Surface gris/blanc 2012

Crée un maillage spérique de la surface corticale

Description

Cette moulinette fournit un maillage sphérique de la surface corticale pour chaque hémisphère. Il s'agit de la surface de la matière blanche (le fond du cortex). Cette surface peut être gonflée à des fins de visualisation. (cf Ana Inflate Cortical Surface).

Paramètres

Side: Choice ( input )

Gauche, droit ou les deux hémisphères

mri_corrected: IRM T1 Biais Corrigé ( entrée )

histo_analysis: Analyse d'histogramme ( entrée )

left_grey_white: Left Grey White Mask ( entrée )

classification (gris=100, blanc=200)

right_grey_white: Right Grey White Mask ( entrée )

classification (gris=100, blanc=200)

left_hemi_cortex: Left CSF+GREY Mask ( sortie )

right_hemi_cortex: Right CSF+GREY Mask ( sortie )

left_white_mesh: Left Hemisphere White Mesh ( sortie )

right_white_mesh: Right Hemisphere White Mesh ( sortie )

fix_random_seed: Booléen ( input )

Informations techniques

Toolbox : Morphologist

Niveau d'utilisateur : 0

Identifiant : GreyWhiteSurface

Nom de fichier : brainvisa/toolboxes/morphologist/processes/segmentationpipeline/components_obsolete/segmentation/GreyWhiteSurface.py

Supported file formats :

mri_corrected :

GIS image, VIDA image, NIFTI-1 image, MINC image, gz compressed MINC image, DICOM image, TIFF image, XBM image, PBM image, PGM image, BMP image, XPM image, PPM image, gz compressed NIFTI-1 image, TIFF(.tif) image, ECAT i image, PNG image, JPEG image, MNG image, GIF image, SPM image, ECAT v image

histo_analysis :

Analyse d'histogramme

left_grey_white :

GIS image, VIDA image, NIFTI-1 image, MINC image, TIFF image, XBM image, PBM image, PGM image, BMP image, XPM image, PPM image, gz compressed NIFTI-1 image, ECAT i image, PNG image, JPEG image, MNG image, GIF image, SPM image, ECAT v image

right_grey_white :

GIS image, VIDA image, NIFTI-1 image, MINC image, TIFF image, XBM image, PBM image, PGM image, BMP image, XPM image, PPM image, gz compressed NIFTI-1 image, ECAT i image, PNG image, JPEG image, MNG image, GIF image, SPM image, ECAT v image

left_hemi_cortex :

GIS image, VIDA image, NIFTI-1 image, MINC image, TIFF image, XBM image, PBM image, PGM image, BMP image, XPM image, PPM image, gz compressed NIFTI-1 image, ECAT i image, PNG image, JPEG image, MNG image, GIF image, SPM image, ECAT v image

right_hemi_cortex :

GIS image, VIDA image, NIFTI-1 image, MINC image, TIFF image, XBM image, PBM image, PGM image, BMP image, XPM image, PPM image, gz compressed NIFTI-1 image, ECAT i image, PNG image, JPEG image, MNG image, GIF image, SPM image, ECAT v image

left_white_mesh :

Maillage TRI, PLY mesh, Maillage MESH, GIFTI file, MNI OBJ mesh

right_white_mesh :

Maillage TRI, PLY mesh, Maillage MESH, GIFTI file, MNI OBJ mesh