Tenseur de Diffusion

Calcul du tenseur de diffusion

Description

Calcul du tenseur de diffusion pour chaque voxel ayant une valeur non nulle dans l'image T2 (ou pour chaque voxel du mask si ce dernier est utilisé). Le résultat est un fichier "Bucket" contenant, pour chaque voxel analysé, les 6 coefficients et le système propre du tenseur. La méthode d'estimation des coefficients du tenseur s'appuie sur une SVD.

Paramètres

t2_diffusion: T2 Diffusion MR ( entrée )

Image T2 extraite des données brutes de diffusion.

dw_diffusion: DW Diffusion MR ( entrée )

Images pondérées en diffusion.

mask: Diffusion Mask ( optional, entrée )

Image binaire utilisée pour limiter les voxels calculés.

diffusion_model: DTI Model ( sortie )

Structure contenant l'information du tenseur de diffusion pour chaque voxel.

error_mask: Error mask ( optional, sortie )

Masque binaire indiquant en quels voxels le tenseur n'a pas pu être calculé.

Informations techniques

Toolbox : Diffusion et Tractographie

Niveau d'utilisateur : 1

Identifiant : DiffusionDTIModel

Nom de fichier : brainvisa/toolboxes/connectomist/processes/Model pipeline components/DiffusionDTIModel.py

Supported file formats :

t2_diffusion :

GIS image, VIDA image, NIFTI-1 image, MINC image, gz compressed MINC image, DICOM image, TIFF image, XBM image, PBM image, PGM image, BMP image, XPM image, PPM image, gz compressed NIFTI-1 image, TIFF(.tif) image, ECAT i image, PNG image, JPEG image, MNG image, GIF image, SPM image, ECAT v image

dw_diffusion :

GIS image, VIDA image, NIFTI-1 image, MINC image, gz compressed MINC image, DICOM image, TIFF image, XBM image, PBM image, PGM image, BMP image, XPM image, PPM image, gz compressed NIFTI-1 image, TIFF(.tif) image, ECAT i image, PNG image, JPEG image, MNG image, GIF image, SPM image, ECAT v image

mask :

GIS image, VIDA image, NIFTI-1 image, MINC image, gz compressed MINC image, DICOM image, TIFF image, XBM image, PBM image, PGM image, BMP image, XPM image, PPM image, gz compressed NIFTI-1 image, TIFF(.tif) image, ECAT i image, PNG image, JPEG image, MNG image, GIF image, SPM image, ECAT v image

diffusion_model :

Bucket

error_mask :

GIS image, VIDA image, NIFTI-1 image, MINC image, TIFF image, XBM image, PBM image, PGM image, BMP image, XPM image, PPM image, gz compressed NIFTI-1 image, ECAT i image, PNG image, JPEG image, MNG image, GIF image, SPM image, ECAT v image