC093688 // GenBank // Homo sapiens transmembrane 4 L six family member 5, mRNA (cDNA clone MGC:120723 IMAGE:7939533), complete cds. // chr17 // 96 // 81 // 24 // 25 // 0 /// BC117163 // GenBank // Homo sapiens transmembrane 4 L six family member 5, mRNA (cDNA clone MGC:150772 IMAGE:40125714), complete cds. // chr17 // 84 // 81 // 21 // 25 // 0 /// CR456925 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834H1115D for gene TM4SF5, transmembrane 4 superfamily member 5; complete cds, incl. stopcodon. // chr17 // 85 // 65 // 17 // 20 // 0 /// CR541798 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834D0931D for gene TM4SF5, transmembrane 4 superfamily member 5; complete cds, without stopcodon. // chr17 // 95 // 65 // 19 // 20 // 0 /// AF027204 // GenBank // Homo sapiens putative tetraspan transmembrane protein L6H (TM4SF5) mRNA, complete cds. // chr17 // 67 // 97 // 20 // 30 // 0 /// GENSCAN00000038207 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:4771923:4783128:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 95 // 68 // 20 // 21 // 0 /// NONHSAT145111 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001014985 // RefSeq // Homo sapiens glycolipid transfer protein domain containing 2 (GLTPD2), mRNA. // chr17 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// ENST00000331264 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:4788959:4790390:1 gene:ENSG00000182327 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000038210 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:4789012:4790296:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0
NM_000173 // RefSeq // Homo sapiens glycoprotein Ib (platelet), alpha polypeptide (GP1BA), mRNA. // chr17 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENST00000329125 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:4932297:4935030:1 gene:ENSG00000185245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// BC027955 // GenBank // Homo sapiens glycoprotein Ib (platelet), alpha polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:34595 IMAGE:5210338), complete cds. // chr17 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// J02940 // GenBank // Human platelet glycoprotein Ib alpha chain mRNA, complete cds. // chr17 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// KC120774 // GenBank // Homo sapiens glycoprotein Ib alpha polypeptide G942 deletion mutant (GP1BA) mRNA, complete cds. // chr17 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// KC120775 // GenBank // Homo sapiens glycoprotein Ib alpha polypeptide A1562T1563 deletion mutant (GP1BA) mRNA, complete cds. // chr17 // 90 // 97 // 26 // 29 // 0 /// KC120776 // GenBank // Homo sapiens glycoprotein Ib alpha polypeptide T624 deletion mutant (GP1BA) mRNA, complete cds. // chr17 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// ENST00000611961 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:4932330:4934979:1 gene:ENSG00000185245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000038220 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:4932605:4934563:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0
NM_006612 // RefSeq // Homo sapiens kinesin family member 1C (KIF1C), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000320785 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:4997948:5028401:1 gene:ENSG00000129250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// U91329 // GenBank // Human kinesin-like motor protein KIF1C mRNA, complete cds. // chr17 // 93 // 97 // 26 // 28 // 0 /// BC034993 // GenBank // Homo sapiens kinesin family member 1C, mRNA (cDNA clone MGC:33078 IMAGE:5266798), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 1 /// GENSCAN00000036005 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:4998266:5024151:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0
NM_153018 // RefSeq // Homo sapiens ZFP3 zinc finger protein (ZFP3), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000318833 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:5078248:5096374:1 gene:ENSG00000180787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK290549 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77979 complete cds. // chr17 // 95 // 70 // 20 // 21 // 0 /// BC142962 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 3 homolog (mouse), mRNA (cDNA clone MGC:167041 IMAGE:8860374), complete cds. // chr17 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000036012 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:5057665:5093013:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0
NM_001083585 // RefSeq // Homo sapiens rabaptin, RAB GTPase binding effector protein 1 (RABEP1), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NM_001291581 // RefSeq // Homo sapiens rabaptin, RAB GTPase binding effector protein 1 (RABEP1), transcript variant 3, mRNA. // chr17 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NM_004703 // RefSeq // Homo sapiens rabaptin, RAB GTPase binding effector protein 1 (RABEP1), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000341923 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:5282487:5383223:1 gene:ENSG00000029725 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000537505 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:5282300:5385812:1 gene:ENSG00000029725 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000575475 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:5282322:5378693:1 gene:ENSG00000029725 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// AF098638 // GenBank // Homo sapiens rabaptin-4 mRNA, complete cds. // chr17 // 95 // 68 // 18 // 19 // 0 /// AK297535 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60304 complete cds, highly similar to Rab GTPase-binding effector protein 1. // chr17 // 95 // 75 // 20 // 21 // 0 /// AK310932 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17974. // chr17 // 94 // 64 // 17 // 18 // 0 /// BC041700 // GenBank // Homo sapiens rabaptin, RAB GTPase binding effector protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:48839 IMAGE:6046320), complete cds. // chr17 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// GENSCAN00000036002 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:5282535:5383223:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0
ENST00000383891 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:6207163:6207269:1 gene:ENSG00000206618 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT145249 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_153230 // RefSeq // Homo sapiens F-box protein 39 (FBXO39), mRNA. // chr17 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// XR_243544 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens F-box protein 39 (FBXO39), transcript variant X1, misc_RNA. // chr17 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000321535 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:6776223:6787646:1 gene:ENSG00000177294 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC034782 // GenBank // Homo sapiens F-box protein 39, mRNA (cDNA clone MGC:35179 IMAGE:5170425), complete cds. // chr17 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000031377 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:6777823:6787711:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0
NM_000697 // RefSeq // Homo sapiens arachidonate 12-lipoxygenase (ALOX12), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_005256588 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens arachidonate 12-lipoxygenase (ALOX12), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// ENST00000251535 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:6996065:7010736:1 gene:ENSG00000108839 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000406228 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:7009489:7010736:1 gene:ENSG00000108839 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000480801 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:6996982:7000469:1 gene:ENSG00000108839 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// AF143883 // GenBank // Homo sapiens clone IMAGE:121454 mRNA sequence. // chr17 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// BC069557 // GenBank // Homo sapiens arachidonate 12-lipoxygenase, mRNA (cDNA clone MGC:97215 IMAGE:7262463), complete cds. // chr17 // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// M35418 // GenBank // Human cell 12-lipoxygenase mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// M58704 // GenBank // Human 12-lipoxygenase mRNA, complete cds. // chr17 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// M62982 // GenBank // Human arachidonate 12-lipoxygenase mRNA, complete cds. // chr17 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// GENSCAN00000035420 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:6954034:7010423:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0
NM_181844 // RefSeq // Homo sapiens B-cell CLL/lymphoma 6, member B (BCL6B), mRNA. // chr17 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENST00000293805 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:7023020:7029642:1 gene:ENSG00000161940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB076580 // GenBank // Homo sapiens mRNA for BAZF, complete cds. // chr17 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// AK292878 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77701 complete cds, highly similar to Homo sapiens B-cell CLL/lymphoma 6, member B (zinc finger protein)(BCL6B), mRNA. // chr17 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// AK293102 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77637 complete cds. // chr17 // 92 // 96 // 23 // 25 // 0 /// BC059404 // GenBank // Homo sapiens B-cell CLL/lymphoma 6, member B (zinc finger protein), mRNA (cDNA clone MGC:71775 IMAGE:30342006), complete cds. // chr17 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000035418 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:7012684:7027619:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1
NM_201566 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 16, member 13 (SLC16A13), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000308027 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:7036075:7040121:1 gene:ENSG00000174327 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC142618 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 16, member 13 (monocarboxylic acid transporter 13), mRNA (cDNA clone MGC:164788 IMAGE:40147405), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000575844 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:7036097:7037064:1 gene:ENSG00000174327 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// BX538323 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686L13176 (from clone DKFZp686L13176). // chr17 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1 /// GENSCAN00000035446 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:7036383:7039962:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONHSAT145331 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001002914 // RefSeq // Homo sapiens potassium channel tetramerization domain containing 11 (KCTD11), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000333751 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:7352162:7354944:1 gene:ENSG00000213859 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY646650 // GenBank // Homo sapiens potassium channel tetramerization domain containing 11 (KCTD11) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC019929 // GenBank // Homo sapiens potassium channel tetramerisation domain containing 11, mRNA (cDNA clone MGC:30003 IMAGE:5115130), complete cds. // chr17 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC110598 // GenBank // Homo sapiens potassium channel tetramerisation domain containing 11, mRNA (cDNA clone MGC:129844 IMAGE:40023989), complete cds. // chr17 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
NM_198154 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 95 (TMEM95), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000330767 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:7355178:7357219:1 gene:ENSG00000182896 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000389982 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:7355123:7357218:1 gene:ENSG00000182896 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000576060 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:7355178:7356696:1 gene:ENSG00000182896 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// AY358218 // GenBank // Homo sapiens clone DNA184140 WRLA9390 (UNQ9390) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC040900 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 95, mRNA (cDNA clone IMAGE:5743767), partial cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC107110 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 95, mRNA (cDNA clone MGC:129793 IMAGE:40022149), complete cds. // chr17 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000035415 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:7355205:7357650:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_020795 // RefSeq // Homo sapiens neuroligin 2 (NLGN2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000302926 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:7408183:7419860:1 gene:ENSG00000169992 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000575301 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:7404874:7418684:1 gene:ENSG00000169992 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AF376802 // GenBank // Homo sapiens neuroligin 2 mRNA, complete cds. // chr17 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000035432 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:7408256:7421605:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0
NM_199339 // RefSeq // Homo sapiens spermatid maturation 1 (SPEM1), mRNA. // chr17 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000323675 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:7420360:7421632:1 gene:ENSG00000181323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// BC033882 // GenBank // Homo sapiens spermatid maturation 1, mRNA (cDNA clone MGC:46279 IMAGE:5742860), complete cds. // chr17 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// AK097400 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ40081 fis, clone TESTI2001823. // chr17 // 64 // 64 // 14 // 22 // 1 /// GENSCAN00000035432 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:7408256:7421605:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0
NM_175734 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 74 (C17orf74), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000333870 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:7425615:7427568:1 gene:ENSG00000184560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000574034 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:7425641:7427568:1 gene:ENSG00000184560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC044816 // GenBank // Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 74, mRNA (cDNA clone IMAGE:5164481). // chr17 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000035425 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:7425689:7437506:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_178518 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 102 (TMEM102), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000323206 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:7435443:7437679:1 gene:ENSG00000181284 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000396568 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:7435454:7437523:1 gene:ENSG00000181284 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// AK094197 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ36878 fis, clone BGGI11000024. // chr17 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// BC046189 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 102, mRNA (cDNA clone MGC:57791 IMAGE:5730428), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000035425 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:7425689:7437506:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0
NM_000937 // RefSeq // Homo sapiens polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide A, 220kDa (POLR2A), mRNA. // chr17 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000572844 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:7484620:7499758:1 gene:ENSG00000181222 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 31 // 12 // 12 // 0 /// AK293777 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53860 complete cds, highly similar to DNA-directed RNA polymerase II largest subunit (EC 2.7.7.6). // chr17 // 100 // 41 // 16 // 16 // 0 /// AK304882 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61585 complete cds, highly similar to DNA-directed RNA polymerase II largest subunit (EC 2.7.7.6). // chr17 // 97 // 85 // 32 // 33 // 0 /// BC067295 // GenBank // Homo sapiens polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide A, 220kDa, mRNA (cDNA clone IMAGE:30378439), complete cds. // chr17 // 100 // 31 // 12 // 12 // 0 /// BC137231 // GenBank // Homo sapiens polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide A, 220kDa, mRNA (cDNA clone MGC:168851 IMAGE:9021228), complete cds. // chr17 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000617998 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:7484366:7514616:1 gene:ENSG00000181222 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000621442 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:7484379:7514618:1 gene:ENSG00000181222 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000035434 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:7484765:7514179:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 77 // 30 // 30 // 0
NR_002918 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 48 (SNORA48), small nucleolar RNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000386847 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:7574713:7574847:1 gene:ENSG00000209582 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000579085 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:7572828:7575077:1 gene:ENSG00000161960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000584054 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:7572824:7575171:1 gene:ENSG00000161960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000584798 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:7574746:7576185:1 gene:ENSG00000161960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// U79273 // GenBank // Human clone 23933 mRNA sequence. // chr17 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000580886 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:7572826:7574782:1 gene:ENSG00000161960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// NONHSAT145398 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT145401 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT145402 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT145403 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONHSAT145399 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NR_002912 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 67 (SNORA67), small nucleolar RNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000384423 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:7577955:7578091:1 gene:ENSG00000277985 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA gene:ENSG00000264772 // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000396527 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:7572826:7578401:1 gene:ENSG00000161960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000578324 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:7574259:7578616:1 gene:ENSG00000161960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000581544 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:7572828:7578467:1 gene:ENSG00000161960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000581621 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:7572826:7582024:1 gene:ENSG00000264772 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000581841 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:7577566:7578306:1 gene:ENSG00000161960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK296664 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58012 complete cds, moderately similar to Eukaryotic initiation factor 4A-I (EC 3.6.1.-). // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB209593 // GenBank // Homo sapiens mRNA for CD68 antigen variant protein. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT145405 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT145407 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001678 // RefSeq // Homo sapiens ATPase, Na+/K+ transporting, beta 2 polypeptide (ATP1B2), mRNA. // chr17 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// ENST00000250111 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:7651112:7657768:1 gene:ENSG00000129244 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000577026 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:7646627:7655768:1 gene:ENSG00000129244 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 34 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000577113 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:7654109:7655934:1 gene:ENSG00000129244 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// AK290143 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75609 complete cds, highly similar to Homo sapiens ATPase, Na+/K+ transporting, beta 2 polypeptide (ATP1B2), mRNA. // chr17 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// BC126175 // GenBank // Homo sapiens ATPase, Na+/K+ transporting, beta 2 polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:161453 IMAGE:8991891), complete cds. // chr17 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// M81181 // GenBank // Human sodium/potassium ATPase beta-2 subunit (atpb2) mRNA, complete cds. // chr17 // 84 // 97 // 26 // 31 // 0 /// U45945 // GenBank // Human Na,K-ATPase beta 2 subunit (ATP1B2) mRNA, complete cds. // chr17 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000035445 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:7651519:7655895:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT145436 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 28 // 9 // 9 // 0
NM_001406 // RefSeq // Homo sapiens ephrin-B3 (EFNB3), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000226091 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:7705202:7711378:1 gene:ENSG00000108947 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK314841 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ95729, Homo sapiens ephrin-B3 (EFNB3), mRNA. // chr17 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// BC042944 // GenBank // Homo sapiens ephrin-B3, mRNA (cDNA clone MGC:41892 IMAGE:5286243), complete cds. // chr17 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// U57001 // GenBank // Human ligand for eph-related receptor tyrosine kinases (EPLG8) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// U62775 // GenBank // Human Eph-related receptor transmembrane ligand Elk-L3 precursor (Elk-L3) mRNA, complete cds. // chr17 // 87 // 60 // 13 // 15 // 0 /// U66406 // GenBank // Human putative EPH-related PTK receptor ligand LERK-8 (Eplg8) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000035450 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:7686070:7747534:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001080424 // RefSeq // Homo sapiens lysine (K)-specific demethylase 6B (KDM6B), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000254846 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:7839904:7854796:1 gene:ENSG00000132510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000448097 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:7839962:7853680:1 gene:ENSG00000132510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000570632 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:7844915:7847571:1 gene:ENSG00000132510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 25 // 10 // 10 // 0 /// BC009994 // GenBank // Homo sapiens jumonji domain containing 3, histone lysine demethylase, mRNA (cDNA clone IMAGE:4129810), partial cds. // chr17 // 100 // 33 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000035460 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:7841634:7853521:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0
NM_203411 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 88 (TMEM88), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000301599 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:7855065:7856099:1 gene:ENSG00000167874 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK000032 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ20025 fis, clone ADSE01840. // chr17 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC057812 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 88, mRNA (cDNA clone MGC:71744 IMAGE:30332216), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000574668 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:7855066:7856061:1 gene:ENSG00000167874 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// GENSCAN00000035424 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:7855075:7855941:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 88 // 65 // 15 // 17 // 0
NM_144607 // RefSeq // Homo sapiens cytochrome b5 domain containing 1 (CYB5D1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_005256440 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens cytochrome b5 domain containing 1 (CYB5D1), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000332439 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:7857983:7862282:1 gene:ENSG00000182224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000571846 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:7857746:7860474:1 gene:ENSG00000182224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000573940 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:7858283:7859544:1 gene:ENSG00000182224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 90 // 33 // 9 // 10 // 0 /// ENST00000574196 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:7858285:7859505:1 gene:ENSG00000182224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// AK125598 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ43610 fis, clone SPLEN2013108. // chr17 // 92 // 40 // 11 // 12 // 0 /// AK289520 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75953 complete cds. // chr17 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// BC060779 // GenBank // Homo sapiens cytochrome b5 domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:71551 IMAGE:30349502), complete cds. // chr17 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENST00000570446 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:7858030:7859774:1 gene:ENSG00000182224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1 /// GENSCAN00000035440 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:7858135:7859612:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0
NM_000180 // RefSeq // Homo sapiens guanylate cyclase 2D, membrane (retina-specific) (GUCY2D), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000254854 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:8002594:8020339:1 gene:ENSG00000132518 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// M92432 // GenBank // Homo sapiens retinal guanylyl cyclase (retGC) mRNA, complete cds. // chr17 // 98 // 100 // 40 // 41 // 0 /// GENSCAN00000001670 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:8003048:8016530:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0
AF116704 // GenBank HTC // Homo sapiens PRO2472 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
ENST00000390904 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:8329583:8329719:1 gene:ENSG00000212206 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT145533 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_153007 // RefSeq // Homo sapiens outer dense fiber of sperm tails 4 (ODF4), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_005256476 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens outer dense fiber of sperm tails 4 (ODF4), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000328248 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:8339864:8346046:1 gene:ENSG00000184650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AB081120 // GenBank // Homo sapiens mRNA for h-OPPO 1, complete cds. // chr17 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// AY237799 // GenBank // Homo sapiens testis-specific OPPO1 mRNA, complete cds. // chr17 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// BC112010 // GenBank // Homo sapiens outer dense fiber of sperm tails 4, mRNA (cDNA clone MGC:138215 IMAGE:8327478), complete cds. // chr17 // 92 // 87 // 24 // 26 // 0 /// BC112014 // GenBank // Homo sapiens outer dense fiber of sperm tails 4, mRNA (cDNA clone MGC:138219 IMAGE:8327482), complete cds. // chr17 // 92 // 87 // 24 // 26 // 0 /// ENST00000584943 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:8339870:8346045:1 gene:ENSG00000184650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// FJ235526 // GenBank // Homo sapiens outer dense fiber 4 (ODF4) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr17 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// GENSCAN00000001667 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:8340286:8345852:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0
NM_004822 // RefSeq // Homo sapiens netrin 1 (NTN1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006721595 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens netrin 1 (NTN1), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000173229 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:9021542:9244000:1 gene:ENSG00000065320 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GU727649 // GenBank // Homo sapiens epididymis secretory sperm binding protein Li 131P mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// U75586 // GenBank // Human netrin-1 mRNA, complete cds. // chr17 // 81 // 100 // 22 // 27 // 0 /// GENSCAN00000024834 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:9101585:9239968:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
AK098731 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ25865 fis, clone CBR01927. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT145609 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_020233 // RefSeq // Homo sapiens ADP-ribose/CDP-alcohol diphosphatase, manganese-dependent (ADPRM), mRNA. // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000379774 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:10697594:10711233:1 gene:ENSG00000170222 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000468843 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:10697614:10711233:1 gene:ENSG00000170222 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000527582 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:10697616:10705928:1 gene:ENSG00000170222 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000609540 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:10704900:10711230:1 gene:ENSG00000170222 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC001294 // GenBank // Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 48, mRNA (cDNA clone MGC:5294 IMAGE:3452502), complete cds. // chr17 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// BC070155 // GenBank // Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 48, mRNA (cDNA clone MGC:88135 IMAGE:4656998), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF168715 // GenBank // Homo sapiens x 006 protein mRNA, complete cds. // chr17 // 73 // 44 // 8 // 11 // 0 /// KF880964 // GenBank // Homo sapiens manganese-dependent ADP-ribose/CDP-alcohol diphosphatase (ADPRM) mRNA, complete cds. // chr17 // 74 // 76 // 14 // 19 // 0 /// AK292629 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75220 complete cds. // chr17 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000039146 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:10704927:10711144:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0
ENST00000471221 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:11157455:11157747:1 gene:ENSG00000243346 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT145663 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001173461 // RefSeq // Homo sapiens shisa family member 6 (SHISA6), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NM_001173462 // RefSeq // Homo sapiens shisa family member 6 (SHISA6), transcript variant 3, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NM_207386 // RefSeq // Homo sapiens shisa family member 6 (SHISA6), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000409168 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:11241423:11564063:1 gene:ENSG00000188803 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000432116 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:11241263:11564063:1 gene:ENSG00000188803 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000441885 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:11241263:11564063:1 gene:ENSG00000188803 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// DQ070854 // GenBank // Homo sapiens FLJ45455-like protein mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr17 // 85 // 69 // 17 // 20 // 0 /// ENST00000343478 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:11241941:11380461:1 gene:ENSG00000188803 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// GENSCAN00000001573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:11551685:11558304:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 34 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000001566 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:11241423:11274558:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
NM_001173461 // RefSeq // Homo sapiens shisa family member 6 (SHISA6), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001173462 // RefSeq // Homo sapiens shisa family member 6 (SHISA6), transcript variant 3, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_207386 // RefSeq // Homo sapiens shisa family member 6 (SHISA6), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000409168 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:11241423:11564063:1 gene:ENSG00000188803 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000432116 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:11241263:11564063:1 gene:ENSG00000188803 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000441885 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:11241263:11564063:1 gene:ENSG00000188803 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT145674 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT145675 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_006041 // RefSeq // Homo sapiens heparan sulfate (glucosamine) 3-O-sulfotransferase 3B1 (HS3ST3B1), mRNA. // chr17 // 100 // 58 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000360954 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:14301083:14349404:1 gene:ENSG00000125430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000466596 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:14301083:14349144:1 gene:ENSG00000125430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// AF105377 // GenBank // Homo sapiens heparan sulfate D-glucosaminyl 3-O-sulfotransferase-3B (3OST3B1) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 58 // 11 // 11 // 0 /// BC063301 // GenBank // Homo sapiens heparan sulfate (glucosamine) 3-O-sulfotransferase 3B1, mRNA (cDNA clone MGC:71688 IMAGE:30343352), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC069664 // GenBank // Homo sapiens heparan sulfate (glucosamine) 3-O-sulfotransferase 3B1, mRNA (cDNA clone MGC:97234 IMAGE:7262483), complete cds. // chr17 // 100 // 58 // 11 // 11 // 0 /// BC069725 // GenBank // Homo sapiens heparan sulfate (glucosamine) 3-O-sulfotransferase 3B1, mRNA (cDNA clone MGC:97246 IMAGE:7262495), complete cds. // chr17 // 100 // 58 // 11 // 11 // 0
ENST00000363567 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:15311345:15311451:1 gene:ENSG00000200437 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT145805 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
ENST00000496286 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:15408384:15408688:1 gene:ENSG00000239888 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT145808 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENST00000225587 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:15675476:15675643:1 gene:ENSG00000108452 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// X52357 // GenBank // Human Kox26 mRNA for zinc finger protein, partial. // chr17 // 76 // 100 // 16 // 21 // 0 /// GENSCAN00000032938 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:15659014:15677704:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT145842 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 76 // 100 // 16 // 21 // 0
NM_178571 // RefSeq // Homo sapiens TBC1 domain family, member 26 (TBC1D26), mRNA. // chr17 // 92 // 76 // 12 // 13 // 0 /// ENST00000437605 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:15732277:15744783:1 gene:ENSG00000255104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSG00000214946 // chr17 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000469477 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:15732283:15746162:1 gene:ENSG00000214946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 65 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000491819 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:15732283:15744454:1 gene:ENSG00000214946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0 /// BC028414 // GenBank // Homo sapiens TBC1 domain family, member 26, mRNA (cDNA clone IMAGE:4823397), complete cds. // chr17 // 79 // 82 // 11 // 14 // 0 /// BC047400 // GenBank // Homo sapiens TBC1 domain family, member 26, mRNA (cDNA clone MGC:51025 IMAGE:5297645), complete cds. // chr17 // 73 // 65 // 8 // 11 // 0 /// ENST00000413242 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:15699741:15744778:1 gene:ENSG00000255104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 76 // 76 // 13 // 17 // 1 /// GENSCAN00000032930 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:15731108:15744592:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 65 // 11 // 11 // 0 /// NONHSAT145857 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0 /// AB058777 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1874 protein, partial cds. // chr17 // 59 // 59 // 10 // 17 // 1
NM_000676 // RefSeq // Homo sapiens adenosine A2b receptor (ADORA2B), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000304222 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:15944917:15975746:1 gene:ENSG00000170425 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 95 // 88 // 20 // 21 // 0 /// AY136748 // GenBank // Homo sapiens adenosine receptor A2B (ADORA2B) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// BC025722 // GenBank // Homo sapiens adenosine A2b receptor, mRNA (cDNA clone MGC:34640 IMAGE:5198898), complete cds. // chr17 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// M97759 // GenBank // Human adenosine A2b receptor (ADORA2) mRNA, complete cds. // chr17 // 95 // 88 // 20 // 21 // 0 /// ENST00000582124 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:15973863:15975737:1 gene:ENSG00000170425 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1 /// AK172851 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ24012 fis, clone LNG11380, highly similar to Adenosine A2b receptor. // chr17 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1 /// GENSCAN00000041979 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:15973758:15975342:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 33 // 8 // 8 // 0
ENST00000516574 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:16098704:16098807:1 gene:ENSG00000252383 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT145892 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
ENST00000473804 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:16191832:16192151:1 gene:ENSG00000239221 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT145896 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NR_002744 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 49A (SNORD49A), small nucleolar RNA. // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000384229 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:16440036:16440106:1 gene:ENSG00000277370 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA gene:ENSG00000175061 // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000497774 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:16439011:16441995:1 gene:ENSG00000175061 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000578757 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:16439038:16441209:1 gene:ENSG00000175061 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT145947 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT145950 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT145952 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT145969 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENST00000516637 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:16691798:16691907:1 gene:ENSG00000252446 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000516674 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:20894532:20894638:-1 gene:ENSG00000252483 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 43 // 88 // 10 // 23 // 0 /// ENST00000517027 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:20323001:20323110:1 gene:ENSG00000276577 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA gene:ENSG00000266839 // chr17 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// NONHSAT145993 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT146559 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// NONHSAT146849 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 43 // 88 // 10 // 23 // 0 /// ENST00000580993 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:20323058:20323337:1 gene:ENSG00000266839 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chr17 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// NONHSAT146560 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
ENST00000578843 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:18605054:18605356:-1 gene:ENSG00000276532 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA gene:ENSG00000264948 // chr17 // 93 // 100 // 14 // 15 // 0 /// ENST00000610816 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:16710059:16710361:1 gene:ENSG00000276088 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000620534 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:18840618:18840920:1 gene:ENSG00000274747 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 93 // 100 // 14 // 15 // 0 /// NONHSAT145995 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT146389 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 93 // 100 // 14 // 15 // 0 /// NONHSAT146409 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 93 // 100 // 14 // 15 // 0 /// ENST00000618956 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:20340743:20341045:1 gene:ENSG00000278701 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 60 // 100 // 9 // 15 // 0 /// NONHSAT146561 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 60 // 100 // 9 // 15 // 0
NR_003190 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 32 pseudogene 1 (USP32P1), non-coding RNA. // chr17 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000341745 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:16798009:16804455:1 gene:ENSG00000188933 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 78 // 7 // 7 // 0 /// ENST00000393005 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:16786990:16804455:1 gene:ENSG00000188933 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000448331 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:16690261:16804453:1 gene:ENSG00000266302 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// BC039345 // GenBank // Homo sapiens TL132 pseudogene, mRNA (cDNA clone IMAGE:5269191). // chr17 // 75 // 89 // 6 // 8 // 0 /// AY363305 // GenBank // Homo sapiens TL132-like protein mRNA, complete cds. // chr17 // 71 // 78 // 5 // 7 // 0 /// BC063453 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5168971, partial cds. // chr17 // 89 // 89 // 8 // 9 // 1 /// NONHSAT146001 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// NONHSAT146011 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 78 // 7 // 7 // 0 /// ENST00000602730 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:16788057:16816540:1 gene:ENSG00000272815 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 89 // 89 // 8 // 9 // 1 /// NONHSAT146003 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 89 // 89 // 8 // 9 // 1 /// NONHSAT146004 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 89 // 89 // 8 // 9 // 1
NR_026809 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 106, member A (FAM106A), long non-coding RNA. // chr17 // 89 // 100 // 49 // 55 // 0 /// NR_026810 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 106, member C, pseudogene (FAM106CP), non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 55 // 55 // 0 /// ENST00000392176 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:18524566:18526846:-1 gene:ENSG00000213077 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 89 // 100 // 49 // 55 // 0 /// NONHSAT146006 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 55 // 55 // 0 /// NONHSAT146570 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 76 // 100 // 42 // 55 // 0
ENST00000422309 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:16853935:16854309:1 gene:ENSG00000229749 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// GENSCAN00000013477 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:16853935:16854309:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000313485 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:17158497:17185560:1 gene:ENSG00000133030 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 77 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000414263 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:17165556:17185560:1 gene:ENSG00000133030 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 77 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000013497 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:17118586:17184894:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 77 // 10 // 10 // 0
ENST00000384132 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:17170083:17170189:1 gene:ENSG00000206859 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT146051 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0
ENST00000498361 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:17178414:17178749:1 gene:ENSG00000243370 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT146056 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_018019 // RefSeq // Homo sapiens mediator complex subunit 9 (MED9), mRNA. // chr17 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000268711 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:17476986:17493226:1 gene:ENSG00000141026 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000581315 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:17477025:17491471:1 gene:ENSG00000141026 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 90 // 45 // 9 // 10 // 0 /// BC000647 // GenBank // Homo sapiens mediator complex subunit 9, mRNA (cDNA clone IMAGE:3344505). // chr17 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// BC104988 // GenBank // Homo sapiens mediator complex subunit 9, mRNA (cDNA clone MGC:132648 IMAGE:8143991), complete cds. // chr17 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0 /// BC112029 // GenBank // Homo sapiens mediator complex subunit 9, mRNA (cDNA clone MGC:138234 IMAGE:8327497), complete cds. // chr17 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000013496 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:17477042:17491495:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 45 // 10 // 10 // 0
ENST00000384003 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:17578631:17578739:1 gene:ENSG00000206730 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT146096 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_030665 // RefSeq // Homo sapiens retinoic acid induced 1 (RAI1), mRNA. // chr17 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000353383 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:17681473:17811453:1 gene:ENSG00000108557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000395774 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:17782132:17795776:1 gene:ENSG00000108557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 35 // 11 // 11 // 0 /// AJ271790 // GenBank // Homo sapiens mRNA for retinoid-acid induced protein 1 (RAI1 gene). // chr17 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0 /// AY172136 // GenBank // Homo sapiens retinoic acid induced 1 (RAI1) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC021209 // GenBank // Homo sapiens retinoic acid induced 1, mRNA (cDNA clone MGC:12824 IMAGE:4137399), complete cds. // chr17 // 100 // 35 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000013486 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:17792949:17810481:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0
NM_024052 // RefSeq // Homo sapiens GID complex subunit 4 (GID4), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000268719 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:18039292:18068404:1 gene:ENSG00000141034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000481836 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:18054148:18065283:1 gene:ENSG00000141034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// BC000636 // GenBank // Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 39, mRNA (cDNA clone IMAGE:3343305), partial cds. // chr17 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// BC041829 // GenBank // Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 39, mRNA (cDNA clone MGC:43491 IMAGE:5268071), complete cds. // chr17 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// XM_005256799 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens GID complex subunit 4 (GID4), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// ENST00000376345 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:18039445:18057467:1 gene:ENSG00000141034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// GENSCAN00000034848 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:18039714:18065243:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0
NONHSAT146151 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_017758 // RefSeq // Homo sapiens alkB, alkylation repair homolog 5 (E. coli) (ALKBH5), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000399138 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:18184239:18209954:1 gene:ENSG00000091542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000490106 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:18206561:18209954:1 gene:ENSG00000091542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000541285 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:18183078:18209398:1 gene:ENSG00000091542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// AK301107 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51727 complete cds, highly similar to Alkylated repair protein alkB. // chr17 // 75 // 48 // 9 // 12 // 0 /// AK311161 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ18203. // chr17 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// AL137263 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp434K1013 (from clone DKFZp434K1013). // chr17 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// BC062339 // GenBank // Homo sapiens alkB, alkylation repair homolog 5 (E. coli), mRNA (cDNA clone MGC:71143 IMAGE:6339184), complete cds. // chr17 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000034830 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:18184244:18242821:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// BC025344 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3839982, containing frame-shift errors. // chr17 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_004140 // RefSeq // Homo sapiens lethal giant larvae homolog 1 (Drosophila) (LLGL1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENST00000316843 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:18225587:18244875:1 gene:ENSG00000131899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENST00000479155 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:18233902:18244875:1 gene:ENSG00000131899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 75 // 36 // 36 // 0 /// BC051466 // GenBank HTC // Homo sapiens lethal giant larvae homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:5263252), with apparent retained intron. // chr17 // 92 // 75 // 33 // 36 // 0 /// BC151838 // GenBank // Homo sapiens lethal giant larvae homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:166967 IMAGE:8860300), complete cds. // chr17 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// D50550 // GenBank // Homo sapiens LLGL mRNA, complete cds. // chr17 // 91 // 94 // 41 // 45 // 0 /// ENST00000621229 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:18225677:18242823:1 gene:ENSG00000131899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 98 // 92 // 43 // 44 // 0 /// GENSCAN00000034830 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:18184244:18242821:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0
NM_144775 // RefSeq // Homo sapiens Smith-Magenis syndrome chromosome region, candidate 8 (SMCR8), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000406438 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:18315310:18323203:1 gene:ENSG00000176994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF467440 // GenBank // Homo sapiens Smith-Magenis syndrome chromosome region candidate 8 protein (SMCR8) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK296847 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60657 complete cds, highly similar to Homo sapiens Smith-Magenis syndrome chromosome region, candidate 8 (SMCR8), mRNA. // chr17 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// BC142680 // GenBank // Homo sapiens Smith-Magenis syndrome chromosome region, candidate 8, mRNA (cDNA clone MGC:164968 IMAGE:40148405), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034839 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:18315790:18323070:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NR_104343 // RefSeq // Homo sapiens FLJ35934 (FLJ35934), long non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000577684 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:18411159:18414380:1 gene:ENSG00000220161 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr17 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC033201 // GenBank HTC // Homo sapiens FLJ35934 protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:4869921), containing frame-shift errors. // chr17 // 91 // 91 // 10 // 11 // 1 /// ENST00000584274 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:20532248:20532881:-1 gene:ENSG00000265916 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr17 // 82 // 100 // 9 // 11 // 0 /// NONHSAT146362 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONHSAT146584 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 82 // 100 // 9 // 11 // 0 /// TCONS_l2_00011139-XLOC_l2_006023 // Broad TUCP // linc-LGALS9B-5 chr17:-:20432532-20460098 // chr17 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
ENST00000447794 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:18650195:18651542:1 gene:ENSG00000174977 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000034832 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:18650439:18651542:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 70 // 7 // 7 // 0
ENST00000578843 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:18605054:18605356:-1 gene:ENSG00000276532 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA gene:ENSG00000264948 // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000610816 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:16710059:16710361:1 gene:ENSG00000276088 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 82 // 100 // 14 // 17 // 0 /// ENST00000620534 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:18840618:18840920:1 gene:ENSG00000274747 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT145995 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr17 // 82 // 100 // 14 // 17 // 0 /// NONHSAT146389 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT146409 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000618956 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:20340743:20341045:1 gene:ENSG00000278701 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 71 // 100 // 12 // 17 // 0 /// NONHSAT146561 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 71 // 100 // 12 // 17 // 0
ENST00000399083 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:19157781:19159111:-1 gene:ENSG00000197665 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000399086 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:19219142:19220473:1 gene:ENSG00000230493 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSG00000072134 // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK026312 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ22659 fis, clone HSI07953. // chr17 // 82 // 100 // 23 // 28 // 0 /// ENST00000399091 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:19092974:19094307:1 gene:ENSG00000228157 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 79 // 100 // 22 // 28 // 0 /// NONHSAT146449 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_007148 // RefSeq // Homo sapiens ring finger protein 112 (RNF112), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000461366 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:17:19411194:19417276:1 gene:ENSG00000128482 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000574149 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:19411178:19413408:1 gene:ENSG00000128482 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 39 // 14 // 14 // 0 /// AB026054 // GenBank // Homo sapiens BFP/ZNF179 mRNA for brain finger protein, complete cds. // chr17 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// AK309372 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99413. // chr17 // 100 // 39 // 14 // 14 // 0 /// BC053989 // GenBank // Homo sapiens ring finger protein 112, mRNA (cDNA clone MGC:59637 IMAGE:5922474), complete cds. // chr17 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// AK293508 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52256 complete cds, highly similar to Zinc finger protein 179. // chr17 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1 /// GENSCAN00000002724 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:19403175:19416175:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0
NR_003022 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 59B (SNORA59B), small nucleolar RNA. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NR_003025 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 59A (SNORA59A), small nucleolar RNA. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000458926 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:19557560:19557711:1 gene:ENSG00000276660 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA gene:ENSG00000266079 // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000459326 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:12507246:12507397:1 gene:ENSG00000239149 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000578183 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:19557211:19557911:1 gene:ENSG00000266079 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// DQ786227 // GenBank // Homo sapiens clone HLS_IMAGE_1687053 mRNA sequence. // chr17 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT139837 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT146495 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT146496 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000607661 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:19601840:19602256:1 gene:ENSG00000271900 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT146504 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
ENST00000607661 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:19601840:19602256:1 gene:ENSG00000271900 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr17 // 100 // 83 // 5 // 5 // 0 /// NONHSAT146504 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0
ENST00000516540 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:19662000:19662090:1 gene:ENSG00000252349 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT146515 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AY358202 // GenBank // Homo sapiens clone DNA93013 RVLA1944 (UNQ1944) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000516637 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:16691798:16691907:1 gene:ENSG00000252446 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000516674 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:20894532:20894638:-1 gene:ENSG00000252483 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 45 // 87 // 9 // 20 // 0 /// ENST00000517027 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:20323001:20323110:1 gene:ENSG00000276577 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA gene:ENSG00000266839 // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT145993 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT146559 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT146849 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 45 // 87 // 9 // 20 // 0 /// ENST00000580993 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:20323058:20323337:1 gene:ENSG00000266839 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chr17 // 70 // 70 // 16 // 23 // 1 /// NONHSAT146560 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 70 // 70 // 16 // 23 // 1
ENST00000578843 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:18605054:18605356:-1 gene:ENSG00000276532 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA gene:ENSG00000264948 // chr17 // 63 // 100 // 12 // 19 // 0 /// ENST00000618956 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:20340743:20341045:1 gene:ENSG00000278701 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT146561 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000620534 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:18840618:18840920:1 gene:ENSG00000274747 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 63 // 100 // 12 // 19 // 0 /// NONHSAT146389 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 63 // 100 // 12 // 19 // 0 /// NONHSAT146409 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 63 // 100 // 12 // 19 // 0 /// ENST00000610816 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:16710059:16710361:1 gene:ENSG00000276088 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 47 // 100 // 9 // 19 // 0 /// NONHSAT145995 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr17 // 47 // 100 // 9 // 19 // 0
NR_026809 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 106, member A (FAM106A), long non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NR_026810 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 106, member C, pseudogene (FAM106CP), non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000392176 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:18524566:18526846:-1 gene:ENSG00000213077 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NONHSAT146006 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NONHSAT146570 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0
ENST00000452760 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:20612667:20614008:1 gene:ENSG00000235546 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr17 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000014691 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:20609672:20614008:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0
NM_021012 // RefSeq // Homo sapiens potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 12 (KCNJ12), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000331718 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:21405136:21417170:1 gene:ENSG00000184185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000583088 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:21376197:21419872:1 gene:ENSG00000184185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AB182123 // GenBank // Homo sapiens KCNJ12 mRNA for potassium inwardly-rectifying channel kir2.2, subfamily J, member 12, complete cds. // chr17 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// BC027982 // GenBank // Homo sapiens potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 12, mRNA (cDNA clone MGC:40138 IMAGE:3873918), complete cds. // chr17 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// L36069 // GenBank // Human high conductance inward rectifier potassium channel alpha subunit mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// NM_001194958 // RefSeq // Homo sapiens potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 18 (KCNJ18), mRNA. // chr17 // 61 // 60 // 11 // 18 // 0 /// ENST00000567955 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:17:21692523:21704612:1 gene:ENSG00000260458 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 61 // 60 // 11 // 18 // 0 /// FJ434338 // GenBank // Homo sapiens inwardly rectifying potassium channel (KCNJ18) mRNA, complete cds. // chr17 // 50 // 60 // 9 // 18 // 0 /// GENSCAN00000025497 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:21371580:21416644:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 95 // 67 // 19 // 20 // 0
ENST00000583708 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:22203295:22205156:1 gene:ENSG00000263563 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 73 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000584755 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:22202995:22205154:1 gene:ENSG00000263563 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000002243 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:22088264:22205009:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC070367 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6618390, containing frame-shift errors. // chr17 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NR_028336 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 27-like (FAM27L), long non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000426869 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:22298691:22299893:1 gene:ENSG00000178130 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC031617 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 27-like, mRNA (cDNA clone MGC:35151 IMAGE:5169482), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000613377 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:22299375:22299694:1 gene:ENSG00000178130 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr17 // 100 // 35 // 8 // 8 // 0 /// NONHSAT052233 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// TCONS_00025102-XLOC_012148 // Rinn lincRNA // linc-MTRNR2L1-1 chr17:+:21825369-21826498 // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NR_027084 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized FLJ36000 (FLJ36000), long non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000612344 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:22406019:22413744:1 gene:ENSG00000276399 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT052238 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0 /// NONHSAT052239 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT052242 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// TCONS_l2_00011541-XLOC_l2_005714 // Broad TUCP // linc-MTRNR2L1-2 chr17:+:21904061-21913070 // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT052241 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 58 // 58 // 11 // 19 // 1 /// TCONS_l2_00010637-XLOC_l2_005714 // Broad TUCP // linc-MTRNR2L1-2 chr17:+:21910898-21913359 // chr17 // 42 // 42 // 8 // 19 // 1
ENST00000463573 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:22527324:22529570:1 gene:ENSG00000240103 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT052272 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000581469 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:27417690:27430190:1 gene:ENSG00000266433 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC112354 // GenBank // Homo sapiens similar to ubiquitin specific protease 6, mRNA (cDNA clone MGC:133239 IMAGE:40034438), complete cds. // chr17 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// NR_033892 // RefSeq // Homo sapiens TBC1 domain family, member 3 pseudogene 5 (TBC1D3P5), non-coding RNA. // chr17 // 71 // 71 // 22 // 31 // 1 /// ENST00000586223 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:27418005:27431623:1 gene:ENSG00000266433 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 71 // 71 // 22 // 31 // 1 /// ENST00000579401 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:27419538:27431301:1 gene:ENSG00000266433 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr17 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1 /// GENSCAN00000012610 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:27406826:27429910:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT052310 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONHSAT052311 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 71 // 71 // 22 // 31 // 1 /// TCONS_l2_00011542-XLOC_l2_005718 // Broad TUCP // linc-KSR1-1 chr17:+:25745030-25758648 // chr17 // 71 // 71 // 22 // 31 // 1
NM_016231 // RefSeq // Homo sapiens nemo-like kinase (NLK), mRNA. // chr17 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000407008 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:28042156:28196381:1 gene:ENSG00000087095 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000496808 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:28043030:28196381:1 gene:ENSG00000087095 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// AF180819 // GenBank // Homo sapiens LAK1 protein (LAK1) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// AF197898 // GenBank // Homo sapiens nemo-like kinase mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// AK024686 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ21033 fis, clone CAE09040, highly similar to AF197898 Homo sapiens nemo-like kinase mRNA. // chr17 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC064663 // GenBank // Homo sapiens nemo-like kinase, mRNA (cDNA clone MGC:60309 IMAGE:6527673), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000040216 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:28098271:28229237:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NR_003064 // RefSeq // Homo sapiens peptide YY, 2 (pseudogene) (PYY2), non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000315776 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:28227306:28227701:1 gene:ENSG00000237575 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr17 // 100 // 33 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000441253 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:28226563:28228065:1 gene:ENSG00000237575 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AF222904 // GenBank // Homo sapiens peptide YY-2 (PYY2) mRNA, complete cds. // chr17 // 91 // 92 // 20 // 22 // 0 /// NONHSAT052368 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT052370 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 33 // 8 // 8 // 0 /// TCONS_l2_00010645-XLOC_l2_005721 // Broad TUCP // linc-TMEM97 chr17:+:26553620-26555002 // chr17 // 83 // 100 // 20 // 24 // 0 /// GENSCAN00000040216 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:28098271:28229237:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1 /// NONHSAT052369 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1
NR_002181 // RefSeq // Homo sapiens pancreatic polypeptide 2 (PPY2), non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000582808 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:28247444:28248289:1 gene:ENSG00000265060 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr17 // 91 // 92 // 20 // 22 // 0 /// ENST00000583761 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:28247444:28248289:1 gene:ENSG00000265060 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AF085945 // GenBank // Homo sapiens full length insert cDNA clone YR72H05. // chr17 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// AF222903 // GenBank // Homo sapiens pancreatic polypeptide-2 (PPY2) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT052374 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_014573 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 97 (TMEM97), mRNA. // chr17 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000226230 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:28319095:28328685:1 gene:ENSG00000109084 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000336687 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:17:28319455:28328225:1 gene:ENSG00000109084 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000583381 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:28319202:28326875:1 gene:ENSG00000109084 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// AK293331 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60416 complete cds. // chr17 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// AK299511 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60051 complete cds. // chr17 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// BC045655 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 97, mRNA (cDNA clone IMAGE:5269880), complete cds. // chr17 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC091504 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 97, mRNA (cDNA clone MGC:111105 IMAGE:30379019), complete cds. // chr17 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000582113 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:28319206:28325835:1 gene:ENSG00000109084 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// ENST00000582384 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:28319269:28327511:1 gene:ENSG00000109084 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// GENSCAN00000040218 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:28308340:28326793:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_015077 // RefSeq // Homo sapiens sterile alpha and TIR motif containing 1 (SARM1), mRNA. // chr17 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// ENST00000379061 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:28364356:28398135:1 gene:ENSG00000004139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 95 // 59 // 19 // 20 // 0 /// ENST00000578128 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:28385100:28396411:1 gene:ENSG00000004139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000585453 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:28384670:28398163:1 gene:ENSG00000004139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron gene:ENSG00000267556 // chr17 // 94 // 50 // 16 // 17 // 0 /// ENST00000585482 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:28371662:28404049:1 gene:ENSG00000004139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSG00000267556 // chr17 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// AK093615 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ36296 fis, clone THYMU2004320, highly similar to Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1. // chr17 // 88 // 50 // 15 // 17 // 0 /// AK302038 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58639 complete cds, highly similar to Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1. // chr17 // 90 // 59 // 18 // 20 // 0 /// AY444166 // GenBank // Homo sapiens sterile alpha and TIR motif containing protein 1 isoform a (SARM1) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000040205 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:28372033:28396286:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0
ENST00000571702 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:28467822:28468406:1 gene:ENSG00000263266 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr17 // 100 // 50 // 6 // 6 // 0 /// NM_001011 // RefSeq // Homo sapiens ribosomal protein S7 (RPS7), mRNA. // chr17 // 58 // 100 // 7 // 12 // 0 /// BC002866 // GenBank // Homo sapiens ribosomal protein S7, mRNA (cDNA clone MGC:10268 IMAGE:3940495), complete cds. // chr17 // 58 // 100 // 7 // 12 // 0 /// BC061901 // GenBank // Homo sapiens ribosomal protein S7, mRNA (cDNA clone MGC:70828 IMAGE:4442840), complete cds. // chr17 // 58 // 100 // 7 // 12 // 0 /// BC071919 // GenBank // Homo sapiens ribosomal protein S7, mRNA (cDNA clone MGC:88601 IMAGE:5811776), complete cds. // chr17 // 55 // 92 // 6 // 11 // 0 /// GENSCAN00000040208 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:28425368:28468406:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0
NM_003593 // RefSeq // Homo sapiens forkhead box N1 (FOXN1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_005258046 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens forkhead box N1 (FOXN1), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000226247 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:28523941:28538896:1 gene:ENSG00000109101 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000579795 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:28506260:28537436:1 gene:ENSG00000109101 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AK313878 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ94512, Homo sapiens forkhead box N1 (FOXN1), mRNA. // chr17 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000040206 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:28521495:28537436:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
NR_000013 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 42B (SNORD42B), small nucleolar RNA. // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000458893 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:28720550:28720616:1 gene:ENSG00000238423 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000472628 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:28720569:28723936:1 gene:ENSG00000198242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 55 // 11 // 11 // 0 /// AB028975 // GenBank // Homo sapiens KIAA1052 mRNA for KIAA1052 protein, partial cds. // chr17 // 77 // 65 // 10 // 13 // 0 /// NONHSAT052636 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NR_000010 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 4A (SNORD4A), small nucleolar RNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000459174 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:28722582:28722653:1 gene:ENSG00000238578 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT052640 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_000014 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 42A (SNORD42A), small nucleolar RNA. // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000459584 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:28723429:28723492:1 gene:ENSG00000238649 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000580755 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:28723300:28723937:1 gene:ENSG00000198242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT052642 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT052643 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NR_000009 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 4B (SNORD4B), small nucleolar RNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000459083 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:28723682:28723753:1 gene:ENSG00000238597 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000578181 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:28720705:28723800:1 gene:ENSG00000198242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT052644 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_178170 // RefSeq // Homo sapiens NIMA-related kinase 8 (NEK8), mRNA. // chr17 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// XR_429883 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens NIMA-related kinase 8 (NEK8), transcript variant X1, misc_RNA. // chr17 // 96 // 73 // 26 // 27 // 0 /// ENST00000268766 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:28728780:28743455:1 gene:ENSG00000160602 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000592510 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:28735278:28738245:1 gene:ENSG00000160602 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 32 // 12 // 12 // 0 /// AY242354 // GenBank // Homo sapiens NIMA-related kinase 12a (NEK12A) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// AY267371 // GenBank // Homo sapiens NIMA-family kinase NEK8 (NEK8) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// BC112240 // GenBank // Homo sapiens NIMA (never in mitosis gene a)- related kinase 8, mRNA (cDNA clone MGC:138445 IMAGE:8327708), complete cds. // chr17 // 97 // 97 // 35 // 36 // 0 /// BC113705 // GenBank // Homo sapiens NIMA (never in mitosis gene a)- related kinase 8, mRNA (cDNA clone MGC:142265 IMAGE:8322757), complete cds. // chr17 // 97 // 97 // 35 // 36 // 0 /// ENST00000543014 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:28728804:28742429:1 gene:ENSG00000160602 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 73 // 73 // 27 // 37 // 1 /// AK301429 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60182 complete cds, highly similar to Serine/threonine-protein kinase Nek8 (EC 2.7.11.1). // chr17 // 68 // 68 // 25 // 37 // 1 /// GENSCAN00000040200 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:28728814:28741571:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0
ENST00000459041 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:28834722:28834822:1 gene:ENSG00000238516 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT052653 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_005208 // RefSeq // Homo sapiens crystallin, beta A1 (CRYBA1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000225387 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:29246863:29254483:1 gene:ENSG00000108255 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000484605 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:29246874:29254494:1 gene:ENSG00000108255 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// BC069537 // GenBank // Homo sapiens crystallin, beta A1, mRNA (cDNA clone MGC:97015 IMAGE:7262224), complete cds. // chr17 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC113693 // GenBank // Homo sapiens crystallin, beta A1, mRNA (cDNA clone MGC:142253 IMAGE:8322745), complete cds. // chr17 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// U59058 // GenBank // Human beta-A3/A1 crystallin (CYRBA3/A1) mRNA, partial cds. // chr17 // 86 // 70 // 18 // 21 // 0 /// GENSCAN00000003553 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:29241414:29254353:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0
ENST00000410431 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:29388560:29388683:1 gene:ENSG00000222363 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT052703 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_020791 // RefSeq // Homo sapiens TAO kinase 1 (TAOK1), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000261716 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:29390600:29551904:1 gene:ENSG00000160551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY049015 // GenBank // Homo sapiens serine/threonine kinase TAO1 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC133039 // GenBank // Homo sapiens TAO kinase 1, mRNA (cDNA clone MGC:164670 IMAGE:40147061), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_025142 // RefSeq // Homo sapiens TAO kinase 1 (TAOK1), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1 /// ENST00000536202 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:29390931:29544340:1 gene:ENSG00000160551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1 /// BC144067 // GenBank // Homo sapiens TAO kinase 1, mRNA (cDNA clone MGC:177604 IMAGE:9052587), complete cds. // chr17 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1 /// ENST00000577583 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:29480071:29514997:1 gene:ENSG00000160551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// AK024376 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ14314 fis, clone PLACE3000350, weakly similar to SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE SULU (EC 2.7.1.-). // chr17 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000003561 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:29337101:29534065:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
ENST00000516848 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:29777619:29777744:1 gene:ENSG00000252657 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT052733 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
ENST00000459235 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:29883006:29883109:1 gene:ENSG00000239129 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT052737 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029945 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 423 (MIR423), microRNA. // chr17 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// ENST00000362201 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:30117079:30117172:1 gene:ENSG00000199071 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr17 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// ENST00000585881 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:30116992:30179144:1 gene:ENSG00000126653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// hsa-mir-423 // miRBase Micro RNA Database // MI0001445 Homo sapiens miR-423 stem-loop // chr17 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// NONHSAT052748 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0
ENST00000364385 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:30360463:30360566:1 gene:ENSG00000201255 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT052766 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_015594 // RefSeq // Homo sapiens TBC1 domain family, member 29 (TBC1D29), mRNA. // chr17 // 100 // 43 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000579181 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:30559566:30563475:1 gene:ENSG00000266733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 43 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000580161 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:30557112:30563493:1 gene:ENSG00000266733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000582511 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:30559566:30563475:1 gene:ENSG00000266733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 43 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000584297 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:17:30559566:30563474:1 gene:ENSG00000266733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 35 // 8 // 8 // 0 /// BC096718 // GenBank // Homo sapiens TBC1 domain family, member 29, mRNA (cDNA clone MGC:119029 IMAGE:40003088), complete cds. // chr17 // 100 // 43 // 10 // 10 // 0 /// BC098126 // GenBank // Homo sapiens TBC1 domain family, member 29, mRNA (cDNA clone MGC:119027 IMAGE:40003085), complete cds. // chr17 // 100 // 35 // 8 // 8 // 0 /// BC098273 // GenBank HTC // Homo sapiens TBC1 domain family, member 29, mRNA (cDNA clone IMAGE:40003087), with apparent retained intron. // chr17 // 100 // 43 // 10 // 10 // 0 /// XM_006721805 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens TBC1 domain family, member 29 (TBC1D29), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 83 // 83 // 19 // 23 // 1 /// NONHSAT052784 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 43 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000046819 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:30550805:30560401:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 52 // 52 // 12 // 23 // 1
ENST00000497969 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:30731706:30758335:1 gene:ENSG00000264538 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC047718 // GenBank // Homo sapiens suppressor of zeste 12 homolog pseudogene, mRNA (cDNA clone IMAGE:5736798). // chr17 // 80 // 100 // 8 // 10 // 0 /// NONHSAT052824 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// TCONS_00025103-XLOC_012162 // Rinn lincRNA // linc-ATAD5-2 chr17:+:29058723-29085351 // chr17 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONHSAT052812 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 90 // 90 // 9 // 10 // 1 /// NONHSAT052820 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 90 // 90 // 9 // 10 // 1 /// NONHSAT052821 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 90 // 90 // 9 // 10 // 1 /// NONHSAT052822 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 90 // 90 // 9 // 10 // 1 /// NONHSAT052823 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 90 // 90 // 9 // 10 // 1
NM_024857 // RefSeq // Homo sapiens ATPase family, AAA domain containing 5 (ATAD5), mRNA. // chr17 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000321990 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:30831970:30895869:1 gene:ENSG00000176208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000578295 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:30831970:30876439:1 gene:ENSG00000176208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:non_stop_decay // chr17 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000585133 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:30835209:30869852:1 gene:ENSG00000176208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// AL832103 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp313B198 (from clone DKFZp313B198). // chr17 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// AY557611 // GenBank // Homo sapiens chromosome fragility associated gene 1 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000045116 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:30832366:30894913:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 95 // 70 // 20 // 21 // 0
ENST00000577405 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:30959564:30959850:1 gene:ENSG00000266274 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT052842 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
BC062632 // GenBank // Homo sapiens hypothetical LOC400590, mRNA (cDNA clone MGC:70830 IMAGE:5248762), complete cds. // chr17 // 91 // 100 // 10 // 11 // 0
ENST00000484117 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:31465543:31465832:1 gene:ENSG00000239595 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT052876 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr17 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0
ENST00000578050 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:31518432:31518729:1 gene:ENSG00000264862 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT052879 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029710 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 193a (MIR193A), microRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000384882 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:31559996:31560083:1 gene:ENSG00000207614 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-193a // miRBase Micro RNA Database // MI0000487 Homo sapiens miR-193a stem-loop // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000365156 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:31713753:31713853:1 gene:ENSG00000202026 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT052895 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_015355 // RefSeq // Homo sapiens SUZ12 polycomb repressive complex 2 subunit (SUZ12), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000322652 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:31937018:32001045:1 gene:ENSG00000178691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000578106 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:31994353:31999376:1 gene:ENSG00000178691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 38 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000580398 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:31937067:32000649:1 gene:ENSG00000178691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AK290014 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76762 complete cds, highly similar to Homo sapiens suppressor of zeste 12 homolog (Drosophila) (SUZ12), mRNA. // chr17 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0 /// BC015704 // GenBank // Homo sapiens suppressor of zeste 12 homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:10177 IMAGE:3908024), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000040819 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:31937247:31999003:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 67 // 14 // 14 // 0
NM_003885 // RefSeq // Homo sapiens cyclin-dependent kinase 5, regulatory subunit 1 (p35) (CDK5R1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000313401 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:32486619:32491256:1 gene:ENSG00000176749 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000584792 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:32487796:32488619:1 gene:ENSG00000176749 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 92 // 38 // 11 // 12 // 0 /// BC020580 // GenBank // Homo sapiens cyclin-dependent kinase 5, regulatory subunit 1 (p35), mRNA (cDNA clone MGC:21957 IMAGE:4392555), complete cds. // chr17 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC026347 // GenBank // Homo sapiens cyclin-dependent kinase 5, regulatory subunit 1 (p35), mRNA (cDNA clone MGC:26687 IMAGE:4816946), complete cds. // chr17 // 96 // 78 // 24 // 25 // 0 /// BC030792 // GenBank // Homo sapiens cyclin-dependent kinase 5, regulatory subunit 1 (p35), mRNA (cDNA clone MGC:33831 IMAGE:5263087), complete cds. // chr17 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// BT019573 // GenBank // Homo sapiens cyclin-dependent kinase 5, regulatory subunit 1 (p35) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000584716 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:32487796:32489520:1 gene:ENSG00000176749 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// GENSCAN00000040817 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:32484165:32489017:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 59 // 59 // 19 // 32 // 1
NM_002982 // RefSeq // Homo sapiens chemokine (C-C motif) ligand 2 (CCL2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000225831 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:34255285:34257203:1 gene:ENSG00000108691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000582017 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:34256208:34257203:1 gene:ENSG00000108691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// BC009716 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-C motif) ligand 2, mRNA (cDNA clone MGC:9434 IMAGE:3901489), complete cds. // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BT007329 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-C motif) ligand 2 mRNA, complete cds. // chr17 // 87 // 60 // 13 // 15 // 0 /// M24545 // GenBank // Human monocyte chemotactic and activating factor (MCAF) mRNA, complete cds. // chr17 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// M26683 // GenBank // Human interferon gamma treatment inducible mRNA. // chr17 // 87 // 60 // 13 // 15 // 0 /// M28226 // GenBank // Human JE gene encoding a monocyte secretory protein mRNA, complete cds. // chr17 // 87 // 92 // 20 // 23 // 0 /// ENST00000580907 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:34255285:34256816:1 gene:ENSG00000108691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// AK311308 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ18350. // chr17 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONHSAT053019 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000000256 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:34162298:34256827:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// NONHSAT053018 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_006273 // RefSeq // Homo sapiens chemokine (C-C motif) ligand 7 (CCL7), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000378569 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:34270221:34272242:1 gene:ENSG00000108688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000394627 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:34270224:34272078:1 gene:ENSG00000108688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000394630 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:34270224:34272240:1 gene:ENSG00000108688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// BC092436 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-C motif) ligand 7, mRNA (cDNA clone MGC:104317 IMAGE:30418073), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC112258 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-C motif) ligand 7, mRNA (cDNA clone MGC:138463 IMAGE:8327726), complete cds. // chr17 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC112260 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-C motif) ligand 7, mRNA (cDNA clone MGC:138465 IMAGE:8327728), complete cds. // chr17 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000000260 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:34270291:34271802:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT053020 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// X72308 // GenBank // Homo sapiens mRNA for monocyte chemotactic protein-3 (MCP-3). // chr17 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
NM_002986 // RefSeq // Homo sapiens chemokine (C-C motif) ligand 11 (CCL11), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000305869 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:34285668:34288334:1 gene:ENSG00000172156 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC017850 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-C motif) ligand 11, mRNA (cDNA clone MGC:22554 IMAGE:4618679), complete cds. // chr17 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// CR457421 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834F1210D for gene CCL11, chemokine (C-C motif) ligand 11; complete cds, incl. stopcodon. // chr17 // 93 // 56 // 14 // 15 // 0 /// D49372 // GenBank // Homo sapiens mRNA for eotaxin, complete cds. // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// U46573 // GenBank // Human eotaxin precursor mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// Z75668 // GenBank // H.sapiens mRNA for CC-chemokine, eotaxin variant (clone 53). // chr17 // 84 // 93 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000248 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:34285809:34287690:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT053021 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0
NM_005623 // RefSeq // Homo sapiens chemokine (C-C motif) ligand 8 (CCL8), mRNA. // chr17 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000394620 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:34319036:34321402:1 gene:ENSG00000108700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC126242 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-C motif) ligand 8, mRNA (cDNA clone MGC:161520 IMAGE:8991958), complete cds. // chr17 // 95 // 74 // 19 // 20 // 0 /// Y16645 // GenBank // Homo sapiens mRNA for monocyte chemotactic protein-2. // chr17 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000000251 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:34319502:34320907:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0
NM_005408 // RefSeq // Homo sapiens chemokine (C-C motif) ligand 13 (CCL13), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000225844 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:34356452:34358610:1 gene:ENSG00000181374 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000577681 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:34357485:34358610:1 gene:ENSG00000181374 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// AJ001634 // GenBank // Homo sapiens mRNA for CC-chemokine MCP-4. // chr17 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// BC008621 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-C motif) ligand 13, mRNA (cDNA clone MGC:17134 IMAGE:4184250), complete cds. // chr17 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BT007385 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-C motif) ligand 13 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// CR450337 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834B112D for gene CCL13, chemokine (C-C motif) ligand 13; complete cds; without stopcodon. // chr17 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// U46767 // GenBank // Homo sapiens monocyte chemoattractant protein-4 precursor (MCP-4) mRNA, complete cds. // chr17 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// U59808 // GenBank // Human monocyte chemotactic protein-4 precursor (MCP-4) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// X98306 // GenBank // H.sapiens mRNA for monocyte chemoattractant protein 4. // chr17 // 95 // 66 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000000255 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:34356527:34358131:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0
NM_207313 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 132E (TMEM132E), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000321639 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:34580749:34639318:1 gene:ENSG00000181291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000000254 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:34544160:34638232:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
NM_052857 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 830 (ZNF830), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000361952 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:34961530:34963775:1 gene:ENSG00000198783 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000578339 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:34962365:34963186:1 gene:ENSG00000198783 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000004217 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:34961519:35004506:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1
ENST00000517275 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:35093909:35093973:1 gene:ENSG00000253084 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONHSAT053058 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_017559 // RefSeq // Homo sapiens fibronectin type III domain containing 8 (FNDC8), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_005257993 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens fibronectin type III domain containing 8 (FNDC8), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 96 // 81 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000158009 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:35121579:35130732:1 gene:ENSG00000073598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AK313775 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ94382. // chr17 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// AL133054 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp434H2215 (from clone DKFZp434H2215). // chr17 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// BC024002 // GenBank // Homo sapiens fibronectin type III domain containing 8, mRNA (cDNA clone MGC:26228 IMAGE:4821771), complete cds. // chr17 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000004211 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:35121763:35130434:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0
NM_001033576 // RefSeq // Homo sapiens unc-45 homolog B (C. elegans) (UNC45B), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_001267052 // RefSeq // Homo sapiens unc-45 homolog B (C. elegans) (UNC45B), transcript variant 3, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_173167 // RefSeq // Homo sapiens unc-45 homolog B (C. elegans) (UNC45B), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000268876 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:35147817:35189345:1 gene:ENSG00000141161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000394570 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:35147841:35189337:1 gene:ENSG00000141161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000591048 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:35148264:35186559:1 gene:ENSG00000141161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// AF539794 // GenBank // Homo sapiens striated muscle UNC45 (UNC45) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC101062 // GenBank // Homo sapiens unc-45 homolog B (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:119540 IMAGE:40008186), complete cds. // chr17 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// BC101063 // GenBank // Homo sapiens unc-45 homolog B (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:119541 IMAGE:40008187), complete cds. // chr17 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000004216 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:35148264:35186559:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
NM_144975 // RefSeq // Homo sapiens schlafen family member 5 (SLFN5), mRNA. // chr17 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000299977 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:35243036:35273655:1 gene:ENSG00000166750 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000592325 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:35243089:35259820:1 gene:ENSG00000166750 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 51 // 19 // 19 // 0 /// AK303299 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52100 complete cds. // chr17 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// AK303632 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52101 complete cds. // chr17 // 96 // 65 // 23 // 24 // 0 /// BC021238 // GenBank // Homo sapiens schlafen family member 5, mRNA (cDNA clone IMAGE:3636653), complete cds. // chr17 // 100 // 51 // 19 // 19 // 0 /// BC125200 // GenBank // Homo sapiens schlafen family member 5, mRNA (cDNA clone MGC:150611 IMAGE:40123369), complete cds. // chr17 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// BC125201 // GenBank // Homo sapiens schlafen family member 5, mRNA (cDNA clone MGC:150612 IMAGE:40123372), complete cds. // chr17 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000542451 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:35243071:35266360:1 gene:ENSG00000166750 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 68 // 68 // 25 // 37 // 1 /// GENSCAN00000004208 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:35243147:35265888:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0
NR_003037 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 7 (SNORD7), small nucleolar RNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000384567 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:35573657:35573753:1 gene:ENSG00000207297 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT053110 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_033315 // RefSeq // Homo sapiens RAS-like, family 10, member B (RASL10B), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000603017 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:35731649:35743521:1 gene:ENSG00000270885 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AB047296 // GenBank // Homo sapiens mRNA for ras-like protein/VTS58635, complete cds. // chr17 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// BC041133 // GenBank // Homo sapiens RAS-like, family 10, member B, mRNA (cDNA clone MGC:47540 IMAGE:5762715), complete cds. // chr17 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000027294 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:35735185:35741305:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0
NM_145272 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 50 (C17orf50), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_005257921 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 50 (C17orf50), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 80 // 58 // 12 // 15 // 0 /// ENST00000603305 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:35760909:35764597:1 gene:ENSG00000270806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000604830 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:35760897:35764614:1 gene:ENSG00000270806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 80 // 58 // 12 // 15 // 0 /// ENST00000605587 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:35760910:35765079:1 gene:ENSG00000270806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000027318 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:35760942:35764834:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0
ENST00000603504 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:35889558:35889804:1 gene:ENSG00000271394 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000621677 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_7_CTG4:35889558:35889804:1 gene:ENSG00000274262 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT053133 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0
ENST00000610833 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_10_CTG4:36110150:36110447:1 gene:ENSG00000274169 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000618767 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:36110150:36110447:1 gene:ENSG00000276014 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000622276 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_7_CTG4:36110539:36110836:1 gene:ENSG00000278781 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AK024994 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ21341 fis, clone COL02653. // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT053179 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_178517 // RefSeq // Homo sapiens phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class W (PIGW), mRNA. // chr17 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// AB097818 // GenBank // Homo sapiens PIG-W mRNA for phosphatidylinositol glycan, class W, complete cds. // chr17 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000614443 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:36535042:36538854:1 gene:ENSG00000277161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000616581 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_7_CTG4:36535927:36539673:1 gene:ENSG00000275600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000619326 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:36535020:36537934:1 gene:ENSG00000277161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000620233 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:36535555:36539310:1 gene:ENSG00000277161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0
NM_024864 // RefSeq // Homo sapiens mitochondrial rRNA methyltransferase 1 homolog (S. cerevisiae) (MRM1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK292307 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77375 complete cds. // chr17 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// BC009416 // GenBank // Homo sapiens mitochondrial rRNA methyltransferase 1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone IMAGE:3506508), complete cds. // chr17 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// BC072411 // GenBank // Homo sapiens mitochondrial rRNA methyltransferase 1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:90266 IMAGE:6164397), complete cds. // chr17 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006725349 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens mitochondrial rRNA methyltransferase 1 homolog (S. cerevisiae) (MRM1), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// ENST00000611231 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_7_CTG4:36602558:36609939:1 gene:ENSG00000274853 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000612760 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:36601962:36608964:1 gene:ENSG00000278619 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000614766 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:36601572:36608971:1 gene:ENSG00000278619 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000013654 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_7_CTG4:36592988:36614536:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// GENSCAN00000027299 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:36592025:36613565:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
NM_173625 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 78 (C17orf78), mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006725319 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 78 (C17orf78), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AK096966 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39647 fis, clone SMINT2004781. // chr17 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// BC034672 // GenBank // Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 78, mRNA (cDNA clone MGC:34759 IMAGE:5184947), complete cds. // chr17 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000611038 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:37375986:37392706:1 gene:ENSG00000278505 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000615133 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:37376043:37392708:1 gene:ENSG00000278505 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000616425 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_7_CTG4:37377518:37394193:1 gene:ENSG00000278145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000021506 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:37376093:37391724:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000001448 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_7_CTG4:37377568:37481620:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
ENST00000384617 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:21564471:21564577:-1 gene:ENSG00000207347 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 48 // 100 // 11 // 23 // 0 /// ENST00000612197 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:36404826:36404932:-1 gene:ENSG00000277029 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000618289 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:37907957:37908063:1 gene:ENSG00000277341 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000620968 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_7_CTG4:36405198:36405304:-1 gene:ENSG00000278515 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000621978 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_7_CTG4:37912034:37912140:1 gene:ENSG00000277891 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT053201 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT053297 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT011720 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 48 // 100 // 11 // 23 // 0
NM_014598 // RefSeq // Homo sapiens suppressor of cytokine signaling 7 (SOCS7), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XR_430781 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens suppressor of cytokine signaling 7 (SOCS7), transcript variant X4, misc_RNA. // chr17 // 68 // 68 // 23 // 34 // 1 /// BC121030 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:40117482. // chr17 // 53 // 53 // 18 // 34 // 1 /// ENST00000612932 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:38352245:38405593:1 gene:ENSG00000274211 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000613678 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:38352228:38399648:1 gene:ENSG00000274211 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 94 // 91 // 29 // 31 // 0 /// ENST00000615473 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_7_CTG4:38152540:38206380:1 gene:ENSG00000274229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000043461 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:38352053:38395968:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000046636 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_7_CTG4:38152469:38196755:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000617360 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:38352551:38399633:1 gene:ENSG00000274211 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 53 // 53 // 18 // 34 // 1
NM_001199417 // RefSeq // Homo sapiens Rho GTPase activating protein 23 (ARHGAP23), mRNA. // chr17 // 90 // 100 // 9 // 10 // 0 /// ENST00000610551 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_7_CTG4:38229254:38313161:1 gene:ENSG00000273780 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000620417 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:38428486:38510136:1 gene:ENSG00000275832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 90 // 100 // 9 // 10 // 0 /// ENST00000622683 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:38428418:38512392:1 gene:ENSG00000275832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 90 // 100 // 9 // 10 // 0 /// GENSCAN00000043465 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:38428156:38510972:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 90 // 100 // 9 // 10 // 0 /// GENSCAN00000046628 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_7_CTG4:38228937:38311742:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001199417 // RefSeq // Homo sapiens Rho GTPase activating protein 23 (ARHGAP23), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000610551 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_7_CTG4:38229254:38313161:1 gene:ENSG00000273780 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000622683 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:38428418:38512392:1 gene:ENSG00000275832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// GENSCAN00000043465 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:38428156:38510972:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// GENSCAN00000046628 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_7_CTG4:38228937:38311742:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0
ENST00000579123 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:38914397:38916837:1 gene:ENSG00000002834 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AY358253 // GenBank // Homo sapiens clone DNA172120 micronovel (UNQ9353) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT053385 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr17 // 50 // 50 // 11 // 22 // 1
NR_033753 // RefSeq // Homo sapiens leucine rich repeat containing 37, member A11, pseudogene (LRRC37A11P), non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000425901 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:39029906:39053205:1 gene:ENSG00000214553 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC111725 // GenBank // Homo sapiens FLJ43826 protein, mRNA (cDNA clone MGC:133195 IMAGE:40028479), complete cds. // chr17 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000579258 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:39027277:39045347:1 gene:ENSG00000214553 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr17 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1 /// NONHSAT053396 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// TCONS_l2_00010741-XLOC_l2_005768 // Broad TUCP // linc-RPL19-2 chr17:+:37186850-37201661 // chr17 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// TCONS_l2_00010742-XLOC_l2_005768 // Broad TUCP // linc-RPL19-2 chr17:+:37187597-37209465 // chr17 // 100 // 55 // 17 // 17 // 0
NM_003673 // RefSeq // Homo sapiens titin-cap (TCAP), mRNA. // chr17 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000309889 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:39664187:39666555:1 gene:ENSG00000173991 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000578283 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:39665349:39666249:1 gene:ENSG00000173991 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// AK096328 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39009 fis, clone NT2RI2025565, highly similar to TELETHONIN. // chr17 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// BC012628 // GenBank // Homo sapiens titin-cap (telethonin), mRNA (cDNA clone MGC:13679 IMAGE:4251080), complete cds. // chr17 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// BC013330 // GenBank // Homo sapiens titin-cap (telethonin), mRNA (cDNA clone MGC:13680 IMAGE:4273711), complete cds. // chr17 // 83 // 72 // 15 // 18 // 0 /// GENSCAN00000049451 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:39665360:39666109:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
NM_002686 // RefSeq // Homo sapiens phenylethanolamine N-methyltransferase (PNMT), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NR_073461 // RefSeq // Homo sapiens phenylethanolamine N-methyltransferase (PNMT), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr17 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000269582 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:39668158:39670475:1 gene:ENSG00000141744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000394246 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:39667981:39670473:1 gene:ENSG00000141744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000581428 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:39668463:39670090:1 gene:ENSG00000141744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// BC037246 // GenBank // Homo sapiens phenylethanolamine N-methyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:34570 IMAGE:5175571), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// CR541815 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834A0132D for gene PNMT, phenylethanolamine N-methyltransferase; complete cds, incl. stopcodon. // chr17 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// J03727 // GenBank // Human phenylethanolamine N-methyltransferase mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000049468 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:39668476:39670389:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NM_178171 // RefSeq // Homo sapiens gasdermin A (GSDMA), mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000301659 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:39962973:39977766:1 gene:ENSG00000167914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AB093591 // GenBank // Homo sapiens GSDM mRNA for gasdermin, complete cds. // chr17 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// AF307953 // GenBank HTC // Homo sapiens gastric cancer-related protein FKSG9 (FKSG9) mRNA, complete cds. // chr17 // 91 // 73 // 20 // 22 // 0 /// AK096439 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39120 fis, clone NTONG2006646, highly similar to Mus musculus Gd mRNA for gasdermin. // chr17 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC109197 // GenBank // Homo sapiens gasdermin A, mRNA (cDNA clone MGC:129596 IMAGE:40005562), complete cds. // chr17 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000049465 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:39950651:39997581:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1
NM_001012241 // RefSeq // Homo sapiens male-specific lethal 1 homolog (Drosophila) (MSL1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000398532 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:40122298:40136916:1 gene:ENSG00000188895 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000578648 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:40122584:40134810:1 gene:ENSG00000188895 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000579565 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:40122614:40134450:1 gene:ENSG00000188895 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC118997 // GenBank // Homo sapiens male-specific lethal 1 homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:141862 IMAGE:40084759), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC122543 // GenBank // Homo sapiens male-specific lethal 1 homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:141861 IMAGE:40084757), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000577454 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:40122573:40130293:1 gene:ENSG00000188895 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 1 /// GENSCAN00000049454 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:40111561:40302001:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 1
NONHSAT053530 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 80 // 4 // 4 // 0
NM_001254 // RefSeq // Homo sapiens cell division cycle 6 (CDC6), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000209728 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:40287633:40304657:1 gene:ENSG00000094804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF022109 // GenBank // Homo sapiens HsCdc18p (HsCdc18) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC025232 // GenBank // Homo sapiens cell division cycle 6 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:39078 IMAGE:5457941), complete cds. // chr17 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// U77949 // GenBank // Human Cdc6-related protein (HsCDC6) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000049454 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:40111561:40302001:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1
NM_001552 // RefSeq // Homo sapiens insulin-like growth factor binding protein 4 (IGFBP4), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000269593 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:40443461:40457731:1 gene:ENSG00000141753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK290810 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76786 complete cds, highly similar to Homo sapiens insulin-like growth factor binding protein 4 (IGFBP4),mRNA. // chr17 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// BC016041 // GenBank // Homo sapiens insulin-like growth factor binding protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:20162 IMAGE:4661581), complete cds. // chr17 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BT019891 // GenBank // Homo sapiens insulin-like growth factor binding protein 4 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// BT019892 // GenBank // Homo sapiens insulin-like growth factor binding protein 4 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// M62403 // GenBank // Human insulin-like growth factor binding protein 4 (IGFBP4) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AK304572 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52130 complete cds, highly similar to Insulin-like growth factor-binding protein 4 precursor. // chr17 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1 /// GENSCAN00000049461 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:40443736:40460709:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_001195386 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 99 (TMEM99), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NM_001195387 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 99 (TMEM99), transcript variant 3, mRNA. // chr17 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// NM_145274 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 99 (TMEM99), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_005257089 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens transmembrane protein 99 (TMEM99), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000301665 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:40819125:40836270:1 gene:ENSG00000167920 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000436612 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:40819106:40835085:1 gene:ENSG00000167920 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 91 // 85 // 20 // 22 // 0 /// AK298616 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52102 complete cds. // chr17 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// BC015365 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 99, mRNA (cDNA clone MGC:21518 IMAGE:3900532), complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENST00000622451 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:40819185:40836274:1 gene:ENSG00000167920 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_001190460 // RefSeq // Homo sapiens keratin associated protein 9-1 (KRTAP9-1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000398470 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:41189887:41190639:1 gene:ENSG00000240542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000012249 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:41189922:41190404:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0
NM_031962 // RefSeq // Homo sapiens keratin associated protein 9-3 (KRTAP9-3), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000411528 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:41232463:41233454:1 gene:ENSG00000204873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000571096 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_5_CTG4:41232462:41233453:1 gene:ENSG00000262749 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC074918 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 9-3, mRNA (cDNA clone MGC:103948 IMAGE:30915341), complete cds. // chr17 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0 /// BC074919 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 9-3, mRNA (cDNA clone MGC:104107 IMAGE:30915560), complete cds. // chr17 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0
ENST00000411193 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:41467956:41468146:1 gene:ENSG00000223125 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT053629 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_000805 // RefSeq // Homo sapiens gastrin (GAST), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000329402 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:41712326:41715969:1 gene:ENSG00000184502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC069724 // GenBank // Homo sapiens gastrin, mRNA (cDNA clone MGC:97269 IMAGE:7262518), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC069762 // GenBank // Homo sapiens gastrin, mRNA (cDNA clone MGC:97281 IMAGE:7262530), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000015251 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:41667631:41715872:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 71 // 12 // 12 // 0
ENST00000365050 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:41718154:41718260:1 gene:ENSG00000201920 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT053649 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_152467 // RefSeq // Homo sapiens kelch-like family member 10 (KLHL10), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_005257273 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens kelch-like family member 10 (KLHL10), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_005257274 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens kelch-like family member 10 (KLHL10), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000293303 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:41837780:41848384:1 gene:ENSG00000161594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK301797 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58296 complete cds, highly similar to Kelch-like protein 10. // chr17 // 93 // 91 // 27 // 29 // 0 /// AK302141 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51379 complete cds, highly similar to Kelch-like protein 10. // chr17 // 77 // 41 // 10 // 13 // 0 /// AY495339 // GenBank // Homo sapiens KLHL10 (KLHL10) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000015249 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:41837933:41848307:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
NM_031421 // RefSeq // Homo sapiens tetratricopeptide repeat domain 25 (TTC25), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NR_110662 // RefSeq // Homo sapiens tetratricopeptide repeat domain 25 (TTC25), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr17 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006722129 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens tetratricopeptide repeat domain 25 (TTC25), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000377540 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:41930656:41965651:1 gene:ENSG00000204815 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000591658 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:41930645:41965630:1 gene:ENSG00000204815 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000593239 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:41930635:41938690:1 gene:ENSG00000204815 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// BC025390 // GenBank // Homo sapiens tetratricopeptide repeat domain 25, mRNA (cDNA clone IMAGE:4831078), complete cds. // chr17 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC067297 // GenBank // Homo sapiens tetratricopeptide repeat domain 25, mRNA (cDNA clone MGC:75456 IMAGE:30383608), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000617460 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:41930664:41965648:1 gene:ENSG00000204815 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000015261 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:41930329:41973924:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0
NM_033194 // RefSeq // Homo sapiens heat shock protein, alpha-crystallin-related, B9 (HSPB9), mRNA. // chr17 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000565659 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:42121431:42123352:1 gene:ENSG00000260325 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK093488 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ36169 fis, clone TESTI2026168, highly similar to Heat-shock protein beta-9. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC093991 // GenBank // Homo sapiens heat shock protein, alpha-crystallin-related, B9, mRNA (cDNA clone MGC:121026 IMAGE:7939836), complete cds. // chr17 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// BC093993 // GenBank // Homo sapiens heat shock protein, alpha-crystallin-related, B9, mRNA (cDNA clone MGC:121028 IMAGE:7939838), complete cds. // chr17 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000015274 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:42122851:42123330:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0
NM_000263 // RefSeq // Homo sapiens N-acetylglucosaminidase, alpha (NAGLU), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000225927 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:42536172:42544449:1 gene:ENSG00000108784 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000586516 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:42536523:42541093:1 gene:ENSG00000108784 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 91 // 33 // 10 // 11 // 0 /// BC053991 // GenBank // Homo sapiens N-acetylglucosaminidase, alpha-, mRNA (cDNA clone MGC:59849 IMAGE:6213852), complete cds. // chr17 // 96 // 82 // 26 // 27 // 0 /// L78464 // GenBank // Human alpha-N-acetylglucosaminidase (ufHSD1) mRNA, complete cds. // chr17 // 96 // 82 // 26 // 27 // 0 /// U40846 // GenBank // Human alpha-N-acetylglucosaminidase (NAG) mRNA, complete cds. // chr17 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// U43573 // GenBank // Human alpha-N-acetylglucosaminidase (NAGLU) mRNA, complete cds. // chr17 // 96 // 82 // 26 // 27 // 0 /// ENST00000591587 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:42536530:42544161:1 gene:ENSG00000108784 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// GENSCAN00000015265 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:42536273:42548807:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000585572 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:42536510:42562062:1 gene:ENSG00000266929 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// AB209530 // GenBank // Homo sapiens mRNA for huntingtin interacting protein-1-related protein. // chr17 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
NM_001070 // RefSeq // Homo sapiens tubulin, gamma 1 (TUBG1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000251413 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:42609676:42615234:1 gene:ENSG00000131462 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000588056 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:42609686:42612266:1 gene:ENSG00000131462 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 42 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000589688 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:42609689:42615221:1 gene:ENSG00000131462 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000591509 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:42609686:42613911:1 gene:ENSG00000131462 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 79 // 74 // 11 // 14 // 0 /// BC000619 // GenBank // Homo sapiens tubulin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:1593 IMAGE:3345973), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BT019931 // GenBank // Homo sapiens tubulin, gamma 1 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0 /// CR407642 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834F112D for gene TUBG1, tubulin, gamma 1 complete cds, without stopcodon. // chr17 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0 /// M61764 // GenBank // Human gamma-tubulin mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000015257 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:42609738:42615041:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0
ENST00000589177 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:42648178:42648738:1 gene:ENSG00000267132 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr17 // 91 // 100 // 20 // 22 // 0 /// GENSCAN00000038546 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:42648178:42666800:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_016437 // RefSeq // Homo sapiens tubulin, gamma 2 (TUBG2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000251412 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:42659305:42667006:1 gene:ENSG00000037042 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000588870 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:42659307:42666822:1 gene:ENSG00000037042 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 94 // 76 // 15 // 16 // 0 /// AF225971 // GenBank // Homo sapiens gamma-tubulin (TUBG2) mRNA, complete cds. // chr17 // 90 // 100 // 19 // 21 // 0 /// BC009670 // GenBank // Homo sapiens tubulin, gamma 2, mRNA (cDNA clone MGC:8716 IMAGE:3891214), complete cds. // chr17 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// BC051890 // GenBank // Homo sapiens tubulin, gamma 2, mRNA (cDNA clone MGC:60302 IMAGE:5726689), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC052283 // GenBank HTC // Homo sapiens tubulin, gamma 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:5458158), containing frame-shift errors. // chr17 // 81 // 76 // 13 // 16 // 0 /// BC108739 // GenBank // Homo sapiens tubulin, gamma 2, mRNA (cDNA clone MGC:131994 IMAGE:5242733), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000038546 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:42648178:42666800:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 93 // 67 // 13 // 14 // 0 /// AK295569 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53044 complete cds, highly similar to Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 40 (EC 3.1.2.15). // chr17 // 71 // 71 // 15 // 21 // 1
NM_003632 // RefSeq // Homo sapiens contactin associated protein 1 (CNTNAP1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_005257748 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens contactin associated protein 1 (CNTNAP1), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000264638 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:42682613:42699814:1 gene:ENSG00000108797 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000591662 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:42682699:42699139:1 gene:ENSG00000108797 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// U87223 // GenBank // Homo sapiens contactin associated protein (Caspr) mRNA, complete cds. // chr17 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000038558 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:42682833:42698910:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0
NM_005854 // RefSeq // Homo sapiens receptor (G protein-coupled) activity modifying protein 2 (RAMP2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000253796 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:42761194:42763036:1 gene:ENSG00000131477 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000587142 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:17:42761258:42762854:1 gene:ENSG00000131477 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 94 // 65 // 16 // 17 // 0 /// ENST00000588576 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:42761258:42763002:1 gene:ENSG00000131477 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 86 // 85 // 19 // 22 // 0 /// ENST00000589683 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:42760775:42763041:1 gene:ENSG00000131477 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// AY265458 // GenBank // Homo sapiens receptor calcitonin activity modifying protein 2 (RAMP2) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// BC027975 // GenBank // Homo sapiens receptor (G protein-coupled) activity modifying protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:34448 IMAGE:5229167), complete cds. // chr17 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// EF687002 // GenBank // Homo sapiens receptor activity modifying protein 2 (RAMP2) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr17 // 88 // 65 // 15 // 17 // 0 /// ENST00000588928 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:42760805:42762698:1 gene:ENSG00000131477 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// GENSCAN00000038554 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:42761262:42809731:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
NM_032353 // RefSeq // Homo sapiens vacuolar protein sorting 25 homolog (S. cerevisiae) (VPS25), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000253794 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:42773436:42779599:1 gene:ENSG00000131475 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000589520 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:42773508:42779374:1 gene:ENSG00000131475 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000589577 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:42773469:42776320:1 gene:ENSG00000131475 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// AB014763 // GenBank // Homo sapiens mRNA for DERP9 (dermal papilla derived protein 9), complete cds. // chr17 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// BC006282 // GenBank // Homo sapiens vacuolar protein sorting 25 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:10540 IMAGE:4025884), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000590339 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:42773480:42779006:1 gene:ENSG00000131475 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// ENST00000589219 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:42773464:42775348:1 gene:ENSG00000131475 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// GENSCAN00000038554 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:42761262:42809731:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_032387 // RefSeq // Homo sapiens WNK lysine deficient protein kinase 4 (WNK4), mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000246914 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:42780678:42796936:1 gene:ENSG00000126562 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000591448 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:42780681:42796936:1 gene:ENSG00000126562 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AF390018 // GenBank // Homo sapiens putative protein kinase WNK4 (PRKWNK4) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AK096052 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ38733 fis, clone KIDNE2010762, moderately similar to Rattus norvegicus protein kinase WNK1 (WNK1) mRNA. // chr17 // 94 // 53 // 15 // 16 // 0 /// BC136664 // GenBank // Homo sapiens WNK lysine deficient protein kinase 4, mRNA (cDNA clone MGC:168277 IMAGE:9020654), complete cds. // chr17 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000038554 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:42761262:42809731:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0
NM_001158 // RefSeq // Homo sapiens amine oxidase, copper containing 2 (retina-specific) (AOC2), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NM_009590 // RefSeq // Homo sapiens amine oxidase, copper containing 2 (retina-specific) (AOC2), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000253799 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:42844600:42850707:1 gene:ENSG00000131480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000452774 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:42844601:42850704:1 gene:ENSG00000131480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// AF081363 // GenBank // Homo sapiens retina copper-containing monoamine oxidase (AOC2) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC142641 // GenBank // Homo sapiens amine oxidase, copper containing 2 (retina-specific), mRNA (cDNA clone MGC:164843 IMAGE:40147885), complete cds. // chr17 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// D88213 // GenBank // Homo sapiens mRNA for retina-specific amine oxidase, complete cds. // chr17 // 96 // 82 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000038561 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:42844627:42850348:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0
NM_173079 // RefSeq // Homo sapiens RUN domain containing 1 (RUNDC1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000361677 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:42980565:42993690:1 gene:ENSG00000198863 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000589705 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:42980581:42991036:1 gene:ENSG00000198863 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// AY189284 // GenBank // Homo sapiens LP5161 protein mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC039247 // GenBank // Homo sapiens RUN domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:33375 IMAGE:5271271), complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000038551 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:42980577:42991716:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
NM_005533 // RefSeq // Homo sapiens interferon-induced protein 35 (IFI35), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000246911 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:43006785:43013582:1 gene:ENSG00000068079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 93 // 58 // 14 // 15 // 0 /// ENST00000415816 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:43006725:43014456:1 gene:ENSG00000068079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000438323 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:43006740:43014456:1 gene:ENSG00000068079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000538473 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:43012061:43013364:1 gene:ENSG00000068079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000546325 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:43012950:43013648:1 gene:ENSG00000068079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// BC001356 // GenBank // Homo sapiens interferon-induced protein 35, mRNA (cDNA clone MGC:2935 IMAGE:3050452), complete cds. // chr17 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// U72882 // GenBank // Human interferon-induced leucine zipper protein (IFP35) mRNA, partial cds. // chr17 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000038524 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:43012218:43014299:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT053809 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
NM_005440 // RefSeq // Homo sapiens Rho family GTPase 2 (RND2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000587250 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:43025241:43029228:1 gene:ENSG00000108830 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF498968 // GenBank // Homo sapiens small GTP binding protein Rho7 (Rho7) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// AK290199 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75191 complete cds, highly similar to Homo sapiens Rho family GTPase 2 (RND2), mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC094842 // GenBank // Homo sapiens Rho family GTPase 2, mRNA (cDNA clone MGC:104852 IMAGE:6599102), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC104986 // GenBank // Homo sapiens Rho family GTPase 2, mRNA (cDNA clone MGC:132646 IMAGE:8143989), complete cds. // chr17 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// BC104990 // GenBank // Homo sapiens Rho family GTPase 2, mRNA (cDNA clone MGC:132650 IMAGE:8143993), complete cds. // chr17 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// BT019394 // GenBank // Homo sapiens ras homolog gene family, member N mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000587117 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:43025241:43026253:1 gene:ENSG00000108830 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// GENSCAN00000038526 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:43025348:43034757:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 94 // 59 // 16 // 17 // 0
NM_001661 // RefSeq // Homo sapiens ADP-ribosylation factor-like 4D (ARL4D), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000320033 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:43398959:43401137:1 gene:ENSG00000175906 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB060692 // GenBank // Homo sapiens mRNA for ADP-ribosylation factor 4L, complete cds. // chr17 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC000043 // GenBank // Homo sapiens ADP-ribosylation factor-like 4D, mRNA (cDNA clone MGC:1801 IMAGE:3509618), complete cds. // chr17 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// L38490 // GenBank // Homo sapiens ADP-ribosylation factor mRNA, complete cds. // chr17 // 90 // 81 // 19 // 21 // 0 /// U25771 // GenBank // Human ADP-ribosylation factor mRNA, complete cds. // chr17 // 76 // 81 // 16 // 21 // 0
ENST00000515954 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:43412427:43412530:1 gene:ENSG00000251763 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT053857 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000516470 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:43445507:43445613:1 gene:ENSG00000252279 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT053862 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000516920 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:43473585:43473690:1 gene:ENSG00000252729 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000363434 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:8:130069541:130069652:-1 gene:ENSG00000200304 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// ENST00000384456 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:11:118593988:118594093:1 gene:ENSG00000207185 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// ENST00000384578 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:11:2321718:2321827:1 gene:ENSG00000207308 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// ENST00000384580 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:119341834:119341940:-1 gene:ENSG00000207310 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// ENST00000391239 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:37991462:37991569:1 gene:ENSG00000212541 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONHSAT053863 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT002491 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONHSAT017505 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONHSAT024499 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONHSAT091383 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONHSAT129145 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
ENST00000431445 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:43476198:43476665:1 gene:ENSG00000237888 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000038548 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:43476198:43476665:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT053864 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
ENST00000449302 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:43780435:43787612:1 gene:ENSG00000231256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000590148 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:43783186:43784833:1 gene:ENSG00000231256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 54 // 7 // 7 // 0 /// AK125817 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ43829 fis, clone TESTI4004200. // chr17 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// BC070324 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6102921. // chr17 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NR_026770 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 215, member A (non-protein coding) (FAM215A), long non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000588043 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:43917209:43917963:1 gene:ENSG00000267496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// AF143236 // GenBank // Homo sapiens apoptosis related protein APR-2 mRNA, complete cds. // chr17 // 82 // 100 // 14 // 17 // 0
NM_153006 // RefSeq // Homo sapiens N-acetylglutamate synthase (NAGS), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000293404 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:44004546:44009060:1 gene:ENSG00000161653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000589767 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:44004757:44009060:1 gene:ENSG00000161653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// AK300923 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54171 complete cds, highly similar to N-acetylglutamate synthase, mitochondrial precursor (EC 2.3.1.1). // chr17 // 96 // 79 // 25 // 26 // 0 /// AK314432 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ95223, Homo sapiens N-acetylglutamate synthase (NAGS), mRNA. // chr17 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// AY116538 // GenBank // Homo sapiens N-acetylglutamate synthetase (NAGS) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC111713 // GenBank // Homo sapiens N-acetylglutamate synthase, mRNA (cDNA clone MGC:133025 IMAGE:40005903), complete cds. // chr17 // 96 // 73 // 23 // 24 // 0 /// ENST00000592915 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:44006048:44009063:1 gene:ENSG00000161653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 52 // 52 // 17 // 33 // 1 /// AK091938 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ34619 fis, clone KIDNE2014717, weakly similar to Acetylglutamate synthase. // chr17 // 52 // 52 // 17 // 33 // 1 /// GENSCAN00000012125 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:44004664:44008601:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0
NM_001171251 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 53 (C17orf53), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NM_024032 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 53 (C17orf53), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000245382 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:17:44142022:44162476:1 gene:ENSG00000125319 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000319977 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:44141906:44162476:1 gene:ENSG00000125319 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000585683 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:44141908:44162285:1 gene:ENSG00000125319 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000588073 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:44154360:44162004:1 gene:ENSG00000125319 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 27 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000588434 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:44147771:44152767:1 gene:ENSG00000125319 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 43 // 16 // 16 // 0 /// AK021656 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ11594 fis, clone HEMBA1003804. // chr17 // 88 // 68 // 22 // 25 // 0 /// AK291924 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75470 complete cds. // chr17 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// BC000121 // GenBank // Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 53, mRNA (cDNA clone MGC:3130 IMAGE:3352851), complete cds. // chr17 // 93 // 81 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000012120 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:44134204:44161932:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0
NM_080863 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat and SOCS box containing 16 (ASB16), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000293414 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:44170706:44179083:1 gene:ENSG00000161664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY557346 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat and SOCS box-containing protein 16 isoform (ASB16) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr17 // 89 // 36 // 8 // 9 // 0 /// BC075088 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat and SOCS box-containing 16, mRNA (cDNA clone MGC:103981 IMAGE:30915388), complete cds. // chr17 // 89 // 76 // 17 // 19 // 0 /// ENST00000589618 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:44170724:44178995:1 gene:ENSG00000161664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// BC118584 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat and SOCS box-containing 16, mRNA (cDNA clone MGC:141877 IMAGE:40084995), complete cds. // chr17 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// BC118585 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat and SOCS box-containing 16, mRNA (cDNA clone MGC:141876 IMAGE:40084992), complete cds. // chr17 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// GENSCAN00000012158 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:44170823:44190864:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
ENST00000408569 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:44303965:44304203:1 gene:ENSG00000221496 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT053932 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000516819 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:44307088:44307172:1 gene:ENSG00000252628 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT053933 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_001466 // RefSeq // Homo sapiens frizzled class receptor 2 (FZD2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000315323 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:44557459:44559570:1 gene:ENSG00000180340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB017364 // GenBank // Homo sapiens mRNA for frizzled-2, complete cds. // chr17 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC113402 // GenBank // Homo sapiens frizzled homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:141962 IMAGE:8322454), complete cds. // chr17 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC113404 // GenBank // Homo sapiens frizzled homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:141964 IMAGE:8322456), complete cds. // chr17 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// L37882 // GenBank // Human frizzled gene product mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000012130 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:44557689:44559386:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0
ENST00000592909 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:44645411:44645587:1 gene:ENSG00000267384 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000004455 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:44645411:44645590:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT053955 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT053956 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001145080 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 104 (C17orf104), mRNA. // chr17 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000409122 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:44656472:44675799:1 gene:ENSG00000180336 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000409464 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:44665118:44671220:1 gene:ENSG00000180336 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// AK302001 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52103 complete cds. // chr17 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// BC035159 // GenBank // Homo sapiens hypothetical protein FLJ35848, mRNA (cDNA clone MGC:43301 IMAGE:5265358), complete cds. // chr17 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000004452 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:44656319:44674196:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0
NR_036623 // RefSeq // Homo sapiens DBF4 zinc finger B (DBF4B), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AY358101 // GenBank // Homo sapiens clone DNA108695 Wpep3002 (UNQ3002) mRNA, complete cds. // chr17 // 91 // 96 // 20 // 22 // 0 /// BC026999 // GenBank HTC // Homo sapiens DBF4 homolog B (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone IMAGE:4943001), with apparent retained intron. // chr17 // 91 // 100 // 21 // 23 // 0 /// ENST00000526924 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:44708698:44750239:1 gene:ENSG00000161692 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 52 // 52 // 12 // 23 // 1
NM_002390 // RefSeq // Homo sapiens ADAM metallopeptidase domain 11 (ADAM11), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_005257373 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ADAM metallopeptidase domain 11 (ADAM11), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000200557 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:44759031:44781846:1 gene:ENSG00000073670 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000355638 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:44759179:44781647:1 gene:ENSG00000073670 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000535346 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:44759325:44779875:1 gene:ENSG00000073670 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000587773 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:44769986:44780610:1 gene:ENSG00000073670 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000588363 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:44775558:44777802:1 gene:ENSG00000073670 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// AB009675 // GenBank // Homo sapiens mRNA for MDC/ADAM11, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK296512 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60626 complete cds, highly similar to ADAM 11 precursor (A disintegrin and metalloproteinase domain 11). // chr17 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// D17390 // GenBank // Homo sapiens mRNA for MDC protein, complete cds. // chr17 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000004462 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:44759200:44787111:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
NM_006460 // RefSeq // Homo sapiens hexamethylene bis-acetamide inducible 1 (HEXIM1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000332499 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:45148502:45152101:1 gene:ENSG00000186834 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// AB021179 // GenBank // Homo sapiens mRNA for HEXIM1 protein, complete cds. // chr17 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// AK023624 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ13562 fis, clone PLACE1008080, highly similar to Homo sapiens hexamethylene bis-acetamide inducible 1 (HEXIM1), mRNA. // chr17 // 94 // 64 // 17 // 18 // 0 /// BC006460 // GenBank // Homo sapiens hexamethylene bis-acetamide inducible 1, mRNA (cDNA clone MGC:1880 IMAGE:3535529), complete cds. // chr17 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000004468 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:45149191:45150270:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0
ENST00000585780 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:45261777:45268059:1 gene:ENSG00000267278 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK097219 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39900 fis, clone SPLEN2017121. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NR_024435 // RefSeq // Homo sapiens MAP3K14 antisense RNA 1 (MAP3K14-AS1), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr17 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1 /// NR_110324 // RefSeq // Homo sapiens MAP3K14 antisense RNA 1 (MAP3K14-AS1), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr17 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1 /// ENST00000586450 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:45262080:45268471:1 gene:ENSG00000267278 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr17 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1 /// NONHSAT054075 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT054076 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1
NR_026680 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC401884 (MGC57346), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NR_027295 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC401884 (MGC57346), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000455565 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:45620610:45637959:1 gene:ENSG00000204650 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000585122 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:45620346:45636473:1 gene:ENSG00000204650 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 80 // 56 // 8 // 10 // 0 /// NONHSAT054159 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 80 // 56 // 8 // 10 // 0 /// NONHSAT054160 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT054162 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT056799 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NR_026905 // RefSeq // Homo sapiens CRHR1 intronic transcript 1 (non-protein coding) (CRHR1-IT1), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr17 // 85 // 83 // 17 // 20 // 0 /// ENST00000578000 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:45638975:45642300:1 gene:ENSG00000204650 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000580655 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:45640362:45642303:1 gene:ENSG00000204650 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// AK057897 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ25168 fis, clone CBR08585. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC069230 // GenBank // Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 69, mRNA (cDNA clone IMAGE:4127819). // chr17 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT054170 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT054172 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT056798 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr17 // 85 // 83 // 17 // 20 // 0
NM_175882 // RefSeq // Homo sapiens signal peptide peptidase like 2C (SPPL2C), mRNA. // chr17 // 95 // 100 // 18 // 19 // 0 /// ENST00000329196 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:45844835:45847072:1 gene:ENSG00000185294 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 95 // 100 // 18 // 19 // 0 /// BC022041 // GenBank // Homo sapiens intramembrane protease 5, mRNA (cDNA clone MGC:27080 IMAGE:4825062), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC025401 // GenBank // Homo sapiens intramembrane protease 5, mRNA (cDNA clone MGC:27096 IMAGE:4829763), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000621383 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_2_CTG5:45856508:45858690:1 gene:ENSG00000277106 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000002802 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:45844907:45846961:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 95 // 100 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000019494 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_2_CTG5:45856525:45858579:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000610319 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_1_CTG5:46250606:46252788:-1 gene:ENSG00000278194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 68 // 100 // 13 // 19 // 0 /// GENSCAN00000012299 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_1_CTG5:46250717:46252771:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 68 // 100 // 13 // 19 // 0
NM_001007532 // RefSeq // Homo sapiens saitohin (STH), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000537309 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:45999250:45999694:1 gene:ENSG00000256762 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY179170 // GenBank // Homo sapiens saitohin (STH) mRNA, STH-Q allele, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC130319 // GenBank // Homo sapiens saitohin, mRNA (cDNA clone MGC:163191 IMAGE:40146350), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC130321 // GenBank // Homo sapiens saitohin, mRNA (cDNA clone MGC:163193 IMAGE:40146352), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000387974 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:46921124:46921249:1 gene:ENSG00000210709 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT054220 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENST00000579643 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:47041825:47042105:1 gene:ENSG00000277198 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA gene:ENSG00000263650 // chr17 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONHSAT054245 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
ENST00000363110 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_7_CTG4:36285684:36285785:1 gene:ENSG00000278320 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA gene:ENSG00000199980 // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000384007 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:47557413:47557514:1 gene:ENSG00000206734 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000476024 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:36285312:36285413:1 gene:ENSG00000265889 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000613607 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_7_CTG4:38031608:38031709:-1 gene:ENSG00000276153 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000614282 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:38089399:38089500:1 gene:ENSG00000275006 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000614695 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:38231043:38231144:-1 gene:ENSG00000274284 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT053299 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT054311 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_014726 // RefSeq // Homo sapiens TBK1 binding protein 1 (TBKBP1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_005257859 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens TBK1 binding protein 1 (TBKBP1), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_005257861 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens TBK1 binding protein 1 (TBKBP1), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000361722 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:47695264:47712050:1 gene:ENSG00000198933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000537587 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:47694619:47698767:1 gene:ENSG00000198933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000578982 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:47694081:47698726:1 gene:ENSG00000198933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 90 // 31 // 9 // 10 // 0 /// BC152407 // GenBank // Homo sapiens TBK1 binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:176631 IMAGE:8862510), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC167150 // GenBank // Homo sapiens TBK1 binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:176643 IMAGE:8862522), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC111418 // GenBank // Homo sapiens TBK1 binding protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:40068358), complete cds. // chr17 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// GENSCAN00000004837 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:47625444:47710626:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 81 // 81 // 26 // 32 // 1 /// ENST00000622396 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:47695685:47711490:1 gene:ENSG00000198933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1
NM_013351 // RefSeq // Homo sapiens T-box 21 (TBX21), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000177694 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:47733244:47746119:1 gene:ENSG00000073861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AF093098 // GenBank // Homo sapiens transcription factor TBLYM (TBLYM) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AF241243 // GenBank // Homo sapiens T-cell-specific T-box transcription factor T-bet mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// BC039739 // GenBank // Homo sapiens T-box 21, mRNA (cDNA clone MGC:47672 IMAGE:6067371), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000004855 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:47726618:47745366:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0
NM_033413 // RefSeq // Homo sapiens leucine rich repeat containing 46 (LRRC46), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_005257775 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens leucine rich repeat containing 46 (LRRC46), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000269025 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:47831627:47837713:1 gene:ENSG00000141294 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000579742 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:47831634:47836062:1 gene:ENSG00000141294 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 93 // 48 // 13 // 14 // 0 /// ENST00000579971 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:47831691:47836100:1 gene:ENSG00000141294 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 94 // 55 // 15 // 16 // 0 /// ENST00000584580 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:47831723:47837228:1 gene:ENSG00000141294 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// AK027206 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ23553 fis, clone LNG09301. // chr17 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// AK292765 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78192 complete cds, highly similar to Homo sapiens leucine rich repeat containing 46 (LRRC46), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC010412 // GenBank // Homo sapiens leucine rich repeat containing 46, mRNA (cDNA clone MGC:16309 IMAGE:3836250), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000004834 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:47835269:47837120:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0
BC016680 // GenBank // Homo sapiens Sp2 transcription factor, mRNA (cDNA clone MGC:21349 IMAGE:4338754), complete cds. // chr17 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC033814 // GenBank // Homo sapiens Sp2 transcription factor, mRNA (cDNA clone MGC:45308 IMAGE:5208525), complete cds. // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// D28588 // GenBank // Homo sapiens KIAA0048 mRNA, partial cds. // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// M97190 // GenBank // Human Sp2 protein mRNA, complete cds. // chr17 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// NM_003110 // RefSeq // Homo sapiens Sp2 transcription factor (SP2), mRNA. // chr17 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// ENST00000376741 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:47896150:47928957:1 gene:ENSG00000167182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// BC005914 // GenBank // Homo sapiens Sp2 transcription factor, mRNA (cDNA clone IMAGE:4095335), complete cds. // chr17 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000004857 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:47916090:47946782:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
ENST00000391263 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:48880840:48880967:1 gene:ENSG00000212565 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT054489 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001160423 // RefSeq // Homo sapiens insulin-like growth factor 2 mRNA binding protein 1 (IGF2BP1), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// NM_006546 // RefSeq // Homo sapiens insulin-like growth factor 2 mRNA binding protein 1 (IGF2BP1), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENST00000290341 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:48997412:49055650:1 gene:ENSG00000159217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 98 // 45 // 45 // 0 /// ENST00000431824 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:17:48997746:49049444:1 gene:ENSG00000159217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 59 // 27 // 27 // 0 /// AF117106 // GenBank // Homo sapiens IGF-II mRNA-binding protein 1 (IMP-1) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 72 // 33 // 33 // 0 /// AF198254 // GenBank // Homo sapiens mRNA-binding protein CRDBP mRNA, complete cds. // chr17 // 97 // 76 // 34 // 35 // 0 /// DQ227344 // GenBank // Homo sapiens IGF2 mRNA-binding protein 1 isoform (IMP1) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr17 // 100 // 59 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000515586 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:48997763:49036933:1 gene:ENSG00000159217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 22 // 22 // 10 // 46 // 1 /// GENSCAN00000014111 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:48997746:49169728:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 61 // 61 // 28 // 46 // 1
ENST00000516827 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:49036352:49036455:1 gene:ENSG00000252636 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT054505 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001135186 // RefSeq // Homo sapiens ABI family, member 3 (ABI3), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NM_016428 // RefSeq // Homo sapiens ABI family, member 3 (ABI3), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000225941 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:49210227:49223225:1 gene:ENSG00000108798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000419580 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:49210411:49223036:1 gene:ENSG00000108798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000571035 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:49219858:49223007:1 gene:ENSG00000108798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 47 // 16 // 16 // 0 /// AB037886 // GenBank // Homo sapiens mRNA for NESH, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC007780 // GenBank // Homo sapiens ABI family, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:12626 IMAGE:4309524), complete cds. // chr17 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000573347 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:49219563:49222562:1 gene:ENSG00000108798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1 /// GENSCAN00000014117 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:49210725:49222715:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 74 // 24 // 25 // 0
NM_002507 // RefSeq // Homo sapiens nerve growth factor receptor (NGFR), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000172229 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:49495293:49515017:1 gene:ENSG00000064300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000504201 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:49497391:49513372:1 gene:ENSG00000064300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// AK303278 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51424 complete cds, highly similar to Tumor necrosis factor receptor superfamilymember 16 precursor. // chr17 // 95 // 65 // 19 // 20 // 0 /// BC050309 // GenBank // Homo sapiens nerve growth factor receptor (TNFR superfamily, member 16), mRNA (cDNA clone MGC:48326 IMAGE:5263715), complete cds. // chr17 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// M14764 // GenBank // Human nerve growth factor receptor mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000014112 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:49495445:49526437:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0
NM_007225 // RefSeq // Homo sapiens neurexophilin 3 (NXPH3), mRNA. // chr17 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000328741 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:49575858:49580358:1 gene:ENSG00000182575 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000570453 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:49578634:49583827:1 gene:ENSG00000182575 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 42 // 10 // 10 // 0 /// AL834282 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp547N1615 (from clone DKFZp547N1615). // chr17 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// AY358526 // GenBank // Homo sapiens clone DNA66521 NXPH3 (UNQ687) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// BC022541 // GenBank // Homo sapiens neurexophilin 3, mRNA (cDNA clone MGC:26801 IMAGE:4794968), complete cds. // chr17 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000513748 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:49576122:49582290:1 gene:ENSG00000182575 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1 /// GENSCAN00000011325 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:49576220:49579300:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 42 // 10 // 10 // 0
NM_001168215 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 92 (TMEM92), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_153229 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 92 (TMEM92), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000300433 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:50271406:50281485:1 gene:ENSG00000167105 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000507382 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:50274427:50279326:1 gene:ENSG00000167105 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// AY358204 // GenBank // Homo sapiens clone DNA131647 SQAW5801 (UNQ5801) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC064507 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 92, mRNA (cDNA clone MGC:71131 IMAGE:6455254), complete cds. // chr17 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000511882 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:50274879:50279116:1 gene:ENSG00000167105 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000011339 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:50229403:50279308:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONHSAT054629 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_022167 // RefSeq // Homo sapiens xylosyltransferase II (XYLT2), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NR_110010 // RefSeq // Homo sapiens xylosyltransferase II (XYLT2), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr17 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// XM_005257572 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens xylosyltransferase II (XYLT2), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000017003 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:50346092:50361151:1 gene:ENSG00000015532 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000376550 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:50346136:50361151:1 gene:ENSG00000015532 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000507602 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:50346135:50363138:1 gene:ENSG00000015532 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 61 // 20 // 20 // 0 /// AK299999 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58089 complete cds, highly similar to Xylosyltransferase 2 (EC 2.4.2.26). // chr17 // 100 // 61 // 20 // 20 // 0 /// AY358090 // GenBank // Homo sapiens clone DNA108774 I-branching enzyme (UNQ3058) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// BC052262 // GenBank // Homo sapiens xylosyltransferase II, mRNA (cDNA clone MGC:59736 IMAGE:6380013), complete cds. // chr17 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000011329 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:50328528:50366910:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 79 // 79 // 26 // 33 // 1
NM_018346 // RefSeq // Homo sapiens radical S-adenosyl methionine domain containing 1 (RSAD1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000258955 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:50478800:50485975:1 gene:ENSG00000136444 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000504284 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:50478903:50484819:1 gene:ENSG00000136444 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000506211 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:50482097:50484998:1 gene:ENSG00000136444 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000515221 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:50478860:50484897:1 gene:ENSG00000136444 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// AK297655 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58916 complete cds, moderately similar to Homo sapiens radical S-adenosyl methionine domain containing 1 (RSAD1), mRNA. // chr17 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// BC050538 // GenBank // Homo sapiens radical S-adenosyl methionine domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:57600 IMAGE:5214885), complete cds. // chr17 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000011318 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:50478885:50531428:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1
ENST00000364470 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:50696644:50696760:1 gene:ENSG00000201340 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT054709 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_175575 // RefSeq // Homo sapiens WAP, follistatin/kazal, immunoglobulin, kunitz and netrin domain containing 2 (WFIKKN2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000311378 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:50835410:50842348:1 gene:ENSG00000173714 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF468657 // GenBank // Homo sapiens multivalent protease inhibitor protein (WFIKKNRP) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// AY358142 // GenBank // Homo sapiens clone DNA178653 Bikunin hlg (UNQ9235) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC140842 // GenBank // Homo sapiens WAP, follistatin/kazal, immunoglobulin, kunitz and netrin domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:176519 IMAGE:9021710), complete cds. // chr17 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC140844 // GenBank // Homo sapiens WAP, follistatin/kazal, immunoglobulin, kunitz and netrin domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:176521 IMAGE:9021712), complete cds. // chr17 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000020907 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:50719733:50841019:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_016001 // RefSeq // Homo sapiens UTP18 small subunit (SSU) processome component homolog (yeast) (UTP18), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006721930 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens UTP18 small subunit (SSU) processome component homolog (yeast) (UTP18), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000225298 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:51260528:51297933:1 gene:ENSG00000011260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF151806 // GenBank // Homo sapiens CGI-48 protein mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC025276 // GenBank // Homo sapiens UTP18, small subunit (SSU) processome component, homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:39182 IMAGE:4861495), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000020904 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:51260534:51297791:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0
NM_032559 // RefSeq // Homo sapiens kinesin family member 2B (KIF2B), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000268919 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:53822901:53825213:1 gene:ENSG00000141200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF333335 // GenBank // Homo sapiens kinesin mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK302262 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53902 complete cds, highly similar to Homo sapiens kinesin family member 2B (KIF2B), mRNA. // chr17 // 94 // 65 // 16 // 17 // 0 /// BC033802 // GenBank // Homo sapiens kinesin family member 2B, mRNA (cDNA clone MGC:44865 IMAGE:5170969), complete cds. // chr17 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000011936 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:53800709:53954379:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0
ENST00000575333 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:54900857:54938033:1 gene:ENSG00000141198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// AB065085 // GenBank // Homo sapiens mRNA for OK/KNS-CL.3, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_178509 // RefSeq // Homo sapiens syntaxin binding protein 4 (STXBP4), mRNA. // chr17 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// XM_006721797 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens syntaxin binding protein 4 (STXBP4), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 100 // 55 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000376352 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:54968765:55164285:1 gene:ENSG00000166263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000398391 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:54968795:55044776:1 gene:ENSG00000166263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 53 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000405898 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:54968775:55044776:1 gene:ENSG00000166263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 55 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000434978 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:17:54968776:55160926:1 gene:ENSG00000166263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000461444 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:54968727:54990988:1 gene:ENSG00000166263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 20 // 8 // 8 // 0 /// BC041485 // GenBank // Homo sapiens syntaxin binding protein 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:5491176), complete cds. // chr17 // 95 // 55 // 21 // 22 // 0 /// BC125116 // GenBank // Homo sapiens syntaxin binding protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:149829 IMAGE:40118892), complete cds. // chr17 // 88 // 85 // 30 // 34 // 0 /// GENSCAN00000023305 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:54990187:55091038:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 48 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT054795 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 20 // 8 // 8 // 0
ENST00000363237 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:55551810:55551920:1 gene:ENSG00000200107 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 91 // 100 // 21 // 23 // 0 /// NONHSAT054817 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 91 // 100 // 21 // 23 // 0
NM_153228 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin-repeat and fibronectin type III domain containing 1 (ANKFN1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// XM_006721728 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ankyrin-repeat and fibronectin type III domain containing 1 (ANKFN1), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000318698 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:56153475:56482646:1 gene:ENSG00000153930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000566473 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:56153510:56511659:1 gene:ENSG00000153930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000036992 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:56456715:56492353:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 32 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000036999 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:56320671:56394667:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1
NM_005450 // RefSeq // Homo sapiens noggin (NOG), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000332822 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:56593699:56595590:1 gene:ENSG00000183691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC034027 // GenBank // Homo sapiens noggin, mRNA (cDNA clone MGC:23903 IMAGE:4737725), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000026466 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:56594224:56594922:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 92 // 50 // 11 // 12 // 0
ENST00000391167 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:56871170:56871276:1 gene:ENSG00000212469 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONHSAT054850 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NR_002818 // RefSeq // Homo sapiens ring finger protein 126 pseudogene 1 (RNF126P1), non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000567452 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:57045478:57046797:1 gene:ENSG00000261192 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000569893 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:57045521:57046445:1 gene:ENSG00000261192 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000026475 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:56978160:57046445:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 83 // 83 // 15 // 18 // 1
ENST00000464937 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:57618108:57618393:1 gene:ENSG00000242889 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT054892 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
ENST00000411044 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:57789449:57789732:1 gene:ENSG00000222976 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// NONHSAT054902 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0
NM_080677 // RefSeq // Homo sapiens dynein, light chain, LC8-type 2 (DYNLL2), mRNA. // chr17 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000579991 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:58083415:58095536:1 gene:ENSG00000264364 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// AF086304 // GenBank // Homo sapiens full length insert cDNA clone ZD50H06. // chr17 // 100 // 48 // 11 // 11 // 0 /// AF112997 // GenBank // Homo sapiens protein inhibitor of neuronal nitric oxide synthase mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0 /// BC010744 // GenBank // Homo sapiens dynein, light chain, LC8-type 2, mRNA (cDNA clone MGC:17810 IMAGE:3891655), complete cds. // chr17 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000036396 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:58078997:58089279:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 48 // 48 // 11 // 23 // 1
NM_012374 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 4, subfamily D, member 1 (OR4D1), mRNA. // chr17 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000268912 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:58155133:58156156:1 gene:ENSG00000141194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC136589 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 4, subfamily D, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:168202 IMAGE:9020579), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC136595 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 4, subfamily D, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:168208 IMAGE:9020585), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000036392 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:58155289:58170579:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0
NR_002307 // RefSeq // Homo sapiens msh homeobox 2 pseudogene 1 (MSX2P1), non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000584100 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:58157028:58157800:1 gene:ENSG00000229590 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000036392 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:58155289:58170579:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT054930 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 83 // 100 // 19 // 23 // 0
NM_001004707 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 4, subfamily D, member 2 (OR4D2), mRNA. // chr17 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000545221 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:58169656:58170579:1 gene:ENSG00000255713 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// AF303373 // GenBank // Homo sapiens B-lymphocyte membrane protein (BC2009) mRNA, complete cds. // chr17 // 65 // 100 // 17 // 26 // 0 /// GENSCAN00000036392 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:58155289:58170579:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_000502 // RefSeq // Homo sapiens eosinophil peroxidase (EPX), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000225371 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:58192737:58205174:1 gene:ENSG00000121053 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// X14346 // GenBank // Human mRNA for eosinophil peroxidase. // chr17 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000036397 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:58192847:58204423:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0
NM_014906 // RefSeq // Homo sapiens protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent, 1E (PPM1E), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NR_048561 // RefSeq // Homo sapiens protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent, 1E (PPM1E), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr17 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000308249 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:58755869:58985176:1 gene:ENSG00000175175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AF260269 // GenBank // Homo sapiens PP2CH mRNA, complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// AF520614 // GenBank // Homo sapiens partner of PIX 1 (POPX1) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// AK289966 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76651 complete cds, highly similar to Homo sapiens partner of PIX 1 (POPX1) mRNA. // chr17 // 95 // 92 // 21 // 22 // 0 /// BC136290 // GenBank // Homo sapiens protein phosphatase 1E (PP2C domain containing), mRNA (cDNA clone MGC:167900 IMAGE:9020277), complete cds. // chr17 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// BC151228 // GenBank // Homo sapiens protein phosphatase 1E (PP2C domain containing), mRNA (cDNA clone MGC:166877 IMAGE:9007247), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// CR749253 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp781F1422 (from clone DKFZp781F1422). // chr17 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000020653 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:58755998:58981031:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0
ENST00000516056 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:58835899:58835994:1 gene:ENSG00000251865 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT054986 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000613789 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:58951185:58951513:1 gene:ENSG00000275680 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_018304 // RefSeq // Homo sapiens proline rich 11 (PRR11), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000262293 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:59155499:59202568:1 gene:ENSG00000068489 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000578542 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:59155746:59204705:1 gene:ENSG00000068489 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000578777 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:59155732:59193686:1 gene:ENSG00000068489 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000580177 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:59155757:59203852:1 gene:ENSG00000068489 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC008669 // GenBank // Homo sapiens proline rich 11, mRNA (cDNA clone MGC:8798 IMAGE:3867293), complete cds. // chr17 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// FJ161961 // GenBank // Homo sapiens transcription repressor of MHCII mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000614081 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:59155757:59203834:1 gene:ENSG00000068489 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000020655 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:59169753:59201631:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_018149 // RefSeq // Homo sapiens SMG8 nonsense mediated mRNA decay factor (SMG8), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000300917 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:59210010:59215247:1 gene:ENSG00000167447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000543872 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:59209400:59215239:1 gene:ENSG00000167447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000578922 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:59209867:59212044:1 gene:ENSG00000167447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// AF349467 // GenBank // Homo sapiens amplified in breast cancer 2 (ABC2) mRNA, complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC020957 // GenBank // Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 71, mRNA (cDNA clone MGC:8821 IMAGE:3851898), complete cds. // chr17 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC031604 // GenBank // Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 71, mRNA (cDNA clone IMAGE:5178217), partial cds. // chr17 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000582469 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:59211423:59215200:1 gene:ENSG00000167447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// ENST00000577660 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:59197566:59215226:1 gene:ENSG00000265303 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000020650 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:59210052:59215002:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
ENST00000384506 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:59260748:59260846:1 gene:ENSG00000207235 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 75 // 3 // 3 // 0 /// NONHSAT055005 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 75 // 3 // 3 // 0
NM_001166301 // RefSeq // Homo sapiens DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 40 (DHX40), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0 /// NM_024612 // RefSeq // Homo sapiens DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 40 (DHX40), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000251241 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:59565525:59608345:1 gene:ENSG00000108406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000425628 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:59565612:59607258:1 gene:ENSG00000108406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 50 // 7 // 7 // 0 /// AF260270 // GenBank // Homo sapiens PAD mRNA, complete cds. // chr17 // 75 // 86 // 9 // 12 // 0 /// AF319521 // GenBank // Homo sapiens ARG147 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 50 // 7 // 7 // 0 /// AF461690 // GenBank // Homo sapiens DEAD-box containing helicase-like protein mRNA, complete cds. // chr17 // 93 // 100 // 13 // 14 // 0 /// AK299151 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58252 complete cds, highly similar to Homo sapiens DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 40 (DHX40), mRNA. // chr17 // 100 // 50 // 7 // 7 // 0 /// BC024187 // GenBank // Homo sapiens DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 40, mRNA (cDNA clone MGC:26626 IMAGE:4822080), complete cds. // chr17 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000020963 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:59540037:59607172:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 79 // 11 // 11 // 0
NM_001288653 // RefSeq // Homo sapiens clathrin, heavy chain (Hc) (CLTC), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// NM_004859 // RefSeq // Homo sapiens clathrin, heavy chain (Hc) (CLTC), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000269122 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:59619858:59696310:1 gene:ENSG00000141367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000393043 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:59619858:59690826:1 gene:ENSG00000141367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 84 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000579456 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:59619932:59694114:1 gene:ENSG00000141367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 40 // 17 // 17 // 0 /// BC051800 // GenBank // Homo sapiens clathrin, heavy chain (Hc), mRNA (cDNA clone MGC:57689 IMAGE:6187185), complete cds. // chr17 // 100 // 84 // 36 // 36 // 0 /// BC054489 // GenBank // Homo sapiens clathrin, heavy chain (Hc), mRNA (cDNA clone MGC:51918 IMAGE:6045540), complete cds. // chr17 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000584313 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:59619943:59651316:1 gene:ENSG00000141367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 19 // 19 // 8 // 43 // 1 /// ENST00000621829 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:59619689:59696956:1 gene:ENSG00000141367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000020974 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:59620132:59693852:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 79 // 34 // 34 // 0
AF090926 // GenBank // Homo sapiens clone HQ0456 PRO0456 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT055020 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NR_029493 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 21 (MIR21), microRNA. // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000362134 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:59841266:59841337:1 gene:ENSG00000199004 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000592790 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:59837931:59842255:1 gene:ENSG00000062716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AY699265 // GenBank // Homo sapiens microRNA pri-miR-21, complete sequence. // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// hsa-mir-21 // miRBase Micro RNA Database // MI0000077 Homo sapiens miR-21 stem-loop // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT055029 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT055031 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_181707 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 64 (C17orf64), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_005257033 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 64 (C17orf64), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// XM_005257036 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 64 (C17orf64), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000269127 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:60422509:60431421:1 gene:ENSG00000141371 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000464714 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:60422535:60426408:1 gene:ENSG00000141371 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 38 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000474834 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:60421742:60426794:1 gene:ENSG00000141371 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 89 // 38 // 8 // 9 // 0 /// BC036356 // GenBank // Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 64, mRNA (cDNA clone IMAGE:5171635), partial cds. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC048806 // GenBank // Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 64, mRNA (cDNA clone MGC:52054 IMAGE:5165502), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000020980 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:60421384:60431266:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0
ENST00000472779 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:60696313:60696605:1 gene:ENSG00000239932 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT055102 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
ENST00000475566 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:60899891:60900185:1 gene:ENSG00000264322 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT055106 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_005994 // RefSeq // Homo sapiens T-box 2 (TBX2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000240328 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:17:61399896:61409425:1 gene:ENSG00000121068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 98 // 100 // 39 // 40 // 0 /// ENST00000419047 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:61399910:61409466:1 gene:ENSG00000121068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000477081 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:61400365:61409124:1 gene:ENSG00000121068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0 /// AB209378 // GenBank // Homo sapiens mRNA for T-box 2 variant protein. // chr17 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0 /// BC052566 // GenBank // Homo sapiens T-box 2, mRNA (cDNA clone MGC:59687 IMAGE:6339405), complete cds. // chr17 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// U28049 // GenBank // Human TBX2 (TXB2) mRNA, complete cds. // chr17 // 96 // 70 // 27 // 28 // 0 /// AK127429 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ45521 fis, clone BRTHA2024712, highly similar to T-box transcription factor TBX2. // chr17 // 50 // 50 // 20 // 40 // 1 /// GENSCAN00000042001 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:61284750:61408951:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 70 // 27 // 28 // 0
ENST00000335108 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:61411751:61413280:1 gene:ENSG00000187013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC046200 // GenBank // Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 82, mRNA (cDNA clone MGC:57831 IMAGE:6152618), complete cds. // chr17 // 90 // 100 // 19 // 21 // 0
ENST00000363972 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:62036833:62036945:1 gene:ENSG00000200842 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT055145 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001144933 // RefSeq // Homo sapiens EF-hand calcium binding domain 3 (EFCAB3), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NM_173503 // RefSeq // Homo sapiens EF-hand calcium binding domain 3 (EFCAB3), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000305286 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:62380553:62416476:1 gene:ENSG00000172421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000450662 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:62370218:62416476:1 gene:ENSG00000172421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000518576 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:62380583:62395188:1 gene:ENSG00000172421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// BC101752 // GenBank // Homo sapiens EF-hand calcium binding domain 3, mRNA (cDNA clone MGC:126801 IMAGE:8069258), complete cds. // chr17 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC101778 // GenBank // Homo sapiens EF-hand calcium binding domain 3, mRNA (cDNA clone MGC:126827 IMAGE:8069284), complete cds. // chr17 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000520404 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:62380556:62406514:1 gene:ENSG00000172421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 71 // 52 // 10 // 14 // 0 /// GENSCAN00000024894 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:62303968:62416329:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
ENST00000516172 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:62383104:62383166:1 gene:ENSG00000251981 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// NONHSAT055153 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0
NM_181725 // RefSeq // Homo sapiens methyltransferase like 2A (METTL2A), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000311506 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:62423867:62450093:1 gene:ENSG00000087995 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000333483 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:62423875:62448914:1 gene:ENSG00000087995 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0 /// BC006985 // GenBank // Homo sapiens methyltransferase like 2A, mRNA (cDNA clone MGC:12209 IMAGE:3930328), complete cds. // chr17 // 75 // 80 // 6 // 8 // 0 /// ENST00000616852 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:62423891:62450822:1 gene:ENSG00000087995 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
ENST00000362827 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:62683905:62684010:1 gene:ENSG00000199697 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT055169 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000389520 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:63009560:63422356:1 gene:ENSG00000170921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_025185 // RefSeq // Homo sapiens tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 (TANC2), mRNA. // chr17 // 96 // 96 // 25 // 26 // 1 /// ENST00000424789 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:63009556:63427699:1 gene:ENSG00000170921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 96 // 25 // 26 // 1 /// ENST00000583356 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:63193994:63424138:1 gene:ENSG00000170921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 92 // 92 // 24 // 26 // 1 /// ENST00000613171 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:63389319:63422350:1 gene:ENSG00000170921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000021594 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:63009560:63421955:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 96 // 25 // 26 // 1
ENST00000606284 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:63471604:63472093:1 gene:ENSG00000228979 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr17 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000003052 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:63446333:63472095:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_005828 // RefSeq // Homo sapiens DDB1 and CUL4 associated factor 7 (DCAF7), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NR_073585 // RefSeq // Homo sapiens DDB1 and CUL4 associated factor 7 (DCAF7), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr17 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000431926 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:63550482:63594266:1 gene:ENSG00000136485 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 61 // 20 // 20 // 0 /// BC001264 // GenBank // Homo sapiens WD repeat domain 68, mRNA (cDNA clone MGC:5032 IMAGE:3458293), complete cds. // chr17 // 100 // 61 // 20 // 20 // 0 /// U94747 // GenBank // Human WD repeat protein HAN11 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000415273 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:63550500:63589785:1 gene:ENSG00000136485 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// AK294925 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60519 complete cds, highly similar to WD repeat protein 68. // chr17 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// AK303212 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54214 complete cds, highly similar to WD repeat protein 68. // chr17 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// ENST00000614556 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:63550461:63594266:1 gene:ENSG00000136485 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000615512 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:63550547:63585251:1 gene:ENSG00000136485 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000003071 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:63550678:63589172:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 48 // 16 // 16 // 0
NM_016360 // RefSeq // Homo sapiens translational activator of mitochondrially encoded cytochrome c oxidase I (TACO1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000258975 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:63600872:63608365:1 gene:ENSG00000136463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000581120 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:63600882:63608364:1 gene:ENSG00000136463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK094052 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ36733 fis, clone UTERU2012856, weakly similar to 26.4 KDA PROTEIN IN RUVC-ASPS INTERGENIC REGION. // chr17 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// AL833861 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp762E1715 (from clone DKFZp762E1715). // chr17 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// BC005049 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 44, mRNA (cDNA clone MGC:12906 IMAGE:3630410), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC007744 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 44, mRNA (cDNA clone MGC:13286 IMAGE:4099917), complete cds. // chr17 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000003075 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:63601084:63608002:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT055208 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF090929 // GenBank // Homo sapiens clone HQ0477 PRO0477p mRNA, complete cds. // chr17 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NR_004380 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 104 (SNORD104), small nucleolar RNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000362883 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:64146083:64146152:1 gene:ENSG00000199753 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONHSAT055274 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000538774 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:64491523:64491789:1 gene:ENSG00000256826 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000029915 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:64491523:64491789:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENST00000516844 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:66267743:66267848:1 gene:ENSG00000252653 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT055385 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_002737 // RefSeq // Homo sapiens protein kinase C, alpha (PRKCA), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000413366 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:66302826:66810743:1 gene:ENSG00000154229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// AB451258 // GenBank // Homo sapiens PRKCA mRNA for protein kinase C alpha type, complete cds, clone: FLJ08071AAAN. // chr17 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// AY633609 // GenBank // Homo sapiens aging-associated gene 6 protein mRNA, complete cds. // chr17 // 95 // 66 // 18 // 19 // 0 /// BC109273 // GenBank // Homo sapiens protein kinase C, alpha, mRNA (cDNA clone MGC:129900 IMAGE:40028305), complete cds. // chr17 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// BC109274 // GenBank // Homo sapiens protein kinase C, alpha, mRNA (cDNA clone MGC:129901 IMAGE:40028308), complete cds. // chr17 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// XM_006721972 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens protein kinase C, alpha (PRKCA), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// ENST00000284384 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:66302860:66775127:1 gene:ENSG00000154229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1 /// ENST00000578063 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:66302636:66703864:1 gene:ENSG00000154229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// AB209475 // GenBank // Homo sapiens mRNA for protein kinase C, alpha variant protein. // chr17 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1 /// BC053321 // GenBank // Homo sapiens protein kinase C, alpha, mRNA (cDNA clone IMAGE:6538304), partial cds. // chr17 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// GENSCAN00000021295 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:66629108:66792873:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1
ENST00000471015 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:66364029:66364320:1 gene:ENSG00000244044 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT055388 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENST00000516876 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:66638271:66638374:1 gene:ENSG00000252685 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT055392 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000533854 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:66835117:66885486:1 gene:ENSG00000075429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// AK290171 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77035 complete cds, highly similar to Homo sapiens calcium channel, voltage-dependent, gamma subunit 5 (CACNG5), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// NM_145811 // RefSeq // Homo sapiens calcium channel, voltage-dependent, gamma subunit 5 (CACNG5), mRNA. // chr17 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// ENST00000307139 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:66877273:66885278:1 gene:ENSG00000075429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// AF361351 // GenBank // Homo sapiens voltage-dependent calcium channel gamma-5 subunit (CACNG5) mRNA, complete cds. // chr17 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// AF458898 // GenBank // Homo sapiens voltage dependent calcium channel gamma 5 subunit (CACNG5) mRNA, complete cds. // chr17 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// BC101607 // GenBank // Homo sapiens calcium channel, voltage-dependent, gamma subunit 5, mRNA (cDNA clone MGC:126656 IMAGE:8069113), complete cds. // chr17 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// BC101633 // GenBank // Homo sapiens calcium channel, voltage-dependent, gamma subunit 5, transcript variant 1, mRNA (cDNA clone MGC:126682 IMAGE:8069139), complete cds. // chr17 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// GENSCAN00000021294 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:66877333:66885240:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
NM_014405 // RefSeq // Homo sapiens calcium channel, voltage-dependent, gamma subunit 4 (CACNG4), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000262138 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:66964910:67033398:1 gene:ENSG00000075461 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AF162692 // GenBank // Homo sapiens putative voltage-gated calcium channel gamma-4 subunit (CACNG4) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// BC034532 // GenBank // Homo sapiens calcium channel, voltage-dependent, gamma subunit 4, mRNA (cDNA clone MGC:24983 IMAGE:4939335), complete cds. // chr17 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000021296 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:67002503:67056271:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_000727 // RefSeq // Homo sapiens calcium channel, voltage-dependent, gamma subunit 1 (CACNG1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000226021 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:67044590:67056797:1 gene:ENSG00000108878 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF086300 // GenBank // Homo sapiens full length insert cDNA clone ZD50F02. // chr17 // 100 // 34 // 11 // 11 // 0 /// BC069493 // GenBank // Homo sapiens calcium channel, voltage-dependent, gamma subunit 1, mRNA (cDNA clone MGC:96990 IMAGE:7262199), complete cds. // chr17 // 92 // 75 // 22 // 24 // 0 /// BC113486 // GenBank // Homo sapiens calcium channel, voltage-dependent, gamma subunit 1, mRNA (cDNA clone MGC:142046 IMAGE:8322538), complete cds. // chr17 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// BC113492 // GenBank // Homo sapiens calcium channel, voltage-dependent, gamma subunit 1, mRNA (cDNA clone MGC:142052 IMAGE:8322544), complete cds. // chr17 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// L07738 // GenBank // Homo sapiens DHP-sensitive calcium channel gamma subunit (CACNLG) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000021296 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:67002503:67056271:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1
ENST00000363749 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:67268110:67268228:1 gene:ENSG00000200619 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT055415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
ENST00000384679 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:67271469:67271607:1 gene:ENSG00000207410 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT055416 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NR_003706 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 38B (SNORA38B), small nucleolar RNA. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000363524 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:67740669:67740799:1 gene:ENSG00000200394 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT055434 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NR_027283 // RefSeq // Homo sapiens Rho GTPase activating protein 27 pseudogene (LOC440461), non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000589904 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:68198921:68199596:1 gene:ENSG00000267472 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr17 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT055518 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONHSAT055519 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000034594 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:68170221:68199701:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1
AF119885 // GenBank HTC // Homo sapiens PRO2543 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
ENST00000362931 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:69985986:69986094:1 gene:ENSG00000199801 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT055606 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_000891 // RefSeq // Homo sapiens potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 2 (KCNJ2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000243457 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:70169535:70180048:1 gene:ENSG00000123700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000535240 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:70168673:70176323:1 gene:ENSG00000123700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// AF153820 // GenBank // Homo sapiens inwardly-rectifying potassium channel Kir2.1 (KCNJ2) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK314081 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ94754, highly similar to Homo sapiens potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 2 (KCNJ2), mRNA. // chr17 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// U12507 // GenBank // Human cardiac inward rectifier potassium channel (HH-IRK1) mRNA, complete cds. // chr17 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// U16861 // GenBank // Human inward rectifying potassium channel mRNA, complete cds. // chr17 // 89 // 73 // 17 // 19 // 0 /// U24055 // GenBank // Human inward rectifier K+ channel protein (hirk1) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000028337 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:70168237:70176323:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
ENST00000412707 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:71620978:71621436:1 gene:ENSG00000228118 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000545441 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_8_CTG4:71620972:71621641:1 gene:ENSG00000275193 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSG00000228118 // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000018510 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_8_CTG4:71620978:71621436:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000020131 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:71620978:71621436:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NR_110124 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 1152 (LINC01152), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NR_110132 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 1152 (LINC01152), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000472655 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:72030654:72041297:1 gene:ENSG00000256124 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// TCONS_00025128-XLOC_012299 // Rinn lincRNA // linc-SOX9-2 chr17:+:70026956-70035822 // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT055642 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 73 // 100 // 16 // 22 // 0
NM_000346 // RefSeq // Homo sapiens SRY (sex determining region Y)-box 9 (SOX9), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000245479 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:72121020:72126420:1 gene:ENSG00000125398 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK295455 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58176 complete cds, highly similar to Transcription factor SOX-9. // chr17 // 95 // 70 // 20 // 21 // 0 /// BC007951 // GenBank // Homo sapiens SRY (sex determining region Y)-box 9, mRNA (cDNA clone MGC:14364 IMAGE:4299305), complete cds. // chr17 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// BC056420 // GenBank // Homo sapiens SRY (sex determining region Y)-box 9, mRNA (cDNA clone MGC:65106 IMAGE:6200521), complete cds. // chr17 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BT006875 // GenBank // Homo sapiens SRY (sex determining region Y)-box 9 (campomelic dysplasia, autosomal sex-reversal) mRNA, complete cds. // chr17 // 94 // 60 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000020139 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:72086212:72124387:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1
NM_001050 // RefSeq // Homo sapiens somatostatin receptor 2 (SSTR2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000357585 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:73165012:73171046:1 gene:ENSG00000180616 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK290745 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78209 complete cds, highly similar to Homo sapiens somatostatin receptor 2, mRNA. // chr17 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// BC019610 // GenBank // Homo sapiens somatostatin receptor 2, mRNA (cDNA clone MGC:24950 IMAGE:3875163), complete cds. // chr17 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// BC095495 // GenBank // Homo sapiens somatostatin receptor 2, mRNA (cDNA clone MGC:111698 IMAGE:6971895), complete cds. // chr17 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// BT019926 // GenBank // Homo sapiens somatostatin receptor 2 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000579323 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:73165012:73169311:1 gene:ENSG00000180616 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// GENSCAN00000017336 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:73169320:73170429:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// NONHSAT055718 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// ENST00000580671 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:73164977:73196593:1 gene:ENSG00000264860 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_018714 // RefSeq // Homo sapiens component of oligomeric golgi complex 1 (COG1), mRNA. // chr17 // 100 // 89 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000299886 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:73192990:73208507:1 gene:ENSG00000166685 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000438720 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:73193072:73208504:1 gene:ENSG00000166685 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000582512 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:73205615:73208420:1 gene:ENSG00000166685 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 18 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000582587 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:73193093:73197081:1 gene:ENSG00000166685 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 32 // 14 // 14 // 0 /// AB037802 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1381 protein, partial cds. // chr17 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// BC021985 // GenBank // Homo sapiens component of oligomeric golgi complex 1, mRNA (cDNA clone MGC:2368 IMAGE:2821581), complete cds. // chr17 // 100 // 89 // 39 // 39 // 0 /// BC047465 // GenBank // Homo sapiens component of oligomeric golgi complex 1, mRNA (cDNA clone MGC:51244 IMAGE:5285077), complete cds. // chr17 // 91 // 100 // 40 // 44 // 0 /// ENST00000618996 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:73192632:73208503:1 gene:ENSG00000166685 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000017342 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:73193070:73232422:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 80 // 35 // 35 // 0
ENST00000359939 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:74326231:74351345:1 gene:ENSG00000196169 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000547389 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:74326257:74351319:1 gene:ENSG00000196169 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000551294 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:74326210:74352326:1 gene:ENSG00000196169 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 77 // 22 // 23 // 0 /// AK094619 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ37300 fis, clone BRAMY2015782, moderately similar to KINESIN-LIKE PROTEIN. // chr17 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC093631 // GenBank // Homo sapiens kinesin family member 19, mRNA (cDNA clone MGC:120666 IMAGE:7939476), complete cds. // chr17 // 92 // 83 // 23 // 25 // 0 /// BC104852 // GenBank // Homo sapiens kinesin family member 19, mRNA (cDNA clone MGC:132512 IMAGE:8143855), complete cds. // chr17 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// BC143327 // GenBank // Homo sapiens kinesin family member 19, mRNA (cDNA clone MGC:176849 IMAGE:9051832), complete cds. // chr17 // 92 // 80 // 22 // 24 // 0 /// NM_153209 // RefSeq // Homo sapiens kinesin family member 19 (KIF19), mRNA. // chr17 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// ENST00000389916 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:74326212:74355820:1 gene:ENSG00000196169 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// GENSCAN00000013710 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:74340697:74355312:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1
NM_181790 // RefSeq // Homo sapiens G protein-coupled receptor 142 (GPR142), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000335666 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:74367458:74372600:1 gene:ENSG00000257008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000582579 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:74367407:74372622:1 gene:ENSG00000257008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000585308 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:74367458:74371840:1 gene:ENSG00000257008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// AB196530 // GenBank // Homo sapiens GPRg1b mRNA for G protein-coupled receptor, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY288421 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 142 (GPR142) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000013734 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:74369541:74372600:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NM_152460 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 77 (C17orf77), mRNA. // chr17 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000328023 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:74590502:74594209:1 gene:ENSG00000182352 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000392620 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:74584918:74594209:1 gene:ENSG00000182352 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000524389 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:74584679:74592161:1 gene:ENSG00000182352 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1
NM_017728 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 104 (TMEM104), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000335464 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:74776483:74839779:1 gene:ENSG00000109066 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000578764 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:74776500:74795589:1 gene:ENSG00000109066 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000582330 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:74776520:74839753:1 gene:ENSG00000109066 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AK291159 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76820 complete cds. // chr17 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// BC037278 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 104, mRNA (cDNA clone MGC:33006 IMAGE:4825529), complete cds. // chr17 // 96 // 87 // 26 // 27 // 0 /// ENST00000417024 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:74776499:74839752:1 gene:ENSG00000109066 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1 /// ENST00000582773 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:74776500:74839751:1 gene:ENSG00000109066 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 68 // 68 // 21 // 31 // 1 /// AK296621 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51226 complete cds. // chr17 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1 /// GENSCAN00000013746 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:74785533:74805869:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1
NM_178160 // RefSeq // Homo sapiens otopetrin 2 (OTOP2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000331427 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:74924275:74933911:1 gene:ENSG00000183034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000580223 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:74924603:74933912:1 gene:ENSG00000183034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000584711 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:74924275:74928045:1 gene:ENSG00000183034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1 /// AK000063 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ20056 fis, clone COL01180. // chr17 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// GENSCAN00000013715 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:74924633:74933545:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0
NM_001272005 // RefSeq // Homo sapiens otopetrin 3 (OTOP3), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_178233 // RefSeq // Homo sapiens otopetrin 3 (OTOP3), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000328801 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:74935802:74949988:1 gene:ENSG00000182938 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000580749 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:74935719:74949992:1 gene:ENSG00000182938 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC143799 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:9052313. // chr17 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000013707 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:74941413:74949416:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
NM_014603 // RefSeq // Homo sapiens cerebellar degeneration-related protein 2-like (CDR2L), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000337231 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:74987632:75005800:1 gene:ENSG00000109089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK294006 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60466 complete cds, highly similar to Homo sapiens paraneoplastic antigen (HUMPPA), mRNA. // chr17 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// BC047534 // GenBank // Homo sapiens cerebellar degeneration-related protein 2-like, mRNA (cDNA clone MGC:39548 IMAGE:5288296), complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013731 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:74988044:75004074:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_001545 // RefSeq // Homo sapiens immature colon carcinoma transcript 1 (ICT1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000301585 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:75012674:75021261:1 gene:ENSG00000167862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000580800 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:75012737:75020575:1 gene:ENSG00000167862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 94 // 64 // 17 // 18 // 0 /// ENST00000583772 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:75020229:75021261:1 gene:ENSG00000167862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000584208 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:75012670:75020939:1 gene:ENSG00000167862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 91 // 79 // 20 // 22 // 0 /// AK222553 // GenBank // Homo sapiens mRNA for immature colon carcinoma transcript 1 variant, clone: adSU02195. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC015335 // GenBank // Homo sapiens immature colon carcinoma transcript 1, mRNA (cDNA clone MGC:21251 IMAGE:4418983), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BT007111 // GenBank // Homo sapiens immature colon carcinoma transcript 1 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000013712 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:75012687:75020676:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
NM_015353 // RefSeq // Homo sapiens potassium channel tetramerization domain containing 2 (KCTD2), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NR_110834 // RefSeq // Homo sapiens potassium channel tetramerization domain containing 2 (KCTD2), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr17 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// NR_110835 // RefSeq // Homo sapiens potassium channel tetramerization domain containing 2 (KCTD2), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr17 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000322444 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:75047245:75065884:1 gene:ENSG00000180901 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000375286 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:75047184:75065889:1 gene:ENSG00000180901 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000577516 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:75048843:75063095:1 gene:ENSG00000180901 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// D79998 // GenBank // Homo sapiens KIAA0176 mRNA, complete cds. // chr17 // 97 // 97 // 32 // 33 // 0 /// ENST00000581589 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:75032612:75063263:1 gene:ENSG00000180901 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 32 // 32 // 11 // 34 // 1 /// GENSCAN00000013704 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:75047251:75077755:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 50 // 50 // 17 // 34 // 1
NM_024585 // RefSeq // Homo sapiens armadillo repeat containing 7 (ARMC7), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000245543 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:75109987:75130265:1 gene:ENSG00000125449 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000581078 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:75109952:75129170:1 gene:ENSG00000125449 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 88 // 70 // 14 // 16 // 0 /// ENST00000584947 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:75110181:75114830:1 gene:ENSG00000125449 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 43 // 10 // 10 // 0 /// AK300997 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52169 complete cds, moderately similar to Armadillo repeat-containing protein 7. // chr17 // 88 // 70 // 14 // 16 // 0 /// BC011728 // GenBank // Homo sapiens armadillo repeat containing 7, mRNA (cDNA clone MGC:19466 IMAGE:4423125), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000582136 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:75109978:75114826:1 gene:ENSG00000125449 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 57 // 57 // 13 // 23 // 1 /// GENSCAN00000013724 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:75110289:75129038:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0
ENST00000516233 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:75145670:75145762:1 gene:ENSG00000252042 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT055863 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_015971 // RefSeq // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein S7 (MRPS7), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000245539 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:75261674:75266373:1 gene:ENSG00000125445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000579002 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:75261912:75266330:1 gene:ENSG00000125445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000581993 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:75262626:75266363:1 gene:ENSG00000125445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 62 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000583407 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:75261961:75266084:1 gene:ENSG00000125445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000584678 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:75262673:75266373:1 gene:ENSG00000125445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 62 // 21 // 21 // 0 /// BC000241 // GenBank // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein S7, mRNA (cDNA clone MGC:711 IMAGE:3350465), complete cds. // chr17 // 97 // 97 // 32 // 33 // 0 /// BC050641 // GenBank // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein S7, mRNA (cDNA clone IMAGE:6150671). // chr17 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000579761 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:75261674:75264490:1 gene:ENSG00000125445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 62 // 62 // 21 // 34 // 1 /// GENSCAN00000013727 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:75261901:75265923:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0
ENST00000413334 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:75338827:75339147:1 gene:ENSG00000228007 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000034532 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:75333604:75339147:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT055885 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000365462 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:75431990:75432087:1 gene:ENSG00000202332 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT055893 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001162995 // RefSeq // Homo sapiens small integral membrane protein 5 (SMIM5), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// XM_006722013 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens small integral membrane protein 5 (SMIM5), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000375215 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:75633434:75641404:1 gene:ENSG00000204323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC027861 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5198488, partial cds. // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NR_028439 // RefSeq // Homo sapiens small integral membrane protein 5 (SMIM5), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 1 /// ENST00000537494 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:75636595:75641400:1 gene:ENSG00000204323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 1 /// AL832643 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp451K2118 (from clone DKFZp451K2118). // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 1 /// NONHSAT055925 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 1
NM_001080419 // RefSeq // Homo sapiens unkempt family zinc finger (UNK), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006722144 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens unkempt family zinc finger (UNK), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// XM_006722148 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens unkempt family zinc finger (UNK), transcript variant X5, mRNA. // chr17 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000586217 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:75812148:75815221:1 gene:ENSG00000132478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000589666 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:75784771:75825799:1 gene:ENSG00000132478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000034535 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:75784881:75824417:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0
NR_037709 // RefSeq // Homo sapiens TEN1-CDK3 readthrough (NMD candidate) (TEN1-CDK3), long non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000567351 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:75979231:76005998:1 gene:ENSG00000261408 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000569284 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:75979260:76005999:1 gene:ENSG00000261408 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BX647274 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686C0493 (from clone DKFZp686C0493). // chr17 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// NM_001113324 // RefSeq // Homo sapiens TEN1 CST complex subunit (TEN1), mRNA. // chr17 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// ENST00000397640 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:75979220:76000586:1 gene:ENSG00000257949 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// ENST00000588202 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:75979241:76000521:1 gene:ENSG00000257949 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// BX648576 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686G1463 (from clone DKFZp686G1463). // chr17 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_001258 // RefSeq // Homo sapiens cyclin-dependent kinase 3 (CDK3), mRNA. // chr17 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NR_037709 // RefSeq // Homo sapiens TEN1-CDK3 readthrough (NMD candidate) (TEN1-CDK3), long non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000425876 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:76001338:76005999:1 gene:ENSG00000250506 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000448471 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:76000906:76005999:1 gene:ENSG00000261408 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSG00000250506 // chr17 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000567351 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:75979231:76005998:1 gene:ENSG00000261408 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000569284 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:75979260:76005999:1 gene:ENSG00000261408 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000586261 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:76001715:76003366:1 gene:ENSG00000250506 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 89 // 58 // 16 // 18 // 0 /// ENST00000588812 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:76000906:76002518:1 gene:ENSG00000250506 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 42 // 13 // 13 // 0 /// BX647274 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686C0493 (from clone DKFZp686C0493). // chr17 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000034527 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:76000922:76005423:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0
NM_003857 // RefSeq // Homo sapiens galanin receptor 2 (GALR2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000329003 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:76074794:76077541:1 gene:ENSG00000182687 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AF040630 // GenBank // Homo sapiens galanin receptor GalR2 mRNA, complete cds. // chr17 // 88 // 100 // 21 // 24 // 0 /// AF080586 // GenBank // Homo sapiens galanin receptor type 2 (GALR2) mRNA, complete cds. // chr17 // 90 // 88 // 19 // 21 // 0 /// BC069130 // GenBank // Homo sapiens galanin receptor 2, mRNA (cDNA clone MGC:95411 IMAGE:7216986), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC074914 // GenBank // Homo sapiens galanin receptor 2, mRNA (cDNA clone MGC:103946 IMAGE:30915339), complete cds. // chr17 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// BC074915 // GenBank // Homo sapiens galanin receptor 2, mRNA (cDNA clone MGC:104105 IMAGE:30915558), complete cds. // chr17 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// BC109051 // GenBank // Homo sapiens galanin receptor 2, mRNA (cDNA clone MGC:125983 IMAGE:40031879), complete cds. // chr17 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// BC109052 // GenBank // Homo sapiens galanin receptor 2, mRNA (cDNA clone MGC:125984 IMAGE:40031882), complete cds. // chr17 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// EF577401 // GenBank // Homo sapiens galanin receptor 2 mRNA, complete cds. // chr17 // 94 // 75 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000034547 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:76074884:76077431:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 94 // 75 // 17 // 18 // 0
NM_182565 // RefSeq // Homo sapiens UBA-like domain containing 2 (UBALD2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000327490 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:76265202:76271299:1 gene:ENSG00000185262 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC035511 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 100, member B, mRNA (cDNA clone MGC:29814 IMAGE:5091979), complete cds. // chr17 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC060859 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 100, member B, mRNA (cDNA clone MGC:71792 IMAGE:30333976), complete cds. // chr17 // 94 // 57 // 15 // 16 // 0 /// ENST00000589240 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:76265703:76270586:1 gene:ENSG00000185262 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// GENSCAN00000034548 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:76265119:76270505:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 92 // 43 // 11 // 12 // 0 /// AF109186 // GenBank HTC // Homo sapiens FWP004 mRNA, complete cds. // chr17 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
ENST00000515970 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:76319376:76319473:1 gene:ENSG00000251779 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT056006 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONHSAT056007 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_004397 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 1C (SNORD1C), small nucleolar RNA. // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000363315 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:76558791:76558868:1 gene:ENSG00000274091 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA gene:ENSG00000163597 // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000587743 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:76557769:76560433:1 gene:ENSG00000163597 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK123993 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ41999 fis, clone SPLEN2029683. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000448136 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:76557778:76565348:1 gene:ENSG00000163597 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:lincRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1 /// BC042949 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4800042. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1 /// NONHSAT056044 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT056050 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT056048 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NR_004396 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 1B (SNORD1B), small nucleolar RNA. // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000363091 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:76561109:76561192:1 gene:ENSG00000199961 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT056051 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NR_004395 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 1A (SNORD1A), small nucleolar RNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000364968 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:76561634:76561705:1 gene:ENSG00000278261 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA gene:ENSG00000163597 // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000591956 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:76557766:76561751:1 gene:ENSG00000163597 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:lincRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT056041 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT056055 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000362865 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:76656320:76656422:1 gene:ENSG00000199735 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 86 // 6 // 6 // 0 /// NONHSAT056066 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 86 // 6 // 6 // 0
NR_003013 // RefSeq // Homo sapiens small Cajal body-specific RNA 16 (SCARNA16), guide RNA. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000366365 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:77088868:77090098:1 gene:ENSG00000234912 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:lincRNA // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000515981 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:77089307:77089493:1 gene:ENSG00000275143 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA gene:ENSG00000234912 // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT056115 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT056116 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000363781 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:77442109:77442213:1 gene:ENSG00000200651 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// AK093770 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ36451 fis, clone THYMU2013757. // chr17 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// AK097965 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ40646 fis, clone THYMU2017398. // chr17 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT056151 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000459500 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:77920098:77920258:1 gene:ENSG00000238898 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT056174 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001142640 // RefSeq // Homo sapiens trinucleotide repeat containing 6C (TNRC6C), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NM_018996 // RefSeq // Homo sapiens trinucleotide repeat containing 6C (TNRC6C), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000301624 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:78005056:78108835:1 gene:ENSG00000078687 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000335749 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:78005056:78108835:1 gene:ENSG00000078687 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000588061 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:78004168:78107464:1 gene:ENSG00000078687 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000588847 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:78004168:78107464:1 gene:ENSG00000078687 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000591851 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:78051067:78077779:1 gene:ENSG00000078687 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 37 // 13 // 13 // 0 /// AK098609 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ25743 fis, clone TST05966. // chr17 // 100 // 37 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000014432 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:78049063:78112576:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0
ENST00000459412 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:78066947:78067053:1 gene:ENSG00000238658 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT056181 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001163075 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 99 (C17orf99), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000340363 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:78146353:78166177:1 gene:ENSG00000187997 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000451352 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:78160064:78166155:1 gene:ENSG00000187997 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 68 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000586029 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:78161040:78166135:1 gene:ENSG00000187997 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 47 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000591995 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:78146854:78164304:1 gene:ENSG00000187997 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 80 // 53 // 8 // 10 // 0 /// AK303128 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50084 complete cds. // chr17 // 100 // 68 // 13 // 13 // 0 /// AY358510 // GenBank // Homo sapiens clone DNA57836 GLPG464 (UNQ464) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT056197 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 47 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000014461 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:78131589:78171936:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 42 // 42 // 8 // 19 // 1
ENST00000363193 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:78399935:78400063:1 gene:ENSG00000200063 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT056226 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001042573 // RefSeq // Homo sapiens endo-beta-N-acetylglucosaminidase (ENGASE), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006722016 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens endo-beta-N-acetylglucosaminidase (ENGASE), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000300682 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:79080312:79088599:1 gene:ENSG00000167280 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000579016 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:79074945:79086696:1 gene:ENSG00000167280 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// AF512564 // GenBank // Homo sapiens endo-beta-N-acetylglucosaminidase mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// BC024213 // GenBank // Homo sapiens endo-beta-N-acetylglucosaminidase, mRNA (cDNA clone IMAGE:3543906), partial cds. // chr17 // 94 // 60 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000014194 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:79074945:79087180:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0
NM_178543 // RefSeq // Homo sapiens ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 7 (ENPP7), mRNA. // chr17 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000328313 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:79730919:79742222:1 gene:ENSG00000182156 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AK126250 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44262 fis, clone TLIVE2002336, weakly similar to Mus musculus ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 5 (Enpp5). // chr17 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// AY230663 // GenBank // Homo sapiens intestinal alkaline sphingomyelinase mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// AY358622 // GenBank // Homo sapiens clone DNA108700 RGLA3077 (UNQ3077) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// BC041453 // GenBank // Homo sapiens ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 7, mRNA (cDNA clone MGC:50179 IMAGE:5186743), complete cds. // chr17 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000043397 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:79731140:79775946:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 88 // 74 // 15 // 17 // 0
NM_032647 // RefSeq // Homo sapiens chromobox homolog 2 (CBX2), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000269399 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:79778194:79782532:1 gene:ENSG00000173894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC004252 // GenBank // Homo sapiens chromobox homolog 2 (Pc class homolog, Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:3626683), complete cds. // chr17 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC119759 // GenBank // Homo sapiens chromobox homolog 2 (Pc class homolog, Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:40119316), complete cds. // chr17 // 94 // 65 // 16 // 17 // 0 /// BC119760 // GenBank // Homo sapiens chromobox homolog 2 (Pc class homolog, Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:40119319), complete cds. // chr17 // 94 // 65 // 16 // 17 // 0 /// NM_005189 // RefSeq // Homo sapiens chromobox homolog 2 (CBX2), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// ENST00000310942 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:79778132:79787983:1 gene:ENSG00000173894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// ENST00000571484 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:79778163:79779739:1 gene:ENSG00000173894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// GENSCAN00000043407 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:79778236:79785042:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// NONHSAT056307 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_000152 // RefSeq // Homo sapiens glucosidase, alpha; acid (GAA), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NM_001079803 // RefSeq // Homo sapiens glucosidase, alpha; acid (GAA), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NM_001079804 // RefSeq // Homo sapiens glucosidase, alpha; acid (GAA), transcript variant 3, mRNA. // chr17 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000302262 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:80101704:80119879:1 gene:ENSG00000171298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000390015 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:80101594:80119877:1 gene:ENSG00000171298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// AK299462 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57046 complete cds, highly similar to Lysosomal alpha-glucosidase precursor (EC 3.2.1.20). // chr17 // 86 // 52 // 12 // 14 // 0 /// BC040431 // GenBank // Homo sapiens glucosidase, alpha; acid, mRNA (cDNA clone MGC:48746 IMAGE:5739991), complete cds. // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// DQ907243 // GenBank // Homo sapiens alpha-glucosidase (GAA) mRNA, GAA-P457L allele, complete cds. // chr17 // 91 // 81 // 20 // 22 // 0 /// M34424 // GenBank // Human acid alpha-glucosidase (GAA) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000043404 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:80104587:80119299:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
NM_020954 // RefSeq // Homo sapiens ring finger protein 213 (RNF213), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000319921 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:80260870:80321463:1 gene:ENSG00000173821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000559070 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:80287959:80336900:1 gene:ENSG00000173821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 96 // 71 // 24 // 25 // 0 /// AB046838 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1618 protein, partial cds. // chr17 // 96 // 71 // 24 // 25 // 0 /// BC036891 // GenBank // Homo sapiens KIAA1618, mRNA (cDNA clone MGC:46622 IMAGE:5501834), complete cds. // chr17 // 96 // 69 // 23 // 24 // 0 /// BC040341 // GenBank // Homo sapiens KIAA1618, mRNA (cDNA clone MGC:9929 IMAGE:3873001), complete cds. // chr17 // 96 // 71 // 24 // 25 // 0 /// NM_001256071 // RefSeq // Homo sapiens ring finger protein 213 (RNF213), transcript variant 3, mRNA. // chr17 // 86 // 86 // 30 // 35 // 1 /// ENST00000508628 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:80260866:80395312:1 gene:ENSG00000173821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 89 // 89 // 31 // 35 // 1 /// ENST00000582970 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:80260868:80398786:1 gene:ENSG00000173821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 86 // 86 // 30 // 35 // 1 /// AB537889 // GenBank // Homo sapiens mystr mRNA for mysterin, complete cds. // chr17 // 86 // 86 // 30 // 35 // 1 /// GENSCAN00000017471 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:80286894:80309677:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 34 // 12 // 12 // 0
NM_024591 // RefSeq // Homo sapiens charged multivesicular body protein 6 (CHMP6), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000325167 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:80991841:81000133:1 gene:ENSG00000176108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000571457 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:80994644:81009517:1 gene:ENSG00000176108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 38 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000572525 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:80991598:80999145:1 gene:ENSG00000176108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// AK292105 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78126 complete cds. // chr17 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// AY329087 // GenBank // Homo sapiens VPS20 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// BC010108 // GenBank // Homo sapiens chromatin modifying protein 6, mRNA (cDNA clone MGC:19477 IMAGE:3604039), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_005257668 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens charged multivesicular body protein 6 (CHMP6), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 54 // 54 // 13 // 24 // 1 /// ENST00000572778 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:80994581:80998670:1 gene:ENSG00000176108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 46 // 46 // 11 // 24 // 1 /// GENSCAN00000017531 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:80987018:80999076:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 54 // 54 // 13 // 24 // 1
AF218021 // GenBank // Homo sapiens clone PP552 unknown mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// AF258550 // GenBank // Homo sapiens PP13 mRNA, complete cds. // chr17 // 94 // 100 // 16 // 17 // 0 /// NONHSAT056419 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 53 // 53 // 9 // 17 // 1
NR_027255 // RefSeq // Homo sapiens AATK antisense RNA 1 (AATK-AS1), long non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000414089 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:81165507:81183164:1 gene:ENSG00000225180 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000571031 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:81165516:81181978:1 gene:ENSG00000225180 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr17 // 97 // 81 // 28 // 29 // 0 /// BC171777 // GenBank // Homo sapiens hypothetical LOC388428, mRNA (cDNA clone IMAGE:9054431). // chr17 // 86 // 81 // 25 // 29 // 0 /// NONHSAT056445 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONHSAT056446 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 97 // 81 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000017547 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:81180991:81183011:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1
NM_001291324 // RefSeq // Homo sapiens BAH domain and coiled-coil containing 1 (BAHCC1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000307745 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:81399740:81466332:1 gene:ENSG00000266074 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSG00000171282 // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000584436 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:81395475:81466331:1 gene:ENSG00000266074 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000012526 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:81432092:81463817:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 83 // 83 // 30 // 36 // 1
NM_001077182 // RefSeq // Homo sapiens fascin actin-bundling protein 2, retinal (FSCN2), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NM_012418 // RefSeq // Homo sapiens fascin actin-bundling protein 2, retinal (FSCN2), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000334850 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:81528532:81537080:1 gene:ENSG00000186765 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 71 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000417245 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:81528396:81537130:1 gene:ENSG00000186765 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// AF030165 // GenBank // Homo sapiens retinal fascin (FSCN2) mRNA, complete cds. // chr17 // 94 // 100 // 16 // 17 // 0 /// BC126295 // GenBank // Homo sapiens fascin homolog 2, actin-bundling protein, retinal (Strongylocentrotus purpuratus), mRNA (cDNA clone MGC:161573 IMAGE:8992011), complete cds. // chr17 // 93 // 88 // 14 // 15 // 0 /// BC130330 // GenBank // Homo sapiens fascin homolog 2, actin-bundling protein, retinal (Strongylocentrotus purpuratus), mRNA (cDNA clone MGC:163202 IMAGE:40146361), complete cds. // chr17 // 93 // 88 // 14 // 15 // 0 /// ENST00000527221 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:81536146:81536956:1 gene:ENSG00000186765 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 47 // 47 // 8 // 17 // 1 /// GENSCAN00000012469 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:81534089:81537080:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 53 // 53 // 9 // 17 // 1
ENST00000384294 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:81573490:81573602:1 gene:ENSG00000207021 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT056526 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_199287 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 137 (CCDC137), mRNA. // chr17 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENST00000329214 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:81666364:81673899:1 gene:ENSG00000185298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000571916 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:81667769:81672721:1 gene:ENSG00000185298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000574107 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:81666755:81672685:1 gene:ENSG00000185298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000575223 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:81666752:81673904:1 gene:ENSG00000185298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC009369 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 137, mRNA (cDNA clone MGC:16597 IMAGE:4110481), complete cds. // chr17 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// FJ649645 // GenBank // Homo sapiens hepatocellular carcinoma related protein 2 mRNA, complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000012461 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:81666414:81672704:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0
NM_002949 // RefSeq // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein L12 (MRPL12), mRNA. // chr17 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000333676 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:81703357:81707526:1 gene:ENSG00000262814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000541223 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:81703370:81707525:1 gene:ENSG00000262814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSG00000183048 // chr17 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// AF105278 // GenBank // Homo sapiens 5c5-2 protein mRNA, complete cds. // chr17 // 76 // 63 // 13 // 17 // 0 /// BC002344 // GenBank // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein L12, mRNA (cDNA clone MGC:8610 IMAGE:2961288), complete cds. // chr17 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC007497 // GenBank // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein L12, mRNA (cDNA clone MGC:3660 IMAGE:2959986), complete cds. // chr17 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// U25041 // GenBank // Homo sapiens 5C5 mRNA, complete cds. // chr17 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// ENST00000571730 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:81703371:81720539:1 gene:ENSG00000262660 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// NONHSAT056553 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 89 // 33 // 8 // 9 // 0 /// AK297076 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60124 complete cds, highly similar to Mitochondrial dicarboxylate carrier. // chr17 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// GENSCAN00000012496 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:81676999:81720077:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
NM_148896 // RefSeq // Homo sapiens neuropeptide B (NPB), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000333383 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:81902109:81902905:1 gene:ENSG00000183979 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000573081 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:81900745:81902898:1 gene:ENSG00000183979 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AB085942 // GenBank // Homo sapiens NPB mRNA for preproneuropeptide B, complete cds. // chr17 // 100 // 73 // 16 // 16 // 0 /// AF525737 // GenBank // Homo sapiens preproprotein L7 (PPL7) mRNA, complete cds. // chr17 // 95 // 95 // 20 // 21 // 0 /// AF525738 // GenBank // Homo sapiens preproprotein L7 (PPL7) precursor RNA, complete cds. // chr17 // 95 // 95 // 20 // 21 // 0 /// BC126128 // GenBank // Homo sapiens neuropeptide B, mRNA (cDNA clone MGC:161406 IMAGE:8991844), complete cds. // chr17 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// BC126485 // GenBank // Homo sapiens neuropeptide B, mRNA (cDNA clone MGC:161763 IMAGE:8992201), complete cds. // chr17 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// BC146875 // GenBank // Homo sapiens neuropeptide B, mRNA (cDNA clone MGC:181978 IMAGE:9056803), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC146890 // GenBank // Homo sapiens neuropeptide B, mRNA (cDNA clone MGC:181993 IMAGE:9056818), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000012460 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:81894478:81902748:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0
NM_144999 // RefSeq // Homo sapiens leucine rich repeat containing 45 (LRRC45), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// XM_006722275 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens leucine rich repeat containing 45 (LRRC45), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 77 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000306688 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:82023302:82031151:1 gene:ENSG00000169683 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000581227 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:82027007:82030632:1 gene:ENSG00000169683 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 49 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000583383 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:82023321:82025425:1 gene:ENSG00000169683 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 28 // 11 // 11 // 0 /// BC014109 // GenBank // Homo sapiens leucine rich repeat containing 45, mRNA (cDNA clone MGC:20806 IMAGE:4330269), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000583302 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:82026806:82029232:1 gene:ENSG00000169683 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 41 // 41 // 16 // 39 // 1 /// GENSCAN00000012497 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:82021991:82033829:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0
NONHSAT056644 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000012533 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:82101812:82151607:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0
AF318321 // GenBank HTC // Homo sapiens pp10472 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT056670 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_207459 // RefSeq // Homo sapiens testis expressed 19 (TEX19), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_005256368 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens testis expressed 19 (TEX19), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000333437 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:82359247:82363776:1 gene:ENSG00000182459 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC016939 // GenBank // Homo sapiens FLJ35767 protein, mRNA (cDNA clone MGC:21411 IMAGE:4419895), complete cds. // chr17 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// BC036191 // GenBank // Homo sapiens FLJ35767 protein, mRNA (cDNA clone MGC:39506 IMAGE:5297531), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC050391 // GenBank // Homo sapiens FLJ35767 protein, mRNA (cDNA clone MGC:51972 IMAGE:5745215), complete cds. // chr17 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC057820 // GenBank // Homo sapiens FLJ35767 protein, mRNA (cDNA clone MGC:71777 IMAGE:4837469), complete cds. // chr17 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0
NM_018949 // RefSeq // Homo sapiens urotensin 2 receptor (UTS2R), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000313135 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:82374230:82375586:1 gene:ENSG00000181408 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC136490 // GenBank // Homo sapiens urotensin 2 receptor, mRNA (cDNA clone MGC:168102 IMAGE:9020479), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023008 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:82374325:82383877:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000364369 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:82417226:82417321:1 gene:ENSG00000201239 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT056696 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_004514 // RefSeq // Homo sapiens forkhead box K2 (FOXK2), mRNA. // chr17 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000335255 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:82519715:82604607:1 gene:ENSG00000141568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000473637 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:82519713:82602392:1 gene:ENSG00000141568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// U58196 // GenBank // Homo sapiens interleukin enhancer binding factor 1 mRNA, complete cds. // chr17 // 95 // 83 // 19 // 20 // 0 /// U58197 // GenBank // Homo sapiens interleukin enhancer binding factor 2 mRNA, complete cds. // chr17 // 91 // 96 // 21 // 23 // 0 /// U58198 // GenBank // Human interleukin enhancer binding factor 3 mRNA, complete cds. // chr17 // 93 // 58 // 13 // 14 // 0 /// ENST00000529652 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:82593422:82602405:1 gene:ENSG00000141568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1 /// AK096800 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39481 fis, clone PROST2014585, highly similar to INTERLEUKIN ENHANCER-BINDING FACTOR 1. // chr17 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1 /// ENST00000622867 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:82519713:82602392:1 gene:ENSG00000141568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// M94654 // GenBank // Human interleukin enhancer binding factor 2 (ILF2) mRNA. // chr17 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT056732 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1
NM_022158 // RefSeq // Homo sapiens fructosamine 3 kinase (FN3K), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000300784 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:82735575:82751197:1 gene:ENSG00000167363 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000573841 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:82735725:82741526:1 gene:ENSG00000167363 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 39 // 9 // 9 // 0 /// BC042680 // GenBank // Homo sapiens fructosamine 3 kinase, mRNA (cDNA clone MGC:34205 IMAGE:5195472), complete cds. // chr17 // 91 // 100 // 21 // 23 // 0 /// ENST00000570734 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:82736072:82749895:1 gene:ENSG00000167363 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 48 // 48 // 11 // 23 // 1 /// AK054838 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ30276 fis, clone BRACE2002736, highly similar to Fructosamine-3-kinase (EC 2.7.1.-). // chr17 // 48 // 48 // 11 // 23 // 1 /// AK294871 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60514 complete cds, highly similar to Fructosamine-3-kinase (EC 2.7.1.-). // chr17 // 48 // 48 // 11 // 23 // 1 /// GENSCAN00000022958 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:82716756:82750755:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 83 // 83 // 19 // 23 // 1
NM_001004431 // RefSeq // Homo sapiens meteorin, glial cell differentiation regulator-like (METRNL), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000320095 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:83079691:83095119:1 gene:ENSG00000176845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC082252 // GenBank // Homo sapiens meteorin, glial cell differentiation regulator-like, mRNA (cDNA clone MGC:99788 IMAGE:6301543), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000616599 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_1_CTG9:83077631:83093184:1 gene:ENSG00000275031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0
NM_003585 // RefSeq // Homo sapiens double C2-like domains, beta (DOC2B), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// XM_006721362 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens double C2-like domains, beta (DOC2B), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000343572 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:156019:181636:-1 gene:ENSG00000272636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000496357 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_1_CTG1:146808:180568:-1 gene:ENSG00000272670 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0 /// D70830 // GenBank // Homo sapiens mRNA for Doc2 beta, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000613549 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:146808:181636:-1 gene:ENSG00000272636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000001339 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_1_CTG1:147441:180411:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0 /// GENSCAN00000016874 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:147441:181479:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_182705 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 101, member B (FAM101B), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000329099 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:439978:445939:-1 gene:ENSG00000183688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC031341 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 101, member B, mRNA (cDNA clone MGC:45871 IMAGE:4908279), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1 /// GENSCAN00000016890 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:443164:445274:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_001128159 // RefSeq // Homo sapiens vacuolar protein sorting 53 homolog (S. cerevisiae) (VPS53), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000437048 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:508668:714856:-1 gene:ENSG00000141252 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000541903 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:519119:522995:-1 gene:ENSG00000141252 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000576149 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:518953:676407:-1 gene:ENSG00000141252 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// AK091388 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ34069 fis, clone FCBBF3001924. // chr17 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// BC029560 // GenBank // Homo sapiens vacuolar protein sorting 53 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone IMAGE:4838620), complete cds. // chr17 // 95 // 100 // 18 // 19 // 0 /// EU021218 // GenBank // Homo sapiens Vps53 long isoform mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr17 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000570771 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:519855:532993:-1 gene:ENSG00000141252 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 53 // 53 // 10 // 19 // 1 /// GENSCAN00000016879 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:519128:714706:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT144728 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 53 // 53 // 10 // 19 // 1
ENST00000358446 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:763565:765319:-1 gene:ENSG00000262228 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:pseudogene gene:ENSG00000196737 // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000570809 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:763565:765319:-1 gene:ENSG00000262228 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AF269286 // GenBank // Homo sapiens HC6 (HC6) mRNA, complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// NONHSAT144761 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000475661 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:1604374:1604672:-1 gene:ENSG00000243704 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000578588 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_1_CTG2:1604374:1604672:-1 gene:ENSG00000273968 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA gene:ENSG00000263714 // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT144844 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NONHSAT144845 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_031430 // RefSeq // Homo sapiens Rab interacting lysosomal protein (RILP), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000301336 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:1646150:1650077:-1 gene:ENSG00000167705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000570858 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:1646193:1648846:-1 gene:ENSG00000167705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 93 // 54 // 13 // 14 // 0 /// ENST00000573398 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:1646500:1649068:-1 gene:ENSG00000167705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000574810 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:1646145:1649032:-1 gene:ENSG00000167705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// AJ404317 // GenBank // Homo sapiens mRNA for rab interacting lysosomal protein (RILP gene). // chr17 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// BC031621 // GenBank // Homo sapiens Rab interacting lysosomal protein, mRNA (cDNA clone MGC:34119 IMAGE:5174974), complete cds. // chr17 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000622136 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_1_CTG2:1646155:1650098:-1 gene:ENSG00000274145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005951 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_1_CTG2:1634758:1649804:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// GENSCAN00000033143 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:1634758:1649804:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_001164407 // RefSeq // Homo sapiens TLC domain containing 2 (TLCD2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000330676 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:17:1702790:1710438:-1 gene:ENSG00000185561 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000611774 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_1_CTG2:1702790:1710368:-1 gene:ENSG00000275246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005947 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_1_CTG2:1707770:1710242:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033122 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:1707770:1710242:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_052928 // RefSeq // Homo sapiens SET and MYND domain containing 4 (SMYD4), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// XM_005256436 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens SET and MYND domain containing 4 (SMYD4), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 58 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000305513 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:1779485:1829881:-1 gene:ENSG00000186532 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000570368 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:1800724:1829459:-1 gene:ENSG00000186532 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000571854 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:1800862:1830634:-1 gene:ENSG00000186532 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000573937 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:1804346:1829810:-1 gene:ENSG00000186532 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0 /// BC035077 // GenBank // Homo sapiens SET and MYND domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:43100 IMAGE:5260399), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000491788 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:1781692:1800805:-1 gene:ENSG00000186532 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 58 // 58 // 22 // 38 // 1 /// AB067523 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1936 protein, partial cds. // chr17 // 55 // 55 // 21 // 38 // 1 /// GENSCAN00000033150 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:1781286:1830095:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 42 // 16 // 16 // 0 /// NONHSAT144878 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0
NM_178568 // RefSeq // Homo sapiens reticulon 4 receptor-like 1 (RTN4RL1), mRNA. // chr17 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENST00000331238 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:1934677:2025345:-1 gene:ENSG00000185924 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NR_029674 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 132 (MIR132), microRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000591554 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:2049908:2050008:-1 gene:ENSG00000267200 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-132 // miRBase Micro RNA Database // MI0000449 Homo sapiens miR-132 stem-loop // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT144899 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029625 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 212 (MIR212), microRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000586026 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:2050271:2050380:-1 gene:ENSG00000267195 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-212 // miRBase Micro RNA Database // MI0000288 Homo sapiens miR-212 stem-loop // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT144900 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_020310 // RefSeq // Homo sapiens MAX network transcriptional repressor (MNT), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000174618 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:2384060:2401118:-1 gene:ENSG00000070444 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000574559 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:2395014:2400446:-1 gene:ENSG00000070444 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 20 // 8 // 8 // 0 /// AK291596 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75090 complete cds, highly similar to Homo sapiens MAX binding protein (MNT), mRNA. // chr17 // 100 // 70 // 28 // 28 // 0 /// BC117563 // GenBank // Homo sapiens MAX binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:131693 IMAGE:3904263), complete cds. // chr17 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000032414 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:2386901:2587819:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 70 // 70 // 28 // 40 // 1
ENST00000571332 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:17:2405562:2416085:-1 gene:ENSG00000127804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK093990 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ36671 fis, clone UTERU2004039. // chr17 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENST00000381977 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:2407013:2415849:-1 gene:ENSG00000127804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// NONHSAT144955 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT144957 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT144956 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
ENST00000462543 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:2557753:2558094:-1 gene:ENSG00000243049 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT144969 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_015229 // RefSeq // Homo sapiens clustered mitochondria (cluA/CLU1) homolog (CLUH), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_005256565 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens clustered mitochondria (cluA/CLU1) homolog (CLUH), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_005256567 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens clustered mitochondria (cluA/CLU1) homolog (CLUH), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000435359 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:2689386:2711633:-1 gene:ENSG00000132361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000570628 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:2689386:2712020:-1 gene:ENSG00000132361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000574210 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:2691553:2694949:-1 gene:ENSG00000132361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000574426 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:2691609:2711795:-1 gene:ENSG00000132361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000575014 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:2689389:2704371:-1 gene:ENSG00000132361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AK308854 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ98895. // chr17 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000032415 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:2690594:2711661:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0
NM_014566 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 1, subfamily D, member 5 (OR1D5), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000575751 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:3062669:3063607:-1 gene:ENSG00000262628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000046254 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:3062669:3063607:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_002548 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 1, subfamily D, member 2 (OR1D2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000331459 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:3092058:3092996:-1 gene:ENSG00000184166 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC069552 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 1, subfamily D, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:97043 IMAGE:7262253), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC106735 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 1, subfamily D, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:119942 IMAGE:40015766), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC106736 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 1, subfamily D, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:119943 IMAGE:40015767), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000046269 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:3092058:3133487:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_003555 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 1, subfamily G, member 1 (OR1G1), mRNA. // chr17 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000328890 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:3126584:3127581:-1 gene:ENSG00000183024 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// BC095520 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 1, subfamily G, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:111736 IMAGE:6971960), complete cds. // chr17 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000046269 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:3092058:3133487:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0
ENST00000571766 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:3153889:3154882:-1 gene:ENSG00000262085 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000046274 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:3153890:3154882:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000573491 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:3278775:3386293:-1 gene:ENSG00000262670 gene_biotype:sense_overlapping transcript_biotype:sense_overlapping // chr17 // 100 // 71 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000576166 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:3279104:3386293:-1 gene:ENSG00000262670 gene_biotype:sense_overlapping transcript_biotype:sense_overlapping // chr17 // 100 // 47 // 8 // 8 // 0 /// NONHSAT144998 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 71 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT144999 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 47 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000573901 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:3284478:3386339:-1 gene:ENSG00000262670 gene_biotype:sense_overlapping transcript_biotype:sense_overlapping // chr17 // 47 // 47 // 8 // 17 // 1 /// NONHSAT145000 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 47 // 47 // 8 // 17 // 1
NM_002550 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 3, subfamily A, member 1 (OR3A1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000323404 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:3291635:3292582:-1 gene:ENSG00000180090 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC069414 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 3, subfamily A, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:97033 IMAGE:7262242), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC096187 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 3, subfamily A, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:116838 IMAGE:40004009), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC096188 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 3, subfamily A, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:116839 IMAGE:40004010), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC096189 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 3, subfamily A, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:116840 IMAGE:40004011), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC096190 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 3, subfamily A, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:116841 IMAGE:40004012), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000615105 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:3291635:3292600:-1 gene:ENSG00000180090 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000046264 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:3291635:3302802:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_003553 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 1, subfamily E, member 1 (OR1E1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000322608 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:3397104:3398410:-1 gene:ENSG00000180016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000046260 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:3397466:3398407:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_003554 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 1, subfamily E, member 2 (OR1E2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000248384 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:3432870:3433841:-1 gene:ENSG00000127780 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC121105 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 1, subfamily E, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:150399 IMAGE:40120312), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC121106 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 1, subfamily E, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:150400 IMAGE:40120314), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000046258 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:3432870:3433838:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_013276 // RefSeq // Homo sapiens sedoheptulokinase (SHPK), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000225519 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:3608262:3636322:-1 gene:ENSG00000197417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000572919 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:3585149:3636249:-1 gene:ENSG00000262304 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// AF163573 // GenBank // Homo sapiens CARKL (CARKL) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC020543 // GenBank // Homo sapiens sedoheptulokinase, mRNA (cDNA clone MGC:21179 IMAGE:4413491), complete cds. // chr17 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// AK298360 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52918 complete cds, highly similar to Carbohydrate kinase-like protein (EC 2.7.1.-). // chr17 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// GENSCAN00000046275 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:3610560:3636219:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0
NM_002208 // RefSeq // Homo sapiens integrin, alpha E (antigen CD103, human mucosal lymphocyte antigen 1; alpha polypeptide) (ITGAE), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000263087 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:3714628:3801243:-1 gene:ENSG00000083457 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000570415 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:3714666:3728474:-1 gene:ENSG00000083457 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 23 // 8 // 8 // 0 /// BC113436 // GenBank // Homo sapiens integrin, alpha E (antigen CD103, human mucosal lymphocyte antigen 1; alpha polypeptide), mRNA (cDNA clone MGC:141996 IMAGE:8322488), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC117207 // GenBank // Homo sapiens integrin, alpha E (antigen CD103, human mucosal lymphocyte antigen 1; alpha polypeptide), mRNA (cDNA clone MGC:150816 IMAGE:40125758), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// L25851 // GenBank // Homo sapiens integrin alpha E precursor, mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000046259 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:3727853:3964518:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0
XR_429819 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 85 (C17orf85), transcript variant X3, misc_RNA. // chr17 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// ENST00000574911 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:3811523:3825021:-1 gene:ENSG00000074356 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000575815 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:3811528:3829291:-1 gene:ENSG00000074356 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// AK125048 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ43058 fis, clone BRTHA3007472, highly similar to Homo sapiens ELG protein (HSA277841), mRNA. // chr17 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NM_001114118 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 85 (C17orf85), mRNA. // chr17 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1 /// ENST00000389005 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:3812147:3846251:-1 gene:ENSG00000074356 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// GENSCAN00000046259 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:3727853:3964518:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
ENST00000572418 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:3896592:3916452:-1 gene:ENSG00000108405 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// AF020498 // GenBank // Homo sapiens P2X1 purinoceptor (P2X) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// BC027949 // GenBank // Homo sapiens purinergic receptor P2X, ligand-gated ion channel, 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5206874), complete cds. // chr17 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NM_002558 // RefSeq // Homo sapiens purinergic receptor P2X, ligand-gated ion channel, 1 (P2RX1), mRNA. // chr17 // 94 // 94 // 34 // 36 // 1 /// ENST00000225538 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:3896592:3916500:-1 gene:ENSG00000108405 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 92 // 92 // 33 // 36 // 1 /// BC044657 // GenBank // Homo sapiens purinergic receptor P2X, ligand-gated ion channel, 1, mRNA (cDNA clone MGC:47756 IMAGE:5756349), complete cds. // chr17 // 89 // 89 // 32 // 36 // 1 /// U45448 // GenBank // Human P2x1 receptor mRNA, complete cds. // chr17 // 89 // 89 // 32 // 36 // 1 /// GENSCAN00000046259 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:3727853:3964518:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 72 // 72 // 26 // 36 // 1
NM_003342 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin-conjugating enzyme E2G 1 (UBE2G1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000396981 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:4269259:4366482:-1 gene:ENSG00000132388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000571980 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:4272297:4366628:-1 gene:ENSG00000132388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 94 // 65 // 16 // 17 // 0 /// ENST00000572484 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:4271980:4366628:-1 gene:ENSG00000132388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// ENST00000574633 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:4272236:4366625:-1 gene:ENSG00000132388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// BC002775 // GenBank // Homo sapiens ubiquitin-conjugating enzyme E2G 1 (UBC7 homolog, yeast), mRNA (cDNA clone MGC:3733 IMAGE:3619626), complete cds. // chr17 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// BT007416 // GenBank // Homo sapiens ubiquitin-conjugating enzyme E2G 1 (UBC7 homolog, C. elegans) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// D78514 // GenBank // Homo sapiens mRNA for ubiquitin-conjugating enzyme, complete cds. // chr17 // 86 // 54 // 12 // 14 // 0
ENST00000410497 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:4619749:4619852:-1 gene:ENSG00000222429 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT145096 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000482495 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:4856757:4857374:-1 gene:ENSG00000230201 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038224 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:4834775:4857374:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_000080 // RefSeq // Homo sapiens cholinergic receptor, nicotinic, epsilon (muscle) (CHRNE), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000293780 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:4897774:4903074:-1 gene:ENSG00000108556 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000572438 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:4898057:4901811:-1 gene:ENSG00000108556 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000575637 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:4901009:4902630:-1 gene:ENSG00000108556 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000038223 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:4898736:4908389:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0
NM_005022 // RefSeq // Homo sapiens profilin 1 (PFN1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000225655 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:4945652:4949014:-1 gene:ENSG00000108518 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC002475 // GenBank // Homo sapiens profilin 1, mRNA (cDNA clone MGC:2264 IMAGE:3349355), complete cds. // chr17 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0 /// BC006768 // GenBank // Homo sapiens profilin 1, mRNA (cDNA clone MGC:5227 IMAGE:2900010), complete cds. // chr17 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0 /// BC013439 // GenBank // Homo sapiens profilin 1, mRNA (cDNA clone MGC:17826 IMAGE:3896948), complete cds. // chr17 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0 /// BC015164 // GenBank // Homo sapiens profilin 1, mRNA (cDNA clone MGC:10045 IMAGE:3890384), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC057828 // GenBank // Homo sapiens profilin 1, mRNA (cDNA clone MGC:71801 IMAGE:30337970), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// J03191 // GenBank // Human profilin mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000574872 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:4945667:4947469:-1 gene:ENSG00000108518 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 53 // 53 // 10 // 19 // 1 /// ENST00000572383 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:4946693:4949061:-1 gene:ENSG00000108518 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 47 // 47 // 9 // 19 // 1 /// GENSCAN00000038221 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:4945900:4949314:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 63 // 12 // 12 // 0
NM_032530 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 594 (ZNF594), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000399604 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:5179536:5184397:-1 gene:ENSG00000180626 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000575779 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:5180078:5191883:-1 gene:ENSG00000180626 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC136604 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 594, mRNA (cDNA clone MGC:168217 IMAGE:9020594), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000036006 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:5180896:5184235:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001165966 // RefSeq // Homo sapiens PITPNM family member 3 (PITPNM3), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// NM_031220 // RefSeq // Homo sapiens PITPNM family member 3 (PITPNM3), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000262483 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:6451265:6556494:-1 gene:ENSG00000091622 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// ENST00000421306 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:6451264:6556460:-1 gene:ENSG00000091622 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000576664 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:6455391:6473216:-1 gene:ENSG00000091622 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 45 // 20 // 20 // 0 /// AF334586 // GenBank // Homo sapiens NIR1 mRNA, complete cds. // chr17 // 98 // 100 // 43 // 44 // 0 /// AL389994 // GenBank // Homo sapiens mRNA full length insert cDNA clone EUROIMAGE 2004661. // chr17 // 89 // 86 // 34 // 38 // 0 /// BC128583 // GenBank // Homo sapiens PITPNM family member 3, mRNA (cDNA clone MGC:157740 IMAGE:40128716), complete cds. // chr17 // 93 // 98 // 40 // 43 // 0 /// BC128584 // GenBank // Homo sapiens PITPNM family member 3, mRNA (cDNA clone MGC:157741 IMAGE:40128724), complete cds. // chr17 // 93 // 98 // 40 // 43 // 0 /// ENST00000572795 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:6455400:6481829:-1 gene:ENSG00000091622 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 61 // 61 // 27 // 44 // 1 /// AB209130 // GenBank // Homo sapiens mRNA for Hypothetical protein protein. // chr17 // 59 // 59 // 26 // 44 // 1 /// GENSCAN00000031386 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:6455338:6489311:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 73 // 32 // 32 // 0
NM_016060 // RefSeq // Homo sapiens mediator complex subunit 31 (MED31), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_005256671 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens mediator complex subunit 31 (MED31), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000225728 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:6643315:6651634:-1 gene:ENSG00000108590 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000574128 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:6644295:6651427:-1 gene:ENSG00000108590 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000575197 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:6644279:6651634:-1 gene:ENSG00000108590 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// AF151883 // GenBank // Homo sapiens CGI-125 protein mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC012539 // GenBank // Homo sapiens mediator complex subunit 31, mRNA (cDNA clone MGC:13339 IMAGE:4248123), complete cds. // chr17 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000575519 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:6649889:6651575:-1 gene:ENSG00000108590 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// AK094033 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ36714 fis, clone UTERU2010320. // chr17 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONHSAT145274 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_053285 // RefSeq // Homo sapiens tektin 1 (TEKT1), mRNA. // chr17 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000338694 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:6797993:6831761:-1 gene:ENSG00000167858 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000572291 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:6799981:6815177:-1 gene:ENSG00000167858 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000573966 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:6814935:6831758:-1 gene:ENSG00000167858 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 91 // 44 // 10 // 11 // 0 /// ENST00000575592 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:6799661:6831761:-1 gene:ENSG00000167858 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AK292818 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76469 complete cds, highly similar to Homo sapiens tektin 1 (TEKT1), mRNA. // chr17 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// AK304345 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52835 complete cds, highly similar to Tektin-1. // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC014599 // GenBank // Homo sapiens tektin 1, mRNA (cDNA clone MGC:26720 IMAGE:4824860), complete cds. // chr17 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000031369 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:6795999:6830376:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
AF161372 // GenBank HTC // Homo sapiens HSPC254 mRNA, partial cds. // chr17 // 88 // 100 // 21 // 24 // 0
NR_029712 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 195 (MIR195), microRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000385194 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:7017615:7017701:-1 gene:ENSG00000275739 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA gene:ENSG00000267532 // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000572453 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:7015822:7019659:-1 gene:ENSG00000267532 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK098506 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ25640 fis, clone STM04823. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-195 // miRBase Micro RNA Database // MI0000489 Homo sapiens miR-195 stem-loop // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT145321 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT145323 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_153357 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 16, member 11 (SLC16A11), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000308009 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:7041630:7043923:-1 gene:ENSG00000174326 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000447225 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:7041630:7043923:-1 gene:ENSG00000174326 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC093860 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 16, member 11 (monocarboxylic acid transporter 11), mRNA (cDNA clone MGC:120895 IMAGE:7939705), complete cds. // chr17 // 96 // 84 // 26 // 27 // 0 /// BC093886 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 16, member 11 (monocarboxylic acid transporter 11), mRNA (cDNA clone MGC:120921 IMAGE:7939731), complete cds. // chr17 // 96 // 84 // 26 // 27 // 0 /// ENST00000573338 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:7041659:7043606:-1 gene:ENSG00000174326 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// BC143369 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:9051874. // chr17 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// ENST00000574600 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:7042995:7043917:-1 gene:ENSG00000174326 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// GENSCAN00000035455 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:7041931:7114240:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
NM_001143775 // RefSeq // Homo sapiens CTD nuclear envelope phosphatase 1 (CTDNEP1), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0 /// NM_015343 // RefSeq // Homo sapiens CTD nuclear envelope phosphatase 1 (CTDNEP1), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000318988 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:7243839:7251961:-1 gene:ENSG00000175826 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000573600 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:7243618:7252081:-1 gene:ENSG00000175826 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000574205 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:7243650:7251682:-1 gene:ENSG00000175826 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 89 // 60 // 8 // 9 // 0 /// ENST00000574322 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:7243591:7251675:-1 gene:ENSG00000175826 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0 /// BC009295 // GenBank // Homo sapiens dullard homolog (Xenopus laevis), mRNA (cDNA clone MGC:16648 IMAGE:4123279), complete cds. // chr17 // 93 // 100 // 14 // 15 // 0
ENST00000365381 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:7266055:7266166:-1 gene:ENSG00000202251 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT145359 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001128833 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger and BTB domain containing 4 (ZBTB4), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// NM_020899 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger and BTB domain containing 4 (ZBTB4), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// ENST00000311403 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:7459366:7484263:-1 gene:ENSG00000174282 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// ENST00000380599 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:7459366:7479525:-1 gene:ENSG00000174282 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// AY302699 // GenBank // Homo sapiens KAISO-like zinc finger protein 1 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// BC043352 // GenBank // Homo sapiens zinc finger and BTB domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:49935 IMAGE:6175382), complete cds. // chr17 // 96 // 96 // 44 // 46 // 0 /// GENSCAN00000035427 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:7461940:7466801:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 54 // 26 // 26 // 0
ENST00000364619 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:7537096:7537196:-1 gene:ENSG00000201489 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// NONHSAT145393 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// ENST00000515983 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:14:50086982:50087083:1 gene:ENSG00000251792 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 60 // 100 // 3 // 5 // 0 /// NONHSAT036784 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 60 // 100 // 3 // 5 // 0
NM_006942 // RefSeq // Homo sapiens SRY (sex determining region Y)-box 15 (SOX15), mRNA. // chr17 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000250055 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:7588178:7590170:-1 gene:ENSG00000129194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000570788 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:7588999:7590091:-1 gene:ENSG00000129194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// AB006867 // GenBank // Homo sapiens mRNA for hSOX20 protein, complete cds. // chr17 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AK301687 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55408 complete cds, highly similar to SOX-15 protein. // chr17 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// BC000985 // GenBank // Homo sapiens SRY (sex determining region Y)-box 15, mRNA (cDNA clone MGC:5138 IMAGE:3447385), complete cds. // chr17 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000538513 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:7588178:7590072:-1 gene:ENSG00000129194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1 /// BC072003 // GenBank // Homo sapiens SRY (sex determining region Y)-box 15, mRNA (cDNA clone MGC:88706 IMAGE:4653140), complete cds. // chr17 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1 /// GENSCAN00000035435 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:7589140:7589676:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0
NM_004860 // RefSeq // Homo sapiens fragile X mental retardation, autosomal homolog 2 (FXR2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// XR_243572 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens fragile X mental retardation, autosomal homolog 2 (FXR2), transcript variant X1, misc_RNA. // chr17 // 100 // 80 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000250113 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:7591230:7614867:-1 gene:ENSG00000129245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENST00000571597 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:7602968:7614871:-1 gene:ENSG00000129245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 75 // 26 // 9 // 12 // 0 /// BC020090 // GenBank // Homo sapiens fragile X mental retardation, autosomal homolog 2, mRNA (cDNA clone MGC:21187 IMAGE:4385430), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// BC051907 // GenBank // Homo sapiens fragile X mental retardation, autosomal homolog 2, mRNA (cDNA clone MGC:60375 IMAGE:6149976), complete cds. // chr17 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// BC067272 // GenBank // Homo sapiens fragile X mental retardation, autosomal homolog 2, mRNA (cDNA clone MGC:75052 IMAGE:6204341), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// BT009817 // GenBank // Homo sapiens fragile X mental retardation, autosomal homolog 2 mRNA, complete cds. // chr17 // 97 // 78 // 35 // 36 // 0 /// U31501 // GenBank // Human fragile X mental retardation syndrome related protein (FXR2) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000035447 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:7591830:7615478:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0
ENST00000571370 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:7685260:7686371:-1 gene:ENSG00000262251 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AK097045 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39726 fis, clone SMINT2015306. // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT145443 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Sense No Exonic // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// U58658 // GenBank // Human unknown protein mRNA within the p53 intron 1, complete cds. // chr17 // 87 // 100 // 20 // 23 // 0
NR_024349 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC284023 (LOC284023), long non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000324348 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:7913324:7915953:-1 gene:ENSG00000179859 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK091084 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ33765 fis, clone BRHIP1000072. // chr17 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000035437 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:7915522:7916456:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 58 // 58 // 14 // 24 // 1
NM_001139 // RefSeq // Homo sapiens arachidonate 12-lipoxygenase, 12R type (ALOX12B), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000319144 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:8072636:8087703:-1 gene:ENSG00000179477 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000577351 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:8073154:8079413:-1 gene:ENSG00000179477 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000583276 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:8076224:8080079:-1 gene:ENSG00000179477 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 89 // 26 // 8 // 9 // 0 /// AF038461 // GenBank // Homo sapiens 12R-lipoxygenase mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// AF059250 // GenBank // Homo sapiens lipoxygenase (ALOX12B) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// BC041058 // GenBank // Homo sapiens arachidonate 12-lipoxygenase, 12R type, mRNA (cDNA clone MGC:52260 IMAGE:5441563), complete cds. // chr17 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// GENSCAN00000001669 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:8072771:8087442:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0
NM_001165967 // RefSeq // Homo sapiens hes family bHLH transcription factor 7 (HES7), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_032580 // RefSeq // Homo sapiens hes family bHLH transcription factor 7 (HES7), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000317814 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:8121571:8124084:-1 gene:ENSG00000179111 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000541682 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:8120590:8124084:-1 gene:ENSG00000179111 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB049064 // GenBank // Homo sapiens mRNA for bHLH factor Hes7, complete cds. // chr17 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// ENST00000577735 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:8121804:8124092:-1 gene:ENSG00000179111 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1 /// GENSCAN00000001662 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:8096627:8176286:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1
NM_017622 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 59 (C17orf59), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000389017 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:8188333:8190907:-1 gene:ENSG00000196544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC009261 // GenBank // Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 59, mRNA (cDNA clone MGC:16364 IMAGE:3928189), complete cds. // chr17 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC018880 // GenBank // Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 59, mRNA (cDNA clone MGC:3463 IMAGE:3615792), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC070272 // GenBank // Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 59, mRNA (cDNA clone MGC:88261 IMAGE:4672989), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000001676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:8186645:8248036:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1
NR_024447 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC100128288 (LOC100128288), long non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_213597 // RefSeq // Homo sapiens KRAB-A domain containing 2 (KRBA2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006721441 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens KRAB-A domain containing 2 (KRBA2), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006721443 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens KRAB-A domain containing 2 (KRBA2), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 100 // 48 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000331336 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:8368655:8371540:-1 gene:ENSG00000184619 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000396267 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:8368637:8376711:-1 gene:ENSG00000184619 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 48 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000582471 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:8368638:8383187:-1 gene:ENSG00000263809 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AK131219 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ16113 fis, clone 3NB692004724. // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC024723 // GenBank HTC // Homo sapiens KRAB-A domain containing 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:4931250), with apparent retained intron. // chr17 // 100 // 48 // 11 // 11 // 0 /// BC033390 // GenBank // Homo sapiens KRAB-A domain containing 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:4753708), partial cds. // chr17 // 100 // 57 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000001674 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:8369134:8393461:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 93 // 65 // 14 // 15 // 0
NM_001146684 // RefSeq // Homo sapiens ring finger protein 222 (RNF222), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000344001 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:8390704:8393489:-1 gene:ENSG00000189051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000399398 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:8390709:8397826:-1 gene:ENSG00000189051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000001674 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:8369134:8393461:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001256012 // RefSeq // Homo sapiens myosin, heavy chain 10, non-muscle (MYH10), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 49 // 49 // 0 /// NM_001256095 // RefSeq // Homo sapiens myosin, heavy chain 10, non-muscle (MYH10), transcript variant 3, mRNA. // chr17 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// NM_005964 // RefSeq // Homo sapiens myosin, heavy chain 10, non-muscle (MYH10), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// ENST00000269243 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:8474212:8630761:-1 gene:ENSG00000133026 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// ENST00000360416 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:17:8474205:8630761:-1 gene:ENSG00000133026 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 49 // 49 // 0 /// ENST00000379980 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:8474207:8630761:-1 gene:ENSG00000133026 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// BC117690 // GenBank // Homo sapiens myosin, heavy chain 10, non-muscle, mRNA (cDNA clone MGC:134913 IMAGE:40072059), complete cds. // chr17 // 100 // 90 // 44 // 44 // 0 /// BC117691 // GenBank // Homo sapiens myosin, heavy chain 10, non-muscle, mRNA (cDNA clone MGC:134914 IMAGE:40072061), complete cds. // chr17 // 100 // 90 // 44 // 44 // 0 /// BC144668 // GenBank // Homo sapiens myosin, heavy chain 10, non-muscle, mRNA (cDNA clone MGC:178216 IMAGE:9053199), complete cds. // chr17 // 100 // 92 // 45 // 45 // 0 /// BC150634 // GenBank // Homo sapiens myosin, heavy chain 10, non-muscle, mRNA (cDNA clone MGC:183544 IMAGE:9057004), complete cds. // chr17 // 100 // 92 // 45 // 45 // 0 /// GENSCAN00000001668 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:8475804:8697480:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 76 // 37 // 37 // 0
NONHSAT145558 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001158261 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 42 (CCDC42), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NM_144681 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 42 (CCDC42), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006721459 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens coiled-coil domain containing 42 (CCDC42), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000293845 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:8729934:8744836:-1 gene:ENSG00000161973 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000539522 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:8729950:8744787:-1 gene:ENSG00000161973 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC029224 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 42, mRNA (cDNA clone MGC:34752 IMAGE:5172741), complete cds. // chr17 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000001664 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:8730130:8744609:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
NM_001128076 // RefSeq // Homo sapiens speedy/RINGO cell cycle regulator family member E4 (SPDYE4), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000328794 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:8753106:8758559:-1 gene:ENSG00000183318 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000582989 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:8753106:8758559:-1 gene:ENSG00000183318 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC146949 // GenBank // Homo sapiens speedy homolog E4 (Xenopus laevis), mRNA (cDNA clone MGC:182052 IMAGE:9056877), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC146966 // GenBank // Homo sapiens speedy homolog E4 (Xenopus laevis), mRNA (cDNA clone MGC:182069 IMAGE:9056894), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000580999 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:8755385:8757387:-1 gene:ENSG00000183318 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// GENSCAN00000001666 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:8752133:8758382:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
NM_152599 // RefSeq // Homo sapiens major facilitator superfamily domain containing 6-like (MFSD6L), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000329805 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:8797162:8799349:-1 gene:ENSG00000185156 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC040487 // GenBank // Homo sapiens major facilitator superfamily domain containing 6-like, mRNA (cDNA clone MGC:33377 IMAGE:5272039), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000001679 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:8797360:8799120:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0
NM_001105571 // RefSeq // Homo sapiens dehydrogenase/reductase (SDR family) member 7C (DHRS7C), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NM_001220493 // RefSeq // Homo sapiens dehydrogenase/reductase (SDR family) member 7C (DHRS7C), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000330255 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:9771434:9791297:-1 gene:ENSG00000184544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000571134 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:9771453:9791297:-1 gene:ENSG00000184544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000571771 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:9771434:9779921:-1 gene:ENSG00000184544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// BC147024 // GenBank // Homo sapiens dehydrogenase/reductase (SDR family) member 7C, mRNA (cDNA clone MGC:182127 IMAGE:9056952), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC147025 // GenBank // Homo sapiens dehydrogenase/reductase (SDR family) member 7C, mRNA (cDNA clone MGC:182128 IMAGE:9056953), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC171909 // GenBank // Homo sapiens dehydrogenase/reductase (SDR family) member 7C, mRNA (cDNA clone MGC:198624 IMAGE:9054563), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000024833 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:9771488:9777271:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000024832 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:9779290:9822071:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1
NM_002903 // RefSeq // Homo sapiens recoverin (RCVRN), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000226193 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:9896320:9905621:-1 gene:ENSG00000109047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000570909 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:9897710:9901202:-1 gene:ENSG00000109047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// AB001838 // GenBank // Homo sapiens mRNA for recoverin, complete cds. // chr17 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// AB593156 // GenBank // Homo sapiens RCVRN mRNA for recoverin, complete cds, clone: HP09147-RBdS105M23. // chr17 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC001720 // GenBank // Homo sapiens recoverin, mRNA (cDNA clone MGC:1649 IMAGE:3354566), complete cds. // chr17 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BT009838 // GenBank // Homo sapiens recoverin mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000024826 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:9898095:9905180:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0
NM_003802 // RefSeq // Homo sapiens myosin, heavy chain 13, skeletal muscle (MYH13), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000252172 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:10300866:10373005:-1 gene:ENSG00000006788 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000418404 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:10298084:10373130:-1 gene:ENSG00000006788 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// AF111782 // GenBank // Homo sapiens extraocular muscle myosin heavy chain mRNA, complete cds. // chr17 // 98 // 100 // 39 // 40 // 0 /// AK294316 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51822 complete cds, highly similar to Myosin-13. // chr17 // 100 // 33 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000621918 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:10300866:10364544:-1 gene:ENSG00000006788 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000039154 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:10297535:10381541:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0
NM_002472 // RefSeq // Homo sapiens myosin, heavy chain 8, skeletal muscle, perinatal (MYH8), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000403437 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:10390322:10421950:-1 gene:ENSG00000133020 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AK303395 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61014 complete cds, highly similar to Myosin-8. // chr17 // 94 // 49 // 16 // 17 // 0 /// M36769 // GenBank // Homo sapiens perinatal myosin heavy chain mRNA, complete cds. // chr17 // 94 // 100 // 33 // 35 // 0 /// GENSCAN00000039143 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:10384203:10420227:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0
NM_017533 // RefSeq // Homo sapiens myosin, heavy chain 4, skeletal muscle (MYH4), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000255381 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:10443290:10469559:-1 gene:ENSG00000264424 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF111783 // GenBank // Homo sapiens myosin heavy chain IIb mRNA, complete cds. // chr17 // 88 // 100 // 28 // 32 // 0 /// GENSCAN00000039157 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:10443375:10516642:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 86 // 91 // 25 // 29 // 0
NM_005963 // RefSeq // Homo sapiens myosin, heavy chain 1, skeletal muscle, adult (MYH1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000226207 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:10492307:10518543:-1 gene:ENSG00000109061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF111785 // GenBank // Homo sapiens myosin heavy chain IIx/d mRNA, complete cds. // chr17 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// AK310004 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17046. // chr17 // 89 // 33 // 8 // 9 // 0 /// BC114545 // GenBank // Homo sapiens myosin, heavy chain 1, skeletal muscle, adult, mRNA (cDNA clone MGC:133384 IMAGE:40070022), complete cds. // chr17 // 88 // 96 // 23 // 26 // 0 /// EU794637 // GenBank // Homo sapiens epididymis luminal protein 71 (HEL71) mRNA, complete cds. // chr17 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// GENSCAN00000039157 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:10443375:10516642:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0
NM_001100112 // RefSeq // Homo sapiens myosin, heavy chain 2, skeletal muscle, adult (MYH2), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// NM_017534 // RefSeq // Homo sapiens myosin, heavy chain 2, skeletal muscle, adult (MYH2), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000245503 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:10521152:10549957:-1 gene:ENSG00000125414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000397183 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:10521156:10549623:-1 gene:ENSG00000125414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000532183 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:10521148:10549623:-1 gene:ENSG00000125414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 38 // 13 // 13 // 0 /// AF111784 // GenBank // Homo sapiens myosin heavy chain IIa mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// BC093082 // GenBank // Homo sapiens myosin, heavy chain 2, skeletal muscle, adult, mRNA (cDNA clone IMAGE:30529284), complete cds. // chr17 // 100 // 38 // 13 // 13 // 0 /// BC126409 // GenBank // Homo sapiens myosin, heavy chain 2, skeletal muscle, adult, mRNA (cDNA clone MGC:161687 IMAGE:8992125), complete cds. // chr17 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000622564 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:10521156:10549700:-1 gene:ENSG00000125414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 41 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000039156 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:10521280:10583406:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0
NM_002470 // RefSeq // Homo sapiens myosin, heavy chain 3, skeletal muscle, embryonic (MYH3), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000583535 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:10628527:10657309:-1 gene:ENSG00000109063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000039145 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:10628653:10698034:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0
NM_004589 // RefSeq // Homo sapiens SCO1 cytochrome c oxidase assembly protein (SCO1), mRNA. // chr17 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// ENST00000255390 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:10672474:10697568:-1 gene:ENSG00000133028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// ENST00000577335 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:10692783:10697532:-1 gene:ENSG00000133028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 93 // 48 // 14 // 15 // 0 /// ENST00000577427 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:10680354:10697530:-1 gene:ENSG00000133028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0 /// AF026852 // GenBank // Homo sapiens h-sco1 (SCO1) mRNA, nuclear gene encoding mitochondrial protein, complete cds. // chr17 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// AF183424 // GenBank // Homo sapiens SCO1/2 protein mRNA, complete cds. // chr17 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// BC015504 // GenBank // Homo sapiens SCO cytochrome oxidase deficient homolog 1 (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:9115 IMAGE:3914068), complete cds. // chr17 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// ENST00000579396 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:10695562:10697527:-1 gene:ENSG00000133028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1 /// GENSCAN00000039145 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:10628653:10698034:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 58 // 58 // 18 // 31 // 1 /// NONHSAT145630 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1
NM_001101387 // RefSeq // Homo sapiens phosphoinositide-interacting regulator of transient receptor potential channels (PIRT), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000580256 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:10822475:10838445:-1 gene:ENSG00000233670 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK299808 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52687 complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039148 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:10825232:10825645:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000384513 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:10857899:10858004:-1 gene:ENSG00000207242 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT145658 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_144680 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 18 (ZNF18), mRNA. // chr17 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000322748 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:11977445:11997372:-1 gene:ENSG00000154957 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000454073 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:11977452:11997457:-1 gene:ENSG00000154957 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000577671 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:11978261:11991013:-1 gene:ENSG00000154957 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 89 // 32 // 8 // 9 // 0 /// ENST00000580613 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:11977445:11992917:-1 gene:ENSG00000154957 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000582607 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:11978339:11991020:-1 gene:ENSG00000154957 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// AY491053 // GenBank // Homo sapiens heart development-specific protein mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC036096 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 18, mRNA (cDNA clone MGC:33845 IMAGE:5301103), complete cds. // chr17 // 79 // 86 // 19 // 24 // 0 /// XM_005256786 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens zinc finger protein 18 (ZNF18), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// ENST00000580306 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:11977439:11997510:-1 gene:ENSG00000154957 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// GENSCAN00000033891 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:11977957:11992829:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
ENST00000516898 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:12036496:12036637:-1 gene:ENSG00000252707 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT145687 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000362986 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:18:7995570:7995785:1 gene:ENSG00000199856 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr17 // 60 // 100 // 6 // 10 // 0 /// ENST00000384034 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:14:101145480:101145695:-1 gene:ENSG00000277754 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA gene:ENSG00000206761 // chr17 // 60 // 100 // 6 // 10 // 0 /// NONHSAT040012 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 60 // 100 // 6 // 10 // 0 /// NONHSAT057163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr17 // 60 // 100 // 6 // 10 // 0 /// NONHSAT076932 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 50 // 100 // 5 // 10 // 0
NM_006042 // RefSeq // Homo sapiens heparan sulfate (glucosamine) 3-O-sulfotransferase 3A1 (HS3ST3A1), mRNA. // chr17 // 95 // 100 // 19 // 20 // 0 /// ENST00000284110 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:13495689:13601927:-1 gene:ENSG00000153976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AF105376 // GenBank // Homo sapiens heparan sulfate D-glucosaminyl 3-O-sulfotransferase-3A (3OST3A1) mRNA, complete cds. // chr17 // 95 // 100 // 19 // 20 // 0 /// AK292047 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77168 complete cds, highly similar to Homo sapiens heparan sulfate (glucosamine) 3-O-sulfotransferase 3A1 (HS3ST3A1), mRNA. // chr17 // 88 // 80 // 14 // 16 // 0 /// AY358838 // GenBank // Homo sapiens clone DNA107792 HS3ST3A1 (UNQ2551) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// BC044647 // GenBank // Homo sapiens heparan sulfate (glucosamine) 3-O-sulfotransferase 3A1, mRNA (cDNA clone MGC:52218 IMAGE:5478042), complete cds. // chr17 // 93 // 70 // 13 // 14 // 0 /// GENSCAN00000044735 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:13595733:13601129:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 60 // 12 // 12 // 0
ENST00000412454 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:14705076:14705534:-1 gene:ENSG00000230897 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000010316 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:14698467:14705534:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 77 // 100 // 17 // 22 // 0
ENST00000379640 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:14767583:14780203:-1 gene:ENSG00000205325 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK127731 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ45831 fis, clone NT2RP8007416. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT145779 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NONHSAT145791 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001204477 // RefSeq // Homo sapiens CMT1A duplicated region transcript 4 (CDRT4), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_001204478 // RefSeq // Homo sapiens TVP23C-CDRT4 readthrough (TVP23C-CDRT4), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NR_037924 // RefSeq // Homo sapiens TVP23C-CDRT4 readthrough (TVP23C-CDRT4), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr17 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000312177 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:15436015:15467611:-1 gene:ENSG00000239704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000519970 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:15436016:15563631:-1 gene:ENSG00000259024 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSG00000175106 // chr17 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000522212 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:15436021:15563561:-1 gene:ENSG00000259024 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// BC029542 // GenBank // Homo sapiens CMT1A duplicated region transcript 4, mRNA (cDNA clone MGC:33988 IMAGE:5298701), complete cds. // chr17 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000619038 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:15436016:15467611:-1 gene:ENSG00000239704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONHSAT145814 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0
NM_145301 // RefSeq // Homo sapiens trans-golgi network vesicle protein 23 homolog C (S. cerevisiae) (TVP23C), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000225576 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:15502264:15563544:-1 gene:ENSG00000175106 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC011952 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 18, member B2, mRNA (cDNA clone MGC:8763 IMAGE:3860433), complete cds. // chr17 // 95 // 100 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000032921 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:15501840:15563774:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 53 // 53 // 10 // 19 // 1
NM_001282540 // RefSeq // Homo sapiens CMT1A duplicated region transcript 1 (CDRT1), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000395667 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:15565483:15619704:-1 gene:ENSG00000241322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSG00000171931 // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000472534 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:15565484:15593408:-1 gene:ENSG00000241322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// AF337810 // GenBank // Homo sapiens CMT duplicated region transcript 1 (CDRT1) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_006470 // RefSeq // Homo sapiens tripartite motif containing 16 (TRIM16), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000336708 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:15627967:15682879:-1 gene:ENSG00000221926 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000578237 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:15627960:15684300:-1 gene:ENSG00000221926 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// AF096870 // GenBank // Homo sapiens estrogen-responsive B box protein (EBBP) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC053514 // GenBank // Homo sapiens tripartite motif-containing 16, mRNA (cDNA clone MGC:59707 IMAGE:6263729), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC067096 // GenBank // Homo sapiens tripartite motif-containing 16, mRNA (cDNA clone MGC:71281 IMAGE:6088764), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// CR457136 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834E1014D for gene TRIM16, tripartite motif-containing 16; complete cds, incl. stopcodon. // chr17 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000032920 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:15628615:15651609:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000455584 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:15571491:15651653:-1 gene:ENSG00000251537 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 80 // 80 // 8 // 10 // 1 /// AB209899 // GenBank // Homo sapiens mRNA for Hypothetical protein DKFZp434O1826 variant protein. // chr17 // 80 // 80 // 8 // 10 // 1
ENST00000362804 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:16137768:16137872:-1 gene:ENSG00000199674 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT145893 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_181716 // RefSeq // Homo sapiens centromere protein V (CENPV), mRNA. // chr17 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000299736 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:16342534:16353499:-1 gene:ENSG00000166582 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000472570 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:16342534:16344742:-1 gene:ENSG00000166582 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000476243 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:16342534:16353456:-1 gene:ENSG00000166582 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000584214 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:16349714:16353445:-1 gene:ENSG00000166582 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// AY382899 // GenBank // Homo sapiens nuclear protein p30 isoform 1 mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr17 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// BC052604 // GenBank // Homo sapiens centromere protein V, mRNA (cDNA clone MGC:59900 IMAGE:5934088), complete cds. // chr17 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC137486 // GenBank // Homo sapiens centromere protein V, mRNA (cDNA clone MGC:169109 IMAGE:9021486), complete cds. // chr17 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// BC137487 // GenBank // Homo sapiens centromere protein V, mRNA (cDNA clone MGC:169110 IMAGE:9021487), complete cds. // chr17 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000482983 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:16342874:16349956:-1 gene:ENSG00000166582 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// GENSCAN00000041981 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:16342817:16353436:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NM_001113567 // RefSeq // Homo sapiens leucine rich repeat containing 75A (LRRC75A), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_207387 // RefSeq // Homo sapiens leucine rich repeat containing 75A (LRRC75A), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000409083 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:17:16442014:16492153:-1 gene:ENSG00000181350 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000409887 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:16441577:16448294:-1 gene:ENSG00000181350 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000470794 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:16443261:16492018:-1 gene:ENSG00000181350 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// AL833260 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp761O0420 (from clone DKFZp761O0420). // chr17 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONHSAT145975 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000041967 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:16443588:16447976:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000041973 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:16462117:16491822:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_020653 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 287 (ZNF287), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000395824 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:16551387:16569169:-1 gene:ENSG00000141040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000395825 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:16551387:16569206:-1 gene:ENSG00000141040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000498796 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:16553110:16563264:-1 gene:ENSG00000141040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 26 // 8 // 8 // 0 /// AF217227 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein ZNF287 (ZNF287) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC041159 // GenBank // Homo sapiens, Similar to zinc finger protein 287, clone IMAGE:5186250, mRNA. // chr17 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// BC101487 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 287, mRNA (cDNA clone MGC:126536 IMAGE:8068993), complete cds. // chr17 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC113363 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 287, mRNA (cDNA clone MGC:141923 IMAGE:8322415), complete cds. // chr17 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// CR457194 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834D016D for gene ZNF287, zinc finger protein 287; complete cds, incl. stopcodon. // chr17 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000041963 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:16551856:16601442:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0
NM_020787 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 624 (ZNF624), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000311331 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:16620737:16653853:-1 gene:ENSG00000197566 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000579528 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:16620746:16624787:-1 gene:ENSG00000197566 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000583766 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:16633862:16653856:-1 gene:ENSG00000197566 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 83 // 43 // 10 // 12 // 0 /// AB037770 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1349 protein, partial cds. // chr17 // 94 // 57 // 15 // 16 // 0 /// BC103943 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 624, mRNA (cDNA clone MGC:119602 IMAGE:40008882), complete cds. // chr17 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// BC103944 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 624, mRNA (cDNA clone MGC:119603 IMAGE:40008883), complete cds. // chr17 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// BC103946 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 624, mRNA (cDNA clone MGC:119605 IMAGE:40008885), complete cds. // chr17 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000423860 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:16633906:16653838:-1 gene:ENSG00000197566 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// GENSCAN00000041971 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:16616953:16665770:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0
NM_178836 // RefSeq // Homo sapiens phospholipase D family, member 6 (PLD6), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000321560 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:17200995:17206315:-1 gene:ENSG00000179598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// AK295282 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55057 complete cds. // chr17 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// BC031263 // GenBank // Homo sapiens phospholipase D family, member 6, mRNA (cDNA clone MGC:39730 IMAGE:5274952), complete cds. // chr17 // 84 // 100 // 26 // 31 // 0 /// GENSCAN00000013500 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:17191446:17206418:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0
ENST00000584952 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:17235433:17236118:-1 gene:ENSG00000266498 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr17 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// BC005072 // GenBank // Homo sapiens hypothetical protein MGC13008, mRNA (cDNA clone MGC:13008 IMAGE:3532504), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT146072 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr17 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0
NM_001199989 // RefSeq // Homo sapiens RAS, dexamethasone-induced 1 (RASD1), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NM_016084 // RefSeq // Homo sapiens RAS, dexamethasone-induced 1 (RASD1), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000225688 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:17494437:17496393:-1 gene:ENSG00000108551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000579152 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:17494707:17496395:-1 gene:ENSG00000108551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AF069506 // GenBank // Homo sapiens activator of G protein signaling (AGS1) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF153192 // GenBank // Homo sapiens ras-related protein mRNA, complete cds. // chr17 // 91 // 69 // 20 // 22 // 0 /// AF172846 // GenBank // Homo sapiens ras-related protein (DEXRAS1) mRNA, complete cds. // chr17 // 96 // 78 // 24 // 25 // 0 /// AF498923 // GenBank // Homo sapiens activator of G protein signaling (RASD1) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// AK294073 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51813 complete cds, moderately similar to Dexamethasone-induced Ras-related protein 1. // chr17 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC018041 // GenBank // Homo sapiens RAS, dexamethasone-induced 1, mRNA (cDNA clone MGC:26290 IMAGE:4797482), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000013474 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:17495125:17499151:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1
NR_024007 // RefSeq // Homo sapiens Smith-Magenis syndrome chromosome region, candidate 5 (non-protein coding) (SMCR5), long non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000543475 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:17776686:17779529:-1 gene:ENSG00000226746 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AF467442 // GenBank // Homo sapiens Smith-Magenis syndrome chromosome region candidate 5 protein (SMCR5) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT146103 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001033551 // RefSeq // Homo sapiens target of myb1-like 2 (chicken) (TOM1L2), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NM_001082968 // RefSeq // Homo sapiens target of myb1-like 2 (chicken) (TOM1L2), transcript variant 3, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NM_001288786 // RefSeq // Homo sapiens target of myb1-like 2 (chicken) (TOM1L2), transcript variant 4, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NM_001288787 // RefSeq // Homo sapiens target of myb1-like 2 (chicken) (TOM1L2), transcript variant 5, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NM_001288788 // RefSeq // Homo sapiens target of myb1-like 2 (chicken) (TOM1L2), transcript variant 6, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NM_001288789 // RefSeq // Homo sapiens target of myb1-like 2 (chicken) (TOM1L2), transcript variant 7, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000581396 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:17843511:17972410:-1 gene:ENSG00000175662 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AY358769 // GenBank // Homo sapiens clone DNA128309 SHSS3124 (UNQ3124) mRNA, complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0
NONHSAT146129 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000411468 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:20441027:20446772:1 gene:ENSG00000230528 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr17 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 /// ENST00000426269 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:18497572:18501034:-1 gene:ENSG00000167494 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000458685 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:20436337:20447249:1 gene:ENSG00000230528 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1 /// GENSCAN00000014680 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:20391469:20445109:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000034835 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:18499230:18641352:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC044655 // GenBank HTC // Homo sapiens, Similar to nitric oxide synthase 2A (inducible, hepatocytes), clone IMAGE:5168672, mRNA. // chr17 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1 /// TCONS_l2_00011534-XLOC_l2_005699 // Broad TUCP // linc-CDRT15L2-2 chr17:+:20340136-20350555 // chr17 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1
NR_026809 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 106, member A (FAM106A), long non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 51 // 51 // 0 /// NR_026810 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 106, member C, pseudogene (FAM106CP), non-coding RNA. // chr17 // 96 // 100 // 49 // 51 // 0 /// ENST00000392176 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:18524566:18526846:-1 gene:ENSG00000213077 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 51 // 51 // 0 /// NONHSAT146006 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 96 // 100 // 49 // 51 // 0 /// NONHSAT146570 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 82 // 100 // 42 // 51 // 0
ENST00000354432 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:18951625:18954149:-1 gene:ENSG00000196893 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC029877 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5172092. // chr17 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONHSAT146416 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001039999 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 83, member G (FAM83G), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000345041 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:18971068:19004238:-1 gene:ENSG00000188522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000388995 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:18968789:19004804:-1 gene:ENSG00000188522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000399096 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:18975710:19003780:-1 gene:ENSG00000188522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 73 // 73 // 11 // 15 // 1 /// AK123558 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ41564 fis, clone CTONG1000508. // chr17 // 73 // 73 // 11 // 15 // 1 /// GENSCAN00000002722 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:18977488:19004041:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 87 // 13 // 13 // 0
ENST00000467595 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:19603274:19603345:-1 gene:ENSG00000242752 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000515977 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:19649494:19649587:-1 gene:ENSG00000275982 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA gene:ENSG00000264932 // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000578640 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:19649373:19649935:-1 gene:ENSG00000264932 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT146513 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT146514 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001142610 // RefSeq // Homo sapiens unc-51 like autophagy activating kinase 2 (ULK2), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 83 // 34 // 34 // 0 /// NM_014683 // RefSeq // Homo sapiens unc-51 like autophagy activating kinase 2 (ULK2), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000361658 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:19770830:19867936:-1 gene:ENSG00000083290 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 83 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000395544 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:19773950:19867917:-1 gene:ENSG00000083290 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// AK098316 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ40997 fis, clone UTERU2016147, highly similar to Serine/threonine-protein kinase ULK2 (EC 2.7.11.1). // chr17 // 100 // 76 // 31 // 31 // 0 /// BC034988 // GenBank // Homo sapiens unc-51-like kinase 2 (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:33037 IMAGE:5268025), complete cds. // chr17 // 100 // 76 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000002717 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:19678686:19817870:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 27 // 27 // 11 // 41 // 1
ENST00000390884 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:20126388:20126488:-1 gene:ENSG00000212186 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT146543 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK127974 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ46089 fis, clone TESTI2011020. // chr17 // 88 // 100 // 7 // 8 // 0 /// BC040601 // GenBank // Homo sapiens keratin pseudogene, mRNA (cDNA clone IMAGE:5270734). // chr17 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000444070 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:18419968:18425097:1 gene:ENSG00000205266 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000445433 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:18415728:18425095:1 gene:ENSG00000205266 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 88 // 100 // 7 // 8 // 0 /// ENST00000579946 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:16847635:16852776:-1 gene:ENSG00000205312 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 83 // 75 // 5 // 6 // 0 /// ENST00000582261 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:20519312:20528687:-1 gene:ENSG00000205215 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONHSAT146018 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 83 // 75 // 5 // 6 // 0 /// NONHSAT146367 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 88 // 100 // 7 // 8 // 0 /// NONHSAT146369 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// NONHSAT146578 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONHSAT146579 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// TCONS_l2_00011633-XLOC_l2_006022 // Broad TUCP // linc-LGALS9B-4 chr17:-:20422624-20432000 // chr17 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
ENST00000516674 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:20894532:20894638:-1 gene:ENSG00000252483 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000516637 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:16691798:16691907:1 gene:ENSG00000252446 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 50 // 100 // 7 // 14 // 0 /// NONHSAT146849 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000517027 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:20323001:20323110:1 gene:ENSG00000276577 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA gene:ENSG00000266839 // chr17 // 50 // 100 // 7 // 14 // 0 /// NONHSAT145993 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 50 // 100 // 7 // 14 // 0 /// NONHSAT146559 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 50 // 100 // 7 // 14 // 0
ENST00000579106 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:21229334:21229628:-1 gene:ENSG00000263815 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT052169 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_152914 // RefSeq // Homo sapiens N-acetyltransferase domain containing 1 (NATD1), mRNA. // chr17 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC029527 // GenBank // Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 103, mRNA (cDNA clone MGC:33894 IMAGE:5302828), complete cds. // chr17 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENST00000611551 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:21238870:21253410:-1 gene:ENSG00000274180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000025500 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:21198324:21276279:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
NM_001113434 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 51 (C17orf51), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000391411 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:21528310:21551680:-1 gene:ENSG00000212719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
ENST00000481618 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:22528853:22528921:-1 gene:ENSG00000241225 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT052273 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
ENST00000580780 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:27651334:27665712:-1 gene:ENSG00000264216 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr17 // 57 // 57 // 12 // 21 // 1 /// GENSCAN00000012591 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:27651912:27672575:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 52 // 52 // 11 // 21 // 1 /// NONHSAT052333 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 57 // 57 // 12 // 21 // 1 /// NONHSAT052334 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 52 // 52 // 11 // 21 // 1 /// NONHSAT052335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 52 // 52 // 11 // 21 // 1
NM_001076680 // RefSeq // Homo sapiens LYR motif containing 9 (LYRM9), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// XM_005257943 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens LYR motif containing 9 (LYRM9), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// XM_005257944 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens LYR motif containing 9 (LYRM9), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000379102 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:27879294:27893383:-1 gene:ENSG00000232859 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 80 // 83 // 4 // 5 // 0 /// ENST00000379103 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:27878314:27892321:-1 gene:ENSG00000232859 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000460380 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:27878358:27893359:-1 gene:ENSG00000232859 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// AK055808 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ31246 fis, clone KIDNE2005266. // chr17 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000508862 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:27879051:27893383:-1 gene:ENSG00000232859 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 6 // 6 // 1
ENST00000365519 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:28022330:28022464:-1 gene:ENSG00000202389 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000040221 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:28022079:28053444:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT052355 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NR_028334 // RefSeq // Homo sapiens keratin 18 pseudogene 55 (KRT18P55), non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000577198 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:28275986:28307382:-1 gene:ENSG00000265480 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000578578 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:28276045:28317783:-1 gene:ENSG00000265480 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr17 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// ENST00000581956 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:28277218:28307382:-1 gene:ENSG00000265480 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0 /// AK097823 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ40504 fis, clone TESTI2045509, highly similar to KERATIN, TYPE I CYTOSKELETAL 18. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONHSAT052554 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000040219 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:28270623:28277166:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1
NM_001290145 // RefSeq // Homo sapiens polymerase (DNA-directed), delta interacting protein 2 (POLDIP2), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 94 // 97 // 32 // 34 // 0 /// NM_015584 // RefSeq // Homo sapiens polymerase (DNA-directed), delta interacting protein 2 (POLDIP2), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 94 // 100 // 33 // 35 // 0 /// ENST00000540200 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:28347177:28357522:-1 gene:ENSG00000004142 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 93 // 86 // 28 // 30 // 0 /// AF179891 // GenBank // Homo sapiens putative DNA polymerase delta p38 subunit (POLD4) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// AK293707 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52257 complete cds, highly similar to Polymerase delta-interacting protein 2. // chr17 // 84 // 71 // 21 // 25 // 0 /// BC000655 // GenBank // Homo sapiens polymerase (DNA-directed), delta interacting protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:780 IMAGE:3349399), complete cds. // chr17 // 93 // 83 // 27 // 29 // 0 /// BC009265 // GenBank // Homo sapiens polymerase (DNA-directed), delta interacting protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:16425 IMAGE:3943941), complete cds. // chr17 // 93 // 83 // 27 // 29 // 0 /// GENSCAN00000040204 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:28347684:28357448:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 91 // 63 // 20 // 22 // 0 /// ENST00000618887 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:28352968:28357463:-1 gene:ENSG00000004142 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 69 // 37 // 9 // 13 // 0
NM_001080837 // RefSeq // Homo sapiens SEBOX homeobox (SEBOX), mRNA. // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000438614 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:28364268:28365244:-1 gene:ENSG00000274529 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSG00000109072 // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000536498 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:28364268:28365244:-1 gene:ENSG00000274529 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSG00000109072 // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000555059 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:28364288:28368012:-1 gene:ENSG00000273171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0
NM_000638 // RefSeq // Homo sapiens vitronectin (VTN), mRNA. // chr17 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000226218 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:28367276:28370822:-1 gene:ENSG00000109072 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000542029 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:28369682:28373091:-1 gene:ENSG00000109072 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 80 // 33 // 8 // 10 // 0 /// AK298441 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51266 complete cds, highly similar to Vitronectin precursor. // chr17 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC005046 // GenBank // Homo sapiens vitronectin, mRNA (cDNA clone MGC:12819 IMAGE:4040317), complete cds. // chr17 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000040211 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:28367369:28370203:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
NM_001242366 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 46 (folate transporter), member 1 (SLC46A1), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 89 // 82 // 16 // 18 // 0 /// NM_080669 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 46 (folate transporter), member 1 (SLC46A1), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 91 // 100 // 20 // 22 // 0 /// ENST00000582590 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:28404316:28406168:-1 gene:ENSG00000076351 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 41 // 9 // 9 // 0 /// AK295883 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58315 complete cds, highly similar to Heme carrier protein 1. // chr17 // 100 // 41 // 9 // 9 // 0 /// BC010691 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 46 (folate transporter), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:9564 IMAGE:3872267), complete cds. // chr17 // 89 // 82 // 16 // 18 // 0 /// ENST00000612814 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:28394756:28406210:-1 gene:ENSG00000076351 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 91 // 100 // 20 // 22 // 0 /// ENST00000618626 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:28395676:28406201:-1 gene:ENSG00000076351 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 89 // 82 // 16 // 18 // 0 /// GENSCAN00000040199 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:28399547:28406114:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 94 // 73 // 15 // 16 // 0
NM_006461 // RefSeq // Homo sapiens sperm associated antigen 5 (SPAG5), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000321765 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:28577574:28599279:-1 gene:ENSG00000076382 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000580083 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:28580009:28585998:-1 gene:ENSG00000076382 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 29 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000582076 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:28577580:28579406:-1 gene:ENSG00000076382 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 26 // 8 // 8 // 0 /// AF063308 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil related protein DEEPEST (DEEPEST) mRNA, complete cds. // chr17 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// AF345347 // GenBank // Homo sapiens mitotic spindle-associated protein p126 mRNA, complete cds. // chr17 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// AF399910 // GenBank // Homo sapiens mitotic spindle associated protein (ASTRIN) mRNA, complete cds. // chr17 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// AK292398 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78740 complete cds, highly similar to Homo sapiens sperm associated antigen 5 (SPAG5), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AL122116 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp434N2421 (from clone DKFZp434N2421). // chr17 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0 /// BC000322 // GenBank // Homo sapiens sperm associated antigen 5, mRNA (cDNA clone MGC:8476 IMAGE:2821784), complete cds. // chr17 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000040195 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:28573526:28598946:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0
NM_001160407 // RefSeq // Homo sapiens TLC domain containing 1 (TLCD1), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// NM_138463 // RefSeq // Homo sapiens TLC domain containing 1 (TLCD1), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006721671 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens TLC domain containing 1 (TLCD1), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000292090 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:28724348:28726208:-1 gene:ENSG00000160606 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000394933 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:28724453:28726932:-1 gene:ENSG00000160606 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000580518 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:28724599:28727935:-1 gene:ENSG00000160606 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 89 // 66 // 17 // 19 // 0 /// ENST00000581236 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:28724358:28724850:-1 gene:ENSG00000160606 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0 /// BC014072 // GenBank // Homo sapiens TLC domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:20499 IMAGE:3957355), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000040197 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:28724510:28726097:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0
NR_029970 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 451a (MIR451A), microRNA. // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000385059 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:28861369:28861440:-1 gene:ENSG00000273915 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA gene:ENSG00000264066 // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000582320 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:28861072:28861966:-1 gene:ENSG00000264066 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// hsa-mir-451a // miRBase Micro RNA Database // MI0001729 Homo sapiens miR-451a stem-loop // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT052655 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT052657 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NR_029685 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 144 (MIR144), microRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000384886 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:28861514:28861624:-1 gene:ENSG00000277441 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA gene:ENSG00000264066 // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000582320 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:28861072:28861966:-1 gene:ENSG00000264066 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003563 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:28861406:28902944:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-144 // miRBase Micro RNA Database // MI0000460 Homo sapiens miR-144 stem-loop // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT052655 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT052659 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_144683 // RefSeq // Homo sapiens dehydrogenase/reductase (SDR family) member 13 (DHRS13), mRNA. // chr17 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XR_429869 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens dehydrogenase/reductase (SDR family) member 13 (DHRS13), transcript variant X1, misc_RNA. // chr17 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000378895 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:28897781:28903071:-1 gene:ENSG00000167536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000394901 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:28897781:28903071:-1 gene:ENSG00000167536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AY358566 // GenBank // Homo sapiens clone DNA48227 EALL419 (UNQ419) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC015582 // GenBank // Homo sapiens dehydrogenase/reductase (SDR family) member 13, mRNA (cDNA clone MGC:23280 IMAGE:4637504), complete cds. // chr17 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000426464 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:28897784:28902965:-1 gene:ENSG00000167536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1 /// AK296017 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51214 complete cds, weakly similar to Retinol dehydrogenase 12 (EC 1.1.1.-). // chr17 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1 /// GENSCAN00000003563 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:28861406:28902944:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
ENST00000580924 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:29021325:29021640:-1 gene:ENSG00000263781 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr17 // 75 // 100 // 12 // 16 // 0 /// GENSCAN00000003555 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:29021320:29021640:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_020772 // RefSeq // Homo sapiens nuclear fragile X mental retardation protein interacting protein 2 (NUFIP2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000225388 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:29255836:29294118:-1 gene:ENSG00000108256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AK293075 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75095 complete cds, highly similar to Homo sapiens 82-kD FMRP Interacting Protein (182-FIP), mRNA. // chr17 // 100 // 61 // 22 // 22 // 0 /// AK297732 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53811 complete cds, highly similar to Nuclear fragile X mentalretardation-interacting protein 2. // chr17 // 100 // 42 // 15 // 15 // 0 /// AY232289 // GenBank // Homo sapiens proliferation-inducing gene 1 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// BC108307 // GenBank // Homo sapiens nuclear fragile X mental retardation protein interacting protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:117262 IMAGE:6502841), complete cds. // chr17 // 100 // 61 // 22 // 22 // 0 /// BC129990 // GenBank // Homo sapiens nuclear fragile X mental retardation protein interacting protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:157732 IMAGE:40128910), complete cds. // chr17 // 100 // 61 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000579665 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:17:29264399:29294115:-1 gene:ENSG00000108256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1 /// BC129989 // GenBank // Homo sapiens nuclear fragile X mental retardation protein interacting protein 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:40128901), complete cds. // chr17 // 44 // 44 // 16 // 36 // 1 /// GENSCAN00000003560 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:29264539:29294059:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0
ENST00000517255 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:29424762:29424867:-1 gene:ENSG00000253064 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT052706 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000365335 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:29445300:29445400:-1 gene:ENSG00000202205 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT052707 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_198147 // RefSeq // Homo sapiens abhydrolase domain containing 15 (ABHD15), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000307201 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:29560547:29567137:-1 gene:ENSG00000168792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY358212 // GenBank // Homo sapiens clone DNA170281 PPWG6510 (UNQ6510) mRNA, complete cds. // chr17 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003554 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:29542757:29566966:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0
ENST00000410926 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:29641611:29641702:-1 gene:ENSG00000222858 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT052726 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
ENST00000384284 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:30059052:30059147:-1 gene:ENSG00000207011 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000590718 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:30059054:30059147:-1 gene:ENSG00000267482 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT052742 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT052743 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_001045 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter), member 4 (SLC6A4), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENST00000261707 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:30194321:30235968:-1 gene:ENSG00000108576 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENST00000394821 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:30198495:30235698:-1 gene:ENSG00000108576 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 77 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000401766 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:30194319:30236002:-1 gene:ENSG00000108576 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000579221 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:30197921:30211369:-1 gene:ENSG00000108576 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 40 // 17 // 17 // 0 /// AY902473 // GenBank // Homo sapiens serotonin transporter (SLC6A4) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 72 // 31 // 31 // 0 /// BC069484 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter, serotonin), member 4, mRNA (cDNA clone MGC:97139 IMAGE:7262380), complete cds. // chr17 // 97 // 70 // 29 // 30 // 0 /// L05568 // GenBank // Human Na+/Cl- dependent serotonin transporter mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 81 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000046831 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:30197477:30233535:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 77 // 33 // 33 // 0
NM_000386 // RefSeq // Homo sapiens bleomycin hydrolase (BLMH), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000261714 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:30248195:30291994:-1 gene:ENSG00000108578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000578090 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:30248822:30291849:-1 gene:ENSG00000108578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000581037 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:30271269:30287914:-1 gene:ENSG00000108578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000584603 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:30272741:30291667:-1 gene:ENSG00000108578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// AK301948 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57650 complete cds, highly similar to Bleomycin hydrolase (EC 3.4.22.40). // chr17 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// BC003616 // GenBank // Homo sapiens bleomycin hydrolase, mRNA (cDNA clone MGC:1568 IMAGE:2989635), complete cds. // chr17 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BT007018 // GenBank // Homo sapiens bleomycin hydrolase mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000577623 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:30266879:30291904:-1 gene:ENSG00000108578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// GENSCAN00000046826 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:30249017:30355344:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1
ENST00000410747 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:30288071:30288177:-1 gene:ENSG00000222679 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT052763 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_206832 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane and immunoglobulin domain containing 1 (TMIGD1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000328886 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:30316348:30334047:-1 gene:ENSG00000182271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000538566 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:30316333:30334059:-1 gene:ENSG00000182271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// AK290266 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76075 complete cds. // chr17 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// AY358153 // GenBank // Homo sapiens clone DNA212309 AWKS9372 (UNQ9372) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC137201 // GenBank // Homo sapiens transmembrane and immunoglobulin domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:168821 IMAGE:9021198), complete cds. // chr17 // 97 // 94 // 28 // 29 // 0 /// BC137202 // GenBank // Homo sapiens transmembrane and immunoglobulin domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:168822 IMAGE:9021199), complete cds. // chr17 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000046826 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:30249017:30355344:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
ENST00000384403 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:30344503:30344604:-1 gene:ENSG00000207132 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT052765 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000461840 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:19:14213052:14213323:1 gene:ENSG00000240803 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000483452 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:30702504:30702775:-1 gene:ENSG00000241631 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT052807 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT061398 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_015986 // RefSeq // Homo sapiens cytokine receptor-like factor 3 (CRLF3), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NR_073118 // RefSeq // Homo sapiens cytokine receptor-like factor 3 (CRLF3), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr17 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000324238 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:30782684:30824776:-1 gene:ENSG00000176390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000578692 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:30783936:30824671:-1 gene:ENSG00000176390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// AF046059 // GenBank // Homo sapiens cytokine receptor related protein 4 (CYTOR4) mRNA, complete cds. // chr17 // 83 // 100 // 24 // 29 // 0 /// AF120151 // GenBank // Homo sapiens cytokine receptor-like molecule 9 (CREME9) mRNA, complete cds. // chr17 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// AK296238 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53011 complete cds, highly similar to Homo sapiens cytokine receptor-like factor 3 (CRLF3), mRNA. // chr17 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// BC023567 // GenBank // Homo sapiens cytokine receptor-like factor 3, mRNA (cDNA clone MGC:20661 IMAGE:4309046), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// DQ298450 // GenBank // Homo sapiens type I cytokine receptor like factor (p48) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000045118 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:30732054:30824639:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1
ENST00000541382 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:30904039:30906235:-1 gene:ENSG00000172171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 33 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000580840 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:30898986:30906235:-1 gene:ENSG00000172171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC024328 // GenBank HTC // Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 42, mRNA (cDNA clone IMAGE:4253473). // chr17 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// BC064631 // GenBank HTC // Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 42, mRNA (cDNA clone IMAGE:5739804), with apparent retained intron. // chr17 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0 /// NM_024683 // RefSeq // Homo sapiens transcription elongation factor, mitochondrial (TEFM), mRNA. // chr17 // 83 // 83 // 20 // 24 // 1 /// ENST00000306049 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:30898986:30906235:-1 gene:ENSG00000172171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 75 // 75 // 18 // 24 // 1 /// ENST00000581216 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:30898983:30906820:-1 gene:ENSG00000172171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 83 // 83 // 20 // 24 // 1 /// BC009025 // GenBank // Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 42, mRNA (cDNA clone IMAGE:4184795), partial cds. // chr17 // 75 // 75 // 18 // 24 // 1 /// AK298495 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60776 complete cds. // chr17 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1 /// BC073169 // GenBank // Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 42, mRNA (cDNA clone IMAGE:6192569), complete cds. // chr17 // 42 // 42 // 10 // 24 // 1 /// GENSCAN00000045125 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:30899169:30920645:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 75 // 75 // 18 // 24 // 1
ENST00000582029 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:31294575:31297539:-1 gene:ENSG00000126861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// M63623 // GenBank // Human oligodendrocyte-myelin glycoprotein (OMGP) mRNA, complete cds. // chr17 // 91 // 100 // 20 // 22 // 0 /// NM_002544 // RefSeq // Homo sapiens oligodendrocyte myelin glycoprotein (OMG), mRNA. // chr17 // 50 // 50 // 11 // 22 // 1 /// ENST00000247271 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:31294647:31297411:-1 gene:ENSG00000126861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 55 // 55 // 12 // 22 // 1 /// BC018050 // GenBank // Homo sapiens oligodendrocyte myelin glycoprotein, mRNA (cDNA clone MGC:26380 IMAGE:4799154), complete cds. // chr17 // 41 // 41 // 9 // 22 // 1
NM_006495 // RefSeq // Homo sapiens ecotropic viral integration site 2B (EVI2B), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000330927 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:31303766:31314112:-1 gene:ENSG00000185862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000577894 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:31304234:31314105:-1 gene:ENSG00000185862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// AK297087 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55224 complete cds, highly similar to EVI2B protein precursor. // chr17 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// BC005926 // GenBank // Homo sapiens ecotropic viral integration site 2B, mRNA (cDNA clone MGC:14529 IMAGE:4043339), complete cds. // chr17 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000578021 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:31305343:31318640:-1 gene:ENSG00000265118 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// ENST00000578584 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:31305213:31318831:-1 gene:ENSG00000265118 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// ENST00000581884 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:31305384:31318639:-1 gene:ENSG00000265118 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// ENST00000584948 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:31305356:31318640:-1 gene:ENSG00000265118 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// GENSCAN00000045129 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:31304263:31319013:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
ENST00000408111 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:31563768:31563894:-1 gene:ENSG00000221038 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AK024534 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ20881 fis, clone ADKA03177. // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT052883 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_018405 // RefSeq // Homo sapiens coordinator of PRMT5, differentiation stimulator (COPRS), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_005258000 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens coordinator of PRMT5, differentiation stimulator (COPRS), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000302362 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:31851864:31859337:-1 gene:ENSG00000172301 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000378634 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:31851871:31859074:-1 gene:ENSG00000172301 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000496655 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:31851871:31859291:-1 gene:ENSG00000172301 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000579741 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:31852231:31858931:-1 gene:ENSG00000172301 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000579984 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:31852219:31859213:-1 gene:ENSG00000172301 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// AF407672 // GenBank // Homo sapiens TTP1 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC012386 // GenBank // Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 79, mRNA (cDNA clone MGC:17778 IMAGE:3882737), complete cds. // chr17 // 86 // 88 // 19 // 22 // 0 /// GENSCAN00000040813 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:31852139:31901627:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
ENST00000365230 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:32463374:32463482:-1 gene:ENSG00000202100 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT052951 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_015194 // RefSeq // Homo sapiens myosin ID (MYO1D), mRNA. // chr17 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000318217 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:32492522:32877177:-1 gene:ENSG00000176658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000394649 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:32492609:32863043:-1 gene:ENSG00000176658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000579584 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:32594203:32877144:-1 gene:ENSG00000176658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000583621 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:32759812:32877177:-1 gene:ENSG00000176658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// AK127942 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ46052 fis, clone SYNOV4003174, highly similar to Rattus norvegicus myosin 1C (Myo1c). // chr17 // 96 // 79 // 25 // 26 // 0 /// BC030602 // GenBank HTC // Homo sapiens myosin ID, mRNA (cDNA clone IMAGE:4824589), with apparent retained intron. // chr17 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// BC030796 // GenBank // Homo sapiens myosin ID, mRNA (cDNA clone IMAGE:3846889), partial cds. // chr17 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0 /// BC146763 // GenBank // Homo sapiens myosin ID, mRNA (cDNA clone MGC:166833 IMAGE:9007203), complete cds. // chr17 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000026257 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:32711988:32876872:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 48 // 16 // 16 // 0
ENST00000364308 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:32830219:32830329:-1 gene:ENSG00000201178 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT052966 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001094 // RefSeq // Homo sapiens acid-sensing (proton-gated) ion channel 2 (ASIC2), transcript variant MDEG1, mRNA. // chr17 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NM_183377 // RefSeq // Homo sapiens acid-sensing (proton-gated) ion channel 2 (ASIC2), transcript variant MDEG2, mRNA. // chr17 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000225823 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:33013087:33292988:-1 gene:ENSG00000108684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000359872 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:33013087:34157294:-1 gene:ENSG00000108684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000448983 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:33023865:33291441:-1 gene:ENSG00000108684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// BC075042 // GenBank // Homo sapiens amiloride-sensitive cation channel 1, neuronal, mRNA (cDNA clone MGC:103959 IMAGE:30915358), complete cds. // chr17 // 95 // 71 // 19 // 20 // 0 /// BC075043 // GenBank // Homo sapiens amiloride-sensitive cation channel 1, neuronal, mRNA (cDNA clone MGC:104120 IMAGE:30915574), complete cds. // chr17 // 95 // 71 // 19 // 20 // 0 /// U50352 // GenBank // Human sodium channel 1 (BNC1) mRNA, complete cds. // chr17 // 85 // 71 // 17 // 20 // 0 /// U57352 // GenBank // Human sodium channel 1 (hBNaC1) mRNA, complete cds. // chr17 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000026268 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:33004379:33074539:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
ENST00000516561 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:34120056:34120167:-1 gene:ENSG00000252370 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT053001 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_002981 // RefSeq // Homo sapiens chemokine (C-C motif) ligand 1 (CCL1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000225842 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:34360328:34363231:-1 gene:ENSG00000108702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC105073 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-C motif) ligand 1, mRNA (cDNA clone MGC:132733 IMAGE:8144076), complete cds. // chr17 // 95 // 68 // 18 // 19 // 0 /// BC105075 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-C motif) ligand 1, mRNA (cDNA clone MGC:132735 IMAGE:8144078), complete cds. // chr17 // 95 // 68 // 18 // 19 // 0 /// M57502 // GenBank // Human secreted protein (I-309) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
ENST00000617547 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:34379112:34379203:-1 gene:ENSG00000275150 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_207454 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 102 (C17orf102), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000357754 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:34574123:34579369:-1 gene:ENSG00000197322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC133004 // GenBank // Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 102, mRNA (cDNA clone MGC:164635 IMAGE:40147026), complete cds. // chr17 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// BC136710 // GenBank // Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 102, mRNA (cDNA clone MGC:168323 IMAGE:9020700), complete cds. // chr17 // 93 // 58 // 14 // 15 // 0 /// BC142651 // GenBank // Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 102, mRNA (cDNA clone MGC:164873 IMAGE:40148022), complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0
NONHSAT053055 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_152462 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 35, member G3 (SLC35G3), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000297307 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:35192520:35194523:-1 gene:ENSG00000164729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC136422 // GenBank // Homo sapiens acyl-malonyl condensing enzyme 1, mRNA (cDNA clone MGC:168034 IMAGE:9020411), complete cds. // chr17 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0 /// BC140700 // GenBank // Homo sapiens acyl-malonyl condensing enzyme 1, mRNA (cDNA clone MGC:168033 IMAGE:9020410), complete cds. // chr17 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0 /// GENSCAN00000004213 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:35193291:35194307:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0
NM_001104587 // RefSeq // Homo sapiens schlafen family member 11 (SLFN11), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001104588 // RefSeq // Homo sapiens schlafen family member 11 (SLFN11), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001104589 // RefSeq // Homo sapiens schlafen family member 11 (SLFN11), transcript variant 3, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001104590 // RefSeq // Homo sapiens schlafen family member 11 (SLFN11), transcript variant 4, mRNA. // chr17 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NM_152270 // RefSeq // Homo sapiens schlafen family member 11 (SLFN11), transcript variant 5, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000308377 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:35350305:35373607:-1 gene:ENSG00000172716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000394566 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:35350305:35373620:-1 gene:ENSG00000172716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// AL831964 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp451E232 (from clone DKFZp451E232); complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC052586 // GenBank // Homo sapiens schlafen family member 11, mRNA (cDNA clone MGC:59997 IMAGE:6258140), complete cds. // chr17 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000004214 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:35352356:35363807:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_001289009 // RefSeq // Homo sapiens schlafen family member 12 (SLFN12), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NM_018042 // RefSeq // Homo sapiens schlafen family member 12 (SLFN12), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000304905 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:35411069:35432524:-1 gene:ENSG00000172123 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000394562 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:35411060:35433196:-1 gene:ENSG00000172123 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000452764 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:35411071:35433283:-1 gene:ENSG00000172123 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000460530 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:35411317:35420765:-1 gene:ENSG00000172123 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// AK291826 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77774 complete cds. // chr17 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC035605 // GenBank // Homo sapiens schlafen family member 12, mRNA (cDNA clone MGC:45076 IMAGE:5163323), complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BX647081 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686O18256 (from clone DKFZp686O18256). // chr17 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// ENST00000479326 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:35411368:35420835:-1 gene:ENSG00000172123 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
ENST00000361112 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:35474904:35537861:-1 gene:ENSG00000205045 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// AK172761 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ23922 fis, clone COL02590. // chr17 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001129820 // RefSeq // Homo sapiens schlafen family member 14 (SLFN14), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000415846 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:35548125:35558098:-1 gene:ENSG00000236320 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC140847 // GenBank // Homo sapiens schlafen family member 14, mRNA (cDNA clone MGC:176524 IMAGE:9021715), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC157877 // GenBank // Homo sapiens schlafen family member 14, mRNA (cDNA clone MGC:189770 IMAGE:9057094), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC157879 // GenBank // Homo sapiens schlafen family member 14, mRNA (cDNA clone MGC:189771 IMAGE:9057095), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000004218 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:35548239:35558062:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_000286 // RefSeq // Homo sapiens peroxisomal biogenesis factor 12 (PEX12), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000225873 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:35574795:35578629:-1 gene:ENSG00000108733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000585380 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:35577055:35578863:-1 gene:ENSG00000108733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000586663 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:35575786:35578552:-1 gene:ENSG00000108733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:non_stop_decay // chr17 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AB004546 // GenBank // Homo sapiens mRNA for peroxisome assembly factor-3 (PAF-3), complete cds. // chr17 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC015751 // GenBank // Homo sapiens peroxisomal biogenesis factor 12, mRNA (cDNA clone IMAGE:4859795), partial cds. // chr17 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// BC031085 // GenBank // Homo sapiens peroxisomal biogenesis factor 12, mRNA (cDNA clone MGC:33813 IMAGE:5296541), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// U91521 // GenBank // Homo sapiens peroxin 12 (PEX12) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000613219 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:35574796:35578637:-1 gene:ENSG00000108733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000004207 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:35575782:35578778:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0
NM_139285 // RefSeq // Homo sapiens growth arrest-specific 2 like 2 (GAS2L2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// XM_006721796 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens growth arrest-specific 2 like 2 (GAS2L2), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000604063 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:35744816:35752878:-1 gene:ENSG00000270765 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000604641 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:35744511:35752878:-1 gene:ENSG00000270765 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// AF508784 // GenBank // Homo sapiens GAS2-related protein isoform alpha (GAR17) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// AF508785 // GenBank // Homo sapiens GAS2-related protein isoform beta (GAR17) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000618498 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:35744823:35752878:-1 gene:ENSG00000270765 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000027310 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:35744854:35752850:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 77 // 34 // 34 // 0
NM_001199951 // RefSeq // Homo sapiens lysozyme-like 6 (LYZL6), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// NM_020426 // RefSeq // Homo sapiens lysozyme-like 6 (LYZL6), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AY359018 // GenBank // Homo sapiens clone DNA73746 TKAL754 (UNQ754) mRNA, complete cds. // chr17 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// AY742214 // GenBank // Homo sapiens LYC1 (LYC1) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// BC054481 // GenBank // Homo sapiens lysozyme-like 6, mRNA (cDNA clone MGC:61906 IMAGE:6620264), complete cds. // chr17 // 93 // 90 // 25 // 27 // 0 /// ENST00000612374 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_7_CTG4:35934521:35943699:-1 gene:ENSG00000277042 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// ENST00000615905 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:35934531:35943699:-1 gene:ENSG00000275722 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENST00000618542 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:35934518:35943670:-1 gene:ENSG00000275722 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 93 // 90 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000013691 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_7_CTG4:35895313:35939356:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// GENSCAN00000027312 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:35895313:35939356:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
ENST00000612357 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_7_CTG4:36491571:36491694:-1 gene:ENSG00000277395 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000617595 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:36491199:36491322:-1 gene:ENSG00000274164 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT053215 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
ENST00000612648 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:36574462:36575325:-1 gene:ENSG00000274756 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000013634 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_7_CTG4:36496623:36575532:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000027307 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:36496251:36575160:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
ENST00000363110 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_7_CTG4:36285684:36285785:1 gene:ENSG00000278320 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA gene:ENSG00000199980 // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000384007 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:47557413:47557514:1 gene:ENSG00000206734 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 79 // 100 // 19 // 24 // 0 /// ENST00000476024 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:36285312:36285413:1 gene:ENSG00000265889 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000613607 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_7_CTG4:38031608:38031709:-1 gene:ENSG00000276153 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000614282 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:38089399:38089500:1 gene:ENSG00000275006 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000614695 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:38231043:38231144:-1 gene:ENSG00000274284 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT053299 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT054311 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 79 // 100 // 19 // 24 // 0
NM_001004334 // RefSeq // Homo sapiens G protein-coupled receptor 179 (GPR179), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AY584611 // GenBank // Homo sapiens GPR158-like 1 receptor (GPR158L1) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000610650 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_7_CTG4:38126026:38144226:-1 gene:ENSG00000276469 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000616987 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:38325610:38343810:-1 gene:ENSG00000277399 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000621958 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:38325610:38343810:-1 gene:ENSG00000277399 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000043460 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:38325202:38343768:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046621 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_7_CTG4:38125618:38144184:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
NM_001130677 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 96 (C17orf96), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000613024 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_7_CTG4:38472495:38475721:-1 gene:ENSG00000277303 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000621654 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:38671703:38675421:-1 gene:ENSG00000273604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037685 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:38673356:38674495:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046634 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_7_CTG4:38474143:38475282:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
AY459295 // GenBank // Homo sapiens NS5ATP13TP1 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000616654 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_7_CTG4:38528620:38528985:-1 gene:ENSG00000277005 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT053356 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000612665 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:38731802:38731920:-1 gene:ENSG00000276036 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr17 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000621661 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_7_CTG4:38532589:38532707:-1 gene:ENSG00000278779 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr17 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT053360 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NR_002576 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 21 (SNORA21), small nucleolar RNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000362423 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:38852863:38852994:-1 gene:ENSG00000199293 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000577760 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:38850684:38853764:-1 gene:ENSG00000125691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000584056 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:38852598:38853738:-1 gene:ENSG00000125691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK095288 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ37969 fis, clone CTONG2009938. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT053377 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT053378 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT053379 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_001008777 // RefSeq // Homo sapiens F-box protein 47 (FBXO47), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000378079 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:38936432:38967402:-1 gene:ENSG00000204952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AY700575 // GenBank // Homo sapiens F-box protein 47 (FBXO47) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC140879 // GenBank // Homo sapiens F-box protein 47, mRNA (cDNA clone MGC:176556 IMAGE:9021747), complete cds. // chr17 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// BC140880 // GenBank // Homo sapiens F-box protein 47, mRNA (cDNA clone MGC:176557 IMAGE:9021748), complete cds. // chr17 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000037694 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:38925640:38952695:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0
NM_001143968 // RefSeq // Homo sapiens ADP-ribosylation factor-like 5C (ARL5C), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000269586 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:39156894:39165760:-1 gene:ENSG00000141748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000578912 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:39160198:39162734:-1 gene:ENSG00000141748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// ENST00000581255 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:39164975:39166161:-1 gene:ENSG00000141748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// ENST00000581554 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:39165073:39167484:-1 gene:ENSG00000141748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// ENST00000583123 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:39164079:39167065:-1 gene:ENSG00000141748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// AK310706 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17748. // chr17 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// GENSCAN00000037687 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:39125146:39165760:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT053412 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// NONHSAT053413 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// NONHSAT053414 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
NM_198993 // RefSeq // Homo sapiens SH3 and cysteine rich domain 2 (STAC2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_005257301 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens SH3 and cysteine rich domain 2 (STAC2), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 57 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000333461 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:39210536:39225872:-1 gene:ENSG00000141750 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000584501 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:39211241:39225668:-1 gene:ENSG00000141750 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// BC109231 // GenBank // Homo sapiens SH3 and cysteine rich domain 2, mRNA (cDNA clone MGC:129694 IMAGE:40011675), complete cds. // chr17 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000037686 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:39212292:39225502:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0
NM_001184906 // RefSeq // Homo sapiens F-box and leucine-rich repeat protein 20 (FBXL20), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NM_032875 // RefSeq // Homo sapiens F-box and leucine-rich repeat protein 20 (FBXL20), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_005257746 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens F-box and leucine-rich repeat protein 20 (FBXL20), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000264658 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:39260587:39401663:-1 gene:ENSG00000108306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000394294 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:39260587:39401623:-1 gene:ENSG00000108306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000577399 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:39261460:39402523:-1 gene:ENSG00000108306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000583610 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:39259131:39401656:-1 gene:ENSG00000108306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// AK291844 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78190 complete cds. // chr17 // 91 // 94 // 31 // 34 // 0 /// BC007557 // GenBank // Homo sapiens F-box and leucine-rich repeat protein 20, mRNA (cDNA clone MGC:15482 IMAGE:2987858), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// DQ223959 // GenBank // Homo sapiens F-box and leucine-rich repeat protein 20 variant b mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr17 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000037696 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:39261460:39402325:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 44 // 16 // 16 // 0
NM_004774 // RefSeq // Homo sapiens mediator complex subunit 1 (MED1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000300651 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:39406601:39451286:-1 gene:ENSG00000125686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000394287 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:39404285:39451268:-1 gene:ENSG00000125686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000577831 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:39407714:39451272:-1 gene:ENSG00000125686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// AF055994 // GenBank // Homo sapiens thyroid hormone receptor-associated protein complex component TRAP220 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AF283812 // GenBank // Homo sapiens vitamin D receptor-interacting protein complex component DRIP205 (DRIP205) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// BC060758 // GenBank // Homo sapiens mediator complex subunit 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4822636), complete cds. // chr17 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// BC131783 // GenBank // Homo sapiens mediator complex subunit 1, mRNA (cDNA clone MGC:156289 IMAGE:40125129), complete cds. // chr17 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000037682 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:39407475:39440660:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0
ENST00000411159 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:39482486:39482590:-1 gene:ENSG00000223091 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT053444 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000410845 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:39546104:39546244:-1 gene:ENSG00000222777 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT053447 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_006160 // RefSeq // Homo sapiens neuronal differentiation 2 (NEUROD2), mRNA. // chr17 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000302584 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:39604780:39607943:-1 gene:ENSG00000171532 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000580874 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:39603536:39609777:-1 gene:ENSG00000171532 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AB021742 // GenBank // Homo sapiens NDRF mRNA for neuroD-related factor, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC022481 // GenBank // Homo sapiens neurogenic differentiation 2, mRNA (cDNA clone MGC:26304 IMAGE:4816285), complete cds. // chr17 // 95 // 66 // 20 // 21 // 0 /// BT019365 // GenBank // Homo sapiens neurogenic differentiation 2 mRNA, complete cds. // chr17 // 95 // 63 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000037689 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:39605451:39606599:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0
NM_021724 // RefSeq // Homo sapiens nuclear receptor subfamily 1, group D, member 1 (NR1D1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000246672 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:40092787:40100725:-1 gene:ENSG00000126368 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC047875 // GenBank // Homo sapiens nuclear receptor subfamily 1, group D, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:57563 IMAGE:6190140), complete cds. // chr17 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC056148 // GenBank // Homo sapiens nuclear receptor subfamily 1, group D, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:64943 IMAGE:6195844), complete cds. // chr17 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// HQ692861 // GenBank // Homo sapiens nuclear receptor Rev-ErbA-alpha (NR1D1) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// M24898 // GenBank // Human triiodothyronine recptor (THRA1, ear1) mRNA, complete cds. // chr17 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// AK300155 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52239 complete cds, highly similar to Orphan nuclear receptor NR1D1. // chr17 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// GENSCAN00000049452 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:40091046:40106555:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0
NM_152219 // RefSeq // Homo sapiens gap junction protein, delta 3, 31.9kDa (GJD3), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000578689 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:40362931:40363815:-1 gene:ENSG00000183153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000049448 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:40362931:40363815:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0
NM_001067 // RefSeq // Homo sapiens topoisomerase (DNA) II alpha 170kDa (TOP2A), mRNA. // chr17 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000423485 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:40388516:40417950:-1 gene:ENSG00000131747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// AF285157 // GenBank // Homo sapiens topoisomerase II alpha-2 (TOP2A) mRNA, partial cds. // chr17 // 100 // 30 // 13 // 13 // 0 /// AF285158 // GenBank // Homo sapiens topoisomerase II alpha-3 (TOP2A) mRNA, partial cds. // chr17 // 100 // 23 // 10 // 10 // 0 /// BC140791 // GenBank // Homo sapiens topoisomerase (DNA) II alpha 170kDa, mRNA (cDNA clone MGC:176468 IMAGE:9021659), complete cds. // chr17 // 98 // 93 // 40 // 41 // 0 /// J04088 // GenBank // Human DNA topoisomerase II (top2) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// AF285159 // GenBank // Homo sapiens topoisomerase II alpha-4 (TOP2A) mRNA, partial cds. // chr17 // 30 // 30 // 13 // 44 // 1 /// GENSCAN00000049466 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:40389519:40437256:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 97 // 73 // 31 // 32 // 0
ENST00000410949 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:40391232:40391338:-1 gene:ENSG00000222881 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT053547 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_032865 // RefSeq // Homo sapiens tensin 4 (TNS4), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000254051 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:40475828:40501597:-1 gene:ENSG00000131746 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000394072 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:40475828:40480875:-1 gene:ENSG00000131746 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 28 // 10 // 10 // 0 /// AF417488 // GenBank // Homo sapiens C-terminal tensin-like protein mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC013373 // GenBank // Homo sapiens tensin 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:3942213), partial cds. // chr17 // 100 // 28 // 10 // 10 // 0 /// BC018706 // GenBank // Homo sapiens tensin 4, mRNA (cDNA clone MGC:31757 IMAGE:5013235), complete cds. // chr17 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000049456 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:40477588:40496425:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT053551 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 28 // 10 // 10 // 0
NM_001838 // RefSeq // Homo sapiens chemokine (C-C motif) receptor 7 (CCR7), mRNA. // chr17 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000246657 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:40553769:40565472:-1 gene:ENSG00000126353 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000578085 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:40555092:40565459:-1 gene:ENSG00000126353 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 38 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000579344 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:40554330:40561013:-1 gene:ENSG00000126353 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 92 // 62 // 12 // 13 // 0 /// AK310277 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17319. // chr17 // 92 // 62 // 12 // 13 // 0 /// AY587876 // GenBank // Homo sapiens CC chemokine receptor 7 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 52 // 11 // 11 // 0 /// BC035343 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-C motif) receptor 7, mRNA (cDNA clone MGC:34623 IMAGE:5180758), complete cds. // chr17 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0 /// L08176 // GenBank // Human Epstein-Barr virus induced G-protein coupled receptor mRNA, complete cds. // chr17 // 95 // 90 // 18 // 19 // 0 /// L31581 // GenBank // Human G protein-coupled receptor (EBI 1) mRNA, complete cds. // chr17 // 95 // 95 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000049457 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:40554742:40621246:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 52 // 52 // 11 // 21 // 1
ENST00000348513 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:40624962:40648508:-1 gene:ENSG00000073584 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// AK095738 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ38419 fis, clone FEBRA2009846. // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_152349 // RefSeq // Homo sapiens keratin 222 (KRT222), mRNA. // chr17 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000394049 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:40654665:40665156:-1 gene:ENSG00000213424 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000394052 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:40655620:40665141:-1 gene:ENSG00000213424 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000580719 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:40660158:40665181:-1 gene:ENSG00000213424 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 89 // 35 // 8 // 9 // 0 /// ENST00000581564 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:40657209:40665145:-1 gene:ENSG00000213424 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// AK308598 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ98639. // chr17 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// BC032815 // GenBank // Homo sapiens keratin 222 pseudogene, mRNA (cDNA clone MGC:45562 IMAGE:4346009), complete cds. // chr17 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BX538083 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686P24273 (from clone DKFZp686P24273); complete cds. // chr17 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000476049 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:40628797:40665141:-1 gene:ENSG00000264058 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// GENSCAN00000012252 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:40648073:40772113:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// AK092967 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ35648 fis, clone SPLEN2013195, highly similar to Homo sapiens BAF57 (BAF57) gene. // chr17 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_019016 // RefSeq // Homo sapiens keratin 24 (KRT24), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000264651 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:40697991:40703750:-1 gene:ENSG00000167916 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK000268 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ20261 fis, clone COLF7630. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC111968 // GenBank // Homo sapiens keratin 24, mRNA (cDNA clone MGC:138173 IMAGE:8327436), complete cds. // chr17 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000012252 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:40648073:40772113:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 53 // 17 // 17 // 0
NM_181534 // RefSeq // Homo sapiens keratin 25 (KRT25), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000312150 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:40748021:40755332:-1 gene:ENSG00000204897 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000012252 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:40648073:40772113:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0
NM_181539 // RefSeq // Homo sapiens keratin 26 (KRT26), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000335552 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:40766238:40772162:-1 gene:ENSG00000186393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC132951 // GenBank // Homo sapiens keratin 26, mRNA (cDNA clone MGC:164582 IMAGE:40146973), complete cds. // chr17 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// BC136896 // GenBank // Homo sapiens keratin 26, mRNA (cDNA clone MGC:168510 IMAGE:9020887), complete cds. // chr17 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000012252 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:40648073:40772113:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_181537 // RefSeq // Homo sapiens keratin 27 (KRT27), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000301656 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:40776808:40782534:-1 gene:ENSG00000171446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000540723 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:40776808:40778020:-1 gene:ENSG00000171446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// AJ564206 // GenBank // Homo sapiens mRNA for type I inner root sheath specific keratin 25 irs3 (KRT25C gene). // chr17 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000012250 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:40776999:40806633:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT053568 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0
NM_181535 // RefSeq // Homo sapiens keratin 28 (KRT28), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000306658 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:40792203:40799959:-1 gene:ENSG00000173908 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000012250 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:40776999:40806633:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NM_000421 // RefSeq // Homo sapiens keratin 10 (KRT10), mRNA. // chr17 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// XM_005257343 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens keratin 10 (KRT10), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000269576 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:40818117:40822595:-1 gene:ENSG00000186395 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC034697 // GenBank // Homo sapiens keratin 10, mRNA (cDNA clone MGC:21369 IMAGE:4751594), complete cds. // chr17 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// M19156 // GenBank // Human acidic keratin-10 mRNA, complete cds. // chr17 // 82 // 79 // 18 // 22 // 0 /// J04029 // GenBank // Homo sapiens keratin 10 type I intermediate filament (KRT10) mRNA, complete cds. // chr17 // 56 // 96 // 15 // 27 // 0 /// GENSCAN00000012276 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:40818376:40822585:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0
NM_000223 // RefSeq // Homo sapiens keratin 12 (KRT12), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000251643 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:40861303:40867210:-1 gene:ENSG00000187242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000572470 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_4_CTG4:40861303:40867210:-1 gene:ENSG00000263243 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// D78367 // GenBank // Homo sapiens mRNA for K12 keratin, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000012283 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:40861661:40885110:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000046920 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_4_CTG4:40861661:40936603:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0
NM_019010 // RefSeq // Homo sapiens keratin 20 (KRT20), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000167588 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:40875941:40885227:-1 gene:ENSG00000171431 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000576098 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_4_CTG4:40875941:40885227:-1 gene:ENSG00000263057 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC031559 // GenBank // Homo sapiens keratin 20, mRNA (cDNA clone MGC:35423 IMAGE:5189289), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000046920 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_4_CTG4:40861661:40936603:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1 /// GENSCAN00000012283 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:40861661:40885110:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1
NM_213656 // RefSeq // Homo sapiens keratin 39 (KRT39), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 60 // 60 // 0 /// ENST00000355612 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:40958417:40966892:-1 gene:ENSG00000196859 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 60 // 60 // 0 /// ENST00000575391 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_4_CTG4:40958544:40967019:-1 gene:ENSG00000262164 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 60 // 60 // 0 /// ENST00000577373 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_4_CTG4:40958627:40960824:-1 gene:ENSG00000262164 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 95 // 32 // 18 // 19 // 0 /// ENST00000578029 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:40958500:40960697:-1 gene:ENSG00000196859 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 95 // 32 // 18 // 19 // 0 /// ENST00000578078 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:40958462:40966886:-1 gene:ENSG00000196859 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 98 // 97 // 57 // 58 // 0 /// ENST00000580328 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_4_CTG4:40958589:40967013:-1 gene:ENSG00000262164 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 98 // 97 // 57 // 58 // 0 /// BC157887 // GenBank // Homo sapiens keratin 39, mRNA (cDNA clone MGC:189711 IMAGE:8862708), complete cds. // chr17 // 95 // 97 // 55 // 58 // 0 /// GENSCAN00000012248 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:40958601:40966856:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 78 // 47 // 47 // 0 /// GENSCAN00000046924 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_4_CTG4:40958728:40966983:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 78 // 47 // 47 // 0
NM_033185 // RefSeq // Homo sapiens keratin associated protein 3-3 (KRTAP3-3), mRNA. // chr17 // 100 // 79 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000391586 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:40993430:40994133:-1 gene:ENSG00000212899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 79 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000572132 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_4_CTG4:40993557:40994260:-1 gene:ENSG00000263101 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 79 // 37 // 37 // 0 /// BC069099 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 3-3, mRNA (cDNA clone MGC:95374 IMAGE:7216913), complete cds. // chr17 // 100 // 79 // 37 // 37 // 0 /// BC093845 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 3-3, mRNA (cDNA clone MGC:120880 IMAGE:7939690), complete cds. // chr17 // 78 // 57 // 21 // 27 // 0 /// BC093847 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 3-3, mRNA (cDNA clone MGC:120882 IMAGE:7939692), complete cds. // chr17 // 78 // 57 // 21 // 27 // 0 /// BC069448 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 3-3, mRNA (cDNA clone MGC:97408 IMAGE:7262684), complete cds. // chr17 // 70 // 57 // 19 // 27 // 0
NM_031959 // RefSeq // Homo sapiens keratin associated protein 3-2 (KRTAP3-2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 50 // 50 // 0 /// ENST00000391587 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:40999193:40999894:-1 gene:ENSG00000212900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 50 // 50 // 0 /// ENST00000575409 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_4_CTG4:40999320:41000021:-1 gene:ENSG00000263296 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 50 // 50 // 0 /// BC034582 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 3-2, mRNA (cDNA clone MGC:34106 IMAGE:3909612), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 50 // 50 // 0 /// GENSCAN00000012277 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:40998977:41027155:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 20 // 20 // 10 // 50 // 1 /// GENSCAN00000046928 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_4_CTG4:40999104:41030205:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 20 // 20 // 10 // 50 // 1
NM_031958 // RefSeq // Homo sapiens keratin associated protein 3-1 (KRTAP3-1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENST00000391588 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:41008521:41009114:-1 gene:ENSG00000212901 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENST00000571440 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_4_CTG4:41008648:41009241:-1 gene:ENSG00000262068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENST00000580358 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_4_CTG4:41008648:41019451:-1 gene:ENSG00000262068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 76 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000581033 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:41008521:41019324:-1 gene:ENSG00000212901 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 76 // 35 // 35 // 0 /// BC113077 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 3-1, mRNA (cDNA clone MGC:134859 IMAGE:40069149), complete cds. // chr17 // 85 // 43 // 17 // 20 // 0 /// BC113078 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 3-1, mRNA (cDNA clone MGC:134860 IMAGE:40069150), complete cds. // chr17 // 85 // 43 // 17 // 20 // 0 /// NONHSAT053619 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 76 // 35 // 35 // 0
NM_001257305 // RefSeq // Homo sapiens keratin associated protein 1-4 (KRTAP1-4), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000377747 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:41029697:41030104:-1 gene:ENSG00000204887 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000576814 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_4_CTG4:41029824:41030231:-1 gene:ENSG00000263242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000012264 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:41029713:41030078:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_033188 // RefSeq // Homo sapiens keratin associated protein 4-5 (KRTAP4-5), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000343246 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:41148924:41149802:-1 gene:ENSG00000198271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// AJ406937 // GenBank // Homo sapiens mRNA for keratin associated protein 4.5 (KRTAP4.5 gene). // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_032524 // RefSeq // Homo sapiens keratin associated protein 4-4 (KRTAP4-4), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000390661 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:41159651:41160731:-1 gene:ENSG00000171396 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000012271 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:41159920:41160691:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 91 // 92 // 10 // 11 // 0
NM_033187 // RefSeq // Homo sapiens keratin associated protein 4-3 (KRTAP4-3), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000391356 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:41167231:41168194:-1 gene:ENSG00000196156 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000012263 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:41167581:41182944:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_033062 // RefSeq // Homo sapiens keratin associated protein 4-2 (KRTAP4-2), mRNA. // chr17 // 81 // 100 // 13 // 16 // 0 /// ENST00000377726 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:41177446:41178208:-1 gene:ENSG00000244537 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC127252 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 4-2, mRNA (cDNA clone MGC:157644 IMAGE:40030890), complete cds. // chr17 // 81 // 100 // 13 // 16 // 0 /// GENSCAN00000012263 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:41167581:41182944:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 50 // 50 // 8 // 16 // 1
NM_033060 // RefSeq // Homo sapiens keratin associated protein 4-1 (KRTAP4-1), mRNA. // chr17 // 84 // 100 // 16 // 19 // 0 /// ENST00000398472 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:41184102:41185342:-1 gene:ENSG00000198443 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC065372 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 4-1, mRNA (cDNA clone IMAGE:6248648). // chr17 // 84 // 100 // 16 // 19 // 0 /// BC103845 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 4-1, mRNA (cDNA clone MGC:118980 IMAGE:40002744), complete cds. // chr17 // 82 // 89 // 14 // 17 // 0 /// BC103846 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 4-1, mRNA (cDNA clone MGC:118981 IMAGE:40002745), complete cds. // chr17 // 82 // 89 // 14 // 17 // 0 /// GENSCAN00000012257 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:41184388:41187136:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 58 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000620667 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:41184102:41184895:-1 gene:ENSG00000198443 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 1
NM_031964 // RefSeq // Homo sapiens keratin associated protein 17-1 (KRTAP17-1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000334202 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:41314917:41315695:-1 gene:ENSG00000186860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000574858 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_1_CTG4:41314917:41315695:-1 gene:ENSG00000263341 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC069078 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 17-1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7216892), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC069297 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 17-1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7262696), complete cds. // chr17 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0
NM_004138 // RefSeq // Homo sapiens keratin 33A (KRT33A), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000007735 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:41346092:41350812:-1 gene:ENSG00000006059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000576236 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_1_CTG4:41346092:41350812:-1 gene:ENSG00000261986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC069135 // GenBank // Homo sapiens keratin 33A, mRNA (cDNA clone MGC:95416 IMAGE:7216991), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000011170 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_1_CTG4:41307700:41431803:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 67 // 86 // 8 // 12 // 0 /// GENSCAN00000012246 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:41302362:41424478:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 67 // 86 // 8 // 12 // 0
NM_002279 // RefSeq // Homo sapiens keratin 33B (KRT33B), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000251646 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:41363494:41369800:-1 gene:ENSG00000131738 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000570596 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_1_CTG4:41363494:41369800:-1 gene:ENSG00000263012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC009971 // GenBank // Homo sapiens keratin 33B, mRNA (cDNA clone MGC:15362 IMAGE:4310076), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000620421 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:41363811:41397592:-1 gene:ENSG00000131738 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0
NM_021013 // RefSeq // Homo sapiens keratin 34 (KRT34), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000394001 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:41377650:41382403:-1 gene:ENSG00000131737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000576522 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_1_CTG4:41384972:41389707:-1 gene:ENSG00000262748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC041070 // GenBank // Homo sapiens keratin 34, mRNA (cDNA clone MGC:52152 IMAGE:5481838), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000571312 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_1_CTG4:41377665:41382400:-1 gene:ENSG00000262045 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000011170 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_1_CTG4:41307700:41431803:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1 /// GENSCAN00000012246 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:41302362:41424478:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1
NM_002277 // RefSeq // Homo sapiens keratin 31 (KRT31), mRNA. // chr17 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// XM_005257351 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens keratin 31 (KRT31), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 67 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000251645 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:41393724:41397592:-1 gene:ENSG00000094796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000573281 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_1_CTG4:41401024:41404892:-1 gene:ENSG00000262993 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 94 // 89 // 15 // 16 // 0 /// AK313419 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ93957. // chr17 // 100 // 67 // 12 // 12 // 0 /// BC114468 // GenBank // Homo sapiens keratin 31, mRNA (cDNA clone MGC:138630 IMAGE:40032590), complete cds. // chr17 // 100 // 72 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000011170 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_1_CTG4:41307700:41431803:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 50 // 50 // 9 // 18 // 1 /// GENSCAN00000012246 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:41302362:41424478:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 50 // 50 // 9 // 18 // 1
NM_003770 // RefSeq // Homo sapiens keratin 37 (KRT37), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000225550 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:41420753:41424523:-1 gene:ENSG00000108417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000574588 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_1_CTG4:41428078:41431848:-1 gene:ENSG00000263022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000011170 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_1_CTG4:41307700:41431803:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000012246 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:41302362:41424478:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0
NM_006771 // RefSeq // Homo sapiens keratin 38 (KRT38), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000246646 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:41436446:41440921:-1 gene:ENSG00000171360 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 15 // 15 // 0 /// BC131715 // GenBank // Homo sapiens keratin 38, mRNA (cDNA clone MGC:150589 IMAGE:40123079), complete cds. // chr17 // 100 // 94 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000012284 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:41437383:41440876:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0
NM_002278 // RefSeq // Homo sapiens keratin 32 (KRT32), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000225899 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:41459811:41467429:-1 gene:ENSG00000108759 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000012266 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:41448576:41481097:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
NM_002280 // RefSeq // Homo sapiens keratin 35 (KRT35), mRNA. // chr17 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000246639 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:41476689:41481140:-1 gene:ENSG00000197079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000393989 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:41476690:41481140:-1 gene:ENSG00000197079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000012266 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:41448576:41481097:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_003771 // RefSeq // Homo sapiens keratin 36 (KRT36), mRNA. // chr17 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000328119 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:41486136:41489864:-1 gene:ENSG00000126337 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000393986 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:41486136:41492546:-1 gene:ENSG00000126337 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC043581 // GenBank // Homo sapiens keratin 36, mRNA (cDNA clone MGC:50268 IMAGE:5227645), complete cds. // chr17 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000012275 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:41486376:41489864:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
NM_002276 // RefSeq // Homo sapiens keratin 19 (KRT19), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000361566 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:41523617:41528308:-1 gene:ENSG00000171345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000468880 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:41523714:41524993:-1 gene:ENSG00000171345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 82 // 63 // 14 // 17 // 0 /// ENST00000593096 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:41523875:41525445:-1 gene:ENSG00000171345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// BC002539 // GenBank // Homo sapiens keratin 19, mRNA (cDNA clone MGC:1712 IMAGE:3138504), complete cds. // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC007628 // GenBank // Homo sapiens keratin 19, mRNA (cDNA clone MGC:15788 IMAGE:3504206), complete cds. // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC010409 // GenBank // Homo sapiens keratin 19, mRNA (cDNA clone MGC:15366 IMAGE:3689178), complete cds. // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC067744 // GenBank // Homo sapiens keratin 19, mRNA (cDNA clone MGC:87006 IMAGE:30332499), complete cds. // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC084574 // GenBank // Homo sapiens keratin 19, mRNA (cDNA clone MGC:99486 IMAGE:6730698), complete cds. // chr17 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000012274 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:41523743:41528247:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// AK293479 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60424 complete cds, highly similar to Junction plakoglobin. // chr17 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1
NM_000226 // RefSeq // Homo sapiens keratin 9 (KRT9), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000246662 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:41565841:41572058:-1 gene:ENSG00000171403 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// S69510 // GenBank // cytokeratin 9=type I cytokeratin [human, foot sole epidermis, mRNA, 2352 nt]. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000588431 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:41566104:41572053:-1 gene:ENSG00000171403 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// GENSCAN00000012279 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:41552367:41571992:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0
NM_000526 // RefSeq // Homo sapiens keratin 14 (KRT14), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000167586 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:41582279:41586921:-1 gene:ENSG00000186847 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC002690 // GenBank // Homo sapiens keratin 14, mRNA (cDNA clone MGC:3944 IMAGE:3610489), complete cds. // chr17 // 93 // 94 // 14 // 15 // 0 /// BC019097 // GenBank // Homo sapiens keratin 14, mRNA (cDNA clone MGC:29662 IMAGE:5013623), complete cds. // chr17 // 93 // 94 // 14 // 15 // 0 /// BC042437 // GenBank // Homo sapiens keratin 14, mRNA (cDNA clone MGC:24954 IMAGE:4776763), complete cds. // chr17 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// BC094830 // GenBank // Homo sapiens keratin 14, mRNA (cDNA clone MGC:104825 IMAGE:5443153), complete cds. // chr17 // 93 // 94 // 14 // 15 // 0 /// BT007186 // GenBank // Homo sapiens keratin 14 (epidermolysis bullosa simplex, Dowling-Meara, Koebner) mRNA, complete cds. // chr17 // 92 // 81 // 12 // 13 // 0 /// M28646 // GenBank // Homo sapiens epidermal type I keratin (K14) mRNA, partial cds. // chr17 // 100 // 50 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000012268 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:41582435:41586834:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0 /// BC127260 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:40120729, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr17 // 73 // 69 // 8 // 11 // 0
NM_005557 // RefSeq // Homo sapiens keratin 16 (KRT16), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000301653 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:41609778:41612753:-1 gene:ENSG00000186832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000593067 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:41610409:41612899:-1 gene:ENSG00000186832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 80 // 40 // 8 // 10 // 0 /// AF061812 // GenBank // Homo sapiens keratin 16 (KRT16A) mRNA, complete cds. // chr17 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// AK290853 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75925 complete cds, highly similar to Homo sapiens keratin 16 (focal non-epidermolytic palmoplantar keratoderma) (KRT16), mRNA. // chr17 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// BC039169 // GenBank // Homo sapiens keratin 16, mRNA (cDNA clone MGC:21296 IMAGE:4752995), complete cds. // chr17 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000588319 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:41611766:41612765:-1 gene:ENSG00000186832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// AK309296 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99337. // chr17 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000012287 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:41598176:41614243:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_001079870 // RefSeq // Homo sapiens huntingtin-associated protein 1 (HAP1), transcript variant 3, mRNA. // chr17 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NM_001079871 // RefSeq // Homo sapiens huntingtin-associated protein 1 (HAP1), transcript variant 4, mRNA. // chr17 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NM_177977 // RefSeq // Homo sapiens huntingtin-associated protein 1 (HAP1), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000310778 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:41722640:41734644:-1 gene:ENSG00000173805 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000341193 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:41722640:41734644:-1 gene:ENSG00000173805 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000347901 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:41722640:41734644:-1 gene:ENSG00000173805 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000393939 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:41720813:41734644:-1 gene:ENSG00000173805 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// AB209105 // GenBank // Homo sapiens mRNA for huntingtin-associated protein 1 isoform 2 variant protein. // chr17 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// AF040723 // GenBank // Homo sapiens neuroan1 mRNA, complete cds. // chr17 // 92 // 93 // 24 // 26 // 0 /// U38371 // GenBank // Human HAP1-like protein (hHLP1) mRNA, complete cds. // chr17 // 90 // 36 // 9 // 10 // 0 /// GENSCAN00000015267 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:41723153:41734634:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
ENST00000471648 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:41730127:41730405:-1 gene:ENSG00000239542 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT053650 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr17 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0
NM_018143 // RefSeq // Homo sapiens kelch-like family member 11 (KLHL11), mRNA. // chr17 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000319121 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:41853545:41865431:-1 gene:ENSG00000178502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC034470 // GenBank // Homo sapiens kelch-like 11 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:26174 IMAGE:4822768), complete cds. // chr17 // 95 // 95 // 19 // 20 // 0 /// AK301952 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51370 complete cds, highly similar to Kelch-like protein 11 precursor. // chr17 // 76 // 76 // 16 // 21 // 1 /// GENSCAN00000015276 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:41853740:41865370:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 94 // 81 // 16 // 17 // 0
ENST00000496039 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:42025576:42028131:-1 gene:ENSG00000187595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC067901 // GenBank HTC // Homo sapiens zinc finger protein 385C, mRNA (cDNA clone IMAGE:5298834), with apparent retained intron. // chr17 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NM_001242704 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 385C (ZNF385C), mRNA. // chr17 // 96 // 96 // 24 // 25 // 1 /// ENST00000461831 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:42025576:42028689:-1 gene:ENSG00000187595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 96 // 96 // 24 // 25 // 1 /// BC080613 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 385C, mRNA (cDNA clone MGC:99757 IMAGE:5922386), complete cds. // chr17 // 96 // 96 // 24 // 25 // 1 /// ENST00000436535 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:42027018:42063057:-1 gene:ENSG00000187595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONHSAT053683 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr17 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000618554 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:42025576:42038026:-1 gene:ENSG00000187595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 96 // 24 // 25 // 1 /// NONHSAT053682 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr17 // 96 // 96 // 24 // 25 // 1 /// GENSCAN00000015264 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:42026897:42073892:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_021078 // RefSeq // Homo sapiens K(lysine) acetyltransferase 2A (KAT2A), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// XM_006721818 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens K(lysine) acetyltransferase 2A (KAT2A), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 70 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000225916 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:42113108:42121358:-1 gene:ENSG00000108773 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000465682 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:42113118:42121058:-1 gene:ENSG00000108773 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000586972 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:42113390:42114398:-1 gene:ENSG00000108773 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 23 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000588759 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:42114224:42115833:-1 gene:ENSG00000108773 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 25 // 10 // 10 // 0 /// BC032743 // GenBank // Homo sapiens K(lysine) acetyltransferase 2A, mRNA (cDNA clone MGC:45022 IMAGE:5575574), complete cds. // chr17 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// BC039907 // GenBank // Homo sapiens K(lysine) acetyltransferase 2A, mRNA (cDNA clone MGC:47610 IMAGE:6064838), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// BC105977 // GenBank // Homo sapiens K(lysine) acetyltransferase 2A, mRNA (cDNA clone MGC:102791 IMAGE:6137532), complete cds. // chr17 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000015258 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:42101761:42121304:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0
NM_012285 // RefSeq // Homo sapiens potassium voltage-gated channel, subfamily H (eag-related), member 4 (KCNH4), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000264661 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:42156895:42181278:-1 gene:ENSG00000089558 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000607371 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:42156891:42181081:-1 gene:ENSG00000089558 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AB022698 // GenBank // Homo sapiens mRNA for BEC2, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000015255 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:42125783:42180945:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
NM_001524 // RefSeq // Homo sapiens hypocretin (orexin) neuropeptide precursor (HCRT), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000293330 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:42184060:42185452:-1 gene:ENSG00000161610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AF041240 // GenBank // Homo sapiens prepro-orexin mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000015252 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:42184154:42193581:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 54 // 54 // 13 // 24 // 1
NM_012448 // RefSeq // Homo sapiens signal transducer and activator of transcription 5B (STAT5B), mRNA. // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000293328 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:42199168:42276406:-1 gene:ENSG00000173757 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC065227 // GenBank // Homo sapiens signal transducer and activator of transcription 5B, mRNA (cDNA clone MGC:74606 IMAGE:5553426), complete cds. // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// U48730 // GenBank // Homo sapiens transcription factor Stat5b (stat5b) mRNA, complete cds. // chr17 // 89 // 72 // 16 // 18 // 0 /// U47686 // GenBank // Human signal transducer and activator of transcription Stat5B mRNA, complete cds. // chr17 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// XM_005257626 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens signal transducer and activator of transcription 5B (STAT5B), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000015254 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:42201738:42232127:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_012232 // RefSeq // Homo sapiens polymerase I and transcript release factor (PTRF), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000357037 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:42402452:42423517:-1 gene:ENSG00000177469 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF312393 // GenBank HTC // Homo sapiens leucine-zipper protein FKSG13 (FKSG13) mRNA, complete cds. // chr17 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// AK298072 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55731 complete cds, highly similar to Polymerase I and transcript release factor. // chr17 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// AK298563 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53495 complete cds, highly similar to Polymerase I and transcript release factor. // chr17 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// BC066123 // GenBank // Homo sapiens polymerase I and transcript release factor, mRNA (cDNA clone MGC:71738 IMAGE:5269172), complete cds. // chr17 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// BC073759 // GenBank // Homo sapiens polymerase I and transcript release factor, mRNA (cDNA clone MGC:88766 IMAGE:6572478), complete cds. // chr17 // 95 // 78 // 20 // 21 // 0 /// XM_005257242 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens polymerase I and transcript release factor (PTRF), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// BC008849 // GenBank // Homo sapiens polymerase I and transcript release factor, mRNA (cDNA clone MGC:14316 IMAGE:4140111), complete cds. // chr17 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// GENSCAN00000015248 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:42404687:42423097:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
NM_016602 // RefSeq // Homo sapiens chemokine (C-C motif) receptor 10 (CCR10), mRNA. // chr17 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000332438 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:42678889:42681843:-1 gene:ENSG00000184451 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000591765 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:42679420:42683064:-1 gene:ENSG00000184451 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// AF208237 // GenBank // Homo sapiens 7-transmembrane G-protein coupled receptor 2 (GPR2) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 60 // 12 // 12 // 0 /// AF215981 // GenBank // Homo sapiens CC chemokine receptor 10 (CCR10) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// AY429103 // GenBank // Homo sapiens C-C motif chemokine receptor 10 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 60 // 12 // 12 // 0 /// BC098132 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-C motif) receptor 10, mRNA (cDNA clone MGC:119239 IMAGE:40004874), complete cds. // chr17 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// BC098157 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-C motif) receptor 10, mRNA (cDNA clone MGC:119240 IMAGE:40004879), complete cds. // chr17 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// BC098304 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-C motif) receptor 10, mRNA (cDNA clone MGC:119241 IMAGE:40004880), complete cds. // chr17 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// BC099840 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-C motif) receptor 10, mRNA (cDNA clone MGC:119238 IMAGE:40004873), complete cds. // chr17 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000038525 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:42668127:42681823:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 40 // 8 // 8 // 0
NM_001040431 // RefSeq // Homo sapiens cytochrome c oxidase assembly factor 3 (COA3), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000328434 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:42797634:42798704:-1 gene:ENSG00000183978 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK225611 // GenBank // Homo sapiens mRNA for HSPC009 variant, clone: PNC06538. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK290863 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76554 complete cds. // chr17 // 90 // 81 // 19 // 21 // 0 /// BC002698 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 56, mRNA (cDNA clone MGC:3372 IMAGE:3609536), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// L38939 // GenBank // Homo sapiens GT233 mRNA. // chr17 // 93 // 58 // 14 // 15 // 0 /// ENST00000586680 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:42795147:42798690:-1 gene:ENSG00000183978 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// AK295023 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50764 complete cds. // chr17 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NR_027254 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 671 (LINC00671), long non-coding RNA. // chr17 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000301683 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:42874670:42898704:-1 gene:ENSG00000213373 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr17 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000417193 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:42879488:42898700:-1 gene:ENSG00000213373 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr17 // 100 // 50 // 8 // 8 // 0 /// AK055784 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ31222 fis, clone KIDNE2004294. // chr17 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000436546 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:42879590:42898704:-1 gene:ENSG00000213373 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr17 // 50 // 50 // 8 // 16 // 1 /// NONHSAT053779 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONHSAT053780 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT146899 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 50 // 8 // 8 // 0 /// NONHSAT053783 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 50 // 50 // 8 // 16 // 1
ENST00000516230 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:42891338:42891435:-1 gene:ENSG00000252039 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT053784 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NONHSAT053787 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000390847 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:42940575:42940702:-1 gene:ENSG00000212149 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr17 // 94 // 100 // 17 // 18 // 0 /// NONHSAT053788 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 94 // 100 // 17 // 18 // 0
NONHSAT053804 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000586231 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:43385863:43389199:-1 gene:ENSG00000188825 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000606190 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:43387226:43387417:-1 gene:ENSG00000277084 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA gene:ENSG00000188825 // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK127427 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ45519 fis, clone BRTHA2024177. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT053855 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000517073 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:43395993:43396091:-1 gene:ENSG00000252882 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT053856 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_025237 // RefSeq // Homo sapiens sclerostin (SOST), mRNA. // chr17 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000301691 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:43753731:43758788:-1 gene:ENSG00000167941 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// AF326739 // GenBank // Homo sapiens sclerostin mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// AF331844 // GenBank // Homo sapiens SOST (SOST) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// AY358203 // GenBank // Homo sapiens clone DNA102863 SOST (UNQ2976) mRNA, complete cds. // chr17 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// AY358627 // GenBank // Homo sapiens clone DNA115253 SOST (UNQ2976) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC101086 // GenBank // Homo sapiens sclerosteosis, mRNA (cDNA clone MGC:119630 IMAGE:40009481), complete cds. // chr17 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// BC101087 // GenBank // Homo sapiens sclerosteosis, mRNA (cDNA clone MGC:119631 IMAGE:40009482), complete cds. // chr17 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// BC101088 // GenBank // Homo sapiens sclerosteosis, mRNA (cDNA clone MGC:119632 IMAGE:40009485), complete cds. // chr17 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// BC101089 // GenBank // Homo sapiens sclerosteosis, mRNA (cDNA clone MGC:119633 IMAGE:40009488), complete cds. // chr17 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000012153 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:43755342:43758741:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_004090 // RefSeq // Homo sapiens dual specificity phosphatase 3 (DUSP3), mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000226004 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:43766121:43778988:-1 gene:ENSG00000108861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000590342 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:43768386:43778935:-1 gene:ENSG00000108861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000590935 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:43766512:43774938:-1 gene:ENSG00000108861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// AK226170 // GenBank // Homo sapiens mRNA for dual specificity phosphatase 3 variant, clone: bj00123. // chr17 // 86 // 70 // 18 // 21 // 0 /// BC002682 // GenBank // Homo sapiens dual specificity phosphatase 3, mRNA (cDNA clone MGC:3615 IMAGE:3605391), complete cds. // chr17 // 87 // 50 // 13 // 15 // 0 /// BC035701 // GenBank // Homo sapiens dual specificity phosphatase 3, mRNA (cDNA clone MGC:46177 IMAGE:5550536), complete cds. // chr17 // 88 // 53 // 14 // 16 // 0 /// L05147 // GenBank // Human dual specificity phosphatase tyrosine/serine mRNA, complete cds. // chr17 // 73 // 37 // 8 // 11 // 0 /// ENST00000590753 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:43766131:43774768:-1 gene:ENSG00000108861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
NM_004160 // RefSeq // Homo sapiens peptide YY (PYY), mRNA. // chr17 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000360085 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:43952738:44004469:-1 gene:ENSG00000131096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000592796 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:43952889:43953940:-1 gene:ENSG00000131096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 57 // 12 // 12 // 0 /// BC041057 // GenBank // Homo sapiens peptide YY, mRNA (cDNA clone MGC:52233 IMAGE:5441270), complete cds. // chr17 // 82 // 81 // 14 // 17 // 0 /// D13902 // GenBank // Homo sapiens mRNA for peptide YY, complete cds. // chr17 // 73 // 52 // 8 // 11 // 0
NM_032376 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 101 (TMEM101), mRNA. // chr17 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006722139 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens transmembrane protein 101 (TMEM101), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000206380 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:44011191:44014977:-1 gene:ENSG00000091947 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000589334 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:44011188:44023151:-1 gene:ENSG00000091947 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB097008 // GenBank // Homo sapiens mRNA for putative NFkB activating protein, complete cds, clone: 130. // chr17 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// AK294237 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52143 complete cds, highly similar to Transmembrane protein 101. // chr17 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// BC007438 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 101, mRNA (cDNA clone MGC:4251 IMAGE:3028940), complete cds. // chr17 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000587529 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:44012509:44014952:-1 gene:ENSG00000091947 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000012145 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:44011928:44014952:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
ENST00000408117 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:44025020:44025223:-1 gene:ENSG00000221044 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT053893 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT053892 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
ENST00000391144 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:44135883:44135989:-1 gene:ENSG00000212446 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT053903 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
ENST00000474076 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:44290856:44291151:-1 gene:ENSG00000239702 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT053929 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_198475 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 171, member A2 (FAM171A2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000293443 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:44353215:44363875:-1 gene:ENSG00000161682 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000588067 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:44356306:44363834:-1 gene:ENSG00000161682 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 89 // 53 // 8 // 9 // 0 /// ENST00000589407 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:44355967:44363812:-1 gene:ENSG00000161682 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 71 // 12 // 12 // 0 /// BC030200 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 171, member A2, mRNA (cDNA clone IMAGE:5200498), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000012133 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:44353733:44363714:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 15 // 15 // 0
ENST00000590816 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:44365014:44365751:-1 gene:ENSG00000267634 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// GENSCAN00000012111 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:44365014:44365298:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// NONHSAT053948 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0
ENST00000478664 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:44409059:44409358:-1 gene:ENSG00000240589 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT053949 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001099225 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 43 (CCDC43), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NM_144609 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 43 (CCDC43), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000315286 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:44677458:44689762:-1 gene:ENSG00000180329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000457422 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:17:44677440:44689779:-1 gene:ENSG00000180329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000588210 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:17:44677483:44689763:-1 gene:ENSG00000180329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC047776 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 43, mRNA (cDNA clone MGC:54279 IMAGE:6023964), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000588687 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:44673069:44689725:-1 gene:ENSG00000180329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// ENST00000592333 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:44681731:44689745:-1 gene:ENSG00000180329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1 /// GENSCAN00000004463 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:44678856:44689753:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0
NM_001264573 // RefSeq // Homo sapiens kinesin family member 18B (KIF18B), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001265577 // RefSeq // Homo sapiens kinesin family member 18B (KIF18B), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000587309 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:17:44924709:44947637:-1 gene:ENSG00000186185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000590129 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:44926360:44936371:-1 gene:ENSG00000186185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// ENST00000593135 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:44925992:44947711:-1 gene:ENSG00000186185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// BC136590 // GenBank // Homo sapiens kinesin family member 18B, mRNA (cDNA clone MGC:168203 IMAGE:9020580), complete cds. // chr17 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// BC144271 // GenBank // Homo sapiens kinesin family member 18B, mRNA (cDNA clone MGC:177808 IMAGE:9052791), complete cds. // chr17 // 96 // 96 // 24 // 25 // 1 /// GU808359 // GenBank // Homo sapiens cell-line HeLa KIF18B mRNA, complete cds. // chr17 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// GENSCAN00000004465 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:44907186:44936371:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_001264573 // RefSeq // Homo sapiens kinesin family member 18B (KIF18B), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_001265577 // RefSeq // Homo sapiens kinesin family member 18B (KIF18B), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000587309 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:17:44924709:44947637:-1 gene:ENSG00000186185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000590129 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:44926360:44936371:-1 gene:ENSG00000186185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000593135 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:44925992:44947711:-1 gene:ENSG00000186185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC136590 // GenBank // Homo sapiens kinesin family member 18B, mRNA (cDNA clone MGC:168203 IMAGE:9020580), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC144271 // GenBank // Homo sapiens kinesin family member 18B, mRNA (cDNA clone MGC:177808 IMAGE:9052791), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GU808359 // GenBank // Homo sapiens cell-line HeLa KIF18B mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000004465 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:44907186:44936371:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_006688 // RefSeq // Homo sapiens complement component 1, q subcomponent-like 1 (C1QL1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000253407 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:44959693:44968071:-1 gene:ENSG00000131094 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// AF095154 // GenBank // Homo sapiens C1q-related factor mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// BC008798 // GenBank // Homo sapiens complement component 1, q subcomponent-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:3776 IMAGE:3635430), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000004457 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:44960188:44969149:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0
NM_133373 // RefSeq // Homo sapiens phospholipase C, delta 3 (PLCD3), mRNA. // chr17 // 98 // 100 // 42 // 43 // 0 /// ENST00000543623 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:45112423:45115128:-1 gene:ENSG00000161714 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 30 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000590644 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:45120355:45133354:-1 gene:ENSG00000161714 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 90 // 23 // 9 // 10 // 0 /// AB075844 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1964 protein. // chr17 // 95 // 93 // 38 // 40 // 0 /// BC072384 // GenBank // Homo sapiens phospholipase C, delta 3, mRNA (cDNA clone MGC:71172 IMAGE:6378601), complete cds. // chr17 // 98 // 100 // 42 // 43 // 0 /// ENST00000539433 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:45112303:45113548:-1 gene:ENSG00000161714 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 19 // 19 // 8 // 43 // 1 /// ENST00000611986 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:45114250:45116711:-1 gene:ENSG00000161714 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 21 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000619929 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:17:45108967:45132498:-1 gene:ENSG00000161714 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000004456 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:45112616:45132410:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 97 // 77 // 32 // 33 // 0
NM_152343 // RefSeq // Homo sapiens spermatogenesis associated 32 (SPATA32), mRNA. // chr17 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000331780 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:45254393:45262112:-1 gene:ENSG00000184361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000586359 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:45254393:45262094:-1 gene:ENSG00000184361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000588866 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:45254393:45262090:-1 gene:ENSG00000184361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// AK302184 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53842 complete cds. // chr17 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC028124 // GenBank // Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 46, mRNA (cDNA clone MGC:40175 IMAGE:5166606), complete cds. // chr17 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000004459 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:45248218:45290745:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0
ENST00000363083 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:45327366:45327497:-1 gene:ENSG00000199953 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr17 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000614507 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_1_CTG5:45327366:45327497:-1 gene:ENSG00000278235 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr17 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000620796 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_2_CTG5:45327366:45327497:-1 gene:ENSG00000275780 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr17 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT054107 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000579599 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:45843874:45895513:-1 gene:ENSG00000264589 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC018035 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4819956. // chr17 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 /// NR_024559 // RefSeq // Homo sapiens MAPT antisense RNA 1 (MAPT-AS1), long non-coding RNA. // chr17 // 54 // 54 // 13 // 24 // 1 /// ENST00000579244 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:45843651:45895600:-1 gene:ENSG00000264589 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr17 // 54 // 54 // 13 // 24 // 1 /// ENST00000581125 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:45843986:45844757:-1 gene:ENSG00000264589 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr17 // 42 // 42 // 10 // 24 // 1 /// NONHSAT054182 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 /// NONHSAT054180 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 54 // 54 // 13 // 24 // 1 /// NONHSAT054181 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 54 // 54 // 13 // 24 // 1 /// NONHSAT056795 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 54 // 54 // 13 // 24 // 1
ENST00000363400 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_1_CTG5:46660217:46660318:1 gene:ENSG00000275775 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA gene:ENSG00000200270 // chr17 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000458981 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:46215070:46215171:-1 gene:ENSG00000238723 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000614338 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_2_CTG5:46226740:46226841:-1 gene:ENSG00000276222 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000621619 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_1_CTG5:45881211:45881312:1 gene:ENSG00000274754 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT054206 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_203400 // RefSeq // Homo sapiens reprimo-like (RPRML), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000322329 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:46978156:46979248:-1 gene:ENSG00000179673 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC033942 // GenBank // Homo sapiens reprimo-like, mRNA (cDNA clone MGC:43894 IMAGE:5274621), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC108690 // GenBank // Homo sapiens reprimo-like, mRNA (cDNA clone MGC:131790 IMAGE:6140781), complete cds. // chr17 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000031209 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:46978645:47001430:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1
NM_001114091 // RefSeq // Homo sapiens cell division cycle 27 (CDC27), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NM_001256 // RefSeq // Homo sapiens cell division cycle 27 (CDC27), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NM_001293089 // RefSeq // Homo sapiens cell division cycle 27 (CDC27), transcript variant 3, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NM_001293091 // RefSeq // Homo sapiens cell division cycle 27 (CDC27), transcript variant 4, mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000066544 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:47117703:47189266:-1 gene:ENSG00000004897 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000527547 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:47120880:47189224:-1 gene:ENSG00000004897 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000531206 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:47120255:47189176:-1 gene:ENSG00000004897 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000533415 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:47120771:47189251:-1 gene:ENSG00000004897 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// AK296881 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57525 complete cds, highly similar to Cell division cycle protein 27 homolog. // chr17 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// BC011656 // GenBank // Homo sapiens cell division cycle 27 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:12709 IMAGE:4301175), complete cds. // chr17 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0
NM_001258248 // RefSeq // Homo sapiens Sp6 transcription factor (SP6), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NM_199262 // RefSeq // Homo sapiens Sp6 transcription factor (SP6), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000342234 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:47844908:47855874:-1 gene:ENSG00000189120 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000536300 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:47844914:47851193:-1 gene:ENSG00000189120 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// AK127707 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ45807 fis, clone NT2RI3009480, highly similar to Transcription factor Sp6. // chr17 // 88 // 62 // 14 // 16 // 0 /// BC103951 // GenBank // Homo sapiens Sp6 transcription factor, mRNA (cDNA clone MGC:119662 IMAGE:40011121), complete cds. // chr17 // 94 // 62 // 15 // 16 // 0 /// BC103952 // GenBank // Homo sapiens Sp6 transcription factor, mRNA (cDNA clone MGC:119663 IMAGE:40011125), complete cds. // chr17 // 94 // 62 // 15 // 16 // 0 /// BC103953 // GenBank // Homo sapiens Sp6 transcription factor, mRNA (cDNA clone MGC:119664 IMAGE:40011129), complete cds. // chr17 // 94 // 62 // 15 // 16 // 0 /// BC103954 // GenBank // Homo sapiens Sp6 transcription factor, mRNA (cDNA clone MGC:119665 IMAGE:40011132), complete cds. // chr17 // 94 // 62 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000004856 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:47847299:47852621:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0
NM_024320 // RefSeq // Homo sapiens proline rich 15-like (PRR15L), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000300557 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:47951967:47957878:-1 gene:ENSG00000167183 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC002865 // GenBank // Homo sapiens ATPase family, AAA domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:11242 IMAGE:3939938), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NR_029687 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 152 (MIR152), microRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000385212 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:48037154:48037262:-1 gene:ENSG00000207947 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-152 // miRBase Micro RNA Database // MI0000462 Homo sapiens miR-152 stem-loop // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT054367 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000384227 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:48088678:48088784:-1 gene:ENSG00000206954 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT054380 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENST00000384576 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:48196680:48196786:-1 gene:ENSG00000207306 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 92 // 100 // 12 // 13 // 0 /// NONHSAT054391 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 92 // 100 // 12 // 13 // 0
ENST00000363668 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:48382371:48382586:-1 gene:ENSG00000200538 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT054396 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENST00000577092 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:48529497:48530910:-1 gene:ENSG00000120094 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// BC096191 // GenBank // Homo sapiens homeobox B1, mRNA (cDNA clone MGC:116842 IMAGE:40004081), complete cds. // chr17 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// BC096192 // GenBank // Homo sapiens homeobox B1, mRNA (cDNA clone MGC:116844 IMAGE:40004085), complete cds. // chr17 // 92 // 96 // 23 // 25 // 0 /// BC096193 // GenBank // Homo sapiens homeobox B1, mRNA (cDNA clone MGC:116845 IMAGE:40004086), complete cds. // chr17 // 88 // 96 // 22 // 25 // 0 /// BC099633 // GenBank // Homo sapiens homeobox B1, mRNA (cDNA clone MGC:116843 IMAGE:40004082), complete cds. // chr17 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// X16666 // GenBank // Human HOX2I mRNA from the Hox2 locus. // chr17 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// NM_002144 // RefSeq // Homo sapiens homeobox B1 (HOXB1), mRNA. // chr17 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// ENST00000239174 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:48528526:48530997:-1 gene:ENSG00000120094 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// GENSCAN00000004847 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:48500933:48530904:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_002145 // RefSeq // Homo sapiens homeobox B2 (HOXB2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_005257275 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens homeobox B2 (HOXB2), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// XM_005257276 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens homeobox B2 (HOXB2), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000330070 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:48542655:48544989:-1 gene:ENSG00000173917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000571287 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:48543159:48543909:-1 gene:ENSG00000173917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 91 // 35 // 10 // 11 // 0 /// BC074805 // GenBank // Homo sapiens homeobox B2, mRNA (cDNA clone MGC:104077 IMAGE:30915528), complete cds. // chr17 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// BC074806 // GenBank // Homo sapiens homeobox B2, mRNA (cDNA clone MGC:103923 IMAGE:30915314), complete cds. // chr17 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000004853 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:48543068:48544911:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0
NM_024015 // RefSeq // Homo sapiens homeobox B4 (HOXB4), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000332503 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:48575513:48580111:-1 gene:ENSG00000182742 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC049204 // GenBank // Homo sapiens homeobox B4, mRNA (cDNA clone MGC:54130 IMAGE:5533346), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000014102 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:48569415:48578313:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0
NR_029608 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 10a (MIR10A), microRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000332503 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:48575513:48580111:-1 gene:ENSG00000182742 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000385043 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:48579838:48579947:-1 gene:ENSG00000274592 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA gene:ENSG00000257178 // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000548801 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:48579630:48582259:-1 gene:ENSG00000257178 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-10a // miRBase Micro RNA Database // MI0000266 Homo sapiens miR-10a stem-loop // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT054421 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT054422 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_002147 // RefSeq // Homo sapiens homeobox B5 (HOXB5), mRNA. // chr17 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000239151 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:48591257:48593961:-1 gene:ENSG00000120075 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC117247 // GenBank // Homo sapiens homeobox B5, mRNA (cDNA clone MGC:150856 IMAGE:40125798), complete cds. // chr17 // 93 // 50 // 13 // 14 // 0 /// M92299 // GenBank // Human homeobox 2.1 protein (HOX2A) mRNA, complete cds. // chr17 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// GENSCAN00000014100 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:48592209:48598150:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_018952 // RefSeq // Homo sapiens homeobox B6 (HOXB6), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_006721856 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens homeobox B6 (HOXB6), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000225648 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:48595753:48604972:-1 gene:ENSG00000108511 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000484302 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:48595751:48604992:-1 gene:ENSG00000108511 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AK292200 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77171 complete cds, highly similar to Homo sapiens homeo box B6 (HOXB6), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC014651 // GenBank // Homo sapiens homeobox B6, mRNA (cDNA clone MGC:20183 IMAGE:4548382), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_005257285 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens homeobox B6 (HOXB6), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1 /// AJ270993 // GenBank // Homo sapiens mRNA for homeobox protein (Hox-2.2 gene). // chr17 // 93 // 71 // 14 // 15 // 0 /// GENSCAN00000014100 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:48592209:48598150:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1
NM_004502 // RefSeq // Homo sapiens homeobox B7 (HOXB7), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000239165 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:48607227:48611020:-1 gene:ENSG00000260027 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000467314 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:48607716:48608326:-1 gene:ENSG00000260027 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 26 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000567101 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:48607627:48633572:-1 gene:ENSG00000260027 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 26 // 9 // 9 // 0 /// AK223249 // GenBank // Homo sapiens mRNA for homeo box B7 variant, clone: STM05613. // chr17 // 82 // 100 // 28 // 34 // 0 /// BC015345 // GenBank // Homo sapiens homeobox B7, mRNA (cDNA clone MGC:21362 IMAGE:4413080), complete cds. // chr17 // 88 // 71 // 21 // 24 // 0 /// AK290653 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76026 complete cds, highly similar to Homo sapiens homeo box B7 (HOXB7), mRNA. // chr17 // 68 // 82 // 19 // 28 // 0 /// M16937 // GenBank // Human homeo box c1 protein, mRNA, complete cds. // chr17 // 68 // 100 // 23 // 34 // 0 /// NONHSAT054451 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 26 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000014114 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:48599765:48618426:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 38 // 38 // 13 // 34 // 1
NM_024016 // RefSeq // Homo sapiens homeobox B8 (HOXB8), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000239144 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:48612346:48614939:-1 gene:ENSG00000120068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000576562 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:48613188:48614704:-1 gene:ENSG00000120068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000014114 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:48599765:48618426:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_024017 // RefSeq // Homo sapiens homeobox B9 (HOXB9), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000311177 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:48621159:48626356:-1 gene:ENSG00000170689 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC015565 // GenBank // Homo sapiens homeobox B9, mRNA (cDNA clone MGC:12925 IMAGE:4139164), complete cds. // chr17 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// GENSCAN00000014119 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:48622900:48627664:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0
NR_029582 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 196a-1 (MIR196A1), microRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000388006 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:48632490:48632559:-1 gene:ENSG00000210741 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-196a-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0000238 Homo sapiens miR-196a-1 stem-loop // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT054459 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_032391 // RefSeq // Homo sapiens prostate cancer susceptibility candidate 1 (PRAC1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000290294 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:48721719:48722522:-1 gene:ENSG00000159182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF331165 // GenBank // Homo sapiens PRAC mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC030950 // GenBank // Homo sapiens prostate cancer susceptibility candidate, mRNA (cDNA clone MGC:32520 IMAGE:4739311), complete cds. // chr17 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0
NM_006361 // RefSeq // Homo sapiens homeobox B13 (HOXB13), mRNA. // chr17 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000290295 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:48724763:48729178:-1 gene:ENSG00000159184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY937237 // GenBank // Homo sapiens PSGD protein (HOXB13) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr17 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// BC007092 // GenBank // Homo sapiens homeobox B13, mRNA (cDNA clone MGC:14711 IMAGE:4250486), complete cds. // chr17 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// BC070233 // GenBank // Homo sapiens homeobox B13, mRNA (cDNA clone MGC:88215 IMAGE:6668163), complete cds. // chr17 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0
ENST00000480790 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:48765554:48765847:-1 gene:ENSG00000244514 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT054476 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000364033 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:48949361:48949520:-1 gene:ENSG00000200903 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT054499 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000459483 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:48956650:48956753:-1 gene:ENSG00000238804 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT054500 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_004123 // RefSeq // Homo sapiens gastric inhibitory polypeptide (GIP), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000357424 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:48958554:48968596:-1 gene:ENSG00000159224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC069100 // GenBank // Homo sapiens gastric inhibitory polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:95375 IMAGE:7216914), complete cds. // chr17 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// BC069663 // GenBank // Homo sapiens gastric inhibitory polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:97293 IMAGE:7262542), complete cds. // chr17 // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// BC069686 // GenBank // Homo sapiens gastric inhibitory polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:97305 IMAGE:7262554), complete cds. // chr17 // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// BC069746 // GenBank // Homo sapiens gastric inhibitory polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:97317 IMAGE:7262566), complete cds. // chr17 // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// BC096146 // GenBank // Homo sapiens gastric inhibitory polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:116794 IMAGE:40002916), complete cds. // chr17 // 84 // 89 // 21 // 25 // 0 /// BC096147 // GenBank // Homo sapiens gastric inhibitory polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:116795 IMAGE:40002922), complete cds. // chr17 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// BC096148 // GenBank // Homo sapiens gastric inhibitory polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:116796 IMAGE:40002923), complete cds. // chr17 // 88 // 89 // 22 // 25 // 0 /// BC096149 // GenBank // Homo sapiens gastric inhibitory polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:116797 IMAGE:40002925), complete cds. // chr17 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// M18185 // GenBank // Human gastric inhibitory polypeptide (GIP) mRNA, complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000014116 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:48958707:48967232:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
NM_001143804 // RefSeq // Homo sapiens phosphatase, orphan 1 (PHOSPHO1), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_178500 // RefSeq // Homo sapiens phosphatase, orphan 1 (PHOSPHO1), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000310544 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:49223362:49230528:-1 gene:ENSG00000173868 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000413580 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:49223370:49230766:-1 gene:ENSG00000173868 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000503902 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:49224800:49230738:-1 gene:ENSG00000173868 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000511066 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:49224439:49230766:-1 gene:ENSG00000173868 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000512250 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:49224791:49230747:-1 gene:ENSG00000173868 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000514112 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:49223660:49226761:-1 gene:ENSG00000173868 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000574638 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:49224791:49229142:-1 gene:ENSG00000173868 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// BC117187 // GenBank // Homo sapiens phosphatase, orphan 1, mRNA (cDNA clone MGC:150796 IMAGE:40125738), complete cds. // chr17 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0
NM_001145365 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 652 (ZNF652), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NM_014897 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 652 (ZNF652), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000362063 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:49294565:49362473:-1 gene:ENSG00000198740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000430262 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:49295999:49362116:-1 gene:ENSG00000198740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// AK292667 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75819 complete cds, highly similar to Homo sapiens zinc finger protein 652 (ZNF652), mRNA. // chr17 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// BC139779 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 652, mRNA (cDNA clone MGC:150547 IMAGE:40122232), complete cds. // chr17 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC152440 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 652, mRNA (cDNA clone MGC:176684 IMAGE:8862563), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000508237 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:49289208:49361993:-1 gene:ENSG00000198740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// BC034987 // GenBank HTC // Homo sapiens zinc finger protein 652, mRNA (cDNA clone IMAGE:5267026), with apparent retained intron. // chr17 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// GENSCAN00000014101 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:49230699:49317662:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
ENST00000362622 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:49966075:49966176:-1 gene:ENSG00000199492 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT054571 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT054572 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_005220 // RefSeq // Homo sapiens distal-less homeobox 3 (DLX3), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000434704 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:49990005:49995224:-1 gene:ENSG00000064195 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000512495 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:49991335:49993703:-1 gene:ENSG00000064195 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 41 // 13 // 13 // 0 /// BC012361 // GenBank // Homo sapiens distal-less homeobox 3, mRNA (cDNA clone MGC:20483 IMAGE:4647487), complete cds. // chr17 // 93 // 88 // 26 // 28 // 0 /// BC028970 // GenBank // Homo sapiens distal-less homeobox 3, mRNA (cDNA clone MGC:30189 IMAGE:4994099), complete cds. // chr17 // 93 // 88 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000011340 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:49980831:49994998:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
NM_032595 // RefSeq // Homo sapiens protein phosphatase 1, regulatory subunit 9B (PPP1R9B), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000513579 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:50139460:50145152:-1 gene:ENSG00000108819 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 19 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000612501 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:17:50133735:50150630:-1 gene:ENSG00000108819 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000011326 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:50128870:50150513:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0
NR_024192 // RefSeq // Homo sapiens histone linker H1 domain, spermatid-specific 1, pseudogene (HILS1), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr17 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NR_024193 // RefSeq // Homo sapiens histone linker H1 domain, spermatid-specific 1, pseudogene (HILS1), transcript variant 1, non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000504307 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:50171428:50181178:-1 gene:ENSG00000188662 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000545329 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:50171514:50171936:-1 gene:ENSG00000188662 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:unitary_pseudogene // chr17 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0 /// AY286318 // GenBank // Homo sapiens spermatid-specific linker histone H1-like protein (HILS1) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// BC033456 // GenBank // Homo sapiens histone linker H1 domain, spermatid-specific 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3925349). // chr17 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000011333 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:50171513:50172678:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT054598 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT054599 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONHSAT054600 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0
NM_000088 // RefSeq // Homo sapiens collagen, type I, alpha 1 (COL1A1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 60 // 60 // 0 /// ENST00000225964 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:50183289:50201632:-1 gene:ENSG00000108821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 60 // 60 // 0 /// ENST00000476387 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:50190909:50194058:-1 gene:ENSG00000108821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 17 // 10 // 10 // 0 /// BC036531 // GenBank // Homo sapiens collagen, type I, alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:33668 IMAGE:5264710), complete cds. // chr17 // 100 // 95 // 57 // 57 // 0 /// JQ236861 // GenBank // Homo sapiens collagen alpha-1(I) chain preproprotein (COL1A1) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 92 // 55 // 55 // 0 /// Z74615 // GenBank // H.sapiens mRNA for prepro-alpha1(I) collagen. // chr17 // 98 // 100 // 59 // 60 // 0 /// ENST00000471344 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:50193550:50195665:-1 gene:ENSG00000108821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 18 // 18 // 11 // 60 // 1 /// GENSCAN00000011338 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:50185502:50214713:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 53 // 53 // 0 /// NONHSAT054609 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 17 // 10 // 10 // 0 /// X98710 // GenBank // H.sapiens mRNA encoding chimaeric transcript of collagen type 1 alpha 1 and platelet derived growth factor beta, 581 bp. // chr17 // 100 // 17 // 10 // 10 // 0 /// Y15915 // GenBank // Homo sapiens mRNA for chimaeric transcript of collagen type 1 alpha 1 and platelet derived growth factor beta, 1068 bp. // chr17 // 100 // 20 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT054612 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 18 // 18 // 11 // 60 // 1
NM_018509 // RefSeq // Homo sapiens leucine rich repeat containing 59 (LRRC59), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000225972 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:50381238:50397553:-1 gene:ENSG00000108829 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC017168 // GenBank // Homo sapiens leucine rich repeat containing 59, mRNA (cDNA clone MGC:9517 IMAGE:3907072), complete cds. // chr17 // 95 // 95 // 20 // 21 // 0 /// BC052279 // GenBank // Homo sapiens leucine rich repeat containing 59, mRNA (cDNA clone MGC:59989 IMAGE:4127952), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000011331 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:50382988:50397317:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 64 // 14 // 14 // 0
NM_001267 // RefSeq // Homo sapiens chondroadherin (CHAD), mRNA. // chr17 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000258969 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:50464499:50468906:-1 gene:ENSG00000136457 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000506187 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:50464496:50465425:-1 gene:ENSG00000136457 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 37 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000508540 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:50464498:50468966:-1 gene:ENSG00000136457 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF371328 // GenBank // Homo sapiens chondroadherin mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// AK292177 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75851 complete cds, highly similar to Homo sapiens chondroadherin (CHAD), mRNA. // chr17 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC036360 // GenBank // Homo sapiens chondroadherin, mRNA (cDNA clone MGC:34613 IMAGE:5163623), complete cds. // chr17 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// BC073974 // GenBank // Homo sapiens chondroadherin, mRNA (cDNA clone MGC:88039 IMAGE:5730623), complete cds. // chr17 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011327 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:50465298:50468813:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0
NM_052855 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat domain 40 (ANKRD40), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000285243 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:50693190:50707924:-1 gene:ENSG00000154945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC012978 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat domain 40, mRNA (cDNA clone MGC:15396 IMAGE:3834331), complete cds. // chr17 // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// EU164539 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat domain 40 (ANKRD40) mRNA, complete cds. // chr17 // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// ENST00000513072 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:50699577:50701098:-1 gene:ENSG00000154945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// GENSCAN00000020902 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:50696331:50707654:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0
NONHSAT054745 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000376381 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:51192657:51209404:-1 gene:ENSG00000011258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 77 // 23 // 24 // 0 /// ENST00000405860 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:51191584:51259941:-1 gene:ENSG00000011258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000591270 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:51192253:51260163:-1 gene:ENSG00000011258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// AK000062 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ20055 fis, clone COL00943. // chr17 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// AK124061 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ42067 fis, clone SYNOV2007965, moderately similar to Homo sapiens mRNA for H-l(3)mbt-like protein. // chr17 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// BC101736 // GenBank // Homo sapiens mbt domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:126785 IMAGE:8069242), complete cds. // chr17 // 96 // 77 // 23 // 24 // 0 /// NM_017643 // RefSeq // Homo sapiens mbt domain containing 1 (MBTD1), mRNA. // chr17 // 84 // 84 // 26 // 31 // 1 /// ENST00000415868 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:51177427:51225224:-1 gene:ENSG00000011258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 84 // 84 // 26 // 31 // 1 /// ENST00000586178 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:51177425:51260066:-1 gene:ENSG00000011258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 84 // 84 // 26 // 31 // 1 /// GENSCAN00000020899 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:51180576:51236689:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 32 // 10 // 10 // 0
ENST00000461513 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:51502488:51503233:-1 gene:ENSG00000187504 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr17 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000020896 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:51502493:51503233:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0
NM_012329 // RefSeq // Homo sapiens monocyte to macrophage differentiation-associated (MMD), mRNA. // chr17 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// XR_429880 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens monocyte to macrophage differentiation-associated (MMD), transcript variant X2, misc_RNA. // chr17 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000262065 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:55392613:55421992:-1 gene:ENSG00000108960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000571578 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:55401469:55421924:-1 gene:ENSG00000108960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// AK303810 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51447 complete cds, highly similar to Monocyte to macrophage differentiation protein. // chr17 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// AY424289 // GenBank // Homo sapiens progestin and adipoQ receptor family member XI (PAQR11) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC026324 // GenBank // Homo sapiens monocyte to macrophage differentiation-associated, mRNA (cDNA clone MGC:26202 IMAGE:4794375), complete cds. // chr17 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// CR541893 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834B0833D for gene MMD, monocyte to macrophage differentiation-associated; complete cds, without stopcodon. // chr17 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000023303 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:55394334:55479041:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 76 // 76 // 22 // 29 // 1
NM_001099640 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 100 (TMEM100), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_018286 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 100 (TMEM100), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000424486 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:55719627:55722856:-1 gene:ENSG00000166292 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000575734 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:55719918:55732121:-1 gene:ENSG00000166292 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000575806 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:55722556:55731884:-1 gene:ENSG00000166292 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// BC010128 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 100, mRNA (cDNA clone MGC:19509 IMAGE:3952255), complete cds. // chr17 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT054824 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0
NM_005082 // RefSeq // Homo sapiens tripartite motif containing 25 (TRIM25), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000316881 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:56887909:56914038:-1 gene:ENSG00000121060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000537230 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:56890668:56914032:-1 gene:ENSG00000121060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 71 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000570749 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:56898961:56904488:-1 gene:ENSG00000121060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 19 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000572021 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:56891583:56913472:-1 gene:ENSG00000121060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 52 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000572550 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:56901427:56908783:-1 gene:ENSG00000121060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 24 // 10 // 10 // 0 /// AK310720 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17762. // chr17 // 100 // 52 // 22 // 22 // 0 /// BC016924 // GenBank // Homo sapiens tripartite motif-containing 25, mRNA (cDNA clone MGC:21231 IMAGE:4419084), complete cds. // chr17 // 97 // 74 // 30 // 31 // 0 /// BC042541 // GenBank // Homo sapiens tripartite motif-containing 25, mRNA (cDNA clone MGC:17069 IMAGE:4338818), complete cds. // chr17 // 97 // 74 // 30 // 31 // 0 /// D21205 // GenBank // Homo sapiens efp mRNA for estrogen responsive finger protein, complete cds. // chr17 // 100 // 67 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000026478 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:56884640:56961019:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 52 // 52 // 22 // 42 // 1
NM_004645 // RefSeq // Homo sapiens coilin (COIL), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000240316 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:56938187:56961054:-1 gene:ENSG00000121058 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC010385 // GenBank // Homo sapiens coilin, mRNA (cDNA clone MGC:13569 IMAGE:4275993), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// U06632 // GenBank // Homo sapiens p80-coilin mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000026478 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:56884640:56961019:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1
NM_001282544 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 182 (CCDC182), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000299415 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:17:57744481:57745312:-1 gene:ENSG00000166329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036400 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:57744811:57750951:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_016070 // RefSeq // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein S23 (MRPS23), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000313608 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:57834781:57850056:-1 gene:ENSG00000181610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000578444 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:57840800:57850044:-1 gene:ENSG00000181610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000579380 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:57841004:57850056:-1 gene:ENSG00000181610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// AF151896 // GenBank // Homo sapiens CGI-138 protein mRNA, complete cds. // chr17 // 81 // 87 // 21 // 26 // 0 /// BC000242 // GenBank // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein S23, mRNA (cDNA clone MGC:676 IMAGE:3350325), complete cds. // chr17 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000036402 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:57774591:57988111:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1
NM_007146 // RefSeq // Homo sapiens vascular endothelial zinc finger 1 (VEZF1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000258963 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:57971547:57982864:-1 gene:ENSG00000136451 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000581208 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:57973759:57988152:-1 gene:ENSG00000136451 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 53 // 8 // 8 // 0 /// BX648862 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686E14252 (from clone DKFZp686E14252). // chr17 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0
NM_000250 // RefSeq // Homo sapiens myeloperoxidase (MPO), mRNA. // chr17 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000225275 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:58269856:58280935:-1 gene:ENSG00000005381 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// BC130476 // GenBank // Homo sapiens myeloperoxidase, mRNA (cDNA clone MGC:163348 IMAGE:40146507), complete cds. // chr17 // 100 // 83 // 33 // 33 // 0 /// J02694 // GenBank // Human myeloperoxidase mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0 /// M19507 // GenBank // Human myeloperoxidase mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000036398 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:58270656:58280680:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 70 // 28 // 28 // 0
NR_029683 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 142 (MIR142), microRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000384835 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:58331215:58331325:-1 gene:ENSG00000273667 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA gene:ENSG00000265206 // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000579003 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:58330884:58332508:-1 gene:ENSG00000265206 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-142 // miRBase Micro RNA Database // MI0000458 Homo sapiens miR-142 stem-loop // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT054945 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT054946 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001080439 // RefSeq // Homo sapiens heat shock transcription factor family member 5 (HSF5), mRNA. // chr17 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// ENST00000323777 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:58420167:58488384:-1 gene:ENSG00000176160 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// BC033017 // GenBank // Homo sapiens heat shock transcription factor family member 5, mRNA (cDNA clone MGC:26980 IMAGE:4825807), complete cds. // chr17 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// BC033020 // GenBank // Homo sapiens heat shock transcription factor family member 5, mRNA (cDNA clone MGC:27073 IMAGE:4823233), complete cds. // chr17 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// BC115385 // GenBank // Homo sapiens heat shock transcription factor family member 5, mRNA (cDNA clone MGC:134827 IMAGE:40038134), complete cds. // chr17 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1 /// GENSCAN00000020647 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:58479893:58488274:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000617946 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:58420775:58488340:-1 gene:ENSG00000176160 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1
NM_004687 // RefSeq // Homo sapiens myotubularin related protein 4 (MTMR4), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_005257785 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens myotubularin related protein 4 (MTMR4), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_005257786 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens myotubularin related protein 4 (MTMR4), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000323456 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:58489537:58517905:-1 gene:ENSG00000108389 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000579925 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:58489529:58517851:-1 gene:ENSG00000108389 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AF264717 // GenBank // Homo sapiens FYVE domain-containing dual specificity protein phosphatase FYVE-DSP2 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC035609 // GenBank // Homo sapiens myotubularin related protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:45014 IMAGE:5201989), complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000020645 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:58491663:58531963:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1
NM_001038704 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 47 (C17orf47), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000321691 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:58541587:58544368:-1 gene:ENSG00000181013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC022189 // GenBank // Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 47, mRNA (cDNA clone MGC:33599 IMAGE:4824904), complete cds. // chr17 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000020654 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:58540175:58652001:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001201457 // RefSeq // Homo sapiens testis expressed 14 (TEX14), transcript variant 3, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NM_031272 // RefSeq // Homo sapiens testis expressed 14 (TEX14), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// NM_198393 // RefSeq // Homo sapiens testis expressed 14 (TEX14), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000240361 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:58556680:58692023:-1 gene:ENSG00000121101 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000349033 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:58556680:58692023:-1 gene:ENSG00000121101 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000389934 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:58556678:58692055:-1 gene:ENSG00000121101 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000582740 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:58556680:58692045:-1 gene:ENSG00000121101 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// AF285601 // GenBank // Homo sapiens testis protein TEX14 (TEX14) mRNA, complete cds. // chr17 // 96 // 65 // 25 // 26 // 0 /// BC040526 // GenBank // Homo sapiens testis expressed 14, mRNA (cDNA clone MGC:39569 IMAGE:4831308), complete cds. // chr17 // 95 // 100 // 38 // 40 // 0 /// GENSCAN00000020654 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:58540175:58652001:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 78 // 31 // 31 // 0
ENST00000390893 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:58631641:58631836:-1 gene:ENSG00000212195 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT054976 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONHSAT054977 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000362556 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:58666537:58666697:-1 gene:ENSG00000199426 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT054978 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000384190 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:58677574:58677737:-1 gene:ENSG00000206917 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT054980 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000364127 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:58679527:58679690:-1 gene:ENSG00000200997 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT054981 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001100595 // RefSeq // Homo sapiens spindle and kinetochore associated complex subunit 2 (SKA2), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NM_182620 // RefSeq // Homo sapiens spindle and kinetochore associated complex subunit 2 (SKA2), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000330137 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:59109951:59155269:-1 gene:ENSG00000182628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// BC106003 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 33, member A, mRNA (cDNA clone MGC:110975 IMAGE:6143473), complete cds. // chr17 // 100 // 85 // 11 // 11 // 0
NR_029842 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 301a (MIR301A), microRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000385261 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:59151136:59151221:-1 gene:ENSG00000207996 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-301a // miRBase Micro RNA Database // MI0000745 Homo sapiens miR-301a stem-loop // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT055001 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000364019 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:59537359:59537499:-1 gene:ENSG00000200889 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT055016 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000409433 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:59697308:59707626:-1 gene:ENSG00000141378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000470557 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:17:59697312:59701425:-1 gene:ENSG00000141378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// AK057033 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ32471 fis, clone SKNMC2000322, highly similar to Peptidyl-tRNA hydrolase 2, mitochondrial precursor (EC 3.1.1.29). // chr17 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// BX647177 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686L12223 (from clone DKFZp686L12223). // chr17 // 94 // 67 // 15 // 16 // 0 /// NM_016077 // RefSeq // Homo sapiens peptidyl-tRNA hydrolase 2 (PTRH2), mRNA. // chr17 // 75 // 75 // 18 // 24 // 1 /// ENST00000393038 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:59697306:59707598:-1 gene:ENSG00000141378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 79 // 79 // 19 // 24 // 1 /// AF151905 // GenBank // Homo sapiens CGI-147 protein mRNA, complete cds. // chr17 // 67 // 67 // 16 // 24 // 1 /// BC006807 // GenBank // Homo sapiens peptidyl-tRNA hydrolase 2, mRNA (cDNA clone MGC:4872 IMAGE:3446518), complete cds. // chr17 // 54 // 54 // 13 // 24 // 1
ENST00000364654 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:59847438:59847544:-1 gene:ENSG00000201524 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT055037 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_022070 // RefSeq // Homo sapiens HEAT repeat containing 6 (HEATR6), mRNA. // chr17 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000184956 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:60043194:60078931:-1 gene:ENSG00000068097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000587003 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:60043563:60078921:-1 gene:ENSG00000068097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// AF349752 // GenBank // Homo sapiens amplified in breast cancer 1 (ABC1) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC119813 // GenBank // Homo sapiens HEAT repeat containing 6, mRNA (cDNA clone MGC:148095 IMAGE:40108426), complete cds. // chr17 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000585976 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:60043492:60078921:-1 gene:ENSG00000068097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 83 // 83 // 24 // 29 // 1 /// BC119771 // GenBank // Homo sapiens HEAT repeat containing 6, mRNA (cDNA clone MGC:148096 IMAGE:40108435), complete cds. // chr17 // 83 // 83 // 24 // 29 // 1 /// GENSCAN00000020968 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:60042789:60095787:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000613428 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:60043492:60078921:-1 gene:ENSG00000068097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 83 // 83 // 24 // 29 // 1
NM_032582 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 32 (USP32), mRNA. // chr17 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000300896 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:60179094:60392134:-1 gene:ENSG00000170832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000393003 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:17:60249058:60391975:-1 gene:ENSG00000170832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000590133 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:60209417:60392408:-1 gene:ENSG00000170832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000592339 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:60179105:60256700:-1 gene:ENSG00000170832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// AF350251 // GenBank // Homo sapiens ubiquitin specific protease mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// AF533230 // GenBank // Homo sapiens ubiquitin-specific protease USP32 (USP32) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC054344 // GenBank // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 32, mRNA (cDNA clone IMAGE:6502630), complete cds. // chr17 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000020966 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:60179255:60391939:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
ENST00000363143 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:60662333:60662437:-1 gene:ENSG00000200013 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000516485 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:X:102678707:102678813:-1 gene:ENSG00000252294 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 45 // 91 // 9 // 20 // 0 /// ENST00000516171 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:157912772:157912885:1 gene:ENSG00000251980 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 36 // 36 // 8 // 22 // 1 /// NONHSAT055099 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT137983 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 45 // 91 // 9 // 20 // 0 /// NONHSAT075075 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 36 // 36 // 8 // 22 // 1
ENST00000437414 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:60727165:60727482:-1 gene:ENSG00000224011 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000042000 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:60727165:60727482:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT055103 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NONHSAT055107 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_199290 // RefSeq // Homo sapiens nascent polypeptide-associated complex alpha subunit 2 (NACA2), mRNA. // chr17 // 100 // 85 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000521764 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:61590426:61591202:-1 gene:ENSG00000253506 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 85 // 11 // 11 // 0 /// BC062710 // GenBank // Homo sapiens nascent polypeptide-associated complex alpha subunit 2, mRNA (cDNA clone MGC:71999 IMAGE:6614481), complete cds. // chr17 // 100 // 85 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000024893 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:61590533:61591180:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 85 // 11 // 11 // 0
NM_032043 // RefSeq // Homo sapiens BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1 (BRIP1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000259008 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:61681266:61863521:-1 gene:ENSG00000136492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000577598 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:61684772:61861539:-1 gene:ENSG00000136492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// AF360549 // GenBank // Homo sapiens BRCA1-binding helicase-like protein BACH1 mRNA, complete cds. // chr17 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// BC101472 // GenBank // Homo sapiens BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1, mRNA (cDNA clone MGC:126521 IMAGE:8068978), complete cds. // chr17 // 88 // 96 // 23 // 26 // 0 /// BC101474 // GenBank // Homo sapiens BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1, mRNA (cDNA clone MGC:126523 IMAGE:8068980), complete cds. // chr17 // 85 // 96 // 22 // 26 // 0 /// AK074713 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ90232 fis, clone NT2RM2000497, weakly similar to CHL1 PROTEIN. // chr17 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// GENSCAN00000024896 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:61683296:62086151:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
NM_020748 // RefSeq // Homo sapiens integrator complex subunit 2 (INTS2), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NR_026641 // RefSeq // Homo sapiens integrator complex subunit 2 (INTS2), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000251334 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:61867249:61927991:-1 gene:ENSG00000108506 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000444766 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:61865370:61928016:-1 gene:ENSG00000108506 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AK299032 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51634 complete cds, highly similar to Integrator complex subunit 2. // chr17 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// CR533582 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834E1121D for gene KIAA1287, KIAA1287 protein; complete cds, incl. stopcodon. // chr17 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// ENST00000617492 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:61865367:61927105:-1 gene:ENSG00000108506 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000024896 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:61683296:62086151:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1
ENST00000365491 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:61874084:61874182:-1 gene:ENSG00000202361 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT055137 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_005121 // RefSeq // Homo sapiens mediator complex subunit 13 (MED13), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000397786 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:61942605:62065282:-1 gene:ENSG00000108510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// AF117754 // GenBank // Homo sapiens thyroid hormone receptor-associated protein complex component TRAP240 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// BC140891 // GenBank // Homo sapiens mediator complex subunit 13, mRNA (cDNA clone MGC:176568 IMAGE:9021759), complete cds. // chr17 // 97 // 87 // 33 // 34 // 0 /// GENSCAN00000024896 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:61683296:62086151:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 77 // 77 // 30 // 39 // 1
ENST00000484823 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:62005737:62006016:-1 gene:ENSG00000242398 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK123839 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ41845 fis, clone NT2RI3003095. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT055140 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000460492 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:62516321:62516767:-1 gene:ENSG00000239246 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000021596 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:62462106:62516767:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
ENST00000384652 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:62661621:62661725:-1 gene:ENSG00000207382 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT055168 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000363690 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:63573242:63573345:-1 gene:ENSG00000200560 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT055204 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_017647 // RefSeq // Homo sapiens FtsJ homolog 3 (E. coli) (FTSJ3), mRNA. // chr17 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000427159 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:63819433:63827671:-1 gene:ENSG00000108592 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000583202 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:63820259:63822023:-1 gene:ENSG00000108592 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0 /// AF327355 // GenBank // Homo sapiens hypothetical protein SB92 mRNA, complete cds. // chr17 // 89 // 97 // 25 // 28 // 0 /// AK296715 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53449 complete cds, highly similar to rRNA methyltransferase 3 (EC 2.1.1.-). // chr17 // 96 // 79 // 22 // 23 // 0 /// BC036710 // GenBank // Homo sapiens FtsJ homolog 3 (E. coli), mRNA (cDNA clone MGC:23312 IMAGE:4641078), complete cds. // chr17 // 89 // 93 // 24 // 27 // 0 /// GENSCAN00000003048 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:63819802:63826902:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// AK027463 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ14557 fis, clone NT2RM2001896. // chr17 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1
NM_022644 // RefSeq // Homo sapiens chorionic somatomammotropin hormone 2 (CSH2), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000336844 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:63872012:63873766:-1 gene:ENSG00000213218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000558516 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:63872047:63873707:-1 gene:ENSG00000213218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000559928 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:63872026:63873685:-1 gene:ENSG00000213218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONHSAT055239 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_000334 // RefSeq // Homo sapiens sodium channel, voltage-gated, type IV, alpha subunit (SCN4A), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000435607 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:63938554:63972918:-1 gene:ENSG00000007314 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000578147 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:63938554:63972918:-1 gene:ENSG00000007314 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY212253 // GenBank // Homo sapiens skeletal muscle voltage-dependent sodium channel type IV alpha subunit (SCN4A) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// M81758 // GenBank // Homo sapiens skeletal muscle voltage-dependent sodium channel alpha subunit (SkM1) mRNA, complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000003049 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:63940771:63951909:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000003054 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:63954551:64036324:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
ENST00000461109 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:64308316:64308690:-1 gene:ENSG00000256358 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000486833 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:60429903:60430276:-1 gene:ENSG00000213896 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003062 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:64308316:64308690:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020539 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:60429903:60430220:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
ENST00000497848 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:64390158:64390263:-1 gene:ENSG00000239823 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chrUn // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC062608 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5166769, partial cds. // chrUn // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_022739 // RefSeq // Homo sapiens SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 2 (SMURF2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000262435 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:64545365:64662068:-1 gene:ENSG00000108854 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000578386 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:64545068:64661928:-1 gene:ENSG00000108854 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000582081 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:64542295:64661897:-1 gene:ENSG00000108854 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000585301 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:64554881:64661912:-1 gene:ENSG00000108854 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 63 // 23 // 24 // 0 /// AF301463 // GenBank // Homo sapiens ubiquitin E3 ligase SMURF2 (SMURF2) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// AF310676 // GenBank // Homo sapiens E3 ubiquitin ligase SMURF2 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// AY014180 // GenBank // Homo sapiens E3 ubiquitin ligase Smurf2 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// BC093876 // GenBank // Homo sapiens SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 2, mRNA (cDNA clone MGC:120911 IMAGE:7939721), complete cds. // chr17 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// BC111945 // GenBank // Homo sapiens SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 2, mRNA (cDNA clone MGC:138150 IMAGE:8327413), complete cds. // chr17 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000029928 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:64545848:64600051:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0
NR_027487 // RefSeq // Homo sapiens Rho GTPase activating protein 27 pseudogene (LOC146880), transcript variant 1, non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000579125 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:64762687:64781707:-1 gene:ENSG00000215769 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 55 // 6 // 6 // 0 /// BC120976 // GenBank // Homo sapiens hypothetical LOC146880, mRNA (cDNA clone IMAGE:40115580). // chr17 // 100 // 55 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000578036 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:64779259:64837139:-1 gene:ENSG00000214176 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 82 // 82 // 9 // 11 // 1 /// NONHSAT055311 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 55 // 6 // 6 // 0 /// NONHSAT055312 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0 /// BC041324 // GenBank // Homo sapiens similar to pleckstrin homology domain containing, family M (with RUN domain) member 1; adapter protein 162, mRNA (cDNA clone IMAGE:5492395). // chr17 // 82 // 82 // 9 // 11 // 1
ENST00000582421 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:64871504:64871784:-1 gene:ENSG00000264840 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT055322 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr17 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_001282425 // RefSeq // Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein), alpha 13 (GNA13), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// NM_006572 // RefSeq // Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein), alpha 13 (GNA13), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000439174 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:65010715:65056839:-1 gene:ENSG00000120063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000541118 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:17:65013788:65055774:-1 gene:ENSG00000120063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 48 // 10 // 10 // 0 /// AF493902 // GenBank // Homo sapiens guanine nucleotide binding protein alpha 13 (GNA13) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// AK301699 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53108 complete cds, highly similar to Guanine nucleotide-binding protein alpha-13 subunit. // chr17 // 100 // 67 // 14 // 14 // 0 /// AK302400 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50732 complete cds, highly similar to Guanine nucleotide-binding protein alpha-13 subunit. // chr17 // 100 // 48 // 10 // 10 // 0 /// BC036756 // GenBank // Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein), alpha 13, mRNA (cDNA clone MGC:46138 IMAGE:5548632), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// L22075 // GenBank // Homo sapiens guanine nucleotide regulatory protein (G13) mRNA, complete cds. // chr17 // 94 // 76 // 15 // 16 // 0 /// BC011925 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4542938, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr17 // 71 // 71 // 15 // 21 // 1 /// GENSCAN00000029932 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:65014257:65056593:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0
NM_000042 // RefSeq // Homo sapiens apolipoprotein H (beta-2-glycoprotein I) (APOH), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000205948 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:66212033:66229417:-1 gene:ENSG00000091583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000577982 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:66220614:66256525:-1 gene:ENSG00000091583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000581797 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:66216791:66228637:-1 gene:ENSG00000091583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 94 // 55 // 17 // 18 // 0 /// ENST00000585162 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:66212039:66220630:-1 gene:ENSG00000091583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// AK298416 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51265 complete cds, moderately similar to Beta-2-glycoprotein 1 precursor (Beta-2-glycoprotein I). // chr17 // 96 // 85 // 27 // 28 // 0 /// BC020703 // GenBank // Homo sapiens apolipoprotein H (beta-2-glycoprotein I), mRNA (cDNA clone MGC:22465 IMAGE:4767966), complete cds. // chr17 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC026283 // GenBank // Homo sapiens apolipoprotein H (beta-2-glycoprotein I), mRNA (cDNA clone MGC:23898 IMAGE:4734357), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// M62839 // GenBank // Human apolipoprotein H mRNA, complete cds. // chr17 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000004283 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:66212133:66302539:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0
NONHSAT055419 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000364677 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:67408774:67408881:-1 gene:ENSG00000201547 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT055420 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000488739 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:67457023:67457290:-1 gene:ENSG00000244610 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT055421 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_181655 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 58 (C17orf58), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0 /// NM_181656 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 58 (C17orf58), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000334461 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:67991130:67993649:-1 gene:ENSG00000186665 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000449250 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:67991101:67993524:-1 gene:ENSG00000186665 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 60 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000536693 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:67991102:67993552:-1 gene:ENSG00000186665 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// AK026583 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ22930 fis, clone KAT07255. // chr17 // 85 // 100 // 17 // 20 // 0 /// BC036760 // GenBank // Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 58, mRNA (cDNA clone MGC:46703 IMAGE:5587712), complete cds. // chr17 // 100 // 60 // 12 // 12 // 0 /// BC105124 // GenBank // Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 58, transcript variant 1, mRNA (cDNA clone MGC:132784 IMAGE:8144127), complete cds. // chr17 // 100 // 40 // 8 // 8 // 0 /// BC112073 // GenBank // Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 58, transcript variant 1, mRNA (cDNA clone MGC:138278 IMAGE:8327541), complete cds. // chr17 // 100 // 40 // 8 // 8 // 0
NM_080283 // RefSeq // Homo sapiens ATP-binding cassette, sub-family A (ABC1), member 9 (ABCA9), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000340001 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:68974488:69061064:-1 gene:ENSG00000154258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000453985 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:68974632:69060924:-1 gene:ENSG00000154258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000495634 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:69042915:69060906:-1 gene:ENSG00000154258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 19 // 8 // 8 // 0 /// AF423307 // GenBank // Homo sapiens ATP-binding cassette sub-family A member 9 (ABCA9) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// AK122687 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ16148 fis, clone BRAMY2042195, highly similar to Homo sapiens ATP-binding cassette, sub-family A (ABC1), member 8 (ABCA8). // chr17 // 90 // 24 // 9 // 10 // 0 /// AY028899 // GenBank // Homo sapiens ATP-binding cassette A9 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// BC062472 // GenBank // Homo sapiens ATP-binding cassette, sub-family A (ABC1), member 9, mRNA (cDNA clone IMAGE:30407790), complete cds. // chr17 // 100 // 19 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000049412 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:68975915:69061625:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 67 // 28 // 28 // 0
ENST00000516543 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:69355133:69355218:-1 gene:ENSG00000252352 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT055579 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
ENST00000363913 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:72663823:72664152:-1 gene:ENSG00000200783 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT055708 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENST00000516465 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:72818836:72818972:-1 gene:ENSG00000252274 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT055710 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001129885 // RefSeq // Homo sapiens cleavage and polyadenylation specific factor 4-like (CPSF4L), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000344935 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:73248449:73261880:-1 gene:ENSG00000187959 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000397671 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:73249793:73262352:-1 gene:ENSG00000187959 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// BC157870 // GenBank // Homo sapiens cleavage and polyadenylation specific factor 4-like, mRNA (cDNA clone MGC:189765 IMAGE:9057089), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000017335 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:73255801:73261818:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0
NM_012121 // RefSeq // Homo sapiens CDC42 effector protein (Rho GTPase binding) 4 (CDC42EP4), mRNA. // chr17 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000335793 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:73283624:73312175:-1 gene:ENSG00000179604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000439510 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:73283625:73311993:-1 gene:ENSG00000179604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000581014 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:73285178:73311997:-1 gene:ENSG00000179604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// AB042237 // GenBank // Homo sapiens Borg4 mRNA, complete cds. // chr17 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// AF099664 // GenBank // Homo sapiens Cdc42 effector protein 4 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// BC002774 // GenBank // Homo sapiens CDC42 effector protein (Rho GTPase binding) 4, mRNA (cDNA clone MGC:3740 IMAGE:3617435), complete cds. // chr17 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// BC010451 // GenBank // Homo sapiens CDC42 effector protein (Rho GTPase binding) 4, mRNA (cDNA clone MGC:17125 IMAGE:4181539), complete cds. // chr17 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000017343 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:73285430:73286500:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
NM_001144952 // RefSeq // Homo sapiens sidekick cell adhesion molecule 2 (SDK2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENST00000392650 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:73334384:73644089:-1 gene:ENSG00000069188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENST00000410094 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:73338443:73369213:-1 gene:ENSG00000069188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 28 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000424778 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:73337939:73414655:-1 gene:ENSG00000069188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 70 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000479356 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:73357370:73437769:-1 gene:ENSG00000069188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 74 // 34 // 34 // 0 /// AB040947 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1514 protein, partial cds. // chr17 // 100 // 74 // 34 // 34 // 0 /// AK091827 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ34508 fis, clone HLUNG2006067, highly similar to Protein sidekick-2 precursor. // chr17 // 17 // 17 // 8 // 46 // 1 /// GENSCAN00000047743 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:73348599:73472579:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0
ENST00000321800 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:73750330:73828520:-1 gene:ENSG00000177338 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr17 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// AK097638 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ40319 fis, clone TESTI2030754. // chr17 // 92 // 96 // 24 // 26 // 0 /// BC101214 // GenBank // Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 54, mRNA (cDNA clone IMAGE:40022036). // chr17 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000544677 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:73750330:73828520:-1 gene:ENSG00000177338 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr17 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// NONHSAT055739 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT055740 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT055741 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
NM_006678 // RefSeq // Homo sapiens CD300c molecule (CD300C), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000330793 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:74541108:74546143:-1 gene:ENSG00000167850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC022279 // GenBank // Homo sapiens CD300c molecule, mRNA (cDNA clone MGC:22395 IMAGE:4692025), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// X66171 // GenBank // H.sapiens CMRF35 mRNA, complete CDS. // chr17 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000013736 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:74522738:74592202:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_001115152 // RefSeq // Homo sapiens CD300 molecule-like family member d (CD300LD), mRNA. // chr17 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000375352 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:74579365:74592283:-1 gene:ENSG00000204345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY358148 // GenBank // Homo sapiens clone DNA186500 CMRF35A4 (UNQ9218) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// EF137868 // GenBank // Homo sapiens immune receptor CD300d (CD300D) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000013736 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:74522738:74592202:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_181449 // RefSeq // Homo sapiens CD300e molecule (CD300E), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000392619 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:74609887:74623738:-1 gene:ENSG00000186407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000426295 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:74609883:74623758:-1 gene:ENSG00000186407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF395839 // GenBank // Homo sapiens immune receptor expressed on myeloid cells 2 (IREM2) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// AK298031 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50082 complete cds, highly similar to Homo sapiens CD300 antigen like family member E (CD300LE), mRNA. // chr17 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// AK303545 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61198 complete cds, highly similar to Homo sapiens CD300 antigen like family member E (CD300LE), mRNA. // chr17 // 91 // 85 // 20 // 22 // 0 /// BC100888 // GenBank // Homo sapiens CD300e molecule, mRNA (cDNA clone MGC:119063 IMAGE:40003374), complete cds. // chr17 // 89 // 69 // 16 // 18 // 0 /// BC100889 // GenBank // Homo sapiens CD300e molecule, mRNA (cDNA clone MGC:119064 IMAGE:40003375), complete cds. // chr17 // 89 // 69 // 16 // 18 // 0 /// BC100890 // GenBank // Homo sapiens CD300e molecule, mRNA (cDNA clone MGC:119065 IMAGE:40003376), complete cds. // chr17 // 89 // 69 // 16 // 18 // 0 /// BX648376 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686H10189 (from clone DKFZp686H10189). // chr17 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000013725 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:74612653:74623621:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NM_178128 // RefSeq // Homo sapiens fatty acid desaturase 6 (FADS6), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000413142 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:74877918:74882884:-1 gene:ENSG00000172782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// AK293720 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59012 complete cds, highly similar to Homo sapiens fatty acid desaturase domain family, member 6 (FADS6), mRNA. // chr17 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// BC117230 // GenBank // Homo sapiens fatty acid desaturase domain family, member 6, mRNA (cDNA clone MGC:150839 IMAGE:40125781), complete cds. // chr17 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000579663 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:74879042:74882704:-1 gene:ENSG00000172782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// ENST00000612771 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:74877299:74893610:-1 gene:ENSG00000172782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000614223 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:74877352:74893607:-1 gene:ENSG00000172782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000013721 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:74878331:74923073:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 89 // 89 // 24 // 27 // 1 /// ENST00000621859 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:74882586:74893781:-1 gene:ENSG00000172782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001282489 // RefSeq // Homo sapiens Usher syndrome 1G (autosomal recessive) (USH1G), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NM_173477 // RefSeq // Homo sapiens Usher syndrome 1G (autosomal recessive) (USH1G), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000579243 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:74917916:74923256:-1 gene:ENSG00000182040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// AK289804 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77965 complete cds. // chr17 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AK296899 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54330 complete cds, highly similar to Usher syndrome type-1G protein. // chr17 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// BC101096 // GenBank // Homo sapiens Usher syndrome 1G (autosomal recessive), mRNA (cDNA clone MGC:119650 IMAGE:40010028), complete cds. // chr17 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// BC101097 // GenBank // Homo sapiens Usher syndrome 1G (autosomal recessive), mRNA (cDNA clone MGC:119651 IMAGE:40010033), complete cds. // chr17 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// BC101098 // GenBank // Homo sapiens Usher syndrome 1G (autosomal recessive), mRNA (cDNA clone MGC:119652 IMAGE:40010036), complete cds. // chr17 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// BC101099 // GenBank // Homo sapiens Usher syndrome 1G (autosomal recessive), mRNA (cDNA clone MGC:119653 IMAGE:40010038), complete cds. // chr17 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000614341 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:74916084:74923256:-1 gene:ENSG00000182040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000013721 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:74878331:74923073:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1
ENST00000383986 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:75089862:75089974:-1 gene:ENSG00000206713 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT055856 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000411285 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:75409086:75409188:-1 gene:ENSG00000223217 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT055892 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001142643 // RefSeq // Homo sapiens CASK interacting protein 2 (CASKIN2), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// NM_020753 // RefSeq // Homo sapiens CASK interacting protein 2 (CASKIN2), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000321617 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:75500261:75515583:-1 gene:ENSG00000177303 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000433559 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:75500809:75509888:-1 gene:ENSG00000177303 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000581870 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:75505319:75515440:-1 gene:ENSG00000177303 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 93 // 41 // 13 // 14 // 0 /// AF451976 // GenBank // Homo sapiens cask-interacting protein 2 (CASKIN2) mRNA, complete cds. // chr17 // 97 // 97 // 32 // 33 // 0 /// AK300354 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53194 complete cds, highly similar to Caskin-2. // chr17 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// AK315936 // GenBank // Homo sapiens cDNA, FLJ78835 complete cds, highly similar to Caskin-2. // chr17 // 97 // 85 // 28 // 29 // 0 /// BC032359 // GenBank HTC // Homo sapiens CASK interacting protein 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:5222780), with apparent retained intron. // chr17 // 86 // 41 // 12 // 14 // 0 /// BC066643 // GenBank // Homo sapiens CASK interacting protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:70409 IMAGE:5576059), complete cds. // chr17 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000034555 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:75501080:75516476:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0
NM_005324 // RefSeq // Homo sapiens H3 histone, family 3B (H3.3B) (H3F3B), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000254810 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:75776434:75779779:-1 gene:ENSG00000132475 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// AK304607 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52843 complete cds, highly similar to Histone H3.3. // chr17 // 91 // 65 // 10 // 11 // 0 /// BC006497 // GenBank // Homo sapiens H3 histone, family 3B (H3.3B), mRNA (cDNA clone MGC:2160 IMAGE:2959756), complete cds. // chr17 // 100 // 53 // 9 // 9 // 0 /// BC012813 // GenBank // Homo sapiens H3 histone, family 3B (H3.3B), mRNA (cDNA clone MGC:4123 IMAGE:2959756), complete cds. // chr17 // 100 // 53 // 9 // 9 // 0 /// BC017558 // GenBank // Homo sapiens H3 histone, family 3B (H3.3B), mRNA (cDNA clone MGC:9614 IMAGE:3910031), complete cds. // chr17 // 100 // 53 // 9 // 9 // 0 /// BC108701 // GenBank // Homo sapiens H3 histone, family 3B (H3.3B), mRNA (cDNA clone MGC:131844 IMAGE:6144255), complete cds. // chr17 // 100 // 53 // 9 // 9 // 0 /// BX537379 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686C2282 (from clone DKFZp686C2282); complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
AK097463 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ40144 fis, clone TESTI2013012. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000586808 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:75818815:75820055:-1 gene:ENSG00000266980 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr17 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT055949 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
NM_033452 // RefSeq // Homo sapiens tripartite motif containing 47 (TRIM47), mRNA. // chr17 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_005257788 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens tripartite motif containing 47 (TRIM47), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000254816 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:75874161:75878575:-1 gene:ENSG00000132481 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000587339 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:75874164:75878196:-1 gene:ENSG00000132481 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// AY026763 // GenBank // Homo sapiens gene overexpressed in astrocytoma mRNA, complete cds. // chr17 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// BC017299 // GenBank // Homo sapiens tripartite motif-containing 47, mRNA (cDNA clone MGC:29809 IMAGE:5017710), complete cds. // chr17 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000034533 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:75864311:75896937:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0
NM_001256124 // RefSeq // Homo sapiens tripartite motif containing 65 (TRIM65), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// NM_173547 // RefSeq // Homo sapiens tripartite motif containing 65 (TRIM65), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000269383 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:75888960:75897003:-1 gene:ENSG00000141569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000540128 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:75891180:75896911:-1 gene:ENSG00000141569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 94 // 51 // 17 // 18 // 0 /// ENST00000543309 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:17:75891023:75896558:-1 gene:ENSG00000141569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 46 // 16 // 16 // 0 /// BC021259 // GenBank // Homo sapiens tripartite motif-containing 65, mRNA (cDNA clone MGC:29759 IMAGE:4128330), complete cds. // chr17 // 97 // 100 // 34 // 35 // 0 /// BC098412 // GenBank // Homo sapiens tripartite motif-containing 65, mRNA (cDNA clone IMAGE:4893059), partial cds. // chr17 // 93 // 43 // 14 // 15 // 0 /// GENSCAN00000034533 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:75864311:75896937:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 63 // 63 // 22 // 35 // 1
NM_001988 // RefSeq // Homo sapiens envoplakin (EVPL), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000301607 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:76006845:76027452:-1 gene:ENSG00000167880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000586740 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:17:76007081:76027231:-1 gene:ENSG00000167880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 95 // 87 // 19 // 20 // 0 /// ENST00000587569 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:76007082:76027231:-1 gene:ENSG00000167880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 95 // 87 // 19 // 20 // 0 /// BC126103 // GenBank // Homo sapiens envoplakin, mRNA (cDNA clone MGC:161381 IMAGE:8991819), complete cds. // chr17 // 95 // 87 // 19 // 20 // 0 /// BC126105 // GenBank // Homo sapiens envoplakin, mRNA (cDNA clone MGC:161383 IMAGE:8991821), complete cds. // chr17 // 95 // 87 // 19 // 20 // 0 /// BC143814 // GenBank // Homo sapiens envoplakin, mRNA (cDNA clone MGC:177346 IMAGE:9052329), complete cds. // chr17 // 95 // 87 // 19 // 20 // 0 /// U53786 // GenBank // Homo sapiens envoplakin (EVPL) mRNA, complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000034545 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:76007103:76072491:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0
NM_001454 // RefSeq // Homo sapiens forkhead box J1 (FOXJ1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000322957 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:76136333:76141299:-1 gene:ENSG00000129654 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC046460 // GenBank // Homo sapiens forkhead box J1, mRNA (cDNA clone MGC:35202 IMAGE:5171637), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U69537 // GenBank // Human forkhead transcription factor HFH-4 (HFH-4) mRNA, complete cds. // chr17 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000034536 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:76083648:76140395:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_052916 // RefSeq // Homo sapiens ring finger protein 157 (RNF157), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_005257009 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ring finger protein 157 (RNF157), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000269391 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:76142453:76240373:-1 gene:ENSG00000141576 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000319945 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:76144340:76240308:-1 gene:ENSG00000141576 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034529 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:76143034:76216292:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NM_032134 // RefSeq // Homo sapiens glutamine rich 2 (QRICH2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000262765 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:76274049:76307680:-1 gene:ENSG00000129646 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000447564 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:76274051:76291252:-1 gene:ENSG00000129646 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000524722 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:76274131:76307565:-1 gene:ENSG00000129646 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000532549 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:76274184:76280357:-1 gene:ENSG00000129646 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0 /// BC131559 // GenBank // Homo sapiens glutamine rich 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:40108824), complete cds. // chr17 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000034534 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:76274079:76307998:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 97 // 97 // 31 // 32 // 0
NM_022066 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin-conjugating enzyme E2O (UBE2O), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000319380 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:76389451:76453206:-1 gene:ENSG00000175931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000586409 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:76395358:76453141:-1 gene:ENSG00000175931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 77 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000587127 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:76389797:76399617:-1 gene:ENSG00000175931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 52 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000587581 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:76397808:76399374:-1 gene:ENSG00000175931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 20 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000590658 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:17:76399789:76402641:-1 gene:ENSG00000175931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 18 // 8 // 8 // 0 /// BC007822 // GenBank HTC // Homo sapiens ubiquitin-conjugating enzyme E2O, mRNA (cDNA clone IMAGE:4303741), with apparent retained intron. // chr17 // 100 // 77 // 34 // 34 // 0 /// BC022237 // GenBank // Homo sapiens ubiquitin-conjugating enzyme E2O, mRNA (cDNA clone IMAGE:4180340), complete cds. // chr17 // 100 // 27 // 12 // 12 // 0 /// BC051868 // GenBank // Homo sapiens ubiquitin-conjugating enzyme E2O, mRNA (cDNA clone MGC:60241 IMAGE:6162673), complete cds. // chr17 // 100 // 52 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000009312 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:76390943:76415499:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 84 // 37 // 37 // 0
NM_134268 // RefSeq // Homo sapiens cytoglobin (CYGB), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000293230 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:76527356:76537905:-1 gene:ENSG00000161544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000589342 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:76528282:76537652:-1 gene:ENSG00000161544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000590175 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:76528368:76532065:-1 gene:ENSG00000161544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// AB057769 // GenBank // Homo sapiens stap mRNA for stellate cell activation-associated protein, complete cds. // chr17 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC029798 // GenBank // Homo sapiens cytoglobin, mRNA (cDNA clone MGC:34702 IMAGE:5193583), complete cds. // chr17 // 84 // 96 // 21 // 25 // 0 /// XM_005257005 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens cytoglobin (CYGB), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// ENST00000589145 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:76528534:76551175:-1 gene:ENSG00000161544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// GENSCAN00000009318 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:76512590:76562923:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// BC018822 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3163464, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr17 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1
ENST00000592148 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:76679571:76690219:-1 gene:ENSG00000182534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 50 // 8 // 8 // 0 /// AK128460 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ46603 fis, clone THYMU3047513. // chr17 // 100 // 50 // 8 // 8 // 0
ENST00000391116 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:17:76703632:76703727:-1 gene:ENSG00000212418 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT056070 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000410876 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:77152561:77152674:-1 gene:ENSG00000222808 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 93 // 100 // 14 // 15 // 0 /// NONHSAT056126 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 93 // 100 // 14 // 15 // 0
NR_028337 // RefSeq // Homo sapiens FLJ45079 protein (FLJ45079), long non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000374983 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:77879027:77884087:-1 gene:ENSG00000204283 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT056173 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
AF086186 // GenBank // Homo sapiens full length insert cDNA clone ZC30F12. // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// L26245 // GenBank // Human effector cell protease receptor-1 (EPR-1) mRNA, partial cds. // chr17 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// BC007606 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3351130, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC012164 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4635456, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// L32866 // GenBank // Human effector cell protease receptor-1 (EPR-1) gene, partial cds. // chr17 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// NONHSAT056213 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0
NM_003955 // RefSeq // Homo sapiens suppressor of cytokine signaling 3 (SOCS3), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000330871 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:78356778:78360077:-1 gene:ENSG00000184557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC060858 // GenBank // Homo sapiens suppressor of cytokine signaling 3, mRNA (cDNA clone MGC:71791 IMAGE:30333577), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000014211 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:78342065:78365783:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
ENST00000484759 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:78370852:78371135:-1 gene:ENSG00000243870 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT056224 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_173628 // RefSeq // Homo sapiens dynein, axonemal, heavy chain 17 (DNAH17), mRNA. // chr17 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000389840 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:78423697:78577394:-1 gene:ENSG00000187775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000585328 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:78423697:78577394:-1 gene:ENSG00000187775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000586052 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:78423905:78491490:-1 gene:ENSG00000187775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000590227 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:78423700:78450298:-1 gene:ENSG00000187775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000591369 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:78423697:78472774:-1 gene:ENSG00000187775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AK126059 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44071 fis, clone TESTI4037727. // chr17 // 93 // 48 // 14 // 15 // 0 /// AK128065 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ46185 fis, clone TESTI4004917. // chr17 // 90 // 100 // 28 // 31 // 0 /// GENSCAN00000014218 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:78421439:78575057:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0
ENST00000492744 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:78532813:78533055:-1 gene:ENSG00000243426 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT056235 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_173628 // RefSeq // Homo sapiens dynein, axonemal, heavy chain 17 (DNAH17), mRNA. // chr17 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000389840 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:78423697:78577394:-1 gene:ENSG00000187775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000585328 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:78423697:78577394:-1 gene:ENSG00000187775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000589793 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:78543755:78571322:-1 gene:ENSG00000187775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK097776 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ40457 fis, clone TESTI2041730, weakly similar to DYNEIN BETA CHAIN, CILIARY. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000014218 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:78421439:78575057:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0
ENST00000516582 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:78696694:78696797:-1 gene:ENSG00000252391 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT056243 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001243540 // RefSeq // Homo sapiens differential display clone 8 (LOC100653515), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NM_001243541 // RefSeq // Homo sapiens differential display clone 8 (LOC100653515), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_005256922 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens differential display clone 8 (LOC100653515), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000322630 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:78890580:78903201:-1 gene:ENSG00000178404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000587052 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:78892269:78903199:-1 gene:ENSG00000178404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 58 // 58 // 14 // 24 // 1 /// ENST00000590267 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:78892165:78903217:-1 gene:ENSG00000178404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 58 // 58 // 14 // 24 // 1 /// ENST00000619342 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:78890638:78901828:-1 gene:ENSG00000178404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000014202 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:78890638:78892329:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT056252 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 58 // 58 // 14 // 24 // 1
NM_003655 // RefSeq // Homo sapiens chromobox homolog 4 (CBX4), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000269397 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:79833156:79839429:-1 gene:ENSG00000141582 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000448310 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:79835044:79839387:-1 gene:ENSG00000141582 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 38 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000494546 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:79837746:79839413:-1 gene:ENSG00000141582 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 23 // 9 // 9 // 0 /// AF013956 // GenBank // Homo sapiens Polycomb 2 homolog (hPc2) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// EU439707 // GenBank // Homo sapiens CBX4 (CBX4) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// AY390430 // GenBank // Homo sapiens NS5ATP1-binding protein 16 mRNA, complete cds. // chr17 // 62 // 62 // 24 // 39 // 1 /// BC014967 // GenBank // Homo sapiens chromobox homolog 4 (Pc class homolog, Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:23084 IMAGE:4856728), complete cds. // chr17 // 64 // 64 // 25 // 39 // 1 /// GENSCAN00000043417 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:79833959:79922063:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 95 // 95 // 37 // 39 // 1
NR_029376 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC100294362 (LOC100294362), long non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000575034 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:80351828:80415118:-1 gene:ENSG00000263069 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000572151 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:80354437:80415118:-1 gene:ENSG00000263069 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr17 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1 /// ENST00000573394 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:80381004:80415168:-1 gene:ENSG00000263069 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr17 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1 /// NONHSAT056371 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT056372 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1 /// ENST00000613190 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:80351837:80353811:-1 gene:ENSG00000263069 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr17 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1 /// NONHSAT056380 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1
NM_002522 // RefSeq // Homo sapiens neuronal pentraxin I (NPTX1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000306773 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:80467148:80476604:-1 gene:ENSG00000171246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC089441 // GenBank // Homo sapiens neuronal pentraxin I, mRNA (cDNA clone MGC:105123 IMAGE:30555728), complete cds. // chr17 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// U61849 // GenBank // Human neuronal pentraxin 1 (NPTX1) mRNA, complete cds. // chr17 // 78 // 97 // 25 // 32 // 0 /// ENST00000535681 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:80467148:80474698:-1 gene:ENSG00000171246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1 /// AK124701 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ42711 fis, clone BRAMY3007723, highly similar to Neuronal pentraxin-1 precursor. // chr17 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1 /// GENSCAN00000017550 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:80470813:80476446:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0
ENST00000448339 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:80602549:80602926:-1 gene:ENSG00000232083 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000017540 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:80602549:80619320:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NR_026857 // RefSeq // Homo sapiens BAIAP2 antisense RNA 1 (head to head) (BAIAP2-AS1), long non-coding RNA. // chr17 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000573167 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:81029702:81034881:-1 gene:ENSG00000226137 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr17 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000577066 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:81029133:81034573:-1 gene:ENSG00000226137 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK124762 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ42772 fis, clone BRAWH3003992. // chr17 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// NONHSAT056425 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT056426 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT056427 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0
AK096606 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39287 fis, clone OCBBF2011897. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK098403 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ25537 fis, clone CBR09136. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT056435 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001080395 // RefSeq // Homo sapiens apoptosis-associated tyrosine kinase (AATK), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// NM_004920 // RefSeq // Homo sapiens apoptosis-associated tyrosine kinase (AATK), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000326724 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:81117295:81166017:-1 gene:ENSG00000181409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000374792 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:81117298:81166072:-1 gene:ENSG00000181409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000417379 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:17:81117304:81131948:-1 gene:ENSG00000181409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000570932 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:81117298:81121505:-1 gene:ENSG00000181409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// AK131395 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ16484 fis, clone BRTHA3003000, moderately similar to Homo sapiens apoptosis-associated tyrosine kinase (AATK). // chr17 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000017510 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:81113225:81149113:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0
NM_144679 // RefSeq // Homo sapiens ENTH domain containing 2 (ENTHD2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000300714 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:81228277:81239091:-1 gene:ENSG00000167302 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000570854 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:81234003:81239057:-1 gene:ENSG00000167302 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 80 // 34 // 8 // 10 // 0 /// ENST00000573295 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:81228277:81239041:-1 gene:ENSG00000167302 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000574944 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:81231862:81234234:-1 gene:ENSG00000167302 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000576090 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:81228279:81238403:-1 gene:ENSG00000167302 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// AK127221 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ45288 fis, clone BRHIP3002141. // chr17 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// AK128728 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ46895 fis, clone UTERU3020090. // chr17 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// BC037231 // GenBank HTC // Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 56, mRNA (cDNA clone IMAGE:5197074), with apparent retained intron. // chr17 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0 /// BC064483 // GenBank // Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 56, mRNA (cDNA clone MGC:71154 IMAGE:5430837), complete cds. // chr17 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000017536 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:81228928:81239033:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0
NR_038080 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 482 (LINC00482), long non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000332012 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:81303771:81309248:-1 gene:ENSG00000185168 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr17 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// BC108932 // GenBank // Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 55, mRNA (cDNA clone MGC:120553 IMAGE:40025762), complete cds. // chr17 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// BC108933 // GenBank // Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 55, mRNA (cDNA clone MGC:120556 IMAGE:40025767), complete cds. // chr17 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT056462 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONHSAT056463 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0
NM_178520 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 105 (TMEM105), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000332900 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:81311270:81330674:-1 gene:ENSG00000185332 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000012466 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:81275969:81320432:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1
AL162045 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp761P0212 (from clone DKFZp761P0212); partial cds. // chr17 // 91 // 100 // 21 // 23 // 0 /// ENST00000574041 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:81379598:81385246:-1 gene:ENSG00000262223 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr17 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1 /// NONHSAT056476 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT056477 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1
NM_001007533 // RefSeq // Homo sapiens protein phosphatase 1, regulatory subunit 27 (PPP1R27), mRNA. // chr17 // 98 // 100 // 43 // 44 // 0 /// ENST00000330261 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:81833492:81835033:-1 gene:ENSG00000182676 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 98 // 98 // 42 // 43 // 0 /// ENST00000570394 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:81833498:81835050:-1 gene:ENSG00000182676 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 98 // 100 // 43 // 44 // 0 /// ENST00000573182 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:81833493:81834019:-1 gene:ENSG00000182676 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 94 // 36 // 15 // 16 // 0 /// AF434846 // GenBank // Homo sapiens dysferlin-interacting protein 1 (DYSFIP1) mRNA, complete cds. // chr17 // 91 // 98 // 39 // 43 // 0 /// AK096888 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39569 fis, clone SKMUS2001823, weakly similar to Homo sapiens MYPT2 mRNA. // chr17 // 93 // 100 // 41 // 44 // 0 /// BC093707 // GenBank // Homo sapiens dysferlin interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:120742 IMAGE:7939552), complete cds. // chr17 // 91 // 73 // 29 // 32 // 0 /// BC112094 // GenBank // Homo sapiens dysferlin interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:138299 IMAGE:8327562), complete cds. // chr17 // 97 // 73 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000012475 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:81833729:81834953:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 93 // 68 // 28 // 30 // 0 /// NONHSAT056564 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 94 // 36 // 15 // 16 // 0
NM_005782 // RefSeq // Homo sapiens Aly/REF export factor (ALYREF), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000505490 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:81887844:81891586:-1 gene:ENSG00000183684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000512673 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:81888901:81891394:-1 gene:ENSG00000183684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// AF047002 // GenBank // Homo sapiens transcriptional coactivator ALY mRNA, partial cds. // chr17 // 90 // 97 // 28 // 31 // 0 /// AF086513 // GenBank // Homo sapiens full length insert cDNA clone ZE03B06. // chr17 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// BC052302 // GenBank // Homo sapiens THO complex 4, mRNA (cDNA clone MGC:59943 IMAGE:6381528), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_005256333 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens Aly/REF export factor (ALYREF), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// ENST00000504015 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:81888341:81888987:-1 gene:ENSG00000183684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// GENSCAN00000012459 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:81886259:81891559:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONHSAT056583 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_002359 // RefSeq // Homo sapiens v-maf avian musculoaponeurotic fibrosarcoma oncogene homolog G (MAFG), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 91 // 61 // 61 // 0 /// NM_032711 // RefSeq // Homo sapiens v-maf avian musculoaponeurotic fibrosarcoma oncogene homolog G (MAFG), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 96 // 64 // 64 // 0 /// ENST00000357736 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:81918270:81927714:-1 gene:ENSG00000197063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 91 // 61 // 61 // 0 /// ENST00000392366 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:81921560:81923532:-1 gene:ENSG00000197063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 43 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000574686 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:81922798:81927708:-1 gene:ENSG00000197063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 82 // 25 // 14 // 17 // 0 /// AF059195 // GenBank // Homo sapiens basic-leucine zipper transcription factor MafG (MAFG) mRNA, complete cds. // chr17 // 96 // 37 // 24 // 25 // 0 /// AK130699 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ27189 fis, clone SYN02525. // chr17 // 96 // 39 // 25 // 26 // 0 /// BC012327 // GenBank // Homo sapiens v-maf musculoaponeurotic fibrosarcoma oncogene homolog G (avian), mRNA (cDNA clone MGC:20149 IMAGE:4637130), complete cds. // chr17 // 100 // 43 // 29 // 29 // 0 /// U84249 // GenBank // Homo sapiens basic-leucine zipper transcription factor MafG (MAFG) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 36 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000012487 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:81922605:81936814:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 27 // 27 // 18 // 67 // 1
NM_001145113 // RefSeq // Homo sapiens myeloid-associated differentiation marker-like 2 (MYADML2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 54 // 54 // 0 /// ENST00000330655 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:81939646:81942379:-1 gene:ENSG00000185105 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 54 // 54 // 0 /// ENST00000409745 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:81939645:81947233:-1 gene:ENSG00000185105 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 54 // 54 // 0 /// ENST00000579366 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:81935048:81941079:-1 gene:ENSG00000183010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 20 // 20 // 11 // 54 // 1 /// GENSCAN00000012520 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:81940818:81941729:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 94 // 57 // 29 // 31 // 0
NM_178493 // RefSeq // Homo sapiens notum pectinacetylesterase homolog (Drosophila) (NOTUM), mRNA. // chr17 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000409678 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:81952507:81961293:-1 gene:ENSG00000185269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000425009 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:81956883:81961840:-1 gene:ENSG00000185269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000477214 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:81955515:81959810:-1 gene:ENSG00000185269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// AB062438 // GenBank // Homo sapiens mRNA for OK/SW-CL.30, complete cds. // chr17 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// BC036872 // GenBank // Homo sapiens notum pectinacetylesterase homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:46492 IMAGE:5225889), complete cds. // chr17 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// BC060882 // GenBank // Homo sapiens notum pectinacetylesterase homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:71851 IMAGE:30336041), complete cds. // chr17 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000489218 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:81958935:81960873:-1 gene:ENSG00000185269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// GENSCAN00000012539 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:81952961:81961706:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
ENST00000580125 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:81965632:81966589:-1 gene:ENSG00000264735 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC008091 // GenBank // Homo sapiens mRNA similar to hypothetical protein FLJ20234 (cDNA clone IMAGE:4212810). // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT056606 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_004104 // RefSeq // Homo sapiens fatty acid synthase (FASN), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENST00000306749 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:82078338:82098332:-1 gene:ENSG00000169710 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// AY451392 // GenBank // Homo sapiens fatty acid synthase mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// BC007909 // GenBank // Homo sapiens fatty acid synthase, mRNA (cDNA clone IMAGE:4299348), complete cds. // chr17 // 100 // 29 // 14 // 14 // 0 /// BC063242 // GenBank // Homo sapiens fatty acid synthase, mRNA (cDNA clone MGC:60044 IMAGE:6172538), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// U29344 // GenBank // Human breast carcinoma fatty acid synthase mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// U26644 // GenBank // Human fatty acid synthase (fas) mRNA, complete cds. // chr17 // 72 // 96 // 33 // 46 // 0 /// GENSCAN00000012540 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:82058115:82096445:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0
AF090930 // GenBank // Homo sapiens clone HQ0478 PRO0478 mRNA, complete cds. // chr17 // 73 // 100 // 16 // 22 // 0
ENST00000576912 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:82602989:82604178:-1 gene:ENSG00000261845 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AL136830 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp434D1428 (from clone DKFZp434D1428). // chr17 // 90 // 100 // 19 // 21 // 0 /// NONHSAT056734 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT056736 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1
NM_024702 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 750 (ZNF750), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000269394 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:82829435:82840578:-1 gene:ENSG00000141579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC109036 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 750, mRNA (cDNA clone MGC:125667 IMAGE:40028398), complete cds. // chr17 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// BC109037 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 750, mRNA (cDNA clone MGC:125668 IMAGE:40028404), complete cds. // chr17 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000022967 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:82830142:82849158:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0
ENST00000571301 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:82943796:82949948:-1 gene:ENSG00000175711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AK126018 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44030 fis, clone TESTI4027821. // chr17 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// BC110528 // GenBank // Homo sapiens UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:126253 IMAGE:40034264), complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// BC110529 // GenBank // Homo sapiens UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:126256 IMAGE:40034267), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT056764 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENST00000615262 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:21:6365955:6366055:1 gene:ENSG00000276902 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17_gl000205_random // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000620032 // ENSEMBL // ncrna:novel scaffold:GRCh38:GL000205.2:93050:93150:-1 gene:ENSG00000276932 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17_gl000205_random // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONHSAT056803 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17_gl000205_random // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NR_003682 // RefSeq // Homo sapiens C-terminal binding protein 2 pseudogene (MGC70870), non-coding RNA. // chr17_gl000205_random // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000036527 // ENSEMBL // cdna:genscan scaffold:GRCh38:GL000205.2:38734:57174:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17_gl000205_random // 50 // 50 // 10 // 20 // 1
NM_003585 // RefSeq // Homo sapiens double C2-like domains, beta (DOC2B), mRNA. // chrUn // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000496357 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR17_1_CTG1:146808:180568:-1 gene:ENSG00000272670 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// D70830 // GenBank // Homo sapiens mRNA for Doc2 beta, complete cds. // chrUn // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000613549 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:146808:181636:-1 gene:ENSG00000272636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
ENST00000571452 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:79598032:79603921:-1 gene:ENSG00000263278 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chr17_gl000204_random // 89 // 100 // 8 // 9 // 0 /// AK126788 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44838 fis, clone BRACE3048756. // chr17_gl000204_random // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000611949 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:17:79598618:79601292:-1 gene:ENSG00000263278 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chr17_gl000204_random // 86 // 78 // 6 // 7 // 0
NM_005782 // RefSeq // Homo sapiens Aly/REF export factor (ALYREF), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000505490 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:81887844:81891586:-1 gene:ENSG00000183684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000512673 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:81888901:81891394:-1 gene:ENSG00000183684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0 /// AF047002 // GenBank // Homo sapiens transcriptional coactivator ALY mRNA, partial cds. // chr17 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// AF086513 // GenBank // Homo sapiens full length insert cDNA clone ZE03B06. // chr17 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// BC052302 // GenBank // Homo sapiens THO complex 4, mRNA (cDNA clone MGC:59943 IMAGE:6381528), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_005256333 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens Aly/REF export factor (ALYREF), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// ENST00000504015 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:17:81888341:81888987:-1 gene:ENSG00000183684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// GENSCAN00000012459 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:81886259:81891559:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// NONHSAT056583 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_002359 // RefSeq // Homo sapiens v-maf avian musculoaponeurotic fibrosarcoma oncogene homolog G (MAFG), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NM_032711 // RefSeq // Homo sapiens v-maf avian musculoaponeurotic fibrosarcoma oncogene homolog G (MAFG), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000357736 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:81918270:81927714:-1 gene:ENSG00000197063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AK130699 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ27189 fis, clone SYN02525. // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_002359 // RefSeq // Homo sapiens v-maf avian musculoaponeurotic fibrosarcoma oncogene homolog G (MAFG), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NM_032711 // RefSeq // Homo sapiens v-maf avian musculoaponeurotic fibrosarcoma oncogene homolog G (MAFG), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000357736 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:81918270:81927714:-1 gene:ENSG00000197063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000392366 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:17:81921560:81923532:-1 gene:ENSG00000197063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF059195 // GenBank // Homo sapiens basic-leucine zipper transcription factor MafG (MAFG) mRNA, complete cds. // chr17 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// BC012327 // GenBank // Homo sapiens v-maf musculoaponeurotic fibrosarcoma oncogene homolog G (avian), mRNA (cDNA clone MGC:20149 IMAGE:4637130), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// U84249 // GenBank // Homo sapiens basic-leucine zipper transcription factor MafG (MAFG) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000574686 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:17:81922798:81927708:-1 gene:ENSG00000197063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// GENSCAN00000012487 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:17:81922605:81936814:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NR_033770 // RefSeq // Homo sapiens Rho-associated, coiled-coil containing protein kinase 1 pseudogene 1 (ROCK1P1), non-coding RNA. // chr18 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000608049 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:109065:122219:1 gene:ENSG00000263006 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr18 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC041849 // GenBank // Homo sapiens Rho-associated, coiled-coil containing protein kinase 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5269982), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONHSAT056826 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// TCONS_00026176-XLOC_012599 // Rinn lincRNA // linc-USP14-2 chr18:+:109064-122217 // chr18 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_004066 // RefSeq // Homo sapiens centrin, EF-hand protein, 1 (CETN1), mRNA. // chr18 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// ENST00000327228 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:580357:582114:1 gene:ENSG00000177143 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC029515 // GenBank // Homo sapiens centrin, EF-hand protein, 1, mRNA (cDNA clone MGC:33791 IMAGE:5297994), complete cds. // chr18 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// U03270 // GenBank // Homo sapiens centrin mRNA, complete cds. // chr18 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000037580 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:580409:580927:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0
NM_006101 // RefSeq // Homo sapiens NDC80 kinetochore complex component (NDC80), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000261597 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:2571511:2616635:1 gene:ENSG00000080986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AF017790 // GenBank // Homo sapiens retinoblastoma-associated protein HEC mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// AK289396 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77925 complete cds, highly similar to Homo sapiens kinetochore associated 2, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC035617 // GenBank // Homo sapiens NDC80 homolog, kinetochore complex component (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:45222 IMAGE:5164424), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000023131 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:2568390:2616574:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 69 // 69 // 24 // 35 // 1
ENST00000365354 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:18:2621090:2621201:1 gene:ENSG00000202224 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr18 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT056933 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0
NM_015295 // RefSeq // Homo sapiens structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain containing 1 (SMCHD1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000320876 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:2655738:2805017:1 gene:ENSG00000101596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000023132 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:2665947:2913404:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
NM_015295 // RefSeq // Homo sapiens structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain containing 1 (SMCHD1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000320876 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:2655738:2805017:1 gene:ENSG00000101596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000577880 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:2700859:2802929:1 gene:ENSG00000101596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr18 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000584897 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:2706443:2802928:1 gene:ENSG00000101596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr18 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC035774 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5580737, containing frame-shift errors. // chr18 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// CR627458 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686O0631 (from clone DKFZp686O0631). // chr18 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000023132 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:2665947:2913404:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1
NONHSAT056944 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000384307 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:18:2778941:2779057:1 gene:ENSG00000207034 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC004890 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3937917, partial cds. // chr18 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONHSAT056945 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_032048 // RefSeq // Homo sapiens elastin microfibril interfacer 2 (EMILIN2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENST00000254528 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:2847030:2915993:1 gene:ENSG00000132205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENST00000308080 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:2906215:2914041:1 gene:ENSG00000132205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr18 // 100 // 40 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000583776 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:2906569:2913162:1 gene:ENSG00000132205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 100 // 37 // 16 // 16 // 0 /// AF270513 // GenBank // Homo sapiens extracellular glycoprotein EMILIN-2 precursor, mRNA, complete cds. // chr18 // 95 // 100 // 41 // 43 // 0 /// BC136541 // GenBank // Homo sapiens elastin microfibril interfacer 2, mRNA (cDNA clone MGC:168154 IMAGE:9020531), complete cds. // chr18 // 93 // 100 // 40 // 43 // 0 /// GENSCAN00000023132 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:2665947:2913404:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// NONHSAT056948 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr18 // 100 // 37 // 16 // 16 // 0
ENST00000584002 // ENSEMBL // havana_ig_gene:known chromosome:GRCh38:18:3394889:3395312:1 gene:ENSG00000265243 gene_biotype:IG_C_pseudogene transcript_biotype:IG_C_pseudogene // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040698 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:3373983:3395316:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT056986 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_170695 // RefSeq // Homo sapiens TGFB-induced factor homeobox 1 (TGIF1), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000330513 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:3451677:3458411:1 gene:ENSG00000177426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0 /// BC031268 // GenBank // Homo sapiens TGFB-induced factor homeobox 1, mRNA (cDNA clone MGC:39747 IMAGE:5284849), complete cds. // chr18 // 92 // 54 // 12 // 13 // 0 /// NM_001278684 // RefSeq // Homo sapiens TGFB-induced factor homeobox 1 (TGIF1), transcript variant 10, mRNA. // chr18 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1 /// NM_003244 // RefSeq // Homo sapiens TGFB-induced factor homeobox 1 (TGIF1), transcript variant 4, mRNA. // chr18 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1 /// NM_173207 // RefSeq // Homo sapiens TGFB-induced factor homeobox 1 (TGIF1), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1 /// NM_173208 // RefSeq // Homo sapiens TGFB-induced factor homeobox 1 (TGIF1), transcript variant 3, mRNA. // chr18 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1 /// ENST00000343820 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:3449704:3458411:1 gene:ENSG00000177426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1 /// AK307230 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ97178. // chr18 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1 /// ENST00000618001 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:3447609:3459978:1 gene:ENSG00000177426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1
NR_024101 // RefSeq // Homo sapiens DLGAP1 antisense RNA 1 (DLGAP1-AS1), long non-coding RNA. // chr18 // 100 // 64 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000317114 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:3594114:3598352:1 gene:ENSG00000177337 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr18 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AK093095 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ35776 fis, clone TESTI2005326. // chr18 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BX647607 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686I0115 (from clone DKFZp686I0115). // chr18 // 55 // 55 // 12 // 22 // 1 /// ENST00000576606 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:3594112:3597372:1 gene:ENSG00000177337 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr18 // 36 // 36 // 8 // 22 // 1 /// NONHSAT057004 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr18 // 100 // 64 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT057006 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr18 // 55 // 55 // 12 // 22 // 1 /// NONHSAT057003 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr18 // 36 // 36 // 8 // 22 // 1
NONHSAT057016 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENST00000362402 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:6454962:6455068:1 gene:ENSG00000199272 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT057112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000479676 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:6601540:6601836:1 gene:ENSG00000243591 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr18 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT057115 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENST00000362986 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:18:7995570:7995785:1 gene:ENSG00000199856 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT057163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000461146 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:8471831:8472128:1 gene:ENSG00000242985 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr18 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT057174 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
XM_006722300 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens RAB12, member RAS oncogene family (RAB12), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 41 // 15 // 15 // 0 /// AK127824 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ45927 fis, clone PLACE6019600, moderately similar to Ras-related protein Rab-12. // chr18 // 87 // 41 // 13 // 15 // 0 /// BC050338 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5766871, containing frame-shift errors. // chr18 // 95 // 51 // 18 // 19 // 0 /// BC071600 // GenBank // Homo sapiens RAB12, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone IMAGE:30344707), complete cds. // chr18 // 100 // 59 // 22 // 22 // 0 /// BC098407 // GenBank // Homo sapiens RAB12, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone IMAGE:30520557), complete cds. // chr18 // 100 // 59 // 22 // 22 // 0 /// NM_001025300 // RefSeq // Homo sapiens RAB12, member RAS oncogene family (RAB12), mRNA. // chr18 // 57 // 57 // 21 // 37 // 1 /// ENST00000329286 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:8609445:8639381:1 gene:ENSG00000206418 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 57 // 57 // 21 // 37 // 1 /// GENSCAN00000037905 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:8609728:8722086:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 30 // 30 // 11 // 37 // 1
ENST00000384364 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:18:9250110:9250211:1 gene:ENSG00000207092 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT057213 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONHSAT057214 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_020648 // RefSeq // Homo sapiens twisted gastrulation BMP signaling modulator 1 (TWSG1), mRNA. // chr18 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENST00000262120 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:9334767:9402420:1 gene:ENSG00000128791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000583147 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:9334767:9400817:1 gene:ENSG00000128791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr18 // 89 // 90 // 24 // 27 // 0 /// AF196834 // GenBank // Homo sapiens twisted gastrulation-like protein precursor (TWSG1) mRNA, complete cds. // chr18 // 85 // 90 // 23 // 27 // 0 /// AF294628 // GenBank // Homo sapiens twisted gastrulation protein precursor, mRNA, complete cds. // chr18 // 94 // 60 // 17 // 18 // 0 /// AK027629 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ14723 fis, clone NT2RP3001708, weakly similar to TWISTED GASTRULATION PROTEIN PRECURSOR. // chr18 // 89 // 90 // 24 // 27 // 0 /// BC020490 // GenBank // Homo sapiens twisted gastrulation homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:10034 IMAGE:3889103), complete cds. // chr18 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000581641 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:18:9334850:9397067:1 gene:ENSG00000128791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1 /// GENSCAN00000025180 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:9337230:9399527:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0
NM_006788 // RefSeq // Homo sapiens ralA binding protein 1 (RALBP1), mRNA. // chr18 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0 /// XM_006722296 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ralA binding protein 1 (RALBP1), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000019317 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:9475009:9538114:1 gene:ENSG00000017797 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000383432 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:9475670:9538116:1 gene:ENSG00000017797 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// BC013126 // GenBank // Homo sapiens ralA binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:5006 IMAGE:3049077), complete cds. // chr18 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// L42542 // GenBank // Human RLIP76 protein mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000025187 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:9475568:9540778:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 47 // 9 // 9 // 0
ENST00000411206 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:9923920:9924021:1 gene:ENSG00000223138 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr18 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT057248 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_153000 // RefSeq // Homo sapiens adenomatosis polyposis coli down-regulated 1 (APCDD1), mRNA. // chr18 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000355285 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:10454628:10489948:1 gene:ENSG00000154856 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000582723 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:10454884:10485503:1 gene:ENSG00000154856 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr18 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0 /// AB056722 // GenBank // Homo sapiens mRNA for DRAPC1, complete cds. // chr18 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AB104887 // GenBank // Homo sapiens APCDD1 mRNA for adenomatosis polyposis coli down-regulated 1, complete cds. // chr18 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AK300743 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56398 complete cds, highly similar to Protein APCDD1 precursor. // chr18 // 91 // 81 // 20 // 22 // 0 /// AK303076 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61194 complete cds, highly similar to Protein APCDD1 precursor. // chr18 // 94 // 67 // 17 // 18 // 0 /// BC053324 // GenBank // Homo sapiens adenomatosis polyposis coli down-regulated 1, mRNA (cDNA clone MGC:60008 IMAGE:6644230), complete cds. // chr18 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008005 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:10463939:10488038:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
NM_020412 // RefSeq // Homo sapiens charged multivesicular body protein 1B (CHMP1B), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000526991 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:11851396:11854449:1 gene:ENSG00000255112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AF281064 // GenBank // Homo sapiens CHMP1.5 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 52 // 12 // 12 // 0 /// BC012733 // GenBank // Homo sapiens chromatin modifying protein 1B, mRNA (cDNA clone MGC:15076 IMAGE:3928338), complete cds. // chr18 // 88 // 74 // 15 // 17 // 0 /// BC065933 // GenBank // Homo sapiens chromatin modifying protein 1B, mRNA (cDNA clone MGC:74953 IMAGE:6165059), complete cds. // chr18 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000001763 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:11779014:11852111:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 52 // 52 // 12 // 23 // 1
NM_001277333 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat domain 62 (ANKRD62), mRNA. // chr18 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000418274 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:12102706:12129749:1 gene:ENSG00000181626 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr18 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000587848 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:18:12093853:12127939:1 gene:ENSG00000181626 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// BX648696 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686E2239 (from clone DKFZp686E2239). // chr18 // 100 // 47 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000017064 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:12094018:12102649:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 35 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000017065 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:12107307:12179619:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0
ENST00000363957 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:12098427:12098532:1 gene:ENSG00000200827 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT058341 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_036468 // RefSeq // Homo sapiens cell death-inducing DFFA-like effector a (CIDEA), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr18 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000520620 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:12254725:12277481:1 gene:ENSG00000176194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr18 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000521296 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:12254702:12277595:1 gene:ENSG00000176194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr18 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000522713 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:12254361:12277593:1 gene:ENSG00000176194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr18 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AK122762 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ16297 fis, clone PERIC2001379, highly similar to Cell death activator CIDE-A. // chr18 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC031896 // GenBank // Homo sapiens cell death-inducing DFFA-like effector a, mRNA (cDNA clone MGC:30089 IMAGE:4776542), complete cds. // chr18 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NM_001279 // RefSeq // Homo sapiens cell death-inducing DFFA-like effector a (CIDEA), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1 /// ENST00000320477 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:12254319:12277373:1 gene:ENSG00000176194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// AF041378 // GenBank // Homo sapiens cell death activator CIDE-A (CIDE-A) mRNA, complete cds. // chr18 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// AY364639 // GenBank // Homo sapiens cell death activator (CIDEA) mRNA, complete cds. // chr18 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// GENSCAN00000017073 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:12258191:12306640:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
ENST00000364596 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:18:12760717:12760818:1 gene:ENSG00000201466 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr18 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT058392 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
AF090940 // GenBank // Homo sapiens clone HQ0644 PRO0644 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_005913 // RefSeq // Homo sapiens melanocortin 5 receptor (MC5R), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000324750 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:13825544:13826743:1 gene:ENSG00000176136 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000589410 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:13824155:13826284:1 gene:ENSG00000176136 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 90 // 37 // 9 // 10 // 0 /// BC069153 // GenBank // Homo sapiens melanocortin 5 receptor, mRNA (cDNA clone MGC:95438 IMAGE:7217013), complete cds. // chr18 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// BC069545 // GenBank // Homo sapiens melanocortin 5 receptor, mRNA (cDNA clone MGC:97023 IMAGE:7262232), complete cds. // chr18 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// BC095531 // GenBank // Homo sapiens melanocortin 5 receptor, mRNA (cDNA clone MGC:111750 IMAGE:6971958), complete cds. // chr18 // 81 // 100 // 22 // 27 // 0 /// GENSCAN00000000137 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:13825766:13826743:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0
ENST00000581363 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:14179370:14205212:1 gene:ENSG00000186481 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr18 // 100 // 83 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000581935 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:14179097:14185401:1 gene:ENSG00000186481 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr18 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC022023 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat domain 20 family, member A5, mRNA (cDNA clone MGC:26718 IMAGE:4824658), complete cds. // chr18 // 75 // 100 // 9 // 12 // 0 /// BC127726 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat domain 20 family, member A5, mRNA (cDNA clone MGC:157829 IMAGE:40127384), complete cds. // chr18 // 100 // 83 // 10 // 10 // 0 /// NR_040113 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat domain 20 family, member A5, pseudogene (ANKRD20A5P), non-coding RNA. // chr18 // 83 // 83 // 10 // 12 // 1 /// ENST00000431648 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:14179395:14226112:1 gene:ENSG00000186481 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr18 // 83 // 83 // 10 // 12 // 1 /// ENST00000581181 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:14179143:14187774:1 gene:ENSG00000186481 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr18 // 67 // 67 // 8 // 12 // 1 /// NONHSAT058490 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 83 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000048302 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:14179395:14221620:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 83 // 83 // 10 // 12 // 1 /// NONHSAT058491 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 67 // 67 // 8 // 12 // 1
ENST00000391027 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:14190700:14190806:1 gene:ENSG00000212329 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr18 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT058494 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
ENST00000578285 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:14340404:14342525:1 gene:ENSG00000265787 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr18 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000582957 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:14337423:14342524:1 gene:ENSG00000265787 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr18 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONHSAT058515 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONHSAT058517 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONHSAT058518 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
ENST00000431829 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:13544282:13545185:-1 gene:ENSG00000179381 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr18 // 76 // 100 // 16 // 21 // 0 /// ENST00000578842 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:14613137:14614184:1 gene:ENSG00000266693 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr18 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC140726 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 4, subfamily K, member 15, mRNA (cDNA clone MGC:176403 IMAGE:9021594), complete cds. // chr18 // 76 // 100 // 16 // 21 // 0 /// NM_001005486 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 4, subfamily K, member 15 (OR4K15), mRNA. // chr18 // 67 // 100 // 14 // 21 // 0 /// ENST00000305051 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:19975444:19976659:1 gene:ENSG00000169488 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 67 // 100 // 14 // 21 // 0 /// GENSCAN00000021207 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:19956840:20003105:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 67 // 100 // 14 // 21 // 0 /// GENSCAN00000048306 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:14542592:14627413:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 48 // 48 // 10 // 21 // 1
NM_001145029 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat domain 30B (ANKRD30B), mRNA. // chr18 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000358984 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:14748240:14852480:1 gene:ENSG00000180777 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000580206 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:14748335:14817089:1 gene:ENSG00000180777 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr18 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0 /// AF269088 // GenBank // Homo sapiens breast cancer antigen NY-BR-1.1 mRNA, partial cds. // chr18 // 95 // 95 // 20 // 21 // 0 /// BC028407 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat domain 30B, mRNA (cDNA clone IMAGE:4821910). // chr18 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000048301 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:14747476:14877173:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 77 // 77 // 17 // 22 // 1
ENST00000363775 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:14759188:14759294:1 gene:ENSG00000200645 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr18 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT058530 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0
AF130101 // GenBank HTC // Homo sapiens clone FLB1901 PRO0435 mRNA, complete cds. // chr18 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_001291916 // RefSeq // Homo sapiens small nuclear ribonucleoprotein D1 polypeptide 16kDa (SNRPD1), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0 /// NM_006938 // RefSeq // Homo sapiens small nuclear ribonucleoprotein D1 polypeptide 16kDa (SNRPD1), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000300413 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:21612267:21630456:1 gene:ENSG00000167088 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000579618 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:18:21612314:21629109:1 gene:ENSG00000167088 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 47 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000582475 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:18:21612331:21629479:1 gene:ENSG00000167088 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 63 // 12 // 12 // 0 /// BC001721 // GenBank // Homo sapiens small nuclear ribonucleoprotein D1 polypeptide 16kDa, mRNA (cDNA clone MGC:2222 IMAGE:3355716), complete cds. // chr18 // 75 // 63 // 9 // 12 // 0 /// BC072427 // GenBank // Homo sapiens small nuclear ribonucleoprotein D1 polypeptide 16kDa, mRNA (cDNA clone MGC:87720 IMAGE:6464946), complete cds. // chr18 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// J03798 // GenBank // Human autoantigen small nuclear ribonucleoprotein Sm-D mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000035089 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:21600260:21629166:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 53 // 53 // 10 // 19 // 1
NR_031565 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 320c-1 (MIR320C1), microRNA. // chr18 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000408566 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:21683510:21683597:1 gene:ENSG00000221493 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr18 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// hsa-mir-320c-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0003778 Homo sapiens miR-320c-1 stem-loop // chr18 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT058581 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENST00000363880 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:18:21724119:21724229:1 gene:ENSG00000200750 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr18 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT058583 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_020774 // RefSeq // Homo sapiens mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 1 (MIB1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000261537 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:21741320:21870957:1 gene:ENSG00000101752 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000578646 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:21704957:21864974:1 gene:ENSG00000101752 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr18 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// AY147849 // GenBank // Homo sapiens MINDBOMB (MIB) mRNA, complete cds. // chr18 // 88 // 87 // 23 // 26 // 0 /// AY149908 // GenBank // Homo sapiens mind bomb (MIB) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// BC022403 // GenBank // Homo sapiens mindbomb homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:4701157), complete cds. // chr18 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// BC110581 // GenBank // Homo sapiens mindbomb homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:129659 IMAGE:40008394), complete cds. // chr18 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// BC110582 // GenBank // Homo sapiens mindbomb homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:129660 IMAGE:40008395), complete cds. // chr18 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000032052 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:21838369:21865319:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000035094 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:21740951:21824743:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// BC014186 // GenBank HTC // Homo sapiens mindbomb homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:4634376), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr18 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0
ENST00000469988 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:21793883:21794159:1 gene:ENSG00000242971 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT058585 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000363107 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:18:21817624:21817828:1 gene:ENSG00000199977 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr18 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT058586 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr18 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
XR_424917 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens uncharacterized LOC102724208 (LOC102724208), ncRNA. // chr18 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000584028 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:22026024:22043478:1 gene:ENSG00000265758 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr18 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000585185 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:22010296:22043471:1 gene:ENSG00000265758 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr18 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT058601 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT058602 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_005257 // RefSeq // Homo sapiens GATA binding protein 6 (GATA6), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000269216 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:22169443:22202528:1 gene:ENSG00000141448 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000581694 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:22170933:22200880:1 gene:ENSG00000141448 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// AK223547 // GenBank // Homo sapiens mRNA for GATA binding protein 6 variant, clone: FCC126D11. // chr18 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// D87811 // GenBank // Homo sapiens mRNA for GATA-6, complete cds. // chr18 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// U66075 // GenBank // Human transcription factor hGATA-6 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000032056 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:22171145:22226856:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 76 // 76 // 26 // 34 // 1
NONHSAT058616 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000384100 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:22647582:22647688:1 gene:ENSG00000206827 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT058622 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000484900 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:23004564:23004862:1 gene:ENSG00000242182 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr18 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT058645 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr18 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0
ENST00000411091 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:18:23024596:23024703:1 gene:ENSG00000223023 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT058646 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001243425 // RefSeq // Homo sapiens tetratricopeptide repeat domain 39C (TTC39C), transcript variant 3, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000577185 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:18:24016634:24020285:1 gene:ENSG00000168234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 85 // 50 // 11 // 13 // 0 /// ENST00000584250 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:24014420:24020288:1 gene:ENSG00000168234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001135993 // RefSeq // Homo sapiens tetratricopeptide repeat domain 39C (TTC39C), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// XM_006722392 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens tetratricopeptide repeat domain 39C (TTC39C), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// ENST00000317571 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:24014636:24133028:1 gene:ENSG00000168234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// GENSCAN00000018728 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:24009725:24015464:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
BC012036 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone MGC:21733 IMAGE:4517792, complete cds. // chr18 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0
ENST00000384039 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:24218300:24218404:1 gene:ENSG00000206766 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT058692 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000578221 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:18:24426742:24443119:1 gene:ENSG00000154059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 35 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000580706 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:24426647:24451596:1 gene:ENSG00000154059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// AB026264 // GenBank // Homo sapiens IMPACT mRNA, complete cds. // chr18 // 93 // 87 // 25 // 27 // 0 /// BC036074 // GenBank // Homo sapiens Impact homolog (mouse), mRNA (cDNA clone MGC:33718 IMAGE:5288990), complete cds. // chr18 // 86 // 90 // 24 // 28 // 0 /// NM_018439 // RefSeq // Homo sapiens impact RWD domain protein (IMPACT), mRNA. // chr18 // 87 // 87 // 27 // 31 // 1 /// ENST00000284202 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:24426616:24453535:1 gene:ENSG00000154059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 94 // 94 // 29 // 31 // 1 /// AF208694 // GenBank // Homo sapiens IMPACT (IMPACT) mRNA, complete cds. // chr18 // 71 // 71 // 22 // 31 // 1 /// AK292533 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75806 complete cds. // chr18 // 71 // 71 // 22 // 31 // 1 /// BC034016 // GenBank // Homo sapiens Impact homolog (mouse), mRNA (cDNA clone MGC:22261 IMAGE:4808621), complete cds. // chr18 // 71 // 71 // 22 // 31 // 1 /// ENST00000585067 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:18:24426699:24443152:1 gene:ENSG00000154059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1 /// GENSCAN00000018720 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:24426757:24488160:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
ENST00000362766 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:18:24429505:24429609:1 gene:ENSG00000199636 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr18 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT058701 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
ENST00000568797 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:26865308:26935946:1 gene:ENSG00000260372 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr18 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// AK055069 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ30507 fis, clone BRAWH2000554. // chr18 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONHSAT058766 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr18 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONHSAT058768 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr18 // 100 // 88 // 7 // 7 // 0
ENST00000515893 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:30984106:30984215:1 gene:ENSG00000251702 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT058805 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001942 // RefSeq // Homo sapiens desmoglein 1 (DSG1), mRNA. // chr18 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// ENST00000257192 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:31318089:31357029:1 gene:ENSG00000134760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000462981 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:18:31343631:31355667:1 gene:ENSG00000134760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 38 // 9 // 9 // 0 /// AF097935 // GenBank // Homo sapiens desmoglein 1 (DSG1) mRNA, complete cds. // chr18 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 /// AK302888 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50928 complete cds, highly similar to Desmoglein-1 precursor. // chr18 // 100 // 38 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000034962 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:31318301:31355346:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0
NM_001134453 // RefSeq // Homo sapiens desmoglein 4 (DSG4), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// NM_177986 // RefSeq // Homo sapiens desmoglein 4 (DSG4), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000308128 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:31376777:31413916:1 gene:ENSG00000175065 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000359747 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:31376883:31414912:1 gene:ENSG00000175065 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// AY168788 // GenBank // Homo sapiens desmoglein 4 (DSG4) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// AY177664 // GenBank // Homo sapiens desmoglein 4 preproprotein (DSG4) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// AY227350 // GenBank // Homo sapiens desmoglein 4 (DSG4) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// AY228236 // GenBank // Homo sapiens desmoglein 4 (DSG4) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// BC132907 // GenBank // Homo sapiens desmoglein 4, mRNA (cDNA clone MGC:164538 IMAGE:40146929), complete cds. // chr18 // 97 // 86 // 37 // 38 // 0 /// BC132909 // GenBank // Homo sapiens desmoglein 4, mRNA (cDNA clone MGC:164540 IMAGE:40146931), complete cds. // chr18 // 97 // 86 // 37 // 38 // 0 /// BC039098 // GenBank // Homo sapiens desmoglein 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:4822945), partial cds. // chr18 // 25 // 25 // 11 // 44 // 1 /// GENSCAN00000034975 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:31377661:31486715:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 77 // 34 // 34 // 0
ENST00000384511 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:18:31382317:31382430:1 gene:ENSG00000207240 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT058819 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001944 // RefSeq // Homo sapiens desmoglein 3 (DSG3), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000257189 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:31447795:31478702:1 gene:ENSG00000134757 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AK290367 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75630 complete cds, highly similar to Homo sapiens desmoglein 3 (pemphigus vulgaris antigen) (DSG3), mRNA. // chr18 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// M76482 // GenBank // Human 130-kD pemphigus vulgaris antigen mRNA, complete cds. // chr18 // 91 // 100 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000034975 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:31377661:31486715:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0
NM_001943 // RefSeq // Homo sapiens desmoglein 2 (DSG2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000261590 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:31498043:31549008:1 gene:ENSG00000046604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC099655 // GenBank // Homo sapiens desmoglein 2, mRNA (cDNA clone MGC:117034 IMAGE:40008691), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC099656 // GenBank // Homo sapiens desmoglein 2, mRNA (cDNA clone MGC:117036 IMAGE:40008693), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC099657 // GenBank // Homo sapiens desmoglein 2, mRNA (cDNA clone MGC:117037 IMAGE:40008694), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000585206 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:18:31498220:31522608:1 gene:ENSG00000046604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// GENSCAN00000034972 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:31498252:31546743:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0
ENST00000363602 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:31718893:31719208:1 gene:ENSG00000200472 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr18 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// NONHSAT058831 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0
ENST00000410388 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:31937533:31937639:1 gene:ENSG00000222320 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT058842 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_017831 // RefSeq // Homo sapiens ring finger protein 125, E3 ubiquitin protein ligase (RNF125), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000217740 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:32018372:32073213:1 gene:ENSG00000101695 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000580863 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:32042079:32068428:1 gene:ENSG00000101695 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 92 // 50 // 12 // 13 // 0 /// ENST00000583384 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:32041823:32068489:1 gene:ENSG00000101695 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr18 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// BC012021 // GenBank // Homo sapiens ring finger protein 125, mRNA (cDNA clone MGC:21737 IMAGE:4521247), complete cds. // chr18 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// ENST00000583814 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:32041906:32068550:1 gene:ENSG00000101695 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// ENST00000583184 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:32018829:32111779:1 gene:ENSG00000263917 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr18 // 94 // 62 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000005809 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:32018864:32068384:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT058845 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr18 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONHSAT058847 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr18 // 92 // 50 // 12 // 13 // 0 /// NONHSAT058846 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr18 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_001191324 // RefSeq // Homo sapiens ring finger protein 138, E3 ubiquitin protein ligase (RNF138), transcript variant 3, mRNA. // chr18 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// NM_016271 // RefSeq // Homo sapiens ring finger protein 138, E3 ubiquitin protein ligase (RNF138), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NM_198128 // RefSeq // Homo sapiens ring finger protein 138, E3 ubiquitin protein ligase (RNF138), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000257190 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:32092690:32130715:1 gene:ENSG00000134758 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 67 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000261593 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:32091855:32131561:1 gene:ENSG00000134758 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// AF162680 // GenBank // Homo sapiens HSD-4 protein (HSD-4) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0 /// AL133557 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp434I1714 (from clone DKFZp434I1714); partial cds. // chr18 // 100 // 56 // 10 // 10 // 0 /// BC018107 // GenBank // Homo sapiens ring finger protein 138, mRNA (cDNA clone MGC:8758 IMAGE:3914953), complete cds. // chr18 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// BT006878 // GenBank // Homo sapiens STRIN protein mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 56 // 10 // 10 // 0 /// CR457150 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834B048D for gene RNF138, ring finger protein 138; complete cds, incl. stopcodon. // chr18 // 100 // 56 // 10 // 10 // 0
NONHSAT058854 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_005925 // RefSeq // Homo sapiens meprin A, beta (MEP1B), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000269202 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:32190024:32220404:1 gene:ENSG00000141434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000579919 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:32190039:32203173:1 gene:ENSG00000141434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 100 // 31 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000581184 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:18:32185069:32204251:1 gene:ENSG00000141434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 90 // 28 // 9 // 10 // 0 /// ENST00000581447 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:18:32190025:32220404:1 gene:ENSG00000141434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AY695931 // GenBank // Homo sapiens N-benzoyl-L-tyrosyl-p-amino-benzoic acid hydrolase beta subunit (MEP1B) mRNA, complete cds. // chr18 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// BC136559 // GenBank // Homo sapiens meprin A, beta, mRNA (cDNA clone MGC:168172 IMAGE:9020549), complete cds. // chr18 // 88 // 94 // 30 // 34 // 0 /// BC144244 // GenBank // Homo sapiens meprin A, beta, mRNA (cDNA clone MGC:177781 IMAGE:9052764), complete cds. // chr18 // 94 // 94 // 32 // 34 // 0 /// GENSCAN00000005817 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:32201656:32238239:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0
NR_003558 // RefSeq // Homo sapiens WW domain binding protein 11 pseudogene 1 (WBP11P1), non-coding RNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000562560 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:32511860:32513790:1 gene:ENSG00000260389 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr18 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000567636 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:32511663:32514634:1 gene:ENSG00000260389 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005822 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:32512192:32513790:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
NM_030632 // RefSeq // Homo sapiens additional sex combs like transcriptional regulator 3 (ASXL3), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000269197 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:33578632:33751192:1 gene:ENSG00000141431 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000032586 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:33738494:33746595:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0
NR_024565 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 271 (ZNF271), transcript variant 1, non-coding RNA. // chr18 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// NR_024566 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 271 (ZNF271), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr18 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000399070 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:35290282:35310766:1 gene:ENSG00000257267 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr18 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000465539 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:35291184:35307896:1 gene:ENSG00000257267 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:unitary_pseudogene // chr18 // 100 // 79 // 31 // 31 // 0 /// AF159567 // GenBank // Homo sapiens epstein-barr virus-induced zinc finger protein mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0 /// AK094216 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ36897 fis, clone BRACE2001151, highly similar to Homo sapiens zinc finger protein dp mRNA. // chr18 // 69 // 69 // 27 // 39 // 1 /// GENSCAN00000036725 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:35290113:35335055:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 72 // 28 // 28 // 0 /// AF153201 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein dp mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// AF373036 // GenBank // Homo sapiens ZNFPHEX133 protein (ZNFPHEX133) mRNA, complete cds. // chr18 // 97 // 100 // 38 // 39 // 0 /// NONHSAT058916 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// NONHSAT058917 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0
ENST00000589189 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:35627429:35710292:1 gene:ENSG00000141429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr18 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// BC038440 // GenBank // Homo sapiens UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 1 (GalNAc-T1), mRNA (cDNA clone MGC:39891 IMAGE:4478643), complete cds. // chr18 // 91 // 70 // 21 // 23 // 0 /// NM_020474 // RefSeq // Homo sapiens polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 1 (GALNT1), mRNA. // chr18 // 91 // 91 // 30 // 33 // 1 /// ENST00000269195 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:35654560:35711834:1 gene:ENSG00000141429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 94 // 94 // 31 // 33 // 1 /// ENST00000590654 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:35654656:35709780:1 gene:ENSG00000141429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr18 // 70 // 70 // 23 // 33 // 1 /// AK293062 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77222 complete cds, highly similar to Homo sapiens UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 1 (GalNAc-T1) (GALNT1), mRNA. // chr18 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1 /// U41514 // GenBank // Human UDP-GalNAc:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase mRNA, complete cds. // chr18 // 70 // 70 // 23 // 33 // 1 /// GENSCAN00000036719 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:35654663:35709770:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0
NM_017947 // RefSeq // Homo sapiens molybdenum cofactor sulfurase (MOCOS), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000261326 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:36187519:36272157:1 gene:ENSG00000075643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// BC012079 // GenBank // Homo sapiens molybdenum cofactor sulfurase, mRNA (cDNA clone MGC:19980 IMAGE:4550285), complete cds. // chr18 // 93 // 100 // 41 // 44 // 0 /// GENSCAN00000028934 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:36185887:36274243:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 77 // 34 // 34 // 0
ENST00000517229 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:39034007:39034110:1 gene:ENSG00000253038 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT059009 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_002647 // RefSeq // Homo sapiens phosphatidylinositol 3-kinase, catalytic subunit type 3 (PIK3C3), mRNA. // chr18 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000262039 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:41955206:42087830:1 gene:ENSG00000078142 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000398870 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:18:41955254:42087830:1 gene:ENSG00000078142 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AK298517 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55742 complete cds, highly similar to Phosphatidylinositol 3-kinase catalyticsubunit type 3 (EC 2.7.1.137). // chr18 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// BC033004 // GenBank // Homo sapiens phosphoinositide-3-kinase, class 3, mRNA (cDNA clone MGC:26376 IMAGE:4823337), complete cds. // chr18 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC053651 // GenBank // Homo sapiens phosphoinositide-3-kinase, class 3, mRNA (cDNA clone MGC:61518 IMAGE:5517878), complete cds. // chr18 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000593098 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:42025331:42081479:1 gene:ENSG00000078142 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// AK090567 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ33248 fis, clone ASTRO2005008, highly similar to Rattus norvegicus mRNA for phosphatidylinositol 3-kinase. // chr18 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// GENSCAN00000039829 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:41860479:42151743:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0
ENST00000517231 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:42270589:42270715:1 gene:ENSG00000253040 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT059072 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000365190 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:44071583:44071701:1 gene:ENSG00000202060 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr18 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// NONHSAT059081 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0
NM_001130110 // RefSeq // Homo sapiens SET binding protein 1 (SETBP1), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 38 // 9 // 9 // 0 /// NM_015559 // RefSeq // Homo sapiens SET binding protein 1 (SETBP1), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000282030 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:44680898:45068510:1 gene:ENSG00000152217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000426838 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:44680173:44877414:1 gene:ENSG00000152217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 38 // 9 // 9 // 0 /// AB022660 // GenBank // Homo sapiens mRNA for SET-binding protein (SEB), complete cds. // chr18 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// AK091663 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ34344 fis, clone FEBRA2010299, moderately similar to SET-binding protein (SEB). // chr18 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0 /// BC062338 // GenBank // Homo sapiens SET binding protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:6338507), complete cds. // chr18 // 100 // 38 // 9 // 9 // 0 /// BC146776 // GenBank // Homo sapiens SET binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:166855 IMAGE:9007225), complete cds. // chr18 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000024025 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:45009048:45159046:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 42 // 42 // 10 // 24 // 1
NM_213602 // RefSeq // Homo sapiens sialic acid binding Ig-like lectin 15 (SIGLEC15), mRNA. // chr18 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000389474 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:45825512:45842556:1 gene:ENSG00000197046 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000546268 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:18:45829091:45842224:1 gene:ENSG00000197046 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 88 // 68 // 15 // 17 // 0 /// ENST00000593178 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:45838522:45844080:1 gene:ENSG00000197046 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// AK092746 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ35427 fis, clone SMINT2001731. // chr18 // 85 // 52 // 11 // 13 // 0 /// AK095432 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ38113 fis, clone D3OST2002417. // chr18 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// AK290400 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77913 complete cds. // chr18 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// AK290402 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78151 complete cds, highly similar to Homo sapiens CD33 antigen-like 3 (CD33L3), mRNA. // chr18 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// AK301189 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59768 complete cds. // chr18 // 88 // 68 // 15 // 17 // 0 /// AY971516 // GenBank // Homo sapiens SIGLEC-15 (SIGLEC15) mRNA, complete cds. // chr18 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// ENST00000602118 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:45829088:45842556:1 gene:ENSG00000197046 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr18 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// GENSCAN00000002756 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:45825729:45842187:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_001008239 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 18 open reading frame 25 (C18orf25), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// NM_145055 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 18 open reading frame 25 (C18orf25), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// AK289738 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75073 complete cds. // chr18 // 88 // 63 // 15 // 17 // 0 /// AK292981 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78541 complete cds. // chr18 // 88 // 59 // 14 // 16 // 0 /// BC016149 // GenBank // Homo sapiens chromosome 18 open reading frame 25, mRNA (cDNA clone MGC:12909 IMAGE:4040087), complete cds. // chr18 // 93 // 52 // 13 // 14 // 0 /// BC084579 // GenBank // Homo sapiens chromosome 18 open reading frame 25, mRNA (cDNA clone MGC:87799 IMAGE:6141272), complete cds. // chr18 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000615052 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:46174027:46266991:1 gene:ENSG00000152242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENST00000619301 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:46174034:46266983:1 gene:ENSG00000152242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002747 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:46215887:46298368:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 89 // 33 // 8 // 9 // 0 /// ENST00000615553 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:18:46174086:46232936:1 gene:ENSG00000152242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// ENST00000619230 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:46174019:46219242:1 gene:ENSG00000152242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001256758 // RefSeq // Homo sapiens ring finger protein 165 (RNF165), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// NM_152470 // RefSeq // Homo sapiens ring finger protein 165 (RNF165), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000269439 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:46334224:46463140:1 gene:ENSG00000141622 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000543885 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:18:46334224:46460820:1 gene:ENSG00000141622 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000586604 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:46334224:46463140:1 gene:ENSG00000141622 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr18 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000592777 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:46447447:46456067:1 gene:ENSG00000141622 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 90 // 31 // 9 // 10 // 0 /// ENST00000593230 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:18:46326809:46450349:1 gene:ENSG00000141622 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0 /// BC012190 // GenBank HTC // Homo sapiens ring finger protein 165, mRNA (cDNA clone IMAGE:4650122), with apparent retained intron. // chr18 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002753 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:46393469:46456636:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1
ENST00000588679 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:18:46334224:46337127:1 gene:ENSG00000141622 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// AK091537 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ34218 fis, clone FCBBF3022311. // chr18 // 94 // 100 // 17 // 18 // 0 /// AK074561 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ90080 fis, clone HEMBA1004797. // chr18 // 50 // 50 // 9 // 18 // 1 /// BC093850 // GenBank // Homo sapiens chromosome 18 open reading frame 23, mRNA (cDNA clone MGC:120885 IMAGE:7939695), complete cds. // chr18 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0
NM_031303 // RefSeq // Homo sapiens katanin p60 subunit A-like 2 (KATNAL2), mRNA. // chr18 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// XM_006722554 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens katanin p60 subunit A-like 2 (KATNAL2), transcript variant X6, mRNA. // chr18 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000245121 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:46946824:47102243:1 gene:ENSG00000167216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000356157 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:18:46946855:47101005:1 gene:ENSG00000167216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000585469 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:18:46946797:47063361:1 gene:ENSG00000167216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 49 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000586198 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:18:47069223:47077542:1 gene:ENSG00000167216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 23 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000588433 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:18:47058234:47100335:1 gene:ENSG00000167216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 57 // 20 // 20 // 0 /// BC034999 // GenBank // Homo sapiens katanin p60 subunit A-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:33211 IMAGE:4829800), complete cds. // chr18 // 97 // 97 // 33 // 34 // 0 /// GENSCAN00000026185 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:47046048:47101005:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0
AF119875 // GenBank HTC // Homo sapiens PRO2309 mRNA, complete cds. // chr18 // 85 // 62 // 11 // 13 // 0
ENST00000592307 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:47630112:47630848:1 gene:ENSG00000267156 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr18 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT059166 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000010688 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:47630112:47809636:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 61 // 61 // 11 // 18 // 1
AB027121 // GenBank // Homo sapiens mRNA for HEIL1, complete cds. // chr18 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0
NM_001142397 // RefSeq // Homo sapiens CBP80/20-dependent translation initiation factor (CTIF), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_014772 // RefSeq // Homo sapiens CBP80/20-dependent translation initiation factor (CTIF), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_005258392 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens CBP80/20-dependent translation initiation factor (CTIF), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// XM_006722588 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens CBP80/20-dependent translation initiation factor (CTIF), transcript variant X7, mRNA. // chr18 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000256413 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:48539046:48863217:1 gene:ENSG00000134030 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000382998 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:48539158:48861906:1 gene:ENSG00000134030 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// BC042146 // GenBank // Homo sapiens KIAA0427, mRNA (cDNA clone MGC:52202 IMAGE:5928756), complete cds. // chr18 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000587860 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:48760182:48860565:1 gene:ENSG00000134030 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// AK095970 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ38651 fis, clone HHDPC2008414. // chr18 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
NR_003003 // RefSeq // Homo sapiens small Cajal body-specific RNA 17 (SCARNA17), guide RNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000516183 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:49814133:49814276:1 gene:ENSG00000251992 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr18 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000615535 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:49814023:49814443:1 gene:ENSG00000267322 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:antisense // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT059251 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT059252 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT146944 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NR_003003 // RefSeq // Homo sapiens small Cajal body-specific RNA 17 (SCARNA17), guide RNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000516330 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:18:49814361:49814443:1 gene:ENSG00000252139 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000615535 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:49814023:49814443:1 gene:ENSG00000267322 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:antisense // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT059251 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT059252 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT059254 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000516188 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:50319002:50319120:1 gene:ENSG00000251997 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000576449 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR18_1_CTG1_1:50319002:50319120:1 gene:ENSG00000262132 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT059275 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001168335 // RefSeq // Homo sapiens malic enzyme 2, NAD(+)-dependent, mitochondrial (ME2), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NM_002396 // RefSeq // Homo sapiens malic enzyme 2, NAD(+)-dependent, mitochondrial (ME2), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000321341 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:50879049:50954257:1 gene:ENSG00000082212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000382927 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:50879120:50947890:1 gene:ENSG00000082212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000589330 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:50917242:50920711:1 gene:ENSG00000082212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// BC000147 // GenBank // Homo sapiens malic enzyme 2, NAD(+)-dependent, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:5187 IMAGE:2900677), complete cds. // chr18 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// M55905 // GenBank // Human mitochondrial NAD(P)+ dependent malic enzyme mRNA, complete cds. // chr18 // 92 // 89 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040860 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:50839793:50947184:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0
NM_018696 // RefSeq // Homo sapiens elaC ribonuclease Z 1 (ELAC1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000269466 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:50968016:50988121:1 gene:ENSG00000141642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000591429 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:18:50968048:50984838:1 gene:ENSG00000141642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// AB029151 // GenBank // Homo sapiens D29 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AF308695 // GenBank // Homo sapiens ELAC1 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AK310911 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17953. // chr18 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// BC014624 // GenBank // Homo sapiens elaC homolog 1 (E. coli), mRNA (cDNA clone MGC:4455 IMAGE:2960155), complete cds. // chr18 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000588577 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:18:50967991:50986946:1 gene:ENSG00000141642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// GENSCAN00000040877 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:50952087:50987085:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000588256 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:50968023:51047111:1 gene:ENSG00000267699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr18 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// NONHSAT059288 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr18 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NONHSAT059312 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_005215 // RefSeq // Homo sapiens DCC netrin 1 receptor (DCC), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000304775 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:52752162:53416557:1 gene:ENSG00000187323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr18 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000412726 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:18:52752032:53535903:1 gene:ENSG00000187323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000442544 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:52340172:53535899:1 gene:ENSG00000187323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000581580 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:18:52934772:53530592:1 gene:ENSG00000187323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 96 // 82 // 26 // 27 // 0 /// AK302643 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51404 complete cds, highly similar to Netrin receptor DCC precursor. // chr18 // 96 // 70 // 22 // 23 // 0 /// AK310385 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17427. // chr18 // 93 // 82 // 25 // 27 // 0 /// BC036524 // GenBank // Homo sapiens deleted in colorectal carcinoma, mRNA (cDNA clone IMAGE:4837261), partial cds. // chr18 // 100 // 48 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000034079 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:53179032:53500277:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 95 // 67 // 21 // 22 // 0
NM_173629 // RefSeq // Homo sapiens dynactin associated protein (DYNAP), mRNA. // chr18 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// ENST00000321600 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:54591159:54599493:1 gene:ENSG00000178690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000585973 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:18:54587757:54598679:1 gene:ENSG00000178690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000020132 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:54591215:54598145:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0
NM_015285 // RefSeq // Homo sapiens WD repeat domain 7 (WDR7), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// NM_052834 // RefSeq // Homo sapiens WD repeat domain 7 (WDR7), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000254442 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:56651385:57036606:1 gene:ENSG00000091157 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000357574 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:56651361:57029811:1 gene:ENSG00000091157 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// AY099325 // GenBank // Homo sapiens rabconnectin-3 beta mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// BC131558 // GenBank // Homo sapiens WD repeat domain 7, mRNA (cDNA clone MGC:148099 IMAGE:40108655), complete cds. // chr18 // 95 // 51 // 19 // 20 // 0 /// BC150282 // GenBank // Homo sapiens WD repeat domain 7, mRNA (cDNA clone MGC:166898 IMAGE:9007268), complete cds. // chr18 // 97 // 100 // 38 // 39 // 0 /// ENST00000615645 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:18:56651385:57029805:1 gene:ENSG00000091157 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 59 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000020795 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:56672516:56934635:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 96 // 67 // 25 // 26 // 0
ENST00000391237 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:18:56957270:56957469:1 gene:ENSG00000212539 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT059429 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001257964 // RefSeq // Homo sapiens biorientation of chromosomes in cell division 1-like 2 (BOD1L2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000585477 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:57147062:57150300:1 gene:ENSG00000228075 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK301799 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54282 complete cds, highly similar to Protein FAM44C. // chr18 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000020784 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:57147313:57147831:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0
NM_015879 // RefSeq // Homo sapiens ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 3 (ST8SIA3), mRNA. // chr18 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000324000 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:57350813:57368933:1 gene:ENSG00000177511 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF003092 // GenBank // Homo sapiens alpha-2,8-sialyltransferase III mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// AF004668 // GenBank // Homo sapiens Sia alpha2,3Galbeta1,4GlcNAcalpha 2,8-sialyltransferase mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AK289517 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78167 complete cds, highly similar to Homo sapiens Sia alpha2,3Galbeta1,4GlcNAcalpha 2,8-sialyltransferase mRNA. // chr18 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// BC074909 // GenBank // Homo sapiens ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 3, mRNA (cDNA clone MGC:103874 IMAGE:30915256), complete cds. // chr18 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000020757 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:57352862:57360277:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0
NM_004852 // RefSeq // Homo sapiens one cut homeobox 2 (ONECUT2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000491143 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:57435685:57491297:1 gene:ENSG00000119547 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000020755 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:57435774:57438543:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 93 // 64 // 13 // 14 // 0
AK056031 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ31469 fis, clone NT2NE2001428. // chr18 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000588925 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:57639455:57738044:1 gene:ENSG00000267787 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr18 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT059462 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr18 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
ENST00000365289 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:57755394:57755500:1 gene:ENSG00000202159 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr18 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONHSAT059465 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
ENST00000591045 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:57838476:57838966:1 gene:ENSG00000231544 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr18 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000016079 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:57838476:57839039:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NR_029667 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 122 (MIR122), microRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000385044 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:58451068:58451176:1 gene:ENSG00000207778 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000590797 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:58446275:58453766:1 gene:ENSG00000267391 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-122 // miRBase Micro RNA Database // MI0000442 Homo sapiens miR-122 stem-loop // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT059505 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONHSAT059530 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000364728 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:58805268:58805374:1 gene:ENSG00000201598 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT059531 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000473094 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:59761558:59761905:1 gene:ENSG00000224161 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021739 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:59761558:59769037:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_021127 // RefSeq // Homo sapiens phorbol-12-myristate-13-acetate-induced protein 1 (PMAIP1), mRNA. // chr18 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000269518 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:18:59900016:59903537:1 gene:ENSG00000141682 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000316660 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:59899948:59904306:1 gene:ENSG00000141682 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000590596 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:59900036:59902963:1 gene:ENSG00000141682 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// BC013120 // GenBank // Homo sapiens phorbol-12-myristate-13-acetate-induced protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:9202 IMAGE:3858958), complete cds. // chr18 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// BC032663 // GenBank // Homo sapiens phorbol-12-myristate-13-acetate-induced protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:45013 IMAGE:5529754), complete cds. // chr18 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// D90070 // GenBank // Homo sapiens mRNA for ATL-derived PMA-responsive peptide, complete cds. // chr18 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// NONHSAT059575 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr18 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0
ENST00000479616 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:59972914:59973207:1 gene:ENSG00000239398 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT059578 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000516746 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:60018625:60018731:1 gene:ENSG00000252555 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT059581 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000365598 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:60163567:60163707:1 gene:ENSG00000202468 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT059584 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_020854 // RefSeq // Homo sapiens KIAA1468 (KIAA1468), mRNA. // chr18 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// XM_005266732 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens KIAA1468 (KIAA1468), transcript variant X4, mRNA. // chr18 // 100 // 67 // 26 // 26 // 0 /// XM_006722513 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens KIAA1468 (KIAA1468), transcript variant X6, mRNA. // chr18 // 100 // 74 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000256858 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:62187258:62307112:1 gene:ENSG00000134444 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000398130 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:62187274:62307829:1 gene:ENSG00000134444 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000587725 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:62187291:62275571:1 gene:ENSG00000134444 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:non_stop_decay // chr18 // 100 // 67 // 26 // 26 // 0 /// AB040901 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1468 protein, partial cds. // chr18 // 100 // 82 // 32 // 32 // 0 /// BC011992 // GenBank // Homo sapiens KIAA1468, mRNA (cDNA clone MGC:16944 IMAGE:4339646), complete cds. // chr18 // 100 // 79 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000047678 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:62187506:62287535:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 59 // 23 // 23 // 0
ENST00000362997 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:18:62330812:62330913:1 gene:ENSG00000199867 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr18 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT059633 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0
ENST00000588676 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:18:62523619:62525495:1 gene:ENSG00000141664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC006340 // GenBank // Homo sapiens zinc finger, CCHC domain containing 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:4079754), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_017742 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, CCHC domain containing 2 (ZCCHC2), mRNA. // chr18 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// XR_245462 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens zinc finger, CCHC domain containing 2 (ZCCHC2), transcript variant X1, misc_RNA. // chr18 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// ENST00000269499 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:62523007:62578583:1 gene:ENSG00000141664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// ENST00000585873 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:62523667:62586729:1 gene:ENSG00000141664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr18 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// GENSCAN00000011583 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:62522814:62524753:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
AY358662 // GenBank // Homo sapiens clone DNA57695 GVEI466 (UNQ466) mRNA, complete cds. // chr18 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0
NM_194449 // RefSeq // Homo sapiens PH domain and leucine rich repeat protein phosphatase 1 (PHLPP1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000262719 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:62715450:62980433:1 gene:ENSG00000081913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC014927 // GenBank // Homo sapiens PH domain and leucine rich repeat protein phosphatase, mRNA (cDNA clone MGC:17934 IMAGE:3916044), complete cds. // chr18 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// BC126277 // GenBank // Homo sapiens PH domain and leucine rich repeat protein phosphatase, mRNA (cDNA clone MGC:161555 IMAGE:8991993), complete cds. // chr18 // 96 // 74 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000011586 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:62715684:62717318:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 23 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000011593 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:62802243:62979431:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 63 // 22 // 22 // 0
NM_002639 // RefSeq // Homo sapiens serpin peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 5 (SERPINB5), mRNA. // chr18 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006722483 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens serpin peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 5 (SERPINB5), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000382771 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:63476761:63505085:1 gene:ENSG00000206075 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000489441 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:63476958:63493701:1 gene:ENSG00000206075 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// AK301667 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57640 complete cds, highly similar to Serpin B5 precursor. // chr18 // 94 // 62 // 15 // 16 // 0 /// BC020713 // GenBank // Homo sapiens serpin peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 5, mRNA (cDNA clone MGC:22489 IMAGE:4248249), complete cds. // chr18 // 88 // 62 // 14 // 16 // 0 /// U04313 // GenBank // Human maspin mRNA, complete cds. // chr18 // 86 // 85 // 19 // 22 // 0 /// GENSCAN00000011589 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:63465244:63503722:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_080474 // RefSeq // Homo sapiens serpin peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 12 (SERPINB12), mRNA. // chr18 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000269491 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:63556160:63567011:1 gene:ENSG00000166634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000382768 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:18:63556160:63567011:1 gene:ENSG00000166634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AF411191 // GenBank // Homo sapiens SERPINB12 (SERPINB12) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// BC103884 // GenBank // Homo sapiens serpin peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 12, mRNA (cDNA clone IMAGE:40004898), complete cds. // chr18 // 94 // 100 // 33 // 35 // 0 /// BC103885 // GenBank // Homo sapiens serpin peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 12, mRNA (cDNA clone MGC:119248 IMAGE:40004899), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AK309754 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99795. // chr18 // 51 // 51 // 18 // 35 // 1 /// GENSCAN00000037874 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:63511197:63597363:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0
NM_005024 // RefSeq // Homo sapiens serpin peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 10 (SERPINB10), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000238508 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:63907991:63936111:1 gene:ENSG00000242550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC096217 // GenBank // Homo sapiens serpin peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 10, mRNA (cDNA clone MGC:116870 IMAGE:40004824), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC096218 // GenBank // Homo sapiens serpin peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 10, mRNA (cDNA clone MGC:116871 IMAGE:40004825), complete cds. // chr18 // 88 // 100 // 28 // 32 // 0 /// BC096219 // GenBank // Homo sapiens serpin peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 10, mRNA (cDNA clone MGC:116872 IMAGE:40004826), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC096220 // GenBank // Homo sapiens serpin peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 10, mRNA (cDNA clone MGC:116873 IMAGE:40004827), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// U35459 // GenBank // Human bomapin mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000619595 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:18:63915511:63935242:1 gene:ENSG00000242550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000037872 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:63907730:63937269:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0
NM_004361 // RefSeq // Homo sapiens cadherin 7, type 2 (CDH7), transcript variant b, mRNA. // chr18 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// NM_033646 // RefSeq // Homo sapiens cadherin 7, type 2 (CDH7), transcript variant a, mRNA. // chr18 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000323011 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:65750252:65880939:1 gene:ENSG00000081138 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000536984 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:18:65750653:65864125:1 gene:ENSG00000081138 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// AB035301 // GenBank // Homo sapiens CDH7 mRNA for cadherin-7, complete cds. // chr18 // 97 // 86 // 29 // 30 // 0 /// BC036786 // GenBank // Homo sapiens cadherin 7, type 2, mRNA (cDNA clone MGC:45983 IMAGE:5744842), complete cds. // chr18 // 93 // 83 // 27 // 29 // 0 /// ENST00000397968 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:65750921:65890341:1 gene:ENSG00000081138 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 86 // 86 // 30 // 35 // 1 /// GENSCAN00000017985 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:65751260:65880894:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0
ENST00000459571 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:66946116:66946222:1 gene:ENSG00000238680 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT059710 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_152721 // RefSeq // Homo sapiens docking protein 6 (DOK6), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000382713 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:69401055:69849087:1 gene:ENSG00000206052 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000582992 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:18:69677734:69739160:1 gene:ENSG00000206052 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000584435 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:69643688:69739080:1 gene:ENSG00000206052 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr18 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// AY599248 // GenBank // Homo sapiens downstream of tyrosine kinase 6 (DOK6) mRNA, complete cds. // chr18 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// BC096744 // GenBank // Homo sapiens docking protein 6, mRNA (cDNA clone MGC:104528 IMAGE:5260167), complete cds. // chr18 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// GENSCAN00000048928 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:69469591:69757887:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
NM_004232 // RefSeq // Homo sapiens suppressor of cytokine signaling 6 (SOCS6), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000397942 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:70288901:70330200:1 gene:ENSG00000170677 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000578377 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:70296599:70325351:1 gene:ENSG00000170677 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000582322 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:70314190:70327116:1 gene:ENSG00000170677 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// AB006968 // GenBank // Homo sapiens mRNA for CIS4, complete cds. // chr18 // 92 // 50 // 11 // 12 // 0 /// AF161545 // GenBank HTC // Homo sapiens HSPC060 mRNA, complete cds. // chr18 // 79 // 79 // 15 // 19 // 0 /// BC020082 // GenBank // Homo sapiens suppressor of cytokine signaling 6, mRNA (cDNA clone MGC:9529 IMAGE:3917519), complete cds. // chr18 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000048933 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:70324669:70326276:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0
ENST00000469617 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:70512727:70513008:1 gene:ENSG00000239748 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr18 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT059781 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
ENST00000470065 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:73744935:73745232:1 gene:ENSG00000241866 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT059852 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000480810 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:74227506:74227803:1 gene:ENSG00000243856 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr18 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT059865 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_017757 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 407 (ZNF407), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000299687 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:74631020:75065669:1 gene:ENSG00000215421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0 /// NM_001146189 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 407 (ZNF407), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 78 // 78 // 14 // 18 // 1 /// ENST00000577538 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:74631020:74921058:1 gene:ENSG00000215421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 78 // 78 // 14 // 18 // 1 /// NM_001146190 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 407 (ZNF407), transcript variant 3, mRNA. // chr18 // 56 // 56 // 10 // 18 // 1 /// ENST00000309902 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:18:74630963:74804624:1 gene:ENSG00000215421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 56 // 56 // 10 // 18 // 1 /// ENST00000582337 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:74597870:74804627:1 gene:ENSG00000215421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 56 // 56 // 10 // 18 // 1
NM_005786 // RefSeq // Homo sapiens teashirt zinc finger homeobox 1 (TSHZ1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_005266640 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens teashirt zinc finger homeobox 1 (TSHZ1), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000322038 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:75210755:75289950:1 gene:ENSG00000179981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000560918 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:75221058:75286372:1 gene:ENSG00000179981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000580243 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:75211529:75288641:1 gene:ENSG00000179981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000584217 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:75282864:75289943:1 gene:ENSG00000179981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// AB210042 // GenBank // Homo sapiens mRNA for SDCCAG33 variant protein, partial cds, clone: pf00940. // chr18 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000031846 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:75279514:75288641:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// AK091155 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ33836 fis, clone CTONG2004423, highly similar to Mus musculus zinc finger protein (Mtsh1) mRNA. // chr18 // 94 // 71 // 16 // 17 // 0
NM_001272093 // RefSeq // Homo sapiens FLJ44313 protein (FLJ44313), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000618178 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:18:76495521:76498088:1 gene:ENSG00000275763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_007345 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 236 (ZNF236), mRNA. // chr18 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// ENST00000253159 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:76824160:76970727:1 gene:ENSG00000130856 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// ENST00000320610 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:18:76822607:76969918:1 gene:ENSG00000130856 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 77 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000543926 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:76824160:76970727:1 gene:ENSG00000130856 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr18 // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// ENST00000579322 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:18:76849199:76881482:1 gene:ENSG00000130856 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 21 // 10 // 10 // 0 /// AF085243 // GenBank // Homo sapiens C2H2 type Kruppel-like zinc finger protein (ZNF236) mRNA, complete cds. // chr18 // 96 // 98 // 44 // 46 // 0 /// AF085244 // GenBank // Homo sapiens C2H2 type Kruppel-like zinc finger protein splice variant b (ZNF236) mRNA, complete cds. // chr18 // 96 // 96 // 43 // 45 // 0 /// BC140859 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 236, mRNA (cDNA clone MGC:176536 IMAGE:9021727), complete cds. // chr18 // 100 // 85 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000011369 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:76860919:76968339:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 62 // 29 // 29 // 0 /// AK000847 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ20840 fis, clone ADKA02336. // chr18 // 21 // 21 // 10 // 47 // 1
NM_001480 // RefSeq // Homo sapiens galanin receptor 1 (GALR1), mRNA. // chr18 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000299727 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:77250549:77277896:1 gene:ENSG00000166573 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// AY541036 // GenBank // Homo sapiens galanin receptor 1 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// BC095530 // GenBank // Homo sapiens galanin receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:111748 IMAGE:6971910), complete cds. // chr18 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// L34339 // GenBank // Human galanin receptor mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// U23854 // GenBank // Human galanin receptor mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// U53511 // GenBank // Homo sapiens galanin receptor (Gal1-R) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000011360 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:77235651:77257786:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0
ENST00000362858 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:78036739:78036845:1 gene:ENSG00000199728 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT060003 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_012283 // RefSeq // Homo sapiens potassium voltage-gated channel, subfamily G, member 2 (KCNG2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000316249 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:79863668:79899816:1 gene:ENSG00000178342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000044979 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:79863454:79872223:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
NM_001171967 // RefSeq // Homo sapiens ribosome binding factor A (putative) (RBFA), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NM_024805 // RefSeq // Homo sapiens ribosome binding factor A (putative) (RBFA), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000262197 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:80034466:80046397:1 gene:ENSG00000101546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000306735 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:80034358:80046392:1 gene:ENSG00000101546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000586847 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:18:80034389:80037504:1 gene:ENSG00000101546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr18 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// BC014195 // GenBank // Homo sapiens chromosome 18 open reading frame 22, mRNA (cDNA clone MGC:20620 IMAGE:3938406), complete cds. // chr18 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC057772 // GenBank // Homo sapiens chromosome 18 open reading frame 22, mRNA (cDNA clone MGC:71535 IMAGE:30337652), complete cds. // chr18 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// ENST00000593019 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:80041302:80046332:1 gene:ENSG00000101546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// AK124595 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ42604 fis, clone BRACE3011505. // chr18 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// GENSCAN00000044972 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:80034496:80064883:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT060074 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr18 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0
NM_014913 // RefSeq // Homo sapiens ADNP homeobox 2 (ADNP2), mRNA. // chr18 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// XM_005266656 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ADNP homeobox 2 (ADNP2), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// ENST00000262198 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:80109031:80140351:1 gene:ENSG00000101544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// AK292566 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78768 complete cds. // chr18 // 91 // 73 // 20 // 22 // 0 /// BC071589 // GenBank // Homo sapiens ADNP homeobox 2, mRNA (cDNA clone MGC:87344 IMAGE:30333923), complete cds. // chr18 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// GENSCAN00000044964 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:80107338:80157400:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0
XM_006722358 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens collectin sub-family member 12 (COLEC12), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000582147 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:319361:500722:-1 gene:ENSG00000158270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// AB034251 // GenBank // Homo sapiens NSR2 mRNA for nurse cell scavenger receptor 2, complete cds. // chr18 // 80 // 36 // 8 // 10 // 0 /// AB038518 // GenBank // Homo sapiens SRCL mRNA for scavenger receptor with C-type lectin type I, complete cds. // chr18 // 91 // 82 // 21 // 23 // 0 /// AB052103 // GenBank // Homo sapiens SRCL mRNA for scavenger receptor with C-type lectin type II, complete cds. // chr18 // 86 // 79 // 19 // 22 // 0 /// BC060789 // GenBank // Homo sapiens collectin sub-family member 12, mRNA (cDNA clone MGC:71579 IMAGE:30344546), complete cds. // chr18 // 91 // 79 // 20 // 22 // 0 /// NM_130386 // RefSeq // Homo sapiens collectin sub-family member 12 (COLEC12), mRNA. // chr18 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// ENST00000400256 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:319361:500722:-1 gene:ENSG00000158270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1 /// AB005145 // GenBank // Homo sapiens CL-P1 mRNA for collectin placenta 1, complete cds. // chr18 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// GENSCAN00000037594 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:275648:337740:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
ENST00000410242 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:586517:586850:-1 gene:ENSG00000222174 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT056846 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001012716 // RefSeq // Homo sapiens TYMS opposite strand (TYMSOS), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000323813 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:18:649620:658340:-1 gene:ENSG00000176912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000585033 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:18:641320:658269:-1 gene:ENSG00000176912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// AK289986 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76378 complete cds. // chr18 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// BC028301 // GenBank // Homo sapiens chromosome 18 open reading frame 56, mRNA (cDNA clone MGC:34991 IMAGE:5141042), complete cds. // chr18 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0
NM_005433 // RefSeq // Homo sapiens YES proto-oncogene 1, Src family tyrosine kinase (YES1), mRNA. // chr18 // 91 // 100 // 21 // 23 // 0 /// ENST00000314574 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:721748:812238:-1 gene:ENSG00000176105 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000577961 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:18:721588:775266:-1 gene:ENSG00000176105 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000584307 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:721588:812546:-1 gene:ENSG00000176105 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// BC031080 // GenBank HTC // Homo sapiens v-yes-1 Yamaguchi sarcoma viral oncogene homolog 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5296819), with apparent retained intron. // chr18 // 85 // 87 // 17 // 20 // 0 /// BC048960 // GenBank // Homo sapiens v-yes-1 Yamaguchi sarcoma viral oncogene homolog 1, mRNA (cDNA clone MGC:57116 IMAGE:5260751), complete cds. // chr18 // 90 // 87 // 18 // 20 // 0 /// M15990 // GenBank // Human c-yes-1 mRNA. // chr18 // 88 // 70 // 14 // 16 // 0 /// GENSCAN00000037582 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:724424:813073:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0
ENST00000383960 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:797989:798135:-1 gene:ENSG00000206687 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000362327 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:1323794:1324085:-1 gene:ENSG00000199197 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr18 // 84 // 96 // 21 // 25 // 0 /// NONHSAT056900 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 84 // 96 // 21 // 25 // 0
ENST00000364005 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:2649761:2649867:-1 gene:ENSG00000200875 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT056935 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_014646 // RefSeq // Homo sapiens lipin 2 (LPIN2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_005258177 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens lipin 2 (LPIN2), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// XM_005258178 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens lipin 2 (LPIN2), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000261596 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:2916994:3011947:-1 gene:ENSG00000101577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC152448 // GenBank // Homo sapiens lipin 2, mRNA (cDNA clone MGC:176700 IMAGE:8862579), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000023128 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:2914284:2970565:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0
ENST00000516449 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:18:3025434:3025566:-1 gene:ENSG00000252258 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr18 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT056967 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_003803 // RefSeq // Homo sapiens myomesin 1 (MYOM1), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// NM_019856 // RefSeq // Homo sapiens myomesin 1 (MYOM1), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000261606 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:3066953:3219849:-1 gene:ENSG00000101605 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 89 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000356443 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:3066807:3220108:-1 gene:ENSG00000101605 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENST00000400569 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:18:3066808:3193954:-1 gene:ENSG00000101605 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 97 // 83 // 37 // 38 // 0 /// AK302444 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56518 complete cds, highly similar to Myomesin-1. // chr18 // 100 // 26 // 12 // 12 // 0 /// BC116183 // GenBank // Homo sapiens myomesin 1, 185kDa, mRNA (cDNA clone MGC:134946 IMAGE:40073728), complete cds. // chr18 // 98 // 89 // 40 // 41 // 0 /// GENSCAN00000040704 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:3044940:3248057:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0
ENST00000462264 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:3571215:3571511:-1 gene:ENSG00000241223 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr18 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT056999 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr18 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NONHSAT057000 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000384548 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:3894699:3894805:-1 gene:ENSG00000207278 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT057020 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NR_026849 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 526 (LINC00526), long non-coding RNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000581067 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:5236724:5238598:-1 gene:ENSG00000264575 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK292743 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75132 complete cds. // chr18 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1 /// NONHSAT057059 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONHSAT057060 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_173464 // RefSeq // Homo sapiens l(3)mbt-like 4 (Drosophila) (L3MBTL4), mRNA. // chr18 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000284898 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:18:5956220:6311625:-1 gene:ENSG00000154655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000317931 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:18:5954706:6414911:-1 gene:ENSG00000154655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000400104 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:6029387:6414911:-1 gene:ENSG00000154655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000400105 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:5954706:6367683:-1 gene:ENSG00000154655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000583054 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:6239799:6326721:-1 gene:ENSG00000154655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000583809 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:18:6243386:6414798:-1 gene:ENSG00000154655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// AK093255 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ35936 fis, clone TESTI2011448, weakly similar to Human l(3)mbt protein homolog mRNA. // chr18 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC039316 // GenBank // Homo sapiens l(3)mbt-like 4 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:39812 IMAGE:5298402), complete cds. // chr18 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000020613 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:6205842:6285227:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
ENST00000363767 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:6017723:6017839:-1 gene:ENSG00000200637 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT057104 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000516088 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:6936912:6937020:-1 gene:ENSG00000251897 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT057147 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000391324 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:18:7301020:7301153:-1 gene:ENSG00000212626 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT057156 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000516510 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:18:8720034:8720132:-1 gene:ENSG00000252319 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT057184 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000364013 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:18:9249649:9249746:-1 gene:ENSG00000200883 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT057212 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000516185 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:9518119:9518260:-1 gene:ENSG00000251994 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT057224 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000391270 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:9617964:9618072:-1 gene:ENSG00000212572 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT057232 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000491550 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:9830330:9830627:-1 gene:ENSG00000242651 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr18 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT057238 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr18 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
ENST00000516871 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:9844717:9844846:-1 gene:ENSG00000252680 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr18 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT057239 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NONHSAT057263 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_022068 // RefSeq // Homo sapiens piezo-type mechanosensitive ion channel component 2 (PIEZO2), mRNA. // chr18 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000302079 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:18:10670241:11148588:-1 gene:ENSG00000154864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000383408 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:18:10670248:11148762:-1 gene:ENSG00000154864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000503781 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:18:10671527:11148588:-1 gene:ENSG00000154864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000579112 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:18:10797497:10855436:-1 gene:ENSG00000154864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 40 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000580640 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:18:10671527:11148588:-1 gene:ENSG00000154864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000582913 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:10671527:11148588:-1 gene:ENSG00000154864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr18 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// AK092226 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ34907 fis, clone NT2RI2003392. // chr18 // 95 // 100 // 19 // 20 // 0 /// JN790819 // GenBank // Homo sapiens PIEZO2 (PIEZO2) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000008007 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:10727319:10809093:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 50 // 50 // 10 // 20 // 1
ENST00000362832 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:12304091:12304194:-1 gene:ENSG00000199702 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT058363 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_006796 // RefSeq // Homo sapiens AFG3-like AAA ATPase 2 (AFG3L2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000269143 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:12328944:12377314:-1 gene:ENSG00000141385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC065016 // GenBank // Homo sapiens AFG3 ATPase family gene 3-like 2 (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:70766 IMAGE:6169804), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000017058 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:12327680:12377082:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0
NONHSAT058378 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000494228 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:13715102:13715368:-1 gene:ENSG00000242707 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr18 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT058461 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr18 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_000529 // RefSeq // Homo sapiens melanocortin 2 receptor (adrenocorticotropic hormone) (MC2R), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_001291911 // RefSeq // Homo sapiens melanocortin 2 receptor (adrenocorticotropic hormone) (MC2R), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000327606 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:13882044:13915540:-1 gene:ENSG00000185231 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000399821 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:13885149:13915707:-1 gene:ENSG00000185231 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 94 // 57 // 15 // 16 // 0 /// AK289381 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77879 complete cds, highly similar to H.sapiens ACTH-R gene for adrenocorticotropic hormone receptor. // chr18 // 96 // 82 // 22 // 23 // 0 /// BC069074 // GenBank // Homo sapiens melanocortin 2 receptor (adrenocorticotropic hormone), mRNA (cDNA clone MGC:95349 IMAGE:7216888), complete cds. // chr18 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// BC094710 // GenBank // Homo sapiens melanocortin 2 receptor (adrenocorticotropic hormone), mRNA (cDNA clone MGC:104423 IMAGE:30330087), complete cds. // chr18 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC104169 // GenBank // Homo sapiens melanocortin 2 receptor (adrenocorticotropic hormone), mRNA (cDNA clone MGC:125798 IMAGE:40030365), complete cds. // chr18 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000000125 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:13832091:13885518:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0
ENST00000494882 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:13919603:13919923:-1 gene:ENSG00000243779 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr18 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000048305 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:13892100:13919923:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT058469 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_145287 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 519 (ZNF519), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000588435 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:18:14105994:14132457:-1 gene:ENSG00000175322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr18 // 100 // 39 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000590202 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:14104721:14132430:-1 gene:ENSG00000175322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC024227 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 519, mRNA (cDNA clone MGC:27166 IMAGE:4806717), complete cds. // chr18 // 87 // 100 // 20 // 23 // 0 /// GENSCAN00000048313 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:14089814:14172409:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 74 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT058481 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr18 // 100 // 70 // 16 // 16 // 0 /// NONHSAT058483 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr18 // 100 // 39 // 9 // 9 // 0
ENST00000583350 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:14377546:14378757:-1 gene:ENSG00000187589 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr18 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000048311 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:14377546:14378763:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NR_027246 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 314 (LINC00314), long non-coding RNA. // chr18 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000324988 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:28013363:28023233:1 gene:ENSG00000178457 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr18 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// AF427489 // GenBank // Homo sapiens C21orf94 protein (C21orf94) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT081586 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// TCONS_00028741-XLOC_013899 // Rinn lincRNA // linc-USP16-6 chr21:+:29385681-29395528 // chr18 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
ENST00000410155 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:15320840:15320944:-1 gene:ENSG00000222087 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr18 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONHSAT058559 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000000434 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:13036821:13085571:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 62 // 100 // 8 // 13 // 0
NM_005406 // RefSeq // Homo sapiens Rho-associated, coiled-coil containing protein kinase 1 (ROCK1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000399799 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:20946906:21111851:-1 gene:ENSG00000067900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC113114 // GenBank // Homo sapiens Rho-associated, coiled-coil containing protein kinase 1, mRNA (cDNA clone MGC:131603 IMAGE:7961989), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// U43195 // GenBank // Human Rho-associated, coiled-coil containing protein kinase p160ROCK mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000035091 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:20953578:21183519:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0
ENST00000516077 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:21120404:21120506:-1 gene:ENSG00000251886 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT058567 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_052911 // RefSeq // Homo sapiens establishment of sister chromatid cohesion N-acetyltransferase 1 (ESCO1), mRNA. // chr18 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000269214 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:21529281:21600736:-1 gene:ENSG00000141446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000383276 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:21529303:21600884:-1 gene:ENSG00000141446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr18 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// BC036943 // GenBank // Homo sapiens establishment of cohesion 1 homolog 1 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone IMAGE:5397819), complete cds. // chr18 // 100 // 43 // 16 // 16 // 0 /// BC089426 // GenBank // Homo sapiens establishment of cohesion 1 homolog 1 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:105022 IMAGE:3090307), complete cds. // chr18 // 100 // 78 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000622333 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:18:21529310:21560981:-1 gene:ENSG00000141446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 43 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000035092 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:21530343:21574840:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 70 // 26 // 26 // 0
NR_029675 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 133a-1 (MIR133A1), microRNA. // chr18 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NR_110369 // RefSeq // Homo sapiens MIR133A1 host gene (non-protein coding) (MIR133A1HG), long non-coding RNA. // chr18 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000385052 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:21825698:21825785:-1 gene:ENSG00000276792 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA gene:ENSG00000265142 // chr18 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000581072 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:21825487:21831406:-1 gene:ENSG00000265142 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr18 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BX648566 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp779F0655 (from clone DKFZp779F0655). // chr18 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// hsa-mir-133a-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0000450 Homo sapiens miR-133a-1 stem-loop // chr18 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT058587 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr18 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT058588 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NR_029662 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 1-2 (MIR1-2), microRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_110369 // RefSeq // Homo sapiens MIR133A1 host gene (non-protein coding) (MIR133A1HG), long non-coding RNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000384961 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:21828996:21829106:-1 gene:ENSG00000278753 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA gene:ENSG00000265142 // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000581072 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:21825487:21831406:-1 gene:ENSG00000265142 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BX648566 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp779F0655 (from clone DKFZp779F0655). // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-1-2 // miRBase Micro RNA Database // MI0000437 Homo sapiens miR-1-2 stem-loop // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT058587 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT058589 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000410588 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:21928985:21929094:-1 gene:ENSG00000222520 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr18 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONHSAT058598 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
ENST00000408436 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:22130603:22130729:-1 gene:ENSG00000221363 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT058604 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000364982 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:22180112:22180218:-1 gene:ENSG00000201852 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr18 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT058613 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_172241 // RefSeq // Homo sapiens cutaneous T-cell lymphoma-associated antigen 1 (CTAGE1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000391403 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:22413603:22417915:-1 gene:ENSG00000212710 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000525417 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:22413601:22414867:-1 gene:ENSG00000212710 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// AF177229 // GenBank // Homo sapiens CTAGE-1 protein (CTAGE-1) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// AF273058 // GenBank // Homo sapiens CTAGE-2 mRNA, complete cds. // chr18 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// BC132871 // GenBank // Homo sapiens cutaneous T-cell lymphoma-associated antigen 1, mRNA (cDNA clone MGC:164502 IMAGE:40146893), complete cds. // chr18 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032067 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:22415574:22419278:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0
NM_000271 // RefSeq // Homo sapiens Niemann-Pick disease, type C1 (NPC1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_005258277 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens Niemann-Pick disease, type C1 (NPC1), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// XM_006722479 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens Niemann-Pick disease, type C1 (NPC1), transcript variant X4, mRNA. // chr18 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000269228 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:23531437:23586898:-1 gene:ENSG00000141458 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000540608 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:23539730:23586487:-1 gene:ENSG00000141458 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr18 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000591051 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:18:23531946:23560342:-1 gene:ENSG00000141458 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// AF002020 // GenBank // Homo sapiens Niemann-Pick C disease protein (NPC1) mRNA, complete cds. // chr18 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// AK293779 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51802 complete cds, highly similar to Niemann-Pick C1 protein precursor. // chr18 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// AK295715 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57114 complete cds, highly similar to Niemann-Pick C1 protein precursor. // chr18 // 89 // 61 // 17 // 19 // 0 /// BC063302 // GenBank // Homo sapiens Niemann-Pick disease, type C1, mRNA (cDNA clone MGC:71703 IMAGE:30340517), complete cds. // chr18 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000014622 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:23532035:23586343:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0
ENST00000362496 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:18:23582016:23582121:-1 gene:ENSG00000199366 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT058672 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_173505 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat domain 29 (ANKRD29), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000322980 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:23600460:23662815:-1 gene:ENSG00000154065 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000586087 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:18:23629852:23662883:-1 gene:ENSG00000154065 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000587763 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:23601046:23629920:-1 gene:ENSG00000154065 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr18 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000591280 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:23600010:23647997:-1 gene:ENSG00000154065 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000592179 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:23598926:23662885:-1 gene:ENSG00000154065 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK123197 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ41203 fis, clone BRACE3000071. // chr18 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// BC030622 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat domain 29, mRNA (cDNA clone MGC:33520 IMAGE:4818619), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONHSAT058674 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr18 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000014639 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:23601226:23662477:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
ENST00000384136 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:24124170:24124285:-1 gene:ENSG00000206863 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT058689 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000363004 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:24170505:24170623:-1 gene:ENSG00000199874 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr18 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT058691 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000617573 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:18:24179038:24179295:-1 gene:ENSG00000273524 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr18 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENST00000427605 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:25016434:25017204:-1 gene:ENSG00000229248 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000006423 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:25016434:25047548:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000486780 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:25818234:25818532:-1 gene:ENSG00000242216 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT058730 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONHSAT058745 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000384431 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:26366301:26366406:-1 gene:ENSG00000207160 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr18 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT058747 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NR_024259 // RefSeq // Homo sapiens prostate cancer associated transcript 18 (non-protein coding) (PCAT18), long non-coding RNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000391065 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:18:26689316:26689529:-1 gene:ENSG00000275900 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA gene:ENSG00000265369 // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000579458 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:26687621:26703638:-1 gene:ENSG00000265369 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT058756 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT058758 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001792 // RefSeq // Homo sapiens cadherin 2, type 1, N-cadherin (neuronal) (CDH2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENST00000269141 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:27950966:28177446:-1 gene:ENSG00000170558 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENST00000399380 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:18:27951081:28036585:-1 gene:ENSG00000170558 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 86 // 37 // 37 // 0 /// AK302831 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53252 complete cds, highly similar to Cadherin-2 precursor. // chr18 // 100 // 79 // 34 // 34 // 0 /// BC036470 // GenBank // Homo sapiens cadherin 2, type 1, N-cadherin (neuronal), mRNA (cDNA clone MGC:41765 IMAGE:5264944), complete cds. // chr18 // 95 // 98 // 40 // 42 // 0 /// M34064 // GenBank // Human N-cadherin mRNA, complete cds. // chr18 // 97 // 84 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000048439 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:27952153:28039359:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 74 // 32 // 32 // 0
NM_001941 // RefSeq // Homo sapiens desmocollin 3 (DSC3), transcript variant Dsc3a, mRNA. // chr18 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// NM_024423 // RefSeq // Homo sapiens desmocollin 3 (DSC3), transcript variant Dsc3b, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000360428 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:30990008:31042741:-1 gene:ENSG00000134762 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000434452 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:18:30990086:31042815:-1 gene:ENSG00000134762 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK291748 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78674 complete cds, highly similar to Homo sapiens mRNA for desmocollin type 4. // chr18 // 95 // 79 // 18 // 19 // 0 /// D17427 // GenBank // Homo sapiens mRNA for desmocollin type 4, complete cds. // chr18 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000034971 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:30923906:31036554:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 94 // 67 // 15 // 16 // 0
NM_004949 // RefSeq // Homo sapiens desmocollin 2 (DSC2), transcript variant Dsc2b, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_024422 // RefSeq // Homo sapiens desmocollin 2 (DSC2), transcript variant Dsc2a, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000251081 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:31065974:31102004:-1 gene:ENSG00000134755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000280904 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:31058840:31102415:-1 gene:ENSG00000134755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK290313 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76245 complete cds, highly similar to Homo sapiens desmocollin 2 (DSC2), transcript variant Dsc2a, mRNA. // chr18 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AK297029 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55716 complete cds, highly similar to Desmocollin-2 precursor. // chr18 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// BC063291 // GenBank // Homo sapiens desmocollin 2, mRNA (cDNA clone MGC:71614 IMAGE:30337780), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// CR749226 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686I11137 (from clone DKFZp686I11137). // chr18 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// EF017811 // GenBank // Homo sapiens desmocollin 2 precursor (DSC2) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// EF017812 // GenBank // Homo sapiens desmocollin 2 precursor (DSC2) mRNA, complete cds. // chr18 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000034977 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:31068015:31101971:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0
NM_004948 // RefSeq // Homo sapiens desmocollin 1 (DSC1), transcript variant Dsc1b, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NM_024421 // RefSeq // Homo sapiens desmocollin 1 (DSC1), transcript variant Dsc1a, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000257197 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:31129236:31162856:-1 gene:ENSG00000134765 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000257198 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:31129236:31162856:-1 gene:ENSG00000134765 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// X72925 // GenBank // Homo sapiens mRNA for desmocollin type 1. // chr18 // 97 // 100 // 37 // 38 // 0 /// GENSCAN00000034970 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:31130514:31256430:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0
ENST00000384292 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:31345362:31345467:-1 gene:ENSG00000207019 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT058816 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONHSAT058828 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0
NM_001034172 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 25, member 52 (SLC25A52), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000269205 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:31759562:31760880:-1 gene:ENSG00000141437 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AK302337 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59637 complete cds, highly similar to Mitochondrial carrier triple repeat 1. // chr18 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC103999 // GenBank // Homo sapiens mitochondrial carrier triple repeat 2, mRNA (cDNA clone MGC:120230 IMAGE:40023323), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC104000 // GenBank // Homo sapiens mitochondrial carrier triple repeat 2, mRNA (cDNA clone MGC:120231 IMAGE:40023324), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC104001 // GenBank // Homo sapiens mitochondrial carrier triple repeat 2, mRNA (cDNA clone MGC:120232 IMAGE:40023325), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000005806 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:31759768:31760661:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 80 // 68 // 12 // 15 // 0
NM_014939 // RefSeq // Homo sapiens trafficking protein particle complex 8 (TRAPPC8), mRNA. // chr18 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// XM_006722420 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens trafficking protein particle complex 8 (TRAPPC8), transcript variant X4, mRNA. // chr18 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000283351 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:31829173:31943100:-1 gene:ENSG00000153339 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000582513 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:18:31873570:31943106:-1 gene:ENSG00000153339 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 46 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000582539 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:18:31830590:31943026:-1 gene:ENSG00000153339 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// BC059380 // GenBank // Homo sapiens KIAA1012, mRNA (cDNA clone IMAGE:30347572), complete cds. // chr18 // 94 // 46 // 16 // 17 // 0 /// BC127109 // GenBank // Homo sapiens KIAA1012, mRNA (cDNA clone MGC:150696 IMAGE:40124744), complete cds. // chr18 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// BC127110 // GenBank // Homo sapiens KIAA1012, mRNA (cDNA clone MGC:150697 IMAGE:40124745), complete cds. // chr18 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000580104 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:31829938:31943136:-1 gene:ENSG00000153339 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr18 // 86 // 86 // 32 // 37 // 1 /// GENSCAN00000005813 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:31830755:31942764:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 73 // 27 // 27 // 0
ENST00000410463 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:18:32263135:32263234:-1 gene:ENSG00000222395 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr18 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT058860 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001242409 // RefSeq // Homo sapiens GRB2 associated, regulator of MAPK1 (GAREM), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NM_022751 // RefSeq // Homo sapiens GRB2 associated, regulator of MAPK1 (GAREM), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000269209 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:32267500:32470432:-1 gene:ENSG00000141441 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000399218 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:32263522:32470484:-1 gene:ENSG00000141441 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AK297430 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57055 complete cds. // chr18 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// BC121067 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 59, member A, mRNA (cDNA clone MGC:149810 IMAGE:40118682), complete cds. // chr18 // 96 // 73 // 23 // 24 // 0 /// BC121068 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 59, member A, mRNA (cDNA clone MGC:149811 IMAGE:40118683), complete cds. // chr18 // 96 // 85 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000005819 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:32267871:32321060:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0
NM_020805 // RefSeq // Homo sapiens kelch-like family member 14 (KLHL14), mRNA. // chr18 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000358095 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:32733687:32772879:-1 gene:ENSG00000197705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 43 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000359358 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:32672671:32773062:-1 gene:ENSG00000197705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000583263 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:18:32769991:32772167:-1 gene:ENSG00000197705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 26 // 9 // 9 // 0 /// AK294996 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54416 complete cds, highly similar to Kelch-like protein 14. // chr18 // 95 // 60 // 20 // 21 // 0 /// BC021267 // GenBank // Homo sapiens kelch-like 14 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:29780 IMAGE:4588702), complete cds. // chr18 // 93 // 43 // 14 // 15 // 0 /// GENSCAN00000005808 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:32526779:32697031:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 34 // 34 // 12 // 35 // 1 /// GENSCAN00000028708 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:32767619:32878386:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1
ENST00000362334 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:18:34001698:34001799:-1 gene:ENSG00000199204 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT058883 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NR_029616 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 187 (MIR187), microRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000385062 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:35904818:35904926:-1 gene:ENSG00000207797 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-187 // miRBase Micro RNA Database // MI0000274 Homo sapiens miR-187 stem-loop // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT058946 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000410772 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:39016047:39016344:-1 gene:ENSG00000222704 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT059008 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000391052 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:39678520:39678622:-1 gene:ENSG00000212354 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr18 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONHSAT059032 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_001272077 // RefSeq // Homo sapiens Ras-like without CAAX 2 (RIT2), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NM_002930 // RefSeq // Homo sapiens Ras-like without CAAX 2 (RIT2), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000326695 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:42743227:43115691:-1 gene:ENSG00000152214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000589109 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:42743227:43115691:-1 gene:ENSG00000152214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000590910 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:18:42743469:43115649:-1 gene:ENSG00000152214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 94 // 63 // 16 // 17 // 0 /// AF493922 // GenBank // Homo sapiens Ras family small GTP binding protein RIN (RIN) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// AY563951 // GenBank // Homo sapiens Ras family small GTP binding protein RIN mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// BC018060 // GenBank // Homo sapiens Ras-like without CAAX 2, mRNA (cDNA clone MGC:26503 IMAGE:4816017), complete cds. // chr18 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// U71204 // GenBank // Human rin mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// U78164 // GenBank // Human Ras-like small GTPase RIBA mRNA, complete cds. // chr18 // 95 // 74 // 19 // 20 // 0 /// U78166 // GenBank // Human Ras-like small GTPase RIBA mRNA, alternatively spliced, complete cds. // chr18 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000026482 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:42743493:43033865:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
ENST00000365380 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:43832159:43832265:-1 gene:ENSG00000202250 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT059079 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_024430 // RefSeq // Homo sapiens proline-serine-threonine phosphatase interacting protein 2 (PSTPIP2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000409746 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:45983536:46072260:-1 gene:ENSG00000152229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000589328 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:45983536:46072257:-1 gene:ENSG00000152229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC035395 // GenBank // Homo sapiens proline-serine-threonine phosphatase interacting protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:34175 IMAGE:4524856), complete cds. // chr18 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000587042 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:46010760:46072272:-1 gene:ENSG00000152229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// ENST00000588801 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:45984233:46040287:-1 gene:ENSG00000152229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr18 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1 /// GENSCAN00000002749 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:45988710:45999543:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// BC008216 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA similar to proline-serine-threonine phosphatase-interacting protein 2 (cDNA clone IMAGE:3871158). // chr18 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
ENST00000410247 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:45989653:45989945:-1 gene:ENSG00000222179 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT059121 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000516225 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:18:46077004:46077099:-1 gene:ENSG00000252034 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr18 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONHSAT059123 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
ENST00000516130 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:46121615:46121721:-1 gene:ENSG00000251939 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT059128 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_016427 // RefSeq // Homo sapiens transcription elongation factor B polypeptide 3B (elongin A2) (TCEB3B), mRNA. // chr18 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000332567 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:47032572:47035621:-1 gene:ENSG00000206181 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// AB030834 // GenBank // Homo sapiens mRNA for transcription factor Elongin A2, complete cds. // chr18 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// BC036022 // GenBank // Homo sapiens transcription elongation factor B polypeptide 3B (elongin A2), mRNA (cDNA clone MGC:33026 IMAGE:5270406), complete cds. // chr18 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// BC103911 // GenBank // Homo sapiens transcription elongation factor B polypeptide 3B (elongin A2), mRNA (cDNA clone MGC:119351 IMAGE:40006025), complete cds. // chr18 // 100 // 67 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000620522 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:18:47033003:47035264:-1 gene:ENSG00000206181 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 48 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000026191 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:47033003:47035264:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 67 // 14 // 14 // 0
NM_016097 // RefSeq // Homo sapiens immediate early response 3 interacting protein 1 (IER3IP1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000256433 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:47152998:47176374:-1 gene:ENSG00000134049 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AF371963 // GenBank // Homo sapiens immediate early response 3 interacting protein 1 (IER3IP1) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// BC010888 // GenBank // Homo sapiens immediate early response 3 interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:13332 IMAGE:4285974), complete cds. // chr18 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// BC017391 // GenBank // Homo sapiens immediate early response 3 interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:23769 IMAGE:4133818), complete cds. // chr18 // 100 // 73 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000588705 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:47134656:47176281:-1 gene:ENSG00000267228 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr18 // 41 // 41 // 9 // 22 // 1
NM_001037802 // RefSeq // Homo sapiens SKI family transcriptional corepressor 2 (SKOR2), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001278063 // RefSeq // Homo sapiens SKI family transcriptional corepressor 2 (SKOR2), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000400404 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:47231123:47249183:-1 gene:ENSG00000215474 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000425639 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:18:47219922:47249183:-1 gene:ENSG00000215474 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY669508 // GenBank // Homo sapiens functional smad suppressing element 18 (FUSSEL18) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000620245 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:18:47212089:47249183:-1 gene:ENSG00000215474 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026188 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:47246508:47249183:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
ENST00000364955 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:47234442:47234548:-1 gene:ENSG00000201825 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT059157 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001003652 // RefSeq // Homo sapiens SMAD family member 2 (SMAD2), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NM_001135937 // RefSeq // Homo sapiens SMAD family member 2 (SMAD2), transcript variant 3, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NM_005901 // RefSeq // Homo sapiens SMAD family member 2 (SMAD2), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000262160 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:47808957:47930559:-1 gene:ENSG00000175387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000356825 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:18:47833096:47931146:-1 gene:ENSG00000175387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000402690 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:47831551:47931141:-1 gene:ENSG00000175387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AY134745 // GenBank // Homo sapiens medulloblastoma antigen MU-MB-50.13 mRNA, complete cds. // chr18 // 89 // 95 // 17 // 19 // 0
ENST00000384217 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:48169784:48169890:-1 gene:ENSG00000206944 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr18 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// NONHSAT059187 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0
ENST00000364002 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:48475487:48475600:-1 gene:ENSG00000200872 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT059189 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_002571 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 58A (SNORD58A), small nucleolar RNA. // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000383875 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:49491283:49491347:-1 gene:ENSG00000206602 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000578966 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:49491050:49492485:-1 gene:ENSG00000265681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000579495 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:49490864:49492450:-1 gene:ENSG00000265681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000581305 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:49491263:49492479:-1 gene:ENSG00000265681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000582782 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:49490965:49492485:-1 gene:ENSG00000265681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT059234 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT059235 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT059236 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT059237 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT059238 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_006111 // RefSeq // Homo sapiens acetyl-CoA acyltransferase 2 (ACAA2), mRNA. // chr18 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000285093 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:49782167:49813960:-1 gene:ENSG00000167315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000586100 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:18:49795811:49813953:-1 gene:ENSG00000167315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 56 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000589432 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:18:49783503:49813042:-1 gene:ENSG00000167315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 56 // 10 // 10 // 0 /// BC001918 // GenBank // Homo sapiens acetyl-Coenzyme A acyltransferase 2, mRNA (cDNA clone MGC:3562 IMAGE:2820744), complete cds. // chr18 // 100 // 56 // 10 // 10 // 0 /// D16294 // GenBank // Homo sapiens mRNA for mitochondrial 3-oxoacyl-CoA thiolase, complete cds. // chr18 // 100 // 56 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000587994 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:18:49783505:49813953:-1 gene:ENSG00000167315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 67 // 67 // 12 // 18 // 1 /// ENST00000586485 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:18:49794320:49813937:-1 gene:ENSG00000167315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 44 // 44 // 8 // 18 // 1
NM_001080467 // RefSeq // Homo sapiens myosin VB (MYO5B), mRNA. // chr18 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000285039 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:49822813:50195093:-1 gene:ENSG00000167306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000324581 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:18:49826260:49902833:-1 gene:ENSG00000167306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 48 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000592688 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:18:49826290:49849846:-1 gene:ENSG00000167306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 21 // 9 // 9 // 0 /// AB290160 // GenBank // Homo sapiens mRNA for MYO5B/KIAA1119 variant protein, complete cds. // chr18 // 98 // 98 // 40 // 41 // 0 /// AK093149 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ35830 fis, clone TESTI2006465, highly similar to Myosin-5B. // chr18 // 94 // 43 // 17 // 18 // 0 /// AK301976 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58435 complete cds, highly similar to Myosin-5B. // chr18 // 100 // 29 // 12 // 12 // 0 /// AY274809 // GenBank // Homo sapiens myosin 5B (MYO5B) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 43 // 18 // 18 // 0 /// BC033527 // GenBank // Homo sapiens myosin VB, mRNA (cDNA clone IMAGE:5162990), complete cds. // chr18 // 100 // 21 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000616031 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:18:49826259:50097618:-1 gene:ENSG00000167306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 43 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000041397 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:49826471:50154011:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0
ENST00000364798 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:18:49871555:49871666:-1 gene:ENSG00000201668 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT059255 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000363657 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:49946266:49946389:-1 gene:ENSG00000200527 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr18 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT059257 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENST00000465317 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:50206998:50207278:-1 gene:ENSG00000240663 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr18 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT059264 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_145020 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 11 (CCDC11), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006722419 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens coiled-coil domain containing 11 (CCDC11), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000398545 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:50227193:50266522:-1 gene:ENSG00000172361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK302114 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55396 complete cds, highly similar to Homo sapiens coiled-coil domain containing 11 (CCDC11), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC030606 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 11, mRNA (cDNA clone MGC:26909 IMAGE:4831081), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000041388 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:50213589:50288099:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
ENST00000363882 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:18:50959267:50959379:-1 gene:ENSG00000200752 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT059287 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONHSAT059300 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_016626 // RefSeq // Homo sapiens mex-3 RNA binding family member C (MEX3C), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000406189 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:51174550:51197320:-1 gene:ENSG00000176624 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000591040 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:51176821:51218304:-1 gene:ENSG00000176624 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr18 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// AY950679 // GenBank // Homo sapiens MEX3C mRNA, complete cds. // chr18 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// ENST00000616921 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:18:51174552:51197320:-1 gene:ENSG00000176624 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000040872 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:51176351:51197320:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// KC456343 // GenBank // Homo sapiens cell-line HEK293 MEX3C variant 1 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr18 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// KC456344 // GenBank // Homo sapiens cell-line HEK293 MEX3C variant 2 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr18 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0
ENST00000384425 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:51283733:51283896:-1 gene:ENSG00000207154 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT059304 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_003927 // RefSeq // Homo sapiens methyl-CpG binding domain protein 2 (MBD2), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NM_015832 // RefSeq // Homo sapiens methyl-CpG binding domain protein 2 (MBD2), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000256429 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:54151601:54224788:-1 gene:ENSG00000134046 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000398398 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:18:54202680:54224647:-1 gene:ENSG00000134046 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000578272 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:54159758:54205021:-1 gene:ENSG00000134046 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr18 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000583046 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:54202681:54224617:-1 gene:ENSG00000134046 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// AF072242 // GenBank // Homo sapiens methyl-CpG binding protein MBD2 (MBD2) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC032638 // GenBank // Homo sapiens methyl-CpG binding domain protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:45085 IMAGE:5496721), complete cds. // chr18 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000028179 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:54159777:54224559:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0
NR_002970 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 37 (SNORA37), small nucleolar RNA. // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000384504 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:54222284:54222412:-1 gene:ENSG00000207233 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT059339 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0
NM_139171 // RefSeq // Homo sapiens StAR-related lipid transfer (START) domain containing 6 (STARD6), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000307844 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:18:54324692:54354573:-1 gene:ENSG00000174448 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000581310 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:54324358:54357964:-1 gene:ENSG00000174448 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF480305 // GenBank // Homo sapiens START domain-containing 6 protein (STARD6) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000577499 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:18:54353927:54357848:-1 gene:ENSG00000174448 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// ENST00000584040 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:18:54354055:54357860:-1 gene:ENSG00000174448 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001143829 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 68 (CCDC68), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NM_025214 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 68 (CCDC68), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000337363 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:54904081:54958048:-1 gene:ENSG00000166510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000432185 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:18:54901511:54942950:-1 gene:ENSG00000166510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000591504 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:54901509:54959508:-1 gene:ENSG00000166510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000592040 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:54903320:54936905:-1 gene:ENSG00000166510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 94 // 53 // 16 // 17 // 0 /// AF273051 // GenBank // Homo sapiens CTCL tumor antigen se57-1 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK058097 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ25368 fis, clone TST01809. // chr18 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC029508 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 68, mRNA (cDNA clone MGC:33688 IMAGE:5297655), complete cds. // chr18 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000587148 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:54937602:54959461:-1 gene:ENSG00000166510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// GENSCAN00000020147 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:54891725:54942791:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0
ENST00000364946 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:18:56079394:56079594:-1 gene:ENSG00000201816 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT059401 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000384138 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:18:56753226:56753326:-1 gene:ENSG00000206865 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr18 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT059427 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_005603 // RefSeq // Homo sapiens ATPase, aminophospholipid transporter, class I, type 8B, member 1 (ATP8B1), mRNA. // chr18 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// XM_006722482 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ATPase, aminophospholipid transporter, class I, type 8B, member 1 (ATP8B1), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000283684 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:57646426:57731807:-1 gene:ENSG00000081923 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000536015 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:18:57646429:57803095:-1 gene:ENSG00000081923 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF038007 // GenBank // Homo sapiens FIC1 mRNA, complete cds. // chr18 // 97 // 97 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000016081 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:57648488:57731807:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0
ENST00000589286 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:58018794:58019061:-1 gene:ENSG00000235028 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr18 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000016082 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:58018789:58119975:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT059471 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT059472 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_052947 // RefSeq // Homo sapiens alpha-kinase 2 (ALPK2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000361673 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:58481247:58628957:-1 gene:ENSG00000198796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AL832018 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp451G074 (from clone DKFZp451G074); complete cds. // chr18 // 94 // 61 // 16 // 17 // 0 /// AY044450 // GenBank // Homo sapiens heart alpha-kinase (HAK) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// BX647796 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686G2187 (from clone DKFZp686G2187). // chr18 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENST00000590662 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:58577944:58580169:-1 gene:ENSG00000198796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// AK125243 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ43253 fis, clone HEART2007031. // chr18 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// GENSCAN00000016061 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:58503839:58538224:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000039329 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:58561252:58612821:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0
ENST00000362843 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:18:58818883:58819016:-1 gene:ENSG00000199713 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr18 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONHSAT059533 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
ENST00000516061 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:58926197:58926296:-1 gene:ENSG00000251870 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr18 // 67 // 75 // 4 // 6 // 0 /// NONHSAT059539 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 67 // 75 // 4 // 6 // 0
NM_013435 // RefSeq // Homo sapiens retina and anterior neural fold homeobox (RAX), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000334889 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:59267035:59273393:-1 gene:ENSG00000134438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF115392 // GenBank // Homo sapiens retinal homeobox protein RX mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC051901 // GenBank // Homo sapiens retina and anterior neural fold homeobox, mRNA (cDNA clone IMAGE:6139916), complete cds. // chr18 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000256852 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:18:59267035:59273385:-1 gene:ENSG00000134438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// AB593018 // GenBank // Homo sapiens RAX mRNA for retinal homeobox protein Rx, complete cds, clone: HP03156-RBb63B05. // chr18 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// GENSCAN00000039333 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:59269004:59384233:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_181654 // RefSeq // Homo sapiens complexin 4 (CPLX4), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000299721 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:59295402:59318649:-1 gene:ENSG00000166569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AB593158 // GenBank // Homo sapiens CPLX4 mRNA for complexin-4, complete cds, clone: HP09189-RBdS132J03. // chr18 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// AY286502 // GenBank // Homo sapiens complexin IV mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// BC106887 // GenBank // Homo sapiens complexin 4, mRNA (cDNA clone MGC:125783 IMAGE:40030305), complete cds. // chr18 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// BC106888 // GenBank // Homo sapiens complexin 4, mRNA (cDNA clone MGC:125784 IMAGE:40030309), complete cds. // chr18 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// BX640655 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686O0683 (from clone DKFZp686O0683); complete cds. // chr18 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000587244 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:18:59275156:59318544:-1 gene:ENSG00000166569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1 /// BC065562 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6144778, partial cds. // chr18 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1 /// GENSCAN00000039333 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:59269004:59384233:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 63 // 63 // 19 // 30 // 1
NM_005570 // RefSeq // Homo sapiens lectin, mannose-binding, 1 (LMAN1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000251047 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:59327823:59359962:-1 gene:ENSG00000074695 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000592562 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:59330776:59331639:-1 gene:ENSG00000074695 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// AK225111 // GenBank // Homo sapiens mRNA for lectin, mannose-binding, 1 precursor variant, clone: CAS11249. // chr18 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// BC032330 // GenBank // Homo sapiens lectin, mannose-binding, 1, mRNA (cDNA clone MGC:40275 IMAGE:5167524), complete cds. // chr18 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// U09716 // GenBank // Human mannose-specific lectin (MR60) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000587561 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:59352681:59359265:-1 gene:ENSG00000074695 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1 /// AK301244 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57897 complete cds, highly similar to ERGIC-53 protein precursor. // chr18 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1 /// NONHSAT059557 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr18 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000039333 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:59269004:59384233:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1
NM_133459 // RefSeq // Homo sapiens collagen and calcium binding EGF domains 1 (CCBE1), mRNA. // chr18 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000439986 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:59430940:59697380:-1 gene:ENSG00000183287 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000589116 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:59435146:59455212:-1 gene:ENSG00000183287 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// BC046645 // GenBank // Homo sapiens collagen and calcium binding EGF domains 1, mRNA (cDNA clone MGC:50861 IMAGE:5766933), complete cds. // chr18 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// AY358347 // GenBank // Homo sapiens clone DNA80840 VPPP1921 (UNQ1921) mRNA, complete cds. // chr18 // 85 // 85 // 28 // 33 // 1 /// ENST00000398179 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:18:59430940:59480240:-1 gene:ENSG00000183287 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// ENST00000589419 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:18:59448046:59666162:-1 gene:ENSG00000183287 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// GENSCAN00000039332 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:59435908:59473794:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1
ENST00000589292 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:60009994:60011143:-1 gene:ENSG00000256704 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr18 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000021746 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:60009926:60011143:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_005912 // RefSeq // Homo sapiens melanocortin 4 receptor (MC4R), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000299766 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:60371110:60372775:-1 gene:ENSG00000166603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC069172 // GenBank // Homo sapiens melanocortin 4 receptor, mRNA (cDNA clone MGC:95419 IMAGE:7216994), complete cds. // chr18 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// BC101802 // GenBank // Homo sapiens melanocortin 4 receptor, mRNA (cDNA clone MGC:126851 IMAGE:8069308), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC111992 // GenBank // Homo sapiens melanocortin 4 receptor, mRNA (cDNA clone MGC:138197 IMAGE:8327460), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000021733 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:60371351:60372349:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0
ENST00000590085 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:60794613:60794916:-1 gene:ENSG00000267513 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr18 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000041237 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:60794608:60794904:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT059594 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT059595 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_173557 // RefSeq // Homo sapiens ring finger protein 152 (RNF152), mRNA. // chr18 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// XM_005266650 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ring finger protein 152 (RNF152), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000312828 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:61808063:61893759:-1 gene:ENSG00000176641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000591306 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:61816122:61894231:-1 gene:ENSG00000176641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// AK096495 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39176 fis, clone OCBBF2003744, weakly similar to ZINC-FINGER PROTEIN HT2A. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK122758 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ16292 fis, clone OCBBF2020825, highly similar to RING finger protein 152. // chr18 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC111956 // GenBank // Homo sapiens ring finger protein 152, mRNA (cDNA clone MGC:138161 IMAGE:8327424), complete cds. // chr18 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000047675 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:61815852:61816463:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
ENST00000481678 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:62650308:62650601:-1 gene:ENSG00000243549 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT059646 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000384019 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:18:62731226:62731332:-1 gene:ENSG00000206746 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr18 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT059647 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
AF130097 // GenBank HTC // Homo sapiens clone FLC0964 PRO2946 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_000633 // RefSeq // Homo sapiens B-cell CLL/lymphoma 2 (BCL2), transcript variant alpha, mRNA. // chr18 // 100 // 78 // 42 // 42 // 0 /// NM_000657 // RefSeq // Homo sapiens B-cell CLL/lymphoma 2 (BCL2), transcript variant beta, mRNA. // chr18 // 95 // 37 // 19 // 20 // 0 /// XM_006722523 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens B-cell CLL/lymphoma 2 (BCL2), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 37 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000333681 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:63127035:63319786:-1 gene:ENSG00000171791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 56 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000398117 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:63123346:63320128:-1 gene:ENSG00000171791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 96 // 52 // 52 // 0 /// ENST00000589955 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:63317902:63318812:-1 gene:ENSG00000171791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 30 // 16 // 16 // 0 /// BC027258 // GenBank // Homo sapiens B-cell CLL/lymphoma 2, mRNA (cDNA clone MGC:21366 IMAGE:4511027), complete cds. // chr18 // 100 // 50 // 27 // 27 // 0 /// EU287875 // GenBank // Homo sapiens B-cell leukemia/lymphoma-2-alpha protein (bcl-2) mRNA, complete cds. // chr18 // 88 // 31 // 15 // 17 // 0 /// M13995 // GenBank // Human B-cell leukemia/lymphoma 2 (bcl-2) proto-oncogene mRNA encoding bcl-2-beta protein, complete cds. // chr18 // 81 // 30 // 13 // 16 // 0 /// M13994 // GenBank // Human B-cell leukemia/lymphoma 2 (bcl-2) proto-oncogene mRNA encoding bcl-2-alpha protein, complete cds. // chr18 // 71 // 76 // 29 // 41 // 0 /// GENSCAN00000011580 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:63283770:63318666:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 24 // 24 // 13 // 54 // 1
NM_002974 // RefSeq // Homo sapiens serpin peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 4 (SERPINB4), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000341074 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:63637259:63644298:-1 gene:ENSG00000206073 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000413673 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:18:63637718:63643582:-1 gene:ENSG00000206073 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 53 // 8 // 8 // 0 /// AB046400 // GenBank // Homo sapiens mRNA for SCCA2b, complete cds. // chr18 // 100 // 53 // 8 // 8 // 0 /// AF461147 // GenBank // Homo sapiens SCCA2/SCCA1 fusion protein isoform 2 mRNA, complete cds. // chr18 // 90 // 67 // 9 // 10 // 0 /// AK292212 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75229 complete cds, highly similar to Homo sapiens serpin peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 4 (SERPINB4), mRNA. // chr18 // 93 // 100 // 14 // 15 // 0 /// AY245780 // GenBank // Homo sapiens 3BP2 squamous cell carcinoma antigen 2 (SERPINB4) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 67 // 10 // 10 // 0 /// AY245782 // GenBank // Homo sapiens 1BP1 squamous cell carcinoma antigen 2 (SERPINB4) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 67 // 10 // 10 // 0 /// BC017401 // GenBank // Homo sapiens serpin peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 4, mRNA (cDNA clone MGC:27150 IMAGE:4047303), complete cds. // chr18 // 100 // 87 // 13 // 13 // 0 /// U19557 // GenBank // Human squamous cell carcinoma antigen 2 (SCCA2) mRNA, complete cds. // chr18 // 92 // 87 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000037873 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:63637719:63674084:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 67 // 67 // 10 // 15 // 1
ENST00000323355 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:64080009:64149030:-1 gene:ENSG00000179676 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000454647 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:64080302:64098610:-1 gene:ENSG00000179676 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr18 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// AY336744 // GenBank // Homo sapiens unknown mRNA; alternatively spliced. // chr18 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// BC029565 // GenBank // Homo sapiens chromosome 18 open reading frame 20, mRNA (cDNA clone IMAGE:4836889). // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT059682 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT059683 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000037875 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:64001919:64219074:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// NONHSAT059684 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_032160 // RefSeq // Homo sapiens dermatan sulfate epimerase-like (DSEL), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000310045 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:67506582:67516980:-1 gene:ENSG00000171451 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000572659 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR18_2_CTG2:67576031:67586429:-1 gene:ENSG00000262102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF480435 // GenBank // Homo sapiens NCAG1 mRNA, complete cds. // chr18 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// BC117325 // GenBank // Homo sapiens dermatan sulfate epimerase-like, mRNA (cDNA clone MGC:150934 IMAGE:40125876), complete cds. // chr18 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000000299 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR18_2_CTG2:67580419:67584057:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000009206 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:67510970:67514608:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0
NM_173630 // RefSeq // Homo sapiens rotatin (RTTN), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 62 // 62 // 0 /// ENST00000255674 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:70003793:70205945:-1 gene:ENSG00000176225 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 62 // 62 // 0 /// ENST00000578780 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:70003804:70020718:-1 gene:ENSG00000176225 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 15 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000581161 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:70003969:70205700:-1 gene:ENSG00000176225 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr18 // 98 // 95 // 58 // 59 // 0 /// ENST00000581583 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:70166434:70205726:-1 gene:ENSG00000176225 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 100 // 24 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000583043 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:70003804:70197686:-1 gene:ENSG00000176225 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr18 // 100 // 89 // 55 // 55 // 0 /// AK096404 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39085 fis, clone NT2RP7019064. // chr18 // 100 // 24 // 15 // 15 // 0 /// AK128137 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ46258 fis, clone TESTI4024245. // chr18 // 92 // 60 // 34 // 37 // 0 /// AL117635 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp434G145 (from clone DKFZp434G145). // chr18 // 100 // 15 // 9 // 9 // 0 /// BC013774 // GenBank // Homo sapiens rotatin, mRNA (cDNA clone IMAGE:4385350), partial cds. // chr18 // 100 // 21 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000048930 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:69950512:70205658:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 52 // 32 // 32 // 0
NM_001278515 // RefSeq // Homo sapiens Gilles de la Tourette syndrome chromosome region, candidate 1 (non-protein coding) (GTSCR1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000582578 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:18:70630519:70650744:-1 gene:ENSG00000263417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AY262164 // GenBank // Homo sapiens Gilles de la Tourette syndrome chromosome region-1 protein (GTSCR1) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// TCONS_l2_00012130-XLOC_l2_006518 // Broad TUCP // linc-RTTN-2 chr18:-:68297831-68309946 // chr18 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
NM_182511 // RefSeq // Homo sapiens cerebellin 2 precursor (CBLN2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000269503 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:72536680:72544539:-1 gene:ENSG00000141668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000585159 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:72536680:72543554:-1 gene:ENSG00000141668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// AK291364 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77292 complete cds, highly similar to Homo sapiens cerebellin 2 precursor (CBLN2), mRNA. // chr18 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// AY359074 // GenBank // Homo sapiens clone DNA81228 cerebellin-2 (UNQ1892) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC035789 // GenBank // Homo sapiens cerebellin 2 precursor, mRNA (cDNA clone MGC:46273 IMAGE:5727802), complete cds. // chr18 // 91 // 92 // 20 // 22 // 0 /// ENST00000581425 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:72536684:72540298:-1 gene:ENSG00000141668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 58 // 58 // 14 // 24 // 1 /// AK125422 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ43433 fis, clone OCBBF2027868, highly similar to CERL_RAT Cerebellin-like glycoprotein. // chr18 // 58 // 58 // 14 // 24 // 1 /// ENST00000584764 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:18:72538020:72543554:-1 gene:ENSG00000141668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1
ENST00000474180 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:74389884:74390297:-1 gene:ENSG00000235297 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr18 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000018976 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:74389884:74390396:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001044369 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 69, member C (FAM69C), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_005266647 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens family with sequence similarity 69, member C (FAM69C), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000343998 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:74434099:74457268:-1 gene:ENSG00000187773 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000400291 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:74435728:74457944:-1 gene:ENSG00000187773 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// BC019628 // GenBank // Homo sapiens chromosome 18 open reading frame 51, mRNA (cDNA clone IMAGE:4511101), complete cds. // chr18 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// GENSCAN00000031833 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:74438852:74448747:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NR_024484 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 909 (LINC00909), long non-coding RNA. // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000580048 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:74591774:74597824:-1 gene:ENSG00000264247 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT059878 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_175907 // RefSeq // Homo sapiens zinc binding alcohol dehydrogenase domain containing 2 (ZADH2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000322342 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:75195108:75209348:-1 gene:ENSG00000180011 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000537114 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:18:75199457:75205513:-1 gene:ENSG00000180011 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// BC078661 // GenBank // Homo sapiens zinc binding alcohol dehydrogenase domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:88091 IMAGE:5575156), complete cds. // chr18 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// BX647730 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686O0225 (from clone DKFZp686O0225). // chr18 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000031844 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:75193292:75209058:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1
NM_001037331 // RefSeq // Homo sapiens small integral membrane protein 21 (SMIM21), mRNA. // chr18 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000382638 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:18:75409872:75427634:-1 gene:ENSG00000206026 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000579022 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:75409476:75427703:-1 gene:ENSG00000206026 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK093452 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ36133 fis, clone TESTI2024641. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC107486 // GenBank // Homo sapiens chromosome 18 open reading frame 62, mRNA (cDNA clone MGC:126049 IMAGE:40032395), complete cds. // chr18 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000584508 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:18:75416018:75427682:-1 gene:ENSG00000206026 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// BC037871 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5273295. // chr18 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_014643 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 516 (ZNF516), mRNA. // chr18 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// ENST00000443185 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:76358190:76495190:-1 gene:ENSG00000101493 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// ENST00000617840 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:18:76361768:76380285:-1 gene:ENSG00000101493 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 88 // 47 // 15 // 17 // 0 /// GENSCAN00000011354 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:76435680:76443030:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 28 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000039069 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:76378556:76380226:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 80 // 28 // 8 // 10 // 0
ENST00000362522 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:18:77431563:77431689:-1 gene:ENSG00000199392 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT059988 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000364853 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:18:78544095:78544188:-1 gene:ENSG00000201723 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000573043 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR18_1_CTG2_1:78544095:78544188:-1 gene:ENSG00000262104 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000613040 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR18_ALT21_CTG2_1:78544095:78544188:-1 gene:ENSG00000273770 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT060007 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000317008 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:79638928:79679745:-1 gene:ENSG00000178412 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr18 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// AK098581 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ25715 fis, clone TST05160. // chr18 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONHSAT060050 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_032510 // RefSeq // Homo sapiens par-6 family cell polarity regulator gamma (PARD6G), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000353265 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:80157232:80247546:-1 gene:ENSG00000178184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AB044556 // GenBank // Homo sapiens mRNA for PAR-6 gamma, complete cds. // chr18 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// AB178535 // GenBank // Homo sapiens PARD6G mRNA for Par6 gamma short form 1, complete cds. // chr18 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// AB178536 // GenBank // Homo sapiens PARD6G mRNA for Par6 gamma short form 2, complete cds. // chr18 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// BC060797 // GenBank // Homo sapiens par-6 partitioning defective 6 homolog gamma (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:71606 IMAGE:30348280), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000470488 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:18:80182850:80247348:-1 gene:ENSG00000178184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1 /// GENSCAN00000044994 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:80159771:80247632:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1
NONHSAT060105 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0
ENST00000328113 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:101926805:101927707:-1 gene:ENSG00000183909 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000492842 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:62948:63887:1 gene:ENSG00000240361 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr19 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// ENST00000588632 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:19:104535:105471:1 gene:ENSG00000267310 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONHSAT000016 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// NONHSAT051704 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONHSAT060106 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
ENST00000516730 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:19:453134:453245:1 gene:ENSG00000252539 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT060131 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_033513 // RefSeq // Homo sapiens tubulin polyglutamylase complex subunit 1 (TPGS1), mRNA. // chr19 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000359315 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:19:507299:519654:1 gene:ENSG00000141933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// AK126170 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44182 fis, clone THYMU2038369, highly similar to Mus musculus GTRGEO22 (Gtrgeo22) mRNA. // chr19 // 93 // 88 // 26 // 28 // 0 /// BC009520 // GenBank // Homo sapiens chromosome 19 open reading frame 20, mRNA (cDNA clone IMAGE:3637796), partial cds. // chr19 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000588278 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:19:507500:510372:1 gene:ENSG00000141933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// GENSCAN00000049606 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:19:496500:549791:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1
NM_001258351 // RefSeq // Homo sapiens granzyme M (lymphocyte met-ase 1) (GZMM), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// NM_005317 // RefSeq // Homo sapiens granzyme M (lymphocyte met-ase 1) (GZMM), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENST00000264553 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:19:544035:549924:1 gene:ENSG00000197540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000592501 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:19:544034:549924:1 gene:ENSG00000197540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC025701 // GenBank // Homo sapiens granzyme M (lymphocyte met-ase 1), mRNA (cDNA clone MGC:34377 IMAGE:5222281), complete cds. // chr19 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// L23134 // GenBank // Homo sapiens metase (MET-1) mRNA, complete cds. // chr19 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000049606 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:19:496500:549791:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_001194 // RefSeq // Homo sapiens hyperpolarization activated cyclic nucleotide-gated potassium channel 2 (HCN2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000251287 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:19:589893:617159:1 gene:ENSG00000099822 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AF065164 // GenBank // Homo sapiens hyperpolarization-activated, cyclic nucleotide-gated channel 2 (HCN2) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000049634 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:19:589946:616474:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 76 // 16 // 16 // 0
NM_020637 // RefSeq // Homo sapiens fibroblast growth factor 22 (FGF22), mRNA. // chr19 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000215530 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:19:639895:643703:1 gene:ENSG00000070388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000586042 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:19:639895:643703:1 gene:ENSG00000070388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// AB021925 // GenBank // Homo sapiens FGF22 mRNA for FGF-22, complete cds. // chr19 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// AY359084 // GenBank // Homo sapiens DNA108912 FGF22 (UNQ2500) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC137444 // GenBank // Homo sapiens fibroblast growth factor 22, mRNA (cDNA clone MGC:169067 IMAGE:9021444), complete cds. // chr19 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC137445 // GenBank // Homo sapiens fibroblast growth factor 22, mRNA (cDNA clone MGC:169068 IMAGE:9021445), complete cds. // chr19 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC144645 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:9053176. // chr19 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000591390 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:19:639879:641590:1 gene:ENSG00000070388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// BC041334 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5277044, with apparent retained intron. // chr19 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000049598 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:19:639926:643604:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT060153 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr19 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
ENST00000469610 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:19:690353:691172:1 gene:ENSG00000213726 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr19 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// GENSCAN00000049607 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:19:690533:690952:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0
NM_173481 // RefSeq // Homo sapiens mitotic spindle positioning (MISP), mRNA. // chr19 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000215582 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:19:751126:764319:1 gene:ENSG00000099812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC042125 // GenBank // Homo sapiens chromosome 19 open reading frame 21, mRNA (cDNA clone MGC:9237 IMAGE:3848272), complete cds. // chr19 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC052236 // GenBank // Homo sapiens chromosome 19 open reading frame 21, mRNA (cDNA clone MGC:59967 IMAGE:5431360), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000049609 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:19:756947:810826:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
ENST00000592205 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:19:825097:832017:1 gene:ENSG00000172232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC044940 // GenBank // Homo sapiens azurocidin 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5203292), partial cds. // chr19 // 97 // 92 // 32 // 33 // 0 /// BC069495 // GenBank // Homo sapiens azurocidin 1, mRNA (cDNA clone MGC:97038 IMAGE:7262247), complete cds. // chr19 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// BC093931 // GenBank // Homo sapiens azurocidin 1, mRNA (cDNA clone MGC:120966 IMAGE:7939776), complete cds. // chr19 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// BC093933 // GenBank // Homo sapiens azurocidin 1, mRNA (cDNA clone MGC:120968 IMAGE:7939778), complete cds. // chr19 // 94 // 50 // 17 // 18 // 0 /// NM_001700 // RefSeq // Homo sapiens azurocidin 1 (AZU1), mRNA. // chr19 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1 /// ENST00000233997 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:19:827836:832018:1 gene:ENSG00000172232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1 /// GENSCAN00000031280 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR19_5_CTG2:827847:831877:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000049605 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:19:827847:831877:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000620695 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR19_5_CTG2:827831:832017:1 gene:ENSG00000278624 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1
NM_001972 // RefSeq // Homo sapiens elastase, neutrophil expressed (ELANE), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000263621 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:19:852291:856242:1 gene:ENSG00000197561 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000590230 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:19:851014:856247:1 gene:ENSG00000197561 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC074816 // GenBank // Homo sapiens elastase 2, neutrophil, mRNA (cDNA clone MGC:104083 IMAGE:30915534), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC074817 // GenBank // Homo sapiens elastase 2, neutrophil, mRNA (cDNA clone MGC:103928 IMAGE:30915320), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// M34379 // GenBank // Human elastase/medullasin mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000615489 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR19_5_CTG2:852335:856285:1 gene:ENSG00000277571 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000031284 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR19_5_CTG2:852373:856207:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000049596 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:19:852329:856164:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
NM_001928 // RefSeq // Homo sapiens complement factor D (adipsin) (CFD), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000327726 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:19:859643:863630:1 gene:ENSG00000197766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000592860 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:19:859664:863238:1 gene:ENSG00000197766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 59 // 13 // 13 // 0 /// AK300963 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54888 complete cds, highly similar to Complement factor D precursor (EC 3.4.21.46). // chr19 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// BC034529 // GenBank // Homo sapiens complement factor D (adipsin), mRNA (cDNA clone IMAGE:4780594), partial cds. // chr19 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// BC057807 // GenBank // Homo sapiens complement factor D (adipsin), mRNA (cDNA clone MGC:71727 IMAGE:5269709), complete cds. // chr19 // 88 // 73 // 14 // 16 // 0 /// CR536575 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834F0522D for gene DF, D component of complement (adipsin); complete cds, incl. stopcodon. // chr19 // 92 // 55 // 11 // 12 // 0 /// M84526 // GenBank // Human adipsin/complement factor D mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000617994 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR19_5_CTG2:859702:863642:1 gene:ENSG00000274619 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000031285 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR19_5_CTG2:859727:863274:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 59 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000049597 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:19:859690:863238:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 59 // 13 // 13 // 0
NM_005224 // RefSeq // Homo sapiens AT rich interactive domain 3A (BRIGHT-like) (ARID3A), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_005259512 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens AT rich interactive domain 3A (BRIGHT-like) (ARID3A), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000263620 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:19:926037:975934:1 gene:ENSG00000116017 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000587532 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:19:932509:972055:1 gene:ENSG00000116017 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// AY152547 // GenBank // Homo sapiens E2F binding protein (E2FBP1) mRNA, complete cds. // chr19 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// AY845638 // GenBank // Homo sapiens DRIL3 mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC060828 // GenBank // Homo sapiens AT rich interactive domain 3A (BRIGHT-like), mRNA (cDNA clone MGC:71697 IMAGE:30342057), complete cds. // chr19 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// U88047 // GenBank // Homo sapiens DNA binding protein homolog (DRIL1) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000049630 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:19:927722:972065:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 81 // 81 // 26 // 32 // 1 /// ENST00000457152 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:19:932565:964366:1 gene:ENSG00000116017 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay gene:ENSG00000234237 // chr19 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_138690 // RefSeq // Homo sapiens glutamate receptor, ionotropic, N-methyl-D-aspartate 3B (GRIN3B), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_003403700 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens glutamate receptor, ionotropic, N-methyl-D-aspartate 3B (GRIN3B), partial mRNA. // chr19 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000234389 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:19:1000419:1009732:1 gene:ENSG00000116032 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AY507106 // GenBank // Homo sapiens clone 20021011.2 NMDA receptor subunit 3B (GRIN3B) mRNA, complete cds. // chr19 // 80 // 97 // 28 // 35 // 0 /// AY507107 // GenBank // Homo sapiens clone 20021019.14 NMDA receptor subunit 3B (GRIN3B) mRNA, complete cds. // chr19 // 91 // 97 // 32 // 35 // 0 /// GENSCAN00000000372 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:19:993720:1009602:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0
NM_177401 // RefSeq // Homo sapiens midnolin (MIDN), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000300952 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:19:1248553:1259140:1 gene:ENSG00000167470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000586757 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:19:1248553:1254430:1 gene:ENSG00000167470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000591446 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:19:1249888:1258699:1 gene:ENSG00000167470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC094778 // GenBank // Homo sapiens midnolin, mRNA (cDNA clone MGC:104683 IMAGE:30342357), complete cds. // chr19 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000000373 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:19:1241851:1257272:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1
NM_001405 // RefSeq // Homo sapiens ephrin-A2 (EFNA2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000215368 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:19:1286154:1300237:1 gene:ENSG00000099617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AJ007292 // GenBank // Homo sapiens mRNA for ephrin-A2. // chr19 // 82 // 100 // 23 // 28 // 0 /// GENSCAN00000000383 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:19:1269722:1299945:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
BC006431 // GenBank // Homo sapiens, clone IMAGE:3625364, mRNA, partial cds. // chr19 // 95 // 100 // 18 // 19 // 0 /// ENST00000594262 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:19:1440839:1441938:1 gene:ENSG00000268798 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr19 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_005883 // RefSeq // Homo sapiens adenomatosis polyposis coli 2 (APC2), mRNA. // chr19 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000233607 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:19:1450149:1473244:1 gene:ENSG00000115266 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000238483 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:19:1452800:1465496:1 gene:ENSG00000115266 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 53 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000535453 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:19:1451289:1473244:1 gene:ENSG00000115266 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000593146 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:19:1450295:1465418:1 gene:ENSG00000115266 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 100 // 53 // 17 // 17 // 0 /// AB012162 // GenBank // Homo sapiens mRNA for APCL protein, complete cds. // chr19 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// BC020381 // GenBank HTC // Homo sapiens adenomatosis polyposis coli 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:4154147). // chr19 // 100 // 53 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000590469 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:19:1450149:1465409:1 gene:ENSG00000115266 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1 /// BC032573 // GenBank // Homo sapiens adenomatosis polyposis coli 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:5247221), partial cds. // chr19 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1 /// AL078616 // GenBank // Homo sapiens mRNA full length insert cDNA clone EUROIMAGE 179130. // chr19 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1 /// GENSCAN00000000378 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:19:1438426:1470213:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0
NM_138393 // RefSeq // Homo sapiens receptor accessory protein 6 (REEP6), mRNA. // chr19 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// XM_006722935 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens receptor accessory protein 6 (REEP6), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000233596 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:19:1490747:1497927:1 gene:ENSG00000115255 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000395479 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:19:1495363:1497498:1 gene:ENSG00000115255 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 93 // 42 // 13 // 14 // 0 /// ENST00000395484 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:19:1495476:1497721:1 gene:ENSG00000115255 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr19 // 87 // 45 // 13 // 15 // 0 /// AY562244 // GenBank // Homo sapiens receptor expression enhancing protein 6 (REEP6) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// BC008201 // GenBank // Homo sapiens receptor accessory protein 6, mRNA (cDNA clone MGC:9381 IMAGE:3865853), complete cds. // chr19 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000591735 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:19:1491166:1496181:1 gene:ENSG00000115255 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1 /// AK293919 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59119 complete cds, highly similar to Receptor expression-enhancing protein 6. // chr19 // 30 // 30 // 10 // 33 // 1 /// GENSCAN00000000374 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:19:1491270:1497897:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0
NM_001243079 // RefSeq // Homo sapiens polo-like kinase 5 (PLK5), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000334770 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:19:1524959:1535456:1 gene:ENSG00000185988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000454744 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:19:1524074:1535453:1 gene:ENSG00000185988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000588430 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:19:1526997:1535250:1 gene:ENSG00000185988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 42 // 15 // 15 // 0 /// AK122648 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ16078 fis, clone NT2NE2003252, weakly similar to Serine/threonine-protein kinase PLK3 (EC 2.7.11.21). // chr19 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000000365 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:19:1524139:1535250:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0
NM_138422 // RefSeq // Homo sapiens adenosine deaminase, tRNA-specific 3 (ADAT3), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000329478 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:19:1905378:1913447:1 gene:ENSG00000213638 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC011824 // GenBank // Homo sapiens adenosine deaminase, tRNA-specific 3, TAD3 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:20450 IMAGE:3830276), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000590266 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:19:1913090:1918161:1 gene:ENSG00000227500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1 /// ENST00000454697 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:19:1908019:1912255:1 gene:ENSG00000213638 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1 /// GENSCAN00000000421 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:19:1912048:1944814:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 33 // 8 // 8 // 0
NM_032482 // RefSeq // Homo sapiens DOT1-like histone H3K79 methyltransferase (DOT1L), mRNA. // chr19 // 97 // 87 // 32 // 33 // 0 /// ENST00000398665 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:19:2164149:2232578:1 gene:ENSG00000104885 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 97 // 87 // 32 // 33 // 0 /// ENST00000452696 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:19:2164185:2199928:1 gene:ENSG00000104885 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 89 // 24 // 8 // 9 // 0 /// ENST00000457590 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:19:2222530:2230694:1 gene:ENSG00000104885 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 24 // 9 // 9 // 0 /// AF509504 // GenBank // Homo sapiens DOT1-like protein (DOT1L) mRNA, complete cds. // chr19 // 97 // 87 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000032672 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:19:2164185:2232451:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0
NM_007165 // RefSeq // Homo sapiens splicing factor 3a, subunit 2, 66kDa (SF3A2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000221494 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:19:2236504:2248679:1 gene:ENSG00000104897 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000586396 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:19:2237794:2246802:1 gene:ENSG00000104897 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000592314 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:19:2236860:2247878:1 gene:ENSG00000104897 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 94 // 63 // 16 // 17 // 0 /// BC004434 // GenBank // Homo sapiens splicing factor 3a, subunit 2, 66kDa, mRNA (cDNA clone MGC:3975 IMAGE:2820900), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC009903 // GenBank // Homo sapiens splicing factor 3a, subunit 2, 66kDa, mRNA (cDNA clone MGC:2362 IMAGE:2959124), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000589118 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:19:2236832:2245186:1 gene:ENSG00000104897 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// ENST00000590034 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:19:2243382:2244953:1 gene:ENSG00000104897 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// ENST00000592839 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:19:2236853:2245838:1 gene:ENSG00000104897 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// GENSCAN00000032679 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:19:2243419:2248546:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0
NM_000479 // RefSeq // Homo sapiens anti-Mullerian hormone (AMH), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000221496 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:19:2249311:2252073:1 gene:ENSG00000104899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC049194 // GenBank // Homo sapiens anti-Mullerian hormone, mRNA (cDNA clone MGC:54208 IMAGE:5168299), complete cds. // chr19 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0 /// ENST00000589313 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:19:2249744:2251607:1 gene:ENSG00000104899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 55 // 55 // 17 // 31 // 1 /// GENSCAN00000032676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:19:2249333:2251957:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0
AY358234 // GenBank // Homo sapiens clone DNA142975 EPWW6493 (UNQ6493) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_182973 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protease, serine 9 (TMPRSS9), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000332578 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:19:2389786:2426239:1 gene:ENSG00000178297 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000395264 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:19:2389771:2414203:1 gene:ENSG00000178297 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 100 // 55 // 24 // 24 // 0 /// AB109390 // GenBank // Homo sapiens mRNA for Serase-1B, complete cds. // chr19 // 96 // 55 // 23 // 24 // 0 /// ENST00000613480 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:19:2389786:2425036:1 gene:ENSG00000178297 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 97 // 84 // 36 // 37 // 0 /// GENSCAN00000032656 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:19:2328710:2426088:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0
ENST00000590044 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:19:2538112:2538754:1 gene:ENSG00000105694 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr19 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// NONHSAT060449 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr19 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// GENSCAN00000032648 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:19:2538110:2546170:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_001102651 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 554 (ZNF554), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000317243 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:19:2819874:2835773:1 gene:ENSG00000172006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000588534 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:19:2830558:2835772:1 gene:ENSG00000172006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000590116 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:19:2819919:2835471:1 gene:ENSG00000172006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr19 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// AK027860 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ14954 fis, clone PLACE3000169, highly similar to Homo sapiens zinc finger protein 554 (ZNF554), mRNA. // chr19 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// AK092136 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ34817 fis, clone NT2NE2007967, weakly similar to ZINC FINGER PROTEIN 84. // chr19 // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// BC047777 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 554, mRNA (cDNA clone MGC:54281 IMAGE:6187000), complete cds. // chr19 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// AK299752 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58790 complete cds, highly similar to Homo sapiens zinc finger protein 554 (ZNF554), mRNA. // chr19 // 96 // 96 // 27 // 28 // 1 /// ENST00000591265 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:19:2819950:2834154:1 gene:ENSG00000172006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1 /// GENSCAN00000032682 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:19:2820072:2834852:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 94 // 64 // 17 // 18 // 0
NM_001172775 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 555 (ZNF555), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_152791 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 555 (ZNF555), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000334241 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:19:2841435:2860484:1 gene:ENSG00000186300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000585966 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:19:2841437:2852496:1 gene:ENSG00000186300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 90 // 31 // 9 // 10 // 0 /// ENST00000591539 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:19:2841444:2854209:1 gene:ENSG00000186300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// AK292954 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77576 complete cds. // chr19 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// BC022022 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 555, mRNA (cDNA clone MGC:26707 IMAGE:4822197), complete cds. // chr19 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000032666 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:19:2840937:2878771:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 81 // 81 // 26 // 32 // 1
NM_024967 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 556 (ZNF556), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000307635 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:19:2867335:2883445:1 gene:ENSG00000172000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000586426 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:19:2867335:2878517:1 gene:ENSG00000172000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000586470 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:19:2867335:2877442:1 gene:ENSG00000172000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr19 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// AK225297 // GenBank // Homo sapiens mRNA for zinc finger protein 556 variant, clone: HEP02849. // chr19 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC009374 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 556, mRNA (cDNA clone MGC:15056 IMAGE:4121795), complete cds. // chr19 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000032666 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:19:2840937:2878771:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_173480 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 57 (ZNF57), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000306908 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:19:2900898:2918476:1 gene:ENSG00000171970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000522294 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:19:2907108:2917159:1 gene:ENSG00000171970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000523428 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:19:2907108:2918346:1 gene:ENSG00000171970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000590305 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:19:2915445:2917170:1 gene:ENSG00000171970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// AK302165 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55452 complete cds. // chr19 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// BC028974 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 57, mRNA (cDNA clone MGC:29928 IMAGE:5138909), complete cds. // chr19 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// EF534355 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 424 mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000614108 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:19:2900898:2918469:1 gene:ENSG00000171970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000032683 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:19:2900359:2918289:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0
NM_002067 // RefSeq // Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein), alpha 11 (Gq class) (GNA11), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000078429 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:19:3094410:3124004:1 gene:ENSG00000088256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC111027 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5247589. // chr19 // 86 // 88 // 18 // 21 // 0 /// NONHSAT060501 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT060502 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0
NM_003775 // RefSeq // Homo sapiens sphingosine-1-phosphate receptor 4 (S1PR4), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000246115 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:19:3178768:3180332:1 gene:ENSG00000125910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC014970 // GenBank // Homo sapiens sphingosine-1-phosphate receptor 4, mRNA (cDNA clone MGC:23096 IMAGE:4849349), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FJ200495 // GenBank // Homo sapiens sphingosine-1-phosphate receptor 4 variant mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000008823 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:19:3172464:3219599:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_001135580 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 19 open reading frame 71 (C19orf71), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_005259462 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chromosome 19 open reading frame 71 (C19orf71), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000329493 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:19:3539154:3544030:1 gene:ENSG00000183397 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006722595 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chromosome 19 open reading frame 71 (C19orf71), transcript variant X4, mRNA. // chr19 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// GENSCAN00000008882 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:19:3500133:3544010:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0
NM_133261 // RefSeq // Homo sapiens GIPC PDZ domain containing family, member 3 (GIPC3), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000322315 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:19:3585553:3593541:1 gene:ENSG00000179855 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// AB073738 // GenBank // Homo sapiens mRNA for PDZ domain protein GIPC3, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC117312 // GenBank // Homo sapiens GIPC PDZ domain containing family, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:150921 IMAGE:40125863), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC117314 // GenBank // Homo sapiens GIPC PDZ domain containing family, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:150923 IMAGE:40125865), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000008826 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:19:3585598:3593372:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0
NR_038865 // RefSeq // Homo sapiens CACTIN antisense RNA 1 (CACTIN-AS1), long non-coding RNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000592274 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:19:3607247:3613930:1 gene:ENSG00000226800 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK097999 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ40680 fis, clone THYMU2022922. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT060536 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK295035 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59622 complete cds. // chr19 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// NONHSAT060537 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr19 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_001267560 // RefSeq // Homo sapiens tight junction protein 3 (TJP3), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// NM_001267561 // RefSeq // Homo sapiens tight junction protein 3 (TJP3), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000539908 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:19:3708503:3750810:1 gene:ENSG00000105289 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000541714 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:19:3708109:3750812:1 gene:ENSG00000105289 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000587686 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:19:3728376:3750813:1 gene:ENSG00000105289 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000589378 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:19:3721737:3750809:1 gene:ENSG00000105289 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// AK304462 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58409 complete cds, highly similar to Tight junction protein ZO-3. // chr19 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// BC108906 // GenBank // Homo sapiens tight junction protein 3 (zona occludens 3), mRNA (cDNA clone MGC:119546 IMAGE:40008232), complete cds. // chr19 // 96 // 96 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000008822 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:19:3698978:3750684:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0
NM_172251 // RefSeq // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein L54 (MRPL54), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000330133 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:19:3762664:3767565:1 gene:ENSG00000183617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC065273 // GenBank // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein L54, mRNA (cDNA clone MGC:70382 IMAGE:6165136), complete cds. // chr19 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008835 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:19:3762701:3767393:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0