Surface MultiActivations Viewer

Afficheur pour la visualisation de résultats des contrastes surfaciques.

Description

Ce visualiseur affiche le cerveau (gonflé) avec la courbure du maillage de la matière blanche et les activations (contrastes, T map, etc). Il permet de changer le niveau de gonflement du cerveau et de changer les palettes de toutes les textures à volonté (le contraste de la courbure ou les seuils des activations). Un maximum de trois contrastes fonctionnels peut être affiché en trois couleurs : rouge, vert et bleu. Le mélange de ces trois couleurs donne trois couleurs différentes : rouge+vert=jaune, rouge+bleu=magenta, vert+bleu=cyan.

Paramètres

activations_texture_1_red: Functional Time Texture ( entrée )
Premier contraste, T map, z map, etc (.tex or .gii). Il apparaît en rouge.
activations_texture_2_green: Functional Time Texture ( optional, entrée )
Deuxième contraste, T map, z map, etc (.tex or .gii). Il apparaît en vert.
activations_texture_3_blue: Functional Time Texture ( optional, entrée )
Troisième contraste, T map, z map, etc (.tex or .gii). Il apparaît en bleu.
input_mesh: Maillage de la matière blanche d'un hémisphère ( entrée )
Maillage de la matière blanche.
compute_inflated_mesh: Booléen ( input )
True/False (valeur par défaut : True) - Indique si le maillage du cerveau gonflé doit être calculé (s'il l'a déjà été ce n'est pas nécessaire).
inflated_mesh: Inflated Hemisphere White Mesh ( sortie )
Maillage gonflé.
curvature_texture: White Curvature Texture ( sortie )
Courbure du maillage d'entrée -matière blanche- (.tex/.gii).
iterations: Entier ( input )
Nombre d'itérations du gonflement (valeur par défaut : 500).
save_inflate_sequence: Booléen ( input )
True/False (valeur par défaut : False) - Si "True" est sélectionné, le traitement calcule et affiche les différentes étapes du gonflement du cerveau. Si "False" est sélectionné, seulement le cerveau gonflé est calculé et affiché.

Informations techniques

Toolbox : Surface corticale

Niveau d'utilisateur : 0

Identifiant : SurfaceActivationsViewer

Nom de fichier : brainvisa/toolboxes/cortical_surface/processes/viewers/SurfaceActivationsViewer.py

Supported file formats :

activations_texture_1_red :
GIFTI file, Texture
activations_texture_2_green :
GIFTI file, Texture
activations_texture_3_blue :
GIFTI file, Texture
input_mesh :
Maillage TRI, PLY mesh, Maillage MESH, GIFTI file, MNI OBJ mesh
inflated_mesh :
Maillage TRI, PLY mesh, Maillage MESH, GIFTI file, MNI OBJ mesh
curvature_texture :
GIFTI file, Texture