NM_203301 // RefSeq // Homo sapiens F-box protein 33 (FBXO33), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000298097 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:39397669:39432500:-1 gene:ENSG00000165355 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK294140 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50090 complete cds, highly similar to F-box only protein 33. // chr14 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// BC042535 // GenBank // Homo sapiens F-box protein 33, mRNA (cDNA clone IMAGE:4751694), partial cds. // chr14 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// BC053537 // GenBank // Homo sapiens F-box protein 33, mRNA (cDNA clone MGC:61678 IMAGE:5181903), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC068566 // GenBank // Homo sapiens F-box protein 33, mRNA (cDNA clone MGC:87518 IMAGE:5270962), complete cds. // chr14 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000554190 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:14:39399566:39431875:-1 gene:ENSG00000165355 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// GENSCAN00000012329 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:39386486:39431988:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 39 // 11 // 11 // 0
NM_032135 // RefSeq // Homo sapiens fibrous sheath CABYR binding protein (FSCB), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000340446 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:44504342:44507279:-1 gene:ENSG00000189139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AK302615 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61728 complete cds. // chr14 // 90 // 95 // 19 // 21 // 0 /// BC039878 // GenBank // Homo sapiens fibrous sheath CABYR binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:44906 IMAGE:5163160), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000028674 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:44504510:44506939:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 45 // 10 // 10 // 0
NM_017658 // RefSeq // Homo sapiens kelch-like family member 28 (KLHL28), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_005267769 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens kelch-like family member 28 (KLHL28), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000355081 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:14:44928813:44961132:-1 gene:ENSG00000179454 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000396128 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:44924319:44961965:-1 gene:ENSG00000179454 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AK289855 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76338 complete cds, highly similar to Homo sapiens BTB (POZ) domain containing 5 (BTBD5), mRNA. // chr14 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// BC057794 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5295395, containing frame-shift errors. // chr14 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// BC121009 // GenBank // Homo sapiens kelch-like 28 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:149636 IMAGE:40116967), complete cds. // chr14 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// BC121010 // GenBank // Homo sapiens kelch-like 28 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:149637 IMAGE:40116970), complete cds. // chr14 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000005055 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:44929028:44934551:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0
NM_002013 // RefSeq // Homo sapiens FK506 binding protein 3, 25kDa (FKBP3), mRNA. // chr14 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000216330 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:45115600:45135319:-1 gene:ENSG00000100442 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000396062 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:14:45115600:45134529:-1 gene:ENSG00000100442 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// BC016288 // GenBank // Homo sapiens FK506 binding protein 3, 25kDa, mRNA (cDNA clone MGC:9482 IMAGE:3919642), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC020809 // GenBank // Homo sapiens FK506 binding protein 3, 25kDa, mRNA (cDNA clone MGC:23847 IMAGE:4292678), complete cds. // chr14 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// BT006904 // GenBank // Homo sapiens FK506 binding protein 3, 25kDa mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// M96256 // GenBank // Human rapamycin binding protein (FK506) mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000005069 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:45117958:45134761:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// M90309 // GenBank // Human FK506-binding protein 25 (FKBP25) mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// M90820 // GenBank // Human rapamycin-binding protein (FKBP25) mRNA, complete cds. // chr14 // 58 // 58 // 14 // 24 // 1
NM_018353 // RefSeq // Homo sapiens MIS18 binding protein 1 (MIS18BP1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000310806 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:45203190:45253402:-1 gene:ENSG00000129534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000454990 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:45226826:45253198:-1 gene:ENSG00000129534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr14 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// AK002048 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ11186 fis, clone PLACE1007524. // chr14 // 92 // 50 // 11 // 12 // 0 /// BC051885 // GenBank // Homo sapiens chromosome 14 open reading frame 106, mRNA (cDNA clone IMAGE:6503933), complete cds. // chr14 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// BC065544 // GenBank // Homo sapiens chromosome 14 open reading frame 106, mRNA (cDNA clone MGC:74990 IMAGE:6015439), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000005065 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:45204109:45247286:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0
ENST00000362869 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:14:45274359:45274477:-1 gene:ENSG00000199739 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr14 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// NONHSAT036651 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0
NM_080746 // RefSeq // Homo sapiens ribosomal protein L10-like (RPL10L), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000298283 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:46651010:46651821:-1 gene:ENSG00000165496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// AB063608 // GenBank // Homo sapiens RPL10L mRNA for ribosomal protein L10-like, complete cds. // chr14 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// BC014310 // GenBank // Homo sapiens ribosomal protein L10-like, mRNA (cDNA clone MGC:22634 IMAGE:3935452), complete cds. // chr14 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// BC066312 // GenBank // Homo sapiens ribosomal protein L10-like, mRNA (cDNA clone MGC:87166 IMAGE:5296757), complete cds. // chr14 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000012018 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:46651092:46651736:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 42 // 10 // 10 // 0
ENST00000384636 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:14:48341226:48341332:-1 gene:ENSG00000207366 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT036701 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001030001 // RefSeq // Homo sapiens ribosomal protein S29 (RPS29), transcript variant 2, mRNA. // chr14 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// NM_001032 // RefSeq // Homo sapiens ribosomal protein S29 (RPS29), transcript variant 1, mRNA. // chr14 // 100 // 45 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000245458 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:49583572:49586376:-1 gene:ENSG00000213741 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 40 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000396020 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:49570984:49586376:-1 gene:ENSG00000213741 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0 /// AK307833 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ97781. // chr14 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// BC015974 // GenBank // Homo sapiens ribosomal protein S29, mRNA (cDNA clone MGC:23746 IMAGE:4105424), complete cds. // chr14 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0 /// U14973 // GenBank // Human ribosomal protein S29 mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 40 // 8 // 8 // 0
XR_253251 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens uncharacterized LOC100288910 (LOC100288910), misc_RNA. // chr14 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000539688 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:49597475:49599164:-1 gene:ENSG00000213741 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript gene:ENSG00000253459 // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BX161511 // GenBank HTC // human full-length cDNA clone CS0DK012YO09 of HeLa cells of Homo sapiens (human). // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000557111 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:14:49583579:49598690:-1 gene:ENSG00000213741 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// NONHSAT036715 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr14 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_001001 // RefSeq // Homo sapiens ribosomal protein L36a-like (RPL36AL), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000298289 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:49618519:49620685:-1 gene:ENSG00000165502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// AB063609 // GenBank // Homo sapiens RPL36AL mRNA for ribosomal protein L36a-like, complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC000741 // GenBank // Homo sapiens ribosomal protein L36a-like, mRNA (cDNA clone MGC:2225 IMAGE:3507009), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC003145 // GenBank // Homo sapiens ribosomal protein L36a-like, mRNA (cDNA clone MGC:3918 IMAGE:2957923), complete cds. // chr14 // 100 // 87 // 13 // 13 // 0 /// BC070207 // GenBank // Homo sapiens ribosomal protein L36a-like, mRNA (cDNA clone MGC:88188 IMAGE:4271403), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC107716 // GenBank // Homo sapiens ribosomal protein L36a-like, mRNA (cDNA clone MGC:111574 IMAGE:6727975), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000036150 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:49618784:49620816:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0
NM_001083908 // RefSeq // Homo sapiens dynein, axonemal, assembly factor 2 (DNAAF2), transcript variant 2, mRNA. // chr14 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NM_018139 // RefSeq // Homo sapiens dynein, axonemal, assembly factor 2 (DNAAF2), transcript variant 1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000298292 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:49625174:49635230:-1 gene:ENSG00000165506 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000406043 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:49625174:49635230:-1 gene:ENSG00000165506 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// FJ158843 // GenBank // Homo sapiens kintoun (KTU) mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000036156 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:49625542:49672466:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
ENST00000584058 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:15738515:15738809:1 gene:ENSG00000263740 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr14 // 50 // 100 // 3 // 6 // 0 /// ENST00000610674 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:14:49853616:49853914:-1 gene:ENSG00000278771 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr14 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// NONHSAT036748 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr14 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// NONHSAT088493 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr14 // 50 // 100 // 3 // 6 // 0
ENST00000516120 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:14:49901850:49901950:-1 gene:ENSG00000251929 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr14 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000516308 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:44927600:44927703:-1 gene:ENSG00000252117 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr14 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0 /// ENST00000516666 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:44962830:44962933:1 gene:ENSG00000252475 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr14 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0 /// NONHSAT036757 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONHSAT042203 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0 /// NONHSAT042204 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0
ENST00000305273 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:14:50083651:50092643:-1 gene:ENSG00000168260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF390030 // GenBank // Homo sapiens unknown mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_006939 // RefSeq // Homo sapiens son of sevenless homolog 2 (Drosophila) (SOS2), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000216373 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:50117120:50231558:-1 gene:ENSG00000100485 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000543680 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:14:50118310:50231309:-1 gene:ENSG00000100485 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AK295868 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53793 complete cds, highly similar to Son of sevenless homolog 2. // chr14 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// AK302825 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56976 complete cds, highly similar to Son of sevenless homolog 2. // chr14 // 90 // 38 // 9 // 10 // 0 /// BC117261 // GenBank // Homo sapiens son of sevenless homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:150870 IMAGE:40125812), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC143366 // GenBank // Homo sapiens son of sevenless homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:176888 IMAGE:9051871), complete cds. // chr14 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC143367 // GenBank // Homo sapiens son of sevenless homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:176889 IMAGE:9051872), complete cds. // chr14 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// L13858 // GenBank // Human guanine nucleotide exchange factor mRNA, complete cds. // chr14 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// L20686 // GenBank // Homo sapiens guanine nucleotide releasing factor (SOS2) mRNA, complete cds. // chr14 // 79 // 54 // 11 // 14 // 0 /// GENSCAN00000036144 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:50118344:50312150:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NM_004196 // RefSeq // Homo sapiens cyclin-dependent kinase-like 1 (CDC2-related kinase) (CDKL1), transcript variant 1, mRNA. // chr14 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000356146 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:50335993:50416461:-1 gene:ENSG00000100490 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr14 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000395834 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:50329592:50395899:-1 gene:ENSG00000100490 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 37 // 11 // 11 // 0 /// AF390028 // GenBank // Homo sapiens serine/threonine protein kinase kkialre-like 1 mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// BC104977 // GenBank // Homo sapiens cyclin-dependent kinase-like 1 (CDC2-related kinase), mRNA (cDNA clone MGC:132637 IMAGE:8143980), complete cds. // chr14 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// X66358 // GenBank // H.sapiens mRNA KKIALRE for serine/threonine protein kinase. // chr14 // 100 // 37 // 11 // 11 // 0 /// NM_001282236 // RefSeq // Homo sapiens cyclin-dependent kinase-like 1 (CDC2-related kinase) (CDKL1), transcript variant 2, mRNA. // chr14 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1 /// ENST00000216378 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:14:50331927:50397404:-1 gene:ENSG00000100490 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1 /// GENSCAN00000036143 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:50335993:50532049:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
ENST00000364703 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:14:50468397:50468498:-1 gene:ENSG00000201573 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT036800 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_021818 // RefSeq // Homo sapiens salvador family WW domain containing protein 1 (SAV1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000324679 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:50633636:50668331:-1 gene:ENSG00000151748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AK290883 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77792 complete cds, highly similar to Homo sapiens salvador homolog 1 (Drosophila) (SAV1), mRNA. // chr14 // 100 // 70 // 16 // 16 // 0 /// BC006385 // GenBank // Homo sapiens salvador homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:4110545), partial cds. // chr14 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// BC020537 // GenBank // Homo sapiens salvador homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:21055 IMAGE:4425620), complete cds. // chr14 // 94 // 78 // 17 // 18 // 0 /// CR457297 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834D1013D for gene SAV1, salvador homolog 1 (Drosophila); complete cds, incl. stopcodon. // chr14 // 100 // 48 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000555720 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:14:50632058:50665509:-1 gene:ENSG00000151748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 39 // 39 // 9 // 23 // 1 /// AL833378 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp667J2214 (from clone DKFZp667J2214). // chr14 // 39 // 39 // 9 // 23 // 1 /// GENSCAN00000012868 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:50635183:50667967:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 48 // 11 // 11 // 0
ENST00000482923 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:14:50637691:50637981:-1 gene:ENSG00000243103 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr14 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT036807 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr14 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0
ENST00000364950 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:14:51253933:51254023:-1 gene:ENSG00000201820 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT036832 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONHSAT036855 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 73 // 52 // 8 // 11 // 0
ENST00000556941 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:51763056:51764076:-1 gene:ENSG00000258550 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr14 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
AF130106 // GenBank HTC // Homo sapiens clone FLB4307 PRO1107 mRNA, complete cds. // chr14 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0
NM_001160047 // RefSeq // Homo sapiens thioredoxin domain containing 16 (TXNDC16), transcript variant 2, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_020784 // RefSeq // Homo sapiens thioredoxin domain containing 16 (TXNDC16), transcript variant 1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000281741 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:52430590:52552506:-1 gene:ENSG00000087301 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK097748 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ40429 fis, clone TESTI2039177. // chr14 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// BC137081 // GenBank // Homo sapiens thioredoxin domain containing 16, mRNA (cDNA clone MGC:168701 IMAGE:9021078), complete cds. // chr14 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC137082 // GenBank // Homo sapiens thioredoxin domain containing 16, mRNA (cDNA clone MGC:168702 IMAGE:9021079), complete cds. // chr14 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC142650 // GenBank // Homo sapiens thioredoxin domain containing 16, mRNA (cDNA clone MGC:164870 IMAGE:40148019), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC144469 // GenBank // Homo sapiens thioredoxin domain containing 16, mRNA (cDNA clone MGC:178013 IMAGE:9052996), complete cds. // chr14 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC150205 // GenBank // Homo sapiens thioredoxin domain containing 16, mRNA (cDNA clone MGC:165072 IMAGE:40148865), complete cds. // chr14 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// BC152428 // GenBank // Homo sapiens thioredoxin domain containing 16, mRNA (cDNA clone MGC:176663 IMAGE:8862542), complete cds. // chr14 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000016466 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:52432304:52514970:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 39 // 11 // 11 // 0
NM_198066 // RefSeq // Homo sapiens glucosamine-phosphate N-acetyltransferase 1 (GNPNAT1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000216410 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:52775194:52791601:-1 gene:ENSG00000100522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000554230 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:14:52776557:52791510:-1 gene:ENSG00000100522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000557604 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:52778375:52791668:-1 gene:ENSG00000100522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// AK001469 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ10607 fis, clone NT2RP2005147. // chr14 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// BC012179 // GenBank // Homo sapiens glucosamine-phosphate N-acetyltransferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:20441 IMAGE:4661046), complete cds. // chr14 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0
NM_004124 // RefSeq // Homo sapiens glia maturation factor, beta (GMFB), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000358056 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:54474485:54489196:-1 gene:ENSG00000197045 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000554908 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:14:54474484:54489025:-1 gene:ENSG00000197045 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// AB001106 // GenBank // Homo sapiens mRNA for glia maturation factor, complete cds. // chr14 // 94 // 100 // 17 // 18 // 0 /// BC005359 // GenBank // Homo sapiens glia maturation factor, beta, mRNA (cDNA clone MGC:12462 IMAGE:3681628), complete cds. // chr14 // 100 // 72 // 13 // 13 // 0 /// BX647679 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686F02112 (from clone DKFZp686F02112). // chr14 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000616146 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:14:54474491:54489026:-1 gene:ENSG00000197045 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_001008396 // RefSeq // Homo sapiens WD repeat and HMG-box DNA binding protein 1 (WDHD1), transcript variant 2, mRNA. // chr14 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NM_007086 // RefSeq // Homo sapiens WD repeat and HMG-box DNA binding protein 1 (WDHD1), transcript variant 1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000360586 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:54938950:55027077:-1 gene:ENSG00000198554 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000420358 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:54941159:55027105:-1 gene:ENSG00000198554 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000567693 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:54941176:54991382:-1 gene:ENSG00000198554 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr14 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// AK293005 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78476 complete cds, highly similar to Homo sapiens WD repeat and HMG-box DNA binding protein 1 (WDHD1), transcript variant 1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC063041 // GenBank // Homo sapiens WD repeat and HMG-box DNA binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:65069 IMAGE:6514641), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000013313 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:54792252:55028232:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 76 // 76 // 22 // 29 // 1
NM_014924 // RefSeq // Homo sapiens autophagy related 14 (ATG14), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000247178 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:55366392:55411858:-1 gene:ENSG00000126775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000558189 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:55366392:55391302:-1 gene:ENSG00000126775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr14 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// AK292810 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78069 complete cds. // chr14 // 93 // 79 // 25 // 27 // 0 /// BC109089 // GenBank // Homo sapiens KIAA0831, mRNA (cDNA clone MGC:126291 IMAGE:40034573), complete cds. // chr14 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// BC109090 // GenBank // Homo sapiens KIAA0831, mRNA (cDNA clone MGC:126292 IMAGE:40034574), complete cds. // chr14 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// AB020638 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA0831 protein, partial cds. // chr14 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000013308 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:55365537:55390968:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 47 // 47 // 16 // 34 // 1
NM_199047 // RefSeq // Homo sapiens TATA box binding protein like 2 (TBPL2), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000247219 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:55413541:55440616:-1 gene:ENSG00000182521 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY457923 // GenBank // Homo sapiens TBP-related factor 3 (TRF3) mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC117159 // GenBank // Homo sapiens TATA box binding protein like 2, mRNA (cDNA clone MGC:150768 IMAGE:40125710), complete cds. // chr14 // 92 // 96 // 24 // 26 // 0 /// BC117185 // GenBank // Homo sapiens TATA box binding protein like 2, mRNA (cDNA clone MGC:150794 IMAGE:40125736), complete cds. // chr14 // 92 // 96 // 24 // 26 // 0 /// DQ448593 // GenBank // Homo sapiens TATA box binding protein like 2 mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000013305 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:55394991:55440545:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
ENST00000484915 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:14:56824375:56824656:-1 gene:ENSG00000243801 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr14 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT037070 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr14 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_006544 // RefSeq // Homo sapiens exocyst complex component 5 (EXOC5), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000340918 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:14:57208160:57268899:-1 gene:ENSG00000070367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 90 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000413566 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:14:57202483:57268899:-1 gene:ENSG00000070367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 90 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000555148 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:57208545:57268837:-1 gene:ENSG00000070367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr14 // 100 // 90 // 9 // 9 // 0 /// AK295085 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54619 complete cds, highly similar to Exocyst complex component 5. // chr14 // 89 // 90 // 8 // 9 // 0 /// AK303531 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54264 complete cds, highly similar to Exocyst complex component 5. // chr14 // 100 // 90 // 9 // 9 // 0 /// BC041126 // GenBank // Homo sapiens exocyst complex component 5, mRNA (cDNA clone MGC:47692 IMAGE:3914527), complete cds. // chr14 // 100 // 90 // 9 // 9 // 0 /// U85946 // GenBank // Homo sapiens brain secretory protein hSec10p (HSEC10) mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 90 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000621441 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:57200507:57269008:-1 gene:ENSG00000070367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000021311 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:57208609:57259957:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0
NM_001206920 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 35, member F4 (SLC35F4), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000339762 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:14:57563922:57596897:-1 gene:ENSG00000151812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000554729 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:14:57563978:57596897:-1 gene:ENSG00000151812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000556306 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:57569863:57581335:-1 gene:ENSG00000151812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr14 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000556826 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:14:57563922:57866062:-1 gene:ENSG00000151812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000557254 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:57564139:57596897:-1 gene:ENSG00000151812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC101319 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 35, member F4, mRNA (cDNA clone IMAGE:40024893). // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000005840 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:57564135:57609896:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
ENST00000517028 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:14:57837354:57837660:-1 gene:ENSG00000252837 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT037097 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000516973 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:14:58292293:58292388:-1 gene:ENSG00000252782 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr14 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT037138 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_022571 // RefSeq // Homo sapiens G protein-coupled receptor 135 (GPR135), mRNA. // chr14 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000395116 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:59460765:59465342:-1 gene:ENSG00000181619 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000481661 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:59429022:59465341:-1 gene:ENSG00000181619 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr14 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AY288418 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 135 (GPR135) mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 58 // 22 // 22 // 0 /// BC032831 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 135, mRNA (cDNA clone MGC:26730 IMAGE:4825908), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// M76676 // GenBank // Homo sapiens leukocyte platelet-activating factor receptor mRNA, complete cds. // chr14 // 65 // 53 // 13 // 20 // 0 /// GENSCAN00000024718 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:59463742:59465226:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 58 // 22 // 22 // 0
NM_001164399 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 175 (CCDC175), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000281581 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:14:59510430:59576775:-1 gene:ENSG00000151838 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000537690 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:59505061:59576831:-1 gene:ENSG00000151838 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000556936 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:59540683:59564454:-1 gene:ENSG00000151838 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr14 // 100 // 32 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000032608 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:59507365:59576775:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT037186 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr14 // 100 // 32 // 10 // 10 // 0
NM_174978 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 14 open reading frame 39 (C14orf39), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000321731 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:60435956:60486096:-1 gene:ENSG00000179008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000555476 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:14:60471632:60486044:-1 gene:ENSG00000179008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 24 // 9 // 9 // 0 /// AL832219 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686F0536 (from clone DKFZp686F0536). // chr14 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC125070 // GenBank // Homo sapiens chromosome 14 open reading frame 39, mRNA (cDNA clone MGC:149706 IMAGE:40117603), complete cds. // chr14 // 97 // 92 // 34 // 35 // 0 /// ENST00000557138 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:60436623:60486019:-1 gene:ENSG00000179008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr14 // 63 // 63 // 24 // 38 // 1
NM_005982 // RefSeq // Homo sapiens SIX homeobox 1 (SIX1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000247182 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:60643415:60649462:-1 gene:ENSG00000126778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC008874 // GenBank // Homo sapiens SIX homeobox 1, mRNA (cDNA clone MGC:15242 IMAGE:4138234), complete cds. // chr14 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// BT007083 // GenBank // Homo sapiens sine oculis homeobox homolog 1 (Drosophila) mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 59 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000553535 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:60645270:60653026:-1 gene:ENSG00000126778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr14 // 41 // 41 // 9 // 22 // 1 /// ENST00000554986 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:14:60644696:60658259:-1 gene:ENSG00000126778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 41 // 41 // 9 // 22 // 1 /// ENST00000555955 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:60644931:60653131:-1 gene:ENSG00000126778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr14 // 41 // 41 // 9 // 22 // 1 /// AK093780 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ36461 fis, clone THYMU2014901, highly similar to HOMEOBOX PROTEIN SIX1. // chr14 // 41 // 41 // 9 // 22 // 1 /// GENSCAN00000010056 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:60637619:60649189:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 59 // 59 // 13 // 22 // 1
NM_017420 // RefSeq // Homo sapiens SIX homeobox 4 (SIX4), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000216513 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:60709528:60724134:-1 gene:ENSG00000100625 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000556952 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:60719802:60724348:-1 gene:ENSG00000100625 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0 /// AK309358 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99399. // chr14 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0 /// BC098135 // GenBank // Homo sapiens SIX homeobox 4, mRNA (cDNA clone MGC:119451 IMAGE:40007527), complete cds. // chr14 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0 /// BC098282 // GenBank // Homo sapiens SIX homeobox 4, mRNA (cDNA clone MGC:119452 IMAGE:40007529), complete cds. // chr14 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0 /// BC099722 // GenBank // Homo sapiens SIX homeobox 4, mRNA (cDNA clone MGC:119453 IMAGE:40007530), complete cds. // chr14 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0 /// BC101934 // GenBank // Homo sapiens SIX homeobox 4, mRNA (cDNA clone MGC:119450 IMAGE:40007526), complete cds. // chr14 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000010041 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:60713407:60724011:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0
NM_020810 // RefSeq // Homo sapiens tRNA methyltransferase 5 (TRMT5), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000261249 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:60971451:60981358:-1 gene:ENSG00000126814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK293158 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54461 complete cds, highly similar to Homo sapiens TRM5 tRNA methyltransferase 5 homolog (TRMT5), mRNA. // chr14 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// BC108284 // GenBank // Homo sapiens TRM5 tRNA methyltransferase 5 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:111453 IMAGE:4371510), complete cds. // chr14 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// BC136606 // GenBank // Homo sapiens TRM5 tRNA methyltransferase 5 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:168219 IMAGE:9020596), complete cds. // chr14 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// BC136607 // GenBank // Homo sapiens TRM5 tRNA methyltransferase 5 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:168220 IMAGE:9020597), complete cds. // chr14 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000010050 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:60975452:61025169:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0
NM_001017970 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 30B (TMEM30B), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000555868 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:61277370:61281840:-1 gene:ENSG00000182107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000557163 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:61279872:61281476:-1 gene:ENSG00000182107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr14 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// BC101726 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 30B, mRNA (cDNA clone MGC:126775 IMAGE:8069232), complete cds. // chr14 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// BC113559 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 30B, mRNA (cDNA clone MGC:142119 IMAGE:8322611), complete cds. // chr14 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000554497 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:61280803:61281761:-1 gene:ENSG00000182107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr14 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// GENSCAN00000010051 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:61280092:61281147:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0
NM_145171 // RefSeq // Homo sapiens glycoprotein hormone beta 5 (GPHB5), mRNA. // chr14 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// ENST00000314140 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:14:63312928:63317849:-1 gene:ENSG00000179600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// AF403430 // GenBank // Homo sapiens glycoprotein beta 5 (GPB5) mRNA, complete cds. // chr14 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// AF467770 // GenBank // Homo sapiens glycoprotein hormone beta subunit (ZLUT1) mRNA, complete cds. // chr14 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// BC069113 // GenBank // Homo sapiens glycoprotein hormone beta 5, mRNA (cDNA clone MGC:95391 IMAGE:7216930), complete cds. // chr14 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// ENST00000621500 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:63312835:63318879:-1 gene:ENSG00000179600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
NM_001008726 // RefSeq // Homo sapiens WD repeat domain 89 (WDR89), transcript variant 1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_001258272 // RefSeq // Homo sapiens WD repeat domain 89 (WDR89), transcript variant 3, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_080666 // RefSeq // Homo sapiens WD repeat domain 89 (WDR89), transcript variant 2, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000267522 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:63598502:63641407:-1 gene:ENSG00000140006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000394942 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:63597039:63641861:-1 gene:ENSG00000140006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000554717 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:14:63599263:63641853:-1 gene:ENSG00000140006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// AF115513 // GenBank // Homo sapiens MSTP050 (MST050) mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// BC010698 // GenBank // Homo sapiens WD repeat domain 89, mRNA (cDNA clone MGC:9907 IMAGE:3870073), complete cds. // chr14 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000620954 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:14:63597040:63599974:-1 gene:ENSG00000140006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
ENST00000363823 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:14:63651296:63651499:-1 gene:ENSG00000200693 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT037311 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_030791 // RefSeq // Homo sapiens sphingosine-1-phosphate phosphatase 1 (SGPP1), mRNA. // chr14 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000247225 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:63684214:63728039:-1 gene:ENSG00000126821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AF349315 // GenBank // Homo sapiens sphingosine-1-phosphate phosphatase mRNA, complete cds. // chr14 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// BC063839 // GenBank // Homo sapiens sphingosine-1-phosphate phosphatase 1, mRNA (cDNA clone MGC:74883 IMAGE:6184825), complete cds. // chr14 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC070060 // GenBank // Homo sapiens sphingosine-1-phosphate phosphatase 1, mRNA (cDNA clone MGC:87248 IMAGE:30347615), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_006977 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger and BTB domain containing 25 (ZBTB25), mRNA. // chr14 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0 /// XM_005268051 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens zinc finger and BTB domain containing 25 (ZBTB25), transcript variant X3, mRNA. // chr14 // 100 // 71 // 10 // 10 // 0 /// XM_006720251 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens zinc finger and BTB domain containing 25 (ZBTB25), transcript variant X7, mRNA. // chr14 // 100 // 71 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000394715 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:64486839:64504584:-1 gene:ENSG00000089775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 71 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000608382 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:64478051:64503845:-1 gene:ENSG00000089775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// AK098181 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ40862 fis, clone TRACH2018262, highly similar to Zinc finger and BTB domain-containing protein 25. // chr14 // 100 // 71 // 10 // 10 // 0 /// BC035804 // GenBank // Homo sapiens zinc finger and BTB domain containing 25, mRNA (cDNA clone MGC:46128 IMAGE:5745935), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// X16576 // GenBank // Human KUP mRNA for protein with two zinc fingers. // chr14 // 100 // 71 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000003419 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:64486923:64518433:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 64 // 9 // 9 // 0
ENST00000411053 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:14:65124352:65124542:-1 gene:ENSG00000222985 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT037374 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000445822 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:66012830:66013789:-1 gene:ENSG00000224861 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr14 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000014392 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:66012830:66024195:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
ENST00000363990 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:14:66177527:66177635:-1 gene:ENSG00000200860 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr14 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT037413 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_016445 // RefSeq // Homo sapiens pleckstrin 2 (PLEK2), mRNA. // chr14 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000216446 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:67386983:67412200:-1 gene:ENSG00000100558 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000553387 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:67388252:67412071:-1 gene:ENSG00000100558 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr14 // 90 // 60 // 19 // 21 // 0 /// ENST00000554395 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:14:67388246:67397670:-1 gene:ENSG00000100558 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 87 // 43 // 13 // 15 // 0 /// ENST00000555803 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:67387388:67397820:-1 gene:ENSG00000100558 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr14 // 93 // 40 // 13 // 14 // 0 /// ENST00000556532 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:14:67386987:67392705:-1 gene:ENSG00000100558 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 34 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000557388 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:67397746:67412167:-1 gene:ENSG00000100558 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr14 // 100 // 31 // 11 // 11 // 0 /// AF228603 // GenBank // Homo sapiens pleckstrin 2 mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// BC001226 // GenBank // Homo sapiens pleckstrin 2, mRNA (cDNA clone MGC:4867 IMAGE:3457876), complete cds. // chr14 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000030754 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:67387329:67397826:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT037442 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr14 // 100 // 31 // 11 // 11 // 0
NM_182526 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 229B (TMEM229B), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// XM_005267373 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens transmembrane protein 229B (TMEM229B), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000357461 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:14:67470266:67515304:-1 gene:ENSG00000198133 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000554278 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:67473520:67533739:-1 gene:ENSG00000198133 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0 /// ENST00000557006 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:67470266:67515471:-1 gene:ENSG00000198133 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC104940 // GenBank // Homo sapiens chromosome 14 open reading frame 83, mRNA (cDNA clone MGC:132600 IMAGE:8143943), complete cds. // chr14 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0 /// BC104942 // GenBank // Homo sapiens chromosome 14 open reading frame 83, mRNA (cDNA clone MGC:132602 IMAGE:8143945), complete cds. // chr14 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0 /// ENST00000555638 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:67447084:67515485:-1 gene:ENSG00000198133 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr14 // 100 // 100 // 9 // 9 // 1 /// AK090706 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ33387 fis, clone BRACE2006636. // chr14 // 100 // 100 // 9 // 9 // 1
NM_004569 // RefSeq // Homo sapiens phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class H (PIGH), mRNA. // chr14 // 82 // 92 // 9 // 11 // 0 /// ENST00000216452 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:67589311:67600287:-1 gene:ENSG00000100564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 92 // 11 // 11 // 0 /// BC071849 // GenBank // Homo sapiens phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class H, mRNA (cDNA clone MGC:88510 IMAGE:5935599), complete cds. // chr14 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// L19783 // GenBank // Human GPI-H mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0
ENST00000364659 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:14:67617302:67617415:-1 gene:ENSG00000201529 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT037457 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONHSAT037472 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0
ENST00000463482 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:14:67751228:67751544:-1 gene:ENSG00000239820 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT037473 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AF132200 // GenBank HTC // Homo sapiens PRO1751 mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
ENST00000460079 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:14:68149617:68149908:-1 gene:ENSG00000244677 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr14 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT037479 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr14 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
ENST00000481903 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:14:68236243:68236539:-1 gene:ENSG00000243546 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr14 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT037480 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr14 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000473054 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:68338728:68339528:-1 gene:ENSG00000240210 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr14 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000014710 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:68338738:68365637:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
ENST00000384361 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:14:68735922:68736028:-1 gene:ENSG00000207089 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr14 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT037493 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000384041 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:14:69143852:69143953:-1 gene:ENSG00000206768 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr14 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT037508 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_001271507 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 177 (CCDC177), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000599174 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:69569816:69574837:-1 gene:ENSG00000267909 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF284217 // GenBank // Homo sapiens myelin proteolipid protein-like protein (PLPL) mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONHSAT037533 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001271507 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 177 (CCDC177), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000599174 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:69569816:69574837:-1 gene:ENSG00000267909 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000010830 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:69571499:69573622:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
ENST00000477943 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:69885340:69886140:-1 gene:ENSG00000242071 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr14 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000010806 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:69885340:69886140:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_003813 // RefSeq // Homo sapiens ADAM metallopeptidase domain 21 (ADAM21), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NR_003951 // RefSeq // Homo sapiens ADAM metallopeptidase domain 21 pseudogene 1 (ADAM21P1), non-coding RNA. // chr14 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000529267 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:70245491:70247660:-1 gene:ENSG00000235812 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr14 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000530196 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:70245753:70247801:-1 gene:ENSG00000235812 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr14 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000603540 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:70452157:70459899:1 gene:ENSG00000139985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC109024 // GenBank // Homo sapiens ADAM metallopeptidase domain 21, mRNA (cDNA clone MGC:125389 IMAGE:40027108), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// DQ202398 // GenBank // Homo sapiens ADAM21-like protein mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000025086 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:70454919:70459668:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NR_037933 // RefSeq // Homo sapiens ADAM metallopeptidase domain 20 pseudogene 1 (ADAM20P1), non-coding RNA. // chr14 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000556964 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:70468881:70483756:-1 gene:ENSG00000259158 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr14 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000320746 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:14:70469160:70471108:-1 gene:ENSG00000259158 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:pseudogene gene:ENSG00000176082 // chr14 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000025091 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:70469022:70471216:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0
NM_003814 // RefSeq // Homo sapiens ADAM metallopeptidase domain 20 (ADAM20), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000256389 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:70522358:70535015:-1 gene:ENSG00000134007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF029899 // GenBank // Homo sapiens ADAM 20 mRNA, complete cds. // chr14 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// BC025378 // GenBank // Homo sapiens ADAM metallopeptidase domain 20, mRNA (cDNA clone MGC:25993 IMAGE:4827383), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000025093 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:70522577:70524907:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
AK024445 // GenBank // Homo sapiens mRNA for FLJ00035 protein, partial cds. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AF130112 // GenBank HTC // Homo sapiens clone FLB7348 PRO1953 mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000363428 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:14:72022407:72022516:-1 gene:ENSG00000200298 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr14 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT037645 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000384024 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:14:72853224:72853331:-1 gene:ENSG00000206751 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT037663 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000488095 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:72929612:72929930:-1 gene:ENSG00000176043 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr14 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT037667 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr14 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT037668 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr14 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000004765 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:72925728:72929930:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 71 // 71 // 15 // 21 // 1
ENST00000479137 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:14:73040619:73040914:-1 gene:ENSG00000241487 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT037676 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001220484 // RefSeq // Homo sapiens HEAT repeat containing 4 (HEATR4), transcript variant 1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_203309 // RefSeq // Homo sapiens HEAT repeat containing 4 (HEATR4), transcript variant 2, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006720143 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens HEAT repeat containing 4 (HEATR4), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006720144 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens HEAT repeat containing 4 (HEATR4), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000334988 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:73478487:73558947:-1 gene:ENSG00000187105 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000553558 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:73478486:73558921:-1 gene:ENSG00000187105 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AK302564 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61725 complete cds. // chr14 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// BC047590 // GenBank // Homo sapiens HEAT repeat containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:48595 IMAGE:4837558), complete cds. // chr14 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GU727638 // GenBank // Homo sapiens epididymis secretory sperm binding protein Li 187n mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000006669 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:73498001:73529762:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_006029 // RefSeq // Homo sapiens paraneoplastic Ma antigen 1 (PNMA1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000316836 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:73711783:73714372:-1 gene:ENSG00000176903 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AF320308 // GenBank // Homo sapiens paraneoplastic antigen (PNMA1) mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// AK290980 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76042 complete cds, highly similar to Homo sapiens paraneoplastic antigen MA1 (PNMA1), mRNA. // chr14 // 94 // 67 // 17 // 18 // 0 /// BC007712 // GenBank HTC // Homo sapiens paraneoplastic antigen MA1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4126114), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr14 // 85 // 48 // 11 // 13 // 0 /// BC039577 // GenBank // Homo sapiens paraneoplastic antigen MA1, mRNA (cDNA clone MGC:48703 IMAGE:4431875), complete cds. // chr14 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// CR457112 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834D0712D for gene PNMA1, paraneoplastic antigen MA1; complete cds, incl. stopcodon. // chr14 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// AF037364 // GenBank // Homo sapiens paraneoplastic neuronal antigen MA1 (MA1) mRNA, complete cds. // chr14 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0
ENST00000411368 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:14:73858061:73858165:-1 gene:ENSG00000223300 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT037751 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_152445 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 161, member B (FAM161B), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000286544 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:73932510:73950414:-1 gene:ENSG00000156050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AK302982 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55603 complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC053909 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 161, member B, mRNA (cDNA clone MGC:61766 IMAGE:6501484), complete cds. // chr14 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000556794 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:14:73931501:73938094:-1 gene:ENSG00000156050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1 /// CR749537 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686I15206 (from clone DKFZp686I15206). // chr14 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1 /// GENSCAN00000006662 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:73934256:73950481:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000555916 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:73913067:73938114:-1 gene:ENSG00000258891 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr14 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
NM_001278593 // RefSeq // Homo sapiens aldehyde dehydrogenase 6 family, member A1 (ALDH6A1), transcript variant 2, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NM_001278594 // RefSeq // Homo sapiens aldehyde dehydrogenase 6 family, member A1 (ALDH6A1), transcript variant 3, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NM_005589 // RefSeq // Homo sapiens aldehyde dehydrogenase 6 family, member A1 (ALDH6A1), transcript variant 1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000553458 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:74056850:74084493:-1 gene:ENSG00000119711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// AF130089 // GenBank HTC // Homo sapiens clone FLB9440 PRO2550 mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
ENST00000554490 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:74377818:74378418:-1 gene:ENSG00000177776 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr14 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// GENSCAN00000034911 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:74377723:74378388:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001105579 // RefSeq // Homo sapiens synapse differentiation inducing 1-like (SYNDIG1L), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000331628 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:14:74405893:74426102:-1 gene:ENSG00000183379 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000554823 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:74405894:74409806:-1 gene:ENSG00000183379 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK094873 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ37554 fis, clone BRCAN2028378. // chr14 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// GENSCAN00000034924 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:74407535:74493274:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONHSAT037789 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr14 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_000428 // RefSeq // Homo sapiens latent transforming growth factor beta binding protein 2 (LTBP2), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENST00000261978 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:74498170:74612331:-1 gene:ENSG00000119681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENST00000553939 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:74500411:74612378:-1 gene:ENSG00000119681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr14 // 100 // 93 // 42 // 42 // 0 /// BC078659 // GenBank // Homo sapiens latent transforming growth factor beta binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:87426 IMAGE:30343778), complete cds. // chr14 // 100 // 93 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000556690 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:14:74500732:74612072:-1 gene:ENSG00000119681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 89 // 89 // 40 // 45 // 1 /// GENSCAN00000034948 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:74500884:74558576:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 78 // 35 // 35 // 0
NM_001243007 // RefSeq // Homo sapiens prospero homeobox 2 (PROX2), transcript variant 1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000556489 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:14:74853033:74863834:-1 gene:ENSG00000119608 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_001080408 // RefSeq // Homo sapiens prospero homeobox 2 (PROX2), transcript variant 2, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 1 /// ENST00000556084 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:74852871:74863834:-1 gene:ENSG00000119608 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 1 /// GENSCAN00000034918 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:74855447:74863834:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0
ENST00000516204 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:14:75202081:75202169:-1 gene:ENSG00000252013 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr14 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT037845 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
GENSCAN00000034909 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:75292106:75294313:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000559021 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:75292131:75292495:-1 gene:ENSG00000119660 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr14 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// NONHSAT037851 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr14 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_007176 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 14 open reading frame 1 (C14orf1), mRNA. // chr14 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000256319 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:75649791:75661189:-1 gene:ENSG00000133935 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF134159 // GenBank // Homo sapiens potential membrane protein C14orf1 mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF136971 // GenBank // Homo sapiens proteinx0006 mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC002444 // GenBank // Homo sapiens chromosome 14 open reading frame 1, mRNA (cDNA clone MGC:1219 IMAGE:3347242), complete cds. // chr14 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// CR533443 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834E0916D for gene C14orf1, chromosome 14 open reading frame 1; complete cds, incl. stopcodon. // chr14 // 95 // 75 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000039429 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:75651555:75660871:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0
NM_015305 // RefSeq // Homo sapiens angel homolog 1 (Drosophila) (ANGEL1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000251089 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:76787243:76812940:-1 gene:ENSG00000013523 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000555079 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:14:76790671:76806515:-1 gene:ENSG00000013523 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 89 // 26 // 8 // 9 // 0 /// ENST00000556298 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:76809181:76812861:-1 gene:ENSG00000013523 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr14 // 100 // 26 // 9 // 9 // 0 /// AK301589 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58955 complete cds. // chr14 // 100 // 38 // 13 // 13 // 0 /// BC028714 // GenBank // Homo sapiens angel homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:27101 IMAGE:4830897), complete cds. // chr14 // 97 // 97 // 32 // 33 // 0 /// XR_429300 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens angel homolog 1 (Drosophila) (ANGEL1), transcript variant X1, misc_RNA. // chr14 // 68 // 68 // 23 // 34 // 1 /// XR_429302 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens angel homolog 1 (Drosophila) (ANGEL1), transcript variant X3, misc_RNA. // chr14 // 65 // 65 // 22 // 34 // 1 /// ENST00000557179 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:14:76788957:76804435:-1 gene:ENSG00000013523 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1 /// AK301069 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60172 complete cds. // chr14 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// GENSCAN00000036124 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:76789228:76812827:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0
NM_024496 // RefSeq // Homo sapiens interferon regulatory factor 2 binding protein-like (IRF2BPL), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000238647 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:77024543:77028699:-1 gene:ENSG00000119669 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000036121 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:77025402:77068362:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0
NM_174976 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, DHHC-type containing 22 (ZDHHC22), mRNA. // chr14 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006720120 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens zinc finger, DHHC-type containing 22 (ZDHHC22), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000319374 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:77131270:77141791:-1 gene:ENSG00000177108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AK294840 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56872 complete cds, highly similar to Rattus norvegicus zinc finger, DHHC-type containing 22 (Zdhhc22), mRNA. // chr14 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// BC035881 // GenBank // Homo sapiens zinc finger, DHHC-type containing 22, mRNA (cDNA clone IMAGE:4939155). // chr14 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// BC117676 // GenBank // Homo sapiens zinc finger, DHHC-type containing 22, mRNA (cDNA clone MGC:134868 IMAGE:40069732), complete cds. // chr14 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000036123 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:77133683:77141887:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
ENST00000364514 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:14:77201026:77201140:-1 gene:ENSG00000201384 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr14 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT037965 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_021257 // RefSeq // Homo sapiens neuroglobin (NGB), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000298352 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:77265483:77271312:-1 gene:ENSG00000165553 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF422797 // GenBank // Homo sapiens neuroglobin (NGB) mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC032509 // GenBank // Homo sapiens neuroglobin, mRNA (cDNA clone MGC:45010 IMAGE:5247233), complete cds. // chr14 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000036119 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:77266536:77306441:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
NM_213601 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane emp24 protein transport domain containing 8 (TMED8), mRNA. // chr14 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000216468 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:77335021:77377109:-1 gene:ENSG00000100580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK095650 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ38331 fis, clone FCBBF3025285, highly similar to Protein TMED8. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY598329 // GenBank // Homo sapiens L10 mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC101510 // GenBank // Homo sapiens transmembrane emp24 protein transport domain containing 8, mRNA (cDNA clone MGC:126559 IMAGE:8069016), complete cds. // chr14 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BX248262 // GenBank HTC // human full-length cDNA clone CS0DN001YD20 of Adult brain of Homo sapiens (human). // chr14 // 92 // 48 // 12 // 13 // 0 /// XM_005267544 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens transmembrane emp24 protein transport domain containing 8 (TMED8), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1 /// GENSCAN00000015773 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:77341771:77346471:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0
ENST00000555603 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:77406736:77423517:-1 gene:ENSG00000165555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 93 // 54 // 13 // 14 // 0 /// ENST00000555901 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:77394443:77423056:-1 gene:ENSG00000165555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr14 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AK057371 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ32809 fis, clone TESTI2002724, highly similar to Homo sapiens serine palmitoyl transferase, subunit II gene. // chr14 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NM_001113475 // RefSeq // Homo sapiens NADP-dependent oxidoreductase domain containing 1 (NOXRED1), mRNA. // chr14 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// XM_005267330 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens NADP-dependent oxidoreductase domain containing 1 (NOXRED1), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// ENST00000380835 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:77394021:77423056:-1 gene:ENSG00000165555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// BC066965 // GenBank // Homo sapiens chromosome 14 open reading frame 148, mRNA (cDNA clone MGC:87510 IMAGE:4373886), complete cds. // chr14 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// XM_005267331 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens NADP-dependent oxidoreductase domain containing 1 (NOXRED1), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// GENSCAN00000015785 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:77405909:77454102:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_004863 // RefSeq // Homo sapiens serine palmitoyltransferase, long chain base subunit 2 (SPTLC2), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000216484 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:77505997:77616773:-1 gene:ENSG00000100596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000554901 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:14:77535600:77597321:-1 gene:ENSG00000100596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 94 // 51 // 17 // 18 // 0 /// ENST00000556607 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:77512341:77552192:-1 gene:ENSG00000100596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr14 // 100 // 23 // 8 // 8 // 0 /// BC005123 // GenBank // Homo sapiens serine palmitoyltransferase, long chain base subunit 2, mRNA (cDNA clone MGC:10362 IMAGE:3688136), complete cds. // chr14 // 97 // 97 // 33 // 34 // 0 /// U15555 // GenBank // Human serine palmitoyltransferase (LCB2) mRNA, partial cds. // chr14 // 89 // 51 // 16 // 18 // 0 /// GENSCAN00000015783 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:77512284:77708004:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 83 // 83 // 29 // 35 // 1
ENST00000459853 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:14:77547566:77547846:-1 gene:ENSG00000240233 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT037993 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_006020 // RefSeq // Homo sapiens alkB, alkylation repair homolog 1 (E. coli) (ALKBH1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000216489 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:77672404:77708020:-1 gene:ENSG00000100601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000555100 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:77674103:77707992:-1 gene:ENSG00000100601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr14 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000557057 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:77673075:77708010:-1 gene:ENSG00000100601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr14 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC025787 // GenBank // Homo sapiens alkB, alkylation repair homolog 1 (E. coli), mRNA (cDNA clone MGC:34444 IMAGE:5229152), complete cds. // chr14 // 92 // 92 // 22 // 24 // 0 /// BX537699 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686E22171 (from clone DKFZp686E22171). // chr14 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// GENSCAN00000015783 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:77512284:77708004:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
ENST00000362570 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:14:77821030:77821142:-1 gene:ENSG00000199440 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr14 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT038005 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
BX248745 // GenBank HTC // human full-length cDNA 5-PRIME end of clone CS0CAP002YE20 of Thymus of Homo sapiens (human). // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000553628 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:78744398:78753878:-1 gene:ENSG00000258478 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr14 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT038017 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr14 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
NM_001244984 // RefSeq // Homo sapiens sel-1 suppressor of lin-12-like (C. elegans) (SEL1L), transcript variant 2, mRNA. // chr14 // 100 // 31 // 11 // 11 // 0 /// NM_005065 // RefSeq // Homo sapiens sel-1 suppressor of lin-12-like (C. elegans) (SEL1L), transcript variant 1, mRNA. // chr14 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000336735 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:81471549:81533861:-1 gene:ENSG00000071537 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000555824 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:81498808:81533833:-1 gene:ENSG00000071537 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 31 // 11 // 11 // 0 /// AB020335 // GenBank // Homo sapiens TSA305 mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// AF052059 // GenBank // Homo sapiens SEL1L (SEL1L) mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// AY358651 // GenBank // Homo sapiens clone DNA49820 SEL1L (UNQ128) mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 31 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000019573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:81430939:81533744:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 63 // 63 // 22 // 35 // 1
ENST00000516974 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:14:87996345:87996448:-1 gene:ENSG00000252783 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr14 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT038167 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_007039 // RefSeq // Homo sapiens protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 21 (PTPN21), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000328736 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:14:88465778:88550622:-1 gene:ENSG00000070778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000536337 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:88467955:88550530:-1 gene:ENSG00000070778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr14 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000554270 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:88467955:88550530:-1 gene:ENSG00000070778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr14 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000554628 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:88492900:88551489:-1 gene:ENSG00000070778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr14 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000556564 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:88465781:88554733:-1 gene:ENSG00000070778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AK310480 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17522. // chr14 // 92 // 41 // 11 // 12 // 0 /// BC143846 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:9052361, containing frame-shift errors. // chr14 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC143847 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:9052362. // chr14 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// X79510 // GenBank // H.sapiens mRNA for protein-tyrosine-phosphatase D1. // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000022381 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:88468087:88554674:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0
NM_183387 // RefSeq // Homo sapiens echinoderm microtubule associated protein like 5 (EML5), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENST00000380664 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:88615818:88792503:-1 gene:ENSG00000165521 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// ENST00000553281 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:88621757:88715130:-1 gene:ENSG00000165521 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr14 // 100 // 60 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000553526 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:88614871:88665361:-1 gene:ENSG00000165521 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr14 // 100 // 48 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000554922 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:88612431:88792752:-1 gene:ENSG00000165521 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// AK128086 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ46207 fis, clone TESTI4010902, weakly similar to Echinoderm microtubule-associated protein. // chr14 // 100 // 60 // 29 // 29 // 0 /// BC032685 // GenBank // Homo sapiens echinoderm microtubule associated protein like 5, mRNA (cDNA clone IMAGE:5582318), partial cds. // chr14 // 100 // 29 // 14 // 14 // 0 /// BC150639 // GenBank // Homo sapiens echinoderm microtubule associated protein like 5, mRNA (cDNA clone MGC:183549 IMAGE:9057009), complete cds. // chr14 // 98 // 98 // 46 // 47 // 0 /// CR933726 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp781D1122 (from clone DKFZp781D1122). // chr14 // 19 // 19 // 9 // 48 // 1 /// GENSCAN00000022378 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:88616045:88792503:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 77 // 37 // 37 // 0
NM_001085471 // RefSeq // Homo sapiens forkhead box N3 (FOXN3), transcript variant 1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NM_005197 // RefSeq // Homo sapiens forkhead box N3 (FOXN3), transcript variant 2, mRNA. // chr14 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000261302 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:14:89161361:89412492:-1 gene:ENSG00000053254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000345097 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:89156172:89619130:-1 gene:ENSG00000053254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000557258 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:89161385:89417112:-1 gene:ENSG00000053254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 56 // 9 // 9 // 0 /// AK225967 // GenBank // Homo sapiens mRNA for checkpoint suppressor 1 variant, clone: FCC113E08. // chr14 // 90 // 63 // 9 // 10 // 0 /// BC007506 // GenBank // Homo sapiens forkhead box N3, mRNA (cDNA clone MGC:4149 IMAGE:3028787), complete cds. // chr14 // 100 // 56 // 9 // 9 // 0 /// U68723 // GenBank // Human checkpoint suppressor 1 mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 69 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000615335 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:14:89161400:89412476:-1 gene:ENSG00000053254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 56 // 9 // 9 // 0
ENST00000516846 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:14:89650793:89650903:-1 gene:ENSG00000252655 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT039196 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000461458 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:90366697:90367179:-1 gene:ENSG00000242571 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr14 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000042884 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:90366697:90367179:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_001010854 // RefSeq // Homo sapiens tetratricopeptide repeat domain 7B (TTC7B), mRNA. // chr14 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000328459 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:90524564:90816417:-1 gene:ENSG00000165914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000553972 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:90540642:90644208:-1 gene:ENSG00000165914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000554654 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:90540642:90644944:-1 gene:ENSG00000165914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr14 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000555005 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:90540588:90689712:-1 gene:ENSG00000165914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr14 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC035865 // GenBank // Homo sapiens tetratricopeptide repeat domain 7B, mRNA (cDNA clone IMAGE:4998878), partial cds. // chr14 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000042883 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:90541368:90676967:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
AK095276 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ37957 fis, clone CTONG2009529. // chr14 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000614987 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:90847862:91060608:-1 gene:ENSG00000100784 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001080414 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 88C (CCDC88C), mRNA. // chr14 // 100 // 83 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000331194 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:14:91271325:91285690:-1 gene:ENSG00000015133 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 75 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000334448 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:91273469:91283623:-1 gene:ENSG00000015133 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr14 // 100 // 58 // 7 // 7 // 0 /// ENST00000389857 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:91271325:91417777:-1 gene:ENSG00000015133 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 83 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000556726 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:91271323:91289331:-1 gene:ENSG00000015133 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr14 // 100 // 83 // 10 // 10 // 0 /// AL833046 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp666F109 (from clone DKFZp666F109). // chr14 // 100 // 50 // 6 // 6 // 0 /// BC035914 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 88C, mRNA (cDNA clone IMAGE:5496219), complete cds. // chr14 // 100 // 75 // 9 // 9 // 0 /// BX248302 // GenBank HTC // human full-length cDNA clone CS0DL007YB06 of B cells (Ramos cell line) of Homo sapiens (human). // chr14 // 100 // 58 // 7 // 7 // 0 /// GENSCAN00000040612 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:91244604:91343649:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 75 // 75 // 9 // 12 // 1
AF318368 // GenBank HTC // Homo sapiens pp8961 mRNA, complete cds. // chr14 // 88 // 100 // 21 // 24 // 0 /// AK091161 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ33842 fis, clone CTONG2005049. // chr14 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000022183 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR14_1_CTG1:91554276:91588389:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 79 // 79 // 19 // 24 // 1 /// GENSCAN00000040617 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:91521381:91588389:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 79 // 79 // 19 // 24 // 1
NM_024764 // RefSeq // Homo sapiens catsper channel auxiliary subunit beta (CATSPERB), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000256343 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:91580774:91732086:-1 gene:ENSG00000133962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000557036 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:91580696:91669930:-1 gene:ENSG00000133962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr14 // 100 // 54 // 19 // 19 // 0 /// AK024360 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ14298 fis, clone PLACE1009935. // chr14 // 100 // 54 // 19 // 19 // 0 /// AK126034 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44046 fis, clone TESTI4030505. // chr14 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC126214 // GenBank // Homo sapiens cation channel, sperm-associated, beta, mRNA (cDNA clone MGC:161492 IMAGE:8991930), complete cds. // chr14 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// BC126216 // GenBank // Homo sapiens cation channel, sperm-associated, beta, mRNA (cDNA clone MGC:161494 IMAGE:8991932), complete cds. // chr14 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000619027 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR14_1_CTG1:91580774:91735728:-1 gene:ENSG00000274338 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000022184 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR14_1_CTG1:91604402:91852143:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 43 // 43 // 15 // 35 // 1 /// GENSCAN00000040596 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:91604402:91859180:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 43 // 43 // 15 // 35 // 1
ENST00000363172 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:14:91714915:91715130:-1 gene:ENSG00000275154 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA gene:ENSG00000200042 // chr14 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000619174 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR14_1_CTG1:91718574:91718789:-1 gene:ENSG00000274581 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr14 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT039284 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr14 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_004239 // RefSeq // Homo sapiens thyroid hormone receptor interactor 11 (TRIP11), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000267622 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:91965991:92040059:-1 gene:ENSG00000100815 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000554357 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:14:91969513:92015751:-1 gene:ENSG00000100815 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 93 // 68 // 14 // 15 // 0 /// AF007217 // GenBank // Homo sapiens Trip230 mRNA, complete cds. // chr14 // 86 // 100 // 19 // 22 // 0 /// BC146845 // GenBank // Homo sapiens thyroid hormone receptor interactor 11, mRNA (cDNA clone MGC:181948 IMAGE:9056773), complete cds. // chr14 // 91 // 100 // 20 // 22 // 0 /// ENST00000620738 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:14:91969565:92040032:-1 gene:ENSG00000100815 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000040597 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:91869964:92025906:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 64 // 14 // 14 // 0
NM_022151 // RefSeq // Homo sapiens modulator of apoptosis 1 (MOAP1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000298894 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:93182196:93184928:-1 gene:ENSG00000165943 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000556883 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:93182199:93184923:-1 gene:ENSG00000165943 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC015044 // GenBank // Homo sapiens modulator of apoptosis 1, mRNA (cDNA clone MGC:9487 IMAGE:3922055), complete cds. // chr14 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000616515 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR14_7_CTG1:93182197:93184904:-1 gene:ENSG00000278268 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007734 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR14_7_CTG1:93082930:93191716:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// GENSCAN00000032197 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:93184559:93191716:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_032490 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 14 open reading frame 142 (C14orf142), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000306954 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:93202894:93207094:-1 gene:ENSG00000170270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000556566 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:14:93203506:93207029:-1 gene:ENSG00000170270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// AF277185 // GenBank // Homo sapiens PNAS-127 mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// BC021733 // GenBank // Homo sapiens chromosome 14 open reading frame 142, mRNA (cDNA clone MGC:33456 IMAGE:4796574), complete cds. // chr14 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// BC107429 // GenBank // Homo sapiens chromosome 14 open reading frame 142, mRNA (cDNA clone MGC:104244 IMAGE:4809642), complete cds. // chr14 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000621279 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR14_7_CTG1:93202892:93207114:-1 gene:ENSG00000275619 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007717 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR14_7_CTG1:93203688:93207037:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000032196 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:93203688:93207037:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
ENST00000365436 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:14:93397139:93397234:-1 gene:ENSG00000202306 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr14 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000611372 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR14_7_CTG1:93397139:93397234:-1 gene:ENSG00000277032 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr14 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT039347 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_006220 // RefSeq // Homo sapiens serpin peptidase inhibitor, clade A (alpha-1 antiproteinase, antitrypsin), member 2 (gene/pseudogene) (SERPINA2), transcript variant 1, mRNA. // chr14 // 77 // 100 // 17 // 22 // 0 /// NR_110563 // RefSeq // Homo sapiens serpin peptidase inhibitor, clade A (alpha-1 antiproteinase, antitrypsin), member 2 (gene/pseudogene) (SERPINA2), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr14 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000553483 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:94363716:94366702:-1 gene:ENSG00000258597 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr14 // 100 // 59 // 13 // 13 // 0 /// JX680599 // GenBank // Homo sapiens alpha-1-antitrypsin-related protein (SERPINA2) mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000613989 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR14_7_CTG1:94363716:94368723:-1 gene:ENSG00000274821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 81 // 95 // 17 // 21 // 0 /// ENST00000616052 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR14_7_CTG1:94363719:94368723:-1 gene:ENSG00000274821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 81 // 95 // 17 // 21 // 0 /// GENSCAN00000014309 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:94350881:94383237:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000040513 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR14_7_CTG1:94363716:94368723:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 81 // 95 // 17 // 21 // 0 /// TCONS_l2_00008202-XLOC_l2_004496 // Broad TUCP // linc-SERPINA6 chr14:-:94830362-94833021 // chr14 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0
NM_001080451 // RefSeq // Homo sapiens serpin peptidase inhibitor, clade A (alpha-1 antiproteinase, antitrypsin), member 11 (SERPINA11), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000334708 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:94442464:94452790:-1 gene:ENSG00000186910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC146962 // GenBank // Homo sapiens serpin peptidase inhibitor, clade A (alpha-1 antiproteinase, antitrypsin), member 11, mRNA (cDNA clone MGC:182065 IMAGE:9056890), complete cds. // chr14 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// XM_006720105 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens serpin peptidase inhibitor, clade A (alpha-1 antiproteinase, antitrypsin), member 11 (SERPINA11), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// GENSCAN00000014267 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:94427958:94474412:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
NM_173850 // RefSeq // Homo sapiens serpin peptidase inhibitor, clade A (alpha-1 antiproteinase, antitrypsin), member 12 (SERPINA12), mRNA. // chr14 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000341228 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:94487283:94517844:-1 gene:ENSG00000165953 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000556881 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:94487274:94504222:-1 gene:ENSG00000165953 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// AY177692 // GenBank // Homo sapiens OL-64 mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// AY326420 // GenBank // Homo sapiens visceral adipose-specific SERPIN mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// BC040857 // GenBank // Homo sapiens serpin peptidase inhibitor, clade A (alpha-1 antiproteinase, antitrypsin), member 12, mRNA (cDNA clone MGC:50359 IMAGE:5527002), complete cds. // chr14 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000014303 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:94487303:94498397:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0
NM_173849 // RefSeq // Homo sapiens goosecoid homeobox (GSC), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000238558 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:94768216:94770230:-1 gene:ENSG00000133937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY177407 // GenBank // Homo sapiens homeobox protein goosecoid mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC063580 // GenBank // Homo sapiens goosecoid homeobox, mRNA (cDNA clone MGC:75223 IMAGE:4370088), complete cds. // chr14 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000014302 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:94737635:94770015:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0
NR_026779 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 341 (LINC00341), long non-coding RNA. // chr14 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000557275 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:95407266:95475836:-1 gene:ENSG00000176438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// CR457337 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834A0310D for gene C14orf139, chromosome 14 open reading frame 139; complete cds, incl. stopcodon. // chr14 // 100 // 43 // 10 // 10 // 0 /// NONHSAT039445 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr14 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT039446 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr14 // 100 // 43 // 10 // 10 // 0
NR_003002 // RefSeq // Homo sapiens small Cajal body-specific RNA 13 (SCARNA13), guide RNA. // chr14 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NR_003138 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA host gene 10 (non-protein coding) (SNHG10), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr14 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000516672 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:14:95533355:95533629:-1 gene:ENSG00000252481 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr14 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT039455 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr14 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT039457 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr14 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000554299 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:14:96275046:96276723:-1 gene:ENSG00000258729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AL834311 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp434O1614 (from clone DKFZp434O1614). // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_018036 // RefSeq // Homo sapiens autophagy related 2B (ATG2B), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000261834 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:96290136:96311263:-1 gene:ENSG00000066739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr14 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000359933 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:96281258:96363870:-1 gene:ENSG00000066739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AK302641 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58344 complete cds. // chr14 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000012452 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:96285755:96364650:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 81 // 81 // 25 // 31 // 1
NONHSAT039522 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_018036 // RefSeq // Homo sapiens autophagy related 2B (ATG2B), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENST00000359933 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:96281258:96363870:-1 gene:ENSG00000066739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000012452 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:96285755:96364650:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 65 // 65 // 30 // 46 // 1
ENST00000411367 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:14:96638187:96638514:-1 gene:ENSG00000223299 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT039549 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONHSAT039574 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr14 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
ENST00000487050 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:14:98351367:98351664:-1 gene:ENSG00000241757 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr14 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT039597 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr14 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001144995 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 85C (CCDC85C), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000380243 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:99500180:99604026:-1 gene:ENSG00000205476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000557769 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:14:99512032:99522563:-1 gene:ENSG00000205476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 62 // 13 // 13 // 0 /// AK123840 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ41846 fis, clone NT2RI3003162. // chr14 // 92 // 62 // 12 // 13 // 0 /// BC031990 // GenBank // Homo sapiens chromosome 14 open reading frame 65, mRNA (cDNA clone IMAGE:4746548). // chr14 // 100 // 43 // 9 // 9 // 0
NM_001144995 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 85C (CCDC85C), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000380243 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:99500180:99604026:-1 gene:ENSG00000205476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000554877 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:14:99515300:99576592:-1 gene:ENSG00000205476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000554996 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:14:99515200:99580126:-1 gene:ENSG00000205476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000555822 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:14:99515087:99522945:-1 gene:ENSG00000205476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 8 // 8 // 1 /// ENST00000557769 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:14:99512032:99522563:-1 gene:ENSG00000205476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 8 // 8 // 1 /// AK123840 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ41846 fis, clone NT2RI3003162. // chr14 // 100 // 100 // 8 // 8 // 1 /// GENSCAN00000008789 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:99515246:99603959:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_206918 // RefSeq // Homo sapiens delta(4)-desaturase, sphingolipid 2 (DEGS2), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006720043 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens delta(4)-desaturase, sphingolipid 2 (DEGS2), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000305631 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:100143957:100160163:-1 gene:ENSG00000168350 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000557117 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:14:100148985:100155717:-1 gene:ENSG00000168350 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr14 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// AY541700 // GenBank // Homo sapiens sphingolipid C4-hydroxylase/delta 4-desaturase protein DES2 mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// BC063598 // GenBank // Homo sapiens degenerative spermatocyte homolog 2, lipid desaturase (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:75497 IMAGE:4775939), complete cds. // chr14 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENST00000553834 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:14:100146577:100159595:-1 gene:ENSG00000168350 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// GENSCAN00000023290 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:100146761:100192444:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
ENST00000484401 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:14:100319073:100319370:-1 gene:ENSG00000243976 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT039694 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AF119863 // GenBank HTC // Homo sapiens PRO2160 mRNA, complete cds. // chr14 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// NONHSAT039752 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr14 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_001134888 // RefSeq // Homo sapiens retrotransposon-like 1 (RTL1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000534062 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:100880655:100884847:-1 gene:ENSG00000254656 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC150617 // GenBank // Homo sapiens retrotransposon-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:183527 IMAGE:9056987), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000023287 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:100880712:100884788:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
ENST00000384034 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:14:101145480:101145695:-1 gene:ENSG00000277754 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA gene:ENSG00000206761 // chr14 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT040012 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr14 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000492799 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:14:102077180:102077472:-1 gene:ENSG00000240457 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT040074 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONHSAT040102 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000362986 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:18:7995570:7995785:1 gene:ENSG00000199856 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr14 // 86 // 70 // 6 // 7 // 0 /// ENST00000384034 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:14:101145480:101145695:-1 gene:ENSG00000277754 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA gene:ENSG00000206761 // chr14 // 86 // 70 // 6 // 7 // 0 /// NONHSAT006578 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 86 // 70 // 6 // 7 // 0 /// NONHSAT040012 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr14 // 86 // 70 // 6 // 7 // 0 /// NONHSAT057163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr14 // 86 // 70 // 6 // 7 // 0 /// NONHSAT076932 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 71 // 70 // 5 // 7 // 0
NM_152326 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat domain 9 (ANKRD9), mRNA. // chr14 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000286918 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:102501760:102509791:-1 gene:ENSG00000156381 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000557902 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:102507574:102508911:-1 gene:ENSG00000156381 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000559404 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:102507111:102509235:-1 gene:ENSG00000156381 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000559651 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:102506842:102508817:-1 gene:ENSG00000156381 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC015422 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat domain 9, mRNA (cDNA clone MGC:21990 IMAGE:4397794), complete cds. // chr14 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC027479 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat domain 9, mRNA (cDNA clone MGC:34938 IMAGE:5114925), complete cds. // chr14 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000560748 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:102506876:102509799:-1 gene:ENSG00000156381 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// AK291868 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76672 complete cds, highly similar to Homo sapiens ankyrin repeat domain 9 (ANKRD9), mRNA. // chr14 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// GENSCAN00000030869 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:102506936:102509856:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
ENST00000479428 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:14:102582888:102583177:-1 gene:ENSG00000239224 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr14 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT040111 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr14 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NONHSAT040121 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_006035 // RefSeq // Homo sapiens CDC42 binding protein kinase beta (DMPK-like) (CDC42BPB), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// XM_005268230 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens CDC42 binding protein kinase beta (DMPK-like) (CDC42BPB), transcript variant X4, mRNA. // chr14 // 100 // 78 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000361246 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:102932379:103057462:-1 gene:ENSG00000198752 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENST00000559043 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:14:102944043:102968532:-1 gene:ENSG00000198752 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 94 // 39 // 17 // 18 // 0 /// AF128625 // GenBank // Homo sapiens CDC42-binding protein kinase beta (CDC42BPB) mRNA, complete cds. // chr14 // 93 // 98 // 42 // 45 // 0 /// BC155541 // GenBank // Homo sapiens CDC42 binding protein kinase beta (DMPK-like), mRNA (cDNA clone MGC:167838 IMAGE:8860517), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000030868 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:102933712:103009213:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 78 // 36 // 36 // 0
NM_015316 // RefSeq // Homo sapiens protein phosphatase 1, regulatory subunit 13B (PPP1R13B), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_005267487 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens protein phosphatase 1, regulatory subunit 13B (PPP1R13B), transcript variant X4, mRNA. // chr14 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000202556 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:103733752:103847590:-1 gene:ENSG00000088808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000555391 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:103734893:103744015:-1 gene:ENSG00000088808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr14 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000556597 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:103733753:103746488:-1 gene:ENSG00000088808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr14 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000557082 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:103734892:103846885:-1 gene:ENSG00000088808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr14 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC047639 // GenBank HTC // Homo sapiens protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 13B, mRNA (cDNA clone IMAGE:4823350), with apparent retained intron. // chr14 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// BC136527 // GenBank // Homo sapiens protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 13B, mRNA (cDNA clone MGC:168140 IMAGE:9020517), complete cds. // chr14 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AK125913 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ43925 fis, clone TESTI4012505, weakly similar to Tumor suppressor p53-binding protein 2. // chr14 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// GENSCAN00000001128 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:103735154:103848484:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0
ENST00000410829 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:14:104400943:104401048:-1 gene:ENSG00000222761 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr14 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT040258 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001286389 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 179 (TMEM179), transcript variant 1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000616017 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:14:104590865:104592509:-1 gene:ENSG00000258986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000620158 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR14_2_CTG1:104598009:104599653:-1 gene:ENSG00000277065 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENST00000476944 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:104835997:104836852:-1 gene:ENSG00000196183 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr14 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000027563 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:104835994:104836821:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0
NM_138420 // RefSeq // Homo sapiens AHNAK nucleoprotein 2 (AHNAK2), mRNA. // chr14 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000333244 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:104937317:104978357:-1 gene:ENSG00000185567 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 97 // 97 // 31 // 32 // 0 /// ENST00000555122 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:104937244:104970481:-1 gene:ENSG00000185567 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr14 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000557457 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:14:104937253:104953904:-1 gene:ENSG00000185567 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// BC049216 // GenBank // Homo sapiens AHNAK nucleoprotein 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:5502765), complete cds. // chr14 // 95 // 67 // 21 // 22 // 0 /// BC090889 // GenBank // Homo sapiens AHNAK nucleoprotein 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:30387958), complete cds. // chr14 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000027533 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:104938063:104978928:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0
NM_017955 // RefSeq // Homo sapiens cell division cycle associated 4 (CDCA4), transcript variant 1, mRNA. // chr14 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NM_145701 // RefSeq // Homo sapiens cell division cycle associated 4 (CDCA4), transcript variant 2, mRNA. // chr14 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000336219 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:105009573:105021148:-1 gene:ENSG00000170779 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000392590 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:105009936:105021060:-1 gene:ENSG00000170779 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// AF322239 // GenBank // Homo sapiens hematopoietic progenitor protein (HEPP) mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AK303947 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52878 complete cds, highly similar to Cell division cycle-associated protein 4. // chr14 // 91 // 85 // 21 // 23 // 0 /// BC011736 // GenBank // Homo sapiens cell division cycle associated 4, mRNA (cDNA clone MGC:19517 IMAGE:4335816), complete cds. // chr14 // 90 // 78 // 19 // 21 // 0 /// BC025263 // GenBank // Homo sapiens cell division cycle associated 4, mRNA (cDNA clone MGC:39154 IMAGE:4860036), complete cds. // chr14 // 90 // 78 // 19 // 21 // 0 /// GENSCAN00000027581 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:105011204:105021228:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
NM_002226 // RefSeq // Homo sapiens jagged 2 (JAG2), transcript variant 1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NM_145159 // RefSeq // Homo sapiens jagged 2 (JAG2), transcript variant 2, mRNA. // chr14 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000331782 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:105140981:105168824:-1 gene:ENSG00000184916 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000347004 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:14:105140982:105168824:-1 gene:ENSG00000184916 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000546616 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:105141755:105147358:-1 gene:ENSG00000184916 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr14 // 100 // 30 // 10 // 10 // 0 /// AF003521 // GenBank // Homo sapiens Jagged 2 mRNA, complete cds. // chr14 // 97 // 97 // 31 // 32 // 0 /// AF020201 // GenBank // Homo sapiens Jagged 2 mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// AF029778 // GenBank // Homo sapiens Jagged2 (JAG2) mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF029779 // GenBank // Homo sapiens hJAG2.del-E6 (JAG2) mRNA, alternatively spliced isoform of Jagged2, complete cds. // chr14 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// AB209370 // GenBank // Homo sapiens mRNA for jagged 2 isoform b precursor variant protein. // chr14 // 30 // 30 // 10 // 33 // 1 /// GENSCAN00000034425 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:105142695:105168420:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0
ENST00000390541 // ENSEMBL // ensembl_havana_ig_gene:known chromosome:GRCh38:14:105599941:105601728:-1 gene:ENSG00000211891 gene_biotype:IG_C_gene transcript_biotype:IG_C_gene // chr14 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// AK130825 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ27315 fis, clone TMS06851, highly similar to Ig epsilon chain C region. // chr14 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000610670 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR14_3_CTG1:105600842:105602504:-1 gene:ENSG00000276192 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000033220 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR14_3_CTG1:105588295:105619467:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000034403 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:105586937:105618696:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
XM_005275748 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens uncharacterized LOC101930405 (LOC101930405), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000425060 // ENSEMBL // havana_ig_gene:known chromosome:GRCh38:14:106518582:106519027:-1 gene:ENSG00000229092 gene_biotype:IG_V_pseudogene transcript_biotype:IG_V_pseudogene // chr14 // 63 // 100 // 5 // 8 // 0 /// GENSCAN00000013799 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR14_3_CTG1:106535786:106603858:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0 /// GENSCAN00000014431 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:106511105:106579177:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0 /// NONHSAT040519 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr14 // 88 // 100 // 7 // 8 // 0
BC002792 // GenBank // Homo sapiens hypothetical protein LOC90925, mRNA (cDNA clone MGC:3963 IMAGE:3621362), complete cds. // chr14 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000618544 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR14_3_CTG1:106874674:106875753:-1 gene:ENSG00000276708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000013777 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR14_3_CTG1:106875277:106875722:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 92 // 54 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000014428 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:106851101:106851546:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 92 // 54 // 12 // 13 // 0
ENST00000390639 // ENSEMBL // ensembl_havana_ig_gene:known chromosome:GRCh38:14:106874583:106875071:-1 gene:ENSG00000211979 gene_biotype:IG_V_gene transcript_biotype:IG_V_gene // chr14 // 75 // 84 // 12 // 16 // 0 /// GENSCAN00000014439 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:106874556:106875017:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 63 // 12 // 12 // 0
ENST00000364371 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:19883614:19883716:1 gene:ENSG00000201241 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT040562 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0
ENST00000384559 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:21307749:21307855:1 gene:ENSG00000207289 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000459468 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:20738679:20738785:1 gene:ENSG00000238478 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000516246 // ENSEMBL // ncrna:novel scaffold:GRCh38:KI270727.1:34890:34996:1 gene:ENSG00000277890 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA gene:ENSG00000252055 // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000621035 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR15_1_CTG1:21307731:21307837:1 gene:ENSG00000275809 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT040659 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT040696 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
ENST00000594169 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:21368459:21370627:1 gene:ENSG00000268531 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr15 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000043313 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:21365264:21370422:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 47 // 47 // 8 // 17 // 1
ENST00000557009 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:22044864:22045399:1 gene:ENSG00000258652 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr15 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0
NM_001004719 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 4, subfamily M, member 2 (OR4M2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000332663 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:15:21637909:21638992:1 gene:ENSG00000182974 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC136985 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 4, subfamily M, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:168600 IMAGE:9020977), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000612201 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR15_1_CTG1:21645163:21646246:1 gene:ENSG00000278776 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000612882 // ENSEMBL // ensembl:novel scaffold:GRCh38:KI270727.1:372322:373405:1 gene:ENSG00000275249 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000614722 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:15:22080527:22081659:1 gene:ENSG00000274102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000010116 // ENSEMBL // cdna:genscan scaffold:GRCh38:KI270727.1:372420:373361:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000042829 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR15_1_CTG1:21645261:21646202:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000043319 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:21638007:21638948:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000045557 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:22002401:22081566:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001005241 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 4, subfamily N, member 4 (OR4N4), mRNA. // chr15 // 100 // 78 // 7 // 7 // 0 /// ENST00000328795 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:22094431:22095556:1 gene:ENSG00000183706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000558896 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:22015233:22095857:1 gene:ENSG00000259176 gene_biotype:sense_overlapping transcript_biotype:sense_overlapping // chr15 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// XM_006724902 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens olfactory receptor 4N4-like (LOC102723532), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 67 // 100 // 6 // 9 // 0 /// AK097598 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ40279 fis, clone TESTI2027296, moderately similar to Mus musculus gene for odorant receptor MOR83. // chr15 // 67 // 100 // 6 // 9 // 0 /// BC136597 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 4, subfamily N, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:168210 IMAGE:9020587), complete cds. // chr15 // 67 // 100 // 6 // 9 // 0 /// BC136598 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 4, subfamily N, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:168211 IMAGE:9020588), complete cds. // chr15 // 67 // 100 // 6 // 9 // 0 /// GENSCAN00000045555 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:22094522:22095472:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 78 // 7 // 7 // 0
NR_028067 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 4, subfamily N, member 3 pseudogene (OR4N3P), non-coding RNA. // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000559395 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:22125618:22126435:1 gene:ENSG00000259435 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// XR_430580 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens olfactory receptor 4N4-like (LOC102723532), transcript variant X3, misc_RNA. // chr15 // 67 // 67 // 10 // 15 // 1 /// ENST00000612034 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR15_1_CTG1:21690124:21691047:1 gene:ENSG00000274846 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000616048 // ENSEMBL // ensembl:known scaffold:GRCh38:KI270727.1:417283:418206:1 gene:ENSG00000276872 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000045571 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:22125862:22126434:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
ENST00000616925 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:22609141:22609377:-1 gene:ENSG00000277515 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000622446 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR15_3_CTG3:22611719:22611955:-1 gene:ENSG00000276062 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT040809 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_005664 // RefSeq // Homo sapiens makorin ring finger protein 3 (MKRN3), mRNA. // chr15 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000314520 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:23565684:23568020:1 gene:ENSG00000179455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000568252 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:23565717:23611564:1 gene:ENSG00000179455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// AK309383 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99424. // chr15 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// BC044639 // GenBank // Homo sapiens makorin ring finger protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:52220 IMAGE:4140028), complete cds. // chr15 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC070293 // GenBank // Homo sapiens makorin ring finger protein 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:4731576), complete cds. // chr15 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000032980 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:23565783:23567306:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_018958 // RefSeq // Homo sapiens nuclear pore associated protein 1 (NPAP1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000329468 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:24675868:24683393:1 gene:ENSG00000185823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005507 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:24577427:24679827:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NR_001294 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 64 (SNORD64), small nucleolar RNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_022008 // RefSeq // Homo sapiens Prader Willi/Angelman region RNA 5 (PWAR5), long non-coding RNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000386683 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:24985100:24985166:1 gene:ENSG00000276610 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA gene:ENSG00000270704 // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000605533 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:24984864:24985173:1 gene:ENSG00000270704 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT040974 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT040975 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT040976 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000552334 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:25031873:25036490:1 gene:ENSG00000257151 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC043194 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5288750. // chr15 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// AB061718 // GenBank // Homo sapiens mRNA for HBT8 protein, complete cds. // chr15 // 40 // 100 // 10 // 25 // 0 /// NONHSAT040980 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT040988 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT040989 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT040991 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT040995 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT040996 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// TCONS_00023880-XLOC_011183 // Rinn lincRNA // linc-GABRA5-7 chr15:+:25259469-25281705 // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// TCONS_00023881-XLOC_011183 // Rinn lincRNA // linc-GABRA5-7 chr15:+:25261086-25281638 // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// TCONS_00023882-XLOC_011183 // Rinn lincRNA // linc-GABRA5-7 chr15:+:25264971-25281638 // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_001289 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 109B (SNORD109B), small nucleolar RNA. // chr15 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// NR_001295 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 109A (SNORD109A), small nucleolar RNA. // chr15 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000458961 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:25278343:25278409:1 gene:ENSG00000239169 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000459128 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:25041974:25042040:1 gene:ENSG00000274640 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA gene:ENSG00000270246 // chr15 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000604135 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:25041918:25042428:1 gene:ENSG00000270246 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT040998 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT140191 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT140214 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0
NR_003316 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 116-1 (SNORD116-1), small nucleolar RNA. // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000384335 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:25051477:25051571:1 gene:ENSG00000207063 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT041002 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NR_003317 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 116-2 (SNORD116-2), small nucleolar RNA. // chr15 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000384274 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:25054210:25054304:1 gene:ENSG00000207001 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NR_003321 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 116-6 (SNORD116-6), small nucleolar RNA. // chr15 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0 /// ENST00000384711 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:25065026:25065121:1 gene:ENSG00000207442 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0 /// NONHSAT140192 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// JX629740 // GenBank // Homo sapiens chromosome 15 sno-lncRNA1 snoRNA, complete sequence. // chr15 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0 /// NONHSAT041013 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0
NR_003319 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 116-4 (SNORD116-4), small nucleolar RNA. // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000384733 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:25059538:25059633:1 gene:ENSG00000275529 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA gene:ENSG00000224078 // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000549804 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:25050632:25122476:1 gene:ENSG00000224078 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:antisense // chr15 // 100 // 70 // 16 // 16 // 0 /// AF400486 // GenBank // Homo sapiens clone kid4 SNURF-SNRPN mRNA, downstream untranslated exons, alternatively spliced. // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC080646 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6577956. // chr15 // 100 // 70 // 16 // 16 // 0 /// AY362862 // GenBank // Homo sapiens clone RT-21 SNURF-SNRPN mRNA, partial sequence; alternatively spliced. // chr15 // 83 // 83 // 19 // 23 // 1 /// NONHSAT040980 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT041000 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 70 // 16 // 16 // 0 /// NONHSAT041004 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT041008 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT041009 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT041010 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT041007 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 1
NR_003320 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 116-5 (SNORD116-5), small nucleolar RNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NR_003322 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 116-7 (SNORD116-7), small nucleolar RNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000384404 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:25067788:25067882:1 gene:ENSG00000207133 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000384462 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:25062333:25062427:1 gene:ENSG00000207191 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NR_003318 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 116-3 (SNORD116-3), small nucleolar RNA. // chr15 // 65 // 100 // 17 // 26 // 0 /// NR_003324 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 116-9 (SNORD116-9), small nucleolar RNA. // chr15 // 65 // 100 // 17 // 26 // 0 /// ENST00000384000 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:25073107:25073201:1 gene:ENSG00000206727 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 65 // 100 // 17 // 26 // 0 /// ENST00000384287 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:25056860:25056954:1 gene:ENSG00000207014 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 65 // 100 // 17 // 26 // 0 /// JX629740 // GenBank // Homo sapiens chromosome 15 sno-lncRNA1 snoRNA, complete sequence. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT140194 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT140195 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT140193 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 65 // 100 // 17 // 26 // 0 /// NONHSAT140196 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 65 // 100 // 17 // 26 // 0
NR_003321 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 116-6 (SNORD116-6), small nucleolar RNA. // chr15 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000384711 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:25065026:25065121:1 gene:ENSG00000207442 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// JX629740 // GenBank // Homo sapiens chromosome 15 sno-lncRNA1 snoRNA, complete sequence. // chr15 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONHSAT041013 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NR_003323 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 116-8 (SNORD116-8), small nucleolar RNA. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000384365 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:25070432:25070526:1 gene:ENSG00000207093 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NR_003318 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 116-3 (SNORD116-3), small nucleolar RNA. // chr15 // 56 // 100 // 15 // 27 // 0 /// NR_003324 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 116-9 (SNORD116-9), small nucleolar RNA. // chr15 // 56 // 100 // 15 // 27 // 0 /// ENST00000384000 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:25073107:25073201:1 gene:ENSG00000206727 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 58 // 96 // 15 // 26 // 0 /// ENST00000384287 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:25056860:25056954:1 gene:ENSG00000207014 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 58 // 96 // 15 // 26 // 0 /// NR_003321 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 116-6 (SNORD116-6), small nucleolar RNA. // chr15 // 33 // 100 // 9 // 27 // 0 /// ENST00000384711 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:25065026:25065121:1 gene:ENSG00000207442 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 31 // 96 // 8 // 26 // 0 /// NONHSAT041019 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// JX629740 // GenBank // Homo sapiens chromosome 15 sno-lncRNA1 snoRNA, complete sequence. // chr15 // 56 // 100 // 15 // 27 // 0 /// NONHSAT140193 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 56 // 100 // 15 // 27 // 0 /// NONHSAT140196 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 56 // 100 // 15 // 27 // 0 /// NONHSAT041013 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 33 // 100 // 9 // 27 // 0
NR_003325 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 116-10 (SNORD116-10), small nucleolar RNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000363791 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:25074114:25074215:1 gene:ENSG00000200661 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT041020 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_003326 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 116-11 (SNORD116-11), small nucleolar RNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000383882 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:25075929:25076020:1 gene:ENSG00000206609 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT041022 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_003327 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 116-12 (SNORD116-12), small nucleolar RNA. // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000384468 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:25077051:25077142:1 gene:ENSG00000207197 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT041024 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NR_003328 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 116-13 (SNORD116-13), small nucleolar RNA. // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000384408 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:25079058:25079149:1 gene:ENSG00000207137 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// JX629741 // GenBank // Homo sapiens chromosome 15 sno-lncRNA2 snoRNA, complete sequence. // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT041025 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NR_003329 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 116-14 (SNORD116-14), small nucleolar RNA. // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000383894 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:25080142:25080233:1 gene:ENSG00000206621 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// JX629741 // GenBank // Homo sapiens chromosome 15 sno-lncRNA2 snoRNA, complete sequence. // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT041026 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NR_003330 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 116-15 (SNORD116-15), small nucleolar RNA. // chr15 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000384445 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:25081287:25081378:1 gene:ENSG00000207174 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONHSAT041029 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONHSAT040980 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 50 // 100 // 5 // 10 // 0
NR_003331 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 116-16 (SNORD116-16), small nucleolar RNA. // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000384533 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:25082768:25082859:1 gene:ENSG00000207263 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT041030 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NR_003333 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 116-18 (SNORD116-18), small nucleolar RNA. // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000383961 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:25085385:25085476:1 gene:ENSG00000206688 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// JX629742 // GenBank // Homo sapiens chromosome 15 sno-lncRNA3 snoRNA, complete sequence. // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT041035 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NR_003334 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 116-20 (SNORD116-20), small nucleolar RNA. // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000384529 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:25087662:25087753:1 gene:ENSG00000278715 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA gene:ENSG00000261069 // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000567527 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:25087661:25088896:1 gene:ENSG00000261069 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// AF241255 // GenBank // Homo sapiens PWCR1 mRNA, complete sequence. // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT040980 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT041037 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT041038 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NR_003335 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 116-21 (SNORD116-21), small nucleolar RNA. // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000384507 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:25088804:25088895:1 gene:ENSG00000277785 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA gene:ENSG00000261069 // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000567527 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:25087661:25088896:1 gene:ENSG00000261069 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// AF241255 // GenBank // Homo sapiens PWCR1 mRNA, complete sequence. // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT040980 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT041038 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT041041 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NR_003336 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 116-22 (SNORD116-22), small nucleolar RNA. // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000384430 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:25089923:25090014:1 gene:ENSG00000275127 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA gene:ENSG00000224078 // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000549804 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:25050632:25122476:1 gene:ENSG00000224078 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:antisense // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT040980 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT041000 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT041008 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT041042 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NR_003337 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 116-23 (SNORD116-23), small nucleolar RNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000384645 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:25091786:25091877:1 gene:ENSG00000207375 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT040980 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT041045 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_003338 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 116-24 (SNORD116-24), small nucleolar RNA. // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000384549 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:25094037:25094128:1 gene:ENSG00000207279 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT041046 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NR_003339 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 116-25 (SNORD116-25), small nucleolar RNA. // chr15 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000516517 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:25097663:25097754:1 gene:ENSG00000252326 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT041048 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NR_003340 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 116-26 (SNORD116-26), small nucleolar RNA. // chr15 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000516006 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:25099499:25099594:1 gene:ENSG00000251815 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// JX629744 // GenBank // Homo sapiens chromosome 15 sno-lncRNA5 snoRNA, complete sequence. // chr15 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT041049 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NR_003341 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 116-27 (SNORD116-27), small nucleolar RNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000516087 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:25101575:25101666:1 gene:ENSG00000251896 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// JX629744 // GenBank // Homo sapiens chromosome 15 sno-lncRNA5 snoRNA, complete sequence. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT041050 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_003361 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 116-28 (SNORD116-28), small nucleolar RNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000516123 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:25104642:25104732:1 gene:ENSG00000278123 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA gene:ENSG00000224078 // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000546682 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:25081154:25113927:1 gene:ENSG00000224078 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:antisense // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT041027 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT041028 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT041051 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_003360 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 116-29 (SNORD116-29), small nucleolar RNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000384516 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:25106521:25106603:1 gene:ENSG00000207245 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT041052 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_003294 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 115-2 (SNORD115-2), small nucleolar RNA. // chr15 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000362842 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:25172635:25172716:1 gene:ENSG00000199712 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT041075 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NR_003295 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 115-3 (SNORD115-3), small nucleolar RNA. // chr15 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000363100 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:25174927:25175008:1 gene:ENSG00000199970 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONHSAT041078 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NR_003296 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 115-4 (SNORD115-4), small nucleolar RNA. // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000363810 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:25176832:25176913:1 gene:ENSG00000200680 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT041079 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NR_003299 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 115-7 (SNORD115-7), small nucleolar RNA. // chr15 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000365306 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:25182385:25182466:1 gene:ENSG00000278089 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA gene:ENSG00000224078 // chr15 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000447911 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:25180314:25182708:1 gene:ENSG00000224078 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AF400492 // GenBank // Homo sapiens clone Rt-8 SNURF-SNRPN mRNA, downstream untranslated exons, alternatively spliced. // chr15 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT041081 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT041082 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT041086 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT041102 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 48 // 100 // 10 // 21 // 0
NR_003300 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 115-8 (SNORD115-8), small nucleolar RNA. // chr15 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000363856 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:25184306:25184387:1 gene:ENSG00000200726 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT041089 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NR_003306 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 115-14 (SNORD115-14), small nucleolar RNA. // chr15 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000363090 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:25194921:25195001:1 gene:ENSG00000199960 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONHSAT041095 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NR_003307 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 115-15 (SNORD115-15), small nucleolar RNA. // chr15 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000364809 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:25197576:25197656:1 gene:ENSG00000201679 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NR_003357 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 115-42 (SNORD115-42), small nucleolar RNA. // chr15 // 53 // 100 // 9 // 17 // 0 /// ENST00000364273 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:25247345:25247426:1 gene:ENSG00000201143 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 53 // 100 // 9 // 17 // 0 /// NR_003298 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 115-6 (SNORD115-6), small nucleolar RNA. // chr15 // 47 // 100 // 8 // 17 // 0 /// ENST00000363942 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:25180497:25180578:1 gene:ENSG00000200812 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 47 // 100 // 8 // 17 // 0 /// NONHSAT041099 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT041102 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 76 // 100 // 13 // 17 // 0 /// NONHSAT140203 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT140212 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 53 // 100 // 9 // 17 // 0 /// NONHSAT041083 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 47 // 100 // 8 // 17 // 0
NR_003315 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 115-23 (SNORD115-23), small nucleolar RNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_022010 // RefSeq // Homo sapiens Prader Willi/Angelman region RNA 4 (PWAR4), long non-coding RNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000364461 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:25211796:25211877:1 gene:ENSG00000201331 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF019617 // GenBank // Homo sapiens PAR4 gene, complete sequence. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT041104 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT041105 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_003495 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 115-24 (SNORD115-24), small nucleolar RNA. // chr15 // 100 // 77 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000363528 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:25213648:25213729:1 gene:ENSG00000200398 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT041107 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 77 // 17 // 17 // 0
NR_003342 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 115-25 (SNORD115-25), small nucleolar RNA. // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000362619 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:25215541:25215622:1 gene:ENSG00000199489 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT041108 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NR_003496 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 115-27 (SNORD115-27), small nucleolar RNA. // chr15 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000364430 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:25220497:25220578:1 gene:ENSG00000201300 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT041112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NR_003497 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 115-28 (SNORD115-28), small nucleolar RNA. // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000363931 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:25222348:25222428:1 gene:ENSG00000200801 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT041113 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NR_003346 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 115-31 (SNORD115-31), small nucleolar RNA. // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000365318 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:25227109:25227190:1 gene:ENSG00000202188 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT041115 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NR_003347 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 115-32 (SNORD115-32), small nucleolar RNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000364079 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:25228967:25229048:1 gene:ENSG00000200949 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT041116 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_003348 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 115-33 (SNORD115-33), small nucleolar RNA. // chr15 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000363723 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:25230838:25230919:1 gene:ENSG00000200593 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT041117 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NR_003349 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 115-34 (SNORD115-34), small nucleolar RNA. // chr15 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000362441 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:25232387:25232468:1 gene:ENSG00000199311 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT041102 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT041118 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NR_003350 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 115-35 (SNORD115-35), small nucleolar RNA. // chr15 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000365122 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:25234247:25234328:1 gene:ENSG00000201992 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT041119 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NR_003352 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 115-37 (SNORD115-37), small nucleolar RNA. // chr15 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000363768 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:25237986:25238067:1 gene:ENSG00000200638 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT041121 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NR_003353 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 115-38 (SNORD115-38), small nucleolar RNA. // chr15 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000365037 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:25239838:25239919:1 gene:ENSG00000201907 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT041122 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NR_003355 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 115-40 (SNORD115-40), small nucleolar RNA. // chr15 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000606510 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:25243614:25243695:1 gene:ENSG00000272460 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT041124 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NR_003356 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 115-41 (SNORD115-41), small nucleolar RNA. // chr15 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000363608 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:25245478:25245559:1 gene:ENSG00000200478 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT041126 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NR_003359 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 115-44 (SNORD115-44), small nucleolar RNA. // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000365391 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:25250859:25250940:1 gene:ENSG00000202261 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT041127 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NR_003362 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 115-48 (SNORD115-48), small nucleolar RNA. // chr15 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000364764 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:25269783:25269858:1 gene:ENSG00000201634 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT041138 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0
NONHSAT041153 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_033223 // RefSeq // Homo sapiens gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, gamma 3 (GABRG3), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000333743 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:15:27326808:27532981:1 gene:ENSG00000182256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 73 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000554696 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:15:27271542:27527515:1 gene:ENSG00000182256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 90 // 45 // 9 // 10 // 0 /// NM_001270873 // RefSeq // Homo sapiens gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, gamma 3 (GABRG3), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 45 // 45 // 10 // 22 // 1 /// ENST00000451330 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:27519972:27530920:1 gene:ENSG00000182256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 36 // 36 // 8 // 22 // 1 /// ENST00000555083 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:26971393:27481337:1 gene:ENSG00000182256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 45 // 45 // 10 // 22 // 1 /// ENST00000615808 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:26971282:27541991:1 gene:ENSG00000182256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000002170 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:27527411:27532881:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 36 // 8 // 8 // 0
ENST00000384699 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:30581184:30581316:1 gene:ENSG00000207430 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000384701 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:30112198:30112330:1 gene:ENSG00000207432 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000459285 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:30384959:30385091:-1 gene:ENSG00000238519 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000610613 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR15_4_CTG8:30535548:30535680:-1 gene:ENSG00000276367 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 86 // 100 // 18 // 21 // 0 /// ENST00000616059 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR15_4_CTG8:30731838:30731970:1 gene:ENSG00000275648 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000622240 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR15_4_CTG8:30263132:30263264:1 gene:ENSG00000275394 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 86 // 100 // 18 // 21 // 0 /// NONHSAT041330 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT041349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT041370 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000384260 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:32426288:32426420:-1 gene:ENSG00000206987 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 62 // 100 // 13 // 21 // 0 /// NONHSAT041493 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 62 // 100 // 13 // 21 // 0
NR_026771 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC26082 (DKFZP434L187), long non-coding RNA. // chr15 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000562624 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:30196036:30214540:1 gene:ENSG00000225930 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr15 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT041338 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
ENST00000364214 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:32175247:32175351:-1 gene:ENSG00000201084 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000459414 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:30355436:30355540:1 gene:ENSG00000238783 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000618599 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR15_4_CTG8:30506091:30506195:1 gene:ENSG00000275698 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000620310 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR15_4_CTG8:32326292:32326396:-1 gene:ENSG00000278470 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT041341 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT041479 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000384699 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:30581184:30581316:1 gene:ENSG00000207430 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000384701 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:30112198:30112330:1 gene:ENSG00000207432 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 78 // 100 // 21 // 27 // 0 /// ENST00000459285 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:30384959:30385091:-1 gene:ENSG00000238519 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000610613 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR15_4_CTG8:30535548:30535680:-1 gene:ENSG00000276367 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 81 // 100 // 22 // 27 // 0 /// ENST00000616059 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR15_4_CTG8:30731838:30731970:1 gene:ENSG00000275648 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000622240 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR15_4_CTG8:30263132:30263264:1 gene:ENSG00000275394 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 81 // 100 // 22 // 27 // 0 /// NONHSAT041330 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 78 // 100 // 21 // 27 // 0 /// NONHSAT041349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONHSAT041370 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000384260 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:32426288:32426420:-1 gene:ENSG00000206987 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 56 // 100 // 15 // 27 // 0 /// NONHSAT041493 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 56 // 100 // 15 // 27 // 0
NONHSAT041380 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
ENST00000384119 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:30673750:30673843:1 gene:ENSG00000206846 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000611061 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR15_4_CTG8:30825003:30825096:1 gene:ENSG00000277980 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT041386 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
ENST00000527159 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:30791573:30801859:1 gene:ENSG00000103832 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr15 // 87 // 87 // 13 // 15 // 1 /// XR_424587 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens golgin subfamily A member 8I-like (LOC101930434), misc_RNA. // chr15 // 67 // 67 // 10 // 15 // 1 /// GENSCAN00000006117 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:30707862:30837982:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000035969 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR15_4_CTG8:30859293:30989424:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 85 // 87 // 11 // 13 // 0
AK127052 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ45109 fis, clone BRAWH3034097. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000500533 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:31392843:31404729:1 gene:ENSG00000169926 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// NONHSAT041460 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr15 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// TCONS_00023342-XLOC_011202 // Rinn lincRNA // linc-CHRNA7 chr15:+:31685851-31697027 // chr15 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// NONHSAT041455 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr15 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// NONHSAT041456 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr15 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// NONHSAT041462 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr15 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
ENST00000561405 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:31420128:31420662:1 gene:ENSG00000259179 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000015463 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:31375817:31439649:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000045775 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR15_4_CTG8:31527370:31591206:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 90 // 83 // 18 // 20 // 0
ENST00000384122 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:31928303:31928434:1 gene:ENSG00000206849 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000616851 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR15_4_CTG8:32079158:32079289:1 gene:ENSG00000273538 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT041474 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK097050 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39731 fis, clone SMINT2015745. // chr15 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045773 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR15_4_CTG8:32123989:32138035:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
XM_006726569 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens uncharacterized LOC100996413 (LOC100996413), mRNA. // chr15 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000006111 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:30520731:30526278:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000028325 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR15_4_CTG8:32565250:32567758:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000035973 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR15_4_CTG8:30590587:30596133:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000036468 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:32481388:32486935:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// AK090403 // GenBank // Homo sapiens mRNA for FLJ00287 protein. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
AK057017 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ32455 fis, clone SKNMC1000010. // chr15 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC137370 // GenBank // Homo sapiens chromosome 15 open reading frame 45, mRNA (cDNA clone MGC:168991 IMAGE:9021368), complete cds. // chr15 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC137374 // GenBank // Homo sapiens chromosome 15 open reading frame 45, mRNA (cDNA clone MGC:168995 IMAGE:9021372), complete cds. // chr15 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT041521 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONHSAT041535 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000391113 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:32970727:32970791:1 gene:ENSG00000212415 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT041538 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001036 // RefSeq // Homo sapiens ryanodine receptor 3 (RYR3), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 99 // 114 // 114 // 0 /// NM_001243996 // RefSeq // Homo sapiens ryanodine receptor 3 (RYR3), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 99 // 114 // 114 // 0 /// ENST00000389232 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:33310976:33866102:1 gene:ENSG00000198838 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 99 // 114 // 114 // 0 /// ENST00000415757 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:33310962:33866101:1 gene:ENSG00000198838 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 115 // 115 // 0 /// AB001025 // GenBank // Homo sapiens mRNA for brain ryanodine receptor, complete cds. // chr15 // 95 // 100 // 109 // 115 // 0 /// AJ001515 // GenBank // Homo sapiens mRNA for ryanodine receptor 3, complete CDS. // chr15 // 97 // 99 // 111 // 114 // 0 /// ENST00000622037 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:15:33310976:33866098:1 gene:ENSG00000198838 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 99 // 114 // 114 // 0 /// GENSCAN00000002418 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:33425108:33865226:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 99 // 89 // 101 // 102 // 0
ENST00000363138 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:33722492:33722596:1 gene:ENSG00000200008 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT041552 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_012125 // RefSeq // Homo sapiens cholinergic receptor, muscarinic 5 (CHRM5), mRNA. // chr15 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000383263 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:33968888:34067457:1 gene:ENSG00000184984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// AB084282 // GenBank // Homo sapiens mACHR for muscarinic acetylcholine receptor M5, complete cds. // chr15 // 95 // 79 // 18 // 19 // 0 /// BC068528 // GenBank // Homo sapiens cholinergic receptor, muscarinic 5, mRNA (cDNA clone MGC:87358 IMAGE:30339053), complete cds. // chr15 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000557872 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:34018227:34065090:1 gene:ENSG00000184984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 88 // 88 // 21 // 24 // 1 /// BC041805 // GenBank // Homo sapiens cholinergic receptor, muscarinic 5, mRNA (cDNA clone MGC:41838 IMAGE:5298446), complete cds. // chr15 // 88 // 88 // 21 // 24 // 1
NM_152595 // RefSeq // Homo sapiens piggyBac transposable element derived 4 (PGBD4), mRNA. // chr15 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000397766 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:34102073:34108684:1 gene:ENSG00000182405 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK289491 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76326 complete cds, highly similar to Homo sapiens piggyBac transposable element derived 4 (PGBD4), mRNA. // chr15 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// BC130441 // GenBank // Homo sapiens piggyBac transposable element derived 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:40146472). // chr15 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0
ENST00000384363 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:34314728:34314828:1 gene:ENSG00000207091 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT041577 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000594613 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:35092481:35093210:1 gene:ENSG00000259397 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr15 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000045831 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:35092481:35093212:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
ENST00000605798 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:36571985:36572212:1 gene:ENSG00000270500 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr15 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000048780 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:36540191:36596367:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 84 // 90 // 16 // 19 // 0 /// NONHSAT041659 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
ENST00000391209 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:36852640:36852859:1 gene:ENSG00000212511 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT041670 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_152594 // RefSeq // Homo sapiens sprouty-related, EVH1 domain containing 1 (SPRED1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000299084 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:38252326:38357249:1 gene:ENSG00000166068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000561317 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:38253181:38339771:1 gene:ENSG00000166068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// AY299089 // GenBank // Homo sapiens SPRED1 mRNA, complete cds. // chr15 // 81 // 87 // 21 // 26 // 0 /// BC137480 // GenBank // Homo sapiens sprouty-related, EVH1 domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:169103 IMAGE:9021480), complete cds. // chr15 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC137481 // GenBank // Homo sapiens sprouty-related, EVH1 domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:169104 IMAGE:9021481), complete cds. // chr15 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000561205 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:38252848:38326363:1 gene:ENSG00000166068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// GENSCAN00000001690 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:38262454:38484675:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1
ENST00000491535 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:38454154:38483665:1 gene:ENSG00000171262 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AK095745 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ38426 fis, clone FEBRA2012507. // chr15 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC093898 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 98, member B, mRNA (cDNA clone MGC:120933 IMAGE:7939743), complete cds. // chr15 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NM_173611 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 98, member B (FAM98B), mRNA. // chr15 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// ENST00000397609 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:38454127:38487710:1 gene:ENSG00000171262 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// GENSCAN00000001690 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:38262454:38484675:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_207444 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 15 open reading frame 53 (C15orf53), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000318792 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:38696598:38700038:1 gene:ENSG00000175779 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK093014 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ35695 fis, clone SPLEN2019709. // chr15 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC119016 // GenBank // Homo sapiens chromosome 15 open reading frame 53, mRNA (cDNA clone MGC:148118 IMAGE:40108911), complete cds. // chr15 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// BC119810 // GenBank // Homo sapiens chromosome 15 open reading frame 53, mRNA (cDNA clone MGC:148119 IMAGE:40108916), complete cds. // chr15 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
NM_207445 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 15 open reading frame 54 (C15orf54), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000318578 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:39250684:39254845:1 gene:ENSG00000175746 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000561223 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:39250766:39252913:1 gene:ENSG00000175746 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 92 // 50 // 11 // 12 // 0 /// BC137300 // GenBank // Homo sapiens chromosome 15 open reading frame 54, mRNA (cDNA clone MGC:168920 IMAGE:9021297), complete cds. // chr15 // 94 // 67 // 15 // 16 // 0 /// BC137301 // GenBank // Homo sapiens chromosome 15 open reading frame 54, mRNA (cDNA clone MGC:168921 IMAGE:9021298), complete cds. // chr15 // 94 // 67 // 15 // 16 // 0 /// BC171789 // GenBank // Homo sapiens chromosome 15 open reading frame 54, mRNA (cDNA clone MGC:198504 IMAGE:9054443), complete cds. // chr15 // 83 // 50 // 10 // 12 // 0 /// BX647708 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686B03201 (from clone DKFZp686B03201). // chr15 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0
NM_003246 // RefSeq // Homo sapiens thrombospondin 1 (THBS1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000260356 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:39581093:39599466:1 gene:ENSG00000137801 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK291639 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76873 complete cds, highly similar to Homo sapiens thrombospondin 1 (THBS1), mRNA. // chr15 // 92 // 92 // 22 // 24 // 0 /// AK310820 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17862. // chr15 // 93 // 54 // 13 // 14 // 0 /// BC136469 // GenBank // Homo sapiens thrombospondin 1, mRNA (cDNA clone MGC:168081 IMAGE:9020458), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC136470 // GenBank // Homo sapiens thrombospondin 1, mRNA (cDNA clone MGC:168082 IMAGE:9020459), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK304754 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51203 complete cds, highly similar to Thrombospondin-1 precursor. // chr15 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// GENSCAN00000003528 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:39580318:39598020:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NONHSAT041781 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_033510 // RefSeq // Homo sapiens dispatched homolog 2 (Drosophila) (DISP2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000267889 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:40358235:40371056:1 gene:ENSG00000140323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AB051529 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1742 protein, partial cds. // chr15 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000015128 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:40356507:40393597:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0
NM_014952 // RefSeq // Homo sapiens bromo adjacent homology domain containing 1 (BAHD1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000416165 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:40441212:40468242:1 gene:ENSG00000140320 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000560846 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:15:40458465:40468228:1 gene:ENSG00000140320 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000561234 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:40439721:40468229:1 gene:ENSG00000140320 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AB023162 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA0945 protein, partial cds. // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC022782 // GenBank // Homo sapiens bromo adjacent homology domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:9439 IMAGE:3903581), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000015123 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:40456756:40466130:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0
NM_130468 // RefSeq // Homo sapiens carbohydrate (N-acetylgalactosamine 4-0) sulfotransferase 14 (CHST14), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000306243 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:40470998:40474571:1 gene:ENSG00000169105 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000559991 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:15:40471086:40473128:1 gene:ENSG00000169105 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// AB066595 // GenBank // Homo sapiens hD4ST mRNA for dermatan 4-sulfotransferase, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF282905 // GenBank // Homo sapiens sulfotransferase N4h mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// AF401222 // GenBank // Homo sapiens dermatan-4-sulfotransferase-1 mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// AY358446 // GenBank // Homo sapiens clone DNA87974 LMFA1925 (UNQ1925) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// BC049214 // GenBank // Homo sapiens carbohydrate (N-acetylgalactosamine 4-0) sulfotransferase 14, mRNA (cDNA clone MGC:54359 IMAGE:5518321), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC053633 // GenBank // Homo sapiens carbohydrate (N-acetylgalactosamine 4-0) sulfotransferase 14, mRNA (cDNA clone MGC:61575 IMAGE:6501263), complete cds. // chr15 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000015137 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:40471214:40472344:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0
ENST00000411381 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:40529570:40529673:1 gene:ENSG00000223313 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT041856 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001286407 // RefSeq // Homo sapiens RNA pseudouridylate synthase domain containing 2 (RPUSD2), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 95 // 92 // 21 // 22 // 0 /// NM_152260 // RefSeq // Homo sapiens RNA pseudouridylate synthase domain containing 2 (RPUSD2), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000315616 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:40569300:40574943:1 gene:ENSG00000166133 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000559271 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:15:40569332:40574358:1 gene:ENSG00000166133 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 95 // 83 // 19 // 20 // 0 /// AK293145 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57803 complete cds, highly similar to Homo sapiens RNA pseudouridylate synthase domain containing 2 (RPUSD2), mRNA. // chr15 // 95 // 83 // 19 // 20 // 0 /// AK301383 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54391 complete cds, highly similar to Homo sapiens RNA pseudouridylate synthase domain containing 2 (RPUSD2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC016967 // GenBank // Homo sapiens RNA pseudouridylate synthase domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:21638 IMAGE:4420027), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK301706 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53934 complete cds, highly similar to Homo sapiens RNA pseudouridylate synthase domain containing 2 (RPUSD2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 1 /// ENST00000616318 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:40569437:40570067:1 gene:ENSG00000166133 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 33 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000015115 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:40569338:40574261:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0
NM_001130448 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 15 open reading frame 62 (C15orf62), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000344320 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:40770080:40772449:1 gene:ENSG00000188277 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// AK291344 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75552 complete cds. // chr15 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_020857 // RefSeq // Homo sapiens vacuolar protein sorting 18 homolog (S. cerevisiae) (VPS18), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000220509 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:40894430:40903975:1 gene:ENSG00000104142 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000558474 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:40894467:40902861:1 gene:ENSG00000104142 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000558855 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:40894452:40899397:1 gene:ENSG00000104142 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// AF308802 // GenBank // Homo sapiens vacuolar protein sorting protein 18 (VPS18) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC001513 // GenBank // Homo sapiens vacuolar protein sorting 18 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:2738 IMAGE:2822780), complete cds. // chr15 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000015132 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:40894769:40903341:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
NM_019074 // RefSeq // Homo sapiens delta-like 4 (Drosophila) (DLL4), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000249749 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:40929393:40939072:1 gene:ENSG00000128917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AB036931 // GenBank // Homo sapiens hdelta2 mRNA for notch ligand delta-2, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AB043894 // GenBank // Homo sapiens dll-4 mRNA for Delta-4, complete cds. // chr15 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// AF253468 // GenBank // Homo sapiens notch ligand DLL4 (DLL4) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// AY358894 // GenBank // Homo sapiens clone DNA81761 DLL4 (UNQ1895) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// BC106950 // GenBank // Homo sapiens delta-like 4 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:126344 IMAGE:40034887), complete cds. // chr15 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// ENST00000557876 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:40929340:40930890:1 gene:ENSG00000128917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// ENST00000559440 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:40930880:40934921:1 gene:ENSG00000128917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// AK308755 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ98796. // chr15 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// GENSCAN00000015127 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:40929669:40955774:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 83 // 83 // 24 // 29 // 1 /// NONHSAT041899 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr15 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
ENST00000528023 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:41163162:41164374:1 gene:ENSG00000157021 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr15 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000046196 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:41163162:41164374:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_015138 // RefSeq // Homo sapiens Rtf1, Paf1/RNA polymerase II complex component, homolog (S. cerevisiae) (RTF1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000389629 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:41417104:41483563:1 gene:ENSG00000137815 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK292302 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75793 complete cds. // chr15 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC015052 // GenBank // Homo sapiens Rtf1, Paf1/RNA polymerase II complex component, homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:9613 IMAGE:3909737), complete cds. // chr15 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000046195 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:41417116:41480687:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_002220 // RefSeq // Homo sapiens inositol-trisphosphate 3-kinase A (ITPKA), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_005254348 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens inositol-trisphosphate 3-kinase A (ITPKA), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000260386 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:41493875:41503551:1 gene:ENSG00000137825 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000425927 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:41493393:41502488:1 gene:ENSG00000137825 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000462816 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:41501439:41503099:1 gene:ENSG00000137825 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 94 // 58 // 17 // 18 // 0 /// ENST00000491007 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:41501794:41502645:1 gene:ENSG00000137825 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 100 // 26 // 8 // 8 // 0 /// BC026331 // GenBank // Homo sapiens inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase A, mRNA (cDNA clone MGC:26387 IMAGE:4792595), complete cds. // chr15 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000046210 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:41493955:41503166:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0
NM_006293 // RefSeq // Homo sapiens TYRO3 protein tyrosine kinase (TYRO3), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000263798 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:41559034:41583586:1 gene:ENSG00000092445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000559066 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:41557675:41578805:1 gene:ENSG00000092445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000568343 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:15:41570677:41577973:1 gene:ENSG00000092445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// AK295496 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56971 complete cds, highly similar to Tyrosine-protein kinase receptor TYRO3precursor (EC 2.7.10.1). // chr15 // 100 // 43 // 13 // 13 // 0 /// BC049368 // GenBank // Homo sapiens TYRO3 protein tyrosine kinase, mRNA (cDNA clone MGC:57186 IMAGE:4821587), complete cds. // chr15 // 89 // 93 // 25 // 28 // 0 /// BC051756 // GenBank // Homo sapiens TYRO3 protein tyrosine kinase, mRNA (cDNA clone MGC:51900 IMAGE:6095596), complete cds. // chr15 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// D17517 // GenBank // Homo sapiens mRNA for Sky, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// D50479 // GenBank // Homo sapiens mRNA for protein-tyrosine kinase, complete cds. // chr15 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// U05682 // GenBank // Human receptor-type tyrosine kinase (rse) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000046202 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:41559276:41585717:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// U18934 // GenBank // Human receptor tyrosine kinase (DTK) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0
ENST00000309874 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:41892793:41895935:1 gene:ENSG00000174171 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000562920 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:41895185:41895943:1 gene:ENSG00000174171 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr15 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000568861 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:41894985:41895943:1 gene:ENSG00000174171 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr15 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// AK057625 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ33063 fis, clone TRACH2000047. // chr15 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// BC022404 // GenBank // Homo sapiens, clone IMAGE:4704591, mRNA, partial cds. // chr15 // 88 // 65 // 15 // 17 // 0 /// NONHSAT041976 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT041977 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT041979 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// NONHSAT041982 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT041983 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// NONHSAT041981 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_020759 // RefSeq // Homo sapiens StAR-related lipid transfer (START) domain containing 9 (STARD9), mRNA. // chr15 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000290607 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:42575659:42720981:1 gene:ENSG00000159433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000562619 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:42689595:42720859:1 gene:ENSG00000159433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// AK297603 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58093 complete cds, highly similar to StAR-related lipid transfer protein 9. // chr15 // 100 // 73 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000002539 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:42582367:42719893:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0
NM_024956 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 62 (TMEM62), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000260403 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:43133524:43185146:1 gene:ENSG00000137842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000563859 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:43160394:43185089:1 gene:ENSG00000137842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 100 // 41 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000564494 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:15:43134282:43184989:1 gene:ENSG00000137842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000564698 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:43123279:43149064:1 gene:ENSG00000137842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 90 // 29 // 9 // 10 // 0 /// ENST00000567441 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:43133843:43151890:1 gene:ENSG00000137842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 90 // 29 // 9 // 10 // 0 /// BC009981 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 62, mRNA (cDNA clone MGC:16634 IMAGE:4121449), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONHSAT042055 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr15 // 100 // 41 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000000830 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:43133803:43194841:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 50 // 50 // 17 // 34 // 1
ENST00000365341 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:43247680:43247781:1 gene:ENSG00000202211 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT042062 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_002373 // RefSeq // Homo sapiens microtubule-associated protein 1A (MAP1A), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000300231 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:43517625:43531620:1 gene:ENSG00000166963 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000382031 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:15:43510958:43531620:1 gene:ENSG00000166963 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// BC094702 // GenBank // Homo sapiens microtubule-associated protein 1A, mRNA (cDNA clone IMAGE:30717647), partial cds. // chr15 // 100 // 31 // 12 // 12 // 0 /// U38292 // GenBank // Human microtubule-associated protein 1a (MAP1A) mRNA, complete cds. // chr15 // 76 // 74 // 22 // 29 // 0 /// GENSCAN00000000825 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:43511031:43530224:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// BC019869 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4154448, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr15 // 21 // 21 // 8 // 39 // 1
ENST00000410466 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:43602543:43602648:1 gene:ENSG00000222398 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT042098 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONHSAT042100 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT042110 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000364266 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:43702363:43702470:1 gene:ENSG00000201136 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// NONHSAT042108 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0
NM_001284335 // RefSeq // Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 3, subunit J (EIF3J), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// NM_001284336 // RefSeq // Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 3, subunit J (EIF3J), transcript variant 3, mRNA. // chr15 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// NM_003758 // RefSeq // Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 3, subunit J (EIF3J), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000261868 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:44537057:44562803:1 gene:ENSG00000104131 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000424492 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:15:44537125:44561999:1 gene:ENSG00000104131 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 52 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000535391 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:15:44537183:44561447:1 gene:ENSG00000104131 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 39 // 9 // 9 // 0 /// AF090923 // GenBank // Homo sapiens clone HQ0391 PRO0391 mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 39 // 9 // 9 // 0 /// AK300659 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57599 complete cds, moderately similar to Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit 1. // chr15 // 100 // 39 // 9 // 9 // 0 /// BC002719 // GenBank // Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 3, subunit J, mRNA (cDNA clone MGC:3801 IMAGE:3632801), complete cds. // chr15 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0 /// U97670 // GenBank // Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor eIF3, p35 subunit mRNA, complete cds. // chr15 // 95 // 91 // 20 // 21 // 0
ENST00000459006 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:44843612:44843724:1 gene:ENSG00000238845 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000611570 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR15_3_CTG8:44844600:44844712:1 gene:ENSG00000273845 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT042198 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
ENST00000391122 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:44884616:44884780:1 gene:ENSG00000212424 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000619058 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR15_3_CTG8:44893143:44893307:1 gene:ENSG00000273636 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONHSAT042200 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_152448 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 15 open reading frame 43 (C15orf43), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000340827 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:44956702:44979229:1 gene:ENSG00000167014 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000557864 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:44956735:44978612:1 gene:ENSG00000167014 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000559137 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:44956710:44978639:1 gene:ENSG00000167014 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC029537 // GenBank // Homo sapiens chromosome 15 open reading frame 43, mRNA (cDNA clone MGC:33951 IMAGE:5298504), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000516479 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:44973558:44973661:1 gene:ENSG00000252288 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT042206 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000350243 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:45114326:45117738:1 gene:ENSG00000140274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000491993 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:45114474:45118105:1 gene:ENSG00000140274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK303955 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50085 complete cds, highly similar to Homo sapiens dual oxidase maturation factor 2 (DUOXA2), mRNA. // chr15 // 89 // 67 // 16 // 18 // 0 /// BX537581 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686C04213 (from clone DKFZp686C04213). // chr15 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// NM_207581 // RefSeq // Homo sapiens dual oxidase maturation factor 2 (DUOXA2), mRNA. // chr15 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// ENST00000323030 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:45114321:45118421:1 gene:ENSG00000140274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// BC137465 // GenBank // Homo sapiens dual oxidase maturation factor 2, mRNA (cDNA clone MGC:169088 IMAGE:9021465), complete cds. // chr15 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// DQ489734 // GenBank // Homo sapiens dual oxidase activator 2 mRNA, complete cds. // chr15 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// GENSCAN00000026441 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:45114606:45117909:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0
NM_024063 // RefSeq // Homo sapiens spermatogenesis associated 5-like 1 (SPATA5L1), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NR_027635 // RefSeq // Homo sapiens spermatogenesis associated 5-like 1 (SPATA5L1), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XR_243126 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens spermatogenesis associated 5-like 1 (SPATA5L1), transcript variant X2, misc_RNA. // chr15 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000305560 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:45402331:45421419:1 gene:ENSG00000171763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000531624 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:15:45410373:45421378:1 gene:ENSG00000171763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000531970 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:45402375:45421327:1 gene:ENSG00000171763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000559860 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:45402370:45415905:1 gene:ENSG00000171763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// AF086107 // GenBank // Homo sapiens full length insert cDNA clone YZ95A01. // chr15 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// AK291457 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78251 complete cds. // chr15 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// BC000981 // GenBank // Homo sapiens spermatogenesis associated 5-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:5347 IMAGE:2985725), complete cds. // chr15 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000026429 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:45402430:45457101:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0
NM_032413 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 15 open reading frame 48 (C15orf48), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NM_197955 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 15 open reading frame 48 (C15orf48), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000344300 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:45430607:45433449:1 gene:ENSG00000166920 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000396650 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:45430529:45433342:1 gene:ENSG00000166920 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// AB026707 // GenBank // Homo sapiens mRNA for FOAP-11 protein, complete cds. // chr15 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// AF228422 // GenBank // Homo sapiens normal mucosa of esophagus specific 1 (NMES1) mRNA, complete cds. // chr15 // 96 // 97 // 27 // 28 // 0 /// BC021173 // GenBank // Homo sapiens chromosome 15 open reading frame 48, mRNA (cDNA clone MGC:32925 IMAGE:5269504), complete cds. // chr15 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000558435 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:45430579:45448761:1 gene:ENSG00000166920 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1 /// ENST00000558632 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:45430611:45431325:1 gene:ENSG00000166920 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1 /// NONHSAT042248 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr15 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1
ENST00000384785 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:45537250:45537377:1 gene:ENSG00000207516 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT042271 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENST00000383940 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:46660658:46660760:1 gene:ENSG00000238456 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT042289 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000410411 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:47272597:47272889:1 gene:ENSG00000222343 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// NONHSAT042296 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr15 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0
NM_014335 // RefSeq // Homo sapiens EP300 interacting inhibitor of differentiation 1 (EID1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000530028 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:48877886:48880183:1 gene:ENSG00000255302 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000560490 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:15:48878136:48878785:1 gene:ENSG00000255302 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 92 // 57 // 12 // 13 // 0 /// AF109873 // GenBank // Homo sapiens retinoblastoma protein-associated protein mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// AF274947 // GenBank // Homo sapiens PNAS-22 mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 39 // 9 // 9 // 0 /// AF349444 // GenBank // Homo sapiens Rb- and p300-binding protein EID-1 mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// AL109701 // GenBank // Homo sapiens mRNA full length insert cDNA clone EUROIMAGE 45620. // chr15 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// AL357456 // GenBank // Homo sapiens mRNA full length insert cDNA clone EUROIMAGE 222180. // chr15 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// BC114944 // GenBank // Homo sapiens EP300 interacting inhibitor of differentiation 1, mRNA (cDNA clone MGC:138883 IMAGE:40084263), complete cds. // chr15 // 95 // 96 // 21 // 22 // 0 /// BC114946 // GenBank // Homo sapiens EP300 interacting inhibitor of differentiation 1, mRNA (cDNA clone MGC:138884 IMAGE:40084266), complete cds. // chr15 // 95 // 96 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000024988 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:48878177:48878740:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0 /// AF274951 // GenBank // Homo sapiens PNAS-26 mRNA, complete cds. // chr15 // 92 // 52 // 11 // 12 // 0
ENST00000560270 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:49423237:49425515:1 gene:ENSG00000140285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// BC010956 // GenBank // Homo sapiens fibroblast growth factor 7 (keratinocyte growth factor), mRNA (cDNA clone MGC:13629 IMAGE:4282925), complete cds. // chr15 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// M60828 // GenBank // Human keratinocyte growth factor mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// NM_002009 // RefSeq // Homo sapiens fibroblast growth factor 7 (FGF7), mRNA. // chr15 // 83 // 83 // 20 // 24 // 1 /// ENST00000267843 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:49423096:49488775:1 gene:ENSG00000140285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 83 // 83 // 20 // 24 // 1 /// ENST00000560765 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:49423258:49484559:1 gene:ENSG00000140285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 67 // 67 // 16 // 24 // 1 /// CR542002 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834D1235D for gene FGF7, fibroblast growth factor 7 (keratinocyte growth factor); complete cds, without stopcodon. // chr15 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1 /// ENST00000614567 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:15:49423178:49487326:1 gene:ENSG00000140285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 83 // 83 // 20 // 24 // 1
ENST00000364216 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:49982443:49982561:1 gene:ENSG00000201086 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr15 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONHSAT042398 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
ENST00000363735 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:50221888:50221996:1 gene:ENSG00000200605 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT042400 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000469282 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:50688900:50689193:1 gene:ENSG00000243027 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT042431 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 90 // 100 // 18 // 20 // 0
NM_181789 // RefSeq // Homo sapiens gliomedin (GLDN), mRNA. // chr15 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000335449 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:51341629:51408013:1 gene:ENSG00000186417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000396399 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:51377258:51408005:1 gene:ENSG00000186417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000558426 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:51377352:51400211:1 gene:ENSG00000186417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 80 // 37 // 8 // 10 // 0 /// AY358144 // GenBank // Homo sapiens clone DNA193158 VDLC9339 (UNQ9339) mRNA, complete cds. // chr15 // 89 // 70 // 17 // 19 // 0 /// BC113397 // GenBank // Homo sapiens gliomedin, mRNA (cDNA clone MGC:141957 IMAGE:8322449), complete cds. // chr15 // 83 // 67 // 15 // 18 // 0 /// BC113399 // GenBank // Homo sapiens gliomedin, mRNA (cDNA clone MGC:141959 IMAGE:8322451), complete cds. // chr15 // 83 // 67 // 15 // 18 // 0 /// BX538105 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686J18145 (from clone DKFZp686J18145); complete cds. // chr15 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000612989 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:15:51377456:51405244:1 gene:ENSG00000186417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000042310 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:51341685:51404754:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0
NM_001165257 // RefSeq // Homo sapiens secretogranin III (SCG3), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// NM_013243 // RefSeq // Homo sapiens secretogranin III (SCG3), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000220478 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:51681353:51721031:1 gene:ENSG00000104112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000542355 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:51681492:51720071:1 gene:ENSG00000104112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000558709 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:51681532:51692336:1 gene:ENSG00000104112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 35 // 11 // 11 // 0 /// AF453583 // GenBank // Homo sapiens secretogranin III mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AK290175 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77891 complete cds, highly similar to Homo sapiens secretogranin III mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// AK296466 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50788 complete cds, highly similar to Secretogranin-3 precursor. // chr15 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// AY359093 // GenBank // Homo sapiens clone DNA96042 secretogranin (UNQ2502) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// BC014539 // GenBank // Homo sapiens secretogranin III, mRNA (cDNA clone MGC:13448 IMAGE:4283082), complete cds. // chr15 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042330 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:51673970:51719526:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0
NM_014547 // RefSeq // Homo sapiens tropomodulin 3 (ubiquitous) (TMOD3), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000308580 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:51829630:51915725:1 gene:ENSG00000138594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000544199 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:15:51862838:51909989:1 gene:ENSG00000138594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// AF177171 // GenBank // Homo sapiens tropomodulin 3 (TMOD3) mRNA, complete cds. // chr15 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// AF237631 // GenBank // Homo sapiens ubiquitous tropomodulin U-Tmod mRNA, complete cds. // chr15 // 88 // 87 // 23 // 26 // 0 /// BC020542 // GenBank // Homo sapiens tropomodulin 3 (ubiquitous), mRNA (cDNA clone MGC:21167 IMAGE:4421113), complete cds. // chr15 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000560549 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:51875026:51929454:1 gene:ENSG00000138594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// AK310344 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17386. // chr15 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// ENST00000561438 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:51893815:51931308:1 gene:ENSG00000138594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// GENSCAN00000042325 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:51862885:51910173:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0
ENST00000606352 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:51907200:51907305:1 gene:ENSG00000272337 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_002748 // RefSeq // Homo sapiens mitogen-activated protein kinase 6 (MAPK6), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// XM_005254536 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens mitogen-activated protein kinase 6 (MAPK6), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 70 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000261845 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:52019201:52067372:1 gene:ENSG00000069956 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AB451301 // GenBank // Homo sapiens MAPK6 mRNA for mitogen-activated protein kinase 6, complete cds, clone: FLJ08157AAAN. // chr15 // 100 // 40 // 8 // 8 // 0 /// AF420474 // GenBank // Homo sapiens ERK-3 mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 70 // 14 // 14 // 0 /// BC035492 // GenBank // Homo sapiens mitogen-activated protein kinase 6, mRNA (cDNA clone MGC:5156 IMAGE:2984834), complete cds. // chr15 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// L77964 // GenBank // Homo sapiens ERK3 protein kinase mRNA, complete cds. // chr15 // 94 // 80 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000002316 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:52046461:52065000:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 40 // 8 // 8 // 0
ENST00000384268 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:52162751:52162852:1 gene:ENSG00000206995 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 75 // 3 // 3 // 0 /// NONHSAT043920 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 75 // 3 // 3 // 0
ENST00000567221 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:52505191:52505862:1 gene:ENSG00000231169 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000002322 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:52505189:52505863:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENST00000516257 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:53651977:53652123:1 gene:ENSG00000252066 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 100 // 75 // 3 // 3 // 0 /// NONHSAT043968 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 75 // 3 // 3 // 0
ENST00000383914 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:53764204:53764310:1 gene:ENSG00000206641 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT043970 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001080534 // RefSeq // Homo sapiens unc-13 homolog C (C. elegans) (UNC13C), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000260323 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:54012904:54633414:1 gene:ENSG00000137766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000561210 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:54264145:54417070:1 gene:ENSG00000137766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// AK293996 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58497 complete cds, highly similar to Unc-13 homolog C. // chr15 // 92 // 75 // 22 // 24 // 0 /// BC039494 // GenBank // Homo sapiens unc-13 homolog C (C. elegans), mRNA (cDNA clone IMAGE:5549002). // chr15 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000030927 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:54155877:54660716:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0
ENST00000569307 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:56846340:56846605:1 gene:ENSG00000225625 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000014825 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:56733279:56846606:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0
NM_001252335 // RefSeq // Homo sapiens cingulin-like 1 (CGNL1), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// NM_032866 // RefSeq // Homo sapiens cingulin-like 1 (CGNL1), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000281282 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:57376505:57550727:1 gene:ENSG00000128849 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AY274808 // GenBank // Homo sapiens KIAA1749 protein mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AY610514 // GenBank // Homo sapiens paracingulin mRNA, complete cds. // chr15 // 91 // 77 // 21 // 23 // 0 /// BC093827 // GenBank // Homo sapiens cingulin-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:120862 IMAGE:7939672), complete cds. // chr15 // 95 // 73 // 21 // 22 // 0 /// BC112049 // GenBank // Homo sapiens cingulin-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:138254 IMAGE:8327517), complete cds. // chr15 // 95 // 73 // 21 // 22 // 0 /// BC118918 // GenBank // Homo sapiens cingulin-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:134972 IMAGE:40074275), complete cds. // chr15 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046134 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:57438000:57547490:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1
NM_020980 // RefSeq // Homo sapiens aquaporin 9 (AQP9), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000219919 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:58138196:58185911:1 gene:ENSG00000103569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000536493 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:15:58138381:58185911:1 gene:ENSG00000103569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000558772 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:58138169:58184579:1 gene:ENSG00000103569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// AB008775 // GenBank // Homo sapiens AQP9 mRNA for aquaporin 9, complete cds. // chr15 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// AF016495 // GenBank // Homo sapiens small solute channel 1 (SSC1) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// AK300055 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50860 complete cds, highly similar to Aquaporin-9. // chr15 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// BC026258 // GenBank // Homo sapiens aquaporin 9, mRNA (cDNA clone MGC:22555 IMAGE:4734559), complete cds. // chr15 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// CR542027 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834G0835D for gene AQP9, aquaporin 9; complete cds, without stopcodon. // chr15 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000559443 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:58138263:58146895:1 gene:ENSG00000103569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// GENSCAN00000022372 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:58162102:58200919:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// NONHSAT044094 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr15 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
ENST00000331871 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:58686411:58686617:1 gene:ENSG00000182625 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr15 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000022354 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:58686411:58686617:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT044124 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
L17330 // GenBank // Human pre-T/NK cell associated protein (6H9A) mRNA, complete cds. // chr15 // 77 // 96 // 20 // 26 // 0
NM_033195 // RefSeq // Homo sapiens lactate dehydrogenase A-like 6B (LDHAL6B), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000307144 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:59206823:59208515:1 gene:ENSG00000171989 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY009108 // GenBank // Homo sapiens lactate dehydrogenase A mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY642121 // GenBank // Homo sapiens lactacte dehydrogenase mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC022034 // GenBank // Homo sapiens lactate dehydrogenase A-like 6B, mRNA (cDNA clone MGC:26983 IMAGE:4825988), complete cds. // chr15 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008057 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:59206941:59208086:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NONHSAT044166 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000363382 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:59408905:59409015:1 gene:ENSG00000200252 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT044168 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_152450 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 81, member A (FAM81A), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000288228 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:59438173:59523549:1 gene:ENSG00000157470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000560394 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:59372995:59492375:1 gene:ENSG00000157470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 89 // 31 // 8 // 9 // 0 /// ENST00000560474 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:59438231:59492389:1 gene:ENSG00000157470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// BC022537 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 81, member A, mRNA (cDNA clone MGC:26690 IMAGE:4817144), complete cds. // chr15 // 90 // 100 // 26 // 29 // 0 /// ENST00000557914 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:59438205:59460116:1 gene:ENSG00000157470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// ENST00000558513 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:59438201:59460640:1 gene:ENSG00000157470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// ENST00000559628 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:59438201:59460115:1 gene:ENSG00000157470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// AK299220 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57422 complete cds. // chr15 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// GENSCAN00000008052 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:59444272:59521378:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0
NM_012182 // RefSeq // Homo sapiens forkhead box B1 (FOXB1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000396057 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:60004222:60007441:1 gene:ENSG00000171956 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF071554 // GenBank // Homo sapiens forkhead/winged helix transcription factor Fkh5 (FKH5) mRNA, complete cds. // chr15 // 91 // 88 // 20 // 22 // 0 /// AK290944 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77870 complete cds, highly similar to Homo sapiens forkhead/winged helix transcription factor Fkh5 (FKH5) mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC113710 // GenBank // Homo sapiens forkhead box B1, mRNA (cDNA clone MGC:142270 IMAGE:8322762), complete cds. // chr15 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000007376 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:59995219:60005941:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000391323 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:60736769:60736886:1 gene:ENSG00000212625 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT044233 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_207322 // RefSeq // Homo sapiens C2 calcium-dependent domain containing 4A (C2CD4A), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000355522 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:62066977:62070917:1 gene:ENSG00000198535 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000048156 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:62066198:62068723:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0
NM_015059 // RefSeq // Homo sapiens talin 2 (TLN2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 63 // 63 // 0 /// ENST00000306829 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:15:62647311:62844631:1 gene:ENSG00000171914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 63 // 63 // 0 /// ENST00000489129 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:62740445:62841486:1 gene:ENSG00000171914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 100 // 49 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000494733 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:15:62727090:62841349:1 gene:ENSG00000171914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 57 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000561311 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:62561365:62844631:1 gene:ENSG00000171914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 63 // 63 // 0 /// AB621808 // GenBank // Homo sapiens TLN2 mRNA for talin-2, complete cds, clone: HP06644-RBb69B09. // chr15 // 100 // 60 // 38 // 38 // 0 /// AF402000 // GenBank // Homo sapiens talin 2 mRNA, complete cds. // chr15 // 98 // 98 // 61 // 62 // 0 /// BX647654 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp451B1011 (from clone DKFZp451B1011). // chr15 // 97 // 49 // 30 // 31 // 0 /// ENST00000472902 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:62758590:62784838:1 gene:ENSG00000171914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 13 // 13 // 8 // 63 // 1 /// BX648144 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686I0976 (from clone DKFZp686I0976). // chr15 // 13 // 13 // 8 // 63 // 1 /// GENSCAN00000048157 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:62647311:62822130:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 89 // 56 // 56 // 0
NR_029709 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 190a (MIR190A), microRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000388402 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:62823957:62824041:1 gene:ENSG00000211137 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-190a // miRBase Micro RNA Database // MI0000486 Homo sapiens miR-190a stem-loop // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT046575 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_032857 // RefSeq // Homo sapiens lactamase, beta (LACTB), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_005254143 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens lactamase, beta (LACTB), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000261893 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:63121800:63142061:1 gene:ENSG00000103642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000557972 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:63122583:63127593:1 gene:ENSG00000103642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0 /// AY358709 // GenBank // Homo sapiens clone DNA76522 MRPL56 (UNQ843) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// BC037198 // GenBank HTC // Homo sapiens lactamase, beta, mRNA (cDNA clone IMAGE:4780106), containing frame-shift errors. // chr15 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// BC067288 // GenBank // Homo sapiens lactamase, beta, mRNA (cDNA clone MGC:75417 IMAGE:30366453), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NM_001288585 // RefSeq // Homo sapiens lactamase, beta (LACTB), transcript variant 3, mRNA. // chr15 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// NM_171846 // RefSeq // Homo sapiens lactamase, beta (LACTB), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// ENST00000413507 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:63121833:63131471:1 gene:ENSG00000103642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 67 // 67 // 22 // 33 // 1 /// GENSCAN00000014771 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:63121872:63141805:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0
NM_016530 // RefSeq // Homo sapiens RAB8B, member RAS oncogene family (RAB8B), mRNA. // chr15 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000321437 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:63189469:63267782:1 gene:ENSG00000166128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000558119 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:63189594:63263679:1 gene:ENSG00000166128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000558990 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:63189560:63256594:1 gene:ENSG00000166128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 100 // 43 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000559006 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:63189606:63262776:1 gene:ENSG00000166128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000559927 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:63189603:63263596:1 gene:ENSG00000166128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 89 // 63 // 17 // 19 // 0 /// AB038995 // GenBank // Homo sapiens mRNA for RAB-8b protein, complete cds. // chr15 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// AK297598 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52970 complete cds, highly similar to Ras-related protein Rab-8B. // chr15 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// BC020654 // GenBank // Homo sapiens RAB8B, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:22321 IMAGE:4701429), complete cds. // chr15 // 92 // 83 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014770 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:63187665:63259806:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_203373 // RefSeq // Homo sapiens F-box and leucine-rich repeat protein 22 (FBXL22), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000360587 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:63597353:63602428:1 gene:ENSG00000197361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC065833 // GenBank // Homo sapiens F-box and leucine-rich repeat protein 22, mRNA (cDNA clone MGC:75496 IMAGE:30390268), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// XM_005254320 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens F-box and leucine-rich repeat protein 22 (FBXL22), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 81 // 81 // 13 // 16 // 1 /// GENSCAN00000014761 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:63597411:63606911:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 50 // 50 // 8 // 16 // 1
ENST00000516965 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:64342539:64342698:1 gene:ENSG00000252774 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT046660 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_015042 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 609 (ZNF609), mRNA. // chr15 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENST00000326648 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:64499292:64686068:1 gene:ENSG00000180357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000024209 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:64592979:64681820:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 37 // 11 // 11 // 0
ENST00000384494 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:64652888:64652989:1 gene:ENSG00000207223 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT046675 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENST00000384433 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:64671263:64671369:1 gene:ENSG00000207162 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT046676 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0
NM_001195059 // RefSeq // Homo sapiens pleckstrin homology domain containing, family O member 2 (PLEKHO2), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NM_025201 // RefSeq // Homo sapiens pleckstrin homology domain containing, family O member 2 (PLEKHO2), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000323544 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:64841889:64868007:1 gene:ENSG00000241839 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF494534 // GenBank // Homo sapiens PH domain containing protein mRNA, complete cds. // chr15 // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// BC008744 // GenBank // Homo sapiens pleckstrin homology domain containing, family O member 2, mRNA (cDNA clone MGC:3072 IMAGE:3346334), complete cds. // chr15 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000437723 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:64841948:64930920:1 gene:ENSG00000249240 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000616065 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:15:64841883:64868000:1 gene:ENSG00000241839 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000024203 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:64825221:64951080:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1 /// ENST00000502574 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:64841883:64922481:1 gene:ENSG00000249240 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// AK311036 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ18078. // chr15 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NM_178859 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 51, beta subunit (SLC51B), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000334287 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:65045370:65053396:1 gene:ENSG00000186198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AY194242 // GenBank // Homo sapiens organic solute transporter beta mRNA, complete cds. // chr15 // 93 // 52 // 14 // 15 // 0 /// BC103842 // GenBank // Homo sapiens organic solute transporter beta, mRNA (cDNA clone MGC:118959 IMAGE:40002450), complete cds. // chr15 // 93 // 52 // 14 // 15 // 0 /// BC103843 // GenBank // Homo sapiens organic solute transporter beta, mRNA (cDNA clone MGC:118960 IMAGE:40002452), complete cds. // chr15 // 93 // 52 // 14 // 15 // 0 /// BC103844 // GenBank // Homo sapiens organic solute transporter beta, mRNA (cDNA clone MGC:118961 IMAGE:40002453), complete cds. // chr15 // 93 // 52 // 14 // 15 // 0 /// GENSCAN00000028966 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:65050005:65053164:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0
NM_001101362 // RefSeq // Homo sapiens kelch repeat and BTB (POZ) domain containing 13 (KBTBD13), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000432196 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:65076816:65078192:1 gene:ENSG00000234438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028979 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:65076816:65078192:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000364839 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:65229861:65229967:1 gene:ENSG00000201709 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 100 // 94 // 16 // 16 // 0 /// NONHSAT046713 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 94 // 16 // 16 // 0
NR_002756 // RefSeq // Homo sapiens RNA, U5A small nuclear 1 (RNU5A-1), small nuclear RNA. // chr15 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000362698 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:65296051:65296166:1 gene:ENSG00000199568 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 75 // 100 // 3 // 4 // 0 /// M11772 // GenBank // Human (HeLa) U5A small nuclear RNA, partial. // chr15 // 100 // 50 // 2 // 2 // 0 /// NONHSAT046719 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 50 // 2 // 2 // 0 /// M23820 // GenBank // Human U5-A ribosomal RNA. // chr15 // 50 // 100 // 2 // 4 // 0 /// NONHSAT046718 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 50 // 100 // 2 // 4 // 0
NR_002757 // RefSeq // Homo sapiens RNA, U5B small nuclear 1 (RNU5B-1), small nuclear RNA. // chr15 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000363286 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:65304677:65304792:1 gene:ENSG00000200156 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 83 // 100 // 5 // 6 // 0 /// NONHSAT046724 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 50 // 3 // 3 // 0 /// NONHSAT046726 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 50 // 3 // 3 // 0 /// NONHSAT046727 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 50 // 3 // 3 // 0
ENST00000516408 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:65502741:65502836:1 gene:ENSG00000252217 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT046744 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0
ENST00000411339 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:66348276:66348375:1 gene:ENSG00000223271 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT046785 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_002755 // RefSeq // Homo sapiens mitogen-activated protein kinase kinase 1 (MAP2K1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000307102 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:66386817:66492312:1 gene:ENSG00000169032 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000566326 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:66453454:66491343:1 gene:ENSG00000169032 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 50 // 8 // 8 // 0 /// AK291500 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76051 complete cds, highly similar to Homo sapiens mitogen-activated protein kinase kinase 1 (MAP2K1), mRNA. // chr15 // 100 // 94 // 15 // 15 // 0 /// AK294322 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58770 complete cds, highly similar to Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 1 (EC 2.7.12.2). // chr15 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0 /// BC137459 // GenBank // Homo sapiens mitogen-activated protein kinase kinase 1, mRNA (cDNA clone MGC:169082 IMAGE:9021459), complete cds. // chr15 // 100 // 94 // 15 // 15 // 0 /// BC139729 // GenBank // Homo sapiens mitogen-activated protein kinase kinase 1, mRNA (cDNA clone MGC:133320 IMAGE:40053655), complete cds. // chr15 // 100 // 94 // 15 // 15 // 0 /// L05624 // GenBank // Homo sapiens MAP kinase kinase mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 94 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000425818 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:66386837:66444966:1 gene:ENSG00000169032 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 50 // 50 // 8 // 16 // 1
NM_001143936 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 15 open reading frame 61 (C15orf61), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000342683 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:67521068:67530143:1 gene:ENSG00000189227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK294012 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59587 complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000557807 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:67521695:67526638:1 gene:ENSG00000189227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// ENST00000560041 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:67521685:67526641:1 gene:ENSG00000189227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// ENST00000560547 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:67521785:67526541:1 gene:ENSG00000189227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// GENSCAN00000015923 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:67521249:67526545:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT046865 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr15 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONHSAT046866 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr15 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001258024 // RefSeq // Homo sapiens SKI family transcriptional corepressor 1 (SKOR1), mRNA. // chr15 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000341418 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:67819704:67834561:1 gene:ENSG00000188779 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000380035 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:67825545:67834555:1 gene:ENSG00000188779 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000554054 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:15:67825516:67834555:1 gene:ENSG00000188779 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000554240 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:15:67823557:67834538:1 gene:ENSG00000188779 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// AY669507 // GenBank // Homo sapiens functional smad suppressing element 15 (FUSSEL15) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000015921 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:67786927:67883610:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0
NM_015322 // RefSeq // Homo sapiens fem-1 homolog b (C. elegans) (FEM1B), mRNA. // chr15 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000306917 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:68277803:68295865:1 gene:ENSG00000169018 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// AF178632 // GenBank // Homo sapiens FEM-1-like death receptor binding protein mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// AF204883 // GenBank // Homo sapiens FEM1 beta (FEM1B) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// AK290167 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76771 complete cds, highly similar to Homo sapiens fem-1 homolog b (C. elegans) (FEM1B), mRNA. // chr15 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0 /// AL833264 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp451E0710 (from clone DKFZp451E0710). // chr15 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// BC010122 // GenBank // Homo sapiens fem-1 homolog b (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:19792 IMAGE:3840453), complete cds. // chr15 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// BC014558 // GenBank // Homo sapiens fem-1 homolog b (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:16322 IMAGE:3840377), complete cds. // chr15 // 96 // 79 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000015526 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:68289833:68291242:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000015525 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:68254681:68278669:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
NM_015554 // RefSeq // Homo sapiens glucuronic acid epimerase (GLCE), mRNA. // chr15 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000261858 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:15:69160634:69272199:1 gene:ENSG00000138604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000559420 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:69255794:69272217:1 gene:ENSG00000138604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// AY635582 // GenBank // Homo sapiens glucuronyl C5-epimerase (GLCE) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000559500 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:69260696:69268670:1 gene:ENSG00000138604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 31 // 31 // 11 // 36 // 1 /// GENSCAN00000039268 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:69232194:69269244:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0
ENST00000517163 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:69367585:69367681:1 gene:ENSG00000252972 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT046940 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000363346 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:70193236:70193341:1 gene:ENSG00000200216 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT046993 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0
NM_016346 // RefSeq // Homo sapiens nuclear receptor subfamily 2, group E, member 3 (NR2E3), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// AB307710 // GenBank // Homo sapiens NR2E3 mRNA for photoreceptor-specific nuclear receptor, complete cds. // chr15 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// AF121129 // GenBank // Homo sapiens photoreceptor-specific nuclear receptor (PNR) mRNA, complete cds. // chr15 // 92 // 73 // 22 // 24 // 0 /// AF148128 // GenBank // Homo sapiens nuclear receptor mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 58 // 19 // 19 // 0 /// HQ692847 // GenBank // Homo sapiens photoreceptor cell-specific nuclear receptor variant 1 (NR2E3) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// NM_014249 // RefSeq // Homo sapiens nuclear receptor subfamily 2, group E, member 3 (NR2E3), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 79 // 79 // 26 // 33 // 1 /// BC041421 // GenBank // Homo sapiens nuclear receptor subfamily 2, group E, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:49976 IMAGE:3876974), complete cds. // chr15 // 85 // 85 // 28 // 33 // 1 /// ENST00000621098 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:71810592:71814929:1 gene:ENSG00000278570 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 58 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000621736 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:71792638:71818259:1 gene:ENSG00000278570 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 85 // 85 // 28 // 33 // 1 /// ENST00000617575 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:71810554:71818259:1 gene:ENSG00000278570 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// GENSCAN00000021097 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:71606946:71822141:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1
ENST00000364003 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:71858570:71858686:1 gene:ENSG00000200873 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr15 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT047055 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000410162 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:72045183:72045367:1 gene:ENSG00000222094 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT047063 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NR_027262 // RefSeq // Homo sapiens HEXA antisense RNA 1 (HEXA-AS1), long non-coding RNA. // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000567598 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:72376113:72378788:1 gene:ENSG00000260339 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT047087 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001080462 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 202 (TMEM202), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000341689 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:72398273:72408029:1 gene:ENSG00000187806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000567679 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:15:72398309:72408029:1 gene:ENSG00000187806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000568167 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:72398305:72408029:1 gene:ENSG00000187806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// AK131033 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ27523 fis, clone TST09443. // chr15 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000002688 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:72398327:72451438:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1
NONHSAT047111 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000479090 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:74072454:74072676:-1 gene:ENSG00000278604 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA gene:ENSG00000244612 // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000486185 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:75268430:75268652:1 gene:ENSG00000277295 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA gene:ENSG00000242542 // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000488659 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:75292706:75292928:1 gene:ENSG00000275992 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA gene:ENSG00000244438 // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000487317 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:77916718:77916982:-1 gene:ENSG00000242066 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 64 // 100 // 18 // 28 // 0 /// ENST00000617250 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:72664577:72664799:1 gene:ENSG00000274350 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONHSAT047115 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONHSAT047201 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONHSAT047302 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONHSAT047303 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONHSAT047472 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 64 // 100 // 18 // 28 // 0
NM_001042367 // RefSeq // Homo sapiens REC114 meiotic recombination protein (REC114), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000331090 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:73443158:73560014:1 gene:ENSG00000183324 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000560581 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:15:73443164:73560010:1 gene:ENSG00000183324 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 95 // 87 // 19 // 20 // 0 /// BC055412 // GenBank // Homo sapiens chromosome 15 open reading frame 60, mRNA (cDNA clone IMAGE:6613738), partial cds. // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AK126071 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44083 fis, clone TESTI4040939. // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000043369 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:73376810:73559916:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 43 // 43 // 10 // 23 // 1
NM_001286434 // RefSeq // Homo sapiens TBC1 domain family, member 21 (TBC1D21), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NM_153356 // RefSeq // Homo sapiens TBC1 domain family, member 21 (TBC1D21), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006720409 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens TBC1 domain family, member 21 (TBC1D21), transcript variant X3, mRNA. // chr15 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000300504 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:73873627:73889214:1 gene:ENSG00000167139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000535547 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:15:73873608:73889101:1 gene:ENSG00000167139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000562056 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:15:73873646:73889102:1 gene:ENSG00000167139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// AB449907 // GenBank // Homo sapiens TBC1D21 mRNA for TBC1 domain family, member 21, complete cds. // chr15 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// BC033516 // GenBank // Homo sapiens TBC1 domain family, member 21, mRNA (cDNA clone MGC:34741 IMAGE:5170475), complete cds. // chr15 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000043368 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:73767407:73887881:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_005576 // RefSeq // Homo sapiens lysyl oxidase-like 1 (LOXL1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000261921 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:73926458:73952137:1 gene:ENSG00000129038 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000566011 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:73925989:73951919:1 gene:ENSG00000129038 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000566530 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:73946368:73949575:1 gene:ENSG00000129038 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 100 // 28 // 10 // 10 // 0 /// BC015090 // GenBank // Homo sapiens lysyl oxidase-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:16541 IMAGE:4040510), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC068542 // GenBank // Homo sapiens lysyl oxidase-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:87398 IMAGE:30344459), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// L21186 // GenBank // Human lysyl oxidase-like protein mRNA, complete cds. // chr15 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// AK303982 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51452 complete cds, highly similar to Lysyl oxidase homolog 1 precursor (EC1.4.3.-). // chr15 // 81 // 81 // 29 // 36 // 1 /// ENST00000562548 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:73947216:73952137:1 gene:ENSG00000129038 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1 /// GENSCAN00000043361 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:73926784:73959392:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// NONHSAT047191 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr15 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
ENST00000565222 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:74062780:74063785:1 gene:ENSG00000260096 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr15 // 100 // 44 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000047978 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:74062710:74064360:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 56 // 10 // 10 // 0
NM_005545 // RefSeq // Homo sapiens immunoglobulin superfamily containing leucine-rich repeat (ISLR), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NM_201526 // RefSeq // Homo sapiens immunoglobulin superfamily containing leucine-rich repeat (ISLR), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000249842 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:74173671:74176872:1 gene:ENSG00000129009 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000395118 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:74174501:74176872:1 gene:ENSG00000129009 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// AB003184 // GenBank // Homo sapiens mRNA for ISLR, complete cds. // chr15 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// AB024536 // GenBank // Homo sapiens ISLR(immunoglobulin superfamily containing leucine-rich repeat) mRNA, complete cds, alternatively spliced transcript ISLR-2. // chr15 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// AK074668 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ90187 fis, clone MAMMA1000994, highly similar to Homo sapiens immunoglobulin superfamily containing leucine-rich repeat, transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// AY358871 // GenBank // Homo sapiens clone DNA32288 ISLR (UNQ189) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC022478 // GenBank // Homo sapiens immunoglobulin superfamily containing leucine-rich repeat, mRNA (cDNA clone MGC:26286 IMAGE:4794738), complete cds. // chr15 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0 /// BC111013 // GenBank // Homo sapiens immunoglobulin superfamily containing leucine-rich repeat, mRNA (cDNA clone MGC:102816 IMAGE:5763157), complete cds. // chr15 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
ENST00000569680 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:74541264:74575017:1 gene:ENSG00000179361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 100 // 73 // 8 // 8 // 0 /// BC060824 // GenBank // Homo sapiens AT rich interactive domain 3B (BRIGHT-like), mRNA (cDNA clone IMAGE:30343734). // chr15 // 100 // 73 // 8 // 8 // 0
NM_000761 // RefSeq // Homo sapiens cytochrome P450, family 1, subfamily A, polypeptide 2 (CYP1A2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000343932 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:74748844:74756202:1 gene:ENSG00000140505 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF182274 // GenBank // Homo sapiens cytochrome P450-1A2 (CYP1A2) mRNA, complete cds. // chr15 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// BC067424 // GenBank // Homo sapiens cytochrome P450, family 1, subfamily A, polypeptide 2, mRNA (cDNA clone MGC:79250 IMAGE:7002123), complete cds. // chr15 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC067425 // GenBank // Homo sapiens cytochrome P450, family 1, subfamily A, polypeptide 2, mRNA (cDNA clone MGC:79251 IMAGE:7002124), complete cds. // chr15 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC067426 // GenBank // Homo sapiens cytochrome P450, family 1, subfamily A, polypeptide 2, mRNA (cDNA clone MGC:79252 IMAGE:7002125), complete cds. // chr15 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC067427 // GenBank // Homo sapiens cytochrome P450, family 1, subfamily A, polypeptide 2, mRNA (cDNA clone MGC:79253 IMAGE:7002126), complete cds. // chr15 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC067428 // GenBank // Homo sapiens cytochrome P450, family 1, subfamily A, polypeptide 2, mRNA (cDNA clone MGC:79254 IMAGE:7002128), complete cds. // chr15 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// BC067429 // GenBank // Homo sapiens cytochrome P450, family 1, subfamily A, polypeptide 2, mRNA (cDNA clone MGC:79255 IMAGE:7002129), complete cds. // chr15 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// M55053 // GenBank // Human cytochrome P-3-450 mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000047992 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:74749739:74755088:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
ENST00000488000 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:74816223:74831233:1 gene:ENSG00000261606 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000564823 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:74821074:74831795:1 gene:ENSG00000261606 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001030005 // RefSeq // Homo sapiens complexin 3 (CPLX3), mRNA. // chr15 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// ENST00000395018 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:74826547:74831802:1 gene:ENSG00000213578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// AB072900 // GenBank // Homo sapiens mRNA for putative protein product of Nbla11589, complete cds. // chr15 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// BC018026 // GenBank // Homo sapiens complexin 3, mRNA (cDNA clone MGC:26015 IMAGE:4817723), complete cds. // chr15 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// AK074096 // GenBank // Homo sapiens mRNA for FLJ00167 protein. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK074177 // GenBank // Homo sapiens mRNA for FLJ00250 protein. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001030005 // RefSeq // Homo sapiens complexin 3 (CPLX3), mRNA. // chr15 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000395018 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:74826547:74831802:1 gene:ENSG00000213578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000488000 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:74816223:74831233:1 gene:ENSG00000261606 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000564823 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:74821074:74831795:1 gene:ENSG00000261606 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AB072900 // GenBank // Homo sapiens mRNA for putative protein product of Nbla11589, complete cds. // chr15 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AY286501 // GenBank // Homo sapiens complexin III mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// BC018026 // GenBank // Homo sapiens complexin 3, mRNA (cDNA clone MGC:26015 IMAGE:4817723), complete cds. // chr15 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// AK074096 // GenBank // Homo sapiens mRNA for FLJ00167 protein. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK074177 // GenBank // Homo sapiens mRNA for FLJ00250 protein. // chr15 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000047989 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:74813377:74830354:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_153271 // RefSeq // Homo sapiens sorting nexin 33 (SNX33), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000308527 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:75647906:75662301:1 gene:ENSG00000173548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000569152 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:15:75649756:75658630:1 gene:ENSG00000173548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// AK126563 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44600 fis, clone BLADE2007744. // chr15 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// BC018775 // GenBank // Homo sapiens sorting nexin 33, mRNA (cDNA clone MGC:32065 IMAGE:4869639), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// EF219141 // GenBank // Homo sapiens sorting nexin 30 mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// EF653821 // GenBank // Homo sapiens sorting nexin 33 (SNX33) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040629 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:75649103:75657215:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
ENST00000435356 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:75678548:75680752:1 gene:ENSG00000203392 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AK023050 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ12988 fis, clone NT2RP3000080. // chr15 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0
NM_175881 // RefSeq // Homo sapiens outer dense fiber of sperm tails 3-like 1 (ODF3L1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006720414 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens outer dense fiber of sperm tails 3-like 1 (ODF3L1), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000332145 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:75723977:75727688:1 gene:ENSG00000182950 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC039862 // GenBank // Homo sapiens outer dense fiber of sperm tails 3-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:48986 IMAGE:5744333), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000040632 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:75724200:75727540:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
AF357221 // GenBank HTC // Homo sapiens FKSG88 mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
ENST00000567565 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:75746769:75747263:1 gene:ENSG00000260815 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr15 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000040630 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:75746769:75751535:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// NONHSAT047368 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0
ENST00000566174 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:75775594:75786898:1 gene:ENSG00000187812 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr15 // 100 // 63 // 5 // 5 // 0 /// NONHSAT047377 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 63 // 5 // 5 // 0
ENST00000480656 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:75785134:75785354:1 gene:ENSG00000241807 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT047379 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
XR_159251 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens golgin-like (LOC441728), misc_RNA. // chr15 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0 /// ENST00000566174 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:75775594:75786898:1 gene:ENSG00000187812 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr15 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0 /// GENSCAN00000040620 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:75775630:75786980:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0 /// NONHSAT047377 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0
NM_152335 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 15 open reading frame 27 (C15orf27), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000388942 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:76059837:76204963:1 gene:ENSG00000169758 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000484722 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:76059958:76204962:1 gene:ENSG00000169758 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000558249 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:76191469:76204962:1 gene:ENSG00000169758 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000561302 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:76059985:76229121:1 gene:ENSG00000169758 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// AK054866 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ30304 fis, clone BRACE2003285. // chr15 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// AK308676 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ98717. // chr15 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// BC104953 // GenBank // Homo sapiens chromosome 15 open reading frame 27, mRNA (cDNA clone MGC:132613 IMAGE:8143956), complete cds. // chr15 // 100 // 43 // 13 // 13 // 0 /// BC104955 // GenBank // Homo sapiens chromosome 15 open reading frame 27, mRNA (cDNA clone MGC:132615 IMAGE:8143958), complete cds. // chr15 // 100 // 43 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000025782 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:76159905:76195830:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_145805 // RefSeq // Homo sapiens ISL LIM homeobox 2 (ISL2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000290759 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:76336724:76342476:1 gene:ENSG00000159556 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AB593133 // GenBank // Homo sapiens ISL2 mRNA for insulin gene enhancer protein ISL-2, complete cds, clone: HP08667-RBd80H05. // chr15 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC011967 // GenBank // Homo sapiens ISL LIM homeobox 2, mRNA (cDNA clone MGC:9275 IMAGE:3866562), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC012136 // GenBank // Homo sapiens ISL LIM homeobox 2, mRNA (cDNA clone MGC:20227 IMAGE:4558235), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000558656 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:76336808:76342388:1 gene:ENSG00000159556 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 68 // 68 // 23 // 34 // 1 /// ENST00000558437 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:76337438:76338514:1 gene:ENSG00000159556 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1 /// GENSCAN00000025781 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:76329142:76342239:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0
ENST00000364640 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:76736641:76736980:1 gene:ENSG00000201510 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT047408 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001271837 // RefSeq // Homo sapiens reticulocalbin 2, EF-hand calcium binding domain (RCN2), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_002902 // RefSeq // Homo sapiens reticulocalbin 2, EF-hand calcium binding domain (RCN2), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000320963 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:15:76931738:76949860:1 gene:ENSG00000117906 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000394885 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:76931619:76954392:1 gene:ENSG00000117906 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000557805 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:76931871:76947489:1 gene:ENSG00000117906 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 92 // 46 // 12 // 13 // 0 /// BC004892 // GenBank // Homo sapiens reticulocalbin 2, EF-hand calcium binding domain, mRNA (cDNA clone MGC:1650 IMAGE:3505241), complete cds. // chr15 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// BT009790 // GenBank // Homo sapiens reticulocalbin 2, EF-hand calcium binding domain mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000394883 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:15:76931755:76949850:1 gene:ENSG00000117906 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// GENSCAN00000025783 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:76931842:76949222:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0
ENST00000421698 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:77278465:77278774:1 gene:ENSG00000230459 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000003700 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:77278465:77365312:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 82 // 92 // 18 // 22 // 0 /// NONHSAT047433 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT047434 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001101404 // RefSeq // Homo sapiens SH2 domain containing 7 (SH2D7), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000328828 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:15:78092585:78104909:1 gene:ENSG00000183476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000409568 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:78077808:78104370:1 gene:ENSG00000183476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000023040 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:78092585:78103515:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_004378 // RefSeq // Homo sapiens cellular retinoic acid binding protein 1 (CRABP1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000299529 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:78340324:78348230:1 gene:ENSG00000166426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000406419 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:78340476:78348078:1 gene:ENSG00000166426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 94 // 60 // 17 // 18 // 0 /// ENST00000560753 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:78347821:78348221:1 gene:ENSG00000166426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// AB593091 // GenBank // Homo sapiens CRABP1 mRNA for cellular retinoic acid-binding protein 1, complete cds, clone: HP06370-ARh10H02. // chr15 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// BC022069 // GenBank // Homo sapiens cellular retinoic acid binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:33108 IMAGE:4797853), complete cds. // chr15 // 93 // 97 // 27 // 29 // 0 /// CR457017 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834H055D for gene CRABP1, cellular retinoic acid binding protein 1; complete cds, incl. stopcodon. // chr15 // 85 // 67 // 17 // 20 // 0 /// GENSCAN00000023060 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:78340429:78347977:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT047564 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr15 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0
NM_004136 // RefSeq // Homo sapiens iron-responsive element binding protein 2 (IREB2), mRNA. // chr15 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000258886 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:78438189:78501456:1 gene:ENSG00000136381 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000558570 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:78438309:78498209:1 gene:ENSG00000136381 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// AK292992 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77383 complete cds, highly similar to Homo sapiens iron-responsive element binding protein 2 (IREB2), mRNA. // chr15 // 92 // 89 // 23 // 25 // 0 /// BC017880 // GenBank // Homo sapiens iron-responsive element binding protein 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:4277855), complete cds. // chr15 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// BC117481 // GenBank // Homo sapiens iron-responsive element binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:151090 IMAGE:40126032), complete cds. // chr15 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// BC117483 // GenBank // Homo sapiens iron-responsive element binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:151092 IMAGE:40126034), complete cds. // chr15 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// ENST00000560440 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:78438284:78476700:1 gene:ENSG00000136381 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1 /// AB586699 // GenBank // Homo sapiens IREB2 variant mRNA for iron-responsive element binding protein 2 variant, complete cds. // chr15 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// GENSCAN00000023054 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:78363651:78533670:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
L10404 // GenBank // Homo sapiens surfactant protein B-binding protein mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_000745 // RefSeq // Homo sapiens cholinergic receptor, nicotinic, alpha 5 (neuronal) (CHRNA5), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000299565 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:78565520:78595269:1 gene:ENSG00000169684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC033639 // GenBank // Homo sapiens cholinergic receptor, nicotinic, alpha 5, mRNA (cDNA clone MGC:45360 IMAGE:5501542), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// M83712 // GenBank // H.sapiens nicotinic receptor alpha 5 subunit mRNA, complete cds. // chr15 // 92 // 96 // 23 // 25 // 0 /// U62434 // GenBank // Human nicotinic acetylcholine receptor alpha5 subunit precursor, mRNA, complete cds. // chr15 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000559554 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:78565571:78593535:1 gene:ENSG00000169684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// ENST00000394802 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:78580890:78593274:1 gene:ENSG00000169684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// GENSCAN00000023050 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:78565720:78593253:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
ENST00000316148 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:78978889:78985926:1 gene:ENSG00000177699 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// AF370414 // GenBank HTC // Homo sapiens PP13187 mRNA, complete cds. // chr15 // 53 // 53 // 8 // 15 // 1 /// AK097337 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ40018 fis, clone STOMA2006398. // chr15 // 93 // 100 // 14 // 15 // 0 /// NONHSAT047634 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NR_029705 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 184 (MIR184), microRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000384962 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:79209788:79209871:1 gene:ENSG00000207695 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-184 // miRBase Micro RNA Database // MI0000481 Homo sapiens miR-184 stem-loop // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT047644 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001146341 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat domain 34C (ANKRD34C), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000421388 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:79293285:79298235:1 gene:ENSG00000235711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030745 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:79293285:79294892:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_015206 // RefSeq // Homo sapiens KIAA1024 (KIAA1024), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000305428 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:79432516:79472290:1 gene:ENSG00000169330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000559272 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:79456096:79471144:1 gene:ENSG00000169330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// BC152466 // GenBank // Homo sapiens KIAA1024, mRNA (cDNA clone MGC:176723 IMAGE:8862602), complete cds. // chr15 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000030742 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:79456148:79468384:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0
NR_028330 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 15 open reading frame 37 (C15orf37), long non-coding RNA. // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000560255 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:79922771:79926993:1 gene:ENSG00000259642 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC101201 // GenBank // Homo sapiens chromosome 15 open reading frame 37, mRNA (cDNA clone MGC:120102 IMAGE:40021818), complete cds. // chr15 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// BC101202 // GenBank // Homo sapiens chromosome 15 open reading frame 37, mRNA (cDNA clone MGC:120103 IMAGE:40021819), complete cds. // chr15 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// BC101203 // GenBank // Homo sapiens chromosome 15 open reading frame 37, mRNA (cDNA clone MGC:120104 IMAGE:40021821), complete cds. // chr15 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000618735 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:15:79922771:79923260:1 gene:ENSG00000259642 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr15 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000030730 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:79922646:79923776:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0
AF161558 // GenBank HTC // Homo sapiens HSPC073 mRNA, complete cds. // chr15 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// NONHSAT047671 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000410207 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:80663772:80663878:1 gene:ENSG00000222139 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT047710 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_021214 // RefSeq // Homo sapiens abhydrolase domain containing 17C (ABHD17C), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000258884 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:80695303:80755621:1 gene:ENSG00000136379 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000558464 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:80695311:80755339:1 gene:ENSG00000136379 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 97 // 88 // 28 // 29 // 0 /// AK298606 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57493 complete cds. // chr15 // 91 // 33 // 10 // 11 // 0 /// AL390079 // GenBank // Homo sapiens mRNA full length insert cDNA clone EUROIMAGE 588495. // chr15 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// BC059401 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 108, member C1, mRNA (cDNA clone MGC:71761 IMAGE:30346383), complete cds. // chr15 // 97 // 97 // 31 // 32 // 0 /// BC115003 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 108, member C1, mRNA (cDNA clone MGC:131546 IMAGE:7503983), complete cds. // chr15 // 93 // 88 // 27 // 29 // 0 /// ENST00000559506 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:80702683:80755619:1 gene:ENSG00000136379 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1 /// AK091780 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ34461 fis, clone HLUNG2002949. // chr15 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// AK092758 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ35439 fis, clone SMINT2002899. // chr15 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1 /// GENSCAN00000019594 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:80693978:80696023:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1
NM_022566 // RefSeq // Homo sapiens mesoderm development candidate 1 (MESDC1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000267984 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:81000944:81005788:1 gene:ENSG00000140406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY007810 // GenBank // Homo sapiens MESDC1 (MESDC1) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC084554 // GenBank // Homo sapiens mesoderm development candidate 1, mRNA (cDNA clone MGC:99595 IMAGE:6088754), complete cds. // chr15 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000005404 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:81002272:81003360:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0
ENST00000560091 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:81007033:81138067:1 gene:ENSG00000156206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 92 // 42 // 12 // 13 // 0 /// ENST00000561216 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:81099408:81136748:1 gene:ENSG00000156206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 45 // 14 // 14 // 0 /// AK095934 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ38615 fis, clone HEART2006787. // chr15 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000286732 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:81134247:81149175:1 gene:ENSG00000156206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 81 // 81 // 25 // 31 // 1 /// AK302120 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55263 complete cds. // chr15 // 81 // 81 // 25 // 31 // 1 /// BC062471 // GenBank // Homo sapiens chromosome 15 open reading frame 26, mRNA (cDNA clone MGC:75413 IMAGE:30390735), complete cds. // chr15 // 77 // 77 // 24 // 31 // 1 /// GENSCAN00000005417 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:81134330:81148533:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 55 // 17 // 17 // 0
NM_001008226 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 154, member B (FAM154B), mRNA. // chr15 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000339465 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:82262811:82284930:1 gene:ENSG00000188659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000565501 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:82262845:82283579:1 gene:ENSG00000188659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// AK304339 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54903 complete cds. // chr15 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// BC144647 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:9053178. // chr15 // 94 // 85 // 16 // 17 // 0 /// ENST00000565432 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:82262844:82272094:1 gene:ENSG00000188659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 45 // 45 // 9 // 20 // 1 /// GENSCAN00000002613 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:82271144:82327217:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 40 // 40 // 8 // 20 // 1
NR_004847 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin-conjugating enzyme E2Q family member 2 pseudogene 2 (UBE2Q2P2), non-coding RNA. // chr15 // 93 // 97 // 26 // 28 // 0 /// ENST00000618775 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:82355142:82414738:1 gene:ENSG00000259429 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 96 // 79 // 22 // 23 // 0 /// NONHSAT047818 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr15 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// ENST00000613592 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:82391844:82420075:1 gene:ENSG00000259429 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr15 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1 /// NONHSAT047779 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr15 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1
ENST00000459938 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:84394072:84394336:1 gene:ENSG00000244056 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 88 // 91 // 38 // 43 // 0 /// NONHSAT047792 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// NONHSAT047808 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// NONHSAT047830 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// NONHSAT047946 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 88 // 91 // 38 // 43 // 0 /// ENST00000613111 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:90293939:90294207:1 gene:ENSG00000275803 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 64 // 77 // 23 // 36 // 0 /// NONHSAT048387 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 64 // 77 // 23 // 36 // 0 /// ENST00000611908 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:84467901:84468147:1 gene:ENSG00000278785 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 21 // 100 // 10 // 47 // 0 /// ENST00000613848 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:85210053:85210299:-1 gene:ENSG00000277582 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 21 // 100 // 10 // 47 // 0 /// ENST00000618054 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:84205454:84205700:-1 gene:ENSG00000278422 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 21 // 100 // 10 // 47 // 0 /// NONHSAT047934 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 21 // 100 // 10 // 47 // 0 /// NONHSAT048064 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 21 // 100 // 10 // 47 // 0
NR_003011 // RefSeq // Homo sapiens small Cajal body-specific RNA 15 (SCARNA15), guide RNA. // chr15 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000516881 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:82755945:82756071:1 gene:ENSG00000277864 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA gene:ENSG00000252690 // chr15 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000607520 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:82752884:82757208:1 gene:ENSG00000252690 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AL360137 // GenBank // Homo sapiens mRNA full length insert cDNA clone EUROIMAGE 898037. // chr15 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// BX538250 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686A1429 (from clone DKFZp686A1429). // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT047861 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT047867 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0
NM_001080435 // RefSeq // Homo sapiens WAS protein homolog associated with actin, golgi membranes and microtubules (WHAMM), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_005272421 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens WAS protein homolog associated with actin, golgi membranes and microtubules (WHAMM), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000286760 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:82809628:82836108:1 gene:ENSG00000156232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_005272424 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens WAS protein homolog associated with actin, golgi membranes and microtubules (WHAMM), transcript variant X4, mRNA. // chr15 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1 /// XR_246658 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens WAS protein homolog associated with actin, golgi membranes and microtubules (WHAMM), transcript variant X5, misc_RNA. // chr15 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1 /// GENSCAN00000002606 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:82809727:82833536:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 56 // 20 // 20 // 0
NM_031452 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 103, member A1 (FAM103A1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000304191 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:82986207:82991057:1 gene:ENSG00000169612 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000444122 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:166586124:166586477:-1 gene:ENSG00000235272 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr15 // 87 // 41 // 13 // 15 // 0 /// BC003627 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 103, member A1, mRNA (cDNA clone MGC:2560 IMAGE:2989772), complete cds. // chr15 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// BC027181 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 103, member A1, mRNA (cDNA clone MGC:18029 IMAGE:3924570), complete cds. // chr15 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// BC112329 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 103, member A1, mRNA (cDNA clone MGC:102778 IMAGE:5578103), complete cds. // chr15 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000002604 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:82989019:82990089:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 92 // 35 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000024557 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:166586121:166586477:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 87 // 41 // 13 // 15 // 0 /// NONHSAT116053 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr15 // 87 // 41 // 13 // 15 // 0
NM_207517 // RefSeq // Homo sapiens ADAMTS-like 3 (ADAMTSL3), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000286744 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:83654086:84039842:1 gene:ENSG00000156218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000561483 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:83654095:84025551:1 gene:ENSG00000156218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000567476 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:83654088:84039427:1 gene:ENSG00000156218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 97 // 100 // 37 // 38 // 0 /// AK308845 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ98886. // chr15 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// BC128389 // GenBank // Homo sapiens ADAMTS-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:150716 IMAGE:40125494), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC128390 // GenBank // Homo sapiens ADAMTS-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:150717 IMAGE:40125501), complete cds. // chr15 // 95 // 100 // 36 // 38 // 0 /// ENST00000569510 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:83654095:83862935:1 gene:ENSG00000156218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 26 // 26 // 10 // 38 // 1 /// AK092324 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ35005 fis, clone OCBBF2012001. // chr15 // 24 // 24 // 9 // 38 // 1
ENST00000391072 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:83717427:83717522:1 gene:ENSG00000212374 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT047907 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_024580 // RefSeq // Homo sapiens elongation factor Tu GTP binding domain containing 1 (EFTUD1), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NR_036652 // RefSeq // Homo sapiens elongation factor Tu GTP binding domain containing 1 pseudogene 1 (EFTUD1P1), non-coding RNA. // chr15 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000268206 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:82130230:82262763:-1 gene:ENSG00000140598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000558187 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:84080168:84113676:1 gene:ENSG00000259404 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000560401 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:84080168:84126604:1 gene:ENSG00000259404 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr15 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// AK300348 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61709 complete cds, highly similar to Homo sapiens elongation factor Tu GTP binding domain containing 1, transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// GENSCAN00000002612 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:82130373:82262803:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 75 // 3 // 3 // 0 /// GENSCAN00000021340 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:84014634:84199925:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// TCONS_l2_00008789-XLOC_l2_004767 // Broad TUCP // linc-ZSCAN2-6 chr15:+:84749040-84773578 // chr15 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// TCONS_l2_00008790-XLOC_l2_004767 // Broad TUCP // linc-ZSCAN2-6 chr15:+:84749899-84771641 // chr15 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000459938 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:84394072:84394336:1 gene:ENSG00000244056 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONHSAT047792 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONHSAT047808 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONHSAT047830 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONHSAT047946 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000613111 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:90293939:90294207:1 gene:ENSG00000275803 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 68 // 89 // 23 // 34 // 0 /// NONHSAT048387 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 68 // 89 // 23 // 34 // 0
NM_014630 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 592 (ZNF592), mRNA. // chr15 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000299927 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:15:84782654:84806430:1 gene:ENSG00000166716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000559607 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:84778260:84802438:1 gene:ENSG00000166716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000560079 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:84748635:84806432:1 gene:ENSG00000166716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC094688 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 592, mRNA (cDNA clone MGC:102942 IMAGE:30397050), complete cds. // chr15 // 96 // 79 // 22 // 23 // 0 /// BC112232 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 592, mRNA (cDNA clone MGC:138437 IMAGE:8327700), complete cds. // chr15 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// BC112234 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 592, mRNA (cDNA clone MGC:138439 IMAGE:8327702), complete cds. // chr15 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// D86966 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA0211 gene, partial cds. // chr15 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000021347 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:84748587:84802393:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0
NM_020778 // RefSeq // Homo sapiens alpha-kinase 3 (ALPK3), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000258888 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:84816680:84873482:1 gene:ENSG00000136383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// AY044449 // GenBank // Homo sapiens muscle alpha-kinase (MAK) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000021346 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:84817453:84982650:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 62 // 62 // 24 // 39 // 1
ENST00000567715 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:86262625:86296215:1 gene:ENSG00000166748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000568785 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:86262625:86295511:1 gene:ENSG00000166748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// AK056872 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ32310 fis, clone PROST2003102. // chr15 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// BC128152 // GenBank // Homo sapiens ATP/GTP binding protein-like 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:40112618), complete cds. // chr15 // 91 // 85 // 20 // 22 // 0 /// NM_152336 // RefSeq // Homo sapiens ATP/GTP binding protein-like 1 (AGBL1), mRNA. // chr15 // 92 // 92 // 24 // 26 // 1 /// ENST00000421325 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:15:86142011:86674452:1 gene:ENSG00000166748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 92 // 92 // 24 // 26 // 1 /// ENST00000441037 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:86141996:87029052:1 gene:ENSG00000166748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 92 // 92 // 24 // 26 // 1 /// GENSCAN00000007967 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:86249868:86409234:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 92 // 92 // 24 // 26 // 1
NR_026869 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 52 (LINC00052), long non-coding RNA. // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000560153 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:87576929:87579866:1 gene:ENSG00000259527 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT048148 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0 /// NONHSAT048149 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// TCONS_00023191-XLOC_011342 // Rinn lincRNA // linc-MRPS11 chr15:+:88120159-88122917 // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NR_029606 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 7-2 (MIR7-2), microRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000384970 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:88611825:88611934:1 gene:ENSG00000207703 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-7-2 // miRBase Micro RNA Database // MI0000264 Homo sapiens miR-7-2 stem-loop // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT048186 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_022767 // RefSeq // Homo sapiens apoptosis enhancing nuclease (AEN), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_005254967 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens apoptosis enhancing nuclease (AEN), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000332810 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:88621296:88632282:1 gene:ENSG00000181026 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000557927 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:88626612:88632281:1 gene:ENSG00000181026 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// AK022624 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ12562 fis, clone NT2RM4000813. // chr15 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// BC014407 // GenBank // Homo sapiens apoptosis enhancing nuclease, mRNA (cDNA clone MGC:19888 IMAGE:4558021), complete cds. // chr15 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// BC020988 // GenBank // Homo sapiens apoptosis enhancing nuclease, mRNA (cDNA clone MGC:9730 IMAGE:3852419), complete cds. // chr15 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC005164 // GenBank // Homo sapiens apoptosis enhancing nuclease, mRNA (cDNA clone MGC:4669 IMAGE:3531883), complete cds. // chr15 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// GENSCAN00000009762 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:88605121:88630294:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NR_029692 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 9-3 (MIR9-3), microRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000385084 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:89368017:89368106:1 gene:ENSG00000207819 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-9-3 // miRBase Micro RNA Database // MI0000468 Homo sapiens miR-9-3 stem-loop // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT048286 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_152259 // RefSeq // Homo sapiens TOPBP1-interacting checkpoint and replication regulator (TICRR), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000268138 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:89575482:89628023:1 gene:ENSG00000140534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000560985 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:89575587:89628012:1 gene:ENSG00000140534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GQ227787 // GenBank // Homo sapiens Treslin mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000010446 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:89575608:89627086:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0
NM_001284395 // RefSeq // Homo sapiens WD repeat domain 93 (WDR93), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NM_020212 // RefSeq // Homo sapiens WD repeat domain 93 (WDR93), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006720618 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens WD repeat domain 93 (WDR93), transcript variant X5, mRNA. // chr15 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000268130 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:89690797:89743638:1 gene:ENSG00000140527 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000444934 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:89721110:89743637:1 gene:ENSG00000140527 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000560294 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:89690829:89743638:1 gene:ENSG00000140527 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AK302032 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51374 complete cds. // chr15 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// AL390084 // GenBank // Homo sapiens mRNA full length insert cDNA clone EUROIMAGE 384293. // chr15 // 93 // 54 // 13 // 14 // 0 /// AL390085 // GenBank // Homo sapiens mRNA full length insert cDNA clone EUROIMAGE 397056. // chr15 // 93 // 54 // 13 // 14 // 0 /// BC064626 // GenBank // Homo sapiens WD repeat domain 93, mRNA (cDNA clone MGC:75315 IMAGE:5742386), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000010432 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:89722109:89743391:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
ENST00000383863 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:89714232:89714338:1 gene:ENSG00000206590 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// NONHSAT048335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0
NM_001039958 // RefSeq // Homo sapiens mesoderm posterior basic helix-loop-helix transcription factor 2 (MESP2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000341735 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:89776358:89778692:1 gene:ENSG00000188095 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// ENST00000558723 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:89760601:89778674:1 gene:ENSG00000188095 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 91 // 37 // 10 // 11 // 0 /// ENST00000560219 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:89760591:89778754:1 gene:ENSG00000188095 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// AL360139 // GenBank // Homo sapiens mRNA full length insert cDNA clone EUROIMAGE 231282. // chr15 // 92 // 40 // 11 // 12 // 0 /// BC111413 // GenBank // Homo sapiens mesoderm posterior 2 homolog (mouse), mRNA (cDNA clone MGC:133018 IMAGE:40004357), complete cds. // chr15 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// GENSCAN00000010441 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:89776358:89777377:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT048339 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr15 // 91 // 37 // 10 // 11 // 0
NM_198526 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 710 (ZNF710), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_005254905 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens zinc finger protein 710 (ZNF710), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// XM_005254906 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens zinc finger protein 710 (ZNF710), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// XM_005254907 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens zinc finger protein 710 (ZNF710), transcript variant X3, mRNA. // chr15 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// XM_006720498 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens zinc finger protein 710 (ZNF710), transcript variant X4, mRNA. // chr15 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000268154 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:90001392:90082200:1 gene:ENSG00000140548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000558883 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:90068014:90074532:1 gene:ENSG00000140548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// BC126476 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 710, mRNA (cDNA clone MGC:161754 IMAGE:8992192), complete cds. // chr15 // 95 // 83 // 19 // 20 // 0 /// BC130541 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 710, mRNA (cDNA clone MGC:163413 IMAGE:40146572), complete cds. // chr15 // 95 // 83 // 19 // 20 // 0 /// AK160373 // GenBank // Homo sapiens mRNA for FLJ00306 protein. // chr15 // 71 // 71 // 17 // 24 // 1 /// GENSCAN00000049251 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:90035678:90079829:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0
NONHSAT048371 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
ENST00000491561 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:90166233:90166526:1 gene:ENSG00000240470 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT048373 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001013657 // RefSeq // Homo sapiens GDP-D-glucose phosphorylase 1 (GDPGP1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000329600 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:15:90240888:90242080:1 gene:ENSG00000183208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000558017 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:90233808:90245811:1 gene:ENSG00000183208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000559204 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:90234226:90241550:1 gene:ENSG00000183208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// AK130527 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ27017 fis, clone SLV05746. // chr15 // 88 // 100 // 21 // 24 // 0 /// BC127821 // GenBank // Homo sapiens chromosome 15 open reading frame 58, mRNA (cDNA clone IMAGE:40131571), partial cds. // chr15 // 93 // 58 // 13 // 14 // 0 /// ENST00000561433 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:90234198:90241057:1 gene:ENSG00000183208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 58 // 58 // 14 // 24 // 1 /// ENST00000558291 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:90234263:90240939:1 gene:ENSG00000183208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 46 // 46 // 11 // 24 // 1 /// GENSCAN00000049266 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:90240909:90242066:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0
NR_104604 // RefSeq // Homo sapiens tubulin tyrosine ligase-like family, member 13 (TTLL13), non-coding RNA. // chr15 // 100 // 57 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000339615 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:90249530:90259088:1 gene:ENSG00000213471 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 100 // 57 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000438251 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:90250631:90264967:1 gene:ENSG00000213471 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:unitary_pseudogene // chr15 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0 /// BC144453 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:9052979. // chr15 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1 /// ENST00000561573 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:90249556:90272208:1 gene:ENSG00000261147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000049263 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:90250655:90264056:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000617037 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:90249530:90265482:1 gene:ENSG00000213471 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 83 // 83 // 19 // 23 // 1 /// ENST00000621485 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:90249782:90259012:1 gene:ENSG00000213471 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 39 // 39 // 9 // 23 // 1
ENST00000438251 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:90250631:90264967:1 gene:ENSG00000213471 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:unitary_pseudogene // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000561573 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:90249556:90272208:1 gene:ENSG00000261147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000617037 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:90249530:90265482:1 gene:ENSG00000213471 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000379095 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:90265705:90278141:1 gene:ENSG00000182768 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000579581 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:90275129:90275716:1 gene:ENSG00000228998 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr15 // 93 // 58 // 13 // 14 // 0 /// GENSCAN00000049259 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:90275129:90275719:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 93 // 58 // 13 // 14 // 0 /// AK098314 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ40995 fis, clone UTERU2015830. // chr15 // 75 // 100 // 18 // 24 // 0
ENST00000459938 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:84394072:84394336:1 gene:ENSG00000244056 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENST00000613111 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:90293939:90294207:1 gene:ENSG00000275803 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT047792 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONHSAT047808 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONHSAT047830 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONHSAT047946 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONHSAT048387 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000049260 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:90293480:90295480:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000622269 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:15:90266317:90314499:1 gene:ENSG00000275674 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 67 // 67 // 10 // 15 // 1
NM_003870 // RefSeq // Homo sapiens IQ motif containing GTPase activating protein 1 (IQGAP1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000268182 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:90388218:90502243:1 gene:ENSG00000140575 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000560738 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:15:90388261:90500371:1 gene:ENSG00000140575 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 62 // 26 // 26 // 0 /// AK298000 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55816 complete cds, highly similar to Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1. // chr15 // 100 // 19 // 8 // 8 // 0 /// AK304337 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55443 complete cds, highly similar to Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1. // chr15 // 100 // 62 // 26 // 26 // 0 /// BC005906 // GenBank // Homo sapiens IQ motif containing GTPase activating protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4272972), partial cds. // chr15 // 100 // 24 // 10 // 10 // 0 /// BC139731 // GenBank // Homo sapiens IQ motif containing GTPase activating protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:134938 IMAGE:40073370), complete cds. // chr15 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// BC151834 // GenBank // Homo sapiens IQ motif containing GTPase activating protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:166899 IMAGE:9007269), complete cds. // chr15 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000049255 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:90388342:90642140:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// L33075 // GenBank // Homo sapiens ras GTPase-activating-like protein (IQGAP1) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0
NM_001289823 // RefSeq // Homo sapiens furin (paired basic amino acid cleaving enzyme) (FURIN), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// NM_001289824 // RefSeq // Homo sapiens furin (paired basic amino acid cleaving enzyme) (FURIN), transcript variant 3, mRNA. // chr15 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// NM_002569 // RefSeq // Homo sapiens furin (paired basic amino acid cleaving enzyme) (FURIN), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000268171 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:90868592:90883458:1 gene:ENSG00000140564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000558794 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:90878194:90880756:1 gene:ENSG00000140564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 100 // 26 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000560824 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:15:90875688:90877166:1 gene:ENSG00000140564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 29 // 12 // 12 // 0 /// BC012181 // GenBank // Homo sapiens furin (paired basic amino acid cleaving enzyme), mRNA (cDNA clone MGC:20463 IMAGE:4550620), complete cds. // chr15 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000610579 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:15:90871539:90883458:1 gene:ENSG00000140564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000618099 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:15:90872878:90883458:1 gene:ENSG00000140564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000049252 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:90675423:90881878:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 74 // 74 // 31 // 42 // 1
NM_001167580 // RefSeq // Homo sapiens synaptic vesicle glycoprotein 2B (SV2B), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 97 // 82 // 30 // 31 // 0 /// NM_014848 // RefSeq // Homo sapiens synaptic vesicle glycoprotein 2B (SV2B), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000330276 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:15:91225870:91301308:1 gene:ENSG00000185518 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000394232 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:91100285:91301309:1 gene:ENSG00000185518 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000557410 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:91100315:91295285:1 gene:ENSG00000185518 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// BC030011 // GenBank // Homo sapiens synaptic vesicle glycoprotein 2B, mRNA (cDNA clone MGC:26452 IMAGE:4826206), complete cds. // chr15 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// CR457086 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834E0814D for gene SV2B, synaptic vesicle glycoprotein 2B; complete cds, incl. stopcodon. // chr15 // 100 // 63 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000545111 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:15:91099950:91292636:1 gene:ENSG00000185518 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 58 // 58 // 22 // 38 // 1 /// AK294902 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50759 complete cds, highly similar to Synaptic vesicle glycoprotein 2B. // chr15 // 58 // 58 // 22 // 38 // 1 /// GENSCAN00000031902 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:91226264:91292552:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 63 // 24 // 24 // 0
ENST00000333334 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:92471654:92501117:1 gene:ENSG00000183643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000556865 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:92471921:92500842:1 gene:ENSG00000183643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// AK057393 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ32831 fis, clone TESTI2003193. // chr15 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC109252 // GenBank // Homo sapiens chromosome 15 open reading frame 32, mRNA (cDNA clone MGC:129836 IMAGE:40023840), complete cds. // chr15 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// BC109253 // GenBank // Homo sapiens chromosome 15 open reading frame 32, mRNA (cDNA clone MGC:129837 IMAGE:40023844), complete cds. // chr15 // 88 // 83 // 21 // 24 // 0
ENST00000431116 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:92711808:92712110:1 gene:ENSG00000253954 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr15 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000001287 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:92711808:92712110:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONHSAT049655 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONHSAT140261 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
AY358245 // GenBank // Homo sapiens clone DNA164558 AGVR6190 (UNQ6190) mRNA, complete cds. // chr15 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0
AY358254 // GenBank // Homo sapiens clone DNA172197 IFMQ9370 (UNQ9370) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000410144 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:95745804:95745994:1 gene:ENSG00000222076 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT050213 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK090480 // GenBank // Homo sapiens mRNA for FLJ00402 protein. // chr15 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0
ENST00000410685 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:96486582:96486891:1 gene:ENSG00000222617 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT050258 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000558553 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:96783474:96785178:1 gene:ENSG00000185594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000560327 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:96783487:96785608:1 gene:ENSG00000185594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC112390 // GenBank // Homo sapiens spermatogenesis associated 8, mRNA (cDNA clone MGC:102678 IMAGE:5168326), complete cds. // chr15 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NM_173499 // RefSeq // Homo sapiens spermatogenesis associated 8 (SPATA8), mRNA. // chr15 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// ENST00000328504 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:96783389:96785615:1 gene:ENSG00000185594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// ENST00000561002 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:96783449:96785075:1 gene:ENSG00000185594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// AY489187 // GenBank // Homo sapiens spermatogenesis-related protein 8 mRNA, complete cds. // chr15 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// BC033979 // GenBank // Homo sapiens spermatogenesis associated 8, mRNA (cDNA clone MGC:44294 IMAGE:5295377), complete cds. // chr15 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1 /// BC066292 // GenBank // Homo sapiens spermatogenesis associated 8, mRNA (cDNA clone MGC:86966 IMAGE:5271997), complete cds. // chr15 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// NONHSAT050706 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr15 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT050704 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr15 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1
ENST00000411188 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:96842069:96842384:1 gene:ENSG00000223120 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
ENST00000466970 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:97353497:97353815:1 gene:ENSG00000242863 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT050730 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_183376 // RefSeq // Homo sapiens arrestin domain containing 4 (ARRDC4), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000268042 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:97960698:97973838:1 gene:ENSG00000140450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK290221 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75621 complete cds, highly similar to Homo sapiens arrestin domain containing 4 (ARRDC4), mRNA. // chr15 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// AK296448 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56955 complete cds, highly similar to Arrestin domain-containing protein 4. // chr15 // 93 // 52 // 13 // 14 // 0 /// AK316280 // GenBank // Homo sapiens cDNA, FLJ79179 complete cds, highly similar to Arrestin domain-containing protein 4. // chr15 // 79 // 52 // 11 // 14 // 0 /// BC028704 // GenBank // Homo sapiens arrestin domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:26929 IMAGE:4838787), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC070100 // GenBank // Homo sapiens arrestin domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:87545 IMAGE:30345612), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000041605 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:97960862:97971187:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0
NM_000875 // RefSeq // Homo sapiens insulin-like growth factor 1 receptor (IGF1R), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NM_001291858 // RefSeq // Homo sapiens insulin-like growth factor 1 receptor (IGF1R), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XM_006720487 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens insulin-like growth factor 1 receptor (IGF1R), transcript variant X4, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000268035 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:98648971:98964530:1 gene:ENSG00000140443 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000558762 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:15:98649044:98964529:1 gene:ENSG00000140443 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_145728 // RefSeq // Homo sapiens synemin, intermediate filament protein (SYNM), transcript variant A, mRNA. // chr15 // 95 // 95 // 40 // 42 // 0 /// ENST00000336292 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:99105035:99135589:1 gene:ENSG00000182253 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 95 // 100 // 42 // 44 // 0 /// AF359284 // GenBank // Homo sapiens desmuslin mRNA, complete cds. // chr15 // 93 // 68 // 28 // 30 // 0 /// BC151243 // GenBank // Homo sapiens synemin, intermediate filament protein, mRNA (cDNA clone MGC:167837 IMAGE:8860516), complete cds. // chr15 // 93 // 100 // 41 // 44 // 0 /// NM_015286 // RefSeq // Homo sapiens synemin, intermediate filament protein (SYNM), transcript variant B, mRNA. // chr15 // 77 // 77 // 34 // 44 // 1 /// ENST00000594047 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:99105080:99135583:1 gene:ENSG00000182253 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSG00000269283 // chr15 // 77 // 77 // 34 // 44 // 1 /// ENST00000328642 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:99105080:99135583:1 gene:ENSG00000182253 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 55 // 55 // 24 // 44 // 1 /// ENST00000560674 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:99098217:99135593:1 gene:ENSG00000182253 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 50 // 50 // 22 // 44 // 1 /// AL833262 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp451C2210 (from clone DKFZp451C2210). // chr15 // 50 // 50 // 22 // 44 // 1 /// GENSCAN00000038009 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:99071277:99133058:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0
NR_073383 // RefSeq // Homo sapiens heat shock protein 90kDa beta (Grp94), member 2, pseudogene (HSP90B2P), non-coding RNA. // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000559111 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:99257632:99260015:1 gene:ENSG00000259706 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AY956768 // GenBank // Homo sapiens heat shock protein 94b (GRP94b) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000037991 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:99258644:99260020:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENST00000462651 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:99791209:99791410:1 gene:ENSG00000241588 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT050899 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_024708 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat and SOCS box containing 7 (ASB7), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NM_198243 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat and SOCS box containing 7 (ASB7), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000343276 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:100602609:100630209:1 gene:ENSG00000183475 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000558747 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:15:100602608:100649533:1 gene:ENSG00000183475 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// AF451994 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat-containing SOCS box protein 7 mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// AK289860 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76339 complete cds, highly similar to Homo sapiens ankyrin repeat and SOCS box-containing 7 (ASB7), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC063581 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat and SOCS box-containing 7, mRNA (cDNA clone MGC:74903 IMAGE:4370796), complete cds. // chr15 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000332783 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:100602534:100651705:1 gene:ENSG00000183475 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 92 // 92 // 23 // 25 // 1 /// GENSCAN00000009468 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:100602174:100648462:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
ENST00000391004 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:100638363:100638457:1 gene:ENSG00000212306 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT051117 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_024652 // RefSeq // Homo sapiens leucine-rich repeat kinase 1 (LRRK1), mRNA. // chr15 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// ENST00000388948 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:100919215:101070112:1 gene:ENSG00000154237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// ENST00000525284 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:100924603:101069068:1 gene:ENSG00000154237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 100 // 87 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000531270 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:100924603:101069068:1 gene:ENSG00000154237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 100 // 84 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000532029 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:15:100919345:100989648:1 gene:ENSG00000154237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 20 // 9 // 9 // 0 /// BC005408 // GenBank // Homo sapiens leucine-rich repeat kinase 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3463078), partial cds. // chr15 // 100 // 27 // 12 // 12 // 0 /// BC068080 // GenBank // Homo sapiens leucine-rich repeat kinase 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:6209274), complete cds. // chr15 // 100 // 20 // 9 // 9 // 0 /// BC171802 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:9054456. // chr15 // 100 // 87 // 39 // 39 // 0 /// DQ013130 // GenBank // Homo sapiens leucine-rich repeat kinase 1 (LRRK1) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 82 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000526457 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:101053337:101078254:1 gene:ENSG00000154237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 27 // 27 // 12 // 45 // 1 /// GENSCAN00000010469 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:100994668:101086709:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 73 // 33 // 33 // 0
NONHSAT051203 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_005255006 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens uncharacterized LOC101927628 (LOC101927628), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// XM_006726588 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens trichohyalin-like (LOC101060703), partial mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// XM_006726591 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens uncharacterized LOC102725178 (LOC102725178), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000561463 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:101751032:101773472:1 gene:ENSG00000259660 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000571780 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:101751553:101764961:1 gene:ENSG00000259660 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr15 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000010480 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:101745596:101764767:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONHSAT051208 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONHSAT051210 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONHSAT051301 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0 /// NONHSAT140282 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0 /// AK125787 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ43799 fis, clone TESTI4000288. // chr15 // 56 // 100 // 5 // 9 // 0
XM_005255006 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens uncharacterized LOC101927628 (LOC101927628), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// XM_006726588 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens trichohyalin-like (LOC101060703), partial mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// XM_006726591 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens uncharacterized LOC102725178 (LOC102725178), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000561463 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:101751032:101773472:1 gene:ENSG00000259660 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000571780 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:101751553:101764961:1 gene:ENSG00000259660 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr15 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000010480 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:101745596:101764767:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONHSAT051208 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONHSAT051210 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONHSAT051301 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONHSAT140282 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0 /// GENSCAN00000038010 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:99796957:99807137:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 56 // 100 // 5 // 9 // 0 /// AK125787 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ43799 fis, clone TESTI4000288. // chr15 // 56 // 100 // 5 // 9 // 0
XM_005255006 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens uncharacterized LOC101927628 (LOC101927628), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// XM_006726588 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens trichohyalin-like (LOC101060703), partial mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// XM_006726591 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens uncharacterized LOC102725178 (LOC102725178), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000561463 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:101751032:101773472:1 gene:ENSG00000259660 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000571780 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:101751553:101764961:1 gene:ENSG00000259660 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr15 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// GENSCAN00000010480 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:101745596:101764767:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT051208 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT051210 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT051301 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT140284 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT140285 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT140303 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT140304 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_001005326 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 6 (OR4F6), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000328882 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:101805699:101806686:1 gene:ENSG00000184140 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC137002 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 6, mRNA (cDNA clone MGC:168618 IMAGE:9020995), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC137003 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 6, mRNA (cDNA clone MGC:168619 IMAGE:9020996), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000536946 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:15:101805720:101819115:1 gene:ENSG00000182854 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSG00000257109 // chr15 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000010475 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:101805720:101829616:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001001674 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 15 (OR4F15), mRNA. // chr15 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000332238 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:101818163:101819147:1 gene:ENSG00000182854 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC137064 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 15, mRNA (cDNA clone MGC:168684 IMAGE:9021061), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC137065 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 15, mRNA (cDNA clone MGC:168685 IMAGE:9021062), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000536946 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:15:101805720:101819115:1 gene:ENSG00000182854 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSG00000257109 // chr15 // 59 // 88 // 13 // 22 // 0
ENST00000355745 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:101828741:101829679:1 gene:ENSG00000232459 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr15 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000010475 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:101805720:101829616:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NR_046417 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 13 pseudogene (OR4F13P), non-coding RNA. // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000428478 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:101848645:101849575:1 gene:ENSG00000214344 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr15 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000560066 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:101842119:101850324:1 gene:ENSG00000214344 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AY792621 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor-like transmembrane 7 protein (GPCRLTM7) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000338912 // ENSEMBL // havana_ig_gene:known chromosome:GRCh38:15:19964666:19965101:-1 gene:ENSG00000188403 gene_biotype:IG_V_gene transcript_biotype:IG_V_gene // chr15 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000045185 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:19944308:19965101:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
ENST00000558565 // ENSEMBL // havana_ig_gene:known chromosome:GRCh38:15:19987656:19988117:-1 gene:ENSG00000259490 gene_biotype:IG_V_gene transcript_biotype:IG_V_gene // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000045188 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:19975543:19991432:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
GENSCAN00000035868 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:20046129:20048318:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000043318 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:21052837:21055026:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000473634 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:21102843:21103138:-1 gene:ENSG00000243059 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000488974 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:22:31059989:31060285:1 gene:ENSG00000240186 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000492309 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:20095733:20096029:-1 gene:ENSG00000239471 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT040573 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT040683 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT084842 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
ENST00000553844 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:20626819:20627365:-1 gene:ENSG00000258707 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr15 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000616872 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:22371736:22373570:1 gene:ENSG00000273679 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr15 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000035873 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:20626819:20627498:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000038157 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR15_3_CTG3:22375624:22376303:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT040649 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONHSAT040822 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000045572 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:22241252:22373570:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 50 // 50 // 8 // 16 // 1
NR_027053 // RefSeq // Homo sapiens p21 protein (Cdc42/Rac)-activated kinase 2 pseudogene (LOC646214), non-coding RNA. // chr15 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000556425 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:21293653:21295201:-1 gene:ENSG00000237161 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr15 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000615005 // ENSEMBL // ensembl:known scaffold:GRCh38:KI270727.1:20741:22392:-1 gene:ENSG00000278673 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr15 // 91 // 100 // 10 // 11 // 0 /// ENST00000615953 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR15_1_CTG1:21293582:21295233:-1 gene:ENSG00000274240 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr15 // 91 // 100 // 10 // 11 // 0 /// GENSCAN00000010122 // ENSEMBL // cdna:genscan scaffold:GRCh38:KI270727.1:20791:22357:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 89 // 82 // 8 // 9 // 0 /// GENSCAN00000042821 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR15_1_CTG1:21293632:21295198:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 89 // 82 // 8 // 9 // 0 /// GENSCAN00000043326 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:21293650:21295216:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0 /// TCONS_l2_00008911-XLOC_l2_004837 // Broad TUCP // linc-POTEB-4 chr15:-:21932496-21938061 // chr15 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
ENST00000363920 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:21866210:21866316:-1 gene:ENSG00000200790 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000459351 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:20855251:20855357:-1 gene:ENSG00000238489 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000612037 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:21428879:21428985:-1 gene:ENSG00000275174 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000613373 // ENSEMBL // ncrna:novel scaffold:GRCh38:KI270727.1:156089:156195:-1 gene:ENSG00000277927 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000622384 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR15_1_CTG1:21428930:21429036:-1 gene:ENSG00000273624 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT040667 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT040705 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NR_002224 // RefSeq // Homo sapiens ADAM metallopeptidase domain 6, pseudogene (ADAM6), non-coding RNA. // chr15 // 30 // 30 // 12 // 40 // 1 /// ENST00000554586 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:21053004:21054702:-1 gene:ENSG00000259025 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr15 // 100 // 55 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000560680 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:20046296:20047994:-1 gene:ENSG00000259769 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr15 // 86 // 55 // 19 // 22 // 0 /// GENSCAN00000043318 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:21052837:21055026:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000033189 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR14_3_CTG1:105970726:105972558:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 43 // 58 // 10 // 23 // 0 /// GENSCAN00000034398 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:105969955:105971787:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 43 // 58 // 10 // 23 // 0 /// GENSCAN00000035868 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:20046129:20048318:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 70 // 70 // 28 // 40 // 1 /// ENST00000606026 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:105969729:105972269:-1 gene:ENSG00000271968 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 30 // 30 // 12 // 40 // 1 /// NONHSAT040451 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 25 // 25 // 10 // 40 // 1
ENST00000558299 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:22030931:22031834:-1 gene:ENSG00000259324 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr15 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
XM_006709982 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens putative V-set and immunoglobulin domain-containing-like protein IGHV4OR15-8-like (LOC642131), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// XM_006726558 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens putative V-set and immunoglobulin domain-containing-like protein IGHV4OR15-8-like (LOC642131), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000557788 // ENSEMBL // ensembl_havana_ig_gene:known chromosome:GRCh38:15:22184967:22185402:-1 gene:ENSG00000259261 gene_biotype:IG_V_gene transcript_biotype:IG_V_gene // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000622410 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:GRCh38:15:21742366:21742799:-1 gene:ENSG00000278263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// TCONS_l2_00008916-XLOC_l2_004840 // Broad TUCP // linc-POTEB-7 chr15:-:22448412-22473375 // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// TCONS_l2_00009483-XLOC_l2_004840 // Broad TUCP // linc-POTEB-7 chr15:-:22472918-22473353 // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_019066 // RefSeq // Homo sapiens MAGE-like 2 (MAGEL2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000532292 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:23643544:23647841:-1 gene:ENSG00000254585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000032968 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:23643993:23647418:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_002487 // RefSeq // Homo sapiens necdin, melanoma antigen (MAGE) family member (NDN), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000331837 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:23685400:23687330:-1 gene:ENSG00000182636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC008750 // GenBank // Homo sapiens necdin homolog (mouse), mRNA (cDNA clone MGC:1697 IMAGE:3347128), complete cds. // chr15 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0 /// U35139 // GenBank // Human NECDIN related protein mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 57 // 13 // 13 // 0
ENST00000383889 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:23777437:23777543:-1 gene:ENSG00000206616 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT040845 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
BC069077 // GenBank // Homo sapiens chromosome 15 open reading frame 49, mRNA (cDNA clone MGC:95352 IMAGE:7216891), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC069090 // GenBank // Homo sapiens chromosome 15 open reading frame 49, mRNA (cDNA clone MGC:95365 IMAGE:7216904), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_024490 // RefSeq // Homo sapiens ATPase, class V, type 10A (ATP10A), mRNA. // chr15 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000356865 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:25677273:25863208:-1 gene:ENSG00000206190 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 83 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000389967 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:25841482:25865170:-1 gene:ENSG00000206190 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 100 // 21 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000555815 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:25677273:25863723:-1 gene:ENSG00000206190 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// AB051358 // GenBank // Homo sapiens ATP10C mRNA for putative aminophospholipid translocase, complete cds. // chr15 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// BC038712 // GenBank // Homo sapiens ATPase, class V, type 10A, mRNA (cDNA clone IMAGE:5271753), complete cds. // chr15 // 100 // 21 // 9 // 9 // 0 /// BC052251 // GenBank // Homo sapiens ATPase, class V, type 10A, mRNA (cDNA clone MGC:59648 IMAGE:6258931), complete cds. // chr15 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// XM_006720619 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ATPase, class V, type 10A (ATP10A), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 31 // 31 // 13 // 42 // 1 /// GENSCAN00000012582 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:25679367:25786428:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 62 // 26 // 26 // 0
ENST00000391302 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:26008940:26009074:-1 gene:ENSG00000212604 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT041163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000363456 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:27280318:27280436:-1 gene:ENSG00000200326 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT041209 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_000275 // RefSeq // Homo sapiens oculocutaneous albinism II (OCA2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000353809 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:15:27754875:28099312:-1 gene:ENSG00000104044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000354638 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:27754875:28099358:-1 gene:ENSG00000104044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000431101 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:28018412:28099293:-1 gene:ENSG00000104044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// BC012097 // GenBank // Homo sapiens oculocutaneous albinism II, mRNA (cDNA clone MGC:20070 IMAGE:4641135), complete cds. // chr15 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// M99564 // GenBank // Homo sapiens (clone DN10mel) P protein mRNA, complete cds. // chr15 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000043229 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:28013880:28081874:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000037912 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR15_4_CTG8:27869676:28081887:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// GENSCAN00000002151 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:27847354:27990710:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
NM_004667 // RefSeq // Homo sapiens HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2 (HERC2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 67 // 67 // 0 /// ENST00000261609 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:28111040:28322152:-1 gene:ENSG00000128731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 67 // 67 // 0 /// ENST00000564734 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:28254488:28322149:-1 gene:ENSG00000128731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 100 // 21 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000566635 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:28111279:28117551:-1 gene:ENSG00000128731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 100 // 15 // 10 // 10 // 0 /// AF071172 // GenBank // Homo sapiens HERC2 (HERC2) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 67 // 67 // 0 /// AL834183 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp547P028 (from clone DKFZp547P028). // chr15 // 100 // 15 // 10 // 10 // 0 /// BC045544 // GenBank // Homo sapiens hect domain and RLD 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:5262032). // chr15 // 100 // 21 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000620983 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR15_4_CTG8:28110459:28116730:-1 gene:ENSG00000276802 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 15 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000037922 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR15_4_CTG8:28110941:28412411:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 76 // 51 // 51 // 0 /// GENSCAN00000043238 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:28111763:28299474:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 84 // 56 // 56 // 0
NM_015307 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 189, member A1 (FAM189A1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000261275 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:29120254:29570723:-1 gene:ENSG00000104059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000560021 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:29123315:29196687:-1 gene:ENSG00000104059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 90 // 64 // 19 // 21 // 0 /// AK295622 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61121 complete cds. // chr15 // 85 // 39 // 11 // 13 // 0 /// BC127817 // GenBank HTC // Homo sapiens KIAA0574 protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:40133693), containing frame-shift errors. // chr15 // 81 // 64 // 17 // 21 // 0 /// ENST00000622117 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR15_4_CTG8:29260594:29720617:-1 gene:ENSG00000273564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 91 // 100 // 30 // 33 // 0 /// GENSCAN00000006880 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR15_4_CTG8:29261388:29383942:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 67 // 67 // 22 // 33 // 1 /// GENSCAN00000013193 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:29118368:29141895:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1
NM_138704 // RefSeq // Homo sapiens necdin-like 2 (NDNL2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000332303 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:29268149:29269829:-1 gene:ENSG00000185115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF490510 // GenBank // Homo sapiens hepatocellular carcinoma-associated protein HCA4 mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// AK074138 // GenBank // Homo sapiens mRNA for FLJ00211 protein. // chr15 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// BC041166 // GenBank // Homo sapiens necdin-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:48906 IMAGE:5730248), complete cds. // chr15 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC053999 // GenBank // Homo sapiens necdin-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:61635 IMAGE:5755143), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000006884 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR15_4_CTG8:29410055:29410969:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000013200 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:29151650:29269705:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
ENST00000391224 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:30956248:30956350:-1 gene:ENSG00000212526 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000614520 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR15_4_CTG8:31107692:31107794:-1 gene:ENSG00000277262 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT041418 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NR_029624 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 211 (MIR211), microRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000384969 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:31065032:31065141:-1 gene:ENSG00000207702 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000612481 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR15_4_CTG8:31216515:31216624:-1 gene:ENSG00000274595 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-211 // miRBase Micro RNA Database // MI0000287 Homo sapiens miR-211 stem-loop // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT041423 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_130901 // RefSeq // Homo sapiens OTU deubiquitinase 7A (OTUD7A), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000307050 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:31475398:31655339:-1 gene:ENSG00000169918 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000015460 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:31483294:31657913:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000045765 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR15_4_CTG8:31634838:31808774:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0
ENST00000384260 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:32426288:32426420:-1 gene:ENSG00000206987 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONHSAT041493 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001103184 // RefSeq // Homo sapiens formin 1 (FMN1), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NM_001277313 // RefSeq // Homo sapiens formin 1 (FMN1), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000334528 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:32765546:33067884:-1 gene:ENSG00000248905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000559047 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:15:32774310:33154914:-1 gene:ENSG00000248905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 87 // 87 // 20 // 23 // 1 /// ENST00000561249 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:15:32774151:33155040:-1 gene:ENSG00000248905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 83 // 83 // 19 // 23 // 1 /// ENST00000616417 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:15:32765545:33194733:-1 gene:ENSG00000248905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// AK127078 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ45135 fis, clone BRAWH3038252. // chr15 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0
NM_001277314 // RefSeq // Homo sapiens formin 1 (FMN1), transcript variant 3, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000320930 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:33149784:33194696:-1 gene:ENSG00000248905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NM_001277313 // RefSeq // Homo sapiens formin 1 (FMN1), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 4 // 4 // 1 /// ENST00000559047 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:15:32774310:33154914:-1 gene:ENSG00000248905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 4 // 4 // 1 /// ENST00000561249 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:15:32774151:33155040:-1 gene:ENSG00000248905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 4 // 4 // 1 /// GENSCAN00000002422 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:33153043:33154914:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000616417 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:15:32765545:33194733:-1 gene:ENSG00000248905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 4 // 4 // 1
NM_020371 // RefSeq // Homo sapiens apoptosis, caspase activation inhibitor (AVEN), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000306730 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:33866227:34039176:-1 gene:ENSG00000169857 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF283508 // GenBank // Homo sapiens cell death regulator aven mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC010488 // GenBank // Homo sapiens apoptosis, caspase activation inhibitor, mRNA (cDNA clone MGC:16897 IMAGE:2900586), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC063533 // GenBank // Homo sapiens apoptosis, caspase activation inhibitor, mRNA (cDNA clone MGC:74954 IMAGE:4425400), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000558136 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:33867773:33885738:-1 gene:ENSG00000169857 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// ENST00000560649 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:33866707:33875994:-1 gene:ENSG00000169857 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000002423 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:33866613:33968502:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONHSAT041558 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr15 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_020154 // RefSeq // Homo sapiens ER membrane protein complex subunit 7 (EMC7), mRNA. // chr15 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000256545 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:34084017:34101948:-1 gene:ENSG00000134153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000527822 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:15:34084330:34101807:-1 gene:ENSG00000134153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000528949 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:34084364:34101807:-1 gene:ENSG00000134153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// AF242729 // GenBank // Homo sapiens HT022 mRNA, complete cds. // chr15 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// AY358445 // GenBank // Homo sapiens clone DNA82340 AAAL905 (UNQ905) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// BC104934 // GenBank // Homo sapiens chromosome 15 open reading frame 24, mRNA (cDNA clone MGC:132594 IMAGE:8143937), complete cds. // chr15 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC104936 // GenBank // Homo sapiens chromosome 15 open reading frame 24, mRNA (cDNA clone MGC:132596 IMAGE:8143939), complete cds. // chr15 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000048896 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:34066060:34101929:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
NM_018648 // RefSeq // Homo sapiens NOP10 ribonucleoprotein (NOP10), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000328848 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:34341713:34343177:-1 gene:ENSG00000182117 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000557912 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:34341719:34343123:-1 gene:ENSG00000182117 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 93 // 75 // 14 // 15 // 0 /// AB043104 // GenBank // Homo sapiens mRNA for Nop10p, complete cds. // chr15 // 95 // 100 // 19 // 20 // 0 /// BC008886 // GenBank // Homo sapiens NOP10 ribonucleoprotein homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:19486 IMAGE:4308721), complete cds. // chr15 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// BC063023 // GenBank // Homo sapiens NOP10 ribonucleoprotein homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:70651 IMAGE:6018963), complete cds. // chr15 // 89 // 90 // 16 // 18 // 0
ENST00000516616 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:34597458:34597558:-1 gene:ENSG00000252425 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT041598 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_020660 // RefSeq // Homo sapiens gap junction protein, delta 2, 36kDa (GJD2), mRNA. // chr15 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000290374 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:34751032:34754965:-1 gene:ENSG00000159248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC069339 // GenBank // Homo sapiens gap junction protein, delta 2, 36kDa, mRNA (cDNA clone MGC:97056 IMAGE:7262267), complete cds. // chr15 // 100 // 59 // 13 // 13 // 0 /// BC112110 // GenBank // Homo sapiens gap junction protein, delta 2, 36kDa, mRNA (cDNA clone MGC:138315 IMAGE:8327578), complete cds. // chr15 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// BC112114 // GenBank // Homo sapiens gap junction protein, delta 2, 36kDa, mRNA (cDNA clone MGC:138319 IMAGE:8327582), complete cds. // chr15 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// BC143788 // GenBank // Homo sapiens gap junction protein, delta 2, 36kDa, mRNA (cDNA clone MGC:177319 IMAGE:9052302), complete cds. // chr15 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000048884 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:34752478:34754488:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 59 // 13 // 13 // 0
NM_005159 // RefSeq // Homo sapiens actin, alpha, cardiac muscle 1 (ACTC1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000290378 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:34788096:34796139:-1 gene:ENSG00000159251 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000557860 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:34791158:34792851:-1 gene:ENSG00000159251 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 90 // 37 // 9 // 10 // 0 /// AK290616 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78096 complete cds, highly similar to Homo sapiens actin, alpha, cardiac muscle (ACTC), mRNA. // chr15 // 92 // 93 // 23 // 25 // 0 /// BC009978 // GenBank // Homo sapiens actin, alpha, cardiac muscle 1, mRNA (cDNA clone MGC:16637 IMAGE:4121697), complete cds. // chr15 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// CR541795 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834A0631D for gene ACTC, actin, alpha, cardiac muscle; complete cds, without stopcodon. // chr15 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000048894 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:34790412:34839665:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 89 // 89 // 24 // 27 // 1
NM_014691 // RefSeq // Homo sapiens aquarius intron-binding spliceosomal factor (AQR), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000156471 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:34851782:34969839:-1 gene:ENSG00000021776 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000543879 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:34856351:34969733:-1 gene:ENSG00000021776 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// AK291615 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75449 complete cds, highly similar to Homo sapiens aquarius homolog (mouse) (AQR), mRNA. // chr15 // 97 // 95 // 36 // 37 // 0 /// BC036913 // GenBank // Homo sapiens aquarius homolog (mouse), mRNA (cDNA clone IMAGE:5109629), partial cds. // chr15 // 100 // 28 // 11 // 11 // 0 /// BC127111 // GenBank // Homo sapiens aquarius homolog (mouse), mRNA (cDNA clone MGC:150700 IMAGE:40124830), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// BC127112 // GenBank // Homo sapiens aquarius homolog (mouse), mRNA (cDNA clone MGC:150701 IMAGE:40124831), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// BX647820 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686D1186 (from clone DKFZp686D1186). // chr15 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000048889 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:34856792:34983332:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 72 // 28 // 28 // 0
NM_014106 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 770 (ZNF770), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000356321 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:34978341:34988287:-1 gene:ENSG00000198146 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK291438 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77553 complete cds. // chr15 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// BC071603 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 770, mRNA (cDNA clone MGC:87579 IMAGE:30340520), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000048889 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:34856792:34983332:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_080650 // RefSeq // Homo sapiens diphthamine biosynthesis 6 (DPH6), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000256538 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:35370882:35546168:-1 gene:ENSG00000134146 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000558266 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:35372107:35454760:-1 gene:ENSG00000134146 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 52 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000559784 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:35381835:35542491:-1 gene:ENSG00000134146 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 91 // 48 // 10 // 11 // 0 /// ENST00000561411 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:35381832:35546165:-1 gene:ENSG00000134146 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 43 // 10 // 10 // 0 /// AK094007 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ36688 fis, clone UTERU2008302. // chr15 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// BC066652 // GenBank // Homo sapiens ATP binding domain 4, mRNA (cDNA clone MGC:74761 IMAGE:6066017), complete cds. // chr15 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// XM_005254751 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens diphthamine biosynthesis 6 (DPH6), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 65 // 65 // 15 // 23 // 1 /// GENSCAN00000045840 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:35429864:35660468:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 39 // 39 // 9 // 23 // 1
NR_027320 // RefSeq // Homo sapiens casein kinase 1, alpha 1 pseudogene 1 (CSNK1A1P1), non-coding RNA. // chr15 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000430593 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:36798596:36818459:-1 gene:ENSG00000223518 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC066972 // GenBank // Homo sapiens similar to casein kinase I alpha, mRNA (cDNA clone IMAGE:4829576). // chr15 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// NONHSAT041664 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// NONHSAT041665 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT041666 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0
ENST00000383949 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:37050828:37050930:-1 gene:ENSG00000206676 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT041684 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_152597 // RefSeq // Homo sapiens fibrous sheath interacting protein 1 (FSIP1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_005254209 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens fibrous sheath interacting protein 1 (FSIP1), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000350221 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:39600031:39782830:-1 gene:ENSG00000150667 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC045191 // GenBank // Homo sapiens fibrous sheath interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:44442 IMAGE:5297527), complete cds. // chr15 // 89 // 100 // 32 // 36 // 0 /// GENSCAN00000003534 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:39682450:39772285:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 56 // 20 // 20 // 0
NM_003134 // RefSeq // Homo sapiens signal recognition particle 14kDa (homologous Alu RNA binding protein) (SRP14), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NR_104021 // RefSeq // Homo sapiens signal recognition particle 14kDa (homologous Alu RNA binding protein) (SRP14), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr15 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000267884 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:40035739:40039188:-1 gene:ENSG00000140319 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000558527 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:40036041:40039164:-1 gene:ENSG00000140319 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0 /// ENST00000560773 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:40036243:40039156:-1 gene:ENSG00000140319 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0 /// AB061546 // GenBank // Homo sapiens SRP14 mRNA for signal recognition particle 14kD, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC035495 // GenBank // Homo sapiens signal recognition particle 14kDa (homologous Alu RNA binding protein), mRNA (cDNA clone MGC:14326 IMAGE:4298087), complete cds. // chr15 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0 /// BC071716 // GenBank // Homo sapiens signal recognition particle 14kDa (homologous Alu RNA binding protein), mRNA (cDNA clone MGC:88011 IMAGE:4476669), complete cds. // chr15 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0 /// BC100031 // GenBank // Homo sapiens signal recognition particle 14kDa (homologous Alu RNA binding protein), mRNA (cDNA clone MGC:111680 IMAGE:2847600), complete cds. // chr15 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0 /// U07857 // GenBank // Human 18 kDa Alu RNA binding protein mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0
NM_001003940 // RefSeq // Homo sapiens Bcl2 modifying factor (BMF), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// NM_001003942 // RefSeq // Homo sapiens Bcl2 modifying factor (BMF), transcript variant 3, mRNA. // chr15 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// NM_001003943 // RefSeq // Homo sapiens Bcl2 modifying factor (BMF), transcript variant 4, mRNA. // chr15 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// NM_033503 // RefSeq // Homo sapiens Bcl2 modifying factor (BMF), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000354670 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:40087890:40108874:-1 gene:ENSG00000104081 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000397573 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:40087893:40106448:-1 gene:ENSG00000104081 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000561282 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:40091718:40106422:-1 gene:ENSG00000104081 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// BC069328 // GenBank // Homo sapiens Bcl2 modifying factor, mRNA (cDNA clone MGC:96952 IMAGE:7262161), complete cds. // chr15 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// BC069505 // GenBank // Homo sapiens Bcl2 modifying factor, mRNA (cDNA clone MGC:96964 IMAGE:7262173), complete cds. // chr15 // 89 // 26 // 8 // 9 // 0 /// BC070043 // GenBank // Homo sapiens Bcl2 modifying factor, mRNA (cDNA clone MGC:87085 IMAGE:30344794), complete cds. // chr15 // 90 // 91 // 28 // 31 // 0 /// GENSCAN00000015114 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:40036333:40110309:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1
ENST00000559747 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:40133768:40135214:-1 gene:ENSG00000259239 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr15 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT041812 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
ENST00000559747 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:40133768:40135214:-1 gene:ENSG00000259239 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT041812 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001039905 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 15 open reading frame 56 (C15orf56), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000319503 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:40250664:40252910:-1 gene:ENSG00000176753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000559727 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:40251776:40252969:-1 gene:ENSG00000176753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC171826 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:9054480. // chr15 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NONHSAT041860 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_133639 // RefSeq // Homo sapiens ras homolog family member V (RHOV), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000220507 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:40872214:40874289:-1 gene:ENSG00000104140 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB079131 // GenBank // Homo sapiens ARHV mRNA for WRCH1-related GTPase, complete cds. // chr15 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// AY059636 // GenBank // Homo sapiens Rho family GTPase Chp mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// BC019353 // GenBank // Homo sapiens ras homolog gene family, member V, mRNA (cDNA clone IMAGE:3943661), partial cds. // chr15 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// BC105020 // GenBank // Homo sapiens ras homolog gene family, member V, mRNA (cDNA clone MGC:132680 IMAGE:8144023), complete cds. // chr15 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC105022 // GenBank // Homo sapiens ras homolog gene family, member V, mRNA (cDNA clone MGC:132682 IMAGE:8144025), complete cds. // chr15 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC112945 // GenBank // Homo sapiens ras homolog gene family, member V, mRNA (cDNA clone MGC:131965 IMAGE:5111021), complete cds. // chr15 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015122 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:40873058:40874139:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
NM_017553 // RefSeq // Homo sapiens INO80 complex subunit (INO80), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// NR_104038 // RefSeq // Homo sapiens INO80 complex subunit (INO80), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr15 // 100 // 98 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000361937 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:40978880:41116354:-1 gene:ENSG00000128908 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENST00000401393 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:15:40978893:41116153:-1 gene:ENSG00000128908 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 93 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000558357 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:40979466:41116132:-1 gene:ENSG00000128908 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 98 // 93 // 41 // 42 // 0 /// BC146785 // GenBank // Homo sapiens INO80 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:166871 IMAGE:9007241), complete cds. // chr15 // 100 // 93 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000616814 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:15:40980223:41116132:-1 gene:ENSG00000128908 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 78 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000046198 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:40997529:41154713:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 58 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000015110 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:40957543:40987974:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 20 // 20 // 9 // 45 // 1 /// BX640651 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686N224 (from clone DKFZp686N224). // chr15 // 24 // 24 // 11 // 45 // 1
NM_001286441 // RefSeq // Homo sapiens exonuclease 3-5 domain containing 1 (EXD1), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_152596 // RefSeq // Homo sapiens exonuclease 3-5 domain containing 1 (EXD1), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000314992 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:41182725:41230697:-1 gene:ENSG00000178997 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000458580 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:15:41183739:41230691:-1 gene:ENSG00000178997 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000558881 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:41182735:41190370:-1 gene:ENSG00000178997 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// AK123414 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ41420 fis, clone BRHIP2002346. // chr15 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// AK292524 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76451 complete cds. // chr15 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AK302864 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55584 complete cds. // chr15 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC030628 // GenBank // Homo sapiens exonuclease 3-5 domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:33637 IMAGE:4827307), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000046206 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:41184034:41216764:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0
ENST00000476341 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:41191965:41192265:-1 gene:ENSG00000240847 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT041916 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_007280 // RefSeq // Homo sapiens Opa interacting protein 5 (OIP5), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000220514 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:41309268:41332621:-1 gene:ENSG00000104147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000560640 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:15:41309762:41332487:-1 gene:ENSG00000104147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 94 // 53 // 16 // 17 // 0 /// BC015050 // GenBank // Homo sapiens Opa interacting protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:9610 IMAGE:3908972), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
ENST00000363537 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:41448742:41448844:-1 gene:ENSG00000200407 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT041945 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_015540 // RefSeq // Homo sapiens RNA polymerase II associated protein 1 (RPAP1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_005254297 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens RNA polymerase II associated protein 1 (RPAP1), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000304330 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:41517176:41544259:-1 gene:ENSG00000103932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000561603 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:41517176:41544257:-1 gene:ENSG00000103932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000562303 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:41517179:41544245:-1 gene:ENSG00000103932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AB037824 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1403 protein, partial cds. // chr15 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// BC000246 // GenBank // Homo sapiens RNA polymerase II associated protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:858 IMAGE:3357380), complete cds. // chr15 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// GENSCAN00000046207 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:41503996:41537125:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 78 // 78 // 25 // 32 // 1
NM_016642 // RefSeq // Homo sapiens spectrin, beta, non-erythrocytic 5 (SPTBN5), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 85 // 85 // 0 /// ENST00000320955 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:41848144:41894077:-1 gene:ENSG00000137877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 85 // 85 // 0 /// AF233523 // GenBank // Homo sapiens beta V spectrin (BSPECV) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 85 // 85 // 0 /// GENSCAN00000046200 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:41849908:41896870:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 99 // 94 // 79 // 80 // 0
NM_139265 // RefSeq // Homo sapiens EH-domain containing 4 (EHD4), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000220325 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:41895939:41972578:-1 gene:ENSG00000103966 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF323924 // GenBank // Homo sapiens hepatocellular carcinoma-associated protein HCA11 mRNA, complete cds. // chr15 // 93 // 91 // 28 // 30 // 0 /// AF454953 // GenBank // Homo sapiens EH domain-containing protein-4 mRNA, complete cds. // chr15 // 97 // 97 // 31 // 32 // 0 /// AK292634 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77391 complete cds, highly similar to Homo sapiens EH-domain containing 4 (EHD4), mRNA. // chr15 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// BC006287 // GenBank // Homo sapiens EH-domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:10536 IMAGE:3958645), complete cds. // chr15 // 94 // 97 // 30 // 32 // 0 /// BC051823 // GenBank // Homo sapiens EH-domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:60080 IMAGE:4944876), complete cds. // chr15 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// ENST00000569223 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:41941604:41972552:-1 gene:ENSG00000103966 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1 /// AK074621 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ90140 fis, clone HEMBB1001048. // chr15 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1 /// ENST00000612090 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:15:41900337:41972545:-1 gene:ENSG00000103966 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000046197 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:41900645:41972494:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0
NM_001206670 // RefSeq // Homo sapiens phospholipase A2, group IVE (PLA2G4E), mRNA. // chr15 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000399518 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:15:41981582:42051190:-1 gene:ENSG00000188089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000547930 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:41981584:41997522:-1 gene:ENSG00000188089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AK127558 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ45651 fis, clone CTONG2010330, weakly similar to Homo sapiens phospholipase A2, group IVB (cytosolic) (PLA2G4B). // chr15 // 92 // 100 // 33 // 36 // 0 /// ENST00000551073 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:41986878:41990202:-1 gene:ENSG00000188089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1 /// GENSCAN00000046199 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:41983754:41995496:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0
ENST00000560932 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:42067009:42071878:-1 gene:ENSG00000159337 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// BC034571 // GenBank // Homo sapiens phospholipase A2, group IVD (cytosolic), mRNA (cDNA clone IMAGE:5167964), complete cds. // chr15 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// NM_178034 // RefSeq // Homo sapiens phospholipase A2, group IVD (cytosolic) (PLA2G4D), mRNA. // chr15 // 89 // 89 // 24 // 27 // 1 /// ENST00000290472 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:42067683:42094554:-1 gene:ENSG00000159337 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 89 // 89 // 24 // 27 // 1 /// AB090876 // GenBank // Homo sapiens cPLA2 delta mRNA for cytosolic phospholipase A2 delta, complete cds. // chr15 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// GENSCAN00000002534 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:42068715:42208153:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1
NM_015289 // RefSeq // Homo sapiens vacuolar protein sorting 39 homolog (S. cerevisiae) (VPS39), mRNA. // chr15 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000318006 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:42158701:42208316:-1 gene:ENSG00000166887 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000348544 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:42160754:42208153:-1 gene:ENSG00000166887 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000562258 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:42158716:42166219:-1 gene:ENSG00000166887 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 100 // 39 // 14 // 14 // 0 /// AF280814 // GenBank // Homo sapiens Vam6/Vps39-like protein mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// AF281052 // GenBank // Homo sapiens VPS39 mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// AK128403 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ46546 fis, clone THYMU3038214, highly similar to Vam6/Vps39-like protein. // chr15 // 93 // 39 // 13 // 14 // 0 /// BC068559 // GenBank // Homo sapiens vacuolar protein sorting 39 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:87483 IMAGE:5295166), complete cds. // chr15 // 97 // 92 // 32 // 33 // 0 /// BX537404 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686A2451 (from clone DKFZp686A2451); complete cds. // chr15 // 97 // 97 // 34 // 35 // 0 /// GENSCAN00000002534 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:42068715:42208153:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 75 // 75 // 27 // 36 // 1
NM_153260 // RefSeq // Homo sapiens leucine rich repeat containing 57 (LRRC57), mRNA. // chr15 // 97 // 86 // 29 // 30 // 0 /// ENST00000323443 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:42537820:42548802:-1 gene:ENSG00000180979 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000563454 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:42542524:42548772:-1 gene:ENSG00000180979 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 97 // 91 // 31 // 32 // 0 /// AK094891 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ37572 fis, clone BRCOC2002751, weakly similar to RAS SUPPRESSOR PROTEIN 1. // chr15 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// BC058935 // GenBank // Homo sapiens leucine rich repeat containing 57, mRNA (cDNA clone MGC:65177 IMAGE:5578024), complete cds. // chr15 // 93 // 80 // 26 // 28 // 0 /// ENST00000397130 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:42542522:42548773:-1 gene:ENSG00000180979 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 83 // 83 // 29 // 35 // 1 /// ENST00000569830 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:42544043:42548793:-1 gene:ENSG00000180979 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 66 // 66 // 23 // 35 // 1 /// AK309861 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99902. // chr15 // 66 // 66 // 23 // 35 // 1 /// ENST00000562868 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:42543967:42545449:-1 gene:ENSG00000180979 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1 /// ENST00000570160 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:42547308:42548793:-1 gene:ENSG00000180979 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 37 // 37 // 13 // 35 // 1 /// NONHSAT042019 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr15 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1
NONHSAT042025 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_138477 // RefSeq // Homo sapiens codanin 1 (CDAN1), mRNA. // chr15 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// ENST00000356231 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:42723562:42737126:-1 gene:ENSG00000140326 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// ENST00000562465 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:42723559:42730764:-1 gene:ENSG00000140326 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 100 // 42 // 19 // 19 // 0 /// BC066640 // GenBank // Homo sapiens congenital dyserythropoietic anemia, type I, mRNA (cDNA clone MGC:71365 IMAGE:6577335), complete cds. // chr15 // 100 // 93 // 42 // 42 // 0 /// AY358467 // GenBank // Homo sapiens clone DNA59218 CDAN1 (UNQ664) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 42 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000002544 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:42724491:42802406:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 80 // 80 // 36 // 45 // 1
NM_052955 // RefSeq // Homo sapiens transglutaminase 7 (TGM7), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000452443 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:43276280:43302255:-1 gene:ENSG00000159495 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF363393 // GenBank // Homo sapiens transglutaminase Z (TGM7) mRNA, complete cds. // chr15 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000000807 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:43276455:43330489:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0
NM_014793 // RefSeq // Homo sapiens leucine carboxyl methyltransferase 2 (LCMT2), mRNA. // chr15 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000305641 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:43323649:43330605:-1 gene:ENSG00000168806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// AK292587 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76457 complete cds, highly similar to Homo sapiens leucine carboxyl methyltransferase 2 (LCMT2), mRNA. // chr15 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// BC015949 // GenBank // Homo sapiens leucine carboxyl methyltransferase 2, mRNA (cDNA clone MGC:9534 IMAGE:3922888), complete cds. // chr15 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000567039 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:43328286:43330582:-1 gene:ENSG00000168806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 61 // 61 // 20 // 33 // 1 /// AK300820 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51321 complete cds, highly similar to Leucine carboxyl methyltransferase 2 (EC 2.1.1.-). // chr15 // 61 // 61 // 20 // 33 // 1 /// AB011119 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA0547 protein, partial cds. // chr15 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000000807 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:43276455:43330489:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1
ENST00000468140 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:43391384:43391727:-1 gene:ENSG00000243871 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT042071 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
ENST00000383862 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:43734179:43734285:-1 gene:ENSG00000206589 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// ENST00000384264 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:43637632:43637738:-1 gene:ENSG00000206991 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// NONHSAT042102 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// NONHSAT042111 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0
NR_002318 // RefSeq // Homo sapiens cation channel, sperm associated 2 pseudogene 1 (CATSPER2P1), non-coding RNA. // chr15 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000381680 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:43735934:43746302:-1 gene:ENSG00000205771 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000416302 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:43736798:43746285:-1 gene:ENSG00000205771 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 100 // 73 // 8 // 8 // 0 /// NONHSAT042112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONHSAT042113 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 73 // 8 // 8 // 0 /// NONHSAT042115 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 91 // 10 // 10 // 0 /// NONHSAT042116 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 91 // 10 // 10 // 0
NM_005926 // RefSeq // Homo sapiens microfibrillar-associated protein 1 (MFAP1), mRNA. // chr15 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000267812 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:43804492:43824802:-1 gene:ENSG00000140259 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000484386 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:43804906:43810132:-1 gene:ENSG00000140259 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 100 // 32 // 12 // 12 // 0 /// BC023557 // GenBank // Homo sapiens microfibrillar-associated protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:19542 IMAGE:4139958), complete cds. // chr15 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// BC050742 // GenBank // Homo sapiens microfibrillar-associated protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:60394 IMAGE:6200464), complete cds. // chr15 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// U04209 // GenBank // Human associated microfibrillar protein mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000000821 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:43805094:43824806:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 73 // 27 // 27 // 0
ENST00000363521 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:43863893:43864005:-1 gene:ENSG00000200391 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT042134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000418351 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:43989061:43990184:-1 gene:ENSG00000185607 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr15 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000000814 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:43989061:43990184:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// HM358952 // GenBank HTC // Homo sapiens clone Hep3-10 actin-like mRNA, partial sequence. // chr15 // 78 // 82 // 7 // 9 // 0
NR_034170 // RefSeq // Homo sapiens EIF3J antisense RNA 1 (head to head) (EIF3J-AS1), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr15 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NR_034171 // RefSeq // Homo sapiens EIF3J antisense RNA 1 (head to head) (EIF3J-AS1), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr15 // 100 // 42 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000313807 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:44533493:44536923:-1 gene:ENSG00000179523 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr15 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000560049 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:44535252:44536900:-1 gene:ENSG00000179523 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr15 // 100 // 29 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000560750 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:44527257:44536640:-1 gene:ENSG00000179523 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr15 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// AK092547 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ35228 fis, clone PROST2001283. // chr15 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// BC026043 // GenBank // Homo sapiens hypothetical LOC645212, mRNA (cDNA clone IMAGE:4592052), partial cds. // chr15 // 74 // 74 // 23 // 31 // 1 /// NONHSAT042160 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT042161 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONHSAT042162 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT042163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 42 // 13 // 13 // 0 /// NONHSAT042166 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000031684 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:44536182:44537691:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1
ENST00000384230 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:44697333:44697430:-1 gene:ENSG00000206957 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000384660 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR15_3_CTG8:44697333:44697430:-1 gene:ENSG00000207390 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT042179 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000516308 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:44927600:44927703:-1 gene:ENSG00000252117 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT042203 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
ENST00000391248 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:45002864:45003028:-1 gene:ENSG00000212550 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 94 // 100 // 17 // 18 // 0 /// ENST00000391122 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:44884616:44884780:1 gene:ENSG00000212424 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 56 // 100 // 10 // 18 // 0 /// NONHSAT042207 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 94 // 100 // 17 // 18 // 0 /// ENST00000619058 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR15_3_CTG8:44893143:44893307:1 gene:ENSG00000273636 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 56 // 100 // 10 // 18 // 0 /// NONHSAT042200 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 56 // 100 // 10 // 18 // 0
ENST00000516362 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:45047103:45047215:-1 gene:ENSG00000252171 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONHSAT042211 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_014080 // RefSeq // Homo sapiens dual oxidase 2 (DUOX2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000389039 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:45092650:45114344:-1 gene:ENSG00000140279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000603300 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:15:45092655:45114161:-1 gene:ENSG00000140279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF181972 // GenBank // Homo sapiens NADH/NADPH thyroid oxidase p138-tox mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// AF230496 // GenBank // Homo sapiens NADPH thyroid oxidase 2 (THOX2) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF267981 // GenBank // Homo sapiens putative NADPH oxidase/peroxidase DUOX2 mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000558383 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:45099029:45113454:-1 gene:ENSG00000140279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 72 // 72 // 23 // 32 // 1 /// AB209010 // GenBank // Homo sapiens mRNA for dual oxidase 2 precursor variant protein. // chr15 // 72 // 72 // 23 // 32 // 1 /// GENSCAN00000026427 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:45094150:45113411:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0
ENST00000560007 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:45321077:45321692:-1 gene:ENSG00000235390 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000026425 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:45321114:45321386:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT042234 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT140237 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000459154 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:45354779:45354885:-1 gene:ENSG00000238941 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// NONHSAT042236 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0
ENST00000516961 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:12:68911921:68911982:1 gene:ENSG00000252770 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 67 // 100 // 4 // 6 // 0 /// NONHSAT042251 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// NONHSAT029348 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 67 // 100 // 4 // 6 // 0
NM_013309 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 30 (zinc transporter), member 4 (SLC30A4), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000261867 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:45479611:45522807:-1 gene:ENSG00000104154 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF025409 // GenBank // Homo sapiens zinc transporter 4 (ZNT4) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// AK290874 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75265 complete cds, highly similar to Homo sapiens solute carrier family 30 (zinc transporter), member 4(SLC30A4), mRNA. // chr15 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// BC026089 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 30 (zinc transporter), member 4, mRNA (cDNA clone MGC:27012 IMAGE:4829839), complete cds. // chr15 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000026426 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:45468609:45522354:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0
NONHSAT042261 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000411376 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:46720193:46720512:-1 gene:ENSG00000223308 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT042291 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000365672 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:48325558:48325671:-1 gene:ENSG00000202542 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT042340 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_000138 // RefSeq // Homo sapiens fibrillin 1 (FBN1), mRNA. // chr15 // 100 // 92 // 71 // 71 // 0 /// ENST00000316623 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:48408306:48645849:-1 gene:ENSG00000166147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 92 // 71 // 71 // 0 /// ENST00000537463 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:48430764:48645709:-1 gene:ENSG00000166147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 100 // 39 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000559133 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:48410074:48467991:-1 gene:ENSG00000166147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 100 // 42 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000560355 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:48640989:48645721:-1 gene:ENSG00000166147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 10 // 8 // 8 // 0 /// BC094721 // GenBank HTC // Homo sapiens fibrillin 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:30528010), with apparent retained intron. // chr15 // 100 // 10 // 8 // 8 // 0 /// BC146854 // GenBank // Homo sapiens fibrillin 1, mRNA (cDNA clone MGC:181957 IMAGE:9056782), complete cds. // chr15 // 97 // 90 // 67 // 69 // 0 /// L13923 // GenBank // Homo sapiens fibrillin mRNA, complete cds. // chr15 // 99 // 90 // 68 // 69 // 0 /// GENSCAN00000024991 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:48410990:48613087:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 77 // 59 // 59 // 0
NM_001194998 // RefSeq // Homo sapiens centrosomal protein 152kDa (CEP152), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NM_014985 // RefSeq // Homo sapiens centrosomal protein 152kDa (CEP152), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000325747 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:48740506:48811030:-1 gene:ENSG00000103995 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000380950 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:48737935:48811141:-1 gene:ENSG00000103995 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000399334 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:48738151:48810987:-1 gene:ENSG00000103995 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000560322 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:48772515:48811146:-1 gene:ENSG00000103995 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:non_stop_decay // chr15 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// AB020719 // GenBank // Homo sapiens KIAA0912 mRNA for KIAA0912 protein, partial cds. // chr15 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// AK303805 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54319 complete cds, highly similar to Centrosomal protein of 152 kDa. // chr15 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// BC117182 // GenBank // Homo sapiens centrosomal protein 152kDa, mRNA (cDNA clone MGC:150791 IMAGE:40125733), complete cds. // chr15 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// BX648822 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686C15165 (from clone DKFZp686C15165). // chr15 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000024982 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:48738249:48869903:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0
NM_001193489 // RefSeq // Homo sapiens SECIS binding protein 2-like (SECISBP2L), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_014701 // RefSeq // Homo sapiens SECIS binding protein 2-like (SECISBP2L), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000261847 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:48988770:49046433:-1 gene:ENSG00000138593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000380927 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:48996384:49046446:-1 gene:ENSG00000138593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000559424 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:15:49016947:49046447:-1 gene:ENSG00000138593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 89 // 33 // 8 // 9 // 0 /// ENST00000559471 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:48988638:49046563:-1 gene:ENSG00000138593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC033001 // GenBank // Homo sapiens SECIS binding protein 2-like, mRNA (cDNA clone MGC:26224 IMAGE:4825784), complete cds. // chr15 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000015407 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:48996367:49155578:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1
ENST00000384377 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:48995912:48996022:-1 gene:ENSG00000207105 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT042361 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000584532 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:49042341:49042643:-1 gene:ENSG00000265942 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT042366 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000490342 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:49198900:49199194:-1 gene:ENSG00000243338 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT042376 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000461517 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:50244628:50244931:-1 gene:ENSG00000241175 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT042401 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000607728 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:50347423:50347529:-1 gene:ENSG00000271819 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_203494 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 50 (USP50), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000532404 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:50500562:50546699:-1 gene:ENSG00000170236 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000559105 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:50500799:50546666:-1 gene:ENSG00000170236 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 61 // 61 // 20 // 33 // 1 /// ENST00000529349 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:50513410:50538836:-1 gene:ENSG00000170236 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// ENST00000530218 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:50500886:50546708:-1 gene:ENSG00000170236 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 39 // 39 // 13 // 33 // 1 /// ENST00000616326 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:15:50500562:50546705:-1 gene:ENSG00000170236 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000024685 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:50500769:50762028:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// NONHSAT042425 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr15 // 39 // 39 // 13 // 33 // 1
NM_017672 // RefSeq // Homo sapiens transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 7 (TRPM7), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 50 // 50 // 0 /// ENST00000313478 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:50557158:50686815:-1 gene:ENSG00000092439 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 50 // 50 // 0 /// ENST00000560955 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:15:50560293:50686771:-1 gene:ENSG00000092439 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 50 // 50 // 0 /// ENST00000561443 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:50561640:50582469:-1 gene:ENSG00000092439 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 91 // 22 // 10 // 11 // 0 /// AF346629 // GenBank // Homo sapiens channel-kinase 1 (CHAK1) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 98 // 49 // 49 // 0 /// AK098584 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ25718 fis, clone TST05334, highly similar to Mus musculus transient receptor potential-related protein (ChaK) mRNA. // chr15 // 91 // 22 // 10 // 11 // 0 /// AY032950 // GenBank // Homo sapiens LTRPC7 (LTRPC7) mRNA, complete cds. // chr15 // 98 // 100 // 49 // 50 // 0 /// ENST00000560638 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:50603947:50624216:-1 gene:ENSG00000092439 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 24 // 24 // 12 // 50 // 1 /// BC051024 // GenBank // Homo sapiens transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 7, mRNA (cDNA clone IMAGE:4444986), partial cds. // chr15 // 24 // 24 // 12 // 50 // 1 /// GENSCAN00000024685 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:50500769:50762028:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 64 // 64 // 32 // 50 // 1
NM_032802 // RefSeq // Homo sapiens signal peptide peptidase like 2A (SPPL2A), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000261854 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:50702266:50765808:-1 gene:ENSG00000138600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000558934 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:15:50707448:50747531:-1 gene:ENSG00000138600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 74 // 14 // 14 // 0 /// AY169314 // GenBank // Homo sapiens intramembrane protease (IMP3) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC025740 // GenBank // Homo sapiens signal peptide peptidase-like 2A, mRNA (cDNA clone MGC:34080 IMAGE:5223715), complete cds. // chr15 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000559527 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:50725916:50747508:-1 gene:ENSG00000138600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 42 // 42 // 8 // 19 // 1 /// NONHSAT042434 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr15 // 42 // 42 // 8 // 19 // 1
NM_207381 // RefSeq // Homo sapiens tumor necrosis factor, alpha-induced protein 8-like 3 (TNFAIP8L3), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006720500 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens tumor necrosis factor, alpha-induced protein 8-like 3 (TNFAIP8L3), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000327536 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:51056598:51105276:-1 gene:ENSG00000183578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC127701 // GenBank // Homo sapiens tumor necrosis factor, alpha-induced protein 8-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:157795 IMAGE:40127272), complete cds. // chr15 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// BC127702 // GenBank // Homo sapiens tumor necrosis factor, alpha-induced protein 8-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:157796 IMAGE:40127273), complete cds. // chr15 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000042319 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:51057881:51105176:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0
NM_001174116 // RefSeq // Homo sapiens Dmx-like 2 (DMXL2), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 57 // 57 // 0 /// NM_015263 // RefSeq // Homo sapiens Dmx-like 2 (DMXL2), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 57 // 57 // 0 /// XM_005254257 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens Dmx-like 2 (DMXL2), transcript variant X3, mRNA. // chr15 // 100 // 77 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000251076 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:51447711:51622833:-1 gene:ENSG00000104093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 57 // 57 // 0 /// ENST00000543779 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:51447788:51622635:-1 gene:ENSG00000104093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 98 // 56 // 56 // 0 /// ENST00000560891 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:15:51447776:51481479:-1 gene:ENSG00000104093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 44 // 25 // 25 // 0 /// AF389880 // GenBank // Homo sapiens rabconnectin mRNA, complete cds. // chr15 // 98 // 100 // 56 // 57 // 0 /// BC144539 // GenBank // Homo sapiens Dmx-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:178083 IMAGE:9053066), complete cds. // chr15 // 98 // 98 // 55 // 56 // 0 /// NM_001174117 // RefSeq // Homo sapiens Dmx-like 2 (DMXL2), transcript variant 3, mRNA. // chr15 // 91 // 91 // 52 // 57 // 1 /// ENST00000449909 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:51448812:51622635:-1 gene:ENSG00000104093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 89 // 89 // 51 // 57 // 1 /// BC140781 // GenBank // Homo sapiens Dmx-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:176458 IMAGE:9021649), complete cds. // chr15 // 89 // 89 // 51 // 57 // 1 /// GENSCAN00000042335 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:51448984:51622545:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 77 // 44 // 44 // 0
NM_153374 // RefSeq // Homo sapiens LysM, putative peptidoglycan-binding, domain containing 2 (LYSMD2), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000267838 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:51723011:51738137:-1 gene:ENSG00000140280 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// AY125955 // GenBank // Homo sapiens putative peptidoglycan binding domain protein-like protein mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// BC022075 // GenBank // Homo sapiens LysM, putative peptidoglycan-binding, domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:33320 IMAGE:4799858), complete cds. // chr15 // 100 // 39 // 9 // 9 // 0 /// BC033515 // GenBank // Homo sapiens LysM, putative peptidoglycan-binding, domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:35274 IMAGE:5175226), complete cds. // chr15 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// NM_001143917 // RefSeq // Homo sapiens LysM, putative peptidoglycan-binding, domain containing 2 (LYSMD2), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1 /// ENST00000454181 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:51723069:51751585:-1 gene:ENSG00000140280 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 43 // 43 // 10 // 23 // 1 /// ENST00000560491 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:51723238:51738121:-1 gene:ENSG00000140280 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 39 // 39 // 9 // 23 // 1 /// GENSCAN00000042311 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:51721197:51751352:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 92 // 57 // 12 // 13 // 0
NM_001286430 // RefSeq // Homo sapiens Leo1, Paf1/RNA polymerase II complex component, homolog (S. cerevisiae) (LEO1), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NM_138792 // RefSeq // Homo sapiens Leo1, Paf1/RNA polymerase II complex component, homolog (S. cerevisiae) (LEO1), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000299601 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:51938025:51971806:-1 gene:ENSG00000166477 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000315141 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:51938027:51971776:-1 gene:ENSG00000166477 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// AY302186 // GenBank // Homo sapiens replicative senescence downregulated leo1-like protein mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC018147 // GenBank // Homo sapiens Leo1, Paf1/RNA polymerase II complex component, homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:9690 IMAGE:3847809), complete cds. // chr15 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AK297972 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60738 complete cds, highly similar to RNA polymerase-associated protein LEO1. // chr15 // 96 // 96 // 26 // 27 // 1 /// GENSCAN00000042317 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:51938156:51971745:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
NM_020396 // RefSeq // Homo sapiens BCL2-like 10 (apoptosis facilitator) (BCL2L10), mRNA. // chr15 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000260442 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:52109263:52112775:-1 gene:ENSG00000137875 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000561198 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:52109750:52112768:-1 gene:ENSG00000137875 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// AF285092 // GenBank // Homo sapiens Bcl-2-like protein 10 mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// AF326964 // GenBank // Homo sapiens BCLB (BCLB) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// BC093826 // GenBank // Homo sapiens BCL2-like 10 (apoptosis facilitator), mRNA (cDNA clone MGC:120861 IMAGE:7939671), complete cds. // chr15 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// BC093828 // GenBank // Homo sapiens BCL2-like 10 (apoptosis facilitator), mRNA (cDNA clone MGC:120863 IMAGE:7939673), complete cds. // chr15 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// BC104442 // GenBank // Homo sapiens BCL2-like 10 (apoptosis facilitator), mRNA (cDNA clone MGC:129810 IMAGE:40022820), complete cds. // chr15 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// BC104443 // GenBank // Homo sapiens BCL2-like 10 (apoptosis facilitator), mRNA (cDNA clone MGC:129811 IMAGE:40022822), complete cds. // chr15 // 95 // 92 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000002323 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:52071572:52154179:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1
NM_018728 // RefSeq // Homo sapiens myosin VC (MYO5C), mRNA. // chr15 // 100 // 98 // 47 // 47 // 0 /// ENST00000261839 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:52192322:52295798:-1 gene:ENSG00000128833 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 98 // 47 // 47 // 0 /// ENST00000541028 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:52261007:52295768:-1 gene:ENSG00000128833 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 100 // 21 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000558902 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:52229230:52295769:-1 gene:ENSG00000128833 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 100 // 54 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000559459 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:52250991:52295744:-1 gene:ENSG00000128833 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 100 // 38 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000560809 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:52192659:52295656:-1 gene:ENSG00000128833 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 100 // 83 // 40 // 40 // 0 /// AF272390 // GenBank // Homo sapiens myosin 5c (MYO5C) mRNA, complete cds. // chr15 // 93 // 94 // 42 // 45 // 0 /// AK301079 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57610 complete cds, highly similar to Myosin-5C. // chr15 // 90 // 21 // 9 // 10 // 0 /// AK304136 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61542 complete cds, highly similar to Myosin-5C. // chr15 // 92 // 54 // 24 // 26 // 0 /// BC064841 // GenBank // Homo sapiens myosin VC, mRNA (cDNA clone IMAGE:6182837), complete cds. // chr15 // 100 // 38 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000002334 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:52176589:52295636:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 98 // 88 // 41 // 42 // 0
NM_006628 // RefSeq // Homo sapiens cAMP-regulated phosphoprotein, 19kDa (ARPP19), mRNA. // chr15 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000249822 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:52547244:52569164:-1 gene:ENSG00000128989 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000561650 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:52549527:52568832:-1 gene:ENSG00000128989 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 56 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000566423 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:52547045:52569239:-1 gene:ENSG00000128989 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0 /// AF084555 // GenBank // Homo sapiens okadaic acid-inducible and cAMP-regulated phosphoprotein 19 (ARPP-19) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// AK123616 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ41622 fis, clone CTONG3008959, highly similar to CAMP-REGULATED PHOSPHOPROTEIN 19. // chr15 // 100 // 56 // 10 // 10 // 0 /// AL833077 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp451F1219 (from clone DKFZp451F1219). // chr15 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0 /// BC003418 // GenBank // Homo sapiens cyclic AMP phosphoprotein, 19 kD, mRNA (cDNA clone MGC:5468 IMAGE:3451558), complete cds. // chr15 // 100 // 44 // 8 // 8 // 0 /// BC100015 // GenBank // Homo sapiens cyclic AMP phosphoprotein, 19 kD, mRNA (cDNA clone MGC:110890 IMAGE:30347082), complete cds. // chr15 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0
NM_004498 // RefSeq // Homo sapiens one cut homeobox 1 (ONECUT1), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000305901 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:52756989:52790012:-1 gene:ENSG00000169856 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC140830 // GenBank // Homo sapiens one cut homeobox 1, mRNA (cDNA clone MGC:176507 IMAGE:9021698), complete cds. // chr15 // 96 // 84 // 26 // 27 // 0 /// U96173 // GenBank // Human hepatocyte nuclear factor-6 alpha (HNF6) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000002321 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:52785325:52789884:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
NM_015617 // RefSeq // Homo sapiens pygopus family PHD finger 1 (PYGO1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_005254300 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens pygopus family PHD finger 1 (PYGO1), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000302000 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:55538890:55588947:-1 gene:ENSG00000171016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000563719 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:15:55544687:55587940:-1 gene:ENSG00000171016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// AF457207 // GenBank // Homo sapiens pygopus 1 (PYGO1) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// EF625686 // GenBank // Homo sapiens pygopus-like protein 1 mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000622086 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:15:55544694:55588311:-1 gene:ENSG00000171016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000024186 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:55546023:55742931:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_173814 // RefSeq // Homo sapiens protogenin (PRTG), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006720473 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens protogenin (PRTG), transcript variant X3, mRNA. // chr15 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000389286 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:55611546:55742979:-1 gene:ENSG00000166450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AY630258 // GenBank // Homo sapiens shen-dan mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000024186 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:55546023:55742931:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0
NONHSAT044011 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000493069 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:56029684:56029981:-1 gene:ENSG00000239703 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT044013 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_022841 // RefSeq // Homo sapiens regulatory factor X, 7 (RFX7), mRNA. // chr15 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000559447 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:56087283:56243266:-1 gene:ENSG00000181827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000559847 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:56087280:56144435:-1 gene:ENSG00000181827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 100 // 63 // 24 // 24 // 0 /// AK128045 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ46165 fis, clone TESTI4002868, weakly similar to DNA-binding protein RFX5. // chr15 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// BC112936 // GenBank // Homo sapiens regulatory factor X, 7, mRNA (cDNA clone MGC:131836 IMAGE:6014850), complete cds. // chr15 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000560792 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:56103552:56189886:-1 gene:ENSG00000181827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 26 // 26 // 10 // 38 // 1 /// GENSCAN00000014817 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:56093345:56193179:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0
ENST00000362914 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:56274530:56274636:-1 gene:ENSG00000199784 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONHSAT044016 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_018365 // RefSeq // Homo sapiens meiosis-specific nuclear structural 1 (MNS1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000260453 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:56428731:56465137:-1 gene:ENSG00000138587 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC031046 // GenBank // Homo sapiens meiosis-specific nuclear structural 1, mRNA (cDNA clone MGC:33009 IMAGE:5273227), complete cds. // chr15 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// BC034991 // GenBank // Homo sapiens meiosis-specific nuclear structural 1, mRNA (cDNA clone MGC:33051 IMAGE:4823345), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000014822 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:56430815:56547867:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// AK310029 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17071. // chr15 // 91 // 92 // 20 // 22 // 0
ENST00000614892 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:56634038:56634167:-1 gene:ENSG00000276696 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000459428 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:57278570:57278673:-1 gene:ENSG00000239035 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT044048 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000517175 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:57405074:57405175:-1 gene:ENSG00000252984 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT044074 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
AF090933 // GenBank // Homo sapiens clone HQ0514 PRO0514 mRNA, complete cds. // chr15 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0
NONHSAT044115 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_073415 // RefSeq // Homo sapiens heat shock protein 90kDa alpha (cytosolic), class B member 4, pseudogene (HSP90AB4P), non-coding RNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY956765 // GenBank // Homo sapiens heat shock protein 90Bd (HSP90Bd) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022351 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:58691103:58750538:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000362860 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:58703852:58704154:-1 gene:ENSG00000199730 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT044125 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr15 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
ENST00000363448 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:58760466:58760681:-1 gene:ENSG00000200318 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONHSAT044127 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_004998 // RefSeq // Homo sapiens myosin IE (MYO1E), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000288235 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:59132434:59372900:-1 gene:ENSG00000157483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000560749 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:15:59171897:59208781:-1 gene:ENSG00000157483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 24 // 9 // 9 // 0 /// AB290177 // GenBank // Homo sapiens mRNA for MYO1E variant protein, complete cds. // chr15 // 97 // 95 // 35 // 36 // 0 /// AK291688 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76307 complete cds, highly similar to Homo sapiens myosin IE (MYO1E), mRNA. // chr15 // 97 // 89 // 33 // 34 // 0 /// BC098392 // GenBank // Homo sapiens myosin IE, mRNA (cDNA clone MGC:104638 IMAGE:30527536), complete cds. // chr15 // 97 // 100 // 37 // 38 // 0 /// U14391 // GenBank // Human myosin-IC mRNA, complete cds. // chr15 // 94 // 95 // 34 // 36 // 0 /// GENSCAN00000008045 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:59137380:59205473:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 45 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000008065 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:59208627:59276252:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 29 // 11 // 11 // 0
ENST00000363200 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:59212648:59212788:-1 gene:ENSG00000200070 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT044157 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000362642 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:59341314:59341417:-1 gene:ENSG00000199512 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT044163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
ENST00000364834 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:59574103:59574222:-1 gene:ENSG00000201704 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT044176 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONHSAT044177 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_001007595 // RefSeq // Homo sapiens C2 calcium-dependent domain containing 4B (C2CD4B), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000380392 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:62163535:62165283:-1 gene:ENSG00000205502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000048176 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:62163890:62164984:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0
ENST00000570077 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:62245707:62248795:-1 gene:ENSG00000166104 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 100 // 34 // 11 // 11 // 0 /// AK096042 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ38723 fis, clone KIDNE2010137, weakly similar to GOLGIN-95. // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC131692 // GenBank // Homo sapiens hypothetical FLJ38723, mRNA (cDNA clone MGC:150365 IMAGE:40119840), complete cds. // chr15 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// XR_429633 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens uncharacterized FLJ38723 (FLJ38723), misc_RNA. // chr15 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// XR_433154 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens uncharacterized FLJ38723 (FLJ38723), misc_RNA. // chr15 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// ENST00000562306 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:62242751:62253235:-1 gene:ENSG00000166104 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr15 // 59 // 59 // 19 // 32 // 1 /// NONHSAT045104 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONHSAT045695 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 34 // 11 // 11 // 0 /// NONHSAT045160 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 59 // 59 // 19 // 32 // 1 /// GENSCAN00000048155 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:62246225:62320307:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
ENST00000618354 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:62244330:62244595:-1 gene:ENSG00000276713 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000558737 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:62362029:62362331:-1 gene:ENSG00000259557 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr15 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000048170 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:62361945:62436168:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT046561 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
ENST00000560903 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:63047694:63049248:-1 gene:ENSG00000259498 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr15 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000561241 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:63046034:63049387:-1 gene:ENSG00000259498 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AK092594 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ35275 fis, clone PROST2006282, weakly similar to TRANSLATION INITIATION FACTOR IF-2. // chr15 // 91 // 100 // 20 // 22 // 0 /// NONHSAT046588 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT046589 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0
ENST00000439025 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:63154971:63157499:-1 gene:ENSG00000185088 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000455271 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:63153853:63157281:-1 gene:ENSG00000185088 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000482846 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:63153853:63157477:-1 gene:ENSG00000185088 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NM_015920 // RefSeq // Homo sapiens ribosomal protein S27-like (RPS27L), mRNA. // chr15 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// ENST00000330964 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:63148250:63157802:-1 gene:ENSG00000185088 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// ENST00000462430 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:63153853:63156774:-1 gene:ENSG00000185088 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// ENST00000411926 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:63153859:63158021:-1 gene:ENSG00000185088 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// BC003667 // GenBank // Homo sapiens ribosomal protein S27-like, mRNA (cDNA clone MGC:12175 IMAGE:3827362), complete cds. // chr15 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// NONHSAT046599 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr15 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_003922 // RefSeq // Homo sapiens HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1 (HERC1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 95 // 95 // 0 /// ENST00000443617 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:63608618:63833888:-1 gene:ENSG00000103657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 99 // 94 // 94 // 0 /// ENST00000559886 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:63752515:63833917:-1 gene:ENSG00000103657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 100 // 11 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000561400 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:63696124:63833942:-1 gene:ENSG00000103657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 11 // 10 // 10 // 0 /// AK296690 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60284 complete cds, highly similar to Homo sapiens guanine nucleotide exchange factor p532. // chr15 // 100 // 11 // 10 // 10 // 0 /// AK310519 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17561. // chr15 // 100 // 11 // 10 // 10 // 0 /// U50078 // GenBank // Human guanine nucleotide exchange factor p532 mRNA, complete cds. // chr15 // 99 // 99 // 93 // 94 // 0 /// GENSCAN00000014756 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:63609081:63775623:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 83 // 79 // 79 // 0
ENST00000364201 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:64111458:64111569:-1 gene:ENSG00000201071 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT046642 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AY358648 // GenBank // Homo sapiens clone DNA48309 GKGM353 (UNQ353) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000559280 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:64365944:64373771:-1 gene:ENSG00000166803 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 78 // 78 // 14 // 18 // 1 /// ENST00000558783 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:64300607:64373765:-1 gene:ENSG00000259316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 78 // 78 // 14 // 18 // 1 /// NONHSAT046659 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr15 // 78 // 78 // 14 // 18 // 1 /// NONHSAT046662 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr15 // 78 // 78 // 14 // 18 // 1 /// ENST00000561349 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:64180348:64373769:-1 gene:ENSG00000259316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 56 // 56 // 10 // 18 // 1 /// AK301858 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58702 complete cds, highly similar to Casein kinase I isoform gamma-1 (EC 2.7.11.1). // chr15 // 56 // 56 // 10 // 18 // 1
ENST00000384054 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:64445130:64445243:-1 gene:ENSG00000206781 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT046668 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_194272 // RefSeq // Homo sapiens RNA binding protein with multiple splicing 2 (RBPMS2), mRNA. // chr15 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000300069 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:64739898:64775587:-1 gene:ENSG00000166831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000560606 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:64739892:64761217:-1 gene:ENSG00000166831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// AK124123 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ42129 fis, clone TESTI2013889, moderately similar to Homo sapiens RNA binding protein with multiple splicing (RBPMS). // chr15 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// AY369207 // GenBank // Homo sapiens RNA-binding protein with multiple splicing 2 (RBPMS2) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// BC131612 // GenBank // Homo sapiens RNA binding protein with multiple splicing 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:40115293), complete cds. // chr15 // 56 // 56 // 19 // 34 // 1 /// GENSCAN00000024219 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:64688704:64753682:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 44 // 44 // 15 // 34 // 1
NM_016563 // RefSeq // Homo sapiens RAS-like, family 12 (RASL12), mRNA. // chr15 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_005254434 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens RAS-like, family 12 (RASL12), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 94 // 59 // 15 // 16 // 0 /// ENST00000220062 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:65053337:65068112:-1 gene:ENSG00000103710 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000421977 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:15:65054228:65067943:-1 gene:ENSG00000103710 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000434605 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:15:65054777:65076690:-1 gene:ENSG00000103710 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// AF233588 // GenBank // Homo sapiens Ris (RIS) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AK296261 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51874 complete cds, highly similar to Homo sapiens RAS-like, family 12 (RASL12), mRNA. // chr15 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// AK300536 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59757 complete cds, highly similar to Homo sapiens RAS-like, family 12 (RASL12), mRNA. // chr15 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// BC053734 // GenBank // Homo sapiens RAS-like, family 12, mRNA (cDNA clone MGC:49887 IMAGE:5588236), complete cds. // chr15 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000028973 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:65054899:65067835:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0
NM_005707 // RefSeq // Homo sapiens programmed cell death 7 (PDCD7), mRNA. // chr15 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000204549 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:65117379:65133836:-1 gene:ENSG00000090470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000028982 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:65093097:65133781:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 79 // 79 // 19 // 24 // 1
NM_003613 // RefSeq // Homo sapiens cartilage intermediate layer protein, nucleotide pyrophosphohydrolase (CILP), mRNA. // chr15 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000261883 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:65194758:65211488:-1 gene:ENSG00000138615 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// AF035408 // GenBank // Homo sapiens cartilage intermediate layer protein (CILP) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// AY358904 // GenBank // Homo sapiens clone DNA52598 CILP (UNQ602) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// BC035776 // GenBank // Homo sapiens cartilage intermediate layer protein, nucleotide pyrophosphohydrolase, mRNA (cDNA clone MGC:46224 IMAGE:5590447), complete cds. // chr15 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000028965 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:65196731:65286426:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0
NM_017851 // RefSeq // Homo sapiens poly (ADP-ribose) polymerase family, member 16 (PARP16), mRNA. // chr15 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// XM_006720591 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens poly (ADP-ribose) polymerase family, member 16 (PARP16), transcript variant X6, mRNA. // chr15 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0 /// XR_429460 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens poly (ADP-ribose) polymerase family, member 16 (PARP16), transcript variant X9, misc_RNA. // chr15 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000261888 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:65258094:65286872:-1 gene:ENSG00000138617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000444347 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:15:65258096:65286843:-1 gene:ENSG00000138617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000560149 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:65259286:65286366:-1 gene:ENSG00000138617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 94 // 50 // 16 // 17 // 0 /// BC006389 // GenBank // Homo sapiens poly (ADP-ribose) polymerase family, member 16, mRNA (cDNA clone MGC:12609 IMAGE:4127509), complete cds. // chr15 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// BC031074 // GenBank // Homo sapiens poly (ADP-ribose) polymerase family, member 16, mRNA (cDNA clone MGC:33721 IMAGE:5274010), complete cds. // chr15 // 94 // 94 // 30 // 32 // 0 /// GENSCAN00000028965 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:65196731:65286426:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 47 // 47 // 16 // 34 // 1 /// BX648817 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686P2498 (from clone DKFZp686P2498). // chr15 // 41 // 41 // 14 // 34 // 1
ENST00000384176 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:65285461:65285591:-1 gene:ENSG00000206903 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT046717 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_004884 // RefSeq // Homo sapiens immunoglobulin superfamily, DCC subclass, member 3 (IGDCC3), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000327987 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:65327127:65378040:-1 gene:ENSG00000174498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000558354 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:15:65329579:65356372:-1 gene:ENSG00000174498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 61 // 20 // 20 // 0 /// AK095529 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ38210 fis, clone FCBBF1000546, highly similar to neuronal cell adhesion molecule precursor. // chr15 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// BC042054 // GenBank // Homo sapiens immunoglobulin superfamily, DCC subclass, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:50440 IMAGE:5579570), complete cds. // chr15 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// BC067107 // GenBank // Homo sapiens immunoglobulin superfamily, DCC subclass, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:71289 IMAGE:6644528), complete cds. // chr15 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// GENSCAN00000028974 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:65319142:65377788:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0
NM_020962 // RefSeq // Homo sapiens immunoglobulin superfamily, DCC subclass, member 4 (IGDCC4), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000352385 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:15:65381464:65423072:-1 gene:ENSG00000103742 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000559327 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:65381487:65396429:-1 gene:ENSG00000103742 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// AB046848 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1628 protein, partial cds. // chr15 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// AB052622 // GenBank // Homo sapiens hDDM36 mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000028980 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:65384009:65422862:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0
NONHSAT046749 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001144823 // RefSeq // Homo sapiens DENN/MADD domain containing 4A (DENND4A), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// NM_005848 // RefSeq // Homo sapiens DENN/MADD domain containing 4A (DENND4A), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENST00000431932 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:65661777:65792124:-1 gene:ENSG00000174485 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 98 // 47 // 47 // 0 /// ENST00000443035 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:65659123:65792124:-1 gene:ENSG00000174485 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENST00000564674 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:65691458:65792293:-1 gene:ENSG00000174485 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 60 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000568515 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:65715075:65792207:-1 gene:ENSG00000174485 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 100 // 40 // 19 // 19 // 0 /// AF534403 // GenBank // Homo sapiens c-MYC promoter-binding protein IRLB (IRLB) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// AK299570 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52112 complete cds, highly similar to C-myc promoter-binding protein. // chr15 // 95 // 40 // 18 // 19 // 0 /// BC041706 // GenBank // Homo sapiens DENN/MADD domain containing 4A, mRNA (cDNA clone MGC:48955 IMAGE:5530033), complete cds. // chr15 // 100 // 98 // 47 // 47 // 0 /// GENSCAN00000028976 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:65661851:65756450:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 58 // 28 // 28 // 0
ENST00000459325 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:65696833:65696936:-1 gene:ENSG00000238311 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT046759 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001289986 // RefSeq // Homo sapiens TIMELESS interacting protein (TIPIN), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 93 // 100 // 14 // 15 // 0 /// NM_017858 // RefSeq // Homo sapiens TIMELESS interacting protein (TIPIN), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 93 // 100 // 14 // 15 // 0 /// XM_005254521 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens TIMELESS interacting protein (TIPIN), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 93 // 93 // 13 // 14 // 0 /// XM_005254522 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens TIMELESS interacting protein (TIPIN), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 87 // 13 // 13 // 0 /// XM_006720593 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens TIMELESS interacting protein (TIPIN), transcript variant X4, mRNA. // chr15 // 100 // 87 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000261881 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:66336206:66356716:-1 gene:ENSG00000075131 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000562124 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:66336981:66386724:-1 gene:ENSG00000075131 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 92 // 80 // 11 // 12 // 0 /// ENST00000566524 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:66336384:66356685:-1 gene:ENSG00000075131 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// AK299233 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53020 complete cds, highly similar to Homo sapiens timeless-interacting protein, mRNA. // chr15 // 87 // 100 // 13 // 15 // 0 /// BC000870 // GenBank // Homo sapiens TIMELESS interacting protein, mRNA (cDNA clone MGC:4958 IMAGE:3460338), complete cds. // chr15 // 93 // 100 // 14 // 15 // 0 /// GENSCAN00000033566 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:66336958:66352841:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0
NR_004388 // RefSeq // Homo sapiens small Cajal body-specific RNA 14 (SCARNA14), guide RNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000516903 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:66347207:66347342:-1 gene:ENSG00000252712 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT046784 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000564517 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:66505243:66523411:-1 gene:ENSG00000174444 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 100 // 56 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000568588 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:66499323:66524532:-1 gene:ENSG00000174444 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// AK125772 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ43784 fis, clone TESTI2051867, highly similar to 60S ribosomal protein L4. // chr15 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONHSAT046806 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 56 // 9 // 9 // 0
NM_001278562 // RefSeq // Homo sapiens lactase-like (LCTL), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NM_207338 // RefSeq // Homo sapiens lactase-like (LCTL), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000341509 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:66547179:66565497:-1 gene:ENSG00000188501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000537670 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:15:66547468:66565964:-1 gene:ENSG00000188501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000565875 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:66548333:66565979:-1 gene:ENSG00000188501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// AY358729 // GenBank // Homo sapiens clone DNA108769 KPVW3022 (UNQ3022) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NR_103739 // RefSeq // Homo sapiens lactase-like (LCTL), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr15 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1 /// GENSCAN00000033568 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:66494436:66565365:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1
AY203937 // GenBank HTC // Homo sapiens LP2570 mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001004439 // RefSeq // Homo sapiens integrin, alpha 11 (ITGA11), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000315757 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:15:68301712:68432153:-1 gene:ENSG00000137809 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000423218 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:15:68296533:68432162:-1 gene:ENSG00000137809 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// AF109681 // GenBank // Homo sapiens integrin alpha-11 subunit precursor (ITGA11) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// AF111799 // GenBank // Homo sapiens MSTP018 (MST018) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 63 // 26 // 26 // 0 /// AF137378 // GenBank // Homo sapiens integrin alpha 11 subunit precursor (ITGA11) mRNA, complete cds. // chr15 // 95 // 90 // 35 // 37 // 0 /// AK292445 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78760 complete cds, highly similar to Homo sapiens integrin, alpha 11 (ITGA11), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 92 // 88 // 33 // 36 // 0 /// AK304778 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58807 complete cds, highly similar to Integrin alpha-11. // chr15 // 100 // 44 // 18 // 18 // 0 /// AL359064 // GenBank // Homo sapiens mRNA full length insert cDNA clone EUROIMAGE 322987. // chr15 // 100 // 37 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000015513 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:68302154:68432066:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 78 // 32 // 32 // 0
NR_026808 // RefSeq // Homo sapiens ANP32A intronic transcript 1 (non-protein coding) (ANP32A-IT1), long non-coding RNA. // chr15 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT046901 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr15 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
ENST00000494456 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:69250525:69250795:-1 gene:ENSG00000241774 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT046925 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENST00000384391 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:69457941:69458149:-1 gene:ENSG00000207119 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT046950 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000470368 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:70796597:70802684:-1 gene:ENSG00000235420 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000484381 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:70796631:70797099:-1 gene:ENSG00000235420 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000496414 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:70796657:70802688:-1 gene:ENSG00000235420 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 87 // 100 // 20 // 23 // 0 /// GENSCAN00000032455 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:70604785:70854088:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT047015 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT047016 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT047017 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 87 // 100 // 20 // 23 // 0 /// TCONS_l2_00009514-XLOC_l2_004980 // Broad TUCP // linc-UACA chr15:-:71088935-71095023 // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// TCONS_l2_00009515-XLOC_l2_004980 // Broad TUCP // linc-UACA chr15:-:71088995-71095027 // chr15 // 87 // 100 // 20 // 23 // 0
NM_020147 // RefSeq // Homo sapiens THAP domain containing 10 (THAP10), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000249861 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:70881342:70892785:-1 gene:ENSG00000129028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AL360202 // GenBank // Homo sapiens mRNA full length insert cDNA clone EUROIMAGE 511235. // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC027857 // GenBank // Homo sapiens THAP domain containing 10, mRNA (cDNA clone MGC:34264 IMAGE:5222191), complete cds. // chr15 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// BC072414 // GenBank // Homo sapiens THAP domain containing 10, mRNA (cDNA clone MGC:87938 IMAGE:6167441), complete cds. // chr15 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// ENST00000560604 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:70882300:70892410:-1 gene:ENSG00000129028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1 /// GENSCAN00000032450 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:70874692:70892272:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0
ENST00000498103 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:71341158:71341712:-1 gene:ENSG00000212664 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr15 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000021105 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:71341158:71341712:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NR_002780 // RefSeq // Homo sapiens HIG1 hypoxia inducible domain family, member 2B (HIGD2B), non-coding RNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000311755 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:72675783:72686149:-1 gene:ENSG00000175202 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_005477 // RefSeq // Homo sapiens hyperpolarization activated cyclic nucleotide-gated potassium channel 4 (HCN4), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000261917 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:73319859:73369264:-1 gene:ENSG00000138622 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000043366 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:73322481:73368270:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0
ENST00000379822 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:15:73739802:73751475:-1 gene:ENSG00000205363 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000558834 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:73739927:73740615:-1 gene:ENSG00000205363 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000569673 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:73735431:73752747:-1 gene:ENSG00000205363 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC111368 // GenBank // Homo sapiens chromosome 15 open reading frame 59, mRNA (cDNA clone MGC:131524 IMAGE:7504115), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000559817 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:73740256:73752378:-1 gene:ENSG00000205363 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// GENSCAN00000043359 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:73739917:73751130:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
ENST00000390977 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:74490959:74491028:-1 gene:ENSG00000212279 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT047247 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_017793 // RefSeq // Homo sapiens ribonuclease P/MRP 25kDa subunit (RPP25), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000322177 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:74954416:74957464:-1 gene:ENSG00000178718 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY034074 // GenBank // Homo sapiens RNase P protein subunit p25 mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// BC002497 // GenBank // Homo sapiens ribonuclease P/MRP 25kDa subunit, mRNA (cDNA clone MGC:1053 IMAGE:3050784), complete cds. // chr15 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC007270 // GenBank // Homo sapiens ribonuclease P/MRP 25kDa subunit, mRNA (cDNA clone MGC:15585 IMAGE:3160319), complete cds. // chr15 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000047982 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:74955984:74965186:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0
ENST00000567292 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:75299953:75302965:-1 gene:ENSG00000260357 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC006530 // GenBank // Homo sapiens DNM1 pseudogene 33, mRNA (cDNA clone IMAGE:3688915). // chr15 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000040643 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:75301634:75322509:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 57 // 57 // 8 // 14 // 1
NM_002833 // RefSeq // Homo sapiens protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 9 (PTPN9), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000306726 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:15:75467127:75579289:-1 gene:ENSG00000169410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 95 // 100 // 38 // 40 // 0 /// BC010863 // GenBank // Homo sapiens protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 9, mRNA (cDNA clone MGC:9424 IMAGE:3895727), complete cds. // chr15 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// BC071574 // GenBank // Homo sapiens protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 9, mRNA (cDNA clone MGC:87169 IMAGE:5276190), complete cds. // chr15 // 92 // 95 // 35 // 38 // 0 /// BT007405 // GenBank // Homo sapiens protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 9 mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0 /// M83738 // GenBank // Human protein-tyrosine phosphatase (PTPase MEG2) mRNA, complete cds. // chr15 // 98 // 100 // 39 // 40 // 0 /// ENST00000618819 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:75463251:75579289:-1 gene:ENSG00000169410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000040628 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:75468769:75578776:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0
NM_018285 // RefSeq // Homo sapiens IMP3, U3 small nucleolar ribonucleoprotein (IMP3), mRNA. // chr15 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000314852 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:75639085:75648706:-1 gene:ENSG00000177971 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000403490 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:15:75639087:75640323:-1 gene:ENSG00000177971 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// AK057531 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ32969 fis, clone TESTI2008835, highly similar to U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP3. // chr15 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// AY050497 // GenBank // Homo sapiens BRMS2 mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// BC006487 // GenBank // Homo sapiens IMP3, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:910 IMAGE:3546883), complete cds. // chr15 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// BC011745 // GenBank // Homo sapiens IMP3, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:19665 IMAGE:3344519), complete cds. // chr15 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000040635 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:75639614:75640483:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0
NM_001897 // RefSeq // Homo sapiens chondroitin sulfate proteoglycan 4 (CSPG4), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000308508 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:75674322:75712848:-1 gene:ENSG00000173546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AY359468 // GenBank // Homo sapiens melanoma chondroitin sulfate proteoglycan (CSPG4) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000040624 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:75675550:75712755:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
ENST00000488843 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:76976915:76977210:-1 gene:ENSG00000243365 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT047417 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_024776 // RefSeq // Homo sapiens pseudopodium-enriched atypical kinase 1 (PEAK1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000312493 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:15:77108164:77252531:-1 gene:ENSG00000173517 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000560626 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:77100656:77420144:-1 gene:ENSG00000173517 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// AK127658 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ45756 fis, clone MESAN2009156. // chr15 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NR_026813 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 597 (LINC00597), long non-coding RNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF216224 // GenBank // Homo sapiens C15orf5 mRNA, complete cds. // chr15 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// AL109679 // GenBank // Homo sapiens mRNA full length insert cDNA clone EUROIMAGE 137356. // chr15 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT047429 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000487317 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:77916718:77916982:-1 gene:ENSG00000242066 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONHSAT047472 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
ENST00000362763 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:78091172:78091297:-1 gene:ENSG00000199633 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT047536 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_000750 // RefSeq // Homo sapiens cholinergic receptor, nicotinic, beta 4 (neuronal) (CHRNB4), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NM_001256567 // RefSeq // Homo sapiens cholinergic receptor, nicotinic, beta 4 (neuronal) (CHRNB4), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000261751 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:78624119:78641245:-1 gene:ENSG00000117971 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000412074 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:15:78624408:78641245:-1 gene:ENSG00000117971 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0 /// BC096080 // GenBank // Homo sapiens cholinergic receptor, nicotinic, beta 4, mRNA (cDNA clone MGC:116718 IMAGE:40000733), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC096082 // GenBank // Homo sapiens cholinergic receptor, nicotinic, beta 4, mRNA (cDNA clone MGC:116720 IMAGE:40000737), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// U48861 // GenBank // Human beta 4 nicotinic acetylcholine receptor subunit mRNA, complete cds. // chr15 // 95 // 100 // 18 // 19 // 0 /// U62439 // GenBank // Human nicotinic acetylcholine receptor beta4 subunit precursor, mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000559849 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:78629353:78660532:-1 gene:ENSG00000117971 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 47 // 47 // 9 // 19 // 1 /// AK310443 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17485. // chr15 // 47 // 47 // 9 // 19 // 1 /// GENSCAN00000023051 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:78625133:78641133:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0
NM_014272 // RefSeq // Homo sapiens ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 7 (ADAMTS7), mRNA. // chr15 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// XM_005254137 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 7 (ADAMTS7), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000388820 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:78759203:78811431:-1 gene:ENSG00000136378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000565793 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:78770626:78800544:-1 gene:ENSG00000136378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 100 // 50 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000568712 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:78770795:78811232:-1 gene:ENSG00000136378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 100 // 55 // 11 // 11 // 0 /// AB209497 // GenBank // Homo sapiens mRNA for a disintegrin and metalloprotease with thrombospondin motifs-7 preproprotein variant protein. // chr15 // 90 // 50 // 9 // 10 // 0 /// AF140675 // GenBank // Homo sapiens zinc metalloprotease ADAMTS7 (ADAMTS7) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 55 // 11 // 11 // 0 /// AY327122 // GenBank // Homo sapiens COMPase precursor, mRNA, complete cds. // chr15 // 94 // 85 // 16 // 17 // 0 /// BC061631 // GenBank // Homo sapiens ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 7, mRNA (cDNA clone MGC:59745 IMAGE:6650221), complete cds. // chr15 // 94 // 90 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000023045 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:78759421:78811220:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0
ENST00000516252 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:78898840:78898936:-1 gene:ENSG00000252061 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT047621 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
ENST00000517186 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:79817349:79817450:-1 gene:ENSG00000252995 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT047664 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_037652 // RefSeq // Homo sapiens suppressor of tumorigenicity 20 (ST20), transcript variant 4, non-coding RNA. // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NR_037653 // RefSeq // Homo sapiens suppressor of tumorigenicity 20 (ST20), transcript variant 5, non-coding RNA. // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000485386 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:79898904:79923702:-1 gene:ENSG00000180953 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// AF249277 // GenBank // Homo sapiens cervical cancer suppressor-1 mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000479961 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:79845195:79923744:-1 gene:ENSG00000259332 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 67 // 67 // 10 // 15 // 1 /// ENST00000494999 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:79845376:79923754:-1 gene:ENSG00000259332 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 67 // 67 // 10 // 15 // 1
NM_001114735 // RefSeq // Homo sapiens BCL2-related protein A1 (BCL2A1), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// NM_004049 // RefSeq // Homo sapiens BCL2-related protein A1 (BCL2A1), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 76 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000267953 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:79960889:79971446:-1 gene:ENSG00000140379 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000335661 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:79960892:79971169:-1 gene:ENSG00000140379 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 76 // 16 // 16 // 0 /// BC016281 // GenBank // Homo sapiens BCL2-related protein A1, mRNA (cDNA clone MGC:8991 IMAGE:3920808), complete cds. // chr15 // 100 // 57 // 12 // 12 // 0 /// CR541937 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834A0734D for gene BCL2A1, BCL2-related protein A1; complete cds, incl. stopcodon. // chr15 // 100 // 38 // 8 // 8 // 0 /// U27467 // GenBank // Human Bcl-2 related (Bfl-1) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 43 // 9 // 9 // 0 /// U29680 // GenBank // Human A1 protein mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 57 // 12 // 12 // 0 /// AY234180 // GenBank // Homo sapiens A1 splice variant mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr15 // 67 // 57 // 8 // 12 // 0 /// AK304026 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60214 complete cds, highly similar to Bcl-2-related protein A1. // chr15 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1
ENST00000610909 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:80057425:80057684:-1 gene:ENSG00000275460 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000548231 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:80433795:80445152:-1 gene:ENSG00000258010 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AK097452 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ40133 fis, clone TESTI2012231. // chr15 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// NONHSAT047704 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT047705 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000019595 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:80419435:80437397:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 41 // 41 // 9 // 22 // 1
NM_001080532 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane channel-like 3 (TMC3), mRNA. // chr15 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000359440 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:81331217:81374213:-1 gene:ENSG00000188869 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000558726 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:15:81331217:81374213:-1 gene:ENSG00000188869 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000559982 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:81337642:81374156:-1 gene:ENSG00000188869 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// AY236490 // GenBank // Homo sapiens transmembrane channel-like protein 3 (TMC3) mRNA, complete cds. // chr15 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// AY263163 // GenBank // Homo sapiens TMC3 protein (TMC3) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC132679 // GenBank // Homo sapiens transmembrane channel-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:164310 IMAGE:40146701), complete cds. // chr15 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC143410 // GenBank // Homo sapiens transmembrane channel-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:176934 IMAGE:9051917), complete cds. // chr15 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC157874 // GenBank // Homo sapiens transmembrane channel-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:189768 IMAGE:9057092), complete cds. // chr15 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000005412 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:81332419:81398389:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
NM_032246 // RefSeq // Homo sapiens mex-3 RNA binding family member B (MEX3B), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000329713 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:82041778:82046141:-1 gene:ENSG00000183496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000558133 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:82041787:82046119:-1 gene:ENSG00000183496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// AB095929 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA2009 protein. // chr15 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// AY950678 // GenBank // Homo sapiens MEX3B mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// BC036211 // GenBank // Homo sapiens mex-3 homolog B (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:39639 IMAGE:5266259), complete cds. // chr15 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC111545 // GenBank // Homo sapiens mex-3 homolog B (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:117199 IMAGE:5742971), complete cds. // chr15 // 96 // 81 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002603 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:82043160:82046796:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0
NM_001040610 // RefSeq // Homo sapiens elongation factor Tu GTP binding domain containing 1 (EFTUD1), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NM_024580 // RefSeq // Homo sapiens elongation factor Tu GTP binding domain containing 1 (EFTUD1), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000268206 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:82130230:82262763:-1 gene:ENSG00000140598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000359445 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:82130233:82262714:-1 gene:ENSG00000140598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// AK300348 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61709 complete cds, highly similar to Homo sapiens elongation factor Tu GTP binding domain containing 1, transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 94 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000002612 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:82130373:82262803:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 82 // 14 // 14 // 0
ENST00000390868 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:82174224:82174385:-1 gene:ENSG00000212170 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT047770 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_036446 // RefSeq // Homo sapiens actin, alpha 2, smooth muscle, aorta pseudogene (LOC283693), non-coding RNA. // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000558391 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:82726307:82727425:-1 gene:ENSG00000259315 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000560958 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:82725873:82738616:-1 gene:ENSG00000259315 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC020234 // GenBank // Homo sapiens actin, gamma pseudogene, mRNA (cDNA clone IMAGE:4864469). // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000002601 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:82533086:82727080:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 83 // 83 // 20 // 24 // 1
AK097109 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39790 fis, clone SPLEN2003204. // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT047878 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000619240 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:82985553:82986070:-1 gene:ENSG00000103942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 52 // 52 // 12 // 23 // 1
NM_001717 // RefSeq // Homo sapiens basonuclin 1 (BNC1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006720641 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens basonuclin 1 (BNC1), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000345382 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:83255903:83284714:-1 gene:ENSG00000169594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000569704 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:83257344:83283319:-1 gene:ENSG00000169594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 96 // 78 // 24 // 25 // 0 /// AK302992 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50932 complete cds, highly similar to Zinc finger protein basonuclin-1. // chr15 // 96 // 78 // 24 // 25 // 0 /// L03427 // GenBank // Human zinc finger protein basonuclin mRNA, complete cds. // chr15 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// ENST00000618086 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:15:83255905:83284716:-1 gene:ENSG00000169594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000028442 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:83257442:83284628:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0
ENST00000363574 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:83824863:83824953:-1 gene:ENSG00000200444 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 100 // 67 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT047909 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 67 // 14 // 14 // 0
ENST00000611908 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:84467901:84468147:1 gene:ENSG00000278785 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000613848 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:85210053:85210299:-1 gene:ENSG00000277582 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000618054 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:84205454:84205700:-1 gene:ENSG00000278422 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT047934 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT048064 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT047792 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 40 // 100 // 10 // 25 // 0 /// NONHSAT047808 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 40 // 100 // 10 // 25 // 0 /// NONHSAT047830 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 40 // 100 // 10 // 25 // 0
ENST00000558801 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:84398316:84411701:-1 gene:ENSG00000235370 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// AB067507 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1920 protein, partial cds. // chr15 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_021077 // RefSeq // Homo sapiens neuromedin B (NMB), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NM_205858 // RefSeq // Homo sapiens neuromedin B (NMB), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000360476 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:84655129:84658548:-1 gene:ENSG00000197696 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000394588 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:84655129:84658563:-1 gene:ENSG00000197696 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC007407 // GenBank // Homo sapiens neuromedin B, mRNA (cDNA clone MGC:2277 IMAGE:3030430), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC007431 // GenBank // Homo sapiens neuromedin B, mRNA (cDNA clone MGC:3936 IMAGE:3030430), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC008603 // GenBank // Homo sapiens neuromedin B, mRNA (cDNA clone MGC:17211 IMAGE:4185578), complete cds. // chr15 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// M21551 // GenBank // Human neuromedin B mRNA, complete cds. // chr15 // 96 // 87 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000021330 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:84645382:84658152:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1
ENST00000364121 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:84852498:84852615:-1 gene:ENSG00000200991 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT048035 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000384310 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:84938416:84938522:-1 gene:ENSG00000207037 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT048036 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000391086 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:84939617:84939723:-1 gene:ENSG00000212388 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT048037 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000365211 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:85651522:85651628:-1 gene:ENSG00000202081 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT048088 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_022480 // RefSeq // Homo sapiens kelch-like family member 25 (KLHL25), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006720635 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens kelch-like family member 25 (KLHL25), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000337975 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:85759323:85795030:-1 gene:ENSG00000183655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AL109693 // GenBank // Homo sapiens mRNA full length insert cDNA clone EUROIMAGE 38244. // chr15 // 89 // 30 // 8 // 9 // 0 /// AL136796 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp434K111 (from clone DKFZp434K111); complete cds. // chr15 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// AY764034 // GenBank // Homo sapiens ENC2 (ENC2) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC028100 // GenBank // Homo sapiens kelch-like 25 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:39894 IMAGE:5242783), complete cds. // chr15 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000536947 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:85759330:85764472:-1 gene:ENSG00000183655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// AK126962 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ45015 fis, clone BRAWH3014639. // chr15 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1 /// GENSCAN00000026010 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:85768041:85769810:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0
ENST00000363336 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:86173198:86173270:-1 gene:ENSG00000200206 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT048131 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000384421 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:87474183:87474289:-1 gene:ENSG00000207150 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT048145 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_000326 // RefSeq // Homo sapiens retinaldehyde binding protein 1 (RLBP1), mRNA. // chr15 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000268125 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:89209869:89221751:-1 gene:ENSG00000140522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000563254 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:15:89210002:89211843:-1 gene:ENSG00000140522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000567787 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:89210750:89221614:-1 gene:ENSG00000140522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 93 // 54 // 13 // 14 // 0 /// BC004199 // GenBank // Homo sapiens retinaldehyde binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:3663 IMAGE:3604048), complete cds. // chr15 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// J04213 // GenBank // Human cellular retinaldehyde-binding protein mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000010447 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:89210285:89228277:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NM_001126131 // RefSeq // Homo sapiens polymerase (DNA directed), gamma (POLG), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_002693 // RefSeq // Homo sapiens polymerase (DNA directed), gamma (POLG), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000268124 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:89316303:89334847:-1 gene:ENSG00000140521 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000442287 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:89316320:89334861:-1 gene:ENSG00000140521 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK291281 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78646 complete cds, highly similar to Homo sapiens polymerase (DNA directed), gamma (POLG), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC042571 // GenBank // Homo sapiens polymerase (DNA directed), gamma, mRNA (cDNA clone MGC:21267 IMAGE:4384475), complete cds. // chr15 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// BC050559 // GenBank // Homo sapiens polymerase (DNA directed), gamma, mRNA (cDNA clone MGC:57709 IMAGE:6042595), complete cds. // chr15 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// D84103 // GenBank // Homo sapiens mRNA for mitochondrial DNA polymerase gamma, complete cds. // chr15 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// U60325 // GenBank // Human DNA polymerase gamma mRNA, nuclear gene encoding mitochondrial protein, complete cds. // chr15 // 97 // 97 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000010437 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:89316751:89333754:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
NM_198525 // RefSeq // Homo sapiens kinesin family member 7 (KIF7), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// XM_006720497 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens kinesin family member 7 (KIF7), transcript variant X4, mRNA. // chr15 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000394412 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:89627977:89655451:-1 gene:ENSG00000166813 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// AY358384 // GenBank // Homo sapiens clone DNA47465 EQYK340 (UNQ340) mRNA, complete cds. // chr15 // 93 // 100 // 39 // 42 // 0 /// BC104044 // GenBank // Homo sapiens kinesin family member 7, mRNA (cDNA clone MGC:120653 IMAGE:40026959), complete cds. // chr15 // 90 // 95 // 36 // 40 // 0 /// BC112271 // GenBank // Homo sapiens kinesin family member 7, mRNA (cDNA clone MGC:138476 IMAGE:8327739), complete cds. // chr15 // 95 // 90 // 36 // 38 // 0 /// BC112273 // GenBank // Homo sapiens kinesin family member 7, mRNA (cDNA clone MGC:138478 IMAGE:8327741), complete cds. // chr15 // 95 // 90 // 36 // 38 // 0 /// BC143461 // GenBank // Homo sapiens kinesin family member 7, mRNA (cDNA clone MGC:176986 IMAGE:9051969), complete cds. // chr15 // 95 // 90 // 36 // 38 // 0 /// GENSCAN00000010428 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:89628419:89652930:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0
NM_001145311 // RefSeq // Homo sapiens perilipin 1 (PLIN1), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NM_002666 // RefSeq // Homo sapiens perilipin 1 (PLIN1), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000300055 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:89664365:89679402:-1 gene:ENSG00000166819 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000430628 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:89664372:89679427:-1 gene:ENSG00000166819 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AB005293 // GenBank // Homo sapiens mRNA for perilipin, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC031084 // GenBank // Homo sapiens perilipin, mRNA (cDNA clone MGC:33812 IMAGE:5284402), complete cds. // chr15 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000010425 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:89665583:89677489:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
NM_018670 // RefSeq // Homo sapiens mesoderm posterior basic helix-loop-helix transcription factor 1 (MESP1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000300057 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:89748661:89751310:-1 gene:ENSG00000166823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AL357533 // GenBank // Homo sapiens mRNA full length insert cDNA clone EUROIMAGE 1899308. // chr15 // 88 // 74 // 15 // 17 // 0 /// AL357534 // GenBank // Homo sapiens mRNA full length insert cDNA clone EUROIMAGE 2250774. // chr15 // 80 // 65 // 12 // 15 // 0 /// AL357571 // GenBank // Homo sapiens EST from clone 2238942, 5 end. // chr15 // 79 // 83 // 15 // 19 // 0 /// BC006219 // GenBank // Homo sapiens mesoderm posterior 1 homolog (mouse), mRNA (cDNA clone MGC:10676 IMAGE:3944350), complete cds. // chr15 // 91 // 100 // 21 // 23 // 0 /// ENST00000559894 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:89749891:89751137:-1 gene:ENSG00000166823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 43 // 43 // 10 // 23 // 1 /// GENSCAN00000010421 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:89750144:89751231:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 74 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT048337 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr15 // 43 // 43 // 10 // 23 // 1
NM_001150 // RefSeq // Homo sapiens alanyl (membrane) aminopeptidase (ANPEP), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000300060 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:89784889:89814862:-1 gene:ENSG00000166825 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000560030 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:89797659:89803969:-1 gene:ENSG00000166825 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// AK298134 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56120 complete cds, highly similar to Aminopeptidase N (EC 3.4.11.2). // chr15 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// AK298339 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55496 complete cds, highly similar to Aminopeptidase N (EC 3.4.11.2). // chr15 // 94 // 67 // 17 // 18 // 0 /// AK300946 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56158 complete cds, highly similar to Aminopeptidase N (EC 3.4.11.2). // chr15 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// BC058928 // GenBank // Homo sapiens alanyl (membrane) aminopeptidase, mRNA (cDNA clone MGC:65137 IMAGE:6020902), complete cds. // chr15 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// M22324 // GenBank // Human aminopeptidase N/CD13 mRNA encoding aminopeptidase N, complete cds. // chr15 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AK298242 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51269 complete cds, highly similar to Aminopeptidase N (EC 3.4.11.2). // chr15 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// GENSCAN00000010435 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:89785349:89806583:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
NM_001282380 // RefSeq // Homo sapiens actin-related protein 2/3 complex inhibitor (ARPIN), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 60 // 12 // 12 // 0 /// NM_182616 // RefSeq // Homo sapiens actin-related protein 2/3 complex inhibitor (ARPIN), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000357484 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:89895006:89912956:-1 gene:ENSG00000242498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000460685 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:15:89900875:89912687:-1 gene:ENSG00000242498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 60 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000558648 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:89837622:89908399:-1 gene:ENSG00000250021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 40 // 8 // 8 // 0 /// BC053602 // GenBank // Homo sapiens chromosome 15 open reading frame 38, mRNA (cDNA clone MGC:61550 IMAGE:5770387), complete cds. // chr15 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// NM_001199058 // RefSeq // Homo sapiens C15orf38-AP3S2 readthrough (C15orf38-AP3S2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 20 // 20 // 1 /// ENST00000398333 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:89834308:89912882:-1 gene:ENSG00000250021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 90 // 90 // 18 // 20 // 1 /// GENSCAN00000010423 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:89835515:89963388:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 90 // 90 // 18 // 20 // 1
NR_028287 // RefSeq // Homo sapiens GABA(A) receptors associated protein like 3, pseudogene (GABARAPL3), non-coding RNA. // chr15 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000412799 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:15:90348844:90349197:-1 gene:ENSG00000238244 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr15 // 100 // 43 // 9 // 9 // 0 /// AF180519 // GenBank // Homo sapiens GABA-A receptor-associated protein mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000049256 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:90348844:90349197:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 43 // 9 // 9 // 0 /// NONHSAT048391 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// TCONS_00023206-XLOC_011576 // Rinn lincRNA // linc-CIB1-2 chr15:-:90889764-90892679 // chr15 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
ENST00000482412 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:90855935:90856207:-1 gene:ENSG00000241869 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT048427 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000363272 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:90977208:90977305:-1 gene:ENSG00000200142 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT048457 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_207446 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 174, member B (FAM174B), mRNA. // chr15 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000327355 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:92617443:92655958:-1 gene:ENSG00000185442 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000555064 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:92619058:92639244:-1 gene:ENSG00000185442 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 26 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000555696 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:92619119:92653210:-1 gene:ENSG00000185442 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 26 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000555748 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:92619000:92655404:-1 gene:ENSG00000185442 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 32 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000557480 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:15:92619183:92668043:-1 gene:ENSG00000185442 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 26 // 8 // 8 // 0 /// BC060873 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 174, member B, mRNA (cDNA clone MGC:71826 IMAGE:30348143), complete cds. // chr15 // 93 // 87 // 25 // 27 // 0 /// BC110328 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 174, member B, mRNA (cDNA clone IMAGE:5730418). // chr15 // 89 // 61 // 17 // 19 // 0 /// GENSCAN00000001294 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:92532354:92655659:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1
AF116651 // GenBank HTC // Homo sapiens PRO0800 mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000515920 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:97472126:97472252:-1 gene:ENSG00000251729 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT050735 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_182562 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 169, member B (FAM169B), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000332908 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:15:98439631:98480780:-1 gene:ENSG00000185087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000558256 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:98437162:98514382:-1 gene:ENSG00000185087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK097062 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39743 fis, clone SMINT2017319. // chr15 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000031102 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:98428248:98487134:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NM_001102612 // RefSeq // Homo sapiens pyroglutamyl-peptidase I-like (PGPEP1L), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NM_001167902 // RefSeq // Homo sapiens pyroglutamyl-peptidase I-like (PGPEP1L), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006720400 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens pyroglutamyl-peptidase I-like (PGPEP1L), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000378919 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:98968280:99005562:-1 gene:ENSG00000183571 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// ENST00000535714 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:15:98968230:99007795:-1 gene:ENSG00000183571 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK058162 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ25433 fis, clone TST06506. // chr15 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// GENSCAN00000031100 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:98963463:98971158:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
ENST00000364854 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:15:99681786:99681877:-1 gene:ENSG00000201724 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT050877 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_139057 // RefSeq // Homo sapiens ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 17 (ADAMTS17), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000268070 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:99971589:100342005:-1 gene:ENSG00000140470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000378898 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:100063614:100339129:-1 gene:ENSG00000140470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 100 // 43 // 13 // 13 // 0 /// AK131344 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ16363 fis, clone THYMU2031139, weakly similar to Homo sapiens zinc metalloprotease ADAMTS7 (ADAMTS7) mRNA. // chr15 // 92 // 43 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000009459 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:99993048:100171710:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1 /// GENSCAN00000009465 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:100248362:100350142:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
ENST00000517148 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:100074081:100074190:-1 gene:ENSG00000252957 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT051082 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NR_028139 // RefSeq // Homo sapiens spermatogenesis associated 41 (non-protein coding) (SPATA41), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NR_028140 // RefSeq // Homo sapiens spermatogenesis associated 41 (non-protein coding) (SPATA41), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr15 // 100 // 92 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000558307 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:100344457:100349388:-1 gene:ENSG00000189419 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr15 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000560282 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:100344478:100349655:-1 gene:ENSG00000189419 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr15 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// BC028144 // GenBank // Homo sapiens hypothetical LOC388182, mRNA (cDNA clone MGC:40120 IMAGE:5214282), complete cds. // chr15 // 100 // 92 // 11 // 11 // 0 /// BC068097 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6301779, partial cds. // chr15 // 67 // 67 // 8 // 12 // 1 /// NONHSAT051091 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT051092 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 92 // 11 // 11 // 0 /// TCONS_00023209-XLOC_011609 // Rinn lincRNA // linc-ADAMTS17 chr15:-:100884661-100890438 // chr15 // 100 // 92 // 11 // 11 // 0 /// TCONS_00023210-XLOC_011609 // Rinn lincRNA // linc-ADAMTS17 chr15:-:100884661-100890923 // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000009465 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:100248362:100350142:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 67 // 67 // 8 // 12 // 1 /// NONHSAT051094 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 67 // 67 // 8 // 12 // 1 /// TCONS_00023833-XLOC_011609 // Rinn lincRNA // linc-ADAMTS17 chr15:-:100889133-100890359 // chr15 // 67 // 67 // 8 // 12 // 1
ENST00000363225 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:100560686:100560792:-1 gene:ENSG00000200095 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT051111 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_014918 // RefSeq // Homo sapiens chondroitin sulfate synthase 1 (CHSY1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000254190 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:101175723:101251932:-1 gene:ENSG00000131873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB071402 // GenBank // Homo sapiens ChSy mRNA for chondroitin synthase, complete cds. // chr15 // 94 // 62 // 15 // 16 // 0 /// AY358529 // GenBank // Homo sapiens clone DNA68836 CHSY1 (UNQ756) mRNA, complete cds. // chr15 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC046247 // GenBank // Homo sapiens chondroitin sulfate synthase 1, mRNA (cDNA clone MGC:47652 IMAGE:5751618), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000010472 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:101235046:101251456:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
ENST00000558036 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:101281514:101295282:-1 gene:ENSG00000131876 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000560433 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:101281515:101288448:-1 gene:ENSG00000131876 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// AK090986 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ33667 fis, clone BRAMY2027782, moderately similar to U2 SMALL NUCLEAR RIBONUCLEOPROTEIN A. // chr15 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC067846 // GenBank // Homo sapiens small nuclear ribonucleoprotein polypeptide A, mRNA (cDNA clone MGC:87438 IMAGE:30330402), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONHSAT051163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr15 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
ENST00000516805 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:101648206:101648312:-1 gene:ENSG00000252614 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT051200 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000488309 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:101773238:101773513:-1 gene:ENSG00000240927 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT051474 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENST00000328113 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:101926805:101927707:-1 gene:ENSG00000183909 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000492842 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:62948:63887:1 gene:ENSG00000240361 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr15 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// ENST00000588632 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:19:104535:105471:1 gene:ENSG00000267310 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONHSAT000016 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// NONHSAT051704 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONHSAT060106 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
ENST00000399966 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:156014623:156016837:-1 gene:ENSG00000185203 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr16 // 82 // 89 // 14 // 17 // 0 /// ENST00000527434 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:22910:25123:1 gene:ENSG00000231439 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr16 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// BC032901 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5261280. // chr16 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT051728 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT051729 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT051730 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT139251 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 82 // 89 // 14 // 17 // 0 /// NONHSAT139819 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 82 // 89 // 14 // 17 // 0 /// TCONS_00024242-XLOC_011617 // Rinn lincRNA // linc-SNRNP25 chr16:+:72909-75121 // chr16 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0
NM_005332 // RefSeq // Homo sapiens hemoglobin, zeta (HBZ), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000252951 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:152687:154503:1 gene:ENSG00000130656 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC027892 // GenBank // Homo sapiens hemoglobin, zeta, mRNA (cDNA clone MGC:34397 IMAGE:5224569), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// CR456848 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834G076D for gene HBZ, hemoglobin, zeta; complete cds, incl. stopcodon. // chr16 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0 /// M24173 // GenBank // Human zeta hemoglobin mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0 /// GENSCAN00000050036 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:152910:154400:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0
ENST00000252951 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:152687:154503:1 gene:ENSG00000130656 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 75 // 100 // 9 // 12 // 0 /// ENST00000354915 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:163122:165156:1 gene:ENSG00000206178 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr16 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NM_005332 // RefSeq // Homo sapiens hemoglobin, zeta (HBZ), mRNA. // chr16 // 67 // 100 // 8 // 12 // 0 /// BC027892 // GenBank // Homo sapiens hemoglobin, zeta, mRNA (cDNA clone MGC:34397 IMAGE:5224569), complete cds. // chr16 // 67 // 100 // 8 // 12 // 0 /// CR456848 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834G076D for gene HBZ, hemoglobin, zeta; complete cds, incl. stopcodon. // chr16 // 67 // 100 // 8 // 12 // 0 /// M24173 // GenBank // Human zeta hemoglobin mRNA, complete cds. // chr16 // 67 // 100 // 8 // 12 // 0 /// GENSCAN00000050012 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:163161:165156:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// TCONS_l2_00009549-XLOC_l2_005089 // Broad TUCP // linc-HBM chr16:+:213180-215176 // chr16 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000050036 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:152910:154400:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 67 // 100 // 8 // 12 // 0
NM_001003938 // RefSeq // Homo sapiens hemoglobin, mu (HBM), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000356815 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:165978:166768:1 gene:ENSG00000206177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000472539 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:153892:166761:1 gene:ENSG00000206177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 95 // 71 // 19 // 20 // 0 /// ENST00000496585 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:164482:166761:1 gene:ENSG00000206177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 95 // 71 // 19 // 20 // 0 /// AY698022 // GenBank // Homo sapiens hemoglobin mu chain (HBM) mRNA, complete cds. // chr16 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// BC035682 // GenBank // Homo sapiens hemoglobin, mu, mRNA (cDNA clone MGC:46348 IMAGE:5749846), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000050029 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:165998:166708:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0
ENST00000384514 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:16:178554:178656:1 gene:ENSG00000207243 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT051748 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_005331 // RefSeq // Homo sapiens hemoglobin, theta 1 (HBQ1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000199708 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:180453:181181:1 gene:ENSG00000086506 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// BC056686 // GenBank // Homo sapiens hemoglobin, theta 1, mRNA (cDNA clone MGC:61857 IMAGE:6738551), complete cds. // chr16 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000050031 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:180487:187294:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1
NM_001008393 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 46 (C4orf46), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0 /// ENST00000379205 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:158666679:158672046:-1 gene:ENSG00000205208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0 /// AK027539 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ14633 fis, clone NT2RP2000938. // chr16 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0 /// BC065017 // GenBank // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 46, mRNA (cDNA clone MGC:70860 IMAGE:6018280), complete cds. // chr16 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0 /// BC094775 // GenBank // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 46, mRNA (cDNA clone MGC:104679 IMAGE:30345779), complete cds. // chr16 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0 /// ENST00000508457 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:158666684:158671892:-1 gene:ENSG00000205208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0 /// ENST00000382990 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:231134:231472:1 gene:ENSG00000206168 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr16 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONHSAT051755 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001176 // RefSeq // Homo sapiens Rho GDP dissociation inhibitor (GDI) gamma (ARHGDIG), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000219409 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:280606:283010:1 gene:ENSG00000242173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000414650 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:280855:282810:1 gene:ENSG00000242173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 89 // 75 // 16 // 18 // 0 /// ENST00000447871 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:16:280450:282688:1 gene:ENSG00000242173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// AB593111 // GenBank // Homo sapiens ARHGDIG mRNA for rho GDP-dissociation inhibitor 3, complete cds, clone: HP06965-RBd09D08. // chr16 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// AF498928 // GenBank // Homo sapiens Rho GDP dissociation inhibitor gamma (ARHGDIG) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// BC047699 // GenBank // Homo sapiens Rho GDP dissociation inhibitor (GDI) gamma, mRNA (cDNA clone MGC:51949 IMAGE:5581679), complete cds. // chr16 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// U82532 // GenBank // Homo sapiens GDI-dissociation inhibitor RhoGDIgamma mRNA, complete cds. // chr16 // 91 // 96 // 21 // 23 // 0 /// ENST00000477621 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:281082:282840:1 gene:ENSG00000242173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 75 // 75 // 18 // 24 // 1 /// GENSCAN00000050037 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:280681:282814:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// AB127078 // GenBank // Homo sapiens ARHGDIG, PDIP polycistronic mRNA for Rho GDP dissociation inhibitor gamma, pancreatic protein disulfide isomerase, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001176 // RefSeq // Homo sapiens Rho GDP dissociation inhibitor (GDI) gamma (ARHGDIG), mRNA. // chr16 // 50 // 50 // 9 // 18 // 1 /// ENST00000219409 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:280606:283010:1 gene:ENSG00000242173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 50 // 50 // 9 // 18 // 1 /// AB593111 // GenBank // Homo sapiens ARHGDIG mRNA for rho GDP-dissociation inhibitor 3, complete cds, clone: HP06965-RBd09D08. // chr16 // 44 // 44 // 8 // 18 // 1 /// BC047699 // GenBank // Homo sapiens Rho GDP dissociation inhibitor (GDI) gamma, mRNA (cDNA clone MGC:51949 IMAGE:5581679), complete cds. // chr16 // 44 // 44 // 8 // 18 // 1 /// AB127078 // GenBank // Homo sapiens ARHGDIG, PDIP polycistronic mRNA for Rho GDP dissociation inhibitor gamma, pancreatic protein disulfide isomerase, complete cds. // chr16 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0
GENSCAN00000050018 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:353124:362532:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1
NM_005632 // RefSeq // Homo sapiens calpain 15 (CAPN15), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// XM_006720933 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens calpain 15 (CAPN15), transcript variant X9, mRNA. // chr16 // 100 // 91 // 41 // 41 // 0 /// XM_006720934 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens calpain 15 (CAPN15), transcript variant X10, mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// ENST00000219611 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:527856:554636:1 gene:ENSG00000103326 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENST00000562370 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:527717:547392:1 gene:ENSG00000103326 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 29 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000565010 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:552297:554636:1 gene:ENSG00000103326 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 24 // 11 // 11 // 0 /// BC044259 // GenBank // Homo sapiens small optic lobes homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:6150279), partial cds. // chr16 // 100 // 24 // 11 // 11 // 0 /// U85647 // GenBank // Homo sapiens small optic lobes homolog (SOLH) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 98 // 44 // 44 // 0 /// BC112918 // GenBank // Homo sapiens small optic lobes homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:7469837), complete cds. // chr16 // 60 // 60 // 27 // 45 // 1 /// NONHSAT051787 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 100 // 24 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000050069 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:543487:568419:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 84 // 84 // 38 // 45 // 1
NM_145270 // RefSeq // Homo sapiens proline rich 35 (PRR35), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_005255130 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chromosome 16 open reading frame 11 (C16orf11), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006720849 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chromosome 16 open reading frame 11 (C16orf11), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000409413 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:560422:565528:1 gene:ENSG00000161992 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC016613 // GenBank // Homo sapiens chromosome 16 open reading frame 11, mRNA (cDNA clone MGC:9566 IMAGE:3874510), complete cds. // chr16 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000050069 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:543487:568419:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NM_176677 // RefSeq // Homo sapiens NHL repeat containing 4 (NHLRC4), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000424439 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:566996:569487:1 gene:ENSG00000257108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENST00000540585 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:567005:569495:1 gene:ENSG00000257108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000293874 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:566995:574519:1 gene:ENSG00000007541 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// ENST00000409527 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:567009:583035:1 gene:ENSG00000007541 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// AK314361 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ95129, highly similar to Homo sapiens phosphatidylinositol glycan, class Q (PIGQ), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// GENSCAN00000050069 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:543487:568419:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NM_053284 // RefSeq // Homo sapiens WAP, follistatin/kazal, immunoglobulin, kunitz and netrin domain containing 1 (WFIKKN1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000319070 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:630932:634116:1 gene:ENSG00000127578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000573440 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:629239:634116:1 gene:ENSG00000127578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF422194 // GenBank // Homo sapiens putative multivalent protease inhibitor WFIKKN (WFIKKN) mRNA, complete cds. // chr16 // 89 // 97 // 25 // 28 // 0 /// AK128777 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ45421 fis, clone BRHIP3036371. // chr16 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// BC101602 // GenBank // Homo sapiens WAP, follistatin/kazal, immunoglobulin, kunitz and netrin domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:126651 IMAGE:8069108), complete cds. // chr16 // 89 // 93 // 24 // 27 // 0 /// BC101606 // GenBank // Homo sapiens WAP, follistatin/kazal, immunoglobulin, kunitz and netrin domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:126655 IMAGE:8069112), complete cds. // chr16 // 81 // 90 // 21 // 26 // 0 /// GENSCAN00000050058 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:611466:634057:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0
NM_001278721 // RefSeq // Homo sapiens rhomboid, veinlet-like 1 (Drosophila) (RHBDL1), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// ENST00000219551 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:676075:678268:1 gene:ENSG00000103269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000450775 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:675722:678267:1 gene:ENSG00000103269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// ENST00000561556 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:16:675683:677843:1 gene:ENSG00000103269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 93 // 58 // 14 // 15 // 0 /// AK294136 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50740 complete cds, highly similar to Rhomboid-related protein 1 (EC 3.4.21.105). // chr16 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// BC120874 // GenBank // Homo sapiens rhomboid, veinlet-like 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:135064 IMAGE:40081041), complete cds. // chr16 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// BC120875 // GenBank // Homo sapiens rhomboid, veinlet-like 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:135065 IMAGE:40081042), complete cds. // chr16 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// Y17108 // GenBank // Homo sapiens mRNA for rhomboid-related protein, complete CDS. // chr16 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NM_001278720 // RefSeq // Homo sapiens rhomboid, veinlet-like 1 (Drosophila) (RHBDL1), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// ENST00000352681 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:675666:678268:1 gene:ENSG00000103269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// GENSCAN00000050039 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:636783:678052:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
AK304832 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52617 complete cds. // chr16 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// GENSCAN00000050050 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:705579:717387:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_024042 // RefSeq // Homo sapiens meteorin, glial cell differentiation regulator (METRN), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000219542 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:715338:717390:1 gene:ENSG00000103260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000567076 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:715641:717477:1 gene:ENSG00000103260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000568223 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:715115:719655:1 gene:ENSG00000103260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000568415 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:716574:717480:1 gene:ENSG00000103260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// BC000662 // GenBank // Homo sapiens meteorin, glial cell differentiation regulator, mRNA (cDNA clone MGC:2601 IMAGE:3347703), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000570132 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:715237:717247:1 gene:ENSG00000103260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// ENST00000564661 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:716427:717817:1 gene:ENSG00000103260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// AK308711 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ98752. // chr16 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// GENSCAN00000050050 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:705579:717387:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NONHSAT051879 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_001013638 // RefSeq // Homo sapiens proline rich 25 (PRR25), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000301698 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:805443:813861:1 gene:ENSG00000167945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000050042 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:813406:813861:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0
NM_014587 // RefSeq // Homo sapiens SRY (sex determining region Y)-box 8 (SOX8), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000293894 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:981808:986979:1 gene:ENSG00000005513 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000566034 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:982086:986978:1 gene:ENSG00000005513 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0 /// AF226675 // GenBank // Homo sapiens transcription factor SOX8 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// AK024491 // GenBank // Homo sapiens mRNA for FLJ00094 protein, partial cds. // chr16 // 93 // 75 // 14 // 15 // 0 /// BC031797 // GenBank // Homo sapiens SRY (sex determining region Y)-box 8, mRNA (cDNA clone MGC:24837 IMAGE:4937883), complete cds. // chr16 // 95 // 100 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000050048 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:981701:985386:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0
GENSCAN00000048718 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:1010120:1038957:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NM_001053 // RefSeq // Homo sapiens somatostatin receptor 5 (SSTR5), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001172560 // RefSeq // Homo sapiens somatostatin receptor 5 (SSTR5), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000293897 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:1078781:1080142:1 gene:ENSG00000162009 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// DQ448304 // GenBank // Homo sapiens somatostatin receptor subtype 5C (SSTR5) mRNA, complete cds. // chr16 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0 /// DQ448303 // GenBank // Homo sapiens somatostatin receptor subtype 5B (SSTR5) mRNA, complete cds. // chr16 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// GENSCAN00000048760 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:1052963:1093360:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_012217 // RefSeq // Homo sapiens tryptase delta 1 (TPSD1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000211076 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:1256133:1258998:1 gene:ENSG00000095917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000397534 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:1256059:1258531:1 gene:ENSG00000095917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC069143 // GenBank // Homo sapiens tryptase delta 1, mRNA (cDNA clone MGC:95428 IMAGE:7217003), complete cds. // chr16 // 87 // 100 // 20 // 23 // 0 /// GENSCAN00000048744 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:1256281:1258496:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 95 // 87 // 19 // 20 // 0
GENSCAN00000048723 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:1289568:1316293:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1
GENSCAN00000048726 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:1430546:1433397:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_016111 // RefSeq // Homo sapiens telomere maintenance 2 (TELO2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006720993 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens telomere maintenance 2 (TELO2), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000262319 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:1493363:1510457:1 gene:ENSG00000100726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000497339 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:1493344:1507325:1 gene:ENSG00000100726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000564507 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:1501707:1506665:1 gene:ENSG00000100726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// BC017188 // GenBank // Homo sapiens TEL2, telomere maintenance 2, homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:1356 IMAGE:3139743), complete cds. // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AK302103 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58340 complete cds. // chr16 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000048728 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:1494282:1509936:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// AK294283 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60481 complete cds. // chr16 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0
NM_024600 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 204 (TMEM204), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000566264 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:1533573:1555580:1 gene:ENSG00000131634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AY358178 // GenBank // Homo sapiens clone DNA147253 TVQR6509 (UNQ6509) mRNA, complete cds. // chr16 // 94 // 53 // 15 // 16 // 0 /// AY676494 // GenBank // Homo sapiens claudin-like protein 24 (CLP24) mRNA, complete cds. // chr16 // 93 // 90 // 25 // 27 // 0 /// BC105785 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 204, mRNA (cDNA clone MGC:111564 IMAGE:4692469), complete cds. // chr16 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// NM_001256541 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 204 (TMEM204), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// ENST00000253934 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:1528688:1555580:1 gene:ENSG00000131634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// BC004932 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 204, mRNA (cDNA clone MGC:10688 IMAGE:3622114), complete cds. // chr16 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// GENSCAN00000048722 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:1534276:1543164:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_020825 // RefSeq // Homo sapiens Crm, cramped-like (Drosophila) (CRAMP1L), mRNA. // chr16 // 100 // 17 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000293925 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:16:1614640:1677906:1 gene:ENSG00000007545 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 17 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000397412 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:1612325:1677908:1 gene:ENSG00000007545 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 17 // 36 // 36 // 0 /// BC137172 // GenBank // Homo sapiens Crm, cramped-like (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:168792 IMAGE:9021169), complete cds. // chr16 // 100 // 14 // 30 // 30 // 0 /// BC137173 // GenBank // Homo sapiens Crm, cramped-like (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:168793 IMAGE:9021170), complete cds. // chr16 // 100 // 14 // 30 // 30 // 0 /// BC152477 // GenBank // Homo sapiens Crm, cramped-like (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:176736 IMAGE:8862615), complete cds. // chr16 // 94 // 15 // 29 // 31 // 0 /// ENST00000454337 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:1632259:1686715:1 gene:ENSG00000261732 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 96 // 12 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000048736 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:1613972:1671812:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 86 // 180 // 180 // 0 /// AL833832 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp434O1216 (from clone DKFZp434O1216). // chr16 // 96 // 12 // 25 // 26 // 0
NM_001257370 // RefSeq // Homo sapiens essential meiotic structure-specific endonuclease subunit 2 (EME2), mRNA. // chr16 // 90 // 83 // 18 // 20 // 0 /// XM_005255162 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens essential meiotic structure-specific endonuclease subunit 2 (EME2), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 90 // 83 // 18 // 20 // 0 /// EF452422 // GenBank // Homo sapiens endonuclease EME2 (EME2) mRNA, complete cds. // chr16 // 90 // 83 // 18 // 20 // 0 /// ENST00000568449 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:16:1773207:1776311:1 gene:ENSG00000197774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 75 // 75 // 18 // 24 // 1 /// ENST00000570069 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:1773326:1780627:1 gene:ENSG00000197774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 83 // 83 // 20 // 24 // 1 /// AK074080 // GenBank // Homo sapiens mRNA for FLJ00151 protein. // chr16 // 83 // 83 // 20 // 24 // 1 /// ENST00000561903 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:1775315:1781708:1 gene:ENSG00000197774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1 /// GENSCAN00000048724 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:1773228:1776238:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT052007 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr16 // 83 // 83 // 20 // 24 // 1
NM_001018104 // RefSeq // Homo sapiens fumarylacetoacetate hydrolase domain containing 1 (FAHD1), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// NM_031208 // RefSeq // Homo sapiens fumarylacetoacetate hydrolase domain containing 1 (FAHD1), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000382666 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:1826967:1840207:1 gene:ENSG00000180185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000427358 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:1826941:1828914:1 gene:ENSG00000180185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// AF293367 // GenBank // Homo sapiens clone 785627 unknown mRNA. // chr16 // 80 // 37 // 8 // 10 // 0 /// NM_001142398 // RefSeq // Homo sapiens fumarylacetoacetate hydrolase domain containing 1 (FAHD1), transcript variant 3, mRNA. // chr16 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// ENST00000382668 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:1826967:1840207:1 gene:ENSG00000180185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// BC063017 // GenBank // Homo sapiens fumarylacetoacetate hydrolase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:74876 IMAGE:5226963), complete cds. // chr16 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
NM_174903 // RefSeq // Homo sapiens ring finger protein 151 (RNF151), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_005255129 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ring finger protein 151 (RNF151), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000321392 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:16:1967273:1968975:1 gene:ENSG00000179580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000569210 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:1966823:1968948:1 gene:ENSG00000179580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000569714 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:1966874:1968975:1 gene:ENSG00000179580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC029501 // GenBank // Homo sapiens ring finger protein 151, mRNA (cDNA clone IMAGE:5272560), partial cds. // chr16 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC113014 // GenBank // Homo sapiens ring finger protein 151, mRNA (cDNA clone MGC:129921 IMAGE:40029536), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000048768 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:1965719:1978685:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0
NM_005262 // RefSeq // Homo sapiens growth factor, augmenter of liver regeneration (GFER), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000248114 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:1984213:1987749:1 gene:ENSG00000127554 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000565658 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:1984332:1986618:1 gene:ENSG00000127554 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000567719 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:1984711:1986115:1 gene:ENSG00000127554 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000569451 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:1984207:1986112:1 gene:ENSG00000127554 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// AF124603 // GenBank // Homo sapiens hepatopoietin HPO1 mRNA, partial cds. // chr16 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// AF124604 // GenBank // Homo sapiens hepatopoietin HPO2 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// AF306863 // GenBank // Homo sapiens hepatopoietin protein mRNA, complete cds. // chr16 // 89 // 33 // 8 // 9 // 0 /// BC002429 // GenBank // Homo sapiens growth factor, augmenter of liver regeneration, mRNA (cDNA clone MGC:1445 IMAGE:3346679), complete cds. // chr16 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC028348 // GenBank // Homo sapiens growth factor, augmenter of liver regeneration, mRNA (cDNA clone MGC:15249 IMAGE:3636052), complete cds. // chr16 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// U31176 // GenBank // Homo sapiens ERV1 (ERV1) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
NM_004209 // RefSeq // Homo sapiens synaptogyrin 3 (SYNGR3), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000248121 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:1989945:1994275:1 gene:ENSG00000127561 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000563869 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:1989660:1993169:1 gene:ENSG00000127561 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// BC014087 // GenBank // Homo sapiens synaptogyrin 3, mRNA (cDNA clone MGC:20003 IMAGE:4334996), complete cds. // chr16 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000562045 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:1991124:1993374:1 gene:ENSG00000127561 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// ENST00000568896 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:16:1990157:1992711:1 gene:ENSG00000127561 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// BC009568 // GenBank // Homo sapiens synaptogyrin 3, mRNA (cDNA clone MGC:12440 IMAGE:3932502), complete cds. // chr16 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// GENSCAN00000018290 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:1990103:1993072:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000618464 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:16:1989999:1994267:1 gene:ENSG00000127561 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
ENST00000582872 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:2013181:2013476:1 gene:ENSG00000265386 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT140309 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001099456 // RefSeq // Homo sapiens neuropeptide W (NPW), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000329610 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:16:2019520:2020754:1 gene:ENSG00000183971 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000566435 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:2019545:2020755:1 gene:ENSG00000183971 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AL365519 // GenBank // Homo sapiens mRNA full length insert cDNA clone EUROIMAGE 2068113. // chr16 // 92 // 52 // 11 // 12 // 0 /// BC171886 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:9054540. // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000567649 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:2009926:2020592:1 gene:ENSG00000183971 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 39 // 39 // 9 // 23 // 1 /// AL365521 // GenBank // Homo sapiens mRNA full length insert cDNA clone EUROIMAGE 2522007. // chr16 // 39 // 39 // 9 // 23 // 1 /// GENSCAN00000018340 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:2019224:2037984:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 48 // 48 // 11 // 23 // 1
ENST00000363189 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:16:2131851:2131950:1 gene:ENSG00000200059 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr16 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT052063 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_032271 // RefSeq // Homo sapiens TNF receptor-associated factor 7, E3 ubiquitin protein ligase (TRAF7), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000326181 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:2155765:2178129:1 gene:ENSG00000131653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000564067 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:2155829:2172589:1 gene:ENSG00000131653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// AY569455 // GenBank // Homo sapiens TRAF7 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000018321 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:2148648:2177958:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 96 // 82 // 22 // 23 // 0
NM_001761 // RefSeq // Homo sapiens cyclin F (CCNF), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000293968 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:2429394:2458851:1 gene:ENSG00000162063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000397066 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:2429394:2458854:1 gene:ENSG00000162063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// BC012349 // GenBank // Homo sapiens cyclin F, mRNA (cDNA clone MGC:20163 IMAGE:4634116), complete cds. // chr16 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// U17105 // GenBank // Human cyclin F mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000569093 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:2429449:2436351:1 gene:ENSG00000162063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 18 // 18 // 8 // 44 // 1 /// GENSCAN00000018293 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:2361771:2464668:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 82 // 82 // 36 // 44 // 1
NM_006181 // RefSeq // Homo sapiens netrin 3 (NTN3), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000293973 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:2471499:2474145:1 gene:ENSG00000162068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U86759 // GenBank // Human netrin-2 like protein (NTN2l) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018319 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:2471702:2474105:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001261816 // RefSeq // Homo sapiens 3-phosphoinositide dependent protein kinase 1 (PDPK1), transcript variant 3, mRNA. // chr16 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0 /// NM_002613 // RefSeq // Homo sapiens 3-phosphoinositide dependent protein kinase 1 (PDPK1), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NM_031268 // RefSeq // Homo sapiens 3-phosphoinositide dependent protein kinase 1 (PDPK1), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000268673 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:2538003:2601095:1 gene:ENSG00000140992 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 90 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000342085 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:2537964:2603188:1 gene:ENSG00000140992 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC006339 // GenBank // Homo sapiens 3-phosphoinositide dependent protein kinase-1, mRNA (cDNA clone MGC:12726 IMAGE:4079551), complete cds. // chr16 // 100 // 50 // 5 // 5 // 0 /// BC012103 // GenBank // Homo sapiens 3-phosphoinositide dependent protein kinase-1, mRNA (cDNA clone MGC:20087 IMAGE:4561371), complete cds. // chr16 // 100 // 50 // 5 // 5 // 0 /// BC033494 // GenBank // Homo sapiens 3-phosphoinositide dependent protein kinase-1, mRNA (cDNA clone MGC:35290 IMAGE:5176294), complete cds. // chr16 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0
NR_015441 // RefSeq // Homo sapiens potassium channel tetramerization domain containing 5 pseudogene (LOC652276), non-coding RNA. // chr16 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000399702 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:2603350:2630494:1 gene:ENSG00000215154 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// AK096394 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39075 fis, clone NT2RP7016911. // chr16 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// AK291606 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78179 complete cds. // chr16 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// BC062576 // GenBank // Homo sapiens hypothetical LOC652276, mRNA (cDNA clone IMAGE:5187889). // chr16 // 86 // 58 // 6 // 7 // 0 /// NONHSAT147803 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0
AK124618 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ42627 fis, clone BRACE3018308. // chr16 // 91 // 100 // 21 // 23 // 0 /// NR_024492 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC645644 (FLJ42627), long non-coding RNA. // chr16 // 52 // 52 // 12 // 23 // 1 /// ENST00000563449 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:2554060:2556060:-1 gene:ENSG00000261613 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr16 // 48 // 48 // 11 // 23 // 1 /// ENST00000569852 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:2561471:2565096:-1 gene:ENSG00000269937 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr16 // 100 // 48 // 11 // 11 // 0 /// AK126677 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44722 fis, clone BRACE3022847. // chr16 // 100 // 48 // 11 // 11 // 0 /// NONHSAT147786 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr16 // 100 // 48 // 11 // 11 // 0 /// NONHSAT052139 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr16 // 70 // 70 // 16 // 23 // 1 /// NONHSAT147812 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 52 // 52 // 12 // 23 // 1 /// NONHSAT147814 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 52 // 52 // 12 // 23 // 1 /// TCONS_00024244-XLOC_011623 // Rinn lincRNA // linc-KCTD5 chr16:+:2693654-2696114 // chr16 // 52 // 52 // 12 // 23 // 1 /// NONHSAT052137 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr16 // 48 // 48 // 11 // 23 // 1 /// NONHSAT052138 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr16 // 48 // 48 // 11 // 23 // 1
NM_018992 // RefSeq // Homo sapiens potassium channel tetramerization domain containing 5 (KCTD5), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000301738 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:2682475:2709030:1 gene:ENSG00000167977 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000564195 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:2682540:2707479:1 gene:ENSG00000167977 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000564246 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:2682533:2699302:1 gene:ENSG00000167977 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0 /// BC007314 // GenBank // Homo sapiens potassium channel tetramerisation domain containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:1078 IMAGE:2989642), complete cds. // chr16 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000018310 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:2682549:2707928:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1
NM_001135086 // RefSeq // Homo sapiens protease, serine, 41 (PRSS41), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000399677 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:2798485:2805132:1 gene:ENSG00000215148 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000421271 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:2798487:2805147:1 gene:ENSG00000215148 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr16 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000018277 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:2798485:2805132:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_001142499 // RefSeq // Homo sapiens FLYWCH family member 2 (FLYWCH2), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NM_001142500 // RefSeq // Homo sapiens FLYWCH family member 2 (FLYWCH2), transcript variant 3, mRNA. // chr16 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// NM_138439 // RefSeq // Homo sapiens FLYWCH family member 2 (FLYWCH2), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_005255078 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens FLYWCH family member 2 (FLYWCH2), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// ENST00000293981 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:2883213:2899382:1 gene:ENSG00000162076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000396958 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:2883186:2899382:1 gene:ENSG00000162076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000572006 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:2883259:2896896:1 gene:ENSG00000162076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000573965 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:2883228:2896723:1 gene:ENSG00000162076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 83 // 44 // 10 // 12 // 0 /// BC014089 // GenBank // Homo sapiens FLYWCH family member 2, mRNA (cDNA clone MGC:20457 IMAGE:4330613), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000572786 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:2898755:2899365:1 gene:ENSG00000162076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// NONHSAT147886 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_020982 // RefSeq // Homo sapiens claudin 9 (CLDN9), mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000445369 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:3012456:3014505:1 gene:ENSG00000213937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AY390431 // GenBank // Homo sapiens HCTP4-binding protein mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0 /// BC065830 // GenBank // Homo sapiens claudin 9, mRNA (cDNA clone MGC:75465 IMAGE:30364848), complete cds. // chr16 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// BC051870 // GenBank // Homo sapiens claudin 9, mRNA (cDNA clone MGC:60245 IMAGE:6172607), complete cds. // chr16 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// GENSCAN00000049330 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:2988277:3014016:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_022468 // RefSeq // Homo sapiens matrix metallopeptidase 25 (MMP25), mRNA. // chr16 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000336577 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:3046681:3060726:1 gene:ENSG00000008516 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000570755 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:3047531:3056162:1 gene:ENSG00000008516 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000575441 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:3056794:3058306:1 gene:ENSG00000008516 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 89 // 25 // 8 // 9 // 0 /// AB042328 // GenBank // Homo sapiens mt6-mmp mRNA for membrane-type 6 matrix metalloproteinase, complete cds. // chr16 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// AF145442 // GenBank // Homo sapiens leukolysin mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// AF185270 // GenBank // Homo sapiens leukolysin (MMP25) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// AJ003144 // GenBank // Homo sapiens mRNA for metalloproteinase. // chr16 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// AJ272137 // GenBank // Homo sapiens mRNA for membrane type matrix metalloproteinase number 6, (MT6-MMP gene). // chr16 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000612971 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:16:3046681:3055949:1 gene:ENSG00000008516 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 33 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000049347 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:3046918:3069355:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 61 // 22 // 22 // 0
ENST00000363334 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:3086143:3086300:1 gene:ENSG00000200204 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT147957 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_012360 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 1, subfamily F, member 1 (OR1F1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000304646 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:3204247:3205188:1 gene:ENSG00000168124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC069335 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 1, subfamily F, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:97054 IMAGE:7262265), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// Y14442 // GenBank // Homo sapiens mRNA for olfactory receptor protein, partial. // chr16 // 87 // 100 // 20 // 23 // 0 /// GENSCAN00000049342 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:3155726:3216549:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0
NR_002169 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 1, subfamily F, member 2 (OR1F2P), non-coding RNA. // chr16 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000570470 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:3215611:3216543:1 gene:ENSG00000203581 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr16 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// AJ003145 // GenBank // Homo sapiens mRNA for olfactory receptor protein, pseudogene. // chr16 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// GENSCAN00000049342 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:3155726:3216549:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0
NR_033904 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 921 (LINC00921), long non-coding RNA. // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000573951 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:3263743:3267567:1 gene:ENSG00000006194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT148015 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT148017 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT148016 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1
NM_005741 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 263 (ZNF263), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_005255031 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens zinc finger protein 263 (ZNF263), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000219069 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:3282943:3291460:1 gene:ENSG00000006194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000538765 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:3263800:3291029:1 gene:ENSG00000006194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// AK295350 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57935 complete cds, highly similar to Zinc finger protein 263. // chr16 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// BC008805 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 263, mRNA (cDNA clone MGC:10489 IMAGE:3945548), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// D88827 // GenBank // Homo sapiens mRNA for zinc finger protein FPM315, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000573578 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:3283506:3286884:1 gene:ENSG00000006194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// ENST00000574253 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:3283510:3289835:1 gene:ENSG00000006194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// ENST00000575823 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:3283955:3289875:1 gene:ENSG00000006194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// GENSCAN00000049337 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:3283819:3291372:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0
NM_153028 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 75a (ZNF75A), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000498240 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:3305406:3318574:1 gene:ENSG00000162086 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000571101 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:3305508:3317252:1 gene:ENSG00000162086 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000572999 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:3311620:3316924:1 gene:ENSG00000162086 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 38 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000574298 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:3305486:3318852:1 gene:ENSG00000162086 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK093979 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ36660 fis, clone UTERU2002662, highly similar to ZINC FINGER PROTEIN 75. // chr16 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// BC119652 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 75a, mRNA (cDNA clone MGC:149511 IMAGE:40115880), complete cds. // chr16 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// BC119653 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 75a, mRNA (cDNA clone MGC:149512 IMAGE:40115881), complete cds. // chr16 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000617839 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:16:3311790:3317925:1 gene:ENSG00000162086 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000049329 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:3308429:3319029:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1
ENST00000575234 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:3305484:3309472:1 gene:ENSG00000162086 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC150306 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:8860416. // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006720994 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens zinc finger protein 75D-like (LOC102724873), mRNA. // chr16 // 54 // 54 // 13 // 24 // 1 /// ENST00000498240 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:3305406:3318574:1 gene:ENSG00000162086 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 54 // 54 // 13 // 24 // 1 /// AK093979 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ36660 fis, clone UTERU2002662, highly similar to ZINC FINGER PROTEIN 75. // chr16 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1 /// ENST00000612186 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:16:3308332:3309449:1 gene:ENSG00000162086 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT148031 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000049329 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:3308429:3319029:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1
NM_012368 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily C, member 1 (OR2C1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000304936 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:3355889:3357294:1 gene:ENSG00000168158 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC069158 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily C, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:95444 IMAGE:7217019), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC069456 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily C, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:97065 IMAGE:7262277), complete cds. // chr16 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// BC126269 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily C, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:161547 IMAGE:8991985), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC130328 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily C, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:163200 IMAGE:40146359), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049354 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:3355941:3356879:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000618352 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:16:3382113:3397745:1 gene:ENSG00000262621 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AF390550 // GenBank // Homo sapiens cervical cancer suppressor gene 5 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
AK098732 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ25866 fis, clone CBR01987. // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT148076 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_032575 // RefSeq // Homo sapiens GLIS family zinc finger 2 (GLIS2), mRNA. // chr16 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000262366 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:4314761:4339597:1 gene:ENSG00000126603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000433375 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:16:4332224:4339597:1 gene:ENSG00000126603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// AF325914 // GenBank // Homo sapiens Kruppel-like zinc finger protein GLIS2 mRNA, complete cds. // chr16 // 83 // 64 // 15 // 18 // 0 /// AK126918 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44970 fis, clone BRAWH3000446, highly similar to Homo sapiens GLIS family zinc finger 2 (GLIS2), mRNA. // chr16 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENST00000612491 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR16_3_CTG1:4332224:4339597:1 gene:ENSG00000274636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 95 // 75 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000003204 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:4332281:4337524:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000016725 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR16_3_CTG1:4332281:4337524:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 94 // 64 // 17 // 18 // 0
NM_138440 // RefSeq // Homo sapiens vasorin (VASN), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000304735 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:4371848:4383528:1 gene:ENSG00000168140 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY166584 // GenBank // Homo sapiens vasorin mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// AY358298 // GenBank // Homo sapiens clone DNA44804 CSRV314 (UNQ314) mRNA, complete cds. // chr16 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// AY358299 // GenBank // Homo sapiens clone DNA45495 CSRV314 (UNQ314) mRNA, complete cds. // chr16 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// BC068575 // GenBank // Homo sapiens vasorin, mRNA (cDNA clone MGC:87552 IMAGE:30349094), complete cds. // chr16 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENST00000622615 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR16_3_CTG1:4373807:4385487:1 gene:ENSG00000274334 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000003211 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:4380878:4382899:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000016727 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR16_3_CTG1:4382837:4384858:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0
AY358225 // GenBank // Homo sapiens clone DNA86575 GRTR3118 (UNQ3118) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000613380 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:16:4658851:4659151:1 gene:ENSG00000278700 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_139170 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 16 open reading frame 71 (C16orf71), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// XM_006720851 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chromosome 16 open reading frame 71 (C16orf71), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000299320 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:4734272:4749396:1 gene:ENSG00000166246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000586256 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:4734502:4749396:1 gene:ENSG00000166246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000590191 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:16:4734480:4749395:1 gene:ENSG00000166246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0 /// AK301794 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56540 complete cds. // chr16 // 100 // 71 // 29 // 29 // 0 /// BC035024 // GenBank // Homo sapiens chromosome 16 open reading frame 71, mRNA (cDNA clone MGC:33631 IMAGE:4826923), complete cds. // chr16 // 95 // 98 // 38 // 40 // 0 /// BX648126 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686H2240 (from clone DKFZp686H2240). // chr16 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000586724 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:4734344:4740345:1 gene:ENSG00000166246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 22 // 22 // 9 // 41 // 1 /// GENSCAN00000003194 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:4733800:4747029:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 59 // 24 // 24 // 0
NM_001079514 // RefSeq // Homo sapiens ubinuclein 1 (UBN1), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NM_001288656 // RefSeq // Homo sapiens ubinuclein 1 (UBN1), transcript variant 3, mRNA. // chr16 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000262376 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:4847631:4882360:1 gene:ENSG00000118900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000396658 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:4852215:4882360:1 gene:ENSG00000118900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000590769 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:16:4848380:4880294:1 gene:ENSG00000118900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// AF108460 // GenBank // Homo sapiens ubinuclein (UBN1) mRNA, alternatively spliced, complete cds. // chr16 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AF108461 // GenBank // Homo sapiens ubinuclein (UBN1) mRNA, alternatively spliced, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK300131 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61704 complete cds, highly similar to Ubinuclein. // chr16 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000003182 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:4869252:4880250:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0
NM_014692 // RefSeq // Homo sapiens SEC14-like 5 (S. cerevisiae) (SEC14L5), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENST00000251170 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:4958317:5019158:1 gene:ENSG00000103184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENST00000587469 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:4959255:4991870:1 gene:ENSG00000103184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 91 // 24 // 10 // 11 // 0 /// AB007880 // GenBank // Homo sapiens KIAA0420 mRNA, complete cds. // chr16 // 96 // 100 // 43 // 45 // 0 /// GENSCAN00000016103 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:4970686:5014970:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 73 // 33 // 33 // 0
AF204269 // GenBank // Homo sapiens pRbBP-39 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000363999 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:6873899:6874005:1 gene:ENSG00000200869 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT140366 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000475032 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:8683254:8683551:1 gene:ENSG00000243954 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT140401 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_014117 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 16 open reading frame 72 (C16orf72), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000327827 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:9091648:9121640:1 gene:ENSG00000182831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC113570 // GenBank // Homo sapiens chromosome 16 open reading frame 72, mRNA (cDNA clone MGC:142130 IMAGE:8322622), complete cds. // chr16 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000048626 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:9090601:9103853:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// ENST00000574285 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:9092191:9113181:1 gene:ENSG00000182831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSG00000262944 // chr16 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
ENST00000517118 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:9600097:9600228:1 gene:ENSG00000252927 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr16 // 100 // 62 // 13 // 13 // 0 /// NONHSAT140470 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 62 // 13 // 13 // 0
ENST00000362612 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:10496272:10496374:1 gene:ENSG00000199482 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT140509 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_001243403 // RefSeq // Homo sapiens C-type lectin domain family 16, member A (CLEC16A), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NM_015226 // RefSeq // Homo sapiens C-type lectin domain family 16, member A (CLEC16A), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// XM_005255215 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens C-type lectin domain family 16, member A (CLEC16A), transcript variant X7, mRNA. // chr16 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// XM_006720870 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens C-type lectin domain family 16, member A (CLEC16A), transcript variant X9, mRNA. // chr16 // 95 // 66 // 18 // 19 // 0 /// ENST00000409552 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:10944581:11126787:1 gene:ENSG00000038532 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000409790 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:10944488:11182189:1 gene:ENSG00000038532 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000465491 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:11024480:11123920:1 gene:ENSG00000038532 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0 /// BC112897 // GenBank // Homo sapiens C-type lectin domain family 16, member A, mRNA (cDNA clone MGC:111457 IMAGE:4419248), complete cds. // chr16 // 96 // 83 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000003450 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:11036071:11148903:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 34 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000003439 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:10944718:11027764:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1
NM_152308 // RefSeq // Homo sapiens RecQ mediated genome instability 2 (RMI2), mRNA. // chr16 // 95 // 63 // 19 // 20 // 0 /// ENST00000312499 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:11345431:11351762:1 gene:ENSG00000175643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000576027 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:11345450:11351365:1 gene:ENSG00000175643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0 /// BC013040 // GenBank // Homo sapiens chromosome 16 open reading frame 75, mRNA (cDNA clone MGC:4772 IMAGE:3542171), complete cds. // chr16 // 95 // 63 // 19 // 20 // 0 /// BC022427 // GenBank // Homo sapiens chromosome 16 open reading frame 75, mRNA (cDNA clone MGC:24665 IMAGE:4252688), complete cds. // chr16 // 95 // 63 // 19 // 20 // 0 /// BC031016 // GenBank // Homo sapiens chromosome 16 open reading frame 75, mRNA (cDNA clone MGC:32773 IMAGE:4659915), complete cds. // chr16 // 85 // 63 // 17 // 20 // 0 /// ENST00000572173 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:11249649:11351755:1 gene:ENSG00000175643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1 /// BC039361 // GenBank // Homo sapiens chromosome 16 open reading frame 75, mRNA (cDNA clone MGC:43647 IMAGE:5270594), complete cds. // chr16 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1 /// GENSCAN00000003423 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:11345472:11357996:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0
NONHSAT140561 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000362798 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:16:11315067:11315178:1 gene:ENSG00000199668 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT140565 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_003498 // RefSeq // Homo sapiens stannin (SNN), mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000329565 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:11668414:11679159:1 gene:ENSG00000184602 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// AF030196 // GenBank // Homo sapiens stannin mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 42 // 10 // 10 // 0 /// AF070673 // GenBank // Homo sapiens stannin mRNA, complete cds. // chr16 // 95 // 88 // 20 // 21 // 0 /// BC036100 // GenBank // Homo sapiens stannin, mRNA (cDNA clone MGC:33874 IMAGE:5277179), complete cds. // chr16 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// BC036443 // GenBank // Homo sapiens stannin, mRNA (cDNA clone MGC:26142 IMAGE:4823944), complete cds. // chr16 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000003433 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:11675637:11676326:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 46 // 46 // 11 // 24 // 1
ENST00000572811 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:11741910:11744506:1 gene:ENSG00000262420 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr16 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// AK025430 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ21777 fis, clone HEP00173. // chr16 // 94 // 100 // 16 // 17 // 0 /// NONHSAT140583 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr16 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
ENST00000564111 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:11976745:12053284:1 gene:ENSG00000048471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000569801 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:11976737:12042997:1 gene:ENSG00000048471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 69 // 11 // 11 // 0 /// AK022425 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ12363 fis, clone MAMMA1002380. // chr16 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NM_032167 // RefSeq // Homo sapiens sorting nexin 29 (SNX29), mRNA. // chr16 // 88 // 88 // 14 // 16 // 1 /// ENST00000566228 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:16:11976738:12574289:1 gene:ENSG00000048471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 88 // 88 // 14 // 16 // 1 /// XM_005255683 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens sorting nexin 29 (SNX29), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 69 // 69 // 11 // 16 // 1 /// GENSCAN00000017651 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:11967587:12136145:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 88 // 88 // 14 // 16 // 1
NM_032167 // RefSeq // Homo sapiens sorting nexin 29 (SNX29), mRNA. // chr16 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000564791 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:12129697:12527397:1 gene:ENSG00000048471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000566228 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:16:11976738:12574289:1 gene:ENSG00000048471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC029857 // GenBank // Homo sapiens sorting nexin 29, mRNA (cDNA clone IMAGE:5177668), partial cds. // chr16 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_001145204 // RefSeq // Homo sapiens shisa family member 9 (SHISA9), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NM_001145205 // RefSeq // Homo sapiens shisa family member 9 (SHISA9), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000423335 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:12901757:12911650:1 gene:ENSG00000237515 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000558583 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:12901620:13240413:1 gene:ENSG00000237515 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AK299610 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58277 complete cds. // chr16 // 59 // 59 // 13 // 22 // 1 /// GENSCAN00000017653 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:12901942:12902815:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENST00000364205 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:16:14275508:14275600:1 gene:ENSG00000201075 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT140675 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029854 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 365a (MIR365A), microRNA. // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000362260 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:14309270:14309380:1 gene:ENSG00000199130 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// hsa-mir-365a // miRBase Micro RNA Database // MI0000767 Homo sapiens miR-365a stem-loop // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT140684 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
AF130116 // GenBank HTC // Homo sapiens clone FLC0461 PRO2812 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENST00000602805 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:18570448:18571068:-1 gene:ENSG00000260550 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr16 // 81 // 100 // 17 // 21 // 0 /// AF116698 // GenBank HTC // Homo sapiens PRO2289 mRNA, complete cds. // chr16 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// NONHSAT140845 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 81 // 100 // 17 // 21 // 0
ENST00000384438 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:19012157:19012263:1 gene:ENSG00000207167 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT140866 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001034841 // RefSeq // Homo sapiens inositol 1,4,5-trisphosphate receptor interacting protein-like 2 (ITPRIPL2), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NR_028028 // RefSeq // Homo sapiens inositol 1,4,5-trisphosphate receptor interacting protein-like 2 (ITPRIPL2), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr16 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000381440 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:19114383:19121629:1 gene:ENSG00000205730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000566735 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:19113932:19116455:1 gene:ENSG00000205730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0 /// BC101749 // GenBank // Homo sapiens inositol 1,4,5-triphosphate receptor interacting protein-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:126798 IMAGE:8069255), complete cds. // chr16 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// BC101751 // GenBank // Homo sapiens inositol 1,4,5-triphosphate receptor interacting protein-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:126800 IMAGE:8069257), complete cds. // chr16 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000032222 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:19114462:19116069:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0
ENST00000465414 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:19285779:19304400:1 gene:ENSG00000261210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000476906 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:19285783:19304394:1 gene:ENSG00000261210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NM_001256720 // RefSeq // Homo sapiens C-type lectin domain family 19, member A (CLEC19A), mRNA. // chr16 // 75 // 75 // 18 // 24 // 1 /// ENST00000493231 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:19285739:19322145:1 gene:ENSG00000261210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1 /// AY358232 // GenBank // Homo sapiens clone DNA139644 QRWT5810 (UNQ5810) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000611742 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:16:19285783:19310946:1 gene:ENSG00000188477 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chr16 // 75 // 75 // 18 // 24 // 1 /// GENSCAN00000032210 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:19284272:19378138:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 71 // 71 // 17 // 24 // 1
NM_001199022 // RefSeq // Homo sapiens centriolar coiled coil protein 110kDa (CCP110), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// NM_014711 // RefSeq // Homo sapiens centriolar coiled coil protein 110kDa (CCP110), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000381396 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:19523857:19553408:1 gene:ENSG00000103540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000396208 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:16:19527836:19553400:1 gene:ENSG00000103540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000396212 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:19523811:19553408:1 gene:ENSG00000103540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// AK300426 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60154 complete cds, highly similar to Centrosomal protein of 110 kDa. // chr16 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// BC036654 // GenBank // Homo sapiens CP110 protein, mRNA (cDNA clone MGC:33038 IMAGE:5267904), complete cds. // chr16 // 89 // 100 // 33 // 37 // 0 /// GENSCAN00000032220 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:19527882:19700476:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 57 // 57 // 21 // 37 // 1
ENST00000575584 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:20409534:20419795:1 gene:ENSG00000183549 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 53 // 10 // 10 // 0 /// BC013753 // GenBank // Homo sapiens acyl-CoA synthetase medium-chain family member 5, mRNA (cDNA clone IMAGE:4469679), complete cds. // chr16 // 100 // 53 // 10 // 10 // 0 /// BC016703 // GenBank // Homo sapiens acyl-CoA synthetase medium-chain family member 5, mRNA (cDNA clone IMAGE:4069865), complete cds. // chr16 // 100 // 53 // 10 // 10 // 0 /// NM_017888 // RefSeq // Homo sapiens acyl-CoA synthetase medium-chain family member 5 (ACSM5), mRNA. // chr16 // 84 // 84 // 16 // 19 // 1 /// ENST00000331849 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:20409534:20441336:1 gene:ENSG00000183549 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 89 // 89 // 17 // 19 // 1 /// BC068516 // GenBank // Homo sapiens acyl-CoA synthetase medium-chain family member 5, mRNA (cDNA clone MGC:87308 IMAGE:5261244), complete cds. // chr16 // 89 // 89 // 17 // 19 // 1 /// GENSCAN00000026519 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:20411485:20486678:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 63 // 63 // 12 // 19 // 1
ENST00000364023 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:20784509:20784615:1 gene:ENSG00000200893 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONHSAT140945 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
ENST00000618345 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:16:20823443:20823537:1 gene:ENSG00000275908 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_145865 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 4B (ANKS4B), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000311620 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:21233665:21253845:1 gene:ENSG00000175311 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000004402 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:21233738:21250820:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0
NR_026675 // RefSeq // Homo sapiens CRYM antisense RNA 1 (CRYM-AS1), long non-coding RNA. // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000338573 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:21300849:21317948:1 gene:ENSG00000189149 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000444326 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:21303247:21318591:1 gene:ENSG00000189149 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr16 // 100 // 38 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000561968 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:21300881:21316886:1 gene:ENSG00000189149 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr16 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// BC056679 // GenBank // Homo sapiens similar to hypothetical protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:4253935). // chr16 // 100 // 38 // 9 // 9 // 0 /// NONHSAT140971 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT140972 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr16 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT140973 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr16 // 100 // 38 // 9 // 9 // 0
ENST00000516989 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:16:21587627:21587864:1 gene:ENSG00000252798 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr16 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT140998 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0
ENST00000384315 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:21642294:21642400:1 gene:ENSG00000207042 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 100 // 93 // 13 // 13 // 0 /// NONHSAT141004 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 93 // 13 // 13 // 0
NM_001161683 // RefSeq // Homo sapiens otoancorin (OTOA), transcript variant 3, mRNA. // chr16 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// NM_144672 // RefSeq // Homo sapiens otoancorin (OTOA), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// ENST00000286149 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:21678514:21760548:1 gene:ENSG00000155719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000388956 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:21684429:21760729:1 gene:ENSG00000155719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// ENST00000388958 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:21678514:21760729:1 gene:ENSG00000155719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// ENST00000563871 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:21704969:21760726:1 gene:ENSG00000155719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// BC129993 // GenBank // Homo sapiens otoancorin, mRNA (cDNA clone MGC:157747 IMAGE:40128985), complete cds. // chr16 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// NM_170664 // RefSeq // Homo sapiens otoancorin (OTOA), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// ENST00000388957 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:21704963:21760728:1 gene:ENSG00000155719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// AK302733 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56012 complete cds, highly similar to Otoancorin precursor. // chr16 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// GENSCAN00000004367 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:21685137:21761633:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
NM_173615 // RefSeq // Homo sapiens von Willebrand factor A domain containing 3A (VWA3A), mRNA. // chr16 // 97 // 97 // 37 // 38 // 0 /// ENST00000299840 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:22121024:22156100:1 gene:ENSG00000175267 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 64 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000389398 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:22092542:22156966:1 gene:ENSG00000175267 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 97 // 97 // 37 // 38 // 0 /// ENST00000563755 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:16:22146272:22155902:1 gene:ENSG00000175267 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000566668 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:22092541:22138425:1 gene:ENSG00000175267 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 54 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000568328 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:16:22092542:22138397:1 gene:ENSG00000175267 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 95 // 56 // 21 // 22 // 0 /// AK093467 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ36148 fis, clone TESTI2025161. // chr16 // 100 // 31 // 12 // 12 // 0 /// AK098260 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ40941 fis, clone UTERU2008426. // chr16 // 100 // 54 // 21 // 21 // 0 /// AY360464 // GenBank // Homo sapiens hypothetical protein LOC146177-like protein mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr16 // 90 // 26 // 9 // 10 // 0 /// BC038400 // GenBank // Homo sapiens von Willebrand factor A domain containing 3A, mRNA (cDNA clone IMAGE:5193948), partial cds. // chr16 // 93 // 36 // 13 // 14 // 0 /// GENSCAN00000022329 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:22008302:22190393:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 74 // 74 // 29 // 39 // 1
ENST00000602312 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:22166297:22191754:1 gene:ENSG00000183921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000022329 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:22008302:22190393:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_013302 // RefSeq // Homo sapiens eukaryotic elongation factor-2 kinase (EEF2K), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000263026 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:22206282:22288732:1 gene:ENSG00000103319 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000568269 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:22206326:22265245:1 gene:ENSG00000103319 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// AK308757 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ98798. // chr16 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// BC032665 // GenBank // Homo sapiens eukaryotic elongation factor-2 kinase, mRNA (cDNA clone MGC:45041 IMAGE:5553055), complete cds. // chr16 // 95 // 73 // 21 // 22 // 0 /// U93850 // GenBank // Homo sapiens elongation factor-2 kinase mRNA, complete cds. // chr16 // 94 // 57 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000022323 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:22225730:22283996:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0
NM_006043 // RefSeq // Homo sapiens heparan sulfate (glucosamine) 3-O-sulfotransferase 2 (HS3ST2), mRNA. // chr16 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000261374 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:22814177:22916338:1 gene:ENSG00000122254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000473392 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:22814497:22916319:1 gene:ENSG00000122254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// AF105374 // GenBank // Homo sapiens heparan sulfate D-glucosaminyl 3-O-sulfotransferase-2 (3OST2) mRNA, 3OST2-1 allele, complete cds. // chr16 // 94 // 57 // 16 // 17 // 0 /// AF105375 // GenBank // Homo sapiens heparan sulfate D-glucosaminyl 3-O-sulfotransferase-2 (3OST2) mRNA, 3OST2-2 allele, complete cds. // chr16 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// AY359095 // GenBank // Homo sapiens clone DNA97013 HS3ST2 (UNQ2442) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// BC093734 // GenBank // Homo sapiens heparan sulfate (glucosamine) 3-O-sulfotransferase 2, mRNA (cDNA clone MGC:120769 IMAGE:7939579), complete cds. // chr16 // 100 // 43 // 13 // 13 // 0 /// BC093736 // GenBank // Homo sapiens heparan sulfate (glucosamine) 3-O-sulfotransferase 2, mRNA (cDNA clone MGC:120771 IMAGE:7939581), complete cds. // chr16 // 100 // 43 // 13 // 13 // 0 /// BC006360 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA similar to heparan sulfate (glucosamine) 3-O-sulfotransferase 2 (cDNA clone IMAGE:4126274). // chr16 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// GENSCAN00000022322 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:22734309:22814586:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_001039 // RefSeq // Homo sapiens sodium channel, non-voltage-gated 1, gamma subunit (SCNN1G), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000300061 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:23182715:23216883:1 gene:ENSG00000166828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC059391 // GenBank // Homo sapiens sodium channel, nonvoltage-gated 1, gamma, mRNA (cDNA clone MGC:71711 IMAGE:30337498), complete cds. // chr16 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// BC069652 // GenBank // Homo sapiens sodium channel, nonvoltage-gated 1, gamma, mRNA (cDNA clone MGC:97189 IMAGE:7262434), complete cds. // chr16 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// DQ402524 // GenBank // Homo sapiens nasal epithelial sodium channel gamma subunit mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// L36592 // GenBank // Homo sapiens kidney epithelial sodium channel gamma subunit (gamma hENaC) mRNA, complete cds. // chr16 // 93 // 85 // 27 // 29 // 0 /// X87160 // GenBank // H.sapiens mRNA for gamma subunit of epithelial amiloride-sensitive sodium channel. // chr16 // 93 // 88 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000004695 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:23182257:23215469:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0
NM_000336 // RefSeq // Homo sapiens sodium channel, non-voltage-gated 1, beta subunit (SCNN1B), mRNA. // chr16 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000307331 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:23303973:23380801:1 gene:ENSG00000168447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000343070 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:23302270:23381299:1 gene:ENSG00000168447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000564275 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:23348592:23380803:1 gene:ENSG00000168447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000568085 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:23348592:23380803:1 gene:ENSG00000168447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000568923 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:23348592:23380803:1 gene:ENSG00000168447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// BC036352 // GenBank // Homo sapiens sodium channel, nonvoltage-gated 1, beta, mRNA (cDNA clone MGC:34556 IMAGE:5178288), complete cds. // chr16 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// DQ402523 // GenBank // Homo sapiens nasal epithelial sodium channel beta subunit mRNA, complete cds. // chr16 // 96 // 80 // 27 // 28 // 0 /// L36593 // GenBank // Homo sapiens kidney epithelial sodium channel beta subunit (beta hENaC) mRNA, complete cds. // chr16 // 96 // 80 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000004699 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:23348600:23380801:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0
ENST00000391291 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:16:23441841:23441921:1 gene:ENSG00000212593 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr16 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT141108 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_019116 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin family domain containing 1 (UBFD1), mRNA. // chr16 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000395878 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:23557362:23574389:1 gene:ENSG00000103353 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000563366 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:23561665:23570857:1 gene:ENSG00000103353 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 38 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000567212 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:16:23557721:23574387:1 gene:ENSG00000103353 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000571064 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:23557737:23564090:1 gene:ENSG00000103353 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// XM_006721064 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ubiquitin family domain containing 1 (UBFD1), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1 /// GENSCAN00000004697 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:23557743:23570590:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0
NM_022097 // RefSeq // Homo sapiens calcineurin-like EF-hand protein 2 (CHP2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000300113 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:23754627:23758951:1 gene:ENSG00000166869 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF146019 // GenBank // Homo sapiens hepatocellular carcinoma antigen gene 520 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK290253 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77903 complete cds. // chr16 // 91 // 81 // 20 // 22 // 0 /// GENSCAN00000004693 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:23755050:23757583:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
NM_002738 // RefSeq // Homo sapiens protein kinase C, beta (PRKCB), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// NM_212535 // RefSeq // Homo sapiens protein kinase C, beta (PRKCB), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 83 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000303531 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:23836024:24220611:1 gene:ENSG00000166501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENST00000321728 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:23836001:24220611:1 gene:ENSG00000166501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 83 // 38 // 38 // 0 /// BC036472 // GenBank // Homo sapiens protein kinase C, beta, mRNA (cDNA clone MGC:41878 IMAGE:5260547), complete cds. // chr16 // 100 // 83 // 38 // 38 // 0 /// M13975 // GenBank // Homo sapiens protein kinase C beta-II type (PRKCB1) mRNA, complete cds. // chr16 // 92 // 80 // 34 // 37 // 0 /// ENST00000487674 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:24174216:24185567:1 gene:ENSG00000166501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 17 // 17 // 8 // 46 // 1 /// ENST00000498739 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:23837223:24113065:1 gene:ENSG00000166501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 17 // 17 // 8 // 46 // 1 /// GENSCAN00000046219 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:24092748:24212120:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 48 // 22 // 22 // 0
NM_006539 // RefSeq // Homo sapiens calcium channel, voltage-dependent, gamma subunit 3 (CACNG3), mRNA. // chr16 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000005284 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:24255553:24362801:1 gene:ENSG00000006116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF100346 // GenBank // Homo sapiens neuronal voltage gated calcium channel gamma-3 subunit mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// AF114832 // GenBank // Homo sapiens voltage-gated calcium channel gamma subunit mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// AF134640 // GenBank // Homo sapiens calcium channel gamma subunit 3 (CACNG3) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// AK095553 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ38234 fis, clone FCBBF2005245, highly similar to Voltage-dependent calcium channel gamma-3 subunit. // chr16 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC037899 // GenBank // Homo sapiens calcium channel, voltage-dependent, gamma subunit 3, mRNA (cDNA clone MGC:43942 IMAGE:5275959), complete cds. // chr16 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC040005 // GenBank // Homo sapiens calcium channel, voltage-dependent, gamma subunit 3, mRNA (cDNA clone MGC:48818 IMAGE:5179278), complete cds. // chr16 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000046221 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:24294085:24361863:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NR_038379 // RefSeq // Homo sapiens leucine carboxyl methyltransferase 1 pseudogene (LOC554206), non-coding RNA. // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AK097891 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ40572 fis, clone THYMU2006170. // chr16 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000575694 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:25031881:25058109:1 gene:ENSG00000262587 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr16 // 100 // 48 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000619106 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:25031744:25032775:1 gene:ENSG00000262587 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT141189 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT141190 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 48 // 10 // 10 // 0
NM_001169 // RefSeq // Homo sapiens aquaporin 8 (AQP8), mRNA. // chr16 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000219660 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:25216921:25228940:1 gene:ENSG00000103375 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000566125 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:25215731:25228932:1 gene:ENSG00000103375 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// AB013456 // GenBank // Homo sapiens hAQP8 mRNA for aquaporin 8, complete cds. // chr16 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// AF067797 // GenBank // Homo sapiens aquaporin 8 (AQP8) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC040630 // GenBank // Homo sapiens aquaporin 8, mRNA (cDNA clone MGC:50607 IMAGE:5759105), complete cds. // chr16 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000043528 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:25111679:25228847:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0
NM_006040 // RefSeq // Homo sapiens heparan sulfate (glucosamine) 3-O-sulfotransferase 4 (HS3ST4), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000331351 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:25692026:26137688:1 gene:ENSG00000182601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000475436 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:25886746:26136207:1 gene:ENSG00000182601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 89 // 27 // 8 // 9 // 0 /// AF105378 // GenBank // Homo sapiens heparan sulfate 3-O-sulfotransferase-4 (HS3ST4) mRNA, complete cds. // chr16 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000043519 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:25692418:25693418:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0
ENST00000363059 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:26028912:26029025:1 gene:ENSG00000199929 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr16 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT141404 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_001145545 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 16 open reading frame 82 (C16orf82), mRNA. // chr16 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000418886 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:16:27066898:27069165:1 gene:ENSG00000234186 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr16 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000505035 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:27066707:27069165:1 gene:ENSG00000234186 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF536240 // GenBank // Homo sapiens TNT protein mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC136370 // GenBank // Homo sapiens chromosome 16 open reading frame 82, mRNA (cDNA clone MGC:167980 IMAGE:9020357), complete cds. // chr16 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// BC136382 // GenBank // Homo sapiens chromosome 16 open reading frame 82, mRNA (cDNA clone MGC:167992 IMAGE:9020369), complete cds. // chr16 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000003318 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:27066876:27116020:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 94 // 44 // 15 // 16 // 0
NM_015202 // RefSeq // Homo sapiens KIAA0556 (KIAA0556), mRNA. // chr16 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000261588 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:27550152:27780369:1 gene:ENSG00000047578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000567894 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:27632464:27727873:1 gene:ENSG00000047578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 32 // 11 // 11 // 0 /// AK097485 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ40166 fis, clone TESTI2016197. // chr16 // 100 // 32 // 11 // 11 // 0 /// BC150276 // GenBank // Homo sapiens KIAA0556, mRNA (cDNA clone MGC:166880 IMAGE:9007250), complete cds. // chr16 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000573850 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:27698328:27755752:1 gene:ENSG00000047578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1 /// GENSCAN00000003310 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:27594357:27786360:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// BC071610 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5267650, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr16 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1
ENST00000391080 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:27863251:27863356:1 gene:ENSG00000212382 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT141469 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000363782 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:16:28179098:28179223:1 gene:ENSG00000200652 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT141476 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000363268 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:16:28183318:28183430:1 gene:ENSG00000200138 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT141477 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001024401 // RefSeq // Homo sapiens SH3 domain binding kinase 1 (SBK1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_005255315 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens SH3 domain binding kinase 1 (SBK1), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000341901 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:28292519:28323849:1 gene:ENSG00000188322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AY874862 // GenBank // Homo sapiens SH3-binding kinase (SBK1) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONHSAT141480 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 100 // 28 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000041959 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:28258295:28364987:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
ENST00000564603 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:28700294:28701540:-1 gene:ENSG00000259982 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr16 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// ENST00000562287 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:28413703:28415018:1 gene:ENSG00000261089 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr16 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041940 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:28413886:28415136:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 93 // 56 // 13 // 14 // 0 /// NONHSAT141515 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr16 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0
NM_018690 // RefSeq // Homo sapiens apolipoprotein B receptor (APOBR), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000564831 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:28494649:28498970:1 gene:ENSG00000184730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000431282 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:16:28494649:28498970:1 gene:ENSG00000184730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 1 /// AF141332 // GenBank // Homo sapiens apolipoprotein B48 receptor (APOB48R) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 1 /// AF141334 // GenBank // Homo sapiens placenta apolipoprotein B48 receptor type 2 (APOB48R) mRNA, complete cds. // chr16 // 93 // 93 // 26 // 28 // 1 /// BC119786 // GenBank // Homo sapiens apolipoprotein B48 receptor, mRNA (cDNA clone MGC:134647 IMAGE:40008686), complete cds. // chr16 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// BC119788 // GenBank // Homo sapiens apolipoprotein B48 receptor, mRNA (cDNA clone MGC:134646 IMAGE:40008685), complete cds. // chr16 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// GENSCAN00000041949 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:28494682:28498505:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0
NM_138414 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 101 (CCDC101), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000317058 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:28553926:28591790:1 gene:ENSG00000176476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000565945 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:28590600:28591788:1 gene:ENSG00000176476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 45 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000567447 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:28590117:28591790:1 gene:ENSG00000176476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 45 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000567564 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:28553972:28590441:1 gene:ENSG00000176476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 50 // 11 // 11 // 0 /// BC011981 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 101, mRNA (cDNA clone MGC:9837 IMAGE:3863665), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000569581 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:28553920:28589420:1 gene:ENSG00000176476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 55 // 55 // 12 // 22 // 1 /// ENST00000564682 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:28553915:28585403:1 gene:ENSG00000176476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 36 // 36 // 8 // 22 // 1 /// GENSCAN00000041946 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:28581070:28591706:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 73 // 16 // 16 // 0 /// NONHSAT141506 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 55 // 55 // 12 // 22 // 1 /// NONHSAT141505 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 36 // 36 // 8 // 22 // 1
ENST00000562472 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:28985064:28986232:1 gene:ENSG00000213658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 50 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000569969 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:28974804:28990775:1 gene:ENSG00000261067 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// AB209402 // GenBank // Homo sapiens mRNA for spinster variant protein. // chr16 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT141557 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 100 // 50 // 6 // 6 // 0 /// GENSCAN00000049721 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:28951012:28990012:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 67 // 67 // 8 // 12 // 1
AK027150 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ23497 fis, clone LNG02604. // chr16 // 93 // 100 // 13 // 14 // 0 /// NONHSAT141592 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NR_002939 // RefSeq // Homo sapiens sorting nexin 29 pseudogene 2 (SNX29P2), non-coding RNA. // chr16 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000604430 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:29291220:29372110:1 gene:ENSG00000198106 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr16 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000569730 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:29312350:29331277:1 gene:ENSG00000260413 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr16 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001030288 // RefSeq // Homo sapiens sialophorin (SPN), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NM_003123 // RefSeq // Homo sapiens sialophorin (SPN), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000360121 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:16:29663219:29670490:1 gene:ENSG00000197471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000395389 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:29662979:29665527:1 gene:ENSG00000197471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000436527 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:29663219:29664793:1 gene:ENSG00000197471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000563039 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:29663255:29670876:1 gene:ENSG00000197471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// AK292626 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77999 complete cds, highly similar to Homo sapiens sialophorin (gpL115, leukosialin, CD43), mRNA. // chr16 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// BC012350 // GenBank // Homo sapiens sialophorin, mRNA (cDNA clone MGC:20177 IMAGE:4564347), complete cds. // chr16 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// J04536 // GenBank // Human sialophorin (CD43) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0 /// J04168 // GenBank // Human leukosialin mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0
NM_152338 // RefSeq // Homo sapiens zymogen granule protein 16 (ZG16), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000400752 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:29778240:29782973:1 gene:ENSG00000174992 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// AB092813 // GenBank // Homo sapiens mRNA for ZG16p, complete cds. // chr16 // 100 // 54 // 22 // 22 // 0 /// AK125559 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ43571 fis, clone RECTM2000433, highly similar to Zymogen granule membrane protein 16 precursor. // chr16 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0 /// BC029149 // GenBank // Homo sapiens zymogen granule protein 16 homolog (rat), mRNA (cDNA clone MGC:34820 IMAGE:5187790), complete cds. // chr16 // 100 // 73 // 30 // 30 // 0 /// BC150656 // GenBank // Homo sapiens zymogen granule protein 16 homolog (rat), mRNA (cDNA clone MGC:183567 IMAGE:9057027), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000049729 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:29779267:29780419:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 54 // 22 // 22 // 0
NM_024516 // RefSeq // Homo sapiens PAXIP1 associated glutamate-rich protein 1 (PAGR1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000320330 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:16:29815964:29820438:1 gene:ENSG00000185928 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000562285 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:29817239:29830627:1 gene:ENSG00000185928 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000609618 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:29816511:29820117:1 gene:ENSG00000263136 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC003640 // GenBank // Homo sapiens chromosome 16 open reading frame 53, mRNA (cDNA clone MGC:4606 IMAGE:3356565), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// EF195235 // GenBank // Homo sapiens PTIP-associated 1 protein mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AK226151 // GenBank // Homo sapiens mRNA for hypothetical protein LOC112476 variant, clone: fk13667. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000029534 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:29813055:29819754:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_181718 // RefSeq // Homo sapiens aspartate beta-hydroxylase domain containing 1 (ASPHD1), mRNA. // chr16 // 96 // 82 // 27 // 28 // 0 /// ENST00000308748 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:29900720:29906056:1 gene:ENSG00000174939 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 96 // 82 // 27 // 28 // 0 /// ENST00000414952 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:29900858:29919632:1 gene:ENSG00000174939 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 96 // 79 // 26 // 27 // 0 /// ENST00000563177 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:29900375:29905887:1 gene:ENSG00000174939 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 35 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000566693 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:29900858:29919864:1 gene:ENSG00000174939 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// BC126319 // GenBank // Homo sapiens aspartate beta-hydroxylase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:161597 IMAGE:8992035), complete cds. // chr16 // 96 // 79 // 26 // 27 // 0 /// BC126321 // GenBank // Homo sapiens aspartate beta-hydroxylase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:161599 IMAGE:8992037), complete cds. // chr16 // 97 // 88 // 29 // 30 // 0 /// BC144152 // GenBank // Homo sapiens aspartate beta-hydroxylase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:177689 IMAGE:9052672), complete cds. // chr16 // 96 // 79 // 26 // 27 // 0 /// ENST00000483405 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:29900379:29906056:1 gene:ENSG00000174939 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 50 // 50 // 17 // 34 // 1 /// GENSCAN00000029555 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:29901173:29905897:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 44 // 15 // 15 // 0
NM_001109660 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 16 open reading frame 92 (C16orf92), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000300575 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:30023334:30024702:1 gene:ENSG00000167194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000561910 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:30023334:30024300:1 gene:ENSG00000167194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// ENST00000569198 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:16:30023726:30027736:1 gene:ENSG00000167194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001142305 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 771 (ZNF771), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// NM_016643 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 771 (ZNF771), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000319296 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:30407297:30419407:1 gene:ENSG00000179965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000434417 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:16:30407414:30418594:1 gene:ENSG00000179965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// AF242768 // GenBank // Homo sapiens mesenchymal stem cell protein DSC43 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// AK313930 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ94570, Homo sapiens mesenchymal stem cell protein DSC43 (LOC51333), mRNA. // chr16 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// BC011870 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 771, mRNA (cDNA clone MGC:19952 IMAGE:2960099), complete cds. // chr16 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// BC026192 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 771, mRNA (cDNA clone MGC:33472 IMAGE:4801104), complete cds. // chr16 // 89 // 79 // 17 // 19 // 0 /// ENST00000566625 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:16:30407629:30429599:1 gene:ENSG00000179965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1 /// AK311157 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ18199. // chr16 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1 /// GENSCAN00000029541 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:30392992:30418367:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 58 // 58 // 14 // 24 // 1
ENST00000410769 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:16:30471587:30471703:1 gene:ENSG00000222701 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr16 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT141750 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NR_002966 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 30 (SNORA30), small nucleolar RNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000384028 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:30710537:30710665:1 gene:ENSG00000206755 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT141805 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001142544 // RefSeq // Homo sapiens cardiotrophin 1 (CTF1), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_001330 // RefSeq // Homo sapiens cardiotrophin 1 (CTF1), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000279804 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:30896607:30903560:1 gene:ENSG00000150281 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000395019 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:30896638:30903547:1 gene:ENSG00000150281 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// BC036787 // GenBank // Homo sapiens cardiotrophin 1, mRNA (cDNA clone MGC:46223 IMAGE:5754188), complete cds. // chr16 // 96 // 82 // 22 // 23 // 0 /// BC064416 // GenBank // Homo sapiens cardiotrophin 1, mRNA (cDNA clone MGC:70822 IMAGE:5750481), complete cds. // chr16 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// U43030 // GenBank // Homo sapiens cardiotrophin-1 (CTF1) mRNA, complete cds. // chr16 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001047 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:30896644:30902539:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0
NM_014712 // RefSeq // Homo sapiens SET domain containing 1A (SETD1A), mRNA. // chr16 // 98 // 100 // 43 // 44 // 0 /// ENST00000262519 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:30957294:30985116:1 gene:ENSG00000099381 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// BC027450 // GenBank // Homo sapiens SET domain containing 1A, mRNA (cDNA clone IMAGE:4156088), partial cds. // chr16 // 100 // 34 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000001043 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:30958732:30988183:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 82 // 36 // 36 // 0
ENST00000622229 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:31056460:31062803:1 gene:ENSG00000232748 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr16 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC047516 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 668, mRNA (cDNA clone IMAGE:5313136), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000417110 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:16:31059477:31062763:1 gene:ENSG00000232748 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr16 // 65 // 100 // 13 // 20 // 0
NM_014699 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 646 (ZNF646), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000300850 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:31074422:31084196:1 gene:ENSG00000167395 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000394979 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:31075902:31084019:1 gene:ENSG00000167395 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000428260 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:31074443:31077044:1 gene:ENSG00000167395 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// AB002294 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA0296 gene, partial cds. // chr16 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AK304808 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61089 complete cds, highly similar to Zinc finger protein 646. // chr16 // 81 // 57 // 13 // 16 // 0 /// BC035589 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 646, mRNA (cDNA clone MGC:45126 IMAGE:5532753), complete cds. // chr16 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000001041 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:31073501:31083092:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0
NM_001008274 // RefSeq // Homo sapiens tripartite motif containing 72, E3 ubiquitin protein ligase (TRIM72), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000322122 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:31214021:31225189:1 gene:ENSG00000177238 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK090695 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ33376 fis, clone BRACE2006162. // chr16 // 95 // 88 // 20 // 21 // 0 /// BC033211 // GenBank // Homo sapiens tripartite motif-containing 72, mRNA (cDNA clone MGC:45868 IMAGE:4906353), complete cds. // chr16 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1 /// GENSCAN00000001035 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:31218980:31224755:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000613872 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:16:31214091:31226427:1 gene:ENSG00000177238 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 42 // 42 // 10 // 24 // 1
NM_000887 // RefSeq // Homo sapiens integrin, alpha X (complement component 3 receptor 4 subunit) (ITGAX), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// NM_001286375 // RefSeq // Homo sapiens integrin, alpha X (complement component 3 receptor 4 subunit) (ITGAX), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000268296 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:31355134:31382997:1 gene:ENSG00000140678 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000562522 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:16:31355222:31382943:1 gene:ENSG00000140678 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000571644 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:31359937:31382932:1 gene:ENSG00000140678 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 74 // 29 // 29 // 0 /// AK074047 // GenBank // Homo sapiens mRNA for FLJ00114 protein. // chr16 // 100 // 74 // 29 // 29 // 0 /// AK293367 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59843 complete cds, highly similar to Integrin alpha-X precursor. // chr16 // 100 // 23 // 9 // 9 // 0 /// BC038237 // GenBank // Homo sapiens integrin, alpha X (complement component 3 receptor 4 subunit), mRNA (cDNA clone MGC:46124 IMAGE:5745308), complete cds. // chr16 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// M81695 // GenBank // Homo sapiens eukocyte adhesion glycoprotein precursor (ITGAX) mRNA, complete cds. // chr16 // 95 // 100 // 37 // 39 // 0 /// GENSCAN00000001023 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:31352344:31426128:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0
NM_005353 // RefSeq // Homo sapiens integrin, alpha D (ITGAD), mRNA. // chr16 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000389202 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:31393312:31426505:1 gene:ENSG00000156886 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000444228 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:31393335:31408619:1 gene:ENSG00000156886 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 39 // 16 // 16 // 0 /// AK301028 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51333 complete cds, highly similar to Integrin alpha-D precursor. // chr16 // 94 // 39 // 15 // 16 // 0 /// AK097160 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39841 fis, clone SPLEN2014210, moderately similar to Rattus norvegicus alpha D integrin mRNA. // chr16 // 34 // 34 // 14 // 41 // 1 /// GENSCAN00000001023 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:31352344:31426128:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 80 // 33 // 33 // 0
NM_016633 // RefSeq // Homo sapiens alpha hemoglobin stabilizing protein (AHSP), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_005255351 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens alpha hemoglobin stabilizing protein (AHSP), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000302312 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:31527864:31528803:1 gene:ENSG00000169877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000564707 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:31527977:31528553:1 gene:ENSG00000169877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000569954 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:31527914:31528803:1 gene:ENSG00000169877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 82 // 65 // 14 // 17 // 0 /// AF112995 // GenBank // Homo sapiens erythroid differentiation-related factor EDRF mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AF147435 // GenBank // Homo sapiens full length insert cDNA clone YP86E09. // chr16 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AF364517 // GenBank // Homo sapiens erythroid associated factor (ERAF) mRNA, complete cds. // chr16 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// BC035842 // GenBank // Homo sapiens erythroid associated factor, mRNA (cDNA clone MGC:46083 IMAGE:5748040), complete cds. // chr16 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000001030 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:31528140:31528691:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
NM_001130913 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 720 (ZNF720), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000316491 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:31713234:31761565:1 gene:ENSG00000197302 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000529515 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:31713306:31754484:1 gene:ENSG00000197302 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000530881 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:31713303:31753856:1 gene:ENSG00000197302 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000539915 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:16:31713232:31759841:1 gene:ENSG00000197302 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0 /// BC018134 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 720, mRNA (cDNA clone MGC:9313 IMAGE:3912539), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC055408 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 720, mRNA (cDNA clone MGC:62019 IMAGE:3684126), complete cds. // chr16 // 100 // 78 // 7 // 7 // 0
NONHSAT142136 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 83 // 67 // 5 // 6 // 0
ENST00000363564 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:34162959:34163110:1 gene:ENSG00000200434 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT142139 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XR_111571 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens uncharacterized protein MGC34800 (MGC34800), misc_RNA. // chr16 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000319817 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:35021749:35024229:1 gene:ENSG00000179755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC029861 // GenBank // Homo sapiens hypothetical protein MGC34800, mRNA (cDNA clone MGC:34800 IMAGE:5167909), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000570988 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:35023339:35023765:1 gene:ENSG00000262885 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr16 // 100 // 30 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000025340 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:34266041:34432848:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 30 // 30 // 10 // 33 // 1 /// GENSCAN00000049989 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:34978988:35106828:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 30 // 30 // 10 // 33 // 1
ENST00000516115 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:35735372:35735471:1 gene:ENSG00000251924 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr16 // 60 // 100 // 15 // 25 // 0 /// NONHSAT142224 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 60 // 100 // 15 // 25 // 0
ENST00000516234 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:16:35746772:35746894:1 gene:ENSG00000277004 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA gene:ENSG00000261122 // chr16 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// NONHSAT142230 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0
ENST00000516373 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:35747032:35747140:1 gene:ENSG00000252182 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT142231 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000516580 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:16:35748520:35748655:1 gene:ENSG00000274228 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA gene:ENSG00000261122 // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT142233 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000517246 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:35750061:35750175:1 gene:ENSG00000253055 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT142234 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000516838 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:35751574:35751684:1 gene:ENSG00000252647 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr16 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONHSAT142235 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
ENST00000516864 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:35754555:35754688:1 gene:ENSG00000252673 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr16 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONHSAT142240 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
AF116720 // GenBank HTC // Homo sapiens PRO3015 mRNA, complete cds. // chr16 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0
ENST00000410336 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:47505432:47505543:1 gene:ENSG00000222268 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT142297 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000564020 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:48496990:48498601:1 gene:ENSG00000260347 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr16 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000010955 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:48496749:48498518:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
AK128747 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44674 fis, clone BRACE3007649. // chr16 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// NONHSAT142374 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 30 // 30 // 10 // 33 // 1
ENST00000299191 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:49373823:49399431:1 gene:ENSG00000166152 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC021181 // GenBank // Homo sapiens chromosome 16 open reading frame 78, mRNA (cDNA clone MGC:33367 IMAGE:5268227), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC021718 // GenBank // Homo sapiens chromosome 16 open reading frame 78, mRNA (cDNA clone MGC:32905 IMAGE:5265370), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000037744 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:49373940:49399278:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
ENST00000299192 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:50065941:50106387:1 gene:ENSG00000155393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// AK000725 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ20718 fis, clone HEP17872. // chr16 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// AK289949 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76756 complete cds. // chr16 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// BC014415 // GenBank // Homo sapiens HEAT repeat containing 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:4577269), partial cds. // chr16 // 89 // 73 // 17 // 19 // 0 /// NM_182922 // RefSeq // Homo sapiens HEAT repeat containing 3 (HEATR3), mRNA. // chr16 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// BC018730 // GenBank // Homo sapiens HEAT repeat containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:31839 IMAGE:4907047), complete cds. // chr16 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// BC033077 // GenBank // Homo sapiens HEAT repeat containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:45634 IMAGE:4301559), complete cds. // chr16 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// GENSCAN00000037335 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:50066132:50120200:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
ENST00000365254 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:50098264:50098358:1 gene:ENSG00000202124 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr16 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT142398 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_033119 // RefSeq // Homo sapiens naked cuticle homolog 1 (Drosophila) (NKD1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// XM_005256211 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens naked cuticle homolog 1 (Drosophila) (NKD1), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 82 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000268459 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:50548330:50640739:1 gene:ENSG00000140807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000564336 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:50548396:50616108:1 gene:ENSG00000140807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 24 // 9 // 9 // 0 /// AB062886 // GenBank // Homo sapiens mRNA for Dvl-binding protein NKD1, complete cds. // chr16 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// AF289584 // GenBank HTC // Homo sapiens clone pp7246 unknown mRNA. // chr16 // 88 // 89 // 30 // 34 // 0 /// AF358135 // GenBank // Homo sapiens naked cuticle-1 (NKD1) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// AY061883 // GenBank // Homo sapiens naked protein (NKD) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// BC051288 // GenBank // Homo sapiens naked cuticle homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:59666 IMAGE:6646089), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000566396 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:50625225:50633222:1 gene:ENSG00000140807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1 /// GENSCAN00000045904 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:50630186:50633781:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 45 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT142413 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 100 // 24 // 9 // 9 // 0
ENST00000459097 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:16:53334562:53334664:1 gene:ENSG00000238645 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT142567 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000365323 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:53337453:53337571:1 gene:ENSG00000202193 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT142568 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_005611 // RefSeq // Homo sapiens retinoblastoma-like 2 (RBL2), mRNA. // chr16 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000262133 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:53434420:53491649:1 gene:ENSG00000103479 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000379935 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:53445781:53491648:1 gene:ENSG00000103479 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000544405 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:53435619:53470079:1 gene:ENSG00000103479 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 42 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000544545 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:16:53454226:53491647:1 gene:ENSG00000103479 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// AK300047 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53188 complete cds, highly similar to Retinoblastoma-like protein 2. // chr16 // 100 // 42 // 13 // 13 // 0 /// BC034490 // GenBank // Homo sapiens retinoblastoma-like 2 (p130), mRNA (cDNA clone MGC:26535 IMAGE:4838444), complete cds. // chr16 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// BX537767 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp781K2028 (from clone DKFZp781K2028); complete cds. // chr16 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// AK304283 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53278 complete cds, highly similar to Retinoblastoma-like protein 2. // chr16 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1 /// GENSCAN00000004131 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:53434557:53490300:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0
NM_001252197 // RefSeq // Homo sapiens iroquois homeobox 5 (IRX5), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000320990 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:54931199:54934485:1 gene:ENSG00000176842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000558597 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:54932072:54934069:1 gene:ENSG00000176842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// AY335945 // GenBank // Homo sapiens homeodomain protein IRXB2 (IRX5) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// BC131510 // GenBank // Homo sapiens iroquois homeobox 5, mRNA (cDNA clone IMAGE:40083630), complete cds. // chr16 // 93 // 45 // 14 // 15 // 0 /// U90304 // GenBank // Human iroquois-class homeodomain protein IRX-2a mRNA, complete cds. // chr16 // 96 // 76 // 24 // 25 // 0 /// NM_005853 // RefSeq // Homo sapiens iroquois homeobox 5 (IRX5), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// ENST00000394636 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:54930862:54934485:1 gene:ENSG00000176842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// ENST00000560154 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:16:54931199:54933960:1 gene:ENSG00000176842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1 /// ENST00000620085 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:16:54931199:54933960:1 gene:ENSG00000176842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 93 // 45 // 14 // 15 // 0 /// GENSCAN00000019905 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:54931199:54937489:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1
NM_024335 // RefSeq // Homo sapiens iroquois homeobox 6 (IRX6), mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000290552 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:55323760:55330760:1 gene:ENSG00000159387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AK125053 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ43063 fis, clone BRTHA3008310, moderately similar to Mus musculus mRNA for iroquois homeobox protein 6. // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AY335937 // GenBank // Homo sapiens homeodomain protein IRXB3 (IRX6) mRNA, complete cds. // chr16 // 95 // 96 // 21 // 22 // 0 /// BC136573 // GenBank // Homo sapiens iroquois homeobox 6, mRNA (cDNA clone MGC:168186 IMAGE:9020563), complete cds. // chr16 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// BC136576 // GenBank // Homo sapiens iroquois homeobox 6, mRNA (cDNA clone MGC:168189 IMAGE:9020566), complete cds. // chr16 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000558315 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:55325800:55327796:1 gene:ENSG00000159387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1 /// AK309149 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99190. // chr16 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1 /// U90305 // GenBank // Human iroquois-class homeodomain protein IRX-3 mRNA, partial cds. // chr16 // 92 // 52 // 11 // 12 // 0 /// GENSCAN00000019892 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:55325092:55454241:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 83 // 83 // 19 // 23 // 1
NM_032330 // RefSeq // Homo sapiens calpain, small subunit 2 (CAPNS2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000457326 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:55566672:55567687:1 gene:ENSG00000256812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY052551 // GenBank // Homo sapiens calpain small subunit 2 (CAPNS2) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC005397 // GenBank // Homo sapiens calpain, small subunit 2, mRNA (cDNA clone MGC:12536 IMAGE:3685903), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC006000 // GenBank // Homo sapiens calpain, small subunit 2, mRNA (cDNA clone MGC:14804 IMAGE:4092675), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019901 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:55509182:55567503:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NR_003276 // RefSeq // Homo sapiens carboxylesterase 1 pseudogene 1 (CES1P1), non-coding RNA. // chr16 // 100 // 53 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000421606 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:55760548:55794158:1 gene:ENSG00000228695 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr16 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000571348 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:55760599:55774926:1 gene:ENSG00000228695 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 53 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000574030 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:55760566:55773511:1 gene:ENSG00000228695 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 53 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000005398 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:55760642:55793960:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 65 // 11 // 11 // 0
NM_032935 // RefSeq // Homo sapiens metallothionein 4 (MT4), mRNA. // chr16 // 90 // 100 // 18 // 20 // 0 /// ENST00000219162 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:56565049:56568957:1 gene:ENSG00000102891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC113442 // GenBank // Homo sapiens metallothionein 4, mRNA (cDNA clone MGC:142002 IMAGE:8322494), complete cds. // chr16 // 90 // 100 // 18 // 20 // 0 /// BC113444 // GenBank // Homo sapiens metallothionein 4, mRNA (cDNA clone MGC:142004 IMAGE:8322496), complete cds. // chr16 // 90 // 100 // 18 // 20 // 0 /// GENSCAN00000005414 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:56567687:56579074:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 45 // 45 // 9 // 20 // 1
NM_005954 // RefSeq // Homo sapiens metallothionein 3 (MT3), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000200691 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:56589368:56591088:1 gene:ENSG00000087250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000561640 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:56589074:56591075:1 gene:ENSG00000087250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000565838 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:56589074:56591078:1 gene:ENSG00000087250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000566576 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:56589545:56591088:1 gene:ENSG00000087250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// BC013081 // GenBank // Homo sapiens metallothionein 3, mRNA (cDNA clone MGC:17054 IMAGE:4152899), complete cds. // chr16 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BT007030 // GenBank // Homo sapiens metallothionein 3 (growth inhibitory factor (neurotrophic)) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000566451 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:56589536:56591085:1 gene:ENSG00000087250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// ENST00000570176 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:56589540:56590366:1 gene:ENSG00000087250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// NONHSAT142687 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT142686 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1
NM_005953 // RefSeq // Homo sapiens metallothionein 2A (MT2A), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000245185 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:56608199:56609497:1 gene:ENSG00000125148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000561491 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:56608606:56609494:1 gene:ENSG00000125148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 83 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000562017 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:56608595:56609497:1 gene:ENSG00000125148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000563985 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:56608584:56609476:1 gene:ENSG00000125148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000567300 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:56608690:56609497:1 gene:ENSG00000125148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 75 // 9 // 9 // 0 /// BC007034 // GenBank // Homo sapiens metallothionein 2A, mRNA (cDNA clone MGC:12397 IMAGE:4051220), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC062435 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4103975, partial cds. // chr16 // 83 // 100 // 10 // 12 // 0 /// BC070289 // GenBank // Homo sapiens metallothionein 2A, mRNA (cDNA clone MGC:88284 IMAGE:4051053), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT142689 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT142690 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 100 // 75 // 9 // 9 // 0
NM_176870 // RefSeq // Homo sapiens metallothionein 1M (MT1M), mRNA. // chr16 // 83 // 100 // 15 // 18 // 0 /// ENST00000379818 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:56632233:56633986:1 gene:ENSG00000205364 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// AF136177 // GenBank // Homo sapiens metallothionein mRNA, complete cds. // chr16 // 83 // 100 // 15 // 18 // 0 /// BC028280 // GenBank // Homo sapiens metallothionein 1M, mRNA (cDNA clone MGC:40498 IMAGE:5191481), complete cds. // chr16 // 83 // 100 // 15 // 18 // 0 /// GENSCAN00000010900 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:56631977:56633842:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 56 // 56 // 10 // 18 // 1
NR_001447 // RefSeq // Homo sapiens metallothionein 1L (gene/pseudogene) (MT1L), non-coding RNA. // chr16 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000565768 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:56617476:56618818:1 gene:ENSG00000260549 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC033653 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3898762, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr16 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0 /// BC070351 // GenBank // Homo sapiens metallothionein 1L (gene/pseudogene), mRNA (cDNA clone IMAGE:4103908). // chr16 // 57 // 100 // 8 // 14 // 0 /// X97261 // GenBank // H.sapiens mRNA for metallothionein isoform 1R. // chr16 // 64 // 79 // 7 // 11 // 0 /// AF348998 // GenBank // Homo sapiens MTF (MTF) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
XM_005255956 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens metallothionein 1E (MT1E), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 56 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000330439 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:56625798:56627112:1 gene:ENSG00000169715 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0 /// AF495759 // GenBank // Homo sapiens unknown mRNA. // chr16 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000306061 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:56625475:56627112:1 gene:ENSG00000169715 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 78 // 78 // 14 // 18 // 1 /// BC009699 // GenBank // Homo sapiens metallothionein 1E, mRNA (cDNA clone MGC:9246 IMAGE:3892441), complete cds. // chr16 // 78 // 78 // 14 // 18 // 1 /// NM_175617 // RefSeq // Homo sapiens metallothionein 1E (MT1E), mRNA. // chr16 // 67 // 67 // 12 // 18 // 1 /// ENST00000568293 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:56625781:56627112:1 gene:ENSG00000169715 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 61 // 61 // 11 // 18 // 1 /// BC062734 // GenBank // Homo sapiens metallothionein 1E, mRNA (cDNA clone MGC:72081 IMAGE:6560167), complete cds. // chr16 // 61 // 61 // 11 // 18 // 1 /// BC131609 // GenBank // Homo sapiens metallothionein 1E, mRNA (cDNA clone MGC:149413 IMAGE:40115058), complete cds. // chr16 // 50 // 50 // 9 // 18 // 1 /// AF348996 // GenBank // Homo sapiens MTD (MTD) mRNA, complete cds. // chr16 // 44 // 44 // 8 // 18 // 1
NR_036677 // RefSeq // Homo sapiens metallothionein 1J, pseudogene (MT1JP), non-coding RNA. // chr16 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000444023 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:56635739:56637086:1 gene:ENSG00000255986 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr16 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000563395 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:56635739:56637086:1 gene:ENSG00000255986 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000564564 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:56635763:56636996:1 gene:ENSG00000255986 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 69 // 11 // 11 // 0 /// AF348994 // GenBank // Homo sapiens MTB (MTB) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC103839 // GenBank // Homo sapiens metallothionein 1J (pseudogene), mRNA (cDNA clone IMAGE:40002172). // chr16 // 100 // 69 // 11 // 11 // 0
NM_005946 // RefSeq // Homo sapiens metallothionein 1A (MT1A), mRNA. // chr16 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000290705 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:56638666:56640087:1 gene:ENSG00000205362 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// AF348995 // GenBank // Homo sapiens MTC (MTC) mRNA, complete cds. // chr16 // 81 // 80 // 13 // 16 // 0 /// AY028617 // GenBank // Homo sapiens metallothionein 1S (MT1S) mRNA, complete cds. // chr16 // 82 // 85 // 14 // 17 // 0 /// BC029475 // GenBank // Homo sapiens metallothionein 1A, mRNA (cDNA clone MGC:32848 IMAGE:4723818), complete cds. // chr16 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000622334 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:16:56638666:56750276:1 gene:ENSG00000205362 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// AY077636 // GenBank // Homo sapiens zinc-induced metallothionein 2A/1A hybrid mRNA, complete cds. // chr16 // 67 // 60 // 8 // 12 // 0 /// GENSCAN00000010922 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:56635818:56639979:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 65 // 65 // 13 // 20 // 1
ENST00000463480 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:56643705:56644786:1 gene:ENSG00000205361 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 79 // 73 // 15 // 19 // 0 /// ENST00000486551 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:56643725:56644765:1 gene:ENSG00000205361 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr16 // 93 // 54 // 13 // 14 // 0 /// AF348999 // GenBank // Homo sapiens MTM (MTM) mRNA, complete cds. // chr16 // 88 // 96 // 22 // 25 // 0 /// NR_027781 // RefSeq // Homo sapiens metallothionein 1D, pseudogene (MT1DP), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr16 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// NR_003658 // RefSeq // Homo sapiens metallothionein 1D, pseudogene (MT1DP), transcript variant 1, non-coding RNA. // chr16 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// NONHSAT142695 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// TCONS_00024226-XLOC_011736 // Rinn lincRNA // linc-MT1B chr16:+:56677598-56678852 // chr16 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// TCONS_00024227-XLOC_011736 // Rinn lincRNA // linc-MT1B chr16:+:56677715-56678852 // chr16 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// NONHSAT142693 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// NONHSAT142694 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// TCONS_00024856-XLOC_011736 // Rinn lincRNA // linc-MT1B chr16:+:56677384-56678101 // chr16 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// TCONS_00024857-XLOC_011736 // Rinn lincRNA // linc-MT1B chr16:+:56677384-56678101 // chr16 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_005947 // RefSeq // Homo sapiens metallothionein 1B (MT1B), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000334346 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:56651899:56653204:1 gene:ENSG00000169688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000562399 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:16:56651926:56653204:1 gene:ENSG00000169688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// AF349000 // GenBank // Homo sapiens MTP (MTP) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY168638 // GenBank // Homo sapiens metallothionein-1B mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC069421 // GenBank // Homo sapiens metallothionein 1B, mRNA (cDNA clone MGC:97427 IMAGE:7262703), complete cds. // chr16 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// BC137478 // GenBank // Homo sapiens metallothionein 1B, mRNA (cDNA clone MGC:169101 IMAGE:9021478), complete cds. // chr16 // 88 // 62 // 14 // 16 // 0 /// BC137479 // GenBank // Homo sapiens metallothionein 1B, mRNA (cDNA clone MGC:169102 IMAGE:9021479), complete cds. // chr16 // 88 // 62 // 14 // 16 // 0 /// GENSCAN00000010898 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:56651954:56653065:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000568608 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:56648881:56652636:1 gene:ENSG00000259923 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// NONHSAT142697 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_005949 // RefSeq // Homo sapiens metallothionein 1F (MT1F), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000334350 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:56657694:56659303:1 gene:ENSG00000198417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000564295 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:56657731:56659303:1 gene:ENSG00000198417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000568475 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:56658012:56659305:1 gene:ENSG00000198417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// BC029453 // GenBank // Homo sapiens metallothionein 1F, mRNA (cDNA clone MGC:32732 IMAGE:4041046), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC108722 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5173491. // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AF078844 // GenBank // Homo sapiens hqp0376 protein mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT142698 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_005951 // RefSeq // Homo sapiens metallothionein 1H (MT1H), mRNA. // chr16 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000332374 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:56669814:56671129:1 gene:ENSG00000205358 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000569155 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:56669840:56671129:1 gene:ENSG00000205358 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// BC008408 // GenBank // Homo sapiens metallothionein 1H, mRNA (cDNA clone MGC:14539 IMAGE:4274128), complete cds. // chr16 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// BC059780 // GenBank // Homo sapiens metallothionein 1H, mRNA (cDNA clone MGC:70702 IMAGE:5227592), complete cds. // chr16 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// BC146930 // GenBank // Homo sapiens metallothionein 1H, mRNA (cDNA clone MGC:182033 IMAGE:9056858), complete cds. // chr16 // 80 // 63 // 8 // 10 // 0 /// BC146934 // GenBank // Homo sapiens metallothionein 1H, mRNA (cDNA clone MGC:182037 IMAGE:9056862), complete cds. // chr16 // 80 // 63 // 8 // 10 // 0
NR_003669 // RefSeq // Homo sapiens metallothionein 1I, pseudogene (MT1IP), transcript variant 1, non-coding RNA. // chr16 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NR_104045 // RefSeq // Homo sapiens metallothionein 1I, pseudogene (MT1IP), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr16 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NR_104046 // RefSeq // Homo sapiens metallothionein 1I, pseudogene (MT1IP), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr16 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000379816 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:16:56676132:56677763:1 gene:ENSG00000275691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSG00000205360 // chr16 // 79 // 73 // 15 // 19 // 0 /// AF348997 // GenBank // Homo sapiens MTE (MTE) mRNA, complete cds. // chr16 // 73 // 100 // 19 // 26 // 0 /// NONHSAT142703 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 78 // 69 // 14 // 18 // 0 /// NONHSAT142702 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 73 // 100 // 19 // 26 // 0 /// NONHSAT142701 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1
NR_029680 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 138-2 (MIR138-2), microRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000384916 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:56858507:56858616:1 gene:ENSG00000207649 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-138-2 // miRBase Micro RNA Database // MI0000455 Homo sapiens miR-138-2 stem-loop // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT142718 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_000339 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 12 (sodium/chloride transporter), member 3 (SLC12A3), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// NM_001126107 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 12 (sodium/chloride transporter), member 3 (SLC12A3), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// NM_001126108 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 12 (sodium/chloride transporter), member 3 (SLC12A3), transcript variant 3, mRNA. // chr16 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// ENST00000262502 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:16:56865211:56914525:1 gene:ENSG00000070915 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000438926 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:56865207:56915850:1 gene:ENSG00000070915 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000563236 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:56865211:56914522:1 gene:ENSG00000070915 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000566786 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:56865207:56913405:1 gene:ENSG00000070915 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// U44128 // GenBank // Human thiazide-sensitive Na-Cl cotransporter (hTSC) mRNA, complete cds. // chr16 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000010889 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:56853850:56913405:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0
NM_133368 // RefSeq // Homo sapiens ring finger and SPRY domain containing 1 (RSPRY1), mRNA. // chr16 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// XM_005256221 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ring finger and SPRY domain containing 1 (RSPRY1), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// XM_006721324 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ring finger and SPRY domain containing 1 (RSPRY1), transcript variant X6, mRNA. // chr16 // 100 // 77 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000394420 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:57186291:57240475:1 gene:ENSG00000159579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000537866 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:57186333:57239957:1 gene:ENSG00000159579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// AB075852 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1972 protein. // chr16 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// AK027549 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ14643 fis, clone NT2RP2001597, weakly similar to RYANODINE RECEPTOR, CARDIAC MUSCLE. // chr16 // 95 // 95 // 20 // 21 // 0 /// BC013173 // GenBank // Homo sapiens ring finger and SPRY domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:17340 IMAGE:4340287), complete cds. // chr16 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000564530 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:57219672:57240446:1 gene:ENSG00000159579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 50 // 50 // 11 // 22 // 1 /// AK124601 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ42610 fis, clone BRACE3013576. // chr16 // 50 // 50 // 11 // 22 // 1 /// GENSCAN00000010886 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:57204776:57252267:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 45 // 10 // 10 // 0
NM_012106 // RefSeq // Homo sapiens ADP-ribosylation factor-like 2 binding protein (ARL2BP), mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000219204 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:57245098:57253635:1 gene:ENSG00000102931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000562023 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:16:57245350:57252424:1 gene:ENSG00000102931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000563234 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:57245376:57253275:1 gene:ENSG00000102931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// AF126062 // GenBank // Homo sapiens Arf-like 2 binding protein BART1 mRNA, complete cds. // chr16 // 95 // 78 // 20 // 21 // 0 /// AK298758 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61153 complete cds, highly similar to Homo sapiens ADP-ribosylation factor-like 2 binding protein (ARL2BP), mRNA. // chr16 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// BC003087 // GenBank // Homo sapiens ADP-ribosylation factor-like 2 binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:1121 IMAGE:3503251), complete cds. // chr16 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000010886 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:57204776:57252267:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// NONHSAT142743 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
NM_002990 // RefSeq // Homo sapiens chemokine (C-C motif) ligand 22 (CCL22), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000219235 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:57358772:57366190:1 gene:ENSG00000102962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC027952 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-C motif) ligand 22, mRNA (cDNA clone MGC:34554 IMAGE:5220453), complete cds. // chr16 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// U83171 // GenBank // Human macrophage-derived chemokine precursor (MDC) mRNA, complete cds. // chr16 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// U83239 // GenBank // Human CC chemokine STCP-1 mRNA, complete cds. // chr16 // 92 // 90 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000010885 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:57358817:57383032:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NM_002987 // RefSeq // Homo sapiens chemokine (C-C motif) ligand 17 (CCL17), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000219244 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:57404767:57416062:1 gene:ENSG00000102970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC069107 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-C motif) ligand 17, mRNA (cDNA clone MGC:95384 IMAGE:7216923), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC112066 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-C motif) ligand 17, mRNA (cDNA clone MGC:138271 IMAGE:8327534), complete cds. // chr16 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// BC112068 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-C motif) ligand 17, mRNA (cDNA clone MGC:138273 IMAGE:8327536), complete cds. // chr16 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// D43767 // GenBank // Homo sapiens mRNA for chemokine, complete cds. // chr16 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000616880 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:16:57413869:57416062:1 gene:ENSG00000102970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000010882 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:57413933:57417331:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
NM_001289162 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 135 (CCDC135), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_001289163 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 135 (CCDC135), transcript variant 3, mRNA. // chr16 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NM_032269 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 135 (CCDC135), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000336825 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:16:57694836:57731454:1 gene:ENSG00000159625 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000360716 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:57694800:57731453:1 gene:ENSG00000159625 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000394337 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:57694806:57731455:1 gene:ENSG00000159625 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000562250 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:57721692:57731805:1 gene:ENSG00000159625 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 39 // 11 // 11 // 0 /// AK292558 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77619 complete cds. // chr16 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC036667 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 135, mRNA (cDNA clone MGC:33410 IMAGE:4828649), complete cds. // chr16 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// ENST00000565609 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:57725474:57731453:1 gene:ENSG00000159625 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// GENSCAN00000046846 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:57668348:57756946:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0
NM_001278081 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC388282 (LOC388282), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000335616 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:57810637:57816946:1 gene:ENSG00000187185 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:lincRNA // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_002428 // RefSeq // Homo sapiens matrix metallopeptidase 15 (membrane-inserted) (MMP15), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000219271 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:58025566:58046901:1 gene:ENSG00000102996 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC036495 // GenBank // Homo sapiens matrix metallopeptidase 15 (membrane-inserted), mRNA (cDNA clone MGC:43196 IMAGE:5263145), complete cds. // chr16 // 95 // 100 // 36 // 38 // 0 /// BC055428 // GenBank // Homo sapiens matrix metallopeptidase 15 (membrane-inserted), mRNA (cDNA clone MGC:51077 IMAGE:4811572), complete cds. // chr16 // 95 // 100 // 36 // 38 // 0 /// BT006715 // GenBank // Homo sapiens matrix metalloproteinase 15 (membrane-inserted) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 53 // 20 // 20 // 0 /// D86331 // GenBank // Homo sapiens MT2-MMP gene for matrix metalloprotein, complete cds. // chr16 // 100 // 58 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000046836 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:58030398:58113480:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 53 // 53 // 20 // 38 // 1
NM_001126129 // RefSeq // Homo sapiens GINS complex subunit 3 (Psf3 homolog) (GINS3), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_001126130 // RefSeq // Homo sapiens GINS complex subunit 3 (Psf3 homolog) (GINS3), transcript variant 3, mRNA. // chr16 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NM_022770 // RefSeq // Homo sapiens GINS complex subunit 3 (Psf3 homolog) (GINS3), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000318129 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:58392394:58406144:1 gene:ENSG00000181938 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000328514 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:58392394:58406036:1 gene:ENSG00000181938 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000426538 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:58392394:58405481:1 gene:ENSG00000181938 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000567143 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:58402942:58406143:1 gene:ENSG00000181938 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// AK127454 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ45546 fis, clone BRTHA2034576. // chr16 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// BC005879 // GenBank // Homo sapiens GINS complex subunit 3 (Psf3 homolog), mRNA (cDNA clone MGC:4637 IMAGE:3529058), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC014437 // GenBank // Homo sapiens GINS complex subunit 3 (Psf3 homolog), mRNA (cDNA clone MGC:22939 IMAGE:4870865), complete cds. // chr16 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000046834 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:58336803:58436222:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
ENST00000363686 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:58496908:58497014:1 gene:ENSG00000200556 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT142844 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
M15530 // GenBank // Human B-cell growth factor (BCGF1) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
ENST00000496780 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:58770524:58770820:1 gene:ENSG00000244003 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr16 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT142878 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
ENST00000363192 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:59540126:59540266:1 gene:ENSG00000200062 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT142890 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001136106 // RefSeq // Homo sapiens brain expressed, associated with NEDD4, 1 (BEAN1), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001178020 // RefSeq // Homo sapiens brain expressed, associated with NEDD4, 1 (BEAN1), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000299694 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:66427371:66482269:1 gene:ENSG00000166546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000536005 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:66427297:66481916:1 gene:ENSG00000166546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000562849 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:66427337:66482842:1 gene:ENSG00000166546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001197224 // RefSeq // Homo sapiens brain expressed, associated with NEDD4, 1 (BEAN1), transcript variant 4, mRNA. // chr16 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// NM_001197225 // RefSeq // Homo sapiens brain expressed, associated with NEDD4, 1 (BEAN1), transcript variant 3, mRNA. // chr16 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// ENST00000561796 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:16:66427371:66493529:1 gene:ENSG00000166546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// GENSCAN00000013272 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:66452473:66493762:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// ENST00000622872 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:16:66427297:66493441:1 gene:ENSG00000166546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
ENST00000563151 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:66549280:66551189:1 gene:ENSG00000261519 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AK000013 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ20006 fis, clone ADKA02694. // chr16 // 87 // 100 // 20 // 23 // 0 /// NONHSAT143019 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENST00000411222 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:16:66550457:66550567:1 gene:ENSG00000275745 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA gene:ENSG00000261519 // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000563151 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:66549280:66551189:1 gene:ENSG00000261519 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK000013 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ20006 fis, clone ADKA02694. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT143019 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT143020 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001014435 // RefSeq // Homo sapiens carbonic anhydrase VII (CA7), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000394069 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:16:66844932:66854153:1 gene:ENSG00000168748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000548332 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:66844932:66853720:1 gene:ENSG00000168748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 61 // 22 // 22 // 0 /// AY075020 // GenBank // Homo sapiens carbonic anhydrase VII short form mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NM_005182 // RefSeq // Homo sapiens carbonic anhydrase VII (CA7), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 92 // 92 // 33 // 36 // 1 /// ENST00000338437 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:66844379:66854149:1 gene:ENSG00000168748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 92 // 92 // 33 // 36 // 1 /// AY075019 // GenBank // Homo sapiens carbonic anhydrase VII mRNA, complete cds. // chr16 // 92 // 92 // 33 // 36 // 1 /// BC033865 // GenBank // Homo sapiens carbonic anhydrase VII, mRNA (cDNA clone MGC:45245 IMAGE:5185069), complete cds. // chr16 // 89 // 89 // 32 // 36 // 1 /// GENSCAN00000022885 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:66842720:66907763:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 75 // 75 // 27 // 36 // 1
ENST00000580506 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:67019519:67019817:1 gene:ENSG00000265918 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT143069 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_024712 // RefSeq // Homo sapiens engulfment and cell motility 3 (ELMO3), mRNA. // chr16 // 100 // 98 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000360833 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:16:67199111:67204029:1 gene:ENSG00000102890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// ENST00000393997 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:67199111:67204029:1 gene:ENSG00000102890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 98 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000477898 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:67199509:67204029:1 gene:ENSG00000102890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 91 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000571587 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:67199166:67201548:1 gene:ENSG00000102890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 94 // 36 // 15 // 16 // 0 /// ENST00000571638 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:67199951:67201599:1 gene:ENSG00000102890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 31 // 14 // 14 // 0 /// AK300976 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53212 complete cds, highly similar to Homo sapiens engulfment and cell motility 3 (ELMO3), mRNA. // chr16 // 93 // 98 // 41 // 44 // 0 /// GENSCAN00000022906 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:67192228:67203877:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 98 // 89 // 39 // 40 // 0
NM_000196 // RefSeq // Homo sapiens hydroxysteroid (11-beta) dehydrogenase 2 (HSD11B2), mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000326152 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:67431117:67437553:1 gene:ENSG00000176387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000566606 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:67431366:67436134:1 gene:ENSG00000176387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// BC036780 // GenBank // Homo sapiens hydroxysteroid (11-beta) dehydrogenase 2, mRNA (cDNA clone MGC:46217 IMAGE:5725938), complete cds. // chr16 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC064536 // GenBank // Homo sapiens hydroxysteroid (11-beta) dehydrogenase 2, mRNA (cDNA clone MGC:70817 IMAGE:5722669), complete cds. // chr16 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// U14631 // GenBank // Human 11 beta-hydroxysteroid dehydrogenase type II mRNA, complete cds. // chr16 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// U26726 // GenBank // Human 11-beta-hydroxysteroid dehydrogenase type 2 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000022896 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:67431249:67437003:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
AF370400 // GenBank HTC // Homo sapiens PP10897 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT143124 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_006565 // RefSeq // Homo sapiens CCCTC-binding factor (zinc finger protein) (CTCF), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000264010 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:67562407:67639183:1 gene:ENSG00000102974 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000566078 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:67562538:67612146:1 gene:ENSG00000102974 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// BC014267 // GenBank // Homo sapiens CCCTC-binding factor (zinc finger protein), mRNA (cDNA clone MGC:10345 IMAGE:3840827), complete cds. // chr16 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// BT009915 // GenBank // Homo sapiens CCCTC-binding factor (zinc finger protein) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// U25435 // GenBank // Human transcriptional repressor (CTCF) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NM_001191022 // RefSeq // Homo sapiens CCCTC-binding factor (zinc finger protein) (CTCF), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 88 // 88 // 30 // 34 // 1 /// ENST00000401394 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:67562407:67639183:1 gene:ENSG00000102974 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 88 // 88 // 30 // 34 // 1 /// GENSCAN00000020260 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:67610833:67657518:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 71 // 71 // 24 // 34 // 1
NM_001013838 // RefSeq // Homo sapiens RGD motif, leucine rich repeats, tropomodulin domain and proline-rich containing (RLTPR), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENST00000334583 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:67644919:67657569:1 gene:ENSG00000159753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENST00000545661 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:16:67645247:67657518:1 gene:ENSG00000159753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 98 // 90 // 42 // 43 // 0 /// ENST00000602368 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:67654518:67657569:1 gene:ENSG00000159753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 21 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000602563 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:67644988:67647612:1 gene:ENSG00000159753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 23 // 11 // 11 // 0 /// FJ026014 // GenBank // Homo sapiens CARMIL2b (RLTPR) mRNA, complete cds. // chr16 // 95 // 90 // 41 // 43 // 0 /// ENST00000602321 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:67647869:67653205:1 gene:ENSG00000159753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 44 // 44 // 21 // 48 // 1 /// AK090421 // GenBank // Homo sapiens mRNA for FLJ00330 protein. // chr16 // 44 // 44 // 21 // 48 // 1 /// GENSCAN00000020260 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:67610833:67657518:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 95 // 90 // 41 // 43 // 0 /// NONHSAT143153 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 44 // 44 // 21 // 48 // 1
NM_020457 // RefSeq // Homo sapiens THAP domain containing 11 (THAP11), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000303596 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:67842082:67844195:1 gene:ENSG00000168286 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK289367 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76985 complete cds, highly similar to Homo sapiens THAP domain containing 11 (THAP11), mRNA. // chr16 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// BC012182 // GenBank // Homo sapiens THAP domain containing 11, mRNA (cDNA clone MGC:20469 IMAGE:4554554), complete cds. // chr16 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000020266 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:67842555:67843499:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT143188 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr16 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0
NM_198443 // RefSeq // Homo sapiens neuritin 1-like (NRN1L), mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000339176 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:67884805:67886372:1 gene:ENSG00000188038 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000576147 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:67885569:67886368:1 gene:ENSG00000188038 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// AY358782 // GenBank // Homo sapiens clone DNA92265 MRCC2446 (UNQ2446) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC100863 // GenBank // Homo sapiens neuritin 1-like, mRNA (cDNA clone MGC:118990 IMAGE:40002773), complete cds. // chr16 // 85 // 80 // 17 // 20 // 0 /// BC100864 // GenBank // Homo sapiens neuritin 1-like, mRNA (cDNA clone MGC:118991 IMAGE:40002775), complete cds. // chr16 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// BC100865 // GenBank // Homo sapiens neuritin 1-like, mRNA (cDNA clone MGC:118992 IMAGE:40002782), complete cds. // chr16 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// BC100866 // GenBank // Homo sapiens neuritin 1-like, mRNA (cDNA clone MGC:118993 IMAGE:40002783), complete cds. // chr16 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// ENST00000572067 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:67882461:67886367:1 gene:ENSG00000263126 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK125818 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ43830 fis, clone TESTI4004887, weakly similar to Homo sapiens autoantigen (RCD-8). // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020270 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:67865131:67927642:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_006742 // RefSeq // Homo sapiens protein serine kinase H1 (PSKH1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000291041 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:67893272:67929678:1 gene:ENSG00000159792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000570631 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:67893272:67910088:1 gene:ENSG00000159792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0 /// AK309272 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99313. // chr16 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0 /// BC062616 // GenBank // Homo sapiens protein serine kinase H1, mRNA (cDNA clone MGC:70352 IMAGE:5188431), complete cds. // chr16 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000020270 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:67865131:67927642:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1
ENST00000391143 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:16:68189287:68189421:1 gene:ENSG00000212445 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT143220 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000364294 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:68535515:68535658:1 gene:ENSG00000201164 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT143287 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001793 // RefSeq // Homo sapiens cadherin 3, type 1, P-cadherin (placental) (CDH3), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000264012 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:68644836:68700295:1 gene:ENSG00000062038 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000429102 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:68644993:68699036:1 gene:ENSG00000062038 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000542274 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:68645301:68698692:1 gene:ENSG00000062038 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 88 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000566808 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:68645637:68679812:1 gene:ENSG00000062038 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 22 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000567674 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:68687620:68698472:1 gene:ENSG00000062038 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 27 // 11 // 11 // 0 /// AK296968 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50795 complete cds, highly similar to Cadherin-3 precursor. // chr16 // 97 // 88 // 35 // 36 // 0 /// BC014462 // GenBank // Homo sapiens cadherin 3, type 1, P-cadherin (placental), mRNA (cDNA clone MGC:23083 IMAGE:4870356), complete cds. // chr16 // 97 // 95 // 38 // 39 // 0 /// BC041846 // GenBank // Homo sapiens cadherin 3, type 1, P-cadherin (placental), mRNA (cDNA clone MGC:43574 IMAGE:5269523), complete cds. // chr16 // 98 // 100 // 40 // 41 // 0 /// GENSCAN00000037678 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:68676104:68701281:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 76 // 31 // 31 // 0
NM_024562 // RefSeq // Homo sapiens transport and golgi organization 6 homolog (Drosophila) (TANGO6), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000261778 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:68843606:69085180:1 gene:ENSG00000103047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000037674 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:68843618:69115266:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1
ENST00000469997 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:69033986:69036042:1 gene:ENSG00000244378 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000490535 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:69033675:69034521:1 gene:ENSG00000244378 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr16 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// AK022393 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ12331 fis, clone MAMMA1002170, moderately similar to 40S RIBOSOMAL PROTEIN S2. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001199280 // RefSeq // Homo sapiens hyaluronan synthase 3 (HAS3), transcript variant 3, mRNA. // chr16 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// NM_005329 // RefSeq // Homo sapiens hyaluronan synthase 3 (HAS3), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// NM_138612 // RefSeq // Homo sapiens hyaluronan synthase 3 (HAS3), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000219322 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:69106257:69118719:1 gene:ENSG00000103044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000306560 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:69107540:69117668:1 gene:ENSG00000103044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000569188 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:69105564:69115550:1 gene:ENSG00000103044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 38 // 9 // 9 // 0 /// AF232772 // GenBank // Homo sapiens hyaluronan synthase 3 (HAS3) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// AF234839 // GenBank // Homo sapiens hyaluronan synthase 3 (HAS3) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// AK291400 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77140 complete cds, highly similar to Homo sapiens hyaluronan synthase 3 (HAS3), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 89 // 38 // 8 // 9 // 0 /// BC021853 // GenBank // Homo sapiens hyaluronan synthase 3, mRNA (cDNA clone MGC:30024 IMAGE:4477285), complete cds. // chr16 // 93 // 63 // 14 // 15 // 0 /// GENSCAN00000037674 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:68843618:69115266:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1
NM_006750 // RefSeq // Homo sapiens syntrophin, beta 2 (dystrophin-associated protein A1, 59kDa, basic component 2) (SNTB2), mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000336278 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:69187129:69309052:1 gene:ENSG00000168807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000467311 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:69187147:69300981:1 gene:ENSG00000168807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// AF243385 // GenBank // Homo sapiens beta-2 syntrophin mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr16 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC048215 // GenBank // Homo sapiens syntrophin, beta 2 (dystrophin-associated protein A1, 59kDa, basic component 2), mRNA (cDNA clone MGC:52142 IMAGE:5805707), complete cds. // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// U40572 // GenBank // Human beta2-syntrophin (SNT B2) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000037675 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:69187167:69300924:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
ENST00000363294 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:16:69191123:69191223:1 gene:ENSG00000200164 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr16 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000572722 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR16_2_CTG3_1:69191115:69191215:1 gene:ENSG00000262354 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr16 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// AK022467 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ12405 fis, clone MAMMA1002838. // chr16 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT143324 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NR_029681 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 140 (MIR140), microRNA. // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000385282 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:69933073:69933182:1 gene:ENSG00000208017 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// hsa-mir-140 // miRBase Micro RNA Database // MI0000456 Homo sapiens miR-140 stem-loop // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT143376 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_012426 // RefSeq // Homo sapiens splicing factor 3b, subunit 3, 130kDa (SF3B3), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000302516 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:70523788:70577668:1 gene:ENSG00000189091 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AK291768 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78677 complete cds, highly similar to Homo sapiens splicing factor 3b, subunit 3, 130kDa (SF3B3), mRNA. // chr16 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// BC000463 // GenBank // Homo sapiens splicing factor 3b, subunit 3, 130kDa, mRNA (cDNA clone IMAGE:2822705), complete cds. // chr16 // 90 // 32 // 9 // 10 // 0 /// BC003146 // GenBank // Homo sapiens splicing factor 3b, subunit 3, 130kDa, mRNA (cDNA clone IMAGE:2822705), complete cds. // chr16 // 90 // 32 // 9 // 10 // 0 /// BC068974 // GenBank // Homo sapiens splicing factor 3b, subunit 3, 130kDa, mRNA (cDNA clone MGC:74943 IMAGE:6168677), complete cds. // chr16 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// D13642 // GenBank // Homo sapiens KIAA0017 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000023406 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:70526657:70571813:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0
AK122592 // GenBank // Homo sapiens mRNA for FLJ00418 protein. // chr16 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
ENST00000408798 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:70852698:70852814:1 gene:ENSG00000221725 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT143453 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT068474 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 50 // 100 // 10 // 20 // 0
NM_001166395 // RefSeq // Homo sapiens carbohydrate (N-acetylglucosamine 6-O) sulfotransferase 4 (CHST4), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NM_005769 // RefSeq // Homo sapiens carbohydrate (N-acetylglucosamine 6-O) sulfotransferase 4 (CHST4), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000338482 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:71525233:71538746:1 gene:ENSG00000140835 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000539698 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:71526251:71538597:1 gene:ENSG00000140835 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000572693 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:71536586:71537918:1 gene:ENSG00000140835 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// AF131235 // GenBank // Homo sapiens N-acetylglucosamine 6-O-sulfotransferase mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// AF149783 // GenBank // Homo sapiens L-selectin ligand sulfotransferase mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// AF280088 // GenBank // Homo sapiens L-selectin ligand sulfotransferase GST-3 mRNA, complete cds. // chr16 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// BC035282 // GenBank // Homo sapiens carbohydrate (N-acetylglucosamine 6-O) sulfotransferase 4, mRNA (cDNA clone MGC:34456 IMAGE:5179826), complete cds. // chr16 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000033949 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:71536696:71537838:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0
ENST00000362431 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:71666091:71666197:1 gene:ENSG00000199301 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT143500 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENST00000563557 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:71726975:71727992:1 gene:ENSG00000260612 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY358233 // GenBank // Homo sapiens clone DNA142958 ISPF6484 (UNQ6484) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT143503 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_020995 // RefSeq // Homo sapiens haptoglobin-related protein (HPR), mRNA. // chr16 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// XM_006721186 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens haptoglobin-related protein (HPR), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 52 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000356967 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:16:72063229:72077245:1 gene:ENSG00000261701 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000540303 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:72063224:72077246:1 gene:ENSG00000261701 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000561690 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:72063229:72077246:1 gene:ENSG00000261701 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 43 // 43 // 10 // 23 // 1 /// ENST00000566168 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:72063226:72074751:1 gene:ENSG00000261701 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1 /// GENSCAN00000033933 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:72063256:72077081:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// X89214 // GenBank // H.sapiens mRNA for haptoglobin related protein. // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENST00000384783 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:72376704:72376760:1 gene:ENSG00000207514 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 75 // 83 // 15 // 20 // 0 /// NONHSAT143561 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 75 // 83 // 15 // 20 // 0
NM_002811 // RefSeq // Homo sapiens proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 7 (PSMD7), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000219313 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:74296775:74306288:1 gene:ENSG00000103035 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000567958 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:74296821:74305513:1 gene:ENSG00000103035 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000568717 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:74296820:74305888:1 gene:ENSG00000103035 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// AK301996 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51373 complete cds, highly similar to 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 7. // chr16 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// BC000338 // GenBank // Homo sapiens proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 7, mRNA (cDNA clone IMAGE:2822691), partial cds. // chr16 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// BC012606 // GenBank // Homo sapiens proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 7, mRNA (cDNA clone MGC:13607 IMAGE:4334058), complete cds. // chr16 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// D50063 // GenBank // Homo sapiens mRNA for proteasome subunit p40 / Mov34 protein, complete cds. // chr16 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENST00000568615 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:74296829:74304709:1 gene:ENSG00000103035 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// GENSCAN00000007139 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:74296915:74305733:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
ENST00000515985 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:74456541:74456611:1 gene:ENSG00000251794 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// NONHSAT143694 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
NM_018975 // RefSeq // Homo sapiens telomeric repeat binding factor 2, interacting protein (TERF2IP), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000300086 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:75647786:75657432:1 gene:ENSG00000166848 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000569234 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:75648396:75656433:1 gene:ENSG00000166848 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// AF250393 // GenBank // Homo sapiens dopamine receptor interacting protein 5 (DRIP5) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AF262988 // GenBank // Homo sapiens TRF2-interacting telomeric RAP1 protein (RAP1) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// AK298880 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60801 complete cds, highly similar to Telomeric repeat-binding factor 2-interacting protein 1. // chr16 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// BC004465 // GenBank // Homo sapiens telomeric repeat binding factor 2, interacting protein, mRNA (cDNA clone MGC:4327 IMAGE:2820760), complete cds. // chr16 // 92 // 93 // 23 // 25 // 0 /// BC005841 // GenBank // Homo sapiens telomeric repeat binding factor 2, interacting protein, mRNA (cDNA clone MGC:2699 IMAGE:2820760), complete cds. // chr16 // 92 // 93 // 23 // 25 // 0 /// BC022428 // GenBank // Homo sapiens telomeric repeat binding factor 2, interacting protein, mRNA (cDNA clone MGC:24671 IMAGE:4253277), complete cds. // chr16 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC078171 // GenBank // Homo sapiens telomeric repeat binding factor 2, interacting protein, mRNA (cDNA clone MGC:87941 IMAGE:5760351), complete cds. // chr16 // 92 // 89 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000007550 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:75647454:75656611:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0
ENST00000517005 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:76287630:76287739:1 gene:ENSG00000252814 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT143779 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_020927 // RefSeq // Homo sapiens vesicle amine transport 1-like (VAT1L), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000302536 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:77788530:77980107:1 gene:ENSG00000171724 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AK290153 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76322 complete cds. // chr16 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// BC033537 // GenBank // Homo sapiens vesicle amine transport protein 1 homolog (T. californica)-like, mRNA (cDNA clone MGC:42386 IMAGE:4821265), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000563850 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:77862748:77882408:1 gene:ENSG00000171724 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// GENSCAN00000031638 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:77788683:77898894:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1
NM_001244755 // RefSeq // Homo sapiens C-type lectin domain family 3, member A (CLEC3A), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// NM_005752 // RefSeq // Homo sapiens C-type lectin domain family 3, member A (CLEC3A), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000299642 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:78022515:78032106:1 gene:ENSG00000166509 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000565808 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:16:78029089:78030951:1 gene:ENSG00000166509 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 38 // 11 // 11 // 0 /// AY358376 // GenBank // Homo sapiens clone DNA64852 CLECSF1 (UNQ700) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// BC104414 // GenBank // Homo sapiens C-type lectin domain family 3, member A, mRNA (cDNA clone MGC:129558 IMAGE:40003144), complete cds. // chr16 // 94 // 62 // 17 // 18 // 0 /// BC104415 // GenBank // Homo sapiens C-type lectin domain family 3, member A, mRNA (cDNA clone MGC:129559 IMAGE:40003149), complete cds. // chr16 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000567430 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:78022515:78066761:1 gene:ENSG00000166509 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// GENSCAN00000031631 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:78022600:78030841:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0 /// AK310847 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17889. // chr16 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
ENST00000410312 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:79264454:79264573:1 gene:ENSG00000222244 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT143845 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_015251 // RefSeq // Homo sapiens ATM interactor (ATMIN), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000299575 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:81035847:81047358:1 gene:ENSG00000166454 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000539819 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:81037182:81045174:1 gene:ENSG00000166454 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000564241 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:16:81037187:81047348:1 gene:ENSG00000166454 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000566488 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:81040525:81047346:1 gene:ENSG00000166454 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// AB007891 // GenBank // Homo sapiens KIAA0431 mRNA, partial cds. // chr16 // 95 // 71 // 19 // 20 // 0 /// AK290943 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76795 complete cds, highly similar to Homo sapiens ATM/ATR-Substrate Chk2-Interacting Zn2+-finger protein, mRNA. // chr16 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// AK301781 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50270 complete cds. // chr16 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000562969 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:81036058:81041711:1 gene:ENSG00000166454 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// GENSCAN00000006685 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:81035871:81044970:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
NM_017429 // RefSeq // Homo sapiens beta-carotene 15,15-monooxygenase 1 (BCMO1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000258168 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:81238448:81291142:1 gene:ENSG00000135697 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000563804 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:81238689:81290700:1 gene:ENSG00000135697 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000564552 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:81238691:81262543:1 gene:ENSG00000135697 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// AF294900 // GenBank // Homo sapiens beta, beta-carotene 15,15- dioxygenase (BCDO) mRNA, complete cds. // chr16 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// AK296011 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54359 complete cds, highly similar to Beta,beta-carotene 15,15-monooxygenase (EC 1.14.99.36). // chr16 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// BC022269 // GenBank HTC // Homo sapiens beta-carotene 15,15-monooxygenase 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4734856), with apparent retained intron. // chr16 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// BC126210 // GenBank // Homo sapiens beta-carotene 15,15-monooxygenase 1, mRNA (cDNA clone MGC:161488 IMAGE:8991926), complete cds. // chr16 // 89 // 93 // 25 // 28 // 0 /// BC126212 // GenBank // Homo sapiens beta-carotene 15,15-monooxygenase 1, mRNA (cDNA clone MGC:161490 IMAGE:8991928), complete cds. // chr16 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000006682 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:81238909:81290577:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0
NM_022041 // RefSeq // Homo sapiens gigaxonin (GAN), mRNA. // chr16 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000568107 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:81314952:81390884:1 gene:ENSG00000261609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF291673 // GenBank // Homo sapiens gigaxonin mRNA, complete cds. // chr16 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// BC044840 // GenBank // Homo sapiens gigaxonin, mRNA (cDNA clone MGC:5326 IMAGE:2900666), complete cds. // chr16 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000006697 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:81315114:81377596:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0
NM_002661 // RefSeq // Homo sapiens phospholipase C, gamma 2 (phosphatidylinositol-specific) (PLCG2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000363673 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:16:81961926:81962243:1 gene:ENSG00000260682 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000564138 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:81779258:81962693:1 gene:ENSG00000197943 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSG00000260682 // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT143969 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT143970 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT143971 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NONHSAT143987 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001537 // RefSeq // Homo sapiens heat shock factor binding protein 1 (HSBP1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000433866 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:83807843:83819737:1 gene:ENSG00000230989 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AF068754 // GenBank // Homo sapiens heat shock factor binding protein 1 HSBP1 mRNA, complete cds. // chr16 // 94 // 73 // 15 // 16 // 0 /// AY320409 // GenBank HTC // Homo sapiens nasopharyngeal carcinoma-associated antigen NPC-A-13 mRNA, complete cds. // chr16 // 94 // 73 // 15 // 16 // 0 /// BC007515 // GenBank // Homo sapiens heat shock factor binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:4536 IMAGE:3010737), complete cds. // chr16 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0 /// BX537440 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686O24200 (from clone DKFZp686O24200); complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000567382 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:83808062:83811503:1 gene:ENSG00000230989 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 41 // 41 // 9 // 22 // 1 /// ENST00000569301 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:83809122:83811667:1 gene:ENSG00000230989 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 41 // 41 // 9 // 22 // 1 /// ENST00000570259 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:83807989:83818484:1 gene:ENSG00000230989 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 41 // 41 // 9 // 22 // 1 /// NONHSAT144016 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 41 // 41 // 9 // 22 // 1
NM_012213 // RefSeq // Homo sapiens malonyl-CoA decarboxylase (MLYCD), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000262430 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:83899126:83927026:1 gene:ENSG00000103150 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF090834 // GenBank // Homo sapiens malonyl coenzyme A decarboxylase mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// AF097832 // GenBank // Homo sapiens malonyl-CoA decarboxylase precursor (MLYCD) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// AF153679 // GenBank // Homo sapiens malonyl-CoA decarboxylase mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC000286 // GenBank // Homo sapiens malonyl-CoA decarboxylase, mRNA (cDNA clone MGC:3193 IMAGE:3357140), complete cds. // chr16 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC052592 // GenBank // Homo sapiens malonyl-CoA decarboxylase, mRNA (cDNA clone MGC:59795 IMAGE:6421051), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000569024 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:83911683:83916171:1 gene:ENSG00000103150 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// AK094095 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ36776 fis, clone ADRGL2001229, moderately similar to Homo sapiens malonyl-CoA decarboxylase mRNA. // chr16 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000044212 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:83899145:84002346:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// ENST00000561562 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:83908132:83951445:1 gene:ENSG00000260300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_019065 // RefSeq // Homo sapiens N-terminal EF-hand calcium binding protein 2 (NECAB2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000305202 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:83968632:84002776:1 gene:ENSG00000103154 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000564166 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:16:83998252:84002776:1 gene:ENSG00000103154 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 34 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000565691 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:83971451:84002776:1 gene:ENSG00000103154 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000566836 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:16:83978545:83998285:1 gene:ENSG00000103154 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 34 // 10 // 10 // 0 /// AY299331 // GenBank // Homo sapiens EF-hand calcium binding protein 2 (EFCBP2) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC016979 // GenBank // Homo sapiens EF-hand calcium binding protein 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:4181575). // chr16 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC131615 // GenBank // Homo sapiens N-terminal EF-hand calcium binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:149585 IMAGE:40116488), complete cds. // chr16 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000044212 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:83899145:84002346:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
NM_024731 // RefSeq // Homo sapiens kelch-like family member 36 (KLHL36), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000258157 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:84648535:84662314:1 gene:ENSG00000135686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 91 // 81 // 20 // 22 // 0 /// ENST00000564996 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:84648525:84662314:1 gene:ENSG00000135686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC032400 // GenBank // Homo sapiens kelch-like 36 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:40550 IMAGE:5210986), complete cds. // chr16 // 91 // 81 // 20 // 22 // 0 /// BC033821 // GenBank // Homo sapiens kelch-like 36 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:44957 IMAGE:5219021), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000564159 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:84657903:84662309:1 gene:ENSG00000135686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// AK122745 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ16270 fis, clone NESOP2001144. // chr16 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// ENST00000325279 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:84659539:84667686:1 gene:ENSG00000135686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// ENST00000567410 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:84648612:84657100:1 gene:ENSG00000135686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// AK074056 // GenBank // Homo sapiens mRNA for FLJ00127 protein. // chr16 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// GENSCAN00000027160 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:84643148:84662133:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0
NM_031476 // RefSeq // Homo sapiens cysteine-rich secretory protein LCCL domain containing 2 (CRISPLD2), mRNA. // chr16 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000262424 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:84819984:84909510:1 gene:ENSG00000103196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000567845 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:16:84819991:84907112:1 gene:ENSG00000103196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// AY358790 // GenBank // Homo sapiens clone DNA131590 trypsin inhibitor (UNQ2914) mRNA, complete cds. // chr16 // 94 // 61 // 16 // 17 // 0 /// ENST00000564567 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:84820003:84880725:1 gene:ENSG00000103196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1 /// BC063012 // GenBank // Homo sapiens cysteine-rich secretory protein LCCL domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:74865 IMAGE:5217820), complete cds. // chr16 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// ENST00000563066 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:84842003:84873110:1 gene:ENSG00000103196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// ENST00000569262 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:84820017:84873508:1 gene:ENSG00000103196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// AK027395 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ14489 fis, clone MAMMA1002881, weakly similar to GLIOMA PATHOGENESIS-RELATED PROTEIN. // chr16 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1 /// GENSCAN00000027155 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:84838496:84907427:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0
ENST00000366314 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:85282958:85285963:1 gene:ENSG00000179219 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr16 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC030801 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 148, mRNA (cDNA clone MGC:22001 IMAGE:4399117), complete cds. // chr16 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// NONHSAT144116 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT144117 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// TCONS_00024296-XLOC_011808 // Rinn lincRNA // linc-KIAA0182-1 chr16:+:85316563-85319569 // chr16 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT144112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
ENST00000577658 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:85659378:85659675:1 gene:ENSG00000263968 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT144131 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
AF384996 // GenBank // Homo sapiens MUSP1 (MUSP1) mRNA, complete cds. // chr16 // 89 // 100 // 17 // 19 // 0
NM_001451 // RefSeq // Homo sapiens forkhead box F1 (FOXF1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000262426 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:86510527:86515418:1 gene:ENSG00000103241 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC089442 // GenBank // Homo sapiens forkhead box F1, mRNA (cDNA clone MGC:105125 IMAGE:30558276), complete cds. // chr16 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// U13219 // GenBank // Human forkhead protein FREAC-1 mRNA, complete cds. // chr16 // 91 // 100 // 29 // 32 // 0 /// GENSCAN00000038321 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:86503508:86526294:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1
NR_026674 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized protein FLJ30679 (FLJ30679), long non-coding RNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK055241 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ30679 fis, clone FCBBF2000105. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT144223 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_005251 // RefSeq // Homo sapiens forkhead box C2 (MFH-1, mesenchyme forkhead 1) (FOXC2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000320354 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:86567251:86569728:1 gene:ENSG00000176692 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC113437 // GenBank // Homo sapiens forkhead box C2 (MFH-1, mesenchyme forkhead 1), mRNA (cDNA clone MGC:141997 IMAGE:8322489), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC113439 // GenBank // Homo sapiens forkhead box C2 (MFH-1, mesenchyme forkhead 1), mRNA (cDNA clone MGC:141999 IMAGE:8322491), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000038318 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:86567336:86568841:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_005250 // RefSeq // Homo sapiens forkhead box L1 (FOXL1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000320241 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:86578506:86582160:1 gene:ENSG00000176678 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC100027 // GenBank // Homo sapiens forkhead box L1, mRNA (cDNA clone MGC:111386 IMAGE:30920793), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC117226 // GenBank // Homo sapiens forkhead box L1, mRNA (cDNA clone MGC:150835 IMAGE:40125777), complete cds. // chr16 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000593625 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:86576368:86579066:1 gene:ENSG00000176678 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 67 // 48 // 8 // 12 // 0 /// GENSCAN00000038307 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:86578724:86588558:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NONHSAT144272 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_022818 // RefSeq // Homo sapiens microtubule-associated protein 1 light chain 3 beta (MAP1LC3B), mRNA. // chr16 // 100 // 54 // 7 // 7 // 0 /// ENST00000268607 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:87391800:87404779:1 gene:ENSG00000140941 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 54 // 7 // 7 // 0 /// ENST00000564844 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:87392344:87404779:1 gene:ENSG00000140941 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 77 // 10 // 10 // 0 /// BC045759 // GenBank // Homo sapiens microtubule-associated protein 1 light chain 3 beta, mRNA (cDNA clone MGC:48651 IMAGE:4828857), complete cds. // chr16 // 90 // 77 // 9 // 10 // 0
NM_001271605 // RefSeq // Homo sapiens junctophilin 3 (JPH3), transcript variant 3, mRNA. // chr16 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// NR_073379 // RefSeq // Homo sapiens junctophilin 3 (JPH3), transcript variant 4, non-coding RNA. // chr16 // 100 // 56 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000537256 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:87601835:87697927:1 gene:ENSG00000154118 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 56 // 20 // 20 // 0 /// AK295518 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58183 complete cds, highly similar to Junctophilin-3. // chr16 // 100 // 56 // 20 // 20 // 0 /// AK297215 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56754 complete cds, highly similar to Junctophilin-3. // chr16 // 100 // 28 // 10 // 10 // 0 /// NM_020655 // RefSeq // Homo sapiens junctophilin 3 (JPH3), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 94 // 94 // 34 // 36 // 1 /// ENST00000284262 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:87602905:87698156:1 gene:ENSG00000154118 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 94 // 94 // 34 // 36 // 1 /// BC036533 // GenBank // Homo sapiens junctophilin 3, mRNA (cDNA clone MGC:33713 IMAGE:5264853), complete cds. // chr16 // 94 // 94 // 34 // 36 // 1 /// ENST00000563609 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:87653562:87698142:1 gene:ENSG00000154118 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 72 // 72 // 26 // 36 // 1 /// AB042636 // GenBank // Homo sapiens JP3 mRNA for junctophilin type3, complete cds. // chr16 // 64 // 64 // 23 // 36 // 1 /// AK126663 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44707 fis, clone BRACE3018083, highly similar to Homo sapiens junctophilin 3 (JPH3). // chr16 // 72 // 72 // 26 // 36 // 1 /// GENSCAN00000041117 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:87641918:87703624:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 39 // 39 // 14 // 36 // 1
NM_001127464 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 469 (ZNF469), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000437464 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:16:88427471:88440757:1 gene:ENSG00000225614 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000565624 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:16:88427471:88440749:1 gene:ENSG00000225614 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:88426302:88467136:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_153813 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein, FOG family member 1 (ZFPM1), mRNA. // chr16 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000319555 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:88453317:88537016:1 gene:ENSG00000179588 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF488691 // GenBank // Homo sapiens friend of GATA-1 (FOG1) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000011639 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:88484124:88538300:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0
ENST00000569133 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:88638591:88640122:1 gene:ENSG00000124391 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AF152099 // GenBank // Homo sapiens interleukin 17C mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// AY358471 // GenBank // Homo sapiens clone DNA62377 IL17C (UNQ561) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC069152 // GenBank // Homo sapiens interleukin 17C, mRNA (cDNA clone MGC:95437 IMAGE:7217012), complete cds. // chr16 // 95 // 66 // 18 // 19 // 0 /// BC069410 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:7262201, with apparent retained intron. // chr16 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NM_013278 // RefSeq // Homo sapiens interleukin 17C (IL17C), mRNA. // chr16 // 97 // 97 // 28 // 29 // 1 /// ENST00000244241 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:88638593:88640473:1 gene:ENSG00000124391 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 97 // 97 // 28 // 29 // 1 /// BC101835 // GenBank // Homo sapiens interleukin 17C, mRNA (cDNA clone MGC:126884 IMAGE:8069341), complete cds. // chr16 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1 /// BC112196 // GenBank // Homo sapiens interleukin 17C, mRNA (cDNA clone MGC:138401 IMAGE:8327664), complete cds. // chr16 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1 /// GENSCAN00000011654 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:88638642:88640072:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0 /// NONHSAT144391 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AF142410 // GenBank // Homo sapiens cytokine CX2 precusor mRNA, complete cds. // chr16 // 76 // 76 // 22 // 29 // 1
ENST00000567997 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:88685133:88687180:1 gene:ENSG00000260630 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr16 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// AY203928 // GenBank HTC // Homo sapiens FP17581 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONHSAT144411 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr16 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
AK097851 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ40532 fis, clone TESTI2047801. // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000564984 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:88718615:88720459:1 gene:ENSG00000260121 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT144420 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NR_103774 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC100289580 (LOC100289580), long non-coding RNA. // chr16 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000567968 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:88736800:88741425:1 gene:ENSG00000224888 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK127064 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ45121 fis, clone BRAWH3036077. // chr16 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// NONHSAT144425 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr16 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT144427 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NR_120387 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC339059 (LOC339059), long non-coding RNA. // chr16 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000333666 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:88742767:88745748:1 gene:ENSG00000182376 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr16 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000567588 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:88742821:88745464:1 gene:ENSG00000182376 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr16 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// AK097767 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ40448 fis, clone TESTI2040815. // chr16 // 80 // 96 // 20 // 25 // 0 /// BC111769 // GenBank // Homo sapiens hypothetical protein FLJ40448, mRNA (cDNA clone MGC:133175 IMAGE:40025355), complete cds. // chr16 // 78 // 88 // 18 // 23 // 0 /// NONHSAT144429 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr16 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT144430 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr16 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
NM_030928 // RefSeq // Homo sapiens chromatin licensing and DNA replication factor 1 (CDT1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000301019 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:88803213:88809258:1 gene:ENSG00000167513 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000562747 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:88804611:88806217:1 gene:ENSG00000167513 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0 /// AB053172 // GenBank // Homo sapiens hCdt1 mRNA, complete cds. // chr16 // 90 // 100 // 26 // 29 // 0 /// AF321125 // GenBank // Homo sapiens DNA replication factor (CDT1) mRNA, complete cds. // chr16 // 88 // 86 // 22 // 25 // 0 /// BC000137 // GenBank // Homo sapiens chromatin licensing and DNA replication factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:5282 IMAGE:3048353), complete cds. // chr16 // 93 // 93 // 25 // 27 // 0 /// BC009410 // GenBank // Homo sapiens chromatin licensing and DNA replication factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:10817 IMAGE:3613566), complete cds. // chr16 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011646 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:88803832:88808278:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0
NR_024347 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 304 (LINC00304), long non-coding RNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000321214 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:89159220:89163675:1 gene:ENSG00000180422 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000562248 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:89159146:89160562:1 gene:ENSG00000180422 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr16 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// AK308636 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ98677. // chr16 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// NONHSAT144472 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// NONHSAT144474 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// TCONS_00024232-XLOC_011833 // Rinn lincRNA // linc-CDH15 chr16:+:89225627-89230083 // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONHSAT144473 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// NONHSAT144467 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_004933 // RefSeq // Homo sapiens cadherin 15, type 1, M-cadherin (myotubule) (CDH15), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000289746 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:89171767:89195492:1 gene:ENSG00000129910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC008951 // GenBank // Homo sapiens cadherin 15, type 1, M-cadherin (myotubule), mRNA (cDNA clone MGC:3599 IMAGE:3027886), complete cds. // chr16 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// D83542 // GenBank // Homo sapiens mRNA for cadherin-15, complete cds. // chr16 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// ENST00000524089 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:89171767:89186192:1 gene:ENSG00000129910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// AK308631 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ98672. // chr16 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// GENSCAN00000011673 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:89171832:89195155:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0
NM_001201407 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 778 (ZNF778), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_182531 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 778 (ZNF778), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NR_037705 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 778 (ZNF778), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr16 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000433976 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:16:89217703:89229557:1 gene:ENSG00000170100 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000564906 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:89217710:89223282:1 gene:ENSG00000170100 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 92 // 46 // 11 // 12 // 0 /// ENST00000567651 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:89221072:89227790:1 gene:ENSG00000170100 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// BC125192 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 778, mRNA (cDNA clone MGC:150573 IMAGE:40122711), complete cds. // chr16 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// ENST00000306502 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:89221076:89228714:1 gene:ENSG00000170100 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// ENST00000620195 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:89217710:89237071:1 gene:ENSG00000170100 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000011665 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:89221128:89248835:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// AK295122 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50766 complete cds. // chr16 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
AK126695 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44741 fis, clone BRACE3027931. // chr16 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000620195 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:89217710:89237071:1 gene:ENSG00000170100 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 50 // 9 // 9 // 0 /// AK295122 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50766 complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000011665 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:89221128:89248835:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 78 // 78 // 14 // 18 // 1
NM_000977 // RefSeq // Homo sapiens ribosomal protein L13 (RPL13), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0 /// NM_001243130 // RefSeq // Homo sapiens ribosomal protein L13 (RPL13), transcript variant 3, mRNA. // chr16 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0 /// NM_001243131 // RefSeq // Homo sapiens ribosomal protein L13 (RPL13), transcript variant 4, mRNA. // chr16 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0 /// NM_033251 // RefSeq // Homo sapiens ribosomal protein L13 (RPL13), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000311528 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:89560657:89566828:1 gene:ENSG00000167526 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0 /// ENST00000393099 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:89560711:89564542:1 gene:ENSG00000167526 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0
ENST00000363214 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:89561434:89561517:1 gene:ENSG00000200084 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000484610 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:89560679:89563067:1 gene:ENSG00000167526 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000487034 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:89560682:89561523:1 gene:ENSG00000167526 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000563749 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:89560677:89563043:1 gene:ENSG00000167526 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK026501 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ22848 fis, clone KAIA897. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_002450 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 68 (SNORD68), small nucleolar RNA. // chr16 // 71 // 96 // 17 // 24 // 0 /// NONHSAT144542 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT144543 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT144546 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 71 // 96 // 17 // 24 // 0
NM_002386 // RefSeq // Homo sapiens melanocortin 1 receptor (alpha melanocyte stimulating hormone receptor) (MC1R), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000555147 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:89917879:89920977:1 gene:ENSG00000258839 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC007856 // GenBank // Homo sapiens melanocortin 1 receptor (alpha melanocyte stimulating hormone receptor), mRNA (cDNA clone MGC:14337 IMAGE:4298428), complete cds. // chr16 // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// BC080622 // GenBank // Homo sapiens melanocortin 1 receptor (alpha melanocyte stimulating hormone receptor), mRNA (cDNA clone MGC:99464 IMAGE:6267157), complete cds. // chr16 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000555427 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:89913418:89920973:1 gene:ENSG00000258839 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// ENST00000556922 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:16:89919165:89936092:1 gene:ENSG00000198211 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// GENSCAN00000033817 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:89918103:89935804:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// AK311630 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ18672. // chr16 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// BT006971 // GenBank // Homo sapiens tubulin, beta, 4 mRNA, complete cds. // chr16 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_016310 // RefSeq // Homo sapiens polymerase (RNA) III (DNA directed) polypeptide K, 12.3 kDa (POLR3K), mRNA. // chr16 // 91 // 88 // 20 // 22 // 0 /// ENST00000293860 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:46407:53628:-1 gene:ENSG00000161980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// AF051316 // GenBank // Homo sapiens RNA polymerase III subunit (hRPC11) mRNA, complete cds. // chr16 // 76 // 68 // 13 // 17 // 0 /// AF060223 // GenBank // Homo sapiens clone 009g11 My010 protein mRNA, complete cds. // chr16 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0 /// BC011932 // GenBank // Homo sapiens polymerase (RNA) III (DNA directed) polypeptide K, 12.3 kDa, mRNA (cDNA clone MGC:19933 IMAGE:4303428), complete cds. // chr16 // 83 // 72 // 15 // 18 // 0 /// ENST00000481810 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:47236:52142:-1 gene:ENSG00000161980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONHSAT051731 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_021259 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 8A (TMEM8A), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000424078 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:16:371862:374851:-1 gene:ENSG00000129925 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000431232 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:370773:381982:-1 gene:ENSG00000129925 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000448854 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:372416:375215:-1 gene:ENSG00000129925 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0 /// AB045292 // GenBank // Homo sapiens mRNA for M83 protein, complete cds. // chr16 // 91 // 100 // 30 // 33 // 0 /// BC021557 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 8 (five membrane-spanning domains), mRNA (cDNA clone MGC:31822 IMAGE:4899167), complete cds. // chr16 // 90 // 94 // 28 // 31 // 0 /// ENST00000250930 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:371864:381978:-1 gene:ENSG00000129925 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1 /// GENSCAN00000050035 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:371987:377746:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0
ENST00000364164 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:16:439297:439397:-1 gene:ENSG00000201034 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000616605 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR16_CTG2:439297:439397:-1 gene:ENSG00000274018 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT051771 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
AK097604 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ40285 fis, clone TESTI2027820. // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT051815 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_032259 // RefSeq // Homo sapiens WD repeat domain 24 (WDR24), mRNA. // chr16 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000293883 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:684622:690400:-1 gene:ENSG00000127580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000567014 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:685450:686929:-1 gene:ENSG00000127580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 26 // 9 // 9 // 0 /// AK301146 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60907 complete cds, highly similar to WD repeat protein 24. // chr16 // 86 // 40 // 12 // 14 // 0 /// BC008025 // GenBank // Homo sapiens WD repeat domain 24, mRNA (cDNA clone MGC:15992 IMAGE:3544791), complete cds. // chr16 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000248142 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:16:684734:690444:-1 gene:ENSG00000127580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 83 // 83 // 29 // 35 // 1 /// GENSCAN00000050061 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:684734:690444:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 83 // 83 // 29 // 35 // 1
NM_153350 // RefSeq // Homo sapiens F-box and leucine-rich repeat protein 16 (FBXL16), mRNA. // chr16 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000324361 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:16:692507:705808:-1 gene:ENSG00000127585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000397621 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:692500:705829:-1 gene:ENSG00000127585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000562563 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:692927:696025:-1 gene:ENSG00000127585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000562648 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:692498:695532:-1 gene:ENSG00000127585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// AK091054 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ33735 fis, clone BRAWH2018317, highly similar to F-box/LRR-repeat protein 16. // chr16 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// BC034014 // GenBank // Homo sapiens F-box and leucine-rich repeat protein 16, mRNA (cDNA clone IMAGE:4398317), complete cds. // chr16 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// BC036680 // GenBank // Homo sapiens F-box and leucine-rich repeat protein 16, mRNA (cDNA clone MGC:33974 IMAGE:5262152), complete cds. // chr16 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000050060 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:694275:700794:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT051847 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0
ENST00000442466 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:16:769428:783370:-1 gene:ENSG00000162006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000537221 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:774188:778700:-1 gene:ENSG00000162006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 38 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000543963 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:769428:782054:-1 gene:ENSG00000162006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000050045 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:769428:782926:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_016541 // RefSeq // Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma 13 (GNG13), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000248150 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:798041:800733:-1 gene:ENSG00000127588 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB030207 // GenBank // Homo sapiens mRNA for G gamma subunit, complete cds, clone:h2-35. // chr16 // 92 // 93 // 23 // 25 // 0 /// AF493880 // GenBank // Homo sapiens guanine nucleotide binding protein gamma 13 (GNG13) mRNA, complete cds. // chr16 // 82 // 41 // 9 // 11 // 0 /// AY029486 // GenBank // Homo sapiens G protein gamma subunit 13 mRNA, complete cds. // chr16 // 92 // 93 // 23 // 25 // 0 /// BC093760 // GenBank // Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma 13, mRNA (cDNA clone MGC:120795 IMAGE:7939605), complete cds. // chr16 // 94 // 67 // 17 // 18 // 0 /// BC095525 // GenBank // Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma 13, mRNA (cDNA clone MGC:111743 IMAGE:6519181), complete cds. // chr16 // 82 // 41 // 9 // 11 // 0 /// GENSCAN00000050055 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:798719:807884:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
ENST00000599946 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:16:991151:1000926:-1 gene:ENSG00000260496 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr16 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000050068 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:987187:992267:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// NONHSAT051908 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// TCONS_00024536-XLOC_011849 // Rinn lincRNA // linc-LMF1 chr16:-:1041084-1043057 // chr16 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
GENSCAN00000048749 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:1043989:1050142:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NR_027242 // RefSeq // Homo sapiens SSTR5 antisense RNA 1 (SSTR5-AS1), long non-coding RNA. // chr16 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0 /// ENST00000569832 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:1064093:1078673:-1 gene:ENSG00000261713 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:lincRNA // chr16 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0 /// NONHSAT051911 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr16 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0 /// NONHSAT051913 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr16 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0
NM_207419 // RefSeq // Homo sapiens C1q and tumor necrosis factor related protein 8 (C1QTNF8), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000328449 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:1090005:1096244:-1 gene:ENSG00000184471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AY358832 // GenBank // Homo sapiens clone DNA145665 C1q Related (UNQ5829) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FJ422561 // GenBank // Homo sapiens C1q/TNF-related protein 8 (C1QTNF8) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000621771 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:16:1090517:1095647:-1 gene:ENSG00000184471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000048767 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:1093501:1094922:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0
GENSCAN00000048746 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:1096811:1129854:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_012467 // RefSeq // Homo sapiens tryptase gamma 1 (TPSG1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006720875 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens tryptase gamma 1 (TPSG1), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000234798 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:1221651:1225257:-1 gene:ENSG00000116176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000564684 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:1222659:1224775:-1 gene:ENSG00000116176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000048737 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:1221788:1229972:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// AF175522 // GenBank // Homo sapiens transmembrane tryptase mRNA, complete cds. // chr16 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONHSAT051924 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
ENST00000440800 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:16:1261421:1262959:-1 gene:ENSG00000196364 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr16 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENST00000568091 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:1260952:1263845:-1 gene:ENSG00000196364 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr16 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048730 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:1261298:1263145:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AK126098 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44110 fis, clone TESTI4045982, moderately similar to MCT7_MOUSE Mast cell protease 7. // chr16 // 92 // 96 // 23 // 25 // 0 /// NONHSAT051927 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
NM_001001410 // RefSeq // Homo sapiens TSR3, 20S rRNA accumulation, homolog (S. cerevisiae) (TSR3), mRNA. // chr16 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000007390 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:1349240:1351911:-1 gene:ENSG00000007520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000566296 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:1349426:1351473:-1 gene:ENSG00000007520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 64 // 14 // 14 // 0 /// BC013943 // GenBank // Homo sapiens chromosome 16 open reading frame 42, mRNA (cDNA clone MGC:24381 IMAGE:4064325), complete cds. // chr16 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// BC016699 // GenBank // Homo sapiens chromosome 16 open reading frame 42, mRNA (cDNA clone MGC:22731 IMAGE:4097703), complete cds. // chr16 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// BC017325 // GenBank // Homo sapiens chromosome 16 open reading frame 42, mRNA (cDNA clone MGC:29685 IMAGE:4549940), complete cds. // chr16 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000048765 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:1349437:1351804:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0
NM_001037125 // RefSeq // Homo sapiens unkempt family zinc finger-like (UNKL), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 38 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000301712 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:1398305:1414751:-1 gene:ENSG00000059145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 38 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000382757 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:1394131:1414697:-1 gene:ENSG00000059145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 36 // 16 // 16 // 0 /// BC011924 // GenBank // Homo sapiens unkempt homolog (Drosophila)-like, mRNA (cDNA clone IMAGE:4542472), complete cds. // chr16 // 88 // 38 // 15 // 17 // 0 /// NM_001193388 // RefSeq // Homo sapiens unkempt family zinc finger-like (UNKL), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 53 // 53 // 24 // 45 // 1 /// XM_006720923 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens unkempt family zinc finger-like (UNKL), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 53 // 53 // 24 // 45 // 1 /// ENST00000389221 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:16:1363205:1414720:-1 gene:ENSG00000059145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 53 // 53 // 24 // 45 // 1 /// ENST00000508903 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:16:1365012:1414691:-1 gene:ENSG00000059145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 53 // 53 // 24 // 45 // 1 /// ENST00000503648 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:1401337:1414695:-1 gene:ENSG00000059145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 22 // 22 // 10 // 45 // 1 /// GENSCAN00000048743 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:1383523:1414691:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 80 // 36 // 36 // 0
NM_001272051 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 16 open reading frame 91 (C16orf91), mRNA. // chr16 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000442039 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:1419744:1420800:-1 gene:ENSG00000174109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000563974 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:1419752:1420756:-1 gene:ENSG00000174109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// BC073941 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5246237, partial cds. // chr16 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// BC092497 // GenBank // Homo sapiens chromosome 16 open reading frame 91, mRNA (cDNA clone IMAGE:30348665), complete cds. // chr16 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000048733 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:1419943:1429344:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0
NM_001143980 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 154 (CCDC154), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000389176 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:16:1434388:1444489:-1 gene:ENSG00000197599 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000409671 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:1434388:1444556:-1 gene:ENSG00000197599 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000483702 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:1434383:1437903:-1 gene:ENSG00000197599 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// JN935901 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 154 (CCDC154) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000048717 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:1434408:1478302:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001013658 // RefSeq // Homo sapiens pentraxin 4, long (PTX4), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000293922 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:16:1485939:1488467:-1 gene:ENSG00000251692 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000447419 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:1485886:1488935:-1 gene:ENSG00000251692 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 73 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000440447 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:1485886:1488981:-1 gene:ENSG00000251692 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 45 // 45 // 10 // 22 // 1 /// GENSCAN00000048727 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:1485939:1488467:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_023936 // RefSeq // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein S34 (MRPS34), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000177742 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:16:1771890:1773150:-1 gene:ENSG00000074071 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000397375 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:1771890:1773155:-1 gene:ENSG00000074071 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000569585 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:1771896:1772698:-1 gene:ENSG00000074071 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC001182 // GenBank // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein S34, mRNA (cDNA clone MGC:2616 IMAGE:3357266), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// EF036486 // GenBank // Homo sapiens mitochondrial 28S ribosomal protein S34 mRNA, complete cds; nuclear gene for mitochondrial product. // chr16 // 94 // 62 // 15 // 16 // 0 /// ENST00000613089 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:16:1772346:1773119:-1 gene:ENSG00000074071 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 94 // 62 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000048766 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:1772221:1773119:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_001163560 // RefSeq // Homo sapiens meiosis specific with OB domains (MEIOB), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// NM_152764 // RefSeq // Homo sapiens meiosis specific with OB domains (MEIOB), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// ENST00000325962 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:1833988:1868185:-1 gene:ENSG00000162039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// ENST00000397344 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:1833988:1872178:-1 gene:ENSG00000162039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// ENST00000412554 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:16:1833983:1872178:-1 gene:ENSG00000162039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// ENST00000470044 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:1833987:1884294:-1 gene:ENSG00000162039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// ENST00000496541 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:1844960:1872144:-1 gene:ENSG00000162039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 93 // 48 // 13 // 14 // 0 /// BC029829 // GenBank // Homo sapiens chromosome 16 open reading frame 73, mRNA (cDNA clone MGC:35212 IMAGE:5171851), complete cds. // chr16 // 91 // 79 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000048732 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:1841816:1903845:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// AK302323 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60954 complete cds. // chr16 // 81 // 90 // 21 // 26 // 0
NM_001009606 // RefSeq // Homo sapiens heparan sulfate (glucosamine) 3-O-sulfotransferase 6 (HS3ST6), mRNA. // chr16 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000293937 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR16_4_CTG1:1913487:1920347:-1 gene:ENSG00000276333 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSG00000162040 // chr16 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000454677 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:16:1911463:1918440:-1 gene:ENSG00000162040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000045024 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR16_4_CTG1:1913614:1922486:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000048747 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:1911590:1920462:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_016332 // RefSeq // Homo sapiens methionine sulfoxide reductase B1 (MSRB1), mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000361871 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:1938210:1943326:-1 gene:ENSG00000198736 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000564908 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:1939095:1943199:-1 gene:ENSG00000198736 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// AF166124 // GenBank // Homo sapiens selenoprotein X mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// AF187272 // GenBank // Homo sapiens methionine sulfoxide reductase mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// BC003127 // GenBank // Homo sapiens selenoprotein X, 1, mRNA (cDNA clone MGC:3344 IMAGE:2905838), complete cds. // chr16 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000399753 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:1939019:1943195:-1 gene:ENSG00000198736 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 67 // 67 // 16 // 24 // 1 /// ENST00000622125 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:16:1938234:1943293:-1 gene:ENSG00000198736 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT052024 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1 /// GENSCAN00000048752 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:1940812:1954631:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1
NM_005061 // RefSeq // Homo sapiens ribosomal protein L3-like (RPL3L), mRNA. // chr16 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000268661 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:1943974:1954726:-1 gene:ENSG00000140986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC050413 // GenBank // Homo sapiens ribosomal protein L3-like, mRNA (cDNA clone MGC:54082 IMAGE:6204847), complete cds. // chr16 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// U65581 // GenBank // Human ribosomal protein L3-like mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000048752 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:1940812:1954631:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1
NR_002327 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 10 (SNORA10), small nucleolar RNA. // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000384084 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:1962334:1962466:-1 gene:ENSG00000206811 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000526586 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:1962061:1963256:-1 gene:ENSG00000140988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000534461 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:1962374:1964365:-1 gene:ENSG00000140988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 54 // 54 // 13 // 24 // 1 /// ENST00000384458 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:2:30187434:30187566:1 gene:ENSG00000207187 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT052028 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT069893 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT052029 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 54 // 54 // 13 // 24 // 1
NR_002326 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 64 (SNORA64), small nucleolar RNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000384674 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:1962973:1963106:-1 gene:ENSG00000207405 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000527109 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:1962061:1964630:-1 gene:ENSG00000140988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000527826 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:1962950:1964805:-1 gene:ENSG00000140988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000527871 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:1962061:1964631:-1 gene:ENSG00000140988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000533872 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:1962061:1964581:-1 gene:ENSG00000140988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC063011 // GenBank // Homo sapiens ribosomal protein S2, mRNA (cDNA clone IMAGE:5217154), partial cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT052030 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT052031 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_002736 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 60 (SNORD60), small nucleolar RNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000383903 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:2155023:2155105:-1 gene:ENSG00000206630 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT052065 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_020764 // RefSeq // Homo sapiens CASK interacting protein 1 (CASKIN1), mRNA. // chr16 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000343516 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:2177180:2196525:-1 gene:ENSG00000167971 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF451977 // GenBank // Homo sapiens cask-interacting protein 1 (CASKIN1) mRNA, complete cds. // chr16 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000018324 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:2178550:2196432:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0
NM_182563 // RefSeq // Homo sapiens BRICHOS domain containing 5 (BRICD5), mRNA. // chr16 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000328540 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:2209253:2211950:-1 gene:ENSG00000182685 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000562360 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:2209362:2210833:-1 gene:ENSG00000182685 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000566018 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:2209979:2210905:-1 gene:ENSG00000182685 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// BC039154 // GenBank // Homo sapiens chromosome 16 open reading frame 79, mRNA (cDNA clone MGC:21830 IMAGE:4213860), complete cds. // chr16 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000018328 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:2209362:2215456:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
NM_001042371 // RefSeq // Homo sapiens phosphoglycolate phosphatase (PGP), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000333503 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:2211997:2214807:-1 gene:ENSG00000184207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000018328 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:2209362:2215456:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 1
NM_001048212 // RefSeq // Homo sapiens cementum protein 1 (CEMP1), mRNA. // chr16 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000565480 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:2530316:2531417:-1 gene:ENSG00000205923 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 38 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000567119 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:2530035:2531408:-1 gene:ENSG00000205923 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// AY584596 // GenBank // Homo sapiens cementoblastoma-derived protein mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// BC146925 // GenBank // Homo sapiens cementum protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:182028 IMAGE:9056853), complete cds. // chr16 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// BC146926 // GenBank // Homo sapiens cementum protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:182029 IMAGE:9056854), complete cds. // chr16 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0
AK124618 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ42627 fis, clone BRACE3018308. // chr16 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// NR_024492 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC645644 (FLJ42627), long non-coding RNA. // chr16 // 50 // 50 // 11 // 22 // 1 /// ENST00000563449 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:2554060:2556060:-1 gene:ENSG00000261613 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr16 // 50 // 50 // 11 // 22 // 1 /// ENST00000569852 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:2561471:2565096:-1 gene:ENSG00000269937 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr16 // 100 // 50 // 11 // 11 // 0 /// AK126677 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44722 fis, clone BRACE3022847. // chr16 // 100 // 50 // 11 // 11 // 0 /// NONHSAT147786 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr16 // 100 // 50 // 11 // 11 // 0 /// NONHSAT052137 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr16 // 50 // 50 // 11 // 22 // 1 /// NONHSAT052138 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr16 // 50 // 50 // 11 // 22 // 1 /// NONHSAT052139 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr16 // 73 // 73 // 16 // 22 // 1 /// NONHSAT147812 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 50 // 50 // 11 // 22 // 1 /// NONHSAT147814 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 50 // 50 // 11 // 22 // 1 /// TCONS_00024244-XLOC_011623 // Rinn lincRNA // linc-KCTD5 chr16:+:2693654-2696114 // chr16 // 50 // 50 // 11 // 22 // 1
AF111845 // GenBank HTC // Homo sapiens PRO0461 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_152891 // RefSeq // Homo sapiens protease, serine, 33 (PRSS33), mRNA. // chr16 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000293851 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:2783953:2786707:-1 gene:ENSG00000103355 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000570702 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:2783953:2787948:-1 gene:ENSG00000103355 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000571674 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:2784944:2786605:-1 gene:ENSG00000103355 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000576886 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:2783953:2786841:-1 gene:ENSG00000103355 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// AF536382 // GenBank // Homo sapiens serine protease EOS mRNA, complete cds. // chr16 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// BC036846 // GenBank // Homo sapiens protease, serine, 33, mRNA (cDNA clone MGC:46555 IMAGE:5245847), complete cds. // chr16 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC062334 // GenBank // Homo sapiens protease, serine, 33, mRNA (cDNA clone MGC:71136 IMAGE:6110198), complete cds. // chr16 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000612593 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:16:2783953:2786611:-1 gene:ENSG00000103355 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000018322 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:2771990:2786547:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_021195 // RefSeq // Homo sapiens claudin 6 (CLDN6), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000328796 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:16:3014713:3018187:-1 gene:ENSG00000184697 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000396925 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:3014712:3020071:-1 gene:ENSG00000184697 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// AY358480 // GenBank // Homo sapiens clone DNA73736 CLDN6 (UNQ757) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0 /// BC008934 // GenBank // Homo sapiens claudin 6, mRNA (cDNA clone MGC:2373 IMAGE:2963008), complete cds. // chr16 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0
NM_001103175 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 64B (CCDC64B), mRNA. // chr16 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENST00000389347 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:16:3027867:3035541:-1 gene:ENSG00000162069 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENST00000572240 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:3027682:3031974:-1 gene:ENSG00000162069 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000572449 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:3027712:3036926:-1 gene:ENSG00000162069 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000573514 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:3027684:3033002:-1 gene:ENSG00000162069 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AL833717 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp666A165 (from clone DKFZp666A165). // chr16 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// AL833749 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp666L166 (from clone DKFZp666L166). // chr16 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// BC128602 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 64B, mRNA (cDNA clone MGC:158069 IMAGE:40132962), complete cds. // chr16 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000576826 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:3029970:3036926:-1 gene:ENSG00000162069 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// AK307181 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ97129. // chr16 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// GENSCAN00000049355 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:3028106:3040657:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT147920 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_033208 // RefSeq // Homo sapiens tigger transposable element derived 7 (TIGD7), mRNA. // chr16 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000396862 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:3298832:3305645:-1 gene:ENSG00000140993 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// AF251050 // GenBank // Homo sapiens jerky mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// BC069623 // GenBank // Homo sapiens tigger transposable element derived 7, mRNA (cDNA clone MGC:97211 IMAGE:7262458), complete cds. // chr16 // 84 // 70 // 16 // 19 // 0 /// BC069632 // GenBank // Homo sapiens tigger transposable element derived 7, mRNA (cDNA clone MGC:97222 IMAGE:7262470), complete cds. // chr16 // 84 // 70 // 16 // 19 // 0 /// GENSCAN00000049351 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:3298965:3300569:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// BC033778 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4515232, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr16 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0
ENST00000572039 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:3323192:3323925:-1 gene:ENSG00000262316 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000049331 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:3323338:3323925:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0
NM_152457 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 597 (ZNF597), mRNA. // chr16 // 92 // 96 // 23 // 25 // 0 /// ENST00000301744 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:3432422:3443542:-1 gene:ENSG00000167981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC029899 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 597, mRNA (cDNA clone MGC:35280 IMAGE:5175734), complete cds. // chr16 // 92 // 96 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049344 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:3413969:3458426:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_178844 // RefSeq // Homo sapiens NLR family, CARD domain containing 3 (NLRC3), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NR_075083 // RefSeq // Homo sapiens NLR family, CARD domain containing 3 (NLRC3), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr16 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000324659 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:3541825:3577288:-1 gene:ENSG00000167984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000359128 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:3539033:3577391:-1 gene:ENSG00000167984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000448023 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:16:3539038:3565092:-1 gene:ENSG00000167984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AY601811 // GenBank // Homo sapiens caterpiller 16.2 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// FJ889357 // GenBank // Homo sapiens NLRC3 (NLRC3) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// AK090476 // GenBank // Homo sapiens mRNA for FLJ00398 protein. // chr16 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// ENST00000615877 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:3539038:3577400:-1 gene:ENSG00000167984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000049327 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:3539052:3577213:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0
NM_032444 // RefSeq // Homo sapiens SLX4 structure-specific endonuclease subunit (SLX4), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000294008 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:3581181:3611598:-1 gene:ENSG00000188827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000466154 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:3595611:3609259:-1 gene:ENSG00000188827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 38 // 13 // 13 // 0 /// AB058687 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1784 protein, partial cds. // chr16 // 90 // 62 // 19 // 21 // 0 /// AB075867 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1987 protein. // chr16 // 100 // 38 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000049335 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:3582342:3608835:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0
NM_001079846 // RefSeq // Homo sapiens CREB binding protein (CREBBP), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 94 // 44 // 44 // 0 /// NM_004380 // RefSeq // Homo sapiens CREB binding protein (CREBBP), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// ENST00000262367 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:3725054:3880726:-1 gene:ENSG00000005339 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// ENST00000382070 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:3727539:3880120:-1 gene:ENSG00000005339 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 91 // 43 // 43 // 0 /// U47741 // GenBank // Human CREB-binding protein (CBP) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// U85962 // GenBank // Homo sapiens CREB-binding protein mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000049341 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:3727718:3922398:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 85 // 40 // 40 // 0
NM_001116 // RefSeq // Homo sapiens adenylate cyclase 9 (ADCY9), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000294016 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:3962651:4116185:-1 gene:ENSG00000162104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000572288 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:16:3992222:4114026:-1 gene:ENSG00000162104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 89 // 26 // 8 // 9 // 0 /// ENST00000576936 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:3953387:3989000:-1 gene:ENSG00000162104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// AF036927 // GenBank // Homo sapiens adenylyl cyclase type IX mRNA, complete cds. // chr16 // 93 // 82 // 26 // 28 // 0 /// BC136657 // GenBank // Homo sapiens adenylate cyclase 9, mRNA (cDNA clone MGC:168270 IMAGE:9020647), complete cds. // chr16 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// BC136658 // GenBank // Homo sapiens adenylate cyclase 9, mRNA (cDNA clone MGC:168271 IMAGE:9020648), complete cds. // chr16 // 93 // 85 // 27 // 29 // 0 /// BC151207 // GenBank // Homo sapiens adenylate cyclase 9, mRNA (cDNA clone MGC:164747 IMAGE:40147127), complete cds. // chr16 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// BC151229 // GenBank // Homo sapiens adenylate cyclase 9, mRNA (cDNA clone MGC:166903 IMAGE:9007273), complete cds. // chr16 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// DQ005545 // GenBank // Homo sapiens adenylyl cyclase type 9 (ADCY9) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// DQ008441 // GenBank // Homo sapiens adenylyl cyclase type 9 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000003189 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:3975041:4007808:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 41 // 41 // 14 // 34 // 1
NM_001098814 // RefSeq // Homo sapiens sarcalumenin (SRL), mRNA. // chr16 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000399609 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:4189374:4242080:-1 gene:ENSG00000185739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000537996 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:4191810:4239743:-1 gene:ENSG00000185739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000572111 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:4189374:4242075:-1 gene:ENSG00000185739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK302601 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51402 complete cds, highly similar to Sarcalumenin precursor. // chr16 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// AL831973 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp451C023 (from clone DKFZp451C023); complete cds. // chr16 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// AL832361 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp451M176 (from clone DKFZp451M176). // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000003212 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:4192153:4208570:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
ENST00000564581 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:4562814:4563128:-1 gene:ENSG00000261612 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr16 // 92 // 65 // 12 // 13 // 0 /// NONHSAT148153 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr16 // 92 // 65 // 12 // 13 // 0
NM_002705 // RefSeq // Homo sapiens periplakin (PPL), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000345988 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:4882507:4937135:-1 gene:ENSG00000118898 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000590782 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:16:4882823:4937064:-1 gene:ENSG00000118898 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000592772 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:4883572:4960741:-1 gene:ENSG00000118898 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// AF001691 // GenBank // Homo sapiens 195 kDa cornified envelope precursor mRNA, complete cds. // chr16 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// AK295623 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51206 complete cds, moderately similar to Periplakin. // chr16 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// BC114620 // GenBank // Homo sapiens periplakin, mRNA (cDNA clone MGC:134872 IMAGE:40070172), complete cds. // chr16 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003183 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:4883384:4915453:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
ENST00000516329 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:16:7726841:7726951:-1 gene:ENSG00000252138 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT140375 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_015421 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 186 (TMEM186), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000333050 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:8795180:8797648:-1 gene:ENSG00000184857 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK093383 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ36064 fis, clone TESTI2018997. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC015912 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 186, mRNA (cDNA clone MGC:20034 IMAGE:4554816), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011508 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:8795952:8796422:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
AF090898 // GenBank // Homo sapiens clone HQ0149 PRO0149 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENST00000363598 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:9564390:9564497:-1 gene:ENSG00000200468 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr16 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT140467 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000580401 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:10221775:10222073:-1 gene:ENSG00000266439 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT140494 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
AF258574 // GenBank // Homo sapiens PP4135 mRNA, complete cds. // chr16 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// NONHSAT140505 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr16 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0
NM_001424 // RefSeq // Homo sapiens epithelial membrane protein 2 (EMP2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006720864 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens epithelial membrane protein 2 (EMP2), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000359543 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:10528422:10580698:-1 gene:ENSG00000213853 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000536829 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:10532849:10559154:-1 gene:ENSG00000213853 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// BC009687 // GenBank // Homo sapiens epithelial membrane protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:9056 IMAGE:3895094), complete cds. // chr16 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// U52100 // GenBank // Human XMP mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000020423 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:10532905:10694873:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 54 // 54 // 13 // 24 // 1
NM_144674 // RefSeq // Homo sapiens tektin 5 (TEKT5), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_005255128 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens tektin 5 (TEKT5), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000283025 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:10627501:10694945:-1 gene:ENSG00000153060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000574923 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:10627501:10671778:-1 gene:ENSG00000153060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000576638 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:10635764:10690119:-1 gene:ENSG00000153060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// BC041081 // GenBank HTC // Homo sapiens tektin 5, mRNA (cDNA clone IMAGE:3830589), with apparent retained intron. // chr16 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// BC130336 // GenBank // Homo sapiens tektin 5, mRNA (cDNA clone MGC:163208 IMAGE:40146367), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC130338 // GenBank // Homo sapiens tektin 5, mRNA (cDNA clone MGC:163210 IMAGE:40146369), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000020423 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:10532905:10694873:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
NM_014015 // RefSeq // Homo sapiens Dexi homolog (mouse) (DEXI), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000331808 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:10928891:10942460:-1 gene:ENSG00000182108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000469379 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:10928891:10942131:-1 gene:ENSG00000182108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 73 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000570992 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:10928942:10941718:-1 gene:ENSG00000182108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 86 // 64 // 6 // 7 // 0 /// AF108145 // GenBank // Homo sapiens DEXI mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 73 // 8 // 8 // 0 /// BC001083 // GenBank // Homo sapiens dexamethasone-induced transcript, mRNA (cDNA clone MGC:2765 IMAGE:2958243), complete cds. // chr16 // 100 // 73 // 8 // 8 // 0 /// BC037569 // GenBank // Homo sapiens dexamethasone-induced transcript, mRNA (cDNA clone MGC:44946 IMAGE:5227606), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC052989 // GenBank // Homo sapiens dexamethasone-induced transcript, mRNA (cDNA clone MGC:60202 IMAGE:6194689), complete cds. // chr16 // 100 // 73 // 8 // 8 // 0 /// BC071683 // GenBank // Homo sapiens dexamethasone-induced transcript, mRNA (cDNA clone MGC:87910 IMAGE:5190179), complete cds. // chr16 // 100 // 91 // 10 // 10 // 0
NM_003745 // RefSeq // Homo sapiens suppressor of cytokine signaling 1 (SOCS1), mRNA. // chr16 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000332029 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:11254405:11256179:-1 gene:ENSG00000185338 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// AB000734 // GenBank // Homo sapiens mRNA for TIP3, complete cds. // chr16 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// AB005043 // GenBank // Homo sapiens mRNA for STAT induced STAT inhibitor-1, complete cds. // chr16 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// AK127621 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ45719 fis, clone FELNG2001953, highly similar to Suppressor of cytokine signaling 1. // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// U88326 // GenBank // Human suppressor of cytokine signalling-1 (SOCS-1) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 64 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000003440 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:11254843:11269262:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 82 // 82 // 18 // 22 // 1
NM_005425 // RefSeq // Homo sapiens transition protein 2 (during histone to protamine replacement) (TNP2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000312693 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:11267857:11269332:-1 gene:ENSG00000178279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000560751 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:11267748:11269533:-1 gene:ENSG00000178279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC096135 // GenBank // Homo sapiens transition protein 2 (during histone to protamine replacement), mRNA (cDNA clone MGC:116782 IMAGE:40002547), complete cds. // chr16 // 93 // 88 // 28 // 30 // 0 /// BC096136 // GenBank // Homo sapiens transition protein 2 (during histone to protamine replacement), mRNA (cDNA clone MGC:116783 IMAGE:40002550), complete cds. // chr16 // 90 // 88 // 27 // 30 // 0 /// BC096137 // GenBank // Homo sapiens transition protein 2 (during histone to protamine replacement), mRNA (cDNA clone MGC:116785 IMAGE:40002553), complete cds. // chr16 // 90 // 88 // 27 // 30 // 0 /// X63759 // GenBank // H.sapiens hTNP2 gene for transition protein 2. // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONHSAT140559 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000003440 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:11254843:11269262:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 82 // 82 // 28 // 34 // 1
NM_021247 // RefSeq // Homo sapiens protamine 3 (PRM3), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000327157 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:11273287:11273595:-1 gene:ENSG00000178257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003451 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:11273284:11328953:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
ENST00000390926 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:16:11274113:11274236:-1 gene:ENSG00000212228 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT140560 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001286356 // RefSeq // Homo sapiens protamine 2 (PRM2), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NM_001286358 // RefSeq // Homo sapiens protamine 2 (PRM2), transcript variant 4, mRNA. // chr16 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// NM_001286359 // RefSeq // Homo sapiens protamine 2 (PRM2), transcript variant 5, mRNA. // chr16 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NR_104428 // RefSeq // Homo sapiens protamine 2 (PRM2), transcript variant 6, non-coding RNA. // chr16 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// ENST00000435245 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:16:11275640:11276480:-1 gene:ENSG00000122304 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK292447 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77648 complete cds, highly similar to Homo sapiens protamine 2, mRNA. // chr16 // 86 // 88 // 19 // 22 // 0 /// BC005303 // GenBank // Homo sapiens protamine 2, mRNA (cDNA clone MGC:12373 IMAGE:3935273), complete cds. // chr16 // 90 // 80 // 18 // 20 // 0 /// NM_001286357 // RefSeq // Homo sapiens protamine 2 (PRM2), transcript variant 3, mRNA. // chr16 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// NM_002762 // RefSeq // Homo sapiens protamine 2 (PRM2), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 96 // 96 // 24 // 25 // 1 /// ENST00000241808 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:11275639:11276480:-1 gene:ENSG00000122304 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1 /// BC042671 // GenBank // Homo sapiens protamine 2, mRNA (cDNA clone MGC:35058 IMAGE:5166075), complete cds. // chr16 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// BC066338 // GenBank // Homo sapiens protamine 2, mRNA (cDNA clone MGC:87443 IMAGE:4821351), complete cds. // chr16 // 96 // 96 // 24 // 25 // 1
NM_002761 // RefSeq // Homo sapiens protamine 1 (PRM1), mRNA. // chr16 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000312511 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:11280836:11281350:-1 gene:ENSG00000175646 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY651260 // GenBank // Homo sapiens testis specific protamine 1 (P1) mRNA, complete cds. // chr16 // 80 // 93 // 20 // 25 // 0 /// BC003673 // GenBank // Homo sapiens protamine 1, mRNA (cDNA clone MGC:12307 IMAGE:3935638), complete cds. // chr16 // 76 // 93 // 19 // 25 // 0 /// Y00443 // GenBank // Human testis specific mRNA for protamine 1 (P1). // chr16 // 80 // 93 // 20 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003451 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:11273284:11328953:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
NM_014153 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger CCCH-type containing 7A (ZC3H7A), mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006720877 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens zinc finger CCCH-type containing 7A (ZC3H7A), transcript variant X5, mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000355758 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:11750586:11797267:-1 gene:ENSG00000122299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000396516 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:11750586:11782552:-1 gene:ENSG00000122299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000571198 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:16:11756329:11797232:-1 gene:ENSG00000122299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000571405 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:11750595:11765561:-1 gene:ENSG00000122299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000576009 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:16:11767437:11776520:-1 gene:ENSG00000122299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// AY163807 // GenBank // Homo sapiens zinc-finger protein mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC046363 // GenBank // Homo sapiens zinc finger CCCH-type containing 7A, mRNA (cDNA clone MGC:50782 IMAGE:5538820), complete cds. // chr16 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000003452 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:11679195:11797330:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
Z29572 // GenBank // H.sapiens antisense mRNA for BCMA peptide. // chr16 // 90 // 87 // 18 // 20 // 0
ENST00000312019 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:12086746:12090302:-1 gene:ENSG00000175604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK057352 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ32790 fis, clone TESTI2002361. // chr16 // 83 // 96 // 19 // 23 // 0
NM_018340 // RefSeq // Homo sapiens calcineurin-like phosphoesterase domain containing 1 (CPPED1), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// ENST00000381774 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:12659799:12804017:-1 gene:ENSG00000103381 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AY553877 // GenBank // Homo sapiens CSTP1 mRNA, complete cds. // chr16 // 92 // 45 // 12 // 13 // 0 /// NM_001099455 // RefSeq // Homo sapiens calcineurin-like phosphoesterase domain containing 1 (CPPED1), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 83 // 83 // 24 // 29 // 1 /// ENST00000433677 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:12663487:12803851:-1 gene:ENSG00000103381 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 76 // 76 // 22 // 29 // 1 /// ENST00000261660 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:12663487:12803851:-1 gene:ENSG00000103381 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1 /// AK298662 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52891 complete cds. // chr16 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1
ENST00000362604 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:16:12842487:12842610:-1 gene:ENSG00000199474 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT140634 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_003561 // RefSeq // Homo sapiens phospholipase A2, group X (PLA2G10), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000438167 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:14672545:14694669:-1 gene:ENSG00000069764 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// U95301 // GenBank // Human calcium-dependent group X phospholipase A2 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC069539 // GenBank // Homo sapiens phospholipase A2, group X, mRNA (cDNA clone MGC:97039 IMAGE:7262248), complete cds. // chr16 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0 /// BC106731 // GenBank // Homo sapiens phospholipase A2, group X, mRNA (cDNA clone MGC:119918 IMAGE:40015660), complete cds. // chr16 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0 /// BC106732 // GenBank // Homo sapiens phospholipase A2, group X, mRNA (cDNA clone MGC:119919 IMAGE:40015664), complete cds. // chr16 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0 /// BC111804 // GenBank // Homo sapiens phospholipase A2, group X, mRNA (cDNA clone MGC:133367 IMAGE:40069347), complete cds. // chr16 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0 /// ENST00000621727 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR16_1_CTG1:14672552:14694674:-1 gene:ENSG00000276870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 88 // 100 // 7 // 8 // 0 /// GENSCAN00000024646 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR16_1_CTG1:14672609:14694234:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0
ENST00000384051 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:15877163:15877266:-1 gene:ENSG00000206778 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000515962 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR16_1_CTG1:15962302:15962405:-1 gene:ENSG00000251771 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// NONHSAT140773 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_022166 // RefSeq // Homo sapiens xylosyltransferase I (XYLT1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000261381 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:17101769:17470881:-1 gene:ENSG00000103489 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000020189 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:17098603:17207596:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0
NM_015092 // RefSeq // Homo sapiens SMG1 phosphatidylinositol 3-kinase-related kinase (SMG1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 56 // 56 // 0 /// ENST00000446231 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:18804853:18926454:-1 gene:ENSG00000157106 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 56 // 56 // 0 /// ENST00000563448 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:18838461:18850361:-1 gene:ENSG00000157106 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 23 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000565324 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:18807760:18896874:-1 gene:ENSG00000157106 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 95 // 53 // 53 // 0 /// AB061371 // GenBank // Homo sapiens smg-1 mRNA for phosphatidylinositol 3-kinase-related protein kinase, complete cds. // chr16 // 98 // 96 // 53 // 54 // 0 /// AF186377 // GenBank // Homo sapiens LIP isoform of BLIP (BLIP) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 89 // 50 // 50 // 0 /// AF395444 // GenBank // Homo sapiens PI-3-kinase ATX mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 95 // 53 // 53 // 0 /// AY014957 // GenBank // Homo sapiens PI-3-kinase-related kinase SMG-1 (SMG1) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 91 // 51 // 51 // 0 /// U32581 // GenBank // Homo sapiens lambda/iota protein kinase C-interacting protein mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 38 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000034562 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:18800558:18861500:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 73 // 41 // 41 // 0
NONHSAT140860 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
ENST00000563613 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:19343647:19401693:-1 gene:ENSG00000259925 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr16 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT140883 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 86 // 86 // 12 // 14 // 1 /// TCONS_00024975-XLOC_011889 // Rinn lincRNA // linc-SMG1 chr16:-:19379154-19404876 // chr16 // 86 // 86 // 12 // 14 // 1 /// ENST00000567369 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:19354462:19367878:-1 gene:ENSG00000259925 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr16 // 64 // 64 // 9 // 14 // 1 /// NONHSAT140882 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 64 // 64 // 9 // 14 // 1
NM_016641 // RefSeq // Homo sapiens glycerophosphodiester phosphodiesterase 1 (GDE1), mRNA. // chr16 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000353258 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:19501689:19522145:-1 gene:ENSG00000006007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000564172 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:19502383:19522123:-1 gene:ENSG00000006007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// AF212862 // GenBank // Homo sapiens membrane interacting protein of RGS16 (MIR16) mRNA, complete cds. // chr16 // 95 // 69 // 19 // 20 // 0 /// AY463154 // GenBank // Homo sapiens membrane interacting protein of RGS16 (MIR16) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// BC014981 // GenBank // Homo sapiens glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mRNA (cDNA clone MGC:23190 IMAGE:4855079), complete cds. // chr16 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// BC025273 // GenBank // Homo sapiens glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mRNA (cDNA clone MGC:39178 IMAGE:5427491), complete cds. // chr16 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000569773 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:19507685:19521588:-1 gene:ENSG00000006007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// ENST00000569899 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:19503861:19517168:-1 gene:ENSG00000006007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// GENSCAN00000032214 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:19503470:19521964:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0
NM_001012991 // RefSeq // Homo sapiens lysine-rich nucleolar protein 1 (KNOP1), mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_005255317 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens lysine-rich nucleolar protein 1 (KNOP1), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000219837 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:19701934:19718234:-1 gene:ENSG00000103550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000565844 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:19710260:19718235:-1 gene:ENSG00000103550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000567367 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:16:19707165:19714577:-1 gene:ENSG00000103550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000568230 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:19706356:19712091:-1 gene:ENSG00000103550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// BC047010 // GenBank HTC // Homo sapiens chromosome 16 open reading frame 88, mRNA (cDNA clone IMAGE:4445040), with apparent retained intron. // chr16 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC117562 // GenBank // Homo sapiens chromosome 16 open reading frame 88, mRNA (cDNA clone MGC:131567 IMAGE:7971177), complete cds. // chr16 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000032216 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:19706910:19731422:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0
NM_001002911 // RefSeq // Homo sapiens G protein-coupled receptor 139 (GPR139), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000326571 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:20031659:20073767:-1 gene:ENSG00000180269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000570682 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:20031485:20073917:-1 gene:ENSG00000180269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// AB196529 // GenBank // Homo sapiens GPRg1 mRNA for G protein-coupled receptor, complete cds. // chr16 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// AK291384 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76355 complete cds, highly similar to Homo sapiens G protein-coupled receptor 139 (GPR139), mRNA. // chr16 // 94 // 100 // 17 // 18 // 0 /// AY635179 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 139 (GPR139) mRNA, complete cds. // chr16 // 94 // 100 // 17 // 18 // 0 /// BC137237 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 139, mRNA (cDNA clone MGC:168857 IMAGE:9021234), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC137238 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 139, mRNA (cDNA clone MGC:168858 IMAGE:9021235), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC144547 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:9053074. // chr16 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000026517 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:20031455:20102925:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 67 // 12 // 12 // 0
NM_174924 // RefSeq // Homo sapiens protein disulfide isomerase-like, testis expressed (PDILT), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000302451 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:20359170:20404737:-1 gene:ENSG00000169340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC042607 // GenBank // Homo sapiens protein disulfide isomerase-like, testis expressed, mRNA (cDNA clone MGC:35157 IMAGE:5169707), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC044936 // GenBank // Homo sapiens protein disulfide isomerase-like, testis expressed, mRNA (cDNA clone MGC:50126 IMAGE:5169707), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000026510 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:20359319:20399300:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0
NM_017736 // RefSeq // Homo sapiens THUMP domain containing 1 (THUMPD1), mRNA. // chr16 // 96 // 82 // 22 // 23 // 0 /// XM_005255424 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens THUMP domain containing 1 (THUMPD1), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000396083 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:20735375:20741796:-1 gene:ENSG00000066654 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000565248 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:20737089:20741803:-1 gene:ENSG00000066654 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 39 // 11 // 11 // 0 /// AK294328 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57359 complete cds, highly similar to THUMP domain-containing protein 1. // chr16 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// BC000448 // GenBank // Homo sapiens THUMP domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:8446 IMAGE:2821354), complete cds. // chr16 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// XM_005255422 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens THUMP domain containing 1 (THUMPD1), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1 /// ENST00000381337 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:20733664:20742084:-1 gene:ENSG00000066654 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1 /// BX640898 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686C1054 (from clone DKFZp686C1054). // chr16 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// ENST00000570231 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:20736812:20738272:-1 gene:ENSG00000066654 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// GENSCAN00000026512 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:20721065:20741739:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0
NM_173475 // RefSeq // Homo sapiens DCN1, defective in cullin neddylation 1, domain containing 3 (DCUN1D3), mRNA. // chr16 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000324344 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:20854925:20900384:-1 gene:ENSG00000188215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000563934 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:20858996:20868980:-1 gene:ENSG00000188215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0 /// AK123719 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ41725 fis, clone HLUNG2014288, weakly similar to DCN1-like protein 2. // chr16 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0 /// BC040442 // GenBank // Homo sapiens DCN1, defective in cullin neddylation 1, domain containing 3 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:48972 IMAGE:5590225), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000004369 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:20859886:20862538:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 44 // 8 // 8 // 0
NM_005849 // RefSeq // Homo sapiens immunoglobulin superfamily, member 6 (IGSF6), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000268389 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:21639537:21652660:-1 gene:ENSG00000140749 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000569602 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:16:21644290:21652606:-1 gene:ENSG00000140749 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// AK223286 // GenBank // Homo sapiens mRNA for immunoglobulin superfamily, member 6 variant, clone: SYN03106. // chr16 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// AK290910 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78097 complete cds, highly similar to Homo sapiens immunoglobulin superfamily, member 6 (IGSF6), mRNA. // chr16 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// BC017844 // GenBank // Homo sapiens immunoglobulin superfamily, member 6, mRNA (cDNA clone MGC:22530 IMAGE:4616809), complete cds. // chr16 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000565499 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:21646386:21652608:-1 gene:ENSG00000140749 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// AK293703 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57907 complete cds, highly similar to Homo sapiens immunoglobulin superfamily, member 6 (IGSF6), mRNA. // chr16 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// GENSCAN00000004372 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:21641534:21648009:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0
NR_033694 // RefSeq // Homo sapiens PDZ domain containing 9 (PDZD9), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr16 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006721028 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens PDZ domain containing 9 (PDZD9), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000424898 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:21983865:22001110:-1 gene:ENSG00000155714 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000523914 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:21983865:22001110:-1 gene:ENSG00000155714 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC021724 // GenBank // Homo sapiens chromosome 16 open reading frame 65, mRNA (cDNA clone MGC:33075 IMAGE:4829370), complete cds. // chr16 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC028605 // GenBank // Homo sapiens chromosome 16 open reading frame 65, mRNA (cDNA clone MGC:33218 IMAGE:5265642), complete cds. // chr16 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC039562 // GenBank // Homo sapiens chromosome 16 open reading frame 65, mRNA (cDNA clone MGC:50721 IMAGE:5169242), complete cds. // chr16 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// NM_173806 // RefSeq // Homo sapiens PDZ domain containing 9 (PDZD9), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// ENST00000537222 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:21983865:22001098:-1 gene:ENSG00000155714 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// GENSCAN00000022328 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:21984267:22001262:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0
NM_001802 // RefSeq // Homo sapiens cerebellar degeneration-related protein 2, 62kDa (CDR2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000268383 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:22345936:22374617:-1 gene:ENSG00000140743 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000561630 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:22347634:22374437:-1 gene:ENSG00000140743 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000564542 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:22347475:22431596:-1 gene:ENSG00000140743 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 42 // 13 // 13 // 0 /// AK292273 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77366 complete cds, highly similar to Homo sapiens cerebellar degeneration-related protein 2, 62kDa (CDR2), mRNA. // chr16 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// BC017503 // GenBank // Homo sapiens cerebellar degeneration-related protein 2, 62kDa, mRNA (cDNA clone MGC:23119 IMAGE:4873337), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// D12981 // GenBank // Homo sapiens mRNA for paraneoplastic cerebellar degeneration-associated antigen, complete cds. // chr16 // 96 // 74 // 22 // 23 // 0 /// ENST00000567406 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:22347755:22375090:-1 gene:ENSG00000140743 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1 /// S78388 // GenBank // 28S RNA, autoantigen recognized by an anti-neuronal cell antibody [human, mRNA, 2192 nt]. // chr16 // 96 // 74 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000022327 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:22346965:22432793:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 90 // 90 // 28 // 31 // 1
NM_020718 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 31 (USP31), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000219689 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:23061406:23149270:-1 gene:ENSG00000103404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000004690 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:23068046:23149270:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
NM_153603 // RefSeq // Homo sapiens component of oligomeric golgi complex 7 (COG7), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// XR_429680 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens component of oligomeric golgi complex 7 (COG7), transcript variant X3, misc_RNA. // chr16 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000307149 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:23388493:23453180:-1 gene:ENSG00000168434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENST00000566364 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:23388641:23393581:-1 gene:ENSG00000168434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 23 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000567821 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:23398046:23417293:-1 gene:ENSG00000168434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 28 // 12 // 12 // 0 /// AY358632 // GenBank // Homo sapiens clone DNA125181 COG7 (UNQ3082) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 70 // 30 // 30 // 0 /// BC000549 // GenBank // Homo sapiens component of oligomeric golgi complex 7, mRNA (cDNA clone MGC:3026 IMAGE:3163316), complete cds. // chr16 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// BC037563 // GenBank // Homo sapiens component of oligomeric golgi complex 7, mRNA (cDNA clone MGC:40369 IMAGE:5393265), complete cds. // chr16 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// AK130714 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ27204 fis, clone SYN03230. // chr16 // 30 // 30 // 13 // 43 // 1 /// GENSCAN00000004694 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:23388920:23452994:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 81 // 35 // 35 // 0
NM_015044 // RefSeq // Homo sapiens golgi-associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 2 (GGA2), mRNA. // chr16 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000309859 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:23463542:23510494:-1 gene:ENSG00000103365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// AF165531 // GenBank // Homo sapiens VEAR protein mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0 /// AF190863 // GenBank // Homo sapiens ADP-ribosylation factor binding protein GGA2 (GGA2) mRNA, complete cds. // chr16 // 91 // 67 // 20 // 22 // 0 /// AF233522 // GenBank // Homo sapiens Golgi-associated, gamma-adaptin ear containing, ARF-binding protein 2 (GGA2) gene, complete cds. // chr16 // 96 // 70 // 22 // 23 // 0 /// AF323754 // GenBank // Homo sapiens ADP-ribosylation factor binding protein GGA2s (GGA2) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr16 // 88 // 79 // 23 // 26 // 0 /// BC000284 // GenBank // Homo sapiens golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:1002 IMAGE:3356490), complete cds. // chr16 // 96 // 73 // 23 // 24 // 0 /// ENST00000567468 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:16:23464323:23510424:-1 gene:ENSG00000103365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1 /// GENSCAN00000004681 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:23467590:23557343:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1
NM_005003 // RefSeq // Homo sapiens NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1, alpha/beta subcomplex, 1, 8kDa (NDUFAB1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000007516 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:23581002:23596356:-1 gene:ENSG00000004779 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000484769 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:23581033:23596303:-1 gene:ENSG00000004779 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000562133 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:23581014:23596277:-1 gene:ENSG00000004779 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000570319 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:23581871:23596291:-1 gene:ENSG00000004779 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// AF087660 // GenBank // Homo sapiens NADH:ubiquinone oxidoreductase SDAP subunit mRNA, complete cds, nuclear gene encoding mitochondrial protein. // chr16 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC058920 // GenBank // Homo sapiens NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1, alpha/beta subcomplex, 1, 8kDa, mRNA (cDNA clone MGC:65095 IMAGE:6167387), complete cds. // chr16 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENST00000567761 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:23582335:23591153:-1 gene:ENSG00000004779 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// GENSCAN00000004696 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:23582284:23640305:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
NM_024675 // RefSeq // Homo sapiens partner and localizer of BRCA2 (PALB2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENST00000261584 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:23603170:23641310:-1 gene:ENSG00000083093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENST00000567003 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:23636035:23641301:-1 gene:ENSG00000083093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 26 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000568219 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:23603168:23641285:-1 gene:ENSG00000083093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 98 // 42 // 42 // 0 /// AK299152 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60823 complete cds. // chr16 // 98 // 98 // 41 // 42 // 0 /// BC044254 // GenBank // Homo sapiens partner and localizer of BRCA2, mRNA (cDNA clone MGC:50910 IMAGE:6045564), complete cds. // chr16 // 100 // 98 // 42 // 42 // 0 /// BX647125 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686O09166 (from clone DKFZp686O09166). // chr16 // 100 // 98 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000004696 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:23582284:23640305:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 53 // 23 // 23 // 0
NM_033266 // RefSeq // Homo sapiens endoplasmic reticulum to nucleus signaling 2 (ERN2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000256797 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:23690376:23713500:-1 gene:ENSG00000134398 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000457008 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:16:23690326:23713226:-1 gene:ENSG00000134398 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000562562 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:23694854:23713222:-1 gene:ENSG00000134398 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// AK310834 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17876. // chr16 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// EF560720 // GenBank // Homo sapiens clone DKFZp781K2190 ERN2 protein (ERN2) mRNA, complete cds. // chr16 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// EF560739 // GenBank // Homo sapiens clone DKFZp781K05102 ERN2 protein (ERN2) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB047079 // GenBank // Homo sapiens IRE1b mRNA for protein kinase/ribonuclease IRE1 beta, complete cds. // chr16 // 62 // 100 // 16 // 26 // 0 /// GENSCAN00000004689 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:23690831:23713187:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
ENST00000364671 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:16:24333415:24333547:-1 gene:ENSG00000201541 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT141156 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_122072 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC400511 (LOC400511), long non-coding RNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000414816 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:24661422:24671062:-1 gene:ENSG00000224310 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT141163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001012981 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger with KRAB and SCAN domains 2 (ZKSCAN2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000328086 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:25236001:25257931:-1 gene:ENSG00000155592 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000565590 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:25246271:25257534:-1 gene:ENSG00000155592 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 56 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000569150 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:25239494:25257557:-1 gene:ENSG00000155592 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// AK131342 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ16359 fis, clone THYMU2028739, weakly similar to ZINC FINGER PROTEIN 263. // chr16 // 100 // 56 // 20 // 20 // 0 /// AK302399 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61469 complete cds, highly similar to Zinc finger protein 694. // chr16 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// AK303472 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56217 complete cds, highly similar to Zinc finger protein 694. // chr16 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC130007 // GenBank // Homo sapiens zinc finger with KRAB and SCAN domains 2, mRNA (cDNA clone MGC:158067 IMAGE:40132986), complete cds. // chr16 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// BC151139 // GenBank // Homo sapiens zinc finger with KRAB and SCAN domains 2, mRNA (cDNA clone MGC:184051 IMAGE:9057039), complete cds. // chr16 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000043525 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:25239816:25389854:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0
ENST00000565821 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:25454339:25454647:-1 gene:ENSG00000260690 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000043521 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:25424122:25454647:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT141402 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
AK055679 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ31117 fis, clone IMR322000609. // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000567108 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:27213308:27214993:-1 gene:ENSG00000259940 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT141432 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENST00000364501 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:16:27722284:27722392:-1 gene:ENSG00000201371 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT141467 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000384536 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:27998295:27998401:-1 gene:ENSG00000207266 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT141470 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001270940 // RefSeq // Homo sapiens exportin 6 (XPO6), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NM_015171 // RefSeq // Homo sapiens exportin 6 (XPO6), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// XM_005255198 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens exportin 6 (XPO6), transcript variant X4, mRNA. // chr16 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000304658 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:28097995:28211869:-1 gene:ENSG00000169180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000565698 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:28097979:28211550:-1 gene:ENSG00000169180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AY026388 // GenBank // Homo sapiens exportin 6 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC130304 // GenBank // Homo sapiens exportin 6, mRNA (cDNA clone MGC:163176 IMAGE:40146335), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC144189 // GenBank // Homo sapiens exportin 6, mRNA (cDNA clone MGC:177726 IMAGE:9052709), complete cds. // chr16 // 95 // 100 // 19 // 20 // 0 /// XM_005255200 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens exportin 6 (XPO6), transcript variant X6, mRNA. // chr16 // 85 // 85 // 17 // 20 // 1 /// GENSCAN00000041952 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:28098538:28191832:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0
NM_145659 // RefSeq // Homo sapiens interleukin 27 (IL27), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000356897 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:28499362:28506834:-1 gene:ENSG00000197272 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// AY099296 // GenBank // Homo sapiens IL-27 p28 subunit mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// BC062422 // GenBank // Homo sapiens interleukin 27, mRNA (cDNA clone MGC:71873 IMAGE:4703457), complete cds. // chr16 // 95 // 100 // 18 // 19 // 0 /// ENST00000568075 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:28501974:28512051:-1 gene:ENSG00000197272 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 42 // 42 // 8 // 19 // 1 /// GENSCAN00000041954 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:28499651:28506217:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 74 // 74 // 14 // 19 // 1
NM_001042483 // RefSeq // Homo sapiens nuclear protein, transcriptional regulator, 1 (NUPR1), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 91 // 100 // 20 // 22 // 0 /// NM_012385 // RefSeq // Homo sapiens nuclear protein, transcriptional regulator, 1 (NUPR1), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 91 // 100 // 20 // 22 // 0 /// ENST00000324873 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:28532708:28539174:-1 gene:ENSG00000176046 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000395641 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:16:28537537:28539008:-1 gene:ENSG00000176046 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 55 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000567646 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:28537507:28538951:-1 gene:ENSG00000176046 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 92 // 55 // 11 // 12 // 0 /// AF069073 // GenBank // Homo sapiens P8 protein mRNA, complete cds. // chr16 // 89 // 86 // 17 // 19 // 0 /// AF135266 // GenBank // Homo sapiens p8 protein homolog (COM1) mRNA, complete cds. // chr16 // 94 // 82 // 17 // 18 // 0 /// BC002434 // GenBank // Homo sapiens nuclear protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:1991 IMAGE:3347264), complete cds. // chr16 // 100 // 73 // 16 // 16 // 0 /// BT006896 // GenBank // Homo sapiens p8 protein (candidate of metastasis 1) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 36 // 8 // 8 // 0 /// CR542144 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834G0423D for gene P8, p8 protein (candidate of metastasis 1); complete cds, incl. stopcodon. // chr16 // 100 // 36 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000041950 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:28538019:28538907:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 36 // 8 // 8 // 0
ENST00000564603 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:28700294:28701540:-1 gene:ENSG00000259982 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr16 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// ENST00000562287 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:28413703:28415018:1 gene:ENSG00000261089 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr16 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// GENSCAN00000041940 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:28413886:28415136:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 87 // 56 // 13 // 15 // 0 /// NONHSAT141515 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr16 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0
NM_003321 // RefSeq // Homo sapiens Tu translation elongation factor, mitochondrial (TUFM), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000313511 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:28842411:28846408:-1 gene:ENSG00000178952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000561644 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:28844626:28845007:-1 gene:ENSG00000178952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 31 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000565012 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:28843952:28846330:-1 gene:ENSG00000178952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000569217 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:28842838:28844332:-1 gene:ENSG00000178952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 31 // 11 // 11 // 0 /// BC001633 // GenBank // Homo sapiens Tu translation elongation factor, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:1592 IMAGE:3536952), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC010041 // GenBank // Homo sapiens Tu translation elongation factor, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:19753 IMAGE:3629164), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// L38995 // GenBank // Homo sapiens nuclear-encoded mitochondrial elongation factor Tu mRNA, complete cds. // chr16 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000049733 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:28842975:28846260:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC023617 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4652596, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr16 // 58 // 58 // 21 // 36 // 1
ENST00000516652 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:16:28881480:28881607:-1 gene:ENSG00000252461 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT141541 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONHSAT141565 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NONHSAT140991 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// NONHSAT141035 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// NONHSAT141074 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// NONHSAT141598 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT141614 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT141732 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT143413 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// NONHSAT140860 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 44 // 100 // 11 // 25 // 0
ENST00000410443 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:29731051:29731404:-1 gene:ENSG00000222375 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr16 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// NONHSAT141624 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0
NM_175900 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 16 open reading frame 54 (C16orf54), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000329410 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:29742463:29746006:-1 gene:ENSG00000185905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AY358833 // GenBank // Homo sapiens clone DNA184132 PLTP9389 (UNQ9389) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// BC104466 // GenBank // Homo sapiens chromosome 16 open reading frame 54, mRNA (cDNA clone MGC:129957 IMAGE:40032034), complete cds. // chr16 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// BC104467 // GenBank // Homo sapiens chromosome 16 open reading frame 54, mRNA (cDNA clone MGC:129958 IMAGE:40032037), complete cds. // chr16 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0
NM_003609 // RefSeq // Homo sapiens HIRA interacting protein 3 (HIRIP3), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000279392 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:29992321:29996436:-1 gene:ENSG00000149929 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000563680 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:29993467:29995592:-1 gene:ENSG00000149929 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 90 // 34 // 9 // 10 // 0 /// BC000588 // GenBank // Homo sapiens HIRA interacting protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:1814 IMAGE:3345739), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NM_001197323 // RefSeq // Homo sapiens HIRA interacting protein 3 (HIRIP3), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// ENST00000563053 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:29992996:29996074:-1 gene:ENSG00000149929 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1 /// AK075145 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ90664 fis, clone PLACE1005239, highly similar to HIRA-interacting protein 3. // chr16 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1 /// ENST00000564026 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:29992990:29995643:-1 gene:ENSG00000149929 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1 /// GENSCAN00000029559 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:29993207:29995605:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT141676 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 90 // 34 // 9 // 10 // 0
NM_031478 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 57, member B (FAM57B), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_005255612 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens family with sequence similarity 57, member B (FAM57B), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// XM_005255613 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens family with sequence similarity 57, member B (FAM57B), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// XM_005255615 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens family with sequence similarity 57, member B (FAM57B), transcript variant X4, mRNA. // chr16 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000279389 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:30024427:30030084:-1 gene:ENSG00000149926 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000380495 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:30024427:30031259:-1 gene:ENSG00000149926 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000564806 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:16:30024452:30029536:-1 gene:ENSG00000149926 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 95 // 70 // 18 // 19 // 0 /// BC007892 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 57, member B, mRNA (cDNA clone MGC:14223 IMAGE:4126084), complete cds. // chr16 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029550 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:30005842:30035475:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1
ENST00000553607 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:30087916:30091887:-1 gene:ENSG00000149922 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// AK022330 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ12268 fis, clone MAMMA1001627, highly similar to Homo sapiens mRNA for transcription factor TBX6. // chr16 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// KJ534981 // GenBank HTC // Homo sapiens clone TBX6_iso-B_fetal-F12 T-box 6 isoform B (TBX6) mRNA, partial cds, alternatively spliced. // chr16 // 94 // 57 // 16 // 17 // 0 /// NM_004608 // RefSeq // Homo sapiens T-box 6 (TBX6), mRNA. // chr16 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1 /// ENST00000279386 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:16:30085796:30091249:-1 gene:ENSG00000149922 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1 /// ENST00000395224 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:30085793:30091884:-1 gene:ENSG00000149922 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1 /// ENST00000567664 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:30086035:30091213:-1 gene:ENSG00000149922 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// BC026031 // GenBank // Homo sapiens T-box 6, mRNA (cDNA clone MGC:39231 IMAGE:5460190), complete cds. // chr16 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1 /// KJ535035 // GenBank HTC // Homo sapiens clone TBX6_iso-A_adult-A16 T-box 6 isoform A (TBX6) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr16 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// GENSCAN00000029553 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:30086225:30091193:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1
NM_024307 // RefSeq // Homo sapiens glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 3 (GDPD3), mRNA. // chr16 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// XR_243307 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 3 (GDPD3), transcript variant X2, misc_RNA. // chr16 // 100 // 74 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000360688 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:30104810:30113537:-1 gene:ENSG00000102886 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000406256 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:30104810:30113856:-1 gene:ENSG00000102886 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000566434 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:30104815:30108432:-1 gene:ENSG00000102886 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 35 // 8 // 8 // 0 /// AK225450 // GenBank // Homo sapiens mRNA for glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 3 isoform 1 variant, clone: HSI04564. // chr16 // 91 // 100 // 21 // 23 // 0 /// BC002714 // GenBank // Homo sapiens glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:4171 IMAGE:3629566), complete cds. // chr16 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000565704 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:30104810:30108498:-1 gene:ENSG00000102886 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1 /// GENSCAN00000029562 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:30104872:30113478:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT141704 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1
NM_001243646 // RefSeq // Homo sapiens CD2 (cytoplasmic tail) binding protein 2 (CD2BP2), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NM_006110 // RefSeq // Homo sapiens CD2 (cytoplasmic tail) binding protein 2 (CD2BP2), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000305596 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:30350766:30355361:-1 gene:ENSG00000169217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000564525 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:30353966:30355291:-1 gene:ENSG00000169217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 92 // 48 // 11 // 12 // 0 /// ENST00000569466 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:30352847:30354934:-1 gene:ENSG00000169217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// AF104222 // GenBank // Homo sapiens CD2 cytoplasmic domain binding protein (CD2BP2) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AF109192 // GenBank HTC // Homo sapiens FWP010 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// BC000495 // GenBank // Homo sapiens CD2 (cytoplasmic tail) binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:8401 IMAGE:2820690), complete cds. // chr16 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC001947 // GenBank // Homo sapiens CD2 (cytoplasmic tail) binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:4324 IMAGE:2820690), complete cds. // chr16 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000029546 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:30352985:30370183:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
ENST00000362917 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:16:30419625:30419759:-1 gene:ENSG00000199787 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT141748 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_012248 // RefSeq // Homo sapiens selenophosphate synthetase 2 (SEPHS2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000478753 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:30443631:30446181:-1 gene:ENSG00000179918 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK303275 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53520 complete cds, highly similar to Selenide, water dikinase 2 (EC 2.7.9.3). // chr16 // 95 // 70 // 20 // 21 // 0 /// BC002381 // GenBank // Homo sapiens selenophosphate synthetase 2, mRNA (cDNA clone MGC:8606 IMAGE:2961275), complete cds. // chr16 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC016643 // GenBank // Homo sapiens selenophosphate synthetase 2, mRNA (cDNA clone MGC:18017 IMAGE:3923979), complete cds. // chr16 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// U43286 // GenBank // Homo sapiens selenophosphate synthetase 2 (SPS2) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0
ENST00000365606 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:16:30453997:30454097:-1 gene:ENSG00000202476 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr16 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT141749 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_024671 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 768 (ZNF768), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000380412 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:30524001:30526589:-1 gene:ENSG00000169957 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000562803 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:30524133:30526821:-1 gene:ENSG00000169957 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// BC013760 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 768, mRNA (cDNA clone MGC:9547 IMAGE:3856266), complete cds. // chr16 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC092403 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 768, mRNA (cDNA clone MGC:102742 IMAGE:6201079), complete cds. // chr16 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// AK295274 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59521 complete cds, moderately similar to Zinc finger and SCAN domain-containing protein 2. // chr16 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
NM_023931 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 747 (ZNF747), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000252799 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:30530367:30535347:-1 gene:ENSG00000169955 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000395094 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:30530367:30534918:-1 gene:ENSG00000169955 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000568028 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:30532306:30535004:-1 gene:ENSG00000169955 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000569360 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:30525923:30534852:-1 gene:ENSG00000261459 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// AK292192 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76927 complete cds. // chr16 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// AK299308 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54920 complete cds, moderately similar to Homo sapiens zinc finger protein 689 (ZNF689), mRNA. // chr16 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// AK316254 // GenBank // Homo sapiens cDNA, FLJ79153 complete cds, highly similar to Homo sapiens zinc finger protein 689 (ZNF689), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC001361 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 747, mRNA (cDNA clone MGC:2474 IMAGE:3050694), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000029529 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:30532499:30534679:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 77 // 17 // 17 // 0
NM_001172679 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 764 (ZNF764), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NM_033410 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 764 (ZNF764), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000252797 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:30553764:30558263:-1 gene:ENSG00000169951 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000395091 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:30553764:30558498:-1 gene:ENSG00000169951 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000568333 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:30555638:30558211:-1 gene:ENSG00000169951 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 90 // 50 // 9 // 10 // 0 /// BC008821 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 764, mRNA (cDNA clone MGC:13138 IMAGE:4130947), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000029530 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:30537234:30558182:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 55 // 11 // 11 // 0 /// NONHSAT141767 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 90 // 50 // 9 // 10 // 0
NM_152458 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 785 (ZNF785), mRNA. // chr16 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000395216 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:30580656:30585771:-1 gene:ENSG00000197162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000470110 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:30578361:30585769:-1 gene:ENSG00000197162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000567773 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:30583129:30585497:-1 gene:ENSG00000197162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// AK056692 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ32130 fis, clone PEBLM2000248, weakly similar to ZINC FINGER PROTEIN 157. // chr16 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// AK292465 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75041 complete cds. // chr16 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// AK298848 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51514 complete cds, highly similar to Zinc finger protein 688. // chr16 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// AK309511 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99552. // chr16 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// BC040642 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 785, mRNA (cDNA clone MGC:41915 IMAGE:4811661), complete cds. // chr16 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000029549 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:30582560:30585611:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0
ENST00000516265 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:30675300:30675402:-1 gene:ENSG00000252074 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT141801 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000410355 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:30701337:30701435:-1 gene:ENSG00000222287 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT141804 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_001080417 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 629 (ZNF629), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000262525 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:30778449:30787202:-1 gene:ENSG00000102870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001017 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:30780109:30793772:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
ENST00000568660 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:30821068:30822110:-1 gene:ENSG00000260082 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr16 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_004765 // RefSeq // Homo sapiens B-cell CLL/lymphoma 7C (BCL7C), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// BC019071 // GenBank // Homo sapiens B-cell CLL/lymphoma 7C, mRNA (cDNA clone MGC:29700 IMAGE:4909589), complete cds. // chr16 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// NM_001286526 // RefSeq // Homo sapiens B-cell CLL/lymphoma 7C (BCL7C), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 82 // 82 // 28 // 34 // 1 /// ENST00000215115 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:30887795:30894960:-1 gene:ENSG00000099385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 82 // 82 // 28 // 34 // 1 /// ENST00000380317 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:30833626:30894302:-1 gene:ENSG00000099385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 82 // 82 // 28 // 34 // 1 /// BC058863 // GenBank // Homo sapiens B-cell CLL/lymphoma 7C, mRNA (cDNA clone MGC:35095 IMAGE:5167136), complete cds. // chr16 // 79 // 79 // 27 // 34 // 1 /// ENST00000572628 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:30851246:30893942:-1 gene:ENSG00000099385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 53 // 53 // 18 // 34 // 1 /// ENST00000574418 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:30834585:30894200:-1 gene:ENSG00000099385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 50 // 50 // 17 // 34 // 1 /// GENSCAN00000001044 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:30887865:30893944:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 62 // 21 // 21 // 0 /// BC010017 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:2819902, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr16 // 53 // 53 // 18 // 34 // 1
NR_024348 // RefSeq // Homo sapiens FBXL19 antisense RNA 1 (head to head) (FBXL19-AS1), long non-coding RNA. // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000563777 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:30919319:30923269:-1 gene:ENSG00000260852 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT141827 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_052874 // RefSeq // Homo sapiens syntaxin 1B (STX1B), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000215095 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:30989256:31010628:-1 gene:ENSG00000099365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000561836 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:31000896:31010502:-1 gene:ENSG00000099365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 33 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000565419 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:30992708:31010396:-1 gene:ENSG00000099365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000569638 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:30989258:31000955:-1 gene:ENSG00000099365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// AY028792 // GenBank // Homo sapiens syntaxin 1B (STX1B) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AY995211 // GenBank // Homo sapiens syntaxin 1B alternative isoform deltaTM (STX1B) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr16 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// BC062298 // GenBank // Homo sapiens syntaxin 1B, mRNA (cDNA clone MGC:71180 IMAGE:6375788), complete cds. // chr16 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000001040 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:30990162:31033448:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 75 // 75 // 18 // 24 // 1
NM_001039503 // RefSeq // Homo sapiens protease, serine, 53 (PRSS53), mRNA. // chr16 // 95 // 44 // 19 // 20 // 0 /// ENST00000280606 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:31083425:31088963:-1 gene:ENSG00000151006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 95 // 44 // 19 // 20 // 0 /// ENST00000486499 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:31083437:31089628:-1 gene:ENSG00000151006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENST00000492427 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:31086015:31088728:-1 gene:ENSG00000151006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 31 // 14 // 14 // 0 /// AK131087 // GenBank // Homo sapiens mRNA for FLJ00289 protein. // chr16 // 96 // 100 // 43 // 45 // 0 /// GENSCAN00000001034 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:31083790:31088809:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 42 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT141860 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr16 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// NONHSAT141863 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr16 // 100 // 31 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000533518 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:31083439:31094602:-1 gene:ENSG00000255439 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 47 // 47 // 21 // 45 // 1 /// AY358456 // GenBank // Homo sapiens clone DNA40571 EDTP308 (UNQ308) mRNA, complete cds. // chr16 // 47 // 47 // 21 // 45 // 1
NM_002773 // RefSeq // Homo sapiens protease, serine, 8 (PRSS8), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000317508 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:31131433:31135762:-1 gene:ENSG00000052344 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000568261 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:16:31131894:31135727:-1 gene:ENSG00000052344 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// AK301619 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54275 complete cds, highly similar to Prostasin precursor (EC 3.4.21.-). // chr16 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC001462 // GenBank // Homo sapiens protease, serine, 8, mRNA (cDNA clone MGC:2133 IMAGE:3138532), complete cds. // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// L41351 // GenBank // Homo sapiens prostasin mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK296656 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53017 complete cds, moderately similar to Prostasin precursor (EC 3.4.21.-). // chr16 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// GENSCAN00000001018 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:31131800:31135498:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_152901 // RefSeq // Homo sapiens PYD (pyrin domain) containing 1 (PYDC1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000302964 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:31215962:31217359:-1 gene:ENSG00000169900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000568383 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:31215962:31216370:-1 gene:ENSG00000169900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// AF086332 // GenBank // Homo sapiens full length insert cDNA clone ZD54H05. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF454669 // GenBank // Homo sapiens pyrin-only protein 1 (POP1) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF467809 // GenBank // Homo sapiens pyrin-domain containing protein (PYC1) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY163727 // GenBank // Homo sapiens PAAD-only protein (POP1) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC105033 // GenBank // Homo sapiens PYD (pyrin domain) containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:132693 IMAGE:8144036), complete cds. // chr16 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// BC105035 // GenBank // Homo sapiens PYD (pyrin domain) containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:132695 IMAGE:8144038), complete cds. // chr16 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// AK313418 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ93956, Homo sapiens pyrin-domain containing protein 1 (PYC1), mRNA. // chr16 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// GENSCAN00000001033 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:31216759:31217028:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0 /// NONHSAT141889 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr16 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0
NM_005205 // RefSeq // Homo sapiens cytochrome c oxidase subunit VIa polypeptide 2 (COX6A2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000287490 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:31427731:31428428:-1 gene:ENSG00000156885 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000565462 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:31427776:31428285:-1 gene:ENSG00000156885 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 83 // 46 // 10 // 12 // 0 /// BC029818 // GenBank // Homo sapiens cytochrome c oxidase subunit VIa polypeptide 2, mRNA (cDNA clone MGC:34466 IMAGE:5174639), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// M83308 // GenBank // Human mitochondrial cytochrome-c oxidase subunit VIa (COX6A) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000001016 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:31427774:31428325:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT141900 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 92 // 92 // 22 // 24 // 0
NM_001136509 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 843 (ZNF843), mRNA. // chr16 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000315678 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:31435438:31443025:-1 gene:ENSG00000176723 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AK291063 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76500 complete cds. // chr16 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC036762 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 843, mRNA (cDNA clone MGC:46336 IMAGE:5588928), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000564218 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:31432593:31443025:-1 gene:ENSG00000176723 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 76 // 76 // 22 // 29 // 1 /// AK096248 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ38929 fis, clone NT2NE2013019. // chr16 // 76 // 76 // 22 // 29 // 1 /// ENST00000618063 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:16:31435438:31443160:-1 gene:ENSG00000176723 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000001024 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:31433392:31437091:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1
ENST00000418822 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:31807926:31808844:-1 gene:ENSG00000180663 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:unitary_pseudogene // chr16 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// BC107073 // GenBank // Homo sapiens vomeronasal 1 receptor 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:40027000). // chr16 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// NONHSAT141972 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000037434 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:31806325:31819823:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1
ENST00000565407 // ENSEMBL // havana_ig_gene:known chromosome:GRCh38:16:33009175:33009620:1 gene:ENSG00000271130 gene_biotype:IG_V_gene transcript_biotype:IG_V_gene // chr16 // 75 // 100 // 9 // 12 // 0 /// ENST00000569103 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:33844784:33845229:-1 gene:ENSG00000259680 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 92 // 100 // 11 // 12 // 0 /// GENSCAN00000011929 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:32902034:33009646:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 83 // 100 // 10 // 12 // 0 /// GENSCAN00000025349 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:33844758:33937076:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
ENST00000380145 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:33972912:33975277:-1 gene:ENSG00000205452 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000398669 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:32886226:32888628:1 gene:ENSG00000214614 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AK128823 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ46121 fis, clone TESTI2039342. // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT142048 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT142120 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000561642 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:33973047:33976346:-1 gene:ENSG00000205452 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 43 // 43 // 10 // 23 // 1 /// ENST00000566260 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:32885194:32888874:1 gene:ENSG00000214614 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr16 // 48 // 48 // 11 // 23 // 1 /// BC033395 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4830595. // chr16 // 43 // 43 // 10 // 23 // 1 /// NONHSAT142047 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 48 // 48 // 11 // 23 // 1 /// NONHSAT142121 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 43 // 43 // 10 // 23 // 1
NR_002837 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin-conjugating enzyme E2M pseudogene 1 (UBE2MP1), non-coding RNA. // chr16 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000568522 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:35169692:35170241:-1 gene:ENSG00000261461 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr16 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000049952 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:35169691:35188647:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NR_026556 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat domain 26 pseudogene 1 (ANKRD26P1), non-coding RNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000566201 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:46471539:46569097:-1 gene:ENSG00000261239 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000569528 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:46471539:46569097:-1 gene:ENSG00000261239 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000571006 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:46469341:46517951:-1 gene:ENSG00000261239 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// GENSCAN00000044535 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:46473911:46564319:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
ENST00000362578 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:46556089:46556191:-1 gene:ENSG00000199448 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT142251 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_024745 // RefSeq // Homo sapiens SHC SH2-domain binding protein 1 (SHCBP1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000303383 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:46580554:46621626:-1 gene:ENSG00000171241 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000566016 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:46603594:46621368:-1 gene:ENSG00000171241 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0 /// AK292164 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78530 complete cds, highly similar to Homo sapiens SHC SH2-domain binding protein 1 (SHCBP1), mRNA. // chr16 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// AK310430 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17472. // chr16 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0 /// BC030699 // GenBank // Homo sapiens SHC SH2-domain binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:26900 IMAGE:4829528), complete cds. // chr16 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000044533 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:46573783:46626949:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1
NM_182493 // RefSeq // Homo sapiens myosin light chain kinase 3 (MYLK3), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// XM_005256233 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens myosin light chain kinase 3 (MYLK3), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 74 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000394809 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:46706979:46748309:-1 gene:ENSG00000140795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// BC109097 // GenBank // Homo sapiens myosin light chain kinase 3, mRNA (cDNA clone MGC:126320 IMAGE:40034724), complete cds. // chr16 // 98 // 98 // 40 // 41 // 0 /// ENST00000536476 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:46707666:46763246:-1 gene:ENSG00000140795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 64 // 64 // 27 // 42 // 1 /// AK299443 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50066 complete cds, highly similar to Homo sapiens cardiac-MyBP-C associated Ca/CaM kinase (MLCK), mRNA. // chr16 // 64 // 64 // 27 // 42 // 1 /// ENST00000564731 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:46725776:46738137:-1 gene:ENSG00000140795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 43 // 43 // 18 // 42 // 1 /// BC039103 // GenBank HTC // Homo sapiens myosin light chain kinase 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:4831102), with apparent retained intron. // chr16 // 43 // 43 // 18 // 42 // 1 /// ENST00000565182 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:46707668:46710987:-1 gene:ENSG00000140795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1 /// GENSCAN00000048211 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:46704953:46748025:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 64 // 27 // 27 // 0
ENST00000285697 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:46802094:46831411:-1 gene:ENSG00000155330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000394806 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:46796607:46831162:-1 gene:ENSG00000155330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000564250 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:46803003:46830759:-1 gene:ENSG00000155330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 88 // 61 // 15 // 17 // 0 /// ENST00000565112 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:46802718:46831068:-1 gene:ENSG00000155330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// BC056676 // GenBank // Homo sapiens chromosome 16 open reading frame 87, mRNA (cDNA clone MGC:62018 IMAGE:6711353), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONHSAT142270 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 88 // 61 // 15 // 17 // 0 /// GENSCAN00000048210 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:46802952:46831105:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
NM_005880 // RefSeq // Homo sapiens DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily A, member 2 (DNAJA2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000317089 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:46955362:46973788:-1 gene:ENSG00000069345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000563158 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:46956622:46973664:-1 gene:ENSG00000069345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 92 // 89 // 22 // 24 // 0 /// AF011793 // GenBank // Homo sapiens DNJ3/CPR3 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// AF088046 // GenBank // Homo sapiens full length insert cDNA clone ZD59G03. // chr16 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// BC013044 // GenBank // Homo sapiens DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily A, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:819 IMAGE:3505399), complete cds. // chr16 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// BC015809 // GenBank // Homo sapiens DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily A, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:9488 IMAGE:3922477), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// Y13350 // GenBank // Homo sapiens mRNA for DnaJ protein. // chr16 // 86 // 81 // 19 // 22 // 0 /// GENSCAN00000048212 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:46957029:46973572:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000617000 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:46964733:46972943:-1 gene:ENSG00000069345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
ENST00000410835 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:16:47313027:47313121:-1 gene:ENSG00000222767 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT142291 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000390988 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:47450347:47450461:-1 gene:ENSG00000212290 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr16 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000565940 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:47448098:47459130:-1 gene:ENSG00000129636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK309475 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99516. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT142294 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_153029 // RefSeq // Homo sapiens NEDD4 binding protein 1 (N4BP1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000262384 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:48538726:48610209:-1 gene:ENSG00000102921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000564124 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:48546097:48620148:-1 gene:ENSG00000102921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 44 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000565423 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:48542880:48551444:-1 gene:ENSG00000102921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// BC152472 // GenBank // Homo sapiens NEDD4 binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:176730 IMAGE:8862609), complete cds. // chr16 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000010967 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:48542904:48575322:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 39 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT142338 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0
NONHSAT142356 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000410238 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:48731704:48731801:-1 gene:ENSG00000222170 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT142357 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_004352 // RefSeq // Homo sapiens cerebellin 1 precursor (CBLN1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000219197 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:49277917:49281831:-1 gene:ENSG00000102924 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000536749 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:16:49279312:49281562:-1 gene:ENSG00000102924 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000564786 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:49279290:49281482:-1 gene:ENSG00000102924 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// BC093692 // GenBank // Homo sapiens cerebellin 1 precursor, mRNA (cDNA clone MGC:120727 IMAGE:7939537), complete cds. // chr16 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC093718 // GenBank // Homo sapiens cerebellin 1 precursor, mRNA (cDNA clone MGC:120753 IMAGE:7939563), complete cds. // chr16 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// M58583 // GenBank // Human precerebellin and cerebellin mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037732 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:49279404:49327838:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
ENST00000516717 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:16:50151642:50151731:-1 gene:ENSG00000252526 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT142403 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONHSAT142407 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_153337 // RefSeq // Homo sapiens sorting nexin 20 (SNX20), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// NM_182854 // RefSeq // Homo sapiens sorting nexin 20 (SNX20), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 42 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000300590 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:50666300:50681353:-1 gene:ENSG00000167208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000568993 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:50666558:50681302:-1 gene:ENSG00000167208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// AK292705 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76579 complete cds, highly similar to Homo sapiens selectin ligand interactor cytoplasmic-1 (SLIC1), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 33 // 8 // 8 // 0 /// AY302441 // GenBank // Homo sapiens selectin ligand interactor cytoplasmic-1 (SLIC1) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 38 // 9 // 9 // 0 /// BC063423 // GenBank // Homo sapiens sorting nexin 20, mRNA (cDNA clone IMAGE:5218959), complete cds. // chr16 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// NM_001144972 // RefSeq // Homo sapiens sorting nexin 20 (SNX20), transcript variant 3, mRNA. // chr16 // 58 // 58 // 14 // 24 // 1 /// ENST00000423026 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:50666300:50681312:-1 gene:ENSG00000167208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 58 // 58 // 14 // 24 // 1 /// ENST00000330943 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:50671625:50681352:-1 gene:ENSG00000167208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 42 // 42 // 10 // 24 // 1 /// AK292650 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76423 complete cds, highly similar to Homo sapiens selectin ligand interactor cytoplasmic-1, mRNA. // chr16 // 42 // 42 // 10 // 24 // 1
ENST00000362901 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:50869455:50869575:-1 gene:ENSG00000199771 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT142448 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001127892 // RefSeq // Homo sapiens spalt-like transcription factor 1 (SALL1), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NM_002968 // RefSeq // Homo sapiens spalt-like transcription factor 1 (SALL1), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000251020 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:51135975:51151275:-1 gene:ENSG00000103449 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000440970 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:16:51135975:51150597:-1 gene:ENSG00000103449 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000570206 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:51137332:51150597:-1 gene:ENSG00000103449 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// AK295103 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55320 complete cds, highly similar to Sal-like protein 1. // chr16 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000045914 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:51137112:51151241:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
ENST00000411236 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:51671236:51671563:-1 gene:ENSG00000223168 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT142481 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AF150735 // GenBank // Homo sapiens proteinx0008 (AD013) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
NM_024336 // RefSeq // Homo sapiens iroquois homeobox 3 (IRX3), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000329734 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:54283304:54286763:-1 gene:ENSG00000177508 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000558180 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:54284120:54286724:-1 gene:ENSG00000177508 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0 /// AK309146 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99187. // chr16 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0 /// AY335943 // GenBank // Homo sapiens homeodomain protein IRXB1 (IRX3) mRNA, complete cds. // chr16 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// BC023667 // GenBank // Homo sapiens iroquois homeobox 3, mRNA (cDNA clone MGC:29708 IMAGE:5020235), complete cds. // chr16 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// BC034328 // GenBank // Homo sapiens iroquois homeobox 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:4780414), partial cds. // chr16 // 100 // 42 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000558054 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:16:54283436:54285855:-1 gene:ENSG00000177508 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1 /// GENSCAN00000003226 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:54283686:54329769:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0
ENST00000470547 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:55291379:55291675:-1 gene:ENSG00000239555 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT142626 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_007006 // RefSeq // Homo sapiens nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 21 (NUDT21), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000300291 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:56429133:56451375:-1 gene:ENSG00000167005 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000566340 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:56434346:56452199:-1 gene:ENSG00000167005 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 90 // 42 // 9 // 10 // 0 /// ENST00000567110 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:56447648:56451351:-1 gene:ENSG00000167005 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 33 // 8 // 8 // 0 /// BC001403 // GenBank // Homo sapiens nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 21, mRNA (cDNA clone MGC:2961 IMAGE:3139379), complete cds. // chr16 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// BX537360 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686H1588 (from clone DKFZp686H1588); complete cds. // chr16 // 88 // 100 // 21 // 24 // 0 /// CR456919 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834F1115D for gene CPSF5, cleavage and polyadenylation specific factor 5, 25 kDa; complete cds, incl. stopcodon. // chr16 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000005396 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:56362909:56451540:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1
NM_005950 // RefSeq // Homo sapiens metallothionein 1G (MT1G), mRNA. // chr16 // 95 // 100 // 18 // 19 // 0 /// ENST00000379811 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:56666735:56668065:-1 gene:ENSG00000125144 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000444837 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:56666731:56668065:-1 gene:ENSG00000125144 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000568675 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:56666806:56668021:-1 gene:ENSG00000125144 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000569500 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:56666735:56668034:-1 gene:ENSG00000125144 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0 /// BC020757 // GenBank // Homo sapiens metallothionein 1G, mRNA (cDNA clone MGC:22610 IMAGE:4767886), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC048334 // GenBank // Homo sapiens, clone IMAGE:5185539, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000010920 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:56666841:56730336:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 42 // 42 // 8 // 19 // 1
NM_015993 // RefSeq // Homo sapiens plasmolipin (PLLP), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000219207 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:57256097:57284687:-1 gene:ENSG00000102934 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000564018 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:57256981:57263371:-1 gene:ENSG00000102934 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 55 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000569059 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:16:57256755:57284672:-1 gene:ENSG00000102934 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0 /// AF137386 // GenBank // Homo sapiens plasmolipin mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AK289599 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78169 complete cds, highly similar to Homo sapiens transmembrane 4 superfamily member 11 (TM4SF11), mRNA. // chr16 // 95 // 91 // 19 // 20 // 0 /// BC002760 // GenBank // Homo sapiens plasma membrane proteolipid (plasmolipin), mRNA (cDNA clone MGC:3357 IMAGE:3633345), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000010918 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:57256913:57284540:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000613167 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:57249039:57284661:-1 gene:ENSG00000102934 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 64 // 64 // 14 // 22 // 1
NM_033212 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 102A (CCDC102A), mRNA. // chr16 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000258214 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:57512178:57536599:-1 gene:ENSG00000135736 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000569068 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:57512387:57516582:-1 gene:ENSG00000135736 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// BC008285 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 102A, mRNA (cDNA clone MGC:10992 IMAGE:3637387), complete cds. // chr16 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC009941 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 102A, mRNA (cDNA clone MGC:13119 IMAGE:4100726), complete cds. // chr16 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000010879 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:57497864:57529177:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
NM_001135639 // RefSeq // Homo sapiens cyclic nucleotide gated channel beta 1 (CNGB1), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 38 // 16 // 16 // 0 /// NM_001286130 // RefSeq // Homo sapiens cyclic nucleotide gated channel beta 1 (CNGB1), transcript variant 3, mRNA. // chr16 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// NM_001297 // RefSeq // Homo sapiens cyclic nucleotide gated channel beta 1 (CNGB1), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000251102 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:57882340:57971112:-1 gene:ENSG00000070729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000311183 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:57954675:57971116:-1 gene:ENSG00000070729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 38 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000562761 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:57960006:57967352:-1 gene:ENSG00000070729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 24 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000564448 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:16:57883599:57971112:-1 gene:ENSG00000070729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// AF042498 // GenBank // Homo sapiens rod photoreceptor CNG-channel beta subunit (RCNC2) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 93 // 39 // 39 // 0 /// U18945 // GenBank // Human cyclic nucleotide gated channel gamma subunit (Gar-1) mRNA, complete cds. // chr16 // 94 // 38 // 15 // 16 // 0 /// U58837 // GenBank // Human cGMP-gated cation channel beta subunit (CNCG2) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000046845 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:57861507:57967226:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 83 // 35 // 35 // 0
NM_020807 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 319 (ZNF319), mRNA. // chr16 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// XM_005256069 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens zinc finger protein 319 (ZNF319), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000299237 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:57994668:57999858:-1 gene:ENSG00000166188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC093919 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 319, mRNA (cDNA clone MGC:120954 IMAGE:7939764), complete cds. // chr16 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// BC101767 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 319, mRNA (cDNA clone MGC:126816 IMAGE:8069273), complete cds. // chr16 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0
ENST00000384444 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:16:58083068:58083168:-1 gene:ENSG00000207173 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT142810 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001896 // RefSeq // Homo sapiens casein kinase 2, alpha prime polypeptide (CSNK2A2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000262506 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:58157907:58197920:-1 gene:ENSG00000070770 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000565188 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:16:58174475:58197878:-1 gene:ENSG00000070770 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 82 // 41 // 9 // 11 // 0 /// ENST00000566813 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:58157907:58192886:-1 gene:ENSG00000070770 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000567730 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:16:58158117:58186856:-1 gene:ENSG00000070770 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// BC008812 // GenBank // Homo sapiens casein kinase 2, alpha prime polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:10397 IMAGE:3951914), complete cds. // chr16 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// M55268 // GenBank // Human casein kinase II alpha subunit mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000563307 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:58159551:58167713:-1 gene:ENSG00000070770 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// GENSCAN00000046844 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:58158173:58197736:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0
ENST00000496148 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:58199568:58199836:-1 gene:ENSG00000240863 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr16 // 94 // 100 // 17 // 18 // 0 /// NONHSAT142824 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 83 // 100 // 15 // 18 // 0
NM_001080492 // RefSeq // Homo sapiens protease, serine, 54 (PRSS54), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000219301 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:16:58279997:58295047:-1 gene:ENSG00000103023 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000543437 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:58280003:58294976:-1 gene:ENSG00000103023 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 96 // 79 // 25 // 26 // 0 /// ENST00000567164 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:58279997:58295039:-1 gene:ENSG00000103023 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000569079 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:58280505:58294983:-1 gene:ENSG00000103023 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 95 // 61 // 19 // 20 // 0 /// ENST00000569727 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:16:58284685:58295047:-1 gene:ENSG00000103023 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0 /// AK302175 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50287 complete cds. // chr16 // 84 // 76 // 21 // 25 // 0 /// BC057843 // GenBank // Homo sapiens plasma kallikrein-like protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:71843 IMAGE:5296090), complete cds. // chr16 // 88 // 100 // 29 // 33 // 0 /// GENSCAN00000046838 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:58283869:58293780:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 42 // 14 // 14 // 0
ENST00000391077 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:58378052:58378148:-1 gene:ENSG00000212379 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT142833 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_002978 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 46 (SNORA46), small nucleolar RNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000384762 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:58548499:58548633:-1 gene:ENSG00000207493 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT142862 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_002980 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 76A (SNORA76A), small nucleolar RNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000384225 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:58559796:58559929:-1 gene:ENSG00000206952 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr16 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT142864 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000363554 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:58744251:58744357:-1 gene:ENSG00000200424 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT142874 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENST00000364419 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:61743154:61743476:-1 gene:ENSG00000201289 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr16 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONHSAT142921 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr16 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_001136505 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 79 (CCDC79), mRNA. // chr16 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// XM_006721177 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens coiled-coil domain containing 79 (CCDC79), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000313294 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:66758299:66801620:-1 gene:ENSG00000249961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000433154 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:16:66754976:66801620:-1 gene:ENSG00000249961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000558713 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:66754976:66801611:-1 gene:ENSG00000249961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000559050 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:66788239:66801584:-1 gene:ENSG00000249961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 83 // 32 // 10 // 12 // 0 /// ENST00000561333 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:66767428:66801026:-1 gene:ENSG00000249961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// AK093213 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ35894 fis, clone TESTI2009390. // chr16 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC126109 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 79, mRNA (cDNA clone MGC:161387 IMAGE:8991825), complete cds. // chr16 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0
NM_033309 // RefSeq // Homo sapiens UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 9 (B3GNT9), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000449549 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:67148105:67151214:-1 gene:ENSG00000237172 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY358485 // GenBank // Homo sapiens clone DNA83505 galactosyltransferase (UNQ1922) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000022905 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:67149277:67150485:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
NM_003789 // RefSeq // Homo sapiens TNFRSF1A-associated via death domain (TRADD), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000345057 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:67154180:67160298:-1 gene:ENSG00000102871 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000486556 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:67154199:67156249:-1 gene:ENSG00000102871 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// AK090673 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ33354 fis, clone BRACE2005124, highly similar to Tumor necrosis factor receptor type1-associated DEATH domain protein. // chr16 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// AK315654 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ96745, Homo sapiens TNFRSF1A-associated via death domain (TRADD),transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// BC004491 // GenBank // Homo sapiens TNFRSF1A-associated via death domain, mRNA (cDNA clone MGC:11078 IMAGE:3689007), complete cds. // chr16 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// BT006934 // GenBank // Homo sapiens TNFRSF1A-associated via death domain mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// AK301593 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54928 complete cds, weakly similar to Tumor necrosis factor receptor type1-associated DEATH domain protein. // chr16 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1 /// GENSCAN00000022904 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:67154649:67157045:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0
NM_001040715 // RefSeq // Homo sapiens KIAA0895-like (KIAA0895L), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000290881 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:67175604:67184040:-1 gene:ENSG00000196123 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000561621 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:67175604:67183952:-1 gene:ENSG00000196123 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000563902 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:67176730:67183941:-1 gene:ENSG00000196123 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 90 // 100 // 9 // 10 // 0 /// BC080183 // GenBank // Homo sapiens KIAA0895-like, mRNA (cDNA clone MGC:88052 IMAGE:5742087), complete cds. // chr16 // 90 // 100 // 9 // 10 // 0 /// GENSCAN00000022891 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:67176811:67180610:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0 /// AY255669 // GenBank // Homo sapiens unknown mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_178516 // RefSeq // Homo sapiens exocyst complex component 3-like 1 (EXOC3L1), mRNA. // chr16 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000314586 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:67184366:67190204:-1 gene:ENSG00000179044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000545725 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:16:67184379:67190172:-1 gene:ENSG00000179044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000563889 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:16:67184380:67190136:-1 gene:ENSG00000179044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000564324 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:67184380:67190099:-1 gene:ENSG00000179044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// AK292004 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76319 complete cds. // chr16 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// AK300915 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55621 partial cds, weakly similar to Exocyst complex component 3. // chr16 // 95 // 86 // 18 // 19 // 0 /// BC034287 // GenBank // Homo sapiens exocyst complex component 3-like, mRNA (cDNA clone IMAGE:5164368). // chr16 // 83 // 82 // 15 // 18 // 0 /// GENSCAN00000022911 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:67184394:67189676:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 77 // 17 // 17 // 0 /// AY255669 // GenBank // Homo sapiens unknown mRNA. // chr16 // 95 // 91 // 19 // 20 // 0
NM_013241 // RefSeq // Homo sapiens formin homology 2 domain containing 1 (FHOD1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000258201 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:67229389:67247658:-1 gene:ENSG00000135723 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000561922 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:67233681:67247478:-1 gene:ENSG00000135723 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000567752 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:67229391:67247464:-1 gene:ENSG00000135723 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// AB041046 // GenBank // Homo sapiens mRNA for p127, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AB209584 // GenBank // Homo sapiens mRNA for P127 variant protein. // chr16 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// AF113615 // GenBank // Homo sapiens FH1/FH2 domain-containing protein FHOS (FHOS) mRNA, complete cds. // chr16 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// AK304232 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54238 complete cds, highly similar to FH1/FH2 domain-containing protein. // chr16 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// AY192154 // GenBank // Homo sapiens FHOS mRNA, complete cds. // chr16 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// BC033084 // GenBank // Homo sapiens formin homology 2 domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:45650 IMAGE:5456031), complete cds. // chr16 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// AK301157 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55372 complete cds, highly similar to FH1/FH2 domain-containing protein. // chr16 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// GENSCAN00000022895 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:67229636:67247410:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0
ENST00000364331 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:67321658:67321987:-1 gene:ENSG00000201201 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT143115 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000458950 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:67390691:67390850:-1 gene:ENSG00000239194 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// ENST00000561537 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:67390479:67393481:-1 gene:ENSG00000159713 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT143118 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
NM_013304 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, DHHC-type containing 1 (ZDHHC1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006721185 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens zinc finger, DHHC-type containing 1 (ZDHHC1), transcript variant X4, mRNA. // chr16 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000348579 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:67394419:67416474:-1 gene:ENSG00000159714 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000562122 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:67395505:67404553:-1 gene:ENSG00000159714 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000565726 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:16:67394521:67400991:-1 gene:ENSG00000159714 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0 /// BC021908 // GenBank // Homo sapiens zinc finger, DHHC-type containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:13113 IMAGE:4053374), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000566075 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:67394425:67396257:-1 gene:ENSG00000159714 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// GENSCAN00000022900 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:67390174:67406442:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1
NM_001138 // RefSeq // Homo sapiens agouti related protein homolog (mouse) (AGRP), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000290953 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:67482571:67483813:-1 gene:ENSG00000159723 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC110443 // GenBank // Homo sapiens agouti related protein homolog (mouse), mRNA (cDNA clone MGC:118963 IMAGE:40002498), complete cds. // chr16 // 93 // 97 // 26 // 28 // 0 /// U88063 // GenBank // Human Agouti related protein (Art) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// U89485 // GenBank // Human agouti-related protein (Agrp) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000022892 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:67438528:67483398:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1
ENST00000602644 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:16:67662970:67666727:-1 gene:ENSG00000124074 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 96 // 77 // 26 // 27 // 0 /// ENST00000602942 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:67662946:67664512:-1 gene:ENSG00000124074 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 66 // 23 // 23 // 0 /// AY358834 // GenBank // Homo sapiens clone DNA167659 DAKV6410 (UNQ6410) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 66 // 23 // 23 // 0 /// NM_032140 // RefSeq // Homo sapiens enkurin domain containing 1 (ENKD1), mRNA. // chr16 // 86 // 86 // 30 // 35 // 1 /// ENST00000243878 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:67662945:67666764:-1 gene:ENSG00000124074 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 86 // 86 // 30 // 35 // 1 /// BC008284 // GenBank // Homo sapiens chromosome 16 open reading frame 48, mRNA (cDNA clone MGC:10689 IMAGE:3638194), complete cds. // chr16 // 83 // 83 // 29 // 35 // 1 /// ENST00000602415 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:67663218:67666274:-1 gene:ENSG00000124074 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 37 // 37 // 13 // 35 // 1 /// GENSCAN00000020256 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:67663161:67666442:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 60 // 60 // 21 // 35 // 1
AF090894 // GenBank // Homo sapiens clone HQ0113 PRO0113 mRNA, complete cds. // chr16 // 95 // 100 // 19 // 20 // 0
NM_001129758 // RefSeq // Homo sapiens dipeptidase 3 (DPEP3), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NM_022357 // RefSeq // Homo sapiens dipeptidase 3 (DPEP3), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000268793 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:67975663:67980829:-1 gene:ENSG00000141096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000574342 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:67978573:67980508:-1 gene:ENSG00000141096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 40 // 16 // 16 // 0 /// AY358390 // GenBank // Homo sapiens clone DNA59817 QPTG834 (UNQ834) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// BC037243 // GenBank // Homo sapiens dipeptidase 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:5171919). // chr16 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// BC057789 // GenBank // Homo sapiens dipeptidase 3, mRNA (cDNA clone MGC:71629 IMAGE:5297958), complete cds. // chr16 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000020241 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:67975765:68005009:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0
ENST00000365466 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:68017710:68017817:-1 gene:ENSG00000202336 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT143210 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_018380 // RefSeq // Homo sapiens DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 28 (DDX28), mRNA. // chr16 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// ENST00000332395 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:68021274:68023442:-1 gene:ENSG00000182810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 96 // 82 // 22 // 23 // 0 /// BC024273 // GenBank // Homo sapiens DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 28, mRNA (cDNA clone MGC:39160 IMAGE:4130937), complete cds. // chr16 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000020248 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:68021580:68023202:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0
ENST00000364980 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:16:68089449:68089543:-1 gene:ENSG00000201850 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT143219 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_024939 // RefSeq // Homo sapiens epithelial splicing regulatory protein 2 (ESRP2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006721273 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens epithelial splicing regulatory protein 2 (ESRP2), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// XM_006721274 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens epithelial splicing regulatory protein 2 (ESRP2), transcript variant X4, mRNA. // chr16 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000251366 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:68229117:68236070:-1 gene:ENSG00000103067 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000473183 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:68229126:68236584:-1 gene:ENSG00000103067 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000565858 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:68229111:68236132:-1 gene:ENSG00000103067 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000566774 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:68229402:68232815:-1 gene:ENSG00000103067 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// BC030146 // GenBank // Homo sapiens epithelial splicing regulatory protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:23148 IMAGE:4810948), complete cds. // chr16 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC069241 // GenBank // Homo sapiens epithelial splicing regulatory protein 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:6429279). // chr16 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000020238 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:68222719:68236045:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// BC009172 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3689611, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr16 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0
NM_032178 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 7, member 6 opposite strand (SLC7A6OS), mRNA. // chr16 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000263997 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:68298035:68310945:-1 gene:ENSG00000103061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000561933 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:68298166:68310946:-1 gene:ENSG00000103061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK091674 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ34355 fis, clone FEBRA2012181. // chr16 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// AY078070 // GenBank // Homo sapiens proteinase-related protein mRNA, complete cds. // chr16 // 91 // 79 // 20 // 22 // 0 /// BC013778 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 7, member 6 opposite strand, mRNA (cDNA clone MGC:16850 IMAGE:4345035), complete cds. // chr16 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000561590 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:68302000:68304229:-1 gene:ENSG00000103061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// ENST00000568315 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:68284503:68304131:-1 gene:ENSG00000103061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// ENST00000619380 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:16:68301041:68310951:-1 gene:ENSG00000103061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 86 // 79 // 19 // 22 // 0 /// GENSCAN00000020254 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:68301275:68310926:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0
NONHSAT143260 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000410245 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:68329387:68329529:-1 gene:ENSG00000222177 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENST00000362393 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:16:68474553:68474664:-1 gene:ENSG00000199263 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT143272 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000363109 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:16:68885576:68885677:-1 gene:ENSG00000199979 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT143308 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000365627 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:69007052:69007155:-1 gene:ENSG00000202497 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONHSAT143312 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
ENST00000384355 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:69175671:69175777:-1 gene:ENSG00000207083 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000572460 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR16_2_CTG3_1:69175662:69175768:-1 gene:ENSG00000262579 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT143321 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_144676 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane emp24 protein transport domain containing 6 (TMED6), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000288025 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:69343248:69351809:-1 gene:ENSG00000157315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY358268 // GenBank // Homo sapiens clone DNA188160 SPLL9146 (UNQ9146) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC020827 // GenBank // Homo sapiens transmembrane emp24 protein transport domain containing 6, mRNA (cDNA clone MGC:23911 IMAGE:4766548), complete cds. // chr16 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000564737 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:69335301:69351730:-1 gene:ENSG00000259900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// ENST00000568748 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:69343489:69348409:-1 gene:ENSG00000157315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// ENST00000570293 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:69335276:69351729:-1 gene:ENSG00000259900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_005652 // RefSeq // Homo sapiens telomeric repeat binding factor 2 (TERF2), mRNA. // chr16 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000254942 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:69355561:69385988:-1 gene:ENSG00000132604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000566257 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:69367049:69384747:-1 gene:ENSG00000132604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000566750 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:16:69366935:69385570:-1 gene:ENSG00000132604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000567296 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:69370211:69385988:-1 gene:ENSG00000132604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000569280 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:69370534:69385733:-1 gene:ENSG00000132604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000569611 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:69368508:69385599:-1 gene:ENSG00000132604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// AF002999 // GenBank // Homo sapiens TTAGGG repeat binding factor 2 (hTRF2) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC024890 // GenBank // Homo sapiens telomeric repeat binding factor 2, mRNA (cDNA clone MGC:17060 IMAGE:4346819), complete cds. // chr16 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000037659 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:69366734:69385971:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0
NONHSAT143365 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_014062 // RefSeq // Homo sapiens NIN1/RPN12 binding protein 1 homolog (S. cerevisiae) (NOB1), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NR_074074 // RefSeq // Homo sapiens NIN1/RPN12 binding protein 1 homolog (S. cerevisiae) (NOB1), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr16 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000268802 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:69741867:69754940:-1 gene:ENSG00000141101 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000564620 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:69744903:69754914:-1 gene:ENSG00000141101 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000569871 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:69742576:69754924:-1 gene:ENSG00000141101 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0 /// AB026125 // GenBank // Homo sapiens ART-4 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// AY487344 // GenBank // Homo sapiens RNA-binding protein NOB1 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC064630 // GenBank // Homo sapiens NIN1/RPN12 binding protein 1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:75033 IMAGE:5740890), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000005663 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:69710976:69757557:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 75 // 75 // 12 // 16 // 1
ENST00000516634 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:16:69785994:69786113:-1 gene:ENSG00000252443 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr16 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONHSAT143372 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NR_003610 // RefSeq // Homo sapiens pyridoxal-dependent decarboxylase domain containing 2, pseudogene (PDXDC2P), non-coding RNA. // chr16 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000530079 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:69976352:70065853:-1 gene:ENSG00000196696 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000531894 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:69976297:70065948:-1 gene:ENSG00000196696 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0 /// BC063633 // GenBank // Homo sapiens pyridoxal-dependent decarboxylase domain containing 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:4403073). // chr16 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000532298 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:69976388:69996188:-1 gene:ENSG00000226232 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr16 // 100 // 50 // 5 // 5 // 0 /// GENSCAN00000005651 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:69979848:70079624:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 50 // 5 // 5 // 0
NONHSAT141598 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT141614 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT141732 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT143413 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT140860 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 52 // 100 // 11 // 21 // 0 /// NONHSAT140991 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 71 // 100 // 15 // 21 // 0 /// NONHSAT141035 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 71 // 100 // 15 // 21 // 0 /// NONHSAT141074 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 71 // 100 // 15 // 21 // 0
NM_058219 // RefSeq // Homo sapiens exosome component 6 (EXOSC6), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000435634 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:70246778:70251930:-1 gene:ENSG00000223496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC052252 // GenBank // Homo sapiens exosome component 6, mRNA (cDNA clone MGC:59978 IMAGE:6256140), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC039194 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4281687, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr16 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000005664 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:70222868:70251900:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
NM_001605 // RefSeq // Homo sapiens alanyl-tRNA synthetase (AARS), mRNA. // chr16 // 100 // 98 // 47 // 47 // 0 /// XM_006721153 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens alanyl-tRNA synthetase (AARS), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 75 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000261772 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:70252295:70289543:-1 gene:ENSG00000090861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENST00000565361 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:16:70254390:70262361:-1 gene:ENSG00000090861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 21 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000569825 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:70253456:70258215:-1 gene:ENSG00000090861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 25 // 12 // 12 // 0 /// AK222824 // GenBank // Homo sapiens mRNA for alanyl-tRNA synthetase variant, clone: HEP06614. // chr16 // 93 // 96 // 43 // 46 // 0 /// AK299098 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61339 complete cds, highly similar to Alanyl-tRNA synthetase (EC 6.1.1.7). // chr16 // 98 // 94 // 44 // 45 // 0 /// BC011451 // GenBank // Homo sapiens alanyl-tRNA synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:9334 IMAGE:3450606), complete cds. // chr16 // 98 // 96 // 45 // 46 // 0 /// D32050 // GenBank // Homo sapiens mRNA for alanyl-tRNA synthetase, complete cds. // chr16 // 98 // 98 // 46 // 47 // 0 /// ENST00000564359 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:70255735:70264985:-1 gene:ENSG00000090861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 17 // 17 // 8 // 48 // 1 /// GENSCAN00000005650 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:70252721:70282763:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0
NM_006927 // RefSeq // Homo sapiens ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 2 (ST3GAL2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000342907 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:16:70379435:70439088:-1 gene:ENSG00000157350 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000393640 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:70375978:70400638:-1 gene:ENSG00000157350 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000567822 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:70381574:70393759:-1 gene:ENSG00000157350 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// AK127322 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ45393 fis, clone BRHIP3027105, highly similar to CMP-N-acetylneuraminate-beta-galactosamide-alpha-2, 3-sialyltransferase (EC 2.4.99.-). // chr16 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC036777 // GenBank // Homo sapiens ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 2, mRNA (cDNA clone MGC:46129 IMAGE:5750330), complete cds. // chr16 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// U63090 // GenBank // Human Gal beta-1,3 GalNAc alpha-2,3 sialyltransferase (ST3Gal II) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000005661 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:70381689:70398530:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
NR_046488 // RefSeq // Homo sapiens RNA, U6 small nuclear 23, pseudogene (RNU6-23P), small nuclear RNA. // chr16 // 75 // 100 // 3 // 4 // 0 /// ENST00000363283 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:70445293:70445399:-1 gene:ENSG00000200153 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT143431 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_138383 // RefSeq // Homo sapiens metastasis suppressor 1-like (MTSS1L), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000338779 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:70661204:70686066:-1 gene:ENSG00000132613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000562883 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:16:70674320:70678339:-1 gene:ENSG00000132613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 21 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000576338 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:16:70676949:70680025:-1 gene:ENSG00000132613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 80 // 26 // 8 // 10 // 0 /// AB115770 // GenBank // Homo sapiens ABBA-1 mRNA for actin-bundling protein with BAIAP2 homology, complete cds. // chr16 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000616026 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:16:70663677:70685791:-1 gene:ENSG00000132613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000023414 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:70663677:70800900:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 95 // 95 // 37 // 39 // 1
NM_018052 // RefSeq // Homo sapiens Vac14 homolog (S. cerevisiae) (VAC14), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_005256038 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens Vac14 homolog (S. cerevisiae) (VAC14), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// XM_005256041 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens Vac14 homolog (S. cerevisiae) (VAC14), transcript variant X4, mRNA. // chr16 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000261776 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:70687439:70801161:-1 gene:ENSG00000103043 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000566655 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:70780798:70786427:-1 gene:ENSG00000103043 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 38 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000568548 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:70687441:70801160:-1 gene:ENSG00000103043 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000568886 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:70687439:70800982:-1 gene:ENSG00000103043 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// AK297564 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53136 complete cds, highly similar to Homo sapiens Vac14 homolog (VAC14), mRNA. // chr16 // 96 // 96 // 22 // 23 // 0 /// BC125108 // GenBank // Homo sapiens Vac14 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:149815 IMAGE:40118772), complete cds. // chr16 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// BC125109 // GenBank // Homo sapiens Vac14 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:149816 IMAGE:40118777), complete cds. // chr16 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000023414 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:70663677:70800900:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0
XM_005256038 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens Vac14 homolog (S. cerevisiae) (VAC14), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000571759 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:70687441:70691049:-1 gene:ENSG00000103043 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AK128439 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ46582 fis, clone THYMU3043327. // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT143440 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001270974 // RefSeq // Homo sapiens HYDIN, axonemal central pair apparatus protein (HYDIN), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000378856 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:70807495:70866297:-1 gene:ENSG00000157423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 98 // 47 // 47 // 0 /// ENST00000393567 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:16:70807378:71230689:-1 gene:ENSG00000157423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// BC043273 // GenBank // Homo sapiens hydrocephalus inducing homolog (mouse), mRNA (cDNA clone IMAGE:5297107), complete cds. // chr16 // 100 // 98 // 47 // 47 // 0 /// ENST00000614586 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:146547367:146898974:1 gene:ENSG00000276975 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr16 // 83 // 83 // 33 // 40 // 0 /// GENSCAN00000023409 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:70807580:70940326:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 88 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000026752 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:146520534:146881789:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 44 // 44 // 21 // 48 // 1
NM_001270974 // RefSeq // Homo sapiens HYDIN, axonemal central pair apparatus protein (HYDIN), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000309900 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:70893536:70973930:-1 gene:ENSG00000157423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000393567 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:16:70807378:71230689:-1 gene:ENSG00000157423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NR_103556 // RefSeq // Homo sapiens HYDIN2, axonemal central pair apparatus protein (pseudogene) (HYDIN2), non-coding RNA. // chr16 // 92 // 92 // 23 // 25 // 1 /// GENSCAN00000023409 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:70807580:70940326:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000026752 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:146520534:146881789:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// ENST00000614586 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:146547367:146898974:1 gene:ENSG00000276975 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr16 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1
NM_001270974 // RefSeq // Homo sapiens HYDIN, axonemal central pair apparatus protein (HYDIN), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// NR_103556 // RefSeq // Homo sapiens HYDIN2, axonemal central pair apparatus protein (pseudogene) (HYDIN2), non-coding RNA. // chr16 // 95 // 76 // 21 // 22 // 0 /// ENST00000309900 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:70893536:70973930:-1 gene:ENSG00000157423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000393567 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:16:70807378:71230689:-1 gene:ENSG00000157423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000543521 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:70941387:70974569:-1 gene:ENSG00000157423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AK027571 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ14665 fis, clone NT2RP2002891. // chr16 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// ENST00000614586 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:146547367:146898974:1 gene:ENSG00000276975 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr16 // 95 // 76 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000023405 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:70941601:71285920:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000026752 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:146520534:146881789:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 91 // 79 // 21 // 23 // 0
NM_001099642 // RefSeq // Homo sapiens cap methyltransferase 2 (CMTR2), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NM_018348 // RefSeq // Homo sapiens cap methyltransferase 2 (CMTR2), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000338099 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:71281389:71289609:-1 gene:ENSG00000180917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000434935 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:71282300:71289539:-1 gene:ENSG00000180917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AK002033 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ11171 fis, clone PLACE1007317, weakly similar to Drosophila melanogaster Adrift mRNA. // chr16 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// BC034468 // GenBank // Homo sapiens FtsJ methyltransferase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:26159 IMAGE:4824516), complete cds. // chr16 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// BC035005 // GenBank // Homo sapiens FtsJ methyltransferase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:33269 IMAGE:5267637), complete cds. // chr16 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000614452 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:16:71284890:71289501:-1 gene:ENSG00000180917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0
ENST00000566010 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:71575403:71577092:-1 gene:ENSG00000198650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 44 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000566094 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:71575078:71577092:-1 gene:ENSG00000198650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 28 // 10 // 10 // 0 /// BC020707 // GenBank // Homo sapiens tyrosine aminotransferase, mRNA (cDNA clone IMAGE:4710626), complete cds. // chr16 // 100 // 44 // 16 // 16 // 0 /// BC022292 // GenBank HTC // Homo sapiens tyrosine aminotransferase, mRNA (cDNA clone IMAGE:4734061), with apparent retained intron. // chr16 // 100 // 28 // 10 // 10 // 0 /// NM_000353 // RefSeq // Homo sapiens tyrosine aminotransferase (TAT), mRNA. // chr16 // 78 // 78 // 28 // 36 // 1 /// ENST00000355962 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:71565660:71577130:-1 gene:ENSG00000198650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 78 // 78 // 28 // 36 // 1 /// BC130534 // GenBank // Homo sapiens tyrosine aminotransferase, mRNA (cDNA clone MGC:163406 IMAGE:40146565), complete cds. // chr16 // 64 // 64 // 23 // 36 // 1 /// NONHSAT143495 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 100 // 44 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000033950 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:71568144:71576415:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 72 // 72 // 26 // 36 // 1
NR_033337 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 70D (SNORA70D), small nucleolar RNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000578836 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:16:71698567:71698701:-1 gene:ENSG00000263666 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT143501 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_181536 // RefSeq // Homo sapiens polycystic kidney disease 1-like 3 (PKD1L3), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// AY164485 // GenBank // Homo sapiens polycystic kidney disease 1-like 3 (PKD1L3) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000620267 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:71929538:71999978:-1 gene:ENSG00000277481 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000033928 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:71927915:72006693:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 97 // 75 // 29 // 30 // 0
NM_001164766 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger homeobox 3 (ZFHX3), transcript variant B, mRNA. // chr16 // 100 // 62 // 24 // 24 // 0 /// NM_006885 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger homeobox 3 (ZFHX3), transcript variant A, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000268489 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:72782885:73048375:-1 gene:ENSG00000140836 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000397992 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:72782885:73059698:-1 gene:ENSG00000140836 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 62 // 24 // 24 // 0 /// BC029653 // GenBank // Homo sapiens zinc finger homeobox 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:5103630), complete cds. // chr16 // 100 // 28 // 11 // 11 // 0 /// D10250 // GenBank // Homo sapiens mRNA for alpha-fetoprotein enhancer binding protein, complete cds. // chr16 // 100 // 62 // 24 // 24 // 0 /// L32832 // GenBank // Homo sapiens zinc finger homeodomain protein (ATBF1-A) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000002474 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:72931214:72962494:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 31 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000002487 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:72787164:72838659:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 56 // 22 // 22 // 0
NM_207385 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 16 open reading frame 47 (C16orf47), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000358463 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:73126637:73144447:-1 gene:ENSG00000197445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
ENST00000484897 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:73940639:73941524:-1 gene:ENSG00000225178 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000007135 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:73941192:73941524:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENST00000384794 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:16:74463888:74463988:-1 gene:ENSG00000207525 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT143695 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000604681 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:74612596:74613221:-1 gene:ENSG00000270945 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr16 // 89 // 100 // 16 // 18 // 0 /// NONHSAT143697 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 89 // 100 // 16 // 18 // 0
ENST00000562145 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:74712955:74717106:-1 gene:ENSG00000103089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000567683 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:74713598:74774831:-1 gene:ENSG00000103089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// AK303878 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52926 complete cds, highly similar to Homo sapiens fatty acid 2-hydroxylase (FA2H), mRNA. // chr16 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// BC010453 // GenBank HTC // Homo sapiens fatty acid 2-hydroxylase, mRNA (cDNA clone IMAGE:4157042), with apparent retained intron. // chr16 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// NM_024306 // RefSeq // Homo sapiens fatty acid 2-hydroxylase (FA2H), mRNA. // chr16 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// ENST00000219368 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:16:74712955:74774825:-1 gene:ENSG00000103089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// BC002679 // GenBank // Homo sapiens fatty acid 2-hydroxylase, mRNA (cDNA clone MGC:4282 IMAGE:3610614), complete cds. // chr16 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// BC004263 // GenBank // Homo sapiens fatty acid 2-hydroxylase, mRNA (cDNA clone MGC:10804 IMAGE:3611279), complete cds. // chr16 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// BC017049 // GenBank // Homo sapiens fatty acid 2-hydroxylase, mRNA (cDNA clone MGC:9239 IMAGE:3850399), complete cds. // chr16 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// GENSCAN00000026659 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:16:74695248:74774755:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1