NM_181712 // RefSeq // Homo sapiens KN motif and ankyrin repeat domains 4 (KANK4), mRNA. // chr1 // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// ENST00000317477 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:62236979:62263424:-1 gene:ENSG00000132854 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 23 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000354381 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:62237544:62319301:-1 gene:ENSG00000132854 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 47 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000371150 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:62237544:62272791:-1 gene:ENSG00000132854 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 38 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000371153 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:62236979:62319414:-1 gene:ENSG00000132854 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// AB284127 // GenBank // Homo sapiens Kank4 mRNA for kidney ankyrin repeat-containing protein 4, complete cds. // chr1 // 91 // 96 // 41 // 45 // 0 /// AK096259 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ38940 fis, clone NT2NE2015860, weakly similar to Erythroid ankyrin. // chr1 // 82 // 23 // 9 // 11 // 0 /// AK127461 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ45553 fis, clone BRTHA2038345, highly similar to Ankyrin repeat domain-containing protein 38. // chr1 // 83 // 38 // 15 // 18 // 0 /// BC060866 // GenBank // Homo sapiens KN motif and ankyrin repeat domains 4, mRNA (cDNA clone MGC:71814 IMAGE:30344114), complete cds. // chr1 // 91 // 96 // 41 // 45 // 0 /// GENSCAN00000044641 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:62238277:62282806:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 36 // 36 // 0
ENST00000364283 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:62298149:62298256:-1 gene:ENSG00000201153 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT003632 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000516450 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:63186336:63186450:-1 gene:ENSG00000252259 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONHSAT003656 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
ENST00000440942 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:63843196:63843685:-1 gene:ENSG00000228056 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000010735 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:63779015:63843655:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0
ENST00000384461 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:64028894:64029000:-1 gene:ENSG00000207190 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT003698 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENST00000363638 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:64066640:64066741:-1 gene:ENSG00000200508 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT003700 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_002227 // RefSeq // Homo sapiens Janus kinase 1 (JAK1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000342505 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:64833229:64966504:-1 gene:ENSG00000162434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB219242 // GenBank // Homo sapiens JAK1 mRNA for janus kinase 1, complete cds. // chr1 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// AK314257 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ95004. // chr1 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// BC111401 // GenBank // Homo sapiens Janus kinase 1 (a protein tyrosine kinase), mRNA (cDNA clone IMAGE:4608694), partial cds. // chr1 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// BC132729 // GenBank // Homo sapiens Janus kinase 1 (a protein tyrosine kinase), mRNA (cDNA clone MGC:164360 IMAGE:40146751), complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// M64174 // GenBank // Human protein-tyrosine kinase (JAK1) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000026774 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:64834562:64891902:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
ENST00000331747 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:64984608:64986087:-1 gene:ENSG00000185031 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000026767 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:64965461:64985816:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 64 // 64 // 9 // 14 // 1
NR_029516 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 101-1 (MIR101-1), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000362265 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:65058434:65058508:-1 gene:ENSG00000199135 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// hsa-mir-101-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0000103 Homo sapiens miR-101-1 stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT003725 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000032276 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:65045056:65058557:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 52 // 52 // 11 // 21 // 1
ENST00000459767 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:65761058:65761352:-1 gene:ENSG00000239319 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT003745 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENST00000411220 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:66094461:66094546:-1 gene:ENSG00000223152 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 79 // 73 // 15 // 19 // 0 /// NONHSAT003750 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 79 // 73 // 15 // 19 // 0
NM_005478 // RefSeq // Homo sapiens insulin-like 5 (INSL5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000304526 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:66797741:66801256:-1 gene:ENSG00000172410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AF133816 // GenBank // Homo sapiens insulin-like peptide INSL5 (INSL5) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// AY359030 // GenBank // Homo sapiens clone DNA27865 INSL5 (UNQ156) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC101646 // GenBank // Homo sapiens insulin-like 5, mRNA (cDNA clone MGC:126695 IMAGE:8069152), complete cds. // chr1 // 95 // 70 // 18 // 19 // 0 /// BC101648 // GenBank // Homo sapiens insulin-like 5, mRNA (cDNA clone MGC:126697 IMAGE:8069154), complete cds. // chr1 // 95 // 70 // 18 // 19 // 0
NM_015139 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 35 (UDP-GlcA/UDP-GalNAc transporter), member D1 (SLC35D1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006710480 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens solute carrier family 35 (UDP-GlcA/UDP-GalNAc transporter), member D1 (SLC35D1), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000235345 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:66999332:67054099:-1 gene:ENSG00000116704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB044343 // GenBank // Homo sapiens hUGTrel7 mRNA for UDP-glucuronic acid, complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AK289800 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76223 complete cds, highly similar to Homo sapiens solute carrier family 35 (UDP-glucuronic acid/UDP-N-acetylgalactosamine dual transporter), member D1 (SLC35D1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC093786 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 35 (UDP-glucuronic acid/UDP-N-acetylgalactosamine dual transporter), member D1, mRNA (cDNA clone MGC:120821 IMAGE:7939631), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC112031 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 35 (UDP-glucuronic acid/UDP-N-acetylgalactosamine dual transporter), member D1, mRNA (cDNA clone MGC:138236 IMAGE:8327499), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AK296449 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51485 complete cds, highly similar to UDP-glucuronic acid/UDP-N-acetylgalactosamine transporter. // chr1 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// AK316023 // GenBank // Homo sapiens cDNA, FLJ78922 complete cds, moderately similar to UDP-glucuronic acid/UDP-N-acetylgalactosamine transporter. // chr1 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000022340 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:67004340:67054013:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
ENST00000516624 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:67102645:67102779:-1 gene:ENSG00000252433 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT003772 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000516307 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:67267601:67267726:-1 gene:ENSG00000252116 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT003782 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001018067 // RefSeq // Homo sapiens SERPINE1 mRNA binding protein 1 (SERBP1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NM_001018068 // RefSeq // Homo sapiens SERPINE1 mRNA binding protein 1 (SERBP1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NM_001018069 // RefSeq // Homo sapiens SERPINE1 mRNA binding protein 1 (SERBP1), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NM_015640 // RefSeq // Homo sapiens SERPINE1 mRNA binding protein 1 (SERBP1), transcript variant 4, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000370994 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:67407810:67430415:-1 gene:ENSG00000142864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0
ENST00000473024 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:67656831:67657129:-1 gene:ENSG00000242482 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT003803 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0
NM_018841 // RefSeq // Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma 12 (GNG12), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000370982 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:67701466:67833467:-1 gene:ENSG00000172380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF119663 // GenBank // Homo sapiens G-protein gamma-12 subunit mRNA, complete cds. // chr1 // 94 // 61 // 16 // 17 // 0 /// AF123766 // GenBank // Homo sapiens G-protein gamma-12 subunit mRNA, complete cds. // chr1 // 88 // 61 // 15 // 17 // 0 /// AF365871 // GenBank // Homo sapiens G protein gamma 12 subunit mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// AF493879 // GenBank // Homo sapiens guanine nucleotide binding protein gamma 12 (GNG12) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// AK293101 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76584 complete cds, highly similar to Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma 12 (GNG12), mRNA. // chr1 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// BC005940 // GenBank // Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma 12, mRNA (cDNA clone MGC:14561 IMAGE:4049838), complete cds. // chr1 // 92 // 86 // 22 // 24 // 0 /// ENST00000494936 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:67777138:67833436:-1 gene:ENSG00000172380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// NONHSAT003807 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_004675 // RefSeq // Homo sapiens DIRAS family, GTP-binding RAS-like 3 (DIRAS3), mRNA. // chr1 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000370981 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:68045962:68051631:-1 gene:ENSG00000162595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000395201 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:68045964:68050777:-1 gene:ENSG00000162595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// AK021882 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ11820 fis, clone HEMBA1006445, highly similar to GTP-binding protein Di-Ras3. // chr1 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// AK096393 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39074 fis, clone NT2RP7016622, highly similar to Homo sapiens small GTP-binding tumor suppressor (ARHI) gene. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC005362 // GenBank // Homo sapiens DIRAS family, GTP-binding RAS-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:12468 IMAGE:3686616), complete cds. // chr1 // 84 // 63 // 16 // 19 // 0 /// CR541892 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834A0833D for gene ARHI, ras homolog gene family, member I; complete cds, without stopcodon. // chr1 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// U96750 // GenBank // Homo sapiens putative tumor supressor NOEY2 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000037848 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:68046608:68067247:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
ENST00000444127 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:68242474:68243055:-1 gene:ENSG00000229133 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000037850 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:68242474:68243055:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_000329 // RefSeq // Homo sapiens retinal pigment epithelium-specific protein 65kDa (RPE65), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000262340 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:68428822:68449959:-1 gene:ENSG00000116745 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK289925 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75249 complete cds, highly similar to Human retinal pigment epithelium-specific 61 kDa protein (RPE65) mRNA. // chr1 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// BC075035 // GenBank // Homo sapiens retinal pigment epithelium-specific protein 65kDa, mRNA (cDNA clone MGC:104166 IMAGE:30915627), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC075036 // GenBank // Homo sapiens retinal pigment epithelium-specific protein 65kDa, mRNA (cDNA clone MGC:104010 IMAGE:30915421), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// U18991 // GenBank // Human retinal pigment epithelium-specific 61 kDa protein (RPE65) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000037840 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:68429776:68455188:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0
NM_017768 // RefSeq // Homo sapiens leucine rich repeat containing 40 (LRRC40), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000370952 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:70144805:70205620:-1 gene:ENSG00000066557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC008586 // GenBank // Homo sapiens leucine rich repeat containing 40, mRNA (cDNA clone MGC:16864 IMAGE:2900193), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000026904 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:70145800:70205540:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 44 // 16 // 16 // 0
ENST00000491451 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:70180144:70180440:-1 gene:ENSG00000244389 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT003845 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_030816 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat domain 13C (ANKRD13C), mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000262346 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:70261237:70354734:-1 gene:ENSG00000118454 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000370944 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:70260588:70354722:-1 gene:ENSG00000118454 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000464236 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:70262274:70276843:-1 gene:ENSG00000118454 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 20 // 9 // 9 // 0 /// BC016937 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat domain 13C, mRNA (cDNA clone IMAGE:3845875), complete cds. // chr1 // 100 // 29 // 13 // 13 // 0 /// BC028840 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat domain 13C, mRNA (cDNA clone MGC:39111 IMAGE:4558748), complete cds. // chr1 // 97 // 80 // 35 // 36 // 0 /// XM_006710930 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ankyrin repeat domain 13C (ANKRD13C), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 47 // 47 // 21 // 45 // 1 /// ENST00000490846 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:70292146:70313790:-1 gene:ENSG00000118454 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 22 // 22 // 10 // 45 // 1 /// GENSCAN00000026915 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:70262717:70354408:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 44 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT003854 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 20 // 9 // 9 // 0
NR_029707 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 186 (MIR186), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000384988 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:71067631:71067716:-1 gene:ENSG00000207721 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-186 // miRBase Micro RNA Database // MI0000483 Homo sapiens miR-186 stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT003883 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_173808 // RefSeq // Homo sapiens neuronal growth regulator 1 (NEGR1), mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000306821 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:71402944:72100930:-1 gene:ENSG00000172260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000357731 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:71395940:72282734:-1 gene:ENSG00000172260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000434200 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:71402942:71935322:-1 gene:ENSG00000172260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000467479 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:71697946:72100917:-1 gene:ENSG00000172260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 35 // 11 // 11 // 0 /// AK295481 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59691 complete cds, highly similar to Neuronal growth regulator 1 precursor. // chr1 // 100 // 42 // 13 // 13 // 0 /// BC036771 // GenBank // Homo sapiens neuronal growth regulator 1, mRNA (cDNA clone MGC:46680 IMAGE:5576828), complete cds. // chr1 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001334 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:71587378:71785605:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 32 // 10 // 10 // 0 /// AY358132 // GenBank // Homo sapiens clone DNA94832 DMML2433 (UNQ2433) mRNA, complete cds. // chr1 // 90 // 68 // 19 // 21 // 0
ENST00000391064 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:72717663:72717769:-1 gene:ENSG00000212366 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT003915 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000516016 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:73191604:73191855:-1 gene:ENSG00000251825 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT003933 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000363731 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:73749517:73749623:-1 gene:ENSG00000200601 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT003952 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_001105659 // RefSeq // Homo sapiens leucine-rich repeats and IQ motif containing 3 (LRRIQ3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XM_005270454 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens leucine-rich repeats and IQ motif containing 3 (LRRIQ3), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000354431 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:74026031:74198187:-1 gene:ENSG00000162620 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000395089 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:74026015:74183684:-1 gene:ENSG00000162620 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC062795 // GenBank // Homo sapiens leucine-rich repeats and IQ motif containing 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:6104681), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000415760 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:74026241:74198187:-1 gene:ENSG00000162620 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 77 // 77 // 17 // 22 // 1 /// AK131476 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ16644 fis, clone TESTI4029690. // chr1 // 77 // 77 // 17 // 22 // 1 /// ENST00000417067 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:74026015:74074790:-1 gene:ENSG00000162620 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 41 // 41 // 9 // 22 // 1 /// GENSCAN00000019840 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:74026813:74086401:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 17 // 17 // 0
ENST00000294635 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:74469878:74512614:-1 gene:ENSG00000162621 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019847 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:74469878:74652013:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001002912 // RefSeq // Homo sapiens glutamate-rich 3 (ERICH3), mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 41 // 41 // 0 /// XM_005270450 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 173 (C1orf173), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 18 // 8 // 8 // 0 /// XM_006710350 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 173 (C1orf173), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 22 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000326665 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:74568111:74673738:-1 gene:ENSG00000178965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000420661 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:74589327:74634855:-1 gene:ENSG00000178965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 42 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000433746 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:74568117:74579763:-1 gene:ENSG00000178965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 18 // 8 // 8 // 0 /// BC073916 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 173, mRNA (cDNA clone IMAGE:5165745), complete cds. // chr1 // 100 // 42 // 19 // 19 // 0 /// CR749349 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp781L0319 (from clone DKFZp781L0319). // chr1 // 100 // 18 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000019847 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:74469878:74652013:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 64 // 64 // 29 // 45 // 1
ENST00000444241 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:75743423:75744776:-1 gene:ENSG00000181227 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000043473 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:75743418:75744774:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// S72422 // GenBank // E2k=alpha-ketoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoyl succinyltransferase [human, fetal brain, mRNA, 2987 nt]. // chr1 // 88 // 100 // 21 // 24 // 0
NM_080868 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat and SOCS box containing 17 (ASB17), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NR_026546 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat and SOCS box containing 17 (ASB17), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000284142 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:75918873:75932431:-1 gene:ENSG00000154007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC022517 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat and SOCS box-containing 17, mRNA (cDNA clone IMAGE:4819827), complete cds. // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC036573 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat and SOCS box-containing 17, mRNA (cDNA clone MGC:41944 IMAGE:5297837), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000043478 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:75921263:75954402:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0
NR_103535 // RefSeq // Homo sapiens NEXN antisense RNA 1 (NEXN-AS1), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000421331 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:77881348:77889539:-1 gene:ENSG00000235927 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000028233 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:77887907:77889515:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// NONHSAT004050 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
ENST00000365393 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:78094807:78094915:-1 gene:ENSG00000202263 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 75 // 100 // 3 // 4 // 0
NM_022159 // RefSeq // Homo sapiens EGF, latrophilin and seven transmembrane domain containing 1 (ELTD1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000370742 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:78889764:79006718:-1 gene:ENSG00000162618 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000401034 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:78889764:78917885:-1 gene:ENSG00000162618 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 20 // 8 // 8 // 0 /// AB032017 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KPG_003 protein, complete cds. // chr1 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// AF192403 // GenBank // Homo sapiens ETL protein (ETL) mRNA, complete cds. // chr1 // 94 // 80 // 30 // 32 // 0 /// AK292894 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75302 complete cds. // chr1 // 94 // 83 // 31 // 33 // 0 /// AY358360 // GenBank // Homo sapiens clone DNA33092 ETL (UNQ202) mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 85 // 33 // 34 // 0 /// BC025721 // GenBank // Homo sapiens EGF, latrophilin and seven transmembrane domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:34204 IMAGE:5229055), complete cds. // chr1 // 94 // 85 // 32 // 34 // 0 /// GENSCAN00000007242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:78762526:78951171:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 25 // 25 // 10 // 40 // 1
NM_005274 // RefSeq // Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma 5 (GNG5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000370641 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:84498329:84506565:-1 gene:ENSG00000174021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000370645 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:84498325:84506565:-1 gene:ENSG00000174021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NR_027379 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 180 (C1orf180), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000370624 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:84628230:84635020:-1 gene:ENSG00000180869 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// BC171792 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 180, mRNA (cDNA clone IMAGE:9054446). // chr1 // 100 // 42 // 10 // 10 // 0
NM_012152 // RefSeq // Homo sapiens lysophosphatidic acid receptor 3 (LPAR3), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000370611 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:84813404:84893213:-1 gene:ENSG00000171517 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000440886 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:84811602:84866159:-1 gene:ENSG00000171517 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000491034 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:84813916:84866144:-1 gene:ENSG00000171517 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// AF127138 // GenBank // Homo sapiens lysophosphatidic acid G protein-coupled receptor (EDG7) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF186380 // GenBank // Homo sapiens calcium-mobilizing lysophosphatidic acid receptor LP-A3/Edg-7 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AF236117 // GenBank // Homo sapiens G-protein coupled receptor EDG-7 mRNA, complete cds. // chr1 // 75 // 71 // 15 // 20 // 0 /// AY322547 // GenBank // Homo sapiens endothelial differentiation G-protein-coupled receptor 7 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC126268 // GenBank // Homo sapiens lysophosphatidic acid receptor 3, mRNA (cDNA clone MGC:161546 IMAGE:8991984), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC126270 // GenBank // Homo sapiens lysophosphatidic acid receptor 3, mRNA (cDNA clone MGC:161548 IMAGE:8991986), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000004355 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:84849429:84866120:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NM_032184 // RefSeq // Homo sapiens synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans) (SYDE2), mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 53 // 53 // 0 /// XM_006710945 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans) (SYDE2), transcript variant X6, mRNA. // chr1 // 98 // 90 // 52 // 53 // 0 /// ENST00000234668 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:85181159:85200513:-1 gene:ENSG00000097096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 49 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000341460 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:85156873:85201046:-1 gene:ENSG00000097096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 53 // 53 // 0 /// AL834286 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp667B2411 (from clone DKFZp667B2411). // chr1 // 97 // 51 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000040675 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:85158750:85201587:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 53 // 53 // 0 /// AK023877 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ13815 fis, clone THYRO1000381. // chr1 // 100 // 42 // 25 // 25 // 0
ENST00000362589 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:85435175:85435284:-1 gene:ENSG00000199459 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT004246 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001170670 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, HIT-type containing 6 (ZNHIT6), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NM_017953 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, HIT-type containing 6 (ZNHIT6), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000370574 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:85652808:85708418:-1 gene:ENSG00000117174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000431532 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:85649423:85708433:-1 gene:ENSG00000117174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK298149 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56607 complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// BC026236 // GenBank // Homo sapiens zinc finger, HIT type 6, mRNA (cDNA clone MGC:22219 IMAGE:4664103), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC110898 // GenBank // Homo sapiens zinc finger, HIT type 6, mRNA (cDNA clone MGC:131963 IMAGE:6012059), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006710703 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens zinc finger, HIT-type containing 6 (ZNHIT6), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 75 // 75 // 18 // 24 // 1 /// GENSCAN00000040665 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:85655245:85970271:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 67 // 67 // 16 // 24 // 1
NM_152890 // RefSeq // Homo sapiens collagen, type XXIV, alpha 1 (COL24A1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 62 // 62 // 0 /// ENST00000370571 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:85729233:86156763:-1 gene:ENSG00000171502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 62 // 62 // 0 /// ENST00000426639 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:85730082:86156763:-1 gene:ENSG00000171502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 95 // 59 // 59 // 0 /// AY244357 // GenBank // Homo sapiens alpha 1 type XXIV collagen precursor, mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 60 // 62 // 0 /// BC113654 // GenBank // Homo sapiens collagen, type XXIV, alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:142214 IMAGE:8322706), complete cds. // chr1 // 100 // 98 // 61 // 61 // 0 /// BC117170 // GenBank // Homo sapiens collagen, type XXIV, alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:150779 IMAGE:40125721), complete cds. // chr1 // 100 // 98 // 61 // 61 // 0 /// AB209686 // GenBank // Homo sapiens mRNA for collagen, type XXIV, alpha 1 variant protein. // chr1 // 60 // 60 // 37 // 62 // 1 /// AK308953 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ98994. // chr1 // 18 // 18 // 11 // 62 // 1 /// GENSCAN00000004803 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:85987601:86213521:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 24 // 14 // 15 // 0 /// GENSCAN00000040665 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:85655245:85970271:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 50 // 31 // 62 // 1
ENST00000364750 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:85883680:85883798:-1 gene:ENSG00000201620 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT004262 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
BC000825 // GenBank // Homo sapiens hypothetical LOC339524, mRNA (cDNA clone IMAGE:3454279). // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT004283 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
ENST00000362448 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:87453240:87453373:-1 gene:ENSG00000199318 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT004304 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000475692 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:88477828:88478114:-1 gene:ENSG00000239504 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT004321 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
ENST00000564037 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:89020300:89022751:-1 gene:ENSG00000117226 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// ENST00000365515 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:89020246:89020365:-1 gene:ENSG00000202385 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT004337 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000439531 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:89104285:89104767:-1 gene:ENSG00000234518 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000010059 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:89007724:89121966:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT004344 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT004345 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 75 // 9 // 9 // 0
NM_004120 // RefSeq // Homo sapiens guanylate binding protein 2, interferon-inducible (GBP2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000464839 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:89106132:89150456:-1 gene:ENSG00000162645 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AL832451 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp451C2311 (from clone DKFZp451C2311); complete cds. // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_207398 // RefSeq // Homo sapiens guanylate binding protein 7 (GBP7), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000294671 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:89131751:89176040:-1 gene:ENSG00000213512 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000010065 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:89125868:89272110:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0
NM_052941 // RefSeq // Homo sapiens guanylate binding protein 4 (GBP4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000355754 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:89181148:89198932:-1 gene:ENSG00000162654 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// AF288814 // GenBank // Homo sapiens guanylate binding protein 4 mRNA, complete cds. // chr1 // 93 // 71 // 27 // 29 // 0 /// AL832576 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp451D0616 (from clone DKFZp451D0616); complete cds. // chr1 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// BC070055 // GenBank // Homo sapiens guanylate binding protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:87193 IMAGE:30345441), complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// BC050625 // GenBank HTC // Homo sapiens guanylate binding protein 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:6147608), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr1 // 68 // 68 // 28 // 41 // 1 /// AK304245 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51459 complete cds, highly similar to Guanylate-binding protein 4. // chr1 // 37 // 37 // 15 // 41 // 1 /// GENSCAN00000010065 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:89125868:89272110:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 66 // 66 // 27 // 41 // 1
NONHSAT004382 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_002830 // RefSeq // Homo sapiens gem (nuclear organelle) associated protein 8 pseudogene 4 (GEMIN8P4), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC009550 // GenBank // Homo sapiens FAM51A1 pseudogene, mRNA (cDNA clone IMAGE:3898110). // chr1 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000380526 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:89993593:89994321:-1 gene:ENSG00000228175 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 70 // 70 // 14 // 20 // 1 /// GENSCAN00000019069 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:89993593:89994403:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 65 // 13 // 13 // 0
ENST00000391157 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:90253456:90253559:-1 gene:ENSG00000212459 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT004389 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_020063 // RefSeq // Homo sapiens BarH-like homeobox 2 (BARHL2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000370445 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:90711539:90717237:-1 gene:ENSG00000143032 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY338397 // GenBank // Homo sapiens BARH-like 2 protein (BARHL2) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC126439 // GenBank // Homo sapiens BarH-like homeobox 2, mRNA (cDNA clone MGC:161717 IMAGE:8992155), complete cds. // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC126441 // GenBank // Homo sapiens BarH-like homeobox 2, mRNA (cDNA clone MGC:161719 IMAGE:8992157), complete cds. // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000019072 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:90706673:90765395:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 93 // 25 // 27 // 1
NM_001017975 // RefSeq // Homo sapiens HFM1, ATP-dependent DNA helicase homolog (S. cerevisiae) (HFM1), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENST00000370425 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:91260766:91404869:-1 gene:ENSG00000162669 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000430465 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:91262186:91347449:-1 gene:ENSG00000162669 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 78 // 20 // 21 // 0 /// ENST00000462405 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:91260766:91352637:-1 gene:ENSG00000162669 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB204867 // GenBank // Homo sapiens HFM1 mRNA for helicase-like protein HFM1, complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// AK302582 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50297 complete cds, weakly similar to ATP-dependent DNA helicase MER3 (EC 3.6.1.-). // chr1 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// BX649037 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686L0198 (from clone DKFZp686L0198). // chr1 // 86 // 78 // 18 // 21 // 0 /// AK294754 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50147 complete cds, weakly similar to ATP-dependent DNA helicase MER3 (EC 3.6.1.-). // chr1 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// NONHSAT004429 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NR_003287 // RefSeq // Homo sapiens RNA, 28S ribosomal 5 (RNA28S5), ribosomal RNA. // chr1 // 82 // 100 // 9 // 11 // 0 /// NR_046235 // RefSeq // Homo sapiens RNA, 45S pre-ribosomal 5 (RNA45S5), ribosomal RNA. // chr1 // 82 // 100 // 9 // 11 // 0 /// AK057879 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ25150 fis, clone CBR07695, highly similar to Homo sapiens BNPI mRNA for brain-specific Na-dependent inorganic phosphate cotransporter. // chr1 // 82 // 100 // 9 // 11 // 0 /// NONHSAT135873 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 82 // 100 // 9 // 11 // 0
ENST00000444540 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:91534666:91535593:-1 gene:ENSG00000241318 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000039176 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:91534665:91537391:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0
ENST00000494134 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:91829774:91830066:-1 gene:ENSG00000239794 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT004440 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_053274 // RefSeq // Homo sapiens glomulin, FKBP associated protein (GLMN), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENST00000370360 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:92246402:92298976:-1 gene:ENSG00000174842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENST00000463560 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:92262865:92286592:-1 gene:ENSG00000174842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 38 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000495106 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:92246490:92298987:-1 gene:ENSG00000174842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// ENST00000495852 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:92247062:92271652:-1 gene:ENSG00000174842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 51 // 23 // 23 // 0 /// AK295971 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60587 complete cds, highly similar to Glomulin. // chr1 // 93 // 96 // 40 // 43 // 0 /// BC001257 // GenBank // Homo sapiens glomulin, FKBP associated protein, mRNA (cDNA clone MGC:5001 IMAGE:3454182), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// U73704 // GenBank // Homo sapiens 48 kDa FKBP-associated protein FAP48 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// ENST00000471465 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:92246492:92248408:-1 gene:ENSG00000174842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 18 // 18 // 8 // 45 // 1
ENST00000470692 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:92402389:92402685:-1 gene:ENSG00000242764 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT004456 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_005665 // RefSeq // Homo sapiens ecotropic viral integration site 5 (EVI5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_005271179 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ecotropic viral integration site 5 (EVI5), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_005271182 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ecotropic viral integration site 5 (EVI5), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000370331 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:92508696:92792404:-1 gene:ENSG00000067208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000540033 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:92508696:92792404:-1 gene:ENSG00000067208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB209513 // GenBank // Homo sapiens mRNA for ecotropic viral integration site 5 variant protein. // chr1 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// AB449875 // GenBank // Homo sapiens EVI5 mRNA for ecotropic viral integration site 5, complete cds. // chr1 // 91 // 85 // 20 // 22 // 0 /// AF008915 // GenBank // Homo sapiens EVI5 homolog mRNA, complete cds. // chr1 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// AF042345 // GenBank // Homo sapiens truncated EVI5 (EVI5) mRNA, complete cds. // chr1 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000032696 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:92513656:92810665:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1
ENST00000364447 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:92700819:92700934:-1 gene:ENSG00000201317 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 73 // 100 // 11 // 15 // 0 /// NONHSAT004462 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 73 // 100 // 11 // 15 // 0
ENST00000516312 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:92969604:92969710:-1 gene:ENSG00000252121 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT004475 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000464677 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:92974827:92975114:-1 gene:ENSG00000239710 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT004476 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000516028 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:93027410:93027506:-1 gene:ENSG00000251837 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT004480 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000391299 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:93488333:93488452:-1 gene:ENSG00000212601 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 /// NONHSAT004535 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0
NM_144988 // RefSeq // Homo sapiens ALG14, UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunit (ALG14), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// XM_005270582 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ALG14, UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunit (ALG14), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000370205 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:94974407:95072945:-1 gene:ENSG00000172339 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// AK289395 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75238 complete cds, highly similar to Homo sapiens asparagine-linked glycosylation 14 homolog (yeast) (ALG14), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// BC011706 // GenBank // Homo sapiens asparagine-linked glycosylation 14 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:19780 IMAGE:3689162), complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000495856 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:95035821:95072874:-1 gene:ENSG00000172339 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// GENSCAN00000036024 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:95039380:95072898:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 26 // 8 // 8 // 0
ENST00000383952 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:95125511:95125609:-1 gene:ENSG00000206679 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT004644 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000484004 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:96584422:96584727:-1 gene:ENSG00000234226 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031017 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:96463397:96584734:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT004708 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT004709 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000411297 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:96695856:96696167:-1 gene:ENSG00000223229 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT004710 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NR_039604 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 2682 (MIR2682), microRNA. // chr1 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000413670 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:98043352:98045458:-1 gene:ENSG00000225206 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000580305 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:98045242:98045351:-1 gene:ENSG00000276280 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA gene:ENSG00000225206 // chr1 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0 /// AK092728 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ35409 fis, clone SKNSH2009435. // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// hsa-mir-2682 // miRBase Micro RNA Database // MI0012063 Homo sapiens miR-2682 stem-loop // chr1 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0 /// NONHSAT004735 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONHSAT004736 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONHSAT004739 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0
NR_029679 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 137 (MIR137), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_046105 // RefSeq // Homo sapiens MIR137 host gene (non-protein coding) (MIR137HG), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000385223 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:98046070:98046171:-1 gene:ENSG00000277990 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA gene:ENSG00000225206 // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000424528 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:97988000:98049863:-1 gene:ENSG00000225206 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000602852 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:98044296:98046224:-1 gene:ENSG00000225206 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000602984 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:98044501:98046221:-1 gene:ENSG00000225206 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK309618 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99659. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK311400 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ18442. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-137 // miRBase Micro RNA Database // MI0000454 Homo sapiens miR-137 stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT004729 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT004731 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT004737 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT004738 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT004740 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001010861 // RefSeq // Homo sapiens lipid phosphate phosphatase-related protein type 5 (LPPR5), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_001037317 // RefSeq // Homo sapiens lipid phosphate phosphatase-related protein type 5 (LPPR5), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000263177 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:98890972:99004893:-1 gene:ENSG00000117598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000370188 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:98890245:99005032:-1 gene:ENSG00000117598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK295688 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60016 complete cds. // chr1 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// AY634620 // GenBank // Homo sapiens PAP2 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 96 // 78 // 24 // 25 // 0 /// BC136350 // GenBank // Homo sapiens phosphatidic acid phosphatase type 2, mRNA (cDNA clone MGC:167960 IMAGE:9020337), complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// BC144000 // GenBank // Homo sapiens phosphatidic acid phosphatase type 2, mRNA (cDNA clone MGC:177535 IMAGE:9052518), complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// FJ472844 // GenBank // Homo sapiens plasticity-related protein 5 (PRG5) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000011315 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:98894417:98972042:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
NM_001013660 // RefSeq // Homo sapiens ferric-chelate reductase 1 (FRRS1), mRNA. // chr1 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// XM_005270861 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ferric-chelate reductase 1 (FRRS1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000287474 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:99708703:99765793:-1 gene:ENSG00000156869 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000005688 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:99692182:99748768:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 47 // 16 // 17 // 0
ENST00000364621 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:99784740:99784885:-1 gene:ENSG00000201491 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONHSAT004760 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
ENST00000365389 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:100000637:100000739:-1 gene:ENSG00000202259 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT004773 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0
NM_194292 // RefSeq // Homo sapiens spindle assembly 6 homolog (C. elegans) (SASS6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000287482 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:100083563:100132955:-1 gene:ENSG00000156876 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000462159 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:100083563:100132955:-1 gene:ENSG00000156876 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// AK302513 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54468 complete cds, highly similar to Spindle assembly abnormal protein 6 homolog. // chr1 // 100 // 83 // 34 // 34 // 0 /// BC054889 // GenBank // Homo sapiens spindle assembly 6 homolog (C. elegans), mRNA (cDNA clone IMAGE:6497976). // chr1 // 100 // 39 // 16 // 16 // 0 /// BC101026 // GenBank // Homo sapiens spindle assembly 6 homolog (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:119440 IMAGE:40007432), complete cds. // chr1 // 97 // 83 // 33 // 34 // 0 /// BX641109 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686C24224 (from clone DKFZp686C24224). // chr1 // 95 // 100 // 39 // 41 // 0 /// GENSCAN00000019726 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:100085328:100132689:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 61 // 25 // 25 // 0
NM_001918 // RefSeq // Homo sapiens dihydrolipoamide branched chain transacylase E2 (DBT), mRNA. // chr1 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000370131 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:100210543:100249820:-1 gene:ENSG00000137992 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000370132 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:100186919:100249834:-1 gene:ENSG00000137992 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// AK303941 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57294 complete cds, highly similar to Lipoamide acyltransferase component of branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex, mitochondrial precursor (EC 2.3.1.168). // chr1 // 96 // 77 // 22 // 23 // 0 /// BC016675 // GenBank // Homo sapiens dihydrolipoamide branched chain transacylase E2, mRNA (cDNA clone MGC:9061 IMAGE:3924492), complete cds. // chr1 // 96 // 77 // 22 // 23 // 0 /// BT007372 // GenBank // Homo sapiens dihydrolipoamide branched chain transacylase (E2 component of branched chain keto acid dehydrogenase complex; maple syrup urine disease) mRNA, complete cds. // chr1 // 95 // 70 // 20 // 21 // 0 /// J03208 // GenBank // Human branched chain acyltransferase mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 77 // 22 // 23 // 0 /// M19301 // GenBank // Human branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase (E2) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// M27093 // GenBank // Homo sapiens nuclear-encoded mitochondrial branched chain alpha-keto acid dehydrogenase transacylase subunit (E2b) mRNA, complete cds. // chr1 // 88 // 80 // 21 // 24 // 0 /// GENSCAN00000019696 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:100196255:100249820:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0
NONHSAT004847 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_005645 // RefSeq // Homo sapiens TAF13 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor, 18kDa (TAF13), mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000338366 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:109064140:109076002:-1 gene:ENSG00000197780 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000461096 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:109062486:109075971:-1 gene:ENSG00000197780 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 97 // 79 // 29 // 30 // 0 /// BC121180 // GenBank // Homo sapiens TAF13 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor, 18kDa, mRNA (cDNA clone MGC:150596 IMAGE:40123243), complete cds. // chr1 // 93 // 76 // 27 // 29 // 0 /// BC121181 // GenBank // Homo sapiens TAF13 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor, 18kDa, mRNA (cDNA clone MGC:150597 IMAGE:40123247), complete cds. // chr1 // 83 // 76 // 24 // 29 // 0
NM_001122961 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 194 (C1orf194), mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000369942 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:109106051:109113835:-1 gene:ENSG00000179902 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 85 // 84 // 23 // 27 // 0 /// ENST00000369945 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:109105955:109112747:-1 gene:ENSG00000179902 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000369948 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:109105951:109112755:-1 gene:ENSG00000179902 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000369949 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:109105951:109113857:-1 gene:ENSG00000179902 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000460065 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:109105955:109112747:-1 gene:ENSG00000179902 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000462402 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:109105951:109113844:-1 gene:ENSG00000179902 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 41 // 13 // 13 // 0 /// BC127905 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:40132698. // chr1 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000000319 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:109106028:109113903:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// NONHSAT005016 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 85 // 84 // 23 // 27 // 0
NM_001010985 // RefSeq // Homo sapiens myosin binding protein H-like (MYBPHL), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NM_001265613 // RefSeq // Homo sapiens myosin binding protein H-like (MYBPHL), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// ENST00000357155 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:109292365:109307041:-1 gene:ENSG00000221986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000489706 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:109292365:109296353:-1 gene:ENSG00000221986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// BC132900 // GenBank // Homo sapiens myosin binding protein H-like, mRNA (cDNA clone MGC:164531 IMAGE:40146922), complete cds. // chr1 // 81 // 79 // 22 // 27 // 0 /// BC132902 // GenBank // Homo sapiens myosin binding protein H-like, mRNA (cDNA clone MGC:164533 IMAGE:40146924), complete cds. // chr1 // 85 // 79 // 23 // 27 // 0 /// BC144471 // GenBank // Homo sapiens myosin binding protein H-like, mRNA (cDNA clone MGC:178015 IMAGE:9052998), complete cds. // chr1 // 81 // 79 // 22 // 27 // 0 /// ENST00000477962 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:109292515:109306995:-1 gene:ENSG00000221986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 32 // 32 // 11 // 34 // 1 /// BC108664 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6153256. // chr1 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// GENSCAN00000000313 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:109275644:109397892:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 44 // 44 // 15 // 34 // 1 /// NONHSAT005026 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 32 // 32 // 11 // 34 // 1
NM_001205228 // RefSeq // Homo sapiens sortilin 1 (SORT1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// NM_002959 // RefSeq // Homo sapiens sortilin 1 (SORT1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000256637 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:109309570:109397951:-1 gene:ENSG00000134243 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000538502 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:109309568:109393357:-1 gene:ENSG00000134243 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// AK000757 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ20750 fis, clone HEP05174. // chr1 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// AK293118 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76489 complete cds, highly similar to Homo sapiens sortilin 1 (SORT1), mRNA. // chr1 // 100 // 68 // 25 // 25 // 0 /// AK301548 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50262 complete cds, highly similar to Sortilin precursor. // chr1 // 100 // 59 // 22 // 22 // 0 /// BC023542 // GenBank // Homo sapiens sortilin 1, mRNA (cDNA clone MGC:15104 IMAGE:4123836), complete cds. // chr1 // 100 // 70 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000000313 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:109275644:109397892:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 65 // 65 // 24 // 37 // 1 /// X98248 // GenBank // H.sapiens mRNA for sortilin. // chr1 // 73 // 73 // 27 // 37 // 1
NM_020703 // RefSeq // Homo sapiens adhesion molecule with Ig-like domain 1 (AMIGO1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000369862 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:109507068:109509738:-1 gene:ENSG00000181754 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000369864 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:109504175:109509682:-1 gene:ENSG00000181754 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AB032989 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1163 protein, partial cds. // chr1 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// AK295678 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50013 complete cds, highly similar to Amphoterin-induced protein 1 precursor. // chr1 // 92 // 96 // 23 // 25 // 0 /// BC040879 // GenBank // Homo sapiens adhesion molecule with Ig-like domain 1, mRNA (cDNA clone MGC:50479 IMAGE:5725643), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
ENST00000384105 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:109591534:109591640:-1 gene:ENSG00000206832 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT005047 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 52 // 95 // 11 // 21 // 0
NM_005272 // RefSeq // Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein), alpha transducing activity polypeptide 2 (GNAT2), mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000351050 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:109603267:109613057:-1 gene:ENSG00000134183 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// AF493909 // GenBank // Homo sapiens guanine nucleotide binding protein alpha transducin cone (GNATC) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// BC000233 // GenBank // Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein), alpha transducing activity polypeptide 2, mRNA (cDNA clone MGC:2232 IMAGE:3350818), complete cds. // chr1 // 97 // 88 // 28 // 29 // 0 /// BT009844 // GenBank // Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein), alpha transducing activity polypeptide 2 mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 73 // 23 // 24 // 0 /// ENST00000622865 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:109608721:109619929:-1 gene:ENSG00000134183 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 42 // 13 // 14 // 0 /// GENSCAN00000000309 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:109603354:109612870:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0
NM_006492 // RefSeq // Homo sapiens ALX homeobox 3 (ALX3), mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000369792 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:110059994:110070700:-1 gene:ENSG00000156150 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF008203 // GenBank // Homo sapiens homeobox protein (Alx3) mRNA, complete cds. // chr1 // 94 // 92 // 31 // 33 // 0 /// BC112007 // GenBank // Homo sapiens ALX homeobox 3, mRNA (cDNA clone MGC:138212 IMAGE:8327475), complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// BC113428 // GenBank // Homo sapiens ALX homeobox 3, mRNA (cDNA clone MGC:141988 IMAGE:8322480), complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000044589 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:110054727:110070612:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 58 // 21 // 21 // 0
AF118066 // GenBank HTC // Homo sapiens PRO1575 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_005549 // RefSeq // Homo sapiens potassium voltage-gated channel, shaker-related subfamily, member 10 (KCNA10), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000369771 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:110517251:110518838:-1 gene:ENSG00000143105 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 48 // 11 // 12 // 0 /// BC074990 // GenBank // Homo sapiens potassium voltage-gated channel, shaker-related subfamily, member 10, mRNA (cDNA clone MGC:103916 IMAGE:30915306), complete cds. // chr1 // 89 // 72 // 16 // 18 // 0 /// GENSCAN00000044593 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:110517252:110584570:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
NM_001204269 // RefSeq // Homo sapiens potassium voltage-gated channel, shaker-related subfamily, member 2 (KCNA2), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// NM_004974 // RefSeq // Homo sapiens potassium voltage-gated channel, shaker-related subfamily, member 2 (KCNA2), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000316361 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:110603254:110606353:-1 gene:ENSG00000177301 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000369770 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:1:110593580:110631474:-1 gene:ENSG00000177301 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000485317 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:110602011:110607429:-1 gene:ENSG00000177301 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// AK290061 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77031 complete cds, highly similar to Homo sapiens potassium voltage-gated channel, shaker-related subfamily, member 2 (KCNA2), mRNA. // chr1 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// BC043564 // GenBank // Homo sapiens potassium voltage-gated channel, shaker-related subfamily, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:50217 IMAGE:5212949), complete cds. // chr1 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// L02752 // GenBank // Human potassium channel mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000044590 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:110603283:110629042:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0
NM_002232 // RefSeq // Homo sapiens potassium voltage-gated channel, shaker-related subfamily, member 3 (KCNA3), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000369769 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:110672465:110675033:-1 gene:ENSG00000177272 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// BC035059 // GenBank // Homo sapiens potassium voltage-gated channel, shaker-related subfamily, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:41884 IMAGE:5261639), complete cds. // chr1 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// M85217 // GenBank // H.sapiens K+ channel protein (HLK3) mRNA, complete cds. // chr1 // 77 // 84 // 20 // 26 // 0
ENST00000362840 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:110764408:110764506:-1 gene:ENSG00000199710 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT005148 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_018372 // RefSeq // Homo sapiens ligand dependent nuclear receptor interacting factor 1 (LRIF1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006710763 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ligand dependent nuclear receptor interacting factor 1 (LRIF1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000369763 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:110947185:110964079:-1 gene:ENSG00000121931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK001826 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ10964 fis, clone PLACE1000748. // chr1 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// AK002131 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ11269 fis, clone PLACE1009190. // chr1 // 95 // 63 // 18 // 19 // 0 /// AY190122 // GenBank // Homo sapiens receptor-interacting factor 1 (RIF1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC008115 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 103, mRNA (cDNA clone MGC:16981 IMAGE:2900378), complete cds. // chr1 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// NM_001006945 // RefSeq // Homo sapiens ligand dependent nuclear receptor interacting factor 1 (LRIF1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// ENST00000485275 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:110947222:110963965:-1 gene:ENSG00000121931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// ENST00000494675 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:110947191:110952961:-1 gene:ENSG00000121931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// GENSCAN00000044600 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:110947959:110952445:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0
ENST00000363490 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:111490317:111490423:-1 gene:ENSG00000200360 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT005192 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENST00000364158 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:111650431:111650537:-1 gene:ENSG00000201028 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT005196 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_019099 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 212, member B (FAM212B), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NM_198926 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 212, member B (FAM212B), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000357260 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:111722064:111739424:-1 gene:ENSG00000197852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000444059 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:111726506:111755824:-1 gene:ENSG00000197852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000527621 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:111727344:111739253:-1 gene:ENSG00000197852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// AK293989 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51810 complete cds. // chr1 // 89 // 60 // 16 // 18 // 0 /// AL137199 // GenBank // Novel human gene mapping to chomosome 1. // chr1 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// BC031558 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 183, mRNA (cDNA clone MGC:34271 IMAGE:5181834), complete cds. // chr1 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000534365 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:111722351:111739363:-1 gene:ENSG00000197852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// AK295012 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52261 complete cds. // chr1 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1 /// GENSCAN00000021032 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:111726968:111739620:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0
NM_005167 // RefSeq // Homo sapiens protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent, 1J (PPM1J), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000309276 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:112709994:112715477:-1 gene:ENSG00000155367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000464951 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:1:112709998:112715291:-1 gene:ENSG00000155367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000471106 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:112709994:112715255:-1 gene:ENSG00000155367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000482367 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:112711993:112715303:-1 gene:ENSG00000155367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 95 // 63 // 19 // 20 // 0 /// AB451327 // GenBank // Homo sapiens PPM1J mRNA for protein phosphatase 1J, complete cds, clone: FLJ35951SAAN. // chr1 // 89 // 56 // 16 // 18 // 0 /// BC064628 // GenBank // Homo sapiens protein phosphatase 1J (PP2C domain containing), mRNA (cDNA clone IMAGE:5742050). // chr1 // 92 // 81 // 24 // 26 // 0 /// BC073828 // GenBank // Homo sapiens protein phosphatase 1J (PP2C domain containing), mRNA (cDNA clone MGC:90149 IMAGE:5244363), complete cds. // chr1 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// GENSCAN00000032269 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:112701540:112715301:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
NR_103746 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 1356 (LINC01356), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000401018 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:112820174:112850643:-1 gene:ENSG00000215866 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// NONHSAT005284 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// TCONS_00000095-XLOC_000966 // Rinn lincRNA // linc-PPM1J chr1:-:113362795-113393265 // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0
NM_018364 // RefSeq // Homo sapiens round spermatid basic protein 1 (RSBN1), mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000261441 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:113761832:113812476:-1 gene:ENSG00000081019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000476412 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:113764616:113812293:-1 gene:ENSG00000081019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// AK292552 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77617 complete cds, highly similar to Homo sapiens round spermatid basic protein 1 (RSBN1), mRNA. // chr1 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// BC026155 // GenBank // Homo sapiens round spermatid basic protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:26157 IMAGE:4827655), complete cds. // chr1 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000612242 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:113761833:113812448:-1 gene:ENSG00000081019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000615321 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:113765848:113812289:-1 gene:ENSG00000081019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000616024 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:113765342:113812275:-1 gene:ENSG00000081019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000049545 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:113765980:113812268:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0
NM_015906 // RefSeq // Homo sapiens tripartite motif containing 33 (TRIM33), transcript variant a, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NM_033020 // RefSeq // Homo sapiens tripartite motif containing 33 (TRIM33), transcript variant b, mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000358465 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:114392777:114511160:-1 gene:ENSG00000197323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000369543 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:114397608:114511160:-1 gene:ENSG00000197323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000448034 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:114397608:114463236:-1 gene:ENSG00000197323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000450349 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:114397621:114511160:-1 gene:ENSG00000197323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 89 // 31 // 32 // 0 /// AF119043 // GenBank // Homo sapiens transcriptional intermediary factor 1 gamma mRNA, complete cds. // chr1 // 94 // 89 // 30 // 32 // 0 /// AF220136 // GenBank // Homo sapiens tripartite motif protein TRIM33 alpha (TRIM33) mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr1 // 97 // 89 // 31 // 32 // 0 /// AF220137 // GenBank // Homo sapiens tripartite motif protein TRIM33 beta mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr1 // 97 // 86 // 30 // 31 // 0 /// AK301997 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55940 complete cds, highly similar to Transcription intermediary factor 1-gamma. // chr1 // 95 // 56 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000012062 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:114397648:114511076:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0
BC063894 // GenBank // Homo sapiens DENN/MADD domain containing 2C, mRNA (cDNA clone IMAGE:30389241). // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
BC063894 // GenBank // Homo sapiens DENN/MADD domain containing 2C, mRNA (cDNA clone IMAGE:30389241). // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT005364 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
BC063894 // GenBank // Homo sapiens DENN/MADD domain containing 2C, mRNA (cDNA clone IMAGE:30389241). // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT005364 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
BC063894 // GenBank // Homo sapiens DENN/MADD domain containing 2C, mRNA (cDNA clone IMAGE:30389241). // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
BC063894 // GenBank // Homo sapiens DENN/MADD domain containing 2C, mRNA (cDNA clone IMAGE:30389241). // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001256404 // RefSeq // Homo sapiens DENN/MADD domain containing 2C (DENND2C), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 98 // 51 // 51 // 0 /// NM_198459 // RefSeq // Homo sapiens DENN/MADD domain containing 2C (DENND2C), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 50 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000393274 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:114582850:114670035:-1 gene:ENSG00000175984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 52 // 52 // 0 /// ENST00000393276 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:114582848:114670111:-1 gene:ENSG00000175984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 52 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000393277 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:114582851:114626193:-1 gene:ENSG00000175984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 98 // 51 // 51 // 0 /// BX647950 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686G0351 (from clone DKFZp686G0351). // chr1 // 93 // 52 // 25 // 27 // 0 /// ENST00000481894 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:114586736:114625325:-1 gene:ENSG00000175984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 83 // 83 // 43 // 52 // 1 /// BX649075 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp779P1149 (from clone DKFZp779P1149). // chr1 // 83 // 83 // 43 // 52 // 1 /// GENSCAN00000012068 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:114568130:114625984:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 46 // 46 // 0 /// BC063894 // GenBank // Homo sapiens DENN/MADD domain containing 2C, mRNA (cDNA clone IMAGE:30389241). // chr1 // 88 // 88 // 46 // 52 // 1
ENST00000493549 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:114625698:114670422:-1 gene:ENSG00000175984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC063894 // GenBank // Homo sapiens DENN/MADD domain containing 2C, mRNA (cDNA clone IMAGE:30389241). // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT005366 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_000036 // RefSeq // Homo sapiens adenosine monophosphate deaminase 1 (AMPD1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_001172626 // RefSeq // Homo sapiens adenosine monophosphate deaminase 1 (AMPD1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000369538 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:1:114673101:114695618:-1 gene:ENSG00000116748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000520113 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:114673098:114695586:-1 gene:ENSG00000116748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AK291349 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78090 complete cds, highly similar to Human myoadenylate deaminase (AMPD1) mRNA. // chr1 // 93 // 94 // 28 // 30 // 0 /// BC056678 // GenBank // Homo sapiens adenosine monophosphate deaminase 1 (isoform M), mRNA (cDNA clone IMAGE:4271545), partial cds. // chr1 // 86 // 44 // 12 // 14 // 0 /// M60092 // GenBank // Human myoadenylate deaminase (AMPD1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000012061 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:114673114:114780607:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC022290 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4288699, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr1 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
ENST00000484057 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:114697627:114697924:-1 gene:ENSG00000242769 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT005367 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_002524 // RefSeq // Homo sapiens neuroblastoma RAS viral (v-ras) oncogene homolog (NRAS), mRNA. // chr1 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000369535 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:114704469:114716894:-1 gene:ENSG00000213281 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// AF493919 // GenBank // Homo sapiens Ras family small GTP binding protein N-Ras (NRAS) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// BC005219 // GenBank // Homo sapiens neuroblastoma RAS viral (v-ras) oncogene homolog, mRNA (cDNA clone MGC:12238 IMAGE:3826638), complete cds. // chr1 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0 /// BT019734 // GenBank // Homo sapiens neuroblastoma RAS viral (v-ras) oncogene homolog mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// BT019735 // GenBank // Homo sapiens neuroblastoma RAS viral (v-ras) oncogene homolog mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// X02751 // GenBank // Human N-ras mRNA and flanking regions. // chr1 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// GENSCAN00000012061 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:114673114:114780607:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1
NM_005725 // RefSeq // Homo sapiens tetraspanin 2 (TSPAN2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000369515 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:115050356:115089500:-1 gene:ENSG00000134198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000369516 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:115048011:115089464:-1 gene:ENSG00000134198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000433172 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:115050383:115089414:-1 gene:ENSG00000134198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 20 // 20 // 0 /// AF054839 // GenBank // Homo sapiens tetraspan TM4SF (TSPAN-2) mRNA, complete cds. // chr1 // 83 // 67 // 20 // 24 // 0 /// BC021675 // GenBank // Homo sapiens tetraspanin 2, mRNA (cDNA clone MGC:22863 IMAGE:4042036), complete cds. // chr1 // 96 // 78 // 27 // 28 // 0 /// GU971730 // GenBank // Homo sapiens tetraspanin 2 isoform (TSPAN2) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 56 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000369514 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:115050490:115089432:-1 gene:ENSG00000134198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1 /// ENST00000491992 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:115050445:115058425:-1 gene:ENSG00000134198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// GENSCAN00000030123 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:115030016:115131789:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1 /// NONHSAT005382 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1
NM_002506 // RefSeq // Homo sapiens nerve growth factor (beta polypeptide) (NGF), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000369512 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:115285918:115338236:-1 gene:ENSG00000134259 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF411526 // GenBank // Homo sapiens nerve growth factor beta (NGFB) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// BC032517 // GenBank // Homo sapiens nerve growth factor (beta polypeptide), mRNA (cDNA clone IMAGE:5493721), partial cds. // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC126148 // GenBank // Homo sapiens nerve growth factor (beta polypeptide), mRNA (cDNA clone MGC:161426 IMAGE:8991864), complete cds. // chr1 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// BC126150 // GenBank // Homo sapiens nerve growth factor (beta polypeptide), mRNA (cDNA clone MGC:161428 IMAGE:8991866), complete cds. // chr1 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// BT019733 // GenBank // Homo sapiens nerve growth factor, beta polypeptide mRNA, complete cds. // chr1 // 90 // 37 // 9 // 10 // 0 /// CR541855 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834H0532D for gene NGFB, nerve growth factor, beta polypeptide; complete cds, incl. stopcodon. // chr1 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000030131 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:115286070:115294002:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0
ENST00000384771 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:115621872:115622005:-1 gene:ENSG00000207502 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT005395 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001232 // RefSeq // Homo sapiens calsequestrin 2 (cardiac muscle) (CASQ2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000261448 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:115700007:115768781:-1 gene:ENSG00000118729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK293595 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56025 complete cds, highly similar to Calsequestrin-2 precursor. // chr1 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// AK295502 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52966 complete cds, moderately similar to Calsequestrin-2 precursor. // chr1 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// BC022288 // GenBank // Homo sapiens calsequestrin 2 (cardiac muscle), mRNA (cDNA clone MGC:22461 IMAGE:4289141), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// D55655 // GenBank // Homo sapiens mRNA for cardiac calsequestrin, complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000030121 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:115701241:115790359:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0
NM_005599 // RefSeq // Homo sapiens nescient helix loop helix 2 (NHLH2), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000320238 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:115836377:115841126:-1 gene:ENSG00000177551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000369506 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:115836692:115843917:-1 gene:ENSG00000177551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// BC096359 // GenBank // Homo sapiens nescient helix loop helix 2, mRNA (cDNA clone MGC:117066 IMAGE:40010648), complete cds. // chr1 // 93 // 63 // 14 // 15 // 0 /// BC096360 // GenBank // Homo sapiens nescient helix loop helix 2, mRNA (cDNA clone MGC:117067 IMAGE:40010649), complete cds. // chr1 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// M96740 // GenBank // Human NSCL-2 gene sequence. // chr1 // 77 // 92 // 17 // 22 // 0 /// NM_001111061 // RefSeq // Homo sapiens nescient helix loop helix 2 (NHLH2), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 83 // 83 // 20 // 24 // 1 /// ENST00000429731 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:115838052:115840741:-1 gene:ENSG00000177551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1 /// AK312849 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ93291, highly similar to Homo sapiens nescient helix loop helix 2 (NHLH2), mRNA. // chr1 // 46 // 46 // 11 // 24 // 1
ENST00000391083 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:116413766:116413869:-1 gene:ENSG00000212385 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT005434 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000319092 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:116532936:116534092:-1 gene:ENSG00000177173 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000004570 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:116532936:116534248:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0
NM_001007237 // RefSeq // Homo sapiens immunoglobulin superfamily, member 3 (IGSF3), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NM_001542 // RefSeq // Homo sapiens immunoglobulin superfamily, member 3 (IGSF3), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000318837 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:116577220:116666431:-1 gene:ENSG00000143061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000369483 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:116574399:116667755:-1 gene:ENSG00000143061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000369486 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:116574409:116667753:-1 gene:ENSG00000143061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AF031174 // GenBank // Homo sapiens Ig-like membrane protein (IGSF3) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 82 // 22 // 23 // 0 /// BC110651 // GenBank // Homo sapiens immunoglobulin superfamily, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:117164 IMAGE:6166346), complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC130279 // GenBank // Homo sapiens immunoglobulin superfamily, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:163151 IMAGE:40146310), complete cds. // chr1 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// BC144132 // GenBank // Homo sapiens immunoglobulin superfamily, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:177669 IMAGE:9052652), complete cds. // chr1 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000004561 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:116577312:116666326:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0
ENST00000516701 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:116962347:116962471:-1 gene:ENSG00000252510 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT005460 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_001145635 // RefSeq // Homo sapiens tripartite motif containing 45 (TRIM45), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// NM_025188 // RefSeq // Homo sapiens tripartite motif containing 45 (TRIM45), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000256649 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:117111060:117121728:-1 gene:ENSG00000134253 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000369464 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:117111060:117121762:-1 gene:ENSG00000134253 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000497970 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:117111060:117115612:-1 gene:ENSG00000134253 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 28 // 10 // 10 // 0 /// AY669488 // GenBank // Homo sapiens tripartite motif-containing 45 (TRIM45) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// BC034943 // GenBank // Homo sapiens tripartite motif-containing 45, mRNA (cDNA clone MGC:26026 IMAGE:4826874), complete cds. // chr1 // 97 // 89 // 31 // 32 // 0 /// ENST00000369461 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:117112185:117122587:-1 gene:ENSG00000134253 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 56 // 56 // 20 // 36 // 1 /// ENST00000485032 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:117118034:117121792:-1 gene:ENSG00000134253 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1 /// GENSCAN00000047211 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:117105914:117122900:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 39 // 14 // 14 // 0
ENST00000613165 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:117243212:117243508:-1 gene:ENSG00000277141 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000390964 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:117688621:117688742:-1 gene:ENSG00000212266 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONHSAT005494 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_206996 // RefSeq // Homo sapiens sperm associated antigen 17 (SPAG17), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 59 // 59 // 0 /// ENST00000336338 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:117953864:118185223:-1 gene:ENSG00000155761 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 98 // 58 // 58 // 0 /// AY555274 // GenBank // Homo sapiens PF6 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 59 // 59 // 0 /// ENST00000437255 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:117965097:118008070:-1 gene:ENSG00000155761 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 31 // 31 // 18 // 59 // 1 /// AK126327 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44353 fis, clone TRACH3006470. // chr1 // 31 // 31 // 18 // 59 // 1 /// GENSCAN00000023678 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:117981270:118129845:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 38 // 38 // 0
ENST00000410277 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:118264372:118264489:-1 gene:ENSG00000222209 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT005510 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_152380 // RefSeq // Homo sapiens T-box 15 (TBX15), mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000207157 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:118883046:118989556:-1 gene:ENSG00000092607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000369429 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:118883047:118987805:-1 gene:ENSG00000092607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000449873 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:118883047:118914125:-1 gene:ENSG00000092607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// AK096396 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39077 fis, clone NT2RP7017795, highly similar to TBX15 PROTEIN. // chr1 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// BC122553 // GenBank // Homo sapiens T-box 15, mRNA (cDNA clone MGC:141832 IMAGE:40077247), complete cds. // chr1 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000023676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:118884732:118933292:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0
ENST00000347264 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:119331397:119331525:-1 gene:ENSG00000194297 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT005557 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000447427 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:119558755:119559774:-1 gene:ENSG00000239873 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000032641 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:119558721:119559308:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001080470 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 697 (ZNF697), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000421812 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:119619422:119647773:-1 gene:ENSG00000143067 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC033126 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 697, mRNA (cDNA clone IMAGE:3050333), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000032644 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:119622705:119626100:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
NM_001047980 // RefSeq // Homo sapiens neuroblastoma breakpoint family, member 7 (NBPF7), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000445758 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:119834870:119844514:-1 gene:ENSG00000215864 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000032617 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:119835513:119844475:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_021794 // RefSeq // Homo sapiens ADAM metallopeptidase domain 30 (ADAM30), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000369400 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:119893533:119896495:-1 gene:ENSG00000134249 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AF171932 // GenBank // Homo sapiens metallaproteinase-disintegrin (ADAM30) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// AF171933 // GenBank // Homo sapiens metallaproteinase-disintegrin beta (ADAM30) mRNA, alternatively spliced, complete cds. // chr1 // 94 // 84 // 30 // 32 // 0 /// AK292483 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75857 complete cds, highly similar to Homo sapiens ADAM metallopeptidase domain 30 (ADAM30), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AY358734 // GenBank // Homo sapiens clone DNA97005 ADAM30 (UNQ2509) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// BC028372 // GenBank // Homo sapiens ADAM metallopeptidase domain 30, mRNA (cDNA clone MGC:27020 IMAGE:4831258), complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 37 // 38 // 0 /// GENSCAN00000032622 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:119893964:119896336:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0
NM_001200001 // RefSeq // Homo sapiens notch 2 (NOTCH2), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 55 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000479412 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:119950120:120069626:-1 gene:ENSG00000134250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 29 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000579475 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:119950408:120051714:-1 gene:ENSG00000134250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSG00000266766 // chr1 // 100 // 29 // 11 // 11 // 0 /// AK307843 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ97791. // chr1 // 100 // 29 // 11 // 11 // 0 /// BC071562 // GenBank // Homo sapiens Notch homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:87008 IMAGE:4822955), complete cds. // chr1 // 95 // 53 // 19 // 20 // 0 /// GQ231534 // GenBank // Homo sapiens neurogenic locus notch-like protein 2 (NOTCH2) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 29 // 11 // 11 // 0 /// NM_024408 // RefSeq // Homo sapiens notch 2 (NOTCH2), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 97 // 97 // 37 // 38 // 1 /// XM_005270901 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens notch 2 (NOTCH2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 92 // 92 // 35 // 38 // 1 /// XM_006710667 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens notch 2 (NOTCH2), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 92 // 92 // 35 // 38 // 1 /// ENST00000256646 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:119911553:120069626:-1 gene:ENSG00000134250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 95 // 36 // 38 // 1 /// AF308601 // GenBank // Homo sapiens NOTCH 2 (N2) mRNA, complete cds. // chr1 // 89 // 89 // 34 // 38 // 1 /// AF315356 // GenBank // Homo sapiens NOTCH2 protein (NOTCH2) mRNA, complete cds. // chr1 // 95 // 95 // 36 // 38 // 1 /// GENSCAN00000032631 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:119915306:119969744:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0
NR_104082 // RefSeq // Homo sapiens RNA, variant U1 small nuclear 10 (RNVU1-10), small nuclear RNA. // chr1 // 83 // 100 // 5 // 6 // 0 /// ENST00000384610 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:148362370:148362533:-1 gene:ENSG00000207340 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 83 // 100 // 5 // 6 // 0 /// NONHSAT139888 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 83 // 100 // 5 // 6 // 0 /// NONHSAT139898 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 83 // 100 // 5 // 6 // 0
ENST00000516326 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:148385829:148385963:-1 gene:ENSG00000252135 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT005739 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT006108 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NR_121646 // RefSeq // Homo sapiens RNA, U1 small nuclear 13, pseudogene (RNU1-13P), small nuclear RNA. // chr1 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// ENST00000384499 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:148388490:148388651:-1 gene:ENSG00000238825 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// NONHSAT139889 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// NONHSAT139899 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0
NR_104073 // RefSeq // Homo sapiens RNA, variant U1 small nuclear 4 (RNVU1-4), small nuclear RNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000612985 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:120942600:120942763:1 gene:ENSG00000277610 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT005786 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT005805 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT006232 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0
ENST00000604273 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:145919013:145920200:1 gene:ENSG00000211451 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 92 // 75 // 11 // 12 // 0 /// AK310736 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17778. // chr1 // 92 // 75 // 11 // 12 // 0 /// NR_002328 // RefSeq // Homo sapiens gonadotropin-releasing hormone (type 2) receptor 2, pseudogene (GNRHR2), transcript variant 1, non-coding RNA. // chr1 // 88 // 88 // 14 // 16 // 1 /// ENST00000312753 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:145919013:145925314:1 gene:ENSG00000211451 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 88 // 88 // 14 // 16 // 1 /// ENST00000581100 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:145919344:145925233:1 gene:ENSG00000211451 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:unitary_pseudogene // chr1 // 56 // 56 // 9 // 16 // 1 /// AY233133 // GenBank // Homo sapiens GnRH receptor II precursor RNA, complete cds. // chr1 // 50 // 50 // 8 // 16 // 1 /// NONHSAT005946 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 92 // 75 // 11 // 12 // 0 /// GENSCAN00000015871 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:145917573:145919951:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 63 // 63 // 10 // 16 // 1
ENST00000384064 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:148014417:148014583:-1 gene:ENSG00000206791 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000580816 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:145431527:145431693:-1 gene:ENSG00000270384 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 83 // 100 // 19 // 23 // 0 /// AK125616 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ43628 fis, clone SPLEN2027268. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT005966 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT006054 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NR_121645 // RefSeq // Homo sapiens RNA, variant U1 small nuclear 8 (RNVU1-8), small nuclear RNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000384480 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:147420199:147420300:-1 gene:ENSG00000207209 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT006034 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_005266 // RefSeq // Homo sapiens gap junction protein, alpha 5, 40kDa (GJA5), transcript variant A, mRNA. // chr1 // 95 // 87 // 19 // 20 // 0 /// NM_181703 // RefSeq // Homo sapiens gap junction protein, alpha 5, 40kDa (GJA5), transcript variant B, mRNA. // chr1 // 95 // 91 // 20 // 21 // 0 /// ENST00000579774 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:147756199:147760606:-1 gene:ENSG00000265107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 91 // 20 // 21 // 0 /// BC013313 // GenBank // Homo sapiens gap junction protein, alpha 5, 40kDa, mRNA (cDNA clone MGC:11185 IMAGE:3844139), complete cds. // chr1 // 100 // 74 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000621517 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:147756200:147773362:-1 gene:ENSG00000265107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 87 // 19 // 20 // 0
ENST00000365538 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:148334612:148334767:-1 gene:ENSG00000202408 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 79 // 100 // 11 // 14 // 0 /// NONHSAT006103 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 93 // 13 // 13 // 0
AK097058 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39739 fis, clone SMINT2016440. // chr1 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// ENST00000622328 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:148362995:148459813:-1 gene:ENSG00000274020 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// NONHSAT005738 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// NONHSAT006105 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// TCONS_l2_00002650-XLOC_l2_001093 // Broad TUCP // linc-FCGR1B-14 chr1:-:143647638-143744587 // chr1 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0
NR_104076 // RefSeq // Homo sapiens RNA, variant U1 small nuclear 15 (RNVU1-15), small nuclear RNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000384476 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:144412576:144412740:1 gene:ENSG00000207205 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT006142 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT006147 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NR_104076 // RefSeq // Homo sapiens RNA, variant U1 small nuclear 15 (RNVU1-15), small nuclear RNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000384476 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:144412576:144412740:1 gene:ENSG00000207205 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT006142 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT006147 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000410903 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:91674857:91674966:1 gene:ENSG00000222835 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000410922 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:144701050:144701159:-1 gene:ENSG00000222854 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000517021 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:143439605:143439714:1 gene:ENSG00000252830 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000516193 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:9792751:9792861:-1 gene:ENSG00000252002 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 31 // 96 // 8 // 26 // 0 /// ENST00000612131 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:89600571:89600680:1 gene:ENSG00000276861 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000621941 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:144265217:144265326:1 gene:ENSG00000276442 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT006153 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT072372 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0
NONHSAT006166 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NR_104078 // RefSeq // Homo sapiens RNA, variant U1 small nuclear 17 (RNVU1-17), small nuclear RNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000384619 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:143699456:143699619:-1 gene:ENSG00000207349 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT006169 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000517017 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:143720510:143720644:-1 gene:ENSG00000252826 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT006171 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_104086 // RefSeq // Homo sapiens RNA, variant U1 small nuclear 19 (RNVU1-19), small nuclear RNA. // chr1 // 82 // 100 // 18 // 22 // 0 /// JQ988807 // GenBank // Homo sapiens U1 snRNA variant 13, complete sequence. // chr1 // 45 // 100 // 10 // 22 // 0 /// ENST00000613023 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:120850819:120850985:-1 gene:ENSG00000275538 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 82 // 100 // 18 // 22 // 0 /// NONHSAT006203 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT006122 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 45 // 100 // 10 // 22 // 0
ENST00000457996 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:121090289:121097655:-1 gene:ENSG00000233029 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 75 // 84 // 12 // 16 // 0 /// AK092418 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ35099 fis, clone PLACE6006287. // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC032860 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4829018. // chr1 // 75 // 84 // 12 // 16 // 0 /// XM_006711719 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens uncharacterized LOC100996713 (LOC100996713), mRNA. // chr1 // 74 // 100 // 14 // 19 // 0 /// ENST00000415338 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:143877731:143885076:-1 gene:ENSG00000234571 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 81 // 84 // 13 // 16 // 0 /// ENST00000428289 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:149785659:149793020:-1 gene:ENSG00000233030 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0 /// NONHSAT006198 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 75 // 84 // 12 // 16 // 0 /// NONHSAT006249 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Sense No Exonic // chr1 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0 /// NONHSAT005599 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 63 // 100 // 12 // 19 // 0 /// NONHSAT005600 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 69 // 84 // 11 // 16 // 0
NM_003528 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 2, H2be (HIST2H2BE), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000369155 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:149884459:149886652:-1 gene:ENSG00000184678 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// AK289725 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77860 complete cds, highly similar to Homo sapiens histone 2, H2be (HIST2H2BE), mRNA. // chr1 // 91 // 73 // 10 // 11 // 0 /// BC005827 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 2, H2be, mRNA (cDNA clone MGC:1729 IMAGE:2989788), complete cds. // chr1 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// BC069193 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 2, H2be, mRNA (cDNA clone MGC:78419 IMAGE:3936695), complete cds. // chr1 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0
NM_175065 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 2, H2ab (HIST2H2AB), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000331128 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:149887524:149887916:-1 gene:ENSG00000184270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// BC132811 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone MGC:164442 IMAGE:40146833, complete cds. // chr1 // 58 // 100 // 14 // 24 // 0 /// GENSCAN00000015427 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:149887524:149887916:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0
ENST00000369145 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:149905472:149917841:-1 gene:ENSG00000159164 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// AK075480 // GenBank // Homo sapiens cDNA PSEC0174 fis, clone NT2RP2002760, highly similar to SYNAPTIC VESICLE PROTEIN 2. // chr1 // 92 // 80 // 22 // 24 // 0 /// AK291718 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75880 complete cds, highly similar to Homo sapiens synaptic vesicle glycoprotein 2A (SV2A), mRNA. // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NM_014849 // RefSeq // Homo sapiens synaptic vesicle glycoprotein 2A (SV2A), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 1 /// ENST00000369146 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:149903318:149917882:-1 gene:ENSG00000159164 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 1 /// BC045111 // GenBank // Homo sapiens synaptic vesicle glycoprotein 2A, mRNA (cDNA clone MGC:52199 IMAGE:5804662), complete cds. // chr1 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// BX537754 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686O1682 (from clone DKFZp686O1682); complete cds. // chr1 // 97 // 97 // 29 // 30 // 1 /// NM_001278719 // RefSeq // Homo sapiens synaptic vesicle glycoprotein 2A (SV2A), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// GENSCAN00000015435 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:149903346:149913840:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
NM_005850 // RefSeq // Homo sapiens splicing factor 3b, subunit 4, 49kDa (SF3B4), mRNA. // chr1 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000271628 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:149923317:149928344:-1 gene:ENSG00000143368 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// AK097315 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39996 fis, clone STOMA2002166, highly similar to Splicing factor 3B subunit 4. // chr1 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// AK310495 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17537. // chr1 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0 /// BC004273 // GenBank // Homo sapiens splicing factor 3b, subunit 4, 49kDa, mRNA (cDNA clone MGC:10828 IMAGE:3615080), complete cds. // chr1 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// BC013886 // GenBank // Homo sapiens splicing factor 3b, subunit 4, 49kDa, mRNA (cDNA clone MGC:11086 IMAGE:3829990), complete cds. // chr1 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// BC090883 // GenBank // Homo sapiens splicing factor 3b, subunit 4, 49kDa, mRNA (cDNA clone MGC:102968 IMAGE:30386953), complete cds. // chr1 // 90 // 90 // 26 // 29 // 1 /// GENSCAN00000015444 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:149923542:149971251:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1
NM_020205 // RefSeq // Homo sapiens OTU deubiquitinase 7B (OTUD7B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// XM_006711463 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens OTU domain containing 7B (OTUD7B), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000417191 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:149947291:150010675:-1 gene:ENSG00000264522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSG00000163113 // chr1 // 100 // 76 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000581312 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:149937812:150010676:-1 gene:ENSG00000264522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AK299790 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61735 complete cds, highly similar to Zinc finger A20 domain-containing protein 1 (EC 3.-.-.-). // chr1 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// BC020622 // GenBank // Homo sapiens OTU domain containing 7B, mRNA (cDNA clone IMAGE:4294961), complete cds. // chr1 // 93 // 76 // 27 // 29 // 0 /// BC072681 // GenBank // Homo sapiens OTU domain containing 7B, mRNA (cDNA clone MGC:87939 IMAGE:6170513), complete cds. // chr1 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// BX641079 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686G11129 (from clone DKFZp686G11129). // chr1 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1 /// GENSCAN00000015444 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:149923542:149971251:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 58 // 58 // 22 // 38 // 1 /// ENST00000619871 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:149960927:149971261:-1 gene:ENSG00000264522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1
ENST00000369035 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:150561004:150561493:-1 gene:ENSG00000203804 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 89 // 36 // 8 // 9 // 0 /// AK127688 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ45786 fis, clone NETRP2008488. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC132992 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 138, mRNA (cDNA clone MGC:164623 IMAGE:40147014), complete cds. // chr1 // 89 // 36 // 8 // 9 // 0 /// NR_104133 // RefSeq // Homo sapiens ADAMTSL4 antisense RNA 1 (ADAMTSL4-AS1), long non-coding RNA. // chr1 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// ENST00000615012 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:150560202:150562115:-1 gene:ENSG00000203804 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000617352 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:150560895:150574552:-1 gene:ENSG00000203804 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:antisense // chr1 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
ENST00000580341 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:150566562:150566860:-1 gene:ENSG00000277452 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA gene:ENSG00000264508 // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT006310 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT006311 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
ENST00000581811 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:150568971:150569269:-1 gene:ENSG00000274963 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA gene:ENSG00000264584 // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT006312 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
ENST00000517238 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:150600539:150600659:-1 gene:ENSG00000253047 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONHSAT006318 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_004436 // RefSeq // Homo sapiens endosulfine alpha (ENSA), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 100 // 42 // 10 // 10 // 0 /// NM_207042 // RefSeq // Homo sapiens endosulfine alpha (ENSA), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 93 // 58 // 13 // 14 // 0 /// NM_207045 // RefSeq // Homo sapiens endosulfine alpha (ENSA), transcript variant 5, mRNA. // chr1 // 90 // 42 // 9 // 10 // 0 /// NM_207168 // RefSeq // Homo sapiens endosulfine alpha (ENSA), transcript variant 8, mRNA. // chr1 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000362052 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:150627054:150629577:-1 gene:ENSG00000143420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 42 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000509582 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:150622729:150629502:-1 gene:ENSG00000143420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 38 // 9 // 9 // 0 /// BC069208 // GenBank // Homo sapiens endosulfine alpha, mRNA (cDNA clone MGC:78563 IMAGE:4853917), complete cds. // chr1 // 100 // 38 // 9 // 9 // 0 /// NM_207043 // RefSeq // Homo sapiens endosulfine alpha (ENSA), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1 /// NM_207044 // RefSeq // Homo sapiens endosulfine alpha (ENSA), transcript variant 4, mRNA. // chr1 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1 /// AK057673 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ33111 fis, clone TRACH2001085. // chr1 // 42 // 42 // 10 // 24 // 1
ENST00000620626 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:150608507:150608623:-1 gene:ENSG00000276103 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_018178 // RefSeq // Homo sapiens golgi phosphoprotein 3-like (GOLPH3L), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006711428 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens golgi phosphoprotein 3-like (GOLPH3L), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000271732 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:150646225:150697024:-1 gene:ENSG00000143457 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000427665 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:150648437:150697144:-1 gene:ENSG00000143457 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// AK300635 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57598 complete cds, highly similar to Homo sapiens golgi phosphoprotein 3-like (GOLPH3L), mRNA. // chr1 // 93 // 54 // 14 // 15 // 0 /// BC013870 // GenBank // Homo sapiens golgi phosphoprotein 3-like, mRNA (cDNA clone MGC:10290 IMAGE:3837466), complete cds. // chr1 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000002877 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:150648321:150876567:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_000396 // RefSeq // Homo sapiens cathepsin K (CTSK), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000271651 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:150796208:150808323:-1 gene:ENSG00000143387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000443913 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:150804041:150807434:-1 gene:ENSG00000143387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 44 // 11 // 12 // 0 /// ENST00000480670 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:150804012:150806768:-1 gene:ENSG00000143387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// BC016058 // GenBank // Homo sapiens cathepsin K, mRNA (cDNA clone MGC:23107 IMAGE:4860926), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// CR541675 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834C0328D for gene CTSK, cathepsin K (pycnodysostosis); complete cds, incl. stopcodon. // chr1 // 95 // 78 // 20 // 21 // 0 /// CR541719 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834E1237D for gene CTSK, cathepsin K (pycnodysostosis); complete cds, without stopcodon. // chr1 // 90 // 78 // 19 // 21 // 0 /// S79895 // GenBank // OC2=cathepsin O2 [human, spleen, mRNA, 1482 nt]. // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// U13665 // GenBank // Human cathepsin O (CTSO) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// U20280 // GenBank // Human cathepsin X mRNA, complete cds. // chr1 // 92 // 89 // 22 // 24 // 0 /// X82153 // GenBank // H.sapiens mRNA for cathepsin O. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000002877 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:150648321:150876567:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
ENST00000363305 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:150812591:150812698:-1 gene:ENSG00000200175 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONHSAT006329 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NONHSAT006335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000363889 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:151022746:151022852:-1 gene:ENSG00000200759 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT006349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_212551 // RefSeq // Homo sapiens LysM, putative peptidoglycan-binding, domain containing 1 (LYSMD1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000368908 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:151159748:151165919:-1 gene:ENSG00000163155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK298814 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52686 complete cds, highly similar to Homo sapiens LysM, peptidoglycan-binding, domain containing 1 (LYSMD1), mRNA. // chr1 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// BC031649 // GenBank // Homo sapiens LysM, putative peptidoglycan-binding, domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:35223 IMAGE:5172124), complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NM_001136543 // RefSeq // Homo sapiens LysM, putative peptidoglycan-binding, domain containing 1 (LYSMD1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// ENST00000440902 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:151160585:151165948:-1 gene:ENSG00000163155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// AK298706 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57075 complete cds, highly similar to Homo sapiens LysM, peptidoglycan-binding, domain containing 1 (LYSMD1), mRNA. // chr1 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1 /// GENSCAN00000011052 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:151160882:151162100:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0
ENST00000578948 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:151300665:151300964:-1 gene:ENSG00000265753 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT006386 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
ENST00000517031 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:151527831:151527938:-1 gene:ENSG00000252840 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT006397 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000384253 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:151747597:151747700:-1 gene:ENSG00000206980 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT006416 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001004432 // RefSeq // Homo sapiens leucine rich repeat and Ig domain containing 4 (LINGO4), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000368820 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:151800264:151806154:-1 gene:ENSG00000213171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY358115 // GenBank // Homo sapiens clone DNA183018 DAAT9248 (UNQ9248) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC137220 // GenBank // Homo sapiens leucine rich repeat and Ig domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:168840 IMAGE:9021217), complete cds. // chr1 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// BC137221 // GenBank // Homo sapiens leucine rich repeat and Ig domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:168841 IMAGE:9021218), complete cds. // chr1 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000011013 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:151800923:151802704:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0
NM_182578 // RefSeq // Homo sapiens thioesterase superfamily member 5 (THEM5), mRNA. // chr1 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// ENST00000368817 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:151847263:151853697:-1 gene:ENSG00000196407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000453881 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:151847282:151851163:-1 gene:ENSG00000196407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 37 // 11 // 11 // 0 /// AK095283 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ37964 fis, clone CTONG2009766. // chr1 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// BC101610 // GenBank // Homo sapiens thioesterase superfamily member 5, mRNA (cDNA clone MGC:126659 IMAGE:8069116), complete cds. // chr1 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// BC112239 // GenBank // Homo sapiens thioesterase superfamily member 5, mRNA (cDNA clone MGC:138444 IMAGE:8327707), complete cds. // chr1 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011016 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:151847371:151909458:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
NM_053055 // RefSeq // Homo sapiens thioesterase superfamily member 4 (THEM4), mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000368814 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:151873584:151909808:-1 gene:ENSG00000159445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000471464 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:151874055:151909502:-1 gene:ENSG00000159445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 73 // 16 // 16 // 0 /// AK289494 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78382 complete cds, highly similar to Homo sapiens C-terminal modulator protein, transcript variant 2,mRNA. // chr1 // 100 // 36 // 8 // 8 // 0 /// BC017339 // GenBank // Homo sapiens C-terminal modulator protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:4870462), partial cds. // chr1 // 100 // 73 // 16 // 16 // 0 /// BC065277 // GenBank // Homo sapiens thioesterase superfamily member 4, mRNA (cDNA clone MGC:74423 IMAGE:6163471), complete cds. // chr1 // 100 // 50 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000483207 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:151874377:151891440:-1 gene:ENSG00000159445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 36 // 36 // 8 // 22 // 1 /// AK096211 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ38892 fis, clone NOVAR1000015. // chr1 // 36 // 36 // 8 // 22 // 1
NM_005620 // RefSeq // Homo sapiens S100 calcium binding protein A11 (S100A11), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000271638 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:152032506:152037035:-1 gene:ENSG00000163191 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000478109 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:152032506:152047907:-1 gene:ENSG00000163191 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC001410 // GenBank // Homo sapiens S100 calcium binding protein A11, mRNA (cDNA clone MGC:2149 IMAGE:3140092), complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC014354 // GenBank // Homo sapiens S100 calcium binding protein A11, mRNA (cDNA clone MGC:24205 IMAGE:3685742), complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BT009912 // GenBank // Homo sapiens S100 calcium binding protein A11 (calgizzarin) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// D38583 // GenBank // Homo sapiens mRNA for calgizzarin, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// D49355 // GenBank // Homo sapiens mRNA for S100C protein, complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// D50374 // GenBank // Homo sapiens mRNA for calcium binding protein, complete cds. // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// EU794659 // GenBank // Homo sapiens epididymis secretory protein Li 43 (HEL-S-43) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000020292 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:152032662:152062224:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_001008536 // RefSeq // Homo sapiens trichohyalin-like 1 (TCHHL1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000368806 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:152084144:152089064:-1 gene:ENSG00000182898 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY456639 // GenBank // Homo sapiens basalin mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC137493 // GenBank // Homo sapiens trichohyalin-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:169116 IMAGE:9021493), complete cds. // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000020298 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:152067659:152088143:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0
NM_007113 // RefSeq // Homo sapiens trichohyalin (TCHH), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000368804 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:152106317:152114080:-1 gene:ENSG00000159450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AK307946 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ97894. // chr1 // 86 // 39 // 12 // 14 // 0 /// BC131826 // GenBank // Homo sapiens trichohyalin, mRNA (cDNA clone IMAGE:40134116), complete cds. // chr1 // 61 // 61 // 22 // 36 // 1 /// BC131827 // GenBank // Homo sapiens trichohyalin, mRNA (cDNA clone IMAGE:40134118), complete cds. // chr1 // 61 // 61 // 22 // 36 // 1 /// ENST00000614923 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:152106317:152115454:-1 gene:ENSG00000159450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000020300 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:152107385:152114080:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0
NM_001122965 // RefSeq // Homo sapiens repetin (RPTN), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000316073 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:152153595:152159228:-1 gene:ENSG00000215853 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AY396742 // GenBank // Homo sapiens repetin (RPTN) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000020291 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:152123690:152157889:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 61 // 21 // 22 // 0
NM_001009931 // RefSeq // Homo sapiens hornerin (HRNR), mRNA. // chr1 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000368801 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:152212082:152224193:-1 gene:ENSG00000197915 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// AY396741 // GenBank // Homo sapiens hornerin precursor mRNA, complete cds. // chr1 // 94 // 62 // 15 // 16 // 0 /// NM_001122965 // RefSeq // Homo sapiens repetin (RPTN), mRNA. // chr1 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// ENST00000316073 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:152153595:152159228:-1 gene:ENSG00000215853 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// AY396742 // GenBank // Homo sapiens repetin (RPTN) mRNA, complete cds. // chr1 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// GENSCAN00000020275 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:152213072:152346181:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_002016 // RefSeq // Homo sapiens filaggrin (FLG), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000368799 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:152302175:152325203:-1 gene:ENSG00000143631 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000020275 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:152213072:152346181:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 52 // 52 // 11 // 21 // 1
NM_001014342 // RefSeq // Homo sapiens filaggrin family member 2 (FLG2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000388718 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:152348735:152360006:-1 gene:ENSG00000143520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY827490 // GenBank // Homo sapiens ifapsoriasin (IFPS) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020293 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:152353180:152358884:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_016190 // RefSeq // Homo sapiens cornulin (CRNN), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000271835 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:152409243:152414263:-1 gene:ENSG00000143536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF077831 // GenBank // Homo sapiens tumor-related protein (PDRC1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// AK291301 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78643 complete cds, highly similar to Homo sapiens cornulin (CRNN), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK298640 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51275 complete cds. // chr1 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// BC030807 // GenBank // Homo sapiens cornulin, mRNA (cDNA clone MGC:22281 IMAGE:4271624), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000020289 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:152409594:152412233:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
NM_178435 // RefSeq // Homo sapiens late cornified envelope 3E (LCE3E), mRNA. // chr1 // 87 // 88 // 13 // 15 // 0 /// ENST00000368789 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:152565654:152566772:-1 gene:ENSG00000185966 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_032563 // RefSeq // Homo sapiens late cornified envelope 3D (LCE3D), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000368787 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:152579381:152580504:-1 gene:ENSG00000163202 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0 /// AB048288 // GenBank // Homo sapiens mRNA for epidermal differentiation complex protein like protein, complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT006489 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0
NM_178431 // RefSeq // Homo sapiens late cornified envelope 3A (LCE3A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000335674 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:152622834:152623103:-1 gene:ENSG00000185962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC120933 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:40115013. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001276331 // RefSeq // Homo sapiens late cornified envelope 1C (LCE1C), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NM_178351 // RefSeq // Homo sapiens late cornified envelope 1C (LCE1C), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000607093 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:152804835:152805478:-1 gene:ENSG00000197084 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 11 // 11 // 0
NM_006945 // RefSeq // Homo sapiens small proline-rich protein 2D (SPRR2D), mRNA. // chr1 // 100 // 67 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000360379 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:153039725:153041118:-1 gene:ENSG00000163216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000368756 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:153039848:153041928:-1 gene:ENSG00000163216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000368757 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:153039828:153041931:-1 gene:ENSG00000163216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 82 // 73 // 9 // 11 // 0 /// AK291317 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76407 complete cds, highly similar to Homo sapiens small proline-rich protein 2D (SPRR2D), mRNA. // chr1 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0 /// M21302 // GenBank // Human small proline rich protein (sprII) mRNA, clone 174N. // chr1 // 100 // 67 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000368758 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:153039744:153041931:-1 gene:ENSG00000163216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 67 // 67 // 10 // 15 // 1
NM_005988 // RefSeq // Homo sapiens small proline-rich protein 2A (SPRR2A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000392653 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:153056113:153057537:-1 gene:ENSG00000241794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
ENST00000368755 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:153070224:153070840:-1 gene:ENSG00000196805 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 57 // 8 // 8 // 0 /// NM_001017418 // RefSeq // Homo sapiens small proline-rich protein 2B (SPRR2B), mRNA. // chr1 // 71 // 100 // 10 // 14 // 0
NM_001024209 // RefSeq // Homo sapiens small proline-rich protein 2E (SPRR2E), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000368750 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:153093135:153094525:-1 gene:ENSG00000203785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000368751 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:153093135:153106184:-1 gene:ENSG00000203785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 90 // 56 // 9 // 10 // 0 /// BC058018 // GenBank // Homo sapiens small proline-rich protein 2E, mRNA (cDNA clone IMAGE:6653118). // chr1 // 90 // 56 // 9 // 10 // 0
NM_001014291 // RefSeq // Homo sapiens small proline-rich protein 2G (SPRR2G), mRNA. // chr1 // 100 // 58 // 7 // 7 // 0 /// ENST00000368748 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:153149582:153150869:-1 gene:ENSG00000159516 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 58 // 7 // 7 // 0 /// AB048287 // GenBank // Homo sapiens mRNA for small proline rich protein like protein, complete cds. // chr1 // 100 // 58 // 7 // 7 // 0 /// NONHSAT006509 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 58 // 7 // 7 // 0
NM_052891 // RefSeq // Homo sapiens peptidoglycan recognition protein 3 (PGLYRP3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000290722 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:153297862:153310718:-1 gene:ENSG00000159527 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY035376 // GenBank // Homo sapiens peptidoglycan recognition protein-I-alpha precursor (PGLYRPIalpha) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC069741 // GenBank // Homo sapiens peptidoglycan recognition protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:97229 IMAGE:7262478), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC069798 // GenBank // Homo sapiens peptidoglycan recognition protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:97241 IMAGE:7262490), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC069801 // GenBank // Homo sapiens peptidoglycan recognition protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:97253 IMAGE:7262502), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC128114 // GenBank // Homo sapiens peptidoglycan recognition protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:149196 IMAGE:40112227), complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC128115 // GenBank // Homo sapiens peptidoglycan recognition protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:149197 IMAGE:40112231), complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000003867 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:153297956:153310665:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
NM_020393 // RefSeq // Homo sapiens peptidoglycan recognition protein 4 (PGLYRP4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000359650 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:153330120:153348546:-1 gene:ENSG00000163218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000368739 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:153330120:153348840:-1 gene:ENSG00000163218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000490266 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:153345025:153347978:-1 gene:ENSG00000163218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 31 // 11 // 11 // 0 /// AK292203 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75788 complete cds, highly similar to Homo sapiens peptidoglycan recognition protein 4 (PGLYRP4), mRNA. // chr1 // 94 // 94 // 31 // 33 // 0 /// AY035377 // GenBank // Homo sapiens peptidoglycan recognition protein-I-beta precursor (PGLYRPIbeta) mRNA, complete cds. // chr1 // 94 // 91 // 30 // 32 // 0 /// BC107157 // GenBank // Homo sapiens peptidoglycan recognition protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:129971 IMAGE:40032748), complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 34 // 35 // 0 /// BC107158 // GenBank // Homo sapiens peptidoglycan recognition protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:129972 IMAGE:40032750), complete cds. // chr1 // 91 // 100 // 32 // 35 // 0 /// BC142636 // GenBank // Homo sapiens peptidoglycan recognition protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:164835 IMAGE:40147772), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000003894 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:153330767:153347932:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// NONHSAT006515 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 31 // 11 // 11 // 0
NM_005621 // RefSeq // Homo sapiens S100 calcium binding protein A12 (S100A12), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000368737 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:153373706:153375649:-1 gene:ENSG00000163221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC070294 // GenBank // Homo sapiens S100 calcium binding protein A12, mRNA (cDNA clone MGC:88289 IMAGE:30415232), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// D49549 // GenBank // Homo sapiens mRNA for calcium-binding protein in amniotic fluid 1, complete cds. // chr1 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// D83664 // GenBank // Homo sapiens mRNA for CAAF1 (calcium-binding protein in amniotic fluid 1), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000003845 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:153373827:153374592:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0
NM_002964 // RefSeq // Homo sapiens S100 calcium binding protein A8 (S100A8), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000368732 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:153390032:153390976:-1 gene:ENSG00000143546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000368733 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:153390032:153391188:-1 gene:ENSG00000143546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK291328 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76560 complete cds, highly similar to Homo sapiens S100 calcium binding protein A8 (calgranulin A) (S100A8), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC005928 // GenBank // Homo sapiens S100 calcium binding protein A8, mRNA (cDNA clone MGC:14536 IMAGE:4246359), complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BT007378 // GenBank // Homo sapiens S100 calcium binding protein A8 (calgranulin A) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// CR407674 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834A1216D for gene S100A8, S100 calcium binding protein A8 (calgranulin A) complete cds, without stopcodon. // chr1 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000477801 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:153390204:153391071:-1 gene:ENSG00000143546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// GENSCAN00000003896 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:153380543:153390535:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// NONHSAT006517 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NM_001045479 // RefSeq // Homo sapiens S100 calcium binding protein A7-like 2 (S100A7L2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000368725 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:153437058:153439949:-1 gene:ENSG00000197364 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000003828 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:153436426:153438329:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_002963 // RefSeq // Homo sapiens S100 calcium binding protein A7 (S100A7), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// XM_005245431 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens S100 calcium binding protein A7 (S100A7), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000368722 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:153457744:153459874:-1 gene:ENSG00000143556 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000368723 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:153457744:153460701:-1 gene:ENSG00000143556 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC034687 // GenBank // Homo sapiens S100 calcium binding protein A7, mRNA (cDNA clone MGC:21353 IMAGE:4751685), complete cds. // chr1 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// M86757 // GenBank // Human psoriasin mRNA, complete cds. // chr1 // 67 // 94 // 10 // 15 // 0
ENST00000583849 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:153500463:153500764:-1 gene:ENSG00000263841 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONHSAT006521 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_014624 // RefSeq // Homo sapiens S100 calcium binding protein A6 (S100A6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000368719 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:153534599:153536222:-1 gene:ENSG00000197956 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000368720 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:153534599:153536244:-1 gene:ENSG00000197956 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000496817 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:153534599:153536215:-1 gene:ENSG00000197956 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0 /// BC001431 // GenBank // Homo sapiens S100 calcium binding protein A6, mRNA (cDNA clone MGC:2187 IMAGE:3138609), complete cds. // chr1 // 100 // 72 // 13 // 13 // 0 /// BC009017 // GenBank // Homo sapiens S100 calcium binding protein A6, mRNA (cDNA clone MGC:18233 IMAGE:4157026), complete cds. // chr1 // 88 // 89 // 14 // 16 // 0
NM_002962 // RefSeq // Homo sapiens S100 calcium binding protein A5 (S100A5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// XM_005245429 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens S100 calcium binding protein A5 (S100A5), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000368717 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:153537157:153540694:-1 gene:ENSG00000196420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 63 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000368718 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:153537147:153541765:-1 gene:ENSG00000196420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC093955 // GenBank // Homo sapiens S100 calcium binding protein A5, mRNA (cDNA clone MGC:120990 IMAGE:7939800), complete cds. // chr1 // 100 // 53 // 10 // 10 // 0 /// BC093957 // GenBank // Homo sapiens S100 calcium binding protein A5, mRNA (cDNA clone MGC:120992 IMAGE:7939802), complete cds. // chr1 // 100 // 53 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000003849 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:153534696:153541424:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 47 // 47 // 9 // 19 // 1
NM_002960 // RefSeq // Homo sapiens S100 calcium binding protein A3 (S100A3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000368712 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:153547513:153549126:-1 gene:ENSG00000188015 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 70 // 13 // 14 // 0 /// ENST00000368713 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:153547329:153549372:-1 gene:ENSG00000188015 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC012893 // GenBank // Homo sapiens S100 calcium binding protein A3, mRNA (cDNA clone MGC:9288 IMAGE:3880514), complete cds. // chr1 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// BT006955 // GenBank // Homo sapiens S100 calcium binding protein A3 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 60 // 12 // 12 // 0 /// CR542163 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834B0524D for gene S100A3, S100 calcium binding protein A3; complete cds, incl. stopcodon. // chr1 // 100 // 60 // 12 // 12 // 0 /// CR542185 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834F0424D for gene S100A3, S100 calcium binding protein A3; complete cds, without stopcodon. // chr1 // 100 // 60 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000003869 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:153547682:153553309:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 12 // 12 // 0
NM_005978 // RefSeq // Homo sapiens S100 calcium binding protein A2 (S100A2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000368707 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:153561349:153565542:-1 gene:ENSG00000196754 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000368708 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:153561108:153565865:-1 gene:ENSG00000196754 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000368709 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:153561343:153566755:-1 gene:ENSG00000196754 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000368710 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:153561340:153567890:-1 gene:ENSG00000196754 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000497140 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:153561340:153565830:-1 gene:ENSG00000196754 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// AF086003 // GenBank // Homo sapiens full length insert cDNA clone YU63D08. // chr1 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0 /// BC002829 // GenBank // Homo sapiens S100 calcium binding protein A2, mRNA (cDNA clone MGC:3847 IMAGE:3659591), complete cds. // chr1 // 92 // 80 // 11 // 12 // 0 /// BC105787 // GenBank // Homo sapiens S100 calcium binding protein A2, mRNA (cDNA clone MGC:111539 IMAGE:6702470), complete cds. // chr1 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000487430 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:153561340:153564233:-1 gene:ENSG00000196754 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 60 // 60 // 9 // 15 // 1
NM_020672 // RefSeq // Homo sapiens S100 calcium binding protein A14 (S100A14), mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_005245362 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens S100 calcium binding protein A14 (S100A14), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000344616 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:153614258:153616332:-1 gene:ENSG00000189334 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000368700 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:153614777:153616264:-1 gene:ENSG00000189334 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000368701 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:153614255:153616289:-1 gene:ENSG00000189334 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000368702 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:153614255:153616986:-1 gene:ENSG00000189334 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000469571 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:153614918:153616927:-1 gene:ENSG00000189334 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000476873 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:153614255:153615938:-1 gene:ENSG00000189334 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// AY007220 // GenBank // Homo sapiens S100-type calcium binding protein A14 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC005019 // GenBank // Homo sapiens S100 calcium binding protein A14, mRNA (cDNA clone MGC:11012 IMAGE:3640899), complete cds. // chr1 // 89 // 69 // 16 // 18 // 0
ENST00000362695 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:153726252:153726353:-1 gene:ENSG00000199565 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000573630 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR1_1_CTG31:153743483:153743584:-1 gene:ENSG00000262469 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT006542 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NONHSAT006545 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AF130066 // GenBank HTC // Homo sapiens clone FLB8124 PRO2179 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000599578 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR1_1_CTG31:153789602:153791310:-1 gene:ENSG00000269823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_020699 // RefSeq // Homo sapiens GATA zinc finger domain containing 2B (GATAD2B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000368655 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:153804725:153922975:-1 gene:ENSG00000143614 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000576342 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR1_1_CTG31:153821956:153845579:-1 gene:ENSG00000261992 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AF411836 // GenBank // Homo sapiens transcription repressor p66 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC069419 // GenBank // Homo sapiens GATA zinc finger domain containing 2B, mRNA (cDNA clone MGC:97079 IMAGE:7262291), complete cds. // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC112052 // GenBank // Homo sapiens GATA zinc finger domain containing 2B, mRNA (cDNA clone MGC:138257 IMAGE:8327520), complete cds. // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC112080 // GenBank // Homo sapiens GATA zinc finger domain containing 2B, mRNA (cDNA clone MGC:138285 IMAGE:8327548), complete cds. // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000003818 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:153810177:153923370:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000015289 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR1_1_CTG31:153827408:153870314:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0
NM_014856 // RefSeq // Homo sapiens DENN/MADD domain containing 4B (DENND4B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// XM_006711691 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens DENN/MADD domain containing 4B (DENND4B), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 82 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000361217 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:153929501:153946696:-1 gene:ENSG00000198837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000368646 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:153932861:153945269:-1 gene:ENSG00000198837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000480340 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:153929501:153933265:-1 gene:ENSG00000198837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0 /// AK124049 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ42055 fis, clone SPLEN2042714. // chr1 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0 /// AK226053 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA0476 gene product variant, clone: hk07353. // chr1 // 100 // 82 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000003819 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:153930297:153944374:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// NONHSAT006556 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0
NM_001159484 // RefSeq // Homo sapiens nucleoporin 210kDa-like (NUP210L), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// NM_207308 // RefSeq // Homo sapiens nucleoporin 210kDa-like (NUP210L), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// ENST00000271854 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:153992694:154155116:-1 gene:ENSG00000143552 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// ENST00000368553 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:153992690:154056866:-1 gene:ENSG00000143552 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 36 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000368559 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:153992685:154155116:-1 gene:ENSG00000143552 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// GENSCAN00000035704 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:153982099:154155044:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 38 // 38 // 0
ENST00000362986 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:18:7995570:7995785:1 gene:ENSG00000199856 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0 /// ENST00000384034 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:14:101145480:101145695:-1 gene:ENSG00000277754 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA gene:ENSG00000206761 // chr1 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0 /// NONHSAT006578 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONHSAT040012 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0 /// NONHSAT057163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr1 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0 /// NONHSAT076932 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 63 // 100 // 5 // 8 // 0
ENST00000363350 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:154039916:154040022:-1 gene:ENSG00000200220 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT006579 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001010979 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 189 (C1orf189), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000368525 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:154199372:154206333:-1 gene:ENSG00000163263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC127710 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 189, mRNA (cDNA clone MGC:157805 IMAGE:40127224), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC130509 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 189, mRNA (cDNA clone MGC:163381 IMAGE:40146540), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0
NM_001010846 // RefSeq // Homo sapiens Src homology 2 domain containing E (SHE), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000304760 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:154479481:154502113:-1 gene:ENSG00000169291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000555188 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:154479481:154489166:-1 gene:ENSG00000169291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0 /// BC117210 // GenBank // Homo sapiens Src homology 2 domain containing E, mRNA (cDNA clone MGC:150819 IMAGE:40125761), complete cds. // chr1 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// BC143765 // GenBank // Homo sapiens Src homology 2 domain containing E, mRNA (cDNA clone MGC:177296 IMAGE:9052279), complete cds. // chr1 // 96 // 79 // 22 // 23 // 0 /// XM_005244891 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens Src homology 2 domain containing E (SHE), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// GENSCAN00000035695 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:154472596:154502026:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0
NM_006556 // RefSeq // Homo sapiens phosphomevalonate kinase (PMVK), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000368467 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:154924734:154936991:-1 gene:ENSG00000163344 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC006089 // GenBank // Homo sapiens phosphomevalonate kinase, mRNA (cDNA clone MGC:12661 IMAGE:3604167), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC007694 // GenBank // Homo sapiens phosphomevalonate kinase, mRNA (cDNA clone MGC:11362 IMAGE:3954909), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BT019976 // GenBank // Homo sapiens phosphomevalonate kinase mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// CR541998 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834B1135D for gene PMVK, phosphomevalonate kinase; complete cds, without stopcodon. // chr1 // 95 // 71 // 21 // 22 // 0 /// L77213 // GenBank // Homo sapiens phosphomevalonate kinase mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// AK130234 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ26724 fis, clone PNC05489. // chr1 // 94 // 94 // 29 // 31 // 1 /// GENSCAN00000035702 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:154925129:154953721:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 58 // 58 // 18 // 31 // 1
NM_138300 // RefSeq // Homo sapiens pygopus family PHD finger 2 (PYGO2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000368457 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:154957026:154961748:-1 gene:ENSG00000163348 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AF457208 // GenBank // Homo sapiens pygopus 2 (PYGO2) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC006132 // GenBank // Homo sapiens pygopus homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:13050 IMAGE:3627860), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC032099 // GenBank // Homo sapiens pygopus homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:20502 IMAGE:4126360), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000368456 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:154958740:154962036:-1 gene:ENSG00000163348 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// GENSCAN00000035697 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:154958779:154962145:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// AK095899 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ38580 fis, clone HCHON2008582, highly similar to FERRITIN HEAVY CHAIN. // chr1 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_144622 // RefSeq // Homo sapiens DC-STAMP domain containing 2 (DCST2), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000368423 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:155018531:155031202:-1 gene:ENSG00000163354 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000368424 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:155018533:155033760:-1 gene:ENSG00000163354 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000485982 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:155018520:155033781:-1 gene:ENSG00000163354 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK057496 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ32934 fis, clone TESTI2007480. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK097993 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ40674 fis, clone THYMU2021684. // chr1 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// XM_006711164 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens DC-STAMP domain containing 2 (DCST2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// GENSCAN00000016410 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:155023360:155033701:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_018489 // RefSeq // Homo sapiens ash1 (absent, small, or homeotic)-like (Drosophila) (ASH1L), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000368346 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:155335268:155562693:-1 gene:ENSG00000116539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000392403 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:155336055:155562532:-1 gene:ENSG00000116539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF257305 // GenBank // Homo sapiens ASH1 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000016418 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:155337660:155414265:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0
ENST00000384405 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:155358712:155358818:-1 gene:ENSG00000207134 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT006733 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NR_002974 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 80E (SNORA80E), small nucleolar RNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000384744 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:155919909:155920045:-1 gene:ENSG00000207475 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT006777 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_003005 // RefSeq // Homo sapiens small Cajal body-specific RNA 4 (SCARNA4), guide RNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000516999 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:155925958:155926086:-1 gene:ENSG00000252808 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT006782 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_015327 // RefSeq // Homo sapiens SMG5 nonsense mediated mRNA decay factor (SMG5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000361813 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:156249224:156282825:-1 gene:ENSG00000198952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AB085691 // GenBank // Homo sapiens mRNA for SMG-5, complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// AY168922 // GenBank // Homo sapiens Est1p-like protein B mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// AY336728 // GenBank // Homo sapiens LPTS interacting protein (LPTSRP1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// BC038296 // GenBank // Homo sapiens Smg-5 homolog, nonsense mediated mRNA decay factor (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:33341 IMAGE:4824487), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000029116 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:156250587:156282955:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0
NM_001004319 // RefSeq // Homo sapiens von Hippel-Lindau tumor suppressor-like (VHLL), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000339922 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:156298624:156299299:-1 gene:ENSG00000189030 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY494836 // GenBank // Homo sapiens von-Hippel-Lindau-like protein (VLP) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC130596 // GenBank // Homo sapiens von Hippel-Lindau tumor suppressor-like, mRNA (cDNA clone MGC:163468 IMAGE:40146627), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC130598 // GenBank // Homo sapiens von Hippel-Lindau tumor suppressor-like, mRNA (cDNA clone MGC:163470 IMAGE:40146629), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000029088 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:156293044:156364858:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0
NR_029691 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 9-1 (MIR9-1), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// hsa-mir-9-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0000466 Homo sapiens miR-9-1 stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT006871 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENST00000383924 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:156484098:156484210:-1 gene:ENSG00000206651 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT006881 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_178229 // RefSeq // Homo sapiens IQ motif containing GTPase activating protein 3 (IQGAP3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000361170 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:156525405:156572540:-1 gene:ENSG00000183856 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// ENST00000491900 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:156525405:156572604:-1 gene:ENSG00000183856 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 93 // 41 // 41 // 0 /// AB105103 // GenBank // Homo sapiens IQGAP3 mRNA, complete cds. // chr1 // 93 // 98 // 40 // 43 // 0 /// AY253300 // GenBank // Homo sapiens IQGAP3 (IQGAP3) mRNA, complete cds. // chr1 // 93 // 91 // 37 // 40 // 0 /// BC131536 // GenBank // Homo sapiens IQ motif containing GTPase activating protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:141847 IMAGE:40082932), complete cds. // chr1 // 90 // 95 // 38 // 42 // 0 /// GENSCAN00000029105 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:156526486:156570171:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 34 // 34 // 0
NM_006617 // RefSeq // Homo sapiens nestin (NES), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000368223 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:156668763:156677397:-1 gene:ENSG00000132688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000029092 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:156667086:156677264:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
NM_014215 // RefSeq // Homo sapiens insulin receptor-related receptor (INSRR), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000368195 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:156840063:156859018:-1 gene:ENSG00000027644 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000029121 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:156837761:156856638:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
NM_014784 // RefSeq // Homo sapiens Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 11 (ARHGEF11), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 98 // 44 // 44 // 0 /// NM_198236 // RefSeq // Homo sapiens Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 11 (ARHGEF11), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENST00000361409 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:156935524:157045073:-1 gene:ENSG00000132694 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 98 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000368194 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:156934840:157045370:-1 gene:ENSG00000132694 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// AK302500 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50916 complete cds, highly similar to Rho guanine nucleotide exchange factor 11. // chr1 // 95 // 49 // 21 // 22 // 0 /// BC057394 // GenBank // Homo sapiens Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 11, mRNA (cDNA clone MGC:60344 IMAGE:6148684), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENST00000487682 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:156934845:156945631:-1 gene:ENSG00000132694 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 33 // 33 // 15 // 45 // 1 /// AL832790 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp667F1223 (from clone DKFZp667F1223). // chr1 // 31 // 31 // 14 // 45 // 1 /// GENSCAN00000029115 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:156936000:156971816:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 33 // 33 // 0
ENST00000497704 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:156985755:156986049:-1 gene:ENSG00000266160 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT006929 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001004341 // RefSeq // Homo sapiens ets variant 3-like (ETV3L), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000454449 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:157092044:157099808:-1 gene:ENSG00000253831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000017997 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:157091356:157119879:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NM_005240 // RefSeq // Homo sapiens ets variant 3 (ETV3), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000326786 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:157133145:157138474:-1 gene:ENSG00000117036 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000368192 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:157121191:157138367:-1 gene:ENSG00000117036 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// AF218540 // GenBank // Homo sapiens short mitogenic Ets transcriptional suppressor METS mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// BC022868 // GenBank // Homo sapiens ets variant 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:4107340), complete cds. // chr1 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// L16464 // GenBank // Human ETS oncogene (PEP1) mRNA, complete cds. // chr1 // 85 // 71 // 17 // 20 // 0 /// NM_001145312 // RefSeq // Homo sapiens ets variant 3 (ETV3), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// AK304789 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54664 complete cds, highly similar to ETS translocation variant 3. // chr1 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// AK316274 // GenBank // Homo sapiens cDNA, FLJ79173 complete cds, highly similar to ETS translocation variant 3. // chr1 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// GENSCAN00000017998 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:157124841:157167480:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
NM_031282 // RefSeq // Homo sapiens Fc receptor-like 4 (FCRL4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000271532 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:157573749:157598080:-1 gene:ENSG00000163518 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000448509 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:157574821:157589251:-1 gene:ENSG00000163518 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 61 // 22 // 22 // 0 /// AF329490 // GenBank // Homo sapiens IFGP2 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// AF329492 // GenBank // Homo sapiens IFGP2 mRNA, partial cds. // chr1 // 100 // 61 // 22 // 22 // 0 /// AF343659 // GenBank // Homo sapiens immunoglobulin superfamily receptor translocation associated protein 1c (IRTA1) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 91 // 89 // 29 // 32 // 0 /// AF343660 // GenBank // Homo sapiens immunoglobulin superfamily receptor translocation associated protein 1b (IRTA1) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 91 // 94 // 31 // 34 // 0 /// AF343661 // GenBank // Homo sapiens immunoglobulin superfamily receptor translocation associated protein 1a (IRTA1) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 92 // 100 // 33 // 36 // 0 /// AF397452 // GenBank // Homo sapiens Fc receptor-like protein 4 (FCRH4) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// BC125173 // GenBank // Homo sapiens Fc receptor-like 4, mRNA (cDNA clone MGC:150522 IMAGE:40121786), complete cds. // chr1 // 93 // 78 // 26 // 28 // 0 /// BC125174 // GenBank // Homo sapiens Fc receptor-like 4, mRNA (cDNA clone MGC:150523 IMAGE:40121790), complete cds. // chr1 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000017994 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:157515675:157700489:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1
NM_005894 // RefSeq // Homo sapiens CD5 molecule-like (CD5L), mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000368174 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:157830914:157841798:-1 gene:ENSG00000073754 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// AF011429 // GenBank // Homo sapiens AIM mRNA, complete cds. // chr1 // 95 // 56 // 19 // 20 // 0 /// AK292040 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75770 complete cds, highly similar to Homo sapiens CD5 antigen-like (scavenger receptor cysteine rich family) (CD5L), mRNA. // chr1 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// AY358494 // GenBank // Homo sapiens clone DNA33100 CD5L (UNQ203) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// BC033586 // GenBank // Homo sapiens CD5 molecule-like, mRNA (cDNA clone MGC:34443 IMAGE:5225975), complete cds. // chr1 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// U82812 // GenBank // Human scavenger receptor cysteine rich Sp alpha mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 86 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000017990 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:157709022:157841701:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1
ENST00000413990 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:158175850:158177755:-1 gene:ENSG00000227295 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NM_012081 // RefSeq // Homo sapiens elongation factor, RNA polymerase II, 2 (ELL2), mRNA. // chr1 // 67 // 100 // 6 // 9 // 0 /// ENST00000237853 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:95885098:95962071:-1 gene:ENSG00000118985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 67 // 100 // 6 // 9 // 0 /// AK296870 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51233 complete cds, highly similar to RNA polymerase II elongation factor ELL2. // chr1 // 67 // 100 // 6 // 9 // 0 /// AK297956 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60736 complete cds, highly similar to RNA polymerase II elongation factor ELL2. // chr1 // 67 // 100 // 6 // 9 // 0 /// AK300310 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52633 complete cds, highly similar to RNA polymerase II elongation factor ELL2. // chr1 // 67 // 100 // 6 // 9 // 0 /// BC028412 // GenBank // Homo sapiens elongation factor, RNA polymerase II, 2, mRNA (cDNA clone MGC:33555 IMAGE:4822236), complete cds. // chr1 // 67 // 100 // 6 // 9 // 0 /// BC151238 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:8860505, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr1 // 67 // 100 // 6 // 9 // 0 /// GENSCAN00000044459 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:158175844:158177856:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000049149 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:95888871:95974133:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 67 // 100 // 6 // 9 // 0
NM_001764 // RefSeq // Homo sapiens CD1b molecule (CD1B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000368168 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:158327951:158331531:-1 gene:ENSG00000158485 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000451207 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:158327951:158331025:-1 gene:ENSG00000158485 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0 /// AK303330 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58995 complete cds, highly similar to T-cell surface glycoprotein CD1b precursor. // chr1 // 100 // 70 // 16 // 16 // 0 /// BC069481 // GenBank // Homo sapiens CD1b molecule, mRNA (cDNA clone MGC:97106 IMAGE:7262331), complete cds. // chr1 // 95 // 87 // 19 // 20 // 0 /// BC074747 // GenBank // Homo sapiens CD1b molecule, mRNA (cDNA clone MGC:103825 IMAGE:30915207), complete cds. // chr1 // 89 // 78 // 16 // 18 // 0 /// BC104216 // GenBank // Homo sapiens CD1b molecule, mRNA (cDNA clone MGC:125990 IMAGE:40031984), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// BC104217 // GenBank // Homo sapiens CD1b molecule, mRNA (cDNA clone MGC:125991 IMAGE:40031985), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// M28826 // GenBank // Human thymocyte antigen CD1b mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// AK303329 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56727 complete cds, highly similar to T-cell surface glycoprotein CD1b precursor. // chr1 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1 /// GENSCAN00000044460 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:158329359:158331688:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 39 // 9 // 9 // 0
NM_001004475 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 10, subfamily T, member 2 (OR10T2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000334438 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:158398522:158399466:-1 gene:ENSG00000186306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000044447 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:158398522:158399328:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_001004476 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 10, subfamily K, member 2 (OR10K2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000314902 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:158419928:158420866:-1 gene:ENSG00000180708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
ENST00000424327 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:158445068:158446014:-1 gene:ENSG00000203758 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// GENSCAN00000044443 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:158445070:158445591:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0
NM_001005189 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 6, subfamily Y, member 1 (OR6Y1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000302617 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:158547128:158548105:-1 gene:ENSG00000197532 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000044453 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:158547128:158548105:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001160325 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 6, subfamily P, member 1 (OR6P1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000334632 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:158562651:158563604:-1 gene:ENSG00000186440 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000044455 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:158562651:158568837:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_001004477 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 10, subfamily X, member 1 (OR10X1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000368150 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:158578919:158579899:-1 gene:ENSG00000186400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000044449 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:158578919:158579848:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
NM_003126 // RefSeq // Homo sapiens spectrin, alpha, erythrocytic 1 (SPTA1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 59 // 59 // 0 /// ENST00000368147 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:158610706:158686698:-1 gene:ENSG00000163554 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 59 // 59 // 0 /// M61877 // GenBank // Human erythroid alpha-spectrin (SPTA1) mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 57 // 59 // 0 /// ENST00000614909 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:158610706:158686698:-1 gene:ENSG00000163554 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 59 // 59 // 0 /// GENSCAN00000044437 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:158611264:158717875:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 53 // 53 // 0
NM_001005279 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 6, subfamily K, member 2 (OR6K2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000359610 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:158699678:158700652:-1 gene:ENSG00000196171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC137022 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 6, subfamily K, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:168638 IMAGE:9021015), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC137023 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 6, subfamily K, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:168639 IMAGE:9021016), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000044437 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:158611264:158717875:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0
NM_001005327 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 6, subfamily K, member 3 (OR6K3), mRNA. // chr1 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000368145 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:158717168:158718115:-1 gene:ENSG00000203757 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000368146 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:158717168:158718163:-1 gene:ENSG00000203757 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0
ENST00000423179 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:158724113:158725067:-1 gene:ENSG00000180437 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000044445 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:158724113:158724820:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 10 // 10 // 0
NM_001005185 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 6, subfamily N, member 1 (OR6N1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000335094 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:158765744:158766682:-1 gene:ENSG00000197403 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC146847 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 6, subfamily N, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:181950 IMAGE:9056775), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000044456 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:158765744:158766682:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001005278 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 6, subfamily N, member 2 (OR6N2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000339258 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:158776682:158777635:-1 gene:ENSG00000188340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000044442 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:158776682:158809335:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000417823 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:158808399:158809335:-1 gene:ENSG00000180409 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000044442 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:158776682:158809335:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0
ENST00000514684 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:159279041:159280001:-1 gene:ENSG00000248642 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000039825 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:159279041:159279622:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0
NM_001004467 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 10, subfamily J, member 3 (OR10J3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000332217 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:159313670:159314659:-1 gene:ENSG00000196266 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000039803 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:159313670:159314659:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001004469 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 10, subfamily J, member 5 (OR10J5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000334857 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:159535078:159536007:-1 gene:ENSG00000184155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC137025 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 10, subfamily J, member 5, mRNA (cDNA clone MGC:168643 IMAGE:9021020), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC137026 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 10, subfamily J, member 5, mRNA (cDNA clone MGC:168644 IMAGE:9021021), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039813 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:159534743:159536007:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_001013661 // RefSeq // Homo sapiens V-set and immunoglobulin domain containing 8 (VSIG8), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000368100 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:159854316:159862657:-1 gene:ENSG00000243284 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC132893 // GenBank // Homo sapiens V-set and immunoglobulin domain containing 8, mRNA (cDNA clone MGC:164524 IMAGE:40146915), complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0 /// BC132895 // GenBank // Homo sapiens V-set and immunoglobulin domain containing 8, mRNA (cDNA clone MGC:164526 IMAGE:40146917), complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000039802 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:159854753:159869149:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 81 // 81 // 17 // 21 // 1
ENST00000390859 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:159851906:159851972:-1 gene:ENSG00000212161 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT007021 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_012337 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 19 (CCDC19), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000368099 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:159872364:159900163:-1 gene:ENSG00000213085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000426543 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:159872366:159898269:-1 gene:ENSG00000213085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000476696 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:159872364:159900125:-1 gene:ENSG00000213085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000479940 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:159886599:159900112:-1 gene:ENSG00000213085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// AF094758 // GenBank // Homo sapiens nasopharyngeal epithelium specific protein 1 (NESG1) mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// AK225582 // GenBank // Homo sapiens mRNA for Nasopharyngeal epithelium specific protein 1 variant, clone: LNG10081. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AK292249 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77178 complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC089391 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 19, mRNA (cDNA clone MGC:102946 IMAGE:30387473), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000621979 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:159872368:159900149:-1 gene:ENSG00000213085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000039814 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:159872485:159918428:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
NM_001277224 // RefSeq // Homo sapiens transgelin 2 (TAGLN2), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 73 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000368096 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:159918107:159923717:-1 gene:ENSG00000158710 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 8 // 8 // 0 /// AY007127 // GenBank // Homo sapiens clone CDABP0035 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 73 // 8 // 8 // 0 /// BC009357 // GenBank // Homo sapiens transgelin 2, mRNA (cDNA clone MGC:15279 IMAGE:4301018), complete cds. // chr1 // 100 // 73 // 8 // 8 // 0 /// CR542126 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834B0923D for gene TAGLN2, transgelin 2; complete cds, incl. stopcodon. // chr1 // 100 // 55 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000368097 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:159918107:159925732:-1 gene:ENSG00000158710 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 1 /// NM_001277223 // RefSeq // Homo sapiens transgelin 2 (TAGLN2), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 73 // 73 // 8 // 11 // 1 /// NM_003564 // RefSeq // Homo sapiens transgelin 2 (TAGLN2), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 73 // 73 // 8 // 11 // 1 /// GU727636 // GenBank // Homo sapiens epididymis tissue sperm binding protein Li 7e mRNA, complete cds. // chr1 // 73 // 73 // 8 // 11 // 1
NM_145167 // RefSeq // Homo sapiens phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class M (PIGM), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000368090 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:160027673:160031991:-1 gene:ENSG00000143315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB028127 // GenBank // Homo sapiens PIG-M mRNA for mannosyltransferase, complete cds. // chr1 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC001803 // GenBank // Homo sapiens phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class M, mRNA (cDNA clone MGC:3194 IMAGE:3357207), complete cds. // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC019865 // GenBank // Homo sapiens phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class M, mRNA (cDNA clone MGC:29896 IMAGE:4931239), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_002241 // RefSeq // Homo sapiens potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 10 (KCNJ10), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000368089 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:160037467:160070248:-1 gene:ENSG00000177807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC131627 // GenBank // Homo sapiens potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 10, mRNA (cDNA clone MGC:149802 IMAGE:40118533), complete cds. // chr1 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// U52155 // GenBank // Human ATP-dependent inwardly rectifying potassium channel Kir4.1 mRNA, complete cds. // chr1 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000005598 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:160041393:160042532:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0
NM_001098398 // RefSeq // Homo sapiens coatomer protein complex, subunit alpha (COPA), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// NM_004371 // RefSeq // Homo sapiens coatomer protein complex, subunit alpha (COPA), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000241704 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:160289273:160343400:-1 gene:ENSG00000122218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000368069 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:160289273:160343248:-1 gene:ENSG00000122218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// BC038447 // GenBank // Homo sapiens coatomer protein complex, subunit alpha, mRNA (cDNA clone MGC:45155 IMAGE:5533230), complete cds. // chr1 // 97 // 95 // 38 // 39 // 0 /// U24105 // GenBank // Homo sapiens coatomer protein (COPA) mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 95 // 38 // 39 // 0 /// GENSCAN00000005582 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:160290157:160343060:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 33 // 33 // 0
ENST00000365208 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:160326104:160326216:-1 gene:ENSG00000202078 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT007059 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000364738 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:160392768:160392909:-1 gene:ENSG00000201608 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT007062 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_080878 // RefSeq // Homo sapiens intelectin 2 (ITLN2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006711170 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens intelectin 2 (ITLN2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000368029 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:160945025:160954799:-1 gene:ENSG00000158764 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AY065973 // GenBank // Homo sapiens endothelial lectin HL-2 mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// AY358905 // GenBank // Homo sapiens clone DNA108701 ITLN2 (UNQ2789) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC117225 // GenBank // Homo sapiens intelectin 2, mRNA (cDNA clone MGC:150834 IMAGE:40125776), complete cds. // chr1 // 97 // 97 // 30 // 31 // 0 /// BC143339 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:9051844. // chr1 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// BC143341 // GenBank // Homo sapiens intelectin 2, mRNA (cDNA clone MGC:176863 IMAGE:9051846), complete cds. // chr1 // 97 // 97 // 30 // 31 // 0 /// ENST00000494442 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:160945094:160951012:-1 gene:ENSG00000158764 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 53 // 53 // 17 // 32 // 1 /// GENSCAN00000005580 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:160945140:160954807:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0
NM_030916 // RefSeq // Homo sapiens poliovirus receptor-related 4 (PVRL4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000368012 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:161070995:161089599:-1 gene:ENSG00000143217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AB755430 // GenBank // Homo sapiens mRNA for nectin 4, complete cds. // chr1 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// AF160477 // GenBank // Homo sapiens Ig superfamily receptor LNIR precursor, mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// AF426163 // GenBank // Homo sapiens nectin 4 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// AK298981 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61684 complete cds, highly similar to Homo sapiens poliovirus receptor-related 4 (PVRL4), mRNA. // chr1 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// AK301481 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52269 complete cds, highly similar to Homo sapiens poliovirus receptor-related 4 (PVRL4), mRNA. // chr1 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0 /// BC010423 // GenBank // Homo sapiens poliovirus receptor-related 4, mRNA (cDNA clone MGC:15117 IMAGE:3610849), complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BX641083 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686K05193 (from clone DKFZp686K05193). // chr1 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000013873 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:161072661:161089296:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0
NM_012394 // RefSeq // Homo sapiens prefoldin subunit 2 (PFDN2), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000368010 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:161100556:161118111:-1 gene:ENSG00000143256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000468311 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:161100556:161118055:-1 gene:ENSG00000143256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// AF117237 // GenBank // Homo sapiens prefoldin subunit 2 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// AF165883 // GenBank // Homo sapiens prefoldin subunit 2 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// BC012464 // GenBank // Homo sapiens prefoldin subunit 2, mRNA (cDNA clone MGC:21606 IMAGE:4538003), complete cds. // chr1 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// BC047042 // GenBank // Homo sapiens prefoldin subunit 2, mRNA (cDNA clone MGC:51828 IMAGE:5541226), complete cds. // chr1 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000013877 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:161100683:161118026:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT007107 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0
NM_005099 // RefSeq // Homo sapiens ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 4 (ADAMTS4), mRNA. // chr1 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000367995 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:161195979:161199053:-1 gene:ENSG00000158859 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000367996 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:161184308:161199056:-1 gene:ENSG00000158859 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// AF148213 // GenBank // Homo sapiens aggrecanase-1 mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 75 // 23 // 24 // 0 /// AK291573 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76304 complete cds, highly similar to Homo sapiens ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 4 (ADAMTS4), mRNA. // chr1 // 91 // 69 // 20 // 22 // 0 /// AY358886 // GenBank // Homo sapiens clone DNA73492 ADAMTS4 (UNQ769) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// BC030812 // GenBank HTC // Homo sapiens ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:4693587), with apparent retained intron. // chr1 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// BC063293 // GenBank // Homo sapiens ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 4, mRNA (cDNA clone MGC:71631 IMAGE:5303796), complete cds. // chr1 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000013856 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:161191138:161198627:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0
NM_001013625 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 192 (C1orf192), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000367974 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:161364731:161367874:-1 gene:ENSG00000188931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000013850 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:161364965:161379359:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// AK127987 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ46103 fis, clone TESTI2023903, weakly similar to Homo sapiens ubiquilin 1 (UBQLN1). // chr1 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
ENST00000367938 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:161983553:161985232:-1 gene:ENSG00000162745 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 33 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000525589 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:161983193:161983941:-1 gene:ENSG00000162745 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 21 // 9 // 9 // 0 /// BC047472 // GenBank // Homo sapiens olfactomedin-like 2B, mRNA (cDNA clone IMAGE:5269601), complete cds. // chr1 // 100 // 33 // 14 // 14 // 0 /// NM_015441 // RefSeq // Homo sapiens olfactomedin-like 2B (OLFML2B), mRNA. // chr1 // 95 // 95 // 40 // 42 // 1 /// ENST00000294794 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:161983192:162023854:-1 gene:ENSG00000162745 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 95 // 40 // 42 // 1 /// ENST00000367940 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:161983456:162023640:-1 gene:ENSG00000162745 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 86 // 86 // 36 // 42 // 1 /// AK301499 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54313 complete cds, highly similar to Homo sapiens olfactomedin-like 2B (OLFML2B), mRNA. // chr1 // 83 // 83 // 35 // 42 // 1 /// AK316154 // GenBank // Homo sapiens cDNA, FLJ79053 complete cds, highly similar to Homo sapiens olfactomedin-like 2B (OLFML2B), mRNA. // chr1 // 86 // 86 // 36 // 42 // 1 /// BC067274 // GenBank // Homo sapiens olfactomedin-like 2B, mRNA (cDNA clone MGC:75232 IMAGE:6177792), complete cds. // chr1 // 95 // 95 // 40 // 42 // 1 /// AB119054 // GenBank // Homo sapiens mRNA for photomedin-2, complete cds. // chr1 // 71 // 71 // 30 // 42 // 1 /// GENSCAN00000029459 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:161972567:162023430:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 67 // 67 // 28 // 42 // 1
NM_182581 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 111 (C1orf111), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_005245103 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 111 (C1orf111), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000367935 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:162373203:162376870:-1 gene:ENSG00000171722 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC032957 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 111, mRNA (cDNA clone MGC:33651 IMAGE:4827863), complete cds. // chr1 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// ENST00000493255 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:162374444:162376808:-1 gene:ENSG00000171722 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// ENST00000620601 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:162374074:162376832:-1 gene:ENSG00000171722 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 88 // 93 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029466 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:162374048:162412016:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// NONHSAT007218 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_053282 // RefSeq // Homo sapiens SH2 domain containing 1B (SH2D1B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000367929 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:162395266:162412126:-1 gene:ENSG00000198574 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF256653 // GenBank // Homo sapiens SH2 domain-containing molecule EAT2 (EAT2) mRNA, complete cds. // chr1 // 93 // 56 // 14 // 15 // 0 /// AF403479 // GenBank // Homo sapiens EWS/FLI1 activated transcript 2 protein mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// AF484964 // GenBank // Homo sapiens EWS/FLI1 activated transcript 2-like protein mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC022407 // GenBank // Homo sapiens SH2 domain containing 1B, mRNA (cDNA clone MGC:24157 IMAGE:4717041), complete cds. // chr1 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// BC066595 // GenBank // Homo sapiens SH2 domain containing 1B, mRNA (cDNA clone MGC:74501 IMAGE:5755414), complete cds. // chr1 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000493550 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:162402477:162412138:-1 gene:ENSG00000198574 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// GENSCAN00000029466 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:162374048:162412016:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// NONHSAT007219 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_178550 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 110 (C1orf110), mRNA. // chr1 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// XM_005245125 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 110 (C1orf110), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000367910 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:162854297:162868761:-1 gene:ENSG00000185860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000367911 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:162854297:162859664:-1 gene:ENSG00000185860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// AK123573 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ41579 fis, clone CTONG2019704. // chr1 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// BC040018 // GenBank HTC // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 110, mRNA (cDNA clone IMAGE:5753568), containing frame-shift errors. // chr1 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000367912 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:162851316:162868815:-1 gene:ENSG00000185860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 67 // 67 // 16 // 24 // 1 /// GENSCAN00000029477 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:162854765:162855750:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 54 // 12 // 13 // 0
ENST00000363457 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:163468496:163468605:-1 gene:ENSG00000200327 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT007270 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000619303 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:164703026:164703309:-1 gene:ENSG00000276359 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0
NM_001017961 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 78, member B (FAM78B), mRNA. // chr1 // 100 // 41 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000338353 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:166070020:166166969:-1 gene:ENSG00000188859 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 49 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000354422 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:166070019:166166715:-1 gene:ENSG00000188859 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 41 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000435676 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:166057426:166166225:-1 gene:ENSG00000188859 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 88 // 43 // 43 // 0 /// ENST00000441649 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:166059901:166166234:-1 gene:ENSG00000188859 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 39 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000456900 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:166059689:166166381:-1 gene:ENSG00000188859 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 41 // 20 // 20 // 0 /// AK055347 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ30785 fis, clone FEBRA2000901. // chr1 // 92 // 51 // 23 // 25 // 0 /// AK299946 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55421 complete cds. // chr1 // 100 // 41 // 20 // 20 // 0 /// BC114214 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 78, member B, mRNA (cDNA clone MGC:131653 IMAGE:5588830), complete cds. // chr1 // 100 // 49 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000017206 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:166070241:166075608:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 16 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000017212 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:166164993:166166736:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 16 // 16 // 8 // 49 // 1
NM_053053 // RefSeq // Homo sapiens transcriptional adaptor 1 (TADA1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000367874 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:166856510:166876327:-1 gene:ENSG00000152382 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000467021 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:166856510:166863216:-1 gene:ENSG00000152382 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// AK290964 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77638 complete cds, highly similar to Homo sapiens SPT3-associated factor 42 (STAF42), mRNA. // chr1 // 93 // 97 // 27 // 29 // 0 /// AK291922 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75093 complete cds, highly similar to Homo sapiens transcriptional adaptor 1-like (TADA1L), mRNA. // chr1 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// BC015401 // GenBank // Homo sapiens transcriptional adaptor 1 (HFI1 homolog, yeast)-like, mRNA (cDNA clone MGC:21805 IMAGE:4182025), complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// BC036497 // GenBank HTC // Homo sapiens transcriptional adaptor 1 (HFI1 homolog, yeast)-like, mRNA (cDNA clone IMAGE:5264296), with apparent retained intron. // chr1 // 88 // 57 // 15 // 17 // 0 /// AK309250 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99291. // chr1 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// AK310391 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17433. // chr1 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// GENSCAN00000017204 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:166857567:166884634:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
NM_003851 // RefSeq // Homo sapiens cellular repressor of E1A-stimulated genes 1 (CREG1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000370509 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:167541013:167553767:-1 gene:ENSG00000143162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AF084523 // GenBank // Homo sapiens cellular repressor of E1A-stimulated genes CREG mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AY359071 // GenBank // Homo sapiens clone DNA71269 CREG (UNQ727) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// BC006786 // GenBank // Homo sapiens cellular repressor of E1A-stimulated genes 1, mRNA (cDNA clone MGC:5274 IMAGE:2900817), complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC008628 // GenBank // Homo sapiens cellular repressor of E1A-stimulated genes 1, mRNA (cDNA clone MGC:17147 IMAGE:4339480), complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000032360 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:167543393:167553741:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NR_026844 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat domain 36B pseudogene 1 (ANKRD36BP1), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000358576 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:168245565:168247343:-1 gene:ENSG00000214262 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000604892 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:168245788:168247204:-1 gene:ENSG00000214262 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr1 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT007426 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENST00000384153 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:168263375:168263481:-1 gene:ENSG00000206880 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT007432 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_003175 // RefSeq // Homo sapiens chemokine (C motif) ligand 2 (XCL2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000367819 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:168540765:168543997:-1 gene:ENSG00000143185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC069360 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C motif) ligand 2, mRNA (cDNA clone MGC:97475 IMAGE:7262751), complete cds. // chr1 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0 /// BC070308 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C motif) ligand 2, mRNA (cDNA clone MGC:88310 IMAGE:30413788), complete cds. // chr1 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0
NM_001937 // RefSeq // Homo sapiens dermatopontin (DPT), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000367817 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:168695459:168729264:-1 gene:ENSG00000143196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC033736 // GenBank // Homo sapiens dermatopontin, mRNA (cDNA clone MGC:45278 IMAGE:5176855), complete cds. // chr1 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// Z22865 // GenBank // H.sapiens dermatopontin mRNA, complete CDS. // chr1 // 75 // 40 // 9 // 12 // 0 /// AK292596 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75811 complete cds, highly similar to Homo sapiens dermatopontin (DPT), mRNA. // chr1 // 86 // 73 // 19 // 22 // 0 /// GENSCAN00000000028 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:168696549:168729174:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_021179 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 181 (CCDC181), mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// XM_005245383 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens coiled-coil domain containing 181 (CCDC181), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000367805 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:169394870:169427474:-1 gene:ENSG00000117477 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000367806 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:169394870:169427417:-1 gene:ENSG00000117477 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000456107 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:169421363:169427462:-1 gene:ENSG00000117477 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000491570 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:169418786:169427474:-1 gene:ENSG00000117477 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000545005 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:169395047:169460669:-1 gene:ENSG00000117477 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// AK313598 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ94167. // chr1 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// BC026073 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 114, mRNA (cDNA clone MGC:26487 IMAGE:4827122), complete cds. // chr1 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000022790 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:169395047:169486321:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
NM_000130 // RefSeq // Homo sapiens coagulation factor V (proaccelerin, labile factor) (F5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000367796 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:169514166:169586588:-1 gene:ENSG00000198734 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000367797 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:169514166:169586588:-1 gene:ENSG00000198734 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AK300469 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50218 complete cds, highly similar to Coagulation factor V precursor. // chr1 // 83 // 35 // 10 // 12 // 0 /// M14335 // GenBank // Human coagulation factor V mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// M16967 // GenBank // Human coagulation factor V mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// GENSCAN00000022784 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:169514313:169555342:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0
NM_000655 // RefSeq // Homo sapiens selectin L (SELL), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NR_029467 // RefSeq // Homo sapiens selectin L (SELL), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr1 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000236147 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:169690667:169711698:-1 gene:ENSG00000188404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000466340 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:169704727:169710532:-1 gene:ENSG00000188404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// AK298705 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57560 complete cds, highly similar to L-selectin precursor. // chr1 // 87 // 58 // 13 // 15 // 0 /// BC020758 // GenBank // Homo sapiens selectin L, mRNA (cDNA clone MGC:22611 IMAGE:4717456), complete cds. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// M25280 // GenBank // Human lymph node homing receptor mRNA, complete cds. // chr1 // 92 // 92 // 22 // 24 // 0 /// ENST00000463108 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:169701495:169711698:-1 gene:ENSG00000188404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// NONHSAT007472 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000022779 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:169556629:169738567:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_033418 // RefSeq // Homo sapiens methyltransferase like 18 (METTL18), mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// XM_006711627 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens methyltransferase like 18 (METTL18), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000303469 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:169792529:169794689:-1 gene:ENSG00000171806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000310392 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:169792529:169794966:-1 gene:ENSG00000171806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000454472 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:169793142:169794963:-1 gene:ENSG00000171806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// AY744366 // GenBank // Homo sapiens arsenic-transactivated protein 2 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0 /// BC008679 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 156, mRNA (cDNA clone MGC:9084 IMAGE:3854146), complete cds. // chr1 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022788 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:169792577:169797351:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
ENST00000467795 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:169957942:169958246:-1 gene:ENSG00000243051 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT007483 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENST00000383965 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:171253906:171254022:-1 gene:ENSG00000206692 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT007522 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AF116629 // GenBank HTC // Homo sapiens PRO1257 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
ENST00000365212 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:171418644:171418750:-1 gene:ENSG00000202082 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT007528 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000364256 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:171519816:171519913:-1 gene:ENSG00000201126 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT007534 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENST00000498507 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:171824610:171824959:-1 gene:ENSG00000224600 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000040178 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:171824611:171824961:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NR_029627 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 214 (MIR214), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_038397 // RefSeq // Homo sapiens DNM3 opposite strand/antisense RNA (DNM3OS), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_103486 // RefSeq // Homo sapiens DNM3 opposite strand/antisense RNA (DNM3OS), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000385214 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:172138798:172138907:-1 gene:ENSG00000207949 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000417354 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:172136531:172144794:-1 gene:ENSG00000230630 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-214 // miRBase Micro RNA Database // MI0000290 Homo sapiens miR-214 stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT007596 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT007597 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT007598 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT007599 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029618 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 199a-2 (MIR199A2), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_038397 // RefSeq // Homo sapiens DNM3 opposite strand/antisense RNA (DNM3OS), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000385289 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:172144535:172144644:-1 gene:ENSG00000208024 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-199a-2 // miRBase Micro RNA Database // MI0000281 Homo sapiens miR-199a-2 stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT007596 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT007598 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT007603 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000367728 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:172441457:172444086:-1 gene:ENSG00000135845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// D85418 // GenBank // Homo sapiens mRNA for phosphatidylinositol-glycan-class C (PIG-C), complete cds. // chr1 // 100 // 57 // 12 // 12 // 0 /// NM_002642 // RefSeq // Homo sapiens phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class C (PIGC), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 62 // 62 // 13 // 21 // 1 /// NM_153747 // RefSeq // Homo sapiens phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class C (PIGC), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 62 // 62 // 13 // 21 // 1 /// ENST00000344529 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:172441457:172444060:-1 gene:ENSG00000135845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 57 // 57 // 12 // 21 // 1 /// BC006539 // GenBank // Homo sapiens phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class C, mRNA (cDNA clone MGC:2049 IMAGE:2823399), complete cds. // chr1 // 57 // 57 // 12 // 21 // 1 /// ENST00000478184 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:172442331:172443946:-1 gene:ENSG00000135845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1
NM_005092 // RefSeq // Homo sapiens tumor necrosis factor (ligand) superfamily, member 18 (TNFSF18), mRNA. // chr1 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000404377 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:173039960:173050963:-1 gene:ENSG00000120337 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF117713 // GenBank // Homo sapiens AITR ligand (TL6) mRNA, complete cds. // chr1 // 75 // 59 // 12 // 16 // 0 /// AF125303 // GenBank // Homo sapiens glucocorticoid-induced TNFR-related protein ligand (TNFSF18) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// AY358868 // GenBank // Homo sapiens clone DNA19355 GITRL (UNQ149) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC069319 // GenBank // Homo sapiens tumor necrosis factor (ligand) superfamily, member 18, mRNA (cDNA clone MGC:96898 IMAGE:7262107), complete cds. // chr1 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// BC093986 // GenBank // Homo sapiens tumor necrosis factor (ligand) superfamily, member 18, mRNA (cDNA clone MGC:121021 IMAGE:7939831), complete cds. // chr1 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// BC112032 // GenBank // Homo sapiens tumor necrosis factor (ligand) superfamily, member 18, mRNA (cDNA clone MGC:138237 IMAGE:8327500), complete cds. // chr1 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000016937 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:172973547:173087202:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_178527 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 9, member C2 (putative) (SLC9C2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000367714 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:173500464:173603094:-1 gene:ENSG00000162753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000466087 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:173500470:173576751:-1 gene:ENSG00000162753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0 /// AK302731 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50303 complete cds, weakly similar to Mus musculus solute carrier family 9, isoform 10 (Slc9a10), mRNA. // chr1 // 92 // 39 // 12 // 13 // 0 /// BC042592 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 9, member 11, mRNA (cDNA clone MGC:43026 IMAGE:4838901), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BX648119 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686J0440 (from clone DKFZp686J0440). // chr1 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000016953 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:173505236:173527746:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// NONHSAT007639 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0
NM_198493 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat domain 45 (ANKRD45), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000333279 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:173609561:173669862:-1 gene:ENSG00000183831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// BC126353 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat domain 45, mRNA (cDNA clone MGC:161631 IMAGE:8992069), complete cds. // chr1 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// BC126355 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat domain 45, mRNA (cDNA clone MGC:161633 IMAGE:8992071), complete cds. // chr1 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000367712 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:173657626:173669832:-1 gene:ENSG00000183831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1 /// BC094694 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:30390156. // chr1 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1 /// GENSCAN00000016950 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:173610145:173692866:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT007645 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
NONHSAT007646 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000422183 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:173863902:173867043:-1 gene:ENSG00000234741 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000434796 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:173863980:173864901:-1 gene:ENSG00000234741 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000456812 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:173863901:173867043:-1 gene:ENSG00000234741 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NR_003938 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 81 (SNORD81), small nucleolar RNA. // chr1 // 63 // 84 // 10 // 16 // 0 /// NONHSAT007659 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT007669 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT007673 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT007676 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT007683 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT007685 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT007686 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 63 // 84 // 10 // 16 // 0
NR_002746 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 47 (SNORD47), small nucleolar RNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000412059 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:173863901:173867987:-1 gene:ENSG00000234741 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000431268 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:173863901:173867989:-1 gene:ENSG00000234741 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000454813 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:173863902:173864871:-1 gene:ENSG00000234741 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC038733 // GenBank // Homo sapiens growth arrest-specific 5, mRNA (cDNA clone IMAGE:5267691). // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT007659 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT007664 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT007667 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT007672 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT007676 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT007678 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT007687 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BX648275 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686I12119 (from clone DKFZp686I12119). // chr1 // 61 // 100 // 14 // 23 // 0
ENST00000416952 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:173865168:173867988:-1 gene:ENSG00000234741 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000436656 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:173863901:173867989:-1 gene:ENSG00000234741 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000442067 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:173864631:173867043:-1 gene:ENSG00000234741 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000443799 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:173865353:173867989:-1 gene:ENSG00000234741 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_003939 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 79 (SNORD79), small nucleolar RNA. // chr1 // 44 // 100 // 11 // 25 // 0 /// NONHSAT007671 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT007676 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT007691 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT007694 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT007695 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_003944 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 78 (SNORD78), small nucleolar RNA. // chr1 // 65 // 100 // 13 // 20 // 0 /// NONHSAT007697 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 65 // 100 // 13 // 20 // 0
NR_002750 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 44 (SNORD44), small nucleolar RNA. // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000421068 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:173865818:173867987:-1 gene:ENSG00000234741 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000443799 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:173865353:173867989:-1 gene:ENSG00000234741 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000456293 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:173865249:173867991:-1 gene:ENSG00000234741 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// X96643 // GenBank // H.sapiens mRNA for U44 small nuclear RNA. // chr1 // 75 // 94 // 12 // 16 // 0 /// NONHSAT007693 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT007695 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT007698 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT007700 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 75 // 94 // 12 // 16 // 0
ENST00000421068 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:173865818:173867987:-1 gene:ENSG00000234741 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000458220 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:173866216:173867987:-1 gene:ENSG00000234741 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NR_003943 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 77 (SNORD77), small nucleolar RNA. // chr1 // 64 // 100 // 14 // 22 // 0 /// NONHSAT007659 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT007698 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT007701 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT007702 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 64 // 100 // 14 // 22 // 0
NR_003941 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 75 (SNORD75), small nucleolar RNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT007659 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT007704 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000451607 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:173865524:173867729:-1 gene:ENSG00000234741 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NR_002579 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 74 (SNORD74), small nucleolar RNA. // chr1 // 56 // 100 // 14 // 25 // 0 /// NONHSAT007659 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT007696 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT007705 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_000488 // RefSeq // Homo sapiens serpin peptidase inhibitor, clade C (antithrombin), member 1 (SERPINC1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000367698 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:173903809:173917378:-1 gene:ENSG00000117601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// D29832 // GenBank // Homo sapiens AT-III mRNA for antithrombin III variant, complete cds. // chr1 // 73 // 90 // 19 // 26 // 0 /// BC022309 // GenBank // Homo sapiens serpin peptidase inhibitor, clade C (antithrombin), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:22579 IMAGE:4734914), complete cds. // chr1 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1 /// GENSCAN00000016938 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:173903889:173965110:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000617423 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:173903804:173917378:-1 gene:ENSG00000117601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 76 // 76 // 22 // 29 // 1
NM_172071 // RefSeq // Homo sapiens ring finger and CCCH-type domains 1 (RC3H1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006711183 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ring finger and CCCH-type domains 1 (RC3H1), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000258349 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:173931214:173993064:-1 gene:ENSG00000135870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000367694 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:173938411:173993072:-1 gene:ENSG00000135870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000367696 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:173931214:174022297:-1 gene:ENSG00000135870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC136784 // GenBank // Homo sapiens ring finger and CCCH-type zinc finger domains 1, mRNA (cDNA clone MGC:168397 IMAGE:9020774), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC144408 // GenBank // Homo sapiens ring finger and CCCH-type zinc finger domains 1, mRNA (cDNA clone MGC:177946 IMAGE:9052929), complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005431 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:173970505:174090472:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000016938 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:173903889:173965110:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1
ENST00000363885 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:173969318:173969436:-1 gene:ENSG00000200755 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT007716 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000488676 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:174090136:174090474:-1 gene:ENSG00000225713 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005431 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:173970505:174090472:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0
NONHSAT007728 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_022100 // RefSeq // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein S14 (MRPS14), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NR_037606 // RefSeq // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein S14 (MRPS14), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000367677 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:175014245:175023415:-1 gene:ENSG00000120333 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000476371 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:175012958:175023425:-1 gene:ENSG00000120333 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC009788 // GenBank // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein S14, mRNA (cDNA clone MGC:13571 IMAGE:4132323), complete cds. // chr1 // 94 // 62 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000001363 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:175015520:175023408:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0
ENST00000326105 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:175044626:175045648:-1 gene:ENSG00000181101 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000001377 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:175044626:175045712:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_003285 // RefSeq // Homo sapiens tenascin R (TNR), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000263525 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:175322799:175743616:-1 gene:ENSG00000116147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000367674 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:175315194:175743770:-1 gene:ENSG00000116147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC129830 // GenBank // Homo sapiens tenascin R (restrictin, janusin), mRNA (cDNA clone MGC:149328 IMAGE:40114168), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000001371 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:175323357:175406714:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
ENST00000423476 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:176616273:176616786:-1 gene:ENSG00000237514 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 81 // 100 // 17 // 21 // 0 /// GENSCAN00000041076 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:176616268:176616741:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT007783 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT007784 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
XR_241157 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens uncharacterized LOC646976 (LOC646976), misc_RNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000608517 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:178724306:178726285:-1 gene:ENSG00000273062 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AK096082 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ38763 fis, clone KIDNE2014119. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_004673 // RefSeq // Homo sapiens angiopoietin-like 1 (ANGPTL1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XR_241102 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens angiopoietin-like 1 (ANGPTL1), transcript variant X2, misc_RNA. // chr1 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000234816 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:178849705:178871052:-1 gene:ENSG00000116194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000367629 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:178850624:178871022:-1 gene:ENSG00000116194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// AB056476 // GenBank // Homo sapiens ARP1 mRNA for angiopoietin-related protein 1, complete cds. // chr1 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// AF107253 // GenBank // Homo sapiens angiopoietin Y1 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// AY358278 // GenBank // Homo sapiens clone DNA28497 NL5 (UNQ162) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC050640 // GenBank // Homo sapiens angiopoietin-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:60131 IMAGE:5725751), complete cds. // chr1 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// AK300218 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51304 complete cds, highly similar to Angiopoietin-related protein 1 precursor. // chr1 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// GENSCAN00000000717 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:178844693:178865776:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0
NM_014625 // RefSeq // Homo sapiens nephrosis 2, idiopathic, steroid-resistant (podocin) (NPHS2), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// XM_006711529 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens nephrosis 2, idiopathic, steroid-resistant (podocin) (NPHS2), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000367615 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:179550539:179575933:-1 gene:ENSG00000116218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000367616 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:179550539:179575952:-1 gene:ENSG00000116218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC029141 // GenBank // Homo sapiens nephrosis 2, idiopathic, steroid-resistant (podocin), mRNA (cDNA clone MGC:34362 IMAGE:5187188), complete cds. // chr1 // 92 // 87 // 24 // 26 // 0 /// NM_001297575 // RefSeq // Homo sapiens nephrosis 2, idiopathic, steroid-resistant (podocin) (NPHS2), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000039960 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:179551173:179577813:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
NM_001199260 // RefSeq // Homo sapiens torsin A interacting protein 2 (TOR1AIP2), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_145034 // RefSeq // Homo sapiens torsin A interacting protein 2 (TOR1AIP2), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000367612 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:179839967:179877799:-1 gene:ENSG00000169905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000609928 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:179843931:179877803:-1 gene:ENSG00000169905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC101532 // GenBank // Homo sapiens torsin A interacting protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:126581 IMAGE:8069038), complete cds. // chr1 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// BC112225 // GenBank // Homo sapiens torsin A interacting protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:138430 IMAGE:8327693), complete cds. // chr1 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000039954 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:179840275:179852665:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0
NM_022347 // RefSeq // Homo sapiens torsin A interacting protein 2 (TOR1AIP2), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000482587 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:179859030:179877799:-1 gene:ENSG00000169905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK289793 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77012 complete cds, highly similar to Homo sapiens interferon responsive gene 15 (IFRG15), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC096704 // GenBank // Homo sapiens interferon responsive gene 15, mRNA (cDNA clone MGC:120075 IMAGE:40021613), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC098170 // GenBank // Homo sapiens interferon responsive gene 15, mRNA (cDNA clone MGC:120076 IMAGE:40021614), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC098309 // GenBank // Homo sapiens interferon responsive gene 15, mRNA (cDNA clone MGC:120077 IMAGE:40021617), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC098348 // GenBank // Homo sapiens interferon responsive gene 15, mRNA (cDNA clone MGC:120074 IMAGE:40021612), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC032790 // GenBank // Homo sapiens interferon responsive gene 15, mRNA (cDNA clone IMAGE:3451211), partial cds. // chr1 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// ENST00000495650 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:179865065:179877790:-1 gene:ENSG00000169905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// BC065285 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6016511, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT008220 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONHSAT008221 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
ENST00000610272 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:179881607:179882595:-1 gene:ENSG00000272906 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC004969 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:2906290. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONHSAT008225 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_032360 // RefSeq // Homo sapiens acyl-CoA binding domain containing 6 (ACBD6), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000367595 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:180288230:180502954:-1 gene:ENSG00000230124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSG00000135847 // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000496993 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:180275380:180430262:-1 gene:ENSG00000230124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript gene:ENSG00000135847 // chr1 // 100 // 58 // 21 // 21 // 0 /// AY606133 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 acyl-CoA binding protein-like mRNA, complete sequence. // chr1 // 85 // 92 // 28 // 33 // 0 /// BC006505 // GenBank // Homo sapiens acyl-Coenzyme A binding domain containing 6, mRNA (cDNA clone MGC:2404 IMAGE:2821736), complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000475338 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:180286983:180413388:-1 gene:ENSG00000230124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript gene:ENSG00000135847 // chr1 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1 /// GENSCAN00000035103 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:180395258:180502266:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT008257 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1
ENST00000384178 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:180519016:180519119:-1 gene:ENSG00000206905 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT008261 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001286210 // RefSeq // Homo sapiens syntaxin 6 (STX6), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0 /// NM_005819 // RefSeq // Homo sapiens syntaxin 6 (STX6), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000258301 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:180972725:181022911:-1 gene:ENSG00000135823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000469135 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:180973039:180989377:-1 gene:ENSG00000135823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 59 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000542060 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:180972712:181023121:-1 gene:ENSG00000135823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0 /// AK299063 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57566 complete cds, highly similar to Syntaxin-6. // chr1 // 100 // 46 // 17 // 17 // 0 /// BC039118 // GenBank HTC // Homo sapiens syntaxin 6, mRNA (cDNA clone IMAGE:4831269), with apparent retained intron. // chr1 // 95 // 59 // 21 // 22 // 0 /// BC009944 // GenBank // Homo sapiens syntaxin 6, mRNA (cDNA clone MGC:12919 IMAGE:4122224), complete cds. // chr1 // 62 // 62 // 23 // 37 // 1 /// AJ002078 // GenBank // Homo sapiens mRNA for syntaxin 6, complete CDS. // chr1 // 46 // 46 // 17 // 37 // 1 /// CR541856 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834F0632D for gene STX6, syntaxin 6; complete cds, incl. stopcodon. // chr1 // 46 // 46 // 17 // 37 // 1 /// CR541873 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834D0133D for gene STX6, syntaxin 6; complete cds, without stopcodon. // chr1 // 46 // 46 // 17 // 37 // 1 /// GENSCAN00000031145 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:180969387:180993422:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 27 // 10 // 10 // 0
ENST00000410465 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:181839473:181839774:-1 gene:ENSG00000222397 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT008297 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001009992 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 648 (ZNF648), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000339948 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:1:182054570:182061712:-1 gene:ENSG00000179930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC137223 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 648, mRNA (cDNA clone MGC:168843 IMAGE:9021220), complete cds. // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC137224 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 648, mRNA (cDNA clone MGC:168844 IMAGE:9021221), complete cds. // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000047241 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:182056304:182058010:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0
NM_172000 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane epididymal protein 1 (TEDDM1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000367565 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:182398117:182400616:-1 gene:ENSG00000203730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000047248 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:182399664:182400332:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 38 // 9 // 9 // 0
BC090934 // GenBank // Homo sapiens ribonuclease L (2,5-oligoisoadenylate synthetase-dependent), mRNA (cDNA clone MGC:104972 IMAGE:3073811), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_021133 // RefSeq // Homo sapiens ribonuclease L (2,5-oligoisoadenylate synthetase-dependent) (RNASEL), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 1 /// ENST00000367559 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:182573634:182589256:-1 gene:ENSG00000135828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 1 /// BC114433 // GenBank // Homo sapiens ribonuclease L (2,5-oligoisoadenylate synthetase-dependent), mRNA (cDNA clone MGC:133329 IMAGE:40054016), complete cds. // chr1 // 83 // 83 // 25 // 30 // 1 /// BC115697 // GenBank // Homo sapiens ribonuclease L (2,5-oligoisoadenylate synthetase-dependent), mRNA (cDNA clone MGC:133328 IMAGE:40054014), complete cds. // chr1 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// XM_005245411 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ribonuclease L (2,5-oligoisoadenylate synthetase-dependent) (RNASEL), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// ENST00000539397 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:182578121:182589256:-1 gene:ENSG00000135828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// CR627369 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp781D08126 (from clone DKFZp781D08126). // chr1 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// GENSCAN00000047237 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:182560453:182586806:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 43 // 12 // 13 // 0
NM_002928 // RefSeq // Homo sapiens regulator of G-protein signaling 16 (RGS16), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000367558 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:182598623:182604408:-1 gene:ENSG00000143333 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF493937 // GenBank // Homo sapiens regulator of G protein signalling 16 (RGS16) mRNA, complete cds. // chr1 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// BC006243 // GenBank // Homo sapiens regulator of G-protein signaling 16, mRNA (cDNA clone MGC:10379 IMAGE:3946461), complete cds. // chr1 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// BT006638 // GenBank // Homo sapiens regulator of G-protein signalling 16 mRNA, complete cds. // chr1 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// U70426 // GenBank // Homo sapiens A28-RGS14p mRNA, complete cds. // chr1 // 87 // 88 // 20 // 23 // 0 /// U94829 // GenBank // Human retinally abundant regulator of G-protein signaling hRGS-r (hRGS-r) mRNA, complete cds. // chr1 // 91 // 85 // 20 // 22 // 0 /// AK301261 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57620 complete cds, highly similar to Regulator of G-protein signaling 16. // chr1 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// GENSCAN00000047238 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:182600292:182604259:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
ENST00000362967 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:182944365:182944490:-1 gene:ENSG00000199837 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT008344 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000453838 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:182959074:182960405:-1 gene:ENSG00000176855 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000047240 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:182959074:182960075:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
BC071857 // GenBank // Homo sapiens actin related protein 2/3 complex, subunit 5, 16kDa, mRNA (cDNA clone MGC:88523 IMAGE:5922521), complete cds. // chr1 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NM_001270439 // RefSeq // Homo sapiens actin related protein 2/3 complex, subunit 5, 16kDa (ARPC5), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// NM_005717 // RefSeq // Homo sapiens actin related protein 2/3 complex, subunit 5, 16kDa (ARPC5), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// ENST00000294742 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:183626458:183635757:-1 gene:ENSG00000162704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// ENST00000359856 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:183626217:183635726:-1 gene:ENSG00000162704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// BC057237 // GenBank // Homo sapiens actin related protein 2/3 complex, subunit 5, 16kDa, mRNA (cDNA clone MGC:62039 IMAGE:3931697), complete cds. // chr1 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// ENST00000462965 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:183626194:183633958:-1 gene:ENSG00000162704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// AF006088 // GenBank // Homo sapiens Arp2/3 protein complex subunit p16-Arc (ARC16) mRNA, complete cds. // chr1 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// AF017807 // GenBank // Homo sapiens Arp2/3 complex 16kDa subunit (ARC16) mRNA, complete cds. // chr1 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// AK095424 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ38105 fis, clone D3OST2001328, highly similar to Actin-related protein 2/3 complex subunit 5. // chr1 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000009044 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:183610528:183636325:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_203454 // RefSeq // Homo sapiens apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide-like 4 (putative) (APOBEC4), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000308641 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:183646404:183653313:-1 gene:ENSG00000173627 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC021711 // GenBank // Homo sapiens apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide-like 4 (putative), mRNA (cDNA clone MGC:26594 IMAGE:4826920), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000009022 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:183647678:183648781:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0
NM_015101 // RefSeq // Homo sapiens collagen beta(1-O)galactosyltransferase 2 (COLGALT2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000361927 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:183935837:184037729:-1 gene:ENSG00000198756 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000367520 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:183937965:183964500:-1 gene:ENSG00000198756 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000367521 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:183935837:183946618:-1 gene:ENSG00000198756 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// AF288389 // GenBank // Homo sapiens C1orf17 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK095090 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ37771 fis, clone BRHIP2025679, highly similar to Homo sapiens glycosyltransferase 25 domain containing 2 (GLT25D2), mRNA. // chr1 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0 /// AK127287 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ45354 fis, clone BRHIP3012357, highly similar to Homo sapiens glycosyltransferase 25 domain containing 2 (GLT25D2), mRNA. // chr1 // 83 // 38 // 10 // 12 // 0 /// AK293973 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60463 complete cds, highly similar to Homo sapiens glycosyltransferase 25 domain containing 2 (GLT25D2), mRNA. // chr1 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// BC035672 // GenBank // Homo sapiens glycosyltransferase 25 domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:46343 IMAGE:5740842), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000009037 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:183938761:183966952:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1
ENST00000362970 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:184171714:184171823:-1 gene:ENSG00000199840 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT008379 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_025191 // RefSeq // Homo sapiens ER degradation enhancer, mannosidase alpha-like 3 (EDEM3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000318130 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:184690231:184754913:-1 gene:ENSG00000116406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000367512 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:184690493:184754907:-1 gene:ENSG00000116406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000474725 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:184720510:184754873:-1 gene:ENSG00000116406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 32 // 11 // 11 // 0 /// AF288393 // GenBank // Homo sapiens C1orf22 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// BC105586 // GenBank // Homo sapiens ER degradation enhancer, mannosidase alpha-like 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:4693089), complete cds. // chr1 // 100 // 32 // 11 // 11 // 0 /// BC144149 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone MGC:177686 IMAGE:9052669, complete cds. // chr1 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000439962 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:184690503:184711757:-1 gene:ENSG00000116406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// GENSCAN00000024696 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:184694063:184754646:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0
NM_052966 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 129, member A (FAM129A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENST00000367511 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:184791030:184974550:-1 gene:ENSG00000135842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENST00000487074 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:184794118:184868041:-1 gene:ENSG00000135842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 96 // 52 // 23 // 24 // 0 /// AB050477 // GenBank // Homo sapiens NIBAN mRNA, complete cds. // chr1 // 98 // 91 // 41 // 42 // 0 /// AF288391 // GenBank // Homo sapiens C1orf24 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// AY550972 // GenBank // Homo sapiens cell growth inhibiting protein 39 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 78 // 36 // 36 // 0 /// BC030531 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 129, member A, mRNA (cDNA clone MGC:40265 IMAGE:5212338), complete cds. // chr1 // 100 // 87 // 40 // 40 // 0 /// AK095547 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ38228 fis, clone FCBBF2004217, highly similar to Homo sapiens NIBAN mRNA. // chr1 // 37 // 37 // 17 // 46 // 1 /// AK310557 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17599. // chr1 // 35 // 35 // 16 // 46 // 1 /// AK311019 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ18061. // chr1 // 37 // 37 // 17 // 46 // 1 /// GENSCAN00000024689 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:184794977:184942845:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 70 // 32 // 32 // 0
ENST00000364442 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:185014951:185015067:-1 gene:ENSG00000201312 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONHSAT008405 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_001202423 // RefSeq // Homo sapiens tRNA methyltransferase 1 homolog (S. cerevisiae)-like (TRMT1L), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NM_030934 // RefSeq // Homo sapiens tRNA methyltransferase 1 homolog (S. cerevisiae)-like (TRMT1L), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000367506 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:185118098:185156981:-1 gene:ENSG00000121486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AF288399 // GenBank // Homo sapiens C1orf25 mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// AK131460 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ16620 fis, clone TESTI4014801. // chr1 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// AK302166 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56040 complete cds. // chr1 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// BC045535 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 25, mRNA (cDNA clone MGC:57134 IMAGE:5296208), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000033869 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:185120019:185161378:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0
ENST00000383913 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:185257911:185258015:-1 gene:ENSG00000206640 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000384380 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:185630428:185630528:-1 gene:ENSG00000207108 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT008434 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000364726 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:185634073:185634182:-1 gene:ENSG00000201596 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT008435 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_003292 // RefSeq // Homo sapiens translocated promoter region, nuclear basket protein (TPR), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 68 // 68 // 0 /// ENST00000367478 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:186311652:186375325:-1 gene:ENSG00000047410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 68 // 68 // 0 /// ENST00000474852 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:186352015:186375325:-1 gene:ENSG00000047410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 32 // 22 // 22 // 0 /// AK309473 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99514. // chr1 // 100 // 22 // 15 // 15 // 0 /// U69668 // GenBank // Human nuclear pore complex-associated protein TPR (tpr) mRNA, complete cds. // chr1 // 98 // 87 // 58 // 59 // 0 /// ENST00000613151 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:186353871:186375325:-1 gene:ENSG00000047410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 29 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000046091 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:186314612:186456544:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 98 // 81 // 54 // 55 // 0
NM_002597 // RefSeq // Homo sapiens phosducin (PDC), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NM_022576 // RefSeq // Homo sapiens phosducin (PDC), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000391997 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:186443566:186461122:-1 gene:ENSG00000116703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000497198 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:186443582:186448724:-1 gene:ENSG00000116703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// AF076464 // GenBank // Homo sapiens PhLOP1 mRNA, complete cds. // chr1 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// M33478 // GenBank // Human 33-kDa phototransducing protein mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// AF076463 // GenBank // Homo sapiens PhLP1 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AF076465 // GenBank // Homo sapiens PhLOP2 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046091 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:186314612:186456544:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
ENST00000410308 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:188155839:188156180:-1 gene:ENSG00000222240 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT008472 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_199051 // RefSeq // Homo sapiens bone morphogenetic protein/retinoic acid inducible neural-specific 3 (BRINP3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_005245119 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens bone morphogenetic protein/retinoic acid inducible neural-specific 3 (BRINP3), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_005245123 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens bone morphogenetic protein/retinoic acid inducible neural-specific 3 (BRINP3), transcript variant X7, mRNA. // chr1 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000367462 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:190097662:190477629:-1 gene:ENSG00000162670 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AB111893 // GenBank // Homo sapiens DBCCR1L mRNA for DBCCR1-like, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AK123637 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ41643 fis, clone FEBRA2008287, highly similar to Protein FAM5C precursor. // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// AK294365 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53468 complete cds, highly similar to Protein FAM5C precursor. // chr1 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// BC105052 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 5, member C, mRNA (cDNA clone MGC:132712 IMAGE:8144055), complete cds. // chr1 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// BC105054 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 5, member C, mRNA (cDNA clone MGC:132714 IMAGE:8144057), complete cds. // chr1 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000040676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:190098018:190454890:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0
ENST00000411143 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:192875686:192875985:-1 gene:ENSG00000223075 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// NONHSAT008546 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0
NM_016066 // RefSeq // Homo sapiens glutaredoxin 2 (GLRX2), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// NM_197962 // RefSeq // Homo sapiens glutaredoxin 2 (GLRX2), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000367439 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:193096468:193105431:-1 gene:ENSG00000023572 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000367440 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:193096468:193106114:-1 gene:ENSG00000023572 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// AF132495 // GenBank // Homo sapiens glutaredoxin 2 (GRX2) mRNA, complete cds.; nuclear gene encoding mitochondrial protein. // chr1 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// AF151891 // GenBank // Homo sapiens CGI-133 protein mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// AF290514 // GenBank // Homo sapiens glutaredoxin 2 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// AY038988 // GenBank // Homo sapiens glutaredoxin 2 mRNA, complete cds; nuclear gene for mitochondrial product. // chr1 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// BC028113 // GenBank // Homo sapiens glutaredoxin 2, mRNA (cDNA clone MGC:39931 IMAGE:5395272), complete cds. // chr1 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// NM_001243399 // RefSeq // Homo sapiens glutaredoxin 2 (GLRX2), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// ENST00000472197 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:193096667:193106057:-1 gene:ENSG00000023572 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1 /// GENSCAN00000018008 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:193096625:193105382:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0
NM_003783 // RefSeq // Homo sapiens UDP-Gal:betaGlcNAc beta 1,3-galactosyltransferase, polypeptide 2 (B3GALT2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000367434 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:193179045:193186654:-1 gene:ENSG00000162630 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF288390 // GenBank // Homo sapiens B3GALT2 mRNA, complete cds. // chr1 // 88 // 96 // 22 // 25 // 0 /// BC022507 // GenBank // Homo sapiens UDP-Gal:betaGlcNAc beta 1,3-galactosyltransferase, polypeptide 2, mRNA (cDNA clone MGC:26499 IMAGE:4792498), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// Y15014 // GenBank // Homo sapiens mRNA for UDP-galactose:2-acetamido-2-deoxy-D-glucose3beta- galactosyltransferase. // chr1 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
NONHSAT008574 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
ENST00000516004 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:194488103:194488205:-1 gene:ENSG00000251813 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT008584 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001994 // RefSeq // Homo sapiens coagulation factor XIII, B polypeptide (F13B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000367412 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:197039191:197067267:-1 gene:ENSG00000143278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK290560 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75540 complete cds, highly similar to Homo sapiens factor XIII b subunit precursor (F13A1) mRNA. // chr1 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// GENSCAN00000042091 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:197018529:197146747:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1
NM_194314 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger and BTB domain containing 41 (ZBTB41), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000367405 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:197153680:197200542:-1 gene:ENSG00000177888 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000467322 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:197158442:197200521:-1 gene:ENSG00000177888 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC132818 // GenBank // Homo sapiens zinc finger and BTB domain containing 41, mRNA (cDNA clone MGC:164449 IMAGE:40146840), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC136600 // GenBank // Homo sapiens zinc finger and BTB domain containing 41, mRNA (cDNA clone MGC:168213 IMAGE:9020590), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000042099 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:197159359:197200473:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// AK093518 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ36199 fis, clone TESTI2028253, weakly similar to ZINC FINGER PROTEIN 135. // chr1 // 95 // 73 // 21 // 22 // 0
ENST00000384410 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:197685640:197685740:-1 gene:ENSG00000207139 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT008630 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029612 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 181b-1 (MIR181B1), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000385240 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:198858873:198858982:-1 gene:ENSG00000207975 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-181b-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0000270 Homo sapiens miR-181b-1 stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT008658 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029626 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 181a-1 (MIR181A1), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000385026 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:198859044:198859153:-1 gene:ENSG00000207759 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-181a-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0000289 Homo sapiens miR-181a-1 stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT008659 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000365621 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:200008505:200008607:-1 gene:ENSG00000202491 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// NONHSAT008682 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0
ENST00000365459 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:200014689:200014795:-1 gene:ENSG00000202329 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT008683 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001281293 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 281 (ZNF281), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_001281294 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 281 (ZNF281), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NM_012482 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 281 (ZNF281), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000294740 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:200404940:200410056:-1 gene:ENSG00000162702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000367352 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:200406730:200409992:-1 gene:ENSG00000162702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000367353 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:200406708:200410009:-1 gene:ENSG00000162702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// AF125158 // GenBank // Homo sapiens zinc finger DNA binding protein 99 (ZNF281) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// AK297233 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53394 complete cds, highly similar to Zinc finger protein 281. // chr1 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// BC051905 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 281, mRNA (cDNA clone MGC:60368 IMAGE:6165292), complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC060820 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 281, mRNA (cDNA clone MGC:71675 IMAGE:30344180), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000014834 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:200362590:200450835:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 93 // 24 // 26 // 0
NM_014875 // RefSeq // Homo sapiens kinesin family member 14 (KIF14), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENST00000367350 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:200551500:200620734:-1 gene:ENSG00000118193 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// BC113742 // GenBank // Homo sapiens kinesin family member 14, mRNA (cDNA clone MGC:142302 IMAGE:8322794), complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000614960 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:200551497:200618723:-1 gene:ENSG00000118193 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000014818 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:200510349:200666740:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 85 // 85 // 39 // 46 // 1
NM_001031725 // RefSeq // Homo sapiens DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 59 (DDX59), mRNA. // chr1 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000331314 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:200644039:200669969:-1 gene:ENSG00000118197 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000433235 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:200644369:200654869:-1 gene:ENSG00000118197 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000447706 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:200623896:200669907:-1 gene:ENSG00000118197 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// AK299219 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56549 complete cds, highly similar to Homo sapiens DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 59 (DDX59), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// AK307569 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ97517. // chr1 // 81 // 57 // 13 // 16 // 0 /// BC014183 // GenBank // Homo sapiens DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 59, mRNA (cDNA clone IMAGE:4622540), partial cds. // chr1 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// BC020201 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4841282, containing frame-shift errors. // chr1 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// BC041801 // GenBank // Homo sapiens DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 59, mRNA (cDNA clone MGC:41772 IMAGE:5302098), complete cds. // chr1 // 86 // 79 // 19 // 22 // 0 /// ENST00000429498 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:200644121:200663964:-1 gene:ENSG00000118197 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// GENSCAN00000014818 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:200510349:200666740:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
ENST00000364162 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:200933345:200933447:-1 gene:ENSG00000201032 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT008715 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_001252100 // RefSeq // Homo sapiens kinesin family member 21B (KIF21B), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// NM_001252102 // RefSeq // Homo sapiens kinesin family member 21B (KIF21B), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 41 // 41 // 0 /// NM_001252103 // RefSeq // Homo sapiens kinesin family member 21B (KIF21B), transcript variant 4, mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 40 // 40 // 0 /// NM_017596 // RefSeq // Homo sapiens kinesin family member 21B (KIF21B), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 98 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000332129 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:200969390:201023700:-1 gene:ENSG00000116852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 98 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000360529 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:200972990:201023408:-1 gene:ENSG00000116852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000422435 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:200973807:201023700:-1 gene:ENSG00000116852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000461742 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:200972990:201023408:-1 gene:ENSG00000116852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 36 // 36 // 0 /// BC137281 // GenBank // Homo sapiens kinesin family member 21B, mRNA (cDNA clone MGC:168901 IMAGE:9021278), complete cds. // chr1 // 100 // 80 // 36 // 36 // 0 /// BC144557 // GenBank // Homo sapiens kinesin family member 21B, mRNA (cDNA clone MGC:178102 IMAGE:9053085), complete cds. // chr1 // 100 // 78 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000027774 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:200972647:201023383:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 36 // 36 // 0
NM_000069 // RefSeq // Homo sapiens calcium channel, voltage-dependent, L type, alpha 1S subunit (CACNA1S), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 51 // 51 // 0 /// ENST00000362061 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:201039514:201112566:-1 gene:ENSG00000081248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 51 // 51 // 0 /// ENST00000367338 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:201039512:201112451:-1 gene:ENSG00000081248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 49 // 49 // 0 /// BC133671 // GenBank // Homo sapiens calcium channel, voltage-dependent, L type, alpha 1S subunit, mRNA (cDNA clone MGC:149103 IMAGE:40073990), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 49 // 49 // 0 /// L33798 // GenBank // Human dihydropyridine-sensitive L-type calcium channel alpha-1 subunit (CACNL1A3) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 51 // 51 // 0 /// GENSCAN00000027789 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:201039831:201112339:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 98 // 90 // 45 // 46 // 0
NM_001270601 // RefSeq // Homo sapiens achaete-scute family bHLH transcription factor 5 (ASCL5), mRNA. // chr1 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000449188 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:201113953:201127184:-1 gene:ENSG00000232237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000458416 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:201113953:201115372:-1 gene:ENSG00000232237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000027794 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:201114752:201115372:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 67 // 15 // 16 // 0
NM_005558 // RefSeq // Homo sapiens ladinin 1 (LAD1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000367313 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:201381207:201399548:-1 gene:ENSG00000159166 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000391967 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:201380838:201399608:-1 gene:ENSG00000159166 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000503578 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:201373244:201385784:-1 gene:ENSG00000159166 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// BC009742 // GenBank // Homo sapiens ladinin 1, mRNA (cDNA clone MGC:10355 IMAGE:3842503), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC071890 // GenBank // Homo sapiens ladinin 1, mRNA (cDNA clone MGC:88569 IMAGE:6082757), complete cds. // chr1 // 88 // 96 // 22 // 25 // 0 /// U42408 // GenBank // Human ladinin (LAD) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AK310917 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17959. // chr1 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// GENSCAN00000027784 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:201353742:201399306:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_012396 // RefSeq // Homo sapiens pleckstrin homology-like domain, family A, member 3 (PHLDA3), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NR_073080 // RefSeq // Homo sapiens pleckstrin homology-like domain, family A, member 3 (PHLDA3), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000367309 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:201465958:201469237:-1 gene:ENSG00000174307 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 90 // 81 // 19 // 21 // 0 /// ENST00000367311 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:201465492:201469184:-1 gene:ENSG00000174307 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000485436 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:201465853:201468581:-1 gene:ENSG00000174307 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// AF151100 // GenBank // Homo sapiens TDAG51/Ipl homologue 1 (TIH1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC014390 // GenBank // Homo sapiens pleckstrin homology-like domain, family A, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:1110 IMAGE:3547186), complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC068273 // GenBank // Homo sapiens pleckstrin homology-like domain, family A, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:35306 IMAGE:5177273), complete cds. // chr1 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027786 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:201468403:201469464:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0
NM_012134 // RefSeq // Homo sapiens leiomodin 1 (smooth muscle) (LMOD1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000367288 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:201896452:201946587:-1 gene:ENSG00000163431 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AK295824 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55689 complete cds, highly similar to Leiomodin-1. // chr1 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// AK304700 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54257 complete cds, highly similar to Leiomodin-1. // chr1 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0 /// AK304852 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53443 complete cds, highly similar to Leiomodin-1. // chr1 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// BC001755 // GenBank // Homo sapiens leiomodin 1 (smooth muscle), mRNA (cDNA clone IMAGE:3355265), complete cds. // chr1 // 100 // 42 // 13 // 13 // 0 /// BC080187 // GenBank // Homo sapiens leiomodin 1 (smooth muscle), mRNA (cDNA clone MGC:87977 IMAGE:6177902), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000616739 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:201896456:201946588:-1 gene:ENSG00000163431 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000027779 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:201898372:201946340:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0
NM_001256129 // RefSeq // Homo sapiens ADP-ribosylation factor-like 8A (ARL8A), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// NM_138795 // RefSeq // Homo sapiens ADP-ribosylation factor-like 8A (ARL8A), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000272217 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:202133404:202144741:-1 gene:ENSG00000143862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000491358 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:202134383:202135608:-1 gene:ENSG00000143862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// AB118752 // GenBank // Homo sapiens gie2 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 60 // 21 // 21 // 0 /// BC015408 // GenBank // Homo sapiens ADP-ribosylation factor-like 8A, mRNA (cDNA clone MGC:21954 IMAGE:4391821), complete cds. // chr1 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000486225 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:202135202:202138034:-1 gene:ENSG00000143862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 26 // 26 // 9 // 35 // 1 /// ENST00000614750 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:202133404:202144743:-1 gene:ENSG00000143862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT008798 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000043774 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:202132366:202159339:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 57 // 57 // 20 // 35 // 1 /// NONHSAT008799 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 26 // 26 // 9 // 35 // 1
NONHSAT008803 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_014176 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin-conjugating enzyme E2T (putative) (UBE2T), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000367274 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:202331657:202341980:-1 gene:ENSG00000077152 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000460852 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:202333010:202335818:-1 gene:ENSG00000077152 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000487227 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:202331837:202341980:-1 gene:ENSG00000077152 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AB032931 // GenBank // Homo sapiens mRNA for ubiquitin-conjugating enzyme isolog, complete cds. // chr1 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// AF160215 // GenBank // Homo sapiens ubiquitin-conjugating enzyme E2 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AY542309 // GenBank // Homo sapiens PIG50 mRNA, complete cds. // chr1 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// BC004152 // GenBank // Homo sapiens ubiquitin-conjugating enzyme E2T (putative), mRNA (cDNA clone MGC:2385 IMAGE:2821806), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC019284 // GenBank // Homo sapiens ubiquitin-conjugating enzyme E2T (putative), mRNA (cDNA clone MGC:4003 IMAGE:2821806), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000043768 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:202331835:202335754:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT008813 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
ENST00000517139 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:Y:26360989:26361092:1 gene:ENSG00000252948 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 88 // 100 // 21 // 24 // 0 /// ENST00000606519 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:202410108:202410207:-1 gene:ENSG00000272262 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT139804 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 88 // 100 // 21 // 24 // 0
ENST00000517233 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:202527310:202527427:-1 gene:ENSG00000253042 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT008821 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001136504 // RefSeq // Homo sapiens synaptotagmin II (SYT2), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NM_177402 // RefSeq // Homo sapiens synaptotagmin II (SYT2), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000367267 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:202590596:202643453:-1 gene:ENSG00000143858 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000367268 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:202590596:202710417:-1 gene:ENSG00000143858 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK090672 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ33353 fis, clone BRACE2005118, highly similar to SYNAPTOTAGMIN II. // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AK094430 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ37111 fis, clone BRACE2021254, highly similar to SYNAPTOTAGMIN II. // chr1 // 93 // 84 // 25 // 27 // 0 /// BC100814 // GenBank // Homo sapiens synaptotagmin II, mRNA (cDNA clone MGC:118846 IMAGE:40000996), complete cds. // chr1 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// BC100815 // GenBank // Homo sapiens synaptotagmin II, mRNA (cDNA clone MGC:118847 IMAGE:40000997), complete cds. // chr1 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// BC100817 // GenBank // Homo sapiens synaptotagmin II, mRNA (cDNA clone MGC:118849 IMAGE:40001000), complete cds. // chr1 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000043773 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:202591740:202639852:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1
NM_006618 // RefSeq // Homo sapiens lysine (K)-specific demethylase 5B (KDM5B), mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000235790 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:202729905:202807299:-1 gene:ENSG00000117139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 72 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000367264 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:202727443:202808418:-1 gene:ENSG00000117139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000367265 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:202724491:202809470:-1 gene:ENSG00000117139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// AF087481 // GenBank // Homo sapiens retinoblastoma binding protein 2 homolog 1 (RBBP2H1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// AJ243706 // GenBank // Homo sapiens mRNA for RB-binding protein (rbbp2h1a gene). // chr1 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// AK122752 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ16281 fis, clone NT2RI3003104, highly similar to Homo sapiens Jumonji, AT rich interactive domain 1B (RBP2-like) (JARID1B), mRNA. // chr1 // 100 // 72 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000043766 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:202729036:202777342:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 25 // 25 // 0
NM_002871 // RefSeq // Homo sapiens RAB interacting factor (RABIF), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000367262 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:202878957:202889135:-1 gene:ENSG00000183155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// BC018488 // GenBank // Homo sapiens RAB interacting factor, mRNA (cDNA clone MGC:21266 IMAGE:4475846), complete cds. // chr1 // 100 // 48 // 11 // 11 // 0 /// BC037392 // GenBank // Homo sapiens RAB interacting factor, mRNA (cDNA clone MGC:34651 IMAGE:5191960), complete cds. // chr1 // 95 // 83 // 18 // 19 // 0 /// BT007133 // GenBank // Homo sapiens RAB interacting factor mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 43 // 10 // 10 // 0 /// S78873 // GenBank // mss4=Zn2+ binding protein/guanine nucleotide exchange factor [human, brain, mRNA Partial, 922 nt]. // chr1 // 92 // 57 // 12 // 13 // 0 /// U74324 // GenBank // Human guanine nucleotide exchange factor mss4 mRNA, complete cds. // chr1 // 94 // 78 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000043763 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:202880978:202889098:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 43 // 10 // 10 // 0
NM_021633 // RefSeq // Homo sapiens kelch-like family member 12 (KLHL12), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000367258 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:202909010:202928636:-1 gene:ENSG00000117153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 42 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000367259 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:202891116:202909161:-1 gene:ENSG00000117153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000367261 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:202891100:202927262:-1 gene:ENSG00000117153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AF190900 // GenBank // Homo sapiens kelch-like protein C3IP1 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// AK301791 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56167 complete cds, highly similar to Kelch-like protein 12. // chr1 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// BC003183 // GenBank // Homo sapiens kelch-like 12 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:4435 IMAGE:2958852), complete cds. // chr1 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// BC004175 // GenBank // Homo sapiens kelch-like 12 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:2770 IMAGE:2958852), complete cds. // chr1 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000043760 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:202892533:202928549:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// AF306688 // GenBank // Homo sapiens clone O19r mRNA sequence. // chr1 // 58 // 100 // 14 // 24 // 0
ENST00000362601 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:202914880:202914980:-1 gene:ENSG00000199471 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT008861 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_002479 // RefSeq // Homo sapiens myogenin (myogenic factor 4) (MYOG), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000241651 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:203083132:203086036:-1 gene:ENSG00000122180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC053899 // GenBank // Homo sapiens myogenin (myogenic factor 4), mRNA (cDNA clone MGC:61433 IMAGE:6170028), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BT007233 // GenBank // Homo sapiens myogenin (myogenic factor 4) mRNA, complete cds. // chr1 // 94 // 65 // 16 // 17 // 0 /// X17651 // GenBank // Human Myf-4 mRNA for myogenic determination factor. // chr1 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000044162 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:203083910:203085961:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0
NM_004997 // RefSeq // Homo sapiens myosin binding protein H (MYBPH), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000255416 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:203167811:203175813:-1 gene:ENSG00000133055 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC044226 // GenBank // Homo sapiens myosin binding protein H, mRNA (cDNA clone MGC:50684 IMAGE:6176021), complete cds. // chr1 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// L05606 // GenBank // Human myosin binding protein H mRNA, complete cds. // chr1 // 88 // 93 // 23 // 26 // 0 /// XM_005245197 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens myosin binding protein H (MYBPH), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// ENST00000621380 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:203167811:203175783:-1 gene:ENSG00000133055 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 93 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000044142 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:203168077:203185918:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0
NM_002023 // RefSeq // Homo sapiens fibromodulin (FMOD), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000354955 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:203340628:203351489:-1 gene:ENSG00000122176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK172740 // GenBank // Homo sapiens cDNA PSEC0234 fis, clone: HEMBA1007044, highly similar to FIBROMODULIN PRECURSOR. // chr1 // 91 // 37 // 10 // 11 // 0 /// AK291632 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75875 complete cds, highly similar to Homo sapiens fibromodulin (FMOD), mRNA. // chr1 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// AK303866 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53615 complete cds, highly similar to Fibromodulin precursor. // chr1 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// BC035281 // GenBank // Homo sapiens fibromodulin, mRNA (cDNA clone MGC:34457 IMAGE:5181410), complete cds. // chr1 // 93 // 93 // 26 // 28 // 0 /// X75546 // GenBank // H.sapiens mRNA for fibromodulin. // chr1 // 90 // 33 // 9 // 10 // 0 /// NR_103757 // RefSeq // Homo sapiens fibromodulin (FMOD), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr1 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1 /// AK098322 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ41003 fis, clone UTERU2016981. // chr1 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// NONHSAT008883 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1 /// GENSCAN00000044151 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:203342343:203447404:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
ENST00000479457 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:203903723:203904013:-1 gene:ENSG00000232917 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// NONHSAT008913 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT008914 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0
NM_000537 // RefSeq // Homo sapiens renin (REN), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000272190 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:204154819:204166322:-1 gene:ENSG00000143839 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC033474 // GenBank // Homo sapiens renin, mRNA (cDNA clone MGC:34221 IMAGE:5188566), complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC047752 // GenBank // Homo sapiens renin, mRNA (cDNA clone MGC:54147 IMAGE:5590211), complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// CR536498 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834A0620D for gene REN, renin; complete cds, incl. stopcodon. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000038725 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:204155016:204163788:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NM_002256 // RefSeq // Homo sapiens KiSS-1 metastasis-suppressor (KISS1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000367194 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:204190341:204196486:-1 gene:ENSG00000170498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK291695 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76664 complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY117143 // GenBank // Homo sapiens KiSS-1 metastasis-suppressor (KISS1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// BC022819 // GenBank // Homo sapiens KiSS-1 metastasis-suppressor, mRNA (cDNA clone MGC:39258 IMAGE:5443510), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// U43527 // GenBank // Human malignant melanoma metastasis-suppressor (KiSS-1) gene, mRNA, complete cds. // chr1 // 85 // 96 // 23 // 27 // 0 /// GENSCAN00000038720 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:204190484:204192876:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0
AB075871 // GenBank // Homo sapiens mRNA for putative protein product of HMFN1187, partial cds. // chr1 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// NM_198447 // RefSeq // Homo sapiens golgi transport 1A (GOLT1A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 1 /// ENST00000308302 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:204198160:204214092:-1 gene:ENSG00000174567 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 1 /// BC058832 // GenBank // Homo sapiens golgi transport 1 homolog A (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:62027 IMAGE:6458279), complete cds. // chr1 // 83 // 83 // 20 // 24 // 1 /// GENSCAN00000038709 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:204198552:204314950:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 42 // 42 // 10 // 24 // 1
NM_014935 // RefSeq // Homo sapiens pleckstrin homology domain containing, family A member 6 (PLEKHA6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006711212 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens pleckstrin homology domain containing, family A member 6 (PLEKHA6), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_006711221 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens pleckstrin homology domain containing, family A member 6 (PLEKHA6), transcript variant X13, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_006711222 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens pleckstrin homology domain containing, family A member 6 (PLEKHA6), transcript variant X14, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000272203 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:204218851:204359916:-1 gene:ENSG00000143850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000414478 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:204221221:204359916:-1 gene:ENSG00000143850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// BC152475 // GenBank // Homo sapiens pleckstrin homology domain containing, family A member 6, mRNA (cDNA clone MGC:176733 IMAGE:8862612), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000038709 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:204198552:204314950:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 88 // 88 // 23 // 26 // 1
NM_032833 // RefSeq // Homo sapiens protein phosphatase 1, regulatory subunit 15B (PPP1R15B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_005245551 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens protein phosphatase 1, regulatory subunit 15B (PPP1R15B), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000367188 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:204403387:204411791:-1 gene:ENSG00000158615 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AK303535 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51594 complete cds, highly similar to Homo sapiens protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 15B (PPP1R15B), mRNA. // chr1 // 95 // 61 // 19 // 20 // 0 /// BC065280 // GenBank // Homo sapiens protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 15B, mRNA (cDNA clone MGC:74824 IMAGE:6172811), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AK316092 // GenBank // Homo sapiens cDNA, FLJ78991 complete cds, highly similar to Homo sapiens protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 15B (PPP1R15B), mRNA. // chr1 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1 /// GENSCAN00000038711 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:204406092:204469802:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1
NM_002646 // RefSeq // Homo sapiens phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase, catalytic subunit type 2 beta (PIK3C2B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000367187 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:204422628:204490424:-1 gene:ENSG00000133056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000424712 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:204422630:204490346:-1 gene:ENSG00000133056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// AB210006 // GenBank // Homo sapiens mRNA for PIK3C2B variant protein, partial cds, clone: fg04853. // chr1 // 97 // 93 // 37 // 38 // 0 /// AK308153 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ98101. // chr1 // 79 // 34 // 11 // 14 // 0 /// BC094741 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:30529036, containing frame-shift errors. // chr1 // 92 // 29 // 11 // 12 // 0 /// BC132876 // GenBank // Homo sapiens phosphoinositide-3-kinase, class 2, beta polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:164507 IMAGE:40146898), complete cds. // chr1 // 98 // 98 // 39 // 40 // 0 /// BC136645 // GenBank // Homo sapiens phosphoinositide-3-kinase, class 2, beta polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:168258 IMAGE:9020635), complete cds. // chr1 // 98 // 98 // 39 // 40 // 0 /// BC144342 // GenBank // Homo sapiens phosphoinositide-3-kinase, class 2, beta polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:177879 IMAGE:9052862), complete cds. // chr1 // 98 // 98 // 39 // 40 // 0 /// Y11312 // GenBank // H.sapiens mRNA for phosphoinositide 3-kinase. // chr1 // 98 // 100 // 40 // 41 // 0 /// GENSCAN00000038711 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:204406092:204469802:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 34 // 34 // 0
ENST00000363538 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:204562413:204562521:-1 gene:ENSG00000200408 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT008957 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000516841 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:204707320:204707430:-1 gene:ENSG00000252650 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT008969 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_203376 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 81 (TMEM81), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000367167 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:205083129:205084460:-1 gene:ENSG00000174529 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK303432 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52639 complete cds. // chr1 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// AY359081 // GenBank // Homo sapiens clone DNA108789 KVLA2788 (UNQ2788) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC061592 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 81, mRNA (cDNA clone MGC:75217 IMAGE:6202253), complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000009382 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:205083553:205084320:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0
NM_030952 // RefSeq // Homo sapiens NUAK family, SNF1-like kinase, 2 (NUAK2), mRNA. // chr1 // 91 // 100 // 30 // 33 // 0 /// XM_005245515 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens NUAK family, SNF1-like kinase, 2 (NUAK2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000367157 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:205302059:205321755:-1 gene:ENSG00000163545 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AK303577 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56013 complete cds, highly similar to NUAK family SNF1-like kinase 2 (EC 2.7.11.1). // chr1 // 87 // 94 // 27 // 31 // 0 /// BC017306 // GenBank // Homo sapiens NUAK family, SNF1-like kinase, 2, mRNA (cDNA clone MGC:29812 IMAGE:5088037), complete cds. // chr1 // 90 // 94 // 28 // 31 // 0 /// BX537564 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686D126 (from clone DKFZp686D126). // chr1 // 83 // 55 // 15 // 18 // 0 /// CR749209 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686F01113 (from clone DKFZp686F01113). // chr1 // 81 // 64 // 17 // 21 // 0 /// AK309520 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99561. // chr1 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1 /// GENSCAN00000009384 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:205303450:205321628:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0
NM_022731 // RefSeq // Homo sapiens nuclear casein kinase and cyclin-dependent kinase substrate 1 (NUCKS1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000367142 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:205712819:205750276:-1 gene:ENSG00000069275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AB049824 // GenBank // Homo sapiens mRNA for JC7, complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AY823399 // GenBank // Homo sapiens nuclear ubiquitous casein kinase and cyclin-dependent kinase substrate variant (NUCKS) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 87 // 77 // 20 // 23 // 0 /// BC000805 // GenBank // Homo sapiens nuclear casein kinase and cyclin-dependent kinase substrate 1, mRNA (cDNA clone MGC:5494 IMAGE:3452665), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// CR457339 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834B0310D for gene NUCKS, nuclear ubiquitous casein kinase and cyclin-dependent kinase substrate; complete cds, incl. stopcodon. // chr1 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// AK300416 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61403 complete cds, highly similar to Nuclear ubiquitous casein andcyclin-dependent kinases substrate. // chr1 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// GENSCAN00000009399 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:205718280:205774956:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// AF212045 // GenBank // Homo sapiens potential LAG1 interactor mRNA, partial cds. // chr1 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1
ENST00000365074 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:205731221:205731352:-1 gene:ENSG00000201944 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT009022 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_173854 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 41 (magnesium transporter), member 1 (SLC41A1), mRNA. // chr1 // 97 // 97 // 36 // 37 // 0 /// ENST00000367137 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:205789093:205813176:-1 gene:ENSG00000133065 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000468057 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:205789094:205801488:-1 gene:ENSG00000133065 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000484000 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:205810299:205813748:-1 gene:ENSG00000133065 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 21 // 8 // 8 // 0 /// AK125075 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ43085 fis, clone BRTHA3018656, highly similar to Homo sapiens solute carrier family 41, member 1 (SLC41A1), mRNA. // chr1 // 96 // 68 // 25 // 26 // 0 /// BC136303 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 41, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:167913 IMAGE:9020290), complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000009390 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:205791533:205813414:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 58 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT009028 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 21 // 8 // 8 // 0
NM_152491 // RefSeq // Homo sapiens peptidase M20 domain containing 1 (PM20D1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000367136 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:205828022:205850117:-1 gene:ENSG00000162877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000460624 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:205828026:205850132:-1 gene:ENSG00000162877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000461807 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:205828353:205841879:-1 gene:ENSG00000162877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 26 // 8 // 8 // 0 /// AK290786 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76145 complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// BC039170 // GenBank // Homo sapiens peptidase M20 domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:21660 IMAGE:4746689), complete cds. // chr1 // 90 // 100 // 28 // 31 // 0 /// BC063477 // GenBank // Homo sapiens peptidase M20 domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:70500 IMAGE:5221187), complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000009368 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:205828620:205850072:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT009032 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 26 // 8 // 8 // 0
NM_001007544 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 186 (C1orf186), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_005272738 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 186 (C1orf186), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000331555 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:206052723:206102459:1 gene:ENSG00000263961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSG00000196533 // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000582070 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:206097699:206102448:1 gene:ENSG00000263961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 86 // 84 // 18 // 21 // 0 /// ENST00000603378 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:206083563:206102007:1 gene:ENSG00000263961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000603488 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:206083571:206101984:1 gene:ENSG00000263961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// BC071785 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 186, mRNA (cDNA clone MGC:88428 IMAGE:4609995), complete cds. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000006060 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:206035258:206101952:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
ENST00000367119 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:206491116:206497728:-1 gene:ENSG00000162888 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK057159 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ32597 fis, clone SPLEN2000541. // chr1 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0
ENST00000362479 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:206747980:206748092:-1 gene:ENSG00000199349 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT009081 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_002644 // RefSeq // Homo sapiens polymeric immunoglobulin receptor (PIGR), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000356495 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:206928518:206946466:-1 gene:ENSG00000162896 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF272149 // GenBank // Homo sapiens hepatocellular carcinoma associated protein TB6 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK225471 // GenBank // Homo sapiens mRNA for polymeric immunoglobulin receptor variant, clone: HSI13542. // chr1 // 92 // 43 // 12 // 13 // 0 /// BC110494 // GenBank // Homo sapiens polymeric immunoglobulin receptor, mRNA (cDNA clone MGC:125361 IMAGE:40007650), complete cds. // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC110495 // GenBank // Homo sapiens polymeric immunoglobulin receptor, mRNA (cDNA clone MGC:125362 IMAGE:40007652), complete cds. // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// X73079 // GenBank // Homo sapiens mRNA for Polymeric immunoglobulin receptor. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_005273163 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens polymeric immunoglobulin receptor (PIGR), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// GENSCAN00000006066 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:206930318:206940531:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
NM_001083924 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 116 (C1orf116), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// NM_023938 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 116 (C1orf116), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000359470 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:207018521:207032747:-1 gene:ENSG00000182795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000461135 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:1:207020695:207032756:-1 gene:ENSG00000182795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// AY352640 // GenBank // Homo sapiens specifically androgen-regulated protein (SARG) mRNA, complete cds. // chr1 // 93 // 97 // 26 // 28 // 0 /// BC000765 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 116, mRNA (cDNA clone MGC:2742 IMAGE:2822914), complete cds. // chr1 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// BC018959 // GenBank HTC // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 116, mRNA (cDNA clone IMAGE:2823907). // chr1 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000029355 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:207021958:207051030:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1
NONHSAT009099 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001276320 // RefSeq // Homo sapiens YOD1 deubiquitinase (YOD1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// NM_018566 // RefSeq // Homo sapiens YOD1 deubiquitinase (YOD1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000315927 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:207043849:207051077:-1 gene:ENSG00000180667 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000367084 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:207043849:207052980:-1 gene:ENSG00000180667 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// BC137166 // GenBank // Homo sapiens YOD1 OTU deubiquinating enzyme 1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:168786 IMAGE:9021163), complete cds. // chr1 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// BC137167 // GenBank // Homo sapiens YOD1 OTU deubiquinating enzyme 1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:168787 IMAGE:9021164), complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000029355 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:207021958:207051030:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1
NR_029832 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 29c (MIR29C), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000385231 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:207801845:207801956:-1 gene:ENSG00000275668 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA gene:ENSG00000203709 // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000608023 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:207801518:207869150:-1 gene:ENSG00000203709 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK123264 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ41270 fis, clone BRAMY2036387. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// EU154352 // GenBank // Homo sapiens microRNA 29b-2/29c, precursor RNA, microRNA 29b-2 and microRNA 29c, complete sequence; alternatively spliced. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-29c // miRBase Micro RNA Database // MI0000735 Homo sapiens miR-29c stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT009145 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT009146 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT009147 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT009148 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT009144 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 52 // 92 // 12 // 23 // 0 /// GENSCAN00000029343 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:207801741:207827033:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NR_029518 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 29b-2 (MIR29B2), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000385055 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:207802440:207802523:-1 gene:ENSG00000276752 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA gene:ENSG00000203709 // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000608023 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:207801518:207869150:-1 gene:ENSG00000203709 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK123264 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ41270 fis, clone BRAMY2036387. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// EU154352 // GenBank // Homo sapiens microRNA 29b-2/29c, precursor RNA, microRNA 29b-2 and microRNA 29c, complete sequence; alternatively spliced. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-29b-2 // miRBase Micro RNA Database // MI0000107 Homo sapiens miR-29b-2 stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT009144 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT009145 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT009146 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT009147 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT009149 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_025179 // RefSeq // Homo sapiens plexin A2 (PLXNA2), mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 59 // 59 // 0 /// XM_005273165 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens plexin A2 (PLXNA2), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 47 // 30 // 30 // 0 /// XM_006711387 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens plexin A2 (PLXNA2), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 97 // 48 // 30 // 31 // 0 /// ENST00000367033 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:208022242:208244320:-1 gene:ENSG00000076356 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 59 // 59 // 0 /// BC132676 // GenBank // Homo sapiens plexin A2, mRNA (cDNA clone MGC:164307 IMAGE:40146698), complete cds. // chr1 // 97 // 52 // 32 // 33 // 0 /// BC136530 // GenBank // Homo sapiens plexin A2, mRNA (cDNA clone MGC:168143 IMAGE:9020520), complete cds. // chr1 // 97 // 52 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000041366 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:208027243:208144692:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 45 // 29 // 29 // 0
NM_152485 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 74 (C1orf74), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000294811 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:209779208:209784559:-1 gene:ENSG00000162757 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC039719 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 74, mRNA (cDNA clone MGC:47797 IMAGE:5770046), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_006147 // RefSeq // Homo sapiens interferon regulatory factor 6 (IRF6), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000367021 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:209785691:209806044:-1 gene:ENSG00000117595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000456314 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:209790726:209802166:-1 gene:ENSG00000117595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 63 // 16 // 17 // 0 /// AF027292 // GenBank // Homo sapiens interferon regulatory factor 6 (IRF6) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC014852 // GenBank // Homo sapiens interferon regulatory factor 6, mRNA (cDNA clone MGC:5122 IMAGE:3449699), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NM_001206696 // RefSeq // Homo sapiens interferon regulatory factor 6 (IRF6), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// ENST00000542854 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:209785623:209806175:-1 gene:ENSG00000117595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// AK296960 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50103 complete cds, highly similar to Interferon regulatory factor 6. // chr1 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// GENSCAN00000008450 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:209782825:209801413:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1
ENST00000364102 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:210374154:210374267:-1 gene:ENSG00000200972 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT009266 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_002238 // RefSeq // Homo sapiens potassium voltage-gated channel, subfamily H (eag-related), member 1 (KCNH1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// NM_172362 // RefSeq // Homo sapiens potassium voltage-gated channel, subfamily H (eag-related), member 1 (KCNH1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000271751 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:210678315:211133973:-1 gene:ENSG00000143473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000367007 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:210683238:211134115:-1 gene:ENSG00000143473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// AF078741 // GenBank // Homo sapiens voltage-gated potassium channel eag (EAG) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// AF078742 // GenBank // Homo sapiens voltage-gated potassium channel eagB (EAG) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC113709 // GenBank // Homo sapiens potassium voltage-gated channel, subfamily H (eag-related), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:142269 IMAGE:8322761), complete cds. // chr1 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// BC143599 // GenBank // Homo sapiens potassium voltage-gated channel, subfamily H (eag-related), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:177128 IMAGE:9052111), complete cds. // chr1 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000039746 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:211013944:211113677:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000003807 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:210748013:210856586:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_001164688 // RefSeq // Homo sapiens retinal degeneration 3 (RD3), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_183059 // RefSeq // Homo sapiens retinal degeneration 3 (RD3), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000367002 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:211476522:211492917:-1 gene:ENSG00000198570 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK291210 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75844 complete cds. // chr1 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// AY191519 // GenBank // Homo sapiens C1ORF36 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC065541 // GenBank // Homo sapiens retinal degeneration 3, mRNA (cDNA clone MGC:75344 IMAGE:6140075), complete cds. // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000484910 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:211476522:211492031:-1 gene:ENSG00000198570 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// GENSCAN00000039751 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:211479036:211516724:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// NONHSAT009300 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_021194 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 30 (zinc transporter), member 1 (SLC30A1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000367001 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:211571568:211578742:-1 gene:ENSG00000170385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC121015 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 30 (zinc transporter), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:149645 IMAGE:40117054), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// BC121016 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 30 (zinc transporter), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:149646 IMAGE:40117055), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000039753 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:211575388:211578612:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
NM_014873 // RefSeq // Homo sapiens lysophosphatidylglycerol acyltransferase 1 (LPGAT1), mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000366996 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:1:211749793:211830238:-1 gene:ENSG00000123684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 70 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000366997 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:211743457:211830772:-1 gene:ENSG00000123684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// AY561706 // GenBank // Homo sapiens HBV pre-S2 trans-regulated protein 1 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 60 // 12 // 12 // 0 /// BC034621 // GenBank // Homo sapiens lysophosphatidylglycerol acyltransferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:43049 IMAGE:4839400), complete cds. // chr1 // 100 // 70 // 14 // 14 // 0 /// D86960 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA0205 gene, partial cds. // chr1 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000039747 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:211663426:211830254:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 50 // 10 // 20 // 1
ENST00000485522 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:211792111:211792406:-1 gene:ENSG00000241395 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT009327 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000517070 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:212099521:212099676:-1 gene:ENSG00000252879 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT009344 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001198862 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 206 (TMEM206), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// NM_018252 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 206 (TMEM206), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000261455 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:212363931:212414895:-1 gene:ENSG00000065600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// ENST00000467822 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:212375248:212410164:-1 gene:ENSG00000065600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 90 // 37 // 9 // 10 // 0 /// ENST00000471937 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:212385274:212414895:-1 gene:ENSG00000065600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 90 // 37 // 9 // 10 // 0 /// ENST00000535273 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:212364476:212414901:-1 gene:ENSG00000065600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// AK001736 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ10874 fis, clone NT2RP4001803. // chr1 // 85 // 96 // 22 // 26 // 0 /// AK295224 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57110 complete cds. // chr1 // 95 // 70 // 18 // 19 // 0 /// AK297200 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55748 complete cds. // chr1 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// BC006320 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 206, mRNA (cDNA clone MGC:12591 IMAGE:4137890), complete cds. // chr1 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000010566 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:212362756:212414912:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 89 // 67 // 16 // 18 // 0
AK097437 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ40118 fis, clone TESTI2009412. // chr1 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENST00000427949 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:212624284:212626771:-1 gene:ENSG00000235862 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_018664 // RefSeq // Homo sapiens basic leucine zipper transcription factor, ATF-like 3 (BATF3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000243440 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:212686418:212699985:-1 gene:ENSG00000123685 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000471382 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:212686418:212687509:-1 gene:ENSG00000123685 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// AF255346 // GenBank // Homo sapiens Jun dimerization protein p21SNFT (SNFT) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC117489 // GenBank // Homo sapiens basic leucine zipper transcription factor, ATF-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:151098 IMAGE:40126040), complete cds. // chr1 // 95 // 74 // 19 // 20 // 0 /// BC117491 // GenBank // Homo sapiens basic leucine zipper transcription factor, ATF-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:151100 IMAGE:40126042), complete cds. // chr1 // 95 // 74 // 19 // 20 // 0 /// ENST00000478275 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:212686418:212698755:-1 gene:ENSG00000123685 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// AK093671 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ36352 fis, clone THYMU2007258. // chr1 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// AK094854 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ37535 fis, clone BRCAN2021669. // chr1 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// GENSCAN00000010565 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:212686791:212697241:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// NONHSAT009397 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// NONHSAT009396 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
NM_001024601 // RefSeq // Homo sapiens spermatogenesis associated 45 (SPATA45), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000332912 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:212830141:212847649:-1 gene:ENSG00000185523 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_027285 // RefSeq // Homo sapiens FLVCR1 antisense RNA 1 (head to head) (FLVCR1-AS1), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 57 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000426161 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:212856604:212858088:-1 gene:ENSG00000198468 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 48 // 10 // 10 // 0 /// AK092887 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ35568 fis, clone SPLEN2005727. // chr1 // 100 // 62 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000356684 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:212852108:212858088:-1 gene:ENSG00000198468 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 62 // 62 // 13 // 21 // 1 /// NR_027286 // RefSeq // Homo sapiens FLVCR1 antisense RNA 1 (head to head) (FLVCR1-AS1), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr1 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1 /// NONHSAT009404 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 62 // 13 // 13 // 0 /// NONHSAT009411 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 57 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT009405 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 62 // 62 // 13 // 21 // 1 /// NONHSAT009409 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1 /// NONHSAT009410 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1 /// TCONS_00000026-XLOC_001197 // Rinn lincRNA // linc-C1orf227-1 chr1:-:213029946-213031480 // chr1 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1 /// TCONS_00001813-XLOC_001197 // Rinn lincRNA // linc-C1orf227-1 chr1:-:213028818-213031452 // chr1 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1
ENST00000484151 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:213428708:213429077:-1 gene:ENSG00000228646 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012051 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:213405555:213445849:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 86 // 56 // 12 // 14 // 0
NM_005401 // RefSeq // Homo sapiens protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 14 (PTPN14), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000366956 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:214348696:214551223:-1 gene:ENSG00000152104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000543945 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:214357751:214551223:-1 gene:ENSG00000152104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// AK291641 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76875 complete cds, highly similar to Homo sapiens protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 14 (PTPN14), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC017300 // GenBank // Homo sapiens protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 14, mRNA (cDNA clone IMAGE:5018155), partial cds. // chr1 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// BC101754 // GenBank // Homo sapiens protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 14, mRNA (cDNA clone MGC:126803 IMAGE:8069260), complete cds. // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC104803 // GenBank // Homo sapiens protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 14, mRNA (cDNA clone MGC:132463 IMAGE:8143806), complete cds. // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// HQ116786 // GenBank // Homo sapiens isolate 2A truncated protein tyrosine phosphatase non-receptor type 14 (PTPN14) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000000648 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:214356261:214483387:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
NM_007123 // RefSeq // Homo sapiens Usher syndrome 2A (autosomal recessive, mild) (USH2A), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 33 // 37 // 37 // 0 /// NM_206933 // RefSeq // Homo sapiens Usher syndrome 2A (autosomal recessive, mild) (USH2A), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 98 // 109 // 109 // 0 /// ENST00000307340 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:215622894:216423396:-1 gene:ENSG00000042781 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 98 // 109 // 109 // 0 /// ENST00000366942 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:216173946:216423396:-1 gene:ENSG00000042781 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 33 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000366943 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:215622894:216423396:-1 gene:ENSG00000042781 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 98 // 109 // 109 // 0 /// AF055580 // GenBank // Homo sapiens Usher syndrome type IIa protein (USH2A) mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 33 // 36 // 37 // 0 /// AY481573 // GenBank // Homo sapiens Usher syndrome 2A isoform B (USH2A) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 98 // 109 // 109 // 0 /// GENSCAN00000027287 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:215625781:215934792:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 44 // 49 // 49 // 0 /// GENSCAN00000040751 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:216181770:216528917:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 24 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000040748 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:215972225:216175333:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 14 // 14 // 15 // 111 // 1
ENST00000365628 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:215630026:215630117:-1 gene:ENSG00000202498 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT009475 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_018040 // RefSeq // Homo sapiens G patch domain containing 2 (GPATCH2), mRNA. // chr1 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000366934 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:217608184:217631082:-1 gene:ENSG00000092978 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000366935 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:217426992:217631082:-1 gene:ENSG00000092978 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// AK001114 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ10252 fis, clone HEMBB1000807. // chr1 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// AK291238 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77283 complete cds, highly similar to Homo sapiens G patch domain containing 2, mRNA. // chr1 // 95 // 57 // 19 // 20 // 0 /// BC027719 // GenBank // Homo sapiens G patch domain containing 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:4589911), partial cds. // chr1 // 100 // 23 // 8 // 8 // 0 /// BC042193 // GenBank // Homo sapiens G patch domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:47636 IMAGE:5532608), complete cds. // chr1 // 100 // 57 // 20 // 20 // 0 /// BC063474 // GenBank // Homo sapiens G patch domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:74998 IMAGE:5206348), complete cds. // chr1 // 100 // 63 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000040736 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:217431145:217620483:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 49 // 17 // 17 // 0
ENST00000391308 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:218541690:218541899:-1 gene:ENSG00000212610 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT009521 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_018713 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 30, member 10 (SLC30A10), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// NR_046437 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 30, member 10 (SLC30A10), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006711437 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens solute carrier family 30, member 10 (SLC30A10), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000356609 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:219913506:219928651:-1 gene:ENSG00000196660 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000366926 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:219915154:219928602:-1 gene:ENSG00000196660 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000484079 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:219914264:219919030:-1 gene:ENSG00000196660 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// AL359609 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp547M236 (from clone DKFZp547M236). // chr1 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// AY212919 // GenBank // Homo sapiens zinc transporter 8 (ZNT8) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// BC036078 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 30, member 10, mRNA (cDNA clone IMAGE:5288669), partial cds. // chr1 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000007814 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:219915449:219928440:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0
NM_004446 // RefSeq // Homo sapiens glutamyl-prolyl-tRNA synthetase (EPRS), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000366923 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:219968601:220046658:-1 gene:ENSG00000136628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000477030 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:220001201:220046530:-1 gene:ENSG00000136628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 33 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000609181 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:219987296:220046451:-1 gene:ENSG00000136628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 61 // 22 // 22 // 0 /// AK298192 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58269 complete cds, highly similar to Bifunctional aminoacyl-tRNA synthetase [Includes: Glutamyl-tRNA synthetase (EC 6.1.1.17). // chr1 // 100 // 36 // 13 // 13 // 0 /// AY493416 // GenBank // Homo sapiens proliferation-inducing protein 32 (PIG32) mRNA, complete cds. // chr1 // 94 // 92 // 31 // 33 // 0 /// BC126275 // GenBank // Homo sapiens glutamyl-prolyl-tRNA synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:161553 IMAGE:8991991), complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// BC136465 // GenBank // Homo sapiens glutamyl-prolyl-tRNA synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:168077 IMAGE:9020454), complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// JQ080075 // GenBank // Homo sapiens EPRSN1 mRNA, complete cds. // chr1 // 95 // 58 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000046789 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:219968806:220079846:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0
NONHSAT009573 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029628 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 215 (MIR215), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000384858 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:220117853:220117962:-1 gene:ENSG00000207590 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-215 // miRBase Micro RNA Database // MI0000291 Homo sapiens miR-215 stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT009580 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NR_029711 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 194-1 (MIR194-1), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000384892 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:220118157:220118241:-1 gene:ENSG00000207624 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-194-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0000488 Homo sapiens miR-194-1 stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT009582 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_012414 // RefSeq // Homo sapiens RAB3 GTPase activating protein subunit 2 (non-catalytic) (RAB3GAP2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000358951 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:220148293:220272454:-1 gene:ENSG00000118873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// AF004828 // GenBank // Homo sapiens rab3-GAP regulatory domain mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// AF255648 // GenBank // Homo sapiens rGAP-iso mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// AK291234 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78421 complete cds, highly similar to Homo sapiens RAB3 GTPase activating protein subunit 2 (non-catalytic) (RAB3GAP2), mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// BC146760 // GenBank // Homo sapiens RAB3 GTPase activating protein subunit 2 (non-catalytic), mRNA (cDNA clone MGC:166829 IMAGE:9007199), complete cds. // chr1 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// AK021928 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ11866 fis, clone HEMBA1006973, highly similar to Homo sapiens rab3-GAP regulatory domain mRNA. // chr1 // 20 // 20 // 8 // 41 // 1 /// GENSCAN00000046793 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:220151251:220220252:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 29 // 29 // 0 /// NONHSAT009584 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 20 // 20 // 8 // 41 // 1
ENST00000492743 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:220571739:220572035:-1 gene:ENSG00000243872 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT009612 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_024236 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC400804 (C1orf140), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000439004 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:221330080:221336296:-1 gene:ENSG00000234754 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000434398 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:221332639:221335920:-1 gene:ENSG00000234754 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1 /// NONHSAT009639 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1
ENST00000363163 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:221837334:221837437:-1 gene:ENSG00000200033 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT009646 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0
NM_024746 // RefSeq // Homo sapiens HHIP-like 2 (HHIPL2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000343410 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:222522260:222548103:-1 gene:ENSG00000143512 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000468172 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:222522809:222538843:-1 gene:ENSG00000143512 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 90 // 26 // 9 // 10 // 0 /// AY358602 // GenBank // Homo sapiens clone DNA73775 LRTS841 (UNQ841) mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 97 // 36 // 37 // 0 /// BC007638 // GenBank // Homo sapiens HHIP-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:15905 IMAGE:3533045), complete cds. // chr1 // 97 // 97 // 36 // 37 // 0 /// BC015167 // GenBank // Homo sapiens HHIP-like 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:3895072), partial cds. // chr1 // 100 // 42 // 16 // 16 // 0 /// BC015201 // GenBank // Homo sapiens HHIP-like 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:3889322), complete cds. // chr1 // 100 // 47 // 18 // 18 // 0 /// BC016552 // GenBank // Homo sapiens HHIP-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:22143 IMAGE:4452939), complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 37 // 38 // 0 /// ENST00000473144 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:222522258:222525239:-1 gene:ENSG00000143512 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 26 // 26 // 10 // 38 // 1 /// GENSCAN00000016339 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:222472269:222601525:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT009685 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 26 // 26 // 10 // 38 // 1
ENST00000474863 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:222668013:222712737:-1 gene:ENSG00000186063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 87 // 13 // 13 // 0 /// BC043142 // GenBank // Homo sapiens axin interactor, dorsalization associated, mRNA (cDNA clone IMAGE:5297142), complete cds. // chr1 // 100 // 87 // 13 // 13 // 0
NONHSAT009720 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_003268 // RefSeq // Homo sapiens toll-like receptor 5 (TLR5), mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006711503 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens toll-like receptor 5 (TLR5), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000366881 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:223110305:223143282:-1 gene:ENSG00000187554 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// ENST00000484766 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:223134432:223143246:-1 gene:ENSG00000187554 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000540964 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:223109406:223137287:-1 gene:ENSG00000187554 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// AB060695 // GenBank // Homo sapiens TLR5 mRNA for Toll-like receptor 5, complete cds. // chr1 // 93 // 90 // 25 // 27 // 0 /// AB445645 // GenBank // Homo sapiens TLR5 mRNA for toll-like receptor 5, complete cds. // chr1 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// AF051151 // GenBank // Homo sapiens Toll/interleukin-1 receptor-like protein 3 (TIL3) mRNA, complete cds. // chr1 // 85 // 90 // 23 // 27 // 0 /// BC109118 // GenBank // Homo sapiens toll-like receptor 5, mRNA (cDNA clone MGC:126430 IMAGE:40035617), complete cds. // chr1 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// BC109119 // GenBank // Homo sapiens toll-like receptor 5, mRNA (cDNA clone MGC:126431 IMAGE:40035618), complete cds. // chr1 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000019660 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:223110455:223113031:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT009730 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0
NM_002296 // RefSeq // Homo sapiens lamin B receptor (LBR), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// NM_194442 // RefSeq // Homo sapiens lamin B receptor (LBR), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000272163 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:225401502:225428035:-1 gene:ENSG00000143815 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000338179 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:225401503:225428855:-1 gene:ENSG00000143815 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000425080 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:225419263:225428925:-1 gene:ENSG00000143815 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 25 // 9 // 9 // 0 /// AK303589 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52178 complete cds, highly similar to Lamin-B receptor. // chr1 // 94 // 47 // 16 // 17 // 0 /// BC020079 // GenBank // Homo sapiens lamin B receptor, mRNA (cDNA clone MGC:9041 IMAGE:3925138), complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// L25931 // GenBank // Human lamin B receptor (LBR) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000042814 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:225403303:225426624:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 23 // 23 // 0
NM_014698 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 63A (TMEM63A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000366835 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:225845536:225882369:-1 gene:ENSG00000196187 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC030245 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 63A, mRNA (cDNA clone MGC:39936 IMAGE:5216414), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AK309210 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99251. // chr1 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1 /// GENSCAN00000042815 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:225847040:225883051:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
NM_020997 // RefSeq // Homo sapiens left-right determination factor 1 (LEFTY1), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000272134 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:225886282:225889146:-1 gene:ENSG00000243709 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0 /// AF081512 // GenBank // Homo sapiens TGF-beta type secreted signaling protein LEFTYB mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 87 // 13 // 13 // 0 /// AY358873 // GenBank // Homo sapiens clone DNA33461 LEFTB (UNQ278) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 87 // 13 // 13 // 0 /// BC027883 // GenBank // Homo sapiens left-right determination factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:34249 IMAGE:5221120), complete cds. // chr1 // 100 // 87 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000042810 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:225886727:225889066:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0
NM_001172425 // RefSeq // Homo sapiens left-right determination factor 2 (LEFTY2), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NM_003240 // RefSeq // Homo sapiens left-right determination factor 2 (LEFTY2), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000366820 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:225936604:225941489:-1 gene:ENSG00000143768 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000420304 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:225936598:225941383:-1 gene:ENSG00000143768 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// AF081513 // GenBank // Homo sapiens TGF-beta type secreted signaling protein LEFTYA mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// AK304549 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51464 complete cds, highly similar to Transforming growth factor beta-4 precursor. // chr1 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// BC035718 // GenBank // Homo sapiens left-right determination factor 2, mRNA (cDNA clone MGC:46222 IMAGE:5588729), complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// U81523 // GenBank // Human endometrial bleeding associated factor mRNA, complete cds. // chr1 // 83 // 67 // 10 // 12 // 0 /// BC065929 // GenBank // Homo sapiens left-right determination factor 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:6140189). // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 1 /// ENST00000616737 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:225936628:225941173:-1 gene:ENSG00000143768 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 12 // 12 // 0 /// BC116448 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:7468470, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr1 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0
NM_152608 // RefSeq // Homo sapiens SDE2 telomere maintenance homolog (S. pombe) (SDE2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_247021 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens SDE2 telomere maintenance homolog (S. pombe) (SDE2), transcript variant X2, misc_RNA. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000272091 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:225982702:225999331:-1 gene:ENSG00000143751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AK291008 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76172 complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// BC071563 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 55, mRNA (cDNA clone MGC:87025 IMAGE:5261192), complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000049491 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:225985302:225999312:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
NM_022735 // RefSeq // Homo sapiens acyl-CoA binding domain containing 3 (ACBD3), mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000366812 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:226144679:226186730:-1 gene:ENSG00000182827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AB043587 // GenBank // Homo sapiens gcp60 mRNA for golgi resident protein GCP60, complete cds. // chr1 // 91 // 100 // 31 // 34 // 0 /// AY150218 // GenBank // Homo sapiens peripherial benzodiazepine receptor associated protein mRNA, complete cds. // chr1 // 91 // 94 // 29 // 32 // 0 /// BC039575 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5725757, containing frame-shift errors. // chr1 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// BC045533 // GenBank // Homo sapiens acyl-Coenzyme A binding domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:57123 IMAGE:5259930), complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// BC060792 // GenBank // Homo sapiens acyl-Coenzyme A binding domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:71593 IMAGE:4813993), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000049505 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:226146610:226186675:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0
NONHSAT009888 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
M18112 // GenBank // Human poly(ADP-ribose) polymerase mRNA, complete cds. // chr1 // 95 // 96 // 21 // 22 // 0 /// M32721 // GenBank // Human poly(ADP-ribose) polymerase mRNA, complete cds. // chr1 // 73 // 96 // 16 // 22 // 0 /// NM_001618 // RefSeq // Homo sapiens poly (ADP-ribose) polymerase 1 (PARP1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 1 /// ENST00000366794 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:226360691:226408073:-1 gene:ENSG00000143799 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 1 /// AK303340 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53442 complete cds, highly similar to Poly (ADP-ribose) polymerase 1 (EC 2.4.2.30). // chr1 // 91 // 91 // 21 // 23 // 1 /// BC037545 // GenBank // Homo sapiens poly (ADP-ribose) polymerase 1, mRNA (cDNA clone MGC:40266 IMAGE:5193735), complete cds. // chr1 // 96 // 96 // 22 // 23 // 1 /// J03473 // GenBank // Human poly(ADP-ribose) synthetase mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 1 /// ENST00000490921 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:226361295:226371115:-1 gene:ENSG00000143799 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 39 // 39 // 9 // 23 // 1 /// AK125650 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ43662 fis, clone SYNOV4005981, highly similar to POLY [ADP-RIBOSE] POLYMERASE (EC 2.4.2.30). // chr1 // 39 // 39 // 9 // 23 // 1 /// GENSCAN00000049490 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:226232501:226407929:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 83 // 83 // 19 // 23 // 1
ENST00000274516 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:26827169:26827520:-1 gene:ENSG00000145835 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// ENST00000460287 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:226493188:226493489:-1 gene:ENSG00000177770 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// GENSCAN00000049500 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:226456445:226541781:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0
NM_002221 // RefSeq // Homo sapiens inositol-trisphosphate 3-kinase B (ITPKB), mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000272117 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:226631690:226737458:-1 gene:ENSG00000143772 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000366784 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:226707190:226739323:-1 gene:ENSG00000143772 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 58 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000429204 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:226631690:226739175:-1 gene:ENSG00000143772 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// AK289700 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78152 complete cds, highly similar to H.sapiens mRNA for 1D-myo-inositol-trisphosphate 3-kinase B isoenzyme. // chr1 // 89 // 44 // 17 // 19 // 0 /// AY513281 // GenBank // Homo sapiens proliferation-inducing protein 37 (PIG37) mRNA, complete cds. // chr1 // 89 // 44 // 17 // 19 // 0 /// BC015009 // GenBank // Homo sapiens inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase B, mRNA (cDNA clone MGC:23636 IMAGE:4862726), complete cds. // chr1 // 91 // 53 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000049497 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:226634671:226737458:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 33 // 33 // 0
BC019830 // GenBank // Homo sapiens hypothetical protein PRO2012, mRNA (cDNA clone IMAGE:4995736). // chr1 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// AF116681 // GenBank HTC // Homo sapiens PRO2012 mRNA, complete cds. // chr1 // 59 // 59 // 13 // 22 // 1
NR_036753 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 847, pseudogene (ZNF847P), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// NONHSAT009936 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// NONHSAT009937 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// NONHSAT009938 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0
NM_001161465 // RefSeq // Homo sapiens jumonji domain containing 4 (JMJD4), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// NM_023007 // RefSeq // Homo sapiens jumonji domain containing 4 (JMJD4), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000366758 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:227731189:227735411:-1 gene:ENSG00000081692 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000438896 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:227731234:227735411:-1 gene:ENSG00000081692 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000480590 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:227733148:227735076:-1 gene:ENSG00000081692 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 21 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000485807 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:227730425:227734377:-1 gene:ENSG00000081692 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// AK026908 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ23255 fis, clone COL05420. // chr1 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000615711 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:227731193:227735411:-1 gene:ENSG00000081692 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000620518 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:227731224:227735283:-1 gene:ENSG00000081692 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000004061 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:227659347:227735411:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 68 // 68 // 26 // 38 // 1
NM_003395 // RefSeq // Homo sapiens wingless-type MMTV integration site family, member 9A (WNT9A), mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000272164 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:227918656:227947898:-1 gene:ENSG00000143816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// AB060283 // GenBank // Homo sapiens mRNA for WNT14, complete cds. // chr1 // 92 // 81 // 23 // 25 // 0 /// AK131041 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ29007 fis, clone STM04662, highly similar to WNT-14 protein precursor. // chr1 // 94 // 52 // 15 // 16 // 0 /// BC111960 // GenBank // Homo sapiens wingless-type MMTV integration site family, member 9A, mRNA (cDNA clone MGC:138165 IMAGE:8327428), complete cds. // chr1 // 96 // 87 // 26 // 27 // 0 /// BC113431 // GenBank // Homo sapiens wingless-type MMTV integration site family, member 9A, mRNA (cDNA clone MGC:141991 IMAGE:8322483), complete cds. // chr1 // 96 // 87 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000004068 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:227888918:227947887:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1
XM_003119777 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens uncharacterized LOC100506571 (LOC100506571), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000611237 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:228073913:228076550:-1 gene:ENSG00000276255 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// AL137472 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp434C0923 (from clone DKFZp434C0923). // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NR_073154 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 145 (C1orf145), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NR_073155 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 145 (C1orf145), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000295012 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:228203506:228213660:-1 gene:ENSG00000162913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000337335 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:228204466:228213664:-1 gene:ENSG00000162913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000472613 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:228203985:228213646:-1 gene:ENSG00000162913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 90 // 36 // 9 // 10 // 0
NM_003493 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 3, H3 (HIST3H3), mRNA. // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000366696 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:228424845:228425325:-1 gene:ENSG00000168148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC069079 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 3, H3, mRNA (cDNA clone MGC:95354 IMAGE:7216893), complete cds. // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC101837 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 3, H3, mRNA (cDNA clone MGC:126886 IMAGE:8069343), complete cds. // chr1 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// BC101839 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 3, H3, mRNA (cDNA clone MGC:126888 IMAGE:8069345), complete cds. // chr1 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// CR542013 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834E0435D for gene HIST3H3, histone 3, H3; complete cds, without stopcodon. // chr1 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000018358 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:228424915:228425325:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0
NM_033445 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 3, H2a (HIST3H2A), mRNA. // chr1 // 88 // 64 // 14 // 16 // 0 /// ENST00000366695 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:228456979:228457873:-1 gene:ENSG00000181218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000436555 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:228464103:228464626:-1 gene:ENSG00000181201 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:unitary_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000018352 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:228464213:228464594:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
ENST00000516242 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:229410500:229410767:-1 gene:ENSG00000252051 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT010082 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001100 // RefSeq // Homo sapiens actin, alpha 1, skeletal muscle (ACTA1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000366684 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:229431245:229434094:-1 gene:ENSG00000143632 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AK300697 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53662 complete cds, highly similar to Actin, alpha skeletal muscle. // chr1 // 88 // 89 // 28 // 32 // 0 /// BC012597 // GenBank // Homo sapiens actin, alpha 1, skeletal muscle, mRNA (cDNA clone MGC:13546 IMAGE:4291656), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// CR536516 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834D1020D for gene ACTA1, actin, alpha 1, skeletal muscle; complete cds, incl. stopcodon. // chr1 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// CR541796 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834B0631D for gene ACTA1, actin, alpha 1, skeletal muscle; complete cds, without stopcodon. // chr1 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000366683 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:229431249:229434098:-1 gene:ENSG00000143632 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 72 // 72 // 26 // 36 // 1 /// AY280960 // GenBank // Homo sapiens actin alpha 1 skeletal muscle protein (ACTA1) mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr1 // 56 // 56 // 20 // 36 // 1 /// GENSCAN00000043294 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:229431499:229508249:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0
NM_018230 // RefSeq // Homo sapiens nucleoporin 133kDa (NUP133), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000261396 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:229441298:229508341:-1 gene:ENSG00000069248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AK304061 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55441 complete cds, highly similar to Nuclear pore complex protein Nup133. // chr1 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// AK304861 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55448 complete cds, highly similar to Nuclear pore complex protein Nup133. // chr1 // 97 // 89 // 30 // 31 // 0 /// BC020107 // GenBank // Homo sapiens nucleoporin 133kDa, mRNA (cDNA clone MGC:21133 IMAGE:3919973), complete cds. // chr1 // 97 // 91 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000043294 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:229431499:229508249:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 66 // 66 // 23 // 35 // 1
NM_012089 // RefSeq // Homo sapiens ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP), member 10 (ABCB10), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000344517 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:229516582:229558695:-1 gene:ENSG00000135776 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB013380 // GenBank // Homo sapiens mRNA for mono ATP-binding cassette protein, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF216833 // GenBank // Homo sapiens M-ABC2 protein (M-ABC2) mRNA, complete cds, nuclear gene for mitochondrial product. // chr1 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// AK172794 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ23955 fis, clone HEP11276, highly similar to Homo sapiens ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP), member 10 (ABCB10). // chr1 // 75 // 62 // 12 // 16 // 0 /// BC064930 // GenBank // Homo sapiens ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP), member 10, mRNA (cDNA clone MGC:70707 IMAGE:6143235), complete cds. // chr1 // 88 // 96 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043295 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:229518179:229558652:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
ENST00000362802 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:229535064:229535189:-1 gene:ENSG00000199672 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT010091 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001258311 // RefSeq // Homo sapiens piggyBac transposable element derived 5 (PGBD5), mRNA. // chr1 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000391860 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:230321646:230425729:-1 gene:ENSG00000177614 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// AK297321 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57838 complete cds, highly similar to Homo sapiens piggyBac transposable element derived 5 (PGBD5), mRNA. // chr1 // 79 // 39 // 11 // 14 // 0 /// AK315968 // GenBank // Homo sapiens cDNA, FLJ78867 complete cds, highly similar to Homo sapiens piggyBac transposable element derived 5 (PGBD5), mRNA. // chr1 // 100 // 39 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000525115 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:1:230323248:230377645:-1 gene:ENSG00000177614 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1 /// BC150638 // GenBank // Homo sapiens piggyBac transposable element derived 5, mRNA (cDNA clone MGC:183548 IMAGE:9057008), complete cds. // chr1 // 64 // 64 // 23 // 36 // 1 /// GENSCAN00000027032 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:230323425:230376634:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0
NM_000029 // RefSeq // Homo sapiens angiotensinogen (serpin peptidase inhibitor, clade A, member 8) (AGT), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000366667 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:230702523:230714297:-1 gene:ENSG00000135744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK303755 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53950 complete cds, highly similar to Angiotensinogen precursor. // chr1 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// BC011519 // GenBank // Homo sapiens angiotensinogen (serpin peptidase inhibitor, clade A, member 8), mRNA (cDNA clone MGC:17092 IMAGE:4213559), complete cds. // chr1 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// BT006851 // GenBank // Homo sapiens angiotensinogen (serine (or cysteine) proteinase inhibitor, clade A (alpha-1 antiproteinase, antitrypsin), member 8) mRNA, complete cds. // chr1 // 93 // 54 // 14 // 15 // 0 /// K02215 // GenBank // Human angiotensinogen mRNA, complete CDS. // chr1 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// AK293507 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52255 complete cds, highly similar to Angiotensinogen precursor. // chr1 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// GENSCAN00000027029 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:230703141:230710823:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0
NM_001122835 // RefSeq // Homo sapiens tetratricopeptide repeat domain 13 (TTC13), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NM_024525 // RefSeq // Homo sapiens tetratricopeptide repeat domain 13 (TTC13), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006711814 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens tetratricopeptide repeat domain 13 (TTC13), transcript variant X6, mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000366661 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:230906243:230978838:-1 gene:ENSG00000143643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000366662 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:230906243:230978859:-1 gene:ENSG00000143643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000466507 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:230940509:230978835:-1 gene:ENSG00000143643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000481976 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:230931418:230978875:-1 gene:ENSG00000143643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// AK309725 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99766. // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC042683 // GenBank // Homo sapiens tetratricopeptide repeat domain 13, mRNA (cDNA clone IMAGE:4754169), partial cds. // chr1 // 93 // 54 // 13 // 14 // 0 /// BC110880 // GenBank HTC // Homo sapiens tetratricopeptide repeat domain 13, mRNA (cDNA clone IMAGE:6068886), with apparent retained intron. // chr1 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000027026 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:230902625:230958299:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
NM_198552 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 89, member A (FAM89A), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000366654 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:231018958:231040246:-1 gene:ENSG00000182118 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000466258 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:231019418:231028732:-1 gene:ENSG00000182118 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// BC009447 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 89, member A, mRNA (cDNA clone MGC:15887 IMAGE:3530481), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000494111 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:231019176:231026949:-1 gene:ENSG00000182118 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// NONHSAT010156 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000037047 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:231032940:231040211:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// NONHSAT010155 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
AK054992 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ30430 fis, clone BRACE2008960. // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONHSAT010158 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
ENST00000318906 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:231223763:231241170:-1 gene:ENSG00000143633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000451322 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:231224255:231241090:-1 gene:ENSG00000143633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 43 // 10 // 10 // 0 /// AK303359 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61512 complete cds. // chr1 // 92 // 52 // 11 // 12 // 0 /// AY358235 // GenBank // Homo sapiens clone DNA142988 LTLL9335 (UNQ9335) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 35 // 8 // 8 // 0 /// NM_152379 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 131 (C1orf131), mRNA. // chr1 // 74 // 74 // 17 // 23 // 1 /// ENST00000366649 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:231223763:231241167:-1 gene:ENSG00000143633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 74 // 74 // 17 // 23 // 1 /// ENST00000366651 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:231223763:231241178:-1 gene:ENSG00000143633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 74 // 74 // 17 // 23 // 1 /// BC036800 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 131, mRNA (cDNA clone MGC:46269 IMAGE:5589128), complete cds. // chr1 // 74 // 74 // 17 // 23 // 1 /// BC062353 // GenBank // Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 131, mRNA (cDNA clone MGC:71140 IMAGE:4648754), complete cds. // chr1 // 65 // 65 // 15 // 23 // 1 /// GENSCAN00000037032 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:231215201:231241141:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 48 // 48 // 11 // 23 // 1
NM_175876 // RefSeq // Homo sapiens exocyst complex component 8 (EXOC8), mRNA. // chr1 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// ENST00000366645 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:231332753:231337852:-1 gene:ENSG00000116903 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC035763 // GenBank // Homo sapiens exocyst complex component 8, mRNA (cDNA clone MGC:46661 IMAGE:5552837), complete cds. // chr1 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000037041 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:231335568:231337745:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0
NM_022051 // RefSeq // Homo sapiens egl-9 family hypoxia-inducible factor 1 (EGLN1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000366641 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:231363751:231425044:-1 gene:ENSG00000135766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF229245 // GenBank // Homo sapiens SM-20 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC005369 // GenBank // Homo sapiens egl nine homolog 1 (C. elegans), mRNA (cDNA clone IMAGE:3931851), complete cds. // chr1 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// XM_006711782 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens egl-9 family hypoxia-inducible factor 1 (EGLN1), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// GENSCAN00000037049 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:231366411:231422659:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
NR_033826 // RefSeq // Homo sapiens small nuclear ribonucleoprotein D2 pseudogene 2 (SNRPD2P2), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000473818 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:231475956:231476288:-1 gene:ENSG00000223982 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// NONHSAT010172 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT010173 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
NM_020808 // RefSeq // Homo sapiens signal-induced proliferation-associated 1 like 2 (SIPA1L2), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000262861 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:232397968:232515566:-1 gene:ENSG00000116991 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000308942 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:232398710:232462417:-1 gene:ENSG00000116991 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000366630 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:232397965:232561558:-1 gene:ENSG00000116991 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// AK093191 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ35872 fis, clone TESTI2008189, weakly similar to SPA-1 like protein p1294. // chr1 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// AY168879 // GenBank // Homo sapiens SPA-1-like 2 (SPAL2) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC150334 // GenBank // Homo sapiens signal-induced proliferation-associated 1 like 2, mRNA (cDNA clone MGC:167831 IMAGE:8860510), complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048919 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:232399127:232497855:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0
ENST00000384108 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:232832017:232832187:-1 gene:ENSG00000206835 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT010235 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000516692 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:233448626:233448781:-1 gene:ENSG00000252501 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONHSAT010260 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
ENST00000422958 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:234356704:234357141:-1 gene:ENSG00000235605 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000011904 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:234356704:234357141:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT010277 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_005646 // RefSeq // Homo sapiens TAR (HIV-1) RNA binding protein 1 (TARBP1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000040877 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:1:234391313:234479103:-1 gene:ENSG00000059588 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000462259 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:234391378:234406380:-1 gene:ENSG00000059588 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 23 // 9 // 9 // 0 /// BC016023 // GenBank // Homo sapiens Tar (HIV-1) RNA binding protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4721653). // chr1 // 100 // 23 // 9 // 9 // 0 /// U38847 // GenBank // Human TAR RNA loop binding protein (TRP-185) mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 38 // 39 // 0 /// GENSCAN00000011894 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:234391577:234457380:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 41 // 16 // 16 // 0
AF193050 // GenBank // Homo sapiens PP2672 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_014765 // RefSeq // Homo sapiens translocase of outer mitochondrial membrane 20 homolog (yeast) (TOMM20), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000366607 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:235109336:235128936:-1 gene:ENSG00000173726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// AK289810 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75096 complete cds, highly similar to Homo sapiens translocase of outer mitochondrial membrane 20 homolog (yeast) (TOMM20), mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0 /// BC000882 // GenBank // Homo sapiens translocase of outer mitochondrial membrane 20 homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:4905 IMAGE:3462090), complete cds. // chr1 // 100 // 64 // 9 // 9 // 0 /// BC066335 // GenBank // Homo sapiens translocase of outer mitochondrial membrane 20 homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:87352 IMAGE:4818590), complete cds. // chr1 // 100 // 64 // 9 // 9 // 0 /// BC071994 // GenBank // Homo sapiens translocase of outer mitochondrial membrane 20 homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:88695 IMAGE:6082526), complete cds. // chr1 // 100 // 64 // 9 // 9 // 0 /// BC100286 // GenBank // Homo sapiens translocase of outer mitochondrial membrane 20 homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:117368 IMAGE:6157036), complete cds. // chr1 // 100 // 71 // 10 // 10 // 0 /// D13641 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA0016 gene, complete cds. // chr1 // 100 // 79 // 11 // 11 // 0
NR_002956 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 14B (SNORA14B), small nucleolar RNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000384452 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:235127803:235127937:-1 gene:ENSG00000207181 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT010337 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0
NM_002508 // RefSeq // Homo sapiens nidogen 1 (NID1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000264187 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:235975830:236065162:-1 gene:ENSG00000116962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000366595 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:235975830:236065109:-1 gene:ENSG00000116962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// AK297234 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51241 complete cds, highly similar to Nidogen-1 precursor. // chr1 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// BC045606 // GenBank // Homo sapiens nidogen 1, mRNA (cDNA clone MGC:33141 IMAGE:5271590), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// M30269 // GenBank // Human nidogen mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000025974 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:236011664:236065079:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0
NM_019891 // RefSeq // Homo sapiens ERO1-like beta (S. cerevisiae) (ERO1LB), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000354619 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:236215555:236281985:-1 gene:ENSG00000086619 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000366589 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:236236332:236281601:-1 gene:ENSG00000086619 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 32 // 12 // 12 // 0 /// AF252538 // GenBank // Homo sapiens endoplasmic reticulum oxidoreductin 1-Lbeta (ERO1Lbeta) mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 89 // 32 // 33 // 0 /// BC032823 // GenBank // Homo sapiens ERO1-like beta (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:26065 IMAGE:4829502), complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// BC044573 // GenBank // Homo sapiens ERO1-like beta (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:57152 IMAGE:5270105), complete cds. // chr1 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// AK293941 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56569 complete cds, highly similar to ERO1-like protein beta precursor (EC 1.8.4.-). // chr1 // 38 // 38 // 14 // 37 // 1 /// ENST00000264181 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:236220173:236226495:-1 gene:ENSG00000086619 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 22 // 22 // 8 // 37 // 1 /// GENSCAN00000025978 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:236217683:236281783:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 41 // 15 // 15 // 0
NR_034040 // RefSeq // Homo sapiens LGALS8 antisense RNA 1 (LGALS8-AS1), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000487567 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:236523069:236524508:-1 gene:ENSG00000223776 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000493812 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:236523071:236524500:-1 gene:ENSG00000223776 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC014452 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4903661, complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000025972 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:236523190:236524498:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// NONHSAT010405 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_018072 // RefSeq // Homo sapiens HEAT repeat containing 1 (HEATR1), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 54 // 54 // 0 /// XR_426917 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens HEAT repeat containing 1 (HEATR1), transcript variant X1, misc_RNA. // chr1 // 100 // 96 // 54 // 54 // 0 /// ENST00000366581 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:236550671:236604504:-1 gene:ENSG00000119285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 52 // 52 // 0 /// ENST00000366582 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:236549005:236604504:-1 gene:ENSG00000119285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 54 // 54 // 0 /// AK304129 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53502 complete cds, highly similar to HEAT repeat-containing protein 1. // chr1 // 100 // 52 // 29 // 29 // 0 /// AK316413 // GenBank // Homo sapiens cDNA, FLJ79312 complete cds, highly similar to HEAT repeat-containing protein 1. // chr1 // 100 // 50 // 28 // 28 // 0 /// BC011983 // GenBank // Homo sapiens HEAT repeat containing 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3863792), complete cds. // chr1 // 100 // 18 // 10 // 10 // 0 /// BC150614 // GenBank // Homo sapiens HEAT repeat containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:183524 IMAGE:9056984), complete cds. // chr1 // 96 // 91 // 49 // 51 // 0 /// GENSCAN00000025977 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:236550902:236604095:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 48 // 48 // 0
NM_001276687 // RefSeq // Homo sapiens metallothionein 1H-like 1 (MT1HL1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000464121 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:237004103:237004418:-1 gene:ENSG00000244020 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AF333388 // GenBank // Homo sapiens metallothionein 1H-like protein mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT010439 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 40 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000020220 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:236997341:237042523:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 60 // 60 // 12 // 20 // 1
ENST00000516481 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:237555040:237555171:-1 gene:ENSG00000252290 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT010444 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_021186 // RefSeq // Homo sapiens zona pellucida glycoprotein 4 (ZP4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000366570 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:237882405:237890794:-1 gene:ENSG00000116996 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC069521 // GenBank // Homo sapiens zona pellucida glycoprotein 4, mRNA (cDNA clone MGC:97109 IMAGE:7262334), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000611898 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:237877864:237890922:-1 gene:ENSG00000116996 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000020219 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:237877695:237890635:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
ENST00000516562 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:238325687:238325788:-1 gene:ENSG00000252371 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT010458 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000365171 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:240154651:240154772:-1 gene:ENSG00000202041 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT010490 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_022469 // RefSeq // Homo sapiens gremlin 2, DAN family BMP antagonist (GREM2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000318160 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:240489573:240612149:-1 gene:ENSG00000180875 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC046632 // GenBank // Homo sapiens gremlin 2, cysteine knot superfamily, homolog (Xenopus laevis), mRNA (cDNA clone MGC:44218 IMAGE:5288555), complete cds. // chr1 // 92 // 87 // 24 // 26 // 0
NM_000143 // RefSeq // Homo sapiens fumarate hydratase (FH), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000366560 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:241497603:241519761:-1 gene:ENSG00000091483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC003108 // GenBank // Homo sapiens fumarate hydratase, mRNA (cDNA clone MGC:2061 IMAGE:3502012), complete cds. // chr1 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// BC017444 // GenBank // Homo sapiens fumarate hydratase, mRNA (cDNA clone MGC:15363 IMAGE:3606118), complete cds. // chr1 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// BT009839 // GenBank // Homo sapiens fumarate hydratase mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// M15502 // GenBank // Human mitochondrial fumarase mRNA, complete cds. // chr1 // 94 // 73 // 15 // 16 // 0 /// U48857 // GenBank // Human fumarase mRNA, nuclear gene encoding mitochondrial protein, complete cds. // chr1 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// U59309 // GenBank // Human fumarase precursor (FH) mRNA, nuclear gene encoding mitochondrial protein, complete cds. // chr1 // 91 // 100 // 20 // 22 // 0 /// GENSCAN00000021621 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:241355559:241519722:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 17 // 17 // 0
NM_001821 // RefSeq // Homo sapiens choroideremia-like (Rab escort protein 2) (CHML), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000366553 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:241628853:241635930:-1 gene:ENSG00000203668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK314125 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ94822, highly similar to Homo sapiens choroideremia-like (Rab escort protein 2) (CHML),mRNA. // chr1 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// BC117360 // GenBank // Homo sapiens choroideremia-like (Rab escort protein 2), mRNA (cDNA clone MGC:150969 IMAGE:40125911), complete cds. // chr1 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000021618 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:241633796:241640254:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0
NM_001004343 // RefSeq // Homo sapiens microtubule-associated protein 1 light chain 3 gamma (MAP1LC3C), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000357246 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:241995490:241999073:-1 gene:ENSG00000197769 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AF276659 // GenBank // Homo sapiens MAP1 light chain 3-like protein 2 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC127722 // GenBank // Homo sapiens microtubule-associated protein 1 light chain 3 gamma, mRNA (cDNA clone MGC:157821 IMAGE:40127238), complete cds. // chr1 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// BC132986 // GenBank // Homo sapiens microtubule-associated protein 1 light chain 3 gamma, mRNA (cDNA clone MGC:164617 IMAGE:40147008), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC132988 // GenBank // Homo sapiens microtubule-associated protein 1 light chain 3 gamma, mRNA (cDNA clone MGC:164619 IMAGE:40147010), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000046806 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:241996163:242001897:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 68 // 14 // 15 // 0
ENST00000411187 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:242023949:242024054:-1 gene:ENSG00000223119 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT010560 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001126 // RefSeq // Homo sapiens adenylosuccinate synthase (ADSS), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000366535 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:244408494:244452134:-1 gene:ENSG00000035687 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK303886 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53126 complete cds, highly similar to Adenylosuccinate synthetase isozyme 2 (EC6.3.4.4). // chr1 // 94 // 64 // 17 // 18 // 0 /// AK308749 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ98790. // chr1 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// BC012356 // GenBank // Homo sapiens adenylosuccinate synthase, mRNA (cDNA clone MGC:20404 IMAGE:4635347), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000006275 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:244409586:244451817:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0
NR_026778 // RefSeq // Homo sapiens HNRNPU antisense RNA 1 (HNRNPU-AS1), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000366527 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:244840638:244846903:-1 gene:ENSG00000188206 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT010656 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr1 // 100 // 61 // 11 // 11 // 0 /// NONHSAT010657 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT010658 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr1 // 100 // 61 // 11 // 11 // 0
AK095945 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ38626 fis, clone HEART2009599. // chr1 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// ENST00000607453 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:244969350:244971088:-1 gene:ENSG00000272195 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000364300 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:245133927:245134090:-1 gene:ENSG00000201170 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT010679 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
ENST00000365314 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:246189014:246189118:-1 gene:ENSG00000202184 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT010703 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000384596 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:246426006:246426119:-1 gene:ENSG00000207326 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT010705 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_022366 // RefSeq // Homo sapiens transcription factor B2, mitochondrial (TFB2M), mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000366514 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:246540560:246566324:-1 gene:ENSG00000162851 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AF529366 // GenBank // Homo sapiens NS5ATP5 (NS5ATP5) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// AK026835 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ23182 fis, clone LNG11207. // chr1 // 95 // 92 // 21 // 22 // 0 /// AK300238 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57434 complete cds, highly similar to Homo sapiens transcription factor B2, mRNA. // chr1 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// BC003383 // GenBank // Homo sapiens transcription factor B2, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:5368 IMAGE:3049009), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000006546 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:246516799:246567105:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1
NM_001204220 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 670 (ZNF670), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NM_033213 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 670 (ZNF670), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000366503 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:247036784:247078755:-1 gene:ENSG00000277462 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSG00000135747 // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC005360 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 670, mRNA (cDNA clone MGC:12466 IMAGE:3684736), complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000047830 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:246986967:247186682:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1
NM_024804 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 669 (ZNF669), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000343381 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:247099991:247104372:-1 gene:ENSG00000188295 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000366501 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:247100856:247104278:-1 gene:ENSG00000188295 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 43 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000476158 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:247101290:247104365:-1 gene:ENSG00000188295 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// AK056020 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ31458 fis, clone NT2NE2001181, highly similar to Zinc finger protein 669. // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC015312 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 669, mRNA (cDNA clone MGC:21047 IMAGE:4413005), complete cds. // chr1 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// NM_001142572 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 669 (ZNF669), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// ENST00000448299 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:247099962:247104368:-1 gene:ENSG00000188295 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// GENSCAN00000047830 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:246986967:247186682:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 63 // 63 // 19 // 30 // 1
ENST00000408893 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:247110266:247112417:-1 gene:ENSG00000221953 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// AK127619 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ45717 fis, clone FELNG2001613. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000047830 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:246986967:247186682:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 58 // 58 // 14 // 24 // 1
ENST00000516707 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:247204570:247204661:-1 gene:ENSG00000252516 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT010765 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000472048 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:247236868:247237957:-1 gene:ENSG00000235818 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001004492 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily B, member 11 (OR2B11), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000318749 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:247451029:247451982:-1 gene:ENSG00000177535 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC137181 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily B, member 11, mRNA (cDNA clone MGC:168801 IMAGE:9021178), complete cds. // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC137205 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily B, member 11, mRNA (cDNA clone MGC:168825 IMAGE:9021202), complete cds. // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047850 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:247451029:247458134:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_198074 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily C, member 3 (OR2C3), mRNA. // chr1 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// ENST00000366487 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:247530132:247533839:-1 gene:ENSG00000196242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC030717 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily C, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:23194 IMAGE:4860551), complete cds. // chr1 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// ENST00000617752 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:247530133:247532613:-1 gene:ENSG00000196242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
ENST00000516585 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:247607126:247607201:-1 gene:ENSG00000252394 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT010787 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001005487 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 13, subfamily G, member 1 (OR13G1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000359688 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:247672118:247673041:-1 gene:ENSG00000197437 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC136736 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 13, subfamily G, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:168349 IMAGE:9020726), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC136738 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 13, subfamily G, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:168351 IMAGE:9020728), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047832 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:247672118:247672924:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001005286 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 6, subfamily F, member 1 (OR6F1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000302084 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:247711829:247712755:-1 gene:ENSG00000169214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC137142 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 6, subfamily F, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:168762 IMAGE:9021139), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC137143 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 6, subfamily F, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:168763 IMAGE:9021140), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000047829 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:247711829:247724043:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000419891 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:247711813:247723764:-1 gene:ENSG00000239395 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:sense_overlapping // chr1 // 52 // 52 // 11 // 21 // 1 /// NONHSAT010793 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 52 // 52 // 11 // 21 // 1
ENST00000366485 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:247723099:247724043:-1 gene:ENSG00000241128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000426444 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:247722957:247723761:-1 gene:ENSG00000239395 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 90 // 36 // 9 // 10 // 0 /// GENSCAN00000047829 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:247711829:247724043:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 61 // 16 // 17 // 0 /// NONHSAT010794 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 90 // 36 // 9 // 10 // 0
NM_012353 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 1, subfamily C, member 1 (OR1C1), mRNA. // chr1 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000408896 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:247757462:247758406:-1 gene:ENSG00000221888 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// BC140914 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 1, subfamily C, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:176591 IMAGE:9056726), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000047852 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:247757462:247759066:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0
NM_001001966 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 14, subfamily A, member 16 (OR14A16), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006711763 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens olfactory receptor, family 14, subfamily A, member 16 (OR14A16), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000357627 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:247814800:247815729:-1 gene:ENSG00000196772 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047837 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:247775102:247815729:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001959 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 11, subfamily L, member 1 (OR11L1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000355784 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:247840928:247841896:-1 gene:ENSG00000197591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC140753 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 11, subfamily L, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:176430 IMAGE:9021621), complete cds. // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047841 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:247833333:247841896:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
ENST00000403423 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:248083634:248084596:-1 gene:ENSG00000197067 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_001004691 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily M, member 7 (OR2M7), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000317965 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:248323630:248324568:-1 gene:ENSG00000177186 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC136944 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily M, member 7, mRNA (cDNA clone MGC:168559 IMAGE:9020936), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC136946 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily M, member 7, mRNA (cDNA clone MGC:168561 IMAGE:9020938), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_001004693 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily T, member 10 (OR2T10), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000330500 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:248592830:248593768:-1 gene:ENSG00000184022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC136937 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily T, member 10, mRNA (cDNA clone MGC:168552 IMAGE:9020929), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC136940 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily T, member 10, mRNA (cDNA clone MGC:168555 IMAGE:9020932), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000028760 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:248592830:248593768:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
ENST00000364732 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:248594925:248595033:-1 gene:ENSG00000201602 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT010816 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0
NM_001001964 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily T, member 11 (OR2T11), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000330803 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:248626178:248627128:-1 gene:ENSG00000183130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC140749 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily T, member 11, mRNA (cDNA clone MGC:176426 IMAGE:9021617), complete cds. // chr1 // 86 // 100 // 18 // 21 // 0 /// GENSCAN00000028748 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:248626178:248674454:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001001824 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily T, member 27 (OR2T27), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000344889 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:248649931:248650884:-1 gene:ENSG00000187701 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000460972 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:248441207:248442133:1 gene:ENSG00000227152 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 77 // 87 // 10 // 13 // 0 /// GENSCAN00000028748 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:248626178:248674454:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000028752 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:248406148:248474307:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 80 // 100 // 12 // 15 // 0 /// GENSCAN00000032133 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR1_2_CTG32_1:248412214:248480373:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 80 // 100 // 12 // 15 // 0 /// GENSCAN00000041177 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR1_ALT2_1_CTG32_1:248408380:248476751:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 80 // 100 // 12 // 15 // 0
NM_001004734 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 14, subfamily I, member 1 (OR14I1), mRNA. // chr1 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// XM_005273131 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens olfactory receptor, family 14, subfamily I, member 1 (OR14I1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000342623 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:248681369:248682304:-1 gene:ENSG00000189181 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// BC137188 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 14, subfamily I, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:168808 IMAGE:9021185), complete cds. // chr1 // 93 // 100 // 14 // 15 // 0 /// BC137189 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 14, subfamily I, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:168809 IMAGE:9021186), complete cds. // chr1 // 93 // 100 // 14 // 15 // 0 /// GENSCAN00000028756 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:248681369:248682304:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0
ENST00000363625 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:248912690:248912795:-1 gene:ENSG00000200495 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT010844 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000441152 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:649948:652655:1 gene:ENSG00000180525 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 91 // 58 // 20 // 22 // 0 /// AK096000 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ38681 fis, clone KIDNE2000678. // chr10 // 100 // 53 // 20 // 20 // 0 /// BC144473 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:9053000. // chr10 // 95 // 58 // 21 // 22 // 0 /// NR_027152 // RefSeq // Homo sapiens proline rich 26 (PRR26), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr10 // 61 // 61 // 23 // 38 // 1 /// ENST00000381489 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:10:650077:665169:1 gene:ENSG00000180525 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 61 // 61 // 23 // 38 // 1 /// AK296168 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57503 complete cds. // chr10 // 39 // 39 // 15 // 38 // 1 /// GENSCAN00000008999 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:647028:651415:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 26 // 26 // 10 // 38 // 1 /// NONHSAT010867 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr10 // 47 // 47 // 18 // 38 // 1
NM_014023 // RefSeq // Homo sapiens WD repeat domain 37 (WDR37), mRNA. // chr10 // 100 // 82 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000263150 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:1056858:1132170:1 gene:ENSG00000047056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 97 // 77 // 33 // 34 // 0 /// ENST00000358220 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:1049538:1132297:1 gene:ENSG00000047056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 80 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000381329 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:1056404:1096626:1 gene:ENSG00000047056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 55 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000436154 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:1074383:1096246:1 gene:ENSG00000047056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 32 // 14 // 14 // 0 /// AK292591 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76685 complete cds, highly similar to Homo sapiens WD repeat domain 37 (WDR37), mRNA. // chr10 // 100 // 70 // 31 // 31 // 0 /// BC018044 // GenBank // Homo sapiens WD repeat domain 37, mRNA (cDNA clone MGC:26330 IMAGE:4794184), complete cds. // chr10 // 88 // 55 // 21 // 24 // 0 /// AK128194 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ46322 fis, clone TESTI4043140. // chr10 // 55 // 55 // 24 // 44 // 1 /// ENST00000620998 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:1056404:1096625:1 gene:ENSG00000047056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 55 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000007858 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:1044382:1125646:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 55 // 55 // 24 // 44 // 1
NR_015376 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 200 (LINC00200), long non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000425630 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:1159768:1164672:1 gene:ENSG00000229205 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000583117 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:1159804:1160997:1 gene:ENSG00000229205 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr10 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// NONHSAT010909 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT010910 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr10 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// TCONS_00017666-XLOC_008338 // Rinn lincRNA // linc-PFKP-7 chr10:+:1205707-1210612 // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// TCONS_00018662-XLOC_008338 // Rinn lincRNA // linc-PFKP-7 chr10:+:1205747-1206617 // chr10 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0
ENST00000390854 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:2199387:2199488:1 gene:ENSG00000212156 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT010961 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000384396 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:4514952:4515057:1 gene:ENSG00000207124 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT011098 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
BC040210 // GenBank // Homo sapiens aldo-keto reductase family 1, member C1 (dihydrodiol dehydrogenase 1; 20-alpha (3-alpha)-hydroxysteroid dehydrogenase), mRNA (cDNA clone MGC:42600 IMAGE:4825338), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
ENST00000459095 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:4962436:4962568:-1 gene:ENSG00000238840 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr10 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// ENST00000459141 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:5004710:5004842:1 gene:ENSG00000239148 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr10 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// NONHSAT011120 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// NONHSAT011128 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0
NM_001818 // RefSeq // Homo sapiens aldo-keto reductase family 1, member C4 (AKR1C4), mRNA. // chr10 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000263126 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:5196835:5218947:1 gene:ENSG00000198610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000380448 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:5195463:5218949:1 gene:ENSG00000198610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AB031085 // GenBank // Homo sapiens mRNA for dihydrodiol dehydrogenase 4, complete cds. // chr10 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// AB045829 // GenBank // Homo sapiens mRNA for 3alpha-hydroxysteroid dehydrogenase variant, complete cds. // chr10 // 89 // 86 // 17 // 19 // 0 /// AK314988 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ95910. // chr10 // 80 // 91 // 16 // 20 // 0 /// BC020744 // GenBank // Homo sapiens aldo-keto reductase family 1, member C4 (chlordecone reductase; 3-alpha hydroxysteroid dehydrogenase, type I; dihydrodiol dehydrogenase 4), mRNA (cDNA clone MGC:22581 IMAGE:4734943), complete cds. // chr10 // 90 // 91 // 18 // 20 // 0 /// M33375 // GenBank // Human chlordecone reductase mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000015823 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:5196868:5271707:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 88 // 73 // 14 // 16 // 0
NM_053049 // RefSeq // Homo sapiens urocortin 3 (UCN3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000380433 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:5365009:5374692:1 gene:ENSG00000178473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY026949 // GenBank // Homo sapiens stresscopin mRNA, complete cds. // chr10 // 82 // 44 // 9 // 11 // 0 /// BC069530 // GenBank // Homo sapiens urocortin 3 (stresscopin), mRNA (cDNA clone MGC:96972 IMAGE:7262181), complete cds. // chr10 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// BC100867 // GenBank // Homo sapiens urocortin 3 (stresscopin), mRNA (cDNA clone MGC:119002 IMAGE:40002991), complete cds. // chr10 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// BC100868 // GenBank // Homo sapiens urocortin 3 (stresscopin), mRNA (cDNA clone MGC:119003 IMAGE:40002995), complete cds. // chr10 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC100869 // GenBank // Homo sapiens urocortin 3 (stresscopin), mRNA (cDNA clone MGC:119004 IMAGE:40002997), complete cds. // chr10 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC100870 // GenBank // Homo sapiens urocortin 3 (stresscopin), mRNA (cDNA clone MGC:119005 IMAGE:40002998), complete cds. // chr10 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000015790 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:5346840:5374206:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
NM_005185 // RefSeq // Homo sapiens calmodulin-like 3 (CALML3), mRNA. // chr10 // 100 // 53 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000315238 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:5524009:5526771:1 gene:ENSG00000178363 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC031889 // GenBank // Homo sapiens calmodulin-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:30093 IMAGE:4777524), complete cds. // chr10 // 94 // 50 // 15 // 16 // 0 /// M36707 // GenBank // Human calmodulin-like processed pseudogene, complete cds. // chr10 // 84 // 97 // 26 // 31 // 0 /// M58026 // GenBank // Human NB-1 mRNA, complete cds. // chr10 // 81 // 50 // 13 // 16 // 0 /// GENSCAN00000015801 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:5525086:5635161:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
ENST00000495609 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:5631463:5631755:1 gene:ENSG00000240577 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT011169 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_017782 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 208, member B (FAM208B), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000328090 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:5684838:5763740:1 gene:ENSG00000108021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000459693 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:5760840:5763740:1 gene:ENSG00000108021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr10 // 20 // 20 // 9 // 44 // 1 /// GENSCAN00000015818 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:5684417:5763910:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 66 // 29 // 29 // 0 /// NONHSAT011183 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr10 // 20 // 20 // 9 // 44 // 1
ENST00000364711 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:6149623:6149940:1 gene:ENSG00000201581 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT011210 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_002216 // RefSeq // Homo sapiens inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain 2 (ITIH2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000358415 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:7703269:7749520:1 gene:ENSG00000151655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000379587 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:10:7703400:7749339:1 gene:ENSG00000151655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000429820 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:10:7703380:7721697:1 gene:ENSG00000151655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// AK291379 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75038 complete cds, highly similar to Homo sapiens inter-alpha (globulin) inhibitor H2 (ITIH2), mRNA. // chr10 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// AK297334 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53848 complete cds, highly similar to Inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H2 precursor. // chr10 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// BC132685 // GenBank // Homo sapiens inter-alpha (globulin) inhibitor H2, mRNA (cDNA clone MGC:164316 IMAGE:40146707), complete cds. // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000613369 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:7703372:7749519:1 gene:ENSG00000151655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000278 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:7703435:7749334:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_031923 // RefSeq // Homo sapiens TAF3 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor, 140kDa (TAF3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 57 // 57 // 0 /// ENST00000344293 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:7818504:8016627:1 gene:ENSG00000165632 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 57 // 57 // 0 /// GENSCAN00000000282 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:7961000:7985756:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 35 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000048799 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:8009178:8014751:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 26 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000000280 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:7796137:7824568:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 21 // 21 // 12 // 57 // 1
NM_001002295 // RefSeq // Homo sapiens GATA binding protein 3 (GATA3), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NM_002051 // RefSeq // Homo sapiens GATA binding protein 3 (GATA3), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_005252442 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens GATA binding protein 3 (GATA3), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000346208 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:8054806:8074890:1 gene:ENSG00000107485 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000379328 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:8054693:8075198:1 gene:ENSG00000107485 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC003070 // GenBank // Homo sapiens GATA binding protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:2346 IMAGE:3504200), complete cds. // chr10 // 95 // 78 // 20 // 21 // 0 /// BC006793 // GenBank // Homo sapiens GATA binding protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:5199 IMAGE:2985843), complete cds. // chr10 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// M69106 // GenBank // Human Gata3 enhancer-binding protein mRNA, complete cds. // chr10 // 77 // 48 // 10 // 13 // 0 /// AK298213 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56578 complete cds, highly similar to Trans-acting T-cell-specific transcription factor GATA-3. // chr10 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// GENSCAN00000048812 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:8055656:8098227:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
AK131480 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ16652 fis, clone TESTI4036767. // chr10 // 95 // 95 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000003180 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:9407122:9407976:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1
ENST00000439303 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:10174230:10174577:1 gene:ENSG00000229919 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT011354 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT011355 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
XR_171055 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens uncharacterized LOC439951 (LOC439951), misc_RNA. // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000604634 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:11611305:11612227:1 gene:ENSG00000271360 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC037281 // GenBank // Homo sapiens hypothetical LOC439951, mRNA (cDNA clone MGC:33041 IMAGE:4838780), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT011420 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_024693 // RefSeq // Homo sapiens enoyl CoA hydratase domain containing 3 (ECHDC3), mRNA. // chr10 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// ENST00000379215 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:11742366:11764070:1 gene:ENSG00000134463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000420401 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:11742446:11755581:1 gene:ENSG00000134463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000422887 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:11747275:11763351:1 gene:ENSG00000134463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 93 // 50 // 13 // 14 // 0 /// ENST00000496136 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:11742366:11764070:1 gene:ENSG00000134463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF275677 // GenBank // Homo sapiens PP1494 protein mRNA, complete cds. // chr10 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// AK290902 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76161 complete cds, highly similar to Homo sapiens enoyl Coenzyme A hydratase domain containing 3 (ECHDC3), mRNA. // chr10 // 89 // 96 // 24 // 27 // 0 /// BC009617 // GenBank // Homo sapiens enoyl Coenzyme A hydratase domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:16831 IMAGE:3893103), complete cds. // chr10 // 78 // 96 // 21 // 27 // 0 /// ENST00000495787 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:11747450:11755730:1 gene:ENSG00000134463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// GENSCAN00000006622 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:11742622:11763544:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0
NM_153256 // RefSeq // Homo sapiens proline and serine rich 2 (PROSER2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000277570 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:11823398:11872277:1 gene:ENSG00000148426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000379200 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:11869644:11870875:1 gene:ENSG00000148426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// BC048800 // GenBank // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 47, mRNA (cDNA clone MGC:54356 IMAGE:5215506), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC017269 // GenBank // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 47, mRNA (cDNA clone MGC:29779 IMAGE:4588686), complete cds. // chr10 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// GENSCAN00000006637 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:11832038:11870406:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000622831 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:11823398:11870872:1 gene:ENSG00000148426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
ENST00000516148 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:11923181:11923288:1 gene:ENSG00000251957 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_018706 // RefSeq // Homo sapiens dehydrogenase E1 and transketolase domain containing 1 (DHTKD1), mRNA. // chr10 // 95 // 100 // 42 // 44 // 0 /// ENST00000263035 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:12068972:12123225:1 gene:ENSG00000181192 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000437298 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:12069024:12091643:1 gene:ENSG00000181192 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 25 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000448829 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:12094260:12113029:1 gene:ENSG00000181192 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 27 // 12 // 12 // 0 /// BC002477 // GenBank // Homo sapiens dehydrogenase E1 and transketolase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:3090 IMAGE:3347913), complete cds. // chr10 // 93 // 95 // 39 // 42 // 0 /// BC007955 // GenBank // Homo sapiens dehydrogenase E1 and transketolase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:14418 IMAGE:4302613), complete cds. // chr10 // 95 // 95 // 40 // 42 // 0 /// GENSCAN00000027248 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:12069034:12120888:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// AB046850 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1630 protein, partial cds. // chr10 // 75 // 75 // 33 // 44 // 1
NONHSAT011447 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_020397 // RefSeq // Homo sapiens calcium/calmodulin-dependent protein kinase ID (CAMK1D), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NM_153498 // RefSeq // Homo sapiens calcium/calmodulin-dependent protein kinase ID (CAMK1D), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000378845 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:12349733:12826143:1 gene:ENSG00000183049 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// AF286366 // GenBank // Homo sapiens CamKI-like protein kinase mRNA, complete cds. // chr10 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// AK289393 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76987 complete cds, highly similar to Homo sapiens calcium/calmodulin-dependent protein kinase ID (CAMK1D), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// BC035745 // GenBank // Homo sapiens calcium/calmodulin-dependent protein kinase ID, mRNA (cDNA clone MGC:46052 IMAGE:5748490), complete cds. // chr10 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// AB081726 // GenBank // Homo sapiens CaM-KI delta mRNA for CaM-kinase I delta, complete cds. // chr10 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1 /// ENST00000615792 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:12760576:12829736:1 gene:ENSG00000183049 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000619168 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:12349482:12835545:1 gene:ENSG00000183049 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000027244 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:12736111:12827044:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NM_018518 // RefSeq // Homo sapiens minichromosome maintenance complex component 10 (MCM10), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// NM_182751 // RefSeq // Homo sapiens minichromosome maintenance complex component 10 (MCM10), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// ENST00000378694 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:13164128:13211104:1 gene:ENSG00000065328 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000378714 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:13161554:13211104:1 gene:ENSG00000065328 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// ENST00000484800 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:13161579:13209736:1 gene:ENSG00000065328 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// AB042719 // GenBank // Homo sapiens mRNA for MCM10 homolog, complete cds. // chr10 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// AK292701 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77264 complete cds, highly similar to Homo sapiens MCM10 minichromosome maintenance deficient 10 (MCM10), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 92 // 87 // 24 // 26 // 0 /// BC101727 // GenBank // Homo sapiens minichromosome maintenance complex component 10, mRNA (cDNA clone MGC:126776 IMAGE:8069233), complete cds. // chr10 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// BC143490 // GenBank // Homo sapiens minichromosome maintenance complex component 10, mRNA (cDNA clone MGC:177015 IMAGE:9051998), complete cds. // chr10 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000038286 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:13092755:13216930:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
NM_003675 // RefSeq // Homo sapiens pre-mRNA processing factor 18 (PRPF18), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000320054 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:10:13586968:13611652:1 gene:ENSG00000165630 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000378572 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:13586927:13630868:1 gene:ENSG00000165630 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000417658 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:10:13586939:13614060:1 gene:ENSG00000165630 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000601460 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:10:13610047:13655482:1 gene:ENSG00000239665 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// AF087997 // GenBank // Homo sapiens full length insert cDNA clone YX43G09. // chr10 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// BC000794 // GenBank // Homo sapiens PRP18 pre-mRNA processing factor 18 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:5075 IMAGE:3451639), complete cds. // chr10 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// U51990 // GenBank // Human hPrp18 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000038282 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:13587087:13630340:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
ENST00000362537 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:13727796:13727916:1 gene:ENSG00000199407 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr10 // 88 // 100 // 14 // 16 // 0 /// NONHSAT011531 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 88 // 100 // 14 // 16 // 0
NM_001080836 // RefSeq // Homo sapiens meiosis/spermiogenesis associated 1 (MEIG1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_005252559 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens meiosis/spermiogenesis associated 1 (MEIG1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_005252561 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens meiosis/spermiogenesis associated 1 (MEIG1), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000378240 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:14966439:14972851:1 gene:ENSG00000197889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000407572 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:14959439:14972851:1 gene:ENSG00000197889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000477770 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:14959439:14972851:1 gene:ENSG00000197889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000496225 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:14959510:14972681:1 gene:ENSG00000197889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// GENSCAN00000014584 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:14966469:14972641:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT011562 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr10 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONHSAT011563 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr10 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NONHSAT011584 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000411224 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:16476003:16476164:1 gene:ENSG00000223156 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// NONHSAT011596 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0
ENST00000515994 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:17403508:17403620:1 gene:ENSG00000251803 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT011618 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_003473 // RefSeq // Homo sapiens signal transducing adaptor molecule (SH3 domain and ITAM motif) 1 (STAM), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NR_037774 // RefSeq // Homo sapiens signal transducing adaptor molecule (SH3 domain and ITAM motif) 1 (STAM), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr10 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// XM_005252603 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens signal transducing adaptor molecule (SH3 domain and ITAM motif) 1 (STAM), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000377524 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:17644125:17715914:1 gene:ENSG00000136738 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000445846 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:17644208:17693281:1 gene:ENSG00000136738 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr10 // 89 // 38 // 8 // 9 // 0 /// AK303083 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57683 complete cds, highly similar to Signal transducing adapter molecule 1. // chr10 // 90 // 83 // 18 // 20 // 0 /// BC030586 // GenBank // Homo sapiens signal transducing adaptor molecule (SH3 domain and ITAM motif) 1, mRNA (cDNA clone MGC:26363 IMAGE:4820857), complete cds. // chr10 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// U43899 // GenBank // Human signal transducing adaptor molecule STAM mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000377500 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:10:17644208:17700221:1 gene:ENSG00000136738 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1 /// GENSCAN00000039660 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:17633523:17714780:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0
NM_001098844 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 236 (TMEM236), mRNA. // chr10 // 100 // 98 // 47 // 47 // 0 /// ENST00000377495 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:17752252:17800868:1 gene:ENSG00000148483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// AK300456 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59050 complete cds, highly similar to Protein FAM23A. // chr10 // 88 // 52 // 22 // 25 // 0 /// BC157856 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 23, member A, mRNA (cDNA clone MGC:189751 IMAGE:9057075), complete cds. // chr10 // 100 // 73 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000039656 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:17726828:17796504:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 69 // 69 // 33 // 48 // 1
NM_002438 // RefSeq // Homo sapiens mannose receptor, C type 1 (MRC1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006726512 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens mannose receptor, C type 1 (MRC1), mRNA. // chr10 // 94 // 47 // 15 // 16 // 0 /// ENST00000569591 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:17809344:17911170:1 gene:ENSG00000260314 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AK297044 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56855 complete cds, highly similar to Macrophage mannose receptor 1 precursor. // chr10 // 100 // 44 // 15 // 15 // 0 /// BC142642 // GenBank // Homo sapiens mannose receptor, C type 1-like 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:40147922), complete cds. // chr10 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// BC146838 // GenBank // Homo sapiens mannose receptor, C type 1-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:181940 IMAGE:9056765), complete cds. // chr10 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// DQ663787 // GenBank // Homo sapiens mannose receptor mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// J05550 // GenBank // Human mannose receptor mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000039653 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:17801580:17910465:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0
NM_001098844 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 236 (TMEM236), mRNA. // chr10 // 100 // 98 // 47 // 47 // 0 /// ENST00000377495 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:17752252:17800868:1 gene:ENSG00000148483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// BC157856 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 23, member A, mRNA (cDNA clone MGC:189751 IMAGE:9057075), complete cds. // chr10 // 73 // 73 // 35 // 48 // 1 /// AK300456 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59050 complete cds, highly similar to Protein FAM23A. // chr10 // 46 // 46 // 22 // 48 // 1 /// GENSCAN00000039656 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:17726828:17796504:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 69 // 69 // 33 // 48 // 1
NM_178815 // RefSeq // Homo sapiens ADP-ribosylation factor-like 5B (ARL5B), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000377275 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:18659405:18681639:1 gene:ENSG00000165997 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF494061 // GenBank // Homo sapiens ADP-ribosylation-like factor 8 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC024163 // GenBank // Homo sapiens ADP-ribosylation factor-like 5B, mRNA (cDNA clone MGC:22841 IMAGE:3931095), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000001797 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:18668534:18736262:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
ENST00000363675 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:19598247:19598463:1 gene:ENSG00000200545 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT011663 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001282736 // RefSeq // Homo sapiens plexin domain containing 2 (PLXDC2), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0 /// NM_032812 // RefSeq // Homo sapiens plexin domain containing 2 (PLXDC2), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000377238 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:20043320:20280357:1 gene:ENSG00000120594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 67 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000377242 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:19816239:20280357:1 gene:ENSG00000120594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000377252 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:19816239:20289856:1 gene:ENSG00000120594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// AF378757 // GenBank // Homo sapiens tumor endothelial marker 7-related precursor (TEM7R) mRNA, complete cds. // chr10 // 94 // 82 // 30 // 32 // 0 /// AK304591 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61564 complete cds, highly similar to Plexin domain-containing protein 2 precursor. // chr10 // 91 // 87 // 31 // 34 // 0 /// AY358486 // GenBank // Homo sapiens clone DNA83568 ARFP2514 (UNQ2514) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// BC012885 // GenBank // Homo sapiens plexin domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:17681 IMAGE:3865073), complete cds. // chr10 // 100 // 79 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000012310 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:19993832:20279819:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 67 // 26 // 26 // 0
ENST00000362352 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:21481716:21481817:1 gene:ENSG00000199222 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT011706 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
ENST00000364494 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:21933143:21933438:1 gene:ENSG00000201364 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 71 // 81 // 15 // 21 // 0 /// NONHSAT011727 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr10 // 71 // 81 // 15 // 21 // 0
ENST00000384115 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:22787393:22787499:1 gene:ENSG00000206842 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT011757 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000411199 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:22997255:22997358:1 gene:ENSG00000223131 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT011759 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_012228 // RefSeq // Homo sapiens methionine sulfoxide reductase B2 (MSRB2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000376510 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:23095506:23122013:1 gene:ENSG00000148450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000472663 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:23104144:23120954:1 gene:ENSG00000148450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr10 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0 /// AF122004 // GenBank // Homo sapiens pilin-like transcription factor mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 78 // 24 // 25 // 0 /// AF151889 // GenBank // Homo sapiens CGI-131 protein mRNA, complete cds. // chr10 // 90 // 97 // 28 // 31 // 0 /// BC018030 // GenBank // Homo sapiens methionine sulfoxide reductase B2, mRNA (cDNA clone MGC:26104 IMAGE:4799583), complete cds. // chr10 // 83 // 91 // 24 // 29 // 0 /// BC117471 // GenBank // Homo sapiens methionine sulfoxide reductase B2, mRNA (cDNA clone MGC:151080 IMAGE:40126022), complete cds. // chr10 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// BC130380 // GenBank // Homo sapiens methionine sulfoxide reductase B2, mRNA (cDNA clone MGC:163252 IMAGE:40146411), complete cds. // chr10 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000468633 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:23119144:23120893:1 gene:ENSG00000148450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1 /// GENSCAN00000048505 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:23095609:23115192:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// NONHSAT011765 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr10 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1
ENST00000415292 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:23136924:23137661:1 gene:ENSG00000229932 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr10 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000048518 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:23136924:23137661:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
ENST00000516240 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:23166985:23167101:1 gene:ENSG00000252049 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT011766 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_178161 // RefSeq // Homo sapiens pancreas specific transcription factor, 1a (PTF1A), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000376504 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:23192327:23194252:1 gene:ENSG00000168267 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000048512 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:23188386:23193906:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
NM_001145373 // RefSeq // Homo sapiens OTU deubiquitinase 1 (OTUD1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000376495 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:23439458:23442390:1 gene:ENSG00000165312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000048510 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:23399679:23440903:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENST00000362665 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:24640166:24640284:1 gene:ENSG00000199535 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT011789 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_024838 // RefSeq // Homo sapiens threonine synthase-like 1 (S. cerevisiae) (THNSL1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000376356 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:25016658:25026664:1 gene:ENSG00000185875 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000524413 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:25016658:25026664:1 gene:ENSG00000185875 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC016697 // GenBank // Homo sapiens threonine synthase-like 1 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone IMAGE:4074401), complete cds. // chr10 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// BC035132 // GenBank // Homo sapiens threonine synthase-like 1 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:43231 IMAGE:5263853), complete cds. // chr10 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000023799 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:25023224:25025455:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0
NM_020752 // RefSeq // Homo sapiens G protein-coupled receptor 158 (GPR158), mRNA. // chr10 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000376351 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:25175062:25602226:1 gene:ENSG00000151025 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AK095120 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ37801 fis, clone BRSSN2000312. // chr10 // 97 // 94 // 28 // 29 // 0 /// AY528411 // GenBank // Homo sapiens G protein coupled receptor 158 (GPR158) mRNA, complete cds. // chr10 // 93 // 94 // 27 // 29 // 0 /// GENSCAN00000023789 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:25175421:25599274:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0
NM_017433 // RefSeq // Homo sapiens myosin IIIA (MYO3A), mRNA. // chr10 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000265944 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:25934267:26212527:1 gene:ENSG00000095777 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000376302 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:25934274:26023481:1 gene:ENSG00000095777 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 23 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000543632 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:25935788:26212209:1 gene:ENSG00000095777 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 45 // 18 // 18 // 0 /// AF229172 // GenBank // Homo sapiens class III myosin (MYO3A) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr10 // 92 // 93 // 34 // 37 // 0 /// AY101367 // GenBank // Homo sapiens myosin IIIA (MYO3A) mRNA, complete cds. // chr10 // 97 // 95 // 37 // 38 // 0 /// BC036079 // GenBank // Homo sapiens myosin IIIA, mRNA (cDNA clone IMAGE:5286499), complete cds. // chr10 // 100 // 23 // 9 // 9 // 0 /// BC045538 // GenBank // Homo sapiens myosin IIIA, mRNA (cDNA clone IMAGE:5313562), complete cds. // chr10 // 100 // 23 // 9 // 9 // 0 /// BC119811 // GenBank // Homo sapiens myosin IIIA, mRNA (cDNA clone IMAGE:40108813), complete cds. // chr10 // 100 // 45 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000619592 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:25934267:26211972:1 gene:ENSG00000095777 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 95 // 93 // 35 // 37 // 0 /// GENSCAN00000020296 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:25996490:26300961:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 70 // 70 // 28 // 40 // 1
NM_000818 // RefSeq // Homo sapiens glutamate decarboxylase 2 (pancreatic islets and brain, 65kDa) (GAD2), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NM_001134366 // RefSeq // Homo sapiens glutamate decarboxylase 2 (pancreatic islets and brain, 65kDa) (GAD2), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000259271 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:26216665:26304558:1 gene:ENSG00000136750 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000376261 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:26216307:26304558:1 gene:ENSG00000136750 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC126327 // GenBank // Homo sapiens glutamate decarboxylase 2 (pancreatic islets and brain, 65kDa), mRNA (cDNA clone MGC:161605 IMAGE:8992043), complete cds. // chr10 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// BC126329 // GenBank // Homo sapiens glutamate decarboxylase 2 (pancreatic islets and brain, 65kDa), mRNA (cDNA clone MGC:161607 IMAGE:8992045), complete cds. // chr10 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// M74826 // GenBank // Human glutamate decarboxylase (GAD-2) mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 83 // 23 // 24 // 0 /// M81882 // GenBank // Human glutamate decarboxylase (GAD65) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// X69936 // GenBank // H.sapiens mRNA for glutamate decarboxylase. // chr10 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// AK127375 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ45451 fis, clone BRSTN2006466, highly similar to Glutamate decarboxylase, 65 kDa isoform (EC 4.1.1.15). // chr10 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// GENSCAN00000020296 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:25996490:26300961:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1
NM_019043 // RefSeq // Homo sapiens amyloid beta (A4) precursor protein-binding, family B, member 1 interacting protein (APBB1IP), mRNA. // chr10 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000356785 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:26438425:26501938:1 gene:ENSG00000077420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 30 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000376236 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:26438203:26567803:1 gene:ENSG00000077420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// AB085852 // GenBank // Homo sapiens RARP1 mRNA for proline-rich protein 73, complete cds. // chr10 // 100 // 83 // 38 // 38 // 0 /// AK000812 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ20805 fis, clone ADSE02009. // chr10 // 100 // 52 // 24 // 24 // 0 /// AK303597 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61520 complete cds, highly similar to Amyloid beta A4 precursor protein-bindingfamily B member 1- interacting protein. // chr10 // 100 // 85 // 39 // 39 // 0 /// AY152730 // GenBank // Homo sapiens Rap1-interacting adaptor molecule (RIAM) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 83 // 38 // 38 // 0 /// BC035636 // GenBank // Homo sapiens amyloid beta (A4) precursor protein-binding, family B, member 1 interacting protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:5216297), complete cds. // chr10 // 93 // 30 // 13 // 14 // 0 /// BC054516 // GenBank // Homo sapiens amyloid beta (A4) precursor protein-binding, family B, member 1 interacting protein, mRNA (cDNA clone MGC:60268 IMAGE:5172946), complete cds. // chr10 // 100 // 83 // 38 // 38 // 0 /// AK308916 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ98957. // chr10 // 57 // 57 // 26 // 46 // 1 /// GENSCAN00000020326 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:26486490:26567488:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 78 // 36 // 36 // 0
ENST00000362863 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:26509589:26509704:1 gene:ENSG00000199733 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT011825 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_014317 // RefSeq // Homo sapiens prenyl (decaprenyl) diphosphate synthase, subunit 1 (PDSS1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// XM_005252439 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens prenyl (decaprenyl) diphosphate synthase, subunit 1 (PDSS1), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 65 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000376215 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:26697659:26746798:1 gene:ENSG00000148459 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000491711 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:26720343:26746541:1 gene:ENSG00000148459 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr10 // 100 // 53 // 9 // 9 // 0 /// AB209763 // GenBank // Homo sapiens mRNA for trans-prenyltransferase variant protein. // chr10 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0 /// AB210838 // GenBank // Homo sapiens hDPS1 mRNA for subunit 1 of decaprenyl diphosphate synthase, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// AF118395 // GenBank // Homo sapiens trans-prenyltransferase mRNA, complete cds. // chr10 // 77 // 76 // 10 // 13 // 0 /// AK024802 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ21149 fis, clone CAS09472, highly similar to AF118395 Homo sapiens trans-prenyltransferase mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC049211 // GenBank // Homo sapiens prenyl (decaprenyl) diphosphate synthase, subunit 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5241998), partial cds. // chr10 // 100 // 88 // 15 // 15 // 0 /// BC063635 // GenBank // Homo sapiens prenyl (decaprenyl) diphosphate synthase, subunit 1, mRNA (cDNA clone MGC:70953 IMAGE:4397753), complete cds. // chr10 // 85 // 76 // 11 // 13 // 0 /// GENSCAN00000020314 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:26673955:26746473:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 94 // 16 // 16 // 0
ENST00000411095 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:26789017:26789157:1 gene:ENSG00000223027 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT011862 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONHSAT011864 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000363499 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:27315120:27315226:1 gene:ENSG00000200369 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000612283 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR10_1_CTG1:27315120:27315226:1 gene:ENSG00000278036 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT011901 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000516592 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:28652630:28652755:1 gene:ENSG00000252401 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONHSAT011946 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_012342 // RefSeq // Homo sapiens BMP and activin membrane-bound inhibitor (BAMBI), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000375533 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:28677342:28682939:1 gene:ENSG00000095739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000497699 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:28677510:28682677:1 gene:ENSG00000095739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr10 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// AK290639 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75658 complete cds, highly similar to Homo sapiens BMP and activin membrane-bound inhibitor homolog(Xenopus laevis) (BAMBI), mRNA. // chr10 // 93 // 97 // 26 // 28 // 0 /// BC019252 // GenBank // Homo sapiens BMP and activin membrane-bound inhibitor homolog (Xenopus laevis), mRNA (cDNA clone MGC:1111 IMAGE:3503549), complete cds. // chr10 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BT006820 // GenBank // Homo sapiens putative transmembrane protein mRNA, complete cds. // chr10 // 95 // 69 // 19 // 20 // 0 /// U23070 // GenBank // Human putative transmembrane protein (nma) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000622753 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:28677495:28682939:1 gene:ENSG00000095739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NONHSAT011949 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr10 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000024946 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:28677952:28716656:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NM_001278522 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 126 (C10orf126), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000375520 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:28846408:28881898:1 gene:ENSG00000204365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC033839 // GenBank // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 126, mRNA (cDNA clone IMAGE:3924461). // chr10 // 88 // 100 // 21 // 24 // 0 /// ENST00000614533 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:28847241:28881895:1 gene:ENSG00000204365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0
NM_032517 // RefSeq // Homo sapiens lysozyme-like 1 (LYZL1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// XR_428650 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens lysozyme-like 1 (LYZL1), transcript variant X2, misc_RNA. // chr10 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000375500 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:29289061:29311232:1 gene:ENSG00000120563 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// AY358694 // GenBank // Homo sapiens clone DNA66304 KAAG648 (UNQ648) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0 /// BC021730 // GenBank // Homo sapiens lysozyme-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:33408 IMAGE:4825273), complete cds. // chr10 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0
AK092379 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ35060 fis, clone OCBBF2018828. // chr10 // 89 // 100 // 17 // 19 // 0 /// NONHSAT012532 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr10 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
ENST00000410160 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:29711915:29712008:1 gene:ENSG00000222092 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT012547 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENST00000516670 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:31259599:31259704:1 gene:ENSG00000252479 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT012603 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000383933 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:32056746:32056839:1 gene:ENSG00000206660 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT012637 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
ENST00000411115 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:34926775:34926882:1 gene:ENSG00000223047 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 83 // 5 // 5 // 0 /// NONHSAT012709 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 83 // 5 // 5 // 0
ENST00000410977 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:34942969:34943075:1 gene:ENSG00000222909 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT012710 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_153368 // RefSeq // Homo sapiens gap junction protein, delta 4, 40.1kDa (GJD4), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000321660 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:35605410:35608935:1 gene:ENSG00000177291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000040293 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:35598513:35608626:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
ENST00000390846 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:36438661:36438788:1 gene:ENSG00000274458 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA gene:ENSG00000237002 // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT012752 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_052997 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat domain 30A (ANKRD30A), mRNA. // chr10 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000361713 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:37125857:37232567:1 gene:ENSG00000148513 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000374660 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:10:37125857:37232567:1 gene:ENSG00000148513 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000602533 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:37125857:37384111:1 gene:ENSG00000148513 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// AF269087 // GenBank // Homo sapiens breast cancer antigen NY-BR-1 mRNA, complete cds. // chr10 // 95 // 83 // 19 // 20 // 0 /// ENST00000611781 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:37125788:37232567:1 gene:ENSG00000148513 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000037865 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:37125788:37289638:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0
ENST00000384069 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:37135237:37135343:1 gene:ENSG00000206796 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT012760 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
ENST00000490735 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:37297398:37297689:1 gene:ENSG00000244402 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT012765 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000384113 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:37994863:37994975:1 gene:ENSG00000206840 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT012801 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001007094 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 37A (ZNF37A), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_001178101 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 37A (ZNF37A), transcript variant 3, mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NM_003421 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 37A (ZNF37A), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_005252585 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens zinc finger protein 37A (ZNF37A), transcript variant X5, mRNA. // chr10 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// XM_005252586 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens zinc finger protein 37A (ZNF37A), transcript variant X6, mRNA. // chr10 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000351773 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:38094336:38123348:1 gene:ENSG00000075407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000361085 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:38094347:38125544:1 gene:ENSG00000075407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000479469 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:38094351:38115385:1 gene:ENSG00000075407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// BC015858 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 37A, mRNA (cDNA clone MGC:27353 IMAGE:4671816), complete cds. // chr10 // 80 // 71 // 16 // 20 // 0 /// BX647089 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686P16111 (from clone DKFZp686P16111). // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000001912 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:38096470:38118837:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT012806 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr10 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0
NR_003086 // RefSeq // Homo sapiens hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 7 pseudogene 2 (HSD17B7P2), non-coding RNA. // chr10 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000471365 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:38356455:38378107:1 gene:ENSG00000099251 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr10 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000494540 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:38356380:38378505:1 gene:ENSG00000099251 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0 /// AY829267 // GenBank // Homo sapiens 17beta-hydroxysteroid dehydrogenase type 7 form 2 mRNA, complete cds. // chr10 // 78 // 82 // 7 // 9 // 0 /// AF165514 // GenBank // Homo sapiens 17-beta-hydroxysteroid dehydrogenase type VII isoform mRNA, complete cds. // chr10 // 73 // 100 // 8 // 11 // 0 /// AF165517 // GenBank // Homo sapiens 17-beta-hydroxysteroid dehydrogenase type VII mRNA, complete cds. // chr10 // 67 // 82 // 6 // 9 // 0
ENST00000515974 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:42605158:42605263:1 gene:ENSG00000251783 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT012911 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_014753 // RefSeq // Homo sapiens BMS1 ribosome biogenesis factor (BMS1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// XM_005271846 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens BMS1 ribosome biogenesis factor (BMS1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000374518 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:42782801:42834937:1 gene:ENSG00000165733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// BC043345 // GenBank // Homo sapiens BMS1 homolog, ribosome assembly protein (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:49890 IMAGE:6062924), complete cds. // chr10 // 85 // 100 // 11 // 13 // 0 /// BC150252 // GenBank // Homo sapiens BMS1 homolog, ribosome assembly protein (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:166808 IMAGE:9007274), complete cds. // chr10 // 92 // 100 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000008892 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:42784395:42836267:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_018590 // RefSeq // Homo sapiens chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2 (CSGALNACT2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// XM_005271819 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2 (CSGALNACT2), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0 /// XM_005271821 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2 (CSGALNACT2), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000374466 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:43138486:43185308:1 gene:ENSG00000169826 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// AB079252 // GenBank // Homo sapiens mRNA for beta-1,4-N-acethylgalactosaminyltransferase, complete cds. // chr10 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// AB090811 // GenBank // Homo sapiens ChGn-2 mRNA for chondroitin beta1,4 N-acetylgalactosaminyltransferase-2, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC030268 // GenBank // Homo sapiens chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, mRNA (cDNA clone MGC:40204 IMAGE:5223190), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// XM_005271820 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2 (CSGALNACT2), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 81 // 81 // 13 // 16 // 1
ENST00000408541 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:43341786:43341910:1 gene:ENSG00000221468 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT012952 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001184963 // RefSeq // Homo sapiens FXYD domain containing ion transport regulator 4 (FXYD4), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NM_173160 // RefSeq // Homo sapiens FXYD domain containing ion transport regulator 4 (FXYD4), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000476166 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:43371642:43376332:1 gene:ENSG00000150201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000479189 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:43374469:43376335:1 gene:ENSG00000150201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// AY358584 // GenBank // Homo sapiens clone DNA59211 ERVT526 (UNQ526) mRNA, complete cds. // chr10 // 92 // 89 // 23 // 25 // 0 /// BC054876 // GenBank // Homo sapiens FXYD domain containing ion transport regulator 4, mRNA (cDNA clone MGC:62088 IMAGE:4610529), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000480834 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:43371653:43376332:1 gene:ENSG00000150201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// ENST00000616495 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:43371644:43376335:1 gene:ENSG00000150201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT012958 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr10 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// NONHSAT012957 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr10 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// GENSCAN00000021143 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:43294186:43385160:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NR_026693 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 487 (ZNF487), non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000315429 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:10:43436841:43481678:1 gene:ENSG00000243660 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000437590 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:10:43437126:43483179:1 gene:ENSG00000243660 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// AK302442 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52643 complete cds, weakly similar to Zinc finger protein 11B. // chr10 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// GENSCAN00000021144 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:43436834:43496069:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_145312 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 485 (ZNF485), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000361807 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:43606407:43617903:1 gene:ENSG00000198298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000374435 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:43606426:43617903:1 gene:ENSG00000198298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000430885 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:43606419:43616395:1 gene:ENSG00000198298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 89 // 75 // 8 // 9 // 0 /// AK299707 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57580 complete cds, highly similar to Zinc finger protein 485. // chr10 // 100 // 75 // 9 // 9 // 0 /// BC014161 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 485, mRNA (cDNA clone MGC:20847 IMAGE:4543606), complete cds. // chr10 // 92 // 100 // 11 // 12 // 0
NM_001123376 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 72 (TMEM72), mRNA. // chr10 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENST00000389583 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:10:44911200:44937002:1 gene:ENSG00000187783 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000460364 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:44931850:44935035:1 gene:ENSG00000187783 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr10 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000544540 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:44911316:44935194:1 gene:ENSG00000187783 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// AB235418 // GenBank // Homo sapiens KSP37 mRNA for kidney-specific secretory protein of 37 kDa, complete cds. // chr10 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC127789 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 72, mRNA (cDNA clone MGC:157906 IMAGE:40133552), complete cds. // chr10 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC127790 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 72, mRNA (cDNA clone MGC:157907 IMAGE:40133554), complete cds. // chr10 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000012678 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:44933637:44936989:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_006963 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 22 (ZNF22), mRNA. // chr10 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000298299 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:45000475:45005326:1 gene:ENSG00000165512 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK291508 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75698 complete cds, highly similar to Homo sapiens zinc finger protein 22 (KOX 15) (ZNF22), mRNA. // chr10 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// BC010642 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 22 (KOX 15), mRNA (cDNA clone MGC:9735 IMAGE:3852749), complete cds. // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC041139 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 22 (KOX 15), mRNA (cDNA clone MGC:47687 IMAGE:5751460), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC053687 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 22 (KOX 15), mRNA (cDNA clone MGC:61583 IMAGE:5214077), complete cds. // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BT009806 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 22 (KOX 15) mRNA, complete cds. // chr10 // 92 // 43 // 11 // 12 // 0 /// GENSCAN00000012722 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:45003369:45004043:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0
NR_033891 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat domain 30B pseudogene 3 (ANKRD30BP3), non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000444850 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:45156775:45176925:1 gene:ENSG00000230501 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr10 // 100 // 63 // 12 // 12 // 0 /// AK098688 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ25822 fis, clone TST07893. // chr10 // 82 // 89 // 14 // 17 // 0 /// NONHSAT013084 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr10 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT013085 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr10 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0
AF119900 // GenBank HTC // Homo sapiens PRO2822 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENST00000374314 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:46549049:46550744:-1 gene:ENSG00000204175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// AB011086 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA0514 protein, partial cds. // chr10 // 75 // 83 // 15 // 20 // 0 /// BC011672 // GenBank // Homo sapiens G protein regulated inducer of neurite outgrowth 2, mRNA (cDNA clone MGC:15171 IMAGE:4300443), complete cds. // chr10 // 79 // 100 // 19 // 24 // 0 /// NM_014696 // RefSeq // Homo sapiens G protein regulated inducer of neurite outgrowth 2 (GPRIN2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 1 /// ENST00000374317 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:46549044:46555530:-1 gene:ENSG00000204175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 1 /// GENSCAN00000005032 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:46549360:46550736:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0
NM_001278688 // RefSeq // Homo sapiens anthrax toxin receptor-like (ANTXRL), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// AK057316 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ32754 fis, clone TESTI2001671. // chr10 // 95 // 100 // 18 // 19 // 0 /// ENST00000617088 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:46286998:46330207:1 gene:ENSG00000274209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr10 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000620264 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:46286998:46330129:1 gene:ENSG00000274209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000622632 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:46286997:46330106:1 gene:ENSG00000274209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000005034 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:46287263:46358714:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// TCONS_00017675-XLOC_008480 // Rinn lincRNA // linc-ANXA8L2-1 chr10:+:47658233-47701446 // chr10 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_153034 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 488 (ZNF488), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_005270313 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens zinc finger protein 488 (ZNF488), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000585316 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:47365496:47384273:-1 gene:ENSG00000265763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000591025 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:47365502:47384261:-1 gene:ENSG00000265763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC026895 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 488, mRNA (cDNA clone MGC:24980 IMAGE:4932309), complete cds. // chr10 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC051323 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 488, mRNA (cDNA clone MGC:59976 IMAGE:6252494), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000047506 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:47367807:47368778:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0
NM_020945 // RefSeq // Homo sapiens WDFY family member 4 (WDFY4), mRNA. // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000325239 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:48709706:48982955:1 gene:ENSG00000128815 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000360890 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:48684876:48736242:1 gene:ENSG00000128815 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// AK127650 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ45748 fis, clone LYMPB1000158. // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC034937 // GenBank // Homo sapiens WDFY family member 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:5094342), complete cds. // chr10 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000036532 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:48659233:48786905:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0
NM_001135196 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 71 (C10orf71), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000374144 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:49299193:49327487:1 gene:ENSG00000177354 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// AL833265 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp451F1910 (from clone DKFZp451F1910). // chr10 // 94 // 95 // 34 // 36 // 0 /// BC126413 // GenBank // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 71, mRNA (cDNA clone IMAGE:8992129), complete cds. // chr10 // 100 // 34 // 13 // 13 // 0 /// AJ311357 // GenBank // Homo sapiens mRNA for hypothetical protein (ORF1), splice variant 1 clone Telethon(Italy_B41)HSPD03549_FL102. // chr10 // 57 // 37 // 8 // 14 // 0 /// GENSCAN00000001543 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:49322549:49326853:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0
NM_003055 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 18 (vesicular acetylcholine transporter), member 3 (SLC18A3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000374115 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:49610301:49612720:1 gene:ENSG00000187714 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC007765 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 18 (vesicular acetylcholine), member 3, mRNA (cDNA clone MGC:12716 IMAGE:4136084), complete cds. // chr10 // 83 // 75 // 15 // 18 // 0 /// U09210 // GenBank // Human vesicular acetylcholine transporter mRNA, complete cds. // chr10 // 88 // 100 // 21 // 24 // 0 /// GENSCAN00000001548 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:49610741:49612339:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0
ENST00000374113 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:49679651:49696044:1 gene:ENSG00000178645 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000535836 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:49679686:49710261:1 gene:ENSG00000178645 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AK091773 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ34454 fis, clone HLUNG2002562. // chr10 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// BC028127 // GenBank // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 53, mRNA (cDNA clone MGC:40171 IMAGE:5164374), complete cds. // chr10 // 79 // 88 // 22 // 28 // 0 /// ENST00000374112 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:49679686:49710261:1 gene:ENSG00000178645 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// NM_182554 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 53 (C10orf53), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1 /// NM_001042427 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 53 (C10orf53), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// ENST00000374111 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:49679686:49695107:1 gene:ENSG00000178645 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// GENSCAN00000001540 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:49679698:49710593:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
ENST00000580726 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:45984610:45984810:1 gene:ENSG00000265733 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT013336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT013364 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000411179 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:49954214:49954414:1 gene:ENSG00000223111 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr10 // 54 // 100 // 13 // 24 // 0
AF116628 // GenBank HTC // Homo sapiens PRO1197 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
AF130105 // GenBank HTC // Homo sapiens clone FLB4246 PRO1102 mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// NONHSAT014001 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr10 // 73 // 79 // 16 // 22 // 0
AF119912 // GenBank HTC // Homo sapiens PRO3073 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AF119852 // GenBank HTC // Homo sapiens PRO1728 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000364326 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:52852607:52852703:1 gene:ENSG00000201196 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT013434 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0
ENST00000516352 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:53458197:53458288:1 gene:ENSG00000252161 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr10 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONHSAT013452 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NONHSAT013464 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001204880 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin-conjugating enzyme E2D 1 (UBE2D1), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NM_003338 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin-conjugating enzyme E2D 1 (UBE2D1), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000373910 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:58334975:58370753:1 gene:ENSG00000072401 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF257220 // GenBank // Homo sapiens ubiquitin-conjugating enzyme (UBCH5) mRNA, complete cds. // chr10 // 97 // 88 // 28 // 29 // 0 /// AK291901 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77160 complete cds, highly similar to Homo sapiens ubiquitin-conjugating enzyme E2D 1 (UBC4/5 homolog, yeast) (UBE2D1), mRNA. // chr10 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// BC005980 // GenBank // Homo sapiens ubiquitin-conjugating enzyme E2D 1 (UBC4/5 homolog, yeast), mRNA (cDNA clone MGC:14673 IMAGE:4106710), complete cds. // chr10 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// BC015997 // GenBank // Homo sapiens ubiquitin-conjugating enzyme E2D 1 (UBC4/5 homolog, yeast), mRNA (cDNA clone MGC:27216 IMAGE:4305900), complete cds. // chr10 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// BT007041 // GenBank // Homo sapiens ubiquitin-conjugating enzyme E2D 1 (UBC4/5 homolog, yeast) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000473824 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:58364456:58369043:1 gene:ENSG00000072401 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr10 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1 /// ENST00000615793 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:58334979:58370751:1 gene:ENSG00000072401 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONHSAT013493 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr10 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1
NM_001080512 // RefSeq // Homo sapiens BicC family RNA binding protein 1 (BICC1), mRNA. // chr10 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_005270168 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens bicaudal C homolog 1 (Drosophila) (BICC1), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000263103 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:58793535:58814314:1 gene:ENSG00000122870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000373886 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:58513140:58831437:1 gene:ENSG00000122870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// AK225427 // GenBank // Homo sapiens mRNA for bicaudal C homolog 1 variant, clone: HRC10682. // chr10 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000016760 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:58701025:58828891:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// AB821310 // GenBank // Homo sapiens FGFR2-BICC1 mRNA for FGFR2-BICC1 fusion kinase protein, complete cds. // chr10 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1
NM_001143774 // RefSeq // Homo sapiens phytanoyl-CoA 2-hydroxylase interacting protein-like (PHYHIPL), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NM_032439 // RefSeq // Homo sapiens phytanoyl-CoA 2-hydroxylase interacting protein-like (PHYHIPL), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// XM_005270228 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens phytanoyl-CoA 2-hydroxylase interacting protein-like (PHYHIPL), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000373878 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:59177258:59247774:1 gene:ENSG00000165443 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000486074 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:59176661:59246147:1 gene:ENSG00000165443 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr10 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// AB058699 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1796 protein, partial cds. // chr10 // 94 // 52 // 15 // 16 // 0 /// AY358162 // GenBank // Homo sapiens clone DNA171774 EELP6309 (UNQ6309) mRNA, complete cds. // chr10 // 94 // 55 // 16 // 17 // 0 /// CR749429 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp781E0752 (from clone DKFZp781E0752). // chr10 // 96 // 74 // 22 // 23 // 0 /// ENST00000373880 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:59176590:59247774:1 gene:ENSG00000165443 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 1 /// BC011268 // GenBank // Homo sapiens phytanoyl-CoA 2-hydroxylase interacting protein-like, mRNA (cDNA clone MGC:18231 IMAGE:4156912), complete cds. // chr10 // 81 // 81 // 25 // 31 // 1 /// GENSCAN00000015495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:59176046:59245591:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1
ENST00000365320 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:60081741:60081854:1 gene:ENSG00000202190 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT013541 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000503220 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:60684505:60685209:1 gene:ENSG00000122872 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr10 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT013546 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr10 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000011852 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:60684505:60793975:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 86 // 86 // 12 // 14 // 1
NM_173554 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 107 (C10orf107), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_005269599 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 107 (C10orf107), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006717690 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 107 (C10orf107), transcript variant X4, mRNA. // chr10 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006717692 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 107 (C10orf107), transcript variant X6, mRNA. // chr10 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000330194 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:61662961:61766766:1 gene:ENSG00000183346 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC041932 // GenBank // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 107, mRNA (cDNA clone MGC:44593 IMAGE:5300631), complete cds. // chr10 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000002460 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:61503132:61783407:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1
NM_001244638 // RefSeq // Homo sapiens AT rich interactive domain 5B (MRF1-like) (ARID5B), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 78 // 29 // 29 // 0 /// NM_032199 // RefSeq // Homo sapiens AT rich interactive domain 5B (MRF1-like) (ARID5B), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000279873 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:61901300:62096944:1 gene:ENSG00000150347 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000309334 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:62049211:62093064:1 gene:ENSG00000150347 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 57 // 21 // 21 // 0 /// BC015120 // GenBank // Homo sapiens AT rich interactive domain 5B (MRF1-like), mRNA (cDNA clone IMAGE:3681098), partial cds. // chr10 // 100 // 30 // 11 // 11 // 0 /// AK296921 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60664 complete cds, highly similar to AT-rich interactive domain-containing protein5B. // chr10 // 24 // 24 // 9 // 37 // 1 /// GENSCAN00000038754 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:62042334:62162801:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 54 // 20 // 20 // 0
ENST00000496150 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:62350006:62350297:1 gene:ENSG00000240940 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT013581 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_032804 // RefSeq // Homo sapiens 2-aminoethanethiol (cysteamine) dioxygenase (ADO), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000373783 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:62804857:62808483:1 gene:ENSG00000181915 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC018660 // GenBank // Homo sapiens 2-aminoethanethiol (cysteamine) dioxygenase, mRNA (cDNA clone MGC:24535 IMAGE:4104391), complete cds. // chr10 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// BC028589 // GenBank // Homo sapiens 2-aminoethanethiol (cysteamine) dioxygenase, mRNA (cDNA clone MGC:27038 IMAGE:4838951), complete cds. // chr10 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// BC067740 // GenBank // Homo sapiens 2-aminoethanethiol (cysteamine) dioxygenase, mRNA (cDNA clone MGC:86991 IMAGE:5295674), complete cds. // chr10 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000038759 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:62805060:62805872:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0
ENST00000362576 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:63110139:63110246:1 gene:ENSG00000199446 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 90 // 9 // 9 // 0 /// NONHSAT013591 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 90 // 9 // 9 // 0
NM_001282405 // RefSeq // Homo sapiens nuclear receptor binding factor 2 (NRBF2), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 94 // 15 // 15 // 0 /// NM_030759 // RefSeq // Homo sapiens nuclear receptor binding factor 2 (NRBF2), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000277746 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:63133290:63155026:1 gene:ENSG00000148572 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000435510 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:63133247:63155031:1 gene:ENSG00000148572 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 94 // 15 // 15 // 0 /// AK301656 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52920 complete cds, highly similar to Nuclear receptor-binding factor 2. // chr10 // 92 // 75 // 11 // 12 // 0 /// AL136656 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp564C1664 (from clone DKFZp564C1664); complete cds. // chr10 // 94 // 100 // 15 // 16 // 0 /// AY267839 // GenBank // Homo sapiens comodulator of PPAR and RXR 1 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// AY267840 // GenBank // Homo sapiens comodulator of PPAR and RXR 2 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0 /// BC011707 // GenBank // Homo sapiens nuclear receptor binding factor 2, mRNA (cDNA clone MGC:19778 IMAGE:3687848), complete cds. // chr10 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000611479 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:63133305:63154427:1 gene:ENSG00000148572 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 92 // 75 // 11 // 12 // 0
NR_027182 // RefSeq // Homo sapiens JMJD1C antisense RNA 1 (JMJD1C-AS1), long non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000609436 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:63465229:63466563:1 gene:ENSG00000272767 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT013605 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001330 // RefSeq // Homo sapiens receptor accessory protein 3 (REEP3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 58 // 58 // 0 /// XM_005269620 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens receptor accessory protein 3 (REEP3), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 31 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000298249 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:63521363:63625123:1 gene:ENSG00000165476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 58 // 58 // 0 /// ENST00000373758 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:63521363:63625123:1 gene:ENSG00000165476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 58 // 58 // 0 /// AK289976 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77025 complete cds. // chr10 // 96 // 48 // 27 // 28 // 0 /// AY562241 // GenBank // Homo sapiens receptor expression enhancing protein 3 (REEP3) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 26 // 15 // 15 // 0 /// BC018658 // GenBank // Homo sapiens receptor accessory protein 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:4082362), complete cds. // chr10 // 100 // 41 // 24 // 24 // 0 /// BC038724 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5267261, containing frame-shift errors. // chr10 // 93 // 48 // 26 // 28 // 0 /// BC068557 // GenBank // Homo sapiens receptor accessory protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:87479 IMAGE:30339865), complete cds. // chr10 // 100 // 52 // 30 // 30 // 0 /// KJ535017 // GenBank HTC // Homo sapiens clone REEP3_iso-A_fetal-F10 receptor accessory protein 3 isoform A (REEP3) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr10 // 96 // 41 // 23 // 24 // 0 /// NONHSAT013607 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr10 // 100 // 33 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000016298 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:63564228:63631134:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 31 // 31 // 18 // 58 // 1
NM_001001330 // RefSeq // Homo sapiens receptor accessory protein 3 (REEP3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000298249 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:63521363:63625123:1 gene:ENSG00000165476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000373758 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:63521363:63625123:1 gene:ENSG00000165476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC018658 // GenBank // Homo sapiens receptor accessory protein 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:4082362), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NR_001446 // RefSeq // Homo sapiens annexin A2 pseudogene 3 (ANXA2P3), non-coding RNA. // chr10 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000404883 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:64825572:64826579:1 gene:ENSG00000216740 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr10 // 100 // 74 // 17 // 17 // 0 /// M62895 // GenBank // Human lipocortin (LIP) 2 pseudogene mRNA, complete cds-like region. // chr10 // 76 // 91 // 16 // 21 // 0 /// GENSCAN00000005322 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:64825572:64826230:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 39 // 9 // 9 // 0
NM_178011 // RefSeq // Homo sapiens leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 (LRRTM3), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000361320 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:66926006:67099830:1 gene:ENSG00000198739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AK290168 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75080 complete cds. // chr10 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// AY182028 // GenBank // Homo sapiens leucine-rich repeat transmembrane neuronal 3 protein mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// AY358315 // GenBank // Homo sapiens clone DNA77301 GFNV803 (UNQ803) mRNA, complete cds. // chr10 // 89 // 67 // 16 // 18 // 0 /// BC111492 // GenBank // Homo sapiens leucine rich repeat transmembrane neuronal 3, mRNA (cDNA clone MGC:131810 IMAGE:5196989), complete cds. // chr10 // 95 // 78 // 20 // 21 // 0 /// BC113715 // GenBank // Homo sapiens leucine rich repeat transmembrane neuronal 3, mRNA (cDNA clone MGC:142275 IMAGE:8322767), complete cds. // chr10 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// BC113717 // GenBank // Homo sapiens leucine rich repeat transmembrane neuronal 3, mRNA (cDNA clone MGC:142277 IMAGE:8322769), complete cds. // chr10 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000035983 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:66926921:66928970:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0
ENST00000391218 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:67808502:67808608:1 gene:ENSG00000212520 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT013680 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000410439 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:68158079:68158408:1 gene:ENSG00000222371 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT013700 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000362768 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:68461407:68461525:1 gene:ENSG00000199638 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT013717 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000384707 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:68503152:68503259:1 gene:ENSG00000207438 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT013723 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_030625 // RefSeq // Homo sapiens tet methylcytosine dioxygenase 1 (TET1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000373644 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:68560656:68694482:1 gene:ENSG00000138336 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF430147 // GenBank // Homo sapiens leukemia-associated protein with a CXXC domain (LCX) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// JX311858 // GenBank // Homo sapiens TET1 splice variant VP_DE4 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr10 // 77 // 77 // 23 // 30 // 1 /// JX311859 // GenBank // Homo sapiens TET1 splice variant VP_DE456 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr10 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// GENSCAN00000041591 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:68568976:68594675:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000041587 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:68636753:68791266:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1
ENST00000363348 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:68846805:68846911:1 gene:ENSG00000200218 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT013743 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_024045 // RefSeq // Homo sapiens DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 50 (DDX50), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000373585 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:68901278:68946847:1 gene:ENSG00000107625 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// AB051075 // GenBank // Homo sapiens mcdrh mRNA for malignant cell derived RNA helicase, complete cds. // chr10 // 82 // 94 // 14 // 17 // 0 /// AF334103 // GenBank // Homo sapiens nucleolar protein GU2 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// AK293577 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56545 complete cds, highly similar to ATP-dependent RNA helicase DDX50 (EC 3.6.1.-). // chr10 // 94 // 89 // 15 // 16 // 0 /// AK301431 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61430 complete cds, highly similar to ATP-dependent RNA helicase DDX50 (EC 3.6.1.-). // chr10 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// BC000272 // GenBank // Homo sapiens DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 50, mRNA (cDNA clone MGC:3199 IMAGE:3357684), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000610822 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:68901289:68946847:1 gene:ENSG00000107625 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000612682 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:68901278:68946846:1 gene:ENSG00000107625 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000033090 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:68901340:69023747:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 67 // 67 // 12 // 18 // 1
NM_001256910 // RefSeq // Homo sapiens DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 21 (DDX21), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// NM_004728 // RefSeq // Homo sapiens DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 21 (DDX21), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000354185 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:68956128:68985073:1 gene:ENSG00000165732 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AB062394 // GenBank // Homo sapiens OK/SW-cl.65 mRNA for DEAD/H(Asp-Glu-Ala-Asp/His)box polypeptide 21, complete cds. // chr10 // 100 // 42 // 10 // 10 // 0 /// BC008071 // GenBank // Homo sapiens DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 21, mRNA (cDNA clone MGC:2857 IMAGE:2987980), complete cds. // chr10 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000620315 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:68956440:68985067:1 gene:ENSG00000165732 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000033090 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:68901340:69023747:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 67 // 67 // 16 // 24 // 1
NM_015634 // RefSeq // Homo sapiens KIAA1279 (KIAA1279), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000361983 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:68988731:69016982:1 gene:ENSG00000198954 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK291343 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75692 complete cds. // chr10 // 95 // 71 // 19 // 20 // 0 /// BC012180 // GenBank // Homo sapiens KIAA1279, mRNA (cDNA clone MGC:20462 IMAGE:4550085), complete cds. // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000033090 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:68901340:69023747:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NR_036430 // RefSeq // Homo sapiens serglycin (SRGN), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr10 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000462445 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:69088106:69104541:1 gene:ENSG00000122862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 43 // 13 // 13 // 0 /// BC015516 // GenBank // Homo sapiens serglycin, mRNA (cDNA clone MGC:9289 IMAGE:3883161), complete cds. // chr10 // 95 // 73 // 21 // 22 // 0 /// BC022313 // GenBank // Homo sapiens serglycin, mRNA (cDNA clone IMAGE:4688573). // chr10 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// J03223 // GenBank // Human secretory granule proteoglycan peptide core mRNA, complete cds. // chr10 // 94 // 57 // 16 // 17 // 0 /// NM_002727 // RefSeq // Homo sapiens serglycin (SRGN), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// ENST00000242465 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:69088118:69104811:1 gene:ENSG00000122862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1 /// NONHSAT013776 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr10 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT013778 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr10 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000033088 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:69088161:69171269:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1
NM_025130 // RefSeq // Homo sapiens hexokinase domain containing 1 (HKDC1), mRNA. // chr10 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENST00000354624 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:69220303:69267559:1 gene:ENSG00000156510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK291024 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77931 complete cds. // chr10 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// AK303408 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57348 complete cds, highly similar to Homo sapiens hexokinase domain containing 1 (HKDC1), mRNA. // chr10 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// BC021278 // GenBank // Homo sapiens hexokinase domain containing 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4873280), complete cds. // chr10 // 94 // 59 // 15 // 16 // 0 /// BC110504 // GenBank // Homo sapiens hexokinase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:125688 IMAGE:40028726), complete cds. // chr10 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// BC110505 // GenBank // Homo sapiens hexokinase domain containing 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:40028728), complete cds. // chr10 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// BX538078 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686I14218 (from clone DKFZp686I14218). // chr10 // 90 // 37 // 9 // 10 // 0 /// GENSCAN00000033102 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:69220436:69401135:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
NM_145306 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 35 (C10orf35), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_005269606 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 35 (C10orf35), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000373279 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:69630258:69633599:1 gene:ENSG00000171224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000421716 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:69630544:69632877:1 gene:ENSG00000171224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000491890 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:69630251:69633112:1 gene:ENSG00000171224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC013587 // GenBank // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 35, mRNA (cDNA clone MGC:9596 IMAGE:3896656), complete cds. // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033093 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:69631744:69633059:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// NONHSAT013810 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_018649 // RefSeq // Homo sapiens H2A histone family, member Y2 (H2AFY2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000373255 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:70052796:70112280:1 gene:ENSG00000099284 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000455786 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:10:70052880:70109180:1 gene:ENSG00000099284 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 94 // 63 // 16 // 17 // 0 /// AF151534 // GenBank // Homo sapiens core histone macroH2A2.2 (MACROH2A2) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AF336304 // GenBank // Homo sapiens macroH2A2 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC016172 // GenBank // Homo sapiens H2A histone family, member Y2, mRNA (cDNA clone MGC:16873 IMAGE:3910208), complete cds. // chr10 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006434 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:70075659:70111683:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0
NM_004096 // RefSeq // Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 4E binding protein 2 (EIF4EBP2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000373218 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:70404379:70428618:1 gene:ENSG00000148730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC005057 // GenBank // Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 4E binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:12944 IMAGE:2823322), complete cds. // chr10 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// BC050633 // GenBank // Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 4E binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:60113 IMAGE:5555034), complete cds. // chr10 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// L36056 // GenBank // Human 4E-binding protein 2 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0
NM_014431 // RefSeq // Homo sapiens phosphatase domain containing, paladin 1 (PALD1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006717765 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens phosphatase domain containing, paladin 1 (PALD1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000263563 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:70478821:70568449:1 gene:ENSG00000107719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC136375 // GenBank // Homo sapiens KIAA1274, mRNA (cDNA clone MGC:167985 IMAGE:9020362), complete cds. // chr10 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC136376 // GenBank // Homo sapiens KIAA1274, mRNA (cDNA clone MGC:167986 IMAGE:9020363), complete cds. // chr10 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000006437 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:70513885:70566733:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
NM_080722 // RefSeq // Homo sapiens ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 14 (ADAMTS14), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_139155 // RefSeq // Homo sapiens ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 14 (ADAMTS14), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000373207 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:70672803:70762441:1 gene:ENSG00000138316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000373208 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:70672803:70762441:1 gene:ENSG00000138316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF358666 // GenBank // Homo sapiens a disintegrin-like and metalloprotease with thrombospondin type 1 motif 14 precursor (ADAMTS14) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// AF366351 // GenBank // Homo sapiens ADAMTS14 (ADAMTS14) mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// AK128469 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ46613 fis, clone TKIDN2011160. // chr10 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// GENSCAN00000006428 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:70672803:70760853:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0
NM_001244889 // RefSeq // Homo sapiens unc-5 homolog B (C. elegans) (UNC5B), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// NM_170744 // RefSeq // Homo sapiens unc-5 homolog B (C. elegans) (UNC5B), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000335350 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:71212570:71302864:1 gene:ENSG00000107731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000373192 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:71212927:71302864:1 gene:ENSG00000107731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// AB096256 // GenBank // Homo sapiens p53RDL1 mRNA for p53-regulated receptor for death and life, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// AY126437 // GenBank // Homo sapiens transmembrane receptor UNC5H2 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// AY358351 // GenBank // Homo sapiens clone DNA91779 GARS1883 (UNQ1883) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000041209 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:71279796:71299277:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// BC018947 // GenBank HTC // Homo sapiens unc-5 homolog B (C. elegans), mRNA (cDNA clone IMAGE:4128151), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr10 // 45 // 45 // 18 // 40 // 1
NONHSAT013881 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_004273 // RefSeq // Homo sapiens carbohydrate (chondroitin 6) sulfotransferase 3 (CHST3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006718075 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens carbohydrate (chondroitin 6) sulfotransferase 3 (CHST3), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000373115 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:71964365:72013564:1 gene:ENSG00000122863 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB012192 // GenBank // Homo sapiens mRNA for chondroitin 6-sulfotransferase, complete cds. // chr10 // 88 // 89 // 22 // 25 // 0 /// AB017915 // GenBank // Homo sapiens mRNA for chondroitin 6-sulfotransferase, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC093690 // GenBank // Homo sapiens carbohydrate (chondroitin 6) sulfotransferase 3, mRNA (cDNA clone MGC:120725 IMAGE:7939535), complete cds. // chr10 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// BC104856 // GenBank // Homo sapiens carbohydrate (chondroitin 6) sulfotransferase 3, mRNA (cDNA clone MGC:132516 IMAGE:8143859), complete cds. // chr10 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000031274 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:72000928:72029831:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
ENST00000363424 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:72180858:72180989:1 gene:ENSG00000200294 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT013910 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000363300 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:72220752:72220852:1 gene:ENSG00000200170 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT013913 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0
NM_019058 // RefSeq // Homo sapiens DNA-damage-inducible transcript 4 (DDIT4), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000307365 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:72273920:72276036:1 gene:ENSG00000168209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000473155 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:72273925:72274950:1 gene:ENSG00000168209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr10 // 100 // 43 // 13 // 13 // 0 /// AF335324 // GenBank // Homo sapiens RTP801 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY090097 // GenBank // Homo sapiens REDD-1 (REDD-1) mRNA, complete cds. // chr10 // 87 // 77 // 20 // 23 // 0 /// BC000708 // GenBank // Homo sapiens DNA-damage-inducible transcript 4, mRNA (cDNA clone MGC:1033 IMAGE:3507244), complete cds. // chr10 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC007714 // GenBank // Homo sapiens DNA-damage-inducible transcript 4, mRNA (cDNA clone MGC:12610 IMAGE:4302878), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC015236 // GenBank // Homo sapiens DNA-damage-inducible transcript 4, mRNA (cDNA clone MGC:17872 IMAGE:3906374), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000471240 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:72274019:72274635:1 gene:ENSG00000168209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr10 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// GENSCAN00000031275 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:72259980:72275188:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// NONHSAT013915 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr10 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
ENST00000365643 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:72391964:72392069:1 gene:ENSG00000202513 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT013920 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
ENST00000606883 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:72582803:72583086:1 gene:ENSG00000272536 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_152635 // RefSeq // Homo sapiens oncoprotein induced transcript 3 (OIT3), mRNA. // chr10 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// ENST00000334011 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:72893581:72933033:1 gene:ENSG00000138315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AY013707 // GenBank // Homo sapiens LZP (LZP) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AY358339 // GenBank // Homo sapiens clone DNA68883 PPFL826 (UNQ826) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC126440 // GenBank // Homo sapiens oncoprotein induced transcript 3, mRNA (cDNA clone MGC:161718 IMAGE:8992156), complete cds. // chr10 // 95 // 66 // 20 // 21 // 0 /// ENST00000622652 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:72893584:72932689:1 gene:ENSG00000138315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 95 // 66 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000019377 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:72895520:72913501:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000019388 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:72924125:72932524:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0
NM_173348 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 149, member B1 (FAM149B1), mRNA. // chr10 // 100 // 82 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000242505 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:73168166:73244504:1 gene:ENSG00000138286 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000372955 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:73177872:73235452:1 gene:ENSG00000138286 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 71 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000445951 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:73208692:73242180:1 gene:ENSG00000138286 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 47 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000475829 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:73210267:73235452:1 gene:ENSG00000138286 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr10 // 100 // 47 // 8 // 8 // 0 /// AB023191 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA0974 protein, partial cds. // chr10 // 100 // 88 // 15 // 15 // 0 /// AK303436 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55604 complete cds. // chr10 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0 /// BC015394 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 149, member B1, mRNA (cDNA clone MGC:21703 IMAGE:4431919), complete cds. // chr10 // 100 // 71 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000019390 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:73174704:73241019:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 65 // 11 // 11 // 0 /// NONHSAT013947 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr10 // 100 // 47 // 8 // 8 // 0
ENST00000363486 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:73279062:73279168:1 gene:ENSG00000200356 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT013964 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0
ENST00000384742 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:73346936:73347048:1 gene:ENSG00000207473 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT013966 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000372837 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:73782047:73783371:1 gene:ENSG00000172586 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// AK098720 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ25854 fis, clone TST09505. // chr10 // 95 // 88 // 20 // 21 // 0 /// NM_203298 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 1 (CHCHD1), mRNA. // chr10 // 92 // 92 // 22 // 24 // 1 /// ENST00000372833 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:73782063:73783652:1 gene:ENSG00000172586 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 92 // 92 // 22 // 24 // 1 /// BC015387 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:21689 IMAGE:4400374), complete cds. // chr10 // 92 // 92 // 22 // 24 // 1 /// BC020852 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:24021 IMAGE:4242977), complete cds. // chr10 // 92 // 92 // 22 // 24 // 1 /// GENSCAN00000019381 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:73782076:73782492:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0
ENST00000446546 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:73785655:73786679:1 gene:ENSG00000214655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr10 // 92 // 54 // 12 // 13 // 0 /// AK091621 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ34302 fis, clone FEBRA2007620. // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC137249 // GenBank // Homo sapiens KIAA0913, mRNA (cDNA clone IMAGE:9021246), complete cds. // chr10 // 92 // 54 // 12 // 13 // 0 /// BC137250 // GenBank // Homo sapiens KIAA0913, mRNA (cDNA clone IMAGE:9021247), complete cds. // chr10 // 92 // 54 // 12 // 13 // 0 /// ENST00000604729 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:10:73785582:73801792:1 gene:ENSG00000214655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1 /// NM_001242487 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, SWIM-type containing 8 (ZSWIM8), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1 /// NM_001242488 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, SWIM-type containing 8 (ZSWIM8), transcript variant 3, mRNA. // chr10 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1 /// NM_015037 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, SWIM-type containing 8 (ZSWIM8), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1 /// ENST00000398706 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:73785624:73801797:1 gene:ENSG00000214655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1 /// ENST00000603114 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:10:73785624:73801792:1 gene:ENSG00000214655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1 /// NONHSAT014024 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr10 // 92 // 54 // 12 // 13 // 0
ENST00000384029 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:74551392:74551493:1 gene:ENSG00000206756 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 75 // 3 // 3 // 0 /// NONHSAT014063 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 75 // 3 // 3 // 0
NM_001174156 // RefSeq // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 8 (SAMD8), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// NM_144660 // RefSeq // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 8 (SAMD8), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000372687 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:75111709:75182123:1 gene:ENSG00000156671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000372690 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:75111471:75176831:1 gene:ENSG00000156671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000447533 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:75099586:75168627:1 gene:ENSG00000156671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 92 // 38 // 11 // 12 // 0 /// ENST00000542569 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:75111635:75182123:1 gene:ENSG00000156671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// BC080593 // GenBank // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 8, mRNA (cDNA clone IMAGE:4548948), partial cds. // chr10 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000027382 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:75150529:75230989:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
NM_001184783 // RefSeq // Homo sapiens voltage-dependent anion channel 2 (VDAC2), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NM_003375 // RefSeq // Homo sapiens voltage-dependent anion channel 2 (VDAC2), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0 /// NR_033675 // RefSeq // Homo sapiens voltage-dependent anion channel 2 (VDAC2), transcript variant 4, non-coding RNA. // chr10 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0 /// ENST00000313132 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:75210848:75231277:1 gene:ENSG00000165637 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 78 // 7 // 7 // 0 /// ENST00000332211 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:75210751:75231448:1 gene:ENSG00000165637 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0 /// AK296635 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60120 complete cds, highly similar to Voltage-dependent anion-selective channel protein 2. // chr10 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0 /// AK315919 // GenBank // Homo sapiens cDNA, FLJ78818 complete cds, highly similar to Voltage-dependent anion-selective channel protein 2. // chr10 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0 /// BC000165 // GenBank // Homo sapiens voltage-dependent anion channel 2, mRNA (cDNA clone MGC:5237 IMAGE:2901130), complete cds. // chr10 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0 /// BC012883 // GenBank // Homo sapiens voltage-dependent anion channel 2, mRNA (cDNA clone MGC:21498 IMAGE:3875077), complete cds. // chr10 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0 /// L08666 // GenBank // Homo sapiens porin (por) mRNA, complete cds and truncated cds. // chr10 // 100 // 78 // 7 // 7 // 0
NR_110299 // RefSeq // Homo sapiens ZNF503 antisense RNA 2 (ZNF503-AS2), transcript variant 3, long non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0 /// ENST00000425916 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:75403054:75408982:1 gene:ENSG00000237149 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:antisense // chr10 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0 /// AK024492 // GenBank // Homo sapiens mRNA for FLJ00096 protein, partial cds. // chr10 // 100 // 57 // 4 // 4 // 0 /// BC017426 // GenBank HTC // Homo sapiens, clone IMAGE:4696119, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0 /// NONHSAT014105 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr10 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0
ENST00000362722 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:77587049:77587159:1 gene:ENSG00000199592 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT014163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_024585 // RefSeq // Homo sapiens DLG5 antisense RNA 1 (DLG5-AS1), long non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT015043 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000364523 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:78367507:78367623:1 gene:ENSG00000201393 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr10 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000032768 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:78248988:78380500:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 88 // 80 // 14 // 16 // 0 /// NONHSAT015074 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0
NM_020338 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, MIZ-type containing 1 (ZMIZ1), mRNA. // chr10 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000334512 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:79069035:79316519:1 gene:ENSG00000108175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000446377 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:79285453:79316528:1 gene:ENSG00000108175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 69 // 29 // 29 // 0 /// AF357909 // GenBank // Homo sapiens TRAFIP10 (TRAFIP10) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 45 // 19 // 19 // 0 /// AY235683 // GenBank // Homo sapiens PIAS-like protein hZimp10 mRNA, complete cds. // chr10 // 97 // 86 // 35 // 36 // 0 /// ENST00000478357 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:79277179:79296935:1 gene:ENSG00000108175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 21 // 21 // 9 // 42 // 1 /// AK024490 // GenBank // Homo sapiens mRNA for FLJ00092 protein, partial cds. // chr10 // 21 // 21 // 9 // 42 // 1 /// GENSCAN00000029036 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:79265022:79312749:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 52 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000611351 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:79201595:79315753:1 gene:ENSG00000108175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1
NR_033857 // RefSeq // Homo sapiens BMS1 homolog, ribosome assembly protein (yeast) pseudogene (LOC100288974), non-coding RNA. // chr10 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000453174 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:79904898:79931801:1 gene:ENSG00000242600 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0 /// BC071736 // GenBank // Homo sapiens similar to BMS1-like, ribosome assembly protein, mRNA (cDNA clone MGC:88084 IMAGE:5180577), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT015204 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT139984 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr10 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0
NM_001012973 // RefSeq // Homo sapiens placenta-specific 9 (PLAC9), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000372263 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:80132721:80145359:1 gene:ENSG00000189129 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000372267 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:10:80132591:80145037:1 gene:ENSG00000189129 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0 /// BC066348 // GenBank // Homo sapiens placenta-specific 9, mRNA (cDNA clone MGC:87537 IMAGE:30339526), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC090922 // GenBank // Homo sapiens placenta-specific 9, mRNA (cDNA clone MGC:104710 IMAGE:30331098), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC117332 // GenBank // Homo sapiens placenta-specific 9, mRNA (cDNA clone MGC:150941 IMAGE:40125883), complete cds. // chr10 // 88 // 89 // 14 // 16 // 0 /// BC117334 // GenBank // Homo sapiens placenta-specific 9, mRNA (cDNA clone MGC:150943 IMAGE:40125885), complete cds. // chr10 // 88 // 89 // 14 // 16 // 0 /// ENST00000372270 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:10:80131682:80145064:1 gene:ENSG00000189129 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 67 // 67 // 12 // 18 // 1 /// GENSCAN00000042015 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:80132763:80144910:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 67 // 12 // 12 // 0
ENST00000481537 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:80642996:80646558:1 gene:ENSG00000178217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// NM_207372 // RefSeq // Homo sapiens SH2 domain containing 4B (SH2D4B), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// ENST00000339284 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:80537902:80646560:1 gene:ENSG00000178217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// NM_001145719 // RefSeq // Homo sapiens SH2 domain containing 4B (SH2D4B), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// ENST00000313455 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:80540819:80646560:1 gene:ENSG00000178217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// ENST00000372150 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:80607299:80646558:1 gene:ENSG00000178217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// NONHSAT015268 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr10 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000042013 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:80531399:80619556:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1 /// NONHSAT015265 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr10 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
ENST00000384545 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:82340771:82340876:1 gene:ENSG00000207275 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT015287 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000391022 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:83764358:83764464:1 gene:ENSG00000212324 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT015310 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000363919 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:84003332:84003479:1 gene:ENSG00000200789 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT015313 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_207373 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 99 (C10orf99), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_005269811 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 99 (C10orf99), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000372126 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:84173738:84185294:1 gene:ENSG00000188373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000472542 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:84176518:84185284:1 gene:ENSG00000188373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// AY358751 // GenBank // Homo sapiens clone DNA92219 RLLV1833 (UNQ1833) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONHSAT015317 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr10 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// AK025416 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ21763 fis, clone COLF6967. // chr10 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// GENSCAN00000016152 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:84173852:84177155:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001171971 // RefSeq // Homo sapiens cadherin-related family member 1 (CDHR1), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// NM_033100 // RefSeq // Homo sapiens cadherin-related family member 1 (CDHR1), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000332904 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:84194654:84219621:1 gene:ENSG00000148600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000372117 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:84194658:84217366:1 gene:ENSG00000148600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000459673 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:84212877:84217366:1 gene:ENSG00000148600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr10 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// AB593154 // GenBank // Homo sapiens CDHR1 mRNA for cadherin-related family member 1, complete cds, clone: HP09128-RBdS105C07. // chr10 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// AB593155 // GenBank // Homo sapiens CDHR1 mRNA for cadherin-related family member 1, complete cds, clone: HP09128-RBdS132J21. // chr10 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AL080188 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp434A132 (from clone DKFZp434A132). // chr10 // 90 // 33 // 9 // 10 // 0 /// BC038799 // GenBank // Homo sapiens protocadherin 21, mRNA (cDNA clone MGC:46603 IMAGE:5492127), complete cds. // chr10 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000016157 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:84194761:84217833:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 77 // 22 // 23 // 0
ENST00000411132 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:85537379:85537483:1 gene:ENSG00000223064 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT015347 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONHSAT015349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
ENST00000363617 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:86052448:86052566:1 gene:ENSG00000200487 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT015359 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000391030 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:86488446:86488549:1 gene:ENSG00000212332 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT015367 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_001030015 // RefSeq // Homo sapiens opsin 4 (OPN4), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// NM_033282 // RefSeq // Homo sapiens opsin 4 (OPN4), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000241891 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:86654617:86666455:1 gene:ENSG00000122375 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000372071 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:86654557:86666455:1 gene:ENSG00000122375 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000443292 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:10:86654617:86666848:1 gene:ENSG00000122375 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 76 // 27 // 28 // 0 /// BC029291 // GenBank // Homo sapiens opsin 4 (melanopsin), mRNA (cDNA clone IMAGE:5182239). // chr10 // 89 // 76 // 25 // 28 // 0 /// BC113558 // GenBank // Homo sapiens opsin 4, mRNA (cDNA clone MGC:142118 IMAGE:8322610), complete cds. // chr10 // 93 // 81 // 28 // 30 // 0 /// BC143688 // GenBank // Homo sapiens opsin 4, mRNA (cDNA clone MGC:177219 IMAGE:9052202), complete cds. // chr10 // 94 // 86 // 30 // 32 // 0 /// GENSCAN00000037019 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:86648585:86687674:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 65 // 65 // 24 // 37 // 1
NM_004329 // RefSeq // Homo sapiens bone morphogenetic protein receptor, type IA (BMPR1A), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 54 // 54 // 0 /// ENST00000372037 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:86756650:86932838:1 gene:ENSG00000107779 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 98 // 53 // 53 // 0 /// ENST00000403332 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:129157523:129159120:-1 gene:ENSG00000219642 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr10 // 91 // 81 // 40 // 44 // 0 /// ENST00000527904 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:11:121361854:121362865:-1 gene:ENSG00000232460 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr10 // 100 // 59 // 32 // 32 // 0 /// AK291764 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75729 complete cds, highly similar to Homo sapiens bone morphogenetic protein receptor, type IA (BMPR1A), mRNA. // chr10 // 100 // 89 // 48 // 48 // 0 /// BC028383 // GenBank // Homo sapiens bone morphogenetic protein receptor, type IA, mRNA (cDNA clone MGC:33112 IMAGE:4824378), complete cds. // chr10 // 98 // 98 // 52 // 53 // 0 /// GENSCAN00000023998 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:129157523:129158710:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 86 // 67 // 31 // 36 // 0 /// GENSCAN00000029127 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:86890013:86923719:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 78 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000034058 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:11:121361850:121366656:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 59 // 32 // 32 // 0
ENST00000363306 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:86889569:86889733:1 gene:ENSG00000200176 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT015381 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_006829 // RefSeq // Homo sapiens adipogenesis regulatory factor (ADIRF), mRNA. // chr10 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000372013 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:86968192:86970915:1 gene:ENSG00000148671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000416348 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:10:86968432:86970530:1 gene:ENSG00000148671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 92 // 45 // 12 // 13 // 0 /// ENST00000561504 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:86968490:86983934:1 gene:ENSG00000148671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr10 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC004471 // GenBank // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 116, mRNA (cDNA clone MGC:10343 IMAGE:3688901), complete cds. // chr10 // 95 // 69 // 19 // 20 // 0 /// D45370 // GenBank // Homo sapiens apM2 mRNA for GS2374 (unknown product specific to adipose tissue), complete cds. // chr10 // 95 // 66 // 18 // 19 // 0 /// NONHSAT015386 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr10 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029134 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:86954849:87026603:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
NM_019054 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 35, member A (FAM35A), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000298784 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:87095196:87191463:1 gene:ENSG00000122376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000298786 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:87095196:87191468:1 gene:ENSG00000122376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC051863 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 35, member A, mRNA (cDNA clone MGC:60227 IMAGE:6146593), complete cds. // chr10 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000029140 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:87151355:87190683:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0
NM_000314 // RefSeq // Homo sapiens phosphatase and tensin homolog (PTEN), mRNA. // chr10 // 93 // 100 // 13 // 14 // 0 /// XM_006717927 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens phosphatase and tensin homolog (PTEN), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 64 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000371953 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:87863113:87971930:1 gene:ENSG00000171862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC005821 // GenBank // Homo sapiens phosphatase and tensin homolog, mRNA (cDNA clone MGC:11227 IMAGE:3937787), complete cds. // chr10 // 91 // 79 // 10 // 11 // 0 /// U92436 // GenBank // Human mutated in multiple advanced cancers protein (MMAC1) mRNA, complete cds. // chr10 // 83 // 86 // 10 // 12 // 0 /// U96180 // GenBank // Human protein tyrosine phosphatase (TEP1) mRNA, complete cds. // chr10 // 90 // 71 // 9 // 10 // 0 /// ENST00000610634 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:87863438:87942691:1 gene:ENSG00000171862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 79 // 11 // 11 // 0
NM_001010939 // RefSeq // Homo sapiens lipase, family member J (LIPJ), mRNA. // chr10 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000371939 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:88586762:88606976:1 gene:ENSG00000204022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000526923 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:88586753:88594312:1 gene:ENSG00000204022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr10 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000531458 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:10:88594746:88606823:1 gene:ENSG00000204022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// BC031219 // GenBank // Homo sapiens lipase, family member J, mRNA (cDNA clone MGC:39509 IMAGE:4830161), complete cds. // chr10 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC042900 // GenBank HTC // Homo sapiens lipase, family member J, mRNA (cDNA clone IMAGE:4823575), with apparent retained intron. // chr10 // 93 // 47 // 13 // 14 // 0 /// XM_006717635 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens lipase, family member J (LIPJ), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1 /// NONHSAT015475 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr10 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0
NM_001080518 // RefSeq // Homo sapiens lipase, family member K (LIPK), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000404190 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:88724544:88752786:1 gene:ENSG00000204021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// EF426482 // GenBank // Homo sapiens lipase K (LIPK) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001102469 // RefSeq // Homo sapiens lipase, family member N (LIPN), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000404459 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:88761406:88778242:1 gene:ENSG00000204020 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// EF426483 // GenBank // Homo sapiens lipase N (LIPN) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// GENSCAN00000037228 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:88712372:88778242:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 6 // 6 // 1
NM_001128215 // RefSeq // Homo sapiens lipase, family member M (LIPM), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000404743 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:88802730:88820501:1 gene:ENSG00000173239 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000539337 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:88805979:88820546:1 gene:ENSG00000173239 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC157888 // GenBank // Homo sapiens lipase, family member M, mRNA (cDNA clone MGC:189712 IMAGE:8862709), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC171908 // GenBank // Homo sapiens lipase, family member M, mRNA (cDNA clone MGC:198623 IMAGE:9054562), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// EF426484 // GenBank // Homo sapiens lipase M (LIPM) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000037224 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:88786149:88820501:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000437930 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:88932643:88940340:1 gene:ENSG00000180139 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK093340 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ36021 fis, clone TESTI2016568. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XR_111103 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ACTA2 antisense RNA 1 (ACTA2-AS1), misc_RNA. // chr10 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// NONHSAT015482 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001547 // RefSeq // Homo sapiens interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 2 (IFIT2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000371826 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:89301955:89309276:1 gene:ENSG00000119922 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK300431 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60157 complete cds, highly similar to Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 2. // chr10 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// BC032839 // GenBank // Homo sapiens interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 2, mRNA (cDNA clone MGC:27037 IMAGE:4838844), complete cds. // chr10 // 92 // 92 // 22 // 24 // 0 /// ENST00000611722 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:89302046:89308919:1 gene:ENSG00000119922 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000000668 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:89302124:89307375:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0
NM_001010987 // RefSeq // Homo sapiens interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1B (IFIT1B), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000371809 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:89378056:89385205:1 gene:ENSG00000204010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC137368 // GenBank // Homo sapiens interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1-like, mRNA (cDNA clone MGC:168989 IMAGE:9021366), complete cds. // chr10 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// BC137369 // GenBank // Homo sapiens interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1-like, mRNA (cDNA clone MGC:168990 IMAGE:9021367), complete cds. // chr10 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// BC150189 // GenBank // Homo sapiens interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1-like, mRNA (cDNA clone MGC:164984 IMAGE:40148511), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000000681 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:89378136:89418648:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 43 // 43 // 10 // 23 // 1
NM_012420 // RefSeq // Homo sapiens interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 5 (IFIT5), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000371795 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:89414586:89421001:1 gene:ENSG00000152778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK293346 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53857 complete cds, highly similar to Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 5. // chr10 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0 /// BC025786 // GenBank // Homo sapiens interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 5, mRNA (cDNA clone MGC:34385 IMAGE:5229306), complete cds. // chr10 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// CR457031 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834A0218D for gene IFIT5, interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 5; complete cds, incl. stopcodon. // chr10 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// U34605 // GenBank // Human retinoic acid- and interferon-inducible 58K protein RI58 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000000681 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:89378136:89418648:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001284259 // RefSeq // Homo sapiens kinesin family member 20B (KIF20B), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// NM_016195 // RefSeq // Homo sapiens kinesin family member 20B (KIF20B), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000260753 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:89701610:89774939:1 gene:ENSG00000138182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000371728 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:89701617:89774939:1 gene:ENSG00000138182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENST00000478929 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:89723576:89774939:1 gene:ENSG00000138182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 58 // 25 // 25 // 0 /// AB033337 // GenBank // Homo sapiens KRMP1 mRNA for mitotic kinesin-related protein, complete cds. // chr10 // 95 // 100 // 41 // 43 // 0 /// AL137392 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp434I152 (from clone DKFZp434I152). // chr10 // 100 // 58 // 25 // 25 // 0 /// AY739715 // GenBank // Homo sapiens M-phase phosphoprotein 1 (MPHOSPH1) mRNA, partial cds. // chr10 // 100 // 40 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000000671 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:89684724:89774048:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 84 // 36 // 36 // 0 /// NONHSAT015531 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr10 // 91 // 26 // 10 // 11 // 0
ENST00000489253 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:89978717:89979070:1 gene:ENSG00000228938 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr10 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000011729 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:89978717:89979070:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT015581 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr10 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
ENST00000450119 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:91053051:91055047:1 gene:ENSG00000220585 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006091 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:91052997:91053467:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_025235 // RefSeq // Homo sapiens tankyrase, TRF1-interacting ankyrin-related ADP-ribose polymerase 2 (TNKS2), mRNA. // chr10 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// XM_005270185 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens tankyrase, TRF1-interacting ankyrin-related ADP-ribose polymerase 2 (TNKS2), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 47 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000371627 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:91798312:91865276:1 gene:ENSG00000107854 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// AF264912 // GenBank // Homo sapiens tankyrase-like protein (TNKL) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// AF309033 // GenBank // Homo sapiens tankyrase-2 (TNKS-2) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// AF329696 // GenBank // Homo sapiens tankyrase 2 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// AF342982 // GenBank // Homo sapiens tankyrase 2 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// AF438201 // GenBank // Homo sapiens tankyrase II mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000006078 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:91798691:91859648:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0
NM_003972 // RefSeq // Homo sapiens BTAF1 RNA polymerase II, B-TFIID transcription factor-associated, 170kDa (BTAF1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// XR_246113 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens BTAF1 RNA polymerase II, B-TFIID transcription factor-associated, 170kDa (BTAF1), transcript variant X3, misc_RNA. // chr10 // 100 // 66 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000265990 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:91923769:92030325:1 gene:ENSG00000095564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000471217 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:91956621:91989395:1 gene:ENSG00000095564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 29 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000544642 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:91935152:92030321:1 gene:ENSG00000095564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// AF038362 // GenBank // Homo sapiens TBP-associated factor 172 (TAF-172) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// AK303554 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54397 complete cds, highly similar to TATA-binding protein-associated factor 172 (EC 3.6.1.-). // chr10 // 100 // 39 // 16 // 16 // 0 /// BC112201 // GenBank // Homo sapiens BTAF1 RNA polymerase II, B-TFIID transcription factor-associated, 170kDa (Mot1 homolog, S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:138406 IMAGE:8327669), complete cds. // chr10 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000039016 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:91923502:92072257:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 73 // 73 // 30 // 41 // 1
NM_017824 // RefSeq // Homo sapiens membrane-associated ring finger (C3HC4) 5 (MARCH5), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_005269923 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens membrane-associated ring finger (C3HC4) 5 (MARCH5), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000358935 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:92291163:92353964:1 gene:ENSG00000198060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000467521 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:92308478:92349775:1 gene:ENSG00000198060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 32 // 10 // 10 // 0 /// AB191202 // GenBank // Homo sapiens MARCH5 mRNA for membrane-associated RING-CH 5, complete cds. // chr10 // 100 // 55 // 17 // 17 // 0 /// AK294799 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54286 complete cds, highly similar to Mus musculus membrane-associated ring finger (C3HC4) 5 (March5), mRNA. // chr10 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// AK309175 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99216. // chr10 // 94 // 52 // 15 // 16 // 0 /// BC015480 // GenBank // Homo sapiens membrane-associated ring finger (C3HC4) 5, mRNA (cDNA clone MGC:8860 IMAGE:3905766), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONHSAT015649 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr10 // 100 // 32 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000039006 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:92274908:92351207:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1
ENST00000365427 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:92334463:92334564:1 gene:ENSG00000202297 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT015651 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_004523 // RefSeq // Homo sapiens kinesin family member 11 (KIF11), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000260731 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:92593286:92655395:1 gene:ENSG00000138160 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC126211 // GenBank // Homo sapiens kinesin family member 11, mRNA (cDNA clone MGC:161489 IMAGE:8991927), complete cds. // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC136474 // GenBank // Homo sapiens kinesin family member 11, mRNA (cDNA clone MGC:168086 IMAGE:9020463), complete cds. // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// U37426 // GenBank // Human kinesin-like spindle protein HKSP (HKSP) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000039014 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:92574402:92653796:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
NM_183374 // RefSeq // Homo sapiens cytochrome P450, family 26, subfamily C, polypeptide 1 (CYP26C1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000285949 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:93061264:93068697:1 gene:ENSG00000187553 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AK131099 // GenBank // Homo sapiens mRNA for FLJ00329 protein. // chr10 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// AY356349 // GenBank // Homo sapiens cytochrome P450 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AK127234 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ45301 fis, clone BRHIP3003795. // chr10 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1 /// GENSCAN00000015145 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:92893349:93069356:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0
NM_000783 // RefSeq // Homo sapiens cytochrome P450, family 26, subfamily A, polypeptide 1 (CYP26A1), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NM_057157 // RefSeq // Homo sapiens cytochrome P450, family 26, subfamily A, polypeptide 1 (CYP26A1), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000224356 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:93073890:93077890:1 gene:ENSG00000095596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000371531 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:93073475:93077884:1 gene:ENSG00000095596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// AF005418 // GenBank // Homo sapiens retinoic acid hydroxylase mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// AK027560 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ14654 fis, clone NT2RP2002256, highly similar to Cytochrome P450 26A1 (EC 1.14.-.-). // chr10 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// AK075374 // GenBank // Homo sapiens cDNA PSEC0064 fis, clone NT2RP2000957, highly similar to CYTOCHROME P450 26 (EC 1.14.-.-). // chr10 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000015152 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:93073935:93077304:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0
NM_001127182 // RefSeq // Homo sapiens centrosomal protein 55kDa (CEP55), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NM_018131 // RefSeq // Homo sapiens centrosomal protein 55kDa (CEP55), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000371485 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:93496632:93529092:1 gene:ENSG00000138180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000445435 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:93507010:93519111:1 gene:ENSG00000138180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// AB091343 // GenBank // Homo sapiens URCC6 mRNA for up-regulated in colon cancer 6, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY788918 // GenBank // Homo sapiens centrosomal protein 55 kDa mRNA, complete cds. // chr10 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// BC008947 // GenBank // Homo sapiens centrosomal protein 55kDa, mRNA (cDNA clone MGC:3422 IMAGE:3028566), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BX640718 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686P16192 (from clone DKFZp686P16192). // chr10 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000015155 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:93495014:93578976:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1
NM_001195755 // RefSeq // Homo sapiens free fatty acid receptor 4 (FFAR4), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// NM_181745 // RefSeq // Homo sapiens free fatty acid receptor 4 (FFAR4), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000371481 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:93566665:93590072:1 gene:ENSG00000186188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000371483 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:93566665:93590072:1 gene:ENSG00000186188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AB115768 // GenBank // Homo sapiens mRNA for G-protein-coupled receptor GT01, complete cds. // chr10 // 95 // 92 // 21 // 22 // 0 /// AK301525 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52634 complete cds, highly similar to G-protein coupled receptor 120. // chr10 // 88 // 71 // 15 // 17 // 0 /// AY288417 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 120 (GPR120) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// BC101175 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 120, mRNA (cDNA clone MGC:119984 IMAGE:40016354), complete cds. // chr10 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000604414 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:10:93566682:93604480:1 gene:ENSG00000186188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 54 // 54 // 13 // 24 // 1 /// GENSCAN00000015155 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:93495014:93578976:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 46 // 46 // 11 // 24 // 1
NM_006204 // RefSeq // Homo sapiens phosphodiesterase 6C, cGMP-specific, cone, alpha prime (PDE6C), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000371447 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:93612588:93666010:1 gene:ENSG00000095464 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// U31973 // GenBank // Human phosphodiesterase A subunit (PDE6C) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000015158 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:93612726:93702800:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0
NM_005097 // RefSeq // Homo sapiens leucine-rich, glioma inactivated 1 (LGI1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000371413 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:93757921:93798157:1 gene:ENSG00000108231 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000371418 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:93757885:93798159:1 gene:ENSG00000108231 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF055636 // GenBank // Homo sapiens leucine-rich glioma-inactivated protein precursor (LGI1) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF473548 // GenBank // Homo sapiens leucine-rich glioma inactivated-1 (LGI1) mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr10 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// AK289706 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75578 complete cds, highly similar to Homo sapiens leucine-rich, glioma inactivated 1 (LGI1), mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AK303956 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50946 complete cds, highly similar to Leucine-rich glioma-inactivated protein 1 precursor. // chr10 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// AK309416 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99457. // chr10 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// AY358885 // GenBank // Homo sapiens clone DNA68882 LGI1 (UNQ775) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC022500 // GenBank // Homo sapiens leucine-rich, glioma inactivated 1, mRNA (cDNA clone MGC:26441 IMAGE:4811956), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB209408 // GenBank // Homo sapiens mRNA for leucine-rich, glioma inactivated 1 precursor variant protein. // chr10 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// GENSCAN00000015146 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:93712035:93797803:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
NM_001134658 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 35, member G1 (SLC35G1), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_153226 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 35, member G1 (SLC35G1), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000371408 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:93893973:93903824:1 gene:ENSG00000176273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000427197 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:93893973:93902733:1 gene:ENSG00000176273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC104814 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 20, mRNA (cDNA clone MGC:132474 IMAGE:8143817), complete cds. // chr10 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// BC143283 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone MGC:176803 IMAGE:9051786, complete cds. // chr10 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// BC143284 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 20, mRNA (cDNA clone MGC:176804 IMAGE:9051787), complete cds. // chr10 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0
NM_015188 // RefSeq // Homo sapiens TBC1 domain family, member 12 (TBC1D12), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// XM_006717732 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens TBC1 domain family, member 12 (TBC1D12), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000225235 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:94402504:94535930:1 gene:ENSG00000108239 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// AB449898 // GenBank // Homo sapiens TBC1D12 mRNA for TBC1 domain family, member 12, complete cds. // chr10 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000485048 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:94508442:94533297:1 gene:ENSG00000108239 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 26 // 26 // 12 // 46 // 1 /// AK090865 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ33546 fis, clone BRAMY2008563. // chr10 // 26 // 26 // 12 // 46 // 1 /// GENSCAN00000032558 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:94402614:94533096:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 83 // 38 // 38 // 0 /// NONHSAT015727 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr10 // 26 // 26 // 12 // 46 // 1
NM_000769 // RefSeq // Homo sapiens cytochrome P450, family 2, subfamily C, polypeptide 19 (CYP2C19), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000371321 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:94762624:94853260:1 gene:ENSG00000165841 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000464755 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:94688154:94853073:1 gene:ENSG00000276490 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay gene:ENSG00000165841 // chr10 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// M61854 // GenBank // Human cytochrome P4502C19 (CYP2C19) mRNA, clone 11a. // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// X65962 // GenBank // H.sapiens mRNA for cytochrome P-450. // chr10 // 75 // 52 // 9 // 12 // 0 /// GENSCAN00000032559 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:94762706:94852914:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// L07093 // GenBank // Human cytochrome P4502C18 and P4502C19 splice variant or composite clone mRNA. // chr10 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0
NM_207321 // RefSeq // Homo sapiens acyl-CoA synthetase medium-chain family member 6 (ACSM6), mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000327739 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:95194200:95226405:1 gene:ENSG00000173124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr10 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000341686 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:95194200:95228928:1 gene:ENSG00000173124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000394005 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:95194477:95228924:1 gene:ENSG00000173124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000404473 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:95194477:95225335:1 gene:ENSG00000173124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr10 // 95 // 76 // 21 // 22 // 0 /// AK126134 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44146 fis, clone THYMU2027734, weakly similar to Homo sapiens SA hypertension-associated homolog (rat) (SAH). // chr10 // 93 // 93 // 25 // 27 // 0 /// BC112988 // GenBank // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 129, mRNA (cDNA clone IMAGE:40031554), partial cds. // chr10 // 91 // 76 // 20 // 22 // 0 /// GENSCAN00000048472 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:95194486:95231009:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0
ENST00000423344 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:95907965:95938723:1 gene:ENSG00000173088 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// AK294399 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59588 complete cds. // chr10 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// ENST00000602648 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:95907603:95924812:1 gene:ENSG00000173088 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// ENST00000618242 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:95922004:95938658:1 gene:ENSG00000173088 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 83 // 83 // 24 // 29 // 1 /// ENST00000491114 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:95860548:95924844:1 gene:ENSG00000270099 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr10 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1 /// GENSCAN00000044538 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:95907908:96032008:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
ENST00000469549 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:95955426:95985028:1 gene:ENSG00000269948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr10 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
XM_006717833 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens coiled-coil and C2 domain containing 2B (CC2D2B), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 60 // 3 // 3 // 0 /// ENST00000475252 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:95974029:96032675:1 gene:ENSG00000269920 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr10 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// AK123423 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ41429 fis, clone BRHIP2005354, weakly similar to Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A. // chr10 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0
NM_001001732 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil and C2 domain containing 2B (CC2D2B), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NM_001159747 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil and C2 domain containing 2B (CC2D2B), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// XM_006717833 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens coiled-coil and C2 domain containing 2B (CC2D2B), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000344386 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:96000126:96032684:1 gene:ENSG00000188649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000410012 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:96000112:96032383:1 gene:ENSG00000188649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// AK302377 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61464 complete cds. // chr10 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// BC075861 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil and C2 domain containing 2B, mRNA (cDNA clone MGC:90420 IMAGE:5171414), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001134375 // RefSeq // Homo sapiens cyclin J (CCNJ), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NM_001134376 // RefSeq // Homo sapiens cyclin J (CCNJ), transcript variant 3, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NM_019084 // RefSeq // Homo sapiens cyclin J (CCNJ), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000265992 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:96043394:96060870:1 gene:ENSG00000107443 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000403870 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:96043394:96059588:1 gene:ENSG00000107443 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000465148 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:96043583:96059588:1 gene:ENSG00000107443 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0 /// AK297264 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58102 complete cds, highly similar to Homo sapiens cyclin J (CCNJ), mRNA. // chr10 // 100 // 64 // 14 // 14 // 0 /// BC043175 // GenBank // Homo sapiens cyclin J, mRNA (cDNA clone MGC:44167 IMAGE:5287365), complete cds. // chr10 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000044546 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:96043402:96058241:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 59 // 13 // 13 // 0
NM_001017520 // RefSeq // Homo sapiens DNA nucleotidylexotransferase (DNTT), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NM_004088 // RefSeq // Homo sapiens DNA nucleotidylexotransferase (DNTT), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000371174 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:96304396:96338564:1 gene:ENSG00000107447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// AB046378 // GenBank // Homo sapiens tdt mRNA for terminal deoxynucleotidyltransferase, complete cds. // chr10 // 94 // 97 // 30 // 32 // 0 /// BC012920 // GenBank // Homo sapiens deoxynucleotidyltransferase, terminal, mRNA (cDNA clone MGC:21346 IMAGE:4509721), complete cds. // chr10 // 93 // 88 // 27 // 29 // 0 /// M22968 // GenBank // Human terminal deoxynucleotidyltransferase gene, 5 end and exon 1. // chr10 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1 /// GENSCAN00000044537 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:96267275:96336232:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// M11722 // GenBank // Human terminal transferase mRNA, complete cds. // chr10 // 93 // 88 // 27 // 29 // 0
ENST00000384557 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:96743167:96743273:1 gene:ENSG00000207287 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT015829 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0
ENST00000439189 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:96750288:96750899:1 gene:ENSG00000236552 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr10 // 100 // 70 // 7 // 7 // 0 /// NR_026712 // RefSeq // Homo sapiens ribosomal protein L13a pseudogene 5 (RPL13AP5), non-coding RNA. // chr10 // 70 // 100 // 7 // 10 // 0 /// GENSCAN00000044549 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:96750288:96750899:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 70 // 7 // 7 // 0
NM_001170765 // RefSeq // Homo sapiens ligand dependent nuclear receptor corepressor (LCOR), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// NM_032440 // RefSeq // Homo sapiens ligand dependent nuclear receptor corepressor (LCOR), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000356016 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:96832955:96958891:1 gene:ENSG00000196233 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000371097 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:96832980:96958926:1 gene:ENSG00000196233 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000371103 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:96832282:96958933:1 gene:ENSG00000196233 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// AL834245 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp451A142 (from clone DKFZp451A142); complete cds. // chr10 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// BC053359 // GenBank // Homo sapiens ligand dependent nuclear receptor corepressor, mRNA (cDNA clone MGC:61698 IMAGE:6009825), complete cds. // chr10 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// NM_001170766 // RefSeq // Homo sapiens ligand dependent nuclear receptor corepressor (LCOR), transcript variant 3, mRNA. // chr10 // 79 // 79 // 23 // 29 // 1 /// ENST00000540664 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:96832260:96964431:1 gene:ENSG00000196233 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 79 // 79 // 23 // 29 // 1 /// GENSCAN00000038261 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:96949008:96998046:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// AK308356 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ98304. // chr10 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
NM_015652 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 12 (C10orf12), mRNA. // chr10 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000286067 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:96981284:96986212:1 gene:ENSG00000155640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// BC024315 // GenBank // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 12, mRNA (cDNA clone MGC:17862 IMAGE:3903728), complete cds. // chr10 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000038261 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:96949008:96998046:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AK308356 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ98304. // chr10 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1
ENST00000615469 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:97297290:97297557:1 gene:ENSG00000277308 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_005479 // RefSeq // Homo sapiens frequently rearranged in advanced T-cell lymphomas 1 (FRAT1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000371021 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:97319267:97321915:1 gene:ENSG00000165879 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB074890 // GenBank // Homo sapiens FRAT1 mRNA for GSK-3beta binding protein FRAT1, complete cds. // chr10 // 94 // 61 // 16 // 17 // 0 /// BC034476 // GenBank // Homo sapiens frequently rearranged in advanced T-cell lymphomas, mRNA (cDNA clone MGC:26295 IMAGE:4823463), complete cds. // chr10 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// U58975 // GenBank // Homo sapiens proto-oncogene (FRAT1) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000038240 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:97319454:97320293:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0
NM_024954 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin domain containing 1 (UBTD1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000370664 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:97498868:97571209:1 gene:ENSG00000165886 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC007331 // GenBank // Homo sapiens ubiquitin domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:15051 IMAGE:3629185), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000038247 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:97542250:97570523:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0
NM_001009997 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 62 (C10orf62), mRNA. // chr10 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000370640 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:97589727:97590934:1 gene:ENSG00000203942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC037252 // GenBank // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 62, mRNA (cDNA clone MGC:34694 IMAGE:5163660), complete cds. // chr10 // 95 // 78 // 20 // 21 // 0 /// BC043281 // GenBank // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 62, mRNA (cDNA clone IMAGE:5297474). // chr10 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000038242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:97572708:97611659:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_018425 // RefSeq // Homo sapiens phosphatidylinositol 4-kinase type 2 alpha (PI4K2A), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000370631 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:97640686:97676434:1 gene:ENSG00000155252 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC003167 // GenBank // Homo sapiens phosphatidylinositol 4-kinase type 2 alpha, mRNA (cDNA clone MGC:4395 IMAGE:2905670), complete cds. // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BT007330 // GenBank // Homo sapiens phosphatidylinositol 4-kinase type II mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000038241 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:97640743:97673742:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000370649 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:10:97584374:97673910:1 gene:ENSG00000249967 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// AK293733 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56960 complete cds, highly similar to Homo sapiens phosphatidylinositol 4-kinase type II (PI4KII), mRNA. // chr10 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_001010917 // RefSeq // Homo sapiens golgin A7 family, member B (GOLGA7B), mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000370602 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:97850239:97871578:1 gene:ENSG00000155265 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000596005 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:97859449:97871577:1 gene:ENSG00000155265 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSG00000269783 // chr10 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC110810 // GenBank // Homo sapiens golgi autoantigen, golgin subfamily a, 7B, mRNA (cDNA clone MGC:131701 IMAGE:5195678), complete cds. // chr10 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000008988 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:97859458:97866955:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 93 // 52 // 13 // 14 // 0
NM_020348 // RefSeq // Homo sapiens cyclin M1 (CNNM1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000356713 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:99329099:99394330:1 gene:ENSG00000119946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF169226 // GenBank // Homo sapiens ancient conserved domain protein 1 (ACDP1) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK296545 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59244 complete cds, highly similar to Homo sapiens cyclin M1 (CNNM1), mRNA. // chr10 // 92 // 81 // 24 // 26 // 0 /// AK299346 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61654 complete cds, highly similar to Homo sapiens cyclin M1 (CNNM1), mRNA. // chr10 // 96 // 81 // 25 // 26 // 0 /// AK308326 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ98274. // chr10 // 87 // 47 // 13 // 15 // 0 /// AK310486 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17528. // chr10 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// BC098103 // GenBank // Homo sapiens cyclin M1, mRNA (cDNA clone MGC:119406 IMAGE:40006972), complete cds. // chr10 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// BC098279 // GenBank // Homo sapiens cyclin M1, mRNA (cDNA clone MGC:119408 IMAGE:40006977), complete cds. // chr10 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// BC098307 // GenBank // Homo sapiens cyclin M1, mRNA (cDNA clone MGC:119409 IMAGE:40006978), complete cds. // chr10 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// JF267782 // GenBank // Homo sapiens CLP-1 mRNA, complete cds. // chr10 // 89 // 59 // 17 // 19 // 0 /// AK308618 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ98659. // chr10 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1 /// GENSCAN00000037314 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:99329388:99395434:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
NM_145285 // RefSeq // Homo sapiens NK2 homeobox 3 (NKX2-3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000344586 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:99532933:99536524:1 gene:ENSG00000119919 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK300856 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60168 complete cds, highly similar to Homeobox protein Nkx-2.3. // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC025788 // GenBank // Homo sapiens NK2 transcription factor related, locus 3 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:34784 IMAGE:5229146), complete cds. // chr10 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000622383 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:99532953:99536521:1 gene:ENSG00000119919 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000037316 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:99533132:99555632:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1
NM_020354 // RefSeq // Homo sapiens ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 7 (ENTPD7), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000370489 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:99659506:99706240:1 gene:ENSG00000198018 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// AF269255 // GenBank // Homo sapiens lysosomal apyrase-like protein 1 (LALP1) mRNA, complete cds. // chr10 // 97 // 88 // 36 // 37 // 0 /// AK309735 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99776. // chr10 // 95 // 93 // 37 // 39 // 0 /// BC119008 // GenBank // Homo sapiens ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 7, mRNA (cDNA clone MGC:141914 IMAGE:40085532), complete cds. // chr10 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// BC122857 // GenBank // Homo sapiens ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 7, mRNA (cDNA clone MGC:141913 IMAGE:40085531), complete cds. // chr10 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000037313 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:99659109:99704959:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 97 // 79 // 32 // 33 // 0
NM_015960 // RefSeq // Homo sapiens cutC copper transporter (CUTC), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000370472 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:99732396:99754550:1 gene:ENSG00000119929 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000370476 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:99732220:99756134:1 gene:ENSG00000119929 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000471520 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:99732281:99755708:1 gene:ENSG00000119929 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr10 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// AF132966 // GenBank // Homo sapiens CGI-32 protein mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC021105 // GenBank // Homo sapiens cutC copper transporter homolog (E. coli), mRNA (cDNA clone MGC:31851 IMAGE:4547900), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC028948 // GenBank // Homo sapiens cutC copper transporter homolog (E. coli), mRNA (cDNA clone MGC:29852 IMAGE:4776344), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK302507 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56751 complete cds, highly similar to Copper homeostasis protein cutC homolog. // chr10 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// GENSCAN00000037320 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:99731877:99847127:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_000392 // RefSeq // Homo sapiens ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 2 (ABCC2), mRNA. // chr10 // 97 // 100 // 38 // 39 // 0 /// XM_006717630 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 2 (ABCC2), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 82 // 32 // 32 // 0 /// XM_006717631 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 2 (ABCC2), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 62 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000370434 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:99782763:99798096:1 gene:ENSG00000023839 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 23 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000370449 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:99782732:99852192:1 gene:ENSG00000023839 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// BC136419 // GenBank // Homo sapiens ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 2, mRNA (cDNA clone MGC:168030 IMAGE:9020407), complete cds. // chr10 // 95 // 97 // 36 // 38 // 0 /// U49248 // GenBank // Human canalicular multispecific organic anion transporter (cMOAT), gene, complete cds. // chr10 // 95 // 100 // 37 // 39 // 0 /// U63970 // GenBank // Human canalicular multispecific organic anion transporter (cMOAT) mRNA, complete cds. // chr10 // 95 // 100 // 37 // 39 // 0 /// GENSCAN00000037320 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:99731877:99847127:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 79 // 31 // 31 // 0
NONHSAT015943 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000384632 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:100258571:100258677:1 gene:ENSG00000207362 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT015955 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_005063 // RefSeq // Homo sapiens stearoyl-CoA desaturase (delta-9-desaturase) (SCD), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000370355 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:100347124:100364834:1 gene:ENSG00000099194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// AF097514 // GenBank // Homo sapiens stearoyl-CoA desaturase (SCD) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// AB032261 // GenBank // Homo sapiens Scd mRNA for stearoyl-CoA desaturase, complete cds. // chr10 // 58 // 86 // 7 // 12 // 0
NM_003393 // RefSeq // Homo sapiens wingless-type MMTV integration site family, member 8B (WNT8B), mRNA. // chr10 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000343737 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:100463041:100483744:1 gene:ENSG00000075290 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// AB073637 // GenBank // Homo sapiens mRNA for WNT8B, complete cds. // chr10 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// Y11094 // GenBank // H.sapiens mRNA for WNT-8B protein. // chr10 // 87 // 97 // 27 // 31 // 0 /// GENSCAN00000033768 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:100391332:100482816:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0
NM_017902 // RefSeq // Homo sapiens hypoxia inducible factor 1, alpha subunit inhibitor (HIF1AN), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000299163 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:100535859:100559998:1 gene:ENSG00000166135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF395830 // GenBank // Homo sapiens factor inhibiting HIF1 (FIH1) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK295353 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60091 complete cds, highly similar to Hypoxia-inducible factor 1 alpha inhibitor(EC 1.14.11.16). // chr10 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// AL359615 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp762F1811 (from clone DKFZp762F1811). // chr10 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// BC007719 // GenBank // Homo sapiens hypoxia inducible factor 1, alpha subunit inhibitor, mRNA (cDNA clone MGC:12605 IMAGE:4138066), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000526476 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:100535915:100545968:1 gene:ENSG00000166135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr10 // 71 // 50 // 10 // 14 // 0 /// ENST00000533589 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:100529072:100546581:1 gene:ENSG00000166135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// GENSCAN00000033769 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:100535959:100546053:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 95 // 68 // 18 // 19 // 0
NM_001136123 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 178, member A (FAM178A), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 97 // 81 // 29 // 30 // 0 /// NM_001243770 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 178, member A (FAM178A), transcript variant 3, mRNA. // chr10 // 100 // 27 // 10 // 10 // 0 /// NM_018121 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 178, member A (FAM178A), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 97 // 92 // 33 // 34 // 0 /// ENST00000238961 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:100912569:100965136:1 gene:ENSG00000119906 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 97 // 92 // 33 // 34 // 0 /// ENST00000370269 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:100912979:100959590:1 gene:ENSG00000119906 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 73 // 26 // 27 // 0 /// AF460991 // GenBank // Homo sapiens C10ORF6 mRNA, complete cds. // chr10 // 97 // 92 // 33 // 34 // 0 /// AK292565 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78767 complete cds. // chr10 // 97 // 78 // 28 // 29 // 0 /// ENST00000370271 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:100912963:100926760:1 gene:ENSG00000119906 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 38 // 38 // 14 // 37 // 1 /// AL833126 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp313F1832 (from clone DKFZp313F1832). // chr10 // 38 // 38 // 14 // 37 // 1 /// BC020915 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 178, member A, mRNA (cDNA clone IMAGE:4769051), partial cds. // chr10 // 22 // 22 // 8 // 37 // 1 /// GENSCAN00000042361 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:100916578:100984131:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 27 // 27 // 10 // 37 // 1
NM_030929 // RefSeq // Homo sapiens Kazal-type serine peptidase inhibitor domain 1 (KAZALD1), mRNA. // chr10 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000370200 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:101061841:101065592:1 gene:ENSG00000107821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 62 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000465807 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:101066299:101068131:1 gene:ENSG00000107821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000477267 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:101063078:101067890:1 gene:ENSG00000107821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 41 // 14 // 14 // 0 /// AK172864 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ24094 fis, clone KAIA397. // chr10 // 97 // 88 // 29 // 30 // 0 /// AY359087 // GenBank // Homo sapiens clone DNA167678 FKSG28 (UNQ2945) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 56 // 19 // 19 // 0 /// BC007758 // GenBank // Homo sapiens Kazal-type serine peptidase inhibitor domain 1, mRNA (cDNA clone MGC:13129 IMAGE:4122366), complete cds. // chr10 // 100 // 62 // 21 // 21 // 0 /// AY014271 // GenBank HTC // Homo sapiens FKSG28 (FKSG28) mRNA, complete cds. // chr10 // 47 // 47 // 16 // 34 // 1 /// GENSCAN00000042374 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:101062593:101064920:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 47 // 16 // 16 // 0 /// NONHSAT016010 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr10 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0
NM_001195517 // RefSeq // Homo sapiens T-cell leukemia homeobox 1 (TLX1), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NM_005521 // RefSeq // Homo sapiens T-cell leukemia homeobox 1 (TLX1), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000370196 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:101130505:101137789:1 gene:ENSG00000107807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000463716 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:10:101131728:101134225:1 gene:ENSG00000107807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000467928 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:101131304:101137497:1 gene:ENSG00000107807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC130530 // GenBank // Homo sapiens T-cell leukemia homeobox 1, mRNA (cDNA clone MGC:163402 IMAGE:40146561), complete cds. // chr10 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// M62626 // GenBank // Human T lymphocyte homeobox protein mRNA, partial cds. // chr10 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// M75952 // GenBank // H.sapiens homeobox protein (HOX-11) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000042369 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:101131542:101226938:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
ENST00000410306 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:101307529:101307718:1 gene:ENSG00000222238 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT016047 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001256856 // RefSeq // Homo sapiens beta-transducin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase (BTRC), transcript variant 3, mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NM_003939 // RefSeq // Homo sapiens beta-transducin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase (BTRC), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NM_033637 // RefSeq // Homo sapiens beta-transducin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase (BTRC), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000370187 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:101354063:101557321:1 gene:ENSG00000166167 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000393441 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:101354033:101557319:1 gene:ENSG00000166167 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000408038 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:101354107:101557321:1 gene:ENSG00000166167 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AF129530 // GenBank // Homo sapiens chromosome 10 F-box protein Fbw1A (FBW1A) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// AK295870 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54002 complete cds, highly similar to F-box/WD repeat protein 1A. // chr10 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// BC027994 // GenBank // Homo sapiens beta-transducin repeat containing, mRNA (cDNA clone MGC:40028 IMAGE:5180993), complete cds. // chr10 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// GU727631 // GenBank // Homo sapiens epididymis tissue sperm binding protein Li 2a mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000042366 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:101430396:101550860:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
NM_015448 // RefSeq // Homo sapiens deleted in primary ciliary dyskinesia homolog (mouse) (DPCD), mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000370147 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:101588325:101609447:1 gene:ENSG00000166171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 89 // 76 // 17 // 19 // 0 /// ENST00000370151 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:101588288:101609668:1 gene:ENSG00000166171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000434727 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:101594702:101609439:1 gene:ENSG00000166171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000475443 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:101600739:101609661:1 gene:ENSG00000166171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// AK290154 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76604 complete cds, highly similar to Homo sapiens deleted in a mouse model of primary ciliary dyskinesia (RP11-529I10.4), mRNA. // chr10 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// BC001082 // GenBank // Homo sapiens deleted in a mouse model of primary ciliary dyskinesia, mRNA (cDNA clone MGC:2759 IMAGE:2907119), complete cds. // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC031695 // GenBank // Homo sapiens deleted in a mouse model of primary ciliary dyskinesia, mRNA (cDNA clone MGC:35075 IMAGE:5166605), complete cds. // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000042362 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:101594699:101609471:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT016061 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr10 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
ENST00000410119 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:101622859:101622965:1 gene:ENSG00000222051 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT016065 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_024747 // RefSeq // Homo sapiens Hermansky-Pudlak syndrome 6 (HPS6), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000299238 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:102065390:102068038:1 gene:ENSG00000166189 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AF536238 // GenBank // Homo sapiens Hermansky-Pudlak syndrome-6 protein (HPS6) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// BC011594 // GenBank // Homo sapiens Hermansky-Pudlak syndrome 6, mRNA (cDNA clone MGC:20522 IMAGE:4578480), complete cds. // chr10 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// BC014993 // GenBank // Homo sapiens Hermansky-Pudlak syndrome 6, mRNA (cDNA clone MGC:23252 IMAGE:4869397), complete cds. // chr10 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000030316 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:102065475:102067802:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 77 // 17 // 17 // 0
NM_152310 // RefSeq // Homo sapiens ELOVL fatty acid elongase 3 (ELOVL3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000370005 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:102226328:102229589:1 gene:ENSG00000119915 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC034344 // GenBank // Homo sapiens elongation of very long chain fatty acids (FEN1/Elo2, SUR4/Elo3, yeast)-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:21435 IMAGE:4745607), complete cds. // chr10 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000030340 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:102133069:102229252:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_001199378 // RefSeq // Homo sapiens golgi brefeldin A resistant guanine nucleotide exchange factor 1 (GBF1), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 98 // 44 // 44 // 0 /// NM_001199379 // RefSeq // Homo sapiens golgi brefeldin A resistant guanine nucleotide exchange factor 1 (GBF1), transcript variant 3, mRNA. // chr10 // 100 // 98 // 44 // 44 // 0 /// NM_004193 // RefSeq // Homo sapiens golgi brefeldin A resistant guanine nucleotide exchange factor 1 (GBF1), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 98 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000369983 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:102245532:102382899:1 gene:ENSG00000107862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 98 // 44 // 44 // 0 /// AF068755 // GenBank // Homo sapiens sec7 domain family member (GBF1) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// BC094763 // GenBank // Homo sapiens golgi-specific brefeldin A resistant guanine nucleotide exchange factor 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:30528881), complete cds. // chr10 // 100 // 31 // 14 // 14 // 0 /// BC117681 // GenBank // Homo sapiens golgi-specific brefeldin A resistant guanine nucleotide exchange factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:134877 IMAGE:40070852), complete cds. // chr10 // 98 // 96 // 42 // 43 // 0 /// BC117682 // GenBank // Homo sapiens golgi-specific brefeldin A resistant guanine nucleotide exchange factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:134878 IMAGE:40070853), complete cds. // chr10 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000030337 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:102258939:102402376:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 82 // 82 // 37 // 45 // 1
NONHSAT016138 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_030912 // RefSeq // Homo sapiens tripartite motif containing 8 (TRIM8), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000302424 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:102644496:102658407:1 gene:ENSG00000171206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000462202 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:10:102644887:102656954:1 gene:ENSG00000171206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000487927 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:102649219:102656969:1 gene:ENSG00000171206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// AF220034 // GenBank // Homo sapiens tripartite motif protein TRIM8 (TRIM8) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// AF281046 // GenBank // Homo sapiens glioblastoma-expressed RING finger protein GERP (GERP) mRNA, complete cds. // chr10 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// AL360160 // GenBank // Homo sapiens mRNA full length insert cDNA clone EUROIMAGE 159487. // chr10 // 90 // 34 // 9 // 10 // 0 /// BC021925 // GenBank // Homo sapiens tripartite motif-containing 8, mRNA (cDNA clone MGC:31796 IMAGE:4857393), complete cds. // chr10 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// XM_006717988 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens tripartite motif containing 8 (TRIM8), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1 /// GENSCAN00000030320 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:102633734:102657354:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0
NM_001083913 // RefSeq // Homo sapiens WW domain binding protein 1-like (WBP1L), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// NM_017787 // RefSeq // Homo sapiens WW domain binding protein 1-like (WBP1L), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000369889 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:102776249:102816267:1 gene:ENSG00000166272 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000448841 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:102743970:102816240:1 gene:ENSG00000166272 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// AK300871 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58693 complete cds. // chr10 // 100 // 43 // 9 // 9 // 0 /// AK316452 // GenBank // Homo sapiens cDNA, FLJ79351 complete cds. // chr10 // 100 // 43 // 9 // 9 // 0 /// AY656171 // GenBank // Homo sapiens outcome predictor in acute leukemia 1 (OPAL1) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC114465 // GenBank // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 26, mRNA (cDNA clone MGC:125647 IMAGE:40027914), complete cds. // chr10 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// BC113857 // GenBank // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 26, mRNA (cDNA clone MGC:125648 IMAGE:40027916), complete cds. // chr10 // 73 // 71 // 11 // 15 // 0 /// GENSCAN00000030339 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:102744081:102813331:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 43 // 9 // 9 // 0
ENST00000517185 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:102803929:102804031:1 gene:ENSG00000252994 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT016142 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001136200 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 32 (C10orf32), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_144591 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 32 (C10orf32), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000339834 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:102854223:102864961:1 gene:ENSG00000166275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000369883 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:102854262:102864213:1 gene:ENSG00000166275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// BC015994 // GenBank // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 32, mRNA (cDNA clone MGC:27171 IMAGE:4698381), complete cds. // chr10 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// NR_037644 // RefSeq // Homo sapiens C10orf32-ASMT readthrough (NMD candidate) (C10orf32-ASMT), long non-coding RNA. // chr10 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// ENST00000299353 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:102854272:102901899:1 gene:ENSG00000270316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr10 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
ENST00000364210 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:102868421:102868519:1 gene:ENSG00000201080 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT016153 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_020682 // RefSeq // Homo sapiens arsenite methyltransferase (AS3MT), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_037644 // RefSeq // Homo sapiens C10orf32-ASMT readthrough (NMD candidate) (C10orf32-ASMT), long non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000299353 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:102854272:102901899:1 gene:ENSG00000270316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000369880 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:102869516:102901899:1 gene:ENSG00000214435 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF226730 // GenBank // Homo sapiens Cyt19 mRNA, complete cds. // chr10 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// AK309737 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99778. // chr10 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000615257 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:102869516:102901894:1 gene:ENSG00000214435 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000029404 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:102869426:102900700:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_017649 // RefSeq // Homo sapiens cyclin M2 (CNNM2), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// NM_199076 // RefSeq // Homo sapiens cyclin M2 (CNNM2), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0 /// NM_199077 // RefSeq // Homo sapiens cyclin M2 (CNNM2), transcript variant 3, mRNA. // chr10 // 100 // 38 // 15 // 15 // 0 /// XM_005269933 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens cyclin M2 (CNNM2), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 93 // 35 // 13 // 14 // 0 /// XM_006717908 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens cyclin M2 (CNNM2), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 33 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000369875 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:102918317:102927618:1 gene:ENSG00000148842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 38 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000369878 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:102918293:103090221:1 gene:ENSG00000148842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000433628 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:102918357:103078351:1 gene:ENSG00000148842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0 /// AF216962 // GenBank // Homo sapiens ancient conserved domain protein 2 (ACDP2) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 73 // 29 // 29 // 0 /// BC021222 // GenBank // Homo sapiens cyclin M2, mRNA (cDNA clone MGC:12933 IMAGE:4308662), complete cds. // chr10 // 100 // 38 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000029415 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:102918559:103084407:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0
NM_001143909 // RefSeq // Homo sapiens ribulose-5-phosphate-3-epimerase-like 1 (RPEL1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000441178 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:10:103245887:103248016:1 gene:ENSG00000235376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC137242 // GenBank // Homo sapiens rcRPE, mRNA (cDNA clone MGC:168862 IMAGE:9021239), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC137243 // GenBank // Homo sapiens rcRPE, mRNA (cDNA clone MGC:168863 IMAGE:9021240), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC157829 // GenBank // Homo sapiens rcRPE, mRNA (cDNA clone MGC:189724 IMAGE:9057048), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC157875 // GenBank // Homo sapiens rcRPE, mRNA (cDNA clone MGC:189769 IMAGE:9057093), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC171806 // GenBank // Homo sapiens rcRPE, mRNA (cDNA clone MGC:198521 IMAGE:9054460), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC171885 // GenBank // Homo sapiens rcRPE, mRNA (cDNA clone MGC:198600 IMAGE:9054539), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000029418 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:103245997:103246683:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_032727 // RefSeq // Homo sapiens internexin neuronal intermediate filament protein, alpha (INA), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000369849 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:103277163:103290351:1 gene:ENSG00000148798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AK293490 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57501 complete cds, highly similar to Alpha-internexin. // chr10 // 100 // 48 // 11 // 11 // 0 /// BC006359 // GenBank // Homo sapiens internexin neuronal intermediate filament protein, alpha, mRNA (cDNA clone MGC:12702 IMAGE:4125949), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000616853 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:103277167:103290342:1 gene:ENSG00000148798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000029383 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:103277212:103290449:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 57 // 13 // 13 // 0
NM_006951 // RefSeq // Homo sapiens TAF5 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor, 100kDa (TAF5), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000369839 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:103367967:103389065:1 gene:ENSG00000148835 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AK291229 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75683 complete cds, highly similar to Homo sapiens TAF5 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor, 100kDa (TAF5), mRNA. // chr10 // 94 // 94 // 32 // 34 // 0 /// BC052268 // GenBank // Homo sapiens TAF5 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor, 100kDa, mRNA (cDNA clone MGC:59660 IMAGE:6575596), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC136340 // GenBank // Homo sapiens TAF5 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor, 100kDa, mRNA (cDNA clone MGC:167950 IMAGE:9020327), complete cds. // chr10 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// BC136348 // GenBank // Homo sapiens TAF5 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor, 100kDa, mRNA (cDNA clone MGC:167958 IMAGE:9020335), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// U80191 // GenBank // Human TFIID subunit TAFII100 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000029394 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:103367990:103446139:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 78 // 78 // 28 // 36 // 1
NM_014976 // RefSeq // Homo sapiens programmed cell death 11 (PDCD11), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000369797 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:103396648:103446292:1 gene:ENSG00000148843 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// AK294971 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54437 partial cds, highly similar to RRP5 protein homolog. // chr10 // 89 // 61 // 24 // 27 // 0 /// D80007 // GenBank // Homo sapiens KIAA0185 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000029394 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:103367990:103446139:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 89 // 39 // 39 // 0 /// AK293772 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61218 complete cds, highly similar to RRP5 protein homolog. // chr10 // 100 // 41 // 18 // 18 // 0
NM_004210 // RefSeq // Homo sapiens neuralized E3 ubiquitin protein ligase 1 (NEURL1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_005270269 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens neuralized E3 ubiquitin protein ligase 1 (NEURL1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000369780 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:103493979:103592552:1 gene:ENSG00000107954 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000437579 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:103555232:103571822:1 gene:ENSG00000107954 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000455386 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:103558085:103571722:1 gene:ENSG00000107954 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 89 // 31 // 8 // 9 // 0 /// AF029729 // GenBank // Homo sapiens neuralized mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// AK299620 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57494 complete cds, highly similar to Neuralized-like protein 1. // chr10 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// BC026336 // GenBank // Homo sapiens neuralized homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:26482 IMAGE:4812302), complete cds. // chr10 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// U87864 // GenBank // Homo sapiens neuralized homolog (h-neuralized) mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000029399 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:103555067:103590372:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0
ENST00000410571 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:103673158:103673265:1 gene:ENSG00000222503 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT016206 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_014720 // RefSeq // Homo sapiens STE20-like kinase (SLK), mRNA. // chr10 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000335753 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:103967201:104029233:1 gene:ENSG00000065613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000369755 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:103967201:104029233:1 gene:ENSG00000065613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AB002804 // GenBank // Homo sapiens mRNA for hSLK, complete cds. // chr10 // 92 // 86 // 23 // 25 // 0 /// AF273048 // GenBank // Homo sapiens CTCL tumor antigen se20-9 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AK302855 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61681 partial cds, highly similar to STE20-like serine/threonine-protein kinase (EC2.7.11.1). // chr10 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// BC111565 // GenBank // Homo sapiens STE20-like kinase (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:133067 IMAGE:40009070), complete cds. // chr10 // 96 // 79 // 22 // 23 // 0 /// D86959 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA0204 gene, partial cds. // chr10 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000008082 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:103966918:104025720:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
AK291184 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76188 complete cds. // chr10 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0 /// NM_001002759 // RefSeq // Homo sapiens SWI5-dependent recombination repair 1 (SFR1), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 53 // 53 // 10 // 19 // 1 /// NM_145247 // RefSeq // Homo sapiens SWI5-dependent recombination repair 1 (SFR1), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 58 // 58 // 11 // 19 // 1 /// ENST00000369727 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:104122165:104126385:1 gene:ENSG00000156384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 53 // 53 // 10 // 19 // 1 /// ENST00000369729 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:104122058:104126385:1 gene:ENSG00000156384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 58 // 58 // 11 // 19 // 1 /// AK123954 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ41960 fis, clone PUAEN2002616. // chr10 // 53 // 53 // 10 // 19 // 1 /// BC140835 // GenBank // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 78, mRNA (cDNA clone MGC:176512 IMAGE:9021703), complete cds. // chr10 // 42 // 42 // 8 // 19 // 1 /// GENSCAN00000008061 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:104117083:104125704:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 42 // 8 // 8 // 0
AK296463 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52096 complete cds. // chr10 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// BX641120 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686L1435 (from clone DKFZp686L1435). // chr10 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NM_001008723 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 147 (CCDC147), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 42 // 42 // 1 /// ENST00000369704 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:104353764:104455090:1 gene:ENSG00000120051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 42 // 42 // 1 /// BC036225 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 147, mRNA (cDNA clone MGC:39717 IMAGE:5272786), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 42 // 42 // 1 /// BC109126 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 147, mRNA (cDNA clone MGC:126475 IMAGE:40036085), complete cds. // chr10 // 95 // 95 // 40 // 42 // 1 /// GENSCAN00000008075 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:104357374:104507926:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 81 // 81 // 34 // 42 // 1
NM_014978 // RefSeq // Homo sapiens sortilin-related VPS10 domain containing receptor 3 (SORCS3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000369699 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:104641328:105265235:1 gene:ENSG00000156395 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000369701 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:104641101:105265235:1 gene:ENSG00000156395 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AB028982 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1059 protein, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AK303009 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50313 complete cds, highly similar to VPS10 domain-containing receptor SorCS3 precursor. // chr10 // 100 // 29 // 9 // 9 // 0 /// BC117417 // GenBank // Homo sapiens sortilin-related VPS10 domain containing receptor 3, mRNA (cDNA clone MGC:151026 IMAGE:40125968), complete cds. // chr10 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000019758 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:105028402:105263374:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 77 // 77 // 24 // 31 // 1
ENST00000363209 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:107461560:107461669:1 gene:ENSG00000200079 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT016285 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000363347 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:109239639:109239746:1 gene:ENSG00000200217 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT016318 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0
NM_004419 // RefSeq // Homo sapiens dual specificity phosphatase 5 (DUSP5), mRNA. // chr10 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000369583 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:110497838:110511544:1 gene:ENSG00000138166 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000468749 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:110502747:110510437:1 gene:ENSG00000138166 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 26 // 8 // 8 // 0 /// BC062545 // GenBank // Homo sapiens dual specificity phosphatase 5, mRNA (cDNA clone MGC:71194 IMAGE:5808876), complete cds. // chr10 // 97 // 94 // 28 // 29 // 0 /// U15932 // GenBank // Human dual-specificity protein phosphatase mRNA, complete cds. // chr10 // 80 // 97 // 24 // 30 // 0 /// U16996 // GenBank // Human protein tyrosine phosphatase mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 77 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000004335 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:110447976:110510426:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 74 // 74 // 23 // 31 // 1
NM_005445 // RefSeq // Homo sapiens structural maintenance of chromosomes 3 (SMC3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000361804 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:110567691:110604636:1 gene:ENSG00000108055 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF020043 // GenBank // Homo sapiens chromosome-associated polypeptide (HCAP) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK289771 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75104 complete cds, highly similar to Homo sapiens chondroitin sulfate proteoglycan 6 (bamacan) (CSPG6),mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK315845 // GenBank // Homo sapiens cDNA, FLJ79494 complete cds, highly similar to Structural maintenance of chromosome 3. // chr10 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// BC047324 // GenBank // Homo sapiens structural maintenance of chromosomes 3, mRNA (cDNA clone MGC:54230 IMAGE:5493263), complete cds. // chr10 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000004334 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:110515474:110596573:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0
NONHSAT016351 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000362494 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:110761142:110761242:1 gene:ENSG00000199364 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr10 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONHSAT016358 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_000681 // RefSeq // Homo sapiens adrenoceptor alpha 2A (ADRA2A), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000280155 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:111077163:111080907:1 gene:ENSG00000150594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF284095 // GenBank // Homo sapiens alpha-2A adrenergic receptor mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC035047 // GenBank // Homo sapiens adrenergic, alpha-2A-, receptor, mRNA (cDNA clone MGC:41760 IMAGE:5266354), complete cds. // chr10 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// BC050414 // GenBank // Homo sapiens adrenergic, alpha-2A-, receptor, mRNA (cDNA clone MGC:54083 IMAGE:6198830), complete cds. // chr10 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0
NM_058222 // RefSeq // Homo sapiens tectorin beta (TECTB), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000369422 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:112283735:112305035:1 gene:ENSG00000119913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AF312827 // GenBank // Homo sapiens tectorin beta (TECTB) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC113497 // GenBank // Homo sapiens tectorin beta, mRNA (cDNA clone MGC:142057 IMAGE:8322549), complete cds. // chr10 // 86 // 100 // 30 // 35 // 0 /// BC113499 // GenBank // Homo sapiens tectorin beta, mRNA (cDNA clone MGC:142059 IMAGE:8322551), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000016662 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:112283735:112303365:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 97 // 86 // 29 // 30 // 0
XM_006717637 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens vesicle transport through interaction with t-SNAREs 1A (VTI1A), transcript variant X8, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK074471 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ23891 fis, clone LNG14431. // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT016414 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// TCONS_00017678-XLOC_008618 // Rinn lincRNA // linc-TCF7L2-2 chr10:+:114610672-114615127 // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001177660 // RefSeq // Homo sapiens hyaluronan binding protein 2 (HABP2), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// NM_004132 // RefSeq // Homo sapiens hyaluronan binding protein 2 (HABP2), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000351270 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:113553026:113589599:1 gene:ENSG00000148702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000542051 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:113550837:113589602:1 gene:ENSG00000148702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// AK290832 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75350 complete cds, highly similar to Homo sapiens hyaluronan binding protein 2, mRNA. // chr10 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0 /// AK303759 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56762 complete cds, highly similar to Hyaluronan-binding protein 2 precursor (EC 3.4.21.-). // chr10 // 90 // 50 // 18 // 20 // 0 /// AK303761 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51607 complete cds. // chr10 // 79 // 35 // 11 // 14 // 0 /// AK303948 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51606 complete cds, highly similar to Hyaluronan-binding protein 2 precursor (EC 3.4.21.-). // chr10 // 87 // 78 // 27 // 31 // 0 /// BC031412 // GenBank // Homo sapiens hyaluronan binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:34485 IMAGE:5187066), complete cds. // chr10 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// D49742 // GenBank // Homo sapiens mRNA for HGF activator like protein, complete cds. // chr10 // 95 // 100 // 38 // 40 // 0 /// GENSCAN00000007303 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:113553134:113588369:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0
ENST00000391287 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:113820459:113820590:1 gene:ENSG00000212589 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONHSAT016439 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_198514 // RefSeq // Homo sapiens NHL repeat containing 2 (NHLRC2), mRNA. // chr10 // 100 // 60 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000369301 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:113854661:113917194:1 gene:ENSG00000196865 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 60 // 60 // 0 /// AK094313 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ36994 fis, clone BRACE2006935. // chr10 // 100 // 17 // 10 // 10 // 0 /// AK126751 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44798 fis, clone BRACE3040863. // chr10 // 100 // 27 // 16 // 16 // 0 /// BC032598 // GenBank // Homo sapiens NHL repeat containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:45492 IMAGE:5529619), complete cds. // chr10 // 100 // 32 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000028031 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:113854873:113927583:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 47 // 28 // 28 // 0 /// NONHSAT016441 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr10 // 100 // 43 // 26 // 26 // 0
NM_000684 // RefSeq // Homo sapiens adrenoceptor beta 1 (ADRB1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000369295 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:114044056:114046908:1 gene:ENSG00000043591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// J03019 // GenBank // Human beta-1-adrenergic receptor mRNA, complete cds. // chr10 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000028051 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:114044133:114045566:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
ENST00000517257 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:114111414:114111517:1 gene:ENSG00000253066 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT016446 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_198795 // RefSeq // Homo sapiens tudor domain containing 1 (TDRD1), mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000251864 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:114179270:114232304:1 gene:ENSG00000095627 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000369280 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:114179590:114228417:1 gene:ENSG00000095627 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 79 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000369282 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:114179270:114231727:1 gene:ENSG00000095627 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// AF285606 // GenBank // Homo sapiens tudor domain containing protein 1 (TDRD1) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 57 // 24 // 24 // 0 /// AK304331 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56365 complete cds, highly similar to Tudor domain-containing protein 1. // chr10 // 95 // 50 // 20 // 21 // 0 /// BC035010 // GenBank // Homo sapiens tudor domain containing 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4836808), partial cds. // chr10 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// BC063133 // GenBank // Homo sapiens tudor domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:72119 IMAGE:6710928), complete cds. // chr10 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000028054 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:114187832:114231517:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 62 // 26 // 26 // 0
NM_001272046 // RefSeq // Homo sapiens von Willebrand factor A domain containing 2 (VWA2), mRNA. // chr10 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000298715 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:114239330:114289992:1 gene:ENSG00000165816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr10 // 100 // 76 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000392982 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:114239330:114291513:1 gene:ENSG00000165816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 83 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000603594 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:114239356:114289873:1 gene:ENSG00000165816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 71 // 29 // 29 // 0 /// AK122716 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ16213 fis, clone CTONG2024206. // chr10 // 100 // 78 // 32 // 32 // 0 /// AK127756 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ45857 fis, clone OCBBF2030927, weakly similar to Homo sapiens matrilin 4 (MATN4). // chr10 // 83 // 73 // 25 // 30 // 0 /// AY572972 // GenBank // Homo sapiens colon cancer secreted protein-2 (CCSP-2) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 85 // 35 // 35 // 0 /// BC128588 // GenBank // Homo sapiens von Willebrand factor A domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:157755 IMAGE:40128488), complete cds. // chr10 // 86 // 71 // 25 // 29 // 0 /// BC143380 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:9051886. // chr10 // 100 // 71 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000028043 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:114248714:114291237:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 66 // 26 // 27 // 0
NONHSAT016461 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_001135051 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 160, member B1 (FAM160B1), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NM_020940 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 160, member B1 (FAM160B1), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000369248 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:114821744:114864717:1 gene:ENSG00000151553 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000369250 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:114821744:114899832:1 gene:ENSG00000151553 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// BC037207 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 160, member B1, mRNA (cDNA clone MGC:42764 IMAGE:4828347), complete cds. // chr10 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000016227 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:114833233:114901344:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0
NM_139169 // RefSeq // Homo sapiens TruB pseudouridine (psi) synthase family member 1 (TRUB1), mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000298746 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:114938193:114977676:1 gene:ENSG00000165832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AF448144 // GenBank // Homo sapiens TruB pseudouridine synthase-like protein 1 (TRUB1) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// BC030601 // GenBank // Homo sapiens TruB pseudouridine (psi) synthase homolog 1 (E. coli), mRNA (cDNA clone MGC:26853 IMAGE:4822413), complete cds. // chr10 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AK302800 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56312 complete cds, highly similar to Homo sapiens TruB pseudouridine (psi) synthase homolog 1 (TRUB1), mRNA. // chr10 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// ENST00000485065 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:114938386:114960000:1 gene:ENSG00000165832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// GENSCAN00000016226 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:114938112:114975379:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0
NM_198515 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 172 (CCDC172), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000333254 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:116324428:116380029:1 gene:ENSG00000182645 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000497093 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:116325008:116342279:1 gene:ENSG00000182645 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// BC044830 // GenBank // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 96, mRNA (cDNA clone MGC:35062 IMAGE:5166167), complete cds. // chr10 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017855 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:116324581:116436737:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_001011709 // RefSeq // Homo sapiens pancreatic lipase-related protein 3 (PNLIPRP3), mRNA. // chr10 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000369230 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:116427867:116477957:1 gene:ENSG00000203837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AL833418 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp313P1022 (from clone DKFZp313P1022). // chr10 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// BC015840 // GenBank HTC // Homo sapiens pancreatic lipase-related protein 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:4305314), with apparent retained intron. // chr10 // 100 // 32 // 10 // 10 // 0 /// BC065752 // GenBank // Homo sapiens pancreatic lipase-related protein 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:4074544), partial cds. // chr10 // 100 // 32 // 10 // 10 // 0 /// BC117224 // GenBank // Homo sapiens pancreatic lipase-related protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:150833 IMAGE:40125775), complete cds. // chr10 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000017856 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:116455423:116490732:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1
ENST00000364065 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:116538183:116538276:1 gene:ENSG00000200935 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 60 // 83 // 3 // 5 // 0 /// NONHSAT016487 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 60 // 83 // 3 // 5 // 0
NM_000936 // RefSeq // Homo sapiens pancreatic lipase (PNLIP), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000369221 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:116545931:116567855:1 gene:ENSG00000175535 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000470562 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:116546093:116551288:1 gene:ENSG00000175535 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0 /// BC014309 // GenBank // Homo sapiens pancreatic lipase, mRNA (cDNA clone MGC:22594 IMAGE:4042766), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// J05125 // GenBank // Human triglyceride lipase mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// M93285 // GenBank // Human pancreatic lipase (PNLIP) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AK223175 // GenBank // Homo sapiens mRNA, alpha 2 type I collagen variant, clone: PNC00393. // chr10 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// GENSCAN00000017843 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:116518987:116646808:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0
NM_001242699 // RefSeq // Homo sapiens enolase family member 4 (ENO4), mRNA. // chr10 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// XM_005269815 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens enolase family member 4 (ENO4), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// XM_006717835 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens enolase family member 4 (ENO4), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// XR_246087 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens enolase family member 4 (ENO4), transcript variant X2, misc_RNA. // chr10 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000341276 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:116849512:116882601:1 gene:ENSG00000188316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000369207 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:10:116859034:116911788:1 gene:ENSG00000188316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000409522 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:10:116849512:116882527:1 gene:ENSG00000188316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 50 // 17 // 17 // 0 /// BX647301 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp781N1041 (from clone DKFZp781N1041). // chr10 // 94 // 50 // 16 // 17 // 0 /// ENST00000622726 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:116849512:116882601:1 gene:ENSG00000188316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000031081 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:116827353:116883863:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 65 // 65 // 22 // 34 // 1
NM_181840 // RefSeq // Homo sapiens potassium channel, subfamily K, member 18 (KCNK18), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000334549 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:117197489:117210299:1 gene:ENSG00000186795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB087138 // GenBank // Homo sapiens TRIK mRNA for TWIK-related individual K+ channel, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031096 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:117163367:117210299:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_003054 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 18 (vesicular monoamine transporter), member 2 (SLC18A2), mRNA. // chr10 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000298472 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:117241093:117279430:1 gene:ENSG00000165646 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000497497 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:117241093:117279430:1 gene:ENSG00000165646 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC030593 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 18 (vesicular monoamine), member 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:4828946), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC108927 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 18 (vesicular monoamine), member 2, mRNA (cDNA clone MGC:120477 IMAGE:40025174), complete cds. // chr10 // 97 // 82 // 30 // 31 // 0 /// BC108928 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 18 (vesicular monoamine), member 2, mRNA (cDNA clone MGC:120478 IMAGE:40025175), complete cds. // chr10 // 97 // 82 // 30 // 31 // 0 /// L09118 // GenBank // Human synaptic vesicle monoamine transporter (SVMT) mRNA, complete cds. // chr10 // 94 // 82 // 29 // 31 // 0 /// L14269 // GenBank // Homo sapiens synaptic vesicle amine transporter (SVAT) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 82 // 31 // 31 // 0 /// L23205 // GenBank // Human vesicle monoamine transporter (VMAT2) mRNA, complete cds. // chr10 // 97 // 87 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000031086 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:117231008:117272437:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 58 // 22 // 22 // 0
NM_001165924 // RefSeq // Homo sapiens empty spiracles homeobox 2 (EMX2), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NM_004098 // RefSeq // Homo sapiens empty spiracles homeobox 2 (EMX2), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000442245 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:117542445:117549545:1 gene:ENSG00000170370 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000546446 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:117544866:117548799:1 gene:ENSG00000170370 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 28 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000553456 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:117542444:117549546:1 gene:ENSG00000170370 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF301598 // GenBank // Homo sapiens empty spiracles-like protein (EMX2) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK311352 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ18394. // chr10 // 100 // 28 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000616794 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:10:117543568:117549542:1 gene:ENSG00000170370 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT016529 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr10 // 100 // 28 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000031083 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:117534672:117548232:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 53 // 53 // 17 // 32 // 1
NM_199461 // RefSeq // Homo sapiens nanos homolog 1 (Drosophila) (NANOS1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000340087 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:119030426:119031533:1 gene:ENSG00000188613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 38 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000425699 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:119029716:119033732:1 gene:ENSG00000188613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// AF275269 // GenBank // Homo sapiens NANOS1 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 56 // 19 // 19 // 0 /// AF458985 // GenBank // Homo sapiens EC_Rep1a mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000019878 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:119029802:119030680:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 35 // 12 // 12 // 0
NM_005308 // RefSeq // Homo sapiens G protein-coupled receptor kinase 5 (GRK5), mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000392870 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:119207589:119455619:1 gene:ENSG00000198873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AK298261 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57156 complete cds, highly similar to G protein-coupled receptor kinase 5 (EC 2.7.11.16). // chr10 // 94 // 59 // 15 // 16 // 0 /// AK301450 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51728 complete cds, highly similar to G protein-coupled receptor kinase 5 (EC 2.7.11.16). // chr10 // 87 // 56 // 13 // 15 // 0 /// AK309761 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99802. // chr10 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// BC064506 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor kinase 5, mRNA (cDNA clone MGC:71228 IMAGE:6482467), complete cds. // chr10 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC114448 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor kinase 5, mRNA (cDNA clone IMAGE:40001324), complete cds. // chr10 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0 /// L15388 // GenBank // Human G protein-coupled receptor kinase (GRK5) mRNA, complete cds. // chr10 // 92 // 93 // 23 // 25 // 0 /// ENST00000369108 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:119452448:119459742:1 gene:ENSG00000198873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr10 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// GENSCAN00000019874 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:119325672:119455929:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
ENST00000460421 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:119212857:119213146:1 gene:ENSG00000242853 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT016625 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000369108 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:119452448:119459742:1 gene:ENSG00000198873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK097099 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39780 fis, clone SPLEN2002007. // chr10 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 /// AF370369 // GenBank HTC // Homo sapiens FP2025 mRNA, complete cds. // chr10 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1
ENST00000454541 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:119638456:119639082:1 gene:ENSG00000227437 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000019876 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:119595796:119639082:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_004281 // RefSeq // Homo sapiens BCL2-associated athanogene 3 (BAG3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000369085 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:119651370:119677819:1 gene:ENSG00000151929 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000450186 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:119656610:119676707:1 gene:ENSG00000151929 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0 /// AF071218 // GenBank // Homo sapiens docking protein CAIR-1 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF095193 // GenBank // Homo sapiens BAG-family molecular chaperone regulator-3 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF127139 // GenBank // Homo sapiens Bcl-2-binding protein BIS (BIS) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK291333 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75690 complete cds, highly similar to Homo sapiens BCL2-associated athanogene 3 (BAG3), mRNA. // chr10 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// BC006418 // GenBank // Homo sapiens BCL2-associated athanogene 3, mRNA (cDNA clone MGC:12641 IMAGE:3635446), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC014656 // GenBank // Homo sapiens BCL2-associated athanogene 3, mRNA (cDNA clone MGC:20407 IMAGE:4636684), complete cds. // chr10 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC107786 // GenBank // Homo sapiens BCL2-associated athanogene 3, mRNA (cDNA clone MGC:104307 IMAGE:6655146), complete cds. // chr10 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000019873 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:119651676:119693038:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
ENST00000467429 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:119768247:119768538:1 gene:ENSG00000242818 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT016648 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_007190 // RefSeq // Homo sapiens SEC23 interacting protein (SEC23IP), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_005269470 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens SEC23 interacting protein (SEC23IP), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000369075 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:119892711:119944658:1 gene:ENSG00000107651 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000543134 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:119892783:119915807:1 gene:ENSG00000107651 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 38 // 11 // 11 // 0 /// AB019435 // GenBank // Homo sapiens mRNA for putative phospholipase, complete cds. // chr10 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AF116723 // GenBank HTC // Homo sapiens MSTP053 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC063800 // GenBank // Homo sapiens SEC23 interacting protein, mRNA (cDNA clone MGC:70759 IMAGE:6514739), complete cds. // chr10 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BT006755 // GenBank // Homo sapiens Sec23-interacting protein p125 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 38 // 11 // 11 // 0 /// NR_037771 // RefSeq // Homo sapiens SEC23 interacting protein (SEC23IP), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr10 // 90 // 90 // 26 // 29 // 1 /// AK301517 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55643 complete cds, highly similar to SEC23-interacting protein. // chr10 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// GENSCAN00000009987 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:119892783:119933767:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0
NR_103717 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 85 (C10orf85), long non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000369071 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:120598209:120600124:1 gene:ENSG00000177234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC108662 // GenBank // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 85, mRNA (cDNA clone MGC:131689 IMAGE:3922405), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000009972 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:120585448:120600343:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
ENST00000411047 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:121410916:121411200:1 gene:ENSG00000222979 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 79 // 92 // 19 // 24 // 0 /// NONHSAT016700 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr10 // 79 // 92 // 19 // 24 // 0
ENST00000365014 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:121846600:121846700:1 gene:ENSG00000201884 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT016709 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_144587 // RefSeq // Homo sapiens BTB (POZ) domain containing 16 (BTBD16), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000260723 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:122271306:122338162:1 gene:ENSG00000138152 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC109261 // GenBank // Homo sapiens BTB (POZ) domain containing 16, mRNA (cDNA clone MGC:129864 IMAGE:40025404), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC109262 // GenBank // Homo sapiens BTB (POZ) domain containing 16, mRNA (cDNA clone MGC:129865 IMAGE:40025414), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000495370 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:122331967:122336622:1 gene:ENSG00000138152 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1 /// GENSCAN00000020686 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:122192679:122338465:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 68 // 68 // 26 // 38 // 1
ENST00000365375 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:122345690:122345793:1 gene:ENSG00000202245 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT016739 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_002775 // RefSeq // Homo sapiens HtrA serine peptidase 1 (HTRA1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000368984 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:122461525:122514908:1 gene:ENSG00000166033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000420892 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:122506691:122514907:1 gene:ENSG00000166033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 39 // 14 // 14 // 0 /// D87258 // GenBank // Homo sapiens mRNA for serin protease with IGF-binding motif, complete cds. // chr10 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// AK290089 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78224 complete cds. // chr10 // 58 // 58 // 21 // 36 // 1 /// GENSCAN00000020676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:122461653:122514359:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0
ENST00000607497 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:122780081:122785079:1 gene:ENSG00000176584 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr10 // 100 // 47 // 8 // 8 // 0 /// NR_003570 // RefSeq // Homo sapiens deleted in malignant brain tumors 1 pseudogene 1 (DMBT1P1), non-coding RNA. // chr10 // 94 // 94 // 16 // 17 // 1 /// ENST00000439464 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:122756694:122797645:1 gene:ENSG00000176584 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 94 // 94 // 16 // 17 // 1 /// NONHSAT016745 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr10 // 94 // 94 // 16 // 17 // 1 /// TCONS_l2_00004049-XLOC_l2_001773 // Broad TUCP // linc-FAM24A-2 chr10:+:124516209-124557161 // chr10 // 94 // 94 // 16 // 17 // 1 /// GENSCAN00000020684 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:122721305:122802457:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 53 // 53 // 9 // 17 // 1
NM_001029888 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 24, member A (FAM24A), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000368894 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:122910701:122913111:1 gene:ENSG00000203795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000026283 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:122908734:122914556:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 46 // 46 // 11 // 24 // 1
NM_001609 // RefSeq // Homo sapiens acyl-CoA dehydrogenase, short/branched chain (ACADSB), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000358776 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:123009016:123058311:1 gene:ENSG00000196177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000368869 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:10:123008979:123054119:1 gene:ENSG00000196177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000496730 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:123034355:123047249:1 gene:ENSG00000196177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// AK298638 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57418 complete cds, highly similar to Short/branched chain specific acyl-CoAdehydrogenase, mitochondrial precursor (EC 1.3.99.-). // chr10 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// BC013756 // GenBank // Homo sapiens acyl-Coenzyme A dehydrogenase, short/branched chain, mRNA (cDNA clone MGC:21286 IMAGE:4706281), complete cds. // chr10 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// U12778 // GenBank // Human acyl-CoA dehydrogenase mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000026272 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:123009030:123053765:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0
NM_001105574 // RefSeq // Homo sapiens H6 family homeobox 3 (HMX3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000357878 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:123135962:123137741:1 gene:ENSG00000188620 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000026284 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:123134433:123137731:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_005519 // RefSeq // Homo sapiens H6 family homeobox 2 (HMX2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_005269743 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens H6 family homeobox 2 (HMX2), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000339992 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:123148122:123150672:1 gene:ENSG00000188816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC132758 // GenBank // Homo sapiens H6 family homeobox 2, mRNA (cDNA clone MGC:164389 IMAGE:40146780), complete cds. // chr10 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// BC137139 // GenBank // Homo sapiens H6 family homeobox 2, mRNA (cDNA clone MGC:168759 IMAGE:9021136), complete cds. // chr10 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000026295 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:123147949:123150123:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0
NM_153442 // RefSeq // Homo sapiens G protein-coupled receptor 26 (GPR26), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000284674 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:123666355:123694607:1 gene:ENSG00000154478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC112011 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 26, mRNA (cDNA clone MGC:138216 IMAGE:8327479), complete cds. // chr10 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// BC113462 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 26, mRNA (cDNA clone MGC:142022 IMAGE:8322514), complete cds. // chr10 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000026271 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:123666408:123688160:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0
ENST00000362596 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:124766196:124766297:1 gene:ENSG00000199466 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT016858 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_032182 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 175, member B (FAM175B), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000298492 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:124801785:124836670:1 gene:ENSG00000165660 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK296677 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60642 complete cds. // chr10 // 86 // 81 // 19 // 22 // 0 /// BC008999 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 175, member B, mRNA (cDNA clone MGC:17346 IMAGE:2900632), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000028064 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:124819384:124834971:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0
NM_017580 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, RAN-binding domain containing 1 (ZRANB1), mRNA. // chr10 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000359653 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:124942123:124988189:1 gene:ENSG00000019995 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// BC048281 // GenBank HTC // Homo sapiens zinc finger, RAN-binding domain containing 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5188569), with apparent retained intron. // chr10 // 91 // 34 // 10 // 11 // 0 /// AK302810 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55914 complete cds, highly similar to Zinc finger Ran-binding domain-containing protein 1. // chr10 // 72 // 72 // 23 // 32 // 1 /// GENSCAN00000028080 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:124943175:124984992:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 34 // 11 // 11 // 0
NM_001290223 // RefSeq // Homo sapiens dedicator of cytokinesis 1 (DOCK1), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 98 // 98 // 58 // 59 // 0 /// NM_001380 // RefSeq // Homo sapiens dedicator of cytokinesis 1 (DOCK1), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 98 // 98 // 58 // 59 // 0 /// XM_006717682 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens dedicator of cytokinesis 1 (DOCK1), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 48 // 29 // 29 // 0 /// XM_006717683 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens dedicator of cytokinesis 1 (DOCK1), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 45 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000280333 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:126905409:127452517:1 gene:ENSG00000150760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 98 // 59 // 59 // 0 /// BC146857 // GenBank // Homo sapiens dedicator of cytokinesis 1, mRNA (cDNA clone MGC:181960 IMAGE:9056785), complete cds. // chr10 // 97 // 97 // 56 // 58 // 0 /// BX648342 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686I17170 (from clone DKFZp686I17170). // chr10 // 93 // 50 // 28 // 30 // 0 /// D50857 // GenBank // Homo sapiens mRNA for DOCK180 protein, complete cds. // chr10 // 97 // 97 // 56 // 58 // 0 /// GENSCAN00000030220 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:127416586:127451427:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 18 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000030225 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:127372990:127409189:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 13 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000030227 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:126965423:127067903:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 35 // 21 // 21 // 0
NONHSAT016945 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_207426 // RefSeq // Homo sapiens forkhead box I2 (FOXI2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000388920 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:127737235:127741186:1 gene:ENSG00000186766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC137296 // GenBank // Homo sapiens forkhead box I2, mRNA (cDNA clone IMAGE:9021293), complete cds. // chr10 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// BC137297 // GenBank // Homo sapiens forkhead box I2, mRNA (cDNA clone IMAGE:9021294), complete cds. // chr10 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000030221 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:127697274:127738965:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 90 // 90 // 26 // 29 // 1
NR_044994 // RefSeq // Homo sapiens CTAGE family, member 7, pseudogene (CTAGE7P), non-coding RNA. // chr10 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000435712 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:130106046:130108481:1 gene:ENSG00000233122 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr10 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// BC036527 // GenBank // Homo sapiens CTAGE family pseudogene, mRNA (cDNA clone IMAGE:5270059). // chr10 // 95 // 95 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000025948 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:130088673:130175789:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 57 // 12 // 12 // 0
NM_001199868 // RefSeq // Homo sapiens glutaredoxin 3 (GLRX3), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// NM_006541 // RefSeq // Homo sapiens glutaredoxin 3 (GLRX3), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 67 // 12 // 12 // 0 /// XM_005252657 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens glutaredoxin 3 (GLRX3), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 61 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000331244 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:130136399:130179664:1 gene:ENSG00000108010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 61 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000481034 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:130136399:130184521:1 gene:ENSG00000108010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr10 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0 /// AF118649 // GenBank // Homo sapiens PKCq-interacting protein PICOT (PICOT) mRNA, complete cds. // chr10 // 82 // 61 // 9 // 11 // 0 /// AF118652 // GenBank // Homo sapiens PKCq-interacting protein PICOT (PICOT) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 61 // 11 // 11 // 0 /// AJ010841 // GenBank // Homo sapiens mRNA for putative thioredoxin-like protein. // chr10 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0 /// BC005289 // GenBank // Homo sapiens glutaredoxin 3, mRNA (cDNA clone MGC:12349 IMAGE:3686411), complete cds. // chr10 // 100 // 61 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000368644 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:130136399:130182881:1 gene:ENSG00000108010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 83 // 83 // 15 // 18 // 1 /// AK021926 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ11864 fis, clone HEMBA1006941, highly similar to Thioredoxin-like protein 2. // chr10 // 82 // 61 // 9 // 11 // 0 /// GENSCAN00000025948 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:130088673:130175789:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 56 // 56 // 10 // 18 // 1
ENST00000411065 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:130505106:130505201:1 gene:ENSG00000222997 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT017042 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001105521 // RefSeq // Homo sapiens Janus kinase and microtubule interacting protein 3 (JAKMIP3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 65 // 65 // 0 /// XM_006717780 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens Janus kinase and microtubule interacting protein 3 (JAKMIP3), transcript variant X7, mRNA. // chr10 // 100 // 94 // 61 // 61 // 0 /// ENST00000298622 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:132104671:132184809:1 gene:ENSG00000188385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 65 // 65 // 0 /// ENST00000477275 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:132143716:132184809:1 gene:ENSG00000188385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 49 // 32 // 32 // 0 /// AL832756 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686B1027 (from clone DKFZp686B1027). // chr10 // 97 // 49 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000047321 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:132104809:132176513:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 88 // 88 // 57 // 65 // 1
NM_138499 // RefSeq // Homo sapiens PWWP domain containing 2B (PWWP2B), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000305233 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:132397168:132417863:1 gene:ENSG00000171813 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC068574 // GenBank // Homo sapiens PWWP domain containing 2B, mRNA (cDNA clone MGC:87543 IMAGE:30344364), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_001098637 // RefSeq // Homo sapiens PWWP domain containing 2B (PWWP2B), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 93 // 93 // 26 // 28 // 1 /// AK096940 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39621 fis, clone SMINT2001158. // chr10 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// GENSCAN00000047287 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:132397227:132425959:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
NM_173541 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 91 (C10orf91), mRNA. // chr10 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000392630 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:132445189:132449408:1 gene:ENSG00000180066 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC030794 // GenBank // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 91, mRNA (cDNA clone MGC:10092 IMAGE:3898116), complete cds. // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000321248 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:132445189:132449386:1 gene:ENSG00000180066 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1 /// ENST00000490765 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:132444327:132447920:1 gene:ENSG00000180066 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONHSAT017075 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr10 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001083909 // RefSeq // Homo sapiens G protein-coupled receptor 123 (GPR123), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000392607 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:10:133087905:133131675:1 gene:ENSG00000197177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000607359 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:10:133070929:133131675:1 gene:ENSG00000197177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AY181241 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 123 (GPR123) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// EF536972 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 123 (GPR123) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000023463 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:133091471:133117668:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000023481 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:133056221:133082862:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_152643 // RefSeq // Homo sapiens kinase non-catalytic C-lobe domain (KIND) containing 1 (KNDC1), mRNA. // chr10 // 98 // 98 // 45 // 46 // 0 /// ENST00000304613 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:133160447:133226412:1 gene:ENSG00000171798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 98 // 98 // 45 // 46 // 0 /// ENST00000368571 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:10:133167184:133207204:1 gene:ENSG00000171798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 53 // 25 // 25 // 0 /// AB000781 // GenBank // Homo sapiens hucep-9 mRNA for cerebral protein-9, complete cds. // chr10 // 88 // 89 // 37 // 42 // 0 /// AB051555 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1768 protein, partial cds. // chr10 // 100 // 53 // 25 // 25 // 0 /// AK074179 // GenBank // Homo sapiens mRNA for FLJ00252 protein. // chr10 // 100 // 28 // 13 // 13 // 0 /// AK090457 // GenBank // Homo sapiens mRNA for FLJ00378 protein. // chr10 // 93 // 62 // 27 // 29 // 0 /// AK294170 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56427 complete cds, highly similar to Homo sapiens kinase non-catalytic C-lobe domain containing 1, transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 94 // 36 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000023471 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:133166747:133224890:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 85 // 40 // 40 // 0
NM_003577 // RefSeq // Homo sapiens undifferentiated embryonic cell transcription factor 1 (UTF1), mRNA. // chr10 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000304477 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:133230274:133231558:1 gene:ENSG00000171794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AB011076 // GenBank // Homo sapiens UTF1 mRNA for undifferentiated embryonic cell transcription factor 1, complete cds. // chr10 // 83 // 92 // 20 // 24 // 0 /// GENSCAN00000023460 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:133230289:133240306:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_014468 // RefSeq // Homo sapiens VENT homeobox (VENTX), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000325980 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:133237404:133241929:1 gene:ENSG00000151650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AF068006 // GenBank // Homo sapiens hemopoietic progenitor homeobox protein VENTX2 (VENTX2) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC108915 // GenBank // Homo sapiens VENT homeobox homolog (Xenopus laevis), mRNA (cDNA clone MGC:119910 IMAGE:40015551), complete cds. // chr10 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// BC108916 // GenBank // Homo sapiens VENT homeobox homolog (Xenopus laevis), mRNA (cDNA clone MGC:119911 IMAGE:40015553), complete cds. // chr10 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000023460 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:133230289:133240306:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 73 // 73 // 16 // 22 // 1
NR_002934 // RefSeq // Homo sapiens scavenger receptor protein family member (SCART1), non-coding RNA. // chr10 // 86 // 71 // 19 // 22 // 0 /// ENST00000463137 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:133453946:133469183:1 gene:ENSG00000214279 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:retained_intron // chr10 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000482993 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:133453928:133468449:1 gene:ENSG00000214279 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:retained_intron // chr10 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000488261 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:133456237:133523558:1 gene:ENSG00000214279 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:retained_intron // chr10 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// AK127253 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ45320 fis, clone BRHIP3005944, weakly similar to Antigen WC1.1 precursor. // chr10 // 95 // 71 // 21 // 22 // 0 /// AK160367 // GenBank // Homo sapiens mRNA for FLJ00268 protein. // chr10 // 86 // 71 // 19 // 22 // 0 /// BC038300 // GenBank // Homo sapiens scavenger receptor protein family member, mRNA (cDNA clone IMAGE:5265018). // chr10 // 86 // 71 // 19 // 22 // 0 /// ENST00000462252 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:133464232:133468991:1 gene:ENSG00000214279 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:retained_intron // chr10 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1 /// AK126713 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44759 fis, clone BRACE3031372. // chr10 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1 /// NONHSAT017156 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr10 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000023455 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:133453998:133481537:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1
NM_177987 // RefSeq // Homo sapiens tubulin, beta 8 class VIII (TUBB8), mRNA. // chr10 // 100 // 75 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000561967 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:10:47057:49293:-1 gene:ENSG00000261456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 83 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000562809 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:10:47494:49269:-1 gene:ENSG00000261456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 50 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000563456 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:47705:49269:-1 gene:ENSG00000261456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr10 // 100 // 58 // 7 // 7 // 0 /// ENST00000564130 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:10:46892:50113:-1 gene:ENSG00000261456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000567466 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:47578:49521:-1 gene:ENSG00000261456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr10 // 100 // 50 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000568584 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:46953:49589:-1 gene:ENSG00000261456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000568866 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:10:46953:49277:-1 gene:ENSG00000261456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 83 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000008998 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:47057:49238:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 75 // 9 // 9 // 0
ENST00000391029 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:154831:154943:-1 gene:ENSG00000212331 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr10 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT010852 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_014974 // RefSeq // Homo sapiens DIP2 disco-interacting protein 2 homolog C (Drosophila) (DIP2C), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000280886 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:274190:689666:-1 gene:ENSG00000151240 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000381496 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:274190:486558:-1 gene:ENSG00000151240 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 41 // 41 // 0 /// AK126063 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44075 fis, clone TESTI4038339, highly similar to Disco-interacting protein 2 homolog C. // chr10 // 100 // 59 // 26 // 26 // 0 /// AK298353 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50825 complete cds, highly similar to Disco-interacting protein 2 homolog C. // chr10 // 100 // 18 // 8 // 8 // 0 /// AK309715 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99756. // chr10 // 100 // 48 // 21 // 21 // 0 /// BC048327 // GenBank // Homo sapiens DIP2 disco-interacting protein 2 homolog C (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:5163354), partial cds. // chr10 // 100 // 25 // 11 // 11 // 0 /// BC063313 // GenBank // Homo sapiens DIP2 disco-interacting protein 2 homolog C (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:71829 IMAGE:30349267), complete cds. // chr10 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// AK310018 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17060. // chr10 // 30 // 30 // 13 // 44 // 1 /// AK310613 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17655. // chr10 // 27 // 27 // 12 // 44 // 1 /// GENSCAN00000009017 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:277325:399933:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 66 // 66 // 29 // 44 // 1
ENST00000470784 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:430239:430504:-1 gene:ENSG00000239822 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT010858 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_015155 // RefSeq // Homo sapiens La ribonucleoprotein domain family, member 4B (LARP4B), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_005252431 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens La ribonucleoprotein domain family, member 4B (LARP4B), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_005252435 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens La ribonucleoprotein domain family, member 4B (LARP4B), transcript variant X5, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006717436 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens La ribonucleoprotein domain family, member 4B (LARP4B), transcript variant X6, mRNA. // chr10 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000316157 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:809542:885762:-1 gene:ENSG00000107929 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC131630 // GenBank // Homo sapiens La ribonucleoprotein domain family, member 5, mRNA (cDNA clone MGC:149825 IMAGE:40118844), complete cds. // chr10 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC152443 // GenBank // Homo sapiens La ribonucleoprotein domain family, member 5, mRNA (cDNA clone MGC:176689 IMAGE:8862568), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000612396 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:806914:931705:-1 gene:ENSG00000107929 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK292946 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75864 complete cds, highly similar to Homo sapiens La ribonucleoprotein domain family, member 5 (LARP5), mRNA. // chr10 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000009006 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:812926:873144:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_033261 // RefSeq // Homo sapiens isopentenyl-diphosphate delta isomerase 2 (IDI2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000277517 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:1018907:1025859:-1 gene:ENSG00000148377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF271725 // GenBank // Homo sapiens isopentenyl diphosphate dimethylallyl diphosphate isomerase 2 (IDI2) mRNA, complete cds. // chr10 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// BC017778 // GenBank // Homo sapiens isopentenyl-diphosphate delta isomerase 2, mRNA (cDNA clone MGC:22262 IMAGE:4291149), complete cds. // chr10 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007841 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:1019517:1044140:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_004508 // RefSeq // Homo sapiens isopentenyl-diphosphate delta isomerase 1 (IDI1), mRNA. // chr10 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// XM_005252445 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens isopentenyl-diphosphate delta isomerase 1 (IDI1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000381344 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:1039908:1049170:-1 gene:ENSG00000067064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000491735 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:1040903:1049103:-1 gene:ENSG00000067064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 43 // 13 // 13 // 0 /// AF271720 // GenBank // Homo sapiens isopentenyl diphosphate dimethylallyl diphosphate isomerase 1 (IDI1) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// AK303669 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56330 complete cds, highly similar to Homo sapiens isopentenyl-diphosphate delta isomerase 1 (IDI1), mRNA. // chr10 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// BC006999 // GenBank // Homo sapiens isopentenyl-diphosphate delta isomerase 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3683381), partial cds. // chr10 // 92 // 80 // 22 // 24 // 0 /// BC057827 // GenBank // Homo sapiens isopentenyl-diphosphate delta isomerase 1, mRNA (cDNA clone MGC:71798 IMAGE:30337530), complete cds. // chr10 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// BT006761 // GenBank // Homo sapiens isopentenyl-diphosphate delta isomerase mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// BX537663 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp779D065 (from clone DKFZp779D065). // chr10 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// GENSCAN00000007841 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:1019517:1044140:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
AY423624 // GenBank // Homo sapiens protein transactivated by hepatitis B virus E antigen mRNA, complete cds. // chr10 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0
NR_026743 // RefSeq // Homo sapiens aldo-keto reductase family 1, member C6, pseudogene (AKR1C6P), non-coding RNA. // chr10 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000432950 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:4871901:4891975:-1 gene:ENSG00000151631 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr10 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// AB037902 // GenBank // Homo sapiens truncated AKR mRNA for truncated aldo-keto reductase type A, complete cds. // chr10 // 95 // 100 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000011259 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:4860319:4891509:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 74 // 14 // 14 // 0
ENST00000459536 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:5093408:5093543:-1 gene:ENSG00000239142 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr10 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// NONHSAT011138 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0
NR_027916 // RefSeq // Homo sapiens aldo-keto reductase family 1, member C-like 1 (AKR1CL1), non-coding RNA. // chr10 // 88 // 76 // 14 // 16 // 0 /// ENST00000578467 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:5154460:5185187:-1 gene:ENSG00000264006 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 88 // 76 // 14 // 16 // 0 /// ENST00000584929 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:5154143:5185104:-1 gene:ENSG00000264006 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr10 // 88 // 76 // 14 // 16 // 0 /// AK131335 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ16347 fis, clone TESTI2036288, moderately similar to PROSTAGLANDIN-F SYNTHASE 1 (EC 1.1.1.188). // chr10 // 88 // 76 // 14 // 16 // 0 /// BC101204 // GenBank // Homo sapiens aldo-keto reductase family 1, member C-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:120107 IMAGE:40021857), complete cds. // chr10 // 100 // 52 // 11 // 11 // 0 /// BC101205 // GenBank // Homo sapiens aldo-keto reductase family 1, member C-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:120109 IMAGE:40021860), complete cds. // chr10 // 91 // 52 // 10 // 11 // 0 /// GENSCAN00000015808 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:5122081:5185101:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 89 // 86 // 16 // 18 // 0 /// TCONS_00017683-XLOC_008705 // Rinn lincRNA // linc-AKR1C2-2 chr10:-:5196654-5227150 // chr10 // 100 // 76 // 16 // 16 // 0
NM_001171864 // RefSeq // Homo sapiens tubulin, alpha-like 3 (TUBAL3), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NM_024803 // RefSeq // Homo sapiens tubulin, alpha-like 3 (TUBAL3), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000380419 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:5393098:5404830:-1 gene:ENSG00000178462 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000479328 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:5393269:5404828:-1 gene:ENSG00000178462 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// AK025318 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ21665 fis, clone COL08913. // chr10 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// AK296616 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55145 complete cds, highly similar to Homo sapiens tubulin, alpha-like 3 (TUBAL3), mRNA. // chr10 // 79 // 68 // 15 // 19 // 0 /// BC098247 // GenBank // Homo sapiens tubulin, alpha-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:119346 IMAGE:40005930), complete cds. // chr10 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// BC099716 // GenBank // Homo sapiens tubulin, alpha-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:119349 IMAGE:40005934), complete cds. // chr10 // 88 // 93 // 23 // 26 // 0 /// BC105634 // GenBank // Homo sapiens tubulin, alpha-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:119347 IMAGE:40005931), complete cds. // chr10 // 88 // 93 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000015821 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:5393517:5404792:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
NM_017422 // RefSeq // Homo sapiens calmodulin-like 5 (CALML5), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000380332 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:5498697:5499555:-1 gene:ENSG00000178372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF172852 // GenBank // Homo sapiens calmodulin-like skin protein (CLSP) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC039172 // GenBank // Homo sapiens calmodulin-like 5, mRNA (cDNA clone MGC:20994 IMAGE:4753280), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015799 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:5498998:5499438:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
NM_024701 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat and SOCS box containing 13 (ASB13), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// NR_024581 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat and SOCS box containing 13 (ASB13), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr10 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// NR_037164 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat and SOCS box containing 13 (ASB13), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000357700 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:5638868:5666578:-1 gene:ENSG00000196372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000459912 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:5638868:5666578:-1 gene:ENSG00000196372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr10 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000479033 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:5638868:5666595:-1 gene:ENSG00000196372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// AK292071 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78731 complete cds. // chr10 // 96 // 73 // 23 // 24 // 0 /// BC012056 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat and SOCS box-containing 13, mRNA (cDNA clone MGC:19879 IMAGE:4552643), complete cds. // chr10 // 94 // 97 // 30 // 32 // 0 /// CR457302 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834C1113D for gene ASB13, ankyrin repeat and SOCS box-containing 13; complete cds, incl. stopcodon. // chr10 // 100 // 39 // 13 // 13 // 0 /// XM_006717507 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ankyrin repeat and SOCS box containing 13 (ASB13), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1 /// GENSCAN00000015796 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:5635494:5666789:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
NM_000417 // RefSeq // Homo sapiens interleukin 2 receptor, alpha (IL2RA), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000256876 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:6012797:6062290:-1 gene:ENSG00000134460 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 91 // 77 // 21 // 23 // 0 /// ENST00000379959 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:6010689:6062325:-1 gene:ENSG00000134460 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000379954 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:6012071:6062309:-1 gene:ENSG00000134460 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 83 // 83 // 25 // 30 // 1 /// K03122 // GenBank // Human interleukin-2 receptor mRNA (short form), complete cds. // chr10 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// GENSCAN00000034447 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:5999766:6054089:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
ENST00000516113 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:6017054:6017194:-1 gene:ENSG00000251922 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONHSAT011201 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
ENST00000459607 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:6245731:6245831:-1 gene:ENSG00000238366 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT011220 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001018039 // RefSeq // Homo sapiens Scm-like with four mbt domains 2 (SFMBT2), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NM_001029880 // RefSeq // Homo sapiens Scm-like with four mbt domains 2 (SFMBT2), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000361972 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:7158624:7409341:-1 gene:ENSG00000198879 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000397167 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:7158624:7411486:-1 gene:ENSG00000198879 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC152430 // GenBank // Homo sapiens Scm-like with four mbt domains 2, mRNA (cDNA clone MGC:176667 IMAGE:8862546), complete cds. // chr10 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000000269 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:7220286:7400670:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// GENSCAN00000000296 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:7163770:7207890:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
ENST00000384722 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:7486703:7486809:-1 gene:ENSG00000207453 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT011286 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_024256 // RefSeq // Homo sapiens GATA3 antisense RNA 1 (GATA3-AS1), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000355358 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:8050450:8053484:-1 gene:ENSG00000197308 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NR_104327 // RefSeq // Homo sapiens GATA3 antisense RNA 1 (GATA3-AS1), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr10 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// ENST00000458727 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:8052243:8053449:-1 gene:ENSG00000243350 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr10 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// NONHSAT011305 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT011307 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr10 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT011308 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr10 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// TCONS_00017684-XLOC_008724 // Rinn lincRNA // linc-KIN-5 chr10:-:8092412-8095447 // chr10 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// TCONS_00017728-XLOC_008724 // Rinn lincRNA // linc-KIN-5 chr10:-:8092412-8095447 // chr10 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT011314 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr10 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// TCONS_00017730-XLOC_008724 // Rinn lincRNA // linc-KIN-5 chr10:-:8094205-8095412 // chr10 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
ENST00000391203 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:8656716:8656831:-1 gene:ENSG00000212505 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT011329 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENST00000379256 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:11316834:11319884:-1 gene:ENSG00000181800 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK097813 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ40494 fis, clone TESTI2044418. // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000006642 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:11315057:11320418:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_001080491 // RefSeq // Homo sapiens USP6 N-terminal like (USP6NL), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 79 // 31 // 31 // 0 /// NM_014688 // RefSeq // Homo sapiens USP6 N-terminal like (USP6NL), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000277575 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:11460510:11532275:-1 gene:ENSG00000148429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 79 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000379237 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:11460510:11573737:-1 gene:ENSG00000148429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 79 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000609104 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:11453946:11611754:-1 gene:ENSG00000148429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// AB449916 // GenBank // Homo sapiens USP6NL mRNA for USP6 N-terminal like, complete cds. // chr10 // 100 // 69 // 27 // 27 // 0 /// AK292944 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75834 complete cds, highly similar to Homo sapiens USP6 N-terminal like, transcript variant 4, mRNA. // chr10 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// BC042943 // GenBank // Homo sapiens USP6 N-terminal like, mRNA (cDNA clone MGC:41831 IMAGE:5296060), complete cds. // chr10 // 100 // 87 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000606752 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:11564127:11611666:-1 gene:ENSG00000148429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 21 // 21 // 8 // 39 // 1 /// BC010351 // GenBank // Homo sapiens USP6 N-terminal like, mRNA (cDNA clone IMAGE:4047207), partial cds. // chr10 // 21 // 21 // 8 // 39 // 1 /// GENSCAN00000006655 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:11441195:11573678:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 41 // 41 // 16 // 39 // 1
ENST00000606801 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:12116280:12116379:-1 gene:ENSG00000272507 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001282658 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 3 (CCDC3), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 97 // 83 // 28 // 29 // 0 /// NM_031455 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 3 (CCDC3), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 97 // 100 // 34 // 35 // 0 /// ENST00000378825 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:12896625:13001697:-1 gene:ENSG00000151468 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000378839 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:10:12896627:13099652:-1 gene:ENSG00000151468 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// AK123393 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ41399 fis, clone BRCOC2019903. // chr10 // 92 // 74 // 24 // 26 // 0 /// BC051334 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:59716 IMAGE:6302570), complete cds. // chr10 // 91 // 100 // 32 // 35 // 0
ENST00000391197 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:12924679:12924785:-1 gene:ENSG00000212499 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT011467 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_145314 // RefSeq // Homo sapiens upper zone of growth plate and cartilage matrix associated (UCMA), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000378681 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:13221767:13234331:-1 gene:ENSG00000165623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000463405 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:10:13221767:13234334:-1 gene:ENSG00000165623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC018068 // GenBank // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 49, mRNA (cDNA clone MGC:26670 IMAGE:4799653), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000038290 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:13222103:13234258:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0
ENST00000365638 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:13511206:13511313:-1 gene:ENSG00000202508 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT011493 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001029954 // RefSeq // Homo sapiens cerebral dopamine neurotrophic factor (CDNF), mRNA. // chr10 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000378441 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:14819531:14837922:-1 gene:ENSG00000185267 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000465530 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:14819980:14838072:-1 gene:ENSG00000185267 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000466269 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:14819888:14836290:-1 gene:ENSG00000185267 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 91 // 41 // 10 // 11 // 0 /// BC133042 // GenBank // Homo sapiens arginine-rich, mutated in early stage tumors-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:164673 IMAGE:40147064), complete cds. // chr10 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// BC133044 // GenBank // Homo sapiens arginine-rich, mutated in early stage tumors-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:164675 IMAGE:40147066), complete cds. // chr10 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000378442 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:14819250:14838575:-1 gene:ENSG00000185267 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// BC037872 // GenBank // Homo sapiens arginine-rich, mutated in early stage tumors-like 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5273319), complete cds. // chr10 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// AK301259 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52647 complete cds, highly similar to Homo sapiens arginine-rich, mutated in early stage tumors-like 1 (ARMETL1), mRNA. // chr10 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
ENST00000502808 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:14999050:15000055:-1 gene:ENSG00000228547 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr10 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
ENST00000382617 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:15007861:15008884:-1 gene:ENSG00000182531 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr10 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// XR_242728 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens uncharacterized LOC101928562 (LOC101928562), ncRNA. // chr10 // 62 // 62 // 8 // 13 // 1 /// XR_252701 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens uncharacterized LOC101928562 (LOC101928562), ncRNA. // chr10 // 62 // 62 // 8 // 13 // 1 /// BX648694 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686D1039 (from clone DKFZp686D1039). // chr10 // 62 // 62 // 8 // 13 // 1
NM_001039844 // RefSeq // Homo sapiens acyl-CoA binding domain containing 7 (ACBD7), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000356189 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:15077523:15088776:-1 gene:ENSG00000176244 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// BC029526 // GenBank // Homo sapiens acyl-Coenzyme A binding domain containing 7, mRNA (cDNA clone MGC:33893 IMAGE:5301753), complete cds. // chr10 // 93 // 61 // 13 // 14 // 0 /// ENST00000496890 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:15078487:15088481:-1 gene:ENSG00000176244 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 39 // 39 // 9 // 23 // 1 /// GENSCAN00000007628 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:15078530:15088864:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 43 // 43 // 10 // 23 // 1
ENST00000378207 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:15095385:15097319:-1 gene:ENSG00000176236 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 58 // 21 // 21 // 0 /// AK314131 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ94828. // chr10 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// BC029034 // GenBank // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 111, mRNA (cDNA clone MGC:35468 IMAGE:5194035), complete cds. // chr10 // 100 // 58 // 21 // 21 // 0 /// BC036401 // GenBank // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 111, mRNA (cDNA clone IMAGE:5264776). // chr10 // 82 // 47 // 14 // 17 // 0 /// GENSCAN00000007634 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:15093077:15097989:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 92 // 69 // 23 // 25 // 0
NM_004808 // RefSeq // Homo sapiens N-myristoyltransferase 2 (NMT2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000378150 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:15108294:15168628:-1 gene:ENSG00000152465 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000378165 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:15107866:15168693:-1 gene:ENSG00000152465 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF043325 // GenBank // Homo sapiens N-myristoyltransferase 2 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// AK295277 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52915 complete cds, highly similar to Glycylpeptide N-tetradecanoyltransferase 2 (EC 2.3.1.97). // chr10 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// AK302101 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54198 complete cds, highly similar to Glycylpeptide N-tetradecanoyltransferase 2 (EC 2.3.1.97). // chr10 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// BC006376 // GenBank // Homo sapiens N-myristoyltransferase 2, mRNA (cDNA clone MGC:12700 IMAGE:4299115), complete cds. // chr10 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// BT007024 // GenBank // Homo sapiens N-myristoyltransferase 2 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000478580 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:15132817:15141353:-1 gene:ENSG00000152465 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// GENSCAN00000007627 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:15108485:15149589:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1
NM_001010924 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 171, member A1 (FAM171A1), mRNA. // chr10 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000378116 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:15211643:15371059:-1 gene:ENSG00000148468 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000455654 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:15248639:15371062:-1 gene:ENSG00000148468 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 28 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000477161 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:15214171:15248707:-1 gene:ENSG00000148468 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 89 // 25 // 8 // 9 // 0 /// AY683003 // GenBank // Homo sapiens astroprincin mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC109302 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 171, member A1, mRNA (cDNA clone MGC:130014 IMAGE:40035211), complete cds. // chr10 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// BC109303 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 171, member A1, mRNA (cDNA clone MGC:130015 IMAGE:40035213), complete cds. // chr10 // 96 // 78 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000007635 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:15200105:15296006:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 61 // 61 // 22 // 36 // 1
NM_001291494 // RefSeq // Homo sapiens integrin, alpha 8 (ITGA8), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// NM_003638 // RefSeq // Homo sapiens integrin, alpha 8 (ITGA8), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000378076 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:15513949:15720125:-1 gene:ENSG00000077943 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000007631 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:15517158:15714054:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0
ENST00000364390 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:16207821:16207927:-1 gene:ENSG00000201260 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT011589 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NONHSAT011595 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_001010908 // RefSeq // Homo sapiens complement component 1, q subcomponent-like 3 (C1QL3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000298943 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:16513743:16522005:-1 gene:ENSG00000165985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC127716 // GenBank // Homo sapiens complement component 1, q subcomponent-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:157813 IMAGE:40127920), complete cds. // chr10 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// BC127717 // GenBank // Homo sapiens complement component 1, q subcomponent-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:157814 IMAGE:40127921), complete cds. // chr10 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000619991 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:16514467:16521145:-1 gene:ENSG00000165985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000037642 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:16514528:16521065:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_001081 // RefSeq // Homo sapiens cubilin (intrinsic factor-cobalamin receptor) (CUBN), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 77 // 77 // 0 /// ENST00000377833 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:16823964:17129831:-1 gene:ENSG00000107611 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 77 // 77 // 0 /// AF034611 // GenBank // Homo sapiens intrinsic factor-B12 receptor precursor, mRNA, complete cds. // chr10 // 95 // 100 // 73 // 77 // 0 /// AK310404 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17446. // chr10 // 100 // 19 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000037643 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:16832521:16952262:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 40 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000039651 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:17007362:17139185:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 36 // 28 // 28 // 0
NM_001004470 // RefSeq // Homo sapiens ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 6 (ST8SIA6), mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000377602 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:17319874:17454330:-1 gene:ENSG00000148488 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB062101 // GenBank // Homo sapiens ST8Sia VI mRNA for alpha-2,8-sialyltransferase, complete cds. // chr10 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC137102 // GenBank // Homo sapiens ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 6, mRNA (cDNA clone MGC:168722 IMAGE:9021099), complete cds. // chr10 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC137103 // GenBank // Homo sapiens ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 6, mRNA (cDNA clone MGC:168723 IMAGE:9021100), complete cds. // chr10 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC144472 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:9052999. // chr10 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000039664 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:17320878:17348698:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0
NM_014241 // RefSeq // Homo sapiens protein tyrosine phosphatase-like (proline instead of catalytic arginine), member A (PTPLA), mRNA. // chr10 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// XR_428651 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens protein tyrosine phosphatase-like (proline instead of catalytic arginine), member A (PTPLA), transcript variant X3, misc_RNA. // chr10 // 92 // 40 // 11 // 12 // 0 /// ENST00000471481 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:17594209:17603828:-1 gene:ENSG00000165996 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr10 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000498812 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:17590275:17603744:-1 gene:ENSG00000165996 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr10 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// AF114494 // GenBank // Homo sapiens putative tyrosine phosphatase (PTPLA) mRNA, complete cds. // chr10 // 86 // 47 // 12 // 14 // 0 /// BC010353 // GenBank // Homo sapiens protein tyrosine phosphatase-like (proline instead of catalytic arginine), member A, mRNA (cDNA clone MGC:13358 IMAGE:4293342), complete cds. // chr10 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// XM_005252641 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens protein tyrosine phosphatase-like (proline instead of catalytic arginine), member A (PTPLA), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// ENST00000361271 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:17589032:17617377:-1 gene:ENSG00000165996 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// AY455942 // GenBank // Homo sapiens cementum attachment protein mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr10 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// NONHSAT011623 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr10 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0
NM_182543 // RefSeq // Homo sapiens NOP2/Sun domain family, member 6 (NSUN6), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_005252397 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens NOP2/Sun domain family, member 6 (NSUN6), transcript variant X4, mRNA. // chr10 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000377304 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:18545561:18651622:-1 gene:ENSG00000241058 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC035778 // GenBank // Homo sapiens NOL1/NOP2/Sun domain family, member 6, mRNA (cDNA clone MGC:46270 IMAGE:5590372), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000001805 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:18584979:18667291:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 39 // 39 // 14 // 36 // 1
ENST00000516192 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:19633683:19633812:-1 gene:ENSG00000252001 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT011664 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000517023 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:19792998:19793101:-1 gene:ENSG00000252832 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT011674 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001010896 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 113 (C10orf113), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NM_001177483 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 113 (C10orf113), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000529198 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:21125763:21146559:-1 gene:ENSG00000204683 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000534331 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:21125763:21146559:-1 gene:ENSG00000204683 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC140744 // GenBank // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 113, mRNA (cDNA clone MGC:176421 IMAGE:9021612), complete cds. // chr10 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0
NM_001010911 // RefSeq // Homo sapiens cancer susceptibility candidate 10 (CASC10), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XR_428637 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens cancer susceptibility candidate 10 (CASC10), transcript variant X1, misc_RNA. // chr10 // 100 // 73 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000377113 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:21492658:21497262:-1 gene:ENSG00000204682 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC130594 // GenBank // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 114, mRNA (cDNA clone MGC:163466 IMAGE:40146625), complete cds. // chr10 // 100 // 55 // 12 // 12 // 0 /// BC132974 // GenBank // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 114, mRNA (cDNA clone MGC:164605 IMAGE:40146996), complete cds. // chr10 // 100 // 55 // 12 // 12 // 0
NM_207371 // RefSeq // Homo sapiens SKI/DACH domain containing 1 (SKIDA1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000444772 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:21515016:21517919:-1 gene:ENSG00000180592 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 71 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000449193 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:21513478:21525682:-1 gene:ENSG00000180592 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// AB234866 // GenBank // Homo sapiens DLN-1 mRNA for DLN-1, complete cds. // chr10 // 100 // 71 // 30 // 30 // 0 /// AK299717 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56759 complete cds. // chr10 // 100 // 31 // 13 // 13 // 0 /// BC142633 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:40147742. // chr10 // 100 // 19 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000036572 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:21515096:21517822:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 67 // 28 // 28 // 0 /// AK303207 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56186 complete cds. // chr10 // 95 // 48 // 19 // 20 // 0
ENST00000384617 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:21564471:21564577:-1 gene:ENSG00000207347 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT011720 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENST00000364520 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:21661635:21661741:-1 gene:ENSG00000201390 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT011722 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_022365 // RefSeq // Homo sapiens DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 1 (DNAJC1), mRNA. // chr10 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000376946 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:21920610:22003769:-1 gene:ENSG00000136770 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 41 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000376980 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:21756537:22003725:-1 gene:ENSG00000136770 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000476103 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:21919889:22003585:-1 gene:ENSG00000136770 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr10 // 100 // 35 // 12 // 12 // 0 /// AY225122 // GenBank // Homo sapiens MTJ1-like protein mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// BC110894 // GenBank // Homo sapiens DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:131954 IMAGE:5164559), complete cds. // chr10 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000036565 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:21756687:21953783:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0
NM_001199938 // RefSeq // Homo sapiens endogenous Bornavirus-like nucleoprotein 1 (EBLN1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000422359 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:22208814:22210021:-1 gene:ENSG00000223601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000010032 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:22208883:22209983:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// TCONS_l2_00003425-XLOC_l2_001879 // Broad TUCP // linc-DNAJC1 chr10:-:22497809-22501886 // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_005028 // RefSeq // Homo sapiens phosphatidylinositol-5-phosphate 4-kinase, type II, alpha (PIP4K2A), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000323883 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:10:22536738:22591713:-1 gene:ENSG00000150867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000376573 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:22534849:22714555:-1 gene:ENSG00000150867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000422321 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:22567537:22609717:-1 gene:ENSG00000150867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000545335 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:10:22537015:22714108:-1 gene:ENSG00000150867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AK294817 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53867 complete cds, highly similar to Phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase type-2 alpha (EC 2.7.1.68). // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AK294867 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51838 complete cds, highly similar to Phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase type-2 alpha (EC 2.7.1.68). // chr10 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// BC018034 // GenBank // Homo sapiens phosphatidylinositol-5-phosphate 4-kinase, type II, alpha, mRNA (cDNA clone MGC:26205 IMAGE:4817357), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U14957 // GenBank // Homo sapiens type II phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase 53K isoform (PIPK) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// S78798 // GenBank // 1-phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase isoform C [human, peripheral blood leukocytes, mRNA, 1835 nt]. // chr10 // 70 // 92 // 16 // 23 // 0
NM_153714 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 67 (C10orf67), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000323327 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:23316737:23344845:-1 gene:ENSG00000179133 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC035732 // GenBank // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 67, mRNA (cDNA clone MGC:46732 IMAGE:5729099), complete cds. // chr10 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// ENST00000376500 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:23267195:23343964:-1 gene:ENSG00000179133 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1 /// GENSCAN00000048517 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:23204173:23324168:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1
NONHSAT011770 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AF119913 // GenBank HTC // Homo sapiens PRO3077 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
ENST00000410611 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:25393557:25393844:-1 gene:ENSG00000222543 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT011803 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000515902 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:25819363:25819426:-1 gene:ENSG00000251711 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 94 // 100 // 15 // 16 // 0 /// NONHSAT011814 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 94 // 100 // 15 // 16 // 0
ENST00000383878 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:26790540:26790646:-1 gene:ENSG00000206605 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT011863 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_001256053 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat domain 26 (ANKRD26), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// NM_014915 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat domain 26 (ANKRD26), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// XM_006717429 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ankyrin repeat domain 26 (ANKRD26), transcript variant X7, mRNA. // chr10 // 100 // 65 // 26 // 26 // 0 /// XM_006717430 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ankyrin repeat domain 26 (ANKRD26), transcript variant X8, mRNA. // chr10 // 100 // 73 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000376087 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:27004298:27100492:-1 gene:ENSG00000107890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000436985 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:27004116:27100498:-1 gene:ENSG00000107890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// AK128577 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ46736 fis, clone TRACH3020769, weakly similar to Myosin heavy chain, nonmuscle type B. // chr10 // 100 // 40 // 16 // 16 // 0 /// BC130453 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat domain 26, mRNA (cDNA clone MGC:163325 IMAGE:40146484), complete cds. // chr10 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000017372 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:26964337:27100326:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 70 // 28 // 28 // 0
ENST00000362985 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:27088321:27088427:-1 gene:ENSG00000199855 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT011883 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NR_003525 // RefSeq // Homo sapiens leucine rich repeat containing 37, member A6, pseudogene (LRRC37A6P), non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000284414 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:27247301:27250562:-1 gene:ENSG00000230445 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000448648 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:27246350:27251793:-1 gene:ENSG00000230445 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000017375 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:27249000:27252426:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
ENST00000384406 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:27335501:27335607:-1 gene:ENSG00000207135 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000621236 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR10_1_CTG1:27382801:27382907:-1 gene:ENSG00000273501 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT011902 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001034842 // RefSeq // Homo sapiens patched domain containing 3 (PTCHD3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000438700 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:27398187:27414368:-1 gene:ENSG00000182077 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK126025 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44037 fis, clone TESTI4028823. // chr10 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// BC107139 // GenBank // Homo sapiens patched domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:129888 IMAGE:40026539), complete cds. // chr10 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// JF332167 // GenBank // Homo sapiens PTCHD3 isoform 2 (PTCHD3) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr10 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000610715 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR10_1_CTG1:27445581:27461668:-1 gene:ENSG00000276595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000617711 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR10_1_CTG1:27445487:27461668:-1 gene:ENSG00000276595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000622555 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:27398281:27414368:-1 gene:ENSG00000182077 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000001945 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR10_1_CTG1:27425387:27461550:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000017367 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:27378087:27414250:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0
NM_001242702 // RefSeq // Homo sapiens mohawk homeobox (MKX), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NM_173576 // RefSeq // Homo sapiens mohawk homeobox (MKX), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006717438 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens mohawk homeobox (MKX), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// XM_006717439 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens mohawk homeobox (MKX), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000375790 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:27672875:27746060:-1 gene:ENSG00000150051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000419761 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:27672875:27745849:-1 gene:ENSG00000150051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000460919 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:10:27718563:27743545:-1 gene:ENSG00000150051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 95 // 58 // 18 // 19 // 0 /// BC036207 // GenBank // Homo sapiens mohawk homeobox, mRNA (cDNA clone MGC:39616 IMAGE:5262515), complete cds. // chr10 // 88 // 97 // 28 // 32 // 0 /// GENSCAN00000017373 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:27675229:27744584:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1
ENST00000516001 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:27783846:27784053:-1 gene:ENSG00000251810 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT011914 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000410734 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:28408039:28408251:-1 gene:ENSG00000222666 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT011926 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000410773 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:28442575:28442896:-1 gene:ENSG00000222705 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT011928 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000364131 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:28760699:28760803:-1 gene:ENSG00000201001 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT011956 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
ENST00000362532 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:28874393:28874507:-1 gene:ENSG00000199402 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT012505 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000480465 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:28898996:28899484:-1 gene:ENSG00000229605 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr10 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000024958 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:28899002:28919196:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0
NM_003174 // RefSeq // Homo sapiens supervillin (SVIL), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 74 // 29 // 29 // 0 /// NM_021738 // RefSeq // Homo sapiens supervillin (SVIL), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000355867 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:29458059:29634972:-1 gene:ENSG00000197321 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000375398 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:29457348:29634972:-1 gene:ENSG00000197321 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000375400 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:29457338:29735804:-1 gene:ENSG00000197321 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 74 // 29 // 29 // 0 /// AF051850 // GenBank // Homo sapiens supervillin mRNA, complete cds. // chr10 // 97 // 74 // 28 // 29 // 0 /// AF051851 // GenBank // Homo sapiens supervillin mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 62 // 24 // 24 // 0 /// AF109135 // GenBank // Homo sapiens archvillin (SVIL) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0 /// AK304720 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53284 complete cds, highly similar to Supervillin. // chr10 // 85 // 33 // 11 // 13 // 0 /// AK304799 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53285 complete cds, highly similar to Supervillin. // chr10 // 91 // 28 // 10 // 11 // 0 /// JX467682 // GenBank // Homo sapiens supervillin isoform 4 (SVIL) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 77 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000022185 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:29452744:29583733:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 67 // 26 // 26 // 0
NM_020848 // RefSeq // Homo sapiens KIAA1462 (KIAA1462), mRNA. // chr10 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000375377 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:30012800:30059524:-1 gene:ENSG00000165757 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000465712 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:30047532:30115494:-1 gene:ENSG00000165757 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 20 // 8 // 8 // 0 /// AK308850 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ98891. // chr10 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0 /// BX648192 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686N1627 (from clone DKFZp686N1627). // chr10 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000021352 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:30017831:30047812:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0 /// NONHSAT012561 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr10 // 100 // 20 // 8 // 8 // 0
ENST00000364017 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:30299569:30299673:-1 gene:ENSG00000200887 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT012563 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000482973 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:30366064:30366299:-1 gene:ENSG00000239625 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT012576 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000468228 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:30555601:30555904:-1 gene:ENSG00000239744 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT012583 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_183058 // RefSeq // Homo sapiens lysozyme-like 2 (LYZL2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000375318 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:30611779:30629762:-1 gene:ENSG00000151033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// AF139543 // GenBank // Homo sapiens lysozyme-2 mRNA, complete cds. // chr10 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0 /// BC066294 // GenBank // Homo sapiens lysozyme-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:86984 IMAGE:4374284), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
ENST00000410480 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:31756042:31756136:-1 gene:ENSG00000222412 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT012628 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000471327 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:31992087:31992381:-1 gene:ENSG00000239731 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT012635 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000363614 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:32394558:32394665:-1 gene:ENSG00000200484 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT012652 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000468834 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:33057615:33058407:-1 gene:ENSG00000235962 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr10 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000048192 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:33057630:33058409:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0
ENST00000470244 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:33288304:33288601:-1 gene:ENSG00000244356 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT012678 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000362330 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:34201979:34202074:-1 gene:ENSG00000199200 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT012696 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000363227 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:35250959:35251052:-1 gene:ENSG00000200097 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONHSAT012732 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
ENST00000609313 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:35606001:35608153:-1 gene:ENSG00000273312 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC035898 // GenBank // Homo sapiens gap junction protein, delta 4, 40.1kDa, mRNA (cDNA clone IMAGE:5240397), partial cds. // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT012738 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr10 // 100 // 64 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT012739 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_031866 // RefSeq // Homo sapiens frizzled class receptor 8 (FZD8), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000374694 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:35638249:35642278:-1 gene:ENSG00000177283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB043703 // GenBank // Homo sapiens FZD8 mRNA for seven-transmembrane receptor Frizzled-8, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000040304 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:35612484:35647062:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1
ENST00000384541 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:36626015:36626138:-1 gene:ENSG00000207271 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT012755 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000516812 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:37303000:37303109:-1 gene:ENSG00000252621 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT012766 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_145011 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 25 (ZNF25), mRNA. // chr10 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000302609 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:37949572:37976633:-1 gene:ENSG00000175395 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000374633 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:37950567:37976627:-1 gene:ENSG00000175395 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000467975 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:37953063:37976592:-1 gene:ENSG00000175395 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC036038 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 25, mRNA (cDNA clone MGC:33240 IMAGE:5272655), complete cds. // chr10 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000001895 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:37952127:37957558:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0
ENST00000516323 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:38043873:38043975:-1 gene:ENSG00000252132 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT012802 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_103829 // RefSeq // Homo sapiens cyclin Y-like 2 (CCNYL2), non-coding RNA. // chr10 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000426433 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:42410083:42454385:-1 gene:ENSG00000182632 gene_biotype:polymorphic_pseudogene transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000472090 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:42409727:42454385:-1 gene:ENSG00000182632 gene_biotype:polymorphic_pseudogene transcript_biotype:polymorphic_pseudogene // chr10 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000483242 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:42408168:42472240:-1 gene:ENSG00000182632 gene_biotype:polymorphic_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000008900 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:42410083:42470205:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 58 // 11 // 11 // 0 /// NONHSAT012867 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr10 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0 /// NONHSAT012868 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr10 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT012869 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr10 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0
NM_006955 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 33B (ZNF33B), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000359467 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:42589107:42638544:-1 gene:ENSG00000196693 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AK304306 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53401 complete cds, highly similar to Zinc finger protein 11B. // chr10 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// BC065181 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 33B, mRNA (cDNA clone IMAGE:4301852), complete cds. // chr10 // 83 // 55 // 10 // 12 // 0 /// ENST00000613419 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:42589107:42632912:-1 gene:ENSG00000196693 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000008889 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:42592613:42711287:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 82 // 82 // 18 // 22 // 1
NONHSAT012931 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000516607 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:42832447:42832550:-1 gene:ENSG00000252416 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT012933 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001282862 // RefSeq // Homo sapiens RasGEF domain family, member 1A (RASGEF1A), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 97 // 91 // 31 // 32 // 0 /// NM_145313 // RefSeq // Homo sapiens RasGEF domain family, member 1A (RASGEF1A), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 97 // 91 // 31 // 32 // 0 /// XM_005271809 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens RasGEF domain family, member 1A (RASGEF1A), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000374455 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:10:43199116:43202682:-1 gene:ENSG00000198915 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000374459 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:10:43194535:43229739:-1 gene:ENSG00000198915 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000395810 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:43194536:43266919:-1 gene:ENSG00000198915 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// BC022548 // GenBank // Homo sapiens RasGEF domain family, member 1A, mRNA (cDNA clone MGC:26821 IMAGE:4814750), complete cds. // chr10 // 94 // 91 // 30 // 32 // 0 /// ENST00000395809 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:43196093:43209184:-1 gene:ENSG00000198915 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 77 // 77 // 27 // 35 // 1 /// AK127432 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ45524 fis, clone BRTHA2026290, highly similar to Homo sapiens RasGEF domain family, member 1A (RASGEF1A), mRNA. // chr10 // 69 // 69 // 24 // 35 // 1 /// GENSCAN00000021141 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:43192760:43211548:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0
ENST00000408473 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:43417249:43417438:-1 gene:ENSG00000221400 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT012961 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001005368 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 32 (ZNF32), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// NM_006973 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 32 (ZNF32), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// XM_005271822 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens zinc finger protein 32 (ZNF32), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000374433 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:43643859:43648856:-1 gene:ENSG00000169740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000395797 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:43643860:43648704:-1 gene:ENSG00000169740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// BC022842 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 32, mRNA (cDNA clone MGC:39461 IMAGE:5014207), complete cds. // chr10 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// U69645 // GenBank // Human zinc finger protein mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000485351 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:43644649:43646275:-1 gene:ENSG00000169740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 55 // 55 // 12 // 22 // 1 /// GENSCAN00000021128 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:43644050:43644796:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 55 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT012985 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr10 // 55 // 55 // 12 // 22 // 1
NR_002726 // RefSeq // Homo sapiens heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 pseudogene 1 (HNRNPA3P1), non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000401429 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:43789249:43790387:-1 gene:ENSG00000226790 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr10 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// S63912 // GenBank // D10S102=FBRNP [human, fetal brain, mRNA, 3043 nt]. // chr10 // 58 // 100 // 11 // 19 // 0 /// GENSCAN00000021140 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:43732285:43790387:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0
NM_007021 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 10 (C10orf10), mRNA. // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000298295 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:44976129:44978810:-1 gene:ENSG00000165507 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000448778 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:44977779:44978789:-1 gene:ENSG00000165507 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 91 // 44 // 10 // 11 // 0 /// AB022718 // GenBank // Homo sapiens mRNA for DEPP (decidual protein induced by progesterone), complete cds. // chr10 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// AB025244 // GenBank // Homo sapiens mRNA for FIG, complete cds. // chr10 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// AK300839 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54167 complete cds, moderately similar to Protein DEPP. // chr10 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// BC011402 // GenBank // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 10, mRNA (cDNA clone MGC:9088 IMAGE:3853931), complete cds. // chr10 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000012711 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:44963953:44978030:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001039380 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 25 (C10orf25), mRNA. // chr10 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000298298 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:44997698:45000888:-1 gene:ENSG00000165511 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC062568 // GenBank // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 25, mRNA (cDNA clone IMAGE:5174890), partial cds. // chr10 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// BC130369 // GenBank // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 25, mRNA (cDNA clone MGC:163241 IMAGE:40146400), complete cds. // chr10 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// BC130395 // GenBank // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 25, mRNA (cDNA clone MGC:163267 IMAGE:40146426), complete cds. // chr10 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0
ENST00000384343 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:45188790:45188896:-1 gene:ENSG00000207071 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000616185 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR10_1_CTG2:45188790:45188896:-1 gene:ENSG00000275615 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT013088 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
AF130105 // GenBank HTC // Homo sapiens clone FLB4246 PRO1102 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT014001 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr10 // 75 // 100 // 18 // 24 // 0
ENST00000582253 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:87154041:87154369:-1 gene:ENSG00000273946 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA gene:ENSG00000266323 // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000615117 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:46648948:46649276:1 gene:ENSG00000274186 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000620275 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:47692399:47692727:-1 gene:ENSG00000276544 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT013137 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT013184 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT013255 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT015398 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
ENST00000583448 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:10:47460162:47484083:-1 gene:ENSG00000265190 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSG00000263801 // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000602274 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:10:47460191:47462683:-1 gene:ENSG00000265190 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000610809 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:47985519:47991850:-1 gene:ENSG00000276850 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr10 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// AK096715 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39396 fis, clone PLACE6008640. // chr10 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// NONHSAT013170 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT013214 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_002900 // RefSeq // Homo sapiens retinol binding protein 3, interstitial (RBP3), mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000584701 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:47348371:47357875:1 gene:ENSG00000265203 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AB593121 // GenBank // Homo sapiens RBP3 mRNA for retinol-binding protein 3, complete cds, clone: HP07871-RBd40H08. // chr10 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC039844 // GenBank // Homo sapiens retinol binding protein 3, interstitial, mRNA (cDNA clone MGC:48862 IMAGE:5578501), complete cds. // chr10 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// J03912 // GenBank // Human interstitial retinol binding protein (IRBP) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// M22453 // GenBank // Human interphotoreceptor retinoid-binding protein (IRBP) mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000047507 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:47348485:47357457:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
NM_016204 // RefSeq // Homo sapiens growth differentiation factor 2 (GDF2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006717761 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens growth differentiation factor 2 (GDF2), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000581492 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:47322490:47326270:1 gene:ENSG00000263761 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AF188285 // GenBank // Homo sapiens bone morphogenetic protein 9 (BMP9) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC069643 // GenBank // Homo sapiens growth differentiation factor 2, mRNA (cDNA clone MGC:97188 IMAGE:7262433), complete cds. // chr10 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// BC074921 // GenBank // Homo sapiens growth differentiation factor 2, mRNA (cDNA clone MGC:104115 IMAGE:30915569), complete cds. // chr10 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000047490 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:47322669:47327254:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0
NM_004962 // RefSeq // Homo sapiens growth differentiation factor 10 (GDF10), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000580279 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:47300386:47313547:1 gene:ENSG00000266524 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AK310360 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17402. // chr10 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// BC028237 // GenBank // Homo sapiens growth differentiation factor 10, mRNA (cDNA clone MGC:39897 IMAGE:5245100), complete cds. // chr10 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1 /// GENSCAN00000047504 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:47300652:47312792:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0
NM_001018071 // RefSeq // Homo sapiens FERM and PDZ domain containing 2 (FRMPD2), transcript variant 3, mRNA. // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000305531 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:48156559:48251757:-1 gene:ENSG00000170324 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000374201 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:48156558:48274870:-1 gene:ENSG00000170324 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000486151 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:48177293:48274674:-1 gene:ENSG00000170324 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr10 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// AK131386 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ16461 fis, clone BRHIP2005271, weakly similar to Homo sapiens protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 13 (APO-1/CD95 (Fas)-associated phosphatase) (PTPN13). // chr10 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// GENSCAN00000036538 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:48010170:48251689:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_001006939 // RefSeq // Homo sapiens leucine rich repeat containing 18 (LRRC18), mRNA. // chr10 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// XM_005269857 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens leucine rich repeat containing 18 (LRRC18), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 90 // 40 // 9 // 10 // 0 /// XM_006717868 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens leucine rich repeat containing 18 (LRRC18), transcript variant X6, mRNA. // chr10 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000298124 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:48909488:48935190:-1 gene:ENSG00000165383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000374160 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:48909483:48914232:-1 gene:ENSG00000165383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// AY358137 // GenBank // Homo sapiens clone DNA193663 VKGE9338 (UNQ9338) mRNA, complete cds. // chr10 // 81 // 64 // 13 // 16 // 0 /// BC036722 // GenBank // Homo sapiens leucine rich repeat containing 18, mRNA (cDNA clone MGC:34773 IMAGE:5206652), complete cds. // chr10 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// XM_006717866 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens leucine rich repeat containing 18 (LRRC18), transcript variant X4, mRNA. // chr10 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000036540 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:48913388:48914155:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 89 // 36 // 8 // 9 // 0
NM_144984 // RefSeq // Homo sapiens V-set and transmembrane domain containing 4 (VSTM4), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0 /// XM_006717689 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens V-set and transmembrane domain containing 4 (VSTM4), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000298454 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:49102172:49115509:-1 gene:ENSG00000165633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0 /// AK297931 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50814 complete cds. // chr10 // 90 // 68 // 19 // 21 // 0 /// BC041414 // GenBank // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 72, mRNA (cDNA clone MGC:44086 IMAGE:5285468), complete cds. // chr10 // 86 // 68 // 18 // 21 // 0 /// NM_001031746 // RefSeq // Homo sapiens V-set and transmembrane domain containing 4 (VSTM4), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 68 // 68 // 21 // 31 // 1 /// ENST00000332853 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:49014245:49115509:-1 gene:ENSG00000165633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 68 // 68 // 21 // 31 // 1 /// GENSCAN00000001535 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:49019650:49115485:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1
NM_001164484 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 170, member B (FAM170B), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000311787 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:49131154:49134008:-1 gene:ENSG00000172538 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC029839 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 170, member B, mRNA (cDNA clone IMAGE:5169825), partial cds. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000001542 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:49131613:49150321:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
NM_001276451 // RefSeq // Homo sapiens dorsal root ganglia homeobox (DRGX), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000374139 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:49364181:49395451:-1 gene:ENSG00000165606 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000434016 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:49366116:49396016:-1 gene:ENSG00000165606 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000001554 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:49366116:49418024:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
AF090890 // GenBank // Homo sapiens clone HQ0097 PRO0097 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NONHSAT013384 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_015235 // RefSeq // Homo sapiens cleavage stimulation factor, 3 pre-RNA, subunit 2, 64kDa, tau variant (CSTF2T), mRNA. // chr10 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000331173 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:51695487:51699591:-1 gene:ENSG00000177613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// AY130299 // GenBank // Homo sapiens tCstF-64 (CSTF2T) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// BC017185 // GenBank HTC // Homo sapiens cleavage stimulation factor, 3 pre-RNA, subunit 2, 64kDa, tau variant, mRNA (cDNA clone IMAGE:3050380), with apparent retained intron. // chr10 // 92 // 67 // 22 // 24 // 0 /// BC028239 // GenBank // Homo sapiens cleavage stimulation factor, 3 pre-RNA, subunit 2, 64kDa, tau variant, mRNA (cDNA clone MGC:39866 IMAGE:5244025), complete cds. // chr10 // 94 // 86 // 29 // 31 // 0 /// GENSCAN00000037559 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:51697699:51807018:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0
NM_152230 // RefSeq // Homo sapiens inositol polyphosphate multikinase (IPMK), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000373935 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:58191517:58267934:-1 gene:ENSG00000151151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AF432853 // GenBank // Homo sapiens inositol polyphosphate multikinase (IPMK) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// BC016612 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4510867, containing frame-shift errors. // chr10 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC065709 // GenBank // Homo sapiens inositol polyphosphate multikinase, mRNA (cDNA clone MGC:71901 IMAGE:6654071), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000016767 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:58196076:58267557:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 70 // 14 // 14 // 0
NONHSAT013487 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_194298 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 16, member 9 (SLC16A9), mRNA. // chr10 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000395347 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:59650765:59736002:-1 gene:ENSG00000165449 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000395348 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:59650761:59710079:-1 gene:ENSG00000165449 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// BC126238 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 16, member 9 (monocarboxylic acid transporter 9), mRNA (cDNA clone MGC:161516 IMAGE:8991954), complete cds. // chr10 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// BC130567 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 16, member 9 (monocarboxylic acid transporter 9), mRNA (cDNA clone MGC:163439 IMAGE:40146598), complete cds. // chr10 // 87 // 72 // 20 // 23 // 0 /// ENST00000490066 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:59684098:59709522:-1 gene:ENSG00000165449 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1 /// GENSCAN00000015485 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:59652772:59689454:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT013527 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr10 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
NM_005436 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 6 (CCDC6), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000263102 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:59788763:59906656:-1 gene:ENSG00000108091 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK292593 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75411 complete cds, highly similar to Homo sapiens coiled-coil domain containing 6, mRNA. // chr10 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// BC022284 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 6, mRNA (cDNA clone IMAGE:4762273), partial cds. // chr10 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// BC036757 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 6, mRNA (cDNA clone MGC:46159 IMAGE:5549623), complete cds. // chr10 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC064391 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 6, mRNA (cDNA clone MGC:75097 IMAGE:5745698), complete cds. // chr10 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000491922 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:59791752:59805576:-1 gene:ENSG00000108091 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr10 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// AK056848 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ32286 fis, clone PROST2000273, highly similar to H4(D10S170) PROTEIN. // chr10 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// GENSCAN00000015491 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:59814642:59906436:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// NONHSAT013535 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr10 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
ENST00000411175 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:60912765:60912927:-1 gene:ENSG00000223107 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT013555 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_178505 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 26 (TMEM26), mRNA. // chr10 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000399298 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:61406647:61453450:-1 gene:ENSG00000196932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000488505 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:61412893:61453167:-1 gene:ENSG00000196932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr10 // 100 // 46 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000503886 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:61406643:61453238:-1 gene:ENSG00000196932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr10 // 100 // 59 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000507507 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:61409447:61414500:-1 gene:ENSG00000196932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 31 // 12 // 12 // 0 /// AK124367 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ42376 fis, clone UTERU2035323. // chr10 // 100 // 31 // 12 // 12 // 0 /// BC042872 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 26, mRNA (cDNA clone MGC:35010 IMAGE:5164050), complete cds. // chr10 // 89 // 46 // 16 // 18 // 0 /// ENST00000277749 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:10:61412893:61431332:-1 gene:ENSG00000196932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 26 // 26 // 10 // 39 // 1 /// GENSCAN00000002459 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:61410322:61453081:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 41 // 41 // 16 // 39 // 1
NM_001282941 // RefSeq // Homo sapiens rhotekin 2 (RTKN2), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 33 // 8 // 8 // 0 /// NM_145307 // RefSeq // Homo sapiens rhotekin 2 (RTKN2), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000315289 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:10:62183035:62236263:-1 gene:ENSG00000182010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000373789 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:62193194:62268707:-1 gene:ENSG00000182010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000395260 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:62238157:62268707:-1 gene:ENSG00000182010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 33 // 8 // 8 // 0 /// AK096671 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39352 fis, clone PEBLM2001312, weakly similar to Homo sapiens rhotekin mRNA. // chr10 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// AY150309 // GenBank // Homo sapiens rhotekin-2 (RTKN2) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// BC025765 // GenBank // Homo sapiens rhotekin 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:5205817), complete cds. // chr10 // 100 // 33 // 8 // 8 // 0 /// BC141821 // GenBank // Homo sapiens rhotekin 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:40148149), complete cds. // chr10 // 100 // 33 // 8 // 8 // 0 /// BC142725 // GenBank // Homo sapiens rhotekin 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:40148911), complete cds. // chr10 // 100 // 33 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000038766 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:62204849:62268610:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 42 // 10 // 10 // 0
NM_000399 // RefSeq // Homo sapiens early growth response 2 (EGR2), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_001136177 // RefSeq // Homo sapiens early growth response 2 (EGR2), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 97 // 97 // 30 // 31 // 0 /// NM_001136178 // RefSeq // Homo sapiens early growth response 2 (EGR2), transcript variant 3, mRNA. // chr10 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NM_001136179 // RefSeq // Homo sapiens early growth response 2 (EGR2), transcript variant 4, mRNA. // chr10 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000242480 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:62811996:62816355:-1 gene:ENSG00000122877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000411732 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:62812003:62816366:-1 gene:ENSG00000122877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000439032 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:62812003:62819167:-1 gene:ENSG00000122877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AF139463 // GenBank // Homo sapiens early growth response 2 protein (EGR2) mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 81 // 25 // 26 // 0 /// AK296830 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54816 complete cds, highly similar to Early growth response protein 2. // chr10 // 80 // 47 // 12 // 15 // 0 /// BC035625 // GenBank // Homo sapiens early growth response 2 (Krox-20 homolog, Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:45038 IMAGE:5208710), complete cds. // chr10 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// J04076 // GenBank // Human early growth response 2 protein (EGR2) mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000038756 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:62813207:62821866:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1
NM_001282948 // RefSeq // Homo sapiens jumonji domain containing 1C (JMJD1C), transcript variant 3, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NM_032776 // RefSeq // Homo sapiens jumonji domain containing 1C (JMJD1C), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000399262 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:63167221:63465881:-1 gene:ENSG00000171988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000402544 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:63167348:63269187:-1 gene:ENSG00000171988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000542921 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:63167590:63269066:-1 gene:ENSG00000171988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// AK024991 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ21338 fis, clone COL02572. // chr10 // 100 // 45 // 14 // 14 // 0 /// BC143722 // GenBank // Homo sapiens jumonji domain containing 1C, mRNA (cDNA clone MGC:177253 IMAGE:9052236), complete cds. // chr10 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// BX537954 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686K091 (from clone DKFZp686K091); complete cds. // chr10 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// EF068222 // GenBank // Homo sapiens jumonji domain-containing 1 C splice variant (JMJD1C) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr10 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000327520 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:10:63176800:63207725:-1 gene:ENSG00000171988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 45 // 45 // 14 // 31 // 1 /// GENSCAN00000016302 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:63159721:63217227:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0
NM_001291133 // RefSeq // Homo sapiens catenin (cadherin-associated protein), alpha 3 (CTNNA3), transcript variant 3, mRNA. // chr10 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// AF091606 // GenBank // Homo sapiens alphaT-catenin (CTNNA3) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// AK289756 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78082 complete cds, highly similar to Homo sapiens alphaT-catenin (CTNNA3) mRNA. // chr10 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// BC022004 // GenBank // Homo sapiens catenin (cadherin-associated protein), alpha 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:4823848), complete cds. // chr10 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// BC030646 // GenBank // Homo sapiens catenin (cadherin-associated protein), alpha 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:4825293), complete cds. // chr10 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// NM_001127384 // RefSeq // Homo sapiens catenin (cadherin-associated protein), alpha 3 (CTNNA3), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 76 // 76 // 22 // 29 // 1 /// NM_013266 // RefSeq // Homo sapiens catenin (cadherin-associated protein), alpha 3 (CTNNA3), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 76 // 76 // 22 // 29 // 1 /// ENST00000433211 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:65912518:67696169:-1 gene:ENSG00000183230 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 76 // 76 // 22 // 29 // 1 /// BC065819 // GenBank // Homo sapiens catenin (cadherin-associated protein), alpha 3, mRNA (cDNA clone MGC:75041 IMAGE:6189390), complete cds. // chr10 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1 /// GENSCAN00000034723 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:65920330:66520713:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0
NONHSAT013669 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000480997 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:67825310:67825600:-1 gene:ENSG00000239942 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT013681 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr10 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
ENST00000581978 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:68007718:68008017:-1 gene:ENSG00000266467 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT013693 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr10 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_145178 // RefSeq // Homo sapiens atonal homolog 7 (Drosophila) (ATOH7), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000373673 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:68230624:68232103:-1 gene:ENSG00000179774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB593108 // GenBank // Homo sapiens ATOH7 mRNA for protein atonal homolog 7, complete cds, clone: HP06949-RBd08C12. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB593109 // GenBank // Homo sapiens ATOH7 mRNA for protein atonal homolog 7, complete cds, clone: HP06949-RBdS081C04. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC032621 // GenBank // Homo sapiens atonal homolog 7 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:45500 IMAGE:5580461), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041597 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:68231219:68231677:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_001080449 // RefSeq // Homo sapiens DNA replication helicase/nuclease 2 (DNA2), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NR_102264 // RefSeq // Homo sapiens DNA replication helicase/nuclease 2 (DNA2), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr10 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000358410 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:68414065:68471915:-1 gene:ENSG00000138346 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000399179 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:68414989:68472121:-1 gene:ENSG00000138346 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr10 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000399180 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:68414989:68472121:-1 gene:ENSG00000138346 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000440722 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:10:68416615:68430607:-1 gene:ENSG00000138346 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000551118 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:10:68414064:68471886:-1 gene:ENSG00000138346 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// AK307939 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ97887. // chr10 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// AK308333 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ98281. // chr10 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// BC028188 // GenBank // Homo sapiens DNA replication helicase 2 homolog (yeast), mRNA (cDNA clone IMAGE:4385301), partial cds. // chr10 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// BC111740 // GenBank // Homo sapiens DNA replication helicase 2 homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:133297 IMAGE:40038149), complete cds. // chr10 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
ENST00000352915 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:68735720:68735823:-1 gene:ENSG00000195401 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT013733 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000384128 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:68911653:68911759:-1 gene:ENSG00000206855 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT013766 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001057 // RefSeq // Homo sapiens tachykinin receptor 2 (TACR2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000373306 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:69404484:69416867:-1 gene:ENSG00000075073 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000373307 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:69403903:69409282:-1 gene:ENSG00000075073 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// AK096906 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39587 fis, clone SKMUS2008407, highly similar to SUBSTANCE-K RECEPTOR. // chr10 // 75 // 55 // 12 // 16 // 0 /// AK291996 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78621 complete cds, highly similar to Homo sapiens tachykinin receptor 2 (TACR2), mRNA. // chr10 // 93 // 97 // 26 // 28 // 0 /// AK300649 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59268 complete cds, highly similar to Substance-K receptor. // chr10 // 91 // 76 // 20 // 22 // 0 /// AY322545 // GenBank // Homo sapiens tachykinin receptor 2 mRNA, complete cds. // chr10 // 92 // 86 // 23 // 25 // 0 /// BC096842 // GenBank // Homo sapiens tachykinin receptor 2, mRNA (cDNA clone MGC:111762 IMAGE:6971906), complete cds. // chr10 // 88 // 86 // 22 // 25 // 0 /// FJ200479 // GenBank // Homo sapiens tachykinin receptor 2 variant mRNA, complete cds. // chr10 // 88 // 83 // 21 // 24 // 0 /// M57414 // GenBank // Human neurokinin A receptor (NK-2R) mRNA, complete cds. // chr10 // 88 // 86 // 22 // 25 // 0 /// ENST00000619173 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:69404202:69416323:-1 gene:ENSG00000075073 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000033103 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:69402992:69439351:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0
NM_020999 // RefSeq // Homo sapiens neurogenin 3 (NEUROG3), mRNA. // chr10 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000242462 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:69571698:69573238:-1 gene:ENSG00000122859 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC069098 // GenBank // Homo sapiens neurogenin 3, mRNA (cDNA clone MGC:95373 IMAGE:7216912), complete cds. // chr10 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC074938 // GenBank // Homo sapiens neurogenin 3, mRNA (cDNA clone MGC:103886 IMAGE:30915270), complete cds. // chr10 // 92 // 48 // 11 // 12 // 0 /// BC074939 // GenBank // Homo sapiens neurogenin 3, mRNA (cDNA clone MGC:104047 IMAGE:30915493), complete cds. // chr10 // 92 // 48 // 11 // 12 // 0 /// BC117488 // GenBank // Homo sapiens neurogenin 3, mRNA (cDNA clone MGC:151097 IMAGE:40126039), complete cds. // chr10 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC126468 // GenBank // Homo sapiens neurogenin 3, mRNA (cDNA clone MGC:161746 IMAGE:8992184), complete cds. // chr10 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000033101 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:69572399:69573043:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
NM_022146 // RefSeq // Homo sapiens neuropeptide FF receptor 1 (NPFFR1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000277942 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:10:70247329:70283676:-1 gene:ENSG00000148734 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB040104 // GenBank // Homo sapiens OT7T022 mRNA for RFamide-related peptide receptor, complete cds. // chr10 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// AF268898 // GenBank // Homo sapiens neuropeptide FF receptor 1 (NPFF1) mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// AF330055 // GenBank // Homo sapiens neuropeptide NPVF receptor mRNA, complete cds. // chr10 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// BC131580 // GenBank // Homo sapiens neuropeptide FF receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:149215 IMAGE:40112416), complete cds. // chr10 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// EU432128 // GenBank // Homo sapiens neuropeptide FF receptor 1 (NPFFR1) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000006440 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:70174949:70290099:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
NM_018055 // RefSeq // Homo sapiens nodal growth differentiation factor (NODAL), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000287139 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:70432315:70441667:-1 gene:ENSG00000156574 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000414871 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:70432749:70447951:-1 gene:ENSG00000156574 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// BC033585 // GenBank // Homo sapiens nodal homolog (mouse), mRNA (cDNA clone IMAGE:5239967), partial cds. // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC104976 // GenBank // Homo sapiens nodal homolog (mouse), mRNA (cDNA clone MGC:132636 IMAGE:8143979), complete cds. // chr10 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// BC112025 // GenBank // Homo sapiens nodal homolog (mouse), mRNA (cDNA clone MGC:138230 IMAGE:8327493), complete cds. // chr10 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000006424 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:70432936:70441667:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
NM_001083116 // RefSeq // Homo sapiens perforin 1 (pore forming protein) (PRF1), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_005041 // RefSeq // Homo sapiens perforin 1 (pore forming protein) (PRF1), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000373209 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:70597348:70602759:-1 gene:ENSG00000180644 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000441259 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:70597349:70602775:-1 gene:ENSG00000180644 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC047695 // GenBank // Homo sapiens perforin 1 (pore forming protein), mRNA (cDNA clone MGC:51909 IMAGE:5752084), complete cds. // chr10 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC063043 // GenBank // Homo sapiens perforin 1 (pore forming protein), mRNA (cDNA clone MGC:65093 IMAGE:5748582), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FJ555237 // GenBank // Homo sapiens perforin 1 (PRF1) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// M28393 // GenBank // Human perforin mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000006432 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:70598053:70600902:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
NM_022153 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 54 (C10orf54), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000394957 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:71747559:71773498:-1 gene:ENSG00000107738 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000470317 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:10:71750916:71757630:-1 gene:ENSG00000107738 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 92 // 38 // 11 // 12 // 0 /// AF193048 // GenBank // Homo sapiens PP2135 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// AF289594 // GenBank HTC // Homo sapiens clone pp7827 unknown mRNA. // chr10 // 75 // 88 // 21 // 28 // 0 /// AY265805 // GenBank // Homo sapiens platelet receptor GI24 mRNA, complete cds. // chr10 // 86 // 88 // 24 // 28 // 0 /// AY358379 // GenBank // Homo sapiens clone DNA64897 GVPT730 (UNQ730) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC020568 // GenBank // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 54, mRNA (cDNA clone MGC:21558 IMAGE:4158410), complete cds. // chr10 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// BC111048 // GenBank // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 54, mRNA (cDNA clone IMAGE:5727175), partial cds. // chr10 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// EF506490 // GenBank // Homo sapiens stress induced secreted protein 1 (SISP1) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000041210 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:71751253:71773439:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0
ENST00000365011 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:72654165:72654276:-1 gene:ENSG00000201881 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT013929 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_032562 // RefSeq // Homo sapiens phospholipase A2, group XIIB (PLA2G12B), mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000373032 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:72935170:72954778:-1 gene:ENSG00000138308 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF349540 // GenBank // Homo sapiens group XIII secreted phospholipase A2 mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 82 // 22 // 23 // 0 /// AY358032 // GenBank // Homo sapiens group XIIB phospholipase A2-like protein mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr10 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// BC093996 // GenBank // Homo sapiens phospholipase A2, group XIIB, mRNA (cDNA clone MGC:121031 IMAGE:7939841), complete cds. // chr10 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// BC111946 // GenBank // Homo sapiens phospholipase A2, group XIIB, mRNA (cDNA clone MGC:138151 IMAGE:8327414), complete cds. // chr10 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// BC143532 // GenBank // Homo sapiens phospholipase A2, group XIIB, mRNA (cDNA clone MGC:177058 IMAGE:9052041), complete cds. // chr10 // 96 // 82 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000019396 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:72935617:72942729:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0
ENST00000364177 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:73082494:73082595:-1 gene:ENSG00000201047 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT013939 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000608444 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:73124573:73125405:-1 gene:ENSG00000272599 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr10 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000621900 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:73124901:73125532:-1 gene:ENSG00000272599 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT013942 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr10 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// U88048 // GenBank // Human clone KiSS-16 unknown product mRNA, complete cds. // chr10 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0
ENST00000362331 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:73192223:73192325:-1 gene:ENSG00000199201 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT013945 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006717734 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 9 (DNAJC9), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 94 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000372950 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:73242824:73248862:-1 gene:ENSG00000213551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// AK094162 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ36843 fis, clone ASTRO2012552, highly similar to DnaJ homolog subfamily C member 9. // chr10 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// AK303204 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58442 complete cds, highly similar to 28S ribosomal protein S16, mitochondrial precursor (S16mt). // chr10 // 50 // 50 // 8 // 16 // 1
NM_016065 // RefSeq // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein S16 (MRPS16), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000372945 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:73248843:73252693:-1 gene:ENSG00000182180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000471251 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:73250741:73252404:-1 gene:ENSG00000182180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000473427 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:73250744:73252634:-1 gene:ENSG00000182180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 94 // 48 // 15 // 16 // 0 /// ENST00000479005 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:73248843:73252625:-1 gene:ENSG00000182180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// AB049948 // GenBank // Homo sapiens MRPS16 mRNA for mitochondrial ribosomal protein S16, complete cds. // chr10 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// AF151890 // GenBank // Homo sapiens CGI-132 protein mRNA, complete cds. // chr10 // 80 // 61 // 16 // 20 // 0 /// BC021106 // GenBank // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein S16, mRNA (cDNA clone MGC:31855 IMAGE:5020046), complete cds. // chr10 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000372940 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:73248938:73252693:-1 gene:ENSG00000182180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1 /// AK303204 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58442 complete cds, highly similar to 28S ribosomal protein S16, mitochondrial precursor (S16mt). // chr10 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// GENSCAN00000019371 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:73250852:73398866:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1
NONHSAT013965 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001024593 // RefSeq // Homo sapiens MSS51 mitochondrial translational activator (MSS51), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000299432 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:73423581:73433561:-1 gene:ENSG00000166343 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000372912 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:73424429:73428287:-1 gene:ENSG00000166343 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// AK309870 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99911. // chr10 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// BC094693 // GenBank // Homo sapiens zinc finger, MYND-type containing 17, mRNA (cDNA clone MGC:102970 IMAGE:30529259), complete cds. // chr10 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// BX537678 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686M10204 (from clone DKFZp686M10204). // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000487126 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:73423579:73433560:-1 gene:ENSG00000166343 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr10 // 90 // 90 // 28 // 31 // 1 /// GENSCAN00000019384 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:73422259:73428284:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0
ENST00000384597 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:73529051:73529157:-1 gene:ENSG00000207327 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT013986 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_021245 // RefSeq // Homo sapiens myozenin 1 (MYOZ1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000359322 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:73631654:73641757:-1 gene:ENSG00000177791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF240633 // GenBank // Homo sapiens myozenin (MYOZ) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// AK300683 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57820 complete cds, moderately similar to Myozenin-1. // chr10 // 90 // 70 // 19 // 21 // 0 /// AY013297 // GenBank // Homo sapiens calcineurin-binding protein calsarcin-2 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// BC025753 // GenBank // Homo sapiens myozenin 1, mRNA (cDNA clone MGC:34233 IMAGE:5202455), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000019376 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:73631930:73665849:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1
NM_001114133 // RefSeq // Homo sapiens synaptopodin 2-like (SYNPO2L), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// NM_024875 // RefSeq // Homo sapiens synaptopodin 2-like (SYNPO2L), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 65 // 26 // 26 // 0 /// XM_005270158 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens synaptopodin 2-like (SYNPO2L), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 33 // 13 // 13 // 0 /// XM_005270160 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens synaptopodin 2-like (SYNPO2L), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 33 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000372873 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:73644881:73651029:-1 gene:ENSG00000166317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 65 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000394810 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:73644881:73656072:-1 gene:ENSG00000166317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// AB188489 // GenBank // Homo sapiens SYNPO2L mRNA for synaptopodin 2-like, complete cds, clone: TH029C03. // chr10 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// AK295873 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57015 complete cds, highly similar to Synaptopodin 2-like protein. // chr10 // 88 // 60 // 21 // 24 // 0 /// BC142635 // GenBank // Homo sapiens synaptopodin 2-like, mRNA (cDNA clone MGC:164834 IMAGE:40147769), complete cds. // chr10 // 100 // 35 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000019376 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:73631930:73665849:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 65 // 65 // 26 // 40 // 1
NM_001001791 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 55 (C10orf55), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000409178 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:73909969:73922777:-1 gene:ENSG00000222047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000412307 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:73909978:73916642:-1 gene:ENSG00000222047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC049374 // GenBank // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 55, mRNA (cDNA clone MGC:57393 IMAGE:5266108), complete cds. // chr10 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
NM_012095 // RefSeq // Homo sapiens adaptor-related protein complex 3, mu 1 subunit (AP3M1), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// NM_207012 // RefSeq // Homo sapiens adaptor-related protein complex 3, mu 1 subunit (AP3M1), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000487653 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:74138256:74150757:-1 gene:ENSG00000185009 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// AF092092 // GenBank // Homo sapiens AP-3 adaptor complex mu3A subunit mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// AK299352 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51284 complete cds, highly similar to Adapter-relatedprotein complex 3 mu-1 subunit. // chr10 // 100 // 56 // 20 // 20 // 0 /// BC067127 // GenBank // Homo sapiens adaptor-related protein complex 3, mu 1 subunit, mRNA (cDNA clone MGC:75195 IMAGE:6169822), complete cds. // chr10 // 94 // 89 // 30 // 32 // 0 /// ENST00000355264 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:74121766:74151063:-1 gene:ENSG00000185009 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 78 // 78 // 28 // 36 // 1 /// ENST00000372745 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:74122964:74150842:-1 gene:ENSG00000185009 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1 /// BC026232 // GenBank // Homo sapiens adaptor-related protein complex 3, mu 1 subunit, mRNA (cDNA clone MGC:22164 IMAGE:4807259), complete cds. // chr10 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1 /// GENSCAN00000023418 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:74122200:74151885:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 56 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT014052 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr10 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0
NM_001003892 // RefSeq // Homo sapiens dual specificity phosphatase and pro isomerase domain containing 1 (DUPD1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000338487 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:75037836:75058514:-1 gene:ENSG00000188716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AY686755 // GenBank // Homo sapiens FMDSP mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC137321 // GenBank // Homo sapiens dual specificity phosphatase and pro isomerase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:168941 IMAGE:9021318), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC137322 // GenBank // Homo sapiens dual specificity phosphatase and pro isomerase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:168942 IMAGE:9021319), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000027379 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:75036695:75109157:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 90 // 87 // 18 // 20 // 0
ENST00000434706 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:75089248:75089725:-1 gene:ENSG00000237882 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr10 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000027379 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:75036695:75109157:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0
NM_032772 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 503 (ZNF503), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000372524 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:75397830:75401906:-1 gene:ENSG00000165655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK127647 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ45745 fis, clone KIDNE2018268, highly similar to Homo sapiens zinc finger protein 503 (ZNF503), mRNA. // chr10 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// BC007494 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 503, mRNA (cDNA clone IMAGE:2967616), complete cds. // chr10 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0 /// BC011625 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 503, mRNA (cDNA clone MGC:10743 IMAGE:4053098), complete cds. // chr10 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC013011 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 503, mRNA (cDNA clone MGC:4159 IMAGE:3604473), complete cds. // chr10 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// BC021165 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 503, mRNA (cDNA clone MGC:16268 IMAGE:3830632), complete cds. // chr10 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// AK290311 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76083 complete cds, highly similar to Homo sapiens zinc finger protein 503 (ZNF503), mRNA. // chr10 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1 /// NR_120651 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 503 (ZNF503), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr10 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// ENST00000535216 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:75398495:75401755:-1 gene:ENSG00000165655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1 /// GENSCAN00000027381 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:75398749:75401419:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0
ENST00000491887 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:76242022:76242301:-1 gene:ENSG00000265486 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONHSAT014121 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr10 // 88 // 100 // 14 // 16 // 0
ENST00000365084 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:76260800:76260903:-1 gene:ENSG00000201954 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT014122 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000362794 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:77776951:77777055:-1 gene:ENSG00000199664 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000516518 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR10_1_CTG4:77776951:77777055:-1 gene:ENSG00000276274 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA gene:ENSG00000252327 // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT014634 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000498823 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:77912271:77912545:-1 gene:ENSG00000243446 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000611238 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR10_1_CTG4:77912271:77912545:-1 gene:ENSG00000276516 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT015041 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr10 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_007055 // RefSeq // Homo sapiens polymerase (RNA) III (DNA directed) polypeptide A, 155kDa (POLR3A), mRNA. // chr10 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000372371 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:77975149:78029545:-1 gene:ENSG00000148606 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000473588 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:78002197:78019252:-1 gene:ENSG00000148606 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr10 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// AF021351 // GenBank // Homo sapiens RNA polymerase III largest subunit (hRPC155) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// AK300329 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61707 complete cds, highly similar to DNA-directed RNA polymerase III largest subunit (EC 2.7.7.6). // chr10 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// BC014399 // GenBank // Homo sapiens polymerase (RNA) III (DNA directed) polypeptide A, 155kDa, mRNA (cDNA clone IMAGE:3356934), complete cds. // chr10 // 100 // 24 // 9 // 9 // 0 /// BC041089 // GenBank // Homo sapiens polymerase (RNA) III (DNA directed) polypeptide A, 155kDa, mRNA (cDNA clone MGC:45186 IMAGE:3915501), complete cds. // chr10 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000616246 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:77969251:77985320:-1 gene:ENSG00000148606 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 24 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000032771 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:77977478:78029407:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0
NM_153367 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, CCHC domain containing 24 (ZCCHC24), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_005269604 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens zinc finger, CCHC domain containing 24 (ZCCHC24), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000372333 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:79386037:79444219:-1 gene:ENSG00000165424 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000372336 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:79382325:79445627:-1 gene:ENSG00000165424 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK293361 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51793 complete cds. // chr10 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// AK303734 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52295 complete cds. // chr10 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// AK308876 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ98917. // chr10 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// BC028617 // GenBank // Homo sapiens zinc finger, CCHC domain containing 24, mRNA (cDNA clone MGC:33537 IMAGE:4821347), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC053564 // GenBank // Homo sapiens zinc finger, CCHC domain containing 24, mRNA (cDNA clone MGC:61761 IMAGE:6193781), complete cds. // chr10 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000029037 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:79386345:79445440:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
AF130084 // GenBank HTC // Homo sapiens clone FLB8310 PRO2225 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AF130084 // GenBank HTC // Homo sapiens clone FLB8310 PRO2225 mRNA, complete cds. // chrUn // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_003019 // RefSeq // Homo sapiens surfactant protein D (SFTPD), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000372292 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:79937740:79949103:-1 gene:ENSG00000133661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000444384 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:10:79941449:79982614:-1 gene:ENSG00000133661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 92 // 59 // 12 // 13 // 0 /// BC022318 // GenBank // Homo sapiens surfactant protein D, mRNA (cDNA clone MGC:22626 IMAGE:4696173), complete cds. // chr10 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// CR541948 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834B1234D for gene SFTPD, surfactant, pulmonary-associated protein D; complete cds, without stopcodon. // chr10 // 89 // 82 // 16 // 18 // 0 /// X65018 // GenBank // H.sapiens mRNA for lung surfactant protein D. // chr10 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000042011 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:79937852:79946659:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0
NM_000429 // RefSeq // Homo sapiens methionine adenosyltransferase I, alpha (MAT1A), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000372213 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:80271820:80289684:-1 gene:ENSG00000151224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000480845 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:80272058:80275199:-1 gene:ENSG00000151224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 92 // 35 // 12 // 13 // 0 /// ENST00000485270 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:80271820:80275479:-1 gene:ENSG00000151224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 62 // 23 // 23 // 0 /// AK026931 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ23278 fis, clone HEP05402, highly similar to HSSAMAA Homo sapiens mRNA for S-adenosylmethionine synthetase. // chr10 // 96 // 62 // 22 // 23 // 0 /// AK290820 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76034 complete cds, highly similar to Homo sapiens methionine adenosyltransferase I, alpha (MAT1A), mRNA. // chr10 // 88 // 68 // 22 // 25 // 0 /// BC018359 // GenBank // Homo sapiens methionine adenosyltransferase I, alpha, mRNA (cDNA clone MGC:17089 IMAGE:4341915), complete cds. // chr10 // 94 // 97 // 34 // 36 // 0 /// D49357 // GenBank // Homo sapiens mRNA for S-adenosylmethionine synthetase, complete cds. // chr10 // 84 // 68 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042017 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:80247219:80289423:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 43 // 43 // 16 // 37 // 1
NM_001269053 // RefSeq // Homo sapiens DPY30 domain containing 1 (DYDC1), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NM_138812 // RefSeq // Homo sapiens DPY30 domain containing 1 (DYDC1), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000372202 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:80336129:80356753:-1 gene:ENSG00000170788 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000372204 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:80336105:80356744:-1 gene:ENSG00000170788 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000421924 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:80336108:80352727:-1 gene:ENSG00000170788 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// AK125908 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ43920 fis, clone TESTI4012086. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC019250 // GenBank // Homo sapiens DPY30 domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:26601 IMAGE:4828878), complete cds. // chr10 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AK292542 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78629 complete cds. // chr10 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1 /// ENST00000453477 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:80351910:80356755:-1 gene:ENSG00000170788 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// ENST00000454362 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:80338513:80356714:-1 gene:ENSG00000170788 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
ENST00000363904 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:83067962:83068071:-1 gene:ENSG00000200774 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT015291 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001017924 // RefSeq // Homo sapiens leucine-rich repeat, immunoglobulin-like and transmembrane domains 2 (LRIT2), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_001284223 // RefSeq // Homo sapiens leucine-rich repeat, immunoglobulin-like and transmembrane domains 2 (LRIT2), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000372113 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:84220498:84225526:-1 gene:ENSG00000204033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000538192 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:84221291:84225589:-1 gene:ENSG00000204033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC140765 // GenBank // Homo sapiens leucine-rich repeat, immunoglobulin-like and transmembrane domains 2, mRNA (cDNA clone MGC:176442 IMAGE:9021633), complete cds. // chr10 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC144475 // GenBank // Homo sapiens leucine-rich repeat, immunoglobulin-like and transmembrane domains 2, mRNA (cDNA clone MGC:178019 IMAGE:9053002), complete cds. // chr10 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BX648524 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686B0995 (from clone DKFZp686B0995). // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000016151 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:84221920:84225520:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0
NM_015613 // RefSeq // Homo sapiens leucine-rich repeat, immunoglobulin-like and transmembrane domains 1 (LRIT1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000372105 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:84231593:84241461:-1 gene:ENSG00000148602 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AB031547 // GenBank // Homo sapiens mRNA for retina specific protein PAL, complete cds. // chr10 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000016142 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:84231927:84241763:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 95 // 91 // 19 // 20 // 0
NM_017551 // RefSeq // Homo sapiens glutamate receptor, ionotropic, delta 1 (GRID1), mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000327946 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:85599555:86366478:-1 gene:ENSG00000182771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000464741 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:85601994:86366493:-1 gene:ENSG00000182771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr10 // 100 // 87 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000536331 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:85599555:85916241:-1 gene:ENSG00000182771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 70 // 32 // 32 // 0 /// AK293104 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78030 complete cds. // chr10 // 100 // 87 // 40 // 40 // 0 /// AK302192 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50913 complete cds, highly similar to Glutamate receptor delta-1 subunit precursor. // chr10 // 100 // 48 // 22 // 22 // 0 /// BC039263 // GenBank // Homo sapiens glutamate receptor, ionotropic, delta 1, mRNA (cDNA clone MGC:33869 IMAGE:5273869), complete cds. // chr10 // 100 // 87 // 40 // 40 // 0 /// BC047948 // GenBank HTC // Homo sapiens glutamate receptor, ionotropic, delta 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5761157), with apparent retained intron. // chr10 // 100 // 17 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000015163 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:85662901:85737532:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 22 // 22 // 10 // 46 // 1 /// GENSCAN00000015168 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:85602273:85649949:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 22 // 22 // 10 // 46 // 1
ENST00000516483 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:85650012:85650260:-1 gene:ENSG00000252292 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT015357 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000481963 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:86630825:86631628:-1 gene:ENSG00000230507 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000037023 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:86630825:86631607:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NONHSAT015378 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_024756 // RefSeq // Homo sapiens multimerin 2 (MMRN2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006717970 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens multimerin 2 (MMRN2), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000372027 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:86935540:86957863:-1 gene:ENSG00000173269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000608090 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:86945222:86957571:-1 gene:ENSG00000173269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr10 // 91 // 33 // 10 // 11 // 0 /// ENST00000610081 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:10:86943821:86954258:-1 gene:ENSG00000173269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// AK293822 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54049 complete cds, highly similar to Multimerin-2 precursor. // chr10 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0 /// AK304727 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54082 complete cds, highly similar to Multimerin-2 precursor. // chr10 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// BC094744 // GenBank // Homo sapiens multimerin 2, mRNA (cDNA clone MGC:104596 IMAGE:30343159), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000474994 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:10:86944364:86969481:-1 gene:ENSG00000173269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// ENST00000609457 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:10:86943872:86969312:-1 gene:ENSG00000173269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1 /// GENSCAN00000029125 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:86934346:86954093:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 95 // 67 // 21 // 22 // 0
ENST00000363383 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:87041238:87041341:-1 gene:ENSG00000200253 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 94 // 100 // 16 // 17 // 0 /// NONHSAT015393 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 94 // 100 // 16 // 17 // 0
NM_032810 // RefSeq // Homo sapiens ATPase family, AAA domain containing 1 (ATAD1), mRNA. // chr10 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000308448 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:87751512:87818160:-1 gene:ENSG00000138138 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000328142 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:87753117:87814882:-1 gene:ENSG00000138138 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// AF361493 // GenBank HTC // Homo sapiens FNP001 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// AK304297 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54240 complete cds, highly similar to ATPase family AAA domain-containing protein 1. // chr10 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0 /// BC010868 // GenBank // Homo sapiens ATPase family, AAA domain containing 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3876875), complete cds. // chr10 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0 /// BC063530 // GenBank // Homo sapiens ATPase family, AAA domain containing 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4386512), partial cds. // chr10 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// BC073998 // GenBank // Homo sapiens ATPase family, AAA domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:90254 IMAGE:6199813), complete cds. // chr10 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000029137 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:87754687:87814599:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0
ENST00000495193 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:87832818:87833098:-1 gene:ENSG00000243782 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT015453 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000364678 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:88585638:88585733:-1 gene:ENSG00000201548 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT015474 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_144590 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat domain 22 (ANKRD22), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000371930 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:88822132:88851818:-1 gene:ENSG00000152766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC021671 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat domain 22, mRNA (cDNA clone MGC:22805 IMAGE:3682099), complete cds. // chr10 // 83 // 89 // 20 // 24 // 0 /// ENST00000476963 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:88822801:88823515:-1 gene:ENSG00000152766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// GENSCAN00000037221 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:88822941:88858664:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT015479 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr10 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_003956 // RefSeq // Homo sapiens cholesterol 25-hydroxylase (CH25H), mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000371852 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:89205629:89207314:-1 gene:ENSG00000138135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF059214 // GenBank // Homo sapiens cholesterol 25-hydroxylase mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC017843 // GenBank // Homo sapiens cholesterol 25-hydroxylase, mRNA (cDNA clone MGC:22529 IMAGE:4619357), complete cds. // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC072430 // GenBank // Homo sapiens cholesterol 25-hydroxylase, mRNA (cDNA clone MGC:88041 IMAGE:5589142), complete cds. // chr10 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000669 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:89206474:89207292:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
NM_213606 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 16, member 12 (SLC16A12), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000371790 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:89430299:89535556:-1 gene:ENSG00000152779 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK124901 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ42911 fis, clone BRHIP3024118, weakly similar to Monocarboxylate transporter 4. // chr10 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000000680 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:89433064:89462488:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
NR_029524 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 107 (MIR107), microRNA. // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000362127 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:89592743:89592829:-1 gene:ENSG00000198997 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// hsa-mir-107 // miRBase Micro RNA Database // MI0000114 Homo sapiens miR-107 stem-loop // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT015516 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
ENST00000410519 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:90163651:90163960:-1 gene:ENSG00000222451 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT015582 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000410373 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:90880040:90880179:-1 gene:ENSG00000222305 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT015605 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_014391 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat domain 1 (cardiac muscle) (ANKRD1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000371697 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:90912096:90921276:-1 gene:ENSG00000148677 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK290960 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76040 complete cds, highly similar to Homo sapiens ankyrin repeat domain 1 (cardiac muscle) (ANKRD1), mRNA. // chr10 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// AY903446 // GenBank // Homo sapiens liver ankyrin repeat domain 1 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// BC018667 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat domain 1 (cardiac muscle), mRNA (cDNA clone MGC:27140 IMAGE:4245591), complete cds. // chr10 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000006077 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:90912866:90921027:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
ENST00000364734 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:90922731:90922835:-1 gene:ENSG00000201604 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT015610 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_002779 // RefSeq // Homo sapiens nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 9 pseudogene 1 (NUDT9P1), non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000006088 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:91152627:91152989:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000477230 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:91152605:91153349:-1 gene:ENSG00000234043 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr10 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
NM_005398 // RefSeq // Homo sapiens protein phosphatase 1, regulatory subunit 3C (PPP1R3C), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000238994 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:91628442:91633054:-1 gene:ENSG00000119938 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AK299392 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53586 complete cds, highly similar to Homo sapiens protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 3C (PPP1R3C), mRNA. // chr10 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// AK299398 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51534 complete cds, highly similar to Homo sapiens protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 3C (PPP1R3C), mRNA. // chr10 // 88 // 63 // 15 // 17 // 0 /// BC012625 // GenBank // Homo sapiens protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 3C, mRNA (cDNA clone MGC:13673 IMAGE:4245774), complete cds. // chr10 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// BX537399 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686A0786 (from clone DKFZp686A0786); complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000006087 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:91629927:91667782:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_152429 // RefSeq // Homo sapiens fibroblast growth factor binding protein 3 (FGFBP3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000311575 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:91906589:91909483:-1 gene:ENSG00000174721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC025966 // GenBank // Homo sapiens fibroblast growth factor binding protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:39320 IMAGE:4895171), complete cds. // chr10 // 96 // 78 // 24 // 25 // 0 /// DQ503576 // GenBank // Homo sapiens fibroblast growth factor binding protein 3 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000039010 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:91908193:91908969:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0
NM_001178137 // RefSeq // Homo sapiens cytoplasmic polyadenylation element binding protein 3 (CPEB3), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// NM_014912 // RefSeq // Homo sapiens cytoplasmic polyadenylation element binding protein 3 (CPEB3), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// XM_006717717 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens cytoplasmic polyadenylation element binding protein 3 (CPEB3), transcript variant X5, mRNA. // chr10 // 95 // 55 // 20 // 21 // 0 /// ENST00000265997 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:92049631:92291087:-1 gene:ENSG00000107864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000412050 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:92046692:92243246:-1 gene:ENSG00000107864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// AK302576 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61637 complete cds, highly similar to Homo sapiens cytoplasmic polyadenylation element binding protein 3 (CPEB3), mRNA. // chr10 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// BC036444 // GenBank // Homo sapiens cytoplasmic polyadenylation element binding protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:26333 IMAGE:4838004), complete cds. // chr10 // 97 // 79 // 29 // 30 // 0 /// ENST00000614585 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:92048642:92243279:-1 gene:ENSG00000107864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000039017 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:92222488:92240500:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 21 // 8 // 8 // 0
ENST00000363011 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:92272147:92272250:-1 gene:ENSG00000199881 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT015648 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000428356 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:92668745:92669743:-1 gene:ENSG00000236493 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000039013 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:92668772:92669743:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
ENST00000364542 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:92710499:92710608:-1 gene:ENSG00000201412 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT015672 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
ENST00000391094 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:93510548:93510680:-1 gene:ENSG00000212396 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT015681 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_006744 // RefSeq // Homo sapiens retinol binding protein 4, plasma (RBP4), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000371464 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:93591687:93601226:-1 gene:ENSG00000138207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000371467 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:93591687:93601663:-1 gene:ENSG00000138207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000371469 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:10:93591889:93601744:-1 gene:ENSG00000138207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// BC020633 // GenBank // Homo sapiens retinol binding protein 4, plasma, mRNA (cDNA clone MGC:22269 IMAGE:4767481), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000615669 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:93591844:93601203:-1 gene:ENSG00000138207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 93 // 93 // 25 // 27 // 1 /// AF119868 // GenBank HTC // Homo sapiens PRO2222 mRNA, complete cds. // chr10 // 89 // 89 // 24 // 27 // 1 /// GENSCAN00000015147 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:93587232:93601028:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
XR_428696 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens fragile site, folic acid type, rare, fra(10)(q23.3) or fra(10)(q24.2) candidate 1 (FRA10AC1), transcript variant X3, misc_RNA. // chr10 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// AJ431722 // GenBank // Homo sapiens mRNA for FRA10AC1 protein, variant 3.3. // chr10 // 91 // 94 // 31 // 34 // 0 /// AJ431723 // GenBank // Homo sapiens mRNA for FRA10AC1 protein, variant 3.2. // chr10 // 91 // 94 // 31 // 34 // 0 /// AJ431724 // GenBank // Homo sapiens mRNA for FRA10AC1 protein, variant 3.1. // chr10 // 91 // 94 // 31 // 34 // 0 /// BC018007 // GenBank // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 4, mRNA (cDNA clone MGC:24718 IMAGE:4278022), complete cds. // chr10 // 78 // 64 // 18 // 23 // 0 /// NM_145246 // RefSeq // Homo sapiens fragile site, folic acid type, rare, fra(10)(q23.3) or fra(10)(q24.2) candidate 1 (FRA10AC1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 1 /// XM_005269516 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens fragile site, folic acid type, rare, fra(10)(q23.3) or fra(10)(q24.2) candidate 1 (FRA10AC1), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 94 // 94 // 34 // 36 // 1 /// ENST00000359204 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:93667883:93702572:-1 gene:ENSG00000148690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 1 /// AK308861 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ98902. // chr10 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// BX648699 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686H1339 (from clone DKFZp686H1339). // chr10 // 31 // 31 // 11 // 36 // 1 /// AF305826 // GenBank HTC // Homo sapiens PRO2972 mRNA, complete cds. // chr10 // 56 // 56 // 20 // 36 // 1
NR_002319 // RefSeq // Homo sapiens PIP5K1A and PSMD4-like, pseudogene (PIPSL), non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000480546 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:10:93958191:93961540:-1 gene:ENSG00000180764 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000489875 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:93958191:93961540:-1 gene:ENSG00000180764 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr10 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000032552 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:93912757:94012696:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 85 // 11 // 11 // 0
ENST00000383904 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:94155639:94155745:-1 gene:ENSG00000206631 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT015716 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_022451 // RefSeq // Homo sapiens nucleolar complex associated 3 homolog (S. cerevisiae) (NOC3L), mRNA. // chr10 // 98 // 98 // 44 // 45 // 0 /// ENST00000371361 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:94333226:94362939:-1 gene:ENSG00000173145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// AB077992 // GenBank // Homo sapiens mRNA for AD24, complete cds. // chr10 // 98 // 91 // 41 // 42 // 0 /// AK292520 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77615 complete cds, highly similar to Homo sapiens nucleolar complex associated 3 homolog (S. cerevisiae) (NOC3L), mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// AK302028 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59781 complete cds, highly similar to Nucleolar complex protein 3 homolog. // chr10 // 96 // 61 // 27 // 28 // 0 /// BC049850 // GenBank // Homo sapiens nucleolar complex associated 3 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:52005 IMAGE:5549517), complete cds. // chr10 // 98 // 98 // 44 // 45 // 0 /// ENST00000463649 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:94346476:94362939:-1 gene:ENSG00000173145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 48 // 48 // 22 // 46 // 1 /// BC030999 // GenBank HTC // Homo sapiens nucleolar complex associated 3 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone IMAGE:4722101), with apparent retained intron. // chr10 // 48 // 48 // 22 // 46 // 1 /// GENSCAN00000032560 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:94334177:94362838:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 97 // 63 // 28 // 29 // 0
NM_020992 // RefSeq // Homo sapiens PDZ and LIM domain 1 (PDLIM1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000329399 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:95237572:95291024:-1 gene:ENSG00000107438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000477757 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:95238010:95291012:-1 gene:ENSG00000107438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 50 // 10 // 10 // 0 /// BC000915 // GenBank // Homo sapiens PDZ and LIM domain 1, mRNA (cDNA clone MGC:5344 IMAGE:2985229), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC018755 // GenBank // Homo sapiens PDZ and LIM domain 1, mRNA (cDNA clone MGC:31954 IMAGE:3610938), complete cds. // chr10 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// FJ224331 // GenBank // Homo sapiens epididymis secretory protein Li 112 (HEL-S-112) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// U90878 // GenBank // Homo sapiens carboxyl terminal LIM domain protein (CLIM1) mRNA, complete cds. // chr10 // 89 // 90 // 16 // 18 // 0 /// AK091847 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ34528 fis, clone HLUNG2008066, weakly similar to LIM DOMAIN PROTEIN CLP-36. // chr10 // 50 // 50 // 10 // 20 // 1
NM_012465 // RefSeq // Homo sapiens tolloid-like 2 (TLL2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000357947 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:96364606:96513911:-1 gene:ENSG00000095587 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000469598 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:96395193:96513918:-1 gene:ENSG00000095587 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// AF059516 // GenBank // Homo sapiens tolloid-like 2 protein (TLL2) mRNA, complete cds. // chr10 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// AK026106 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ22453 fis, clone HRC09679, highly similar to AF059516 Homo sapiens tolloid-like 2 protein (TLL2) mRNA. // chr10 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// BC030548 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5182610, containing frame-shift errors. // chr10 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// BC112341 // GenBank // Homo sapiens tolloid-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:133312 IMAGE:40038720), complete cds. // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC112366 // GenBank // Homo sapiens tolloid-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:133313 IMAGE:40038726), complete cds. // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC113577 // GenBank // Homo sapiens tolloid-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:142137 IMAGE:8322629), complete cds. // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000044547 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:96368088:96448288:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_020123 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane 9 superfamily member 3 (TM9SF3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000371142 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:96518109:96587052:-1 gene:ENSG00000077147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000443638 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:96551311:96587452:-1 gene:ENSG00000077147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 93 // 34 // 13 // 14 // 0 /// ENST00000464654 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:96553024:96577542:-1 gene:ENSG00000077147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 24 // 10 // 10 // 0 /// AF160213 // GenBank // Homo sapiens endomembrane protein emp70 precursor isolog mRNA, complete cds. // chr10 // 88 // 100 // 36 // 41 // 0 /// AF269150 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein TM9SF3 (TM9SF3) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// AK297721 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59136 complete cds, highly similar to Transmembrane 9 superfamily protein member 3 precursor. // chr10 // 100 // 41 // 17 // 17 // 0 /// AY358819 // GenBank // Homo sapiens clone DNA16416 PATY245 (UNQ245) mRNA, complete cds. // chr10 // 97 // 90 // 36 // 37 // 0 /// BC136788 // GenBank // Homo sapiens transmembrane 9 superfamily member 3, mRNA (cDNA clone MGC:168401 IMAGE:9020778), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// BC136789 // GenBank // Homo sapiens transmembrane 9 superfamily member 3, mRNA (cDNA clone MGC:168402 IMAGE:9020779), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000044548 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:96522263:96586835:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 63 // 26 // 26 // 0
NM_152309 // RefSeq // Homo sapiens phosphoinositide-3-kinase adaptor protein 1 (PIK3AP1), mRNA. // chr10 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000339364 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:96593312:96720514:-1 gene:ENSG00000155629 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000371109 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:96595208:96633241:-1 gene:ENSG00000155629 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000371110 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:96594495:96669611:-1 gene:ENSG00000155629 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// BC029917 // GenBank // Homo sapiens phosphoinositide-3-kinase adaptor protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:35132 IMAGE:5168493), complete cds. // chr10 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000468783 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:96628398:96700878:-1 gene:ENSG00000155629 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1 /// AK122584 // GenBank // Homo sapiens mRNA for FLJ00308 protein. // chr10 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1 /// GENSCAN00000044541 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:96626688:96720394:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 42 // 42 // 10 // 24 // 1
AF116714 // GenBank HTC // Homo sapiens PRO2796 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_003061 // RefSeq // Homo sapiens slit homolog 1 (Drosophila) (SLIT1), mRNA. // chr10 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// ENST00000266058 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:96998038:97185920:-1 gene:ENSG00000187122 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// ENST00000314867 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:10:97037698:97185623:-1 gene:ENSG00000187122 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 50 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000371041 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:10:97057742:97185920:-1 gene:ENSG00000187122 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 25 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000371070 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:10:97001113:97185758:-1 gene:ENSG00000187122 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 82 // 36 // 36 // 0 /// AB017167 // GenBank // Homo sapiens mRNA for Slit-1 protein, complete cds. // chr10 // 92 // 86 // 35 // 38 // 0 /// BC028105 // GenBank HTC // Homo sapiens slit homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:5247200), with apparent retained intron. // chr10 // 100 // 25 // 11 // 11 // 0 /// BC146761 // GenBank // Homo sapiens slit homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:166830 IMAGE:9007200), complete cds. // chr10 // 98 // 98 // 42 // 43 // 0 /// BC146851 // GenBank // Homo sapiens slit homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:181954 IMAGE:9056779), complete cds. // chr10 // 97 // 84 // 36 // 37 // 0 /// GENSCAN00000038253 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:97001112:97105990:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 75 // 33 // 33 // 0
NR_037909 // RefSeq // Homo sapiens ARHGAP19-SLIT1 readthrough (NMD candidate) (ARHGAP19-SLIT1), long non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000475285 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:97153045:97155433:-1 gene:ENSG00000269891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000479633 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:97153046:97292637:-1 gene:ENSG00000269891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK097919 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ40600 fis, clone THYMU2011431. // chr10 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// AY336750 // GenBank // Homo sapiens putative RhoGAP protein mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT015848 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_012083 // RefSeq // Homo sapiens frequently rearranged in advanced T-cell lymphomas 2 (FRAT2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000371019 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:97332497:97334709:-1 gene:ENSG00000181274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// AB045118 // GenBank // Homo sapiens FRAT2 mRNA, complete cds. // chr10 // 94 // 100 // 17 // 18 // 0 /// BC020165 // GenBank // Homo sapiens frequently rearranged in advanced T-cell lymphomas 2, mRNA (cDNA clone MGC:10562 IMAGE:3629702), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BT009770 // GenBank // Homo sapiens frequently rearranged in advanced T-cell lymphomas mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 44 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000038276 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:97333871:97342882:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 56 // 10 // 10 // 0
NM_021732 // RefSeq // Homo sapiens arginine vasopressin-induced 1 (AVPI1), mRNA. // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000370626 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:97677424:97687323:-1 gene:ENSG00000119986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF241786 // GenBank // Homo sapiens NPD013 (NPD013) mRNA, complete cds. // chr10 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// AK024533 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ20880 fis, clone ADKA03171, highly similar to AF131791 Homo sapiens clone 25116 mRNA sequence. // chr10 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// BC000877 // GenBank // Homo sapiens arginine vasopressin-induced 1, mRNA (cDNA clone MGC:5610 IMAGE:3461724), complete cds. // chr10 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0
NM_003015 // RefSeq // Homo sapiens secreted frizzled-related protein 5 (SFRP5), mRNA. // chr10 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000266066 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:97766751:97771952:-1 gene:ENSG00000120057 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AF017988 // GenBank // Homo sapiens secreted apoptosis related protein 3 (SARP3) mRNA, complete cds. // chr10 // 89 // 96 // 24 // 27 // 0 /// AF117758 // GenBank // Homo sapiens secreted frizzled-related protein 5 (SFRP5) mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// BC050435 // GenBank // Homo sapiens secreted frizzled-related protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:54179 IMAGE:6189478), complete cds. // chr10 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000038272 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:97767514:97771833:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0
NM_001206528 // RefSeq // Homo sapiens cartilage acidic protein 1 (CRTAC1), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// NM_018058 // RefSeq // Homo sapiens cartilage acidic protein 1 (CRTAC1), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// XM_005269938 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens cartilage acidic protein 1 (CRTAC1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 78 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000309155 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:97879651:98011337:-1 gene:ENSG00000095713 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 78 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000370591 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:97879629:98030828:-1 gene:ENSG00000095713 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000370597 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:97865000:98030828:-1 gene:ENSG00000095713 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000413387 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:97865000:97936278:-1 gene:ENSG00000095713 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 78 // 29 // 29 // 0 /// AK292084 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77583 complete cds, highly similar to Homo sapiens cartilage acidic protein 1 (CRTAC1), mRNA. // chr10 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// BC034245 // GenBank // Homo sapiens cartilage acidic protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:16989 IMAGE:4178363), complete cds. // chr10 // 97 // 78 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000008987 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:97873484:98029547:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 78 // 78 // 29 // 37 // 1
NM_032211 // RefSeq // Homo sapiens lysyl oxidase-like 4 (LOXL4), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000260702 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:98247690:98268250:-1 gene:ENSG00000138131 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// AF338441 // GenBank // Homo sapiens lysyl oxidase-related protein C (LOXC) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0 /// AF395336 // GenBank // Homo sapiens lysyl oxidase-like 4 (LOXL4) mRNA, complete cds. // chr10 // 97 // 80 // 31 // 32 // 0 /// AY036093 // GenBank // Homo sapiens lysyl oxidase-like 4 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// BC007522 // GenBank // Homo sapiens lysyl oxidase-like 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:3353864), complete cds. // chr10 // 100 // 48 // 19 // 19 // 0 /// BC013153 // GenBank // Homo sapiens lysyl oxidase-like 4, mRNA (cDNA clone MGC:17373 IMAGE:3872314), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000008993 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:98248921:98263019:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 70 // 28 // 28 // 0
NM_032709 // RefSeq // Homo sapiens pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase domain 2 (PYROXD2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000370575 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:98383565:98415184:-1 gene:ENSG00000119943 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000483923 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:98383565:98411877:-1 gene:ENSG00000119943 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// AK295699 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58845 complete cds, highly similar to Probable oxidoreductase C10orf33 (EC 1.-.-.-). // chr10 // 100 // 42 // 14 // 14 // 0 /// BC006131 // GenBank // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 33, mRNA (cDNA clone MGC:13047 IMAGE:3626506), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC050574 // GenBank HTC // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 33, mRNA (cDNA clone IMAGE:5587655), containing frame-shift errors. // chr10 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// AK123713 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ41719 fis, clone HLUNG2013204, moderately similar to Phytoene dehydrogenase-like. // chr10 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1 /// GENSCAN00000008986 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:98384022:98415135:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0
NM_002079 // RefSeq // Homo sapiens glutamic-oxaloacetic transaminase 1, soluble (GOT1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000370508 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:99396870:99430593:-1 gene:ENSG00000120053 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000489349 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:99397465:99403749:-1 gene:ENSG00000120053 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// AK293483 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53826 complete cds, highly similar to Aspartate aminotransferase, cytoplasmic (EC 2.6.1.1). // chr10 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// AK301916 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51134 complete cds, highly similar to Aspartate aminotransferase, cytoplasmic (EC 2.6.1.1). // chr10 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// AY513279 // GenBank // Homo sapiens growth-inhibiting protein 18 (GIG18) mRNA, complete cds. // chr10 // 95 // 71 // 19 // 20 // 0 /// BC000498 // GenBank // Homo sapiens glutamic-oxaloacetic transaminase 1, soluble (aspartate aminotransferase 1), mRNA (cDNA clone MGC:8411 IMAGE:2820849), complete cds. // chr10 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// M37400 // GenBank // Human cytosolic aspartate aminotransferase mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000037307 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:99397547:99456485:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NM_015221 // RefSeq // Homo sapiens dynamin binding protein (DNMBP), mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000324109 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:99875577:100009919:-1 gene:ENSG00000107554 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000422692 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:99898197:99914082:-1 gene:ENSG00000107554 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 20 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000543621 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:99875577:99914081:-1 gene:ENSG00000107554 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 65 // 30 // 30 // 0 /// AK128576 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ46735 fis, clone TRACH3020605, highly similar to Dynamin-binding protein. // chr10 // 93 // 61 // 26 // 28 // 0 /// AK303479 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51432 complete cds, highly similar to Dynamin-binding protein. // chr10 // 100 // 43 // 20 // 20 // 0 /// AL833283 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp451J178 (from clone DKFZp451J178). // chr10 // 95 // 96 // 42 // 44 // 0 /// AY196211 // GenBank // Homo sapiens TUBA mRNA, complete cds. // chr10 // 98 // 87 // 39 // 40 // 0 /// BC041628 // GenBank // Homo sapiens dynamin binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:52388 IMAGE:4329464), complete cds. // chr10 // 93 // 65 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000033759 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:99877151:100081625:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 83 // 38 // 38 // 0
NM_001308 // RefSeq // Homo sapiens carboxypeptidase N, polypeptide 1 (CPN1), mRNA. // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000370418 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:100042193:100081877:-1 gene:ENSG00000120054 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000441382 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:100048767:100065394:-1 gene:ENSG00000120054 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// BC027897 // GenBank // Homo sapiens carboxypeptidase N, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:34611 IMAGE:5227795), complete cds. // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000033759 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:99877151:100081625:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1
NM_001100626 // RefSeq // Homo sapiens ER lipid raft associated 1 (ERLIN1), mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NM_006459 // RefSeq // Homo sapiens ER lipid raft associated 1 (ERLIN1), mRNA. // chr10 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000421367 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:100150094:100188334:-1 gene:ENSG00000107566 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK056574 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ32012 fis, clone NTONG1000006, highly similar to Homo sapiens KE04p mRNA. // chr10 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// AK298427 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57553 complete cds, highly similar to SPFH domain-containing protein 1 precursor. // chr10 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// BC031791 // GenBank // Homo sapiens ER lipid raft associated 1, mRNA (cDNA clone MGC:24915 IMAGE:4214940), complete cds. // chr10 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000370408 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:100154860:100186029:-1 gene:ENSG00000107566 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// ENST00000407654 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:100151808:100186033:-1 gene:ENSG00000107566 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 88 // 88 // 23 // 26 // 1 /// AF064093 // GenBank // Homo sapiens KE04p mRNA, complete cds. // chr10 // 88 // 88 // 23 // 26 // 1 /// AK222480 // GenBank // Homo sapiens mRNA for SPFH domain family, member 1 variant, clone: adKA01927. // chr10 // 88 // 88 // 23 // 26 // 1 /// AK127017 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ45073 fis, clone BRAWH3027420. // chr10 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// GENSCAN00000033772 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:100120998:100229532:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1
NM_001278 // RefSeq // Homo sapiens conserved helix-loop-helix ubiquitous kinase (CHUK), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000370397 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:100188298:100229619:-1 gene:ENSG00000213341 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB209028 // GenBank // Homo sapiens mRNA for conserved helix-loop-helix ubiquitous kinase variant protein. // chr10 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// AF009225 // GenBank // Homo sapiens IkB kinase alpha subunit (IKK alpha) mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// AF012890 // GenBank // Homo sapiens IKK-a kinase (IKK-a) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AF080157 // GenBank // Homo sapiens IkB kinase-a (IKK-alpha) mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC092514 // GenBank // Homo sapiens conserved helix-loop-helix ubiquitous kinase, mRNA (cDNA clone MGC:104955 IMAGE:3063613), complete cds. // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// U22512 // GenBank // Human helix-loop-helix protein CHUK mRNA, complete cds. // chr10 // 91 // 88 // 21 // 23 // 0 /// ENST00000590930 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:100188367:100195942:-1 gene:ENSG00000213341 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// AL133012 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp566L084 (from clone DKFZp566L084). // chr10 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000033772 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:100120998:100229532:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// NONHSAT015947 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr10 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001253837 // RefSeq // Homo sapiens polycystic kidney disease 2-like 1 (PKD2L1), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NM_016112 // RefSeq // Homo sapiens polycystic kidney disease 2-like 1 (PKD2L1), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000318222 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:100288154:100330486:-1 gene:ENSG00000107593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000528248 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:100288396:100329940:-1 gene:ENSG00000107593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr10 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000532547 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:100299635:100330264:-1 gene:ENSG00000107593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr10 // 100 // 21 // 9 // 9 // 0 /// AF073481 // GenBank // Homo sapiens polycystin-L (PKDL) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// BC025665 // GenBank // Homo sapiens polycystic kidney disease 2-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:34317 IMAGE:5200440), complete cds. // chr10 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// DQ084244 // GenBank // Homo sapiens polycystic kidney disease 2-like 1 variant (PKD2L1) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000465680 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:10:100288160:100329972:-1 gene:ENSG00000107593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1 /// GENSCAN00000033758 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:100253417:100330103:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 71 // 71 // 30 // 42 // 1
AF132203 // GenBank HTC // Homo sapiens PRO1933 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
ENST00000391023 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:100398352:100398446:-1 gene:ENSG00000212325 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT015973 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001195263 // RefSeq // Homo sapiens PDZ domain containing 7 (PDZD7), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// NM_024895 // RefSeq // Homo sapiens PDZ domain containing 7 (PDZD7), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// XM_006717975 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens PDZ domain containing 7 (PDZD7), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 37 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000370215 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:101017332:101031133:-1 gene:ENSG00000186862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// BC029054 // GenBank // Homo sapiens PDZ domain containing 7, mRNA (cDNA clone MGC:34150 IMAGE:5179973), complete cds. // chr10 // 100 // 37 // 11 // 11 // 0 /// FJ617449 // GenBank // Homo sapiens PDZD7 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000474125 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:101007683:101031105:-1 gene:ENSG00000186862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr10 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// AK024422 // GenBank // Homo sapiens mRNA for FLJ00011 protein, partial cds. // chr10 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// AK225136 // GenBank // Homo sapiens mRNA for Splice isoform 2 of Q9H5P4 variant, clone: CBL05843. // chr10 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// ENST00000619208 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:101007684:101031157:-1 gene:ENSG00000186862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042372 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:101007916:101030219:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0
NM_006562 // RefSeq // Homo sapiens ladybird homeobox 1 (LBX1), mRNA. // chr10 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENST00000370193 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:101226195:101229794:-1 gene:ENSG00000138136 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC069156 // GenBank // Homo sapiens ladybird homeobox 1, mRNA (cDNA clone MGC:95442 IMAGE:7217017), complete cds. // chr10 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC136321 // GenBank // Homo sapiens ladybird homeobox 1, mRNA (cDNA clone MGC:167931 IMAGE:9020308), complete cds. // chr10 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// X90828 // GenBank // H.sapiens mRNA for transcription factor, Lbx1. // chr10 // 58 // 100 // 15 // 26 // 0 /// GENSCAN00000042375 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:101227270:101240980:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 91 // 88 // 21 // 23 // 0
ENST00000410482 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:101364845:101365035:-1 gene:ENSG00000222414 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT139992 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NONHSAT016055 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AF090931 // GenBank // Homo sapiens clone HQ0483$ PRO0483 mRNA, complete cds. // chr10 // 90 // 100 // 18 // 20 // 0
NM_022039 // RefSeq // Homo sapiens F-box and WD repeat domain containing 4 (FBXW4), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000331272 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:101610666:101695259:-1 gene:ENSG00000107829 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000457105 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:101624747:101695295:-1 gene:ENSG00000107829 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 36 // 8 // 8 // 0 /// AF281859 // GenBank // Homo sapiens dactylin mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC063415 // GenBank // Homo sapiens F-box and WD repeat domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:74486 IMAGE:5223794), complete cds. // chr10 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000470093 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:101610664:101626899:-1 gene:ENSG00000107829 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 36 // 36 // 8 // 22 // 1 /// AK056917 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ32355 fis, clone PROST2007956, highly similar to Homo sapiens dactylin mRNA. // chr10 // 36 // 36 // 8 // 22 // 1 /// AK123173 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ41178 fis, clone BRACE2042873, highly similar to Homo sapiens dactylin mRNA. // chr10 // 36 // 36 // 8 // 22 // 1 /// GENSCAN00000042364 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:101611291:101695183:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// AK226061 // GenBank // Homo sapiens mRNA for solute carrier family 9 (sodium/hydrogen exchanger), isoform 6 variant, clone: hh00225. // chr10 // 64 // 64 // 14 // 22 // 1
NM_006993 // RefSeq // Homo sapiens nucleophosmin/nucleoplasmin 3 (NPM3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000370110 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:101781325:101783413:-1 gene:ENSG00000107833 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000462391 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:101781589:101783375:-1 gene:ENSG00000107833 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000468544 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:101781727:101782648:-1 gene:ENSG00000107833 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000474993 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:101781332:101783384:-1 gene:ENSG00000107833 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// AF081280 // GenBank // Homo sapiens nucleoplasmin-3 (NPM3) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY049737 // GenBank // Homo sapiens nucleophosmin/nucleoplasmin 3 (NPM3) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC041067 // GenBank // Homo sapiens nucleophosmin/nucleoplasmin, 3, mRNA (cDNA clone MGC:52213 IMAGE:5473410), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC054868 // GenBank // Homo sapiens nucleophosmin/nucleoplasmin, 3, mRNA (cDNA clone MGC:61940 IMAGE:6496849), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000042359 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:101781736:101834369:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1
NM_024541 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 76 (C10orf76), mRNA. // chr10 // 100 // 90 // 56 // 56 // 0 /// ENST00000311122 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:102029448:102056193:-1 gene:ENSG00000120029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 47 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000370033 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:101845599:102056193:-1 gene:ENSG00000120029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 57 // 57 // 0 /// ENST00000470043 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:102029448:102033438:-1 gene:ENSG00000120029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 31 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000495001 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:101845599:101889736:-1 gene:ENSG00000120029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 24 // 15 // 15 // 0 /// AK097972 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ40653 fis, clone THYMU2018673. // chr10 // 100 // 24 // 15 // 15 // 0 /// BC054882 // GenBank // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 76, mRNA (cDNA clone IMAGE:6451327), partial cds. // chr10 // 100 // 47 // 29 // 29 // 0 /// AK308479 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ98520. // chr10 // 13 // 13 // 8 // 62 // 1 /// GENSCAN00000030318 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:101847528:102040114:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 69 // 43 // 43 // 0 /// NONHSAT016083 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr10 // 100 // 31 // 19 // 19 // 0
NM_005029 // RefSeq // Homo sapiens paired-like homeodomain 3 (PITX3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000370002 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:102230186:102241474:-1 gene:ENSG00000107859 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000539804 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:102230186:102232083:-1 gene:ENSG00000107859 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// AF041339 // GenBank // Homo sapiens homeodomain protein (PITX3) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// BC011642 // GenBank // Homo sapiens paired-like homeodomain 3, mRNA (cDNA clone MGC:12766 IMAGE:4131442), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000030326 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:102230514:102232080:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0
NM_001270965 // RefSeq // Homo sapiens pleckstrin and Sec7 domain containing (PSD), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NM_001270966 // RefSeq // Homo sapiens pleckstrin and Sec7 domain containing (PSD), transcript variant 3, mRNA. // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NM_002779 // RefSeq // Homo sapiens pleckstrin and Sec7 domain containing (PSD), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NR_073110 // RefSeq // Homo sapiens pleckstrin and Sec7 domain containing (PSD), transcript variant 4, non-coding RNA. // chr10 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000020673 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:102402619:102419144:-1 gene:ENSG00000059915 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000406432 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:102402617:102419934:-1 gene:ENSG00000059915 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC142643 // GenBank // Homo sapiens pleckstrin and Sec7 domain containing, mRNA (cDNA clone MGC:164849 IMAGE:40147927), complete cds. // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC142689 // GenBank // Homo sapiens pleckstrin and Sec7 domain containing, mRNA (cDNA clone MGC:165002 IMAGE:40148656), complete cds. // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000611678 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:102402617:102419727:-1 gene:ENSG00000059915 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000030330 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:102403200:102417038:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// X99688 // GenBank // H.sapiens mRNA from TYL gene. // chr10 // 96 // 82 // 22 // 23 // 0
NM_024040 // RefSeq // Homo sapiens CUE domain containing 2 (CUEDC2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000369937 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:102423245:102432661:-1 gene:ENSG00000107874 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000465409 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:102423245:102424304:-1 gene:ENSG00000107874 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000477994 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:102424031:102432584:-1 gene:ENSG00000107874 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 91 // 44 // 10 // 11 // 0 /// ENST00000486762 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:102424009:102432568:-1 gene:ENSG00000107874 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 90 // 40 // 9 // 10 // 0 /// AB025425 // GenBank // Homo sapiens mRNA for HOYS6, complete cds. // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AB232358 // GenBank // Homo sapiens cuedc2 mRNA for CUE domain containing 2 (CUEDC2), complete cds. // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC000262 // GenBank // Homo sapiens CUE domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:2491 IMAGE:3353174), complete cds. // chr10 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000030324 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:102423426:102425188:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_024886 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 95 (C10orf95), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000239125 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:102449837:102451543:-1 gene:ENSG00000120055 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC126459 // GenBank // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 95, mRNA (cDNA clone MGC:161737 IMAGE:8992175), complete cds. // chr10 // 100 // 70 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000030333 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:102450452:102451093:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 35 // 8 // 8 // 0
NM_004311 // RefSeq // Homo sapiens ADP-ribosylation factor-like 3 (ARL3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000260746 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:102673731:102714407:-1 gene:ENSG00000138175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF493889 // GenBank // Homo sapiens ADP-ribosylation factor-like protein 3 (ARL3) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// BC009841 // GenBank // Homo sapiens ADP-ribosylation factor-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:15269 IMAGE:3926032), complete cds. // chr10 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// CR407637 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834F042D for gene ARL3, ADP-ribosylation factor-like 3 complete cds, without stopcodon. // chr10 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// U07151 // GenBank // Human GTP binding protein (ARL3) mRNA, complete cds. // chr10 // 88 // 61 // 15 // 17 // 0 /// GENSCAN00000030317 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:102665439:102707647:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NM_000102 // RefSeq // Homo sapiens cytochrome P450, family 17, subfamily A, polypeptide 1 (CYP17A1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000369887 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:102830531:102837533:-1 gene:ENSG00000148795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK289898 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78498 complete cds, highly similar to Homo sapiens cytochrome P450, family 17, subfamily A, polypeptide 1 (CYP17A1), mRNA. // chr10 // 93 // 97 // 27 // 29 // 0 /// BC062997 // GenBank // Homo sapiens cytochrome P450, family 17, subfamily A, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:70666 IMAGE:5171626), complete cds. // chr10 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// BC063388 // GenBank // Homo sapiens cytochrome P450, family 17, subfamily A, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:74864 IMAGE:5170736), complete cds. // chr10 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BT020000 // GenBank // Homo sapiens cytochrome P450, family 17, subfamily A, polypeptide 1 mRNA, complete cds. // chr10 // 92 // 87 // 24 // 26 // 0 /// M14564 // GenBank // Human cytochrome P450c17 (steroid 17-alpha-hydroxylase/17,20 lyase) mRNA, complete cds. // chr10 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// ENST00000489268 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:102833475:102837414:-1 gene:ENSG00000148795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1 /// AK094106 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ36787 fis, clone ADRGL2003585, highly similar to CYTOCHROME P450 17 (EC 1.14.99.9). // chr10 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1 /// GENSCAN00000030322 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:102822376:102837361:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
NM_001011663 // RefSeq // Homo sapiens polycomb group ring finger 6 (PCGF6), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NM_032154 // RefSeq // Homo sapiens polycomb group ring finger 6 (PCGF6), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000337211 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:103302796:103351079:-1 gene:ENSG00000156374 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000369847 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:103302796:103351134:-1 gene:ENSG00000156374 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000490296 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:103303127:103351081:-1 gene:ENSG00000156374 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// AB047006 // GenBank // Homo sapiens hMBLR mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// AK290679 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77076 complete cds, highly similar to Homo sapiens polycomb group ring finger 6 (PCGF6), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// AK309105 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99146. // chr10 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// BC007602 // GenBank // Homo sapiens polycomb group ring finger 6, mRNA (cDNA clone MGC:15678 IMAGE:3350074), complete cds. // chr10 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// BC010235 // GenBank // Homo sapiens polycomb group ring finger 6, mRNA (cDNA clone MGC:17541 IMAGE:3461513), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
ENST00000391111 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:103312436:103312568:-1 gene:ENSG00000212413 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT016167 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001206427 // RefSeq // Homo sapiens up-regulated during skeletal muscle growth 5 homolog (mouse) (USMG5), transcript variant 3, mRNA. // chr10 // 100 // 67 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000369825 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:103389041:103396023:-1 gene:ENSG00000173915 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 67 // 10 // 10 // 0 /// NM_032747 // RefSeq // Homo sapiens up-regulated during skeletal muscle growth 5 homolog (mouse) (USMG5), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 1 /// ENST00000337003 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:103389050:103396466:-1 gene:ENSG00000173915 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 93 // 93 // 14 // 15 // 1 /// BC007087 // GenBank // Homo sapiens up-regulated during skeletal muscle growth 5 homolog (mouse), mRNA (cDNA clone MGC:14697 IMAGE:4245636), complete cds. // chr10 // 80 // 80 // 12 // 15 // 1 /// NM_001206426 // RefSeq // Homo sapiens up-regulated during skeletal muscle growth 5 homolog (mouse) (USMG5), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 67 // 67 // 10 // 15 // 1 /// ENST00000309579 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:103389050:103396466:-1 gene:ENSG00000173915 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 60 // 60 // 9 // 15 // 1 /// BC072683 // GenBank // Homo sapiens up-regulated during skeletal muscle growth 5 homolog (mouse), mRNA (cDNA clone MGC:87882 IMAGE:6056764), complete cds. // chr10 // 60 // 60 // 9 // 15 // 1 /// BC091507 // GenBank // Homo sapiens up-regulated during skeletal muscle growth 5 homolog (mouse), mRNA (cDNA clone MGC:111165 IMAGE:30417704), complete cds. // chr10 // 53 // 53 // 8 // 15 // 1
AY007124 // GenBank // Homo sapiens clone CDABP0021 mRNA sequence. // chr10 // 92 // 96 // 24 // 26 // 0
NM_001001412 // RefSeq // Homo sapiens calcium homeostasis modulator 1 (CALHM1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000329905 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:103453387:103458888:-1 gene:ENSG00000185933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC036193 // GenBank // Homo sapiens calcium homeostasis modulator 1, mRNA (cDNA clone MGC:39514 IMAGE:5262638), complete cds. // chr10 // 91 // 100 // 30 // 33 // 0 /// BC036208 // GenBank // Homo sapiens calcium homeostasis modulator 1, mRNA (cDNA clone MGC:39617 IMAGE:5262620), complete cds. // chr10 // 91 // 100 // 30 // 33 // 0 /// GENSCAN00000029412 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:103447152:103458751:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
NM_001129742 // RefSeq // Homo sapiens calcium homeostasis modulator 3 (CALHM3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000369783 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:103472804:103479240:-1 gene:ENSG00000183128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC043367 // GenBank // Homo sapiens calcium homeostasis modulator 3, mRNA (cDNA clone MGC:50049 IMAGE:5110383), complete cds. // chr10 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000029410 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:103473213:103549407:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0
NM_024928 // RefSeq // Homo sapiens oligonucleotide/oligosaccharide-binding fold containing 1 (OBFC1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006717976 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens oligonucleotide/oligosaccharide-binding fold containing 1 (OBFC1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006717977 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens oligonucleotide/oligosaccharide-binding fold containing 1 (OBFC1), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000224950 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:103882542:103918205:-1 gene:ENSG00000107960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000369764 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:103882555:103917669:-1 gene:ENSG00000107960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000466828 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:103882555:103918130:-1 gene:ENSG00000107960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000472951 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:103882745:103900153:-1 gene:ENSG00000107960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// BC017400 // GenBank // Homo sapiens oligonucleotide/oligosaccharide-binding fold containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:2472 IMAGE:3029792), complete cds. // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008081 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:103882684:103918432:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_000494 // RefSeq // Homo sapiens collagen, type XVII, alpha 1 (COL17A1), mRNA. // chr10 // 100 // 98 // 62 // 62 // 0 /// ENST00000353479 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:104031286:104086002:-1 gene:ENSG00000065618 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 63 // 63 // 0 /// ENST00000369733 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:10:104031286:104086002:-1 gene:ENSG00000065618 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 94 // 59 // 59 // 0 /// ENST00000393211 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:10:104059317:104085778:-1 gene:ENSG00000065618 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 25 // 16 // 16 // 0 /// AB900157 // GenBank // Homo sapiens COL17A1 mRNA for type XVII collagen alpha-1, complete cds. // chr10 // 95 // 94 // 56 // 59 // 0 /// AK309940 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99981. // chr10 // 17 // 17 // 11 // 63 // 1 /// GENSCAN00000008077 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:104028114:104087156:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 86 // 52 // 54 // 0 /// AK300117 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60881 complete cds, highly similar to Collagen alpha-1(XVII) chain. // chr10 // 96 // 37 // 22 // 23 // 0 /// AK300226 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50211 complete cds, highly similar to Collagen alpha-1(XVII) chain. // chr10 // 95 // 35 // 21 // 22 // 0
NM_001272012 // RefSeq // Homo sapiens inositol 1,4,5-trisphosphate receptor interacting protein (ITPRIP), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 95 // 71 // 19 // 20 // 0 /// NM_033397 // RefSeq // Homo sapiens inositol 1,4,5-trisphosphate receptor interacting protein (ITPRIP), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// ENST00000278071 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:104309698:104333905:-1 gene:ENSG00000148841 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000358187 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:104312144:104328924:-1 gene:ENSG00000148841 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// AY189283 // GenBank // Homo sapiens LP5085 protein mRNA, complete cds. // chr10 // 94 // 61 // 16 // 17 // 0 /// AY358776 // GenBank // Homo sapiens clone DNA69555 GTWW5826 (UNQ5826) mRNA, complete cds. // chr10 // 94 // 57 // 15 // 16 // 0 /// BC040536 // GenBank // Homo sapiens inositol 1,4,5-triphosphate receptor interacting protein, mRNA (cDNA clone MGC:39629 IMAGE:5265379), complete cds. // chr10 // 95 // 71 // 19 // 20 // 0 /// BC070108 // GenBank // Homo sapiens inositol 1,4,5-triphosphate receptor interacting protein, mRNA (cDNA clone MGC:87628 IMAGE:4837204), complete cds. // chr10 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// NM_001272013 // RefSeq // Homo sapiens inositol 1,4,5-trisphosphate receptor interacting protein (ITPRIP), transcript variant 3, mRNA. // chr10 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1 /// ENST00000337478 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:104312131:104338404:-1 gene:ENSG00000148841 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1
ENST00000410504 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:108940969:108941310:-1 gene:ENSG00000222436 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT016311 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000516765 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:109184934:109185001:-1 gene:ENSG00000252574 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT016317 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
ENST00000369592 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:10:110294062:110304697:-1 gene:ENSG00000119953 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000460483 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:110295230:110304906:-1 gene:ENSG00000119953 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000471297 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:110297570:110304938:-1 gene:ENSG00000119953 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0 /// AF083385 // GenBank // Homo sapiens 30kDa splicing factor mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// AF107463 // GenBank // Homo sapiens splicing factor mRNA, complete cds. // chr10 // 89 // 84 // 24 // 27 // 0 /// NM_005871 // RefSeq // Homo sapiens survival motor neuron domain containing 1 (SMNDC1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 1 /// ENST00000369603 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:110290730:110304951:-1 gene:ENSG00000119953 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 1 /// BC011234 // GenBank // Homo sapiens survival motor neuron domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:17138 IMAGE:4153336), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 1 /// NONHSAT016340 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr10 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000004322 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:110294150:110341168:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
ENST00000411370 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:110642678:110642785:-1 gene:ENSG00000223302 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT016354 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_026715 // RefSeq // Homo sapiens ribosomal protein L13a pseudogene 6 (RPL13AP6), non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000430133 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:110936622:110937233:-1 gene:ENSG00000234118 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000022761 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:110936622:110937233:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001244949 // RefSeq // Homo sapiens glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial (GPAM), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_020918 // RefSeq // Homo sapiens glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial (GPAM), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_005269999 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial (GPAM), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000348367 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:112149864:112183763:-1 gene:ENSG00000119927 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000369425 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:112153870:112183710:-1 gene:ENSG00000119927 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// AL832464 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp313H071 (from clone DKFZp313H071). // chr10 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// AL833061 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp451B1115 (from clone DKFZp451B1115); complete cds. // chr10 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// BC030783 // GenBank // Homo sapiens glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:26846 IMAGE:4821342), complete cds. // chr10 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// AL833093 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp451P0819 (from clone DKFZp451P0819); complete cds. // chr10 // 92 // 92 // 24 // 26 // 1 /// AK172782 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ23943 fis, clone HEP04035, highly similar to Glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial precursor (EC 2.3.1.15). // chr10 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// GENSCAN00000016669 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:112149267:112245430:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0
NM_022494 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, DHHC-type containing 6 (ZDHHC6), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000369404 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:112430724:112446901:-1 gene:ENSG00000023041 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000369405 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:112430300:112446914:-1 gene:ENSG00000023041 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000471035 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:112430824:112433570:-1 gene:ENSG00000023041 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0 /// AF267740 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein H4 mRNA, complete cds. // chr10 // 89 // 97 // 25 // 28 // 0 /// AK308026 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ97974. // chr10 // 80 // 52 // 12 // 15 // 0 /// BC007213 // GenBank // Homo sapiens zinc finger, DHHC-type containing 6, mRNA (cDNA clone MGC:14922 IMAGE:2960984), complete cds. // chr10 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC017434 // GenBank // Homo sapiens zinc finger, DHHC-type containing 6, mRNA (cDNA clone MGC:2790 IMAGE:2960984), complete cds. // chr10 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BX647270 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686F2193 (from clone DKFZp686F2193). // chr10 // 93 // 93 // 25 // 27 // 0 /// ENST00000482410 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:112430809:112433485:-1 gene:ENSG00000023041 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// GENSCAN00000016665 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:112430804:112438200:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 34 // 10 // 10 // 0
NM_014881 // RefSeq // Homo sapiens DNA cross-link repair 1A (DCLRE1A), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000361384 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:113834725:113854100:-1 gene:ENSG00000198924 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC013124 // GenBank // Homo sapiens DNA cross-link repair 1A (PSO2 homolog, S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:5167 IMAGE:3048375), complete cds. // chr10 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC062582 // GenBank // Homo sapiens DNA cross-link repair 1A (PSO2 homolog, S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:70449 IMAGE:5202821), complete cds. // chr10 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// NM_001271816 // RefSeq // Homo sapiens DNA cross-link repair 1A (DCLRE1A), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 93 // 93 // 28 // 30 // 1 /// ENST00000369305 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:113834729:113854383:-1 gene:ENSG00000198924 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 93 // 93 // 28 // 30 // 1 /// GENSCAN00000028035 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:113835152:113853182:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1
ENST00000490382 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:114423770:114424067:-1 gene:ENSG00000242912 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT016452 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENST00000486414 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:114690143:114690634:-1 gene:ENSG00000228169 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr10 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000028030 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:114690143:114768073:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
XM_005269556 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 82 (C10orf82), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// XM_005269557 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 82 (C10orf82), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000369210 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:10:116663696:116669970:-1 gene:ENSG00000165863 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000588184 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:116663799:116669955:-1 gene:ENSG00000165863 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// BC021737 // GenBank // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 82, mRNA (cDNA clone MGC:33547 IMAGE:4821913), complete cds. // chr10 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006717639 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 82 (C10orf82), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// ENST00000467153 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:116663786:116669959:-1 gene:ENSG00000165863 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr10 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// ENST00000588224 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:116664286:116670264:-1 gene:ENSG00000165863 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr10 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// AK097587 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ40268 fis, clone TESTI2026537. // chr10 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// BX537582 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686O02198 (from clone DKFZp686O02198). // chr10 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// GENSCAN00000017866 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:116663906:116670143:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 93 // 56 // 14 // 15 // 0
NM_025015 // RefSeq // Homo sapiens heat shock 70kDa protein 12A (HSPA12A), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000369209 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:116671192:116742574:-1 gene:ENSG00000165868 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB007877 // GenBank // Homo sapiens KIAA0417 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK294672 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54655 complete cds, highly similar to Heat shock 70 kDa protein 12A. // chr10 // 90 // 71 // 18 // 20 // 0 /// AK294884 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54654 complete cds, highly similar to Heat shock 70 kDa protein 12A. // chr10 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// BC041412 // GenBank // Homo sapiens heat shock 70kDa protein 12A, mRNA (cDNA clone IMAGE:5285193), partial cds. // chr10 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000017840 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:116674781:116708043:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NM_199131 // RefSeq // Homo sapiens ventral anterior homeobox 1 (VAX1), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000277905 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:117128521:117138301:-1 gene:ENSG00000148704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC101694 // GenBank // Homo sapiens ventral anterior homeobox 1, mRNA (cDNA clone MGC:126743 IMAGE:8069200), complete cds. // chr10 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// BC101696 // GenBank // Homo sapiens ventral anterior homeobox 1, mRNA (cDNA clone MGC:126745 IMAGE:8069202), complete cds. // chr10 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// NM_001112704 // RefSeq // Homo sapiens ventral anterior homeobox 1 (VAX1), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// ENST00000369206 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:117133290:117138056:-1 gene:ENSG00000148704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// GENSCAN00000031094 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:117134008:117138035:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0
NM_173791 // RefSeq // Homo sapiens PDZ domain containing 8 (PDZD8), mRNA. // chr10 // 95 // 83 // 19 // 20 // 0 /// XR_246069 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens PDZ domain containing 8 (PDZD8), transcript variant X3, misc_RNA. // chr10 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000334464 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:117277274:117375467:-1 gene:ENSG00000165650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC028375 // GenBank // Homo sapiens PDZ domain containing 8, mRNA (cDNA clone MGC:27107 IMAGE:4837939), complete cds. // chr10 // 95 // 83 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000031079 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:117283268:117375227:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0
NM_014904 // RefSeq // Homo sapiens RAB11 family interacting protein 2 (class I) (RAB11FIP2), mRNA. // chr10 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000355624 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:118004916:118046603:-1 gene:ENSG00000107560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000369199 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:118004918:118046603:-1 gene:ENSG00000107560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000476207 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:118005756:118015110:-1 gene:ENSG00000107560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 26 // 9 // 9 // 0 /// AY037299 // GenBank // Homo sapiens nRip11 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// BC075073 // GenBank // Homo sapiens RAB11 family interacting protein 2 (class I), mRNA (cDNA clone MGC:104137 IMAGE:30915593), complete cds. // chr10 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// BC075074 // GenBank // Homo sapiens RAB11 family interacting protein 2 (class I), mRNA (cDNA clone MGC:103973 IMAGE:30915380), complete cds. // chr10 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// DQ013303 // GenBank // Homo sapiens RAB11-FIP2 long isoform mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr10 // 100 // 63 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000045151 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:118008998:118167193:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 74 // 74 // 26 // 35 // 1
NM_001134672 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 204, member A (FAM204A), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// NM_022063 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 204, member A (FAM204A), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000369172 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:118310746:118342320:-1 gene:ENSG00000165669 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000369183 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:118297930:118342320:-1 gene:ENSG00000165669 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000469758 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:118310720:118342315:-1 gene:ENSG00000165669 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000470476 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:118310720:118342315:-1 gene:ENSG00000165669 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr10 // 100 // 57 // 13 // 13 // 0 /// AK026630 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ22977 fis, clone KAT11312. // chr10 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// BC023577 // GenBank // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 84, mRNA (cDNA clone MGC:20613 IMAGE:4765095), complete cds. // chr10 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000369170 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:118335114:118342240:-1 gene:ENSG00000165669 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1 /// NONHSAT016577 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr10 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0
NM_004248 // RefSeq // Homo sapiens prolactin releasing hormone receptor (PRLHR), mRNA. // chr10 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// ENST00000239032 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:118589989:118595699:-1 gene:ENSG00000119973 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// AB015745 // GenBank // Homo sapiens mRNA for human prolactin-releasing peptide receptor, complete cds. // chr10 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// AK290461 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77977 complete cds, highly similar to Homo sapiens G protein-coupled receptor 10 (GPR10), mRNA. // chr10 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// BC095539 // GenBank // Homo sapiens prolactin releasing hormone receptor, mRNA (cDNA clone MGC:111758 IMAGE:30706566), complete cds. // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC101490 // GenBank // Homo sapiens prolactin releasing hormone receptor, mRNA (cDNA clone MGC:126539 IMAGE:8068996), complete cds. // chr10 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// BC101492 // GenBank // Homo sapiens prolactin releasing hormone receptor, mRNA (cDNA clone MGC:126541 IMAGE:8068998), complete cds. // chr10 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// EF577402 // GenBank // Homo sapiens prolactin releasing hormone receptor mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000045142 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:118594132:118595244:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_153810 // RefSeq // Homo sapiens CDK2-associated, cullin domain 1 (CACUL1), mRNA. // chr10 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000369151 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:118676411:118755246:-1 gene:ENSG00000151893 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000493518 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:118684556:118755249:-1 gene:ENSG00000151893 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr10 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// AK097728 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ40409 fis, clone TESTI2037723. // chr10 // 96 // 66 // 22 // 23 // 0 /// AY743663 // GenBank // Homo sapiens cullin mRNA, complete cds. // chr10 // 97 // 94 // 32 // 33 // 0 /// BC038294 // GenBank // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 46, mRNA (cDNA clone MGC:33215 IMAGE:4837841), complete cds. // chr10 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000544392 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:118674167:118726385:-1 gene:ENSG00000151893 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 34 // 34 // 12 // 35 // 1 /// AK301182 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51338 complete cds. // chr10 // 34 // 34 // 12 // 35 // 1 /// GENSCAN00000045134 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:118681685:118730408:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 46 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000045136 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:118754166:118755647:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 23 // 23 // 8 // 35 // 1
NONHSAT016599 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_003750 // RefSeq // Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 3, subunit A (EIF3A), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000369144 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:119033670:119080804:-1 gene:ENSG00000107581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000541549 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:119035793:119080823:-1 gene:ENSG00000107581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK302575 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50921 complete cds, highly similar to Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit 10. // chr10 // 96 // 96 // 22 // 23 // 0 /// BC114429 // GenBank // Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 3, subunit A, mRNA (cDNA clone MGC:133101 IMAGE:40027607), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// JX312508 // GenBank // Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 3 (eIF3a) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// U58046 // GenBank // Human p167 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// U78311 // GenBank // Human translation initiation factor 3 large subunit mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000019883 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:119036039:119080676:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NR_002917 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 19 (SNORA19), small nucleolar RNA. // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000384737 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:119060011:119060138:-1 gene:ENSG00000207468 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONHSAT016608 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
ENST00000410656 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:119060983:119061111:-1 gene:ENSG00000222588 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT016609 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001010912 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 120 (C10orf120), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000329446 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:122697709:122699822:-1 gene:ENSG00000183559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000432000 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:10:122697709:122699768:-1 gene:ENSG00000183559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// BC140922 // GenBank // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 120, mRNA (cDNA clone MGC:176599 IMAGE:9056734), complete cds. // chr10 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000020680 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:122697733:122717471:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0
NM_024942 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 88 (C10orf88), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000368891 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:122930903:122954311:-1 gene:ENSG00000119965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000470158 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:122932603:122952007:-1 gene:ENSG00000119965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000481909 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:122931508:122954403:-1 gene:ENSG00000119965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC032645 // GenBank // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 88, mRNA (cDNA clone MGC:44952 IMAGE:5519534), complete cds. // chr10 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000026294 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:122932427:122948720:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// NONHSAT016755 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr10 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
ENST00000469206 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:123171535:123171875:-1 gene:ENSG00000227586 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr10 // 87 // 100 // 20 // 23 // 0 /// GENSCAN00000026286 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:123171532:123203542:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001146340 // RefSeq // Homo sapiens NK1 homeobox 2 (NKX1-2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000451024 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:10:124447023:124450184:-1 gene:ENSG00000229544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037383 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:124447429:124455688:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_014661 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 53, member B (FAM53B), mRNA. // chr10 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000280780 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:10:124667190:124744269:-1 gene:ENSG00000189319 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000337318 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:124619292:124744050:-1 gene:ENSG00000189319 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000392754 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:124621671:124742970:-1 gene:ENSG00000189319 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0 /// AK127323 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ45394 fis, clone BRHIP3027160. // chr10 // 90 // 42 // 9 // 10 // 0 /// AK127343 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ45415 fis, clone BRHIP3033734, highly similar to Protein FAM53B. // chr10 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0 /// BC031654 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 53, member B, mRNA (cDNA clone MGC:34356 IMAGE:5174078), complete cds. // chr10 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000494792 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:124617080:124791727:-1 gene:ENSG00000258539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr10 // 42 // 42 // 10 // 24 // 1 /// AK023081 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ13019 fis, clone NT2RP3000736, highly similar to Protein FAM53B. // chr10 // 42 // 42 // 10 // 24 // 1
ENST00000384763 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:10:124814958:124815062:-1 gene:ENSG00000207494 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT016861 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001290214 // RefSeq // Homo sapiens C-terminal binding protein 2 (CTBP2), transcript variant 4, mRNA. // chr10 // 100 // 33 // 8 // 8 // 0 /// NM_022802 // RefSeq // Homo sapiens C-terminal binding protein 2 (CTBP2), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// XM_006717642 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens C-terminal binding protein 2 (CTBP2), transcript variant X15, mRNA. // chr10 // 100 // 33 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000309035 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:124988938:125027890:-1 gene:ENSG00000175029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// AF222711 // GenBank // Homo sapiens ribeye mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// BC052276 // GenBank // Homo sapiens C-terminal binding protein 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:4562556), complete cds. // chr10 // 100 // 33 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000028083 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:124989518:125027759:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0
NM_001128202 // RefSeq // Homo sapiens testis expressed 36 (TEX36), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_005269817 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens testis expressed 36 (TEX36), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 94 // 53 // 16 // 17 // 0 /// ENST00000368821 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:125655694:125683144:-1 gene:ENSG00000175018 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000526819 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:10:125621613:125683130:-1 gene:ENSG00000175018 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// BC062717 // GenBank // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 122, mRNA (cDNA clone MGC:72014 IMAGE:6101709), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000532135 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:10:125576522:125683106:-1 gene:ENSG00000175018 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// BC127766 // GenBank // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 122, mRNA (cDNA clone MGC:157877 IMAGE:40127344), complete cds. // chr10 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// BC127767 // GenBank // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 122, mRNA (cDNA clone MGC:157878 IMAGE:40127345), complete cds. // chr10 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
ENST00000398050 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:125666875:125667950:-1 gene:ENSG00000214297 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr10 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// M21191 // GenBank // Human aldolase pseudogene mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000028068 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:125667414:125667950:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 42 // 10 // 10 // 0
NM_147191 // RefSeq // Homo sapiens matrix metallopeptidase 21 (MMP21), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000368808 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:125766453:125775821:-1 gene:ENSG00000154485 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF331526 // GenBank // Homo sapiens chromosome 10 putative matrix metalloproteinase (MMP) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF520613 // GenBank // Homo sapiens matrix metalloproteinase-21 (MMP21) mRNA, complete cds. // chr10 // 93 // 91 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000028071 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:125766662:125775821:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0
ENST00000368721 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:125836337:125854859:-1 gene:ENSG00000089876 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 68 // 23 // 23 // 0 /// BC037925 // GenBank // Homo sapiens DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 32, mRNA (cDNA clone IMAGE:5284465), complete cds. // chr10 // 100 // 68 // 23 // 23 // 0 /// BC068471 // GenBank // Homo sapiens DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 32, mRNA (cDNA clone MGC:87093 IMAGE:30343301), complete cds. // chr10 // 96 // 79 // 26 // 27 // 0 /// NM_018180 // RefSeq // Homo sapiens DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 32 (DHX32), mRNA. // chr10 // 91 // 91 // 31 // 34 // 1 /// ENST00000284690 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:125836340:125881315:-1 gene:ENSG00000089876 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 91 // 91 // 31 // 34 // 1 /// AF427340 // GenBank // Homo sapiens putative DEAD/DEXH helicase DDX32 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr10 // 91 // 91 // 31 // 34 // 1 /// AY064250 // GenBank // Homo sapiens DEAD/H helicase-like protein-1 (DHLP1) mRNA, complete cds. // chr10 // 88 // 88 // 30 // 34 // 1 /// BC002473 // GenBank // Homo sapiens DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 32, mRNA (cDNA clone MGC:942 IMAGE:3347657), complete cds. // chr10 // 79 // 79 // 27 // 34 // 1 /// GENSCAN00000008225 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:125838202:125880824:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 53 // 18 // 18 // 0
ENST00000410697 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:125890566:125890678:-1 gene:ENSG00000222629 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 71 // 93 // 10 // 14 // 0 /// ENST00000611062 // ENSEMBL // ncrna:novel scaffold:GRCh38:GL000216.2:93197:93309:-1 gene:ENSG00000274202 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 71 // 93 // 10 // 14 // 0 /// ENST00000621409 // ENSEMBL // ncrna:novel scaffold:GRCh38:GL000225.1:183252:183364:1 gene:ENSG00000276711 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr10 // 71 // 93 // 10 // 14 // 0 /// NONHSAT016923 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 71 // 93 // 10 // 14 // 0 /// NONHSAT135862 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 71 // 93 // 10 // 14 // 0 /// NONHSAT135997 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 71 // 93 // 10 // 14 // 0
ENST00000410808 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:126145474:126145582:-1 gene:ENSG00000222740 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT016935 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001039762 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 196, member A (FAM196A), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000424811 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:10:127136194:127177009:-1 gene:ENSG00000188916 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000522781 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:127135430:127196158:-1 gene:ENSG00000188916 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AK127465 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ45557 fis, clone BRTHA3002411. // chr10 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// BC131825 // GenBank // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 141, mRNA (cDNA clone MGC:157760 IMAGE:40128007), complete cds. // chr10 // 94 // 44 // 15 // 16 // 0 /// BC137112 // GenBank // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 141, mRNA (cDNA clone MGC:168732 IMAGE:9021109), complete cds. // chr10 // 100 // 58 // 21 // 21 // 0 /// BC144478 // GenBank // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 141, mRNA (cDNA clone MGC:178022 IMAGE:9053005), complete cds. // chr10 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000614311 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:127135426:127196158:-1 gene:ENSG00000188916 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000030229 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:127137837:127176395:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 92 // 36 // 12 // 13 // 0
AK127642 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ45740 fis, clone KIDNE2014496. // chr10 // 79 // 100 // 11 // 14 // 0 /// NONHSAT016963 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr10 // 93 // 100 // 13 // 14 // 0
NM_152311 // RefSeq // Homo sapiens clarin 3 (CLRN3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000368671 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:127877841:127892947:-1 gene:ENSG00000180745 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC029478 // GenBank // Homo sapiens clarin 3, mRNA (cDNA clone MGC:32871 IMAGE:4733535), complete cds. // chr10 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// BX640823 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686F11218 (from clone DKFZp686F11218). // chr10 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// GENSCAN00000036421 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:127878149:127908002:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
NM_001145966 // RefSeq // Homo sapiens marker of proliferation Ki-67 (MKI67), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// NM_002417 // RefSeq // Homo sapiens marker of proliferation Ki-67 (MKI67), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000368653 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:128096659:128126204:-1 gene:ENSG00000148773 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000368654 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:128096659:128126385:-1 gene:ENSG00000148773 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// X65550 // GenBank // H.sapiens mki67a mRNA (long type) for antigen of monoclonal antibody Ki-67. // chr10 // 93 // 97 // 28 // 30 // 0 /// ENST00000617118 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:128096663:128126204:-1 gene:ENSG00000148773 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000036410 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:128084455:128131261:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0
BC022565 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4797124, partial cds. // chr10 // 94 // 100 // 15 // 16 // 0
NM_001005463 // RefSeq // Homo sapiens early B-cell factor 3 (EBF3), mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// XM_006717741 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens early B-cell factor 3 (EBF3), transcript variant X6, mRNA. // chr10 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000355311 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:129836800:129963841:-1 gene:ENSG00000108001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000368648 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:129835283:129963841:-1 gene:ENSG00000108001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000440978 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:129837700:129842171:-1 gene:ENSG00000108001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 25 // 10 // 10 // 0 /// BC126130 // GenBank // Homo sapiens early B-cell factor 3, mRNA (cDNA clone MGC:161408 IMAGE:8991846), complete cds. // chr10 // 100 // 78 // 31 // 31 // 0 /// BC130479 // GenBank // Homo sapiens early B-cell factor 3, mRNA (cDNA clone MGC:163351 IMAGE:40146510), complete cds. // chr10 // 97 // 80 // 31 // 32 // 0 /// AK097335 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ40016 fis, clone STOMA2006325, moderately similar to TRANSCRIPTION FACTOR COE3. // chr10 // 23 // 23 // 9 // 40 // 1 /// GENSCAN00000025936 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:129813668:129896464:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 55 // 55 // 22 // 40 // 1 /// GENSCAN00000025954 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:129943786:129963726:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 25 // 25 // 10 // 40 // 1
NM_174937 // RefSeq // Homo sapiens transcription elongation regulator 1-like (TCERG1L), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000368642 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:131092391:131311721:-1 gene:ENSG00000176769 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000483040 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:131092391:131260336:-1 gene:ENSG00000176769 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr10 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// AK096269 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ38950 fis, clone NT2NE2018490, moderately similar to Mus musculus mRNA for transcription factor CA150b. // chr10 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// BC042951 // GenBank // Homo sapiens transcription elongation regulator 1-like, mRNA (cDNA clone MGC:43915 IMAGE:5275182), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC093639 // GenBank // Homo sapiens transcription elongation regulator 1-like, mRNA (cDNA clone MGC:120674 IMAGE:7939484), complete cds. // chr10 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// BC101535 // GenBank // Homo sapiens transcription elongation regulator 1-like, mRNA (cDNA clone MGC:126584 IMAGE:8069041), complete cds. // chr10 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000018999 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:131304895:131410849:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1
NR_038365 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 1164 (LINC01164), long non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000341866 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:131772398:131790199:-1 gene:ENSG00000189275 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
XR_242765 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 1165 (LINC01165), misc_RNA. // chr10 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000445190 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:132520827:132522449:-1 gene:ENSG00000229081 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr10 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// AK097584 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ40265 fis, clone TESTI2026291. // chr10 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONHSAT017078 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr10 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_177400 // RefSeq // Homo sapiens NK6 homeobox 2 (NKX6-2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000368592 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:132784816:132786052:-1 gene:ENSG00000148826 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC101635 // GenBank // Homo sapiens NK6 homeobox 2, mRNA (cDNA clone MGC:126684 IMAGE:8069141), complete cds. // chr10 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// BC104823 // GenBank // Homo sapiens NK6 homeobox 2, mRNA (cDNA clone MGC:132483 IMAGE:8143826), complete cds. // chr10 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000047315 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:132784916:132785948:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_001200049 // RefSeq // Homo sapiens tetratricopeptide repeat domain 40 (TTC40), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000368586 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:10:132808392:132942585:-1 gene:ENSG00000171811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000448925 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:10:132832616:132835353:-1 gene:ENSG00000171811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 18 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000476633 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:132834682:132837077:-1 gene:ENSG00000171811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr10 // 90 // 23 // 9 // 10 // 0 /// AL122111 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp434A1721 (from clone DKFZp434A1721). // chr10 // 93 // 68 // 28 // 30 // 0 /// BC034223 // GenBank // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 92, mRNA (cDNA clone MGC:39590 IMAGE:4838774), complete cds. // chr10 // 98 // 100 // 43 // 44 // 0 /// GENSCAN00000023446 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:132801771:132886132:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 98 // 95 // 41 // 42 // 0
ENST00000475340 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:132937115:132942543:-1 gene:ENSG00000171811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr10 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0 /// BC044661 // GenBank // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 93, mRNA (cDNA clone IMAGE:5188190), complete cds. // chr10 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000368585 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:132929185:132942823:-1 gene:ENSG00000171811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 82 // 82 // 28 // 34 // 1 /// NM_001200049 // RefSeq // Homo sapiens tetratricopeptide repeat domain 40 (TTC40), mRNA. // chr10 // 65 // 65 // 22 // 34 // 1 /// ENST00000368586 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:10:132808392:132942585:-1 gene:ENSG00000171811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 65 // 65 // 22 // 34 // 1 /// AK098820 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ25954 fis, clone TST03491. // chr10 // 74 // 74 // 25 // 34 // 1 /// BC146900 // GenBank // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 93, mRNA (cDNA clone MGC:182003 IMAGE:9056828), complete cds. // chr10 // 62 // 62 // 21 // 34 // 1 /// BC146908 // GenBank // Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 93, mRNA (cDNA clone MGC:182011 IMAGE:9056836), complete cds. // chr10 // 62 // 62 // 21 // 34 // 1 /// GENSCAN00000023475 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:132892325:132981977:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 71 // 71 // 24 // 34 // 1
NR_030170 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 202 (MIR202), microRNA. // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000362219 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:10:133247511:133247620:-1 gene:ENSG00000278352 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA gene:ENSG00000166917 // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NR_108078 // RefSeq // Homo sapiens MIR202 host gene (non-protein coding) (MIR202HG), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr10 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// ENST00000300167 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:133246910:133247885:-1 gene:ENSG00000166917 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr10 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// hsa-mir-202 // miRBase Micro RNA Database // MI0003130 Homo sapiens miR-202 stem-loop // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT017133 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT017135 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 83 // 92 // 19 // 23 // 0 /// NONHSAT017132 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr10 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
ENST00000605518 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:133324072:133324745:-1 gene:ENSG00000270235 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC047942 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5200632, partial cds. // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT017145 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_015722 // RefSeq // Homo sapiens calcyon neuron-specific vesicular protein (CALY), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XM_005252685 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens calcyon neuron-specific vesicular protein (CALY), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000252939 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:133325423:133336907:-1 gene:ENSG00000130643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000368558 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:10:133325932:133336935:-1 gene:ENSG00000130643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 59 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000467433 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:133325428:133326175:-1 gene:ENSG00000130643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 55 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000467611 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:133325428:133326314:-1 gene:ENSG00000130643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 55 // 12 // 12 // 0 /// AF225903 // GenBank // Homo sapiens D1 dopamine receptor interacting protein calcyon mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// BC038978 // GenBank // Homo sapiens calcyon neuron-specific vesicular protein, mRNA (cDNA clone MGC:47621 IMAGE:5734358), complete cds. // chr10 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000023448 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:133325827:133344864:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 73 // 73 // 16 // 22 // 1
NM_004092 // RefSeq // Homo sapiens enoyl CoA hydratase, short chain, 1, mitochondrial (ECHS1), mRNA. // chr10 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000368547 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:133362480:133373689:-1 gene:ENSG00000127884 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC008906 // GenBank // Homo sapiens enoyl Coenzyme A hydratase, short chain, 1, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:1513 IMAGE:2907059), complete cds. // chr10 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// BT007123 // GenBank // Homo sapiens enoyl Coenzyme A hydratase, short chain, 1, mitochondrial mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 73 // 23 // 24 // 0 /// D13900 // GenBank // Homo sapiens mRNA for mitochondrial short-chain enoyl-CoA hydratase, complete cds. // chr10 // 83 // 91 // 25 // 30 // 0 /// GENSCAN00000023438 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:133364875:133373333:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1
NM_001012508 // RefSeq // Homo sapiens shadow of prion protein homolog (zebrafish) (SPRN), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000414069 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:133420666:133424572:-1 gene:ENSG00000203772 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC040198 // GenBank // Homo sapiens shadow of prion protein homolog (zebrafish), mRNA (cDNA clone MGC:42296 IMAGE:4816858), complete cds. // chr10 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// GENSCAN00000023470 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:133423226:133424919:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 28 // 9 // 9 // 0
NR_033789 // RefSeq // Homo sapiens shadow of prion protein homolog (zebrafish) pseudogene 1 (SPRNP1), non-coding RNA. // chr10 // 94 // 100 // 17 // 18 // 0 /// ENST00000432597 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:133567798:133569835:-1 gene:ENSG00000171772 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0 /// AK126615 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44653 fis, clone BRACE2046976. // chr10 // 94 // 100 // 17 // 18 // 0 /// BC136964 // GenBank // Homo sapiens FLJ44653 protein, mRNA (cDNA clone MGC:168579 IMAGE:9020956), complete cds. // chr10 // 93 // 83 // 14 // 15 // 0 /// NONHSAT017164 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr10 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT140002 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr10 // 94 // 100 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000023457 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:133554992:133569714:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 56 // 56 // 10 // 18 // 1
NM_001276700 // RefSeq // Homo sapiens NLR family, pyrin domain containing 6 (NLRP6), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_138329 // RefSeq // Homo sapiens NLR family, pyrin domain containing 6 (NLRP6), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000312165 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:11:278570:285304:1 gene:ENSG00000174885 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000534750 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:11:278365:285359:1 gene:ENSG00000174885 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF479748 // GenBank // Homo sapiens PYRIN-containing APAF1-like protein 5 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK292668 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77198 complete cds, highly similar to Homo sapiens NACHT, leucine rich repeat and PYD containing 6 (NALP6), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY154461 // GenBank // Homo sapiens NALP6 (NALP6) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000030645 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:11:278570:294749:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NM_006435 // RefSeq // Homo sapiens interferon induced transmembrane protein 2 (IFITM2), mRNA. // chr11 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000399817 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:11:308163:309395:1 gene:ENSG00000185201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000602569 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:11:308217:309395:1 gene:ENSG00000185201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 67 // 10 // 10 // 0 /// BC009696 // GenBank // Homo sapiens interferon induced transmembrane protein 2 (1-8D), mRNA (cDNA clone MGC:9196 IMAGE:3876542), complete cds. // chr11 // 75 // 80 // 9 // 12 // 0 /// X57351 // GenBank // Human 1-8D gene from interferon-inducible gene family. // chr11 // 60 // 100 // 9 // 15 // 0 /// ENST00000616316 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:11:307927:309392:1 gene:ENSG00000185201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000619184 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:11:307927:309392:1 gene:ENSG00000185201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_003641 // RefSeq // Homo sapiens interferon induced transmembrane protein 1 (IFITM1), mRNA. // chr11 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000328221 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:11:313527:315240:1 gene:ENSG00000185885 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 92 // 86 // 22 // 24 // 0 /// ENST00000399815 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:11:308408:315272:1 gene:ENSG00000185201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000408968 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:11:313853:315272:1 gene:ENSG00000185885 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000528780 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:11:313506:315272:1 gene:ENSG00000185885 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// AK290480 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76538 complete cds, highly similar to Homo sapiens interferon induced transmembrane protein 1 (9-27), mRNA. // chr11 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// BC000897 // GenBank // Homo sapiens interferon induced transmembrane protein 1 (9-27), mRNA (cDNA clone MGC:5195 IMAGE:3464598), complete cds. // chr11 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BT007173 // GenBank // Homo sapiens interferon induced transmembrane protein 1 (9-27) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// J04164 // GenBank // Human interferon-inducible protein 9-27 mRNA, complete cds. // chr11 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000030633 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:11:310891:315113:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0
NM_178537 // RefSeq // Homo sapiens beta-1,4-N-acetyl-galactosaminyl transferase 4 (B4GALNT4), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000329962 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:11:369804:382116:1 gene:ENSG00000182272 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AB089939 // GenBank // Homo sapiens NGalNAc-T1 mRNA for N-acetylgalactosaminyltransferase, complete cds. // chr11 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000030631 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:11:369804:404569:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
NM_198075 // RefSeq // Homo sapiens leucine rich repeat containing 56 (LRRC56), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006725133 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens leucine rich repeat containing 56 (LRRC56), transcript variant X6, mRNA. // chr11 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000270115 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:11:537527:554916:1 gene:ENSG00000161328 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK024495 // GenBank // Homo sapiens mRNA for FLJ00101 protein, partial cds. // chr11 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC016439 // GenBank // Homo sapiens leucine rich repeat containing 56, mRNA (cDNA clone MGC:16772 IMAGE:3447051), complete cds. // chr11 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC035937 // GenBank // Homo sapiens leucine rich repeat containing 56, mRNA (cDNA clone MGC:25996 IMAGE:4816105), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000611111 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR11_1_CTG8:537522:554912:1 gene:ENSG00000273831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000026134 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR11_1_CTG8:536945:552823:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// GENSCAN00000030646 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:11:536945:554145:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
ENST00000527620 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:11:557595:560106:1 gene:ENSG00000254815 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK093839 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ36520 fis, clone TRACH2002100. // chr11 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000527113 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:11:558892:560106:1 gene:ENSG00000254815 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr11 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// ENST00000533844 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:11:559476:560107:1 gene:ENSG00000254815 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr11 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// BC031953 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4837775. // chr11 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONHSAT017272 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT017271 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr11 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONHSAT017274 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr11 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// NONHSAT017275 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr11 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1