STRUCTURED FILE V0.1 BINARY_BE MOLECULE_TRAJECTORY_2 TYPE struct { typbase : extern ; molecules : array of struct { id : integer*4; name : string; groupings : struct { atoms : array of struct { id : integer*4; type : integer*4; name : string; charge : real*4; }; bonds : array of struct { id : integer*4; type : integer*4; components : integer*4[2]; index : integer*4; }; }; trajectory : array of struct { coordinates : real*4[3,.]; }; }; }; DATA; mmff.typ=PALA  N CA C H O HA CB 1HB 2HB  3HB                                               PAAst # 1H# 2H# 3H! N?А CA C O                                          bPAAen   N CA( C H OXT┐ O┐                                PAAse # 1H# 2H# 3H! N?А CA( C OXT┐ O┐                                           PDNAst  H5* O5*        PDNAen  P O1P┐ O2P┐ O5* C5* C4* O4* C3* O3*  3HO*  C2*  C1*                                                                  °       ∙       ·       √        ¤        №        ■ PRNAst  H5* O5*        PRNAen  P O1P┐ O2P┐ O5* C5* C4* O4* C3* O3*  3HO*  C2*  O2*  C1*                                                                 °       ∙       ·       √        №        ¤         ■!      PRNAse  H5* O5* C5* C4* O4* C3* O3* 3HO* C2*  O2*  C1*                                                         °       ∙       ·       √       №        ¤        ■      PARG   N CA C H O HA CB 1HB 2HB  CG  1HG  2HG  CD  1HD 2HD7 NE>ккл# HE8 CZ7 NH1>ккл# 1HH1# 2HH17 NH2>ккл# 1HH2# 2HH2                            b         !     "     #     $     %     &     '     (    )    *    +    ,    -    .    /     PASP  N CA C H O HA CB 1HB 2HB ( CG  OD1┐  OD2┐                              b                        PASPH1  N CA C H O HA CB 1HB 2HB  CG  OD1  OD2  HD1                             b                             PASPH2  N CA C H O HA CB 1HB 2HB  CG  OD1  OD2  HD2                             b                             PASN   N CA C H O HA CB 1HB 2HB  CG  OD1  ND2  1HD2  2HD2                            b                                 PCYSH  N CA C H O HA CB 1HB 2HB  SG F HG                               b                   PCYS1  N CA C H O HA CB 1HB 2HB  SG                                b              PCYS2  N CA C H O HA CB 1HB 2HB  SG                                b                     Ь PGLU   N CA C H O HA CB 1HB 2HB  CG  1HG  2HG ( CD  OE1┐ OE2┐                            b                                      PGLUH1   N CA C H O HA CB 1HB 2HB  CG  1HG  2HG  CD  OE1 OE2 HE1                            b                                           PGLUH2   N CA C H O HA CB 1HB 2HB  CG  1HG  2HG  CD  OE1 OE2 HE2                            b                                          PGLN   N CA C H O HA CB 1HB 2HB  CG  1HG  2HG  CD  OE1  NE2 1HE2 2HE2                            b                                           !    PGLY   N CA C H O 1HA 2HA                                 bPHIS   N CA C H O HA CB 1HB 2HB M CG P ND1? # HD1 M CD2  HD2O CE1 HE1P NE2?# HE2                            b                                      !    "    #     $     PHISD   N CA C H O HA CB 1HB 2HB > CG & ND1  HD1 ? CD2  HD2> CE1 HE1A NE2                            b                                          !     "     PHISE   N CA C H O HA CB 1HB 2HB ? CG A ND1 > CD2  HD2 > CE1 HE1& NE2 HE2                            b                                           !     "     PILE   N CA C H O HA CB HB CG1  1HG1  2HG1  CG2  1HG2  2HG2 3HG2 CD1 1HD1 2HD1 3HD1                            b                                 !     "     #    $    %    PLEU   N CA C H O HA CB 1HB 2HB  CG  HG  CD1  1HD1  2HD1 3HD1 CD2 1HD2 2HD2 3HD2                            b                                  !     "     #    $    %    PLYSH   N CA C H O HA CB 1HB 2HB  CG  1HG  2HG  CD  1HD 2HD CE 1HE 2HE! NZ?А# 1HZ# 2HZ# 3HZ                            b                   !     "     #     $     %     &    '    (    )    *    +    PLYS   N CA C H O HA CB 1HB 1HB  CG  1HG  2HG  CD  1HD 2HD CE 1HE 2HE NZ 1HZ 2HZ                            b                        !     "     #     $     %    &    '    (    )    PMET   N CA C H O HA CB 1HB 2HB  CG  1HG  2HG  SD  CE 1HE 2HE 3HE                            b                                            !     PPHE   N CA C H O HA CB 1HB 2HB $ CG $ CD1  HD1 $ CD2  HD2$ CE1 HE1$ CE2 HE2$ CZ HZ                            b                             !     "     #     $    %    &    '    (    PPRO   N CA C O HA CB 1HB 2HB CG  1HG  2HG  CD  1HD  1HD                             b                                      PPROst  N CA C O HA CB 1HB 2HB CG  1HG  2HG  CD  1HD  2HD 1H 2H                                                                           !PSER  N CA C H O HA CB 1HB 2HB  OG  HG                               b                   "PTHR   N CA C H O HA CB HB OG1  HG1  CG2  1HG2  2HG2  3HG2                            b                                 #PTRP   N CA C H O HA CB 1HB 1HB ? CG > CD1  HD1 $ CD2 & NE1 HE1$ CE2$ CE3 HE3$ CZ2 HZ2$ CZ3 HZ3$ CH2 HH2                            b         !     "     #     $     %     &     '     (     )     *    +    ,    -    .    /    0    1    $PTYR   N CA C H O HA CB 1HB 2HB $ CG $ CD1  HD1 $ CD2  HD2$ CE1 HE1$ CE2 HE2$ CZ OH HH                            b                        !     "     #     $     %    &    '    (    )    *    %PVAL   N CA C H O HA CB HB CG1  CG2  1HG1  2HG1  3HG1  1HG2 2HG2 3HG2                            b                                           &P5HP  N CA C O CB CG CD OD HA  1HB  2HB  1HG  2HG                                                          'PAAR  CA CB  N C O HA1 HA2 HB2 HB1  H                                          (PBE2  CA  N CB C O CG2 OG1 H HA  HB  HG22  HG21  HG23  P O1P O2P O3P 2HOP 3HOP                                                               !     "     #    $    )PACE  C O CH3 1H 2H 3H                      *PFOR  C O H        +PHOH E O 1H 2H        ,Ph2o E OW HW1 HW2        -PA  P O1P┐ O2P┐ O5* C5* C4* O4* C3* O3*  C2*  C1* & N9 > C8 A N7? C5$ C6' N6% N1$ C2% N3> C4 H8 1H6 2H6 H2 1H5* 2H5* H4* H3* 1H2* 2H2* H1*#     b!    "    #    $    %    &    '    (     )    *     +     ,     -    .    /    0    1     2     3     4     5     6     7     8    9    :    ;    <    =    >    ?     @    A    B     .PC  P O1P┐ O2P┐ O5* C5* C4* O4* C3* O3*  C2*  C1* ' N1  C2  O2 N3 C4' N4 C5 C6 1H4 2H4 H5 H6 1H5* 2H5* H4* H3* 1H2* 2H2* H1*     b         !    "    #    $    %    &     '    (     )     *    +    ,    -    .     /     0     1     2     3     4     5    6    7    8    9    :    ;     <    =    /PG ! P O1P┐ O2P┐ O5* C5* C4* O4* C3* O3*  C2*  C1* & N9 > C8 A N7? C5 C6 O6  N1 C2' N2 N3> C4 H8 H1 1H2 2H2 1H5* 2H5* H4* H3* 1H2* 2H2*  H1*$!    b"    #    $    %    &    '    (    )     *    +     ,     -    .    /    0    1     2     3     4     5     6     7     8     9    :    ;    <    =    >    ?    @    A     B    C    D    !0PT  P O1P┐ O2P┐ O5* C5* C4* O4* C3* O3*  C2*  C1* ' N1  C2  O2  N3 C4 O4 C5 C5M C6 H3 1H5M 2H5M 3H5M H6 1H5* 2H5* H4* H3* 1H2* 2H2* H1*"     b!    "    #    $    %    &    '    (    )    *    +     ,    -     .    /     0     1     2     3     4     5     6     7     8    9    :    ;    <    =    >    ?    @    A     1PR_A ! P O1P┐ O2P┐ O5* C5* C4* O4* C3* O3*  C2*  O2*  C1* & N9 > C8A N7? C5$ C6' N6% N1$ C2% N3> C4 H8 1H6 2H6 H2 1H5* 2H5* H4* H3* 1H2* 2HO*  H1*$!    b"    #    $    %    &    '    (    )     *    +     ,     -     .    /    0    1    2     3     4     5     6     7     8     9    :    ;    <    =    >    ?    @    A     B    C    D    !2PR_C  P O1P┐ O2P┐ O5* C5* C4* O4* C3* O3*  C2*  O2*  C1* ' N1  C2 O2 N3 C4' N4 C5 C6 1H4 2H4 H5 H6 1H5* 2H5* H4* H3* 1H2* 2HO* H1*!    b     !    "    #    $    %    &    '     (    )     *     +     ,    -    .    /    0     1     2     3     4     5     6     7    8    9    :    ;     <    =    >    ?    3PR_G " P O1P┐ O2P┐ O5* C5* C4* O4* C3* O3*  C2*  O2*  C1* & N9 > C8A N7? C5 C6 O6  N1 C2' N2 N3> C4 H8 H1 1H2 2H2 1H5* 2H5* H4* H3* 1H2*  2HO*! H1*%"    b#    $    %    &    '    (    )    *     +    ,     -     .     /    0    1    2    3     4     5     !6     7     8     9     :    ;    <    =    >    ?    @    A    B    C     D    E    F    "4PR_U  P O1P┐ O2P┐ O5* C5* C4* O4* C3* O3*  C2*  O2*  C1* ' N1  C2 O2  N3 C4 O4 C5 C6 H3 H5 H6 1H5* 2H5* H4* H3* 1H2* 2HO* H1*     b         !    "    #    $    %    &     '    (     )     *     +    ,    -    .    /     0     1     2     3     4     5     6    7    8    9    :     ;    <    =    5PCL- Y CL┐А6PNA+ \ NA?А7PK+ ] K?А8PCA+ _ CA@9PMG+ b MG@:PFE+ V FE@;PSI* c SI*@ЩЪ<PO* d O*┐ЩЩЪ