Extraction de la surface ouverte d'un cerveau entier

Crée un maillage du cerveau complet

Description

Cette procédure peut être utilisée pour calculer un maillage de la surface du cerveau. L'objet maillé n'est pas directement le masque du cerveau. En fait, un prétraitement cherche à ouvrir les sillons avant de réaliser la triangulation, de manière à rendre la lecture de la surface corticale plus simple. Le maillage final associe les deux hémisphères et le cervelet, mais la qualité de la segmentation du cervelet peut parfois sérieusement laisser à désirer. En effet, la résolution des acquisitions IRM standard n'est pas suffisante pour gérer correctement les plis du cervelet. Plus particulièrement, les effets de volume partiel entre matières grises et blanches peuvent perturber les processus de segmentation mis en oeuvre.

Exemple de résultat:

Paramètres

mri_corrected: IRM T1 Biais Corrigé ( entrée )

histo_analysis: Analyse d'histogramme ( entrée )

brain_mask: T1 Brain Mask ( entrée )

cortex: Both CSF+GREY Mask ( sortie )

Résultat intermédiaire

brain_mesh: Maillage du cerveau ( sortie )

Informations techniques

Toolbox : Morphologist

Niveau d'utilisateur : 2

Identifiant : AnaGetOpenedBrainSurface

Nom de fichier : brainvisa/toolboxes/morphologist/processes/segmentationpipeline/components_obsolete/segmentation/AnaGetOpenedBrainSurface.py

Supported file formats :

mri_corrected :

GIS image

histo_analysis :

Analyse d'histogramme

brain_mask :

GIS image

cortex :

GIS image

brain_mesh :

Maillage MESH