NM_080608 // RefSeq // Homo sapiens spermatogenesis associated 25 (SPATA25), mRNA. // chr20 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// XM_005260271 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens spermatogenesis associated 25 (SPATA25), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000372519 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:45886489:45887635:-1 gene:ENSG00000149634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC039607 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 165, mRNA (cDNA clone MGC:48936 IMAGE:5167905), complete cds. // chr20 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0
NM_001278535 // RefSeq // Homo sapiens neuralized E3 ubiquitin protein ligase 2 (NEURL2), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NM_080749 // RefSeq // Homo sapiens neuralized E3 ubiquitin protein ligase 2 (NEURL2), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000372518 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:45888634:45891287:-1 gene:ENSG00000124257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000545238 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:20:45888625:45890476:-1 gene:ENSG00000124257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// BC074737 // GenBank // Homo sapiens neuralized homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:103813 IMAGE:30915194), complete cds. // chr20 // 93 // 52 // 14 // 15 // 0 /// BC105935 // GenBank // Homo sapiens neuralized homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:125935 IMAGE:40031539), complete cds. // chr20 // 87 // 79 // 20 // 23 // 0 /// BC107485 // GenBank // Homo sapiens neuralized homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:125934 IMAGE:40031537), complete cds. // chr20 // 87 // 79 // 20 // 23 // 0 /// GENSCAN00000021779 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:45888758:45890991:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0
NM_022095 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 335 (ZNF335), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000322927 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:45948653:45972172:-1 gene:ENSG00000198026 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AF395833 // GenBank // Homo sapiens zinc-finger/leucine-zipper co-transducer NIF1 mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AK122963 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ16685 fis, clone TRACH2024293, moderately similar to Gallus gallus zinc finger protein (Fzf-1). // chr20 // 100 // 37 // 14 // 14 // 0 /// AK296989 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56899 complete cds, highly similar to Zinc finger protein 335. // chr20 // 97 // 87 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000021762 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:45948953:46000441:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0
NM_020967 // RefSeq // Homo sapiens nuclear receptor coactivator 5 (NCOA5), mRNA. // chr20 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000290231 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:46060985:46089952:-1 gene:ENSG00000124160 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// AB046857 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1637 protein, partial cds. // chr20 // 100 // 58 // 22 // 22 // 0 /// AF470686 // GenBank // Homo sapiens estrogen receptor coactivator (CIA) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// BC140836 // GenBank // Homo sapiens nuclear receptor coactivator 5, mRNA (cDNA clone MGC:176513 IMAGE:9021704), complete cds. // chr20 // 100 // 82 // 31 // 31 // 0 /// BC151133 // GenBank // Homo sapiens nuclear receptor coactivator 5, mRNA (cDNA clone MGC:184045 IMAGE:9057033), complete cds. // chr20 // 100 // 82 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000372291 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:46067055:46089952:-1 gene:ENSG00000124160 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 42 // 42 // 16 // 38 // 1 /// GENSCAN00000021760 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:46062300:46073830:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 58 // 22 // 22 // 0
NM_021248 // RefSeq // Homo sapiens cadherin 22, type 2 (CDH22), mRNA. // chr20 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000372262 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:46173733:46251695:-1 gene:ENSG00000149654 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000537909 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:20:46173734:46308498:-1 gene:ENSG00000149654 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// AK289584 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76999 complete cds, highly similar to Homo sapiens cadherin-like 22 (CDH22), mRNA. // chr20 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// BC136526 // GenBank // Homo sapiens cadherin-like 22, mRNA (cDNA clone MGC:168139 IMAGE:9020516), complete cds. // chr20 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000021774 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:46174506:46251294:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0
NR_045983 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 663, pseudogene (ZNF663P), non-coding RNA. // chr20 // 88 // 50 // 15 // 17 // 0 /// ENST00000400371 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:46414228:46459276:-1 gene:ENSG00000215452 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr20 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000472805 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:46455587:46457085:-1 gene:ENSG00000215452 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:unitary_pseudogene // chr20 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// AL831934 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp547G0215 (from clone DKFZp547G0215). // chr20 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC100775 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:40000317. // chr20 // 88 // 50 // 15 // 17 // 0 /// NONHSAT080016 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr20 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NM_080721 // RefSeq // Homo sapiens osteoclast stimulatory transmembrane protein (OCSTAMP), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000279028 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:46540946:46550574:-1 gene:ENSG00000149635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000021761 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:46501296:46546127:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_033550 // RefSeq // Homo sapiens TP53 regulating kinase (TP53RK), mRNA. // chr20 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000372102 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:46685534:46689440:-1 gene:ENSG00000172315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000372114 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:46684365:46689779:-1 gene:ENSG00000172315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AB017505 // GenBank // Homo sapiens mRNA for Nori-2p, complete cds. // chr20 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// AB065434 // GenBank // Homo sapiens prpk mRNA for PRPK mutant1, complete cds. // chr20 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// BC009727 // GenBank // Homo sapiens TP53 regulating kinase, mRNA (cDNA clone MGC:9600 IMAGE:3899629), complete cds. // chr20 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// BC019621 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3461030, containing frame-shift errors. // chr20 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// BC066309 // GenBank // Homo sapiens TP53 regulating kinase, mRNA (cDNA clone MGC:87135 IMAGE:5277911), complete cds. // chr20 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000033389 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:46640210:46689414:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1
ENST00000365316 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:47484278:47484381:-1 gene:ENSG00000202186 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr20 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT080067 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
ENST00000364872 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:47492978:47493085:-1 gene:ENSG00000201742 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT080069 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_020820 // RefSeq // Homo sapiens phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchange factor 1 (PREX1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 52 // 52 // 0 /// ENST00000371941 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:48624252:48827883:-1 gene:ENSG00000124126 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 52 // 52 // 0 /// ENST00000482556 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:48624252:48657127:-1 gene:ENSG00000124126 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr20 // 100 // 63 // 33 // 33 // 0 /// AL136579 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp761D0724 (from clone DKFZp761D0724). // chr20 // 100 // 56 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000041758 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:48625885:48827860:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 85 // 44 // 44 // 0
NM_004975 // RefSeq // Homo sapiens potassium voltage-gated channel, Shab-related subfamily, member 1 (KCNB1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000371741 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:49363877:49482647:-1 gene:ENSG00000158445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF026005 // GenBank // Homo sapiens delayed rectifier potassium channel Kv2.1 (DRK1) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// L02840 // GenBank // Homo sapiens potassium channel Kv2.1 mRNA, complete cds. // chr20 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000041757 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:49372983:49482480:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
NM_000961 // RefSeq // Homo sapiens prostaglandin I2 (prostacyclin) synthase (PTGIS), mRNA. // chr20 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000244043 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:49503874:49568146:-1 gene:ENSG00000124212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000478971 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:49507901:49568116:-1 gene:ENSG00000124212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr20 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// AF297048 // GenBank // Homo sapiens prostacyclin synthase (CYP8A1) mRNA, CYP8A1*1B allele, complete cds. // chr20 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// AF297049 // GenBank // Homo sapiens prostacyclin synthase (CYP8A1) mRNA, CYP8A1*1C allele, complete cds. // chr20 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// AF297050 // GenBank // Homo sapiens prostacyclin synthase (CYP8A1) mRNA, CYP8A1*2 allele, complete cds. // chr20 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// AF297051 // GenBank // Homo sapiens prostacyclin synthase (CYP8A1) mRNA, CYP8A1*3 allele, complete cds. // chr20 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// AF297052 // GenBank // Homo sapiens prostacyclin synthase (CYP8A1) mRNA, CYP8A1*4 allele, complete cds. // chr20 // 95 // 74 // 19 // 20 // 0 /// BC101809 // GenBank // Homo sapiens prostaglandin I2 (prostacyclin) synthase, mRNA (cDNA clone MGC:126858 IMAGE:8069315), complete cds. // chr20 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC101811 // GenBank // Homo sapiens prostaglandin I2 (prostacyclin) synthase, mRNA (cDNA clone MGC:126860 IMAGE:8069317), complete cds. // chr20 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// D38145 // GenBank // Homo sapiens PTGIS mRNA for prostacyclin synthase, complete cds. // chr20 // 95 // 78 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000041760 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:49507920:49568116:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0
NM_004776 // RefSeq // Homo sapiens UDP-Gal:betaGlcNAc beta 1,4- galactosyltransferase, polypeptide 5 (B4GALT5), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000371711 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:49632945:49713878:-1 gene:ENSG00000158470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AB004550 // GenBank // Homo sapiens mRNA for beta-1,4-galactosyltransferase (beta-1,4-GalT) V, complete cds. // chr20 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// AF038663 // GenBank // Homo sapiens beta-1,4-galactosyltransferase mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// BC074821 // GenBank // Homo sapiens UDP-Gal:betaGlcNAc beta 1,4- galactosyltransferase, polypeptide 5, mRNA (cDNA clone MGC:104086 IMAGE:30915537), complete cds. // chr20 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// BC074873 // GenBank // Homo sapiens UDP-Gal:betaGlcNAc beta 1,4- galactosyltransferase, polypeptide 5, mRNA (cDNA clone MGC:103852 IMAGE:30915234), complete cds. // chr20 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// BC104987 // GenBank // Homo sapiens UDP-Gal:betaGlcNAc beta 1,4- galactosyltransferase, polypeptide 5, mRNA (cDNA clone MGC:132647 IMAGE:8143990), complete cds. // chr20 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// BC112265 // GenBank // Homo sapiens UDP-Gal:betaGlcNAc beta 1,4- galactosyltransferase, polypeptide 5, mRNA (cDNA clone MGC:138470 IMAGE:8327733), complete cds. // chr20 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000017790 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:49636312:49713690:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0
NM_001135773 // RefSeq // Homo sapiens spermatogenesis associated 2 (SPATA2), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NM_006038 // RefSeq // Homo sapiens spermatogenesis associated 2 (SPATA2), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000289431 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:49903391:49915508:-1 gene:ENSG00000158480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000422556 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:20:49903394:49913739:-1 gene:ENSG00000158480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AK289644 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78311 complete cds, highly similar to Homo sapiens spermatogenesis associated 2 (SPATA2), mRNA. // chr20 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// BC009481 // GenBank // Homo sapiens spermatogenesis associated 2, mRNA (cDNA clone MGC:15312 IMAGE:3953522), complete cds. // chr20 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// U28164 // GenBank // Homo sapiens spermatogenesis associated PD1 mRNA, complete cds. // chr20 // 95 // 70 // 20 // 21 // 0 /// AK295536 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50158 complete cds, highly similar to Spermatogenesis-associated protein 2. // chr20 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1 /// GENSCAN00000017792 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:49905619:49915897:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0
ENST00000362620 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:49920597:49920694:-1 gene:ENSG00000199490 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT080243 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONHSAT080244 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000497504 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:50429190:50429483:-1 gene:ENSG00000244376 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr20 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT080301 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr20 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENST00000474091 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:50557682:50557998:-1 gene:ENSG00000239742 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr20 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT080305 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr20 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_002237 // RefSeq // Homo sapiens potassium voltage-gated channel, subfamily G, member 1 (KCNG1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000371571 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:51003656:51023129:-1 gene:ENSG00000026559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AF033383 // GenBank // Homo sapiens potassium channel mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// AK290689 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76129 complete cds, highly similar to Homo sapiens potassium voltage-gated channel, subfamily G, member 1 (KCNG1), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC046629 // GenBank // Homo sapiens potassium voltage-gated channel, subfamily G, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:41883 IMAGE:5287759), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000506387 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:51003657:51008040:-1 gene:ENSG00000026559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr20 // 71 // 71 // 17 // 24 // 1 /// AK128721 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ46888 fis, clone UTERU3017626, highly similar to Homo sapiens potassium voltage-gated channel, subfamily G, member 1 (KCNG1). // chr20 // 71 // 71 // 17 // 24 // 1 /// GENSCAN00000024125 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:51004039:51010338:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0
ENST00000424171 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:51009797:51023094:-1 gene:ENSG00000026559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 52 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000433903 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:51010049:51023081:-1 gene:ENSG00000026559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 94 // 55 // 17 // 18 // 0 /// ENST00000439216 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:51009565:51023107:-1 gene:ENSG00000026559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 52 // 17 // 17 // 0 /// BC006367 // GenBank // Homo sapiens potassium voltage-gated channel, subfamily G, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:12878 IMAGE:4131541), complete cds. // chr20 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// NM_002237 // RefSeq // Homo sapiens potassium voltage-gated channel, subfamily G, member 1 (KCNG1), mRNA. // chr20 // 39 // 39 // 13 // 33 // 1 /// ENST00000371571 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:51003656:51023129:-1 gene:ENSG00000026559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 39 // 39 // 13 // 33 // 1 /// AK290689 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76129 complete cds, highly similar to Homo sapiens potassium voltage-gated channel, subfamily G, member 1 (KCNG1), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 39 // 39 // 13 // 33 // 1 /// BC046629 // GenBank // Homo sapiens potassium voltage-gated channel, subfamily G, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:41883 IMAGE:5287759), complete cds. // chr20 // 39 // 39 // 13 // 33 // 1 /// ENST00000447736 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:51010195:51014108:-1 gene:ENSG00000026559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
NM_006045 // RefSeq // Homo sapiens ATPase, class II, type 9A (ATP9A), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000311637 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:51596514:51768328:-1 gene:ENSG00000054793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 84 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000338821 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:51596514:51768634:-1 gene:ENSG00000054793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// AK299064 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60816 complete cds, highly similar to Probable phospholipid-transporting ATPase IIA (EC 3.6.3.1). // chr20 // 97 // 80 // 34 // 35 // 0 /// GENSCAN00000011985 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:51562413:51701686:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 70 // 70 // 31 // 44 // 1
NM_020436 // RefSeq // Homo sapiens spalt-like transcription factor 4 (SALL4), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006723834 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens spalt-like transcription factor 4 (SALL4), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000217086 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:51784042:51802520:-1 gene:ENSG00000101115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY172738 // GenBank // Homo sapiens SALL4A protein mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC111714 // GenBank // Homo sapiens sal-like 4 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:133050 IMAGE:40008661), complete cds. // chr20 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000371539 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:20:51784046:51802509:-1 gene:ENSG00000101115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// ENST00000395997 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:20:51784265:51802475:-1 gene:ENSG00000101115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// AY170621 // GenBank // Homo sapiens SALL4B mRNA, complete cds. // chr20 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// GENSCAN00000011995 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:51784265:51802408:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_006526 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 217 (ZNF217), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000302342 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:20:53567073:53583097:-1 gene:ENSG00000171940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000371471 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:53567065:53593839:-1 gene:ENSG00000171940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF041259 // GenBank // Homo sapiens breast cancer putative transcription factor (ZABC1) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AK290350 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77047 partial cds, highly similar to Homo sapiens zinc finger protein 217 (ZNF217), mRNA. // chr20 // 91 // 79 // 21 // 23 // 0 /// BC113427 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 217, mRNA (cDNA clone MGC:141987 IMAGE:8322479), complete cds. // chr20 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005510 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:53575716:53582802:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0
NR_002189 // RefSeq // Homo sapiens SUMO1 pseudogene 1 (SUMO1P1), non-coding RNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001128915 // RefSeq // Homo sapiens cytochrome P450, family 24, subfamily A, polypeptide 1 (CYP24A1), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000395954 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:20:54154713:54171953:-1 gene:ENSG00000019186 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000395955 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:54153962:54173649:-1 gene:ENSG00000019186 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// AY858838 // GenBank // Homo sapiens vitamin D 24-hydroxylase splice variant (CYP24) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr20 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// BC109083 // GenBank // Homo sapiens cytochrome P450, family 24, subfamily A, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:126273 IMAGE:40034385), complete cds. // chr20 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// BC109084 // GenBank // Homo sapiens cytochrome P450, family 24, subfamily A, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:126274 IMAGE:40034387), complete cds. // chr20 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// L13286 // GenBank // Human mitochondrial 1,25-dihydroxyvitamin D3 24-hydroxylase mRNA, complete cds. // chr20 // 91 // 100 // 31 // 34 // 0 /// NM_000782 // RefSeq // Homo sapiens cytochrome P450, family 24, subfamily A, polypeptide 1 (CYP24A1), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 34 // 34 // 1 /// ENST00000216862 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:54153449:54173973:-1 gene:ENSG00000019186 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 34 // 34 // 1 /// GENSCAN00000005521 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:54157179:54180041:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0
ENST00000516280 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:54859688:54859812:-1 gene:ENSG00000252089 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT080424 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_080617 // RefSeq // Homo sapiens cerebellin 4 precursor (CBLN4), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006723704 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens cerebellin 4 precursor (CBLN4), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 86 // 47 // 12 // 14 // 0 /// ENST00000064571 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:55997440:56005472:-1 gene:ENSG00000054803 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK289640 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77003 complete cds, highly similar to Homo sapiens cerebellin 4 precursor (CBLN4), mRNA. // chr20 // 88 // 83 // 22 // 25 // 0 /// AY358527 // GenBank // Homo sapiens clone DNA66526 GSGR718 (UNQ718) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC050026 // GenBank // Homo sapiens cerebellin 4 precursor, mRNA (cDNA clone MGC:42375 IMAGE:4820943), complete cds. // chr20 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// BC069402 // GenBank // Homo sapiens cerebellin 4 precursor, mRNA (cDNA clone MGC:96961 IMAGE:7262170), complete cds. // chr20 // 94 // 53 // 15 // 16 // 0 /// BC069488 // GenBank // Homo sapiens cerebellin 4 precursor, mRNA (cDNA clone MGC:96973 IMAGE:7262182), complete cds. // chr20 // 94 // 53 // 15 // 16 // 0 /// BC069516 // GenBank // Homo sapiens cerebellin 4 precursor, mRNA (cDNA clone MGC:96890 IMAGE:7262099), complete cds. // chr20 // 94 // 53 // 15 // 16 // 0
ENST00000410186 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:56205052:56205173:-1 gene:ENSG00000222118 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT080443 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_080615 // RefSeq // Homo sapiens glucosaminyl (N-acetyl) transferase family member 7 (GCNT7), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000243913 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:20:56491492:56525925:-1 gene:ENSG00000124091 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000617620 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:20:56491492:56497608:-1 gene:ENSG00000124091 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039377 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:56491557:56505035:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0
ENST00000384429 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:56785981:56786087:-1 gene:ENSG00000207158 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr20 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONHSAT080475 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
ENST00000417346 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:57384160:57393062:-1 gene:ENSG00000218018 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK096426 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39107 fis, clone NTONG2005062. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT080504 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT080505 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr20 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
ENST00000522557 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:57488392:57489027:-1 gene:ENSG00000124097 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr20 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC137482 // GenBank // Homo sapiens high-mobility group box 1-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:169105 IMAGE:9021482), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC137483 // GenBank // Homo sapiens high-mobility group box 1-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:169106 IMAGE:9021483), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000018642 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:57488392:57489027:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
XM_006723895 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ankyrin repeat domain 60 (ANKRD60), mRNA. // chr20 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000457363 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:58218495:58228653:-1 gene:ENSG00000124227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000020802 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:58218495:58228653:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_153360 // RefSeq // Homo sapiens adenomatosis polyposis coli down-regulated 1-like (APCDD1L), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000371149 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:58459101:58514938:-1 gene:ENSG00000198768 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AK293299 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59663 complete cds, moderately similar to Protein APCDD1 precursor. // chr20 // 97 // 88 // 29 // 30 // 0 /// BC101758 // GenBank // Homo sapiens adenomatosis polyposis coli down-regulated 1-like, mRNA (cDNA clone MGC:126807 IMAGE:8069264), complete cds. // chr20 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// BC101760 // GenBank // Homo sapiens adenomatosis polyposis coli down-regulated 1-like, mRNA (cDNA clone MGC:126809 IMAGE:8069266), complete cds. // chr20 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000425773 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:20:58467640:58515131:-1 gene:ENSG00000198768 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 44 // 44 // 15 // 34 // 1 /// GENSCAN00000020814 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:58460790:58481863:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 53 // 18 // 18 // 0
NR_029844 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 296 (MIR296), microRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000385215 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:58817615:58817694:-1 gene:ENSG00000276373 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA gene:ENSG00000268649 // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000596276 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:58817132:58817725:-1 gene:ENSG00000268649 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-296 // miRBase Micro RNA Database // MI0000747 Homo sapiens miR-296 stem-loop // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT080575 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT080576 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT080577 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_006886 // RefSeq // Homo sapiens ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial F1 complex, epsilon subunit (ATP5E), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000243997 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:59025467:59032382:-1 gene:ENSG00000124172 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000395659 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:59028678:59032345:-1 gene:ENSG00000124172 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 94 // 15 // 15 // 0 /// AF052955 // GenBank // Homo sapiens F1-ATPase epsilon-subunit (ATP5E) mRNA, complete cds; nuclear gene for mitochondrial product. // chr20 // 100 // 94 // 15 // 15 // 0 /// AK026556 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ22903 fis, clone KAT05624. // chr20 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0 /// BC001690 // GenBank // Homo sapiens ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial F1 complex, epsilon subunit, mRNA (cDNA clone MGC:1243 IMAGE:2988582), complete cds. // chr20 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// BC003671 // GenBank // Homo sapiens ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial F1 complex, epsilon subunit, mRNA (cDNA clone MGC:12246 IMAGE:4052063), complete cds. // chr20 // 100 // 69 // 11 // 11 // 0 /// BC105811 // GenBank // Homo sapiens ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial F1 complex, epsilon subunit, mRNA (cDNA clone MGC:104243 IMAGE:6739745), complete cds. // chr20 // 100 // 94 // 15 // 15 // 0 /// NR_037929 // RefSeq // Homo sapiens SLMO2-ATP5E readthrough (SLMO2-ATP5E), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr20 // 63 // 63 // 10 // 16 // 1 /// NR_037930 // RefSeq // Homo sapiens SLMO2-ATP5E readthrough (SLMO2-ATP5E), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr20 // 63 // 63 // 10 // 16 // 1 /// NONHSAT080611 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr20 // 63 // 63 // 10 // 16 // 1
NM_001256403 // RefSeq // Homo sapiens slowmo homolog 2 (Drosophila) (SLMO2), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NM_016045 // RefSeq // Homo sapiens slowmo homolog 2 (Drosophila) (SLMO2), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NR_037929 // RefSeq // Homo sapiens SLMO2-ATP5E readthrough (SLMO2-ATP5E), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr20 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000355937 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:59033145:59042909:-1 gene:ENSG00000101166 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000371033 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:20:59034634:59042805:-1 gene:ENSG00000101166 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000463057 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:59034909:59042732:-1 gene:ENSG00000101166 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr20 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// AF151865 // GenBank // Homo sapiens CGI-107 protein mRNA, complete cds. // chr20 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// AK298135 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55117 complete cds. // chr20 // 94 // 61 // 16 // 17 // 0 /// BC010649 // GenBank // Homo sapiens slowmo homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:8785 IMAGE:3873112), complete cds. // chr20 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// BC013969 // GenBank // Homo sapiens slowmo homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:3361 IMAGE:3631601), complete cds. // chr20 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// NR_037930 // RefSeq // Homo sapiens SLMO2-ATP5E readthrough (SLMO2-ATP5E), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr20 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// NONHSAT080611 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr20 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0
ENST00000485427 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:59460619:59460837:-1 gene:ENSG00000233686 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr20 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000028216 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:59342380:59470849:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 77 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT080619 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr20 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0
NM_014258 // RefSeq // Homo sapiens synaptonemal complex protein 2 (SYCP2), mRNA. // chr20 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// XM_006723681 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens synaptonemal complex protein 2 (SYCP2), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 51 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000357552 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:59863563:59933655:-1 gene:ENSG00000196074 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 49 // 49 // 0 /// ENST00000371001 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:20:59863564:59932154:-1 gene:ENSG00000196074 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// ENST00000412613 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:20:59864337:59868880:-1 gene:ENSG00000196074 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 20 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000446834 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:59877464:59933361:-1 gene:ENSG00000196074 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 63 // 31 // 31 // 0 /// BC040566 // GenBank // Homo sapiens synaptonemal complex protein 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:5267059), partial cds. // chr20 // 100 // 63 // 31 // 31 // 0 /// BC132864 // GenBank // Homo sapiens synaptonemal complex protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:164495 IMAGE:40146886), complete cds. // chr20 // 100 // 94 // 46 // 46 // 0 /// BC132870 // GenBank // Homo sapiens synaptonemal complex protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:164501 IMAGE:40146892), complete cds. // chr20 // 100 // 94 // 46 // 46 // 0 /// AK308889 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ98930. // chr20 // 31 // 31 // 15 // 49 // 1 /// GENSCAN00000002194 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:59864311:59933274:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 18 // 9 // 9 // 0
NM_006242 // RefSeq // Homo sapiens protein phosphatase 1, regulatory subunit 3D (PPP1R3D), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000370996 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:59936668:59940297:-1 gene:ENSG00000132825 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC047502 // GenBank // Homo sapiens protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 3D, mRNA (cDNA clone MGC:48529 IMAGE:5312727), complete cds. // chr20 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// BC074860 // GenBank // Homo sapiens protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 3D, mRNA (cDNA clone MGC:103845 IMAGE:30915227), complete cds. // chr20 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// BC074861 // GenBank // Homo sapiens protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 3D, mRNA (cDNA clone MGC:104020 IMAGE:30915464), complete cds. // chr20 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000002197 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:59939032:59939931:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0
ENST00000317652 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:61717506:61719748:-1 gene:ENSG00000179253 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK097866 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ40547 fis, clone THYMU2001819. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_003185 // RefSeq // Homo sapiens TAF4 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor, 135kDa (TAF4), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000252996 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:61974798:62065810:-1 gene:ENSG00000130699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000436129 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:61975357:62008187:-1 gene:ENSG00000130699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr20 // 100 // 53 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000488539 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:20:62000568:62007561:-1 gene:ENSG00000130699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// AK123937 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ41943 fis, clone PERIC2009566, highly similar to TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR TFIID 135 KDA SUBUNIT. // chr20 // 100 // 53 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT080700 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr20 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000036649 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:61979380:62015117:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 50 // 50 // 17 // 34 // 1 /// GENSCAN00000017312 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR20_1_CTG2:61976272:62004546:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1 /// GENSCAN00000036662 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:62064362:62106260:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1
AF172328 // GenBank // Homo sapiens clone hft005 unknown mRNA, complete cds. // chr20 // 83 // 100 // 20 // 24 // 0 /// NONHSAT080708 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr20 // 83 // 100 // 20 // 24 // 0
NM_005560 // RefSeq // Homo sapiens laminin, alpha 5 (LAMA5), mRNA. // chr20 // 100 // 98 // 96 // 96 // 0 /// XM_006723798 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens laminin, alpha 5 (LAMA5), transcript variant X3, mRNA. // chr20 // 100 // 59 // 58 // 58 // 0 /// ENST00000252999 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:62309065:62367312:-1 gene:ENSG00000130702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 98 // 96 // 96 // 0 /// ENST00000370677 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:62345414:62367270:-1 gene:ENSG00000130702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr20 // 100 // 14 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000370691 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:62309059:62314879:-1 gene:ENSG00000130702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr20 // 100 // 28 // 27 // 27 // 0 /// AF443072 // GenBank // Homo sapiens laminin alpha5 chain precursor, mRNA, complete cds. // chr20 // 96 // 97 // 91 // 95 // 0 /// BC003355 // GenBank HTC // Homo sapiens laminin, alpha 5, mRNA (cDNA clone IMAGE:2900097), with apparent retained intron. // chr20 // 100 // 28 // 27 // 27 // 0 /// BC015386 // GenBank HTC // Homo sapiens laminin, alpha 5, mRNA (cDNA clone IMAGE:4393304), with apparent retained intron. // chr20 // 100 // 14 // 14 // 14 // 0 /// BC085017 // GenBank // Homo sapiens laminin, alpha 5, mRNA (cDNA clone IMAGE:6651170), complete cds. // chr20 // 94 // 16 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000036659 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:62309336:62368349:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 89 // 87 // 87 // 0
NM_031215 // RefSeq // Homo sapiens Cdk5 and Abl enzyme substrate 2 (CABLES2), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000279101 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:62388632:62407285:-1 gene:ENSG00000149679 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000453274 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:62391014:62396331:-1 gene:ENSG00000149679 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000036642 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:62390971:62407276:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 92 // 92 // 23 // 25 // 1
NM_080833 // RefSeq // Homo sapiens RBBP8 N-terminal like (RBBP8NL), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000252998 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:62410237:62427533:-1 gene:ENSG00000130701 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// AK290299 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77972 complete cds. // chr20 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// BC137326 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 151, mRNA (cDNA clone MGC:168947 IMAGE:9021324), complete cds. // chr20 // 95 // 90 // 36 // 38 // 0 /// BC137327 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 151, mRNA (cDNA clone MGC:168948 IMAGE:9021325), complete cds. // chr20 // 95 // 90 // 36 // 38 // 0 /// AK128718 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ46885 fis, clone UTERU3016274. // chr20 // 50 // 50 // 21 // 42 // 1 /// GENSCAN00000036673 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:62410254:62419647:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 69 // 29 // 29 // 0
NM_080473 // RefSeq // Homo sapiens GATA binding protein 5 (GATA5), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000252997 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:62463497:62475970:-1 gene:ENSG00000130700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC047790 // GenBank // Homo sapiens GATA binding protein 5, mRNA (cDNA clone IMAGE:6464800), partial cds. // chr20 // 88 // 100 // 29 // 33 // 0 /// BC117356 // GenBank // Homo sapiens GATA binding protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:150965 IMAGE:40125907), complete cds. // chr20 // 86 // 64 // 18 // 21 // 0 /// BC117358 // GenBank // Homo sapiens GATA binding protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:150967 IMAGE:40125909), complete cds. // chr20 // 86 // 64 // 18 // 21 // 0 /// GENSCAN00000050075 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:62462231:62488607:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1
ENST00000370520 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:62640719:62643304:-1 gene:ENSG00000167046 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK056716 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ32154 fis, clone PLACE6000070. // chr20 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0
NR_024470 // RefSeq // Homo sapiens SLCO4A1 antisense RNA 1 (SLCO4A1-AS1), long non-coding RNA. // chr20 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000433126 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:62663031:62666622:-1 gene:ENSG00000232803 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr20 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000411824 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:62663019:62666724:-1 gene:ENSG00000232803 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr20 // 50 // 50 // 11 // 22 // 1 /// NONHSAT080773 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr20 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT080772 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr20 // 50 // 50 // 11 // 22 // 1
ENST00000435412 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:62695024:62700480:-1 gene:ENSG00000237687 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr20 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONHSAT080776 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr20 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0
ENST00000217162 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:20:62845138:62861763:-1 gene:ENSG00000101190 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// AF070992 // GenBank // Homo sapiens HPV-16 E2 binding protein (E2BP-1) mRNA, complete cds. // chr20 // 95 // 78 // 20 // 21 // 0 /// BC046933 // GenBank // Homo sapiens transcription factor-like 5 (basic helix-loop-helix), mRNA (cDNA clone MGC:46135 IMAGE:5549053), complete cds. // chr20 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// NM_006602 // RefSeq // Homo sapiens transcription factor-like 5 (basic helix-loop-helix) (TCFL5), mRNA. // chr20 // 93 // 93 // 25 // 27 // 1 /// ENST00000335351 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:62841115:62861763:-1 gene:ENSG00000101190 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 93 // 93 // 25 // 27 // 1 /// AB012124 // GenBank // Homo sapiens TCFL5 mRNA for transcription factor-like 5, complete cds. // chr20 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// BC065520 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5787400, partial cds. // chr20 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1 /// AJ271337 // GenBank // Homo sapiens partial mRNA for cha transcription factor (Cha gene). // chr20 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// GENSCAN00000050077 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:62852880:62861670:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0
NM_080606 // RefSeq // Homo sapiens basic helix-loop-helix family, member e23 (BHLHE23), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000370346 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:20:63005979:63007035:-1 gene:ENSG00000125533 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC137288 // GenBank // Homo sapiens basic helix-loop-helix family, member e23, mRNA (cDNA clone MGC:168908 IMAGE:9021285), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC137308 // GenBank // Homo sapiens basic helix-loop-helix family, member e23, mRNA (cDNA clone MGC:168928 IMAGE:9021305), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000612929 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:63005927:63007035:-1 gene:ENSG00000125533 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000050112 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:63000915:63021933:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
NM_017798 // RefSeq // Homo sapiens YTH domain family, member 1 (YTHDF1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000370339 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:63195429:63216234:-1 gene:ENSG00000149658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK300073 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58619 complete cds, highly similar to YTH domain protein 1. // chr20 // 86 // 58 // 12 // 14 // 0 /// BC050284 // GenBank // Homo sapiens YTH domain family, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:41808 IMAGE:5298438), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000370334 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:20:63196367:63216139:-1 gene:ENSG00000149658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1 /// GENSCAN00000050101 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:63202209:63215293:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 42 // 10 // 10 // 0
NM_001958 // RefSeq // Homo sapiens eukaryotic translation elongation factor 1 alpha 2 (EEF1A2), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000217182 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:20:63488013:63499315:-1 gene:ENSG00000101210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000298049 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:63488013:63497834:-1 gene:ENSG00000101210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC000432 // GenBank // Homo sapiens eukaryotic translation elongation factor 1 alpha 2, mRNA (cDNA clone MGC:8362 IMAGE:2819899), complete cds. // chr20 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC110409 // GenBank // Homo sapiens eukaryotic translation elongation factor 1 alpha 2, mRNA (cDNA clone MGC:117295 IMAGE:5741243), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AB209064 // GenBank // Homo sapiens mRNA for eukaryotic translation elongation factor 1 alpha 2 variant protein. // chr20 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1 /// GENSCAN00000028850 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:63488298:63502549:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0
NM_001256358 // RefSeq // Homo sapiens protein tyrosine kinase 6 (PTK6), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NM_005975 // RefSeq // Homo sapiens protein tyrosine kinase 6 (PTK6), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000217185 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:20:63528425:63537370:-1 gene:ENSG00000101213 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000542869 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:63528001:63537354:-1 gene:ENSG00000101213 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AK301364 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57625 complete cds, highly similar to Tyrosine-protein kinase 6 (EC 2.7.10.2). // chr20 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// BC035843 // GenBank // Homo sapiens PTK6 protein tyrosine kinase 6, mRNA (cDNA clone MGC:46149 IMAGE:5746034), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AK124082 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ42088 fis, clone TESOP2000801, moderately similar to PROTO-ONCOGENE TYROSINE-PROTEIN KINASE YES (EC 2.7.1.112). // chr20 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1 /// AK301691 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56703 complete cds, highly similar to Tyrosine-protein kinase 6 (EC 2.7.10.2). // chr20 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// GENSCAN00000028848 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:63529536:63537314:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0
NM_080823 // RefSeq // Homo sapiens src-related kinase lacking C-terminal regulatory tyrosine and N-terminal myristylation sites (SRMS), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000217188 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:63540810:63547504:-1 gene:ENSG00000125508 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000028823 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:63540818:63547463:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_012384 // RefSeq // Homo sapiens glucocorticoid modulatory element binding protein 2 (GMEB2), mRNA. // chr20 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000266068 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:63587602:63619876:-1 gene:ENSG00000101216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000370069 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:63587602:63604902:-1 gene:ENSG00000101216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000370077 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:63587602:63627041:-1 gene:ENSG00000101216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AF173867 // GenBank // Homo sapiens DNA binding protein p79PIF mRNA, complete cds. // chr20 // 91 // 73 // 20 // 22 // 0 /// BC036305 // GenBank // Homo sapiens glucocorticoid modulatory element binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:34137 IMAGE:5166938), complete cds. // chr20 // 86 // 73 // 19 // 22 // 0 /// AK298927 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60807 complete cds, highly similar to Glucocorticoid modulatory element-binding protein 2. // chr20 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// GENSCAN00000028839 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:63590089:63628078:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1
NM_001276310 // RefSeq // Homo sapiens stathmin-like 3 (STMN3), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NM_015894 // RefSeq // Homo sapiens stathmin-like 3 (STMN3), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NR_075070 // RefSeq // Homo sapiens stathmin-like 3 (STMN3), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr20 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000370053 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:63639708:63653427:-1 gene:ENSG00000197457 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000540534 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:20:63639705:63652766:-1 gene:ENSG00000197457 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// AF069709 // GenBank // Homo sapiens SCG10-like-protein (SCLIP) mRNA, complete cds. // chr20 // 91 // 65 // 10 // 11 // 0 /// AK094112 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ36793 fis, clone ADRGL2006124, highly similar to Stathmin-3. // chr20 // 81 // 94 // 13 // 16 // 0 /// AK298903 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57076 complete cds, highly similar to Stathmin-3. // chr20 // 77 // 76 // 10 // 13 // 0 /// BC009381 // GenBank // Homo sapiens stathmin-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:16668 IMAGE:4124704), complete cds. // chr20 // 82 // 100 // 14 // 17 // 0 /// BC025234 // GenBank // Homo sapiens stathmin-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:39085 IMAGE:4894236), complete cds. // chr20 // 82 // 100 // 14 // 17 // 0 /// BC032527 // GenBank // Homo sapiens stathmin-like 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:5502255), partial cds. // chr20 // 82 // 100 // 14 // 17 // 0 /// GENSCAN00000028842 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:63641338:63644382:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 59 // 10 // 10 // 0 /// NONHSAT080910 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr20 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_025224 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger and BTB domain containing 46 (ZBTB46), mRNA. // chr20 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// XM_005260195 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens zinc finger and BTB domain containing 46 (ZBTB46), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// XM_006723701 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens zinc finger and BTB domain containing 46 (ZBTB46), transcript variant X6, mRNA. // chr20 // 100 // 25 // 9 // 9 // 0 /// XR_430293 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens zinc finger and BTB domain containing 46 (ZBTB46), transcript variant X7, misc_RNA. // chr20 // 100 // 25 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000245663 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:63743666:63831214:-1 gene:ENSG00000130584 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000302995 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:20:63744525:63831244:-1 gene:ENSG00000130584 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000395104 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:20:63743668:63790923:-1 gene:ENSG00000130584 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// AK126720 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44766 fis, clone BRACE3032537. // chr20 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// BC052269 // GenBank // Homo sapiens zinc finger and BTB domain containing 46, mRNA (cDNA clone MGC:59877 IMAGE:6574149), complete cds. // chr20 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// BC073800 // GenBank // Homo sapiens zinc finger and BTB domain containing 46, mRNA (cDNA clone MGC:88821 IMAGE:6576441), complete cds. // chr20 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0
XR_109593 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 181 (C20orf181), misc_RNA. // chr20 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XR_172338 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 181 (C20orf181), misc_RNA. // chr20 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// U63828 // GenBank // Human tissue plasminogen activator mRNA, partial cds. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_020713 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 512B (ZNF512B), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000217130 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:20:63959644:64038583:-1 gene:ENSG00000196700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000369888 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:63956702:63969865:-1 gene:ENSG00000196700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000450537 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:20:63956705:64048758:-1 gene:ENSG00000196700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC125128 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 512B, mRNA (cDNA clone MGC:149845 IMAGE:40119047), complete cds. // chr20 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// BC125129 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 512B, mRNA (cDNA clone MGC:149846 IMAGE:40119053), complete cds. // chr20 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000028824 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:63933241:63979467:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_080621 // RefSeq // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 10 (SAMD10), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000369886 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:63974113:63979642:-1 gene:ENSG00000130590 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000450107 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:63977297:63979642:-1 gene:ENSG00000130590 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000478694 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:63975475:63979984:-1 gene:ENSG00000130590 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr20 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000498830 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:63975360:63980008:-1 gene:ENSG00000130590 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr20 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// BC041436 // GenBank HTC // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 10, mRNA (cDNA clone IMAGE:5111025), with apparent retained intron. // chr20 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// BC067362 // GenBank // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 10, mRNA (cDNA clone MGC:71144 IMAGE:6672007), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000028824 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:63933241:63979467:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_018419 // RefSeq // Homo sapiens SRY (sex determining region Y)-box 18 (SOX18), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000340356 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:64047582:64049641:-1 gene:ENSG00000203883 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB033888 // GenBank // Homo sapiens SOX18 mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// AF270652 // GenBank // Homo sapiens Sry-related HMG-box protein (SOX18) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC038590 // GenBank // Homo sapiens SRY (sex determining region Y)-box 18, mRNA (cDNA clone MGC:46062 IMAGE:5589289), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC073971 // GenBank // Homo sapiens SRY (sex determining region Y)-box 18, mRNA (cDNA clone MGC:87946 IMAGE:6183010), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC111390 // GenBank // Homo sapiens SRY (sex determining region Y)-box 18, mRNA (cDNA clone MGC:102793 IMAGE:5751646), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000028847 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:64048166:64058380:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1
NM_001007125 // RefSeq // Homo sapiens LKAAEAR motif containing 1 (LKAAEAR1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000302096 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:20:64083399:64084359:-1 gene:ENSG00000171695 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000308906 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:64083380:64084359:-1 gene:ENSG00000171695 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC036837 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 201, mRNA (cDNA clone MGC:46433 IMAGE:5173095), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000028840 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:64073853:64086201:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_005286 // RefSeq // Homo sapiens neuropeptides B/W receptor 2 (NPBWR2), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000369768 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:64105820:64107171:-1 gene:ENSG00000125522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC067481 // GenBank // Homo sapiens neuropeptides B/W receptor 2, mRNA (cDNA clone MGC:79315 IMAGE:6971825), complete cds. // chr20 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC067482 // GenBank // Homo sapiens neuropeptides B/W receptor 2, mRNA (cDNA clone MGC:79316 IMAGE:6971826), complete cds. // chr20 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC067483 // GenBank // Homo sapiens neuropeptides B/W receptor 2, mRNA (cDNA clone MGC:79317 IMAGE:6971827), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000612646 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR20_1_CTG3:64105830:64106831:-1 gene:ENSG00000277339 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013560 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR20_1_CTG3:64104413:64144065:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028859 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:20:64104413:64116222:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000338912 // ENSEMBL // havana_ig_gene:known chromosome:GRCh38:15:19964666:19965101:-1 gene:ENSG00000188403 gene_biotype:IG_V_gene transcript_biotype:IG_V_gene // chr21 // 75 // 100 // 21 // 28 // 0 /// ENST00000622028 // ENSEMBL // havana_ig_gene:known chromosome:GRCh38:21:10649400:10649835:-1 gene:ENSG00000277282 gene_biotype:IG_V_gene transcript_biotype:IG_V_gene // chr21 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000015711 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:10649390:10649835:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000045185 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:15:19944308:19965101:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 75 // 100 // 21 // 28 // 0
ENST00000384369 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:21:13047583:13047689:1 gene:ENSG00000207097 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr21 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000615686 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:13:18418526:18418632:1 gene:ENSG00000276183 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr21 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000000434 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:13036821:13085571:1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT081095 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr21 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NR_027246 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 314 (LINC00314), long non-coding RNA. // chr21 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000324988 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:28013363:28023233:1 gene:ENSG00000178457 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr21 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// AF427489 // GenBank // Homo sapiens C21orf94 protein (C21orf94) mRNA, complete cds. // chr21 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// NONHSAT081586 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr21 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// TCONS_00028741-XLOC_013899 // Rinn lincRNA // linc-USP16-6 chr21:+:29385681-29395528 // chr21 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0
ENST00000444901 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:13525599:13528579:1 gene:ENSG00000228184 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr21 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000452841 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:13:18892260:18895230:-1 gene:ENSG00000235500 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr21 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000580193 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:14629832:14632806:-1 gene:ENSG00000264570 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr21 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// GENSCAN00000000446 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:13514877:13528412:1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// GENSCAN00000005010 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:13:18838325:18894725:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// GENSCAN00000048320 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:14629999:14643741:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT032223 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr21 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000384745 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:21:13621577:13621683:1 gene:ENSG00000207476 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr21 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000616468 // ENSEMBL // ncrna:novel scaffold:GRCh38:GL000213.1:127840:127946:-1 gene:ENSG00000278793 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr21 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT081110 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr21 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT135861 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr21 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
ENST00000457709 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:14000927:14005279:1 gene:ENSG00000183249 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr21 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000026081 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:13975262:14033091:1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 75 // 9 // 9 // 0 /// NONHSAT081140 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr21 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
ENST00000364942 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:21:14070871:14070986:1 gene:ENSG00000201812 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT081146 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000391262 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:21:15614283:15614389:1 gene:ENSG00000212564 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT081207 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONHSAT081211 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr21 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0
NR_029514 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 99a (MIR99A), microRNA. // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000384906 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:21:16539089:16539169:1 gene:ENSG00000207638 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-99a // miRBase Micro RNA Database // MI0000101 Homo sapiens miR-99a stem-loop // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT081246 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr21 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NR_029480 // RefSeq // Homo sapiens microRNA let-7c (MIRLET7C), microRNA. // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000362160 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:21:16539823:16539916:1 gene:ENSG00000199030 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-let-7c // miRBase Micro RNA Database // MI0000064 Homo sapiens let-7c stem-loop // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT081249 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029694 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 125b-2 (MIR125B2), microRNA. // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000385128 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:21:16590237:16590325:1 gene:ENSG00000207863 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-125b-2 // miRBase Micro RNA Database // MI0000470 Homo sapiens miR-125b-2 stem-loop // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT081256 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000458992 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:21:16718998:16719157:1 gene:ENSG00000239023 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT081265 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000516653 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:21:17431547:17431647:1 gene:ENSG00000252462 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT081272 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000363092 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:21:17576798:17576906:1 gene:ENSG00000199962 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT081286 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AF304443 // GenBank // Homo sapiens B lymphocyte activation-related protein BC-2048 mRNA, complete cds. // chr21 // 73 // 100 // 11 // 15 // 0
ENST00000391307 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:21:19345148:19345312:1 gene:ENSG00000212609 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT081330 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000517154 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:21:20356653:20356896:1 gene:ENSG00000252963 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT081346 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_004540 // RefSeq // Homo sapiens neural cell adhesion molecule 2 (NCAM2), mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006724008 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens neural cell adhesion molecule 2 (NCAM2), transcript variant X4, mRNA. // chr21 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000284894 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:21:21280576:21540195:1 gene:ENSG00000154654 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000400546 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:20998315:21543329:1 gene:ENSG00000154654 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK302870 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53114 complete cds, highly similar to Neural cell adhesion molecule 2 precursor. // chr21 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// BC052946 // GenBank // Homo sapiens neural cell adhesion molecule 2, mRNA (cDNA clone MGC:51008 IMAGE:5315109), complete cds. // chr21 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// U75330 // GenBank // Human neural cell adhesion protein (NCAM21) mRNA, complete cds. // chr21 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// XM_006724007 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens neural cell adhesion molecule 2 (NCAM2), transcript variant X3, mRNA. // chr21 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// AK299054 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54289 complete cds, highly similar to Neural cell adhesion molecule 2 precursor. // chr21 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// GENSCAN00000048153 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:21241584:21537957:1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NR_038400 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 308 (LINC00308), long non-coding RNA. // chr21 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000419431 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:22098617:22116528:1 gene:ENSG00000184856 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr21 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000572717 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR21_2_CTG1_1:22109451:22116528:1 gene:ENSG00000262510 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr21 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// AY077696 // GenBank // Homo sapiens clone qd65g07 PRED16 protein (PRED16) mRNA, complete cds. // chr21 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONHSAT081390 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr21 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONHSAT081391 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr21 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// TCONS_00028765-XLOC_013879 // Rinn lincRNA // linc-JAM2-11 chr21:+:23470935-23488847 // chr21 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
ENST00000365469 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:21:22205192:22205332:1 gene:ENSG00000202339 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000572180 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR21_2_CTG1_1:22205192:22205332:1 gene:ENSG00000262704 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT081396 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000410635 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:21:25101132:25101415:1 gene:ENSG00000274662 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA gene:ENSG00000232512 // chr21 // 82 // 85 // 18 // 22 // 0 /// NONHSAT081464 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr21 // 82 // 85 // 18 // 22 // 0
ENST00000410986 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:21:25202207:25202315:1 gene:ENSG00000238627 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr21 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT081469 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr21 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NR_001458 // RefSeq // Homo sapiens MIR155 host gene (non-protein coding) (MIR155HG), long non-coding RNA. // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_030784 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 155 (MIR155), microRNA. // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000385060 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:21:25573980:25574044:1 gene:ENSG00000275402 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA gene:ENSG00000234883 // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000456917 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:25561909:25575168:1 gene:ENSG00000234883 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-155 // miRBase Micro RNA Database // MI0000681 Homo sapiens miR-155 stem-loop // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT081498 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT081499 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT081503 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001197297 // RefSeq // Homo sapiens GA binding protein transcription factor, alpha subunit 60kDa (GABPA), transcript variant 2, mRNA. // chr21 // 100 // 38 // 8 // 8 // 0 /// NM_002040 // RefSeq // Homo sapiens GA binding protein transcription factor, alpha subunit 60kDa (GABPA), transcript variant 1, mRNA. // chr21 // 100 // 48 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000354828 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:25734570:25772460:1 gene:ENSG00000154727 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000400075 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:25735384:25772460:1 gene:ENSG00000154727 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 38 // 8 // 8 // 0 /// BC035031 // GenBank // Homo sapiens GA binding protein transcription factor, alpha subunit 60kDa, mRNA (cDNA clone MGC:33827 IMAGE:5264778), complete cds. // chr21 // 100 // 38 // 8 // 8 // 0 /// BX647755 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686G2131 (from clone DKFZp686G2131). // chr21 // 94 // 81 // 16 // 17 // 0
ENST00000384075 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:21:26190707:26190813:1 gene:ENSG00000206802 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT081533 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_027246 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 314 (LINC00314), long non-coding RNA. // chr21 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000324988 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:28013363:28023233:1 gene:ENSG00000178457 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr21 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AF427489 // GenBank // Homo sapiens C21orf94 protein (C21orf94) mRNA, complete cds. // chr21 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// NONHSAT081586 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr21 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// TCONS_00028741-XLOC_013899 // Rinn lincRNA // linc-USP16-6 chr21:+:29385681-29395528 // chr21 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NR_026552 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 161 (LINC00161), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr21 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000412526 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:28539318:28540355:1 gene:ENSG00000226935 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr21 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AY063458 // GenBank // Homo sapiens C21orf100 isoform A (C21orf100) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr21 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// NR_026553 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 161 (LINC00161), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr21 // 83 // 83 // 19 // 23 // 1 /// ENST00000455939 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:28539318:28540355:1 gene:ENSG00000226935 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr21 // 83 // 83 // 19 // 23 // 1 /// AY063459 // GenBank // Homo sapiens C21orf100 isoform B (C21orf100) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr21 // 78 // 78 // 18 // 23 // 1 /// NONHSAT081600 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr21 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT081601 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr21 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// NONHSAT081602 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr21 // 78 // 78 // 18 // 23 // 1 /// TCONS_00028743-XLOC_013901 // Rinn lincRNA // linc-USP16-4 chr21:+:29911639-29912676 // chr21 // 78 // 78 // 18 // 23 // 1
ENST00000462262 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:29596040:29630747:1 gene:ENSG00000156273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY081145 // GenBank // Homo sapiens C21ORF41 (C21ORF41) mRNA, complete cds. // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000422809 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:21:29327129:29630751:1 gene:ENSG00000156273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// ENST00000468059 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:21:29327276:29630751:1 gene:ENSG00000156273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NR_027021 // RefSeq // Homo sapiens GRIK1 antisense RNA 1 (GRIK1-AS1), long non-coding RNA. // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000309331 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:29748938:29764002:1 gene:ENSG00000174680 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000412579 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:29758831:29764002:1 gene:ENSG00000174680 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr21 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000413131 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:29760394:29764002:1 gene:ENSG00000174680 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr21 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000423221 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:29748947:29764002:1 gene:ENSG00000174680 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr21 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// AY077697 // GenBank // Homo sapiens clone qa81f10 C21ORF9 (C21orf9) mRNA, complete cds. // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000455392 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:29748175:29763680:1 gene:ENSG00000174680 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr21 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// NONHSAT081648 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT081649 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT081650 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr21 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT081651 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr21 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
NM_181599 // RefSeq // Homo sapiens keratin associated protein 13-1 (KRTAP13-1), mRNA. // chr21 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000355459 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:30396074:30396822:1 gene:ENSG00000198390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// AB096939 // GenBank // Homo sapiens KRTAP13-1 mRNA for keratin associated protein, complete cds. // chr21 // 95 // 70 // 18 // 19 // 0 /// BC113536 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 13-1, mRNA (cDNA clone MGC:142096 IMAGE:8322588), complete cds. // chr21 // 91 // 85 // 21 // 23 // 0 /// BC113538 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 13-1, mRNA (cDNA clone MGC:142098 IMAGE:8322590), complete cds. // chr21 // 91 // 85 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000015989 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:30396087:30396605:1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0
NM_181600 // RefSeq // Homo sapiens keratin associated protein 13-4 (KRTAP13-4), mRNA. // chr21 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000334068 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:30430230:30431026:1 gene:ENSG00000186971 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB096941 // GenBank // Homo sapiens KRTAP13-4 mRNA for keratin associated protein, complete cds. // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC131691 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 13-4, mRNA (cDNA clone MGC:150347 IMAGE:40119689), complete cds. // chr21 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000016005 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:30425625:30436951:1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_181623 // RefSeq // Homo sapiens keratin associated protein 15-1 (KRTAP15-1), mRNA. // chr21 // 100 // 48 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000334067 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:30440275:30440945:1 gene:ENSG00000186970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AB096942 // GenBank // Homo sapiens KRTAP15-1 mRNA for keratin associated protein, complete cds. // chr21 // 100 // 70 // 16 // 16 // 0 /// BC104925 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 15-1, mRNA (cDNA clone MGC:132585 IMAGE:8143928), complete cds. // chr21 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0 /// BC104927 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 15-1, mRNA (cDNA clone MGC:132587 IMAGE:8143930), complete cds. // chr21 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0
NM_181605 // RefSeq // Homo sapiens keratin associated protein 6-3 (KRTAP6-3), mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000391624 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:30592440:30593075:1 gene:ENSG00000212938 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AB096951 // GenBank // Homo sapiens KRTAP6-3 mRNA for keratin associated protein, complete cds. // chr21 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000015991 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:30592495:30592836:1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT081666 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr21 // 94 // 71 // 16 // 17 // 0 /// NONHSAT081667 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr21 // 89 // 38 // 8 // 9 // 0
NM_181620 // RefSeq // Homo sapiens keratin associated protein 22-1 (KRTAP22-1), mRNA. // chr21 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000334680 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:30601087:30601382:1 gene:ENSG00000186924 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AB096953 // GenBank // Homo sapiens KRTAP22-1 mRNA for keratin associated protein, complete cds. // chr21 // 80 // 100 // 24 // 30 // 0 /// BC101682 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 22-1, mRNA (cDNA clone MGC:126731 IMAGE:8069188), complete cds. // chr21 // 72 // 83 // 18 // 25 // 0 /// BC101686 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 22-1, mRNA (cDNA clone MGC:126735 IMAGE:8069192), complete cds. // chr21 // 72 // 83 // 18 // 25 // 0
NM_181615 // RefSeq // Homo sapiens keratin associated protein 20-1 (KRTAP20-1), mRNA. // chr21 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000334664 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:30616425:30616699:1 gene:ENSG00000244624 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AB096955 // GenBank // Homo sapiens KRTAP20-1 mRNA for keratin associated protein, complete cds. // chr21 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC104846 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 20-1, mRNA (cDNA clone MGC:132506 IMAGE:8143849), complete cds. // chr21 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC104872 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 20-1, mRNA (cDNA clone MGC:132532 IMAGE:8143875), complete cds. // chr21 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NR_023342 // RefSeq // Homo sapiens keratin associated protein 20-4 (KRTAP20-4), long non-coding RNA. // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000382828 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:30620627:30620850:1 gene:ENSG00000206105 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB096956 // GenBank // Homo sapiens KRTAP20-4 mRNA for keratin associated protein, complete cds. // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015987 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:30620658:30635461:1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_181616 // RefSeq // Homo sapiens keratin associated protein 20-2 (KRTAP20-2), mRNA. // chr21 // 100 // 52 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000330798 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:30635236:30635619:1 gene:ENSG00000184032 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AB096957 // GenBank // Homo sapiens KRTAP20-2 mRNA for keratin associated protein, complete cds. // chr21 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC111084 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 20-2, mRNA (cDNA clone MGC:133104 IMAGE:40013739), complete cds. // chr21 // 100 // 52 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000015987 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:30620658:30635461:1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1
NM_001128077 // RefSeq // Homo sapiens keratin associated protein 20-3 (KRTAP20-3), mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000382826 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:21:30642864:30643136:1 gene:ENSG00000206104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB096958 // GenBank // Homo sapiens KRTAP20-3 mRNA for keratin associated protein, complete cds. // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_014586 // RefSeq // Homo sapiens hormonally up-regulated Neu-associated kinase (HUNK), mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000270112 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:31873315:32004064:1 gene:ENSG00000142149 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026833 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:31873675:31999184:1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NR_026845 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 21 open reading frame 119 (C21orf119), long non-coding RNA. // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000534991 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:32393130:32393960:1 gene:ENSG00000256073 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC007928 // GenBank // Homo sapiens chromosome 21 open reading frame 119, mRNA (cDNA clone IMAGE:3945901). // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000516236 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:21:32538299:32538434:1 gene:ENSG00000252045 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT081729 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000517141 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:21:32563075:32563210:1 gene:ENSG00000252950 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT081732 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_005806 // RefSeq // Homo sapiens oligodendrocyte lineage transcription factor 2 (OLIG2), mRNA. // chr21 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000333337 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:33025935:33029196:1 gene:ENSG00000205927 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000382357 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:33025845:33029196:1 gene:ENSG00000205927 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// BC036245 // GenBank // Homo sapiens oligodendrocyte lineage transcription factor 2, mRNA (cDNA clone MGC:39835 IMAGE:5303546), complete cds. // chr21 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC047511 // GenBank // Homo sapiens oligodendrocyte lineage transcription factor 2, mRNA (cDNA clone MGC:51023 IMAGE:5300879), complete cds. // chr21 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000430860 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:33025935:33027049:1 gene:ENSG00000205927 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// GENSCAN00000014299 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:33006895:33076231:1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_138983 // RefSeq // Homo sapiens oligodendrocyte transcription factor 1 (OLIG1), mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000382348 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:33070144:33072420:1 gene:ENSG00000184221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC026989 // GenBank // Homo sapiens oligodendrocyte transcription factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:30174 IMAGE:4944525), complete cds. // chr21 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// BC033290 // GenBank // Homo sapiens oligodendrocyte transcription factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:24984 IMAGE:4940343), complete cds. // chr21 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000426947 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:33070965:33072413:1 gene:ENSG00000184221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 38 // 38 // 13 // 34 // 1 /// NONHSAT081765 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr21 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000014299 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:33006895:33076231:1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 56 // 56 // 19 // 34 // 1
NM_000629 // RefSeq // Homo sapiens interferon (alpha, beta and omega) receptor 1 (IFNAR1), mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000270139 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:33324904:33359862:1 gene:ENSG00000142166 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000442071 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:21:33324973:33345277:1 gene:ENSG00000142166 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 27 // 10 // 10 // 0 /// AK298051 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57545 complete cds, highly similar to Interferon-alpha/beta receptor alpha chain precursor. // chr21 // 96 // 70 // 25 // 26 // 0 /// BC021825 // GenBank // Homo sapiens interferon (alpha, beta and omega) receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:24928 IMAGE:4932084), complete cds. // chr21 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// J03171 // GenBank // Human interferon-alpha receptor (HuIFN-alpha-Rec) mRNA, complete cds. // chr21 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000014266 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:33325056:33380996:1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 59 // 59 // 22 // 37 // 1
NM_001288961 // RefSeq // Homo sapiens uncharactered LOC400863 (LOC400863), mRNA. // chr21 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000381181 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:33948926:33963958:1 gene:ENSG00000237945 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr21 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000600155 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:33948788:33969598:1 gene:ENSG00000237945 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr21 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// NONHSAT081851 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr21 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// TCONS_00028837-XLOC_013922 // Rinn lincRNA // linc-SLC5A3-1 chr21:+:35321229-35336260 // chr21 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT081842 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr21 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// NONHSAT081850 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr21 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_006933 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 5 (sodium/myo-inositol cotransporter), member 3 (SLC5A3), mRNA. // chr21 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENST00000381151 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:34073570:34106260:1 gene:ENSG00000198743 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028360 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:34095199:34097355:1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NR_027267 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 310 (LINC00310), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr21 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000428914 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:34180677:34183245:1 gene:ENSG00000227456 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr21 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000609062 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:34180715:34189066:1 gene:ENSG00000227456 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr21 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// ENST00000609947 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:34180729:34189183:1 gene:ENSG00000227456 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr21 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// AF426258 // GenBank // Homo sapiens C21orf82 protein (C21orf82) mRNA, complete cds. // chr21 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NR_027266 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 310 (LINC00310), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr21 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// NONHSAT081861 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr21 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONHSAT081863 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr21 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT081864 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr21 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// TCONS_00028744-XLOC_013923 // Rinn lincRNA // linc-KCNE2-3 chr21:+:35552977-35555545 // chr21 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// TCONS_00029212-XLOC_013923 // Rinn lincRNA // linc-KCNE2-3 chr21:+:35553026-35561387 // chr21 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT081862 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr21 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// TCONS_00028745-XLOC_013923 // Rinn lincRNA // linc-KCNE2-3 chr21:+:35552977-35562220 // chr21 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_172201 // RefSeq // Homo sapiens potassium voltage-gated channel, Isk-related family, member 2 (KCNE2), mRNA. // chr21 // 95 // 96 // 21 // 22 // 0 /// ENST00000290310 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:34364024:34371389:1 gene:ENSG00000159197 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 95 // 96 // 21 // 22 // 0 /// AF071002 // GenBank // Homo sapiens minK-related peptide 1 mRNA, complete cds. // chr21 // 93 // 65 // 14 // 15 // 0 /// AF302095 // GenBank // Homo sapiens voltage-gated K+ channel subunit MIRP1 (KCNE2) mRNA, complete cds. // chr21 // 95 // 96 // 21 // 22 // 0 /// BC093892 // GenBank // Homo sapiens potassium voltage-gated channel, Isk-related family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:120927 IMAGE:7939737), complete cds. // chr21 // 92 // 57 // 12 // 13 // 0 /// BC112087 // GenBank // Homo sapiens potassium voltage-gated channel, Isk-related family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:138292 IMAGE:8327555), complete cds. // chr21 // 93 // 61 // 13 // 14 // 0 /// GENSCAN00000028359 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:34370479:34370850:1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 39 // 9 // 9 // 0
NM_053277 // RefSeq // Homo sapiens chloride intracellular channel 6 (CLIC6), mRNA. // chr21 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000349499 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:34669389:34718227:1 gene:ENSG00000159212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000360731 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:34669389:34718227:1 gene:ENSG00000159212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF448438 // GenBank // Homo sapiens chloride channel form A (CLIC6) mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr21 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// AF448439 // GenBank // Homo sapiens chloride channel form B (CLIC6) mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr21 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AK289663 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77263 complete cds, highly similar to Homo sapiens chloride intracellular channel 6 (CLIC6), mRNA. // chr21 // 96 // 73 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000028358 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:34669389:34716482:1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0
ENST00000408914 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:36050214:36051377:1 gene:ENSG00000189089 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr21 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000047271 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:36023207:36051323:1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 15 // 15 // 1
ENST00000363343 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:21:36066545:36066652:1 gene:ENSG00000200213 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT081937 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001236 // RefSeq // Homo sapiens carbonyl reductase 3 (CBR3), mRNA. // chr21 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000290354 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:36134912:36146566:1 gene:ENSG00000159231 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AB004854 // GenBank // Homo sapiens mRNA for carbonyl reductase 3, complete cds. // chr21 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// AB041012 // GenBank // Homo sapiens CBR3 mRNA for NADPH-dependent carbonyl reductase 3, complete cds. // chr21 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AB124847 // GenBank // Homo sapiens hCBR3 mRNA for carbonyl reductase 3, complete cds. // chr21 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// BC002812 // GenBank // Homo sapiens carbonyl reductase 3, mRNA (cDNA clone MGC:3489 IMAGE:3637434), complete cds. // chr21 // 86 // 66 // 18 // 21 // 0 /// CR541709 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834F1128D for gene CBR3, carbonyl reductase 3; complete cds, without stopcodon. // chr21 // 80 // 47 // 12 // 15 // 0 /// FJ224313 // GenBank // Homo sapiens epididymis secretory protein Li 25 (HEL-S-25) mRNA, complete cds. // chr21 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000047268 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:36132450:36150776:1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 53 // 17 // 17 // 0
NM_005128 // RefSeq // Homo sapiens dopey family member 2 (DOPEY2), mRNA. // chr21 // 98 // 100 // 46 // 47 // 0 /// ENST00000399151 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:36164535:36294274:1 gene:ENSG00000142197 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// GENSCAN00000047257 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:36188329:36293571:1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 74 // 35 // 35 // 0
NM_015358 // RefSeq // Homo sapiens MORC family CW-type zinc finger 3 (MORC3), mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000400485 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:36320189:36376646:1 gene:ENSG00000159256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000487909 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:36320231:36376646:1 gene:ENSG00000159256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr21 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AK292957 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76977 complete cds, highly similar to Homo sapiens MORC family CW-type zinc finger 3 (MORC3), mRNA. // chr21 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// AK295133 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57931 complete cds, highly similar to MORC family CW-type zinc finger 3. // chr21 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC094779 // GenBank // Homo sapiens MORC family CW-type zinc finger 3, mRNA (cDNA clone MGC:104687 IMAGE:30527767), complete cds. // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC132731 // GenBank // Homo sapiens MORC family CW-type zinc finger 3, mRNA (cDNA clone MGC:164362 IMAGE:40146753), complete cds. // chr21 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000492336 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:36320189:36339527:1 gene:ENSG00000159256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr21 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// BC058002 // GenBank // Homo sapiens MORC family CW-type zinc finger 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:4609005). // chr21 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000047265 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:36338779:36375296:1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
NM_005441 // RefSeq // Homo sapiens chromatin assembly factor 1, subunit B (p60) (CHAF1B), mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000314103 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:36385378:36419015:1 gene:ENSG00000159259 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000481458 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:36399502:36412962:1 gene:ENSG00000159259 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr21 // 100 // 23 // 8 // 8 // 0 /// BC021218 // GenBank // Homo sapiens chromatin assembly factor 1, subunit B (p60), mRNA (cDNA clone MGC:12639 IMAGE:4302243), complete cds. // chr21 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// U20980 // GenBank // Human chromatin assembly factor-I p60 subunit mRNA, complete cds. // chr21 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000480486 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:36386060:36398239:1 gene:ENSG00000159259 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr21 // 37 // 37 // 13 // 35 // 1 /// AK092781 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ35462 fis, clone SMINT2005174. // chr21 // 26 // 26 // 9 // 35 // 1 /// GENSCAN00000047264 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:36385352:36416653:1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 60 // 21 // 21 // 0
AF050199 // GenBank // Homo sapiens putative peroxisome microbody protein 175.1 mRNA, complete cds. // chr21 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_005069 // RefSeq // Homo sapiens single-minded family bHLH transcription factor 2 (SIM2), transcript variant SIM2, mRNA. // chr21 // 100 // 55 // 22 // 22 // 0 /// NM_009586 // RefSeq // Homo sapiens single-minded family bHLH transcription factor 2 (SIM2), transcript variant SIM2s, mRNA. // chr21 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000290399 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:36699134:36749917:1 gene:ENSG00000159263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 55 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000431229 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:21:36709181:36745871:1 gene:ENSG00000159263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 95 // 48 // 18 // 19 // 0 /// ENST00000481185 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:36699134:36746324:1 gene:ENSG00000159263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr21 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// BC110444 // GenBank // Homo sapiens single-minded homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:119447 IMAGE:40007501), complete cds. // chr21 // 97 // 88 // 34 // 35 // 0 /// U80456 // GenBank // Human transcription factor SIM2 long form mRNA, complete cds. // chr21 // 100 // 55 // 22 // 22 // 0 /// U80457 // GenBank // Human transcription factor SIM2 short form mRNA, complete cds. // chr21 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000047260 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:36668591:36748092:1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 55 // 55 // 22 // 40 // 1
ENST00000362936 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:21:36851911:36852028:1 gene:ENSG00000199806 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT081993 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_018962 // RefSeq // Homo sapiens ripply transcriptional repressor 3 (RIPPLY3), mRNA. // chr21 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000329553 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:37006563:37019659:1 gene:ENSG00000183145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000485272 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:37006150:37019659:1 gene:ENSG00000183145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr21 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000490393 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:37006202:37019659:1 gene:ENSG00000183145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr21 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// AB037158 // GenBank // Homo sapiens DSCR6a mRNA, complete cds. // chr21 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// AB037159 // GenBank // Homo sapiens DSCR6b mRNA, complete cds. // chr21 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// AB037160 // GenBank // Homo sapiens DSCR6c mRNA, complete cds. // chr21 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// AB037161 // GenBank // Homo sapiens DSCR6d mRNA, complete cds. // chr21 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// NONHSAT082002 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr21 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT082003 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr21 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0
ENST00000390834 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:21:37045530:37045636:1 gene:ENSG00000212136 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT082005 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000579533 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:21:37215605:37215903:1 gene:ENSG00000263969 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr21 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONHSAT082018 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr21 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NR_027695 // RefSeq // Homo sapiens Down syndrome critical region gene 10 (non-protein coding) (DSCR10), long non-coding RNA. // chr21 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000432141 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:38206156:38208644:1 gene:ENSG00000233316 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chr21 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB066291 // GenBank // Homo sapiens DSCR10 mRNA, complete cds. // chr21 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000538415 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:21:38208135:38208460:1 gene:ENSG00000233316 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chr21 // 71 // 50 // 10 // 14 // 0 /// BC093855 // GenBank // Homo sapiens Down syndrome critical region gene 10, mRNA (cDNA clone MGC:120890 IMAGE:7939700), complete cds. // chr21 // 71 // 50 // 10 // 14 // 0 /// NONHSAT082079 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr21 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONHSAT082080 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr21 // 71 // 50 // 10 // 14 // 0
ENST00000467573 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:39127568:39128040:1 gene:ENSG00000228861 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr21 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000013472 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:39054276:39128040:1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT082149 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr21 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT082150 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr21 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0
ENST00000517106 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:21:39344537:39344628:1 gene:ENSG00000252915 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT082175 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001080444 // RefSeq // Homo sapiens immunoglobulin superfamily, member 5 (IGSF5), mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006723974 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens immunoglobulin superfamily, member 5 (IGSF5), transcript variant X1, mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000380588 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:21:39745407:39802096:1 gene:ENSG00000183067 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000479378 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:39751172:39788188:1 gene:ENSG00000183067 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr21 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000459922 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:39791630:39801435:1 gene:ENSG00000183067 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr21 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
ENST00000384418 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:21:40513144:40513279:1 gene:ENSG00000207147 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr21 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT082226 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr21 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000362986 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:18:7995570:7995785:1 gene:ENSG00000199856 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr21 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0 /// ENST00000384034 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:14:101145480:101145695:-1 gene:ENSG00000277754 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA gene:ENSG00000206761 // chr21 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0 /// NONHSAT040012 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr21 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0 /// NONHSAT057163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr21 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0 /// ENST00000363823 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:14:63651296:63651499:-1 gene:ENSG00000200693 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr21 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0 /// NONHSAT037311 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr21 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0 /// NONHSAT076932 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr21 // 63 // 100 // 5 // 8 // 0
GENSCAN00000047088 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:41072732:41153029:1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
ENST00000384772 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:21:41539206:41539326:1 gene:ENSG00000207503 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT082266 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000515969 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:21:41882205:41882300:1 gene:ENSG00000251778 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT082295 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_027273 // RefSeq // Homo sapiens ZNF295 antisense RNA 1 (ZNF295-AS1), transcript variant 3, long non-coding RNA. // chr21 // 100 // 57 // 13 // 13 // 0 /// NR_119385 // RefSeq // Homo sapiens ZNF295 antisense RNA 1 (ZNF295-AS1), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr21 // 100 // 48 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000429739 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:42022267:42024924:1 gene:ENSG00000237232 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr21 // 100 // 57 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000455701 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:42022023:42024866:1 gene:ENSG00000237232 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr21 // 100 // 39 // 9 // 9 // 0 /// NR_119384 // RefSeq // Homo sapiens ZNF295 antisense RNA 1 (ZNF295-AS1), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr21 // 91 // 91 // 21 // 23 // 1 /// ENST00000412906 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:42009194:42024866:1 gene:ENSG00000237232 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr21 // 83 // 83 // 19 // 23 // 1 /// AK055167 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ30605 fis, clone CTONG2000303. // chr21 // 57 // 57 // 13 // 23 // 1 /// NONHSAT082303 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr21 // 100 // 57 // 13 // 13 // 0 /// NONHSAT082304 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr21 // 100 // 39 // 9 // 9 // 0 /// NONHSAT082299 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr21 // 83 // 83 // 19 // 23 // 1 /// NONHSAT082305 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr21 // 57 // 57 // 13 // 23 // 1 /// NONHSAT082300 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr21 // 48 // 48 // 11 // 23 // 1 /// NONHSAT082301 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr21 // 48 // 48 // 11 // 23 // 1
ENST00000411330 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:21:42221173:42221286:1 gene:ENSG00000223262 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT082314 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_018964 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 37 (glucose-6-phosphate transporter), member 1 (SLC37A1), mRNA. // chr21 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000352133 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:42513914:42581440:1 gene:ENSG00000160190 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000398341 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:42499632:42581440:1 gene:ENSG00000160190 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AF311320 // GenBank // Homo sapiens glycerol 3-phosphate permease (SLC37A1) mRNA, complete cds. // chr21 // 92 // 93 // 23 // 25 // 0 /// XM_006724015 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens solute carrier family 37 (glucose-6-phosphate transporter), member 1 (SLC37A1), transcript variant X6, mRNA. // chr21 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// GENSCAN00000017807 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:42531855:42644809:1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
NR_026960 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 319 (LINC00319), long non-coding RNA. // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006710095 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens putative uncharacterized protein C21orf125-like (LOC102724398), mRNA. // chr21 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000342757 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:43450024:43453893:1 gene:ENSG00000188660 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000448049 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:43446601:43453893:1 gene:ENSG00000188660 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr21 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// AK095355 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ38036 fis, clone CTONG2013630. // chr21 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT082407 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT082408 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr21 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT082409 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr21 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// TCONS_00028751-XLOC_013964 // Rinn lincRNA // linc-RRP1B-2 chr21:+:44869903-44873769 // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// TCONS_00028852-XLOC_013964 // Rinn lincRNA // linc-RRP1B-2 chr21:+:44866480-44873773 // chr21 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_015056 // RefSeq // Homo sapiens ribosomal RNA processing 1B (RRP1B), mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENST00000340648 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:43659548:43696079:1 gene:ENSG00000160208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENST00000470886 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:43686132:43696077:1 gene:ENSG00000160208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr21 // 100 // 48 // 22 // 22 // 0 /// AK124620 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ42629 fis, clone BRACE3019055. // chr21 // 95 // 48 // 21 // 22 // 0 /// BC028386 // GenBank // Homo sapiens ribosomal RNA processing 1 homolog B (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:33175 IMAGE:4821672), complete cds. // chr21 // 93 // 87 // 37 // 40 // 0 /// D80001 // GenBank // Homo sapiens KIAA0179 mRNA, complete cds. // chr21 // 93 // 96 // 41 // 44 // 0 /// GENSCAN00000033666 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:43659665:43693383:1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 80 // 37 // 37 // 0
NM_005049 // RefSeq // Homo sapiens PWP2 periodic tryptophan protein homolog (yeast) (PWP2), mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000291576 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:44107290:44131181:1 gene:ENSG00000241945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC013309 // GenBank // Homo sapiens PWP2 periodic tryptophan protein homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:4635 IMAGE:3528790), complete cds. // chr21 // 92 // 93 // 23 // 25 // 0 /// BC014988 // GenBank // Homo sapiens PWP2 periodic tryptophan protein homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:23222 IMAGE:4906611), complete cds. // chr21 // 92 // 93 // 23 // 25 // 0 /// U53346 // GenBank // Human PWP2H protein mRNA, complete cds. // chr21 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// U56085 // GenBank // Human periodic tryptophan protein 2 (PWP2) mRNA, complete cds. // chr21 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// ENST00000471490 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:44119159:44127855:1 gene:ENSG00000241945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr21 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// ENST00000617716 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:GRCh38:21:5130872:5154730:-1 gene:ENSG00000275464 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000033407 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:5117103:5154297:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000036915 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:44107760:44144949:1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
AK074162 // GenBank // Homo sapiens mRNA for FLJ00235 protein. // chr21 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000448927 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:44331234:44335851:1 gene:ENSG00000184441 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr21 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT082506 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr21 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT082507 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr21 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_030891 // RefSeq // Homo sapiens leucine rich repeat containing 3 (LRRC3), mRNA. // chr21 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000291592 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:44455486:44462196:1 gene:ENSG00000160233 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB058646 // GenBank // Homo sapiens mRNA for LRRC3, complete cds. // chr21 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// AY061857 // GenBank // Homo sapiens leucine-rich repeat domain-containing protein (C21orf102) mRNA, complete cds. // chr21 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// AY358120 // GenBank // Homo sapiens clone DNA178618 LLR protein (UNQ9233) mRNA, complete cds. // chr21 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC119648 // GenBank // Homo sapiens leucine rich repeat containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:149505 IMAGE:40115796), complete cds. // chr21 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// BC119649 // GenBank // Homo sapiens leucine rich repeat containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:149506 IMAGE:40115797), complete cds. // chr21 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000036906 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:44456645:44457418:1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
XR_109680 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens LRRC3 downstream neighbor (non-protein coding) (LRRC3DN), misc_RNA. // chr21 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000291592 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:44455486:44462196:1 gene:ENSG00000160233 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AL117578 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp434C128 (from clone DKFZp434C128). // chr21 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NR_026547 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 21 open reading frame 90 (C21orf90), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr21 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NR_026548 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 21 open reading frame 90 (C21orf90), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr21 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000330490 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:44517216:44518756:1 gene:ENSG00000182912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000354333 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:21:44517617:44520830:1 gene:ENSG00000182912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// AF426269 // GenBank // Homo sapiens C21orf90 protein form A (C21orf90) mRNA, complete cds. // chr21 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// AF426270 // GenBank // Homo sapiens C21orf90 protein form B (C21orf90) mRNA, complete cds. // chr21 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// BC016690 // GenBank // Homo sapiens chromosome 21 open reading frame 90, mRNA (cDNA clone IMAGE:4026098). // chr21 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NM_198687 // RefSeq // Homo sapiens keratin associated protein 10-4 (KRTAP10-4), mRNA. // chr21 // 88 // 100 // 7 // 8 // 0 /// ENST00000400374 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:44573729:44575371:1 gene:ENSG00000215454 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 88 // 100 // 7 // 8 // 0 /// AB076351 // GenBank // Homo sapiens KRTAP18.4 mRNA for keratin associated protein, complete cds. // chr21 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC125048 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 10-4, mRNA (cDNA clone MGC:149545 IMAGE:40116133), complete cds. // chr21 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC125049 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 10-4, mRNA (cDNA clone MGC:149546 IMAGE:40116140), complete cds. // chr21 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_198689 // RefSeq // Homo sapiens keratin associated protein 10-7 (KRTAP10-7), mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000609664 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:44600597:44602174:1 gene:ENSG00000272804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// AB076354 // GenBank // Homo sapiens KRTAP18.7 mRNA for keratin associated protein, complete cds. // chr21 // 95 // 100 // 18 // 19 // 0 /// BC119643 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 10-7, mRNA (cDNA clone MGC:149497 IMAGE:40115724), complete cds. // chr21 // 95 // 100 // 18 // 19 // 0
NM_198695 // RefSeq // Homo sapiens keratin associated protein 10-8 (KRTAP10-8), mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000334662 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:44612079:44612954:1 gene:ENSG00000187766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AB076355 // GenBank // Homo sapiens KRTAP18.8 mRNA for keratin associated protein, complete cds. // chr21 // 87 // 100 // 20 // 23 // 0 /// BC127016 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 10-8, mRNA (cDNA clone MGC:149886 IMAGE:40119338), complete cds. // chr21 // 82 // 96 // 18 // 22 // 0
NM_198690 // RefSeq // Homo sapiens keratin associated protein 10-9 (KRTAP10-9), mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000397911 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:44627123:44628293:1 gene:ENSG00000221837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// AB076356 // GenBank // Homo sapiens KRTAP18.9 mRNA for keratin associated protein, complete cds. // chr21 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC131613 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 10-9, mRNA (cDNA clone MGC:149461 IMAGE:40115414), complete cds. // chr21 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000616529 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:21:44627148:44628062:1 gene:ENSG00000221837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0 /// GENSCAN00000036911 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:44627172:44628050:1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_181688 // RefSeq // Homo sapiens keratin associated protein 10-10 (KRTAP10-10), mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000380095 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:44637356:44638455:1 gene:ENSG00000221859 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// AB076358 // GenBank // Homo sapiens KRTAP18.10 mRNA for keratin associated protein, complete cds. // chr21 // 88 // 89 // 15 // 17 // 0 /// GENSCAN00000036922 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:44637418:44638173:1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 74 // 14 // 14 // 0
NM_198692 // RefSeq // Homo sapiens keratin associated protein 10-11 (KRTAP10-11), mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000334670 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:44646414:44647650:1 gene:ENSG00000243489 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// AB076359 // GenBank // Homo sapiens KRTAP18.11 mRNA for keratin associated protein, complete cds. // chr21 // 85 // 100 // 11 // 13 // 0 /// BC131611 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 10-11, mRNA (cDNA clone MGC:149444 IMAGE:40115290), complete cds. // chr21 // 92 // 100 // 12 // 13 // 0
NM_198697 // RefSeq // Homo sapiens keratin associated protein 12-3 (KRTAP12-3), mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000397907 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:44657932:44658341:1 gene:ENSG00000205439 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AB076361 // GenBank // Homo sapiens KRTAP12.3 mRNA for keratin associated protein, complete cds. // chr21 // 80 // 100 // 16 // 20 // 0 /// GENSCAN00000036916 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:44657980:44658317:1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 75 // 60 // 9 // 12 // 0 /// ENST00000619249 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:21:44646657:44658270:1 gene:ENSG00000205439 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 50 // 50 // 10 // 20 // 1
NM_198699 // RefSeq // Homo sapiens keratin associated protein 10-12 (KRTAP10-12), mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000400365 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:44697172:44698044:1 gene:ENSG00000189169 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// AB076364 // GenBank // Homo sapiens KRTAP18.12 mRNA for keratin associated protein, complete cds. // chr21 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC137339 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 10-12, mRNA (cDNA clone MGC:168960 IMAGE:9021337), complete cds. // chr21 // 100 // 71 // 12 // 12 // 0 /// BC137341 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 10-12, mRNA (cDNA clone MGC:168962 IMAGE:9021339), complete cds. // chr21 // 100 // 71 // 12 // 12 // 0
NM_058190 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 207, member A (FAM207A), mRNA. // chr21 // 100 // 88 // 7 // 7 // 0 /// XM_005261190 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens family with sequence similarity 207, member A (FAM207A), transcript variant X2, mRNA. // chr21 // 100 // 63 // 5 // 5 // 0 /// ENST00000291634 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:44940010:44976989:1 gene:ENSG00000160256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000397826 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:44940012:44976989:1 gene:ENSG00000160256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 63 // 5 // 5 // 0 /// ENST00000458015 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:21:44940025:44969264:1 gene:ENSG00000160256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 63 // 5 // 5 // 0 /// AF391113 // GenBank // Homo sapiens C21orf70 isoform A protein (C21orf70) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr21 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// AF391114 // GenBank // Homo sapiens C21orf70 isoform B protein (C21orf70) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr21 // 100 // 63 // 5 // 5 // 0 /// BC009341 // GenBank // Homo sapiens chromosome 21 open reading frame 70, mRNA (cDNA clone MGC:16722 IMAGE:4128732), complete cds. // chr21 // 100 // 88 // 7 // 7 // 0 /// GENSCAN00000034665 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:44940058:44944108:1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0
ENST00000328344 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:45234352:45258730:1 gene:ENSG00000182586 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF426268 // GenBank // Homo sapiens C21orf89 protein (C21orf89) mRNA, complete cds. // chr21 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000584169 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:45234340:45257267:1 gene:ENSG00000182586 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr21 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONHSAT082921 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// TCONS_00028775-XLOC_013979 // Rinn lincRNA // linc-COL18A1-6 chr21:+:46654266-46678645 // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034638 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:45253936:45258648:1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONHSAT082920 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr21 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001848 // RefSeq // Homo sapiens collagen, type VI, alpha 1 (COL6A1), mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_006723964 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens collagen, type VI, alpha 1 (COL6A1), transcript variant X1, mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000361866 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:45981737:46005050:1 gene:ENSG00000142156 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000498614 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:46001197:46005050:1 gene:ENSG00000142156 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr21 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// AK299396 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61362 complete cds, highly similar to Collagen alpha-1(VI) chain precursor. // chr21 // 96 // 66 // 22 // 23 // 0 /// BC052575 // GenBank // Homo sapiens collagen, type VI, alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:59702 IMAGE:6598940), complete cds. // chr21 // 91 // 97 // 31 // 34 // 0 /// AK298968 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58994 complete cds, highly similar to Collagen alpha-1(VI) chain precursor. // chr21 // 43 // 43 // 15 // 35 // 1 /// ENST00000612273 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:21:45981769:46004101:1 gene:ENSG00000142156 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 97 // 97 // 33 // 34 // 0 /// GENSCAN00000004624 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:45938812:46004013:1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0
NM_006031 // RefSeq // Homo sapiens pericentrin (PCNT), mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 60 // 60 // 0 /// ENST00000359568 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:46324122:46445769:1 gene:ENSG00000160299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 60 // 60 // 0 /// ENST00000480896 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:46324888:46445769:1 gene:ENSG00000160299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr21 // 100 // 80 // 48 // 48 // 0 /// ENST00000490468 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:46324141:46349800:1 gene:ENSG00000160299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr21 // 100 // 18 // 11 // 11 // 0 /// AF515282 // GenBank // Homo sapiens pericentrin B (PCNT2) mRNA, complete cds. // chr21 // 98 // 98 // 58 // 59 // 0 /// U52962 // GenBank // Human centrosomal protein kendrin mRNA, complete cds. // chr21 // 95 // 98 // 56 // 59 // 0 /// BC035913 // GenBank // Homo sapiens pericentrin, mRNA (cDNA clone IMAGE:5495146), partial cds. // chr21 // 30 // 30 // 18 // 60 // 1 /// GENSCAN00000004635 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:46324229:46567622:1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 93 // 56 // 56 // 0 /// NONHSAT083061 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr21 // 100 // 18 // 11 // 11 // 0
ENST00000365369 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:21:46525618:46525722:1 gene:ENSG00000202239 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr21 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT083073 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr21 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_182481 // RefSeq // Homo sapiens B melanoma antigen family, member 3 (BAGE3), mRNA. // chr21 // 100 // 50 // 7 // 7 // 0 /// NM_182482 // RefSeq // Homo sapiens B melanoma antigen family, member 2 (BAGE2), mRNA. // chr21 // 100 // 50 // 7 // 7 // 0 /// NM_182484 // RefSeq // Homo sapiens B melanoma antigen family, member 5 (BAGE5), mRNA. // chr21 // 100 // 50 // 7 // 7 // 0 /// ENST00000470054 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:10413532:10491615:1 gene:ENSG00000187172 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr21 // 100 // 50 // 7 // 7 // 0 /// AF218570 // GenBank // Homo sapiens BAGE2 antigen (BAGE2) mRNA, complete cds. // chr21 // 100 // 50 // 7 // 7 // 0 /// AF339514 // GenBank // Homo sapiens B melanoma antigen family member 3 (BAGE3) mRNA, complete cds. // chr21 // 100 // 50 // 7 // 7 // 0 /// AF339516 // GenBank // Homo sapiens B melanoma antigen family member 5 (BAGE5) mRNA, complete cds. // chr21 // 100 // 50 // 7 // 7 // 0
NM_001145029 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat domain 30B (ANKRD30B), mRNA. // chr21 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENST00000320584 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:14837149:14852738:1 gene:ENSG00000180777 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr21 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENST00000358984 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:18:14748240:14852480:1 gene:ENSG00000180777 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENST00000451052 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:13384249:13427773:-1 gene:ENSG00000175302 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK294693 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60250 complete cds, moderately similar to Ankyrin repeat domain-containing protein 30A. // chr21 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// AF269088 // GenBank // Homo sapiens breast cancer antigen NY-BR-1.1 mRNA, partial cds. // chr21 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// GENSCAN00000000444 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:13371718:13489176:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000048301 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:14747476:14877173:1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
AK125677 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ43689 fis, clone TBAES2003550. // chr21 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000000445 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:13679670:13682211:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000004302 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:6814637:6817178:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000044834 // ENSEMBL // cdna:genscan scaffold:GRCh38:GL000213.1:67369:69910:1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0
NR_027270 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat domain 20 family, member A11, pseudogene (ANKRD20A11P), non-coding RNA. // chr21 // 100 // 93 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000344693 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:13943769:13980437:-1 gene:ENSG00000215559 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr21 // 100 // 93 // 13 // 13 // 0 /// AF426257 // GenBank // Homo sapiens C21orf81 protein (C21orf81) mRNA, complete cds. // chr21 // 100 // 93 // 13 // 13 // 0 /// BC043199 // GenBank // Homo sapiens chromosome 21 open reading frame 81, mRNA (cDNA clone IMAGE:5289033). // chr21 // 100 // 57 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000451663 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:13909574:13979911:-1 gene:ENSG00000215559 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr21 // 64 // 64 // 9 // 14 // 1 /// NONHSAT081134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr21 // 100 // 93 // 13 // 13 // 0 /// NONHSAT081137 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr21 // 100 // 57 // 8 // 8 // 0 /// TCONS_l2_00017425-XLOC_l2_009136 // Broad TUCP // linc-BAGE-4 chr21:-:15316095-15352765 // chr21 // 100 // 93 // 13 // 13 // 0 /// TCONS_l2_00017426-XLOC_l2_009136 // Broad TUCP // linc-BAGE-4 chr21:-:15349069-15352765 // chr21 // 100 // 57 // 8 // 8 // 0
NR_027995 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat domain 20 family, member A9, pseudogene (ANKRD20A9P), non-coding RNA. // chr21 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// NR_046929 // RefSeq // Homo sapiens RNA, U6 small nuclear 55, pseudogene (RNU6-55P), small nuclear RNA. // chr21 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// ENST00000411092 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:13:18869185:18869291:-1 gene:ENSG00000223024 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr21 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// ENST00000411355 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:21:13968489:13968595:-1 gene:ENSG00000223287 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr21 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000615657 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR13_1_CTG3:18869185:18869291:-1 gene:ENSG00000278853 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr21 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// NONHSAT032215 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr21 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// NONHSAT032221 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr21 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// NONHSAT081135 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr21 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_006948 // RefSeq // Homo sapiens heat shock protein 70kDa family, member 13 (HSPA13), mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000285667 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:14371115:14383187:-1 gene:ENSG00000155304 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK299004 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54131 complete cds, highly similar to Stress 70 protein chaperone microsome-associated 60 kDa protein precursor. // chr21 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// BC036370 // GenBank // Homo sapiens heat shock protein 70kDa family, member 13, mRNA (cDNA clone MGC:26248 IMAGE:4837136), complete cds. // chr21 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// U04735 // GenBank // Human microsomal stress 70 protein ATPase core (stch) mRNA, complete cds. // chr21 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000026080 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:14373617:14658867:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1
NM_003489 // RefSeq // Homo sapiens nuclear receptor interacting protein 1 (NRIP1), mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006724054 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens nuclear receptor interacting protein 1 (NRIP1), transcript variant X6, mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000318948 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:21:14961235:15064805:-1 gene:ENSG00000180530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000400199 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:14961235:15064934:-1 gene:ENSG00000180530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000400202 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:14961235:15065000:-1 gene:ENSG00000180530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000411932 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:14967996:15002368:-1 gene:ENSG00000180530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// AK289786 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77253 complete cds, highly similar to Homo sapiens nuclear receptor interacting protein 1 (NRIP1), mRNA. // chr21 // 88 // 65 // 15 // 17 // 0 /// BC040361 // GenBank // Homo sapiens nuclear receptor interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:9257 IMAGE:3918685), complete cds. // chr21 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// X84373 // GenBank // H.sapiens mRNA for nuclear factor RIP140. // chr21 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// HF584750 // GenBank // Homo sapiens mRNA for partial nuclear receptor interacting protein 1 (NRIP1_var2 gene). // chr21 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000045982 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:14964716:14968192:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0
ENST00000516464 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:21:16035413:16035509:-1 gene:ENSG00000252273 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr21 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT081218 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr21 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
ENST00000363884 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:21:17527140:17527247:-1 gene:ENSG00000200754 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT081282 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001100420 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 21 open reading frame 91 (C21orf91), transcript variant 1, mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NM_001100421 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 21 open reading frame 91 (C21orf91), transcript variant 3, mRNA. // chr21 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// NM_017447 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 21 open reading frame 91 (C21orf91), transcript variant 2, mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000284881 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:17788967:17819386:-1 gene:ENSG00000154642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000400558 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:21:17793247:17819386:-1 gene:ENSG00000154642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 56 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000400559 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:17792804:17819386:-1 gene:ENSG00000154642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000405964 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:17795208:17819019:-1 gene:ENSG00000154642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 26 // 9 // 9 // 0 /// BC015468 // GenBank // Homo sapiens chromosome 21 open reading frame 91, mRNA (cDNA clone MGC:8771 IMAGE:3916462), complete cds. // chr21 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000034676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:17780704:17818975:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 44 // 15 // 15 // 0
NM_002772 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protease, serine 15 (TMPRSS15), mRNA. // chr21 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// ENST00000284885 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:18269116:18403656:-1 gene:ENSG00000154646 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC111749 // GenBank // Homo sapiens protease, serine, 7 (enterokinase), mRNA (cDNA clone MGC:133046 IMAGE:40008569), complete cds. // chr21 // 94 // 100 // 32 // 34 // 0 /// U09860 // GenBank // Human enterokinase mRNA, complete cds. // chr21 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// GENSCAN00000046121 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:18267855:18386423:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 56 // 19 // 19 // 0
ENST00000516042 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:21:20355748:20355852:-1 gene:ENSG00000251851 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT081345 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000362828 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:21:23432181:23432282:-1 gene:ENSG00000199698 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT081426 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_017446 // RefSeq // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein L39 (MRPL39), transcript variant 1, mRNA. // chr21 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NM_080794 // RefSeq // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein L39 (MRPL39), transcript variant 2, mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006724026 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein L39 (MRPL39), transcript variant X1, mRNA. // chr21 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000307301 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:25585656:25607517:-1 gene:ENSG00000154719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000352957 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:25585656:25607517:-1 gene:ENSG00000154719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000419219 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:21:25592812:25607484:-1 gene:ENSG00000154719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// AF109357 // GenBank // Homo sapiens MSTP003 mRNA, complete cds. // chr21 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// AF270511 // GenBank // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein-L5 heart-specific splice-variant mRNA, complete cds. // chr21 // 88 // 68 // 15 // 17 // 0 /// BC107719 // GenBank // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein L39, mRNA (cDNA clone MGC:104174 IMAGE:6737868), complete cds. // chr21 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000005536 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:25487677:25625934:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
ENST00000516163 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:21:25943044:25943145:-1 gene:ENSG00000251972 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr21 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT081522 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr21 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_006988 // RefSeq // Homo sapiens ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 1 (ADAMTS1), mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000284984 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:26835747:26845409:-1 gene:ENSG00000154734 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000492656 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:26838093:26840489:-1 gene:ENSG00000154734 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr21 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// AF060152 // GenBank // Homo sapiens METH1 protein (METH1) mRNA, complete cds. // chr21 // 97 // 85 // 28 // 29 // 0 /// AF170084 // GenBank // Homo sapiens metalloproteinase with thrombospondin type 1 motifs ADAMTS1 (ADAMTS1) mRNA, complete cds. // chr21 // 94 // 100 // 32 // 34 // 0 /// AF207664 // GenBank // Homo sapiens matrix metalloprotease (ADAMTS1) mRNA, complete cds. // chr21 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC036515 // GenBank // Homo sapiens ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 1, mRNA (cDNA clone MGC:32979 IMAGE:5266513), complete cds. // chr21 // 94 // 100 // 32 // 34 // 0 /// ENST00000464589 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:26836287:26841711:-1 gene:ENSG00000154734 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr21 // 65 // 65 // 22 // 34 // 1 /// AK023795 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ13733 fis, clone PLACE3000147, highly similar to Homo sapiens metalloproteinase with thrombospondin type 1 motifs ADAMTS1 (ADAMTS1) mRNA. // chr21 // 59 // 59 // 20 // 34 // 1 /// GENSCAN00000001133 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:26837579:26847378:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0
NM_007038 // RefSeq // Homo sapiens ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 5 (ADAMTS5), mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000284987 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:26917912:26966513:-1 gene:ENSG00000154736 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// AF142099 // GenBank // Homo sapiens aggrecanase-2 (ADAMTS11) mRNA, complete cds. // chr21 // 100 // 70 // 26 // 26 // 0 /// BC093775 // GenBank // Homo sapiens ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 5, mRNA (cDNA clone MGC:120810 IMAGE:7939620), complete cds. // chr21 // 95 // 59 // 21 // 22 // 0 /// BC093777 // GenBank // Homo sapiens ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 5, mRNA (cDNA clone MGC:120812 IMAGE:7939622), complete cds. // chr21 // 95 // 59 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000001135 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:26924053:26966391:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 54 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT081552 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr21 // 90 // 27 // 9 // 10 // 0
NM_013240 // RefSeq // Homo sapiens N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 (putative) (N6AMT1), transcript variant 1, mRNA. // chr21 // 85 // 57 // 11 // 13 // 0 /// NM_182749 // RefSeq // Homo sapiens N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 (putative) (N6AMT1), transcript variant 2, mRNA. // chr21 // 82 // 48 // 9 // 11 // 0 /// ENST00000303775 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:28872191:28885371:-1 gene:ENSG00000156239 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 86 // 96 // 19 // 22 // 0 /// ENST00000351429 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:28872191:28885371:-1 gene:ENSG00000156239 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 85 // 87 // 17 // 20 // 0 /// AF139682 // GenBank // Homo sapiens putative N5-methyl-Gln methyltransferase mRNA, complete cds. // chr21 // 75 // 52 // 9 // 12 // 0 /// NR_047510 // RefSeq // Homo sapiens N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 (putative) (N6AMT1), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr21 // 48 // 48 // 11 // 23 // 1 /// ENST00000460212 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:28872191:28885371:-1 gene:ENSG00000156239 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr21 // 43 // 43 // 10 // 23 // 1
NM_015565 // RefSeq // Homo sapiens listerin E3 ubiquitin protein ligase 1 (LTN1), mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENST00000361371 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:21:28928144:28992885:-1 gene:ENSG00000198862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 98 // 45 // 45 // 0 /// ENST00000389194 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:28928144:28992949:-1 gene:ENSG00000198862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENST00000389195 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:21:28961317:28992949:-1 gene:ENSG00000198862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 37 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000483326 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:28966895:28986761:-1 gene:ENSG00000198862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr21 // 100 // 20 // 9 // 9 // 0 /// AK023499 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ13437 fis, clone PLACE1002625. // chr21 // 89 // 20 // 8 // 9 // 0 /// BC031633 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5172245, containing frame-shift errors. // chr21 // 88 // 37 // 15 // 17 // 0 /// BC140790 // GenBank // Homo sapiens ring finger protein 160, mRNA (cDNA clone MGC:176467 IMAGE:9021658), complete cds. // chr21 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// BC150284 // GenBank // Homo sapiens ring finger protein 160, mRNA (cDNA clone MGC:166904 IMAGE:8860138), complete cds. // chr21 // 98 // 96 // 43 // 44 // 0 /// ENST00000614971 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:21:28928144:28992956:-1 gene:ENSG00000198862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000035406 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:28903095:29002843:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 48 // 48 // 22 // 46 // 1
ENST00000365114 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:21:29139283:29139384:-1 gene:ENSG00000201984 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT081625 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000391177 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:21:29180425:29180639:-1 gene:ENSG00000212479 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT081626 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONHSAT081645 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_012131 // RefSeq // Homo sapiens claudin 17 (CLDN17), mRNA. // chr21 // 92 // 54 // 12 // 13 // 0 /// ENST00000286808 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:30165564:30166756:-1 gene:ENSG00000156282 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AY358094 // GenBank // Homo sapiens clone DNA73737 CLDN17 (UNQ758) mRNA, complete cds. // chr21 // 91 // 92 // 20 // 22 // 0 /// BC101503 // GenBank // Homo sapiens claudin 17, mRNA (cDNA clone MGC:126552 IMAGE:8069009), complete cds. // chr21 // 92 // 54 // 12 // 13 // 0 /// BC101505 // GenBank // Homo sapiens claudin 17, mRNA (cDNA clone MGC:126554 IMAGE:8069011), complete cds. // chr21 // 92 // 54 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000016000 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:30102969:30166617:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1
NM_199328 // RefSeq // Homo sapiens claudin 8 (CLDN8), mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000399899 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:30214006:30216073:-1 gene:ENSG00000156284 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY358707 // GenBank // Homo sapiens clone DNA73735 CLDN8 (UNQ779) mRNA, complete cds. // chr21 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC020866 // GenBank // Homo sapiens claudin 8, mRNA (cDNA clone MGC:24067 IMAGE:4594155), complete cds. // chr21 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// BC058004 // GenBank // Homo sapiens claudin 8, mRNA (cDNA clone MGC:61830 IMAGE:4606880), complete cds. // chr21 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000016006 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:30215248:30215925:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0
NM_001085455 // RefSeq // Homo sapiens keratin associated protein 24-1 (KRTAP24-1), mRNA. // chr21 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// ENST00000340345 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:30281309:30282958:-1 gene:ENSG00000188694 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// AB096935 // GenBank // Homo sapiens KRTAP24-1 mRNA for keratin associated protein, complete cds. // chr21 // 90 // 100 // 19 // 21 // 0 /// GENSCAN00000015992 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:30282437:30305637:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 57 // 12 // 12 // 0
NM_203405 // RefSeq // Homo sapiens keratin associated protein 26-1 (KRTAP26-1), mRNA. // chr21 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000360542 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:30319124:30320316:-1 gene:ENSG00000197683 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB096936 // GenBank // Homo sapiens KRTAP26-1 mRNA for keratin associated protein, complete cds. // chr21 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// BC057825 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 26-1, mRNA (cDNA clone MGC:71787 IMAGE:30331793), complete cds. // chr21 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0
NM_001077711 // RefSeq // Homo sapiens keratin associated protein 27-1 (KRTAP27-1), mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000382835 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:30337013:30337694:-1 gene:ENSG00000206107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB096937 // GenBank // Homo sapiens KRTAP27-1 mRNA for keratin associated protein, complete cds. // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016004 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:30337045:30337668:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_181624 // RefSeq // Homo sapiens keratin associated protein 23-1 (KRTAP23-1), mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000334160 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:30348399:30348609:-1 gene:ENSG00000186980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC128435 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 23-1, mRNA (cDNA clone MGC:156230 IMAGE:40119522), complete cds. // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_181621 // RefSeq // Homo sapiens keratin associated protein 13-2 (KRTAP13-2), mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000399889 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:30371391:30372257:-1 gene:ENSG00000182816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB096938 // GenBank // Homo sapiens KRTAP13-2 mRNA for keratin associated protein, complete cds. // chr21 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// BC093934 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 13-2, mRNA (cDNA clone MGC:120969 IMAGE:7939779), complete cds. // chr21 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC093936 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 13-2, mRNA (cDNA clone MGC:120971 IMAGE:7939781), complete cds. // chr21 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000015998 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:30348075:30375482:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_181622 // RefSeq // Homo sapiens keratin associated protein 13-3 (KRTAP13-3), mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000390690 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:30425265:30425968:-1 gene:ENSG00000240432 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AB096940 // GenBank // Homo sapiens KRTAP13-3 mRNA for keratin associated protein, complete cds. // chr21 // 83 // 100 // 19 // 23 // 0 /// BC103965 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 13-3, mRNA (cDNA clone MGC:119828 IMAGE:40014483), complete cds. // chr21 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_181607 // RefSeq // Homo sapiens keratin associated protein 19-1 (KRTAP19-1), mRNA. // chr21 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000390689 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:30479699:30480344:-1 gene:ENSG00000184351 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// AB096943 // GenBank // Homo sapiens KRTAP19-1 mRNA for keratin associated protein, complete cds. // chr21 // 79 // 100 // 19 // 24 // 0 /// AJ457067 // GenBank // Homo sapiens partial mRNA for high tyrosine glycine keratin associated protein 19.1 (KRTAP19.1 gene). // chr21 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// BC126284 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 19-1, mRNA (cDNA clone MGC:161562 IMAGE:8992000), complete cds. // chr21 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 /// BC126286 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 19-1, mRNA (cDNA clone MGC:161564 IMAGE:8992002), complete cds. // chr21 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 /// ENST00000620117 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:21:30480048:30491957:-1 gene:ENSG00000244025 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 80 // 42 // 8 // 10 // 0 /// GENSCAN00000015980 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:30480045:30480317:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0
NM_181608 // RefSeq // Homo sapiens keratin associated protein 19-2 (KRTAP19-2), mRNA. // chr21 // 100 // 50 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000334055 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:30487057:30487436:-1 gene:ENSG00000186965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AB180041 // GenBank // Homo sapiens KRTAP19-2 mRNA for keratin associated protein, complete cds. // chr21 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000015982 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:30487177:30487371:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 85 // 59 // 11 // 13 // 0
NM_181609 // RefSeq // Homo sapiens keratin associated protein 19-3 (KRTAP19-3), mRNA. // chr21 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000334063 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:30491464:30491985:-1 gene:ENSG00000244025 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AB096944 // GenBank // Homo sapiens KRTAP19-3 mRNA for keratin associated protein, complete cds. // chr21 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// AF139541 // GenBank // Homo sapiens glycine/tyrosine-rich protein mRNA, complete cds. // chr21 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// BC126280 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:8991996. // chr21 // 92 // 54 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000016008 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:30491712:30491957:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 33 // 8 // 8 // 0
NM_181610 // RefSeq // Homo sapiens keratin associated protein 19-4 (KRTAP19-4), mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000334058 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:30496824:30497133:-1 gene:ENSG00000186967 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// AB096945 // GenBank // Homo sapiens KRTAP19-4 mRNA for keratin associated protein, complete cds. // chr21 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC117197 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 19-4, mRNA (cDNA clone MGC:150806 IMAGE:40125748), complete cds. // chr21 // 84 // 100 // 16 // 19 // 0 /// BC117199 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 19-4, mRNA (cDNA clone MGC:150808 IMAGE:40125750), complete cds. // chr21 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000015990 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:30496856:30497110:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_181611 // RefSeq // Homo sapiens keratin associated protein 19-5 (KRTAP19-5), mRNA. // chr21 // 100 // 52 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000334151 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:30501657:30502117:-1 gene:ENSG00000186977 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AB096946 // GenBank // Homo sapiens KRTAP19-5 mRNA for keratin associated protein, complete cds. // chr21 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC100836 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 19-5, mRNA (cDNA clone MGC:118930 IMAGE:40002081), complete cds. // chr21 // 100 // 52 // 11 // 11 // 0 /// BC100837 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 19-5, mRNA (cDNA clone MGC:118931 IMAGE:40002082), complete cds. // chr21 // 100 // 52 // 11 // 11 // 0 /// BC100838 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 19-5, mRNA (cDNA clone MGC:118932 IMAGE:40002083), complete cds. // chr21 // 100 // 52 // 11 // 11 // 0 /// BC100839 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 19-5, mRNA (cDNA clone MGC:118933 IMAGE:40002084), complete cds. // chr21 // 100 // 52 // 11 // 11 // 0 /// BC113020 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 19-5, mRNA (cDNA clone MGC:134652 IMAGE:40013750), complete cds. // chr21 // 100 // 52 // 11 // 11 // 0 /// BC113021 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 19-5, mRNA (cDNA clone MGC:134653 IMAGE:40013751), complete cds. // chr21 // 100 // 52 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000015975 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:30501872:30502090:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 52 // 11 // 11 // 0
ENST00000334046 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:30541535:30541864:-1 gene:ENSG00000186925 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// NM_181612 // RefSeq // Homo sapiens keratin associated protein 19-6 (KRTAP19-6), mRNA. // chr21 // 63 // 100 // 15 // 24 // 0 /// AB096947 // GenBank // Homo sapiens KRTAP19-6-V1 mRNA for keratin associated protein, complete cds. // chr21 // 63 // 100 // 15 // 24 // 0 /// AB096948 // GenBank // Homo sapiens KRTAP19-6-V2 mRNA for keratin associated protein, complete cds. // chr21 // 63 // 100 // 15 // 24 // 0 /// GENSCAN00000015996 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:30541578:30541823:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000614763 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:21:30541660:30561289:-1 gene:ENSG00000244362 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1
NM_181614 // RefSeq // Homo sapiens keratin associated protein 19-7 (KRTAP19-7), mRNA. // chr21 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000334849 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:30560875:30561314:-1 gene:ENSG00000244362 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AB096949 // GenBank // Homo sapiens KRTAP19-7 mRNA for keratin associated protein, complete cds. // chr21 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC103836 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 19-7, mRNA (cDNA clone MGC:118926 IMAGE:40002029), complete cds. // chr21 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// BC103837 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 19-7, mRNA (cDNA clone MGC:118927 IMAGE:40002030), complete cds. // chr21 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// BC103838 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 19-7, mRNA (cDNA clone MGC:118928 IMAGE:40002031), complete cds. // chr21 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000015997 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:30561098:30561289:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0
NM_181604 // RefSeq // Homo sapiens keratin associated protein 6-2 (KRTAP6-2), mRNA. // chr21 // 100 // 67 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000334897 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:30598590:30598902:-1 gene:ENSG00000186930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0 /// AB096952 // GenBank // Homo sapiens KRTAP6-2 mRNA for keratin associated protein, complete cds. // chr21 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000015985 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:30598686:30601144:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0
NM_181602 // RefSeq // Homo sapiens keratin associated protein 6-1 (KRTAP6-1), mRNA. // chr21 // 100 // 60 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000329122 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:30613431:30613930:-1 gene:ENSG00000184724 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 95 // 100 // 19 // 20 // 0 /// AB096954 // GenBank // Homo sapiens KRTAP6-1 mRNA for keratin associated protein, complete cds. // chr21 // 95 // 100 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000015978 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:30613689:30616456:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 60 // 12 // 12 // 0
NM_181617 // RefSeq // Homo sapiens keratin associated protein 21-2 (KRTAP21-2), mRNA. // chr21 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000333892 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:30746794:30747233:-1 gene:ENSG00000187026 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB096959 // GenBank // Homo sapiens KRTAP21-2 mRNA for keratin associated protein, complete cds. // chr21 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000015983 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:30746917:30747159:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 93 // 54 // 13 // 14 // 0
ENST00000335093 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:30754830:30755428:-1 gene:ENSG00000187005 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// AB096960 // GenBank // Homo sapiens KRTAP21-1 mRNA for keratin associated protein, complete cds. // chr21 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000015993 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:30755102:30755344:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 78 // 75 // 7 // 9 // 0
NM_175857 // RefSeq // Homo sapiens keratin associated protein 8-1 (KRTAP8-1), mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000329621 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:30812697:30813252:-1 gene:ENSG00000183640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB096961 // GenBank // Homo sapiens KRTAP8-1 mRNA for keratin associated protein, complete cds. // chr21 // 90 // 75 // 19 // 21 // 0 /// BC130397 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 8-1, mRNA (cDNA clone MGC:163269 IMAGE:40146428), complete cds. // chr21 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// BC133033 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 8-1, mRNA (cDNA clone MGC:164664 IMAGE:40147055), complete cds. // chr21 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0
NM_181606 // RefSeq // Homo sapiens keratin associated protein 7-1 (gene/pseudogene) (KRTAP7-1), mRNA. // chr21 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// AB096962 // GenBank // Homo sapiens KRTAP7-1 mRNA for keratin associated protein, complete cds. // chr21 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000621162 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:30829039:30829759:-1 gene:ENSG00000274749 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_175858 // RefSeq // Homo sapiens keratin associated protein 11-1 (KRTAP11-1), mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000332378 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:30880644:30881555:-1 gene:ENSG00000182591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB096963 // GenBank // Homo sapiens KRTAP11-1 mRNA for keratin associated protein, complete cds. // chr21 // 79 // 70 // 15 // 19 // 0 /// BC130555 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 11-1, mRNA (cDNA clone MGC:163427 IMAGE:40146586), complete cds. // chr21 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// BC130557 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 11-1, mRNA (cDNA clone MGC:163429 IMAGE:40146588), complete cds. // chr21 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0
NM_001099219 // RefSeq // Homo sapiens keratin associated protein 19-8 (KRTAP19-8), mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000382822 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:31038159:31038476:-1 gene:ENSG00000206102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB096964 // GenBank // Homo sapiens KRTAP19-8 mRNA for keratin associated protein, complete cds. // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032575 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:31038252:31038443:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 81 // 64 // 13 // 16 // 0
NM_018944 // RefSeq // Homo sapiens MIS18 kinetochore protein A (MIS18A), mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000290130 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:32268219:32279069:-1 gene:ENSG00000159055 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF387845 // GenBank // Homo sapiens FAPP1-associated protein 1 (FASP1) mRNA, complete cds. // chr21 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// AK312073 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ92354. // chr21 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC042917 // GenBank // Homo sapiens chromosome 21 open reading frame 45, mRNA (cDNA clone MGC:52175 IMAGE:5934336), complete cds. // chr21 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000026838 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:32264834:32279014:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// BC033076 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5516956, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr21 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_014825 // RefSeq // Homo sapiens URB1 ribosome biogenesis 1 homolog (S. cerevisiae) (URB1), mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENST00000382751 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:32311018:32393026:-1 gene:ENSG00000142207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// GENSCAN00000026843 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:32314918:32393292:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0
NONHSAT081720 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr21 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NR_002996 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 80A (SNORA80A), small nucleolar RNA. // chr21 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000363922 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:21:32377187:32377322:-1 gene:ENSG00000200792 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr21 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT081721 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr21 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_144659 // RefSeq // Homo sapiens t-complex 10-like (TCP10L), mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000334165 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:32572238:32575881:-1 gene:ENSG00000186842 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr21 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// AK001794 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ10932 fis, clone OVARC1000588. // chr21 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// BC027970 // GenBank // Homo sapiens t-complex 10 (mouse)-like, mRNA (cDNA clone MGC:34297 IMAGE:5225527), complete cds. // chr21 // 86 // 100 // 19 // 22 // 0 /// NONHSAT081734 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr21 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0
NM_144659 // RefSeq // Homo sapiens t-complex 10-like (TCP10L), mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000300258 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:32576552:32585533:-1 gene:ENSG00000242220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000472557 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:21:32576659:32585533:-1 gene:ENSG00000242220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000582575 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:32576848:32587373:-1 gene:ENSG00000242220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 93 // 54 // 13 // 14 // 0 /// AF115967 // GenBank // Homo sapiens T-complex protein 10A-2 mRNA, complete cds. // chr21 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC033855 // GenBank // Homo sapiens t-complex 10 (mouse)-like, mRNA (cDNA clone MGC:45397 IMAGE:5163416), complete cds. // chr21 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000491828 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:32576659:32582434:-1 gene:ENSG00000242220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr21 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// NONHSAT081735 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr21 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// GENSCAN00000026836 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:32556344:32703550:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
ENST00000384370 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:21:32841861:32841995:-1 gene:ENSG00000207098 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr21 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT081748 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr21 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000467060 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:21:33918995:33919338:-1 gene:ENSG00000244294 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr21 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT081837 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr21 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NONHSAT081966 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000384685 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:21:36986739:36986851:-1 gene:ENSG00000207416 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr21 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT082001 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr21 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_002240 // RefSeq // Homo sapiens potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 6 (KCNJ6), mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000609713 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:37607376:37916446:-1 gene:ENSG00000157542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC101547 // GenBank // Homo sapiens potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 6, mRNA (cDNA clone MGC:126596 IMAGE:8069053), complete cds. // chr21 // 100 // 43 // 13 // 13 // 0 /// D87327 // GenBank // Homo sapiens GIRK2 mRNA for G protein-coupled inward rectifier potassium channel, complete cds. // chr21 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// U24660 // GenBank // Human G protein coupled inward rectifier potassium channel 2 (hiGIRK2) mRNA, complete cds. // chr21 // 93 // 93 // 26 // 28 // 0 /// AJ001894 // GenBank // Homo sapiens cDNA from cDNA selection, DCR1-23.0. // chr21 // 73 // 37 // 8 // 11 // 0 /// L78480 // GenBank // Homo sapiens inwardly rectifying potassium channel (Kir3.2) mRNA, complete cds. // chr21 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// U52153 // GenBank // Human inwardly rectifying potassium channel Kir3.2 mRNA, complete cds. // chr21 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000005160 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:37622648:37645570:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_005867 // RefSeq // Homo sapiens Down syndrome critical region gene 4 (DSCR4), mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000328264 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:38054011:38121360:-1 gene:ENSG00000184029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB000099 // GenBank // Homo sapiens mRNA for DCRB, complete cds. // chr21 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC069729 // GenBank // Homo sapiens Down syndrome critical region gene 4, mRNA (cDNA clone MGC:97367 IMAGE:7262631), complete cds. // chr21 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// BC096162 // GenBank // Homo sapiens Down syndrome critical region gene 4, mRNA (cDNA clone MGC:116810 IMAGE:40003276), complete cds. // chr21 // 96 // 82 // 22 // 23 // 0 /// BC096163 // GenBank // Homo sapiens Down syndrome critical region gene 4, mRNA (cDNA clone MGC:116811 IMAGE:40003277), complete cds. // chr21 // 96 // 82 // 22 // 23 // 0 /// BC096164 // GenBank // Homo sapiens Down syndrome critical region gene 4, mRNA (cDNA clone MGC:116812 IMAGE:40003278), complete cds. // chr21 // 96 // 82 // 22 // 23 // 0 /// ENST00000398948 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:21:37951425:38121339:-1 gene:ENSG00000184029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// ENST00000482032 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:38093244:38121331:-1 gene:ENSG00000184029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr21 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NONHSAT082077 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr21 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
AY204748 // GenBank // Homo sapiens chromosome 21 open reading frame 24 isoform 6 (C21orf24) mRNA, complete cds. // chr21 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// AY204749 // GenBank // Homo sapiens chromosome 21 open reading frame 24 isoform 7 (C21orf24) mRNA, complete cds. // chr21 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
AJ011409 // GenBank // Homo sapiens mRNA for hypothetical protein, partial. // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT082142 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AF426265 // GenBank // Homo sapiens C21orf87 protein (C21orf87) mRNA, complete cds. // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC130301 // GenBank // Homo sapiens chromosome 21 open reading frame 87, mRNA (cDNA clone MGC:163173 IMAGE:40146332), complete cds. // chr21 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// BC130303 // GenBank // Homo sapiens chromosome 21 open reading frame 87, mRNA (cDNA clone MGC:163175 IMAGE:40146334), complete cds. // chr21 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONHSAT082161 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT082162 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr21 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NR_026543 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 21 open reading frame 88 (C21orf88), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr21 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000329618 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:21:39605599:39612821:-1 gene:ENSG00000184809 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NR_026542 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 21 open reading frame 88 (C21orf88), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr21 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// ENST00000380604 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:21:39605599:39612441:-1 gene:ENSG00000184809 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// ENST00000380612 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:21:39597147:39612441:-1 gene:ENSG00000184809 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// AF426266 // GenBank // Homo sapiens C21orf88 protein form A (C21orf88) mRNA, complete cds. // chr21 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// AF426267 // GenBank // Homo sapiens C21orf88 protein form B (C21orf88) mRNA, complete cds. // chr21 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// NONHSAT082200 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr21 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001271534 // RefSeq // Homo sapiens Down syndrome cell adhesion molecule (DSCAM), transcript variant 2, mRNA. // chr21 // 98 // 98 // 43 // 44 // 0 /// NM_001389 // RefSeq // Homo sapiens Down syndrome cell adhesion molecule (DSCAM), transcript variant 1, mRNA. // chr21 // 100 // 98 // 44 // 44 // 0 /// NR_073202 // RefSeq // Homo sapiens Down syndrome cell adhesion molecule (DSCAM), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr21 // 98 // 93 // 41 // 42 // 0 /// XM_006723975 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens Down syndrome cell adhesion molecule (DSCAM), transcript variant X1, mRNA. // chr21 // 100 // 82 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000400454 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:40010999:40847139:-1 gene:ENSG00000171587 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENST00000404019 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:21:40012901:40353654:-1 gene:ENSG00000171587 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 97 // 78 // 34 // 35 // 0 /// AF023450 // GenBank // Homo sapiens CHD2-52 Down syndrome cell adhesion molecule (DSCAM) mRNA, complete cds. // chr21 // 98 // 91 // 40 // 41 // 0 /// AF217525 // GenBank // Homo sapiens clone cDSC1 Down syndrome cell adhesion molecule (DSCAM) mRNA, complete cds. // chr21 // 100 // 98 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000617870 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:21:40012414:40369270:-1 gene:ENSG00000171587 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 82 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000045976 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:40078592:40124281:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 18 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000045961 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:40286666:40401812:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 22 // 22 // 10 // 45 // 1
NM_182832 // RefSeq // Homo sapiens placenta-specific 4 (PLAC4), mRNA. // chr21 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AF269287 // GenBank // Homo sapiens PP1416 mRNA, complete cds. // chr21 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0
NR_027272 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 479 (LINC00479), long non-coding RNA. // chr21 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000412102 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:41711520:41715775:-1 gene:ENSG00000236384 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr21 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000589300 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:41712856:41715753:-1 gene:ENSG00000236384 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr21 // 94 // 57 // 15 // 16 // 0 /// BC128198 // GenBank // Homo sapiens chromosome 21 open reading frame 129, mRNA (cDNA clone IMAGE:40113932). // chr21 // 94 // 57 // 15 // 16 // 0 /// ENST00000457881 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:41712157:41714055:-1 gene:ENSG00000236384 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr21 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1 /// NONHSAT082274 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr21 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONHSAT082279 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr21 // 94 // 57 // 15 // 16 // 0 /// NONHSAT082276 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr21 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1 /// NONHSAT082277 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr21 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_020639 // RefSeq // Homo sapiens receptor-interacting serine-threonine kinase 4 (RIPK4), mRNA. // chr21 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000332512 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:41739369:41767106:-1 gene:ENSG00000183421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000352483 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:21:41739369:41767089:-1 gene:ENSG00000183421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// AB047783 // GenBank // Homo sapiens ANKRD3 mRNA for dual-specificity Ser/Thr/Tyr kinase, complete cds. // chr21 // 96 // 81 // 25 // 26 // 0 /// AK296685 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50981 complete cds, highly similar to Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4 (EC 2.7.11.1). // chr21 // 93 // 47 // 14 // 15 // 0 /// AK302592 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51151 complete cds, highly similar to Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4 (EC 2.7.11.1). // chr21 // 90 // 63 // 18 // 20 // 0 /// AK316412 // GenBank // Homo sapiens cDNA, FLJ79311 complete cds, highly similar to Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4 (EC 2.7.11.1). // chr21 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// BC110617 // GenBank // Homo sapiens receptor-interacting serine-threonine kinase 4, mRNA (cDNA clone MGC:129992 IMAGE:40034395), complete cds. // chr21 // 81 // 66 // 17 // 21 // 0 /// BC110618 // GenBank // Homo sapiens receptor-interacting serine-threonine kinase 4, mRNA (cDNA clone MGC:129993 IMAGE:40034396), complete cds. // chr21 // 90 // 66 // 19 // 21 // 0 /// GENSCAN00000017803 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:41740893:41767041:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 96 // 72 // 22 // 23 // 0
NR_027243 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 21 open reading frame 128 (C21orf128), long non-coding RNA. // chr21 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000329015 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:21:42102134:42108534:-1 gene:ENSG00000184385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_003226 // RefSeq // Homo sapiens trefoil factor 3 (intestinal) (TFF3), mRNA. // chr21 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000291525 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:21:42312074:42315353:-1 gene:ENSG00000160180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 88 // 74 // 15 // 17 // 0 /// ENST00000398431 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:21:42312053:42315336:-1 gene:ENSG00000160180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 94 // 78 // 17 // 18 // 0 /// ENST00000489676 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:21:42312053:42313686:-1 gene:ENSG00000160180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr21 // 94 // 74 // 16 // 17 // 0 /// ENST00000518498 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:42311667:42315651:-1 gene:ENSG00000160180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AF432265 // GenBank // Homo sapiens trefoil factor 3 mRNA, partial cds. // chr21 // 100 // 43 // 10 // 10 // 0 /// BC017859 // GenBank // Homo sapiens trefoil factor 3 (intestinal), mRNA (cDNA clone MGC:22588 IMAGE:4696566), complete cds. // chr21 // 100 // 74 // 17 // 17 // 0 /// L15203 // GenBank // Human secretory protein (P1.B) mRNA, complete cds. // chr21 // 94 // 78 // 17 // 18 // 0 /// L08044 // GenBank // Human intestinal trefoil factor mRNA, complete cds. // chr21 // 53 // 74 // 9 // 17 // 0 /// GENSCAN00000017802 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:42312256:42315416:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 43 // 10 // 10 // 0 /// NONHSAT082322 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr21 // 94 // 74 // 16 // 17 // 0
NM_005423 // RefSeq // Homo sapiens trefoil factor 2 (TFF2), mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000291526 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:42346357:42351128:-1 gene:ENSG00000160181 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000463771 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:42346374:42350997:-1 gene:ENSG00000160181 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr21 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000475297 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:42346422:42350994:-1 gene:ENSG00000160181 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr21 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC032820 // GenBank // Homo sapiens trefoil factor 2, mRNA (cDNA clone MGC:45237 IMAGE:5184770), complete cds. // chr21 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// X51698 // GenBank // H.sapiens spasmolytic polypeptide (SP) mRNA. // chr21 // 83 // 96 // 19 // 23 // 0 /// GENSCAN00000017810 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:42347154:42350957:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0 /// NONHSAT082324 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr21 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT082325 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr21 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_003225 // RefSeq // Homo sapiens trefoil factor 1 (TFF1), mRNA. // chr21 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000291527 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:42362282:42366594:-1 gene:ENSG00000160182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC032811 // GenBank // Homo sapiens trefoil factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:45303 IMAGE:5186922), complete cds. // chr21 // 95 // 92 // 21 // 22 // 0 /// X00474 // GenBank // Human pS2 mRNA induced by estrogen from human breast cancer cell line MCF-7. // chr21 // 96 // 96 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000017798 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:42362479:42366486:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT082326 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr21 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0
ENST00000516810 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:21:42417497:42417593:-1 gene:ENSG00000252619 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr21 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT082328 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr21 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_001286506 // RefSeq // Homo sapiens radial spoke head 1 homolog (Chlamydomonas) (RSPH1), transcript variant 2, mRNA. // chr21 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NM_080860 // RefSeq // Homo sapiens radial spoke head 1 homolog (Chlamydomonas) (RSPH1), transcript variant 1, mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000291536 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:42472486:42496354:-1 gene:ENSG00000160188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000493019 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:42472486:42496246:-1 gene:ENSG00000160188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr21 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// AB006536 // GenBank // Homo sapiens mRNA for h-meichroacidin, complete cds. // chr21 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AB041016 // GenBank // Homo sapiens TSGA2 mRNA for testis specific protein A2, complete cds. // chr21 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// AK057315 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ32753 fis, clone TESTI2001665. // chr21 // 88 // 97 // 28 // 32 // 0 /// BC101519 // GenBank // Homo sapiens radial spoke head 1 homolog (Chlamydomonas), mRNA (cDNA clone MGC:126568 IMAGE:8069025), complete cds. // chr21 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// BC113367 // GenBank // Homo sapiens radial spoke head 1 homolog (Chlamydomonas), mRNA (cDNA clone MGC:141927 IMAGE:8322419), complete cds. // chr21 // 97 // 88 // 28 // 29 // 0 /// ENST00000398352 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:21:42472697:42496186:-1 gene:ENSG00000160188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 79 // 79 // 26 // 33 // 1 /// GENSCAN00000017806 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:42472818:42496186:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0
XM_003846632 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens uncharacterized LOC100996619 (LOC100996619), mRNA. // chr21 // 76 // 95 // 16 // 21 // 0 /// ENST00000447535 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:42916803:42925646:-1 gene:ENSG00000233056 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr21 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC005107 // GenBank // Homo sapiens chromosome 21 open reading frame 105, mRNA (cDNA clone IMAGE:3840937), partial cds. // chr21 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AB610407 // GenBank // Homo sapiens HERV-Fb1 mRNA for suppressyn, complete cds. // chr21 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT082363 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr21 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000617971 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:21:42917250:42919343:-1 gene:ENSG00000233056 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr21 // 55 // 55 // 12 // 22 // 1
NM_173354 // RefSeq // Homo sapiens salt-inducible kinase 1 (SIK1), mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000270162 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:43414515:43427128:-1 gene:ENSG00000142178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AB047786 // GenBank // Homo sapiens SNF1LK mRNA for serine/threonine protein kinase, complete cds. // chr21 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC038504 // GenBank // Homo sapiens salt-inducible kinase 1, mRNA (cDNA clone MGC:33415 IMAGE:4831049), complete cds. // chr21 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000613488 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:GRCh38:21:6111140:6123740:1 gene:ENSG00000275993 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 97 // 100 // 37 // 38 // 0 /// GENSCAN00000004296 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:6092014:6121519:1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000033661 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:43416742:43426178:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0
NM_007031 // RefSeq // Homo sapiens heat shock transcription factor 2 binding protein (HSF2BP), mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_005261090 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens heat shock transcription factor 2 binding protein (HSF2BP), transcript variant X1, mRNA. // chr21 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000291560 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:43529192:43659493:-1 gene:ENSG00000160207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000443485 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:21:43613851:43659470:-1 gene:ENSG00000160207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// AB007131 // GenBank // Homo sapiens mRNA for HSF2BP, complete cds. // chr21 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK301795 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50271 complete cds, highly similar to Heat shock factor 2-binding protein. // chr21 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC000153 // GenBank // Homo sapiens heat shock transcription factor 2 binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:5123 IMAGE:3048040), complete cds. // chr21 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// CR457067 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834H0411D for gene HSF2BP, heat shock transcription factor 2 binding protein; complete cds, incl. stopcodon. // chr21 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000033665 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:43571824:43659532:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1
NM_000100 // RefSeq // Homo sapiens cystatin B (stefin B) (CSTB), mRNA. // chr21 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000291568 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:43772512:43776445:-1 gene:ENSG00000160213 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC003370 // GenBank // Homo sapiens cystatin B (stefin B), mRNA (cDNA clone MGC:5180 IMAGE:2900656), complete cds. // chr21 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC010532 // GenBank // Homo sapiens cystatin B (stefin B), mRNA (cDNA clone MGC:17497 IMAGE:3453675), complete cds. // chr21 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BT007040 // GenBank // Homo sapiens cystatin B (stefin B) mRNA, complete cds. // chr21 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// CR542148 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834F0723D for gene CSTB, cystatin B (stefin B); complete cds, without stopcodon. // chr21 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// L03558 // GenBank // Homo sapiens cystatin B mRNA, complete cds. // chr21 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// ENST00000480147 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:43774190:43776306:-1 gene:ENSG00000160213 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr21 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// GENSCAN00000036903 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:43774202:43776269:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 93 // 52 // 14 // 15 // 0 /// NONHSAT082449 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr21 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1
ENST00000362728 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:21:43919795:43919901:-1 gene:ENSG00000199598 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT082464 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000516797 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:21:43996322:43996420:-1 gene:ENSG00000252606 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT082469 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_013369 // RefSeq // Homo sapiens DNA (cytosine-5-)-methyltransferase 3-like (DNMT3L), transcript variant 1, mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_175867 // RefSeq // Homo sapiens DNA (cytosine-5-)-methyltransferase 3-like (DNMT3L), transcript variant 2, mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006723911 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3-like (LOC102724184), mRNA. // chr21 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000270172 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:44246339:44262216:-1 gene:ENSG00000142182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000431166 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:21:44250810:44261882:-1 gene:ENSG00000142182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000436357 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:21:44246339:44251238:-1 gene:ENSG00000142182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// AF194032 // GenBank // Homo sapiens cytosine-5-methyltransferase 3-like protein (DNMT3L) mRNA, complete cds. // chr21 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC002560 // GenBank // Homo sapiens DNA (cytosine-5-)-methyltransferase 3-like, mRNA (cDNA clone MGC:1090 IMAGE:3138514), complete cds. // chr21 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000036921 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:44197212:44282534:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000033401 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:5011799:5064936:1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_001272037 // RefSeq // Homo sapiens thrombospondin-type laminin G domain and EAR repeats (TSPEAR), transcript variant 2, mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_144991 // RefSeq // Homo sapiens thrombospondin-type laminin G domain and EAR repeats (TSPEAR), transcript variant 1, mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000323084 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:44497892:44711580:-1 gene:ENSG00000175894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000397916 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:21:44508507:44573816:-1 gene:ENSG00000175894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// BC021197 // GenBank // Homo sapiens chromosome 21 open reading frame 29, mRNA (cDNA clone IMAGE:3940847), partial cds. // chr21 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// BC115415 // GenBank // Homo sapiens chromosome 21 open reading frame 29, mRNA (cDNA clone MGC:135061 IMAGE:40080529), complete cds. // chr21 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000613245 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:21:44497894:44711580:-1 gene:ENSG00000175894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000614657 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:21:44497894:44711580:-1 gene:ENSG00000175894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000036919 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:44499783:44540150:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NM_198691 // RefSeq // Homo sapiens keratin associated protein 10-1 (KRTAP10-1), mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000400375 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:44538981:44540195:-1 gene:ENSG00000215455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AB076347 // GenBank // Homo sapiens KRTAP18.1 mRNA for keratin associated protein, complete cds. // chr21 // 85 // 100 // 17 // 20 // 0 /// BC120959 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 10-1, mRNA (cDNA clone MGC:149442 IMAGE:40115271), complete cds. // chr21 // 89 // 95 // 17 // 19 // 0 /// BC120960 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 10-1, mRNA (cDNA clone MGC:149443 IMAGE:40115274), complete cds. // chr21 // 89 // 95 // 17 // 19 // 0 /// AJ566380 // GenBank // Homo sapiens partial mRNA for keratin associated protein KAP10.1 (KRTAP10-1 gene). // chr21 // 60 // 60 // 12 // 20 // 1 /// NONHSAT082866 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr21 // 60 // 60 // 12 // 20 // 1
NM_198693 // RefSeq // Homo sapiens keratin associated protein 10-2 (KRTAP10-2), mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000391621 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:44550357:44551505:-1 gene:ENSG00000205445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// AB076348 // GenBank // Homo sapiens KRTAP18.2 mRNA for keratin associated protein, complete cds. // chr21 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000498210 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:44550435:44551505:-1 gene:ENSG00000205445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr21 // 67 // 67 // 8 // 12 // 1 /// GENSCAN00000036920 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:44550691:44551458:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// NONHSAT082868 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr21 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// NONHSAT082867 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr21 // 67 // 67 // 8 // 12 // 1
NM_198696 // RefSeq // Homo sapiens keratin associated protein 10-3 (KRTAP10-3), mRNA. // chr21 // 92 // 100 // 11 // 12 // 0 /// ENST00000391620 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:44557790:44558760:-1 gene:ENSG00000212935 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// AB076350 // GenBank // Homo sapiens KRTAP18.3 mRNA for keratin associated protein, complete cds. // chr21 // 92 // 100 // 11 // 12 // 0 /// BC133677 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 10-3, mRNA (cDNA clone MGC:149874 IMAGE:40119288), complete cds. // chr21 // 55 // 92 // 6 // 11 // 0
NM_198694 // RefSeq // Homo sapiens keratin associated protein 10-5 (KRTAP10-5), mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000400372 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:44579455:44580604:-1 gene:ENSG00000241123 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// AB076352 // GenBank // Homo sapiens KRTAP18.5 mRNA for keratin associated protein, complete cds. // chr21 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC120949 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 10-5, mRNA (cDNA clone MGC:149428 IMAGE:40115143), complete cds. // chr21 // 88 // 100 // 14 // 16 // 0 /// BC120950 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 10-5, mRNA (cDNA clone MGC:149429 IMAGE:40115146), complete cds. // chr21 // 56 // 100 // 9 // 16 // 0
NM_198698 // RefSeq // Homo sapiens keratin associated protein 12-4 (KRTAP12-4), mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000391618 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:44654213:44654659:-1 gene:ENSG00000212933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB076360 // GenBank // Homo sapiens KRTAP12.4 mRNA for keratin associated protein, complete cds. // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC125198 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 12-4, mRNA (cDNA clone MGC:150594 IMAGE:40123223), complete cds. // chr21 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// NONHSAT082873 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036907 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:44646494:44657096:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_181684 // RefSeq // Homo sapiens keratin associated protein 12-2 (KRTAP12-2), mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000360770 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:44666189:44666927:-1 gene:ENSG00000221864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// AB076362 // GenBank // Homo sapiens KRTAP12.2 mRNA for keratin associated protein, complete cds. // chr21 // 94 // 100 // 15 // 16 // 0 /// AJ566389 // GenBank // Homo sapiens mRNA for keratin associated protein KAP12.2 (KRTAP12-2 gene). // chr21 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC120941 // GenBank // Homo sapiens keratin associated protein 12-2, mRNA (cDNA clone MGC:149419 IMAGE:40115087), complete cds. // chr21 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0
NM_181686 // RefSeq // Homo sapiens keratin associated protein 12-1 (KRTAP12-1), mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000391617 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:44681576:44682163:-1 gene:ENSG00000187175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// AB076363 // GenBank // Homo sapiens KRTAP12.1 mRNA for keratin associated protein, complete cds. // chr21 // 85 // 76 // 11 // 13 // 0
NR_027128 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 21 open reading frame 67 (C21orf67), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr21 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000397841 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:21:44932814:44939913:-1 gene:ENSG00000183250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// AY035381 // GenBank // Homo sapiens C21orf69 protein mRNA, complete cds. // chr21 // 78 // 96 // 21 // 27 // 0 /// ENST00000615847 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:21:44932814:44934973:-1 gene:ENSG00000183250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 89 // 96 // 24 // 27 // 0 /// GENSCAN00000034639 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:44884354:44935248:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NR_027129 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 21 open reading frame 67 (C21orf67), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr21 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000330551 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:21:44934725:44939845:-1 gene:ENSG00000183250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF380178 // GenBank // Homo sapiens C21orf67 protein (C21orf67) mRNA, complete cds. // chr21 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AY040088 // GenBank // Homo sapiens C21orf67 isoform B protein (C21orf67) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr21 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NR_027128 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 21 open reading frame 67 (C21orf67), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr21 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1 /// ENST00000397841 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:21:44932814:44939913:-1 gene:ENSG00000183250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1 /// AK127059 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ45116 fis, clone BRAWH3035154. // chr21 // 31 // 31 // 11 // 36 // 1
GENSCAN00000034642 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:45091681:45095578:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
AF426264 // GenBank // Homo sapiens C21orf86 protein (C21orf86) mRNA, complete cds. // chr21 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006724071 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens putative uncharacterized protein encoded by LINC00205-like (LOC102723489), mRNA. // chr21 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// XM_006726808 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens putative uncharacterized protein encoded by LINC00205-like (LOC102725097), mRNA. // chr21 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
GENSCAN00000034656 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:45265482:45352167:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NR_028082 // RefSeq // Homo sapiens COL18A1 antisense RNA 1 (COL18A1-AS1), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr21 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000397787 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:45419716:45425040:-1 gene:ENSG00000183535 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr21 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC111539 // GenBank // Homo sapiens chromosome 21 open reading frame 123, mRNA (cDNA clone MGC:129884 IMAGE:40026216), complete cds. // chr21 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NR_027498 // RefSeq // Homo sapiens COL18A1 antisense RNA 1 (COL18A1-AS1), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr21 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// ENST00000485206 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:45419716:45425070:-1 gene:ENSG00000183535 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr21 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// BC111540 // GenBank // Homo sapiens chromosome 21 open reading frame 123, mRNA (cDNA clone MGC:129885 IMAGE:40026217), complete cds. // chr21 // 76 // 76 // 22 // 29 // 1 /// NONHSAT082960 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr21 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// NONHSAT082961 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr21 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// GENSCAN00000034648 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:45420144:45430411:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
GENSCAN00000004625 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:45761356:45821903:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
GENSCAN00000004630 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:45914364:45932563:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_006272 // RefSeq // Homo sapiens S100 calcium binding protein B (S100B), mRNA. // chr21 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000291700 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:21:46598962:46605208:-1 gene:ENSG00000160307 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000367071 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:21:46598962:46605208:-1 gene:ENSG00000160307 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC001766 // GenBank // Homo sapiens S100 calcium binding protein B, mRNA (cDNA clone MGC:1323 IMAGE:3543825), complete cds. // chr21 // 90 // 80 // 18 // 20 // 0 /// CR542123 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834C0623D for gene S100B, S100 calcium binding protein, beta (neural); complete cds, incl. stopcodon. // chr21 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000397648 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:21:46599281:46602893:-1 gene:ENSG00000160307 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// GENSCAN00000004634 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:21:46599363:46602415:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr21 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
AF172850 // GenBank // Homo sapiens melanoma antigen mRNA, complete cds. // chrUn // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000436585 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:13:18809830:18810048:1 gene:ENSG00000225016 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrUn // 45 // 74 // 9 // 20 // 0 /// ENST00000618686 // ENSEMBL // ensembl:known scaffold:GRCh38:GL000009.2:56140:58376:-1 gene:ENSG00000278704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 74 // 100 // 20 // 27 // 0 /// NONHSAT032213 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrUn // 45 // 74 // 9 // 20 // 0
ENST00000588548 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:16612582:16615104:1 gene:ENSG00000100181 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr22 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// AK097082 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39763 fis, clone SPLEN2000064. // chr22 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT083139 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr22 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001289905 // RefSeq // Homo sapiens interleukin 17 receptor A (IL17RA), transcript variant 2, mRNA. // chr22 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// NM_014339 // RefSeq // Homo sapiens interleukin 17 receptor A (IL17RA), transcript variant 1, mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000319363 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:17084959:17115693:1 gene:ENSG00000177663 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000477874 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:22:17084954:17100469:1 gene:ENSG00000177663 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr22 // 91 // 32 // 10 // 11 // 0 /// BC011624 // GenBank // Homo sapiens interleukin 17 receptor A, mRNA (cDNA clone MGC:10262 IMAGE:4053746), complete cds. // chr22 // 94 // 97 // 31 // 33 // 0 /// CT841520 // GenBank // Homo sapiens IL17R full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.IL17R.V3). // chr22 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// JF305973 // GenBank // Homo sapiens truncated IL-17RA mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// U58917 // GenBank // Homo sapiens IL-17 receptor mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000612619 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:22:17084959:17115694:1 gene:ENSG00000177663 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000044961 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:17085092:17109820:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0
NR_024483 // RefSeq // Homo sapiens CECR5 antisense RNA 1 (CECR5-AS1), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr22 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000431923 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:17159399:17165445:1 gene:ENSG00000185837 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr22 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONHSAT083196 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr22 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONHSAT083198 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr22 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_001290046 // RefSeq // Homo sapiens cat eye syndrome chromosome region, candidate 2 (CECR2), transcript variant 2, mRNA. // chr22 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NM_001290047 // RefSeq // Homo sapiens cat eye syndrome chromosome region, candidate 2 (CECR2), transcript variant 1, mRNA. // chr22 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// XM_006724079 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens cat eye syndrome chromosome region, candidate 2 (CECR2), transcript variant X3, mRNA. // chr22 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000262608 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:22:17369784:17554145:1 gene:ENSG00000099954 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000342247 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:22:17369366:17554145:1 gene:ENSG00000099954 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000400585 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:22:17359949:17553332:1 gene:ENSG00000099954 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// AF336133 // GenBank // Homo sapiens CECR2 protein (CECR2) mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AF411609 // GenBank // Homo sapiens CECR2B mRNA, partial cds. // chr22 // 92 // 44 // 11 // 12 // 0 /// ENST00000612582 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:22:17477093:17558149:1 gene:ENSG00000099954 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000044958 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:17264725:17590236:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
NR_103718 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 528 (LINC00528), long non-coding RNA. // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000600723 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:17777322:17779481:1 gene:ENSG00000269220 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT083229 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr22 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// TCONS_00029501-XLOC_014144 // Rinn lincRNA // linc-PEX26-2 chr22:+:18257667-18262240 // chr22 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
NM_001193414 // RefSeq // Homo sapiens tubulin, alpha 8 (TUBA8), transcript variant 2, mRNA. // chr22 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NM_018943 // RefSeq // Homo sapiens tubulin, alpha 8 (TUBA8), transcript variant 1, mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000316027 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:22:18110687:18131154:1 gene:ENSG00000183785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000330423 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:18110793:18131731:1 gene:ENSG00000183785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000416740 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:22:18121107:18131117:1 gene:ENSG00000183785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC074827 // GenBank // Homo sapiens tubulin, alpha 8, mRNA (cDNA clone MGC:104090 IMAGE:30915541), complete cds. // chr22 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC104845 // GenBank // Homo sapiens tubulin, alpha 8, mRNA (cDNA clone MGC:132505 IMAGE:8143848), complete cds. // chr22 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BX537702 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686L04275 (from clone DKFZp686L04275). // chr22 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// CR456600 // GenBank // Homo sapiens TUBA8 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.TUBA8.V2). // chr22 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000474897 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:18078015:18131138:1 gene:ENSG00000215193 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr22 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// GENSCAN00000048609 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:18091730:18176817:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_017414 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 18 (USP18), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000215794 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:18149899:18177397:1 gene:ENSG00000184979 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// AF176642 // GenBank // Homo sapiens ubiquitin-specific protease ISG43 (ISG43) mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0 /// AJ243526 // GenBank // Homo sapiens mRNA for putative deubiquitinazing enzyme (hUBP43 gene). // chr22 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0 /// BC014896 // GenBank // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 18, mRNA (cDNA clone MGC:10206 IMAGE:3910720), complete cds. // chr22 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0 /// BT006835 // GenBank // Homo sapiens ubiquitin specific protease 18 mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0 /// CT841507 // GenBank // Homo sapiens Em:AC008079.1 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.Em:AC008079.1.V3). // chr22 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0
AK090944 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ33625 fis, clone BRAMY2022052. // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000384012 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:22:19045256:19045367:1 gene:ENSG00000206739 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT083378 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_053006 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific serine kinase 2 (TSSK2), mRNA. // chr22 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000399635 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:19130808:19132623:1 gene:ENSG00000206203 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// AF362953 // GenBank // Homo sapiens testis specific serine/threonine kinase 2 (STK22B) mRNA, complete cds. // chr22 // 86 // 58 // 12 // 14 // 0 /// BC037781 // GenBank // Homo sapiens testis-specific serine kinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:41904 IMAGE:5273397), complete cds. // chr22 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0
ENST00000516131 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:22:19249873:19249966:1 gene:ENSG00000251940 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr22 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT083399 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0
ENST00000463821 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:22:19365766:19366044:1 gene:ENSG00000244296 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT083402 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_003776 // RefSeq // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein L40 (MRPL40), mRNA. // chr22 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000333130 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:19431902:19436075:1 gene:ENSG00000185608 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000443660 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:19432579:19436067:1 gene:ENSG00000185608 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr22 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// AF034091 // GenBank // Homo sapiens nuclear localization signal containing protein deleted in Velo-Cardio-Facial syndrome (Nlvcf) mRNA, complete cds. // chr22 // 88 // 86 // 21 // 24 // 0 /// AK123768 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ41774 fis, clone IMR322011689, highly similar to 39S ribosomal protein L40, mitochondrial precursor. // chr22 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC009707 // GenBank // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein L40, mRNA (cDNA clone MGC:9400 IMAGE:3876531), complete cds. // chr22 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// CR456532 // GenBank // Homo sapiens NLVCF full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.NLVCF). // chr22 // 90 // 71 // 18 // 20 // 0 /// AK057708 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ33146 fis, clone UTERU2000197, moderately similar to Homo sapiens nuclear localization signal containing protein deleted in Velo-Cardio-Facial syndrome (Nlvcf) mRNA. // chr22 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// ENST00000471259 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:22:19432939:19436010:1 gene:ENSG00000185608 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr22 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// GENSCAN00000019647 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:19431538:19435962:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
L20860 // GenBank // Human glycoprotein Ib beta mRNA, complete cds. // chr22 // 95 // 100 // 38 // 40 // 0 /// NR_037611 // RefSeq // Homo sapiens SEPT5-GP1BB readthrough (SEPT5-GP1BB), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr22 // 85 // 85 // 34 // 40 // 1 /// NR_037612 // RefSeq // Homo sapiens SEPT5-GP1BB readthrough (SEPT5-GP1BB), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr22 // 85 // 85 // 34 // 40 // 1 /// ENST00000366425 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:19722945:19724771:1 gene:ENSG00000203618 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 78 // 78 // 31 // 40 // 1 /// ENST00000431044 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:19718469:19724772:1 gene:ENSG00000184702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr22 // 85 // 85 // 34 // 40 // 1 /// U59632 // GenBank // Homo sapiens H5 mRNA, partial cds; and platelet glycoprotein Ib beta chain mRNA, complete cds. // chr22 // 85 // 85 // 34 // 40 // 1 /// NM_000407 // RefSeq // Homo sapiens glycoprotein Ib (platelet), beta polypeptide (GP1BB), mRNA. // chr22 // 63 // 63 // 25 // 40 // 1 /// ENST00000455843 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:19717220:19724216:1 gene:ENSG00000184702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr22 // 55 // 55 // 22 // 40 // 1 /// ENST00000470814 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:19720554:19724224:1 gene:ENSG00000184702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr22 // 55 // 55 // 22 // 40 // 1 /// J03259 // GenBank // Human platelet glycoprotein Ib beta chain mRNA, complete cds. // chr22 // 55 // 55 // 22 // 40 // 1 /// GENSCAN00000019656 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:19718295:19724464:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 30 // 30 // 12 // 40 // 1
NM_000407 // RefSeq // Homo sapiens glycoprotein Ib (platelet), beta polypeptide (GP1BB), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_037611 // RefSeq // Homo sapiens SEPT5-GP1BB readthrough (SEPT5-GP1BB), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_037612 // RefSeq // Homo sapiens SEPT5-GP1BB readthrough (SEPT5-GP1BB), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000366425 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:19722945:19724771:1 gene:ENSG00000203618 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000431044 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:19718469:19724772:1 gene:ENSG00000184702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// J03259 // GenBank // Human platelet glycoprotein Ib beta chain mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// L20860 // GenBank // Human glycoprotein Ib beta mRNA, complete cds. // chr22 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// U59632 // GenBank // Homo sapiens H5 mRNA, partial cds; and platelet glycoprotein Ib beta chain mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000455843 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:19717220:19724216:1 gene:ENSG00000184702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr22 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// ENST00000470814 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:19720554:19724224:1 gene:ENSG00000184702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr22 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// GENSCAN00000019656 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:19718295:19724464:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
L20860 // GenBank // Human glycoprotein Ib beta mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
L20860 // GenBank // Human glycoprotein Ib beta mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 100 // 5 // 5 // 1
NM_005992 // RefSeq // Homo sapiens T-box 1 (TBX1), transcript variant B, mRNA. // chr22 // 100 // 61 // 25 // 25 // 0 /// NM_080646 // RefSeq // Homo sapiens T-box 1 (TBX1), transcript variant A, mRNA. // chr22 // 100 // 51 // 21 // 21 // 0 /// NM_080647 // RefSeq // Homo sapiens T-box 1 (TBX1), transcript variant C, mRNA. // chr22 // 100 // 78 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000329705 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:19756703:19779546:1 gene:ENSG00000184058 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 51 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000332710 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:22:19756703:19767334:1 gene:ENSG00000184058 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 78 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000359500 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:19756703:19783593:1 gene:ENSG00000184058 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 61 // 25 // 25 // 0 /// AF012130 // GenBank // Homo sapiens brachyury variant A (TBX1) mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 51 // 21 // 21 // 0 /// AF012131 // GenBank // Homo sapiens brachyury variant B (TBX1) mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 61 // 25 // 25 // 0 /// AF373867 // GenBank // Homo sapiens T-box 1 transcription factor C (TBX1C) mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 78 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000621939 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:22:19756703:19783022:1 gene:ENSG00000184058 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 56 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000019635 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:19756993:19766867:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 54 // 54 // 22 // 41 // 1
NR_029706 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 185 (MIR185), microRNA. // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000385288 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:22:20033133:20033241:1 gene:ENSG00000208023 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-185 // miRBase Micro RNA Database // MI0000482 Homo sapiens miR-185 stem-loop // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT083465 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_026919 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 896 (LINC00896), long non-coding RNA. // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000609602 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:20206397:20208524:1 gene:ENSG00000236499 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT083493 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONHSAT083513 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT083666 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT083689 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000611762 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:22:18615581:18615900:1 gene:ENSG00000275362 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr22 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000617743 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:22:21379382:21379701:-1 gene:ENSG00000273846 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr22 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000619894 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:22:21555138:21555457:1 gene:ENSG00000275293 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr22 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENST00000365046 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:22:20481158:20481268:1 gene:ENSG00000201916 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT083541 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_024592 // RefSeq // Homo sapiens POM121 transmembrane nucleoporin-like 4 pseudogene (POM121L4P), non-coding RNA. // chr22 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000412250 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:20690031:20691317:1 gene:ENSG00000217261 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr22 // 100 // 74 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000427789 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:20689929:20698938:1 gene:ENSG00000217261 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr22 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000018459 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:20690031:20691838:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0
NR_026815 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 191A (pseudogene) (TMEM191A), non-coding RNA. // chr22 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000450925 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:20701114:20704606:1 gene:ENSG00000226287 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:lincRNA // chr22 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000018478 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:20702007:20704490:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 70 // 7 // 7 // 0 /// NONHSAT083579 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr22 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// TCONS_00029319-XLOC_014160 // Rinn lincRNA // linc-SERPIND1 chr22:+:21055401-21058891 // chr22 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_000185 // RefSeq // Homo sapiens serpin peptidase inhibitor, clade D (heparin cofactor), member 1 (SERPIND1), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000215727 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:20773879:20787720:1 gene:ENSG00000099937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000406799 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:20779181:20787232:1 gene:ENSG00000099937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// BC035028 // GenBank // Homo sapiens serpin peptidase inhibitor, clade D (heparin cofactor), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:33758 IMAGE:5262187), complete cds. // chr22 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// CR456573 // GenBank // Homo sapiens SERPIND1 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.SERPIND1.V2). // chr22 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// M12849 // GenBank // Human heparin cofactor II (HC-II) mRNA, complete cds. // chr22 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000018495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:20779313:20787066:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
NM_004782 // RefSeq // Homo sapiens synaptosomal-associated protein, 29kDa (SNAP29), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000215730 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:20858983:20891218:1 gene:ENSG00000099940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000439214 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:22:20859483:20887819:1 gene:ENSG00000099940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// AF115436 // GenBank // Homo sapiens SNAP-29 mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// BC009715 // GenBank // Homo sapiens synaptosomal-associated protein, 29kDa, mRNA (cDNA clone MGC:9432 IMAGE:3900895), complete cds. // chr22 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// BT007357 // GenBank // Homo sapiens synaptosomal-associated protein, 29kDa mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// CR456582 // GenBank // Homo sapiens SNAP29 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.SNAP29). // chr22 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000018485 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:20845125:20887836:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1
NM_005207 // RefSeq // Homo sapiens v-crk avian sarcoma virus CT10 oncogene homolog-like (CRKL), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000354336 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:20917426:20953749:1 gene:ENSG00000099942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000411769 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:20917434:20953747:1 gene:ENSG00000099942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr22 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// AK292909 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77301 complete cds, highly similar to Homo sapiens v-crk sarcoma virus CT10 oncogene homolog (avian)-like (CRKL), mRNA. // chr22 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// BC043500 // GenBank // Homo sapiens v-crk sarcoma virus CT10 oncogene homolog (avian)-like, mRNA (cDNA clone MGC:49914 IMAGE:6046673), complete cds. // chr22 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// CR456423 // GenBank // Homo sapiens CRKL full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.CRKL). // chr22 // 100 // 33 // 12 // 12 // 0
ENST00000362986 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:18:7995570:7995785:1 gene:ENSG00000199856 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr22 // 86 // 100 // 6 // 7 // 0 /// ENST00000384034 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:14:101145480:101145695:-1 gene:ENSG00000277754 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA gene:ENSG00000206761 // chr22 // 86 // 100 // 6 // 7 // 0 /// NONHSAT006578 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 86 // 100 // 6 // 7 // 0 /// NONHSAT040012 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr22 // 86 // 100 // 6 // 7 // 0 /// NONHSAT057163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr22 // 86 // 100 // 6 // 7 // 0 /// NONHSAT076932 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 71 // 100 // 5 // 7 // 0
NR_027006 // RefSeq // Homo sapiens leucine-rich repeat-containing protein LOC400891 (LOC400891), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr22 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NR_110991 // RefSeq // Homo sapiens leucine-rich repeat-containing protein LOC400891 (LOC400891), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr22 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000442047 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:22:21045987:21060447:1 gene:ENSG00000187905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000473769 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:21045981:21062276:1 gene:ENSG00000187905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr22 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000497328 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:21045960:21064168:1 gene:ENSG00000187905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr22 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NM_001291006 // RefSeq // Homo sapiens leucine-rich repeat-containing protein LOC400891 (LOC400891), transcript variant 1, mRNA. // chr22 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// NONHSAT083628 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr22 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// NONHSAT083629 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr22 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// TCONS_00029320-XLOC_014162 // Rinn lincRNA // linc-RIMBP3C-5 chr22:+:21400248-21418455 // chr22 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// TCONS_00029522-XLOC_014162 // Rinn lincRNA // linc-RIMBP3C-5 chr22:+:21408237-21416630 // chr22 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// TCONS_00029768-XLOC_014162 // Rinn lincRNA // linc-RIMBP3C-5 chr22:+:21410799-21416553 // chr22 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000010615 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:21045987:21070097:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_015094 // RefSeq // Homo sapiens hypermethylated in cancer 2 (HIC2), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000407464 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:21417404:21451463:1 gene:ENSG00000169635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000407598 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:21420636:21449434:1 gene:ENSG00000169635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000443632 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:21442460:21451463:1 gene:ENSG00000169635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AF349035 // GenBank // Homo sapiens HIC-3 mRNA, complete cds. // chr22 // 92 // 52 // 11 // 12 // 0 /// BC094787 // GenBank // Homo sapiens hypermethylated in cancer 2, mRNA (cDNA clone MGC:104729 IMAGE:30531041), complete cds. // chr22 // 95 // 83 // 18 // 19 // 0 /// CR456377 // GenBank // Homo sapiens Em:AP000557.1 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.Em:AP000557.1.V3). // chr22 // 93 // 65 // 14 // 15 // 0 /// GENSCAN00000010624 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:21444950:21446743:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 39 // 9 // 9 // 0
NM_001256355 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin-conjugating enzyme E2L 3 (UBE2L3), transcript variant 4, mRNA. // chr22 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// NM_001256356 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin-conjugating enzyme E2L 3 (UBE2L3), transcript variant 3, mRNA. // chr22 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// NM_003347 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin-conjugating enzyme E2L 3 (UBE2L3), transcript variant 1, mRNA. // chr22 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// NR_028436 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin-conjugating enzyme E2L 3 (UBE2L3), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr22 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NR_046082 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin-conjugating enzyme E2L 3 (UBE2L3), transcript variant 5, non-coding RNA. // chr22 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000342192 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:21567547:21624034:1 gene:ENSG00000185651 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000458578 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:22:21549447:21624034:1 gene:ENSG00000185651 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000496722 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:21567730:21624034:1 gene:ENSG00000185651 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr22 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000545681 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:22:21567547:21624034:1 gene:ENSG00000185651 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT083691 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr22 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT083692 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr22 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0
NM_152612 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 116 (CCDC116), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006724159 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens coiled-coil domain containing 116 (CCDC116), transcript variant X1, mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000292779 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:21632729:21637327:1 gene:ENSG00000161180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK093365 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ36046 fis, clone TESTI2017923. // chr22 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC033499 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 116, mRNA (cDNA clone MGC:35219 IMAGE:5172053), complete cds. // chr22 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000607942 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:22:21632716:21635802:1 gene:ENSG00000161180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// AK302030 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61602 complete cds, moderately similar to Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 116 (Ccdc116), mRNA. // chr22 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// ENST00000425975 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:22:21632718:21634209:1 gene:ENSG00000161180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// GENSCAN00000010647 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:21632643:21637070:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_022044 // RefSeq // Homo sapiens stromal cell-derived factor 2-like 1 (SDF2L1), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000248958 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:21642261:21644298:1 gene:ENSG00000128228 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// AB043007 // GenBank // Homo sapiens SDF2L1 mRNA for SDF2 like protein 1, complete cds. // chr22 // 91 // 92 // 20 // 22 // 0 /// AF277316 // GenBank // Homo sapiens PWP1-interacting protein 8 percursor (PWP1) mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// AY359118 // GenBank // Homo sapiens clone DNA96857 HGS_A135 (UNQ1941) mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// BC132849 // GenBank // Homo sapiens stromal cell-derived factor 2-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:164480 IMAGE:40146871), complete cds. // chr22 // 86 // 92 // 19 // 22 // 0 /// BC132851 // GenBank // Homo sapiens stromal cell-derived factor 2-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:164482 IMAGE:40146873), complete cds. // chr22 // 86 // 92 // 19 // 22 // 0 /// CR456570 // GenBank // Homo sapiens SDF2L1 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.SDF2L1). // chr22 // 95 // 83 // 19 // 20 // 0 /// ENST00000466935 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:21642354:21643292:1 gene:ENSG00000128228 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr22 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1 /// GENSCAN00000010631 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:21642337:21695490:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 94 // 75 // 17 // 18 // 0 /// BC006248 // GenBank HTC // Homo sapiens stromal cell-derived factor 2-like 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3946057). // chr22 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// BT006944 // GenBank // Homo sapiens dihydropyrimidinase-like 2 mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0
NR_029845 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 130b (MIR130B), microRNA. // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000385018 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:22:21653304:21653385:1 gene:ENSG00000207751 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000498589 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:21652270:21670237:1 gene:ENSG00000100023 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr22 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// hsa-mir-130b // miRBase Micro RNA Database // MI0000748 Homo sapiens miR-130b stem-loop // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT083701 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT083698 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr22 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONHSAT083699 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr22 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
ENST00000364115 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:22:21792434:21792524:1 gene:ENSG00000200985 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr22 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000364976 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:148557947:148558048:1 gene:ENSG00000201846 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr22 // 50 // 100 // 2 // 4 // 0 /// NONHSAT083720 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT098697 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 50 // 100 // 2 // 4 // 0
ENST00000390285 // ENSEMBL // ensembl_havana_ig_gene:known chromosome:GRCh38:22:22195713:22196460:1 gene:ENSG00000211640 gene_biotype:IG_V_gene transcript_biotype:IG_V_gene // chr22 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000037252 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:22182396:22202206:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// X02422 // GenBank // Human mRNA for Ig lambda L-chain V(VI)-J-C. // chr22 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_007128 // RefSeq // Homo sapiens pre-B lymphocyte 1 (VPREB1), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000302273 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:22:22244780:22245505:1 gene:ENSG00000169575 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000403807 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:22244675:22245515:1 gene:ENSG00000169575 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC017922 // GenBank // Homo sapiens pre-B lymphocyte gene 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4699435). // chr22 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// CR456609 // GenBank // Homo sapiens VPREB1 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.VPREB1). // chr22 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000037262 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:22244745:22245337:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
BC033148 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4122983, containing frame-shift errors. // chr22 // 92 // 87 // 12 // 13 // 0 /// BX641141 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686N19169 (from clone DKFZp686N19169). // chr22 // 67 // 100 // 10 // 15 // 0 /// XR_430414 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens BMS1 pseudogene 20 (BMS1P20), transcript variant X1, misc_RNA. // chr22 // 80 // 80 // 12 // 15 // 1 /// NR_027293 // RefSeq // Homo sapiens BMS1 pseudogene 20 (BMS1P20), non-coding RNA. // chr22 // 60 // 60 // 9 // 15 // 1 /// NONHSAT083763 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr22 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT083765 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr22 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000413293 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:22303224:22310401:1 gene:ENSG00000272779 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr22 // 80 // 80 // 12 // 15 // 1 /// NONHSAT083767 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr22 // 80 // 80 // 12 // 15 // 1 /// NONHSAT083764 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr22 // 60 // 60 // 9 // 15 // 1 /// NONHSAT147204 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr22 // 60 // 60 // 9 // 15 // 1
ENST00000427632 // ENSEMBL // havana_ig_gene:known chromosome:GRCh38:22:22343187:22343732:1 gene:ENSG00000223350 gene_biotype:IG_V_gene transcript_biotype:IG_V_gene // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC022822 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4575521, partial cds. // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037240 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:22343224:22343732:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
ENST00000390295 // ENSEMBL // havana_ig_gene:known chromosome:GRCh38:22:22369614:22370086:1 gene:ENSG00000211649 gene_biotype:IG_V_gene transcript_biotype:IG_V_gene // chr22 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000037247 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:22357795:22370123:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001282879 // RefSeq // Homo sapiens gamma-glutamyltransferase light chain 2 (GGTLC2), transcript variant 3, mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NM_199127 // RefSeq // Homo sapiens gamma-glutamyltransferase light chain 2 (GGTLC2), transcript variant 1, mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000417145 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:22646310:22647898:1 gene:ENSG00000100121 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr22 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000448514 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:22646346:22647741:1 gene:ENSG00000100121 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000480559 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:22646346:22647741:1 gene:ENSG00000100121 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0 /// BC069534 // GenBank // Homo sapiens gamma-glutamyltransferase light chain 2, mRNA (cDNA clone MGC:96916 IMAGE:7262125), complete cds. // chr22 // 88 // 80 // 7 // 8 // 0 /// ENST00000613850 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:22:22646082:22647903:1 gene:ENSG00000100121 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000618722 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:22:22644475:22647903:1 gene:ENSG00000100121 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000037256 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:22646346:22647741:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0
NM_004914 // RefSeq // Homo sapiens RAB36, member RAS oncogene family (RAB36), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_005261859 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens RAB36, member RAS oncogene family (RAB36), transcript variant X1, mRNA. // chr22 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000263116 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:23145326:23164350:1 gene:ENSG00000100228 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000341989 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:23145366:23161564:1 gene:ENSG00000100228 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// AB023061 // GenBank // Homo sapiens mRNA for small GTP-binding protein Rab36, complete cds. // chr22 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF133588 // GenBank // Homo sapiens RAB36 (RAB36) mRNA, complete cds. // chr22 // 93 // 93 // 26 // 28 // 0 /// AY336745 // GenBank // Homo sapiens RAB36 (RAB36) mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr22 // 95 // 67 // 19 // 20 // 0 /// BC104989 // GenBank // Homo sapiens RAB36, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:132649 IMAGE:8143992), complete cds. // chr22 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// BC104991 // GenBank // Homo sapiens RAB36, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:132651 IMAGE:8143994), complete cds. // chr22 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// CR456553 // GenBank // Homo sapiens RAB36 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.RAB36.V8). // chr22 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000047018 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:23145284:23174072:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1
NM_004327 // RefSeq // Homo sapiens breakpoint cluster region (BCR), transcript variant 1, mRNA. // chr22 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NM_021574 // RefSeq // Homo sapiens breakpoint cluster region (BCR), transcript variant 2, mRNA. // chr22 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000305877 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:23180210:23318037:1 gene:ENSG00000186716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000359540 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:23180365:23315950:1 gene:ENSG00000186716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000398512 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:22:23180961:23318037:1 gene:ENSG00000186716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// AK303241 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58654 complete cds, highly similar to Breakpoint cluster region protein (EC 2.7.11.1). // chr22 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000047029 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:23250249:23315522:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// EU216071 // GenBank // Homo sapiens BCR/ABL fusion protein isoform Y5 (BCR/ABL fusion) mRNA, complete cds. // chr22 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NR_033408 // RefSeq // Homo sapiens F-box and WD repeat domain containing 4 pseudogene 1 (FBXW4P1), non-coding RNA. // chr22 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000426721 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:23263136:23264354:1 gene:ENSG00000230701 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr22 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// AF174606 // GenBank // Homo sapiens F-box protein Fbw3 (FBW3) mRNA, complete cds. // chr22 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// AK024483 // GenBank // Homo sapiens mRNA for FLJ00077 protein, partial cds. // chr22 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000047029 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:23250249:23315522:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 82 // 82 // 18 // 22 // 1
ENST00000506097 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:23976904:23977585:-1 gene:ENSG00000250470 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr22 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// GENSCAN00000012025 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:23963490:23967779:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// GENSCAN00000012028 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:23973550:23977839:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// GENSCAN00000014531 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR22_1_CTG7:23963490:23967780:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// GENSCAN00000014536 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR22_1_CTG7:23973552:23977843:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT084312 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr22 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000620637 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR22_1_CTG7:24024565:24028695:1 gene:ENSG00000276636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 92 // 100 // 11 // 12 // 0 /// NONHSAT084319 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr22 // 92 // 100 // 11 // 12 // 0 /// NONHSAT084320 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr22 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000014525 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR22_1_CTG7:24024565:24031686:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 83 // 83 // 10 // 12 // 1
NM_019601 // RefSeq // Homo sapiens sushi domain containing 2 (SUSD2), mRNA. // chr22 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000358321 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:24181259:24189110:1 gene:ENSG00000099994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000463101 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:24182577:24189106:1 gene:ENSG00000099994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr22 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// AK126105 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44117 fis, clone TESTI4046903. // chr22 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// BC033107 // GenBank // Homo sapiens sushi domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:45695 IMAGE:5457186), complete cds. // chr22 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000012003 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:24181520:24188331:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 96 // 82 // 26 // 27 // 0
ENST00000442565 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:24712292:24712520:1 gene:ENSG00000182351 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr22 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000012011 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:24686923:24712522:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT084380 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr22 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT084381 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr22 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001145206 // RefSeq // Homo sapiens KIAA1671 (KIAA1671), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000358431 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:22:25027974:25197444:1 gene:ENSG00000197077 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000401395 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:25069969:25197448:1 gene:ENSG00000197077 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000406486 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:24952730:25194457:1 gene:ENSG00000197077 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0 /// AB051458 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1671 protein, partial cds. // chr22 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC171801 // GenBank // Homo sapiens KIAA1671 protein, mRNA (cDNA clone MGC:198516 IMAGE:9054455), complete cds. // chr22 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000494730 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:25040581:25186451:1 gene:ENSG00000197077 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr22 // 79 // 79 // 15 // 19 // 1 /// AL832019 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp451H144 (from clone DKFZp451H144). // chr22 // 79 // 79 // 15 // 19 // 1 /// GENSCAN00000011758 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:25167813:25192529:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0
NM_004076 // RefSeq // Homo sapiens crystallin, beta B3 (CRYBB3), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000215855 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:25199850:25207363:1 gene:ENSG00000100053 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000404334 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:22:25199873:25207267:1 gene:ENSG00000100053 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// BC069479 // GenBank // Homo sapiens crystallin, beta B3, mRNA (cDNA clone MGC:97028 IMAGE:7262237), complete cds. // chr22 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC102021 // GenBank // Homo sapiens crystallin, beta B3, mRNA (cDNA clone MGC:125773 IMAGE:40029651), complete cds. // chr22 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC102022 // GenBank // Homo sapiens crystallin, beta B3, mRNA (cDNA clone MGC:125772 IMAGE:40029650), complete cds. // chr22 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC107482 // GenBank // Homo sapiens crystallin, beta B3, mRNA (cDNA clone MGC:125774 IMAGE:40029652), complete cds. // chr22 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// CR456427 // GenBank // Homo sapiens CRYBB3 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.CRYBB3). // chr22 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011745 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:25201397:25231772:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// NONHSAT084398 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr22 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0
NM_000496 // RefSeq // Homo sapiens crystallin, beta B2 (CRYBB2), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000398215 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:25219522:25231869:1 gene:ENSG00000244752 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC069535 // GenBank // Homo sapiens crystallin, beta B2, mRNA (cDNA clone MGC:96979 IMAGE:7262188), complete cds. // chr22 // 100 // 76 // 16 // 16 // 0 /// CR456426 // GenBank // Homo sapiens CRYBB2 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.CRYBB2). // chr22 // 89 // 86 // 16 // 18 // 0 /// L10035 // GenBank // Human crystallin beta-B2 mRNA, complete cds. // chr22 // 84 // 90 // 16 // 19 // 0 /// GENSCAN00000011745 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:25201397:25231772:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0
NM_005160 // RefSeq // Homo sapiens adrenergic, beta, receptor kinase 2 (ADRBK2), mRNA. // chr22 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000324198 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:25564849:25729294:1 gene:ENSG00000100077 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AK292234 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77587 complete cds, highly similar to Homo sapiens adrenergic, beta, receptor kinase 2 (ADRBK2), mRNA. // chr22 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// AK310398 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17440. // chr22 // 94 // 59 // 15 // 16 // 0 /// BC021221 // GenBank // Homo sapiens adrenergic, beta, receptor kinase 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:4309686), partial cds. // chr22 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// BC036797 // GenBank // Homo sapiens adrenergic, beta, receptor kinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:46121 IMAGE:5590378), complete cds. // chr22 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000619906 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:22:25564912:25723018:1 gene:ENSG00000100077 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000011743 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:25519986:25905845:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_020437 // RefSeq // Homo sapiens aspartate beta-hydroxylase domain containing 2 (ASPHD2), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000215906 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:26429273:26445015:1 gene:ENSG00000128203 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC036753 // GenBank // Homo sapiens aspartate beta-hydroxylase domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:45029 IMAGE:5186506), complete cds. // chr22 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// CR456391 // GenBank // Homo sapiens bK1048E9.3 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.bK1048E9.3.V2). // chr22 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000011716 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:26433694:26443206:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 43 // 9 // 9 // 0
NM_001013694 // RefSeq // Homo sapiens SRR1 domain containing (SRRD), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000215917 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:26483877:26494658:1 gene:ENSG00000100104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000477945 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:26487982:26491070:1 gene:ENSG00000100104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr22 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// AK293916 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52671 complete cds, highly similar to SRR1-like protein. // chr22 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC066962 // GenBank // Homo sapiens SRR1 domain containing, mRNA (cDNA clone MGC:87474 IMAGE:4820477), complete cds. // chr22 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000471799 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:26490773:26491832:1 gene:ENSG00000100104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr22 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// ENST00000613968 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:22:26483880:26491931:1 gene:ENSG00000100104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 97 // 97 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000011721 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:26487992:26491672:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0
ENST00000395823 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:26560526:26561088:1 gene:ENSG00000213707 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr22 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000011708 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:26560526:26561161:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001886 // RefSeq // Homo sapiens crystallin, beta A4 (CRYBA4), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000354760 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:26621964:26630672:1 gene:ENSG00000196431 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000466315 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:26621983:26630641:1 gene:ENSG00000196431 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr22 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC069404 // GenBank // Homo sapiens crystallin, beta A4, mRNA (cDNA clone MGC:96950 IMAGE:7262159), complete cds. // chr22 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// BC096171 // GenBank // Homo sapiens crystallin, beta A4, mRNA (cDNA clone MGC:116822 IMAGE:40003445), complete cds. // chr22 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC096172 // GenBank // Homo sapiens crystallin, beta A4, mRNA (cDNA clone MGC:116823 IMAGE:40003449), complete cds. // chr22 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC096173 // GenBank // Homo sapiens crystallin, beta A4, mRNA (cDNA clone MGC:116824 IMAGE:40003451), complete cds. // chr22 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC096174 // GenBank // Homo sapiens crystallin, beta A4, mRNA (cDNA clone MGC:116825 IMAGE:40003452), complete cds. // chr22 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// CR456424 // GenBank // Homo sapiens CRYBA4 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.CRYBA4.V3). // chr22 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// U59057 // GenBank // Human beta-A4 crystallin (CRYBA4) mRNA, complete cds. // chr22 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000011704 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:26621966:26630487:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
ENST00000363573 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:22:27035887:27035991:1 gene:ENSG00000200443 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr22 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT084574 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENST00000362927 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:22:28303754:28303850:1 gene:ENSG00000199797 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr22 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT084649 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_001206998 // RefSeq // Homo sapiens zinc and ring finger 3 (ZNRF3), transcript variant 1, mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NM_032173 // RefSeq // Homo sapiens zinc and ring finger 3 (ZNRF3), transcript variant 2, mRNA. // chr22 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000402174 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:28917389:29053685:1 gene:ENSG00000183579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000406323 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:28987052:29053965:1 gene:ENSG00000183579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000544604 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:28883592:29057487:1 gene:ENSG00000183579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AK096397 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39078 fis, clone NT2RP7017971. // chr22 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// CR456397 // GenBank // Homo sapiens bK175E3.6 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.bK175E3.6.V4). // chr22 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000019513 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:28983014:29053677:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0
NM_001039570 // RefSeq // Homo sapiens kringle containing transmembrane protein 1 (KREMEN1), transcript variant 3, mRNA. // chr22 // 96 // 84 // 26 // 27 // 0 /// NM_032045 // RefSeq // Homo sapiens kringle containing transmembrane protein 1 (KREMEN1), transcript variant 2, mRNA. // chr22 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000327813 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:29073118:29168333:1 gene:ENSG00000183762 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000400335 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:29073078:29146820:1 gene:ENSG00000183762 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 96 // 84 // 26 // 27 // 0 /// ENST00000407188 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:29073131:29142112:1 gene:ENSG00000183762 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// AB059618 // GenBank // Homo sapiens kremen mRNA for kringle-containing transmembrane protein, complete cds. // chr22 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// BC063787 // GenBank // Homo sapiens kringle containing transmembrane protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:70445 IMAGE:6315614), complete cds. // chr22 // 96 // 78 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019537 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:29073131:29156151:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1
ENST00000364001 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:22:29134014:29134120:1 gene:ENSG00000200871 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr22 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT084670 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_021026 // RefSeq // Homo sapiens ret finger protein-like 1 (RFPL1), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000354373 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:29438583:29442455:1 gene:ENSG00000128250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// CR456562 // GenBank // Homo sapiens RFPL1 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.RFPL1.V2). // chr22 // 92 // 100 // 11 // 12 // 0
NM_021076 // RefSeq // Homo sapiens neurofilament, heavy polypeptide (NEFH), mRNA. // chr22 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000310624 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:29480230:29491390:1 gene:ENSG00000100285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AB020652 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA0845 protein, partial cds. // chr22 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AF203032 // GenBank // Homo sapiens neurofilament protein mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// AK302660 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54495 complete cds, highly similar to Neurofilament triplet H protein. // chr22 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC073969 // GenBank // Homo sapiens neurofilament, heavy polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:90283 IMAGE:6137962), complete cds. // chr22 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000019526 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:29480263:29490703:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0
NM_182527 // RefSeq // Homo sapiens calcium binding protein 7 (CABP7), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006724161 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens calcium binding protein 7 (CABP7), transcript variant X1, mRNA. // chr22 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000216144 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:29720084:29731839:1 gene:ENSG00000100314 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC051805 // GenBank // Homo sapiens calcium binding protein 7, mRNA (cDNA clone MGC:57793 IMAGE:5732223), complete cds. // chr22 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000019524 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:29702889:29729569:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1
ENST00000364106 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:22:29758758:29758859:1 gene:ENSG00000200976 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT084731 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001003684 // RefSeq // Homo sapiens ubiquinol-cytochrome c reductase, complex III subunit X (UQCR10), transcript variant 2, mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_013387 // RefSeq // Homo sapiens ubiquinol-cytochrome c reductase, complex III subunit X (UQCR10), transcript variant 1, mRNA. // chr22 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000330029 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:29767369:29770413:1 gene:ENSG00000184076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000401406 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:29767374:29770027:1 gene:ENSG00000184076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// AB028598 // GenBank // Homo sapiens UQCR10 mRNA for ubiquinol-cytochrome C reductase complex 7.2 kDa protein homologue, complete cds. // chr22 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// AF112217 // GenBank // Homo sapiens ubiquinol-cytochrome c reductase complex 7.2 kDa protein mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// BC005402 // GenBank // Homo sapiens ubiquinol-cytochrome c reductase complex (7.2 kD), mRNA (cDNA clone MGC:12543 IMAGE:3961930), complete cds. // chr22 // 81 // 59 // 13 // 16 // 0 /// BC015971 // GenBank // Homo sapiens ubiquinol-cytochrome c reductase complex (7.2 kD), mRNA (cDNA clone MGC:23725 IMAGE:4097106), complete cds. // chr22 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000616603 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:22:29767369:29770413:1 gene:ENSG00000184076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000019522 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:29767399:29773658:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_021090 // RefSeq // Homo sapiens myotubularin related protein 3 (MTMR3), transcript variant 3, mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NM_153050 // RefSeq // Homo sapiens myotubularin related protein 3 (MTMR3), transcript variant 1, mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NM_153051 // RefSeq // Homo sapiens myotubularin related protein 3 (MTMR3), transcript variant 2, mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000333027 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:22:29883169:30030866:1 gene:ENSG00000100330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT084752 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr22 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0
NM_152510 // RefSeq // Homo sapiens HORMA domain containing 2 (HORMAD2), mRNA. // chr22 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006724146 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens HORMA domain containing 2 (HORMAD2), transcript variant X1, mRNA. // chr22 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000336726 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:30080174:30177075:1 gene:ENSG00000176635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000403975 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:30081011:30177073:1 gene:ENSG00000176635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000450612 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:30080472:30122033:1 gene:ENSG00000176635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr22 // 93 // 58 // 14 // 15 // 0 /// AK098703 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ25837 fis, clone TST08521. // chr22 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC030013 // GenBank // Homo sapiens HORMA domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:26710 IMAGE:4823215), complete cds. // chr22 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// CR456341 // GenBank // Homo sapiens Em:AC002378.1 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.Em:AC002378.1). // chr22 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000491605 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:30093958:30104577:1 gene:ENSG00000176635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr22 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// NONHSAT084757 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr22 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
ENST00000608354 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:30246205:30246998:1 gene:ENSG00000268812 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr22 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC008289 // GenBank // Homo sapiens hypothetical protein MGC20647, mRNA (cDNA clone IMAGE:3355596), partial cds. // chr22 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT084761 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr22 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
XM_006724278 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens coiled-coil domain containing 157 (CCDC157), transcript variant X1, mRNA. // chr22 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000405659 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:30356635:30376829:1 gene:ENSG00000187860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000475975 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:30357114:30378658:1 gene:ENSG00000187860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr22 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// BC092419 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 157, mRNA (cDNA clone MGC:102960 IMAGE:30383661), complete cds. // chr22 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC119799 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 157, mRNA (cDNA clone IMAGE:40108737), partial cds. // chr22 // 93 // 42 // 13 // 14 // 0 /// NM_001017437 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 157 (CCDC157), mRNA. // chr22 // 94 // 94 // 31 // 33 // 1 /// ENST00000338306 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:22:30356638:30376827:1 gene:ENSG00000187860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 94 // 94 // 31 // 33 // 1 /// ENST00000482413 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:30373692:30376827:1 gene:ENSG00000187860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr22 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// GENSCAN00000007580 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:30366001:30376745:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 97 // 88 // 28 // 29 // 0 /// NONHSAT084774 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr22 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// NONHSAT084777 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr22 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
ENST00000410983 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:22:30421045:30421148:1 gene:ENSG00000222915 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr22 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT084781 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0
ENST00000607893 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:30435544:30436247:1 gene:ENSG00000273428 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY358802 // GenBank // Homo sapiens clone DNA96880 VLGN1945 (UNQ1945) mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000366413 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:22:30435544:30436244:1 gene:ENSG00000273428 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:pseudogene gene:ENSG00000203606 // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT084784 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000448467 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:30542536:30544305:1 gene:ENSG00000225774 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr22 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000007566 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:30542573:30544083:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001001479 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 35, member E4 (SLC35E4), mRNA. // chr22 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000343605 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:30635652:30647893:1 gene:ENSG00000100036 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// BC040191 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 35, member E4, mRNA (cDNA clone MGC:42248 IMAGE:4814106), complete cds. // chr22 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// BC107119 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 35, member E4, mRNA (cDNA clone MGC:129826 IMAGE:40023535), complete cds. // chr22 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// CR456351 // GenBank // Homo sapiens Em:AC005006.4 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.Em:AC005006.4). // chr22 // 93 // 54 // 14 // 15 // 0 /// ENST00000406566 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:30636323:30663299:1 gene:ENSG00000100036 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// BC093099 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 35, member E4, mRNA (cDNA clone MGC:111589 IMAGE:30511864), complete cds. // chr22 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1 /// ENST00000451479 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:22:30636523:30669016:1 gene:ENSG00000100036 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// GENSCAN00000007584 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:30607332:30647031:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NR_026920 // RefSeq // Homo sapiens MORC2 antisense RNA 1 (MORC2-AS1), long non-coding RNA. // chr22 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000422995 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:30922345:30926654:1 gene:ENSG00000235989 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr22 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000432624 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:30922308:30926550:1 gene:ENSG00000235989 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr22 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// BC042980 // GenBank // Homo sapiens chromosome 22 open reading frame 27, mRNA (cDNA clone IMAGE:5295586). // chr22 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// NONHSAT084818 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr22 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT084819 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr22 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
ENST00000473634 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:21102843:21103138:-1 gene:ENSG00000243059 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr22 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// ENST00000488974 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:22:31059989:31060285:1 gene:ENSG00000240186 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000492309 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:15:20095733:20096029:-1 gene:ENSG00000239471 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr22 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// NONHSAT040573 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr22 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// NONHSAT040683 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr22 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// NONHSAT084842 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000391240 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:22:31305404:31305512:1 gene:ENSG00000212542 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr22 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT084874 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
BC007304 // GenBank // Homo sapiens hypothetical protein MGC15705, mRNA (cDNA clone MGC:15705 IMAGE:3352097), complete cds. // chr22 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NR_120386 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC54944 (LOC54944), long non-coding RNA. // chr22 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000504184 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:31346777:31348719:1 gene:ENSG00000213888 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr22 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_004147 // RefSeq // Homo sapiens developmentally regulated GTP binding protein 1 (DRG1), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000331457 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:31399523:31434452:1 gene:ENSG00000185721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000469673 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:31426513:31434155:1 gene:ENSG00000185721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr22 // 100 // 55 // 6 // 6 // 0 /// AF078103 // GenBank // Homo sapiens developmentally regulated GTP-binding protein (DRG) mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0 /// AL133085 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp434N1827 (from clone DKFZp434N1827). // chr22 // 100 // 55 // 6 // 6 // 0 /// BC019285 // GenBank // Homo sapiens developmentally regulated GTP binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:4011 IMAGE:2823263), complete cds. // chr22 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0 /// BC020803 // GenBank // Homo sapiens developmentally regulated GTP binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:23799 IMAGE:4250998), complete cds. // chr22 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0 /// BT007237 // GenBank // Homo sapiens developmentally regulated GTP binding protein 1 mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0 /// CR456488 // GenBank // Homo sapiens DRG1 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.DRG1.V2). // chr22 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0 /// CR542059 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834C1036D for gene DRG1, developmentally regulated GTP binding protein 1; complete cds, without stopcodon. // chr22 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000003455 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:31399684:31433971:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0
ENST00000488827 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:22:31757202:31757498:1 gene:ENSG00000242251 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr22 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT084914 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr22 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENST00000494065 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:31833918:31837322:1 gene:ENSG00000100150 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr22 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000517100 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:22:31837238:31837298:1 gene:ENSG00000252909 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr22 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT084917 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_003405 // RefSeq // Homo sapiens tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein, eta (YWHAH), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000248975 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:31944461:31957603:1 gene:ENSG00000128245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000397492 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:22:31944522:31957603:1 gene:ENSG00000128245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000443669 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:31944522:31956482:1 gene:ENSG00000128245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr22 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000471374 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:31944966:31957603:1 gene:ENSG00000128245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr22 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// AY007132 // GenBank // Homo sapiens clone CDABP0046 mRNA sequence. // chr22 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// BC003047 // GenBank // Homo sapiens tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein, eta polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:675 IMAGE:3543571), complete cds. // chr22 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// CR456612 // GenBank // Homo sapiens YWHAH full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.YWHAH.V2). // chr22 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// L20422 // GenBank // Human 14-3-3n protein mRNA, complete cds. // chr22 // 73 // 85 // 16 // 22 // 0 /// AK307750 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ97698. // chr22 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NONHSAT084922 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000423610 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:32039490:32039896:1 gene:ENSG00000232346 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr22 // 93 // 61 // 13 // 14 // 0 /// GENSCAN00000013579 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:32039489:32110213:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 43 // 43 // 10 // 23 // 1
NM_000343 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 5 (sodium/glucose cotransporter), member 1 (SLC5A1), transcript variant 1, mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NM_001256314 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 5 (sodium/glucose cotransporter), member 1 (SLC5A1), transcript variant 2, mRNA. // chr22 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000266088 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:32043032:32113029:1 gene:ENSG00000100170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000477969 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:32084849:32102207:1 gene:ENSG00000100170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr22 // 100 // 32 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000486394 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:32083051:32086326:1 gene:ENSG00000100170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr22 // 90 // 26 // 9 // 10 // 0 /// ENST00000543737 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:22:32059170:32113002:1 gene:ENSG00000100170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// AK297665 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55281 complete cds, highly similar to Sodium/glucose cotransporter 1. // chr22 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// AK316184 // GenBank // Homo sapiens cDNA, FLJ79083 complete cds, highly similar to Sodium/glucose cotransporter 1. // chr22 // 91 // 87 // 30 // 33 // 0 /// CR456579 // GenBank // Homo sapiens SLC5A1 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.SLC5A1.V4). // chr22 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// M24847 // GenBank // Human Na+/glucose cotransporter 1 mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000013579 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:32039489:32110213:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0
AK097738 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ40419 fis, clone TESTI2038596, highly similar to Homo sapiens mRNA for RET finger protein-like 3. // chr22 // 89 // 100 // 8 // 9 // 0
NM_000362 // RefSeq // Homo sapiens TIMP metallopeptidase inhibitor 3 (TIMP3), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000266085 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:32801701:32863043:1 gene:ENSG00000100234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// AK298126 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51917 complete cds, highly similar to Metalloproteinase inhibitor 3 precursor. // chr22 // 100 // 52 // 17 // 17 // 0 /// BC014277 // GenBank // Homo sapiens TIMP metallopeptidase inhibitor 3, mRNA (cDNA clone MGC:11079 IMAGE:3689386), complete cds. // chr22 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// BT006848 // GenBank // Homo sapiens tissue inhibitor of metalloproteinase 3 (Sorsby fundus dystrophy, pseudoinflammatory) mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// CR456593 // GenBank // Homo sapiens TIMP3 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.TIMP3.V2). // chr22 // 94 // 55 // 17 // 18 // 0 /// S78453 // GenBank // TIMP-3=tissue inhibitor of metalloproteinases-3 [human, THP-1 cells, mRNA, 1284 nt]. // chr22 // 86 // 64 // 18 // 21 // 0 /// U02571 // GenBank // Human tissue inhibitor of metalloproteinase-3 precursor (TIMP-3) mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// U14394 // GenBank // Human tissue inhibitor of metalloproteinases-3 mRNA, complete cds. // chr22 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// U67195 // GenBank // Human tissue inhibitor of metalloproteinase-3 mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000013567 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:32802002:32859377:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1
NM_001008494 // RefSeq // Homo sapiens intestine-specific homeobox (ISX), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000308700 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:35066136:35087387:1 gene:ENSG00000175329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AB219123 // GenBank // Homo sapiens Pix-1 mRNA for pancreas-intestine homeodomain transcription factor, complete cds. // chr22 // 85 // 41 // 11 // 13 // 0 /// AK025181 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ21528 fis, clone COL05977. // chr22 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// BC112212 // GenBank // Homo sapiens intestine-specific homeobox, mRNA (cDNA clone MGC:138417 IMAGE:8327680), complete cds. // chr22 // 83 // 38 // 10 // 12 // 0 /// BC113633 // GenBank // Homo sapiens intestine-specific homeobox, mRNA (cDNA clone MGC:142193 IMAGE:8322685), complete cds. // chr22 // 83 // 38 // 10 // 12 // 0 /// ENST00000404699 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:35066136:35087386:1 gene:ENSG00000175329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 94 // 94 // 30 // 32 // 1 /// GENSCAN00000011872 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:34913169:35144773:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_002133 // RefSeq // Homo sapiens heme oxygenase (decycling) 1 (HMOX1), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000216117 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:35380835:35394214:1 gene:ENSG00000100292 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000412893 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:35380361:35387101:1 gene:ENSG00000100292 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000481190 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:35381093:35386908:1 gene:ENSG00000100292 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr22 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// BC001491 // GenBank // Homo sapiens heme oxygenase (decycling) 1, mRNA (cDNA clone MGC:1723 IMAGE:3504480), complete cds. // chr22 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// BT019785 // GenBank // Homo sapiens heme oxygenase (decycling) 1 mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// CR456505 // GenBank // Homo sapiens HMOX1 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.HMOX1.V2). // chr22 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// CR541945 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834A1134D for gene HMOX1, heme oxygenase (decycling) 1; complete cds, incl. stopcodon. // chr22 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// CR541968 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834H0934D for gene HMOX1, heme oxygenase (decycling) 1; complete cds, without stopcodon. // chr22 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000011885 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:35383107:35527158:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_014310 // RefSeq // Homo sapiens RASD family, member 2 (RASD2), mRNA. // chr22 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_005261441 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens RASD family, member 2 (RASD2), transcript variant X1, mRNA. // chr22 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000216127 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:35540868:35554001:1 gene:ENSG00000100302 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// AF279143 // GenBank // Homo sapiens tumor endothelial marker 2 (TEM2) mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC013419 // GenBank // Homo sapiens RASD family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:4834 IMAGE:3604196), complete cds. // chr22 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// CR456477 // GenBank // Homo sapiens dJ569D19.1 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.dJ569D19.1.V2). // chr22 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000011869 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:35546150:35552032:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
NM_030641 // RefSeq // Homo sapiens apolipoprotein L, 6 (APOL6), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000409652 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:35648395:35668409:1 gene:ENSG00000221963 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// AY014879 // GenBank // Homo sapiens apolipoprotein L6 mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 53 // 18 // 18 // 0 /// AY358210 // GenBank // Homo sapiens clone DNA164989 APOL-like (UNQ3095) mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 35 // 12 // 12 // 0 /// BC038950 // GenBank // Homo sapiens apolipoprotein L, 6, mRNA (cDNA clone MGC:47573 IMAGE:5552006), complete cds. // chr22 // 100 // 38 // 13 // 13 // 0 /// BC047864 // GenBank // Homo sapiens apolipoprotein L, 6, mRNA (cDNA clone MGC:57495 IMAGE:5498605), complete cds. // chr22 // 100 // 50 // 17 // 17 // 0
NM_030642 // RefSeq // Homo sapiens apolipoprotein L, 5 (APOL5), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006725403 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens apolipoprotein L, 5 (APOL5), transcript variant X1, mRNA. // chr22 // 88 // 61 // 15 // 17 // 0 /// ENST00000249044 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:35717872:35729483:1 gene:ENSG00000128313 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY014878 // GenBank // Homo sapiens apolipoprotein L5 mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000617827 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR22_1_CTG4:35717872:35729483:1 gene:ENSG00000277390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000017814 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR22_1_CTG4:35717872:35735676:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 92 // 46 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000011883 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:35630429:35742970:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_000395 // RefSeq // Homo sapiens colony stimulating factor 2 receptor, beta, low-affinity (granulocyte-macrophage) (CSF2RB), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000403662 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:36913628:36940449:1 gene:ENSG00000100368 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000406230 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:22:36922134:36938611:1 gene:ENSG00000100368 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000421539 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:36922612:36930744:1 gene:ENSG00000100368 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 26 // 8 // 8 // 0 /// AK302993 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51731 complete cds, highly similar to Cytokine receptor common beta chain precursor. // chr22 // 96 // 87 // 26 // 27 // 0 /// CR456428 // GenBank // Homo sapiens CSF2RB full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.CSF2RB.V2). // chr22 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0 /// M59941 // GenBank // Human GM-CSF receptor beta chain mRNA, complete cds. // chr22 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0 /// ENST00000262825 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:22:36913633:36940433:1 gene:ENSG00000100368 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 97 // 97 // 30 // 31 // 1 /// BC070085 // GenBank // Homo sapiens colony stimulating factor 2 receptor, beta, low-affinity (granulocyte-macrophage), mRNA (cDNA clone MGC:87425 IMAGE:30344148), complete cds. // chr22 // 94 // 94 // 29 // 31 // 1 /// GENSCAN00000012596 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:36922208:36938502:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0
ENST00000516603 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:22:37013225:37013319:1 gene:ENSG00000252412 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr22 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT085137 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_152243 // RefSeq // Homo sapiens CDC42 effector protein (Rho GTPase binding) 1 (CDC42EP1), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006724107 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens CDC42 effector protein (Rho GTPase binding) 1 (CDC42EP1), transcript variant X1, mRNA. // chr22 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006724108 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens CDC42 effector protein (Rho GTPase binding) 1 (CDC42EP1), transcript variant X2, mRNA. // chr22 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006724109 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens CDC42 effector protein (Rho GTPase binding) 1 (CDC42EP1), transcript variant X3, mRNA. // chr22 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000249014 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:37560447:37569405:1 gene:ENSG00000128283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000430687 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:37560480:37566559:1 gene:ENSG00000128283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// BC009356 // GenBank // Homo sapiens CDC42 effector protein (Rho GTPase binding) 1, mRNA (cDNA clone MGC:15316 IMAGE:4300677), complete cds. // chr22 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// CR456524 // GenBank // Homo sapiens MSE55 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.MSE55.V2). // chr22 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// M88338 // GenBank // Human serum constituent protein (MSE55) mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AK292190 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76678 complete cds, highly similar to Homo sapiens CDC42 effector protein (Rho GTPase binding) 1, transcript variant 2, mRNA. // chr22 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1 /// GENSCAN00000012613 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:37545733:37568820:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1
NM_020315 // RefSeq // Homo sapiens pyridoxal (pyridoxine, vitamin B6) phosphatase (PDXP), mRNA. // chr22 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000215904 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:37658727:37666934:1 gene:ENSG00000241360 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000403251 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:37664911:37666932:1 gene:ENSG00000241360 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// AY125047 // GenBank // Homo sapiens pyridoxal phosphate phosphatase mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// BC000320 // GenBank // Homo sapiens pyridoxal (pyridoxine, vitamin B6) phosphatase, mRNA (cDNA clone MGC:8472 IMAGE:2821743), complete cds. // chr22 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC064922 // GenBank // Homo sapiens pyridoxal (pyridoxine, vitamin B6) phosphatase, mRNA (cDNA clone MGC:74719 IMAGE:6141538), complete cds. // chr22 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000451997 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:37639693:37666932:1 gene:ENSG00000100092 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr22 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// GENSCAN00000012609 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:37610853:37679749:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// AK126873 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44925 fis, clone BRAMY3014613, highly similar to Homo sapiens SH3-domain binding protein 1 (SH3BP1). // chr22 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NONHSAT086633 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_005318 // RefSeq // Homo sapiens H1 histone family, member 0 (H1F0), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000340857 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:37805093:37807436:1 gene:ENSG00000189060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK299209 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54804 complete cds, highly similar to Histone H1.0. // chr22 // 89 // 76 // 17 // 19 // 0 /// BC000145 // GenBank // Homo sapiens H1 histone family, member 0, mRNA (cDNA clone MGC:5241 IMAGE:3049108), complete cds. // chr22 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// BC029046 // GenBank // Homo sapiens H1 histone family, member 0, mRNA (cDNA clone MGC:35420 IMAGE:5189077), complete cds. // chr22 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// CR456502 // GenBank // Homo sapiens H1F0 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.H1F0). // chr22 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// CR542220 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834C0825D for gene H1F0, H1 histone family, member 0; complete cds, incl. stopcodon. // chr22 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000012595 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:37805545:37806129:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_001171690 // RefSeq // Homo sapiens glycine C-acetyltransferase (GCAT), transcript variant 1, mRNA. // chr22 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// NM_014291 // RefSeq // Homo sapiens glycine C-acetyltransferase (GCAT), transcript variant 2, mRNA. // chr22 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000248924 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:37807912:37816899:1 gene:ENSG00000100116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000323205 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:22:37807905:37817176:1 gene:ENSG00000100116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// AF077740 // GenBank // Homo sapiens 2-amino-3-ketobutyrate-CoA ligase mRNA, nuclear gene encoding mitochondrial protein, complete cds. // chr22 // 76 // 89 // 13 // 17 // 0 /// AK290093 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77874 complete cds, highly similar to Homo sapiens glycine C-acetyltransferase (2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase), mRNA. // chr22 // 82 // 89 // 14 // 17 // 0 /// BC014457 // GenBank // Homo sapiens glycine C-acetyltransferase (2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase), mRNA (cDNA clone MGC:23053 IMAGE:4859130), complete cds. // chr22 // 82 // 89 // 14 // 17 // 0 /// GENSCAN00000012603 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:37807968:37825470:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 68 // 68 // 13 // 19 // 1
NM_003614 // RefSeq // Homo sapiens galanin receptor 3 (GALR3), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000249041 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:37823382:37825495:1 gene:ENSG00000128310 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AF067733 // GenBank // Homo sapiens galanin 2 receptor homolog mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// AF073799 // GenBank // Homo sapiens galanin receptor GALR3 mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AY587582 // GenBank // Homo sapiens galanin receptor 3 (GALR3) mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000012603 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:37807968:37825470:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0
ENST00000384498 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:22:37891347:37891448:1 gene:ENSG00000207227 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr22 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT086642 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_033386 // RefSeq // Homo sapiens MICAL-like 1 (MICALL1), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006724345 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens MICAL-like 1 (MICALL1), transcript variant X3, mRNA. // chr22 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000215957 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:37906297:37942822:1 gene:ENSG00000100139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000402631 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:37926563:37942009:1 gene:ENSG00000100139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr22 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000445494 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:37905657:37922286:1 gene:ENSG00000100139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000454685 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:22:37925847:37937153:1 gene:ENSG00000100139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 90 // 36 // 9 // 10 // 0 /// AB051455 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1668 protein, partial cds. // chr22 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// CR456437 // GenBank // Homo sapiens dJ1014D13.2 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.dJ1014D13.2). // chr22 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// CR749566 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686M2226 (from clone DKFZp686M2226). // chr22 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000014131 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:37906037:37940830:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
ENST00000478699 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:22:38231720:38231993:1 gene:ENSG00000241693 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr22 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT086674 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr22 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_020243 // RefSeq // Homo sapiens translocase of outer mitochondrial membrane 22 homolog (yeast) (TOMM22), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000216034 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:38681948:38685421:1 gene:ENSG00000100216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000492561 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:38682172:38684160:1 gene:ENSG00000100216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr22 // 100 // 43 // 10 // 10 // 0 /// AB040119 // GenBank // Homo sapiens mRNA for mitochondrial import receptor Tom22, complete cds. // chr22 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0 /// AB041906 // GenBank // Homo sapiens mRNA for Tom22, complete cds. // chr22 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// BC009363 // GenBank // Homo sapiens translocase of outer mitochondrial membrane 22 homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:14851 IMAGE:4302531), complete cds. // chr22 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// CR456475 // GenBank // Homo sapiens dJ508I15.5 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.dJ508I15.5). // chr22 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000014128 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:38668055:38683841:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 61 // 61 // 14 // 23 // 1
NM_004286 // RefSeq // Homo sapiens GTP binding protein 1 (GTPBP1), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000216044 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:38705723:38733587:1 gene:ENSG00000100226 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// CR456501 // GenBank // Homo sapiens GTPBP1 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.GTPBP1). // chr22 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// U87964 // GenBank // Human putative G-protein (GP-1) mRNA, complete cds. // chr22 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// ENST00000462332 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:38728256:38732239:1 gene:ENSG00000100226 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr22 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// AK096647 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39328 fis, clone OCBBF2015659, highly similar to GTP-BINDING PROTEIN 1. // chr22 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000014145 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:38705956:38732201:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// NONHSAT086725 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr22 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_014508 // RefSeq // Homo sapiens apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide-like 3C (APOBEC3C), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000361441 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:39014083:39020352:1 gene:ENSG00000244509 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000428892 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:39014262:39018926:1 gene:ENSG00000244509 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr22 // 100 // 60 // 12 // 12 // 0 /// AF165520 // GenBank // Homo sapiens phorbolin I protein (PBI) mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC011739 // GenBank // Homo sapiens apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide-like 3C, mRNA (cDNA clone MGC:19485 IMAGE:4331363), complete cds. // chr22 // 95 // 100 // 19 // 20 // 0 /// CR456394 // GenBank // Homo sapiens bK150C2.3 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.bK150C2.3). // chr22 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// KC329528 // GenBank // Homo sapiens apolipoprotein B editing enzyme catalytic polypeptide-like 3C (APOBEC3C) mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 60 // 12 // 12 // 0 /// AK094570 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ37251 fis, clone BRAMY2007043, highly similar to Homo sapiens phorbolin I protein (PBI) mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 20 // 20 // 1 /// GENSCAN00000047737 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:38952809:39124317:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 60 // 60 // 12 // 20 // 1
NM_152426 // RefSeq // Homo sapiens apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide-like 3D (APOBEC3D), mRNA. // chr22 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_005261335 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide-like 3D (APOBEC3D), transcript variant X2, mRNA. // chr22 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000216099 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:39021113:39033276:1 gene:ENSG00000243811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000381568 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:22:39014363:39032316:1 gene:ENSG00000243811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// EU527884 // GenBank // Homo sapiens apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic polypeptide-like 3DE (APOBEC3DE) mRNA, complete cds. // chr22 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// ENST00000427494 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:22:39021113:39033261:1 gene:ENSG00000243811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// GENSCAN00000047737 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:38952809:39124317:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1
NM_145298 // RefSeq // Homo sapiens apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide-like 3F (APOBEC3F), transcript variant 1, mRNA. // chr22 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// XR_244357 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide-like 3F (APOBEC3F), transcript variant X2, misc_RNA. // chr22 // 93 // 67 // 13 // 14 // 0 /// ENST00000308521 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:39040604:39053910:1 gene:ENSG00000128394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// BC038808 // GenBank // Homo sapiens apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide-like 3F, mRNA (cDNA clone MGC:46498 IMAGE:5227163), complete cds. // chr22 // 71 // 81 // 12 // 17 // 0 /// JF262037 // GenBank // Homo sapiens apolipoprotein B mRNA editing enzyme cytidine deaminase (APOBEC3F) mRNA, complete cds. // chr22 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1 /// KC329530 // GenBank // Homo sapiens apolipoprotein B editing enzyme catalytic polypeptide-like 3F (APOBEC3F) mRNA, complete cds. // chr22 // 48 // 48 // 10 // 21 // 1 /// GENSCAN00000047737 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:38952809:39124317:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 52 // 52 // 11 // 21 // 1
NM_019008 // RefSeq // Homo sapiens mitochondrial elongation factor 1 (MIEF1), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENST00000325301 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:39502353:39518132:1 gene:ENSG00000100335 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 93 // 43 // 43 // 0 /// ENST00000402881 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:22:39500100:39515708:1 gene:ENSG00000100335 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 30 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000404569 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:39502377:39516178:1 gene:ENSG00000100335 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 59 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000428069 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:39502397:39513866:1 gene:ENSG00000100335 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr22 // 100 // 28 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000433117 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:39502302:39516380:1 gene:ENSG00000100335 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr22 // 100 // 61 // 28 // 28 // 0 /// AK290954 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77734 complete cds. // chr22 // 100 // 28 // 13 // 13 // 0 /// BC008327 // GenBank // Homo sapiens Smith-Magenis syndrome chromosome region, candidate 7-like, mRNA (cDNA clone MGC:15774 IMAGE:3502711), complete cds. // chr22 // 100 // 59 // 27 // 27 // 0 /// AL136768 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp434F0116 (from clone DKFZp434F0116). // chr22 // 39 // 39 // 18 // 46 // 1 /// GENSCAN00000047730 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:39511295:39514323:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 30 // 14 // 14 // 0 /// U79252 // GenBank // Human clone 23679 mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 30 // 14 // 14 // 0
NM_001675 // RefSeq // Homo sapiens activating transcription factor 4 (ATF4), transcript variant 1, mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000337304 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:39520564:39522683:1 gene:ENSG00000128272 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// D90209 // GenBank // Homo sapiens mRNA for DNA binding protein TAXREB67, complete cds. // chr22 // 85 // 100 // 11 // 13 // 0
ENST00000473717 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:22:40009688:40030031:1 gene:ENSG00000133477 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// BC011204 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 83, member F, mRNA (cDNA clone MGC:17507 IMAGE:3455576), complete cds. // chr22 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// NM_138435 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 83, member F (FAM83F), mRNA. // chr22 // 92 // 92 // 24 // 26 // 1 /// ENST00000333407 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:39994949:40043529:1 gene:ENSG00000133477 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 92 // 92 // 24 // 26 // 1 /// BC031099 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 83, member F, mRNA (cDNA clone MGC:33937 IMAGE:5296483), complete cds. // chr22 // 92 // 92 // 24 // 26 // 1 /// GENSCAN00000043184 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:39875307:39996906:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// GENSCAN00000043188 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:40018953:40034141:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
ENST00000312310 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:40569286:40569895:1 gene:ENSG00000172912 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT086852 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043181 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:40569288:40681928:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NONHSAT086874 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000616394 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:22:40917111:40917381:1 gene:ENSG00000273979 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000363658 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:8:53914719:53914824:1 gene:ENSG00000200528 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr22 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// ENST00000363813 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:22:40917743:40917846:1 gene:ENSG00000200683 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr22 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// ENST00000364309 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:7:105332790:105332896:1 gene:ENSG00000201179 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr22 // 60 // 100 // 3 // 5 // 0 /// ENST00000384359 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:43091388:43091494:-1 gene:ENSG00000207087 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr22 // 60 // 100 // 3 // 5 // 0 /// ENST00000362659 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:101723876:101723980:1 gene:ENSG00000199529 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr22 // 100 // 100 // 5 // 5 // 1 /// NONHSAT086875 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// NONHSAT126616 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// ENST00000610426 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:74766992:74780113:1 gene:ENSG00000164346 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 60 // 100 // 3 // 5 // 0 /// NONHSAT070376 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 60 // 100 // 3 // 5 // 0 /// NONHSAT122618 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 60 // 100 // 3 // 5 // 0 /// NONHSAT097573 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 100 // 100 // 5 // 5 // 1
ENST00000410766 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:22:41045497:41045591:1 gene:ENSG00000222698 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr22 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT086881 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
ENST00000418783 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:41064052:41064633:1 gene:ENSG00000237214 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr22 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000028206 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:41064052:41064636:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001429 // RefSeq // Homo sapiens E1A binding protein p300 (EP300), mRNA. // chr22 // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// ENST00000263253 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:41091786:41180077:1 gene:ENSG00000100393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// U01877 // GenBank // Human p300 protein mRNA, complete cds. // chr22 // 93 // 96 // 42 // 45 // 0 /// GENSCAN00000028199 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:41093005:41178956:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 74 // 35 // 35 // 0
NM_031488 // RefSeq // Homo sapiens l(3)mbt-like 2 (Drosophila) (L3MBTL2), mRNA. // chr22 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000216237 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:41205205:41231271:1 gene:ENSG00000100395 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000452106 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:41205324:41231271:1 gene:ENSG00000100395 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr22 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000466589 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:41205309:41230654:1 gene:ENSG00000100395 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr22 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000479978 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:41205321:41231270:1 gene:ENSG00000100395 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr22 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000481902 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:41205282:41227810:1 gene:ENSG00000100395 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr22 // 100 // 74 // 14 // 14 // 0 /// AK074091 // GenBank // Homo sapiens mRNA for FLJ00162 protein. // chr22 // 95 // 100 // 18 // 19 // 0 /// AK097052 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39733 fis, clone SMINT2016122. // chr22 // 100 // 74 // 14 // 14 // 0 /// BC017191 // GenBank // Homo sapiens l(3)mbt-like 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:2476 IMAGE:3138444), complete cds. // chr22 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0 /// CR456482 // GenBank // Homo sapiens dJ756G23.3 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.dJ756G23.3.V3). // chr22 // 88 // 89 // 15 // 17 // 0 /// GENSCAN00000028205 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:41209717:41230251:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0
NM_017590 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger CCCH-type containing 7B (ZC3H7B), mRNA. // chr22 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000352645 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:41301522:41360147:1 gene:ENSG00000100403 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// BC152558 // GenBank // Homo sapiens zinc finger CCCH-type containing 7B, mRNA (cDNA clone MGC:167072 IMAGE:8860405), complete cds. // chr22 // 93 // 94 // 27 // 29 // 0 /// ENST00000486331 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:41301715:41336843:1 gene:ENSG00000100403 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr22 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// AK023849 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ13787 fis, clone PLACE4000670. // chr22 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// GENSCAN00000028194 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:41320476:41357429:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// BC016159 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3532348, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr22 // 100 // 55 // 17 // 17 // 0
NM_014460 // RefSeq // Homo sapiens cold shock domain containing C2, RNA binding (CSDC2), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000306149 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:41560763:41576666:1 gene:ENSG00000172346 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AB027011 // GenBank // Homo sapiens mRNA for RNA-binding protein PIPPin, complete cds. // chr22 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// BC067113 // GenBank // Homo sapiens cold shock domain containing C2, RNA binding, mRNA (cDNA clone MGC:70438 IMAGE:5759182), complete cds. // chr22 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// CR456457 // GenBank // Homo sapiens dJ347H13.2 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.dJ347H13.2). // chr22 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000028190 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:41555150:41575272:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 45 // 45 // 14 // 31 // 1
NM_001142964 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 22 open reading frame 46 (C22orf46), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENST00000402966 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:41690543:41698136:1 gene:ENSG00000184208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// GENSCAN00000028196 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:41694187:41825823:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 40 // 40 // 18 // 45 // 1
ENST00000384086 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:22:41747312:41747413:1 gene:ENSG00000206813 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr22 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT086941 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_024821 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 134 (CCDC134), mRNA. // chr22 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000255784 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:41800679:41826299:1 gene:ENSG00000100147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// AK026002 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ22349 fis, clone HRC06310. // chr22 // 93 // 97 // 28 // 30 // 0 /// BC017693 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 134, mRNA (cDNA clone MGC:21013 IMAGE:4403280), complete cds. // chr22 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// CR456484 // GenBank // Homo sapiens dJ821D11.3 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.dJ821D11.3). // chr22 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000402061 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:22:41800679:41825893:1 gene:ENSG00000100147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 45 // 45 // 14 // 31 // 1 /// AK299311 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50180 complete cds. // chr22 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1 /// GENSCAN00000028196 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:41694187:41825823:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1
NR_029507 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 33a (MIR33A), microRNA. // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000385197 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:22:41900944:41901012:1 gene:ENSG00000207932 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-33a // miRBase Micro RNA Database // MI0000091 Homo sapiens miR-33a stem-loop // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT086993 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_024355 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 634 (LINC00634), long non-coding RNA. // chr22 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000381348 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:41952174:41958933:1 gene:ENSG00000205704 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr22 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC068568 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5276364. // chr22 // 92 // 100 // 11 // 12 // 0 /// NONHSAT087000 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr22 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001002034 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 109, member B (FAM109B), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_005261373 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens family with sequence similarity 109, member B (FAM109B), transcript variant X1, mRNA. // chr22 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000321753 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:42074251:42079441:1 gene:ENSG00000177096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000419475 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:42074357:42077618:1 gene:ENSG00000177096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// BC104175 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 109, member B, mRNA (cDNA clone MGC:125831 IMAGE:40030677), complete cds. // chr22 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// BC104176 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 109, member B, mRNA (cDNA clone MGC:125832 IMAGE:40030679), complete cds. // chr22 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// BX648402 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686J07229 (from clone DKFZp686J07229). // chr22 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// CR456454 // GenBank // Homo sapiens dJ186O1.2 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.dJ186O1.2.V2). // chr22 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000006960 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:42074017:42082062:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NR_036498 // RefSeq // Homo sapiens opioid growth factor receptor pseudogene 1 (OGFRP1), non-coding RNA. // chr22 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000332965 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:42269753:42274862:1 gene:ENSG00000182057 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr22 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000446578 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:42269768:42275033:1 gene:ENSG00000182057 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr22 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// ENST00000415205 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:42269760:42275196:1 gene:ENSG00000182057 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr22 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// NONHSAT087038 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr22 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT087039 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr22 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_001284334 // RefSeq // Homo sapiens serine hydrolase-like 2 (SERHL2), transcript variant 2, mRNA. // chr22 // 100 // 75 // 9 // 9 // 0 /// NM_014509 // RefSeq // Homo sapiens serine hydrolase-like 2 (SERHL2), transcript variant 1, mRNA. // chr22 // 100 // 75 // 9 // 9 // 0 /// NR_104300 // RefSeq // Homo sapiens serine hydrolase-like 2 (SERHL2), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr22 // 100 // 83 // 10 // 10 // 0 /// NR_104301 // RefSeq // Homo sapiens serine hydrolase-like 2 (SERHL2), transcript variant 4, non-coding RNA. // chr22 // 100 // 83 // 10 // 10 // 0 /// XM_006724222 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens serine hydrolase-like 2 (SERHL2), transcript variant X8, mRNA. // chr22 // 100 // 58 // 7 // 7 // 0 /// ENST00000327678 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:42553919:42574382:1 gene:ENSG00000183569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 75 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000416156 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:42553918:42573997:1 gene:ENSG00000183569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr22 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000477564 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:42553859:42574381:1 gene:ENSG00000183569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr22 // 100 // 83 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000534080 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:42553885:42571664:1 gene:ENSG00000183569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr22 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// AK294584 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60497 complete cds, highly similar to Serine hydrolase-like protein (EC 3.1.-.-). // chr22 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// AK295223 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53041 complete cds, highly similar to Serine hydrolase-like protein (EC 3.1.-.-). // chr22 // 100 // 58 // 7 // 7 // 0
NR_029422 // RefSeq // Homo sapiens RNA, U12 small nuclear (RNU12), small nuclear RNA. // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000362512 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:22:42615244:42615393:1 gene:ENSG00000276027 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA gene:ENSG00000270022 // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000602478 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:42615244:42615907:1 gene:ENSG00000270022 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// J04119 // GenBank // Human small nuclear RNA U12. // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT087070 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT087071 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT087072 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001197 // RefSeq // Homo sapiens BCL2-interacting killer (apoptosis-inducing) (BIK), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000216115 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:43110748:43129712:1 gene:ENSG00000100290 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC001599 // GenBank // Homo sapiens BCL2-interacting killer (apoptosis-inducing), mRNA (cDNA clone MGC:1907 IMAGE:3542939), complete cds. // chr22 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BT006728 // GenBank // Homo sapiens BCL2-interacting killer (apoptosis-inducing) mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// CR456390 // GenBank // Homo sapiens BIK full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.BIK.V2). // chr22 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// CR541863 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834G0832D for gene BIK, BCL2-interacting killer (apoptosis-inducing); complete cds, incl. stopcodon. // chr22 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// CR541883 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834C0533D for gene BIK, BCL2-interacting killer (apoptosis-inducing); complete cds, without stopcodon. // chr22 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// U34584 // GenBank // Human Bcl-2 interacting killer (BIK) mRNA, complete cds. // chr22 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// U49730 // GenBank // Homo sapiens apoptosis inducer Nbk mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000035509 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:43124023:43129305:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// X89986 // GenBank // H.sapiens mRNA for NBK apoptotic inducer protein. // chr22 // 71 // 96 // 17 // 24 // 0
ENST00000476875 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:43802544:43802772:1 gene:ENSG00000180150 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr22 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000035494 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:43802556:43802777:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT087119 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr22 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_025225 // RefSeq // Homo sapiens patatin-like phospholipase domain containing 3 (PNPLA3), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000216180 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:43923739:43947568:1 gene:ENSG00000100344 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000406117 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:43923792:43964488:1 gene:ENSG00000100344 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr22 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000423180 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:22:43923803:43947061:1 gene:ENSG00000100344 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC065195 // GenBank // Homo sapiens patatin-like phospholipase domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:75176 IMAGE:5243623), complete cds. // chr22 // 92 // 96 // 23 // 25 // 0 /// CR456476 // GenBank // Homo sapiens dJ549K18.1 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.dJ549K18.1). // chr22 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// AK308995 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99036. // chr22 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000040507 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:43923912:43999263:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NR_028409 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 207 (LINC00207), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr22 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NR_028410 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 207 (LINC00207), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr22 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NR_028411 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 207 (LINC00207), transcript variant 3, long non-coding RNA. // chr22 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000334566 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:44569339:44572210:1 gene:ENSG00000187012 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr22 // 95 // 83 // 19 // 20 // 0 /// ENST00000603530 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:44569352:44572341:1 gene:ENSG00000187012 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr22 // 95 // 92 // 21 // 22 // 0 /// ENST00000605505 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:44569352:44572341:1 gene:ENSG00000187012 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr22 // 95 // 92 // 21 // 22 // 0 /// NONHSAT087174 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr22 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_007172 // RefSeq // Homo sapiens nucleoporin 50kDa (NUP50), transcript variant 2, mRNA. // chr22 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0 /// NM_153645 // RefSeq // Homo sapiens nucleoporin 50kDa (NUP50), transcript variant 3, mRNA. // chr22 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0 /// XM_005261313 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens nucleoporin 50kDa (NUP50), transcript variant X3, mRNA. // chr22 // 100 // 69 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000347635 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:45163841:45188015:1 gene:ENSG00000093000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000396096 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:45164646:45184830:1 gene:ENSG00000093000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 50 // 8 // 8 // 0 /// BC028125 // GenBank // Homo sapiens nucleoporin 50kDa, mRNA (cDNA clone MGC:39961 IMAGE:5166132), complete cds. // chr22 // 100 // 50 // 8 // 8 // 0
NM_001167574 // RefSeq // Homo sapiens uroplakin 3A (UPK3A), transcript variant 2, mRNA. // chr22 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NM_006953 // RefSeq // Homo sapiens uroplakin 3A (UPK3A), transcript variant 1, mRNA. // chr22 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000216211 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:45284982:45295874:1 gene:ENSG00000100373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000396082 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:22:45284991:45295822:1 gene:ENSG00000100373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// AB010637 // GenBank // Homo sapiens mRNA for uroplkin 3, complete cds. // chr22 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// AF085808 // GenBank // Homo sapiens uroplakin III mRNA, complete cds. // chr22 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// BC069544 // GenBank // Homo sapiens uroplakin 3A, mRNA (cDNA clone MGC:97009 IMAGE:7262218), complete cds. // chr22 // 81 // 81 // 17 // 21 // 0 /// BC108900 // GenBank // Homo sapiens uroplakin 3A, mRNA (cDNA clone MGC:119178 IMAGE:40004236), complete cds. // chr22 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// CR456608 // GenBank // Homo sapiens UPK3 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.UPK3.V4). // chr22 // 78 // 88 // 18 // 23 // 0 /// GENSCAN00000033082 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:45285014:45335463:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0
NM_015653 // RefSeq // Homo sapiens RIB43A domain with coiled-coils 2 (RIBC2), mRNA. // chr22 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// XM_005261524 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens RIB43A domain with coiled-coils 2 (RIBC2), transcript variant X2, mRNA. // chr22 // 96 // 79 // 22 // 23 // 0 /// BC003024 // GenBank // Homo sapiens RIB43A domain with coiled-coils 2, mRNA (cDNA clone MGC:4107 IMAGE:2822570), complete cds. // chr22 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// BC009904 // GenBank // Homo sapiens RIB43A domain with coiled-coils 2, mRNA (cDNA clone MGC:2444 IMAGE:2822570), complete cds. // chr22 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// CR456438 // GenBank // Homo sapiens dJ102D24.2 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.dJ102D24.2). // chr22 // 85 // 69 // 17 // 20 // 0 /// CR457398 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834B0514D for gene DKFZP566F0546, DKFZP566F0546 protein; complete cds, incl. stopcodon. // chr22 // 94 // 62 // 17 // 18 // 0 /// ENST00000466226 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:45418007:45431016:1 gene:ENSG00000128408 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr22 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// ENST00000614167 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:45413691:45432496:1 gene:ENSG00000128408 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000621287 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:45414323:45422506:1 gene:ENSG00000128408 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr22 // 100 // 38 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000033069 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:45413902:45455694:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0
NR_027033 // RefSeq // Homo sapiens MIRLET7B host gene (non-protein coding) (MIRLET7BHG), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr22 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000381051 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:22:46053869:46106023:1 gene:ENSG00000197182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 34 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000435439 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:46085997:46111475:1 gene:ENSG00000197182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr22 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NR_110479 // RefSeq // Homo sapiens MIRLET7B host gene (non-protein coding) (MIRLET7BHG), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr22 // 100 // 100 // 29 // 29 // 1 /// ENST00000360737 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:22:46086003:46113928:1 gene:ENSG00000197182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 29 // 29 // 1 /// ENST00000443490 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:22:46080312:46098558:1 gene:ENSG00000197182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// BC036832 // GenBank // Homo sapiens, clone IMAGE:3890870, mRNA. // chr22 // 100 // 34 // 10 // 10 // 0
NR_027033 // RefSeq // Homo sapiens MIRLET7B host gene (non-protein coding) (MIRLET7BHG), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_029478 // RefSeq // Homo sapiens microRNA let-7a-3 (MIRLET7A3), microRNA. // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_110479 // RefSeq // Homo sapiens MIRLET7B host gene (non-protein coding) (MIRLET7BHG), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000360737 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:22:46086003:46113928:1 gene:ENSG00000197182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000362116 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:22:46112732:46112840:1 gene:ENSG00000198986 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-let-7a-3 // miRBase Micro RNA Database // MI0000062 Homo sapiens let-7a-3 stem-loop // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT087278 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_027033 // RefSeq // Homo sapiens MIRLET7B host gene (non-protein coding) (MIRLET7BHG), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_029479 // RefSeq // Homo sapiens microRNA let-7b (MIRLET7B), microRNA. // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_110479 // RefSeq // Homo sapiens MIRLET7B host gene (non-protein coding) (MIRLET7BHG), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000360737 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:22:46086003:46113928:1 gene:ENSG00000197182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000385140 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:22:46113686:46113768:1 gene:ENSG00000207875 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-let-7b // miRBase Micro RNA Database // MI0000063 Homo sapiens let-7b stem-loop // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT087280 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_017931 // RefSeq // Homo sapiens tetratricopeptide repeat domain 38 (TTC38), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000381031 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:22:46267964:46294008:1 gene:ENSG00000075234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000417709 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:46267961:46275285:1 gene:ENSG00000075234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr22 // 100 // 34 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000421359 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:22:46268008:46280242:1 gene:ENSG00000075234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 41 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000422713 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:46272372:46284032:1 gene:ENSG00000075234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr22 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// AK300606 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58627 complete cds. // chr22 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// BC018918 // GenBank // Homo sapiens tetratricopeptide repeat domain 38, mRNA (cDNA clone MGC:12603 IMAGE:4130906), complete cds. // chr22 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000006833 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:46268040:46330130:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1
NM_016426 // RefSeq // Homo sapiens G-2 and S-phase expressed 1 (GTSE1), mRNA. // chr22 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000454366 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:46296741:46330810:1 gene:ENSG00000075218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000479645 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:46316037:46329130:1 gene:ENSG00000075218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr22 // 100 // 24 // 10 // 10 // 0 /// AF223408 // GenBank // Homo sapiens B99 mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 79 // 33 // 33 // 0 /// AK303087 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54919 complete cds, highly similar to G2 and S phase expressed protein 1. // chr22 // 100 // 71 // 30 // 30 // 0 /// AY927427 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA sequence. // chr22 // 100 // 24 // 10 // 10 // 0 /// BC006325 // GenBank // Homo sapiens G-2 and S-phase expressed 1, mRNA (cDNA clone MGC:12560 IMAGE:4138532), complete cds. // chr22 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// BC075828 // GenBank // Homo sapiens G-2 and S-phase expressed 1, mRNA (cDNA clone MGC:88566 IMAGE:5092448), complete cds. // chr22 // 100 // 83 // 35 // 35 // 0 /// CT841519 // GenBank // Homo sapiens GTSE1 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.GTSE1). // chr22 // 100 // 71 // 30 // 30 // 0 /// NONHSAT087312 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr22 // 100 // 24 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000006833 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:46268040:46330130:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 48 // 48 // 20 // 42 // 1
NM_001082967 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 19 (chemokine (C-C motif)-like), member A5 (FAM19A5), transcript variant 1, mRNA. // chr22 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0 /// NM_015381 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 19 (chemokine (C-C motif)-like), member A5 (FAM19A5), transcript variant 2, mRNA. // chr22 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000336769 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:22:48489592:48850912:1 gene:ENSG00000219438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 26 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000358295 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:48576306:48751932:1 gene:ENSG00000219438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000402357 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:22:48489460:48750823:1 gene:ENSG00000219438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 51 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000473898 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:48576453:48750488:1 gene:ENSG00000219438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr22 // 100 // 34 // 12 // 12 // 0 /// AY325118 // GenBank // Homo sapiens TAFA5 mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// AY358847 // GenBank // Homo sapiens clone DNA173024 QLLK5208 (UNQ5208) mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 49 // 17 // 17 // 0 /// BC039396 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 19 (chemokine (C-C motif)-like), member A5, mRNA (cDNA clone MGC:44558 IMAGE:5299791), complete cds. // chr22 // 100 // 51 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT087384 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr22 // 100 // 34 // 12 // 12 // 0
ENST00000391625 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:49548681:49556473:1 gene:ENSG00000212939 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr22 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK126356 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44385 fis, clone TRACH3036456. // chr22 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT087401 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr22 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENST00000411210 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:22:49738677:49739003:1 gene:ENSG00000223142 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT087416 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_014838 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, BED-type containing 4 (ZBED4), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000216268 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:49853842:49890078:1 gene:ENSG00000100426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC117670 // GenBank // Homo sapiens zinc finger, BED-type containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:134835 IMAGE:40038569), complete cds. // chr22 // 97 // 85 // 28 // 29 // 0 /// BC167155 // GenBank // Homo sapiens zinc finger, BED-type containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:176685 IMAGE:8862564), complete cds. // chr22 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// CR456387 // GenBank // Homo sapiens bA494O16.1 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.bA494O16.1.V3). // chr22 // 96 // 79 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000016237 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:49883663:49887178:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 56 // 19 // 19 // 0
NM_001001852 // RefSeq // Homo sapiens Pim-3 proto-oncogene, serine/threonine kinase (PIM3), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 79 // 79 // 0 /// ENST00000360612 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:49960513:49964080:1 gene:ENSG00000198355 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 79 // 79 // 0 /// AB114795 // GenBank // Homo sapiens mRNA for serine/threonine kinase Pim-3, complete cds. // chr22 // 100 // 100 // 79 // 79 // 0 /// AK292005 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75766 complete cds, highly similar to Homo sapiens pim-3 oncogene (PIM3), mRNA. // chr22 // 79 // 18 // 11 // 14 // 0 /// BC064477 // GenBank // Homo sapiens pim-3 oncogene, mRNA (cDNA clone IMAGE:6186546), partial cds. // chr22 // 100 // 100 // 79 // 79 // 0 /// BC141855 // GenBank // Homo sapiens pim-3 oncogene, mRNA (cDNA clone MGC:167042 IMAGE:8860375), complete cds. // chr22 // 85 // 100 // 67 // 79 // 0
NM_001160300 // RefSeq // Homo sapiens pannexin 2 (PANX2), transcript variant 2, mRNA. // chr22 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NM_052839 // RefSeq // Homo sapiens pannexin 2 (PANX2), transcript variant 1, mRNA. // chr22 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NR_027691 // RefSeq // Homo sapiens pannexin 2 (PANX2), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr22 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000159647 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:22:50170731:50180292:1 gene:ENSG00000073150 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000395842 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:50170731:50180294:1 gene:ENSG00000073150 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000402472 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:50170761:50179598:1 gene:ENSG00000073150 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr22 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AF398510 // GenBank // Homo sapiens pannexin 2 isoform 1 (PANX2) mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// AF398511 // GenBank // Homo sapiens pannexin 2 isoform 2 (PANX2) mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AK299910 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61621 complete cds, highly similar to Pannexin-2. // chr22 // 96 // 79 // 22 // 23 // 0 /// BC101023 // GenBank // Homo sapiens pannexin 2, mRNA (cDNA clone MGC:119432 IMAGE:40007400), complete cds. // chr22 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// CR456467 // GenBank // Homo sapiens dJ402G11.9 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.dJ402G11.9.V2). // chr22 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000016286 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:50090089:50185059:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1
NM_031454 // RefSeq // Homo sapiens selenoprotein O (SELO), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000380903 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:50200979:50217616:1 gene:ENSG00000073169 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000492092 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:50206442:50217616:1 gene:ENSG00000073169 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr22 // 100 // 67 // 26 // 26 // 0 /// AF274946 // GenBank // Homo sapiens PNAS-21 mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 23 // 9 // 9 // 0 /// AY324823 // GenBank // Homo sapiens selenoprotein O mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// BC032384 // GenBank // Homo sapiens selenoprotein O, mRNA (cDNA clone IMAGE:5178935), partial cds. // chr22 // 100 // 44 // 17 // 17 // 0 /// BC051758 // GenBank // Homo sapiens selenoprotein O, mRNA (cDNA clone IMAGE:5755547), partial cds. // chr22 // 100 // 69 // 27 // 27 // 0 /// BC110866 // GenBank // Homo sapiens selenoprotein O, mRNA (cDNA clone MGC:131879 IMAGE:6041782), complete cds. // chr22 // 92 // 95 // 34 // 37 // 0 /// CR456464 // GenBank // Homo sapiens dJ402G11.5 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.dJ402G11.5.V2). // chr22 // 93 // 74 // 27 // 29 // 0 /// ENST00000611222 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:22:50200979:50217615:1 gene:ENSG00000073169 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 97 // 100 // 38 // 39 // 0 /// GENSCAN00000016252 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:50201037:50217360:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 79 // 31 // 31 // 0
ENST00000470627 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:22:50371210:50371496:1 gene:ENSG00000242463 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr22 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT087479 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr22 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
ENST00000459259 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:22:50398820:50398920:1 gene:ENSG00000238604 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT087480 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001253845 // RefSeq // Homo sapiens adrenomedullin 2 (ADM2), transcript variant 2, mRNA. // chr22 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NM_024866 // RefSeq // Homo sapiens adrenomedullin 2 (ADM2), transcript variant 1, mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000395737 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:50481724:50482940:1 gene:ENSG00000128165 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000395738 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:50481556:50486440:1 gene:ENSG00000128165 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AB121034 // GenBank // Homo sapiens ADM2 mRNA for adrenomedullin 2, complete cds. // chr22 // 100 // 42 // 15 // 15 // 0 /// AB236970 // GenBank // Homo sapiens ADM2 mRNA for adrenomedullin 2, complete cds. // chr22 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// AF529213 // GenBank // Homo sapiens intermedin precursor, mRNA, complete cds. // chr22 // 80 // 42 // 12 // 15 // 0 /// AK090635 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ33316 fis, clone BNGH42007366. // chr22 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// CR456479 // GenBank // Homo sapiens dJ579N16.4 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.dJ579N16.4). // chr22 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT087491 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr22 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000016297 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:50481848:50489856:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1
NM_138433 // RefSeq // Homo sapiens kelch domain containing 7B (KLHDC7B), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000395676 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:50548033:50551023:1 gene:ENSG00000130487 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC009980 // GenBank // Homo sapiens kelch domain containing 7B, mRNA (cDNA clone MGC:16635 IMAGE:4121528), complete cds. // chr22 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000016249 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:50548464:50549951:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0
NM_012324 // RefSeq // Homo sapiens mitogen-activated protein kinase 8 interacting protein 2 (MAPK8IP2), mRNA. // chr22 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// ENST00000008876 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:50603133:50613981:1 gene:ENSG00000008735 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000329492 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:50600685:50611551:1 gene:ENSG00000008735 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// AF136382 // GenBank // Homo sapiens JNK MAP kinase scaffold protein JIP2 mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AF218778 // GenBank // Homo sapiens islet-brain 2 mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// AK293580 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54593 complete cds, highly similar to C-jun-amino-terminal kinase-interactingprotein 2. // chr22 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// AK294265 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61227 complete cds, highly similar to C-jun-amino-terminal kinase-interacting protein 2. // chr22 // 89 // 63 // 17 // 19 // 0 /// BC009940 // GenBank // Homo sapiens mitogen-activated protein kinase 8 interacting protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:12630 IMAGE:4100637), complete cds. // chr22 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// BC047527 // GenBank // Homo sapiens mitogen-activated protein kinase 8 interacting protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:33760 IMAGE:5277237), complete cds. // chr22 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000016244 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:50600819:50610779:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0
NM_033517 // RefSeq // Homo sapiens SH3 and multiple ankyrin repeat domains 3 (SHANK3), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 67 // 67 // 0 /// ENST00000262795 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:22:50674642:50733210:1 gene:ENSG00000251322 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr22 // 100 // 100 // 67 // 67 // 0 /// ENST00000414786 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:50674415:50733298:1 gene:ENSG00000251322 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr22 // 100 // 100 // 67 // 67 // 0 /// ENST00000445220 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:22:50674642:50731312:1 gene:ENSG00000251322 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr22 // 100 // 91 // 61 // 61 // 0 /// AB569469 // GenBank // Homo sapiens SHANK3 mRNA for SH3 and multiple ankyrin repeat domains 3, complete cds. // chr22 // 100 // 91 // 61 // 61 // 0 /// GENSCAN00000016241 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:50674642:50731312:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 91 // 61 // 61 // 0
NM_001097 // RefSeq // Homo sapiens acrosin (ACR), mRNA. // chr22 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000216139 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:50738196:50745334:1 gene:ENSG00000100312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000529621 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:22:50738230:50740757:1 gene:ENSG00000100312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0 /// CR456366 // GenBank // Homo sapiens ACR full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.ACR.V3). // chr22 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0 /// Y00970 // GenBank // Human mRNA for acrosin (EC 3.4.21.10). // chr22 // 92 // 86 // 11 // 12 // 0 /// ENST00000533930 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:50738196:50740359:1 gene:ENSG00000100312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr22 // 100 // 100 // 14 // 14 // 1 /// AK310316 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17358. // chr22 // 100 // 100 // 14 // 14 // 1 /// GENSCAN00000016254 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:50738236:50745207:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0
ENST00000390914 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:22:15701459:15701565:1 gene:ENSG00000212216 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr22 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000391214 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:14:19422815:19422921:-1 gene:ENSG00000212516 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr22 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000391310 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:14:18978847:18978953:1 gene:ENSG00000212612 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr22 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000515948 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:130622838:130622944:1 gene:ENSG00000251757 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr22 // 68 // 100 // 19 // 28 // 0 /// ENST00000516147 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:131602790:131602896:1 gene:ENSG00000251956 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr22 // 68 // 100 // 19 // 28 // 0 /// ENST00000516164 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:130497743:130497849:-1 gene:ENSG00000251973 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr22 // 68 // 100 // 19 // 28 // 0 /// ENST00000390897 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:2:131229607:131229713:1 gene:ENSG00000212199 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr22 // 46 // 100 // 13 // 28 // 0 /// NONHSAT035457 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONHSAT035531 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONHSAT083103 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONHSAT074423 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 46 // 100 // 13 // 28 // 0
NM_014406 // RefSeq // Homo sapiens chaperonin containing TCP1, subunit 8 (theta)-like 2 (CCT8L2), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000359963 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:16590751:16592810:-1 gene:ENSG00000198445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC033797 // GenBank // Homo sapiens chaperonin containing TCP1, subunit 8 (theta)-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:45140 IMAGE:5172617), complete cds. // chr22 // 100 // 69 // 11 // 11 // 0 /// BC100811 // GenBank // Homo sapiens chaperonin containing TCP1, subunit 8 (theta)-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:118839 IMAGE:40000853), complete cds. // chr22 // 89 // 56 // 8 // 9 // 0 /// BC100812 // GenBank // Homo sapiens chaperonin containing TCP1, subunit 8 (theta)-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:118840 IMAGE:40000855), complete cds. // chr22 // 89 // 56 // 8 // 9 // 0 /// BC100813 // GenBank // Homo sapiens chaperonin containing TCP1, subunit 8 (theta)-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:118841 IMAGE:40000856), complete cds. // chr22 // 89 // 56 // 8 // 9 // 0 /// CR456508 // GenBank // Homo sapiens KCNMB3L full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.KCNMB3L). // chr22 // 89 // 56 // 8 // 9 // 0
ENST00000434304 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:16671090:16679493:-1 gene:ENSG00000259271 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr22 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// NM_001277333 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat domain 62 (ANKRD62), mRNA. // chr22 // 71 // 91 // 15 // 21 // 0 /// ENST00000418274 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:18:12102706:12129749:1 gene:ENSG00000181626 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr22 // 71 // 91 // 15 // 21 // 0 /// ENST00000587848 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:18:12093853:12127939:1 gene:ENSG00000181626 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 71 // 91 // 15 // 21 // 0 /// GENSCAN00000046705 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:16671466:16695437:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// TCONS_l2_00017860-XLOC_l2_009448 // Broad TUCP // linc-CCT8L2-3 chr22:-:17140317-17160204 // chr22 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// TCONS_l2_00018304-XLOC_l2_009448 // Broad TUCP // linc-CCT8L2-3 chr22:-:17154450-17158187 // chr22 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000017065 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:18:12107307:12179619:1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 74 // 100 // 17 // 23 // 0 /// ENST00000423580 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:16676016:16694648:-1 gene:ENSG00000273244 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr22 // 39 // 39 // 9 // 23 // 1
NM_175878 // RefSeq // Homo sapiens XK, Kell blood group complex subunit-related family, member 3 (XKR3), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000331428 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:16783412:16821699:-1 gene:ENSG00000172967 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY534240 // GenBank // Homo sapiens XK-related protein 3 mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY989815 // GenBank // Homo sapiens XTES mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC137521 // GenBank // Homo sapiens XK, Kell blood group complex subunit-related family, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:169144 IMAGE:9021521), complete cds. // chr22 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC137522 // GenBank // Homo sapiens XK, Kell blood group complex subunit-related family, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:169145 IMAGE:9021522), complete cds. // chr22 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC144679 // GenBank // Homo sapiens XK, Kell blood group complex subunit-related family, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:178230 IMAGE:9053213), complete cds. // chr22 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000046714 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:16747821:16808073:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
ENST00000523309 // ENSEMBL // havana_ig_gene:known chromosome:GRCh38:22:16914235:16914981:-1 gene:ENSG00000253691 gene_biotype:IG_V_pseudogene transcript_biotype:IG_V_pseudogene // chr22 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000046724 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:16859891:16914979:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0 /// BC144530 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone MGC:178074 IMAGE:9053057, complete cds. // chr22 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_001037814 // RefSeq // Homo sapiens GRB2-associated binding protein family, member 4 (GAB4), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000400588 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:16961936:17008222:-1 gene:ENSG00000215568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AB076978 // GenBank // Homo sapiens mRNA for Grb2-associated binder 2-like protein, complete cds. // chr22 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000465611 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:16962460:17007999:-1 gene:ENSG00000215568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr22 // 70 // 70 // 23 // 33 // 1 /// AK057252 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ32690 fis, clone TESTI2000208, moderately similar to Homo sapiens mRNA for Gab2. // chr22 // 67 // 67 // 22 // 33 // 1 /// GENSCAN00000044950 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:16962733:17021600:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1
NM_031890 // RefSeq // Homo sapiens cat eye syndrome chromosome region, candidate 6 (CECR6), transcript variant 1, mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000331437 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:17116300:17121253:-1 gene:ENSG00000183307 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF307451 // GenBank // Homo sapiens Cat eye syndrome critical region candidate gene number 6 (CECR6) mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000044962 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:17119391:17121127:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0
ENST00000485262 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:22:17352881:17353177:-1 gene:ENSG00000239547 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT083207 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_022719 // RefSeq // Homo sapiens DiGeorge syndrome critical region gene 14 (DGCR14), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000252137 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:19130279:19144684:-1 gene:ENSG00000100056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_022719 // RefSeq // Homo sapiens DiGeorge syndrome critical region gene 14 (DGCR14), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_006724330 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens DiGeorge syndrome critical region gene 14 (DGCR14), transcript variant X3, mRNA. // chr22 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000252137 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:19130279:19144684:-1 gene:ENSG00000100056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000434568 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:19133937:19144684:-1 gene:ENSG00000100056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr22 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000472073 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:19133968:19144633:-1 gene:ENSG00000100056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr22 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// BC006542 // GenBank // Homo sapiens DiGeorge syndrome critical region gene 14, mRNA (cDNA clone MGC:2370 IMAGE:2823027), complete cds. // chr22 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// CR456344 // GenBank // Homo sapiens Em:AC004471.1 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.Em:AC004471.1.V2). // chr22 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// L78010 // GenBank // Homo sapiens ES2 (ES2) mRNA, complete cds. // chr22 // 96 // 74 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000019640 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:19134196:19150283:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 69 // 69 // 24 // 35 // 1
NM_005315 // RefSeq // Homo sapiens goosecoid homeobox 2 (GSC2), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000086933 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:19148576:19150283:-1 gene:ENSG00000063515 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_425298 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens uncharacterized LOC102725440 (LOC102725440), ncRNA. // chr22 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000019640 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:19134196:19150283:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0
NM_003325 // RefSeq // Homo sapiens histone cell cycle regulator (HIRA), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000263208 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:19330698:19431733:-1 gene:ENSG00000100084 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000509549 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:19351368:19447691:-1 gene:ENSG00000242259 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr22 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// AK289809 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78369 complete cds, highly similar to H.sapiens HIRA mRNA. // chr22 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// AK299950 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58422 complete cds, highly similar to HIRA protein. // chr22 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// AK302835 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61741 complete cds, highly similar to HIRA protein. // chr22 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC039835 // GenBank // Homo sapiens HIR histone cell cycle regulation defective homolog A (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:48803 IMAGE:5491361), complete cds. // chr22 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// CR456503 // GenBank // Homo sapiens HIRA full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.HIRA). // chr22 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// ENST00000340170 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:19330698:19431696:-1 gene:ENSG00000100084 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// GENSCAN00000019637 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:19331440:19411268:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0
NM_173793 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 22 open reading frame 39 (C22orf39), transcript variant 1, mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000333059 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:22:19443371:19447697:-1 gene:ENSG00000242259 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000399562 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:19441777:19448232:-1 gene:ENSG00000242259 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AK095271 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ37952 fis, clone CTONG2009258. // chr22 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// BC062599 // GenBank // Homo sapiens chromosome 22 open reading frame 39, mRNA (cDNA clone MGC:74441 IMAGE:5248209), complete cds. // chr22 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// CR456339 // GenBank // Homo sapiens Em:AC000068.3 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.Em:AC000068.3). // chr22 // 100 // 50 // 10 // 10 // 0 /// AK290073 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78353 complete cds. // chr22 // 50 // 50 // 10 // 20 // 1 /// ENST00000611555 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:22:19443150:19448232:-1 gene:ENSG00000242259 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC072437 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5756372, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr22 // 90 // 90 // 18 // 20 // 1
NM_023004 // RefSeq // Homo sapiens reticulon 4 receptor (RTN4R), mRNA. // chr22 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000043402 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:20241415:20268531:-1 gene:ENSG00000040608 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000416372 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:22:20241415:20267689:-1 gene:ENSG00000040608 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000425986 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:22:20241417:20243684:-1 gene:ENSG00000040608 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// AF283463 // GenBank // Homo sapiens Nogo receptor mRNA, complete cds. // chr22 // 93 // 50 // 14 // 15 // 0 /// AK054602 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ30040 fis, clone 3NB692001520, weakly similar to PLATELET GLYCOPROTEIN IB BETA CHAIN PRECURSOR. // chr22 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// BC011787 // GenBank // Homo sapiens reticulon 4 receptor, mRNA (cDNA clone MGC:19831 IMAGE:4040540), complete cds. // chr22 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// CR456360 // GenBank // Homo sapiens Em:AC007663.1 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.Em:AC007663.1). // chr22 // 95 // 67 // 19 // 20 // 0 /// AY358297 // GenBank // Homo sapiens clone DNA44184 NOGOR (UNQ330) mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000018468 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:20264536:20274189:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// GENSCAN00000018482 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:20241711:20249313:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1
NM_033257 // RefSeq // Homo sapiens DiGeorge syndrome critical region gene 6-like (DGCR6L), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000248879 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:20314276:20320080:-1 gene:ENSG00000128185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000405465 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:22:20314283:20320009:-1 gene:ENSG00000128185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000443409 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:20314394:20320080:-1 gene:ENSG00000128185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr22 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// AF228708 // GenBank // Homo sapiens DiGeorge syndrome critical region 6-like protein (DGCR6L) mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// AK289952 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78500 complete cds, highly similar to Homo sapiens DiGeorge syndrome critical region gene 6-like, mRNA. // chr22 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// AK310899 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17941. // chr22 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC000682 // GenBank // Homo sapiens DiGeorge syndrome critical region gene 6-like, mRNA (cDNA clone MGC:1411 IMAGE:3349309), complete cds. // chr22 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0 /// CR456361 // GenBank // Homo sapiens Em:AC007663.3 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.Em:AC007663.3). // chr22 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// KJ535014 // GenBank HTC // Homo sapiens clone DGCR6_iso-B_fetal-F08 DiGeorge syndrome critical region 6 isoform B (DGCR6) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr22 // 67 // 75 // 8 // 12 // 0 /// GENSCAN00000018496 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:20314675:20319988:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0
ENST00000363187 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:22:21389191:21389491:1 gene:ENSG00000200057 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr22 // 86 // 93 // 24 // 28 // 0 /// ENST00000410698 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:22:18605802:18606102:-1 gene:ENSG00000222630 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr22 // 86 // 93 // 24 // 28 // 0 /// AB051453 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1666 protein, partial cds. // chr22 // 92 // 83 // 23 // 25 // 0 /// ENST00000331505 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:21545357:21550831:-1 gene:ENSG00000183246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 68 // 83 // 17 // 25 // 0 /// ENST00000410420 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:22:21545344:21545644:-1 gene:ENSG00000222352 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr22 // 61 // 93 // 17 // 28 // 0 /// ENST00000619918 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:18605815:18611919:-1 gene:ENSG00000275793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 92 // 83 // 23 // 25 // 0 /// ENST00000620804 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:21383374:21389478:1 gene:ENSG00000274600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 92 // 83 // 23 // 25 // 0 /// NONHSAT083514 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr22 // 86 // 93 // 24 // 28 // 0 /// NONHSAT083665 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr22 // 86 // 93 // 24 // 28 // 0 /// NONHSAT083690 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr22 // 61 // 93 // 17 // 28 // 0
ENST00000384613 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:22:20416797:20416899:-1 gene:ENSG00000207343 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr22 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT083537 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_153334 // RefSeq // Homo sapiens scavenger receptor class F, member 2 (SCARF2), transcript variant 1, mRNA. // chr22 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NM_182895 // RefSeq // Homo sapiens scavenger receptor class F, member 2 (SCARF2), transcript variant 2, mRNA. // chr22 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// XM_006724364 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens scavenger receptor class F, member 2 (SCARF2), transcript variant X1, mRNA. // chr22 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// AB024433 // GenBank // Homo sapiens mRNA for NSR1, chromosome 22q11.2, complete cds. // chr22 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// AB052951 // GenBank // Homo sapiens SRECRP mRNA for SRECRP-1, complete cds. // chr22 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// AF522196 // GenBank // Homo sapiens scavenger receptor type F mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000615031 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:22:20424585:20437859:-1 gene:ENSG00000244486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENST00000622235 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:20424584:20437825:-1 gene:ENSG00000244486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018481 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:20425375:20437754:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// AK075058 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ90577 fis, clone OVARC1002058. // chr22 // 83 // 46 // 10 // 12 // 0
ENST00000532431 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:22:20475203:20475311:-1 gene:ENSG00000255156 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT083540 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000493791 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:22:20481935:20482213:-1 gene:ENSG00000242876 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr22 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT083542 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr22 // 95 // 100 // 19 // 20 // 0
ENST00000411545 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:20667836:20670984:-1 gene:ENSG00000229107 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr22 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000580133 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:22114844:22118005:-1 gene:ENSG00000263366 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr22 // 73 // 100 // 8 // 11 // 0 /// GENSCAN00000018458 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:20667818:20671269:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000037260 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:22114844:22125832:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 64 // 100 // 7 // 11 // 0
NM_002650 // RefSeq // Homo sapiens phosphatidylinositol 4-kinase, catalytic, alpha (PI4KA), transcript variant 2, mRNA. // chr22 // 100 // 23 // 10 // 10 // 0 /// NM_058004 // RefSeq // Homo sapiens phosphatidylinositol 4-kinase, catalytic, alpha (PI4KA), transcript variant 1, mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENST00000255882 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:20707691:20858812:-1 gene:ENSG00000241973 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENST00000477245 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:20707703:20734667:-1 gene:ENSG00000241973 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr22 // 100 // 23 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000485963 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:20798478:20858812:-1 gene:ENSG00000241973 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr22 // 100 // 42 // 18 // 18 // 0 /// AF012872 // GenBank // Homo sapiens phosphatidylinositol 4-kinase 230 (pi4K230) mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// AK131431 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ16556 fis, clone SPLEN2039379, highly similar to Homo sapiens phosphatidylinositol 4-kinase 230 (pi4K230) mRNA. // chr22 // 100 // 42 // 18 // 18 // 0 /// AK302424 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60960 complete cds, highly similar to Phosphatidylinositol 4-kinase alpha (EC 2.7.1.67). // chr22 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// L36151 // GenBank // Homo sapiens phosphatidylinositol 4-kinase mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 23 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000018487 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:20708047:20776628:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 51 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000018492 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:20793178:20836636:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 44 // 19 // 19 // 0
NR_003608 // RefSeq // Homo sapiens tubulin, alpha 3f, pseudogene (TUBA3FP), non-coding RNA. // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000292748 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:21008637:21014292:-1 gene:ENSG00000161149 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr22 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000422086 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:21008193:21014287:-1 gene:ENSG00000161149 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000442739 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:21002895:21009453:-1 gene:ENSG00000161149 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr22 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000010639 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:20999880:21014217:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_004173 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 7, member 4 (SLC7A4), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000382932 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:21028718:21032558:-1 gene:ENSG00000099960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000403586 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:21028718:21032549:-1 gene:ENSG00000099960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// BC008814 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 7 (cationic amino acid transporter, y+ system), member 4, mRNA (cDNA clone MGC:10733 IMAGE:3958091), complete cds. // chr22 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC062565 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 7 (cationic amino acid transporter, y+ system), member 4, mRNA (cDNA clone MGC:75107 IMAGE:5165369), complete cds. // chr22 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// BC107160 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 7 (cationic amino acid transporter, y+ system), member 4, mRNA (cDNA clone MGC:129976 IMAGE:40033862), complete cds. // chr22 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// BC107161 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 7 (cationic amino acid transporter, y+ system), member 4, mRNA (cDNA clone MGC:129977 IMAGE:40033864), complete cds. // chr22 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// CR456580 // GenBank // Homo sapiens SLC7A4 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.SLC7A4). // chr22 // 96 // 87 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000010650 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:21029055:21031812:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 95 // 65 // 19 // 20 // 0
ENST00000331505 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:21545357:21550831:-1 gene:ENSG00000183246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 92 // 83 // 22 // 24 // 0 /// ENST00000410420 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:22:21545344:21545644:-1 gene:ENSG00000222352 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr22 // 85 // 93 // 23 // 27 // 0 /// ENST00000363187 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:22:21389191:21389491:1 gene:ENSG00000200057 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr22 // 63 // 93 // 17 // 27 // 0 /// ENST00000410698 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:22:18605802:18606102:-1 gene:ENSG00000222630 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr22 // 63 // 93 // 17 // 27 // 0 /// AB051453 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1666 protein, partial cds. // chr22 // 67 // 83 // 16 // 24 // 0 /// NONHSAT083690 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr22 // 85 // 93 // 23 // 27 // 0 /// ENST00000619918 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:18605815:18611919:-1 gene:ENSG00000275793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 67 // 83 // 16 // 24 // 0 /// ENST00000620804 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:21383374:21389478:1 gene:ENSG00000274600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 67 // 83 // 16 // 24 // 0 /// NONHSAT083514 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr22 // 63 // 93 // 17 // 27 // 0 /// NONHSAT083665 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr22 // 63 // 93 // 17 // 27 // 0
ENST00000496490 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:22:21722895:21723182:-1 gene:ENSG00000244671 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr22 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT083715 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr22 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENST00000337471 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:21991100:22043934:-1 gene:ENSG00000197549 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr22 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// ENST00000548391 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:21991236:21995428:-1 gene:ENSG00000197549 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr22 // 90 // 58 // 19 // 21 // 0 /// AK131325 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ16327 fis, clone SYNOV1000256, weakly similar to Human preferentially expressed antigen of melanoma (PRAME) mRNA. // chr22 // 89 // 100 // 32 // 36 // 0 /// ENST00000419303 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:21991099:22043858:-1 gene:ENSG00000197549 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr22 // 94 // 94 // 34 // 36 // 1 /// GENSCAN00000037258 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:21991211:21995428:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 86 // 58 // 18 // 21 // 0 /// BC032467 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5210139, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr22 // 94 // 94 // 34 // 36 // 1
NM_080764 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 280B (ZNF280B), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC040020 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 280B, mRNA (cDNA clone MGC:49006 IMAGE:5785297), complete cds. // chr22 // 88 // 83 // 21 // 24 // 0 /// CR456614 // GenBank // Homo sapiens ZNF279 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.ZNF279). // chr22 // 87 // 52 // 13 // 15 // 0 /// ENST00000613655 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:22:22484873:22489468:-1 gene:ENSG00000275004 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 89 // 66 // 17 // 19 // 0 /// ENST00000616997 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR22_1_CTG3:22493978:22498573:-1 gene:ENSG00000277421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 89 // 66 // 17 // 19 // 0 /// ENST00000619852 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:22484421:22509154:-1 gene:ENSG00000275004 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 93 // 93 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000001050 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR22_1_CTG3:22496872:22498503:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 92 // 41 // 11 // 12 // 0 /// GENSCAN00000037248 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:22487767:22489398:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 92 // 41 // 11 // 12 // 0
NM_080740 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 280A (ZNF280A), mRNA. // chr22 // 91 // 100 // 29 // 32 // 0 /// ENST00000302097 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:22513736:22520270:-1 gene:ENSG00000169548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 91 // 100 // 29 // 32 // 0 /// BC053901 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 280A, mRNA (cDNA clone MGC:61573 IMAGE:6166804), complete cds. // chr22 // 90 // 97 // 28 // 31 // 0 /// ENST00000620282 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR22_1_CTG3:22522846:22529375:-1 gene:ENSG00000275499 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 91 // 100 // 29 // 32 // 0 /// GENSCAN00000001054 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR22_1_CTG3:22513891:22524735:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000037243 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:22504786:22515630:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0
NM_014433 // RefSeq // Homo sapiens rhabdoid tumor deletion region gene 1 (RTDR1), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000216036 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:23059415:23142093:-1 gene:ENSG00000100218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF133587 // GenBank // Homo sapiens rhabdoid tumor deletion region protein 1 (RTDR1) mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC008986 // GenBank // Homo sapiens rhabdoid tumor deletion region gene 1, mRNA (cDNA clone MGC:16968 IMAGE:4339021), complete cds. // chr22 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// CR456567 // GenBank // Homo sapiens RTDR1 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.RTDR1). // chr22 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000406876 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:22:23136198:23145021:-1 gene:ENSG00000100218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// AK299530 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52272 complete cds, highly similar to Rhabdoid tumor deletion region protein 1. // chr22 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1 /// GENSCAN00000047043 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:23125376:23140420:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000047047 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:23059462:23064332:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0
ENST00000606537 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:22:23132730:23133005:-1 gene:ENSG00000272019 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT083854 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr22 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
BC027465 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4155919, complete cds. // chr22 // 67 // 100 // 18 // 27 // 0
ENST00000412037 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:23179918:23180172:-1 gene:ENSG00000236794 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr22 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT083857 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr22 // 79 // 96 // 19 // 24 // 0 /// NONHSAT083858 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr22 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000047046 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:23179250:23180828:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
ENST00000467969 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:22:23261782:23262071:-1 gene:ENSG00000240160 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr22 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT083870 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr22 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0
NM_020070 // RefSeq // Homo sapiens immunoglobulin lambda-like polypeptide 1 (IGLL1), transcript variant 1, mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NM_152855 // RefSeq // Homo sapiens immunoglobulin lambda-like polypeptide 1 (IGLL1), transcript variant 2, mRNA. // chr22 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000249053 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:22:23573125:23580239:-1 gene:ENSG00000128322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000330377 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:23573125:23580308:-1 gene:ENSG00000128322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000438703 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:22:23573369:23580302:-1 gene:ENSG00000128322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// BC012293 // GenBank // Homo sapiens immunoglobulin lambda-like polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:21361 IMAGE:4508892), complete cds. // chr22 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0 /// BC030239 // GenBank // Homo sapiens immunoglobulin lambda-like polypeptide 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4539615), complete cds. // chr22 // 100 // 76 // 16 // 16 // 0 /// M27749 // GenBank // Human immunoglobulin-related 14.1 protein mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000047017 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:23573266:23583419:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 48 // 10 // 10 // 0
NM_016449 // RefSeq // Homo sapiens aspartate-rich 1 (DRICH1), mRNA. // chr22 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000317749 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:23608452:23632321:-1 gene:ENSG00000189269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0 /// BC063390 // GenBank HTC // Homo sapiens hypothetical protein LOC51233, mRNA (cDNA clone IMAGE:5170001), with apparent retained intron. // chr22 // 100 // 50 // 10 // 10 // 0 /// CR456370 // GenBank // Homo sapiens Em:AP000346.6 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.Em:AP000346.6). // chr22 // 100 // 60 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000614553 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:22:23613287:23632023:-1 gene:ENSG00000189269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 60 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000047041 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:23613212:23653457:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 40 // 40 // 8 // 20 // 1
NM_021916 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 70 (ZNF70), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000341976 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:23741582:23751092:-1 gene:ENSG00000187792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC040161 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 70, mRNA (cDNA clone MGC:48959 IMAGE:5551072), complete cds. // chr22 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// CR456615 // GenBank // Homo sapiens ZNF70 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.ZNF70.V4). // chr22 // 95 // 61 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000047022 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:23743800:23745140:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0
NM_013378 // RefSeq // Homo sapiens pre-B lymphocyte 3 (VPREB3), mRNA. // chr22 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// ENST00000248948 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:23752743:23754468:-1 gene:ENSG00000128218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// ENST00000398465 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:22:23752743:23754409:-1 gene:ENSG00000128218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 94 // 70 // 15 // 16 // 0 /// AF163825 // GenBank // Homo sapiens pre-B lymphocyte protein 3 (VPREB3) mRNA, complete cds. // chr22 // 94 // 78 // 17 // 18 // 0 /// AY359000 // GenBank // Homo sapiens clone DNA49821 VPREB3 (UNQ355) mRNA, complete cds. // chr22 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// BC020666 // GenBank // Homo sapiens pre-B lymphocyte 3, mRNA (cDNA clone MGC:22350 IMAGE:4772032), complete cds. // chr22 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// CR456610 // GenBank // Homo sapiens VPREB3 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.VPREB3.V2). // chr22 // 100 // 70 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000047037 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:23752876:23754363:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0
ENST00000491172 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:22:23879493:23879790:-1 gene:ENSG00000244425 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr22 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000611500 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR22_1_CTG7:23879493:23879790:-1 gene:ENSG00000277187 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr22 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT083991 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr22 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NR_028484 // RefSeq // Homo sapiens ADORA2A antisense RNA 1 (ADORA2A-AS1), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000326341 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:24429206:24494800:-1 gene:ENSG00000178803 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT084344 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT084345 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr22 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONHSAT084346 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012000 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:24423971:24432959:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001001663 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 211 (TMEM211), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000407886 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:24935110:24946695:-1 gene:ENSG00000206069 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000423535 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:22:24935241:24939535:-1 gene:ENSG00000206069 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC130647 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 211, mRNA (cDNA clone MGC:163519 IMAGE:40146678), complete cds. // chr22 // 89 // 95 // 17 // 19 // 0 /// BC130649 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 211, mRNA (cDNA clone MGC:163521 IMAGE:40146680), complete cds. // chr22 // 89 // 95 // 17 // 19 // 0 /// CR456388 // GenBank // Homo sapiens bA9F11.1 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.bA9F11.1). // chr22 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000011737 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:24935333:24990755:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0
ENST00000410653 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:22:25715041:25715169:-1 gene:ENSG00000222585 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr22 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT084445 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000411124 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:22:25963983:25964273:-1 gene:ENSG00000223056 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT084470 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000516458 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:22:26390667:26390776:-1 gene:ENSG00000252267 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr22 // 76 // 84 // 16 // 21 // 0 /// NONHSAT084480 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 76 // 84 // 16 // 21 // 0
NM_001887 // RefSeq // Homo sapiens crystallin, beta B1 (CRYBB1), mRNA. // chr22 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000215939 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:26599278:26618088:-1 gene:ENSG00000100122 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC036790 // GenBank // Homo sapiens crystallin, beta B1, mRNA (cDNA clone MGC:45992 IMAGE:5752689), complete cds. // chr22 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// CR456425 // GenBank // Homo sapiens CRYBB1 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.CRYBB1). // chr22 // 89 // 88 // 25 // 28 // 0 /// U35340 // GenBank // Homo sapiens beta B1-crystallin mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000011700 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:26579309:26616319:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0
NM_002430 // RefSeq // Homo sapiens meningioma (disrupted in balanced translocation) 1 (MN1), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000302326 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:27748277:27801498:-1 gene:ENSG00000169184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000042194 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:27750915:27896626:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 68 // 27 // 27 // 0
NM_001145418 // RefSeq // Homo sapiens tetratricopeptide repeat domain 28 (TTC28), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 61 // 61 // 0 /// ENST00000397906 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:22:27978014:28679865:-1 gene:ENSG00000100154 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 61 // 61 // 0 /// ENST00000431039 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:22:27983599:27996239:-1 gene:ENSG00000100154 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 13 // 8 // 8 // 0 /// AB028966 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1043 protein, partial cds. // chr22 // 100 // 59 // 36 // 36 // 0 /// AB665284 // GenBank // Homo sapiens TPRBK mRNA for TPR-containing big gene cloned at Keio, complete cds. // chr22 // 100 // 100 // 61 // 61 // 0 /// BC016465 // GenBank // Homo sapiens tetratricopeptide repeat domain 28, mRNA (cDNA clone MGC:18145 IMAGE:4154050), complete cds. // chr22 // 100 // 52 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000468807 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:28629428:28679812:-1 gene:ENSG00000100154 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr22 // 41 // 41 // 25 // 61 // 1 /// ENST00000612946 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:22:27978014:28306645:-1 gene:ENSG00000100154 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 59 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000037353 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:28049575:28172611:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 23 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000037343 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:28562231:28734721:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 41 // 41 // 25 // 61 // 1 /// GENSCAN00000037351 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:27982221:28035641:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 36 // 36 // 22 // 61 // 1
ENST00000466709 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:22:28056153:28056453:-1 gene:ENSG00000239249 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr22 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT084647 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr22 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000579233 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:22:28642979:28643270:-1 gene:ENSG00000266503 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr22 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT084650 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr22 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NR_046851 // RefSeq // Homo sapiens ZNRF3 antisense RNA 1 (ZNRF3-AS1), long non-coding RNA. // chr22 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000325660 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:29024999:29031476:-1 gene:ENSG00000177993 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr22 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT084665 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr22 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000216071 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:29058672:29061844:-1 gene:ENSG00000100249 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// AL035364 // GenBank // H.sapiens novel gene from chromosome 22. // chr22 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC074758 // GenBank // Homo sapiens chromosome 22 open reading frame 31, mRNA (cDNA clone MGC:103835 IMAGE:30915217), complete cds. // chr22 // 83 // 79 // 19 // 23 // 0 /// BC126262 // GenBank // Homo sapiens chromosome 22 open reading frame 31, mRNA (cDNA clone MGC:161540 IMAGE:8991978), complete cds. // chr22 // 92 // 90 // 24 // 26 // 0 /// BC126264 // GenBank // Homo sapiens chromosome 22 open reading frame 31, mRNA (cDNA clone MGC:161542 IMAGE:8991980), complete cds. // chr22 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// CR456405 // GenBank // Homo sapiens bK747E2.1 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.bK747E2.1). // chr22 // 61 // 62 // 11 // 18 // 0 /// XM_005261491 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chromosome 22 open reading frame 31 (C22orf31), transcript variant X2, mRNA. // chr22 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1
ENST00000516143 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:22:29191697:29191808:-1 gene:ENSG00000251952 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT084678 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000401450 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:22:29312933:29315692:-1 gene:ENSG00000100276 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000474590 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:29313535:29314306:-1 gene:ENSG00000100276 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr22 // 80 // 38 // 8 // 10 // 0 /// BC040434 // GenBank // Homo sapiens RAS-like, family 10, member A, mRNA (cDNA clone MGC:48823 IMAGE:5727949), complete cds. // chr22 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC050739 // GenBank // Homo sapiens RAS-like, family 10, member A, mRNA (cDNA clone MGC:60386 IMAGE:5244128), complete cds. // chr22 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_006477 // RefSeq // Homo sapiens RAS-like, family 10, member A (RASL10A), mRNA. // chr22 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// ENST00000216101 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:29312933:29315756:-1 gene:ENSG00000100276 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// BC022473 // GenBank // Homo sapiens RAS-like, family 10, member A, mRNA (cDNA clone MGC:26268 IMAGE:4794714), complete cds. // chr22 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// BC058077 // GenBank // Homo sapiens RAS-like, family 10, member A, mRNA (cDNA clone MGC:65075 IMAGE:5240551), complete cds. // chr22 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// GENSCAN00000019536 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:29313134:29319383:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT084695 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr22 // 80 // 38 // 8 // 10 // 0
NM_001003692 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, matrin-type 5 (ZMAT5), transcript variant 2, mRNA. // chr22 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NM_019103 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, matrin-type 5 (ZMAT5), transcript variant 1, mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_005261683 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens zinc finger, matrin-type 5 (ZMAT5), transcript variant X1, mRNA. // chr22 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000344318 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:29730956:29766961:-1 gene:ENSG00000100319 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// AK292671 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75820 complete cds, highly similar to Homo sapiens zinc finger, matrin type 5 (ZMAT5), transcript variant 2, mRNA. // chr22 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC009717 // GenBank // Homo sapiens zinc finger, matrin type 5, mRNA (cDNA clone MGC:9510 IMAGE:3890730), complete cds. // chr22 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// CR456353 // GenBank // Homo sapiens Em:AC005529.5 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.Em:AC005529.5.V2). // chr22 // 95 // 68 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000019535 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:29733863:29748544:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 94 // 55 // 16 // 17 // 0
ENST00000384724 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:22:29899587:29899693:-1 gene:ENSG00000207455 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr22 // 94 // 100 // 16 // 17 // 0 /// NONHSAT084742 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 94 // 100 // 16 // 17 // 0
NM_001257135 // RefSeq // Homo sapiens leukemia inhibitory factor (LIF), transcript variant 2, mRNA. // chr22 // 100 // 70 // 16 // 16 // 0 /// NM_002309 // RefSeq // Homo sapiens leukemia inhibitory factor (LIF), transcript variant 1, mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000249075 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:30240447:30246851:-1 gene:ENSG00000128342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000403987 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:22:30243533:30246739:-1 gene:ENSG00000128342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 35 // 8 // 8 // 0 /// BC069540 // GenBank // Homo sapiens leukemia inhibitory factor (cholinergic differentiation factor), mRNA (cDNA clone MGC:97016 IMAGE:7262225), complete cds. // chr22 // 100 // 70 // 16 // 16 // 0 /// BC093733 // GenBank // Homo sapiens leukemia inhibitory factor (cholinergic differentiation factor), mRNA (cDNA clone MGC:120768 IMAGE:7939578), complete cds. // chr22 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0 /// BC093735 // GenBank // Homo sapiens leukemia inhibitory factor (cholinergic differentiation factor), mRNA (cDNA clone MGC:120770 IMAGE:7939580), complete cds. // chr22 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000007581 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:30243651:30284311:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 52 // 52 // 12 // 23 // 1
NM_020530 // RefSeq // Homo sapiens oncostatin M (OSM), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000215781 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:30262829:30266840:-1 gene:ENSG00000099985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000403389 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:22:30263868:30265818:-1 gene:ENSG00000099985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000403463 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:22:30264075:30266839:-1 gene:ENSG00000099985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// AB451493 // GenBank // Homo sapiens OSM mRNA for oncostatin M precursor, partial cds, clone: FLJ80003DABN. // chr22 // 83 // 43 // 10 // 12 // 0 /// BC011589 // GenBank // Homo sapiens oncostatin M, mRNA (cDNA clone MGC:20461 IMAGE:4548943), complete cds. // chr22 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// CR456534 // GenBank // Homo sapiens OSM full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.OSM.V6). // chr22 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// CR541703 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834E0828D for gene OSM, oncostatin M; complete cds, without stopcodon. // chr22 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000007581 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:30243651:30284311:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
NR_046312 // RefSeq // Homo sapiens KIAA1656 protein (KIAA1656), long non-coding RNA. // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// CR456347 // GenBank // Homo sapiens Em:AC004997.11 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.Em:AC004997.11). // chr22 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENST00000619645 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:GRCh38:22:30374324:30374878:-1 gene:ENSG00000273967 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT084775 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001017981 // RefSeq // Homo sapiens ring finger protein 215 (RNF215), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000215798 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:22:30378983:30387125:-1 gene:ENSG00000099999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000382363 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:30378817:30387388:-1 gene:ENSG00000099999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000473077 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:30384370:30386886:-1 gene:ENSG00000099999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr22 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// AK293904 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59014 complete cds. // chr22 // 96 // 76 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000431544 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:22:30385907:30421771:-1 gene:ENSG00000099999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// ENST00000463319 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:30379590:30384834:-1 gene:ENSG00000099999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr22 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1 /// GENSCAN00000007575 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:30379600:30387313:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0
NM_014941 // RefSeq // Homo sapiens MORC family CW-type zinc finger 2 (MORC2), mRNA. // chr22 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENST00000215862 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:22:30926611:30968201:-1 gene:ENSG00000133422 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000397641 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:30925130:30968298:-1 gene:ENSG00000133422 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000476152 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:30941900:30958884:-1 gene:ENSG00000133422 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr22 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// BC019257 // GenBank // Homo sapiens MORC family CW-type zinc finger 2, mRNA (cDNA clone MGC:1834 IMAGE:3503651), complete cds. // chr22 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC136782 // GenBank // Homo sapiens MORC family CW-type zinc finger 2, mRNA (cDNA clone MGC:168395 IMAGE:9020772), complete cds. // chr22 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// CR456469 // GenBank // Homo sapiens dJ430N8.1 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.dJ430N8.1). // chr22 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000003460 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:30926803:30967889:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
ENST00000609017 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:31082156:31083565:-1 gene:ENSG00000273387 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr22 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC012026 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4476475, complete cds. // chr22 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_015715 // RefSeq // Homo sapiens phospholipase A2, group III (PLA2G3), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000215885 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:31134809:31140607:-1 gene:ENSG00000100078 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF220490 // GenBank // Homo sapiens group III secreted phospholipase A2 mRNA, complete cds. // chr22 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC025316 // GenBank // Homo sapiens phospholipase A2, group III, mRNA (cDNA clone MGC:39312 IMAGE:5458919), complete cds. // chr22 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000003457 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:31135723:31170058:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
ENST00000526089 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:31205264:31205616:-1 gene:ENSG00000254835 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr22 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC069286 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:7262680. // chr22 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONHSAT084859 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr22 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
ENST00000362825 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:22:31222745:31222853:-1 gene:ENSG00000199695 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr22 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT084861 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000365149 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:22:31230071:31230172:-1 gene:ENSG00000202019 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT084862 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000383888 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:22:31388733:31388837:-1 gene:ENSG00000206615 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr22 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONHSAT084882 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_173566 // RefSeq // Homo sapiens proline rich 14-like (PRR14L), mRNA. // chr22 // 100 // 90 // 55 // 55 // 0 /// ENST00000327423 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:22:31681347:31750131:-1 gene:ENSG00000183530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 90 // 55 // 55 // 0 /// ENST00000431684 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:31685042:31713845:-1 gene:ENSG00000183530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr22 // 100 // 44 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000432485 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:31681350:31703718:-1 gene:ENSG00000183530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr22 // 100 // 16 // 10 // 10 // 0 /// CT841517 // GenBank // Homo sapiens dJ694E4.2 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.dJ694E4.2.V3). // chr22 // 100 // 90 // 55 // 55 // 0 /// ENST00000330495 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:22:31676256:31712745:-1 gene:ENSG00000183530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 59 // 59 // 36 // 61 // 1 /// BC040859 // GenBank // Homo sapiens chromosome 22 open reading frame 30, mRNA (cDNA clone MGC:50372 IMAGE:5535580), complete cds. // chr22 // 59 // 59 // 36 // 61 // 1 /// ENST00000492705 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:22:31704444:31712347:-1 gene:ENSG00000183530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr22 // 23 // 23 // 14 // 61 // 1 /// GENSCAN00000003461 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:31685527:31738812:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 64 // 39 // 39 // 0 /// AK026712 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ23059 fis, clone LNG03912. // chr22 // 88 // 41 // 22 // 25 // 0 /// NONHSAT084912 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr22 // 23 // 23 // 14 // 61 // 1
ENST00000248984 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:31933521:31945350:-1 gene:ENSG00000128254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000486651 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:31934040:31945518:-1 gene:ENSG00000128254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr22 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// AL050256 // GenBank // Novel human gene mapping to chomosome 22. // chr22 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK294232 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55838 complete cds. // chr22 // 88 // 88 // 23 // 26 // 1 /// ENST00000484682 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:31934348:31938454:-1 gene:ENSG00000128254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr22 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// NONHSAT084920 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr22 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT084921 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr22 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
ENST00000464862 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:22:31981147:31981427:-1 gene:ENSG00000240647 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr22 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONHSAT084929 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr22 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_001010859 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 22 open reading frame 42 (C22orf42), mRNA. // chr22 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// XM_005261369 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chromosome 22 open reading frame 42 (C22orf42), transcript variant X1, mRNA. // chr22 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000382097 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:32149006:32159288:-1 gene:ENSG00000205856 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000467813 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:32149006:32159322:-1 gene:ENSG00000205856 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr22 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// CR456485 // GenBank // Homo sapiens dJ90G24.6 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.dJ90G24.6.V7). // chr22 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000013573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:32144208:32173327:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 58 // 11 // 11 // 0
NM_006605 // RefSeq // Homo sapiens ret finger protein-like 2 (RFPL2), transcript variant 1, mRNA. // chr22 // 100 // 50 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000248980 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:22:32190435:32193479:-1 gene:ENSG00000128253 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 50 // 6 // 6 // 0 /// NM_001098527 // RefSeq // Homo sapiens ret finger protein-like 2 (RFPL2), transcript variant 2, mRNA. // chr22 // 92 // 92 // 11 // 12 // 1 /// NM_001159545 // RefSeq // Homo sapiens ret finger protein-like 2 (RFPL2), transcript variant 3, mRNA. // chr22 // 92 // 92 // 11 // 12 // 1 /// NM_001159546 // RefSeq // Homo sapiens ret finger protein-like 2 (RFPL2), transcript variant 4, mRNA. // chr22 // 92 // 92 // 11 // 12 // 1 /// ENST00000400237 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:32190438:32203477:-1 gene:ENSG00000128253 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 92 // 92 // 11 // 12 // 1 /// BC051910 // GenBank // Homo sapiens ret finger protein-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:60383 IMAGE:5729832), complete cds. // chr22 // 83 // 83 // 10 // 12 // 1
NM_014227 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 5 (glucose activated ion channel), member 4 (SLC5A4), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006724308 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens solute carrier family 5 (glucose activated ion channel), member 4 (SLC5A4), transcript variant X1, mRNA. // chr22 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000266086 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:32218476:32255341:-1 gene:ENSG00000100191 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AJ133127 // GenBank // Homo sapiens mRNA for sodium-glucose cotransporter (SGLT2 gene). // chr22 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// U41897 // GenBank // Human low affinity sodium-glucose cotransporter SAAT1 mRNA, partial cds. // chr22 // 100 // 34 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000013578 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:32218514:32255329:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0
NM_174932 // RefSeq // Homo sapiens BPI fold containing family C (BPIFC), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000300399 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:22:32413847:32457386:-1 gene:ENSG00000184459 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000397452 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:32413847:32464484:-1 gene:ENSG00000184459 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000432451 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:22:32414303:32457386:-1 gene:ENSG00000184459 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000534972 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:22:32413847:32457386:-1 gene:ENSG00000184459 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// AF465766 // GenBank // Homo sapiens bactericidal/permeability-increasing protein-like 2 (BPIL2) mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// AK301685 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61439 complete cds, highly similar to Bactericidal/permeability-increasingprotein-like 2 precursor. // chr22 // 90 // 84 // 28 // 31 // 0 /// BC131582 // GenBank // Homo sapiens bactericidal/permeability-increasing protein-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:149237 IMAGE:40112599), complete cds. // chr22 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000013572 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:32424566:32446840:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 41 // 41 // 15 // 37 // 1
ENST00000516081 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:22:32635102:32635198:-1 gene:ENSG00000251890 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr22 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT084987 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
X77690 // GenBank // H.sapiens mRNA for K222 expressed in degenerative retinas. // chr22 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// NONHSAT084992 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Sense No Exonic // chr22 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0
ENST00000517198 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:22:33704786:33704920:-1 gene:ENSG00000253007 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr22 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT085009 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
ENST00000472240 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:35626988:35635134:-1 gene:ENSG00000268818 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic gene:ENSG00000198125 // chr22 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC001801 // GenBank // Homo sapiens hypothetical gene supported by BC001801, mRNA (cDNA clone MGC:3170 IMAGE:3355513), complete cds. // chr22 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT085067 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr22 // 100 // 70 // 16 // 16 // 0
NM_002473 // RefSeq // Homo sapiens myosin, heavy chain 9, non-muscle (MYH9), mRNA. // chr22 // 100 // 97 // 56 // 56 // 0 /// ENST00000216181 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:36281281:36388018:-1 gene:ENSG00000100345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 97 // 56 // 56 // 0 /// AB191263 // GenBank // Homo sapiens MYH9 mRNA for non-muscle myosin heavy polypeptide 9, complete cds. // chr22 // 100 // 97 // 56 // 56 // 0 /// AB290175 // GenBank // Homo sapiens mRNA for MYH9 variant protein, complete cds. // chr22 // 100 // 95 // 55 // 55 // 0 /// AK304840 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57040 complete cds, highly similar to Myosin-9. // chr22 // 96 // 41 // 23 // 24 // 0 /// AL832639 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp451J0218 (from clone DKFZp451J0218); complete cds. // chr22 // 100 // 76 // 44 // 44 // 0 /// CR456526 // GenBank // Homo sapiens MYH9 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.MYH9). // chr22 // 100 // 83 // 48 // 48 // 0 /// GENSCAN00000034193 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:36282668:36349236:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 83 // 48 // 48 // 0
ENST00000516416 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:22:36440880:36440970:-1 gene:ENSG00000252225 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr22 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT085111 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENST00000339367 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:36536656:36537604:-1 gene:ENSG00000188078 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr22 // 91 // 100 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000034197 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:36467804:36537604:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_006078 // RefSeq // Homo sapiens calcium channel, voltage-dependent, gamma subunit 2 (CACNG2), mRNA. // chr22 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000300105 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:36563921:36703558:-1 gene:ENSG00000166862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AF096322 // GenBank // Homo sapiens neuronal voltage-gated calcium channel gamma-2 subunit (CACGN2) mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// BC069612 // GenBank // Homo sapiens calcium channel, voltage-dependent, gamma subunit 2, mRNA (cDNA clone MGC:97080 IMAGE:7262295), complete cds. // chr22 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// BC112297 // GenBank // Homo sapiens calcium channel, voltage-dependent, gamma subunit 2, mRNA (cDNA clone MGC:138502 IMAGE:8327765), complete cds. // chr22 // 96 // 96 // 22 // 23 // 0 /// BC112299 // GenBank // Homo sapiens calcium channel, voltage-dependent, gamma subunit 2, mRNA (cDNA clone MGC:138504 IMAGE:8327767), complete cds. // chr22 // 96 // 96 // 22 // 23 // 0 /// CR456414 // GenBank // Homo sapiens CACNG2 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.CACNG2). // chr22 // 96 // 96 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000034198 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:36564351:36672694:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1
AK075161 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ90680 fis, clone PLACE1005768. // chr22 // 81 // 100 // 22 // 27 // 0 /// ENST00000619915 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:36847372:36870441:-1 gene:ENSG00000183822 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr22 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// NONHSAT085132 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr22 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
NM_001163857 // RefSeq // Homo sapiens testis expressed 33 (TEX33), transcript variant 1, mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_178552 // RefSeq // Homo sapiens testis expressed 33 (TEX33), transcript variant 2, mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000381821 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:36991156:37007802:-1 gene:ENSG00000185264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// ENST00000402860 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:36991125:37007798:-1 gene:ENSG00000185264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000405091 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:36991125:37007841:-1 gene:ENSG00000185264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC042635 // GenBank // Homo sapiens chromosome 22 open reading frame 33, mRNA (cDNA clone MGC:35206 IMAGE:5171722), complete cds. // chr22 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// CR456416 // GenBank // Homo sapiens cE81G9.2 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.cE81G9.2). // chr22 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// ENST00000442538 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:22:36991120:37002256:-1 gene:ENSG00000185264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// GENSCAN00000012625 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:36991179:37018732:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
ENST00000364208 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:22:37055033:37055347:-1 gene:ENSG00000201078 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr22 // 81 // 100 // 17 // 21 // 0 /// NONHSAT085138 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr22 // 81 // 100 // 17 // 21 // 0
NM_000878 // RefSeq // Homo sapiens interleukin 2 receptor, beta (IL2RB), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000216223 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:37125838:37149990:-1 gene:ENSG00000100385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000429622 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:37137685:37175054:-1 gene:ENSG00000100385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 92 // 43 // 11 // 12 // 0 /// ENST00000453962 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:37136365:37175054:-1 gene:ENSG00000100385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000461607 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:37139072:37175054:-1 gene:ENSG00000100385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr22 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000483573 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:37128522:37136408:-1 gene:ENSG00000100385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr22 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// BC025691 // GenBank // Homo sapiens interleukin 2 receptor, beta, mRNA (cDNA clone MGC:34584 IMAGE:5207833), complete cds. // chr22 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// CR456506 // GenBank // Homo sapiens IL2RB full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.IL2RB.V7). // chr22 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// M26062 // GenBank // Human interleukin 2 receptor beta chain (p70-75) mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000012619 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:37128096:37144172:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT085144 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr22 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0
NM_001051 // RefSeq // Homo sapiens somatostatin receptor 3 (SSTR3), transcript variant 1, mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NM_001278687 // RefSeq // Homo sapiens somatostatin receptor 3 (SSTR3), transcript variant 2, mRNA. // chr22 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// AK291165 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77124 complete cds, highly similar to Homo sapiens somatostatin receptor 3 (SSTR3), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC096829 // GenBank // Homo sapiens somatostatin receptor 3, mRNA (cDNA clone MGC:111697 IMAGE:6971896), complete cds. // chr22 // 89 // 79 // 17 // 19 // 0 /// CR456585 // GenBank // Homo sapiens SSTR3 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.SSTR3.V2). // chr22 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000610913 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:37204238:37212322:-1 gene:ENSG00000278195 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000617123 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:37206480:37210965:-1 gene:ENSG00000278195 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000012621 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:37206547:37207803:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0
NM_052906 // RefSeq // Homo sapiens extracellular leucine-rich repeat and fibronectin type III domain containing 2 (ELFN2), transcript variant 1, mRNA. // chr22 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000402918 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:37367960:37427470:-1 gene:ENSG00000166897 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000613079 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:22:37367961:37427470:-1 gene:ENSG00000166897 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012597 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:37373072:37375534:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_006498 // RefSeq // Homo sapiens lectin, galactoside-binding, soluble, 2 (LGALS2), mRNA. // chr22 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000215886 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:37570246:37580080:-1 gene:ENSG00000100079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC059782 // GenBank // Homo sapiens lectin, galactoside-binding, soluble, 2, mRNA (cDNA clone MGC:75071 IMAGE:5185491), complete cds. // chr22 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// CR456512 // GenBank // Homo sapiens LGALS2 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.LGALS2.V3). // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// CR541972 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834E1234D for gene LGALS2, lectin, galactoside-binding, soluble, 2 (galectin 2); complete cds, incl. stopcodon. // chr22 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// CR542000 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834A1235D for gene LGALS2, lectin, galactoside-binding, soluble, 2 (galectin 2); complete cds, without stopcodon. // chr22 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// M87842 // GenBank // Human S-lac lectin L-14-II (LGALS2) mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000416480 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:37571849:37582616:-1 gene:ENSG00000100079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000012615 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:37570263:37572012:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NR_109952 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC101927051 (LOC101927051), long non-coding RNA. // chr22 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1 /// ENST00000456099 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:37641832:37658377:-1 gene:ENSG00000233360 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr22 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1 /// AK024971 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ21318 fis, clone COL02295. // chr22 // 90 // 83 // 18 // 20 // 0 /// NONHSAT086620 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr22 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT086618 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr22 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1 /// NONHSAT086619 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr22 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1
ENST00000468873 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:22:37669464:37669739:-1 gene:ENSG00000241333 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr22 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT086621 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr22 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_013356 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 16 (monocarboxylate transporter), member 8 (SLC16A8), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000320521 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:38078134:38083142:-1 gene:ENSG00000100156 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000469516 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:38078134:38084093:-1 gene:ENSG00000100156 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr22 // 100 // 38 // 9 // 9 // 0 /// AF132610 // GenBank // Homo sapiens monocarboxylate transporter MCT3 mRNA, complete cds. // chr22 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000014129 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:38078388:38082873:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0
NM_025045 // RefSeq // Homo sapiens BAI1-associated protein 2-like 2 (BAIAP2L2), mRNA. // chr22 // 95 // 100 // 40 // 42 // 0 /// ENST00000332536 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:22:38084903:38110645:-1 gene:ENSG00000128298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 93 // 98 // 38 // 41 // 0 /// ENST00000381669 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:38084889:38110670:-1 gene:ENSG00000128298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 95 // 100 // 40 // 42 // 0 /// ENST00000428572 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:22:38085165:38088938:-1 gene:ENSG00000128298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 43 // 18 // 18 // 0 /// AY358164 // GenBank // Homo sapiens clone DNA203568 APEM9336 (UNQ9336) mRNA, complete cds. // chr22 // 95 // 100 // 40 // 42 // 0 /// AK026235 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ22582 fis, clone HSI02576. // chr22 // 31 // 31 // 13 // 42 // 1 /// AK026263 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ22610 fis, clone HSI04930. // chr22 // 24 // 24 // 10 // 42 // 1 /// GENSCAN00000014151 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:38085300:38109202:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// BC015619 // GenBank // Homo sapiens BAI1-associated protein 2-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:22924 IMAGE:4843302), complete cds. // chr22 // 93 // 98 // 38 // 41 // 0
NM_004981 // RefSeq // Homo sapiens potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 4 (KCNJ4), transcript variant 2, mRNA. // chr22 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// NM_152868 // RefSeq // Homo sapiens potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 4 (KCNJ4), transcript variant 1, mRNA. // chr22 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000303592 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:38426327:38455199:-1 gene:ENSG00000168135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// BC113506 // GenBank // Homo sapiens potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:142066 IMAGE:8322558), complete cds. // chr22 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// BC113508 // GenBank // Homo sapiens potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:142068 IMAGE:8322560), complete cds. // chr22 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// CR456507 // GenBank // Homo sapiens KCNJ4 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.KCNJ4). // chr22 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// U07364 // GenBank // Human inwardly rectifying potassium channel mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// U24056 // GenBank // Human inward rectifier K+ channel protein (hirk2) mRNA, complete cds. // chr22 // 90 // 83 // 18 // 20 // 0 /// GENSCAN00000014135 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:38426795:38428132:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0
NM_014293 // RefSeq // Homo sapiens neuronal pentraxin receptor (NPTXR), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000333039 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:38818452:38843982:-1 gene:ENSG00000221890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014137 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:38822609:38860947:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
NM_014292 // RefSeq // Homo sapiens chromobox homolog 6 (CBX6), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000216083 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:22:38864229:38872216:-1 gene:ENSG00000183741 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000407418 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:38861450:38872314:-1 gene:ENSG00000183741 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK293035 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75278 complete cds, highly similar to Homo sapiens chromobox homolog 6, mRNA. // chr22 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// BC012111 // GenBank // Homo sapiens chromobox homolog 6, mRNA (cDNA clone MGC:20115 IMAGE:4554483), complete cds. // chr22 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// BC064900 // GenBank // Homo sapiens chromobox homolog 6, mRNA (cDNA clone MGC:74950 IMAGE:6009294), complete cds. // chr22 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000469420 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:38869572:38872249:-1 gene:ENSG00000183741 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr22 // 42 // 42 // 10 // 24 // 1 /// AK094829 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ37510 fis, clone BRCAN1000149, moderately similar to Chromobox protein homolog 6. // chr22 // 42 // 42 // 10 // 24 // 1 /// GENSCAN00000047722 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:38866209:38884594:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0
NM_175709 // RefSeq // Homo sapiens chromobox homolog 7 (CBX7), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000216133 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:39130772:39152650:-1 gene:ENSG00000100307 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000434260 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:22:39134569:39152552:-1 gene:ENSG00000100307 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000490741 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:39133691:39134779:-1 gene:ENSG00000100307 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr22 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// BC051773 // GenBank // Homo sapiens chromobox homolog 7, mRNA (cDNA clone MGC:54332 IMAGE:6196346), complete cds. // chr22 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENST00000401405 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:22:39133584:39152444:-1 gene:ENSG00000100307 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// DQ064603 // GenBank // Homo sapiens chromobox-like 7 mRNA, complete cds. // chr22 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// ENST00000477827 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:39141120:39152540:-1 gene:ENSG00000100307 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr22 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// ENST00000482294 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:39147118:39152674:-1 gene:ENSG00000100307 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr22 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// AK124408 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ42417 fis, clone BLADE2001940. // chr22 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// GENSCAN00000047739 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:39133891:39222447:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1
NR_000028 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 83B (SNORD83B), small nucleolar RNA. // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000386745 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:22:39313819:39313911:-1 gene:ENSG00000209480 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000467105 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:39312887:39314965:-1 gene:ENSG00000100316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT086763 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT086764 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_000027 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 83A (SNORD83A), small nucleolar RNA. // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000386747 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:22:39315213:39315307:-1 gene:ENSG00000209482 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT086774 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_002439 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 43 (SNORD43), small nucleolar RNA. // chr22 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000453303 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:22:39314700:39319111:-1 gene:ENSG00000100316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000583861 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:22:39319050:39319113:-1 gene:ENSG00000263764 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT086780 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_152512 // RefSeq // Homo sapiens ENTH domain containing 1 (ENTHD1), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006724151 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ENTH domain containing 1 (ENTHD1), transcript variant X3, mRNA. // chr22 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// XM_006724153 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ENTH domain containing 1 (ENTHD1), transcript variant X5, mRNA. // chr22 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000325157 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:39743044:39893790:-1 gene:ENSG00000176177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC033895 // GenBank // Homo sapiens ENTH domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:33348 IMAGE:4831324), complete cds. // chr22 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// CR456452 // GenBank // Homo sapiens dJ172B20.3 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.dJ172B20.3). // chr22 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
ENST00000459176 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:22:39874255:39874515:-1 gene:ENSG00000238875 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT086819 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_145174 // RefSeq // Homo sapiens DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 7 (DNAJB7), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000307221 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:40859549:40862126:-1 gene:ENSG00000172404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF085232 // GenBank // Homo sapiens HSC3 mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC112135 // GenBank // Homo sapiens DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 7, mRNA (cDNA clone MGC:138340 IMAGE:8327603), complete cds. // chr22 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// CR456468 // GenBank // Homo sapiens dJ408N23.2 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.dJ408N23.2.V2). // chr22 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000028189 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:40855750:40861994:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0
ENST00000362645 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:22:41065554:41065646:-1 gene:ENSG00000199515 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT086883 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_138481 // RefSeq // Homo sapiens chondroadherin-like (CHADL), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_005261370 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chondroadherin-like (CHADL), transcript variant X1, mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000216241 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:41229513:41240934:-1 gene:ENSG00000100399 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000417999 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:41229510:41239621:-1 gene:ENSG00000100399 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000455425 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:22:41235140:41240894:-1 gene:ENSG00000100399 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 35 // 11 // 11 // 0 /// BC068590 // GenBank // Homo sapiens chondroadherin-like, mRNA (cDNA clone IMAGE:4819656), partial cds. // chr22 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC012882 // GenBank // Homo sapiens chondroadherin-like, mRNA (cDNA clone IMAGE:4153436), partial cds. // chr22 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1 /// GENSCAN00000028201 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:41232350:41302584:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
ENST00000362995 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:22:41377177:41377283:-1 gene:ENSG00000199865 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr22 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT086900 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_016272 // RefSeq // Homo sapiens transducer of ERBB2, 2 (TOB2), mRNA. // chr22 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// XM_006724105 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens transducer of ERBB2, 2 (TOB2), transcript variant X2, mRNA. // chr22 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000327492 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:41433492:41447023:-1 gene:ENSG00000183864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// AB035207 // GenBank // Homo sapiens mRNA for Tob2, complete cds. // chr22 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// BC028919 // GenBank // Homo sapiens transducer of ERBB2, 2, mRNA (cDNA clone MGC:24875 IMAGE:4940977), complete cds. // chr22 // 100 // 45 // 10 // 10 // 0 /// BC038957 // GenBank // Homo sapiens transducer of ERBB2, 2, mRNA (cDNA clone MGC:47645 IMAGE:5786640), complete cds. // chr22 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// CR456594 // GenBank // Homo sapiens TOB2 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.TOB2). // chr22 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0 /// CR541684 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834A0728D for gene TOB2, transducer of ERBB2, 2; complete cds, without stopcodon. // chr22 // 100 // 55 // 12 // 12 // 0 /// D64109 // GenBank // Homo sapiens mRNA for tob family, complete cds. // chr22 // 93 // 68 // 14 // 15 // 0 /// GENSCAN00000028197 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:41436311:41437345:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 55 // 12 // 12 // 0
NM_032758 // RefSeq // Homo sapiens PHD finger protein 5A (PHF5A), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000216252 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:41459717:41468725:-1 gene:ENSG00000100410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000459687 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:41460303:41468625:-1 gene:ENSG00000100410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr22 // 100 // 44 // 8 // 8 // 0 /// BC007321 // GenBank // Homo sapiens PHD finger protein 5A, mRNA (cDNA clone MGC:1346 IMAGE:2989046), complete cds. // chr22 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC075808 // GenBank // Homo sapiens PHD finger protein 5A, mRNA (cDNA clone MGC:87881 IMAGE:5574722), complete cds. // chr22 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0 /// CR456398 // GenBank // Homo sapiens bK223H9.2 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.bK223H9.2). // chr22 // 90 // 56 // 9 // 10 // 0 /// NONHSAT086909 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr22 // 100 // 44 // 8 // 8 // 0
NM_015704 // RefSeq // Homo sapiens desumoylating isopeptidase 1 (DESI1), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000263256 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:41598028:41621096:-1 gene:ENSG00000100418 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC093956 // GenBank // Homo sapiens PPPDE peptidase domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:120991 IMAGE:7939801), complete cds. // chr22 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// BC112179 // GenBank // Homo sapiens PPPDE peptidase domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:138384 IMAGE:8327647), complete cds. // chr22 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// CR456458 // GenBank // Homo sapiens dJ347H13.4 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.dJ347H13.4). // chr22 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// XM_005261571 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens desumoylating isopeptidase 1 (DESI1), transcript variant X1, mRNA. // chr22 // 86 // 86 // 18 // 21 // 1 /// GENSCAN00000028207 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:41577318:41621431:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 86 // 86 // 18 // 21 // 1
ENST00000516794 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:22:41722043:41722131:-1 gene:ENSG00000252603 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT086939 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000333487 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:41831215:41834665:-1 gene:ENSG00000184068 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr22 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK096917 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39598 fis, clone SKNSH2002866. // chr22 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT086984 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr22 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_052945 // RefSeq // Homo sapiens tumor necrosis factor receptor superfamily, member 13C (TNFRSF13C), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000291232 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:41925041:41926818:-1 gene:ENSG00000159958 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF373846 // GenBank // Homo sapiens BAFF receptor mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC105123 // GenBank // Homo sapiens tumor necrosis factor receptor superfamily, member 13C, mRNA (cDNA clone MGC:132783 IMAGE:8144126), complete cds. // chr22 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// BC112030 // GenBank // Homo sapiens tumor necrosis factor receptor superfamily, member 13C, mRNA (cDNA clone MGC:138235 IMAGE:8327498), complete cds. // chr22 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000006975 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:41925367:41947344:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1
NM_000262 // RefSeq // Homo sapiens N-acetylgalactosaminidase, alpha- (NAGA), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000396398 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:42058354:42070830:-1 gene:ENSG00000198951 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000402937 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:42059802:42070842:-1 gene:ENSG00000198951 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000403363 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:42059796:42070830:-1 gene:ENSG00000198951 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// BC000095 // GenBank // Homo sapiens N-acetylgalactosaminidase, alpha-, mRNA (cDNA clone MGC:2280 IMAGE:3504221), complete cds. // chr22 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// CR456527 // GenBank // Homo sapiens NAGA full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.NAGA). // chr22 // 96 // 71 // 23 // 24 // 0 /// M29276 // GenBank // Human alpha-N-acetylgalactosaminidase mRNA, complete cds. // chr22 // 97 // 88 // 29 // 30 // 0 /// M38083 // GenBank // Human alpha-N-acetylgalactosaminidase mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// M62783 // GenBank // Human alpha-N-acetylgalactosaminidase mRNA, complete cds. // chr22 // 94 // 100 // 32 // 34 // 0 /// GENSCAN00000006971 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:42059922:42070297:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 62 // 21 // 21 // 0
X58061 // GenBank // H.sapiens U13 snRNA pseudogene U13.12A. // chr22 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000458891 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:22:42076058:42076161:-1 gene:ENSG00000238498 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr22 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT087015 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_005650 // RefSeq // Homo sapiens transcription factor 20 (AR1) (TCF20), transcript variant 1, mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NM_181492 // RefSeq // Homo sapiens transcription factor 20 (AR1) (TCF20), transcript variant 2, mRNA. // chr22 // 100 // 57 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000359486 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:42160013:42215442:-1 gene:ENSG00000100207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000404876 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:22:42161098:42210208:-1 gene:ENSG00000100207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 64 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000574269 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR22_1_CTG1:42148944:42198059:-1 gene:ENSG00000262024 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 64 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000574943 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR22_1_CTG1:42147859:42203293:-1 gene:ENSG00000262024 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// KF851355 // GenBank // Homo sapiens transcription factor 20 (TCF20) mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 57 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000621408 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR22_3_CTG1:42160013:42215341:-1 gene:ENSG00000276461 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000031382 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR22_1_CTG1:42148237:42203192:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 57 // 8 // 8 // 0
NM_145912 // RefSeq // Homo sapiens NFAT activating protein with ITAM motif 1 (NFAM1), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_005261374 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens NFAT activating protein with ITAM motif 1 (NFAM1), transcript variant X1, mRNA. // chr22 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000329021 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:42380410:42432395:-1 gene:ENSG00000235568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY121370 // GenBank // Homo sapiens NFAT activation molecule 1 (NFAM1) mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AY247409 // GenBank // Homo sapiens calcinerin/NFAT-activating ITAM-containing protein (CNAIP) mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC038241 // GenBank // Homo sapiens NFAT activating protein with ITAM motif 1, mRNA (cDNA clone MGC:46306 IMAGE:5180790), complete cds. // chr22 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// CT841509 // GenBank // Homo sapiens bK126B4.4 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.bK126B4.4). // chr22 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000355469 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:42410277:42432362:-1 gene:ENSG00000235568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr22 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// GENSCAN00000006985 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:42331939:42459271:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
ENST00000357802 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:42555223:42582038:-1 gene:ENSG00000182841 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr22 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000566851 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:42574733:42582001:-1 gene:ENSG00000182841 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr22 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// AK098201 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ40882 fis, clone UTERU2000424. // chr22 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC053540 // GenBank HTC // Homo sapiens ribosomal RNA processing 7 homolog B (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone IMAGE:5588353), containing frame-shift errors. // chr22 // 88 // 100 // 7 // 8 // 0 /// ENST00000437211 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:42569129:42582009:-1 gene:ENSG00000182841 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr22 // 100 // 100 // 8 // 8 // 1 /// ENST00000458605 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:42573244:42582011:-1 gene:ENSG00000182841 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr22 // 100 // 100 // 8 // 8 // 1 /// BC143340 // GenBank // Homo sapiens ribosomal RNA processing 7 homolog B (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone IMAGE:9051845). // chr22 // 100 // 100 // 8 // 8 // 1
NM_015703 // RefSeq // Homo sapiens ribosomal RNA processing 7 homolog A (S. cerevisiae) (RRP7A), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000323013 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:42509968:42519802:-1 gene:ENSG00000189306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000416699 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:42514677:42519794:-1 gene:ENSG00000189306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr22 // 100 // 71 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000483303 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:42515201:42519796:-1 gene:ENSG00000189306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr22 // 100 // 57 // 8 // 8 // 0 /// BC042335 // GenBank // Homo sapiens ribosomal RNA processing 7 homolog A (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone IMAGE:5744277), partial cds. // chr22 // 77 // 93 // 10 // 13 // 0 /// BC073834 // GenBank // Homo sapiens ribosomal RNA processing 7 homolog A (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:90162 IMAGE:5533064), complete cds. // chr22 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC121118 // GenBank // Homo sapiens ribosomal RNA processing 7 homolog A (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:150422 IMAGE:40120513), complete cds. // chr22 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC121119 // GenBank // Homo sapiens ribosomal RNA processing 7 homolog A (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:150423 IMAGE:40120514), complete cds. // chr22 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// AK092492 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ35173 fis, clone PLACE6013288. // chr22 // 71 // 71 // 10 // 14 // 1 /// GENSCAN00000006959 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:42512910:42519786:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
ENST00000365188 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:22:42565048:42565330:-1 gene:ENSG00000202058 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr22 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT087063 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr22 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
ENST00000437211 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:42569129:42582009:-1 gene:ENSG00000182841 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000516104 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:22:42569147:42569250:-1 gene:ENSG00000251913 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC014647 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4646900. // chr22 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// NONHSAT087064 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001165877 // RefSeq // Homo sapiens ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial Fo complex, subunit G2 (ATP5L2), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000505920 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:42639803:42640601:-1 gene:ENSG00000249222 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF092923 // GenBank // Homo sapiens F1Fo-ATP synthase complex Fo membrane domain g subunit mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_017436 // RefSeq // Homo sapiens alpha 1,4-galactosyltransferase (A4GALT), mRNA. // chr22 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// XM_005261643 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens alpha 1,4-galactosyltransferase (A4GALT), transcript variant X1, mRNA. // chr22 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000249005 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:42692121:42695633:-1 gene:ENSG00000128274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000381278 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:42692122:42695633:-1 gene:ENSG00000128274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 90 // 72 // 19 // 21 // 0 /// ENST00000401850 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:42692121:42694986:-1 gene:ENSG00000128274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// AB037883 // GenBank // Homo sapiens mRNA for Gb3/CD77 synthase, complete cds. // chr22 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// AK312927 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ93377, Homo sapiens alpha 1,4-galactosyltransferase (A4GALT), mRNA. // chr22 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// BC017068 // GenBank // Homo sapiens alpha 1,4-galactosyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:9631 IMAGE:3913851), complete cds. // chr22 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// BC055286 // GenBank // Homo sapiens alpha 1,4-galactosyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:61705 IMAGE:6161307), complete cds. // chr22 // 91 // 76 // 20 // 22 // 0 /// XM_006724267 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens alpha 1,4-galactosyltransferase (A4GALT), transcript variant X9, mRNA. // chr22 // 83 // 83 // 24 // 29 // 1 /// GENSCAN00000006974 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:42692890:42693951:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0
ENST00000363578 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:22:42762860:42762959:-1 gene:ENSG00000200448 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT087081 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000616842 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:42791814:42794313:-1 gene:ENSG00000274717 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr22 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000006970 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:42725779:42835493:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
AB051441 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1654 protein, partial cds. // chr22 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_014507 // RefSeq // Homo sapiens malonyl CoA:ACP acyltransferase (mitochondrial) (MCAT), transcript variant 2, mRNA. // chr22 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// NM_173467 // RefSeq // Homo sapiens malonyl CoA:ACP acyltransferase (mitochondrial) (MCAT), transcript variant 1, mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NR_046423 // RefSeq // Homo sapiens malonyl CoA:ACP acyltransferase (mitochondrial) (MCAT), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr22 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000290429 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:43132206:43143394:-1 gene:ENSG00000100294 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000327555 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:43132880:43143364:-1 gene:ENSG00000100294 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000464244 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:43141056:43143280:-1 gene:ENSG00000100294 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr22 // 100 // 28 // 9 // 9 // 0 /// BC030985 // GenBank // Homo sapiens malonyl CoA:ACP acyltransferase (mitochondrial), mRNA (cDNA clone IMAGE:4774272), complete cds. // chr22 // 96 // 72 // 22 // 23 // 0 /// BC042195 // GenBank // Homo sapiens malonyl CoA:ACP acyltransferase (mitochondrial), mRNA (cDNA clone MGC:47838 IMAGE:6052380), complete cds. // chr22 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000035488 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:43133043:43143348:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
NM_015140 // RefSeq // Homo sapiens tubulin tyrosine ligase-like family, member 12 (TTLL12), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000216129 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:43166622:43187133:-1 gene:ENSG00000100304 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000484711 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:43166623:43170274:-1 gene:ENSG00000100304 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr22 // 100 // 30 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000494035 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:22:43167603:43171750:-1 gene:ENSG00000100304 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// AK123789 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ41795 fis, clone NESOP2002738. // chr22 // 100 // 27 // 10 // 10 // 0 /// AK304464 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55625 complete cds. // chr22 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// BC001070 // GenBank // Homo sapiens tubulin tyrosine ligase-like family, member 12, mRNA (cDNA clone MGC:2635 IMAGE:3504490), complete cds. // chr22 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// CT841516 // GenBank // Homo sapiens dJ526I14.2 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.dJ526I14.2.V2). // chr22 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// D63487 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA0153 gene, partial cds. // chr22 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000035511 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:43168008:43187069:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// NONHSAT087096 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr22 // 100 // 27 // 10 // 10 // 0
ENST00000360835 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:43197283:43343388:-1 gene:ENSG00000159307 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AK056490 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ31928 fis, clone NT2RP7005520, weakly similar to INTEGUMENTARY MUCIN A.1 PRECURSOR. // chr22 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT087098 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr22 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT087099 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr22 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0
NM_173050 // RefSeq // Homo sapiens signal peptide, CUB domain, EGF-like 1 (SCUBE1), mRNA. // chr22 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000290460 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:43237576:43343323:-1 gene:ENSG00000159307 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// AF525689 // GenBank // Homo sapiens signal peptide-CUB-EGF-like domain containing protein 1 (SCUBE1) mRNA, complete cds. // chr22 // 88 // 87 // 23 // 26 // 0 /// BC047916 // GenBank // Homo sapiens signal peptide, CUB domain, EGF-like 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:6189117), complete cds. // chr22 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// BC127263 // GenBank // Homo sapiens signal peptide, CUB domain, EGF-like 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:40128679), complete cds. // chr22 // 100 // 37 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000360835 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:43197283:43343388:-1 gene:ENSG00000159307 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// ENST00000615096 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:22:43203992:43343283:-1 gene:ENSG00000159307 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000035502 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:43203997:43245046:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 63 // 63 // 19 // 30 // 1
NM_001099294 // RefSeq // Homo sapiens KIAA1644 (KIAA1644), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000381176 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:22:44243667:44312851:-1 gene:ENSG00000138944 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC104183 // GenBank // Homo sapiens KIAA1644, mRNA (cDNA clone MGC:125851 IMAGE:40030810), complete cds. // chr22 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// BC104184 // GenBank // Homo sapiens KIAA1644, mRNA (cDNA clone MGC:125852 IMAGE:40030814), complete cds. // chr22 // 91 // 100 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000040502 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:44276881:44300945:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0
NM_032287 // RefSeq // Homo sapiens leucine zipper, down-regulated in cancer 1-like (LDOC1L), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000341255 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:44492572:44498298:-1 gene:ENSG00000188636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK296479 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56306 complete cds, highly similar to Mus musculus leucine zipper, down-regulated in cancer 1-like (Ldoc1l), mRNA. // chr22 // 92 // 46 // 12 // 13 // 0 /// BC030232 // GenBank // Homo sapiens leucine zipper, down-regulated in cancer 1-like, mRNA (cDNA clone MGC:34785 IMAGE:5240032), complete cds. // chr22 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// CR456439 // GenBank // Homo sapiens dJ1033E15.2 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.dJ1033E15.2). // chr22 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000040506 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:44496837:44497556:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0
NM_001291501 // RefSeq // Homo sapiens structural maintenance of chromosomes 1B (SMC1B), transcript variant 2, mRNA. // chr22 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NM_148674 // RefSeq // Homo sapiens structural maintenance of chromosomes 1B (SMC1B), transcript variant 1, mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000357450 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:45344063:45413567:-1 gene:ENSG00000077935 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000404354 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:45344458:45413619:-1 gene:ENSG00000077935 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0 /// BC126208 // GenBank // Homo sapiens structural maintenance of chromosomes 1B, mRNA (cDNA clone MGC:161486 IMAGE:8991924), complete cds. // chr22 // 96 // 87 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000033072 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:45344556:45413567:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 55 // 17 // 17 // 0
ENST00000516176 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:22:45624531:45624632:-1 gene:ENSG00000251985 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT087240 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_058238 // RefSeq // Homo sapiens wingless-type MMTV integration site family, member 7B (WNT7B), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000339464 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:45920362:45977129:-1 gene:ENSG00000188064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000409496 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:22:45922111:45972715:-1 gene:ENSG00000188064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000410058 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:22:45927482:45976805:-1 gene:ENSG00000188064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 70 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000410089 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:22:45922111:45976022:-1 gene:ENSG00000188064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AB062766 // GenBank // Homo sapiens mRNA for WNT7B, complete cds. // chr22 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AF416743 // GenBank // Homo sapiens WNT7B (WNT7B) mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// AK289526 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75378 complete cds. // chr22 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC034923 // GenBank // Homo sapiens wingless-type MMTV integration site family, member 7B, mRNA (cDNA clone MGC:45711 IMAGE:5457045), complete cds. // chr22 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000428540 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:22:45931296:45975909:-1 gene:ENSG00000188064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 40 // 40 // 8 // 20 // 1 /// GENSCAN00000006828 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:45916276:46014928:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 90 // 90 // 18 // 20 // 1
NM_018280 // RefSeq // Homo sapiens proline rich 34 (PRR34), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000396008 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:46049478:46054144:-1 gene:ENSG00000182257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// AK096201 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ38882 fis, clone MESAN2016159. // chr22 // 92 // 76 // 12 // 13 // 0
ENST00000439423 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:46055740:46058160:-1 gene:ENSG00000231010 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr22 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC009388 // GenBank // Homo sapiens hypothetical LOC554174, mRNA (cDNA clone MGC:16743 IMAGE:4130428), complete cds. // chr22 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// NONHSAT087274 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr22 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0
XR_244447 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens uncharacterized LOC642648 (LOC642648), transcript variant X1, misc_RNA. // chr22 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// AK123383 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ41389 fis, clone BRCAN2024563. // chr22 // 86 // 100 // 19 // 22 // 0 /// GENSCAN00000006847 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:46067783:46072035:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 93 // 68 // 14 // 15 // 0
NM_006071 // RefSeq // Homo sapiens polycystin (PKD) family receptor for egg jelly (PKDREJ), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000253255 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:46255663:46263355:-1 gene:ENSG00000130943 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF116458 // GenBank // Homo sapiens polycystic kidney disease and receptor for egg jelly related protein (PKDREJ) mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC027601 // GenBank // Homo sapiens polycystic kidney disease (polycystin) and REJ (sperm receptor for egg jelly homolog, sea urchin)-like, mRNA (cDNA clone IMAGE:4839036). // chr22 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000006851 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:46256561:46263322:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0
NM_014246 // RefSeq // Homo sapiens cadherin, EGF LAG seven-pass G-type receptor 1 (CELSR1), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000262738 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:46360834:46537170:-1 gene:ENSG00000075275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// AF231024 // GenBank // Homo sapiens protocadherin Flamingo 2 (FMI2) mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// AK302517 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51399 complete cds, highly similar to Cadherin EGF LAG seven-pass G-type receptor 1 precursor. // chr22 // 100 // 48 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000006825 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:46393192:46440248:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 30 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000006838 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:46369297:46391948:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 30 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000006855 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:46363992:46367887:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 20 // 8 // 8 // 0
NM_022766 // RefSeq // Homo sapiens ceramide kinase (CERK), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// ENST00000216264 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:46684411:46738261:-1 gene:ENSG00000100422 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// ENST00000443629 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:46686983:46738207:-1 gene:ENSG00000100422 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr22 // 100 // 70 // 33 // 33 // 0 /// AB079066 // GenBank // Homo sapiens cerk mRNA for ceramide kinase, complete cds. // chr22 // 96 // 100 // 45 // 47 // 0 /// AK291476 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77308 complete cds, highly similar to Homo sapiens ceramide kinase (CERK), transcript variant 1, mRNA. // chr22 // 97 // 74 // 34 // 35 // 0 /// BC004278 // GenBank // Homo sapiens ceramide kinase, mRNA (cDNA clone IMAGE:3615986), complete cds. // chr22 // 95 // 43 // 19 // 20 // 0 /// BC067255 // GenBank // Homo sapiens ceramide kinase, mRNA (cDNA clone IMAGE:6185601), complete cds. // chr22 // 94 // 70 // 31 // 33 // 0 /// BC108712 // GenBank // Homo sapiens ceramide kinase, mRNA (cDNA clone IMAGE:6140739), complete cds. // chr22 // 100 // 32 // 15 // 15 // 0 /// BC126940 // GenBank // Homo sapiens ceramide kinase, mRNA (cDNA clone MGC:141854 IMAGE:40084110), complete cds. // chr22 // 97 // 74 // 34 // 35 // 0 /// CR456404 // GenBank // Homo sapiens bK29F11.1 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.bK29F11.1). // chr22 // 100 // 70 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000006832 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:46679782:46753946:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 60 // 60 // 28 // 47 // 1
NR_122047 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC642757 (LOC642757), long non-coding RNA. // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC041833 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5268302. // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// CR456602 // GenBank // Homo sapiens Em:U51561.2 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.Em:U51561.2). // chr22 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020590 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:46915345:46952386:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
AY358194 // GenBank // Homo sapiens clone DNA165391 LPEQ6126 (UNQ6126) mRNA, complete cds. // chr22 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0
NR_033377 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 898 (LINC00898), long non-coding RNA. // chr22 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000380990 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:47621043:47631569:-1 gene:ENSG00000205634 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr22 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONHSAT087349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr22 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONHSAT087352 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr22 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
ENST00000343999 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:49619642:49624920:-1 gene:ENSG00000188511 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr22 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AK126430 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44466 fis, clone UTERU2025645. // chr22 // 86 // 84 // 18 // 21 // 0 /// BC118575 // GenBank // Homo sapiens chromosome 22 open reading frame 34, mRNA (cDNA clone IMAGE:40053633). // chr22 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000400023 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:49619644:49657542:-1 gene:ENSG00000188511 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// BC048207 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5419610. // chr22 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NM_001289922 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 22 open reading frame 34 (C22orf34), transcript variant 1, mRNA. // chr22 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// ENST00000405854 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:22:49620471:49657430:-1 gene:ENSG00000188511 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONHSAT087409 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr22 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_024105 // RefSeq // Homo sapiens ALG12, alpha-1,6-mannosyltransferase (ALG12), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000330817 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:49900229:49918458:-1 gene:ENSG00000182858 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000486602 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:22:49903650:49907918:-1 gene:ENSG00000182858 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 88 // 43 // 15 // 17 // 0 /// ENST00000492791 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:49903961:49910088:-1 gene:ENSG00000182858 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr22 // 100 // 33 // 13 // 13 // 0 /// AF258571 // GenBank // Homo sapiens PP3999 mRNA, complete cds. // chr22 // 100 // 70 // 28 // 28 // 0 /// BC001729 // GenBank // Homo sapiens asparagine-linked glycosylation 12, alpha-1,6-mannosyltransferase homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:3136 IMAGE:3353085), complete cds. // chr22 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// BC098562 // GenBank // Homo sapiens asparagine-linked glycosylation 12, alpha-1,6-mannosyltransferase homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:111358 IMAGE:30560020), complete cds. // chr22 // 92 // 95 // 35 // 38 // 0 /// CR456369 // GenBank // Homo sapiens ALG12 full length open reading frame (ORF) cDNA clone (cDNA clone C22ORF:pGEM.ALG12.V3). // chr22 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000016274 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:49903838:49913765:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 60 // 24 // 24 // 0 /// AF311904 // GenBank // Homo sapiens membrane protein SB87 precursor, mRNA, complete cds. // chr22 // 93 // 100 // 37 // 40 // 0
NM_001001694 // RefSeq // Homo sapiens interleukin 17 receptor E-like (IL17REL), mRNA. // chr22 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000341280 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:22:49994513:50008692:-1 gene:ENSG00000188263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000389983 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:22:49994513:50012659:-1 gene:ENSG00000188263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AK123987 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ41993 fis, clone SPLEN2017104. // chr22 // 92 // 100 // 33 // 36 // 0 /// GENSCAN00000016301 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:49965280:50058487:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 61 // 61 // 22 // 36 // 1
XM_003403494 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens tubulin tyrosine ligase-like family, member 8 (TTLL8), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000266182 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:22:50015123:50054626:-1 gene:ENSG00000138892 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000433387 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:22:50015127:50056935:-1 gene:ENSG00000138892 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000016301 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:49965280:50058487:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001001794 // RefSeq // Homo sapiens DENN/MADD domain containing 6B (DENND6B), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 70 // 70 // 0 /// ENST00000413817 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:50309030:50327060:-1 gene:ENSG00000205593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 70 // 70 // 0 /// ENST00000495607 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:50311966:50326977:-1 gene:ENSG00000205593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr22 // 100 // 100 // 70 // 70 // 0 /// AK054743 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ30181 fis, clone BRACE2001143. // chr22 // 94 // 100 // 66 // 70 // 0 /// BC031069 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 116, member B, mRNA (cDNA clone MGC:33692 IMAGE:5296726), complete cds. // chr22 // 100 // 100 // 70 // 70 // 0 /// GENSCAN00000016285 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:50312139:50326988:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 93 // 79 // 51 // 55 // 0 /// NONHSAT087471 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr22 // 100 // 100 // 70 // 70 // 0
NM_002972 // RefSeq // Homo sapiens SET binding factor 1 (SBF1), mRNA. // chr22 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENST00000348911 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:22:50446806:50474942:-1 gene:ENSG00000100241 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000380817 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:22:50445000:50475024:-1 gene:ENSG00000100241 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENST00000390679 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:22:50447142:50475025:-1 gene:ENSG00000100241 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000470434 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:22:50446826:50455989:-1 gene:ENSG00000100241 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr22 // 100 // 17 // 8 // 8 // 0 /// BC087612 // GenBank // Homo sapiens SET binding factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:99700 IMAGE:6671883), complete cds. // chr22 // 100 // 98 // 45 // 45 // 0 /// GENSCAN00000016240 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:22:50447142:50475012:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr22 // 98 // 96 // 43 // 44 // 0
ENST00000384114 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:22:50691260:50691363:-1 gene:ENSG00000206841 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr22 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT087534 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr22 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_000482 // RefSeq // Homo sapiens apolipoprotein A-IV (APOA4), mRNA. // chr11 // 95 // 100 // 42 // 44 // 0 /// ENST00000357780 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:11:116820700:116823306:-1 gene:ENSG00000110244 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 95 // 100 // 42 // 44 // 0 /// BC074764 // GenBank // Homo sapiens apolipoprotein A-IV, mRNA (cDNA clone MGC:103796 IMAGE:30915177), complete cds. // chr11 // 86 // 82 // 31 // 36 // 0 /// BC113594 // GenBank // Homo sapiens apolipoprotein A-IV, mRNA (cDNA clone MGC:142154 IMAGE:8322646), complete cds. // chr11 // 90 // 95 // 38 // 42 // 0 /// BC113596 // GenBank // Homo sapiens apolipoprotein A-IV, mRNA (cDNA clone MGC:142156 IMAGE:8322648), complete cds. // chr11 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000021368 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:11:116820867:116823191:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 55 // 23 // 24 // 0
BC057848 // GenBank // Homo sapiens similar to Asparagine synthetase [glutamine-hydrolyzing] (Glutamine-dependent asparagine synthetase) (TS11 cell cycle control protein), mRNA (cDNA clone IMAGE:30345211). // chrUn_gl000211 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_001289080 // RefSeq // Homo sapiens contactin 6 (CNTN6), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NM_001289081 // RefSeq // Homo sapiens contactin 6 (CNTN6), transcript variant 3, mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NM_014461 // RefSeq // Homo sapiens contactin 6 (CNTN6), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000350110 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:1092661:1403594:1 gene:ENSG00000134115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000397479 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:1092658:1403442:1 gene:ENSG00000134115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000446702 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:1092576:1404217:1 gene:ENSG00000134115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AB003592 // GenBank // Homo sapiens hNB-3 mRNA for neural adhesion molecule NB-3, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AK294786 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60251 complete cds, highly similar to Contactin-6 precursor. // chr3 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC113118 // GenBank // Homo sapiens contactin 6, mRNA (cDNA clone MGC:133256 IMAGE:40036214), complete cds. // chr3 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// ENST00000394261 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:1093024:1298369:1 gene:ENSG00000134115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1 /// AK307814 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ97762. // chr3 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1 /// GENSCAN00000009773 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:1125428:1578511:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0
ENST00000517240 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:3102913:3103015:1 gene:ENSG00000253049 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT087596 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0
NM_182916 // RefSeq // Homo sapiens tRNA nucleotidyl transferase, CCA-adding, 1 (TRNT1), mRNA. // chr3 // 93 // 74 // 13 // 14 // 0 /// XM_005265196 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens tRNA nucleotidyl transferase, CCA-adding, 1 (TRNT1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 63 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000251607 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:3126916:3149023:1 gene:ENSG00000072756 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 74 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000280591 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:3126952:3149023:1 gene:ENSG00000072756 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 68 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000434583 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:3126965:3150879:1 gene:ENSG00000072756 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 68 // 13 // 13 // 0 /// AB063105 // GenBank // Homo sapiens hMtCCA mRNA for tRNA-nucleotidyltransferase, complete cds. // chr3 // 82 // 58 // 9 // 11 // 0 /// AF151805 // GenBank // Homo sapiens CGI-47 protein mRNA, complete cds. // chr3 // 82 // 58 // 9 // 11 // 0 /// AK290411 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75300 complete cds, highly similar to Homo sapiens hMtCCA mRNA for tRNA-nucleotidyltransferase. // chr3 // 91 // 58 // 10 // 11 // 0 /// AL834397 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp547J2110 (from clone DKFZp547J2110). // chr3 // 92 // 68 // 12 // 13 // 0 /// BC012537 // GenBank // Homo sapiens tRNA nucleotidyl transferase, CCA-adding, 1, mRNA (cDNA clone MGC:13334 IMAGE:4097092), complete cds. // chr3 // 92 // 68 // 12 // 13 // 0
NM_020873 // RefSeq // Homo sapiens leucine rich repeat neuronal 1 (LRRN1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_005265351 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens leucine rich repeat neuronal 1 (LRRN1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000319331 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:3799437:3847703:1 gene:ENSG00000175928 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AB040930 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1497 protein, partial cds. // chr3 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// AK023273 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ13211 fis, clone NT2RP4000907, highly similar to Mouse NLRR-1 mRNA for leucine-rich-repeat protein. // chr3 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0 /// AK291717 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77567 complete cds. // chr3 // 89 // 79 // 17 // 19 // 0 /// AY358312 // GenBank // Homo sapiens clone DNA66667 NLRR (UNQ693) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// BC034947 // GenBank // Homo sapiens leucine rich repeat neuronal 1, mRNA (cDNA clone MGC:26098 IMAGE:4826337), complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000001502 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:3844642:3846792:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 33 // 8 // 8 // 0
NM_003670 // RefSeq // Homo sapiens basic helix-loop-helix family, member e40 (BHLHE40), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000256495 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:4979116:4985323:1 gene:ENSG00000134107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000467610 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:4979437:4983268:1 gene:ENSG00000134107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// AB004066 // GenBank // Homo sapiens mRNA for DEC1, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK293205 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58052 complete cds, weakly similar to Class B basic helix-loop-helix protein 2. // chr3 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// BC082238 // GenBank // Homo sapiens basic helix-loop-helix family, member e40, mRNA (cDNA clone MGC:99681 IMAGE:4860809), complete cds. // chr3 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// CR456921 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834E1118D for gene BHLHB2, basic helix-loop-helix domain containing, class B, 2; complete cds, incl. stopcodon. // chr3 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000010272 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:4976966:4981515:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_018184 // RefSeq // Homo sapiens ADP-ribosylation factor-like 8B (ARL8B), mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000256496 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:5122220:5180911:1 gene:ENSG00000134108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000419534 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:5122296:5179805:1 gene:ENSG00000134108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 50 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000455168 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:5122292:5179646:1 gene:ENSG00000134108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0 /// AK295465 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50155 complete cds, highly similar to ADP-ribosylation factor-like protein 8B. // chr3 // 100 // 50 // 8 // 8 // 0 /// AK298951 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61158 complete cds, highly similar to ADP-ribosylation factor-like protein 8B. // chr3 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0 /// AK303872 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56285 complete cds, highly similar to ADP-ribosylation factor-like protein 8B. // chr3 // 90 // 63 // 9 // 10 // 0 /// BC013131 // GenBank // Homo sapiens ADP-ribosylation factor-like 8B, mRNA (cDNA clone MGC:21136 IMAGE:4508077), complete cds. // chr3 // 100 // 69 // 11 // 11 // 0 /// BC063125 // GenBank // Homo sapiens ADP-ribosylation factor-like 8B, mRNA (cDNA clone MGC:71988 IMAGE:6622791), complete cds. // chr3 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000611208 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:5122245:5180912:1 gene:ENSG00000134108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0
NM_014674 // RefSeq // Homo sapiens ER degradation enhancer, mannosidase alpha-like 1 (EDEM1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000256497 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:5187673:5219957:1 gene:ENSG00000134109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000445686 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:5188349:5211298:1 gene:ENSG00000134109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 42 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000465369 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:5187720:5211406:1 gene:ENSG00000134109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// AK292643 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76956 complete cds, highly similar to Homo sapiens ER degradation enhancer, mannosidase alpha-like 1 (EDEM1), mRNA. // chr3 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// AK302065 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51559 complete cds, highly similar to ER degradation-enhancingalpha-mannosidase-like 1. // chr3 // 100 // 42 // 10 // 10 // 0 /// BC019088 // GenBank // Homo sapiens ER degradation enhancer, mannosidase alpha-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:29498 IMAGE:4863779), complete cds. // chr3 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000032787 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:5187806:5231182:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0
NR_024065 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 312 (LINC00312), long non-coding RNA. // chr3 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// ENST00000442796 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:8571782:8573875:1 gene:ENSG00000237697 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AF086709 // GenBank // Homo sapiens NAG-7 protein (NAG-7) mRNA, complete cds. // chr3 // 85 // 83 // 17 // 20 // 0 /// BC055409 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4663469, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr3 // 94 // 67 // 15 // 16 // 0 /// NONHSAT087715 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT087716 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000362945 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:8931506:8931631:1 gene:ENSG00000199815 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT087737 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_153635 // RefSeq // Homo sapiens copine family member IX (CPNE9), mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// ENST00000273027 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:9715340:9726713:1 gene:ENSG00000144550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 23 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000383831 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:9703826:9727450:1 gene:ENSG00000144550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 43 // 43 // 0 /// ENST00000383832 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:9703807:9729908:1 gene:ENSG00000144550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// ENST00000491802 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:9703833:9705033:1 gene:ENSG00000144550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 92 // 26 // 11 // 12 // 0 /// BC035735 // GenBank // Homo sapiens copine family member IX, mRNA (cDNA clone MGC:46340 IMAGE:5729888), complete cds. // chr3 // 100 // 91 // 43 // 43 // 0 /// BC130375 // GenBank // Homo sapiens copine family member IX, mRNA (cDNA clone MGC:163247 IMAGE:40146406), complete cds. // chr3 // 100 // 87 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000613455 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:9703826:9727441:1 gene:ENSG00000144550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000029071 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:9703763:9729692:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 43 // 43 // 0 /// NONHSAT087808 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 92 // 26 // 11 // 12 // 0
NM_001003694 // RefSeq // Homo sapiens bromodomain and PHD finger containing, 1 (BRPF1), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NM_004634 // RefSeq // Homo sapiens bromodomain and PHD finger containing, 1 (BRPF1), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// XM_005265454 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens bromodomain and PHD finger containing, 1 (BRPF1), transcript variant X6, mRNA. // chr3 // 100 // 50 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000383829 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:9731745:9748018:1 gene:ENSG00000156983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000424362 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:9731745:9748015:1 gene:ENSG00000156983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000433861 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:9731729:9747873:1 gene:ENSG00000156983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 59 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000457855 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:9734130:9748001:1 gene:ENSG00000156983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// AK293865 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60100 complete cds, highly similar to Peregrin. // chr3 // 100 // 59 // 26 // 26 // 0 /// BC053851 // GenBank // Homo sapiens bromodomain and PHD finger containing, 1, mRNA (cDNA clone MGC:61492 IMAGE:6140996), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// M91585 // GenBank // Human Br140 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000029073 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:9734141:9757150:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0
NM_032492 // RefSeq // Homo sapiens jagunal homolog 1 (Drosophila) (JAGN1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000307768 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:9890554:9894349:1 gene:ENSG00000171135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF212230 // GenBank // Homo sapiens GL009 mRNA, complete cds. // chr3 // 84 // 68 // 16 // 19 // 0 /// BC008507 // GenBank HTC // Homo sapiens jagunal homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:3461248), with apparent retained intron. // chr3 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// BC032101 // GenBank // Homo sapiens jagunal homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:20680 IMAGE:4554225), complete cds. // chr3 // 91 // 79 // 20 // 22 // 0 /// ENST00000489724 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:9890633:9892971:1 gene:ENSG00000171135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// ENST00000616966 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:9890587:9894349:1 gene:ENSG00000171135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000029056 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:9890723:9893377:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// NONHSAT087835 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NR_103821 // RefSeq // Homo sapiens EMC3 antisense RNA 1 (EMC3-AS1), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000326237 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:9986911:10005244:1 gene:ENSG00000180385 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK125558 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ43570 fis, clone PUAEN2009852, weakly similar to Homo sapiens serine/threonine protein kinase Kp78. // chr3 // 92 // 46 // 11 // 12 // 0 /// GENSCAN00000020353 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:9987864:10003294:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// NONHSAT087855 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT087856 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENST00000364312 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:10037552:10037655:1 gene:ENSG00000201182 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT087875 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_018462 // RefSeq // Homo sapiens BRICK1, SCAR/WAVE actin-nucleating complex subunit (BRK1), mRNA. // chr3 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000530758 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:10115592:10127190:1 gene:ENSG00000254999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AY148219 // GenBank // Homo sapiens Brk1-like protein mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// AY148220 // GenBank // Homo sapiens Brk1-like protein mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr3 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// BC001067 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 10, mRNA (cDNA clone MGC:2529 IMAGE:2823162), complete cds. // chr3 // 100 // 57 // 12 // 12 // 0 /// BC007929 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 10, mRNA (cDNA clone MGC:14130 IMAGE:3688264), complete cds. // chr3 // 100 // 57 // 12 // 12 // 0 /// BC019303 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 10, mRNA (cDNA clone MGC:4198 IMAGE:2823162), complete cds. // chr3 // 100 // 57 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000020362 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:10115702:10149965:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1
NONHSAT087882 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000256474 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:10141008:10152220:1 gene:ENSG00000134086 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT087883 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_000551 // RefSeq // Homo sapiens von Hippel-Lindau tumor suppressor, E3 ubiquitin protein ligase (VHL), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NM_198156 // RefSeq // Homo sapiens von Hippel-Lindau tumor suppressor, E3 ubiquitin protein ligase (VHL), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000256474 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:10141008:10152220:1 gene:ENSG00000134086 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000345392 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:10141788:10152082:1 gene:ENSG00000134086 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// BC058831 // GenBank // Homo sapiens von Hippel-Lindau tumor suppressor, mRNA (cDNA clone MGC:61974 IMAGE:6457060), complete cds. // chr3 // 96 // 76 // 25 // 26 // 0 /// AK304002 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51515 complete cds, highly similar to Von Hippel-Lindau disease tumor suppressor. // chr3 // 53 // 53 // 18 // 34 // 1 /// ENST00000477538 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:10142546:10150145:1 gene:ENSG00000134086 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 38 // 38 // 13 // 34 // 1 /// AK309560 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99601. // chr3 // 38 // 38 // 13 // 34 // 1 /// GENSCAN00000020362 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:10115702:10149965:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 53 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT087885 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 38 // 38 // 13 // 34 // 1
NM_001570 // RefSeq // Homo sapiens interleukin-1 receptor-associated kinase 2 (IRAK2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000256458 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:10164865:10243743:1 gene:ENSG00000134070 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// AF026273 // GenBank // Homo sapiens interleukin-1 receptor-associated kinase-2 mRNA, complete cds. // chr3 // 97 // 85 // 32 // 33 // 0 /// AK299033 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57341 complete cds, highly similar to Interleukin-1 receptor-associated kinase-like 2. // chr3 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0 /// BC125184 // GenBank // Homo sapiens interleukin-1 receptor-associated kinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:150550 IMAGE:40122282), complete cds. // chr3 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000020352 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:10164955:10242228:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0
NR_026829 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 852 (LINC00852), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000475197 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:10284419:10285746:1 gene:ENSG00000231177 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000538717 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:10284419:10285745:1 gene:ENSG00000231177 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AF280797 // GenBank // Homo sapiens NPC-related protein NAG73 mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// NONHSAT087925 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_014229 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter), member 11 (SLC6A11), mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000454147 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:10816201:10825498:1 gene:ENSG00000132164 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 40 // 14 // 14 // 0 /// BC036083 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter, GABA), member 11, mRNA (cDNA clone IMAGE:5313099), complete cds. // chr3 // 100 // 40 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000254488 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:10816200:10940733:1 gene:ENSG00000132164 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 94 // 94 // 33 // 35 // 1 /// GENSCAN00000020354 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:10903060:10938402:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 49 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000020357 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:10816266:10888260:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 40 // 40 // 14 // 35 // 1
NM_003042 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter), member 1 (SLC6A1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000287766 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:10992724:11039247:1 gene:ENSG00000157103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000425938 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:10992728:11017327:1 gene:ENSG00000157103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 19 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000462473 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:10992734:11017876:1 gene:ENSG00000157103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 24 // 10 // 10 // 0 /// BC033904 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter, GABA), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:33804 IMAGE:5264672), complete cds. // chr3 // 95 // 98 // 39 // 41 // 0 /// X54673 // GenBank // H.sapiens GAT1 mRNA for GABA transporter. // chr3 // 95 // 90 // 36 // 38 // 0 /// AK295702 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57116 complete cds, highly similar to Sodium-and chloride-dependent GABA transporter 1. // chr3 // 71 // 71 // 30 // 42 // 1 /// ENST00000460480 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:11017116:11022437:1 gene:ENSG00000157103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 24 // 24 // 10 // 42 // 1 /// ENST00000495636 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:11033237:11037278:1 gene:ENSG00000157103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1 /// GENSCAN00000035018 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:10962265:11036966:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 97 // 79 // 32 // 33 // 0 /// NONHSAT087959 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 100 // 24 // 10 // 10 // 0
ENST00000515965 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:12514706:12514807:1 gene:ENSG00000251774 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT088016 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001271707 // RefSeq // Homo sapiens makorin ring finger protein 2 (MKRN2), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NM_014160 // RefSeq // Homo sapiens makorin ring finger protein 2 (MKRN2), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000170447 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:12557014:12583713:1 gene:ENSG00000075975 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000411987 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:3:12557087:12582503:1 gene:ENSG00000075975 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000448482 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:12557090:12582626:1 gene:ENSG00000075975 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// AF302084 // GenBank // Homo sapiens MAKORIN2 (MKRN2) mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AK298463 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52346 complete cds, highly similar to Makorin-2. // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC015715 // GenBank // Homo sapiens makorin ring finger protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:16931 IMAGE:3916199), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029240 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:12570120:12582253:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NONHSAT088020 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001162499 // RefSeq // Homo sapiens cullin-associated and neddylation-dissociated 2 (putative) (CAND2), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_012298 // RefSeq // Homo sapiens cullin-associated and neddylation-dissociated 2 (putative) (CAND2), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000295989 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:12796472:12834802:1 gene:ENSG00000144712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000446928 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:12796672:12813092:1 gene:ENSG00000144712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000456430 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:12796680:12834803:1 gene:ENSG00000144712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC136592 // GenBank // Homo sapiens cullin-associated and neddylation-dissociated 2 (putative), mRNA (cDNA clone MGC:168205 IMAGE:9020582), complete cds. // chr3 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// GU727621 // GenBank // Homo sapiens epididymis tissue protein Li 169 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000029255 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:12796721:12833982:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
NR_002223 // RefSeq // Homo sapiens tetra-peptide repeat homeobox-like (TPRXL), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000326972 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:13937401:14065985:1 gene:ENSG00000180438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000424053 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:14017401:14065985:1 gene:ENSG00000180438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000429201 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:14017553:14065985:1 gene:ENSG00000180438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC016304 // GenBank // Homo sapiens tetra-peptide repeat homeobox-like, mRNA (cDNA clone IMAGE:3844335). // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC027729 // GenBank // Homo sapiens tetra-peptide repeat homeobox-like, mRNA (cDNA clone IMAGE:4651726). // chr3 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000532924 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:14019700:14064625:1 gene:ENSG00000180438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 53 // 53 // 10 // 19 // 1 /// ENST00000524375 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:13937396:14064328:1 gene:ENSG00000180438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 47 // 47 // 9 // 19 // 1 /// ENST00000528067 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:14017480:14064401:1 gene:ENSG00000180438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 47 // 47 // 9 // 19 // 1
NM_024334 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 43 (TMEM43), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000306077 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:14124940:14143679:1 gene:ENSG00000170876 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000432444 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:14125015:14132921:1 gene:ENSG00000170876 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 80 // 25 // 8 // 10 // 0 /// AK074073 // GenBank // Homo sapiens mRNA for FLJ00144 protein. // chr3 // 92 // 95 // 35 // 38 // 0 /// BC003125 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 43, mRNA (cDNA clone MGC:3222 IMAGE:3503636), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// BC011719 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 43, mRNA (cDNA clone MGC:19834 IMAGE:4079766), complete cds. // chr3 // 88 // 85 // 30 // 34 // 0 /// AY358625 // GenBank // Homo sapiens clone DNA108743 MGC32 (UNQ2564) mRNA, complete cds. // chr3 // 70 // 70 // 28 // 40 // 1 /// GENSCAN00000029179 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:14127615:14142118:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 70 // 28 // 28 // 0
NM_014463 // RefSeq // Homo sapiens LSM3 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae) (LSM3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000306024 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:14178358:14201119:1 gene:ENSG00000170860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// AF182289 // GenBank // Homo sapiens U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// AF182418 // GenBank // Homo sapiens MDS017 (MDS017) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC007055 // GenBank // Homo sapiens LSM3 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:12477 IMAGE:3828636), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// CR457185 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834D118D for gene LSM3, LSM3 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae); complete cds, incl. stopcodon. // chr3 // 100 // 88 // 7 // 7 // 0
ENST00000362739 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:14394648:14394757:1 gene:ENSG00000199609 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT088344 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001184957 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 20 (C3orf20), transcript variant 3, mRNA. // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NM_001184958 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 20 (C3orf20), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NM_032137 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 20 (C3orf20), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000253697 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:14675099:14773034:1 gene:ENSG00000131379 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000412910 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:14675179:14773034:1 gene:ENSG00000131379 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000435614 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:14675141:14773005:1 gene:ENSG00000131379 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// AK131481 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ16655 fis, clone TESTI4038721. // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC030599 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 20, mRNA (cDNA clone MGC:26771 IMAGE:4831210), complete cds. // chr3 // 91 // 88 // 21 // 23 // 0 /// BC038406 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 20, mRNA (cDNA clone MGC:35115 IMAGE:5167835), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000029181 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:14682762:14809414:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NM_014296 // RefSeq // Homo sapiens calpain 7 (CAPN7), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006713080 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens calpain 7 (CAPN7), transcript variant X5, mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000253693 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:15206243:15252918:1 gene:ENSG00000131375 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AB028639 // GenBank // Homo sapiens CAPN7 mRNA for PalBH, complete cds. // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC056202 // GenBank // Homo sapiens calpain 7, mRNA (cDNA clone MGC:51000 IMAGE:5274889), complete cds. // chr3 // 93 // 97 // 26 // 28 // 0 /// ENST00000463417 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:15245887:15252302:1 gene:ENSG00000131375 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// AK093742 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ36423 fis, clone THYMU2011308. // chr3 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// GENSCAN00000002864 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:15206496:15251027:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// NONHSAT088448 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
ENST00000364292 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:15339749:15339855:1 gene:ENSG00000201162 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT088458 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_033083 // RefSeq // Homo sapiens ELL associated factor 1 (EAF1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000396842 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:15427355:15442613:1 gene:ENSG00000144597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000449565 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:15427598:15439340:1 gene:ENSG00000144597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// AF272973 // GenBank // Homo sapiens EAF1 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// AK304697 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57288 complete cds, highly similar to ELL-associated factor 1. // chr3 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// BC041329 // GenBank // Homo sapiens ELL associated factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:41764 IMAGE:5284115), complete cds. // chr3 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// BC029294 // GenBank HTC // Homo sapiens ELL associated factor 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5169496). // chr3 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// GENSCAN00000002852 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:15427513:15440591:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT088463 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr3 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
ENST00000584058 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:15738515:15738809:1 gene:ENSG00000263740 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONHSAT088493 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_001144382 // RefSeq // Homo sapiens phospholipase C-like 2 (PLCL2), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// NM_015184 // RefSeq // Homo sapiens phospholipase C-like 2 (PLCL2), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000419842 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:17010494:17081546:1 gene:ENSG00000154822 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000432376 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:16933090:17090593:1 gene:ENSG00000154822 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK023546 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ13484 fis, clone PLACE1003888, weakly similar to 1-PHOSPHATIDYLINOSITOL-4,5-BISPHOSPHATE PHOSPHODIESTERASE DELTA 1 (EC 3.1.4.11). // chr3 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// AK291419 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78651 complete cds, highly similar to Homo sapiens phospholipase C-like 2 (PLCL2), mRNA. // chr3 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// AL117515 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp434L0735 (from clone DKFZp434L0735); partial cds. // chr3 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// BC036392 // GenBank // Homo sapiens phospholipase C-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:43056 IMAGE:5259033), complete cds. // chr3 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 /// ENST00000615277 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:16884959:17090594:1 gene:ENSG00000154822 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000032086 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:16994928:17089912:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0
NM_144633 // RefSeq // Homo sapiens potassium voltage-gated channel, subfamily H (eag-related), member 8 (KCNH8), mRNA. // chr3 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000328405 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:19148454:19535646:1 gene:ENSG00000183960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000452398 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:19148534:19534739:1 gene:ENSG00000183960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// AB209053 // GenBank // Homo sapiens mRNA for potassium voltage-gated channel, subfamily H, member 8 variant protein. // chr3 // 95 // 95 // 37 // 39 // 0 /// AK294417 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50075 complete cds, highly similar to Potassium voltage-gated channel subfamily H member 8. // chr3 // 95 // 46 // 18 // 19 // 0 /// AK294759 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57487 complete cds, highly similar to Potassium voltage-gated channel subfamily H member 8. // chr3 // 100 // 22 // 9 // 9 // 0 /// AK295633 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50012 complete cds, highly similar to Potassium voltage-gated channel subfamily H member 8. // chr3 // 95 // 49 // 19 // 20 // 0 /// AY053503 // GenBank // Homo sapiens ether-a-go-go-like potassium channel 1 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000017558 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:19148720:19647151:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 33 // 33 // 0
ENST00000364675 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:19996803:19996925:1 gene:ENSG00000201545 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT088607 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_003884 // RefSeq // Homo sapiens K(lysine) acetyltransferase 2B (KAT2B), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// XR_245162 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens K(lysine) acetyltransferase 2B (KAT2B), transcript variant X2, misc_RNA. // chr3 // 100 // 52 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000263754 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:20040023:20154404:1 gene:ENSG00000114166 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000426228 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:20040698:20101113:1 gene:ENSG00000114166 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 20 // 9 // 9 // 0 /// BC060823 // GenBank // Homo sapiens K(lysine) acetyltransferase 2B, mRNA (cDNA clone MGC:71679 IMAGE:30336561), complete cds. // chr3 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// BC070075 // GenBank // Homo sapiens K(lysine) acetyltransferase 2B, mRNA (cDNA clone MGC:87369 IMAGE:30333414), complete cds. // chr3 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// U57317 // GenBank // Homo sapiens p300/CBP-associated factor (P/CAF) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000017202 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:20040478:20152525:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 77 // 34 // 34 // 0
NM_152653 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin-conjugating enzyme E2E 2 (UBE2E2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_005265432 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ubiquitin-conjugating enzyme E2E 2 (UBE2E2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// XM_005265433 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ubiquitin-conjugating enzyme E2E 2 (UBE2E2), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000335798 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:23203162:23590579:1 gene:ENSG00000182247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000396703 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:23203293:23591793:1 gene:ENSG00000182247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000425792 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:23203020:23590222:1 gene:ENSG00000182247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// AK307075 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ97023. // chr3 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC022332 // GenBank // Homo sapiens ubiquitin-conjugating enzyme E2E 2 (UBC4/5 homolog, yeast), mRNA (cDNA clone MGC:22765 IMAGE:4295679), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000427371 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:23203330:23271158:1 gene:ENSG00000182247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// ENST00000452894 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:23203100:23532615:1 gene:ENSG00000182247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000006073 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:23470928:23602129:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
ENST00000384001 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:23273807:23273910:1 gene:ENSG00000206728 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT088667 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
ENST00000364843 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:25025007:25025126:1 gene:ENSG00000201713 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONHSAT088707 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
ENST00000364163 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:27513871:27514032:1 gene:ENSG00000201033 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONHSAT088762 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_001040432 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, CW type with PWWP domain 2 (ZCWPW2), mRNA. // chr3 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// XM_005264892 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens zinc finger, CW type with PWWP domain 2 (ZCWPW2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000383768 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:28349149:28525145:1 gene:ENSG00000206559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000419130 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:28435224:28525145:1 gene:ENSG00000206559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// BC065764 // GenBank // Homo sapiens zinc finger, CW type with PWWP domain 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:4672151). // chr3 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// BC094696 // GenBank // Homo sapiens zinc finger, CW type with PWWP domain 2, mRNA (cDNA clone MGC:103003 IMAGE:30529418), complete cds. // chr3 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000420223 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:28349146:28435157:1 gene:ENSG00000206559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1 /// ENST00000457897 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:28511003:28538122:1 gene:ENSG00000206559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1 /// GENSCAN00000008111 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:28390976:28557370:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1
ENST00000415378 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:31794470:31796175:1 gene:ENSG00000223965 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000033024 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:31794476:31796326:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 7 // 7 // 0
NM_001137674 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 860 (ZNF860), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000360311 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:31981774:31991628:1 gene:ENSG00000197385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AK294003 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60236 complete cds, moderately similar to Zinc finger protein 611. // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000017290 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:31989128:31990978:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENST00000364831 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:32037526:32037653:1 gene:ENSG00000201701 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000516589 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:32045873:32045979:1 gene:ENSG00000252398 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT088871 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NONHSAT088874 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_178868 // RefSeq // Homo sapiens CKLF-like MARVEL transmembrane domain containing 8 (CMTM8), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000307526 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:32238679:32370325:1 gene:ENSG00000170293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000458535 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:32238679:32370321:1 gene:ENSG00000170293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// AF474370 // GenBank // Homo sapiens chemokine-like factor super family member 8 (CKLFSF8) mRNA, complete cds. // chr3 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// AY598783 // GenBank // Homo sapiens CKLFSF8-V2 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr3 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// BC041390 // GenBank // Homo sapiens CKLF-like MARVEL transmembrane domain containing 8, mRNA (cDNA clone MGC:43963 IMAGE:5276695), complete cds. // chr3 // 93 // 97 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000017271 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:32354509:32388669:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
NM_001039111 // RefSeq // Homo sapiens tripartite motif containing 71, E3 ubiquitin protein ligase (TRIM71), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000383763 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:32818018:32897826:1 gene:ENSG00000206557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// DQ232881 // GenBank // Homo sapiens LIN41 (LIN41) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000029150 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:32885934:32891811:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0
NM_005508 // RefSeq // Homo sapiens chemokine (C-C motif) receptor 4 (CCR4), mRNA. // chr3 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000330953 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:32951574:32956349:1 gene:ENSG00000183813 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AK292674 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75821 complete cds, highly similar to Homo sapiens chemokine (C-C motif) receptor 4 (CCR4), mRNA. // chr3 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// BC069139 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-C motif) receptor 4, mRNA (cDNA clone MGC:95423 IMAGE:7216998), complete cds. // chr3 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// BC071751 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-C motif) receptor 4, mRNA (cDNA clone MGC:88293 IMAGE:30415446), complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC074935 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-C motif) receptor 4, mRNA (cDNA clone MGC:103884 IMAGE:30915268), complete cds. // chr3 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000029164 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:32953423:32954505:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// X85740 // GenBank // H.sapiens mRNA for C-C chemokine receptor-4. // chr3 // 94 // 65 // 16 // 17 // 0
ENST00000585237 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:33103008:33103306:1 gene:ENSG00000275090 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA gene:ENSG00000263587 // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT088913 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_006371 // RefSeq // Homo sapiens cartilage associated protein (CRTAP), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000320954 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:33113979:33147773:1 gene:ENSG00000170275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000449224 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:33114054:33143158:1 gene:ENSG00000170275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// AK298250 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55123 complete cds, highly similar to Cartilage-associated protein precursor. // chr3 // 93 // 71 // 25 // 27 // 0 /// BC008745 // GenBank // Homo sapiens cartilage associated protein, mRNA (cDNA clone MGC:1926 IMAGE:3347384), complete cds. // chr3 // 93 // 71 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000029148 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:33114078:33142448:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 63 // 24 // 24 // 0
NR_029824 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 128-2 (MIR128-2), microRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000384893 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:35744476:35744559:1 gene:ENSG00000207625 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-128-2 // miRBase Micro RNA Database // MI0000727 Homo sapiens miR-128-2 stem-loop // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT088974 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000364445 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:36685040:36685369:1 gene:ENSG00000201315 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT088983 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000362724 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:37140327:37140430:1 gene:ENSG00000199594 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT088998 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0
NONHSAT089006 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000410276 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:37341649:37341766:1 gene:ENSG00000222208 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT089012 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_002207 // RefSeq // Homo sapiens integrin, alpha 9 (ITGA9), mRNA. // chr3 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000264741 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:37452119:37823514:1 gene:ENSG00000144668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000422441 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:37452115:37629519:1 gene:ENSG00000144668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 61 // 20 // 20 // 0 /// BC030198 // GenBank // Homo sapiens integrin, alpha 9, mRNA (cDNA clone MGC:34652 IMAGE:5199296), complete cds. // chr3 // 100 // 61 // 20 // 20 // 0 /// D25303 // GenBank // Homo sapiens mRNA for integrin alpha subunit, complete cds. // chr3 // 93 // 91 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000018011 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:37575077:37818989:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// GENSCAN00000018015 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:37498601:37551889:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 30 // 30 // 10 // 33 // 1
NR_029499 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 26a-1 (MIR26A1), microRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000362205 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:37969404:37969480:1 gene:ENSG00000199075 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-26a-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0000083 Homo sapiens miR-26a-1 stem-loop // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT089041 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000363709 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:38014568:38014669:1 gene:ENSG00000200579 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 75 // 3 // 3 // 0 /// NONHSAT089046 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 75 // 3 // 3 // 0
NM_005109 // RefSeq // Homo sapiens oxidative stress responsive 1 (OXSR1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000311806 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:38165505:38255488:1 gene:ENSG00000172939 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000426620 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:38165647:38230693:1 gene:ENSG00000172939 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 50 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000446845 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:38165505:38250179:1 gene:ENSG00000172939 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 73 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000467900 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:38236661:38251412:1 gene:ENSG00000172939 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 20 // 9 // 9 // 0 /// AB017642 // GenBank // Homo sapiens OSR1 mRNA for oxidative-stress responsive 1, complete cds. // chr3 // 95 // 100 // 42 // 44 // 0 /// AF087893 // GenBank // Homo sapiens DCHT2 mRNA, complete cds. // chr3 // 77 // 59 // 20 // 26 // 0 /// AK309634 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99675. // chr3 // 100 // 50 // 22 // 22 // 0 /// BC008726 // GenBank // Homo sapiens oxidative-stress responsive 1, mRNA (cDNA clone MGC:1572 IMAGE:3163379), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000483695 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:38216094:38225069:1 gene:ENSG00000172939 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 20 // 20 // 9 // 44 // 1 /// GENSCAN00000008554 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:38154770:38253641:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 57 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT089064 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 100 // 20 // 9 // 9 // 0
NM_004256 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 22 (organic anion/urate transporter), member 13 (SLC22A13), mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000311856 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:38265812:38278315:1 gene:ENSG00000172940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000415844 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:38265906:38276328:1 gene:ENSG00000172940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 39 // 13 // 13 // 0 /// AB010438 // GenBank // Homo sapiens ORCTL3 mRNA for organic-cation transporter like 3, complete cds. // chr3 // 93 // 91 // 28 // 30 // 0 /// AK298375 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61150 complete cds, highly similar to Organic-cation transporter-like 3. // chr3 // 100 // 39 // 13 // 13 // 0 /// BC035973 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 22 (organic anion transporter), member 13, mRNA (cDNA clone MGC:32613 IMAGE:4609915), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000008566 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:38265861:38318249:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 76 // 76 // 25 // 33 // 1
NM_004803 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 22, member 14 (SLC22A14), mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000273173 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:38305936:38318575:1 gene:ENSG00000144671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000448498 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:38282298:38318249:1 gene:ENSG00000144671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// AB011082 // GenBank // Homo sapiens ORCTL4 mRNA for organic-cation transporter like 4, complete cds. // chr3 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// BC075070 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 22, member 14, mRNA (cDNA clone MGC:103972 IMAGE:30915378), complete cds. // chr3 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// BC075071 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 22, member 14, mRNA (cDNA clone MGC:104135 IMAGE:30915591), complete cds. // chr3 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// BC126482 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 22, member 14, mRNA (cDNA clone MGC:161760 IMAGE:8992198), complete cds. // chr3 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// BC130543 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 22, member 14, mRNA (cDNA clone MGC:163415 IMAGE:40146574), complete cds. // chr3 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// ENST00000496724 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:38305174:38308161:1 gene:ENSG00000144671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1 /// AK130497 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ26987 fis, clone SLV03201, highly similar to Homo sapiens organic cationic transporter-like 4 (ORCTL4). // chr3 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1 /// GENSCAN00000008566 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:38265861:38318249:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0
AB015046 // GenBank // Homo sapiens XYLB mRNA for xylulokinase, complete cds. // chr3 // 81 // 84 // 17 // 21 // 0 /// AK293325 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53504 complete cds, highly similar to Xylulose kinase (EC 2.7.1.17). // chr3 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// NM_005108 // RefSeq // Homo sapiens xylulokinase homolog (H. influenzae) (XYLB), mRNA. // chr3 // 92 // 92 // 23 // 25 // 1 /// ENST00000207870 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:38346779:38414976:1 gene:ENSG00000093217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 92 // 92 // 23 // 25 // 1 /// ENST00000424034 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:38346808:38414976:1 gene:ENSG00000093217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// BC137076 // GenBank // Homo sapiens xylulokinase homolog (H. influenzae), mRNA (cDNA clone MGC:168696 IMAGE:9021073), complete cds. // chr3 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// BC137080 // GenBank // Homo sapiens xylulokinase homolog (H. influenzae), mRNA (cDNA clone MGC:168700 IMAGE:9021077), complete cds. // chr3 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// GENSCAN00000008558 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:38346869:38413013:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_001106 // RefSeq // Homo sapiens activin A receptor, type IIB (ACVR2B), mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000352511 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:38453851:38493142:1 gene:ENSG00000114739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000461232 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:38473446:38483374:1 gene:ENSG00000114739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000465020 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:38454319:38483373:1 gene:ENSG00000114739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB209449 // GenBank // Homo sapiens mRNA for activin A type IIB receptor precursor variant protein. // chr3 // 91 // 85 // 20 // 22 // 0 /// BC096243 // GenBank // Homo sapiens activin A receptor, type IIB, mRNA (cDNA clone MGC:116906 IMAGE:40005760), complete cds. // chr3 // 83 // 92 // 20 // 24 // 0 /// BC096244 // GenBank // Homo sapiens activin A receptor, type IIB, mRNA (cDNA clone MGC:116907 IMAGE:40005761), complete cds. // chr3 // 83 // 92 // 20 // 24 // 0 /// BC096245 // GenBank // Homo sapiens activin A receptor, type IIB, mRNA (cDNA clone MGC:116909 IMAGE:40005763), complete cds. // chr3 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// BC099642 // GenBank // Homo sapiens activin A receptor, type IIB, mRNA (cDNA clone MGC:116908 IMAGE:40005762), complete cds. // chr3 // 83 // 92 // 20 // 24 // 0 /// GENSCAN00000008559 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:38454323:38483332:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
ENST00000383981 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:39025987:39026093:1 gene:ENSG00000206708 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT089104 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_005201 // RefSeq // Homo sapiens chemokine (C-C motif) receptor 8 (CCR8), mRNA. // chr3 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000326306 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:39329706:39333446:1 gene:ENSG00000179934 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000414803 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:3:39329773:39333511:1 gene:ENSG00000179934 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 43 // 13 // 13 // 0 /// BC069067 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-C motif) receptor 8, mRNA (cDNA clone MGC:95341 IMAGE:7216880), complete cds. // chr3 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// BC074743 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-C motif) receptor 8, mRNA (cDNA clone MGC:103820 IMAGE:30915201), complete cds. // chr3 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// BC107152 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-C motif) receptor 8, mRNA (cDNA clone MGC:129966 IMAGE:40032486), complete cds. // chr3 // 88 // 57 // 15 // 17 // 0 /// BC107159 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-C motif) receptor 8, mRNA (cDNA clone MGC:129973 IMAGE:40032938), complete cds. // chr3 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// D49919 // GenBank // Homo sapiens mRNA for C-C chemokine receptor type 2, complete cds. // chr3 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT089126 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000045737 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:39277357:39335876:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1
NM_017875 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 25, member 38 (SLC25A38), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000273158 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:39383348:39397351:1 gene:ENSG00000144659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000431510 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:39383389:39391620:1 gene:ENSG00000144659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 50 // 7 // 7 // 0 /// BC013194 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 25, member 38, mRNA (cDNA clone MGC:8852 IMAGE:3918744), complete cds. // chr3 // 100 // 57 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000045738 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:39358545:39443683:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 57 // 57 // 8 // 14 // 1
NR_002325 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 6 (SNORA6), small nucleolar RNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000384033 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:39408389:39408539:1 gene:ENSG00000206760 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000490490 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:39408204:39410934:1 gene:ENSG00000168028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT089134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0
NR_002324 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 62 (SNORA62), small nucleolar RNA. // chr3 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000365493 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:39411054:39411206:1 gene:ENSG00000202363 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000495394 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:39410259:39412434:1 gene:ENSG00000168028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// AK055991 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ31429 fis, clone NT2NE2000536, moderately similar to 40S RIBOSOMAL PROTEIN SA. // chr3 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT089135 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000364700 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:39970125:39970266:1 gene:ENSG00000201570 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT089145 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
ENST00000585204 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:40209005:40209304:1 gene:ENSG00000265327 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT089147 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENST00000365647 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:40238608:40238741:1 gene:ENSG00000202517 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT089148 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001248 // RefSeq // Homo sapiens ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 3 (ENTPD3), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NM_001291960 // RefSeq // Homo sapiens ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 3 (ENTPD3), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NM_001291961 // RefSeq // Homo sapiens ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 3 (ENTPD3), transcript variant 3, mRNA. // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_005265606 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 3 (ENTPD3), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000301825 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:40387156:40428619:1 gene:ENSG00000168032 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000445129 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:3:40387997:40425010:1 gene:ENSG00000168032 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000456402 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:40387245:40427508:1 gene:ENSG00000168032 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// AF034840 // GenBank // Homo sapiens E-type ATPase (HB6) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AF039917 // GenBank // Homo sapiens CD39L3 (CD39L3) mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// BC029869 // GenBank // Homo sapiens ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 3, mRNA (cDNA clone MGC:34514 IMAGE:5174918), complete cds. // chr3 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000045178 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:40385395:40462232:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
NM_175888 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 620 (ZNF620), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_005265011 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens zinc finger protein 620 (ZNF620), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// XM_005265012 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens zinc finger protein 620 (ZNF620), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000314529 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:40506039:40518736:1 gene:ENSG00000177842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000420891 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:40505992:40515944:1 gene:ENSG00000177842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// NM_001256167 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 620 (ZNF620), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 71 // 71 // 17 // 24 // 1 /// NM_001256168 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 620 (ZNF620), transcript variant 3, mRNA. // chr3 // 58 // 58 // 14 // 24 // 1 /// ENST00000418905 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:3:40506040:40517709:1 gene:ENSG00000177842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 71 // 71 // 17 // 24 // 1 /// GENSCAN00000045182 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:40505849:40583128:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 67 // 67 // 16 // 24 // 1
ENST00000410940 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:42221840:42221965:1 gene:ENSG00000222872 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT089213 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_016305 // RefSeq // Homo sapiens synovial sarcoma translocation gene on chromosome 18-like 2 (SS18L2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000011691 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:42590806:42594998:1 gene:ENSG00000008324 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000447630 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:42581840:42595114:1 gene:ENSG00000008324 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AF201950 // GenBank // Homo sapiens kiaa-iso protein mRNA, complete cds. // chr3 // 88 // 100 // 21 // 24 // 0 /// BC017804 // GenBank // Homo sapiens synovial sarcoma translocation gene on chromosome 18-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:22369 IMAGE:4658643), complete cds. // chr3 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000474941 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:42591274:42594660:1 gene:ENSG00000008324 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1 /// GENSCAN00000007708 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:42590898:42664598:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1 /// NONHSAT089237 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr3 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1
NM_145166 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger and BTB domain containing 47 (ZBTB47), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_005265582 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens zinc finger and BTB domain containing 47 (ZBTB47), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000232974 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:42653684:42665854:1 gene:ENSG00000114853 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000505904 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:42658814:42665854:1 gene:ENSG00000114853 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// BC021855 // GenBank // Homo sapiens zinc finger and BTB domain containing 47, mRNA (cDNA clone MGC:29994 IMAGE:4943271), complete cds. // chr3 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000007708 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:42590898:42664598:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
NM_152393 // RefSeq // Homo sapiens kelch-like family member 40 (KLHL40), mRNA. // chr3 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// ENST00000287777 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:42685519:42692544:1 gene:ENSG00000157119 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// AK291294 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76839 complete cds, highly similar to Homo sapiens kelch repeat and BTB (POZ) domain containing 5 (KBTBD5), mRNA. // chr3 // 89 // 88 // 25 // 28 // 0 /// AK300682 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51312 complete cds, highly similar to Homo sapiens kelch repeat and BTB (POZ) domain containing 5 (KBTBD5), mRNA. // chr3 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// AY176040 // GenBank // Homo sapiens sarcosynapsin (SRYP) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AY177390 // GenBank // Homo sapiens sarcosynapsin (SRYP) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC110491 // GenBank // Homo sapiens kelch repeat and BTB (POZ) domain containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:125350 IMAGE:40007554), complete cds. // chr3 // 90 // 91 // 26 // 29 // 0 /// GENSCAN00000007713 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:42685619:42691993:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0
NM_001134656 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 662 (ZNF662), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// NM_207404 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 662 (ZNF662), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000328199 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:42906166:42916995:1 gene:ENSG00000182983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000440367 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:42905731:42917641:1 gene:ENSG00000182983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC128085 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 662, mRNA (cDNA clone MGC:149141 IMAGE:40108370), complete cds. // chr3 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000475386 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:42906174:42915370:1 gene:ENSG00000182983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// AK128676 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ46840 fis, clone UTERU2037423, moderately similar to Zinc finger protein 135. // chr3 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// ENST00000422021 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:42908022:42917640:1 gene:ENSG00000182983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// GENSCAN00000039620 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:42907237:42915354:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0
NM_001129908 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 198, member A (FAM198A), mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000273146 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:42979267:43060211:1 gene:ENSG00000144649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000430121 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:42979548:43057684:1 gene:ENSG00000144649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000434206 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:42979313:43054121:1 gene:ENSG00000144649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// AK091001 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ33682 fis, clone BRAWH2002601, weakly similar to AD021 protein. // chr3 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// AK311059 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ18101. // chr3 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000488863 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:42979281:43056366:1 gene:ENSG00000144649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// GENSCAN00000039621 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:42936335:43056386:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
ENST00000462240 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:43314951:43315255:1 gene:ENSG00000241939 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT089285 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENST00000516002 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:43472477:43472596:1 gene:ENSG00000251811 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT089291 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_016006 // RefSeq // Homo sapiens abhydrolase domain containing 5 (ABHD5), mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000013894 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:43690951:43711864:1 gene:ENSG00000011198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000413300 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:43711707:43718606:1 gene:ENSG00000011198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 91 // 44 // 10 // 11 // 0 /// ENST00000458276 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:43690870:43719049:1 gene:ENSG00000011198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF151816 // GenBank // Homo sapiens CGI-58 protein mRNA, complete cds. // chr3 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// BC021958 // GenBank // Homo sapiens abhydrolase domain containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:8731 IMAGE:3920855), complete cds. // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000463153 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:43717668:43734371:1 gene:ENSG00000011198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000039610 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:43690993:43718532:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
ENST00000517171 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:44071087:44071186:1 gene:ENSG00000252980 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT089301 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NR_029700 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 138-1 (MIR138-1), microRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000385219 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:44114212:44114310:1 gene:ENSG00000207954 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-138-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0000476 Homo sapiens miR-138-1 stem-loop // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT089303 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001145030 // RefSeq // Homo sapiens testis and ovary specific PAZ domain containing 1 (TOPAZ1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000309765 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:44241886:44332098:1 gene:ENSG00000173769 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000039049 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:44241663:44332011:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 95 // 87 // 19 // 20 // 0
NM_173658 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 660 (ZNF660), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000322734 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:44584964:44599694:1 gene:ENSG00000144792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000416644 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:44578223:44594311:1 gene:ENSG00000144792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 86 // 48 // 12 // 14 // 0 /// ENST00000441021 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:44584964:44594295:1 gene:ENSG00000144792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 89 // 62 // 16 // 18 // 0 /// BC075094 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 660, mRNA (cDNA clone MGC:104146 IMAGE:30915605), complete cds. // chr3 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0 /// BC075095 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 660, mRNA (cDNA clone MGC:103985 IMAGE:30915393), complete cds. // chr3 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0 /// BX538171 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686K13123 (from clone DKFZp686K13123). // chr3 // 100 // 34 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000412641 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:44584888:44629390:1 gene:ENSG00000186448 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// ENST00000468987 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:44584962:44586702:1 gene:ENSG00000144792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// GENSCAN00000039037 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:44594194:44595189:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0 /// NONHSAT089364 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
NM_003420 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 35 (ZNF35), mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000296092 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:44648742:44660791:1 gene:ENSG00000169981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000396056 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:44648727:44660789:1 gene:ENSG00000169981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK300581 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50867 complete cds, highly similar to Zinc finger protein 35. // chr3 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// BC013597 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 35, mRNA (cDNA clone MGC:17095 IMAGE:4186299), complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// BT006962 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 35 (clone HF.10) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000432115 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:44648741:44652701:1 gene:ENSG00000169981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1 /// GENSCAN00000039051 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:44651068:44659947:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0
NM_001134440 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 502 (ZNF502), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// NM_001134441 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 502 (ZNF502), transcript variant 3, mRNA. // chr3 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// NM_001134442 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 502 (ZNF502), transcript variant 4, mRNA. // chr3 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// NM_001282880 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 502 (ZNF502), transcript variant 5, mRNA. // chr3 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// NM_033210 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 502 (ZNF502), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENST00000296091 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:44712646:44723831:1 gene:ENSG00000196653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000411443 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:44712676:44721282:1 gene:ENSG00000196653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000436624 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:44712646:44722977:1 gene:ENSG00000196653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000449836 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:44712643:44723829:1 gene:ENSG00000196653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC028377 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 502, mRNA (cDNA clone MGC:32901 IMAGE:4822224), complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000039047 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:44720271:44722452:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0
NM_001258280 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 501 (ZNF501), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_145044 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 501 (ZNF501), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000396048 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:44729596:44737083:1 gene:ENSG00000186446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK297216 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56990 complete cds, highly similar to Zinc finger protein 501. // chr3 // 88 // 93 // 23 // 26 // 0 /// BC013762 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 501, mRNA (cDNA clone MGC:21738 IMAGE:4521303), complete cds. // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000620116 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:44729606:44737083:1 gene:ENSG00000186446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000039058 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:44734470:44735237:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0
NM_144638 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 42 (TMEM42), mRNA. // chr3 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENST00000302392 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:44861869:44865670:1 gene:ENSG00000169964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000477126 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:44861904:44865670:1 gene:ENSG00000169964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC019851 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 42, mRNA (cDNA clone MGC:29956 IMAGE:5114515), complete cds. // chr3 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// NONHSAT089378 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000024172 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:44843140:44913725:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_003241 // RefSeq // Homo sapiens transglutaminase 4 (TGM4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENST00000296125 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:44874611:44914990:1 gene:ENSG00000163810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENST00000422219 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:44874635:44901570:1 gene:ENSG00000163810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 91 // 26 // 10 // 11 // 0 /// AK300523 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58243 complete cds, highly similar to Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4(EC 2.3.2.13). // chr3 // 100 // 93 // 40 // 40 // 0 /// BC007003 // GenBank // Homo sapiens transglutaminase 4 (prostate), mRNA (cDNA clone MGC:12298 IMAGE:3950865), complete cds. // chr3 // 95 // 100 // 41 // 43 // 0 /// L34840 // GenBank // Homo sapiens transglutaminase mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// U31905 // GenBank // Human prostate-specific transglutaminase (hTGP) mRNA, complete cds. // chr3 // 98 // 95 // 40 // 41 // 0 /// ENST00000459830 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:44903535:44907202:1 gene:ENSG00000163810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 21 // 21 // 9 // 43 // 1 /// ENST00000490928 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:44874608:44889170:1 gene:ENSG00000163810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 19 // 19 // 8 // 43 // 1 /// AK125536 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ43548 fis, clone PROST2017367, highly similar to PROTEIN-GLUTAMINE GLUTAMYLTRANSFERASE 4 (EC 2.3.2.13). // chr3 // 19 // 19 // 8 // 43 // 1 /// GENSCAN00000024172 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:44843140:44913725:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 86 // 86 // 37 // 43 // 1
NM_015340 // RefSeq // Homo sapiens leucyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (LARS2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000265537 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:45388506:45548837:1 gene:ENSG00000011376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000414984 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:45388564:45547609:1 gene:ENSG00000011376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000415258 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:45388561:45549421:1 gene:ENSG00000011376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000431023 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:45388564:45446935:1 gene:ENSG00000011376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// BC025989 // GenBank // Homo sapiens leucyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:26121 IMAGE:4822546), complete cds. // chr3 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000024178 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:45313974:45547530:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
NM_014240 // RefSeq // Homo sapiens LIM domains containing 1 (LIMD1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006713381 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens LIM domains containing 1 (LIMD1), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000273317 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:45594859:45686338:1 gene:ENSG00000144791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC117236 // GenBank // Homo sapiens LIM domains containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:150845 IMAGE:40125787), complete cds. // chr3 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC117238 // GenBank // Homo sapiens LIM domains containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:150847 IMAGE:40125789), complete cds. // chr3 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000440097 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:45594324:45673898:1 gene:ENSG00000144791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// ENST00000465039 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:45555394:45673506:1 gene:ENSG00000144791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// ENST00000474665 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:45665675:45674566:1 gene:ENSG00000144791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// M80651 // GenBank // Hum ORF (CEI5) mRNA, 3 flank. // chr3 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000024173 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:45594880:45677059:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
ENST00000469955 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:45742675:45742970:1 gene:ENSG00000244357 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT089412 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001256369 // RefSeq // Homo sapiens chemokine (C-C motif) receptor 9 (CCR9), transcript variant C, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_006641 // RefSeq // Homo sapiens chemokine (C-C motif) receptor 9 (CCR9), transcript variant B, mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NM_031200 // RefSeq // Homo sapiens chemokine (C-C motif) receptor 9 (CCR9), transcript variant A, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000355983 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:45886504:45903175:1 gene:ENSG00000173585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000357632 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:45886504:45903177:1 gene:ENSG00000173585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000395963 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:45886509:45903174:1 gene:ENSG00000173585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000422395 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:45886549:45901898:1 gene:ENSG00000173585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// AF145439 // GenBank // Homo sapiens CC chemokine receptor 9A (CCR9) mRNA, alternatively spliced, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF145440 // GenBank // Homo sapiens CC chemokine receptor 9B (CCR9) mRNA, alternatively spliced, complete cds. // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC069678 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-C motif) receptor 9, mRNA (cDNA clone MGC:97366 IMAGE:7262627), complete cds. // chr3 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0
ENST00000364765 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:45903187:45903298:1 gene:ENSG00000201635 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT089423 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000458629 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:45945019:45947823:1 gene:ENSG00000172215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// AF007545 // GenBank // Homo sapiens SIV/HIV receptor Bonzo (Bonzo) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// BC033584 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) receptor 6, mRNA (cDNA clone MGC:34420 IMAGE:5225727), complete cds. // chr3 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// U73529 // GenBank // Human G protein-coupled receptor STRL33.1 (STRL33) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// U73531 // GenBank // Human G protein-coupled receptor STRL33.3 (STRL33) mRNA, complete cds. // chr3 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// NM_006564 // RefSeq // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) receptor 6 (CXCR6), mRNA. // chr3 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// ENST00000304552 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:45943472:45948353:1 gene:ENSG00000172215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// ENST00000438735 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:45940933:45948337:1 gene:ENSG00000172215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// ENST00000457814 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:45945049:45947510:1 gene:ENSG00000172215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// GENSCAN00000029276 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:45946482:45947510:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0
NM_000579 // RefSeq // Homo sapiens chemokine (C-C motif) receptor 5 (gene/pseudogene) (CCR5), transcript variant A, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_001100168 // RefSeq // Homo sapiens chemokine (C-C motif) receptor 5 (gene/pseudogene) (CCR5), transcript variant B, mRNA. // chr3 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000292303 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:46370854:46376206:1 gene:ENSG00000160791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// AK292132 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78003 complete cds, highly similar to Homo sapiens chemokine (C-C motif) receptor 5, mRNA. // chr3 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// BC038398 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-C motif) receptor 5, mRNA (cDNA clone MGC:34624 IMAGE:5186388), complete cds. // chr3 // 93 // 47 // 13 // 14 // 0 /// U54994 // GenBank // Human CC chemokine receptor 5 (CCR5) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// U57840 // GenBank // Human CC chemokine receptor 5 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0
NM_031440 // RefSeq // Homo sapiens receptor (chemosensory) transporter protein 3 (RTP3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000296142 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:46497491:46500949:1 gene:ENSG00000163825 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY562237 // GenBank // Homo sapiens receptor transporting protein 3 (RTP3) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// BC131756 // GenBank // Homo sapiens receptor (chemosensory) transporter protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:156227 IMAGE:40119315), complete cds. // chr3 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029274 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:46498063:46505781:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 91 // 41 // 10 // 11 // 0
NR_073385 // RefSeq // Homo sapiens LRRC2 antisense RNA 1 (LRRC2-AS1), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// AJ312775 // GenBank // Homo sapiens mRNA for leucine zipper protein 3 (LUZP3 gene). // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000599511 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:46557398:46559688:1 gene:ENSG00000268324 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000614743 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:46557404:46559694:1 gene:ENSG00000268324 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr3 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// NONHSAT089447 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr3 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0
NM_001174136 // RefSeq // Homo sapiens teratocarcinoma-derived growth factor 1 (TDGF1), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NM_003212 // RefSeq // Homo sapiens teratocarcinoma-derived growth factor 1 (TDGF1), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000296145 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:46577237:46582463:1 gene:ENSG00000241186 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000493282 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:46577748:46579936:1 gene:ENSG00000241186 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000542931 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:46574555:46582460:1 gene:ENSG00000241186 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC022393 // GenBank // Homo sapiens teratocarcinoma-derived growth factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:24110 IMAGE:4615416), complete cds. // chr3 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0 /// BC067844 // GenBank // Homo sapiens teratocarcinoma-derived growth factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:87434 IMAGE:5286020), complete cds. // chr3 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0 /// GENSCAN00000029260 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:46579108:46581250:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0
NM_147196 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane inner ear (TMIE), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006713097 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens transmembrane inner ear (TMIE), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000326431 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:46701333:46710886:1 gene:ENSG00000181585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY081842 // GenBank // Homo sapiens transmembrane inner ear protein (TMIE) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC126258 // GenBank // Homo sapiens transmembrane inner ear, mRNA (cDNA clone MGC:161536 IMAGE:8991974), complete cds. // chr3 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// BC126260 // GenBank // Homo sapiens transmembrane inner ear, mRNA (cDNA clone MGC:161538 IMAGE:8991976), complete cds. // chr3 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000029265 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:46701488:46709688:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// AK289625 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76643 complete cds, highly similar to Homo sapiens transmembrane inner ear (TMIE), mRNA. // chr3 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
NM_015175 // RefSeq // Homo sapiens neurobeachin-like 2 (NBEAL2), mRNA. // chr3 // 100 // 98 // 61 // 61 // 0 /// ENST00000416683 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:46995321:47009556:1 gene:ENSG00000160796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 79 // 49 // 49 // 0 /// ENST00000443829 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:3:47002033:47009548:1 gene:ENSG00000160796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 45 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000450053 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:46979683:47009703:1 gene:ENSG00000160796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 98 // 61 // 61 // 0 /// AK092871 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ35552 fis, clone SPLEN2004346. // chr3 // 92 // 21 // 12 // 13 // 0 /// AK293387 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57099 complete cds, moderately similar to Neurobeachin-like 1. // chr3 // 100 // 27 // 17 // 17 // 0 /// AK301269 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50251 complete cds, highly similar to Neurobeachin-like 1. // chr3 // 91 // 37 // 21 // 23 // 0 /// AY358455 // GenBank // Homo sapiens clone DNA35680 SQFE253 (UNQ253) mRNA, complete cds. // chr3 // 93 // 45 // 26 // 28 // 0 /// AK074036 // GenBank // Homo sapiens mRNA for FLJ00082 protein. // chr3 // 27 // 27 // 17 // 62 // 1 /// GENSCAN00000026238 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:46979862:47013008:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 58 // 58 // 0
ENST00000435191 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:48181547:48181726:1 gene:ENSG00000231884 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 83 // 60 // 10 // 12 // 0 /// NONHSAT089542 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 83 // 60 // 10 // 12 // 0
NM_004345 // RefSeq // Homo sapiens cathelicidin antimicrobial peptide (CAMP), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000296435 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:48223347:48225491:1 gene:ENSG00000164047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY162210 // GenBank // Homo sapiens CAP18 mRNA, complete cds. // chr3 // 95 // 71 // 19 // 20 // 0 /// BC055089 // GenBank // Homo sapiens cathelicidin antimicrobial peptide, mRNA (cDNA clone MGC:61960 IMAGE:6457987), complete cds. // chr3 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// CR457083 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834B117D for gene CAMP, cathelicidin antimicrobial peptide; complete cds, incl. stopcodon. // chr3 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// CR541961 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834F0634D for gene CAMP, cathelicidin antimicrobial peptide; complete cds, without stopcodon. // chr3 // 85 // 71 // 17 // 20 // 0 /// U19970 // GenBank // Human antimicrobial LPS-binding protein CAP18 precursor mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// Z38026 // GenBank // H.sapiens mRNA for FALL-39 peptide antibiotic. // chr3 // 92 // 86 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000022081 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:48223512:48225424:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
ENST00000362606 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:48288587:48288694:1 gene:ENSG00000199476 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT089550 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000581742 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:48379834:48380132:1 gene:ENSG00000277483 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA gene:ENSG00000265053 // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT089559 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
ENST00000496499 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:49083233:49083532:1 gene:ENSG00000241461 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT089661 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_173546 // RefSeq // Homo sapiens kelch domain containing 8B (KLHDC8B), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000332780 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:49171611:49176486:1 gene:ENSG00000185909 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000471811 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:49174188:49175186:1 gene:ENSG00000185909 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 90 // 40 // 9 // 10 // 0 /// ENST00000476495 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:49172713:49174966:1 gene:ENSG00000185909 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// AK294160 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59227 complete cds, highly similar to Kelch domain-containing protein 8B. // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC039083 // GenBank // Homo sapiens kelch domain containing 8B, mRNA (cDNA clone MGC:35097 IMAGE:5167173), complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000459846 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:49171622:49175167:1 gene:ENSG00000185909 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// AK002164 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ11302 fis, clone PLACE1009971. // chr3 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// GENSCAN00000000204 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:49171488:49277404:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1
ENST00000440528 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:49260085:49261311:1 gene:ENSG00000225399 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY078383 // GenBank // Homo sapiens STGC3 mRNA, complete cds. // chr3 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENST00000622888 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:49260085:49261316:1 gene:ENSG00000225399 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000362676 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:49270132:49270239:1 gene:ENSG00000199546 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT089687 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_022171 // RefSeq // Homo sapiens T-cell leukemia translocation altered (TCTA), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000273590 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:49412206:49416475:1 gene:ENSG00000145022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000487432 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:49412365:49415265:1 gene:ENSG00000145022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 61 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000493381 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:49412400:49415442:1 gene:ENSG00000145022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 52 // 17 // 17 // 0 /// BC005157 // GenBank // Homo sapiens T-cell leukemia translocation altered gene, mRNA (cDNA clone MGC:4449 IMAGE:2959904), complete cds. // chr3 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0 /// CR457411 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834F1010D for gene TCTA, T-cell leukemia translocation altered gene; complete cds, incl. stopcodon. // chr3 // 89 // 27 // 8 // 9 // 0 /// L41143 // GenBank // Homo sapiens expressed pseudo TCTA mRNA at t(1;3) translocation site, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000488385 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:49412212:49413426:1 gene:ENSG00000145022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// GENSCAN00000000214 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:49412427:49415053:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0
NM_003458 // RefSeq // Homo sapiens bassoon presynaptic cytomatrix protein (BSN), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000296452 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:49554489:49671545:1 gene:ENSG00000164061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF052224 // GenBank // Homo sapiens neuronal double zinc finger protein (ZNF231) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000000205 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:49614390:49683342:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0
NM_203370 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 212, member A (FAM212A), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000333323 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:49803254:49805030:1 gene:ENSG00000185614 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC012170 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 54, mRNA (cDNA clone MGC:20416 IMAGE:4642270), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000000218 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:49803387:49804987:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0
NM_144499 // RefSeq // Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein), alpha transducing activity polypeptide 1 (GNAT1), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000232461 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:50191612:50196516:1 gene:ENSG00000114349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000433068 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:50191670:50196515:1 gene:ENSG00000114349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000440836 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:50192672:50193837:1 gene:ENSG00000114349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 90 // 30 // 9 // 10 // 0 /// AF493908 // GenBank // Homo sapiens guanine nucleotide binding protein alpha transducin rod (GNATR) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0 /// BC095505 // GenBank // Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein), alpha transducing activity polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:111716 IMAGE:6519160), complete cds. // chr3 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0 /// NM_000172 // RefSeq // Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein), alpha transducing activity polypeptide 1 (GNAT1), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1 /// GENSCAN00000042721 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:50191726:50194955:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0
ENST00000492383 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:50256283:50258166:1 gene:ENSG00000114353 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// AY555145 // GenBank // Homo sapiens viral protein-binding protein C1 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_153215 // RefSeq // Homo sapiens leucine-rich single-pass membrane protein 2 (LSMEM2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_005264882 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens leucine-rich single-pass membrane protein 2 (LSMEM2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000316436 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:50279027:50288114:1 gene:ENSG00000179564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC028000 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 45, mRNA (cDNA clone MGC:40187 IMAGE:5197901), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006712980 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens leucine-rich single-pass membrane protein 2 (LSMEM2), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 75 // 75 // 18 // 24 // 1 /// XM_006712981 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens leucine-rich single-pass membrane protein 2 (LSMEM2), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 67 // 67 // 16 // 24 // 1 /// GENSCAN00000042714 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:50282432:50287202:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0
ENST00000365452 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:50419781:50419899:1 gene:ENSG00000202322 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT089843 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_004947 // RefSeq // Homo sapiens dedicator of cytokinesis 3 (DOCK3), mRNA. // chrUn // 100 // 100 // 63 // 63 // 0 /// ENST00000266037 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:50675241:51384198:1 gene:ENSG00000088538 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 100 // 63 // 63 // 0 /// AY145303 // GenBank // Homo sapiens modifier of cell adhesion mRNA, complete cds. // chrUn // 100 // 94 // 59 // 59 // 0 /// AY254099 // GenBank // Homo sapiens DOCK3 (DOCK3) mRNA, complete cds. // chrUn // 100 // 100 // 63 // 63 // 0 /// GENSCAN00000004947 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:50841675:51381559:1 transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 78 // 49 // 49 // 0
NM_006010 // RefSeq // Homo sapiens mesencephalic astrocyte-derived neurotrophic factor (MANF), mRNA. // chr3 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000446668 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:51385357:51389262:1 gene:ENSG00000145050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000528157 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:51385047:51389397:1 gene:ENSG00000145050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK292243 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77177 complete cds, highly similar to Homo sapiens arginine-rich, mutated in early stage tumors (ARMET), mRNA. // chr3 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// BC113588 // GenBank // Homo sapiens arginine-rich, mutated in early stage tumors, mRNA (cDNA clone MGC:142148 IMAGE:8322640), complete cds. // chr3 // 93 // 58 // 13 // 14 // 0 /// BC113590 // GenBank // Homo sapiens arginine-rich, mutated in early stage tumors, mRNA (cDNA clone MGC:142150 IMAGE:8322642), complete cds. // chr3 // 93 // 58 // 13 // 14 // 0 /// BT007110 // GenBank // Homo sapiens arginine-rich, mutated in early stage tumors mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// M83751 // GenBank // Human arginine-rich protein (ARP) gene, complete cds. // chr3 // 78 // 96 // 18 // 23 // 0 /// ENST00000470900 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:51385409:51389344:1 gene:ENSG00000145050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1 /// BC033055 // GenBank HTC // Homo sapiens arginine-rich, mutated in early stage tumors, mRNA (cDNA clone IMAGE:5262063), with apparent retained intron. // chr3 // 46 // 46 // 11 // 24 // 1 /// GENSCAN00000004942 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:51385231:51389089:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0
NM_013286 // RefSeq // Homo sapiens RNA binding motif protein 15B (RBM15B), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000563281 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:51391268:51397908:1 gene:ENSG00000259956 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// L13434 // GenBank // Human chromosome 3p21.1 gene sequence, complete cds. // chr3 // 86 // 54 // 12 // 14 // 0 /// BC139836 // GenBank // Homo sapiens RNA binding motif protein 15B, mRNA (cDNA clone MGC:161922 IMAGE:40123447), complete cds. // chr3 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// GENSCAN00000004956 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:51391721:51394072:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
NM_015106 // RefSeq // Homo sapiens RAD54-like 2 (S. cerevisiae) (RAD54L2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000409535 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:51541580:51668667:1 gene:ENSG00000164080 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000432863 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:51629391:51663457:1 gene:ENSG00000164080 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 98 // 91 // 39 // 40 // 0 /// ENST00000461680 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:51630322:51663594:1 gene:ENSG00000164080 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000487093 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:51541580:51663594:1 gene:ENSG00000164080 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// AK023824 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ13762 fis, clone PLACE4000014, weakly similar to X-LINKED HELICASE II. // chr3 // 92 // 86 // 35 // 38 // 0 /// AK122683 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ16136 fis, clone BRACE3000520, highly similar to Mus musculus mRNA for steroid receptor-interacting SNF2 domain protein. // chr3 // 98 // 100 // 43 // 44 // 0 /// AK304881 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58240 complete cds. // chr3 // 98 // 91 // 39 // 40 // 0 /// BC024298 // GenBank // Homo sapiens RAD54-like 2 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:39353 IMAGE:4578867), complete cds. // chr3 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000004953 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:51590421:51719434:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0
NM_203424 // RefSeq // Homo sapiens IQ motif containing F2 (IQCF2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000333127 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:51861638:51863424:1 gene:ENSG00000184345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000429548 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:51861629:51863423:1 gene:ENSG00000184345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// AK128883 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ46915 fis, clone TESTI2014474. // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC040047 // GenBank // Homo sapiens IQ motif containing F2, mRNA (cDNA clone MGC:50809 IMAGE:5742210), complete cds. // chr3 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000012709 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:51817997:51863370:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 72 // 13 // 13 // 0
ENST00000494496 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:51872178:51872464:1 gene:ENSG00000241789 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT089887 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_080865 // RefSeq // Homo sapiens G protein-coupled receptor 62 (GPR62), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000322241 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:51955314:51957504:1 gene:ENSG00000180929 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AB032600 // GenBank // Homo sapiens KPG_005 mRNA for G-protein coupled receptor, complete cds. // chr3 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// BC026357 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 62, mRNA (cDNA clone MGC:26943 IMAGE:4812283), complete cds. // chr3 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// HQ709188 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 62 (GPR62) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000012771 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:51955653:51956759:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0
NM_015512 // RefSeq // Homo sapiens dynein, axonemal, heavy chain 1 (DNAH1), mRNA. // chr3 // 100 // 98 // 89 // 89 // 0 /// ENST00000420323 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:52316319:52400491:1 gene:ENSG00000114841 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 98 // 89 // 89 // 0 /// ENST00000486752 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:52316319:52400491:1 gene:ENSG00000114841 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 100 // 91 // 91 // 0 /// ENST00000488988 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:52384874:52400487:1 gene:ENSG00000114841 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 34 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000490713 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:52388547:52400487:1 gene:ENSG00000114841 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 26 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000497875 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:52317871:52353821:1 gene:ENSG00000114841 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 23 // 21 // 21 // 0 /// AB290163 // GenBank // Homo sapiens mRNA for DNAH1/KIAA1410 variant protein, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 91 // 91 // 0 /// AK125990 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44002 fis, clone TESTI4022873. // chr3 // 100 // 23 // 21 // 21 // 0 /// AY221994 // GenBank // Homo sapiens heat shock regulated-1 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 42 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000012712 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:52374529:52400446:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 41 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000012704 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:52290343:52373754:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 51 // 51 // 46 // 91 // 1
ENST00000622394 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:53290640:53290751:1 gene:ENSG00000274967 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT089996 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000363509 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:56072104:56072407:1 gene:ENSG00000200379 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// NONHSAT090043 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr3 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0
ENST00000363368 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:56185104:56185222:1 gene:ENSG00000200238 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT090045 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_181727 // RefSeq // Homo sapiens spermatogenesis associated 12 (SPATA12), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000334325 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:57060441:57075432:1 gene:ENSG00000186451 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY221117 // GenBank // Homo sapiens spermatogenesis-related protein 5 (SRG5) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC033337 // GenBank // Homo sapiens spermatogenesis associated 12, mRNA (cDNA clone MGC:43027 IMAGE:4838903), complete cds. // chr3 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0 /// BC126274 // GenBank // Homo sapiens spermatogenesis associated 12, mRNA (cDNA clone MGC:161552 IMAGE:8991990), complete cds. // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC136498 // GenBank // Homo sapiens spermatogenesis associated 12, mRNA (cDNA clone MGC:168110 IMAGE:9020487), complete cds. // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_012096 // RefSeq // Homo sapiens adaptor protein, phosphotyrosine interaction, PH domain and leucine zipper containing 1 (APPL1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000288266 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:57227737:57273468:1 gene:ENSG00000157500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000482800 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:57227789:57268021:1 gene:ENSG00000157500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// AF169797 // GenBank // Homo sapiens adaptor protein APPL mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// AF424738 // GenBank // Homo sapiens signaling adaptor protein DIP13alpha mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// AK310716 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17758. // chr3 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// BC010911 // GenBank HTC // Homo sapiens adaptor protein containing pH domain, PTB domain and leucine zipper motif 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4295177), with apparent retained intron. // chr3 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// BC028599 // GenBank // Homo sapiens adaptor protein, phosphotyrosine interaction, PH domain and leucine zipper containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:33057 IMAGE:4829430), complete cds. // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000014047 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:57227884:57269687:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// NONHSAT090074 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0
ENST00000384088 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:57548838:57548945:1 gene:ENSG00000206815 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT090084 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_177966 // RefSeq // Homo sapiens phosphodiesterase 12 (PDE12), mRNA. // chr3 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000311180 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:57556277:57566844:1 gene:ENSG00000174840 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000487257 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:57556276:57560937:1 gene:ENSG00000174840 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AB115695 // GenBank // Homo sapiens 2-PDE mRNA for 2-phosphodiesterase, complete cds. // chr3 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// AK074423 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ23843 fis, clone KAT07393. // chr3 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// AK300374 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54489 complete cds, highly similar to Homo sapiens 2-phosphodiesterase (2-PDE), mRNA. // chr3 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// BC034978 // GenBank HTC // Homo sapiens phosphodiesterase 12, mRNA (cDNA clone IMAGE:4823249), with apparent retained intron. // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000014043 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:57556380:57560004:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0
ENST00000388106 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:57619447:57619572:1 gene:ENSG00000210841 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT090091 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_020676 // RefSeq // Homo sapiens abhydrolase domain containing 6 (ABHD6), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000295962 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:58237532:58294734:1 gene:ENSG00000163686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000463756 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:58238028:58274809:1 gene:ENSG00000163686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000478253 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:58237506:58294732:1 gene:ENSG00000163686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000485900 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:58238422:58271061:1 gene:ENSG00000163686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// AF225418 // GenBank // Homo sapiens lipase mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// AK225942 // GenBank // Homo sapiens mRNA for abhydrolase domain containing 6 variant, clone: FCC116A04. // chr3 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// BC001698 // GenBank // Homo sapiens abhydrolase domain containing 6, mRNA (cDNA clone MGC:2843 IMAGE:2966979), complete cds. // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// AK055828 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ31266 fis, clone KIDNE2006039. // chr3 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// AK092841 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ35522 fis, clone SPLEN2001383. // chr3 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// ENST00000613521 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:58237532:58294732:1 gene:ENSG00000163686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049834 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:58256587:58293765:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
ENST00000516640 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:62814382:62814491:1 gene:ENSG00000252449 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT090192 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001080537 // RefSeq // Homo sapiens sentan, cilia apical structure protein (SNTN), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000343837 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:63652668:63664721:1 gene:ENSG00000188817 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000469440 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:63652679:63664060:1 gene:ENSG00000188817 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000496807 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:63652698:63679020:1 gene:ENSG00000188817 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// AK126350 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44379 fis, clone TRACH3035235. // chr3 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// GENSCAN00000031009 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:63652688:63664095:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_026866 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 49 (C3orf49), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000295896 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:63819362:63848636:1 gene:ENSG00000163632 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000491896 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:63823500:63832106:1 gene:ENSG00000163632 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// ENST00000616659 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:63819472:63833637:1 gene:ENSG00000163632 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 95 // 68 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000002513 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:63819472:63831877:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0
ENST00000391038 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:64511755:64511857:1 gene:ENSG00000212340 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT090242 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000487928 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:66323855:66324152:1 gene:ENSG00000241587 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT090303 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_032505 // RefSeq // Homo sapiens kelch repeat and BTB (POZ) domain containing 8 (KBTBD8), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000417314 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:66998307:67011210:1 gene:ENSG00000163376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000460784 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:66998925:67003484:1 gene:ENSG00000163376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 39 // 11 // 11 // 0 /// AF385438 // GenBank // Homo sapiens T-cell activation kelch repeat protein mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// AK096640 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39321 fis, clone OCBBF2014873. // chr3 // 82 // 100 // 23 // 28 // 0 /// BC117487 // GenBank // Homo sapiens kelch repeat and BTB (POZ) domain containing 8, mRNA (cDNA clone MGC:151096 IMAGE:40126038), complete cds. // chr3 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000469661 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:66998307:67003828:1 gene:ENSG00000163376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// ENST00000460576 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:66998307:67008840:1 gene:ENSG00000163376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// GENSCAN00000018034 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:66838815:67008385:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT090311 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1
NM_001252216 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 19 (chemokine (C-C motif)-like), member A1 (FAM19A1), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NM_213609 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 19 (chemokine (C-C motif)-like), member A1 (FAM19A1), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000478136 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:68004216:68545625:1 gene:ENSG00000183662 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000496687 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:68006230:68545621:1 gene:ENSG00000183662 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// AK289668 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78170 complete cds. // chr3 // 100 // 77 // 10 // 10 // 0 /// AK290446 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75347 complete cds. // chr3 // 100 // 77 // 10 // 10 // 0 /// AL713702 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp566B064 (from clone DKFZp566B064). // chr3 // 85 // 100 // 11 // 13 // 0 /// AY325114 // GenBank // Homo sapiens TAFA1 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 77 // 10 // 10 // 0 /// BC025746 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 19 (chemokine (C-C motif)-like), member A1, mRNA (cDNA clone MGC:35540 IMAGE:5200142), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
ENST00000384212 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:70808350:70808452:1 gene:ENSG00000206939 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT090390 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_018971 // RefSeq // Homo sapiens G protein-coupled receptor 27 (GPR27), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000304411 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:71754050:71756496:1 gene:ENSG00000170837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AB040799 // GenBank // Homo sapiens mRNA for SREB1, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// HQ709187 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 27 (GPR27) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000000474 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:71754050:71755177:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
ENST00000487601 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:71827177:71827471:1 gene:ENSG00000239250 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT090424 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000362599 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:72576691:72576854:1 gene:ENSG00000199469 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT090458 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001080393 // RefSeq // Homo sapiens glucoside xylosyltransferase 2 (GXYLT2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000389617 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:72888073:72976926:1 gene:ENSG00000172986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000491839 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:72955215:72998138:1 gene:ENSG00000172986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0 /// BC127733 // GenBank // Homo sapiens glycosyltransferase 8 domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:157837 IMAGE:40127813), complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000498315 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:72908022:72955181:1 gene:ENSG00000172986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1 /// GENSCAN00000009471 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:72938834:72975159:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000009480 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:72888234:72929416:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1
NM_174907 // RefSeq // Homo sapiens protein phosphatase 4, regulatory subunit 2 (PPP4R2), mRNA. // chr3 // 100 // 79 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000356692 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:72996785:73069199:1 gene:ENSG00000163605 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000460360 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:73064014:73065290:1 gene:ENSG00000163605 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 57 // 8 // 8 // 0 /// AJ271448 // GenBank // Homo sapiens mRNA for protein phosphatase 4 regulatory subunit 2 (PPP4R2 gene). // chr3 // 92 // 93 // 12 // 13 // 0 /// AK289901 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75248 complete cds. // chr3 // 100 // 93 // 13 // 13 // 0 /// AL833216 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp667B117 (from clone DKFZp667B117). // chr3 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0 /// BC110889 // GenBank // Homo sapiens protein phosphatase 4, regulatory subunit 2, mRNA (cDNA clone MGC:131930 IMAGE:6503859), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC128136 // GenBank // Homo sapiens protein phosphatase 4, regulatory subunit 2, mRNA (cDNA clone MGC:149220 IMAGE:40112443), complete cds. // chr3 // 100 // 79 // 11 // 11 // 0 /// BC128137 // GenBank // Homo sapiens protein phosphatase 4, regulatory subunit 2, mRNA (cDNA clone MGC:149221 IMAGE:40112444), complete cds. // chr3 // 100 // 79 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000009482 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:73062223:73065722:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 71 // 71 // 10 // 14 // 1
NM_018029 // RefSeq // Homo sapiens endogenous Bornavirus-like nucleoprotein 2 (EBLN2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000533473 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:73061659:73063337:1 gene:ENSG00000255423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY036895 // GenBank // Homo sapiens GK006 (GK006) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000009482 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:73062223:73065722:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NONHSAT090474 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000411315 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:73110992:73111182:1 gene:ENSG00000223247 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT090476 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
ENST00000468766 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:74101349:74103553:1 gene:ENSG00000223738 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY956766 // GenBank // Homo sapiens heat shock protein 90Be (HSP90Be) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000184 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:74103231:74103455:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT090489 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONHSAT090490 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_001124759 // RefSeq // Homo sapiens FSHD region gene 2 family, member C (FRG2C), mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000308062 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:75664330:75667220:1 gene:ENSG00000172969 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000464571 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:75664330:75667220:1 gene:ENSG00000172969 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000040017 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:75664380:75671610:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 60 // 60 // 9 // 15 // 1
XM_003960330 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens double homeobox protein 4-like (LOC100996350), mRNA. // chr3 // 100 // 67 // 10 // 10 // 0 /// XM_005264778 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens double homeobox protein 4-like (LOC100996350), partial mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000489078 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:75668931:75670185:1 gene:ENSG00000236138 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 67 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000040017 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:75664380:75671610:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 67 // 10 // 10 // 0 /// NONHSAT090546 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 67 // 10 // 10 // 0
ENST00000362650 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:77092057:77092163:1 gene:ENSG00000199520 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT090559 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000485429 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:78115158:78115457:1 gene:ENSG00000243957 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT090573 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENST00000410642 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:78161698:78161992:1 gene:ENSG00000222574 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT090574 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000410457 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:81509476:81509664:1 gene:ENSG00000222389 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT090614 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000515964 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:86235321:86235424:1 gene:ENSG00000251773 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT090667 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000411002 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:86362132:86362474:1 gene:ENSG00000222934 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT090671 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001244644 // RefSeq // Homo sapiens charged multivesicular body protein 2B (CHMP2B), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NM_014043 // RefSeq // Homo sapiens charged multivesicular body protein 2B (CHMP2B), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000263780 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:87227285:87255499:1 gene:ENSG00000083937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000471660 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:3:87227271:87255548:1 gene:ENSG00000083937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000472024 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:87227309:87253470:1 gene:ENSG00000083937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 95 // 66 // 20 // 21 // 0 /// ENST00000494980 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:87227302:87254224:1 gene:ENSG00000083937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// AF151842 // GenBank // Homo sapiens CGI-84 protein mRNA, complete cds. // chr3 // 83 // 75 // 20 // 24 // 0 /// AK296072 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57117 complete cds, highly similar to Charged multivesicular body protein 2b. // chr3 // 86 // 66 // 18 // 21 // 0 /// BC001553 // GenBank // Homo sapiens chromatin modifying protein 2B, mRNA (cDNA clone MGC:5027 IMAGE:3460712), complete cds. // chr3 // 90 // 91 // 26 // 29 // 0 /// CR533456 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834F1016D for gene DKFZP564O123, DKFZP564O123 protein; complete cds, incl. stopcodon. // chr3 // 74 // 72 // 17 // 23 // 0 /// GENSCAN00000007079 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:87219310:87253822:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1
ENST00000408132 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:87910220:87910345:1 gene:ENSG00000221059 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT090695 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_000866 // RefSeq // Homo sapiens 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 1F, G protein-coupled (HTR1F), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000319595 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:87990696:87993835:1 gene:ENSG00000179097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF498981 // GenBank // Homo sapiens 5-hydroxytryptamine receptor 1F (HTR1F) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC069125 // GenBank // Homo sapiens 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 1F, mRNA (cDNA clone MGC:95405 IMAGE:7216980), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008633 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:87990750:88005215:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_018293 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 654 (ZNF654), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000309495 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:88139104:88144665:1 gene:ENSG00000175105 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_006713246 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens zinc finger protein 654 (ZNF654), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 90 // 90 // 19 // 21 // 1 /// GENSCAN00000008621 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:88059320:88156635:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 90 // 90 // 19 // 21 // 1
NM_173824 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 38 (C3orf38), mRNA. // chr3 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENST00000318887 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:88149743:88157968:1 gene:ENSG00000179021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000486971 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:88149987:88156944:1 gene:ENSG00000179021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 93 // 54 // 13 // 14 // 0 /// AK297719 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54270 complete cds. // chr3 // 93 // 54 // 13 // 14 // 0 /// BC024188 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 38, mRNA (cDNA clone MGC:26717 IMAGE:4824439), complete cds. // chr3 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000008621 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:88059320:88156635:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
ENST00000384586 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:88431191:88431309:1 gene:ENSG00000207316 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT090708 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_005233 // RefSeq // Homo sapiens EPH receptor A3 (EPHA3), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NM_182644 // RefSeq // Homo sapiens EPH receptor A3 (EPHA3), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000336596 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:89107524:89482134:1 gene:ENSG00000044524 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000452448 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:89107662:89400345:1 gene:ENSG00000044524 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000494014 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:89107676:89479659:1 gene:ENSG00000044524 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// AF213459 // GenBank // Homo sapiens ephrin receptor EPHA3 complete form (EPHA3) mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 97 // 27 // 28 // 0 /// AF213460 // GenBank // Homo sapiens ephrin receptor EPHA3 secreted form (EPHA3) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// AK291411 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77258 complete cds, highly similar to Homo sapiens EPH receptor A3 (EPHA3), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// BC063282 // GenBank // Homo sapiens EPH receptor A3, mRNA (cDNA clone MGC:71556 IMAGE:30347891), complete cds. // chr3 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// M83941 // GenBank // Human receptor tyrosine kinase (HEK) mRNA, complete cds. // chr3 // 92 // 86 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000044570 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:89340954:89472623:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0
ENST00000391296 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:90030284:90030495:1 gene:ENSG00000212598 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT090712 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000410558 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:90184634:90184733:1 gene:ENSG00000222490 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 93 // 13 // 13 // 0 /// NONHSAT090713 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 93 // 13 // 13 // 0
ENST00000515918 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:93843764:93843862:1 gene:ENSG00000251727 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT090717 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0
ENST00000364469 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:93967926:93968020:1 gene:ENSG00000201339 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT090720 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000363496 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:93977029:93977135:1 gene:ENSG00000200366 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT090721 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_022072 // RefSeq // Homo sapiens NOP2/Sun domain family, member 3 (NSUN3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000314622 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:94062916:94128545:1 gene:ENSG00000178694 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC020602 // GenBank // Homo sapiens NOL1/NOP2/Sun domain family, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:22174 IMAGE:4713693), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC057238 // GenBank // Homo sapiens NOL1/NOP2/Sun domain family, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:62061 IMAGE:6463177), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000483378 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:94062980:94095094:1 gene:ENSG00000178694 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 57 // 57 // 12 // 21 // 1 /// ENST00000476588 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:94062990:94085382:1 gene:ENSG00000178694 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1 /// AK025762 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ22109 fis, clone HEP18091. // chr3 // 57 // 57 // 12 // 21 // 1 /// AF351612 // GenBank HTC // Homo sapiens UG0651E06 mRNA, complete cds. // chr3 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1 /// NONHSAT090727 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr3 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1
ENST00000471403 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:96776945:96777683:1 gene:ENSG00000176243 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 93 // 100 // 13 // 14 // 0 /// NM_001134422 // RefSeq // Homo sapiens CDV3 homolog (mouse) (CDV3), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 54 // 93 // 7 // 13 // 0 /// NM_001134423 // RefSeq // Homo sapiens CDV3 homolog (mouse) (CDV3), transcript variant 3, mRNA. // chr3 // 54 // 93 // 7 // 13 // 0 /// NM_001282762 // RefSeq // Homo sapiens CDV3 homolog (mouse) (CDV3), transcript variant 4, mRNA. // chr3 // 54 // 93 // 7 // 13 // 0 /// NM_001282763 // RefSeq // Homo sapiens CDV3 homolog (mouse) (CDV3), transcript variant 5, mRNA. // chr3 // 54 // 93 // 7 // 13 // 0 /// NM_001282765 // RefSeq // Homo sapiens CDV3 homolog (mouse) (CDV3), transcript variant 7, mRNA. // chr3 // 54 // 93 // 7 // 13 // 0 /// NM_017548 // RefSeq // Homo sapiens CDV3 homolog (mouse) (CDV3), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 54 // 93 // 7 // 13 // 0 /// ENST00000264993 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:133573730:133590261:1 gene:ENSG00000091527 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 54 // 93 // 7 // 13 // 0 /// ENST00000420115 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:133574457:133590260:1 gene:ENSG00000091527 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 54 // 93 // 7 // 13 // 0 /// ENST00000508481 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:133574434:133588052:1 gene:ENSG00000091527 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 54 // 93 // 7 // 13 // 0
NM_153605 // RefSeq // Homo sapiens beta-gamma crystallin domain containing 3 (CRYBG3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000182096 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:97876975:97944963:1 gene:ENSG00000080200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000389622 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:97822040:97944983:1 gene:ENSG00000080200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BX647079 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686E22223 (from clone DKFZp686E22223). // chr3 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000031785 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:97735967:97943314:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1
NM_054106 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 5, subfamily AC, member 2 (OR5AC2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000358642 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:98087173:98088102:1 gene:ENSG00000196578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENST00000514084 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:98238352:98239281:1 gene:ENSG00000187900 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONHSAT090797 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_001005479 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 5, subfamily H, member 6 (OR5H6), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000383696 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:98264285:98265262:1 gene:ENSG00000230301 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC137523 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 5, subfamily H, member 6, mRNA (cDNA clone MGC:169146 IMAGE:9021523), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC137524 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 5, subfamily H, member 6, mRNA (cDNA clone MGC:169147 IMAGE:9021524), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001005482 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 5, subfamily H, member 2 (OR5H2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000355273 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:98282888:98283832:1 gene:ENSG00000197938 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001005517 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 5, subfamily K, member 4 (OR5K4), mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000354924 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:98353854:98354819:1 gene:ENSG00000196098 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000031779 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:98353854:98506241:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 48 // 48 // 11 // 23 // 1
NM_001005516 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 5, subfamily K, member 3 (OR5K3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000383695 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:98390666:98391631:1 gene:ENSG00000206536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001004736 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 5, subfamily K, member 1 (OR5K1), mRNA. // chr3 // 81 // 100 // 13 // 16 // 0 /// ENST00000332650 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:98469480:98470576:1 gene:ENSG00000232382 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC136918 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 5, subfamily K, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:168532 IMAGE:9020909), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC136919 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 5, subfamily K, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:168533 IMAGE:9020910), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_001004737 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 5, subfamily K, member 2 (OR5K2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000427338 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:98497604:98498663:1 gene:ENSG00000231861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC136724 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 5, subfamily K, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:168337 IMAGE:9020714), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC136725 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 5, subfamily K, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:168338 IMAGE:9020715), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_005290 // RefSeq // Homo sapiens G protein-coupled receptor 15 (GPR15), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000284311 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:98531899:98533150:1 gene:ENSG00000154165 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC069437 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 15, mRNA (cDNA clone MGC:97025 IMAGE:7262234), complete cds. // chr3 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// BC101779 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 15, mRNA (cDNA clone MGC:126828 IMAGE:8069285), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC101781 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 15, mRNA (cDNA clone MGC:126830 IMAGE:8069287), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000031782 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:98532034:98533116:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
ENST00000466609 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:98657802:98660570:1 gene:ENSG00000244153 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0
ENST00000384601 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:98908459:98908564:1 gene:ENSG00000207331 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000364502 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:20:43473013:43473119:1 gene:ENSG00000201372 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 56 // 75 // 10 // 18 // 0 /// NONHSAT090833 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT079821 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 56 // 75 // 10 // 18 // 0
NM_001850 // RefSeq // Homo sapiens collagen, type VIII, alpha 1 (COL8A1), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 49 // 17 // 17 // 0 /// NM_020351 // RefSeq // Homo sapiens collagen, type VIII, alpha 1 (COL8A1), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 43 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000273342 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:99638596:99796733:1 gene:ENSG00000144810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 43 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000463753 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:99638475:99680462:1 gene:ENSG00000144810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 57 // 20 // 20 // 0 /// AF170702 // GenBank // Homo sapiens smooth muscle cell-expressed and macrophage conditioned medium-induced protein smag-64 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 57 // 20 // 20 // 0 /// AY550974 // GenBank // Homo sapiens cell proliferation-inducing protein 41 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 40 // 14 // 14 // 0 /// BC013581 // GenBank // Homo sapiens collagen, type VIII, alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:9568 IMAGE:3875911), complete cds. // chr3 // 100 // 49 // 17 // 17 // 0 /// BT009917 // GenBank // Homo sapiens collagen, type VIII, alpha 1 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 37 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000261037 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:99638475:99799226:1 gene:ENSG00000144810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 49 // 49 // 17 // 35 // 1 /// GENSCAN00000028791 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:99790683:99829056:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 34 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT090847 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 100 // 57 // 20 // 20 // 0
AF090939 // GenBank // Homo sapiens clone HQ0641 PRO0641 mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONHSAT090856 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Sense No Exonic // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_032787 // RefSeq // Homo sapiens G protein-coupled receptor 128 (GPR128), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000273352 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:100609589:100695479:1 gene:ENSG00000144820 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000475887 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:100635598:100695258:1 gene:ENSG00000144820 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// AK172774 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ23935 fis, clone COLF0858. // chr3 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// AK295345 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55998 complete cds, highly similar to Probable G-protein coupled receptor 128 precursor. // chr3 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC113451 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 128, mRNA (cDNA clone MGC:142011 IMAGE:8322503), complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC130388 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 128, mRNA (cDNA clone MGC:163260 IMAGE:40146419), complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000481506 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:100654196:100695338:1 gene:ENSG00000144820 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// AK122804 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ16382 fis, clone TLIVE2006621, weakly similar to H.sapiens mRNA for HE6 Tm7 receptor. // chr3 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// GENSCAN00000004014 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:100643266:100682609:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000028798 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:100609857:100637406:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0
ENST00000364772 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:100952627:100952733:1 gene:ENSG00000201642 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT090883 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONHSAT090885 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_003960331 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens protein FAM136A-like (LOC100287852), mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000468519 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:101414228:101414633:1 gene:ENSG00000232830 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000004012 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:101414262:101414633:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0
ENST00000364684 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:101458530:101458626:1 gene:ENSG00000201554 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT090890 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONHSAT090891 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_036433 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 172, member B, pseudogene (FAM172BP), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000487497 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:101521891:101522979:1 gene:ENSG00000175841 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// AK127584 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ45679 fis, clone ERLTF2001835. // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000004015 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:101521891:101565993:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_017819 // RefSeq // Homo sapiens tRNA methyltransferase 10 homolog C (S. cerevisiae) (TRMT10C), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000309922 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:101561862:101566446:1 gene:ENSG00000174173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000495642 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:101562041:101565717:1 gene:ENSG00000174173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// AF086243 // GenBank // Homo sapiens full length insert cDNA clone ZD37F12. // chr3 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// AF226052 // GenBank // Homo sapiens HNYA (HNYA) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AY561707 // GenBank // Homo sapiens HBV pre-S2 trans-regulated protein 2 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// BC035967 // GenBank // Homo sapiens RNA (guanine-9-) methyltransferase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:32567 IMAGE:4719195), complete cds. // chr3 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AK026532 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ22879 fis, clone KAT03544. // chr3 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// GENSCAN00000004015 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:101521891:101565993:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0
ENST00000516539 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:101615826:101615928:1 gene:ENSG00000252348 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT090895 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000364641 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:101647421:101647522:1 gene:ENSG00000201511 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT090898 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NR_024407 // RefSeq // Homo sapiens ZBTB11 antisense RNA 1 (ZBTB11-AS1), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000609682 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:101676475:101679217:1 gene:ENSG00000256628 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT090901 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENST00000365307 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:101955077:101955185:1 gene:ENSG00000202177 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT090920 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_175056 // RefSeq // Homo sapiens zona pellucida-like domain containing 1 (ZPLD1), mRNA. // chr3 // 100 // 70 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000306176 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:102435015:102479841:1 gene:ENSG00000170044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 70 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000466937 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:102435033:102477657:1 gene:ENSG00000170044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 57 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000491959 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:102099244:102477677:1 gene:ENSG00000170044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 78 // 36 // 36 // 0 /// BC021279 // GenBank // Homo sapiens zona pellucida-like domain containing 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4876551), partial cds. // chr3 // 100 // 37 // 17 // 17 // 0 /// BC031261 // GenBank // Homo sapiens zona pellucida-like domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:39721 IMAGE:5273136), complete cds. // chr3 // 100 // 78 // 36 // 36 // 0 /// BC143817 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:9052332. // chr3 // 100 // 57 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000042928 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:102241988:102469147:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 35 // 35 // 16 // 46 // 1
ENST00000365052 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:103159960:103160124:1 gene:ENSG00000201922 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT090939 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000489989 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:103240987:103241230:1 gene:ENSG00000236691 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT090940 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0
ENST00000363740 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:106515897:106515998:1 gene:ENSG00000200610 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT090987 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000363491 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:106688678:106688779:1 gene:ENSG00000200361 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT090990 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000516817 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:107007568:107007670:1 gene:ENSG00000252626 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT091017 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_032600 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 54 (CCDC54), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000261058 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:107377194:107378637:1 gene:ENSG00000138483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF367469 // GenBank // Homo sapiens testes development-related NYD-SP17 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC030780 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 54, mRNA (cDNA clone MGC:26586 IMAGE:4824584), complete cds. // chr3 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000039291 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:107377588:107378574:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0
ENST00000365509 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:108574565:108574698:1 gene:ENSG00000202379 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT091089 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_016388 // RefSeq // Homo sapiens T cell receptor associated transmembrane adaptor 1 (TRAT1), mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000295756 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:108822698:108855005:1 gene:ENSG00000163519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000426646 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:3:108822772:108854867:1 gene:ENSG00000163519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// AK291991 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75765 complete cds, highly similar to Homo sapiens T cell receptor associated transmembrane adaptor 1 (TRAT1), mRNA. // chr3 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// BC025713 // GenBank // Homo sapiens T cell receptor associated transmembrane adaptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:34314 IMAGE:5227396), complete cds. // chr3 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000484927 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:108822770:108847338:1 gene:ENSG00000163519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// ENST00000493604 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:108822773:108847380:1 gene:ENSG00000163519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// GENSCAN00000028683 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:108819033:108853877:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT091096 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// NONHSAT091097 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
ENST00000364556 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:110727021:110727121:1 gene:ENSG00000201426 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT091131 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_005816 // RefSeq // Homo sapiens CD96 molecule (CD96), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// NM_198196 // RefSeq // Homo sapiens CD96 molecule (CD96), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000283285 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:111542118:111652241:1 gene:ENSG00000153283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000352690 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:111542009:111652372:1 gene:ENSG00000153283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000438817 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:111542150:111607078:1 gene:ENSG00000153283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 52 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000488054 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:111542184:111577540:1 gene:ENSG00000153283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 20 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000494798 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:111542193:111665750:1 gene:ENSG00000153283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 68 // 30 // 30 // 0 /// AK290719 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77983 complete cds, highly similar to Homo sapiens CD96 antigen (CD96), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 97 // 68 // 29 // 30 // 0 /// BC020749 // GenBank // Homo sapiens CD96 molecule, mRNA (cDNA clone MGC:22596 IMAGE:4669495), complete cds. // chr3 // 96 // 52 // 22 // 23 // 0 /// M88282 // GenBank // Human tactile protein mRNA, complete cds. // chr3 // 95 // 86 // 36 // 38 // 0 /// GENSCAN00000030211 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:111542249:111569389:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 18 // 18 // 8 // 44 // 1
NM_001185106 // RefSeq // Homo sapiens phosphatidylinositol-specific phospholipase C, X domain containing 2 (PLCXD2), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_153268 // RefSeq // Homo sapiens phosphatidylinositol-specific phospholipase C, X domain containing 2 (PLCXD2), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000393934 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:111674676:111846447:1 gene:ENSG00000240891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000477665 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:111674922:111846266:1 gene:ENSG00000240891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// BC121155 // GenBank // Homo sapiens phosphatidylinositol-specific phospholipase C, X domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:150493 IMAGE:40121377), complete cds. // chr3 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// BC121156 // GenBank // Homo sapiens phosphatidylinositol-specific phospholipase C, X domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:150494 IMAGE:40121378), complete cds. // chr3 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019744 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:111703273:111720882:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_001042575 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protease, serine 7 (TMPRSS7), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NR_026734 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protease, serine 7 (TMPRSS7), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000419127 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:112039706:112081165:1 gene:ENSG00000176040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000435737 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:112039620:112081269:1 gene:ENSG00000176040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000452346 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:112034843:112081165:1 gene:ENSG00000176040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC117322 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protease, serine 7, mRNA (cDNA clone MGC:150931 IMAGE:40125873), complete cds. // chr3 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// ENST00000617607 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:112041920:112081269:1 gene:ENSG00000176040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000019747 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:112034846:112115309:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0
NM_017699 // RefSeq // Homo sapiens SID1 transmembrane family, member 1 (SIDT1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006713680 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens SID1 transmembrane family, member 1 (SIDT1), transcript variant X9, mRNA. // chr3 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000264852 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:113532296:113629578:1 gene:ENSG00000072858 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000393830 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:113532983:113627742:1 gene:ENSG00000072858 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000463226 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:113602402:113627841:1 gene:ENSG00000072858 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0 /// AK295938 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52305 complete cds, highly similar to SID1 transmembrane family member 1 precursor. // chr3 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0 /// AK303385 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51429 complete cds, highly similar to SID1 transmembrane family member 1 precursor. // chr3 // 100 // 38 // 11 // 11 // 0 /// BC117222 // GenBank // Homo sapiens SID1 transmembrane family, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:150831 IMAGE:40125773), complete cds. // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// XM_006713675 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens SID1 transmembrane family, member 1 (SIDT1), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 90 // 90 // 26 // 29 // 1 /// GENSCAN00000020065 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:113601599:113628606:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 38 // 11 // 11 // 0
AF119886 // GenBank HTC // Homo sapiens PRO2591 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001130064 // RefSeq // Homo sapiens growth associated protein 43 (GAP43), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_002045 // RefSeq // Homo sapiens growth associated protein 43 (GAP43), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000305124 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:115623324:115721490:1 gene:ENSG00000172020 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000393780 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:3:115623510:115721490:1 gene:ENSG00000172020 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF279774 // GenBank // Homo sapiens clone N4 NTera2D1 teratocarcinoma mRNA. // chr3 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// AK123311 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ41317 fis, clone BRAMY2043345, highly similar to NEUROMODULIN. // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AK289699 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75013 complete cds. // chr3 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// AK290100 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78058 complete cds. // chr3 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC007936 // GenBank // Homo sapiens growth associated protein 43, mRNA (cDNA clone MGC:14099 IMAGE:4126520), complete cds. // chr3 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BT019771 // GenBank // Homo sapiens growth associated protein 43 mRNA, complete cds. // chr3 // 76 // 68 // 13 // 17 // 0 /// BT019810 // GenBank // Homo sapiens growth associated protein 43 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// M25667 // GenBank // Human neuronal growth protein 43 (GAP-43) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000039115 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:115666994:115720882:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
ENST00000470970 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:115837870:115838159:1 gene:ENSG00000243359 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT091308 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
ENST00000384162 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:117544205:117544311:1 gene:ENSG00000206889 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT091332 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_152539 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 30 (C3orf30), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000295622 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:119146150:119151455:1 gene:ENSG00000163424 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000473121 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:119146813:119151452:1 gene:ENSG00000163424 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000492792 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:119146987:119151313:1 gene:ENSG00000163424 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000494105 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:119146151:119160025:1 gene:ENSG00000163424 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 92 // 92 // 22 // 24 // 0 /// BC130475 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 30, mRNA (cDNA clone MGC:163347 IMAGE:40146506), complete cds. // chr3 // 92 // 92 // 22 // 24 // 0 /// BC144197 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 30, mRNA (cDNA clone MGC:177734 IMAGE:9052717), complete cds. // chr3 // 92 // 92 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000045462 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:119099286:119177854:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 92 // 46 // 11 // 12 // 0
NM_020754 // RefSeq // Homo sapiens Rho GTPase activating protein 31 (ARHGAP31), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000264245 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:119294373:119420714:1 gene:ENSG00000031081 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000482743 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:119324892:119383128:1 gene:ENSG00000031081 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// AK293726 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61628 complete cds, highly similar to Homo sapiens Cdc42 GTPase-activating protein (CDGAP), mRNA. // chr3 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC112163 // GenBank // Homo sapiens Cdc42 GTPase-activating protein, mRNA (cDNA clone MGC:138368 IMAGE:8327631), complete cds. // chr3 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC112165 // GenBank // Homo sapiens Cdc42 GTPase-activating protein, mRNA (cDNA clone MGC:138370 IMAGE:8327633), complete cds. // chr3 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000045465 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:119363569:119416264:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
ENST00000487309 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:120121909:120122206:1 gene:ENSG00000244139 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT091429 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENST00000383994 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:120210320:120210421:1 gene:ENSG00000206721 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT091432 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_005513 // RefSeq // Homo sapiens general transcription factor IIE, polypeptide 1, alpha 56kDa (GTF2E1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000283875 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:120742732:120783069:1 gene:ENSG00000153767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000497393 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:120742762:120751056:1 gene:ENSG00000153767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// BC005917 // GenBank // Homo sapiens general transcription factor IIE, polypeptide 1, alpha 56kDa, mRNA (cDNA clone IMAGE:4331839), complete cds. // chr3 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000469772 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:120742732:120776660:1 gene:ENSG00000153767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// GENSCAN00000046679 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:120750553:120781470:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0
NM_001012659 // RefSeq // Homo sapiens arginine-fifty homeobox (ARGFX), mRNA. // chr3 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000334384 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:121570704:121586634:1 gene:ENSG00000186103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000014962 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:121570714:121626910:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 68 // 68 // 15 // 22 // 1
NONHSAT091473 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_016298 // RefSeq // Homo sapiens F-box protein 40 (FBXO40), mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000338040 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:121593119:121630295:1 gene:ENSG00000163833 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AB033021 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1195 protein, partial cds. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF204674 // GenBank // Homo sapiens muscle disease-related protein mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// BC109275 // GenBank // Homo sapiens F-box protein 40, mRNA (cDNA clone MGC:129902 IMAGE:40028315), complete cds. // chr3 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC109276 // GenBank // Homo sapiens F-box protein 40, mRNA (cDNA clone MGC:129903 IMAGE:40028318), complete cds. // chr3 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000014962 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:121570714:121626910:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0
NM_018456 // RefSeq // Homo sapiens ELL associated factor 2 (EAF2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_005247618 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ELL associated factor 2 (EAF2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000273668 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:121835215:121886526:1 gene:ENSG00000145088 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000451944 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:121835237:121873163:1 gene:ENSG00000145088 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000490434 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:121835183:121886468:1 gene:ENSG00000145088 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000490477 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:121835277:121857156:1 gene:ENSG00000145088 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// AF517829 // GenBank // Homo sapiens EAF2 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// AK301560 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60185 complete cds, highly similar to ELL-associated factor 2. // chr3 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// AY049020 // GenBank // Homo sapiens testosterone regulated apoptosis inducer and tumor suppressor (TRAITS) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC014209 // GenBank // Homo sapiens ELL associated factor 2, mRNA (cDNA clone MGC:20630 IMAGE:4765823), complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000014969 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:121848161:121886388:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0
NM_000388 // RefSeq // Homo sapiens calcium-sensing receptor (CASR), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NM_001178065 // RefSeq // Homo sapiens calcium-sensing receptor (CASR), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_005247836 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens calcium-sensing receptor (CASR), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000498619 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:122184334:122286503:1 gene:ENSG00000036828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC104999 // GenBank // Homo sapiens calcium-sensing receptor, mRNA (cDNA clone MGC:132659 IMAGE:8144002), complete cds. // chr3 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// BC112236 // GenBank // Homo sapiens calcium-sensing receptor, mRNA (cDNA clone MGC:138441 IMAGE:8327704), complete cds. // chr3 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// U20760 // GenBank // Human extracellular calcium-sensing receptor mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// ENST00000490131 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:122183683:122285365:1 gene:ENSG00000036828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// D50855 // GenBank // Homo sapiens mRNA for Ca-sensing receptor, complete cds. // chr3 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// U20759 // GenBank // Human parathyroid cell calcium-sensing receptor mRNA, complete cds. // chr3 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// GENSCAN00000014965 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:122254190:122285191:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
NM_005213 // RefSeq // Homo sapiens cystatin A (stefin A) (CSTA), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000264474 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:122325244:122341972:1 gene:ENSG00000121552 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AK291308 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76406 complete cds, highly similar to Homo sapiens cystatin A (stefin A) (CSTA), mRNA. // chr3 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// BC010379 // GenBank // Homo sapiens cystatin A (stefin A), mRNA (cDNA clone MGC:13552 IMAGE:4063525), complete cds. // chr3 // 90 // 71 // 18 // 20 // 0 /// CR456914 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834F1015D for gene CSTA, cystatin A (stefin A); complete cds, incl. stopcodon. // chr3 // 83 // 43 // 10 // 12 // 0 /// ENST00000479204 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:122325262:122338270:1 gene:ENSG00000121552 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1 /// GENSCAN00000014966 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:122286960:122341567:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_138287 // RefSeq // Homo sapiens deltex 3 like, E3 ubiquitin ligase (DTX3L), mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000296161 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:122564238:122575203:1 gene:ENSG00000163840 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000383661 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:3:122564427:122571747:1 gene:ENSG00000163840 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// AF484416 // GenBank // Homo sapiens rhysin 2 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// AY225123 // GenBank // Homo sapiens B-lymphoma and BAL associated protein (BBAP) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AY780792 // GenBank // Homo sapiens rhysin 2 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr3 // 90 // 31 // 9 // 10 // 0 /// BC042191 // GenBank // Homo sapiens deltex 3-like (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:47846 IMAGE:4339554), complete cds. // chr3 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// BC060509 // GenBank // Homo sapiens deltex 3-like (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:62133 IMAGE:6457163), complete cds. // chr3 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// BX648267 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686N20115 (from clone DKFZp686N20115). // chr3 // 95 // 69 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000002709 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:122566017:122571747:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0
ENST00000460683 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:122692423:122730840:1 gene:ENSG00000173193 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// AK026003 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ22350 fis, clone HRC06313. // chr3 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// AK098816 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ25950 fis, clone SYN00129. // chr3 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0 /// BX648758 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686O21109 (from clone DKFZp686O21109). // chr3 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// DQ063584 // GenBank // Homo sapiens B-aggressive lymphoma 2B (BAL2B) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// DQ063585 // GenBank // Homo sapiens B-aggressive lymphoma 2A (BAL2A) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// NM_017554 // RefSeq // Homo sapiens poly (ADP-ribose) polymerase family, member 14 (PARP14), mRNA. // chr3 // 94 // 94 // 31 // 33 // 1 /// ENST00000474629 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:122680618:122730840:1 gene:ENSG00000173193 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 94 // 94 // 31 // 33 // 1 /// ENST00000474669 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:122700526:122722647:1 gene:ENSG00000173193 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// AB033094 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1268 protein, partial cds. // chr3 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// GENSCAN00000002700 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:122680884:122728597:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0
NONHSAT091506 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_032839 // RefSeq // Homo sapiens disrupted in renal carcinoma 2 (DIRC2), mRNA. // chr3 // 97 // 94 // 28 // 29 // 0 /// ENST00000261038 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:122794795:122881139:1 gene:ENSG00000138463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000477647 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:122795084:122879748:1 gene:ENSG00000138463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 96 // 84 // 25 // 26 // 0 /// AK075158 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ90677 fis, clone PLACE1005725. // chr3 // 97 // 94 // 28 // 29 // 0 /// AK291176 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77986 complete cds, highly similar to Homo sapiens disrupted in renal carcinoma 2, mRNA. // chr3 // 96 // 84 // 25 // 26 // 0 /// BC022204 // GenBank HTC // Homo sapiens disrupted in renal carcinoma 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:3630049). // chr3 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// BC033738 // GenBank // Homo sapiens disrupted in renal carcinoma 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:5179427), complete cds. // chr3 // 96 // 81 // 24 // 25 // 0 /// BC039821 // GenBank // Homo sapiens disrupted in renal carcinoma 2, mRNA (cDNA clone MGC:48709 IMAGE:6062886), complete cds. // chr3 // 97 // 94 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000002713 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:122795193:122891331:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0
ENST00000384275 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:123814077:123814207:1 gene:ENSG00000207002 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT091548 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0
ENST00000493631 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:125310881:125311350:1 gene:ENSG00000229048 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF090907 // GenBank // Homo sapiens clone HQ0245 PRO0245 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT091590 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT147249 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONHSAT091594 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000364930 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:125516979:125517086:1 gene:ENSG00000201800 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT091595 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000509527 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:125703349:125704312:1 gene:ENSG00000234458 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000035958 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR3_4_CTG2_1:125676013:125712501:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 93 // 100 // 13 // 14 // 0 /// GENSCAN00000048529 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:125676013:125712501:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 93 // 100 // 13 // 14 // 0
ENST00000508347 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:125724539:125725445:1 gene:ENSG00000228963 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000035957 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR3_4_CTG2_1:125724642:125734655:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 88 // 80 // 14 // 16 // 0 /// GENSCAN00000048538 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:125724642:125734655:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 88 // 80 // 14 // 16 // 0
ENST00000466578 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:125747084:125748098:1 gene:ENSG00000179170 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000035960 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR3_4_CTG2_1:125747237:125747887:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000048543 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:125747237:125747887:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_182628 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 37 (CCDC37), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// XM_005247431 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens coiled-coil domain containing 37 (CCDC37), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000352312 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:126394939:126436555:1 gene:ENSG00000163885 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000505024 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:126395972:126436530:1 gene:ENSG00000163885 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 95 // 95 // 36 // 38 // 0 /// ENST00000506204 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:126433380:126436556:1 gene:ENSG00000163885 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 25 // 10 // 10 // 0 /// BC101366 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 37, mRNA (cDNA clone MGC:120557 IMAGE:40025823), complete cds. // chr3 // 95 // 95 // 36 // 38 // 0 /// BC101367 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 37, mRNA (cDNA clone MGC:120558 IMAGE:40025824), complete cds. // chr3 // 95 // 95 // 36 // 38 // 0 /// BC101368 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 37, mRNA (cDNA clone MGC:120559 IMAGE:40025828), complete cds. // chr3 // 95 // 95 // 36 // 38 // 0 /// BC101369 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 37, mRNA (cDNA clone MGC:120560 IMAGE:40025829), complete cds. // chr3 // 95 // 95 // 36 // 38 // 0 /// ENST00000510833 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:126395397:126414343:1 gene:ENSG00000163885 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1 /// GENSCAN00000048536 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:126396001:126447172:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 97 // 83 // 32 // 33 // 0
NM_152889 // RefSeq // Homo sapiens carbohydrate (chondroitin 4) sulfotransferase 13 (CHST13), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000319340 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:126524283:126543291:1 gene:ENSG00000180767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AY120869 // GenBank // Homo sapiens chondroitin-4-O-sulfotransferase-3 mRNA, complete cds. // chr3 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// BC103895 // GenBank // Homo sapiens carbohydrate (chondroitin 4) sulfotransferase 13, mRNA (cDNA clone MGC:119278 IMAGE:40005100), complete cds. // chr3 // 90 // 97 // 28 // 31 // 0 /// BC103896 // GenBank // Homo sapiens carbohydrate (chondroitin 4) sulfotransferase 13, mRNA (cDNA clone MGC:119279 IMAGE:40005101), complete cds. // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC103897 // GenBank // Homo sapiens carbohydrate (chondroitin 4) sulfotransferase 13, mRNA (cDNA clone MGC:119281 IMAGE:40005103), complete cds. // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000615522 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:126524333:126542879:1 gene:ENSG00000180767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000048532 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:126524333:126542578:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0
NR_034158 // RefSeq // Homo sapiens nucleoporin 210kDa pseudogene 1 (NUP210P1), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000357061 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:126662081:126671939:1 gene:ENSG00000198284 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000514993 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:126662146:126667326:1 gene:ENSG00000198284 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 85 // 59 // 11 // 13 // 0 /// BC042038 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 46, mRNA (cDNA clone IMAGE:4828419), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000504322 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:126660609:126667348:1 gene:ENSG00000198284 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr3 // 64 // 64 // 14 // 22 // 1 /// NONHSAT091698 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 85 // 59 // 11 // 13 // 0 /// GENSCAN00000009788 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:126660642:126667957:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 50 // 50 // 11 // 22 // 1
NM_032242 // RefSeq // Homo sapiens plexin A1 (PLXNA1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000393409 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:126988594:127037392:1 gene:ENSG00000114554 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AK293425 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57256 complete cds, highly similar to Plexin-A1 precursor. // chr3 // 100 // 37 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000503234 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:127026385:127035579:1 gene:ENSG00000114554 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 29 // 29 // 11 // 38 // 1 /// AK126101 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44113 fis, clone TESTI4046487, highly similar to Mus musculus plexin A1 (Plxna1). // chr3 // 29 // 29 // 11 // 38 // 1 /// GENSCAN00000009772 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:126983119:127034017:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0
NM_001007534 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 56 (C3orf56), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000398112 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:127193131:127198185:1 gene:ENSG00000214324 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC137154 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 56, mRNA (cDNA clone MGC:168774 IMAGE:9021151), complete cds. // chr3 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// BC137155 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 56, mRNA (cDNA clone MGC:168775 IMAGE:9021152), complete cds. // chr3 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000009761 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:127183626:127197961:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
NM_015720 // RefSeq // Homo sapiens podocalyxin-like 2 (PODXL2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000342480 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:127629181:127672809:1 gene:ENSG00000114631 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF219137 // GenBank // Homo sapiens endoglycan mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AY359096 // GenBank // Homo sapiens clone DNA92243 podocalyxin-like protein (UNQ1861) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC052585 // GenBank // Homo sapiens podocalyxin-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:59786 IMAGE:6264322), complete cds. // chr3 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC019330 // GenBank // Homo sapiens podocalyxin-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:851 IMAGE:3502164), complete cds. // chr3 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// GENSCAN00000036235 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:127629220:127680475:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
NM_207335 // RefSeq // Homo sapiens kelch repeat and BTB (POZ) domain containing 12 (KBTBD12), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000343941 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:127923413:127987662:1 gene:ENSG00000187715 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000405109 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:127915232:127987666:1 gene:ENSG00000187715 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000405256 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:127923059:127987671:1 gene:ENSG00000187715 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000407609 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:127915475:127987666:1 gene:ENSG00000187715 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000476626 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:127915475:127984337:1 gene:ENSG00000187715 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 50 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000492025 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:127924081:127984298:1 gene:ENSG00000187715 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 67 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000036217 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:127923062:127984278:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 83 // 83 // 15 // 18 // 1
ENST00000364340 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:127963608:127963724:1 gene:ENSG00000201210 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT091745 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_013336 // RefSeq // Homo sapiens Sec61 alpha 1 subunit (S. cerevisiae) (SEC61A1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000243253 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:128052369:128071682:1 gene:ENSG00000058262 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000424880 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:128052759:128071677:1 gene:ENSG00000058262 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000464451 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:128051641:128069839:1 gene:ENSG00000058262 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 66 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000481210 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:128052426:128060211:1 gene:ENSG00000058262 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 21 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000483956 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:128064899:128071683:1 gene:ENSG00000058262 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 61 // 23 // 23 // 0 /// AF084458 // GenBank // Homo sapiens sec61 homolog mRNA, complete cds. // chr3 // 97 // 97 // 36 // 37 // 0 /// AF346602 // GenBank // Homo sapiens Sec61 alpha form 1 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// AK299118 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59739 complete cds, highly similar to Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1. // chr3 // 100 // 66 // 25 // 25 // 0 /// AL831940 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp313F1012 (from clone DKFZp313F1012). // chr3 // 96 // 61 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000036219 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:128047209:128069662:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 63 // 24 // 24 // 0
NM_021937 // RefSeq // Homo sapiens eukaryotic elongation factor, selenocysteine-tRNA-specific (EEFSEC), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006713723 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens eukaryotic elongation factor, selenocysteine-tRNA-specific (EEFSEC), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000254730 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:128153454:128408646:1 gene:ENSG00000132394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000483457 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:128153501:128408642:1 gene:ENSG00000132394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// BC007933 // GenBank // Homo sapiens eukaryotic elongation factor, selenocysteine-tRNA-specific, mRNA (cDNA clone MGC:14173 IMAGE:4120858), complete cds. // chr3 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000036220 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:128200595:128269417:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
ENST00000480095 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:128785147:128785448:1 gene:ENSG00000244232 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT091784 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_024768 // RefSeq // Homo sapiens EF-hand and coiled-coil domain containing 1 (EFCC1), mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000436022 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:3:129001629:129040742:1 gene:ENSG00000114654 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000481536 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:129030449:129040740:1 gene:ENSG00000114654 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK022119 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ12057 fis, clone HEMBB1002068. // chr3 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// BC093800 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 48, mRNA (cDNA clone MGC:120835 IMAGE:7939645), complete cds. // chr3 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// BC112195 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 48, mRNA (cDNA clone MGC:138400 IMAGE:8327663), complete cds. // chr3 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// BX649124 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686B0148 (from clone DKFZp686B0148). // chr3 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// GENSCAN00000001487 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:129001629:129062273:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1
NM_000174 // RefSeq // Homo sapiens glycoprotein IX (platelet) (GP9), mRNA. // chr3 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000307395 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:129060767:129062406:1 gene:ENSG00000169704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC030229 // GenBank // Homo sapiens glycoprotein IX (platelet), mRNA (cDNA clone MGC:34594 IMAGE:5226377), complete cds. // chr3 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// X52997 // GenBank // Human mRNA for platelet glycoprotein IX. // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000001487 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:129001629:129062273:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NM_016128 // RefSeq // Homo sapiens coatomer protein complex, subunit gamma 1 (COPG1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000314797 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:129249606:129277773:1 gene:ENSG00000181789 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000515725 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:129249632:129277771:1 gene:ENSG00000181789 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB047846 // GenBank // Homo sapiens mRNA for gamma1-COP, complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// AF100756 // GenBank // Homo sapiens coat protein gamma-cop mRNA, complete cds. // chr3 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// AK291693 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77708 complete cds, highly similar to Homo sapiens coatomer protein complex, subunit gamma (COPG), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC066650 // GenBank // Homo sapiens coatomer protein complex, subunit gamma, mRNA (cDNA clone MGC:70562 IMAGE:6046736), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000001483 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:129183537:129304825:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0
NR_026991 // RefSeq // Homo sapiens H1FX antisense RNA 1 (H1FX-AS1), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000383461 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:129318106:129326225:1 gene:ENSG00000206417 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000502789 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:129318236:129324569:1 gene:ENSG00000206417 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr3 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// AK091470 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ34151 fis, clone FCBBF3012842. // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONHSAT092022 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONHSAT092025 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONHSAT092027 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONHSAT092028 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr3 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT147252 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONHSAT092023 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr3 // 69 // 69 // 11 // 16 // 1 /// NONHSAT092024 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr3 // 69 // 69 // 11 // 16 // 1 /// NONHSAT092026 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr3 // 69 // 69 // 11 // 16 // 1 /// NONHSAT147251 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr3 // 69 // 69 // 11 // 16 // 1
NM_000539 // RefSeq // Homo sapiens rhodopsin (RHO), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000296271 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:129528640:129535169:1 gene:ENSG00000163914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC112104 // GenBank // Homo sapiens rhodopsin, mRNA (cDNA clone MGC:138309 IMAGE:8327572), complete cds. // chr3 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC112106 // GenBank // Homo sapiens rhodopsin, mRNA (cDNA clone MGC:138311 IMAGE:8327574), complete cds. // chr3 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BX537381 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686B2082 (from clone DKFZp686B2082); complete cds. // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000001494 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:129528734:129533718:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_153833 // RefSeq // Homo sapiens H1 histone family, member O, oocyte-specific (H1FOO), mRNA. // chr3 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// XM_005247123 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens H1 histone family, member O, oocyte-specific (H1FOO), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000324382 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:129543214:129551361:1 gene:ENSG00000178804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000503977 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:3:129548386:129551467:1 gene:ENSG00000178804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// AY158091 // GenBank // Homo sapiens oocyte-specific histone H1 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC047943 // GenBank // Homo sapiens H1 histone family, member O, oocyte-specific, mRNA (cDNA clone MGC:50807 IMAGE:5742122), complete cds. // chr3 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000012658 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:129543219:129551340:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
ENST00000365542 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:129818932:129819033:1 gene:ENSG00000202412 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT092070 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
ENST00000516977 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:129819777:129819876:1 gene:ENSG00000252786 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT092071 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_007117 // RefSeq // Homo sapiens thyrotropin-releasing hormone (TRH), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000302649 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:129974305:129977938:1 gene:ENSG00000170893 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000507066 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:129974688:129977935:1 gene:ENSG00000170893 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC069375 // GenBank // Homo sapiens thyrotropin-releasing hormone, mRNA (cDNA clone MGC:97018 IMAGE:7262227), complete cds. // chr3 // 89 // 69 // 16 // 18 // 0 /// BC074888 // GenBank // Homo sapiens thyrotropin-releasing hormone, mRNA (cDNA clone MGC:103862 IMAGE:30915244), complete cds. // chr3 // 87 // 58 // 13 // 15 // 0 /// BC074889 // GenBank // Homo sapiens thyrotropin-releasing hormone, mRNA (cDNA clone MGC:104031 IMAGE:30915475), complete cds. // chr3 // 87 // 58 // 13 // 15 // 0 /// BC110515 // GenBank // Homo sapiens thyrotropin-releasing hormone, mRNA (cDNA clone MGC:125964 IMAGE:40031770), complete cds. // chr3 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// BC110516 // GenBank // Homo sapiens thyrotropin-releasing hormone, mRNA (cDNA clone MGC:125965 IMAGE:40031772), complete cds. // chr3 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000012666 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:129894424:129977216:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
AY358247 // GenBank // Homo sapiens clone DNA165325 ARVP6125 (UNQ6125) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001278298 // RefSeq // Homo sapiens collagen, type VI, alpha 5 (COL6A5), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NR_022012 // RefSeq // Homo sapiens collagen, type VI, alpha 5 (COL6A5), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000265379 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:130345516:130484844:1 gene:ENSG00000172752 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000312481 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:130345516:130484844:1 gene:ENSG00000172752 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000373157 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:130440510:130484156:1 gene:ENSG00000172752 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000512482 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:130443484:130477338:1 gene:ENSG00000172752 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// EU085556 // GenBank // Homo sapiens collagen XXIX alpha 1 (COL29A1) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_153264 // RefSeq // Homo sapiens collagen, type VI, alpha 5 (COL6A5), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// ENST00000512836 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:130431463:130484844:1 gene:ENSG00000172752 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// GENSCAN00000012660 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:130244298:130471997:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1
NM_001102608 // RefSeq // Homo sapiens collagen, type VI, alpha 6 (COL6A6), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000358511 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:130560334:130678155:1 gene:ENSG00000206384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000031115 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:130563068:130671474:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0
NR_002949 // RefSeq // Homo sapiens nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 16 pseudogene 1 (NUDT16P1), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr3 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NR_027766 // RefSeq // Homo sapiens nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 16 pseudogene 1 (NUDT16P1), transcript variant 1, non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000498923 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:131361912:131364531:1 gene:ENSG00000246082 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000499077 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:131361898:131365122:1 gene:ENSG00000246082 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000513809 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:131361930:131363564:1 gene:ENSG00000246082 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:unitary_pseudogene // chr3 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// AK297126 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53804 complete cds, highly similar to Nucleoside diphosphate-linked moiety X motif 16 (EC 3.6.1.-). // chr3 // 86 // 52 // 12 // 14 // 0 /// TCONS_l2_00018864-XLOC_l2_009889 // Broad TUCP // linc-NUDT16 chr3:+:131080776-131082229 // chr3 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// TCONS_l2_00018865-XLOC_l2_009889 // Broad TUCP // linc-NUDT16 chr3:+:131080923-131089110 // chr3 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// TCONS_l2_00019887-XLOC_l2_009889 // Broad TUCP // linc-NUDT16 chr3:+:131080688-131083965 // chr3 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
NM_015268 // RefSeq // Homo sapiens DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 13 (DNAJC13), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 61 // 61 // 0 /// ENST00000260818 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:132417526:132539032:1 gene:ENSG00000138246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 61 // 61 // 0 /// ENST00000486798 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:132417709:132467346:1 gene:ENSG00000138246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 34 // 21 // 21 // 0 /// AY779857 // GenBank // Homo sapiens DnaJ domain-containing protein RME-8 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 61 // 61 // 0 /// BC043583 // GenBank // Homo sapiens DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 13, mRNA (cDNA clone IMAGE:5229049), partial cds. // chr3 // 100 // 34 // 21 // 21 // 0 /// BC151246 // GenBank // Homo sapiens DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 13, mRNA (cDNA clone MGC:167856 IMAGE:9007477), complete cds. // chr3 // 98 // 100 // 60 // 61 // 0 /// GENSCAN00000033968 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:132424136:132528332:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 70 // 43 // 43 // 0
NM_178445 // RefSeq // Homo sapiens atypical chemokine receptor 4 (ACKR4), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 83 // 10 // 10 // 0
NM_003571 // RefSeq // Homo sapiens beaded filament structural protein 2, phakinin (BFSP2), mRNA. // chr3 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// ENST00000302334 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:133399995:133475193:1 gene:ENSG00000170819 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// ENST00000510039 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:133450423:133475222:1 gene:ENSG00000170819 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000511434 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:133449066:133472515:1 gene:ENSG00000170819 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 89 // 30 // 8 // 9 // 0 /// BC113518 // GenBank // Homo sapiens beaded filament structural protein 2, phakinin, mRNA (cDNA clone MGC:142078 IMAGE:8322570), complete cds. // chr3 // 88 // 87 // 23 // 26 // 0 /// BC113520 // GenBank // Homo sapiens beaded filament structural protein 2, phakinin, mRNA (cDNA clone MGC:142080 IMAGE:8322572), complete cds. // chr3 // 88 // 87 // 23 // 26 // 0 /// U48224 // GenBank // Human beaded filament protein CP49 (LIFL-L) mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 77 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000013101 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:133409955:133472569:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
ENST00000364957 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:133551186:133551315:1 gene:ENSG00000201827 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT092190 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000516832 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:133664926:133665034:1 gene:ENSG00000252641 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT092195 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT147256 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_001063 // RefSeq // Homo sapiens transferrin (TF), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000402696 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:133745956:133779006:1 gene:ENSG00000091513 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000461695 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:133766278:133778782:1 gene:ENSG00000091513 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 41 // 9 // 9 // 0 /// AK295334 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54029 complete cds, highly similar to Serotransferrin precursor. // chr3 // 95 // 95 // 20 // 21 // 0 /// AK295419 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54111 complete cds, highly similar to Serotransferrin precursor. // chr3 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// AK303753 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53691 complete cds, highly similar to Serotransferrin precursor. // chr3 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// BC059367 // GenBank // Homo sapiens transferrin, mRNA (cDNA clone MGC:71545 IMAGE:5264299), complete cds. // chr3 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// DQ923758 // GenBank // Homo sapiens transferrin (TF) mRNA, complete cds. // chr3 // 90 // 95 // 19 // 21 // 0 /// M12530 // GenBank // Human transferrin mRNA, complete cds. // chr3 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// S95936 // GenBank // transferrin [human, liver, mRNA, 2347 nt]. // chr3 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000027561 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:133746441:133819766:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// AF118063 // GenBank HTC // Homo sapiens PRO1400 mRNA, complete cds. // chr3 // 94 // 82 // 17 // 18 // 0
NM_004189 // RefSeq // Homo sapiens SRY (sex determining region Y)-box 14 (SOX14), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000306087 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:137764284:137766338:1 gene:ENSG00000168875 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC106729 // GenBank // Homo sapiens SRY (sex determining region Y)-box 14, mRNA (cDNA clone MGC:119898 IMAGE:40015392), complete cds. // chr3 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// BC106730 // GenBank // Homo sapiens SRY (sex determining region Y)-box 14, mRNA (cDNA clone MGC:119899 IMAGE:40015393), complete cds. // chr3 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000003411 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:137764785:137765507:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0
NM_031913 // RefSeq // Homo sapiens extended synaptotagmin-like protein 3 (ESYT3), mRNA. // chr3 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000289135 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:138434625:138462473:1 gene:ENSG00000158220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000389567 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:138434613:138478414:1 gene:ENSG00000158220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000486831 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:138434586:138477060:1 gene:ENSG00000158220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000490835 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:138434616:138472833:1 gene:ENSG00000158220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// AK125080 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ43090 fis, clone COLON2001721. // chr3 // 93 // 82 // 25 // 27 // 0 /// AK289530 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76329 complete cds. // chr3 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// BC037292 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 62 (C2 domain containing), member C, mRNA (cDNA clone MGC:33352 IMAGE:4837811), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// DQ993202 // GenBank // Homo sapiens extended-synaptotagmin 3 (ESYT3) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000003426 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:138450953:138479074:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0
NR_026783 // RefSeq // Homo sapiens blepharophimosis, epicanthus inversus and ptosis, candidate 1 (non-protein coding) (BPESC1), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000418282 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:139104185:139125171:1 gene:ENSG00000232416 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF196865 // GenBank // Homo sapiens blepharophimosis, epicanthus inversus and ptosis, candidate 1 (BPESC1) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONHSAT092348 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
ENST00000516436 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:139388277:139388364:1 gene:ENSG00000252245 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT092357 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000415794 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:139493809:139494937:1 gene:ENSG00000178631 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0
NM_022131 // RefSeq // Homo sapiens calsyntenin 2 (CLSTN2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000458420 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:139935185:140577397:1 gene:ENSG00000158258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000511524 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:139935187:140557055:1 gene:ENSG00000158258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 63 // 25 // 25 // 0 /// AK096432 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39113 fis, clone NTONG2005897, highly similar to Calsyntenin-2 precursor. // chr3 // 100 // 63 // 25 // 25 // 0 /// AY753303 // GenBank // Homo sapiens alcadein gamma mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// BC103496 // GenBank // Homo sapiens calsyntenin 2, mRNA (cDNA clone MGC:119559 IMAGE:40008317), complete cds. // chr3 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// BC103506 // GenBank // Homo sapiens calsyntenin 2, mRNA (cDNA clone MGC:119561 IMAGE:40008319), complete cds. // chr3 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// BC104485 // GenBank // Homo sapiens calsyntenin 2, mRNA (cDNA clone MGC:119560 IMAGE:40008318), complete cds. // chr3 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000620185 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:140403582:140568077:1 gene:ENSG00000158258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000001271 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:140509692:140566253:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 55 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000019146 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:140402074:140488746:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 33 // 13 // 13 // 0
NM_152616 // RefSeq // Homo sapiens tripartite motif containing 42 (TRIM42), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000286349 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:140678039:140701150:1 gene:ENSG00000155890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AF521868 // GenBank // Homo sapiens tripartite motif protein 42 (TRIM42) mRNA, complete cds. // chr3 // 97 // 83 // 28 // 29 // 0 /// AK310536 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17578. // chr3 // 97 // 83 // 28 // 29 // 0 /// BC130472 // GenBank // Homo sapiens tripartite motif-containing 42, mRNA (cDNA clone MGC:163344 IMAGE:40146503), complete cds. // chr3 // 97 // 83 // 28 // 29 // 0 /// BC130474 // GenBank // Homo sapiens tripartite motif-containing 42, mRNA (cDNA clone MGC:163346 IMAGE:40146505), complete cds. // chr3 // 97 // 83 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000001268 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:140588079:140700974:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 66 // 23 // 23 // 0
ENST00000484754 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:140902194:140902651:1 gene:ENSG00000224085 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONHSAT092406 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_080862 // RefSeq // Homo sapiens splA/ryanodine receptor domain and SOCS box containing 4 (SPSB4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000310546 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:141051402:141148611:1 gene:ENSG00000175093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000508126 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:141066638:141148610:1 gene:ENSG00000175093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// AF403029 // GenBank // Homo sapiens SPRY domain-containing SOCS box protein SSB-4 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK056147 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ31585 fis, clone NT2RI2002179. // chr3 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// BC008324 // GenBank // Homo sapiens splA/ryanodine receptor domain and SOCS box containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:15766 IMAGE:3501702), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000507895 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:141077446:141147460:1 gene:ENSG00000175093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000001273 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:141066105:141147269:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// NONHSAT092413 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001080412 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger and BTB domain containing 38 (ZBTB38), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_005247258 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens zinc finger and BTB domain containing 38 (ZBTB38), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000321464 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:141442389:141445976:1 gene:ENSG00000177311 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000441582 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:141426116:141446000:1 gene:ENSG00000177311 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000509883 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:141387647:141444701:1 gene:ENSG00000177311 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000514251 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:141387812:141449792:1 gene:ENSG00000177311 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK092355 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ35036 fis, clone OCBBF2016690, weakly similar to ZINC FINGER PROTEIN CLONE 647. // chr3 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// AK302568 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56473 complete cds, highly similar to Zinc finger and BTB domain-containing protein 38. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK307452 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ97400. // chr3 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000001269 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:141402405:141445976:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001080412 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger and BTB domain containing 38 (ZBTB38), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_005247258 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens zinc finger and BTB domain containing 38 (ZBTB38), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000514251 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:141387812:141449792:1 gene:ENSG00000177311 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_006506 // RefSeq // Homo sapiens RAS p21 protein activator 2 (RASA2), mRNA. // chr3 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// ENST00000286364 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:141487049:141615342:1 gene:ENSG00000155903 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000452898 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:141487084:141612313:1 gene:ENSG00000155903 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF115573 // GenBank // Homo sapiens GTPase-activating protein GAP1m mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// AK292016 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76675 complete cds, highly similar to Homo sapiens RAS p21 protein activator 2 (RASA2), mRNA. // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AK301015 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60904 complete cds, highly similar to Ras GTPase-activating protein 2. // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// D78155 // GenBank // Homo sapiens mRNA for rasGTPase activating protein, complete cds. // chr3 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// D82880 // GenBank // Homo sapiens brain mRNA for Homo sapiens ras GTPase-activating protein,Gap1m, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000509118 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:141578713:141609974:1 gene:ENSG00000155903 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000041670 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:141512204:141660387:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_139209 // RefSeq // Homo sapiens G protein-coupled receptor kinase 7 (GRK7), mRNA. // chr3 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000264952 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:141778148:141818490:1 gene:ENSG00000114124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF282269 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor kinase 7 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AF439409 // GenBank // Homo sapiens G-protein-coupled receptor kinase 7 (GRK7) mRNA, GRK7-S allele, complete cds. // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000041676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:141778285:141860958:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
NM_001679 // RefSeq // Homo sapiens ATPase, Na+/K+ transporting, beta 3 polypeptide (ATP1B3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000286371 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:141876614:141926484:1 gene:ENSG00000069849 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000465172 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:141876616:141926514:1 gene:ENSG00000069849 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000466678 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:141876806:141926481:1 gene:ENSG00000069849 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0 /// AK293697 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50753 complete cds, highly similar to Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3. // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC011835 // GenBank // Homo sapiens ATPase, Na+/K+ transporting, beta 3 polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:20152 IMAGE:3944210), complete cds. // chr3 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0 /// U51478 // GenBank // Human sodium/potassium-transporting ATPase beta-3 subunit mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0 /// GENSCAN00000041665 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:141876802:141925701:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0
ENST00000383877 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:142145454:142145555:1 gene:ENSG00000206604 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT092464 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000362449 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:142673597:142673904:1 gene:ENSG00000199319 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 73 // 100 // 19 // 26 // 0 /// NONHSAT092479 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr3 // 73 // 100 // 19 // 26 // 0
NM_004267 // RefSeq // Homo sapiens carbohydrate (N-acetylglucosamine-6-O) sulfotransferase 2 (CHST2), mRNA. // chr3 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000309575 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:143119331:143122958:1 gene:ENSG00000175040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// AB014679 // GenBank // Homo sapiens GN6ST mRNA for N-acetylglucosamine-6-O-sulfotransferase (GlcNAc6ST), complete cds. // chr3 // 100 // 76 // 31 // 31 // 0 /// AB014680 // GenBank // Homo sapiens GN6ST mRNA for long form of N-acetylglucosamine-6-O-sulfotransferase (GlcNAc6ST), complete cds. // chr3 // 100 // 76 // 31 // 31 // 0 /// AB021124 // GenBank // Homo sapiens mRNA for N-acetylglucosamine 6-O-sulfotransferase, complete cds. // chr3 // 95 // 100 // 39 // 41 // 0 /// AF083066 // GenBank // Homo sapiens carbohydrate sulfotransferase 2 (CHST2) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 71 // 29 // 29 // 0 /// BC105010 // GenBank // Homo sapiens carbohydrate (N-acetylglucosamine-6-O) sulfotransferase 2, mRNA (cDNA clone MGC:132670 IMAGE:8144013), complete cds. // chr3 // 96 // 63 // 25 // 26 // 0 /// BC105012 // GenBank // Homo sapiens carbohydrate (N-acetylglucosamine-6-O) sulfotransferase 2, mRNA (cDNA clone MGC:132672 IMAGE:8144015), complete cds. // chr3 // 96 // 63 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000016900 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:143114389:143122409:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 97 // 73 // 29 // 30 // 0
NM_001134470 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 58 (C3orf58), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NM_173552 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 58 (C3orf58), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000315691 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:143971798:143992359:1 gene:ENSG00000181744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000441925 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:143973608:143992367:1 gene:ENSG00000181744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000492452 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:143973090:143989769:1 gene:ENSG00000181744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 90 // 38 // 9 // 10 // 0 /// ENST00000495414 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:3:143973081:143990599:1 gene:ENSG00000181744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// AK095400 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ38081 fis, clone CTONG2016217. // chr3 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// AK294020 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55179 complete cds. // chr3 // 92 // 50 // 12 // 13 // 0 /// BC037293 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 58, mRNA (cDNA clone MGC:33365 IMAGE:5267770), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000002291 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:143985600:144039498:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
AF132204 // GenBank HTC // Homo sapiens PRO2259 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
AF116706 // GenBank HTC // Homo sapiens PRO2533 mRNA, complete cds. // chr3 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_003412 // RefSeq // Homo sapiens Zic family member 1 (ZIC1), mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000282928 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:147409384:147416719:1 gene:ENSG00000152977 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC104848 // GenBank // Homo sapiens Zic family member 1 (odd-paired homolog, Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:132508 IMAGE:8143851), complete cds. // chr3 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// BC104850 // GenBank // Homo sapiens Zic family member 1 (odd-paired homolog, Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:132510 IMAGE:8143853), complete cds. // chr3 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000000782 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:147410113:147414740:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// D76435 // GenBank // Homo sapiens mRNA for Zic protein, complete cds. // chr3 // 95 // 70 // 20 // 21 // 0
NM_001870 // RefSeq // Homo sapiens carboxypeptidase A3 (mast cell) (CPA3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000296046 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:148865256:148897196:1 gene:ENSG00000163751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000477926 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:148881469:148896522:1 gene:ENSG00000163751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 33 // 8 // 8 // 0 /// BC012613 // GenBank // Homo sapiens carboxypeptidase A3 (mast cell), mRNA (cDNA clone MGC:13637 IMAGE:4104766), complete cds. // chr3 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 /// M27717 // GenBank // Human mast cell carboxypeptidase A mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000033946 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:148865308:148896707:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0
NM_004617 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane 4 L six family member 4 (TM4SF4), mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000305354 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:149473974:149503281:1 gene:ENSG00000169903 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000463068 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:149475784:149498911:1 gene:ENSG00000169903 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// AK055577 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ31015 fis, clone HLUNG2000281, highly similar to Transmembrane 4 L6 family member 4. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC001386 // GenBank // Homo sapiens transmembrane 4 L six family member 4, mRNA (cDNA clone MGC:1477 IMAGE:3051146), complete cds. // chr3 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// BT007430 // GenBank // Homo sapiens transmembrane 4 superfamily member 4 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// U31449 // GenBank // Human intestinal and liver tetraspan membrane protein (il-TMP) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000014596 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:149474877:149511760:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_007282 // RefSeq // Homo sapiens ring finger protein 13 (RNF13), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NM_183381 // RefSeq // Homo sapiens ring finger protein 13 (RNF13), transcript variant 4, mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000344229 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:149812770:149962122:1 gene:ENSG00000082996 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000392894 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:149812708:149962139:1 gene:ENSG00000082996 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000491086 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:149813204:149961016:1 gene:ENSG00000082996 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 44 // 8 // 8 // 0 /// AF037204 // GenBank // Homo sapiens RING zinc finger protein (RZF) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 56 // 10 // 10 // 0 /// AF070558 // GenBank // Homo sapiens clone 24450 RING zinc finger protein RZF mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 50 // 9 // 9 // 0 /// BC009781 // GenBank // Homo sapiens ring finger protein 13, mRNA (cDNA clone MGC:13487 IMAGE:3683407), complete cds. // chr3 // 100 // 56 // 10 // 10 // 0 /// BC009803 // GenBank // Homo sapiens ring finger protein 13, mRNA (cDNA clone MGC:13689 IMAGE:4274992), complete cds. // chr3 // 100 // 72 // 13 // 13 // 0
NR_036538 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC646903 (LOC646903), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT092665 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT092666 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000487390 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:149984395:149984797:1 gene:ENSG00000182000 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000014601 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:149984486:149984797:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_014779 // RefSeq // Homo sapiens TSC22 domain family, member 2 (TSC22D2), mRNA. // chr3 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// XR_427388 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens TSC22 domain family, member 2 (TSC22D2), transcript variant X2, misc_RNA. // chr3 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000361875 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:150408335:150466431:1 gene:ENSG00000196428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000466814 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:150411009:150460116:1 gene:ENSG00000196428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000485421 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:150411179:150458679:1 gene:ENSG00000196428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 32 // 11 // 11 // 0 /// AB014569 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA0669 protein, partial cds. // chr3 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// AF201290 // GenBank // Homo sapiens TSC22-related inducible leucine zipper 4c (TILZ4c) mRNA, partial cds. // chr3 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// AF201292 // GenBank // Homo sapiens TSC22-related inducible leucine zipper 4a (TILZ4a) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 32 // 11 // 11 // 0 /// AK297383 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57127 complete cds, highly similar to TSC22 domain family protein 2. // chr3 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// BC044643 // GenBank // Homo sapiens TSC22 domain family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:52200 IMAGE:5454441), complete cds. // chr3 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000014581 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:150384964:150458636:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 50 // 17 // 17 // 0
AF318318 // GenBank HTC // Homo sapiens pp10394 mRNA, complete cds. // chr3 // 87 // 100 // 20 // 23 // 0
NM_207365 // RefSeq // Homo sapiens arylacetamide deacetylase-like 2 (AADACL2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000356517 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:151733927:151757766:1 gene:ENSG00000197953 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000445270 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:151733916:151761339:1 gene:ENSG00000197953 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000570799 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR3_1_CTG2_1:151744465:151768304:1 gene:ENSG00000261846 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000576369 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR3_1_CTG2_1:151744454:151770036:1 gene:ENSG00000261846 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC065724 // GenBank // Homo sapiens arylacetamide deacetylase-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:72001 IMAGE:6663150), complete cds. // chr3 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// BX647585 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp313M1119 (from clone DKFZp313M1119). // chr3 // 81 // 87 // 21 // 26 // 0 /// GENSCAN00000030133 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR3_1_CTG2_1:151744640:151768105:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000031244 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:151734102:151828172:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 95 // 70 // 20 // 21 // 0
NM_001086 // RefSeq // Homo sapiens arylacetamide deacetylase (AADAC), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_005247103 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens arylacetamide deacetylase (AADAC), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000232892 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:151814037:151828488:1 gene:ENSG00000114771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000488869 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:151814073:151824860:1 gene:ENSG00000114771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// AK290628 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75654 complete cds, highly similar to Homo sapiens arylacetamide deacetylase (esterase) (AADAC), mRNA. // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC032309 // GenBank // Homo sapiens arylacetamide deacetylase (esterase), mRNA (cDNA clone MGC:40338 IMAGE:5185099), complete cds. // chr3 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// L32179 // GenBank // Human arylacetamide deacetylase mRNA, complete cds. // chr3 // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000031244 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:151734102:151828172:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0
NM_033050 // RefSeq // Homo sapiens succinate receptor 1 (SUCNR1), mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000362032 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:151873643:151884619:1 gene:ENSG00000198829 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AF247785 // GenBank // Homo sapiens P2Y purinoceptor 1 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// AF348078 // GenBank // Homo sapiens G-protein coupled receptor 91 (GPR91) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AK290420 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75637 complete cds, highly similar to Homo sapiens succinate receptor 1 (SUCNR1), mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC030948 // GenBank // Homo sapiens succinate receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:32514 IMAGE:4594810), complete cds. // chr3 // 92 // 93 // 24 // 26 // 0 /// EU432110 // GenBank // Homo sapiens succinate receptor 1 (SUCNR1) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000031247 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:151873621:151881548:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0
ENST00000364347 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:152449272:152449384:1 gene:ENSG00000201217 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT092752 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_002563 // RefSeq // Homo sapiens purinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 1 (P2RY1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000305097 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:152834693:152838051:1 gene:ENSG00000169860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// U42029 // GenBank // Human P2Y1 purinoceptor mRNA, short form, complete cds. // chr3 // 100 // 26 // 8 // 8 // 0 /// U42030 // GenBank // Human P2Y1 purinoceptor mRNA, long form, complete cds. // chr3 // 100 // 42 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000035522 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:152623221:152836904:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
NM_002886 // RefSeq // Homo sapiens RAP2B, member of RAS oncogene family (RAP2B), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000323534 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:153162270:153167173:1 gene:ENSG00000181467 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC012362 // GenBank // Homo sapiens RAP2B, member of RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:20484 IMAGE:4650072), complete cds. // chr3 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0
ENST00000446603 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:153484495:153502697:1 gene:ENSG00000237787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// AF086445 // GenBank // Homo sapiens full length insert cDNA clone ZD81E02. // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
ENST00000363292 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:153607377:153607479:1 gene:ENSG00000200162 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT092788 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000607291 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:154329716:154329819:1 gene:ENSG00000271922 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_003875 // RefSeq // Homo sapiens guanine monphosphate synthase (GMPS), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000295920 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:3:155870650:155937710:1 gene:ENSG00000163655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000496455 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:155870536:155944026:1 gene:ENSG00000163655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AK291504 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75406 complete cds, highly similar to Homo sapiens guanine monphosphate synthetase (GMPS), mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// AK300787 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57604 complete cds, highly similar to GMP synthase (glutamine-hydrolyzing) (EC 6.3.5.2). // chr3 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// AK302148 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57661 complete cds, highly similar to GMP synthase (glutamine-hydrolyzing) (EC 6.3.5.2). // chr3 // 96 // 81 // 24 // 25 // 0 /// AK315832 // GenBank // Homo sapiens cDNA, FLJ79481 complete cds, highly similar to GMP synthase (glutamine-hydrolyzing) (EC6.3.5.2). // chr3 // 93 // 87 // 25 // 27 // 0 /// BC012178 // GenBank // Homo sapiens guanine monphosphate synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:20438 IMAGE:4653684), complete cds. // chr3 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// U10860 // GenBank // Human guanosine 5-monophosphate synthase mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000028907 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:155885013:155988095:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// AF297747 // GenBank // Homo sapiens clone 1426-37 MLL/GMPS fusion protein mRNA, partial cds. // chr3 // 89 // 58 // 16 // 18 // 0
ENST00000449668 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:156019646:156037647:1 gene:ENSG00000174930 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:unitary_pseudogene // chr3 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1
ENST00000410567 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:157017342:157017696:1 gene:ENSG00000222499 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT092876 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
ENST00000364908 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:157153548:157153640:1 gene:ENSG00000201778 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT092901 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_002852 // RefSeq // Homo sapiens pentraxin 3, long (PTX3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000295927 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:157436789:157443628:1 gene:ENSG00000163661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC039733 // GenBank // Homo sapiens pentraxin-related gene, rapidly induced by IL-1 beta, mRNA (cDNA clone MGC:47747 IMAGE:5768379), complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// M31166 // GenBank // Human tumor necrosis factor-inducible (TSG-14) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033373 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:157436934:157437914:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0
NM_024996 // RefSeq // Homo sapiens G elongation factor, mitochondrial 1 (GFM1), mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000264263 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:158644597:158692569:1 gene:ENSG00000168827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000478254 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:158644528:158692572:1 gene:ENSG00000168827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000478576 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:158644528:158682433:1 gene:ENSG00000168827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000486715 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:158644278:158692575:1 gene:ENSG00000168827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF309777 // GenBank // Homo sapiens elongation factor G (EFG) mRNA, complete cds; nuclear gene for mitochondrial product. // chr3 // 92 // 96 // 23 // 25 // 0 /// AF367998 // GenBank // Homo sapiens elongation factor G1 (EFG1) mRNA, complete cds; nuclear gene for mitochondrial product. // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AK000780 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ20773 fis, clone COL06050, highly similar to EFGM_RAT ELONGATION FACTOR G. // chr3 // 94 // 62 // 15 // 16 // 0 /// BC049210 // GenBank // Homo sapiens G elongation factor, mitochondrial 1, mRNA (cDNA clone MGC:51775 IMAGE:5574223), complete cds. // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000000607 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:158644635:158691467:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
ENST00000477589 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:158740417:158743592:1 gene:ENSG00000240207 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000496842 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:158740426:158743336:1 gene:ENSG00000240207 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr3 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// AY070437 // GenBank // Homo sapiens cytokine receptor CRL2 precursor, mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000465477 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:158732327:158784070:1 gene:ENSG00000240207 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr3 // 50 // 50 // 10 // 20 // 1 /// ENST00000468242 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:158732378:158771089:1 gene:ENSG00000240207 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr3 // 50 // 50 // 10 // 20 // 1 /// NONHSAT092940 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT092941 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr3 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT092938 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr3 // 50 // 50 // 10 // 20 // 1 /// NONHSAT092939 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr3 // 50 // 50 // 10 // 20 // 1
NM_001168214 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 80 (C3orf80), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000326474 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:160225636:160228212:1 gene:ENSG00000180044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000490320 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:160225797:160228054:1 gene:ENSG00000180044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:antisense gene:ENSG00000244078 // chr3 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000610477 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:160225842:160228213:1 gene:ENSG00000180044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:antisense // chr3 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000045018 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:160225636:160226379:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0
NR_029663 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 15b (MIR15B), microRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000385045 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:160404588:160404685:1 gene:ENSG00000207779 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-15b // miRBase Micro RNA Database // MI0000438 Homo sapiens miR-15b stem-loop // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT092988 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029525 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 16-2 (MIR16-2), microRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000362117 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:160404745:160404825:1 gene:ENSG00000198987 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-16-2 // miRBase Micro RNA Database // MI0000115 Homo sapiens miR-16-2 stem-loop // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT092990 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_025047 // RefSeq // Homo sapiens ADP-ribosylation factor-like 14 (ARL14), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000320767 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:160677159:160678452:1 gene:ENSG00000179674 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC034354 // GenBank // Homo sapiens ADP-ribosylation factor-like 14, mRNA (cDNA clone MGC:21008 IMAGE:4747382), complete cds. // chr3 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000002441 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:160676941:160729294:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 45 // 45 // 14 // 31 // 1
ENST00000384356 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:160696929:160697060:1 gene:ENSG00000207084 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT093001 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_015938 // RefSeq // Homo sapiens NMD3 ribosome export adaptor (NMD3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000351193 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:161221290:161252307:1 gene:ENSG00000169251 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000460469 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:161221559:161252004:1 gene:ENSG00000169251 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 15 // 15 // 0 /// AF132941 // GenBank // Homo sapiens CGI-07 protein mRNA, complete cds. // chr3 // 94 // 100 // 15 // 16 // 0 /// AK094749 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ37430 fis, clone BRAWH2001679, highly similar to Homo sapiens NMD3 homolog (NMD3), mRNA. // chr3 // 93 // 94 // 14 // 15 // 0 /// BC013317 // GenBank // Homo sapiens NMD3 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:13335 IMAGE:4291797), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000472947 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:161221308:161253532:1 gene:ENSG00000169251 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 88 // 88 // 14 // 16 // 1 /// AK225664 // GenBank // Homo sapiens mRNA for NMD3 homolog, clone: STM05655. // chr3 // 88 // 88 // 14 // 16 // 1 /// AK296710 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57520 complete cds, highly similar to Homo sapiens NMD3 homolog (NMD3), mRNA. // chr3 // 81 // 81 // 13 // 16 // 1 /// AK308865 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ98906. // chr3 // 75 // 75 // 12 // 16 // 1 /// GENSCAN00000002447 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:161222014:161274746:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 56 // 9 // 9 // 0
NM_001080440 // RefSeq // Homo sapiens otolin 1 (OTOL1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000327928 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:161496808:161503942:1 gene:ENSG00000182447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005270 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:161496862:161503942:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
ENST00000475330 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:166811009:166811567:1 gene:ENSG00000231516 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONHSAT093085 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
ENST00000469748 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:167065831:167066320:1 gene:ENSG00000220343 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000019967 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:167065783:167066325:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000410425 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:168475198:168475388:1 gene:ENSG00000222357 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT093130 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000484597 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:169709295:169709765:1 gene:ENSG00000244381 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT093150 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_001080460 // RefSeq // Homo sapiens leucine-rich repeats and IQ motif containing 4 (LRRIQ4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000340806 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:169821922:169837775:1 gene:ENSG00000188306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000047354 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:169821922:169837631:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_182610 // RefSeq // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 7 (SAMD7), mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000335556 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:169911572:169939175:1 gene:ENSG00000187033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000428432 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:169911572:169939175:1 gene:ENSG00000187033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000487910 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:169915411:169938587:1 gene:ENSG00000187033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// BC117339 // GenBank // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 7, mRNA (cDNA clone MGC:150948 IMAGE:40125890), complete cds. // chr3 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// BC143909 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:9052427. // chr3 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// BX537903 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686E1583 (from clone DKFZp686E1583); complete cds. // chr3 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// BX648991 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686J0784 (from clone DKFZp686J0784). // chr3 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// GENSCAN00000047343 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:169919499:169993063:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 58 // 58 // 18 // 31 // 1
NM_014373 // RefSeq // Homo sapiens G protein-coupled receptor 160 (GPR160), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006713582 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens G protein-coupled receptor 160 (GPR160), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006713584 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens G protein-coupled receptor 160 (GPR160), transcript variant X5, mRNA. // chr3 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000355897 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:170037929:170085403:1 gene:ENSG00000173890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AJ249248 // GenBank // Homo sapiens mRNA for putative G protein-coupled Receptor. // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC000181 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 160, mRNA (cDNA clone MGC:5003 IMAGE:3048193), complete cds. // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000492492 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:170038138:170084071:1 gene:ENSG00000173890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
ENST00000364472 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:170057301:170057429:1 gene:ENSG00000201342 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT093177 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK095225 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ37906 fis, clone COLON2004318. // chr3 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// ENST00000599781 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:170087810:170089590:1 gene:ENSG00000268220 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT093182 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENST00000362666 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:170149845:170149951:1 gene:ENSG00000199536 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// NONHSAT093189 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0
NM_002740 // RefSeq // Homo sapiens protein kinase C, iota (PRKCI), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000295797 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:170222365:170305981:1 gene:ENSG00000163558 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000476635 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:170291642:170305977:1 gene:ENSG00000163558 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// BC022016 // GenBank // Homo sapiens protein kinase C, iota, mRNA (cDNA clone MGC:26534 IMAGE:4823853), complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC042405 // GenBank HTC // Homo sapiens protein kinase C, iota, mRNA (cDNA clone IMAGE:4831064). // chr3 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// L33881 // GenBank // Human protein kinase C iota isoform, complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// L18964 // GenBank // Human protein kinase C iota isoform (PRKCI) mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 96 // 24 // 25 // 1 /// ENST00000392722 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:X:101537485:101539276:-1 gene:ENSG00000237682 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 80 // 80 // 16 // 20 // 0 /// GENSCAN00000021550 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:X:101537585:101539382:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 76 // 68 // 13 // 17 // 0 /// NONHSAT137937 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 80 // 80 // 16 // 20 // 0 /// GENSCAN00000047344 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:170222388:170392417:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
BC033582 // GenBank // Homo sapiens mRNA similar to LOC166173 (cDNA clone IMAGE:5203730). // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONHSAT093231 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001164436 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 212 (TMEM212), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000334567 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:171843349:171859318:1 gene:ENSG00000186329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000420375 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:171843401:171938715:1 gene:ENSG00000186329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000450693 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:171843516:171856974:1 gene:ENSG00000186329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000619900 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:171843384:171856704:1 gene:ENSG00000186329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000382 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:171843384:171900454:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0
ENST00000484215 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:172237326:172237591:1 gene:ENSG00000243398 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT093244 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AF116626 // GenBank HTC // Homo sapiens PRO1163 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENST00000516273 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:172703124:172703225:1 gene:ENSG00000252082 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT093259 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_014932 // RefSeq // Homo sapiens neuroligin 1 (NLGN1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_005247232 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens neuroligin 1 (NLGN1), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000361589 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:173584555:174283123:1 gene:ENSG00000169760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000401917 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:174275314:174281303:1 gene:ENSG00000169760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000415045 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:173584920:174278982:1 gene:ENSG00000169760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 48 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000457714 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:173398448:174286644:1 gene:ENSG00000169760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AB028993 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1070 protein, partial cds. // chr3 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// AK307813 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ97761. // chr3 // 100 // 48 // 16 // 16 // 0 /// BC032555 // GenBank // Homo sapiens neuroligin 1, mRNA (cDNA clone MGC:45115 IMAGE:5558890), complete cds. // chr3 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// GQ489206 // GenBank // Homo sapiens neuroligin 1 (nlgn1) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000034446 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:174000678:174378005:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
NM_207015 // RefSeq // Homo sapiens N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase-like 2 (NAALADL2), mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000454872 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:174859280:175805640:1 gene:ENSG00000177694 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000473253 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:174863816:175581221:1 gene:ENSG00000177694 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000485853 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:174859322:175257213:1 gene:ENSG00000177694 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 42 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000489299 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:175124406:175655563:1 gene:ENSG00000177694 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 42 // 10 // 10 // 0 /// AK131044 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ29010 fis, clone TST07383. // chr3 // 100 // 42 // 10 // 10 // 0 /// AL832144 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686E21111 (from clone DKFZp686E21111). // chr3 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// BC057243 // GenBank // Homo sapiens N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase-like 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:4593084), complete cds. // chr3 // 90 // 42 // 9 // 10 // 0 /// ENST00000614002 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:175096783:175805640:1 gene:ENSG00000177694 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// AK126272 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44286 fis, clone TRACH2007059, weakly similar to Folate hydrolase. // chr3 // 42 // 42 // 10 // 24 // 1
ENST00000364778 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:175609479:175609613:1 gene:ENSG00000201648 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONHSAT093302 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
ENST00000364582 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:175767558:175767661:1 gene:ENSG00000201452 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT093305 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000516493 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:176763233:176763341:1 gene:ENSG00000252302 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT093331 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
ENST00000363746 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:179097731:179097840:1 gene:ENSG00000200616 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT093386 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_006218 // RefSeq // Homo sapiens phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase, catalytic subunit alpha (PIK3CA), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000263967 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:179148523:179240093:1 gene:ENSG00000121879 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// AK292940 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75190 complete cds, highly similar to H.sapiens mRNA for phosphatidylinositol 3-kinase. // chr3 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// AK297203 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54636 complete cds, highly similar to Phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform (EC 2.7.1.153). // chr3 // 100 // 78 // 29 // 29 // 0 /// AK302608 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50922 complete cds, highly similar to Phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform (EC 2.7.1.153). // chr3 // 97 // 86 // 31 // 32 // 0 /// BC113601 // GenBank // Homo sapiens phosphoinositide-3-kinase, catalytic, alpha polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:142161 IMAGE:8322653), complete cds. // chr3 // 97 // 95 // 34 // 35 // 0 /// BC113603 // GenBank // Homo sapiens phosphoinositide-3-kinase, catalytic, alpha polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:142163 IMAGE:8322655), complete cds. // chr3 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// U79143 // GenBank // Human phosphoinositide 3-hydroxykinase p110-alpha subunit mRNA, complete cds. // chr3 // 97 // 86 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000019167 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:179198826:179234364:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0
NM_033540 // RefSeq // Homo sapiens mitofusin 1 (MFN1), mRNA. // chr3 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000263969 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:179348761:179392496:1 gene:ENSG00000171109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 77 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000357390 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:179347735:179393025:1 gene:ENSG00000171109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000471841 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:179347692:179394931:1 gene:ENSG00000171109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000474903 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:179362358:179392496:1 gene:ENSG00000171109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 45 // 10 // 10 // 0 /// AB043588 // GenBank // Homo sapiens hfzo2 mRNA for mitochondrial transmembrane GTPase FZO-2, complete cds. // chr3 // 100 // 77 // 17 // 17 // 0 /// AB043589 // GenBank // Homo sapiens hfzo1 mRNA for mitochondrial transmembrane GTPase Fzo-1, complete cds. // chr3 // 100 // 77 // 17 // 17 // 0 /// AF329637 // GenBank // Homo sapiens mitofusin 1 mRNA, nuclear gene for mitochondrial protein, complete cds. // chr3 // 100 // 73 // 16 // 16 // 0 /// BC040557 // GenBank // Homo sapiens mitofusin 1, mRNA (cDNA clone MGC:41806 IMAGE:5270347), complete cds. // chr3 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// U95822 // GenBank // Human putative transmembrane GTPase mRNA, partial cds. // chr3 // 100 // 45 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000006358 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:179365118:179400378:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 45 // 10 // 10 // 0
NM_003940 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 13 (isopeptidase T-3) (USP13), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000263966 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:179652755:179789401:1 gene:ENSG00000058056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000482333 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:179653050:179757137:1 gene:ENSG00000058056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000496897 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:179653693:179784406:1 gene:ENSG00000058056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000497155 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:179721564:179761151:1 gene:ENSG00000058056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// AK290338 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75259 complete cds, highly similar to Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 13 (isopeptidase T-3), mRNA. // chr3 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// AK302404 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53942 complete cds, highly similar to Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13 (EC 3.1.2.15). // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC016146 // GenBank // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 13 (isopeptidase T-3), mRNA (cDNA clone MGC:9455 IMAGE:3910925), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// U75362 // GenBank // Homo sapiens isopeptidase T-3 (ISOT-3) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000006356 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:179653226:179789690:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0
ENST00000364940 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:180542701:180542836:1 gene:ENSG00000201810 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// NONHSAT093436 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0
ENST00000363116 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:180581057:180581163:1 gene:ENSG00000199986 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT093438 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_003106 // RefSeq // Homo sapiens SRY (sex determining region Y)-box 2 (SOX2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000325404 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:181711924:181714436:1 gene:ENSG00000181449 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC013923 // GenBank // Homo sapiens SRY (sex determining region Y)-box 2, mRNA (cDNA clone MGC:2413 IMAGE:2823424), complete cds. // chr3 // 100 // 45 // 10 // 10 // 0 /// sox2ot // lncRNA Db // hg18 chr3:182811028-182941712 // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000025844 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:181712370:181725373:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 41 // 41 // 9 // 22 // 1
ENST00000578485 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:181813401:181813702:1 gene:ENSG00000266317 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT093514 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
ENST00000469911 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:182610674:182611414:1 gene:ENSG00000228766 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000036777 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:182610674:182611413:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0
NM_014616 // RefSeq // Homo sapiens ATPase, class VI, type 11B (ATP11B), mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000323116 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:182793500:182921635:1 gene:ENSG00000058063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000466758 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:182873966:182919063:1 gene:ENSG00000058063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 32 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000490303 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:182865527:182914103:1 gene:ENSG00000058063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 54 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000493826 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:182793503:182836624:1 gene:ENSG00000058063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 22 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000498086 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:182837117:182918341:1 gene:ENSG00000058063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 68 // 28 // 28 // 0 /// AK296750 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60651 complete cds, highly similar to Probable phospholipid-transporting ATPase IF(EC 3.6.3.1). // chr3 // 100 // 37 // 15 // 15 // 0 /// AK304855 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56374 complete cds, highly similar to Probable phospholipid-transporting ATPase IF(EC 3.6.3.1). // chr3 // 100 // 61 // 25 // 25 // 0 /// BC042180 // GenBank // Homo sapiens ATPase, class VI, type 11B, mRNA (cDNA clone IMAGE:5395206), complete cds. // chr3 // 100 // 22 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000036788 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:182782544:182905919:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 41 // 17 // 17 // 0
ENST00000364359 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:183451857:183451988:1 gene:ENSG00000201229 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT093650 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000482098 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:183453643:183455541:1 gene:ENSG00000240024 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000362493 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:183453814:183453944:1 gene:ENSG00000199363 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT093652 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT093653 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000515921 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:183454128:183454262:1 gene:ENSG00000251730 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT093654 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_017644 // RefSeq // Homo sapiens kelch-like family member 24 (KLHL24), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000242810 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:183635568:183679478:1 gene:ENSG00000114796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000437402 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:183635619:183650538:1 gene:ENSG00000114796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 21 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000454652 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:183635623:183684477:1 gene:ENSG00000114796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000476808 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:183650357:183673008:1 gene:ENSG00000114796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 47 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000492409 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:183664101:183672484:1 gene:ENSG00000114796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 21 // 8 // 8 // 0 /// AK000066 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ20059 fis, clone COL01349. // chr3 // 100 // 42 // 16 // 16 // 0 /// AK098662 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ25796 fis, clone TST07033. // chr3 // 100 // 42 // 16 // 16 // 0 /// AY422472 // GenBank // Homo sapiens DRE1 protein (DRE1) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// BC142993 // GenBank // Homo sapiens kelch-like 24 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:167115 IMAGE:8860448), complete cds. // chr3 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// DQ925701 // GenBank // Homo sapiens fibroblast-related protein mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 58 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000007008 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:183614253:183810998:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 50 // 50 // 19 // 38 // 1
NM_018023 // RefSeq // Homo sapiens YEATS domain containing 2 (YEATS2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENST00000305135 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:183697818:183812625:1 gene:ENSG00000163872 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// BC150273 // GenBank // Homo sapiens YEATS domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:166875 IMAGE:9007245), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENST00000472593 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:183800977:183812623:1 gene:ENSG00000163872 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 28 // 28 // 12 // 43 // 1 /// AK022903 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ12841 fis, clone NT2RP2003280. // chr3 // 28 // 28 // 12 // 43 // 1 /// GENSCAN00000007008 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:183614253:183810998:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 60 // 60 // 26 // 43 // 1
NM_130770 // RefSeq // Homo sapiens 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 3C, ionotropic (HTR3C), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000318351 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:184053047:184060671:1 gene:ENSG00000178084 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AF459285 // GenBank // Homo sapiens 5-hydroxytryptamine receptor 3 subunit C (HTR3C) mRNA, complete cds. // chr3 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 /// BC131799 // GenBank // Homo sapiens 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 3, family member C, mRNA (cDNA clone MGC:156912 IMAGE:40069671), complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000007003 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:184053081:184060352:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0
ENST00000438353 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:184115352:184117898:1 gene:ENSG00000205955 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AY956761 // GenBank // Homo sapiens heat shock protein 90Ae (HSP90Ae) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000007004 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:184117145:184117898:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000007005 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:184112860:184116713:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 38 // 9 // 9 // 0
NM_138345 // RefSeq // Homo sapiens von Willebrand factor A domain containing 5B2 (VWA5B2), mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000273794 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:184233416:184242283:1 gene:ENSG00000145198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000426955 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:184230429:184242329:1 gene:ENSG00000145198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000461141 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:184234520:184242329:1 gene:ENSG00000145198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK293885 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56885 complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC001200 // GenBank // Homo sapiens von Willebrand factor A domain containing 5B2, mRNA (cDNA clone IMAGE:3356192), partial cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC136609 // GenBank // Homo sapiens von Willebrand factor A domain containing 5B2, mRNA (cDNA clone MGC:168222 IMAGE:9020599), complete cds. // chr3 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000007006 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:184228485:184242038:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_004443 // RefSeq // Homo sapiens EPH receptor B3 (EPHB3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000330394 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:184561784:184582409:1 gene:ENSG00000182580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// BC052968 // GenBank // Homo sapiens EPH receptor B3, mRNA (cDNA clone MGC:54077 IMAGE:6472607), complete cds. // chr3 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000031063 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:184530403:184617795:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0
NONHSAT093765 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_027317 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 65 (C3orf65), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000296270 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:185713292:185718167:1 gene:ENSG00000163915 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000456447 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:185713252:185729787:1 gene:ENSG00000163915 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// BC041450 // GenBank // Homo sapiens, clone IMAGE:5171726, mRNA. // chr3 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_001622 // RefSeq // Homo sapiens alpha-2-HS-glycoprotein (AHSG), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000273784 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:186613066:186621300:1 gene:ENSG00000145192 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000411641 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:186612923:186621318:1 gene:ENSG00000145192 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AK292751 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77950 complete cds, highly similar to Homo sapiens alpha-2-HS-glycoprotein (AHSG), mRNA. // chr3 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// AK303754 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55606 complete cds, highly similar to Alpha-2-HS-glycoprotein precursor. // chr3 // 91 // 97 // 30 // 33 // 0 /// BC048198 // GenBank // Homo sapiens alpha-2-HS-glycoprotein, mRNA (cDNA clone MGC:52261 IMAGE:5798874), complete cds. // chr3 // 91 // 97 // 30 // 33 // 0 /// BC052590 // GenBank // Homo sapiens alpha-2-HS-glycoprotein, mRNA (cDNA clone MGC:59866 IMAGE:6300060), complete cds. // chr3 // 91 // 97 // 30 // 33 // 0 /// M16961 // GenBank // Human alpha-2-HS-glycoprotein alpha and beta chain mRNA, complete cds. // chr3 // 91 // 97 // 30 // 33 // 0 /// ENST00000478441 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:186613085:186617989:1 gene:ENSG00000145192 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1 /// AK298447 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56822 complete cds, highly similar to Alpha-2-HS-glycoprotein precursor. // chr3 // 38 // 38 // 13 // 34 // 1 /// GENSCAN00000028950 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:186613142:186627274:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 62 // 21 // 21 // 0 /// AF119895 // GenBank HTC // Homo sapiens PRO2743 mRNA, complete cds. // chr3 // 86 // 62 // 18 // 21 // 0
NM_000412 // RefSeq // Homo sapiens histidine-rich glycoprotein (HRG), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000232003 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:186665952:186678240:1 gene:ENSG00000113905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000495413 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:186668978:186678231:1 gene:ENSG00000113905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// BC069574 // GenBank // Homo sapiens histidine-rich glycoprotein, mRNA (cDNA clone MGC:97078 IMAGE:7262290), complete cds. // chr3 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC150591 // GenBank // Homo sapiens histidine-rich glycoprotein, mRNA (cDNA clone MGC:183501 IMAGE:9056961), complete cds. // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// CR749302 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp779H1622 (from clone DKFZp779H1622). // chr3 // 83 // 82 // 19 // 23 // 0 /// M13149 // GenBank // Human histidine-rich glycoprotein mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000028940 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:186666032:186742331:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
ENST00000465792 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:186786076:186787290:1 gene:ENSG00000156976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000466362 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:186785061:186786498:1 gene:ENSG00000156976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000485101 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:186783578:186789894:1 gene:ENSG00000156976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB209021 // GenBank // Homo sapiens mRNA for BM-010 variant protein. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000363548 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:186786323:186786445:1 gene:ENSG00000200418 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONHSAT093855 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT093856 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_002588 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 4 (SNORA4), small nucleolar RNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000468362 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:186785962:186788368:1 gene:ENSG00000156976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000485101 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:186783578:186789894:1 gene:ENSG00000156976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000584302 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:186787612:186787749:1 gene:ENSG00000263776 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB209021 // GenBank // Homo sapiens mRNA for BM-010 variant protein. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK296279 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58834 complete cds, highly similar to Eukaryotic initiation factor 4A-II (EC 3.6.1.-). // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT093864 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000412545 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:186900198:186900557:1 gene:ENSG00000223803 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000028935 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:186900198:186900557:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_153708 // RefSeq // Homo sapiens receptor (chemosensory) transporter protein 1 (RTP1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000312295 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:187197486:187201465:1 gene:ENSG00000175077 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY562235 // GenBank // Homo sapiens receptor transporting protein 1 short (RTP1) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// BC065202 // GenBank // Homo sapiens receptor (chemosensory) transporter protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:70423 IMAGE:5179096), complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000028925 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:187186782:187200070:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
NM_022147 // RefSeq // Homo sapiens receptor (chemosensory) transporter protein 4 (RTP4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000259030 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:187368332:187372076:1 gene:ENSG00000136514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY562238 // GenBank // Homo sapiens receptor transporting protein 4 (RTP4) mRNA, complete cds. // chr3 // 88 // 59 // 14 // 16 // 0 /// BC013161 // GenBank // Homo sapiens receptor (chemosensory) transporter protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:21535 IMAGE:3919961), complete cds. // chr3 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000008173 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:187368442:187649606:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
ENST00000459452 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:187423315:187423419:1 gene:ENSG00000239093 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT093887 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NR_024413 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC401105 (FLJ42393), long non-coding RNA. // chr3 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// AK124384 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ42393 fis, clone ADRGL2003329. // chr3 // 79 // 100 // 19 // 24 // 0 /// AY358227 // GenBank // Homo sapiens clone DNA96847 AVPC1948 (UNQ1948) mRNA, complete cds. // chr3 // 92 // 50 // 11 // 12 // 0
NR_029502 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 28 (MIR28), microRNA. // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000384918 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:188688781:188688866:1 gene:ENSG00000207651 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// hsa-mir-28 // miRBase Micro RNA Database // MI0000086 Homo sapiens miR-28 stem-loop // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT093914 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_198485 // RefSeq // Homo sapiens tumor protein p63 regulated 1 (TPRG1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006713604 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens tumor protein p63 regulated 1 (TPRG1), transcript variant X8, mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006713605 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens tumor protein p63 regulated 1 (TPRG1), transcript variant X9, mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000345063 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:189171974:189325304:1 gene:ENSG00000188001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC101550 // GenBank // Homo sapiens tumor protein p63 regulated 1, mRNA (cDNA clone MGC:126599 IMAGE:8069056), complete cds. // chr3 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// BC101552 // GenBank // Homo sapiens tumor protein p63 regulated 1, mRNA (cDNA clone MGC:126601 IMAGE:8069058), complete cds. // chr3 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000433971 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:188947214:189321061:1 gene:ENSG00000188001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// AK123232 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ41238 fis, clone BRAMY2032014. // chr3 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// ENST00000425670 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:189215300:189315693:1 gene:ENSG00000188001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1 /// GENSCAN00000006865 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:189207256:189260950:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_006580 // RefSeq // Homo sapiens claudin 16 (CLDN16), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000264734 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:190387872:190412143:1 gene:ENSG00000113946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000456423 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:3:190388120:190410008:1 gene:ENSG00000113946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// AF152101 // GenBank // Homo sapiens paracellin-1 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC069662 // GenBank // Homo sapiens claudin 16, mRNA (cDNA clone MGC:97314 IMAGE:7262563), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC069682 // GenBank // Homo sapiens claudin 16, mRNA (cDNA clone MGC:97231 IMAGE:7262480), complete cds. // chr3 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// BC069759 // GenBank // Homo sapiens claudin 16, mRNA (cDNA clone MGC:97243 IMAGE:7262492), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC069777 // GenBank // Homo sapiens claudin 16, mRNA (cDNA clone MGC:97255 IMAGE:7262504), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000468220 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:190322541:190404930:1 gene:ENSG00000113946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// GENSCAN00000011858 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:190388330:190482043:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// NONHSAT093947 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
ENST00000411185 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:190642163:190642503:1 gene:ENSG00000223117 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT093955 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_198184 // RefSeq // Homo sapiens osteocrin (OSTN), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000339051 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:191212533:191250121:1 gene:ENSG00000188729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000445281 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:191199241:191265615:1 gene:ENSG00000188729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// AY398681 // GenBank // Homo sapiens osteocrin protein precursor, mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY573933 // GenBank // Homo sapiens musclin mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC128106 // GenBank // Homo sapiens osteocrin, mRNA (cDNA clone MGC:149188 IMAGE:40112103), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC128107 // GenBank // Homo sapiens osteocrin, mRNA (cDNA clone MGC:149189 IMAGE:40112104), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000011860 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:191212533:191250121:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_178335 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 50 (CCDC50), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000392456 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:191329085:191392175:1 gene:ENSG00000152492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_174908 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 50 (CCDC50), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 93 // 93 // 28 // 30 // 1 /// ENST00000392455 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:191329077:191398670:1 gene:ENSG00000152492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 93 // 93 // 28 // 30 // 1 /// BC065004 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 50, mRNA (cDNA clone MGC:70346 IMAGE:6049272), complete cds. // chr3 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1 /// GENSCAN00000037887 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:191353383:191391760:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0
NM_001083308 // RefSeq // Homo sapiens pyrin domain containing 2 (PYDC2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000518817 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:191461163:191461456:1 gene:ENSG00000253548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AY858112 // GenBank // Homo sapiens pyrin-only protein 2 (POP2) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000037890 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:191461163:191461456:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENST00000364990 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:191641135:191641237:1 gene:ENSG00000201860 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT093977 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000410651 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:192093122:192093436:1 gene:ENSG00000222583 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT093993 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_020386 // RefSeq // Homo sapiens HRAS-like suppressor (HRASLS), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000264735 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:193241125:193270855:1 gene:ENSG00000127252 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000416012 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:193263002:193277738:1 gene:ENSG00000127252 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 83 // 44 // 10 // 12 // 0 /// AB030816 // GenBank // Homo sapiens mRNA for H-REV107 protein-related protein, complete cds. // chr3 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// AB510981 // GenBank // Homo sapiens A-C1 mRNA for phospholipase A, complete cds. // chr3 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// BC048095 // GenBank // Homo sapiens HRAS-like suppressor, mRNA (cDNA clone MGC:57150 IMAGE:4830228), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_005247658 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens HRAS-like suppressor (HRASLS), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
ENST00000384640 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:193624189:193624301:1 gene:ENSG00000207370 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 75 // 3 // 3 // 0 /// NONHSAT094016 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 75 // 3 // 3 // 0
NM_005524 // RefSeq // Homo sapiens hes family bHLH transcription factor 1 (HES1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000232424 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:194136145:194138732:1 gene:ENSG00000114315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF264785 // GenBank // Homo sapiens hairy (HRY) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC039152 // GenBank // Homo sapiens hairy and enhancer of split 1, (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:21078 IMAGE:4749611), complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// CR541843 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834C1232D for gene HES1, hairy and enhancer of split 1, (Drosophila); complete cds, without stopcodon. // chr3 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000476918 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:194136148:194137284:1 gene:ENSG00000114315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// AK300482 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57168 complete cds, moderately similar to Transcription factor HES-1. // chr3 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// GENSCAN00000046081 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:194136381:194138233:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0
ENST00000487718 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:194145674:194145971:1 gene:ENSG00000242201 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT094065 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_153690 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 43, member A (FAM43A), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000329759 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:194686544:194689037:1 gene:ENSG00000185112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AF289585 // GenBank HTC // Homo sapiens clone pp7298 unknown mRNA. // chr3 // 96 // 84 // 26 // 27 // 0 /// BC039689 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 43, member A, mRNA (cDNA clone MGC:29738 IMAGE:4906944), complete cds. // chr3 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// BC064989 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 43, member A, mRNA (cDNA clone MGC:71447 IMAGE:5423287), complete cds. // chr3 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000005179 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:194678121:194688098:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0
AK094115 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ36796 fis, clone ADRGL2006817. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT094265 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1
ENST00000410403 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:196202349:196202453:1 gene:ENSG00000222335 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT094304 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000470264 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:196399911:196400207:1 gene:ENSG00000243339 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT094332 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
AK092964 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ35645 fis, clone SPLEN2012611. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_427461 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens UBXN7 antisense RNA 1 (UBXN7-AS1), ncRNA. // chr3 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONHSAT094336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000439929 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:196536532:196536702:1 gene:ENSG00000225770 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0 /// NONHSAT094348 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0
NM_001105573 // RefSeq // Homo sapiens F-box protein 45 (FBXO45), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000311630 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:196568688:196589059:1 gene:ENSG00000174013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000440469 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:196568611:196587287:1 gene:ENSG00000174013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// AK025697 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ22044 fis, clone HEP09141. // chr3 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000010867 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:196566791:196670715:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_198565 // RefSeq // Homo sapiens negative regulator of reactive oxygen species (NRROS), mRNA. // chr3 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000328557 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:196639686:196662004:1 gene:ENSG00000174004 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AY358322 // GenBank // Homo sapiens clone DNA130809 ELLP3030 (UNQ3030) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// BC044233 // GenBank // Homo sapiens leucine rich repeat containing 33, mRNA (cDNA clone MGC:50789 IMAGE:5725567), complete cds. // chr3 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000010867 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:196566791:196670715:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0
NM_002577 // RefSeq // Homo sapiens p21 protein (Cdc42/Rac)-activated kinase 2 (PAK2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000327134 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:196739857:196832647:1 gene:ENSG00000180370 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// AK291339 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75088 complete cds, highly similar to Homo sapiens p21 (CDKN1A)-activated kinase 2 (PAK2), mRNA. // chr3 // 100 // 50 // 6 // 6 // 0
NM_152699 // RefSeq // Homo sapiens SUMO1/sentrin specific peptidase 5 (SENP5), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000323460 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:196867856:196934714:1 gene:ENSG00000119231 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000445299 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:196867856:196931035:1 gene:ENSG00000119231 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// AK124389 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ42398 fis, clone ASTRO2002842, moderately similar to Mus musculus smt3-specific isopeptidase 1 (Smt3ip1-pending). // chr3 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// AK302305 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56806 complete cds, highly similar to Sentrin-specific protease 5 (EC 3.4.22.-). // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC030705 // GenBank // Homo sapiens SUMO1/sentrin specific peptidase 5, mRNA (cDNA clone MGC:27076 IMAGE:4824344), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000419026 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:196867945:196931012:1 gene:ENSG00000119231 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// GENSCAN00000010870 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:196885182:196930923:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
NR_024388 // RefSeq // Homo sapiens NCBP2 antisense RNA 2 (head to head) (NCBP2-AS2), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000602845 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:196942623:196943540:1 gene:ENSG00000270170 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr3 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT094370 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT094371 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0
ENST00000362436 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:197894507:197894613:1 gene:ENSG00000199306 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT094458 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000364752 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:197994601:197994709:1 gene:ENSG00000201622 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONHSAT094471 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
ENST00000463924 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:1065580:1065875:-1 gene:ENSG00000244169 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT087577 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000423801 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:1595777:1596245:-1 gene:ENSG00000184423 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000009770 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:1595774:1596016:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONHSAT087579 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
ENST00000411108 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:2088933:2089211:-1 gene:ENSG00000223040 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 78 // 88 // 18 // 23 // 0 /// NONHSAT087586 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 78 // 88 // 18 // 23 // 0
NONHSAT087642 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000384553 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:5086178:5086279:-1 gene:ENSG00000207283 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT087653 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000600805 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:5187172:5188298:-1 gene:ENSG00000268509 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC011805 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4335840, partial cds. // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENST00000482215 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:5252926:5253223:-1 gene:ENSG00000241227 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT087662 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
ENST00000517272 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:8364529:8364648:-1 gene:ENSG00000253081 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_000916 // RefSeq // Homo sapiens oxytocin receptor (OXTR), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000316793 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:8750408:8769617:-1 gene:ENSG00000180914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000431493 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:8768058:8769628:-1 gene:ENSG00000180914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 92 // 36 // 11 // 12 // 0 /// ENST00000449615 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:8767912:8768677:-1 gene:ENSG00000180914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0 /// AY389507 // GenBank // Homo sapiens oxytocin receptor (OXTR) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// BC137443 // GenBank // Homo sapiens oxytocin receptor, mRNA (cDNA clone MGC:169066 IMAGE:9021443), complete cds. // chr3 // 100 // 48 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000031798 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:8752924:8813756:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1
NM_001033117 // RefSeq // Homo sapiens SLIT-ROBO Rho GTPase activating protein 3 (SRGAP3), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 76 // 29 // 29 // 0 /// NM_014850 // RefSeq // Homo sapiens SLIT-ROBO Rho GTPase activating protein 3 (SRGAP3), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 76 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000360413 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:8980594:9249213:-1 gene:ENSG00000196220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000383836 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:8980591:9249379:-1 gene:ENSG00000196220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000433332 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:9014742:9216760:-1 gene:ENSG00000196220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 50 // 19 // 19 // 0 /// AF427144 // GenBank // Homo sapiens MEGAP transcript variant a mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 71 // 27 // 27 // 0 /// AF464189 // GenBank // Homo sapiens WAVE-associated Rac GTPase activating protein mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// BC039300 // GenBank // Homo sapiens SLIT-ROBO Rho GTPase activating protein 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:4830856), complete cds. // chr3 // 92 // 68 // 24 // 26 // 0 /// FM209427 // GenBank // Homo sapiens mRNA for SRGAP3:RAF1 fusion protein (SRGAP3:RAF1 gene). // chr3 // 34 // 34 // 13 // 38 // 1 /// ENST00000618999 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:9006979:9124977:-1 gene:ENSG00000196220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 66 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029053 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:8985519:9159432:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 55 // 21 // 21 // 0
AK128398 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ46541 fis, clone THYMU3037867. // chr3 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT087790 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr3 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_198560 // RefSeq // Homo sapiens lipoma HMGIC fusion partner-like 4 (LHFPL4), mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000287585 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:9498361:9553802:-1 gene:ENSG00000156959 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// AY278320 // GenBank // Homo sapiens lipoma HMGIC fusion partner-like protein 4 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000029082 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:9500561:9562888:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0
ENST00000391025 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:9919051:9919153:-1 gene:ENSG00000212327 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONHSAT087842 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_207351 // RefSeq // Homo sapiens proline-rich transmembrane protein 3 (PRRT3), mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XR_427267 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens proline-rich transmembrane protein 3 (PRRT3), transcript variant X3, misc_RNA. // chr3 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000295984 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:9945542:9952374:-1 gene:ENSG00000163704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000411976 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:9948580:9952390:-1 gene:ENSG00000163704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000412055 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:9945542:9952394:-1 gene:ENSG00000163704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AY358158 // GenBank // Homo sapiens clone DNA145558 ASSP5823 (UNQ5823) mRNA, complete cds. // chr3 // 95 // 59 // 18 // 19 // 0 /// BC040508 // GenBank // Homo sapiens proline-rich transmembrane protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:33990 IMAGE:5300209), complete cds. // chr3 // 93 // 88 // 26 // 28 // 0 /// BC089447 // GenBank // Homo sapiens proline-rich transmembrane protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:105134 IMAGE:30563721), complete cds. // chr3 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// BC111555 // GenBank // Homo sapiens proline-rich transmembrane protein 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:40024307), complete cds. // chr3 // 86 // 44 // 12 // 14 // 0 /// AK296317 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60609 complete cds. // chr3 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1 /// GENSCAN00000029043 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:9946227:9950115:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0
NM_018447 // RefSeq // Homo sapiens ER membrane protein complex subunit 3 (EMC3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000245046 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:9962537:9987120:-1 gene:ENSG00000125037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000470827 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:9977029:10011116:-1 gene:ENSG00000125037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 82 // 33 // 9 // 11 // 0 /// ENST00000497557 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:9969729:9978297:-1 gene:ENSG00000125037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 89 // 55 // 16 // 18 // 0 /// AF157321 // GenBank // Homo sapiens 30 kDa protein mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC022807 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 111, mRNA (cDNA clone MGC:39153 IMAGE:4897577), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000487465 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:9968644:9986838:-1 gene:ENSG00000125037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// AK222953 // GenBank // Homo sapiens mRNA for 30 kDa protein variant, clone: HSI00133. // chr3 // 67 // 67 // 22 // 33 // 1 /// ENST00000429759 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:9973506:9986682:-1 gene:ENSG00000125037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1 /// GENSCAN00000020355 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:9969676:9986661:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0
ENST00000383808 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:10006418:10011095:-1 gene:ENSG00000206567 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000420091 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:10006445:10009131:-1 gene:ENSG00000206567 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr3 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// AK022260 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ12198 fis, clone MAMMA1000876. // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000426698 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:10008303:10011114:-1 gene:ENSG00000206567 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr3 // 50 // 50 // 8 // 16 // 1 /// ENST00000454232 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:10007462:10011209:-1 gene:ENSG00000206567 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr3 // 56 // 56 // 9 // 16 // 1 /// NONHSAT087864 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT087866 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT087863 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 88 // 88 // 14 // 16 // 1 /// NONHSAT087865 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 81 // 81 // 13 // 16 // 1 /// NONHSAT087869 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 50 // 50 // 8 // 16 // 1
NM_001164839 // RefSeq // Homo sapiens FANCD2 opposite strand (FANCD2OS), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NM_173472 // RefSeq // Homo sapiens FANCD2 opposite strand (FANCD2OS), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_427248 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens FANCD2 opposite strand (FANCD2OS), transcript variant X2, misc_RNA. // chr3 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// XR_427249 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens FANCD2 opposite strand (FANCD2OS), transcript variant X3, misc_RNA. // chr3 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000450660 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:10103937:10108223:-1 gene:ENSG00000163705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000524279 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:10081320:10108231:-1 gene:ENSG00000163705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC028122 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 24, mRNA (cDNA clone MGC:40179 IMAGE:5168387), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020369 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:10104241:10108561:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// NONHSAT087881 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr3 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
AF220047 // GenBank // Homo sapiens uncharacterized hematopoietic stem/progenitor cells protein MDS027 mRNA, complete cds. // chr3 // 90 // 100 // 19 // 21 // 0 /// AF281279 // GenBank // Homo sapiens unknown mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 76 // 16 // 16 // 0
ENST00000487345 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:11952788:11953085:-1 gene:ENSG00000263988 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000582635 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR3_1_CTG1:11954709:11955006:-1 gene:ENSG00000266381 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT087995 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_003256 // RefSeq // Homo sapiens TIMP metallopeptidase inhibitor 4 (TIMP4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000287814 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:12153051:12159351:-1 gene:ENSG00000157150 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC010553 // GenBank // Homo sapiens TIMP metallopeptidase inhibitor 4, mRNA (cDNA clone MGC:17099 IMAGE:4154090), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BT019627 // GenBank // Homo sapiens tissue inhibitor of metalloproteinase 4 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// U76456 // GenBank // Homo sapiens tissue inhibitor of metalloproteinase 4 mRNA, complete cds. // chr3 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000029254 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:12153515:12158840:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0
ENST00000434751 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:12257801:12258460:-1 gene:ENSG00000236062 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
ENST00000363244 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:12511095:12511213:-1 gene:ENSG00000200114 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT088015 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_000994 // RefSeq // Homo sapiens ribosomal protein L32 (RPL32), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 62 // 8 // 8 // 0 /// NM_001007073 // RefSeq // Homo sapiens ribosomal protein L32 (RPL32), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NM_001007074 // RefSeq // Homo sapiens ribosomal protein L32 (RPL32), transcript variant 3, mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000396957 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:12834946:12841582:-1 gene:ENSG00000144713 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000429711 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:12834485:12841588:-1 gene:ENSG00000144713 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 62 // 8 // 8 // 0
NM_001134382 // RefSeq // Homo sapiens IQ motif and Sec7 domain 1 (IQSEC1), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// NM_014869 // RefSeq // Homo sapiens IQ motif and Sec7 domain 1 (IQSEC1), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000273221 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:12897220:12967668:-1 gene:ENSG00000144711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// AK294525 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60491 complete cds, highly similar to IQ motif and Sec7 domain-containing protein 1. // chr3 // 95 // 83 // 19 // 20 // 0 /// AY653734 // GenBank // Homo sapiens brefeldin resistant Arf-GEF 2b isoform mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr3 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// BC010267 // GenBank // Homo sapiens IQ motif and Sec7 domain 1, mRNA (cDNA clone MGC:5112 IMAGE:2900367), complete cds. // chr3 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000613206 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:12900849:13073117:-1 gene:ENSG00000144711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000618604 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:12900577:12987036:-1 gene:ENSG00000144711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000029242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:12900983:12943786:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 75 // 75 // 18 // 24 // 1
AY358240 // GenBank // Homo sapiens clone DNA147258 LMNE6487 (UNQ6487) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_024923 // RefSeq // Homo sapiens nucleoporin 210kDa (NUP210), mRNA. // chr3 // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// XM_005264994 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens nucleoporin 210kDa (NUP210), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 49 // 23 // 23 // 0 /// XR_245105 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens nucleoporin 210kDa (NUP210), transcript variant X2, misc_RNA. // chr3 // 100 // 49 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000254508 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:13316235:13420309:-1 gene:ENSG00000132182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// ENST00000420141 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:13351663:13420309:-1 gene:ENSG00000132182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 51 // 24 // 24 // 0 /// BC067089 // GenBank // Homo sapiens nucleoporin 210kDa, mRNA (cDNA clone MGC:71114 IMAGE:6281693), complete cds. // chr3 // 100 // 49 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000009196 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:13319064:13388356:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 72 // 34 // 34 // 0
NM_004625 // RefSeq // Homo sapiens wingless-type MMTV integration site family, member 7A (WNT7A), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000285018 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:13816258:13880121:-1 gene:ENSG00000154764 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC008811 // GenBank // Homo sapiens wingless-type MMTV integration site family, member 7A, mRNA (cDNA clone MGC:10346 IMAGE:3949579), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// D83175 // GenBank // Homo sapiens WNT7a mRNA, complete cds. // chr3 // 83 // 83 // 20 // 24 // 0 /// U53476 // GenBank // Human proto-oncogene Wnt7a mRNA, complete cds. // chr3 // 71 // 83 // 17 // 24 // 0 /// GENSCAN00000009185 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:13796027:13856160:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// GENSCAN00000009201 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:13861490:13879816:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
NM_001098502 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 4 (CHCHD4), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 60 // 12 // 12 // 0 /// NM_144636 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 4 (CHCHD4), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000295767 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:14112077:14124870:-1 gene:ENSG00000163528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000396914 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:14112093:14124858:-1 gene:ENSG00000163528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 60 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000420103 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:14113144:14124749:-1 gene:ENSG00000163528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 50 // 10 // 10 // 0 /// BC017082 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:9700 IMAGE:3848900), complete cds. // chr3 // 100 // 45 // 9 // 9 // 0 /// BC033775 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:45435 IMAGE:4538841), complete cds. // chr3 // 100 // 55 // 11 // 11 // 0
NM_001145769 // RefSeq // Homo sapiens xeroderma pigmentosum, complementation group C (XPC), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// NM_004628 // RefSeq // Homo sapiens xeroderma pigmentosum, complementation group C (XPC), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// NR_027299 // RefSeq // Homo sapiens xeroderma pigmentosum, complementation group C (XPC), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr3 // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// ENST00000285021 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:14145147:14178783:-1 gene:ENSG00000154767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// ENST00000476581 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:14145729:14178601:-1 gene:ENSG00000154767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 92 // 86 // 22 // 24 // 0 /// AK289761 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76216 complete cds, highly similar to Homo sapiens xeroderma pigmentosum, complementation group C (XPC), mRNA. // chr3 // 83 // 86 // 20 // 24 // 0 /// AK295711 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54356 complete cds, highly similar to DNA-repair protein complementing XP-C cells. // chr3 // 88 // 89 // 22 // 25 // 0 /// BC016620 // GenBank // Homo sapiens xeroderma pigmentosum, complementation group C, mRNA (cDNA clone MGC:21338 IMAGE:4509957), complete cds. // chr3 // 89 // 96 // 24 // 27 // 0 /// D21089 // GenBank // Homo sapiens mRNA for XP-C repair complementing protein (p125), complete cds. // chr3 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// HM113488 // GenBank // Homo sapiens xeroderma pigmentosum complementation group C (XPC) mRNA, complete cds. // chr3 // 92 // 86 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000029185 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:14145941:14178568:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 92 // 86 // 22 // 24 // 0
NM_001080423 // RefSeq // Homo sapiens glutamate receptor interacting protein 2 (GRIP2), mRNA. // chr3 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENST00000430219 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:14491170:14512858:-1 gene:ENSG00000144596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 43 // 13 // 13 // 0 /// AK024507 // GenBank // Homo sapiens mRNA for FLJ00117 protein, partial cds. // chr3 // 100 // 43 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000619221 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:14489111:14542081:-1 gene:ENSG00000144596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000621039 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:14489111:14540374:-1 gene:ENSG00000144596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000029184 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:14493665:14555954:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 77 // 22 // 23 // 0
ENST00000384434 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:14530982:14531088:-1 gene:ENSG00000207163 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 95 // 100 // 18 // 19 // 0 /// NONHSAT088351 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 95 // 100 // 18 // 19 // 0
NONHSAT088447 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000384199 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:15433110:15433216:-1 gene:ENSG00000206926 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT088464 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000498222 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:15506623:15506905:-1 gene:ENSG00000241064 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT088479 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001047434 // RefSeq // Homo sapiens diphthamide biosynthesis 3 (DPH3), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NM_206831 // RefSeq // Homo sapiens diphthamide biosynthesis 3 (DPH3), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000285082 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:16259910:16264777:-1 gene:ENSG00000154813 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000383775 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:16257979:16264969:-1 gene:ENSG00000154813 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000488423 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:16257978:16264972:-1 gene:ENSG00000154813 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AK311618 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ18660. // chr3 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// BC010181 // GenBank // Homo sapiens DPH3, KTI11 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:20197 IMAGE:4543414), complete cds. // chr3 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// BC073931 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5200193, partial cds. // chr3 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000462982 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:16260424:16264587:-1 gene:ENSG00000154813 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// NONHSAT088508 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT088509 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
NM_001190811 // RefSeq // Homo sapiens deleted in azoospermia-like (DAZL), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NM_001351 // RefSeq // Homo sapiens deleted in azoospermia-like (DAZL), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000250863 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:3:16586792:16604790:-1 gene:ENSG00000092345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000399444 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:16586792:16605499:-1 gene:ENSG00000092345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK303026 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50315 complete cds, highly similar to Deleted in azoospermia-like. // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC027595 // GenBank // Homo sapiens deleted in azoospermia-like, mRNA (cDNA clone MGC:26406 IMAGE:4829381), complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// U65918 // GenBank // Human putative RNA binding protein (DAZH) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// U66078 // GenBank // Human DAZLA mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// U66726 // GenBank // Homo sapiens germline specific RNA binding protein (DAZL1) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000454457 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:16596750:16670306:-1 gene:ENSG00000092345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// GENSCAN00000045202 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:16537393:16693566:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
ENST00000515952 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:18954943:18955049:-1 gene:ENSG00000251761 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT088593 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001252657 // RefSeq // Homo sapiens protein phosphatase 2C-like domain containing 1 (PP2D1), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// NR_027694 // RefSeq // Homo sapiens protein phosphatase 2C-like domain containing 1 (PP2D1), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr3 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// XM_006712989 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens protein phosphatase 2C-like domain containing 1 (PP2D1), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000333083 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:19979961:20012267:-1 gene:ENSG00000183977 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000389050 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:19985380:20012330:-1 gene:ENSG00000183977 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000461033 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:20000975:20012257:-1 gene:ENSG00000183977 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// AK058178 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ25449 fis, clone TST08763. // chr3 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// BC105097 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 48, mRNA (cDNA clone IMAGE:8144100), partial cds. // chr3 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000017201 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:19985380:20008247:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT088608 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0
NONHSAT088618 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENST00000362707 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:20268965:20269070:-1 gene:ENSG00000199577 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT088620 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000384080 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:20507644:20507756:-1 gene:ENSG00000206807 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT088629 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_024697 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 385D (ZNF385D), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_005265485 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens zinc finger protein 385D (ZNF385D), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000281523 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:21418419:21751435:-1 gene:ENSG00000151789 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000446749 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:21437077:21751114:-1 gene:ENSG00000151789 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 91 // 42 // 10 // 11 // 0 /// BC007212 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 385D, mRNA (cDNA clone MGC:14900 IMAGE:3347783), complete cds. // chr3 // 91 // 88 // 21 // 23 // 0 /// XM_005265488 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens zinc finger protein 385D (ZNF385D), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// XM_006713336 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens zinc finger protein 385D (ZNF385D), transcript variant X5, mRNA. // chr3 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// GENSCAN00000017563 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:21421214:21520231:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
ENST00000516753 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:23613661:23613759:-1 gene:ENSG00000252562 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT088677 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0
ENST00000390967 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:23641489:23641592:-1 gene:ENSG00000212269 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT088679 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENST00000471607 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:25020166:25020463:-1 gene:ENSG00000244404 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONHSAT088706 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000365092 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:25352284:25352392:-1 gene:ENSG00000201962 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT088709 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001068 // RefSeq // Homo sapiens topoisomerase (DNA) II beta 180kDa (TOP2B), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000264331 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:25597905:25664372:-1 gene:ENSG00000077097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000413971 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:25597984:25618849:-1 gene:ENSG00000077097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 34 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000424225 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:25615473:25664907:-1 gene:ENSG00000077097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 70 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000435706 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:25597986:25664499:-1 gene:ENSG00000077097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// AK297171 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50986 complete cds, highly similar to DNA topoisomerase 2-beta (EC 5.99.1.3). // chr3 // 93 // 34 // 14 // 15 // 0 /// AK316492 // GenBank // Homo sapiens cDNA, FLJ79391 complete cds, highly similar to DNA topoisomerase 2-beta (EC 5.99.1.3). // chr3 // 92 // 30 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000017049 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:25598307:25664893:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 41 // 41 // 0
ENST00000384521 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:27265580:27265683:-1 gene:ENSG00000207251 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONHSAT088753 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
XM_003403510 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens putative uncharacterized protein C3orf53-like (LOC100652807), mRNA. // chr3 // 100 // 45 // 9 // 9 // 0 /// AK090970 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ33651 fis, clone BRAMY2024535. // chr3 // 95 // 100 // 19 // 20 // 0 /// BC128112 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:40112147. // chr3 // 60 // 60 // 12 // 20 // 1 /// NONHSAT088792 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 55 // 55 // 11 // 20 // 1
ENST00000363057 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:30304320:30304536:-1 gene:ENSG00000199927 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT088816 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_207359 // RefSeq // Homo sapiens glutamate decarboxylase-like 1 (GADL1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000282538 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:30726200:30894765:-1 gene:ENSG00000144644 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC093701 // GenBank // Homo sapiens glutamate decarboxylase-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:120736 IMAGE:7939546), complete cds. // chr3 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// BC111986 // GenBank // Homo sapiens glutamate decarboxylase-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:138191 IMAGE:8327454), complete cds. // chr3 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000454381 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:30797677:30894661:-1 gene:ENSG00000144644 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1 /// AL832766 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686I1727 (from clone DKFZp686I1727). // chr3 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1 /// GENSCAN00000026924 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:30723482:30861765:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
NM_017801 // RefSeq // Homo sapiens CKLF-like MARVEL transmembrane domain containing 6 (CMTM6), mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000205636 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:32481312:32503408:-1 gene:ENSG00000091317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF479261 // GenBank // Homo sapiens chemokine-like factor super family 6 (CKLFSF6) mRNA, complete cds. // chr3 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// BC002797 // GenBank // Homo sapiens CKLF-like MARVEL transmembrane domain containing 6, mRNA (cDNA clone MGC:3456 IMAGE:3633497), complete cds. // chr3 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// CR457231 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834C039D for gene CKLFSF6, chemokine-like factor super family 6; complete cds, incl. stopcodon. // chr3 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000478886 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:32483739:32488381:-1 gene:ENSG00000091317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// ENST00000495177 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:32487733:32502796:-1 gene:ENSG00000091317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// GENSCAN00000017278 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:32483960:32502745:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT088880 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_016141 // RefSeq // Homo sapiens dynein, cytoplasmic 1, light intermediate chain 1 (DYNC1LI1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000273130 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:32525971:32570874:-1 gene:ENSG00000144635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000424991 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:32544989:32570858:-1 gene:ENSG00000144635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000432458 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:32526284:32570858:-1 gene:ENSG00000144635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000472985 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:32529630:32537272:-1 gene:ENSG00000144635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000481915 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:32526100:32570693:-1 gene:ENSG00000144635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// AK293253 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58500 complete cds, highly similar to Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 1. // chr3 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// BC131620 // GenBank // Homo sapiens dynein, cytoplasmic 1, light intermediate chain 1, mRNA (cDNA clone MGC:149683 IMAGE:40117391), complete cds. // chr3 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// BX649189 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686A1525 (from clone DKFZp686A1525). // chr3 // 96 // 82 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000017284 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:32526799:32570770:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 52 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT088882 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0
AY358209 // GenBank // Homo sapiens clone DNA147309 YPLR6490 (UNQ6490) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001039770 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein with metallophosphoesterase domain (TMPPE), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000342462 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:33090425:33096801:-1 gene:ENSG00000188167 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC136872 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein with metallophosphoesterase domain, mRNA (cDNA clone MGC:168486 IMAGE:9020863), complete cds. // chr3 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// BC136873 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein with metallophosphoesterase domain, mRNA (cDNA clone MGC:168487 IMAGE:9020864), complete cds. // chr3 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NM_001136238 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein with metallophosphoesterase domain (TMPPE), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1 /// ENST00000416695 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:33090421:33096801:-1 gene:ENSG00000188167 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1 /// GENSCAN00000029158 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:32997045:33097085:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NM_015551 // RefSeq // Homo sapiens sushi domain containing 5 (SUSD5), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000309558 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:33150042:33219215:-1 gene:ENSG00000173705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000412539 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:33153710:33218793:-1 gene:ENSG00000173705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// AK295869 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56620 complete cds. // chr3 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000029161 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:33152742:33300110:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
ENST00000365305 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:33491983:33492098:-1 gene:ENSG00000202175 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT088930 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_033403 // RefSeq // Homo sapiens doublecortin-like kinase 3 (DCLK3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000416516 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:36712422:36739861:-1 gene:ENSG00000163673 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000025913 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:36711144:36767410:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NM_014831 // RefSeq // Homo sapiens tetratricopeptide repeat and ankyrin repeat containing 1 (TRANK1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000428977 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:36826820:36858883:-1 gene:ENSG00000168016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000429976 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:36826820:36945057:-1 gene:ENSG00000168016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000025916 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:36795297:36864480:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
ENST00000387446 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:36968191:36968316:-1 gene:ENSG00000210181 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT088988 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_014805 // RefSeq // Homo sapiens EPM2A (laforin) interacting protein 1 (EPM2AIP1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000322716 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:36987866:36993168:-1 gene:ENSG00000178567 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// AF059751 // GenBank // Homo sapiens clone 008a09 My007 protein mRNA, complete cds. // chr3 // 86 // 61 // 12 // 14 // 0 /// AY178832 // GenBank // Homo sapiens laforin-interacting protein mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC064696 // GenBank // Homo sapiens EPM2A (laforin) interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:71663 IMAGE:30345499), complete cds. // chr3 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000018022 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:36991254:36993050:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 57 // 13 // 13 // 0
ENST00000383918 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:37093133:37093234:-1 gene:ENSG00000206645 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT088995 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000604992 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:37241789:37244177:-1 gene:ENSG00000270194 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC022164 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3831619. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018023 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:37243060:37244160:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 87 // 60 // 13 // 15 // 0 /// NONHSAT089008 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT089009 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000469559 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:38122716:38132552:-1 gene:ENSG00000060971 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// AK127051 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ45108 fis, clone BRAWH3033513, highly similar to 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal precursor (EC 2.3.1.16). // chr3 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000365095 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:38125292:38125394:-1 gene:ENSG00000201965 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT089055 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000362644 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:38303773:38303879:-1 gene:ENSG00000199514 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONHSAT089068 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001293306 // RefSeq // Homo sapiens sodium channel, voltage-gated, type X, alpha subunit (SCN10A), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NM_001293307 // RefSeq // Homo sapiens sodium channel, voltage-gated, type X, alpha subunit (SCN10A), transcript variant 3, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NM_006514 // RefSeq // Homo sapiens sodium channel, voltage-gated, type X, alpha subunit (SCN10A), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000449082 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:38696802:38794010:-1 gene:ENSG00000185313 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF117907 // GenBank // Homo sapiens tetrodotoxin-resistant voltage-gated sodium channel (SCN10A) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000008557 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:38628151:38834432:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0
ENST00000444237 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:38849278:38950561:-1 gene:ENSG00000168356 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 82 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000456224 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:38846694:38950362:-1 gene:ENSG00000168356 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 74 // 37 // 37 // 0 /// AF109737 // GenBank // Homo sapiens voltage-gated sodium channel alpha subunit SCN12A (SCN12A) mRNA, complete cds. // chr3 // 98 // 96 // 47 // 48 // 0 /// AF150882 // GenBank // Homo sapiens voltage-gated sodium channel alpha subunit, alternate splice variant SCN12A-s (SCN12A) mRNA, complete cds. // chr3 // 98 // 82 // 40 // 41 // 0 /// NM_001287223 // RefSeq // Homo sapiens sodium channel, voltage-gated, type XI, alpha subunit (SCN11A), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 94 // 94 // 47 // 50 // 1 /// NM_014139 // RefSeq // Homo sapiens sodium channel, voltage-gated, type XI, alpha subunit (SCN11A), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 96 // 96 // 48 // 50 // 1 /// ENST00000302328 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:38845769:38950561:-1 gene:ENSG00000168356 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 96 // 48 // 50 // 1 /// AF188679 // GenBank // Homo sapiens voltage-gated sodium channel type XI alpha subunit (SCN11A) mRNA, complete cds. // chr3 // 94 // 94 // 47 // 50 // 1 /// GENSCAN00000045734 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:38868881:38964345:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 66 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000008565 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:38846694:38852093:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 18 // 18 // 9 // 50 // 1
NM_033027 // RefSeq // Homo sapiens cysteine-serine-rich nuclear protein 1 (CSRNP1), mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// XM_005265403 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens cysteine-serine-rich nuclear protein 1 (CSRNP1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000273153 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:39141855:39153575:-1 gene:ENSG00000144655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000514182 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:39142338:39154562:-1 gene:ENSG00000144655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// AB053121 // GenBank // Homo sapiens URAX1 mRNA, complete cds. // chr3 // 89 // 90 // 25 // 28 // 0 /// AB063301 // GenBank // Homo sapiens TAIP-3 mRNA for TGF-beta induced apotosis protein 3, complete cds. // chr3 // 88 // 77 // 21 // 24 // 0 /// BC038949 // GenBank // Homo sapiens AXIN1 up-regulated 1, mRNA (cDNA clone MGC:47534 IMAGE:5547938), complete cds. // chr3 // 89 // 90 // 25 // 28 // 0 /// GENSCAN00000045740 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:39143055:39191133:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 71 // 71 // 22 // 31 // 1
NM_001198621 // RefSeq // Homo sapiens xin actin-binding repeat containing 1 (XIRP1), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 97 // 95 // 37 // 38 // 0 /// NM_194293 // RefSeq // Homo sapiens xin actin-binding repeat containing 1 (XIRP1), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000340369 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:39183215:39192594:-1 gene:ENSG00000168334 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000396251 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:39183210:39192596:-1 gene:ENSG00000168334 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000421646 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:39183216:39192595:-1 gene:ENSG00000168334 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 55 // 22 // 22 // 0 /// AJ626900 // GenBank // Homo sapiens mRNA for Xin A (CMYA1 gene). // chr3 // 98 // 100 // 39 // 40 // 0 /// AY375160 // GenBank // Homo sapiens cardiomyopathy associated protein 1 (CMYA1) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// BC127119 // GenBank // Homo sapiens xin actin-binding repeat containing 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:40125445), complete cds. // chr3 // 100 // 50 // 20 // 20 // 0 /// BC139782 // GenBank // Homo sapiens xin actin-binding repeat containing 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:40125446), complete cds. // chr3 // 100 // 50 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000045740 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:39143055:39191133:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0
ENST00000363036 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:40498891:40499003:-1 gene:ENSG00000199906 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONHSAT089172 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_017886 // RefSeq // Homo sapiens unc-51 like kinase 4 (ULK4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENST00000301831 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:41246607:41962430:-1 gene:ENSG00000168038 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// AK304341 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56804 complete cds, weakly similar to Serine/threonine-protein kinase 36 (EC 2.7.11.1). // chr3 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// BC040739 // GenBank // Homo sapiens unc-51-like kinase 4 (C. elegans), mRNA (cDNA clone IMAGE:5743829), partial cds. // chr3 // 100 // 56 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000489118 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:41246599:41278151:-1 gene:ENSG00000168038 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 33 // 33 // 14 // 43 // 1 /// BC018795 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:2967282. // chr3 // 33 // 33 // 14 // 43 // 1 /// GENSCAN00000033989 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:41631910:41835971:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 26 // 26 // 11 // 43 // 1 /// NONHSAT089191 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 33 // 33 // 14 // 43 // 1
ENST00000411010 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:41766615:41766919:-1 gene:ENSG00000222942 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT089198 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000516177 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:41868998:41869095:-1 gene:ENSG00000251986 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT089201 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_017886 // RefSeq // Homo sapiens unc-51 like kinase 4 (ULK4), mRNA. // chr3 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000301831 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:41246607:41962430:-1 gene:ENSG00000168038 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000420927 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:3:41882150:41961994:-1 gene:ENSG00000168038 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000459802 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:41919720:41962077:-1 gene:ENSG00000168038 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000497684 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:41931751:41954798:-1 gene:ENSG00000168038 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 28 // 10 // 10 // 0 /// AK000581 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ20574 fis, clone REC01035. // chr3 // 80 // 83 // 24 // 30 // 0 /// AK304341 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56804 complete cds, weakly similar to Serine/threonine-protein kinase 36 (EC 2.7.11.1). // chr3 // 80 // 83 // 24 // 30 // 0 /// BC014794 // GenBank // Homo sapiens unc-51-like kinase 4 (C. elegans), mRNA (cDNA clone IMAGE:4343362), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000007702 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:41896822:42035472:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 44 // 44 // 16 // 36 // 1
ENST00000390843 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:41899111:41899253:-1 gene:ENSG00000212145 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT089203 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_000729 // RefSeq // Homo sapiens cholecystokinin (CCK), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NM_001174138 // RefSeq // Homo sapiens cholecystokinin (CCK), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000334681 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:42257825:42264903:-1 gene:ENSG00000187094 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000396169 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:42257825:42266207:-1 gene:ENSG00000187094 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000434608 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:42257826:42263947:-1 gene:ENSG00000187094 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// AK289716 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76519 complete cds, highly similar to Homo sapiens cholecystokinin (CCK), mRNA. // chr3 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// BC008283 // GenBank // Homo sapiens cholecystokinin, mRNA (cDNA clone MGC:10571 IMAGE:3639109), complete cds. // chr3 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// BC093055 // GenBank // Homo sapiens cholecystokinin, mRNA (cDNA clone MGC:111138 IMAGE:30722619), complete cds. // chr3 // 100 // 37 // 11 // 11 // 0 /// BC111026 // GenBank // Homo sapiens cholecystokinin, mRNA (cDNA clone MGC:117187 IMAGE:5199880), complete cds. // chr3 // 89 // 90 // 24 // 27 // 0 /// GENSCAN00000007739 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:42258098:42273827:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0
NM_144634 // RefSeq // Homo sapiens lysozyme-like 4 (LYZL4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_005264865 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens lysozyme-like 4 (LYZL4), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// ENST00000287748 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:42397078:42410600:-1 gene:ENSG00000157093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000441172 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:42397083:42410558:-1 gene:ENSG00000157093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000470991 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:42397097:42407508:-1 gene:ENSG00000157093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 89 // 66 // 17 // 19 // 0 /// AF326749 // GenBank // Homo sapiens LYC4 (LYC4) mRNA, complete cds. // chr3 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// BC016747 // GenBank // Homo sapiens lysozyme-like 4, mRNA (cDNA clone MGC:26768 IMAGE:4830396), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000007698 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:42397265:42407251:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0
ENST00000462015 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:42676189:42676491:-1 gene:ENSG00000240203 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT089251 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT089252 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// TCONS_00006498-XLOC_003100 // Rinn lincRNA // linc-SEC22C-1 chr3:-:42716783-42724788 // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_144719 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 13 (CCDC13), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// XM_005264898 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens coiled-coil domain containing 13 (CCDC13), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000310232 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:42708269:42773253:-1 gene:ENSG00000244607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENST00000435327 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:42749815:42773243:-1 gene:ENSG00000244607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 23 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000479576 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:42745735:42757120:-1 gene:ENSG00000244607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 19 // 8 // 8 // 0 /// AK302859 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61498 complete cds, highly similar to Coiled-coil domain-containing protein 13. // chr3 // 90 // 23 // 9 // 10 // 0 /// BC036050 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 13, mRNA (cDNA clone MGC:33372 IMAGE:5270468), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENST00000492806 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:42746794:42773253:-1 gene:ENSG00000244607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 28 // 28 // 12 // 43 // 1 /// AK058196 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ25467 fis, clone TST09387. // chr3 // 28 // 28 // 12 // 43 // 1 /// GENSCAN00000007732 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:42692751:42758345:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 97 // 77 // 32 // 33 // 0
NM_004391 // RefSeq // Homo sapiens cytochrome P450, family 8, subfamily B, polypeptide 1 (CYP8B1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000316161 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:42872192:42876165:-1 gene:ENSG00000180432 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000437102 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:42856005:42875898:-1 gene:ENSG00000180432 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0 /// AK310784 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17826. // chr3 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0 /// BC067434 // GenBank // Homo sapiens cytochrome P450, family 8, subfamily B, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:79261 IMAGE:7002161), complete cds. // chr3 // 91 // 46 // 10 // 11 // 0 /// BC067441 // GenBank // Homo sapiens cytochrome P450, family 8, subfamily B, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:79268 IMAGE:7002145), complete cds. // chr3 // 91 // 46 // 10 // 11 // 0 /// BC067442 // GenBank // Homo sapiens cytochrome P450, family 8, subfamily B, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:79269 IMAGE:7002146), complete cds. // chr3 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0 /// BC067444 // GenBank // Homo sapiens cytochrome P450, family 8, subfamily B, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:79271 IMAGE:7002148), complete cds. // chr3 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0
NM_032806 // RefSeq // Homo sapiens protein O-linked mannose N-acetylglucosaminyltransferase 2 (beta 1,4-) (POMGNT2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_005265515 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens protein O-linked mannose N-acetylglucosaminyltransferase 2 (beta 1,4-) (POMGNT2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000344697 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:43079234:43106076:-1 gene:ENSG00000144647 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000441964 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:43079232:43105939:-1 gene:ENSG00000144647 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// AK124737 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ42747 fis, clone BRAWH3000314, highly similar to Homo sapiens glycosyltransferase (AGO61), mRNA. // chr3 // 96 // 75 // 23 // 24 // 0 /// BC060861 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 39, mRNA (cDNA clone MGC:71796 IMAGE:30335722), complete cds. // chr3 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// XM_006713455 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens uncharacterized LOC102723588 (LOC102723588), mRNA. // chr3 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// GENSCAN00000039614 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:43079689:43081431:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0
NM_001287349 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 852 (ZNF852), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000436261 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:44498970:44510636:-1 gene:ENSG00000178917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000463067 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:44499576:44503110:-1 gene:ENSG00000178917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000489411 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:44499523:44510636:-1 gene:ENSG00000178917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// AK131507 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ16720 fis, clone UTERU3001053. // chr3 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// AK296954 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56103 complete cds, highly similar to Zinc finger protein 167. // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000616809 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:44499182:44510640:-1 gene:ENSG00000178917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000039041 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:44479238:44503330:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0
NM_020696 // RefSeq // Homo sapiens KIAA1143 (KIAA1143), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// XM_005265345 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens KIAA1143 (KIAA1143), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000296121 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:44748744:44761662:-1 gene:ENSG00000163807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 98 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000484437 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:44737661:44761511:-1 gene:ENSG00000163807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 67 // 29 // 29 // 0 /// AK289549 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76370 complete cds. // chr3 // 90 // 91 // 35 // 39 // 0 /// BC008468 // GenBank // Homo sapiens KIAA1143, mRNA (cDNA clone MGC:14734 IMAGE:4277104), complete cds. // chr3 // 95 // 98 // 40 // 42 // 0 /// BC016790 // GenBank // Homo sapiens KIAA1143, mRNA (cDNA clone MGC:24015 IMAGE:4102473), complete cds. // chr3 // 97 // 91 // 38 // 39 // 0 /// ENST00000556746 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:32271857:32272301:-1 gene:ENSG00000259086 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 79 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000030798 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:14:32230273:32412979:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 77 // 77 // 33 // 43 // 1 /// GENSCAN00000039044 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:44742118:44761602:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 79 // 79 // 34 // 43 // 1
NM_001135179 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, DHHC-type containing 3 (ZDHHC3), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// NM_016598 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, DHHC-type containing 3 (ZDHHC3), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// XM_006713190 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens zinc finger, DHHC-type containing 3 (ZDHHC3), transcript variant X6, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 6 // 6 // 1 /// ENST00000339420 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:44915257:44945196:-1 gene:ENSG00000163812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 6 // 6 // 1 /// ENST00000466084 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:44917409:44919338:-1 gene:ENSG00000163812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 6 // 6 // 1 /// AK299782 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57791 complete cds, highly similar to Palmitoyltransferase ZDHHC3 (EC 2.3.1.-). // chr3 // 100 // 100 // 6 // 6 // 1 /// GENSCAN00000024171 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:44917895:44959433:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 6 // 6 // 1
ENST00000516601 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:45034474:45034588:-1 gene:ENSG00000252410 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 92 // 96 // 23 // 25 // 0 /// NONHSAT089385 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 92 // 96 // 23 // 25 // 0
NM_022842 // RefSeq // Homo sapiens CUB domain containing protein 1 (CDCP1), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NM_178181 // RefSeq // Homo sapiens CUB domain containing protein 1 (CDCP1), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000296129 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:45082278:45146422:-1 gene:ENSG00000163814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000425231 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:45110216:45146422:-1 gene:ENSG00000163814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// AF468010 // GenBank // Homo sapiens NCSG135 mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// AY026461 // GenBank // Homo sapiens CUB domain containing protein 1 (CDCP1) mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// AY167484 // GenBank // Homo sapiens transmembrane and associated with src kinases (TRASK) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// AY358779 // GenBank // Homo sapiens clone DNA92253 AGLN2486 (UNQ2486) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// BC021099 // GenBank // Homo sapiens CUB domain containing protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4590554), complete cds. // chr3 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000024176 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:45085638:45146287:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NM_015444 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 158 (gene/pseudogene) (TMEM158), mRNA. // chr3 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// ENST00000503771 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:45224466:45226278:-1 gene:ENSG00000249992 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// AB078417 // GenBank // Homo sapiens hbbp mRNA for p40BBp, complete cds. // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AF438313 // GenBank // Homo sapiens Ras-induced senescence 1 (RIS1) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC057390 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 158, mRNA (cDNA clone MGC:57838 IMAGE:6175193), complete cds. // chr3 // 84 // 84 // 27 // 32 // 1 /// GENSCAN00000024180 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:45225125:45226027:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 81 // 25 // 26 // 0
ENST00000365398 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:45255409:45255620:-1 gene:ENSG00000202268 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT089388 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000429798 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:45679232:45689134:-1 gene:ENSG00000230530 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr3 // 100 // 100 // 4 // 4 // 1 /// BC047037 // GenBank // Homo sapiens, clone IMAGE:5168377, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 4 // 4 // 1 /// NONHSAT089406 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT089399 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr3 // 100 // 100 // 4 // 4 // 1
NM_024513 // RefSeq // Homo sapiens FYVE and coiled-coil domain containing 1 (FYCO1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_005265484 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens FYVE and coiled-coil domain containing 1 (FYCO1), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 55 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000296137 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:45917904:45995815:-1 gene:ENSG00000163820 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000433878 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:45917904:45958572:-1 gene:ENSG00000163820 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 26 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000535325 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:45917899:45995824:-1 gene:ENSG00000163820 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC101468 // GenBank // Homo sapiens FYVE and coiled-coil domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:126517 IMAGE:8068974), complete cds. // chr3 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// BC101470 // GenBank // Homo sapiens FYVE and coiled-coil domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:126519 IMAGE:8068976), complete cds. // chr3 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// BC143368 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone MGC:176890 IMAGE:9051873, complete cds. // chr3 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029278 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:45952554:45995804:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0
NM_001024644 // RefSeq // Homo sapiens chemokine (C motif) receptor 1 (XCR1), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NM_005283 // RefSeq // Homo sapiens chemokine (C motif) receptor 1 (XCR1), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000309285 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:46017024:46027742:-1 gene:ENSG00000173578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000395946 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:46021840:46027487:-1 gene:ENSG00000173578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 90 // 42 // 9 // 10 // 0 /// AK314277 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ95031, highly similar to Homo sapiens chemokine (C motif) receptor 1 (XCR1), mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// BC069075 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C motif) receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:95350 IMAGE:7216889), complete cds. // chr3 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// BC069589 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C motif) receptor 1, transcript variant 2, mRNA (cDNA clone MGC:97068 IMAGE:7262280), complete cds. // chr3 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// BC095533 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C motif) receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:111752 IMAGE:6971949), complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000029270 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:46020946:46021947:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT089427 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 90 // 42 // 9 // 10 // 0
NM_001295 // RefSeq // Homo sapiens chemokine (C-C motif) receptor 1 (CCR1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000296140 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:46201709:46208396:-1 gene:ENSG00000163823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC051306 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-C motif) receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:59862 IMAGE:5485097), complete cds. // chr3 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC064991 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-C motif) receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:71247 IMAGE:5483554), complete cds. // chr3 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// BT019908 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-C motif) receptor 1 mRNA, complete cds. // chr3 // 90 // 37 // 9 // 10 // 0 /// BT019909 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-C motif) receptor 1 mRNA, complete cds. // chr3 // 90 // 37 // 9 // 10 // 0 /// D10925 // GenBank // Homo sapiens mRNA for HM145, complete cds. // chr3 // 90 // 78 // 19 // 21 // 0 /// L09230 // GenBank // Human C-C chemokine receptor type 1 (C-C CKR-1) mRNA, complete cds. // chr3 // 93 // 52 // 13 // 14 // 0 /// L10918 // GenBank // Homo sapiens macrophage inflammatory protein-1-alpha/RANTES receptor mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
NM_024512 // RefSeq // Homo sapiens leucine rich repeat containing 2 (LRRC2), mRNA. // chr3 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000296144 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:46518349:46580099:-1 gene:ENSG00000163827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000395905 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:46515423:46566550:-1 gene:ENSG00000163827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// BC029118 // GenBank // Homo sapiens leucine rich repeat containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:34065 IMAGE:5183639), complete cds. // chr3 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000029263 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:46519014:46551591:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 62 // 21 // 21 // 0
NM_013270 // RefSeq // Homo sapiens protease, serine, 50 (PRSS50), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000315170 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:46712116:46717883:-1 gene:ENSG00000206549 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000460241 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:46712117:46812574:-1 gene:ENSG00000206549 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// AF100707 // GenBank // Homo sapiens testes-specific protein TSP50 (TSP50) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 91 // 10 // 10 // 0 /// BC033016 // GenBank // Homo sapiens testes-specific protease 50, mRNA (cDNA clone MGC:26854 IMAGE:4822455), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC037775 // GenBank // Homo sapiens testes-specific protease 50, mRNA (cDNA clone MGC:41840 IMAGE:5272458), complete cds. // chr3 // 100 // 91 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000029257 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:46712246:46756867:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 10 // 10 // 0 /// AK092598 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ35279 fis, clone PROST2006766, highly similar to Testis-specific protease-like protein 50 precursor. // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// AK097666 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ40347 fis, clone TESTI2033254, highly similar to Testis-specific protease-like protein 50 precursor. // chr3 // 86 // 64 // 6 // 7 // 0
NM_182702 // RefSeq // Homo sapiens protease, serine, 42 (PRSS42), mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000429665 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:46830404:46834095:-1 gene:ENSG00000178055 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000613792 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:46830404:46834095:-1 gene:ENSG00000178055 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000029268 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:46807429:46833184:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
NM_000258 // RefSeq // Homo sapiens myosin, light chain 3, alkali; ventricular, skeletal, slow (MYL3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000292327 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:46857872:46863483:-1 gene:ENSG00000160808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000395869 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:46857872:46863442:-1 gene:ENSG00000160808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF174483 // GenBank // Homo sapiens cardiac myosin light chain-1 (CMLC1) mRNA, complete cds. // chr3 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// BC009790 // GenBank // Homo sapiens myosin, light chain 3, alkali; ventricular, skeletal, slow, mRNA (cDNA clone MGC:13575 IMAGE:4292684), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// M24122 // GenBank // Human myosin alkali light chain (ventricular) mRNA, complete cds. // chr3 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000026213 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:46858244:46863490:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
X58062 // GenBank // H.sapiens U13 snRNA pseudogene U13.4B. // chr3 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// ENST00000459492 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:47250523:47250626:-1 gene:ENSG00000239128 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// NONHSAT089489 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0
ENST00000460111 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:47560229:47560524:-1 gene:ENSG00000244732 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT089517 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 91 // 92 // 20 // 22 // 0
ENST00000362721 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:47931808:47931914:-1 gene:ENSG00000199591 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT089535 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000584239 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:48094801:48095105:-1 gene:ENSG00000265078 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT089539 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_033199 // RefSeq // Homo sapiens urocortin 2 (UCN2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000273610 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:48561727:48563773:-1 gene:ENSG00000145040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// AF320560 // GenBank // Homo sapiens stresscopin-related protein mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 56 // 10 // 10 // 0 /// BC002647 // GenBank // Homo sapiens urocortin 2, mRNA (cDNA clone MGC:4274 IMAGE:3606964), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC022096 // GenBank // Homo sapiens urocortin 2, mRNA (cDNA clone MGC:17394 IMAGE:3916164), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000022085 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:48562786:48563124:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 56 // 10 // 10 // 0
NM_000094 // RefSeq // Homo sapiens collagen, type VII, alpha 1 (COL7A1), mRNA. // chr3 // 100 // 99 // 120 // 120 // 0 /// ENST00000328333 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:48564073:48595267:-1 gene:ENSG00000114270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 121 // 121 // 0 /// ENST00000422991 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:48569758:48571626:-1 gene:ENSG00000114270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 7 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000459756 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:48567698:48570441:-1 gene:ENSG00000114270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 8 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000467985 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:48568164:48570882:-1 gene:ENSG00000114270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 7 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000487017 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:48564073:48584520:-1 gene:ENSG00000114270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 67 // 81 // 81 // 0 /// AB209645 // GenBank // Homo sapiens mRNA for alpha 1 type VII collagen precursor variant protein. // chr3 // 100 // 66 // 80 // 80 // 0 /// L02870 // GenBank // Human alpha-1 type VII collagen (COL7A1) mRNA, complete cds. // chr3 // 97 // 100 // 117 // 121 // 0 /// GENSCAN00000022076 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:48564406:48595159:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 98 // 86 // 102 // 104 // 0 /// NONHSAT089590 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 100 // 8 // 10 // 10 // 0 /// NONHSAT089591 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 100 // 7 // 9 // 9 // 0
NM_001008269 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 89 (TMEM89), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000330862 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:48620759:48621855:-1 gene:ENSG00000183396 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC133034 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 89, mRNA (cDNA clone MGC:164665 IMAGE:40147056), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC133036 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 89, mRNA (cDNA clone MGC:164667 IMAGE:40147058), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022073 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:48599128:48621756:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001407 // RefSeq // Homo sapiens cadherin, EGF LAG seven-pass G-type receptor 3 (CELSR3), mRNA. // chr3 // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// ENST00000164024 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:48636469:48662915:-1 gene:ENSG00000008300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// ENST00000461362 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:48636599:48643930:-1 gene:ENSG00000008300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 17 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000498057 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:48636599:48643930:-1 gene:ENSG00000008300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 19 // 9 // 9 // 0 /// AF231023 // GenBank // Homo sapiens protocadherin Flamingo 1 (FMI1) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// BC111746 // GenBank HTC // Homo sapiens cadherin, EGF LAG seven-pass G-type receptor 3 (flamingo homolog, Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:40068066), with apparent retained intron. // chr3 // 100 // 19 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000022075 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:48625398:48672548:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 98 // 89 // 41 // 42 // 0 /// AY714129 // GenBank // Homo sapiens anchor protein (RESDA1) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 91 // 43 // 43 // 0
NM_000387 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 25 (carnitine/acylcarnitine translocase), member 20 (SLC25A20), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000319017 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:48856936:48898993:-1 gene:ENSG00000178537 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000430379 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:48856931:48898904:-1 gene:ENSG00000178537 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000440964 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:48857392:48898892:-1 gene:ENSG00000178537 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000479050 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:48857241:48858668:-1 gene:ENSG00000178537 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// AK301744 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53016 complete cds, highly similar to Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein. // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC001689 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 25 (carnitine/acylcarnitine translocase), member 20, mRNA (cDNA clone MGC:1207 IMAGE:3050073), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT089611 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000000211 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:48847335:48898794:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_001123040 // RefSeq // Homo sapiens ariadne homolog 2 opposite strand (ARIH2OS), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000408959 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:48917788:48919385:-1 gene:ENSG00000221883 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000000208 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:48918277:48919149:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0
NR_029948 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 425 (MIR425), microRNA. // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000362162 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:49020148:49020234:-1 gene:ENSG00000199032 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// hsa-mir-425 // miRBase Micro RNA Database // MI0001448 Homo sapiens miR-425 stem-loop // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT089649 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NR_029690 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 191 (MIR191), microRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000384873 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:49020602:49020714:-1 gene:ENSG00000207605 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-191 // miRBase Micro RNA Database // MI0000465 Homo sapiens miR-191 stem-loop // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT089650 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_002292 // RefSeq // Homo sapiens laminin, beta 2 (laminin S) (LAMB2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENST00000305544 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:49121133:49133020:-1 gene:ENSG00000172037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 98 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000418109 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:49121114:49133118:-1 gene:ENSG00000172037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 98 // 100 // 42 // 43 // 0 /// S77512 // GenBank // Homo sapiens laminin beta 2 chain (LAMB2) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 98 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000000229 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:49108412:49164208:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 35 // 35 // 0
NM_022903 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 71 (CCDC71), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000321895 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:49162535:49166321:-1 gene:ENSG00000177352 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC035516 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 71, mRNA (cDNA clone MGC:34190 IMAGE:5229681), complete cds. // chr3 // 94 // 100 // 15 // 16 // 0 /// AK023691 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ13629 fis, clone PLACE1011056, weakly similar to HISTONE H1, GONADAL. // chr3 // 50 // 50 // 8 // 16 // 1 /// GENSCAN00000000229 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:49108412:49164208:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0
NM_198562 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 62 (C3orf62), mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000343010 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:49268786:49277909:-1 gene:ENSG00000188315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000424960 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:49271203:49276842:-1 gene:ENSG00000188315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 91 // 41 // 10 // 11 // 0 /// ENST00000479673 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:49268602:49274534:-1 gene:ENSG00000188315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// AK096799 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39480 fis, clone PROST2014422. // chr3 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// BC023586 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 62, mRNA (cDNA clone MGC:23381 IMAGE:4650297), complete cds. // chr3 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC053629 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 62, mRNA (cDNA clone MGC:61663 IMAGE:6204001), complete cds. // chr3 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// BC061697 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 62, mRNA (cDNA clone MGC:62079 IMAGE:6737728), complete cds. // chr3 // 95 // 74 // 19 // 20 // 0 /// ENST00000436325 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:49271406:49277219:-1 gene:ENSG00000188315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_201397 // RefSeq // Homo sapiens glutathione peroxidase 1 (GPX1), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000419349 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:49357178:49358283:-1 gene:ENSG00000233276 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0
NM_198722 // RefSeq // Homo sapiens adhesion molecule with Ig-like domain 3 (AMIGO3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000320431 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:49716834:49719695:-1 gene:ENSG00000176020 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000480687 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:49716844:49723951:-1 gene:ENSG00000173540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AY237003 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein AMIGO3 (AMIGO3) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// AY358134 // GenBank // Homo sapiens clone DNA147293 TWLV6084 (UNQ6084) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC101363 // GenBank // Homo sapiens adhesion molecule with Ig-like domain 3, mRNA (cDNA clone MGC:120549 IMAGE:40025738), complete cds. // chr3 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// BC101364 // GenBank // Homo sapiens adhesion molecule with Ig-like domain 3, mRNA (cDNA clone MGC:120550 IMAGE:40025739), complete cds. // chr3 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// BC101365 // GenBank // Homo sapiens adhesion molecule with Ig-like domain 3, mRNA (cDNA clone MGC:120552 IMAGE:40025741), complete cds. // chr3 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// BC110418 // GenBank // Homo sapiens adhesion molecule with Ig-like domain 3, mRNA (cDNA clone MGC:117236 IMAGE:5211193), complete cds. // chr3 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000000228 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:49717951:49719465:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// AB058754 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1851 protein, partial cds. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
ENST00000343366 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:49798232:49799835:-1 gene:ENSG00000187492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000487256 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:49798327:49799835:-1 gene:ENSG00000187492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// AY358221 // GenBank // Homo sapiens clone DNA188150 VLLR9392 (UNQ9392) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC132756 // GenBank // Homo sapiens cadherin-like 29, mRNA (cDNA clone IMAGE:40146778), complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC144445 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone MGC:177987 IMAGE:9052970, complete cds. // chr3 // 96 // 82 // 22 // 23 // 0 /// NM_001007540 // RefSeq // Homo sapiens cadherin-related family member 4 (CDHR4), mRNA. // chr3 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// ENST00000412678 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:49790732:49799821:-1 gene:ENSG00000187492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// BC146674 // GenBank // Homo sapiens cadherin-like 29, mRNA (cDNA clone MGC:164982 IMAGE:40148497), complete cds. // chr3 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// GENSCAN00000000207 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:49721752:49799812:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_003335 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin-like modifier activating enzyme 7 (UBA7), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000333486 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:49805207:49813946:-1 gene:ENSG00000182179 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC006378 // GenBank // Homo sapiens ubiquitin-like modifier activating enzyme 7, mRNA (cDNA clone MGC:12713 IMAGE:4299266), complete cds. // chr3 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// BT007026 // GenBank // Homo sapiens ubiquitin-activating enzyme E1-like mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// L13852 // GenBank // Homo sapiens ubiquitin-activating enzyme E1 related protein mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000000219 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:49805893:49813942:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0
ENST00000584520 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:49863375:49863660:-1 gene:ENSG00000264706 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT089767 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_007275 // RefSeq // Homo sapiens tumor suppressor candidate 2 (TUSC2), mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000232496 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:50324907:50328243:-1 gene:ENSG00000114383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000421918 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:50326008:50328251:-1 gene:ENSG00000114383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000454201 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:50326008:50328206:-1 gene:ENSG00000114383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000463304 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:50326090:50328238:-1 gene:ENSG00000114383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 95 // 59 // 19 // 20 // 0 /// AF055479 // GenBank // Homo sapiens lung cancer candidate FUS1 (FUS1) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// BC023976 // GenBank // Homo sapiens tumor suppressor candidate 2, mRNA (cDNA clone MGC:1932 IMAGE:3504783), complete cds. // chr3 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000417867 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:50326356:50328195:-1 gene:ENSG00000114383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 59 // 59 // 20 // 34 // 1 /// ENST00000462137 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:50320027:50328157:-1 gene:ENSG00000114383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 53 // 53 // 18 // 34 // 1 /// GENSCAN00000042700 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:50326121:50328099:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 53 // 18 // 18 // 0
NM_007024 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 115 (TMEM115), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000266025 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:50354749:50359610:-1 gene:ENSG00000126062 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC011948 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 115, mRNA (cDNA clone MGC:18285 IMAGE:4178931), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC017367 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 115, mRNA (cDNA clone MGC:1238 IMAGE:3010216), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// CR457020 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834H095D for gene PL6, placental protein 6; complete cds, incl. stopcodon. // chr3 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// U09584 // GenBank // Human PL6 protein (PL6) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042694 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:50355343:50359063:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0
NM_013324 // RefSeq // Homo sapiens cytokine inducible SH2-containing protein (CISH), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// NM_145071 // RefSeq // Homo sapiens cytokine inducible SH2-containing protein (CISH), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000348721 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:50606522:50611831:-1 gene:ENSG00000114737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000443053 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:50606496:50611772:-1 gene:ENSG00000114737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000491847 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:50606490:50611761:-1 gene:ENSG00000114737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF035947 // GenBank // Homo sapiens cytokine-inducible inhibitor of signalling type 1b mRNA, complete cds. // chr3 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// AF132297 // GenBank // Homo sapiens cytokine-inducible SH2-containing protein (G18) mRNA, complete cds. // chr3 // 95 // 68 // 20 // 21 // 0 /// BC031590 // GenBank // Homo sapiens cytokine inducible SH2-containing protein, mRNA (cDNA clone MGC:34375 IMAGE:5182644), complete cds. // chr3 // 94 // 58 // 17 // 18 // 0 /// BC064354 // GenBank // Homo sapiens cytokine inducible SH2-containing protein, mRNA (cDNA clone MGC:75431 IMAGE:4804249), complete cds. // chr3 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// D83532 // GenBank // Homo sapiens mRNA for cytokine-inducible SH2-containing protein, complete cds. // chr3 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000042715 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:50607607:50614127:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0
ENST00000442420 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:50786674:50788285:-1 gene:ENSG00000235278 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000042723 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:50786658:50788088:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT089856 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001171904 // RefSeq // Homo sapiens Vpr (HIV-1) binding protein (VPRBP), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// NM_014703 // RefSeq // Homo sapiens Vpr (HIV-1) binding protein (VPRBP), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// XM_006713427 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens Vpr (HIV-1) binding protein (VPRBP), transcript variant X9, mRNA. // chr3 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// XR_254197 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens Vpr (HIV-1) binding protein (VPRBP), transcript variant X6, misc_RNA. // chr3 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000335891 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:51397842:51483838:-1 gene:ENSG00000145041 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 62 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000423656 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:51395867:51499994:-1 gene:ENSG00000145041 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000504652 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:51395867:51500002:-1 gene:ENSG00000145041 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// BC022792 // GenBank // Homo sapiens Vpr (HIV-1) binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:23092 IMAGE:4853730), complete cds. // chr3 // 100 // 68 // 23 // 23 // 0 /// BC110371 // GenBank // Homo sapiens Vpr (HIV-1) binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:102804 IMAGE:5547856), complete cds. // chr3 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000004958 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:51398769:51509045:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0
ENST00000408088 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:51611438:51611562:-1 gene:ENSG00000221015 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT089871 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000364725 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:51694465:51694582:-1 gene:ENSG00000201595 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT089879 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_152397 // RefSeq // Homo sapiens IQ motif containing F1 (IQCF1), mRNA. // chr3 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// XM_005264877 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens IQ motif containing F1 (IQCF1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000310914 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:51894876:51903335:-1 gene:ENSG00000173389 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000314534 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:51894876:51903335:-1 gene:ENSG00000173389 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// BC029595 // GenBank // Homo sapiens IQ motif containing F1, mRNA (cDNA clone MGC:39725 IMAGE:5273825), complete cds. // chr3 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// BC034228 // GenBank // Homo sapiens IQ motif containing F1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5266078), complete cds. // chr3 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000012762 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:51894890:51938976:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_004704 // RefSeq // Homo sapiens ribosomal RNA processing 9, small subunit (SSU) processome component, homolog (yeast) (RRP9), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000232888 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:51933430:51941941:-1 gene:ENSG00000114767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC001113 // GenBank // Homo sapiens ribosomal RNA processing 9, small subunit (SSU) processome component, homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:1474 IMAGE:3050186), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC009879 // GenBank // Homo sapiens ribosomal RNA processing 9, small subunit (SSU) processome component, homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:16472 IMAGE:3954043), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC010048 // GenBank // Homo sapiens ribosomal RNA processing 9, small subunit (SSU) processome component, homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:19546 IMAGE:3832948), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC023662 // GenBank // Homo sapiens ribosomal RNA processing 9, small subunit (SSU) processome component, homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:29699 IMAGE:4898690), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000012762 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:51894890:51938976:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0
NM_001947 // RefSeq // Homo sapiens dual specificity phosphatase 7 (DUSP7), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000495880 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:3:52048919:52056550:-1 gene:ENSG00000164086 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF508727 // GenBank // Homo sapiens dual-specificity phosphatase 7 PYST2-L (PYST2) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC104880 // GenBank // Homo sapiens dual specificity phosphatase 7, mRNA (cDNA clone MGC:132540 IMAGE:8143883), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC104882 // GenBank // Homo sapiens dual specificity phosphatase 7, mRNA (cDNA clone MGC:132542 IMAGE:8143885), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000469623 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:52051632:52056165:-1 gene:ENSG00000164086 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// GENSCAN00000012765 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:51993749:52056366:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
NM_001161580 // RefSeq // Homo sapiens POC1 centriolar protein A (POC1A), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// NM_001161581 // RefSeq // Homo sapiens POC1 centriolar protein A (POC1A), transcript variant 3, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// NM_015426 // RefSeq // Homo sapiens POC1 centriolar protein A (POC1A), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000296484 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:52075253:52154412:-1 gene:ENSG00000164087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000394970 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:52075286:52154690:-1 gene:ENSG00000164087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000474012 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:3:52075454:52154404:-1 gene:ENSG00000164087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// AF088072 // GenBank // Homo sapiens full length insert cDNA clone ZD93D10. // chr3 // 91 // 28 // 10 // 11 // 0 /// BC007417 // GenBank // Homo sapiens WD repeat domain 51A, mRNA (cDNA clone IMAGE:2989835), partial cds. // chr3 // 94 // 79 // 29 // 31 // 0 /// BC110877 // GenBank // Homo sapiens WD repeat domain 51A, mRNA (cDNA clone MGC:131902 IMAGE:5588109), complete cds. // chr3 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// BC119692 // GenBank // Homo sapiens WD repeat domain 51A, mRNA (cDNA clone MGC:149611 IMAGE:40116721), complete cds. // chr3 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000012747 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:52119982:52176710:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 62 // 62 // 24 // 39 // 1
NM_025222 // RefSeq // Homo sapiens WD repeat domain 82 (WDR82), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000296490 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:52254421:52278643:-1 gene:ENSG00000164091 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000487402 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:52254960:52268138:-1 gene:ENSG00000164091 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0 /// AK123860 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ41866 fis, clone OCBBF2004883. // chr3 // 86 // 64 // 6 // 7 // 0 /// AK291380 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77819 complete cds. // chr3 // 100 // 73 // 8 // 8 // 0 /// AY358264 // GenBank // Homo sapiens clone DNA181718 WD40 protein (UNQ9342) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 73 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000012719 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:52257490:52278361:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 73 // 8 // 8 // 0
NR_029660 // RefSeq // Homo sapiens microRNA let-7g (MIRLET7G), microRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000362280 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:52268267:52268377:-1 gene:ENSG00000199150 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-let-7g // miRBase Micro RNA Database // MI0000433 Homo sapiens let-7g stem-loop // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT089906 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029677 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 135a-1 (MIR135A1), microRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000385191 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:52294219:52294308:-1 gene:ENSG00000207926 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-135a-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0000452 Homo sapiens miR-135a-1 stem-loop // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_003280 // RefSeq // Homo sapiens troponin C type 1 (slow) (TNNC1), mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000232975 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:52451102:52454070:-1 gene:ENSG00000114854 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF020769 // GenBank // Homo sapiens cardiac ventricular troponin C mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// BC030244 // GenBank // Homo sapiens troponin C type 1 (slow), mRNA (cDNA clone MGC:39997 IMAGE:5213381), complete cds. // chr3 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// CR541865 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834E0932D for gene TNNC1, troponin C, slow; complete cds, incl. stopcodon. // chr3 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// CR541885 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834A0633D for gene TNNC1, troponin C, slow; complete cds, without stopcodon. // chr3 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000496590 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:52451415:52452834:-1 gene:ENSG00000114854 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// ENST00000461086 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:52451439:52451991:-1 gene:ENSG00000114854 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// GENSCAN00000012750 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:52451275:52454015:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT089925 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NM_001198974 // RefSeq // Homo sapiens TMEM110-MUSTN1 readthrough (TMEM110-MUSTN1), mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NM_198563 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 110 (TMEM110), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000355083 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:52836756:52897596:-1 gene:ENSG00000213533 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000504329 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:3:52833150:52897562:-1 gene:ENSG00000248592 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC047015 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 110, mRNA (cDNA clone MGC:52022 IMAGE:5199769), complete cds. // chr3 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000019620 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:52833324:52897450:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 83 // 83 // 25 // 30 // 1
NM_016329 // RefSeq // Homo sapiens Scm-like with four mbt domains 1 (SFMBT1), mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000394752 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:52903572:53046068:-1 gene:ENSG00000163935 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AB189472 // GenBank // Homo sapiens SFMBT mRNA for Scm-related gene product containing four mbt domains, complete cds. // chr3 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// AF168132 // GenBank // Homo sapiens RU1 (RU1) mRNA, complete cds. // chr3 // 93 // 90 // 25 // 27 // 0 /// BC014614 // GenBank // Homo sapiens Scm-like with four mbt domains 1, mRNA (cDNA clone MGC:3342 IMAGE:3029598), complete cds. // chr3 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000019627 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:52905136:52969128:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 88 // 53 // 14 // 16 // 0
NM_052859 // RefSeq // Homo sapiens RFT1 homolog (S. cerevisiae) (RFT1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// ENST00000296292 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:53088483:53130462:-1 gene:ENSG00000163933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0
NM_052859 // RefSeq // Homo sapiens RFT1 homolog (S. cerevisiae) (RFT1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_005265537 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens RFT1 homolog (S. cerevisiae) (RFT1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 95 // 71 // 21 // 22 // 0 /// XM_006713384 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens RFT1 homolog (S. cerevisiae) (RFT1), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000296292 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:53088483:53130462:-1 gene:ENSG00000163933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000394738 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:53091665:53130453:-1 gene:ENSG00000163933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000467048 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:53104042:53130411:-1 gene:ENSG00000163933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0 /// AJ318099 // GenBank // Homo sapiens mRNA for putative endoplasmic reticulum multispan transmembrane protein (RFT1 gene). // chr3 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC043595 // GenBank // Homo sapiens RFT1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:50674 IMAGE:5769824), complete cds. // chr3 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// ENST00000471158 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:53103573:53120021:-1 gene:ENSG00000163933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1 /// GENSCAN00000019626 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:53064282:53130400:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 68 // 68 // 21 // 31 // 1
NONHSAT089990 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000384381 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:53333060:53333128:-1 gene:ENSG00000207109 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT089997 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_018397 // RefSeq // Homo sapiens choline dehydrogenase (CHDH), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000315251 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:53812335:53846390:-1 gene:ENSG00000016391 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000467802 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:53823631:53844769:-1 gene:ENSG00000016391 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 35 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000481668 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:53823544:53844617:-1 gene:ENSG00000016391 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 39 // 9 // 9 // 0 /// AJ272267 // GenBank // Homo sapiens partial mRNA for choline dehydrogenase (chdh gene). // chr3 // 93 // 65 // 14 // 15 // 0 /// AK297575 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61138 complete cds, highly similar to Choline dehydrogenase, mitochondrial precursor (EC 1.1.99.1). // chr3 // 100 // 43 // 10 // 10 // 0 /// BC034502 // GenBank // Homo sapiens choline dehydrogenase, mRNA (cDNA clone MGC:26969 IMAGE:4824572), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000021646 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:53817777:53824008:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 94 // 78 // 17 // 18 // 0
NM_022899 // RefSeq // Homo sapiens ARP8 actin-related protein 8 homolog (yeast) (ACTR8), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000335754 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:53867066:53882202:-1 gene:ENSG00000113812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000482349 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:53868502:53881824:-1 gene:ENSG00000113812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000486794 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:3:53868653:53877293:-1 gene:ENSG00000113812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 53 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000498740 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:53877259:53881857:-1 gene:ENSG00000113812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 90 // 29 // 9 // 10 // 0 /// AK094507 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ37188 fis, clone BRALZ2002174, highly similar to Actin-related protein 8. // chr3 // 96 // 82 // 27 // 28 // 0 /// BC032744 // GenBank // Homo sapiens ARP8 actin-related protein 8 homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:44968 IMAGE:5575464), complete cds. // chr3 // 94 // 53 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000021666 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:53868719:53883743:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0
NM_021237 // RefSeq // Homo sapiens selenoprotein K (SELK), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000488746 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:53885301:53891865:-1 gene:ENSG00000113811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 45 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000495461 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:53884410:53891988:-1 gene:ENSG00000113811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000541726 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:53885200:53891962:-1 gene:ENSG00000113811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AF537132 // GenBank // Homo sapiens selenoprotein K mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 60 // 12 // 12 // 0 /// AK289594 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76513 complete cds, highly similar to Homo sapiens HSPC030 mRNA. // chr3 // 100 // 45 // 9 // 9 // 0 /// BC013162 // GenBank // Homo sapiens selenoprotein K, mRNA (cDNA clone MGC:17057 IMAGE:4345594), complete cds. // chr3 // 100 // 65 // 13 // 13 // 0
NM_020678 // RefSeq // Homo sapiens leucine-rich repeats and transmembrane domains 1 (LRTM1), mRNA. // chr3 // 95 // 87 // 19 // 20 // 0 /// ENST00000273286 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:54918237:54928074:-1 gene:ENSG00000144771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000493075 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:54918333:54967088:-1 gene:ENSG00000144771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// AF225421 // GenBank // Homo sapiens HT017 mRNA, complete cds. // chr3 // 95 // 87 // 19 // 20 // 0 /// BC040732 // GenBank // Homo sapiens leucine-rich repeats and transmembrane domains 1, mRNA (cDNA clone MGC:50257 IMAGE:5223743), complete cds. // chr3 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// BC074741 // GenBank // Homo sapiens leucine-rich repeats and transmembrane domains 1, mRNA (cDNA clone MGC:103818 IMAGE:30915199), complete cds. // chr3 // 100 // 70 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000047531 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:54918459:54942254:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0
NM_015576 // RefSeq // Homo sapiens ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 2 (ERC2), mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000288221 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:55508308:56468363:-1 gene:ENSG00000187672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000460849 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:55510776:56468337:-1 gene:ENSG00000187672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 93 // 43 // 43 // 0 /// ENST00000492584 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:55734838:56173510:-1 gene:ENSG00000187672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 50 // 23 // 23 // 0 /// BC111550 // GenBank // Homo sapiens ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 2, mRNA (cDNA clone MGC:133063 IMAGE:40008953), complete cds. // chr3 // 100 // 93 // 43 // 43 // 0 /// BC112391 // GenBank // Homo sapiens ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 2, mRNA (cDNA clone MGC:133064 IMAGE:40008962), complete cds. // chr3 // 100 // 85 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000612797 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:55510776:56468337:-1 gene:ENSG00000187672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 43 // 43 // 0 /// BC046212 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA similar to cytomatrix protein p110 (cDNA clone IMAGE:6192926). // chr3 // 100 // 37 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000005592 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:55888385:56085630:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 35 // 35 // 16 // 46 // 1 /// GENSCAN00000005602 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:56116253:56362489:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 22 // 22 // 10 // 46 // 1
NR_024615 // RefSeq // Homo sapiens ERC2 intronic transcript 1 (non-protein coding) (ERC2-IT1), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// U88965 // GenBank // Human PO42 gene, complete cds. // chr3 // 82 // 100 // 23 // 28 // 0 /// NONHSAT090039 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_003865 // RefSeq // Homo sapiens HESX homeobox 1 (HESX1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000295934 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:57197843:57199987:-1 gene:ENSG00000163666 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000473921 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:57197916:57199938:-1 gene:ENSG00000163666 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// BC069515 // GenBank // Homo sapiens HESX homeobox 1, mRNA (cDNA clone MGC:96906 IMAGE:7262115), complete cds. // chr3 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// BC093979 // GenBank // Homo sapiens HESX homeobox 1, mRNA (cDNA clone MGC:121014 IMAGE:7939824), complete cds. // chr3 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// BC112089 // GenBank // Homo sapiens HESX homeobox 1, mRNA (cDNA clone MGC:138294 IMAGE:8327557), complete cds. // chr3 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000495160 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:57198789:57226521:-1 gene:ENSG00000163666 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// U82811 // GenBank // Human homeodomain-containing protein (HANF) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0
XM_005264885 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ankyrin repeat and SOCS box containing 14 (ASB14), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 95 // 71 // 19 // 20 // 0 /// ENST00000515033 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:57276550:57278952:-1 gene:ENSG00000239388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// AF403032 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat domain-containing SOCS box protein Asb-14 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// BC114953 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat and SOCS box-containing 14, mRNA (cDNA clone MGC:138537 IMAGE:40004208), complete cds. // chr3 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// NM_001142733 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat and SOCS box containing 14 (ASB14), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// NM_130387 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat and SOCS box containing 14 (ASB14), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 1 /// ENST00000389601 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:57268351:57292682:-1 gene:ENSG00000239388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// ENST00000487349 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:57268347:57292682:-1 gene:ENSG00000239388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// AL832472 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp313L0121 (from clone DKFZp313L0121). // chr3 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1 /// GENSCAN00000014042 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:57276550:57542870:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1
NM_001291661 // RefSeq // Homo sapiens dynein, axonemal, heavy chain 12 (DNAH12), transcript variant 3, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000351747 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:57293699:57544344:-1 gene:ENSG00000174844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000462713 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:57293700:57297308:-1 gene:ENSG00000174844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000466540 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:57293749:57352227:-1 gene:ENSG00000174844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000479363 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:57293704:57297151:-1 gene:ENSG00000174844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000494758 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:57293700:57309245:-1 gene:ENSG00000174844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 29 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000495027 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:57293699:57544344:-1 gene:ENSG00000174844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000014042 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:57276550:57542870:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0
NM_001291661 // RefSeq // Homo sapiens dynein, axonemal, heavy chain 12 (DNAH12), transcript variant 3, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000351747 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:57293699:57544344:-1 gene:ENSG00000174844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000495027 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:57293699:57544344:-1 gene:ENSG00000174844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// U53532 // GenBank // Human cytoplasmic dynein 3 heavy chain mRNA, partial cds. // chr3 // 75 // 67 // 15 // 20 // 0 /// Z83802 // GenBank // H.sapiens mRNA for axonemal dynein heavy chain (partial, ID hdhc3). // chr3 // 79 // 47 // 11 // 14 // 0 /// GENSCAN00000014042 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:57276550:57542870:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
NM_001291661 // RefSeq // Homo sapiens dynein, axonemal, heavy chain 12 (DNAH12), transcript variant 3, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// NM_198564 // RefSeq // Homo sapiens dynein, axonemal, heavy chain 12 (DNAH12), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000311202 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:57498500:57544344:-1 gene:ENSG00000174844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000351747 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:57293699:57544344:-1 gene:ENSG00000174844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000389536 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:57468653:57544344:-1 gene:ENSG00000174844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000495027 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:57293699:57544344:-1 gene:ENSG00000174844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000613504 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:57498004:57544341:-1 gene:ENSG00000174844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000014042 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:57276550:57542870:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
NONHSAT090078 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000365558 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:57536252:57536358:-1 gene:ENSG00000202428 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT090083 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_152678 // RefSeq // Homo sapiens DENN/MADD domain containing 6A (DENND6A), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000311128 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:57625457:57693089:-1 gene:ENSG00000174839 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC040291 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 116, member A, mRNA (cDNA clone MGC:42456 IMAGE:4822560), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC054343 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 116, member A, mRNA (cDNA clone IMAGE:6503360), partial cds. // chr3 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000014048 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:57572212:57693018:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_138805 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 3, member D (FAM3D), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_005264864 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens family with sequence similarity 3, member D (FAM3D), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000358781 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:58633946:58666848:-1 gene:ENSG00000198643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000489857 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:58637152:58666834:-1 gene:ENSG00000198643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 84 // 54 // 16 // 19 // 0 /// ENST00000498347 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:58643676:58657748:-1 gene:ENSG00000198643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 88 // 46 // 14 // 16 // 0 /// AF494381 // GenBank // Homo sapiens cytokine-like protein EF-7 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// AY358677 // GenBank // Homo sapiens clone DNA59814 FAM3D (UNQ567) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC015359 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 3, member D, mRNA (cDNA clone MGC:21481 IMAGE:3852062), complete cds. // chr3 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000483787 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:58637142:58657766:-1 gene:ENSG00000198643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 54 // 54 // 19 // 35 // 1 /// ENST00000482623 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:58637155:58657696:-1 gene:ENSG00000198643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1 /// GENSCAN00000049831 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:58634279:58758477:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 74 // 74 // 26 // 35 // 1
AF134979 // GenBank // Homo sapiens nasopharyngeal carcinoma-related protein (NPCR) mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// AF156973 // GenBank // Homo sapiens nasopharyngeal carcinoma down-regulated protein (NPCDRG) mRNA, complete cds. // chr3 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 /// NONHSAT090157 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000496953 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:60690225:60690719:-1 gene:ENSG00000232407 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000046953 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:60690225:60690719:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000516611 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:61739127:61739229:-1 gene:ENSG00000252420 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT090172 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000472730 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:61742455:61743106:-1 gene:ENSG00000226360 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000037972 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:61742455:61779152:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 11 // 11 // 0
M96843 // GenBank // Human striated muscle contraction regulatory protein (Id2B) mRNA, complete cds. // chr3 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// ENST00000462623 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:62124204:62124608:-1 gene:ENSG00000237456 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 87 // 60 // 13 // 15 // 0
NM_018008 // RefSeq // Homo sapiens FEZ family zinc finger 2 (FEZF2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000283268 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:62369684:62373515:-1 gene:ENSG00000153266 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000475839 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:62369692:62373015:-1 gene:ENSG00000153266 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000486811 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:62369681:62374324:-1 gene:ENSG00000153266 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF332890 // GenBank HTC // Homo sapiens zinc finger FEZL (FKSG36) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// AK290464 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76101 complete cds, highly similar to Homo sapiens zinc finger protein 312 (ZNF312), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC022464 // GenBank // Homo sapiens FEZ family zinc finger 2, mRNA (cDNA clone MGC:26179 IMAGE:4794121), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AK001004 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ10142 fis, clone HEMBA1003257. // chr3 // 76 // 76 // 22 // 29 // 1 /// GENSCAN00000005648 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:62370083:62372868:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0
ENST00000462370 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:62796124:62796419:-1 gene:ENSG00000244632 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT090191 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000363352 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:64071807:64072019:-1 gene:ENSG00000200222 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT090228 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NR_033978 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 994 (LINC00994), long non-coding RNA. // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000485805 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:64078361:64087363:-1 gene:ENSG00000189196 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONHSAT090229 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// TCONS_00005397-XLOC_003145 // Rinn lincRNA // linc-PSMD6 chr3:-:64064036-64073039 // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002524 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:64067842:64097428:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_198859 // RefSeq // Homo sapiens prickle homolog 2 (Drosophila) (PRICKLE2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_005264910 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens prickle homolog 2 (Drosophila) (PRICKLE2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// XM_006713007 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens prickle homolog 2 (Drosophila) (PRICKLE2), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 100 // 56 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000295902 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:64093867:64225455:-1 gene:ENSG00000163637 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000498162 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:64157310:64267979:-1 gene:ENSG00000163637 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 25 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000564377 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:64097522:64445382:-1 gene:ENSG00000163637 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 61 // 22 // 22 // 0 /// AK127113 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ45170 fis, clone BRAWH3045229. // chr3 // 92 // 36 // 12 // 13 // 0 /// BC119002 // GenBank // Homo sapiens prickle homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:141845 IMAGE:40082599), complete cds. // chr3 // 89 // 78 // 25 // 28 // 0 /// GENSCAN00000002526 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:64133434:64168854:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 39 // 39 // 14 // 36 // 1
ENST00000365201 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:66003839:66003940:-1 gene:ENSG00000202071 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT090294 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
AY358705 // GenBank // Homo sapiens clone DNA71234 HHSL751 (UNQ751) mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 96 // 22 // 23 // 0 /// ENST00000366454 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:66008770:66009200:-1 gene:ENSG00000203647 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 90 // 42 // 9 // 10 // 0 /// NONHSAT090295 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr3 // 90 // 42 // 9 // 10 // 0
NM_001177599 // RefSeq // Homo sapiens succinate-CoA ligase, GDP-forming, beta subunit (SUCLG2), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0 /// NM_003848 // RefSeq // Homo sapiens succinate-CoA ligase, GDP-forming, beta subunit (SUCLG2), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000307227 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:67374719:67654614:-1 gene:ENSG00000172340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000492795 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:67408606:67654607:-1 gene:ENSG00000172340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000493112 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:3:67360460:67654610:-1 gene:ENSG00000172340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0 /// AK294598 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50080 complete cds, highly similar to Succinyl-CoA ligase (GDP-forming) beta-chain, mitochondrial precursor (EC 6.2.1.4). // chr3 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0 /// BC007716 // GenBank // Homo sapiens succinate-CoA ligase, GDP-forming, beta subunit, mRNA (cDNA clone MGC:12896 IMAGE:4303307), complete cds. // chr3 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// BC047024 // GenBank // Homo sapiens succinate-CoA ligase, GDP-forming, beta subunit, mRNA (cDNA clone MGC:52082 IMAGE:5415743), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC068602 // GenBank // Homo sapiens succinate-CoA ligase, GDP-forming, beta subunit, mRNA (cDNA clone MGC:87665 IMAGE:5274341), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// XR_245062 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens succinate-CoA ligase, GDP-forming, beta subunit (SUCLG2), transcript variant X2, misc_RNA. // chr3 // 89 // 89 // 8 // 9 // 1
NM_001005527 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 19 (chemokine (C-C motif)-like), member A4 (FAM19A4), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NM_182522 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 19 (chemokine (C-C motif)-like), member A4 (FAM19A4), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000295569 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:68731766:68932610:-1 gene:ENSG00000163377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000495737 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:68752916:68932568:-1 gene:ENSG00000163377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 94 // 55 // 15 // 16 // 0 /// AY325117 // GenBank // Homo sapiens TAFA4 mRNA, complete cds. // chr3 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// BC031566 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 19 (chemokine (C-C motif)-like), member A4, mRNA (cDNA clone MGC:35479 IMAGE:5195201), complete cds. // chr3 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0
NM_007114 // RefSeq // Homo sapiens TATA element modulatory factor 1 (TMF1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000398559 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:69019827:69052303:-1 gene:ENSG00000144747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000488010 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:69023077:69052290:-1 gene:ENSG00000144747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000543976 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:69023177:69052086:-1 gene:ENSG00000144747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 97 // 100 // 38 // 39 // 0 /// BC117418 // GenBank // Homo sapiens TATA element modulatory factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:151027 IMAGE:40125969), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// BC126123 // GenBank // Homo sapiens TATA element modulatory factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:161401 IMAGE:8991839), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// BC143840 // GenBank // Homo sapiens TATA element modulatory factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:177372 IMAGE:9052355), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// L01042 // GenBank // Homo sapiens TATA element modulatory factor mRNA, complete cds. // chr3 // 95 // 100 // 37 // 39 // 0 /// GENSCAN00000007947 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:69023177:69077917:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 72 // 28 // 28 // 0
NM_198271 // RefSeq // Homo sapiens leiomodin 3 (fetal) (LMOD3), mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000420581 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:69106872:69122566:-1 gene:ENSG00000163380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000475434 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:69108724:69123032:-1 gene:ENSG00000163380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000489031 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:69108672:69122595:-1 gene:ENSG00000163380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// AK300096 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54332 complete cds, highly similar to Homo sapiens leiomodin 3 (fetal) (LMOD3), mRNA. // chr3 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// BC017925 // GenBank // Homo sapiens leiomodin 3 (fetal), mRNA (cDNA clone IMAGE:4290663). // chr3 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// BC121019 // GenBank // Homo sapiens leiomodin 3 (fetal), mRNA (cDNA clone MGC:149678 IMAGE:40117347), complete cds. // chr3 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC039202 // GenBank // Homo sapiens leiomodin 3 (fetal), mRNA (cDNA clone IMAGE:4246558), complete cds. // chr3 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// GENSCAN00000007944 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:69118672:69122386:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_015123 // RefSeq // Homo sapiens FERM domain containing 4B (FRMD4B), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_005264722 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens FERM domain containing 4B (FRMD4B), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000398540 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:69169990:69386073:-1 gene:ENSG00000114541 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000478263 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:69170807:69200848:-1 gene:ENSG00000114541 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// AK295045 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57979 complete cds, highly similar to FERM domain-containing protein 4B. // chr3 // 95 // 78 // 20 // 21 // 0 /// AL832231 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686E1053 (from clone DKFZp686E1053). // chr3 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000470070 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:69197715:69320944:-1 gene:ENSG00000114541 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// AK000244 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ20237 fis, clone COLF5879, highly similar to AB023230 Homo sapiens mRNA for KIAA1013 protein. // chr3 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// GENSCAN00000007941 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:69171861:69324179:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
ENST00000473031 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:69769487:69769773:-1 gene:ENSG00000241665 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT090368 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_017619 // RefSeq // Homo sapiens RNA-binding region (RNP1, RRM) containing 3 (RNPC3), mRNA. // chr3 // 41 // 96 // 11 // 27 // 0 /// ENST00000423855 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:103525971:103555239:1 gene:ENSG00000185946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 41 // 96 // 11 // 27 // 0 /// ENST00000524631 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:103525691:103553343:1 gene:ENSG00000185946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 42 // 93 // 11 // 26 // 0 /// ENST00000533099 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:103525699:103555112:1 gene:ENSG00000185946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 41 // 96 // 11 // 27 // 0 /// AK057799 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ25070 fis, clone CBL05164. // chr3 // 41 // 96 // 11 // 27 // 0 /// AK289844 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77710 complete cds. // chr3 // 42 // 93 // 11 // 26 // 0 /// AY099329 // GenBank // Homo sapiens RNA recognition protein (RNP) mRNA, complete cds. // chr3 // 41 // 96 // 11 // 27 // 0 /// BC010697 // GenBank // Homo sapiens RNA-binding region (RNP1, RRM) containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:9935 IMAGE:3873751), complete cds. // chr3 // 41 // 96 // 11 // 27 // 0 /// ENST00000605810 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:70125070:70126609:-1 gene:ENSG00000271034 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONHSAT090376 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB058742 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1839 protein, partial cds. // chr3 // 41 // 96 // 11 // 27 // 0 /// GENSCAN00000042690 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:70083399:70126573:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1