NM_000405 // RefSeq // Homo sapiens GM2 ganglioside activator (GM2A), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NM_001167607 // RefSeq // Homo sapiens GM2 ganglioside activator (GM2A), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000357164 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:151252892:151270440:1 gene:ENSG00000196743 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AK225978 // GenBank // Homo sapiens mRNA for Ganglioside GM2 activator precursor variant, clone: FCC112C01. // chr5 // 88 // 76 // 14 // 16 // 0 /// AK298867 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51277 complete cds, highly similar to Ganglioside GM2 activator precursor. // chr5 // 100 // 57 // 12 // 12 // 0 /// BC009273 // GenBank // Homo sapiens GM2 ganglioside activator, mRNA (cDNA clone MGC:10462 IMAGE:4053681), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// L01439 // GenBank // Human GM2-activator protein (GM2A) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 57 // 12 // 12 // 0 /// M76477 // GenBank // Human G-M2 activator protein mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 57 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000027223 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:151253217:151267451:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 38 // 8 // 8 // 0 /// NONHSAT104603 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr5 // 100 // 38 // 8 // 8 // 0
ENST00000476596 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:153755382:153755680:1 gene:ENSG00000242976 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT104665 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_001135037 // RefSeq // Homo sapiens microfibrillar-associated protein 3 (MFAP3), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 38 // 9 // 9 // 0 /// NM_001242336 // RefSeq // Homo sapiens microfibrillar-associated protein 3 (MFAP3), transcript variant 3, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NM_005927 // RefSeq // Homo sapiens microfibrillar-associated protein 3 (MFAP3), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000322602 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:154038993:154055033:1 gene:ENSG00000037749 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000519928 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:154049602:154053002:1 gene:ENSG00000037749 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000520899 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:154038999:154049772:1 gene:ENSG00000037749 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 75 // 50 // 9 // 12 // 0 /// ENST00000522782 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:154038906:154052995:1 gene:ENSG00000037749 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 92 // 54 // 12 // 13 // 0 /// BC026244 // GenBank // Homo sapiens microfibrillar-associated protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:22342 IMAGE:4697443), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000522177 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:154038994:154052952:1 gene:ENSG00000037749 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1 /// GENSCAN00000049302 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:154038531:154053713:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1
NM_198321 // RefSeq // Homo sapiens polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 10 (GALNT10), mRNA. // chr5 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000297107 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:154190730:154420984:1 gene:ENSG00000164574 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000377661 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:154190774:154419031:1 gene:ENSG00000164574 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 59 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000517958 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:154403777:154419033:1 gene:ENSG00000164574 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 36 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000520647 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:154190735:154419012:1 gene:ENSG00000164574 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0 /// AB078145 // GenBank // Homo sapiens GALNT10 mRNA for UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 10, complete cds. // chr5 // 100 // 59 // 13 // 13 // 0 /// AL096739 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp586H0623 (from clone DKFZp586H0623). // chr5 // 100 // 36 // 8 // 8 // 0 /// BC050333 // GenBank HTC // Homo sapiens UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 10 (GalNAc-T10), mRNA (cDNA clone IMAGE:4838534), with apparent retained intron. // chr5 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000425427 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:154190730:154389581:1 gene:ENSG00000164574 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 41 // 41 // 9 // 22 // 1 /// GENSCAN00000049299 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:154283626:154416972:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 45 // 10 // 10 // 0
ENST00000486087 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:154349428:154349725:1 gene:ENSG00000241963 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT104691 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_015315 // RefSeq // Homo sapiens La ribonucleoprotein domain family, member 1 (LARP1), mRNA. // chr5 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// XM_005268407 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens La ribonucleoprotein domain family, member 1 (LARP1), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000336314 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:154712902:154817607:1 gene:ENSG00000155506 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000518297 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:154755575:154804208:1 gene:ENSG00000155506 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000524248 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:154757174:154804208:1 gene:ENSG00000155506 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0 /// AB018274 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA0731 protein, partial cds. // chr5 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// AK091465 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ34146 fis, clone FCBBF3011889, weakly similar to Drosophila melanogaster La related protein (larp) mRNA. // chr5 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// AK307554 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ97502. // chr5 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0 /// BC001460 // GenBank // Homo sapiens La ribonucleoprotein domain family, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:2954 IMAGE:3138935), complete cds. // chr5 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000022297 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:154755758:154814096:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0
NM_001099293 // RefSeq // Homo sapiens kinesin family member 4B (KIF4B), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000435029 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:155013755:155018132:1 gene:ENSG00000226650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AK302388 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61467 complete cds, highly similar to Chromosome-associated kinesin KIF4A. // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NM_012310 // RefSeq // Homo sapiens kinesin family member 4A (KIF4A), mRNA. // chr5 // 40 // 100 // 8 // 20 // 0 /// ENST00000374403 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:X:70290090:70420832:1 gene:ENSG00000090889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 40 // 100 // 8 // 20 // 0 /// AF071592 // GenBank // Homo sapiens kinesin superfamily motor KIF4 mRNA, complete cds. // chr5 // 40 // 100 // 8 // 20 // 0 /// AF179308 // GenBank // Homo sapiens KIF4 (KIF4) mRNA, complete cds. // chr5 // 40 // 100 // 8 // 20 // 0 /// AK313133 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ93621, highly similar to Homo sapiens kinesin family member 4A (KIF4A), mRNA. // chr5 // 40 // 100 // 8 // 20 // 0 /// GENSCAN00000022301 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:155013860:155017564:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000007445 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:X:70290459:70420265:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 42 // 95 // 8 // 19 // 0
ENST00000362598 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:156814130:156814234:1 gene:ENSG00000199468 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT104740 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NR_038443 // RefSeq // Homo sapiens protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 2 pseudogene 3 (PPP1R2P3), non-coding RNA. // chr5 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000522232 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:156850563:156851174:1 gene:ENSG00000231989 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 38 // 8 // 8 // 0 /// JF438008 // GenBank // Homo sapiens protein phosphatase inhibitor 2-like protein mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 57 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000035791 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:156850563:156851180:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 38 // 8 // 8 // 0
ENST00000516259 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:157579497:157579599:1 gene:ENSG00000252068 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT104771 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001145132 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 5 open reading frame 52 (C5orf52), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000409999 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:157671553:157680143:1 gene:ENSG00000187658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000046986 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:157659369:157691443:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 64 // 14 // 14 // 0
NM_173491 // RefSeq // Homo sapiens LSM11, U7 small nuclear RNA associated (LSM11), mRNA. // chr5 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// ENST00000286307 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:157743695:157760709:1 gene:ENSG00000155858 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC051353 // GenBank // Homo sapiens LSM11, U7 small nuclear RNA associated, mRNA (cDNA clone IMAGE:6584604), partial cds. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC126449 // GenBank // Homo sapiens LSM11, U7 small nuclear RNA associated, mRNA (cDNA clone MGC:161727 IMAGE:8992165), complete cds. // chr5 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0 /// AK124248 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ42254 fis, clone TKIDN2009794. // chr5 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// GENSCAN00000046990 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:157743751:157755264:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0
ENST00000384092 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:157809098:157809204:1 gene:ENSG00000206819 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT104779 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AF118062 // GenBank HTC // Homo sapiens PRO1386 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENST00000516649 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:159230194:159230322:1 gene:ENSG00000252458 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT104818 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_145049 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin-like domain containing CTD phosphatase 1 (UBLCP1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000296786 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:159263081:159286040:1 gene:ENSG00000164332 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000519276 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:159274542:159286036:1 gene:ENSG00000164332 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// AY444562 // GenBank // Homo sapiens CTD-like phosphatase domain-containing protein mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC013425 // GenBank // Homo sapiens ubiquitin-like domain containing CTD phosphatase 1, mRNA (cDNA clone MGC:10067 IMAGE:3894780), complete cds. // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT104822 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000049123 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:159208590:159312385:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
ENST00000408674 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:159318042:159318167:1 gene:ENSG00000221601 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONHSAT104824 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_000679 // RefSeq // Homo sapiens adrenoceptor alpha 1B (ADRA1B), mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// XM_006714821 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens adrenoceptor alpha 1B (ADRA1B), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000306675 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:159916783:159972544:1 gene:ENSG00000170214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// BC136568 // GenBank // Homo sapiens adrenergic, alpha-1B-, receptor, mRNA (cDNA clone MGC:168181 IMAGE:9020558), complete cds. // chr5 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// BC136569 // GenBank // Homo sapiens adrenergic, alpha-1B-, receptor, mRNA (cDNA clone MGC:168182 IMAGE:9020559), complete cds. // chr5 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// L31773 // GenBank // Human alpha-1B-adrenergic receptor mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// U03865 // GenBank // Human adrenergic alpha-1b receptor protein mRNA, complete cds. // chr5 // 89 // 84 // 24 // 27 // 0 /// XM_005265818 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens adrenoceptor alpha 1B (ADRA1B), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1 /// XM_005265819 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens adrenoceptor alpha 1B (ADRA1B), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1 /// AK309989 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17031. // chr5 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1 /// GENSCAN00000019222 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:159784320:159928461:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1 /// GENSCAN00000019227 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:159951113:159972492:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
ENST00000362528 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:160008445:160008546:1 gene:ENSG00000199398 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT104835 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001282500 // RefSeq // Homo sapiens tetratricopeptide repeat domain 1 (TTC1), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NM_003314 // RefSeq // Homo sapiens tetratricopeptide repeat domain 1 (TTC1), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000231238 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:160009113:160065543:1 gene:ENSG00000113312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000522073 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:160036506:160065511:1 gene:ENSG00000113312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 66 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000522793 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:160009113:160065511:1 gene:ENSG00000113312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC000942 // GenBank // Homo sapiens tetratricopeptide repeat domain 1, mRNA (cDNA clone MGC:5385 IMAGE:3446109), complete cds. // chr5 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// U46570 // GenBank // Human tetratricopeptide repeat protein (tpr1) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000518560 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:160043133:160065487:1 gene:ENSG00000113312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 40 // 40 // 14 // 35 // 1 /// ENST00000520274 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:160038915:160065130:1 gene:ENSG00000113312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 40 // 40 // 14 // 35 // 1 /// AK128840 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ46404 fis, clone THYMU3008935. // chr5 // 34 // 34 // 12 // 35 // 1 /// GENSCAN00000019221 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:160010529:160065065:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 66 // 23 // 23 // 0
NONHSAT104843 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NR_029701 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 146a (MIR146A), microRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000385201 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:160485352:160485450:1 gene:ENSG00000277727 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA gene:ENSG00000253522 // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000517927 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:160468268:160487426:1 gene:ENSG00000253522 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// DQ658414 // GenBank // Homo sapiens microRNA miR-146a primary transcript, complete sequence. // chr5 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// hsa-mir-146a // miRBase Micro RNA Database // MI0000477 Homo sapiens miR-146a stem-loop // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT104852 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT104854 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000516985 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:165609441:165609679:1 gene:ENSG00000252794 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT104956 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001122679 // RefSeq // Homo sapiens teneurin transmembrane protein 2 (TENM2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000403607 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:5:167875985:168264157:1 gene:ENSG00000145934 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000518659 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:167284799:168262996:1 gene:ENSG00000145934 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000519204 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:5:167754936:168264157:1 gene:ENSG00000145934 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000520394 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:5:167755003:168263185:1 gene:ENSG00000145934 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000545108 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:5:167875985:168263159:1 gene:ENSG00000145934 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000021913 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:168182004:168270489:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 74 // 17 // 17 // 0
NR_024356 // RefSeq // Homo sapiens fibrillarin-like 1 (FBLL1), non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000338333 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:168529116:168530634:1 gene:ENSG00000188573 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021907 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:168529505:168530509:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000365475 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:168791498:168791610:1 gene:ENSG00000202345 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT105005 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000383887 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:169552449:169552555:1 gene:ENSG00000206614 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT105024 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_012188 // RefSeq // Homo sapiens forkhead box I1 (FOXI1), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// XM_005265846 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens forkhead box I1 (FOXI1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 42 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000306268 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:170105897:170109403:1 gene:ENSG00000168269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK292176 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76677 complete cds, highly similar to Homo sapiens forkhead box I1 (FOXI1), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 86 // 92 // 19 // 22 // 0 /// L13203 // GenBank // Homo sapiens forkhead box L1 (Foxl1) mRNA, complete cds. // chr5 // 94 // 67 // 15 // 16 // 0 /// NM_144769 // RefSeq // Homo sapiens forkhead box I1 (FOXI1), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 75 // 75 // 18 // 24 // 1 /// ENST00000449804 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:170105913:170109725:1 gene:ENSG00000168269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 75 // 75 // 18 // 24 // 1 /// BC029778 // GenBank // Homo sapiens forkhead box I1, mRNA (cDNA clone MGC:34197 IMAGE:5185923), complete cds. // chr5 // 71 // 71 // 17 // 24 // 1 /// GENSCAN00000005978 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:170105958:170108611:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0
NR_026945 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 1366 (LINC01366), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_108024 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 1366 (LINC01366), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_108025 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 1366 (LINC01366), transcript variant 3, long non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000436248 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:170331431:170333879:1 gene:ENSG00000235172 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000518357 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:170331430:170333710:1 gene:ENSG00000235172 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr5 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// ENST00000521471 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:170331429:170333760:1 gene:ENSG00000235172 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr5 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// AK093725 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ36406 fis, clone THYMU2010059. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT105047 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT105048 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// NONHSAT105049 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// NONHSAT105050 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// TCONS_00009215-XLOC_004628 // Rinn lincRNA // linc-KCNIP1 chr5:+:169758434-169762104 // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// TCONS_00009541-XLOC_004628 // Rinn lincRNA // linc-KCNIP1 chr5:+:169758396-169762104 // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000494330 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:170866835:170867144:1 gene:ENSG00000244501 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT105066 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_021025 // RefSeq // Homo sapiens T-cell leukemia homeobox 3 (TLX3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000296921 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:171309284:171312134:1 gene:ENSG00000164438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC017291 // GenBank // Homo sapiens T-cell leukemia homeobox 3, mRNA (cDNA clone MGC:29804 IMAGE:4906239), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000031306 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:171309366:171311499:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 57 // 57 // 13 // 23 // 1
ENST00000384182 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:171366118:171366252:1 gene:ENSG00000206909 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT105078 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000031317 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:171366203:171423149:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 52 // 52 // 11 // 21 // 1
ENST00000517671 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:171387116:171410883:1 gene:ENSG00000181163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 77 // 77 // 10 // 13 // 1 /// AY347529 // GenBank // Homo sapiens nucleophosmin mRNA, complete cds. // chr5 // 77 // 77 // 10 // 13 // 1
NM_003862 // RefSeq // Homo sapiens fibroblast growth factor 18 (FGF18), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000274625 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:171419656:171457623:1 gene:ENSG00000156427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AB007422 // GenBank // Homo sapiens mRNA for fibroblast growth factor (FGF-18), complete cds. // chr5 // 86 // 70 // 18 // 21 // 0 /// AF075292 // GenBank // Homo sapiens fibroblast growth factor 18 (FGF18) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF211188 // GenBank // Homo sapiens zFGF5 mRNA, complete cds. // chr5 // 92 // 83 // 23 // 25 // 0 /// BC006245 // GenBank // Homo sapiens fibroblast growth factor 18, mRNA (cDNA clone MGC:10529 IMAGE:3948893), complete cds. // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BT019570 // GenBank // Homo sapiens fibroblast growth factor 18 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// BT019571 // GenBank // Homo sapiens fibroblast growth factor 18 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000031308 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:171429362:171456805:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
NM_016093 // RefSeq // Homo sapiens ribosomal protein L26-like 1 (RPL26L1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// XM_005265922 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ribosomal protein L26-like 1 (RPL26L1), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0 /// XM_005265923 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ribosomal protein L26-like 1 (RPL26L1), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000265100 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:172959424:172969771:1 gene:ENSG00000037241 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC017360 // GenBank // Homo sapiens ribosomal protein L26-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:29489 IMAGE:4551093), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC070192 // GenBank // Homo sapiens ribosomal protein L26-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:88173 IMAGE:6727802), complete cds. // chr5 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0
NM_003945 // RefSeq // Homo sapiens ATPase, H+ transporting, lysosomal 9kDa, V0 subunit e1 (ATP6V0E1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000265093 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:5:172983816:173034892:1 gene:ENSG00000113732 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000519374 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:172983757:173035445:1 gene:ENSG00000113732 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000519911 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:172983781:173034884:1 gene:ENSG00000113732 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// BC119714 // GenBank // Homo sapiens ATPase, H+ transporting, lysosomal 9kDa, V0 subunit e1, mRNA (cDNA clone MGC:149663 IMAGE:40117211), complete cds. // chr5 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// BC119715 // GenBank // Homo sapiens ATPase, H+ transporting, lysosomal 9kDa, V0 subunit e1, mRNA (cDNA clone MGC:149664 IMAGE:40117212), complete cds. // chr5 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// CR456856 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834C058D for gene ATP6V0E, ATPase, H+ transporting, lysosomal 9kDa, V0 subunit e; complete cds, incl. stopcodon. // chr5 // 100 // 41 // 13 // 13 // 0 /// CR542131 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834B1223D for gene ATP6V0E, ATPase, H+ transporting, lysosomal 9kDa, V0 subunit e; complete cds, without stopcodon. // chr5 // 100 // 41 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000517669 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:172983831:173020557:1 gene:ENSG00000113732 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
NM_001144954 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 5 open reading frame 47 (C5orf47), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006714820 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chromosome 5 open reading frame 47 (C5orf47), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000340147 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:173989159:174006140:1 gene:ENSG00000185056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010006 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:173973782:174064336:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_002449 // RefSeq // Homo sapiens msh homeobox 2 (MSX2), mRNA. // chr5 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000239243 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:174724533:174730893:1 gene:ENSG00000120149 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000507785 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:174724602:174729880:1 gene:ENSG00000120149 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 58 // 11 // 11 // 0 /// BC015509 // GenBank // Homo sapiens msh homeobox 2, mRNA (cDNA clone MGC:9173 IMAGE:3903028), complete cds. // chr5 // 100 // 58 // 11 // 11 // 0 /// BT009814 // GenBank // Homo sapiens msh homeo box homolog 2 (Drosophila) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 42 // 8 // 8 // 0 /// D26145 // GenBank // Homo sapiens MSX-2 mRNA, derived full length clone. // chr5 // 89 // 95 // 16 // 18 // 0 /// D31771 // GenBank // Homo sapiens mRNA for MSX-2, complete cds. // chr5 // 100 // 58 // 11 // 11 // 0 /// D89377 // GenBank // Homo sapiens mRNA for MSX-2, complete cds. // chr5 // 94 // 95 // 17 // 18 // 0 /// X69295 // GenBank // H.sapiens MSX2 mRNA for transcription factor. // chr5 // 61 // 95 // 11 // 18 // 0 /// GENSCAN00000047905 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:174724660:174729583:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 42 // 8 // 8 // 0
ENST00000410179 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:175628188:175628462:1 gene:ENSG00000222111 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT105267 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001131055 // RefSeq // Homo sapiens histamine receptor H2 (HRH2), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XR_245274 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens histamine receptor H2 (HRH2), transcript variant X5, misc_RNA. // chr5 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000377291 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:175658030:175686242:1 gene:ENSG00000113749 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC054510 // GenBank // Homo sapiens histamine receptor H2, mRNA (cDNA clone MGC:60198 IMAGE:6146988), complete cds. // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NM_022304 // RefSeq // Homo sapiens histamine receptor H2 (HRH2), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// XM_006714864 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens histamine receptor H2 (HRH2), transcript variant X6, mRNA. // chr5 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
ENST00000363778 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:175703898:175704004:1 gene:ENSG00000200648 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT105269 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001008220 // RefSeq // Homo sapiens complexin 2 (CPLX2), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0 /// NM_006650 // RefSeq // Homo sapiens complexin 2 (CPLX2), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000359546 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:175796310:175884020:1 gene:ENSG00000145920 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000393745 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:175871498:175880170:1 gene:ENSG00000145920 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 24 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000512824 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:175871578:175879826:1 gene:ENSG00000145920 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 20 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000515094 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:175878206:175880053:1 gene:ENSG00000145920 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 20 // 8 // 8 // 0 /// AK293819 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52864 complete cds, moderately similar to Complexin-2. // chr5 // 86 // 51 // 18 // 21 // 0 /// U35100 // GenBank // Human complexin II mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 27 // 11 // 11 // 0 /// NONHSAT105275 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 20 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000002818 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:175851649:175956554:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 34 // 34 // 14 // 41 // 1
BC059361 // GenBank // Homo sapiens ADP-ribosylation factor-like 10, mRNA (cDNA clone MGC:71502 IMAGE:30344341), complete cds. // chr5 // 96 // 75 // 23 // 24 // 0 /// ENST00000310389 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:176365468:176381909:1 gene:ENSG00000175414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// NM_173664 // RefSeq // Homo sapiens ADP-ribosylation factor-like 10 (ARL10), mRNA. // chr5 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1 /// XM_005265891 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ADP-ribosylation factor-like 10 (ARL10), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// GENSCAN00000002822 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:176365564:176371895:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// AK096568 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39249 fis, clone OCBBF2008640, highly similar to Mus musculus ADP-ribosylation factor-like membrane-associated protein (Arm1) mRNA. // chr5 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1
NM_138820 // RefSeq // Homo sapiens HIG1 hypoxia inducible domain family, member 2A (HIGD2A), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000274787 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:176388747:176389771:1 gene:ENSG00000146066 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC007502 // GenBank // Homo sapiens HIG1 domain family, member 2A, mRNA (cDNA clone MGC:3907 IMAGE:2959830), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000002813 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:176388820:176389497:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 92 // 55 // 11 // 12 // 0 /// BC000587 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3345790. // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_014613 // RefSeq // Homo sapiens Fas associated factor family member 2 (FAF2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000261942 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:176448355:176510074:1 gene:ENSG00000113194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000504983 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:176492239:176498977:1 gene:ENSG00000113194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// AB088120 // GenBank // Homo sapiens mRNA for ETEA, complete cds. // chr5 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// BC001069 // GenBank // Homo sapiens Fas associated factor family member 2, mRNA (cDNA clone MGC:2542 IMAGE:2961467), complete cds. // chr5 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC006145 // GenBank // Homo sapiens Fas associated factor family member 2, mRNA (cDNA clone MGC:13094 IMAGE:3942891), complete cds. // chr5 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC014001 // GenBank // Homo sapiens Fas associated factor family member 2, mRNA (cDNA clone MGC:20495 IMAGE:3936113), complete cds. // chr5 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// AK304346 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61076 complete cds, highly similar to UBX domain-containing protein 8. // chr5 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// GENSCAN00000002828 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:176447741:176509458:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0
NM_001171976 // RefSeq // Homo sapiens cadherin-related family member 2 (CDHR2), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// NM_017675 // RefSeq // Homo sapiens cadherin-related family member 2 (CDHR2), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000261944 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:176549391:176595768:1 gene:ENSG00000074276 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000506348 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:176565306:176595697:1 gene:ENSG00000074276 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000510636 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:176542511:176595974:1 gene:ENSG00000074276 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000513031 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:176586651:176590661:1 gene:ENSG00000074276 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 25 // 9 // 9 // 0 /// AB047004 // GenBank // Homo sapiens PC-LKC mRNA for protocadherin LKC, complete cds. // chr5 // 94 // 97 // 33 // 35 // 0 /// BC130282 // GenBank // Homo sapiens protocadherin 24, mRNA (cDNA clone MGC:163154 IMAGE:40146313), complete cds. // chr5 // 94 // 97 // 33 // 35 // 0 /// GENSCAN00000003669 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:176565353:176591327:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0
ENST00000384689 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:176556704:176556805:1 gene:ENSG00000207420 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT105361 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001099408 // RefSeq // Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 4E family member 1B (EIF4E1B), mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000318682 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:5:176630682:176646641:1 gene:ENSG00000175766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000504597 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:176641672:176646607:1 gene:ENSG00000175766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000505497 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:176643245:176645981:1 gene:ENSG00000175766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000515458 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:176630955:176646641:1 gene:ENSG00000175766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AK094270 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ36951 fis, clone BRACE2005762, weakly similar to EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 4E. // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000503895 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:176642928:176645300:1 gene:ENSG00000175766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1 /// ENST00000512734 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:176644580:176646140:1 gene:ENSG00000175766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1 /// GENSCAN00000003681 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:176642837:176666195:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT105367 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
NM_133369 // RefSeq // Homo sapiens unc-5 homolog A (C. elegans) (UNC5A), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// XM_006714927 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens unc-5 homolog A (C. elegans) (UNC5A), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 82 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000329542 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:176810477:176880895:1 gene:ENSG00000113763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000509580 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:5:176862658:176874048:1 gene:ENSG00000113763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 91 // 29 // 10 // 11 // 0 /// ENST00000513890 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:176862624:176874400:1 gene:ENSG00000113763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 94 // 42 // 15 // 16 // 0 /// BC033727 // GenBank // Homo sapiens unc-5 homolog A (C. elegans), mRNA (cDNA clone IMAGE:5166762), partial cds. // chr5 // 94 // 42 // 15 // 16 // 0 /// BC157824 // GenBank // Homo sapiens unc-5 homolog A (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:189719 IMAGE:9057043), complete cds. // chr5 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// AB075856 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1976 protein. // chr5 // 47 // 47 // 18 // 38 // 1 /// AK131380 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ16449 fis, clone BRAWH2006395, highly similar to Rattus norvegicus transmembrane receptor Unc5H1. // chr5 // 34 // 34 // 13 // 38 // 1 /// GENSCAN00000003662 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:176860536:176879886:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0
NM_017510 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane emp24 protein transport domain containing 9 (TMED9), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000332598 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:177592158:177596124:1 gene:ENSG00000184840 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000513799 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:177592488:177595577:1 gene:ENSG00000184840 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 53 // 8 // 8 // 0 /// AF441399 // GenBank // Homo sapiens p25 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0 /// BC001123 // GenBank // Homo sapiens transmembrane emp24 protein transport domain containing 9, mRNA (cDNA clone MGC:2142 IMAGE:2967520), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// X90872 // GenBank // H.sapiens mRNA for gp25L2 protein. // chr5 // 73 // 73 // 8 // 11 // 0 /// ENST00000507723 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:177592272:177595420:1 gene:ENSG00000184840 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 67 // 67 // 10 // 15 // 1 /// AK298435 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56646 complete cds, highly similar to Transmembrane emp24 domain-containing protein 9 precursor. // chr5 // 67 // 67 // 10 // 15 // 1 /// GENSCAN00000007756 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:177592215:177595416:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0
NM_015111 // RefSeq // Homo sapiens NEDD4 binding protein 3 (N4BP3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000274605 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:178113443:178126087:1 gene:ENSG00000145911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK295663 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50774 complete cds, highly similar to NEDD4-binding protein 3. // chr5 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0 /// BC053323 // GenBank // Homo sapiens Nedd4 binding protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:59984 IMAGE:6585266), complete cds. // chr5 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000007769 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:178119584:178122001:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0
ENST00000492969 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:178377924:178378220:1 gene:ENSG00000242341 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT105532 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_058230 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 354B (ZNF354B), mRNA. // chr5 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000322434 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:178859953:178885028:1 gene:ENSG00000178338 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK289667 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77963 complete cds. // chr5 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// BC022190 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 354B, mRNA (cDNA clone IMAGE:4824383). // chr5 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// BC104777 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 354B, mRNA (cDNA clone MGC:132437 IMAGE:8143780), complete cds. // chr5 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// BC112111 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 354B, mRNA (cDNA clone MGC:138316 IMAGE:8327579), complete cds. // chr5 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000047551 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:178840788:178884291:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0
NM_001136116 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 879 (ZNF879), mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000444149 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:179023752:179035064:1 gene:ENSG00000234284 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000519896 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:179023804:179032321:1 gene:ENSG00000234284 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000522442 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:179023804:179032352:1 gene:ENSG00000234284 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// AK300504 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50050 complete cds, moderately similar to Zinc finger protein 184. // chr5 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// BX648737 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686E2433 (from clone DKFZp686E2433). // chr5 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000047538 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:179027044:179080097:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_014594 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 354C (ZNF354C), mRNA. // chr5 // 93 // 87 // 25 // 27 // 0 /// ENST00000315475 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:179060415:179083537:1 gene:ENSG00000177932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF525463 // GenBank // Homo sapiens zinc finger KID3 (ZNF354C) mRNA, complete cds. // chr5 // 93 // 87 // 25 // 27 // 0 /// BC063312 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 354C, mRNA (cDNA clone MGC:71807 IMAGE:30341631), complete cds. // chr5 // 90 // 100 // 28 // 31 // 0 /// GENSCAN00000047538 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:179027044:179080097:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 55 // 55 // 17 // 31 // 1
AK093042 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ35723 fis, clone TESTI2001959. // chr5 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 /// ENST00000514664 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:179641544:179645007:-1 gene:ENSG00000204661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 70 // 96 // 16 // 23 // 0 /// BC040992 // GenBank HTC // Homo sapiens hypothetical protein LOC285679, mRNA (cDNA clone IMAGE:5272524), with apparent retained intron. // chr5 // 74 // 96 // 17 // 23 // 0 /// ENST00000511063 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:179641546:179645007:-1 gene:ENSG00000204661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 46 // 46 // 11 // 24 // 1 /// ENST00000425471 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:179651297:179652290:1 gene:ENSG00000228259 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr5 // 80 // 42 // 8 // 10 // 0 /// NONHSAT105606 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 70 // 96 // 16 // 23 // 0 /// ENST00000418535 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:179651284:179652457:1 gene:ENSG00000228259 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr5 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1 /// ENST00000505650 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:179522457:179525074:1 gene:ENSG00000251545 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr5 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1 /// NONHSAT105586 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1 /// NONHSAT105587 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1
ENST00000451823 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:179694197:179694768:1 gene:ENSG00000225051 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000442010 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:179679032:179694649:1 gene:ENSG00000225051 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 36 // 36 // 8 // 22 // 1 /// GENSCAN00000027046 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:179694197:179774877:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT105615 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 36 // 36 // 8 // 22 // 1
ENST00000410516 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:179845832:179846152:1 gene:ENSG00000222448 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// NONHSAT105645 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0
ENST00000363685 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:180444509:180444612:1 gene:ENSG00000200555 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT105680 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_015455 // RefSeq // Homo sapiens CCR4-NOT transcription complex, subunit 6 (CNOT6), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000261951 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:5:180494417:180578353:1 gene:ENSG00000113300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000393356 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:180494433:180578405:1 gene:ENSG00000113300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 95 // 100 // 42 // 44 // 0 /// ENST00000502447 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:180494707:180564682:1 gene:ENSG00000113300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 18 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000504343 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:5:180529275:180567968:1 gene:ENSG00000113300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 27 // 12 // 12 // 0 /// AB033020 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1194 protein, partial cds. // chr5 // 95 // 100 // 42 // 44 // 0 /// BC152469 // GenBank // Homo sapiens CCR4-NOT transcription complex, subunit 6, mRNA (cDNA clone MGC:176727 IMAGE:8862606), complete cds. // chr5 // 95 // 100 // 42 // 44 // 0 /// ENST00000618123 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:5:180494507:180578349:1 gene:ENSG00000113300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000011442 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:180565834:180575936:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 27 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT105685 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 18 // 8 // 8 // 0
ENST00000363022 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:180729586:180729737:1 gene:ENSG00000199892 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT105805 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000410920 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:180909838:180909927:1 gene:ENSG00000222852 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT105851 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_197975 // RefSeq // Homo sapiens butyrophilin-like 3 (BTNL3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000342868 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:180988845:181006727:1 gene:ENSG00000168903 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// AB020625 // GenBank // Homo sapiens mRNA for butyrophilin like receptor, complete cds. // chr5 // 100 // 74 // 14 // 14 // 0 /// AY358385 // GenBank // Homo sapiens clone DNA68866 BTNL3 (UNQ744) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC100800 // GenBank // Homo sapiens butyrophilin-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:118823 IMAGE:40000697), complete cds. // chr5 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// BC100801 // GenBank // Homo sapiens butyrophilin-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:118824 IMAGE:40000698), complete cds. // chr5 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// BC100802 // GenBank // Homo sapiens butyrophilin-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:118825 IMAGE:40000699), complete cds. // chr5 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000011450 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:180989029:181005872:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 53 // 10 // 10 // 0
ENST00000383959 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:181007281:181007384:1 gene:ENSG00000206686 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT105856 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_152547 // RefSeq // Homo sapiens butyrophilin-like 9 (BTNL9), mRNA. // chr5 // 97 // 73 // 28 // 29 // 0 /// ENST00000327705 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:181040225:181061523:1 gene:ENSG00000165810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 73 // 28 // 29 // 0 /// ENST00000376841 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:181040225:181057169:1 gene:ENSG00000165810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 55 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000491209 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:181040237:181055768:1 gene:ENSG00000165810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 45 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000515271 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:181040266:181054001:1 gene:ENSG00000165810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 35 // 14 // 14 // 0 /// AK057097 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ32535 fis, clone SMINT2000277, weakly similar to BUTYROPHILIN PRECURSOR. // chr5 // 100 // 45 // 18 // 18 // 0 /// AK298113 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52190 complete cds, highly similar to Butyrophilin-like protein 9 precursor. // chr5 // 100 // 35 // 14 // 14 // 0 /// AY358358 // GenBank // Homo sapiens clone DNA86594 VDLS1900 (UNQ1900) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0 /// BC062459 // GenBank // Homo sapiens butyrophilin-like 9, mRNA (cDNA clone MGC:74561 IMAGE:6185476), complete cds. // chr5 // 100 // 45 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000011460 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:181036450:181059862:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 45 // 45 // 18 // 40 // 1
NM_206880 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily V, member 2 (OR2V2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000328275 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:181154943:181155890:1 gene:ENSG00000182613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011452 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:181154943:181155890:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000599439 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:181255719:181257586:1 gene:ENSG00000233937 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron gene:ENSG00000268397 // chr5 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// AK026811 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ23158 fis, clone LNG09623. // chr5 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0
ENST00000410601 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:181301967:181302070:1 gene:ENSG00000222533 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT105949 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
ENST00000362670 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:144087:144197:-1 gene:ENSG00000199540 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT099837 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000296824 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:196871:218215:-1 gene:ENSG00000164366 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// AK126844 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44896 fis, clone BRAMY3001409. // chr5 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_145265 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 127 (CCDC127), mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000296824 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:196871:218215:-1 gene:ENSG00000164366 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC015349 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 127, mRNA (cDNA clone MGC:21397 IMAGE:3852440), complete cds. // chr5 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000044895 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:205297:211211:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 56 // 10 // 10 // 0 /// BC021027 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3621797, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr5 // 50 // 50 // 9 // 18 // 1
NM_138464 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 5 open reading frame 55 (C5orf55), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000408966 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:441498:443160:-1 gene:ENSG00000221990 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NR_024158 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC25845 (PP7080), long non-coding RNA. // chr5 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// AK023178 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ13116 fis, clone NT2RP3002659. // chr5 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// BC086861 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5755941. // chr5 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000342584 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:5:470510:473098:-1 gene:ENSG00000188242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000510604 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:471247:472960:-1 gene:ENSG00000188242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 48 // 11 // 11 // 0 /// NONHSAT099881 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0
NM_007030 // RefSeq // Homo sapiens tubulin polymerization promoting protein (TPPP), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_005248237 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens tubulin polymerization promoting protein (TPPP), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000360578 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:659862:693395:-1 gene:ENSG00000171368 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AB017016 // GenBank // Homo sapiens mRNA for p25 alpha, complete cds. // chr5 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// AK054920 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ30358 fis, clone BRACE2007749, highly similar to Tubulin polymerization-promoting protein. // chr5 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// AY319261 // GenBank // Homo sapiens fibroblast growth factor-2 repression protein-1 (FREP1) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 28 // 9 // 9 // 0 /// BC131506 // GenBank // Homo sapiens tubulin polymerization promoting protein, mRNA (cDNA clone MGC:138836 IMAGE:40082752), complete cds. // chr5 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// BC152382 // GenBank // Homo sapiens tubulin polymerization promoting protein, mRNA (cDNA clone MGC:166937 IMAGE:100013441), complete cds. // chr5 // 100 // 28 // 9 // 9 // 0 /// BT020035 // GenBank // Homo sapiens brain-specific protein p25 alpha mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 28 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000044861 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:662839:681456:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_024786 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, DHHC-type containing 11 (ZDHHC11), mRNA. // chr5 // 100 // 67 // 12 // 12 // 0 /// XM_005248369 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens zinc finger, DHHC-type containing 11 (ZDHHC11), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 50 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000283441 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:795607:850986:-1 gene:ENSG00000188818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 67 // 12 // 12 // 0 /// AK023215 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ13153 fis, clone NT2RP3003409, weakly similar to Human DHHC-domain-containing cysteine-rich protein mRNA. // chr5 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// BC032000 // GenBank // Homo sapiens zinc finger, DHHC-type containing 11, mRNA (cDNA clone MGC:21040 IMAGE:4750082), complete cds. // chr5 // 100 // 72 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000503758 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:795606:842495:-1 gene:ENSG00000188818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 56 // 56 // 10 // 18 // 1 /// AK024233 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ14171 fis, clone NT2RP2002333. // chr5 // 56 // 56 // 10 // 18 // 1 /// GENSCAN00000044890 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:769862:850817:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 56 // 56 // 10 // 18 // 1 /// NONHSAT099932 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 56 // 56 // 10 // 18 // 1
NM_006598 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 12 (potassium/chloride transporter), member 7 (SLC12A7), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000264930 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:1050376:1112035:-1 gene:ENSG00000113504 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF105365 // GenBank // Homo sapiens K-Cl cotransporter KCC4 mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// BC007760 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 12 (potassium/chloride transporters), member 7, mRNA (cDNA clone IMAGE:4127444), complete cds. // chr5 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// BC098390 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 12 (potassium/chloride transporters), member 7, mRNA (cDNA clone MGC:104628 IMAGE:5265743), complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// AK302856 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59172 complete cds, highly similar to Solute carrier family 12 member 7. // chr5 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// ENST00000611005 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR5_4_CTG1:1050378:1111232:-1 gene:ENSG00000276482 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000025859 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:1051747:1112252:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1 /// GENSCAN00000032704 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR5_4_CTG1:1072811:1111427:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1
NM_001044 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter), member 3 (SLC6A3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000270349 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:1392790:1445430:-1 gene:ENSG00000142319 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000513308 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:1416028:1442975:-1 gene:ENSG00000142319 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 29 // 12 // 12 // 0 /// BC132977 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter, dopamine), member 3, mRNA (cDNA clone MGC:164608 IMAGE:40146999), complete cds. // chr5 // 100 // 88 // 37 // 37 // 0 /// BC133003 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter, dopamine), member 3, mRNA (cDNA clone MGC:164634 IMAGE:40147025), complete cds. // chr5 // 100 // 88 // 37 // 37 // 0 /// EF174603 // GenBank // Homo sapiens dopamine transporter (SLC6A3) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// L24178 // GenBank // Homo sapiens dopamine transporter mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 71 // 30 // 30 // 0 /// M95167 // GenBank // Homo sapiens dopamine transporter (SLC6A3) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000621716 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR5_3_CTG1:1392794:1449666:-1 gene:ENSG00000276996 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000025882 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:1345759:1432792:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 67 // 67 // 28 // 42 // 1 /// GENSCAN00000047273 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR5_3_CTG1:1345759:1425393:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 62 // 62 // 26 // 42 // 1
NM_032479 // RefSeq // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein L36 (MRPL36), mRNA. // chr5 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000505059 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:1798386:1799839:-1 gene:ENSG00000171421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000508987 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:1798387:1799895:-1 gene:ENSG00000171421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC020642 // GenBank // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein L36, mRNA (cDNA clone MGC:22294 IMAGE:4774879), complete cds. // chr5 // 100 // 78 // 7 // 7 // 0 /// BC104652 // GenBank // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein L36, mRNA (cDNA clone MGC:104245 IMAGE:6738291), complete cds. // chr5 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// EF036487 // GenBank // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein L36 mRNA, complete cds; nuclear gene for mitochondrial product. // chr5 // 86 // 78 // 6 // 7 // 0
NM_001134222 // RefSeq // Homo sapiens iroquois homeobox 2 (IRX2), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// NM_033267 // RefSeq // Homo sapiens iroquois homeobox 2 (IRX2), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000302057 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:2746766:2751655:-1 gene:ENSG00000170561 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// AB188492 // GenBank // Homo sapiens IRX2 mRNA for iroquois homeobox protein 2, complete cds, clone: TH032G07. // chr5 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC065189 // GenBank // Homo sapiens iroquois homeobox 2, mRNA (cDNA clone MGC:71253 IMAGE:6422941), complete cds. // chr5 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000382611 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:2745845:2751662:-1 gene:ENSG00000170561 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 93 // 93 // 28 // 30 // 1 /// AY335940 // GenBank // Homo sapiens homeodomain protein IRXA2 (IRX2) mRNA, complete cds. // chr5 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// GENSCAN00000045782 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:2747564:2751413:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0
ENST00000447087 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:7:57187892:57190140:1 gene:ENSG00000236692 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONHSAT120817 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NR_028351 // RefSeq // Homo sapiens FLJ33360 protein (FLJ33360), long non-coding RNA. // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000507444 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:6310441:6337292:-1 gene:ENSG00000250490 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC132707 // GenBank // Homo sapiens FLJ33360 protein, mRNA (cDNA clone MGC:164338 IMAGE:40146729), complete cds. // chr5 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// BC132709 // GenBank // Homo sapiens FLJ33360 protein, mRNA (cDNA clone MGC:164340 IMAGE:40146731), complete cds. // chr5 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000041338 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:6326633:6378483:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_032286 // RefSeq // Homo sapiens mediator complex subunit 10 (MED10), mRNA. // chr5 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000255764 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:6371881:6378594:-1 gene:ENSG00000133398 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// AY277599 // GenBank // Homo sapiens transformation-related protein 17 (TRG17) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 63 // 12 // 12 // 0 /// AY453397 // GenBank // Homo sapiens transformation-related protein 20 (TRG20) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 63 // 12 // 12 // 0 /// AY598325 // GenBank // Homo sapiens L6 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 63 // 12 // 12 // 0 /// BC003353 // GenBank // Homo sapiens mediator complex subunit 10, mRNA (cDNA clone MGC:5309 IMAGE:2899986), complete cds. // chr5 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000503112 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:6372165:6374811:-1 gene:ENSG00000133398 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 47 // 47 // 9 // 19 // 1 /// AK075493 // GenBank // Homo sapiens cDNA PSEC0190 fis, clone HEMBA1000296. // chr5 // 47 // 47 // 9 // 19 // 1 /// GENSCAN00000041338 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:6326633:6378483:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 47 // 47 // 9 // 19 // 1 /// NONHSAT100196 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 47 // 47 // 9 // 19 // 1
ENST00000363373 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:6848127:6848462:-1 gene:ENSG00000200243 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT100226 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_003966 // RefSeq // Homo sapiens sema domain, seven thrombospondin repeats (type 1 and type 1-like), transmembrane domain (TM) and short cytoplasmic domain, (semaphorin) 5A (SEMA5A), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000382496 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:9035026:9546075:-1 gene:ENSG00000112902 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000513968 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:9202124:9380201:-1 gene:ENSG00000112902 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 89 // 27 // 8 // 9 // 0 /// AK293441 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56616 complete cds, highly similar to Semaphorin-5A precursor. // chr5 // 100 // 52 // 17 // 17 // 0 /// BC115696 // GenBank // Homo sapiens sema domain, seven thrombospondin repeats (type 1 and type 1-like), transmembrane domain (TM) and short cytoplasmic domain, (semaphorin) 5A, mRNA (cDNA clone MGC:133317 IMAGE:40038868), complete cds. // chr5 // 97 // 88 // 28 // 29 // 0 /// U52840 // GenBank // Homo sapiens semaphorin F homolog mRNA, complete cds. // chr5 // 94 // 97 // 30 // 32 // 0
NM_019599 // RefSeq // Homo sapiens taste receptor, type 2, member 1 (TAS2R1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000382492 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:9628997:9630355:-1 gene:ENSG00000169777 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC095521 // GenBank // Homo sapiens taste receptor, type 2, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:111739 IMAGE:30706582), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC101729 // GenBank // Homo sapiens taste receptor, type 2, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:126778 IMAGE:8069235), complete cds. // chr5 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// BC101731 // GenBank // Homo sapiens taste receptor, type 2, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:126780 IMAGE:8069237), complete cds. // chr5 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0
NM_138809 // RefSeq // Homo sapiens carboxymethylenebutenolidase homolog (Pseudomonas) (CMBL), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000296658 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:10279277:10308026:-1 gene:ENSG00000164237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000506821 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:10286173:10307859:-1 gene:ENSG00000164237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000510532 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:10280466:10307563:-1 gene:ENSG00000164237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000514202 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:10290404:10307839:-1 gene:ENSG00000164237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// BC001573 // GenBank // Homo sapiens carboxymethylenebutenolidase homolog (Pseudomonas), mRNA (cDNA clone MGC:5522 IMAGE:3454199), complete cds. // chr5 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000511963 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:10286132:10307603:-1 gene:ENSG00000164237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// GENSCAN00000049322 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:10280453:10290762:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT100414 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT100415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0
ENST00000516532 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:10292041:10292148:-1 gene:ENSG00000252341 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT100416 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001291963 // RefSeq // Homo sapiens death-associated protein (DAP), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// NM_004394 // RefSeq // Homo sapiens death-associated protein (DAP), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000230895 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:10679230:10761272:-1 gene:ENSG00000112977 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000432074 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:10680434:10761228:-1 gene:ENSG00000112977 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// AK298670 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55133 complete cds, weakly similar to Death-associated protein 1. // chr5 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// BC002726 // GenBank // Homo sapiens death-associated protein, mRNA (cDNA clone MGC:3617 IMAGE:3631886), complete cds. // chr5 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// CR542184 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834G0324D for gene DAP, death-associated protein; complete cds, without stopcodon. // chr5 // 100 // 26 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000514882 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:10681091:10761136:-1 gene:ENSG00000112977 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// GENSCAN00000049319 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:10673561:10715934:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// NONHSAT100471 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1
ENST00000391003 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:12297399:12297504:-1 gene:ENSG00000212305 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT100508 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001369 // RefSeq // Homo sapiens dynein, axonemal, heavy chain 5 (DNAH5), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 91 // 91 // 0 /// ENST00000265104 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:13690331:13944543:-1 gene:ENSG00000039139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 91 // 91 // 0 /// ENST00000508040 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:13911357:13932456:-1 gene:ENSG00000039139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 12 // 11 // 11 // 0 /// AK055138 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ30576 fis, clone BRAWH2006622, weakly similar to DYNEIN GAMMA CHAIN, FLAGELLAR OUTER ARM. // chr5 // 100 // 12 // 11 // 11 // 0 /// AY045575 // GenBank // Homo sapiens axonemal dynein heavy chain DNAH5 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 91 // 91 // 0 /// GENSCAN00000015956 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:13676702:13831507:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 52 // 47 // 47 // 0 /// GENSCAN00000015957 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:13840891:13963026:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 40 // 36 // 36 // 0
ENST00000503537 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:14651941:14653329:-1 gene:ENSG00000250182 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000048558 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:14651938:14653326:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_054027 // RefSeq // Homo sapiens ANKH inorganic pyrophosphate transport regulator (ANKH), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000284268 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:14704804:14871778:-1 gene:ENSG00000154122 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000503939 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:14741292:14755888:-1 gene:ENSG00000154122 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 19 // 8 // 8 // 0 /// AF274753 // GenBank // Homo sapiens progressive ankylosis-like protein (ANK) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 62 // 26 // 26 // 0 /// AK222631 // GenBank // Homo sapiens mRNA for ankylosis, progressive homolog, clone: CBL03846. // chr5 // 96 // 62 // 25 // 26 // 0 /// AY358503 // GenBank // Homo sapiens clone DNA39987 ANKH (UNQ241) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// BC009835 // GenBank // Homo sapiens ankylosis, progressive homolog (mouse), mRNA (cDNA clone MGC:15102 IMAGE:3927236), complete cds. // chr5 // 97 // 71 // 29 // 30 // 0 /// BC014526 // GenBank // Homo sapiens ankylosis, progressive homolog (mouse), mRNA (cDNA clone MGC:11142 IMAGE:3837372), complete cds. // chr5 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000502585 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:14711088:14717088:-1 gene:ENSG00000154122 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 21 // 21 // 9 // 42 // 1 /// GENSCAN00000048566 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:14733714:14778283:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 38 // 38 // 16 // 42 // 1 /// GENSCAN00000048553 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:14711197:14731965:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1
ENST00000365399 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:15110786:15110920:-1 gene:ENSG00000202269 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONHSAT100576 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
ENST00000410380 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:16033229:16033356:-1 gene:ENSG00000222312 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT100590 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001102562 // RefSeq // Homo sapiens membrane-associated ring finger (C3HC4) 11 (MARCH11), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000332432 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:16067139:16179775:-1 gene:ENSG00000183654 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC150513 // GenBank // Homo sapiens membrane-associated ring finger (C3HC4) 11, mRNA (cDNA clone IMAGE:40132680), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC150514 // GenBank // Homo sapiens membrane-associated ring finger (C3HC4) 11, mRNA (cDNA clone IMAGE:40132681), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000505509 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:16090887:16180762:-1 gene:ENSG00000183654 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 61 // 61 // 11 // 18 // 1 /// GENSCAN00000018649 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:16067471:16192707:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 72 // 13 // 13 // 0 /// NONHSAT100591 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 61 // 61 // 11 // 18 // 1
NM_001102562 // RefSeq // Homo sapiens membrane-associated ring finger (C3HC4) 11 (MARCH11), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0 /// ENST00000332432 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:16067139:16179775:-1 gene:ENSG00000183654 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0 /// ENST00000505509 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:16090887:16180762:-1 gene:ENSG00000183654 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 100 // 7 // 7 // 1 /// GENSCAN00000018649 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:16067471:16192707:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0 /// NONHSAT100591 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 100 // 7 // 7 // 1
NM_033414 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 622 (ZNF622), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000308683 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:16451519:16465792:-1 gene:ENSG00000173545 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY046059 // GenBank // Homo sapiens zinc finger-like protein 9 (ZPR9) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC008752 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 622, mRNA (cDNA clone MGC:2485 IMAGE:3345757), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC010545 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 622, mRNA (cDNA clone MGC:17552 IMAGE:3463070), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018677 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:16427702:16465665:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_001034850 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 134, member B (FAM134B), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 93 // 88 // 27 // 29 // 0 /// NM_019000 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 134, member B (FAM134B), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// XM_005248312 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens family with sequence similarity 134, member B (FAM134B), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000306320 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:16473054:16617058:-1 gene:ENSG00000154153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000399793 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:16473053:16508998:-1 gene:ENSG00000154153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000509977 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:16475231:16509436:-1 gene:ENSG00000154153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 92 // 39 // 12 // 13 // 0 /// ENST00000510362 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:16473038:16478065:-1 gene:ENSG00000154153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// BC053326 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 134, member B, mRNA (cDNA clone MGC:59895 IMAGE:5014868), complete cds. // chr5 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0 /// BC073132 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 134, member B, mRNA (cDNA clone MGC:87806 IMAGE:5760145), complete cds. // chr5 // 100 // 61 // 20 // 20 // 0 /// BC030517 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 134, member B, mRNA (cDNA clone IMAGE:5165560), complete cds. // chr5 // 30 // 30 // 10 // 33 // 1
ENST00000364500 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:16623004:16623095:-1 gene:ENSG00000201370 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT100612 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000364566 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:16941843:16941951:-1 gene:ENSG00000201436 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT100616 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000384087 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:17117576:17117686:-1 gene:ENSG00000206814 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT100619 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000363005 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:11:93719603:93719715:1 gene:ENSG00000199875 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 50 // 100 // 2 // 4 // 0 /// NONHSAT023655 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 50 // 100 // 2 // 4 // 0
ENST00000516181 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:17156971:17157071:-1 gene:ENSG00000251990 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr5 // 100 // 75 // 3 // 3 // 0 /// NONHSAT100621 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 75 // 3 // 3 // 0
ENST00000401830 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:17353695:17354624:-1 gene:ENSG00000223361 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000430907 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:17353875:17354424:-1 gene:ENSG00000223361 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000038978 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:17353873:17354634:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
ENST00000600799 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:17491361:17491769:-1 gene:ENSG00000268799 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 90 // 77 // 9 // 10 // 0 /// GENSCAN00000038971 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:17491325:17495761:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONHSAT100647 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 90 // 77 // 9 // 10 // 0 /// NONHSAT100648 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 90 // 77 // 9 // 10 // 0
ENST00000598383 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:17655129:17655538:-1 gene:ENSG00000269466 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000600799 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:17491361:17491769:-1 gene:ENSG00000268799 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000038966 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:17655128:17678020:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000038971 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:17491325:17495761:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// NONHSAT100647 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// NONHSAT100648 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// NONHSAT100662 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONHSAT100663 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
ENST00000622625 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:18958147:18958413:-1 gene:ENSG00000276764 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000516274 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:23972188:23972294:-1 gene:ENSG00000252083 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONHSAT100747 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
ENST00000363730 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:23994502:23994603:-1 gene:ENSG00000200600 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT100749 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_006727 // RefSeq // Homo sapiens cadherin 10, type 2 (T2-cadherin) (CDH10), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000264463 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:24487100:24644978:-1 gene:ENSG00000040731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000502921 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:24487146:24499521:-1 gene:ENSG00000040731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 34 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000503958 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:24487532:24492963:-1 gene:ENSG00000040731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 23 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000510477 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:24487348:24644780:-1 gene:ENSG00000040731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 97 // 91 // 31 // 32 // 0 /// AB035303 // GenBank // Homo sapiens CDH10 mRNA for cadherin-10, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000015413 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:24487663:24593418:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 63 // 22 // 22 // 0 /// AF039747 // GenBank // Homo sapiens cadherin-10 (CDH10) mRNA, complete cds. // chr5 // 97 // 94 // 32 // 33 // 0
ENST00000364146 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:25701217:25701324:-1 gene:ENSG00000201016 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT100782 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
ENST00000362895 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:31595565:31595669:-1 gene:ENSG00000199765 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT100890 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_022130 // RefSeq // Homo sapiens golgi phosphoprotein 3 (coat-protein) (GOLPH3), mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000265070 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:32124704:32174350:-1 gene:ENSG00000113384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000503610 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:32126367:32174302:-1 gene:ENSG00000113384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 63 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000512668 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:32126595:32174317:-1 gene:ENSG00000113384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 54 // 19 // 19 // 0 /// AK128510 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ46665 fis, clone TRACH3007277, highly similar to Golgi phosphoprotein 3. // chr5 // 100 // 43 // 15 // 15 // 0 /// AK293368 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54589 complete cds, highly similar to Golgi phosphoprotein 3. // chr5 // 83 // 51 // 15 // 18 // 0 /// AK301588 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55806 complete cds, highly similar to Golgi phosphoprotein 3. // chr5 // 85 // 74 // 22 // 26 // 0 /// BC012123 // GenBank // Homo sapiens golgi phosphoprotein 3 (coat-protein), mRNA (cDNA clone MGC:20187 IMAGE:4558305), complete cds. // chr5 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// BC033725 // GenBank // Homo sapiens golgi phosphoprotein 3 (coat-protein), mRNA (cDNA clone MGC:44986 IMAGE:4999629), complete cds. // chr5 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// BC063586 // GenBank // Homo sapiens golgi phosphoprotein 3 (coat-protein), mRNA (cDNA clone MGC:74684 IMAGE:4428707), complete cds. // chr5 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000027803 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:32126212:32174034:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 57 // 20 // 20 // 0
ENST00000362861 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:32234766:32234875:-1 gene:ENSG00000199731 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT100921 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_030955 // RefSeq // Homo sapiens ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 12 (ADAMTS12), mRNA. // chr5 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000352040 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:33527181:33891941:-1 gene:ENSG00000151388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000504582 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:33576963:33840312:-1 gene:ENSG00000151388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000504830 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:33523535:33892192:-1 gene:ENSG00000151388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AJ250725 // GenBank // Homo sapiens mRNA for ADAMTS12. // chr5 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// BC131733 // GenBank // Homo sapiens ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 12, mRNA (cDNA clone MGC:150699 IMAGE:40124828), complete cds. // chr5 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005194 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:33517785:33690186:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0
ENST00000364753 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:33888056:33888162:-1 gene:ENSG00000201623 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000410416 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR5_6_CTG1:33890040:33890146:-1 gene:ENSG00000277091 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA gene:ENSG00000222348 // chr5 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT100962 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001042625 // RefSeq // Homo sapiens calcyphosine-like (CAPSL), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NM_144647 // RefSeq // Homo sapiens calcyphosine-like (CAPSL), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006714445 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens calcyphosine-like (CAPSL), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000397366 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:5:35904298:35938635:-1 gene:ENSG00000152611 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000397367 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:35904295:35938779:-1 gene:ENSG00000152611 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000513623 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:35904602:35938635:-1 gene:ENSG00000152611 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 94 // 64 // 17 // 18 // 0 /// ENST00000514524 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:35909830:35938635:-1 gene:ENSG00000152611 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// BC017586 // GenBank // Homo sapiens calcyphosine-like, mRNA (cDNA clone MGC:26610 IMAGE:4837506), complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000039670 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:35909866:35927295:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0
NM_001007527 // RefSeq // Homo sapiens LMBR1 domain containing 2 (LMBRD2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000296603 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:36098412:36151961:-1 gene:ENSG00000164187 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000505524 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:36108522:36115054:-1 gene:ENSG00000164187 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 91 // 28 // 10 // 11 // 0 /// AK300433 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57146 complete cds, highly similar to Homo sapiens LMBR1 domain containing 2 (LMBRD2), mRNA. // chr5 // 95 // 97 // 36 // 38 // 0 /// BC110506 // GenBank // Homo sapiens LMBR1 domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:125692 IMAGE:40028737), complete cds. // chr5 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000039678 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:36104046:36143349:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 69 // 27 // 27 // 0 /// NONHSAT101023 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 91 // 28 // 10 // 11 // 0
NM_001161429 // RefSeq // Homo sapiens RAN binding protein 3-like (RANBP3L), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NM_145000 // RefSeq // Homo sapiens RAN binding protein 3-like (RANBP3L), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000296604 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:36248434:36301902:-1 gene:ENSG00000164188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000502994 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:5:36249333:36301900:-1 gene:ENSG00000164188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000505865 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:36265463:36302114:-1 gene:ENSG00000164188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 33 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000515759 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:5:36256796:36301900:-1 gene:ENSG00000164188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0 /// AK058151 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ25422 fis, clone TST03753. // chr5 // 96 // 70 // 22 // 23 // 0 /// AK302947 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61646 complete cds, weakly similar to Ran-binding protein 3. // chr5 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// BC047660 // GenBank // Homo sapiens RAN binding protein 3-like, mRNA (cDNA clone MGC:51303 IMAGE:5261736), complete cds. // chr5 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// XM_006714452 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens RAN binding protein 3-like (RANBP3L), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 91 // 91 // 30 // 33 // 1 /// GENSCAN00000039665 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:36195144:36301416:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 67 // 67 // 22 // 33 // 1
ENST00000490461 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:37246173:37246479:-1 gene:ENSG00000242493 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT101056 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001278312 // RefSeq // Homo sapiens nucleoporin 155kDa (NUP155), transcript variant 3, mRNA. // chr5 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// NM_004298 // RefSeq // Homo sapiens nucleoporin 155kDa (NUP155), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NM_153485 // RefSeq // Homo sapiens nucleoporin 155kDa (NUP155), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000231498 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:37288137:37371181:-1 gene:ENSG00000113569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000381843 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:37291839:37370785:-1 gene:ENSG00000113569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000502533 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:37291838:37310668:-1 gene:ENSG00000113569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 34 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000513532 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:5:37291900:37371081:-1 gene:ENSG00000113569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// AK297143 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56637 complete cds, highly similar to Nuclear pore complex protein Nup155. // chr5 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// AL117585 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp434L038 (from clone DKFZp434L038). // chr5 // 100 // 45 // 17 // 17 // 0 /// BC039257 // GenBank // Homo sapiens nucleoporin 155kDa, mRNA (cDNA clone MGC:33787 IMAGE:5295664), complete cds. // chr5 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000025286 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:37213467:37379403:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 63 // 63 // 24 // 38 // 1
ENST00000410811 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:37619985:37620088:-1 gene:ENSG00000222743 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 88 // 100 // 7 // 8 // 0 /// NONHSAT101067 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 88 // 100 // 7 // 8 // 0
ENST00000384016 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:37700331:37700437:-1 gene:ENSG00000206743 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0
NM_001127671 // RefSeq // Homo sapiens leukemia inhibitory factor receptor alpha (LIFR), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NM_002310 // RefSeq // Homo sapiens leukemia inhibitory factor receptor alpha (LIFR), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000263409 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:38474963:38595404:-1 gene:ENSG00000113594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000453190 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:38480968:38556646:-1 gene:ENSG00000113594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000503088 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:38490620:38595404:-1 gene:ENSG00000113594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// AK290059 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76704 complete cds, highly similar to Homo sapiens leukemia inhibitory factor receptor (LIFR), mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AK309882 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99923. // chr5 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// X61615 // GenBank // H.sapiens mRNA for leukemia inhibitory factor (LIF) receptor. // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000038832 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:38481595:38530647:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0
NM_001737 // RefSeq // Homo sapiens complement component 9 (C9), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000263408 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:39284262:39364560:-1 gene:ENSG00000113600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000467285 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:39341081:39364495:-1 gene:ENSG00000113600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 27 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000483232 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:39331773:39424868:-1 gene:ENSG00000113600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000509186 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:39315769:39371290:-1 gene:ENSG00000113600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 32 // 12 // 12 // 0 /// BC020721 // GenBank // Homo sapiens complement component 9, mRNA (cDNA clone MGC:22516 IMAGE:4734153), complete cds. // chr5 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// K02766 // GenBank // Human complement component C9 mRNA, complete cds. // chr5 // 94 // 86 // 30 // 32 // 0 /// NONHSAT101120 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// NONHSAT101121 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 27 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000001643 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:39107443:39426408:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 65 // 65 // 24 // 37 // 1
ENST00000391265 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:40790077:40790204:-1 gene:ENSG00000212567 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT101152 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_000065 // RefSeq // Homo sapiens complement component 6 (C6), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NM_001115131 // RefSeq // Homo sapiens complement component 6 (C6), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000263413 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:41142234:41261438:-1 gene:ENSG00000039537 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000337836 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:41142234:41213510:-1 gene:ENSG00000039537 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AB126592 // GenBank // Homo sapiens C6 mRNA for complement component 6, complete cds. // chr5 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// AK292509 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78071 complete cds, highly similar to Human MHC class III complement component C6 mRNA. // chr5 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// BC035723 // GenBank // Homo sapiens complement component 6, mRNA (cDNA clone MGC:46183 IMAGE:5591446), complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// J05024 // GenBank // Human MHC class III complement component C6 mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// J05064 // GenBank // Human complement component C6 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000027120 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:40991362:41203230:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1
NM_001005473 // RefSeq // Homo sapiens phosphatidylinositol-specific phospholipase C, X domain containing 3 (PLCXD3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000328457 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:5:41306957:41510628:-1 gene:ENSG00000182836 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// ENST00000377801 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:41306954:41510601:-1 gene:ENSG00000182836 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000027123 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:41313617:41434048:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0
ENST00000362617 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:41963868:41963969:-1 gene:ENSG00000199487 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT101189 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_034086 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC648987 (LOC648987), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NR_104649 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC648987 (LOC648987), transcript variant 3, long non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000314957 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:43014414:43018724:-1 gene:ENSG00000177738 gene_biotype:sense_overlapping transcript_biotype:sense_overlapping // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000499871 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:43014734:43018811:-1 gene:ENSG00000177738 gene_biotype:sense_overlapping transcript_biotype:sense_overlapping // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC046188 // GenBank // Homo sapiens, clone IMAGE:5561763, mRNA. // chr5 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// NR_034085 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC648987 (LOC648987), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr5 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// GENSCAN00000021427 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:43017130:43019642:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT101254 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONHSAT101255 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// TCONS_00009223-XLOC_004804 // Rinn lincRNA // linc-SEPP1-1 chr5:-:43014830-43018913 // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// TCONS_00009278-XLOC_004804 // Rinn lincRNA // linc-SEPP1-1 chr5:-:43014522-43018913 // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// TCONS_00010322-XLOC_004804 // Rinn lincRNA // linc-SEPP1-1 chr5:-:43012799-43018741 // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONHSAT101258 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr5 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1
NM_001014279 // RefSeq // Homo sapiens annexin A2 receptor (ANXA2R), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000314890 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:43039233:43043170:-1 gene:ENSG00000177721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AY032883 // GenBank // Homo sapiens annexin II receptor mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC067873 // GenBank // Homo sapiens chromosome 5 open reading frame 39, mRNA (cDNA clone MGC:87542 IMAGE:30344324), complete cds. // chr5 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000616064 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:5:43039081:43040345:-1 gene:ENSG00000177721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NR_034127 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC100132356 (LOC100132356), long non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT101276 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT101277 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT101278 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// TCONS_00010927-XLOC_004805 // Rinn lincRNA // linc-C5orf39 chr5:-:43066161-43067888 // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001098272 // RefSeq // Homo sapiens 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA synthase 1 (soluble) (HMGCS1), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NM_002130 // RefSeq // Homo sapiens 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA synthase 1 (soluble) (HMGCS1), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000325110 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:43289395:43313493:-1 gene:ENSG00000112972 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000433297 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:43289395:43313512:-1 gene:ENSG00000112972 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC083514 // GenBank // Homo sapiens 3-hydroxy-3-methylglutaryl-Coenzyme A synthase 1 (soluble), mRNA (cDNA clone MGC:90332 IMAGE:4443624), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BT007302 // GenBank // Homo sapiens 3-hydroxy-3-methylglutaryl-Coenzyme A synthase 1 (soluble) mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 68 // 22 // 23 // 0 /// L25798 // GenBank // Homo sapiens 3-hydroxy-3-methylglutaryl coenzyme A synthase mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 68 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000021416 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:43291131:43298965:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 68 // 23 // 23 // 0 /// AK025736 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ22083 fis, clone HEP14459, highly similar to HUM3H3M Homo sapiens 3-hydroxy-3-methylglutaryl coenzyme A synthase mRNA. // chr5 // 100 // 68 // 23 // 23 // 0 /// BX537620 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686E20188 (from clone DKFZp686E20188). // chr5 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1
NM_198566 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 5 open reading frame 34 (C5orf34), mRNA. // chr5 // 97 // 100 // 36 // 37 // 0 /// XM_006714473 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chromosome 5 open reading frame 34 (C5orf34), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000306862 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:43486701:43515145:-1 gene:ENSG00000172244 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 100 // 36 // 37 // 0 /// ENST00000509489 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:43503665:43515024:-1 gene:ENSG00000172244 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 30 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000514462 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:43505550:43515078:-1 gene:ENSG00000172244 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 32 // 12 // 12 // 0 /// AK303336 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50329 complete cds. // chr5 // 100 // 32 // 12 // 12 // 0 /// BC036867 // GenBank // Homo sapiens chromosome 5 open reading frame 34, mRNA (cDNA clone MGC:46448 IMAGE:5198039), complete cds. // chr5 // 94 // 97 // 34 // 36 // 0 /// ENST00000506213 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:43490329:43494605:-1 gene:ENSG00000172244 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 27 // 27 // 10 // 37 // 1 /// NONHSAT101316 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 32 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT101315 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 27 // 27 // 10 // 37 // 1 /// GENSCAN00000021412 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:43505744:43588223:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 24 // 24 // 9 // 37 // 1
ENST00000481681 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:43666766:43667232:-1 gene:ENSG00000224993 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000021422 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:43666765:43667232:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// NONHSAT101327 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// NONHSAT101328 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0
ENST00000391259 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:44066624:44066731:-1 gene:ENSG00000212561 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT101330 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_021072 // RefSeq // Homo sapiens hyperpolarization activated cyclic nucleotide-gated potassium channel 1 (HCN1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000303230 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:45259247:45696151:-1 gene:ENSG00000164588 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF488549 // GenBank // Homo sapiens hyperpolarization activated cyclic nucleotide-gated potassium channel (HCN1) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000021837 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:45261921:45486564:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0
NM_198449 // RefSeq // Homo sapiens embigin (EMB), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000303221 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:50396192:50441367:-1 gene:ENSG00000170571 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000505896 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:50398027:50411998:-1 gene:ENSG00000170571 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 67 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000506190 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:50403256:50443248:-1 gene:ENSG00000170571 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 67 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000508934 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:5:50398677:50441350:-1 gene:ENSG00000170571 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000514111 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:50398939:50428727:-1 gene:ENSG00000170571 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0 /// AK300860 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50061 complete cds, highly similar to Embigin precursor. // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// AK304226 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50040 complete cds, highly similar to Embigin precursor. // chr5 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0 /// BC059398 // GenBank // Homo sapiens embigin homolog (mouse), mRNA (cDNA clone MGC:71745 IMAGE:30332712), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000017600 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:50361486:50441151:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 67 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT101366 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 67 // 12 // 12 // 0
ENST00000363601 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:7:54621025:54621131:1 gene:ENSG00000200471 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0 /// ENST00000384332 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:51055353:51055459:-1 gene:ENSG00000207060 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0 /// NONHSAT101383 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0 /// NONHSAT120655 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0
ENST00000383879 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:51167541:51167647:-1 gene:ENSG00000206606 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT101385 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AF118075 // GenBank HTC // Homo sapiens PRO1770 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENST00000411028 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:53912020:53912123:-1 gene:ENSG00000222960 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT101438 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000479462 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:54048007:54048308:-1 gene:ENSG00000241230 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT101442 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001135604 // RefSeq // Homo sapiens endothelial cell-specific molecule 1 (ESM1), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NM_007036 // RefSeq // Homo sapiens endothelial cell-specific molecule 1 (ESM1), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000381403 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:54978487:54985593:-1 gene:ENSG00000164283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 42 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000381405 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:54977864:54985663:-1 gene:ENSG00000164283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AK300634 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50870 complete cds, moderately similar to Endothelial cell-specific molecule 1 precursor. // chr5 // 100 // 42 // 13 // 13 // 0 /// BC011989 // GenBank // Homo sapiens endothelial cell-specific molecule 1, mRNA (cDNA clone MGC:9412 IMAGE:3882426), complete cds. // chr5 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000017456 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:54895020:54985814:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1
ENST00000501463 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:55231152:55233597:-1 gene:ENSG00000152669 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 97 // 88 // 28 // 29 // 0 /// AK290030 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75321 complete cds, highly similar to Homo sapiens uracil-DNA glycosylase 2, mRNA. // chr5 // 89 // 27 // 8 // 9 // 0 /// BC004877 // GenBank // Homo sapiens cyclin O, mRNA (cDNA clone IMAGE:3688593), complete cds. // chr5 // 97 // 88 // 28 // 29 // 0 /// X52486 // GenBank // Human mRNA for uracil-DNA glycosylase. // chr5 // 88 // 76 // 22 // 25 // 0 /// NM_021147 // RefSeq // Homo sapiens cyclin O (CCNO), mRNA. // chr5 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1 /// ENST00000282572 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:55231152:55233680:-1 gene:ENSG00000152669 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1 /// GENSCAN00000017452 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:55230110:55307573:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
NM_019030 // RefSeq // Homo sapiens DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 29 (DHX29), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000251636 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:55256245:55307722:-1 gene:ENSG00000067248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000504778 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:55256249:55307694:-1 gene:ENSG00000067248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AK025145 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ21492 fis, clone COL05554, highly similar to HST000015 Homo sapiens mRNA full length insert cDNA clone EUROIMAGE 48814. // chr5 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// AL079292 // GenBank // Homo sapiens mRNA full length insert cDNA clone EUROIMAGE 48814. // chr5 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// AL834496 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp761B122 (from clone DKFZp761B122). // chr5 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// AY036974 // GenBank // Homo sapiens nucleic acid helicase DDXx mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC056219 // GenBank // Homo sapiens DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 29, mRNA (cDNA clone MGC:51309 IMAGE:5315083), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BX649135 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686C2356 (from clone DKFZp686C2356). // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000621106 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:5:55256246:55307674:-1 gene:ENSG00000067248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000017452 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:55230110:55307573:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0
ENST00000459441 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:56000518:56000621:-1 gene:ENSG00000238326 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT101524 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000390963 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:56260333:56260446:-1 gene:ENSG00000212265 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT101533 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
ENST00000384563 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:57169108:57169209:-1 gene:ENSG00000207293 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT101570 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001017992 // RefSeq // Homo sapiens actin, beta-like 2 (ACTBL2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000423391 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:57480016:57482809:-1 gene:ENSG00000169067 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC137470 // GenBank // Homo sapiens actin, beta-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:169093 IMAGE:9021470), complete cds. // chr5 // 87 // 60 // 13 // 15 // 0 /// BC137473 // GenBank // Homo sapiens actin, beta-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:169096 IMAGE:9021473), complete cds. // chr5 // 87 // 60 // 13 // 15 // 0 /// BX648504 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686D0972 (from clone DKFZp686D0972). // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013978 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:57481577:57482707:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
ENST00000365147 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:60304047:60304151:-1 gene:ENSG00000202017 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT101635 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001048249 // RefSeq // Homo sapiens small integral membrane protein 15 (SMIM15), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000339020 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:61157709:61162474:-1 gene:ENSG00000188725 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000507416 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:61159922:61162468:-1 gene:ENSG00000188725 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// AK291180 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76405 complete cds. // chr5 // 88 // 50 // 14 // 16 // 0 /// BC146876 // GenBank // Homo sapiens chromosome 5 open reading frame 43, mRNA (cDNA clone MGC:181979 IMAGE:9056804), complete cds. // chr5 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// BC146881 // GenBank // Homo sapiens chromosome 5 open reading frame 43, mRNA (cDNA clone MGC:181984 IMAGE:9056809), complete cds. // chr5 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// BX538015 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686E2158 (from clone DKFZp686E2158); complete cds. // chr5 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0
AF264626 // GenBank // Homo sapiens uncharacterized gastric protein ZA52P mRNA, complete cds. // chr5 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0
ENST00000390913 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:61664145:61664239:-1 gene:ENSG00000212215 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT101683 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
AF119904 // GenBank HTC // Homo sapiens PRO2849 mRNA, complete cds. // chr5 // 82 // 100 // 14 // 17 // 0
NM_000524 // RefSeq // Homo sapiens 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 1A, G protein-coupled (HTR1A), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000323865 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:63960356:63962133:-1 gene:ENSG00000178394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF498978 // GenBank // Homo sapiens 5-hydroxytryptamine receptor 1A (HTR1A) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK291429 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75939 complete cds, highly similar to Homo sapiens 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 1A (HTR1A), mRNA. // chr5 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC069159 // GenBank // Homo sapiens 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 1A, mRNA (cDNA clone MGC:95445 IMAGE:7217020), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC136263 // GenBank // Homo sapiens 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 1A, mRNA (cDNA clone MGC:167873 IMAGE:9020250), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017434 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:63960171:63961719:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_173829 // RefSeq // Homo sapiens SREK1-interacting protein 1 (SREK1IP1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000513458 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:64718144:64768685:-1 gene:ENSG00000153006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC108716 // GenBank // Homo sapiens SFRS12-interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:131910 IMAGE:6184559), complete cds. // chr5 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// BC127085 // GenBank // Homo sapiens SFRS12-interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:150548 IMAGE:40122236), complete cds. // chr5 // 95 // 74 // 19 // 20 // 0 /// BC127086 // GenBank // Homo sapiens SFRS12-interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:150549 IMAGE:40122239), complete cds. // chr5 // 95 // 74 // 19 // 20 // 0 /// ENST00000622404 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:5:64723312:64768599:-1 gene:ENSG00000153006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
ENST00000384622 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:65604661:65604761:-1 gene:ENSG00000207352 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 93 // 100 // 14 // 15 // 0 /// NONHSAT101755 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 93 // 100 // 14 // 15 // 0
NM_019072 // RefSeq // Homo sapiens small glutamine-rich tetratricopeptide repeat (TPR)-containing, beta (SGTB), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000381007 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:65665928:65722130:-1 gene:ENSG00000197860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF075050 // GenBank // Homo sapiens full length insert cDNA YN88E09. // chr5 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// AF368281 // GenBank // Homo sapiens small glutamine rich protein with tetratricopeptide repeats 2 (SGT2) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC012044 // GenBank // Homo sapiens small glutamine-rich tetratricopeptide repeat (TPR)-containing, beta, mRNA (cDNA clone MGC:10496 IMAGE:3625993), complete cds. // chr5 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000506816 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:65680688:65723035:-1 gene:ENSG00000197860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// GENSCAN00000031988 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:65670246:65720807:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0
NONHSAT101788 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_005582 // RefSeq // Homo sapiens CD180 molecule (CD180), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_005248504 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens CD180 molecule (CD180), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000256447 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:67182275:67196799:-1 gene:ENSG00000134061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC109069 // GenBank // Homo sapiens CD180 molecule, mRNA (cDNA clone MGC:126233 IMAGE:40034168), complete cds. // chr5 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// BC109070 // GenBank // Homo sapiens CD180 molecule, mRNA (cDNA clone MGC:126234 IMAGE:40034172), complete cds. // chr5 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// D83597 // GenBank // Homo sapiens mRNA for RP105, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NONHSAT101892 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000486501 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:72314397:72314688:-1 gene:ENSG00000244748 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT102054 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_152625 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 366 (ZNF366), mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000318442 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:72442652:72507727:-1 gene:ENSG00000178175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC121053 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 366, mRNA (cDNA clone MGC:149782 IMAGE:40118323), complete cds. // chr5 // 91 // 77 // 21 // 23 // 0 /// BC121054 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 366, mRNA (cDNA clone MGC:149783 IMAGE:40118325), complete cds. // chr5 // 91 // 77 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000025427 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:72443756:72486735:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1
NM_004472 // RefSeq // Homo sapiens forkhead box D1 (FOXD1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// U59832 // GenBank // Human transcription factor, forkhead related activator 4 (FREAC-4) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000615637 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:73446256:73448362:-1 gene:ENSG00000251493 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000006495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:73446965:73448362:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0
AF116675 // GenBank HTC // Homo sapiens PRO1942 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
ENST00000508746 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:73803296:73803599:-1 gene:ENSG00000184084 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000006474 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:73803292:73803533:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONHSAT102139 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
ENST00000384606 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:74725099:74725204:-1 gene:ENSG00000207336 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 90 // 100 // 9 // 10 // 0 /// NONHSAT102176 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 90 // 100 // 9 // 10 // 0
ENST00000391061 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:74882656:74882783:-1 gene:ENSG00000212363 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT102183 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000469428 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:74990189:74990637:-1 gene:ENSG00000182383 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 89 // 100 // 8 // 9 // 0 /// GENSCAN00000000894 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:74987568:75018266:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 89 // 100 // 8 // 9 // 0 /// NONHSAT102191 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 89 // 100 // 8 // 9 // 0
NM_016591 // RefSeq // Homo sapiens glucosaminyl (N-acetyl) transferase 4, core 2 (GCNT4), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000322348 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:75025346:75030899:-1 gene:ENSG00000176928 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF132035 // GenBank // Homo sapiens core 2 beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 3 (C2GnT3) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000000896 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:75028676:75053847:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_001164443 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat domain 31 (ANKRD31), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000274361 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:5:75068297:75236878:-1 gene:ENSG00000145700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000506364 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:75068297:75236878:-1 gene:ENSG00000145700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000000888 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:75080948:75236686:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0
ENST00000384603 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:75709495:75709599:-1 gene:ENSG00000207333 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT102222 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENST00000517024 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:76091708:76091801:-1 gene:ENSG00000252833 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT102228 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001256566 // RefSeq // Homo sapiens coagulation factor II (thrombin) receptor-like 2 (F2RL2), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// NM_004101 // RefSeq // Homo sapiens coagulation factor II (thrombin) receptor-like 2 (F2RL2), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000296641 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:76615482:76623434:-1 gene:ENSG00000164220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000504899 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:76617373:76623413:-1 gene:ENSG00000164220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 94 // 61 // 16 // 17 // 0 /// AK298585 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51933 complete cds, highly similar to Proteinase-activated receptor 3 precursor. // chr5 // 88 // 61 // 15 // 17 // 0 /// BC093648 // GenBank // Homo sapiens coagulation factor II (thrombin) receptor-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:120683 IMAGE:7939493), complete cds. // chr5 // 94 // 64 // 17 // 18 // 0 /// BC093650 // GenBank // Homo sapiens coagulation factor II (thrombin) receptor-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:120685 IMAGE:7939495), complete cds. // chr5 // 94 // 64 // 17 // 18 // 0 /// BX537386 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686N1782 (from clone DKFZp686N1782); complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// U92971 // GenBank // Human protease-activated receptor 3 (PAR3) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0
ENST00000577964 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:76836900:76837195:-1 gene:ENSG00000264391 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT102252 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_032367 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, BED-type containing 3 (ZBED3), mRNA. // chr5 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000255198 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:77072072:77087323:-1 gene:ENSG00000132846 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000511587 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:77077427:77087183:-1 gene:ENSG00000132846 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 92 // 42 // 12 // 13 // 0 /// BC007239 // GenBank // Homo sapiens zinc finger, BED-type containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:15435 IMAGE:2906114), complete cds. // chr5 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035248 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:77076839:77077473:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 89 // 29 // 8 // 9 // 0
NM_032109 // RefSeq // Homo sapiens orthopedia homeobox (OTP), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000306422 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:77628712:77639688:-1 gene:ENSG00000171540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC001800 // GenBank // Homo sapiens orthopedia homeobox, mRNA (cDNA clone MGC:3161 IMAGE:3354882), complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_004607 // RefSeq // Homo sapiens tubulin folding cofactor A (TBCA), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000306388 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:77691241:77776287:-1 gene:ENSG00000171530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0 /// ENST00000380377 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:77691166:77776361:-1 gene:ENSG00000171530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000518338 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:5:77691267:77776261:-1 gene:ENSG00000171530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 55 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000520361 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:5:77691248:77776293:-1 gene:ENSG00000171530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0 /// BC018210 // GenBank // Homo sapiens tubulin folding cofactor A, mRNA (cDNA clone MGC:9129 IMAGE:3861138), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC105285 // GenBank // Homo sapiens tubulin folding cofactor A, mRNA (cDNA clone MGC:104402 IMAGE:6702573), complete cds. // chr5 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0 /// BT007354 // GenBank // Homo sapiens tubulin-specific chaperone a mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 55 // 6 // 6 // 0 /// CR542170 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834A0824D for gene TBCA, tubulin-specific chaperone a; complete cds, incl. stopcodon. // chr5 // 100 // 55 // 6 // 6 // 0 /// CR542186 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834G0424D for gene TBCA, tubulin-specific chaperone a; complete cds, without stopcodon. // chr5 // 100 // 55 // 6 // 6 // 0
NM_001271769 // RefSeq // Homo sapiens adaptor-related protein complex 3, beta 1 subunit (AP3B1), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NM_003664 // RefSeq // Homo sapiens adaptor-related protein complex 3, beta 1 subunit (AP3B1), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_005248619 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens adaptor-related protein complex 3, beta 1 subunit (AP3B1), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000255194 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:78000525:78294755:-1 gene:ENSG00000132842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000519295 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:5:78002326:78294692:-1 gene:ENSG00000132842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AK291201 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76822 complete cds, highly similar to Homo sapiens adaptor-related protein complex 3, beta 1 subunit (AP3B1), mRNA. // chr5 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// AK303300 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51426 complete cds, highly similar to Adapter-related protein complex 3 beta-1 subunit. // chr5 // 89 // 55 // 16 // 18 // 0 /// BC038444 // GenBank // Homo sapiens adaptor-related protein complex 3, beta 1 subunit, mRNA (cDNA clone MGC:40360 IMAGE:3914400), complete cds. // chr5 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// U81504 // GenBank // Homo sapiens beta-3A-adaptin subunit of the AP-3 complex mRNA, complete cds. // chr5 // 97 // 97 // 31 // 32 // 0 /// U91931 // GenBank // Homo sapiens AP-3 complex beta3A subunit mRNA, complete cds. // chr5 // 97 // 97 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000022619 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:77986810:78339891:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 85 // 85 // 28 // 33 // 1
ENST00000363461 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:78314916:78315025:-1 gene:ENSG00000200331 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT102313 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_000046 // RefSeq // Homo sapiens arylsulfatase B (ARSB), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// XM_005248506 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens arylsulfatase B (ARSB), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 95 // 48 // 18 // 19 // 0 /// ENST00000264914 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:78777209:78985785:-1 gene:ENSG00000113273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 83 // 33 // 33 // 0 /// AK290865 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76497 complete cds, highly similar to Homo sapiens arylsulfatase B (ARSB), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 95 // 55 // 21 // 22 // 0 /// J05225 // GenBank // Human arylsulfatase B (ASB) mRNA, complete cds. // chr5 // 88 // 65 // 23 // 26 // 0 /// M32373 // GenBank // Human arylsulfatase B (ASB) mRNA, complete cds. // chr5 // 94 // 78 // 29 // 31 // 0 /// NM_198709 // RefSeq // Homo sapiens arylsulfatase B (ARSB), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 65 // 65 // 26 // 40 // 1 /// ENST00000396151 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:78815511:78986087:-1 gene:ENSG00000113273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 65 // 65 // 26 // 40 // 1 /// ENST00000565165 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:5:78816055:78986087:-1 gene:ENSG00000113273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 60 // 60 // 24 // 40 // 1 /// BC029051 // GenBank // Homo sapiens arylsulfatase B, mRNA (cDNA clone MGC:34518 IMAGE:5186657), complete cds. // chr5 // 65 // 65 // 26 // 40 // 1 /// GENSCAN00000025665 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:78919900:78985248:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 20 // 8 // 8 // 0
ENST00000364639 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:79562745:79562846:-1 gene:ENSG00000277818 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA gene:ENSG00000201509 // chr5 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_001010891 // RefSeq // Homo sapiens metaxin 3 (MTX3), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NM_001167741 // RefSeq // Homo sapiens metaxin 3 (MTX3), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000509852 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:79982900:79991259:-1 gene:ENSG00000177034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 75 // 75 // 12 // 16 // 1 /// ENST00000512528 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:79983364:79991259:-1 gene:ENSG00000177034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 75 // 75 // 12 // 16 // 1 /// ENST00000512560 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:5:79979761:79991245:-1 gene:ENSG00000177034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 75 // 75 // 12 // 16 // 1 /// AK296864 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51232 complete cds, highly similar to Homo sapiens metaxin 3 (MTX3), mRNA. // chr5 // 75 // 75 // 12 // 16 // 1 /// ENST00000617335 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:5:79976731:79991262:-1 gene:ENSG00000177034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000041469 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:79983684:79991238:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 50 // 50 // 8 // 16 // 1
NONHSAT102394 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_004845 // RefSeq // Homo sapiens actin, beta pseudogene (LOC644936), non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000507366 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:80299678:80302847:-1 gene:ENSG00000184188 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000041472 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:80299678:80300337:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0
ENST00000516019 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:80306235:80306368:-1 gene:ENSG00000251828 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT102398 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000424312 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:80331573:80332541:-1 gene:ENSG00000227087 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000041461 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:80331609:80332541:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 94 // 100 // 16 // 17 // 0
ENST00000515379 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:80359080:80360040:-1 gene:ENSG00000220157 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000041459 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:80359077:80359925:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0
ENST00000384047 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:80365726:80365832:-1 gene:ENSG00000206774 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000384576 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:17:48196680:48196786:-1 gene:ENSG00000207306 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 55 // 100 // 6 // 11 // 0 /// NONHSAT102400 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONHSAT054391 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 55 // 100 // 6 // 11 // 0
NM_001004441 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat domain 34B (ANKRD34B), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000338682 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:80556755:80570488:-1 gene:ENSG00000189127 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000508916 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:80559969:80570250:-1 gene:ENSG00000189127 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// BC137441 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat domain 34B, mRNA (cDNA clone MGC:169062 IMAGE:9021439), complete cds. // chr5 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// BC137442 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat domain 34B, mRNA (cDNA clone MGC:169063 IMAGE:9021440), complete cds. // chr5 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// BC142957 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat domain 34B, mRNA (cDNA clone MGC:167026 IMAGE:8860359), complete cds. // chr5 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041466 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:80558475:80560019:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 89 // 32 // 8 // 9 // 0 /// GENSCAN00000041468 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:80566710:80570727:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NONHSAT102415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENST00000389680 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:GRCh38:MT:648:1601:1 gene:ENSG00000211459 gene_biotype:Mt_rRNA transcript_biotype:Mt_rRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NC_001807 // GenBank // gi|17981852|ref|NC_001807.4|:650-1603; gene=RNR1; product=s-rRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT102416 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT135785 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT102415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr5 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1
ENST00000510729 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:82009602:82010094:-1 gene:ENSG00000251495 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000047629 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:82009596:82010093:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001025 // RefSeq // Homo sapiens ribosomal protein S23 (RPS23), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000296674 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:82273358:82278577:-1 gene:ENSG00000186468 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000507980 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:82275878:82278354:-1 gene:ENSG00000186468 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000510019 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:82275421:82278396:-1 gene:ENSG00000186468 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000510210 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:82274524:82278341:-1 gene:ENSG00000186468 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 86 // 54 // 12 // 14 // 0 /// AK291132 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77921 complete cds, highly similar to Homo sapiens ribosomal protein S23 (RPS23), mRNA. // chr5 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// BC070221 // GenBank // Homo sapiens ribosomal protein S23, mRNA (cDNA clone MGC:88202 IMAGE:4770703), complete cds. // chr5 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0
NM_001278642 // RefSeq // Homo sapiens EGF-like repeats and discoidin I-like domains 3 (EDIL3), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NM_005711 // RefSeq // Homo sapiens EGF-like repeats and discoidin I-like domains 3 (EDIL3), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000296591 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:83940554:84384793:-1 gene:ENSG00000164176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000380138 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:83940600:84384386:-1 gene:ENSG00000164176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000507663 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:84106660:84181242:-1 gene:ENSG00000164176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// BC030828 // GenBank // Homo sapiens EGF-like repeats and discoidin I-like domains 3, mRNA (cDNA clone MGC:26287 IMAGE:4791845), complete cds. // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC053656 // GenBank // Homo sapiens EGF-like repeats and discoidin I-like domains 3, mRNA (cDNA clone MGC:61588 IMAGE:5753154), complete cds. // chr5 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// U70312 // GenBank // Homo sapiens integrin binding protein Del-1 (Del1) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000019890 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:84044740:84289409:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT102530 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0
ENST00000384286 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:86663144:86663250:-1 gene:ENSG00000207013 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT102575 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
AF258587 // GenBank // Homo sapiens PP565 mRNA, complete cds. // chr5 // 95 // 100 // 18 // 19 // 0
ENST00000489622 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:87294189:87294473:-1 gene:ENSG00000241243 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT102589 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
ENST00000384721 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:87299687:87299797:-1 gene:ENSG00000207452 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT102590 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000384400 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:88274258:88274376:-1 gene:ENSG00000207129 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT102623 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_203406 // RefSeq // Homo sapiens metallo-beta-lactamase domain containing 2 (MBLAC2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000316610 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:90458203:90474768:-1 gene:ENSG00000176055 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK289778 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75971 complete cds. // chr5 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// BC038230 // GenBank // Homo sapiens beta-lactamase-like, mRNA (cDNA clone MGC:46734 IMAGE:5729339), complete cds. // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// CR749512 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686P15118 (from clone DKFZp686P15118). // chr5 // 94 // 57 // 15 // 16 // 0 /// ENST00000514906 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:90472443:90474378:-1 gene:ENSG00000176055 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// GENSCAN00000042806 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:90461167:90474292:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
XR_241838 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens uncharacterized LOC729040 (LOC729040), misc_RNA. // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000440769 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:91280097:91281142:-1 gene:ENSG00000234292 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AF452720 // GenBank HTC // Homo sapiens clone KU010717 unknown mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT102742 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_020801 // RefSeq // Homo sapiens arrestin domain containing 3 (ARRDC3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000265138 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:91368724:91383359:-1 gene:ENSG00000113369 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000507075 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:91376559:91382875:-1 gene:ENSG00000113369 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0 /// AK291753 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77330 complete cds, highly similar to Homo sapiens arrestin domain containing 3 (ARRDC3), mRNA. // chr5 // 92 // 86 // 23 // 25 // 0 /// BC015928 // GenBank // Homo sapiens arrestin domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:8773 IMAGE:3908916), complete cds. // chr5 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC053619 // GenBank // Homo sapiens arrestin domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:61602 IMAGE:6155815), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000503192 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:91375527:91380151:-1 gene:ENSG00000113369 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// ENST00000508948 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:91375521:91381020:-1 gene:ENSG00000113369 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// GENSCAN00000002617 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:91371400:91450511:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT102760 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// NONHSAT102761 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NM_153216 // RefSeq // Homo sapiens POU domain class 5, transcription factor 2 (POU5F2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000510627 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:93740308:93741637:-1 gene:ENSG00000248483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC029532 // GenBank // Homo sapiens POU domain class 5, transcription factor 2, mRNA (cDNA clone MGC:33931 IMAGE:5295125), complete cds. // chr5 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000606183 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:93734806:93741123:-1 gene:ENSG00000248483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1 /// BX641019 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686P02123 (from clone DKFZp686P02123). // chr5 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// GENSCAN00000041629 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:93740577:93741491:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0
NM_001145678 // RefSeq // Homo sapiens KIAA0825 (KIAA0825), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000427991 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:5:94384367:94618604:-1 gene:ENSG00000185261 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000513200 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:94152966:94618571:-1 gene:ENSG00000185261 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000034186 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:94221487:94452886:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 68 // 68 // 15 // 22 // 1
ENST00000504117 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:94412974:94477184:-1 gene:ENSG00000185261 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB020632 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA0825 protein, partial cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001145678 // RefSeq // Homo sapiens KIAA0825 (KIAA0825), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 92 // 92 // 24 // 26 // 1 /// ENST00000427991 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:5:94384367:94618604:-1 gene:ENSG00000185261 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 92 // 92 // 24 // 26 // 1 /// ENST00000513200 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:94152966:94618571:-1 gene:ENSG00000185261 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 92 // 92 // 24 // 26 // 1 /// GENSCAN00000034187 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:94457596:94520881:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_173665 // RefSeq // Homo sapiens KIAA0825 (KIAA0825), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000329378 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:94519206:94618597:-1 gene:ENSG00000185261 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC035515 // GenBank // Homo sapiens chromosome 5 open reading frame 36, mRNA (cDNA clone MGC:34713 IMAGE:5201671), complete cds. // chr5 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// NM_001145678 // RefSeq // Homo sapiens KIAA0825 (KIAA0825), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 83 // 83 // 24 // 29 // 1 /// ENST00000427991 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:5:94384367:94618604:-1 gene:ENSG00000185261 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 83 // 83 // 24 // 29 // 1 /// ENST00000513200 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:94152966:94618571:-1 gene:ENSG00000185261 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1 /// GENSCAN00000034187 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:94457596:94520881:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
ENST00000387459 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:GRCh38:MT:14674:14742:-1 gene:ENSG00000210194 gene_biotype:Mt_tRNA transcript_biotype:Mt_tRNA // chr5 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// NC_001807 // GenBank // gi|17981852|ref|NC_001807.4|:c14743-14675; gene=TRNE; product=tRNA-Glu // chr5 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// NONHSAT135846 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0
AF222858 // GenBank // Homo sapiens uncharacterized gastric protein YC11P mRNA, complete cds. // chr5 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1
NM_014639 // RefSeq // Homo sapiens tetratricopeptide repeat domain 37 (TTC37), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENST00000358746 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:95463895:95555007:-1 gene:ENSG00000198677 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENST00000507805 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:95506977:95522086:-1 gene:ENSG00000198677 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 91 // 23 // 10 // 11 // 0 /// ENST00000508181 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:95502903:95516674:-1 gene:ENSG00000198677 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 19 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000514952 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:5:95522088:95554977:-1 gene:ENSG00000198677 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 40 // 19 // 19 // 0 /// BC030966 // GenBank HTC // Homo sapiens tetratricopeptide repeat domain 37, mRNA (cDNA clone IMAGE:4108519), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr5 // 89 // 38 // 16 // 18 // 0 /// BC056893 // GenBank // Homo sapiens tetratricopeptide repeat domain 37, mRNA (cDNA clone MGC:65037 IMAGE:6164578), complete cds. // chr5 // 100 // 94 // 45 // 45 // 0 /// GENSCAN00000039790 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:95464607:95555813:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 75 // 36 // 36 // 0 /// AK310926 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17968. // chr5 // 19 // 19 // 9 // 48 // 1
NM_012081 // RefSeq // Homo sapiens elongation factor, RNA polymerase II, 2 (ELL2), mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006714574 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens elongation factor, RNA polymerase II, 2 (ELL2), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000237853 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:95885098:95962071:-1 gene:ENSG00000118985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AK300310 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52633 complete cds, highly similar to RNA polymerase II elongation factor ELL2. // chr5 // 92 // 44 // 11 // 12 // 0 /// BC028412 // GenBank // Homo sapiens elongation factor, RNA polymerase II, 2, mRNA (cDNA clone MGC:33555 IMAGE:4822236), complete cds. // chr5 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// BC151238 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:8860505, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr5 // 92 // 48 // 12 // 13 // 0 /// AK296870 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51233 complete cds, highly similar to RNA polymerase II elongation factor ELL2. // chr5 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// AK297956 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60736 complete cds, highly similar to RNA polymerase II elongation factor ELL2. // chr5 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// ENST00000513343 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:5:95898764:95961848:-1 gene:ENSG00000118985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// GENSCAN00000049149 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:95888871:95974133:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
ENST00000384270 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:96210121:96210227:-1 gene:ENSG00000206997 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT102886 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000364014 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:96962656:96962757:-1 gene:ENSG00000200884 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT102918 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
AF119888 // GenBank HTC // Homo sapiens PRO2613 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_153234 // RefSeq // Homo sapiens Lix1 homolog (chicken) (LIX1), mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000274382 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:97091867:97142872:-1 gene:ENSG00000145721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK291034 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78158 complete cds. // chr5 // 95 // 78 // 20 // 21 // 0 /// BC036467 // GenBank // Homo sapiens Lix1 homolog (chicken), mRNA (cDNA clone MGC:33866 IMAGE:5264055), complete cds. // chr5 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009453 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:97094748:97142576:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
NM_018343 // RefSeq // Homo sapiens RIO kinase 2 (RIOK2), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000283109 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:97160867:97183260:-1 gene:ENSG00000058729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000511293 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:5:97162936:97167577:-1 gene:ENSG00000058729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// BC000953 // GenBank // Homo sapiens RIO kinase 2 (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:4923 IMAGE:3449997), complete cds. // chr5 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// NM_001159749 // RefSeq // Homo sapiens RIO kinase 2 (RIOK2), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 58 // 58 // 19 // 33 // 1 /// ENST00000508447 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:97166746:97183222:-1 gene:ENSG00000058729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// GENSCAN00000009443 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:97163061:97183969:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0
ENST00000383971 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:97175950:97176113:-1 gene:ENSG00000206698 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT102921 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001270 // RefSeq // Homo sapiens chromodomain helicase DNA binding protein 1 (CHD1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000284049 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:5:98855204:98926534:-1 gene:ENSG00000153922 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000514344 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:98855204:98872557:-1 gene:ENSG00000153922 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 31 // 13 // 13 // 0 /// AF006513 // GenBank // Homo sapiens CHD1 mRNA, complete cds. // chr5 // 98 // 95 // 39 // 40 // 0 /// BC117134 // GenBank // Homo sapiens chromodomain helicase DNA binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:150743 IMAGE:40125685), complete cds. // chr5 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// BX648767 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686E2337 (from clone DKFZp686E2337). // chr5 // 100 // 31 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000614616 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:98853985:98928957:-1 gene:ENSG00000153922 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000041772 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:98856380:98928509:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 74 // 31 // 31 // 0
ENST00000363481 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:98936638:98936747:-1 gene:ENSG00000200351 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT102973 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000362916 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:102131007:102131135:-1 gene:ENSG00000199786 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT103021 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_180991 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier organic anion transporter family, member 4C1 (SLCO4C1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000310954 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:102233986:102296549:-1 gene:ENSG00000173930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF401643 // GenBank // Homo sapiens organic anion transporter OATP-M1 mRNA, complete cds. // chr5 // 97 // 86 // 30 // 31 // 0 /// AY273896 // GenBank // Homo sapiens OATP-H mRNA, complete cds. // chr5 // 97 // 97 // 34 // 35 // 0 /// GENSCAN00000035373 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:102154340:102498844:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 47 // 47 // 17 // 36 // 1
NM_017676 // RefSeq // Homo sapiens gypsy retrotransposon integrase 1 (GIN1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000399004 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:103086333:103120151:-1 gene:ENSG00000145723 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000512248 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:103086000:103120108:-1 gene:ENSG00000145723 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AK295796 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61279 complete cds. // chr5 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// BC151135 // GenBank // Homo sapiens gypsy retrotransposon integrase 1, mRNA (cDNA clone MGC:184047 IMAGE:9057035), complete cds. // chr5 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC157835 // GenBank // Homo sapiens gypsy retrotransposon integrase 1, mRNA (cDNA clone MGC:189730 IMAGE:9057054), complete cds. // chr5 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000507478 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:103087815:103097693:-1 gene:ENSG00000145723 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// ENST00000508629 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:103087813:103120097:-1 gene:ENSG00000145723 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// BC015325 // GenBank // Homo sapiens gypsy retrotransposon integrase 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4414731), complete cds. // chr5 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1 /// GENSCAN00000025933 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:103087898:103108707:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0
NM_031438 // RefSeq // Homo sapiens nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 12 (NUDT12), mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000230792 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:103548855:103562793:-1 gene:ENSG00000112874 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000507423 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:5:103550508:103562789:-1 gene:ENSG00000112874 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 85 // 27 // 28 // 0 /// AK304010 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51732 complete cds, highly similar to Peroxisomal NADH pyrophosphatase NUDT12 (EC 3.6.1.22). // chr5 // 96 // 85 // 27 // 28 // 0 /// BC041099 // GenBank // Homo sapiens nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 12, mRNA (cDNA clone MGC:46006 IMAGE:5495144), complete cds. // chr5 // 97 // 97 // 31 // 32 // 0 /// ENST00000508889 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:103559405:103562790:-1 gene:ENSG00000112874 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1 /// ENST00000515407 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:103554502:103556089:-1 gene:ENSG00000112874 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1 /// GENSCAN00000025914 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:103527920:103605546:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// NONHSAT103064 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1 /// NONHSAT103065 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
AF067801 // GenBank // Homo sapiens HDCGC21P mRNA, complete cds. // chr5 // 91 // 100 // 21 // 23 // 0
ENST00000470639 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:104260531:104260826:-1 gene:ENSG00000239808 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT103075 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000517072 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:104780288:104780389:-1 gene:ENSG00000252881 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT103093 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000364920 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:105922994:105923108:-1 gene:ENSG00000201790 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT103099 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_001962 // RefSeq // Homo sapiens ephrin-A5 (EFNA5), mRNA. // chr5 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENST00000333274 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:107376889:107670895:-1 gene:ENSG00000184349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000504941 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:107426976:107670885:-1 gene:ENSG00000184349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000509503 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:5:107381238:107670627:-1 gene:ENSG00000184349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000510359 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:107380984:107388553:-1 gene:ENSG00000184349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// AK308672 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ98713. // chr5 // 92 // 44 // 11 // 12 // 0 /// BC075054 // GenBank // Homo sapiens ephrin-A5, mRNA (cDNA clone MGC:103964 IMAGE:30915365), complete cds. // chr5 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// BC075055 // GenBank // Homo sapiens ephrin-A5, mRNA (cDNA clone MGC:104127 IMAGE:30915581), complete cds. // chr5 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// U26403 // GenBank // Human receptor tyrosine kinase ligand LERK-7 precursor (EPLG7) mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// ENST00000611503 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:5:107376889:107427514:-1 gene:ENSG00000184349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT103112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000030515 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:107217800:107490742:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
ENST00000476421 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:107734773:107735066:-1 gene:ENSG00000239708 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// NONHSAT103117 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 86 // 100 // 19 // 22 // 0
ENST00000511478 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:109051315:109052457:-1 gene:ENSG00000176857 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000001532 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:109051312:109052457:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_014819 // RefSeq // Homo sapiens praja ring finger 2, E3 ubiquitin protein ligase (PJA2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000361189 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:109334709:109409994:-1 gene:ENSG00000198961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000361557 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:5:109334713:109383433:-1 gene:ENSG00000198961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AK291759 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76892 complete cds, highly similar to Homo sapiens praja 2, RING-H2 motif containing (PJA2), mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC030826 // GenBank // Homo sapiens praja ring finger 2, mRNA (cDNA clone MGC:26115 IMAGE:4811738), complete cds. // chr5 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000001531 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:109337231:109388859:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// AB636596 // GenBank // Homo sapiens Pe7Fe14 mRNA for PJA2/FER fusion protein, complete cds. // chr5 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
ENST00000365642 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:109699500:109699834:-1 gene:ENSG00000202512 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT103149 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000384448 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:110684794:110684927:-1 gene:ENSG00000207177 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BX537598 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686E12119 (from clone DKFZp686E12119). // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT103174 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT103175 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000517248 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:111719769:111720061:-1 gene:ENSG00000253057 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT103198 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_022140 // RefSeq // Homo sapiens erythrocyte membrane protein band 4.1 like 4A (EPB41L4A), mRNA. // chr5 // 97 // 88 // 29 // 30 // 0 /// ENST00000261486 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:112162621:112419316:-1 gene:ENSG00000129595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000305368 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:112263408:112419313:-1 gene:ENSG00000129595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 26 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000515047 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:112170009:112205502:-1 gene:ENSG00000129595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 26 // 9 // 9 // 0 /// AB030240 // GenBank // Homo sapiens mRNA for hNBL4, complete cds. // chr5 // 84 // 74 // 21 // 25 // 0 /// BC031042 // GenBank // Homo sapiens erythrocyte membrane protein band 4.1 like 4A, mRNA (cDNA clone IMAGE:5271362), complete cds. // chr5 // 100 // 26 // 9 // 9 // 0 /// BC114632 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:40084555. // chr5 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000507810 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:112142441:112228778:-1 gene:ENSG00000129595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 41 // 41 // 14 // 34 // 1 /// AK096057 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ38738 fis, clone KIDNE2011508, highly similar to Homo sapiens mRNA for hNBL4. // chr5 // 32 // 32 // 11 // 34 // 1 /// ENST00000621003 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:5:112162618:112419313:-1 gene:ENSG00000129595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000001725 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:112160549:112354733:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 47 // 47 // 16 // 34 // 1
NM_032028 // RefSeq // Homo sapiens testis-specific serine kinase 1B (TSSK1B), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000390666 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:113432554:113435031:-1 gene:ENSG00000212122 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY028964 // GenBank // Homo sapiens testis-specific serine/threonine kinase 1 (TSSK1) mRNA, complete cds. // chr5 // 93 // 56 // 13 // 14 // 0 /// BC022515 // GenBank // Homo sapiens testis-specific serine kinase 1B, mRNA (cDNA clone MGC:26573 IMAGE:4816988), complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
ENST00000515849 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:115389643:115392370:-1 gene:ENSG00000249026 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_020177 // RefSeq // Homo sapiens fem-1 homolog c (C. elegans) (FEM1C), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000274457 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:115520908:115544894:-1 gene:ENSG00000145780 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AB058688 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1785 protein, partial cds. // chr5 // 100 // 58 // 19 // 19 // 0 /// AF391093 // GenBank // Homo sapiens FEM1A (FEM1A) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0 /// AL365415 // GenBank // Homo sapiens mRNA full length insert cDNA clone EUROIMAGE 686608. // chr5 // 100 // 30 // 10 // 10 // 0 /// AY249188 // GenBank // Homo sapiens FEM1C (FEM1C) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0 /// BC028369 // GenBank // Homo sapiens fem-1 homolog c (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:26985 IMAGE:4826273), complete cds. // chr5 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000029312 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:115524308:115543493:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0
ENST00000410666 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:115774319:115774502:-1 gene:ENSG00000222598 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT103324 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001801 // RefSeq // Homo sapiens cysteine dioxygenase type 1 (CDO1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XR_427700 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens cysteine dioxygenase type 1 (CDO1), transcript variant X1, misc_RNA. // chr5 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000250535 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:115804733:115816954:-1 gene:ENSG00000129596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000502631 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:115805264:115816657:-1 gene:ENSG00000129596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 53 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000504613 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:115813189:115816657:-1 gene:ENSG00000129596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// BC024241 // GenBank // Homo sapiens cysteine dioxygenase, type I, mRNA (cDNA clone MGC:33161 IMAGE:4797463), complete cds. // chr5 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// CR536540 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834A0422D for gene CDO1, cysteine dioxygenase, type I; complete cds, incl. stopcodon. // chr5 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// D85777 // GenBank // Homo sapiens mRNA for cysteine dioxygenase, complete cds. // chr5 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000006922 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:115805433:115842937:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1
ENST00000427352 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:116218026:116218295:-1 gene:ENSG00000232916 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000006920 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:116212364:116218295:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT103356 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_020796 // RefSeq // Homo sapiens sema domain, transmembrane domain (TM), and cytoplasmic domain, (semaphorin) 6A (SEMA6A), mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000257414 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:116445750:116574395:-1 gene:ENSG00000092421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000343348 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:116443616:116574934:-1 gene:ENSG00000092421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000510263 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:116446613:116536458:-1 gene:ENSG00000092421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000515129 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:116446134:116478677:-1 gene:ENSG00000092421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// AF279656 // GenBank // Homo sapiens semaphorin SEMA6A1 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// AK315143 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ96110, highly similar to Homo sapiens sema domain, transmembrane domain (TM), andcytoplasmic domain, (semaphorin) 6A (SEMA6A), mRNA. // chr5 // 90 // 75 // 19 // 21 // 0 /// BC032619 // GenBank // Homo sapiens sema domain, transmembrane domain (TM), and cytoplasmic domain, (semaphorin) 6A, mRNA (cDNA clone IMAGE:5578066). // chr5 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000006945 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:116446613:116494609:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0
ENST00000513004 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:117778826:117779532:-1 gene:ENSG00000249582 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000047700 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:117706938:117792058:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT103390 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0
NM_173666 // RefSeq // Homo sapiens DTW domain containing 2 (DTWD2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000304058 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:118837322:118988220:-1 gene:ENSG00000169570 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000506980 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:118840279:118988539:-1 gene:ENSG00000169570 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000510708 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:118839541:118988545:-1 gene:ENSG00000169570 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC114508 // GenBank // Homo sapiens DTW domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:138580 IMAGE:40024023), complete cds. // chr5 // 95 // 91 // 20 // 21 // 0 /// BC114955 // GenBank // Homo sapiens DTW domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:138579 IMAGE:40024022), complete cds. // chr5 // 95 // 91 // 20 // 21 // 0 /// BX648369 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686H02185 (from clone DKFZp686H02185). // chr5 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000515439 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:5:118840279:118988539:-1 gene:ENSG00000169570 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 70 // 70 // 16 // 23 // 1
NONHSAT103416 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000475578 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:119306343:119306631:-1 gene:ENSG00000243333 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT103432 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NONHSAT103441 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000516166 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:120337549:120337653:-1 gene:ENSG00000251975 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT103443 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000410677 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:120710698:120710840:-1 gene:ENSG00000222609 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT103446 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_051996 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC153163 (MGC32805), long non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000509993 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:122436759:122469067:-1 gene:ENSG00000250328 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr5 // 100 // 38 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000510972 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:122436497:122479087:-1 gene:ENSG00000250328 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000503529 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:122437254:122479080:-1 gene:ENSG00000250328 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr5 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1 /// NONHSAT103474 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT103475 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 100 // 38 // 8 // 8 // 0 /// NONHSAT103477 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1
ENST00000577215 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:123022487:123022783:-1 gene:ENSG00000263432 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT103498 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_000943 // RefSeq // Homo sapiens peptidylprolyl isomerase C (cyclophilin C) (PPIC), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000306442 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:123023250:123036741:-1 gene:ENSG00000168938 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK290321 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76246 complete cds, highly similar to Homo sapiens peptidylprolyl isomerase C (cyclophilin C) (PPIC), mRNA. // chr5 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// BC002678 // GenBank // Homo sapiens peptidylprolyl isomerase C (cyclophilin C), mRNA (cDNA clone MGC:3673 IMAGE:3610178), complete cds. // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// S71018 // GenBank // cyclophilin C [human, kidney, mRNA, 883 nt]. // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000415659 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:123028493:123036725:-1 gene:ENSG00000168938 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// AK304053 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57929 complete cds, moderately similar to Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase C (EC5.2.1.8). // chr5 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// GENSCAN00000006262 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:123023875:123026254:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// BC014480 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA similar to peptidylprolyl isomerase C (cyclophilin C) (cDNA clone IMAGE:4858474). // chr5 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// NONHSAT103500 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NONHSAT103509 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000410175 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:125350868:125351131:-1 gene:ENSG00000222107 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000613143 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR5_4_CTG1_1:125350868:125351131:-1 gene:ENSG00000276134 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT103553 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000363477 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:126553302:126553402:-1 gene:ENSG00000200347 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT103589 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000490423 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:126628019:126628319:-1 gene:ENSG00000230929 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000044659 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:126628017:126628319:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT103591 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT103592 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000516376 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:126755316:126755417:-1 gene:ENSG00000252185 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT103599 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000384560 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:128371099:128371212:-1 gene:ENSG00000207290 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT103662 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001008738 // RefSeq // Homo sapiens folliculin interacting protein 1 (FNIP1), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NM_133372 // RefSeq // Homo sapiens folliculin interacting protein 1 (FNIP1), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000307954 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:5:131641714:131796950:-1 gene:ENSG00000217128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000307968 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:131641714:131796921:-1 gene:ENSG00000217128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000510461 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:131644437:131797017:-1 gene:ENSG00000217128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000511848 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:131677597:131797016:-1 gene:ENSG00000217128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// AK292473 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76444 complete cds. // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC001956 // GenBank // Homo sapiens folliculin interacting protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3536789), complete cds. // chr5 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// DQ145719 // GenBank // Homo sapiens folliculin-interacting protein 1 (FNIP1) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000615660 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:5:131641715:131797063:-1 gene:ENSG00000217128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000039973 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:131670463:131754150:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0
GENSCAN00000039684 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:131395545:131660014:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0
ENST00000471826 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:132248907:132295315:-1 gene:ENSG00000072682 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC030525 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5207811. // chr5 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT103730 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT103731 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_000879 // RefSeq // Homo sapiens interleukin 5 (IL5), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000231454 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:132541444:132543522:-1 gene:ENSG00000113525 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC066282 // GenBank // Homo sapiens interleukin 5 (colony-stimulating factor, eosinophil), mRNA (cDNA clone MGC:79409 IMAGE:6971771), complete cds. // chr5 // 95 // 74 // 19 // 20 // 0 /// ENST00000462418 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:132542066:132543920:-1 gene:ENSG00000113525 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// DQ655974 // GenBank HTC // Homo sapiens clone UGL8e03, mRNA sequence. // chr5 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// ENST00000450655 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:132542066:132556838:-1 gene:ENSG00000113525 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// DQ655971 // GenBank HTC // Homo sapiens clone UGL8g04, mRNA sequence. // chr5 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// GENSCAN00000039984 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:132541811:132543478:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT103759 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 95 // 74 // 19 // 20 // 0 /// NONHSAT103760 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// NONHSAT103761 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_007054 // RefSeq // Homo sapiens kinesin family member 3A (KIF3A), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006714526 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens kinesin family member 3A (KIF3A), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000378735 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:132695630:132737572:-1 gene:ENSG00000131437 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000378746 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:132692628:132737638:-1 gene:ENSG00000131437 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000403231 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:5:132696634:132737419:-1 gene:ENSG00000131437 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// AF041853 // GenBank // Homo sapiens kinesin family member protein KIF3A mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// AK295089 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60533 complete cds, highly similar to Kinesin-like protein KIF3A. // chr5 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC045542 // GenBank // Homo sapiens kinesin family member 3A, mRNA (cDNA clone MGC:57178 IMAGE:5298675), complete cds. // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000618515 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:5:132695632:132737572:-1 gene:ENSG00000131437 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000005480 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:132692983:132737419:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
ENST00000362807 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:132993099:132993200:-1 gene:ENSG00000199677 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT103795 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000384444 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:16:58083068:58083168:-1 gene:ENSG00000207173 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 50 // 100 // 2 // 4 // 0 /// NONHSAT142810 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 50 // 100 // 2 // 4 // 0
NM_017665 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, CCHC domain containing 10 (ZCCHC10), mRNA. // chr5 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000324170 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:132996985:133026604:-1 gene:ENSG00000155329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000355372 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:5:132996996:133026549:-1 gene:ENSG00000155329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000509437 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:5:132998100:133026545:-1 gene:ENSG00000155329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 48 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000513541 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:132998408:133026549:-1 gene:ENSG00000155329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 43 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000513848 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:5:132998212:133026571:-1 gene:ENSG00000155329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 43 // 9 // 9 // 0 /// AK122970 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ16714 fis, clone UTERU2035231, highly similar to Zinc finger CCHC domain-containing protein 10. // chr5 // 89 // 86 // 16 // 18 // 0 /// BC022443 // GenBank // Homo sapiens zinc finger, CCHC domain containing 10, mRNA (cDNA clone MGC:24789 IMAGE:4285562), complete cds. // chr5 // 100 // 48 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000504170 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:5:133019038:133026589:-1 gene:ENSG00000155329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1
NM_015082 // RefSeq // Homo sapiens follistatin-like 4 (FSTL4), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000265342 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:133196455:133612564:-1 gene:ENSG00000053108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000507112 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:133220773:133252264:-1 gene:ENSG00000053108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 24 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000509525 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:133198468:133225925:-1 gene:ENSG00000053108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 43 // 18 // 18 // 0 /// AK056284 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ31722 fis, clone NT2RI2006679, highly similar to Homo sapiens follistatin-like 4 (FSTL4), mRNA. // chr5 // 94 // 43 // 17 // 18 // 0 /// BC024300 // GenBank // Homo sapiens follistatin-like 4, mRNA (cDNA clone MGC:39367 IMAGE:4662520), complete cds. // chr5 // 97 // 76 // 31 // 32 // 0 /// BX640845 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686E04229 (from clone DKFZp686E04229). // chr5 // 64 // 64 // 27 // 42 // 1 /// ENST00000510685 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:133316597:133583641:-1 gene:ENSG00000053108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1 /// ENST00000621681 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:5:133198468:133603994:-1 gene:ENSG00000053108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 67 // 67 // 28 // 42 // 1 /// GENSCAN00000005478 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:133121691:133328255:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 57 // 57 // 24 // 42 // 1
NONHSAT103824 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_020199 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 5 open reading frame 15 (C5orf15), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000231512 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:133955502:133968787:-1 gene:ENSG00000113583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000507191 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:133959535:133968674:-1 gene:ENSG00000113583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 58 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000509913 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:133959778:133968625:-1 gene:ENSG00000113583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 42 // 8 // 8 // 0 /// AF226055 // GenBank // Homo sapiens HTGN29 (HTGN29) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// AK298515 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51928 complete cds, highly similar to Keratinocytes-associated transmembrane protein 2 precursor. // chr5 // 100 // 74 // 14 // 14 // 0 /// AY157581 // GenBank // Homo sapiens keratinocytes associated transmembrane protein 2 (KCT2) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 74 // 14 // 14 // 0 /// BC020875 // GenBank // Homo sapiens chromosome 5 open reading frame 15, mRNA (cDNA clone MGC:24093 IMAGE:4610607), complete cds. // chr5 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT103826 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 42 // 8 // 8 // 0
NM_003374 // RefSeq // Homo sapiens voltage-dependent anion channel 1 (VDAC1), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 83 // 10 // 10 // 0 /// NR_036624 // RefSeq // Homo sapiens voltage-dependent anion channel 1 (VDAC1), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr5 // 100 // 83 // 10 // 10 // 0 /// NR_036625 // RefSeq // Homo sapiens voltage-dependent anion channel 1 (VDAC1), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr5 // 100 // 83 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000265333 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:133971915:134005133:-1 gene:ENSG00000213585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000395044 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:133971915:134004742:-1 gene:ENSG00000213585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000395047 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:133971952:134004842:-1 gene:ENSG00000213585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 75 // 67 // 6 // 8 // 0 /// AK122953 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ16670 fis, clone THYMU3001133, highly similar to Voltage-dependent anion-selective channel protein 1. // chr5 // 100 // 50 // 6 // 6 // 0 /// BC008482 // GenBank // Homo sapiens voltage-dependent anion channel 1, mRNA (cDNA clone MGC:14782 IMAGE:4332199), complete cds. // chr5 // 100 // 75 // 9 // 9 // 0 /// BC071168 // GenBank // Homo sapiens voltage-dependent anion channel 1, mRNA (cDNA clone MGC:88007 IMAGE:6023095), complete cds. // chr5 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// BC090042 // GenBank // Homo sapiens voltage-dependent anion channel 1, mRNA (cDNA clone MGC:111064 IMAGE:30395350), complete cds. // chr5 // 100 // 58 // 7 // 7 // 0 /// L06132 // GenBank // Human voltage-dependent anion channel isoform 1 (VDAC) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0
NM_006930 // RefSeq // Homo sapiens S-phase kinase-associated protein 1 (SKP1), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000522552 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:134157338:134176964:-1 gene:ENSG00000113558 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC025673 // GenBank // Homo sapiens S-phase kinase-associated protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:34403 IMAGE:5203008), complete cds. // chr5 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0
NM_080656 // RefSeq // Homo sapiens CDKN2A interacting protein N-terminal like (CDKN2AIPNL), mRNA. // chr5 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000458198 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:134402087:134411898:-1 gene:ENSG00000237190 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// BC008293 // GenBank // Homo sapiens CDKN2A interacting protein N-terminal like, mRNA (cDNA clone MGC:13017 IMAGE:3537789), complete cds. // chr5 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0
ENST00000384493 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:134500178:134500284:-1 gene:ENSG00000207222 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT103860 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000384728 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:134634839:134634945:-1 gene:ENSG00000207459 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT103867 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
ENST00000364428 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:134701172:134701278:-1 gene:ENSG00000201298 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT103869 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_002653 // RefSeq // Homo sapiens paired-like homeodomain 1 (PITX1), mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000265340 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:135027735:135034298:-1 gene:ENSG00000069011 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000502676 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:135031336:135034757:-1 gene:ENSG00000069011 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000507253 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:135031286:135034813:-1 gene:ENSG00000069011 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 38 // 9 // 9 // 0 /// AK290635 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76022 complete cds, highly similar to Homo sapiens paired-like homeodomain transcription factor 1 (PITX1), mRNA. // chr5 // 88 // 71 // 15 // 17 // 0 /// BC003685 // GenBank // Homo sapiens paired-like homeodomain 1, mRNA (cDNA clone MGC:5147 IMAGE:3452956), complete cds. // chr5 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// BC009412 // GenBank // Homo sapiens paired-like homeodomain 1, mRNA (cDNA clone MGC:10891 IMAGE:3622592), complete cds. // chr5 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// U70370 // GenBank // Human hindlimb expressed homeobox protein backfoot (Bft) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000506438 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:135028553:135034634:-1 gene:ENSG00000069011 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1 /// GENSCAN00000002409 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:135028779:135050644:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1
NM_001099221 // RefSeq // Homo sapiens TRAF-interacting protein with forkhead-associated domain, family member B (TIFAB), mRNA. // chr5 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// NM_130848 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 5 open reading frame 20 (C5orf20), mRNA. // chr5 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000503143 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:135444214:135447348:-1 gene:ENSG00000251380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000537858 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:135444218:135452399:-1 gene:ENSG00000255833 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AB074498 // GenBank // Homo sapiens mRNA for DCNP1, complete cds. // chr5 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0 /// BC069608 // GenBank // Homo sapiens chromosome 5 open reading frame 20, mRNA (cDNA clone MGC:97001 IMAGE:7262210), complete cds. // chr5 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// BC069610 // GenBank // Homo sapiens chromosome 5 open reading frame 20, mRNA (cDNA clone MGC:97013 IMAGE:7262222), complete cds. // chr5 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// AK131088 // GenBank // Homo sapiens mRNA for FLJ00292 protein. // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000002415 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:135445789:135472351:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1
NM_006161 // RefSeq // Homo sapiens neurogenin 1 (NEUROG1), mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000314744 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:135534282:135535949:-1 gene:ENSG00000181965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AB593107 // GenBank // Homo sapiens NEUROG1 mRNA for neurogenin-1, complete cds, clone: HP06849-RBd04F09. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC008687 // GenBank // Homo sapiens neurogenin 1, mRNA (cDNA clone MGC:9390 IMAGE:3872172), complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC028226 // GenBank // Homo sapiens neurogenin 1, mRNA (cDNA clone MGC:40048 IMAGE:5241507), complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BT019366 // GenBank // Homo sapiens neurogenin 1 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000002407 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:135534977:135535690:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
NM_004887 // RefSeq // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) ligand 14 (CXCL14), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000337225 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:5:135570683:135579279:-1 gene:ENSG00000145824 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000512158 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:135570679:135579064:-1 gene:ENSG00000145824 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// AF073957 // GenBank // Homo sapiens CXC chemokine BRAK mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// AF086340 // GenBank // Homo sapiens full length insert cDNA clone ZD60C06. // chr5 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// AF106911 // GenBank // Homo sapiens chemokine MIP-2 gamma (MIP-2 gamma) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// AF144103 // GenBank // Homo sapiens NJAC protein (NJAC) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// AY358906 // GenBank // Homo sapiens clone DNA39523 SCYB14 (UNQ240) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC003513 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) ligand 14, mRNA (cDNA clone MGC:10687 IMAGE:3611714), complete cds. // chr5 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// BT007080 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) ligand 14 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000002400 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:135547355:135578778:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_000590 // RefSeq // Homo sapiens interleukin 9 (IL9), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000274520 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:135892246:135895827:-1 gene:ENSG00000145839 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC066283 // GenBank // Homo sapiens interleukin 9, mRNA (cDNA clone MGC:79411 IMAGE:6971717), complete cds. // chr5 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// BC066284 // GenBank // Homo sapiens interleukin 9, mRNA (cDNA clone MGC:79412 IMAGE:6971718), complete cds. // chr5 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// BC066285 // GenBank // Homo sapiens interleukin 9, mRNA (cDNA clone MGC:79413 IMAGE:6971719), complete cds. // chr5 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// BC066286 // GenBank // Homo sapiens interleukin 9, mRNA (cDNA clone MGC:79414 IMAGE:6971720), complete cds. // chr5 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// BC066287 // GenBank // Homo sapiens interleukin 9, mRNA (cDNA clone MGC:79415 IMAGE:6971721), complete cds. // chr5 // 83 // 82 // 19 // 23 // 0 /// M30134 // GenBank // Human P40 protein mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000023849 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:135892391:135895816:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 93 // 50 // 13 // 14 // 0
NM_002302 // RefSeq // Homo sapiens leukocyte cell-derived chemotaxin 2 (LECT2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000274507 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:135946911:135955034:-1 gene:ENSG00000145826 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000512872 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:135947150:135953138:-1 gene:ENSG00000145826 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000522943 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:135922279:135954962:-1 gene:ENSG00000145826 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// BC093670 // GenBank // Homo sapiens leukocyte cell-derived chemotaxin 2, mRNA (cDNA clone MGC:120705 IMAGE:7939515), complete cds. // chr5 // 95 // 73 // 21 // 22 // 0 /// BC101579 // GenBank // Homo sapiens leukocyte cell-derived chemotaxin 2, mRNA (cDNA clone MGC:126628 IMAGE:8069085), complete cds. // chr5 // 95 // 73 // 21 // 22 // 0 /// D63521 // GenBank // Homo sapiens mRNA for LECT2 precursor, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000514447 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:135950872:135954982:-1 gene:ENSG00000145826 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// ENST00000471827 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:135938584:135953116:-1 gene:ENSG00000145826 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1 /// GENSCAN00000023846 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:135947331:136008513:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
NR_026763 // RefSeq // Homo sapiens SMAD5 antisense RNA 1 (SMAD5-AS1), long non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000297163 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:136129507:136134890:-1 gene:ENSG00000164621 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF071111 // GenBank // Homo sapiens DAMS mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF086556 // GenBank // Homo sapiens full length insert cDNA clone ZE15A05. // chr5 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT103949 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT103950 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENST00000410353 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:136969200:136969306:-1 gene:ENSG00000222285 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT103970 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001101800 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 13, member B (FAM13B), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// NM_001101801 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 13, member B (FAM13B), transcript variant 3, mRNA. // chr5 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// NM_016603 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 13, member B (FAM13B), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENST00000033079 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:137937960:138033031:-1 gene:ENSG00000031003 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000420893 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:137940181:138033085:-1 gene:ENSG00000031003 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000425075 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:137940172:138033086:-1 gene:ENSG00000031003 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// AF251038 // GenBank // Homo sapiens GAP-like protein (N61) mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// BC048965 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 13, member B, mRNA (cDNA clone MGC:57159 IMAGE:5265611), complete cds. // chr5 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// BC056887 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 13, member B, mRNA (cDNA clone MGC:65022 IMAGE:6148274), complete cds. // chr5 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042312 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:137978645:138021483:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000042332 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:137940225:137965381:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 39 // 11 // 11 // 0
ENST00000410992 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:138069355:138069458:-1 gene:ENSG00000222924 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT104001 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_003551 // RefSeq // Homo sapiens NME/NM23 family member 5 (NME5), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000265191 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:138115172:138139415:-1 gene:ENSG00000112981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000506657 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:138115407:138128643:-1 gene:ENSG00000112981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0 /// AF067724 // GenBank // Homo sapiens nm23-H5 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC026182 // GenBank // Homo sapiens non-metastatic cells 5, protein expressed in (nucleoside-diphosphate kinase), mRNA (cDNA clone MGC:33140 IMAGE:5270050), complete cds. // chr5 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// U90450 // GenBank // Human inhibitor of p53-induced apoptosis-beta (IPIA-beta) mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 75 // 23 // 24 // 0 /// XM_005272099 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens NME/NM23 family member 5 (NME5), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1 /// ENST00000508252 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:138127433:138129435:-1 gene:ENSG00000112981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1 /// NONHSAT104004 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000042326 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:138110646:138178614:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// NONHSAT104008 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
ENST00000363010 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:138123011:138123111:-1 gene:ENSG00000199880 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT104007 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_001496 // RefSeq // Homo sapiens GDNF family receptor alpha 3 (GFRA3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000274721 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:138252379:138274671:-1 gene:ENSG00000146013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000378362 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:138252382:138274565:-1 gene:ENSG00000146013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AF051767 // GenBank // Homo sapiens GDNF family receptor alpha 3 (GFRA3) mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// AK297693 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52334 complete cds, highly similar to GDNF family receptor alpha-3 precursor. // chr5 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AY358997 // GenBank // Homo sapiens clone DNA48613 GFRA3 (UNQ339) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY359037 // GenBank // Homo sapiens clone DNA48614 GFRA3 (UNQ339) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC037951 // GenBank // Homo sapiens GDNF family receptor alpha 3, mRNA (cDNA clone MGC:45283 IMAGE:5227725), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FJ200487 // GenBank // Homo sapiens GDNF family receptor alpha-3 variant (GDNFR3) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000042336 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:138188978:138274424:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1
NR_002913 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 63 (SNORD63), small nucleolar RNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000384262 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:138561043:138561110:-1 gene:ENSG00000206989 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT104045 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000517206 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:139333038:139333365:-1 gene:ENSG00000253015 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT104095 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000384293 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:139554900:139555001:-1 gene:ENSG00000207020 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT104112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000363886 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:139717985:139718090:-1 gene:ENSG00000200756 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT104122 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001945 // RefSeq // Homo sapiens heparin-binding EGF-like growth factor (HBEGF), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000230990 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:140332843:140346631:-1 gene:ENSG00000113070 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC033097 // GenBank // Homo sapiens heparin-binding EGF-like growth factor, mRNA (cDNA clone MGC:45671 IMAGE:5424240), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// M60278 // GenBank // Human heparin-binding EGF-like growth factor mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000482211 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:140333524:140335130:-1 gene:ENSG00000113070 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1 /// GENSCAN00000038808 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:140245974:140346328:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1 /// NONHSAT104180 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1
ENST00000410858 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:140397323:140397444:-1 gene:ENSG00000222790 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT104186 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000363181 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:140527352:140527428:-1 gene:ENSG00000200051 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT104193 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_194249 // RefSeq // Homo sapiens DND microRNA-mediated repression inhibitor 1 (DND1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000542735 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:140670794:140673586:-1 gene:ENSG00000256453 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC033496 // GenBank // Homo sapiens dead end homolog 1 (zebrafish), mRNA (cDNA clone MGC:34750 IMAGE:5172595), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_031947 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 25 (mitochondrial carrier; ornithine transporter) member 2 (SLC25A2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000239451 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:141302629:141303865:-1 gene:ENSG00000120329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// AF332005 // GenBank // Homo sapiens ornithine transporter 2 (ORNT2) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// AF378119 // GenBank // Homo sapiens ornithine transporter 2 (ORNT2) mRNA, complete cds; nuclear gene for mitochondrial product. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AY208943 // GenBank // Homo sapiens ornithine transporter 2 (ORNT2) mRNA, ORNT2-Val181 allele, complete cds; nuclear gene for mitochondrial product. // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC069458 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 25 (mitochondrial carrier; ornithine transporter) member 2, mRNA (cDNA clone MGC:97066 IMAGE:7262278), complete cds. // chr5 // 92 // 45 // 12 // 13 // 0 /// BC100935 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 25 (mitochondrial carrier; ornithine transporter) member 2, mRNA (cDNA clone MGC:119151 IMAGE:40004045), complete cds. // chr5 // 92 // 45 // 12 // 13 // 0 /// BC100936 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 25 (mitochondrial carrier; ornithine transporter) member 2, mRNA (cDNA clone MGC:119152 IMAGE:40004046), complete cds. // chr5 // 92 // 45 // 12 // 13 // 0 /// BC100937 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 25 (mitochondrial carrier; ornithine transporter) member 2, mRNA (cDNA clone MGC:119153 IMAGE:40004047), complete cds. // chr5 // 85 // 45 // 11 // 13 // 0 /// GENSCAN00000030954 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:141302960:141303865:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0
NM_005642 // RefSeq // Homo sapiens TAF7 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor, 55kDa (TAF7), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000313368 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:141318488:141320763:-1 gene:ENSG00000178913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// AK314837 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ95724, Homo sapiens TAF7 RNA polymerase II, TATA box binding protein(TBP)-associated factor, 55kDa (TAF7), mRNA. // chr5 // 94 // 64 // 17 // 18 // 0 /// BC032737 // GenBank // Homo sapiens TAF7 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor, 55kDa, mRNA (cDNA clone MGC:44874 IMAGE:5539359), complete cds. // chr5 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// U18062 // GenBank // Human TFIID subunit TAFII55 (TAFII55) mRNA, complete cds. // chr5 // 92 // 89 // 23 // 25 // 0 /// NONHSAT104253 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 39 // 11 // 11 // 0
NM_033449 // RefSeq // Homo sapiens FCH and double SH3 domains 1 (FCHSD1), mRNA. // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000435817 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:141639302:141651419:-1 gene:ENSG00000197948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000522126 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:141640982:141651117:-1 gene:ENSG00000197948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000523856 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:141639308:141647483:-1 gene:ENSG00000197948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// AY217346 // GenBank // Homo sapiens FLJ00007-like protein mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AY358478 // GenBank // Homo sapiens clone DNA73401 QLAK737 (UNQ737) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC047016 // GenBank // Homo sapiens FCH and double SH3 domains 1, mRNA (cDNA clone MGC:54314 IMAGE:5215830), complete cds. // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000522783 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:5:141640987:141651376:-1 gene:ENSG00000197948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// GENSCAN00000023435 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:141644218:141680486:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_016580 // RefSeq // Homo sapiens protocadherin 12 (PCDH12), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000231484 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:141943585:141959062:-1 gene:ENSG00000113555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AB026893 // GenBank // Homo sapiens mRNA for vascular cadherin-2, complete cds. // chr5 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// AF231025 // GenBank // Homo sapiens protocadherin 12 (PCDH12) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// AF240635 // GenBank // Homo sapiens vascular endothelial cadherin 2 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AY358428 // GenBank // Homo sapiens clone DNA48331 PCDH12 (UNQ395) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// BC042634 // GenBank // Homo sapiens protocadherin 12, mRNA (cDNA clone MGC:34069 IMAGE:5177606), complete cds. // chr5 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// BC052973 // GenBank // Homo sapiens protocadherin 12, mRNA (cDNA clone MGC:57546 IMAGE:5174442), complete cds. // chr5 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000510041 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:141957781:141958812:-1 gene:ENSG00000113555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 24 // 24 // 9 // 38 // 1 /// GENSCAN00000023424 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:141945381:141965408:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 63 // 24 // 24 // 0
NM_001127496 // RefSeq // Homo sapiens sprouty homolog 4 (Drosophila) (SPRY4), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NM_001293289 // RefSeq // Homo sapiens sprouty homolog 4 (Drosophila) (SPRY4), transcript variant 3, mRNA. // chr5 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// NM_001293290 // RefSeq // Homo sapiens sprouty homolog 4 (Drosophila) (SPRY4), transcript variant 4, mRNA. // chr5 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// NM_030964 // RefSeq // Homo sapiens sprouty homolog 4 (Drosophila) (SPRY4), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000344120 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:142310427:142325001:-1 gene:ENSG00000187678 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000434127 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:142312974:142325040:-1 gene:ENSG00000187678 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// AF227516 // GenBank // Homo sapiens sprouty-4A mRNA, complete cds. // chr5 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// AF251060 // GenBank // Homo sapiens parathyroid hormone mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 34 // 10 // 10 // 0 /// AK226147 // GenBank // Homo sapiens mRNA for sprouty homolog 4 variant, clone: ah04696. // chr5 // 95 // 66 // 18 // 19 // 0 /// BC125095 // GenBank // Homo sapiens sprouty homolog 4 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:149774 IMAGE:40118267), complete cds. // chr5 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// BC125096 // GenBank // Homo sapiens sprouty homolog 4 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:149775 IMAGE:40118268), complete cds. // chr5 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// AF227517 // GenBank // Homo sapiens sprouty-4C mRNA, complete cds. // chr5 // 95 // 76 // 21 // 22 // 0
ENST00000364553 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:144535354:144535670:-1 gene:ENSG00000201423 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT104367 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001029869 // RefSeq // Homo sapiens PLAC8-like 1 (PLAC8L1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_005268381 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens PLAC8-like 1 (PLAC8L1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000311450 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:146084386:146104369:-1 gene:ENSG00000173261 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 85 // 93 // 22 // 26 // 0 /// ENST00000512998 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:146084386:146104369:-1 gene:ENSG00000173261 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 83 // 86 // 20 // 24 // 0 /// BC130586 // GenBank // Homo sapiens PLAC8-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:163458 IMAGE:40146617), complete cds. // chr5 // 85 // 93 // 22 // 26 // 0 /// BC130588 // GenBank // Homo sapiens PLAC8-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:163460 IMAGE:40146619), complete cds. // chr5 // 85 // 93 // 22 // 26 // 0 /// BC144389 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:9052910. // chr5 // 83 // 86 // 20 // 24 // 0
NM_194251 // RefSeq // Homo sapiens G protein-coupled receptor 151 (GPR151), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000311104 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:146513103:146516190:-1 gene:ENSG00000173250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY351676 // GenBank // Homo sapiens galanin receptor-like protein mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021052 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:146514854:146516113:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK122627 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ16048 fis, clone FEBRA2008311, weakly similar to GALANIN RECEPTOR TYPE 1. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
ENST00000394409 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:146581146:146878642:-1 gene:ENSG00000156475 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000516984 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:146586099:146586200:-1 gene:ENSG00000252793 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT104411 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
ENST00000467868 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:146656401:146656695:-1 gene:ENSG00000241291 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT104412 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_003122 // RefSeq // Homo sapiens serine peptidase inhibitor, Kazal type 1 (SPINK1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000296695 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:147824568:147831786:-1 gene:ENSG00000164266 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000505722 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:147824572:147828130:-1 gene:ENSG00000164266 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// BC025790 // GenBank // Homo sapiens serine peptidase inhibitor, Kazal type 1, mRNA (cDNA clone MGC:34543 IMAGE:5225693), complete cds. // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// M11949 // GenBank // Human pancreatic secretory trypsin inhibitor (PSTI) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000510027 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:147827086:147831635:-1 gene:ENSG00000164266 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONHSAT104429 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000035685 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:147823148:147831577:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_206966 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 5 open reading frame 46 (C5orf46), mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000318315 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:147892708:147906502:-1 gene:ENSG00000178776 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// AY358656 // GenBank // Homo sapiens clone DNA56859 AVLV472 (UNQ472) mRNA, complete cds. // chr5 // 90 // 77 // 18 // 20 // 0 /// BC021680 // GenBank // Homo sapiens chromosome 5 open reading frame 46, mRNA (cDNA clone MGC:23985 IMAGE:3931172), complete cds. // chr5 // 86 // 54 // 12 // 14 // 0 /// ENST00000515291 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:147901308:147906538:-1 gene:ENSG00000178776 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// AK289403 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76367 complete cds. // chr5 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// GENSCAN00000035672 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:147892750:147906501:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 86 // 54 // 12 // 14 // 0
ENST00000516033 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:149057554:149057656:-1 gene:ENSG00000251842 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT104469 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
ENST00000363291 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:149116178:149116480:-1 gene:ENSG00000200161 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 83 // 100 // 20 // 24 // 0 /// NONHSAT104478 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 83 // 100 // 20 // 24 // 0
ENST00000410281 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:149606637:149606741:-1 gene:ENSG00000222213 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT104516 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000408116 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:149695748:149695959:-1 gene:ENSG00000221043 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT104519 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000363464 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:149940030:149940131:-1 gene:ENSG00000200334 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT104529 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001243253 // RefSeq // Homo sapiens tigger transposable element derived 6 (TIGD6), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// NM_030953 // RefSeq // Homo sapiens tigger transposable element derived 6 (TIGD6), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000296736 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:149993118:150001167:-1 gene:ENSG00000164296 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000515406 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:149994728:150000654:-1 gene:ENSG00000164296 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// BC117249 // GenBank // Homo sapiens tigger transposable element derived 6, mRNA (cDNA clone MGC:150858 IMAGE:40125800), complete cds. // chr5 // 100 // 74 // 17 // 17 // 0 /// CR533559 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834F0821D for gene TIGD6, tigger transposable element derived 6; complete cds, incl. stopcodon. // chr5 // 100 // 43 // 10 // 10 // 0
NONHSAT104533 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_002609 // RefSeq // Homo sapiens platelet-derived growth factor receptor, beta polypeptide (PDGFRB), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000261799 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:150113837:150155860:-1 gene:ENSG00000113721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000520579 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:150115727:150155859:-1 gene:ENSG00000113721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// AK293093 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76012 complete cds, highly similar to Homo sapiens platelet-derived growth factor receptor, betapolypeptide (PDGFRB), mRNA. // chr5 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// BC032224 // GenBank // Homo sapiens platelet-derived growth factor receptor, beta polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:34052 IMAGE:5309813), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// J03278 // GenBank // Human platelet-derived growth factor (PDGF) receptor mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// M21616 // GenBank // Human platelet-derived growth factor (PDGF) receptor mRNA, complete cds. // chr5 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// JN003579 // GenBank // Homo sapiens EBF1-PDGFRB fusion protein mRNA, complete cds. // chr5 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// GENSCAN00000031893 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:150108694:150138210:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0
NM_001012301 // RefSeq // Homo sapiens arylsulfatase family, member I (ARSI), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000328668 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:150296343:150302953:-1 gene:ENSG00000183876 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000515301 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:150297214:150339307:-1 gene:ENSG00000183876 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 53 // 10 // 10 // 0 /// AB448735 // GenBank // Homo sapiens ARSI mRNA for arylsulfatase I, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// AY875937 // GenBank // Homo sapiens arylsulfatase I (ARSI) mRNA, complete cds. // chr5 // 84 // 100 // 16 // 19 // 0 /// BC129995 // GenBank // Homo sapiens arylsulfatase family, member I, mRNA (cDNA clone MGC:157789 IMAGE:40127932), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC129996 // GenBank // Homo sapiens arylsulfatase family, member I, mRNA (cDNA clone MGC:157790 IMAGE:40127934), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000031899 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:150297214:150320719:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0
ENST00000519690 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:150444238:150449727:-1 gene:ENSG00000164587 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT104558 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONHSAT104567 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_026867 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 300 pseudogene 1 (functional) (ZNF300P1), non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000356555 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:150930763:150946289:-1 gene:ENSG00000197083 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000520773 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:150930645:150945059:-1 gene:ENSG00000197083 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// AK096536 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39217 fis, clone OCBBF2006639, moderately similar to ZINC FINGER PROTEIN 84. // chr5 // 75 // 100 // 9 // 12 // 0 /// AK097462 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ40143 fis, clone TESTI2013001, moderately similar to ZINC FINGER PROTEIN 84. // chr5 // 92 // 100 // 11 // 12 // 0
NM_001447 // RefSeq // Homo sapiens FAT atypical cadherin 2 (FAT2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000261800 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:151504094:151568944:-1 gene:ENSG00000086570 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000520200 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:5:151504093:151531972:-1 gene:ENSG00000086570 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 45 // 17 // 17 // 0 /// AF231022 // GenBank // Homo sapiens protocadherin Fat 2 (FAT2) mRNA, complete cds. // chr5 // 97 // 100 // 37 // 38 // 0 /// GENSCAN00000027220 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:151505565:151611517:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0
ENST00000410170 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:151704289:151704578:-1 gene:ENSG00000222102 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 87 // 88 // 20 // 23 // 0 /// NONHSAT104626 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 87 // 88 // 20 // 23 // 0
ENST00000410376 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:151875566:151875692:-1 gene:ENSG00000222308 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr5 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT104643 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_020167 // RefSeq // Homo sapiens neuromedin U receptor 2 (NMUR2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000255262 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:152391532:152405279:-1 gene:ENSG00000132911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB041228 // GenBank // Homo sapiens mRNA for G protein-coupled receptor TGR-1, complete cds. // chr5 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// AF242874 // GenBank // Homo sapiens neuromedin U receptor 2 (NMU2R) mRNA, complete cds. // chr5 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// AF272363 // GenBank // Homo sapiens neuromedin U receptor 2 (NMUR2) mRNA, complete cds. // chr5 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// AF292402 // GenBank // Homo sapiens neuromedin U receptor-type 2 mRNA, complete cds. // chr5 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// BC016938 // GenBank // Homo sapiens neuromedin U receptor 2, mRNA (cDNA clone MGC:21396 IMAGE:3852151), complete cds. // chr5 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC067776 // GenBank // Homo sapiens neuromedin U receptor 2, mRNA (cDNA clone MGC:87130 IMAGE:30336834), complete cds. // chr5 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000008652 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:152271684:152405104:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_004821 // RefSeq // Homo sapiens heart and neural crest derivatives expressed 1 (HAND1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000231121 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:154474972:154478264:-1 gene:ENSG00000113196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF061756 // GenBank // Homo sapiens Hand1 protein mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC021190 // GenBank // Homo sapiens heart and neural crest derivatives expressed 1, mRNA (cDNA clone MGC:1826 IMAGE:3162118), complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049305 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:154475806:154494035:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0
ENST00000607433 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:154718383:154718689:-1 gene:ENSG00000272197 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001252156 // RefSeq // Homo sapiens gem (nuclear organelle) associated protein 5 (GEMIN5), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NM_015465 // RefSeq // Homo sapiens gem (nuclear organelle) associated protein 5 (GEMIN5), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000285873 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:154887416:154938209:-1 gene:ENSG00000082516 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// AY063750 // GenBank // Homo sapiens WD repeat protein Gemin5 mRNA, complete cds. // chr5 // 94 // 95 // 33 // 35 // 0 /// BC113614 // GenBank // Homo sapiens gem (nuclear organelle) associated protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:142174 IMAGE:8322666), complete cds. // chr5 // 94 // 97 // 34 // 36 // 0 /// BC143724 // GenBank // Homo sapiens gem (nuclear organelle) associated protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:177255 IMAGE:9052238), complete cds. // chr5 // 94 // 97 // 34 // 36 // 0 /// GENSCAN00000022296 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:154888193:154949960:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 78 // 29 // 29 // 0
NM_001146726 // RefSeq // Homo sapiens T-cell immunoglobulin and mucin domain containing 4 (TIMD4), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// NM_138379 // RefSeq // Homo sapiens T-cell immunoglobulin and mucin domain containing 4 (TIMD4), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000274532 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:156919282:156963255:-1 gene:ENSG00000145850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000407087 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:5:156919389:156963222:-1 gene:ENSG00000145850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// AK131025 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ27515 fis, clone TST08558. // chr5 // 100 // 35 // 12 // 12 // 0 /// AK301337 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60176 complete cds, highly similar to T-cell immunoglobulin and mucindomain-containing protein 4 precursor. // chr5 // 84 // 91 // 26 // 31 // 0 /// BC008988 // GenBank // Homo sapiens T-cell immunoglobulin and mucin domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:17333 IMAGE:4184237), complete cds. // chr5 // 91 // 100 // 31 // 34 // 0 /// JX049980 // GenBank // Homo sapiens T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4 mRNA, complete cds. // chr5 // 91 // 97 // 30 // 33 // 0 /// ENST00000406964 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:156919355:156935676:-1 gene:ENSG00000145850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1 /// GENSCAN00000035772 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:156914199:156963198:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0
NM_032782 // RefSeq // Homo sapiens hepatitis A virus cellular receptor 2 (HAVCR2), mRNA. // chr5 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000307851 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:157085832:157109714:-1 gene:ENSG00000135077 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000522902 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:157106120:157109092:-1 gene:ENSG00000135077 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// AF251707 // GenBank // Homo sapiens hepatitis A virus cellular receptor 2 mRNA, complete cds. // chr5 // 93 // 80 // 26 // 28 // 0 /// AF450242 // GenBank // Homo sapiens clone 1 T cell immunoglobulin mucin-3 (TIM3) mRNA, complete cds. // chr5 // 95 // 60 // 20 // 21 // 0 /// AF450243 // GenBank // Homo sapiens clone 2 T cell immunoglobulin mucin-3 (TIM3) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 60 // 21 // 21 // 0 /// AY069944 // GenBank // Homo sapiens putative kidney injury molecule-3 mRNA, complete cds. // chr5 // 95 // 60 // 20 // 21 // 0 /// BC020843 // GenBank // Homo sapiens hepatitis A virus cellular receptor 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:4701288), complete cds. // chr5 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// BC063431 // GenBank // Homo sapiens hepatitis A virus cellular receptor 2, mRNA (cDNA clone MGC:74657 IMAGE:5229539), complete cds. // chr5 // 93 // 80 // 26 // 28 // 0 /// JX049979 // GenBank // Homo sapiens T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 3 mRNA, complete cds. // chr5 // 95 // 60 // 20 // 21 // 0 /// ENST00000522593 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:5:157087088:157109122:-1 gene:ENSG00000135077 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 57 // 57 // 20 // 35 // 1 /// GENSCAN00000035785 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:157087102:157108983:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 94 // 46 // 15 // 16 // 0
AF465821 // GenBank // Homo sapiens unknown protein mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 61 // 20 // 20 // 0 /// NM_130899 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 71, member B (FAM71B), mRNA. // chr5 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// ENST00000302938 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:157161846:157166264:-1 gene:ENSG00000170613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// AY973323 // GenBank // Homo sapiens HSD-51 mRNA, complete cds. // chr5 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// BC022035 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 71, member B, mRNA (cDNA clone MGC:26988 IMAGE:4826350), complete cds. // chr5 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// BC025397 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 71, member B, mRNA (cDNA clone MGC:26998 IMAGE:4827541), complete cds. // chr5 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// BC025409 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 71, member B, mRNA (cDNA clone MGC:33605 IMAGE:4825198), complete cds. // chr5 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// BC025998 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 71, member B, mRNA (cDNA clone MGC:27022 IMAGE:4836822), complete cds. // chr5 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// GENSCAN00000035781 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:157162447:157166096:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1
NM_001001343 // RefSeq // Homo sapiens fibronectin type III domain containing 9 (FNDC9), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000312349 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:157341600:157345721:-1 gene:ENSG00000172568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK289701 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75994 complete cds. // chr5 // 95 // 83 // 19 // 20 // 0 /// BC022570 // GenBank // Homo sapiens chromosome 5 open reading frame 40, mRNA (cDNA clone MGC:27121 IMAGE:4793169), complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0
NM_033274 // RefSeq // Homo sapiens ADAM metallopeptidase domain 19 (ADAM19), mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// XM_005266003 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ADAM metallopeptidase domain 19 (ADAM19), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000257527 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:157477304:157575775:-1 gene:ENSG00000135074 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000517374 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:157477304:157502822:-1 gene:ENSG00000135074 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 31 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000517905 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:157481227:157575741:-1 gene:ENSG00000135074 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000517951 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:157395534:157575775:-1 gene:ENSG00000135074 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 64 // 23 // 23 // 0 /// AF134707 // GenBank // Homo sapiens disintegrin and metalloproteinase domain 19 (ADAM19) mRNA, partial cds. // chr5 // 100 // 61 // 22 // 22 // 0 /// AF311317 // GenBank // Homo sapiens disintegrin and metalloproteinase ADAM19 (ADAM19) mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 75 // 26 // 27 // 0 /// AF326918 // GenBank HTC // Homo sapiens metalloprotease-disintegrin meltrin beta (FKSG34) mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 72 // 25 // 26 // 0 /// AK091464 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ34145 fis, clone FCBBF3011867, highly similar to ADAM 19 precursor (EC 3.4.24.-). // chr5 // 96 // 64 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000035776 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:157480240:157541979:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 58 // 21 // 21 // 0
NM_178424 // RefSeq // Homo sapiens SRY (sex determining region Y)-box 30 (SOX30), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000265007 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:157625679:157652420:-1 gene:ENSG00000039600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000519442 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:157626175:157671480:-1 gene:ENSG00000039600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// AB022083 // GenBank // Homo sapiens mRNA for SOX30 protein, complete cds. // chr5 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AK302162 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53881 complete cds, highly similar to Transcription factor SOX-30. // chr5 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// BC033492 // GenBank // Homo sapiens SRY (sex determining region Y)-box 30, mRNA (cDNA clone MGC:34408 IMAGE:5172577), complete cds. // chr5 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NM_007017 // RefSeq // Homo sapiens SRY (sex determining region Y)-box 30 (SOX30), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// ENST00000311371 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:157625679:157652364:-1 gene:ENSG00000039600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// AB022441 // GenBank // Homo sapiens mRNA for Sox30 protein typeII, complete cds. // chr5 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// GENSCAN00000046980 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:157626340:157652078:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
ENST00000410694 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:157976766:157976956:-1 gene:ENSG00000222626 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT104784 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001130864 // RefSeq // Homo sapiens PWWP domain containing 2A (PWWP2A), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// NM_001267035 // RefSeq // Homo sapiens PWWP domain containing 2A (PWWP2A), transcript variant 3, mRNA. // chr5 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// NM_052927 // RefSeq // Homo sapiens PWWP domain containing 2A (PWWP2A), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_005265813 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens PWWP domain containing 2A (PWWP2A), transcript variant X7, mRNA. // chr5 // 100 // 74 // 17 // 17 // 0 /// XM_005265814 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens PWWP domain containing 2A (PWWP2A), transcript variant X8, mRNA. // chr5 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0 /// XM_006714817 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens PWWP domain containing 2A (PWWP2A), transcript variant X11, mRNA. // chr5 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000307063 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:160091339:160119423:-1 gene:ENSG00000170234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000456329 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:160075882:160119423:-1 gene:ENSG00000170234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000523662 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:5:160077933:160119422:-1 gene:ENSG00000170234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// BC105110 // GenBank // Homo sapiens PWWP domain containing 2A, mRNA (cDNA clone MGC:132770 IMAGE:8144113), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000019211 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:160071731:160119388:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0
NM_031908 // RefSeq // Homo sapiens C1q and tumor necrosis factor related protein 2 (C1QTNF2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_005265815 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens C1q and tumor necrosis factor related protein 2 (C1QTNF2), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000393975 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:160347751:160370641:-1 gene:ENSG00000145861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF329836 // GenBank // Homo sapiens complement-c1q tumor necrosis factor-related protein (CTRP2) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// AY358839 // GenBank // Homo sapiens clone DNA143501 CTRP2 (UNQ6349) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC054506 // GenBank // Homo sapiens C1q and tumor necrosis factor related protein 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:5179095), partial cds. // chr5 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000019224 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:160349168:160355011:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
NM_022090 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, BED-type containing 8 (ZBED8), mRNA. // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000408953 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:160393148:160400097:-1 gene:ENSG00000221886 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000523213 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:160393528:160400036:-1 gene:ENSG00000221886 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// AK026754 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ23101 fis, clone LNG07536. // chr5 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// BC032603 // GenBank // Homo sapiens chromosome 5 open reading frame 54, mRNA (cDNA clone MGC:44989 IMAGE:5535434), complete cds. // chr5 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC112128 // GenBank // Homo sapiens chromosome 5 open reading frame 54, mRNA (cDNA clone MGC:138333 IMAGE:8327596), complete cds. // chr5 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// BC112130 // GenBank // Homo sapiens chromosome 5 open reading frame 54, mRNA (cDNA clone MGC:138335 IMAGE:8327598), complete cds. // chr5 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
NM_006425 // RefSeq // Homo sapiens SLU7 splicing factor homolog (S. cerevisiae) (SLU7), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000297151 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:160401641:160419394:-1 gene:ENSG00000164609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000520841 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:160406349:160408421:-1 gene:ENSG00000164609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000521190 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:160413802:160419081:-1 gene:ENSG00000164609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 23 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000521320 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:160403153:160404619:-1 gene:ENSG00000164609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 23 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000521826 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:160413595:160421711:-1 gene:ENSG00000164609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 89 // 26 // 8 // 9 // 0 /// AF101074 // GenBank // Homo sapiens step II splicing factor SLU7 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// BC010634 // GenBank // Homo sapiens SLU7 splicing factor homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:9280 IMAGE:3871882), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000019217 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:160403285:160415294:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0
NM_025153 // RefSeq // Homo sapiens ATPase, class V, type 10B (ATP10B), mRNA. // chr5 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// XM_005265849 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ATPase, class V, type 10B (ATP10B), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 70 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000326831 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:160632624:160685385:-1 gene:ENSG00000118322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 35 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000327245 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:160563120:160852212:-1 gene:ENSG00000118322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000521033 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:160633753:160852188:-1 gene:ENSG00000118322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 30 // 11 // 11 // 0 /// AK025130 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ21477 fis, clone COL04982. // chr5 // 100 // 35 // 13 // 13 // 0 /// AK295081 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55474 complete cds, highly similar to Probable phospholipid-transporting ATPase VB (EC 3.6.3.1). // chr5 // 100 // 30 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000517802 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:160633255:160852212:-1 gene:ENSG00000118322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 32 // 32 // 12 // 37 // 1 /// AK090832 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ33513 fis, clone BRAMY2005576, moderately similar to POTENTIAL PHOSPHOLIPID-TRANSPORTING ATPASE VA (EC 3.6.1.-). // chr5 // 32 // 32 // 12 // 37 // 1 /// GENSCAN00000024130 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:160598770:160984589:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 54 // 20 // 20 // 0
ENST00000470810 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:161751448:161751768:-1 gene:ENSG00000118990 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_145266 // RefSeq // Homo sapiens NudC domain containing 2 (NUDCD2), mRNA. // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000302764 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:163446526:163460140:-1 gene:ENSG00000170584 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000517501 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:5:163453923:163460055:-1 gene:ENSG00000170584 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// BC017934 // GenBank // Homo sapiens NudC domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:23968 IMAGE:4698187), complete cds. // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BX538290 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686E10109 (from clone DKFZp686E10109); complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FJ215684 // GenBank // Homo sapiens NudC-like protein 2 mRNA, complete cds. // chr5 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0
ENST00000516189 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:163796065:163796165:-1 gene:ENSG00000251998 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT104918 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENST00000384118 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:164935162:164935268:-1 gene:ENSG00000206845 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT104943 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
ENST00000517256 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:168033091:168033205:-1 gene:ENSG00000253065 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONHSAT104979 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_024594 // RefSeq // Homo sapiens pantothenate kinase 3 (PANK3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000239231 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:168548495:168579600:-1 gene:ENSG00000120137 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC013705 // GenBank // Homo sapiens pantothenate kinase 3, mRNA (cDNA clone MGC:16863 IMAGE:4343270), complete cds. // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000021905 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:168559023:168568998:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
NR_029520 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 103a-1 (MIR103A1), microRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000362165 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:168560892:168560977:-1 gene:ENSG00000199035 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-103a-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0000109 Homo sapiens miR-103a-1 stem-loop // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT104994 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NR_029632 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 218-2 (MIR218-2), microRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000385006 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:168768146:168768255:-1 gene:ENSG00000207739 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-218-2 // miRBase Micro RNA Database // MI0000295 Homo sapiens miR-218-2 stem-loop // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT105003 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AY358216 // GenBank // Homo sapiens clone DNA175753 VCEW9374 (UNQ9374) mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_004137 // RefSeq // Homo sapiens potassium large conductance calcium-activated channel, subfamily M, beta member 1 (KCNMB1), mRNA. // chr5 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000521859 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:170382652:170389634:-1 gene:ENSG00000145936 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// AF026002 // GenBank // Homo sapiens calcium-activated potassium channel beta subunit mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// AY044441 // GenBank // Homo sapiens potassium large conductance calcium-activated channel (KCNMB1) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 41 // 13 // 13 // 0 /// AY515264 // GenBank // Homo sapiens large conductance Ca2+-activated K+ channel beta 1 subunit (KCNMB1) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0 /// BC025707 // GenBank // Homo sapiens potassium large conductance calcium-activated channel, subfamily M, beta member 1, mRNA (cDNA clone MGC:34483 IMAGE:5224514), complete cds. // chr5 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// U25138 // GenBank // Human MaxiK potassium channel beta subunit mRNA, complete cds. // chr5 // 94 // 53 // 16 // 17 // 0 /// U38907 // GenBank // Human beta-subunit of BK channels mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// U42600 // GenBank // Human calcium-activated potassium channel beta subunit mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 53 // 17 // 17 // 0 /// U61536 // GenBank // Human potassium channel beta subunit mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 53 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000274629 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:170374671:170389677:-1 gene:ENSG00000145936 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// GENSCAN00000005981 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:170378704:170385429:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0
NM_005990 // RefSeq // Homo sapiens serine/threonine kinase 10 (STK10), mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000176763 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:172042073:172188386:-1 gene:ENSG00000072786 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AB015718 // GenBank // Homo sapiens lok mRNA for protein kinase, complete cds. // chr5 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// BC070077 // GenBank // Homo sapiens serine/threonine kinase 10, mRNA (cDNA clone MGC:87394 IMAGE:5267449), complete cds. // chr5 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000008681 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:172044882:172096662:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_152277 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin domain containing 2 (UBTD2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000393792 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:172209640:172284071:-1 gene:ENSG00000168246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF251700 // GenBank // Homo sapiens ubiquitin-like protein SB72 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// BC019910 // GenBank // Homo sapiens ubiquitin domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:30022 IMAGE:4402070), complete cds. // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000008684 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:172211830:172283665:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1
ENST00000391227 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:172252334:172252478:-1 gene:ENSG00000212529 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT105111 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001017995 // RefSeq // Homo sapiens SH3 and PX domains 2B (SH3PXD2B), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000311601 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:172333499:172454523:-1 gene:ENSG00000174705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000519643 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:172325181:172454358:-1 gene:ENSG00000174705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// AB430862 // GenBank // Homo sapiens fad49 mRNA for FAD49, complete cds. // chr5 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// BC038561 // GenBank // Homo sapiens SH3 and PX domains 2B, mRNA (cDNA clone IMAGE:3898606). // chr5 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// DQ109556 // GenBank // Homo sapiens adaptor protein HOFI mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000008686 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:172325276:172424320:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0
AF342767 // GenBank // Homo sapiens hypothetical drug-resistance-associated protein mRNA, complete cds. // chr5 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0
NM_004417 // RefSeq // Homo sapiens dual specificity phosphatase 1 (DUSP1), mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000239223 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:172768090:172771195:-1 gene:ENSG00000120129 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// AK298047 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59221 complete cds, highly similar to Dual specificity protein phosphatase 1 (EC 3.1.3.48). // chr5 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// AK298658 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51038 complete cds, highly similar to Dual specificity protein phosphatase 1 (EC3.1.3.48). // chr5 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// AK299391 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60839 complete cds, highly similar to Dual specificity protein phosphatase 1 (EC 3.1.3.48). // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AK300487 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53922 complete cds, highly similar to Dual specificity protein phosphatase 1 (EC 3.1.3.48). // chr5 // 87 // 94 // 26 // 30 // 0 /// AK304475 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51202 complete cds, highly similar to Dual specificity protein phosphatase 1 (EC 3.1.3.48). // chr5 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// AK316321 // GenBank // Homo sapiens cDNA, FLJ79220 complete cds, highly similar to Dual specificity protein phosphatase 1 (EC3.1.3.48). // chr5 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// BC022463 // GenBank // Homo sapiens dual specificity phosphatase 1, mRNA (cDNA clone MGC:26153 IMAGE:4794895), complete cds. // chr5 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000042870 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:172768762:172795610:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AK127679 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ45777 fis, clone NETRP2004385, highly similar to Dual specificity protein phosphatase 1 (EC 3.1.3.48). // chr5 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0
ENST00000384014 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:172779982:172780094:-1 gene:ENSG00000206741 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT105143 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000384481 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:173052452:173052555:-1 gene:ENSG00000207210 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT105163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000364407 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:173254190:173254290:-1 gene:ENSG00000201277 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT105169 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000516360 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:173292517:173292619:-1 gene:ENSG00000252169 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT105171 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
ENST00000362349 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:173362134:173362240:-1 gene:ENSG00000199219 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONHSAT105179 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NR_046113 // RefSeq // Homo sapiens FLJ16171 protein (FLJ16171), long non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT105255 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_000794 // RefSeq // Homo sapiens dopamine receptor D1 (DRD1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000393752 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:175440039:175444208:-1 gene:ENSG00000184845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC074978 // GenBank // Homo sapiens dopamine receptor D1, mRNA (cDNA clone MGC:104066 IMAGE:30915514), complete cds. // chr5 // 86 // 54 // 12 // 14 // 0 /// BC074979 // GenBank // Homo sapiens dopamine receptor D1, mRNA (cDNA clone MGC:103908 IMAGE:30915297), complete cds. // chr5 // 86 // 54 // 12 // 14 // 0
NONHSAT105260 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000465665 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:176547433:176547726:-1 gene:ENSG00000243959 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT105360 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_052899 // RefSeq // Homo sapiens G protein regulated inducer of neurite outgrowth 1 (GPRIN1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000303991 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:176595802:176610133:-1 gene:ENSG00000169258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC052950 // GenBank // Homo sapiens G protein regulated inducer of neurite outgrowth 1, mRNA (cDNA clone MGC:43428 IMAGE:5267189), complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000003667 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:176591510:176610177:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_002115 // RefSeq // Homo sapiens hexokinase 3 (white cell) (HK3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENST00000292432 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:176880871:176899332:-1 gene:ENSG00000160883 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENST00000506834 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:176880869:176888647:-1 gene:ENSG00000160883 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 51 // 23 // 23 // 0 /// AB208951 // GenBank // Homo sapiens premature mRNA for hexokinase 3 variant. // chr5 // 93 // 93 // 39 // 42 // 0 /// BC028129 // GenBank // Homo sapiens hexokinase 3 (white cell), mRNA (cDNA clone MGC:40018 IMAGE:5211860), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// U42303 // GenBank // Human ATP:D-hexose 6-phosphotransferase mRNA, partial cds. // chr5 // 83 // 51 // 19 // 23 // 0 /// U51333 // GenBank // Human hexokinase III (HK3) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000003663 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:176881073:177006829:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 87 // 39 // 39 // 0
NM_001029886 // RefSeq // Homo sapiens profilin 3 (PFN3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000358571 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:177400107:177400636:-1 gene:ENSG00000196570 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC132952 // GenBank // Homo sapiens profilin 3, mRNA (cDNA clone MGC:164583 IMAGE:40146974), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC132954 // GenBank // Homo sapiens profilin 3, mRNA (cDNA clone MGC:164585 IMAGE:40146976), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:177400163:177400576:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_000505 // RefSeq // Homo sapiens coagulation factor XII (Hageman factor) (F12), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000253496 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:177402140:177409576:-1 gene:ENSG00000131187 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000502854 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:177402160:177404472:-1 gene:ENSG00000131187 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 60 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000503736 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:177403492:177404981:-1 gene:ENSG00000131187 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 35 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000504406 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:177402163:177403750:-1 gene:ENSG00000131187 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 30 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000510358 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:177402172:177404472:-1 gene:ENSG00000131187 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 60 // 24 // 24 // 0 /// AB095845 // GenBank // Homo sapiens mRNA for coagulation factor XII-Mie, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// BC012390 // GenBank // Homo sapiens coagulation factor XII (Hageman factor), mRNA (cDNA clone IMAGE:3881207), complete cds. // chr5 // 100 // 55 // 22 // 22 // 0 /// BT007350 // GenBank // Homo sapiens coagulation factor XII (Hageman factor) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 45 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000003673 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:177402292:177409527:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0
NM_001190946 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 193, member B (FAM193B), transcript variant 3, mRNA. // chr5 // 100 // 60 // 21 // 21 // 0 /// NR_024019 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 193, member B (FAM193B), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_006714882 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens family with sequence similarity 193, member B (FAM193B), transcript variant X8, mRNA. // chr5 // 100 // 54 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000506955 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:177519790:177554541:-1 gene:ENSG00000146067 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000510163 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:177519791:177536390:-1 gene:ENSG00000146067 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 31 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000514747 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:5:177519788:177554507:-1 gene:ENSG00000146067 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 60 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000515394 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:177536304:177538019:-1 gene:ENSG00000146067 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000510479 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:177519790:177539066:-1 gene:ENSG00000146067 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 54 // 54 // 19 // 35 // 1 /// GENSCAN00000003671 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:177520921:177539147:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 49 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT105436 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0
NR_026921 // RefSeq // Homo sapiens SUMO-interacting motifs containing 1 pseudogene (LOC202181), non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK021623 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ11561 fis, clone HEMBA1003142. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000499314 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:177619059:177631535:-1 gene:ENSG00000246596 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 67 // 67 // 16 // 24 // 1 /// AF086197 // GenBank // Homo sapiens full length insert cDNA clone ZC39B06. // chr5 // 46 // 46 // 11 // 24 // 1 /// NONHSAT105448 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT105449 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_006261 // RefSeq // Homo sapiens PROP paired-like homeobox 1 (PROP1), mRNA. // chr5 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// ENST00000308304 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:177992235:177996242:-1 gene:ENSG00000175325 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF076215 // GenBank // Homo sapiens prophet of Pit1 (PROP1) mRNA, complete cds. // chr5 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// BC069076 // GenBank // Homo sapiens PROP paired-like homeobox 1, mRNA (cDNA clone MGC:95351 IMAGE:7216890), complete cds. // chr5 // 91 // 73 // 20 // 22 // 0 /// ENST00000614006 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR5_3_CTG5:177993018:177996243:-1 gene:ENSG00000274382 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 91 // 73 // 20 // 22 // 0 /// GENSCAN00000007778 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:177992709:177995933:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000010768 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR5_3_CTG5:177993019:177996243:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 91 // 73 // 20 // 22 // 0
NM_001034833 // RefSeq // Homo sapiens NHP2 ribonucleoprotein (NHP2), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0 /// NM_017838 // RefSeq // Homo sapiens NHP2 ribonucleoprotein (NHP2), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000274606 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:178149460:178153967:-1 gene:ENSG00000145912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000314397 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:178149482:178153829:-1 gene:ENSG00000145912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0 /// AF401219 // GenBank // Homo sapiens small nucleolar RNA binding-like protein NHP2 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0 /// AK000486 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ20479 fis, clone KAT07382. // chr5 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0 /// BC000009 // GenBank // Homo sapiens NHP2 ribonucleoprotein homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:1038 IMAGE:3505294), complete cds. // chr5 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0 /// BC006387 // GenBank // Homo sapiens NHP2 ribonucleoprotein homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:13306 IMAGE:4109843), complete cds. // chr5 // 100 // 67 // 10 // 10 // 0 /// CR457238 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834A069D for gene NOLA2, nucleolar protein family A, member 2 (H/ACA small nucleolar RNPs); complete cds, incl. stopcodon. // chr5 // 100 // 53 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000007762 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:178149713:178162156:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0
NR_003281 // RefSeq // Homo sapiens germ cell-less, spermatogenesis associated 1 pseudogene 1 (GMCL1P1), non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000463439 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:178185719:178187299:-1 gene:ENSG00000244234 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0 /// BC024185 // GenBank // Homo sapiens germ cell-less homolog 1 (Drosophila)-like, mRNA (cDNA clone IMAGE:4824160). // chr5 // 88 // 100 // 14 // 16 // 0 /// GENSCAN00000007760 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:178185719:178187299:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0 /// NONHSAT105522 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_173465 // RefSeq // Homo sapiens collagen, type XXIII, alpha 1 (COL23A1), mRNA. // chr5 // 97 // 92 // 34 // 35 // 0 /// ENST00000390654 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:178237618:178590555:-1 gene:ENSG00000050767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 92 // 34 // 35 // 0 /// ENST00000407622 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:5:178237620:178306934:-1 gene:ENSG00000050767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 76 // 28 // 29 // 0 /// AY158895 // GenBank // Homo sapiens alpha 1 type XXIII collagen (COL23A1) mRNA, complete cds. // chr5 // 97 // 92 // 34 // 35 // 0 /// AY898961 // GenBank // Homo sapiens type XXIII collagen mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr5 // 97 // 92 // 34 // 35 // 0 /// BC042428 // GenBank // Homo sapiens collagen, type XXIII, alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:35032 IMAGE:5165083), complete cds. // chr5 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000007770 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:178211810:178356538:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 66 // 66 // 25 // 38 // 1
NM_005649 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 354A (ZNF354A), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000335815 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:178711592:178730702:-1 gene:ENSG00000169131 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0 /// AF116030 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein EZNF (EZNF) mRNA, complete cds. // chr5 // 94 // 95 // 17 // 18 // 0 /// AK290711 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76133 complete cds, highly similar to Homo sapiens zinc finger protein 354A (ZNF354A), mRNA. // chr5 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// BC047105 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 354A, mRNA (cDNA clone MGC:51006 IMAGE:5312219), complete cds. // chr5 // 88 // 89 // 15 // 17 // 0 /// D89928 // GenBank // Homo sapiens HKL1 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// EU794664 // GenBank // Homo sapiens epididymis luminal protein 104 (HEL104) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000047542 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:178712060:178730769:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 74 // 14 // 14 // 0
NM_000843 // RefSeq // Homo sapiens glutamate receptor, metabotropic 6 (GRM6), mRNA. // chr5 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000231188 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:5:178978327:178995123:-1 gene:ENSG00000113262 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000517717 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:178981657:178995298:-1 gene:ENSG00000113262 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000047537 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:178981657:179024373:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0
NM_014244 // RefSeq // Homo sapiens ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 2 (ADAMTS2), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// NM_021599 // RefSeq // Homo sapiens ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 2 (ADAMTS2), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 48 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000251582 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:179110851:179345430:-1 gene:ENSG00000087116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENST00000274609 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:179150888:179345430:-1 gene:ENSG00000087116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 48 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000047546 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:179113867:179279438:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0
NM_001142306 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 5 open reading frame 60 (C5orf60), mRNA. // chr5 // 100 // 50 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000448248 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:179641544:179645046:-1 gene:ENSG00000204661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 50 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000511063 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:179641546:179645007:-1 gene:ENSG00000204661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 72 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000512899 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:179641790:179645046:-1 gene:ENSG00000204661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 44 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000514664 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:179641544:179645007:-1 gene:ENSG00000204661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// AK093042 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ35723 fis, clone TESTI2001959. // chr5 // 94 // 89 // 15 // 16 // 0 /// BC040992 // GenBank HTC // Homo sapiens hypothetical protein LOC285679, mRNA (cDNA clone IMAGE:5272524), with apparent retained intron. // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000505650 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:179522457:179525074:1 gene:ENSG00000251545 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr5 // 100 // 44 // 8 // 8 // 0 /// NONHSAT105586 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 44 // 8 // 8 // 0 /// NONHSAT105587 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 44 // 8 // 8 // 0 /// NONHSAT105606 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
ENST00000516393 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:179847035:179847130:-1 gene:ENSG00000252202 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT105646 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000484005 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:180226378:180227000:-1 gene:ENSG00000229721 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 94 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000027036 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:180226592:180250107:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_005110 // RefSeq // Homo sapiens glutamine-fructose-6-phosphate transaminase 2 (GFPT2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000253778 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:180300690:180353387:-1 gene:ENSG00000131459 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB016789 // GenBank // Homo sapiens mRNA for Glutamine:fructose-6-phosphate amidotransferase, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK297750 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56595 complete cds, highly similar to Glucosamine--fructose-6-phosphateaminotransferase (isomerizing) 2 (EC 2.6.1.16). // chr5 // 90 // 80 // 18 // 20 // 0 /// BC000012 // GenBank // Homo sapiens glutamine-fructose-6-phosphate transaminase 2, mRNA (cDNA clone MGC:1837 IMAGE:3506723), complete cds. // chr5 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// BT009818 // GenBank // Homo sapiens glutamine-fructose-6-phosphate transaminase 2 mRNA, complete cds. // chr5 // 85 // 80 // 17 // 20 // 0 /// GENSCAN00000027040 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:180261428:180495634:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1
NM_052863 // RefSeq // Homo sapiens secretoglobin, family 3A, member 1 (SCGB3A1), mRNA. // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000292641 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:180590103:180591540:-1 gene:ENSG00000161055 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000512120 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:180590105:180591163:-1 gene:ENSG00000161055 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// AF086152 // GenBank // Homo sapiens full length insert cDNA clone ZB52D10. // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// AF436839 // GenBank // Homo sapiens pneumo secretory protein 2 mRNA, complete cds. // chr5 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// AY040564 // GenBank // Homo sapiens HIN-1 putative cytokine mRNA, complete cds. // chr5 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// AY359064 // GenBank // Homo sapiens clone DNA64884 SCGB3A1 (UNQ629) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC029176 // GenBank // Homo sapiens secretoglobin, family 3A, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:34758 IMAGE:5180304), complete cds. // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC072673 // GenBank // Homo sapiens secretoglobin, family 3A, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:87867 IMAGE:5753142), complete cds. // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// AF313458 // GenBank // Homo sapiens UGRP2 mRNA, complete cds. // chr5 // 71 // 68 // 12 // 17 // 0 /// GENSCAN00000011439 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:180581001:180591462:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
ENST00000448534 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:180692832:180693763:-1 gene:ENSG00000236791 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011448 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:180603192:180740058:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_001001657 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily Y, member 1 (OR2Y1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000307832 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:180739042:180740099:-1 gene:ENSG00000174339 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC140756 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily Y, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:176433 IMAGE:9021624), complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011448 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:180603192:180740058:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 87 // 60 // 13 // 15 // 0
NM_001258283 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily V, member 1 (OR2V1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000329365 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:181124357:181125304:-1 gene:ENSG00000185372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011453 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:181119336:181125304:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_002592 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 96A (SNORD96A), small nucleolar RNA. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000502890 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:181239070:181241880:-1 gene:ENSG00000204628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000513060 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:181236961:181243947:-1 gene:ENSG00000204628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000606577 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:181241814:181241892:-1 gene:ENSG00000272296 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT105929 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT105931 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NR_002591 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 95 (SNORD95), small nucleolar RNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000502844 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:181238124:181243370:-1 gene:ENSG00000204628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000503170 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:181242250:181243904:-1 gene:ENSG00000204628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000513027 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:181239539:181243904:-1 gene:ENSG00000204628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000514318 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:181243042:181243908:-1 gene:ENSG00000204628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000579879 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:181243312:181243379:-1 gene:ENSG00000264549 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT105932 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT105933 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT105934 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_032765 // RefSeq // Homo sapiens tripartite motif containing 52 (TRIM52), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AB209243 // GenBank // Homo sapiens mRNA for tripartite motif-containing 52 variant protein. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC007372 // GenBank // Homo sapiens tripartite motif-containing 52, mRNA (cDNA clone MGC:16175 IMAGE:3636274), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// JX896146 // GenBank // Homo sapiens tripartite motif-containing protein 52 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000514805 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:181259261:181261081:-1 gene:ENSG00000183718 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 67 // 67 // 16 // 24 // 1 /// ENST00000611618 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:181255147:181261118:-1 gene:ENSG00000183718 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000612671 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:181256387:181261139:-1 gene:ENSG00000183718 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000011441 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:181255896:181331806:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 58 // 58 // 14 // 24 // 1
ENST00000381078 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:203313:206392:1 gene:ENSG00000205653 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK125751 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ43763 fis, clone TESTI2048603. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT105978 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001195286 // RefSeq // Homo sapiens interferon regulatory factor 4 (IRF4), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NM_002460 // RefSeq // Homo sapiens interferon regulatory factor 4 (IRF4), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NR_046000 // RefSeq // Homo sapiens interferon regulatory factor 4 (IRF4), transcript variant 4, non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000380956 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:391739:411447:1 gene:ENSG00000137265 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000493114 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:391768:407618:1 gene:ENSG00000137265 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// AK310149 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17191. // chr6 // 100 // 56 // 19 // 19 // 0 /// BC015752 // GenBank // Homo sapiens interferon regulatory factor 4, mRNA (cDNA clone MGC:23069 IMAGE:4861223), complete cds. // chr6 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// U52682 // GenBank // Human lymphocyte specific interferon regulatory factor/interferon regulatory factor 4 (LSIRF/IRF4) mRNA, complete cds. // chr6 // 91 // 100 // 31 // 34 // 0 /// GENSCAN00000002034 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:384725:425026:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 53 // 53 // 18 // 34 // 1
NONHSAT106393 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT106394 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_033260 // RefSeq // Homo sapiens forkhead box Q1 (FOXQ1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000296839 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:1312473:1314187:1 gene:ENSG00000164379 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// BC053850 // GenBank // Homo sapiens forkhead box Q1, mRNA (cDNA clone MGC:61699 IMAGE:6010412), complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000004412 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:1312705:1313916:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0
NM_001452 // RefSeq // Homo sapiens forkhead box F2 (FOXF2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000259806 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:1389834:1395597:1 gene:ENSG00000137273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// U13220 // GenBank // Homo sapiens forkhead protein FREAC-2 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000004377 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:1389948:1412756:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0
ENST00000466002 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:1507322:1507598:1 gene:ENSG00000243439 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT106508 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001453 // RefSeq // Homo sapiens forkhead box C1 (FOXC1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000380874 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:1609972:1613897:1 gene:ENSG00000054598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC134421 // GenBank // Homo sapiens forkhead box C1, mRNA (cDNA clone IMAGE:40121475), complete cds. // chr6 // 26 // 26 // 9 // 35 // 1 /// GENSCAN00000004411 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:1610446:1612107:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0
ENST00000606102 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:2341450:2341711:1 gene:ENSG00000236086 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000049799 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:2341450:2341716:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT106648 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT106649 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NR_026855 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 1011 (LINC01011), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NR_026856 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 1011 (LINC01011), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr6 // 100 // 35 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000445000 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:2987967:2991173:1 gene:ENSG00000244041 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000450238 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:2987967:2990348:1 gene:ENSG00000244041 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr6 // 100 // 26 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000605901 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:2988648:2991173:1 gene:ENSG00000244041 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr6 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000454015 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:2988658:2990252:1 gene:ENSG00000244041 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr6 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1 /// NONHSAT106901 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONHSAT106902 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 26 // 8 // 8 // 0 /// NONHSAT106903 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 35 // 11 // 11 // 0 /// NONHSAT106904 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT106906 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NONHSAT106905 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1
ENST00000428729 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:3045384:3045800:1 gene:ENSG00000232654 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000048027 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:3045384:3045800:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
BC131577 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:40109262. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT107017 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000380274 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:6:3849386:3851317:1 gene:ENSG00000145945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NM_012135 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 50, member B (FAM50B), mRNA. // chr6 // 96 // 96 // 27 // 28 // 1 /// ENST00000380272 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:6:3849388:3851317:1 gene:ENSG00000145945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 96 // 27 // 28 // 1 /// BC001261 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 50, member B, mRNA (cDNA clone MGC:5026 IMAGE:3457886), complete cds. // chr6 // 96 // 96 // 27 // 28 // 1 /// GENSCAN00000048010 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:3784564:3850789:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
AF210650 // GenBank // Homo sapiens NAG19 (NAG19) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NR_122107 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC497048 (KU-MEL-3), long non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000380106 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:4610656:4611304:1 gene:ENSG00000205444 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr6 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// AY870321 // GenBank // Homo sapiens KU-MEL-3 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC130651 // GenBank // Homo sapiens KU-MEL-3, mRNA (cDNA clone MGC:163523 IMAGE:40146682), complete cds. // chr6 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// BC130655 // GenBank // Homo sapiens KU-MEL-3, mRNA (cDNA clone MGC:163527 IMAGE:40146686), complete cds. // chr6 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// NONHSAT107459 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// TCONS_00011153-XLOC_005142 // Rinn lincRNA // linc-CDYL-1 chr6:+:4610845-4612152 // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
AY358807 // GenBank // Homo sapiens clone DNA129580 QIQN5815 (UNQ5815) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_004271 // RefSeq // Homo sapiens lymphocyte antigen 86 (LY86), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000230568 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:6588669:6654631:1 gene:ENSG00000112799 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 73 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000379953 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:6588108:6654983:1 gene:ENSG00000112799 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AB020499 // GenBank // Homo sapiens BCG-regulated mRNA for MD-1 homologue, complete cds. // chr6 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// AF057178 // GenBank // Homo sapiens MD-1 mRNA, complete cds. // chr6 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// AY931019 // GenBank // Homo sapiens MMD-1 (MMD-1) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 73 // 16 // 16 // 0 /// BC038846 // GenBank // Homo sapiens lymphocyte antigen 86, mRNA (cDNA clone MGC:47723 IMAGE:6015123), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000014803 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:6505722:6780457:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 45 // 45 // 10 // 22 // 1
NM_031480 // RefSeq // Homo sapiens RIO kinase 1 (RIOK1), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NM_153005 // RefSeq // Homo sapiens RIO kinase 1 (RIOK1), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000264874 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:7396752:7418037:1 gene:ENSG00000124784 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000379834 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:7389496:7418037:1 gene:ENSG00000124784 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000475351 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:7389793:7402848:1 gene:ENSG00000124784 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// AF258661 // GenBank // Homo sapiens AD034 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// AL834277 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp547L2113 (from clone DKFZp547L2113). // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AY094356 // GenBank // Homo sapiens truncated hypothetical protein AD034 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// BC006104 // GenBank // Homo sapiens RIO kinase 1 (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:12903 IMAGE:3537086), complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000025557 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:7390003:7433401:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_004415 // RefSeq // Homo sapiens desmoplakin (DSP), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 98 // 100 // 40 // 41 // 0 /// ENST00000379802 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:7541575:7586717:1 gene:ENSG00000096696 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 98 // 100 // 40 // 41 // 0 /// AK304182 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61543 complete cds, highly similar to Desmoplakin. // chr6 // 92 // 61 // 23 // 25 // 0 /// HM151899 // GenBank // Homo sapiens desmoplakin Ia mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr6 // 97 // 93 // 37 // 38 // 0 /// M77830 // GenBank // Homo sapiens desmoplakin I (DPI) mRNA, complete cds. // chr6 // 98 // 98 // 39 // 40 // 0 /// NM_001008844 // RefSeq // Homo sapiens desmoplakin (DSP), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 88 // 88 // 36 // 41 // 1 /// ENST00000418664 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:7541617:7586572:1 gene:ENSG00000096696 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 85 // 85 // 35 // 41 // 1 /// BC140802 // GenBank // Homo sapiens desmoplakin, mRNA (cDNA clone MGC:176479 IMAGE:9021670), complete cds. // chr6 // 80 // 80 // 33 // 41 // 1 /// GENSCAN00000025532 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:7555731:7612911:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 97 // 83 // 33 // 34 // 0
NM_152551 // RefSeq // Homo sapiens small nuclear ribonucleoprotein 48kDa (U11/U12) (SNRNP48), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000342415 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:7590199:7611967:1 gene:ENSG00000168566 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AK292409 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77380 complete cds. // chr6 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// BC114630 // GenBank // Homo sapiens small nuclear ribonucleoprotein 48kDa (U11/U12), mRNA (cDNA clone MGC:138904 IMAGE:40084896), complete cds. // chr6 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// BC114631 // GenBank // Homo sapiens small nuclear ribonucleoprotein 48kDa (U11/U12), mRNA (cDNA clone MGC:138905 IMAGE:40084903), complete cds. // chr6 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// AK056796 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ32234 fis, clone PLACE6004687. // chr6 // 79 // 79 // 23 // 29 // 1 /// ENST00000496946 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:7599673:7609206:1 gene:ENSG00000168566 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1 /// GENSCAN00000025532 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:7555731:7612911:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1 /// AK092158 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ34839 fis, clone NT2NE2010688. // chr6 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
NM_001718 // RefSeq // Homo sapiens bone morphogenetic protein 6 (BMP6), mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000283147 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:7726797:7881422:1 gene:ENSG00000153162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// M60315 // GenBank // Human transforming growth factor-beta BMP protein (tgf-beta) mRNA, complete cds. // chr6 // 93 // 93 // 26 // 28 // 0 /// AK300628 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51307 complete cds, highly similar to Bone morphogenetic protein 6 precursor. // chr6 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1
NR_027712 // RefSeq // Homo sapiens phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase, type I, pseudogene 1 (PIP5K1P1), non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000460661 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:7986537:7988192:1 gene:ENSG00000219294 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 70 // 14 // 14 // 0 /// BC028580 // GenBank // Homo sapiens PIP5K1A pseudogene, mRNA (cDNA clone IMAGE:4828163). // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000025545 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:7986537:7988075:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 70 // 14 // 14 // 0
ENST00000408656 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:10222036:10222161:1 gene:ENSG00000221583 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT107674 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000443546 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:10414578:10415722:1 gene:ENSG00000229950 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr6 // 100 // 74 // 17 // 17 // 0 /// AK092393 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ35074 fis, clone PLACE6001118. // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC012200 // GenBank // Homo sapiens, clone IMAGE:3863392, mRNA. // chr6 // 100 // 74 // 17 // 17 // 0 /// BC037167 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4132069, partial cds. // chr6 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0 /// NR_033910 // RefSeq // Homo sapiens TFAP2A antisense RNA 1 (TFAP2A-AS1), long non-coding RNA. // chr6 // 65 // 65 // 15 // 23 // 1 /// ENST00000420777 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:10409340:10416446:1 gene:ENSG00000229950 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr6 // 65 // 65 // 15 // 23 // 1 /// NONHSAT107681 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr6 // 100 // 74 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT107679 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr6 // 65 // 65 // 15 // 23 // 1 /// NONHSAT107680 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr6 // 65 // 65 // 15 // 23 // 1
NM_017906 // RefSeq // Homo sapiens PAK1 interacting protein 1 (PAK1IP1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_005249204 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens PAK1 interacting protein 1 (PAK1IP1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000379568 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:10694695:10709782:1 gene:ENSG00000111845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF283303 // GenBank // Homo sapiens PAK/PLC-interacting protein 1 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK225516 // GenBank // Homo sapiens mRNA for PAK1 interacting protein 1 variant, clone: KAT04557. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC010907 // GenBank // Homo sapiens PAK1 interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:13426 IMAGE:4251347), complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000045593 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:10694986:10709452:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_001040274 // RefSeq // Homo sapiens synaptonemal complex protein 2-like (SYCP2L), mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000283141 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:10886831:10974309:1 gene:ENSG00000153157 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000341041 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:10886831:10974194:1 gene:ENSG00000153157 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000487561 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:10898014:10924584:1 gene:ENSG00000153157 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000543878 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:10891507:10963806:1 gene:ENSG00000153157 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// AK128130 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ46251 fis, clone TESTI4021713, weakly similar to Homo sapiens synaptonemal complex protein 2 (SYCP2). // chr6 // 97 // 91 // 30 // 31 // 0 /// ENST00000480294 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:10747794:10930423:1 gene:ENSG00000272162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 95 // 56 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000045583 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:10902462:10976974:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 35 // 12 // 12 // 0 /// AK294018 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60468 complete cds, weakly similar to Synaptonemal complex protein 2. // chr6 // 89 // 56 // 17 // 19 // 0
NR_038962 // RefSeq // Homo sapiens ELOVL2 antisense RNA 1 (ELOVL2-AS1), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NR_038963 // RefSeq // Homo sapiens ELOVL2 antisense RNA 1 (ELOVL2-AS1), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NR_038964 // RefSeq // Homo sapiens ELOVL2 antisense RNA 1 (ELOVL2-AS1), transcript variant 3, long non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC038757 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5269899. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT107726 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT107727 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT107729 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT107734 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000622203 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:6:11644067:11644343:1 gene:ENSG00000277473 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000384688 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:6:11709819:11709960:1 gene:ENSG00000207419 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT107761 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_002114 // RefSeq // Homo sapiens human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 1 (HIVEP1), mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// XR_241895 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 1 (HIVEP1), transcript variant X3, misc_RNA. // chr6 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000379388 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:12012338:12164999:1 gene:ENSG00000095951 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000541134 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:12012338:12164998:1 gene:ENSG00000095951 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC140816 // GenBank // Homo sapiens human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:176493 IMAGE:9021684), complete cds. // chr6 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// M32019 // GenBank // Human DNA-binding protein (mbp-1) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// X51435 // GenBank // Human PRDII-BF1 gene for a DNA-binding protein. // chr6 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// GENSCAN00000001435 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:12065812:12164461:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 79 // 22 // 23 // 0
NM_001168319 // RefSeq // Homo sapiens endothelin 1 (EDN1), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001955 // RefSeq // Homo sapiens endothelin 1 (EDN1), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000379375 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:12290363:12297194:1 gene:ENSG00000078401 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK291838 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75736 complete cds, highly similar to Homo sapiens endothelin 1 (EDN1), mRNA. // chr6 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// BC009720 // GenBank // Homo sapiens endothelin 1, mRNA (cDNA clone MGC:9513 IMAGE:3900704), complete cds. // chr6 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// CR541903 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834D1233D for gene EDN1, endothelin 1; complete cds, incl. stopcodon. // chr6 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// AK226096 // GenBank // Homo sapiens mRNA for endothelin 1 variant, clone: ek00259. // chr6 // 92 // 92 // 23 // 25 // 1 /// AK307089 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ97037. // chr6 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000001447 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:12279456:12296067:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
ENST00000383975 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:13214056:13214219:1 gene:ENSG00000206702 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT107793 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000365481 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:13547704:13548013:1 gene:ENSG00000202351 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT107809 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_016167 // RefSeq // Homo sapiens nucleolar protein 7, 27kDa (NOL7), mRNA. // chr6 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000451315 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:13615327:13621205:1 gene:ENSG00000225921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// AF172066 // GenBank // Homo sapiens 27 kDa nucleolar protein (NOL7) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// AK075301 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ90820 fis, clone Y79AA1001272. // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC023517 // GenBank // Homo sapiens nucleolar protein 7, 27kDa, mRNA (cDNA clone MGC:12551 IMAGE:4298095), complete cds. // chr6 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// BC062683 // GenBank // Homo sapiens nucleolar protein 7, 27kDa, mRNA (cDNA clone MGC:71933 IMAGE:6499123), complete cds. // chr6 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// XM_005249173 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens nucleolar protein 7, 27kDa (NOL7), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 76 // 76 // 22 // 29 // 1 /// ENST00000474485 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:13615589:13632739:1 gene:ENSG00000225921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1 /// ENST00000420088 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:13615547:13618217:1 gene:ENSG00000225921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
NM_001040280 // RefSeq // Homo sapiens CD83 molecule (CD83), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// NM_001251901 // RefSeq // Homo sapiens CD83 molecule (CD83), transcript variant 3, mRNA. // chr6 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// NM_004233 // RefSeq // Homo sapiens CD83 molecule (CD83), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000379153 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:14117641:14136918:1 gene:ENSG00000112149 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// AK290426 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75916 complete cds, highly similar to Homo sapiens CD83 antigen (activated B lymphocytes, immunoglobulin superfamily) (CD83), mRNA. // chr6 // 96 // 74 // 24 // 25 // 0 /// BC030830 // GenBank // Homo sapiens CD83 molecule, mRNA (cDNA clone MGC:26322 IMAGE:4818856), complete cds. // chr6 // 94 // 97 // 31 // 33 // 0 /// BT019498 // GenBank // Homo sapiens CD83 antigen (activated B lymphocytes, immunoglobulin superfamily) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 47 // 16 // 16 // 0 /// CR457019 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834H085D for gene CD83, CD83 antigen (activated B lymphocytes, immunoglobulin superfamily); complete cds, incl. stopcodon. // chr6 // 94 // 47 // 15 // 16 // 0 /// AK309541 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99582. // chr6 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// ENST00000612003 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:14117256:14136918:1 gene:ENSG00000112149 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000025013 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:14117374:14135236:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 41 // 41 // 14 // 34 // 1
AY358259 // GenBank // Homo sapiens clone DNA175919 FLFF9364 (UNQ9364) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000384233 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:14646535:14646638:1 gene:ENSG00000206960 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT107852 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000482163 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:15112968:15113221:1 gene:ENSG00000242989 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT107865 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001267040 // RefSeq // Homo sapiens jumonji, AT rich interactive domain 2 (JARID2), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// NM_004973 // RefSeq // Homo sapiens jumonji, AT rich interactive domain 2 (JARID2), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000341776 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:15246296:15522021:1 gene:ENSG00000008083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000397311 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:15248855:15522040:1 gene:ENSG00000008083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// AK292861 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76971 complete cds, highly similar to Homo sapiens Jumonji, AT rich interactive domain 2 (JARID2), mRNA. // chr6 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// AK299349 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55641 complete cds, highly similar to Jumonji protein (Jumonji/ARIDdomain-containing protein 2). // chr6 // 100 // 49 // 20 // 20 // 0 /// AK302624 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53248 complete cds, highly similar to Jumonji protein (Jumonji/ARIDdomain-containing protein 2). // chr6 // 100 // 24 // 10 // 10 // 0 /// AK303610 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53263 complete cds, highly similar to Jumonji protein (Jumonji/ARIDdomain-containing protein 2). // chr6 // 100 // 85 // 35 // 35 // 0 /// BC046246 // GenBank // Homo sapiens jumonji, AT rich interactive domain 2, mRNA (cDNA clone MGC:47594 IMAGE:4520786), complete cds. // chr6 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// U57592 // GenBank // Human jumonji putative protein (jumonji) mRNA, complete cds. // chr6 // 97 // 95 // 38 // 39 // 0 /// GENSCAN00000045312 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:15445702:15518313:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 68 // 68 // 28 // 41 // 1
ENST00000364497 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:15314920:15315026:1 gene:ENSG00000201367 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT107870 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_013262 // RefSeq // Homo sapiens myosin regulatory light chain interacting protein (MYLIP), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000349606 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:16129171:16148248:1 gene:ENSG00000007944 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000356840 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:16129125:16146881:1 gene:ENSG00000007944 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// AF006003 // GenBank // Homo sapiens band 4.1 superfamily member BZF1 (BZF1) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// AF187016 // GenBank // Homo sapiens myosin regulatory light chain interacting protein MIR mRNA, complete cds. // chr6 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// AF258586 // GenBank // Homo sapiens PP5242 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// BC002860 // GenBank // Homo sapiens myosin regulatory light chain interacting protein, mRNA (cDNA clone MGC:4180 IMAGE:3638617), complete cds. // chr6 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// BT007055 // GenBank // Homo sapiens myosin regulatory light chain interacting protein mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000038196 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:16129323:16146265:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0
ENST00000516022 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:16205014:16205120:1 gene:ENSG00000251831 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT107895 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_006877 // RefSeq // Homo sapiens guanosine monophosphate reductase (GMPR), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000259727 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:16238580:16295549:1 gene:ENSG00000137198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000543191 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:16257973:16295328:1 gene:ENSG00000137198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 30 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000544145 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:6:16289518:16295544:1 gene:ENSG00000137198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0 /// BC008281 // GenBank // Homo sapiens guanosine monophosphate reductase, mRNA (cDNA clone MGC:10464 IMAGE:3635871), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// M24470 // GenBank // Human glucose-6-phosphate dehydrogenase, complete cds. // chr6 // 85 // 100 // 28 // 33 // 0 /// GENSCAN00000038195 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:16238694:16274829:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1
NM_016255 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 8, member A1 (FAM8A1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000259963 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:17600355:17611719:1 gene:ENSG00000137414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF097027 // GenBank // Homo sapiens Autosomal Highly Conserved Protein (AHCP) mRNA, complete cds. // chr6 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// BC047881 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 8, member A1, mRNA (cDNA clone MGC:57616 IMAGE:5742372), complete cds. // chr6 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000032338 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:17421565:17608339:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
ENST00000384154 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:17619533:17619634:1 gene:ENSG00000206881 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT107928 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000429798 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:45679232:45689134:-1 gene:ENSG00000230530 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr6 // 83 // 100 // 5 // 6 // 0 /// BC047037 // GenBank // Homo sapiens, clone IMAGE:5168377, mRNA. // chr6 // 83 // 100 // 5 // 6 // 0 /// NR_110002 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC101926933 (LOC101926933), long non-coding RNA. // chr6 // 50 // 100 // 3 // 6 // 0 /// ENST00000548322 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:22929645:22955562:1 gene:ENSG00000257285 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr6 // 50 // 100 // 3 // 6 // 0 /// ENST00000548819 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:14:22929609:22954692:1 gene:ENSG00000257285 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr6 // 50 // 100 // 3 // 6 // 0 /// NONHSAT089399 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr6 // 83 // 100 // 5 // 6 // 0 /// NONHSAT035844 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr6 // 50 // 100 // 3 // 6 // 0 /// NONHSAT035845 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr6 // 50 // 100 // 3 // 6 // 0 /// NONHSAT089406 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 67 // 100 // 4 // 6 // 0
NM_153042 // RefSeq // Homo sapiens lysine (K)-specific demethylase 1B (KDM1B), mRNA. // chr6 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000297792 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:18155452:18223853:1 gene:ENSG00000165097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000449850 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:18185788:18222115:1 gene:ENSG00000165097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 94 // 67 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000028167 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:18160277:18225950:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// AK091428 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ34109 fis, clone FCBBF3008556. // chr6 // 95 // 70 // 18 // 19 // 0
NM_182757 // RefSeq // Homo sapiens ring finger protein 144B (RNF144B), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// XM_005248985 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ring finger protein 144B (RNF144B), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000259939 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:18387350:18468874:1 gene:ENSG00000137393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AB076367 // GenBank // Homo sapiens p53RFP mRNA for p53-inducible RING finger protein, complete cds. // chr6 // 92 // 100 // 35 // 38 // 0 /// AK302935 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59797 complete cds, highly similar to E3 ubiquitin ligase IBRDC2 (EC 6.3.2.-). // chr6 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0 /// BC063311 // GenBank // Homo sapiens ring finger protein 144B, mRNA (cDNA clone MGC:71786 IMAGE:30331343), complete cds. // chr6 // 97 // 97 // 36 // 37 // 0 /// ENST00000486622 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:18387514:18402095:1 gene:ENSG00000137393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1 /// GENSCAN00000028163 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:18425378:18669276:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 26 // 26 // 10 // 38 // 1 /// NONHSAT107973 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1
ENST00000364653 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:19438283:19438418:1 gene:ENSG00000201523 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT107992 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001546 // RefSeq // Homo sapiens inhibitor of DNA binding 4, dominant negative helix-loop-helix protein (ID4), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000378700 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:19837386:19840684:1 gene:ENSG00000172201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC014941 // GenBank // Homo sapiens inhibitor of DNA binding 4, dominant negative helix-loop-helix protein, mRNA (cDNA clone MGC:20126 IMAGE:4552357), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// U28368 // GenBank // Human Id-related helix-loop-helix protein Id4 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// U16153 // GenBank // Human Id-4H protein mRNA, complete cds. // chr6 // 71 // 64 // 10 // 14 // 0 /// ENST00000618493 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:19837441:19839430:1 gene:ENSG00000172201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 87 // 68 // 13 // 15 // 0 /// GENSCAN00000013061 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:19837755:19838628:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 45 // 10 // 10 // 0
NM_001243076 // RefSeq // Homo sapiens E2F transcription factor 3 (E2F3), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// NM_001949 // RefSeq // Homo sapiens E2F transcription factor 3 (E2F3), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000346618 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:20402167:20493715:1 gene:ENSG00000112242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000535432 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:20403679:20493714:1 gene:ENSG00000112242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// BC099908 // GenBank // Homo sapiens E2F transcription factor 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:30531209), complete cds. // chr6 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// BC114554 // GenBank // Homo sapiens E2F transcription factor 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:40054034), complete cds. // chr6 // 100 // 76 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000613242 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:20401906:20493714:1 gene:ENSG00000112242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0
ENST00000364813 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:6:20500175:20500276:1 gene:ENSG00000201683 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT108029 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
AF090895 // GenBank // Homo sapiens clone HQ0117 PRO0117 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_003107 // RefSeq // Homo sapiens SRY (sex determining region Y)-box 4 (SOX4), mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000244745 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:21592769:21598619:1 gene:ENSG00000124766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// BC072668 // GenBank // Homo sapiens SRY (sex determining region Y)-box 4, mRNA (cDNA clone MGC:71240 IMAGE:6584346), complete cds. // chr6 // 100 // 70 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000035303 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:21594535:21595959:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 65 // 24 // 24 // 0 /// BC021970 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3937344, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr6 // 32 // 32 // 12 // 37 // 1
ENST00000410583 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:22085544:22085918:1 gene:ENSG00000222515 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT108058 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_138574 // RefSeq // Homo sapiens hepatoma derived growth factor-like 1 (HDGFL1), mRNA. // chr6 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000510882 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:22569493:22571666:1 gene:ENSG00000112273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AK056824 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ32262 fis, clone PROST1000362, moderately similar to HEPATOMA-DERIVED GROWTH FACTOR. // chr6 // 91 // 100 // 30 // 33 // 0 /// AK302110 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50911 complete cds, moderately similar to Homo sapiens hepatoma derived growth factor-like 1 (HDGFL1), mRNA. // chr6 // 67 // 67 // 22 // 33 // 1 /// GENSCAN00000001658 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:22564635:22570331:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0
NM_080723 // RefSeq // Homo sapiens neurensin 1 (NRSN1), mRNA. // chr6 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000378477 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:24126240:24145876:1 gene:ENSG00000152954 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 43 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000378478 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:24126186:24147529:1 gene:ENSG00000152954 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000378491 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:24126122:24147411:1 gene:ENSG00000152954 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF418980 // GenBank // Homo sapiens vesicular membrane protein P24 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// AK096290 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ38971 fis, clone NT2RI2002540, highly similar to Mouse mRNA for P24 protein. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC023514 // GenBank // Homo sapiens neurensin 1, mRNA (cDNA clone MGC:12874 IMAGE:4128341), complete cds. // chr6 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029777 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:24107486:24145946:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0
ENST00000516021 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:6:24166273:24166374:1 gene:ENSG00000251830 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT108107 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_181337 // RefSeq // Homo sapiens kidney associated antigen 1 (KAAG1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000274766 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:24356903:24358284:1 gene:ENSG00000146049 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF181722 // GenBank // Homo sapiens RU2AS (RU2) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000365180 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:24365651:24365754:1 gene:ENSG00000202050 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT108108 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001160094 // RefSeq // Homo sapiens acyl-CoA thioesterase 13 (ACOT13), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_018473 // RefSeq // Homo sapiens acyl-CoA thioesterase 13 (ACOT13), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000230048 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:24667071:24705046:1 gene:ENSG00000112304 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000537591 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:24667035:24705065:1 gene:ENSG00000112304 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF220186 // GenBank // Homo sapiens uncharacterized hypothalamus protein HT012 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF274952 // GenBank // Homo sapiens PNAS-27 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC000894 // GenBank // Homo sapiens thioesterase superfamily member 2, mRNA (cDNA clone MGC:4961 IMAGE:3464165), complete cds. // chr6 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000476436 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:24687402:24701714:1 gene:ENSG00000112304 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1 /// NONHSAT108119 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1
ENST00000405676 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:25140003:25141403:1 gene:ENSG00000219682 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 88 // 7 // 7 // 0 /// GENSCAN00000019794 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:25140084:25141403:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 7 // 7 // 0
NONHSAT108143 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000493462 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:25261239:25261731:1 gene:ENSG00000216718 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000019799 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:25261239:25261730:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001173977 // RefSeq // Homo sapiens leucine rich repeat containing 16A (LRRC16A), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 86 // 42 // 42 // 0 /// NM_017640 // RefSeq // Homo sapiens leucine rich repeat containing 16A (LRRC16A), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 86 // 42 // 42 // 0 /// XM_006715139 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens leucine rich repeat containing 16A (LRRC16A), transcript variant X5, mRNA. // chr6 // 100 // 61 // 30 // 30 // 0 /// XM_006715140 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens leucine rich repeat containing 16A (LRRC16A), transcript variant X6, mRNA. // chr6 // 100 // 61 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000329474 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:6:25279428:25620530:1 gene:ENSG00000079691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 86 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000461945 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:25279078:25452597:1 gene:ENSG00000079691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 24 // 12 // 12 // 0 /// AK125696 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ43708 fis, clone TESOP2001953. // chr6 // 89 // 37 // 16 // 18 // 0 /// BC040903 // GenBank // Homo sapiens leucine rich repeat containing 16A, mRNA (cDNA clone IMAGE:5744007), partial cds. // chr6 // 92 // 27 // 12 // 13 // 0 /// BC140770 // GenBank // Homo sapiens leucine rich repeat containing 16A, mRNA (cDNA clone MGC:176447 IMAGE:9021638), complete cds. // chr6 // 90 // 86 // 38 // 42 // 0 /// FJ009082 // GenBank // Homo sapiens CARMIL1a (LRRC16A) mRNA, complete cds. // chr6 // 92 // 80 // 36 // 39 // 0 /// GENSCAN00000019796 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:25461419:25619583:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 55 // 27 // 27 // 0
ENST00000384759 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:25383599:25383702:1 gene:ENSG00000207490 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT108155 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NONHSAT108159 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_006998 // RefSeq // Homo sapiens secretagogin, EF-hand calcium binding protein (SCGN), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000334979 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:25652404:25701335:1 gene:ENSG00000079689 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000377961 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:25652236:25701783:1 gene:ENSG00000079689 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AF420280 // GenBank // Homo sapiens setagin mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr6 // 95 // 79 // 18 // 19 // 0 /// AK289477 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75349 complete cds, highly similar to Homo sapiens secretagogin, EF-hand calcium binding protein (SCGN),mRNA. // chr6 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// BC000336 // GenBank // Homo sapiens secretagogin, EF-hand calcium binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:8532 IMAGE:2822613), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC003036 // GenBank // Homo sapiens secretagogin, EF-hand calcium binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:4356 IMAGE:2822613), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// Y16752 // GenBank // Homo sapiens mRNA for secretagogin, complete CDS. // chr6 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// ENST00000612225 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:25652201:25701774:1 gene:ENSG00000079689 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000019804 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:25652404:25701335:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0
NM_170610 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 1, H2ba (HIST1H2BA), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000274764 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:25726909:25727292:1 gene:ENSG00000146047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 95 // 79 // 18 // 19 // 0 /// AK312055 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ92336, Homo sapiens testis-specific histone H2B (TSH2B), mRNA. // chr6 // 95 // 79 // 18 // 19 // 0 /// BC066238 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H2ba, mRNA (cDNA clone MGC:79328 IMAGE:7002047), complete cds. // chr6 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 /// BC066241 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H2ba, mRNA (cDNA clone MGC:79331 IMAGE:7002054), complete cds. // chr6 // 79 // 100 // 19 // 24 // 0 /// BC066242 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H2ba, mRNA (cDNA clone MGC:79332 IMAGE:7002055), complete cds. // chr6 // 79 // 100 // 19 // 24 // 0 /// BC066239 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H2ba, mRNA (cDNA clone MGC:79329 IMAGE:7002048), complete cds. // chr6 // 71 // 100 // 17 // 24 // 0 /// BC066240 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H2ba, mRNA (cDNA clone MGC:79330 IMAGE:7002052), complete cds. // chr6 // 67 // 100 // 16 // 24 // 0 /// GENSCAN00000019795 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:25726909:25732745:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 95 // 79 // 18 // 19 // 0
XM_006714946 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens solute carrier family 17, member 4 (SLC17A4), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 59 // 23 // 23 // 0 /// BC109207 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 17 (sodium phosphate), member 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:40006613), complete cds. // chr6 // 100 // 62 // 24 // 24 // 0 /// BC109208 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 17 (sodium phosphate), member 4, mRNA (cDNA clone MGC:129623 IMAGE:40006623), complete cds. // chr6 // 100 // 69 // 27 // 27 // 0 /// NM_001286121 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 17, member 4 (SLC17A4), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 90 // 90 // 35 // 39 // 1 /// NM_005495 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 17, member 4 (SLC17A4), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 90 // 90 // 35 // 39 // 1 /// ENST00000377905 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:25754699:25781191:1 gene:ENSG00000146039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 90 // 90 // 35 // 39 // 1 /// ENST00000439485 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:25754699:25781174:1 gene:ENSG00000146039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 90 // 90 // 35 // 39 // 1 /// AB020527 // GenBank // Homo sapiens mRNA for Na/PO4 cotransporter homolog, complete cds. // chr6 // 79 // 79 // 31 // 39 // 1 /// ENST00000397076 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:25761923:25779500:1 gene:ENSG00000146039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 62 // 62 // 24 // 39 // 1 /// AK293354 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50112 complete cds, highly similar to Homo sapiens solute carrier family 17 (sodium phosphate), member 4 (SLC17A4), mRNA. // chr6 // 41 // 41 // 16 // 39 // 1 /// GENSCAN00000019802 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:25761963:25779188:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 51 // 20 // 20 // 0
NM_006355 // RefSeq // Homo sapiens tripartite motif containing 38 (TRIM38), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XR_241880 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens tripartite motif containing 38 (TRIM38), transcript variant X3, misc_RNA. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000357085 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:25962802:25987156:1 gene:ENSG00000112343 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AB209906 // GenBank // Homo sapiens mRNA for tripartite motif-containing 38 variant protein. // chr6 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// BC026930 // GenBank // Homo sapiens tripartite motif-containing 38, mRNA (cDNA clone MGC:8946 IMAGE:3879491), complete cds. // chr6 // 96 // 96 // 22 // 23 // 0 /// BX640949 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686F23130 (from clone DKFZp686F23130). // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// U90547 // GenBank // Human Ro/SSA ribonucleoprotein homolog (RoRet) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000029817 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:25971869:25992200:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 42 // 10 // 10 // 0
NM_003529 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 1, H3a (HIST1H3A), mRNA. // chr6 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// BC066245 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H3a, mRNA (cDNA clone MGC:79340 IMAGE:7002068), complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// BC066246 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H3a, mRNA (cDNA clone MGC:79341 IMAGE:7002069), complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// BC066247 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H3a, mRNA (cDNA clone MGC:79342 IMAGE:7002070), complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// BC067490 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H3a, mRNA (cDNA clone MGC:79343 IMAGE:7002071), complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// BC067491 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H3a, mRNA (cDNA clone MGC:79344 IMAGE:7002072), complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// BC069303 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H3a, mRNA (cDNA clone MGC:97421 IMAGE:7262697), complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// CR541858 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834H0632D for gene HIST1H3A, histone 1, H3a; complete cds, incl. stopcodon. // chr6 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000613854 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:26020490:26020900:1 gene:ENSG00000275714 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000029849 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:26020490:26020900:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0
NM_003538 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 1, H4a (HIST1H4A), mRNA. // chr6 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC066248 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H4a, mRNA (cDNA clone MGC:79349 IMAGE:7002088), complete cds. // chr6 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC066249 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H4a, mRNA (cDNA clone MGC:79350 IMAGE:7002089), complete cds. // chr6 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC067495 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H4a, mRNA (cDNA clone MGC:79351 IMAGE:7002090), complete cds. // chr6 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC069654 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H4a, mRNA (cDNA clone MGC:97476 IMAGE:7262752), complete cds. // chr6 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000454320 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:26043989:26044357:1 gene:ENSG00000234816 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr6 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000617569 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:26021679:26021990:1 gene:ENSG00000278637 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 92 // 48 // 11 // 12 // 0 /// GENSCAN00000029858 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:26021679:26021990:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 92 // 48 // 11 // 12 // 0 /// NONHSAT108206 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
NM_003531 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 1, H3c (HIST1H3C), mRNA. // chr6 // 100 // 80 // 33 // 33 // 0 /// BC127610 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H3c, mRNA (cDNA clone MGC:156109 IMAGE:40002514), complete cds. // chr6 // 100 // 80 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000612966 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:26045411:26045821:1 gene:ENSG00000278272 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 73 // 54 // 16 // 22 // 0 /// GENSCAN00000029856 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:26045411:26045821:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 73 // 54 // 16 // 22 // 0
NM_003542 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 1, H4c (HIST1H4C), mRNA. // chr6 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000377803 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:26103876:26104310:1 gene:ENSG00000197061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC054014 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H4c, mRNA (cDNA clone MGC:61831 IMAGE:6499185), complete cds. // chr6 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// BC130558 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H4c, mRNA (cDNA clone MGC:163430 IMAGE:40146589), complete cds. // chr6 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// BC130560 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H4c, mRNA (cDNA clone MGC:163432 IMAGE:40146591), complete cds. // chr6 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000029832 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:26087441:26104259:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 92 // 57 // 11 // 12 // 0
NM_003512 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 1, H2ac (HIST1H2AC), mRNA. // chr6 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000314088 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:26124145:26139116:1 gene:ENSG00000180573 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000377791 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:26124145:26139102:1 gene:ENSG00000180573 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// ENST00000602637 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:26124203:26139084:1 gene:ENSG00000180573 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 75 // 74 // 15 // 20 // 0 /// BC085010 // GenBank HTC // Homo sapiens histone cluster 1, H2ac, mRNA (cDNA clone IMAGE:5933682). // chr6 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// U90551 // GenBank // Human histone 2A-like protein (H2A/l) mRNA, complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000029844 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:26124233:26124625:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0
NM_005321 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 1, H1e (HIST1H1E), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000304218 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:26156391:26157050:1 gene:ENSG00000168298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 63 // 12 // 12 // 0 /// BC096168 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H1e, mRNA (cDNA clone MGC:116818 IMAGE:40003408), complete cds. // chr6 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0 /// BC096169 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H1e, mRNA (cDNA clone MGC:116820 IMAGE:40003411), complete cds. // chr6 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0 /// BC096170 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H1e, mRNA (cDNA clone MGC:116821 IMAGE:40003413), complete cds. // chr6 // 88 // 84 // 14 // 16 // 0 /// BC099632 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H1e, mRNA (cDNA clone MGC:116819 IMAGE:40003410), complete cds. // chr6 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0 /// EF065554 // GenBank // Homo sapiens liver histone H1e mRNA, complete cds. // chr6 // 85 // 68 // 11 // 13 // 0 /// EF065555 // GenBank // Homo sapiens histone H1e mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 68 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000029826 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:26156391:26157050:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 63 // 12 // 12 // 0
NM_138720 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 1, H2bd (HIST1H2BD), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 92 // 65 // 12 // 13 // 0 /// ENST00000289316 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:26158146:26171349:1 gene:ENSG00000158373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 92 // 65 // 12 // 13 // 0 /// ENST00000377777 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:26158146:26158641:1 gene:ENSG00000158373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 92 // 65 // 12 // 13 // 0 /// AK292712 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78520 complete cds, highly similar to Homo sapiens histone 1, H2bn (HIST1H2BN), mRNA. // chr6 // 82 // 55 // 9 // 11 // 0 /// BC002842 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H2bd, mRNA (cDNA clone MGC:3802 IMAGE:3659807), complete cds. // chr6 // 92 // 65 // 12 // 13 // 0 /// NM_021063 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 1, H2bd (HIST1H2BD), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 73 // 55 // 8 // 11 // 0
NM_003523 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 1, H2be (HIST1H2BE), mRNA. // chr6 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// BC101748 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H2be, mRNA (cDNA clone MGC:126797 IMAGE:8069254), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC101750 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H2be, mRNA (cDNA clone MGC:126799 IMAGE:8069256), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_003522 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 1, H2bf (HIST1H2BF), mRNA. // chr6 // 100 // 61 // 23 // 23 // 0 /// BC056264 // GenBank // Homo sapiens histone 1, H2bg, mRNA (cDNA clone IMAGE:6668499), partial cds. // chr6 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC096120 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H2bf, mRNA (cDNA clone MGC:116766 IMAGE:40002352), complete cds. // chr6 // 100 // 61 // 23 // 23 // 0 /// BC096123 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H2bf, mRNA (cDNA clone MGC:116769 IMAGE:40002357), complete cds. // chr6 // 100 // 61 // 23 // 23 // 0
NM_003545 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 1, H4e (HIST1H4E), mRNA. // chr6 // 100 // 50 // 11 // 11 // 0 /// AK312153 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ92438, Homo sapiens histone 1, H4e (HIST1H4E), mRNA. // chr6 // 92 // 55 // 11 // 12 // 0 /// CR542180 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834B1224D for gene HIST1H4F, histone 1, H4f; complete cds, incl. stopcodon. // chr6 // 100 // 36 // 8 // 8 // 0 /// CR542189 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834F0524D for gene HIST1H4F, histone 1, H4f; complete cds, without stopcodon. // chr6 // 100 // 36 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000615164 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:26204645:26204956:1 gene:ENSG00000276966 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 36 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000029812 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:26202373:26204956:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 55 // 12 // 12 // 0
NM_021052 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 1, H2ae (HIST1H2AE), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000303910 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:26216975:26217367:1 gene:ENSG00000277075 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSG00000168274 // chr6 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// BC093836 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H2ae, mRNA (cDNA clone MGC:120871 IMAGE:7939681), complete cds. // chr6 // 91 // 41 // 10 // 11 // 0 /// BC093862 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H2ae, mRNA (cDNA clone MGC:120897 IMAGE:7939707), complete cds. // chr6 // 91 // 41 // 10 // 11 // 0 /// GENSCAN00000029843 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:26216975:26217367:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0
NM_003532 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 1, H3e (HIST1H3E), mRNA. // chr6 // 100 // 56 // 28 // 28 // 0 /// AK313905 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ94542, Homo sapiens histone 1, H3e (HIST1H3E), mRNA. // chr6 // 87 // 30 // 13 // 15 // 0
NM_003540 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 1, H4f (HIST1H4F), mRNA. // chr6 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000244537 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:26240426:26240737:1 gene:ENSG00000274618 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSG00000124578 // chr6 // 100 // 77 // 17 // 17 // 0 /// BC069288 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H4f, mRNA (cDNA clone MGC:97393 IMAGE:7262669), complete cds. // chr6 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// BC093763 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H4f, mRNA (cDNA clone MGC:120798 IMAGE:7939608), complete cds. // chr6 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// BC093765 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H4f, mRNA (cDNA clone MGC:120800 IMAGE:7939610), complete cds. // chr6 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000029814 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:26240426:26240737:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 77 // 17 // 17 // 0
NM_003524 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 1, H2bh (HIST1H2BH), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// AK310576 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17618. // chr6 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0 /// AK312052 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ92333, Homo sapiens histone 1, H2bh (HIST1H2BH), mRNA. // chr6 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0 /// BC096116 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H2bh, mRNA (cDNA clone MGC:116762 IMAGE:40002316), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC096117 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H2bh, mRNA (cDNA clone MGC:116763 IMAGE:40002317), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC096118 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H2bh, mRNA (cDNA clone MGC:116764 IMAGE:40002318), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC096119 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H2bh, mRNA (cDNA clone MGC:116765 IMAGE:40002319), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000619466 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:26251651:26252031:1 gene:ENSG00000275713 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000029845 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:26251651:26252031:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0
NM_003525 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 1, H2bi (HIST1H2BI), mRNA. // chr6 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// BC101653 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H2bi, mRNA (cDNA clone MGC:126702 IMAGE:8069159), complete cds. // chr6 // 83 // 96 // 20 // 24 // 0 /// BC101655 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H2bi, mRNA (cDNA clone MGC:126704 IMAGE:8069161), complete cds. // chr6 // 83 // 96 // 20 // 24 // 0
ENST00000377662 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:26422119:26431615:1 gene:ENSG00000124549 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr6 // 87 // 87 // 20 // 23 // 1 /// NR_027795 // RefSeq // Homo sapiens butyrophilin, subfamily 2, member A3, pseudogene (BTN2A3P), non-coding RNA. // chr6 // 52 // 52 // 12 // 23 // 1 /// ENST00000465856 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:26421391:26430588:1 gene:ENSG00000124549 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 52 // 52 // 12 // 23 // 1 /// ENST00000466808 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:26422119:26432383:1 gene:ENSG00000124549 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 74 // 74 // 17 // 23 // 1 /// BC143636 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:9052149. // chr6 // 70 // 70 // 16 // 23 // 1 /// GENSCAN00000029860 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:26422119:26468549:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 61 // 61 // 14 // 23 // 1
NM_001732 // RefSeq // Homo sapiens butyrophilin, subfamily 1, member A1 (BTN1A1), mRNA. // chr6 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// XM_005249341 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens butyrophilin, subfamily 1, member A1 (BTN1A1), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000244513 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:26501221:26510422:1 gene:ENSG00000124557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC096312 // GenBank // Homo sapiens butyrophilin, subfamily 1, member A1, mRNA (cDNA clone MGC:116990 IMAGE:40007624), complete cds. // chr6 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// BC096313 // GenBank // Homo sapiens butyrophilin, subfamily 1, member A1, mRNA (cDNA clone MGC:116991 IMAGE:40007625), complete cds. // chr6 // 96 // 79 // 22 // 23 // 0 /// BC096314 // GenBank // Homo sapiens butyrophilin, subfamily 1, member A1, mRNA (cDNA clone MGC:116992 IMAGE:40007626), complete cds. // chr6 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// BC096315 // GenBank // Homo sapiens butyrophilin, subfamily 1, member A1, mRNA (cDNA clone MGC:116993 IMAGE:40007627), complete cds. // chr6 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// U39576 // GenBank // Human butyrophilin precursor mRNA, complete cds. // chr6 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0 /// ENST00000613186 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:26501267:26509935:1 gene:ENSG00000124557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000029857 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:26485832:26509174:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0
U90549 // GenBank // Human non-histone chromosomal protein (NHC) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// NM_006353 // RefSeq // Homo sapiens high mobility group nucleosomal binding domain 4 (HMGN4), mRNA. // chr6 // 92 // 92 // 24 // 26 // 1 /// BC001282 // GenBank // Homo sapiens high mobility group nucleosomal binding domain 4, mRNA (cDNA clone MGC:5145 IMAGE:3452950), complete cds. // chr6 // 88 // 88 // 23 // 26 // 1 /// ENST00000377575 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:26538405:26546254:1 gene:ENSG00000182952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_013375 // RefSeq // Homo sapiens activator of basal transcription 1 (ABT1), mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000274849 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:26596952:26600744:1 gene:ENSG00000146109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// AB027258 // GenBank // Homo sapiens mRNA for basal transcriptional activator hABT1, complete cds. // chr6 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// BC048812 // GenBank // Homo sapiens activator of basal transcription 1, mRNA (cDNA clone MGC:51778 IMAGE:5574755), complete cds. // chr6 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// BC066313 // GenBank // Homo sapiens activator of basal transcription 1, mRNA (cDNA clone MGC:87175 IMAGE:5272771), complete cds. // chr6 // 95 // 83 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000029853 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:26556034:26598645:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 67 // 67 // 16 // 24 // 1
NM_021064 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 1, H2ag (HIST1H2AG), mRNA. // chr6 // 91 // 44 // 10 // 11 // 0 /// ENST00000359193 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:27133042:27135291:1 gene:ENSG00000196787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC016677 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H2ag, mRNA (cDNA clone MGC:17204 IMAGE:4342191), complete cds. // chr6 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC067782 // GenBank // Homo sapiens histone 1, H2ag, mRNA (cDNA clone IMAGE:5314244), partial cds. // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// L19778 // GenBank // Homo sapiens histone H2A.1b mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048844 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:27133072:27134008:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_003495 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 1, H4i (HIST1H4I), mRNA. // chr6 // 100 // 45 // 9 // 9 // 0 /// BC066250 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H4i, mRNA (cDNA clone MGC:79353 IMAGE:7002105), complete cds. // chr6 // 100 // 40 // 8 // 8 // 0 /// BC067497 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H4i, mRNA (cDNA clone MGC:79354 IMAGE:7002106), complete cds. // chr6 // 100 // 40 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000615353 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:27138588:27139881:1 gene:ENSG00000276180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 88 // 85 // 15 // 17 // 0
NM_080596 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 1, H2ah (HIST1H2AH), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC093849 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H2ah, mRNA (cDNA clone MGC:120884 IMAGE:7939694), complete cds. // chr6 // 81 // 100 // 17 // 21 // 0 /// BC093851 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H2ah, mRNA (cDNA clone MGC:120886 IMAGE:7939696), complete cds. // chr6 // 81 // 100 // 17 // 21 // 0 /// BC134366 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H2ah, mRNA (cDNA clone MGC:158907 IMAGE:40021708), complete cds. // chr6 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// BC148293 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H2ah, mRNA (cDNA clone MGC:171151 IMAGE:40021709), complete cds. // chr6 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000377459 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:27147129:27147515:1 gene:ENSG00000274997 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSG00000184825 // chr6 // 73 // 52 // 8 // 11 // 0 /// GENSCAN00000048872 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:27147129:27147515:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 73 // 52 // 8 // 11 // 0
NR_045612 // RefSeq // Homo sapiens vomeronasal 1 receptor 10 pseudogene (VN1R10P), non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000447106 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:27324894:27325768:1 gene:ENSG00000220758 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr6 // 100 // 52 // 11 // 11 // 0 /// BC107050 // GenBank // Homo sapiens FKSG83, mRNA (cDNA clone MGC:129573 IMAGE:40004452), complete cds. // chr6 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT108362 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT147386 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 52 // 11 // 11 // 0
ENST00000461521 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:27388992:27400769:1 gene:ENSG00000124613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 92 // 24 // 11 // 12 // 0 /// AK092633 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ35314 fis, clone PROST2010606. // chr6 // 92 // 50 // 23 // 25 // 0 /// NM_001076781 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 391 (ZNF391), mRNA. // chr6 // 76 // 76 // 38 // 50 // 1 /// ENST00000244576 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:27388718:27403904:1 gene:ENSG00000124613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 76 // 76 // 38 // 50 // 1 /// AK294965 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60252 complete cds, moderately similar to Zinc finger protein 135. // chr6 // 76 // 76 // 38 // 50 // 1 /// GENSCAN00000048861 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:27400371:27401447:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 50 // 25 // 25 // 0
ENST00000417812 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:27407697:27407996:1 gene:ENSG00000237154 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000048853 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:27407754:27407996:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 68 // 13 // 13 // 0
ENST00000383944 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:27596412:27596517:1 gene:ENSG00000206671 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT108390 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_003509 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 1, H2ai (HIST1H2AI), mRNA. // chr6 // 100 // 67 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000358739 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:27808199:27808701:1 gene:ENSG00000196747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 67 // 10 // 10 // 0 /// BC112254 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H2ai, mRNA (cDNA clone MGC:138459 IMAGE:8327722), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC112256 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H2ai, mRNA (cDNA clone MGC:138461 IMAGE:8327724), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_003536 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 1, H3h (HIST1H3H), mRNA. // chr6 // 91 // 50 // 10 // 11 // 0 /// ENST00000369163 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:27810064:27811300:1 gene:ENSG00000278828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSG00000203813 // chr6 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// BC007518 // GenBank HTC // Homo sapiens histone cluster 1, H3h, mRNA (cDNA clone IMAGE:3030790). // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC096128 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H3h, mRNA (cDNA clone MGC:116774 IMAGE:40002508), complete cds. // chr6 // 91 // 50 // 10 // 11 // 0 /// BC096129 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H3h, mRNA (cDNA clone MGC:116775 IMAGE:40002509), complete cds. // chr6 // 91 // 50 // 10 // 11 // 0 /// BC096130 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H3h, mRNA (cDNA clone MGC:116776 IMAGE:40002510), complete cds. // chr6 // 91 // 50 // 10 // 11 // 0 /// BC143046 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H3h, mRNA (cDNA clone MGC:165323 IMAGE:40112088), complete cds. // chr6 // 91 // 50 // 10 // 11 // 0 /// BC148243 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H3h, mRNA (cDNA clone MGC:165244 IMAGE:40082529), complete cds. // chr6 // 91 // 50 // 10 // 11 // 0 /// BC148250 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H3h, mRNA (cDNA clone MGC:165298 IMAGE:40002516), complete cds. // chr6 // 91 // 50 // 10 // 11 // 0 /// GENSCAN00000048860 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:27808210:27810484:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 45 // 45 // 10 // 22 // 1
NM_003521 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 1, H2bm (HIST1H2BM), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC066244 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H2bm, mRNA (cDNA clone MGC:79335 IMAGE:7002058), complete cds. // chr6 // 82 // 100 // 14 // 17 // 0 /// BC067486 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H2bm, mRNA (cDNA clone MGC:79336 IMAGE:7002060), complete cds. // chr6 // 88 // 100 // 15 // 17 // 0 /// BC067489 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H2bm, mRNA (cDNA clone MGC:79339 IMAGE:7002066), complete cds. // chr6 // 88 // 100 // 15 // 17 // 0 /// BC067487 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H2bm, mRNA (cDNA clone MGC:79337 IMAGE:7002064), complete cds. // chr6 // 65 // 100 // 11 // 17 // 0 /// BC067488 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H2bm, mRNA (cDNA clone MGC:79338 IMAGE:7002065), complete cds. // chr6 // 65 // 100 // 11 // 17 // 0 /// ENST00000621112 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:27815044:27815424:1 gene:ENSG00000273703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 83 // 71 // 10 // 12 // 0 /// GENSCAN00000048850 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:27815044:27824436:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 83 // 71 // 10 // 12 // 0
NM_003520 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 1, H2bn (HIST1H2BN), mRNA. // chr6 // 100 // 36 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000449538 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:27838545:27852204:1 gene:ENSG00000233822 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 89 // 41 // 8 // 9 // 0 /// AK130106 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ26596 fis, clone LNF08501. // chr6 // 100 // 73 // 16 // 16 // 0 /// BC009783 // GenBank HTC // Homo sapiens histone cluster 1, H2bn, mRNA (cDNA clone IMAGE:4132165), with apparent retained intron. // chr6 // 89 // 41 // 8 // 9 // 0 /// ENST00000606613 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:6:27838601:27855709:1 gene:ENSG00000233822 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 50 // 50 // 11 // 22 // 1 /// BC011372 // GenBank HTC // Homo sapiens histone cluster 1, H2bn, mRNA (cDNA clone IMAGE:3871305), with apparent retained intron. // chr6 // 50 // 50 // 11 // 22 // 1 /// ENST00000612898 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:27837760:27839482:1 gene:ENSG00000233822 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 73 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000048851 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:27838662:27865747:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 36 // 36 // 8 // 22 // 1
NM_003511 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 1, H2al (HIST1H2AL), mRNA. // chr6 // 94 // 71 // 30 // 32 // 0 /// BC069306 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H2al, mRNA (cDNA clone MGC:97481 IMAGE:7262757), complete cds. // chr6 // 94 // 71 // 30 // 32 // 0 /// BC105129 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H2ai, mRNA (cDNA clone MGC:132789 IMAGE:8144132), complete cds. // chr6 // 98 // 100 // 44 // 45 // 0 /// BC112072 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H2al, mRNA (cDNA clone MGC:138277 IMAGE:8327540), complete cds. // chr6 // 98 // 100 // 44 // 45 // 0 /// ENST00000396980 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:27838662:27865798:1 gene:ENSG00000233822 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 22 // 22 // 10 // 45 // 1 /// ENST00000613174 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:27865355:27865747:1 gene:ENSG00000276903 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 56 // 40 // 10 // 18 // 0 /// GENSCAN00000048851 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:27838662:27865747:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 65 // 51 // 15 // 23 // 0
NM_003527 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 1, H2bo (HIST1H2BO), mRNA. // chr6 // 93 // 61 // 13 // 14 // 0 /// BC106720 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H2bo, mRNA (cDNA clone MGC:119806 IMAGE:40014271), complete cds. // chr6 // 89 // 39 // 8 // 9 // 0 /// BX647290 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp781B2436 (from clone DKFZp781B2436). // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENST00000439689 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:27937465:27938403:1 gene:ENSG00000168126 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000048840 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:27937591:27938403:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 65 // 11 // 11 // 0
NM_012367 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily B, member 6 (OR2B6), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000244623 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:27957241:27958182:1 gene:ENSG00000124657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC109251 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily B, member 6, mRNA (cDNA clone MGC:129828 IMAGE:40023640), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC110457 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily B, member 6, mRNA (cDNA clone MGC:120190 IMAGE:40022996), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000048870 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:27957592:27965456:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 48 // 10 // 10 // 0
ENST00000362981 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:6:28015568:28015777:1 gene:ENSG00000199851 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT108423 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000429302 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:28046434:28047367:1 gene:ENSG00000187763 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000027416 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:28046786:28047415:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 50 // 11 // 11 // 0
ENST00000402365 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:28073316:28074233:1 gene:ENSG00000220721 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_003447 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 165 (ZNF165), mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006715179 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens zinc finger protein 165 (ZNF165), transcript variant X4, mRNA. // chr6 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000377325 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:28080975:28089563:1 gene:ENSG00000197279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// AK292371 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76430 complete cds, highly similar to Homo sapiens zinc finger protein 165 (ZNF165), mRNA. // chr6 // 94 // 64 // 17 // 18 // 0 /// AY083664 // GenBank // Homo sapiens HCG1 protein mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY366500 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 165 (ZNF165) mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr6 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// BC037779 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 165, mRNA (cDNA clone MGC:41869 IMAGE:5272359), complete cds. // chr6 // 94 // 64 // 17 // 18 // 0 /// U78722 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 165 (Zpf165) mRNA, complete cds. // chr6 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// BC026092 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 165, mRNA (cDNA clone MGC:27105 IMAGE:4837021), complete cds. // chr6 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// GENSCAN00000027409 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:28073556:28116412:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_025231 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger and SCAN domain containing 16 (ZSCAN16), mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_005249426 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens zinc finger and SCAN domain containing 16 (ZSCAN16), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000340487 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:28124560:28130082:1 gene:ENSG00000196812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC004255 // GenBank // Homo sapiens zinc finger and SCAN domain containing 16, mRNA (cDNA clone MGC:10653 IMAGE:3609511), complete cds. // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AK294017 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60044 complete cds, highly similar to Zinc finger protein 435. // chr6 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// GENSCAN00000027387 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:28125444:28129950:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 89 // 69 // 16 // 18 // 0
NM_001007531 // RefSeq // Homo sapiens NFKB activating protein-like (NKAPL), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000343684 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:28259320:28260958:1 gene:ENSG00000189134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF085870 // GenBank // Homo sapiens full length insert cDNA clone YN97H09. // chr6 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// BC038240 // GenBank // Homo sapiens NFKB activating protein-like, mRNA (cDNA clone MGC:46351 IMAGE:5766894), complete cds. // chr6 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// BC101681 // GenBank // Homo sapiens NFKB activating protein-like, mRNA (cDNA clone MGC:126730 IMAGE:8069187), complete cds. // chr6 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC101685 // GenBank // Homo sapiens NFKB activating protein-like, mRNA (cDNA clone MGC:126734 IMAGE:8069191), complete cds. // chr6 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000027390 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:28259372:28260580:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_001184743 // RefSeq // Homo sapiens piggyBac transposable element derived 1 (PGBD1), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_032507 // RefSeq // Homo sapiens piggyBac transposable element derived 1 (PGBD1), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000259883 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:28281572:28302549:1 gene:ENSG00000137338 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK291228 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76829 complete cds, highly similar to Homo sapiens piggyBac transposable element derived 1 (PGBD1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC032507 // GenBank // Homo sapiens piggyBac transposable element derived 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5245774). // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC128585 // GenBank // Homo sapiens piggyBac transposable element derived 1, mRNA (cDNA clone MGC:157743 IMAGE:40128523), complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// D88259 // GenBank // Homo sapiens hucep-4 mRNA for cerebral protein-4, complete cds. // chr6 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// BC019876 // GenBank HTC // Homo sapiens piggyBac transposable element derived 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5113009), with apparent retained intron. // chr6 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000027392 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:28271920:28302284:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
ENST00000489116 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:28446973:28447807:1 gene:ENSG00000231162 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
ENST00000377171 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:29100609:29101881:1 gene:ENSG00000204702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000427659 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR6_MHC_MCF_CTG1:29100753:29102025:1 gene:ENSG00000226931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 63 // 100 // 5 // 8 // 0
ENST00000365371 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:30864250:30864552:1 gene:ENSG00000202241 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 79 // 100 // 15 // 19 // 0 /// ENST00000581577 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR6_MHC_COX_CTG1:30854117:30854419:1 gene:ENSG00000265903 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 79 // 100 // 15 // 19 // 0 /// ENST00000581605 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR6_MHC_DBB_CTG1:30854930:30855232:1 gene:ENSG00000265255 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 79 // 100 // 15 // 19 // 0 /// ENST00000583754 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR6_MHC_MANN_CTG1:30908902:30909204:1 gene:ENSG00000266263 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 79 // 100 // 15 // 19 // 0 /// NONHSAT108687 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 79 // 100 // 15 // 19 // 0 /// NONHSAT116661 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 79 // 100 // 15 // 19 // 0 /// NONHSAT117011 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 79 // 100 // 15 // 19 // 0 /// NONHSAT117362 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 79 // 100 // 15 // 19 // 0 /// ENST00000581358 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR6_MHC_QBL_CTG1:30853833:30854135:1 gene:ENSG00000264415 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 74 // 100 // 14 // 19 // 0 /// ENST00000581402 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR6_MHC_MCF_CTG1:30942815:30943117:1 gene:ENSG00000265633 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 74 // 100 // 14 // 19 // 0 /// NONHSAT117660 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 74 // 100 // 14 // 19 // 0 /// NONHSAT118020 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 74 // 100 // 14 // 19 // 0
ENST00000464084 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR6_MHC_DBB_CTG1:30898953:30917183:1 gene:ENSG00000230985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000469311 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR6_MHC_MANN_CTG1:30952885:30971104:1 gene:ENSG00000223494 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000469489 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR6_MHC_COX_CTG1:30898107:30916176:1 gene:ENSG00000236178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 92 // 100 // 11 // 12 // 0 /// ENST00000475673 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR6_MHC_QBL_CTG1:30897815:30916043:1 gene:ENSG00000206476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000477288 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:30908242:30926459:1 gene:ENSG00000137411 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000493326 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR6_MHC_MCF_CTG1:30986796:31005022:1 gene:ENSG00000234032 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// AB209479 // GenBank // Homo sapiens premature mRNA for VARS2L protein variant. // chr6 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
ENST00000364788 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:31370134:31370240:1 gene:ENSG00000201658 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000581308 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR6_MHC_COX_CTG1:31360589:31360695:1 gene:ENSG00000264185 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000577780 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR6_MHC_MANN_CTG1:31413150:31413256:1 gene:ENSG00000263701 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000581846 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR6_MHC_QBL_CTG1:31360234:31360340:1 gene:ENSG00000266886 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000583231 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR6_MHC_SSTO_CTG1:31363816:31363922:1 gene:ENSG00000266784 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT108758 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT116700 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT117402 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT118059 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT118390 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000364953 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:31835263:31835326:1 gene:ENSG00000201823 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr6 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT108843 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
ENST00000425033 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:32255711:32265838:1 gene:ENSG00000225914 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AK123889 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ41895 fis, clone OCBBF2025458. // chr6 // 90 // 100 // 19 // 21 // 0 /// NONHSAT108899 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_002122 // RefSeq // Homo sapiens major histocompatibility complex, class II, DQ alpha 1 (HLA-DQA1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000343139 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:32637357:32643652:1 gene:ENSG00000196735 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000460633 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:32637431:32647062:1 gene:ENSG00000196735 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000482745 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:32637427:32643272:1 gene:ENSG00000196735 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 56 // 10 // 10 // 0 /// AB209628 // GenBank // Homo sapiens mRNA for major histocompatibility complex, class II, DQ alpha 1 precursor variant protein. // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC051832 // GenBank // Homo sapiens major histocompatibility complex, class II, DQ alpha 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5753417). // chr6 // 80 // 56 // 8 // 10 // 0 /// BC073977 // GenBank // Homo sapiens major histocompatibility complex, class II, DQ alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:87852 IMAGE:6014803), complete cds. // chr6 // 80 // 56 // 8 // 10 // 0 /// ENST00000395363 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:32637401:32643652:1 gene:ENSG00000196735 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 78 // 78 // 14 // 18 // 1
ENST00000365571 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:33199601:33199696:1 gene:ENSG00000202441 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// ENST00000481041 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR6_MHC_QBL_CTG1:33128412:33128507:1 gene:ENSG00000265071 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// ENST00000577883 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR6_MHC_DBB_CTG1:33177507:33177602:1 gene:ENSG00000266410 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// ENST00000577984 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR6_MHC_MCF_CTG1:33369961:33370056:1 gene:ENSG00000266464 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// ENST00000578877 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR6_MHC_MANN_CTG1:33353481:33353576:1 gene:ENSG00000265159 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// ENST00000579625 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR6_MHC_COX_CTG1:33121225:33121320:1 gene:ENSG00000266781 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0
NM_152735 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger and BTB domain containing 9 (ZBTB9), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000395064 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:33454579:33457548:1 gene:ENSG00000213588 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000414934 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR6_MHC_SSTO_CTG1:33594767:33597736:1 gene:ENSG00000236515 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC014978 // GenBank // Homo sapiens zinc finger and BTB domain containing 9, mRNA (cDNA clone MGC:23166 IMAGE:4874020), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000612407 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:6:33455406:33456190:1 gene:ENSG00000213588 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// AB067525 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1938 protein, partial cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023919 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR6_MHC_SSTO_CTG1:33560455:33596710:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// GENSCAN00000041265 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:33420265:33456522:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1
ENST00000460792 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:33540694:33541000:1 gene:ENSG00000242014 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT109002 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NR_028361 // RefSeq // Homo sapiens gametogenetin binding protein 1 (pseudogene) (GGNBP1), non-coding RNA. // chr6 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENST00000374458 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:33583738:33589026:1 gene:ENSG00000204188 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// AY383626 // GenBank // Homo sapiens gametogenetin 1 binding protein 1 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr6 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// AY383627 // GenBank // Homo sapiens gametogenetin-binding protein 1 variant mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr6 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENST00000610663 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:33584584:33585731:1 gene:ENSG00000204188 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 93 // 52 // 13 // 14 // 0 /// ENST00000613113 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:33583699:33589026:1 gene:ENSG00000204188 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:unitary_pseudogene // chr6 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000618642 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:33583738:33589026:1 gene:ENSG00000204188 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// ENST00000616119 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:33584584:33585531:1 gene:ENSG00000204188 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_002224 // RefSeq // Homo sapiens inositol 1,4,5-trisphosphate receptor, type 3 (ITPR3), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 62 // 62 // 0 /// ENST00000374316 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:33620365:33696574:1 gene:ENSG00000096433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 62 // 62 // 0 /// ENST00000605930 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:33621379:33696569:1 gene:ENSG00000096433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 62 // 62 // 0 /// D26351 // GenBank // Homo sapiens mRNA for type 3 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor, complete cds. // chr6 // 95 // 98 // 58 // 61 // 0 /// U01062 // GenBank // Human type 3 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor (ITPR3) mRNA, complete cds. // chr6 // 94 // 100 // 58 // 62 // 0 /// GENSCAN00000041270 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:33621603:33695780:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 98 // 61 // 61 // 0
NONHSAT112141 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONHSAT112144 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000408001 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:34744176:34744673:1 gene:ENSG00000217130 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0
ENST00000374017 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:34757554:34773794:1 gene:ENSG00000124562 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000374018 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:34757525:34773714:1 gene:ENSG00000124562 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000474635 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:34757912:34773532:1 gene:ENSG00000124562 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// BC121082 // GenBank // Homo sapiens small nuclear ribonucleoprotein polypeptide C, mRNA (cDNA clone MGC:150357 IMAGE:40119776), complete cds. // chr6 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC121083 // GenBank // Homo sapiens small nuclear ribonucleoprotein polypeptide C, mRNA (cDNA clone MGC:150358 IMAGE:40119777), complete cds. // chr6 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NM_003093 // RefSeq // Homo sapiens small nuclear ribonucleoprotein polypeptide C (SNRPC), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 1 /// NR_029472 // RefSeq // Homo sapiens small nuclear ribonucleoprotein polypeptide C (SNRPC), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr6 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// ENST00000244520 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:34757406:34773794:1 gene:ENSG00000124562 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 1 /// AK223098 // GenBank // Homo sapiens mRNA for small nuclear ribonucleoprotein polypeptide C variant, clone: KAT04768. // chr6 // 97 // 97 // 29 // 30 // 1 /// NONHSAT112147 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000006804 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:34744176:34872438:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
NM_017754 // RefSeq // Homo sapiens UHRF1 binding protein 1 (UHRF1BP1), mRNA. // chr6 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000192788 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:34792080:34877514:1 gene:ENSG00000065060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000452449 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:34792015:34883138:1 gene:ENSG00000065060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// AB126777 // GenBank // Homo sapiens UHRF1BP1 mRNA for ICBP90 binding protein 1, complete cds. // chr6 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// BC137120 // GenBank // Homo sapiens UHRF1 binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:168740 IMAGE:9021117), complete cds. // chr6 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// BC137127 // GenBank // Homo sapiens UHRF1 binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:168747 IMAGE:9021124), complete cds. // chr6 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// BX640641 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686F10110 (from clone DKFZp686F10110). // chr6 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000006804 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:34744176:34872438:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0 /// AK000309 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ20302 fis, clone HEP06648. // chr6 // 94 // 51 // 17 // 18 // 0
ENST00000383990 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:6:34821445:34821542:1 gene:ENSG00000206717 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT112148 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_015245 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1A (ANKS1A), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000360359 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:34889265:35091413:1 gene:ENSG00000064999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC031934 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1A, mRNA (cDNA clone MGC:42354 IMAGE:4819948), complete cds. // chr6 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// BC132832 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1A, mRNA (cDNA clone MGC:164463 IMAGE:40146854), complete cds. // chr6 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// XM_006715035 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1A (ANKS1A), transcript variant X5, mRNA. // chr6 // 77 // 77 // 24 // 31 // 1 /// AK298987 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60812 complete cds, highly similar to Ankyrin repeat and SAM domain-containing protein 1A. // chr6 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// GENSCAN00000002335 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:34967239:35090307:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0
NM_152753 // RefSeq // Homo sapiens signal peptide, CUB domain, EGF-like 3 (SCUBE3), mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000274938 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:35214419:35253079:1 gene:ENSG00000146197 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AF452494 // GenBank // Homo sapiens CUB and EGF containing protein (CEGF3) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AK291218 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78644 complete cds, highly similar to Homo sapiens signal peptide, CUB domain, EGF-like 3 (SCUBE3), mRNA. // chr6 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// AY639608 // GenBank // Homo sapiens signal peptide, CUB and EGF-like domain containing protein 3 (SCUBE3) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC052263 // GenBank // Homo sapiens signal peptide, CUB domain, EGF-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:59874 IMAGE:6379512), complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// CR936873 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686D20108 (from clone DKFZp686D20108). // chr6 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// GENSCAN00000002352 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:35214419:35248705:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0
NM_022047 // RefSeq // Homo sapiens differentially expressed in FDCP 6 homolog (mouse) (DEF6), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000316637 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:35297852:35321771:1 gene:ENSG00000023892 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// AK093613 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ36294 fis, clone THYMU2004123, highly similar to Homo sapiens differentially expressed in FDCP 6 homolog (mouse) (DEF6), mRNA. // chr6 // 97 // 90 // 37 // 38 // 0 /// AY241694 // GenBank // Homo sapiens IRF4-binding protein (IBP) mRNA, complete cds. // chr6 // 98 // 100 // 41 // 42 // 0 /// GENSCAN00000002329 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:35297857:35426079:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0
NM_021922 // RefSeq // Homo sapiens Fanconi anemia, complementation group E (FANCE), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000229769 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:35452361:35467103:1 gene:ENSG00000112039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF265210 // GenBank // Homo sapiens fanconi anemia protein E (FANCE) mRNA, complete cds. // chr6 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// AK292522 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75805 complete cds, highly similar to Homo sapiens Fanconi anemia, complementation group E (FANCE), mRNA. // chr6 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// BC046359 // GenBank // Homo sapiens Fanconi anemia, complementation group E, mRNA (cDNA clone MGC:50663 IMAGE:6154799), complete cds. // chr6 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000002344 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:35452546:35470750:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
ENST00000391277 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:6:35651818:35651945:1 gene:ENSG00000212579 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT112186 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_001286574 // RefSeq // Homo sapiens armadillo repeat containing 12 (ARMC12), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NM_001286576 // RefSeq // Homo sapiens armadillo repeat containing 12 (ARMC12), transcript variant 3, mRNA. // chr6 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NM_145028 // RefSeq // Homo sapiens armadillo repeat containing 12 (ARMC12), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_005248920 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens armadillo repeat containing 12 (ARMC12), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000288065 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:35737082:35748908:1 gene:ENSG00000157343 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000373866 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:35737087:35749079:1 gene:ENSG00000157343 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000373869 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:35737032:35748911:1 gene:ENSG00000157343 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000471400 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:35737092:35738509:1 gene:ENSG00000157343 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 89 // 35 // 8 // 9 // 0 /// BC033033 // GenBank // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 81, mRNA (cDNA clone MGC:33273 IMAGE:5268250), complete cds. // chr6 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000002346 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:35728121:35748870:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
NM_001286550 // RefSeq // Homo sapiens colipase-like 2 (CLPSL2), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_207409 // RefSeq // Homo sapiens colipase-like 2 (CLPSL2), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NR_104467 // RefSeq // Homo sapiens colipase-like 2 (CLPSL2), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000360454 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:35776615:35779552:1 gene:ENSG00000196748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000403376 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:35776619:35779552:1 gene:ENSG00000196748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000481904 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:35776594:35779552:1 gene:ENSG00000196748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AY358823 // GenBank // Homo sapiens clone DNA125190 AAAL3045 (UNQ3045) mRNA, complete cds. // chr6 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// NR_104469 // RefSeq // Homo sapiens colipase-like 2 (CLPSL2), transcript variant 4, non-coding RNA. // chr6 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// ENST00000467122 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:35776690:35779552:1 gene:ENSG00000196748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// NONHSAT112192 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000002347 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:35773698:35788010:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// NONHSAT112193 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_182548 // RefSeq // Homo sapiens lipoma HMGIC fusion partner-like 5 (LHFPL5), mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000360215 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:35805294:35824075:1 gene:ENSG00000197753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000373853 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:35805293:35819447:1 gene:ENSG00000197753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 95 // 75 // 20 // 21 // 0 /// BC028630 // GenBank // Homo sapiens lipoma HMGIC fusion partner-like 5, mRNA (cDNA clone MGC:33835 IMAGE:5262164), complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENST00000496656 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:35811245:35833874:1 gene:ENSG00000197753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// GENSCAN00000002333 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:35805671:35815676:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0
ENST00000483066 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:36522191:36522501:1 gene:ENSG00000239964 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT112223 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001257357 // RefSeq // Homo sapiens RAB44, member RAS oncogene family (RAB44), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000229824 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:6:36715479:36732093:1 gene:ENSG00000255587 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// ENST00000612677 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:36697851:36733183:1 gene:ENSG00000255587 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONHSAT112230 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// TCONS_l2_00024199-XLOC_l2_012524 // Broad TUCP // linc-C6orf89 chr6:+:36698446-36700248 // chr6 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000046696 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:36674723:36737706:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
NM_001257357 // RefSeq // Homo sapiens RAB44, member RAS oncogene family (RAB44), mRNA. // chr6 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000229824 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:6:36715479:36732093:1 gene:ENSG00000255587 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000612677 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:36697851:36733183:1 gene:ENSG00000255587 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000046696 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:36674723:36737706:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0
ENST00000494644 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:36737050:36737986:1 gene:ENSG00000220349 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000046696 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:36674723:36737706:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001199159 // RefSeq // Homo sapiens peptidase inhibitor 16 (PI16), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NM_153370 // RefSeq // Homo sapiens peptidase inhibitor 16 (PI16), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000373674 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:36954433:36964837:1 gene:ENSG00000164530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AK124589 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ42598 fis, clone BRACE3010397. // chr6 // 93 // 82 // 25 // 27 // 0 /// AK302193 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54201 complete cds, highly similar to Homo sapiens peptidase inhibitor 16 (PI16), mRNA. // chr6 // 90 // 64 // 19 // 21 // 0 /// AK303928 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54232 complete cds, highly similar to Homo sapiens peptidase inhibitor 16 (PI16), mRNA. // chr6 // 93 // 88 // 27 // 29 // 0 /// AY358422 // GenBank // Homo sapiens clone DNA40587 HGSC289 (UNQ289) mRNA, complete cds. // chr6 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// BC022399 // GenBank // Homo sapiens peptidase inhibitor 16, mRNA (cDNA clone MGC:24129 IMAGE:4691115), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC035634 // GenBank // Homo sapiens peptidase inhibitor 16, mRNA (cDNA clone MGC:45378 IMAGE:5217121), complete cds. // chr6 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// ENST00000611814 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:36948263:36964835:1 gene:ENSG00000164530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000020465 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:36958362:36963944:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0
ENST00000424565 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:37091314:37091806:1 gene:ENSG00000216412 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 59 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000020462 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:37091312:37174091:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 64 // 14 // 14 // 0
NM_017772 // RefSeq // Homo sapiens TBC1 domain family, member 22B (TBC1D22B), mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000373491 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:37257772:37332970:1 gene:ENSG00000065491 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// AB449909 // GenBank // Homo sapiens TBC1D22B mRNA for TBC1 domain family, member 22B, complete cds. // chr6 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AK292893 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77294 complete cds, highly similar to Homo sapiens TBC1 domain family, member 22B (TBC1D22B), mRNA. // chr6 // 93 // 90 // 25 // 27 // 0 /// AY313781 // GenBank // Homo sapiens TBC1 domain-containing protein mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// AY927466 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA sequence. // chr6 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// BC047658 // GenBank // Homo sapiens TBC1 domain family, member 22B, mRNA (cDNA clone IMAGE:5265785). // chr6 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// BC109026 // GenBank // Homo sapiens TBC1 domain family, member 22B, mRNA (cDNA clone MGC:125626 IMAGE:40027698), complete cds. // chr6 // 93 // 93 // 26 // 28 // 0 /// BC109027 // GenBank // Homo sapiens TBC1 domain family, member 22B, mRNA (cDNA clone MGC:125627 IMAGE:40027700), complete cds. // chr6 // 93 // 93 // 26 // 28 // 0 /// CR749710 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp762J0110 (from clone DKFZp762J0110). // chr6 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// AY927467 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA sequence. // chr6 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// GENSCAN00000020469 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:37257918:37331172:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0
ENST00000481561 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:37361185:37361483:1 gene:ENSG00000239953 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000469316 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:37354073:37368538:1 gene:ENSG00000112130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 53 // 53 // 9 // 17 // 1 /// NONHSAT112258 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr6 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_015050 // RefSeq // Homo sapiens cap methyltransferase 1 (CMTR1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_005248955 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens cap methyltransferase 1 (CMTR1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000373451 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:37433220:37481506:1 gene:ENSG00000137200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000455891 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:37433220:37462061:1 gene:ENSG00000137200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// AK292564 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77620 complete cds. // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC031890 // GenBank // Homo sapiens FtsJ methyltransferase domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:29890 IMAGE:4944457), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK000348 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ20341 fis, clone HEP13116, highly similar to D43949 Human mRNA for KIAA0082 gene. // chr6 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// GENSCAN00000020474 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:37354165:37480145:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 93 // 93 // 26 // 28 // 1
NM_021943 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, AN1-type domain 3 (ZFAND3), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000287218 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:37819499:38154624:1 gene:ENSG00000156639 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000373389 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:6:37929959:38142331:1 gene:ENSG00000156639 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000373391 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:6:37819798:38154624:1 gene:ENSG00000156639 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000440482 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:38088331:38152844:1 gene:ENSG00000156639 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 89 // 35 // 8 // 9 // 0 /// ENST00000474522 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:6:37819942:38116676:1 gene:ENSG00000156639 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 90 // 38 // 9 // 10 // 0 /// BC031481 // GenBank // Homo sapiens zinc finger, AN1-type domain 3, mRNA (cDNA clone MGC:21038 IMAGE:4448968), complete cds. // chr6 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// XM_006715155 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens zinc finger, AN1-type domain 3 (ZFAND3), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// NONHSAT112291 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 89 // 35 // 8 // 9 // 0 /// GENSCAN00000018860 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:38150789:38155646:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
ENST00000363727 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:37915573:37915742:1 gene:ENSG00000200597 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT112288 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
ENST00000363836 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:6:38207274:38207345:1 gene:ENSG00000200706 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT112310 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
ENST00000363068 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:6:38565950:38566055:1 gene:ENSG00000199938 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT112315 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_001206927 // RefSeq // Homo sapiens dynein, axonemal, heavy chain 8 (DNAH8), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 104 // 104 // 0 /// ENST00000327475 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:6:38715341:39030519:1 gene:ENSG00000124721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 104 // 104 // 0 /// ENST00000359357 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:38723122:39030529:1 gene:ENSG00000124721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 101 // 101 // 0 /// ENST00000449981 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:38722810:38972080:1 gene:ENSG00000124721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 92 // 92 // 0 /// AF356519 // GenBank // Homo sapiens axonemal dynein heavy chain 8 (DNAH8) mRNA, complete cds. // chr6 // 98 // 97 // 99 // 101 // 0 /// AK093653 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ36334 fis, clone THYMU2006261, moderately similar to DYNEIN GAMMA CHAIN, FLAGELLAR OUTER ARM. // chr6 // 100 // 13 // 13 // 13 // 0 /// AK098716 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ25850 fis, clone TST09136. // chr6 // 100 // 9 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000018863 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:38715161:38951520:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 71 // 74 // 74 // 0 /// GENSCAN00000022417 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:38971592:39038155:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 8 // 8 // 8 // 0
ENST00000468411 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:38744086:38744386:1 gene:ENSG00000244297 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT112330 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_002062 // RefSeq // Homo sapiens glucagon-like peptide 1 receptor (GLP1R), mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000373256 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:39048798:39087743:1 gene:ENSG00000112164 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// BC112126 // GenBank // Homo sapiens glucagon-like peptide 1 receptor, mRNA (cDNA clone MGC:138331 IMAGE:8327594), complete cds. // chr6 // 90 // 83 // 27 // 30 // 0 /// BC113493 // GenBank // Homo sapiens glucagon-like peptide 1 receptor, mRNA (cDNA clone MGC:142053 IMAGE:8322545), complete cds. // chr6 // 90 // 83 // 27 // 30 // 0 /// L23503 // GenBank // Human glucagon-like peptide-1 receptor (GLP-1) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// U01156 // GenBank // Human glucagon-like peptide-1 receptor mRNA, complete cds. // chr6 // 94 // 86 // 29 // 31 // 0 /// U01157 // GenBank // Human glucagon-like peptide-1 receptor mRNA with CA dinucleotide repeat, complete cds. // chr6 // 94 // 94 // 32 // 34 // 0 /// U10037 // GenBank // Human glucagon-like peptide-1 receptor mRNA, complete cds. // chr6 // 93 // 83 // 28 // 30 // 0 /// U01104 // GenBank // Human glucagon-like peptide-1 receptor mRNA, complete cds. // chr6 // 74 // 97 // 26 // 35 // 0 /// GENSCAN00000022422 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:39048841:39086073:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0
NM_001201427 // RefSeq // Homo sapiens dishevelled associated activator of morphogenesis 2 (DAAM2), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// NM_015345 // RefSeq // Homo sapiens dishevelled associated activator of morphogenesis 2 (DAAM2), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// XM_006715042 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens dishevelled associated activator of morphogenesis 2 (DAAM2), transcript variant X4, mRNA. // chr6 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000274867 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:39792366:39904868:1 gene:ENSG00000146122 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000398904 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:39793018:39904868:1 gene:ENSG00000146122 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000538976 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:39792997:39904877:1 gene:ENSG00000146122 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// AK310941 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17983. // chr6 // 100 // 43 // 16 // 16 // 0 /// AL833083 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp451J0719 (from clone DKFZp451J0719); complete cds. // chr6 // 94 // 84 // 29 // 31 // 0 /// BX647839 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp451D2311 (from clone DKFZp451D2311). // chr6 // 32 // 32 // 12 // 37 // 1 /// GENSCAN00000022424 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:39853629:39902037:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 68 // 25 // 25 // 0 /// AK091749 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ34430 fis, clone HLUNG2000846. // chr6 // 41 // 41 // 15 // 37 // 1
ENST00000516958 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:40407853:40407955:1 gene:ENSG00000252767 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT112683 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001010873 // RefSeq // Homo sapiens translocator protein 2 (TSPO2), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001159726 // RefSeq // Homo sapiens translocator protein 2 (TSPO2), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000373158 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:6:41042571:41044256:1 gene:ENSG00000112212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// ENST00000373161 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:41042554:41044337:1 gene:ENSG00000112212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000470917 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:41042718:41044212:1 gene:ENSG00000112212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 84 // 76 // 16 // 19 // 0 /// BC104440 // GenBank // Homo sapiens benzodiazapine receptor (peripheral)-like 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:40022778), complete cds. // chr6 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// BC104441 // GenBank // Homo sapiens benzodiazapine receptor (peripheral)-like 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:40022780), complete cds. // chr6 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// BC137560 // GenBank // Homo sapiens benzodiazapine receptor (peripheral)-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:169183 IMAGE:9021560), complete cds. // chr6 // 84 // 76 // 16 // 19 // 0 /// BC137565 // GenBank // Homo sapiens benzodiazapine receptor (peripheral)-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:169188 IMAGE:9021565), complete cds. // chr6 // 84 // 76 // 16 // 19 // 0 /// BC144710 // GenBank // Homo sapiens benzodiazapine receptor (peripheral)-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:178265 IMAGE:9053248), complete cds. // chr6 // 84 // 76 // 16 // 19 // 0 /// GENSCAN00000010124 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:41042986:41044137:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0
NM_006789 // RefSeq // Homo sapiens apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide-like 2 (APOBEC2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000244669 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:41053304:41064511:1 gene:ENSG00000124701 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AF161698 // GenBank // Homo sapiens APOBEC-2 (APOBEC-2) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AK300689 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51098 complete cds. // chr6 // 94 // 90 // 17 // 18 // 0 /// BC047767 // GenBank // Homo sapiens apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:54215 IMAGE:6202939), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC069688 // GenBank // Homo sapiens apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:97306 IMAGE:7262555), complete cds. // chr6 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// BC069764 // GenBank // Homo sapiens apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:97318 IMAGE:7262567), complete cds. // chr6 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000010141 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:41053348:41061871:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 60 // 12 // 12 // 0
NM_021705 // RefSeq // Homo sapiens nuclear transcription factor Y, alpha (NFYA), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000353205 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:41072983:41097950:1 gene:ENSG00000001167 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// BC039244 // GenBank // Homo sapiens nuclear transcription factor Y, alpha, mRNA (cDNA clone MGC:32974 IMAGE:5270842), complete cds. // chr6 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GQ167198 // GenBank // Homo sapiens nuclear transcription factor Y alpha isoform 1 (NFYA) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// M59079 // GenBank // Human CCAAT-binding protein (Hap2) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// NM_002505 // RefSeq // Homo sapiens nuclear transcription factor Y, alpha (NFYA), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// ENST00000341376 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:41072945:41099976:1 gene:ENSG00000001167 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 93 // 93 // 28 // 30 // 1 /// GENSCAN00000010148 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:41070763:41097410:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0
ENST00000457653 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:41101022:41138727:1 gene:ENSG00000161912 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr6 // 100 // 80 // 4 // 4 // 0 /// AK126092 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44104 fis, clone TESTI4044123. // chr6 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// AK128294 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ46432 fis, clone THYMU3014701. // chr6 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// BX537595 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686I2295 (from clone DKFZp686I2295). // chr6 // 100 // 80 // 4 // 4 // 0 /// GENSCAN00000010139 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:41117508:41140680:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 80 // 4 // 4 // 0
NM_198153 // RefSeq // Homo sapiens triggering receptor expressed on myeloid cells-like 4 (TREML4), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000341495 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:41228324:41238382:1 gene:ENSG00000188056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000448827 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:41228339:41237100:1 gene:ENSG00000188056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000461240 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:41228955:41238882:1 gene:ENSG00000188056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// AK090633 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ33314 fis, clone BNGH42006234. // chr6 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// AY358271 // GenBank // Homo sapiens clone DNA216575 AWGG9425 (UNQ9425) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC101780 // GenBank // Homo sapiens triggering receptor expressed on myeloid cells-like 4, mRNA (cDNA clone MGC:126829 IMAGE:8069286), complete cds. // chr6 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// BC105101 // GenBank // Homo sapiens triggering receptor expressed on myeloid cells-like 4, mRNA (cDNA clone MGC:132761 IMAGE:8144104), complete cds. // chr6 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// BC143652 // GenBank // Homo sapiens triggering receptor expressed on myeloid cells-like 4, mRNA (cDNA clone MGC:177183 IMAGE:9052166), complete cds. // chr6 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0
NM_001199509 // RefSeq // Homo sapiens natural cytotoxicity triggering receptor 2 (NCR2), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NM_001199510 // RefSeq // Homo sapiens natural cytotoxicity triggering receptor 2 (NCR2), transcript variant 3, mRNA. // chr6 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NM_004828 // RefSeq // Homo sapiens natural cytotoxicity triggering receptor 2 (NCR2), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 96 // 81 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000373083 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:41335655:41350858:1 gene:ENSG00000096264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000373086 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:41335851:41350864:1 gene:ENSG00000096264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000373089 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:41335789:41350887:1 gene:ENSG00000096264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 81 // 24 // 25 // 0 /// AJ225109 // GenBank // Homo sapiens mRNA for NKp44 NK cell activating receptor. // chr6 // 84 // 81 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010110 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:41335877:41407369:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1
ENST00000384250 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:6:41832854:41832993:1 gene:ENSG00000206977 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT112777 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK025343 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ21690 fis, clone COL09538. // chr6 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// AY465895 // GenBank // Homo sapiens hepatocellular carcinoma-related HCRP1 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000464297 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:42499710:42500022:1 gene:ENSG00000237107 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT112800 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0
ENST00000384121 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:42664162:42664268:1 gene:ENSG00000206848 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT112802 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_015349 // RefSeq // Homo sapiens GLTSCR1-like (GLTSCR1L), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000314073 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:42782027:42868560:1 gene:ENSG00000112624 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000394168 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:42821056:42868558:1 gene:ENSG00000112624 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AK091434 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ34115 fis, clone FCBBF3009152. // chr6 // 100 // 42 // 16 // 16 // 0 /// AK093526 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ36207 fis, clone TESTI2028776. // chr6 // 100 // 42 // 16 // 16 // 0 /// AK294706 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61607 complete cds, weakly similar to Glioma tumor suppressor candidate region gene 1 protein. // chr6 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// BC130302 // GenBank // Homo sapiens KIAA0240, mRNA (cDNA clone MGC:163174 IMAGE:40146333), complete cds. // chr6 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// D87077 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA0240 protein, partial cds. // chr6 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000614467 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:42746958:42868390:1 gene:ENSG00000112624 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000004481 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:42781897:42865446:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 63 // 63 // 24 // 38 // 1
NM_006586 // RefSeq // Homo sapiens canopy FGF signaling regulator 3 (CNPY3), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XR_427823 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens canopy FGF signaling regulator 3 (CNPY3), transcript variant X7, misc_RNA. // chr6 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000372836 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:42929200:42939287:1 gene:ENSG00000137161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000394142 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:42929192:42938170:1 gene:ENSG00000137161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// AY358960 // GenBank // Homo sapiens clone DNA88004 CTG4A (UNQ1934) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC004423 // GenBank // Homo sapiens canopy 3 homolog (zebrafish), mRNA (cDNA clone MGC:3530 IMAGE:2819660), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC008898 // GenBank // Homo sapiens canopy 3 homolog (zebrafish), mRNA (cDNA clone MGC:1220 IMAGE:2959532), complete cds. // chr6 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// BC008961 // GenBank // Homo sapiens canopy 3 homolog (zebrafish), mRNA (cDNA clone MGC:4122 IMAGE:2959532), complete cds. // chr6 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// U80744 // GenBank // Homo sapiens CTG4a mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// AK090425 // GenBank // Homo sapiens mRNA for FLJ00338 protein. // chr6 // 75 // 75 // 18 // 24 // 1 /// AK124196 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ42202 fis, clone THYMU2035321, weakly similar to Homo sapiens CTG4a mRNA. // chr6 // 75 // 75 // 18 // 24 // 1 /// GENSCAN00000004482 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:42929571:42938791:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT112854 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 75 // 75 // 18 // 24 // 1
NM_018960 // RefSeq // Homo sapiens glycine N-methyltransferase (GNMT), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000372808 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:42960758:42963880:1 gene:ENSG00000124713 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF101477 // GenBank // Homo sapiens glycine N-methyltransferase (GNMT) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC032627 // GenBank // Homo sapiens glycine N-methyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:45044 IMAGE:5229272), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FJ224320 // GenBank // Homo sapiens epididymis secretory sperm binding protein Li 182mP (HEL-S-182mP) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// X62250 // GenBank // H.sapiens mRNA for liver glycine methyltransferase. // chr6 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// GENSCAN00000036317 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:42960768:42963706:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_033112 // RefSeq // Homo sapiens ribosomal RNA processing 36 homolog (S. cerevisiae) (RRP36), mRNA. // chr6 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000244496 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:43021645:43029597:1 gene:ENSG00000124541 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000607394 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:43026073:43033971:1 gene:ENSG00000124541 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 79 // 47 // 11 // 14 // 0 /// BC011933 // GenBank // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 153, mRNA (cDNA clone MGC:20327 IMAGE:4300313), complete cds. // chr6 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000036343 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:43017193:43029228:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1
NM_001292001 // RefSeq // Homo sapiens serum response factor (c-fos serum response element-binding transcription factor) (SRF), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// NM_003131 // RefSeq // Homo sapiens serum response factor (c-fos serum response element-binding transcription factor) (SRF), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000265354 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:43171299:43181507:1 gene:ENSG00000112658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AK300467 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51683 complete cds, highly similar to Serum response factor. // chr6 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// BC048211 // GenBank // Homo sapiens serum response factor (c-fos serum response element-binding transcription factor), mRNA (cDNA clone MGC:52246 IMAGE:5808348), complete cds. // chr6 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// BC052572 // GenBank // Homo sapiens serum response factor (c-fos serum response element-binding transcription factor), mRNA (cDNA clone MGC:59837 IMAGE:6462845), complete cds. // chr6 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// J03161 // GenBank // Human serum response factor (SRF) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AB209128 // GenBank // Homo sapiens mRNA for serum response factor (c-fos serum response element-binding transcription factor) variant protein. // chr6 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1 /// GENSCAN00000036336 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:43171657:43179190:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
NM_015089 // RefSeq // Homo sapiens cullin 9 (CUL9), mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 50 // 50 // 0 /// ENST00000252050 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:43182175:43224587:1 gene:ENSG00000112659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 50 // 50 // 0 /// ENST00000372647 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:6:43182185:43224585:1 gene:ENSG00000112659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 50 // 50 // 0 /// ENST00000451399 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:43182184:43188958:1 gene:ENSG00000112659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 17 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000506830 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:43213823:43224585:1 gene:ENSG00000112659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 33 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000515773 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:43182184:43224587:1 gene:ENSG00000112659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 96 // 50 // 50 // 0 /// AK125228 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ43238 fis, clone HCHON2007881. // chr6 // 100 // 17 // 9 // 9 // 0 /// AY145132 // GenBank // Homo sapiens p53-associated parkin-like cytoplasmic protein (PARC) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 90 // 47 // 47 // 0 /// ENST00000503766 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:43221505:43224584:1 gene:ENSG00000112659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 19 // 19 // 10 // 52 // 1 /// AK128364 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ46507 fis, clone THYMU3031146. // chr6 // 19 // 19 // 10 // 52 // 1 /// GENSCAN00000036327 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:43184311:43224445:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 47 // 47 // 0
NM_032538 // RefSeq // Homo sapiens tau tubulin kinase 1 (TTBK1), mRNA. // chr6 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000259750 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:43243680:43288259:1 gene:ENSG00000146216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000304139 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:6:43247989:43270096:1 gene:ENSG00000146216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0 /// AB218664 // GenBank // Homo sapiens BDTK mRNA for brain-derived tau kinase, complete cds. // chr6 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AK131217 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ16105 fis, clone TESTI2025924, weakly similar to CASEIN KINASE I, EPSILON ISOFORM (EC 2.7.1.-). // chr6 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0 /// XM_006715229 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens tau tubulin kinase 1 (TTBK1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// GENSCAN00000036337 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:43243445:43295044:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 78 // 24 // 25 // 0
NM_001198934 // RefSeq // Homo sapiens ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 10 (ABCC10), transcript variant MRP7, mRNA. // chr6 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// NM_033450 // RefSeq // Homo sapiens ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 10 (ABCC10), transcript variant MRP7A, mRNA. // chr6 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000244533 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:43431751:43450425:1 gene:ENSG00000124574 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000372530 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:43427554:43450430:1 gene:ENSG00000124574 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// AY032599 // GenBank // Homo sapiens multidrug resistance-associated protein 7 (SIMRP7) mRNA, complete cds. // chr6 // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// BC024103 // GenBank // Homo sapiens ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 10, mRNA (cDNA clone IMAGE:4554918), complete cds. // chr6 // 100 // 26 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000463024 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:43435798:43450426:1 gene:ENSG00000124574 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 68 // 68 // 23 // 34 // 1 /// AK024446 // GenBank // Homo sapiens mRNA for FLJ00036 protein, partial cds. // chr6 // 68 // 68 // 23 // 34 // 1 /// GENSCAN00000036318 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:43427113:43450091:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// U66684 // GenBank HTC // Homo sapiens clone EST182763 mRNA sequence. // chr6 // 82 // 32 // 9 // 11 // 0
ENST00000384348 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:43474186:43474292:1 gene:ENSG00000207076 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT112893 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000516409 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:6:43544144:43544270:1 gene:ENSG00000252218 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT112901 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001003690 // RefSeq // Homo sapiens MAD2L1 binding protein (MAD2L1BP), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NM_014628 // RefSeq // Homo sapiens MAD2L1 binding protein (MAD2L1BP), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000372171 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:43635819:43640952:1 gene:ENSG00000124688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000451025 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:43629540:43640919:1 gene:ENSG00000124688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// AK297172 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56354 complete cds, highly similar to MAD2L1-binding protein. // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC002904 // GenBank // Homo sapiens MAD2L1 binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:11282 IMAGE:3945348), complete cds. // chr6 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// CR456893 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834E0111D for gene MAD2L1BP, MAD2L1 binding protein; complete cds, incl. stopcodon. // chr6 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// D14811 // GenBank // Homo sapiens KIAA0110 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000508232 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:43635859:43636873:1 gene:ENSG00000124688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// GENSCAN00000036322 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:43635876:43640533:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NONHSAT112909 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001193341 // RefSeq // Homo sapiens radial spoke head 9 homolog (Chlamydomonas) (RSPH9), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NM_152732 // RefSeq // Homo sapiens radial spoke head 9 homolog (Chlamydomonas) (RSPH9), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// XM_006715014 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens radial spoke head 9 homolog (Chlamydomonas) (RSPH9), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000372163 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:43645046:43672599:1 gene:ENSG00000172426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000372165 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:43645046:43672599:1 gene:ENSG00000172426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// AK055407 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ30845 fis, clone FEBRA2002727. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AK291399 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77296 complete cds. // chr6 // 87 // 60 // 13 // 15 // 0 /// BC029519 // GenBank // Homo sapiens radial spoke head 9 homolog (Chlamydomonas), mRNA (cDNA clone MGC:33840 IMAGE:5296237), complete cds. // chr6 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000036323 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:43645099:43670949:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NR_024478 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC100132354 (LOC100132354), long non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK095548 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ38229 fis, clone FCBBF2004256. // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONHSAT112932 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// TCONS_00011120-XLOC_005295 // Rinn lincRNA // linc-C6orf223 chr6:+:43858764-43905943 // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT112926 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// NONHSAT112931 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
ENST00000442114 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:6:44000580:44005150:1 gene:ENSG00000181577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC032706 // GenBank // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 223, mRNA (cDNA clone MGC:45491 IMAGE:5497384), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NM_001171992 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 223 (C6orf223), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 91 // 91 // 30 // 33 // 1 /// NM_153246 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 223 (C6orf223), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 91 // 91 // 30 // 33 // 1 /// ENST00000336600 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:44000600:44005958:1 gene:ENSG00000181577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 91 // 91 // 30 // 33 // 1 /// ENST00000439969 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:44000617:44005108:1 gene:ENSG00000181577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1 /// BC029071 // GenBank // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 223, mRNA (cDNA clone MGC:21868 IMAGE:4341806), complete cds. // chr6 // 91 // 91 // 30 // 33 // 1 /// ENST00000448947 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:44000632:44003405:1 gene:ENSG00000181577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// NONHSAT112936 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONHSAT112937 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
NM_007058 // RefSeq // Homo sapiens calpain 11 (CAPN11), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000398776 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:44158811:44184402:1 gene:ENSG00000137225 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000533604 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:44176616:44183267:1 gene:ENSG00000137225 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// AK300107 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60880 complete cds, highly similar to Calpain-11 (EC 3.4.22.-). // chr6 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// BC033733 // GenBank // Homo sapiens calpain 11, mRNA (cDNA clone MGC:45189 IMAGE:5170266), complete cds. // chr6 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000524554 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:44176551:44181321:1 gene:ENSG00000137225 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// AK309883 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99924. // chr6 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000046500 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:44120377:44192525:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
ENST00000438774 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:6:44270743:44307506:1 gene:ENSG00000178233 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// NM_001137560 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 151B (TMEM151B), mRNA. // chr6 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// ENST00000451188 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:44270466:44279444:1 gene:ENSG00000178233 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// BC040881 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5729217, partial cds. // chr6 // 89 // 93 // 24 // 27 // 0 /// ENST00000505802 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:44273194:44378957:1 gene:ENSG00000272442 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1 /// GENSCAN00000046499 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:44268733:44276527:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// AK126641 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44683 fis, clone BRACE3010702. // chr6 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1
NM_001253 // RefSeq // Homo sapiens cell division cycle 5-like (CDC5L), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// XM_006715289 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens cell division cycle 5-like (CDC5L), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 76 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000371477 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:44387525:44450426:1 gene:ENSG00000096401 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// AK299738 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51295 complete cds, highly similar to Cell division cycle 5-like protein. // chr6 // 90 // 87 // 35 // 39 // 0 /// BC001568 // GenBank // Homo sapiens CDC5 cell division cycle 5-like (S. pombe), mRNA (cDNA clone MGC:5485 IMAGE:3452352), complete cds. // chr6 // 100 // 89 // 40 // 40 // 0 /// U86753 // GenBank // Human Cdc5-related protein (PCDC5RP) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 78 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000046503 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:44343783:44446711:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 82 // 37 // 37 // 0
ENST00000391166 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:46018745:46018851:1 gene:ENSG00000212468 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT113002 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_014936 // RefSeq // Homo sapiens ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 4 (putative) (ENPP4), mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000321037 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:46129993:46146699:1 gene:ENSG00000001561 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// AK291276 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75684 complete cds, highly similar to Homo sapiens ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 4 (ENPP4), mRNA. // chr6 // 100 // 46 // 16 // 16 // 0 /// BC018054 // GenBank // Homo sapiens ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 4 (putative function), mRNA (cDNA clone MGC:26424 IMAGE:4797659), complete cds. // chr6 // 86 // 63 // 19 // 22 // 0 /// GENSCAN00000013948 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:46139584:46143640:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 31 // 11 // 11 // 0
NM_001010870 // RefSeq // Homo sapiens tudor domain containing 6 (TDRD6), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NM_001168359 // RefSeq // Homo sapiens tudor domain containing 6 (TDRD6), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000316081 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:46688129:46702413:1 gene:ENSG00000180113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000450697 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:46693972:46701958:1 gene:ENSG00000180113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 90 // 24 // 9 // 10 // 0 /// ENST00000544460 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:46687875:46704319:1 gene:ENSG00000180113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// EF185284 // GenBank // Homo sapiens tudor domain containing 6 (TDRD6) mRNA, complete cds. // chr6 // 52 // 52 // 22 // 42 // 1 /// GENSCAN00000013944 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:46688129:46698114:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0
NM_005588 // RefSeq // Homo sapiens meprin A, alpha (PABA peptide hydrolase) (MEP1A), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000230588 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:46793390:46839778:1 gene:ENSG00000112818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF478685 // GenBank // Homo sapiens N-benzoyl-L-tyrosyl-p-amino-benzoic acid hydrolase alpha subunit (MEP1A) mRNA, complete cds. // chr6 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// AK290282 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77956 complete cds, highly similar to Homo sapiens meprin A, alpha (PABA peptide hydrolase) (MEP1A), mRNA. // chr6 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// AK315840 // GenBank // Homo sapiens cDNA, FLJ79489 complete cds, highly similar to Meprin A subunit alpha precursor (EC3.4.24.18). // chr6 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// BC131714 // GenBank // Homo sapiens meprin A, alpha (PABA peptide hydrolase), mRNA (cDNA clone MGC:150581 IMAGE:40122874), complete cds. // chr6 // 93 // 91 // 28 // 30 // 0 /// BC143650 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:9052164. // chr6 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// BC143651 // GenBank // Homo sapiens meprin A, alpha (PABA peptide hydrolase), mRNA (cDNA clone MGC:177182 IMAGE:9052165), complete cds. // chr6 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// M82962 // GenBank // Human N-benzoyl-L-tyrosyl-p-amino-benzoic acid hydrolase alpha subunit (PPH alpha) mRNA, complete cds. // chr6 // 91 // 100 // 30 // 33 // 0 /// ENST00000611727 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:46793399:46839782:1 gene:ENSG00000112818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000013935 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:46793399:46839136:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0
NM_012120 // RefSeq // Homo sapiens CD2-associated protein (CD2AP), mRNA. // chr6 // 100 // 98 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000359314 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:47477789:47627263:1 gene:ENSG00000198087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 98 // 42 // 42 // 0 /// AF146277 // GenBank // Homo sapiens adapter protein CMS mRNA, complete cds. // chr6 // 98 // 98 // 41 // 42 // 0 /// AF164377 // GenBank // Homo sapiens CD2AP homolog mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 81 // 35 // 35 // 0 /// BC069444 // GenBank // Homo sapiens CD2-associated protein, mRNA (cDNA clone MGC:97150 IMAGE:7262392), complete cds. // chr6 // 97 // 88 // 37 // 38 // 0 /// GENSCAN00000034485 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:47334558:47659984:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 70 // 70 // 30 // 43 // 1
NM_153839 // RefSeq // Homo sapiens G protein-coupled receptor 111 (GPR111), mRNA. // chr6 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000398742 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:47673371:47697793:1 gene:ENSG00000164393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000467205 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:47656590:47697797:1 gene:ENSG00000164393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000507065 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:6:47656436:47683528:1 gene:ENSG00000164393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// DQ315369 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 111 (GPR111) mRNA, complete cds. // chr6 // 89 // 69 // 16 // 18 // 0 /// ENST00000296862 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:47656487:47682686:1 gene:ENSG00000164393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// AY140953 // GenBank // Homo sapiens G-protein coupled receptor GPR111 (GPR111) mRNA, complete cds. // chr6 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// GENSCAN00000034488 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:47676658:47682686:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
NM_153838 // RefSeq // Homo sapiens G protein-coupled receptor 115 (GPR115), mRNA. // chr6 // 100 // 48 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000283303 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:47698553:47722021:1 gene:ENSG00000153294 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 48 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000327753 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:47698553:47722021:1 gene:ENSG00000153294 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 44 // 23 // 23 // 0 /// DQ315370 // GenBank // Homo sapiens clone IMAGE:8317335 G protein-coupled receptor 115 (GPR115) mRNA, complete cds. // chr6 // 96 // 46 // 23 // 24 // 0 /// ENST00000371220 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:47685864:47722021:1 gene:ENSG00000153294 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 88 // 88 // 46 // 52 // 1 /// AY140957 // GenBank // Homo sapiens G-protein coupled receptor GPR115 (GPR115) mRNA, complete cds. // chr6 // 81 // 81 // 42 // 52 // 1 /// GENSCAN00000034487 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:47693673:47861302:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 25 // 25 // 13 // 52 // 1
NM_181744 // RefSeq // Homo sapiens opsin 5 (OPN5), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NR_033806 // RefSeq // Homo sapiens opsin 5 (OPN5), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000244799 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:47787068:47826381:1 gene:ENSG00000124818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000371211 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:47782039:47824699:1 gene:ENSG00000124818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000393699 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:6:47782067:47811817:1 gene:ENSG00000124818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// AY288419 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 136 (GPR136) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// AY377391 // GenBank // Homo sapiens neuropsin (OPN5) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// BC126194 // GenBank // Homo sapiens opsin 5, mRNA (cDNA clone MGC:161472 IMAGE:8991910), complete cds. // chr6 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// BC126198 // GenBank // Homo sapiens opsin 5, mRNA (cDNA clone MGC:161476 IMAGE:8991914), complete cds. // chr6 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000489301 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:6:47781982:47832780:1 gene:ENSG00000124818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// GENSCAN00000034487 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:47693673:47861302:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
ENST00000363470 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:47823390:47823550:1 gene:ENSG00000200340 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT113046 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_018132 // RefSeq // Homo sapiens centromere protein Q (CENPQ), mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000335783 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:49463378:49493107:1 gene:ENSG00000031691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AK293016 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77389 complete cds. // chr6 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// BC016279 // GenBank // Homo sapiens centromere protein Q, mRNA (cDNA clone MGC:8823 IMAGE:3908895), complete cds. // chr6 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000035484 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:49470177:49492275:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC072444 // GenBank HTC // Homo sapiens centromere protein Q, mRNA (cDNA clone IMAGE:6163523), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr6 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
ENST00000371194 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:49550675:49561907:1 gene:ENSG00000197261 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000414696 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:49550666:49560934:1 gene:ENSG00000197261 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// AK054918 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ30356 fis, clone BRACE2007708. // chr6 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// BC036917 // GenBank // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 141, mRNA (cDNA clone MGC:46457 IMAGE:5201433), complete cds. // chr6 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// XM_005248852 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 141 (C6orf141), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// NM_001145652 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 141 (C6orf141), mRNA. // chr6 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// ENST00000529246 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:49550646:49552095:1 gene:ENSG00000197261 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// AK289889 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77687 complete cds. // chr6 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// ENST00000526429 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:49552353:49555308:1 gene:ENSG00000197261 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000035482 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:49538780:49551527:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT113060 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// NONHSAT113058 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_172238 // RefSeq // Homo sapiens transcription factor AP-2 delta (activating enhancer binding protein 2 delta) (TFAP2D), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000008391 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:50713828:50772988:1 gene:ENSG00000008197 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000492804 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:50718042:50751274:1 gene:ENSG00000008197 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 89 // 35 // 8 // 9 // 0 /// AY028376 // GenBank // Homo sapiens AP-2-like protein mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC144200 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:9052720, containing frame-shift errors. // chr6 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000003717 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:50714056:50772864:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
NM_003221 // RefSeq // Homo sapiens transcription factor AP-2 beta (activating enhancer binding protein 2 beta) (TFAP2B), mRNA. // chr6 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006715178 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens transcription factor AP-2 beta (activating enhancer binding protein 2 beta) (TFAP2B), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000344788 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:50818723:50828679:1 gene:ENSG00000008196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000393655 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:50818723:50847613:1 gene:ENSG00000008196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// AK291172 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78195 complete cds, highly similar to Homo sapiens transcription factor AP-2 beta (activating enhancer binding protein 2 beta), mRNA. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC037225 // GenBank // Homo sapiens transcription factor AP-2 beta (activating enhancer binding protein 2 beta), mRNA (cDNA clone MGC:21381 IMAGE:4745989), complete cds. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006715177 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens transcription factor AP-2 beta (activating enhancer binding protein 2 beta) (TFAP2B), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// GENSCAN00000003710 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:50818925:50843392:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
ENST00000492489 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:51975673:51975959:1 gene:ENSG00000240641 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT113095 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029713 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 206 (MIR206), microRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000384872 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:52144331:52144442:1 gene:ENSG00000207604 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-206 // miRBase Micro RNA Database // MI0000490 Homo sapiens miR-206 stem-loop // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT113097 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029903 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 133b (MIR133B), microRNA. // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000362210 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:52148923:52149041:1 gene:ENSG00000199080 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// hsa-mir-133b // miRBase Micro RNA Database // MI0000822 Homo sapiens miR-133b stem-loop // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT113099 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_002190 // RefSeq // Homo sapiens interleukin 17A (IL17A), mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000340057 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:52186387:52190638:1 gene:ENSG00000112115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC066251 // GenBank // Homo sapiens interleukin 17A, mRNA (cDNA clone MGC:79361 IMAGE:6971875), complete cds. // chr6 // 95 // 70 // 18 // 19 // 0 /// BC066252 // GenBank // Homo sapiens interleukin 17A, mRNA (cDNA clone MGC:79362 IMAGE:6971876), complete cds. // chr6 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// BC066253 // GenBank // Homo sapiens interleukin 17A, mRNA (cDNA clone MGC:79364 IMAGE:6971878), complete cds. // chr6 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// BC067503 // GenBank // Homo sapiens interleukin 17A, mRNA (cDNA clone MGC:79363 IMAGE:6971877), complete cds. // chr6 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// BC067504 // GenBank // Homo sapiens interleukin 17A, mRNA (cDNA clone MGC:79365 IMAGE:6971879), complete cds. // chr6 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// BC067505 // GenBank // Homo sapiens interleukin 17A, mRNA (cDNA clone MGC:79367 IMAGE:6971881), complete cds. // chr6 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// U32659 // GenBank // Human IL-17 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000044906 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:52140011:52189292:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
NM_133367 // RefSeq // Homo sapiens progestin and adipoQ receptor family member VIII (PAQR8), mRNA. // chr6 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000360726 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:52362446:52407691:1 gene:ENSG00000170915 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000442253 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:52362128:52407777:1 gene:ENSG00000170915 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// AF347029 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein (C6ORF33) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// AK128085 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ46206 fis, clone TESTI4010721, highly similar to Membrane progestin receptor beta. // chr6 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// AY424286 // GenBank // Homo sapiens progestin and adipoQ receptor family member VIII (PAQR8) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC030664 // GenBank // Homo sapiens progestin and adipoQ receptor family member VIII, mRNA (cDNA clone MGC:33833 IMAGE:5260230), complete cds. // chr6 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0
NM_014051 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 14A (TMEM14A), mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000211314 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:52671109:52686588:1 gene:ENSG00000096092 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// AF239771 // GenBank // Homo sapiens TS58 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// BC015097 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 14A, mRNA (cDNA clone MGC:22819 IMAGE:3686196), complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// BC019328 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 14A, mRNA (cDNA clone MGC:746 IMAGE:3534851), complete cds. // chr6 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0
AK095315 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ37996 fis, clone CTONG2011920, weakly similar to Homo sapiens NY-REN-57 antigen mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000474457 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:53090892:53097904:1 gene:ENSG00000112146 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000493405 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:53090961:53091257:1 gene:ENSG00000242865 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK095307 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ37988 fis, clone CTONG2011474, moderately similar to Homo sapiens NY-REN-57 antigen mRNA. // chr6 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// AK095315 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ37996 fis, clone CTONG2011920, weakly similar to Homo sapiens NY-REN-57 antigen mRNA. // chr6 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// NONHSAT113151 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT113152 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000384181 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:53219261:53219424:1 gene:ENSG00000206908 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT113160 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000406329 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:53354715:53355065:1 gene:ENSG00000219863 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000040835 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:53351389:53355065:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000487251 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:53794497:53905362:1 gene:ENSG00000137269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// AK021896 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ11834 fis, clone HEMBA1006583, weakly similar to Drosophila melanogaster Scribble (scrib) mRNA. // chr6 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// NM_018214 // RefSeq // Homo sapiens leucine rich repeat containing 1 (LRRC1), mRNA. // chr6 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// ENST00000370888 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:53794980:53924121:1 gene:ENSG00000137269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// AF332199 // GenBank // Homo sapiens leucine-rich repeats protein mRNA, complete cds. // chr6 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1 /// AF359380 // GenBank // Homo sapiens LANO adaptor protein (LANO) mRNA, complete cds. // chr6 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// AK292248 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77590 complete cds, highly similar to Homo sapiens leucine rich repeat containing 1, mRNA. // chr6 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// BC003193 // GenBank // Homo sapiens leucine rich repeat containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:936 IMAGE:3504090), complete cds. // chr6 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// GENSCAN00000040828 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:53841082:53922793:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 92 // 44 // 11 // 12 // 0
ENST00000516137 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:54786387:54786492:1 gene:ENSG00000251946 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT113227 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001010872 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 83, member B (FAM83B), mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000306858 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:54846771:54942022:1 gene:ENSG00000168143 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC101628 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 83, member B, mRNA (cDNA clone MGC:126677 IMAGE:8069134), complete cds. // chr6 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// BC112275 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 83, member B, mRNA (cDNA clone MGC:138480 IMAGE:8327743), complete cds. // chr6 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003937 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:54870247:54927632:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0
NM_001526 // RefSeq // Homo sapiens hypocretin (orexin) receptor 2 (HCRTR2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000370862 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:55174252:55282620:1 gene:ENSG00000137252 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF041245 // GenBank // Homo sapiens orexin receptor-2 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC035858 // GenBank HTC // Homo sapiens hypocretin (orexin) receptor 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:5767576), with apparent retained intron. // chr6 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// KC812499 // GenBank // Homo sapiens orexin type-2 receptor isoform 1 (HCRTR2) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// KC812500 // GenBank // Homo sapiens orexin type-2 receptor isoform 2 (HCRTR2) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr6 // 100 // 58 // 21 // 21 // 0 /// AK307819 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ97767. // chr6 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// EF633108 // GenBank // Homo sapiens orexin receptor 2 variant 1B mRNA, 5 UTR and partial cds, alternatively spliced. // chr6 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// EF633109 // GenBank // Homo sapiens orexin receptor 2 variant 1C short mRNA, 5 UTR and partial cds, alternatively spliced. // chr6 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// EF633110 // GenBank // Homo sapiens orexin receptor 2 variant 1C long mRNA, 5 UTR and partial cds, alternatively spliced. // chr6 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// ENST00000615358 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:55106460:55282592:1 gene:ENSG00000137252 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000009525 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:55169294:55282454:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0
NM_207410 // RefSeq // Homo sapiens GDNF family receptor alpha like (GFRAL), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000340465 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:55327469:55402493:1 gene:ENSG00000187871 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AY358198 // GenBank // Homo sapiens clone DNA194917 IVFI9356 (UNQ9356) mRNA, complete cds. // chr6 // 91 // 100 // 30 // 33 // 0 /// GENSCAN00000009530 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:55291672:55363073:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
ENST00000363354 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:56945730:56945836:1 gene:ENSG00000200224 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT113253 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_152731 // RefSeq // Homo sapiens BEN domain containing 6 (BEND6), mRNA. // chr6 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// XM_005248889 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens BEN domain containing 6 (BEND6), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0 /// XM_005248890 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens BEN domain containing 6 (BEND6), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000370746 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:56955292:57027342:1 gene:ENSG00000151917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000370748 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:56955126:57010944:1 gene:ENSG00000151917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000484701 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:57013809:57018471:1 gene:ENSG00000151917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// AK303705 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50941 complete cds. // chr6 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// AK315926 // GenBank // Homo sapiens cDNA, FLJ78825 complete cds. // chr6 // 100 // 32 // 10 // 10 // 0 /// BC022988 // GenBank // Homo sapiens BEN domain containing 6, mRNA (cDNA clone MGC:30132 IMAGE:4932760), complete cds. // chr6 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0 /// BC036119 // GenBank // Homo sapiens BEN domain containing 6, mRNA (cDNA clone IMAGE:5274898), complete cds. // chr6 // 92 // 39 // 11 // 12 // 0 /// ENST00000370745 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:6:56955372:57015160:1 gene:ENSG00000151917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1 /// GENSCAN00000045992 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:56981811:57037903:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 45 // 14 // 14 // 0
NM_001286274 // RefSeq // Homo sapiens KIAA1586 (KIAA1586), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 91 // 10 // 10 // 0 /// NM_001286275 // RefSeq // Homo sapiens KIAA1586 (KIAA1586), transcript variant 3, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NM_001286276 // RefSeq // Homo sapiens KIAA1586 (KIAA1586), transcript variant 4, mRNA. // chr6 // 100 // 91 // 10 // 10 // 0 /// NM_020931 // RefSeq // Homo sapiens KIAA1586 (KIAA1586), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000370733 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:57046549:57055225:1 gene:ENSG00000168116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000545356 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:57046532:57055239:1 gene:ENSG00000168116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 91 // 10 // 10 // 0 /// AB046806 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1586 protein, partial cds. // chr6 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0 /// AK295519 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58160 complete cds, weakly similar to Zinc finger protein 451. // chr6 // 100 // 73 // 8 // 8 // 0 /// BC041125 // GenBank // Homo sapiens KIAA1586, mRNA (cDNA clone MGC:47798 IMAGE:5785266), complete cds. // chr6 // 100 // 91 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000045998 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:57046954:57154390:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 73 // 73 // 8 // 11 // 1
NM_001031623 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 451 (ZNF451), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NM_015555 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 451 (ZNF451), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000357489 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:57090030:57170201:1 gene:ENSG00000112200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000370706 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:57090010:57170307:1 gene:ENSG00000112200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000491832 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:6:57090189:57154544:1 gene:ENSG00000112200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// AY055204 // GenBank // Homo sapiens COASTER mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC098382 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 451, mRNA (cDNA clone MGC:104563 IMAGE:5295845), complete cds. // chr6 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000444273 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:57090113:57151371:1 gene:ENSG00000112200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// BC021712 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 451, mRNA (cDNA clone MGC:26701 IMAGE:4821000), complete cds. // chr6 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// GENSCAN00000045998 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:57046954:57154390:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_004282 // RefSeq // Homo sapiens BCL2-associated athanogene 2 (BAG2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000370693 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:57172326:57189833:1 gene:ENSG00000112208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF095192 // GenBank // Homo sapiens BAG-family molecular chaperone regulator-2 mRNA, complete cds. // chr6 // 90 // 80 // 18 // 20 // 0 /// AK301934 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50277 complete cds, highly similar to BAG family molecular chaperone regulator 2. // chr6 // 93 // 56 // 13 // 14 // 0 /// BC125039 // GenBank // Homo sapiens BCL2-associated athanogene 2, mRNA (cDNA clone MGC:149462 IMAGE:40115422), complete cds. // chr6 // 83 // 72 // 15 // 18 // 0 /// CR533496 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834G0217D for gene BAG2, BCL2-associated athanogene 2; complete cds, incl. stopcodon. // chr6 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000046002 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:57172698:57184190:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_003463 // RefSeq // Homo sapiens protein tyrosine phosphatase type IVA, member 1 (PTP4A1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000370651 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:63572012:63583587:1 gene:ENSG00000112245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AJ420505 // GenBank // Homo sapiens mRNA full length insert cDNA clone EUROIMAGE 2096405. // chr6 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// BC023975 // GenBank // Homo sapiens protein tyrosine phosphatase type IVA, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:1659 IMAGE:2960001), complete cds. // chr6 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// BC045571 // GenBank // Homo sapiens protein tyrosine phosphatase type IVA, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:57320 IMAGE:4826233), complete cds. // chr6 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// CR749458 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp779M0721 (from clone DKFZp779M0721). // chr6 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// U48296 // GenBank // Homo sapiens protein tyrosine phosphatase PTPCAAX1 (hPTPCAAX1) mRNA, complete cds. // chr6 // 90 // 40 // 9 // 10 // 0
NR_026540 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 25, member 51 pseudogene 1 (SLC25A51P1), non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000468432 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:65788417:65789287:1 gene:ENSG00000220483 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000018410 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:65715566:65788995:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 33 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000047664 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR6_1_CTG7:65788678:65788995:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 33 // 8 // 8 // 0 /// NONHSAT113375 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000364145 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:67546651:67546754:1 gene:ENSG00000201015 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT113389 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000383945 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:6:67625356:67625464:1 gene:ENSG00000206672 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT113390 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001858 // RefSeq // Homo sapiens collagen, type XIX, alpha 1 (COL19A1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 53 // 53 // 0 /// AK310621 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17663. // chr6 // 93 // 28 // 14 // 15 // 0 /// BC113362 // GenBank // Homo sapiens collagen, type XIX, alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:141922 IMAGE:8322414), complete cds. // chr6 // 98 // 94 // 49 // 50 // 0 /// BC113364 // GenBank // Homo sapiens collagen, type XIX, alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:141924 IMAGE:8322416), complete cds. // chr6 // 98 // 94 // 49 // 50 // 0 /// D38163 // GenBank // Homo sapiens mRNA for a1(XIX) collagen chain, complete cds. // chr6 // 94 // 94 // 47 // 50 // 0 /// L12347 // GenBank // Homo sapiens collagen chain mRNA, 3 end. // chr6 // 100 // 55 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000620364 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:69866571:70209976:1 gene:ENSG00000082293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 53 // 53 // 0 /// GENSCAN00000041244 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:69927909:70194247:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 45 // 24 // 24 // 0
NM_145267 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 57 (C6orf57), mRNA. // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000370474 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:70566917:70589569:1 gene:ENSG00000154079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC018085 // GenBank // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 57, mRNA (cDNA clone MGC:26946 IMAGE:4817876), complete cds. // chr6 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// BC104649 // GenBank // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 57, mRNA (cDNA clone MGC:104225 IMAGE:6713316), complete cds. // chr6 // 82 // 81 // 18 // 22 // 0 /// GENSCAN00000041242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:70566941:70588724:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
ENST00000384451 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:71182612:71182718:1 gene:ENSG00000207180 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT113464 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_024576 // RefSeq // Homo sapiens opioid growth factor receptor-like 1 (OGFRL1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000370435 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:71288803:71308950:1 gene:ENSG00000119900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// AK308623 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ98664. // chr6 // 100 // 29 // 9 // 9 // 0 /// BC018688 // GenBank // Homo sapiens opioid growth factor receptor-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:27500 IMAGE:4717736), complete cds. // chr6 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// BC110999 // GenBank // Homo sapiens opioid growth factor receptor-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:102783 IMAGE:5585901), complete cds. // chr6 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000044486 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:71288721:71302049:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 68 // 68 // 21 // 31 // 1
NM_001017361 // RefSeq // Homo sapiens KH domain containing 3-like, subcortical maternal complex member (KHDC3L), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006715351 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens KH domain containing 3-like, subcortical maternal complex member (KHDC3L), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000370367 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:73362677:73364171:1 gene:ENSG00000203908 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB211062 // GenBank // Homo sapiens ECAT1 mRNA for ES cell associated trasnsript 1, complete cds. // chr6 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// BC132844 // GenBank // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 221, mRNA (cDNA clone MGC:164475 IMAGE:40146866), complete cds. // chr6 // 89 // 72 // 16 // 18 // 0 /// BC137160 // GenBank // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 221, mRNA (cDNA clone MGC:168780 IMAGE:9021157), complete cds. // chr6 // 89 // 72 // 16 // 18 // 0 /// GENSCAN00000008576 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:73362395:73363860:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0
NM_018665 // RefSeq // Homo sapiens DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 43 (DDX43), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000370336 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:73394748:73417569:1 gene:ENSG00000080007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000479773 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:73406965:73414007:1 gene:ENSG00000080007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 28 // 11 // 11 // 0 /// AJ278110 // GenBank // Homo sapiens mRNA for DEAD-box protein (HAGE gene). // chr6 // 95 // 100 // 38 // 40 // 0 /// AK303324 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57506 complete cds, highly similar to Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43 (EC 3.6.1.-). // chr6 // 100 // 40 // 16 // 16 // 0 /// BC066938 // GenBank // Homo sapiens DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 43, mRNA (cDNA clone MGC:87287 IMAGE:4829072), complete cds. // chr6 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000008582 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:73394906:73416226:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 55 // 22 // 22 // 0
ENST00000384296 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:73464073:73464177:1 gene:ENSG00000207023 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT113560 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001159587 // RefSeq // Homo sapiens CD109 molecule (CD109), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 48 // 48 // 0 /// NM_001159588 // RefSeq // Homo sapiens CD109 molecule (CD109), transcript variant 3, mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 48 // 48 // 0 /// NM_133493 // RefSeq // Homo sapiens CD109 molecule (CD109), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 98 // 49 // 49 // 0 /// ENST00000287097 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:73696104:73828313:1 gene:ENSG00000156535 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 98 // 49 // 49 // 0 /// ENST00000422508 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:73695785:73828316:1 gene:ENSG00000156535 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 98 // 49 // 49 // 0 /// ENST00000437994 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:73695785:73828316:1 gene:ENSG00000156535 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 98 // 49 // 49 // 0 /// AF410459 // GenBank // Homo sapiens CD109 (CD109) mRNA, complete cds. // chr6 // 96 // 98 // 47 // 49 // 0 /// AY149920 // GenBank // Homo sapiens activated T-cell marker CD109 (CD109) mRNA, complete cds. // chr6 // 90 // 80 // 36 // 40 // 0 /// AY788891 // GenBank // Homo sapiens CD109 mRNA, complete cds. // chr6 // 92 // 78 // 36 // 39 // 0 /// GENSCAN00000008573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:73696216:73824653:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 64 // 32 // 32 // 0
ENST00000362920 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:41084607:41084713:1 gene:ENSG00000199790 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 75 // 3 // 3 // 0 /// ENST00000516328 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:75593055:75593145:1 gene:ENSG00000252137 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 75 // 3 // 3 // 0 /// NONHSAT096155 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 75 // 3 // 3 // 0 /// NONHSAT113621 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 75 // 3 // 3 // 0
NM_004999 // RefSeq // Homo sapiens myosin VI (MYO6), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000369975 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:75817523:75916612:1 gene:ENSG00000196586 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000369977 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:75749332:75916612:1 gene:ENSG00000196586 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000369981 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:75749192:75919537:1 gene:ENSG00000196586 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000369985 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:75749209:75919536:1 gene:ENSG00000196586 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// BC146764 // GenBank // Homo sapiens myosin VI, mRNA (cDNA clone MGC:166836 IMAGE:9007206), complete cds. // chr6 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// U90236 // GenBank // Homo sapiens myosin VI (MYO6) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000615563 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:75817516:75915217:1 gene:ENSG00000196586 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 87 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000020988 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:75817548:75909786:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 72 // 28 // 28 // 0
NONHSAT113636 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000363170 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:6:75928513:75928625:1 gene:ENSG00000200040 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT113637 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000410720 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:76092834:76092940:1 gene:ENSG00000222652 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT113639 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_031469 // RefSeq // Homo sapiens SH3 domain binding glutamate-rich protein like 2 (SH3BGRL2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000369838 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:79631283:79703659:1 gene:ENSG00000198478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF340151 // GenBank // Homo sapiens fovea-associated SH3 domain binding protein (FASH3) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC040489 // GenBank // Homo sapiens SH3 domain binding glutamic acid-rich protein like 2, mRNA (cDNA clone MGC:33682 IMAGE:5286092), complete cds. // chr6 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// BC052987 // GenBank // Homo sapiens SH3 domain binding glutamic acid-rich protein like 2, mRNA (cDNA clone MGC:60185 IMAGE:5503583), complete cds. // chr6 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// BC060799 // GenBank // Homo sapiens SH3 domain binding glutamic acid-rich protein like 2, mRNA (cDNA clone MGC:71608 IMAGE:30330699), complete cds. // chr6 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// BC070059 // GenBank // Homo sapiens SH3 domain binding glutamic acid-rich protein like 2, mRNA (cDNA clone MGC:87241 IMAGE:30346325), complete cds. // chr6 // 85 // 96 // 22 // 26 // 0 /// BC109043 // GenBank // Homo sapiens SH3 domain binding glutamic acid-rich protein like 2, mRNA (cDNA clone MGC:125696 IMAGE:40028800), complete cds. // chr6 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// BC109044 // GenBank // Homo sapiens SH3 domain binding glutamic acid-rich protein like 2, mRNA (cDNA clone MGC:125697 IMAGE:40028802), complete cds. // chr6 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// AK307145 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ97093. // chr6 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// GENSCAN00000024469 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:79668400:79723231:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
ENST00000391034 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:81622200:81622319:1 gene:ENSG00000212336 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK126547 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44583 fis, clone AHMSC1000138. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT113742 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000384159 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:6:81764024:81764156:1 gene:ENSG00000206886 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT113746 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001166392 // RefSeq // Homo sapiens trophoblast glycoprotein (TPBG), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NM_006670 // RefSeq // Homo sapiens trophoblast glycoprotein (TPBG), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000369750 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:82363631:82370828:1 gene:ENSG00000146242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000535040 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:82363206:82367417:1 gene:ENSG00000146242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000543496 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:82364244:82367417:1 gene:ENSG00000146242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AK291170 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78281 complete cds, highly similar to Homo sapiens trophoblast glycoprotein (TPBG), mRNA. // chr6 // 92 // 89 // 22 // 24 // 0 /// BC037161 // GenBank // Homo sapiens trophoblast glycoprotein, mRNA (cDNA clone MGC:15317 IMAGE:4138906), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000008524 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:82364962:82366224:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0
NM_001199942 // RefSeq // Homo sapiens dopey family member 1 (DOPEY1), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 94 // 44 // 44 // 0 /// NM_015018 // RefSeq // Homo sapiens dopey family member 1 (DOPEY1), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 94 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000237163 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:83067666:83168471:1 gene:ENSG00000083097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 94 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000349129 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:83067666:83168719:1 gene:ENSG00000083097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 94 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000369739 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:6:83096729:83168331:1 gene:ENSG00000083097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000484282 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:83137676:83171350:1 gene:ENSG00000083097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 40 // 19 // 19 // 0 /// AK094766 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ37447 fis, clone BRAWH2010136. // chr6 // 100 // 28 // 13 // 13 // 0 /// BC048342 // GenBank // Homo sapiens dopey family member 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5243500), partial cds. // chr6 // 100 // 30 // 14 // 14 // 0 /// BC144544 // GenBank // Homo sapiens dopey family member 1, mRNA (cDNA clone MGC:178088 IMAGE:9053071), complete cds. // chr6 // 100 // 87 // 41 // 41 // 0 /// BC150619 // GenBank // Homo sapiens dopey family member 1, mRNA (cDNA clone MGC:183529 IMAGE:9056989), complete cds. // chr6 // 100 // 87 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000006229 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:83096978:83168167:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 68 // 32 // 32 // 0
NM_033411 // RefSeq // Homo sapiens RWD domain containing 2A (RWDD2A), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000369724 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:83193379:83198932:1 gene:ENSG00000013392 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK295724 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58360 complete cds, highly similar to RWD domain-containing protein 2. // chr6 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// AK302978 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52176 complete cds, highly similar to RWD domain-containing protein 2. // chr6 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// BC010930 // GenBank // Homo sapiens RWD domain containing 2A, mRNA (cDNA clone MGC:13523 IMAGE:4105371), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC104816 // GenBank // Homo sapiens RWD domain containing 2A, mRNA (cDNA clone MGC:132476 IMAGE:8143819), complete cds. // chr6 // 94 // 62 // 15 // 16 // 0 /// BC112003 // GenBank // Homo sapiens RWD domain containing 2A, mRNA (cDNA clone MGC:138208 IMAGE:8327471), complete cds. // chr6 // 94 // 62 // 15 // 16 // 0 /// AK309249 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99290. // chr6 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// GENSCAN00000006235 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:83194452:83196272:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0
NM_001170423 // RefSeq // Homo sapiens protease, serine, 35 (PRSS35), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_153362 // RefSeq // Homo sapiens protease, serine, 35 (PRSS35), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000369700 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:83512538:83525704:1 gene:ENSG00000146250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AK291928 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75755 complete cds, highly similar to Homo sapiens protease, serine, 35 (PRSS35), mRNA. // chr6 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// AY358661 // GenBank // Homo sapiens clone DNA57253 ENML522 (UNQ522) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC037170 // GenBank // Homo sapiens protease, serine, 35, mRNA (cDNA clone MGC:46520 IMAGE:5241063), complete cds. // chr6 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_001009994 // RefSeq // Homo sapiens ripply transcriptional repressor 2 (RIPPLY2), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NR_103525 // RefSeq // Homo sapiens ripply transcriptional repressor 2 (RIPPLY2), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr6 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000369687 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:83853592:83857515:1 gene:ENSG00000203877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000369689 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:83853266:83857515:1 gene:ENSG00000203877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC130460 // GenBank // Homo sapiens ripply2 homolog (zebrafish), mRNA (cDNA clone MGC:163332 IMAGE:40146491), complete cds. // chr6 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// BC132968 // GenBank // Homo sapiens ripply2 homolog (zebrafish), mRNA (cDNA clone MGC:164599 IMAGE:40146990), complete cds. // chr6 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// AK124105 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ42111 fis, clone TESTI1000330. // chr6 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1 /// GENSCAN00000006227 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:83853308:83893622:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// NONHSAT113794 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1
NM_016230 // RefSeq // Homo sapiens cytochrome b5 reductase 4 (CYB5R4), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000369679 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:83859656:83910296:1 gene:ENSG00000065615 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 28 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000369681 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:83859643:83967424:1 gene:ENSG00000065615 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000479164 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:83926269:83955375:1 gene:ENSG00000065615 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 23 // 9 // 9 // 0 /// AF169803 // GenBank // Homo sapiens flavohemoprotein b5+b5R mRNA, complete cds. // chr6 // 97 // 82 // 31 // 32 // 0 /// BC025380 // GenBank // Homo sapiens cytochrome b5 reductase 4, mRNA (cDNA clone MGC:26107 IMAGE:4829042), complete cds. // chr6 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000013290 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:83909009:84089481:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 26 // 26 // 10 // 39 // 1 /// GENSCAN00000006227 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:83853308:83893622:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 23 // 23 // 9 // 39 // 1
NM_138409 // RefSeq // Homo sapiens melanocortin 2 receptor accessory protein 2 (MRAP2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_005248644 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens melanocortin 2 receptor accessory protein 2 (MRAP2), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_005248646 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens melanocortin 2 receptor accessory protein 2 (MRAP2), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000257776 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:84033756:84090881:1 gene:ENSG00000135324 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// AK292736 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78178 complete cds. // chr6 // 95 // 75 // 20 // 21 // 0 /// BC010003 // GenBank // Homo sapiens melanocortin 2 receptor accessory protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:16762 IMAGE:4134852), complete cds. // chr6 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC039855 // GenBank // Homo sapiens melanocortin 2 receptor accessory protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:48925 IMAGE:3850270), complete cds. // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000013290 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:83909009:84089481:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NM_002526 // RefSeq // Homo sapiens 5-nucleotidase, ecto (CD73) (NT5E), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000257770 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:85450091:85495778:1 gene:ENSG00000135318 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000369646 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:85450091:85471599:1 gene:ENSG00000135318 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 37 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000416334 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:85471381:85492161:1 gene:ENSG00000135318 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000437581 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:85485397:85491325:1 gene:ENSG00000135318 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 23 // 8 // 8 // 0 /// BC015940 // GenBank // Homo sapiens 5-nucleotidase, ecto (CD73), mRNA (cDNA clone IMAGE:3920680), complete cds. // chr6 // 100 // 37 // 13 // 13 // 0 /// BC065937 // GenBank // Homo sapiens 5-nucleotidase, ecto (CD73), mRNA (cDNA clone MGC:75146 IMAGE:6163101), complete cds. // chr6 // 97 // 89 // 30 // 31 // 0 /// DQ186653 // GenBank // Homo sapiens liver ecto-5-nucleotidase (NT5E) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0 /// NM_001204813 // RefSeq // Homo sapiens 5-nucleotidase, ecto (CD73) (NT5E), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 83 // 83 // 29 // 35 // 1 /// ENST00000369651 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:85449584:85495791:1 gene:ENSG00000135318 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 83 // 83 // 29 // 35 // 1 /// GENSCAN00000039281 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:85450140:85494004:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0
ENST00000410754 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:85751581:85751753:1 gene:ENSG00000222686 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONHSAT113870 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
ENST00000471845 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:86435848:86436138:1 gene:ENSG00000243124 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT113881 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0
NM_000865 // RefSeq // Homo sapiens 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 1E, G protein-coupled (HTR1E), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000305344 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:86937306:87016683:1 gene:ENSG00000168830 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF498980 // GenBank // Homo sapiens 5-hydroxytryptamine receptor 1E (HTR1E) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// BC069751 // GenBank // Homo sapiens 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 1E, mRNA (cDNA clone MGC:97353 IMAGE:7262611), complete cds. // chr6 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// M91467 // GenBank // Human serotonin receptor (5HT1E) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000013925 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:87015335:87016432:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0
ENST00000516888 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:87083233:87083536:1 gene:ENSG00000252697 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT113894 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_015021 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 292 (ZNF292), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000339907 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:6:87155581:87261920:1 gene:ENSG00000188994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000369577 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:87155549:87264196:1 gene:ENSG00000188994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000485016 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:87213738:87222867:1 gene:ENSG00000188994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000369578 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:87155565:87223936:1 gene:ENSG00000188994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 31 // 31 // 12 // 39 // 1 /// ENST00000524067 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:87213714:87222904:1 gene:ENSG00000188994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 26 // 26 // 10 // 39 // 1 /// AK123473 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ41479 fis, clone BRTHA2002442. // chr6 // 31 // 31 // 12 // 39 // 1 /// GENSCAN00000013924 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:87149952:87322946:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 87 // 34 // 34 // 0
NM_001042493 // RefSeq // Homo sapiens small integral membrane protein 8 (SMIM8), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NM_020425 // RefSeq // Homo sapiens small integral membrane protein 8 (SMIM8), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000229570 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:87322593:87342322:1 gene:ENSG00000111850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000392863 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:87322588:87342328:1 gene:ENSG00000111850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000608353 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:6:87322583:87341759:1 gene:ENSG00000111850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AF311339 // GenBank // Homo sapiens DC18 mRNA, complete cds. // chr6 // 86 // 92 // 19 // 22 // 0 /// BC070260 // GenBank // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 162, mRNA (cDNA clone MGC:88247 IMAGE:6452586), complete cds. // chr6 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000608868 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:87322632:87340504:1 gene:ENSG00000111850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 75 // 75 // 18 // 24 // 1 /// NM_001287445 // RefSeq // Homo sapiens small integral membrane protein 8 (SMIM8), transcript variant 3, mRNA. // chr6 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1 /// GENSCAN00000013921 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:87337032:87365396:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1
NM_001010868 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 163 (C6orf163), mRNA. // chr6 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// XM_006715370 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 163 (C6orf163), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// XM_006715372 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 163 (C6orf163), transcript variant X5, mRNA. // chr6 // 100 // 33 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000369574 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:87356144:87365318:1 gene:ENSG00000203872 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000388923 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:87344849:87365463:1 gene:ENSG00000203872 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000608891 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:87359093:87365463:1 gene:ENSG00000203872 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 33 // 8 // 8 // 0 /// AK092941 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ35622 fis, clone SPLEN2010978. // chr6 // 91 // 96 // 21 // 23 // 0 /// BC044236 // GenBank // Homo sapiens, clone IMAGE:5742882, mRNA. // chr6 // 100 // 33 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000608326 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:6:87347502:87365462:1 gene:ENSG00000203872 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 1 /// GENSCAN00000013921 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:87337032:87365396:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0
NM_001031743 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 165 (C6orf165), mRNA. // chr6 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000296885 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:87408013:87436057:1 gene:ENSG00000272514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000369562 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:87407983:87464465:1 gene:ENSG00000272514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000480123 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:87408489:87418331:1 gene:ENSG00000272514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 93 // 41 // 13 // 14 // 0 /// ENST00000489338 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:87408026:87464460:1 gene:ENSG00000272514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000507897 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:87408012:87496140:1 gene:ENSG00000213204 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// AK093830 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ36511 fis, clone TRACH2001249. // chr6 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// BC035083 // GenBank // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 165, mRNA (cDNA clone MGC:43118 IMAGE:5260875), complete cds. // chr6 // 91 // 94 // 29 // 32 // 0 /// GENSCAN00000013917 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:87409840:87464250:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 41 // 14 // 14 // 0 /// AK292584 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76955 complete cds. // chr6 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0
ENST00000383988 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:87488445:87488552:1 gene:ENSG00000206715 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT113907 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000459219 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:6:87720915:87721018:1 gene:ENSG00000238628 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT113916 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000488870 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:87845650:87845947:1 gene:ENSG00000240997 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT113920 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_030960 // RefSeq // Homo sapiens sperm acrosome associated 1 (SPACA1), mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000237201 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:88047789:88066832:1 gene:ENSG00000118434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000462227 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:88059453:88066832:1 gene:ENSG00000118434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 51 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000462690 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:88059453:88066832:1 gene:ENSG00000118434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 43 // 15 // 15 // 0 /// AF203447 // GenBank // Homo sapiens sperm acrosome membrane protein SAMP32 (SAMP32) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// BC029488 // GenBank // Homo sapiens sperm acrosome associated 1, mRNA (cDNA clone MGC:32952 IMAGE:5270534), complete cds. // chr6 // 97 // 89 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000018578 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:88047906:88066335:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT113924 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 51 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT113925 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 43 // 15 // 15 // 0
BC044919 // GenBank // Homo sapiens proline-rich nuclear receptor coactivator 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5295281), complete cds. // chr6 // 100 // 45 // 10 // 10 // 0 /// NM_006813 // RefSeq // Homo sapiens proline-rich nuclear receptor coactivator 1 (PNRC1), mRNA. // chr6 // 91 // 91 // 20 // 22 // 1 /// ENST00000336032 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:89080778:89085160:1 gene:ENSG00000146278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 91 // 91 // 20 // 22 // 1 /// BC018112 // GenBank // Homo sapiens proline-rich nuclear receptor coactivator 1, mRNA (cDNA clone MGC:8929 IMAGE:3916954), complete cds. // chr6 // 91 // 91 // 20 // 22 // 1 /// U03105 // GenBank // Human B4-2 protein mRNA, complete cds. // chr6 // 91 // 91 // 20 // 22 // 1 /// AY303779 // GenBank // Homo sapiens proline rich 2 protein (PROL2) mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr6 // 55 // 55 // 12 // 22 // 1 /// ENST00000369472 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:6:89080751:89084345:1 gene:ENSG00000146278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 36 // 36 // 8 // 22 // 1 /// AK130722 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ27212 fis, clone SYN03631, highly similar to Homo sapiens proline rich 2 (PROL2). // chr6 // 36 // 36 // 8 // 22 // 1 /// GENSCAN00000037122 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:89035707:89084196:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 55 // 55 // 12 // 22 // 1
ENST00000580171 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:89090946:89091242:1 gene:ENSG00000264017 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT113938 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_001010853 // RefSeq // Homo sapiens peptidase M20 domain containing 2 (PM20D2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_005248662 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens peptidase M20 domain containing 2 (PM20D2), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000275072 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:89146050:89165565:1 gene:ENSG00000146281 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AK302464 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53568 complete cds. // chr6 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// BC035036 // GenBank // Homo sapiens peptidase M20 domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:33973 IMAGE:5262128), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000037142 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:89146145:89162263:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0
ENST00000471305 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:89478141:89478433:1 gene:ENSG00000239316 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT113945 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NONHSAT113964 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000362760 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:6:89841329:89841424:1 gene:ENSG00000199630 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF074983 // GenBank // Homo sapiens full length insert cDNA YH66C10. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT113967 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT113968 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_032602 // RefSeq // Homo sapiens gap junction protein, alpha 10, 62kDa (GJA10), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000369352 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:89894469:89896120:1 gene:ENSG00000135355 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF296766 // GenBank // Homo sapiens connexin 62 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037123 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:89894469:89895908:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0
ENST00000574491 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:91726810:91727070:1 gene:ENSG00000262095 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONHSAT113996 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
ENST00000490790 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:91739609:91739897:1 gene:ENSG00000240961 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT113999 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000363622 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:6:92119423:92119633:1 gene:ENSG00000200492 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT114002 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
ENST00000408528 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:6:92790453:92790665:1 gene:ENSG00000221455 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT114014 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000516440 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:6:93879106:93879229:1 gene:ENSG00000252249 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT114031 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_006581 // RefSeq // Homo sapiens fucosyltransferase 9 (alpha (1,3) fucosyltransferase) (FUT9), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000302103 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:96015984:96215612:1 gene:ENSG00000172461 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB023021 // GenBank // Homo sapiens FUT9 mRNA for alpha-1,3-fucosyltransferase IX, complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// AY800264 // GenBank // Homo sapiens fucosyltransferase 9 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// BC036101 // GenBank // Homo sapiens fucosyltransferase 9 (alpha (1,3) fucosyltransferase), mRNA (cDNA clone MGC:33876 IMAGE:5286309), complete cds. // chr6 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000011249 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:96175118:96204235:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0
ENST00000486314 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:96282567:96282863:1 gene:ENSG00000242560 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT114056 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 91 // 100 // 21 // 23 // 0
NM_015323 // RefSeq // Homo sapiens UFM1-specific ligase 1 (UFL1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENST00000369278 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:96521808:96555276:1 gene:ENSG00000014123 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// AK295934 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51863 complete cds. // chr6 // 100 // 86 // 37 // 37 // 0 /// AK316453 // GenBank // Homo sapiens cDNA, FLJ79352 complete cds. // chr6 // 90 // 47 // 18 // 20 // 0 /// BC028608 // GenBank // Homo sapiens KIAA0776, mRNA (cDNA clone MGC:33250 IMAGE:4825054), complete cds. // chr6 // 100 // 98 // 42 // 42 // 0 /// BC036379 // GenBank // Homo sapiens KIAA0776, mRNA (cDNA clone MGC:33225 IMAGE:5267922), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000011252 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:96298661:96553503:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 70 // 70 // 30 // 43 // 1
NM_001170807 // RefSeq // Homo sapiens four and a half LIM domains 5 (FHL5), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NM_020482 // RefSeq // Homo sapiens four and a half LIM domains 5 (FHL5), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006715613 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens four and a half LIM domains 5 (FHL5), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000326771 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:96562584:96616568:1 gene:ENSG00000112214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000450218 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:96562584:96610697:1 gene:ENSG00000112214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 92 // 48 // 12 // 13 // 0 /// ENST00000541107 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:96562548:96616636:1 gene:ENSG00000112214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AF278541 // GenBank // Homo sapiens LIM protein ACT mRNA, complete cds. // chr6 // 95 // 70 // 18 // 19 // 0 /// BC021723 // GenBank // Homo sapiens four and a half LIM domains 5, mRNA (cDNA clone MGC:33058 IMAGE:4827311), complete cds. // chr6 // 95 // 70 // 18 // 19 // 0 /// BC029490 // GenBank // Homo sapiens four and a half LIM domains 5, mRNA (cDNA clone MGC:32991 IMAGE:5273208), complete cds. // chr6 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000011253 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:96603614:96615772:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0
NM_005604 // RefSeq // Homo sapiens POU class 3 homeobox 2 (POU3F2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000328345 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:98834592:98839490:1 gene:ENSG00000184486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC051699 // GenBank // Homo sapiens POU class 3 homeobox 2, mRNA (cDNA clone MGC:26417 IMAGE:4817001), complete cds. // chr6 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// GENSCAN00000042268 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:98802719:98836205:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1
ENST00000602288 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:99174744:99175479:1 gene:ENSG00000232699 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000016127 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:99174744:99175481:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
ENST00000384290 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:6:99526097:99526205:1 gene:ENSG00000274603 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA gene:ENSG00000228439 // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NR_004391 // RefSeq // Homo sapiens RNA, Ro-associated Y1 (RNY1), Y RNA. // chr6 // 50 // 100 // 2 // 4 // 0 /// ENST00000364228 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:7:148987136:148987248:-1 gene:ENSG00000201098 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 50 // 100 // 2 // 4 // 0 /// NONHSAT114127 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT123989 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 50 // 100 // 2 // 4 // 0 /// y_rnas // lncRNA Db // hg18 chr7:148315161-148315273 RNY1 (gi|161087011|ref|NR_004391.1| Homo sapiens RNA, Ro-associated Y1 small cytoplasmic RNA) // chr6 // 50 // 100 // 2 // 4 // 0
NM_021620 // RefSeq // Homo sapiens PR domain containing 13 (PRDM13), mRNA. // chr6 // 95 // 98 // 37 // 39 // 0 /// ENST00000369214 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:99606774:99615578:1 gene:ENSG00000112238 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000369215 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:99606730:99614759:1 gene:ENSG00000112238 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 95 // 95 // 36 // 38 // 0 /// AY004253 // GenBank // Homo sapiens PR-domain containing protein 13 (PRDM13) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000016117 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:99607035:99614759:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 63 // 63 // 25 // 40 // 1
NONHSAT114167 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000365413 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:6:103583135:103583268:1 gene:ENSG00000202283 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT114184 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000517135 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:104766822:104766926:1 gene:ENSG00000252944 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT114198 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001004317 // RefSeq // Homo sapiens lin-28 homolog B (C. elegans) (LIN28B), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000345080 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:104957048:105083332:1 gene:ENSG00000187772 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC137526 // GenBank // Homo sapiens lin-28 homolog B (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:169149 IMAGE:9021526), complete cds. // chr6 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0 /// BC137527 // GenBank // Homo sapiens lin-28 homolog B (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:169150 IMAGE:9021527), complete cds. // chr6 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0 /// DQ127228 // GenBank // Homo sapiens LIN28B mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
ENST00000363328 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:105904373:105904687:1 gene:ENSG00000200198 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONHSAT114224 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
ENST00000516635 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:106304176:106304286:1 gene:ENSG00000252444 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT114232 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000365516 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:106449381:106449497:1 gene:ENSG00000202386 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr6 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT114236 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0
ENST00000363444 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:6:106454828:106454929:1 gene:ENSG00000200314 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT114238 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_001624 // RefSeq // Homo sapiens absent in melanoma 1 (AIM1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000369066 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:106511855:106570451:1 gene:ENSG00000112297 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000457437 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:106541134:106555897:1 gene:ENSG00000112297 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 28 // 9 // 9 // 0 /// AK297008 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56460 complete cds, highly similar to Absent in melanoma 1 protein. // chr6 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// AK300443 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61405 complete cds, highly similar to Absent in melanoma 1 protein. // chr6 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0 /// AK316287 // GenBank // Homo sapiens cDNA, FLJ79186 complete cds, highly similar to Absent in melanoma 1 protein. // chr6 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0 /// BC062788 // GenBank // Homo sapiens absent in melanoma 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4769888), partial cds. // chr6 // 100 // 28 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000008464 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:106461788:106568678:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0
ENST00000363425 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:106607716:106607819:1 gene:ENSG00000200295 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT114246 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0
NM_018292 // RefSeq // Homo sapiens glutaminyl-tRNA synthase (glutamine-hydrolyzing)-like 1 (QRSL1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000369044 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:106629614:106653823:1 gene:ENSG00000130348 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000369046 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:106629578:106668417:1 gene:ENSG00000130348 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AK022251 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ12189 fis, clone MAMMA1000841, moderately similar to PUTATIVE AMIDASE (EC 3.5.1.4). // chr6 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// BC006084 // GenBank // Homo sapiens glutaminyl-tRNA synthase (glutamine-hydrolyzing)-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:12589 IMAGE:3605968), complete cds. // chr6 // 93 // 93 // 27 // 29 // 1 /// BC014389 // GenBank // Homo sapiens glutaminyl-tRNA synthase (glutamine-hydrolyzing)-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:907 IMAGE:3504569), complete cds. // chr6 // 93 // 93 // 27 // 29 // 1 /// GENSCAN00000008463 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:106642710:106716430:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1
NM_001142468 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 203 (C6orf203), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001142470 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 203 (C6orf203), transcript variant 3, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_016487 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 203 (C6orf203), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_005267008 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 203 (C6orf203), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000311381 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:107028213:107051342:1 gene:ENSG00000130349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000405204 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:107028213:107051336:1 gene:ENSG00000130349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC010899 // GenBank // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 203, mRNA (cDNA clone MGC:13381 IMAGE:4078296), complete cds. // chr6 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000038083 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:106944551:107051236:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
ENST00000516316 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:107133071:107133170:1 gene:ENSG00000252125 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONHSAT114296 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_018013 // RefSeq // Homo sapiens sine oculis binding protein homolog (Drosophila) (SOBP), mRNA. // chr6 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// XM_005267042 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens sine oculis binding protein homolog (Drosophila) (SOBP), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000317357 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:107489958:107660167:1 gene:ENSG00000112320 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// DQ507800 // GenBank // Homo sapiens JXC1 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// BC014859 // GenBank HTC // Homo sapiens sine oculis binding protein homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:3875312), with apparent retained intron. // chr6 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1 /// ENST00000477448 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:107490106:107558287:1 gene:ENSG00000112320 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// AK090879 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ33560 fis, clone BRAMY2009557. // chr6 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// ENST00000618129 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:107490604:107515073:1 gene:ENSG00000112320 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000038076 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:107503675:107545432:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// GENSCAN00000038078 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:107633622:107635466:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1
ENST00000459408 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:107930088:107930182:1 gene:ENSG00000238420 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT114318 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000364811 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:6:108060818:108060930:1 gene:ENSG00000238490 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT114329 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_001286102 // RefSeq // Homo sapiens nuclear receptor subfamily 2, group E, member 1 (NR2E1), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NM_003269 // RefSeq // Homo sapiens nuclear receptor subfamily 2, group E, member 1 (NR2E1), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000368983 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:6:108168023:108188802:1 gene:ENSG00000112333 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000368986 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:108166058:108188809:1 gene:ENSG00000112333 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB307709 // GenBank // Homo sapiens NR2E1 mRNA for tailes-related receptor, complete cds. // chr6 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// AF220532 // GenBank // Homo sapiens orphan nuclear receptor (NR2E1) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF411525 // GenBank // Homo sapiens nuclear receptor subfamily 2 group E member 1 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// BC028031 // GenBank // Homo sapiens nuclear receptor subfamily 2, group E, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:39998 IMAGE:5242079), complete cds. // chr6 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// HQ692846 // GenBank // Homo sapiens nuclear receptor TLX (NR2E1) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000006587 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:108165268:108181655:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1
ENST00000384247 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:108292766:108292869:1 gene:ENSG00000206974 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONHSAT114343 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
ENST00000363929 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:108392073:108392177:1 gene:ENSG00000200799 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT114349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_001455 // RefSeq // Homo sapiens forkhead box O3 (FOXO3), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0 /// ENST00000406360 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:108560866:108684768:1 gene:ENSG00000118689 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0 /// AF032886 // GenBank // Homo sapiens forkhead protein (FKHRL1) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0 /// BC068552 // GenBank // Homo sapiens forkhead box O3, mRNA (cDNA clone MGC:87459 IMAGE:30347471), complete cds. // chr6 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0
NM_001277339 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein FLJ37396 (LOC100996634), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000453496 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:109236614:109271014:1 gene:ENSG00000243587 gene_biotype:polymorphic_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AK094715 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ37396 fis, clone BRAMY2027396. // chr6 // 91 // 100 // 20 // 22 // 0 /// GENSCAN00000029751 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:109169692:109316189:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0
ENST00000364153 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:6:109305494:109305595:1 gene:ENSG00000201023 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT114391 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_003080 // RefSeq // Homo sapiens sphingomyelin phosphodiesterase 2, neutral membrane (neutral sphingomyelinase) (SMPD2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000258052 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:109440763:109443919:1 gene:ENSG00000135587 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000458487 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:6:109442571:109443556:1 gene:ENSG00000135587 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// BC000038 // GenBank // Homo sapiens sphingomyelin phosphodiesterase 2, neutral membrane (neutral sphingomyelinase), mRNA (cDNA clone MGC:1617 IMAGE:3509845), complete cds. // chr6 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// AK310148 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17190. // chr6 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// GENSCAN00000029749 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:109394602:109443905:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
NM_014845 // RefSeq // Homo sapiens FIG4 homolog, SAC1 lipid phosphatase domain containing (S. cerevisiae) (FIG4), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000230124 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:109691312:109825428:1 gene:ENSG00000112367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000454215 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:109701720:109738453:1 gene:ENSG00000112367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// AK291671 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76880 complete cds. // chr6 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// AK293422 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57101 complete cds, highly similar to SAC domain-containing protein 3. // chr6 // 95 // 70 // 18 // 19 // 0 /// BC041338 // GenBank // Homo sapiens FIG4 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:41828 IMAGE:5274004), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000029747 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:109705488:109825265:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0
NM_001286099 // RefSeq // Homo sapiens G protein-coupled receptor 6 (GPR6), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// NM_005284 // RefSeq // Homo sapiens G protein-coupled receptor 6 (GPR6), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000275169 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:109979113:109980201:1 gene:ENSG00000146360 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000414000 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:109978256:109980718:1 gene:ENSG00000146360 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// AK294648 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59257 complete cds, highly similar to Sphingosine 1-phosphate receptor GPR6. // chr6 // 78 // 72 // 14 // 18 // 0 /// AK295250 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56400 complete cds, highly similar to Sphingosine 1-phosphate receptor GPR6. // chr6 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// BC043414 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 6, mRNA (cDNA clone MGC:41859 IMAGE:5294842), complete cds. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC117298 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 6, mRNA (cDNA clone MGC:150907 IMAGE:40125849), complete cds. // chr6 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// BC126301 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 6, mRNA (cDNA clone MGC:161579 IMAGE:8992017), complete cds. // chr6 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// HQ709190 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 6 (GPR6) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// HQ709191 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 6 (GPR6) mRNA, complete cds. // chr6 // 88 // 68 // 15 // 17 // 0 /// GENSCAN00000010415 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:109976845:110055299:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
ENST00000391285 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:6:110848546:110848673:1 gene:ENSG00000212587 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr6 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// NONHSAT114435 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0
ENST00000362490 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:110856417:110856522:1 gene:ENSG00000199360 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT114436 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_138408 // RefSeq // Homo sapiens general transcription factor IIIC, polypeptide 6, alpha 35kDa (GTF3C6), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000329970 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:110958560:110967890:1 gene:ENSG00000155115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000480191 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:110958928:110967890:1 gene:ENSG00000155115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 64 // 9 // 9 // 0 /// BC011593 // GenBank // Homo sapiens general transcription factor IIIC, polypeptide 6, alpha 35kDa, mRNA (cDNA clone MGC:20479 IMAGE:4639268), complete cds. // chr6 // 100 // 79 // 11 // 11 // 0 /// BC104655 // GenBank // Homo sapiens general transcription factor IIIC, polypeptide 6, alpha 35kDa, mRNA (cDNA clone IMAGE:6739343), partial cds. // chr6 // 90 // 71 // 9 // 10 // 0 /// EF137904 // GenBank // Homo sapiens TFIIIC35 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 71 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000005675 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:110958770:110967790:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 71 // 10 // 10 // 0 /// NONHSAT114438 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 71 // 10 // 10 // 0
NONHSAT114439 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001289111 // RefSeq // Homo sapiens ribosome production factor 2 homolog (S. cerevisiae) (RPF2), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NM_032194 // RefSeq // Homo sapiens ribosome production factor 2 homolog (S. cerevisiae) (RPF2), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000368864 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:110982015:111024327:1 gene:ENSG00000197498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 64 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000441448 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:110982015:111026100:1 gene:ENSG00000197498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000607388 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:110982050:111028263:1 gene:ENSG00000197498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// AK292165 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76924 complete cds, highly similar to Homo sapiens brix domain containing 1 (BXDC1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// AK301662 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57639 complete cds, highly similar to Brix domain-containing protein 1. // chr6 // 100 // 64 // 9 // 9 // 0 /// BC035314 // GenBank // Homo sapiens brix domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:21067 IMAGE:4745524), complete cds. // chr6 // 100 // 79 // 11 // 11 // 0 /// NONHSAT114441 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 57 // 8 // 8 // 0 /// NONHSAT114442 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 93 // 13 // 13 // 0
NM_153369 // RefSeq // Homo sapiens KIAA1919 (KIAA1919), mRNA. // chr6 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000368847 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:111259348:111271167:1 gene:ENSG00000173214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// AB067506 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1919 protein, partial cds. // chr6 // 100 // 45 // 14 // 14 // 0 /// AK292735 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78034 complete cds. // chr6 // 96 // 87 // 26 // 27 // 0 /// BC036115 // GenBank // Homo sapiens KIAA1919, mRNA (cDNA clone MGC:33953 IMAGE:5298999), complete cds. // chr6 // 93 // 87 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000005666 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:111104610:111267119:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1
NM_001033564 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 229, member B (FAM229B), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000368656 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:112087599:112102790:1 gene:ENSG00000203778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000604268 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:112087638:112100895:1 gene:ENSG00000203778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// BC044912 // GenBank // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 225, mRNA (cDNA clone MGC:44120 IMAGE:5286266), complete cds. // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
NM_001013734 // RefSeq // Homo sapiens ret finger protein-like 4B (RFPL4B), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000441065 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:112347330:112351296:1 gene:ENSG00000251258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000587816 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:112236806:112350094:1 gene:ENSG00000226440 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr6 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000590673 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:112236806:112349814:1 gene:ENSG00000226440 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr6 // 95 // 70 // 18 // 19 // 0 /// BC132796 // GenBank // Homo sapiens ret finger protein-like 4B, mRNA (cDNA clone MGC:164427 IMAGE:40146818), complete cds. // chr6 // 93 // 52 // 13 // 14 // 0 /// BC132798 // GenBank // Homo sapiens ret finger protein-like 4B, mRNA (cDNA clone MGC:164429 IMAGE:40146820), complete cds. // chr6 // 93 // 52 // 13 // 14 // 0 /// ENST00000585611 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:112236806:112349918:1 gene:ENSG00000226440 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr6 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1 /// NONHSAT114512 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr6 // 95 // 70 // 18 // 19 // 0 /// NONHSAT114515 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr6 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NONHSAT114527 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000364516 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:112971493:112971599:1 gene:ENSG00000201386 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT114534 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000480085 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:113839279:113839621:1 gene:ENSG00000219758 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000033232 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:113819848:113855885:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 87 // 100 // 20 // 23 // 0
NM_002356 // RefSeq // Homo sapiens myristoylated alanine-rich protein kinase C substrate (MARCKS), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC089040 // GenBank // Homo sapiens myristoylated alanine-rich protein kinase C substrate, mRNA (cDNA clone MGC:99613 IMAGE:6378349), complete cds. // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// D10522 // GenBank // Homo sapiens mRNA for 80K-L protein, complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// M68956 // GenBank // Human myristoylated alanine-rich C-kinase substrate mRNA, complete cds. // chr6 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// ENST00000612661 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:113857362:113863471:1 gene:ENSG00000277443 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000617290 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:113857438:113861146:1 gene:ENSG00000277443 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000033229 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:113857746:113860579:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// NONHSAT114573 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT114574 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0
NM_152729 // RefSeq // Homo sapiens 5-nucleotidase domain containing 1 (NT5DC1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XM_006715377 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens 5-nucleotidase domain containing 1 (NT5DC1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 50 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000319550 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:116100849:116249497:1 gene:ENSG00000178425 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000419791 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:116100851:116145495:1 gene:ENSG00000178425 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 36 // 8 // 8 // 0 /// AK290408 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76092 complete cds, highly similar to Homo sapiens 5-nucleotidase, cytosolic II-like 1 (NT5C2L1), mRNA. // chr6 // 93 // 68 // 14 // 15 // 0 /// BC108699 // GenBank // Homo sapiens 5-nucleotidase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:131837 IMAGE:6061738), complete cds. // chr6 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0 /// BC136832 // GenBank // Homo sapiens 5-nucleotidase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:168446 IMAGE:9020823), complete cds. // chr6 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0 /// BC136841 // GenBank // Homo sapiens 5-nucleotidase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:168455 IMAGE:9020832), complete cds. // chr6 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0 /// AK090918 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ33599 fis, clone BRAMY2013736, highly similar to 5-nucleotidase domain-containing protein 1. // chr6 // 50 // 50 // 11 // 22 // 1
NM_001010919 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 26, member F (FAM26F), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000368604 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:6:116462467:116463768:1 gene:ENSG00000188820 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000368605 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:116461393:116463779:1 gene:ENSG00000188820 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// AF086130 // GenBank // Homo sapiens full length insert cDNA clone ZA84A12. // chr6 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// BC146842 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 26, member F, mRNA (cDNA clone MGC:181945 IMAGE:9056770), complete cds. // chr6 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NM_001276460 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 26, member F (FAM26F), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1 /// ENST00000368606 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:6:116461370:116463768:1 gene:ENSG00000188820 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1 /// GENSCAN00000041160 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:116461324:116463705:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0
NM_153711 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 26, member E (FAM26E), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000368599 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:116511646:116524792:1 gene:ENSG00000178033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0
NM_001010892 // RefSeq // Homo sapiens radial spoke head 4 homolog A (Chlamydomonas) (RSPH4A), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NM_001161664 // RefSeq // Homo sapiens radial spoke head 4 homolog A (Chlamydomonas) (RSPH4A), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000229554 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:116616487:116632978:1 gene:ENSG00000111834 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000368581 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:116616479:116632985:1 gene:ENSG00000111834 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// AK299754 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58105 complete cds, highly similar to Homo sapiens radial spokehead-like 3 (RSHL3), mRNA. // chr6 // 94 // 100 // 32 // 34 // 0 /// BC106949 // GenBank // Homo sapiens radial spoke head 4 homolog A (Chlamydomonas), mRNA (cDNA clone MGC:126303 IMAGE:40034633), complete cds. // chr6 // 97 // 88 // 29 // 30 // 0 /// ENST00000368580 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:116616624:116632441:1 gene:ENSG00000111834 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 59 // 59 // 20 // 34 // 1 /// GENSCAN00000041162 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:116616624:116632441:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0
NM_002269 // RefSeq // Homo sapiens karyopherin alpha 5 (importin alpha 6) (KPNA5), mRNA. // chr6 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// XM_005266964 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens karyopherin alpha 5 (importin alpha 6) (KPNA5), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000356348 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:116681204:116741866:1 gene:ENSG00000196911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000368564 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:116681187:116735644:1 gene:ENSG00000196911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000392517 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:116729563:116741866:1 gene:ENSG00000196911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 21 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000413340 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:116681187:116698798:1 gene:ENSG00000196911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0 /// AF005361 // GenBank // Homo sapiens importin alpha 6 mRNA, complete cds. // chr6 // 94 // 84 // 30 // 32 // 0 /// BC047409 // GenBank // Homo sapiens karyopherin alpha 5 (importin alpha 6), mRNA (cDNA clone MGC:51011 IMAGE:5297277), complete cds. // chr6 // 97 // 95 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000041165 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:116673863:116732323:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0
ENST00000487683 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:116877212:116923528:1 gene:ENSG00000185002 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 71 // 34 // 34 // 0 /// NM_173560 // RefSeq // Homo sapiens regulatory factor X, 6 (RFX6), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 48 // 48 // 1 /// ENST00000332958 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:116877260:116932163:1 gene:ENSG00000185002 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 96 // 46 // 48 // 1 /// BC039248 // GenBank // Homo sapiens regulatory factor X, 6, mRNA (cDNA clone MGC:33442 IMAGE:5272028), complete cds. // chr6 // 98 // 98 // 47 // 48 // 1 /// ENST00000471966 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:116884789:116918110:1 gene:ENSG00000185002 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 25 // 25 // 12 // 48 // 1 /// GENSCAN00000045756 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:116877276:116931506:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 63 // 30 // 30 // 0 /// NONHSAT114664 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 25 // 25 // 12 // 48 // 1
NM_182645 // RefSeq // Homo sapiens vestigial-like family member 2 (VGLL2), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_005266883 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens vestigial like 2 (Drosophila) (VGLL2), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000326274 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:117265574:117273562:1 gene:ENSG00000170162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// BC069316 // GenBank // Homo sapiens vestigial like 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:7262154), complete cds. // chr6 // 100 // 28 // 9 // 9 // 0 /// NM_153453 // RefSeq // Homo sapiens vestigial-like family member 2 (VGLL2), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// ENST00000352536 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:117265558:117273565:1 gene:ENSG00000170162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// AY056583 // GenBank // Homo sapiens transcription cofactor vestigial-like 2 protein (VGL2) mRNA, complete cds. // chr6 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// BC100798 // GenBank // Homo sapiens vestigial like 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:40000690), complete cds. // chr6 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// BC100799 // GenBank // Homo sapiens vestigial like 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:40000691), complete cds. // chr6 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// BC118545 // GenBank // Homo sapiens vestigial like 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:40000693), complete cds. // chr6 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// BC118622 // GenBank // Homo sapiens vestigial like 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:40000692), complete cds. // chr6 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// GENSCAN00000045763 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:117265764:117268631:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0
ENST00000516005 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:117299364:117299638:1 gene:ENSG00000251814 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT114667 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000410781 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:117301455:117301758:1 gene:ENSG00000222713 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT114668 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001029858 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 35, member F1 (SLC35F1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000360388 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:117907526:118317676:1 gene:ENSG00000196376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AK295860 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56332 complete cds, highly similar to Homo sapiens solute carrier family 35, member F1 (SLC35F1), mRNA. // chr6 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// BC028615 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 35, member F1, mRNA (cDNA clone MGC:33512 IMAGE:4817165), complete cds. // chr6 // 94 // 100 // 32 // 34 // 0 /// BC114925 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 35, member F1, mRNA (cDNA clone MGC:133177 IMAGE:40025808), complete cds. // chr6 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000621341 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:118154442:118317676:1 gene:ENSG00000196376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000008983 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:118147270:118314252:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 53 // 53 // 18 // 34 // 1
NR_002730 // RefSeq // Homo sapiens bromodomain containing 7 pseudogene 3 (BRD7P3), non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000469424 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:118501430:118502906:1 gene:ENSG00000169075 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AF167351 // GenBank // Homo sapiens FT002 (FT002) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NR_002730 // RefSeq // Homo sapiens bromodomain containing 7 pseudogene 3 (BRD7P3), non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000469424 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:118501430:118502906:1 gene:ENSG00000169075 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 44 // 44 // 8 // 18 // 1
NM_002667 // RefSeq // Homo sapiens phospholamban (PLN), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000357525 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:118548298:118560730:1 gene:ENSG00000198523 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC005269 // GenBank // Homo sapiens phospholamban, mRNA (cDNA clone MGC:12311 IMAGE:3934199), complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// M60411 // GenBank // Human phospholamban mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// M63603 // GenBank // Human phospholamban mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0
NM_014034 // RefSeq // Homo sapiens anti-silencing function 1A histone chaperone (ASF1A), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000229595 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:118894220:118909167:1 gene:ENSG00000111875 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB028628 // GenBank // Homo sapiens mRNA for CIA, complete cds. // chr6 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// AF279306 // GenBank // Homo sapiens anti-silencing function 1A (ASF1A) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// CR457347 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834D0510D for gene ASF1A, ASF1 anti-silencing function 1 homolog A (S. cerevisiae); complete cds, incl. stopcodon. // chr6 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// AF151856 // GenBank // Homo sapiens CGI-98 protein mRNA, complete cds. // chr6 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1 /// BC010878 // GenBank // Homo sapiens ASF1 anti-silencing function 1 homolog A (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:1429 IMAGE:3546858), complete cds. // chr6 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// GENSCAN00000027881 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:118894414:118907614:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0
ENST00000410717 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:6:119057880:119057974:1 gene:ENSG00000222649 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT114704 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000363862 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:119327281:119327385:1 gene:ENSG00000200732 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT114710 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000383871 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:121354354:121354460:1 gene:ENSG00000206598 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT114731 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_000165 // RefSeq // Homo sapiens gap junction protein, alpha 1, 43kDa (GJA1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000282561 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:121435692:121449727:1 gene:ENSG00000152661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// AK295460 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53043 complete cds, highly similar to Gap junction alpha-1 protein. // chr6 // 100 // 61 // 11 // 11 // 0 /// AK297764 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51901 complete cds, highly similar to Gap junction alpha-1 protein. // chr6 // 100 // 56 // 10 // 10 // 0 /// BC026329 // GenBank // Homo sapiens gap junction protein, alpha 1, 43kDa, mRNA (cDNA clone MGC:26323 IMAGE:4794131), complete cds. // chr6 // 100 // 72 // 13 // 13 // 0 /// M65188 // GenBank // Human connexin 43 (GJA1, Cx43) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 61 // 11 // 11 // 0 /// AK294670 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50955 complete cds, highly similar to Gap junction alpha-1 protein. // chr6 // 67 // 67 // 12 // 18 // 1 /// AK297761 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57333 complete cds, highly similar to Gap junction alpha-1 protein. // chr6 // 44 // 44 // 8 // 18 // 1
ENST00000363062 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:122211648:122211811:1 gene:ENSG00000199932 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 94 // 62 // 15 // 16 // 0 /// NONHSAT114754 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 94 // 62 // 15 // 16 // 0
ENST00000496309 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:122745280:122745529:1 gene:ENSG00000240606 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT114759 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_001446 // RefSeq // Homo sapiens fatty acid binding protein 7, brain (FABP7), mRNA. // chr6 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// XM_005266858 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens fatty acid binding protein 7, brain (FABP7), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000356535 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:122779759:122782896:1 gene:ENSG00000164434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000368444 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:122779475:122784074:1 gene:ENSG00000164434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// AK091664 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ34345 fis, clone FEBRA2010746. // chr6 // 94 // 57 // 15 // 16 // 0 /// AK289836 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75346 complete cds. // chr6 // 92 // 46 // 12 // 13 // 0 /// BC012299 // GenBank // Homo sapiens fatty acid binding protein 7, brain, mRNA (cDNA clone MGC:21253 IMAGE:4707233), complete cds. // chr6 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// CR457057 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834C077D for gene FABP7, fatty acid binding protein 7, brain; complete cds, incl. stopcodon. // chr6 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// D50373 // GenBank // Homo sapiens mRNA for fatty acid binding protein, complete cds. // chr6 // 94 // 57 // 15 // 16 // 0 /// D88648 // GenBank // Homo sapiens mRNA for B-FABP, complete cds. // chr6 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// U51338 // GenBank // Human retina fatty acid binding protein mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// U81235 // GenBank // Human mammary derived growth inhibitor related (MRG) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0
NM_001010852 // RefSeq // Homo sapiens clavesin 2 (CLVS2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000275162 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:122995971:123072927:1 gene:ENSG00000146352 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC101376 // GenBank // Homo sapiens retinaldehyde binding protein 1-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:120570 IMAGE:40025886), complete cds. // chr6 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC101377 // GenBank // Homo sapiens retinaldehyde binding protein 1-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:120572 IMAGE:40025889), complete cds. // chr6 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000368438 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:6:122996689:123064467:1 gene:ENSG00000146352 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1 /// AK295158 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50767 complete cds, moderately similar to Cellular retinaldehyde-binding protein. // chr6 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1 /// GENSCAN00000025409 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:122997778:123063761:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0
NM_001040214 // RefSeq // Homo sapiens Na+/K+ transporting ATPase interacting 2 (NKAIN2), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NM_153355 // RefSeq // Homo sapiens Na+/K+ transporting ATPase interacting 2 (NKAIN2), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// XM_005266834 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens Na+/K+ transporting ATPase interacting 2 (NKAIN2), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000368416 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:123804141:124658958:1 gene:ENSG00000188580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000368417 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:123804141:124825657:1 gene:ENSG00000188580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000545433 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:124121850:124825616:1 gene:ENSG00000188580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// AB070452 // GenBank // Homo sapiens TCBA1 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// AK309385 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99426. // chr6 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0 /// AK315886 // GenBank // Homo sapiens cDNA, FLJ79535 complete cds, highly similar to Homo sapiens T-cell lymphoma breakpoint associated target 1 (TCBA1), mRNA. // chr6 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// BC035062 // GenBank // Homo sapiens Na+/K+ transporting ATPase interacting 2, mRNA (cDNA clone MGC:41924 IMAGE:5264304), complete cds. // chr6 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
ENST00000410513 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:125875168:125875498:1 gene:ENSG00000222445 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT114812 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_138571 // RefSeq // Homo sapiens histidine triad nucleotide binding protein 3 (HINT3), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000229633 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:125956781:125980244:1 gene:ENSG00000111911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AJ420577 // GenBank // Homo sapiens mRNA full length insert cDNA clone EUROIMAGE 1657685. // chr6 // 95 // 78 // 20 // 21 // 0 /// AY035387 // GenBank // Homo sapiens HINT4 mRNA, complete cds. // chr6 // 95 // 78 // 20 // 21 // 0 /// AY035388 // GenBank // Homo sapiens HINT4 mRNA, complete cds. // chr6 // 95 // 78 // 20 // 21 // 0 /// AY486460 // GenBank // Homo sapiens histidine triad protein 3 mutant (HINT3) mRNA, HINT3-2 allele, complete cds. // chr6 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// AY486461 // GenBank // Homo sapiens histidine triad protein 3 (HINT3) mRNA, HINT3-1 allele, complete cds. // chr6 // 93 // 52 // 13 // 14 // 0 /// BC015732 // GenBank // Homo sapiens histidine triad nucleotide binding protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:22976 IMAGE:4875139), complete cds. // chr6 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BX647228 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686J1636 (from clone DKFZp686J1636). // chr6 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// GENSCAN00000007831 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:125956978:126054720:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
NM_032784 // RefSeq // Homo sapiens R-spondin 3 (RSPO3), mRNA. // chr6 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_005267167 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens R-spondin 3 (RSPO3), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000356698 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:127118604:127197296:1 gene:ENSG00000146374 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000368317 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:127119038:127197765:1 gene:ENSG00000146374 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000485757 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:127119827:127155285:1 gene:ENSG00000146374 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// AF251057 // GenBank // Homo sapiens clone 1 thrombospondin mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC022367 // GenBank // Homo sapiens R-spondin 3 homolog (Xenopus laevis), mRNA (cDNA clone MGC:23895 IMAGE:4733444), complete cds. // chr6 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000010465 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:127148758:127196007:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// NONHSAT114840 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// AK027346 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ14440 fis, clone HEMBB1000915, weakly similar to SUBTILISIN-LIKE PROTEASE PACE4 PRECURSOR (EC 3.4.21.-). // chr6 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
NM_001010905 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 58 (C6orf58), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000329722 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:127577174:127591817:1 gene:ENSG00000184530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK303850 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50045 complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC062712 // GenBank // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 58, mRNA (cDNA clone MGC:72003 IMAGE:30353154), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000010454 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:127577186:127618956:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0
ENST00000384255 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:6:128584390:128584491:1 gene:ENSG00000206982 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT114871 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0
NONHSAT114872 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_000426 // RefSeq // Homo sapiens laminin, alpha 2 (LAMA2), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 67 // 67 // 0 /// NM_001079823 // RefSeq // Homo sapiens laminin, alpha 2 (LAMA2), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 67 // 67 // 0 /// ENST00000421865 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:128883197:129516569:1 gene:ENSG00000196569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 67 // 67 // 0 /// ENST00000617695 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:128883141:129516563:1 gene:ENSG00000196569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 67 // 67 // 0 /// ENST00000618192 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:128883141:129516563:1 gene:ENSG00000196569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 67 // 67 // 0 /// GENSCAN00000023992 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:129176501:129521544:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 79 // 53 // 53 // 0
NM_001258276 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 200A (TMEM200A), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// NM_001258277 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 200A (TMEM200A), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// NM_052913 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 200A (TMEM200A), transcript variant 4, mRNA. // chr6 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// XM_005266817 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens transmembrane protein 200A (TMEM200A), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000296978 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:130365734:130443063:1 gene:ENSG00000164484 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000392429 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:130437117:130443061:1 gene:ENSG00000164484 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// AB052099 // GenBank // Homo sapiens mRNA for HBE61, complete cds. // chr6 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// AB067500 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1913 protein, partial cds. // chr6 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// AK315824 // GenBank // Homo sapiens cDNA, FLJ79473 complete cds. // chr6 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// BC044246 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 200A, mRNA (cDNA clone MGC:50847 IMAGE:5760073), complete cds. // chr6 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000617887 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:130366281:130443061:1 gene:ENSG00000164484 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0
NM_000045 // RefSeq // Homo sapiens arginase 1 (ARG1), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NM_001244438 // RefSeq // Homo sapiens arginase 1 (ARG1), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000275196 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:131573226:131583398:1 gene:ENSG00000118520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 94 // 63 // 16 // 17 // 0 /// ENST00000356962 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:131573225:131584325:1 gene:ENSG00000118520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000368087 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:131573144:131584332:1 gene:ENSG00000118520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY074488 // GenBank // Homo sapiens arginase type I erythroid variant mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr6 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC020653 // GenBank // Homo sapiens arginase, liver, mRNA (cDNA clone MGC:22316 IMAGE:4712189), complete cds. // chr6 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BT006741 // GenBank // Homo sapiens arginase, liver mRNA, complete cds. // chr6 // 94 // 59 // 15 // 16 // 0 /// M14502 // GenBank // Human liver arginase mRNA, complete cds. // chr6 // 92 // 93 // 23 // 25 // 0 /// AK128314 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ46455 fis, clone THYMU3020595, highly similar to Arginase 1 (EC 3.5.3.1). // chr6 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// BC005321 // GenBank // Homo sapiens arginase, liver, mRNA (cDNA clone MGC:12405 IMAGE:3934479), complete cds. // chr6 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1 /// GENSCAN00000002123 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:131373779:131583908:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
NM_006208 // RefSeq // Homo sapiens ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 1 (ENPP1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000360971 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:131808016:131895155:1 gene:ENSG00000197594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000513998 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:131808034:131890864:1 gene:ENSG00000197594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// BC059375 // GenBank // Homo sapiens ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 1, mRNA (cDNA clone MGC:71620 IMAGE:30341060), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// D12485 // GenBank // Homo sapiens mRNA for nucleotide pyrophosphatase, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// M57736 // GenBank // Human plasma cell membrane glycoprotein (PC-1) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000459624 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:131861610:131877857:1 gene:ENSG00000197594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1 /// BX537580 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686P13218 (from clone DKFZp686P13218). // chr6 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1 /// GENSCAN00000045601 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:131851142:131890511:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 56 // 19 // 19 // 0
ENST00000364025 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:131820334:131820653:1 gene:ENSG00000200895 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 77 // 100 // 20 // 26 // 0 /// NONHSAT114928 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr6 // 77 // 100 // 20 // 26 // 0
NM_175057 // RefSeq // Homo sapiens trace amine associated receptor 9 (gene/pseudogene) (TAAR9), mRNA. // chr6 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// ENST00000434551 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:132538290:132539336:1 gene:ENSG00000237110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// AY183469 // GenBank // Homo sapiens trace amine receptor 3 mRNA, complete cds. // chr6 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045606 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:132538290:132539336:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
NM_053278 // RefSeq // Homo sapiens trace amine associated receptor 8 (TAAR8), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000275200 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:132552693:132553721:1 gene:ENSG00000146385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AY183468 // GenBank // Homo sapiens trace amine receptor 5 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC069166 // GenBank // Homo sapiens trace amine associated receptor 8, mRNA (cDNA clone MGC:95427 IMAGE:7217002), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000045611 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:132552693:132571359:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 42 // 100 // 10 // 24 // 0
NM_175067 // RefSeq // Homo sapiens trace amine associated receptor 6 (TAAR6), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000275198 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:132570322:132571359:1 gene:ENSG00000146383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY183470 // GenBank // Homo sapiens trace amine receptor 4 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC069157 // GenBank // Homo sapiens trace amine associated receptor 6, mRNA (cDNA clone MGC:95443 IMAGE:7217018), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045611 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:132552693:132571359:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001016 // RefSeq // Homo sapiens ribosomal protein S12 (RPS12), mRNA. // chr6 // 100 // 82 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000230050 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:132814441:132817564:1 gene:ENSG00000112306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000484616 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:132814569:132817564:1 gene:ENSG00000112306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 82 // 14 // 14 // 0 /// BC002550 // GenBank HTC // Homo sapiens ribosomal protein S12, mRNA (cDNA clone IMAGE:3138639). // chr6 // 100 // 82 // 14 // 14 // 0 /// BC095424 // GenBank // Homo sapiens ribosomal protein S12, mRNA (cDNA clone MGC:110961 IMAGE:30792687), complete cds. // chr6 // 100 // 82 // 14 // 14 // 0 /// AK096147 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ38828 fis, clone MAMGL1000017. // chr6 // 71 // 82 // 10 // 14 // 0 /// BC017321 // GenBank // Homo sapiens ribosomal protein S12, mRNA (cDNA clone MGC:29768 IMAGE:4565075), complete cds. // chr6 // 71 // 82 // 10 // 14 // 0 /// BC071930 // GenBank // Homo sapiens ribosomal protein S12, mRNA (cDNA clone MGC:88615 IMAGE:6295016), complete cds. // chr6 // 71 // 82 // 10 // 14 // 0 /// NONHSAT114976 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 82 // 14 // 14 // 0 /// AK025643 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ21990 fis, clone HEP06386. // chr6 // 71 // 82 // 10 // 14 // 0
NR_002434 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 101 (SNORD101), small nucleolar RNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000384027 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:132815307:132815379:1 gene:ENSG00000206754 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK096147 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ38828 fis, clone MAMGL1000017. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT114978 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_002436 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 33 (SNORA33), small nucleolar RNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000363664 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:132817219:132817348:1 gene:ENSG00000200534 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK096147 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ38828 fis, clone MAMGL1000017. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT114982 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_003206 // RefSeq // Homo sapiens transcription factor 21 (TCF21), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000367882 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:133889138:133895553:1 gene:ENSG00000118526 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF035718 // GenBank // Homo sapiens mesoderm-specific basic-helix-loop-helix protein (POD1) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AF047419 // GenBank // Homo sapiens epicardin mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BT019660 // GenBank // Homo sapiens transcription factor 21 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// CR450293 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834B111D for gene TCF21, transcription factor 21; complete cds; without stopcodon. // chr6 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// NM_198392 // RefSeq // Homo sapiens transcription factor 21 (TCF21), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// ENST00000237316 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:133889335:133895553:1 gene:ENSG00000118526 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// BC025697 // GenBank // Homo sapiens transcription factor 21, mRNA (cDNA clone MGC:34534 IMAGE:5221575), complete cds. // chr6 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// GENSCAN00000015593 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:133889398:133893097:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0
ENST00000577207 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:134133573:134133868:1 gene:ENSG00000266875 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT115014 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 95 // 100 // 19 // 20 // 0
ENST00000363188 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:134257035:134257143:1 gene:ENSG00000200058 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT115024 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000364439 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:6:134283092:134283193:1 gene:ENSG00000201309 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT115025 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000390940 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:136630243:136630355:1 gene:ENSG00000212242 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT115137 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001008783 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 35, member D3 (SLC35D3), mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000331858 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:136922264:136925639:1 gene:ENSG00000182747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AK295424 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52685 complete cds, highly similar to Homo sapiens solute carrier family 35, member D3 (SLC35D3), mRNA. // chr6 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// AK316095 // GenBank // Homo sapiens cDNA, FLJ78994 complete cds, highly similar to Homo sapiens solute carrier family 35, member D3 (SLC35D3), mRNA. // chr6 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// BC087842 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 35, member D3, mRNA (cDNA clone MGC:102873 IMAGE:6191889), complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000011631 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:136922429:136962952:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0
ENST00000384518 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:6:136934765:136934866:1 gene:ENSG00000207247 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 75 // 3 // 3 // 0 /// NONHSAT115141 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 75 // 3 // 3 // 0
AF116669 // GenBank HTC // Homo sapiens PRO1828 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
ENST00000384570 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:6:137784374:137784486:1 gene:ENSG00000207300 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT115178 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000403415 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:137995270:137996147:1 gene:ENSG00000219463 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT115200 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_020340 // RefSeq // Homo sapiens KIAA1244 (KIAA1244), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 69 // 69 // 0 /// ENST00000251691 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:138161921:138344663:1 gene:ENSG00000112379 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 69 // 69 // 0 /// AF413080 // GenBank // Homo sapiens BIG3 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 39 // 27 // 27 // 0 /// BC137174 // GenBank // Homo sapiens KIAA1244, mRNA (cDNA clone MGC:168794 IMAGE:9021171), complete cds. // chr6 // 100 // 61 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000028411 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:138262705:138339181:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 39 // 27 // 27 // 0 /// BC033191 // GenBank // Homo sapiens KIAA1244, mRNA (cDNA clone IMAGE:4660870), partial cds. // chr6 // 100 // 16 // 11 // 11 // 0 /// NONHSAT115202 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 36 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028406 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:138162311:138255916:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 13 // 13 // 9 // 69 // 1
NM_014320 // RefSeq // Homo sapiens heme binding protein 2 (HEBP2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000367697 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:6:138404247:138413173:1 gene:ENSG00000051620 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 94 // 89 // 30 // 32 // 0 /// ENST00000448741 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:6:138403531:138413173:1 gene:ENSG00000051620 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 90 // 58 // 19 // 21 // 0 /// ENST00000607197 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:138404219:138422197:1 gene:ENSG00000051620 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// AF117616 // GenBank // Homo sapiens SOUL protein (SOUL) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// AY427823 // GenBank // Homo sapiens placental protein 23 (PP23) mRNA, complete cds. // chr6 // 97 // 89 // 31 // 32 // 0 /// BC008205 // GenBank // Homo sapiens heme binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:17713 IMAGE:3869026), complete cds. // chr6 // 97 // 86 // 30 // 31 // 0 /// BC010290 // GenBank // Homo sapiens heme binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:4902 IMAGE:3445763), complete cds. // chr6 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// BC093037 // GenBank // Homo sapiens heme binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:110954 IMAGE:30333215), complete cds. // chr6 // 97 // 86 // 30 // 31 // 0 /// ENST00000453452 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:138405971:138413154:1 gene:ENSG00000051620 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 44 // 44 // 16 // 36 // 1 /// GENSCAN00000028405 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:138396235:138413078:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 83 // 83 // 30 // 36 // 1
NM_016557 // RefSeq // Homo sapiens atypical chemokine receptor 4 (ACKR4), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NM_178445 // RefSeq // Homo sapiens atypical chemokine receptor 4 (ACKR4), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000249887 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:132597237:132602215:1 gene:ENSG00000129048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AF110640 // GenBank // Homo sapiens orphan seven-transmembrane receptor (VSHK1) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AK304461 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57069 complete cds, highly similar to C-C chemokine receptor type 11. // chr6 // 100 // 65 // 13 // 13 // 0 /// BC069438 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-C motif) receptor-like 1, transcript variant 2, mRNA (cDNA clone MGC:97099 IMAGE:7262320), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000449542 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:138822747:138823799:1 gene:ENSG00000225415 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000013119 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:132600398:132601450:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000028409 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:138822747:138823799:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_021243 // RefSeq // Homo sapiens ABRA C-terminal like (ABRACL), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000367660 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:139028682:139043302:1 gene:ENSG00000146386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC014953 // GenBank // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 115, mRNA (cDNA clone IMAGE:4849571), complete cds. // chr6 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// AK309402 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99443. // chr6 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// GENSCAN00000027433 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:139016871:139042903:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1
NM_016217 // RefSeq // Homo sapiens headcase homolog (Drosophila) (HECA), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000367658 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:139135112:139180802:1 gene:ENSG00000112406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AB033492 // GenBank // Homo sapiens hHDC mRNA for homolog of Drosophila headcase, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC070068 // GenBank // Homo sapiens headcase homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:87326 IMAGE:30340910), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000027432 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:139160045:139177105:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 50 // 11 // 11 // 0
ENST00000402141 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:143436216:143436710:1 gene:ENSG00000218896 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000043819 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:143436270:143436710:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0
NM_003630 // RefSeq // Homo sapiens peroxisomal biogenesis factor 3 (PEX3), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000367591 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:143450980:143490010:1 gene:ENSG00000034693 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000367592 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:6:143450807:143472261:1 gene:ENSG00000034693 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 45 // 14 // 14 // 0 /// AB035307 // GenBank // Homo sapiens mRNA for Pex3p, complete cds. // chr6 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// AK300907 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57497 complete cds, highly similar to Peroxisomal biogenesis factor 3. // chr6 // 94 // 52 // 15 // 16 // 0 /// AY277600 // GenBank // Homo sapiens transformation-related protein 18 (TRG18) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// BC014551 // GenBank // Homo sapiens peroxisomal biogenesis factor 3, mRNA (cDNA clone MGC:13693 IMAGE:4333011), complete cds. // chr6 // 96 // 87 // 26 // 27 // 0 /// BC015506 // GenBank // Homo sapiens peroxisomal biogenesis factor 3, mRNA (cDNA clone MGC:9125 IMAGE:3914956), complete cds. // chr6 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// CR542062 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834A1236D for gene PEX3, peroxisomal biogenesis factor 3; complete cds, without stopcodon. // chr6 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// AK025644 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ21991 fis, clone HEP06475, highly similar to HSPEX3P Homo sapiens mRNA for Pex3 protein. // chr6 // 84 // 84 // 26 // 31 // 1 /// GENSCAN00000043810 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:143459075:143490706:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 55 // 17 // 17 // 0
NM_032860 // RefSeq // Homo sapiens LTV1 ribosome biogenesis factor (LTV1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000367576 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:143843344:143863812:1 gene:ENSG00000135521 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK300360 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61396 complete cds. // chr6 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// BC009855 // GenBank // Homo sapiens LTV1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:16354 IMAGE:3926227), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK091447 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ34128 fis, clone FCBBF3010130. // chr6 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// GENSCAN00000043565 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:143843088:143938251:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_001013623 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, C2HC-type containing 1B (ZC2HC1B), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000237275 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:143864436:143938346:1 gene:ENSG00000118491 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000416313 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:143884304:143898691:1 gene:ENSG00000118491 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000539295 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:143864436:143938201:1 gene:ENSG00000118491 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC146950 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 164, member B, mRNA (cDNA clone MGC:182053 IMAGE:9056878), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC146969 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 164, member B, mRNA (cDNA clone MGC:182072 IMAGE:9056897), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC171862 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 164, member B, mRNA (cDNA clone MGC:198577 IMAGE:9054516), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000043565 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:143843088:143938251:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// AK311477 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ18519. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_003764 // RefSeq // Homo sapiens syntaxin 11 (STX11), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_005267189 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens syntaxin 11 (STX11), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 70 // 16 // 16 // 0 /// XM_006715588 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens syntaxin 11 (STX11), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000367568 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:144150526:144188370:1 gene:ENSG00000135604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AF044309 // GenBank // Homo sapiens syntaxin 11 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// AF071504 // GenBank // Homo sapiens syntaxin 11 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 43 // 10 // 10 // 0 /// BC033519 // GenBank // Homo sapiens syntaxin 11, mRNA (cDNA clone MGC:34537 IMAGE:5176646), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_007124 // RefSeq // Homo sapiens utrophin (UTRN), mRNA. // chr6 // 100 // 99 // 77 // 77 // 0 /// XM_006715560 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens utrophin (UTRN), transcript variant X9, mRNA. // chr6 // 100 // 33 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000367524 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:144789229:144828851:1 gene:ENSG00000152818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 10 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000367526 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:144583210:144851003:1 gene:ENSG00000152818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 33 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000367545 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:144291829:144853034:1 gene:ENSG00000152818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 99 // 77 // 77 // 0 /// GENSCAN00000043567 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:144373724:144735709:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 67 // 52 // 52 // 0 /// GENSCAN00000043568 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:144744884:144828859:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 18 // 14 // 14 // 0
ENST00000411039 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:146340420:146340524:1 gene:ENSG00000222971 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT115420 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_006834 // RefSeq // Homo sapiens RAB32, member RAS oncogene family (RAB32), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000367495 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:146543693:146554965:1 gene:ENSG00000118508 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF498958 // GenBank // Homo sapiens small GTP binding protein RAB32 (RAB32) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// BC015061 // GenBank // Homo sapiens RAB32, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:13500 IMAGE:4280407), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BT020016 // GenBank // Homo sapiens RAB32, member RAS oncogene family mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// U71127 // GenBank // Human low-Mr GTP-binding protein Rab32 (RAB32) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000030096 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:146543872:146554605:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0
NM_024694 // RefSeq // Homo sapiens androglobin (ADGB), mRNA. // chr6 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// ENST00000326929 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:146599000:146724377:1 gene:ENSG00000118492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 48 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000367490 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:6:146736518:146815462:1 gene:ENSG00000118492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 39 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000397944 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:146598965:146815462:1 gene:ENSG00000118492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// ENST00000480328 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:146716883:146815459:1 gene:ENSG00000118492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 61 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000493950 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:146599005:146815462:1 gene:ENSG00000118492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// AL832192 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686B242 (from clone DKFZp686B242). // chr6 // 98 // 91 // 39 // 40 // 0 /// GENSCAN00000030097 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:146598786:146815217:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 84 // 37 // 37 // 0 /// AK021951 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ11889 fis, clone HEMBA1007251, weakly similar to Homo sapiens F-box protein FBX29 (FBX29) mRNA. // chr6 // 100 // 64 // 28 // 28 // 0
NM_001030060 // RefSeq // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 5 (SAMD5), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000367474 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:147508927:147570021:1 gene:ENSG00000203727 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000010837 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:147506306:147553811:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 49 // 49 // 17 // 35 // 1
NM_015278 // RefSeq // Homo sapiens SAM and SH3 domain containing 1 (SASH1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006715406 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens SAM and SH3 domain containing 1 (SASH1), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000367467 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:148342593:148552050:1 gene:ENSG00000111961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AK300403 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53196 complete cds, highly similar to SAM and SH3 domain-containing protein 1. // chr6 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// BX537611 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686I1750 (from clone DKFZp686I1750). // chr6 // 92 // 39 // 11 // 12 // 0 /// ENST00000622663 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:148524413:148552048:1 gene:ENSG00000111961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 92 // 39 // 11 // 12 // 0 /// GENSCAN00000018600 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:148519387:148548558:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0
ENST00000384615 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:148278672:148278778:1 gene:ENSG00000207345 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT115473 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_005715 // RefSeq // Homo sapiens uronyl-2-sulfotransferase (UST), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000367463 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:148747328:149076990:1 gene:ENSG00000111962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AB020316 // GenBank // Homo sapiens mRNA for dermatan/chondroitin sulfate 2-sulfotransferase, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AJ420554 // GenBank // Homo sapiens mRNA full length insert cDNA clone EUROIMAGE 1838850. // chr6 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// AK292922 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78137 complete cds, highly similar to Homo sapiens uronyl-2-sulfotransferase (UST), mRNA. // chr6 // 100 // 60 // 21 // 21 // 0 /// BC093668 // GenBank // Homo sapiens uronyl-2-sulfotransferase, mRNA (cDNA clone MGC:120703 IMAGE:7939513), complete cds. // chr6 // 100 // 54 // 19 // 19 // 0 /// BC093694 // GenBank // Homo sapiens uronyl-2-sulfotransferase, mRNA (cDNA clone MGC:120729 IMAGE:7939539), complete cds. // chr6 // 100 // 54 // 19 // 19 // 0 /// XM_005266790 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens uronyl-2-sulfotransferase (UST), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 37 // 37 // 13 // 35 // 1
ENST00000485574 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:149291352:149291646:1 gene:ENSG00000241391 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT115495 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001002255 // RefSeq // Homo sapiens small ubiquitin-like modifier 4 (SUMO4), mRNA. // chr6 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000326669 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:149400227:149401292:1 gene:ENSG00000177688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AY340238 // GenBank // Homo sapiens small ubiquitin-like protein 4 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// BC130305 // GenBank // Homo sapiens SMT3 suppressor of mif two 3 homolog 4 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:163177 IMAGE:40146336), complete cds. // chr6 // 93 // 58 // 13 // 14 // 0 /// GENSCAN00000030610 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:149369998:149409719:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 67 // 67 // 16 // 24 // 1
NM_138785 // RefSeq // Homo sapiens glycoprotein integral membrane 1 (GINM1), mRNA. // chr6 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000367419 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:149566294:149591748:1 gene:ENSG00000055211 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AK289402 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77641 complete cds. // chr6 // 91 // 92 // 30 // 33 // 0 /// AY358952 // GenBank // Homo sapiens clone DNA60783 EGAP710 (UNQ710) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC014320 // GenBank // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 72, mRNA (cDNA clone MGC:22821 IMAGE:3686673), complete cds. // chr6 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000433539 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:149578923:149582283:1 gene:ENSG00000055211 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// AK295690 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50535 complete cds. // chr6 // 44 // 44 // 16 // 36 // 1 /// AK308844 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ98885. // chr6 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1 /// AK308994 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99035. // chr6 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// AK311061 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ18103. // chr6 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1 /// GENSCAN00000030625 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:149573549:149590838:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 58 // 21 // 21 // 0
NR_077247 // RefSeq // Homo sapiens ribosomal protein S18 pseudogene 9 (RPS18P9), non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000482817 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:149594084:149594543:1 gene:ENSG00000220848 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC071678 // GenBank // Homo sapiens ribosomal protein S18 pseudogene 9, mRNA (cDNA clone IMAGE:5201620). // chr6 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030607 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:149594319:149594543:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
ENST00000365473 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:6:149594625:149594759:1 gene:ENSG00000202343 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT115506 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000384562 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:6:149631437:149631549:1 gene:ENSG00000207292 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 75 // 3 // 3 // 0 /// NONHSAT115508 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 75 // 3 // 3 // 0
NR_045126 // RefSeq // Homo sapiens RAET1E antisense RNA 1 (RAET1E-AS1), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000605899 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:149884431:149919506:1 gene:ENSG00000223701 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr6 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000606915 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:149863494:149919507:1 gene:ENSG00000268592 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC016788 // GenBank // Homo sapiens low density lipoprotein receptor-related protein 11, mRNA (cDNA clone IMAGE:4072521), partial cds. // chr6 // 88 // 96 // 22 // 25 // 0 /// NR_045127 // RefSeq // Homo sapiens RAET1E antisense RNA 1 (RAET1E-AS1), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr6 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// ENST00000446954 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:149890103:149919508:1 gene:ENSG00000223701 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr6 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// NONHSAT115514 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT115515 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT115518 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr6 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// NONHSAT115519 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr6 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_025217 // RefSeq // Homo sapiens UL16 binding protein 2 (ULBP2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000367351 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:149942000:149949235:1 gene:ENSG00000131015 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// AB052906 // GenBank // Homo sapiens mRNA for ALCAN-alpha, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// AY358665 // GenBank // Homo sapiens clone DNA57838 ULBP2 (UNQ463) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 83 // 10 // 10 // 0 /// BC034689 // GenBank // Homo sapiens UL16 binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:21383 IMAGE:4747126), complete cds. // chr6 // 100 // 83 // 10 // 10 // 0
NM_025218 // RefSeq // Homo sapiens UL16 binding protein 1 (ULBP1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000229708 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:149964007:149973710:1 gene:ENSG00000111981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AB052907 // GenBank // Homo sapiens mRNA for ALCAN-beta, complete cds. // chr6 // 88 // 67 // 14 // 16 // 0 /// AF304377 // GenBank // Homo sapiens ULBP1 protein mRNA, complete cds. // chr6 // 88 // 67 // 14 // 16 // 0 /// AF346416 // GenBank // Homo sapiens retinoic acid early transcript 1 (RAET1I) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// AK292519 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75804 complete cds, highly similar to Homo sapiens UL16 binding protein 1 (ULBP1), mRNA. // chr6 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// BC035416 // GenBank // Homo sapiens UL16 binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:41778 IMAGE:4822311), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000022578 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:149964050:149990447:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 42 // 42 // 10 // 24 // 1
ENST00000433415 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:149977922:149978416:1 gene:ENSG00000231120 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_030949 // RefSeq // Homo sapiens protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 14C (PPP1R14C), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_005267152 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 14C (PPP1R14C), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000361131 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:150143076:150250357:1 gene:ENSG00000198729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF407165 // GenBank // Homo sapiens PKC-potentiated PP1 inhibitory protein (KEPI) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC015773 // GenBank // Homo sapiens protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 14C, mRNA (cDNA clone MGC:23255 IMAGE:4877511), complete cds. // chr6 // 93 // 87 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000022577 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:150130916:150264339:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 87 // 87 // 27 // 31 // 1
ENST00000459301 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:6:150164584:150164686:1 gene:ENSG00000238594 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT115532 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000365249 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:150939222:150939328:1 gene:ENSG00000202119 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT115548 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0
ENST00000459080 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:151201341:151201444:1 gene:ENSG00000238616 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT115557 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_005100 // RefSeq // Homo sapiens A kinase (PRKA) anchor protein 12 (AKAP12), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 80 // 36 // 36 // 0 /// NM_144497 // RefSeq // Homo sapiens A kinase (PRKA) anchor protein 12 (AKAP12), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 64 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000253332 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:151240374:151356773:1 gene:ENSG00000131016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 80 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000354675 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:151325688:151356773:1 gene:ENSG00000131016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 64 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000359755 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:151341686:151356773:1 gene:ENSG00000131016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 62 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000402676 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:151239999:151358557:1 gene:ENSG00000131016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 80 // 36 // 36 // 0 /// AB003476 // GenBank // Homo sapiens mRNA for gravin, complete cds. // chr6 // 100 // 64 // 29 // 29 // 0 /// BC046095 // GenBank // Homo sapiens A kinase (PRKA) anchor protein 12, mRNA (cDNA clone IMAGE:6190455). // chr6 // 93 // 31 // 13 // 14 // 0 /// U81607 // GenBank // Homo sapiens gravin mRNA, complete cds. // chr6 // 86 // 80 // 31 // 36 // 0 /// GENSCAN00000021246 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:151341588:151353740:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 58 // 26 // 26 // 0 /// BC006094 // GenBank HTC // Homo sapiens A kinase (PRKA) anchor protein 12, mRNA (cDNA clone IMAGE:3927492), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr6 // 84 // 42 // 16 // 19 // 0
ENST00000411107 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:151319635:151319950:1 gene:ENSG00000223039 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 89 // 100 // 16 // 18 // 0 /// NONHSAT115563 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr6 // 89 // 100 // 16 // 18 // 0
NM_001286562 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 211 (C6orf211), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NM_024573 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 211 (C6orf211), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000367294 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:151452287:151470101:1 gene:ENSG00000146476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000483931 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:151452524:151464566:1 gene:ENSG00000146476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000494826 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:151452486:151468542:1 gene:ENSG00000146476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000545879 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:151452258:151470097:1 gene:ENSG00000146476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// AJ420548 // GenBank // Homo sapiens mRNA full length insert cDNA clone EUROIMAGE 1581670. // chr6 // 100 // 29 // 9 // 9 // 0 /// AK298490 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52347 complete cds. // chr6 // 96 // 74 // 22 // 23 // 0 /// BC011348 // GenBank // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 211, mRNA (cDNA clone MGC:16862 IMAGE:4340090), complete cds. // chr6 // 96 // 81 // 24 // 25 // 0 /// AK310840 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17882. // chr6 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1 /// GENSCAN00000021241 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:151445267:151469110:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT115570 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0
NM_025059 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 170 (CCDC170), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000239374 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:151494030:151621193:1 gene:ENSG00000120262 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC060803 // GenBank // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 97, mRNA (cDNA clone MGC:71616 IMAGE:5298914), complete cds. // chr6 // 94 // 97 // 29 // 31 // 0 /// GENSCAN00000021236 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:151494129:151618147:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0
ENST00000338799 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:151804431:152099053:1 gene:ENSG00000091831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 90 // 80 // 18 // 20 // 0 /// X74439 // GenBank // H.sapiens mRNA for estrogen receptor gene 5flanking region. // chr6 // 89 // 76 // 17 // 19 // 0
ENST00000365174 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:152410275:152410394:1 gene:ENSG00000202044 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT115589 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_025107 // RefSeq // Homo sapiens myc target 1 (MYCT1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000367245 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:152697895:152724567:1 gene:ENSG00000120279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF527367 // GenBank // Homo sapiens MTLC (MTLC) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC128463 // GenBank // Homo sapiens myc target 1, mRNA (cDNA clone MGC:156309 IMAGE:40126671), complete cds. // chr6 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0 /// BC128464 // GenBank // Homo sapiens myc target 1, mRNA (cDNA clone MGC:156310 IMAGE:40126673), complete cds. // chr6 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0 /// GU997693 // GenBank // Homo sapiens myc target 1 transcript variant 1 (MYCT1) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000532295 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:152697961:152724501:1 gene:ENSG00000120279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// ENST00000529453 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:6:152697897:152723284:1 gene:ENSG00000120279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_003381 // RefSeq // Homo sapiens vasoactive intestinal peptide (VIP), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NM_194435 // RefSeq // Homo sapiens vasoactive intestinal peptide (VIP), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000367243 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:152750798:152759765:1 gene:ENSG00000146469 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000367244 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:152750798:152759765:1 gene:ENSG00000146469 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000431366 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:152754211:152759765:1 gene:ENSG00000146469 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 61 // 20 // 20 // 0 /// AK291959 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77165 complete cds, highly similar to Homo sapiens vasoactive intestinal peptide (VIP), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 96 // 76 // 24 // 25 // 0 /// BC009794 // GenBank // Homo sapiens vasoactive intestinal peptide, mRNA (cDNA clone MGC:13587 IMAGE:4294373), complete cds. // chr6 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// M36634 // GenBank // Human vasoactive intestinal peptide (VIP) mRNA, complete cds. // chr6 // 93 // 88 // 27 // 29 // 0 /// M54930 // GenBank // Human vasoactive intestinal peptide and peptide histidine isoleucine mRNA, 3 end. // chr6 // 86 // 42 // 12 // 14 // 0 /// GENSCAN00000002308 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:152752178:152818822:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 48 // 16 // 16 // 0
ENST00000410874 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:153420438:153420572:1 gene:ENSG00000222806 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT115621 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000362376 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:153681447:153681553:1 gene:ENSG00000199246 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT115630 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001001346 // RefSeq // Homo sapiens claudin 20 (CLDN20), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000367165 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:155264013:155276548:1 gene:ENSG00000171217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC020838 // GenBank // Homo sapiens claudin 20, mRNA (cDNA clone MGC:23949 IMAGE:4243903), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000039993 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:155275720:155276379:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0
ENST00000390993 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:6:156378750:156378824:1 gene:ENSG00000212295 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT115689 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_017519 // RefSeq // Homo sapiens AT rich interactive domain 1B (SWI1-like) (ARID1B), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0 /// NM_020732 // RefSeq // Homo sapiens AT rich interactive domain 1B (SWI1-like) (ARID1B), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 91 // 10 // 10 // 0 /// XM_006715523 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens AT rich interactive domain 1B (SWI1-like) (ARID1B), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 91 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000346085 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:156777929:157210779:1 gene:ENSG00000049618 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 91 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000350026 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:156777929:157209150:1 gene:ENSG00000049618 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0 /// AF253515 // GenBank // Homo sapiens BAF250b subunit mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0 /// AF468300 // GenBank // Homo sapiens BRG1-binding protein ELD/OSA1 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0
NM_024630 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, DHHC-type containing 14 (ZDHHC14), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NM_153746 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, DHHC-type containing 14 (ZDHHC14), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000341375 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:157592773:157673938:1 gene:ENSG00000175048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000359775 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:157381133:157678146:1 gene:ENSG00000175048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000414563 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:157381133:157673945:1 gene:ENSG00000175048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0 /// AF542388 // GenBank // Homo sapiens NEW1 domain containing protein mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// AF542389 // GenBank // Homo sapiens NEW1 domain containing protein isoform mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr6 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0 /// AJ420552 // GenBank // Homo sapiens mRNA full length insert cDNA clone EUROIMAGE 1666986. // chr6 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000523706 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:157629389:157673937:1 gene:ENSG00000175048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 1 /// AK124573 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ42582 fis, clone BRACE3008772, highly similar to Probable palmitoyltransferase ZDHHC14 (EC 2.3.1.-). // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 1
NM_016224 // RefSeq // Homo sapiens sorting nexin 9 (SNX9), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_005267015 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens sorting nexin 9 (SNX9), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000392185 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:157823264:157945077:1 gene:ENSG00000130340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB209736 // GenBank // Homo sapiens mRNA for sorting nexin 9 variant protein. // chr6 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// AF001629 // GenBank // Homo sapiens WASP interactor protein (WISP) mRNA, partial cds. // chr6 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// AF076957 // GenBank // Homo sapiens SDP1 protein mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// AF121859 // GenBank // Homo sapiens sorting nexin 9 (SNX9) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// AF131214 // GenBank // Homo sapiens SH3 and PX domain-containing protein SH3PX1 (SH3PX1) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// AF172847 // GenBank // Homo sapiens sorting nexin 9 (SNX9) mRNA, complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// AK127345 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ45417 fis, clone BRHIP3033811, highly similar to Sorting nexin-9. // chr6 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// BC005022 // GenBank // Homo sapiens sorting nexin 9, mRNA (cDNA clone MGC:12550 IMAGE:3832234), complete cds. // chr6 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// ENST00000611124 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:157867249:157945077:1 gene:ENSG00000130340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005795 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:157822965:158096364:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_207118 // RefSeq // Homo sapiens general transcription factor IIH, polypeptide 5 (GTF2H5), mRNA. // chr6 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000607778 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:158168352:158199344:1 gene:ENSG00000272047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// BC004568 // GenBank // Homo sapiens general transcription factor IIH, polypeptide 5, mRNA (cDNA clone IMAGE:3640720), partial cds. // chr6 // 100 // 43 // 9 // 9 // 0 /// BC056906 // GenBank // Homo sapiens general transcription factor IIH, polypeptide 5, mRNA (cDNA clone MGC:65153 IMAGE:4446165), complete cds. // chr6 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0 /// BC060317 // GenBank // Homo sapiens general transcription factor IIH, polypeptide 5, mRNA (cDNA clone MGC:75182 IMAGE:4345335), complete cds. // chr6 // 100 // 67 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000005797 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:158168331:158192157:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 52 // 11 // 11 // 0
NM_020245 // RefSeq // Homo sapiens tubby like protein 4 (TULP4), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000367097 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:158312488:158511828:1 gene:ENSG00000130338 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF219946 // GenBank // Homo sapiens tubby super-family protein (TUSP) mRNA, complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AF288480 // GenBank // Homo sapiens tubby super-family protein (TUSP) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr6 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// AK304056 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60216 complete cds, highly similar to Tubby-like protein 4. // chr6 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// NM_001007466 // RefSeq // Homo sapiens tubby like protein 4 (TULP4), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// ENST00000367094 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:158312660:158508376:1 gene:ENSG00000130338 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// BC152476 // GenBank // Homo sapiens tubby like protein 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:8862614), complete cds. // chr6 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// ENST00000616856 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:158313445:158481538:1 gene:ENSG00000130338 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000005801 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:158285395:158516350:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
ENST00000461853 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:158437797:158438088:1 gene:ENSG00000243373 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT115740 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_020823 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 181 (TMEM181), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// XM_005267074 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens transmembrane protein 181 (TMEM181), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000367090 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:158536436:158635428:1 gene:ENSG00000146433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// AY927471 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA sequence. // chr6 // 24 // 24 // 10 // 42 // 1 /// AY927472 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA sequence. // chr6 // 24 // 24 // 10 // 42 // 1 /// GENSCAN00000005799 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:158565023:158631888:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 52 // 22 // 22 // 0
NM_001195032 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 99 (C6orf99), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// XM_005266787 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 99 (C6orf99), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000367072 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:158869939:158910257:1 gene:ENSG00000203711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000367073 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:6:158870169:158910353:1 gene:ENSG00000203711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000486232 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:158908837:158910236:1 gene:ENSG00000203711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 50 // 2 // 2 // 0 /// ENST00000608817 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:158895217:158910352:1 gene:ENSG00000203711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT115818 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 50 // 2 // 2 // 0
NM_032532 // RefSeq // Homo sapiens fibronectin type III domain containing 1 (FNDC1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENST00000297267 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:159169397:159272109:1 gene:ENSG00000164694 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENST00000329629 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:6:159197447:159272105:1 gene:ENSG00000164694 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 43 // 43 // 0 /// BC146783 // GenBank // Homo sapiens fibronectin type III domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:166869 IMAGE:9007239), complete cds. // chr6 // 98 // 93 // 42 // 43 // 0 /// BC150607 // GenBank // Homo sapiens fibronectin type III domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:183517 IMAGE:9056977), complete cds. // chr6 // 98 // 91 // 41 // 42 // 0 /// DQ009660 // GenBank // Homo sapiens expressed in synovial lining protein (FNDC1) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000036843 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:159210041:159276187:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 97 // 72 // 32 // 33 // 0
NM_001270531 // RefSeq // Homo sapiens Wilms tumor 1 associated protein (WTAP), transcript variant 4, mRNA. // chr6 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// NM_004906 // RefSeq // Homo sapiens Wilms tumor 1 associated protein (WTAP), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000358372 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:159725585:159756319:1 gene:ENSG00000146457 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// AF374416 // GenBank // Homo sapiens putative pre-mRNA splicing regulator female-lethal(2D) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// AK290854 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76151 complete cds, highly similar to Homo sapiens Wilms tumor 1 associated protein (WTAP), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 93 // 70 // 13 // 14 // 0 /// BC069192 // GenBank // Homo sapiens Wilms tumor 1 associated protein, mRNA (cDNA clone MGC:78409 IMAGE:4653831), complete cds. // chr6 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// AK131393 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ16480 fis, clone BRTHA2016318, highly similar to WTAP protein. // chr6 // 55 // 55 // 11 // 20 // 1 /// ENST00000621533 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:159727500:159756317:1 gene:ENSG00000146457 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000036846 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:159727665:159778829:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 55 // 55 // 11 // 20 // 1
NM_014161 // RefSeq // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein L18 (MRPL18), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000367034 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:159790466:159798436:1 gene:ENSG00000112110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000476826 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:159789812:159798313:1 gene:ENSG00000112110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000480842 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:159790517:159798436:1 gene:ENSG00000112110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// AK311391 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ18433. // chr6 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// BC001623 // GenBank // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein L18, mRNA (cDNA clone MGC:777 IMAGE:3357333), complete cds. // chr6 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// CR533491 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834D1117D for gene MRPL18, mitochondrial ribosomal protein L18; complete cds, incl. stopcodon. // chr6 // 95 // 76 // 21 // 22 // 0 /// ENST00000479638 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:159789886:159797404:1 gene:ENSG00000112110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// AK292647 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76688 complete cds, highly similar to Homo sapiens HSPC071 mRNA. // chr6 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000036842 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:159788857:159814575:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NM_002377 // RefSeq // Homo sapiens MAS1 proto-oncogene, G protein-coupled receptor (MAS1), mRNA. // chr6 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000252660 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:159906690:159916530:1 gene:ENSG00000130368 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC069142 // GenBank // Homo sapiens MAS1 oncogene, mRNA (cDNA clone MGC:95426 IMAGE:7217001), complete cds. // chr6 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC069581 // GenBank // Homo sapiens MAS1 oncogene, mRNA (cDNA clone MGC:97047 IMAGE:7262257), complete cds. // chr6 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0 /// BC110454 // GenBank // Homo sapiens MAS1 oncogene, mRNA (cDNA clone MGC:119966 IMAGE:40016114), complete cds. // chr6 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0 /// CR542261 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834B1126D for gene MAS1, MAS1 oncogene; complete cds, incl. stopcodon. // chr6 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// M13150 // GenBank // Human mas proto-oncogene mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037601 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:159906956:159907933:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
NM_000876 // RefSeq // Homo sapiens insulin-like growth factor 2 receptor (IGF2R), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 58 // 58 // 0 /// ENST00000356956 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:159969099:160106551:1 gene:ENSG00000197081 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 58 // 58 // 0 /// J03528 // GenBank // Human cation-independent mannose 6-phosphate receptor mRNA, complete cds. // chr6 // 95 // 100 // 55 // 58 // 0 /// GENSCAN00000037606 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:159969247:160105084:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 95 // 55 // 55 // 0
NR_003288 // RefSeq // Homo sapiens calcineurin-like EF-hand protein 1 pseudogene (LOC729603), non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000366273 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:160093423:160093993:1 gene:ENSG00000213073 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr6 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000569097 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:160093082:160096212:1 gene:ENSG00000213073 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_021977 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 22 (organic cation transporter), member 3 (SLC22A3), mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_005267106 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens solute carrier family 22 (organic cation transporter), member 3 (SLC22A3), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000275300 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:160348268:160452581:1 gene:ENSG00000146477 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC144280 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:9052800. // chr6 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_005267107 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens solute carrier family 22 (organic cation transporter), member 3 (SLC22A3), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// GENSCAN00000037604 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:160348420:160456951:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
NM_000301 // RefSeq // Homo sapiens plasminogen (PLG), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 1 /// ENST00000308192 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:160702242:160753306:1 gene:ENSG00000122194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 1 /// BC060513 // GenBank // Homo sapiens plasminogen, mRNA (cDNA clone MGC:61954 IMAGE:4609795), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 1 /// M74220 // GenBank // Human plasminogen mRNA, complete cds. // chr6 // 93 // 93 // 14 // 15 // 1 /// AK298338 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58778 complete cds, highly similar to Plasminogen precursor (EC 3.4.21.7). // chr6 // 73 // 73 // 11 // 15 // 1 /// GENSCAN00000037598 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:160700476:160734454:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 67 // 67 // 10 // 15 // 1
NONHSAT115953 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000577957 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:163840561:163840852:1 gene:ENSG00000266128 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT115978 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0
NR_027284 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 602 (LINC00602), long non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONHSAT116024 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000024538 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:165972253:166065300:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
ENST00000363572 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:6:166099853:166099924:1 gene:ENSG00000276643 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA gene:ENSG00000231297 // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000456477 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:166099665:166113273:1 gene:ENSG00000231297 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT116031 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT116032 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000364422 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:166209403:166209506:1 gene:ENSG00000201292 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT116033 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000366847 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:166999182:167052713:1 gene:ENSG00000213066 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000609590 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:166999405:167139141:1 gene:ENSG00000272980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BX647686 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686O1481 (from clone DKFZp686O1481). // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000609590 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:166999405:167139141:1 gene:ENSG00000272980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BX647686 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686O1481 (from clone DKFZp686O1481). // chr6 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_031949 // RefSeq // Homo sapiens tubulin tyrosine ligase-like family, member 2 (TTLL2), mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000239587 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:167325086:167341887:1 gene:ENSG00000120440 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000515138 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:167325098:167359503:1 gene:ENSG00000120440 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK301755 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54193 complete cds, highly similar to Tubulin--tyrosine ligase-like protein 2. // chr6 // 91 // 79 // 20 // 22 // 0 /// AY026506 // GenBank // Homo sapiens NYD-TSPG mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC030650 // GenBank // Homo sapiens tubulin tyrosine ligase-like family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:32942 IMAGE:5269216), complete cds. // chr6 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// BC047411 // GenBank // Homo sapiens tubulin tyrosine ligase-like family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:48294 IMAGE:5296230), complete cds. // chr6 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000039713 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:167291490:167341679:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
ENST00000597278 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:167795530:167798248:1 gene:ENSG00000269155 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr6 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// AK125190 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ43200 fis, clone FEBRA2007793. // chr6 // 92 // 100 // 36 // 39 // 0 /// GENSCAN00000039706 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:167778573:167797356:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 36 // 36 // 14 // 39 // 1
NM_005355 // RefSeq // Homo sapiens kinesin family member 25 (KIF25), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// NM_030615 // RefSeq // Homo sapiens kinesin family member 25 (KIF25), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006715473 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens kinesin family member 25 (KIF25), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000351261 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:168017901:168045089:1 gene:ENSG00000125337 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000354419 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:168017873:168045089:1 gene:ENSG00000125337 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000443060 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:167999092:168045063:1 gene:ENSG00000125337 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// AB012722 // GenBank // Homo sapiens mRNA for kinesin-like protein, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK289488 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76991 complete cds, highly similar to Homo sapiens kinesin family member 25 (KIF25), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// BC130489 // GenBank // Homo sapiens kinesin family member 25, mRNA (cDNA clone IMAGE:40146520). // chr6 // 91 // 92 // 20 // 22 // 0 /// GENSCAN00000018945 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:167827133:168052706:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 42 // 42 // 10 // 24 // 1
NM_001029863 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 120 (C6orf120), mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000332290 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:169702190:169704856:1 gene:ENSG00000185127 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 57 // 13 // 13 // 0 /// AK295061 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52626 complete cds. // chr6 // 100 // 39 // 9 // 9 // 0 /// BC051700 // GenBank // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 120, mRNA (cDNA clone MGC:27118 IMAGE:4792634), complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0
NR_026780 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 574 (LINC00574), long non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000420557 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:169790321:169802873:1 gene:ENSG00000231690 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT116230 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT116232 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_018303 // RefSeq // Homo sapiens exocyst complex component 2 (EXOC2), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 97 // 95 // 35 // 36 // 0 /// NR_073064 // RefSeq // Homo sapiens exocyst complex component 2 (EXOC2), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr6 // 97 // 100 // 37 // 38 // 0 /// ENST00000230449 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:485133:693111:-1 gene:ENSG00000112685 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 97 // 95 // 35 // 36 // 0 /// AJ420556 // GenBank // Homo sapiens mRNA full length insert cDNA clone EUROIMAGE 1870740. // chr6 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0 /// AK302941 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57241 complete cds, highly similar to Exocyst complex component 2. // chr6 // 95 // 55 // 20 // 21 // 0 /// BC080542 // GenBank // Homo sapiens exocyst complex component 2, mRNA (cDNA clone MGC:99527 IMAGE:5479496), complete cds. // chr6 // 97 // 97 // 36 // 37 // 0 /// GENSCAN00000002024 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:529371:642103:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 58 // 22 // 22 // 0
NM_148959 // RefSeq // Homo sapiens HUS1 checkpoint homolog b (S. pombe) (HUS1B), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000380907 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:655939:656963:-1 gene:ENSG00000188996 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF508547 // GenBank // Homo sapiens HUS1B mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC101697 // GenBank // Homo sapiens HUS1 checkpoint homolog b (S. pombe), mRNA (cDNA clone MGC:126746 IMAGE:8069203), complete cds. // chr6 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0 /// BC101699 // GenBank // Homo sapiens HUS1 checkpoint homolog b (S. pombe), mRNA (cDNA clone MGC:126748 IMAGE:8069205), complete cds. // chr6 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0 /// GENSCAN00000002031 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:656108:656944:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_152554 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 195 (C6orf195), mRNA. // chr6 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000296847 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:2621913:2634603:-1 gene:ENSG00000164385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK056496 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ31934 fis, clone NT2RP7006374. // chr6 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// BC104007 // GenBank // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 195, mRNA (cDNA clone MGC:120321 IMAGE:40024375), complete cds. // chr6 // 92 // 46 // 12 // 13 // 0 /// BC104008 // GenBank // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 195, mRNA (cDNA clone MGC:120322 IMAGE:40024376), complete cds. // chr6 // 85 // 46 // 11 // 13 // 0 /// BC104009 // GenBank // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 195, mRNA (cDNA clone MGC:120323 IMAGE:40024379), complete cds. // chr6 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0
NM_001012418 // RefSeq // Homo sapiens myosin light chain kinase family, member 4 (MYLK4), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_005249080 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens myosin light chain kinase family, member 4 (MYLK4), transcript variant X4, mRNA. // chr6 // 100 // 47 // 16 // 16 // 0 /// XM_006715081 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens myosin light chain kinase family, member 4 (MYLK4), transcript variant X5, mRNA. // chr6 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// XM_006715082 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens myosin light chain kinase family, member 4 (MYLK4), transcript variant X6, mRNA. // chr6 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// XM_006715083 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens myosin light chain kinase family, member 4 (MYLK4), transcript variant X7, mRNA. // chr6 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000274643 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:2663629:2750966:-1 gene:ENSG00000145949 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC132831 // GenBank // Homo sapiens myosin light chain kinase family, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:164462 IMAGE:40146853), complete cds. // chr6 // 96 // 71 // 23 // 24 // 0 /// BC132833 // GenBank // Homo sapiens myosin light chain kinase family, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:164464 IMAGE:40146855), complete cds. // chr6 // 96 // 71 // 23 // 24 // 0 /// BX647582 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp451H166 (from clone DKFZp451H166). // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000049792 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:2674908:2693258:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 47 // 47 // 16 // 34 // 1
NR_033851 // RefSeq // Homo sapiens serpin peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 9, pseudogene 1 (SERPINB9P1), non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000420981 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:2854926:2876510:-1 gene:ENSG00000230438 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000545177 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:2854657:2881407:-1 gene:ENSG00000230438 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr6 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT106799 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT106800 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// NONHSAT106801 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// TCONS_l2_00024567-XLOC_l2_012847 // Broad TUCP // linc-SERPINB1 chr6:-:2851294-2866568 // chr6 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// TCONS_l2_00024572-XLOC_l2_012847 // Broad TUCP // linc-SERPINB1 chr6:-:2854287-2876678 // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// TCONS_l2_00025309-XLOC_l2_012847 // Broad TUCP // linc-SERPINB1 chr6:-:2854890-2876744 // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_004155 // RefSeq // Homo sapiens serpin peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 9 (SERPINB9), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000380698 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:2887266:2903280:-1 gene:ENSG00000170542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB060690 // GenBank // Homo sapiens mRNA for serine protease inhibitor 9, complete cds. // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC002538 // GenBank // Homo sapiens serpin peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 9, mRNA (cDNA clone MGC:2131 IMAGE:3140427), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BT006673 // GenBank // Homo sapiens serine (or cysteine) proteinase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 9 mRNA, complete cds. // chr6 // 94 // 64 // 17 // 18 // 0 /// BX640606 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686O07189 (from clone DKFZp686O07189). // chr6 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// CR407627 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834D032D for gene SERPINB9, serine (or cysteine) proteinase inhibitor, clade B (ovalbumin ), member 9 complete cds, without stopcodon. // chr6 // 94 // 64 // 17 // 18 // 0 /// L40378 // GenBank // Homo sapiens cytoplasmic antiproteinase 3 (CAP3) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// U71364 // GenBank // Human serine proteinase inhibitor (P19) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000049788 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:2874530:2904089:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
AK128391 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ46534 fis, clone THYMU3037052, weakly similar to Homo sapiens HIV TAT specific factor 1 (HTATSF1). // chr6 // 91 // 100 // 21 // 23 // 0 /// NR_033884 // RefSeq // Homo sapiens HIV-1 Tat specific factor 1 pseudogene 2 (HTATSF1P2), non-coding RNA. // chr6 // 78 // 78 // 18 // 23 // 1 /// NONHSAT106932 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr6 // 78 // 78 // 18 // 23 // 1
ENST00000410316 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:3088686:3088809:-1 gene:ENSG00000222248 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT106972 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001069 // RefSeq // Homo sapiens tubulin, beta 2A class IIa (TUBB2A), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000333628 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:3153669:3157526:-1 gene:ENSG00000137267 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000489942 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:3154579:3157526:-1 gene:ENSG00000137267 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 77 // 68 // 10 // 13 // 0 /// BC001194 // GenBank // Homo sapiens tubulin, beta 2A, mRNA (cDNA clone MGC:3167 IMAGE:3355410), complete cds. // chr6 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0 /// BC018780 // GenBank // Homo sapiens tubulin, beta 2A, mRNA (cDNA clone MGC:32077 IMAGE:4870519), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000048031 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:3153863:3199302:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 68 // 13 // 13 // 0
NM_178012 // RefSeq // Homo sapiens tubulin, beta 2B class IIb (TUBB2B), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000259818 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:3224261:3227735:-1 gene:ENSG00000137285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000473006 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:3224283:3231730:-1 gene:ENSG00000137285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 72 // 13 // 13 // 0 /// AK289433 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78522 complete cds, highly similar to Homo sapiens tubulin, beta 2 (TUBB2), mRNA. // chr6 // 86 // 78 // 12 // 14 // 0 /// BC001352 // GenBank // Homo sapiens tubulin, beta 2B, mRNA (cDNA clone MGC:8685 IMAGE:2964590), complete cds. // chr6 // 94 // 89 // 15 // 16 // 0 /// BC063610 // GenBank // Homo sapiens tubulin, beta 2B, mRNA (cDNA clone MGC:70829 IMAGE:4941267), complete cds. // chr6 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0
NM_183373 // RefSeq // Homo sapiens PX domain containing 1 (PXDC1), mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XR_241883 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens PX domain containing 1 (PXDC1), transcript variant X2, misc_RNA. // chr6 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000380277 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:3722620:3738894:-1 gene:ENSG00000168994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000380283 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:3722620:3752026:-1 gene:ENSG00000168994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000477592 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:3722614:3751532:-1 gene:ENSG00000168994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AK289598 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75961 complete cds. // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC056908 // GenBank // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 145, mRNA (cDNA clone MGC:65163 IMAGE:6158428), complete cds. // chr6 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// AJ420534 // GenBank // Homo sapiens mRNA full length insert cDNA clone EUROIMAGE 881368. // chr6 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// GENSCAN00000048019 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:3723619:3751531:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NM_173563 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 217, member A (FAM217A), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000274673 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:4068362:4079221:-1 gene:ENSG00000145975 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000380188 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:4068367:4087344:-1 gene:ENSG00000145975 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000478714 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:4073458:4079221:-1 gene:ENSG00000145975 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 85 // 42 // 11 // 13 // 0 /// ENST00000492651 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:6:4073292:4079100:-1 gene:ENSG00000145975 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 29 // 9 // 9 // 0 /// AK097426 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ40107 fis, clone TESTI2006677. // chr6 // 90 // 65 // 18 // 20 // 0 /// BC039349 // GenBank // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 146, mRNA (cDNA clone MGC:43581 IMAGE:5269651), complete cds. // chr6 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000498677 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:6:4069891:4079134:-1 gene:ENSG00000145975 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 73 // 35 // 8 // 11 // 0 /// NONHSAT107292 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr6 // 85 // 42 // 11 // 13 // 0 /// GENSCAN00000034271 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:4068696:4087386:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 71 // 71 // 22 // 31 // 1
AF090908 // GenBank // Homo sapiens clone HQ0246 PRO0246 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NONHSAT107508 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT107509 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// TCONS_00012062-XLOC_005592 // Rinn lincRNA // linc-RPP40 chr6:-:5044718-5055048 // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000466190 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:5918564:5918844:-1 gene:ENSG00000239472 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT107533 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_000129 // RefSeq // Homo sapiens coagulation factor XIII, A1 polypeptide (F13A1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000264870 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:6144085:6320834:-1 gene:ENSG00000124491 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000414279 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:6266713:6321013:-1 gene:ENSG00000124491 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000431222 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:6:6266734:6320905:-1 gene:ENSG00000124491 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// AK304335 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53487 complete cds, highly similar to Coagulation factor XIII A chain precursor (EC 2.3.2.13). // chr6 // 97 // 81 // 28 // 29 // 0 /// BC027963 // GenBank // Homo sapiens coagulation factor XIII, A1 polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:34260 IMAGE:5222962), complete cds. // chr6 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// M14354 // GenBank // Human placental FXIIIa mRNA, complete cds. // chr6 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000014799 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:6145619:6267609:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000014802 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:6289474:6390995:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
ENST00000435641 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:6360591:6622695:-1 gene:ENSG00000216863 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// AK091027 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ33708 fis, clone BRAWH2007862. // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONHSAT107542 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
ENST00000468197 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:6938606:6938897:-1 gene:ENSG00000240936 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT107584 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
ENST00000364613 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:6:7187582:7187686:-1 gene:ENSG00000201483 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT107592 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000440581 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:7516600:7517840:-1 gene:ENSG00000234115 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 79 // 78 // 11 // 14 // 0 /// GENSCAN00000025538 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:7516495:7542905:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
ENST00000364178 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:6:10674658:10674768:-1 gene:ENSG00000201048 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT107709 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000410451 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:10752791:10752926:-1 gene:ENSG00000222383 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT107717 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_004752 // RefSeq // Homo sapiens glial cells missing homolog 2 (Drosophila) (GCM2), mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000379491 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:10873223:10881941:-1 gene:ENSG00000124827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AF079550 // GenBank // Homo sapiens glial cells missing protein homolog mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// AF091149 // GenBank // Homo sapiens glide/gcm protein homolog (GCMB) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// BC069603 // GenBank // Homo sapiens glial cells missing homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:97113 IMAGE:7262338), complete cds. // chr6 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// BC117316 // GenBank // Homo sapiens glial cells missing homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:150925 IMAGE:40125867), complete cds. // chr6 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// BC117318 // GenBank // Homo sapiens glial cells missing homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:150927 IMAGE:40125869), complete cds. // chr6 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000045581 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:10873995:10887259:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0
NM_017770 // RefSeq // Homo sapiens ELOVL fatty acid elongase 2 (ELOVL2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000354666 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:10980759:11044314:-1 gene:ENSG00000197977 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC050278 // GenBank // Homo sapiens elongation of very long chain fatty acids (FEN1/Elo2, SUR4/Elo3, yeast)-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:33724 IMAGE:5295258), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC060809 // GenBank // Homo sapiens elongation of very long chain fatty acids (FEN1/Elo2, SUR4/Elo3, yeast)-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:71645 IMAGE:5288523), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_207582 // RefSeq // Homo sapiens endogenous retrovirus group FRD, member 1 (ERVFRD-1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000472091 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:11102489:11111732:-1 gene:ENSG00000244476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000542862 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:11102491:11105674:-1 gene:ENSG00000244476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// AY358244 // GenBank // Homo sapiens clone DNA164533 GLLL6191 (UNQ6191) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// BC068585 // GenBank // Homo sapiens HERV-FRD provirus ancestral Env polyprotein, mRNA (cDNA clone MGC:87585 IMAGE:30346522), complete cds. // chr6 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0
ENST00000365443 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:11503509:11503671:-1 gene:ENSG00000202313 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT107758 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000411389 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:12406486:12406781:-1 gene:ENSG00000223321 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT107784 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001242629 // RefSeq // Homo sapiens glucose-fructose oxidoreductase domain containing 1 (GFOD1), transcript variant 4, mRNA. // chr6 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NR_038459 // RefSeq // Homo sapiens glucose-fructose oxidoreductase domain containing 1 (GFOD1), transcript variant 5, non-coding RNA. // chr6 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000379278 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:13469275:13486183:-1 gene:ENSG00000145990 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000603223 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:6:13469268:13487662:-1 gene:ENSG00000145990 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000605067 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:13469268:13472044:-1 gene:ENSG00000145990 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AF264036 // GenBank // Homo sapiens ADG-90 mRNA, complete cds. // chr6 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// BC066553 // GenBank // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 114, mRNA (cDNA clone MGC:70653 IMAGE:6165591), complete cds. // chr6 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// NONHSAT107806 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
AF130102 // GenBank HTC // Homo sapiens clone FLB2205 PRO0522 mRNA, complete cds. // chr6 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0
NM_005493 // RefSeq // Homo sapiens RAN binding protein 9 (RANBP9), mRNA. // chr6 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// XM_006714945 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens RAN binding protein 9 (RANBP9), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 78 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000011619 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:13621498:13711564:-1 gene:ENSG00000010017 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000539980 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:13621501:13696805:-1 gene:ENSG00000010017 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 73 // 27 // 27 // 0 /// AB008515 // GenBank // Homo sapiens mRNA for RanBPM, complete cds. // chr6 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// AB055311 // GenBank // Homo sapiens mRNA for RanBPM, complete cds. // chr6 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// AF306510 // GenBank // Homo sapiens RANBPM mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// AK313334 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ93856, Homo sapiens RAN binding protein 9 (RANBP9), mRNA. // chr6 // 100 // 68 // 25 // 25 // 0 /// BC052781 // GenBank // Homo sapiens RAN binding protein 9, mRNA (cDNA clone IMAGE:5272048), partial cds. // chr6 // 97 // 100 // 36 // 37 // 0 /// BC063849 // GenBank // Homo sapiens RAN binding protein 9, mRNA (cDNA clone MGC:75091 IMAGE:6186252), complete cds. // chr6 // 100 // 73 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000032943 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:13622362:13711505:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0
ENST00000488770 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:13790788:13814568:-1 gene:ENSG00000050393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK024611 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ20958 fis, clone ADSE02059. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_001031713 // RefSeq // Homo sapiens mitochondrial calcium uniporter regulator 1 (MCUR1), mRNA. // chr6 // 93 // 93 // 26 // 28 // 1 /// ENST00000379170 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:13786557:13814568:-1 gene:ENSG00000050393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 93 // 93 // 26 // 28 // 1 /// BC016850 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 90A, mRNA (cDNA clone MGC:16830 IMAGE:3886144), complete cds. // chr6 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1 /// ENST00000607303 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:6:13787134:13801345:-1 gene:ENSG00000050393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// NONHSAT107815 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000032965 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:13791259:13826569:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 93 // 93 // 26 // 28 // 1
ENST00000364649 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:15324367:15324472:-1 gene:ENSG00000201519 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT107871 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONHSAT107888 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000384464 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:6:16232231:16232330:-1 gene:ENSG00000207193 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT107899 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_000332 // RefSeq // Homo sapiens ataxin 1 (ATXN1), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NM_001128164 // RefSeq // Homo sapiens ataxin 1 (ATXN1), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000244769 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:16299112:16761456:-1 gene:ENSG00000124788 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000436367 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:16299112:16761490:-1 gene:ENSG00000124788 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC117125 // GenBank // Homo sapiens ataxin 1, mRNA (cDNA clone MGC:150734 IMAGE:40125676), complete cds. // chr6 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// X79204 // GenBank // H.sapiens SCA1 mRNA for ataxin. // chr6 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000038197 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:16306329:16356047:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0
ENST00000333817 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:17530899:17531652:-1 gene:ENSG00000184612 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001278209 // RefSeq // Homo sapiens nucleoporin 153kDa (NUP153), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_001278210 // RefSeq // Homo sapiens nucleoporin 153kDa (NUP153), transcript variant 3, mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NM_005124 // RefSeq // Homo sapiens nucleoporin 153kDa (NUP153), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006715291 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens nucleoporin 153kDa (NUP153), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000262077 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:17615038:17706387:-1 gene:ENSG00000124789 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000537253 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:17615035:17706834:-1 gene:ENSG00000124789 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK295644 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60565 complete cds, highly similar to Nuclear pore complex protein Nup153. // chr6 // 88 // 96 // 23 // 26 // 0 /// BC052965 // GenBank // Homo sapiens nucleoporin 153kDa, mRNA (cDNA clone MGC:51910 IMAGE:6067006), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000613258 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:17615035:17706834:-1 gene:ENSG00000124789 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000032345 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:17616097:17876422:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
ENST00000364545 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:17721786:17721903:-1 gene:ENSG00000201415 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT107931 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000364572 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:6:17737458:17737556:-1 gene:ENSG00000201442 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT107932 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_198586 // RefSeq // Homo sapiens NHL repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 (NHLRC1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000340650 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:18121419:18122606:-1 gene:ENSG00000187566 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// AY324850 // GenBank // Homo sapiens clone UI-CF-FNO-AFA malin (EPM2B) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC103888 // GenBank // Homo sapiens NHL repeat containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:119262 IMAGE:40004980), complete cds. // chr6 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// BC103889 // GenBank // Homo sapiens NHL repeat containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:119264 IMAGE:40004983), complete cds. // chr6 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// BC103890 // GenBank // Homo sapiens NHL repeat containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:119265 IMAGE:40004985), complete cds. // chr6 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000028169 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:18121419:18122606:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_000367 // RefSeq // Homo sapiens thiopurine S-methyltransferase (TPMT), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000309983 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:18128311:18155074:-1 gene:ENSG00000137364 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// BC005339 // GenBank // Homo sapiens thiopurine S-methyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:12430 IMAGE:3829338), complete cds. // chr6 // 100 // 70 // 14 // 14 // 0 /// BC009596 // GenBank // Homo sapiens thiopurine S-methyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:14685 IMAGE:4133029), complete cds. // chr6 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0 /// U12387 // GenBank // Human thiopurine methyltransferase (TPMT) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 70 // 14 // 14 // 0 /// AK310420 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17462. // chr6 // 50 // 50 // 10 // 20 // 1
ENST00000362845 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:6:18273165:18273266:-1 gene:ENSG00000199715 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT107940 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000363811 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:18306973:18307079:-1 gene:ENSG00000200681 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT107941 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NONHSAT107975 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000364087 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:19642425:19642529:-1 gene:ENSG00000200957 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT107999 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
ENST00000446953 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:20042455:20042940:-1 gene:ENSG00000229700 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONHSAT108018 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// TCONS_l2_00024643-XLOC_l2_012902 // Broad TUCP // linc-DEK-8 chr6:-:20042902-20045304 // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001080480 // RefSeq // Homo sapiens membrane bound O-acyltransferase domain containing 1 (MBOAT1), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NR_073465 // RefSeq // Homo sapiens membrane bound O-acyltransferase domain containing 1 (MBOAT1), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr6 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000324607 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:20102145:20212399:-1 gene:ENSG00000172197 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0 /// AB305043 // GenBank // Homo sapiens OACT1 mRNA for lysophospholipid acyltransferase, complete cds. // chr6 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0 /// AK296857 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60658 complete cds, highly similar to Mus musculus membrane bound O-acyltransferase domain containing 1 (Mboat1), mRNA. // chr6 // 92 // 65 // 24 // 26 // 0 /// AK304748 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57857 complete cds, highly similar to Mus musculus membrane bound O-acyltransferase domain containing 1 (Mboat1), mRNA. // chr6 // 100 // 35 // 14 // 14 // 0 /// BC150650 // GenBank // Homo sapiens membrane bound O-acyltransferase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:183561 IMAGE:9057021), complete cds. // chr6 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0 /// BC150652 // GenBank // Homo sapiens membrane bound O-acyltransferase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:183563 IMAGE:9057023), complete cds. // chr6 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000039833 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:20068324:20144697:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 50 // 50 // 20 // 40 // 1
ENST00000467883 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:20421583:20421887:-1 gene:ENSG00000240869 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT108024 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000410499 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:20452369:20452473:-1 gene:ENSG00000222431 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT108027 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_000948 // RefSeq // Homo sapiens prolactin (PRL), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001163558 // RefSeq // Homo sapiens prolactin (PRL), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000306482 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:22287251:22297501:-1 gene:ENSG00000172179 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC015850 // GenBank // Homo sapiens prolactin, mRNA (cDNA clone MGC:27289 IMAGE:4657724), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC088370 // GenBank // Homo sapiens prolactin, mRNA (cDNA clone MGC:111116 IMAGE:30393428), complete cds. // chr6 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GQ305133 // GenBank // Homo sapiens prolactin precursor (PRL) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr6 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000615510 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:22287244:22297501:-1 gene:ENSG00000172179 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// ENST00000617911 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:22287244:22297501:-1 gene:ENSG00000172179 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000001648 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:22287402:22399988:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_001195610 // RefSeq // Homo sapiens doublecortin domain containing 2 (DCDC2), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 97 // 88 // 37 // 38 // 0 /// NM_016356 // RefSeq // Homo sapiens doublecortin domain containing 2 (DCDC2), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000378450 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:24171756:24205303:-1 gene:ENSG00000146038 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 33 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000378454 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:24171756:24358052:-1 gene:ENSG00000146038 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// AB032980 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1154 protein, partial cds. // chr6 // 100 // 81 // 35 // 35 // 0 /// AF181721 // GenBank // Homo sapiens RU2S (RU2) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 81 // 35 // 35 // 0 /// BC050704 // GenBank // Homo sapiens doublecortin domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:60304 IMAGE:5758845), complete cds. // chr6 // 97 // 79 // 33 // 34 // 0 /// AL133043 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp564C147 (from clone DKFZp564C147); partial cds. // chr6 // 67 // 28 // 8 // 12 // 0 /// GENSCAN00000029771 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:24174730:24208179:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 19 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000029776 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:24227444:24303176:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 28 // 28 // 12 // 43 // 1 /// BC014954 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4874845, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr6 // 19 // 19 // 8 // 43 // 1
NM_030939 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 62 (C6orf62), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000378102 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:24706096:24719998:-1 gene:ENSG00000112308 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000378119 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:24704861:24720836:-1 gene:ENSG00000112308 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AJ420475 // GenBank // Homo sapiens mRNA full length insert cDNA clone EUROIMAGE 1576210. // chr6 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// AY598792 // GenBank // Homo sapiens HBV X-transactivated protein 12 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// BC047866 // GenBank // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 62, mRNA (cDNA clone MGC:57512 IMAGE:6499979), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// CR457292 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834E059D for gene C6orf62, chromosome 6 open reading frame 62; complete cds, incl. stopcodon. // chr6 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// CR533486 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834C1017D for gene C6orf62, chromosome 6 open reading frame 62; complete cds, incl. stopcodon. // chr6 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// AK301718 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52139 complete cds. // chr6 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1 /// XM_005249433 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 62 (C6orf62), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// GENSCAN00000029775 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:24645742:24716279:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
ENST00000465067 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:25031009:25031287:-1 gene:ENSG00000244618 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 74 // 100 // 17 // 23 // 0 /// NONHSAT108130 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 74 // 100 // 17 // 23 // 0
ENST00000384556 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:6:25287432:25287533:-1 gene:ENSG00000207286 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT108150 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_170745 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 1, H2aa (HIST1H2AA), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000297012 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:25726132:25726527:-1 gene:ENSG00000164508 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0 /// BC062211 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H2aa, mRNA (cDNA clone MGC:71871 IMAGE:6614487), complete cds. // chr6 // 79 // 100 // 19 // 24 // 0
ENST00000369177 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:25731782:25732091:-1 gene:ENSG00000178762 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT108180 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001286123 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 17, member 2 (SLC17A2), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// NM_001286125 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 17, member 2 (SLC17A2), transcript variant 3, mRNA. // chr6 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// NM_005835 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 17, member 2 (SLC17A2), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000265425 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:25913317:25925817:-1 gene:ENSG00000112337 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000360488 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:25912754:25930611:-1 gene:ENSG00000112337 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000377850 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:25912763:25930726:-1 gene:ENSG00000112337 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC104822 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 17 (sodium phosphate), member 2, mRNA (cDNA clone MGC:132482 IMAGE:8143825), complete cds. // chr6 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// BC112033 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 17 (sodium phosphate), member 2, mRNA (cDNA clone MGC:138238 IMAGE:8327501), complete cds. // chr6 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// U90544 // GenBank // Human sodium phosphate transporter (NPT3) mRNA, complete cds. // chr6 // 94 // 94 // 29 // 31 // 0 /// GENSCAN00000019807 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:25913317:25923844:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 58 // 19 // 19 // 0
NM_005325 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 1, H1a (HIST1H1A), mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000244573 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:26017085:26017732:-1 gene:ENSG00000124610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// BC069492 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H1a, mRNA (cDNA clone MGC:96978 IMAGE:7262187), complete cds. // chr6 // 91 // 96 // 21 // 23 // 0 /// BC101593 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H1a, mRNA (cDNA clone MGC:126642 IMAGE:8069099), complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// BC112140 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H1a, mRNA (cDNA clone MGC:138345 IMAGE:8327608), complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000029815 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:25997506:26017732:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0
NM_003544 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 1, H4b (HIST1H4B), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000377745 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:26026815:26027252:-1 gene:ENSG00000278705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSG00000198327 // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC069467 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H4b, mRNA (cDNA clone MGC:97440 IMAGE:7262716), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000029864 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:26026941:26027309:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0
NM_003537 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 1, H3b (HIST1H3B), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC069133 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H3b, mRNA (cDNA clone MGC:95414 IMAGE:7216989), complete cds. // chr6 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// BC096132 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H3b, mRNA (cDNA clone MGC:116779 IMAGE:40002522), complete cds. // chr6 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// BC096133 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H3b, mRNA (cDNA clone MGC:116780 IMAGE:40002523), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC096134 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H3b, mRNA (cDNA clone MGC:116781 IMAGE:40002524), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC099630 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H3b, mRNA (cDNA clone MGC:116778 IMAGE:40002521), complete cds. // chr6 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// ENST00000621411 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:26031650:26032060:-1 gene:ENSG00000274267 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000029846 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:26031650:26032060:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_003513 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 1, H2ab (HIST1H2AB), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK311785 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ92046, Homo sapiens histone 1, H2ab (HIST1H2AB), mRNA. // chr6 // 93 // 58 // 13 // 14 // 0 /// BC125140 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H2ab, mRNA (cDNA clone MGC:150342 IMAGE:40119630), complete cds. // chr6 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 /// ENST00000615868 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:26033176:26033568:-1 gene:ENSG00000278463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000029813 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:26033176:26043657:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0
NM_021062 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 1, H2bb (HIST1H2BB), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC096728 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H2bb, mRNA (cDNA clone MGC:119805 IMAGE:40014250), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000615966 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:26043277:26043657:-1 gene:ENSG00000276410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000029813 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:26033176:26043657:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0
NM_005319 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 1, H1c (HIST1H1C), mRNA. // chr6 // 85 // 93 // 22 // 26 // 0 /// ENST00000343677 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:26055787:26056428:-1 gene:ENSG00000187837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// AB451259 // GenBank // Homo sapiens HIST1H1C mRNA for histone H1.2, complete cds, clone: FLJ08073AAAN. // chr6 // 93 // 50 // 13 // 14 // 0 /// AK290947 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76039 complete cds, highly similar to Homo sapiens histone 1, H1c (HIST1H1C), mRNA. // chr6 // 82 // 100 // 23 // 28 // 0 /// GENSCAN00000029851 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:26055787:26056428:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0
NM_005323 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 1, H1t (HIST1H1T), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000338379 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:26107419:26108136:-1 gene:ENSG00000187475 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC069517 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H1t, mRNA (cDNA clone MGC:96974 IMAGE:7262183), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC130350 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H1t, mRNA (cDNA clone MGC:163222 IMAGE:40146381), complete cds. // chr6 // 83 // 88 // 19 // 23 // 0 /// GENSCAN00000029838 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:26107470:26108135:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
NM_003526 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 1, H2bc (HIST1H2BC), mRNA. // chr6 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000314332 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:26114873:26123910:-1 gene:ENSG00000180596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 92 // 57 // 11 // 12 // 0 /// ENST00000396984 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:26123356:26123926:-1 gene:ENSG00000180596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 94 // 76 // 15 // 16 // 0 /// BC009612 // GenBank HTC // Homo sapiens histone cluster 1, H2bc, mRNA (cDNA clone IMAGE:4102077), with apparent retained intron. // chr6 // 93 // 71 // 14 // 15 // 0 /// BC105595 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H2bc, mRNA (cDNA clone MGC:104246 IMAGE:4734445), complete cds. // chr6 // 92 // 57 // 11 // 12 // 0 /// GENSCAN00000029852 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:26123524:26123904:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 43 // 9 // 9 // 0 /// BC038854 // GenBank HTC // Homo sapiens SECIS binding protein 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:5209694), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr6 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1
NM_003539 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 1, H4d (HIST1H4D), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC128104 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H4d, mRNA (cDNA clone MGC:149184 IMAGE:40112084), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC143045 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H4d, mRNA (cDNA clone MGC:165322 IMAGE:40112087), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000614247 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:26188765:26189076:-1 gene:ENSG00000277157 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000029820 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:26188765:26189076:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_003518 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 1, H2bg (HIST1H2BG), mRNA. // chr6 // 100 // 60 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000541790 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:26216066:26216692:-1 gene:ENSG00000273802 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSG00000124635 // chr6 // 100 // 65 // 13 // 13 // 0 /// AK311935 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ92202, Homo sapiens histone 1, H2bg (HIST1H2BG), mRNA. // chr6 // 100 // 45 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000029840 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:26216263:26216643:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 40 // 8 // 8 // 0
NM_005320 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 1, H1d (HIST1H1D), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000244534 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:26234268:26234933:-1 gene:ENSG00000124575 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 60 // 12 // 12 // 0 /// BC104874 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H1d, mRNA (cDNA clone MGC:132534 IMAGE:8143877), complete cds. // chr6 // 95 // 100 // 19 // 20 // 0 /// BC111971 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H1d, mRNA (cDNA clone MGC:138176 IMAGE:8327439), complete cds. // chr6 // 95 // 100 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000029822 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:26234268:26234933:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 60 // 12 // 12 // 0
NM_003547 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 1, H4g (HIST1H4G), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC126276 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H4g, mRNA (cDNA clone MGC:161554 IMAGE:8991992), complete cds. // chr6 // 75 // 77 // 15 // 20 // 0 /// BC126278 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H4g, mRNA (cDNA clone MGC:161556 IMAGE:8991994), complete cds. // chr6 // 75 // 77 // 15 // 20 // 0 /// ENST00000611444 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:26246681:26246977:-1 gene:ENSG00000275663 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000029823 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:26246681:26247739:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0
NM_021018 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 1, H3f (HIST1H3F), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AK314142 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ94844, Homo sapiens histone 1, H3f (HIST1H3F), mRNA. // chr6 // 100 // 52 // 11 // 11 // 0 /// BC067492 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H3f, mRNA (cDNA clone MGC:79345 IMAGE:7002073), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC069818 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H3f, mRNA (cDNA clone MGC:97445 IMAGE:7262721), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC096131 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H3f, mRNA (cDNA clone MGC:116777 IMAGE:40002512), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// CR541983 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834C0335D for gene HIST1H3F, histone 1, H3f; complete cds, incl. stopcodon. // chr6 // 100 // 52 // 11 // 11 // 0 /// CR542011 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834F0335D for gene HIST1H3F, histone 1, H3f; complete cds, without stopcodon. // chr6 // 91 // 52 // 10 // 11 // 0 /// ENST00000618052 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:26250195:26250605:-1 gene:ENSG00000277775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 52 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000029824 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:26250195:26250605:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 52 // 11 // 11 // 0
NM_003534 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 1, H3g (HIST1H3G), mRNA. // chr6 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0 /// BC079835 // GenBank HTC // Homo sapiens histone cluster 1, H3g, mRNA (cDNA clone IMAGE:5935692). // chr6 // 71 // 52 // 10 // 14 // 0 /// ENST00000614378 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:26269405:26271815:-1 gene:ENSG00000273983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENST00000362070 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:26272193:26272540:-1 gene:ENSG00000218690 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029834 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:26272193:26272540:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_003543 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 1, H4h (HIST1H4H), mRNA. // chr6 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000377727 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:26285113:26285509:-1 gene:ENSG00000158406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 93 // 56 // 13 // 14 // 0 /// BC120939 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H4h, mRNA (cDNA clone MGC:149417 IMAGE:40115073), complete cds. // chr6 // 77 // 52 // 10 // 13 // 0 /// CR542169 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834D0724D for gene HIST1H4H, histone 1, H4h; complete cds, incl. stopcodon. // chr6 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000029811 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:26285188:26285499:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
ENST00000362419 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:26519351:26519458:-1 gene:ENSG00000199289 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT108288 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000410868 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:27109790:27109980:-1 gene:ENSG00000222800 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT108336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_021058 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 1, H2bj (HIST1H2BJ), mRNA. // chr6 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000339812 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:27132370:27132750:-1 gene:ENSG00000124635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000607124 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:27125897:27132750:-1 gene:ENSG00000124635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 93 // 47 // 13 // 14 // 0 /// AK311849 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ92114, Homo sapiens histone 1, H2bj (HIST1H2BJ), mRNA. // chr6 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// BC014312 // GenBank HTC // Homo sapiens histone cluster 1, H2bj, mRNA (cDNA clone IMAGE:4048288), with apparent retained intron. // chr6 // 95 // 73 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000048846 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:27002496:27132750:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_080593 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 1, H2bk (HIST1H2BK), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC000893 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H2bk, mRNA (cDNA clone MGC:5132 IMAGE:3463930), complete cds. // chr6 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// BC051872 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H2bk, mRNA (cDNA clone MGC:60248 IMAGE:6526835), complete cds. // chr6 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// BC064959 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H2bk, mRNA (cDNA clone MGC:74942 IMAGE:6093977), complete cds. // chr6 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// BC108737 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H2bk, mRNA (cDNA clone MGC:131989 IMAGE:4707078), complete cds. // chr6 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0
NM_033482 // RefSeq // Homo sapiens POM121 transmembrane nucleoporin-like 2 (POM121L2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000444565 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:27309063:27312170:-1 gene:ENSG00000158553 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000048858 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:27309063:27344450:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NR_002722 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 204, pseudogene (ZNF204P), transcript variant 1, non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NR_024553 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 204, pseudogene (ZNF204P), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000416749 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:27357825:27360221:-1 gene:ENSG00000204789 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// AK296042 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52606 complete cds, moderately similar to Zinc finger protein 79. // chr6 // 100 // 71 // 10 // 10 // 0 /// BC067282 // GenBank HTC // Homo sapiens zinc finger protein 204 pseudogene, mRNA (cDNA clone IMAGE:6184975). // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT108367 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT108368 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT108369 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT108370 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT108371 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT108372 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT108373 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT108374 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_007149 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 184 (ZNF184), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000211936 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:27450743:27473118:-1 gene:ENSG00000096654 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000377419 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:27450820:27472681:-1 gene:ENSG00000096654 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// AK123011 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ16814 fis, clone THYMU3030710, highly similar to Zinc finger protein 184. // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AK131264 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ16197 fis, clone CTONG1000113, highly similar to ZINC FINGER PROTEIN 184. // chr6 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// BC022992 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 184, mRNA (cDNA clone MGC:29879 IMAGE:4997766), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000048867 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:27451303:27473031:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0
NM_003519 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 1, H2bl (HIST1H2BL), mRNA. // chr6 // 92 // 62 // 12 // 13 // 0 /// ENST00000377401 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:27807444:27807931:-1 gene:ENSG00000185130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 94 // 76 // 15 // 16 // 0
NM_021066 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 1, H2aj (HIST1H2AJ), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_003510 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 1, H2ak (HIST1H2AK), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC034487 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H2ak, mRNA (cDNA clone MGC:26490 IMAGE:4825623), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC104198 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H2ak, mRNA (cDNA clone MGC:125892 IMAGE:40031339), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC104199 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H2ak, mRNA (cDNA clone MGC:125893 IMAGE:40031340), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000618958 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:27837947:27838339:-1 gene:ENSG00000275221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 57 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000048843 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:27831216:27838339:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 57 // 12 // 12 // 0
NM_005322 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 1, H1b (HIST1H1B), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000331442 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:27866849:27867529:-1 gene:ENSG00000184357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 53 // 9 // 9 // 0 /// BC069101 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H1b, mRNA (cDNA clone MGC:95376 IMAGE:7216915), complete cds. // chr6 // 94 // 100 // 16 // 17 // 0 /// BC101581 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H1b, mRNA (cDNA clone MGC:126630 IMAGE:8069087), complete cds. // chr6 // 69 // 76 // 9 // 13 // 0 /// BC101583 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H1b, mRNA (cDNA clone MGC:126632 IMAGE:8069089), complete cds. // chr6 // 69 // 76 // 9 // 13 // 0 /// GENSCAN00000048852 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:27866849:27867529:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 53 // 9 // 9 // 0
NM_003533 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 1, H3i (HIST1H3I), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC066884 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H3i, mRNA (cDNA clone MGC:79346 IMAGE:7002077), complete cds. // chr6 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC067493 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H3i, mRNA (cDNA clone MGC:79347 IMAGE:7002079), complete cds. // chr6 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// BC069305 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H3i, mRNA (cDNA clone MGC:97469 IMAGE:7262745), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000616365 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:27871905:27872315:-1 gene:ENSG00000275379 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000048862 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:27871905:27872315:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_003546 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 1, H4l (HIST1H4L), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC069392 // GenBank // Homo sapiens histone cluster 1, H4l, mRNA (cDNA clone MGC:97405 IMAGE:7262681), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000618305 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:27873199:27873510:-1 gene:ENSG00000275126 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000048848 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:27873199:27893149:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0
NM_003535 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 1, H3j (HIST1H3J), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000359303 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:27890382:27890792:-1 gene:ENSG00000197153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000048848 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:27873199:27893149:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_003514 // RefSeq // Homo sapiens histone cluster 1, H2am (HIST1H2AM), mRNA. // chr6 // 92 // 52 // 11 // 12 // 0 /// BC032756 // GenBank HTC // Homo sapiens histone cluster 1, H2am, mRNA (cDNA clone IMAGE:5581631). // chr6 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0
NM_033057 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily B, member 2 (OR2B2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000303324 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:27911246:27912319:-1 gene:ENSG00000168131 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC136881 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily B, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:168495 IMAGE:9020872), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC136901 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 2, subfamily B, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:168515 IMAGE:9020892), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000048839 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:27895560:27911968:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 33 // 8 // 8 // 0
ENST00000432841 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:28053228:28054165:-1 gene:ENSG00000182477 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000027420 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:28053228:28053815:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0
NR_002936 // RefSeq // Homo sapiens transducer of ERBB2, 2 pseudogene 1 (TOB2P1), non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000469761 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:28217643:28218634:-1 gene:ENSG00000176933 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK292767 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75558 complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC039027 // GenBank // Homo sapiens transducer of ERBB2, 2 pseudogene, mRNA (cDNA clone IMAGE:4934105). // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC050562 // GenBank // Homo sapiens transducer of ERBB2, 2 pseudogene, mRNA (cDNA clone IMAGE:5785687). // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// HQ268503 // GenBank // Homo sapiens CRA_a protein mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF318346 // GenBank HTC // Homo sapiens pp14762 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_019110 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger with KRAB and SCAN domains 4 (ZKSCAN4), mRNA. // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000377294 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:28244623:28252224:-1 gene:ENSG00000187626 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AK302017 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57654 complete cds, highly similar to Zinc finger protein 307. // chr6 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// AY781778 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 307 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC014031 // GenBank // Homo sapiens zinc finger with KRAB and SCAN domains 4, mRNA (cDNA clone MGC:20459 IMAGE:4336904), complete cds. // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000027394 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:28245116:28251980:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0
NR_028077 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger and SCAN domain containing 12 (ZSCAN12), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr6 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000361028 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:28378955:28399734:-1 gene:ENSG00000158691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000396827 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:28379219:28399731:-1 gene:ENSG00000158691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// AB007886 // GenBank // Homo sapiens KIAA0426 mRNA, partial cds. // chr6 // 97 // 98 // 38 // 39 // 0 /// AK289802 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75996 complete cds, highly similar to Homo sapiens zinc finger protein 96 (ZNF96), mRNA. // chr6 // 100 // 68 // 27 // 27 // 0 /// BC041661 // GenBank // Homo sapiens zinc finger and SCAN domain containing 12, mRNA (cDNA clone MGC:47655 IMAGE:6063526), complete cds. // chr6 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// NM_001163391 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger and SCAN domain containing 12 (ZSCAN12), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 55 // 55 // 22 // 40 // 1 /// XM_006715282 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens zinc finger and SCAN domain containing 12 (ZSCAN12), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 55 // 55 // 22 // 40 // 1 /// GENSCAN00000027405 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:28390454:28408401:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 48 // 19 // 19 // 0
NM_001012455 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger and SCAN domain containing 23 (ZSCAN23), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_005248950 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens zinc finger and SCAN domain containing 23 (ZSCAN23), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000289788 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:28432655:28443467:-1 gene:ENSG00000187987 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000481983 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:28431930:28443480:-1 gene:ENSG00000187987 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// BC101557 // GenBank // Homo sapiens zinc finger and SCAN domain containing 23, mRNA (cDNA clone MGC:126606 IMAGE:8069063), complete cds. // chr6 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC101559 // GenBank // Homo sapiens zinc finger and SCAN domain containing 23, mRNA (cDNA clone MGC:126608 IMAGE:8069065), complete cds. // chr6 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AK092117 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ34798 fis, clone NT2NE2006103, moderately similar to ZINC FINGER PROTEIN 165. // chr6 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1 /// ENST00000486481 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:28434891:28443502:-1 gene:ENSG00000187987 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1 /// GENSCAN00000027400 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:28434465:28507339:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1
NM_182701 // RefSeq // Homo sapiens glutathione peroxidase 6 (olfactory) (GPX6), mRNA. // chr6 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENST00000361902 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:28503296:28515793:-1 gene:ENSG00000198704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENST00000474923 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:6:28504186:28515787:-1 gene:ENSG00000198704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// AY324826 // GenBank // Homo sapiens glutathione peroxidase 6 mRNA, complete cds. // chr6 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// BC133691 // GenBank // Homo sapiens glutathione peroxidase 6 (olfactory), mRNA (cDNA clone IMAGE:40120192), complete cds. // chr6 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000483058 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:28506333:28528215:-1 gene:ENSG00000198704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// ENST00000612264 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:28503296:28515793:-1 gene:ENSG00000198704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 90 // 97 // 26 // 29 // 0 /// GENSCAN00000027400 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:28434465:28507339:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_052923 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, BED-type containing 9 (ZBED9), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000452236 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:28571630:28587335:-1 gene:ENSG00000232040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000508341 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR6_MHC_COX_CTG1:28573507:28587330:-1 gene:ENSG00000248496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// AY517631 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 452 (ZNF452) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC110834 // GenBank // Homo sapiens SCAN domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:131782 IMAGE:6499684), complete cds. // chr6 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// BC111741 // GenBank // Homo sapiens SCAN domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:133311 IMAGE:40038622), complete cds. // chr6 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// BC111742 // GenBank // Homo sapiens SCAN domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:133310 IMAGE:40038617), complete cds. // chr6 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000000084 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR6_MHC_COX_CTG1:28542677:28606667:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 33 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000027397 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:28542302:28606672:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
AY358246 // GenBank // Homo sapiens clone DNA165054 PAMP6501 (UNQ6501) mRNA, complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// ENST00000610635 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR6_MHC_DBB_CTG1:30000771:30002215:-1 gene:ENSG00000225618 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000612676 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR6_MHC_APD_CTG1:30002945:30004389:-1 gene:ENSG00000236598 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000616736 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR6_MHC_MCF_CTG1:30089292:30090736:-1 gene:ENSG00000232691 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000616897 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR6_MHC_SSTO_CTG1:30000101:30001545:-1 gene:ENSG00000196299 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000618817 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR6_MHC_MANN_CTG1:30005967:30007411:-1 gene:ENSG00000235394 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000622469 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:30010829:30012273:-1 gene:ENSG00000204623 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000365118 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:6:30736304:30736414:-1 gene:ENSG00000201988 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000581716 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR6_MHC_DBB_CTG1:30726562:30726672:-1 gene:ENSG00000263950 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000581902 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR6_MHC_MCF_CTG1:30814786:30814896:-1 gene:ENSG00000266523 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000583857 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR6_MHC_COX_CTG1:30726158:30726268:-1 gene:ENSG00000266119 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000585173 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR6_MHC_QBL_CTG1:30725828:30725938:-1 gene:ENSG00000265955 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000585305 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR6_MHC_SSTO_CTG1:30728556:30728666:-1 gene:ENSG00000263610 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT108673 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT116653 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT117003 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT117657 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT118012 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT118362 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000362462 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:6:31402152:31402250:-1 gene:ENSG00000199332 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000494551 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR6_MHC_COX_CTG1:31392641:31392739:-1 gene:ENSG00000264692 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000577206 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR6_MHC_MANN_CTG1:31445150:31445248:-1 gene:ENSG00000266747 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// ENST00000581456 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR6_MHC_QBL_CTG1:31392186:31392284:-1 gene:ENSG00000265896 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000583561 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR6_MHC_SSTO_CTG1:31395893:31395991:-1 gene:ENSG00000266250 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONHSAT108769 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONHSAT116705 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONHSAT117406 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// NONHSAT118063 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONHSAT118395 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENST00000364685 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:6:31778817:31778905:-1 gene:ENSG00000201555 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000463759 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR6_MHC_APD_CTG1:31845835:31845923:-1 gene:ENSG00000264393 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000580051 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR6_MHC_COX_CTG1:31766178:31766266:-1 gene:ENSG00000264955 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000580300 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR6_MHC_SSTO_CTG1:31769573:31769661:-1 gene:ENSG00000264778 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000580858 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR6_MHC_MCF_CTG1:31855113:31855201:-1 gene:ENSG00000264887 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000583189 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR6_MHC_DBB_CTG1:31760998:31761086:-1 gene:ENSG00000266113 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT108836 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT116438 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT116757 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT117099 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT117754 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT118448 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_002125 // RefSeq // Homo sapiens major histocompatibility complex, class II, DR beta 5 (HLA-DRB5), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000374975 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:32517343:32530287:-1 gene:ENSG00000198502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC009234 // GenBank // Homo sapiens major histocompatibility complex, class II, DR beta 5, mRNA (cDNA clone MGC:16550 IMAGE:4054398), complete cds. // chr6 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// M20429 // GenBank // Human MHC class II HLA-DR-beta mRNA (DR2-DQw1/DR4 DQw3), complete cds, clone ROF-beta-2a. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// M20503 // GenBank // Human MHC class II HLA-DR-beta-1 mRNA, complete cds. // chr6 // 85 // 77 // 17 // 20 // 0 /// M32578 // GenBank // Human MHC class II HLA-DR beta-1 mRNA (DR2.3), 5end. // chr6 // 68 // 96 // 17 // 25 // 0 /// M57648 // GenBank // Human MHC HLA-Dw12 mRNA, complete cds. // chr6 // 73 // 100 // 19 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005709 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:32445244:32589742:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1
ENST00000516107 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:32549940:32550090:-1 gene:ENSG00000251916 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000583936 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR6_MHC_COX_CTG1:32479741:32479887:-1 gene:ENSG00000264909 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 93 // 100 // 14 // 15 // 0 /// NONHSAT108913 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT116809 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 93 // 100 // 14 // 15 // 0 /// ENST00000582426 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR6_MHC_QBL_CTG1:32485042:32485188:-1 gene:ENSG00000264389 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 67 // 100 // 10 // 15 // 0 /// NONHSAT118161 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 67 // 100 // 10 // 15 // 0
NM_001188 // RefSeq // Homo sapiens BCL2-antagonist/killer 1 (BAK1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000360661 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:33572547:33580293:-1 gene:ENSG00000030110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000374467 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:33572552:33580242:-1 gene:ENSG00000030110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000442998 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:33572547:33580293:-1 gene:ENSG00000030110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// AF520590 // GenBank // Homo sapiens pro-apoptotic protein BAKM variant (BAK) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 90 // 9 // 9 // 0 /// AK293547 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55169 complete cds, highly similar to Bcl-2 homologous antagonist/killer. // chr6 // 80 // 100 // 8 // 10 // 0 /// BC004431 // GenBank // Homo sapiens BCL2-antagonist/killer 1, mRNA (cDNA clone MGC:3887 IMAGE:2819507), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC110337 // GenBank // Homo sapiens BCL2-antagonist/killer 1, mRNA (cDNA clone MGC:117255 IMAGE:5755200), complete cds. // chr6 // 100 // 90 // 9 // 9 // 0 /// CR457419 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834E1210D for gene BAK1, BCL2-antagonist/killer 1; complete cds, incl. stopcodon. // chr6 // 100 // 90 // 9 // 9 // 0 /// U16811 // GenBank // Human Bak mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// U23765 // GenBank // Human Bak protein mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 90 // 9 // 9 // 0 /// AK292093 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75165 complete cds, highly similar to Homo sapiens BCL2-antagonist/killer 1 (BAK1), mRNA. // chr6 // 70 // 100 // 7 // 10 // 0
NR_027908 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 336 (LINC00336), long non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000477984 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:33586106:33593338:-1 gene:ENSG00000197251 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONHSAT109006 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000041261 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:33573803:33608178:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_032340 // RefSeq // Homo sapiens ubiquinol-cytochrome c reductase complex assembly factor 2 (UQCC2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000374214 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:6:33697568:33711727:-1 gene:ENSG00000137288 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000374231 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:33695349:33711684:-1 gene:ENSG00000137288 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 95 // 75 // 20 // 21 // 0 /// ENST00000607484 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:33696761:33711727:-1 gene:ENSG00000137288 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF086234 // GenBank // Homo sapiens full length insert cDNA clone ZD17G12. // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AY568085 // GenBank // Homo sapiens breast cancer associated protein SGA-81M mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC006007 // GenBank // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 125, mRNA (cDNA clone MGC:14833 IMAGE:4284544), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000606961 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:33694293:33698657:-1 gene:ENSG00000137288 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// AK127468 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ45560 fis, clone BRTHA3003417. // chr6 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// GENSCAN00000041252 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:33697653:33711686:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0
NM_001142883 // RefSeq // Homo sapiens inositol hexakisphosphate kinase 3 (IP6K3), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_054111 // RefSeq // Homo sapiens inositol hexakisphosphate kinase 3 (IP6K3), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_005248843 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens inositol hexakisphosphate kinase 3 (IP6K3), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000293756 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:33721670:33746905:-1 gene:ENSG00000161896 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000451316 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:33721667:33746985:-1 gene:ENSG00000161896 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF393812 // GenBank // Homo sapiens inositol hexakisphosphate kinase 3 mRNA, complete cds. // chr6 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// AK289935 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75297 complete cds, highly similar to Homo sapiens inositol hexakisphosphate kinase 3 mRNA. // chr6 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// BC089389 // GenBank // Homo sapiens inositol hexakisphosphate kinase 3, mRNA (cDNA clone MGC:102928 IMAGE:30530548), complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000041253 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:33722720:33735476:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0
NM_001040109 // RefSeq // Homo sapiens motilin (MLN), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_001184698 // RefSeq // Homo sapiens motilin (MLN), transcript variant 3, mRNA. // chr6 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// NM_002418 // RefSeq // Homo sapiens motilin (MLN), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000266003 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:33794700:33804002:-1 gene:ENSG00000096395 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 92 // 93 // 23 // 25 // 0 /// ENST00000430124 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:33794673:33804011:-1 gene:ENSG00000096395 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000507738 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:6:33794787:33803980:-1 gene:ENSG00000096395 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 78 // 67 // 14 // 18 // 0 /// BC069675 // GenBank // Homo sapiens motilin, mRNA (cDNA clone MGC:97389 IMAGE:7262661), complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC112314 // GenBank // Homo sapiens motilin, mRNA (cDNA clone MGC:138519 IMAGE:8327782), complete cds. // chr6 // 83 // 67 // 15 // 18 // 0 /// BC143981 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone MGC:177516 IMAGE:9052499, complete cds. // chr6 // 78 // 67 // 14 // 18 // 0 /// GENSCAN00000041271 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:33793918:33801163:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0
NM_006703 // RefSeq // Homo sapiens nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 3 (NUDT3), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000607016 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:34279679:34392674:-1 gene:ENSG00000272325 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AF062529 // GenBank // Homo sapiens clone 486790 diphosphoinositol polyphosphate phosphohydrolase mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// AF062530 // GenBank // Homo sapiens clone 469920 diphosphoinositol polyphosphate phosphohydrolase mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// BC007727 // GenBank // Homo sapiens nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 3, mRNA (cDNA clone MGC:12752 IMAGE:4303483), complete cds. // chr6 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// BT019984 // GenBank // Homo sapiens nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 3 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 48 // 11 // 11 // 0 /// BT019985 // GenBank // Homo sapiens nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 3 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 48 // 11 // 11 // 0 /// NM_001202470 // RefSeq // Homo sapiens RPS10-NUDT3 readthrough (RPS10-NUDT3), mRNA. // chr6 // 65 // 65 // 15 // 23 // 1 /// ENST00000605528 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:6:34288770:34426048:-1 gene:ENSG00000270800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1 /// GENSCAN00000006805 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:34288753:34426078:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 61 // 61 // 14 // 23 // 1
NM_001252294 // RefSeq // Homo sapiens SAM pointed domain containing ETS transcription factor (SPDEF), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NM_012391 // RefSeq // Homo sapiens SAM pointed domain containing ETS transcription factor (SPDEF), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000374037 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:34537802:34556314:-1 gene:ENSG00000124664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000544425 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:34537802:34556333:-1 gene:ENSG00000124664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AB031549 // GenBank // Homo sapiens PSE mRNA for prostate ets, complete cds. // chr6 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// AF071538 // GenBank // Homo sapiens Ets transcription factor PDEF (PDEF) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK301543 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59217 complete cds, highly similar to SAM pointed domain-containing Ets transcription factor. // chr6 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC021299 // GenBank // Homo sapiens SAM pointed domain containing ets transcription factor, mRNA (cDNA clone MGC:29592 IMAGE:4546860), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000006798 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:34538274:34572313:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
NM_024294 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 106 (C6orf106), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_005249298 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 106 (C6orf106), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 41 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000374021 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:34590509:34671956:-1 gene:ENSG00000196821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 35 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000374023 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:34587288:34696847:-1 gene:ENSG00000196821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000374026 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:34587288:34696859:-1 gene:ENSG00000196821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// BC002328 // GenBank // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 106, mRNA (cDNA clone MGC:4614 IMAGE:3504258), complete cds. // chr6 // 100 // 47 // 16 // 16 // 0 /// BC010184 // GenBank // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 106, mRNA (cDNA clone MGC:20568 IMAGE:3959622), complete cds. // chr6 // 100 // 47 // 16 // 16 // 0 /// BC075810 // GenBank // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 106, mRNA (cDNA clone MGC:87922 IMAGE:5535440), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NM_022758 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 106 (C6orf106), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 88 // 88 // 30 // 34 // 1 /// GENSCAN00000006799 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:34576521:34696603:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 41 // 41 // 14 // 34 // 1
ENST00000585129 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:34685355:34685642:-1 gene:ENSG00000265123 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT112142 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_003214 // RefSeq // Homo sapiens TEA domain family member 3 (TEAD3), mRNA. // chr6 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000338863 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:35473597:35497076:-1 gene:ENSG00000007866 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000402886 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:6:35473597:35496950:-1 gene:ENSG00000007866 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000433586 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:6:35475683:35480122:-1 gene:ENSG00000007866 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 44 // 16 // 16 // 0 /// AF142482 // GenBank // Homo sapiens transcription enhancer factor-5 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// AK226144 // GenBank // Homo sapiens mRNA for TEA domain family member 3 variant, clone: pj02363. // chr6 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// BC027877 // GenBank // Homo sapiens TEA domain family member 3, mRNA (cDNA clone MGC:34093 IMAGE:5207501), complete cds. // chr6 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// BC091488 // GenBank // Homo sapiens TEA domain family member 3, mRNA (cDNA clone MGC:111054 IMAGE:6187474), complete cds. // chr6 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000002350 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:35475044:35493161:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0
NM_001252597 // RefSeq // Homo sapiens colipase, pancreatic (CLPS), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_001252598 // RefSeq // Homo sapiens colipase, pancreatic (CLPS), transcript variant 3, mRNA. // chr6 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NM_001832 // RefSeq // Homo sapiens colipase, pancreatic (CLPS), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000259938 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:35794982:35797311:-1 gene:ENSG00000137392 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC007061 // GenBank // Homo sapiens colipase, pancreatic, mRNA (cDNA clone MGC:12507 IMAGE:3950152), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC017897 // GenBank // Homo sapiens colipase, pancreatic, mRNA (cDNA clone MGC:23801 IMAGE:4251084), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BT006812 // GenBank // Homo sapiens colipase, pancreatic mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// J02883 // GenBank // Human colipase mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000616014 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:35794982:35797344:-1 gene:ENSG00000137392 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000622413 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:35794982:35796850:-1 gene:ENSG00000137392 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000002341 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:35795146:35797288:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT112194 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 77 // 46 // 10 // 13 // 0
NM_001010903 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 222 (C6orf222), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000437635 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:36315757:36336885:-1 gene:ENSG00000189325 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC140873 // GenBank // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 222, mRNA (cDNA clone MGC:176550 IMAGE:9021741), complete cds. // chr6 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// BX648558 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp779B1540 (from clone DKFZp779B1540). // chr6 // 94 // 100 // 33 // 35 // 0 /// GENSCAN00000046694 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:36315014:36330690:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0
NM_152990 // RefSeq // Homo sapiens peroxisomal, testis specific 1 (PXT1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000454782 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:6:36390551:36442889:-1 gene:ENSG00000179165 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AF486827 // GenBank // Homo sapiens small testis-specific peroxisomal protein (STEPP) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// BC031105 // GenBank // Homo sapiens peroxisomal, testis specific 1, mRNA (cDNA clone MGC:33985 IMAGE:5297409), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC107049 // GenBank // Homo sapiens peroxisomal, testis specific 1, mRNA (cDNA clone MGC:129569 IMAGE:40003975), complete cds. // chr6 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1 /// ENST00000619547 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:36391001:36400524:-1 gene:ENSG00000179165 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1
ENST00000481857 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:36450912:36451201:-1 gene:ENSG00000240733 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT112217 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_007271 // RefSeq // Homo sapiens serine/threonine kinase 38 (STK38), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000229812 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:36493892:36547470:-1 gene:ENSG00000112079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC012085 // GenBank // Homo sapiens serine/threonine kinase 38, mRNA (cDNA clone MGC:20014 IMAGE:4554884), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC095413 // GenBank // Homo sapiens serine/threonine kinase 38, mRNA (cDNA clone MGC:110916 IMAGE:30337276), complete cds. // chr6 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// Z35102 // GenBank // H.sapiens mRNA for Ndr protein kinase. // chr6 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000046695 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:36495784:36540139:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0
NM_020939 // RefSeq // Homo sapiens copine V (CPNE5), mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// XM_006715152 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens copine V (CPNE5), transcript variant X9, mRNA. // chr6 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// XM_006715154 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens copine V (CPNE5), transcript variant X11, mRNA. // chr6 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000244751 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:36740778:36840002:-1 gene:ENSG00000124772 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000393189 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:36740778:36757409:-1 gene:ENSG00000124772 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000459703 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:36740775:36757381:-1 gene:ENSG00000124772 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 42 // 10 // 10 // 0 /// AB046819 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1599 protein, partial cds. // chr6 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// BC053872 // GenBank // Homo sapiens copine V, mRNA (cDNA clone MGC:61794 IMAGE:5553022), complete cds. // chr6 // 91 // 46 // 10 // 11 // 0 /// XM_005249249 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens copine V (CPNE5), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 88 // 88 // 21 // 24 // 1 /// GENSCAN00000046687 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:36742268:36839377:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 95 // 88 // 20 // 21 // 0 /// AK096023 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ38704 fis, clone KIDNE2002483, weakly similar to Homo sapiens copine I mRNA. // chr6 // 42 // 42 // 10 // 24 // 1
NM_016059 // RefSeq // Homo sapiens peptidylprolyl isomerase (cyclophilin)-like 1 (PPIL1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000373699 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:36854827:36875024:-1 gene:ENSG00000137168 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000483552 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:36854827:36858635:-1 gene:ENSG00000137168 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// AF151882 // GenBank // Homo sapiens CGI-124 protein mRNA, complete cds. // chr6 // 96 // 81 // 25 // 26 // 0 /// AY359032 // GenBank // Homo sapiens clone DNA37155 PPIL1 (UNQ2425) mRNA, complete cds. // chr6 // 93 // 88 // 26 // 28 // 0 /// BC003048 // GenBank // Homo sapiens peptidylprolyl isomerase (cyclophilin)-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:678 IMAGE:3543388), complete cds. // chr6 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000046684 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:36855813:36885965:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0
NONHSAT112254 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_138493 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 167 (CCDC167), mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000373408 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:37482920:37499922:-1 gene:ENSG00000198937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC104835 // GenBank // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 129, mRNA (cDNA clone MGC:132495 IMAGE:8143838), complete cds. // chr6 // 95 // 72 // 20 // 21 // 0 /// BC108655 // GenBank // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 129, mRNA (cDNA clone MGC:131656 IMAGE:6053765), complete cds. // chr6 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000020470 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:37483186:37587235:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
ENST00000496478 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:37832922:37833185:-1 gene:ENSG00000243313 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT112286 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_006708 // RefSeq // Homo sapiens glyoxalase I (GLO1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000373365 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:38675925:38703141:-1 gene:ENSG00000124767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000470973 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:38675943:38683215:-1 gene:ENSG00000124767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// AK293345 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51791 complete cds, highly similar to Lactoylglutathione lyase (EC 4.4.1.5). // chr6 // 90 // 61 // 18 // 20 // 0 /// BC001741 // GenBank // Homo sapiens glyoxalase I, mRNA (cDNA clone MGC:2259 IMAGE:3352922), complete cds. // chr6 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// BC011365 // GenBank // Homo sapiens glyoxalase I, mRNA (cDNA clone MGC:17245 IMAGE:4182593), complete cds. // chr6 // 94 // 94 // 29 // 31 // 0 /// BC015934 // GenBank // Homo sapiens glyoxalase I, mRNA (cDNA clone MGC:9077 IMAGE:3912185), complete cds. // chr6 // 94 // 94 // 29 // 31 // 0 /// BT019987 // GenBank // Homo sapiens glyoxalase I mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// BT019988 // GenBank // Homo sapiens glyoxalase I mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// FJ224325 // GenBank // Homo sapiens epididymis secretory protein Li 74 (HEL-S-74) mRNA, complete cds. // chr6 // 94 // 94 // 29 // 31 // 0 /// L07837 // GenBank // Human glyoxalase-1 mRNA, complete cds. // chr6 // 91 // 67 // 20 // 22 // 0 /// GENSCAN00000018859 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:38490692:38703054:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1
ENST00000490892 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:39039603:39039985:-1 gene:ENSG00000220556 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022416 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:39039668:39039937:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT112342 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000373249 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:39104064:39109572:-1 gene:ENSG00000112167 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0 /// AL136839 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp434H012 (from clone DKFZp434H012); complete cds. // chr6 // 100 // 52 // 12 // 12 // 0 /// NM_018322 // RefSeq // Homo sapiens SAYSVFN motif domain containing 1 (SAYSD1), mRNA. // chr6 // 87 // 87 // 20 // 23 // 1 /// ENST00000229903 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:39104064:39115189:-1 gene:ENSG00000112167 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 1 /// BC022007 // GenBank // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 64, mRNA (cDNA clone MGC:26272 IMAGE:4825803), complete cds. // chr6 // 78 // 78 // 18 // 23 // 1 /// AK124992 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ43002 fis, clone BRTHA2013054. // chr6 // 48 // 48 // 11 // 23 // 1 /// GENSCAN00000022426 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:39105432:39115212:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 74 // 74 // 17 // 23 // 1
NM_003740 // RefSeq // Homo sapiens potassium channel, subfamily K, member 5 (KCNK5), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000359534 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:39188973:39229450:-1 gene:ENSG00000164626 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF084830 // GenBank // Homo sapiens two pore domain K+ channel (TASK-2) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC060793 // GenBank // Homo sapiens potassium channel, subfamily K, member 5, mRNA (cDNA clone MGC:71594 IMAGE:30348251), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC069573 // GenBank // Homo sapiens potassium channel, subfamily K, member 5, mRNA (cDNA clone MGC:97128 IMAGE:7262361), complete cds. // chr6 // 86 // 75 // 18 // 21 // 0 /// EU978936 // GenBank // Homo sapiens K2P5.1 potassium channel (KCNK5) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000022427 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:39190890:39203233:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0
NM_001135111 // RefSeq // Homo sapiens potassium channel, subfamily K, member 17 (KCNK17), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NM_031460 // RefSeq // Homo sapiens potassium channel, subfamily K, member 17 (KCNK17), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000373231 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:39299001:39314553:-1 gene:ENSG00000124780 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000453413 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:39299012:39314461:-1 gene:ENSG00000124780 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AF339912 // GenBank // Homo sapiens potassium channel TASK-4 mRNA, complete cds. // chr6 // 88 // 94 // 29 // 33 // 0 /// AF358910 // GenBank // Homo sapiens 2P domain potassium channel Talk-2 (KCNK17) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// AY358853 // GenBank // Homo sapiens clone DNA129591 TASK-4 (UNQ5816) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// BC025726 // GenBank // Homo sapiens potassium channel, subfamily K, member 17, mRNA (cDNA clone MGC:34117 IMAGE:5201326), complete cds. // chr6 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// EU978944 // GenBank // Homo sapiens K2P17.1 potassium channel (KCNK17) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000503878 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:39303979:39314425:-1 gene:ENSG00000124780 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 54 // 54 // 19 // 35 // 1 /// AK310582 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17624. // chr6 // 54 // 54 // 19 // 35 // 1 /// GENSCAN00000022415 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:39247665:39314320:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 66 // 23 // 23 // 0
NM_020737 // RefSeq // Homo sapiens leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 2 (LRFN2), mRNA. // chr6 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENST00000338305 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:40391586:40587465:-1 gene:ENSG00000156564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK291474 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75318 complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC142616 // GenBank // Homo sapiens leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:164779 IMAGE:40147341), complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000035757 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:40391943:40470135:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// BC150197 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:40148767, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr6 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_173561 // RefSeq // Homo sapiens unc-5 homolog C (C. elegans)-like (UNC5CL), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000244565 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:41026911:41039217:-1 gene:ENSG00000124602 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000373164 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:41028371:41035135:-1 gene:ENSG00000124602 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000470102 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:41028373:41032987:-1 gene:ENSG00000124602 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// AY510109 // GenBank // Homo sapiens ZU5 and death domain-containing inhibitor of NF-kB mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC035284 // GenBank // Homo sapiens unc-5 homolog C (C. elegans)-like, mRNA (cDNA clone MGC:34763 IMAGE:5189247), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// JF681947 // GenBank // Homo sapiens cell-line CaCo-2 MUXA protein (MUXA) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000482853 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:41033627:41071217:-1 gene:ENSG00000124596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// GENSCAN00000010131 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:41028373:41034849:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// AK310594 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17636. // chr6 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1
NM_018965 // RefSeq // Homo sapiens triggering receptor expressed on myeloid cells 2 (TREM2), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000373113 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:41158507:41163176:-1 gene:ENSG00000095970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000373122 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:41158506:41163103:-1 gene:ENSG00000095970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// AF213457 // GenBank // Homo sapiens triggering receptor expressed on myeloid cells 2 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC032362 // GenBank // Homo sapiens triggering receptor expressed on myeloid cells 2, mRNA (cDNA clone MGC:40278 IMAGE:5240587), complete cds. // chr6 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NM_001271821 // RefSeq // Homo sapiens triggering receptor expressed on myeloid cells 2 (TREM2), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// ENST00000338469 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:41158507:41163186:-1 gene:ENSG00000095970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// AB062787 // GenBank // Homo sapiens mRNA for triggering receptor TREM-2V, complete cds. // chr6 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// GENSCAN00000010117 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:41149604:41217758:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
NM_024807 // RefSeq // Homo sapiens triggering receptor expressed on myeloid cells-like 2 (TREML2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000483722 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:41190277:41201194:-1 gene:ENSG00000112195 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF534824 // GenBank // Homo sapiens TREM-like transcript 2 (TLT2) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// AY358171 // GenBank // Homo sapiens clone DNA163134 APAF6268 (UNQ6268) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC125078 // GenBank // Homo sapiens triggering receptor expressed on myeloid cells-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:149715 IMAGE:40117710), complete cds. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC125079 // GenBank // Homo sapiens triggering receptor expressed on myeloid cells-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:149716 IMAGE:40117711), complete cds. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000010117 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:41149604:41217758:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NR_027256 // RefSeq // Homo sapiens triggering receptor expressed on myeloid cells-like 3, pseudogene (TREML3P), non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000457327 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:41209634:41217947:-1 gene:ENSG00000184106 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000564680 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:41208713:41217947:-1 gene:ENSG00000184106 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000010117 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:41149604:41217758:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 48 // 48 // 10 // 21 // 1
ENST00000390874 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:41239520:41239626:-1 gene:ENSG00000212176 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT112725 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000384018 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:41302466:41302572:-1 gene:ENSG00000206745 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// NONHSAT112730 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0
NM_002630 // RefSeq // Homo sapiens progastricsin (pepsinogen C) (PGC), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000373025 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:41736711:41747397:-1 gene:ENSG00000096088 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK301325 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51342 complete cds, highly similar to Gastricsin precursor (EC 3.4.23.3). // chr6 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// BC073740 // GenBank // Homo sapiens progastricsin (pepsinogen C), mRNA (cDNA clone MGC:88742 IMAGE:6296399), complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// J04443 // GenBank // Homo sapiens pepsinogen C (PGC) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// U75272 // GenBank // Human gastricsin mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NM_001166424 // RefSeq // Homo sapiens progastricsin (pepsinogen C) (PGC), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// ENST00000425343 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:41740838:41747401:-1 gene:ENSG00000096088 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// AK301298 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58861 complete cds, highly similar to Gastricsin precursor (EC 3.4.23.3). // chr6 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// BC042578 // GenBank // Homo sapiens progastricsin (pepsinogen C), mRNA (cDNA clone IMAGE:5180836), complete cds. // chr6 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// GENSCAN00000010112 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:41736852:41747334:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// AK309522 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99563. // chr6 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_006653 // RefSeq // Homo sapiens fibroblast growth factor receptor substrate 3 (FRS3), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000259748 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:41770176:41778181:-1 gene:ENSG00000137218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000373018 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:41770176:41779900:-1 gene:ENSG00000137218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000426290 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:6:41772844:41780466:-1 gene:ENSG00000137218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// AF036718 // GenBank // Homo sapiens FGFR signalling adaptor SNT-2 mRNA, complete cds. // chr6 // 92 // 89 // 23 // 25 // 0 /// BC010611 // GenBank // Homo sapiens fibroblast growth factor receptor substrate 3, mRNA (cDNA clone MGC:17167 IMAGE:4183414), complete cds. // chr6 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// CR457026 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834B0118D for gene FRS3, fibroblast growth factor receptor substrate 3; complete cds, incl. stopcodon. // chr6 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// XM_006714969 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens fibroblast growth factor receptor substrate 3 (FRS3), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// GENSCAN00000010129 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:41748048:41776987:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1
ENST00000373010 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:6:41796498:41887329:-1 gene:ENSG00000164663 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// NM_018561 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 49 (USP49), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 1 /// ENST00000373006 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:41797645:41895361:-1 gene:ENSG00000164663 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 1 /// BC014176 // GenBank // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 49, mRNA (cDNA clone MGC:20741 IMAGE:4579283), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 1 /// NM_001286554 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 49 (USP49), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 74 // 74 // 23 // 31 // 1 /// ENST00000373009 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:41789898:41871637:-1 gene:ENSG00000164663 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 74 // 74 // 23 // 31 // 1 /// ENST00000394253 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:41789896:41894160:-1 gene:ENSG00000164663 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 74 // 74 // 23 // 31 // 1 /// ENST00000423567 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:41806939:41894455:-1 gene:ENSG00000164663 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// GENSCAN00000010149 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:41792125:41916929:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 55 // 55 // 17 // 31 // 1
AF119901 // GenBank HTC // Homo sapiens PRO2831 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENST00000384641 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:6:41917416:41917526:-1 gene:ENSG00000207371 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT112779 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001164446 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 132 (C6orf132), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000341865 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:6:42101118:42142444:-1 gene:ENSG00000188112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000004483 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:42103761:42142444:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 1
NM_001164446 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 132 (C6orf132), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000341865 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:6:42101118:42142444:-1 gene:ENSG00000188112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000356542 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:6:42126377:42142619:-1 gene:ENSG00000188112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// GENSCAN00000004483 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:42103761:42142444:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// TCONS_l2_00024755-XLOC_l2_012991 // Broad TUCP // linc-CCND3 chr6:-:42096419-42110415 // chr6 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_002098 // RefSeq // Homo sapiens guanylate cyclase activator 1B (retina) (GUCA1B), mRNA. // chr6 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// ENST00000230361 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:42184401:42194916:-1 gene:ENSG00000112599 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BX537393 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686E1183 (from clone DKFZp686E1183); complete cds. // chr6 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// GENSCAN00000004493 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:42184815:42217849:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
NM_018141 // RefSeq // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein S10 (MRPS10), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000053468 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:42206801:42217865:-1 gene:ENSG00000048544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 94 // 15 // 15 // 0 /// AK001429 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ10567 fis, clone NT2RP2002980, weakly similar to 30S RIBOSOMAL PROTEIN S10. // chr6 // 93 // 94 // 14 // 15 // 0 /// AK298219 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57413 complete cds, highly similar to Mitochondrial 28S ribosomal protein S10. // chr6 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// BC012560 // GenBank // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein S10, mRNA (cDNA clone MGC:13410 IMAGE:4277803), complete cds. // chr6 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0
NM_033502 // RefSeq // Homo sapiens transcriptional regulating factor 1 (TRERF1), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000372922 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:42225225:42452045:-1 gene:ENSG00000124496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000541110 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:42224931:42452051:-1 gene:ENSG00000124496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF111801 // GenBank // Homo sapiens MSTP020 (MST020) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AM404182 // GenBank // Homo sapiens mRNA for breast cancer anti-estrogen resistance 2 (BCAR2 gene), isoform alpha. // chr6 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// NM_001297573 // RefSeq // Homo sapiens transcriptional regulating factor 1 (TRERF1), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_001297574 // RefSeq // Homo sapiens transcriptional regulating factor 1 (TRERF1), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NONHSAT112795 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0
NONHSAT112801 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_000322 // RefSeq // Homo sapiens peripherin 2 (retinal degeneration, slow) (PRPH2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000230381 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:42696600:42722574:-1 gene:ENSG00000112619 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC074720 // GenBank // Homo sapiens peripherin 2 (retinal degeneration, slow), mRNA (cDNA clone MGC:103789 IMAGE:30915170), complete cds. // chr6 // 95 // 69 // 19 // 20 // 0 /// M73531 // GenBank // Human retinal degeneration slow mRNA, complete cds. // chr6 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// XM_005249261 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens peripherin 2 (retinal degeneration, slow) (PRPH2), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1 /// GENSCAN00000004479 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:42698295:42705233:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 34 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000004480 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:42721750:42722334:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0
NM_003192 // RefSeq // Homo sapiens tubulin folding cofactor C (TBCC), mRNA. // chr6 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// ENST00000372876 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:42744481:42746096:-1 gene:ENSG00000124659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC017479 // GenBank // Homo sapiens tubulin folding cofactor C, mRNA (cDNA clone MGC:15753 IMAGE:3357283), complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC020170 // GenBank // Homo sapiens tubulin folding cofactor C, mRNA (cDNA clone MGC:1601 IMAGE:3536688), complete cds. // chr6 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// BT007002 // GenBank // Homo sapiens tubulin-specific chaperone c mRNA, complete cds. // chr6 // 94 // 67 // 17 // 18 // 0 /// U61234 // GenBank // Human tubulin-folding cofactor C mRNA, complete cds. // chr6 // 92 // 89 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000004486 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:42745033:42746073:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
NM_001008739 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 226 (C6orf226), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000408925 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:6:42890265:42890816:-1 gene:ENSG00000221821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC060325 // GenBank // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 226, mRNA (cDNA clone MGC:75222 IMAGE:4364495), complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC073804 // GenBank // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 226, mRNA (cDNA clone MGC:88826 IMAGE:6254518), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC094854 // GenBank // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 226, mRNA (cDNA clone MGC:104883 IMAGE:6211808), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004484 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:42890483:42890788:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0
NM_000287 // RefSeq // Homo sapiens peroxisomal biogenesis factor 6 (PEX6), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000244546 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:42964335:42979150:-1 gene:ENSG00000124587 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000304611 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:42963870:42979220:-1 gene:ENSG00000124587 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB051076 // GenBank // Homo sapiens PEX6 mRNA for peroxine Pex6p, complete cds. // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AB051077 // GenBank // Homo sapiens PEX6 mRNA for peroxin Pex6p, complete cds, CG6-PEX6(1) sequence. // chr6 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// AB051078 // GenBank // Homo sapiens PEX6 mRNA for peroxin Pex6p, complete cds, CG6-PEX6(2) sequence. // chr6 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// AB208906 // GenBank // Homo sapiens mRNA for peroxisomal biogenesis factor 6 variant protein. // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AK225704 // GenBank // Homo sapiens mRNA for peroxisomal biogenesis factor 6 variant, clone: TMS01483. // chr6 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// BC048331 // GenBank // Homo sapiens peroxisomal biogenesis factor 6, mRNA (cDNA clone MGC:54056 IMAGE:5189685), complete cds. // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// D83703 // GenBank // Homo sapiens mRNA for peroxisome assembly factor-2, complete cds. // chr6 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000036315 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:42964335:42979150:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0
NM_014623 // RefSeq // Homo sapiens male-enhanced antigen 1 (MEA1), mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// XM_005249121 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens male-enhanced antigen 1 (MEA1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000244711 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:43012094:43013968:-1 gene:ENSG00000124733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC001754 // GenBank // Homo sapiens male-enhanced antigen 1, mRNA (cDNA clone MGC:2286 IMAGE:3355279), complete cds. // chr6 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BT009831 // GenBank // Homo sapiens male-enhanced antigen mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// L10400 // GenBank // Homo sapiens male-enhanced antigen (Mea) mRNA, complete cds. // chr6 // 88 // 90 // 23 // 26 // 0 /// M27937 // GenBank // Human male-enhanced antigen mRNA (Mea), complete cds. // chr6 // 88 // 90 // 23 // 26 // 0 /// XM_005249123 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens male-enhanced antigen 1 (MEA1), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// AK309759 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99800. // chr6 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// GENSCAN00000036340 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:43012470:43013348:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0
ENST00000481783 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:43036196:43036500:-1 gene:ENSG00000240625 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 94 // 100 // 17 // 18 // 0 /// NONHSAT112866 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 83 // 100 // 15 // 18 // 0
NM_001168370 // RefSeq // Homo sapiens cullin 7 (CUL7), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// NM_014780 // RefSeq // Homo sapiens cullin 7 (CUL7), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000265348 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:43037617:43053699:-1 gene:ENSG00000044090 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000535468 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:43037620:43053945:-1 gene:ENSG00000044090 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// AK292806 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76468 complete cds, highly similar to Homo sapiens cullin 7 (CUL7), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AK302668 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56181 complete cds, highly similar to Cullin-7. // chr6 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// AK307936 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ97884. // chr6 // 100 // 47 // 17 // 17 // 0 /// AK309902 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99943. // chr6 // 89 // 25 // 8 // 9 // 0 /// BC033647 // GenBank // Homo sapiens cullin 7, mRNA (cDNA clone MGC:45130 IMAGE:5580027), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000036334 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:43037688:43059381:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0
NM_006443 // RefSeq // Homo sapiens 2-deoxynucleoside 5-phosphate N-hydrolase 1 (DNPH1), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NM_199184 // RefSeq // Homo sapiens 2-deoxynucleoside 5-phosphate N-hydrolase 1 (DNPH1), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000230431 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:43225629:43229484:-1 gene:ENSG00000112667 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000393987 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:43225635:43229478:-1 gene:ENSG00000112667 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000509253 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:6:43225631:43229453:-1 gene:ENSG00000112667 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// AF040105 // GenBank // Homo sapiens RCL (Rcl) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC011683 // GenBank // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 108, mRNA (cDNA clone MGC:19540 IMAGE:3633266), complete cds. // chr6 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// EU585603 // GenBank // Homo sapiens Rcl mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000036329 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:43225733:43229444:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NM_014345 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 318 (ZNF318), mRNA. // chr6 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000361428 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:43336070:43369443:-1 gene:ENSG00000171467 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000605935 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:43311133:43369478:-1 gene:ENSG00000171467 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 46 // 16 // 16 // 0 /// AF090114 // GenBank // Homo sapiens unknown mRNA. // chr6 // 91 // 94 // 30 // 33 // 0 /// AF121141 // GenBank // Homo sapiens endocrine regulator mRNA, complete cds. // chr6 // 93 // 86 // 28 // 30 // 0 /// BC030687 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 318, mRNA (cDNA clone IMAGE:4824620). // chr6 // 100 // 46 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000036338 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:43337158:43357785:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 66 // 23 // 23 // 0
NM_001012974 // RefSeq // Homo sapiens leucine rich repeat containing 73 (LRRC73), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NM_001271882 // RefSeq // Homo sapiens leucine rich repeat containing 73 (LRRC73), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000372441 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:6:43506969:43510686:-1 gene:ENSG00000204052 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK126786 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44836 fis, clone BRACE3048615. // chr6 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0 /// BC107130 // GenBank // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 154, mRNA (cDNA clone IMAGE:40024851), partial cds. // chr6 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// BC108661 // GenBank // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 154, mRNA (cDNA clone MGC:131686 IMAGE:5240367), complete cds. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000036312 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:43507238:43516807:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_018135 // RefSeq // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein S18A (MRPS18A), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000372133 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:43671303:43687791:-1 gene:ENSG00000096080 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000427312 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:43671784:43687791:-1 gene:ENSG00000096080 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 87 // 88 // 20 // 23 // 0 /// AB049952 // GenBank // Homo sapiens MRPS18a mRNA for mitochondrial ribosomal protein S18a, complete cds. // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AK001410 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ10548 fis, clone NT2RP2001969. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC010364 // GenBank // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein S18A, mRNA (cDNA clone MGC:13413 IMAGE:4248325), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001193343 // RefSeq // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein S18A (MRPS18A), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// ENST00000372116 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:43671510:43687791:-1 gene:ENSG00000096080 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// AK300757 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52919 complete cds, highly similar to 28S ribosomal protein S18a, mitochondrial precursor. // chr6 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// AK307183 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ97131. // chr6 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000036333 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:43674991:43687779:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
NM_032111 // RefSeq // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein L14 (MRPL14), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_005249300 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein L14 (MRPL14), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000372014 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:44113454:44127457:-1 gene:ENSG00000180992 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC065005 // GenBank // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein L14, mRNA (cDNA clone MGC:70566 IMAGE:6052682), complete cds. // chr6 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0
NM_004556 // RefSeq // Homo sapiens nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells inhibitor, epsilon (NFKBIE), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000275015 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:44258166:44265788:-1 gene:ENSG00000146232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000443607 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:44258693:44260144:-1 gene:ENSG00000146232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// AK301360 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61640 complete cds, highly similar to NF-kappa-B inhibitor epsilon. // chr6 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// U91616 // GenBank // Human I kappa B epsilon (IkBe) mRNA, complete cds. // chr6 // 92 // 89 // 23 // 25 // 0 /// AK130739 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ27229 fis, clone SYN05701. // chr6 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1 /// ENST00000615286 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:44258166:44265788:-1 gene:ENSG00000146232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000616555 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:44258694:44265788:-1 gene:ENSG00000146232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000619360 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:6:44258166:44265534:-1 gene:ENSG00000146232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000046505 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:44254706:44265346:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
NM_182539 // RefSeq // Homo sapiens t-complex-associated-testis-expressed 1 (TCTE1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_005248872 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens t-complex-associated-testis-expressed 1 (TCTE1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// XM_005248874 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens t-complex-associated-testis-expressed 1 (TCTE1), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000371505 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:44278743:44297688:-1 gene:ENSG00000146221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// AK301825 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50033 complete cds. // chr6 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// BC035022 // GenBank // Homo sapiens t-complex-associated-testis-expressed 1, mRNA (cDNA clone MGC:33600 IMAGE:4824970), complete cds. // chr6 // 89 // 97 // 25 // 28 // 0 /// ENST00000371504 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:44280165:44286353:-1 gene:ENSG00000146221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// AK304265 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50041 complete cds. // chr6 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1 /// GENSCAN00000046493 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:44280181:44313323:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 83 // 83 // 24 // 29 // 1
NM_020745 // RefSeq // Homo sapiens alanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (AARS2), mRNA. // chr6 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// ENST00000244571 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:44299654:44313326:-1 gene:ENSG00000124608 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC131728 // GenBank // Homo sapiens alanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (putative), mRNA (cDNA clone MGC:150665 IMAGE:40124256), complete cds. // chr6 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000046493 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:44280181:44313323:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 79 // 79 // 23 // 29 // 1
AF090903 // GenBank // Homo sapiens clone HQ0214 PRO0214 mRNA, complete cds. // chr6 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0
NM_001114086 // RefSeq // Homo sapiens chloride intracellular channel 5 (CLIC5), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NM_016929 // RefSeq // Homo sapiens chloride intracellular channel 5 (CLIC5), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NR_045672 // RefSeq // Homo sapiens chloride intracellular channel 5 (CLIC5), transcript variant 4, non-coding RNA. // chr6 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NR_045673 // RefSeq // Homo sapiens chloride intracellular channel 5 (CLIC5), transcript variant 5, non-coding RNA. // chr6 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000185206 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:45898451:46080395:-1 gene:ENSG00000112782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000339561 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:45901761:46015849:-1 gene:ENSG00000112782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// AF216941 // GenBank // Homo sapiens CLIC5 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// BC035968 // GenBank // Homo sapiens chloride intracellular channel 5, mRNA (cDNA clone MGC:32580 IMAGE:4611102), complete cds. // chr6 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// DQ679794 // GenBank // Homo sapiens chloride intracellular channel 5A (CLIC5) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT112995 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_001290072 // RefSeq // Homo sapiens ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 5 (putative) (ENPP5), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_021572 // RefSeq // Homo sapiens ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 5 (putative) (ENPP5), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000230565 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:46160415:46170971:-1 gene:ENSG00000112796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000371383 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:46159187:46170971:-1 gene:ENSG00000112796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// AK292842 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76474 complete cds, highly similar to Homo sapiens ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 5 (putative function) (ENPP5), mRNA. // chr6 // 96 // 77 // 22 // 23 // 0 /// AK295192 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53839 complete cds, highly similar to Ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 5 precursor (EC 3.1.-.-). // chr6 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// AY358514 // GenBank // Homo sapiens clone DNA59606 ENPP5 (UNQ550) mRNA, complete cds. // chr6 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// BC027615 // GenBank // Homo sapiens ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 5 (putative function), mRNA (cDNA clone MGC:27041 IMAGE:4839342), complete cds. // chr6 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// NM_001290073 // RefSeq // Homo sapiens ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 5 (putative) (ENPP5), transcript variant 3, mRNA. // chr6 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// GENSCAN00000013940 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:46161326:46168262:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0
NM_014452 // RefSeq // Homo sapiens tumor necrosis factor receptor superfamily, member 21 (TNFRSF21), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000296861 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:47231532:47309905:-1 gene:ENSG00000146072 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// AB209394 // GenBank // Homo sapiens mRNA for tumor necrosis factor receptor superfamily, member 21 precursor variant protein. // chr6 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// AF068868 // GenBank // Homo sapiens TNFR-related death receptor-6 (DR6) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0 /// AJ420531 // GenBank // Homo sapiens mRNA full length insert cDNA clone EUROIMAGE 2156033. // chr6 // 96 // 71 // 23 // 24 // 0 /// AY358304 // GenBank // Homo sapiens clone DNA52594 DR6-TNFR (UNQ437) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// BC010241 // GenBank // Homo sapiens tumor necrosis factor receptor superfamily, member 21, mRNA (cDNA clone MGC:18151 IMAGE:4154494), complete cds. // chr6 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// BC017730 // GenBank // Homo sapiens tumor necrosis factor receptor superfamily, member 21, mRNA (cDNA clone MGC:21476 IMAGE:3847246), complete cds. // chr6 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// BC021572 // GenBank // Homo sapiens tumor necrosis factor receptor superfamily, member 21, mRNA (cDNA clone MGC:31965 IMAGE:4874397), complete cds. // chr6 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// BT007420 // GenBank // Homo sapiens tumor necrosis factor receptor superfamily, member 21 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000034490 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:47232765:47309511:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0
NM_001013732 // RefSeq // Homo sapiens patched domain containing 4 (PTCHD4), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000339488 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:47878028:48068689:-1 gene:ENSG00000244694 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AK299301 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56419 complete cds, weakly similar to Homo sapiens patched domain containing 1 (PTCHD1), mRNA. // chr6 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// AK300335 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50861 complete cds, moderately similar to Homo sapiens patched domain containing 1 (PTCHD1), mRNA. // chr6 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// BC137359 // GenBank // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 138, mRNA (cDNA clone MGC:168980 IMAGE:9021357), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC137364 // GenBank // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 138, mRNA (cDNA clone MGC:168985 IMAGE:9021362), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000034484 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:47878303:47923062:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_207499 // RefSeq // Homo sapiens patched domain containing 4 (PTCHD4), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000398738 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:6:47899609:48068653:-1 gene:ENSG00000244694 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC136779 // GenBank // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 138, mRNA (cDNA clone IMAGE:9020769), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NM_001013732 // RefSeq // Homo sapiens patched domain containing 4 (PTCHD4), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 71 // 71 // 12 // 17 // 1 /// ENST00000339488 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:47878028:48068689:-1 gene:ENSG00000244694 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 71 // 71 // 12 // 17 // 1 /// AK299301 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56419 complete cds, weakly similar to Homo sapiens patched domain containing 1 (PTCHD1), mRNA. // chr6 // 71 // 71 // 12 // 17 // 1 /// GENSCAN00000006810 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:48008611:48099316:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 53 // 53 // 9 // 17 // 1
NM_000255 // RefSeq // Homo sapiens methylmalonyl CoA mutase (MUT), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000274813 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:49430360:49463191:-1 gene:ENSG00000146085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// AK292568 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78010 complete cds, highly similar to Homo sapiens methylmalonyl Coenzyme A mutase, mRNA. // chr6 // 97 // 95 // 36 // 37 // 0 /// BC016282 // GenBank // Homo sapiens methylmalonyl Coenzyme A mutase, mRNA (cDNA clone MGC:9002 IMAGE:3908548), complete cds. // chr6 // 94 // 87 // 32 // 34 // 0 /// BT007434 // GenBank // Homo sapiens methylmalonyl Coenzyme A mutase mRNA, complete cds. // chr6 // 93 // 72 // 26 // 28 // 0 /// BX647789 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686K0186 (from clone DKFZp686K0186). // chr6 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0 /// M65131 // GenBank // Human methylmalonyl-CoA mutase (MCM) mRNA, complete cds. // chr6 // 95 // 97 // 36 // 38 // 0 /// AB208845 // GenBank // Homo sapiens mRNA for methylmalonyl Coenzyme A mutase precursor variant protein. // chr6 // 51 // 51 // 20 // 39 // 1 /// GENSCAN00000035483 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:49431728:49459466:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 72 // 28 // 28 // 0
NM_138733 // RefSeq // Homo sapiens phosphoglycerate kinase 2 (PGK2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000304801 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:49785934:49787187:-1 gene:ENSG00000170950 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// BC038843 // GenBank // Homo sapiens phosphoglycerate kinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:47832 IMAGE:5741907), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FJ224296 // GenBank // Homo sapiens epididymis secretory protein Li 272 (HEL-S-272) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000035481 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:49785934:49787187:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
NM_001131 // RefSeq // Homo sapiens cysteine-rich secretory protein 1 (CRISP1), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NM_001205220 // RefSeq // Homo sapiens cysteine-rich secretory protein 1 (CRISP1), transcript variant 3, mRNA. // chr6 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NM_170609 // RefSeq // Homo sapiens cysteine-rich secretory protein 1 (CRISP1), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000329411 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:49834271:49857403:-1 gene:ENSG00000124812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000335847 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:49834257:49866528:-1 gene:ENSG00000124812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000505118 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:49834860:49877096:-1 gene:ENSG00000124812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000507853 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:49834257:49866499:-1 gene:ENSG00000124812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// AB451334 // GenBank // Homo sapiens CRISP1 mRNA for acidic epididymal glycoprotein-like 1 isoform 2 precursor, complete cds, clone: FLJ80331SAAN. // chr6 // 92 // 42 // 12 // 13 // 0 /// AK292497 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75803 complete cds, highly similar to Homo sapiens cysteine-rich secretory protein 1 (CRISP1), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 92 // 77 // 22 // 24 // 0 /// D38451 // GenBank // Homo sapiens mRNA for ARP (AEG-related protein), complete cds. // chr6 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035477 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:49816702:49942433:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1
NM_001166478 // RefSeq // Homo sapiens defensin, beta 133 (DEFB133), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000398721 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:49946101:49949444:-1 gene:ENSG00000214643 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// DQ012023 // GenBank // Homo sapiens beta-defensin 133 (DEFB133) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000620560 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:49946101:49949444:-1 gene:ENSG00000214643 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONHSAT113070 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// TCONS_l2_00024782-XLOC_l2_013009 // Broad TUCP // linc-CRISP1 chr6:-:49913730-49925733 // chr6 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001037499 // RefSeq // Homo sapiens defensin, beta 114 (DEFB114), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000322066 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:49960249:49964105:-1 gene:ENSG00000177684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// DQ012018 // GenBank // Homo sapiens beta-defensin 114 (DEFB114) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000003713 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:49960292:49964105:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001037729 // RefSeq // Homo sapiens defensin, beta 113 (DEFB113), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000398718 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:49968677:49969625:-1 gene:ENSG00000214642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// DQ012017 // GenBank // Homo sapiens beta-defensin 113 (DEFB113) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001037497 // RefSeq // Homo sapiens defensin, beta 110 locus (DEFB110), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000371148 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:50018843:50021981:-1 gene:ENSG00000203970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0 /// DQ012015 // GenBank // Homo sapiens beta-defensin 111 (DEFB111) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0 /// NM_001037728 // RefSeq // Homo sapiens defensin, beta 110 locus (DEFB110), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 65 // 65 // 15 // 23 // 1 /// ENST00000393660 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:50009138:50021935:-1 gene:ENSG00000203970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 65 // 65 // 15 // 23 // 1 /// DQ012014 // GenBank // Homo sapiens beta-defensin 110 (DEFB110) mRNA, complete cds. // chr6 // 65 // 65 // 15 // 23 // 1
NM_001037498 // RefSeq // Homo sapiens defensin, beta 112 (DEFB112), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000322246 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:50043575:50048651:-1 gene:ENSG00000180872 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// DQ012016 // GenBank // Homo sapiens beta-defensin 112 (DEFB112) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000003712 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:50043575:50048609:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0
ENST00000498293 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:50857255:50857662:-1 gene:ENSG00000060303 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000003714 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:50857255:50857662:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
ENST00000425761 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:50912712:50913256:-1 gene:ENSG00000230204 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0 /// J04755 // GenBank // Human ferritin H processed pseudogene, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT113088 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0
NM_138694 // RefSeq // Homo sapiens polycystic kidney and hepatic disease 1 (autosomal recessive) (PKHD1), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 98 // 88 // 88 // 0 /// NM_170724 // RefSeq // Homo sapiens polycystic kidney and hepatic disease 1 (autosomal recessive) (PKHD1), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 81 // 73 // 73 // 0 /// ENST00000340994 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:51720849:52087610:-1 gene:ENSG00000170927 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 80 // 72 // 72 // 0 /// ENST00000371117 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:51615300:52087625:-1 gene:ENSG00000170927 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 98 // 88 // 88 // 0 /// AF480064 // GenBank // Homo sapiens polycystic kidney and hepatic disease 1 (PKHD1) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 92 // 83 // 83 // 0 /// AK128031 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ46150 fis, clone TESTI4000703. // chr6 // 100 // 31 // 28 // 28 // 0 /// AY074797 // GenBank // Homo sapiens polycystic kidney and hepatic disease 1 (PKHD1) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 98 // 88 // 88 // 0 /// AY092083 // GenBank // Homo sapiens TIG multiple domains-1 (TIGM1) mRNA, complete cds. // chr6 // 99 // 80 // 71 // 72 // 0 /// GENSCAN00000029596 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:51860232:51934322:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 14 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000029597 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:51609103:51856036:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 30 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000044908 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:51959870:52086550:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 97 // 32 // 28 // 29 // 0
NM_052872 // RefSeq // Homo sapiens interleukin 17F (IL17F), mRNA. // chr6 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000336123 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:52236681:52244537:-1 gene:ENSG00000112116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000478427 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:52236681:52239167:-1 gene:ENSG00000112116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// AF332389 // GenBank // Homo sapiens ML1 mRNA, complete cds. // chr6 // 95 // 78 // 20 // 21 // 0 /// AF384857 // GenBank // Homo sapiens interleukin-17F (IL17F) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// BC070124 // GenBank // Homo sapiens interleukin 17F, mRNA (cDNA clone MGC:88102 IMAGE:30417554), complete cds. // chr6 // 95 // 78 // 20 // 21 // 0 /// JF305974 // GenBank // Homo sapiens mutant IL-17F mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000044915 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:52194439:52244429:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0
NM_012288 // RefSeq // Homo sapiens translocation associated membrane protein 2 (TRAM2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000182527 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:52497402:52576915:-1 gene:ENSG00000065308 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AK291751 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75727 complete cds, highly similar to Homo sapiens translocation associated membrane protein 2 (TRAM2), mRNA. // chr6 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// AK311560 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ18602. // chr6 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// BC028121 // GenBank // Homo sapiens translocation associated membrane protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:39954 IMAGE:5169808), complete cds. // chr6 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000044919 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:52498541:52547915:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_000846 // RefSeq // Homo sapiens glutathione S-transferase alpha 2 (GSTA2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000493422 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:52750089:52763569:-1 gene:ENSG00000244067 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// AK292602 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77911 complete cds, highly similar to Homo sapiens glutathione S-transferase A2 (GSTA2), mRNA. // chr6 // 92 // 81 // 12 // 13 // 0 /// BC002895 // GenBank // Homo sapiens glutathione S-transferase alpha 2, mRNA (cDNA clone MGC:10525 IMAGE:3943417), complete cds. // chr6 // 92 // 75 // 11 // 12 // 0 /// M16594 // GenBank // Human glutathione S-transferase Ha subunit 2 (GST) mRNA, complete cds. // chr6 // 90 // 63 // 9 // 10 // 0
NM_145740 // RefSeq // Homo sapiens glutathione S-transferase alpha 1 (GSTA1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000334575 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:52791664:52803910:-1 gene:ENSG00000243955 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 87 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000493331 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:52791664:52799297:-1 gene:ENSG00000243955 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 67 // 10 // 10 // 0 /// BC053578 // GenBank // Homo sapiens glutathione S-transferase alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:61426 IMAGE:5167338), complete cds. // chr6 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// BC110891 // GenBank // Homo sapiens glutathione S-transferase alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:131939 IMAGE:5171697), complete cds. // chr6 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0 /// M14777 // GenBank // Human glutathione S-transferase (GST) a-subunit mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0 /// M15872 // GenBank // Human glutathione S-transferase 2 (GST) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0 /// M21758 // GenBank // Human glutathione S-transferase (GST) Ha subunit 1 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0
NM_153699 // RefSeq // Homo sapiens glutathione S-transferase alpha 5 (GSTA5), mRNA. // chr6 // 92 // 87 // 12 // 13 // 0 /// ENST00000284562 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:52831742:52846095:-1 gene:ENSG00000182793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 92 // 87 // 12 // 13 // 0 /// ENST00000370989 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:52831655:52840843:-1 gene:ENSG00000182793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000475052 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:52831655:52840843:-1 gene:ENSG00000182793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000619736 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:52831848:52870329:-1 gene:ENSG00000182793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 82 // 73 // 9 // 11 // 0 /// GENSCAN00000044909 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:52832648:52840813:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0
NM_000847 // RefSeq // Homo sapiens glutathione S-transferase alpha 3 (GSTA3), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000211122 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:52896639:52909685:-1 gene:ENSG00000174156 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000370968 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:6:52896639:52909666:-1 gene:ENSG00000174156 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 56 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000431899 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:6:52897842:52905822:-1 gene:ENSG00000174156 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 67 // 12 // 12 // 0 /// AF508266 // GenBank // Homo sapiens glutathione transferase A3-3 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0 /// BC020619 // GenBank // Homo sapiens glutathione S-transferase alpha 3, mRNA (cDNA clone MGC:22232 IMAGE:4721622), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000616666 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:52847910:52905834:-1 gene:ENSG00000174156 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000044907 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:52858235:52937093:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 83 // 83 // 15 // 18 // 1
NONHSAT113148 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_014920 // RefSeq // Homo sapiens intestinal cell (MAK-like) kinase (ICK), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NM_016513 // RefSeq // Homo sapiens intestinal cell (MAK-like) kinase (ICK), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000350082 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:53001279:53061770:-1 gene:ENSG00000112144 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000356971 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:53001311:53061802:-1 gene:ENSG00000112144 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// AF152469 // GenBank // Homo sapiens MAK-related kinase (LCK2) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// AF225919 // GenBank // Homo sapiens intestinal cell kinase (ICK) mRNA, complete cds. // chr6 // 89 // 67 // 16 // 18 // 0 /// BC035807 // GenBank // Homo sapiens intestinal cell (MAK-like) kinase, mRNA (cDNA clone IMAGE:5745248), complete cds. // chr6 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// BC136420 // GenBank // Homo sapiens intestinal cell (MAK-like) kinase, mRNA (cDNA clone MGC:168031 IMAGE:9020408), complete cds. // chr6 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// BC136421 // GenBank // Homo sapiens intestinal cell (MAK-like) kinase, mRNA (cDNA clone MGC:168032 IMAGE:9020409), complete cds. // chr6 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// BC152464 // GenBank // Homo sapiens intestinal cell (MAK-like) kinase, mRNA (cDNA clone MGC:176721 IMAGE:8862600), complete cds. // chr6 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000040825 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:52978470:53041236:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
NM_003643 // RefSeq // Homo sapiens glial cells missing homolog 1 (Drosophila) (GCM1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000259803 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:53126964:53148829:-1 gene:ENSG00000137270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AB026493 // GenBank // Homo sapiens mRNA for GCM motif protein, complete cds. // chr6 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// AB041714 // GenBank // Homo sapiens mRNA for chorion-specific transcription factor GCMa, complete cds. // chr6 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// BC096288 // GenBank // Homo sapiens glial cells missing homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:116958 IMAGE:40007164), complete cds. // chr6 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// D88613 // GenBank // Homo sapiens hGCMa mRNA, complete cds. // chr6 // 97 // 92 // 32 // 33 // 0 /// AK309881 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99922. // chr6 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// GENSCAN00000040840 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:53128206:53150200:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0
NONHSAT113156 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENST00000517217 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:53153795:53153898:-1 gene:ENSG00000253026 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT113157 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000517201 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:53415294:53415607:-1 gene:ENSG00000253010 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT113175 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001003760 // RefSeq // Homo sapiens kelch-like family member 31 (KLHL31), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000370905 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:53647901:53665708:-1 gene:ENSG00000124743 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000407079 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:53651598:53655272:-1 gene:ENSG00000124743 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC137267 // GenBank // Homo sapiens kelch-like 31 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:168887 IMAGE:9021264), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC137269 // GenBank // Homo sapiens kelch-like 31 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:168889 IMAGE:9021266), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// EF633513 // GenBank // Homo sapiens kelch-like 31 (KLHL31) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040832 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:53651598:53655272:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_021073 // RefSeq // Homo sapiens bone morphogenetic protein 5 (BMP5), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000370830 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:55753645:55875564:-1 gene:ENSG00000112175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AK291559 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78712 complete cds, highly similar to Homo sapiens bone morphogenetic protein 5 (BMP5), mRNA. // chr6 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// AK303576 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59222 complete cds, highly similar to Bone morphogenetic protein 5 precursor. // chr6 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// BC027958 // GenBank // Homo sapiens bone morphogenetic protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:34244 IMAGE:5209637), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// KC485577 // GenBank // Homo sapiens bone morphogenenic protein-5 (BMP5) mRNA, complete cds. // chr6 // 93 // 82 // 25 // 27 // 0 /// M60314 // GenBank // Homo sapiens bone morphogenetic protein 5 (BMP-5) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000009526 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:55755533:55916313:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0
ENST00000423899 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:57919784:57930291:-1 gene:ENSG00000239650 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr6 // 100 // 63 // 5 // 5 // 0 /// NONHSAT113307 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 63 // 5 // 5 // 0
NM_152688 // RefSeq // Homo sapiens KH domain containing, RNA binding, signal transduction associated 2 (KHDRBS2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006715355 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens KH domain containing, RNA binding, signal transduction associated 2 (KHDRBS2), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// XR_427965 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens KH domain containing, RNA binding, signal transduction associated 2 (KHDRBS2), transcript variant X3, misc_RNA. // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000281156 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:61679960:62286227:-1 gene:ENSG00000112232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK292043 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77356 complete cds, highly similar to Homo sapiens KH domain containing, RNA binding, signal transduction associated 2 (KHDRBS2), mRNA. // chr6 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// AY077838 // GenBank // Homo sapiens Sam68-like mammalian protein 1 (SLM1) mRNA, complete cds. // chr6 // 82 // 100 // 23 // 28 // 0 /// BC034043 // GenBank // Homo sapiens KH domain containing, RNA binding, signal transduction associated 2, mRNA (cDNA clone MGC:26664 IMAGE:4796658), complete cds. // chr6 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// AK095983 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ38664 fis, clone HLUNG2002334, highly similar to Homo sapiens KH domain containing, RNA binding, signal transduction associated 2 (KHDRBS2), mRNA. // chr6 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// GENSCAN00000011893 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:61680963:61901371:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0
NM_001142800 // RefSeq // Homo sapiens eyes shut homolog (Drosophila) (EYS), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001292009 // RefSeq // Homo sapiens eyes shut homolog (Drosophila) (EYS), transcript variant 4, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000370616 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:63720596:65495410:-1 gene:ENSG00000188107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000370618 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:63720596:65495410:-1 gene:ENSG00000188107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000370621 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:63720136:65707214:-1 gene:ENSG00000188107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000503581 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:63719980:65707225:-1 gene:ENSG00000188107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FJ416331 // GenBank // Homo sapiens spacemaker (EYS) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037289 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:63720596:63912238:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001142800 // RefSeq // Homo sapiens eyes shut homolog (Drosophila) (EYS), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001292009 // RefSeq // Homo sapiens eyes shut homolog (Drosophila) (EYS), transcript variant 4, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000330816 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:6:64593131:64713335:-1 gene:ENSG00000188107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000370616 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:63720596:65495410:-1 gene:ENSG00000188107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000370618 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:63720596:65495410:-1 gene:ENSG00000188107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000370621 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:63720136:65707214:-1 gene:ENSG00000188107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000503581 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:63719980:65707225:-1 gene:ENSG00000188107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FJ416331 // GenBank // Homo sapiens spacemaker (EYS) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT113363 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001142800 // RefSeq // Homo sapiens eyes shut homolog (Drosophila) (EYS), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NM_001292009 // RefSeq // Homo sapiens eyes shut homolog (Drosophila) (EYS), transcript variant 4, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000370616 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:63720596:65495410:-1 gene:ENSG00000188107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000370618 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:63720596:65495410:-1 gene:ENSG00000188107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000370621 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:63720136:65707214:-1 gene:ENSG00000188107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000503581 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:63719980:65707225:-1 gene:ENSG00000188107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// FJ416331 // GenBank // Homo sapiens spacemaker (EYS) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_001142800 // RefSeq // Homo sapiens eyes shut homolog (Drosophila) (EYS), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_001292009 // RefSeq // Homo sapiens eyes shut homolog (Drosophila) (EYS), transcript variant 4, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000370616 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:63720596:65495410:-1 gene:ENSG00000188107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000370618 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:63720596:65495410:-1 gene:ENSG00000188107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000370621 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:63720136:65707214:-1 gene:ENSG00000188107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000503581 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:63719980:65707225:-1 gene:ENSG00000188107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FJ416331 // GenBank // Homo sapiens spacemaker (EYS) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000019009 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:64733328:64912743:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
ENST00000433151 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:65836930:65838039:-1 gene:ENSG00000233859 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000444694 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR6_1_CTG7:65836933:65838054:-1 gene:ENSG00000277364 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene gene:ENSG00000233859 // chr6 // 80 // 100 // 12 // 15 // 0 /// GENSCAN00000018407 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:65836930:65838039:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000047663 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR6_1_CTG7:65836930:65838039:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 80 // 100 // 12 // 15 // 0
ENST00000516156 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:67467231:67467308:-1 gene:ENSG00000251965 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT113388 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_080742 // RefSeq // Homo sapiens beta-1,3-glucuronyltransferase 2 (glucuronosyltransferase S) (B3GAT2), mRNA. // chr6 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000230053 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:70856679:70957038:-1 gene:ENSG00000112309 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// AB075843 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1963 protein. // chr6 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// AK290018 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77912 complete cds. // chr6 // 100 // 44 // 16 // 16 // 0 /// AY070019 // GenBank // Homo sapiens UDP-glucuronyltransferase-S (GLCATS) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// BC101165 // GenBank // Homo sapiens beta-1,3-glucuronyltransferase 2 (glucuronosyltransferase S), mRNA (cDNA clone IMAGE:40015910). // chr6 // 93 // 42 // 14 // 15 // 0 /// BC113995 // GenBank // Homo sapiens beta-1,3-glucuronyltransferase 2 (glucuronosyltransferase S), mRNA (cDNA clone MGC:138535 IMAGE:40004155), complete cds. // chr6 // 100 // 39 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000615536 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:70857213:70956429:-1 gene:ENSG00000112309 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 61 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000041245 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:70861663:70894272:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1 /// GENSCAN00000044483 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:70933641:70962935:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 44 // 44 // 16 // 36 // 1
ENST00000408418 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:6:71126893:71127105:-1 gene:ENSG00000221345 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT113462 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029598 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 30c-2 (MIR30C2), microRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000362224 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:71376933:71377045:-1 gene:ENSG00000199094 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-30c-2 // miRBase Micro RNA Database // MI0000254 Homo sapiens miR-30c-2 stem-loop // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT113497 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT113498 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029504 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 30a (MIR30A), microRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000385092 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:71403551:71403621:-1 gene:ENSG00000207827 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF480569 // GenBank // Homo sapiens miR-97-precursor-6 micro RNA, complete sequence. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-30a // miRBase Micro RNA Database // MI0000088 Homo sapiens miR-30a stem-loop // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT113502 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000365199 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:71652474:71652611:-1 gene:ENSG00000202069 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT113523 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000428697 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:72598451:72599634:-1 gene:ENSG00000181514 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001025290 // RefSeq // Homo sapiens developmental pluripotency associated 5 (DPPA5), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000370370 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:73353062:73354295:-1 gene:ENSG00000203909 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC137549 // GenBank // Homo sapiens developmental pluripotency associated 5, mRNA (cDNA clone MGC:169172 IMAGE:9021549), complete cds. // chr6 // 95 // 79 // 18 // 19 // 0 /// BC137558 // GenBank // Homo sapiens developmental pluripotency associated 5, mRNA (cDNA clone MGC:169181 IMAGE:9021558), complete cds. // chr6 // 95 // 79 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000008581 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:73299148:73354373:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 54 // 54 // 13 // 24 // 1
NONHSAT113557 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_138441 // RefSeq // Homo sapiens Mab-21 domain containing 1 (MB21D1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006715327 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens Mab-21 domain containing 1 (MB21D1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000370315 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:73423709:73452276:-1 gene:ENSG00000164430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000370318 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:73413515:73452259:-1 gene:ENSG00000164430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// AK097148 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39829 fis, clone SPLEN2012800. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC012928 // GenBank // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 150, mRNA (cDNA clone IMAGE:4475680), partial cds. // chr6 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC108714 // GenBank // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 150, mRNA (cDNA clone MGC:131892 IMAGE:6015929), complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC113606 // GenBank // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 150, mRNA (cDNA clone MGC:142166 IMAGE:8322658), complete cds. // chr6 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// BC113608 // GenBank // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 150, mRNA (cDNA clone MGC:142168 IMAGE:8322660), complete cds. // chr6 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// BC143694 // GenBank // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 150, mRNA (cDNA clone MGC:177225 IMAGE:9052208), complete cds. // chr6 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// KC294566 // GenBank // Homo sapiens cyclic GMP-AMP synthase mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000008578 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:73425227:73452181:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
ENST00000607480 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:6:73487590:73487877:-1 gene:ENSG00000271986 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENST00000316292 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:73515750:73521018:-1 gene:ENSG00000156508 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 9 // 9 // 0
NM_012434 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 17 (acidic sugar transporter), member 5 (SLC17A5), mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// XM_005248710 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens solute carrier family 17 (acidic sugar transporter), member 5 (SLC17A5), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000355773 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:73593379:73654155:-1 gene:ENSG00000119899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000481996 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:73635233:73644463:-1 gene:ENSG00000119899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 25 // 10 // 10 // 0 /// AF244577 // GenBank // Homo sapiens membrane glycoprotein HP59 (HP59) mRNA, complete cds. // chr6 // 97 // 93 // 36 // 37 // 0 /// AK026921 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ23268 fis, clone COL08932, highly similar to HSA387747 Homo sapiens mRNA for sialin. // chr6 // 100 // 30 // 12 // 12 // 0 /// AK075320 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ90839 fis, clone Y79AA1002213, highly similar to Solute carrier family 17 (anion/sugar transporter), member 5. // chr6 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0 /// AK294068 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57875 complete cds, highly similar to Sialin. // chr6 // 100 // 53 // 21 // 21 // 0 /// BC020961 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 17 (anion/sugar transporter), member 5, mRNA (cDNA clone MGC:8885 IMAGE:3847279), complete cds. // chr6 // 97 // 93 // 36 // 37 // 0 /// GENSCAN00000008571 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:73595077:73653852:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 40 // 16 // 16 // 0 /// NONHSAT113577 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 25 // 10 // 10 // 0
NM_001143958 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 30A (TMEM30A), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NM_018247 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 30A (TMEM30A), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000230461 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:75252924:75284968:-1 gene:ENSG00000112697 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000370050 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:75253613:75272900:-1 gene:ENSG00000112697 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000475111 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:75254599:75284948:-1 gene:ENSG00000112697 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// AK292823 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76471 complete cds, highly similar to Homo sapiens transmembrane protein 30A, mRNA. // chr6 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// AK293225 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53706 complete cds, highly similar to Cell cycle control protein 50A. // chr6 // 88 // 65 // 15 // 17 // 0 /// AK295567 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55687 complete cds, highly similar to Cell cycle control protein 50A. // chr6 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// AL832490 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686K1722 (from clone DKFZp686K1722). // chr6 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// BC009006 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 30A, mRNA (cDNA clone MGC:16987 IMAGE:4154200), complete cds. // chr6 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000020984 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:75085190:75305376:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
ENST00000408405 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:6:75398860:75399067:-1 gene:ENSG00000221332 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT113614 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000364421 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:75473738:75473894:-1 gene:ENSG00000201291 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT113618 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000363221 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:75654970:75655299:-1 gene:ENSG00000200091 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT113628 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENST00000516347 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:75768059:75768158:-1 gene:ENSG00000252156 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT113633 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000411237 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:75865239:75865335:-1 gene:ENSG00000223169 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT113635 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001282368 // RefSeq // Homo sapiens interphotoreceptor matrix proteoglycan 1 (IMPG1), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// NM_001563 // RefSeq // Homo sapiens interphotoreceptor matrix proteoglycan 1 (IMPG1), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000369950 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:75921115:76072678:-1 gene:ENSG00000112706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000369963 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:75921115:76072678:-1 gene:ENSG00000112706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// AF047492 // GenBank // Homo sapiens interphotoreceptor matrix proteoglycan 150 (IMPG1) mRNA, complete cds. // chr6 // 98 // 95 // 41 // 42 // 0 /// BC117450 // GenBank // Homo sapiens interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, mRNA (cDNA clone MGC:151059 IMAGE:40126001), complete cds. // chr6 // 98 // 93 // 40 // 41 // 0 /// BC117452 // GenBank // Homo sapiens interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, mRNA (cDNA clone MGC:151061 IMAGE:40126003), complete cds. // chr6 // 98 // 93 // 40 // 41 // 0 /// ENST00000611179 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:75921115:76072678:-1 gene:ENSG00000112706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000043333 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:75922089:75951071:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 32 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000043339 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:76012464:76043922:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 18 // 18 // 8 // 44 // 1
ENST00000459506 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:76446988:76447089:-1 gene:ENSG00000238697 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT113640 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000607737 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:6:76557653:76557754:-1 gene:ENSG00000272445 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_000863 // RefSeq // Homo sapiens 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 1B, G protein-coupled (HTR1B), mRNA. // chr6 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000369947 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:77462205:77463464:-1 gene:ENSG00000135312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK290080 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77883 complete cds, highly similar to Human gene for serotonin 1B receptor. // chr6 // 83 // 100 // 20 // 24 // 0 /// BC069065 // GenBank // Homo sapiens 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 1B, mRNA (cDNA clone MGC:95339 IMAGE:7216878), complete cds. // chr6 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// BC096207 // GenBank // Homo sapiens 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 1B, mRNA (cDNA clone MGC:116860 IMAGE:40004711), complete cds. // chr6 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// M81590 // GenBank // Homo sapiens serotonin 1D receptor (5-HT1D~) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000019233 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:77462231:77500098:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0
ENST00000479165 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:78940546:78982943:-1 gene:ENSG00000146247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 43 // 22 // 22 // 0 /// NM_017934 // RefSeq // Homo sapiens pleckstrin homology domain interacting protein (PHIP), mRNA. // chr6 // 94 // 94 // 48 // 51 // 1 /// ENST00000275034 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:78935867:79078236:-1 gene:ENSG00000146247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 94 // 94 // 48 // 51 // 1 /// BC137488 // GenBank // Homo sapiens pleckstrin homology domain interacting protein, mRNA (cDNA clone MGC:169111 IMAGE:9021488), complete cds. // chr6 // 92 // 92 // 47 // 51 // 1 /// DQ924532 // GenBank // Homo sapiens pleckstrin homology domain-interacting protein variant 1 (PHIP) mRNA, complete cds. // chr6 // 92 // 92 // 47 // 51 // 1 /// AF310250 // GenBank // Homo sapiens IRS-1 PH domain binding protein PHIP variant 9 mRNA, complete cds. // chr6 // 29 // 29 // 15 // 51 // 1 /// BC081569 // GenBank // Homo sapiens pleckstrin homology domain interacting protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:4942836), complete cds. // chr6 // 31 // 31 // 16 // 51 // 1 /// GENSCAN00000024470 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:78940693:79026074:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 61 // 31 // 31 // 0
ENST00000364594 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:6:79301963:79302066:-1 gene:ENSG00000201464 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT113684 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001122769 // RefSeq // Homo sapiens Leber congenital amaurosis 5 (LCA5), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NM_181714 // RefSeq // Homo sapiens Leber congenital amaurosis 5 (LCA5), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000369846 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:79484991:79537408:-1 gene:ENSG00000135338 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000392959 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:79484991:79537430:-1 gene:ENSG00000135338 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK299314 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60138 complete cds. // chr6 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// BC050327 // GenBank // Homo sapiens Leber congenital amaurosis 5, mRNA (cDNA clone MGC:48608 IMAGE:4823983), complete cds. // chr6 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// ENST00000467898 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:6:79487828:79537458:-1 gene:ENSG00000135338 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 53 // 53 // 17 // 32 // 1 /// GENSCAN00000024475 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:79487004:79518894:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0
NM_022726 // RefSeq // Homo sapiens ELOVL fatty acid elongase 4 (ELOVL4), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000369816 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:79914812:79947580:-1 gene:ENSG00000118402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF277094 // GenBank // Homo sapiens ELOVL4 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AJ420478 // GenBank // Homo sapiens mRNA full length insert cDNA clone EUROIMAGE 1625104. // chr6 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// AY037298 // GenBank // Homo sapiens elongation of very long chain fatty acids protein (ELOVL4) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC038506 // GenBank // Homo sapiens elongation of very long chain fatty acids (FEN1/Elo2, SUR4/Elo3, yeast)-like 4, mRNA (cDNA clone MGC:33699 IMAGE:5263012), complete cds. // chr6 // 89 // 90 // 24 // 27 // 0 /// GENSCAN00000045803 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:79916608:79947279:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0
AF130064 // GenBank HTC // Homo sapiens clone FLB7925 PRO2122 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000411112 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:82210338:82210440:-1 gene:ENSG00000223044 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT113760 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_002395 // RefSeq // Homo sapiens malic enzyme 1, NADP(+)-dependent, cytosolic (ME1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000369705 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:83210389:83431071:-1 gene:ENSG00000065833 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AK289783 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76221 complete cds, highly similar to Homo sapiens malic enzyme 1, NADP(+)-dependent, cytosolic (ME1), mRNA. // chr6 // 97 // 97 // 32 // 33 // 0 /// AK301875 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57648 complete cds, highly similar to NADP-dependent malic enzyme (EC 1.1.1.40). // chr6 // 97 // 85 // 28 // 29 // 0 /// AK302777 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57677 complete cds, highly similar to NADP-dependent malic enzyme (EC 1.1.1.40). // chr6 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// BC025246 // GenBank // Homo sapiens malic enzyme 1, NADP(+)-dependent, cytosolic, mRNA (cDNA clone MGC:39115 IMAGE:4870714), complete cds. // chr6 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// L34035 // GenBank // Homo sapiens NADP-dependent malic enzyme mRNA, complete cds. // chr6 // 73 // 88 // 22 // 30 // 0 /// GENSCAN00000006228 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:83211924:83356070:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0
NM_001286206 // RefSeq // Homo sapiens centrosomal protein 162kDa (CEP162), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NM_014895 // RefSeq // Homo sapiens centrosomal protein 162kDa (CEP162), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000257766 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:6:84124241:84227596:-1 gene:ENSG00000135315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000403245 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:84124241:84227635:-1 gene:ENSG00000135315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000461137 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:84124241:84195030:-1 gene:ENSG00000135315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 64 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000487999 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:84124955:84155594:-1 gene:ENSG00000135315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000497936 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:84174772:84227608:-1 gene:ENSG00000135315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 95 // 56 // 19 // 20 // 0 /// ENST00000617909 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:84124242:84227635:-1 gene:ENSG00000135315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000013289 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:84125070:84329261:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0
NM_001159673 // RefSeq // Homo sapiens synaptotagmin binding, cytoplasmic RNA interacting protein (SYNCRIP), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 54 // 7 // 7 // 0 /// NM_001159674 // RefSeq // Homo sapiens synaptotagmin binding, cytoplasmic RNA interacting protein (SYNCRIP), transcript variant 3, mRNA. // chr6 // 100 // 54 // 7 // 7 // 0 /// NM_001159677 // RefSeq // Homo sapiens synaptotagmin binding, cytoplasmic RNA interacting protein (SYNCRIP), transcript variant 6, mRNA. // chr6 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0 /// NM_001253771 // RefSeq // Homo sapiens synaptotagmin binding, cytoplasmic RNA interacting protein (SYNCRIP), transcript variant 7, mRNA. // chr6 // 100 // 54 // 7 // 7 // 0 /// NM_006372 // RefSeq // Homo sapiens synaptotagmin binding, cytoplasmic RNA interacting protein (SYNCRIP), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 62 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000355238 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:85608329:85642991:-1 gene:ENSG00000135316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 62 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000369622 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:85614106:85643285:-1 gene:ENSG00000135316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 62 // 8 // 8 // 0 /// AF037448 // GenBank // Homo sapiens RRM RNA binding protein Gry-rbp (GRY-RBP) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 62 // 8 // 8 // 0 /// BC032643 // GenBank // Homo sapiens synaptotagmin binding, cytoplasmic RNA interacting protein, mRNA (cDNA clone MGC:45213 IMAGE:5495201), complete cds. // chr6 // 100 // 54 // 7 // 7 // 0 /// ENST00000616122 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:85607785:85642922:-1 gene:ENSG00000135316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 54 // 7 // 7 // 0
NR_002743 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 50A (SNORD50A), small nucleolar RNA. // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000431043 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:85677128:85678733:-1 gene:ENSG00000203875 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000433843 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:85677329:85678199:-1 gene:ENSG00000203875 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:lincRNA // chr6 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONHSAT113863 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT113864 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONHSAT113865 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NR_003044 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 50B (SNORD50B), small nucleolar RNA. // chr6 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// ENST00000364995 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:85677589:85677658:-1 gene:ENSG00000275072 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA gene:ENSG00000203875 // chr6 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// ENST00000427501 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:85677082:85677993:-1 gene:ENSG00000203875 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000431043 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:85677128:85678733:-1 gene:ENSG00000203875 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT113859 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT113863 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT113867 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0
ENST00000369586 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:85735744:85735921:-1 gene:ENSG00000198738 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000363557 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:6:85777639:85777755:-1 gene:ENSG00000200427 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT113872 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000365233 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:85993021:85993159:-1 gene:ENSG00000202103 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT113875 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
ENST00000472609 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:86214237:86214576:-1 gene:ENSG00000220831 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000009895 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:86214247:86214585:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_000735 // RefSeq // Homo sapiens glycoprotein hormones, alpha polypeptide (CGA), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NM_001252383 // RefSeq // Homo sapiens glycoprotein hormones, alpha polypeptide (CGA), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000369582 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:87085498:87095106:-1 gene:ENSG00000135346 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC010957 // GenBank // Homo sapiens glycoprotein hormones, alpha polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:13639 IMAGE:4043527), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC020782 // GenBank // Homo sapiens glycoprotein hormones, alpha polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:22783 IMAGE:4732686), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC055080 // GenBank // Homo sapiens glycoprotein hormones, alpha polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:62040 IMAGE:4044086), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// CR457427 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834A0815D for gene CGA, glycoprotein hormones, alpha polypeptide; complete cds, incl. stopcodon. // chr6 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// FJ624079 // GenBank // Homo sapiens clone F1-351a follicle-stimulating hormone alpha subunit (CGA) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000610310 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:87085500:87095147:-1 gene:ENSG00000135346 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_198568 // RefSeq // Homo sapiens gap junction protein, beta 7, 25kDa (GJB7), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_005248716 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens gap junction protein, beta 7, 25kDa (GJB7), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 70 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000296882 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:87282979:87323077:-1 gene:ENSG00000164411 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000369576 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:87284425:87291988:-1 gene:ENSG00000164411 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 48 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000525899 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:87282978:87329278:-1 gene:ENSG00000164411 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC057813 // GenBank // Homo sapiens gap junction protein, beta 7, 25kDa, mRNA (cDNA clone MGC:71746 IMAGE:30336398), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_020320 // RefSeq // Homo sapiens arginyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (RARS2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000369536 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:87514378:87590003:-1 gene:ENSG00000146282 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000451155 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:87545616:87569590:-1 gene:ENSG00000146282 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 27 // 12 // 12 // 0 /// AK093934 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ36615 fis, clone TRACH2016384, weakly similar to ARGINYL-TRNA SYNTHETASE, CYTOPLASMIC (EC 6.1.1.19). // chr6 // 98 // 91 // 39 // 40 // 0 /// BC010420 // GenBank // Homo sapiens arginyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:14993 IMAGE:3613406), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// BC105784 // GenBank // Homo sapiens arginyl-tRNA synthetase-like, mRNA (cDNA clone IMAGE:4685309). // chr6 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000013922 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:87472780:87594516:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 50 // 50 // 22 // 44 // 1 /// BC006261 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3947934, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr6 // 50 // 50 // 22 // 44 // 1
NM_018064 // RefSeq // Homo sapiens akirin 2 (AKIRIN2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000257787 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:87675072:87702209:-1 gene:ENSG00000135334 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC000764 // GenBank // Homo sapiens akirin 2, mRNA (cDNA clone MGC:2740 IMAGE:2822886), complete cds. // chr6 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// BC003042 // GenBank // Homo sapiens akirin 2, mRNA (cDNA clone MGC:4366 IMAGE:2822886), complete cds. // chr6 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// BC005051 // GenBank // Homo sapiens akirin 2, mRNA (cDNA clone MGC:12937 IMAGE:2820292), complete cds. // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000013915 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:87675314:87710284:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 95 // 68 // 18 // 19 // 0
ENST00000410213 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:6:88714242:88714430:-1 gene:ENSG00000222145 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT113933 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000411069 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:89063500:89063690:-1 gene:ENSG00000223001 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT113937 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_080743 // RefSeq // Homo sapiens serine/arginine-rich splicing factor 12 (SRSF12), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000452027 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:89095959:89118081:-1 gene:ENSG00000154548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF449428 // GenBank // Homo sapiens SRrp35 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// BC021715 // GenBank // Homo sapiens serine-arginine repressor protein (35 kDa), mRNA (cDNA clone MGC:26758 IMAGE:4828704), complete cds. // chr6 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000475068 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:89105145:89118005:-1 gene:ENSG00000154548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1 /// AK123215 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ41221 fis, clone BRAMY2028914, highly similar to 35 kDa SR repressor protein. // chr6 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1 /// ENST00000488604 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:89098937:89105966:-1 gene:ENSG00000154548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// ENST00000524221 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:89098853:89105816:-1 gene:ENSG00000154548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// NONHSAT113939 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// NONHSAT113940 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
NM_002043 // RefSeq // Homo sapiens gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, rho 2 (GABRR2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000402938 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:89257520:89315299:-1 gene:ENSG00000111886 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000602432 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:89257208:89269353:-1 gene:ENSG00000111886 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// AK293751 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57909 complete cds, highly similar to Gamma-aminobutyric-acid receptor rho-2 subunit precursor. // chr6 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// BC130352 // GenBank // Homo sapiens gamma-aminobutyric acid (GABA) receptor, rho 2, mRNA (cDNA clone MGC:163224 IMAGE:40146383), complete cds. // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC130354 // GenBank // Homo sapiens gamma-aminobutyric acid (GABA) receptor, rho 2, mRNA (cDNA clone MGC:163226 IMAGE:40146385), complete cds. // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// M86868 // GenBank // Human gamma amino butyric acid (GABA rho2) gene mRNA, complete cds. // chr6 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000602808 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:89270393:89315299:-1 gene:ENSG00000111886 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// GENSCAN00000037130 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:89178447:89279192:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_016021 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin-conjugating enzyme E2, J1 (UBE2J1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000435041 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:89326625:89352848:-1 gene:ENSG00000198833 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// AF151834 // GenBank // Homo sapiens CGI-76 protein mRNA, complete cds. // chr6 // 95 // 62 // 20 // 21 // 0 /// AJ420522 // GenBank // Homo sapiens mRNA full length insert cDNA clone EUROIMAGE 1998380. // chr6 // 100 // 32 // 11 // 11 // 0 /// AJ420578 // GenBank // Homo sapiens mRNA full length insert cDNA clone EUROIMAGE 1658099. // chr6 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// AJ420600 // GenBank // Homo sapiens mRNA full length insert cDNA clone EUROIMAGE 684268. // chr6 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// AK290574 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76258 complete cds, highly similar to Homo sapiens ubiquitin-conjugating enzyme E2, J1 (UBC6 homolog, yeast) (UBE2J1), mRNA. // chr6 // 100 // 62 // 21 // 21 // 0 /// AK300629 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52165 complete cds, highly similar to Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1 (EC 6.3.2.19). // chr6 // 100 // 50 // 17 // 17 // 0 /// BC013973 // GenBank // Homo sapiens ubiquitin-conjugating enzyme E2, J1 (UBC6 homolog, yeast), mRNA (cDNA clone MGC:12555 IMAGE:4137664), complete cds. // chr6 // 100 // 62 // 21 // 21 // 0 /// U93243 // GenBank // Homo sapiens Ubc6p homolog mRNA, complete cds. // chr6 // 90 // 59 // 18 // 20 // 0 /// GENSCAN00000037139 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:89312067:89343742:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 41 // 14 // 14 // 0
NM_021244 // RefSeq // Homo sapiens Ras-related GTP binding D (RRAGD), mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000369415 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:89364636:89412270:-1 gene:ENSG00000025039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000492783 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:89377705:89411505:-1 gene:ENSG00000025039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 93 // 48 // 14 // 15 // 0 /// AF272036 // GenBank // Homo sapiens Rag D mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// AK289799 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75246 complete cds, highly similar to Homo sapiens Rag D mRNA. // chr6 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC003088 // GenBank // Homo sapiens Ras-related GTP binding D, mRNA (cDNA clone MGC:1129 IMAGE:3536088), complete cds. // chr6 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000359203 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:6:89364998:89412070:-1 gene:ENSG00000025039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 77 // 77 // 24 // 31 // 1 /// GENSCAN00000037127 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:89368056:89411993:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0
NM_014611 // RefSeq // Homo sapiens MDN1, midasin homolog (yeast) (MDN1), mRNA. // chr6 // 100 // 98 // 130 // 130 // 0 /// XM_006715405 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens MDN1, midasin homolog (yeast) (MDN1), transcript variant X4, mRNA. // chr6 // 100 // 67 // 89 // 89 // 0 /// ENST00000369393 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:89642499:89819723:-1 gene:ENSG00000112159 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 98 // 130 // 130 // 0 /// ENST00000439638 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:89749223:89819718:-1 gene:ENSG00000112159 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 20 // 26 // 26 // 0 /// AF503925 // GenBank // Homo sapiens midasin (MDN1) mRNA, complete cds. // chr6 // 99 // 97 // 128 // 129 // 0 /// AK098453 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ25587 fis, clone JTH10544. // chr6 // 100 // 12 // 16 // 16 // 0 /// AK124025 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ42031 fis, clone SPLEN2037194, weakly similar to NORQ PROTEIN. // chr6 // 100 // 9 // 12 // 12 // 0 /// BC014882 // GenBank // Homo sapiens MDN1, midasin homolog (yeast), mRNA (cDNA clone IMAGE:3907159), partial cds. // chr6 // 100 // 11 // 14 // 14 // 0 /// BC036888 // GenBank HTC // Homo sapiens, Similar to RIKEN cDNA 4833432B22 gene, clone IMAGE:5393957, mRNA. // chr6 // 100 // 6 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000037134 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:89644005:89794704:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 84 // 112 // 112 // 0
ENST00000517082 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:6:89898283:89898392:-1 gene:ENSG00000252891 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT113970 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000410146 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:90001222:90001506:-1 gene:ENSG00000222078 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT113977 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000404146 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:94446740:94447179:-1 gene:ENSG00000216853 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT114039 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0
ENST00000384579 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:96649453:96649591:-1 gene:ENSG00000207309 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT114064 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001143957 // RefSeq // Homo sapiens G protein-coupled receptor 63 (GPR63), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NM_030784 // RefSeq // Homo sapiens G protein-coupled receptor 63 (GPR63), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000229955 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:96794126:96837463:-1 gene:ENSG00000112218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AB030566 // GenBank // Homo sapiens mRNA for PSP24, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AK289839 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78200 complete cds, highly similar to Homo sapiens mRNA for PSP24. // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC067465 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 63, mRNA (cDNA clone MGC:79298 IMAGE:6971763), complete cds. // chr6 // 89 // 43 // 8 // 9 // 0 /// BC067466 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 63, mRNA (cDNA clone MGC:79299 IMAGE:6971764), complete cds. // chr6 // 100 // 43 // 9 // 9 // 0 /// BC067467 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 63, mRNA (cDNA clone MGC:79300 IMAGE:6971765), complete cds. // chr6 // 89 // 43 // 8 // 9 // 0 /// BC067468 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 63, mRNA (cDNA clone MGC:79301 IMAGE:6971766), complete cds. // chr6 // 100 // 43 // 9 // 9 // 0 /// BC067469 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 63, mRNA (cDNA clone MGC:79302 IMAGE:6971767), complete cds. // chr6 // 100 // 43 // 9 // 9 // 0
NM_014165 // RefSeq // Homo sapiens NADH dehydrogenase (ubiquinone) complex I, assembly factor 4 (NDUFAF4), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000316149 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:96889313:96897881:-1 gene:ENSG00000123545 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000478382 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:96891012:96896918:-1 gene:ENSG00000123545 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000489477 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:96891151:96897874:-1 gene:ENSG00000123545 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// AF060508 // GenBank // Homo sapiens clone 015g09 My013 protein mRNA, complete cds. // chr6 // 91 // 88 // 21 // 23 // 0 /// AK026245 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ22592 fis, clone HSI03180. // chr6 // 88 // 62 // 14 // 16 // 0 /// BC039464 // GenBank // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 66, mRNA (cDNA clone MGC:49892 IMAGE:4388671), complete cds. // chr6 // 92 // 96 // 23 // 25 // 0 /// NONHSAT114073 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000001383 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:96891104:96897801:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
ENST00000579670 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:6:96914699:96914995:-1 gene:ENSG00000263479 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT114075 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_032511 // RefSeq // Homo sapiens failed axon connections homolog (Drosophila) (FAXC), mRNA. // chr6 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// XM_005267164 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens failed axon connections homolog (Drosophila) (FAXC), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0 /// XM_006715581 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens failed axon connections homolog (Drosophila) (FAXC), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000389677 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:99271169:99349655:-1 gene:ENSG00000146267 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000480148 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:99323483:99350062:-1 gene:ENSG00000146267 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 42 // 10 // 10 // 0 /// BC004869 // GenBank // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 168, mRNA (cDNA clone MGC:10706 IMAGE:3834272), complete cds. // chr6 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// BC011583 // GenBank // Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 168, mRNA (cDNA clone MGC:20396 IMAGE:4577456), complete cds. // chr6 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// XM_006715582 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens failed axon connections homolog (Drosophila) (FAXC), transcript variant X4, mRNA. // chr6 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1 /// GENSCAN00000016129 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:99238401:99349372:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1
NM_017421 // RefSeq // Homo sapiens coenzyme Q3 methyltransferase (COQ3), mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000254759 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:99369400:99394204:-1 gene:ENSG00000132423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000369242 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:99369498:99394150:-1 gene:ENSG00000132423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// ENST00000479163 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:99376118:99394191:-1 gene:ENSG00000132423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// AF193016 // GenBank // Homo sapiens methyltransferase COQ3 (COQ3) mRNA, complete cds. // chr6 // 79 // 89 // 19 // 24 // 0 /// AK056955 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ32393 fis, clone SKMUS2000074, highly similar to Hexaprenyldihydroxybenzoate methyltransferase, mitochondrial precursor (EC 2.1.1.114). // chr6 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// BC063463 // GenBank // Homo sapiens coenzyme Q3 homolog, methyltransferase (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:75175 IMAGE:5196692), complete cds. // chr6 // 92 // 89 // 22 // 24 // 0 /// ENST00000369240 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:6:99369404:99377454:-1 gene:ENSG00000132423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// GENSCAN00000016118 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:99369600:99377430:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT114113 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0
ENST00000362433 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:6:99642237:99642347:-1 gene:ENSG00000199303 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT114138 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_005068 // RefSeq // Homo sapiens single-minded family bHLH transcription factor 1 (SIM1), mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000262901 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:100388872:100463677:-1 gene:ENSG00000112246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000369208 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:100385015:100464929:-1 gene:ENSG00000112246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// U70212 // GenBank // Human SIM1 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000021588 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:100390361:100465452:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0
NM_022361 // RefSeq // Homo sapiens popeye domain containing 3 (POPDC3), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000254765 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:105158280:105179860:-1 gene:ENSG00000132429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// AF204171 // GenBank // Homo sapiens clone IMAGE:249526 popeye protein 3 (POP3) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC022323 // GenBank // Homo sapiens popeye domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:22671 IMAGE:4293961), complete cds. // chr6 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NR_024539 // RefSeq // Homo sapiens popeye domain containing 3 (POPDC3), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr6 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// ENST00000474760 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:105158360:105179995:-1 gene:ENSG00000132429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// ENST00000489134 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:105158300:105163765:-1 gene:ENSG00000132429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// AK225989 // GenBank // Homo sapiens mRNA for popeye protein 3 variant, clone: FCC111C07. // chr6 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// NONHSAT114212 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// GENSCAN00000005064 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:105108092:105166682:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_002726 // RefSeq // Homo sapiens prolyl endopeptidase (PREP), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000369110 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:6:105277565:105403084:-1 gene:ENSG00000085377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// AB020018 // GenBank // Homo sapiens mRNA for prolyl endopeptidase, complete cds. // chr6 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// AB028867 // GenBank // Homo sapiens mRNA for prolyl oligopeptidase, complete cds. // chr6 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// AY660966 // GenBank // Homo sapiens prolyl oligopeptidase mRNA, complete cds. // chr6 // 97 // 73 // 31 // 32 // 0 /// BC030636 // GenBank // Homo sapiens prolyl endopeptidase, mRNA (cDNA clone MGC:16060 IMAGE:3614248), complete cds. // chr6 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// XM_005267044 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens prolyl endopeptidase (PREP), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 59 // 59 // 26 // 44 // 1 /// D21102 // GenBank // Homo sapiens PEP mRNA for prolyl endopeptidase, complete cds. // chr6 // 64 // 64 // 28 // 44 // 1 /// GENSCAN00000005056 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:105312820:105492497:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 55 // 55 // 24 // 44 // 1 /// GENSCAN00000005051 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:6:105278144:105302823:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 23 // 23 // 10 // 44 // 1