Extraction de la surface sphérique d'un hémisphère

Crée un maillage d'un ou deux hémisphères

Description

Cette procédure crée un maillage de chacun des hémisphères cérébraux. Elle inclue un prétraitement qui ouvre les sillons afin de faciliter la lecture de la surface corticale.
Le maillage de cette nouvelle version est sphérique, ce qui autorise le gonflement pour le déplisser.

Paramètres

Side: Choice ( input )

Gauche, Droit, ou les Deux Hémisphères

mri_corrected: IRM T1 Biais Corrigé ( entrée )

split_mask: Séparation du masque du cerveau ( entrée )

left_hemi_cortex: Left CSF+GREY Mask ( entrée )

right_hemi_cortex: Right CSF+GREY Mask ( entrée )

left_hemi_mesh: Left Hemisphere Mesh ( sortie )

right_hemi_mesh: Right Hemisphere Mesh ( sortie )

fix_random_seed: Booléen ( input )

Informations techniques

Toolbox : Morphologist

Niveau d'utilisateur : 2

Identifiant : GetSphericalHemiSurface

Nom de fichier : brainvisa/toolboxes/morphologist/processes/segmentationpipeline/components_obsolete/segmentation/GetSphericalHemiSurface.py

Supported file formats :

mri_corrected :

GIS image, VIDA image, NIFTI-1 image, MINC image, gz compressed MINC image, DICOM image, TIFF image, XBM image, PBM image, PGM image, BMP image, XPM image, PPM image, gz compressed NIFTI-1 image, TIFF(.tif) image, ECAT i image, PNG image, JPEG image, MNG image, GIF image, SPM image, ECAT v image

split_mask :

GIS image, VIDA image, NIFTI-1 image, MINC image, gz compressed MINC image, DICOM image, TIFF image, XBM image, PBM image, PGM image, BMP image, XPM image, PPM image, gz compressed NIFTI-1 image, TIFF(.tif) image, ECAT i image, PNG image, JPEG image, MNG image, GIF image, SPM image, ECAT v image

left_hemi_cortex :

GIS image, VIDA image, NIFTI-1 image, MINC image, TIFF image, XBM image, PBM image, PGM image, BMP image, XPM image, PPM image, gz compressed NIFTI-1 image, ECAT i image, PNG image, JPEG image, MNG image, GIF image, SPM image, ECAT v image

right_hemi_cortex :

GIS image, VIDA image, NIFTI-1 image, MINC image, TIFF image, XBM image, PBM image, PGM image, BMP image, XPM image, PPM image, gz compressed NIFTI-1 image, ECAT i image, PNG image, JPEG image, MNG image, GIF image, SPM image, ECAT v image

left_hemi_mesh :

Maillage TRI, PLY mesh, Maillage MESH, GIFTI file, MNI OBJ mesh

right_hemi_mesh :

Maillage TRI, PLY mesh, Maillage MESH, GIFTI file, MNI OBJ mesh