NM_001126128 // RefSeq // Homo sapiens prokineticin 2 (PROK2), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_021935 // RefSeq // Homo sapiens prokineticin 2 (PROK2), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000295619 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:71772101:71785061:-1 gene:ENSG00000163421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// ENST00000353065 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:71771656:71785206:-1 gene:ENSG00000163421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// AF333025 // GenBank // Homo sapiens prokineticin 2 precursor (PROK2) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// AY349131 // GenBank // Homo sapiens prokineticin 2 beta (PK2beta) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC069395 // GenBank // Homo sapiens prokineticin 2, mRNA (cDNA clone MGC:97442 IMAGE:7262718), complete cds. // chr3 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// BC096695 // GenBank // Homo sapiens prokineticin 2, mRNA (cDNA clone MGC:119783 IMAGE:40014094), complete cds. // chr3 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// BC098110 // GenBank // Homo sapiens prokineticin 2, mRNA (cDNA clone MGC:119782 IMAGE:40014092), complete cds. // chr3 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// BC098162 // GenBank // Homo sapiens prokineticin 2, mRNA (cDNA clone MGC:119784 IMAGE:40014096), complete cds. // chr3 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000000473 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:71755619:71785052:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_012234 // RefSeq // Homo sapiens RING1 and YY1 binding protein (RYBP), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000477973 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:72371825:72446918:-1 gene:ENSG00000163602 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AB029551 // GenBank // Homo sapiens YEAF1 mRNA for YY1 and E4TF1 associated factor 1, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF179286 // GenBank // Homo sapiens death effector domain-associated factor mRNA, complete cds. // chr3 // 95 // 71 // 21 // 22 // 0 /// AF227959 // GenBank // Homo sapiens apoptin-associated protein APAP1 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// AY228125 // GenBank // Homo sapiens apoptin-associating protein 1 (AAP1) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// BC014959 // GenBank // Homo sapiens RING1 and YY1 binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:23015 IMAGE:4902201), complete cds. // chr3 // 91 // 71 // 20 // 22 // 0 /// BC036459 // GenBank // Homo sapiens RING1 and YY1 binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:33492 IMAGE:4813939), complete cds. // chr3 // 96 // 81 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000482 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:72378385:72391133:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 45 // 14 // 14 // 0
ENST00000410906 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:72691705:72691811:-1 gene:ENSG00000222838 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT090463 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000516842 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:73092148:73092257:-1 gene:ENSG00000252651 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT090475 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000469247 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:73182501:73183291:-1 gene:ENSG00000182921 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000009483 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:73182473:73218006:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
ENST00000517128 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:73241789:73241896:-1 gene:ENSG00000252937 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT090477 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000616260 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:73959642:73959927:-1 gene:ENSG00000278554 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_020872 // RefSeq // Homo sapiens contactin 3 (plasmacytoma associated) (CNTN3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000263665 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:74262568:74521140:-1 gene:ENSG00000113805 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC150608 // GenBank // Homo sapiens contactin 3 (plasmacytoma associated), mRNA (cDNA clone MGC:183518 IMAGE:9056978), complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000183 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:74266357:74493019:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
ENST00000477271 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:75182754:75183048:-1 gene:ENSG00000242638 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT090502 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000478335 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:75356516:75357503:-1 gene:ENSG00000179799 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000040018 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:75348464:75357354:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 79 // 11 // 11 // 0
ENST00000504027 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:75370448:75371342:-1 gene:ENSG00000230655 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NR_024241 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 86, member D, pseudogene (FAM86DP), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000459803 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:75421566:75435048:-1 gene:ENSG00000244026 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000477247 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:75422961:75435110:-1 gene:ENSG00000244026 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr3 // 100 // 68 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000497543 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:75421552:75435048:-1 gene:ENSG00000244026 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 58 // 11 // 11 // 0 /// BC068011 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6168872, partial cds. // chr3 // 100 // 58 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000484945 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:75421560:75434957:-1 gene:ENSG00000244026 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 79 // 79 // 15 // 19 // 1 /// ENST00000478666 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:75422419:75435046:-1 gene:ENSG00000244026 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 42 // 42 // 8 // 19 // 1 /// NONHSAT090525 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 58 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000040024 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:75425643:75491427:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 58 // 58 // 11 // 19 // 1 /// NONHSAT090526 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 53 // 53 // 10 // 19 // 1 /// NONHSAT090527 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 42 // 42 // 8 // 19 // 1
ENST00000494533 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:75598652:75599673:-1 gene:ENSG00000244222 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
ENST00000492925 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:75624686:75625153:-1 gene:ENSG00000243422 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000040028 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:75617114:75625153:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0 /// NONHSAT090538 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT090539 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// TCONS_l2_00019360-XLOC_l2_010247 // Broad TUCP // linc-CNTN3-5 chr3:-:75673410-75679341 // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
ENST00000410951 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:75964980:75965069:-1 gene:ENSG00000222883 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT090554 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000384164 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:77811741:77811844:-1 gene:ENSG00000206891 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// NONHSAT090565 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0
ENST00000473281 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:78938009:78938292:-1 gene:ENSG00000240964 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT090582 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_000158 // RefSeq // Homo sapiens glucan (1,4-alpha-), branching enzyme 1 (GBE1), mRNA. // chr3 // 98 // 100 // 39 // 40 // 0 /// ENST00000429644 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:81489699:81762161:-1 gene:ENSG00000114480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000489715 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:81489933:81743629:-1 gene:ENSG00000114480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0 /// AK125918 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ43930 fis, clone TESTI4013441, highly similar to 1,4-alpha-glucan branching enzyme (EC 2.4.1.18). // chr3 // 98 // 100 // 39 // 40 // 0 /// AK297939 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57129 complete cds, highly similar to 1,4-alpha-glucan branching enzyme (EC 2.4.1.18). // chr3 // 97 // 78 // 30 // 31 // 0 /// AK300620 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59760 complete cds, highly similar to 1,4-alpha-glucan branching enzyme (EC 2.4.1.18). // chr3 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0 /// BC012098 // GenBank // Homo sapiens glucan (1,4-alpha-), branching enzyme 1, mRNA (cDNA clone MGC:20071 IMAGE:4574938), complete cds. // chr3 // 93 // 100 // 37 // 40 // 0 /// L07956 // GenBank // Homo sapiens 1,4-alpha-glucan branching enzyme (HGBE) mRNA, complete cds. // chr3 // 95 // 98 // 37 // 39 // 0 /// GENSCAN00000027714 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:81619073:81705613:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 30 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000027720 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:81387162:81593916:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 35 // 35 // 14 // 40 // 1
NM_016206 // RefSeq // Homo sapiens vestigial-like family member 3 (VGLL3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000383698 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:86961906:86991119:-1 gene:ENSG00000206538 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000398399 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:86937969:86991107:-1 gene:ENSG00000206538 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC094780 // GenBank // Homo sapiens vestigial like 3 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:104691 IMAGE:30528902), complete cds. // chr3 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000007077 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:86843649:86986365:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_000306 // RefSeq // Homo sapiens POU class 1 homeobox 1 (POU1F1), transcript variant alpha, mRNA. // chr3 // 87 // 88 // 20 // 23 // 0 /// NM_001122757 // RefSeq // Homo sapiens POU class 1 homeobox 1 (POU1F1), transcript variant beta, mRNA. // chr3 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// ENST00000344265 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:87259741:87276504:-1 gene:ENSG00000064835 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000350375 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:87259404:87276587:-1 gene:ENSG00000064835 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 87 // 88 // 20 // 23 // 0 /// ENST00000560656 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:87259897:87276462:-1 gene:ENSG00000064835 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000561167 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:87259895:87276462:-1 gene:ENSG00000064835 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// D10216 // GenBank // Homo sapiens mRNA for Pit-1/GHF-1, complete cds. // chr3 // 87 // 88 // 20 // 23 // 0 /// L18781 // GenBank // Homo sapiens Pit-1/GHF-1 variant mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000007083 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:87259894:87276462:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
ENST00000363833 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:87742543:87742649:-1 gene:ENSG00000200703 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT090693 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001008390 // RefSeq // Homo sapiens CGG triplet repeat binding protein 1 (CGGBP1), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NM_001195308 // RefSeq // Homo sapiens CGG triplet repeat binding protein 1 (CGGBP1), transcript variant 3, mRNA. // chr3 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// NM_003663 // RefSeq // Homo sapiens CGG triplet repeat binding protein 1 (CGGBP1), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000309534 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:88051944:88059048:-1 gene:ENSG00000163320 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000398392 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:88052012:88057309:-1 gene:ENSG00000163320 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000482016 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:88055414:88059068:-1 gene:ENSG00000163320 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0 /// AJ000258 // GenBank // Homo sapiens trinucleotide repeat 5-d(CGG)n-3ds binding protein p20-CGGBP. // chr3 // 100 // 43 // 10 // 10 // 0 /// BC052980 // GenBank // Homo sapiens CGG triplet repeat binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:60069 IMAGE:6012191), complete cds. // chr3 // 95 // 83 // 18 // 19 // 0
NM_000313 // RefSeq // Homo sapiens protein S (alpha) (PROS1), mRNA. // chr3 // 88 // 100 // 21 // 24 // 0 /// ENST00000394236 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:93873033:93974066:-1 gene:ENSG00000184500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 88 // 100 // 21 // 24 // 0 /// ENST00000407433 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:3:93873109:93958754:-1 gene:ENSG00000184500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 88 // 100 // 21 // 24 // 0 /// ENST00000474651 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:90202316:90257415:-1 gene:ENSG00000189002 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK292994 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75323 complete cds, highly similar to Human vitamin K-dependent plasma protein S mRNA. // chr3 // 88 // 100 // 21 // 24 // 0 /// AK303895 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56936 complete cds, highly similar to Vitamin K-dependent protein S precursor. // chr3 // 75 // 100 // 18 // 24 // 0 /// BC015801 // GenBank // Homo sapiens protein S (alpha), mRNA (cDNA clone MGC:9207 IMAGE:3909023), complete cds. // chr3 // 83 // 100 // 20 // 24 // 0 /// M14338 // GenBank // Homo sapiens PROS1 (PROS1) precursor RNA, partial cds. // chr3 // 88 // 100 // 21 // 24 // 0 /// M15036 // GenBank // Human vitamin K-dependent plasma protein S mRNA, complete cds. // chr3 // 88 // 100 // 21 // 24 // 0 /// GENSCAN00000035171 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:93874245:93973749:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 83 // 100 // 20 // 24 // 0 /// GENSCAN00000041360 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:90202316:90213939:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000474651 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:90202316:90257415:-1 gene:ENSG00000189002 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000041361 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:90215560:90257406:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0
NM_000313 // RefSeq // Homo sapiens protein S (alpha) (PROS1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000348974 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:93905788:93973862:-1 gene:ENSG00000184500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 42 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000394236 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:93873033:93974066:-1 gene:ENSG00000184500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000407433 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:3:93873109:93958754:-1 gene:ENSG00000184500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// AK292994 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75323 complete cds, highly similar to Human vitamin K-dependent plasma protein S mRNA. // chr3 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// AK303895 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56936 complete cds, highly similar to Vitamin K-dependent protein S precursor. // chr3 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// BC015801 // GenBank // Homo sapiens protein S (alpha), mRNA (cDNA clone MGC:9207 IMAGE:3909023), complete cds. // chr3 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// M14338 // GenBank // Homo sapiens PROS1 (PROS1) precursor RNA, partial cds. // chr3 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// M15036 // GenBank // Human vitamin K-dependent plasma protein S mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000035171 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:93874245:93973749:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0
NM_001001850 // RefSeq // Homo sapiens syntaxin 19 (STX19), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_005247455 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens syntaxin 19 (STX19), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000315099 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:94014369:94028610:-1 gene:ENSG00000178750 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AF461456 // GenBank // Homo sapiens syntaxin 19 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0 /// BC034696 // GenBank // Homo sapiens syntaxin 19, mRNA (cDNA clone MGC:21382 IMAGE:4746351), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000035178 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:94014385:94015269:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0
ENST00000439836 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:94937086:94938024:-1 gene:ENSG00000234629 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 86 // 100 // 19 // 22 // 0 /// GENSCAN00000029570 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:94937077:94938024:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NONHSAT102415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001105580 // RefSeq // Homo sapiens gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, rho 3 (GABRR3), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_047685 // RefSeq // Homo sapiens gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, rho 3 (GABRR3), transcript variant 1, non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000472788 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:97986673:98034989:-1 gene:ENSG00000183185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000621172 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:97986683:98035304:-1 gene:ENSG00000183185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_000097 // RefSeq // Homo sapiens coproporphyrinogen oxidase (CPOX), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_005247125 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens coproporphyrinogen oxidase (CPOX), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000264193 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:98579442:98593723:-1 gene:ENSG00000080819 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000515041 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:98590519:98593610:-1 gene:ENSG00000080819 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// AK290140 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76234 complete cds, highly similar to Homo sapiens coproporphyrinogen oxidase (CPOX), mRNA. // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AK299692 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56733 complete cds, highly similar to Coproporphyrinogen III oxidase, mitochondrial precursor (EC 1.3.3.3). // chr3 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// BC017210 // GenBank // Homo sapiens coproporphyrinogen oxidase, mRNA (cDNA clone MGC:10533 IMAGE:3956896), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC023551 // GenBank // Homo sapiens coproporphyrinogen oxidase, mRNA (cDNA clone MGC:19660 IMAGE:3161428), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC023554 // GenBank // Homo sapiens coproporphyrinogen oxidase, mRNA (cDNA clone MGC:19736 IMAGE:3607724), complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// D16611 // GenBank // Homo sapiens mRNA for coproporphyrinogen oxidase, complete cds. // chr3 // 86 // 84 // 18 // 21 // 0 /// BX648974 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp779B0713 (from clone DKFZp779B0713). // chr3 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000031783 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:98573433:98593504:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_080927 // RefSeq // Homo sapiens discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 (DCBLD2), mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000326840 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:98795941:98901689:-1 gene:ENSG00000057019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000326857 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:98797783:98901326:-1 gene:ENSG00000057019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// AB073146 // GenBank // Homo sapiens mRNA for CLCP1, complete cds. // chr3 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// AF387547 // GenBank // Homo sapiens endothelial and smooth muscle cell-derived neuropilin-like protein (ESDN) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// AK302649 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61618 complete cds, highly similar to Discoidin, CUB and LCCL domain-containing protein 2 precursor. // chr3 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// BC029658 // GenBank // Homo sapiens discoidin, CUB and LCCL domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:30023 IMAGE:4431275), complete cds. // chr3 // 95 // 69 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000030527 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:98799372:98901188:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0
ENST00000608028 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:99802699:99806058:-1 gene:ENSG00000273374 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK126064 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44076 fis, clone TESTI4038492. // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_014820 // RefSeq // Homo sapiens translocase of outer mitochondrial membrane 70 homolog A (S. cerevisiae) (TOMM70A), mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000284320 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:100363431:100401398:-1 gene:ENSG00000154174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// BC003633 // GenBank // Homo sapiens translocase of outer mitochondrial membrane 70 homolog A (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:3766 IMAGE:3605218), complete cds. // chr3 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// BC052994 // GenBank // Homo sapiens translocase of outer mitochondrial membrane 70 homolog A (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:60332 IMAGE:5549394), complete cds. // chr3 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// BC065555 // GenBank // Homo sapiens translocase of outer mitochondrial membrane 70 homolog A (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone IMAGE:6067022). // chr3 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// AK302796 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57240 complete cds, highly similar to Mitochondrial precursor proteins import receptor. // chr3 // 70 // 70 // 26 // 37 // 1 /// GENSCAN00000028796 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:100365564:100413101:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0
NM_016247 // RefSeq // Homo sapiens interphotoreceptor matrix proteoglycan 2 (IMPG2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000193391 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:101222546:101320560:-1 gene:ENSG00000081148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AB593127 // GenBank // Homo sapiens IMPG2 mRNA for interphotoreceptor matrix proteoglycan 2, complete cds, clone: HP08405-RBd54F07. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AF157624 // GenBank // Homo sapiens Spacrcan mRNA, complete cds. // chr3 // 87 // 96 // 20 // 23 // 0 /// AF173155 // GenBank // Homo sapiens interphotoreceptor matrix proteoglycan 200 (IMPG2) mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// BC144092 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:9052612, with apparent retained intron. // chr3 // 91 // 96 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000004008 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:101228793:101372325:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0
ENST00000496294 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:101576489:101576947:-1 gene:ENSG00000242299 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// GENSCAN00000004006 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:101574063:101576947:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0
ENST00000391017 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:101628310:101628406:-1 gene:ENSG00000212319 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT090896 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_014415 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger and BTB domain containing 11 (ZBTB11), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000312938 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:101648889:101677495:-1 gene:ENSG00000066422 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC111700 // GenBank // Homo sapiens zinc finger and BTB domain containing 11, mRNA (cDNA clone MGC:133303 IMAGE:40038346), complete cds. // chr3 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// U69274 // GenBank // Human zinc finger protein mRNA, complete cds. // chr3 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// ENST00000461821 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:101670613:101677118:-1 gene:ENSG00000066422 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1 /// BC028062 // GenBank HTC // Homo sapiens zinc finger and BTB domain containing 11, mRNA (cDNA clone IMAGE:5189665), with apparent retained intron. // chr3 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1 /// GENSCAN00000042923 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:101651166:101686676:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0
ENST00000364251 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:101662060:101662164:-1 gene:ENSG00000201121 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT090900 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000364195 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:102755064:102755170:-1 gene:ENSG00000201065 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT090935 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
AY831680 // GenBank // Homo sapiens HC1 (HC1) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_014981 // RefSeq // Homo sapiens myosin, heavy chain 15 (MYH15), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENST00000273353 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:108380369:108529322:-1 gene:ENSG00000144821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENST00000478998 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:108404919:108459433:-1 gene:ENSG00000144821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 35 // 17 // 17 // 0 /// AK126801 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44851 fis, clone BRACE3051819, moderately similar to Myosin heavy chain, cardiac muscle alpha isoform. // chr3 // 100 // 35 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000007313 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:108381605:108510530:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 39 // 39 // 0
NM_020890 // RefSeq // Homo sapiens KIAA1524 (KIAA1524), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000295746 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:108549869:108589452:-1 gene:ENSG00000163507 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000481530 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:108551116:108589452:-1 gene:ENSG00000163507 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000487834 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:108560735:108589644:-1 gene:ENSG00000163507 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000491772 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:108549986:108585763:-1 gene:ENSG00000163507 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AF334474 // GenBank // Homo sapiens p90 autoantigen mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC130564 // GenBank // Homo sapiens KIAA1524, mRNA (cDNA clone MGC:163436 IMAGE:40146595), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC136371 // GenBank // Homo sapiens KIAA1524, mRNA (cDNA clone MGC:167981 IMAGE:9020358), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000619684 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:108551067:108589411:-1 gene:ENSG00000163507 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007314 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:108551149:108589375:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONHSAT091088 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr3 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_032579 // RefSeq // Homo sapiens resistin like beta (RETNLB), mRNA. // chr3 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000295755 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:108755637:108757384:-1 gene:ENSG00000163515 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// AF290873 // GenBank // Homo sapiens cysteine-rich secreted A12-alpha-like protein 1 mRNA, complete cds. // chr3 // 90 // 83 // 18 // 20 // 0 /// AF323084 // GenBank // Homo sapiens resistin-like molecule beta mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// AY358655 // GenBank // Homo sapiens clone DNA54228 FIZZ-1 (UNQ408) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// BC069318 // GenBank // Homo sapiens resistin like beta, mRNA (cDNA clone MGC:96886 IMAGE:7262095), complete cds. // chr3 // 95 // 83 // 19 // 20 // 0 /// BC113502 // GenBank // Homo sapiens resistin like beta, mRNA (cDNA clone MGC:142062 IMAGE:8322554), complete cds. // chr3 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// BC113528 // GenBank // Homo sapiens resistin like beta, mRNA (cDNA clone MGC:142088 IMAGE:8322580), complete cds. // chr3 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000028678 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:108755778:108757185:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// AF323921 // GenBank // Homo sapiens putative colon carcinoma-related protein precursor (CCRG) mRNA, complete cds. // chr3 // 75 // 75 // 18 // 24 // 1
NM_005459 // RefSeq // Homo sapiens guanylate cyclase activator 1C (GUCA1C), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000261047 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:108907803:108953895:-1 gene:ENSG00000138472 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000393963 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:108907792:108953762:-1 gene:ENSG00000138472 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000471108 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:108915940:108953766:-1 gene:ENSG00000138472 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 71 // 12 // 12 // 0 /// AB593147 // GenBank // Homo sapiens GUCA1C mRNA for guanylyl cyclase-activating protein 3, complete cds, clone: HP09011-RBdS070M04. // chr3 // 94 // 100 // 16 // 17 // 0 /// AF110002 // GenBank // Homo sapiens guanylate cyclase activating protein 3 (GCAP3) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC103993 // GenBank // Homo sapiens guanylate cyclase activator 1C, mRNA (cDNA clone MGC:120158 IMAGE:40022396), complete cds. // chr3 // 94 // 100 // 16 // 17 // 0 /// BC103994 // GenBank // Homo sapiens guanylate cyclase activator 1C, mRNA (cDNA clone MGC:120159 IMAGE:40022398), complete cds. // chr3 // 94 // 100 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000028687 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:108876250:108953762:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 16 // 16 // 0
NM_014429 // RefSeq // Homo sapiens MORC family CW-type zinc finger 1 (MORC1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000232603 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:108958239:109118142:-1 gene:ENSG00000114487 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000483760 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:108958845:109118103:-1 gene:ENSG00000114487 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// AF084946 // GenBank // Homo sapiens microrchidia (MORC) mRNA, complete cds. // chr3 // 91 // 100 // 32 // 35 // 0 /// AK302642 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57672 complete cds, highly similar to Homo sapiens MORC family CW-type zinc finger 1 (MORC1), mRNA. // chr3 // 82 // 94 // 27 // 33 // 0 /// BC050307 // GenBank // Homo sapiens MORC family CW-type zinc finger 1, mRNA (cDNA clone MGC:48317 IMAGE:4838254), complete cds. // chr3 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000028677 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:108987272:109118059:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 60 // 21 // 21 // 0
ENST00000408706 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:109018909:109019116:-1 gene:ENSG00000221633 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT091100 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_138815 // RefSeq // Homo sapiens developmental pluripotency associated 2 (DPPA2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_006713510 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens developmental pluripotency associated 2 (DPPA2), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 76 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000478945 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:109293788:109316517:-1 gene:ENSG00000163530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AY283672 // GenBank // Homo sapiens pluripotent embryonic stem cell-related protein (PESCRG1) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC018070 // GenBank // Homo sapiens developmental pluripotency associated 2, mRNA (cDNA clone MGC:26688 IMAGE:4817054), complete cds. // chr3 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000028680 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:109284966:109337517:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 57 // 57 // 12 // 21 // 1
ENST00000497682 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:109409678:109410084:-1 gene:ENSG00000230618 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000028681 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:109364038:109410084:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 42 // 42 // 8 // 19 // 1
ENST00000488231 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:109915976:109916940:-1 gene:ENSG00000214380 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023695 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:109657119:109916934:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 83 // 48 // 10 // 12 // 0
ENST00000408279 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:110551845:110551965:-1 gene:ENSG00000221206 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT091130 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XR_171398 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens uncharacterized LOC151760 (LOC151760), misc_RNA. // chr3 // 86 // 100 // 12 // 14 // 0 /// BC038577 // GenBank // Homo sapiens hypothetical LOC151760, mRNA (cDNA clone MGC:50053 IMAGE:5114505), complete cds. // chr3 // 86 // 100 // 12 // 14 // 0 /// ENST00000383686 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:110892123:110893476:-1 gene:ENSG00000206532 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_024508 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, BED-type containing 2 (ZBED2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000317012 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:111592900:111595443:-1 gene:ENSG00000177494 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC003536 // GenBank // Homo sapiens zinc finger, BED-type containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:10796 IMAGE:3609995), complete cds. // chr3 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// BC071956 // GenBank // Homo sapiens zinc finger, BED-type containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:88648 IMAGE:3928218), complete cds. // chr3 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
AY358772 // GenBank // Homo sapiens clone DNA139632 VGSA5840 (UNQ5840) mRNA, complete cds. // chr3 // 91 // 100 // 21 // 23 // 0
NM_183061 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 9, subfamily C (Na+-transporting carboxylic acid decarboxylase), member 1 (SLC9C1), mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// XM_006713602 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens solute carrier family 9, subfamily C (Na+-transporting carboxylic acid decarboxylase), member 1 (SLC9C1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000305815 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:112140887:112294258:-1 gene:ENSG00000172139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000487372 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:112140905:112294227:-1 gene:ENSG00000172139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// AK128084 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ46205 fis, clone TESTI4010544. // chr3 // 89 // 100 // 32 // 36 // 0 /// BC044801 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 9, member 10, mRNA (cDNA clone MGC:42712 IMAGE:4827529), complete cds. // chr3 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000471295 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:112141216:112286879:-1 gene:ENSG00000172139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 72 // 72 // 26 // 36 // 1 /// GENSCAN00000019745 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:112123243:112286791:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1
NM_001164496 // RefSeq // Homo sapiens WD repeat domain 52 (WDR52), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000393845 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:113286930:113441514:-1 gene:ENSG00000206530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000461734 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:113290853:113327797:-1 gene:ENSG00000206530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 90 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000465636 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:113290120:113366162:-1 gene:ENSG00000206530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// AK002004 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ11142 fis, clone PLACE1006552. // chr3 // 89 // 90 // 8 // 9 // 0 /// AL133606 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp434A2017 (from clone DKFZp434A2017). // chr3 // 90 // 100 // 9 // 10 // 0 /// GENSCAN00000030937 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:113291557:113441579:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 90 // 90 // 9 // 10 // 1
NM_001164496 // RefSeq // Homo sapiens WD repeat domain 52 (WDR52), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NM_018338 // RefSeq // Homo sapiens WD repeat domain 52 (WDR52), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000295868 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:113362865:113441610:-1 gene:ENSG00000206530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000393845 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:113286930:113441514:-1 gene:ENSG00000206530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000488854 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:113362848:113441513:-1 gene:ENSG00000206530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// BC101582 // GenBank // Homo sapiens WD repeat domain 52, mRNA (cDNA clone MGC:126631 IMAGE:8069088), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC113553 // GenBank // Homo sapiens WD repeat domain 52, mRNA (cDNA clone MGC:142113 IMAGE:8322605), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000030937 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:113291557:113441579:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0
NM_144718 // RefSeq // Homo sapiens spindle and centriole associated protein 1 (SPICE1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000295872 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:113442718:113515156:-1 gene:ENSG00000163611 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC036951 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 52, mRNA (cDNA clone MGC:46619 IMAGE:5500345), complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AL832327 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp451E115 (from clone DKFZp451E115). // chr3 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// ENST00000467618 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:113445254:113488990:-1 gene:ENSG00000163611 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// ENST00000496105 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:113448835:113494130:-1 gene:ENSG00000163611 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// AK126897 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44949 fis, clone BRAMY4002628. // chr3 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// GENSCAN00000030936 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:113453451:113506605:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
NM_001009899 // RefSeq // Homo sapiens KIAA2018 (KIAA2018), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000316407 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:113648385:113696646:-1 gene:ENSG00000176542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000478658 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:113653239:113674896:-1 gene:ENSG00000176542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000496826 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:113653239:113670233:-1 gene:ENSG00000176542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000020069 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:113654944:113696433:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0
NM_020817 // RefSeq // Homo sapiens KIAA1407 (KIAA1407), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000295878 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:113964137:114056613:-1 gene:ENSG00000163617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000460813 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:113978309:114056549:-1 gene:ENSG00000163617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000481358 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:114004074:114056539:-1 gene:ENSG00000163617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000491000 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:114005508:114056594:-1 gene:ENSG00000163617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 39 // 11 // 11 // 0 /// AK295855 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56949 complete cds. // chr3 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// AK302488 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52088 complete cds. // chr3 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000020055 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:113957430:114056975:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
ENST00000465850 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:114103249:114103628:-1 gene:ENSG00000240912 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000020058 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:114103249:114110036:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_007136 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 80 (ZNF80), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XR_241507 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens zinc finger protein 80 (ZNF80), transcript variant X1, misc_RNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000308095 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:114234636:114237578:-1 gene:ENSG00000174255 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000482457 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:114234631:114237101:-1 gene:ENSG00000174255 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC069606 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 80, mRNA (cDNA clone MGC:97164 IMAGE:7262407), complete cds. // chr3 // 100 // 55 // 17 // 17 // 0 /// BC069826 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 80, mRNA (cDNA clone MGC:97175 IMAGE:7262419), complete cds. // chr3 // 100 // 55 // 17 // 17 // 0 /// BC129925 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 80, mRNA (cDNA clone MGC:150535 IMAGE:40121991), complete cds. // chr3 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000619534 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:114234975:114237578:-1 gene:ENSG00000174255 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000020060 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:114235951:114239317:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 35 // 11 // 11 // 0
ENST00000491078 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:116582552:116582830:-1 gene:ENSG00000241156 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT091312 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000363502 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:116965112:116965227:-1 gene:ENSG00000200372 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONHSAT091323 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
ENST00000384580 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:119341834:119341940:-1 gene:ENSG00000207310 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT091383 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000383669 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:119527771:119557728:-1 gene:ENSG00000121594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000463729 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:119544343:119557840:-1 gene:ENSG00000121594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000478182 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:119527464:119559556:-1 gene:ENSG00000121594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// AK292129 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75225 complete cds, highly similar to Homo sapiens CD80 antigen (CD28 antigen ligand 1, B7-1 antigen) (CD80), mRNA. // chr3 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// AY081815 // GenBank // Homo sapiens costimulatory molecule variant IgV-CD80 (CD80) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr3 // 92 // 40 // 11 // 12 // 0 /// AY197777 // GenBank // Homo sapiens costimulatory factor CD80 type 1 mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr3 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// NM_005191 // RefSeq // Homo sapiens CD80 molecule (CD80), mRNA. // chr3 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// ENST00000264246 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:119524293:119559602:-1 gene:ENSG00000121594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// BC042665 // GenBank // Homo sapiens CD80 molecule, mRNA (cDNA clone MGC:34467 IMAGE:5181343), complete cds. // chr3 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// AY197778 // GenBank // Homo sapiens costimulatory factor CD80 type 2 mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr3 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// GENSCAN00000045466 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:119530664:119574328:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
ENST00000469864 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:120110498:120110786:-1 gene:ENSG00000244308 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT091427 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001168271 // RefSeq // Homo sapiens G protein-coupled receptor 156 (GPR156), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_153002 // RefSeq // Homo sapiens G protein-coupled receptor 156 (GPR156), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000315843 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:120165481:120244295:-1 gene:ENSG00000175697 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000461057 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:120166958:120244116:-1 gene:ENSG00000175697 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000464295 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:120165481:120285094:-1 gene:ENSG00000175697 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000495912 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:120164645:120244120:-1 gene:ENSG00000175697 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// AB209362 // GenBank // Homo sapiens mRNA for G protein-coupled receptor 156 variant protein. // chr3 // 87 // 54 // 13 // 15 // 0 /// AF488739 // GenBank // Homo sapiens GABAB-related G-protein coupled receptor (GABABL) mRNA, complete cds. // chr3 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// BC113701 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 156, mRNA (cDNA clone MGC:142261 IMAGE:8322753), complete cds. // chr3 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// BC143606 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 156, mRNA (cDNA clone MGC:177136 IMAGE:9052119), complete cds. // chr3 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000001950 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:120132772:120226701:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1
NM_001099678 // RefSeq // Homo sapiens leucine rich repeat containing 58 (LRRC58), mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000295628 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:120324509:120349339:-1 gene:ENSG00000163428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000001946 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:120244343:120349243:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
L23545 // GenBank // Homo sapiens unknown mRNA. // chr3 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0
NM_199420 // RefSeq // Homo sapiens polymerase (DNA directed), theta (POLQ), mRNA. // chr3 // 100 // 84 // 47 // 47 // 0 /// ENST00000264233 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:121431431:121546006:-1 gene:ENSG00000051341 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 47 // 47 // 0 /// AF052573 // GenBank // Homo sapiens DNA polymerase theta (POLQ) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 52 // 29 // 29 // 0 /// AF090919 // GenBank // Homo sapiens clone HQ0327 PRO0327 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 16 // 9 // 9 // 0 /// AY032677 // GenBank // Homo sapiens DNA polymerase theta (POLQ) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 86 // 48 // 48 // 0 /// AY338826 // GenBank // Homo sapiens DNA polymerase theta (POLQ) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 82 // 46 // 46 // 0 /// BC034254 // GenBank // Homo sapiens, clone IMAGE:3866451, mRNA. // chr3 // 92 // 21 // 11 // 12 // 0 /// ENST00000621776 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:121431427:121546641:-1 gene:ENSG00000051341 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 48 // 48 // 0 /// GENSCAN00000046675 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:121498473:121545877:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 29 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000046681 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:121432304:121493680:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 45 // 25 // 25 // 0
ENST00000460535 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:121653994:121654296:-1 gene:ENSG00000243544 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT091474 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000410125 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:121655475:121655604:-1 gene:ENSG00000222057 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT091475 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
ENST00000365518 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:122025195:122025304:-1 gene:ENSG00000202388 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT091487 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_019069 // RefSeq // Homo sapiens WD repeat domain 5B (WDR5B), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000330689 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:122412332:122416051:-1 gene:ENSG00000196981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC043494 // GenBank // Homo sapiens WD repeat domain 5B, mRNA (cDNA clone MGC:49879 IMAGE:6056052), complete cds. // chr3 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// CR457279 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834A0813D for gene WDR5B, WD repeat domain 5B; complete cds, incl. stopcodon. // chr3 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000014964 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:122414536:122415528:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
NM_198402 // RefSeq // Homo sapiens protein tyrosine phosphatase-like (proline instead of catalytic arginine), member b (PTPLB), mRNA. // chr3 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000383657 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:123491554:123585185:-1 gene:ENSG00000206527 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000469317 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:123500568:123584555:-1 gene:ENSG00000206527 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// AK289983 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77861 complete cds. // chr3 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// AY191814 // GenBank // Homo sapiens protein tyrosine phosphatase-like member b (PTPLB) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC049369 // GenBank // Homo sapiens protein tyrosine phosphatase-like (proline instead of catalytic arginine), member b, mRNA (cDNA clone MGC:57203 IMAGE:5286864), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC060839 // GenBank // Homo sapiens protein tyrosine phosphatase-like (proline instead of catalytic arginine), member b, mRNA (cDNA clone MGC:71739 IMAGE:5273705), complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AK125375 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ43385 fis, clone OCBBF2006151, highly similar to Mus musculus protein tyrosine phosphatase-like protein PTPLB (Ptplb) mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0
NM_033049 // RefSeq // Homo sapiens mucin 13, cell surface associated (MUC13), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000490147 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:124920167:124927771:-1 gene:ENSG00000173702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 26 // 9 // 9 // 0 /// AB035807 // GenBank // Homo sapiens DRCC1 mRNA for down-regulated in colon cancer 1, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AF286113 // GenBank // Homo sapiens transmembrane mucin MUC13 (MUC13) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AY358831 // GenBank // Homo sapiens clone DNA142930 MUC13 (UNQ6194) mRNA, complete cds. // chr3 // 97 // 100 // 34 // 35 // 0 /// ENST00000478191 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:124916336:124934747:-1 gene:ENSG00000173702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 37 // 37 // 13 // 35 // 1 /// ENST00000616727 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:124905442:124934751:-1 gene:ENSG00000173702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONHSAT091576 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 100 // 26 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000015830 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:124902166:125015163:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 60 // 60 // 21 // 35 // 1
NM_020733 // RefSeq // Homo sapiens heart development protein with EGF-like domains 1 (HEG1), mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000311127 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:124965710:125055958:-1 gene:ENSG00000173706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000487661 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:124967477:125002020:-1 gene:ENSG00000173706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 44 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000015830 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:124902166:125015163:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 64 // 64 // 23 // 36 // 1
ENST00000516833 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:125058304:125058438:-1 gene:ENSG00000252642 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT091581 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000362457 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:125119097:125119200:-1 gene:ENSG00000199327 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT091585 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_003794 // RefSeq // Homo sapiens sorting nexin 4 (SNX4), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000251775 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:125446644:125520197:-1 gene:ENSG00000114520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000465505 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:125476695:125504744:-1 gene:ENSG00000114520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 30 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000471751 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:125447711:125520181:-1 gene:ENSG00000114520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 97 // 73 // 28 // 29 // 0 /// ENST00000473417 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:125469444:125520191:-1 gene:ENSG00000114520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 40 // 16 // 16 // 0 /// AF065485 // GenBank // Homo sapiens sorting nexin 4 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0 /// AK298972 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50837 complete cds, highly similar to Sorting nexin-4. // chr3 // 97 // 73 // 28 // 29 // 0 /// BC018762 // GenBank // Homo sapiens sorting nexin 4, mRNA (cDNA clone MGC:31982 IMAGE:4641014), complete cds. // chr3 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0 /// NR_073435 // RefSeq // Homo sapiens sorting nexin 4 (SNX4), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr3 // 95 // 95 // 38 // 40 // 1 /// GENSCAN00000015805 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:125375127:125520172:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 60 // 60 // 24 // 40 // 1
NM_022776 // RefSeq // Homo sapiens oxysterol binding protein-like 11 (OSBPL11), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENST00000296220 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:125528858:125595090:-1 gene:ENSG00000144909 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// AF392454 // GenBank // Homo sapiens oxysterol-binding protein-like protein OSBPL11 (OSBPL11) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// AK292702 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76960 complete cds, highly similar to Homo sapiens oxysterol binding protein-like 11 (OSBPL11), mRNA. // chr3 // 100 // 82 // 37 // 37 // 0 /// BC010422 // GenBank // Homo sapiens oxysterol binding protein-like 11, mRNA (cDNA clone IMAGE:3028650), complete cds. // chr3 // 100 // 76 // 34 // 34 // 0 /// BC065213 // GenBank // Homo sapiens oxysterol binding protein-like 11, mRNA (cDNA clone MGC:74549 IMAGE:3916115), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// GENSCAN00000015820 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:125530406:125552679:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 29 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000048531 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:125560379:125649142:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 29 // 29 // 13 // 45 // 1
NM_001015050 // RefSeq // Homo sapiens ALG1, chitobiosyldiphosphodolichol beta-mannosyltransferase-like (ALG1L), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NM_001195223 // RefSeq // Homo sapiens ALG1, chitobiosyldiphosphodolichol beta-mannosyltransferase-like (ALG1L), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// XM_006713528 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ALG1, chitobiosyldiphosphodolichol beta-mannosyltransferase-like (ALG1L), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000340333 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:125929275:125937039:-1 gene:ENSG00000189366 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC073816 // GenBank // Homo sapiens beta-1,4-mannosyltransferase-like, mRNA (cDNA clone MGC:88848 IMAGE:5419254), complete cds. // chr3 // 80 // 100 // 8 // 10 // 0 /// ENST00000611639 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:125929275:125934473:-1 gene:ENSG00000189366 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000048528 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:125929352:125959790:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 80 // 80 // 8 // 10 // 1
ENST00000606575 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:126160283:126160445:-1 gene:ENSG00000272020 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_014079 // RefSeq // Homo sapiens Kruppel-like factor 15 (KLF15), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_005247400 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens Kruppel-like factor 15 (KLF15), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000296233 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:126342635:126357442:-1 gene:ENSG00000163884 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AB029254 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KKLF, complete cds. // chr3 // 93 // 61 // 13 // 14 // 0 /// BC036733 // GenBank // Homo sapiens Kruppel-like factor 15, mRNA (cDNA clone MGC:45113 IMAGE:5526657), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000048540 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:126343727:126380509:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0
NM_001165974 // RefSeq // Homo sapiens urocanate hydratase 1 (UROC1), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NM_144639 // RefSeq // Homo sapiens urocanate hydratase 1 (UROC1), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000290868 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:126481281:126517773:-1 gene:ENSG00000159650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000383579 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:3:126481855:126517753:-1 gene:ENSG00000159650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// BC115405 // GenBank // Homo sapiens urocanase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:135007 IMAGE:40076084), complete cds. // chr3 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// BC115406 // GenBank // Homo sapiens urocanase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:135008 IMAGE:40076086), complete cds. // chr3 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000048541 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:126482345:126518561:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 41 // 41 // 0
ENST00000318225 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:126549673:126558965:-1 gene:ENSG00000180697 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC032025 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 22, mRNA (cDNA clone MGC:34728 IMAGE:5165128), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000505070 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:126526999:126558965:-1 gene:ENSG00000180697 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1 /// AK097841 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ40522 fis, clone TESTI2046863. // chr3 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1
ENST00000391254 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:127202372:127202473:-1 gene:ENSG00000212556 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT091713 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000364418 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:127240968:127241074:-1 gene:ENSG00000201288 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT091715 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
ENST00000410695 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:128075073:128075249:-1 gene:ENSG00000222627 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT091751 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000391042 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:128141875:128141977:-1 gene:ENSG00000212344 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT091756 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_153330 // RefSeq // Homo sapiens DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 8 (DNAJB8), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000319153 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:128462442:128467248:-1 gene:ENSG00000179407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000469083 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:128462439:128466968:-1 gene:ENSG00000179407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK125946 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ43958 fis, clone TESTI4016110, highly similar to DnaJ homolog subfamily B member 8. // chr3 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// BC029521 // GenBank // Homo sapiens DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 8, mRNA (cDNA clone MGC:33884 IMAGE:5296554), complete cds. // chr3 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// BC050288 // GenBank // Homo sapiens DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 8, mRNA (cDNA clone MGC:43650 IMAGE:5270636), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000036228 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:128444621:128463245:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_007354 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 27 (C3orf27), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000356020 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:128572000:128576086:-1 gene:ENSG00000198685 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF008192 // GenBank // Homo sapiens putative GR6 protein (GR6) mRNA, complete cds. // chr3 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// ENST00000613423 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:128573280:128573729:-1 gene:ENSG00000198685 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0
NM_002950 // RefSeq // Homo sapiens ribophorin I (RPN1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000296255 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:128619970:128650849:-1 gene:ENSG00000163902 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000497289 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:128620159:128681075:-1 gene:ENSG00000163902 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// AK296905 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51740 complete cds, highly similar to Dolichyl-diphosphooligosaccharide--proteinglycosyltransferase 67 kDa subunit precursor (EC 2.4.1.119). // chr3 // 96 // 77 // 22 // 23 // 0 /// AK297513 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50809 complete cds, highly similar to Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase 67 kDa subunit precursor (EC 2.4.1.119). // chr3 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// AK297941 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51908 complete cds, highly similar to Dolichyl-diphosphooligosaccharide--proteinglycosyltransferase 67 kDa subunit precursor (EC 2.4.1.119). // chr3 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// BC010839 // GenBank // Homo sapiens ribophorin I, mRNA (cDNA clone MGC:5072 IMAGE:3461167), complete cds. // chr3 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// CR456742 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834H0114D for gene RPN1, ribophorin I; complete cds, incl. stopcodon. // chr3 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// Y00281 // GenBank // Human mRNA for ribophorin I. // chr3 // 89 // 93 // 25 // 28 // 0 /// GENSCAN00000001479 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:128620411:128650800:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0
ENST00000620153 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:128673681:128674021:-1 gene:ENSG00000277250 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000384401 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:128714571:128714705:-1 gene:ENSG00000207130 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT091779 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENST00000480365 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:128764466:128765018:-1 gene:ENSG00000242992 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000001492 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:128764466:128765017:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
AF119891 // GenBank HTC // Homo sapiens PRO2706 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
XM_003403421 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens uncharacterized LOC100132731 (LOC100132731), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006713834 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens uncharacterized LOC100132731 (LOC100132731), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000508239 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:128909874:128971330:-1 gene:ENSG00000187695 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK125726 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ43738 fis, clone TESTI2014843. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000001491 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:128913220:128993304:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0
XM_005247667 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens KIAA1257 (KIAA1257), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 68 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000265068 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:128966589:128994115:-1 gene:ENSG00000114656 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000507225 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:128971324:128978315:-1 gene:ENSG00000114656 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 27 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000510149 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:128977013:129002690:-1 gene:ENSG00000114656 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 27 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000515659 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:3:128970980:128991897:-1 gene:ENSG00000114656 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 65 // 23 // 24 // 0 /// AB033083 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1257 protein, partial cds. // chr3 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// BC031632 // GenBank // Homo sapiens KIAA1257, mRNA (cDNA clone MGC:35174 IMAGE:5170293), complete cds. // chr3 // 100 // 62 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000511438 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:128909866:128994076:-1 gene:ENSG00000114656 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 57 // 57 // 21 // 37 // 1 /// AK056377 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ31815 fis, clone NT2RI2009595. // chr3 // 57 // 57 // 21 // 37 // 1 /// NONHSAT091989 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 100 // 27 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000001491 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:128913220:128993304:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 51 // 51 // 19 // 37 // 1
NM_006026 // RefSeq // Homo sapiens H1 histone family, member X (H1FX), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000333762 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:129314771:129316277:-1 gene:ENSG00000184897 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC000426 // GenBank // Homo sapiens H1 histone family, member X, mRNA (cDNA clone MGC:8350 IMAGE:2819756), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC010435 // GenBank // Homo sapiens H1 histone family, member X, mRNA (cDNA clone MGC:15959 IMAGE:3538400), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// D64142 // GenBank // Homo sapiens mRNA for histone H1x, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000001489 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:129315261:129330515:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1
NR_002992 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 7B (SNORA7B), small nucleolar RNA. // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000384360 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:129397210:129397348:-1 gene:ENSG00000207088 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT092048 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT092050 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_207307 // RefSeq // Homo sapiens EF-hand calcium binding domain 12 (EFCAB12), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000326085 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:129401322:129428651:-1 gene:ENSG00000172771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000503498 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:129401326:129421583:-1 gene:ENSG00000172771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000505956 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:129401321:129428651:-1 gene:ENSG00000172771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AL133011 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp434P201 (from clone DKFZp434P201). // chr3 // 96 // 75 // 26 // 27 // 0 /// BC066975 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 25, mRNA (cDNA clone MGC:87592 IMAGE:4374763), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000514900 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:129401322:129418523:-1 gene:ENSG00000172771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 61 // 61 // 22 // 36 // 1 /// AK096099 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ38780 fis, clone LIVER1000479. // chr3 // 58 // 58 // 21 // 36 // 1 /// ENST00000503957 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:129411267:129428617:-1 gene:ENSG00000172771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// GENSCAN00000001480 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:129401593:129440011:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0
GENSCAN00000012652 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:130021769:130039395:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_014602 // RefSeq // Homo sapiens phosphoinositide-3-kinase, regulatory subunit 4 (PIK3R4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000356763 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:130678935:130746829:-1 gene:ENSG00000196455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC110318 // GenBank // Homo sapiens phosphoinositide-3-kinase, regulatory subunit 4, mRNA (cDNA clone MGC:102700 IMAGE:5492292), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC127105 // GenBank // Homo sapiens phosphoinositide-3-kinase, regulatory subunit 4, mRNA (cDNA clone MGC:150691 IMAGE:40124707), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC127106 // GenBank // Homo sapiens phosphoinositide-3-kinase, regulatory subunit 4, mRNA (cDNA clone MGC:150692 IMAGE:40124708), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// Y08991 // GenBank // H.sapiens mRNA for adaptor protein p150. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000031114 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:130679315:130756614:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
ENST00000410851 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:130811768:130812095:-1 gene:ENSG00000222783 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT092121 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000517085 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:130914340:130914452:-1 gene:ENSG00000252894 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT092124 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000364680 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:131092821:131092927:-1 gene:ENSG00000201550 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT092134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NR_002985 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 58 (SNORA58), small nucleolar RNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000505219 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:131479097:131479233:-1 gene:ENSG00000249020 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONHSAT092148 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT092149 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_007027 // RefSeq // Homo sapiens topoisomerase (DNA) II binding protein 1 (TOPBP1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000260810 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:133600573:133661893:-1 gene:ENSG00000163781 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AB019397 // GenBank // Homo sapiens mRNA for DNA topoisomerase II binding protein, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AK302584 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61726 complete cds, highly similar to DNA topoisomerase 2-binding protein 1. // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC126209 // GenBank // Homo sapiens topoisomerase (DNA) II binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:161487 IMAGE:8991925), complete cds. // chr3 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// BC151237 // GenBank // Homo sapiens topoisomerase (DNA) II binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:167825 IMAGE:8860504), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000027572 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:133598508:133655458:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 54 // 19 // 19 // 0
ENST00000364524 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:133710076:133710167:-1 gene:ENSG00000201394 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONHSAT092198 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_025041 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 36 (C3orf36), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000408895 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:133928145:133929812:-1 gene:ENSG00000221972 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC104161 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 36, mRNA (cDNA clone MGC:125760 IMAGE:40029559), complete cds. // chr3 // 88 // 59 // 14 // 16 // 0 /// BC104162 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 36, mRNA (cDNA clone MGC:125761 IMAGE:40029562), complete cds. // chr3 // 93 // 56 // 14 // 15 // 0
NM_001005861 // RefSeq // Homo sapiens receptor-like tyrosine kinase (RYK), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NM_002958 // RefSeq // Homo sapiens receptor-like tyrosine kinase (RYK), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000460933 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:134157133:134250593:-1 gene:ENSG00000163785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000480381 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:134183002:134195339:-1 gene:ENSG00000163785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000486725 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:134159283:134191916:-1 gene:ENSG00000163785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0 /// X96588 // GenBank // H.sapiens mRNA for H-RYK receptor tyrosine kinase. // chr3 // 84 // 86 // 21 // 25 // 0 /// S59184 // GenBank // RYK=related to receptor tyrosine kinase [human, hepatoma, mRNA, 3068 nt]. // chr3 // 72 // 100 // 21 // 29 // 0 /// ENST00000473208 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:134157134:134181672:-1 gene:ENSG00000163785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// AB209405 // GenBank // Homo sapiens mRNA for RYK receptor-like tyrosine kinase isoform 1 variant protein. // chr3 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// ENST00000620660 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:134157134:134250744:-1 gene:ENSG00000163785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000027557 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:134158153:134317466:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 91 // 76 // 20 // 22 // 0
ENST00000517278 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:134780527:134780627:-1 gene:ENSG00000253087 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT092253 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001145417 // RefSeq // Homo sapiens male-specific lethal 2 homolog (Drosophila) (MSL2), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// NM_018133 // RefSeq // Homo sapiens male-specific lethal 2 homolog (Drosophila) (MSL2), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_005247571 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens male-specific lethal 2 homolog (Drosophila) (MSL2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000309993 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:136148922:136195846:-1 gene:ENSG00000174579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000434835 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:3:136150627:136194554:-1 gene:ENSG00000174579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// AK292557 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76454 complete cds, highly similar to Homo sapiens ring finger protein 184 (RNF184), mRNA. // chr3 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// AK302491 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54913 complete cds, highly similar to Homo sapiens ring finger protein 184 (RNF184), mRNA. // chr3 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// BC093764 // GenBank // Homo sapiens male-specific lethal 2 homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:120799 IMAGE:7939609), complete cds. // chr3 // 93 // 50 // 13 // 14 // 0 /// BC093790 // GenBank // Homo sapiens male-specific lethal 2 homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:120825 IMAGE:7939635), complete cds. // chr3 // 92 // 46 // 12 // 13 // 0
ENST00000363701 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:136430084:136430183:-1 gene:ENSG00000200571 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT092276 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000364455 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:137518134:137518255:-1 gene:ENSG00000201325 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT092302 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001170538 // RefSeq // Homo sapiens DAZ interacting zinc finger protein 1-like (DZIP1L), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 68 // 25 // 25 // 0 /// NM_173543 // RefSeq // Homo sapiens DAZ interacting zinc finger protein 1-like (DZIP1L), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// XM_006713526 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens DAZ interacting zinc finger protein 1-like (DZIP1L), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000327532 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:138061990:138115609:-1 gene:ENSG00000158163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000469243 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:138068983:138113480:-1 gene:ENSG00000158163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 68 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000488595 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:138068301:138092465:-1 gene:ENSG00000158163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 32 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000490472 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:138092352:138103778:-1 gene:ENSG00000158163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 24 // 9 // 9 // 0 /// BC033308 // GenBank // Homo sapiens DAZ interacting protein 1-like, mRNA (cDNA clone MGC:24946 IMAGE:4940443), complete cds. // chr3 // 97 // 100 // 36 // 37 // 0 /// XM_005247200 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens DAZ interacting zinc finger protein 1-like (DZIP1L), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 51 // 51 // 19 // 37 // 1 /// GENSCAN00000003395 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:138062816:138133354:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 78 // 78 // 29 // 37 // 1
NM_016161 // RefSeq // Homo sapiens alpha-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase (A4GNT), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000236709 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:138123718:138132387:-1 gene:ENSG00000118017 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF141315 // GenBank // Homo sapiens alpha-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AK225668 // GenBank // Homo sapiens mRNA for alpha-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase variant, clone: STM07477. // chr3 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// BC119639 // GenBank // Homo sapiens alpha-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:149493 IMAGE:40115688), complete cds. // chr3 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC119640 // GenBank // Homo sapiens alpha-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:149494 IMAGE:40115689), complete cds. // chr3 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000003395 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:138062816:138133354:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1
NM_016216 // RefSeq // Homo sapiens debranching RNA lariats 1 (DBR1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000260803 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:138161012:138174949:-1 gene:ENSG00000138231 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000463982 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:138171320:138174866:-1 gene:ENSG00000138231 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// AF180919 // GenBank // Homo sapiens RNA lariat debranching enzyme mRNA, complete cds. // chr3 // 97 // 85 // 28 // 29 // 0 /// AK000116 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ20109 fis, clone COL05067. // chr3 // 100 // 47 // 16 // 16 // 0 /// BC009472 // GenBank // Homo sapiens debranching enzyme homolog 1 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:694 IMAGE:3503627), complete cds. // chr3 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000477557 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:138163349:138174859:-1 gene:ENSG00000138231 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 47 // 47 // 16 // 34 // 1 /// GENSCAN00000003414 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:138161889:138174795:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0
NM_023067 // RefSeq // Homo sapiens forkhead box L2 (FOXL2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000330315 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:138944224:138947140:-1 gene:ENSG00000183770 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF301906 // GenBank // Homo sapiens forkhead transcription factor FOXL2 (FOXL2) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC062549 // GenBank // Homo sapiens forkhead box L2, mRNA (cDNA clone MGC:71193 IMAGE:6572303), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// DQ089670 // GenBank // Homo sapiens transcription factor FOXL2 mutant 1 (FOXL2) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// DQ089671 // GenBank // Homo sapiens transcription factor FOXL2 mutant 2 (FOXL2) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// DQ089672 // GenBank // Homo sapiens transcription factor FOXL2 mutant 3 (FOXL2) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021912 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:138945125:138946719:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
NM_001134659 // RefSeq // Homo sapiens proline rich 23A (PRR23A), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000383163 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:139005468:139006268:-1 gene:ENSG00000206260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NM_001013650 // RefSeq // Homo sapiens proline rich 23B (PRR23B), mRNA. // chr3 // 62 // 100 // 8 // 13 // 0 /// ENST00000329447 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:139019031:139020926:-1 gene:ENSG00000184814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 62 // 100 // 8 // 13 // 0 /// AK127998 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ46116 fis, clone TESTI2037209. // chr3 // 62 // 100 // 8 // 13 // 0 /// GENSCAN00000021896 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:139005468:139105836:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_001013650 // RefSeq // Homo sapiens proline rich 23B (PRR23B), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000329447 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:139019031:139020926:-1 gene:ENSG00000184814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK127998 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ46116 fis, clone TESTI2037209. // chr3 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000021896 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:139005468:139105836:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 67 // 67 // 16 // 24 // 1
NM_001134657 // RefSeq // Homo sapiens proline rich 23C (PRR23C), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000413199 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:139042102:139044892:-1 gene:ENSG00000233701 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000364730 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:139584105:139584445:-1 gene:ENSG00000201600 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT092378 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENST00000461895 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:139609669:139609939:-1 gene:ENSG00000244692 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// AK021889 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ11827 fis, clone HEMBA1006502. // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONHSAT092380 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
ENST00000486956 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:141865012:141865279:-1 gene:ENSG00000228398 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 88 // 100 // 21 // 24 // 0 /// GENSCAN00000041671 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:141865007:141865279:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT092447 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT092448 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000363519 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:141902924:141903030:-1 gene:ENSG00000200389 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONHSAT092449 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001039547 // RefSeq // Homo sapiens glycerol kinase 5 (putative) (GK5), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NR_033289 // RefSeq // Homo sapiens glycerol kinase 5 (putative) (GK5), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000392993 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:142163942:142225607:-1 gene:ENSG00000175066 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000460515 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:142163919:142183066:-1 gene:ENSG00000175066 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000460544 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:142186166:142225416:-1 gene:ENSG00000175066 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000480757 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:142163909:142225548:-1 gene:ENSG00000175066 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000492097 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:142163572:142225567:-1 gene:ENSG00000175066 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC032470 // GenBank // Homo sapiens glycerol kinase 5 (putative), mRNA (cDNA clone MGC:40579 IMAGE:5217372), complete cds. // chr3 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT092465 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000041666 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:142120876:142446890:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
ENST00000515995 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:142407657:142407737:-1 gene:ENSG00000251804 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 70 // 16 // 16 // 0 /// NONHSAT092467 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 70 // 16 // 16 // 0
ENST00000365255 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:142420205:142420369:-1 gene:ENSG00000202125 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT092469 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001184 // RefSeq // Homo sapiens ATR serine/threonine kinase (ATR), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 61 // 61 // 0 /// ENST00000350721 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:142449237:142578826:-1 gene:ENSG00000175054 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 61 // 61 // 0 /// U49844 // GenBank // Human FRAP-related protein (FRP1) mRNA, complete cds. // chr3 // 98 // 98 // 59 // 60 // 0 /// U76308 // GenBank // Human protein kinase ATR mRNA, complete cds. // chr3 // 98 // 98 // 59 // 60 // 0 /// ENST00000513291 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:142449238:142469427:-1 gene:ENSG00000175054 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 18 // 18 // 11 // 61 // 1 /// AB208847 // GenBank // Homo sapiens mRNA for ataxia telangiectasia and Rad3 related protein variant protein. // chr3 // 18 // 18 // 11 // 61 // 1 /// GENSCAN00000016905 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:142496361:142562555:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 38 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000041668 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:142449429:142485282:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 21 // 13 // 13 // 0
ENST00000516936 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:142591677:142591791:-1 gene:ENSG00000252745 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr3 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT092477 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_198504 // RefSeq // Homo sapiens progestin and adipoQ receptor family member IX (PAQR9), mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000340634 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:142961231:142963682:-1 gene:ENSG00000188582 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY424287 // GenBank // Homo sapiens progestin and adipoQ receptor family member IX (PAQR9) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// BC118666 // GenBank // Homo sapiens progestin and adipoQ receptor family member IX, mRNA (cDNA clone MGC:141692 IMAGE:40016554), complete cds. // chr3 // 95 // 68 // 18 // 19 // 0 /// BC122527 // GenBank // Homo sapiens progestin and adipoQ receptor family member IX, mRNA (cDNA clone MGC:141693 IMAGE:40016555), complete cds. // chr3 // 95 // 68 // 18 // 19 // 0 /// ENST00000492509 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:142949164:142962557:-1 gene:ENSG00000188582 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// AK093381 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ36062 fis, clone TESTI2018697. // chr3 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// GENSCAN00000016910 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:142962203:142963336:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0
NM_173653 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 9, subfamily A (NHE9, cation proton antiporter 9), member 9 (SLC9A9), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000316549 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:143265222:143848531:-1 gene:ENSG00000181804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB089794 // GenBank // Homo sapiens mRNA for sodium/proton exchanger NHE9, complete cds. // chr3 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// AK301816 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55881 complete cds, highly similar to Sodium/hydrogen exchanger 9. // chr3 // 85 // 52 // 11 // 13 // 0 /// AY254100 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 9 member 9 (SLC9A9) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC035779 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 9 (sodium/hydrogen exchanger), member 9, mRNA (cDNA clone MGC:46316 IMAGE:5590356), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000477300 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:143855739:143856142:-1 gene:ENSG00000235110 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000002268 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:143855739:143882138:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0
ENST00000410846 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:144186905:144187020:-1 gene:ENSG00000222778 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONHSAT092534 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
ENST00000384427 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:146996607:146996713:-1 gene:ENSG00000207156 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT092572 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_005245348 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ubiquilin 4 (UBQLN4), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000461599 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:148985868:148987668:-1 gene:ENSG00000241627 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000472638 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:156048502:156053650:-1 gene:ENSG00000160803 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0 /// NM_020131 // RefSeq // Homo sapiens ubiquilin 4 (UBQLN4), mRNA. // chr3 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0 /// XM_005245347 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ubiquilin 4 (UBQLN4), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0 /// ENST00000368309 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:156035301:156053794:-1 gene:ENSG00000160803 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0 /// AF188240 // GenBank // Homo sapiens A1U mRNA, complete cds. // chr3 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0 /// AK302895 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54206 complete cds, highly similar to Ubiquilin-4. // chr3 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0 /// BC018403 // GenBank // Homo sapiens ubiquilin 4, mRNA (cDNA clone MGC:16849 IMAGE:4214386), complete cds. // chr3 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0 /// BC063841 // GenBank // Homo sapiens ubiquilin 4, mRNA (cDNA clone MGC:74959 IMAGE:6183942), complete cds. // chr3 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0 /// GENSCAN00000033934 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:148985861:148987666:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000029119 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:156036978:156053701:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0
NM_001184723 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane 4 L six family member 18 (TM4SF18), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NM_138786 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane 4 L six family member 18 (TM4SF18), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000296059 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:149318498:149333761:-1 gene:ENSG00000163762 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000470080 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:149321277:149333482:-1 gene:ENSG00000163762 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000474754 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:149322368:149334414:-1 gene:ENSG00000163762 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000491182 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:149324804:149333635:-1 gene:ENSG00000163762 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// BC014339 // GenBank // Homo sapiens transmembrane 4 L six family member 18, mRNA (cDNA clone MGC:23935 IMAGE:3828466), complete cds. // chr3 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
ENST00000516363 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:149917342:149917449:-1 gene:ENSG00000252172 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT092662 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000464673 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:150077494:150080117:-1 gene:ENSG00000243321 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC037912 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5277541. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT092674 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT092675 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT092676 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_152394 // RefSeq // Homo sapiens glutamate-rich 6 (ERICH6), mRNA. // chr3 // 98 // 100 // 41 // 42 // 0 /// ENST00000295910 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:150659885:150703951:-1 gene:ENSG00000163645 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000474463 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:150686338:150703932:-1 gene:ENSG00000163645 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 92 // 29 // 11 // 12 // 0 /// ENST00000491716 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:150659885:150682319:-1 gene:ENSG00000163645 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 55 // 23 // 23 // 0 /// AL834214 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp434A2219 (from clone DKFZp434A2219). // chr3 // 100 // 55 // 23 // 23 // 0 /// BC036239 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 44, mRNA (cDNA clone MGC:39805 IMAGE:5297417), complete cds. // chr3 // 98 // 100 // 41 // 42 // 0 /// ENST00000491361 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:150659885:150703958:-1 gene:ENSG00000163645 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 88 // 88 // 37 // 42 // 1 /// BC029577 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 44, mRNA (cDNA clone MGC:39662 IMAGE:5268183), complete cds. // chr3 // 88 // 88 // 37 // 42 // 1 /// ENST00000498386 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:150698818:150703971:-1 gene:ENSG00000163645 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 24 // 24 // 10 // 42 // 1 /// GENSCAN00000034990 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:150630645:150703898:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 69 // 29 // 29 // 0
NM_005067 // RefSeq // Homo sapiens siah E3 ubiquitin protein ligase 2 (SIAH2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000312960 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:150741127:150763377:-1 gene:ENSG00000181788 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AK055290 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ30728 fis, clone FEBRA2000021, highly similar to Human hSIAH2 mRNA. // chr3 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// BC013082 // GenBank // Homo sapiens seven in absentia homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:17169 IMAGE:4153095), complete cds. // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// U76248 // GenBank // Human hSIAH2 mRNA, complete cds. // chr3 // 82 // 88 // 18 // 22 // 0
NM_013308 // RefSeq // Homo sapiens G protein-coupled receptor 171 (GPR171), mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_005247402 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens G protein-coupled receptor 171 (GPR171), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_005247403 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens G protein-coupled receptor 171 (GPR171), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000309180 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:151197832:151203192:-1 gene:ENSG00000174946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// AF002986 // GenBank // Homo sapiens platelet activating receptor homolog (H963) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC036815 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 171, mRNA (cDNA clone MGC:46113 IMAGE:5747378), complete cds. // chr3 // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// ENST00000617554 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:151198427:151199386:-1 gene:ENSG00000174946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000034989 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:151198427:151199697:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0
NM_001081455 // RefSeq // Homo sapiens purinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 14 (P2RY14), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// NM_014879 // RefSeq // Homo sapiens purinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 14 (P2RY14), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000309170 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:151212117:151278467:-1 gene:ENSG00000174944 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000424796 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:151212919:151249114:-1 gene:ENSG00000174944 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 57 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000494668 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:151214030:151278369:-1 gene:ENSG00000174944 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 48 // 11 // 11 // 0 /// AK289617 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75398 complete cds, highly similar to Homo sapiens purinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 14, mRNA. // chr3 // 100 // 57 // 13 // 13 // 0 /// BC034989 // GenBank // Homo sapiens purinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 14, mRNA (cDNA clone MGC:33042 IMAGE:5265592), complete cds. // chr3 // 95 // 96 // 21 // 22 // 0
NM_023915 // RefSeq // Homo sapiens G protein-coupled receptor 87 (GPR87), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000260843 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:151294103:151316952:-1 gene:ENSG00000138271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB031548 // GenBank // Homo sapiens KPG_002 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AF086432 // GenBank // Homo sapiens full length insert cDNA clone ZD79H11. // chr3 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// AF237763 // GenBank // Homo sapiens orphan G protein-coupled receptor 87 (GPR87) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AF345566 // GenBank HTC // Homo sapiens putative G-protein-coupled receptor FKSG78 (FKSG78) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// AF411114 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor (GPR95) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// BC112941 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 87, mRNA (cDNA clone MGC:131898 IMAGE:4500655), complete cds. // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC117565 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 87, mRNA (cDNA clone MGC:131822 IMAGE:4521950), complete cds. // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC132888 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 87, mRNA (cDNA clone MGC:164519 IMAGE:40146910), complete cds. // chr3 // 88 // 93 // 22 // 25 // 0 /// BC132890 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 87, mRNA (cDNA clone MGC:164521 IMAGE:40146912), complete cds. // chr3 // 88 // 93 // 22 // 25 // 0 /// EU883576 // GenBank // Homo sapiens orphan GPCR 87 (GPR87) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000034985 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:151278529:151328992:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_176894 // RefSeq // Homo sapiens purinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 13 (P2RY13), mRNA. // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000325602 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:151326312:151329548:-1 gene:ENSG00000181631 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AF178982 // GenBank // Homo sapiens putative G protein-coupled receptor GPCR1 precursor, mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// AF295368 // GenBank // Homo sapiens G-protein coupled receptor GPR86 (GPR86) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AF406692 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor GPR86 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// BC029363 // GenBank // Homo sapiens purinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 13, mRNA (cDNA clone IMAGE:4732407), partial cds. // chr3 // 100 // 39 // 11 // 11 // 0 /// BC041116 // GenBank // Homo sapiens purinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 13, mRNA (cDNA clone MGC:47584 IMAGE:5173463), complete cds. // chr3 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// JF810883 // GenBank // Homo sapiens purinergic receptor P2Y G-protein coupled 13 (P2RY13) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000034985 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:151278529:151328992:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_022788 // RefSeq // Homo sapiens purinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 12 (P2RY12), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NM_176876 // RefSeq // Homo sapiens purinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 12 (P2RY12), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000302632 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:151337380:151384812:-1 gene:ENSG00000169313 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000468596 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:151338158:151340853:-1 gene:ENSG00000169313 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// AB052684 // GenBank // Homo sapiens mRNA for Gi-coupled ADP receptor HORK3, complete cds. // chr3 // 87 // 52 // 13 // 15 // 0 /// AF313449 // GenBank // Homo sapiens P2Y12 platelet ADP receptor mRNA, complete cds. // chr3 // 89 // 62 // 16 // 18 // 0 /// AF321815 // GenBank // Homo sapiens G-protein coupled receptor SP1999 mRNA, complete cds. // chr3 // 76 // 59 // 13 // 17 // 0 /// AK292096 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76055 complete cds, highly similar to Homo sapiens purinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 12 (P2RY12), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 85 // 90 // 22 // 26 // 0 /// AY136754 // GenBank // Homo sapiens purinergic receptor P2RY12 (P2RY12) mRNA, complete cds. // chr3 // 87 // 52 // 13 // 15 // 0 /// BC017898 // GenBank // Homo sapiens purinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 12, mRNA (cDNA clone MGC:23802 IMAGE:4251263), complete cds. // chr3 // 81 // 90 // 21 // 26 // 0 /// AK303714 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58663 complete cds, moderately similar to P2Y purinoceptor 12. // chr3 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// GENSCAN00000034982 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:151337817:151344367:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0
NM_001123228 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 14E (TMEM14E), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000408960 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:152340527:152340904:-1 gene:ENSG00000221962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 38 // 9 // 9 // 0 /// AY358260 // GenBank // Homo sapiens clone DNA176661 QMDP9344 (UNQ9344) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000031245 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:152340527:152340904:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 38 // 9 // 9 // 0
ENST00000582522 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:153199700:153200017:-1 gene:ENSG00000265813 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT092776 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENST00000384593 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:153471466:153471571:-1 gene:ENSG00000207323 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT092786 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000364528 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:154007367:154007502:-1 gene:ENSG00000201398 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT092793 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001114397 // RefSeq // Homo sapiens DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 36 (DHX36), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NM_020865 // RefSeq // Homo sapiens DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 36 (DHX36), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000308361 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:154275668:154324460:-1 gene:ENSG00000174953 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000329463 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:154276171:154324416:-1 gene:ENSG00000174953 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000481941 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:154277635:154319284:-1 gene:ENSG00000174953 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000496811 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:154272546:154324497:-1 gene:ENSG00000174953 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF217190 // GenBank // Homo sapiens MLEL1 protein (MLEL1) mRNA, complete cds. // chr3 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// AK303720 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51438 partial cds, highly similar to Probable ATP-dependent RNA helicase DHX36 (EC 3.6.1.-). // chr3 // 96 // 79 // 22 // 23 // 0 /// BC036035 // GenBank // Homo sapiens DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 36, mRNA (cDNA clone MGC:33187 IMAGE:5273384), complete cds. // chr3 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000035636 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:154276171:154324416:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 79 // 22 // 23 // 0
NM_001038705 // RefSeq // Homo sapiens G protein-coupled receptor 149 (GPR149), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000389740 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:154337672:154429715:-1 gene:ENSG00000174948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// DQ318360 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 149 (GPR149) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000035641 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:154337699:154429435:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0
ENST00000606972 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:155437538:155437823:-1 gene:ENSG00000272096 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_173657 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 33 (C3orf33), mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000340171 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:155762617:155806351:-1 gene:ENSG00000174928 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000465810 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:155763528:155806259:-1 gene:ENSG00000174928 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000482061 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:155762617:155806266:-1 gene:ENSG00000174928 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000486435 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:155763787:155806251:-1 gene:ENSG00000174928 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000534941 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:155762618:155806272:-1 gene:ENSG00000174928 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AF115515 // GenBank // Homo sapiens MSTP052 (MST052) mRNA, complete cds. // chr3 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// AK289890 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75973 complete cds. // chr3 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// BC064898 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 33, mRNA (cDNA clone MGC:70365 IMAGE:6008321), complete cds. // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000028894 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:155763517:155854685:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
NM_001190992 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 33 (acetyl-CoA transporter), member 1 (SLC33A1), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// NM_004733 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 33 (acetyl-CoA transporter), member 1 (SLC33A1), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000359479 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:155826526:155854429:-1 gene:ENSG00000169359 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000392845 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:155821024:155854378:-1 gene:ENSG00000169359 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000475842 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:155827958:155853491:-1 gene:ENSG00000169359 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 33 // 8 // 8 // 0 /// BC014416 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 33 (acetyl-CoA transporter), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:20012 IMAGE:4559958), complete cds. // chr3 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// D88152 // GenBank // Homo sapiens mRNA for acetyl-coenzyme A transporter, complete cds. // chr3 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000028894 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:155763517:155854685:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 42 // 42 // 10 // 24 // 1
NM_007107 // RefSeq // Homo sapiens signal sequence receptor, gamma (translocon-associated protein gamma) (SSR3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000265044 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:156540140:156555184:-1 gene:ENSG00000114850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000467789 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:156542821:156555149:-1 gene:ENSG00000114850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000476217 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:156543004:156555125:-1 gene:ENSG00000114850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 45 // 10 // 10 // 0 /// AF087907 // GenBank // Homo sapiens SSR gamma mRNA, complete cds. // chr3 // 83 // 55 // 10 // 12 // 0 /// AF110647 // GenBank // Homo sapiens translocon-associated protein gamma subunit mRNA, complete cds. // chr3 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// AK304364 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52061 complete cds, highly similar to Translocon-associated protein subunit gamma. // chr3 // 100 // 55 // 12 // 12 // 0 /// BC017203 // GenBank // Homo sapiens signal sequence receptor, gamma (translocon-associated protein gamma), mRNA (cDNA clone MGC:3501 IMAGE:3618589), complete cds. // chr3 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// BT006669 // GenBank // Homo sapiens signal sequence receptor, gamma (translocon-associated protein gamma) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 41 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000467733 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:156543954:156555117:-1 gene:ENSG00000114850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 41 // 41 // 9 // 22 // 1 /// GENSCAN00000033375 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:156544289:156595544:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 41 // 9 // 9 // 0
ENST00000410743 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:157173918:157174040:-1 gene:ENSG00000222675 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr3 // 88 // 100 // 21 // 24 // 0 /// NONHSAT092904 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 88 // 100 // 21 // 24 // 0
ENST00000515942 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:157930492:157930725:-1 gene:ENSG00000251751 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT092918 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AF257098 // GenBank // Homo sapiens ovarian cancer related protein OVN9-3 (OVN9-3) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_020169 // RefSeq // Homo sapiens latexin (LXN), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000264265 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:158666414:158672693:-1 gene:ENSG00000079257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF087851 // GenBank // Homo sapiens LATEX mRNA, complete cds. // chr3 // 83 // 94 // 25 // 30 // 0 /// AF282594 // GenBank // Homo sapiens MUM (MUM) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AF282626 // GenBank // Homo sapiens latexin mRNA, complete cds. // chr3 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// BC005346 // GenBank // Homo sapiens latexin, mRNA (cDNA clone MGC:12439 IMAGE:3932274), complete cds. // chr3 // 84 // 100 // 27 // 32 // 0 /// BC008438 // GenBank // Homo sapiens latexin, mRNA (cDNA clone MGC:14640 IMAGE:4093065), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000482640 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:158645822:158669593:-1 gene:ENSG00000079257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_002888 // RefSeq // Homo sapiens retinoic acid receptor responder (tazarotene induced) 1 (RARRES1), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 90 // 71 // 18 // 20 // 0 /// NM_206963 // RefSeq // Homo sapiens retinoic acid receptor responder (tazarotene induced) 1 (RARRES1), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000237696 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:158696892:158732696:-1 gene:ENSG00000118849 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000479756 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:158704651:158732442:-1 gene:ENSG00000118849 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000498640 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:158704809:158732489:-1 gene:ENSG00000118849 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 93 // 50 // 13 // 14 // 0 /// BC029640 // GenBank // Homo sapiens retinoic acid receptor responder (tazarotene induced) 1, mRNA (cDNA clone MGC:24933 IMAGE:4776506), complete cds. // chr3 // 84 // 89 // 21 // 25 // 0 /// U27185 // GenBank // Human RAR-responsive (TIG1) mRNA, complete cds. // chr3 // 70 // 71 // 14 // 20 // 0 /// GENSCAN00000000610 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:158697678:158749143:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1
ENST00000498175 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:158841093:158841960:-1 gene:ENSG00000232374 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000000602 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:158827861:158850365:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
ENST00000516954 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:159808416:159808570:-1 gene:ENSG00000252763 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT092964 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000483754 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:160227454:160449829:-1 gene:ENSG00000248710 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC033011 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4823529, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_173084 // RefSeq // Homo sapiens tripartite motif containing 59 (TRIM59), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000309784 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:160435503:160449829:-1 gene:ENSG00000213186 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AK291284 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76294 complete cds, highly similar to Homo sapiens tripartite motif-containing 59 (TRIM59), mRNA. // chr3 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// AY159379 // GenBank // Homo sapiens tumor suppressor TSBF1 (TSBF1) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// BC109259 // GenBank // Homo sapiens tripartite motif-containing 59, mRNA (cDNA clone MGC:129860 IMAGE:40025031), complete cds. // chr3 // 95 // 72 // 20 // 21 // 0 /// BC109260 // GenBank // Homo sapiens tripartite motif-containing 59, mRNA (cDNA clone MGC:129861 IMAGE:40025036), complete cds. // chr3 // 95 // 72 // 20 // 21 // 0 /// ENST00000483754 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:160227454:160449829:-1 gene:ENSG00000248710 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1 /// ENST00000543469 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:160432445:160448937:-1 gene:ENSG00000213186 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1 /// BX537987 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686N1030 (from clone DKFZp686N1030). // chr3 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1 /// GENSCAN00000002446 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:160436828:160439183:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// BC033011 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4823529, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr3 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
NM_002268 // RefSeq // Homo sapiens karyopherin alpha 4 (importin alpha 3) (KPNA4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000334256 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:160494995:160565588:-1 gene:ENSG00000186432 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// AB002533 // GenBank // Homo sapiens mRNA for Qip1, complete cds. // chr3 // 91 // 69 // 10 // 11 // 0 /// AK291041 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76805 complete cds, highly similar to Homo sapiens karyopherin alpha 4 (importin alpha 3) (KPNA4), mRNA. // chr3 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0 /// BC028691 // GenBank // Homo sapiens karyopherin alpha 4 (importin alpha 3), mRNA (cDNA clone MGC:26508 IMAGE:4838709), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC034493 // GenBank // Homo sapiens karyopherin alpha 4 (importin alpha 3), mRNA (cDNA clone MGC:26703 IMAGE:4821602), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// U93240 // GenBank // Human importin alpha 3 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000002451 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:160501466:160565282:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 56 // 9 // 9 // 0
NR_003001 // RefSeq // Homo sapiens small Cajal body-specific RNA 7 (SCARNA7), guide RNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000458797 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:160514907:160515236:-1 gene:ENSG00000238741 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT092997 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001040100 // RefSeq // Homo sapiens serine palmitoyltransferase, small subunit B (SPTSSB), mRNA. // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000359175 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:161344792:161372880:-1 gene:ENSG00000196542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000497137 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:161345775:161371501:-1 gene:ENSG00000196542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// AF458592 // GenBank // Homo sapiens ADMP mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// AK123348 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ41354 fis, clone BRAWH2014876. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC065208 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 57, mRNA (cDNA clone MGC:70533 IMAGE:5207108), complete cds. // chr3 // 95 // 71 // 19 // 20 // 0 /// BC071875 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 57, mRNA (cDNA clone IMAGE:6570614), complete cds. // chr3 // 95 // 71 // 19 // 20 // 0 /// BC107756 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 57, mRNA (cDNA clone MGC:104229 IMAGE:6737276), complete cds. // chr3 // 95 // 71 // 19 // 20 // 0 /// BC126236 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 57, mRNA (cDNA clone MGC:161514 IMAGE:8991952), complete cds. // chr3 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000617024 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:161371530:161372821:-1 gene:ENSG00000196542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000620149 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:161346093:161346323:-1 gene:ENSG00000196542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0
NM_001041 // RefSeq // Homo sapiens sucrase-isomaltase (alpha-glucosidase) (SI), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 56 // 56 // 0 /// ENST00000264382 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:164978898:165078495:-1 gene:ENSG00000090402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 56 // 56 // 0 /// ENST00000476593 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:165068719:165078495:-1 gene:ENSG00000090402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 14 // 8 // 8 // 0 /// BC115034 // GenBank // Homo sapiens sucrase-isomaltase (alpha-glucosidase), mRNA (cDNA clone MGC:131624 IMAGE:7962025), complete cds. // chr3 // 91 // 98 // 50 // 55 // 0 /// BC116452 // GenBank // Homo sapiens sucrase-isomaltase (alpha-glucosidase), mRNA (cDNA clone MGC:131621 IMAGE:7962021), complete cds. // chr3 // 96 // 98 // 53 // 55 // 0 /// BC132834 // GenBank // Homo sapiens sucrase-isomaltase (alpha-glucosidase), mRNA (cDNA clone MGC:164465 IMAGE:40146856), complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 54 // 56 // 0 /// BC132860 // GenBank // Homo sapiens sucrase-isomaltase (alpha-glucosidase), mRNA (cDNA clone MGC:164491 IMAGE:40146882), complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 54 // 56 // 0 /// GENSCAN00000047194 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:164979362:165157915:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 47 // 47 // 0
ENST00000363182 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:165122713:165122823:-1 gene:ENSG00000200052 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT093062 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_014926 // RefSeq // Homo sapiens SLIT and NTRK-like family, member 3 (SLITRK3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000241274 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:165186722:165196852:-1 gene:ENSG00000121871 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000475390 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:165186720:165196002:-1 gene:ENSG00000121871 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AB020655 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA0848 protein, partial cds. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK290024 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78429 complete cds, highly similar to Homo sapiens SLIT and NTRK-like family, member 3 (SLITRK3), mRNA. // chr3 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC114621 // GenBank // Homo sapiens SLIT and NTRK-like family, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:138681 IMAGE:40036558), complete cds. // chr3 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000047195 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:165187897:165190830:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
NM_000055 // RefSeq // Homo sapiens butyrylcholinesterase (BCHE), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000264381 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:165772904:165837472:-1 gene:ENSG00000114200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000482958 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:165772905:165837462:-1 gene:ENSG00000114200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000497011 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:165772905:165837462:-1 gene:ENSG00000114200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK292063 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75409 complete cds, highly similar to Homo sapiens butyrylcholinesterase (BCHE), mRNA. // chr3 // 94 // 65 // 16 // 17 // 0 /// BC008396 // GenBank // Homo sapiens butyrylcholinesterase, mRNA (cDNA clone IMAGE:4286343), complete cds. // chr3 // 92 // 50 // 12 // 13 // 0 /// BC018141 // GenBank // Homo sapiens butyrylcholinesterase, mRNA (cDNA clone MGC:9475 IMAGE:3916859), complete cds. // chr3 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// M16474 // GenBank // Human fetal butyrylcholinesterase mRNA, complete cds. // chr3 // 88 // 92 // 21 // 24 // 0 /// M16541 // GenBank // Human butyrylcholinesterase, mRNA, complete cds. // chr3 // 92 // 96 // 23 // 25 // 0 /// ENST00000479451 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:3:165773079:165837420:-1 gene:ENSG00000114200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// GENSCAN00000007918 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:165773382:165988496:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
ENST00000515950 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:166670029:166670122:-1 gene:ENSG00000251759 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 76 // 84 // 16 // 21 // 0 /// NONHSAT093083 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 76 // 84 // 16 // 21 // 0
NM_178824 // RefSeq // Homo sapiens WD repeat domain 49 (WDR49), mRNA. // chr3 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000308378 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:167478684:167653501:-1 gene:ENSG00000174776 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000460448 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:167532883:167653925:-1 gene:ENSG00000174776 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 33 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000476376 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:167478687:167575231:-1 gene:ENSG00000174776 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000479765 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:167478687:167653983:-1 gene:ENSG00000174776 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0 /// AK090939 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ33620 fis, clone BRAMY2020634. // chr3 // 93 // 58 // 13 // 14 // 0 /// AK097556 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ40237 fis, clone TESTI2023414. // chr3 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0 /// BC035512 // GenBank // Homo sapiens WD repeat domain 49, mRNA (cDNA clone MGC:34766 IMAGE:5199615), complete cds. // chr3 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000472600 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:167478687:167620557:-1 gene:ENSG00000174776 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1 /// AK294387 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60484 complete cds, highly similar to Homo sapiens WD repeat domain 49 (WDR49), mRNA. // chr3 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1 /// GENSCAN00000020545 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:167411139:167653425:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0
NM_014498 // RefSeq // Homo sapiens golgi integral membrane protein 4 (GOLIM4), mRNA. // chr3 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000309027 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:168010235:168095344:-1 gene:ENSG00000173905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 97 // 93 // 38 // 39 // 0 /// ENST00000470487 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:168008677:168095975:-1 gene:ENSG00000173905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// U55853 // GenBank // Homo sapiens 130 kD Golgi-localized phosphoprotein (GPP130) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 93 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000020542 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:168010269:168095285:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0
ENST00000485957 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:169149482:169663618:-1 gene:ENSG00000085276 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 95 // 88 // 20 // 21 // 0 /// ENST00000486748 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:169381259:169663390:-1 gene:ENSG00000085276 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 93 // 58 // 13 // 14 // 0 /// BC069498 // GenBank // Homo sapiens myelodysplasia syndrome 1, mRNA (cDNA clone MGC:97004 IMAGE:7262213), complete cds. // chr3 // 95 // 88 // 20 // 21 // 0 /// CR541866 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834F0932D for gene MDS1, myelodysplasia syndrome 1; complete cds, incl. stopcodon. // chr3 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// CR541886 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834B0633D for gene MDS1, myelodysplasia syndrome 1; complete cds, without stopcodon. // chr3 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// U43292 // GenBank // Human MDS1B (MDS1) mRNA, complete cds. // chr3 // 95 // 83 // 19 // 20 // 0 /// NM_004991 // RefSeq // Homo sapiens MDS1 and EVI1 complex locus (MECOM), transcript variant 4, mRNA. // chr3 // 58 // 58 // 14 // 24 // 1 /// ENST00000494292 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:169084761:169663470:-1 gene:ENSG00000085276 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 58 // 58 // 14 // 24 // 1 /// U43293 // GenBank // Human MDS1A (AML1/MDS1 fusion) mRNA, partial cds. // chr3 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1 /// GENSCAN00000015268 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:169314092:169381524:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1 /// S69002 // GenBank // AML1-EVI-1=AML1-EVI-1 fusion protein {rearranged translocation} [human, leukemic cell line SKH1, mRNA Mutant, 5938 nt]. // chr3 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1
ENST00000384050 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:169720187:169720293:-1 gene:ENSG00000206777 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT093151 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NR_001566 // RefSeq // Homo sapiens telomerase RNA component (TERC), telomerase RNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000363312 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:169764610:169765047:-1 gene:ENSG00000277925 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA gene:ENSG00000270141 // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000602385 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:169764520:169765060:-1 gene:ENSG00000270141 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT093153 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0
NM_032487 // RefSeq // Homo sapiens actin-related protein T3 (ACTRT3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000330368 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:169766921:169769895:-1 gene:ENSG00000184378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AB049117 // GenBank // Homo sapiens mRNA for actin related protein, complete cds. // chr3 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// BC007289 // GenBank // Homo sapiens actin related protein M1, mRNA (cDNA clone MGC:15664 IMAGE:3349184), complete cds. // chr3 // 95 // 66 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000047345 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:169767432:169769520:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0
NM_020949 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 7, member 14 (SLC7A14), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000231706 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:170459584:170586074:-1 gene:ENSG00000013293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000019701 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:170437236:170461958:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 52 // 52 // 11 // 21 // 1 /// NONHSAT093203 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 52 // 52 // 11 // 21 // 1
NM_020949 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 7, member 14 (SLC7A14), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000231706 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:170459584:170586074:-1 gene:ENSG00000013293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000019717 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:170467055:170488420:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 33 // 8 // 8 // 0
NONHSAT093211 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000362618 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:170994870:170995033:-1 gene:ENSG00000199488 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT093217 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000384386 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:171504245:171504351:-1 gene:ENSG00000207114 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT093227 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001130081 // RefSeq // Homo sapiens phospholipase D1, phosphatidylcholine-specific (PLD1), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// NM_002662 // RefSeq // Homo sapiens phospholipase D1, phosphatidylcholine-specific (PLD1), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000351298 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:171600826:171810494:-1 gene:ENSG00000075651 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000356327 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:171600405:171810438:-1 gene:ENSG00000075651 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000498278 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:171713878:171810437:-1 gene:ENSG00000075651 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// BC068976 // GenBank // Homo sapiens phospholipase D1, phosphatidylcholine-specific, mRNA (cDNA clone MGC:70810 IMAGE:6068382), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// U38545 // GenBank // Human ARF-activated phosphatidylcholine-specific phospholipase D1a (hPLD1) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000000393 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:171603078:171753852:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0
AF318333 // GenBank HTC // Homo sapiens pp13439 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000331659 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:171791790:171809924:-1 gene:ENSG00000075651 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSG00000183657 // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_004122 // RefSeq // Homo sapiens growth hormone secretagogue receptor (GHSR), transcript variant 1b, mRNA. // chr3 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// NM_198407 // RefSeq // Homo sapiens growth hormone secretagogue receptor (GHSR), transcript variant 1a, mRNA. // chr3 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000241256 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:172445133:172448456:-1 gene:ENSG00000121853 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000427970 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:172447544:172448455:-1 gene:ENSG00000121853 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// AY429112 // GenBank // Homo sapiens growth hormone secretagogue receptor type 1a mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// BC069068 // GenBank // Homo sapiens growth hormone secretagogue receptor, mRNA (cDNA clone MGC:95342 IMAGE:7216881), complete cds. // chr3 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// BC069374 // GenBank // Homo sapiens growth hormone secretagogue receptor, mRNA (cDNA clone MGC:96982 IMAGE:7262191), complete cds. // chr3 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// BC113547 // GenBank // Homo sapiens growth hormone secretagogue receptor, mRNA (cDNA clone MGC:142107 IMAGE:8322599), complete cds. // chr3 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// U60179 // GenBank // Human growth hormone secretagogue receptor type 1a mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// U60181 // GenBank // Human growth hormone secretagogue receptor type 1b mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000038999 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:172445161:172450050:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0
ENST00000363485 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:172771277:172771405:-1 gene:ENSG00000200355 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT093261 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000364588 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:172796429:172796558:-1 gene:ENSG00000201458 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 93 // 100 // 14 // 15 // 0 /// NONHSAT093262 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 93 // 100 // 14 // 15 // 0
NM_031955 // RefSeq // Homo sapiens spermatogenesis associated 16 (SPATA16), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006713778 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens spermatogenesis associated 16 (SPATA16), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000351008 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:172889358:173141268:-1 gene:ENSG00000144962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF345909 // GenBank // Homo sapiens NYD-SP12 mRNA, complete cds. // chr3 // 87 // 100 // 26 // 30 // 0 /// AF404758 // GenBank // Homo sapiens NYD-SP12 mRNA, complete cds. // chr3 // 87 // 100 // 26 // 30 // 0 /// BC034496 // GenBank // Homo sapiens spermatogenesis associated 16, mRNA (cDNA clone MGC:26729 IMAGE:4825905), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000038993 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:173117108:173141268:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000038997 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:172889570:172977045:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 43 // 13 // 13 // 0 /// AK310524 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17566. // chr3 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
ENST00000362922 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:175397247:175397348:-1 gene:ENSG00000199792 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT093301 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_024665 // RefSeq // Homo sapiens transducin (beta)-like 1 X-linked receptor 1 (TBL1XR1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000430069 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:177019355:177196478:-1 gene:ENSG00000177565 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000457928 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:177023320:177197468:-1 gene:ENSG00000177565 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0 /// AF268193 // GenBank // Homo sapiens IRA1 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr3 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0 /// AF314544 // GenBank // Homo sapiens nuclear receptor co-repressor/HDAC3 complex subunit TBLR1 (TBLR1) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 72 // 13 // 13 // 0 /// AK296946 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55712 complete cds, highly similar to F-box-like/WD repeat protein TBL1XR1. // chr3 // 100 // 56 // 10 // 10 // 0 /// BC113421 // GenBank // Homo sapiens transducin (beta)-like 1 X-linked receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:141981 IMAGE:8322473), complete cds. // chr3 // 100 // 67 // 12 // 12 // 0 /// BX648935 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686A0748 (from clone DKFZp686A0748). // chr3 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000025834 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:176922097:177104627:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 50 // 50 // 9 // 18 // 1
ENST00000364473 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:177120691:177120800:-1 gene:ENSG00000201343 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT093339 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000364012 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:177126017:177126120:-1 gene:ENSG00000200882 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT093340 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000516219 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:177503303:177503552:-1 gene:ENSG00000252028 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT093347 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000363418 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:177624282:177624409:-1 gene:ENSG00000200288 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT093351 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000362988 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:178007672:178007779:-1 gene:ENSG00000199858 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT093363 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000516527 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:178429197:178429290:-1 gene:ENSG00000252336 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT093373 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_022470 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, matrin-type 3 (ZMAT3), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_152240 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, matrin-type 3 (ZMAT3), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_005247706 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens zinc finger, matrin-type 3 (ZMAT3), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006713725 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens zinc finger, matrin-type 3 (ZMAT3), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000311417 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:179017223:179072279:-1 gene:ENSG00000172667 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000432729 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:179023739:179072215:-1 gene:ENSG00000172667 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF355465 // GenBank // Homo sapiens WIG-1/PAG608 protein mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// AY037945 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein WIG1 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC002896 // GenBank // Homo sapiens zinc finger, matrin type 3, mRNA (cDNA clone MGC:10613 IMAGE:3943641), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000414084 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:179027757:179071566:-1 gene:ENSG00000172667 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// GENSCAN00000019168 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:179025017:179164999:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
ENST00000365087 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:179169083:179169210:-1 gene:ENSG00000201957 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_171830 // RefSeq // Homo sapiens potassium large conductance calcium-activated channel, subfamily M beta member 3 (KCNMB3), transcript variant 3, mRNA. // chr3 // 100 // 56 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000392685 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:179242764:179251630:-1 gene:ENSG00000171121 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 50 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000019160 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:179239996:179269507:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 44 // 44 // 8 // 18 // 1
NM_020409 // RefSeq // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein L47 (MRPL47), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_177988 // RefSeq // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein L47 (MRPL47), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000259038 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:179588455:179604640:-1 gene:ENSG00000136522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000392659 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:179588831:179604649:-1 gene:ENSG00000136522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000476781 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:179588285:179604654:-1 gene:ENSG00000136522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY212270 // GenBank // Homo sapiens nasopharyngeal carcinoma metastasis-related 1 (NCM1) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC021575 // GenBank // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein L47, mRNA (cDNA clone MGC:31986 IMAGE:3161966), complete cds. // chr3 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// BC032522 // GenBank // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein L47, mRNA (cDNA clone MGC:45403 IMAGE:5500168), complete cds. // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AF285120 // GenBank // Homo sapiens CGI-204 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
ENST00000459278 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:179614775:179614878:-1 gene:ENSG00000239096 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT093414 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_181426 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 39 (CCDC39), mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000442201 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:180614588:180679500:-1 gene:ENSG00000145075 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000476379 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:180614008:180737874:-1 gene:ENSG00000145075 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AK304270 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58733 complete cds, moderately similar to Coiled-coil domain-containing protein 39. // chr3 // 93 // 88 // 28 // 30 // 0 /// AL122120 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp434A128 (from clone DKFZp434A128). // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000008483 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:180615761:180681683:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0
ENST00000495651 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:180736405:180736703:-1 gene:ENSG00000242811 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT093446 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001190233 // RefSeq // Homo sapiens DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 19 (DNAJC19), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// NM_145261 // RefSeq // Homo sapiens DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 19 (DNAJC19), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NR_033721 // RefSeq // Homo sapiens DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 19 (DNAJC19), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NR_033722 // RefSeq // Homo sapiens DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 19 (DNAJC19), transcript variant 4, non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NR_033723 // RefSeq // Homo sapiens DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 19 (DNAJC19), transcript variant 5, non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NR_046073 // RefSeq // Homo sapiens DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 19 (DNAJC19), transcript variant 8, non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000382564 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:180983709:180989773:-1 gene:ENSG00000205981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000469657 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:180983773:180989703:-1 gene:ENSG00000205981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000486355 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:180984275:180989769:-1 gene:ENSG00000205981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 56 // 9 // 9 // 0 /// BC073989 // GenBank // Homo sapiens DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 19, mRNA (cDNA clone MGC:87790 IMAGE:5760865), complete cds. // chr3 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT093459 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_020640 // RefSeq // Homo sapiens DCN1, defective in cullin neddylation 1, domain containing 1 (DCUN1D1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000292782 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:182938074:182980643:-1 gene:ENSG00000043093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000469954 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:182945034:182985953:-1 gene:ENSG00000043093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000492563 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:182945104:182980520:-1 gene:ENSG00000043093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 53 // 8 // 8 // 0 /// AF456425 // GenBank // Homo sapiens squamous cell carcinoma-related oncoprotein (SCCRO) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0 /// AF456426 // GenBank // Homo sapiens squamous cell carcinoma-related oncoprotein (SCCRO) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0 /// AK297328 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57531 complete cds, highly similar to DCN1-like protein 1. // chr3 // 92 // 80 // 11 // 12 // 0 /// BC009478 // GenBank // Homo sapiens DCN1, defective in cullin neddylation 1, domain containing 1 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:15099 IMAGE:3939758), complete cds. // chr3 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// AF292100 // GenBank // Homo sapiens RP42 protein mRNA, complete cds. // chr3 // 60 // 100 // 9 // 15 // 0 /// GENSCAN00000036793 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:182911869:182982205:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 53 // 53 // 8 // 15 // 1
NM_014398 // RefSeq // Homo sapiens lysosomal-associated membrane protein 3 (LAMP3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000265598 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:183122213:183162911:-1 gene:ENSG00000078081 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000466939 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:183123925:183162015:-1 gene:ENSG00000078081 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000470251 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:183153940:183162882:-1 gene:ENSG00000078081 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000476015 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:183153901:183163839:-1 gene:ENSG00000078081 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// AB013924 // GenBank // Homo sapiens mRNA for TSC403 protein, complete cds. // chr3 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// AK302894 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51411 complete cds, highly similar to Lysosome-associated membrane glycoprotein 3 precursor. // chr3 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// BC032940 // GenBank // Homo sapiens lysosomal-associated membrane protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:26448 IMAGE:4829125), complete cds. // chr3 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// XM_005247360 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens lysosomal-associated membrane protein 3 (LAMP3), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// XM_006713586 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens lysosomal-associated membrane protein 3 (LAMP3), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// GENSCAN00000036784 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:183132817:183162655:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0
ENST00000365632 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:183258300:183258416:-1 gene:ENSG00000202502 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT093639 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_130446 // RefSeq // Homo sapiens kelch-like family member 6 (KLHL6), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000341319 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:183487531:183555689:-1 gene:ENSG00000172578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000468734 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:183487551:183555620:-1 gene:ENSG00000172578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// AF441792 // GenBank // Homo sapiens kelch-like protein KLHL6 (KLHL6) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// BC032348 // GenBank // Homo sapiens kelch-like 6 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:40562 IMAGE:5213743), complete cds. // chr3 // 92 // 71 // 22 // 24 // 0 /// ENST00000489245 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:183491010:183555665:-1 gene:ENSG00000172578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 56 // 56 // 19 // 34 // 1 /// BX648370 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686J13185 (from clone DKFZp686J13185). // chr3 // 53 // 53 // 18 // 34 // 1 /// GENSCAN00000007001 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:183491927:183589695:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 50 // 17 // 17 // 0
NM_024871 // RefSeq // Homo sapiens MAP6 domain containing 1 (MAP6D1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000318631 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:183815876:183825578:-1 gene:ENSG00000180834 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000431348 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:183817062:183825594:-1 gene:ENSG00000180834 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// BC006434 // GenBank // Homo sapiens MAP6 domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:13089 IMAGE:3937613), complete cds. // chr3 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000445426 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:183817377:183825521:-1 gene:ENSG00000180834 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 73 // 39 // 8 // 11 // 0 /// GENSCAN00000007012 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:183816689:183825547:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
ENST00000384621 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:184086791:184086903:-1 gene:ENSG00000207351 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT093676 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_033259 // RefSeq // Homo sapiens calcium/calmodulin-dependent protein kinase II inhibitor 2 (CAMK2N2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000296238 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:184259213:184261463:-1 gene:ENSG00000163888 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC105077 // GenBank // Homo sapiens calcium/calmodulin-dependent protein kinase II inhibitor 2, mRNA (cDNA clone MGC:132737 IMAGE:8144080), complete cds. // chr3 // 75 // 50 // 12 // 16 // 0 /// BC105079 // GenBank // Homo sapiens calcium/calmodulin-dependent protein kinase II inhibitor 2, mRNA (cDNA clone MGC:132739 IMAGE:8144082), complete cds. // chr3 // 75 // 50 // 12 // 16 // 0 /// GENSCAN00000006998 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:184259730:184261285:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 89 // 28 // 8 // 9 // 0
NM_022149 // RefSeq // Homo sapiens melanoma antigen family F, 1 (MAGEF1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000317897 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:184710367:184712002:-1 gene:ENSG00000177383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AF295378 // GenBank // Homo sapiens MAGEF1 (MAGEF1) mRNA, complete cds. // chr3 // 88 // 86 // 21 // 24 // 0 /// BC010056 // GenBank // Homo sapiens melanoma antigen family F, 1, mRNA (cDNA clone MGC:19617 IMAGE:3943384), complete cds. // chr3 // 92 // 86 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000031073 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:184656932:184719905:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1
NM_001025266 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 70 (C3orf70), mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000335012 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:185078050:185153014:-1 gene:ENSG00000187068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// BC137178 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 70, mRNA (cDNA clone MGC:168798 IMAGE:9021175), complete cds. // chr3 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// BC137179 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 70, mRNA (cDNA clone MGC:168799 IMAGE:9021176), complete cds. // chr3 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// BC150565 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 70, mRNA (cDNA clone MGC:179716 IMAGE:40127634), complete cds. // chr3 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000031074 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:185083007:185153419:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// AK091454 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ34135 fis, clone FCBBF3010695. // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
ENST00000422486 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:185417495:185418778:-1 gene:ENSG00000229638 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_080652 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 41A (TMEM41A), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000421852 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:185489601:185499057:-1 gene:ENSG00000163900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// AK290878 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76157 complete cds, highly similar to Homo sapiens transmembrane protein 41A (TMEM41A), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// AY358547 // GenBank // Homo sapiens clone DNA26844 RPLL168 (UNQ168) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC008043 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 41A, mRNA (cDNA clone MGC:15397 IMAGE:3838280), complete cds. // chr3 // 100 // 94 // 15 // 15 // 0 /// BC019884 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 41A, mRNA (cDNA clone MGC:29941 IMAGE:4991416), complete cds. // chr3 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000296254 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:185490997:185498987:-1 gene:ENSG00000163900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 63 // 63 // 10 // 16 // 1 /// ENST00000467061 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:185492276:185499057:-1 gene:ENSG00000163900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 63 // 63 // 10 // 16 // 1 /// ENST00000475480 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:185480160:185498985:-1 gene:ENSG00000163900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 50 // 50 // 8 // 16 // 1 /// BX647128 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686N06149 (from clone DKFZp686N06149). // chr3 // 50 // 50 // 8 // 16 // 1 /// BX647928 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686K031 (from clone DKFZp686K031). // chr3 // 63 // 63 // 10 // 16 // 1
NM_139248 // RefSeq // Homo sapiens lipase, member H (LIPH), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000296252 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:185506262:185552613:-1 gene:ENSG00000163898 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000424591 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:3:185508066:185552558:-1 gene:ENSG00000163898 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AK298380 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54609 complete cds, highly similar to Homo sapiens lipase, member H (LIPH), mRNA. // chr3 // 96 // 77 // 22 // 23 // 0 /// AY036912 // GenBank // Homo sapiens membrane-bound phosphatidic acid-selective phospholipase A1 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY093498 // GenBank // Homo sapiens lipase H (LIPH) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC064941 // GenBank // Homo sapiens lipase, member H, mRNA (cDNA clone MGC:70573 IMAGE:6006910), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// EF186228 // GenBank // Homo sapiens mutant lipase H mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// EF186229 // GenBank // Homo sapiens lipase H (LIPH) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000038647 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:185503886:185535052:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0
ENST00000619409 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:186076306:186076591:-1 gene:ENSG00000277118 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_017541 // RefSeq // Homo sapiens crystallin, gamma S (CRYGS), mRNA. // chr3 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000307944 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:186538599:186544451:-1 gene:ENSG00000213139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 73 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000392499 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:186538441:186546702:-1 gene:ENSG00000213139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AF161703 // GenBank // Homo sapiens gammaS-crystallin (CRYGS) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 73 // 16 // 16 // 0 /// BC069478 // GenBank // Homo sapiens crystallin, gamma S, mRNA (cDNA clone MGC:97060 IMAGE:7262271), complete cds. // chr3 // 94 // 73 // 15 // 16 // 0 /// BC070241 // GenBank // Homo sapiens crystallin, gamma S, mRNA (cDNA clone MGC:88225 IMAGE:30405628), complete cds. // chr3 // 94 // 82 // 17 // 18 // 0 /// ENST00000460288 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:186538599:186540520:-1 gene:ENSG00000213139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 55 // 55 // 12 // 22 // 1 /// BX648612 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686M09224 (from clone DKFZp686M09224). // chr3 // 55 // 55 // 12 // 22 // 1 /// GENSCAN00000028953 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:186538696:186544326:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 36 // 8 // 8 // 0
NM_001134415 // RefSeq // Homo sapiens TBCC domain containing 1 (TBCCD1), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NM_001286749 // RefSeq // Homo sapiens TBCC domain containing 1 (TBCCD1), transcript variant 3, mRNA. // chr3 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NM_018138 // RefSeq // Homo sapiens TBCC domain containing 1 (TBCCD1), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000338733 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:186546339:186567352:-1 gene:ENSG00000113838 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000424280 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:186546073:186570543:-1 gene:ENSG00000113838 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000446782 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:3:186546341:186570318:-1 gene:ENSG00000113838 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// BC025748 // GenBank // Homo sapiens TBCC domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:34302 IMAGE:5200082), complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENST00000413695 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:186556590:186570543:-1 gene:ENSG00000113838 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// GENSCAN00000028945 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:186551150:186564329:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
ENST00000384774 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:186771841:186771947:-1 gene:ENSG00000207505 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT093845 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_052969 // RefSeq // Homo sapiens ribosomal protein L39-like (RPL39L), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000296277 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:187120948:187139523:-1 gene:ENSG00000163923 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000455270 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:187120948:187139484:-1 gene:ENSG00000163923 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AB063610 // GenBank // Homo sapiens RPL39L mRNA for ribosomal protein L39-like, complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC012328 // GenBank // Homo sapiens ribosomal protein L39-like, mRNA (cDNA clone MGC:20168 IMAGE:4555759), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// L05096 // GenBank // Homo sapiens ribosomal protein L39 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000433055 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:187120948:187180908:-1 gene:ENSG00000163923 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1
NM_001048 // RefSeq // Homo sapiens somatostatin (SST), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000287641 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:187668906:187670399:-1 gene:ENSG00000157005 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC032625 // GenBank // Homo sapiens somatostatin, mRNA (cDNA clone MGC:45307 IMAGE:5240781), complete cds. // chr3 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000008172 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:187669065:187670291:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
NM_001004312 // RefSeq // Homo sapiens receptor (chemosensory) transporter protein 2 (RTP2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000358241 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:187698259:187702557:-1 gene:ENSG00000198471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY562236 // GenBank // Homo sapiens receptor transporting protein 2 (RTP2) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// BC068081 // GenBank // Homo sapiens receptor (chemosensory) transporter protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:78665 IMAGE:6212901), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008185 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:187695796:187702128:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
AF315716 // GenBank // Homo sapiens ovarian cancer-related protein 2 (OCR2) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_018192 // RefSeq // Homo sapiens leprecan-like 1 (LEPREL1), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000319332 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:189956728:190120929:-1 gene:ENSG00000090530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC005029 // GenBank // Homo sapiens leprecan-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:12594 IMAGE:4040181), complete cds. // chr3 // 94 // 65 // 16 // 17 // 0 /// NM_001134418 // RefSeq // Homo sapiens leprecan-like 1 (LEPREL1), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// ENST00000427335 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:3:189956831:190122437:-1 gene:ENSG00000090530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// GENSCAN00000032876 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:189961707:190120731:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
ENST00000391187 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:190165417:190165523:-1 gene:ENSG00000212489 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT093944 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_207316 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 207 (TMEM207), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000354905 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:190428655:190449876:-1 gene:ENSG00000198398 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AY358607 // GenBank // Homo sapiens clone DNA77303 SRSR846 (UNQ846) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC071780 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 207, mRNA (cDNA clone MGC:88422 IMAGE:4607584), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_198152 // RefSeq // Homo sapiens urotensin 2B (UTS2B), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000340524 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:191267168:191330536:-1 gene:ENSG00000188958 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000427544 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:191268314:191282403:-1 gene:ENSG00000188958 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000440476 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:191268041:191282331:-1 gene:ENSG00000188958 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 90 // 88 // 19 // 21 // 0 /// ENST00000446788 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:191268191:191282261:-1 gene:ENSG00000188958 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// AB116021 // GenBank // Homo sapiens URP mRNA for urotensin II-related peptide, complete cds. // chr3 // 95 // 88 // 20 // 21 // 0 /// AY321313 // GenBank // Homo sapiens urotensin IIB precursor, mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// BC112166 // GenBank // Homo sapiens urotensin 2 domain containing, mRNA (cDNA clone MGC:138371 IMAGE:8327634), complete cds. // chr3 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000425357 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:191268337:191282310:-1 gene:ENSG00000188958 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 79 // 79 // 19 // 24 // 1 /// ENST00000463450 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:191277591:191316218:-1 gene:ENSG00000188958 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 42 // 42 // 10 // 24 // 1 /// NONHSAT093962 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 42 // 42 // 10 // 24 // 1
NONHSAT093978 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
ENST00000363314 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:192729555:192729716:-1 gene:ENSG00000200184 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT094003 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_178496 // RefSeq // Homo sapiens Mab-21 domain containing 2 (MB21D2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000392452 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:192796815:192918161:-1 gene:ENSG00000180611 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK290447 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76099 complete cds. // chr3 // 91 // 41 // 10 // 11 // 0 /// BC013123 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 59, mRNA (cDNA clone MGC:21714 IMAGE:4471808), complete cds. // chr3 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// BC036194 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 59, mRNA (cDNA clone MGC:39517 IMAGE:5267040), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC045582 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 59, mRNA (cDNA clone MGC:57376 IMAGE:5262015), complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0
NM_198505 // RefSeq // Homo sapiens ATPase type 13A5 (ATP13A5), mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000342358 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:193274790:193378843:-1 gene:ENSG00000187527 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000495496 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:193274889:193313363:-1 gene:ENSG00000187527 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 91 // 34 // 10 // 11 // 0 /// AY823163 // GenBank // Homo sapiens cation-transporting P5-ATPase (ATP13A5) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// AK122613 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ16025 fis, clone CTONG2004062, highly similar to ATPase subunit 6. // chr3 // 59 // 59 // 19 // 32 // 1 /// GENSCAN00000046072 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:193331117:193378725:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0
ENST00000494711 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:193740471:193740715:-1 gene:ENSG00000243991 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT094019 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001080513 // RefSeq // Homo sapiens carboxypeptidase N, polypeptide 2 (CPN2), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// NM_001291988 // RefSeq // Homo sapiens carboxypeptidase N, polypeptide 2 (CPN2), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// XM_005269280 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens carboxypeptidase N, polypeptide 2 (CPN2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000323830 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:194339765:194351328:-1 gene:ENSG00000178772 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENST00000429275 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:194340772:194351318:-1 gene:ENSG00000178772 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// BC031569 // GenBank // Homo sapiens carboxypeptidase N, polypeptide 2, mRNA (cDNA clone MGC:35415 IMAGE:5188827), complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC042334 // GenBank // Homo sapiens carboxypeptidase N, polypeptide 2, mRNA (cDNA clone MGC:48937 IMAGE:5190234), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC137398 // GenBank // Homo sapiens carboxypeptidase N, polypeptide 2, mRNA (cDNA clone MGC:169019 IMAGE:9021396), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC137403 // GenBank // Homo sapiens carboxypeptidase N, polypeptide 2, mRNA (cDNA clone MGC:169024 IMAGE:9021401), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// J05158 // GenBank // Homo sapiens carboxypeptidase N precursor (CPN2) mRNA, complete cds. // chr3 // 75 // 77 // 15 // 20 // 0 /// GENSCAN00000005169 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:194341065:194342702:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 93 // 58 // 14 // 15 // 0
NM_001135057 // RefSeq // Homo sapiens leucine rich repeat containing 15 (LRRC15), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NM_130830 // RefSeq // Homo sapiens leucine rich repeat containing 15 (LRRC15), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0 /// ENST00000347624 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:194355247:194369743:-1 gene:ENSG00000172061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0 /// ENST00000428839 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:3:194357927:194369731:-1 gene:ENSG00000172061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0 /// AB071037 // GenBank // Homo sapiens hLib mRNA for Lib, complete cds. // chr3 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// BC101064 // GenBank // Homo sapiens leucine rich repeat containing 15, mRNA (cDNA clone MGC:119586 IMAGE:40008605), complete cds. // chr3 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0 /// BC101065 // GenBank // Homo sapiens leucine rich repeat containing 15, mRNA (cDNA clone MGC:119589 IMAGE:40008610), complete cds. // chr3 // 88 // 68 // 15 // 17 // 0 /// GENSCAN00000005178 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:194359298:194386005:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0
NM_004488 // RefSeq // Homo sapiens glycoprotein V (platelet) (GP5), mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000401815 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:194394821:194398354:-1 gene:ENSG00000178732 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// L11238 // GenBank // Homo sapiens platelet membrane glycoprotein V mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005185 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:194396600:194398282:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NM_024524 // RefSeq // Homo sapiens ATPase type 13A3 (ATP13A3), mRNA. // chr3 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000256031 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:194402680:194468239:-1 gene:ENSG00000133657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000439040 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:194402672:194498364:-1 gene:ENSG00000133657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// AJ306929 // GenBank // Homo sapiens ORF for hypothetical protein. // chr3 // 100 // 48 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000619199 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:194402674:194452041:-1 gene:ENSG00000133657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 48 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000005188 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:194405919:194555195:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 50 // 50 // 20 // 40 // 1
ENST00000455557 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:194496317:194501503:-1 gene:ENSG00000244675 gene_biotype:sense_overlapping transcript_biotype:sense_overlapping // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// AK091192 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ33873 fis, clone CTONG2006942. // chr3 // 89 // 100 // 17 // 19 // 0 /// NONHSAT094095 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
ENST00000516244 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:194533503:194533583:-1 gene:ENSG00000252053 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT094098 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_018385 // RefSeq // Homo sapiens large 60S subunit nuclear export GTPase 1 (LSG1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000265245 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:194640788:194672477:-1 gene:ENSG00000041802 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000427461 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:194659106:194672162:-1 gene:ENSG00000041802 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 92 // 32 // 12 // 13 // 0 /// ENST00000437613 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:194644666:194653102:-1 gene:ENSG00000041802 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 95 // 46 // 18 // 19 // 0 /// BC068500 // GenBank // Homo sapiens large subunit GTPase 1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:87237 IMAGE:30343878), complete cds. // chr3 // 95 // 100 // 39 // 41 // 0 /// GENSCAN00000005184 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:194615410:194672162:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 76 // 76 // 31 // 41 // 1
NM_152531 // RefSeq // Homo sapiens xyloside xylosyltransferase 1 (XXYLT1), mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_005269283 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens xyloside xylosyltransferase 1 (XXYLT1), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// XM_006713512 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens xyloside xylosyltransferase 1 (XXYLT1), transcript variant X9, mRNA. // chr3 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000310380 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:195068279:195271167:-1 gene:ENSG00000173950 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000429994 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:195069677:195247920:-1 gene:ENSG00000173950 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000437101 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:195068601:195184798:-1 gene:ENSG00000173950 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// AK057046 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ32484 fis, clone SKNMC2001555. // chr3 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// AK092474 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ35155 fis, clone PLACE6010991. // chr3 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// BC019036 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 21, mRNA (cDNA clone MGC:20777 IMAGE:4591786), complete cds. // chr3 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// BC039067 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 21, mRNA (cDNA clone MGC:35389 IMAGE:5185557), complete cds. // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AK301133 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58429 complete cds. // chr3 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// GENSCAN00000005171 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:195226683:195271019:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
ENST00000469345 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:195146728:195147003:-1 gene:ENSG00000244314 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT094143 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_012287 // RefSeq // Homo sapiens ArfGAP with coiled-coil, ankyrin repeat and PH domains 2 (ACAP2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006713558 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ArfGAP with coiled-coil, ankyrin repeat and PH domains 2 (ACAP2), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000326793 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:195274736:195443078:-1 gene:ENSG00000114331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000439758 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:195302148:195342609:-1 gene:ENSG00000114331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// AK290369 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75053 complete cds, highly similar to Homo sapiens centaurin, beta 2 (CENTB2), mRNA. // chr3 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// BC060767 // GenBank // Homo sapiens ArfGAP with coiled-coil, ankyrin repeat and PH domains 2, mRNA (cDNA clone MGC:71512 IMAGE:30343546), complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENST00000480906 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:195335899:195443043:-1 gene:ENSG00000114331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// AK222635 // GenBank // Homo sapiens mRNA, centaurin, beta 2 variant, clone: CBL03533. // chr3 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// ENST00000618471 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:3:195278515:195442907:-1 gene:ENSG00000114331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015031 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:195306511:195524892:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
ENST00000384638 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:195419436:195419546:-1 gene:ENSG00000207368 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT094154 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000516811 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:195523087:195523221:-1 gene:ENSG00000252620 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK124014 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ42020 fis, clone SPLEN2034252, weakly similar to Homo sapiens hypoxia-inducible protein 2. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT094158 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NONHSAT094267 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000459191 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:195928589:195928775:-1 gene:ENSG00000239122 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT094268 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001128148 // RefSeq // Homo sapiens transferrin receptor (TFRC), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// NM_003234 // RefSeq // Homo sapiens transferrin receptor (TFRC), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000360110 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:196049284:196082189:-1 gene:ENSG00000072274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// ENST00000392396 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:196049476:196082090:-1 gene:ENSG00000072274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000420415 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:196049284:196082094:-1 gene:ENSG00000072274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 96 // 22 // 23 // 0 /// AK291723 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75881 complete cds, highly similar to Homo sapiens transferrin receptor (p90, CD71) (TFRC), mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// AK294758 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57106 complete cds, highly similar to Transferrin receptor protein 1. // chr3 // 89 // 75 // 16 // 18 // 0 /// BC001188 // GenBank // Homo sapiens transferrin receptor (p90, CD71), mRNA (cDNA clone MGC:3151 IMAGE:3354176), complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// M11507 // GenBank // Human transferrin receptor mRNA, complete cds. // chr3 // 95 // 92 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000015036 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:196051942:196211315:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 71 // 71 // 17 // 24 // 1
NM_152773 // RefSeq // Homo sapiens Tctex1 domain containing 2 (TCTEX1D2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000325318 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:196291219:196318288:-1 gene:ENSG00000213123 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000426563 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:196291219:196318214:-1 gene:ENSG00000213123 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000446494 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:196291221:196318299:-1 gene:ENSG00000213123 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC021177 // GenBank // Homo sapiens Tctex1 domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:33212 IMAGE:4830500), complete cds. // chr3 // 94 // 95 // 17 // 18 // 0 /// NONHSAT094324 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 100 // 53 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000431391 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:196248230:196318222:-1 gene:ENSG00000272741 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 63 // 63 // 12 // 19 // 1
ENST00000390844 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:196341609:196341715:-1 gene:ENSG00000212146 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT094329 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_015562 // RefSeq // Homo sapiens UBX domain protein 7 (UBXN7), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000296328 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:196347662:196432474:-1 gene:ENSG00000163960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000429160 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:196354877:196432427:-1 gene:ENSG00000163960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// AK303630 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61199 complete cds, highly similar to UBX domain-containing protein 7. // chr3 // 88 // 78 // 22 // 25 // 0 /// ENST00000428095 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:196356618:196432430:-1 gene:ENSG00000163960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1 /// GENSCAN00000010868 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:196356685:196432540:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0
ENST00000383917 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:196393710:196393812:-1 gene:ENSG00000206644 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT094330 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000495872 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:196397508:196397778:-1 gene:ENSG00000241868 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT094331 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_152617 // RefSeq // Homo sapiens ring finger protein 168, E3 ubiquitin protein ligase (RNF168), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000318037 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:196468783:196503768:-1 gene:ENSG00000163961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000437070 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:196471760:196503677:-1 gene:ENSG00000163961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// BC033791 // GenBank // Homo sapiens ring finger protein 168, mRNA (cDNA clone MGC:45398 IMAGE:5163887), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000010875 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:196471659:196561523:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 68 // 68 // 23 // 34 // 1
NM_001077657 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 43 (C3orf43), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000397537 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:196506877:196515366:-1 gene:ENSG00000214097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000452776 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:196506879:196515346:-1 gene:ENSG00000214097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// AK291522 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77313 complete cds. // chr3 // 94 // 94 // 16 // 17 // 0 /// AL833443 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp313J1442 (from clone DKFZp313J1442). // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC118556 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 43, mRNA (cDNA clone MGC:141735 IMAGE:40023903), complete cds. // chr3 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0 /// BC118636 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 43, mRNA (cDNA clone MGC:141734 IMAGE:40023902), complete cds. // chr3 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000010875 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:196471659:196561523:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 50 // 50 // 9 // 18 // 1
NM_182627 // RefSeq // Homo sapiens WD repeat domain 53 (WDR53), mRNA. // chr3 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// ENST00000332629 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:196554177:196568639:-1 gene:ENSG00000185798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// ENST00000425888 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:196561014:196568522:-1 gene:ENSG00000185798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 83 // 50 // 10 // 12 // 0 /// ENST00000429115 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:196554188:196568581:-1 gene:ENSG00000185798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// BC054030 // GenBank // Homo sapiens WD repeat domain 53, mRNA (cDNA clone MGC:64882 IMAGE:6145598), complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// EF011620 // GenBank // Homo sapiens CDW10/WDR53 mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// ENST00000433160 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:196554194:196568674:-1 gene:ENSG00000185798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1 /// BC007768 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA similar to RIKEN cDNA 1500002B03 gene (cDNA clone IMAGE:4298414). // chr3 // 94 // 75 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000010875 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:196471659:196561523:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1
NM_032898 // RefSeq // Homo sapiens centrosomal protein 19kDa (CEP19), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000399942 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:196707061:196712248:-1 gene:ENSG00000174007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000409690 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:196706277:196712293:-1 gene:ENSG00000174007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY099509 // GenBank // Homo sapiens HSD5 mRNA, complete cds. // chr3 // 92 // 86 // 22 // 24 // 0 /// BC007827 // GenBank // Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 34, mRNA (cDNA clone MGC:14126 IMAGE:3533603), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000010872 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:196707551:196708669:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 39 // 11 // 11 // 0
ENST00000364571 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:3:196708859:196708964:-1 gene:ENSG00000201441 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT094358 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENST00000607443 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:3:196747192:196747324:-1 gene:ENSG00000272359 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0
NM_025163 // RefSeq // Homo sapiens phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class Z (PIGZ), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000412723 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:196946343:196968833:-1 gene:ENSG00000119227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000413127 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:196946737:196951930:-1 gene:ENSG00000119227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// AK296867 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53840 complete cds, highly similar to GPI mannosyltransferase 4 (EC 2.4.1.-). // chr3 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// BC044640 // GenBank // Homo sapiens phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class Z, mRNA (cDNA clone MGC:52163 IMAGE:4871581), complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000443835 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:196948097:196968871:-1 gene:ENSG00000119227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// ENST00000238138 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:196951538:196969060:-1 gene:ENSG00000119227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// GENSCAN00000010871 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:196947157:196951938:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT094372 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_001145642 // RefSeq // Homo sapiens KIAA0226 (KIAA0226), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// NM_014687 // RefSeq // Homo sapiens KIAA0226 (KIAA0226), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000273582 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:3:197671393:197749699:-1 gene:ENSG00000145016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000296343 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:3:197675018:197736719:-1 gene:ENSG00000145016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000413360 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:3:197674020:197718130:-1 gene:ENSG00000145016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000415452 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:197676217:197701710:-1 gene:ENSG00000145016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000449205 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:3:197700460:197736908:-1 gene:ENSG00000145016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// BC014173 // GenBank // Homo sapiens KIAA0226, mRNA (cDNA clone IMAGE:4562995), partial cds. // chr3 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// BC033615 // GenBank // Homo sapiens KIAA0226, mRNA (cDNA clone IMAGE:5217239), complete cds. // chr3 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// BX647598 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp313O2236 (from clone DKFZp313O2236). // chr3 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// GENSCAN00000008277 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:197675018:197736698:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0
ENST00000452862 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:197850400:197850954:-1 gene:ENSG00000234742 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000008276 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:3:197850400:197850954:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0
NR_003291 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat domain 18D, pseudogene (ANKRD18DP), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000335478 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:198058053:198080720:-1 gene:ENSG00000226435 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000435620 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:198057531:198080671:-1 gene:ENSG00000226435 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000455355 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:198053522:198080512:-1 gene:ENSG00000226435 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr3 // 100 // 74 // 17 // 17 // 0 /// BC053879 // GenBank // Homo sapiens hypothetical LOC348840, mRNA (cDNA clone IMAGE:5755091). // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AK125940 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ43952 fis, clone TESTI4015471. // chr3 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1
NR_027481 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 876, pseudogene (ZNF876P), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000356347 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:212610:255985:1 gene:ENSG00000198155 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000398732 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:218650:254841:1 gene:ENSG00000198155 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr4 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// TCONS_l2_00020332-XLOC_l2_010519 // Broad TUCP // linc-ZNF141 chr4:+:235982-249448 // chr4 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0
ENST00000391156 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:1118884:1119013:1 gene:ENSG00000212458 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT094666 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_175918 // RefSeq // Homo sapiens cysteine-rich PAK1 inhibitor (CRIPAK), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000324803 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:1391552:1395989:1 gene:ENSG00000179979 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NR_003004 // RefSeq // Homo sapiens small Cajal body-specific RNA 22 (SCARNA22), guide RNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000503991 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:1974636:1974760:1 gene:ENSG00000249784 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT094754 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_178557 // RefSeq // Homo sapiens N-acetyltransferase 8-like (GCN5-related, putative) (NAT8L), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006710156 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens N-acetyltransferase 8-like (GCN5-related, putative) (NAT8L), mRNA. // chr4 // 95 // 88 // 20 // 21 // 0 /// ENST00000331662 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:2059812:2069089:1 gene:ENSG00000185818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000423729 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:2059512:2069088:1 gene:ENSG00000185818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC093906 // GenBank // Homo sapiens N-acetyltransferase 8-like (GCN5-related, putative), mRNA (cDNA clone MGC:120941 IMAGE:7939751), complete cds. // chr4 // 92 // 50 // 11 // 12 // 0 /// BC093908 // GenBank // Homo sapiens N-acetyltransferase 8-like (GCN5-related, putative), mRNA (cDNA clone MGC:120943 IMAGE:7939753), complete cds. // chr4 // 92 // 50 // 11 // 12 // 0 /// BC103748 // GenBank // Homo sapiens N-acetyltransferase 8-like (GCN5-related, putative), mRNA (cDNA clone MGC:117272 IMAGE:6195512), complete cds. // chr4 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000013002 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:2059533:2064127:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 75 // 75 // 18 // 24 // 1
ENST00000362465 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:3044101:3044207:1 gene:ENSG00000199335 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT094840 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0
NM_002111 // RefSeq // Homo sapiens huntingtin (HTT), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 98 // 98 // 0 /// ENST00000355072 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:3074681:3243959:1 gene:ENSG00000197386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 99 // 97 // 97 // 0 /// ENST00000510626 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:3128339:3243940:1 gene:ENSG00000197386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 82 // 80 // 80 // 0 /// AB016794 // GenBank // Homo sapiens mRNA for huntingtin, complete cds. // chr4 // 98 // 99 // 95 // 97 // 0 /// AB209506 // GenBank // Homo sapiens mRNA for huntingtin variant protein. // chr4 // 97 // 72 // 69 // 71 // 0 /// AK290544 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76709 complete cds, highly similar to Homo sapiens Huntington disease-associated protein (HD) mRNA. // chr4 // 100 // 14 // 14 // 14 // 0 /// L12392 // GenBank // Homo sapiens Huntingtons Disease (HD) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 91 // 89 // 89 // 0 /// L20431 // GenBank // Homo sapiens Huntington disease-associated protein (HD) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 22 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000010224 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:2988727:3255965:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 82 // 80 // 80 // 0
NM_001042690 // RefSeq // Homo sapiens Myb/SANT-like DNA-binding domain containing 1 (MSANTD1), mRNA. // chr4 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// XM_006713883 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens Myb/SANT-like DNA-binding domain containing 1 (MSANTD1), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 65 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000438480 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:3247476:3256303:1 gene:ENSG00000188981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000507492 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:3244369:3256613:1 gene:ENSG00000188981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 65 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000505599 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:3249040:3271738:1 gene:ENSG00000188981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 70 // 70 // 14 // 20 // 1 /// ENST00000510580 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:3249159:3262541:1 gene:ENSG00000188981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 55 // 55 // 11 // 20 // 1 /// AK126094 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44106 fis, clone TESTI4044234. // chr4 // 65 // 65 // 13 // 20 // 1 /// BC043530 // GenBank // Homo sapiens hypothetical gene supported by BC043530, mRNA (cDNA clone IMAGE:5168535). // chr4 // 60 // 60 // 12 // 20 // 1 /// GENSCAN00000010224 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:2988727:3255965:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 50 // 50 // 10 // 20 // 1
NM_001297439 // RefSeq // Homo sapiens HGF activator (HGFAC), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NM_001528 // RefSeq // Homo sapiens HGF activator (HGFAC), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000382774 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:3441887:3449495:1 gene:ENSG00000109758 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000506132 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:3445900:3448194:1 gene:ENSG00000109758 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 89 // 26 // 8 // 9 // 0 /// ENST00000509689 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:3444349:3449435:1 gene:ENSG00000109758 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000511533 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:3441975:3449419:1 gene:ENSG00000109758 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// BC112190 // GenBank // Homo sapiens HGF activator, mRNA (cDNA clone MGC:138395 IMAGE:8327658), complete cds. // chr4 // 94 // 100 // 32 // 34 // 0 /// BC112192 // GenBank // Homo sapiens HGF activator, mRNA (cDNA clone MGC:138397 IMAGE:8327660), complete cds. // chr4 // 94 // 100 // 32 // 34 // 0 /// D14012 // GenBank // Homo sapiens mRNA for HGF activator precursor, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000010221 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:3411811:3449419:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0
NM_000683 // RefSeq // Homo sapiens adrenoceptor alpha 2C (ADRA2C), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000330055 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:3766398:3768526:1 gene:ENSG00000184160 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC142625 // GenBank // Homo sapiens adrenergic, alpha-2C-, receptor, mRNA (cDNA clone MGC:164798 IMAGE:40147492), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// J03853 // GenBank // Human kidney alpha-2-adrenergic receptor mRNA, complete cds. // chr4 // 63 // 84 // 17 // 27 // 0 /// ENST00000509482 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:4:3766348:3768491:1 gene:ENSG00000184160 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 72 // 72 // 23 // 32 // 1 /// GENSCAN00000010226 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:3765546:3833803:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1
NM_145291 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger and BTB domain containing 49 (ZBTB49), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000337872 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:4290251:4321786:1 gene:ENSG00000168826 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000502918 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:4290269:4302274:1 gene:ENSG00000168826 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 80 // 33 // 8 // 10 // 0 /// ENST00000503703 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:4290251:4321786:1 gene:ENSG00000168826 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000515012 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:4290251:4321398:1 gene:ENSG00000168826 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// AK292551 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77782 complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC016477 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 509, mRNA (cDNA clone IMAGE:3862213), complete cds. // chr4 // 92 // 87 // 24 // 26 // 0 /// BC109087 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 509, mRNA (cDNA clone MGC:126279 IMAGE:40034514), complete cds. // chr4 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// BC109088 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 509, mRNA (cDNA clone IMAGE:40034515), complete cds. // chr4 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000020438 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:4299946:4321316:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0
NM_002448 // RefSeq // Homo sapiens msh homeobox 1 (MSX1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000382723 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:4859666:4863936:1 gene:ENSG00000163132 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK290636 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75656 complete cds, highly similar to Homo sapiens msh homeo box homolog 1 (Drosophila) (MSX1), mRNA. // chr4 // 82 // 85 // 18 // 22 // 0 /// BC021285 // GenBank // Homo sapiens msh homeobox 1, mRNA (cDNA clone MGC:29576 IMAGE:5018103), complete cds. // chr4 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC067353 // GenBank // Homo sapiens msh homeobox 1, mRNA (cDNA clone MGC:78580 IMAGE:4893288), complete cds. // chr4 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// M97676 // GenBank // Homo sapiens (region 7) homeobox protein (HOX7) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000020430 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:4859918:4863143:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0
NM_005750 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 6 (C4orf6), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000195455 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:5525156:5527801:1 gene:ENSG00000082929 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000504943 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:5527152:5527801:1 gene:ENSG00000082929 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000505296 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:4:5525390:5527800:1 gene:ENSG00000082929 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000515342 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:5524569:5527595:1 gene:ENSG00000082929 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 88 // 65 // 15 // 17 // 0 /// BC117444 // GenBank // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 6, mRNA (cDNA clone MGC:151053 IMAGE:40125995), complete cds. // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC117446 // GenBank // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 6, mRNA (cDNA clone MGC:151055 IMAGE:40125997), complete cds. // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// D82070 // GenBank // Homo sapiens aC1 mRNA, complete cds. // chr4 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// NONHSAT094967 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0
NM_153717 // RefSeq // Homo sapiens Ellis van Creveld syndrome (EVC), mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// XM_006713867 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens Ellis van Creveld syndrome (EVC), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 100 // 55 // 17 // 17 // 0 /// XR_427477 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens Ellis van Creveld syndrome (EVC), transcript variant X11, misc_RNA. // chr4 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000264956 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:5711197:5814305:1 gene:ENSG00000072840 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000509451 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:4:5711215:5758311:1 gene:ENSG00000072840 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 42 // 13 // 13 // 0 /// AF216184 // GenBank // Homo sapiens tissue-type heart Ellis-van Creveld syndrome protein (EVC) mRNA, complete cds. // chr4 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// AF216185 // GenBank // Homo sapiens tissue-type brain Ellis-van Creveld syndrome protein (EVC) mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0 /// AF239742 // GenBank // Homo sapiens DWF-1 mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 74 // 22 // 23 // 0 /// BC085608 // GenBank // Homo sapiens Ellis van Creveld syndrome, mRNA (cDNA clone MGC:105107 IMAGE:30523373), complete cds. // chr4 // 85 // 42 // 11 // 13 // 0 /// GENSCAN00000013906 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:5711381:5820358:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0
NM_005980 // RefSeq // Homo sapiens S100 calcium binding protein P (S100P), mRNA. // chr4 // 86 // 79 // 19 // 22 // 0 /// ENST00000296370 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:6693069:6697169:1 gene:ENSG00000163993 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000513778 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:6693878:6697170:1 gene:ENSG00000163993 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 86 // 50 // 12 // 14 // 0 /// AF539739 // GenBank // Homo sapiens calcium-binding S100 protein mRNA, complete cds. // chr4 // 82 // 100 // 23 // 28 // 0 /// BC006819 // GenBank // Homo sapiens S100 calcium binding protein P, mRNA (cDNA clone MGC:5028 IMAGE:3448490), complete cds. // chr4 // 82 // 79 // 18 // 22 // 0 /// BT007289 // GenBank // Homo sapiens S100 calcium binding protein P mRNA, complete cds. // chr4 // 75 // 43 // 9 // 12 // 0 /// AY423724 // GenBank // Homo sapiens migration-inducing gene 9 protein mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr4 // 71 // 50 // 10 // 14 // 0 /// GENSCAN00000048673 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:6693933:6697042:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT095018 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 86 // 50 // 12 // 14 // 0
NM_018366 // RefSeq // Homo sapiens biogenesis of lysosomal organelles complex-1, subunit 4, cappuccino (BLOC1S4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000320776 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:6716055:6717671:1 gene:ENSG00000186222 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC009890 // GenBank HTC // Homo sapiens cappuccino homolog (mouse), mRNA (cDNA clone IMAGE:4053085), with apparent retained intron. // chr4 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// BC067815 // GenBank // Homo sapiens cappuccino homolog (mouse), mRNA (cDNA clone MGC:87313 IMAGE:30349339), complete cds. // chr4 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000048677 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:6716210:6716863:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0
NM_001100590 // RefSeq // Homo sapiens KIAA0232 (KIAA0232), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// NM_014743 // RefSeq // Homo sapiens KIAA0232 (KIAA0232), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000307659 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:6782740:6884164:1 gene:ENSG00000170871 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000425103 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:6782732:6884170:1 gene:ENSG00000170871 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000508423 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:6782642:6824684:1 gene:ENSG00000170871 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 20 // 8 // 8 // 0 /// BC150286 // GenBank // Homo sapiens KIAA0232, mRNA (cDNA clone MGC:166909 IMAGE:8860111), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000048669 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:6815227:6864222:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 30 // 12 // 12 // 0
AF130051 // GenBank HTC // Homo sapiens clone FLB3535 PRO0898 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000365522 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:6997012:6997328:1 gene:ENSG00000202392 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT095032 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_152293 // RefSeq // Homo sapiens transcriptional adaptor 2B (TADA2B), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000310074 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:7043391:7057952:1 gene:ENSG00000173011 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000512388 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:7043535:7055314:1 gene:ENSG00000173011 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000515646 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:7052824:7056641:1 gene:ENSG00000173011 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AK096655 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39336 fis, clone OCBBF2017815. // chr4 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// AK126966 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ45019 fis, clone BRAWH3015825. // chr4 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// BC101334 // GenBank // Homo sapiens transcriptional adaptor 2 (ADA2 homolog, yeast)-beta, mRNA (cDNA clone MGC:120461 IMAGE:40025078), complete cds. // chr4 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// BC101335 // GenBank // Homo sapiens transcriptional adaptor 2 (ADA2 homolog, yeast)-beta, mRNA (cDNA clone MGC:120462 IMAGE:40025081), complete cds. // chr4 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// BC101336 // GenBank // Homo sapiens transcriptional adaptor 2 (ADA2 homolog, yeast)-beta, mRNA (cDNA clone MGC:120463 IMAGE:40025082), complete cds. // chr4 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000007356 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:7043325:7055054:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NM_020777 // RefSeq // Homo sapiens sortilin-related VPS10 domain containing receptor 2 (SORCS2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000329016 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:7396278:7742836:1 gene:ENSG00000184985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000507866 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:7192538:7742827:1 gene:ENSG00000184985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// AK295629 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51207 complete cds, highly similar to VPS10 domain-containing receptor SorCS2 precursor. // chr4 // 97 // 74 // 28 // 29 // 0 /// NONHSAT095053 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr4 // 100 // 31 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000007352 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:7627643:7744731:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 72 // 72 // 28 // 39 // 1
NR_026892 // RefSeq // Homo sapiens AFAP1 antisense RNA 1 (AFAP1-AS1), antisense RNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000608442 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:7754090:7778928:1 gene:ENSG00000272620 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT095059 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT095065 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XR_112616 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens uncharacterized LOC389199 (LOC389199), misc_RNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000429019 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:4:7939001:7940296:1 gene:ENSG00000228919 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC031673 // GenBank // Homo sapiens hypothetical gene supported by BC031673, mRNA (cDNA clone MGC:35057 IMAGE:5166037), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_053044 // RefSeq // Homo sapiens HtrA serine peptidase 3 (HTRA3), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000307358 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:8269765:8307111:1 gene:ENSG00000170801 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000382512 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:8269777:8296474:1 gene:ENSG00000170801 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 46 // 17 // 17 // 0 /// AY040094 // GenBank // Homo sapiens serine protease HTRA3 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// AY280665 // GenBank // Homo sapiens pregnancy-related serine protease HTRA3 mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr4 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// AY280666 // GenBank // Homo sapiens pregnancy-related serine protease HTRA3 mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr4 // 100 // 43 // 16 // 16 // 0 /// BC034390 // GenBank // Homo sapiens HtrA serine peptidase 3, mRNA (cDNA clone MGC:35339 IMAGE:5180585), complete cds. // chr4 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// BC035717 // GenBank // Homo sapiens HtrA serine peptidase 3, mRNA (cDNA clone MGC:46243 IMAGE:5588608), complete cds. // chr4 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// NM_001297559 // RefSeq // Homo sapiens HtrA serine peptidase 3 (HTRA3), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 46 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000016514 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:8269969:8321929:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 51 // 51 // 19 // 37 // 1
ENST00000365184 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:8393015:8393124:1 gene:ENSG00000202054 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT095095 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_152544 // RefSeq // Homo sapiens tRNA methyltransferase 44 homolog (S. cerevisiae) (TRMT44), mRNA. // chr4 // 100 // 72 // 31 // 31 // 0 /// XM_006713862 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens tRNA methyltransferase 44 homolog (S. cerevisiae) (TRMT44), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 63 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000389737 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:8440823:8476526:1 gene:ENSG00000155275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 72 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000511366 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:8473516:8493531:1 gene:ENSG00000155275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 19 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000513449 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:8438869:8468559:1 gene:ENSG00000155275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 72 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000532477 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:8454416:8476554:1 gene:ENSG00000155275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 56 // 24 // 24 // 0 /// AK092387 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ35068 fis, clone PLACE5000070. // chr4 // 100 // 19 // 8 // 8 // 0 /// AK093044 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ35725 fis, clone TESTI2002802. // chr4 // 100 // 56 // 24 // 24 // 0 /// BC035655 // GenBank // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 23, mRNA (cDNA clone MGC:46706 IMAGE:5588410), complete cds. // chr4 // 100 // 70 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000016507 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:8440823:8476001:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 53 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT095103 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 19 // 8 // 8 // 0
ENST00000512164 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:9483718:9484702:1 gene:ENSG00000250884 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr4 // 63 // 100 // 12 // 19 // 0
ENST00000340703 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:9692495:9702954:1 gene:ENSG00000186234 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000024095 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:9677641:9703163:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 93 // 88 // 13 // 14 // 0
ENST00000514144 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:9754898:9755778:1 gene:ENSG00000250425 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000024112 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:9735834:9755238:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_000798 // RefSeq // Homo sapiens dopamine receptor D5 (DRD5), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000304374 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:9781680:9784009:1 gene:ENSG00000169676 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC009748 // GenBank // Homo sapiens dopamine receptor D5, mRNA (cDNA clone MGC:10601 IMAGE:3928370), complete cds. // chr4 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000024109 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:9764904:9783463:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 42 // 42 // 8 // 19 // 1
ENST00000390980 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:12312588:12312690:1 gene:ENSG00000212282 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT095558 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000507090 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:13336482:13338657:1 gene:ENSG00000205940 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000602906 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:13333414:13338302:1 gene:ENSG00000205940 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// AY956763 // GenBank // Homo sapiens heat shock protein 90Bb (HSP90Bb) mRNA, complete cds. // chr4 // 83 // 100 // 24 // 29 // 0 /// GENSCAN00000036521 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:13306837:13338302:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 83 // 100 // 24 // 29 // 0
NM_001080522 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil and C2 domain containing 2A (CC2D2A), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000389652 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:15479223:15601546:1 gene:ENSG00000048342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000424120 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:15469865:15601557:1 gene:ENSG00000048342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000503292 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:15469930:15601557:1 gene:ENSG00000048342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000506643 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:15536985:15601552:1 gene:ENSG00000048342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 63 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000512702 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:15469891:15537076:1 gene:ENSG00000048342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 38 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000513811 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:15469896:15543961:1 gene:ENSG00000048342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 43 // 17 // 17 // 0 /// AK309178 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99219. // chr4 // 94 // 43 // 16 // 17 // 0 /// BC103710 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil and C2 domain containing 2A, mRNA (cDNA clone IMAGE:5785768), partial cds. // chr4 // 93 // 35 // 13 // 14 // 0 /// EU450799 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil and C2 domain-containing 2A (CC2D2A) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000047692 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:15457230:15601425:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0
AK096972 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39653 fis, clone SMINT2005387. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC010030 // GenBank // Homo sapiens hypothetical protein FLJ39653, mRNA (cDNA clone IMAGE:3503500), partial cds. // chr4 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// NR_027696 // RefSeq // Homo sapiens TAPT1 antisense RNA 1 (head to head) (TAPT1-AS1), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr4 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// NR_027697 // RefSeq // Homo sapiens TAPT1 antisense RNA 1 (head to head) (TAPT1-AS1), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr4 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// ENST00000573308 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:16226685:16256744:1 gene:ENSG00000263327 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr4 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// NONHSAT095673 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONHSAT095672 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// NONHSAT095674 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
NM_001079827 // RefSeq // Homo sapiens clarin 2 (CLRN2), mRNA. // chr4 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// ENST00000511148 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:17515165:17527104:1 gene:ENSG00000249581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// BC127863 // GenBank // Homo sapiens clarin 2, mRNA (cDNA clone MGC:157995 IMAGE:40133257), complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000004242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:17515267:17527082:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0
NONHSAT095707 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_025205 // RefSeq // Homo sapiens mediator complex subunit 28 (MED28), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000237380 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:17614631:17634105:1 gene:ENSG00000118579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AF317679 // GenBank // Homo sapiens tumor-related mRNA sequence. // chr4 // 95 // 95 // 20 // 21 // 0 /// AF317680 // GenBank // Homo sapiens tumor-related protein mRNA, complete cds. // chr4 // 95 // 91 // 19 // 20 // 0 /// AF358829 // GenBank // Homo sapiens tumor angiogenesis marker mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC011936 // GenBank // Homo sapiens mediator complex subunit 28, mRNA (cDNA clone MGC:20562 IMAGE:3936713), complete cds. // chr4 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000503945 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:17614664:17628170:1 gene:ENSG00000118579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 82 // 82 // 18 // 22 // 1 /// AF317678 // GenBank // Homo sapiens putative angiogenesis-related mRNA sequence. // chr4 // 82 // 82 // 18 // 22 // 1 /// ENST00000612711 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:17614652:17624018:1 gene:ENSG00000118579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// AF321617 // GenBank // Homo sapiens unknown mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000004246 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:17577466:17623798:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 64 // 64 // 14 // 22 // 1
NR_029631 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 218-1 (MIR218-1), microRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000384999 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:20528275:20528384:1 gene:ENSG00000207732 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-218-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0000294 Homo sapiens miR-218-1 stem-loop // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT095732 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000458780 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:22118983:22119089:1 gene:ENSG00000239001 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT095751 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONHSAT095755 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000480875 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:22594196:22594450:1 gene:ENSG00000244538 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONHSAT095763 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_003102 // RefSeq // Homo sapiens superoxide dismutase 3, extracellular (SOD3), mRNA. // chr4 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// ENST00000382120 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:24795463:24800842:1 gene:ENSG00000109610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC014418 // GenBank // Homo sapiens superoxide dismutase 3, extracellular, mRNA (cDNA clone MGC:20077 IMAGE:4644224), complete cds. // chr4 // 91 // 82 // 21 // 23 // 0 /// CR541853 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834H0432D for gene SOD3, superoxide dismutase 3, extracellular; complete cds, incl. stopcodon. // chr4 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// J02947 // GenBank // Human extracellular-superoxide dismutase (SOD3) mRNA, complete cds. // chr4 // 91 // 82 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000035163 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:24790629:24800244:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0
NM_018323 // RefSeq // Homo sapiens phosphatidylinositol 4-kinase type 2 beta (PI4K2B), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000264864 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:25233975:25279092:1 gene:ENSG00000038210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000512921 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:25160663:25277306:1 gene:ENSG00000038210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// AF411320 // GenBank // Homo sapiens type II phosphatidylinositol 4-kinase beta isoform mRNA, complete cds. // chr4 // 92 // 75 // 22 // 24 // 0 /// AK296302 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58191 complete cds, highly similar to Homo sapiens phosphatidylinositol 4-kinase type 2 beta (PI4K2B), mRNA. // chr4 // 90 // 63 // 18 // 20 // 0 /// AY065990 // GenBank // Homo sapiens phosphatidylinositol 4-kinase type-II beta mRNA, complete cds. // chr4 // 94 // 97 // 29 // 31 // 0 /// AY091514 // GenBank // Homo sapiens phosphatidylinositol 4-kinase type-II beta mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC051749 // GenBank // Homo sapiens phosphatidylinositol 4-kinase type 2 beta, mRNA (cDNA clone MGC:51774 IMAGE:6050442), complete cds. // chr4 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// GENSCAN00000000163 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:25182242:25277187:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0
ENST00000506450 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:25622777:25623601:1 gene:ENSG00000228154 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000000174 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:25504997:25676749:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENST00000364129 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:26702309:26702388:1 gene:ENSG00000200999 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT095881 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000496350 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:28711198:28711476:1 gene:ENSG00000243548 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT095914 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENST00000516494 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:29510635:29510737:1 gene:ENSG00000252303 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT095927 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001173523 // RefSeq // Homo sapiens protocadherin 7 (PCDH7), transcript variant d, mRNA. // chr4 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// NM_002589 // RefSeq // Homo sapiens protocadherin 7 (PCDH7), transcript variant a, mRNA. // chr4 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// NM_032456 // RefSeq // Homo sapiens protocadherin 7 (PCDH7), transcript variant b, mRNA. // chr4 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// NM_032457 // RefSeq // Homo sapiens protocadherin 7 (PCDH7), transcript variant c, mRNA. // chr4 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000361762 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:30720415:30732973:1 gene:ENSG00000169851 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000543491 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:30720853:30725309:1 gene:ENSG00000169851 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0 /// AB006755 // GenBank // Homo sapiens mRNA for PCDH7 (BH-Pcdh)a, complete cds. // chr4 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// AB006756 // GenBank // Homo sapiens mRNA for PCDH7 (BH-Pcdh)b, complete cds. // chr4 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0 /// AB006757 // GenBank // Homo sapiens mRNA for PCDH7 (BH-Pcdh)c, complete cds. // chr4 // 94 // 53 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000024656 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:30721432:30737722:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 34 // 11 // 11 // 0
ENST00000383938 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:35495898:35496003:1 gene:ENSG00000206665 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT095992 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001136536 // RefSeq // Homo sapiens death domain containing 1 (DTHD1), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 91 // 100 // 21 // 23 // 0 /// NM_001170700 // RefSeq // Homo sapiens death domain containing 1 (DTHD1), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000357504 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:36281622:36344785:1 gene:ENSG00000197057 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 91 // 100 // 21 // 23 // 0 /// ENST00000456874 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:36284022:36344785:1 gene:ENSG00000197057 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000507598 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:4:36283862:36343866:1 gene:ENSG00000197057 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// AK304357 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52089 complete cds. // chr4 // 83 // 100 // 19 // 23 // 0 /// AK316523 // GenBank // Homo sapiens cDNA, FLJ79422 complete cds. // chr4 // 83 // 100 // 19 // 23 // 0 /// BC157885 // GenBank // Homo sapiens FLJ16686 protein, mRNA (cDNA clone MGC:189772 IMAGE:9057096), complete cds. // chr4 // 83 // 78 // 15 // 18 // 0 /// GENSCAN00000013896 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:36284080:36310964:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 57 // 57 // 13 // 23 // 1
NM_001144990 // RefSeq // Homo sapiens NACHT and WD repeat domain containing 2 (NWD2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 59 // 59 // 0 /// ENST00000309447 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:37244220:37449465:1 gene:ENSG00000174145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 59 // 59 // 0 /// GENSCAN00000030895 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:37258893:37591000:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 78 // 78 // 46 // 59 // 1
NM_001104629 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 19 (C4orf19), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NM_018302 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 19 (C4orf19), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000284437 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:37584233:37591826:1 gene:ENSG00000154274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000381980 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:37453941:37591826:1 gene:ENSG00000154274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC037906 // GenBank // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 19, mRNA (cDNA clone MGC:43960 IMAGE:5276648), complete cds. // chr4 // 88 // 89 // 21 // 24 // 0 /// GENSCAN00000030895 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:37258893:37591000:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1
NM_006607 // RefSeq // Homo sapiens pituitary tumor-transforming 2 (PTTG2), mRNA. // chr4 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000504686 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:37960435:37961125:1 gene:ENSG00000250254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// AF095288 // GenBank // Homo sapiens pituitary tumor transforming gene protein 2 (PTTG2) mRNA, complete cds. // chr4 // 75 // 80 // 9 // 12 // 0 /// BC069114 // GenBank // Homo sapiens pituitary tumor-transforming 2, mRNA (cDNA clone MGC:95393 IMAGE:7216932), complete cds. // chr4 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// BC069400 // GenBank // Homo sapiens pituitary tumor-transforming 2, mRNA (cDNA clone MGC:96925 IMAGE:7262134), complete cds. // chr4 // 75 // 80 // 9 // 12 // 0 /// GENSCAN00000035846 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:37960435:37961010:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0
NM_016531 // RefSeq // Homo sapiens Kruppel-like factor 3 (basic) (KLF3), mRNA. // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006714015 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens Kruppel-like factor 3 (basic) (KLF3), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000261438 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:38664196:38701042:1 gene:ENSG00000109787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000514033 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:38664197:38690751:1 gene:ENSG00000109787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// AF285837 // GenBank // Homo sapiens transcription factor BKLF (D4585) mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// BC030662 // GenBank // Homo sapiens Kruppel-like factor 3 (basic), mRNA (cDNA clone MGC:33736 IMAGE:5262512), complete cds. // chr4 // 92 // 89 // 22 // 24 // 0 /// BC051687 // GenBank // Homo sapiens Kruppel-like factor 3 (basic), mRNA (cDNA clone MGC:48279 IMAGE:5303520), complete cds. // chr4 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// AB024523 // GenBank // Homo sapiens hBKLF mRNA for basic kruppel like factor, complete cds. // chr4 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// GENSCAN00000035841 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:38678724:38697263:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
ENST00000410660 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:39399149:39399248:1 gene:ENSG00000222592 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT096077 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_175737 // RefSeq // Homo sapiens klotho beta (KLB), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000257408 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:39406853:39451536:1 gene:ENSG00000134962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AB079373 // GenBank // Homo sapiens mRNA for klotho beta like protein, complete cds. // chr4 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AK302436 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50094 complete cds, highly similar to Beta klotho. // chr4 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// BC104871 // GenBank // Homo sapiens klotho beta, mRNA (cDNA clone MGC:132531 IMAGE:8143874), complete cds. // chr4 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC113653 // GenBank // Homo sapiens klotho beta, mRNA (cDNA clone MGC:142213 IMAGE:8322705), complete cds. // chr4 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC143575 // GenBank // Homo sapiens klotho beta, mRNA (cDNA clone MGC:177103 IMAGE:9052086), complete cds. // chr4 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000033308 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:39375463:39448686:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
ENST00000459360 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:39441665:39441764:1 gene:ENSG00000238797 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT096079 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NR_026854 // RefSeq // Homo sapiens WD repeat domain 5 pseudogene (LOC401127), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000507033 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:39480485:39481466:1 gene:ENSG00000224097 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr4 // 100 // 70 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000513652 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:39480255:39481905:1 gene:ENSG00000224097 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000597991 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:39480357:39481765:1 gene:ENSG00000224097 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT096085 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT096086 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT096087 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 70 // 14 // 14 // 0 /// TCONS_l2_00021578-XLOC_l2_010646 // Broad TUCP // linc-UBE2K chr4:+:39481874-39483521 // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// TCONS_l2_00021579-XLOC_l2_010646 // Broad TUCP // linc-UBE2K chr4:+:39481984-39483385 // chr4 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000033312 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:39459118:39481466:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 70 // 70 // 14 // 20 // 1
ENST00000497468 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:39761000:39761298:1 gene:ENSG00000243260 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT096107 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_018177 // RefSeq // Homo sapiens NEDD4 binding protein 2 (N4BP2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000261435 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:40056826:40158252:1 gene:ENSG00000078177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000511480 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:40056913:40158251:1 gene:ENSG00000078177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000513269 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:40102907:40155397:1 gene:ENSG00000078177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// AB371584 // GenBank // Homo sapiens N4BP2 mRNA for Nedd4 binding protein 2, splicing variant, complete cds, clone: HP07459-ARiS023B20. // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AY267013 // GenBank // Homo sapiens BCL-3 binding protein (B3BP) mRNA, complete cds. // chr4 // 94 // 97 // 31 // 33 // 0 /// BC126466 // GenBank // Homo sapiens NEDD4 binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:161744 IMAGE:8992182), complete cds. // chr4 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000048484 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:40039141:40189554:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0
ENST00000363585 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:40077884:40077982:1 gene:ENSG00000200455 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT096117 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000364993 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:40082983:40083106:1 gene:ENSG00000201863 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_017581 // RefSeq // Homo sapiens cholinergic receptor, nicotinic, alpha 9 (neuronal) (CHRNA9), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000310169 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:40335329:40355217:1 gene:ENSG00000174343 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC113549 // GenBank // Homo sapiens cholinergic receptor, nicotinic, alpha 9, mRNA (cDNA clone MGC:142109 IMAGE:8322601), complete cds. // chr4 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// BC113575 // GenBank // Homo sapiens cholinergic receptor, nicotinic, alpha 9, mRNA (cDNA clone MGC:142135 IMAGE:8322627), complete cds. // chr4 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000048480 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:40335468:40354520:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
ENST00000364866 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:40990154:40990273:1 gene:ENSG00000201736 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT096150 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000362920 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:41084607:41084713:1 gene:ENSG00000199790 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT096155 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
ENST00000384469 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:41113942:41114045:1 gene:ENSG00000207198 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT096156 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001029955 // RefSeq // Homo sapiens DDB1 and CUL4 associated factor 4-like 1 (DCAF4L1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000333141 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:41981696:41986467:1 gene:ENSG00000182308 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC035027 // GenBank // Homo sapiens WD repeat domain 21B, mRNA (cDNA clone MGC:33663 IMAGE:4828469), complete cds. // chr4 // 87 // 63 // 13 // 15 // 0 /// BC052943 // GenBank // Homo sapiens WD repeat domain 21B, mRNA (cDNA clone MGC:51312 IMAGE:5268527), complete cds. // chr4 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 /// BC104224 // GenBank // Homo sapiens WD repeat domain 21B, mRNA (cDNA clone MGC:126021 IMAGE:40032133), complete cds. // chr4 // 94 // 71 // 16 // 17 // 0 /// BC104225 // GenBank // Homo sapiens WD repeat domain 21B, mRNA (cDNA clone MGC:126022 IMAGE:40032134), complete cds. // chr4 // 94 // 71 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000011538 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:41981793:41982983:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0
NM_006345 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 30 (zinc transporter), member 9 (SLC30A9), mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000264451 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:41990472:42090457:1 gene:ENSG00000014824 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000513699 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:41990502:42086369:1 gene:ENSG00000014824 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// AF006621 // GenBank // Homo sapiens embryonic lung protein (HUEL) mRNA, complete cds. // chr4 // 91 // 96 // 21 // 23 // 0 /// AK299917 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50854 complete cds, highly similar to Homo sapiens solute carrier family 30 (zinc transporter), member 9 (SLC30A9), mRNA. // chr4 // 91 // 92 // 20 // 22 // 0 /// AY319413 // GenBank // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 1 (C4orf1) mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr4 // 91 // 92 // 20 // 22 // 0 /// AY594282 // GenBank // Homo sapiens HUEL (SLC30A9) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// BC007732 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 30 (zinc transporter), member 9, mRNA (cDNA clone MGC:12570 IMAGE:4109702), complete cds. // chr4 // 91 // 96 // 21 // 23 // 0 /// BC016949 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 30 (zinc transporter), member 9, mRNA (cDNA clone MGC:21480 IMAGE:3850521), complete cds. // chr4 // 91 // 96 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000011519 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:41987757:42029643:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1
NM_001080505 // RefSeq // Homo sapiens shisa family member 3 (SHISA3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000319234 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:42397839:42402487:1 gene:ENSG00000178343 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC127690 // GenBank // Homo sapiens shisa homolog 3 (Xenopus laevis), mRNA (cDNA clone MGC:157779 IMAGE:40127704), complete cds. // chr4 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// BC127691 // GenBank // Homo sapiens shisa homolog 3 (Xenopus laevis), mRNA (cDNA clone MGC:157780 IMAGE:40127705), complete cds. // chr4 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000011530 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:42398057:42401451:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 93 // 70 // 13 // 14 // 0
ENST00000491708 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:43863274:43863549:1 gene:ENSG00000239679 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT096214 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
ENST00000513465 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:43898962:43899351:1 gene:ENSG00000124399 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000014322 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:43898218:43899351:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT096215 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_021927 // RefSeq // Homo sapiens GUF1 GTPase homolog (S. cerevisiae) (GUF1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// XM_005248122 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens GUF1 GTPase homolog (S. cerevisiae) (GUF1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000281543 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:44678429:44700926:1 gene:ENSG00000151806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000511493 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:44694409:44700679:1 gene:ENSG00000151806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 18 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000513775 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:44678494:44689409:1 gene:ENSG00000151806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 57 // 25 // 25 // 0 /// AK308667 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ98708. // chr4 // 92 // 57 // 23 // 25 // 0 /// BC036768 // GenBank // Homo sapiens GUF1 GTPase homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:46045 IMAGE:5744283), complete cds. // chr4 // 100 // 89 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000506793 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:44678427:44700759:1 gene:ENSG00000151806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 86 // 86 // 38 // 44 // 1 /// CR749539 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686E09246 (from clone DKFZp686E09246). // chr4 // 18 // 18 // 8 // 44 // 1 /// GENSCAN00000014330 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:44678623:44700847:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 68 // 30 // 30 // 0 /// BX647242 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686M0649 (from clone DKFZp686M0649). // chr4 // 92 // 86 // 35 // 38 // 0 /// NONHSAT096229 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 18 // 8 // 8 // 0
ENST00000363850 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:45480030:45480136:1 gene:ENSG00000200720 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT096236 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
ENST00000410325 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:45995119:45995423:1 gene:ENSG00000222257 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// NONHSAT096240 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0
NM_000812 // RefSeq // Homo sapiens gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, beta 1 (GABRB1), mRNA. // chr4 // 97 // 97 // 29 // 30 // 1 /// ENST00000295454 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:47031360:47426444:1 gene:ENSG00000163288 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 1 /// BC022449 // GenBank // Homo sapiens gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, beta 1, mRNA (cDNA clone MGC:25991 IMAGE:4797401), complete cds. // chr4 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// AK293691 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57719 complete cds, highly similar to Gamma-aminobutyric-acid receptor beta-1 subunit precursor. // chr4 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// ENST00000509366 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:47031551:47043345:1 gene:ENSG00000163288 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// ENST00000510909 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:47031633:47403385:1 gene:ENSG00000163288 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1 /// AK127001 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ45056 fis, clone BRAWH3023156. // chr4 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// AK296023 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60591 complete cds, moderately similar to Gamma-aminobutyric-acid receptor beta-1 subunit precursor. // chr4 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// AK307120 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ97068. // chr4 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// GENSCAN00000003579 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:47259296:47427370:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1
NM_020453 // RefSeq // Homo sapiens ATPase, class V, type 10D (ATP10D), mRNA. // chr4 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// XM_006714024 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ATPase, class V, type 10D (ATP10D), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000273859 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:47485288:47593486:1 gene:ENSG00000145246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000503288 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:47536480:47592891:1 gene:ENSG00000145246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 65 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000504445 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:4:47485299:47547564:1 gene:ENSG00000145246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 38 // 15 // 15 // 0 /// BC057839 // GenBank // Homo sapiens ATPase, class V, type 10D, mRNA (cDNA clone IMAGE:30349338), complete cds. // chr4 // 100 // 38 // 15 // 15 // 0 /// BC131535 // GenBank // Homo sapiens ATPase, class V, type 10D, mRNA (cDNA clone MGC:141846 IMAGE:40082621), complete cds. // chr4 // 94 // 90 // 34 // 36 // 0 /// GENSCAN00000003590 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:47507769:47591381:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0
AF547222 // GenBank // Homo sapiens putative anti-CNG alpha 1 cation channel translation product mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_207330 // RefSeq // Homo sapiens NIPA-like domain containing 1 (NIPAL1), mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000295461 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:48016774:48040173:1 gene:ENSG00000163293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000508180 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:48016772:48035613:1 gene:ENSG00000163293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 94 // 71 // 16 // 17 // 0 /// ENST00000511852 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:48016810:48035884:1 gene:ENSG00000163293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// AK095299 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ37980 fis, clone CTONG2010508, highly similar to NIPA-like protein 1. // chr4 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// BC067881 // GenBank // Homo sapiens NIPA-like domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:87584 IMAGE:30345943), complete cds. // chr4 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000011108 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:48022622:48036172:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0
ENST00000365144 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:48153434:48153535:1 gene:ENSG00000202014 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT096280 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_020846 // RefSeq // Homo sapiens SLAIN motif family, member 2 (SLAIN2), mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000264313 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:48341322:48426212:1 gene:ENSG00000109171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000512093 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:48377901:48425015:1 gene:ENSG00000109171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// AK291006 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76171 complete cds. // chr4 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// BC031691 // GenBank // Homo sapiens SLAIN motif family, member 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:4752398), complete cds. // chr4 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0 /// BC040993 // GenBank // Homo sapiens SLAIN motif family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:43785 IMAGE:5272534), complete cds. // chr4 // 96 // 84 // 25 // 26 // 0 /// AK025264 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ21611 fis, clone COL07344. // chr4 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// GENSCAN00000011104 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:48341740:48488939:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 58 // 58 // 18 // 31 // 1 /// AK023949 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ13887 fis, clone THYRO1001570. // chr4 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1
NM_152679 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 10, member 4 (SLC10A4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000273861 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:48483343:48489196:1 gene:ENSG00000145248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY704414 // GenBank // Homo sapiens bile acid transporter SLC10A4 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// BC012048 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 10 (sodium/bile acid cotransporter family), member 4, mRNA (cDNA clone MGC:12990 IMAGE:3502817), complete cds. // chr4 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC019066 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 10 (sodium/bile acid cotransporter family), member 4, mRNA (cDNA clone MGC:29802 IMAGE:4897519), complete cds. // chr4 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000011104 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:48341740:48488939:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1
NM_175619 // RefSeq // Homo sapiens zygote arrest 1 (ZAR1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000327939 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:48490252:48494389:1 gene:ENSG00000182223 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY191416 // GenBank // Homo sapiens zygote arrest 1 (ZAR1) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC136265 // GenBank // Homo sapiens zygote arrest 1, mRNA (cDNA clone MGC:167875 IMAGE:9020252), complete cds. // chr4 // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000011078 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:48490292:48491885:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
AK125574 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ43586 fis, clone SKNMC2007504. // chr4 // 36 // 100 // 15 // 42 // 0 /// GENSCAN00000022675 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:49278898:49303595:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 31 // 31 // 13 // 42 // 1 /// GENSCAN00000022699 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:49308768:49318298:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 45 // 45 // 19 // 42 // 1
ENST00000363054 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:52494849:52494952:1 gene:ENSG00000199924 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT096361 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NONHSAT096362 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_023940 // RefSeq // Homo sapiens RAS-like, family 11, member B (RASL11B), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000248706 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:52862290:52866835:1 gene:ENSG00000128045 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000505041 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:52864146:52866799:1 gene:ENSG00000128045 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// AY839725 // GenBank // Homo sapiens RAS-like family 11 member B (RASL11B) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY839726 // GenBank // Homo sapiens RAS-like family 11 member B variant A (RASL11B) mRNA, partial cds. // chr4 // 96 // 82 // 22 // 23 // 0 /// BC001087 // GenBank // Homo sapiens RAS-like, family 11, member B, mRNA (cDNA clone MGC:2827 IMAGE:2964565), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC001846 // GenBank // Homo sapiens RAS-like, family 11, member B, mRNA (cDNA clone MGC:4499 IMAGE:2964565), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC025694 // GenBank // Homo sapiens RAS-like, family 11, member B, mRNA (cDNA clone MGC:34182 IMAGE:5209000), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000515677 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:52862332:52863610:1 gene:ENSG00000128045 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// AK021492 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ11430 fis, clone HEMBA1001080. // chr4 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// GENSCAN00000020171 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:52792111:52879310:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1
XM_005276251 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens COMM domain-containing protein 5-like (LOC101928879), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000513286 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:53575713:53576387:1 gene:ENSG00000173966 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000020179 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:53575818:53576387:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0
NM_133267 // RefSeq // Homo sapiens GS homeobox 2 (GSX2), mRNA. // chr4 // 86 // 97 // 25 // 29 // 0 /// ENST00000326902 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:54100031:54102505:1 gene:ENSG00000180613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000503800 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:4:54100173:54102227:1 gene:ENSG00000180613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 77 // 22 // 23 // 0 /// ENST00000507839 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:54099523:54101928:1 gene:ENSG00000180613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000548609 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:54100816:54102146:1 gene:ENSG00000180613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// AB028838 // GenBank // Homo sapiens mRNA for homeobox protein GSH-2, complete cds. // chr4 // 87 // 100 // 26 // 30 // 0 /// BC075089 // GenBank // Homo sapiens GS homeobox 2, mRNA (cDNA clone MGC:103982 IMAGE:30915389), complete cds. // chr4 // 81 // 90 // 22 // 27 // 0 /// BC075090 // GenBank // Homo sapiens GS homeobox 2, mRNA (cDNA clone MGC:104144 IMAGE:30915601), complete cds. // chr4 // 81 // 90 // 22 // 27 // 0 /// ENST00000611459 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:54100031:54101955:1 gene:ENSG00000180613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000022608 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:54100345:54102123:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0
ENST00000468013 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:55063738:55064026:1 gene:ENSG00000244034 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT096434 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000384112 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:55294490:55294598:1 gene:ENSG00000206839 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT096439 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_024592 // RefSeq // Homo sapiens steroid 5 alpha-reductase 3 (SRD5A3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000264228 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:55346109:55373096:1 gene:ENSG00000128039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC002480 // GenBank // Homo sapiens steroid 5 alpha-reductase 3, mRNA (cDNA clone MGC:3099 IMAGE:3350037), complete cds. // chr4 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000505210 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:4:55346412:55370310:1 gene:ENSG00000128039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000047340 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:55346337:55370091:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
ENST00000459077 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:55412636:55412738:1 gene:ENSG00000239040 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT096460 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000516114 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:55798636:55798731:1 gene:ENSG00000251923 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT096477 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001024924 // RefSeq // Homo sapiens exocyst complex component 1 (EXOC1), transcript variant 3, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_018261 // RefSeq // Homo sapiens exocyst complex component 1 (EXOC1), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NM_178237 // RefSeq // Homo sapiens exocyst complex component 1 (EXOC1), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006714043 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens exocyst complex component 1 (EXOC1), transcript variant X6, mRNA. // chr4 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000346134 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:55853675:55905034:1 gene:ENSG00000090989 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// ENST00000349598 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:55853739:55905034:1 gene:ENSG00000090989 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// ENST00000381295 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:55853616:55905013:1 gene:ENSG00000090989 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC094751 // GenBank // Homo sapiens exocyst complex component 1, mRNA (cDNA clone MGC:104609 IMAGE:4828034), complete cds. // chr4 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000511971 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:55882727:55905007:1 gene:ENSG00000090989 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// AK023461 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ13399 fis, clone PLACE1001395. // chr4 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// GENSCAN00000009706 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:55858324:55904495:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0
ENST00000365488 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:55885595:55885701:1 gene:ENSG00000202358 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT096478 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_025009 // RefSeq // Homo sapiens centrosomal protein 135kDa (CEP135), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000257287 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:55948981:56033363:1 gene:ENSG00000174799 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000506202 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:55964866:56033104:1 gene:ENSG00000174799 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// AB014535 // GenBank // Homo sapiens KIAA0635 mRNA for KIAA0635 protein, partial cds. // chr4 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// BC136535 // GenBank // Homo sapiens centrosomal protein 135kDa, mRNA (cDNA clone MGC:168148 IMAGE:9020525), complete cds. // chr4 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC136536 // GenBank // Homo sapiens centrosomal protein 135kDa, mRNA (cDNA clone MGC:168149 IMAGE:9020526), complete cds. // chr4 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000009715 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:55932637:56049802:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0
ENST00000363871 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:56097390:56097504:1 gene:ENSG00000200741 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr4 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT096489 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_020722 // RefSeq // Homo sapiens KIAA1211 (KIAA1211), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_005265752 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens KIAA1211 (KIAA1211), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000264229 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:4:56170195:56327820:1 gene:ENSG00000109265 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000504228 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:56272404:56328625:1 gene:ENSG00000109265 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000541073 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:56272404:56328092:1 gene:ENSG00000109265 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK302486 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60370 complete cds, weakly similar to Homo sapiens retinitis pigmentosa GTPase regulator (RPGR), transcript variant C, mRNA. // chr4 // 95 // 70 // 20 // 21 // 0 /// BC144536 // GenBank // Homo sapiens KIAA1211, mRNA (cDNA clone MGC:178080 IMAGE:9053063), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC150615 // GenBank // Homo sapiens KIAA1211, mRNA (cDNA clone MGC:183525 IMAGE:9056985), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC171783 // GenBank // Homo sapiens KIAA1211, mRNA (cDNA clone MGC:198498 IMAGE:9054437), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK097530 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ40211 fis, clone TESTI2021114. // chr4 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// GENSCAN00000009730 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:56065390:56327804:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
NM_001267722 // RefSeq // Homo sapiens signal recognition particle 72kDa (SRP72), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NM_006947 // RefSeq // Homo sapiens signal recognition particle 72kDa (SRP72), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// XM_005265765 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens signal recognition particle 72kDa (SRP72), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 65 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000342756 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:56466915:56503107:1 gene:ENSG00000174780 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000510663 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:4:56467617:56502482:1 gene:ENSG00000174780 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 82 // 14 // 14 // 0 /// AF038851 // GenBank // Homo sapiens putative signal recognition particle mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 94 // 16 // 16 // 0 /// AF069765 // GenBank // Homo sapiens signal recognition particle 72 (SRP72) mRNA, complete cds. // chr4 // 93 // 82 // 13 // 14 // 0 /// AF077019 // GenBank // Homo sapiens signal recognition particle 72 (SRP72) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0 /// BX537991 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686A04192 (from clone DKFZp686A04192); complete cds. // chr4 // 100 // 82 // 14 // 14 // 0 /// EU794663 // GenBank // Homo sapiens epididymis luminal protein 103 (HEL103) mRNA, complete cds. // chr4 // 93 // 82 // 13 // 14 // 0 /// GENSCAN00000009721 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:56410516:56501861:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 65 // 65 // 11 // 17 // 1
NM_206919 // RefSeq // Homo sapiens ADP-ribosylation factor-like 9 (ARL9), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006714036 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ADP-ribosylation factor-like 9 (ARL9), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000360096 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:56505343:56524448:1 gene:ENSG00000196503 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// AY439003 // GenBank // Homo sapiens ADP-ribosylation factor-like 9 (ARL9) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_005265719 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ADP-ribosylation factor-like 9 (ARL9), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 65 // 65 // 15 // 23 // 1 /// GENSCAN00000009709 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:56505863:56603323:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 48 // 48 // 11 // 23 // 1
ENST00000581065 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:56805834:56806131:1 gene:ENSG00000265894 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT096518 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
ENST00000515894 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:57002692:57002792:1 gene:ENSG00000251703 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT096538 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000362910 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:59533786:59533898:1 gene:ENSG00000199780 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT096590 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000364806 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:59833175:59833276:1 gene:ENSG00000201676 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT096593 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000364905 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:59834063:59834167:1 gene:ENSG00000201775 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT096594 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000365299 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:61906313:61906408:1 gene:ENSG00000202169 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT096614 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000505282 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:66094142:66094526:1 gene:ENSG00000236562 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 84 // 90 // 16 // 19 // 0 /// GENSCAN00000026991 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:66052637:66094524:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 86 // 100 // 18 // 21 // 0
NM_012108 // RefSeq // Homo sapiens signal transducing adaptor family member 1 (STAP1), mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_005265675 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens signal transducing adaptor family member 1 (STAP1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// XM_006714176 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens signal transducing adaptor family member 1 (STAP1), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000265404 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:67558728:67606898:1 gene:ENSG00000035720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000396225 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:67558728:67607337:1 gene:ENSG00000035720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AB023483 // GenBank // Homo sapiens mRNA for docking protein BRDG1, complete cds. // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC014958 // GenBank // Homo sapiens signal transducing adaptor family member 1, mRNA (cDNA clone MGC:23010 IMAGE:4851485), complete cds. // chr4 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000024420 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:67561175:67606357:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0
ENST00000365504 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:67747236:67747386:1 gene:ENSG00000202374 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT096709 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000384697 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:68003895:68004001:1 gene:ENSG00000207428 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT096718 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000509133 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:68038544:68039647:1 gene:ENSG00000227725 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000034048 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:68038544:68039650:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0
NM_014058 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protease, serine 11E (TMPRSS11E), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000305363 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:68447449:68497604:1 gene:ENSG00000087128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000510647 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:68461821:68477630:1 gene:ENSG00000087128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 49 // 18 // 18 // 0 /// AF064819 // GenBank // Homo sapiens serine protease DESC1 (DESC1) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// AK292787 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75331 complete cds, highly similar to Homo sapiens serine protease mRNA. // chr4 // 97 // 97 // 35 // 36 // 0 /// AY359017 // GenBank // Homo sapiens clone DNA68871 serine protease (UNQ742) mRNA, complete cds. // chr4 // 97 // 97 // 35 // 36 // 0 /// BC113412 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protease, serine 11E, mRNA (cDNA clone MGC:141972 IMAGE:8322464), complete cds. // chr4 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// BC113414 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protease, serine 11E, mRNA (cDNA clone MGC:141974 IMAGE:8322466), complete cds. // chr4 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000621758 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR4_1_CTG9:68447498:68497649:1 gene:ENSG00000274058 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000002101 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR4_1_CTG9:68428774:68496849:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000034044 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:68428719:68496804:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0
NM_014058 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protease, serine 11E (TMPRSS11E), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000305363 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:68447449:68497604:1 gene:ENSG00000087128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000510647 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:68461821:68477630:1 gene:ENSG00000087128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// AF064819 // GenBank // Homo sapiens serine protease DESC1 (DESC1) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// AK292787 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75331 complete cds, highly similar to Homo sapiens serine protease mRNA. // chr4 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// AY359017 // GenBank // Homo sapiens clone DNA68871 serine protease (UNQ742) mRNA, complete cds. // chr4 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// BC113412 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protease, serine 11E, mRNA (cDNA clone MGC:141972 IMAGE:8322464), complete cds. // chr4 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// BC113414 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protease, serine 11E, mRNA (cDNA clone MGC:141974 IMAGE:8322466), complete cds. // chr4 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000621758 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR4_1_CTG9:68447498:68497649:1 gene:ENSG00000274058 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000002101 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR4_1_CTG9:68428774:68496849:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000034044 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:68428719:68496804:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0
NM_001074 // RefSeq // Homo sapiens UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide B7 (UGT2B7), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// XM_005265702 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide B7 (UGT2B7), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000305231 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:69096475:69112987:1 gene:ENSG00000171234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000508661 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:69096494:69112972:1 gene:ENSG00000171234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0 /// BC030974 // GenBank // Homo sapiens UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide B7, mRNA (cDNA clone MGC:32620 IMAGE:4593426), complete cds. // chr4 // 100 // 87 // 13 // 13 // 0 /// J05428 // GenBank // Human 3,4-catechol estrogen UDP-glucuronosyltransferase mRNA, complete cds. // chr4 // 71 // 93 // 10 // 14 // 0 /// ENST00000622664 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:69096519:69112984:1 gene:ENSG00000171234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 67 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000033870 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:69096521:69144939:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 53 // 8 // 8 // 0
NM_001207004 // RefSeq // Homo sapiens UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide B28 (UGT2B28), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0 /// NM_053039 // RefSeq // Homo sapiens UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide B28 (UGT2B28), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 73 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000335568 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:69280499:69295050:1 gene:ENSG00000135226 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 73 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000511240 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:69280499:69295050:1 gene:ENSG00000135226 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0 /// AF177272 // GenBank // Homo sapiens UDP-glucuronosyltransferase type 1 (UGT2B28) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr4 // 100 // 73 // 8 // 8 // 0 /// AF177273 // GenBank // Homo sapiens UDP-glucuronosyltransferase type 2 (UGT2B28) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr4 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0 /// ENST00000612433 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:69280487:69423402:1 gene:ENSG00000135226 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 75 // 73 // 6 // 8 // 0 /// GENSCAN00000033875 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:69242628:69294809:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 55 // 6 // 6 // 0
NM_002159 // RefSeq // Homo sapiens histatin 1 (HTN1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000246896 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:70050402:70058845:1 gene:ENSG00000126550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000506754 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:70052882:70058845:1 gene:ENSG00000126550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// BC017835 // GenBank // Homo sapiens histatin 1, mRNA (cDNA clone MGC:22502 IMAGE:4289874), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// M26664 // GenBank // Human histatin 1 (HIS1) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000503645 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:70050438:70055844:1 gene:ENSG00000126550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 83 // 83 // 19 // 23 // 1 /// ENST00000511674 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:70050438:70055947:1 gene:ENSG00000126550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 83 // 83 // 19 // 23 // 1 /// ENST00000610341 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:70050442:70058841:1 gene:ENSG00000126550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AK131070 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ29036 fis, clone SLV00594. // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT096782 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT096781 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 83 // 83 // 19 // 23 // 1
NR_003720 // RefSeq // Homo sapiens casein alpha s2-like A, pseudogene (CSN1S2AP), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000451783 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:70067386:70085273:1 gene:ENSG00000234124 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000503711 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:70069083:70085120:1 gene:ENSG00000234124 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000512167 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:70074026:70085290:1 gene:ENSG00000234124 gene_biotype:unitary_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// AY154892 // GenBank // Homo sapiens alpha-S2-like casein A (CSN1S2A) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT096783 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT096784 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT096785 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
NM_214711 // RefSeq // Homo sapiens proline rich 27 (PRR27), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000344526 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:70154187:70164939:1 gene:ENSG00000187533 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000502294 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:70152076:70164935:1 gene:ENSG00000187533 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000509633 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:70154243:70166606:1 gene:ENSG00000187533 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000512173 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:70158728:70176799:1 gene:ENSG00000187533 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000502441 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:70133616:70158777:1 gene:ENSG00000187533 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1 /// GENSCAN00000033297 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:70047694:70249459:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1 /// NONHSAT096788 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
NM_017855 // RefSeq // Homo sapiens odontogenic, ameloblast asssociated (ODAM), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000396094 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:70196496:70204576:1 gene:ENSG00000109205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000510709 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:4:70196525:70202910:1 gene:ENSG00000109205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000510847 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:70198122:70204201:1 gene:ENSG00000109205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000514097 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:70197924:70203214:1 gene:ENSG00000109205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// BC017796 // GenBank // Homo sapiens odontogenic, ameloblast asssociated, mRNA (cDNA clone MGC:22340 IMAGE:4689080), complete cds. // chr4 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// EF113908 // GenBank // Homo sapiens odontogenic ameloblast-associated protein precursor (ODAM) mRNA, complete cds. // chr4 // 88 // 80 // 21 // 24 // 0 /// ENST00000506248 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:70197729:70200573:1 gene:ENSG00000109205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// AK098169 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ40850 fis, clone TRACH2014938. // chr4 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// GENSCAN00000033297 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:70047694:70249459:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// NONHSAT096789 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_152997 // RefSeq // Homo sapiens follicular dendritic cell secreted protein (FDCSP), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000317987 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:70226071:70235252:1 gene:ENSG00000181617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF086120 // GenBank // Homo sapiens full length insert cDNA clone ZA74F12. // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AF435080 // GenBank // Homo sapiens follicular dendritic cell secreted peptide precursor, mRNA, complete cds. // chr4 // 86 // 88 // 19 // 22 // 0 /// AY190326 // GenBank // Homo sapiens NPC-associated peptide (NAP1) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY358958 // GenBank // Homo sapiens clone DNA71290 C4orf7 (UNQ733) mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// BC062213 // GenBank // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 7, mRNA (cDNA clone MGC:71894 IMAGE:30326274), complete cds. // chr4 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000033297 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:70047694:70249459:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_005212 // RefSeq // Homo sapiens casein kappa (CSN3), mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000304954 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:70242588:70251428:1 gene:ENSG00000171209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC010935 // GenBank // Homo sapiens casein kappa, mRNA (cDNA clone MGC:13553 IMAGE:4279903), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// M73628 // GenBank // Homo sapiens kappa-casein mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// X66417 // GenBank // H.sapiens casK mRNA for kappa-casein. // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000033297 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:70047694:70249459:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_033122 // RefSeq // Homo sapiens calcium-binding protein, spermatid-specific 1 (CABS1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000273936 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:70334966:70337116:1 gene:ENSG00000145309 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF380838 // GenBank // Homo sapiens testis development protein NYD-SP26 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC046111 // GenBank // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 35, mRNA (cDNA clone MGC:57543 IMAGE:5171504), complete cds. // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000033296 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:70335040:70336227:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0
NM_012390 // RefSeq // Homo sapiens submaxillary gland androgen regulated protein 3A (SMR3A), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000226460 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:70360761:70367158:1 gene:ENSG00000109208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// AK312075 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ92356, Homo sapiens proline rich 5 (salivary) (PROL5), mRNA. // chr4 // 89 // 100 // 16 // 18 // 0 /// BC140927 // GenBank // Homo sapiens submaxillary gland androgen regulated protein 3A, mRNA (cDNA clone MGC:176604 IMAGE:9056739), complete cds. // chr4 // 92 // 67 // 11 // 12 // 0
NM_006685 // RefSeq // Homo sapiens submaxillary gland androgen regulated protein 3B (SMR3B), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000304915 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:70383078:70390244:1 gene:ENSG00000171201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000504825 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:70370093:70389906:1 gene:ENSG00000171201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 38 // 9 // 9 // 0 /// BC015327 // GenBank // Homo sapiens submaxillary gland androgen regulated protein 3B, mRNA (cDNA clone MGC:21182 IMAGE:4397938), complete cds. // chr4 // 90 // 83 // 18 // 20 // 0 /// BC094707 // GenBank // Homo sapiens submaxillary gland androgen regulated protein 3B, mRNA (cDNA clone MGC:104379 IMAGE:30350039), complete cds. // chr4 // 83 // 75 // 15 // 18 // 0 /// D29833 // GenBank // Homo sapiens mRNA for proline rich peptide P-B, complete cds. // chr4 // 80 // 83 // 16 // 20 // 0 /// BX640810 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686O02249 (from clone DKFZp686O02249). // chr4 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1 /// ENST00000614072 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:70383078:70390242:1 gene:ENSG00000171201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK130485 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ26975 fis, clone SLV02102, highly similar to Homo sapiens proline rich 5 (salivary) (PROL5). // chr4 // 91 // 92 // 20 // 22 // 0
NM_021225 // RefSeq // Homo sapiens proline rich, lacrimal 1 (PROL1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000399575 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:4:70397882:70410194:1 gene:ENSG00000171199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000505023 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:70397965:70409908:1 gene:ENSG00000171199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000514338 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:70397931:70409892:1 gene:ENSG00000171199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000615728 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:70397976:70410194:1 gene:ENSG00000171199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000033299 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:70402384:70410075:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// NONHSAT096791 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT096792 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0
NM_001286731 // RefSeq // Homo sapiens amelotin (AMTN), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_212557 // RefSeq // Homo sapiens amelotin (AMTN), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000339336 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:70518540:70532742:1 gene:ENSG00000187689 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000504451 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:70518585:70532514:1 gene:ENSG00000187689 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// AB593161 // GenBank // Homo sapiens AMTN mRNA for amelotin, complete cds, clone: HP10845-ARe01C03. // chr4 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// AY358528 // GenBank // Homo sapiens clone DNA66660 RSTI689 (UNQ689) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC121812 // GenBank // Homo sapiens amelotin, mRNA (cDNA clone MGC:148133 IMAGE:40109020), complete cds. // chr4 // 93 // 93 // 26 // 28 // 0 /// BC121817 // GenBank // Homo sapiens amelotin, mRNA (cDNA clone MGC:148132 IMAGE:40109016), complete cds. // chr4 // 93 // 93 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000033289 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:70474022:70560338:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_016519 // RefSeq // Homo sapiens ameloblastin (enamel matrix protein) (AMBN), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000322937 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:70592256:70607288:1 gene:ENSG00000178522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000449493 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:70592295:70606879:1 gene:ENSG00000178522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AF209780 // GenBank // Homo sapiens ameloblastin precursor (AMBN) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr4 // 88 // 100 // 28 // 32 // 0 /// AF219994 // GenBank // Homo sapiens ameloblastin mRNA, complete cds. // chr4 // 93 // 94 // 28 // 30 // 0 /// AF263464 // GenBank // Homo sapiens ameloblastin mRNA, complete cds. // chr4 // 93 // 94 // 28 // 30 // 0 /// BC106931 // GenBank // Homo sapiens ameloblastin (enamel matrix protein), mRNA (cDNA clone MGC:126152 IMAGE:40033703), complete cds. // chr4 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// BC106932 // GenBank // Homo sapiens ameloblastin (enamel matrix protein), mRNA (cDNA clone MGC:126153 IMAGE:40033705), complete cds. // chr4 // 84 // 100 // 27 // 32 // 0 /// ENST00000613447 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:70592258:70607285:1 gene:ENSG00000178522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0
NM_031889 // RefSeq // Homo sapiens enamelin (ENAM), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000396073 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:70628744:70646824:1 gene:ENSG00000132464 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// AF125373 // GenBank // Homo sapiens enamelin mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC117308 // GenBank // Homo sapiens enamelin, mRNA (cDNA clone MGC:150917 IMAGE:40125859), complete cds. // chr4 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0 /// BC117310 // GenBank // Homo sapiens enamelin, mRNA (cDNA clone MGC:150919 IMAGE:40125861), complete cds. // chr4 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000033286 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:70617805:70647723:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0
NM_020368 // RefSeq // Homo sapiens UTP3, small subunit (SSU) processome component, homolog (S. cerevisiae) (UTP3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000254803 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:70688479:70690551:1 gene:ENSG00000132467 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF271212 // GenBank // Homo sapiens disrupter of silencing SAS10 (SAS10) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC004546 // GenBank // Homo sapiens UTP3, small subunit (SSU) processome component, homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:11290 IMAGE:3946633), complete cds. // chr4 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// CR533544 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834F0819D for gene SAS10, disrupter of silencing 10; complete cds, incl. stopcodon. // chr4 // 96 // 75 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000033276 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:70688678:70690117:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0
ENST00000384717 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:70701755:70701858:1 gene:ENSG00000207448 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT096798 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NONHSAT096807 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000384280 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:70852130:70852240:1 gene:ENSG00000207007 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT096812 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001244766 // RefSeq // Homo sapiens MOB kinase activator 1B (MOB1B), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_173468 // RefSeq // Homo sapiens MOB kinase activator 1B (MOB1B), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000309395 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:70902336:70988168:1 gene:ENSG00000173542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000396051 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:4:70902378:70982242:1 gene:ENSG00000173542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000502869 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:70902326:70975254:1 gene:ENSG00000173542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 88 // 57 // 14 // 16 // 0 /// AK299481 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52228 complete cds, highly similar to Mps one binder kinase activator-like 1A. // chr4 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// BC038112 // GenBank // Homo sapiens MOB1, Mps One Binder kinase activator-like 1A (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:33910 IMAGE:5264730), complete cds. // chr4 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// NM_001244767 // RefSeq // Homo sapiens MOB kinase activator 1B (MOB1B), transcript variant 3, mRNA. // chr4 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// ENST00000509041 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:70902347:70976743:1 gene:ENSG00000173542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// ENST00000511449 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:70902384:71022449:1 gene:ENSG00000173542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
ENST00000517146 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:72965178:72965303:1 gene:ENSG00000252955 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT096829 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000388104 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:73026748:73026873:1 gene:ENSG00000210839 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 93 // 13 // 13 // 0 /// NONHSAT096830 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 93 // 13 // 13 // 0
NM_001134 // RefSeq // Homo sapiens alpha-fetoprotein (AFP), mRNA. // chr4 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// ENST00000226359 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:73436247:73455743:1 gene:ENSG00000081051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000395792 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:73436163:73456174:1 gene:ENSG00000081051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000508838 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:73450549:73455741:1 gene:ENSG00000081051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 32 // 10 // 10 // 0 /// AK297669 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51509 complete cds, highly similar to Alpha-fetoprotein precursor. // chr4 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// AK297674 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57154 complete cds, highly similar to Alpha-fetoprotein precursor. // chr4 // 93 // 94 // 27 // 29 // 0 /// BC027881 // GenBank // Homo sapiens alpha-fetoprotein, mRNA (cDNA clone MGC:34639 IMAGE:5208299), complete cds. // chr4 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000032987 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:73400438:73532517:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0
NM_001133 // RefSeq // Homo sapiens afamin (AFM), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000226355 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:73481683:73504001:1 gene:ENSG00000079557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AK290556 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76019 complete cds, highly similar to Homo sapiens afamin (AFM), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC109020 // GenBank // Homo sapiens afamin, mRNA (cDNA clone MGC:125338 IMAGE:40006696), complete cds. // chr4 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// BC109021 // GenBank // Homo sapiens afamin, mRNA (cDNA clone MGC:125339 IMAGE:40006697), complete cds. // chr4 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// L32140 // GenBank // Human afamin mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000032987 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:73400438:73532517:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 59 // 59 // 20 // 34 // 1
NM_000584 // RefSeq // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) ligand 8 (CXCL8), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000307407 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:73740506:73743716:1 gene:ENSG00000169429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC013615 // GenBank // Homo sapiens interleukin 8, mRNA (cDNA clone MGC:9211 IMAGE:3882471), complete cds. // chr4 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// BT007067 // GenBank // Homo sapiens interleukin 8 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 62 // 13 // 13 // 0 /// CR542151 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834G0923D for gene IL8, interleukin 8; complete cds, without stopcodon. // chr4 // 100 // 62 // 13 // 13 // 0 /// M17017 // GenBank // Human beta-thromboglobulin-like protein mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// M26383 // GenBank // Human monocyte-derived neutrophil-activating protein (MONAP) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000401931 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:73740541:73742330:1 gene:ENSG00000169429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 81 // 81 // 17 // 21 // 1 /// ENST00000483500 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:73740569:73741986:1 gene:ENSG00000169429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 52 // 52 // 11 // 21 // 1 /// AF043337 // GenBank // Homo sapiens interleukin 8 C-terminal variant (IL8) mRNA, complete cds. // chr4 // 92 // 62 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000049182 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:73740659:73788642:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 62 // 62 // 13 // 21 // 1 /// NONHSAT096867 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 52 // 52 // 11 // 21 // 1
NM_002993 // RefSeq // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) ligand 6 (CXCL6), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000226317 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:73836497:73838760:1 gene:ENSG00000124875 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC013744 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) ligand 6 (granulocyte chemotactic protein 2), mRNA (cDNA clone MGC:21713 IMAGE:4471095), complete cds. // chr4 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// U81234 // GenBank // Human chemokine alpha 3 (CKA-3) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000515050 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:73836640:73837406:1 gene:ENSG00000124875 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// GENSCAN00000049189 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:73836751:73848838:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
NM_002620 // RefSeq // Homo sapiens platelet factor 4 variant 1 (PF4V1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000226524 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:73853189:73854155:1 gene:ENSG00000109272 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// BC130653 // GenBank // Homo sapiens platelet factor 4 variant 1, mRNA (cDNA clone MGC:163525 IMAGE:40146684), complete cds. // chr4 // 92 // 65 // 12 // 13 // 0 /// BC130657 // GenBank // Homo sapiens platelet factor 4 variant 1, mRNA (cDNA clone MGC:163529 IMAGE:40146688), complete cds. // chr4 // 92 // 65 // 12 // 13 // 0
NM_001511 // RefSeq // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) ligand 1 (melanoma growth stimulating activity, alpha) (CXCL1), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NR_046035 // RefSeq // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) ligand 1 (melanoma growth stimulating activity, alpha) (CXCL1), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000395761 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:73869404:73871242:1 gene:ENSG00000163739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC011976 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) ligand 1 (melanoma growth stimulating activity, alpha), mRNA (cDNA clone MGC:9049 IMAGE:3856841), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BT006880 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) ligand 1 (melanoma growth stimulating activity, alpha) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 48 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000509101 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:73869393:73870177:1 gene:ENSG00000163739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 61 // 61 // 14 // 23 // 1 /// NONHSAT096873 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000049194 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:73853363:73888170:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 61 // 61 // 14 // 23 // 1
ENST00000464637 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:74011578:74011876:1 gene:ENSG00000244194 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONHSAT096878 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_001432 // RefSeq // Homo sapiens epiregulin (EREG), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000244869 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:74365143:74388751:1 gene:ENSG00000124882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC136404 // GenBank // Homo sapiens epiregulin, mRNA (cDNA clone MGC:168014 IMAGE:9020391), complete cds. // chr4 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC136405 // GenBank // Homo sapiens epiregulin, mRNA (cDNA clone MGC:168015 IMAGE:9020392), complete cds. // chr4 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// CR541887 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834C0633D for gene EREG, epiregulin; complete cds, without stopcodon. // chr4 // 94 // 64 // 17 // 18 // 0 /// D30783 // GenBank // Homo sapiens mRNA for epiregulin, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000507603 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:74365173:74382013:1 gene:ENSG00000124882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// BC035806 // GenBank HTC // Homo sapiens epiregulin, mRNA (cDNA clone IMAGE:5745333), with apparent retained intron. // chr4 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// ENST00000503689 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:74382423:74384952:1 gene:ENSG00000124882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// GENSCAN00000049191 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:74325932:74421966:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// NONHSAT096892 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// NONHSAT096893 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001657 // RefSeq // Homo sapiens amphiregulin (AREG), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000395748 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:74445134:74455009:1 gene:ENSG00000109321 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000502307 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:74445302:74455005:1 gene:ENSG00000109321 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC009799 // GenBank // Homo sapiens amphiregulin, mRNA (cDNA clone MGC:13647 IMAGE:4277616), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC146953 // GenBank // Homo sapiens amphiregulin, mRNA (cDNA clone MGC:182056 IMAGE:9056881), complete cds. // chr4 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC146967 // GenBank // Homo sapiens amphiregulin, mRNA (cDNA clone MGC:182070 IMAGE:9056895), complete cds. // chr4 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BT019866 // GenBank // Homo sapiens amphiregulin (schwannoma-derived growth factor) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// M30704 // GenBank // Human amphiregulin (AR) mRNA, complete cds, clones lambda-AR1 and lambda-AR2. // chr4 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENST00000511560 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:74448639:74450532:1 gene:ENSG00000109321 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// GENSCAN00000049187 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:74445078:74474782:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// NONHSAT096895 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// NONHSAT096898 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_001657 // RefSeq // Homo sapiens amphiregulin (AREG), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000395748 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:74445134:74455009:1 gene:ENSG00000109321 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000502307 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:74445302:74455005:1 gene:ENSG00000109321 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// BC009799 // GenBank // Homo sapiens amphiregulin, mRNA (cDNA clone MGC:13647 IMAGE:4277616), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC146953 // GenBank // Homo sapiens amphiregulin, mRNA (cDNA clone MGC:182056 IMAGE:9056881), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC146967 // GenBank // Homo sapiens amphiregulin, mRNA (cDNA clone MGC:182070 IMAGE:9056895), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BT019866 // GenBank // Homo sapiens amphiregulin (schwannoma-derived growth factor) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// M30704 // GenBank // Human amphiregulin (AR) mRNA, complete cds, clones lambda-AR1 and lambda-AR2. // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000511560 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:74448639:74450532:1 gene:ENSG00000109321 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 56 // 56 // 10 // 18 // 1 /// GENSCAN00000049187 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:74445078:74474782:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 56 // 56 // 10 // 18 // 1 /// NONHSAT096895 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 56 // 56 // 10 // 18 // 1 /// NONHSAT096898 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 56 // 56 // 10 // 18 // 1
NM_015393 // RefSeq // Homo sapiens prostate androgen-regulated mucin-like protein 1 (PARM1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000307428 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:74933116:75050113:1 gene:ENSG00000169116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000513238 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:4:74933095:75050115:1 gene:ENSG00000169116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// AY358777 // GenBank // Homo sapiens clone DNA92223 VYKT1879 (UNQ1879) mRNA, complete cds. // chr4 // 92 // 73 // 22 // 24 // 0 /// BC013294 // GenBank // Homo sapiens DKFZP564O0823 protein, mRNA (cDNA clone MGC:3551 IMAGE:3028327), complete cds. // chr4 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000011206 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:75008960:75046247:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0
AF118087 // GenBank HTC // Homo sapiens PRO1996 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001290049 // RefSeq // Homo sapiens USO1 vesicle transport factor (USO1), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_003715 // RefSeq // Homo sapiens USO1 vesicle transport factor (USO1), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000264904 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:4:75757497:75814213:1 gene:ENSG00000138768 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000441296 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:75790148:75814229:1 gene:ENSG00000138768 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 94 // 65 // 16 // 17 // 0 /// ENST00000514213 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:75724645:75814211:1 gene:ENSG00000138768 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AL832010 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp451D234 (from clone DKFZp451D234); complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC032654 // GenBank // Homo sapiens USO1 homolog, vesicle docking protein (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:45332 IMAGE:5533256), complete cds. // chr4 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// D86326 // GenBank // Homo sapiens mRNA for p115, complete cds. // chr4 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000041848 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:75688690:75813295:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
AF132198 // GenBank HTC // Homo sapiens PRO1405 mRNA, complete cds. // chr4 // 95 // 91 // 20 // 21 // 0
NM_020859 // RefSeq // Homo sapiens shroom family member 3 (SHROOM3), mRNA. // chr4 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// XM_005263163 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens shroom family member 3 (SHROOM3), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 83 // 33 // 33 // 0 /// XM_005263165 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens shroom family member 3 (SHROOM3), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 100 // 83 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000296043 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:76435100:76783253:1 gene:ENSG00000138771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000486758 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:76689571:76742130:1 gene:ENSG00000138771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 45 // 18 // 18 // 0 /// AB055660 // GenBank // Homo sapiens hShrmL mRNA for Shroom-related protein, complete cds. // chr4 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// AK027744 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ14838 fis, clone OVARC1001726, weakly similar to APICAL-LIKE PROTEIN. // chr4 // 100 // 23 // 9 // 9 // 0 /// AK304103 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55531 complete cds, highly similar to Homo sapiens shroom (SHRM), mRNA. // chr4 // 94 // 45 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000041142 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:76689600:76802337:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 78 // 31 // 31 // 0
AY358789 // GenBank // Homo sapiens clone DNA129794 TSSP3028 (UNQ3028) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_006419 // RefSeq // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) ligand 13 (CXCL13), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000286758 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:77511753:77611834:1 gene:ENSG00000156234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF029894 // GenBank // Homo sapiens Angie mRNA, complete cds. // chr4 // 89 // 64 // 16 // 18 // 0 /// AF044197 // GenBank // Homo sapiens B lymphocyte chemoattractant BLC mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AJ002211 // GenBank // Homo sapiens cDNA for a CXC chemokine. // chr4 // 90 // 71 // 18 // 20 // 0 /// BC012589 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) ligand 13, mRNA (cDNA clone MGC:13521 IMAGE:4246053), complete cds. // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// CR407624 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834C102D for gene CXCL13, chemokine (C-X-C motif) ligand 13 (B-cell chemoattractant) complete cds, without stopcodon. // chr4 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000506590 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:77605832:77610922:1 gene:ENSG00000156234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// NONHSAT097055 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// GENSCAN00000041151 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:77605866:77619631:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NONHSAT097068 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_017593 // RefSeq // Homo sapiens BMP2 inducible kinase (BMP2K), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// NM_198892 // RefSeq // Homo sapiens BMP2 inducible kinase (BMP2K), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000335016 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:78776378:78912185:1 gene:ENSG00000138756 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000389010 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:78776342:78879435:1 gene:ENSG00000138756 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000502871 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:78776378:78879969:1 gene:ENSG00000138756 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// AK292147 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78410 complete cds, highly similar to Homo sapiens BMP2 inducible kinase (BMP2K), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 95 // 73 // 21 // 22 // 0 /// AL137661 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp434P0116 (from clone DKFZp434P0116). // chr4 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC036021 // GenBank // Homo sapiens BMP2 inducible kinase, mRNA (cDNA clone MGC:33000 IMAGE:5272264), complete cds. // chr4 // 96 // 77 // 22 // 23 // 0 /// XM_005263117 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens BMP2 inducible kinase (BMP2K), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// ENST00000502613 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:78859624:78916372:1 gene:ENSG00000138756 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// GENSCAN00000047656 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:78721300:78887301:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0
ENST00000494856 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:78898855:78899154:1 gene:ENSG00000242175 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT097090 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NR_026555 // RefSeq // Homo sapiens prostate cancer associated transcript 4 (non-protein coding) (PCAT4), long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000504263 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:79827471:79863247:1 gene:ENSG00000251321 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// AF388200 // GenBank // Homo sapiens GDEP mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC105591 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4249749. // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONHSAT097121 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
ENST00000391318 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:79843102:79843228:1 gene:ENSG00000212620 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT097123 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001201 // RefSeq // Homo sapiens bone morphogenetic protein 3 (BMP3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000282701 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:81030965:81057531:1 gene:ENSG00000152785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC096269 // GenBank // Homo sapiens bone morphogenetic protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:116934 IMAGE:40006302), complete cds. // chr4 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC096270 // GenBank // Homo sapiens bone morphogenetic protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:116935 IMAGE:40006303), complete cds. // chr4 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC096271 // GenBank // Homo sapiens bone morphogenetic protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:116936 IMAGE:40006304), complete cds. // chr4 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC117514 // GenBank // Homo sapiens bone morphogenetic protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:116937 IMAGE:40006306), complete cds. // chr4 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000005137 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:81031285:81046693:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0
ENST00000384337 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:81334303:81334418:1 gene:ENSG00000207065 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT097146 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000365615 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:82174547:82174653:1 gene:ENSG00000202485 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONHSAT097157 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
ENST00000504996 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:82275071:82276600:1 gene:ENSG00000234568 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000044855 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:82275575:82276603:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_024672 // RefSeq // Homo sapiens THAP domain containing 9 (THAP9), mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// XM_005263221 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens THAP domain containing 9 (THAP9), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000302236 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:82900752:82919969:1 gene:ENSG00000168152 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000505901 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:82900769:82919460:1 gene:ENSG00000168152 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 96 // 82 // 26 // 27 // 0 /// ENST00000506208 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:82906426:82917040:1 gene:ENSG00000168152 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 90 // 30 // 9 // 10 // 0 /// ENST00000509353 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:82900766:82907791:1 gene:ENSG00000168152 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000514244 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:82900703:82907915:1 gene:ENSG00000168152 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// AK091412 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ34093 fis, clone FCBBF3006821, highly similar to Homo sapiens THAP domain containing 9 (THAP9), mRNA. // chr4 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BX648134 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686P1740 (from clone DKFZp686P1740). // chr4 // 96 // 73 // 23 // 24 // 0 /// ENST00000514440 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:82900684:82904824:1 gene:ENSG00000168152 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
NM_016067 // RefSeq // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein S18C (MRPS18C), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// XM_005263043 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein S18C (MRPS18C), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 50 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000295491 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:83455965:83462298:1 gene:ENSG00000163319 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000505719 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:83456090:83461328:1 gene:ENSG00000163319 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 82 // 61 // 9 // 11 // 0 /// ENST00000507019 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:4:83455983:83461423:1 gene:ENSG00000163319 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 67 // 12 // 12 // 0 /// AF151892 // GenBank // Homo sapiens CGI-134 protein mRNA, complete cds. // chr4 // 94 // 94 // 16 // 17 // 0 /// BC005186 // GenBank // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein S18C, mRNA (cDNA clone MGC:12177 IMAGE:3839381), complete cds. // chr4 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000509970 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:83456083:83467504:1 gene:ENSG00000163319 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 44 // 44 // 8 // 18 // 1
NM_001263 // RefSeq // Homo sapiens CDP-diacylglycerol synthase (phosphatidate cytidylyltransferase) 1 (CDS1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000295887 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:84582979:84651338:1 gene:ENSG00000163624 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000511298 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:84583269:84619511:1 gene:ENSG00000163624 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 33 // 14 // 14 // 0 /// BC074833 // GenBank // Homo sapiens CDP-diacylglycerol synthase (phosphatidate cytidylyltransferase) 1, mRNA (cDNA clone MGC:104094 IMAGE:30915545), complete cds. // chr4 // 100 // 71 // 30 // 30 // 0 /// BC074881 // GenBank // Homo sapiens CDP-diacylglycerol synthase (phosphatidate cytidylyltransferase) 1, mRNA (cDNA clone MGC:103857 IMAGE:30915239), complete cds. // chr4 // 100 // 71 // 30 // 30 // 0 /// U60808 // GenBank // Human CDP-diacylglycerol synthase (CDS) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// U65887 // GenBank // Human CDP-diacylglycerol synthase mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000028549 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:84580602:84649939:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 38 // 38 // 16 // 42 // 1
NR_015359 // RefSeq // Homo sapiens WDFY3 antisense RNA 2 (WDFY3-AS2), long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000318186 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:84966793:85007015:1 gene:ENSG00000180769 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000451762 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:84966385:85011277:1 gene:ENSG00000180769 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AY250185 // GenBank // Homo sapiens C4ORF12 protein (C4ORF12) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NONHSAT097251 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT097252 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONHSAT097254 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT097255 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 92 // 42 // 12 // 13 // 0
ENST00000365031 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:85100496:85100823:1 gene:ENSG00000201901 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT097260 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NONHSAT097310 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_014208 // RefSeq // Homo sapiens dentin sialophosphoprotein (DSPP), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000282478 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:87610876:87616910:1 gene:ENSG00000152591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000399271 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:87608529:87616873:1 gene:ENSG00000152591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF094508 // GenBank // Homo sapiens dentin phosphoryn mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 39 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000033832 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:87565562:87616602:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0
NM_001079911 // RefSeq // Homo sapiens dentin matrix acidic phosphoprotein 1 (DMP1), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NM_004407 // RefSeq // Homo sapiens dentin matrix acidic phosphoprotein 1 (DMP1), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000282479 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:87650307:87664361:1 gene:ENSG00000152592 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000339673 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:87650307:87664361:1 gene:ENSG00000152592 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC130581 // GenBank // Homo sapiens dentin matrix acidic phosphoprotein 1, mRNA (cDNA clone MGC:163453 IMAGE:40146612), complete cds. // chr4 // 93 // 91 // 28 // 30 // 0 /// BC132865 // GenBank // Homo sapiens dentin matrix acidic phosphoprotein 1, mRNA (cDNA clone MGC:164496 IMAGE:40146887), complete cds. // chr4 // 93 // 91 // 28 // 30 // 0 /// U65378 // GenBank // Human dentin matrix protein 1 mRNA, complete cds. // chr4 // 90 // 91 // 27 // 30 // 0 /// U89012 // GenBank // Homo sapiens dentin matrix acidic phosphoprotein 1 (DMP1) mRNA, complete cds. // chr4 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000038119 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:87656493:87663320:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 67 // 21 // 22 // 0
NM_004967 // RefSeq // Homo sapiens integrin-binding sialoprotein (IBSP), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000226284 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:87799581:87812435:1 gene:ENSG00000029559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// J05213 // GenBank // Homo sapiens sialoprotein precursor (IBSP) mRNA, complete cds. // chr4 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000038129 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:87802362:87894015:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0
ENST00000505987 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:87891843:87894015:1 gene:ENSG00000183199 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// AY956764 // GenBank // Homo sapiens heat shock protein 90Bc (HSP90Bc) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000038129 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:87802362:87894015:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
ENST00000365130 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:88000237:88000401:1 gene:ENSG00000202000 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT097331 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000364837 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:88201703:88201810:1 gene:ENSG00000201707 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT097336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000362456 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:88226729:88226829:1 gene:ENSG00000199326 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT097339 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0
NM_145715 // RefSeq // Homo sapiens tigger transposable element derived 2 (TIGD2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000317005 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:89112817:89114899:1 gene:ENSG00000180346 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// EU794666 // GenBank // Homo sapiens epididymis luminal protein 106 (HEL106) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000036265 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:89112975:89114552:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1
NM_007351 // RefSeq // Homo sapiens multimerin 1 (MMRN1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000264790 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:89894901:89954627:1 gene:ENSG00000138722 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000394980 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:89879532:89954629:1 gene:ENSG00000138722 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000508372 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:89901983:89953455:1 gene:ENSG00000138722 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 59 // 21 // 22 // 0 /// AK302421 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55622 complete cds, highly similar to Multimerin-1 precursor. // chr4 // 91 // 59 // 20 // 22 // 0 /// BC063848 // GenBank // Homo sapiens multimerin 1, mRNA (cDNA clone MGC:75051 IMAGE:6180674), complete cds. // chr4 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// U27109 // GenBank // Human prepromultimerin mRNA, complete cds. // chr4 // 97 // 95 // 34 // 35 // 0 /// GENSCAN00000019483 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:89895086:89953418:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 78 // 29 // 29 // 0
NM_207491 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil serine-rich protein 1 (CCSER1), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000432775 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:90235031:90782004:1 gene:ENSG00000184305 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000505073 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:90127535:90923530:1 gene:ENSG00000184305 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000513522 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:90628025:90938832:1 gene:ENSG00000184305 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 26 // 8 // 8 // 0 /// AK310825 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17867. // chr4 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// BC051694 // GenBank // Homo sapiens KIAA1680 protein, mRNA (cDNA clone MGC:48628 IMAGE:5296943), complete cds. // chr4 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// NM_001145065 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil serine-rich protein 1 (CCSER1), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 87 // 87 // 27 // 31 // 1 /// ENST00000509176 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:90127585:91601913:1 gene:ENSG00000184305 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 87 // 87 // 27 // 31 // 1 /// ENST00000509109 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:90649520:91130040:1 gene:ENSG00000184305 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// BC073917 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5167920, partial cds. // chr4 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// GENSCAN00000019484 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:90308285:90318163:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 26 // 8 // 8 // 0
ENST00000516278 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:90370123:90370427:1 gene:ENSG00000252087 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT097410 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000516533 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:93820171:93820280:1 gene:ENSG00000252342 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr4 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT097439 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_005172 // RefSeq // Homo sapiens atonal homolog 1 (Drosophila) (ATOH1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000306011 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:93828753:93830964:1 gene:ENSG00000172238 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC069145 // GenBank // Homo sapiens atonal homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:95430 IMAGE:7217005), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC069594 // GenBank // Homo sapiens atonal homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:97152 IMAGE:7262394), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC069604 // GenBank // Homo sapiens atonal homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:97163 IMAGE:7262406), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC113623 // GenBank // Homo sapiens atonal homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:142183 IMAGE:8322675), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC113625 // GenBank // Homo sapiens atonal homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:142185 IMAGE:8322677), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046938 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:93828927:93829991:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_005390 // RefSeq // Homo sapiens pyruvate dehydrogenase (lipoamide) alpha 2 (PDHA2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000295266 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:95840019:95841474:1 gene:ENSG00000163114 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC030697 // GenBank // Homo sapiens pyruvate dehydrogenase (lipoamide) alpha 2, mRNA (cDNA clone MGC:26632 IMAGE:4824350), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC066953 // GenBank // Homo sapiens pyruvate dehydrogenase (lipoamide) alpha 2, mRNA (cDNA clone MGC:87402 IMAGE:5273609), complete cds. // chr4 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// BC119656 // GenBank // Homo sapiens pyruvate dehydrogenase (lipoamide) alpha 2, mRNA (cDNA clone MGC:149517 IMAGE:40115940), complete cds. // chr4 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// BC119657 // GenBank // Homo sapiens pyruvate dehydrogenase (lipoamide) alpha 2, mRNA (cDNA clone MGC:149518 IMAGE:40115941), complete cds. // chr4 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// BC127637 // GenBank // Homo sapiens pyruvate dehydrogenase (lipoamide) alpha 2, mRNA (cDNA clone MGC:157671 IMAGE:40115943), complete cds. // chr4 // 95 // 95 // 19 // 20 // 0 /// BC127638 // GenBank // Homo sapiens pyruvate dehydrogenase (lipoamide) alpha 2, mRNA (cDNA clone MGC:157672 IMAGE:40115944), complete cds. // chr4 // 95 // 95 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000016451 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:95821583:95841317:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0
ENST00000505291 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:96902801:96903050:1 gene:ENSG00000236764 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 77 // 54 // 10 // 13 // 0 /// NONHSAT097475 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 77 // 54 // 10 // 13 // 0
NONHSAT097484 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000513224 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:98740742:98741231:1 gene:ENSG00000227118 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 91 // 92 // 20 // 22 // 0 /// GENSCAN00000028389 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:98640541:98741298:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_032149 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 17 (C4orf17), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000326581 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:99511004:99542303:1 gene:ENSG00000138813 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000477187 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:99511012:99542285:1 gene:ENSG00000138813 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000503257 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:99519242:99529955:1 gene:ENSG00000138813 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000514652 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:99511012:99541763:1 gene:ENSG00000138813 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// AK093085 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ35766 fis, clone TESTI2004999. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC074759 // GenBank // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 17, mRNA (cDNA clone MGC:103836 IMAGE:30915218), complete cds. // chr4 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000028393 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:99513082:99542109:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0
NM_014395 // RefSeq // Homo sapiens dual adaptor of phosphotyrosine and 3-phosphoinositides (DAPP1), mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000296414 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:99816833:99870154:1 gene:ENSG00000070190 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENST00000512369 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:99816846:99868714:1 gene:ENSG00000070190 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// AF163254 // GenBank // Homo sapiens adaptor protein DAPP1 (DAPP1) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// AF178987 // GenBank // Homo sapiens protein-tyrosine phosphatase D mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// AF186022 // GenBank // Homo sapiens B lymphocyte adapter protein BAM32 (BAM32) mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// BC012924 // GenBank // Homo sapiens dual adaptor of phosphotyrosine and 3-phosphoinositides, mRNA (cDNA clone MGC:21117 IMAGE:4517170), complete cds. // chr4 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000507994 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:99816850:99864286:1 gene:ENSG00000070190 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// AK301355 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57624 complete cds, highly similar to Dual adapter for phosphotyrosine and3-phosphotyrosine and 3-phosphoinositide. // chr4 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// GENSCAN00000004964 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:99754611:99894272:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// NONHSAT097539 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
ENST00000362659 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:101723876:101723980:1 gene:ENSG00000199529 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT097573 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
ENST00000510791 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:102734358:102734612:1 gene:ENSG00000224207 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000001712 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:102734358:102751991:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT097596 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT097597 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_001008388 // RefSeq // Homo sapiens CDGSH iron sulfur domain 2 (CISD2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// XM_005263040 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens CDGSH iron sulfur domain 2 (CISD2), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 57 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000273986 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:102868978:102889242:1 gene:ENSG00000145354 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000574446 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:102869054:102887359:1 gene:ENSG00000145354 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 79 // 11 // 11 // 0 /// AK292134 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76572 complete cds. // chr4 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0 /// BC020831 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4771696, containing frame-shift errors. // chr4 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0 /// BC032300 // GenBank // Homo sapiens CDGSH iron sulfur domain 2, mRNA (cDNA clone MGC:40370 IMAGE:5105935), complete cds. // chr4 // 100 // 93 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000001711 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:102864426:102898241:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 86 // 86 // 12 // 14 // 1
ENST00000516097 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:104974672:104974771:1 gene:ENSG00000251906 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT097661 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001127208 // RefSeq // Homo sapiens tet methylcytosine dioxygenase 2 (TET2), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000265149 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:105146786:105279803:1 gene:ENSG00000168769 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000380013 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:105146786:105279803:1 gene:ENSG00000168769 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000513237 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:105146293:105279816:1 gene:ENSG00000168769 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000540549 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:105146293:105279816:1 gene:ENSG00000168769 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// FM992369 // GenBank // Homo sapiens mRNA for tet oncogene family member 2 (TET2 gene). // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000027674 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:105182194:105276519:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 91 // 91 // 20 // 22 // 1
ENST00000480252 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:105293664:105293946:1 gene:ENSG00000243383 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT097669 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0
NM_017700 // RefSeq // Homo sapiens Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 38 (ARHGEF38), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENST00000265154 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:105552620:105631680:1 gene:ENSG00000236699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENST00000506828 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:105552893:105645298:1 gene:ENSG00000236699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 92 // 44 // 11 // 12 // 0 /// NM_001242729 // RefSeq // Homo sapiens Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 38 (ARHGEF38), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1 /// XR_427548 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 38 (ARHGEF38), transcript variant X2, misc_RNA. // chr4 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1 /// ENST00000420470 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:4:105552622:105680913:1 gene:ENSG00000236699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1 /// GENSCAN00000013829 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:105589248:105677937:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
ENST00000516661 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:107435118:107435220:1 gene:ENSG00000252470 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT097720 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_000995 // RefSeq // Homo sapiens ribosomal protein L34 (RPL34), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 67 // 12 // 12 // 0 /// NM_033625 // RefSeq // Homo sapiens ribosomal protein L34 (RPL34), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000394665 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:108620590:108625255:1 gene:ENSG00000109475 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 44 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000394668 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:108620656:108630412:1 gene:ENSG00000109475 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 92 // 67 // 11 // 12 // 0 /// BC001773 // GenBank // Homo sapiens ribosomal protein L34, mRNA (cDNA clone MGC:1640 IMAGE:3355603), complete cds. // chr4 // 92 // 67 // 11 // 12 // 0 /// GENSCAN00000002372 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:108581936:108625212:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 44 // 44 // 8 // 18 // 1
ENST00000383874 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:108652150:108652256:1 gene:ENSG00000206601 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT097766 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_017918 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 109B (CCDC109B), mRNA. // chr4 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000394650 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:109560205:109688726:1 gene:ENSG00000005059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK095936 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ38617 fis, clone HEART2007231. // chr4 // 90 // 97 // 26 // 29 // 0 /// AK291098 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78514 complete cds. // chr4 // 88 // 87 // 23 // 26 // 0 /// BC002633 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 109B, mRNA (cDNA clone MGC:3443 IMAGE:3613298), complete cds. // chr4 // 92 // 83 // 23 // 25 // 0 /// ENST00000452915 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:109560990:109681469:1 gene:ENSG00000005059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// ENST00000472310 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:109560209:109683194:1 gene:ENSG00000005059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// ENST00000494604 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:109684440:109687716:1 gene:ENSG00000005059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// AK311030 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ18072. // chr4 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1 /// AL832311 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp667M1319 (from clone DKFZp667M1319). // chr4 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// GENSCAN00000025631 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:109560338:109687592:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// NONHSAT097791 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_018983 // RefSeq // Homo sapiens GAR1 ribonucleoprotein (GAR1), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NM_032993 // RefSeq // Homo sapiens GAR1 ribonucleoprotein (GAR1), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// XM_005263069 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens GAR1 ribonucleoprotein (GAR1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000226796 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:109815553:109824737:1 gene:ENSG00000109534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000394631 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:109815510:109824740:1 gene:ENSG00000109534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000506840 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:109815635:109822566:1 gene:ENSG00000109534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 67 // 14 // 14 // 0 /// AY780787 // GenBank // Homo sapiens chromosome 4 nucleolar protein family A member 1 (NOLA1) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr4 // 77 // 62 // 10 // 13 // 0 /// BC003413 // GenBank // Homo sapiens GAR1 ribonucleoprotein homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:4917 IMAGE:3451136), complete cds. // chr4 // 88 // 81 // 15 // 17 // 0 /// GENSCAN00000025656 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:109815932:109877069:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 48 // 48 // 10 // 21 // 1
NM_006583 // RefSeq // Homo sapiens retinal pigment epithelium-derived rhodopsin homolog (RRH), mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000317735 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:109827994:109844604:1 gene:ENSG00000180245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// AF012270 // GenBank // Homo sapiens visual pigment-like receptor peropsin (Rrh) mRNA, complete cds. // chr4 // 97 // 94 // 32 // 33 // 0 /// BC128120 // GenBank // Homo sapiens retinal pigment epithelium-derived rhodopsin homolog, mRNA (cDNA clone MGC:149202 IMAGE:40112275), complete cds. // chr4 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// BC128121 // GenBank // Homo sapiens retinal pigment epithelium-derived rhodopsin homolog, mRNA (cDNA clone MGC:149203 IMAGE:40112276), complete cds. // chr4 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// BC128401 // GenBank // Homo sapiens retinal pigment epithelium-derived rhodopsin homolog, mRNA (cDNA clone MGC:156162 IMAGE:40112297), complete cds. // chr4 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000025656 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:109815932:109877069:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 60 // 60 // 21 // 35 // 1
NM_198506 // RefSeq // Homo sapiens leucine-rich repeat, immunoglobulin-like and transmembrane domains 3 (LRIT3), mRNA. // chr4 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000327908 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:109851330:109872315:1 gene:ENSG00000183423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000594814 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:109848202:109872315:1 gene:ENSG00000183423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// AK126648 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44691 fis, clone BRACE3013874. // chr4 // 88 // 100 // 29 // 33 // 0 /// BC104037 // GenBank // Homo sapiens leucine-rich repeat, immunoglobulin-like and transmembrane domains 3, mRNA (cDNA clone MGC:120618 IMAGE:40026462), complete cds. // chr4 // 94 // 55 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000025656 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:109815932:109877069:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1
ENST00000390858 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:110278185:110278291:1 gene:ENSG00000212160 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT097811 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001977 // RefSeq // Homo sapiens glutamyl aminopeptidase (aminopeptidase A) (ENPEP), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000265162 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:110476073:110565285:1 gene:ENSG00000138792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC094770 // GenBank // Homo sapiens glutamyl aminopeptidase (aminopeptidase A), mRNA (cDNA clone MGC:104663 IMAGE:30528477), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// L12468 // GenBank // Homo sapiens aminopeptidase A mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// L14721 // GenBank // Homo sapiens aminopeptidase A mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000025632 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:110476415:110543070:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0
ENST00000364093 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:111331412:111331518:1 gene:ENSG00000200963 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT097829 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
BC041964 // GenBank HTC // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 32, mRNA (cDNA clone IMAGE:5302353), with apparent retained intron. // chr4 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0 /// NM_152400 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 32 (C4orf32), mRNA. // chr4 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// ENST00000309733 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:112145397:112195256:1 gene:ENSG00000174749 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// BC022534 // GenBank // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 32, mRNA (cDNA clone MGC:26681 IMAGE:4815687), complete cds. // chr4 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001128426 // RefSeq // Homo sapiens adaptor-related protein complex 1 associated regulatory protein (AP1AR), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// NM_018569 // RefSeq // Homo sapiens adaptor-related protein complex 1 associated regulatory protein (AP1AR), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000274000 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:112231737:112270047:1 gene:ENSG00000138660 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000309703 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:112231833:112269677:1 gene:ENSG00000138660 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000502954 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:112231825:112254894:1 gene:ENSG00000138660 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 91 // 38 // 10 // 11 // 0 /// ENST00000510527 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:112231740:112265319:1 gene:ENSG00000138660 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// AK310787 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17829. // chr4 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// BC009485 // GenBank // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 16, mRNA (cDNA clone MGC:16114 IMAGE:3623656), complete cds. // chr4 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000019858 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:112232092:112268409:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// AK094126 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ36807 fis, clone ASTRO2000141. // chr4 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1
NONHSAT097842 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 60 // 12 // 12 // 0
ENST00000512361 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:112653098:112654762:1 gene:ENSG00000174720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
ENST00000504528 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:112826307:112827607:1 gene:ENSG00000234841 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000038174 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:112818125:112827682:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT097887 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
ENST00000488308 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:113419840:113420136:1 gene:ENSG00000239279 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT097899 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENST00000384093 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:113420323:113420486:1 gene:ENSG00000206820 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT097900 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_003360 // RefSeq // Homo sapiens UDP glycosyltransferase 8 (UGT8), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000394511 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:114622367:114676596:1 gene:ENSG00000174607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// AK294438 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52624 complete cds, highly similar to 2-hydroxyacylsphingosine1-beta-galactosyltransferase precursor (EC 2.4.1.45). // chr4 // 94 // 60 // 17 // 18 // 0 /// U30930 // GenBank // Human UDP-Galactose ceramide galactosyl transferase (CGT) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// NM_001128174 // RefSeq // Homo sapiens UDP glycosyltransferase 8 (UGT8), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// ENST00000310836 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:114598455:114678224:1 gene:ENSG00000174607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// XM_006714303 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens UDP glycosyltransferase 8 (UGT8), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// BC075069 // GenBank // Homo sapiens UDP glycosyltransferase 8, mRNA (cDNA clone MGC:104134 IMAGE:30915590), complete cds. // chr4 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// U62899 // GenBank // Human ceramide UDPgalactosyltransferase mRNA, complete cds. // chr4 // 63 // 63 // 19 // 30 // 1 /// GENSCAN00000014953 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:114622881:114676288:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0
ENST00000496066 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:114799331:114799629:1 gene:ENSG00000240637 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT097927 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENST00000364882 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:116839279:116839385:1 gene:ENSG00000201752 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT097947 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NR_002963 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 24 (SNORA24), small nucleolar RNA. // chr4 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000384096 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:118279190:118279320:1 gene:ENSG00000275994 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA gene:ENSG00000269893 // chr4 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000602573 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:118279060:118279821:1 gene:ENSG00000269893 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr4 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT097976 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT097978 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT097979 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
ENST00000411293 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:118606450:118606553:1 gene:ENSG00000223225 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT097986 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_020961 // RefSeq // Homo sapiens methyltransferase like 14 (METTL14), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_005263166 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens methyltransferase like 14 (METTL14), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000388822 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:118685368:118715433:1 gene:ENSG00000145388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000502564 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:118692042:118704054:1 gene:ENSG00000145388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000506780 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:4:118685413:118710603:1 gene:ENSG00000145388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK296056 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56915 complete cds. // chr4 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// BC006565 // GenBank // Homo sapiens methyltransferase like 14, mRNA (cDNA clone MGC:2902 IMAGE:3010654), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC007449 // GenBank // Homo sapiens methyltransferase like 14, mRNA (cDNA clone MGC:4531 IMAGE:3010654), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006714283 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens methyltransferase like 14 (METTL14), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// ENST00000508801 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:118685415:118689429:1 gene:ENSG00000145388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1 /// GENSCAN00000016797 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:118685535:118710302:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0
NM_016599 // RefSeq // Homo sapiens myozenin 2 (MYOZ2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006714234 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens myozenin 2 (MYOZ2), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 95 // 66 // 20 // 21 // 0 /// ENST00000307128 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:119135784:119187789:1 gene:ENSG00000172399 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF249873 // GenBank // Homo sapiens muscle-specific protein (C4orf5) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// AY013295 // GenBank // Homo sapiens calcineurin-binding protein calsarcin-1 mRNA, complete cds. // chr4 // 91 // 100 // 29 // 32 // 0 /// BC005195 // GenBank // Homo sapiens myozenin 2, mRNA (cDNA clone MGC:12200 IMAGE:3934051), complete cds. // chr4 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// BC017402 // GenBank // Homo sapiens myozenin 2, mRNA (cDNA clone MGC:27163 IMAGE:4292715), complete cds. // chr4 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// BC020932 // GenBank // Homo sapiens myozenin 2, mRNA (cDNA clone MGC:24686 IMAGE:4271710), complete cds. // chr4 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// BT007214 // GenBank // Homo sapiens myozenin 2 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000016789 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:119080582:119186200:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
NM_019050 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 53 (USP53), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000274030 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:119212636:119294746:1 gene:ENSG00000145390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000450251 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:119239216:119295517:1 gene:ENSG00000145390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000507906 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:119261793:119271353:1 gene:ENSG00000145390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 89 // 24 // 8 // 9 // 0 /// ENST00000509769 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:119239640:119294638:1 gene:ENSG00000145390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000510852 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:119267381:119273330:1 gene:ENSG00000145390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1 /// AK025301 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ21648 fis, clone COL08469. // chr4 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1 /// GENSCAN00000016773 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:119212652:119293211:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// NONHSAT098040 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1
ENST00000364316 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:119367562:119367646:1 gene:ENSG00000201186 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 81 // 67 // 13 // 16 // 0 /// ENST00000364104 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:165252580:165252661:1 gene:ENSG00000200974 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 63 // 67 // 10 // 16 // 0 /// NONHSAT098043 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 81 // 67 // 13 // 16 // 0 /// NONHSAT099103 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 63 // 67 // 10 // 16 // 0
ENST00000363683 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:119947131:119947232:1 gene:ENSG00000200553 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT098111 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
ENST00000434012 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:120342056:120342647:1 gene:ENSG00000225665 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000020233 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:120321322:120367868:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT098122 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT098123 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000391057 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:120810469:120810569:1 gene:ENSG00000212359 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT098128 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_024365 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC100192379 (PP12613), long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000424958 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:121764585:121766814:1 gene:ENSG00000226757 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001178007 // RefSeq // Homo sapiens Bardet-Biedl syndrome 12 (BBS12), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_152618 // RefSeq // Homo sapiens Bardet-Biedl syndrome 12 (BBS12), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000314218 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:122732702:122744943:1 gene:ENSG00000181004 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000542236 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:122732702:122744942:1 gene:ENSG00000181004 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC055426 // GenBank // Homo sapiens Bardet-Biedl syndrome 12, mRNA (cDNA clone MGC:48618 IMAGE:5262398), complete cds. // chr4 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// BX538148 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686E11104 (from clone DKFZp686E11104); complete cds. // chr4 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000044386 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:122741899:122744025:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0
NM_002006 // RefSeq // Homo sapiens fibroblast growth factor 2 (basic) (FGF2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000264498 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:122826708:122898236:1 gene:ENSG00000138685 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000608478 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:122826831:122895464:1 gene:ENSG00000138685 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// AB451321 // GenBank // Homo sapiens FGF2 mRNA for heparin-binding growth factor 2 precursor, complete cds, clone: FLJ08202AAAN. // chr4 // 89 // 29 // 8 // 9 // 0 /// J04513 // GenBank // Human basic fibroblast growth factor (bFGF) 22.5 kd, 21 kd and 18 kd protein mRNA, complete cds. // chr4 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// M27968 // GenBank // Human basic fibroblast growth factor (FGF) mRNA, complete cds. // chr4 // 83 // 77 // 20 // 24 // 0 /// ENST00000614010 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:122826708:122898235:1 gene:ENSG00000138685 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000044389 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:122827175:122892396:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 29 // 9 // 9 // 0
NM_145207 // RefSeq // Homo sapiens spermatogenesis associated 5 (SPATA5), mRNA. // chr4 // 100 // 89 // 42 // 42 // 0 /// XM_005262784 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens spermatogenesis associated 5 (SPATA5), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 77 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000274008 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:122923074:123319450:1 gene:ENSG00000145375 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000422835 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:122923101:123102293:1 gene:ENSG00000145375 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 77 // 36 // 36 // 0 /// AF361489 // GenBank // Homo sapiens spermatogenesis associated factor (SPAF) mRNA, complete cds. // chr4 // 90 // 89 // 38 // 42 // 0 /// AF479656 // GenBank // Homo sapiens spermatogenesis associated factor protein (SPAF) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 77 // 36 // 36 // 0 /// BC048217 // GenBank // Homo sapiens spermatogenesis associated 5, mRNA (cDNA clone MGC:47791 IMAGE:6052305), complete cds. // chr4 // 100 // 55 // 26 // 26 // 0 /// XM_006714117 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens spermatogenesis associated 5 (SPATA5), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 72 // 72 // 34 // 47 // 1 /// GENSCAN00000044385 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:122929097:123264717:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 55 // 26 // 26 // 0
NM_001291285 // RefSeq // Homo sapiens FAT atypical cadherin 4 (FAT4), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 97 // 68 // 68 // 0 /// NM_001291303 // RefSeq // Homo sapiens FAT atypical cadherin 4 (FAT4), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 97 // 68 // 68 // 0 /// NM_024582 // RefSeq // Homo sapiens FAT atypical cadherin 4 (FAT4), transcript variant 3, mRNA. // chr4 // 100 // 97 // 68 // 68 // 0 /// ENST00000335110 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:125393936:125491768:1 gene:ENSG00000196159 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 41 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000394329 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:125316399:125492932:1 gene:ENSG00000196159 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 68 // 68 // 0 /// AK291461 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77878 complete cds. // chr4 // 100 // 17 // 12 // 12 // 0 /// AY356402 // GenBank // Homo sapiens fat-like cadherin FATJ protein (FATJ) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 41 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000023713 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:125316412:125322616:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 59 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000023718 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:125393936:125481738:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 34 // 24 // 24 // 0
ENST00000364427 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:125362819:125362929:1 gene:ENSG00000201297 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT098216 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_015693 // RefSeq // Homo sapiens inturned planar cell polarity protein (INTU), mRNA. // chr4 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000503626 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:127632957:127716775:1 gene:ENSG00000164066 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000503952 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:127632966:127716479:1 gene:ENSG00000164066 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// AK291481 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78175 complete cds, highly similar to Homo sapiens PDZ domain containing 6 (PDZK6), mRNA. // chr4 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// BC051698 // GenBank // Homo sapiens inturned planar cell polarity effector homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:4811690), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC130611 // GenBank // Homo sapiens inturned planar cell polarity effector homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:163483 IMAGE:40146642), complete cds. // chr4 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000335251 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:127632932:127726737:1 gene:ENSG00000164066 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 83 // 83 // 20 // 24 // 1 /// GENSCAN00000022590 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:127633035:127811669:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 58 // 58 // 14 // 24 // 1
NM_031291 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 25 (mitochondrial carrier; adenine nucleotide translocator), member 31 (SLC25A31), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000281154 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:127730378:127774299:1 gene:ENSG00000151475 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY550240 // GenBank // Homo sapiens sperm flagellar energy carrier protein (SFEC35kDa) mRNA, complete cds. // chr4 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// BC022032 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 25 (mitochondrial carrier; adenine nucleotide translocator), member 31, mRNA (cDNA clone MGC:26955 IMAGE:4822384), complete cds. // chr4 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000022590 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:127633035:127811669:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1
NONHSAT098278 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONHSAT098286 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000506566 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:129903010:129904163:1 gene:ENSG00000234125 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000043487 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:129903232:129903582:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0
ENST00000384055 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:131273242:131273348:1 gene:ENSG00000206782 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT098310 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000516205 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:131768140:131768249:1 gene:ENSG00000252014 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONHSAT098320 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_020815 // RefSeq // Homo sapiens protocadherin 10 (PCDH10), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 77 // 33 // 33 // 0 /// NM_032961 // RefSeq // Homo sapiens protocadherin 10 (PCDH10), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000264360 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:133149315:133194700:1 gene:ENSG00000138650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// AY013874 // GenBank // Homo sapiens protocadherin 10 (PCDH10) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 77 // 33 // 33 // 0 /// BC111560 // GenBank // Homo sapiens protocadherin 10, mRNA (cDNA clone MGC:133344 IMAGE:40068151), complete cds. // chr4 // 100 // 77 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000618019 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:133149315:133153888:1 gene:ENSG00000138650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 77 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000003980 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:133150174:133325393:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 67 // 29 // 29 // 0
NM_012118 // RefSeq // Homo sapiens CCR4 carbon catabolite repression 4-like (S. cerevisiae) (CCRN4L), mRNA. // chr4 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000280614 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:139015789:139045752:1 gene:ENSG00000151014 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// AF183961 // GenBank // Homo sapiens carbon catabolite repression 4 protein homolog mRNA, complete cds. // chr4 // 92 // 77 // 22 // 24 // 0 /// BC021963 // GenBank // Homo sapiens CCR4 carbon catabolite repression 4-like (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone IMAGE:2959975), complete cds. // chr4 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// BC023512 // GenBank // Homo sapiens CCR4 carbon catabolite repression 4-like (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone IMAGE:4120817), complete cds. // chr4 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// BC077723 // GenBank // Homo sapiens CCR4 carbon catabolite repression 4-like (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone IMAGE:2959976), complete cds. // chr4 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// BC113494 // GenBank // Homo sapiens CCR4 carbon catabolite repression 4-like (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:142054 IMAGE:8322546), complete cds. // chr4 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// BC113500 // GenBank // Homo sapiens CCR4 carbon catabolite repression 4-like (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:142060 IMAGE:8322552), complete cds. // chr4 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000025375 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:138961241:139045474:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0
ENST00000516694 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:139055475:139055578:1 gene:ENSG00000252503 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT098450 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000482631 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:139100377:139100658:1 gene:ENSG00000240723 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT098452 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 91 // 100 // 21 // 23 // 0
ENST00000615106 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:139155153:139155444:1 gene:ENSG00000276396 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0
GENSCAN00000025363 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:139157903:139178777:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 71 // 5 // 5 // 0
ENST00000579858 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:139185441:139185746:1 gene:ENSG00000265892 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT098456 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENST00000384654 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:139200395:139200513:1 gene:ENSG00000207384 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT098457 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_057175 // RefSeq // Homo sapiens N(alpha)-acetyltransferase 15, NatA auxiliary subunit (NAA15), mRNA. // chr4 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000296543 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:139301455:139391382:1 gene:ENSG00000164134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000398947 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:139301588:139391368:1 gene:ENSG00000164134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000480277 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:139336873:139351613:1 gene:ENSG00000164134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// AF327722 // GenBank // Homo sapiens putative acetyltransferase mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// AY039242 // GenBank // Homo sapiens gastric cancer antigen Ga19 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// AY112670 // GenBank // Homo sapiens transcriptional coactivator tubedown-100 (TBDN100) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// BC093928 // GenBank // Homo sapiens NMDA receptor regulated 1, mRNA (cDNA clone MGC:120963 IMAGE:7939773), complete cds. // chr4 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// BC104806 // GenBank // Homo sapiens NMDA receptor regulated 1, mRNA (cDNA clone MGC:132466 IMAGE:8143809), complete cds. // chr4 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// AK304417 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58231 complete cds, highly similar to NMDA receptor-regulated protein 1. // chr4 // 77 // 77 // 23 // 30 // 1 /// GENSCAN00000025369 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:139301778:139388084:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0
ENST00000363650 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:139318378:139318486:1 gene:ENSG00000200520 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT098463 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_031296 // RefSeq // Homo sapiens RAB33B, member RAS oncogene family (RAB33B), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000305626 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:139453807:139476609:1 gene:ENSG00000172007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AF350420 // GenBank // Homo sapiens RAB33B mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// BC036064 // GenBank // Homo sapiens RAB33B, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:33684 IMAGE:5288066), complete cds. // chr4 // 94 // 78 // 17 // 18 // 0 /// BC111977 // GenBank // Homo sapiens RAB33B, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:138182 IMAGE:8327445), complete cds. // chr4 // 93 // 65 // 14 // 15 // 0 /// GENSCAN00000042207 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:139453476:139473126:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 57 // 57 // 13 // 23 // 1
ENST00000484176 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:140577925:140578222:1 gene:ENSG00000242102 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT098506 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001290325 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 38 (USP38), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// NM_001290326 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 38 (USP38), transcript variant 3, mRNA. // chr4 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// NM_032557 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 38 (USP38), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000307017 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:143184945:143223830:1 gene:ENSG00000170185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000510377 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:143184917:143215577:1 gene:ENSG00000170185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000511739 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:143185694:143223830:1 gene:ENSG00000170185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 73 // 29 // 29 // 0 /// AF211481 // GenBank // Homo sapiens HP43.8KD mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 28 // 11 // 11 // 0 /// BC039115 // GenBank // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 38, mRNA (cDNA clone MGC:43052 IMAGE:5258804), complete cds. // chr4 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// BC068975 // GenBank // Homo sapiens ubiquitin specific peptidase 38, mRNA (cDNA clone MGC:70375 IMAGE:6067501), complete cds. // chr4 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000034092 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:143185451:143220456:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 55 // 22 // 22 // 0
NM_003601 // RefSeq // Homo sapiens SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 5 (SMARCA5), mRNA. // chr4 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENST00000283131 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:143513463:143557486:1 gene:ENSG00000153147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB010882 // GenBank // Homo sapiens mRNA for hSNF2H, complete cds. // chr4 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// AK316444 // GenBank // Homo sapiens cDNA, FLJ79343 complete cds, highly similar to SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5 (EC 3.6.1.-). // chr4 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// BC023144 // GenBank // Homo sapiens SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 5, mRNA (cDNA clone MGC:17104 IMAGE:4340921), complete cds. // chr4 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// AK302841 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51771 complete cds, highly similar to SWI/SNF-related matrix-associatedactin-dependent regulator of chromatin subfamily A member5 (EC 3.6.1.-). // chr4 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// GENSCAN00000024379 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:143475562:143553184:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NR_003675 // RefSeq // Homo sapiens glucuronidase, beta pseudogene 5 (GUSBP5), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000418136 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:143559487:143560064:1 gene:ENSG00000236296 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr4 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000509369 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:143559472:143568160:1 gene:ENSG00000236296 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000510805 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:143559472:143561460:1 gene:ENSG00000236296 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC025996 // GenBank // Homo sapiens glucuronidase, beta pseudogene, mRNA (cDNA clone IMAGE:4838986). // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000514475 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:143559695:143572724:1 gene:ENSG00000236296 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1 /// NONHSAT098565 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT098566 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONHSAT098567 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// TCONS_l2_00020791-XLOC_l2_010863 // Broad TUCP // linc-HHIP-2 chr4:+:144480655-144493614 // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// TCONS_l2_00021733-XLOC_l2_010863 // Broad TUCP // linc-HHIP-2 chr4:+:144480624-144489313 // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT098568 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1
NM_022475 // RefSeq // Homo sapiens hedgehog interacting protein (HHIP), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000296575 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:144646021:144745271:1 gene:ENSG00000164161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000434550 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:144646172:144660273:1 gene:ENSG00000164161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 33 // 12 // 12 // 0 /// AK074711 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ90230 fis, clone NT2RM2000410. // chr4 // 90 // 28 // 9 // 10 // 0 /// AK291849 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77575 complete cds, highly similar to Homo sapiens hedgehog interacting protein (HHIP), mRNA. // chr4 // 97 // 81 // 28 // 29 // 0 /// AY009317 // GenBank // Homo sapiens hedgehog-interacting protein (HHIP) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// AY009951 // GenBank // Homo sapiens hedgehog-interacting protein mRNA, complete cds. // chr4 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// AY358747 // GenBank // Homo sapiens clone DNA139592 HIP (UNQ5825) mRNA, complete cds. // chr4 // 97 // 94 // 33 // 34 // 0 /// BC015636 // GenBank // Homo sapiens hedgehog interacting protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:4139148), partial cds. // chr4 // 100 // 33 // 12 // 12 // 0 /// BC025311 // GenBank // Homo sapiens hedgehog interacting protein, mRNA (cDNA clone MGC:39295 IMAGE:4122618), complete cds. // chr4 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000512791 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:144708131:144715623:1 gene:ENSG00000164161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1 /// GENSCAN00000013419 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:144575279:144737883:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1
ENST00000410662 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:145035132:145035436:1 gene:ENSG00000222594 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 84 // 96 // 21 // 25 // 0 /// NONHSAT098613 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 84 // 96 // 21 // 25 // 0
NM_001040876 // RefSeq // Homo sapiens ATP-binding cassette, sub-family E (OABP), member 1 (ABCE1), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NM_002940 // RefSeq // Homo sapiens ATP-binding cassette, sub-family E (OABP), member 1 (ABCE1), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000296577 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:145097932:145129179:1 gene:ENSG00000164163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000507193 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:145098311:145127573:1 gene:ENSG00000164163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0 /// AB062293 // GenBank // Homo sapiens OK/SW-cl.40 mRNA for ATP-binding cassette sub-family E member 1, complete cds. // chr4 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0 /// AK315198 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ96183. // chr4 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0 /// BC016283 // GenBank // Homo sapiens ATP-binding cassette, sub-family E (OABP), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:9023 IMAGE:3909151), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BT009779 // GenBank // Homo sapiens ATP-binding cassette, sub-family E (OABP), member 1 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000013412 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:145104413:145127573:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0
ENST00000536295 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:145375543:145376253:1 gene:ENSG00000251333 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000013421 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:145375543:145376253:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
ENST00000384453 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:146580048:146580210:1 gene:ENSG00000207182 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT098671 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_004575 // RefSeq // Homo sapiens POU class 4 homeobox 2 (POU4F2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000281321 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:146638893:146642474:1 gene:ENSG00000151615 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC136344 // GenBank // Homo sapiens POU class 4 homeobox 2, mRNA (cDNA clone MGC:167954 IMAGE:9020331), complete cds. // chr4 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC136345 // GenBank // Homo sapiens POU class 4 homeobox 2, mRNA (cDNA clone MGC:167955 IMAGE:9020332), complete cds. // chr4 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// U06233 // GenBank // Human POU domain protein (Brn-3b) mRNA, complete cds. // chr4 // 93 // 97 // 27 // 29 // 0 /// GENSCAN00000003110 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:146639141:146655633:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1
L10123 // GenBank // Homo sapiens surfactant protein A mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// NONHSAT098680 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0
NM_018241 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 184C (TMEM184C), mRNA. // chr4 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000296582 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:147617383:147636721:1 gene:ENSG00000164168 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000505999 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:147629612:147634528:1 gene:ENSG00000164168 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 35 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000508208 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:147617386:147672044:1 gene:ENSG00000164168 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 57 // 21 // 21 // 0 /// BC046128 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 184C, mRNA (cDNA clone MGC:57601 IMAGE:5750613), complete cds. // chr4 // 100 // 57 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000002675 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:147586674:147634434:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 54 // 20 // 20 // 0
ENST00000460609 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:147808926:147809209:1 gene:ENSG00000240014 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT098691 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000365461 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:149907560:149907675:1 gene:ENSG00000202331 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT098725 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
ENST00000384393 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:149934376:149934483:1 gene:ENSG00000207121 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT098726 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001040260 // RefSeq // Homo sapiens doublecortin-like kinase 2 (DCLK2), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NM_001040261 // RefSeq // Homo sapiens doublecortin-like kinase 2 (DCLK2), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NR_036614 // RefSeq // Homo sapiens doublecortin-like kinase 2 (DCLK2), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000296550 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:150078274:150257457:1 gene:ENSG00000170390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000302176 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:150079028:150257438:1 gene:ENSG00000170390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000411937 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:150078989:150257438:1 gene:ENSG00000170390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000506325 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:150079028:150256247:1 gene:ENSG00000170390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000004024 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:150175565:150256595:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_006439 // RefSeq // Homo sapiens mab-21-like 2 (C. elegans) (MAB21L2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000317605 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:150581922:150584693:1 gene:ENSG00000181541 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AF262032 // GenBank // Homo sapiens MAB21L2 protein (MAB21L2) mRNA, complete cds. // chr4 // 94 // 77 // 16 // 17 // 0 /// BC009983 // GenBank // Homo sapiens mab-21-like 2 (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:15078 IMAGE:4125321), complete cds. // chr4 // 100 // 73 // 16 // 16 // 0
ENST00000342688 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:150720981:150721478:1 gene:ENSG00000183432 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000364394 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:151102057:151102128:1 gene:ENSG00000201264 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT098741 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001267699 // RefSeq // Homo sapiens ribosomal protein S3A (RPS3A), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_000007 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, C/D box 73A (SNORD73A), small nucleolar RNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000386062 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:151103827:151103891:1 gene:ENSG00000208797 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000507485 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:151099628:151104205:1 gene:ENSG00000145425 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK296121 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51870 complete cds, highly similar to 40S ribosomal protein S3a. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT098743 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_183375 // RefSeq // Homo sapiens protease, serine, 48 (PRSS48), mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000455694 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:151277171:151291453:1 gene:ENSG00000189099 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// BC121109 // GenBank // Homo sapiens epidermis-specific serine protease-like protein, mRNA (cDNA clone MGC:150407 IMAGE:40120369), complete cds. // chr4 // 95 // 92 // 21 // 22 // 0 /// ENST00000441586 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:151277171:151291453:1 gene:ENSG00000189099 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 58 // 58 // 14 // 24 // 1 /// BC121110 // GenBank // Homo sapiens epidermis-specific serine protease-like protein, mRNA (cDNA clone MGC:150408 IMAGE:40120371), complete cds. // chr4 // 58 // 58 // 14 // 24 // 1 /// GENSCAN00000002129 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:151277173:151314097:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 67 // 67 // 16 // 24 // 1
NM_001109977 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 160, member A1 (FAM160A1), mRNA. // chr4 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000435205 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:151409246:151663632:1 gene:ENSG00000164142 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000505231 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:151533012:151663628:1 gene:ENSG00000164142 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000513962 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:151436435:151577471:1 gene:ENSG00000164142 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0 /// AK125363 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ43373 fis, clone NTONG2007249. // chr4 // 78 // 100 // 7 // 9 // 0
ENST00000517210 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:151576766:151576916:1 gene:ENSG00000253019 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONHSAT098763 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NR_033797 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized protein DKFZP434I0714 (DKFZP434I0714), long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000604157 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:152536264:152539263:1 gene:ENSG00000268471 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AL137273 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp434I0714 (from clone DKFZp434I0714). // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT098805 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONHSAT098806 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000414628 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:152927446:152928207:1 gene:ENSG00000231841 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 93 // 100 // 14 // 15 // 0 /// GENSCAN00000036104 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:152927446:152938967:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_033393 // RefSeq // Homo sapiens FH2 domain containing 1 (FHDC1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000260008 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:152942983:152979696:1 gene:ENSG00000137460 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000511601 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:152936352:152979686:1 gene:ENSG00000137460 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000036105 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:152943058:153091249:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 78 // 78 // 32 // 41 // 1 /// AK092402 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ35083 fis, clone PLACE6005423. // chr4 // 51 // 51 // 21 // 41 // 1
NM_001131007 // RefSeq // Homo sapiens KIAA0922 (KIAA0922), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// NM_015196 // RefSeq // Homo sapiens KIAA0922 (KIAA0922), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000409663 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:153466346:153636711:1 gene:ENSG00000121210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000409959 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:153466349:153636711:1 gene:ENSG00000121210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// BC131505 // GenBank // Homo sapiens KIAA0922, mRNA (cDNA clone MGC:138827 IMAGE:40082592), complete cds. // chr4 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000240487 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:153555896:153636711:1 gene:ENSG00000121210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 78 // 78 // 32 // 41 // 1 /// GENSCAN00000004671 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:153538649:153636576:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 63 // 26 // 26 // 0
NM_004744 // RefSeq // Homo sapiens lecithin retinol acyltransferase (phosphatidylcholine--retinol O-acyltransferase) (LRAT), mRNA. // chr4 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// XM_006714412 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens lecithin retinol acyltransferase (phosphatidylcholine--retinol O-acyltransferase) (LRAT), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000336356 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:154743971:154753118:1 gene:ENSG00000121207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000510733 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:154744000:154753118:1 gene:ENSG00000121207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AF071510 // GenBank // Homo sapiens lecithin retinol acyltransferase (LRAT) mRNA, complete cds. // chr4 // 76 // 57 // 13 // 17 // 0 /// AK292598 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75813 complete cds, highly similar to Homo sapiens lecithin retinol acyltransferase (phosphatidylcholine--retinol O-acyltransferase) (LRAT), mRNA. // chr4 // 90 // 33 // 9 // 10 // 0 /// AY546085 // GenBank // Homo sapiens lecithin:retinol acyltransferase isoform 1 (LRAT) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AY546086 // GenBank // Homo sapiens lecithin:retinol acyltransferase isoform 2 (LRAT) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// BC031053 // GenBank // Homo sapiens lecithin retinol acyltransferase (phosphatidylcholine--retinol O-acyltransferase), mRNA (cDNA clone MGC:33103 IMAGE:5272486), complete cds. // chr4 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000507827 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:154740838:154751035:1 gene:ENSG00000121207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
NM_001277171 // RefSeq // Homo sapiens RNA binding motif protein 46 (RBM46), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001277173 // RefSeq // Homo sapiens RNA binding motif protein 46 (RBM46), transcript variant 3, mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NM_144979 // RefSeq // Homo sapiens RNA binding motif protein 46 (RBM46), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000281722 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:154781213:154828813:1 gene:ENSG00000151962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000510397 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:4:154781505:154828812:1 gene:ENSG00000151962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AK302720 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61489 complete cds, moderately similar to APOBEC1 complementation factor. // chr4 // 94 // 65 // 16 // 17 // 0 /// BC028588 // GenBank // Homo sapiens RNA binding motif protein 46, mRNA (cDNA clone MGC:27016 IMAGE:4830259), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000514866 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:4:154781213:154827385:1 gene:ENSG00000151962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// GENSCAN00000047397 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:154796753:154916366:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
ENST00000410650 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:154787118:154787278:1 gene:ENSG00000222582 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT098887 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
ENST00000516795 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:154790291:154790484:1 gene:ENSG00000252604 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT098888 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_000910 // RefSeq // Homo sapiens neuropeptide Y receptor Y2 (NPY2R), mRNA. // chr4 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// ENST00000329476 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:155208629:155217076:1 gene:ENSG00000185149 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// U32500 // GenBank // Human type 2 neuropeptide Y receptor mRNA, complete cds. // chr4 // 94 // 59 // 15 // 16 // 0 /// U42389 // GenBank // human neuropeptide y/peptide YY receptor type 2 mRNA, complete cds. // chr4 // 92 // 44 // 11 // 12 // 0 /// U42766 // GenBank // Human neuropeptide y2 receptor mRNA, complete cds. // chr4 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// ENST00000506608 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:155208735:155217078:1 gene:ENSG00000185149 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// GENSCAN00000047393 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:155204147:155215085:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
ENST00000516715 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:157064557:157064663:1 gene:ENSG00000252524 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT098963 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000362764 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:158395394:158395534:1 gene:ENSG00000199634 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT098995 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000607547 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:158700691:158700909:1 gene:ENSG00000271817 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_020840 // RefSeq // Homo sapiens folliculin interacting protein 2 (FNIP2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_005263161 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens folliculin interacting protein 2 (FNIP2), transcript variant X6, mRNA. // chr4 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000264433 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:158769138:158908049:1 gene:ENSG00000052795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000512986 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:158806094:158868586:1 gene:ENSG00000052795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// AK022968 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ12906 fis, clone NT2RP2004373. // chr4 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// XM_005263160 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens folliculin interacting protein 2 (FNIP2), transcript variant X5, mRNA. // chr4 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// GENSCAN00000026228 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:158806248:158945755:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_014247 // RefSeq // Homo sapiens Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 2 (RAPGEF2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000264431 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:159267737:159360169:1 gene:ENSG00000109756 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AB002311 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA0313 gene, partial cds. // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC117321 // GenBank // Homo sapiens Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 2, mRNA (cDNA clone MGC:150930 IMAGE:40125872), complete cds. // chr4 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000026231 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:159194877:159341947:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000037867 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:159342979:159360866:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0
NM_006174 // RefSeq // Homo sapiens neuropeptide Y receptor Y5 (NPY5R), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// XM_005263038 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens neuropeptide Y receptor Y5 (NPY5R), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000338566 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:163343939:163351934:1 gene:ENSG00000164129 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000506953 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:163350219:163351636:1 gene:ENSG00000164129 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 67 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000515560 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:163344102:163351934:1 gene:ENSG00000164129 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC042416 // GenBank // Homo sapiens neuropeptide Y receptor Y5, mRNA (cDNA clone MGC:34438 IMAGE:5191617), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// U56079 // GenBank // Human Y5 receptor mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 67 // 12 // 12 // 0 /// U66275 // GenBank // Human neuropeptide Y5 receptor (NPYR5) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 67 // 12 // 12 // 0 /// U94320 // GenBank // Human neuropeptide Y5 receptor (NPYY5) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 72 // 13 // 13 // 0
NM_018352 // RefSeq // Homo sapiens translation machinery associated 16 homolog (S. cerevisiae) (TMA16), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000358572 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:163494461:163520539:1 gene:ENSG00000198498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000508268 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:163494708:163517559:1 gene:ENSG00000198498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 36 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000511562 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:163494668:163515461:1 gene:ENSG00000198498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 36 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000513272 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:163494667:163519719:1 gene:ENSG00000198498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 50 // 11 // 11 // 0 /// BC011842 // GenBank // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 43, mRNA (cDNA clone MGC:19960 IMAGE:4110177), complete cds. // chr4 // 100 // 64 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000509657 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:163494442:163519720:1 gene:ENSG00000198498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 64 // 64 // 14 // 22 // 1 /// ENST00000506214 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:163512424:163519463:1 gene:ENSG00000198498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 41 // 41 // 9 // 22 // 1 /// ENST00000508652 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:163494668:163516102:1 gene:ENSG00000198498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 36 // 36 // 8 // 22 // 1 /// AK298235 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52950 complete cds. // chr4 // 36 // 36 // 8 // 22 // 1
ENST00000436268 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:163932526:163933182:1 gene:ENSG00000177803 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000022313 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:163932535:163933182:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
ENST00000411105 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:164620732:164620837:1 gene:ENSG00000223037 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT099072 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000364180 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:164787290:164787396:1 gene:ENSG00000201050 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT099077 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
ENST00000359690 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:164943290:164943937:1 gene:ENSG00000121089 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 94 // 81 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000030564 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:164943290:164945907:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0
NM_153027 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 218, member A (FAM218A), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000513876 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:164956948:164959122:1 gene:ENSG00000250486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC022381 // GenBank // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 39, mRNA (cDNA clone MGC:24024 IMAGE:4248805), complete cds. // chr4 // 100 // 73 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000030561 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:164948290:164957496:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 36 // 36 // 8 // 22 // 1
NM_001258025 // RefSeq // Homo sapiens tripartite motif containing 60 (TRIM60), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_152620 // RefSeq // Homo sapiens tripartite motif containing 60 (TRIM60), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000341062 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:165039425:165041744:1 gene:ENSG00000176979 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000508504 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:165039198:165041513:1 gene:ENSG00000176979 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000512596 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:165031953:165041744:1 gene:ENSG00000176979 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC100983 // GenBank // Homo sapiens tripartite motif-containing 60, mRNA (cDNA clone MGC:119322 IMAGE:40005592), complete cds. // chr4 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// BC100984 // GenBank // Homo sapiens tripartite motif-containing 60, mRNA (cDNA clone MGC:119323 IMAGE:40005593), complete cds. // chr4 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// BC100985 // GenBank // Homo sapiens tripartite motif-containing 60, mRNA (cDNA clone MGC:119324 IMAGE:40005594), complete cds. // chr4 // 93 // 58 // 14 // 15 // 0 /// BC100986 // GenBank // Homo sapiens tripartite motif-containing 60, mRNA (cDNA clone MGC:119325 IMAGE:40005597), complete cds. // chr4 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000507119 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:165032000:165040344:1 gene:ENSG00000176979 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// GENSCAN00000030558 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:165040073:165041488:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0
ENST00000503032 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:165059148:165060554:1 gene:ENSG00000250374 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030554 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:165059148:165060554:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000364104 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:165252580:165252661:1 gene:ENSG00000200974 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONHSAT099103 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001873 // RefSeq // Homo sapiens carboxypeptidase E (CPE), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000402744 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:165378942:165498320:1 gene:ENSG00000109472 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000431967 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:165415085:165482347:1 gene:ENSG00000109472 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 83 // 30 // 10 // 12 // 0 /// ENST00000511992 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:165418226:165484438:1 gene:ENSG00000109472 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 30 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000513982 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:165361194:165482322:1 gene:ENSG00000109472 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 25 // 10 // 10 // 0 /// AK290996 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76798 complete cds, highly similar to Homo sapiens carboxypeptidase E (CPE), mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// AK294175 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53369 complete cds, highly similar to Carboxypeptidase E precursor (EC 3.4.17.10). // chr4 // 94 // 88 // 33 // 35 // 0 /// BC033866 // GenBank // Homo sapiens carboxypeptidase E, mRNA (cDNA clone MGC:45357 IMAGE:5182962), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// BC053612 // GenBank // Homo sapiens carboxypeptidase E, mRNA (cDNA clone MGC:61542 IMAGE:6139788), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000024456 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:165453725:165525154:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 60 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000024449 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:165379222:165389669:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1
ENST00000410789 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:167662986:167663302:1 gene:ENSG00000222721 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT099123 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_007193 // RefSeq // Homo sapiens annexin A10 (ANXA10), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000359299 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:168092515:168187690:1 gene:ENSG00000109511 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000507278 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:168165184:168187690:1 gene:ENSG00000109511 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0 /// AF196478 // GenBank // Homo sapiens annexin 14 (ANX14) mRNA, complete cds. // chr4 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// AY626137 // GenBank // Homo sapiens putative annexin A10 short isoform mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0 /// BC007320 // GenBank // Homo sapiens annexin A10, mRNA (cDNA clone MGC:1303 IMAGE:2988009), complete cds. // chr4 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// ENST00000617524 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:168092575:168187677:1 gene:ENSG00000109511 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000009360 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:168013239:168187434:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 55 // 55 // 17 // 31 // 1
NONHSAT099130 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000384442 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:168471409:168471539:1 gene:ENSG00000207171 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT099134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000364306 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:168885355:168885461:1 gene:ENSG00000201176 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT099146 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000364948 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:169005249:169005344:1 gene:ENSG00000201818 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT099148 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000476759 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:173141643:173141938:1 gene:ENSG00000241652 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT099217 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_003864 // RefSeq // Homo sapiens Sin3A-associated protein, 30kDa (SAP30), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000296504 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:173370943:173377532:1 gene:ENSG00000164105 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// AF055993 // GenBank // Homo sapiens mSin3A associated polypeptide p30 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// BC016757 // GenBank // Homo sapiens Sin3A-associated protein, 30kDa, mRNA (cDNA clone MGC:13685 IMAGE:4074154), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000008952 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:173370118:173377327:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 77 // 10 // 10 // 0
NM_170710 // RefSeq // Homo sapiens WD repeat domain 17 (WDR17), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NM_181265 // RefSeq // Homo sapiens WD repeat domain 17 (WDR17), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000280190 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:176065981:176180159:1 gene:ENSG00000150627 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000443118 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:4:176150491:176182818:1 gene:ENSG00000150627 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 46 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000507824 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:4:176096485:176179769:1 gene:ENSG00000150627 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000508596 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:4:176065834:176179769:1 gene:ENSG00000150627 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// AF492460 // GenBank // Homo sapiens WD repeat 17 (WDR17) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000034800 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:175944328:176179579:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 59 // 59 // 22 // 37 // 1
ENST00000364646 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:176098163:176098285:1 gene:ENSG00000201516 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT099352 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_021928 // RefSeq // Homo sapiens signal peptidase complex subunit 3 homolog (S. cerevisiae) (SPCS3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000503362 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:176319964:176332245:1 gene:ENSG00000129128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000513139 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:176320002:176327381:1 gene:ENSG00000129128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 73 // 16 // 16 // 0 /// AK092634 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ35315 fis, clone PROST2010885, highly similar to MICROSOMAL SIGNAL PEPTIDASE 23 KDA SUBUNIT (EC 3.4.-.-). // chr4 // 100 // 64 // 14 // 14 // 0 /// AY359044 // GenBank // Homo sapiens clone DNA56049 signal peptidase (UNQ1841) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// BC047290 // GenBank // Homo sapiens signal peptidase complex subunit 3 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:54142 IMAGE:5224927), complete cds. // chr4 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000507678 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:176319991:176328406:1 gene:ENSG00000129128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 91 // 91 // 20 // 22 // 1 /// BC053883 // GenBank // Homo sapiens signal peptidase complex subunit 3 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone IMAGE:5745446). // chr4 // 91 // 91 // 20 // 22 // 1 /// ENST00000507001 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:176326956:176328353:1 gene:ENSG00000129128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 36 // 36 // 8 // 22 // 1 /// NONHSAT099358 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 91 // 91 // 20 // 22 // 1 /// NONHSAT099359 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 36 // 36 // 8 // 22 // 1
ENST00000410927 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:177181442:177181741:1 gene:ENSG00000222859 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT099373 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_018248 // RefSeq // Homo sapiens nei endonuclease VIII-like 3 (E. coli) (NEIL3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000264596 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:177309836:177362943:1 gene:ENSG00000109674 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC025954 // GenBank // Homo sapiens nei endonuclease VIII-like 3 (E. coli), mRNA (cDNA clone MGC:39163 IMAGE:4853168), complete cds. // chr4 // 94 // 97 // 29 // 31 // 0 /// ENST00000513321 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:177309903:177354279:1 gene:ENSG00000109674 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// AK307692 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ97640. // chr4 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// GENSCAN00000046896 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:177309917:177389771:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0
ENST00000364857 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:178406695:178406830:1 gene:ENSG00000201727 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT099401 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000516534 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:182548659:182548779:1 gene:ENSG00000252343 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 84 // 86 // 16 // 19 // 0 /// NONHSAT099441 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 84 // 86 // 16 // 19 // 0
NR_003612 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 92, member A1 pseudogene 2 (FAM92A1P2), non-coding RNA. // chr4 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENST00000502308 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:183037665:183040119:1 gene:ENSG00000230219 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENST00000504766 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:183037767:183039138:1 gene:ENSG00000230219 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr4 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// BC059396 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 92, member A3, mRNA (cDNA clone IMAGE:5265575). // chr4 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// NONHSAT099458 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// TCONS_l2_00020920-XLOC_l2_010963 // Broad TUCP // linc-WWC2 chr4:+:183938624-183961207 // chr4 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000015619 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:183037767:183176953:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NONHSAT099471 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000514910 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:183380345:183381705:1 gene:ENSG00000250292 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018782 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:183359958:183381705:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT099477 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_017632 // RefSeq // Homo sapiens CDKN2A interacting protein (CDKN2AIP), mRNA. // chr4 // 97 // 97 // 31 // 32 // 0 /// ENST00000302350 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:183444635:183448198:1 gene:ENSG00000168564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000504169 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:183444591:183448198:1 gene:ENSG00000168564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000506835 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:183445176:183446759:1 gene:ENSG00000168564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// AF246705 // GenBank // Homo sapiens putative serine-rich protein mRNA, partial cds. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC022270 // GenBank // Homo sapiens CDKN2A interacting protein, mRNA (cDNA clone MGC:22346 IMAGE:4697255), complete cds. // chr4 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// ENST00000510928 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:183444697:183446021:1 gene:ENSG00000168564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 30 // 30 // 10 // 33 // 1 /// NONHSAT099480 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000018753 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:183423125:183447427:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1
ENST00000394154 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:183483490:183484185:1 gene:ENSG00000213434 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000018738 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:183483490:183484185:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_001291959 // RefSeq // Homo sapiens inhibitor of growth family, member 2 (ING2), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// NM_001564 // RefSeq // Homo sapiens inhibitor of growth family, member 2 (ING2), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000302327 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:183504994:183511096:1 gene:ENSG00000168556 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AB012853 // GenBank // Homo sapiens ING1L mRNA for ING1Lp, complete cds. // chr4 // 91 // 92 // 20 // 22 // 0 /// AB196793 // GenBank // Homo sapiens ING2b mRNA for ING2 splice variant 1, complete cds. // chr4 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0 /// AF053537 // GenBank // Homo sapiens p33 (ING2) mRNA, complete cds. // chr4 // 95 // 92 // 21 // 22 // 0 /// AK294310 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52242 complete cds, highly similar to Inhibitor of growth protein 2. // chr4 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// BC030128 // GenBank // Homo sapiens inhibitor of growth family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:10524 IMAGE:3941655), complete cds. // chr4 // 96 // 96 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000018739 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:183504280:183513381:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0
ENST00000515930 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:183705931:183706031:1 gene:ENSG00000251739 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT099498 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_020225 // RefSeq // Homo sapiens storkhead box 2 (STOX2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000308497 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:183905356:184023526:1 gene:ENSG00000173320 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AK289840 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75343 complete cds. // chr4 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// BC146754 // GenBank // Homo sapiens storkhead box 2, mRNA (cDNA clone MGC:166820 IMAGE:9007190), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000018742 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:183916163:184031850:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1
ENST00000488836 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:184278936:184279233:1 gene:ENSG00000244512 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT099515 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001029887 // RefSeq // Homo sapiens helt bHLH transcription factor (HELT), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000338875 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:185018929:185020772:1 gene:ENSG00000187821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000505610 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:185018841:185020804:1 gene:ENSG00000187821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000513599 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:185018841:185020802:1 gene:ENSG00000187821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000515777 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:4:185018841:185020796:1 gene:ENSG00000187821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// BC140795 // GenBank // Homo sapiens HES/HEY-like transcription factor, mRNA (cDNA clone MGC:176472 IMAGE:9021663), complete cds. // chr4 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// BC144567 // GenBank // Homo sapiens HES/HEY-like transcription factor, mRNA (cDNA clone MGC:178112 IMAGE:9053095), complete cds. // chr4 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// BC144568 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:9053096. // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC144569 // GenBank // Homo sapiens HES/HEY-like transcription factor, mRNA (cDNA clone MGC:178114 IMAGE:9053097), complete cds. // chr4 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000023971 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:185018929:185020772:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000391085 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:186501109:186501215:1 gene:ENSG00000212387 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT099663 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_174900 // RefSeq // Homo sapiens ZFP42 zinc finger protein (ZFP42), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000326866 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:187995771:188005050:1 gene:ENSG00000179059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000509524 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:187995771:188005045:1 gene:ENSG00000179059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AF450454 // GenBank // Homo sapiens putative zinc finger protein 42 (ZFP42) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// AY429593 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 42 (ZFP42) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr4 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENST00000618147 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:188002708:188005045:1 gene:ENSG00000179059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000012904 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:188002808:188003740:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0
NM_178556 // RefSeq // Homo sapiens tripartite motif family-like 1 (TRIML1), mRNA. // chr4 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// XM_006714207 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens tripartite motif family-like 1 (TRIML1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// XM_006714208 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens tripartite motif family-like 1 (TRIML1), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000332517 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:188139419:188147622:1 gene:ENSG00000184108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000507581 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:188143643:188147743:1 gene:ENSG00000184108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 53 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000512233 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:188143663:188147306:1 gene:ENSG00000184108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 34 // 11 // 11 // 0 /// BC015684 // GenBank // Homo sapiens tripartite motif family-like 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4650977), complete cds. // chr4 // 88 // 53 // 15 // 17 // 0 /// BC113860 // GenBank // Homo sapiens tripartite motif family-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:138639 IMAGE:40033174), complete cds. // chr4 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// BC114469 // GenBank // Homo sapiens tripartite motif family-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:138638 IMAGE:40033173), complete cds. // chr4 // 96 // 75 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000012895 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:188139559:188147372:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0
ENST00000378770 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:189473147:189475190:1 gene:ENSG00000205100 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000506915 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:189472965:189475192:1 gene:ENSG00000205100 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// AY956760 // GenBank // Homo sapiens heat shock protein 90Ad (HSP90Ad) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000032244 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:189429471:189492056:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000045899 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR4_7_CTG12:189429471:189492056:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// TCONS_l2_00020973-XLOC_l2_011005 // Broad TUCP // linc-FRG1-5 chr4:+:190395549-190396339 // chr4 // 89 // 47 // 8 // 9 // 0 /// TCONS_l2_00021806-XLOC_l2_011005 // Broad TUCP // linc-FRG1-5 chr4:+:190394300-190396344 // chr4 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_004477 // RefSeq // Homo sapiens FSHD region gene 1 (FRG1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// XM_006714166 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens FSHD region gene 1 (FRG1), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 65 // 11 // 11 // 0 /// XM_006725445 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens FSHD region gene 1 (FRG1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 71 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000226798 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:189940788:189963204:1 gene:ENSG00000109536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000531991 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:189940901:189957502:1 gene:ENSG00000109536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 59 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000533157 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:189940899:189955150:1 gene:ENSG00000109536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 59 // 10 // 10 // 0 /// AK291890 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75747 complete cds, highly similar to Homo sapiens FSHD region gene 1 (FRG1), mRNA. // chr4 // 100 // 88 // 15 // 15 // 0 /// BC053997 // GenBank // Homo sapiens FSHD region gene 1, mRNA (cDNA clone MGC:61487 IMAGE:5555121), complete cds. // chr4 // 100 // 88 // 15 // 15 // 0 /// L76159 // GenBank // Homo sapiens FRG1 mRNA, complete cds. // chr4 // 88 // 100 // 15 // 17 // 0 /// ENST00000514482 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:189941024:189961176:1 gene:ENSG00000109536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 47 // 47 // 8 // 17 // 1 /// ENST00000620886 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR4_6_CTG12:189944796:189967179:1 gene:ENSG00000275145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
ENST00000362702 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:190015138:190015255:1 gene:ENSG00000199572 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000619241 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR4_6_CTG12:190019116:190019233:1 gene:ENSG00000277584 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT099813 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT135999 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0
ENST00000364275 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:190017696:190017814:1 gene:ENSG00000201145 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000616426 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR4_6_CTG12:190021674:190021792:1 gene:ENSG00000275999 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT099814 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT136000 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001137608 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 732 (ZNF732), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000419098 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:270675:305321:-1 gene:ENSG00000186777 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AK302099 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59067 complete cds, moderately similar to Zinc finger protein 595. // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000619749 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:270675:296155:-1 gene:ENSG00000186777 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000006725 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:271099:305249:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0
NM_133474 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 721 (ZNF721), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000338977 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:439988:499102:-1 gene:ENSG00000182903 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000511833 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:441695:499156:-1 gene:ENSG00000182903 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000006706 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:441695:444301:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0
NM_006651 // RefSeq // Homo sapiens complexin 1 (CPLX1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000304062 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:784957:826198:-1 gene:ENSG00000168993 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB593095 // GenBank // Homo sapiens CPLX1 mRNA for complexin-1, complete cds, clone: HP06406-RBb63D03. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AF022383 // GenBank // Homo sapiens complexin I mRNA, complete cds. // chr4 // 90 // 40 // 9 // 10 // 0 /// BC002471 // GenBank // Homo sapiens complexin 1, mRNA (cDNA clone MGC:3097 IMAGE:3349779), complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000505203 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:4:784958:826092:-1 gene:ENSG00000168993 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1 /// GENSCAN00000006705 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:772834:793313:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001347 // RefSeq // Homo sapiens diacylglycerol kinase, theta 110kDa (DGKQ), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XR_427469 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens diacylglycerol kinase, theta 110kDa (DGKQ), transcript variant X2, misc_RNA. // chr4 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000273814 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:958887:973556:-1 gene:ENSG00000145214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000509465 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:4:958888:973322:-1 gene:ENSG00000145214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC063801 // GenBank // Homo sapiens diacylglycerol kinase, theta 110kDa, mRNA (cDNA clone MGC:70803 IMAGE:6526640), complete cds. // chr4 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// GU727647 // GenBank // Homo sapiens epididymis tissue sperm binding protein Li 19mP mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// L38707 // GenBank // Human diacylglycerol kinase (DAGK) mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// ENST00000621998 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:958885:973560:-1 gene:ENSG00000145214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000006704 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:960440:973482:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0
AK091779 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ34460 fis, clone HLUNG2002942. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NR_024569 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC100130872 (LOC100130872), long non-coding RNA. // chr4 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// ENST00000400762 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:1199028:1208962:-1 gene:ENSG00000159674 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// GENSCAN00000040579 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:1200250:1209371:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// NONHSAT094677 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// NONHSAT094680 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_001013622 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 53, member A (FAM53A), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NM_001174070 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 53, member A (FAM53A), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NM_001297435 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 53, member A (FAM53A), transcript variant 3, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000308132 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:1639881:1684261:-1 gene:ENSG00000174137 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000461064 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:1640495:1668905:-1 gene:ENSG00000174137 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// ENST00000463238 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:1655536:1684302:-1 gene:ENSG00000174137 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 94 // 55 // 17 // 18 // 0 /// ENST00000472884 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:1640602:1683991:-1 gene:ENSG00000174137 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000489363 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:1640466:1684127:-1 gene:ENSG00000174137 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC070112 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 53, member A, mRNA (cDNA clone MGC:87650 IMAGE:5268061), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000040578 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:1651588:1657534:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0
ENST00000384282 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:1683420:1683529:-1 gene:ENSG00000207009 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT094731 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_012318 // RefSeq // Homo sapiens leucine zipper-EF-hand containing transmembrane protein 1 (LETM1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_005247970 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens leucine zipper-EF-hand containing transmembrane protein 1 (LETM1), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000302787 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:1811479:1856247:-1 gene:ENSG00000168924 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AF061025 // GenBank // Homo sapiens leucine zipper-EF-hand containing transmembrane protein 1 (LETM1) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC014500 // GenBank // Homo sapiens leucine zipper-EF-hand containing transmembrane protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:23613 IMAGE:4860194), complete cds. // chr4 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// BC021208 // GenBank // Homo sapiens leucine zipper-EF-hand containing transmembrane protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:12631 IMAGE:4126510), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000466175 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:1834100:1855955:-1 gene:ENSG00000168924 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1 /// AK293572 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60432 complete cds, highly similar to Leucine zipper-EF-hand-containing transmembrane protein 1. // chr4 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1 /// GENSCAN00000040584 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:1814424:1856824:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 70 // 16 // 16 // 0
NONHSAT094746 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
AF161361 // GenBank // Homo sapiens HSPC098 mRNA, partial cds. // chr4 // 83 // 100 // 19 // 23 // 0 /// NONHSAT094752 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_181808 // RefSeq // Homo sapiens polymerase (DNA directed) nu (POLN), mRNA. // chr4 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000382865 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:2071918:2229231:-1 gene:ENSG00000130997 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000511098 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:4:2071950:2179387:-1 gene:ENSG00000130997 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 69 // 21 // 22 // 0 /// ENST00000511885 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:2071918:2242121:-1 gene:ENSG00000130997 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000514858 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:2078492:2208111:-1 gene:ENSG00000130997 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000515357 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:2156394:2242121:-1 gene:ENSG00000130997 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// AK131239 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ16155 fis, clone BRAWH1000369, highly similar to Homo sapiens putative DNA polymerase mRNA. // chr4 // 87 // 47 // 13 // 15 // 0 /// AK303673 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61029 complete cds, highly similar to DNA polymerase nu (EC 2.7.7.7). // chr4 // 94 // 56 // 17 // 18 // 0 /// AY136549 // GenBank // Homo sapiens DNA polymerase N mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000013009 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:2125542:2261980:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1
NM_024511 // RefSeq // Homo sapiens HAUS augmin-like complex, subunit 3 (HAUS3), mRNA. // chr4 // 97 // 89 // 30 // 31 // 0 /// ENST00000243706 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:2228349:2242133:-1 gene:ENSG00000214367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000443786 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:2231841:2242164:-1 gene:ENSG00000214367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000502440 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:2240916:2242128:-1 gene:ENSG00000214367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 23 // 8 // 8 // 0 /// BC003648 // GenBank // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 15, mRNA (cDNA clone MGC:4701 IMAGE:3534250), complete cds. // chr4 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// BC025356 // GenBank // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 15, mRNA (cDNA clone MGC:39444 IMAGE:4906369), complete cds. // chr4 // 100 // 57 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000506763 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:2227464:2242121:-1 gene:ENSG00000214367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 66 // 66 // 23 // 35 // 1 /// AK293948 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52073 complete cds. // chr4 // 66 // 66 // 23 // 35 // 1 /// ENST00000511885 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:2071918:2242121:-1 gene:ENSG00000130997 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 23 // 23 // 8 // 35 // 1 /// GENSCAN00000013009 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:2125542:2261980:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 66 // 66 // 23 // 35 // 1
NM_006454 // RefSeq // Homo sapiens MAX dimerization protein 4 (MXD4), mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000337190 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:2247432:2262294:-1 gene:ENSG00000123933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AF040963 // GenBank // Homo sapiens Mad4 homolog (Mad4) mRNA, complete cds. // chr4 // 93 // 54 // 14 // 15 // 0 /// AF082740 // GenBank // Homo sapiens Max-associated protein (MAD4) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC068060 // GenBank // Homo sapiens MAX dimerization protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:78518 IMAGE:6538192), complete cds. // chr4 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// BT019969 // GenBank // Homo sapiens MAX dimerization protein 4 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// BT019970 // GenBank // Homo sapiens MAX dimerization protein 4 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000513372 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:2249464:2255234:-1 gene:ENSG00000123933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// AK024501 // GenBank // Homo sapiens mRNA for FLJ00110 protein, partial cds. // chr4 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// BC002713 // GenBank // Homo sapiens MAX dimerization protein 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:3627757), complete cds. // chr4 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// GENSCAN00000013009 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:2125542:2261980:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
ENST00000481268 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:2316197:2316506:-1 gene:ENSG00000239247 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT094782 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000384011 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:2615124:2615224:-1 gene:ENSG00000206738 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT094801 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
ENST00000398413 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:3901566:3902594:-1 gene:ENSG00000234386 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000010239 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:3902169:3921864:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
ENST00000503910 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:4174319:4175238:-1 gene:ENSG00000249844 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr4 // 100 // 70 // 7 // 7 // 0 /// GENSCAN00000020439 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:4076989:4226864:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_177998 // RefSeq // Homo sapiens otopetrin 1 (OTOP1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000296358 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:4188803:4226889:-1 gene:ENSG00000163982 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0 /// BC130430 // GenBank // Homo sapiens otopetrin 1, mRNA (cDNA clone MGC:163302 IMAGE:40146461), complete cds. // chr4 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0 /// BC130432 // GenBank // Homo sapiens otopetrin 1, mRNA (cDNA clone MGC:163304 IMAGE:40146463), complete cds. // chr4 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000020439 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:4076989:4226864:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0
NM_032927 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 128 (TMEM128), transcript variant 3, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000254742 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:4235542:4248212:-1 gene:ENSG00000132406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// BC007729 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 128, mRNA (cDNA clone MGC:13159 IMAGE:4303698), complete cds. // chr4 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000382753 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:4235553:4248212:-1 gene:ENSG00000132406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 75 // 75 // 15 // 20 // 1 /// AK295248 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59889 complete cds. // chr4 // 50 // 50 // 10 // 20 // 1 /// BC091482 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 128, mRNA (cDNA clone MGC:110944 IMAGE:30344390), complete cds. // chr4 // 70 // 70 // 14 // 20 // 1 /// AK296007 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51973 complete cds. // chr4 // 45 // 45 // 9 // 20 // 1 /// NM_001297552 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 128 (TMEM128), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// NM_001297551 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 128 (TMEM128), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 80 // 80 // 16 // 20 // 1 /// GENSCAN00000020444 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:4236469:4248202:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 45 // 45 // 9 // 20 // 1
NM_001145725 // RefSeq // Homo sapiens Ly1 antibody reactive (LYAR), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NM_017816 // RefSeq // Homo sapiens Ly1 antibody reactive (LYAR), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000343470 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:4267701:4290169:-1 gene:ENSG00000145220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000452476 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:4267704:4290021:-1 gene:ENSG00000145220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AK000432 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ20425 fis, clone KAT02707. // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AK290750 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78186 complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC015796 // GenBank // Homo sapiens Ly1 antibody reactive homolog (mouse), mRNA (cDNA clone MGC:8861 IMAGE:3911275), complete cds. // chr4 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000513174 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:4281783:4290038:-1 gene:ENSG00000145220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// GENSCAN00000020445 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:4267889:4290453:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
NM_016930 // RefSeq // Homo sapiens syntaxin 18 (STX18), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// XM_005247972 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens syntaxin 18 (STX18), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 71 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000306200 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:4418968:4542028:-1 gene:ENSG00000168818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000503861 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:4419943:4461937:-1 gene:ENSG00000168818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 64 // 9 // 9 // 0 /// AB028741 // GenBank // Homo sapiens mRNA for syntaxin 18, complete cds. // chr4 // 100 // 71 // 10 // 10 // 0 /// AY453396 // GenBank // Homo sapiens growth-inhibiting protein 9 (GIG9) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 57 // 8 // 8 // 0 /// BC014613 // GenBank // Homo sapiens syntaxin 18, mRNA (cDNA clone MGC:3333 IMAGE:2960768), complete cds. // chr4 // 100 // 71 // 10 // 10 // 0 /// BT007150 // GenBank // Homo sapiens syntaxin 18 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 57 // 8 // 8 // 0 /// BT020135 // GenBank // Homo sapiens syntaxin 18 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 57 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000505286 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:4:4415742:4542010:-1 gene:ENSG00000168818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 57 // 57 // 8 // 14 // 1 /// AK310026 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17068. // chr4 // 57 // 57 // 8 // 14 // 1 /// GENSCAN00000020440 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:4420034:4459462:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 57 // 8 // 8 // 0
ENST00000363891 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:4920770:4921064:-1 gene:ENSG00000200761 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// NONHSAT094955 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0
NM_018659 // RefSeq // Homo sapiens cytokine-like 1 (CYTL1), mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000307746 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:5014586:5019472:-1 gene:ENSG00000170891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000506508 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:5014827:5019437:-1 gene:ENSG00000170891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000509419 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:5015144:5019441:-1 gene:ENSG00000170891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// AF193766 // GenBank // Homo sapiens cytokine-like protein C17 (C17) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF274956 // GenBank // Homo sapiens PNAS-31 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// AY359101 // GenBank // Homo sapiens clone DNA93011 HGS_RE295 (UNQ1942) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC031391 // GenBank // Homo sapiens cytokine-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:35397 IMAGE:5186334), complete cds. // chr4 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013894 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:5015151:5019445:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0
ENST00000516457 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:5426885:5426984:-1 gene:ENSG00000252266 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT094964 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000364626 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:5458581:5458881:-1 gene:ENSG00000201496 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 75 // 92 // 18 // 24 // 0 /// NONHSAT094966 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 75 // 92 // 18 // 24 // 0
NM_001166136 // RefSeq // Homo sapiens Ellis van Creveld syndrome 2 (EVC2), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// NM_147127 // RefSeq // Homo sapiens Ellis van Creveld syndrome 2 (EVC2), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006713859 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens Ellis van Creveld syndrome 2 (EVC2), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000310917 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:5562439:5709548:-1 gene:ENSG00000173040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000344408 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:5562439:5708567:-1 gene:ENSG00000173040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000475313 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:5542772:5709548:-1 gene:ENSG00000173040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000509670 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:5562789:5709063:-1 gene:ENSG00000173040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// AB083067 // GenBank // Homo sapiens LBN mRNA for limbin, complete cds. // chr4 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// AY152402 // GenBank // Homo sapiens EVC2 protein (EVC2) mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 84 // 26 // 27 // 0 /// AY152403 // GenBank // Homo sapiens EVC2 protein variant (EVC2) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// AY185210 // GenBank // Homo sapiens EVC2 (EVC2) mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000013904 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:5543131:5669524:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 53 // 17 // 17 // 0
ENST00000324058 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:5897591:5989647:-1 gene:ENSG00000181215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000531445 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:5957118:5989818:-1 gene:ENSG00000181215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC140710 // GenBank // Homo sapiens FLJ46481 protein, mRNA (cDNA clone MGC:176387 IMAGE:9021578), complete cds. // chr4 // 85 // 93 // 11 // 13 // 0 /// BX648674 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686I0747 (from clone DKFZp686I0747). // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
AF289593 // GenBank HTC // Homo sapiens clone pp7683 unknown mRNA. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
ENST00000500563 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:6707701:6709827:-1 gene:ENSG00000178988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// AF155654 // GenBank // Human putative ribosomal protein S1 mRNA. // chr4 // 91 // 82 // 21 // 23 // 0 /// AF258591 // GenBank // Homo sapiens PP784 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC066897 // GenBank // Homo sapiens Morf4 family associated protein 1-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:86990 IMAGE:4818881), complete cds. // chr4 // 87 // 82 // 20 // 23 // 0 /// NM_203462 // RefSeq // Homo sapiens Morf4 family associated protein 1-like 1 (MRFAP1L1), mRNA. // chr4 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1 /// ENST00000320848 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:6707701:6709880:-1 gene:ENSG00000178988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// BC008087 // GenBank // Homo sapiens Morf4 family associated protein 1-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:9651 IMAGE:3446352), complete cds. // chr4 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// GENSCAN00000048660 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:6709246:6709629:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0
NM_153376 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 96 (CCDC96), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000310085 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:7040849:7042939:-1 gene:ENSG00000173013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// BC105055 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 96, mRNA (cDNA clone MGC:132715 IMAGE:8144058), complete cds. // chr4 // 95 // 88 // 20 // 21 // 0 /// BC112274 // GenBank // Homo sapiens coiled-coil domain containing 96, mRNA (cDNA clone MGC:138479 IMAGE:8327742), complete cds. // chr4 // 87 // 96 // 20 // 23 // 0 /// GENSCAN00000007341 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:7041271:7042938:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0
NM_025196 // RefSeq // Homo sapiens GrpE-like 1, mitochondrial (E. coli) (GRPEL1), mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000264954 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:7058906:7068197:-1 gene:ENSG00000109519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000509696 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:7060688:7064341:-1 gene:ENSG00000109519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000514056 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:7061138:7067547:-1 gene:ENSG00000109519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// AF087896 // GenBank // Homo sapiens stress-inducible chaperone GrpE mRNA, complete cds. // chr4 // 92 // 83 // 23 // 25 // 0 /// AK301695 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52947 complete cds, highly similar to GrpE protein homolog 1, mitochondrial precursor. // chr4 // 86 // 93 // 24 // 28 // 0 /// BC024242 // GenBank // Homo sapiens GrpE-like 1, mitochondrial (E. coli), mRNA (cDNA clone MGC:33210 IMAGE:4823476), complete cds. // chr4 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000504920 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:7060529:7068064:-1 gene:ENSG00000109519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// AK098475 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ25609 fis, clone STM00363. // chr4 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// AF070525 // GenBank // Homo sapiens clone 24706 mRNA sequence. // chr4 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// GENSCAN00000007361 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:7055280:7068032:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
ENST00000363997 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:7112088:7112399:-1 gene:ENSG00000200867 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT095049 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001085382 // RefSeq // Homo sapiens prosaposin-like 1 (gene/pseudogene) (PSAPL1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000319098 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:7432258:7434945:-1 gene:ENSG00000178597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// DQ991252 // GenBank // Homo sapiens prosaposin-like protein 1 (PSAPL1) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000007351 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:7433314:7434879:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 87 // 54 // 13 // 15 // 0
NR_029511 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 95 (MIR95), microRNA. // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000385072 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:8005301:8005381:-1 gene:ENSG00000207807 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// hsa-mir-95 // miRBase Micro RNA Database // MI0000097 Homo sapiens miR-95 stem-loop // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
ENST00000516193 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:9792751:9792861:-1 gene:ENSG00000252002 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
ENST00000411154 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:10115756:10115884:-1 gene:ENSG00000223086 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT095163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_053042 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 518B (ZNF518B), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000326756 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:10439874:10457360:-1 gene:ENSG00000178163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000041056 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:10443104:10461391:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 74 // 74 // 26 // 35 // 1
NM_052964 // RefSeq // Homo sapiens cytokine-dependent hematopoietic cell linker (CLNK), mRNA. // chr4 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000226951 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:10486395:10684865:-1 gene:ENSG00000109684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000442825 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:10490215:10598681:-1 gene:ENSG00000109684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 82 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000507719 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:10531413:10656561:-1 gene:ENSG00000109684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 45 // 20 // 20 // 0 /// AB110420 // GenBank // Homo sapiens mRNA for MIST, complete cds. // chr4 // 90 // 95 // 38 // 42 // 0 /// AK093001 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ35682 fis, clone SPLEN2019102, highly similar to Homo sapiens mast cell immunoreceptor signal transducer (MIST), mRNA. // chr4 // 95 // 95 // 40 // 42 // 0 /// BC029887 // GenBank // Homo sapiens cytokine-dependent hematopoietic cell linker, mRNA (cDNA clone IMAGE:5171424), complete cds. // chr4 // 100 // 45 // 20 // 20 // 0 /// BC137553 // GenBank // Homo sapiens cytokine-dependent hematopoietic cell linker, mRNA (cDNA clone MGC:169176 IMAGE:9021553), complete cds. // chr4 // 95 // 86 // 36 // 38 // 0 /// BC137556 // GenBank // Homo sapiens cytokine-dependent hematopoietic cell linker, mRNA (cDNA clone MGC:169179 IMAGE:9021556), complete cds. // chr4 // 95 // 86 // 36 // 38 // 0 /// ENST00000515667 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:10486874:10517465:-1 gene:ENSG00000109684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 32 // 32 // 14 // 44 // 1 /// GENSCAN00000041055 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:10490467:10594662:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 50 // 50 // 22 // 44 // 1
NM_005114 // RefSeq // Homo sapiens heparan sulfate (glucosamine) 3-O-sulfotransferase 1 (HS3ST1), mRNA. // chr4 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// ENST00000002596 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:11393150:11429765:-1 gene:ENSG00000002587 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000514690 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:11399758:11428597:-1 gene:ENSG00000002587 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// AF019386 // GenBank // Homo sapiens heparan sulfate 3-O-sulfotransferase-1 precursor (3OST1) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// AK096823 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39504 fis, clone PROST2017203, highly similar to Heparan sulfate glucosamine3-O-sulfotransferase 1 precursor (EC 2.8.2.23). // chr4 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// BC057803 // GenBank // Homo sapiens heparan sulfate (glucosamine) 3-O-sulfotransferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:71699 IMAGE:5261530), complete cds. // chr4 // 89 // 70 // 17 // 19 // 0 /// ENST00000510712 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:11399758:11429564:-1 gene:ENSG00000002587 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
ENST00000410250 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:11414051:11414160:-1 gene:ENSG00000222182 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONHSAT095524 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_001189 // RefSeq // Homo sapiens NK3 homeobox 2 (NKX3-2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000382438 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:13540830:13545050:-1 gene:ENSG00000109705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF009801 // GenBank // Homo sapiens homeodomain protein (BAPX1) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC111966 // GenBank // Homo sapiens NK3 homeobox 2, mRNA (cDNA clone MGC:138171 IMAGE:8327434), complete cds. // chr4 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000036519 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:13541993:13544414:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0
NM_148894 // RefSeq // Homo sapiens biorientation of chromosomes in cell division 1-like 1 (BOD1L1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000040738 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:13568738:13627723:-1 gene:ENSG00000038219 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC016987 // GenBank // Homo sapiens biorientation of chromosomes in cell division 1-like, mRNA (cDNA clone IMAGE:4395670), complete cds. // chr4 // 100 // 57 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000482713 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:13613506:13627701:-1 gene:ENSG00000038219 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1 /// BC043603 // GenBank HTC // Homo sapiens family with sequence similarity 44, member A, mRNA (cDNA clone IMAGE:5503684), with apparent retained intron. // chr4 // 26 // 26 // 9 // 35 // 1 /// AK122806 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ16385 fis, clone TLIVE2009489. // chr4 // 23 // 23 // 8 // 35 // 1 /// GENSCAN00000036511 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:13570011:13623425:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 54 // 19 // 19 // 0
ENST00000362550 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:15093767:15094094:-1 gene:ENSG00000199420 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT095617 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_005130 // RefSeq // Homo sapiens fibroblast growth factor binding protein 1 (FGFBP1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000382333 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:15935569:15938740:-1 gene:ENSG00000137440 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK291307 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75688 complete cds, highly similar to Homo sapiens fibroblast growth factor binding protein 1 (FGFBP1), mRNA. // chr4 // 88 // 92 // 21 // 24 // 0 /// BC003628 // GenBank // Homo sapiens fibroblast growth factor binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:2568 IMAGE:3030037), complete cds. // chr4 // 88 // 92 // 21 // 24 // 0 /// BC008910 // GenBank // Homo sapiens fibroblast growth factor binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:15257 IMAGE:3689309), complete cds. // chr4 // 88 // 92 // 21 // 24 // 0 /// BC018852 // GenBank HTC // Homo sapiens fibroblast growth factor binding protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3141643). // chr4 // 88 // 92 // 21 // 24 // 0 /// M60047 // GenBank // Human heparin binding protein (HBp17) mRNA, complete cds. // chr4 // 83 // 92 // 20 // 24 // 0 /// GENSCAN00000043879 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:15935928:15936632:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0
NM_031950 // RefSeq // Homo sapiens fibroblast growth factor binding protein 2 (FGFBP2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000259989 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:15960243:15963236:-1 gene:ENSG00000137441 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY358978 // GenBank // Homo sapiens clone DNA59602 KSP37 (UNQ425) mRNA, complete cds. // chr4 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// BC025720 // GenBank // Homo sapiens fibroblast growth factor binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:34108 IMAGE:5228917), complete cds. // chr4 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0 /// AB021123 // GenBank // Homo sapiens mRNA for Ksp37, complete cds. // chr4 // 71 // 84 // 15 // 21 // 0 /// GENSCAN00000043884 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:15962458:15993753:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NONHSAT095655 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_153365 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane anterior posterior transformation 1 (TAPT1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_005248140 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens transmembrane anterior posterior transformation 1 (TAPT1), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000405303 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:16160505:16226541:-1 gene:ENSG00000169762 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000505603 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:16163261:16226471:-1 gene:ENSG00000169762 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000513782 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:16163296:16191484:-1 gene:ENSG00000169762 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 92 // 52 // 11 // 12 // 0 /// AK296104 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52307 complete cds. // chr4 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// AK299163 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59140 complete cds. // chr4 // 92 // 52 // 11 // 12 // 0 /// BC066899 // GenBank // Homo sapiens transmembrane anterior posterior transformation 1, mRNA (cDNA clone MGC:87011 IMAGE:4825556), complete cds. // chr4 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000043887 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:16163308:16227081:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 39 // 39 // 9 // 23 // 1
ENST00000384053 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:17320746:17320882:-1 gene:ENSG00000206780 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT095701 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_015688 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 184, member B (FAM184B), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000265018 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:17629306:17781512:-1 gene:ENSG00000047662 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000004259 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:17632532:17782053:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
NM_017741 // RefSeq // Homo sapiens DDB1 and CUL4 associated factor 16 (DCAF16), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000382247 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:17800655:17810758:-1 gene:ENSG00000163257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC050697 // GenBank // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 30, mRNA (cDNA clone MGC:60283 IMAGE:6044417), complete cds. // chr4 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// BC068025 // GenBank // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 30, mRNA (cDNA clone MGC:71947 IMAGE:4593954), complete cds. // chr4 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
NM_145290 // RefSeq // Homo sapiens G protein-coupled receptor 125 (GPR125), mRNA. // chr4 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// XM_005248137 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens G protein-coupled receptor 125 (GPR125), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 55 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000282943 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:22387708:22455834:-1 gene:ENSG00000152990 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 60 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000334304 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:22387375:22516054:-1 gene:ENSG00000152990 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000502482 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:22420038:22515997:-1 gene:ENSG00000152990 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 40 // 8 // 8 // 0 /// AK299168 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61345 complete cds, highly similar to Probable G-protein coupled receptor 125 precursor. // chr4 // 100 // 70 // 14 // 14 // 0 /// AY358306 // GenBank // Homo sapiens clone DNA57254 GPR125 (UNQ556) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 40 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000043064 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:22387705:22515784:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 50 // 10 // 10 // 0
ENST00000421246 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:22727375:22727950:-1 gene:ENSG00000237350 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000043054 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:22697680:22727950:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
ENST00000508032 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:24527475:24539150:-1 gene:ENSG00000109606 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// AB001636 // GenBank // Homo sapiens mRNA for ATP-dependent RNA helicase #46, complete cds. // chr4 // 92 // 93 // 23 // 25 // 0 /// AF279891 // GenBank // Homo sapiens dead box protein 15 mRNA, complete cds. // chr4 // 94 // 59 // 15 // 16 // 0 /// AK056726 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ32164 fis, clone PLACE6000379, highly similar to PUTATIVE PRE-MRNA SPLICING FACTOR RNA HELICASE. // chr4 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// AK303506 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55635 complete cds, highly similar to pre-mRNA-splicing factorATP-dependent RNA helicase DHX15 (EC 3.6.1.-). // chr4 // 83 // 67 // 15 // 18 // 0 /// NM_001358 // RefSeq // Homo sapiens DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box helicase 15 (DHX15), mRNA. // chr4 // 93 // 93 // 25 // 27 // 1 /// ENST00000336812 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:24527475:24584550:-1 gene:ENSG00000109606 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 93 // 93 // 25 // 27 // 1 /// BC035974 // GenBank // Homo sapiens DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 15, mRNA (cDNA clone MGC:32617 IMAGE:4806964), complete cds. // chr4 // 93 // 93 // 25 // 27 // 1 /// GENSCAN00000035150 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:24527924:24584672:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0
ENST00000476316 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:24563193:24563461:-1 gene:ENSG00000243005 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT095808 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_018176 // RefSeq // Homo sapiens leucine-rich repeat LGI family, member 2 (LGI2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000382114 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:24998847:25030879:-1 gene:ENSG00000153012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000512108 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:24999767:25030665:-1 gene:ENSG00000153012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// AF467955 // GenBank // Homo sapiens LGI2 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC101759 // GenBank // Homo sapiens leucine-rich repeat LGI family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:126808 IMAGE:8069265), complete cds. // chr4 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC101761 // GenBank // Homo sapiens leucine-rich repeat LGI family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:126810 IMAGE:8069267), complete cds. // chr4 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000000168 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:24906793:25030693:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1
NM_000730 // RefSeq // Homo sapiens cholecystokinin A receptor (CCKAR), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000295589 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:26481400:26490462:-1 gene:ENSG00000163394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AY322549 // GenBank // Homo sapiens cholecystokinin A receptor mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// BC074987 // GenBank // Homo sapiens cholecystokinin A receptor, mRNA (cDNA clone MGC:104068 IMAGE:30915519), complete cds. // chr4 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// L13605 // GenBank // Human cholecystokinin A receptor mRNA, complete cds. // chr4 // 95 // 91 // 20 // 21 // 0 /// L19315 // GenBank // Human cholecystokinin A receptor mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000030152 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:26478237:26557310:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0
ENST00000410274 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:27223319:27223427:-1 gene:ENSG00000222206 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT095899 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000458842 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:34966241:34966344:-1 gene:ENSG00000238694 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT095987 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_015230 // RefSeq // Homo sapiens ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 (ARAP2), mRNA. // chr4 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// XM_005262642 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 (ARAP2), transcript variant X5, mRNA. // chr4 // 100 // 50 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000303965 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:36065998:36244509:-1 gene:ENSG00000047365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// ENST00000508066 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:36160112:36243862:-1 gene:ENSG00000047365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 36 // 16 // 16 // 0 /// AF411982 // GenBank // Homo sapiens centaurin delta1 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 55 // 24 // 24 // 0 /// AF439781 // GenBank // Homo sapiens PARX protein mRNA, complete cds. // chr4 // 95 // 95 // 40 // 42 // 0 /// AK126864 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44916 fis, clone BRAMY3010321. // chr4 // 100 // 36 // 16 // 16 // 0 /// AY049733 // GenBank // Homo sapiens ARAP2 mRNA, complete cds. // chr4 // 98 // 98 // 42 // 43 // 0 /// ENST00000618163 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:36068206:36161500:-1 gene:ENSG00000047365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 55 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000013890 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:36067907:36244748:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 68 // 30 // 30 // 0
NM_001085399 // RefSeq // Homo sapiens RELT-like 1 (RELL1), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XR_427509 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens RELT-like 1 (RELL1), transcript variant X1, misc_RNA. // chr4 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000314117 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:37590800:37686376:-1 gene:ENSG00000181826 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000512114 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:37634887:37665381:-1 gene:ENSG00000181826 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// BC039540 // GenBank // Homo sapiens RELT-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:50583 IMAGE:5748847), complete cds. // chr4 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// NM_001085400 // RefSeq // Homo sapiens RELT-like 1 (RELL1), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 91 // 91 // 30 // 33 // 1 /// ENST00000454158 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:37612901:37686376:-1 gene:ENSG00000181826 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 91 // 91 // 30 // 33 // 1 /// GENSCAN00000030885 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:37631388:37649516:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000030892 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:37666867:37686419:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
ENST00000384347 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:37699895:37700002:-1 gene:ENSG00000207075 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT096017 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AF220235 // GenBank // Homo sapiens FGF-2 activity-associated protein 3 (GAFA3) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
AF289565 // GenBank HTC // Homo sapiens clone pp6414 unknown mRNA. // chr4 // 83 // 52 // 10 // 12 // 0 /// NR_026804 // RefSeq // Homo sapiens KLF3 antisense RNA 1 (KLF3-AS1), long non-coding RNA. // chr4 // 83 // 83 // 19 // 23 // 1 /// ENST00000440181 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:38612701:38664628:-1 gene:ENSG00000231160 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:antisense // chr4 // 83 // 83 // 19 // 23 // 1 /// ENST00000507091 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:38625334:38664855:-1 gene:ENSG00000231160 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:antisense // chr4 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1 /// ENST00000436901 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:38626408:38664809:-1 gene:ENSG00000231160 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron gene:ENSG00000196355 // chr4 // 83 // 52 // 10 // 12 // 0 /// NONHSAT096045 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 83 // 83 // 19 // 23 // 1 /// ENST00000610668 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:38625410:38664876:-1 gene:ENSG00000231160 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1 /// ENST00000620339 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:38625226:38664883:-1 gene:ENSG00000231160 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:antisense // chr4 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1 /// NONHSAT096051 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1
NM_006068 // RefSeq // Homo sapiens toll-like receptor 6 (TLR6), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000381950 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:38826602:38829539:-1 gene:ENSG00000174130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000436693 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:38823715:38856817:-1 gene:ENSG00000174130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000508254 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:38829023:38856817:-1 gene:ENSG00000174130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// AB020807 // GenBank // Homo sapiens mRNA for TLR6, complete cds. // chr4 // 92 // 93 // 23 // 25 // 0 /// AB445652 // GenBank // Homo sapiens TLR6 mRNA for toll-like receptor 6, complete cds. // chr4 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// BC111755 // GenBank // Homo sapiens toll-like receptor 6, mRNA (cDNA clone MGC:133029 IMAGE:40007924), complete cds. // chr4 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000514655 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:38829200:38856817:-1 gene:ENSG00000174130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// ENST00000610323 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:38826924:38829499:-1 gene:ENSG00000174130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000035852 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:38827083:38829473:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0
NM_024943 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 156 (TMEM156), mRNA. // chr4 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// XM_005262670 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens transmembrane protein 156 (TMEM156), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000372489 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:38998460:39032407:-1 gene:ENSG00000121895 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 39 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000381938 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:38966744:39032421:-1 gene:ENSG00000121895 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// BC030803 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 156, mRNA (cDNA clone MGC:22165 IMAGE:4806992), complete cds. // chr4 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000344606 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:4:38993735:39032922:-1 gene:ENSG00000121895 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 47 // 47 // 17 // 36 // 1 /// NONHSAT096065 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 39 // 14 // 14 // 0
BC006419 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3946309. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT096102 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000517166 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:39710085:39710176:-1 gene:ENSG00000252975 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT096105 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000314232 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:39770081:39771371:-1 gene:ENSG00000180610 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 91 // 73 // 10 // 11 // 0 /// GENSCAN00000033306 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:39770081:39771371:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
ENST00000384466 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:40826655:40826765:-1 gene:ENSG00000207195 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT096147 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONHSAT096149 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_003924 // RefSeq // Homo sapiens paired-like homeobox 2b (PHOX2B), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000226382 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:41744082:41748970:-1 gene:ENSG00000109132 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC017199 // GenBank // Homo sapiens paired-like homeobox 2b, mRNA (cDNA clone MGC:1678 IMAGE:3161284), complete cds. // chr4 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// D82344 // GenBank // Homo sapiens mRNA for NBPhox, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000001359 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:41745807:41749966:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0
ENST00000363468 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:41771945:41772103:-1 gene:ENSG00000200338 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT096172 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0
NM_001159547 // RefSeq // Homo sapiens BEN domain containing 4 (BEND4), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 88 // 37 // 37 // 0 /// NM_207406 // RefSeq // Homo sapiens BEN domain containing 4 (BEND4), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000502486 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:42110938:42152878:-1 gene:ENSG00000188848 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000504360 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:42110940:42152878:-1 gene:ENSG00000188848 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 37 // 37 // 0 /// AK125953 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ43965 fis, clone TESTI4017001. // chr4 // 100 // 57 // 24 // 24 // 0 /// BC128592 // GenBank // Homo sapiens BEN domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:157807 IMAGE:40127911), complete cds. // chr4 // 100 // 31 // 13 // 13 // 0 /// BC128593 // GenBank // Homo sapiens BEN domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:157808 IMAGE:40127915), complete cds. // chr4 // 100 // 33 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000611697 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:42117440:42152183:-1 gene:ENSG00000188848 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 33 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000011541 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:42119956:42152980:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 57 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT096188 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 19 // 8 // 8 // 0
ENST00000494487 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:43598544:43598844:-1 gene:ENSG00000239464 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 86 // 100 // 18 // 21 // 0 /// NONHSAT096211 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 90 // 100 // 19 // 21 // 0
NM_198353 // RefSeq // Homo sapiens potassium channel tetramerization domain containing 8 (KCTD8), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000360029 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:44173909:44448807:-1 gene:ENSG00000183783 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AK298831 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61155 complete cds, highly similar to Homo sapiens potassium channel tetramerisation domain containing 8 (KCTD8), mRNA. // chr4 // 91 // 63 // 20 // 22 // 0 /// BC132743 // GenBank // Homo sapiens potassium channel tetramerisation domain containing 8, mRNA (cDNA clone MGC:164374 IMAGE:40146765), complete cds. // chr4 // 97 // 83 // 28 // 29 // 0 /// BC136793 // GenBank // Homo sapiens potassium channel tetramerisation domain containing 8, mRNA (cDNA clone MGC:168406 IMAGE:9020783), complete cds. // chr4 // 97 // 83 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000014324 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:44447405:44448469:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 54 // 19 // 19 // 0
ENST00000502794 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:44629171:44651641:-1 gene:ENSG00000177752 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 94 // 53 // 15 // 16 // 0 /// ENST00000510035 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:44629171:44651641:-1 gene:ENSG00000177752 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// AK096895 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39576 fis, clone SKMUS2002840, moderately similar to Mus musculus YIP1B (Yip1b) mRNA. // chr4 // 88 // 80 // 21 // 24 // 0 /// BC103995 // GenBank // Homo sapiens Yip1 domain family, member 7, mRNA (cDNA clone IMAGE:40022406), complete cds. // chr4 // 94 // 53 // 15 // 16 // 0 /// BC103996 // GenBank // Homo sapiens Yip1 domain family, member 7, mRNA (cDNA clone IMAGE:40022409), complete cds. // chr4 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// NM_182592 // RefSeq // Homo sapiens Yip1 domain family, member 7 (YIPF7), mRNA. // chr4 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// ENST00000332990 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:44622337:44651641:-1 gene:ENSG00000177752 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// ENST00000415895 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:44622065:44651628:-1 gene:ENSG00000177752 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// XM_006714004 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens Yip1 domain family, member 7 (YIPF7), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// NONHSAT096227 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr4 // 94 // 53 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000014319 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:44523143:44668565:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
ENST00000512696 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:45414337:45414910:-1 gene:ENSG00000224560 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004620 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:45414337:45414645:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_173536 // RefSeq // Homo sapiens gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, gamma 1 (GABRG1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000295452 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:46035769:46124081:-1 gene:ENSG00000163285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AK289806 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78149 complete cds, highly similar to Homo sapiens gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, gamma 1, mRNA. // chr4 // 97 // 83 // 29 // 30 // 0 /// AK299884 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56944 complete cds, highly similar to Gamma-aminobutyric-acid receptor gamma-1subunit precursor. // chr4 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// BC031087 // GenBank // Homo sapiens gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:33838 IMAGE:5289008), complete cds. // chr4 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// BX648937 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686G1844 (from clone DKFZp686G1844). // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000010242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:45937438:46388706:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1
ENST00000516434 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:46531237:46531342:-1 gene:ENSG00000252243 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT096244 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000511164 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:46723830:46724408:-1 gene:ENSG00000249936 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000010243 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:46723830:46764137:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_130902 // RefSeq // Homo sapiens cytochrome c oxidase subunit VIIb2 (COX7B2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_005248056 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens cytochrome c oxidase subunit VIIb2 (COX7B2), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// XM_006713995 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens cytochrome c oxidase subunit VIIb2 (COX7B2), transcript variant X5, mRNA. // chr4 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000355591 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:46734827:46909231:-1 gene:ENSG00000170516 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000396533 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:46734827:46909207:-1 gene:ENSG00000170516 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000543208 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:46734832:46876760:-1 gene:ENSG00000170516 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AF125109 // GenBank // Homo sapiens cytochrome c oxidase subunit VIIb2 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC035923 // GenBank // Homo sapiens cytochrome c oxidase subunit VIIb2, mRNA (cDNA clone MGC:46258 IMAGE:5541089), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC107855 // GenBank // Homo sapiens cytochrome c oxidase subunit VIIb2, mRNA (cDNA clone MGC:102754 IMAGE:5171051), complete cds. // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000505102 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:46735095:46909235:-1 gene:ENSG00000170516 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_000809 // RefSeq // Homo sapiens gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, alpha 4 (GABRA4), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_001204266 // RefSeq // Homo sapiens gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, alpha 4 (GABRA4), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NM_001204267 // RefSeq // Homo sapiens gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, alpha 4 (GABRA4), transcript variant 3, mRNA. // chr4 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000264318 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:46918900:46994407:-1 gene:ENSG00000109158 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000502874 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:46971083:46993540:-1 gene:ENSG00000109158 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 53 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000508560 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:46928127:46993505:-1 gene:ENSG00000109158 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000511523 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:46928127:46993505:-1 gene:ENSG00000109158 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// BC035055 // GenBank // Homo sapiens gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, alpha 4, mRNA (cDNA clone MGC:41866 IMAGE:5259426), complete cds. // chr4 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// U30461 // GenBank // Human GABAA receptor subunit alpha4 mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 81 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000003580 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:46928225:46993424:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0
NONHSAT096247 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_017845 // RefSeq // Homo sapiens COMM domain containing 8 (COMMD8), mRNA. // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000381571 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:47450796:47463719:-1 gene:ENSG00000169019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF182421 // GenBank // Homo sapiens MDS022 (MDS022) mRNA, complete cds. // chr4 // 91 // 85 // 21 // 23 // 0 /// AY542163 // GenBank // Homo sapiens COMMD8 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// BC008371 // GenBank // Homo sapiens COMM domain containing 8, mRNA (cDNA clone MGC:12221 IMAGE:4051246), complete cds. // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC015145 // GenBank // Homo sapiens COMM domain containing 8, mRNA (cDNA clone MGC:24376 IMAGE:4052767), complete cds. // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC019826 // GenBank // Homo sapiens COMM domain containing 8, mRNA (cDNA clone MGC:29946 IMAGE:4995315), complete cds. // chr4 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000509220 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:47459847:47463665:-1 gene:ENSG00000169019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// GENSCAN00000003587 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:47428032:47463651:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT096251 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NONHSAT096260 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_003328 // RefSeq // Homo sapiens TXK tyrosine kinase (TXK), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000264316 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:48066393:48134256:-1 gene:ENSG00000074966 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000506073 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:48110569:48114545:-1 gene:ENSG00000074966 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000507351 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:48067161:48080177:-1 gene:ENSG00000074966 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000510457 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:48089385:48134229:-1 gene:ENSG00000074966 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0 /// AK300141 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59978 complete cds, highly similar to Tyrosine-protein kinase TXK (EC 2.7.10.2). // chr4 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// L27071 // GenBank // Human tyrosine kinase (TXK) mRNA, complete cds. // chr4 // 94 // 94 // 30 // 32 // 0 /// BC017829 // GenBank HTC // Homo sapiens TXK tyrosine kinase, mRNA (cDNA clone IMAGE:4617083), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr4 // 56 // 56 // 19 // 34 // 1 /// GENSCAN00000011110 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:48067637:48119594:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0
ENST00000363399 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:48106081:48106188:-1 gene:ENSG00000200269 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// NONHSAT096277 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0
ENST00000517241 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:48109353:48109410:-1 gene:ENSG00000253050 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT096278 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_003215 // RefSeq // Homo sapiens tec protein tyrosine kinase (TEC), mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000381501 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:48135783:48269864:-1 gene:ENSG00000135605 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000505452 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:48136804:48228659:-1 gene:ENSG00000135605 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000511471 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:48141356:48155866:-1 gene:ENSG00000135605 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 33 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000515146 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:48137410:48146401:-1 gene:ENSG00000135605 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 33 // 12 // 12 // 0 /// BC101711 // GenBank // Homo sapiens tec protein tyrosine kinase, mRNA (cDNA clone MGC:126760 IMAGE:8069217), complete cds. // chr4 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// BC101713 // GenBank // Homo sapiens tec protein tyrosine kinase, mRNA (cDNA clone MGC:126762 IMAGE:8069219), complete cds. // chr4 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// BC143487 // GenBank // Homo sapiens tec protein tyrosine kinase, mRNA (cDNA clone MGC:177012 IMAGE:9051995), complete cds. // chr4 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// D29767 // GenBank // Homo sapiens mRNA for Tec protein-tyrosine kinase, complete cds. // chr4 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000011097 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:48127748:48177599:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 44 // 44 // 16 // 36 // 1
ENST00000515913 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:48574453:48574520:-1 gene:ENSG00000251722 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0 /// NONHSAT096289 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0
ENST00000302806 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:48617604:48653917:-1 gene:ENSG00000075539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK131250 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ16177 fis, clone BRHIP2008389, weakly similar to Drosophila melanogaster furry protein short isoform mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_015030 // RefSeq // Homo sapiens FRY-like (FRYL), mRNA. // chr4 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// XM_005248082 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens FRY-like (FRYL), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// ENST00000358350 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:48497363:48780299:-1 gene:ENSG00000075539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// ENST00000503238 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:48497361:48634410:-1 gene:ENSG00000075539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// ENST00000507711 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:48550502:48780248:-1 gene:ENSG00000075539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// AL833444 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp313M0542 (from clone DKFZp313M0542). // chr4 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// ENST00000505759 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:4:48620657:48681171:-1 gene:ENSG00000075539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// GENSCAN00000011080 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:48494044:48634410:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
ENST00000517104 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:48932755:48932854:-1 gene:ENSG00000252913 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT096304 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000429684 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:161281902:161282618:1 gene:ENSG00000225813 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 56 // 100 // 5 // 9 // 0 /// AK125574 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ43586 fis, clone SKNMC2007504. // chr4 // 67 // 100 // 6 // 9 // 0 /// NONHSAT075174 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 56 // 100 // 5 // 9 // 0
NM_001024611 // RefSeq // Homo sapiens leucine rich repeat containing 66 (LRRC66), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000343457 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:51993702:52017620:-1 gene:ENSG00000188993 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC040414 // GenBank HTC // Homo sapiens leucine rich repeat containing 66, mRNA (cDNA clone IMAGE:5175002). // chr4 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000004120 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:51994379:52038259:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1
NM_001242690 // RefSeq // Homo sapiens endogenous retrovirus group MER34, member 1 (ERVMER34-1), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// NM_024534 // RefSeq // Homo sapiens endogenous retrovirus group MER34, member 1 (ERVMER34-1), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000440542 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:52743517:52751399:-1 gene:ENSG00000226887 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000443173 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:52742552:52751640:-1 gene:ENSG00000226887 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000454756 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:52722618:52751586:-1 gene:ENSG00000226887 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0 /// AY189288 // GenBank // Homo sapiens LP9056 protein mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// AK095318 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ37999 fis, clone CTONG2012029. // chr4 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONHSAT096379 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0
NM_152540 // RefSeq // Homo sapiens sec1 family domain containing 2 (SCFD2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000388940 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:52873788:53366061:-1 gene:ENSG00000184178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000401642 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:52872982:53366075:-1 gene:ENSG00000184178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AY299407 // GenBank // Homo sapiens syntaxin binding protein 1-like 1 (STXBP1L1) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC021137 // GenBank // Homo sapiens sec1 family domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:32058 IMAGE:4866354), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC032453 // GenBank // Homo sapiens sec1 family domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:40484 IMAGE:5176029), complete cds. // chr4 // 90 // 91 // 26 // 29 // 0 /// ENST00000611795 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:53273579:53365941:-1 gene:ENSG00000184178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000020181 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:53226942:53365941:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0
ENST00000384655 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:53265461:53265567:-1 gene:ENSG00000207385 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 92 // 100 // 12 // 13 // 0 /// NONHSAT096392 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 92 // 100 // 12 // 13 // 0
NM_032622 // RefSeq // Homo sapiens ligand of numb-protein X 1, E3 ubiquitin protein ligase (LNX1), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000306888 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:53459301:53558217:-1 gene:ENSG00000072201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// AF237782 // GenBank // Homo sapiens multi-PDZ-domain-containing protein mRNA, complete cds. // chr4 // 94 // 84 // 30 // 32 // 0 /// AK294611 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53402 complete cds, highly similar to Ubiquitin ligase LNX (EC 6.3.2.-). // chr4 // 96 // 66 // 24 // 25 // 0 /// AY358326 // GenBank // Homo sapiens clone DNA57827 LNX (UNQ574) mRNA, complete cds. // chr4 // 93 // 79 // 28 // 30 // 0 /// BC034737 // GenBank // Homo sapiens ligand of numb-protein X 1, mRNA (cDNA clone MGC:34086 IMAGE:5194423), complete cds. // chr4 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// NM_001126328 // RefSeq // Homo sapiens ligand of numb-protein X 1, E3 ubiquitin protein ligase (LNX1), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 79 // 79 // 30 // 38 // 1 /// ENST00000263925 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:53460456:53591616:-1 gene:ENSG00000072201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 79 // 79 // 30 // 38 // 1 /// XM_005265785 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ligand of numb-protein X 1, E3 ubiquitin protein ligase (LNX1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 74 // 74 // 28 // 38 // 1 /// BC022983 // GenBank // Homo sapiens ligand of numb-protein X 1, mRNA (cDNA clone MGC:29996 IMAGE:4995278), complete cds. // chr4 // 74 // 74 // 28 // 38 // 1 /// BC094772 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:30341064. // chr4 // 42 // 42 // 16 // 38 // 1 /// GENSCAN00000020169 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:53460907:53574002:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 63 // 24 // 24 // 0
NR_027153 // RefSeq // Homo sapiens ribosomal protein L21 pseudogene 44 (RPL21P44), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000491826 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:53986587:53987058:-1 gene:ENSG00000229585 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000022609 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:53986584:53986994:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 52 // 12 // 12 // 0
NONHSAT096415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000517006 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:55031965:55032071:-1 gene:ENSG00000252815 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT096432 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_002253 // RefSeq // Homo sapiens kinase insert domain receptor (a type III receptor tyrosine kinase) (KDR), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000263923 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:55078477:55125589:-1 gene:ENSG00000128052 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000512566 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:55104593:55125293:-1 gene:ENSG00000128052 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 34 // 13 // 13 // 0 /// AF035121 // GenBank // Homo sapiens KDR/flk-1 protein mRNA, complete cds. // chr4 // 97 // 100 // 37 // 38 // 0 /// AF063658 // GenBank // Homo sapiens vascular endothelial growth factor receptor 2 (KDR) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// BC131822 // GenBank // Homo sapiens kinase insert domain receptor (a type III receptor tyrosine kinase), mRNA (cDNA clone MGC:157715 IMAGE:40129287), complete cds. // chr4 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// EU826563 // GenBank // Homo sapiens soluble VEGFR2 (VEGFR2) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr4 // 100 // 37 // 14 // 14 // 0 /// FJ899739 // GenBank // Homo sapiens truncated soluble vascular endothelial growth factor receptor 2 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr4 // 100 // 34 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000047336 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:55079941:55125983:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0
ENST00000475674 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:55215624:55215919:-1 gene:ENSG00000239545 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT096437 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
ENST00000459424 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:55501595:55501708:-1 gene:ENSG00000238585 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT096473 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000411373 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:55540502:55540835:-1 gene:ENSG00000223305 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 87 // 100 // 20 // 23 // 0 /// NONHSAT096474 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr4 // 87 // 100 // 20 // 23 // 0
NM_152401 // RefSeq // Homo sapiens phosducin-like 2 (PDCL2), mRNA. // chr4 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// XM_005265728 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens phosducin-like 2 (PDCL2), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000295645 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:55556525:55592212:-1 gene:ENSG00000163440 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// BC034431 // GenBank // Homo sapiens phosducin-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:35083 IMAGE:5166825), complete cds. // chr4 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000615028 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:55556528:55592212:-1 gene:ENSG00000163440 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000047330 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:55556557:55705052:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0
ENST00000516680 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:56288485:56288584:-1 gene:ENSG00000252489 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT096492 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000362686 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:12:45117771:45117888:1 gene:ENSG00000199556 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr4 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// NONHSAT027820 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// NONHSAT096497 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 48 // 100 // 12 // 25 // 0
NM_002703 // RefSeq // Homo sapiens phosphoribosyl pyrophosphate amidotransferase (PPAT), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000264220 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:56393362:56435615:-1 gene:ENSG00000128059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000507648 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:56401390:56408328:-1 gene:ENSG00000128059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 45 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000507724 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:56403074:56435496:-1 gene:ENSG00000128059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 45 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000510643 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:56403063:56435508:-1 gene:ENSG00000128059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 55 // 12 // 12 // 0 /// AK290942 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78123 complete cds, highly similar to Homo sapiens phosphoribosyl pyrophosphate amidotransferase (PPAT), mRNA. // chr4 // 88 // 73 // 14 // 16 // 0 /// BC004200 // GenBank // Homo sapiens phosphoribosyl pyrophosphate amidotransferase, mRNA (cDNA clone MGC:3674 IMAGE:3533162), complete cds. // chr4 // 89 // 82 // 16 // 18 // 0 /// D13757 // GenBank // Homo sapiens mRNA for amidophosphoribosyltransferase, complete cds. // chr4 // 95 // 86 // 18 // 19 // 0 /// U00238 // GenBank // Homo sapiens glutamine PRPP amidotransferase (GPAT) mRNA, complete cds. // chr4 // 90 // 91 // 18 // 20 // 0 /// GENSCAN00000009727 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:56395352:56406698:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 50 // 11 // 11 // 0
ENST00000514020 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:56760919:56761485:-1 gene:ENSG00000227040 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000009708 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:56747762:56761535:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONHSAT096516 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
ENST00000460700 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:56794348:56794642:-1 gene:ENSG00000240545 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT096517 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
ENST00000515990 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:56818218:56818314:-1 gene:ENSG00000251799 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT096525 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_032313 // RefSeq // Homo sapiens nitric oxide associated 1 (NOA1), mRNA. // chr4 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// ENST00000264230 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:56963370:56978823:-1 gene:ENSG00000084092 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AK128696 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ46863 fis, clone UTERU3011558. // chr4 // 90 // 100 // 26 // 29 // 0 /// BC004894 // GenBank // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 14, mRNA (cDNA clone MGC:3232 IMAGE:3504209), complete cds. // chr4 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000041660 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:56955221:56977585:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
AK001150 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ10288 fis, clone MAMMA1002317. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT096542 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONHSAT096561 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000461060 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:61775449:61775850:-1 gene:ENSG00000226439 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000043287 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:61775449:61775850:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
ENST00000470598 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:62105660:62106049:-1 gene:ENSG00000225405 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000043290 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:62105660:62106049:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000410833 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:65807240:65807435:-1 gene:ENSG00000222765 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT096669 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000383902 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:67429591:67429754:-1 gene:ENSG00000206629 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT096684 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000506882 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:67472482:67545483:-1 gene:ENSG00000145241 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 92 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000513216 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:67472477:67530866:-1 gene:ENSG00000145241 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 58 // 7 // 7 // 0 /// BC030695 // GenBank // Homo sapiens centromere protein C 1, mRNA (cDNA clone MGC:26559 IMAGE:4826768), complete cds. // chr4 // 100 // 92 // 11 // 11 // 0 /// BX648166 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686M1340 (from clone DKFZp686M1340). // chr4 // 90 // 83 // 9 // 10 // 0 /// M95724 // GenBank // H.sapiens centromere autoantigen C (CENPC) mRNA, complete cds. // chr4 // 90 // 83 // 9 // 10 // 0 /// NM_001812 // RefSeq // Homo sapiens centromere protein C (CENPC), mRNA. // chr4 // 92 // 92 // 11 // 12 // 1 /// ENST00000273853 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:67471803:67545606:-1 gene:ENSG00000145241 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 92 // 92 // 11 // 12 // 1 /// BC041117 // GenBank // Homo sapiens centromere protein C 1, mRNA (cDNA clone MGC:47774 IMAGE:5215096), complete cds. // chr4 // 75 // 75 // 9 // 12 // 1
NM_000406 // RefSeq // Homo sapiens gonadotropin-releasing hormone receptor (GNRHR), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_001012763 // RefSeq // Homo sapiens gonadotropin-releasing hormone receptor (GNRHR), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000226413 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:67739328:67754360:-1 gene:ENSG00000109163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000420975 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:67740480:67754335:-1 gene:ENSG00000109163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// AY392011 // GenBank // Homo sapiens gonadotropin-releasing hormone receptor mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// BC113546 // GenBank // Homo sapiens gonadotropin-releasing hormone receptor, mRNA (cDNA clone MGC:142106 IMAGE:8322598), complete cds. // chr4 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// L03380 // GenBank // Human gonadotropin-releasing hormone receptor mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// L07949 // GenBank // Homo sapiens GnRH receptor mRNA, complete cds. // chr4 // 95 // 78 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000034034 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:67720503:67754335:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0
NM_207407 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protease, serine 11F (TMPRSS11F), mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000356291 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:68053198:68129880:-1 gene:ENSG00000198092 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000034031 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:68069871:68099563:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 43 // 15 // 15 // 0
NR_027094 // RefSeq // Homo sapiens synaptotagmin XIV pseudogene 1 (SYT14P1), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000481459 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:68062548:68063268:-1 gene:ENSG00000215127 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr4 // 84 // 100 // 16 // 19 // 0 /// ENST00000600441 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:68061822:68063269:-1 gene:ENSG00000215127 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// AY954513 // GenBank // Homo sapiens synaptotagmin XIV derived protein mRNA, complete cds. // chr4 // 89 // 100 // 17 // 19 // 0 /// BC132697 // GenBank // Homo sapiens synaptotagmin XIV-like, mRNA (cDNA clone IMAGE:40146719). // chr4 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000034041 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:68062542:68063108:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT096720 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr4 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT096721 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr4 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT096722 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr4 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT147287 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr4 // 84 // 100 // 16 // 19 // 0
NM_182502 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protease, serine 11B (TMPRSS11B), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000332644 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:68226653:68245720:-1 gene:ENSG00000185873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK290904 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75359 complete cds. // chr4 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// AL833167 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686L1818 (from clone DKFZp686L1818); complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC126195 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protease, serine 11B, mRNA (cDNA clone MGC:161473 IMAGE:8991911), complete cds. // chr4 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BX537945 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686A2412 (from clone DKFZp686A2412); complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000502365 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:68231833:68245691:-1 gene:ENSG00000185873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// AK310210 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17252. // chr4 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// GENSCAN00000034043 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:68227911:68250665:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0
NM_001077 // RefSeq // Homo sapiens UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide B17 (UGT2B17), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000317746 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:68537184:68568527:-1 gene:ENSG00000197888 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// U59209 // GenBank // Homo sapiens C19steroid specific UDP-glucuronosyltransferase mRNA, complete cds. // chr4 // 63 // 100 // 5 // 8 // 0
AF242527 // GenBank // Homo sapiens pparl mRNA, complete cds. // chr4 // 42 // 100 // 10 // 24 // 0
AF241539 // GenBank // Homo sapiens ncaml mRNA, complete cds. // chr4 // 70 // 100 // 16 // 23 // 0
NM_014465 // RefSeq // Homo sapiens sulfotransferase family, cytosolic, 1B, member 1 (SULT1B1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000310613 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:69721162:69760712:-1 gene:ENSG00000173597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000510821 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:69734173:69760598:-1 gene:ENSG00000173597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// BC010895 // GenBank // Homo sapiens sulfotransferase family, cytosolic, 1B, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:13356 IMAGE:4105139), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// D89479 // GenBank // Homo sapiens mRNA for ST1B2, complete cds. // chr4 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// U95726 // GenBank // Human thyroid hormone sulfotransferase mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000512870 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:69754670:69787961:-1 gene:ENSG00000173597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// GENSCAN00000033279 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:69727088:69783119:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
NM_005420 // RefSeq // Homo sapiens sulfotransferase family 1E, estrogen-preferring, member 1 (SULT1E1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000226444 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:69841212:69860152:-1 gene:ENSG00000109193 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC027956 // GenBank // Homo sapiens sulfotransferase family 1E, estrogen-preferring, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:34459 IMAGE:5210178), complete cds. // chr4 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// CR407621 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834C022D for gene SULT1E1, sulfotransferase family 1E, estrogen-preferring, member 1 complete cds, without stopcodon. // chr4 // 94 // 62 // 15 // 16 // 0 /// U08098 // GenBank // Human estrogen sulfotransferase (STE) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000504002 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:69849126:69860145:-1 gene:ENSG00000109193 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// ENST00000506796 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:69810780:69847786:-1 gene:ENSG00000109193 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// AK310845 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17887. // chr4 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// GENSCAN00000033293 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:69841994:69857644:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0
NM_001891 // RefSeq // Homo sapiens casein beta (CSN2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000353151 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:69955256:69961007:-1 gene:ENSG00000135222 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC069554 // GenBank // Homo sapiens casein beta, mRNA (cDNA clone MGC:96987 IMAGE:7262196), complete cds. // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC096194 // GenBank // Homo sapiens casein beta, mRNA (cDNA clone MGC:116846 IMAGE:40004178), complete cds. // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC096195 // GenBank // Homo sapiens casein beta, mRNA (cDNA clone MGC:116847 IMAGE:40004179), complete cds. // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC096196 // GenBank // Homo sapiens casein beta, mRNA (cDNA clone MGC:116848 IMAGE:40004180), complete cds. // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC096197 // GenBank // Homo sapiens casein beta, mRNA (cDNA clone MGC:116849 IMAGE:40004181), complete cds. // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// KF751868 // GenBank // Homo sapiens casein beta mRNA, complete cds. // chr4 // 90 // 71 // 18 // 20 // 0 /// GENSCAN00000033300 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:69955587:69960995:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0
ENST00000384330 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:70703018:70703123:-1 gene:ENSG00000207058 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT096799 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000517071 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:70848136:70848218:-1 gene:ENSG00000252880 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT096811 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000410304 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:71759518:71759616:-1 gene:ENSG00000222236 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT096821 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_014243 // RefSeq // Homo sapiens ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 3 (ADAMTS3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000286657 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:72280969:72568799:-1 gene:ENSG00000156140 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC130287 // GenBank // Homo sapiens ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 3, mRNA (cDNA clone MGC:163159 IMAGE:40146318), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC132735 // GenBank // Homo sapiens ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 3, mRNA (cDNA clone MGC:164366 IMAGE:40146757), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000622135 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:72282041:72568796:-1 gene:ENSG00000156140 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000013845 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:72283136:72548992:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
NM_173827 // RefSeq // Homo sapiens COX18 cytochrome C oxidase assembly factor (COX18), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000295890 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:73056080:73069741:-1 gene:ENSG00000163626 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000449739 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:73056080:73069741:-1 gene:ENSG00000163626 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000507544 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:4:73058076:73069692:-1 gene:ENSG00000163626 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000510031 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:73058114:73069726:-1 gene:ENSG00000163626 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// BC101684 // GenBank // Homo sapiens COX18 cytochrome c oxidase assembly homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:126733 IMAGE:8069190), complete cds. // chr4 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// BC143642 // GenBank // Homo sapiens COX18 cytochrome c oxidase assembly homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:177173 IMAGE:9052156), complete cds. // chr4 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// AY957564 // GenBank // Homo sapiens mitochondrial COX18 mRNA, transcript variant 1, complete cds; nuclear gene for mitochondrial product. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 1 /// AY957565 // GenBank // Homo sapiens mitochondrial COX18 mRNA, transcript variant 2, complete cds; nuclear gene for mitochondrial product. // chr4 // 83 // 83 // 20 // 24 // 1 /// GENSCAN00000032998 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:72815961:73070020:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1
NM_002619 // RefSeq // Homo sapiens platelet factor 4 (PF4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// XM_005265696 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens platelet factor 4 (PF4), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 70 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000296029 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:73981077:73982124:-1 gene:ENSG00000163737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC093965 // GenBank // Homo sapiens platelet factor 4, mRNA (cDNA clone MGC:121000 IMAGE:7939810), complete cds. // chr4 // 88 // 80 // 14 // 16 // 0 /// BC112093 // GenBank // Homo sapiens platelet factor 4, mRNA (cDNA clone MGC:138298 IMAGE:8327561), complete cds. // chr4 // 88 // 80 // 14 // 16 // 0 /// CR407677 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834B1216D for gene PF4, platelet factor 4 (chemokine (C-X-C motif) ligand 4) complete cds, without stopcodon. // chr4 // 100 // 60 // 12 // 12 // 0 /// M25897 // GenBank // Human platelet factor 4 (PF4) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_002704 // RefSeq // Homo sapiens pro-platelet basic protein (chemokine (C-X-C motif) ligand 7) (PPBP), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000296028 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:73987038:73988197:-1 gene:ENSG00000163736 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC028217 // GenBank // Homo sapiens pro-platelet basic protein (chemokine (C-X-C motif) ligand 7), mRNA (cDNA clone MGC:40008 IMAGE:5214257), complete cds. // chr4 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// CR456805 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834A1015D for gene PPBP, pro-platelet basic protein (chemokine (C-X-C motif) ligand 7); complete cds, incl. stopcodon. // chr4 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0 /// M54995 // GenBank // Human connective tissue activation peptide III mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000049181 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:73981859:74038611:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 52 // 52 // 12 // 23 // 1
NM_002994 // RefSeq // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) ligand 5 (CXCL5), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000296027 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:73995642:73998779:-1 gene:ENSG00000163735 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC008376 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) ligand 5, mRNA (cDNA clone MGC:12304 IMAGE:3826939), complete cds. // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BT006807 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) ligand 5 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// CR457428 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834F0616D for gene CXCL5, chemokine (C-X-C motif) ligand 5; complete cds, incl. stopcodon. // chr4 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// X78686 // GenBank // H.sapiens ENA-78 mRNA. // chr4 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000049181 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:73981859:74038611:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_002090 // RefSeq // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) ligand 3 (CXCL3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000296026 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:74036589:74038689:-1 gene:ENSG00000163734 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000502974 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:74037132:74038689:-1 gene:ENSG00000163734 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 67 // 14 // 14 // 0 /// BC016308 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) ligand 3, mRNA (cDNA clone MGC:22505 IMAGE:4070983), complete cds. // chr4 // 90 // 95 // 18 // 20 // 0 /// BC065743 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) ligand 3, mRNA (cDNA clone MGC:72105 IMAGE:4717346), complete cds. // chr4 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// M36821 // GenBank // Human cytokine (GRO-gamma) mRNA, complete cds. // chr4 // 95 // 95 // 19 // 20 // 0 /// ENST00000511669 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:74037069:74038807:-1 gene:ENSG00000163734 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 71 // 71 // 15 // 21 // 1 /// AK311367 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ18409. // chr4 // 71 // 71 // 15 // 21 // 1 /// ENST00000510390 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:74037656:74038650:-1 gene:ENSG00000163734 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 48 // 48 // 10 // 21 // 1 /// NONHSAT096879 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 71 // 71 // 15 // 21 // 1
NR_026769 // RefSeq // Homo sapiens pro-platelet basic protein pseudogene 2 (PPBPP2), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000513150 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:74054038:74055399:-1 gene:ENSG00000248848 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000514391 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:74054041:74054820:-1 gene:ENSG00000248848 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr4 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// L10403 // GenBank // Homo sapiens DNA binding protein for surfactant protein B mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT096880 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT096881 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0
NM_002089 // RefSeq // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) ligand 2 (CXCL2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000296031 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:74097676:74099195:-1 gene:ENSG00000081041 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 42 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000508487 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:74097035:74099293:-1 gene:ENSG00000081041 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC015753 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) ligand 2, mRNA (cDNA clone MGC:23071 IMAGE:4875789), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// M36820 // GenBank // Human cytokine (GRO-beta) mRNA, complete cds. // chr4 // 89 // 100 // 17 // 19 // 0 /// M57731 // GenBank // Human gro-beta mRNA, complete cds. // chr4 // 83 // 95 // 15 // 18 // 0 /// NONHSAT096882 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 42 // 8 // 8 // 0
ENST00000600169 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:74156511:74158373:-1 gene:ENSG00000269559 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC045815 // GenBank // Homo sapiens hypothetical LOC541467, mRNA (cDNA clone IMAGE:4830703), partial cds. // chr4 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000049185 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:74157610:74161472:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001729 // RefSeq // Homo sapiens betacellulin (BTC), mRNA. // chr4 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000395743 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:74744759:74794686:-1 gene:ENSG00000174808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000512743 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:4:74746379:74770156:-1 gene:ENSG00000174808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// BC011618 // GenBank // Homo sapiens betacellulin, mRNA (cDNA clone MGC:10530 IMAGE:3952444), complete cds. // chr4 // 92 // 93 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011203 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:74748041:74794325:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
NR_121617 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC100507388 (LOC100507388), long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// ENST00000508031 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:74955974:74970362:-1 gene:ENSG00000249717 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr4 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// AK027257 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ23604 fis, clone LNG15857. // chr4 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// NONHSAT096904 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0
NM_003948 // RefSeq // Homo sapiens cyclin-dependent kinase-like 2 (CDC2-related kinase) (CDKL2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_005263335 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens cyclin-dependent kinase-like 2 (CDC2-related kinase) (CDKL2), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000307465 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:4:75578864:75630526:-1 gene:ENSG00000138769 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000429927 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:75578005:75630716:-1 gene:ENSG00000138769 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK294866 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56980 complete cds, highly similar to Cyclin-dependent kinase-like 2 (EC 2.7.11.22). // chr4 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// BC093646 // GenBank // Homo sapiens cyclin-dependent kinase-like 2 (CDC2-related kinase), mRNA (cDNA clone MGC:120681 IMAGE:7939491), complete cds. // chr4 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// BC093981 // GenBank // Homo sapiens cyclin-dependent kinase-like 2 (CDC2-related kinase), mRNA (cDNA clone MGC:121016 IMAGE:7939826), complete cds. // chr4 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// U35146 // GenBank // Homo sapiens p56 KKIAMRE protein kinase (KKIAMRE) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000506234 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:75598119:75630486:-1 gene:ENSG00000138769 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1 /// AK309127 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99168. // chr4 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// GENSCAN00000011205 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:75579054:75630904:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0
ENST00000364774 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:75662120:75662213:-1 gene:ENSG00000201644 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT096936 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000410712 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:75829454:75829589:-1 gene:ENSG00000222644 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 73 // 100 // 8 // 11 // 0 /// NONHSAT096942 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 73 // 100 // 8 // 11 // 0
NM_006239 // RefSeq // Homo sapiens protein phosphatase, EF-hand calcium binding domain 2 (PPEF2), mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000286719 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:75859872:75902528:-1 gene:ENSG00000156194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000511880 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:75859864:75902423:-1 gene:ENSG00000156194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF023456 // GenBank // Homo sapiens protein phosphatase with EF-hands-2 long form (PPEF-2) mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// AF023457 // GenBank // Homo sapiens protein phosphatase with EF-hands-2 short form (PPEF-2) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BX648754 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686O2298 (from clone DKFZp686O2298). // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000621010 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:75866479:75896325:-1 gene:ENSG00000156194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000041847 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:75844033:75990841:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_002416 // RefSeq // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) ligand 9 (CXCL9), mRNA. // chr4 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000264888 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:76001275:76007488:-1 gene:ENSG00000138755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// AK311852 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ92117, highly similar to Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) ligand 9 (CXCL9), mRNA. // chr4 // 95 // 68 // 18 // 19 // 0 /// BC042178 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) ligand 9, mRNA (cDNA clone IMAGE:5228247). // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC063122 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) ligand 9, mRNA (cDNA clone MGC:71972 IMAGE:30370826), complete cds. // chr4 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// BC095396 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) ligand 9, mRNA (cDNA clone MGC:110863 IMAGE:30336410), complete cds. // chr4 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000041852 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:76003598:76007449:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0
NM_001565 // RefSeq // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) ligand 10 (CXCL10), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000306602 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:76021117:76023497:-1 gene:ENSG00000169245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC010954 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) ligand 10, mRNA (cDNA clone MGC:13622 IMAGE:4274617), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000041855 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:76011136:76023431:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
NM_005409 // RefSeq // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) ligand 11 (CXCL11), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000306621 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:76033682:76036197:-1 gene:ENSG00000169248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF002985 // GenBank // Homo sapiens putative alpha chemokine (H174) mRNA, complete cds. // chr4 // 86 // 75 // 18 // 21 // 0 /// AF030514 // GenBank // Homo sapiens interferon stimulated T-cell alpha chemoattractant precursor, mRNA, complete cds. // chr4 // 82 // 79 // 18 // 22 // 0 /// BC005292 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) ligand 11, mRNA (cDNA clone MGC:12356 IMAGE:3934139), complete cds. // chr4 // 82 // 79 // 18 // 22 // 0 /// BC110986 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) ligand 11, mRNA (cDNA clone MGC:102770 IMAGE:5178174), complete cds. // chr4 // 82 // 79 // 18 // 22 // 0 /// BT006787 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) ligand 11 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// U66096 // GenBank // Homo sapiens cell-line THP-1 small cytokine B subfamily member 11 SCYB11 precursor, mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// AF352781 // GenBank // Homo sapiens IMAGE:1030351 I-TAC mRNA, partial cds. // chr4 // 67 // 64 // 12 // 18 // 0 /// BC012532 // GenBank // Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) ligand 11, mRNA (cDNA clone MGC:13317 IMAGE:4096572), complete cds. // chr4 // 68 // 100 // 19 // 28 // 0 /// ENST00000503860 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:76034690:76041415:-1 gene:ENSG00000169248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// GENSCAN00000041856 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:76034843:76035987:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0
ENST00000477971 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:76036750:76037064:-1 gene:ENSG00000225846 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000041851 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:76036750:76037064:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT096970 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_005506 // RefSeq // Homo sapiens scavenger receptor class B, member 2 (SCARB2), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000264896 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:76158737:76213893:-1 gene:ENSG00000138760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// BC021892 // GenBank // Homo sapiens scavenger receptor class B, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:9392 IMAGE:3872778), complete cds. // chr4 // 100 // 76 // 31 // 31 // 0 /// BT006939 // GenBank // Homo sapiens scavenger receptor class B, member 2 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 66 // 27 // 27 // 0 /// D12676 // GenBank // Homo sapiens mRNA for 85kDa lysosomal sialoglycoprotein, complete cds. // chr4 // 97 // 80 // 32 // 33 // 0 /// NM_001204255 // RefSeq // Homo sapiens scavenger receptor class B, member 2 (SCARB2), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 80 // 80 // 33 // 41 // 1 /// ENST00000452464 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:4:76161286:76213603:-1 gene:ENSG00000138760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 56 // 56 // 23 // 41 // 1 /// AK296519 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51982 complete cds, highly similar to Lysosome membrane protein 2. // chr4 // 54 // 54 // 22 // 41 // 1 /// GENSCAN00000041853 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:76161713:76213543:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 56 // 23 // 23 // 0
NM_001042784 // RefSeq // Homo sapiens coiled-coil domain containing 158 (CCDC158), mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000388914 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:76313002:76407305:-1 gene:ENSG00000163749 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000434846 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:76375177:76407323:-1 gene:ENSG00000163749 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 37 // 11 // 11 // 0 /// BC035224 // GenBank HTC // Homo sapiens hypothetical protein FLJ25770, mRNA (cDNA clone IMAGE:5166907), containing frame-shift errors. // chr4 // 100 // 37 // 11 // 11 // 0 /// BC086869 // GenBank // Homo sapiens hypothetical protein FLJ25770, mRNA (cDNA clone IMAGE:30389955), partial cds. // chr4 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000504667 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:76312997:76367634:-1 gene:ENSG00000163749 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1 /// AL832445 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp434A1929 (from clone DKFZp434A1929). // chr4 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1 /// GENSCAN00000041845 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:76350960:76421336:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0
ENST00000391066 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:76356610:76356715:-1 gene:ENSG00000212368 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT096996 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001029870 // RefSeq // Homo sapiens sosondowah ankyrin repeat domain family member B (SOWAHB), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000334306 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:76894928:76898147:-1 gene:ENSG00000186212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC137241 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat domain 56, mRNA (cDNA clone MGC:168861 IMAGE:9021238), complete cds. // chr4 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// BC137255 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat domain 56, mRNA (cDNA clone MGC:168875 IMAGE:9021252), complete cds. // chr4 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000041148 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:76895468:76897849:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0
ENST00000510190 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:76958860:76959169:-1 gene:ENSG00000234036 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000041154 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:76955600:76978419:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 15 // 15 // 0
ENST00000470927 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:77082403:77083126:-1 gene:ENSG00000214062 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000041144 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:77048219:77096538:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT097042 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
ENST00000364771 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:77150328:77150437:-1 gene:ENSG00000201641 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT097044 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001286790 // RefSeq // Homo sapiens CCR4-NOT transcription complex, subunit 6-like (CNOT6L), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// NM_144571 // RefSeq // Homo sapiens CCR4-NOT transcription complex, subunit 6-like (CNOT6L), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000504123 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:77713387:77819368:-1 gene:ENSG00000138767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000515506 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:77718021:77819063:-1 gene:ENSG00000138767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 43 // 9 // 9 // 0 /// AK058188 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ25459 fis, clone TST09038. // chr4 // 100 // 48 // 10 // 10 // 0
ENST00000364128 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:78632273:78632385:-1 gene:ENSG00000200998 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT097067 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_032693 // RefSeq // Homo sapiens N(alpha)-acetyltransferase 11, NatA catalytic subunit (NAA11), mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000286794 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:79316653:79326050:-1 gene:ENSG00000156269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC063623 // GenBank // Homo sapiens ARD1 homolog B (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone IMAGE:3922934), partial cds. // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000047662 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:79325188:79325877:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
NM_033214 // RefSeq // Homo sapiens glycerol kinase 2 (GK2), mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000358842 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:79406352:79408293:-1 gene:ENSG00000196475 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AK292241 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75853 complete cds, highly similar to Homo sapiens glycerol kinase 2 (GK2), mRNA. // chr4 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// BC029820 // GenBank // Homo sapiens glycerol kinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:35147 IMAGE:5169374), complete cds. // chr4 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// BC048274 // GenBank // Homo sapiens glycerol kinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:51785 IMAGE:5166566), complete cds. // chr4 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// BC058888 // GenBank // Homo sapiens glycerol kinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:64903 IMAGE:5172337), complete cds. // chr4 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0
AB014771 // GenBank // Homo sapiens mRNA for MOP-1, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
BC052613 // GenBank // Homo sapiens ribosomal protein S6 pseudogene, mRNA (cDNA clone IMAGE:6301163). // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000471756 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:82494837:82495893:-1 gene:ENSG00000227304 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr4 // 92 // 100 // 11 // 12 // 0 /// ENST00000488045 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:82494786:82496278:-1 gene:ENSG00000227304 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT147291 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr4 // 92 // 100 // 11 // 12 // 0
NR_024087 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 575 (LINC00575), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000426551 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:82613113:82621437:-1 gene:ENSG00000231782 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000515811 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:82613113:82621437:-1 gene:ENSG00000231782 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT097169 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONHSAT097170 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// TCONS_00007373-XLOC_003999 // Rinn lincRNA // linc-TMEM150C chr4:-:83534266-83542590 // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// TCONS_00008515-XLOC_003999 // Rinn lincRNA // linc-TMEM150C chr4:-:83534310-83536141 // chr4 // 95 // 72 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000044846 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:82594495:82621752:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NM_024906 // RefSeq // Homo sapiens stearoyl-CoA desaturase 5 (SCD5), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000273908 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:82659887:82798772:-1 gene:ENSG00000145284 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// BC004936 // GenBank // Homo sapiens stearoyl-CoA desaturase 5, mRNA (cDNA clone IMAGE:3607979), complete cds. // chr4 // 100 // 47 // 17 // 17 // 0 /// BC137429 // GenBank // Homo sapiens stearoyl-CoA desaturase 5, mRNA (cDNA clone MGC:169050 IMAGE:9021427), complete cds. // chr4 // 100 // 53 // 19 // 19 // 0 /// NM_001037582 // RefSeq // Homo sapiens stearoyl-CoA desaturase 5 (SCD5), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 58 // 58 // 21 // 36 // 1 /// ENST00000319540 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:82629539:82798857:-1 gene:ENSG00000145284 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 58 // 58 // 21 // 36 // 1 /// AF389338 // GenBank // Homo sapiens acyl-CoA-desaturase mRNA, complete cds. // chr4 // 58 // 58 // 21 // 36 // 1 /// BC137432 // GenBank // Homo sapiens stearoyl-CoA desaturase 5, mRNA (cDNA clone MGC:169053 IMAGE:9021430), complete cds. // chr4 // 53 // 53 // 19 // 36 // 1
ENST00000362660 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:82944738:82944845:-1 gene:ENSG00000199530 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT097199 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_133636 // RefSeq // Homo sapiens helicase, POLQ-like (HELQ), mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006714076 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens helicase, POLQ-like (HELQ), transcript variant X7, mRNA. // chr4 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// XM_006714077 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens helicase, POLQ-like (HELQ), transcript variant X8, mRNA. // chr4 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000295488 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:83407343:83455856:-1 gene:ENSG00000163312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000508591 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:83407343:83455804:-1 gene:ENSG00000163312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000510985 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:4:83407373:83455823:-1 gene:ENSG00000163312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AF436845 // GenBank // Homo sapiens DNA helicase HEL308 (HEL308) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000014576 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:83367060:83456221:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0
AB064670 // GenBank // Homo sapiens mRNA for OK/SW-CL.36, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_006168 // RefSeq // Homo sapiens NK6 homeobox 1 (NKX6-1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000295886 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:84491987:84498450:-1 gene:ENSG00000163623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000515820 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:84491987:84496950:-1 gene:ENSG00000163623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// GENSCAN00000028563 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:84493289:84517251:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENST00000462094 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:84687725:84688000:-1 gene:ENSG00000239466 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT097243 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_197965 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 10 (sodium/bile acid cotransporter), member 6 (SLC10A6), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000273905 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:86823468:86849263:-1 gene:ENSG00000145283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000505535 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:86825448:86849124:-1 gene:ENSG00000145283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 93 // 54 // 13 // 14 // 0 /// BC107051 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 10 (sodium/bile acid cotransporter family), member 6, mRNA (cDNA clone MGC:129575 IMAGE:40004572), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC107052 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 10 (sodium/bile acid cotransporter family), member 6, mRNA (cDNA clone MGC:129576 IMAGE:40004575), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// EF437223 // GenBank // Homo sapiens sodium-dependent organic anion transporter (SLC10A6) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_005262980 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens solute carrier family 10 (sodium/bile acid cotransporter), member 6 (SLC10A6), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// GENSCAN00000033841 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:86823688:86849115:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENST00000482763 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:87386883:87387174:-1 gene:ENSG00000240966 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT097309 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr4 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0
ENST00000363154 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:87743952:87744053:-1 gene:ENSG00000200024 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT097322 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000408513 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:88206427:88206552:-1 gene:ENSG00000221440 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT097337 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_152542 // RefSeq // Homo sapiens protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent, 1K (PPM1K), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000608933 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:88257620:88284736:-1 gene:ENSG00000163644 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONHSAT097340 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
ENST00000384749 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:88330176:88330278:-1 gene:ENSG00000207480 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT097350 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001042616 // RefSeq // Homo sapiens phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class Y (PIGY), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NM_032906 // RefSeq // Homo sapiens PIGY upstream reading frame (PYURF), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000273968 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:88520985:88523813:-1 gene:ENSG00000145337 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AB206972 // GenBank // Homo sapiens PIG-Y mRNA for phosphatidylinositol glycan class Y, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC007876 // GenBank // Homo sapiens phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class Y, mRNA (cDNA clone MGC:14156 IMAGE:3947944), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000038127 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:88521888:88527880:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1
ENST00000516513 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:88583666:88583972:-1 gene:ENSG00000252322 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT097367 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_153757 // RefSeq // Homo sapiens nucleosome assembly protein 1-like 5 (NAP1L5), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000323061 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:88695915:88698235:-1 gene:ENSG00000177432 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC104883 // GenBank // Homo sapiens nucleosome assembly protein 1-like 5, mRNA (cDNA clone MGC:132543 IMAGE:8143886), complete cds. // chr4 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000036258 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:88697206:88699370:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_198281 // RefSeq // Homo sapiens GPRIN family member 3 (GPRIN3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000333209 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:89244935:89251194:-1 gene:ENSG00000185477 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000609438 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:89236386:89308010:-1 gene:ENSG00000185477 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB095947 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA2027 protein. // chr4 // 95 // 78 // 20 // 21 // 0 /// BC126371 // GenBank // Homo sapiens GPRIN family member 3, mRNA (cDNA clone MGC:161649 IMAGE:8992087), complete cds. // chr4 // 95 // 70 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000036266 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:89247780:89333709:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0
NM_014485 // RefSeq // Homo sapiens hematopoietic prostaglandin D synthase (HPGDS), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000295256 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:94298535:94342876:-1 gene:ENSG00000163106 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000514774 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:94303763:94342865:-1 gene:ENSG00000163106 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0 /// AK290075 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76006 complete cds, highly similar to Homo sapiens prostaglandin D2 synthase, hematopoietic (PGDS), mRNA. // chr4 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// BC020734 // GenBank // Homo sapiens prostaglandin D2 synthase, hematopoietic, mRNA (cDNA clone MGC:22552 IMAGE:4731411), complete cds. // chr4 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// CR541662 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834F0227D for gene PGDS, prostaglandin D2 synthase, hematopoietic; complete cds, incl. stopcodon. // chr4 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// CR541679 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834E0937D for gene PGDS, prostaglandin D2 synthase, hematopoietic; complete cds, without stopcodon. // chr4 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// D82073 // GenBank // Homo sapiens mRNA for glutathione-requiring prostaglandin D synthase, complete cds. // chr4 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000046931 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:94308625:94350839:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0 /// NONHSAT097445 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0
ENST00000363752 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:95868667:95868764:-1 gene:ENSG00000200622 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT097467 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000364770 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:96348734:96349038:-1 gene:ENSG00000201640 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// NONHSAT097473 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0
NM_174952 // RefSeq // Homo sapiens sperm-tail PG-rich repeat containing 2 (STPG2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000295268 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:97558876:98143240:-1 gene:ENSG00000163116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// BC036870 // GenBank // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 37, mRNA (cDNA clone MGC:46496 IMAGE:5226859), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000522676 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:97184093:97972354:-1 gene:ENSG00000163116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 32 // 32 // 12 // 37 // 1 /// BX648305 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686C22119 (from clone DKFZp686C22119). // chr4 // 32 // 32 // 12 // 37 // 1 /// GENSCAN00000035947 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:98081255:98261843:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 41 // 41 // 15 // 37 // 1
NM_001130679 // RefSeq // Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 4E (EIF4E), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NM_001968 // RefSeq // Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 4E (EIF4E), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000450253 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:98871684:98930637:-1 gene:ENSG00000151247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC035166 // GenBank // Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 4E, mRNA (cDNA clone MGC:43316 IMAGE:5265600), complete cds. // chr4 // 93 // 88 // 13 // 14 // 0 /// BC043226 // GenBank // Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 4E, mRNA (cDNA clone MGC:44309 IMAGE:5295521), complete cds. // chr4 // 90 // 63 // 9 // 10 // 0
NM_000671 // RefSeq // Homo sapiens alcohol dehydrogenase 5 (class III), chi polypeptide (ADH5), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000296412 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:99070978:99088751:-1 gene:ENSG00000197894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000512621 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:99072186:99085216:-1 gene:ENSG00000197894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 62 // 8 // 8 // 0 /// AK226177 // GenBank // Homo sapiens mRNA for class III alcohol dehydrogenase 5 chi subunit variant, clone: ef06333. // chr4 // 100 // 85 // 11 // 11 // 0 /// BC014665 // GenBank // Homo sapiens alcohol dehydrogenase 5 (class III), chi polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:23126 IMAGE:4853366), complete cds. // chr4 // 100 // 62 // 8 // 8 // 0 /// M29872 // GenBank // Human alcohol dehydrogenase class III (ADH5) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 62 // 8 // 8 // 0 /// M30471 // GenBank // Human class III alcohol dehydrogenase (ADH5) chi subunit mRNA, complete cds. // chr4 // 89 // 69 // 8 // 9 // 0
NM_000667 // RefSeq // Homo sapiens alcohol dehydrogenase 1A (class I), alpha polypeptide (ADH1A), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000209668 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:99276367:99291028:-1 gene:ENSG00000187758 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// AK290558 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75261 complete cds, highly similar to Human class I alcohol dehydrogenase (ADH1) alpha subunit mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC074738 // GenBank // Homo sapiens alcohol dehydrogenase 1A (class I), alpha polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:103814 IMAGE:30915195), complete cds. // chr4 // 92 // 87 // 12 // 13 // 0 /// BC117442 // GenBank // Homo sapiens alcohol dehydrogenase 1A (class I), alpha polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:151051 IMAGE:40125993), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC126306 // GenBank // Homo sapiens alcohol dehydrogenase 1A (class I), alpha polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:161584 IMAGE:8992022), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BT019812 // GenBank // Homo sapiens alcohol dehydrogenase 1A (class I), alpha polypeptide mRNA, complete cds. // chr4 // 91 // 73 // 10 // 11 // 0 /// M12271 // GenBank // Homo sapiens class I alcohol dehydrogenase (ADH1) alpha subunit mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 87 // 13 // 13 // 0 /// M12963 // GenBank // Human class I alcohol dehydrogenase (ADH1) alpha subunit mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000028394 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:99202633:99471862:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 53 // 53 // 8 // 15 // 1
NM_001134665 // RefSeq // Homo sapiens tRNA methyltransferase 10 homolog A (S. cerevisiae) (TRMT10A), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// NM_001134666 // RefSeq // Homo sapiens tRNA methyltransferase 10 homolog A (S. cerevisiae) (TRMT10A), transcript variant 3, mRNA. // chr4 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// NM_152292 // RefSeq // Homo sapiens tRNA methyltransferase 10 homolog A (S. cerevisiae) (TRMT10A), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000273962 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:99546727:99563668:-1 gene:ENSG00000145331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000394876 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:99548613:99564032:-1 gene:ENSG00000145331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000394877 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:99546709:99564017:-1 gene:ENSG00000145331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000455368 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:99553813:99563730:-1 gene:ENSG00000145331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 91 // 48 // 10 // 11 // 0 /// ENST00000514547 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:99553831:99563723:-1 gene:ENSG00000145331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 43 // 10 // 10 // 0 /// BC028373 // GenBank // Homo sapiens RNA (guanine-9-) methyltransferase domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:27034 IMAGE:4838346), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000028396 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:99549088:99559326:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0
NM_001243736 // RefSeq // Homo sapiens late endosomal/lysosomal adaptor, MAPK and MTOR activator 3 (LAMTOR3), transcript variant 3, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NM_021970 // RefSeq // Homo sapiens late endosomal/lysosomal adaptor, MAPK and MTOR activator 3 (LAMTOR3), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NR_024170 // RefSeq // Homo sapiens late endosomal/lysosomal adaptor, MAPK and MTOR activator 3 (LAMTOR3), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr4 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000226522 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:4:99881207:99894376:-1 gene:ENSG00000109270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000499666 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:99878336:99894490:-1 gene:ENSG00000109270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000515100 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:99881493:99894428:-1 gene:ENSG00000109270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 64 // 14 // 14 // 0 /// AF201947 // GenBank // Homo sapiens MEK binding partner 1 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// BC026245 // GenBank // Homo sapiens MAPK scaffold protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:22370 IMAGE:4808855), complete cds. // chr4 // 90 // 91 // 18 // 20 // 0 /// NONHSAT097541 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// AK093581 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ36262 fis, clone THYMU2002789. // chr4 // 68 // 68 // 15 // 22 // 1
ENST00000420137 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:99898760:99930534:-1 gene:ENSG00000164031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 53 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000471101 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:99899396:99927091:-1 gene:ENSG00000164031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 47 // 8 // 8 // 0 /// AY358272 // GenBank // Homo sapiens clone DNA216624 EGNR9427 (UNQ9427) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 53 // 9 // 9 // 0 /// NM_001031723 // RefSeq // Homo sapiens DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 14 (DNAJB14), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 65 // 65 // 11 // 17 // 1 /// NM_001278310 // RefSeq // Homo sapiens DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 14 (DNAJB14), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 53 // 53 // 9 // 17 // 1 /// ENST00000442697 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:99896248:99946726:-1 gene:ENSG00000164031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 65 // 65 // 11 // 17 // 1 /// ENST00000469942 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:99924307:99946586:-1 gene:ENSG00000164031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 59 // 59 // 10 // 17 // 1 /// BX537609 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686I04113 (from clone DKFZp686I04113). // chr4 // 53 // 53 // 9 // 17 // 1 /// NONHSAT097543 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 59 // 59 // 10 // 17 // 1
NM_145244 // RefSeq // Homo sapiens DNA-damage-inducible transcript 4-like (DDIT4L), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_005262721 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens DNA-damage-inducible transcript 4-like (DDIT4L), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000273990 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:100185870:100190468:-1 gene:ENSG00000145358 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000513992 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:100187875:100190782:-1 gene:ENSG00000145358 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 92 // 48 // 12 // 13 // 0 /// BC013592 // GenBank // Homo sapiens DNA-damage-inducible transcript 4-like, mRNA (cDNA clone MGC:9960 IMAGE:3877854), complete cds. // chr4 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000502763 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:100187728:100190304:-1 gene:ENSG00000145358 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// GENSCAN00000004966 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:100187677:100190896:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1
ENST00000464718 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:102348392:102348691:-1 gene:ENSG00000241144 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT097583 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_181886 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin-conjugating enzyme E2D 3 (UBE2D3), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 57 // 8 // 8 // 0 /// NM_181891 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin-conjugating enzyme E2D 3 (UBE2D3), transcript variant 7, mRNA. // chr4 // 100 // 50 // 7 // 7 // 0 /// NM_181892 // RefSeq // Homo sapiens ubiquitin-conjugating enzyme E2D 3 (UBE2D3), transcript variant 8, mRNA. // chr4 // 100 // 57 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000343106 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:102796134:102827122:-1 gene:ENSG00000109332 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 50 // 7 // 7 // 0 /// ENST00000394804 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:102794386:102827948:-1 gene:ENSG00000109332 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 57 // 8 // 8 // 0 /// NONHSAT097602 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 50 // 7 // 7 // 0
NONHSAT097614 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001286734 // RefSeq // Homo sapiens centromere protein E, 312kDa (CENPE), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 97 // 62 // 62 // 0 /// NM_001813 // RefSeq // Homo sapiens centromere protein E, 312kDa (CENPE), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 64 // 64 // 0 /// ENST00000265148 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:103105806:103198409:-1 gene:ENSG00000138778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 64 // 64 // 0 /// ENST00000380026 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:103105813:103198408:-1 gene:ENSG00000138778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 62 // 62 // 0 /// ENST00000503705 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:4:103151236:103198408:-1 gene:ENSG00000138778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 47 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000611174 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:103106047:103198409:-1 gene:ENSG00000138778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 72 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000001717 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:103081031:103198319:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 80 // 51 // 51 // 0
NM_001059 // RefSeq // Homo sapiens tachykinin receptor 3 (TACR3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000304883 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:103586031:103719816:-1 gene:ENSG00000169836 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY462099 // GenBank // Homo sapiens tachykinin receptor 3 (TACR3) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC121806 // GenBank // Homo sapiens tachykinin receptor 3, mRNA (cDNA clone MGC:148061 IMAGE:40107936), complete cds. // chr4 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC122551 // GenBank // Homo sapiens tachykinin receptor 3, mRNA (cDNA clone MGC:148060 IMAGE:40107934), complete cds. // chr4 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// M89473 // GenBank // Human neurokinin 3 receptor (NK3R) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000002804 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:103589682:103719675:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT097641 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0
NM_025212 // RefSeq // Homo sapiens CXXC finger protein 4 (CXXC4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000394767 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:104468312:104494894:-1 gene:ENSG00000168772 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000466963 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:104469514:104494901:-1 gene:ENSG00000168772 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// AF272159 // GenBank // Homo sapiens Dvl-binding protein IDAX mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// BC119751 // GenBank // Homo sapiens CXXC finger 4, mRNA (cDNA clone MGC:149872 IMAGE:40119265), complete cds. // chr4 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// BC119752 // GenBank // Homo sapiens CXXC finger 4, mRNA (cDNA clone MGC:149873 IMAGE:40119266), complete cds. // chr4 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// CR627201 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp781K171 (from clone DKFZp781K171). // chr4 // 90 // 36 // 9 // 10 // 0 /// GENSCAN00000002806 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:104447441:104492216:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
ENST00000502488 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:105526596:105527397:-1 gene:ENSG00000216425 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0 /// GENSCAN00000027683 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:105489526:105527376:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0 /// NONHSAT097680 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0
ENST00000410759 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:107867807:107867910:-1 gene:ENSG00000222691 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT097725 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_026968 // RefSeq // Homo sapiens RPL34 antisense RNA 1 (head to head) (RPL34-AS1), long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0 /// ENST00000507248 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:108538190:108620397:-1 gene:ENSG00000234492 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr4 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0 /// ENST00000509984 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:108556101:108620395:-1 gene:ENSG00000234492 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr4 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0 /// AK308624 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ98665. // chr4 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0 /// NONHSAT097756 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0 /// NONHSAT097758 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0
ENST00000464534 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:109450772:109451068:-1 gene:ENSG00000243227 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT097783 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 94 // 100 // 16 // 17 // 0
ENST00000299671 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:110251871:110252099:-1 gene:ENSG00000166530 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000025647 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:110248212:110252114:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 89 // 83 // 17 // 19 // 0 /// NONHSAT097808 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT097809 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0
NM_052864 // RefSeq // Homo sapiens TRAF-interacting protein with forkhead-associated domain (TIFA), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000361717 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:112274542:112285903:-1 gene:ENSG00000145365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000500655 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:112277759:112281773:-1 gene:ENSG00000145365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// AB062110 // GenBank // Homo sapiens mRNA for TIFA, complete cds. // chr4 // 92 // 43 // 11 // 12 // 0 /// AB097011 // GenBank // Homo sapiens mRNA for putative NFkB activating protein, complete cds, clone: 20. // chr4 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// AB097038 // GenBank // Homo sapiens mRNA for putative MAPK activating protein, complete cds, clone: PM14. // chr4 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// AK292900 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75832 complete cds, highly similar to Homo sapiens TRAF-interacting protein with a forkhead-associated domain (TIFA), mRNA. // chr4 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// BC008294 // GenBank // Homo sapiens TRAF-interacting protein with forkhead-associated domain, mRNA (cDNA clone IMAGE:3659339), complete cds. // chr4 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC014259 // GenBank // Homo sapiens TRAF-interacting protein with forkhead-associated domain, mRNA (cDNA clone MGC:20791 IMAGE:4763971), complete cds. // chr4 // 95 // 71 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000019849 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:112277862:112294790:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0
NM_024019 // RefSeq // Homo sapiens neurogenin 2 (NEUROG2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000313341 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:112513516:112516172:-1 gene:ENSG00000178403 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC036847 // GenBank // Homo sapiens neurogenin 2, mRNA (cDNA clone MGC:46562 IMAGE:5247719), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000019853 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:112514657:112517540:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 42 // 14 // 14 // 0
NM_018392 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, GRF-type containing 1 (ZGRF1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000445203 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:112539333:112633176:-1 gene:ENSG00000138658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000445413 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:112539339:112587750:-1 gene:ENSG00000138658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// ENST00000505019 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:112539336:112636910:-1 gene:ENSG00000138658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000506675 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:112539429:112561538:-1 gene:ENSG00000138658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 62 // 24 // 24 // 0 /// AK090556 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ33237 fis, clone ASTRO2002632, highly similar to Homo sapiens prematurely terminated mRNA decay factor-like, mRNA. // chr4 // 100 // 62 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000473015 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:112562273:112636903:-1 gene:ENSG00000138658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 38 // 38 // 15 // 39 // 1 /// ENST00000612287 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:112539344:112584061:-1 gene:ENSG00000138658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 74 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000038177 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:112539547:112642685:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0
NR_029835 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 302a (MIR302A), microRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000385192 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:112648183:112648251:-1 gene:ENSG00000207927 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-302a // miRBase Micro RNA Database // MI0000738 Homo sapiens miR-302a stem-loop // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT097871 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029857 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 302b (MIR302B), microRNA. // chr4 // 89 // 100 // 17 // 19 // 0 /// ENST00000362188 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:112648485:112648557:-1 gene:ENSG00000274389 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA gene:ENSG00000249532 // chr4 // 89 // 100 // 17 // 19 // 0 /// ENST00000510655 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:112646476:112650051:-1 gene:ENSG00000249532 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr4 // 58 // 58 // 11 // 19 // 1 /// hsa-mir-302b // miRBase Micro RNA Database // MI0000772 Homo sapiens miR-302b stem-loop // chr4 // 89 // 100 // 17 // 19 // 0 /// NONHSAT097875 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 89 // 100 // 17 // 19 // 0 /// NONHSAT097863 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 58 // 58 // 11 // 19 // 1
ENST00000365666 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:112755816:112755917:-1 gene:ENSG00000202536 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT097884 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_022569 // RefSeq // Homo sapiens N-deacetylase/N-sulfotransferase (heparan glucosaminyl) 4 (NDST4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000264363 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:114827763:115113876:-1 gene:ENSG00000138653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000514570 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:114935048:115113849:-1 gene:ENSG00000138653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 32 // 10 // 10 // 0 /// AB036429 // GenBank // Homo sapiens NDST4 mRNA for N-deacetylase/N-sulfotransferase 4, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AK289670 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77004 complete cds, highly similar to Homo sapiens N-deacetylase/N-sulfotransferase (heparan glucosaminyl) 4 (NDST4), mRNA. // chr4 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// BC012326 // GenBank HTC // Homo sapiens N-deacetylase/N-sulfotransferase (heparan glucosaminyl) 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:4638812), with apparent retained intron. // chr4 // 100 // 32 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000504854 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:114827786:115113777:-1 gene:ENSG00000138653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 81 // 81 // 25 // 31 // 1 /// BC113075 // GenBank // Homo sapiens N-deacetylase/N-sulfotransferase (heparan glucosaminyl) 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:40028507), complete cds. // chr4 // 81 // 81 // 25 // 31 // 1 /// ENST00000613194 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:114827773:115113876:-1 gene:ENSG00000138653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000014956 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:114681725:115077036:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0
NM_152402 // RefSeq // Homo sapiens translocation associated membrane protein 1-like 1 (TRAM1L1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000310754 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:117083554:117085576:-1 gene:ENSG00000174599 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC030831 // GenBank // Homo sapiens translocation associated membrane protein 1-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:26568 IMAGE:4796626), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000034715 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:117084284:117085393:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0
NM_003619 // RefSeq // Homo sapiens protease, serine, 12 (neurotrypsin, motopsin) (PRSS12), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_005263318 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens protease, serine, 12 (neurotrypsin, motopsin) (PRSS12), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000296498 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:118280038:118353003:-1 gene:ENSG00000164099 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC007761 // GenBank // Homo sapiens protease, serine, 12 (neurotrypsin, motopsin), mRNA (cDNA clone MGC:12722 IMAGE:4126901), complete cds. // chr4 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000048708 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:118281936:118352720:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
XR_244698 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens uncharacterized LOC101929762 (LOC101929762), ncRNA. // chr4 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000503243 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:119192773:119212512:-1 gene:ENSG00000178636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000515843 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:119193688:119212644:-1 gene:ENSG00000178636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// AK309988 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17030. // chr4 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// AK098126 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ40807 fis, clone TRACH2009268. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONHSAT098035 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
NM_001001701 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 3 (C4orf3), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// NM_001170330 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 3 (C4orf3), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000399075 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:119297052:119304445:-1 gene:ENSG00000164096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000504110 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:119298699:119300921:-1 gene:ENSG00000164096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 42 // 8 // 8 // 0 /// AF075061 // GenBank // Homo sapiens full length insert cDNA YP07G10. // chr4 // 100 // 53 // 10 // 10 // 0 /// AY605045 // GenBank // Homo sapiens HCV F-transactivated protein 1 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 63 // 12 // 12 // 0 /// BC017399 // GenBank // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 3, mRNA (cDNA clone MGC:24558 IMAGE:4108498), complete cds. // chr4 // 86 // 74 // 12 // 14 // 0 /// GENSCAN00000016774 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:119300332:119322102:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 42 // 42 // 8 // 19 // 1
NM_000134 // RefSeq // Homo sapiens fatty acid binding protein 2, intestinal (FABP2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000274024 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:119317250:119322390:-1 gene:ENSG00000145384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC069466 // GenBank // Homo sapiens fatty acid binding protein 2, intestinal, mRNA (cDNA clone MGC:97202 IMAGE:7262448), complete cds. // chr4 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// BC069617 // GenBank // Homo sapiens fatty acid binding protein 2, intestinal, mRNA (cDNA clone MGC:97180 IMAGE:7262424), complete cds. // chr4 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// BC069625 // GenBank // Homo sapiens fatty acid binding protein 2, intestinal, mRNA (cDNA clone MGC:97191 IMAGE:7262436), complete cds. // chr4 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// BC069637 // GenBank // Homo sapiens fatty acid binding protein 2, intestinal, mRNA (cDNA clone MGC:97213 IMAGE:7262460), complete cds. // chr4 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// BC111791 // GenBank // Homo sapiens fatty acid binding protein 2, intestinal, mRNA (cDNA clone MGC:133132 IMAGE:40017872), complete cds. // chr4 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016774 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:119300332:119322102:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NM_024574 // RefSeq // Homo sapiens neuron-derived neurotrophic factor (NDNF), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000379692 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:121035613:121072518:-1 gene:ENSG00000173376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000515757 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:121037536:121073021:-1 gene:ENSG00000173376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// AK289615 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77000 complete cds. // chr4 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// AY358821 // GenBank // Homo sapiens clone DNA108750 VLLH2748 (UNQ2748) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC019351 // GenBank // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 31, mRNA (cDNA clone MGC:13086 IMAGE:3928768), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000511408 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:121037621:121072001:-1 gene:ENSG00000173376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// GENSCAN00000003086 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:121017165:121045837:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0
ENST00000411074 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:121061172:121061478:-1 gene:ENSG00000223006 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 /// NONHSAT098134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr4 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0
ENST00000516374 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:121192797:121192903:-1 gene:ENSG00000252183 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT098137 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_198179 // RefSeq // Homo sapiens pyroglutamylated RFamide peptide receptor (QRFPR), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000384419 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:121329069:121329170:-1 gene:ENSG00000207148 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT098139 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_198179 // RefSeq // Homo sapiens pyroglutamylated RFamide peptide receptor (QRFPR), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000334383 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:121329314:121380679:-1 gene:ENSG00000186867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000394427 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:121329314:121381059:-1 gene:ENSG00000186867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000507331 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:121329312:121380647:-1 gene:ENSG00000186867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// AB109629 // GenBank // Homo sapiens AQ27 mRNA for QRFP receptor, complete cds. // chr4 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC128132 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 103, mRNA (cDNA clone IMAGE:40112419). // chr4 // 93 // 97 // 26 // 28 // 0 /// BC128133 // GenBank // Homo sapiens pyroglutamylated RFamide peptide receptor, mRNA (cDNA clone MGC:149217 IMAGE:40112420), complete cds. // chr4 // 96 // 97 // 27 // 28 // 0 /// JF810892 // GenBank // Homo sapiens pyroglutamylated RFamide peptide receptor (QRFPR) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000512235 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:121340133:121381059:-1 gene:ENSG00000186867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// AK309337 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99378. // chr4 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// AF411117 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor (GPR103) mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003087 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:121329314:121398278:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1
NM_001237 // RefSeq // Homo sapiens cyclin A2 (CCNA2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000274026 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:121816444:121823932:-1 gene:ENSG00000145386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AK291931 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77347 complete cds, highly similar to Homo sapiens cyclin A2 (CCNA2), mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// BC104783 // GenBank // Homo sapiens cyclin A2, mRNA (cDNA clone MGC:132443 IMAGE:8143786), complete cds. // chr4 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC104787 // GenBank // Homo sapiens cyclin A2, mRNA (cDNA clone MGC:132447 IMAGE:8143790), complete cds. // chr4 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// CR407692 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834E053D for gene CCNA2, cyclin A2 complete cds, without stopcodon. // chr4 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000618014 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:121816445:121823933:-1 gene:ENSG00000145386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000033473 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:121817638:121823628:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0
NM_018190 // RefSeq // Homo sapiens Bardet-Biedl syndrome 7 (BBS7), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 88 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000502444 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:121861294:121870487:-1 gene:ENSG00000138686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 21 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000506636 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:121827727:121870450:-1 gene:ENSG00000138686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000507814 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:121824924:121828673:-1 gene:ENSG00000138686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 17 // 8 // 8 // 0 /// AF521643 // GenBank // Homo sapiens BBS7 short isoform (BBS7) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 85 // 41 // 41 // 0 /// AF521644 // GenBank // Homo sapiens BBS7 long isoform (BBS7) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 81 // 39 // 39 // 0 /// BC032691 // GenBank // Homo sapiens Bardet-Biedl syndrome 7, mRNA (cDNA clone MGC:45066 IMAGE:5240398), complete cds. // chr4 // 98 // 85 // 40 // 41 // 0 /// NM_176824 // RefSeq // Homo sapiens Bardet-Biedl syndrome 7 (BBS7), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 96 // 96 // 46 // 48 // 1 /// ENST00000264499 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:121824440:121870497:-1 gene:ENSG00000138686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 96 // 46 // 48 // 1 /// NONHSAT098154 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 21 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000033470 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:121834706:121933002:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 42 // 42 // 20 // 48 // 1
ENST00000482790 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:122087508:122087811:-1 gene:ENSG00000241037 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT098160 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001167882 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat domain 50 (ANKRD50), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// NM_020337 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat domain 50 (ANKRD50), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000504087 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:124664052:124712732:-1 gene:ENSG00000151458 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000515641 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:4:124667359:124712732:-1 gene:ENSG00000151458 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// AK291068 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78750 complete cds. // chr4 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// AK295135 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58180 complete cds, highly similar to Ankyrin repeat domain-containing protein 50. // chr4 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// BC024725 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat domain 50, mRNA (cDNA clone MGC:30046 IMAGE:4943808), complete cds. // chr4 // 100 // 48 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000023720 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:124668987:124766384:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0
ENST00000362992 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:127028107:127028219:-1 gene:ENSG00000199862 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT098227 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000491435 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:127812720:127813200:-1 gene:ENSG00000244021 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000022593 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:127812718:127813200:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
ENST00000475247 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:128069014:128069612:-1 gene:ENSG00000241651 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000022594 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:128069005:128069583:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NONHSAT098301 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
ENST00000490174 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:131720260:131720543:-1 gene:ENSG00000241392 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT098317 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
ENST00000384459 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:135315418:135315522:-1 gene:ENSG00000207188 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT098371 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000384592 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:135995929:135996092:-1 gene:ENSG00000207322 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 75 // 100 // 3 // 4 // 0 /// NONHSAT098377 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 75 // 100 // 3 // 4 // 0
NM_014331 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 7 (anionic amino acid transporter light chain, xc- system), member 11 (SLC7A11), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// XM_005262875 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens solute carrier family 7 (anionic amino acid transporter light chain, xc- system), member 11 (SLC7A11), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 47 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000280612 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:138164097:138242349:-1 gene:ENSG00000151012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000509248 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:138171844:138223244:-1 gene:ENSG00000151012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 34 // 13 // 13 // 0 /// AB026891 // GenBank // Homo sapiens mRNA for cystine/glutamate transporter, complete cds. // chr4 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// AB040875 // GenBank // Homo sapiens hxCT mRNA for cystine/glutamate exchanger, complete cds. // chr4 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// AF200708 // GenBank // Homo sapiens calcium channel blocker resistance protein CCBR1 mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 68 // 25 // 26 // 0 /// AF252872 // GenBank // Homo sapiens cystine/glutamate transporter xCT mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// AK290359 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78174 complete cds, highly similar to Homo sapiens mRNA for cystine/glutamate transporter (XCT gene). // chr4 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// BC012087 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 7, (cationic amino acid transporter, y+ system) member 11, mRNA (cDNA clone MGC:20026 IMAGE:4562994), complete cds. // chr4 // 93 // 71 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000018777 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:138176253:138328202:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 53 // 20 // 20 // 0
ENST00000383995 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:139256657:139256760:-1 gene:ENSG00000206722 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0
NM_032623 // RefSeq // Homo sapiens mitochondria-localized glutamic acid-rich protein (MGARP), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000398955 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:139266163:139280338:-1 gene:ENSG00000137463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF329088 // GenBank // Homo sapiens ovary-specific acidic protein mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AF484960 // GenBank // Homo sapiens corneal endothelium specific protein 1 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC104173 // GenBank // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 49, mRNA (cDNA clone MGC:125827 IMAGE:40030666), complete cds. // chr4 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// BC104174 // GenBank // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 49, mRNA (cDNA clone MGC:125828 IMAGE:40030667), complete cds. // chr4 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000503997 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:139266880:139295815:-1 gene:ENSG00000109390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
ENST00000364663 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:139685127:139685427:-1 gene:ENSG00000201533 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 88 // 96 // 22 // 25 // 0 /// NONHSAT098483 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 88 // 96 // 22 // 25 // 0
NM_018717 // RefSeq // Homo sapiens mastermind-like 3 (Drosophila) (MAML3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000398940 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:139889183:139890052:-1 gene:ENSG00000196782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 19 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000509479 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:139716753:140154184:-1 gene:ENSG00000196782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// AK296891 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52323 complete cds, highly similar to Mastermind-like protein 3 (Mam-3). // chr4 // 100 // 19 // 8 // 8 // 0 /// BC137130 // GenBank // Homo sapiens mastermind-like 3 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:168750 IMAGE:9021127), complete cds. // chr4 // 100 // 76 // 32 // 32 // 0 /// BC137131 // GenBank // Homo sapiens mastermind-like 3 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:168751 IMAGE:9021128), complete cds. // chr4 // 100 // 76 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000042209 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:139888327:139897010:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 38 // 16 // 16 // 0 /// AB058719 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1816 protein, partial cds. // chr4 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// U80747 // GenBank // Homo sapiens CAGH3 mRNA, complete cds. // chr4 // 26 // 26 // 11 // 42 // 1 /// GENSCAN00000042216 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:139717556:139743474:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 24 // 24 // 10 // 42 // 1
ENST00000516424 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:139794125:139794433:-1 gene:ENSG00000252233 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT098485 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_033939 // RefSeq // Homo sapiens SCOC antisense RNA 1 (SCOC-AS1), long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000512692 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:140283724:140373360:-1 gene:ENSG00000196951 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT098491 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENST00000476715 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:140366240:140366861:-1 gene:ENSG00000241923 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000042211 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:140366390:140366860:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001130675 // RefSeq // Homo sapiens calmegin (CLGN), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NM_004362 // RefSeq // Homo sapiens calmegin (CLGN), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000325617 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:140388455:140427968:-1 gene:ENSG00000153132 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000414773 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:140388455:140427661:-1 gene:ENSG00000153132 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000509477 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:140400512:140427610:-1 gene:ENSG00000153132 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 33 // 12 // 12 // 0 /// AK093096 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ35777 fis, clone TESTI2005363, highly similar to CALMEGIN PRECURSOR. // chr4 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// AK290819 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78187 complete cds, highly similar to Homo sapiens calmegin, mRNA. // chr4 // 97 // 89 // 31 // 32 // 0 /// AK299243 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55357 complete cds, highly similar to Calmegin precursor. // chr4 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// AK302149 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54199 complete cds, highly similar to Calmegin precursor. // chr4 // 91 // 64 // 21 // 23 // 0 /// BC028357 // GenBank // Homo sapiens calmegin, mRNA (cDNA clone MGC:26321 IMAGE:4830135), complete cds. // chr4 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// D86322 // GenBank // Homo sapiens mRNA for calmegin, complete cds. // chr4 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000042212 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:140373341:140413087:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0
NM_021833 // RefSeq // Homo sapiens uncoupling protein 1 (mitochondrial, proton carrier) (UCP1), mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000262999 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:140559434:140568805:-1 gene:ENSG00000109424 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC096736 // GenBank // Homo sapiens uncoupling protein 1 (mitochondrial, proton carrier), mRNA (cDNA clone MGC:119953 IMAGE:40016003), complete cds. // chr4 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC098168 // GenBank // Homo sapiens uncoupling protein 1 (mitochondrial, proton carrier), mRNA (cDNA clone MGC:119952 IMAGE:40016002), complete cds. // chr4 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC098258 // GenBank // Homo sapiens uncoupling protein 1 (mitochondrial, proton carrier), mRNA (cDNA clone MGC:119951 IMAGE:40016001), complete cds. // chr4 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC098352 // GenBank // Homo sapiens uncoupling protein 1 (mitochondrial, proton carrier), mRNA (cDNA clone MGC:119950 IMAGE:40016000), complete cds. // chr4 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// U28480 // GenBank // Human uncoupling protein (UCP) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000047062 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:140524053:140568729:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0
NM_015130 // RefSeq // Homo sapiens TBC1 domain family, member 9 (with GRAM domain) (TBC1D9), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000442267 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:140620765:140756120:-1 gene:ENSG00000109436 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB449892 // GenBank // Homo sapiens TBC1D9A mRNA for TBC1 domain family, member 9A, complete cds. // chr4 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// BC146758 // GenBank // Homo sapiens TBC1 domain family, member 9 (with GRAM domain), mRNA (cDNA clone MGC:166826 IMAGE:9007196), complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000047066 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:140622195:140733995:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1
ENST00000384426 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:140700835:140700942:-1 gene:ENSG00000207155 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT098510 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_020724 // RefSeq // Homo sapiens ring finger protein 150 (RNF150), mRNA. // chr4 // 97 // 97 // 30 // 31 // 0 /// ENST00000306799 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:140865571:141133462:-1 gene:ENSG00000170153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// ENST00000420921 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:140865571:141212877:-1 gene:ENSG00000170153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 59 // 18 // 19 // 0 /// ENST00000506101 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:4:140911144:140997036:-1 gene:ENSG00000170153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000515673 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:140859807:141132842:-1 gene:ENSG00000170153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 81 // 25 // 26 // 0 /// AB033040 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1214 protein, partial cds. // chr4 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// AK130520 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ27010 fis, clone SLV05175. // chr4 // 95 // 59 // 18 // 19 // 0 /// ENST00000507500 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:140911053:141133049:-1 gene:ENSG00000170153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 78 // 78 // 25 // 32 // 1 /// BC101992 // GenBank // Homo sapiens ring finger protein 150, mRNA (cDNA clone MGC:125502 IMAGE:40023129), complete cds. // chr4 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1 /// ENST00000515057 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:140944549:140967870:-1 gene:ENSG00000170153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// GENSCAN00000047063 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:140868261:140992782:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
NONHSAT098522 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AF494508 // GenBank // Homo sapiens GDDM (GDDM) mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
AK074381 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ23801 fis, clone HEP22544. // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT098553 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENST00000475555 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:143349275:143350117:-1 gene:ENSG00000228981 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000034089 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:143269342:143350117:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001168235 // RefSeq // Homo sapiens FRAS1 related extracellular matrix 3 (FREM3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000329798 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:4:143577302:143700675:-1 gene:ENSG00000183090 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024385 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:143577611:143834947:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_002102 // RefSeq // Homo sapiens glycophorin E (MNS blood group) (GYPE), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 61 // 11 // 11 // 0 /// NM_198682 // RefSeq // Homo sapiens glycophorin E (MNS blood group) (GYPE), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000358615 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:143870867:143905559:-1 gene:ENSG00000197465 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000437468 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:143875313:143905563:-1 gene:ENSG00000197465 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 61 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000506264 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:143870896:143905519:-1 gene:ENSG00000197465 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 61 // 11 // 11 // 0 /// BC017864 // GenBank // Homo sapiens glycophorin E, mRNA (cDNA clone MGC:22629 IMAGE:4686481), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// M29610 // GenBank // Human glycophorin E mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 61 // 11 // 11 // 0
NM_178835 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 827 (ZNF827), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENST00000379448 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:4:145760738:145938471:-1 gene:ENSG00000151612 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENST00000508784 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:145757627:145938635:-1 gene:ENSG00000151612 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENST00000511659 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:145761282:145774667:-1 gene:ENSG00000151612 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 19 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000513320 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:145760729:145938489:-1 gene:ENSG00000151612 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 79 // 34 // 34 // 0 /// BC117407 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 827, mRNA (cDNA clone MGC:151016 IMAGE:40125958), complete cds. // chr4 // 100 // 86 // 37 // 37 // 0 /// BC143577 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 827, mRNA (cDNA clone MGC:177105 IMAGE:9052088), complete cds. // chr4 // 100 // 86 // 37 // 37 // 0 /// AK094136 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ36817 fis, clone ASTRO2004032. // chr4 // 58 // 58 // 25 // 43 // 1 /// AK131430 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ16555 fis, clone SPLEN2016781. // chr4 // 19 // 19 // 8 // 43 // 1 /// GENSCAN00000025723 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:145760779:145779533:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 37 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000025729 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:145839230:145903969:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 44 // 19 // 19 // 0
ENST00000364444 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:145958128:145958240:-1 gene:ENSG00000201314 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT098650 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_138364 // RefSeq // Homo sapiens protein arginine methyltransferase 9 (PRMT9), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000322396 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:147637785:147684230:-1 gene:ENSG00000164169 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000510269 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:147638385:147661318:-1 gene:ENSG00000164169 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000514886 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:147638385:147684125:-1 gene:ENSG00000164169 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AK096703 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39384 fis, clone PLACE5000066. // chr4 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AK128483 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ46629 fis, clone TRACH2013585. // chr4 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// AK292904 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75167 complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_005263338 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens protein arginine methyltransferase 9 (PRMT9), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 93 // 93 // 28 // 30 // 1 /// BC004337 // GenBank // Homo sapiens hypothetical protein BC004337, mRNA (cDNA clone IMAGE:3631943), partial cds. // chr4 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// GENSCAN00000002676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:147638532:147683987:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
ENST00000517268 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:151971497:151971613:-1 gene:ENSG00000253077 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr4 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// NONHSAT098781 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0
ENST00000476053 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:152264150:152264445:-1 gene:ENSG00000244544 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT098795 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_152680 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 154 (TMEM154), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XR_427533 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens transmembrane protein 154 (TMEM154), transcript variant X3, misc_RNA. // chr4 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000304385 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:152618632:152680165:-1 gene:ENSG00000170006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK296694 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57153 complete cds. // chr4 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// BC060775 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 154, mRNA (cDNA clone MGC:71534 IMAGE:30336271), complete cds. // chr4 // 91 // 96 // 21 // 23 // 0 /// ENST00000504064 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:152646558:152680012:-1 gene:ENSG00000170006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1 /// AK309319 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99360. // chr4 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1 /// ENST00000613578 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:152639773:152652928:-1 gene:ENSG00000170006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000036107 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:152649394:152679933:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1
NM_145720 // RefSeq // Homo sapiens tigger transposable element derived 4 (TIGD4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006714131 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens tigger transposable element derived 4 (TIGD4), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000304337 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:152769354:152779764:-1 gene:ENSG00000169989 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC037869 // GenBank // Homo sapiens tigger transposable element derived 4, mRNA (cDNA clone MGC:43837 IMAGE:5273281), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000036112 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:152769466:152771004:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0
ENST00000364916 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:153266909:153267010:-1 gene:ENSG00000201786 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT098831 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NR_001562 // RefSeq // Homo sapiens annexin A2 pseudogene 1 (ANXA2P1), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000505539 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:153307792:153308717:-1 gene:ENSG00000213406 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// M62896 // GenBank // Human lipocortin (LIP) 2 pseudogene mRNA, complete cds-like region. // chr4 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000036100 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:153307709:153311274:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 82 // 22 // 23 // 0
ENST00000471592 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:153381729:153382015:-1 gene:ENSG00000243883 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT098836 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_003013 // RefSeq // Homo sapiens secreted frizzled-related protein 2 (SFRP2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000274063 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:153780592:153789120:-1 gene:ENSG00000145423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF017986 // GenBank // Homo sapiens secreted apoptosis related protein 1 (SARP1) mRNA, partial cds. // chr4 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// AY359001 // GenBank // Homo sapiens clone DNA50920 sFRP-2 (UNQ361) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// BC008666 // GenBank // Homo sapiens secreted frizzled-related protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:9395 IMAGE:3874262), complete cds. // chr4 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000004672 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:153715363:153788835:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
NM_001142552 // RefSeq // Homo sapiens dachsous cadherin-related 2 (DCHS2), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 36 // 16 // 16 // 0 /// NM_017639 // RefSeq // Homo sapiens dachsous cadherin-related 2 (DCHS2), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 84 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000339452 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:154322654:154491716:-1 gene:ENSG00000197410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 36 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000357232 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:154232247:154391297:-1 gene:ENSG00000197410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 38 // 38 // 0 /// AY354497 // GenBank // Homo sapiens cadherin protein (CDHJ) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 82 // 37 // 37 // 0 /// BC140919 // GenBank // Homo sapiens dachsous 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:9056731), complete cds. // chr4 // 87 // 33 // 13 // 15 // 0 /// GENSCAN00000004675 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:154233192:154335104:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 60 // 27 // 27 // 0
ENST00000363480 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:154543933:154544037:-1 gene:ENSG00000200350 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT098854 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_017419 // RefSeq // Homo sapiens acid-sensing (proton-gated) ion channel family member 5 (ASIC5), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000537611 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:155829729:155866273:-1 gene:ENSG00000256394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000572394 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR4_1_CTG12:155836689:155866273:-1 gene:ENSG00000262505 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000016169 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR4_1_CTG12:155843681:155866226:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000045884 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:155831260:155866226:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0
NM_001334 // RefSeq // Homo sapiens cathepsin O (CTSO), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000433477 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:155924118:155953917:-1 gene:ENSG00000256043 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000573499 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR4_1_CTG12:155924118:155953911:-1 gene:ENSG00000263238 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK300112 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57428 complete cds, highly similar to Cathepsin O precursor (EC 3.4.22.42). // chr4 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// BC049206 // GenBank // Homo sapiens cathepsin O, mRNA (cDNA clone MGC:51921 IMAGE:5189657), complete cds. // chr4 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000016170 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR4_1_CTG12:155925414:155953841:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000045874 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:155925414:155953847:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0
ENST00000516541 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:156986372:156986693:-1 gene:ENSG00000252350 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT098962 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
ENST00000362989 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:157201562:157201668:-1 gene:ENSG00000199859 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT098965 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000363651 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:157768013:157768113:-1 gene:ENSG00000200521 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT098976 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_001008393 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 46 (C4orf46), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000379205 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:158666679:158672046:-1 gene:ENSG00000205208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000508457 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:158666684:158671892:-1 gene:ENSG00000205208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// AK027539 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ14633 fis, clone NT2RP2000938. // chr4 // 92 // 68 // 12 // 13 // 0 /// BC065017 // GenBank // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 46, mRNA (cDNA clone MGC:70860 IMAGE:6018280), complete cds. // chr4 // 100 // 74 // 14 // 14 // 0 /// BC094775 // GenBank // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 46, mRNA (cDNA clone MGC:104679 IMAGE:30345779), complete cds. // chr4 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0
NM_005038 // RefSeq // Homo sapiens peptidylprolyl isomerase D (PPID), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000307720 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:158709134:158723396:-1 gene:ENSG00000171497 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000512699 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:158709761:158717055:-1 gene:ENSG00000171497 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 83 // 46 // 10 // 12 // 0 /// BC030707 // GenBank // Homo sapiens peptidylprolyl isomerase D, mRNA (cDNA clone MGC:33096 IMAGE:4819748), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// CR542081 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834G1236D for gene PPID, peptidylprolyl isomerase D (cyclophilin D); complete cds, incl. stopcodon. // chr4 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// L11667 // GenBank // Human cyclophilin-40 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000026240 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:158709736:158723288:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 94 // 65 // 16 // 17 // 0
NM_152543 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 45 (C4orf45), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000434826 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:158893134:159035181:-1 gene:ENSG00000164123 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000508011 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:158893544:159038760:-1 gene:ENSG00000164123 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// AK307319 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ97267. // chr4 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// NONHSAT099015 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr4 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0
ENST00000384251 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:159064297:159064398:-1 gene:ENSG00000206978 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT099019 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONHSAT099028 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_001128427 // RefSeq // Homo sapiens follistatin-like 5 (FSTL5), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NM_001128428 // RefSeq // Homo sapiens follistatin-like 5 (FSTL5), transcript variant 3, mRNA. // chr4 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// NM_020116 // RefSeq // Homo sapiens follistatin-like 5 (FSTL5), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000306100 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:161383897:162164035:-1 gene:ENSG00000168843 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000379164 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:161383899:162163966:-1 gene:ENSG00000168843 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000427802 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:161385747:162164004:-1 gene:ENSG00000168843 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// BC036502 // GenBank // Homo sapiens follistatin-like 5, mRNA (cDNA clone MGC:43288 IMAGE:5265170), complete cds. // chr4 // 95 // 100 // 40 // 42 // 0 /// BC073978 // GenBank // Homo sapiens follistatin-like 5, mRNA (cDNA clone IMAGE:6055688). // chr4 // 94 // 40 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000004177 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:161385747:161499781:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 24 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000004178 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:161537708:162066391:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 48 // 48 // 20 // 42 // 1
NM_000909 // RefSeq // Homo sapiens neuropeptide Y receptor Y1 (NPY1R), mRNA. // chr4 // 100 // 77 // 17 // 17 // 0 /// XM_005263032 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens neuropeptide Y receptor Y1 (NPY1R), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000296533 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:163323961:163332862:-1 gene:ENSG00000164128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 94 // 82 // 17 // 18 // 0 /// AB209237 // GenBank // Homo sapiens mRNA for neuropeptide Y receptor Y1 variant protein. // chr4 // 100 // 77 // 17 // 17 // 0 /// AY548168 // GenBank // Homo sapiens neuropeptide Y1 receptor mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 41 // 9 // 9 // 0 /// BC036657 // GenBank // Homo sapiens neuropeptide Y receptor Y1, mRNA (cDNA clone MGC:33139 IMAGE:5265511), complete cds. // chr4 // 100 // 77 // 17 // 17 // 0 /// BC071720 // GenBank // Homo sapiens neuropeptide Y receptor Y1, mRNA (cDNA clone MGC:88022 IMAGE:5229113), complete cds. // chr4 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0 /// L07615 // GenBank // Human neuropeptide Y receptor Y1 (NPYY1) mRNA, exon 2-3 and complete cds. // chr4 // 95 // 91 // 19 // 20 // 0 /// M84755 // GenBank // Human neuropeptide y receptor mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 45 // 10 // 10 // 0 /// M88461 // GenBank // Human neuropeptide Y peptide YY receptor mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0 /// AK298282 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57072 complete cds, highly similar to Neuropeptide Y receptor type 1. // chr4 // 50 // 50 // 11 // 22 // 1
NM_032136 // RefSeq // Homo sapiens transketolase-like 2 (TKTL2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000280605 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:163471093:163473746:-1 gene:ENSG00000151005 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC028707 // GenBank // Homo sapiens transketolase-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:26975 IMAGE:4825223), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC125101 // GenBank // Homo sapiens transketolase-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:149780 IMAGE:40118304), complete cds. // chr4 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// BC142943 // GenBank // Homo sapiens transketolase-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:166992 IMAGE:8860325), complete cds. // chr4 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000022314 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:163471854:163473731:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
ENST00000517192 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:163828800:163829113:-1 gene:ENSG00000253001 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT099065 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_012403 // RefSeq // Homo sapiens acidic (leucine-rich) nuclear phosphoprotein 32 family, member C (ANP32C), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000512835 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:164197007:164197711:-1 gene:ENSG00000248546 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000022308 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:164197007:164197711:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001012414 // RefSeq // Homo sapiens tripartite motif containing 61 (TRIM61), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000329314 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:164954446:164977668:-1 gene:ENSG00000183439 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC089393 // GenBank // Homo sapiens tripartite motif-containing 61, mRNA (cDNA clone MGC:102996 IMAGE:30378540), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001100389 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 192 (TMEM192), mRNA. // chr4 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000306480 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:165074422:165112919:-1 gene:ENSG00000170088 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000505095 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:165085586:165112854:-1 gene:ENSG00000170088 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000506087 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:165078420:165208549:-1 gene:ENSG00000170088 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// AK095801 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ38482 fis, clone FEBRA2022963. // chr4 // 96 // 83 // 23 // 24 // 0 /// BC036301 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 192, mRNA (cDNA clone MGC:24936 IMAGE:4778254), complete cds. // chr4 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// BX538029 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686K0275 (from clone DKFZp686K0275); complete cds. // chr4 // 91 // 76 // 20 // 22 // 0 /// GENSCAN00000030563 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:165079658:165109831:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0
NR_026575 // RefSeq // Homo sapiens glycerol kinase 3 pseudogene (GK3P), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000505354 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:165277984:165279645:-1 gene:ENSG00000229894 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0 /// AK292282 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76723 complete cds, highly similar to Homo sapiens glycerol kinase pseudogene 3, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000030566 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:165277984:165279645:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0
ENST00000517150 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:166053187:166053287:-1 gene:ENSG00000252959 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONHSAT099112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
ENST00000383984 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:166312935:166313034:-1 gene:ENSG00000206711 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT099114 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000391071 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:166918364:166918478:-1 gene:ENSG00000212373 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT099118 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000493390 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:167400495:167400762:-1 gene:ENSG00000240772 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT099120 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_017631 // RefSeq // Homo sapiens DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60 (DDX60), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// ENST00000393743 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:168216293:168318807:-1 gene:ENSG00000137628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// BC020601 // GenBank // Homo sapiens DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mRNA (cDNA clone IMAGE:4730802), complete cds. // chr4 // 100 // 19 // 9 // 9 // 0 /// BC038115 // GenBank // Homo sapiens DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mRNA (cDNA clone MGC:43125 IMAGE:5261001), complete cds. // chr4 // 98 // 100 // 46 // 47 // 0 /// AL137464 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp434E1722 (from clone DKFZp434E1722); partial cds. // chr4 // 19 // 19 // 9 // 47 // 1 /// GENSCAN00000009362 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:168199367:168302416:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 64 // 30 // 30 // 0
NM_001012967 // RefSeq // Homo sapiens DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60-like (DDX60L), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NM_001291510 // RefSeq // Homo sapiens DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60-like (DDX60L), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000260184 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:168356735:168480487:-1 gene:ENSG00000181381 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000505863 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:4:168396099:168456059:-1 gene:ENSG00000181381 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000505890 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:168390102:168480487:-1 gene:ENSG00000181381 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000511577 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:168356735:168480514:-1 gene:ENSG00000181381 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000046530 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:168306379:168501717:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0
ENST00000383886 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:168686608:168686716:-1 gene:ENSG00000206613 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT099140 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_020870 // RefSeq // Homo sapiens SH3 domain containing ring finger 1 (SH3RF1), mRNA. // chr4 // 95 // 100 // 38 // 40 // 0 /// ENST00000284637 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:169094256:169271105:-1 gene:ENSG00000154447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 100 // 38 // 40 // 0 /// ENST00000508685 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:169116269:169269093:-1 gene:ENSG00000154447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 58 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000511421 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:169116269:169156657:-1 gene:ENSG00000154447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 45 // 18 // 18 // 0 /// BC053671 // GenBank // Homo sapiens SH3 domain containing ring finger 1, mRNA (cDNA clone MGC:61566 IMAGE:6144754), complete cds. // chr4 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000046532 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:169062925:169162946:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 60 // 24 // 24 // 0
AB062480 // GenBank // Homo sapiens OK/SW-cl.79 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_017867 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 27 (C4orf27), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000393381 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:169729465:169757953:-1 gene:ENSG00000056050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC010367 // GenBank // Homo sapiens chromosome 4 open reading frame 27, mRNA (cDNA clone MGC:13432 IMAGE:4334172), complete cds. // chr4 // 86 // 100 // 18 // 21 // 0 /// GENSCAN00000017432 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:169729578:169758016:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0
ENST00000511479 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:169791221:169791702:-1 gene:ENSG00000229204 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000017416 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:169791220:169811527:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT099164 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT099165 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENST00000325407 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:170581470:170604984:-1 gene:ENSG00000181359 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// AY956762 // GenBank // Homo sapiens heat shock protein 90Af (HSP90Af) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// TCONS_l2_00022045-XLOC_l2_011348 // Broad TUCP // linc-AADAT-2 chr4:-:171502620-171526135 // chr4 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0
AK128523 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ46681 fis, clone TRACH3010382. // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONHSAT099211 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_007281 // RefSeq // Homo sapiens stimulator of chondrogenesis 1 (SCRG1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006714075 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens stimulator of chondrogenesis 1 (SCRG1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000296506 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:173384701:173399536:-1 gene:ENSG00000164106 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000512188 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:173388162:173406380:-1 gene:ENSG00000164106 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// AY359040 // GenBank // Homo sapiens clone DNA52758 SCRG1 (UNQ390) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC017583 // GenBank // Homo sapiens scrapie responsive protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4828130). // chr4 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// CR542142 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834G0323D for gene SCRG1, scrapie responsive protein 1; complete cds, incl. stopcodon. // chr4 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000008957 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:173391169:173412292:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
ENST00000517089 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:173446603:173446704:-1 gene:ENSG00000252898 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT099250 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_021973 // RefSeq // Homo sapiens heart and neural crest derivatives expressed 2 (HAND2), mRNA. // chr4 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENST00000359562 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:173526091:173530229:-1 gene:ENSG00000164107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC101406 // GenBank // Homo sapiens heart and neural crest derivatives expressed 2, mRNA (cDNA clone MGC:125303 IMAGE:40003700), complete cds. // chr4 // 91 // 41 // 10 // 11 // 0 /// BC101974 // GenBank // Homo sapiens heart and neural crest derivatives expressed 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:40003701), complete cds. // chr4 // 91 // 41 // 10 // 11 // 0 /// FJ226608 // GenBank // Homo sapiens heart and neural crest derivatives expressed 2 (HAND2) mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENST00000505300 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:173528079:173530206:-1 gene:ENSG00000164107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// ENST00000621866 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:173526501:173529289:-1 gene:ENSG00000164107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 90 // 74 // 18 // 20 // 0 /// GENSCAN00000008959 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:173419341:173529289:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
ENST00000447135 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:173615936:173616906:-1 gene:ENSG00000234801 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000008953 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:173615936:173634371:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001042543 // RefSeq // Homo sapiens glycine receptor, alpha 3 (GLRA3), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NM_006529 // RefSeq // Homo sapiens glycine receptor, alpha 3 (GLRA3), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000274093 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:174636914:174829314:-1 gene:ENSG00000145451 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000340217 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:174642487:174829227:-1 gene:ENSG00000145451 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC036086 // GenBank // Homo sapiens glycine receptor, alpha 3, mRNA (cDNA clone MGC:33772 IMAGE:5286731), complete cds. // chr4 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// U93917 // GenBank // Human glycine receptor alpha 3 subunit mRNA, complete cds. // chr4 // 93 // 93 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000021395 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:174580869:174817087:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
ENST00000515234 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:176184660:176194877:-1 gene:ENSG00000150628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// BC039342 // GenBank // Homo sapiens spermatogenesis associated 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:5268782), complete cds. // chr4 // 85 // 75 // 23 // 27 // 0 /// NM_144644 // RefSeq // Homo sapiens spermatogenesis associated 4 (SPATA4), mRNA. // chr4 // 89 // 89 // 32 // 36 // 1 /// ENST00000280191 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:176184638:176195671:-1 gene:ENSG00000150628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 83 // 83 // 30 // 36 // 1 /// AY040204 // GenBank // Homo sapiens testis and spermatogenesis cell related protein 2 (TSARG2) mRNA, complete cds. // chr4 // 89 // 89 // 32 // 36 // 1 /// BC021731 // GenBank // Homo sapiens spermatogenesis associated 4, mRNA (cDNA clone MGC:33432 IMAGE:5269042), complete cds. // chr4 // 72 // 72 // 26 // 36 // 1 /// ENST00000508699 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:176192972:176195541:-1 gene:ENSG00000150628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// GENSCAN00000034797 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:176182958:176195562:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 25 // 9 // 9 // 0
NM_080874 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat and SOCS box containing 5 (ASB5), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_005262760 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ankyrin repeat and SOCS box containing 5 (ASB5), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000296525 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:176213673:176269222:-1 gene:ENSG00000164122 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000512254 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:176215573:176241676:-1 gene:ENSG00000164122 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// AK098693 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ25827 fis, clone TST08047. // chr4 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// AY057053 // GenBank // Homo sapiens SOCS box protein ASB-5 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC065710 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat and SOCS box-containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:71906 IMAGE:4272258), complete cds. // chr4 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000034802 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:176214774:176269197:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_005429 // RefSeq // Homo sapiens vascular endothelial growth factor C (VEGFC), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC035212 // GenBank // Homo sapiens vascular endothelial growth factor C, mRNA (cDNA clone MGC:24887 IMAGE:4753457), complete cds. // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC063685 // GenBank // Homo sapiens vascular endothelial growth factor C, mRNA (cDNA clone MGC:74703 IMAGE:4513934), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// CR541897 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834C1033D for gene VEGFC, vascular endothelial growth factor C; complete cds, incl. stopcodon. // chr4 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// U43142 // GenBank // Human vascular endothelial growth factor related protein VRP mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// U58111 // GenBank // Human FLT4 ligand mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000507638 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:176689300:176729592:-1 gene:ENSG00000150630 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// ENST00000618562 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:176683538:176792727:-1 gene:ENSG00000150630 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000011398 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:176683926:176792311:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
ENST00000365061 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:177457111:177457228:-1 gene:ENSG00000201931 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr4 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT099387 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000517191 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:178116721:178116861:-1 gene:ENSG00000253000 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT099398 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NR_027107 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC90768 (MGC45800), long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000315302 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:182141650:182144466:-1 gene:ENSG00000177822 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000511052 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:182143178:182143888:-1 gene:ENSG00000177822 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr4 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000505873 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:182142383:182143776:-1 gene:ENSG00000177822 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr4 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// ENST00000508968 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:182143491:182145249:-1 gene:ENSG00000177822 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr4 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// ENST00000513752 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:182141186:182144500:-1 gene:ENSG00000177822 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr4 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// NONHSAT099430 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONHSAT099434 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT099435 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// NONHSAT099432 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// NONHSAT099433 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// NONHSAT099436 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NR_024008 // RefSeq // Homo sapiens WWC2 antisense RNA 2 (WWC2-AS2), long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000578387 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:183097017:183099199:-1 gene:ENSG00000251359 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONHSAT099461 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NONHSAT099464 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONHSAT099469 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001111319 // RefSeq // Homo sapiens claudin 22 (CLDN22), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000323319 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:183318194:183320774:-1 gene:ENSG00000177300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AK303864 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51450 complete cds, highly similar to Claudin-22. // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 1 /// GENSCAN00000018716 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:183319497:183320077:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 40 // 8 // 8 // 0
NM_001185149 // RefSeq // Homo sapiens claudin 24 (CLDN24), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000514470 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:4:183321812:183322408:-1 gene:ENSG00000185758 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 85 // 100 // 17 // 20 // 0 /// ENST00000541814 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:183321764:183322426:-1 gene:ENSG00000185758 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000018748 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:183321764:183330156:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
ENST00000364563 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:183675603:183675715:-1 gene:ENSG00000201433 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT099496 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_153343 // RefSeq // Homo sapiens ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 6 (ENPP6), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000296741 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:184088706:184217961:-1 gene:ENSG00000164303 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000512353 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:4:184116863:184221230:-1 gene:ENSG00000164303 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// AY358676 // GenBank // Homo sapiens clone DNA59608 AVKL1889 (UNQ1889) mRNA, complete cds. // chr4 // 90 // 80 // 18 // 20 // 0 /// BC035035 // GenBank // Homo sapiens ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 6, mRNA (cDNA clone MGC:33971 IMAGE:5259487), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018726 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:184090703:184155420:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
XM_003960344 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens myosin regulatory light chain 12B-like (LOC391722), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_373042 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens myosin regulatory light chain 12B-like (LOC391722), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000503948 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:184299129:184299640:-1 gene:ENSG00000227765 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000023974 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:184299129:184347912:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NR_003542 // RefSeq // Homo sapiens proteoglycan 3 pseudogene (SLED1), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000506741 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:184798296:184799046:-1 gene:ENSG00000249138 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000512051 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:184798512:184798891:-1 gene:ENSG00000249138 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr4 // 87 // 60 // 13 // 15 // 0 /// AY358224 // GenBank // Homo sapiens clone DNA213069 RTFV9368 (UNQ9368) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT099561 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT099562 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr4 // 87 // 60 // 13 // 15 // 0
NM_001292033 // RefSeq // Homo sapiens KIAA1430 (KIAA1430), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000296775 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:185190376:185203965:-1 gene:ENSG00000164323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000514798 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:4:185169026:185204028:-1 gene:ENSG00000164323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC020772 // GenBank // Homo sapiens KIAA1430, mRNA (cDNA clone IMAGE:4774475), complete cds. // chr4 // 94 // 64 // 17 // 18 // 0 /// BC030535 // GenBank // Homo sapiens KIAA1430, mRNA (cDNA clone MGC:40366 IMAGE:5240222), complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// NM_020827 // RefSeq // Homo sapiens KIAA1430 (KIAA1430), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// ENST00000458385 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:4:185159665:185204001:-1 gene:ENSG00000164323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// GENSCAN00000023963 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:185162798:185191196:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0
ENST00000384502 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:185415973:185416086:-1 gene:ENSG00000207231 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT099609 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AF090937 // GenBank // Homo sapiens clone HQ0618 PRO0618 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENST00000384766 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:185709873:185709967:-1 gene:ENSG00000207497 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT099624 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000410795 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:186026456:186026586:-1 gene:ENSG00000222727 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT099635 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NR_046264 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC651430 (FLJ38576), long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT099644 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_005958 // RefSeq // Homo sapiens melatonin receptor 1A (MTNR1A), mRNA. // chr4 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000307161 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:186533655:186555567:-1 gene:ENSG00000168412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC074946 // GenBank // Homo sapiens melatonin receptor 1A, mRNA (cDNA clone MGC:104051 IMAGE:30915497), complete cds. // chr4 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// BC074947 // GenBank // Homo sapiens melatonin receptor 1A, mRNA (cDNA clone MGC:103890 IMAGE:30915274), complete cds. // chr4 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// BC126297 // GenBank // Homo sapiens melatonin receptor 1A, mRNA (cDNA clone MGC:161575 IMAGE:8992013), complete cds. // chr4 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// BC126299 // GenBank // Homo sapiens melatonin receptor 1A, mRNA (cDNA clone MGC:161577 IMAGE:8992015), complete cds. // chr4 // 90 // 100 // 19 // 21 // 0 /// EU432127 // GenBank // Homo sapiens melatonin receptor 1A (MTNR1A) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 76 // 16 // 16 // 0 /// U14108 // GenBank // Human Mel-1a melatonin receptor mRNA, complete cds. // chr4 // 78 // 86 // 14 // 18 // 0 /// GENSCAN00000024915 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:186533689:186555365:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 76 // 16 // 16 // 0
NM_005245 // RefSeq // Homo sapiens FAT atypical cadherin 1 (FAT1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000441802 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:186587783:186723855:-1 gene:ENSG00000083857 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000614102 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:186587795:186723833:-1 gene:ENSG00000083857 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000024909 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:186588592:186709827:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0
ENST00000364215 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:188121531:188121634:-1 gene:ENSG00000201085 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT099730 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000365345 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:4:189709539:189709714:-1 gene:ENSG00000202215 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 75 // 77 // 15 // 20 // 0 /// ENST00000611407 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR4_3_CTG12:189709539:189709714:-1 gene:ENSG00000276052 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 75 // 77 // 15 // 20 // 0 /// ENST00000611896 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR4_7_CTG12:189720125:189720300:-1 gene:ENSG00000274208 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 75 // 77 // 15 // 20 // 0 /// ENST00000612437 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR4_6_CTG12:189709539:189709714:-1 gene:ENSG00000277908 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 75 // 77 // 15 // 20 // 0 /// NONHSAT099796 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 75 // 77 // 15 // 20 // 0 /// ENST00000612925 // ENSEMBL // ncrna:novel scaffold:GRCh38:KI270750.1:148668:148843:1 gene:ENSG00000277374 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 50 // 77 // 10 // 20 // 0 /// ENST00000620684 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:21:9646825:9647000:1 gene:ENSG00000275631 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 50 // 77 // 10 // 20 // 0
ENST00000428444 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:189982523:189984871:-1 gene:ENSG00000251297 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000447903 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR4_6_CTG12:189986501:189988849:-1 gene:ENSG00000173876 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000006007 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR4_6_CTG12:189986501:190031182:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000032243 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:189982523:190027204:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
ENST00000516390 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:21:9907916:9908010:1 gene:ENSG00000252199 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4_gl000193_random // 54 // 100 // 20 // 37 // 0 /// NONHSAT099829 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4_gl000193_random // 54 // 100 // 20 // 37 // 0 /// ENST00000516205 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:4:131768140:131768249:1 gene:ENSG00000252014 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4_gl000193_random // 35 // 100 // 13 // 37 // 0 /// NONHSAT081070 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4_gl000193_random // 38 // 100 // 14 // 37 // 0 /// NONHSAT098320 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4_gl000193_random // 35 // 100 // 13 // 37 // 0
NM_018942 // RefSeq // Homo sapiens H6 family homeobox 1 (HMX1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000400677 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:4:8867048:8871817:-1 gene:ENSG00000215612 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// M99587 // GenBank // Homo sapiens H6 homeodomain protein mRNA, complete cds. // chr4 // 73 // 100 // 19 // 26 // 0 /// ENST00000617742 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:4:8867050:8871817:-1 gene:ENSG00000215612 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000016501 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:4:8867304:8874576:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NR_027420 // RefSeq // Homo sapiens ankyrin repeat domain 57 pseudogene (LOC389834), non-coding RNA. // chrUn_gl000218 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000612565 // ENSEMBL // ensembl:known scaffold:GRCh38:GL000218.1:51867:54893:-1 gene:ENSG00000278384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn_gl000218 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT135863 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrUn_gl000218 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_052909 // RefSeq // Homo sapiens pleckstrin homology domain containing, family G (with RhoGef domain) member 4B (PLEKHG4B), mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000283426 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:140258:189970:1 gene:ENSG00000153404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000502646 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:140566:157110:1 gene:ENSG00000153404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000504041 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:169053:182589:1 gene:ENSG00000153404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// AK125163 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ43173 fis, clone FCBBF3007540. // chr5 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// BC008352 // GenBank // Homo sapiens pleckstrin homology domain containing, family G (with RhoGef domain) member 4B, mRNA (cDNA clone IMAGE:3536432), partial cds. // chr5 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000044887 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:104914:195353:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1
NM_001080478 // RefSeq // Homo sapiens leucine rich repeat containing 14B (LRRC14B), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000328278 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:5:191511:195353:1 gene:ENSG00000185028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000044887 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:104914:195353:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
NM_007277 // RefSeq // Homo sapiens exocyst complex component 3 (EXOC3), mRNA. // chr5 // 100 // 77 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000315013 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:5:446149:467285:1 gene:ENSG00000180104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 73 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000503889 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:453397:471936:1 gene:ENSG00000180104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000512944 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:443158:467296:1 gene:ENSG00000180104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 77 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000515601 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:443233:471937:1 gene:ENSG00000180104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// AK074086 // GenBank // Homo sapiens mRNA for FLJ00157 protein. // chr5 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// AK131103 // GenBank // Homo sapiens mRNA for FLJ00339 protein. // chr5 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// BC064569 // GenBank // Homo sapiens exocyst complex component 3, mRNA (cDNA clone MGC:74518 IMAGE:5590332), complete cds. // chr5 // 100 // 73 // 16 // 16 // 0 /// GU727644 // GenBank // Homo sapiens epididymis secretory sperm binding protein Li 19lP mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 77 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000044863 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:446206:466898:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 55 // 12 // 12 // 0 /// BC010127 // GenBank HTC // Homo sapiens exocyst complex component 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:3951643), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr5 // 59 // 59 // 13 // 22 // 1
NM_018140 // RefSeq // Homo sapiens centrosomal protein 72kDa (CEP72), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// XM_005248321 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens centrosomal protein 72kDa (CEP72), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000264935 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:612272:653553:1 gene:ENSG00000112877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000512038 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:644138:653243:1 gene:ENSG00000112877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 20 // 8 // 8 // 0 /// AK299072 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57567 complete cds, highly similar to Centrosomal protein of 72 kDa. // chr5 // 100 // 35 // 14 // 14 // 0 /// BC000132 // GenBank // Homo sapiens centrosomal protein 72kDa, mRNA (cDNA clone MGC:5307 IMAGE:2899944), complete cds. // chr5 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000044869 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:637146:641443:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 30 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000044873 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:612362:624619:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 20 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000043926 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR5_5_CTG1:614036:626778:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1
NM_004237 // RefSeq // Homo sapiens thyroid hormone receptor interactor 13 (TRIP13), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000166345 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:892643:918120:1 gene:ENSG00000071539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENST00000513435 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:893642:908074:1 gene:ENSG00000071539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 36 // 16 // 16 // 0 /// BC000404 // GenBank // Homo sapiens thyroid hormone receptor interactor 13, mRNA (cDNA clone MGC:8565 IMAGE:2822981), complete cds. // chr5 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// BC019294 // GenBank // Homo sapiens thyroid hormone receptor interactor 13, mRNA (cDNA clone MGC:4108 IMAGE:2822981), complete cds. // chr5 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// CR456744 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834B0611D for gene TRIP13, thyroid hormone receptor interactor 13; complete cds, incl. stopcodon. // chr5 // 100 // 64 // 28 // 28 // 0 /// L40384 // GenBank // Homo sapiens thyroid receptor interactor (TRIP13) mRNA, partial cds. // chr5 // 82 // 25 // 9 // 11 // 0 /// U96131 // GenBank // Homo sapiens HPV16 E1 protein binding protein mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// NM_001166260 // RefSeq // Homo sapiens thyroid hormone receptor interactor 13 (TRIP13), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 45 // 45 // 20 // 44 // 1 /// ENST00000512024 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:892884:908932:1 gene:ENSG00000071539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 45 // 45 // 20 // 44 // 1 /// GENSCAN00000044888 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:892999:917103:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 64 // 64 // 28 // 44 // 1
NM_001003841 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 6 (neutral amino acid transporter), member 19 (SLC6A19), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000304460 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:1201595:1225117:1 gene:ENSG00000174358 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000515652 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:1201595:1223270:1 gene:ENSG00000174358 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// AK096054 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ38735 fis, clone KIDNE2010973, highly similar to Sodium-dependent neutral amino acid transporter B. // chr5 // 85 // 93 // 23 // 27 // 0 /// AK290811 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75430 complete cds, highly similar to Homo sapiens solute carrier family 6 (neutral amino acid transporter), member 19 (SLC6A19), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AY591756 // GenBank // Homo sapiens system B0 neutral amino acid transporter (SLC6A19) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AY596807 // GenBank // Homo sapiens sodium-dependent amino acid transporter mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000025857 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:1201651:1221904:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_182632 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 6 (neutral amino acid transporter), member 18 (SLC6A18), mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000324642 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:1225355:1246189:1 gene:ENSG00000164363 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000513607 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:1225409:1232839:1 gene:ENSG00000164363 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 21 // 8 // 8 // 0 /// AK298257 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53853 complete cds, highly similar to Sodium-and chloride-dependent transporter XTRP2. // chr5 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// BC056757 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 6, member 18, mRNA (cDNA clone MGC:50843 IMAGE:5758770), complete cds. // chr5 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000025899 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:1225478:1246078:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0
NM_004553 // RefSeq // Homo sapiens NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 6, 13kDa (NADH-coenzyme Q reductase) (NDUFS6), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF044959 // GenBank // Homo sapiens NADH:ubiquinone oxidoreductase NDUFS6 subunit mRNA, nuclear gene encoding mitochondrial protein, complete cds. // chr5 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// BC038664 // GenBank // Homo sapiens NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 6, 13kDa (NADH-coenzyme Q reductase), mRNA (cDNA clone MGC:40334 IMAGE:5204222), complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC046155 // GenBank // Homo sapiens NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 6, 13kDa (NADH-coenzyme Q reductase), mRNA (cDNA clone MGC:57685 IMAGE:6047460), complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// CR456880 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834B017D for gene NDUFS6, NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 6, 13kDa (NADH-coenzyme Q reductase); complete cds, incl. stopcodon. // chr5 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000274137 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:1801400:1816605:1 gene:ENSG00000145494 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 96 // 25 // 26 // 1 /// ENST00000469176 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:1801415:1814699:1 gene:ENSG00000145494 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// GENSCAN00000025867 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:1801418:1820683:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
ENST00000364156 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:2184710:2184820:1 gene:ENSG00000201026 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT100090 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_024337 // RefSeq // Homo sapiens iroquois homeobox 1 (IRX1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000302006 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:3596054:3601403:1 gene:ENSG00000170549 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY335938 // GenBank // Homo sapiens homeodomain protein IRXA1 (IRX1) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000014183 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:3558243:3622400:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0
ENST00000411075 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:5126046:5126337:1 gene:ENSG00000223007 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT100163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_139056 // RefSeq // Homo sapiens ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 16 (ADAMTS16), mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000274181 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:5140330:5320304:1 gene:ENSG00000145536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000433402 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:5140468:5303807:1 gene:ENSG00000145536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000511368 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:5140330:5223727:1 gene:ENSG00000145536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 43 // 15 // 15 // 0 /// DQ266047 // GenBank // Homo sapiens ADAMTS16s alternative splice form mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 43 // 15 // 15 // 0
NM_015325 // RefSeq // Homo sapiens interactor of little elongator complex ELL subunit 1 (ICE1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000296564 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:5422694:5490234:1 gene:ENSG00000164151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000512608 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:5420664:5454615:1 gene:ENSG00000164151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000006017 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:5416304:5571065:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// AK126937 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44990 fis, clone BRAWH3008559. // chr5 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0
ENST00000390956 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:7047227:7047336:1 gene:ENSG00000212258 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr5 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// NONHSAT100229 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0
ENST00000362903 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:7980146:7980304:1 gene:ENSG00000199773 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT100276 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0
ENST00000410122 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:9760907:9761013:1 gene:ENSG00000222054 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT100381 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000516862 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:10337277:10337386:1 gene:ENSG00000252671 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT100420 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000384582 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:11027200:11027307:1 gene:ENSG00000207312 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT100492 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
AY358688 // GenBank // Homo sapiens clone DNA62312 GALI1870 (UNQ1870) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_019018 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 105, member A (FAM105A), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000274217 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:14581775:14612720:1 gene:ENSG00000145569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000513825 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:14600965:14607370:1 gene:ENSG00000145569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 86 // 42 // 12 // 14 // 0 /// AL512750 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp667E105 (from clone DKFZp667E105). // chr5 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// BC011524 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 105, member A, mRNA (cDNA clone MGC:8793 IMAGE:3872837), complete cds. // chr5 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000048573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:14581895:14610314:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NONHSAT100543 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 86 // 42 // 12 // 14 // 0
NM_138348 // RefSeq // Homo sapiens OTU deubiquitinase with linear linkage specificity (OTULIN), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000284274 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:14664748:14699711:1 gene:ENSG00000154124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000503023 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:14664664:14690270:1 gene:ENSG00000154124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// BC007706 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 105, member B, mRNA (cDNA clone MGC:10725 IMAGE:3952677), complete cds. // chr5 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// BC015392 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 105, member B, mRNA (cDNA clone MGC:21699 IMAGE:4430188), complete cds. // chr5 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000507335 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:14664732:14674137:1 gene:ENSG00000154124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000048576 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:14664841:14694479:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT100551 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NR_046285 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC100130744 (LOC100130744), long non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT100564 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001278317 // RefSeq // Homo sapiens F-box and leucine-rich repeat protein 7 (FBXL7), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// NM_012304 // RefSeq // Homo sapiens F-box and leucine-rich repeat protein 7 (FBXL7), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// XM_005248273 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens F-box and leucine-rich repeat protein 7 (FBXL7), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000329673 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:5:15927888:15939795:1 gene:ENSG00000183580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 62 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000504595 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:15500196:15939791:1 gene:ENSG00000183580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000510662 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:15501438:15937219:1 gene:ENSG00000183580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 44 // 15 // 15 // 0 /// AF199356 // GenBank // Homo sapiens F-box protein FBL6 (FBL6) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 41 // 14 // 14 // 0 /// BC075061 // GenBank // Homo sapiens F-box and leucine-rich repeat protein 7, mRNA (cDNA clone MGC:104130 IMAGE:30915585), complete cds. // chr5 // 100 // 44 // 15 // 15 // 0 /// BC136424 // GenBank // Homo sapiens F-box and leucine-rich repeat protein 7, mRNA (cDNA clone MGC:168036 IMAGE:9020413), complete cds. // chr5 // 100 // 62 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000019550 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:15900328:15937186:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 35 // 12 // 12 // 0
ENST00000517284 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:16853994:16854114:1 gene:ENSG00000253093 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT100615 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001271606 // RefSeq // Homo sapiens brain abundant, membrane attached signal protein 1 (BASP1), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NM_006317 // RefSeq // Homo sapiens brain abundant, membrane attached signal protein 1 (BASP1), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000322611 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:17217560:17276834:1 gene:ENSG00000176788 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF039656 // GenBank // Homo sapiens neuronal tissue-enriched acidic protein (NAP-22) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// AK295995 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51212 complete cds, moderately similar to Brain acid soluble protein 1. // chr5 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BT019340 // GenBank // Homo sapiens brain abundant, membrane attached signal protein 1 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// BT019341 // GenBank // Homo sapiens brain abundant, membrane attached signal protein 1 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// BC000518 // GenBank // Homo sapiens brain abundant, membrane attached signal protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:8555 IMAGE:2822874), complete cds. // chr5 // 89 // 89 // 24 // 27 // 1 /// ENST00000616743 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:5:17216823:17276843:1 gene:ENSG00000176788 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000038982 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:17255528:17275900:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0
ENST00000517099 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:17240611:17240715:1 gene:ENSG00000252908 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT100624 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000505520 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:17306381:17306960:1 gene:ENSG00000185296 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 94 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000038951 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:17292459:17306823:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
ENST00000364845 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:17345616:17345955:1 gene:ENSG00000201715 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONHSAT100625 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0
ENST00000503531 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:17498231:17498825:1 gene:ENSG00000185041 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000038962 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:17498276:17498827:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 77 // 10 // 10 // 0
ENST00000505613 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:17604781:17605377:1 gene:ENSG00000249357 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000038959 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:17604781:17605377:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
ENST00000473445 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:18547312:18547605:1 gene:ENSG00000241552 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT100672 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000503199 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:21882585:21884310:1 gene:ENSG00000213430 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000047610 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:21882563:21884312:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENST00000418902 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:22142352:22152356:1 gene:ENSG00000168967 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0 /// AY008411 // GenBank // Homo sapiens pro-melanin-concentrating hormone-like 1 protein (PMCHL1) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr5 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT100729 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 100 // 71 // 10 // 10 // 0
ENST00000384185 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:23299155:23299262:1 gene:ENSG00000206912 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT100743 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_020227 // RefSeq // Homo sapiens PR domain containing 9 (PRDM9), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000296682 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:23507615:23528597:1 gene:ENSG00000164256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// AF275816 // GenBank // Homo sapiens PR-domain containing protein 9 (PRDM9) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0 /// AK301776 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61643 complete cds, highly similar to PR domain zinc finger protein 9. // chr5 // 93 // 88 // 13 // 14 // 0 /// DQ388610 // GenBank // Homo sapiens PR domain-containing 9 (PRDM9) mRNA, PRDM9-MEISETZ allele, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000048008 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:23509034:23527773:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0
ENST00000507936 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:23951564:23979986:1 gene:ENSG00000248874 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000512559 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:23951348:24178263:1 gene:ENSG00000248874 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// AK092155 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ34836 fis, clone NT2NE2010400. // chr5 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
ENST00000363041 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:24910594:24910695:1 gene:ENSG00000199911 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT100764 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENST00000410628 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:26012889:26013025:1 gene:ENSG00000222560 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT100783 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000384531 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:27111569:27111674:1 gene:ENSG00000207261 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT100793 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000517058 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:28624657:28624763:1 gene:ENSG00000252867 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONHSAT100818 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NONHSAT100826 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000031288 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:28926870:29003332:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 58 // 58 // 11 // 19 // 1
ENST00000516792 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:29070496:29070610:1 gene:ENSG00000252601 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr5 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000611262 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR5_2_CTG1:29079384:29079498:1 gene:ENSG00000277995 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr5 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT100832 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0
ENST00000411204 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:29948828:29949130:1 gene:ENSG00000223136 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// NONHSAT100867 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0
NM_004932 // RefSeq // Homo sapiens cadherin 6, type 2, K-cadherin (fetal kidney) (CDH6), mRNA. // chr5 // 100 // 87 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000265071 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:31193750:31329146:1 gene:ENSG00000113361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 83 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000514738 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:31193750:31318346:1 gene:ENSG00000113361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 78 // 36 // 36 // 0 /// AK291290 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75483 complete cds, highly similar to Homo sapiens cadherin 6, type 2, K-cadherin (fetal kidney) (CDH6), mRNA. // chr5 // 94 // 78 // 34 // 36 // 0 /// BC000019 // GenBank // Homo sapiens cadherin 6, type 2, K-cadherin (fetal kidney), mRNA (cDNA clone MGC:1470 IMAGE:3506873), complete cds. // chr5 // 94 // 78 // 34 // 36 // 0 /// D31784 // GenBank // Homo sapiens mRNA for cadherin-6, complete cds. // chr5 // 100 // 76 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000504835 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:31316250:31319042:1 gene:ENSG00000113361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 24 // 24 // 11 // 46 // 1 /// GENSCAN00000043440 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:31267474:31323308:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 61 // 28 // 28 // 0
NM_178140 // RefSeq // Homo sapiens PDZ domain containing 2 (PDZD2), mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// XM_006714460 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens PDZ domain containing 2 (PDZD2), transcript variant X9, mRNA. // chr5 // 100 // 89 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000438447 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:31639410:32110931:1 gene:ENSG00000133401 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// ENST00000502489 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:31854937:32077955:1 gene:ENSG00000133401 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 43 // 20 // 20 // 0 /// AB002298 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA0300 gene, partial cds. // chr5 // 98 // 98 // 45 // 46 // 0 /// AF338650 // GenBank // Homo sapiens PDZ domain-containing protein AIPC (AIPC) mRNA, complete cds. // chr5 // 97 // 83 // 38 // 39 // 0 /// AK304804 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60401 complete cds, highly similar to PDZ domain-containing protein 2. // chr5 // 100 // 43 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000513490 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:32099174:32110926:1 gene:ENSG00000133401 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 17 // 17 // 8 // 47 // 1 /// BX648242 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686K16108 (from clone DKFZp686K16108). // chr5 // 21 // 21 // 10 // 47 // 1 /// GENSCAN00000027798 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:31950239:32108135:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 70 // 33 // 33 // 0 /// NONHSAT100912 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 17 // 17 // 8 // 47 // 1
NONHSAT100900 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000516078 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:31832439:31832535:1 gene:ENSG00000251887 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT100901 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
ENST00000506046 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:31923367:31923532:1 gene:ENSG00000249774 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT100906 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENST00000363195 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:32134738:32134834:1 gene:ENSG00000200065 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT100916 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AF090909 // GenBank // Homo sapiens clone HQ0255 PRO0255 mRNA, complete cds. // chr5 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0
NM_000908 // RefSeq // Homo sapiens natriuretic peptide receptor 3 (NPR3), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NM_001204375 // RefSeq // Homo sapiens natriuretic peptide receptor 3 (NPR3), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NM_001204376 // RefSeq // Homo sapiens natriuretic peptide receptor 3 (NPR3), transcript variant 3, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000265074 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:32711434:32791720:1 gene:ENSG00000113389 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC022250 // GenBank // Homo sapiens chromosome 5 open reading frame 23, mRNA (cDNA clone MGC:22189 IMAGE:4702775), complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// ENST00000326958 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:5:32710637:32791724:1 gene:ENSG00000113389 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSG00000181495 // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_016568 // RefSeq // Homo sapiens relaxin/insulin-like family peptide receptor 3 (RXFP3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000330120 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:33936386:33938237:1 gene:ENSG00000182631 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY394501 // GenBank // Homo sapiens relaxin-3 receptor-1 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// BC095526 // GenBank // Homo sapiens relaxin/insulin-like family peptide receptor 3, mRNA (cDNA clone MGC:111744 IMAGE:30706560), complete cds. // chr5 // 85 // 90 // 23 // 27 // 0 /// BC113438 // GenBank // Homo sapiens relaxin/insulin-like family peptide receptor 3, mRNA (cDNA clone MGC:141998 IMAGE:8322490), complete cds. // chr5 // 89 // 90 // 24 // 27 // 0 /// BC113440 // GenBank // Homo sapiens relaxin/insulin-like family peptide receptor 3, mRNA (cDNA clone MGC:142000 IMAGE:8322492), complete cds. // chr5 // 89 // 90 // 24 // 27 // 0 /// D88437 // GenBank // Homo sapiens mRNA for G-protein coupled receptor SALPR, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000616205 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR5_6_CTG1:33938372:33940904:1 gene:ENSG00000277069 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000033045 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:33936747:33938150:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000044433 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:CHR_HSCHR5_6_CTG1:33938733:33940136:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0
NM_001012339 // RefSeq // Homo sapiens DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 21 (DNAJC21), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NM_194283 // RefSeq // Homo sapiens DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 21 (DNAJC21), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000342382 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:34929593:34955200:1 gene:ENSG00000168724 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000382021 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:34929593:34958964:1 gene:ENSG00000168724 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000514237 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:34936204:34953941:1 gene:ENSG00000168724 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// AY177688 // GenBank // Homo sapiens GS3 protein mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AY258422 // GenBank // Homo sapiens DnaJ domain protein mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC065745 // GenBank // Homo sapiens DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 21, mRNA (cDNA clone IMAGE:6498385), partial cds. // chr5 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// BC107577 // GenBank // Homo sapiens DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 21, mRNA (cDNA clone IMAGE:4307151), partial cds. // chr5 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// XM_005248250 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 21 (DNAJC21), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// GENSCAN00000019824 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:34915739:34954714:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0
ENST00000364498 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:35429064:35429277:1 gene:ENSG00000201368 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT101010 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000364353 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:36155119:36155222:1 gene:ENSG00000201223 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000410246 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:36485343:36485440:1 gene:ENSG00000222178 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr5 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT101034 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
ENST00000437639 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:37209364:37212381:1 gene:ENSG00000228212 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000025272 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:37209382:37212381:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0
NM_001168355 // RefSeq // Homo sapiens oncostatin M receptor (OSMR), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// NM_003999 // RefSeq // Homo sapiens oncostatin M receptor (OSMR), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_005248386 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens oncostatin M receptor (OSMR), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000274276 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:38845999:38935641:1 gene:ENSG00000145623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000502536 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:38845858:38886657:1 gene:ENSG00000145623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// AK304016 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61046 complete cds, highly similar to Homo sapiens oncostatin M receptor (OSMR), mRNA. // chr5 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// BC010943 // GenBank // Homo sapiens oncostatin M receptor, mRNA (cDNA clone IMAGE:4043935), complete cds. // chr5 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// BC063468 // GenBank // Homo sapiens oncostatin M receptor, mRNA (cDNA clone IMAGE:5190501), complete cds. // chr5 // 89 // 36 // 8 // 9 // 0 /// BC125209 // GenBank // Homo sapiens oncostatin M receptor, mRNA (cDNA clone MGC:150626 IMAGE:40123501), complete cds. // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC125210 // GenBank // Homo sapiens oncostatin M receptor, mRNA (cDNA clone MGC:150627 IMAGE:40123502), complete cds. // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// U60805 // GenBank // Human oncostatin-M specific receptor beta subunit (OSMRB) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000001641 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:38903882:38933444:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
AF116653 // GenBank HTC // Homo sapiens PRO0823 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000362491 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:40269558:40269719:1 gene:ENSG00000199361 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT101139 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_000958 // RefSeq // Homo sapiens prostaglandin E receptor 4 (subtype EP4) (PTGER4), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_005248326 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens prostaglandin E receptor 4 (subtype EP4) (PTGER4), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0 /// XM_005248327 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens prostaglandin E receptor 4 (subtype EP4) (PTGER4), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 34 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000302472 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:40679498:40693735:1 gene:ENSG00000171522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000514343 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:40679930:40681680:1 gene:ENSG00000171522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// AY429109 // GenBank // Homo sapiens prostaglandin E receptor 4 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 38 // 11 // 11 // 0 /// BC101534 // GenBank // Homo sapiens prostaglandin E receptor 4 (subtype EP4), mRNA (cDNA clone MGC:126583 IMAGE:8069040), complete cds. // chr5 // 94 // 62 // 17 // 18 // 0 /// BC113523 // GenBank // Homo sapiens prostaglandin E receptor 4 (subtype EP4), mRNA (cDNA clone MGC:142083 IMAGE:8322575), complete cds. // chr5 // 94 // 62 // 17 // 18 // 0 /// D28472 // GenBank // Homo sapiens mRNA for prostaglandin E receptor EP4 subtype, complete cds. // chr5 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// L25124 // GenBank // Homo sapiens prostaglandin E2 receptor mRNA, complete cds. // chr5 // 95 // 76 // 21 // 22 // 0 /// L28175 // GenBank // Homo sapiens prostaglandin E2 receptor EP2 subtype mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000010216 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:40532533:40692378:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
NM_032587 // RefSeq // Homo sapiens caspase recruitment domain family, member 6 (CARD6), mRNA. // chr5 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// ENST00000254691 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:40841184:40855354:1 gene:ENSG00000132357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// ENST00000381677 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:5:40841308:40860175:1 gene:ENSG00000132357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// AF356193 // GenBank // Homo sapiens caspase recruitment domain protein 6 mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// AK304349 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56560 complete cds, highly similar to Caspase recruitment domain-containing protein 6. // chr5 // 89 // 36 // 8 // 9 // 0 /// AY196783 // GenBank // Homo sapiens CINCIN1 (CINCIN1) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// BC093825 // GenBank // Homo sapiens caspase recruitment domain family, member 6, mRNA (cDNA clone MGC:120860 IMAGE:7939670), complete cds. // chr5 // 90 // 80 // 18 // 20 // 0 /// GENSCAN00000010217 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:40841383:40854446:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0
NM_175921 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 5 open reading frame 51 (C5orf51), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_005248289 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chromosome 5 open reading frame 51 (C5orf51), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 90 // 31 // 9 // 10 // 0 /// ENST00000381647 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:41904349:41921636:1 gene:ENSG00000205765 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000509976 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:41904371:41911333:1 gene:ENSG00000205765 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// BC131721 // GenBank // Homo sapiens chromosome 5 open reading frame 51, mRNA (cDNA clone MGC:150636 IMAGE:40123669), complete cds. // chr5 // 86 // 44 // 12 // 14 // 0 /// GENSCAN00000040925 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:41904368:41918247:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 92 // 41 // 12 // 13 // 0 /// ENST00000612065 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:5:41904368:41919694:1 gene:ENSG00000205765 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
ENST00000399543 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:43042093:43045390:1 gene:ENSG00000215068 gene_biotype:antisense transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000451894 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:43041575:43045264:1 gene:ENSG00000215068 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr5 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000508913 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:43042133:43045268:1 gene:ENSG00000215068 gene_biotype:antisense transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000515108 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:43042133:43045268:1 gene:ENSG00000215068 gene_biotype:antisense transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// AK123995 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ42001 fis, clone SPLEN2029912. // chr5 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// ENST00000505541 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:43041757:43044886:1 gene:ENSG00000215068 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr5 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1 /// AK002146 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ11284 fis, clone PLACE1009542. // chr5 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1 /// NONHSAT101267 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT101269 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONHSAT101270 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT101271 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000021428 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:43041863:43067585:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1 /// NONHSAT101268 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
NM_153361 // RefSeq // Homo sapiens NIM1 serine/threonine protein kinase (NIM1K), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NR_072980 // RefSeq // Homo sapiens NIM1 serine/threonine protein kinase (NIM1K), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr5 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_006714450 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens NIM1 serine/threonine protein kinase (NIM1K), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000326035 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:43192225:43280850:1 gene:ENSG00000177453 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000512796 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:43192852:43280848:1 gene:ENSG00000177453 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// BC036422 // GenBank // Homo sapiens serine/threonine-protein kinase NIM1, mRNA (cDNA clone MGC:42105 IMAGE:4797792), complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000021421 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:43245776:43280729:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
ENST00000511991 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:43336164:43348716:1 gene:ENSG00000188850 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 69 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000514136 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:43348329:43348672:1 gene:ENSG00000188850 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONHSAT101308 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 69 // 11 // 11 // 0 /// NONHSAT101309 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// TCONS_l2_00023383-XLOC_l2_011566 // Broad TUCP // linc-NNT-2 chr5:+:43336265-43348818 // chr5 // 100 // 69 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000021419 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:43309753:43363842:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 69 // 69 // 11 // 16 // 1
ENST00000581587 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:44716193:44716486:1 gene:ENSG00000263556 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONHSAT101336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_016640 // RefSeq // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein S30 (MRPS30), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000507110 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:44808925:44815522:1 gene:ENSG00000112996 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000515647 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:44809843:44815066:1 gene:ENSG00000112996 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// AF146192 // GenBank // Homo sapiens programmed cell death 9 (PDCD9) mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// AL355715 // GenBank // Homo sapiens mRNA full length insert cDNA clone EUROIMAGE 1368574. // chr5 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// AL355716 // GenBank // Homo sapiens mRNA full length insert cDNA clone EUROIMAGE 549763. // chr5 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// BC007735 // GenBank // Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein S30, mRNA (cDNA clone MGC:12561 IMAGE:4123055), complete cds. // chr5 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000622078 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:5:44809226:44815306:1 gene:ENSG00000112996 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000003938 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:44808963:44815202:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT101349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0
NONHSAT101387 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_002202 // RefSeq // Homo sapiens ISL LIM homeobox 1 (ISL1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000230658 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:51383391:51394738:1 gene:ENSG00000016082 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000511384 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:51383672:51393610:1 gene:ENSG00000016082 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 39 // 13 // 13 // 0 /// AK290742 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77081 complete cds, highly similar to Homo sapiens ISL1 transcription factor, LIM/homeodomain, (islet-1), mRNA. // chr5 // 100 // 58 // 19 // 19 // 0 /// BC031213 // GenBank // Homo sapiens ISL LIM homeobox 1, mRNA (cDNA clone MGC:39494 IMAGE:5269369), complete cds. // chr5 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// U07559 // GenBank // Human ISL-1 (Islet-1) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000505475 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:51386204:51393567:1 gene:ENSG00000016082 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// GENSCAN00000019916 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:51347890:51393610:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1
NM_006350 // RefSeq // Homo sapiens follistatin (FST), transcript variant FST317, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_013409 // RefSeq // Homo sapiens follistatin (FST), transcript variant FST344, mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000256759 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:53480409:53487134:1 gene:ENSG00000134363 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000396947 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:53480626:53487106:1 gene:ENSG00000134363 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000497789 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:5:53484216:53486092:1 gene:ENSG00000134363 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000504226 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:5:53483611:53486090:1 gene:ENSG00000134363 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// AB451330 // GenBank // Homo sapiens FST mRNA for follistatin isoform FST317 precursor, complete cds, clone: FLJ80201SAAN. // chr5 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC004107 // GenBank // Homo sapiens follistatin, mRNA (cDNA clone MGC:10663 IMAGE:3688745), complete cds. // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// CR541813 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834G1031D for gene FST, follistatin; complete cds, incl. stopcodon. // chr5 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000017777 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:53480792:53486033:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_002495 // RefSeq // Homo sapiens NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 4, 18kDa (NADH-coenzyme Q reductase) (NDUFS4), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000296684 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:53560635:53683340:1 gene:ENSG00000164258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000502423 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:53560635:53683138:1 gene:ENSG00000164258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000506765 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:5:53560675:53683338:1 gene:ENSG00000164258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000506974 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:53560647:53683338:1 gene:ENSG00000164258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000507026 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:53560633:53683219:1 gene:ENSG00000164258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// AF020351 // GenBank // Homo sapiens NADH:ubiquinone oxidoreductase 18 kDa IP subunit mRNA, nuclear gene encoding mitochondrial protein, complete cds. // chr5 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC005270 // GenBank // Homo sapiens NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 4, 18kDa (NADH-coenzyme Q reductase), mRNA (cDNA clone MGC:12313 IMAGE:3681312), complete cds. // chr5 // 81 // 84 // 17 // 21 // 0
AB062482 // GenBank // Homo sapiens OK/SW-cl.89 mRNA, complete cds. // chr5 // 77 // 96 // 17 // 22 // 0
NM_006308 // RefSeq // Homo sapiens heat shock 27kDa protein 3 (HSPB3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000302005 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:54455601:54456384:1 gene:ENSG00000169271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// CR450314 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834F081D for gene HSPB3, heat shock 27kDa protein 3; complete cds; without stopcodon. // chr5 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// U15590 // GenBank // Homo sapiens heat shock 17kD protein 3 (HSPB3) mRNA, complete cds. // chr5 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// BC126272 // GenBank // Homo sapiens heat shock 27kDa protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:161550 IMAGE:8991988), complete cds. // chr5 // 65 // 68 // 11 // 17 // 0 /// BC132869 // GenBank // Homo sapiens heat shock 27kDa protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:164500 IMAGE:40146891), complete cds. // chr5 // 65 // 68 // 11 // 17 // 0 /// GENSCAN00000007991 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:54455790:54456242:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 92 // 48 // 11 // 12 // 0
NM_002104 // RefSeq // Homo sapiens granzyme K (granzyme 3; tryptase II) (GZMK), mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000231009 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:55024253:55034570:1 gene:ENSG00000113088 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC035802 // GenBank // Homo sapiens granzyme K (granzyme 3; tryptase II), mRNA (cDNA clone MGC:46219 IMAGE:5748080), complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// U26174 // GenBank // Homo sapiens pre-granzyme 3 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// U35237 // GenBank // Human HNK-Tryptase-2 (HNK-Tryp-2) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000017463 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:55024668:55096354:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0
ENST00000384500 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:55040847:55040945:1 gene:ENSG00000207229 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT101466 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_006144 // RefSeq // Homo sapiens granzyme A (granzyme 1, cytotoxic T-lymphocyte-associated serine esterase 3) (GZMA), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000274306 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:55102648:55110252:1 gene:ENSG00000145649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC015739 // GenBank // Homo sapiens granzyme A (granzyme 1, cytotoxic T-lymphocyte-associated serine esterase 3), mRNA (cDNA clone MGC:23007 IMAGE:4849202), complete cds. // chr5 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// CR456968 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834B105D for gene GZMA, granzyme A (granzyme 1, cytotoxic T-lymphocyte-associated serine esterase 3); complete cds, incl. stopcodon. // chr5 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// M18737 // GenBank // Human Hanukah factor serine protease (HuHF) mRNA, complete cds. // chr5 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000017455 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:55102683:55110182:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_015360 // RefSeq // Homo sapiens superkiller viralicidic activity 2-like 2 (S. cerevisiae) (SKIV2L2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000230640 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:55307760:55425581:1 gene:ENSG00000039123 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000506750 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:55308001:55425106:1 gene:ENSG00000039123 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AK291649 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76877 complete cds, highly similar to Homo sapiens superkiller viralicidic activity 2-like 2 (SKIV2L2), mRNA. // chr5 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// AK304788 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55446 complete cds, highly similar to Superkiller viralicidic activity 2-like 2 (EC 3.6.1.-). // chr5 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// BC028604 // GenBank // Homo sapiens superkiller viralicidic activity 2-like 2 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:33192 IMAGE:4820164), complete cds. // chr5 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC104996 // GenBank // Homo sapiens superkiller viralicidic activity 2-like 2 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:132656 IMAGE:8143999), complete cds. // chr5 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// BC113509 // GenBank // Homo sapiens superkiller viralicidic activity 2-like 2 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:142069 IMAGE:8322561), complete cds. // chr5 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000017453 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:55324145:55424772:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0
ENST00000362452 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:55777469:55777587:1 gene:ENSG00000199322 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr5 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT101513 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENST00000517223 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:56125671:56125770:1 gene:ENSG00000253032 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT101529 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_005921 // RefSeq // Homo sapiens mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, E3 ubiquitin protein ligase (MAP3K1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_005248519 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, E3 ubiquitin protein ligase (MAP3K1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000399503 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:5:56815574:56896152:1 gene:ENSG00000095015 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000013974 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:56856643:56893680:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1
NONHSAT101595 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_138453 // RefSeq // Homo sapiens RAB3C, member RAS oncogene family (RAB3C), mRNA. // chr5 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// ENST00000282878 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:58583040:58859394:1 gene:ENSG00000152932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000381158 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:58788279:58851527:1 gene:ENSG00000152932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// AY026936 // GenBank // Homo sapiens Rab3c mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC013033 // GenBank // Homo sapiens RAB3C, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:4711 IMAGE:3534915), complete cds. // chr5 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0
NR_028508 // RefSeq // Homo sapiens prostate androgen-regulated transcript 1 (non-protein coding) (PART1), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000515734 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:60487713:60491518:1 gene:ENSG00000152931 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF163475 // GenBank // Homo sapiens PART-1 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NR_024617 // RefSeq // Homo sapiens prostate androgen-regulated transcript 1 (non-protein coding) (PART1), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr5 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// NR_028509 // RefSeq // Homo sapiens prostate androgen-regulated transcript 1 (non-protein coding) (PART1), transcript variant 3, long non-coding RNA. // chr5 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// ENST00000612397 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:60488078:60488327:1 gene:ENSG00000275634 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// NONHSAT101636 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// TCONS_00009975-XLOC_004399 // Rinn lincRNA // linc-NDUFAF2-3 chr5:+:59784030-59785670 // chr5 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT101637 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// NONHSAT101638 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
NM_020928 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, SWIM-type containing 6 (ZSWIM6), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006714664 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens zinc finger, SWIM-type containing 6 (ZSWIM6), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000252744 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:5:61332273:61546170:1 gene:ENSG00000130449 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000002900 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:61471395:61544317:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 90 // 90 // 28 // 31 // 1
NM_173667 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 5 open reading frame 64 (C5orf64), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000313303 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:5:61686076:61706535:1 gene:ENSG00000178722 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000502395 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:61686872:61704183:1 gene:ENSG00000178722 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000505642 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:61637809:61706535:1 gene:ENSG00000178722 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000510414 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:61637809:61730378:1 gene:ENSG00000178722 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// NONHSAT101684 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT101679 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_001134779 // RefSeq // Homo sapiens importin 11 (IPO11), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NM_016338 // RefSeq // Homo sapiens importin 11 (IPO11), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000325324 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:62412767:62628577:1 gene:ENSG00000086200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000409296 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:62418884:62627704:1 gene:ENSG00000086200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000424533 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:62404050:62580680:1 gene:ENSG00000086200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// AF111109 // GenBank // Homo sapiens Ran binding protein 11 mRNA, complete cds. // chr5 // 97 // 92 // 32 // 33 // 0 /// AK302781 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59791 complete cds, highly similar to Importin-11. // chr5 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// BC033776 // GenBank // Homo sapiens importin 11, mRNA (cDNA clone MGC:45101 IMAGE:4525238), complete cds. // chr5 // 97 // 97 // 34 // 35 // 0 /// BC036454 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5265850, containing frame-shift errors. // chr5 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000003340 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:62433757:62627318:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1
ENST00000362409 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:62443176:62443282:1 gene:ENSG00000199279 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT101710 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_181506 // RefSeq // Homo sapiens leucine rich repeat containing 70 (LRRC70), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000334994 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:62578735:62581448:1 gene:ENSG00000186105 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000491184 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:62578875:62580863:1 gene:ENSG00000186105 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 33 // 11 // 11 // 0 /// AY280614 // GenBank // Homo sapiens synleurin mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// AY358733 // GenBank // Homo sapiens clone DNA94833 CGLQ1891 (UNQ1891) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000448151 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:62578837:62581442:1 gene:ENSG00000186105 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 52 // 52 // 17 // 33 // 1 /// ENST00000413749 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:62561136:62581467:1 gene:ENSG00000086200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// NONHSAT101716 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 52 // 52 // 17 // 33 // 1 /// GENSCAN00000003340 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:62433757:62627318:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
NM_001113561 // RefSeq // Homo sapiens ring finger protein 180 (RNF180), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NM_178532 // RefSeq // Homo sapiens ring finger protein 180 (RNF180), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 92 // 48 // 11 // 12 // 0 /// XM_006714591 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens ring finger protein 180 (RNF180), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000296615 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:64165844:64217786:1 gene:ENSG00000164197 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// ENST00000389100 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:64165882:64372869:1 gene:ENSG00000164197 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// AK090756 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ33437 fis, clone BRACE2021541, weakly similar to PROTEIN-TYROSINE PHOSPHATASE YVH1 (EC 3.1.3.48). // chr5 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// BC101277 // GenBank // Homo sapiens ring finger protein 180, mRNA (cDNA clone MGC:120325 IMAGE:40024386), complete cds. // chr5 // 92 // 48 // 11 // 12 // 0 /// BC101278 // GenBank // Homo sapiens ring finger protein 180, mRNA (cDNA clone MGC:120326 IMAGE:40024390), complete cds. // chr5 // 92 // 48 // 11 // 12 // 0 /// BC101397 // GenBank // Homo sapiens ring finger protein 180, mRNA (cDNA clone MGC:120328 IMAGE:40024392), complete cds. // chr5 // 92 // 48 // 11 // 12 // 0 /// BC101279 // GenBank // Homo sapiens ring finger protein 180, mRNA (cDNA clone IMAGE:40024391), complete cds. // chr5 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000017442 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:64064881:64513696:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
ENST00000485643 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:64539504:64539792:1 gene:ENSG00000242547 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT101729 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000364999 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:64573569:64573670:1 gene:ENSG00000201869 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT101730 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_001164442 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 159, member B (FAM159B), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000389074 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:64690308:64718070:1 gene:ENSG00000145642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000506473 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:64690532:64717963:1 gene:ENSG00000145642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// ENST00000509189 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:64690442:64718090:1 gene:ENSG00000145642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000512767 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:64691241:64717999:1 gene:ENSG00000145642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// ENST00000513930 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:64691319:64718082:1 gene:ENSG00000145642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// GENSCAN00000017440 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:64690624:64718022:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// NONHSAT101731 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// NONHSAT101732 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
ENST00000384708 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:65123369:65123474:1 gene:ENSG00000207439 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT101739 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000478174 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:65415353:65416222:1 gene:ENSG00000205644 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000031996 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:65415742:65416222:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0
NR_003545 // RefSeq // Homo sapiens trafficking protein particle complex 13 (TRAPPC13), transcript variant 4, non-coding RNA. // chr5 // 100 // 74 // 17 // 17 // 0 /// AK130467 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ26957 fis, clone SLV00486. // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000510585 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:65624765:65630891:1 gene:ENSG00000253251 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 74 // 17 // 17 // 0
AK127903 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ46010 fis, clone SPLEN2001227. // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT101784 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
ENST00000414951 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:66572057:66572546:1 gene:ENSG00000234838 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 74 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000012502 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:66572059:66572601:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 74 // 14 // 14 // 0
ENST00000390947 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:68873954:68874087:1 gene:ENSG00000212249 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT101871 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_022909 // RefSeq // Homo sapiens centromere protein H (CENPH), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000283006 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:69189548:69210357:1 gene:ENSG00000153044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000502689 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:5:69189742:69209929:1 gene:ENSG00000153044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 64 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000513575 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:69189592:69202569:1 gene:ENSG00000153044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 88 // 73 // 14 // 16 // 0 /// ENST00000515001 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:5:69189574:69210356:1 gene:ENSG00000153044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// AB035124 // GenBank // Homo sapiens mRNA for kinetochore protein CENP-H, complete cds. // chr5 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// AK290746 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76140 complete cds, highly similar to Homo sapiens centromere protein H (CENPH), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC012024 // GenBank // Homo sapiens centromere protein H, mRNA (cDNA clone MGC:21431 IMAGE:4510607), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC015355 // GenBank // Homo sapiens centromere protein H, mRNA (cDNA clone MGC:21458 IMAGE:3451767), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000514753 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:69189646:69197499:1 gene:ENSG00000153044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 50 // 50 // 11 // 22 // 1 /// GENSCAN00000031976 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:69094256:69209799:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 45 // 45 // 10 // 22 // 1
NONHSAT101928 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT101999 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_004291 // RefSeq // Homo sapiens CART prepropeptide (CARTPT), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000296777 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:71719163:71721048:1 gene:ENSG00000164326 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC029882 // GenBank // Homo sapiens CART prepropeptide, mRNA (cDNA clone MGC:34499 IMAGE:5171665), complete cds. // chr5 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// CR542216 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834B0625D for gene CART, cocaine- and amphetamine-regulated transcript; complete cds, incl. stopcodon. // chr5 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// U16826 // GenBank // Human cocaine and amphetamine regulated transcript CART (hCART) mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// ENST00000513096 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:71719579:71721048:1 gene:ENSG00000164326 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// NONHSAT102038 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// GENSCAN00000017393 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:71719294:71787029:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_005909 // RefSeq // Homo sapiens microtubule-associated protein 1B (MAP1B), mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000296755 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:72107234:72209570:1 gene:ENSG00000131711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000504492 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:5:72179628:72195440:1 gene:ENSG00000131711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000511641 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:5:72107486:72195314:1 gene:ENSG00000131711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 39 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000512974 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:5:72107234:72183823:1 gene:ENSG00000131711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000513526 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:72107477:72195422:1 gene:ENSG00000131711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 39 // 14 // 14 // 0 /// BC032516 // GenBank // Homo sapiens microtubule-associated protein 1B, mRNA (cDNA clone IMAGE:5493646), partial cds. // chr5 // 100 // 39 // 14 // 14 // 0 /// BC141853 // GenBank // Homo sapiens microtubule-associated protein 1B, mRNA (cDNA clone IMAGE:8860354), partial cds. // chr5 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000025424 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:72181229:72205239:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 61 // 22 // 22 // 0
ENST00000384043 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:72768702:72768811:1 gene:ENSG00000206770 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// NONHSAT102080 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0
NM_002270 // RefSeq // Homo sapiens transportin 1 (TNPO1), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NM_153188 // RefSeq // Homo sapiens transportin 1 (TNPO1), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000337273 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:72816312:72916733:1 gene:ENSG00000083312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000506351 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:5:72848184:72908951:1 gene:ENSG00000083312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000523768 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:5:72816672:72905429:1 gene:ENSG00000083312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// AK301021 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58732 complete cds, highly similar to Transportin-1. // chr5 // 94 // 89 // 15 // 16 // 0 /// BC040340 // GenBank // Homo sapiens transportin 1, mRNA (cDNA clone MGC:17116 IMAGE:4178989), complete cds. // chr5 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0 /// U70322 // GenBank // Human transportin (TRN) mRNA, complete cds. // chr5 // 94 // 94 // 16 // 17 // 0 /// U72069 // GenBank // Human karyopherin beta2 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// U72395 // GenBank // Homo sapiens MIP mRNA, complete cds. // chr5 // 94 // 89 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000006475 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:72848394:72905410:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 44 // 8 // 8 // 0
ENST00000363963 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:73100073:73100183:1 gene:ENSG00000200833 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT102097 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001161342 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 171 (TMEM171), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_173490 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 171 (TMEM171), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000287773 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:73120569:73131809:1 gene:ENSG00000157111 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000454765 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:73120292:73131817:1 gene:ENSG00000157111 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC018083 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 171, mRNA (cDNA clone MGC:26940 IMAGE:4797244), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC035310 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 171, mRNA (cDNA clone MGC:21769 IMAGE:4746772), complete cds. // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000006491 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:73123542:73136244:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_153217 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 174 (TMEM174), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000296776 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:73173195:73175143:1 gene:ENSG00000164325 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK315460 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ96519. // chr5 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// BC019346 // GenBank // Homo sapiens transmembrane protein 174, mRNA (cDNA clone MGC:13034 IMAGE:3613225), complete cds. // chr5 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000006494 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:73173244:73174165:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0
NM_001037637 // RefSeq // Homo sapiens basic transcription factor 3 (BTF3), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// NM_001207 // RefSeq // Homo sapiens basic transcription factor 3 (BTF3), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 61 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000335895 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:73498408:73505495:1 gene:ENSG00000145741 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 61 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000380591 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:73498449:73505635:1 gene:ENSG00000145741 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000510787 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:73498457:73502685:1 gene:ENSG00000145741 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 44 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000514360 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:73498442:73505495:1 gene:ENSG00000145741 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 50 // 9 // 9 // 0 /// AB062126 // GenBank // Homo sapiens OK/SW-cl.8 mRNA for transcription factor BTF 3, complete cds. // chr5 // 100 // 44 // 8 // 8 // 0 /// BC008062 // GenBank // Homo sapiens basic transcription factor 3, mRNA (cDNA clone MGC:2209 IMAGE:2966788), complete cds. // chr5 // 100 // 44 // 8 // 8 // 0 /// BC061913 // GenBank HTC // Homo sapiens basic transcription factor 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:4182376), with apparent retained intron. // chr5 // 100 // 50 // 9 // 9 // 0 /// NONHSAT102129 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 44 // 8 // 8 // 0 /// NONHSAT102126 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 67 // 67 // 12 // 18 // 1
ENST00000487715 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:74317986:74318285:1 gene:ENSG00000244326 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT102154 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
ENST00000362775 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:74779309:74779413:1 gene:ENSG00000199645 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000610426 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:74766992:74780113:1 gene:ENSG00000164346 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT102182 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_014979 // RefSeq // Homo sapiens synaptic vesicle glycoprotein 2C (SV2C), mRNA. // chr5 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENST00000322285 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:76083414:76353939:1 gene:ENSG00000122012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000502798 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:76083172:76330079:1 gene:ENSG00000122012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK094917 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ37598 fis, clone BRCOC2008642, highly similar to Synaptic vesicle glycoprotein 2C. // chr5 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// BC100824 // GenBank // Homo sapiens synaptic vesicle glycoprotein 2C, mRNA (cDNA clone MGC:118874 IMAGE:40001296), complete cds. // chr5 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// BC100825 // GenBank // Homo sapiens synaptic vesicle glycoprotein 2C, mRNA (cDNA clone MGC:118875 IMAGE:40001297), complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC100826 // GenBank // Homo sapiens synaptic vesicle glycoprotein 2C, mRNA (cDNA clone MGC:118876 IMAGE:40001302), complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC100827 // GenBank // Homo sapiens synaptic vesicle glycoprotein 2C, mRNA (cDNA clone MGC:118877 IMAGE:40001303), complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// AB028977 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1054 protein, partial cds. // chr5 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// GENSCAN00000046329 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:76285080:76350513:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
AB072904 // GenBank // Homo sapiens mRNA for putative protein product of Nbla11895, complete cds. // chr5 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0
ENST00000504370 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:76376675:76377149:1 gene:ENSG00000251235 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000046334 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:76376675:76377142:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT102237 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT102238 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001992 // RefSeq // Homo sapiens coagulation factor II (thrombin) receptor (F2R), mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000319211 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:76716043:76735781:1 gene:ENSG00000181104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// AY771596 // GenBank // Homo sapiens cell proliferation-inducing protein 18 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 33 // 12 // 12 // 0 /// BC002464 // GenBank // Homo sapiens coagulation factor II (thrombin) receptor, mRNA (cDNA clone MGC:1197 IMAGE:3343051), complete cds. // chr5 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// BC051909 // GenBank // Homo sapiens coagulation factor II (thrombin) receptor, mRNA (cDNA clone MGC:60377 IMAGE:6172703), complete cds. // chr5 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// BT007279 // GenBank // Homo sapiens coagulation factor II (thrombin) receptor mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 58 // 21 // 21 // 0 /// M62424 // GenBank // Human thrombin receptor mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// AK297131 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55303 complete cds, highly similar to Proteinase-activated receptor 1 precursor. // chr5 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1 /// GENSCAN00000046325 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:76716308:76742690:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 42 // 15 // 15 // 0
NONHSAT102250 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_005242 // RefSeq // Homo sapiens coagulation factor II (thrombin) receptor-like 1 (F2RL1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000296677 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:76818977:76835315:1 gene:ENSG00000164251 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY336105 // GenBank // Homo sapiens protease-activated receptor 2 (F2RL1) mRNA, complete cds. // chr5 // 92 // 48 // 12 // 13 // 0 /// BC012453 // GenBank // Homo sapiens coagulation factor II (thrombin) receptor-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:9549 IMAGE:3857382), complete cds. // chr5 // 91 // 85 // 21 // 23 // 0 /// BC018130 // GenBank // Homo sapiens coagulation factor II (thrombin) receptor-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:9298 IMAGE:3895653), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BT009856 // GenBank // Homo sapiens coagulation factor II (thrombin) receptor-like 1 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// U34038 // GenBank // Human proteinase-activated receptor-2 mRNA, complete cds. // chr5 // 95 // 78 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000035232 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:76819183:76833801:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// NONHSAT102251 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0
ENST00000513010 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:76850001:76878219:1 gene:ENSG00000171643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// AF437876 // GenBank // Homo sapiens S100Z protein mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// BC022320 // GenBank // Homo sapiens S100 calcium binding protein Z, mRNA (cDNA clone MGC:22642 IMAGE:4696667), complete cds. // chr5 // 95 // 79 // 18 // 19 // 0 /// NM_130772 // RefSeq // Homo sapiens S100 calcium binding protein Z (S100Z), mRNA. // chr5 // 88 // 88 // 21 // 24 // 1 /// ENST00000317593 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:76850099:76921650:1 gene:ENSG00000171643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 75 // 75 // 18 // 24 // 1 /// GENSCAN00000035230 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:76875360:76877832:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 33 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000613039 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:5:76875301:76921026:1 gene:ENSG00000171643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1
NM_001882 // RefSeq // Homo sapiens corticotropin releasing hormone binding protein (CRHBP), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000274368 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:76952713:76969474:1 gene:ENSG00000145708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000506501 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:76953049:76959022:1 gene:ENSG00000145708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 54 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000512446 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:76953417:76958844:1 gene:ENSG00000145708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 93 // 40 // 13 // 14 // 0 /// AK311052 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ18094. // chr5 // 100 // 54 // 19 // 19 // 0 /// BC018038 // GenBank // Homo sapiens corticotropin releasing hormone binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:26246 IMAGE:4812893), complete cds. // chr5 // 97 // 83 // 28 // 29 // 0 /// CR541666 // GenBank // Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834H0627D for gene CRHBP, corticotropin releasing hormone binding protein; complete cds, incl. stopcodon. // chr5 // 96 // 69 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000035241 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:76920508:76968885:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 83 // 83 // 29 // 35 // 1
NM_018046 // RefSeq // Homo sapiens angiogenic factor with G patch and FHA domains 1 (AGGF1), mRNA. // chr5 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000312916 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:77030385:77065234:1 gene:ENSG00000164252 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AK289394 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75192 complete cds. // chr5 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// AY500994 // GenBank // Homo sapiens angiogenic factor VG5Q mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC002828 // GenBank // Homo sapiens angiogenic factor with G patch and FHA domains 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3659316), complete cds. // chr5 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// BC032844 // GenBank // Homo sapiens angiogenic factor with G patch and FHA domains 1, mRNA (cDNA clone MGC:32998 IMAGE:5266978), complete cds. // chr5 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000506806 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:77030456:77036058:1 gene:ENSG00000164252 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// U84971 // GenBank // Homo sapiens fetal unknown mRNA, complete cds. // chr5 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// GENSCAN00000035246 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:77001217:77063252:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0
ENST00000493874 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:77582376:77583122:1 gene:ENSG00000244363 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000035244 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:77582376:77583122:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
ENST00000515712 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:77784881:77786003:1 gene:ENSG00000213763 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000035236 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:77784887:77786024:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0 /// HM358961 // GenBank HTC // Homo sapiens clone Huh7-2 actin-like mRNA, partial sequence. // chr5 // 67 // 75 // 4 // 6 // 0
ENST00000383987 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:78317036:78317137:1 gene:ENSG00000206714 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT102314 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_001713 // RefSeq // Homo sapiens betaine--homocysteine S-methyltransferase (BHMT), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000274353 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:79111779:79132290:1 gene:ENSG00000145692 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000523508 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:79120352:79126297:1 gene:ENSG00000145692 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// AK298308 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54604 complete cds, highly similar to Betaine--homocysteine S-methyltransferase (EC 2.1.1.5). // chr5 // 80 // 80 // 16 // 20 // 0 /// AK303780 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50349 complete cds, moderately similar to Betaine--homocysteine S-methyltransferase (EC 2.1.1.5). // chr5 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0 /// BC012616 // GenBank // Homo sapiens betaine-homocysteine methyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:13645 IMAGE:4045543), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// EU794592 // GenBank // Homo sapiens epididymis secretory sperm binding protein Li 61p (HEL-S-61p) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U50929 // GenBank // Human betaine:homocysteine methyltransferase mRNA, complete cds. // chr5 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// ENST00000524080 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:5:79111809:79131484:1 gene:ENSG00000145692 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// GENSCAN00000025678 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:79111694:79131116:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
ENST00000383865 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:79220942:79221073:1 gene:ENSG00000206592 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT102350 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_152405 // RefSeq // Homo sapiens junction mediating and regulatory protein, p53 cofactor (JMY), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000396137 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:79236189:79327215:1 gene:ENSG00000152409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC130624 // GenBank // Homo sapiens junction mediating and regulatory protein, p53 cofactor, mRNA (cDNA clone MGC:163496 IMAGE:40146655), complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000025668 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:79290127:79316307:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0
ENST00000482584 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:79510434:79510919:1 gene:ENSG00000213755 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000025675 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:79510434:79529706:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONHSAT102357 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
ENST00000486157 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:79529302:79530093:1 gene:ENSG00000243160 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000025675 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:79510434:79529706:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
ENST00000384661 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:79534853:79534954:1 gene:ENSG00000207391 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT102358 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_153610 // RefSeq // Homo sapiens cardiomyopathy associated 5 (CMYA5), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000446378 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:79689877:79800222:1 gene:ENSG00000164309 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000506603 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:79738142:79800240:1 gene:ENSG00000164309 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 55 // 17 // 17 // 0 /// AF533705 // GenBank // Homo sapiens tissue-type breast unknown protein mRNA, complete cds. // chr5 // 94 // 52 // 15 // 16 // 0 /// AL831986 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp451G223 (from clone DKFZp451G223). // chr5 // 94 // 55 // 16 // 17 // 0 /// BC111529 // GenBank // Homo sapiens cardiomyopathy associated 5, mRNA (cDNA clone IMAGE:40009093), complete cds. // chr5 // 95 // 61 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000025671 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:79554169:79795734:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0
NM_003248 // RefSeq // Homo sapiens thrombospondin 4 (THBS4), mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000350881 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:80035348:80083287:1 gene:ENSG00000113296 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000511733 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:80036023:80083282:1 gene:ENSG00000113296 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// AK302842 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51409 complete cds, highly similar to Thrombospondin-4 precursor. // chr5 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// BC050456 // GenBank // Homo sapiens thrombospondin 4, mRNA (cDNA clone MGC:54257 IMAGE:6191808), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041474 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:80035538:80089477:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_032567 // RefSeq // Homo sapiens spermatogenic leucine zipper 1 (SPZ1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000296739 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:80319975:80321842:1 gene:ENSG00000164299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000511881 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:80319625:80320918:1 gene:ENSG00000164299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// AF333098 // GenBank // Homo sapiens testis-specific protein NYD-TSP1 mRNA, complete cds. // chr5 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// AK314007 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ94661, Homo sapiens testis-specific protein NYD-TSP1 (NYD-TSP1), mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC033798 // GenBank // Homo sapiens spermatogenic leucine zipper 1, mRNA (cDNA clone MGC:44892 IMAGE:5172551), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK098575 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ25709 fis, clone TST04944. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 1 /// GENSCAN00000041467 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:80302731:80321508:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0
NM_205548 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 151, member B (FAM151B), mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000282226 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:80487969:80542563:1 gene:ENSG00000152380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000511718 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:80487986:80542042:1 gene:ENSG00000152380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// AY358256 // GenBank // Homo sapiens clone DNA175249 AASA9217 (UNQ9217) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC131563 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 151, member B, mRNA (cDNA clone MGC:148159 IMAGE:40109365), complete cds. // chr5 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC142990 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:8860439. // chr5 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000509292 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:80501805:80522524:1 gene:ENSG00000152380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// NONHSAT102407 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000041453 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:80500333:80541832:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1
NM_002439 // RefSeq // Homo sapiens mutS homolog 3 (MSH3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000265081 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:80654648:80876460:1 gene:ENSG00000113318 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK289856 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75589 complete cds, highly similar to Homo sapiens mutS homolog 3 (E. coli) (MSH3), mRNA. // chr5 // 93 // 97 // 27 // 29 // 0 /// BC130434 // GenBank // Homo sapiens mutS homolog 3 (E. coli), mRNA (cDNA clone MGC:163306 IMAGE:40146465), complete cds. // chr5 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// BC130436 // GenBank // Homo sapiens mutS homolog 3 (E. coli), mRNA (cDNA clone MGC:163308 IMAGE:40146467), complete cds. // chr5 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// J04810 // GenBank // Human MSH3 gene, complete cds. // chr5 // 93 // 97 // 27 // 29 // 0 /// U61981 // GenBank // Human putative mismatch repair/binding protein hMSH3 (hMSH3) mRNA, complete cds. // chr5 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000041460 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:80654728:80792844:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0
NM_006909 // RefSeq // Homo sapiens Ras protein-specific guanine nucleotide-releasing factor 2 (RASGRF2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_005248565 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens Ras protein-specific guanine nucleotide-releasing factor 2 (RASGRF2), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000265080 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:80960672:81230156:1 gene:ENSG00000113319 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000503795 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:80960689:81225812:1 gene:ENSG00000113319 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// BC126112 // GenBank // Homo sapiens Ras protein-specific guanine nucleotide-releasing factor 2, mRNA (cDNA clone MGC:161390 IMAGE:8991828), complete cds. // chr5 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// BC136296 // GenBank // Homo sapiens Ras protein-specific guanine nucleotide-releasing factor 2, mRNA (cDNA clone MGC:167906 IMAGE:9020283), complete cds. // chr5 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000004225 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:81195148:81225770:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000004230 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:81027994:81130173:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0
ENST00000355178 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:81972025:82148117:1 gene:ENSG00000152348 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 45 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000504770 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:81972261:82253431:1 gene:ENSG00000152348 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 64 // 14 // 14 // 0 /// AK024016 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ13954 fis, clone Y79AA1001145. // chr5 // 100 // 45 // 10 // 10 // 0 /// BC029268 // GenBank // Homo sapiens ATG10 autophagy related 10 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:34134 IMAGE:4521833), complete cds. // chr5 // 100 // 77 // 17 // 17 // 0 /// NM_001131028 // RefSeq // Homo sapiens autophagy related 10 (ATG10), transcript variant 3, mRNA. // chr5 // 86 // 86 // 19 // 22 // 1 /// NM_031482 // RefSeq // Homo sapiens autophagy related 10 (ATG10), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 86 // 86 // 19 // 22 // 1 /// XM_005248610 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens autophagy related 10 (ATG10), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 77 // 77 // 17 // 22 // 1 /// ENST00000282185 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:81972025:82256139:1 gene:ENSG00000152348 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 86 // 86 // 19 // 22 // 1 /// ENST00000458350 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:81972051:82254792:1 gene:ENSG00000152348 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 77 // 77 // 17 // 22 // 1 /// ENST00000513634 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:81987558:82252713:1 gene:ENSG00000152348 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 59 // 59 // 13 // 22 // 1 /// AK225969 // GenBank // Homo sapiens mRNA for APG10 autophagy 10-like, clone: FCC113C01. // chr5 // 64 // 64 // 14 // 22 // 1
ENST00000582657 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:82078427:82078724:1 gene:ENSG00000265684 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT102476 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001017971 // RefSeq // Homo sapiens ATPase, H+ transporting, lysosomal accessory protein 1-like (ATP6AP1L), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000380167 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:82279462:82318803:1 gene:ENSG00000205464 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000439350 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:5:82305347:82318328:1 gene:ENSG00000205464 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000514672 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:82310036:82318380:1 gene:ENSG00000205464 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// BC093982 // GenBank // Homo sapiens V-type proton ATPase subunit S1-like protein, mRNA (cDNA clone MGC:121017 IMAGE:7939827), complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// BC112191 // GenBank // Homo sapiens V-type proton ATPase subunit S1-like protein, mRNA (cDNA clone MGC:138396 IMAGE:8327659), complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000508366 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:82308859:82386977:1 gene:ENSG00000205464 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 42 // 42 // 10 // 24 // 1 /// AK094973 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ37654 fis, clone BRHIP2010309, weakly similar to VACUOLAR ATP SYNTHASE SUBUNIT AC45 PRECURSOR (EC 3.6.1.34). // chr5 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1 /// GENSCAN00000047628 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:82303791:82318300:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0
ENST00000502523 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:82382945:82386516:1 gene:ENSG00000205464 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AK123303 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ41309 fis, clone BRAMY2042641. // chr5 // 91 // 100 // 21 // 23 // 0 /// ENST00000508366 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:82308859:82386977:1 gene:ENSG00000205464 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 57 // 57 // 13 // 23 // 1 /// XR_427737 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens uncharacterized LOC645079 (FLJ41309), transcript variant X2, misc_RNA. // chr5 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1 /// AK094973 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ37654 fis, clone BRHIP2010309, weakly similar to VACUOLAR ATP SYNTHASE SUBUNIT AC45 PRECURSOR (EC 3.6.1.34). // chr5 // 48 // 48 // 11 // 23 // 1 /// NONHSAT102489 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// TCONS_00009252-XLOC_004445 // Rinn lincRNA // linc-XRCC4-3 chr5:+:81678763-81682335 // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENST00000384017 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:83703448:83703543:1 gene:ENSG00000206744 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT102525 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000365287 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:83803554:83803685:1 gene:ENSG00000202157 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT102527 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENST00000517052 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:84196883:84196989:1 gene:ENSG00000252861 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT102531 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000512074 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:85549409:85549952:1 gene:ENSG00000251066 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 93 // 100 // 13 // 14 // 0 /// GENSCAN00000049275 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:85549591:85549956:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NR_003719 // RefSeq // Homo sapiens neuroblastoma breakpoint family, member 22, pseudogene (NBPF22P), non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000508988 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:86282766:86296309:1 gene:ENSG00000205449 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr5 // 100 // 63 // 5 // 5 // 0 /// ENST00000590707 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:86282460:86296463:1 gene:ENSG00000205449 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
ENST00000384231 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:88382772:88382907:1 gene:ENSG00000206958 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT102646 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NR_105024 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC731157 (LOC731157), long non-coding RNA. // chr5 // 100 // 62 // 13 // 13 // 0 /// AF161364 // GenBank // Homo sapiens HSPC101 mRNA, partial cds. // chr5 // 86 // 100 // 18 // 21 // 0 /// ENST00000546238 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:90410033:90410669:1 gene:ENSG00000255647 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:lincRNA // chr5 // 100 // 57 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT102730 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 95 // 95 // 19 // 20 // 0 /// NONHSAT102731 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 52 // 11 // 11 // 0 /// TCONS_00010036-XLOC_004467 // Rinn lincRNA // linc-POLR3G-1 chr5:+:89705871-89706495 // chr5 // 100 // 52 // 11 // 11 // 0
NM_006467 // RefSeq // Homo sapiens polymerase (RNA) III (DNA directed) polypeptide G (32kD) (POLR3G), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000399107 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:5:90474864:90514552:1 gene:ENSG00000113356 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000503373 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:90474261:90512129:1 gene:ENSG00000113356 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 91 // 79 // 10 // 11 // 0 /// ENST00000504930 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:90474889:90514553:1 gene:ENSG00000113356 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// AK295434 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60555 complete cds, highly similar to DNA-directed RNA polymerase III subunit G (EC2.7.7.6). // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// U93868 // GenBank // Human RNA polymerase III subunit (RPC32) mRNA, complete cds. // chr5 // 71 // 100 // 10 // 14 // 0 /// ENST00000622335 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:5:90474909:90512308:1 gene:ENSG00000113356 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 86 // 100 // 12 // 14 // 0 /// GENSCAN00000042802 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:90485568:90512139:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 57 // 8 // 8 // 0
ENST00000362773 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:91270727:91270867:1 gene:ENSG00000199643 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT102740 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_005654 // RefSeq // Homo sapiens nuclear receptor subfamily 2, group F, member 1 (NR2F1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000327111 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:93583337:93594615:1 gene:ENSG00000175745 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000506162 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:93591973:93594143:1 gene:ENSG00000175745 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// BC004154 // GenBank // Homo sapiens nuclear receptor subfamily 2, group F, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:2388 IMAGE:2824138), complete cds. // chr5 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// BC017493 // GenBank // Homo sapiens nuclear receptor subfamily 2, group F, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:17907 IMAGE:3912075), complete cds. // chr5 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// HQ709180 // GenBank // Homo sapiens chicken ovalbumin upstream promoter-transcription factor I (NR2F1) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// HQ709181 // GenBank // Homo sapiens chicken ovalbumin upstream promoter-transcription factor I (NR2F1) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// HQ709182 // GenBank // Homo sapiens chicken ovalbumin upstream promoter-transcription factor I (NR2F1) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// HQ709183 // GenBank // Homo sapiens chicken ovalbumin upstream promoter-transcription factor I (NR2F1) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000615873 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:5:93585024:93594072:1 gene:ENSG00000175745 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 95 // 63 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000041621 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:93569461:93593842:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
ENST00000390957 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:95521369:95521475:1 gene:ENSG00000212259 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT102847 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_198150 // RefSeq // Homo sapiens arylsulfatase family, member K (ARSK), mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000380009 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:95555074:95605064:1 gene:ENSG00000164291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000504873 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:95555183:95603680:1 gene:ENSG00000164291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000513814 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:95555137:95603680:1 gene:ENSG00000164291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// AK303855 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50046 complete cds, highly similar to Arylsulfatase K precursor (EC 3.1.6.-). // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AK316253 // GenBank // Homo sapiens cDNA, FLJ79152 complete cds, highly similar to Arylsulfatase K precursor (EC 3.1.6.-). // chr5 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// AY358596 // GenBank // Homo sapiens clone DNA64885 Bone Rel Sulphatase (UNQ630) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// AY875939 // GenBank // Homo sapiens arylsulfatase K (ARSK) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// BC050392 // GenBank // Homo sapiens arylsulfatase family, member K, mRNA (cDNA clone IMAGE:5759220), partial cds. // chr5 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// BC130329 // GenBank // Homo sapiens arylsulfatase family, member K, mRNA (cDNA clone MGC:163201 IMAGE:40146360), complete cds. // chr5 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// BC144161 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:9052681. // chr5 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000039789 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:95567892:95603526:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0
NM_199243 // RefSeq // Homo sapiens G protein-coupled receptor 150 (GPR150), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000380007 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:95620078:95622142:1 gene:ENSG00000178015 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC030197 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 150, mRNA (cDNA clone IMAGE:5199056), partial cds. // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// JF810884 // GenBank // Homo sapiens G protein-coupled receptor 150 (GPR150) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039781 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:95620519:95621580:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_001131065 // RefSeq // Homo sapiens Rieske (Fe-S) domain containing (RFESD), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NM_173362 // RefSeq // Homo sapiens Rieske (Fe-S) domain containing (RFESD), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000311364 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:95646854:95657140:1 gene:ENSG00000175449 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000458310 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:5:95646879:95657133:1 gene:ENSG00000175449 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC024023 // GenBank // Homo sapiens Rieske (Fe-S) domain containing, mRNA (cDNA clone MGC:27344 IMAGE:4670524), complete cds. // chr5 // 100 // 67 // 12 // 12 // 0 /// BC035110 // GenBank // Homo sapiens Rieske (Fe-S) domain containing, mRNA (cDNA clone MGC:43188 IMAGE:5262922), complete cds. // chr5 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0 /// BC048979 // GenBank // Homo sapiens Rieske (Fe-S) domain containing, mRNA (cDNA clone MGC:57355 IMAGE:4838006), complete cds. // chr5 // 77 // 72 // 10 // 13 // 0 /// NM_001131066 // RefSeq // Homo sapiens Rieske (Fe-S) domain containing (RFESD), transcript variant 3, mRNA. // chr5 // 94 // 94 // 17 // 18 // 1 /// ENST00000380005 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:95646772:95658082:1 gene:ENSG00000175449 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 94 // 94 // 17 // 18 // 1
NM_014899 // RefSeq // Homo sapiens Rho-related BTB domain containing 3 (RHOBTB3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000379982 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:95731175:95796367:1 gene:ENSG00000164292 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000502541 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:95736939:95763542:1 gene:ENSG00000164292 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000504179 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:95767755:95793246:1 gene:ENSG00000164292 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000506959 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:95730872:95748441:1 gene:ENSG00000164292 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// AK290034 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76764 complete cds, highly similar to Homo sapiens Rho-related BTB domain containing 3 (RHOBTB3), mRNA. // chr5 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// BC041337 // GenBank // Homo sapiens Rho-related BTB domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:41820 IMAGE:5285051), complete cds. // chr5 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// ENST00000504949 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:95717633:95756093:1 gene:ENSG00000164292 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1 /// AK023621 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ13559 fis, clone PLACE1007852, highly similar to Homo sapiens mRNA for KIAA0878 protein. // chr5 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1 /// GENSCAN00000039786 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:95682682:95755761:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0
NR_026936 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 5 open reading frame 27 (C5orf27), long non-coding RNA. // chr5 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000357880 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:95852232:95859020:1 gene:ENSG00000236882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000436592 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:95852232:95860133:1 gene:ENSG00000236882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AY168789 // GenBank // Homo sapiens FIS (FIS) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000620167 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:5:95856869:95860133:1 gene:ENSG00000236882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NONHSAT102871 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000049150 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:95763508:95878619:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
NM_005575 // RefSeq // Homo sapiens leucyl/cystinyl aminopeptidase (LNPEP), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 49 // 26 // 26 // 0 /// NM_175920 // RefSeq // Homo sapiens leucyl/cystinyl aminopeptidase (LNPEP), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 47 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000231368 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:96935464:97037515:1 gene:ENSG00000113441 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 98 // 52 // 52 // 0 /// ENST00000395770 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:96958451:97029036:1 gene:ENSG00000113441 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 47 // 25 // 25 // 0 /// AB208883 // GenBank // Homo sapiens mRNA for leucyl/cystinyl aminopeptidase variant protein. // chr5 // 100 // 43 // 23 // 23 // 0 /// D50810 // GenBank // Homo sapiens mRNA for placental leucine aminopeptidase, complete cds. // chr5 // 100 // 49 // 26 // 26 // 0 /// U62768 // GenBank // Human oxytocinase splice variant 1 mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 45 // 23 // 24 // 0 /// U62769 // GenBank // Human oxytocinase variant 2 mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 47 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009456 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:96979161:97036628:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 34 // 18 // 18 // 0 /// AF178574 // GenBank HTC // Homo sapiens MSTP146 (MST146) mRNA, complete cds. // chr5 // 92 // 23 // 11 // 12 // 0 /// AK124143 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ42149 fis, clone THYMU1000692. // chr5 // 100 // 43 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT102920 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 91 // 21 // 10 // 11 // 0
ENST00000442824 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:98213402:98214121:1 gene:ENSG00000238000 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000049140 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:98213402:98214121:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
ENST00000512165 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:98338744:98339832:1 gene:ENSG00000176183 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000049146 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:98338871:98339716:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// HM358988 // GenBank HTC // Homo sapiens clone HepG-3 actin-like mRNA, partial sequence. // chr5 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0
NM_001012761 // RefSeq // Homo sapiens repulsive guidance molecule family member b (RGMB), mRNA. // chr5 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000308234 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:98769295:98796494:1 gene:ENSG00000174136 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000434027 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:98769294:98781185:1 gene:ENSG00000174136 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000504776 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:98768650:98779919:1 gene:ENSG00000174136 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000513185 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:98773635:98794055:1 gene:ENSG00000174136 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// AK074887 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ90406 fis, clone NT2RP2006134. // chr5 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// AK125284 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ43294 fis, clone MESTC1000042. // chr5 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// BC067736 // GenBank // Homo sapiens RGM domain family, member B, mRNA (cDNA clone MGC:86970 IMAGE:30340500), complete cds. // chr5 // 95 // 70 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000041769 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:98779537:98793753:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0
ENST00000410678 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:98889731:98889833:1 gene:ENSG00000222610 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT102965 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000362508 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:100021804:100021906:1 gene:ENSG00000199378 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT102984 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000384349 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:100153672:100153779:1 gene:ENSG00000207077 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000009107 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:100150159:100153748:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// NONHSAT102995 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_198507 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 174, member A (FAM174A), mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000312637 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:100535305:100586741:1 gene:ENSG00000174132 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000505792 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:100562052:100586729:1 gene:ENSG00000174132 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000509040 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:100535382:100586228:1 gene:ENSG00000174132 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// AF529367 // GenBank // Homo sapiens NS5ATP6 (NS3ATP6) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// AY359108 // GenBank // Homo sapiens clone DNA92233 HGS_RE408 (UNQ1912) mRNA, complete cds. // chr5 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// BC027332 // GenBank // Homo sapiens family with sequence similarity 174, member A, mRNA (cDNA clone MGC:17345 IMAGE:4346026), complete cds. // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// AK289539 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75569 complete cds, highly similar to Homo sapiens HGS_RE408 (UNQ1912), mRNA. // chr5 // 74 // 92 // 17 // 23 // 0 /// NONHSAT103005 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONHSAT103006 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000009099 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:100535531:100693884:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
ENST00000384539 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:100733058:100733386:1 gene:ENSG00000207269 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONHSAT103009 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
ENST00000577858 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:101581830:101582128:1 gene:ENSG00000277506 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA gene:ENSG00000264318 // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT103016 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0
AF119865 // GenBank HTC // Homo sapiens PRO2176 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
ENST00000411055 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:102302504:102302810:1 gene:ENSG00000222987 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// NONHSAT103024 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0
ENST00000513279 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:103032376:103033031:1 gene:ENSG00000175749 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 91 // 100 // 10 // 11 // 0 /// GENSCAN00000025931 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:103032376:103033031:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 86 // 64 // 6 // 7 // 0
NM_033211 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 5 open reading frame 30 (C5orf30), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000319933 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:103258702:103278660:1 gene:ENSG00000181751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000510890 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:103259424:103278371:1 gene:ENSG00000181751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000515669 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:103259036:103277228:1 gene:ENSG00000181751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// AK090558 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ33239 fis, clone ASTRO2002733. // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC009203 // GenBank // Homo sapiens chromosome 5 open reading frame 30, mRNA (cDNA clone MGC:15393 IMAGE:3628991), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000025924 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:103275920:103276540:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
ENST00000365040 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:104098874:104099038:1 gene:ENSG00000201910 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT103074 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_000039 // RefSeq // Homo sapiens RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 (RAB9BP1), non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000519581 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:105099473:105100098:1 gene:ENSG00000232159 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U44105 // GenBank // Homo sapiens Rab9 expressed pseudogene mRNA, complete cds. // chr5 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// NONHSAT103096 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000516528 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:106546665:106546803:1 gene:ENSG00000252337 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT103103 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000515923 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:107810629:107810924:1 gene:ENSG00000251732 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT103119 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
ENST00000384673 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:108891437:108891546:1 gene:ENSG00000207404 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT103131 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006714616 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens mannosidase, alpha, class 2A, member 1 (MAN2A1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 52 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000261483 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:109689366:109867178:1 gene:ENSG00000112893 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// BC142656 // GenBank // Homo sapiens mannosidase, alpha, class 2A, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:164891 IMAGE:40148064), complete cds. // chr5 // 93 // 91 // 28 // 30 // 0 /// BC142696 // GenBank // Homo sapiens mannosidase, alpha, class 2A, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:165017 IMAGE:40148740), complete cds. // chr5 // 93 // 91 // 28 // 30 // 0 /// D63998 // GenBank // Homo sapiens mRNA for golgi alpha-mannosidaseII, complete cds. // chr5 // 94 // 97 // 30 // 32 // 0 /// U31520 // GenBank // Human alpha mannosidase II mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 82 // 26 // 27 // 0 /// NM_002372 // RefSeq // Homo sapiens mannosidase, alpha, class 2A, member 1 (MAN2A1), mRNA. // chr5 // 97 // 97 // 32 // 33 // 1 /// GENSCAN00000040238 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:109755329:109835605:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0
NM_139281 // RefSeq // Homo sapiens WD repeat domain 36 (WDR36), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000505303 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:111092321:111111552:1 gene:ENSG00000134987 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000506538 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:111091716:111130502:1 gene:ENSG00000134987 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000513710 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:5:111092314:111127192:1 gene:ENSG00000134987 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// AF385437 // GenBank // Homo sapiens T-cell activation WD repeat protein mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// BC037427 // GenBank HTC // Homo sapiens WD repeat domain 36, mRNA (cDNA clone IMAGE:5533588), with apparent retained intron. // chr5 // 100 // 56 // 20 // 20 // 0 /// BC133025 // GenBank // Homo sapiens WD repeat domain 36, mRNA (cDNA clone MGC:164656 IMAGE:40147047), complete cds. // chr5 // 97 // 83 // 29 // 30 // 0 /// BC136517 // GenBank // Homo sapiens WD repeat domain 36, mRNA (cDNA clone MGC:168130 IMAGE:9020507), complete cds. // chr5 // 97 // 83 // 29 // 30 // 0 /// ENST00000612402 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:5:111092172:111130502:1 gene:ENSG00000134987 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000025745 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:111069742:111154190:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 64 // 64 // 23 // 36 // 1
NR_015370 // RefSeq // Homo sapiens EPB41L4A antisense RNA 1 (EPB41L4A-AS1), long non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000413221 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:112160526:112164276:1 gene:ENSG00000224032 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000427306 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:112160529:112162302:1 gene:ENSG00000224032 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000442823 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:112160892:112162324:1 gene:ENSG00000224032 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr5 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// AB002437 // GenBank // Homo sapiens mRNA, clone: LI33, from chromosome 5q21-q22. // chr5 // 79 // 68 // 15 // 19 // 0 /// AB048207 // GenBank // Homo sapiens mRNA for TIGA1, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000508590 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:112160934:112162311:1 gene:ENSG00000224032 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr5 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// NONHSAT103210 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONHSAT103211 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONHSAT103212 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// NONHSAT103215 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// NONHSAT103213 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NR_002922 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 13 (SNORA13), small nucleolar RNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000458790 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:112161485:112161617:1 gene:ENSG00000238363 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT103214 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_027706 // RefSeq // Homo sapiens EPB41L4A antisense RNA 2 (head to head) (EPB41L4A-AS2), long non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT103228 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000001722 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:112365894:112420492:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
ENST00000391068 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:112778363:112778469:1 gene:ENSG00000212370 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001204199 // RefSeq // Homo sapiens signal recognition particle 19kDa (SRP19), transcript variant 6, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000391338 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:112891422:112893094:1 gene:ENSG00000212643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000506997 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:112861295:112892951:1 gene:ENSG00000272869 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 70 // 7 // 7 // 0 /// ENST00000512790 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:112861305:112893079:1 gene:ENSG00000272869 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC104811 // GenBank // Homo sapiens zinc finger (CCCH type), RNA-binding motif and serine/arginine rich 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:8143814). // chr5 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0 /// D49676 // GenBank // Homo sapiens U2AF1-RS1 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000031358 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:112891640:112977230:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 50 // 5 // 5 // 0
ENST00000515932 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:113493835:113493960:1 gene:ENSG00000251741 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT103268 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_022828 // RefSeq // Homo sapiens YTH domain containing 2 (YTHDC2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENST00000161863 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:113513683:113595284:1 gene:ENSG00000047188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENST00000515883 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:113513709:113556360:1 gene:ENSG00000047188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 51 // 22 // 22 // 0 /// AK096486 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39167 fis, clone OCBBF2002865, weakly similar to DOSAGE COMPENSATION REGULATOR. // chr5 // 96 // 53 // 22 // 23 // 0 /// AK131450 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ16598 fis, clone TESTI4006473, weakly similar to ATP-dependent RNA helicase A. // chr5 // 97 // 70 // 29 // 30 // 0 /// AK310855 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ17897. // chr5 // 100 // 51 // 22 // 22 // 0 /// BC137285 // GenBank // Homo sapiens YTH domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:168905 IMAGE:9021282), complete cds. // chr5 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000503857 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:113513694:113561196:1 gene:ENSG00000047188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 51 // 51 // 22 // 43 // 1 /// ENST00000512600 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:113581266:113595285:1 gene:ENSG00000047188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 30 // 30 // 13 // 43 // 1 /// AK095368 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ38049 fis, clone CTONG2014280. // chr5 // 21 // 21 // 9 // 43 // 1 /// GENSCAN00000031346 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:113513896:113593383:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 67 // 29 // 29 // 0 /// NONHSAT103270 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 30 // 30 // 13 // 43 // 1
ENST00000410774 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:114253513:114253754:1 gene:ENSG00000222706 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT103278 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_016144 // RefSeq // Homo sapiens COMM domain containing 10 (COMMD10), mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000274458 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:116084991:116293287:1 gene:ENSG00000145781 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000506589 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:116091079:116292916:1 gene:ENSG00000145781 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000507356 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:116085016:116292718:1 gene:ENSG00000145781 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000515539 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:116085474:116292657:1 gene:ENSG00000145781 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// AY542165 // GenBank // Homo sapiens COMMD10 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// BC005179 // GenBank // Homo sapiens COMM domain containing 10, mRNA (cDNA clone MGC:12165 IMAGE:3683093), complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000006929 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:116079408:116198268:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
ENST00000461663 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:116716243:116716650:1 gene:ENSG00000197575 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 82 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000006567 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:116716243:116716650:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 82 // 14 // 14 // 0
ENST00000411247 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:119007571:119007668:1 gene:ENSG00000223179 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 52 // 11 // 11 // 0 /// NONHSAT103411 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 52 // 11 // 11 // 0
ENST00000384059 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:119138859:119138965:1 gene:ENSG00000206786 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT103425 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000365222 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:119445716:119445833:1 gene:ENSG00000202092 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT103434 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_016644 // RefSeq // Homo sapiens proline rich 16 (PRR16), mRNA. // chr5 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// XM_005272012 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens proline rich 16 (PRR16), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000379551 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:120464324:120687332:1 gene:ENSG00000184838 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000446965 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:5:120617137:120686925:1 gene:ENSG00000184838 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 56 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000505123 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:120531464:120686930:1 gene:ENSG00000184838 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 56 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000509923 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:120465631:120686431:1 gene:ENSG00000184838 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// AF242769 // GenBank // Homo sapiens mesenchymal stem cell protein DSC54 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// BC038838 // GenBank // Homo sapiens proline rich 16, mRNA (cDNA clone MGC:47873 IMAGE:5170587), complete cds. // chr5 // 100 // 56 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000407149 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:120464278:120687332:1 gene:ENSG00000184838 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 76 // 76 // 26 // 34 // 1 /// BC092474 // GenBank // Homo sapiens proline rich 16, mRNA (cDNA clone MGC:104614 IMAGE:30528467), complete cds. // chr5 // 76 // 76 // 26 // 34 // 1 /// GENSCAN00000002046 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:120392557:120686709:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 35 // 12 // 12 // 0
NM_177478 // RefSeq // Homo sapiens ferritin mitochondrial (FTMT), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000321339 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:121851955:121852833:1 gene:ENSG00000181867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC034419 // GenBank // Homo sapiens ferritin mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:34793 IMAGE:5165964), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000006 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:121851964:121852692:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_152546 // RefSeq // Homo sapiens serum response factor binding protein 1 (SRFBP1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000339397 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:121961961:122028619:1 gene:ENSG00000151304 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AY611630 // GenBank // Homo sapiens SRF-dependent transcription regulation associated protein mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// BC031222 // GenBank // Homo sapiens serum response factor binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:39522 IMAGE:5297296), complete cds. // chr5 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000504881 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:122020530:122075570:1 gene:ENSG00000151304 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// GENSCAN00000000008 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:121975382:122027126:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT103463 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr5 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NM_207317 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger protein 474 (ZNF474), mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000296600 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:122129513:122153571:1 gene:ENSG00000164185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000504912 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:122129560:122152179:1 gene:ENSG00000164185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 90 // 29 // 9 // 10 // 0 /// AK290985 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75344 complete cds. // chr5 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// AY461732 // GenBank // Homo sapiens testis-specific zinc finger protein (ZNF474) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// BC133022 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 474, mRNA (cDNA clone MGC:164653 IMAGE:40147044), complete cds. // chr5 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// BC133026 // GenBank // Homo sapiens zinc finger protein 474, mRNA (cDNA clone MGC:164657 IMAGE:40147048), complete cds. // chr5 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000001 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:122151991:122153085:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0
ENST00000579731 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:123070782:123071080:1 gene:ENSG00000276047 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA gene:ENSG00000263654 // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT103502 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_001136239 // RefSeq // Homo sapiens PR domain containing 6 (PRDM6), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_005272128 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens PR domain containing 6 (PRDM6), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000407847 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:123089121:123194266:1 gene:ENSG00000061455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000434521 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:123099745:123180285:1 gene:ENSG00000061455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000464424 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:123099746:123170935:1 gene:ENSG00000061455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// AK297992 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60025 complete cds, highly similar to Mus musculus PR domain containing 6 (Prdm6), mRNA. // chr5 // 30 // 30 // 10 // 33 // 1 /// GENSCAN00000006258 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:123073085:123187201:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 76 // 76 // 25 // 33 // 1
NM_207408 // RefSeq // Homo sapiens testis expressed 43 (TEX43), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000357147 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:126631722:126636287:1 gene:ENSG00000196900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000506701 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:126632534:126636242:1 gene:ENSG00000196900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC130495 // GenBank // Homo sapiens chromosome 5 open reading frame 48, mRNA (cDNA clone MGC:163367 IMAGE:40146526), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC130497 // GenBank // Homo sapiens chromosome 5 open reading frame 48, mRNA (cDNA clone MGC:163369 IMAGE:40146528), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT103594 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_001256545 // RefSeq // Homo sapiens multiple EGF-like-domains 10 (MEGF10), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// NM_032446 // RefSeq // Homo sapiens multiple EGF-like-domains 10 (MEGF10), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000274473 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:127290859:127461222:1 gene:ENSG00000145794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000418761 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:127290847:127424604:1 gene:ENSG00000145794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 52 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000503335 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:127290831:127461222:1 gene:ENSG00000145794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000508365 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:127290846:127424781:1 gene:ENSG00000145794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 48 // 16 // 16 // 0 /// AK123568 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ41574 fis, clone CTONG2010116, weakly similar to Rattus norvegicus mRNA for MEGF6. // chr5 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0 /// AK307919 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ97867. // chr5 // 100 // 48 // 16 // 16 // 0 /// BC020198 // GenBank // Homo sapiens multiple EGF-like-domains 10, mRNA (cDNA clone IMAGE:4904255), complete cds. // chr5 // 100 // 52 // 17 // 17 // 0 /// BC152478 // GenBank // Homo sapiens multiple EGF-like-domains 10, mRNA (cDNA clone MGC:176737 IMAGE:8862616), complete cds. // chr5 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000022443 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:127396397:127457318:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0
NM_130809 // RefSeq // Homo sapiens proline-rich coiled-coil 1 (PRRC1), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000296666 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:127517609:127555089:1 gene:ENSG00000164244 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000513427 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:127547835:127552456:1 gene:ENSG00000164244 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// AL831963 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp451D162 (from clone DKFZp451D162); complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC017066 // GenBank // Homo sapiens proline-rich coiled-coil 1, mRNA (cDNA clone MGC:9628 IMAGE:3913311), complete cds. // chr5 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// NM_001286808 // RefSeq // Homo sapiens proline-rich coiled-coil 1 (PRRC1), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// ENST00000442138 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:127517651:127552151:1 gene:ENSG00000164244 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// ENST00000512635 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:127517656:127555081:1 gene:ENSG00000164244 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// GENSCAN00000022432 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:127517548:127551916:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONHSAT103625 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0
NM_001048252 // RefSeq // Homo sapiens cortexin 3 (CTXN3), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NM_001127385 // RefSeq // Homo sapiens cortexin 3 (CTXN3), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000379445 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:127649044:127658630:1 gene:ENSG00000205279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000395322 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:127653049:127658630:1 gene:ENSG00000205279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AB219764 // GenBank // Homo sapiens KABE mRNA, complete cds, clone:Kidney-DDD-17. // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AB219832 // GenBank // Homo sapiens KABE mRNA, complete cds, clone:K-DDD-23. // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC071790 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4611512. // chr5 // 92 // 86 // 22 // 24 // 0 /// BC147012 // GenBank // Homo sapiens cortexin 3, mRNA (cDNA clone MGC:182115 IMAGE:9056940), complete cds. // chr5 // 91 // 39 // 10 // 11 // 0 /// ENST00000514851 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:127653015:127653691:1 gene:ENSG00000205279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// ENST00000620385 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:5:127657423:127658630:1 gene:ENSG00000205279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// NONHSAT103627 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_016048 // RefSeq // Homo sapiens isochorismatase domain containing 1 (ISOC1), mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000173527 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:129094751:129114028:1 gene:ENSG00000066583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000514194 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:5:129094751:129105347:1 gene:ENSG00000066583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 83 // 48 // 10 // 12 // 0 /// BC008367 // GenBank // Homo sapiens isochorismatase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:721 IMAGE:3355904), complete cds. // chr5 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// BC014105 // GenBank // Homo sapiens isochorismatase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:20632 IMAGE:4129769), complete cds. // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// AF151869 // GenBank // Homo sapiens CGI-111 protein mRNA, complete cds. // chr5 // 71 // 96 // 17 // 24 // 0 /// GENSCAN00000027484 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:129094767:129113001:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_133638 // RefSeq // Homo sapiens ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 19 (ADAMTS19), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000274487 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:129460265:129738683:1 gene:ENSG00000145808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000027481 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:129460410:129665579:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0
NM_175856 // RefSeq // Homo sapiens chondroitin sulfate synthase 3 (CHSY3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// XM_005271982 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chondroitin sulfate synthase 3 (CHSY3), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 40 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000305031 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:129904472:130186634:1 gene:ENSG00000198108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AB086062 // GenBank // Homo sapiens CSS2 mRNA for chondroitin sulfate synthase, complete cds. // chr5 // 100 // 60 // 12 // 12 // 0 /// AB175496 // GenBank // Homo sapiens ChSy-2 mRNA for chondroitin synthase-2, complete cds. // chr5 // 95 // 100 // 19 // 20 // 0 /// AJ578034 // GenBank // Homo sapiens mRNA for chodroitin synthase 2 (CHSY2 gene). // chr5 // 95 // 100 // 19 // 20 // 0 /// BC137325 // GenBank // Homo sapiens chondroitin sulfate synthase 3, mRNA (cDNA clone MGC:168945 IMAGE:9021322), complete cds. // chr5 // 92 // 65 // 12 // 13 // 0 /// XM_005271983 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens chondroitin sulfate synthase 3 (CHSY3), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 40 // 40 // 8 // 20 // 1 /// AJ862728 // GenBank // Homo sapiens mRNA for chondroitin synthase (CHSY2 gene). // chr5 // 40 // 40 // 8 // 20 // 1
ENST00000362585 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:130114409:130114510:1 gene:ENSG00000199455 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr5 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT103673 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_001293735 // RefSeq // Homo sapiens LYR motif containing 7 (LYRM7), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// NM_181705 // RefSeq // Homo sapiens LYR motif containing 7 (LYRM7), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NR_121658 // RefSeq // Homo sapiens LYR motif containing 7 (LYRM7), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr5 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000379380 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:131170810:131205426:1 gene:ENSG00000186687 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000507584 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:131170989:131199653:1 gene:ENSG00000186687 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 29 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000510516 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:5:131170944:131199966:1 gene:ENSG00000186687 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 24 // 10 // 10 // 0 /// BC022429 // GenBank // Homo sapiens Lyrm7 homolog (mouse), mRNA (cDNA clone IMAGE:4270959). // chr5 // 100 // 48 // 20 // 20 // 0 /// BC037930 // GenBank // Homo sapiens Lyrm7 homolog (mouse), mRNA (cDNA clone MGC:44056 IMAGE:5284728), complete cds. // chr5 // 100 // 50 // 21 // 21 // 0 /// BC047079 // GenBank // Homo sapiens Lyrm7 homolog (mouse), mRNA (cDNA clone MGC:51245 IMAGE:5286889), complete cds. // chr5 // 90 // 48 // 18 // 20 // 0 /// NONHSAT103685 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 48 // 20 // 20 // 0
NM_001038702 // RefSeq // Homo sapiens CDC42 small effector 2 (CDC42SE2), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NM_020240 // RefSeq // Homo sapiens CDC42 small effector 2 (CDC42SE2), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000360515 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:131264075:131394690:1 gene:ENSG00000158985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000395246 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:5:131264009:131394687:1 gene:ENSG00000158985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000503291 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:131264068:131393106:1 gene:ENSG00000158985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000505065 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:131264100:131394667:1 gene:ENSG00000158985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// BC058909 // GenBank // Homo sapiens CDC42 small effector 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:6528127). // chr5 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0
NM_000588 // RefSeq // Homo sapiens interleukin 3 (IL3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000296870 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:132060529:132063204:1 gene:ENSG00000164399 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC066272 // GenBank // Homo sapiens interleukin 3 (colony-stimulating factor, multiple), mRNA (cDNA clone MGC:79396 IMAGE:6971773), complete cds. // chr5 // 96 // 83 // 23 // 24 // 0 /// BC066273 // GenBank // Homo sapiens interleukin 3 (colony-stimulating factor, multiple), mRNA (cDNA clone MGC:79397 IMAGE:6971774), complete cds. // chr5 // 96 // 83 // 23 // 24 // 0 /// BC066274 // GenBank // Homo sapiens interleukin 3 (colony-stimulating factor, multiple), mRNA (cDNA clone MGC:79398 IMAGE:6971775), complete cds. // chr5 // 88 // 83 // 21 // 24 // 0 /// BC066275 // GenBank // Homo sapiens interleukin 3 (colony-stimulating factor, multiple), mRNA (cDNA clone MGC:79399 IMAGE:6971776), complete cds. // chr5 // 92 // 83 // 22 // 24 // 0 /// BC066276 // GenBank // Homo sapiens interleukin 3 (colony-stimulating factor, multiple), mRNA (cDNA clone MGC:79400 IMAGE:6971777), complete cds. // chr5 // 96 // 83 // 23 // 24 // 0 /// BC069472 // GenBank // Homo sapiens interleukin 3 (colony-stimulating factor, multiple), mRNA (cDNA clone MGC:96913 IMAGE:7262122), complete cds. // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// M14743 // GenBank // Human interleukin 3 (IL-3) mRNA, complete cds. // chr5 // 91 // 79 // 21 // 23 // 0 /// M17115 // GenBank // Human multilineage-colony-stimulating factor mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// M20137 // GenBank // Human interleukin 3 (IL-3) mRNA, complete cds, clone pcD-SR-alpha. // chr5 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000039980 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:132060707:132095809:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
NM_000758 // RefSeq // Homo sapiens colony stimulating factor 2 (granulocyte-macrophage) (CSF2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000296871 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:132073790:132076170:1 gene:ENSG00000164400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY720441 // GenBank // Homo sapiens granulocyte-macrophage colony stimulating factor 2 mRNA, complete cds. // chr5 // 80 // 71 // 16 // 20 // 0 /// BC108724 // GenBank // Homo sapiens colony stimulating factor 2 (granulocyte-macrophage), mRNA (cDNA clone MGC:131935 IMAGE:3886571), complete cds. // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC113924 // GenBank // Homo sapiens colony stimulating factor 2 (granulocyte-macrophage), mRNA (cDNA clone MGC:138897 IMAGE:40084800), complete cds. // chr5 // 87 // 82 // 20 // 23 // 0 /// BC113999 // GenBank // Homo sapiens colony stimulating factor 2 (granulocyte-macrophage), mRNA (cDNA clone MGC:138896 IMAGE:40084798), complete cds. // chr5 // 96 // 82 // 22 // 23 // 0 /// M11734 // GenBank // Human granulocyte/macrophage colony-stimulating factor mRNA, complete cds. // chr5 // 90 // 75 // 19 // 21 // 0 /// GENSCAN00000039980 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:132060707:132095809:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_003059 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 22 (organic cation/zwitterion transporter), member 4 (SLC22A4), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000200652 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:132294443:132344206:1 gene:ENSG00000197208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB007448 // GenBank // Homo sapiens mRNA for OCTN1, complete cds. // chr5 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// BC028313 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 22 (organic cation/ergothioneine transporter), member 4, mRNA (cDNA clone MGC:34546 IMAGE:5186192), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000039978 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:132294617:132370392:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
NR_045116 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 5 open reading frame 56 (C5orf56), long non-coding RNA. // chr5 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000378947 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:5:132410989:132457421:1 gene:ENSG00000197536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000378953 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:5:132410636:132476044:1 gene:ENSG00000197536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// AK096941 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39622 fis, clone SMINT2001199. // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000337752 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:5:132410981:132465109:1 gene:ENSG00000197536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// ENST00000407797 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:132410989:132470908:1 gene:ENSG00000197536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1 /// ENST00000461203 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:132410981:132449991:1 gene:ENSG00000197536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1 /// AK309191 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ99232. // chr5 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// ENST00000621237 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:5:132419864:132460930:1 gene:ENSG00000197536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 92 // 43 // 11 // 12 // 0 /// GENSCAN00000039979 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:132410608:132467157:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// NONHSAT103750 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1
ENST00000365663 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:132468147:132468257:1 gene:ENSG00000202533 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 75 // 3 // 3 // 0 /// NONHSAT103753 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 75 // 3 // 3 // 0
NM_005732 // RefSeq // Homo sapiens RAD50 homolog (S. cerevisiae) (RAD50), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000378823 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:132556938:132646344:1 gene:ENSG00000113522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000423956 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:132557231:132609339:1 gene:ENSG00000113522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// ENST00000453394 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:5:132557231:132595768:1 gene:ENSG00000113522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000533482 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:132556938:132642476:1 gene:ENSG00000113522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AF057299 // GenBank // Homo sapiens RAD50-2 protein (RAD50) mRNA, alternatively spliced, complete cds. // chr5 // 97 // 97 // 30 // 31 // 0 /// AF057300 // GenBank // Homo sapiens truncated RAD50 protein (RAD50) mRNA, complete cds. // chr5 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// BC136436 // GenBank // Homo sapiens RAD50 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:168048 IMAGE:9020425), complete cds. // chr5 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// U63139 // GenBank // Homo sapiens Rad50 (Rad50) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000039975 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:132557325:132642364:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0
NM_001039780 // RefSeq // Homo sapiens cyclin I family, member 2 (CCNI2), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001287252 // RefSeq // Homo sapiens cyclin I family, member 2 (CCNI2), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001287253 // RefSeq // Homo sapiens cyclin I family, member 2 (CCNI2), transcript variant 3, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000378731 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:5:132747445:132754164:1 gene:ENSG00000205089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC132837 // GenBank // Homo sapiens cyclin I family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:164468 IMAGE:40146859), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC136836 // GenBank // Homo sapiens cyclin I family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:168450 IMAGE:9020827), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC144416 // GenBank // Homo sapiens cyclin I family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:177954 IMAGE:9052937), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC144417 // GenBank // Homo sapiens cyclin I family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:177955 IMAGE:9052938), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000614847 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:5:132747445:132754403:1 gene:ENSG00000205089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005486 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:132747496:132752970:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_175873 // RefSeq // Homo sapiens sosondowah ankyrin repeat domain family member A (SOWAHA), mRNA. // chr5 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENST00000378693 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:132813587:132816797:1 gene:ENSG00000198944 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC104771 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat domain 43, mRNA (cDNA clone MGC:132431 IMAGE:8143774), complete cds. // chr5 // 86 // 54 // 12 // 14 // 0 /// BC104775 // GenBank // Homo sapiens ankyrin repeat domain 43, mRNA (cDNA clone MGC:132435 IMAGE:8143778), complete cds. // chr5 // 86 // 54 // 12 // 14 // 0 /// GENSCAN00000005490 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:132813622:132815271:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0
ENST00000364404 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:132848577:132848696:1 gene:ENSG00000201274 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr5 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT103781 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_052971 // RefSeq // Homo sapiens liver expressed antimicrobial peptide 2 (LEAP2), mRNA. // chr5 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000296877 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:132872322:132875046:1 gene:ENSG00000164406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000483190 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:132873444:132874698:1 gene:ENSG00000164406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000485457 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:132873666:132874695:1 gene:ENSG00000164406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// AF143867 // GenBank // Homo sapiens clone IMAGE:111122 mRNA sequence. // chr5 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// AJ409065 // GenBank // Homo sapiens mRNA for liver-expressed antimicrobial peptide 2, alternative promotor region. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY052782 // GenBank // Homo sapiens liver-expressed antimicrobial peptide 2 isoform mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// BC070199 // GenBank // Homo sapiens liver expressed antimicrobial peptide 2, mRNA (cDNA clone MGC:88180 IMAGE:4711742), complete cds. // chr5 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005487 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:132873695:132874571:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 94 // 61 // 16 // 17 // 0 /// NONHSAT103786 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT103787 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0
ENST00000365547 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:132945342:132945454:1 gene:ENSG00000202417 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT103791 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000009738 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:133703159:133885450:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0
ENST00000464317 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:134517810:134518092:1 gene:ENSG00000240250 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT103863 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001252231 // RefSeq // Homo sapiens SEC24 family member A (SEC24A), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 48 // 16 // 16 // 0 /// NM_021982 // RefSeq // Homo sapiens SEC24 family member A (SEC24A), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000322887 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:5:134648824:134693698:1 gene:ENSG00000113615 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 48 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000398844 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:134648789:134727823:1 gene:ENSG00000113615 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// AK304060 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ61651 complete cds, highly similar to Protein transport protein Sec24A. // chr5 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// BC019341 // GenBank // Homo sapiens SEC24 family, member A (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:12985 IMAGE:3355949), complete cds. // chr5 // 94 // 48 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000002401 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:134666877:134855467:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1
NM_001745 // RefSeq // Homo sapiens calcium modulating ligand (CAMLG), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000297156 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:134738501:134752160:1 gene:ENSG00000164615 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC130325 // GenBank // Homo sapiens calcium modulating ligand, mRNA (cDNA clone MGC:163197 IMAGE:40146356), complete cds. // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// U18242 // GenBank // Human calcium modulating cyclophilin ligand (CAMLG) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000514518 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:134738583:134751377:1 gene:ENSG00000164615 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// BC063532 // GenBank // Homo sapiens calcium modulating ligand, mRNA (cDNA clone IMAGE:4419345). // chr5 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// GENSCAN00000002401 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:134666877:134855467:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_014829 // RefSeq // Homo sapiens DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 46 (DDX46), mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000354283 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:134758804:134829296:1 gene:ENSG00000145833 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000452510 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:134758781:134831138:1 gene:ENSG00000145833 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000507392 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:134758779:134829039:1 gene:ENSG00000145833 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// AK126011 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ44023 fis, clone TESTI4026510, highly similar to Homo sapiens RNA helicase. // chr5 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// AK291788 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78679 complete cds, highly similar to Homo sapiens DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 46 (DDX46), mRNA. // chr5 // 96 // 74 // 22 // 23 // 0 /// BC012304 // GenBank // Homo sapiens DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 46, mRNA (cDNA clone MGC:9936 IMAGE:3873814), complete cds. // chr5 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// AF106680 // GenBank // Homo sapiens RNA helicase mRNA, complete cds. // chr5 // 72 // 81 // 18 // 25 // 0 /// ENST00000503946 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:134790153:134829932:1 gene:ENSG00000145833 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1 /// BX647426 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686J23144 (from clone DKFZp686J23144). // chr5 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1 /// GENSCAN00000002401 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:134666877:134855467:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1
NM_001135586 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 5 open reading frame 24 (C5orf24), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// NM_152409 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 5 open reading frame 24 (C5orf24), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000338051 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:134845680:134859109:1 gene:ENSG00000181904 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000394976 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:134845988:134859737:1 gene:ENSG00000181904 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// BC053677 // GenBank // Homo sapiens chromosome 5 open reading frame 24, mRNA (cDNA clone MGC:61708 IMAGE:6166677), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000504727 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCh38:5:134846096:134859732:1 gene:ENSG00000181904 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1 /// ENST00000435259 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:134846154:134855488:1 gene:ENSG00000181904 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1 /// GENSCAN00000002401 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:134666877:134855467:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1
ENST00000254908 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:134904906:134961277:1 gene:ENSG00000132570 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000512783 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:134905120:134969660:1 gene:ENSG00000132570 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 94 // 85 // 16 // 17 // 0 /// AF499009 // GenBank // Homo sapiens HNF1-alpha dimerization cofactor (DCOHM) mRNA, complete cds. // chr5 // 90 // 50 // 9 // 10 // 0 /// AK098495 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ25629 fis, clone STM03715. // chr5 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// AL136721 // GenBank HTC // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp566K1946 (from clone DKFZp566K1946). // chr5 // 82 // 85 // 14 // 17 // 0 /// BC054021 // GenBank // Homo sapiens pterin-4 alpha-carbinolamine dehydratase/dimerization cofactor of hepatocyte nuclear factor 1 alpha (TCF1) 2, mRNA (cDNA clone MGC:61862 IMAGE:6385036), complete cds. // chr5 // 100 // 70 // 14 // 14 // 0 /// NM_032151 // RefSeq // Homo sapiens pterin-4 alpha-carbinolamine dehydratase/dimerization cofactor of hepatocyte nuclear factor 1 alpha (TCF1) 2 (PCBD2), mRNA. // chr5 // 80 // 80 // 16 // 20 // 1 /// ENST00000504352 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:134905173:135007959:1 gene:ENSG00000132570 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 45 // 45 // 9 // 20 // 1
NM_178019 // RefSeq // Homo sapiens cation channel, sperm associated 3 (CATSPER3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000282611 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:134967906:135011707:1 gene:ENSG00000152705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF432876 // GenBank // Homo sapiens putative one-repeat calcium channel mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AK292427 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77381 complete cds, highly similar to Homo sapiens cation channel, sperm associated 3 (CATSPER3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC101692 // GenBank // Homo sapiens cation channel, sperm associated 3, mRNA (cDNA clone MGC:126741 IMAGE:8069198), complete cds. // chr5 // 97 // 94 // 28 // 29 // 0 /// BC110384 // GenBank // Homo sapiens cation channel, sperm associated 3, mRNA (cDNA clone MGC:117279 IMAGE:5166215), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000504352 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:134905173:135007959:1 gene:ENSG00000132570 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1 /// ENST00000511235 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:134967907:134995854:1 gene:ENSG00000152705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1 /// GENSCAN00000002420 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:134969982:135011623:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT103889 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1
NM_001277348 // RefSeq // Homo sapiens chromosome 5 open reading frame 66 (C5orf66), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000432382 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:135033280:135344685:1 gene:ENSG00000224186 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000505828 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:135033442:135215565:1 gene:ENSG00000224186 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONHSAT103892 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr5 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
ENST00000472159 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:135930403:135940871:1 gene:ENSG00000164616 gene_biotype:polymorphic_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000478939 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:135936795:135941678:1 gene:ENSG00000164616 gene_biotype:polymorphic_pseudogene transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0 /// BC106753 // GenBank // Homo sapiens F-box and leucine-rich repeat protein 21, mRNA (cDNA clone IMAGE:40023472), complete cds. // chr5 // 92 // 54 // 12 // 13 // 0 /// ENST00000467490 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:135930403:135951591:1 gene:ENSG00000164616 gene_biotype:polymorphic_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 75 // 75 // 18 // 24 // 1 /// BC044938 // GenBank HTC // Homo sapiens F-box and leucine-rich repeat protein 21, mRNA (cDNA clone IMAGE:5190011), with apparent retained intron. // chr5 // 75 // 75 // 18 // 24 // 1 /// NM_012159 // RefSeq // Homo sapiens F-box and leucine-rich repeat protein 21 (gene/pseudogene) (FBXL21), mRNA. // chr5 // 71 // 71 // 17 // 24 // 1 /// ENST00000297158 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:135936595:135941671:1 gene:ENSG00000164616 gene_biotype:polymorphic_pseudogene transcript_biotype:polymorphic_pseudogene // chr5 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1 /// ENST00000620812 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:5:135930317:135941678:1 gene:ENSG00000164616 gene_biotype:polymorphic_pseudogene transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 71 // 71 // 17 // 24 // 1
NR_002713 // RefSeq // Homo sapiens neuropeptide Y receptor Y6 (pseudogene) (NPY6R), non-coding RNA. // chr5 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000503807 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:137808211:137809322:1 gene:ENSG00000226306 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr5 // 95 // 71 // 21 // 22 // 0 /// ENST00000510937 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:137801193:137810751:1 gene:ENSG00000226306 gene_biotype:transcribed_processed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// AK297855 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53561 complete cds, highly similar to Neuropeptide Y receptor type 6. // chr5 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// AK299427 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52676 complete cds, moderately similar to Neuropeptide Y receptor type 6. // chr5 // 96 // 84 // 25 // 26 // 0 /// D86519 // GenBank // Homo sapiens mRNA for neuropeptide y/peptide YY Y6 receptor, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// U59431 // GenBank // Human truncated pancreatic polypeptide receptor PP2 mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 87 // 26 // 27 // 0 /// U67780 // GenBank // Human NPY Y1-like receptor pseudogene mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000042341 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:137808211:137809083:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0
NM_001135940 // RefSeq // Homo sapiens myotilin (MYOT), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// NM_006790 // RefSeq // Homo sapiens myotilin (MYOT), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000239926 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:137867791:137887851:1 gene:ENSG00000120729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000421631 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:137867858:137887537:1 gene:ENSG00000120729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000509812 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:137867860:137886104:1 gene:ENSG00000120729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 34 // 10 // 10 // 0 /// AF133820 // GenBank // Homo sapiens titin-like protein (TTID) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF144477 // GenBank // Homo sapiens myotilin mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AK300088 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52422 complete cds, highly similar to Myotilin. // chr5 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// BC005376 // GenBank // Homo sapiens myotilin, mRNA (cDNA clone MGC:12492 IMAGE:3934230), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENST00000515645 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:137867876:137887528:1 gene:ENSG00000120729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 79 // 79 // 23 // 29 // 1 /// AK300076 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52421 complete cds, highly similar to Myotilin. // chr5 // 79 // 79 // 23 // 29 // 1 /// GENSCAN00000042342 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:137845938:137935913:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1
NM_058244 // RefSeq // Homo sapiens wingless-type MMTV integration site family, member 8A (WNT8A), mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// XM_005272076 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens wingless-type MMTV integration site family, member 8A (WNT8A), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 95 // 83 // 19 // 20 // 0 /// ENST00000361560 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:138083990:138092365:1 gene:ENSG00000061492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000398754 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:138084085:138091510:1 gene:ENSG00000061492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000504809 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:138084015:138091459:1 gene:ENSG00000061492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000506684 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:138083892:138091270:1 gene:ENSG00000061492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 95 // 83 // 19 // 20 // 0 /// AB057725 // GenBank // Homo sapiens mRNA for WNT8A, complete cds. // chr5 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// AY009402 // GenBank // Homo sapiens WNT8d precursor (WNT8d) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// BC144001 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:9052519, with apparent retained intron. // chr5 // 94 // 67 // 15 // 16 // 0 /// BC144497 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:9053024, containing frame-shift errors. // chr5 // 90 // 83 // 18 // 20 // 0 /// GENSCAN00000042334 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:138084090:138095617:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0
ENST00000391158 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:138116573:138116680:1 gene:ENSG00000212460 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT104006 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_005733 // RefSeq // Homo sapiens kinesin family member 20A (KIF20A), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000394894 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:138178998:138187715:1 gene:ENSG00000112984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENST00000502338 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:138184828:138187243:1 gene:ENSG00000112984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 23 // 9 // 9 // 0 /// ENST00000504621 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:138179221:138182747:1 gene:ENSG00000112984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 90 // 25 // 9 // 10 // 0 /// ENST00000508792 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:5:138179160:138187665:1 gene:ENSG00000112984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000513276 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:138178719:138182425:1 gene:ENSG00000112984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 20 // 8 // 8 // 0 /// AF070672 // GenBank // Homo sapiens rabkinesin6 mRNA, complete cds. // chr5 // 95 // 100 // 38 // 40 // 0 /// AF153329 // GenBank // Homo sapiens RAB6KIFL mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// AK296879 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55710 complete cds, highly similar to Kinesin family member 20A. // chr5 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// BC012999 // GenBank // Homo sapiens kinesin family member 20A, mRNA (cDNA clone MGC:3571 IMAGE:3604291), complete cds. // chr5 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000042329 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:138179681:138187413:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0
NM_016604 // RefSeq // Homo sapiens lysine (K)-specific demethylase 3B (KDM3B), mRNA. // chr5 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// ENST00000314358 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:138352596:138437027:1 gene:ENSG00000120733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000507996 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:138386577:138436032:1 gene:ENSG00000120733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000510866 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:138372674:138437028:1 gene:ENSG00000120733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000542866 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:5:138377811:138436937:1 gene:ENSG00000120733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 64 // 23 // 23 // 0 /// AF251039 // GenBank // Homo sapiens putative zinc finger protein mRNA, complete cds. // chr5 // 97 // 92 // 32 // 33 // 0 /// AF338242 // GenBank // Homo sapiens nuclear protein 5qNCA (LOC51780) mRNA, complete cds. // chr5 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// AK304371 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56207 complete cds, highly similar to JmjC domain-containing histone demethylation protein 2B (EC 1.14.11.-). // chr5 // 96 // 67 // 23 // 24 // 0 /// BC001202 // GenBank // Homo sapiens jumonji domain containing 1B, mRNA (cDNA clone IMAGE:3356650), complete cds. // chr5 // 100 // 64 // 23 // 23 // 0 /// BC146788 // GenBank // Homo sapiens jumonji domain containing 1B, mRNA (cDNA clone MGC:166881 IMAGE:9007251), complete cds. // chr5 // 97 // 97 // 34 // 35 // 0 /// GENSCAN00000042338 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:138352796:138470104:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0
NM_001964 // RefSeq // Homo sapiens early growth response 1 (EGR1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENST00000239938 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:138465490:138469315:1 gene:ENSG00000120738 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK298101 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56577 complete cds, highly similar to Early growth response protein 1. // chr5 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// AK301065 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60905 complete cds, highly similar to Early growth response protein 1. // chr5 // 94 // 53 // 16 // 17 // 0 /// BC073983 // GenBank // Homo sapiens early growth response 1, mRNA (cDNA clone MGC:88036 IMAGE:6188360), complete cds. // chr5 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// M62829 // GenBank // Human transcription factor ETR103 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000042338 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:138352796:138470104:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 72 // 72 // 23 // 32 // 1
ENST00000459407 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:138623479:138623582:1 gene:ENSG00000238745 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT104050 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000516724 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:139221758:139221837:1 gene:ENSG00000252533 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT104070 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_002915 // RefSeq // Homo sapiens small nucleolar RNA, H/ACA box 74A (SNORA74A), small nucleolar RNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000364089 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:139278781:139278978:1 gene:ENSG00000200959 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT104085 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000362675 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:139299852:139299968:1 gene:ENSG00000199545 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT104090 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENST00000363508 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:139447907:139448017:1 gene:ENSG00000200378 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT104106 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_032289 // RefSeq // Homo sapiens pleckstrin and Sec7 domain containing 2 (PSD2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000274710 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:139795821:139844466:1 gene:ENSG00000146005 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC038233 // GenBank // Homo sapiens pleckstrin and Sec7 domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:45998 IMAGE:5752229), complete cds. // chr5 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000038799 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:139680524:139842474:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 84 // 84 // 32 // 38 // 1
ENST00000384587 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:140019492:140019592:1 gene:ENSG00000207317 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT104136 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_005859 // RefSeq // Homo sapiens purine-rich element binding protein A (PURA), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000331327 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:140114123:140125619:1 gene:ENSG00000185129 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC036087 // GenBank // Homo sapiens purine-rich element binding protein A, mRNA (cDNA clone MGC:33782 IMAGE:5284976), complete cds. // chr5 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// BT019388 // GenBank // Homo sapiens purine-rich element binding protein A mRNA, complete cds. // chr5 // 95 // 70 // 20 // 21 // 0 /// M96684 // GenBank // H.sapiens Pur (pur-alpha) mRNA, complete cds. // chr5 // 95 // 70 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000038806 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:140108798:140115150:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1
NM_001007189 // RefSeq // Homo sapiens IgA-inducing protein (IGIP), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000333305 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:140125935:140129392:1 gene:ENSG00000182700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC017422 // GenBank // Homo sapiens chromosome 5 open reading frame 53, mRNA (cDNA clone MGC:27375 IMAGE:4688423), complete cds. // chr5 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// AB073888 // GenBank // Homo sapiens primary neuroblastoma cDNA, clone:Nbla02981, full insert sequence. // chr5 // 67 // 67 // 16 // 24 // 1
NM_032412 // RefSeq // Homo sapiens cysteine-rich transmembrane module containing 1 (CYSTM1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000261811 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:140174642:140243789:1 gene:ENSG00000120306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000504227 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:140175188:140265830:1 gene:ENSG00000120306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000509589 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:140175156:140244810:1 gene:ENSG00000120306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// BC013643 // GenBank // Homo sapiens chromosome 5 open reading frame 32, mRNA (cDNA clone MGC:18101 IMAGE:4152168), complete cds. // chr5 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC023982 // GenBank // Homo sapiens chromosome 5 open reading frame 32, mRNA (cDNA clone MGC:22879 IMAGE:4046171), complete cds. // chr5 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000509789 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:140175188:140282052:1 gene:ENSG00000120306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// AK311640 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ18682. // chr5 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// NONHSAT104171 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr5 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT104172 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr5 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT104173 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr5 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
NM_080670 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 35, member A4 (SLC35A4), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000323146 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:140564456:140569103:1 gene:ENSG00000176087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000508770 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:140564565:140567300:1 gene:ENSG00000176087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000514137 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:140565746:140567229:1 gene:ENSG00000176087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000514199 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:140564891:140569100:1 gene:ENSG00000176087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AJ420598 // GenBank // Homo sapiens mRNA full length insert cDNA clone EUROIMAGE 993277. // chr5 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// AK289378 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ75234 complete cds, highly similar to Homo sapiens solute carrier family 35, member A4, mRNA. // chr5 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// AK307282 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ97230. // chr5 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// BC009906 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 35, member A4, mRNA (cDNA clone MGC:2541 IMAGE:2961449), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000612662 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:5:140564835:140569098:1 gene:ENSG00000176087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000038805 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:140564844:140568144:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0
ENST00000363365 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:5:140579667:140579792:1 gene:ENSG00000200235 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT104205 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_006083 // RefSeq // Homo sapiens IK cytokine, down-regulator of HLA II (IK), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000417647 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:140647770:140662478:1 gene:ENSG00000113141 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// AF182645 // GenBank // Homo sapiens chondrosarcoma-associated protein 2 (CSA2) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// AK225924 // GenBank // Homo sapiens mRNA for RED protein variant, clone: FCC118A06. // chr5 // 100 // 94 // 16 // 16 // 0 /// AK293626 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ53904 complete cds, highly similar to Protein Red. // chr5 // 100 // 88 // 15 // 15 // 0 /// AK308730 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ98771. // chr5 // 100 // 53 // 9 // 9 // 0 /// BC013005 // GenBank // Homo sapiens IK cytokine, down-regulator of HLA II, mRNA (cDNA clone MGC:3980 IMAGE:3030079), complete cds. // chr5 // 93 // 88 // 14 // 15 // 0 /// BC071964 // GenBank // Homo sapiens IK cytokine, down-regulator of HLA II, mRNA (cDNA clone MGC:88657 IMAGE:6461871), complete cds. // chr5 // 100 // 88 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000610522 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:5:140658736:140662214:1 gene:ENSG00000113141 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 47 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000613660 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:5:140647799:140662479:1 gene:ENSG00000113141 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000620556 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:5:140647875:140662479:1 gene:ENSG00000113141 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 93 // 82 // 13 // 14 // 0
NM_144723 // RefSeq // Homo sapiens zinc finger, matrin-type 2 (ZMAT2), mRNA. // chr5 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// ENST00000274712 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:140700334:140706676:1 gene:ENSG00000146007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000506644 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:140700464:140705881:1 gene:ENSG00000146007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000519913 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:140698680:140704502:1 gene:ENSG00000146007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// BC056668 // GenBank // Homo sapiens zinc finger, matrin type 2, mRNA (cDNA clone MGC:61999 IMAGE:4773709), complete cds. // chr5 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000030986 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:140693914:140705756:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1
NR_026703 // RefSeq // Homo sapiens vault RNA 1-1 (VTRNA1-1), vault RNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000363120 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:140711275:140711373:1 gene:ENSG00000199990 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT104227 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF058927 // GenBank // Homo sapiens clone hvRNA92 vRNA sequence. // chr5 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0
NR_026704 // RefSeq // Homo sapiens vault RNA 1-2 (VTRNA1-2), vault RNA. // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000365241 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:140718925:140719013:1 gene:ENSG00000202111 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT104228 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AF058926 // GenBank // Homo sapiens clone hvRNA82 vRNA sequence. // chr5 // 57 // 100 // 13 // 23 // 0 /// NONHSAT104229 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 57 // 100 // 13 // 23 // 0
NR_026705 // RefSeq // Homo sapiens vault RNA 1-3 (VTRNA1-3), vault RNA. // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000365645 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:140726158:140726246:1 gene:ENSG00000202515 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT104230 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_013340 // RefSeq // Homo sapiens protocadherin beta 1 (PCDHB1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000306549 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:141051376:141054001:1 gene:ENSG00000171815 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF152488 // GenBank // Homo sapiens protocadherin beta 1 (PCDH-beta1) mRNA, complete cds. // chr5 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0 /// BC112096 // GenBank // Homo sapiens protocadherin beta 1, mRNA (cDNA clone MGC:138301 IMAGE:8327564), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC112098 // GenBank // Homo sapiens protocadherin beta 1, mRNA (cDNA clone MGC:138303 IMAGE:8327566), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030967 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:141051471:141124386:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_018936 // RefSeq // Homo sapiens protocadherin beta 2 (PCDHB2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000194155 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:141094635:141097380:1 gene:ENSG00000112852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// AF152495 // GenBank // Homo sapiens protocadherin beta 2 (PCDH-beta2) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 63 // 12 // 12 // 0 /// AF217756 // GenBank // Homo sapiens protocadherin-beta2 (PCDHB2) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// BC098347 // GenBank // Homo sapiens protocadherin beta 2, mRNA (cDNA clone MGC:119506 IMAGE:40007951), complete cds. // chr5 // 94 // 84 // 15 // 16 // 0 /// BC098575 // GenBank // Homo sapiens protocadherin beta 2, mRNA (cDNA clone MGC:111392 IMAGE:30921306), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000030967 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:141051471:141124386:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 68 // 13 // 13 // 0
NM_018937 // RefSeq // Homo sapiens protocadherin beta 3 (PCDHB3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENST00000231130 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:141100473:141103827:1 gene:ENSG00000113205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// AF217755 // GenBank // Homo sapiens protocadherin-beta3 (PCDHB3) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0 /// BC104817 // GenBank // Homo sapiens protocadherin beta 3, mRNA (cDNA clone MGC:132477 IMAGE:8143820), complete cds. // chr5 // 100 // 59 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000030967 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:141051471:141124386:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 53 // 9 // 9 // 0
NM_018938 // RefSeq // Homo sapiens protocadherin beta 4 (PCDHB4), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000194152 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:141121840:141125623:1 gene:ENSG00000081818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AF152497 // GenBank // Homo sapiens protocadherin beta 4 (PCDH-beta4) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 62 // 13 // 13 // 0 /// AF217754 // GenBank // Homo sapiens protocadherin-beta4 (PCDHB4) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC098139 // GenBank // Homo sapiens protocadherin beta 4, mRNA (cDNA clone MGC:119527 IMAGE:40008131), complete cds. // chr5 // 93 // 67 // 13 // 14 // 0 /// BC098346 // GenBank // Homo sapiens protocadherin beta 4, mRNA (cDNA clone MGC:119526 IMAGE:40008130), complete cds. // chr5 // 93 // 67 // 13 // 14 // 0 /// GENSCAN00000030967 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:141051471:141124386:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 62 // 62 // 13 // 21 // 1
NM_015669 // RefSeq // Homo sapiens protocadherin beta 5 (PCDHB5), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000231134 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:141135218:141138130:1 gene:ENSG00000113209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AF134474 // GenBank // Homo sapiens protocadherin mRNA, complete cds. // chr5 // 94 // 86 // 17 // 18 // 0 /// AF152498 // GenBank // Homo sapiens protocadherin beta 5 (PCDH-beta5) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// AF217753 // GenBank // Homo sapiens protocadherin-beta5 (PCDHB5) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// BC001186 // GenBank // Homo sapiens protocadherin beta 5, mRNA (cDNA clone MGC:2649 IMAGE:3528826), complete cds. // chr5 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000030956 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:141135435:141137822:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0
NM_018939 // RefSeq // Homo sapiens protocadherin beta 6 (PCDHB6), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000231136 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:141150102:141153287:1 gene:ENSG00000113211 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AF152499 // GenBank // Homo sapiens protocadherin beta 6 (PCDH-beta6) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// AF217752 // GenBank // Homo sapiens protocadherin-beta6 (PCDHB6) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK299661 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ51292 complete cds, highly similar to Protocadherin beta 6 precursor. // chr5 // 89 // 75 // 16 // 18 // 0 /// AK313482 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ94030, highly similar to Homo sapiens protocadherin beta 6 (PCDHB6), mRNA. // chr5 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000030976 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:141147236:141152642:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0
NR_001280 // RefSeq // Homo sapiens protocadherin beta 17 pseudogene (PCDHB17), non-coding RNA. // chr5 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// ENST00000539533 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:141155999:141158385:1 gene:ENSG00000255622 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// AF217751 // GenBank // Homo sapiens protocadherin-psi1 (PCDH-psi1) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000030950 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:141155999:141175217:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0
NM_018940 // RefSeq // Homo sapiens protocadherin beta 7 (PCDHB7), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000231137 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:141172754:141176383:1 gene:ENSG00000113212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AF152500 // GenBank // Homo sapiens protocadherin beta 7 (PCDH-beta7) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// AF217750 // GenBank // Homo sapiens protocadherin-beta7 (PCDHB7) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// BC098574 // GenBank // Homo sapiens protocadherin beta 7, mRNA (cDNA clone MGC:111391 IMAGE:30925247), complete cds. // chr5 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// BC130331 // GenBank // Homo sapiens protocadherin beta 7, mRNA (cDNA clone MGC:163203 IMAGE:40146362), complete cds. // chr5 // 91 // 88 // 21 // 23 // 0 /// BC130333 // GenBank // Homo sapiens protocadherin beta 7, mRNA (cDNA clone MGC:163205 IMAGE:40146364), complete cds. // chr5 // 91 // 88 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000030950 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:141155999:141175217:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_019120 // RefSeq // Homo sapiens protocadherin beta 8 (PCDHB8), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000239444 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:141177790:141180500:1 gene:ENSG00000120322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 90 // 100 // 9 // 10 // 0 /// AF152501 // GenBank // Homo sapiens protocadherin beta 8 (PCDH-beta8) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 90 // 9 // 9 // 0 /// BC136801 // GenBank // Homo sapiens protocadherin beta 8, mRNA (cDNA clone MGC:168414 IMAGE:9020791), complete cds. // chr5 // 90 // 100 // 9 // 10 // 0 /// GENSCAN00000030946 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:141178035:141180440:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 89 // 90 // 8 // 9 // 0
NM_020957 // RefSeq // Homo sapiens protocadherin beta 16 (PCDHB16), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000609684 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:141181399:141186399:1 gene:ENSG00000272674 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// AB046841 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1621 protein, partial cds. // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// AY013878 // GenBank // Homo sapiens protocadherin beta 8a (PCDHB8a) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// BC036062 // GenBank // Homo sapiens protocadherin beta 16, mRNA (cDNA clone MGC:33674 IMAGE:5303291), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000030948 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:141182560:141184890:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0
NM_019119 // RefSeq // Homo sapiens protocadherin beta 9 (PCDHB9), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000316105 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:141187147:141191538:1 gene:ENSG00000177839 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF152502 // GenBank // Homo sapiens protocadherin beta 9 (PCDH-beta9) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AF217749 // GenBank // Homo sapiens protocadherin beta 9 (PCDHB9) mRNA, complete cds. // chr5 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// BC100672 // GenBank // Homo sapiens protocadherin beta 9, mRNA (cDNA clone MGC:119557 IMAGE:40008309), complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC105636 // GenBank // Homo sapiens protocadherin beta 9, mRNA (cDNA clone MGC:119555 IMAGE:40008305), complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC105640 // GenBank // Homo sapiens protocadherin beta 9, mRNA (cDNA clone MGC:119556 IMAGE:40008308), complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000030984 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:141187319:141189712:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_018930 // RefSeq // Homo sapiens protocadherin beta 10 (PCDHB10), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000239446 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:141192369:141195642:1 gene:ENSG00000120324 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000515856 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:5:141187319:141194955:1 gene:ENSG00000120324 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSG00000120327 // chr5 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// AF131761 // GenBank // Homo sapiens clone 25205 mRNA sequence, complete cds. // chr5 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// AF152489 // GenBank // Homo sapiens protocadherin beta 10 (PCDH-beta10) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// AF217748 // GenBank // Homo sapiens protocadherin-beta10 (PCDHB10) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// AY358720 // GenBank // Homo sapiens clone DNA87976 PCDHB10 (UNQ1906) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC031837 // GenBank // Homo sapiens protocadherin beta 10, mRNA (cDNA clone MGC:24979 IMAGE:4931995), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000030957 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:141192553:141194955:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NM_018931 // RefSeq // Homo sapiens protocadherin beta 11 (PCDHB11), mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000354757 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:141199775:141203045:1 gene:ENSG00000197479 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AF152490 // GenBank // Homo sapiens protocadherin beta 11 (PCDH-beta11) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// AF217747 // GenBank // Homo sapiens protocadherin-beta11 (PCDHB11) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AK313428 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ93967, highly similar to Homo sapiens protocadherin beta 11 (PCDHB11), mRNA. // chr5 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC112132 // GenBank // Homo sapiens protocadherin beta 11, mRNA (cDNA clone MGC:138337 IMAGE:8327600), complete cds. // chr5 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC113611 // GenBank // Homo sapiens protocadherin beta 11, mRNA (cDNA clone MGC:142171 IMAGE:8322663), complete cds. // chr5 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// AK299719 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57142 complete cds, highly similar to Protocadherin beta 11 precursor. // chr5 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// GENSCAN00000030942 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:141199775:141202168:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_018932 // RefSeq // Homo sapiens protocadherin beta 12 (PCDHB12), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000239450 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:141208719:141212126:1 gene:ENSG00000120328 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF152491 // GenBank // Homo sapiens protocadherin beta 12 (PCDH-beta12) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// AF217746 // GenBank // Homo sapiens protocadherin-beta12 (PCDHB12) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC045637 // GenBank // Homo sapiens protocadherin beta 12, mRNA (cDNA clone MGC:41768 IMAGE:5302381), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK316160 // GenBank // Homo sapiens cDNA, FLJ79059 complete cds, highly similar to Protocadherin beta 12 precursor. // chr5 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1 /// AK293336 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ55315 complete cds, highly similar to Protocadherin beta 12 precursor. // chr5 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// GENSCAN00000030963 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:141208908:141211295:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0
NM_018933 // RefSeq // Homo sapiens protocadherin beta 13 (PCDHB13), mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000341948 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:141213937:141218979:1 gene:ENSG00000187372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AF217745 // GenBank // Homo sapiens protocadherin-beta13 (PCDHB13) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 76 // 16 // 16 // 0 /// AK292821 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76969 complete cds, highly similar to Homo sapiens protocadherin beta 13 (PCDHB13), mRNA. // chr5 // 100 // 57 // 12 // 12 // 0 /// AK296151 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ56534 complete cds, highly similar to Protocadherin beta 13 precursor. // chr5 // 100 // 67 // 14 // 14 // 0 /// AY358427 // GenBank // Homo sapiens clone DNA48314 PCDHB13 (UNQ332) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 57 // 12 // 12 // 0 /// BC033068 // GenBank // Homo sapiens protocadherin beta 13, mRNA (cDNA clone MGC:45607 IMAGE:5446016), complete cds. // chr5 // 92 // 62 // 12 // 13 // 0 /// BC051348 // GenBank // Homo sapiens protocadherin beta 13, mRNA (cDNA clone MGC:59713 IMAGE:6483735), complete cds. // chr5 // 92 // 62 // 12 // 13 // 0 /// BC071934 // GenBank // Homo sapiens protocadherin beta 13, mRNA (cDNA clone MGC:88620 IMAGE:6383780), complete cds. // chr5 // 92 // 62 // 12 // 13 // 0
NM_018934 // RefSeq // Homo sapiens protocadherin beta 14 (PCDHB14), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000239449 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:141222932:141226293:1 gene:ENSG00000120327 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AF152493 // GenBank // Homo sapiens protocadherin beta 14 (PCDH-beta14) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 40 // 8 // 8 // 0 /// AF217744 // GenBank // Homo sapiens protocadherin-beta14 (PCDHB14) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 60 // 12 // 12 // 0 /// AK301346 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58480 complete cds, highly similar to Protocadherin beta 14 precursor. // chr5 // 100 // 60 // 12 // 12 // 0 /// BC099728 // GenBank // Homo sapiens protocadherin beta 14, mRNA (cDNA clone MGC:120065 IMAGE:40019185), complete cds. // chr5 // 89 // 45 // 8 // 9 // 0 /// AK298296 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ58154 complete cds, highly similar to Protocadherin beta 14 precursor. // chr5 // 65 // 65 // 13 // 20 // 1 /// GENSCAN00000030958 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:141223506:141225902:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 40 // 8 // 8 // 0
NR_001281 // RefSeq // Homo sapiens protocadherin beta 18 pseudogene (PCDHB18), non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000524813 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:141234712:141236911:1 gene:ENSG00000146001 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr5 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000526308 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:141234366:141237529:1 gene:ENSG00000146001 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF217743 // GenBank // Homo sapiens protocadherin-psi2 (PCDH-psi2) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000030952 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:141234714:141236918:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
NM_018935 // RefSeq // Homo sapiens protocadherin beta 15 (PCDHB15), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000231173 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:141245413:141248234:1 gene:ENSG00000113248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AF152494 // GenBank // Homo sapiens protocadherin beta 15 (PCDH-beta15) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 57 // 12 // 12 // 0 /// AF217742 // GenBank // Homo sapiens protocadherin-beta15 (PCDHB15) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// BC038797 // GenBank // Homo sapiens protocadherin beta 15, mRNA (cDNA clone MGC:45997 IMAGE:5767743), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000030953 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:141245579:141247942:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 57 // 12 // 12 // 0
ENST00000488078 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:141479316:141479625:1 gene:ENSG00000242020 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONHSAT104256 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr5 // 91 // 100 // 20 // 22 // 0
NM_030571 // RefSeq // Homo sapiens Nedd4 family interacting protein 1 (NDFIP1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000253814 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:142108505:142154443:1 gene:ENSG00000131507 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB097010 // GenBank // Homo sapiens mRNA for putative NFkB activating protein, complete cds, clone: 164. // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// AB097037 // GenBank // Homo sapiens mRNA for putative MAPK activating protein, complete cds, clone: PM13. // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// AY192728 // GenBank // Homo sapiens breast cancer-associated protein SGA-1M mRNA, complete cds. // chr5 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// BC004317 // GenBank // Homo sapiens Nedd4 family interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:10924 IMAGE:3628100), complete cds. // chr5 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000503388 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:142142978:142154195:1 gene:ENSG00000131507 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// AK124884 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ42894 fis, clone BRHIP3008606. // chr5 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000023431 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:142108975:142188993:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT104292 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_021182 // RefSeq // Homo sapiens histocompatibility (minor) HB-1 (HMHB1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000289448 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:143812161:143820719:1 gene:ENSG00000158497 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF103884 // GenBank // Homo sapiens minor histocompatibility antigen HB-1 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC104412 // GenBank // Homo sapiens histocompatibility (minor) HB-1, mRNA (cDNA clone MGC:129522 IMAGE:40000018), complete cds. // chr5 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC104413 // GenBank // Homo sapiens histocompatibility (minor) HB-1, mRNA (cDNA clone MGC:129523 IMAGE:40000019), complete cds. // chr5 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONHSAT104358 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
ENST00000497657 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:144140879:144141166:1 gene:ENSG00000239390 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONHSAT104359 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_020768 // RefSeq // Homo sapiens potassium channel tetramerization domain containing 16 (KCTD16), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000507359 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:144205277:144485686:1 gene:ENSG00000183775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000512467 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:144170832:144474470:1 gene:ENSG00000183775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// AB037738 // GenBank // Homo sapiens mRNA for KIAA1317 protein, partial cds. // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AK292477 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77188 complete cds, highly similar to Homo sapiens potassium channel tetramerisation domain containing 16 (KCTD16), mRNA. // chr5 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// BC111962 // GenBank // Homo sapiens potassium channel tetramerisation domain containing 16, mRNA (cDNA clone MGC:138167 IMAGE:8327430), complete cds. // chr5 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// BC113435 // GenBank // Homo sapiens potassium channel tetramerisation domain containing 16, mRNA (cDNA clone MGC:141995 IMAGE:8322487), complete cds. // chr5 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0
NM_018989 // RefSeq // Homo sapiens RNA binding motif protein 27 (RBM27), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000265271 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:146203600:146289132:1 gene:ENSG00000091009 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000506502 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:146203550:146339251:1 gene:ENSG00000275740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSG00000091009 // chr5 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000021057 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:146203766:146286030:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
NM_002700 // RefSeq // Homo sapiens POU class 4 homeobox 3 (POU4F3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000230732 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:146339024:146340520:1 gene:ENSG00000091010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC104923 // GenBank // Homo sapiens POU class 4 homeobox 3, mRNA (cDNA clone MGC:132583 IMAGE:8143926), complete cds. // chr5 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// BC112207 // GenBank // Homo sapiens POU class 4 homeobox 3, mRNA (cDNA clone MGC:138412 IMAGE:8327675), complete cds. // chr5 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// ENST00000506502 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:146203550:146339251:1 gene:ENSG00000275740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSG00000091009 // chr5 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// GENSCAN00000021051 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:146336008:146340444:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
NM_001112724 // RefSeq // Homo sapiens serine/threonine kinase 32A (STK32A), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NM_145001 // RefSeq // Homo sapiens serine/threonine kinase 32A (STK32A), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000306304 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:147234963:147375916:1 gene:ENSG00000169302 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000398523 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCh38:5:147235125:147384678:1 gene:ENSG00000169302 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// AK094580 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ37261 fis, clone BRAMY2010464, highly similar to Serine/threonine-protein kinase 32A (EC 2.7.11.1). // chr5 // 96 // 87 // 26 // 27 // 0 /// AK299099 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ57345 complete cds, highly similar to Serine/threonine-protein kinase 32A (EC 2.7.11.1). // chr5 // 96 // 77 // 23 // 24 // 0 /// AK315942 // GenBank // Homo sapiens cDNA, FLJ78841 complete cds, highly similar to Serine/threonine-protein kinase 32A (EC 2.7.11.1). // chr5 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// BC021666 // GenBank // Homo sapiens serine/threonine kinase 32A, mRNA (cDNA clone MGC:22688 IMAGE:3682677), complete cds. // chr5 // 94 // 58 // 17 // 18 // 0 /// NM_001287740 // RefSeq // Homo sapiens serine/threonine kinase 32A (STK32A), transcript variant 3, mRNA. // chr5 // 81 // 81 // 25 // 31 // 1 /// ENST00000397936 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:147234963:147387852:1 gene:ENSG00000169302 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 81 // 81 // 25 // 31 // 1 /// GENSCAN00000049052 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:147019467:147392089:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 68 // 68 // 21 // 31 // 1
NM_054023 // RefSeq // Homo sapiens secretoglobin, family 3A, member 2 (SCGB3A2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000296694 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:147878711:147882190:1 gene:ENSG00000164265 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000504320 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:147870682:147882190:1 gene:ENSG00000164265 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000507160 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:147871498:147882190:1 gene:ENSG00000164265 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000514688 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:147872018:147882191:1 gene:ENSG00000164265 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// AF313455 // GenBank // Homo sapiens UGRP1 mRNA, complete cds. // chr5 // 94 // 65 // 16 // 17 // 0 /// AF439545 // GenBank // Homo sapiens pneumo secretory protein 1 (PNSP1) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AY358979 // GenBank // Homo sapiens clone DNA59855 SCGB3A2 (UNQ566) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC024232 // GenBank // Homo sapiens secretoglobin, family 3A, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:27412 IMAGE:4694514), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000035679 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:147878804:147881753:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT104431 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// NONHSAT104432 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0
NM_001001325 // RefSeq // Homo sapiens serine peptidase inhibitor, Kazal type 14 (putative) (SPINK14), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000356972 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:148169733:148175398:1 gene:ENSG00000196800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000562793 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:148169733:148175398:1 gene:ENSG00000196800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// JF509943 // GenBank // Homo sapiens SPINK14 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// JF509944 // GenBank // Homo sapiens chimeric Alu/SPINK14 mRNA, complete cds. // chr5 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
NM_001195290 // RefSeq // Homo sapiens serine peptidase inhibitor, Kazal type 6 (SPINK6), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// NM_205841 // RefSeq // Homo sapiens serine peptidase inhibitor, Kazal type 6 (SPINK6), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000325630 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:148202841:148215137:1 gene:ENSG00000178172 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY358716 // GenBank // Homo sapiens clone DNA80899 protease inhibitor H (UNQ844) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// BC032003 // GenBank // Homo sapiens serine peptidase inhibitor, Kazal type 6, mRNA (cDNA clone MGC:21394 IMAGE:4754193), complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GQ504704 // GenBank // Homo sapiens serine peptidase inhibitor Kazal type 6 precursor variant 1 (SPINK6) mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GQ504705 // GenBank // Homo sapiens serine peptidase inhibitor Kazal type 6 precursor variant 2 (SPINK6) mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENST00000514389 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:148202794:148213952:1 gene:ENSG00000178172 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 67 // 54 // 10 // 15 // 0 /// ENST00000621437 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:5:148202794:148215136:1 gene:ENSG00000178172 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 93 // 96 // 25 // 27 // 0
NM_001040433 // RefSeq // Homo sapiens serine peptidase inhibitor, Kazal type 9 (SPINK9), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000377906 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:148335559:148339849:1 gene:ENSG00000204909 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AY396740 // GenBank // Homo sapiens serine protease inhibitor Kazal type 9 (SPINK9) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC137530 // GenBank // Homo sapiens serine peptidase inhibitor, Kazal type 9, mRNA (cDNA clone MGC:169153 IMAGE:9021530), complete cds. // chr5 // 95 // 96 // 21 // 22 // 0 /// BC137531 // GenBank // Homo sapiens serine peptidase inhibitor, Kazal type 9, mRNA (cDNA clone MGC:169154 IMAGE:9021531), complete cds. // chr5 // 95 // 96 // 21 // 22 // 0 /// ENST00000511717 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:148321203:148339722:1 gene:ENSG00000204909 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 43 // 43 // 10 // 23 // 1
NM_000024 // RefSeq // Homo sapiens adrenoceptor beta 2, surface (ADRB2), mRNA. // chr5 // 100 // 56 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000305988 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:148825245:148828687:1 gene:ENSG00000169252 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC073856 // GenBank // Homo sapiens adrenergic, beta-2-, receptor, surface, mRNA (cDNA clone MGC:90247 IMAGE:5217922), complete cds. // chr5 // 100 // 38 // 13 // 13 // 0 /// M15169 // GenBank // Human beta-2-adrenergic receptor mRNA, complete cds. // chr5 // 85 // 100 // 29 // 34 // 0 /// BC012481 // GenBank // Homo sapiens adrenergic, beta-2-, receptor, surface, mRNA (cDNA clone MGC:21367 IMAGE:4538187), complete cds. // chr5 // 67 // 53 // 12 // 18 // 0 /// BC063486 // GenBank // Homo sapiens adrenergic, beta-2-, receptor, surface, mRNA (cDNA clone MGC:74793 IMAGE:5241774), complete cds. // chr5 // 72 // 53 // 13 // 18 // 0
NM_152407 // RefSeq // Homo sapiens GrpE-like 2, mitochondrial (E. coli) (GRPEL2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000329271 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:149345430:149354583:1 gene:ENSG00000164284 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000416916 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:149345502:149351654:1 gene:ENSG00000164284 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// ENST00000507562 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:149345619:149354583:1 gene:ENSG00000164284 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// ENST00000513661 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:149345430:149349858:1 gene:ENSG00000164284 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// AK294005 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ52481 complete cds, moderately similar to GrpE protein homolog 2, mitochondrial precursor. // chr5 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// AL832325 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp451C205 (from clone DKFZp451C205); complete cds. // chr5 // 91 // 73 // 20 // 22 // 0 /// BC036678 // GenBank // Homo sapiens GrpE-like 2, mitochondrial (E. coli), mRNA (cDNA clone MGC:33849 IMAGE:5259464), complete cds. // chr5 // 88 // 87 // 23 // 26 // 0 /// BC070090 // GenBank // Homo sapiens GrpE-like 2, mitochondrial (E. coli), mRNA (cDNA clone MGC:87471 IMAGE:30347705), complete cds. // chr5 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000036060 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:149345540:149351282:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0
NR_029684 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 143 (MIR143), microRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_105059 // RefSeq // Homo sapiens MIR143 host gene (non-protein coding) (MIR143HG), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_105060 // RefSeq // Homo sapiens MIR143 host gene (non-protein coding) (MIR143HG), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000385300 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:149428918:149429023:1 gene:ENSG00000208035 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-143 // miRBase Micro RNA Database // MI0000459 Homo sapiens miR-143 stem-loop // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT104492 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT104493 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT104507 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029686 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 145 (MIR145), microRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000384967 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:149430646:149430733:1 gene:ENSG00000276365 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA gene:ENSG00000269936 // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000602315 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:149430286:149432834:1 gene:ENSG00000269936 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK093957 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ36638 fis, clone TRACH2018950. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GQ292874 // GenBank // Homo sapiens precursor microRNA 145, complete sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-145 // miRBase Micro RNA Database // MI0000461 Homo sapiens miR-145 stem-loop // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT104492 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT104493 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT104509 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT104510 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001669 // RefSeq // Homo sapiens Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 37 (ARHGEF37), mRNA. // chr5 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// ENST00000333677 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:149581473:149634968:1 gene:ENSG00000183111 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// AK023814 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ13752 fis, clone PLACE3000352. // chr5 // 100 // 19 // 8 // 8 // 0 /// AK300355 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ54440 complete cds, weakly similar to Dynamin-binding protein. // chr5 // 94 // 76 // 30 // 32 // 0 /// AK300559 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50067 complete cds, weakly similar to Dynamin-binding protein. // chr5 // 95 // 88 // 35 // 37 // 0 /// AK316002 // GenBank // Homo sapiens cDNA, FLJ78901 complete cds, weakly similar to Dynamin-binding protein. // chr5 // 95 // 88 // 35 // 37 // 0 /// ENST00000505810 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:149551947:149601231:1 gene:ENSG00000183111 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1 /// ENST00000509831 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:149626897:149632036:1 gene:ENSG00000183111 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1 /// GENSCAN00000031887 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:149620371:149632191:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 43 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000036051 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:149600459:149619042:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 29 // 12 // 12 // 0
ENST00000485915 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:5:149722070:149722372:1 gene:ENSG00000242928 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT104521 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_000112 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 26 (anion exchanger), member 2 (SLC26A2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000286298 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:149960737:149987405:1 gene:ENSG00000155850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AK290358 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ77975 complete cds, highly similar to Homo sapiens solute carrier family 26 (sulfate transporter), member 2, mRNA. // chr5 // 91 // 74 // 21 // 23 // 0 /// BC059390 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 26 (sulfate transporter), member 2, mRNA (cDNA clone MGC:71706 IMAGE:30341764), complete cds. // chr5 // 96 // 84 // 25 // 26 // 0 /// U14528 // GenBank // Human sulfate transporter (DTD) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000503336 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:149977980:149993455:1 gene:ENSG00000155850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1 /// GENSCAN00000031895 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:149977653:149981813:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0
NM_014983 // RefSeq // Homo sapiens HMG box domain containing 3 (HMGXB3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000502717 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:150000718:150052823:1 gene:ENSG00000113716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000503427 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:5:150000321:150052823:1 gene:ENSG00000113716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000613459 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:5:150000046:150053142:1 gene:ENSG00000113716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031900 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:150000275:150052192:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_001804 // RefSeq // Homo sapiens caudal type homeobox 1 (CDX1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENST00000231656 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:150166795:150184558:1 gene:ENSG00000113722 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF239666 // GenBank // Homo sapiens CDX1 homeobox protein (CDX1) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC096251 // GenBank // Homo sapiens caudal type homeobox 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:40005954), complete cds. // chr5 // 95 // 75 // 20 // 21 // 0 /// BC096252 // GenBank // Homo sapiens caudal type homeobox 1, mRNA (cDNA clone MGC:116917 IMAGE:40005955), complete cds. // chr5 // 87 // 82 // 20 // 23 // 0 /// BC127122 // GenBank // Homo sapiens caudal type homeobox 1, mRNA (cDNA clone MGC:156115 IMAGE:40005957), complete cds. // chr5 // 91 // 82 // 21 // 23 // 0 /// U51095 // GenBank // Human homeobox protein Cdx1 mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// BC096250 // GenBank // Homo sapiens caudal type homeobox 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:40005953), complete cds. // chr5 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// BC096249 // GenBank // Homo sapiens caudal type homeobox 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:40005952), complete cds. // chr5 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// ENST00000616154 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:5:150166890:150184558:1 gene:ENSG00000113722 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 94 // 61 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000031898 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:150166877:150183680:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
NM_014228 // RefSeq // Homo sapiens solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter), member 7 (SLC6A7), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000230671 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:150189957:150211072:1 gene:ENSG00000011083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENST00000524041 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:5:150190085:150222788:1 gene:ENSG00000011083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// AK308895 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA, FLJ98936. // chr5 // 94 // 89 // 29 // 31 // 0 /// BC069631 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter, L-proline), member 7, mRNA (cDNA clone MGC:97192 IMAGE:7262437), complete cds. // chr5 // 97 // 86 // 29 // 30 // 0 /// BC093785 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter, L-proline), member 7, mRNA (cDNA clone MGC:120820 IMAGE:7939630), complete cds. // chr5 // 90 // 86 // 27 // 30 // 0 /// BC113425 // GenBank // Homo sapiens solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter, L-proline), member 7, mRNA (cDNA clone MGC:141985 IMAGE:8322477), complete cds. // chr5 // 90 // 86 // 27 // 30 // 0 /// GENSCAN00000031894 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:150190085:150209615:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 89 // 30 // 31 // 0
NM_001543 // RefSeq // Homo sapiens N-deacetylase/N-sulfotransferase (heparan glucosaminyl) 1 (NDST1), mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XR_245854 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens N-deacetylase/N-sulfotransferase (heparan glucosaminyl) 1 (NDST1), transcript variant X12, misc_RNA. // chr5 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0 /// ENST00000261797 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:150508112:150558211:1 gene:ENSG00000070614 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000523767 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:5:150497778:150553714:1 gene:ENSG00000070614 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// AK292448 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ76493 complete cds, highly similar to Homo sapiens N-deacetylase/N-sulfotransferase (heparan glucosaminyl) 1 (NDST1), mRNA. // chr5 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// AK293746 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59302 complete cds, highly similar to Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1 (EC 2.8.2.8). // chr5 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC012888 // GenBank // Homo sapiens N-deacetylase/N-sulfotransferase (heparan glucosaminyl) 1, mRNA (cDNA clone MGC:9410 IMAGE:3882074), complete cds. // chr5 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// U17970 // GenBank // Human heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// U18918 // GenBank // Human heparan sulfate-N-deacetylase/N-sulfotransferase mRNA, clone HSST, complete cds. // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// U36600 // GenBank // Homo sapiens heparan N-deacetylase/N-sulfotransferase-1 mRNA, complete cds. // chr5 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000031891 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:150521255:150601994:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_001122853 // RefSeq // Homo sapiens myozenin 3 (MYOZ3), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NM_133371 // RefSeq // Homo sapiens myozenin 3 (MYOZ3), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000297130 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:150660882:150679365:1 gene:ENSG00000164591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000517768 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:150660874:150677015:1 gene:ENSG00000164591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// ENST00000521300 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:150671658:150676957:1 gene:ENSG00000164591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 45 // 9 // 9 // 0 /// AF480443 // GenBank // Homo sapiens calsarcin-3 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// BC069380 // GenBank // Homo sapiens myozenin 3, mRNA (cDNA clone MGC:96986 IMAGE:7262195), complete cds. // chr5 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// BC069553 // GenBank // Homo sapiens myozenin 3, mRNA (cDNA clone MGC:96998 IMAGE:7262207), complete cds. // chr5 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// BC074870 // GenBank // Homo sapiens myozenin 3, mRNA (cDNA clone MGC:103850 IMAGE:30915232), complete cds. // chr5 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// BC074871 // GenBank // Homo sapiens myozenin 3, mRNA (cDNA clone MGC:104025 IMAGE:30915469), complete cds. // chr5 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000027219 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:150618368:150676875:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 80 // 80 // 16 // 20 // 1
NM_032947 // RefSeq // Homo sapiens small integral membrane protein 3 (SMIM3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000526627 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:150777946:150796734:1 gene:ENSG00000256235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF313413 // GenBank // Homo sapiens putative small membrane protein NID67 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// BC009719 // GenBank // Homo sapiens MSTP150, mRNA (cDNA clone IMAGE:3895865), complete cds. // chr5 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// BC101838 // GenBank // Homo sapiens MSTP150, mRNA (cDNA clone MGC:126887 IMAGE:8069344), complete cds. // chr5 // 75 // 44 // 9 // 12 // 0 /// BC101840 // GenBank // Homo sapiens MSTP150, mRNA (cDNA clone MGC:126889 IMAGE:8069346), complete cds. // chr5 // 75 // 44 // 9 // 12 // 0 /// BC106040 // GenBank // Homo sapiens MSTP150, mRNA (cDNA clone MGC:117221 IMAGE:4940258), complete cds. // chr5 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC082259 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6455860, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr5 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// AF190153 // GenBank HTC // Homo sapiens MSTP150 (MST150) mRNA, complete cds. // chr5 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1