XR_432573 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens uncharacterized LOC102725194 (LOC102725194), transcript variant X2, ncRNA. // chr10 // 94 // 59 // 16 // 17 // 0 /// ENST00000374336 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:46788397:46799819:1 gene:ENSG00000204177 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr10 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000450360 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:47540077:47551919:-1 gene:ENSG00000251079 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr10 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000602440 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:48050282:48060016:-1 gene:ENSG00000270025 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr10 // 95 // 72 // 20 // 21 // 0 /// BC065722 // GenBank // Homo sapiens BMS1 pseudogene 5, mRNA (cDNA clone IMAGE:4607417). // chr10 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000441263 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:73717115:73728580:-1 gene:ENSG00000242338 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr10 // 52 // 79 // 12 // 23 // 0 /// AK294783 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60014 complete cds, highly similar to Ribosome biogenesis protein BMS1 homolog. // chr10 // 52 // 79 // 12 // 23 // 0 /// ENST00000372011 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:86992253:87000435:1 gene:ENSG00000240089 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr10 // 48 // 79 // 11 // 23 // 0 /// NR_003611 // RefSeq // Homo sapiens BMS1 pseudogene 5 (BMS1P5), non-coding RNA. // chr10 // 90 // 90 // 26 // 29 // 1 /// NR_024495 // RefSeq // Homo sapiens BMS1 pseudogene 6 (BMS1P6), non-coding RNA. // chr10 // 90 // 90 // 26 // 29 // 1 /// ENST00000532854 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:47538377:47551954:-1 gene:ENSG00000251079 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 79 // 79 // 23 // 29 // 1 /// ENST00000580094 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:46788390:46811989:1 gene:ENSG00000204177 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript gene:ENSG00000265124 // chr10 // 79 // 79 // 23 // 29 // 1 /// AL832069 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp313K0918 (from clone DKFZp313K0918). // chr10 // 83 // 83 // 24 // 29 // 1 /// BC131568 // GenBank // Homo sapiens BMS1 pseudogene 5, mRNA (cDNA clone IMAGE:40107930). // chr10 // 79 // 79 // 23 // 29 // 1 /// XR_432572 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens uncharacterized LOC102725194 (LOC102725194), transcript variant X1, ncRNA. // chr10 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// NM_014753 // RefSeq // Homo sapiens BMS1 ribosome biogenesis factor (BMS1), mRNA. // chr10 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// NM_133447 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat and GTPase domain Arf GTPase activating protein 11 (AGAP11), mRNA. // chr10 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// NR_026592 // RefSeq // Homo sapiens BMS1 pseudogene 4 (BMS1P4), non-coding RNA. // chr10 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1 /// XM_005271846 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens BMS1 ribosome biogenesis factor (BMS1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// ENST00000374518 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:42782801:42834937:1 gene:ENSG00000165733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// ENST00000433214 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:10:86970741:87010126:1 gene:ENSG00000271880 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// ENST00000444431 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:86992406:87010203:1 gene:ENSG00000151303 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// ENST00000580790 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:73699151:73730487:-1 gene:ENSG00000271816 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1 /// ENST00000584747 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:73715843:73730469:-1 gene:ENSG00000242338 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1 /// AB075855 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1975 protein. // chr10 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// BC043345 // GenBank // Homo sapiens BMS1 homolog, ribosome assembly protein (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:49890 IMAGE:6062924), complete cds. // chr10 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// BC046139 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6202141, containing frame-shift errors. // chr10 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1 /// BC062776 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat and GTPase domain Arf GTPase activating protein 11, mRNA (cDNA clone IMAGE:4617569), complete cds. // chr10 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// BC150252 // GenBank // Homo sapiens BMS1 homolog, ribosome assembly protein (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:166808 IMAGE:9007274), complete cds. // chr10 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// ENST00000431840 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:47523358:47553514:-1 gene:ENSG00000254929 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT013130 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr10 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT013174 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr10 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT013176 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr10 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT013210 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr10 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT013259 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr10 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// TCONS_l2_00003538-XLOC_l2_001953 // Broad TUCP // linc-PTPN20B-1 chr10:-:46758499-46760053 // chr10 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// TCONS_l2_00003558-XLOC_l2_001972 // Broad TUCP // linc-FAM25C-3 chr10:-:49265280-49267984 // chr10 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// TCONS_l2_00004183-XLOC_l2_001972 // Broad TUCP // linc-FAM25C-3 chr10:-:49265488-49272430 // chr10 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT015387 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr10 // 48 // 79 // 11 // 23 // 0 /// ENST00000605970 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:47517816:47553483:-1 gene:ENSG00000254929 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 79 // 79 // 23 // 29 // 1 /// BC075841 // GenBank // Homo sapiens hypothetical protein LOC642517, mRNA (cDNA clone IMAGE:4865591). // chr10 // 79 // 79 // 23 // 29 // 1 /// TCONS_l2_00004167-XLOC_l2_001953 // Broad TUCP // linc-PTPN20B-1 chr10:-:46737611-46761205 // chr10 // 79 // 79 // 23 // 29 // 1 /// TCONS_l2_00004168-XLOC_l2_001953 // Broad TUCP // linc-PTPN20B-1 chr10:-:46737614-46762892 // chr10 // 90 // 90 // 26 // 29 // 1 /// TCONS_l2_00004169-XLOC_l2_001953 // Broad TUCP // linc-PTPN20B-1 chr10:-:46744224-46762776 // chr10 // 90 // 90 // 26 // 29 // 1 /// TCONS_l2_00004179-XLOC_l2_001967 // Broad TUCP // linc-PTPN20B-7 chr10:-:48927372-48950972 // chr10 // 79 // 79 // 23 // 29 // 1 /// TCONS_l2_00004180-XLOC_l2_001967 // Broad TUCP // linc-PTPN20B-7 chr10:-:48927375-48952629 // chr10 // 90 // 90 // 26 // 29 // 1 /// ENST00000399449 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:73674295:73730466:-1 gene:ENSG00000242288 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1 /// ENST00000444180 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:86993432:87024732:1 gene:ENSG00000272508 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr10 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// GENSCAN00000005041 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:46788425:46837947:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1 /// GENSCAN00000019374 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:73707892:73728554:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// GENSCAN00000036538 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:10:48010170:48251689:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// BC020053 // GenBank // Homo sapiens hypothetical protein LOC653468, mRNA (cDNA clone IMAGE:4342566). // chr10 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1 /// NONHSAT015388 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr10 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1