# # Copyright (C) 1999-2004 Liz Potterton, Peter Briggs # # This code is distributed under the terms and conditions of the # CCP4 Program Suite Licence Agreement as a CCP4 Library. # A copy of the CCP4 licence can be obtained by writing to the # CCP4 Secretary, Daresbury Laboratory, Warrington WA4 4AD, UK. # #CCP4i_cvs_Id $Id$ ################################################## # FFFEAR: COMMAND SCRIPT ################################################## 1 SOLC $SOLC - $USE_MEAN MEAN $SOLVVAL $PROTVAL 1 RESOLUTION $RESO_MIN $RESO_MAX ################################################## # SEARCH parameters ################################################## $USE_SEARCH SEARCH - $USE_STEP STEP $SEARCH_STEP - $USE_RANGE RANGE $SEARCH_RANGE - $USE_PEAKS PEAKS $SEARCH_PEAKS ################################################## # MTZ file labels ################################################## LABELLINE labin "FP SIGFP PHIO FOMO" ################################################## # CENTRE ################################################## $USE_CENTRE CENTRE $FRC_OR_ORTH - $USE_FRAC $FRAC_X $FRAC_Y $FRAC_Z - $USE_ORTH $ORTH_X $ORTH_Y $ORTH_Z ################################################## # MODEL ################################################## 1 MODEL RADIUS $MODEL_RADIUS - $USE_MODEL_RESOL RESOLUTION $MODEL_RESOL - { [IfSet $MODEL_BFAC] } BFACTOR $MODEL_BFAC - $ROTATE_FRAG ROTATE $MODEL_ALPHA $MODEL_BETA $MODEL_GAMMA ################################################## # SCALE ################################################## IF { [StringSame $SCALE_TYPE USER] } 1 SCALE $SCALE_SCALING $SCALE_BFAC ELSE $SCALE_NATURAL SCALE NATURAL ENDIF ################################################## # MASK ################################################## $USE_MASK MASK - { [IfSet $MASK_RADIUS] } RADIUS $MASK_RADIUS ################################################## # FILTER ################################################## $APPLY_FILTER FILTER $FILTER_MAPMODEL - $FILTER_VARIANCE VARIANCE - 1 RADIUS $FILTER_RADIUS ################################################## # END of script ################################################## 1 END