Pipeline de conversion des sorties de FreeSurfer vers BrainVisa, version légère

Please to refer to the following documentation: Freesurfer outputs To BrainVISA conversion pipeline

Paramètres

anat: RawFreesurferAnat ( entrée )

leftPial: FreesurferType ( entrée )

leftWhite: FreesurferType ( entrée )

leftSphereReg: FreesurferType ( entrée )

leftThickness: FreesurferType ( entrée )

leftCurv: FreesurferType ( entrée )

leftAvgCurv: FreesurferType ( entrée )

leftCurvPial: FreesurferType ( entrée )

leftGyri: FreesurferGyriTexture ( entrée )

leftSulciGyri: FreesurferSulciGyriTexture ( optional, entrée )

rightPial: FreesurferType ( entrée )

rightWhite: FreesurferType ( entrée )

rightSphereReg: FreesurferType ( entrée )

rightThickness: FreesurferType ( entrée )

rightCurv: FreesurferType ( entrée )

rightAvgCurv: FreesurferType ( entrée )

rightCurvPial: FreesurferType ( entrée )

rightGyri: FreesurferGyriTexture ( entrée )

rightSulciGyri: FreesurferSulciGyriTexture ( optional, entrée )

Informations techniques

Toolbox : FreeSurfer

Niveau d'utilisateur : 1

Identifiant : freesurferToBrainvisaConversionPipelineLight

Nom de fichier : brainvisa/toolboxes/freesurfer/processes/Tools/freesurferToBrainvisaConversionPipelineLight.py

Supported file formats :

anat :

FreesurferMGZ

leftPial :

FreesurferPial

leftWhite :

FreesurferWhite

leftSphereReg :

FreesurferSphereReg

leftThickness :

FreesurferThickness

leftCurv :

FreesurferCurv

leftAvgCurv :

FreesurferAvgCurv

leftCurvPial :

FreesurferCurvPial

leftGyri :

FreesurferParcellation

leftSulciGyri :

FreesurferParcellation

rightPial :

FreesurferPial

rightWhite :

FreesurferWhite

rightSphereReg :

FreesurferSphereReg

rightThickness :

FreesurferThickness

rightCurv :

FreesurferCurv

rightAvgCurv :

FreesurferAvgCurv

rightCurvPial :

FreesurferCurvPial

rightGyri :

FreesurferParcellation

rightSulciGyri :

FreesurferParcellation