NM_004667 // RefSeq // Homo sapiens HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2 (HERC2), mRNA. // chr15 // 80 // 98 // 45 // 56 // 0 /// NR_002824 // RefSeq // Homo sapiens hect domain and RLD 2 pseudogene 2 (HERC2P2), non-coding RNA. // chr15 // 93 // 98 // 52 // 56 // 0 /// NR_036432 // RefSeq // Homo sapiens hect domain and RLD 2 pseudogene 3 (HERC2P3), non-coding RNA. // chr15 // 96 // 95 // 52 // 54 // 0 /// ENST00000261609 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:28111040:28322152:-1 gene:ENSG00000128731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 80 // 98 // 45 // 56 // 0 /// ENST00000414804 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:20462378:20506171:-1 gene:ENSG00000180229 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 100 // 16 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000424611 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:20438697:20453675:-1 gene:ENSG00000180229 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 100 // 32 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000428453 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:20383115:20506161:-1 gene:ENSG00000180229 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 98 // 95 // 53 // 54 // 0 /// ENST00000429257 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:20431093:20505462:-1 gene:ENSG00000180229 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr15 // 98 // 91 // 51 // 52 // 0 /// ENST00000430598 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:20408396:20506180:-1 gene:ENSG00000180229 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 96 // 95 // 52 // 54 // 0 /// ENST00000437318 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:20383304:20505485:-1 gene:ENSG00000180229 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 96 // 86 // 47 // 49 // 0 /// ENST00000524476 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:28633123:28641565:1 gene:ENSG00000206149 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 86 // 25 // 12 // 14 // 0 /// ENST00000529353 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:28633125:28642421:1 gene:ENSG00000206149 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 86 // 25 // 12 // 14 // 0 /// ENST00000529624 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:28590189:28674027:1 gene:ENSG00000206149 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr15 // 90 // 91 // 47 // 52 // 0 /// AF041081 // GenBank // Homo sapiens D15F37 pseudogene, S4 allele, mRNA sequence. // chr15 // 88 // 86 // 43 // 49 // 0 /// AF071172 // GenBank // Homo sapiens HERC2 (HERC2) mRNA, complete cds. // chr15 // 79 // 93 // 42 // 53 // 0 /// AK293845 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59185 complete cds, highly similar to HECT domain and RCC1-like domain-containing protein 2. // chr15 // 89 // 33 // 17 // 19 // 0 /// AK294470 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60245 complete cds, highly similar to HECT domain and RCC1-like domain-containing protein 2. // chr15 // 100 // 23 // 13 // 13 // 0 /// AK294795 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54444 complete cds, highly similar to HECT domain and RCC1-like domain-containing protein 2. // chr15 // 91 // 40 // 21 // 23 // 0 /// AK308640 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ98681. // chr15 // 100 // 21 // 12 // 12 // 0 /// AK309255 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99296. // chr15 // 86 // 25 // 12 // 14 // 0 /// BC000975 // GenBank // Homo sapiens hect domain and RLD 2 pseudogene 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:3448306). // chr15 // 94 // 58 // 31 // 33 // 0 /// BC144698 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:9053232, containing frame-shift errors. // chr15 // 94 // 86 // 46 // 49 // 0 /// ENST00000562687 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:32742353:32775368:1 gene:ENSG00000260644 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr15 // 59 // 77 // 26 // 44 // 0 /// ENST00000564334 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:33095029:33117178:-1 gene:ENSG00000261599 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr15 // 66 // 61 // 23 // 35 // 0 /// ENST00000566902 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:32152111:32187070:-1 gene:ENSG00000230267 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr15 // 60 // 75 // 26 // 43 // 0 /// ENST00000426501 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:20379495:20453880:-1 gene:ENSG00000180229 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 56 // 56 // 32 // 57 // 1 /// CR749409 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp781N1423 (from clone DKFZp781N1423). // chr15 // 53 // 53 // 30 // 57 // 1 /// ENST00000530420 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:28651421:28673915:1 gene:ENSG00000206149 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 37 // 37 // 21 // 57 // 1 /// ENST00000563904 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:32151719:32152987:-1 gene:ENSG00000230267 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 25 // 25 // 14 // 57 // 1 /// ENST00000564458 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:32774929:32776196:1 gene:ENSG00000260644 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 25 // 25 // 14 // 57 // 1 /// ENST00000564795 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:33094204:33095471:-1 gene:ENSG00000261599 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 25 // 25 // 14 // 57 // 1 /// AK293512 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55955 complete cds, highly similar to HECT domain and RCC1-like domain-containing protein 2. // chr15 // 32 // 32 // 18 // 57 // 1 /// BC038215 // GenBank // Homo sapiens hect domain and RLD 2 pseudogene 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:5416019). // chr15 // 25 // 25 // 14 // 57 // 1 /// NR_036443 // RefSeq // Homo sapiens hect domain and RLD 2 pseudogene 9 (HERC2P9), non-coding RNA. // chr15 // 19 // 19 // 11 // 57 // 1 /// ENST00000528584 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:28654442:28685264:1 gene:ENSG00000206149 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 19 // 19 // 11 // 57 // 1 /// ENST00000564734 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:28254488:28322149:-1 gene:ENSG00000128731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 16 // 16 // 9 // 57 // 1 /// BC045544 // GenBank // Homo sapiens hect domain and RLD 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:5262032). // chr15 // 16 // 16 // 9 // 57 // 1 /// ENST00000613386 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:22495570:22579813:1 gene:ENSG00000276550 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr15 // 92 // 93 // 49 // 53 // 0 /// ENST00000619021 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:22516909:22590815:1 gene:ENSG00000276550 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 90 // 86 // 44 // 49 // 0 /// GENSCAN00000006877 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR15_4_CTG8:28760028:28813136:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 89 // 63 // 32 // 36 // 0 /// GENSCAN00000035883 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:20349683:20483465:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 98 // 74 // 41 // 42 // 0 /// GENSCAN00000038162 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR15_3_CTG3:22519391:22576694:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 83 // 70 // 33 // 40 // 0 /// GENSCAN00000043233 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:28612111:28671633:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 90 // 72 // 37 // 41 // 0 /// GENSCAN00000043238 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:28111763:28299474:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 78 // 72 // 32 // 41 // 0 /// GENSCAN00000045559 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:22516892:22579714:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 92 // 88 // 46 // 50 // 0 /// BC070076 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4821823, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr15 // 98 // 95 // 53 // 54 // 0 /// NONHSAT040635 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 14 // 8 // 8 // 0 /// NONHSAT040639 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 16 // 9 // 9 // 0 /// NONHSAT041253 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 83 // 32 // 15 // 18 // 0 /// TCONS_l2_00008468-XLOC_l2_004594 // Broad TUCP // linc-APBA2-4 chr15:+:28834618-28930405 // chr15 // 90 // 84 // 43 // 48 // 0 /// TCONS_l2_00008469-XLOC_l2_004594 // Broad TUCP // linc-APBA2-4 chr15:+:28834618-28930405 // chr15 // 90 // 84 // 43 // 48 // 0 /// TCONS_l2_00008470-XLOC_l2_004594 // Broad TUCP // linc-APBA2-4 chr15:+:28874185-28882273 // chr15 // 100 // 18 // 10 // 10 // 0 /// TCONS_l2_00008471-XLOC_l2_004594 // Broad TUCP // linc-APBA2-4 chr15:+:28877790-28930814 // chr15 // 91 // 75 // 39 // 43 // 0 /// TCONS_l2_00009410-XLOC_l2_004594 // Broad TUCP // linc-APBA2-4 chr15:+:28878268-28886727 // chr15 // 86 // 25 // 12 // 14 // 0 /// TCONS_l2_00009411-XLOC_l2_004594 // Broad TUCP // linc-APBA2-4 chr15:+:28878268-28887567 // chr15 // 86 // 25 // 12 // 14 // 0 /// GENSCAN00000011926 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:33094951:33130219:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 59 // 60 // 20 // 34 // 0 /// GENSCAN00000020720 // ENSEMBL // cdna:genscan scaffold:GRCh38:KI270728.1:1000504:1037697:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 66 // 51 // 19 // 29 // 0 /// GENSCAN00000011917 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:32760938:32847007:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 28 // 28 // 16 // 57 // 1 /// GENSCAN00000037448 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:32152033:32189236:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 39 // 39 // 22 // 57 // 1 /// TCONS_l2_00008473-XLOC_l2_004594 // Broad TUCP // linc-APBA2-4 chr15:+:28881632-28930461 // chr15 // 49 // 49 // 28 // 57 // 1 /// TCONS_l2_00008474-XLOC_l2_004594 // Broad TUCP // linc-APBA2-4 chr15:+:28882260-28930461 // chr15 // 44 // 44 // 25 // 57 // 1 /// TCONS_l2_00008475-XLOC_l2_004594 // Broad TUCP // linc-APBA2-4 chr15:+:28895651-28930413 // chr15 // 25 // 25 // 14 // 57 // 1 /// TCONS_l2_00008476-XLOC_l2_004594 // Broad TUCP // linc-APBA2-4 chr15:+:28895663-28930415 // chr15 // 39 // 39 // 22 // 57 // 1 /// TCONS_l2_00008478-XLOC_l2_004594 // Broad TUCP // linc-APBA2-4 chr15:+:28896726-28913627 // chr15 // 35 // 35 // 20 // 57 // 1 /// TCONS_l2_00008479-XLOC_l2_004594 // Broad TUCP // linc-APBA2-4 chr15:+:28900748-28928519 // chr15 // 28 // 28 // 16 // 57 // 1 /// TCONS_l2_00009413-XLOC_l2_004594 // Broad TUCP // linc-APBA2-4 chr15:+:28900418-28919173 // chr15 // 33 // 33 // 19 // 57 // 1 /// TCONS_l2_00010106-XLOC_l2_005449 // Broad TUCP // linc-C16orf58-2 chr16:-:32163126-32165476 // chr15 // 28 // 28 // 16 // 57 // 1 /// TCONS_l2_00010456-XLOC_l2_005449 // Broad TUCP // linc-C16orf58-2 chr16:-:32162609-32163874 // chr15 // 25 // 25 // 14 // 57 // 1 /// ENST00000615156 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:22561434:22564467:1 gene:ENSG00000276550 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 14 // 14 // 8 // 57 // 1 /// NONHSAT040814 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 21 // 21 // 12 // 57 // 1 /// TCONS_l2_00008477-XLOC_l2_004594 // Broad TUCP // linc-APBA2-4 chr15:+:28896719-28930405 // chr15 // 21 // 21 // 12 // 57 // 1 /// TCONS_l2_00009412-XLOC_l2_004594 // Broad TUCP // linc-APBA2-4 chr15:+:28899587-28930408 // chr15 // 19 // 19 // 11 // 57 // 1